[1] # (a,c,g,t)= (0.4, 0.1, 0.1, 0.4) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.355 C 0.145 G 0.145 T 0.355 # l= 1 # Values AA 0.132 AC 0.0509 AG 0.0436 AT 0.129 CA 0.0535 CC 0.0187 CG 0.0293 CT 0.0436 GA 0.0511 GC 0.0243 GG 0.0187 GT 0.051 TA 0.119 TC 0.0511 TG 0.0535 TT 0.132 # l= 2 # Values AAA 0.0519 AAC 0.0173 AAG 0.0167 AAT 0.0459 ACA 0.021 ACC 0.00586 ACG 0.01 ACT 0.014 AGA 0.0167 AGC 0.00669 AGG 0.00608 AGT 0.0141 ATA 0.0478 ATC 0.0162 ATG 0.0187 ATT 0.0459 CAA 0.0188 CAC 0.00849 CAG 0.00748 CAT 0.0187 CCA 0.00651 CCC 0.00257 CCG 0.00359 CCT 0.00608 CGA 0.0105 CGC 0.00523 CGG 0.00359 CGT 0.01 CTA 0.0123 CTC 0.00711 CTG 0.00748 CTT 0.0167 GAA 0.0212 GAC 0.00664 GAG 0.00711 GAT 0.0162 GCA 0.0092 GCC 0.00321 GCG 0.00523 GCT 0.00669 GGA 0.00711 GGC 0.0032 GGG 0.00257 GGT 0.00586 GTA 0.0186 GTC 0.00664 GTG 0.00849 GTT 0.0173 TAA 0.0399 TAC 0.0186 TAG 0.0123 TAT 0.0478 TCA 0.0167 TCC 0.00711 TCG 0.0105 TCT 0.0167 TGA 0.0167 TGC 0.0092 TGG 0.00651 TGT 0.021 TTA 0.0399 TTC 0.0212 TTG 0.0188 TTT 0.0519 # l= 3 # Values AAAA 0.0196 AAAC 0.00661 AAAG 0.00682 AAAT 0.0188 AACA 0.00708 AACC 0.00191 AACG 0.00343 AACT 0.00485 AAGA 0.00655 AAGC 0.00238 AAGG 0.0023 AAGT 0.00544 AATA 0.0172 AATC 0.00532 AATG 0.00697 AATT 0.0164 ACAA 0.00744 ACAC 0.0031 ACAG 0.00287 ACAT 0.00763 ACCA 0.00212 ACCC 0.000683 ACCG 0.00123 ACCT 0.00182 ACGA 0.00372 ACGC 0.00165 ACGG 0.00116 ACGT 0.00348 ACTA 0.00417 ACTC 0.00189 ACTG 0.00255 ACTT 0.00544 AGAA 0.00726 AGAC 0.0019 AGAG 0.00253 AGAT 0.00504 AGCA 0.00263 AGCC 0.000836 AGCG 0.00135 AGCT 0.00187 AGGA 0.00247 AGGC 0.000895 AGGG 0.000897 AGGT 0.00182 AGTA 0.00519 AGTC 0.00173 AGTG 0.00227 AGTT 0.00485 ATAA 0.0161 ATAC 0.00683 ATAG 0.00477 ATAT 0.0201 ATCA 0.00558 ATCC 0.00197 ATCG 0.00358 ATCT 0.00504 ATGA 0.00604 ATGC 0.00291 ATGG 0.00217 ATGT 0.00763 ATTA 0.0144 ATTC 0.00627 ATTG 0.00642 ATTT 0.0188 CAAA 0.00726 CAAC 0.00263 CAAG 0.00247 CAAT 0.00642 CACA 0.00317 CACC 0.00108 CACG 0.00197 CACT 0.00227 CAGA 0.0026 CAGC 0.0013 CAGG 0.00103 CAGT 0.00255 CATA 0.00655 CATC 0.00251 CATG 0.00272 CATT 0.00697 CCAA 0.00218 CCAC 0.0012 CCAG 0.00097 CCAT 0.00217 CCCA 0.000746 CCCC 0.000448 CCCG 0.000477 CCCT 0.000897 CCGA 0.00118 CCGC 0.000729 CCGG 0.000523 CCGT 0.00116 CCTA 0.00157 CCTC 0.00118 CCTG 0.00103 CCTT 0.0023 CGAA 0.00376 CGAC 0.0015 CGAG 0.00165 CGAT 0.00358 CGCA 0.00158 CGCC 0.000714 CGCG 0.00157 CGCT 0.00135 CGGA 0.00117 CGGC 0.000717 CGGG 0.000477 CGGT 0.00123 CGTA 0.00311 CGTC 0.0015 CGTG 0.00197 CGTT 0.00343 CTAA 0.00389 CTAC 0.00219 CTAG 0.00146 CTAT 0.00476 CTCA 0.00185 CTCC 0.00107 CTCG 0.00165 CTCT 0.00253 CTGA 0.00221 CTGC 0.00142 CTGG 0.00097 CTGT 0.00287 CTTA 0.00433 CTTC 0.00305 CTTG 0.00247 CTTT 0.00682 GAAA 0.00908 GAAC 0.00278 GAAG 0.00305 GAAT 0.00627 GACA 0.00257 GACC 0.000835 GACG 0.0015 GACT 0.00173 GAGA 0.00296 GAGC 0.00107 GAGG 0.00118 GAGT 0.00189 GATA 0.00593 GATC 0.0024 GATG 0.00252 GATT 0.00532 GCAA 0.00337 GCAC 0.00149 GCAG 0.00143 GCAT 0.00291 GCCA 0.0012 GCCC 0.000397 GCCG 0.000717 GCCT 0.000896 GCGA 0.00182 GCGC 0.00102 GCGG 0.000729 GCGT 0.00165 GCTA 0.00194 GCTC 0.00107 GCTG 0.0013 GCTT 0.00238 GGAA 0.00318 GGAC 0.000896 GGAG 0.00107 GGAT 0.00197 GGCA 0.00119 GGCC 0.000469 GGCG 0.000714 GGCT 0.000835 GGGA 0.00104 GGGC 0.000396 GGGG 0.000448 GGGT 0.000684 GGTA 0.00204 GGTC 0.000835 GGTG 0.00108 GGTT 0.00191 GTAA 0.00638 GTAC 0.00314 GTAG 0.00219 GTAT 0.00684 GTCA 0.00233 GTCC 0.000896 GTCG 0.0015 GTCT 0.0019 GTGA 0.00269 GTGC 0.00149 GTGG 0.0012 GTGT 0.0031 GTTA 0.00525 GTTC 0.00278 GTTG 0.00263 GTTT 0.00661 TAAA 0.0159 TAAC 0.00524 TAAG 0.00433 TAAT 0.0144 TACA 0.00822 TACC 0.00204 TACG 0.00311 TACT 0.00519 TAGA 0.00463 TAGC 0.00194 TAGG 0.00156 TAGT 0.00417 TATA 0.0181 TATC 0.00593 TATG 0.00655 TATT 0.0172 TCAA 0.00579 TCAC 0.00269 TCAG 0.00221 TCAT 0.00605 TCCA 0.00244 TCCC 0.00104 TCCG 0.00117 TCCT 0.00247 TCGA 0.00378 TCGC 0.00182 TCGG 0.00118 TCGT 0.00372 TCTA 0.00463 TCTC 0.00296 TCTG 0.0026 TCTT 0.00655 TGAA 0.00698 TGAC 0.00233 TGAG 0.00185 TGAT 0.00558 TGCA 0.0038 TGCC 0.00119 TGCG 0.00158 TGCT 0.00263 TGGA 0.00244 TGGC 0.0012 TGGG 0.000747 TGGT 0.00212 TGTA 0.00822 TGTC 0.00257 TGTG 0.00317 TGTT 0.00708 TTAA 0.0135 TTAC 0.00638 TTAG 0.00389 TTAT 0.0161 TTCA 0.00698 TTCC 0.00318 TTCG 0.00376 TTCT 0.00726 TTGA 0.00579 TTGC 0.00337 TTGG 0.00218 TTGT 0.00744 TTTA 0.0159 TTTC 0.00908 TTTG 0.00726 TTTT 0.0196 # l= 4 # Values AAAAA 0.00721 AAAAC 0.00233 AAAAG 0.0027 AAAAT 0.00738 AAACA 0.00278 AAACC 0.000656 AAACG 0.00128 AAACT 0.0019 AAAGA 0.00276 AAAGC 0.000906 AAAGG 0.000919 AAAGT 0.00223 AAATA 0.00734 AAATC 0.00204 AAATG 0.00288 AAATT 0.00658 AACAA 0.00268 AACAC 0.000945 AACAG 0.000995 AACAT 0.00245 AACCA 0.000712 AACCC 0.000215 AACCG 0.000383 AACCT 0.000599 AACGA 0.00137 AACGC 0.000521 AACGG 0.000403 AACGT 0.00114 AACTA 0.00149 AACTC 0.000612 AACTG 0.0009 AACTT 0.00185 AAGAA 0.00297 AAGAC 0.000691 AAGAG 0.000927 AAGAT 0.00196 AAGCA 0.000986 AAGCC 0.000261 AAGCG 0.000451 AAGCT 0.000681 AAGGA 0.000984 AAGGC 0.000327 AAGGG 0.00033 AAGGT 0.000662 AAGTA 0.00211 AAGTC 0.000604 AAGTG 0.000867 AAGTT 0.00185 AATAA 0.00622 AATAC 0.00226 AATAG 0.0017 AATAT 0.00705 AATCA 0.00191 AATCC 0.000613 AATCG 0.00114 AATCT 0.00166 AATGA 0.00238 AATGC 0.00103 AATGG 0.000815 AATGT 0.00274 AATTA 0.00534 AATTC 0.00216 AATTG 0.0023 AATTT 0.00658 ACAAA 0.00302 ACAAC 0.000893 ACAAG 0.000954 ACAAT 0.00257 ACACA 0.00131 ACACC 0.000324 ACACG 0.000702 ACACT 0.00077 ACAGA 0.00105 ACAGC 0.00046 ACAGG 0.000393 ACAGT 0.000963 ACATA 0.00294 ACATC 0.000871 ACATG 0.00107 ACATT 0.00274 ACCAA 0.00073 ACCAC 0.000372 ACCAG 0.000331 ACCAT 0.000691 ACCCA 0.000218 ACCCC 0.000104 ACCCG 0.000122 ACCCT 0.00024 ACCGA 0.000424 ACCGC 0.000226 ACCGG 0.000182 ACCGT 0.000398 ACCTA 0.000541 ACCTC 0.000304 ACCTG 0.000314 ACCTT 0.000662 ACGAA 0.00141 ACGAC 0.00048 ACGAG 0.000576 ACGAT 0.00125 ACGCA 0.000544 ACGCC 0.000182 ACGCG 0.000506 ACGCT 0.00042 ACGGA 0.000412 ACGGC 0.000193 ACGGG 0.000156 ACGGT 0.000398 ACGTA 0.0012 ACGTC 0.000462 ACGTG 0.000678 ACGTT 0.00114 ACTAA 0.00136 ACTAC 0.000712 ACTAG 0.000502 ACTAT 0.0016 ACTCA 0.000545 ACTCC 0.000249 ACTCG 0.00047 ACTCT 0.000627 ACTGA 0.000794 ACTGC 0.000462 ACTGG 0.000334 ACTGT 0.000963 ACTTA 0.00149 ACTTC 0.000893 ACTTG 0.000828 ACTTT 0.00223 AGAAA 0.00326 AGAAC 0.000843 AGAAG 0.00105 AGAAT 0.00211 AGACA 0.000787 AGACC 0.000207 AGACG 0.000395 AGACT 0.000514 AGAGA 0.00117 AGAGC 0.000323 AGAGG 0.000417 AGAGT 0.000627 AGATA 0.00196 AGATC 0.000656 AGATG 0.000774 AGATT 0.00166 AGCAA 0.000988 AGCAC 0.000393 AGCAG 0.000435 AGCAT 0.000813 AGCCA 0.000314 AGCCC 0.000101 AGCCG 0.000188 AGCCT 0.000232 AGCGA 0.000502 AGCGC 0.00023 AGCGG 0.000202 AGCGT 0.00042 AGCTA 0.000549 AGCTC 0.000267 AGCTG 0.000373 AGCTT 0.000681 AGGAA 0.00116 AGGAC 0.000279 AGGAG 0.00036 AGGAT 0.000672 AGGCA 0.000366 AGGCC 0.000108 AGGCG 0.000189 AGGCT 0.000232 AGGGA 0.000372 AGGGC 0.000122 AGGGG 0.000163 AGGGT 0.00024 AGGTA 0.000664 AGGTC 0.000239 AGGTG 0.000319 AGGTT 0.000599 AGTAA 0.00188 AGTAC 0.000815 AGTAG 0.000677 AGTAT 0.00182 AGTCA 0.000652 AGTCC 0.000198 AGTCG 0.000369 AGTCT 0.000514 AGTGA 0.000778 AGTGC 0.000371 AGTGG 0.000355 AGTGT 0.00077 AGTTA 0.00147 AGTTC 0.000723 AGTTG 0.000755 AGTTT 0.0019 ATAAA 0.00668 ATAAC 0.00193 ATAAG 0.00168 ATAAT 0.00582 ATACA 0.00322 ATACC 0.00069 ATACG 0.00111 ATACT 0.00182 ATAGA 0.00184 ATAGC 0.000731 ATAGG 0.000595 ATAGT 0.0016 ATATA 0.00815 ATATC 0.00223 ATATG 0.00265 ATATT 0.00705 ATCAA 0.00194 ATCAC 0.000869 ATCAG 0.00076 ATCAT 0.00201 ATCCA 0.000682 ATCCC 0.000269 ATCCG 0.000344 ATCCT 0.000672 ATCGA 0.00135 ATCGC 0.000584 ATCGG 0.00039 ATCGT 0.00125 ATCTA 0.00149 ATCTC 0.000814 ATCTG 0.00078 ATCTT 0.00196 ATGAA 0.00261 ATGAC 0.000785 ATGAG 0.000642 ATGAT 0.00201 ATGCA 0.00129 ATGCC 0.000322 ATGCG 0.000486 ATGCT 0.000813 ATGGA 0.000834 ATGGC 0.000385 ATGGG 0.000255 ATGGT 0.000691 ATGTA 0.00333 ATGTC 0.000796 ATGTG 0.00104 ATGTT 0.00245 ATTAA 0.00493 ATTAC 0.00223 ATTAG 0.00138 ATTAT 0.00582 ATTCA 0.00214 ATTCC 0.000877 ATTCG 0.00115 ATTCT 0.00211 ATTGA 0.00201 ATTGC 0.00112 ATTGG 0.00072 ATTGT 0.00257 ATTTA 0.00583 ATTTC 0.00305 ATTTG 0.00258 ATTTT 0.00738 CAAAA 0.00265 CAAAC 0.00102 CAAAG 0.001 CAAAT 0.00258 CAACA 0.000988 CAACC 0.000333 CAACG 0.000552 CAACT 0.000755 CAAGA 0.00088 CAAGC 0.000392 CAAGG 0.000373 CAAGT 0.000828 CAATA 0.00224 CAATC 0.000817 CAATG 0.00106 CAATT 0.0023 CACAA 0.00102 CACAC 0.000629 CACAG 0.000476 CACAT 0.00104 CACCA 0.000352 CACCC 0.000154 CACCG 0.000256 CACCT 0.000319 CACGA 0.000658 CACGC 0.00038 CACGG 0.00025 CACGT 0.000678 CACTA 0.000605 CACTC 0.000349 CACTG 0.000454 CACTT 0.000867 CAGAA 0.00106 CAGAC 0.000327 CAGAG 0.000427 CAGAT 0.00078 CAGCA 0.00046 CAGCC 0.000199 CAGCG 0.000264 CAGCT 0.000373 CAGGA 0.000384 CAGGC 0.000177 CAGGG 0.000154 CAGGT 0.000314 CAGTA 0.000834 CAGTC 0.000367 CAGTG 0.000454 CAGTT 0.0009 CATAA 0.00213 CATAC 0.00107 CATAG 0.000701 CATAT 0.00265 CATCA 0.000797 CATCC 0.00035 CATCG 0.000595 CATCT 0.000774 CATGA 0.000824 CATGC 0.000476 CATGG 0.000342 CATGT 0.00107 CATTA 0.00197 CATTC 0.00106 CATTG 0.00106 CATTT 0.00288 CCAAA 0.000784 CCAAC 0.000366 CCAAG 0.000307 CCAAT 0.00072 CCACA 0.000329 CCACC 0.000211 CCACG 0.0003 CCACT 0.000355 CCAGA 0.000303 CCAGC 0.000194 CCAGG 0.000139 CCAGT 0.000334 CCATA 0.000643 CCATC 0.000366 CCATG 0.000342 CCATT 0.000815 CCCAA 0.000236 CCCAC 0.000149 CCCAG 0.000107 CCCAT 0.000255 CCCCA 0.000116 CCCCC 8.8e-05 CCCCG 8.08e-05 CCCCT 0.000163 CCCGA 0.000149 CCCGC 0.000102 CCCGG 7.01e-05 CCCGT 0.000156 CCCTA 0.000205 CCCTC 0.000207 CCCTG 0.000154 CCCTT 0.00033 CCGAA 0.000395 CCGAC 0.000193 CCGAG 0.0002 CCGAT 0.00039 CCGCA 0.000182 CCGCC 0.000124 CCGCG 0.000221 CCGCT 0.000202 CCGGA 0.000154 CCGGC 0.000116 CCGGG 7.01e-05 CCGGT 0.000182 CCGTA 0.000312 CCGTC 0.000193 CCGTG 0.00025 CCGTT 0.000403 CCTAA 0.000492 CCTAC 0.000283 CCTAG 0.000193 CCTAT 0.000595 CCTCA 0.000254 CCTCC 0.000219 CCTCG 0.000292 CCTCT 0.000417 CCTGA 0.000292 CCTGC 0.000207 CCTGG 0.000139 CCTGT 0.000393 CCTTA 0.000554 CCTTC 0.000459 CCTTG 0.000373 CCTTT 0.000919 CGAAA 0.00141 CGAAC 0.0006 CGAAG 0.000601 CGAAT 0.00115 CGACA 0.000484 CGACC 0.000231 CGACG 0.000418 CGACT 0.000369 CGAGA 0.000576 CGAGC 0.000316 CGAGG 0.000292 CGAGT 0.00047 CGATA 0.00119 CGATC 0.000658 CGATG 0.000595 CGATT 0.00114 CGCAA 0.000547 CGCAC 0.000282 CGCAG 0.000267 CGCAT 0.000486 CGCCA 0.000258 CGCCC 9.53e-05 CGCCG 0.000171 CGCCT 0.000189 CGCGA 0.000512 CGCGC 0.000335 CGCGG 0.000221 CGCGT 0.000506 CGCTA 0.000378 CGCTC 0.000262 CGCTG 0.000264 CGCTT 0.000451 CGGAA 0.000446 CGGAC 0.00017 CGGAG 0.000205 CGGAT 0.000344 CGGCA 0.000232 CGGCC 0.000125 CGGCG 0.000171 CGGCT 0.000188 CGGGA 0.000188 CGGGC 8.6e-05 CGGGG 8.08e-05 CGGGT 0.000122 CGGTA 0.00039 CGGTC 0.000202 CGGTG 0.000256 CGGTT 0.000383 CGTAA 0.00104 CGTAC 0.000556 CGTAG 0.000403 CGTAT 0.00111 CGTCA 0.000454 CGTCC 0.000234 CGTCG 0.000418 CGTCT 0.000395 CGTGA 0.000598 CGTGC 0.000365 CGTGG 0.0003 CGTGT 0.000702 CGTTA 0.000949 CGTTC 0.000656 CGTTG 0.000552 CGTTT 0.00128 CTAAA 0.00148 CTAAC 0.000585 CTAAG 0.000438 CTAAT 0.00138 CTACA 0.000815 CTACC 0.000294 CTACG 0.000403 CTACT 0.000677 CTAGA 0.000518 CTAGC 0.000247 CTAGG 0.000193 CTAGT 0.000502 CTATA 0.00166 CTATC 0.000705 CTATG 0.000701 CTATT 0.0017 CTCAA 0.000648 CTCAC 0.000317 CTCAG 0.000245 CTCAT 0.000642 CTCCA 0.000325 CTCCC 0.000179 CTCCG 0.000205 CTCCT 0.00036 CTCGA 0.000569 CTCGC 0.000309 CTCGG 0.0002 CTCGT 0.000576 CTCTA 0.000595 CTCTC 0.000585 CTCTG 0.000427 CTCTT 0.000927 CTGAA 0.000877 CTGAC 0.000328 CTGAG 0.000245 CTGAT 0.00076 CTGCA 0.000494 CTGCC 0.00023 CTGCG 0.000267 CTGCT 0.000435 CTGGA 0.000335 CTGGC 0.000197 CTGGG 0.000107 CTGGT 0.000331 CTGTA 0.000989 CTGTC 0.000409 CTGTG 0.000476 CTGTT 0.000995 CTTAA 0.00147 CTTAC 0.000738 CTTAG 0.000438 CTTAT 0.00168 CTTCA 0.000874 CTTCC 0.000532 CTTCG 0.000601 CTTCT 0.00105 CTTGA 0.000756 CTTGC 0.000456 CTTGG 0.000307 CTTGT 0.000954 CTTTA 0.00178 CTTTC 0.00133 CTTTG 0.001 CTTTT 0.0027 GAAAA 0.00333 GAAAC 0.00138 GAAAG 0.00133 GAAAT 0.00305 GAACA 0.00109 GAACC 0.00031 GAACG 0.000656 GAACT 0.000723 GAAGA 0.00122 GAAGC 0.000478 GAAGG 0.000459 GAAGT 0.000893 GAATA 0.0022 GAATC 0.00085 GAATG 0.00106 GAATT 0.00216 GACAA 0.000931 GACAC 0.00043 GACAG 0.000409 GACAT 0.000796 GACCA 0.000296 GACCC 9.87e-05 GACCG 0.000202 GACCT 0.000239 GACGA 0.000578 GACGC 0.000268 GACGG 0.000193 GACGT 0.000462 GACTA 0.000491 GACTC 0.000271 GACTG 0.000367 GACTT 0.000604 GAGAA 0.0012 GAGAC 0.000359 GAGAG 0.000585 GAGAT 0.000814 GAGCA 0.00041 GAGCC 0.000135 GAGCG 0.000262 GAGCT 0.000267 GAGGA 0.000489 GAGGC 0.000181 GAGGG 0.000207 GAGGT 0.000304 GAGTA 0.000659 GAGTC 0.000271 GAGTG 0.000349 GAGTT 0.000612 GATAA 0.00203 GATAC 0.000969 GATAG 0.000705 GATAT 0.00223 GATCA 0.000779 GATCC 0.000305 GATCG 0.000658 GATCT 0.000656 GATGA 0.000848 GATGC 0.000431 GATGG 0.000366 GATGT 0.000871 GATTA 0.00162 GATTC 0.00085 GATTG 0.000817 GATTT 0.00204 GCAAA 0.00123 GCAAC 0.000562 GCAAG 0.000456 GCAAT 0.00112 GCACA 0.00057 GCACC 0.000188 GCACG 0.000365 GCACT 0.000371 GCAGA 0.000475 GCAGC 0.000281 GCAGG 0.000207 GCAGT 0.000462 GCATA 0.000974 GCATC 0.000431 GCATG 0.000476 GCATT 0.00103 GCCAA 0.000379 GCCAC 0.000236 GCCAG 0.000197 GCCAT 0.000385 GCCCA 0.000117 GCCCC 7.17e-05 GCCCG 8.6e-05 GCCCT 0.000122 GCCGA 0.000235 GCCGC 0.000173 GCCGG 0.000116 GCCGT 0.000193 GCCTA 0.00021 GCCTC 0.000181 GCCTG 0.000177 GCCTT 0.000327 GCGAA 0.000639 GCGAC 0.000291 GCGAG 0.000309 GCGAT 0.000584 GCGCA 0.000307 GCGCC 0.000149 GCGCG 0.000335 GCGCT 0.00023 GCGGA 0.000228 GCGGC 0.000173 GCGGG 0.000102 GCGGT 0.000226 GCGTA 0.000483 GCGTC 0.000268 GCGTG 0.00038 GCGTT 0.000521 GCTAA 0.00058 GCTAC 0.000383 GCTAG 0.000247 GCTAT 0.000731 GCTCA 0.00027 GCTCC 0.000165 GCTCG 0.000316 GCTCT 0.000323 GCTGA 0.00036 GCTGC 0.000281 GCTGG 0.000194 GCTGT 0.00046 GCTTA 0.000604 GCTTC 0.000478 GCTTG 0.000392 GCTTT 0.000906 GGAAA 0.00132 GGAAC 0.000451 GGAAG 0.000532 GGAAT 0.000877 GGACA 0.00035 GGACC 0.000114 GGACG 0.000234 GGACT 0.000198 GGAGA 0.000437 GGAGC 0.000165 GGAGG 0.000219 GGAGT 0.000249 GGATA 0.000699 GGATC 0.000305 GGATG 0.00035 GGATT 0.000613 GGCAA 0.000431 GGCAC 0.000203 GGCAG 0.00023 GGCAT 0.000322 GGCCA 0.000174 GGCCC 6.21e-05 GGCCG 0.000125 GGCCT 0.000108 GGCGA 0.000259 GGCGC 0.000149 GGCGG 0.000124 GGCGT 0.000182 GGCTA 0.000241 GGCTC 0.000135 GGCTG 0.000199 GGCTT 0.000261 GGGAA 0.000452 GGGAC 0.000139 GGGAG 0.000179 GGGAT 0.000269 GGGCA 0.000139 GGGCC 6.21e-05 GGGCG 9.53e-05 GGGCT 0.000101 GGGGA 0.000184 GGGGC 7.17e-05 GGGGG 8.8e-05 GGGGT 0.000104 GGGTA 0.000216 GGGTC 9.87e-05 GGGTG 0.000154 GGGTT 0.000215 GGTAA 0.000694 GGTAC 0.000357 GGTAG 0.000294 GGTAT 0.00069 GGTCA 0.000283 GGTCC 0.000114 GGTCG 0.000231 GGTCT 0.000207 GGTGA 0.000356 GGTGC 0.000188 GGTGG 0.000211 GGTGT 0.000324 GGTTA 0.000609 GGTTC 0.00031 GGTTG 0.000333 GGTTT 0.000656 GTAAA 0.00239 GTAAC 0.00102 GTAAG 0.000738 GTAAT 0.00223 GTACA 0.00142 GTACC 0.000357 GTACG 0.000556 GTACT 0.000815 GTAGA 0.000812 GTAGC 0.000383 GTAGG 0.000283 GTAGT 0.000712 GTATA 0.00253 GTATC 0.000969 GTATG 0.00107 GTATT 0.00226 GTCAA 0.000773 GTCAC 0.000448 GTCAG 0.000328 GTCAT 0.000785 GTCCA 0.000308 GTCCC 0.000139 GTCCG 0.00017 GTCCT 0.000279 GTCGA 0.000538 GTCGC 0.000291 GTCGG 0.000193 GTCGT 0.00048 GTCTA 0.000526 GTCTC 0.000359 GTCTG 0.000327 GTCTT 0.000691 GTGAA 0.00106 GTGAC 0.000448 GTGAG 0.000317 GTGAT 0.000869 GTGCA 0.000616 GTGCC 0.000203 GTGCG 0.000282 GTGCT 0.000393 GTGGA 0.000439 GTGGC 0.000236 GTGGG 0.000149 GTGGT 0.000372 GTGTA 0.0011 GTGTC 0.00043 GTGTG 0.000629 GTGTT 0.000945 GTTAA 0.00171 GTTAC 0.00102 GTTAG 0.000585 GTTAT 0.00193 GTTCA 0.000887 GTTCC 0.000451 GTTCG 0.0006 GTTCT 0.000843 GTTGA 0.000807 GTTGC 0.000562 GTTGG 0.000366 GTTGT 0.000893 GTTTA 0.00188 GTTTC 0.00138 GTTTG 0.00102 GTTTT 0.00233 TAAAA 0.00644 TAAAC 0.00188 TAAAG 0.00178 TAAAT 0.00583 TAACA 0.00222 TAACC 0.000609 TAACG 0.000949 TAACT 0.00147 TAAGA 0.00168 TAAGC 0.000604 TAAGG 0.000554 TAAGT 0.00149 TAATA 0.00544 TAATC 0.00162 TAATG 0.00197 TAATT 0.00534 TACAA 0.0028 TACAC 0.0011 TACAG 0.000989 TACAT 0.00333 TACCA 0.000766 TACCC 0.000216 TACCG 0.00039 TACCT 0.000664 TACGA 0.00111 TACGC 0.000483 TACGG 0.000312 TACGT 0.0012 TACTA 0.00158 TACTC 0.000659 TACTG 0.000834 TACTT 0.00211 TAGAA 0.00202 TAGAC 0.000526 TAGAG 0.000595 TAGAT 0.00149 TAGCA 0.000772 TAGCC 0.000241 TAGCG 0.000378 TAGCT 0.000549 TAGGA 0.000611 TAGGC 0.00021 TAGGG 0.000205 TAGGT 0.000541 TAGTA 0.00158 TAGTC 0.000491 TAGTG 0.000605 TAGTT 0.00149 TATAA 0.00574 TATAC 0.00253 TATAG 0.00166 TATAT 0.00815 TATCA 0.00209 TATCC 0.000699 TATCG 0.00119 TATCT 0.00196 TATGA 0.00199 TATGC 0.000974 TATGG 0.000643 TATGT 0.00294 TATTA 0.00544 TATTC 0.0022 TATTG 0.00224 TATTT 0.00734 TCAAA 0.00222 TCAAC 0.000807 TCAAG 0.000756 TCAAT 0.00201 TCACA 0.000962 TCACC 0.000356 TCACG 0.000598 TCACT 0.000778 TCAGA 0.000764 TCAGC 0.00036 TCAGG 0.000292 TCAGT 0.000794 TCATA 0.00199 TCATC 0.000848 TCATG 0.000824 TCATT 0.00238 TCCAA 0.000831 TCCAC 0.000439 TCCAG 0.000335 TCCAT 0.000834 TCCCA 0.000295 TCCCC 0.000184 TCCCG 0.000188 TCCCT 0.000372 TCCGA 0.000371 TCCGC 0.000228 TCCGG 0.000154 TCCGT 0.000412 TCCTA 0.000611 TCCTC 0.000489 TCCTG 0.000384 TCCTT 0.000984 TCGAA 0.00132 TCGAC 0.000538 TCGAG 0.000569 TCGAT 0.00135 TCGCA 0.000549 TCGCC 0.000259 TCGCG 0.000512 TCGCT 0.000502 TCGGA 0.000371 TCGGC 0.000235 TCGGG 0.000149 TCGGT 0.000424 TCGTA 0.00111 TCGTC 0.000578 TCGTG 0.000658 TCGTT 0.00137 TCTAA 0.00146 TCTAC 0.000812 TCTAG 0.000518 TCTAT 0.00184 TCTCA 0.000783 TCTCC 0.000437 TCTCG 0.000576 TCTCT 0.00117 TCTGA 0.000764 TCTGC 0.000475 TCTGG 0.000303 TCTGT 0.00105 TCTTA 0.00168 TCTTC 0.00122 TCTTG 0.00088 TCTTT 0.00276 TGAAA 0.00308 TGAAC 0.000887 TGAAG 0.000874 TGAAT 0.00214 TGACA 0.000946 TGACC 0.000283 TGACG 0.000454 TGACT 0.000652 TGAGA 0.000783 TGAGC 0.00027 TGAGG 0.000254 TGAGT 0.000545 TGATA 0.00209 TGATC 0.000779 TGATG 0.000797 TGATT 0.00191 TGCAA 0.00141 TGCAC 0.000616 TGCAG 0.000494 TGCAT 0.00129 TGCCA 0.00045 TGCCC 0.000139 TGCCG 0.000232 TGCCT 0.000366 TGCGA 0.000549 TGCGC 0.000307 TGCGG 0.000182 TGCGT 0.000544 TGCTA 0.000772 TGCTC 0.00041 TGCTG 0.00046 TGCTT 0.000986 TGGAA 0.00112 TGGAC 0.000308 TGGAG 0.000325 TGGAT 0.000682 TGGCA 0.00045 TGGCC 0.000174 TGGCG 0.000258 TGGCT 0.000314 TGGGA 0.000295 TGGGC 0.000117 TGGGG 0.000116 TGGGT 0.000218 TGGTA 0.000766 TGGTC 0.000296 TGGTG 0.000352 TGGTT 0.000712 TGTAA 0.00277 TGTAC 0.00142 TGTAG 0.000815 TGTAT 0.00322 TGTCA 0.000946 TGTCC 0.00035 TGTCG 0.000484 TGTCT 0.000787 TGTGA 0.000962 TGTGC 0.00057 TGTGG 0.000329 TGTGT 0.00131 TGTTA 0.00222 TGTTC 0.00109 TGTTG 0.000988 TGTTT 0.00278 TTAAA 0.00538 TTAAC 0.00171 TTAAG 0.00147 TTAAT 0.00493 TTACA 0.00277 TTACC 0.000694 TTACG 0.00104 TTACT 0.00188 TTAGA 0.00146 TTAGC 0.00058 TTAGG 0.000492 TTAGT 0.00136 TTATA 0.00574 TTATC 0.00203 TTATG 0.00213 TTATT 0.00622 TTCAA 0.00244 TTCAC 0.00106 TTCAG 0.000877 TTCAT 0.00261 TTCCA 0.00112 TTCCC 0.000452 TTCCG 0.000446 TTCCT 0.00116 TTCGA 0.00132 TTCGC 0.000639 TTCGG 0.000395 TTCGT 0.00141 TTCTA 0.00202 TTCTC 0.0012 TTCTG 0.00106 TTCTT 0.00297 TTGAA 0.00244 TTGAC 0.000773 TTGAG 0.000648 TTGAT 0.00194 TTGCA 0.00141 TTGCC 0.000431 TTGCG 0.000547 TTGCT 0.000988 TTGGA 0.000831 TTGGC 0.000379 TTGGG 0.000236 TTGGT 0.00073 TTGTA 0.0028 TTGTC 0.000931 TTGTG 0.00102 TTGTT 0.00268 TTTAA 0.00538 TTTAC 0.00239 TTTAG 0.00148 TTTAT 0.00668 TTTCA 0.00308 TTTCC 0.00132 TTTCG 0.00141 TTTCT 0.00326 TTTGA 0.00222 TTTGC 0.00123 TTTGG 0.000784 TTTGT 0.00302 TTTTA 0.00644 TTTTC 0.00333 TTTTG 0.00265 TTTTT 0.00721 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [2] # (a,c,g,t)= (0.375, 0.125, 0.125, 0.375) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.351 C 0.149 G 0.149 T 0.351 # l= 1 # Values AA 0.13 AC 0.0515 AG 0.0443 AT 0.125 CA 0.0538 CC 0.0196 CG 0.0313 CT 0.0443 GA 0.0525 GC 0.0253 GG 0.0196 GT 0.0515 TA 0.115 TC 0.0526 TG 0.0538 TT 0.13 # l= 2 # Values AAA 0.0508 AAC 0.0175 AAG 0.0168 AAT 0.0447 ACA 0.0208 ACC 0.00607 ACG 0.0106 ACT 0.014 AGA 0.017 AGC 0.00694 AGG 0.00631 AGT 0.014 ATA 0.0458 ATC 0.0165 ATG 0.0185 ATT 0.0447 CAA 0.0188 CAC 0.00874 CAG 0.00771 CAT 0.0185 CCA 0.00676 CCC 0.00272 CCG 0.00384 CCT 0.00631 CGA 0.0113 CGC 0.00557 CGG 0.00384 CGT 0.0106 CTA 0.0123 CTC 0.00745 CTG 0.0077 CTT 0.0168 GAA 0.0217 GAC 0.00695 GAG 0.00745 GAT 0.0165 GCA 0.00941 GCC 0.00339 GCG 0.00557 GCT 0.00693 GGA 0.00745 GGC 0.00339 GGG 0.00272 GGT 0.00607 GTA 0.0183 GTC 0.00695 GTG 0.00875 GTT 0.0175 TAA 0.0385 TAC 0.0183 TAG 0.0123 TAT 0.0458 TCA 0.0168 TCC 0.00745 TCG 0.0113 TCT 0.017 TGA 0.0168 TGC 0.00941 TGG 0.00676 TGT 0.0208 TTA 0.0385 TTC 0.0217 TTG 0.0188 TTT 0.0508 # l= 3 # Values AAAA 0.0191 AAAC 0.00664 AAAG 0.00687 AAAT 0.0182 AACA 0.00701 AACC 0.00197 AACG 0.00365 AACT 0.00483 AAGA 0.00662 AAGC 0.00246 AAGG 0.00238 AAGT 0.00539 AATA 0.0165 AATC 0.00539 AATG 0.00686 AATT 0.0159 ACAA 0.00732 ACAC 0.00315 ACAG 0.00293 ACAT 0.00738 ACCA 0.00218 ACCC 0.000718 ACCG 0.00132 ACCT 0.00186 ACGA 0.00397 ACGC 0.00176 ACGG 0.00124 ACGT 0.00366 ACTA 0.00407 ACTC 0.00196 ACTG 0.00259 ACTT 0.00539 AGAA 0.00736 AGAC 0.00197 AGAG 0.00263 AGAT 0.00507 AGCA 0.00266 AGCC 0.000888 AGCG 0.00145 AGCT 0.00194 AGGA 0.00257 AGGC 0.000941 AGGG 0.00094 AGGT 0.00186 AGTA 0.00507 AGTC 0.0018 AGTG 0.00232 AGTT 0.00483 ATAA 0.0154 ATAC 0.00669 ATAG 0.00471 ATAT 0.019 ATCA 0.00555 ATCC 0.00204 ATCG 0.00384 ATCT 0.00507 ATGA 0.00598 ATGC 0.00294 ATGG 0.00223 ATGT 0.00738 ATTA 0.0138 ATTC 0.00634 ATTG 0.00635 ATTT 0.0182 CAAA 0.00718 CAAC 0.00272 CAAG 0.00254 CAAT 0.00635 CACA 0.00317 CACC 0.00114 CACG 0.00211 CACT 0.00232 CAGA 0.00267 CAGC 0.00136 CAGG 0.00108 CAGT 0.00259 CATA 0.00633 CATC 0.00261 CATG 0.00272 CATT 0.00686 CCAA 0.00224 CCAC 0.00126 CCAG 0.00103 CCAT 0.00223 CCCA 0.000787 CCCC 0.000479 CCCG 0.000515 CCCT 0.00094 CCGA 0.00127 CCGC 0.000775 CCGG 0.000563 CCGT 0.00124 CCTA 0.00159 CCTC 0.00125 CCTG 0.00108 CCTT 0.00238 CGAA 0.00401 CGAC 0.00163 CGAG 0.00178 CGAT 0.00384 CGCA 0.00168 CGCC 0.000765 CGCG 0.00167 CGCT 0.00145 CGGA 0.00125 CGGC 0.00076 CGGG 0.000515 CGGT 0.00132 CGTA 0.00325 CGTC 0.00162 CGTG 0.00211 CGTT 0.00365 CTAA 0.00387 CTAC 0.00222 CTAG 0.00148 CTAT 0.0047 CTCA 0.0019 CTCC 0.00113 CTCG 0.00179 CTCT 0.00263 CTGA 0.00227 CTGC 0.00148 CTGG 0.00103 CTGT 0.00293 CTTA 0.00426 CTTC 0.00318 CTTG 0.00254 CTTT 0.00687 GAAA 0.00924 GAAC 0.00289 GAAG 0.00318 GAAT 0.00634 GACA 0.00265 GACC 0.000886 GACG 0.00162 GACT 0.0018 GAGA 0.0031 GAGC 0.00115 GAGG 0.00125 GAGT 0.00196 GATA 0.00597 GATC 0.00253 GATG 0.00261 GATT 0.00539 GCAA 0.00344 GCAC 0.00155 GCAG 0.00148 GCAT 0.00294 GCCA 0.00126 GCCC 0.000425 GCCG 0.00076 GCCT 0.000941 GCGA 0.00195 GCGC 0.00108 GCGG 0.000775 GCGT 0.00176 GCTA 0.00198 GCTC 0.00114 GCTG 0.00136 GCTT 0.00246 GGAA 0.00332 GGAC 0.00095 GGAG 0.00113 GGAT 0.00204 GGCA 0.00124 GGCC 0.000503 GGCG 0.000764 GGCT 0.000887 GGGA 0.0011 GGGC 0.000424 GGGG 0.000479 GGGT 0.000718 GGTA 0.00207 GGTC 0.000886 GGTG 0.00114 GGTT 0.00197 GTAA 0.00628 GTAC 0.00314 GTAG 0.00222 GTAT 0.00669 GTCA 0.0024 GTCC 0.00095 GTCG 0.00163 GTCT 0.00197 GTGA 0.00277 GTGC 0.00155 GTGG 0.00126 GTGT 0.00315 GTTA 0.00521 GTTC 0.00289 GTTG 0.00272 GTTT 0.00664 TAAA 0.0153 TAAC 0.00521 TAAG 0.00426 TAAT 0.0138 TACA 0.00794 TACC 0.00207 TACG 0.00325 TACT 0.00507 TAGA 0.00464 TAGC 0.00198 TAGG 0.00159 TAGT 0.00408 TATA 0.017 TATC 0.00597 TATG 0.00633 TATT 0.0165 TCAA 0.00579 TCAC 0.00277 TCAG 0.00227 TCAT 0.00598 TCCA 0.00253 TCCC 0.0011 TCCG 0.00125 TCCT 0.00257 TCGA 0.00407 TCGC 0.00195 TCGG 0.00127 TCGT 0.00397 TCTA 0.00464 TCTC 0.0031 TCTG 0.00267 TCTT 0.00662 TGAA 0.00696 TGAC 0.0024 TGAG 0.0019 TGAT 0.00555 TGCA 0.00384 TGCC 0.00124 TGCG 0.00168 TGCT 0.00266 TGGA 0.00253 TGGC 0.00127 TGGG 0.000788 TGGT 0.00218 TGTA 0.00794 TGTC 0.00265 TGTG 0.00317 TGTT 0.00701 TTAA 0.013 TTAC 0.00628 TTAG 0.00387 TTAT 0.0154 TTCA 0.00696 TTCC 0.00332 TTCG 0.00401 TTCT 0.00736 TTGA 0.00579 TTGC 0.00344 TTGG 0.00224 TTGT 0.00732 TTTA 0.0153 TTTC 0.00924 TTTG 0.00718 TTTT 0.0191 # l= 4 # Values AAAAA 0.00703 AAAAC 0.00231 AAAAG 0.0027 AAAAT 0.00709 AAACA 0.00274 AAACC 0.000678 AAACG 0.00135 AAACT 0.00187 AAAGA 0.00279 AAAGC 0.00093 AAAGG 0.000947 AAAGT 0.0022 AAATA 0.00699 AAATC 0.00205 AAATG 0.00282 AAATT 0.00633 AACAA 0.00265 AACAC 0.000968 AACAG 0.00102 AACAT 0.00238 AACCA 0.000728 AACCC 0.000224 AACCG 0.000412 AACCT 0.000606 AACGA 0.00146 AACGC 0.00056 AACGG 0.00043 AACGT 0.0012 AACTA 0.00145 AACTC 0.000636 AACTG 0.00091 AACTT 0.00183 AAGAA 0.003 AAGAC 0.000706 AAGAG 0.00096 AAGAT 0.00195 AAGCA 0.000994 AAGCC 0.000277 AAGCG 0.000487 AAGCT 0.0007 AAGGA 0.00102 AAGGC 0.00034 AAGGG 0.000345 AAGGT 0.000674 AAGTA 0.00206 AAGTC 0.000618 AAGTG 0.000879 AAGTT 0.00183 AATAA 0.00594 AATAC 0.00221 AATAG 0.00167 AATAT 0.00667 AATCA 0.00189 AATCC 0.000633 AATCG 0.00121 AATCT 0.00165 AATGA 0.00235 AATGC 0.00104 AATGG 0.000833 AATGT 0.00265 AATTA 0.00512 AATTC 0.00219 AATTG 0.00228 AATTT 0.00633 ACAAA 0.00295 ACAAC 0.000911 ACAAG 0.000969 ACAAT 0.00249 ACACA 0.00129 ACACC 0.00034 ACACG 0.000748 ACACT 0.000774 ACAGA 0.00108 ACAGC 0.000475 ACAGG 0.000413 ACAGT 0.000967 ACATA 0.0028 ACATC 0.000879 ACATG 0.00105 ACATT 0.00265 ACCAA 0.000743 ACCAC 0.000387 ACCAG 0.000345 ACCAT 0.0007 ACCCA 0.000228 ACCCC 0.00011 ACCCG 0.000133 ACCCT 0.000248 ACCGA 0.000456 ACCGC 0.000241 ACCGG 0.000197 ACCGT 0.000425 ACCTA 0.000541 ACCTC 0.000317 ACCTG 0.000327 ACCTT 0.000674 ACGAA 0.00149 ACGAC 0.000515 ACGAG 0.000621 ACGAT 0.00134 ACGCA 0.000573 ACGCC 0.000196 ACGCG 0.000537 ACGCT 0.000456 ACGGA 0.000437 ACGGC 0.000204 ACGGG 0.00017 ACGGT 0.000425 ACGTA 0.00124 ACGTC 0.000492 ACGTG 0.000728 ACGTT 0.0012 ACTAA 0.00132 ACTAC 0.000706 ACTAG 0.000501 ACTAT 0.00155 ACTCA 0.000549 ACTCC 0.00026 ACTCG 0.000508 ACTCT 0.000645 ACTGA 0.000803 ACTGC 0.000471 ACTGG 0.00035 ACTGT 0.000967 ACTTA 0.00144 ACTTC 0.000907 ACTTG 0.000835 ACTTT 0.0022 AGAAA 0.00329 AGAAC 0.000866 AGAAG 0.00108 AGAAT 0.00211 AGACA 0.000804 AGACC 0.000215 AGACG 0.000425 AGACT 0.000527 AGAGA 0.00121 AGAGC 0.00034 AGAGG 0.000437 AGAGT 0.000645 AGATA 0.00194 AGATC 0.000684 AGATG 0.000789 AGATT 0.00165 AGCAA 0.000999 AGCAC 0.000402 AGCAG 0.000448 AGCAT 0.000809 AGCCA 0.000334 AGCCC 0.000107 AGCCG 0.0002 AGCCT 0.000245 AGCGA 0.000539 AGCGC 0.000243 AGCGG 0.000215 AGCGT 0.000456 AGCTA 0.000558 AGCTC 0.000285 AGCTG 0.000391 AGCTT 0.0007 AGGAA 0.00121 AGGAC 0.000293 AGGAG 0.000377 AGGAT 0.000692 AGGCA 0.000377 AGGCC 0.000116 AGGCG 0.000203 AGGCT 0.000245 AGGGA 0.000389 AGGGC 0.000131 AGGGG 0.000172 AGGGT 0.000248 AGGTA 0.000666 AGGTC 0.000253 AGGTG 0.000333 AGGTT 0.000606 AGTAA 0.00182 AGTAC 0.000804 AGTAG 0.000681 AGTAT 0.00176 AGTCA 0.000663 AGTCC 0.000208 AGTCG 0.000401 AGTCT 0.000527 AGTGA 0.000792 AGTGC 0.000382 AGTGG 0.000371 AGTGT 0.000774 AGTTA 0.00144 AGTTC 0.000741 AGTTG 0.000768 AGTTT 0.00187 ATAAA 0.00635 ATAAC 0.00189 ATAAG 0.00163 ATAAT 0.00551 ATACA 0.00308 ATACC 0.000698 ATACG 0.00115 ATACT 0.00176 ATAGA 0.00182 ATAGC 0.000735 ATAGG 0.0006 ATAGT 0.00155 ATATA 0.00762 ATATC 0.0022 ATATG 0.00253 ATATT 0.00667 ATCAA 0.00192 ATCAC 0.000885 ATCAG 0.000777 ATCAT 0.00197 ATCCA 0.000697 ATCCC 0.000283 ATCCG 0.000367 ATCCT 0.000692 ATCGA 0.00145 ATCGC 0.000622 ATCGG 0.000421 ATCGT 0.00134 ATCTA 0.00148 ATCTC 0.000838 ATCTG 0.000797 ATCTT 0.00195 ATGAA 0.00257 ATGAC 0.000792 ATGAG 0.00065 ATGAT 0.00197 ATGCA 0.00129 ATGCC 0.000334 ATGCG 0.000512 ATGCT 0.000809 ATGGA 0.000856 ATGGC 0.000404 ATGGG 0.000269 ATGGT 0.0007 ATGTA 0.00316 ATGTC 0.000802 ATGTG 0.00103 ATGTT 0.00238 ATTAA 0.00472 ATTAC 0.00217 ATTAG 0.00137 ATTAT 0.00551 ATTCA 0.00211 ATTCC 0.000903 ATTCG 0.00122 ATTCT 0.00211 ATTGA 0.00198 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.00074 ATTGT 0.00249 ATTTA 0.00553 ATTTC 0.00305 ATTTG 0.00251 ATTTT 0.00709 CAAAA 0.0026 CAAAC 0.00104 CAAAG 0.00103 CAAAT 0.00251 CAACA 0.001 CAACC 0.00035 CAACG 0.000599 CAACT 0.000768 CAAGA 0.0009 CAAGC 0.000413 CAAGG 0.000392 CAAGT 0.000835 CAATA 0.00216 CAATC 0.000838 CAATG 0.00107 CAATT 0.00228 CACAA 0.00102 CACAC 0.000634 CACAG 0.000493 CACAT 0.00103 CACCA 0.000368 CACCC 0.000164 CACCG 0.000274 CACCT 0.000333 CACGA 0.00071 CACGC 0.000404 CACGG 0.00027 CACGT 0.000728 CACTA 0.000599 CACTC 0.000365 CACTG 0.000476 CACTT 0.000879 CAGAA 0.00108 CAGAC 0.000346 CAGAG 0.000448 CAGAT 0.000797 CAGCA 0.000468 CAGCC 0.000211 CAGCG 0.000286 CAGCT 0.000391 CAGGA 0.000403 CAGGC 0.000189 CAGGG 0.000164 CAGGT 0.000327 CAGTA 0.000822 CAGTC 0.000384 CAGTG 0.000476 CAGTT 0.00091 CATAA 0.00204 CATAC 0.00106 CATAG 0.000704 CATAT 0.00253 CATCA 0.000804 CATCC 0.000368 CATCG 0.00065 CATCT 0.000789 CATGA 0.000829 CATGC 0.000487 CATGG 0.000357 CATGT 0.00105 CATTA 0.0019 CATTC 0.00108 CATTG 0.00107 CATTT 0.00282 CCAAA 0.000793 CCAAC 0.000383 CCAAG 0.000323 CCAAT 0.00074 CCACA 0.000338 CCACC 0.000225 CCACG 0.000328 CCACT 0.000371 CCAGA 0.00032 CCAGC 0.000206 CCAGG 0.000151 CCAGT 0.00035 CCATA 0.000647 CCATC 0.000391 CCATG 0.000357 CCATT 0.000833 CCCAA 0.000246 CCCAC 0.000159 CCCAG 0.000115 CCCAT 0.000269 CCCCA 0.000125 CCCCC 9.59e-05 CCCCG 8.62e-05 CCCCT 0.000172 CCCGA 0.000162 CCCGC 0.000107 CCCGG 7.61e-05 CCCGT 0.00017 CCCTA 0.000212 CCCTC 0.000219 CCCTG 0.000164 CCCTT 0.000345 CCGAA 0.000423 CCGAC 0.00021 CCGAG 0.000216 CCGAT 0.000421 CCGCA 0.000197 CCGCC 0.000131 CCGCG 0.000233 CCGCT 0.000215 CCGGA 0.000166 CCGGC 0.000124 CCGGG 7.61e-05 CCGGT 0.000197 CCGTA 0.000329 CCGTC 0.000207 CCGTG 0.00027 CCGTT 0.00043 CCTAA 0.000499 CCTAC 0.000295 CCTAG 0.000198 CCTAT 0.0006 CCTCA 0.000265 CCTCC 0.000233 CCTCG 0.000315 CCTCT 0.000437 CCTGA 0.000303 CCTGC 0.000217 CCTGG 0.000151 CCTGT 0.000413 CCTTA 0.000556 CCTTC 0.000486 CCTTG 0.000392 CCTTT 0.000947 CGAAA 0.0015 CGAAC 0.000643 CGAAG 0.000652 CGAAT 0.00122 CGACA 0.000523 CGACC 0.00025 CGACG 0.000458 CGACT 0.000401 CGAGA 0.00062 CGAGC 0.000342 CGAGG 0.000315 CGAGT 0.000508 CGATA 0.00127 CGATC 0.00071 CGATG 0.00065 CGATT 0.00121 CGCAA 0.000579 CGCAC 0.000303 CGCAG 0.000286 CGCAT 0.000512 CGCCA 0.000278 CGCCC 0.000102 CGCCG 0.000182 CGCCT 0.000203 CGCGA 0.00055 CGCGC 0.000352 CGCGG 0.000233 CGCGT 0.000537 CGCTA 0.000399 CGCTC 0.000281 CGCTG 0.000286 CGCTT 0.000487 CGGAA 0.000479 CGGAC 0.000183 CGGAG 0.000221 CGGAT 0.000367 CGGCA 0.000243 CGGCC 0.000134 CGGCG 0.000182 CGGCT 0.0002 CGGGA 0.000204 CGGGC 9.18e-05 CGGGG 8.62e-05 CGGGT 0.000133 CGGTA 0.000413 CGGTC 0.000219 CGGTG 0.000274 CGGTT 0.000412 CGTAA 0.00108 CGTAC 0.000587 CGTAG 0.00043 CGTAT 0.00115 CGTCA 0.000482 CGTCC 0.000251 CGTCG 0.000458 CGTCT 0.000425 CGTGA 0.000642 CGTGC 0.000394 CGTGG 0.000328 CGTGT 0.000748 CGTTA 0.000996 CGTTC 0.000709 CGTTG 0.000599 CGTTT 0.00135 CTAAA 0.00146 CTAAC 0.000599 CTAAG 0.000445 CTAAT 0.00137 CTACA 0.000804 CTACC 0.000306 CTACG 0.00043 CTACT 0.000681 CTAGA 0.000529 CTAGC 0.000254 CTAGG 0.000198 CTAGT 0.000501 CTATA 0.0016 CTATC 0.000728 CTATG 0.000704 CTATT 0.00167 CTCAA 0.000659 CTCAC 0.000336 CTCAG 0.000255 CTCAT 0.00065 CTCCA 0.000346 CTCCC 0.000189 CTCCG 0.000221 CTCCT 0.000377 CTCGA 0.000616 CTCGC 0.000332 CTCGG 0.000216 CTCGT 0.000621 CTCTA 0.000607 CTCTC 0.000617 CTCTG 0.000448 CTCTT 0.00096 CTGAA 0.00089 CTGAC 0.000347 CTGAG 0.000255 CTGAT 0.000777 CTGCA 0.000506 CTGCC 0.000237 CTGCG 0.000286 CTGCT 0.000448 CTGGA 0.000357 CTGGC 0.000211 CTGGG 0.000115 CTGGT 0.000345 CTGTA 0.000989 CTGTC 0.000431 CTGTG 0.000493 CTGTT 0.00102 CTTAA 0.00144 CTTAC 0.000741 CTTAG 0.000445 CTTAT 0.00163 CTTCA 0.000883 CTTCC 0.000563 CTTCG 0.000652 CTTCT 0.00108 CTTGA 0.000772 CTTGC 0.000477 CTTGG 0.000323 CTTGT 0.000969 CTTTA 0.00175 CTTTC 0.00139 CTTTG 0.00103 CTTTT 0.0027 GAAAA 0.00337 GAAAC 0.00143 GAAAG 0.00139 GAAAT 0.00305 GAACA 0.00111 GAACC 0.00033 GAACG 0.000709 GAACT 0.000741 GAAGA 0.00128 GAAGC 0.000506 GAAGG 0.000486 GAAGT 0.000907 GAATA 0.00219 GAATC 0.000891 GAATG 0.00108 GAATT 0.00219 GACAA 0.000959 GACAC 0.000455 GACAG 0.000431 GACAT 0.000802 GACCA 0.000308 GACCC 0.000106 GACCG 0.000219 GACCT 0.000253 GACGA 0.000629 GACGC 0.000288 GACGG 0.000207 GACGT 0.000492 GACTA 0.000508 GACTC 0.000288 GACTG 0.000384 GACTT 0.000618 GAGAA 0.00126 GAGAC 0.00038 GAGAG 0.000617 GAGAT 0.000838 GAGCA 0.00043 GAGCC 0.000148 GAGCG 0.000281 GAGCT 0.000285 GAGGA 0.00052 GAGGC 0.000193 GAGGG 0.000219 GAGGT 0.000317 GAGTA 0.000673 GAGTC 0.000288 GAGTG 0.000365 GAGTT 0.000636 GATAA 0.00204 GATAC 0.000993 GATAG 0.000728 GATAT 0.0022 GATCA 0.000813 GATCC 0.000324 GATCG 0.00071 GATCT 0.000684 GATGA 0.000887 GATGC 0.000451 GATGG 0.000391 GATGT 0.000879 GATTA 0.00161 GATTC 0.000891 GATTG 0.000838 GATTT 0.00205 GCAAA 0.00125 GCAAC 0.000585 GCAAG 0.000477 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000581 GCACC 0.000196 GCACG 0.000394 GCACT 0.000382 GCAGA 0.000496 GCAGC 0.000294 GCAGG 0.000217 GCAGT 0.000471 GCATA 0.000966 GCATC 0.000451 GCATG 0.000487 GCATT 0.00104 GCCAA 0.000397 GCCAC 0.000253 GCCAG 0.000211 GCCAT 0.000404 GCCCA 0.000124 GCCCC 7.73e-05 GCCCG 9.18e-05 GCCCT 0.000131 GCCGA 0.000252 GCCGC 0.000181 GCCGG 0.000124 GCCGT 0.000204 GCCTA 0.000219 GCCTC 0.000193 GCCTG 0.000189 GCCTT 0.00034 GCGAA 0.000686 GCGAC 0.000315 GCGAG 0.000332 GCGAT 0.000622 GCGCA 0.000326 GCGCC 0.000158 GCGCG 0.000352 GCGCT 0.000243 GCGGA 0.000246 GCGGC 0.000181 GCGGG 0.000107 GCGGT 0.000241 GCGTA 0.00051 GCGTC 0.000288 GCGTG 0.000404 GCGTT 0.00056 GCTAA 0.000593 GCTAC 0.000394 GCTAG 0.000254 GCTAT 0.000735 GCTCA 0.000283 GCTCC 0.000179 GCTCG 0.000342 GCTCT 0.00034 GCTGA 0.000381 GCTGC 0.000294 GCTGG 0.000206 GCTGT 0.000475 GCTTA 0.000609 GCTTC 0.000506 GCTTG 0.000413 GCTTT 0.00093 GGAAA 0.00138 GGAAC 0.000477 GGAAG 0.000563 GGAAT 0.000903 GGACA 0.00037 GGACC 0.000121 GGACG 0.000251 GGACT 0.000208 GGAGA 0.000462 GGAGC 0.000179 GGAGG 0.000233 GGAGT 0.00026 GGATA 0.000715 GGATC 0.000324 GGATG 0.000368 GGATT 0.000633 GGCAA 0.00045 GGCAC 0.000216 GGCAG 0.000237 GGCAT 0.000334 GGCCA 0.000186 GGCCC 6.79e-05 GGCCG 0.000134 GGCCT 0.000116 GGCGA 0.00028 GGCGC 0.000158 GGCGG 0.000131 GGCGT 0.000196 GGCTA 0.000252 GGCTC 0.000148 GGCTG 0.000211 GGCTT 0.000277 GGGAA 0.000478 GGGAC 0.000148 GGGAG 0.000189 GGGAT 0.000283 GGGCA 0.000148 GGGCC 6.79e-05 GGGCG 0.000102 GGGCT 0.000107 GGGGA 0.000196 GGGGC 7.73e-05 GGGGG 9.59e-05 GGGGT 0.00011 GGGTA 0.000224 GGGTC 0.000106 GGGTG 0.000164 GGGTT 0.000224 GGTAA 0.000704 GGTAC 0.000366 GGTAG 0.000306 GGTAT 0.000698 GGTCA 0.0003 GGTCC 0.000121 GGTCG 0.00025 GGTCT 0.000215 GGTGA 0.000378 GGTGC 0.000196 GGTGG 0.000225 GGTGT 0.00034 GGTTA 0.000612 GGTTC 0.00033 GGTTG 0.00035 GGTTT 0.000678 GTAAA 0.00234 GTAAC 0.00103 GTAAG 0.000741 GTAAT 0.00217 GTACA 0.00139 GTACC 0.000366 GTACG 0.000587 GTACT 0.000804 GTAGA 0.000828 GTAGC 0.000394 GTAGG 0.000295 GTAGT 0.000706 GTATA 0.00243 GTATC 0.000993 GTATG 0.00106 GTATT 0.00221 GTCAA 0.000788 GTCAC 0.000468 GTCAG 0.000347 GTCAT 0.000792 GTCCA 0.000325 GTCCC 0.000148 GTCCG 0.000183 GTCCT 0.000293 GTCGA 0.000592 GTCGC 0.000315 GTCGG 0.00021 GTCGT 0.000515 GTCTA 0.000539 GTCTC 0.00038 GTCTG 0.000346 GTCTT 0.000706 GTGAA 0.00108 GTGAC 0.000468 GTGAG 0.000336 GTGAT 0.000885 GTGCA 0.000633 GTGCC 0.000216 GTGCG 0.000303 GTGCT 0.000402 GTGGA 0.000463 GTGGC 0.000253 GTGGG 0.000159 GTGGT 0.000387 GTGTA 0.00109 GTGTC 0.000455 GTGTG 0.000634 GTGTT 0.000968 GTTAA 0.00169 GTTAC 0.00103 GTTAG 0.000599 GTTAT 0.00189 GTTCA 0.000905 GTTCC 0.000477 GTTCG 0.000643 GTTCT 0.000866 GTTGA 0.000839 GTTGC 0.000585 GTTGG 0.000383 GTTGT 0.000911 GTTTA 0.00186 GTTTC 0.00143 GTTTG 0.00104 GTTTT 0.00231 TAAAA 0.00613 TAAAC 0.00186 TAAAG 0.00175 TAAAT 0.00553 TAACA 0.00216 TAACC 0.000612 TAACG 0.000996 TAACT 0.00144 TAAGA 0.00165 TAAGC 0.000609 TAAGG 0.000556 TAAGT 0.00144 TAATA 0.00514 TAATC 0.00161 TAATG 0.0019 TAATT 0.00512 TACAA 0.00269 TACAC 0.00109 TACAG 0.000989 TACAT 0.00316 TACCA 0.00077 TACCC 0.000224 TACCG 0.000413 TACCT 0.000666 TACGA 0.00117 TACGC 0.00051 TACGG 0.000329 TACGT 0.00124 TACTA 0.00152 TACTC 0.000673 TACTG 0.000822 TACTT 0.00206 TAGAA 0.00201 TAGAC 0.000539 TAGAG 0.000607 TAGAT 0.00148 TAGCA 0.000767 TAGCC 0.000252 TAGCG 0.000399 TAGCT 0.000558 TAGGA 0.000622 TAGGC 0.000219 TAGGG 0.000212 TAGGT 0.000541 TAGTA 0.00152 TAGTC 0.000508 TAGTG 0.000599 TAGTT 0.00145 TATAA 0.00537 TATAC 0.00243 TATAG 0.0016 TATAT 0.00762 TATCA 0.00204 TATCC 0.000715 TATCG 0.00127 TATCT 0.00194 TATGA 0.00192 TATGC 0.000966 TATGG 0.000647 TATGT 0.0028 TATTA 0.00514 TATTC 0.00219 TATTG 0.00216 TATTT 0.00699 TCAAA 0.00219 TCAAC 0.000839 TCAAG 0.000772 TCAAT 0.00198 TCACA 0.000963 TCACC 0.000378 TCACG 0.000642 TCACT 0.000792 TCAGA 0.000781 TCAGC 0.000381 TCAGG 0.000303 TCAGT 0.000803 TCATA 0.00192 TCATC 0.000887 TCATG 0.000829 TCATT 0.00235 TCCAA 0.000852 TCCAC 0.000463 TCCAG 0.000357 TCCAT 0.000856 TCCCA 0.00031 TCCCC 0.000196 TCCCG 0.000204 TCCCT 0.000389 TCCGA 0.000402 TCCGC 0.000246 TCCGG 0.000166 TCCGT 0.000437 TCCTA 0.000622 TCCTC 0.00052 TCCTG 0.000403 TCCTT 0.00102 TCGAA 0.00141 TCGAC 0.000592 TCGAG 0.000616 TCGAT 0.00145 TCGCA 0.000584 TCGCC 0.00028 TCGCG 0.00055 TCGCT 0.000539 TCGGA 0.000402 TCGGC 0.000252 TCGGG 0.000162 TCGGT 0.000456 TCGTA 0.00117 TCGTC 0.000629 TCGTG 0.00071 TCGTT 0.00146 TCTAA 0.00146 TCTAC 0.000828 TCTAG 0.000529 TCTAT 0.00182 TCTCA 0.000805 TCTCC 0.000462 TCTCG 0.00062 TCTCT 0.00121 TCTGA 0.000781 TCTGC 0.000496 TCTGG 0.00032 TCTGT 0.00108 TCTTA 0.00165 TCTTC 0.00128 TCTTG 0.0009 TCTTT 0.00279 TGAAA 0.00307 TGAAC 0.000905 TGAAG 0.000883 TGAAT 0.00211 TGACA 0.000951 TGACC 0.0003 TGACG 0.000482 TGACT 0.000663 TGAGA 0.000805 TGAGC 0.000283 TGAGG 0.000265 TGAGT 0.000549 TGATA 0.00204 TGATC 0.000813 TGATG 0.000804 TGATT 0.00189 TGCAA 0.00142 TGCAC 0.000633 TGCAG 0.000506 TGCAT 0.00129 TGCCA 0.000466 TGCCC 0.000148 TGCCG 0.000243 TGCCT 0.000377 TGCGA 0.000584 TGCGC 0.000326 TGCGG 0.000197 TGCGT 0.000573 TGCTA 0.000767 TGCTC 0.00043 TGCTG 0.000468 TGCTT 0.000994 TGGAA 0.00116 TGGAC 0.000325 TGGAG 0.000346 TGGAT 0.000697 TGGCA 0.000466 TGGCC 0.000186 TGGCG 0.000278 TGGCT 0.000334 TGGGA 0.00031 TGGGC 0.000124 TGGGG 0.000125 TGGGT 0.000228 TGGTA 0.00077 TGGTC 0.000308 TGGTG 0.000368 TGGTT 0.000728 TGTAA 0.00267 TGTAC 0.00139 TGTAG 0.000804 TGTAT 0.00308 TGTCA 0.000951 TGTCC 0.00037 TGTCG 0.000523 TGTCT 0.000804 TGTGA 0.000963 TGTGC 0.000581 TGTGG 0.000338 TGTGT 0.00129 TGTTA 0.00216 TGTTC 0.00111 TGTTG 0.001 TGTTT 0.00274 TTAAA 0.00512 TTAAC 0.00169 TTAAG 0.00144 TTAAT 0.00472 TTACA 0.00267 TTACC 0.000704 TTACG 0.00108 TTACT 0.00182 TTAGA 0.00146 TTAGC 0.000593 TTAGG 0.000499 TTAGT 0.00132 TTATA 0.00537 TTATC 0.00204 TTATG 0.00204 TTATT 0.00594 TTCAA 0.00242 TTCAC 0.00108 TTCAG 0.00089 TTCAT 0.00257 TTCCA 0.00116 TTCCC 0.000478 TTCCG 0.000479 TTCCT 0.00121 TTCGA 0.00141 TTCGC 0.000686 TTCGG 0.000423 TTCGT 0.00149 TTCTA 0.00201 TTCTC 0.00126 TTCTG 0.00108 TTCTT 0.003 TTGAA 0.00242 TTGAC 0.000788 TTGAG 0.000659 TTGAT 0.00192 TTGCA 0.00142 TTGCC 0.00045 TTGCG 0.000579 TTGCT 0.000999 TTGGA 0.000852 TTGGC 0.000397 TTGGG 0.000246 TTGGT 0.000743 TTGTA 0.00269 TTGTC 0.000959 TTGTG 0.00102 TTGTT 0.00265 TTTAA 0.00512 TTTAC 0.00234 TTTAG 0.00146 TTTAT 0.00635 TTTCA 0.00307 TTTCC 0.00138 TTTCG 0.0015 TTTCT 0.00329 TTTGA 0.00219 TTTGC 0.00125 TTTGG 0.000793 TTTGT 0.00295 TTTTA 0.00613 TTTTC 0.00337 TTTTG 0.0026 TTTTT 0.00703 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [3] # (a,c,g,t)= (0.35, 0.15, 0.15, 0.35) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.343 C 0.157 G 0.157 T 0.343 # l= 1 # Values AA 0.126 AC 0.0524 AG 0.0455 AT 0.12 CA 0.0538 CC 0.0216 CG 0.0359 CT 0.0455 GA 0.0551 GC 0.0276 GG 0.0216 GT 0.0524 TA 0.109 TC 0.0551 TG 0.0538 TT 0.126 # l= 2 # Values AAA 0.0488 AAC 0.0177 AAG 0.0171 AAT 0.0423 ACA 0.0202 ACC 0.00651 ACG 0.0119 ACT 0.0138 AGA 0.0174 AGC 0.00744 AGG 0.00677 AGT 0.0138 ATA 0.0424 ATC 0.017 ATG 0.018 ATT 0.0423 CAA 0.0186 CAC 0.00918 CAG 0.00807 CAT 0.018 CCA 0.00719 CCC 0.0031 CCG 0.00452 CCT 0.00677 CGA 0.0129 CGC 0.0065 CGG 0.00452 CGT 0.0119 CTA 0.0121 CTC 0.00821 CTG 0.00807 CTT 0.0171 GAA 0.0224 GAC 0.00756 GAG 0.00821 GAT 0.017 GCA 0.00977 GCC 0.00386 GCG 0.0065 GCT 0.00744 GGA 0.00812 GGC 0.00386 GGG 0.0031 GGT 0.00651 GTA 0.0179 GTC 0.00756 GTG 0.00919 GTT 0.0177 TAA 0.0361 TAC 0.0179 TAG 0.0121 TAT 0.0424 TCA 0.0167 TCC 0.00812 TCG 0.0129 TCT 0.0174 TGA 0.0167 TGC 0.00977 TGG 0.0072 TGT 0.0202 TTA 0.0361 TTC 0.0224 TTG 0.0186 TTT 0.0488 # l= 3 # Values AAAA 0.0182 AAAC 0.00667 AAAG 0.00691 AAAT 0.017 AACA 0.00682 AACC 0.00208 AACG 0.00411 AACT 0.00473 AAGA 0.0067 AAGC 0.0026 AAGG 0.00253 AAGT 0.00525 AATA 0.0152 AATC 0.00547 AATG 0.00661 AATT 0.015 ACAA 0.00702 ACAC 0.00324 ACAG 0.003 ACAT 0.00691 ACCA 0.00226 ACCC 0.000798 ACCG 0.00153 ACCT 0.00192 ACGA 0.00447 ACGC 0.00204 ACGG 0.00143 ACGT 0.00399 ACTA 0.00387 ACTC 0.00208 ACTG 0.00262 ACTT 0.00524 AGAA 0.00746 AGAC 0.00208 AGAG 0.00285 AGAT 0.00504 AGCA 0.00271 AGCC 0.00101 AGCG 0.00168 AGCT 0.00205 AGGA 0.00276 AGGC 0.00104 AGGG 0.00105 AGGT 0.00192 AGTA 0.00483 AGTC 0.0019 AGTG 0.00236 AGTT 0.00474 ATAA 0.0142 ATAC 0.0064 ATAG 0.00455 ATAT 0.0172 ATCA 0.00542 ATCC 0.00218 ATCG 0.00435 ATCT 0.00505 ATGA 0.00578 ATGC 0.00296 ATGG 0.00231 ATGT 0.00691 ATTA 0.0128 ATTC 0.00639 ATTG 0.0061 ATTT 0.017 CAAA 0.00699 CAAC 0.00286 CAAG 0.00263 CAAT 0.0061 CACA 0.00314 CACC 0.00128 CACG 0.00242 CACT 0.00236 CAGA 0.00277 CAGC 0.00149 CAGG 0.00119 CAGT 0.00262 CATA 0.0059 CATC 0.00276 CATG 0.00268 CATT 0.00661 CCAA 0.00234 CCAC 0.0014 CCAG 0.00115 CCAT 0.00231 CCCA 0.000857 CCCC 0.000563 CCCG 0.000625 CCCT 0.00105 CCGA 0.00149 CCGC 0.000928 CCGG 0.000682 CCGT 0.00143 CCTA 0.00163 CCTC 0.00143 CCTG 0.00119 CCTT 0.00253 CGAA 0.0045 CGAC 0.00193 CGAG 0.00214 CGAT 0.00435 CGCA 0.00188 CGCC 0.000916 CGCG 0.00204 CGCT 0.00168 CGGA 0.00145 CGGC 0.00092 CGGG 0.000624 CGGT 0.00153 CGTA 0.00351 CGTC 0.00189 CGTG 0.00242 CGTT 0.00411 CTAA 0.00379 CTAC 0.00228 CTAG 0.0015 CTAT 0.00455 CTCA 0.00194 CTCC 0.00129 CTCG 0.00214 CTCT 0.00285 CTGA 0.00234 CTGC 0.00159 CTGG 0.00115 CTGT 0.003 CTTA 0.00411 CTTC 0.00341 CTTG 0.00263 CTTT 0.00691 GAAA 0.00946 GAAC 0.00311 GAAG 0.00341 GAAT 0.00639 GACA 0.00277 GACC 0.00101 GACG 0.00189 GACT 0.0019 GAGA 0.00339 GAGC 0.00131 GAGG 0.00143 GAGT 0.00208 GATA 0.00597 GATC 0.00279 GATG 0.00276 GATT 0.00547 GCAA 0.00355 GCAC 0.00167 GCAG 0.00159 GCAT 0.00296 GCCA 0.00141 GCCC 0.000494 GCCG 0.00092 GCCT 0.00104 GCGA 0.00229 GCGC 0.00125 GCGG 0.000929 GCGT 0.00204 GCTA 0.00204 GCTC 0.00131 GCTG 0.00149 GCTT 0.00259 GGAA 0.00358 GGAC 0.00107 GGAG 0.00129 GGAT 0.00218 GGCA 0.00134 GGCC 0.000596 GGCG 0.000916 GGCT 0.00101 GGGA 0.00124 GGGC 0.000494 GGGG 0.000563 GGGT 0.000798 GGTA 0.00215 GGTC 0.00101 GGTG 0.00128 GGTT 0.00208 GTAA 0.00609 GTAC 0.00316 GTAG 0.00228 GTAT 0.0064 GTCA 0.00248 GTCC 0.00107 GTCG 0.00193 GTCT 0.00208 GTGA 0.00288 GTGC 0.00167 GTGG 0.0014 GTGT 0.00324 GTTA 0.0051 GTTC 0.00311 GTTG 0.00286 GTTT 0.00667 TAAA 0.0141 TAAC 0.0051 TAAG 0.00411 TAAT 0.0128 TACA 0.00744 TACC 0.00215 TACG 0.0035 TACT 0.00483 TAGA 0.00457 TAGC 0.00204 TAGG 0.00162 TAGT 0.00388 TATA 0.0153 TATC 0.00597 TATG 0.0059 TATT 0.0152 TCAA 0.00567 TCAC 0.00287 TCAG 0.00234 TCAT 0.00578 TCCA 0.00267 TCCC 0.00124 TCCG 0.00145 TCCT 0.00276 TCGA 0.00466 TCGC 0.00229 TCGG 0.00149 TCGT 0.00447 TCTA 0.00457 TCTC 0.00339 TCTG 0.00277 TCTT 0.0067 TGAA 0.00683 TGAC 0.00248 TGAG 0.00194 TGAT 0.00542 TGCA 0.00385 TGCC 0.00134 TGCG 0.00188 TGCT 0.00271 TGGA 0.00267 TGGC 0.00141 TGGG 0.000857 TGGT 0.00226 TGTA 0.00744 TGTC 0.00276 TGTG 0.00314 TGTT 0.00682 TTAA 0.0121 TTAC 0.00609 TTAG 0.00378 TTAT 0.0142 TTCA 0.00683 TTCC 0.00358 TTCG 0.0045 TTCT 0.00746 TTGA 0.00567 TTGC 0.00355 TTGG 0.00234 TTGT 0.00702 TTTA 0.0141 TTTC 0.00946 TTTG 0.00699 TTTT 0.0182 # l= 4 # Values AAAAA 0.00664 AAAAC 0.00226 AAAAG 0.00268 AAAAT 0.00658 AAACA 0.00265 AAACC 0.000709 AAACG 0.0015 AAACT 0.00182 AAAGA 0.0028 AAAGC 0.000969 AAAGG 0.001 AAAGT 0.00214 AAATA 0.00641 AAATC 0.00204 AAATG 0.00269 AAATT 0.00588 AACAA 0.00255 AACAC 0.000995 AACAG 0.00104 AACAT 0.00224 AACCA 0.00075 AACCC 0.000246 AACCG 0.000474 AACCT 0.000611 AACGA 0.00165 AACGC 0.000649 AACGG 0.000493 AACGT 0.00132 AACTA 0.00138 AACTC 0.000669 AACTG 0.00091 AACTT 0.00178 AAGAA 0.00302 AAGAC 0.000725 AAGAG 0.00103 AAGAT 0.00192 AAGCA 0.001 AAGCC 0.000306 AAGCG 0.000557 AAGCT 0.000731 AAGGA 0.00109 AAGGC 0.000366 AAGGG 0.000384 AAGGT 0.000689 AAGTA 0.00195 AAGTC 0.000636 AAGTG 0.000882 AAGTT 0.00178 AATAA 0.00547 AATAC 0.0021 AATAG 0.00161 AATAT 0.00602 AATCA 0.00183 AATCC 0.000668 AATCG 0.00134 AATCT 0.00163 AATGA 0.00226 AATGC 0.00103 AATGG 0.000854 AATGT 0.00247 AATTA 0.00474 AATTC 0.00219 AATTG 0.0022 AATTT 0.00588 ACAAA 0.0028 ACAAC 0.000926 ACAAG 0.000974 ACAAT 0.00232 ACACA 0.00126 ACACC 0.000372 ACACG 0.000841 ACACT 0.000766 ACAGA 0.0011 ACAGC 0.000503 ACAGG 0.000446 ACAGT 0.000958 ACATA 0.00255 ACATC 0.000893 ACATG 0.000997 ACATT 0.00247 ACCAA 0.000761 ACCAC 0.000418 ACCAG 0.000373 ACCAT 0.000707 ACCCA 0.00024 ACCCC 0.000129 ACCCG 0.000157 ACCCT 0.000272 ACCGA 0.000528 ACCGC 0.000284 ACCGG 0.000235 ACCGT 0.000485 ACCTA 0.000539 ACCTC 0.000343 ACCTG 0.000349 ACCTT 0.000689 ACGAA 0.00165 ACGAC 0.000597 ACGAG 0.000734 ACGAT 0.00149 ACGCA 0.000629 ACGCC 0.000232 ACGCG 0.00065 ACGCT 0.000524 ACGGA 0.000494 ACGGC 0.000242 ACGGG 0.000205 ACGGT 0.000485 ACGTA 0.0013 ACGTC 0.000555 ACGTG 0.000811 ACGTT 0.00132 ACTAA 0.00125 ACTAC 0.000692 ACTAG 0.000492 ACTAT 0.00144 ACTCA 0.000538 ACTCC 0.00028 ACTCG 0.000594 ACTCT 0.00067 ACTGA 0.000802 ACTGC 0.000482 ACTGG 0.000376 ACTGT 0.000958 ACTTA 0.00136 ACTTC 0.000918 ACTTG 0.000835 ACTTT 0.00214 AGAAA 0.00333 AGAAC 0.000906 AGAAG 0.00115 AGAAT 0.00208 AGACA 0.000822 AGACC 0.000236 AGACG 0.000485 AGACT 0.000537 AGAGA 0.00131 AGAGC 0.000375 AGAGG 0.000489 AGAGT 0.00067 AGATA 0.00189 AGATC 0.000725 AGATG 0.0008 AGATT 0.00163 AGCAA 0.00101 AGCAC 0.000419 AGCAG 0.000477 AGCAT 0.000798 AGCCA 0.000375 AGCCC 0.000123 AGCCG 0.000242 AGCCT 0.000271 AGCGA 0.000623 AGCGC 0.000274 AGCGG 0.000254 AGCGT 0.000524 AGCTA 0.000573 AGCTC 0.00032 AGCTG 0.000424 AGCTT 0.000731 AGGAA 0.00128 AGGAC 0.000321 AGGAG 0.000422 AGGAT 0.00073 AGGCA 0.000398 AGGCC 0.000132 AGGCG 0.00024 AGGCT 0.000271 AGGGA 0.000434 AGGGC 0.000149 AGGGG 0.000198 AGGGT 0.000272 AGGTA 0.000675 AGGTC 0.000275 AGGTG 0.00036 AGGTT 0.000611 AGTAA 0.00172 AGTAC 0.000781 AGTAG 0.000677 AGTAT 0.00165 AGTCA 0.00067 AGTCC 0.000225 AGTCG 0.000465 AGTCT 0.000537 AGTGA 0.000796 AGTGC 0.000394 AGTGG 0.000398 AGTGT 0.000766 AGTTA 0.00138 AGTTC 0.000758 AGTTG 0.000781 AGTTT 0.00182 ATAAA 0.00581 ATAAC 0.00181 ATAAG 0.00154 ATAAT 0.00502 ATACA 0.00284 ATACC 0.000706 ATACG 0.0012 ATACT 0.00165 ATAGA 0.00177 ATAGC 0.000741 ATAGG 0.000599 ATAGT 0.00144 ATATA 0.00678 ATATC 0.00214 ATATG 0.00231 ATATT 0.00602 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.000897 ATCAG 0.00079 ATCAT 0.00188 ATCCA 0.000721 ATCCC 0.000313 ATCCG 0.000416 ATCCT 0.00073 ATCGA 0.00165 ATCGC 0.000714 ATCGG 0.000495 ATCGT 0.00149 ATCTA 0.00143 ATCTC 0.00088 ATCTG 0.000811 ATCTT 0.00192 ATGAA 0.00246 ATGAC 0.000792 ATGAG 0.000646 ATGAT 0.00188 ATGCA 0.00126 ATGCC 0.000352 ATGCG 0.000558 ATGCT 0.000798 ATGGA 0.000885 ATGGC 0.000431 ATGGG 0.000286 ATGGT 0.000707 ATGTA 0.00288 ATGTC 0.000798 ATGTG 0.000987 ATGTT 0.00224 ATTAA 0.00435 ATTAC 0.00206 ATTAG 0.00133 ATTAT 0.00502 ATTCA 0.00203 ATTCC 0.000942 ATTCG 0.00134 ATTCT 0.00208 ATTGA 0.00189 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.000758 ATTGT 0.00232 ATTTA 0.00504 ATTTC 0.00302 ATTTG 0.00238 ATTTT 0.00658 CAAAA 0.00248 CAAAC 0.00107 CAAAG 0.00107 CAAAT 0.00238 CAACA 0.000999 CAACC 0.000383 CAACG 0.000698 CAACT 0.000781 CAAGA 0.000922 CAAGC 0.000449 CAAGG 0.000422 CAAGT 0.000835 CAATA 0.002 CAATC 0.000861 CAATG 0.00105 CAATT 0.0022 CACAA 0.000986 CACAC 0.000653 CACAG 0.000516 CACAT 0.000987 CACCA 0.000396 CACCC 0.000191 CACCG 0.000329 CACCT 0.00036 CACGA 0.00081 CACGC 0.000471 CACGG 0.000324 CACGT 0.000811 CACTA 0.000573 CACTC 0.000396 CACTG 0.000504 CACTT 0.000882 CAGAA 0.0011 CAGAC 0.000377 CAGAG 0.000489 CAGAT 0.000811 CAGCA 0.000486 CAGCC 0.000246 CAGCG 0.000338 CAGCT 0.000424 CAGGA 0.000438 CAGGC 0.000215 CAGGG 0.000186 CAGGT 0.000349 CAGTA 0.000789 CAGTC 0.000414 CAGTG 0.000504 CAGTT 0.00091 CATAA 0.00189 CATAC 0.00102 CATAG 0.000689 CATAT 0.00231 CATCA 0.0008 CATCC 0.000402 CATCG 0.000763 CATCT 0.0008 CATGA 0.000809 CATGC 0.000498 CATGG 0.000378 CATGT 0.000997 CATTA 0.00178 CATTC 0.0011 CATTG 0.00105 CATTT 0.00269 CCAAA 0.000803 CCAAC 0.000422 CCAAG 0.000353 CCAAT 0.000758 CCACA 0.000351 CCACC 0.000266 CCACG 0.000388 CCACT 0.000398 CCAGA 0.000348 CCAGC 0.000242 CCAGG 0.000179 CCAGT 0.000376 CCATA 0.000643 CCATC 0.000436 CCATG 0.000378 CCATT 0.000854 CCCAA 0.00026 CCCAC 0.00018 CCCAG 0.000131 CCCAT 0.000286 CCCCA 0.00014 CCCCC 0.000114 CCCCG 0.000111 CCCCT 0.000198 CCCGA 0.000195 CCCGC 0.000128 CCCGG 9.58e-05 CCCGT 0.000205 CCCTA 0.000222 CCCTC 0.00026 CCCTG 0.000186 CCCTT 0.000384 CCGAA 0.000478 CCGAC 0.00025 CCGAG 0.000264 CCGAT 0.000495 CCGCA 0.000227 CCGCC 0.000159 CCGCG 0.000289 CCGCT 0.000254 CCGGA 0.000195 CCGGC 0.000156 CCGGG 9.58e-05 CCGGT 0.000235 CCGTA 0.000365 CCGTC 0.000244 CCGTG 0.000324 CCGTT 0.000493 CCTAA 0.000505 CCTAC 0.000315 CCTAG 0.000206 CCTAT 0.000599 CCTCA 0.000277 CCTCC 0.000275 CCTCG 0.000389 CCTCT 0.000489 CCTGA 0.000321 CCTGC 0.000243 CCTGG 0.000179 CCTGT 0.000446 CCTTA 0.000555 CCTTC 0.000548 CCTTG 0.000422 CCTTT 0.001 CGAAA 0.00165 CGAAC 0.000752 CGAAG 0.000761 CGAAT 0.00134 CGACA 0.00059 CGACC 0.000303 CGACG 0.000568 CGACT 0.000465 CGAGA 0.00073 CGAGC 0.000425 CGAGG 0.000389 CGAGT 0.000594 CGATA 0.0014 CGATC 0.000846 CGATG 0.000763 CGATT 0.00134 CGCAA 0.000641 CGCAC 0.000346 CGCAG 0.000329 CGCAT 0.000558 CGCCA 0.000324 CGCCC 0.000122 CGCCG 0.000229 CGCCT 0.00024 CGCGA 0.000676 CGCGC 0.000423 CGCGG 0.000289 CGCGT 0.00065 CGCTA 0.000441 CGCTC 0.000339 CGCTG 0.000338 CGCTT 0.000557 CGGAA 0.000549 CGGAC 0.000219 CGGAG 0.000263 CGGAT 0.000416 CGGCA 0.000282 CGGCC 0.000166 CGGCG 0.000229 CGGCT 0.000242 CGGGA 0.000242 CGGGC 0.000114 CGGGG 0.000111 CGGGT 0.000157 CGGTA 0.000464 CGGTC 0.000265 CGGTG 0.000329 CGGTT 0.000474 CGTAA 0.00116 CGTAC 0.000655 CGTAG 0.000486 CGTAT 0.0012 CGTCA 0.000536 CGTCC 0.000299 CGTCG 0.000568 CGTCT 0.000485 CGTGA 0.000723 CGTGC 0.000463 CGTGG 0.000388 CGTGT 0.000841 CGTTA 0.00108 CGTTC 0.000834 CGTTG 0.000698 CGTTT 0.0015 CTAAA 0.0014 CTAAC 0.000611 CTAAG 0.000449 CTAAT 0.00133 CTACA 0.00078 CTACC 0.000332 CTACG 0.000486 CTACT 0.000677 CTAGA 0.000537 CTAGC 0.000269 CTAGG 0.000206 CTAGT 0.000492 CTATA 0.00149 CTATC 0.000759 CTATG 0.000689 CTATT 0.00161 CTCAA 0.00066 CTCAC 0.000362 CTCAG 0.00027 CTCAT 0.000646 CTCCA 0.000382 CTCCC 0.000222 CTCCG 0.000263 CTCCT 0.000422 CTCGA 0.000736 CTCGC 0.000404 CTCGG 0.000264 CTCGT 0.000734 CTCTA 0.000619 CTCTC 0.000708 CTCTG 0.000489 CTCTT 0.00103 CTGAA 0.000899 CTGAC 0.000379 CTGAG 0.00027 CTGAT 0.00079 CTGCA 0.000524 CTGCC 0.00026 CTGCG 0.000329 CTGCT 0.000477 CTGGA 0.000396 CTGGC 0.000246 CTGGG 0.000131 CTGGT 0.000373 CTGTA 0.000974 CTGTC 0.000474 CTGTG 0.000516 CTGTT 0.00104 CTTAA 0.00138 CTTAC 0.000741 CTTAG 0.000449 CTTAT 0.00154 CTTCA 0.00088 CTTCC 0.000623 CTTCG 0.000761 CTTCT 0.00115 CTTGA 0.000789 CTTGC 0.000513 CTTGG 0.000353 CTTGT 0.000974 CTTTA 0.00167 CTTTC 0.00149 CTTTG 0.00107 CTTTT 0.00268 GAAAA 0.00341 GAAAC 0.00154 GAAAG 0.00149 GAAAT 0.00302 GAACA 0.00114 GAACC 0.00037 GAACG 0.000834 GAACT 0.000758 GAAGA 0.00139 GAAGC 0.000563 GAAGG 0.000548 GAAGT 0.000918 GAATA 0.00214 GAATC 0.000963 GAATG 0.0011 GAATT 0.00219 GACAA 0.000991 GACAC 0.000501 GACAG 0.000474 GACAT 0.000798 GACCA 0.000342 GACCC 0.000123 GACCG 0.000265 GACCT 0.000275 GACGA 0.000747 GACGC 0.000343 GACGG 0.000244 GACGT 0.000555 GACTA 0.000524 GACTC 0.000323 GACTG 0.000414 GACTT 0.000636 GAGAA 0.00137 GAGAC 0.000428 GAGAG 0.000708 GAGAT 0.00088 GAGCA 0.000471 GAGCC 0.00018 GAGCG 0.000339 GAGCT 0.00032 GAGGA 0.000597 GAGGC 0.000229 GAGGG 0.00026 GAGGT 0.000343 GAGTA 0.000693 GAGTC 0.000323 GAGTG 0.000396 GAGTT 0.000669 GATAA 0.00204 GATAC 0.00103 GATAG 0.000759 GATAT 0.00214 GATCA 0.00085 GATCC 0.000368 GATCG 0.000846 GATCT 0.000725 GATGA 0.000939 GATGC 0.000497 GATGG 0.000436 GATGT 0.000893 GATTA 0.0016 GATTC 0.000963 GATTG 0.000861 GATTT 0.00204 GCAAA 0.00127 GCAAC 0.000633 GCAAG 0.000513 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000591 GCACC 0.000221 GCACG 0.000463 GCACT 0.000394 GCAGA 0.000535 GCAGC 0.000331 GCAGG 0.000243 GCAGT 0.000482 GCATA 0.000943 GCATC 0.000497 GCATG 0.000498 GCATT 0.00103 GCCAA 0.000434 GCCAC 0.000296 GCCAG 0.000246 GCCAT 0.000431 GCCCA 0.000137 GCCCC 9.36e-05 GCCCG 0.000114 GCCCT 0.000149 GCCGA 0.000301 GCCGC 0.000221 GCCGG 0.000156 GCCGT 0.000242 GCCTA 0.000231 GCCTC 0.000229 GCCTG 0.000215 GCCTT 0.000366 GCGAA 0.000792 GCGAC 0.000379 GCGAG 0.000404 GCGAT 0.000714 GCGCA 0.000368 GCGCC 0.000186 GCGCG 0.000423 GCGCT 0.000274 GCGGA 0.000295 GCGGC 0.000221 GCGGG 0.000128 GCGGT 0.000284 GCGTA 0.000572 GCGTC 0.000343 GCGTG 0.000471 GCGTT 0.000649 GCTAA 0.000611 GCTAC 0.000421 GCTAG 0.000269 GCTAT 0.000741 GCTCA 0.0003 GCTCC 0.000211 GCTCG 0.000425 GCTCT 0.000375 GCTGA 0.000418 GCTGC 0.000331 GCTGG 0.000242 GCTGT 0.000503 GCTTA 0.000614 GCTTC 0.000563 GCTTG 0.000449 GCTTT 0.000969 GGAAA 0.00149 GGAAC 0.000528 GGAAG 0.000623 GGAAT 0.000942 GGACA 0.000405 GGACC 0.000141 GGACG 0.000299 GGACT 0.000225 GGAGA 0.000523 GGAGC 0.000211 GGAGG 0.000275 GGAGT 0.00028 GGATA 0.000742 GGATC 0.000368 GGATG 0.000402 GGATT 0.000668 GGCAA 0.000485 GGCAC 0.000243 GGCAG 0.00026 GGCAT 0.000352 GGCCA 0.000215 GGCCC 8.16e-05 GGCCG 0.000166 GGCCT 0.000132 GGCGA 0.000338 GGCGC 0.000186 GGCGG 0.000159 GGCGT 0.000232 GGCTA 0.000279 GGCTC 0.00018 GGCTG 0.000246 GGCTT 0.000306 GGGAA 0.000531 GGGAC 0.000174 GGGAG 0.000222 GGGAT 0.000313 GGGCA 0.000167 GGGCC 8.16e-05 GGGCG 0.000122 GGGCT 0.000123 GGGGA 0.000226 GGGGC 9.36e-05 GGGGG 0.000114 GGGGT 0.000129 GGGTA 0.000239 GGGTC 0.000123 GGGTG 0.000191 GGGTT 0.000246 GGTAA 0.000724 GGTAC 0.000385 GGTAG 0.000332 GGTAT 0.000706 GGTCA 0.000325 GGTCC 0.000141 GGTCG 0.000303 GGTCT 0.000236 GGTGA 0.000416 GGTGC 0.000221 GGTGG 0.000266 GGTGT 0.000372 GGTTA 0.000618 GGTTC 0.00037 GGTTG 0.000383 GGTTT 0.000709 GTAAA 0.00225 GTAAC 0.00103 GTAAG 0.000741 GTAAT 0.00206 GTACA 0.00134 GTACC 0.000385 GTACG 0.000655 GTACT 0.000781 GTAGA 0.000848 GTAGC 0.000421 GTAGG 0.000315 GTAGT 0.000692 GTATA 0.00226 GTATC 0.00103 GTATG 0.00102 GTATT 0.0021 GTCAA 0.000806 GTCAC 0.000503 GTCAG 0.000379 GTCAT 0.000792 GTCCA 0.000355 GTCCC 0.000174 GTCCG 0.000219 GTCCT 0.000321 GTCGA 0.000701 GTCGC 0.000379 GTCGG 0.00025 GTCGT 0.000597 GTCTA 0.00055 GTCTC 0.000428 GTCTG 0.000377 GTCTT 0.000725 GTGAA 0.00111 GTGAC 0.000503 GTGAG 0.000362 GTGAT 0.000897 GTGCA 0.000662 GTGCC 0.000243 GTGCG 0.000346 GTGCT 0.000419 GTGGA 0.00051 GTGGC 0.000296 GTGGG 0.00018 GTGGT 0.000418 GTGTA 0.00109 GTGTC 0.000501 GTGTG 0.000653 GTGTT 0.000995 GTTAA 0.00165 GTTAC 0.00103 GTTAG 0.000611 GTTAT 0.00181 GTTCA 0.00092 GTTCC 0.000528 GTTCG 0.000752 GTTCT 0.000906 GTTGA 0.000879 GTTGC 0.000633 GTTGG 0.000422 GTTGT 0.000926 GTTTA 0.0018 GTTTC 0.00154 GTTTG 0.00107 GTTTT 0.00226 TAAAA 0.00563 TAAAC 0.0018 TAAAG 0.00167 TAAAT 0.00504 TAACA 0.00203 TAACC 0.000618 TAACG 0.00108 TAACT 0.00138 TAAGA 0.00158 TAAGC 0.000614 TAAGG 0.000555 TAAGT 0.00136 TAATA 0.00464 TAATC 0.0016 TAATG 0.00178 TAATT 0.00474 TACAA 0.0025 TACAC 0.00109 TACAG 0.000974 TACAT 0.00288 TACCA 0.00077 TACCC 0.000239 TACCG 0.000464 TACCT 0.000675 TACGA 0.00127 TACGC 0.000572 TACGG 0.000365 TACGT 0.0013 TACTA 0.0014 TACTC 0.000693 TACTG 0.000789 TACTT 0.00195 TAGAA 0.00197 TAGAC 0.00055 TAGAG 0.000619 TAGAT 0.00143 TAGCA 0.000749 TAGCC 0.000279 TAGCG 0.000441 TAGCT 0.000573 TAGGA 0.000635 TAGGC 0.000231 TAGGG 0.000222 TAGGT 0.000539 TAGTA 0.0014 TAGTC 0.000524 TAGTG 0.000573 TAGTT 0.00138 TATAA 0.00477 TATAC 0.00226 TATAG 0.00149 TATAT 0.00678 TATCA 0.00194 TATCC 0.000742 TATCG 0.0014 TATCT 0.00189 TATGA 0.00177 TATGC 0.000943 TATGG 0.000643 TATGT 0.00255 TATTA 0.00464 TATTC 0.00214 TATTG 0.002 TATTT 0.00641 TCAAA 0.00211 TCAAC 0.000879 TCAAG 0.000789 TCAAT 0.00189 TCACA 0.000941 TCACC 0.000416 TCACG 0.000723 TCACT 0.000796 TCAGA 0.000796 TCAGC 0.000418 TCAGG 0.000321 TCAGT 0.000802 TCATA 0.00177 TCATC 0.000939 TCATG 0.000809 TCATT 0.00226 TCCAA 0.000882 TCCAC 0.00051 TCCAG 0.000396 TCCAT 0.000885 TCCCA 0.000339 TCCCC 0.000226 TCCCG 0.000242 TCCCT 0.000434 TCCGA 0.000464 TCCGC 0.000295 TCCGG 0.000195 TCCGT 0.000494 TCCTA 0.000635 TCCTC 0.000597 TCCTG 0.000438 TCCTT 0.00109 TCGAA 0.00158 TCGAC 0.000701 TCGAG 0.000736 TCGAT 0.00165 TCGCA 0.000651 TCGCC 0.000338 TCGCG 0.000676 TCGCT 0.000623 TCGGA 0.000464 TCGGC 0.000301 TCGGG 0.000195 TCGGT 0.000528 TCGTA 0.00127 TCGTC 0.000747 TCGTG 0.00081 TCGTT 0.00165 TCTAA 0.00142 TCTAC 0.000848 TCTAG 0.000537 TCTAT 0.00177 TCTCA 0.000823 TCTCC 0.000523 TCTCG 0.00073 TCTCT 0.00131 TCTGA 0.000796 TCTGC 0.000535 TCTGG 0.000348 TCTGT 0.0011 TCTTA 0.00158 TCTTC 0.00139 TCTTG 0.000922 TCTTT 0.0028 TGAAA 0.003 TGAAC 0.00092 TGAAG 0.00088 TGAAT 0.00203 TGACA 0.000949 TGACC 0.000325 TGACG 0.000536 TGACT 0.00067 TGAGA 0.000823 TGAGC 0.0003 TGAGG 0.000277 TGAGT 0.000538 TGATA 0.00194 TGATC 0.00085 TGATG 0.0008 TGATT 0.00183 TGCAA 0.00141 TGCAC 0.000662 TGCAG 0.000524 TGCAT 0.00126 TGCCA 0.000492 TGCCC 0.000167 TGCCG 0.000282 TGCCT 0.000398 TGCGA 0.000651 TGCGC 0.000368 TGCGG 0.000227 TGCGT 0.000629 TGCTA 0.000749 TGCTC 0.000471 TGCTG 0.000486 TGCTT 0.001 TGGAA 0.00122 TGGAC 0.000355 TGGAG 0.000382 TGGAT 0.000721 TGGCA 0.000492 TGGCC 0.000215 TGGCG 0.000324 TGGCT 0.000375 TGGGA 0.000339 TGGGC 0.000137 TGGGG 0.00014 TGGGT 0.00024 TGGTA 0.00077 TGGTC 0.000342 TGGTG 0.000396 TGGTT 0.00075 TGTAA 0.00248 TGTAC 0.00134 TGTAG 0.00078 TGTAT 0.00284 TGTCA 0.000949 TGTCC 0.000405 TGTCG 0.00059 TGTCT 0.000822 TGTGA 0.000941 TGTGC 0.000591 TGTGG 0.000351 TGTGT 0.00126 TGTTA 0.00203 TGTTC 0.00114 TGTTG 0.000999 TGTTT 0.00265 TTAAA 0.00469 TTAAC 0.00165 TTAAG 0.00138 TTAAT 0.00435 TTACA 0.00248 TTACC 0.000724 TTACG 0.00116 TTACT 0.00172 TTAGA 0.00142 TTAGC 0.000611 TTAGG 0.000505 TTAGT 0.00125 TTATA 0.00477 TTATC 0.00204 TTATG 0.00189 TTATT 0.00547 TTCAA 0.00235 TTCAC 0.00111 TTCAG 0.000899 TTCAT 0.00246 TTCCA 0.00122 TTCCC 0.000531 TTCCG 0.000549 TTCCT 0.00128 TTCGA 0.00158 TTCGC 0.000792 TTCGG 0.000478 TTCGT 0.00165 TTCTA 0.00197 TTCTC 0.00137 TTCTG 0.0011 TTCTT 0.00302 TTGAA 0.00235 TTGAC 0.000806 TTGAG 0.00066 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00141 TTGCC 0.000485 TTGCG 0.000641 TTGCT 0.00101 TTGGA 0.000882 TTGGC 0.000434 TTGGG 0.00026 TTGGT 0.000761 TTGTA 0.0025 TTGTC 0.000991 TTGTG 0.000986 TTGTT 0.00255 TTTAA 0.00469 TTTAC 0.00225 TTTAG 0.0014 TTTAT 0.00581 TTTCA 0.003 TTTCC 0.00149 TTTCG 0.00165 TTTCT 0.00333 TTTGA 0.00211 TTTGC 0.00127 TTTGG 0.000803 TTTGT 0.0028 TTTTA 0.00563 TTTTC 0.00341 TTTTG 0.00248 TTTTT 0.00664 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [4] # (a,c,g,t)= (0.325, 0.175, 0.175, 0.325) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.334 C 0.165 G 0.165 T 0.335 # l= 1 # Values AA 0.121 AC 0.0534 AG 0.0467 AT 0.113 CA 0.0536 CC 0.0239 CG 0.0413 CT 0.0467 GA 0.0579 GC 0.0303 GG 0.0239 GT 0.0534 TA 0.102 TC 0.0579 TG 0.0536 TT 0.121 # l= 2 # Values AAA 0.0465 AAC 0.018 AAG 0.0172 AAT 0.0396 ACA 0.0194 ACC 0.00702 ACG 0.0134 ACT 0.0135 AGA 0.0178 AGC 0.00801 AGG 0.0073 AGT 0.0136 ATA 0.0387 ATC 0.0175 ATG 0.0173 ATT 0.0396 CAA 0.0183 CAC 0.00965 CAG 0.00845 CAT 0.0173 CCA 0.00767 CCC 0.00357 CCG 0.00538 CCT 0.00729 CGA 0.0148 CGC 0.00768 CGG 0.00538 CGT 0.0134 CTA 0.0119 CTC 0.00911 CTG 0.00845 CTT 0.0172 GAA 0.0231 GAC 0.00824 GAG 0.00911 GAT 0.0175 GCA 0.0101 GCC 0.00444 GCG 0.00768 GCT 0.00801 GGA 0.0089 GGC 0.00444 GGG 0.00357 GGT 0.00702 GTA 0.0175 GTC 0.00824 GTG 0.00965 GTT 0.018 TAA 0.0335 TAC 0.0175 TAG 0.0119 TAT 0.0387 TCA 0.0164 TCC 0.0089 TCG 0.0148 TCT 0.0178 TGA 0.0164 TGC 0.0101 TGG 0.00767 TGT 0.0194 TTA 0.0335 TTC 0.0231 TTG 0.0183 TTT 0.0465 # l= 3 # Values AAAA 0.0171 AAAC 0.00669 AAAG 0.00694 AAAT 0.0158 AACA 0.00657 AACC 0.0022 AACG 0.00463 AACT 0.00462 AAGA 0.00674 AAGC 0.00275 AAGG 0.00269 AAGT 0.00507 AATA 0.0138 AATC 0.00554 AATG 0.0063 AATT 0.014 ACAA 0.00667 ACAC 0.00331 ACAG 0.00306 ACAT 0.00638 ACCA 0.00235 ACCC 0.000896 ACCG 0.00179 ACCT 0.00198 ACGA 0.00504 ACGC 0.00237 ACGG 0.00166 ACGT 0.00433 ACTA 0.00365 ACTC 0.00221 ACTG 0.00262 ACTT 0.00506 AGAA 0.00755 AGAC 0.00219 AGAG 0.0031 AGAT 0.00499 AGCA 0.00275 AGCC 0.00115 AGCG 0.00194 AGCT 0.00217 AGGA 0.00296 AGGC 0.00116 AGGG 0.00119 AGGT 0.00198 AGTA 0.00456 AGTC 0.002 AGTG 0.00238 AGTT 0.00462 ATAA 0.0129 ATAC 0.00607 ATAG 0.00437 ATAT 0.0154 ATCA 0.00524 ATCC 0.00234 ATCG 0.00492 ATCT 0.00499 ATGA 0.00551 ATGC 0.00297 ATGG 0.00239 ATGT 0.00638 ATTA 0.0117 ATTC 0.00641 ATTG 0.0058 ATTT 0.0158 CAAA 0.00674 CAAC 0.00301 CAAG 0.00271 CAAT 0.0058 CACA 0.00307 CACC 0.00144 CACG 0.00276 CACT 0.00238 CAGA 0.00287 CAGC 0.00165 CAGG 0.0013 CAGT 0.00262 CATA 0.00543 CATC 0.00292 CATG 0.00261 CATT 0.00629 CCAA 0.00243 CCAC 0.00157 CCAG 0.00128 CCAT 0.00239 CCCA 0.000933 CCCC 0.000674 CCCG 0.000765 CCCT 0.00119 CCGA 0.00175 CCGC 0.00113 CCGG 0.000841 CCGT 0.00166 CCTA 0.00165 CCTC 0.00165 CCTG 0.0013 CCTT 0.00269 CGAA 0.00506 CGAC 0.00228 CGAG 0.00258 CGAT 0.00492 CGCA 0.00209 CGCC 0.00111 CGCG 0.00254 CGCT 0.00194 CGGA 0.00169 CGGC 0.00113 CGGG 0.000765 CGGT 0.00179 CGTA 0.00378 CGTC 0.00222 CGTG 0.00276 CGTT 0.00463 CTAA 0.00366 CTAC 0.00233 CTAG 0.00152 CTAT 0.00437 CTCA 0.00196 CTCC 0.00148 CTCG 0.00258 CTCT 0.0031 CTGA 0.00239 CTGC 0.00172 CTGG 0.00128 CTGT 0.00306 CTTA 0.00393 CTTC 0.00367 CTTG 0.00271 CTTT 0.00694 GAAA 0.00968 GAAC 0.00335 GAAG 0.00367 GAAT 0.00641 GACA 0.00288 GACC 0.00115 GACG 0.00222 GACT 0.002 GAGA 0.00374 GAGC 0.00151 GAGG 0.00165 GAGT 0.00221 GATA 0.00594 GATC 0.00308 GATG 0.00292 GATT 0.00554 GCAA 0.00366 GCAC 0.0018 GCAG 0.00172 GCAT 0.00297 GCCA 0.00157 GCCC 0.000579 GCCG 0.00113 GCCT 0.00116 GCGA 0.00271 GCGC 0.00147 GCGG 0.00113 GCGT 0.00237 GCTA 0.00211 GCTC 0.00151 GCTG 0.00165 GCTT 0.00274 GGAA 0.00386 GGAC 0.00121 GGAG 0.00148 GGAT 0.00234 GGCA 0.00146 GGCC 0.000709 GGCG 0.00111 GGCT 0.00115 GGGA 0.00142 GGGC 0.000578 GGGG 0.000674 GGGT 0.000896 GGTA 0.00223 GGTC 0.00115 GGTG 0.00144 GGTT 0.0022 GTAA 0.00588 GTAC 0.00317 GTAG 0.00233 GTAT 0.00607 GTCA 0.00256 GTCC 0.00121 GTCG 0.00228 GTCT 0.00219 GTGA 0.00297 GTGC 0.0018 GTGG 0.00157 GTGT 0.00331 GTTA 0.00497 GTTC 0.00335 GTTG 0.00301 GTTT 0.00669 TAAA 0.013 TAAC 0.00497 TAAG 0.00393 TAAT 0.0117 TACA 0.00689 TACC 0.00223 TACG 0.00377 TACT 0.00456 TAGA 0.00448 TAGC 0.0021 TAGG 0.00165 TAGT 0.00365 TATA 0.0135 TATC 0.00594 TATG 0.00543 TATT 0.0138 TCAA 0.00551 TCAC 0.00297 TCAG 0.00239 TCAT 0.00551 TCCA 0.00283 TCCC 0.00142 TCCG 0.00169 TCCT 0.00296 TCGA 0.00534 TCGC 0.00271 TCGG 0.00175 TCGT 0.00504 TCTA 0.00448 TCTC 0.00374 TCTG 0.00287 TCTT 0.00674 TGAA 0.00663 TGAC 0.00256 TGAG 0.00196 TGAT 0.00524 TGCA 0.00383 TGCC 0.00147 TGCG 0.00209 TGCT 0.00275 TGGA 0.00283 TGGC 0.00157 TGGG 0.000933 TGGT 0.00235 TGTA 0.00689 TGTC 0.00287 TGTG 0.00307 TGTT 0.00657 TTAA 0.0111 TTAC 0.00588 TTAG 0.00366 TTAT 0.0129 TTCA 0.00663 TTCC 0.00386 TTCG 0.00506 TTCT 0.00755 TTGA 0.00551 TTGC 0.00366 TTGG 0.00243 TTGT 0.00667 TTTA 0.013 TTTC 0.00968 TTTG 0.00674 TTTT 0.0171 # l= 4 # Values AAAAA 0.0062 AAAAC 0.0022 AAAAG 0.00264 AAAAT 0.00603 AAACA 0.00253 AAACC 0.000739 AAACG 0.00166 AAACT 0.00176 AAAGA 0.0028 AAAGC 0.00101 AAAGG 0.00106 AAAGT 0.00206 AAATA 0.00579 AAATC 0.00203 AAATG 0.00253 AAATT 0.00541 AACAA 0.00243 AACAC 0.00102 AACAG 0.00105 AACAT 0.00207 AACCA 0.000769 AACCC 0.000271 AACCG 0.000546 AACCT 0.000614 AACGA 0.00186 AACGC 0.000756 AACGG 0.00057 AACGT 0.00144 AACTA 0.0013 AACTC 0.000706 AACTG 0.000904 AACTT 0.00171 AAGAA 0.00302 AAGAC 0.00074 AAGAG 0.00111 AAGAT 0.00188 AAGCA 0.001 AAGCC 0.000339 AAGCG 0.000637 AAGCT 0.000766 AAGGA 0.00115 AAGGC 0.000394 AAGGG 0.000435 AAGGT 0.000705 AAGTA 0.00182 AAGTC 0.000652 AAGTG 0.000876 AAGTT 0.00171 AATAA 0.00495 AATAC 0.00198 AATAG 0.00153 AATAT 0.00535 AATCA 0.00176 AATCC 0.00071 AATCG 0.00148 AATCT 0.00159 AATGA 0.00214 AATGC 0.00101 AATGG 0.000872 AATGT 0.00228 AATTA 0.00433 AATTC 0.00217 AATTG 0.00209 AATTT 0.00541 ACAAA 0.00263 ACAAC 0.000936 ACAAG 0.00097 ACAAT 0.00214 ACACA 0.00121 ACACC 0.000408 ACACG 0.000943 ACACT 0.000752 ACAGA 0.00111 ACAGC 0.000532 ACAGG 0.000477 ACAGT 0.000939 ACATA 0.00227 ACATC 0.0009 ACATG 0.00093 ACATT 0.00228 ACCAA 0.000776 ACCAC 0.000452 ACCAG 0.000407 ACCAT 0.000713 ACCCA 0.000253 ACCCC 0.000155 ACCCG 0.000187 ACCCT 0.000301 ACCGA 0.000614 ACCGC 0.000338 ACCGG 0.000284 ACCGT 0.000555 ACCTA 0.000535 ACCTC 0.000373 ACCTG 0.000371 ACCTT 0.000705 ACGAA 0.00182 ACGAC 0.000693 ACGAG 0.000873 ACGAT 0.00165 ACGCA 0.000688 ACGCC 0.000278 ACGCG 0.000805 ACGCT 0.000598 ACGGA 0.000564 ACGGC 0.000293 ACGGG 0.000248 ACGGT 0.000555 ACGTA 0.00136 ACGTC 0.000626 ACGTG 0.000893 ACGTT 0.00144 ACTAA 0.00117 ACTAC 0.000676 ACTAG 0.00048 ACTAT 0.00133 ACTCA 0.00052 ACTCC 0.000303 ACTCG 0.000695 ACTCT 0.000694 ACTGA 0.000789 ACTGC 0.000492 ACTGG 0.000402 ACTGT 0.000939 ACTTA 0.00125 ACTTC 0.000921 ACTTG 0.00083 ACTTT 0.00206 AGAAA 0.00335 AGAAC 0.00095 AGAAG 0.00122 AGAAT 0.00203 AGACA 0.000832 AGACC 0.000258 AGACG 0.000553 AGACT 0.000546 AGAGA 0.00144 AGAGC 0.000412 AGAGG 0.000552 AGAGT 0.000694 AGATA 0.00183 AGATC 0.000766 AGATG 0.000809 AGATT 0.00159 AGCAA 0.00103 AGCAC 0.000436 AGCAG 0.000507 AGCAT 0.000783 AGCCA 0.000419 AGCCC 0.000142 AGCCG 0.000297 AGCCT 0.000298 AGCGA 0.000725 AGCGC 0.000312 AGCGG 0.000302 AGCGT 0.000598 AGCTA 0.000584 AGCTC 0.000358 AGCTG 0.00046 AGCTT 0.000766 AGGAA 0.00136 AGGAC 0.000355 AGGAG 0.000476 AGGAT 0.000767 AGGCA 0.000422 AGGCC 0.000152 AGGCG 0.000286 AGGCT 0.000298 AGGGA 0.000492 AGGGC 0.000169 AGGGG 0.000233 AGGGT 0.000301 AGGTA 0.000682 AGGTC 0.000297 AGGTG 0.00039 AGGTT 0.000614 AGTAA 0.00161 AGTAC 0.000753 AGTAG 0.000668 AGTAT 0.00152 AGTCA 0.000672 AGTCC 0.000243 AGTCG 0.000536 AGTCT 0.000546 AGTGA 0.000793 AGTGC 0.000404 AGTGG 0.000428 AGTGT 0.000752 AGTTA 0.0013 AGTTC 0.000772 AGTTG 0.00079 AGTTT 0.00176 ATAAA 0.00524 ATAAC 0.00171 ATAAG 0.00143 ATAAT 0.0045 ATACA 0.00257 ATACC 0.000713 ATACG 0.00126 ATACT 0.00152 ATAGA 0.0017 ATAGC 0.000743 ATAGG 0.000595 ATAGT 0.00133 ATATA 0.00591 ATATC 0.00207 ATATG 0.00207 ATATT 0.00535 ATCAA 0.00178 ATCAC 0.000904 ATCAG 0.000792 ATCAT 0.00176 ATCCA 0.000748 ATCCC 0.000349 ATCCG 0.000476 ATCCT 0.000767 ATCGA 0.00186 ATCGC 0.000824 ATCGG 0.000584 ATCGT 0.00165 ATCTA 0.00136 ATCTC 0.000927 ATCTG 0.000822 ATCTT 0.00188 ATGAA 0.00233 ATGAC 0.000786 ATGAG 0.000634 ATGAT 0.00176 ATGCA 0.00121 ATGCC 0.00037 ATGCG 0.000607 ATGCT 0.000783 ATGGA 0.000915 ATGGC 0.000457 ATGGG 0.000303 ATGGT 0.000713 ATGTA 0.00259 ATGTC 0.000787 ATGTG 0.000931 ATGTT 0.00207 ATTAA 0.00397 ATTAC 0.00194 ATTAG 0.00127 ATTAT 0.0045 ATTCA 0.00192 ATTCC 0.000982 ATTCG 0.00147 ATTCT 0.00203 ATTGA 0.00178 ATTGC 0.00112 ATTGG 0.000767 ATTGT 0.00214 ATTTA 0.00453 ATTTC 0.00297 ATTTG 0.00222 ATTTT 0.00603 CAAAA 0.00233 CAAAC 0.00109 CAAAG 0.0011 CAAAT 0.00222 CAACA 0.000988 CAACC 0.000421 CAACG 0.00081 CAACT 0.00079 CAAGA 0.000936 CAAGC 0.000486 CAAGG 0.000454 CAAGT 0.00083 CAATA 0.00182 CAATC 0.000876 CAATG 0.00102 CAATT 0.00209 CACAA 0.00094 CACAC 0.000666 CACAG 0.000537 CACAT 0.000931 CACCA 0.000427 CACCC 0.000226 CACCG 0.000399 CACCT 0.00039 CACGA 0.000923 CACGC 0.000555 CACGG 0.000391 CACGT 0.000893 CACTA 0.000543 CACTC 0.000432 CACTG 0.000525 CACTT 0.000876 CAGAA 0.0011 CAGAC 0.000407 CAGAG 0.000534 CAGAT 0.000822 CAGCA 0.000504 CAGCC 0.000288 CAGCG 0.000401 CAGCT 0.00046 CAGGA 0.000474 CAGGC 0.000247 CAGGG 0.000213 CAGGT 0.000371 CAGTA 0.000748 CAGTC 0.000444 CAGTG 0.000525 CAGTT 0.000904 CATAA 0.00174 CATAC 0.00096 CATAG 0.000668 CATAT 0.00207 CATCA 0.000786 CATCC 0.00044 CATCG 0.000888 CATCT 0.000809 CATGA 0.000775 CATGC 0.000504 CATGG 0.000398 CATGT 0.00093 CATTA 0.00164 CATTC 0.00111 CATTG 0.00102 CATTT 0.00253 CCAAA 0.000809 CCAAC 0.000469 CCAAG 0.000386 CCAAT 0.000767 CCACA 0.000361 CCACC 0.00032 CCACG 0.000463 CCACT 0.000428 CCAGA 0.000381 CCAGC 0.000287 CCAGG 0.000214 CCAGT 0.000402 CCATA 0.000635 CCATC 0.000484 CCATG 0.000398 CCATT 0.000872 CCCAA 0.000274 CCCAC 0.000205 CCCAG 0.00015 CCCAT 0.000303 CCCCA 0.000156 CCCCC 0.000139 CCCCG 0.000146 CCCCT 0.000233 CCCGA 0.000236 CCCGC 0.000158 CCCGG 0.000123 CCCGT 0.000248 CCCTA 0.000234 CCCTC 0.000314 CCCTG 0.000213 CCCTT 0.000435 CCGAA 0.00054 CCGAC 0.000302 CCGAG 0.000325 CCGAT 0.000584 CCGCA 0.000263 CCGCC 0.000197 CCGCG 0.000369 CCGCT 0.000302 CCGGA 0.000235 CCGGC 0.0002 CCGGG 0.000123 CCGGT 0.000284 CCGTA 0.000406 CCGTC 0.000292 CCGTG 0.000391 CCGTT 0.00057 CCTAA 0.000506 CCTAC 0.000338 CCTAG 0.000215 CCTAT 0.000595 CCTCA 0.000287 CCTCC 0.000328 CCTCG 0.000483 CCTCT 0.000552 CCTGA 0.000341 CCTGC 0.000273 CCTGG 0.000214 CCTGT 0.000477 CCTTA 0.000549 CCTTC 0.000623 CCTTG 0.000454 CCTTT 0.00106 CGAAA 0.00182 CGAAC 0.000884 CGAAG 0.000887 CGAAT 0.00147 CGACA 0.000663 CGACC 0.000372 CGACG 0.000711 CGACT 0.000536 CGAGA 0.000866 CGAGC 0.000531 CGAGG 0.000483 CGAGT 0.000695 CGATA 0.00154 CGATC 0.00101 CGATG 0.000888 CGATT 0.00148 CGCAA 0.00071 CGCAC 0.000396 CGCAG 0.000378 CGCAT 0.000607 CGCCA 0.000379 CGCCC 0.000149 CGCCG 0.000293 CGCCT 0.000286 CGCGA 0.000846 CGCGC 0.000523 CGCGG 0.000369 CGCGT 0.000805 CGCTA 0.000486 CGCTC 0.000412 CGCTG 0.000401 CGCTT 0.000637 CGGAA 0.000634 CGGAC 0.000266 CGGAG 0.000317 CGGAT 0.000476 CGGCA 0.000333 CGGCC 0.000209 CGGCG 0.000293 CGGCT 0.000297 CGGGA 0.00029 CGGGC 0.000142 CGGGG 0.000146 CGGGT 0.000187 CGGTA 0.000524 CGGTC 0.000323 CGGTG 0.000399 CGGTT 0.000546 CGTAA 0.00124 CGTAC 0.000728 CGTAG 0.000551 CGTAT 0.00126 CGTCA 0.000596 CGTCC 0.000362 CGTCG 0.000711 CGTCT 0.000553 CGTGA 0.00081 CGTGC 0.000545 CGTGG 0.000463 CGTGT 0.000943 CGTTA 0.00117 CGTTC 0.000988 CGTTG 0.00081 CGTTT 0.00166 CTAAA 0.00133 CTAAC 0.000621 CTAAG 0.000445 CTAAT 0.00127 CTACA 0.00075 CTACC 0.000364 CTACG 0.000551 CTACT 0.000668 CTAGA 0.000544 CTAGC 0.000286 CTAGG 0.000215 CTAGT 0.00048 CTATA 0.00138 CTATC 0.000786 CTATG 0.000668 CTATT 0.00153 CTCAA 0.000652 CTCAC 0.000387 CTCAG 0.000284 CTCAT 0.000634 CTCCA 0.000418 CTCCC 0.000266 CTCCG 0.000317 CTCCT 0.000476 CTCGA 0.000879 CTCGC 0.000499 CTCGG 0.000325 CTCGT 0.000873 CTCTA 0.000628 CTCTC 0.000831 CTCTG 0.000534 CTCTT 0.00111 CTGAA 0.000905 CTGAC 0.000409 CTGAG 0.000284 CTGAT 0.000792 CTGCA 0.000539 CTGCC 0.00029 CTGCG 0.000378 CTGCT 0.000507 CTGGA 0.000437 CTGGC 0.00029 CTGGG 0.00015 CTGGT 0.000407 CTGTA 0.000949 CTGTC 0.00052 CTGTG 0.000537 CTGTT 0.00105 CTTAA 0.00132 CTTAC 0.000736 CTTAG 0.000445 CTTAT 0.00143 CTTCA 0.00087 CTTCC 0.000692 CTTCG 0.000887 CTTCT 0.00122 CTTGA 0.0008 CTTGC 0.000551 CTTGG 0.000386 CTTGT 0.00097 CTTTA 0.00159 CTTTC 0.0016 CTTTG 0.0011 CTTTT 0.00264 GAAAA 0.00345 GAAAC 0.00166 GAAAG 0.0016 GAAAT 0.00297 GAACA 0.00118 GAACC 0.000416 GAACG 0.000988 GAACT 0.000772 GAAGA 0.00149 GAAGC 0.00063 GAAGG 0.000623 GAAGT 0.000921 GAATA 0.00208 GAATC 0.00105 GAATG 0.00111 GAATT 0.00217 GACAA 0.00102 GACAC 0.000549 GACAG 0.00052 GACAT 0.000787 GACCA 0.000382 GACCC 0.000145 GACCG 0.000323 GACCT 0.000297 GACGA 0.000889 GACGC 0.000415 GACGG 0.000292 GACGT 0.000626 GACTA 0.000538 GACTC 0.000363 GACTG 0.000444 GACTT 0.000652 GAGAA 0.0015 GAGAC 0.000485 GAGAG 0.000831 GAGAT 0.000927 GAGCA 0.000517 GAGCC 0.00022 GAGCG 0.000412 GAGCT 0.000358 GAGGA 0.000688 GAGGC 0.000275 GAGGG 0.000314 GAGGT 0.000373 GAGTA 0.00071 GAGTC 0.000363 GAGTG 0.000432 GAGTT 0.000706 GATAA 0.00203 GATAC 0.00106 GATAG 0.000786 GATAT 0.00207 GATCA 0.00088 GATCC 0.000421 GATCG 0.00101 GATCT 0.000766 GATGA 0.000991 GATGC 0.000548 GATGG 0.000484 GATGT 0.0009 GATTA 0.00159 GATTC 0.00105 GATTG 0.000876 GATTT 0.00203 GCAAA 0.0013 GCAAC 0.000691 GCAAG 0.000551 GCAAT 0.00112 GCACA 0.000596 GCACC 0.000253 GCACG 0.000545 GCACT 0.000404 GCAGA 0.000574 GCAGC 0.000377 GCAGG 0.000273 GCAGT 0.000492 GCATA 0.000912 GCATC 0.000548 GCATG 0.000504 GCATT 0.00101 GCCAA 0.000471 GCCAC 0.000349 GCCAG 0.00029 GCCAT 0.000457 GCCCA 0.000152 GCCCC 0.000115 GCCCG 0.000142 GCCCT 0.000169 GCCGA 0.000363 GCCGC 0.000276 GCCGG 0.0002 GCCGT 0.000293 GCCTA 0.000242 GCCTC 0.000275 GCCTG 0.000247 GCCTT 0.000394 GCGAA 0.000921 GCGAC 0.000463 GCGAG 0.000499 GCGAT 0.000824 GCGCA 0.000415 GCGCC 0.000221 GCGCG 0.000523 GCGCT 0.000312 GCGGA 0.000357 GCGGC 0.000276 GCGGG 0.000158 GCGGT 0.000338 GCGTA 0.000644 GCGTC 0.000415 GCGTG 0.000555 GCGTT 0.000756 GCTAA 0.000626 GCTAC 0.00045 GCTAG 0.000286 GCTAT 0.000743 GCTCA 0.000316 GCTCC 0.000249 GCTCG 0.000531 GCTCT 0.000412 GCTGA 0.000457 GCTGC 0.000377 GCTGG 0.000287 GCTGT 0.000532 GCTTA 0.000617 GCTTC 0.00063 GCTTG 0.000486 GCTTT 0.00101 GGAAA 0.0016 GGAAC 0.000588 GGAAG 0.000692 GGAAT 0.000982 GGACA 0.000444 GGACC 0.000166 GGACG 0.000362 GGACT 0.000243 GGAGA 0.000598 GGAGC 0.000249 GGAGG 0.000328 GGAGT 0.000303 GGATA 0.000769 GGATC 0.000421 GGATG 0.00044 GGATT 0.00071 GGCAA 0.000529 GGCAC 0.000275 GGCAG 0.00029 GGCAT 0.00037 GGCCA 0.00025 GGCCC 9.74e-05 GGCCG 0.000209 GGCCT 0.000152 GGCGA 0.000411 GGCGC 0.000221 GGCGG 0.000197 GGCGT 0.000278 GGCTA 0.000308 GGCTC 0.00022 GGCTG 0.000288 GGCTT 0.000339 GGGAA 0.000598 GGGAC 0.000206 GGGAG 0.000266 GGGAT 0.000349 GGGCA 0.000191 GGGCC 9.74e-05 GGGCG 0.000149 GGGCT 0.000142 GGGGA 0.000265 GGGGC 0.000115 GGGGG 0.000139 GGGGT 0.000155 GGGTA 0.000254 GGGTC 0.000145 GGGTG 0.000226 GGGTT 0.000271 GGTAA 0.000748 GGTAC 0.000404 GGTAG 0.000364 GGTAT 0.000713 GGTCA 0.000351 GGTCC 0.000166 GGTCG 0.000372 GGTCT 0.000258 GGTGA 0.00046 GGTGC 0.000253 GGTGG 0.00032 GGTGT 0.000408 GGTTA 0.000624 GGTTC 0.000416 GGTTG 0.000421 GGTTT 0.000739 GTAAA 0.00216 GTAAC 0.00104 GTAAG 0.000736 GTAAT 0.00194 GTACA 0.00129 GTACC 0.000404 GTACG 0.000728 GTACT 0.000753 GTAGA 0.000869 GTAGC 0.00045 GTAGG 0.000338 GTAGT 0.000676 GTATA 0.00207 GTATC 0.00106 GTATG 0.00096 GTATT 0.00198 GTCAA 0.00082 GTCAC 0.00054 GTCAG 0.000409 GTCAT 0.000786 GTCCA 0.000387 GTCCC 0.000206 GTCCG 0.000266 GTCCT 0.000355 GTCGA 0.000825 GTCGC 0.000463 GTCGG 0.000302 GTCGT 0.000693 GTCTA 0.000557 GTCTC 0.000485 GTCTG 0.000407 GTCTT 0.00074 GTGAA 0.00114 GTGAC 0.00054 GTGAG 0.000387 GTGAT 0.000904 GTGCA 0.000692 GTGCC 0.000275 GTGCG 0.000396 GTGCT 0.000436 GTGGA 0.000564 GTGGC 0.000349 GTGGG 0.000205 GTGGT 0.000452 GTGTA 0.00108 GTGTC 0.000549 GTGTG 0.000666 GTGTT 0.00102 GTTAA 0.0016 GTTAC 0.00104 GTTAG 0.000621 GTTAT 0.00171 GTTCA 0.000928 GTTCC 0.000588 GTTCG 0.000884 GTTCT 0.00095 GTTGA 0.000914 GTTGC 0.000691 GTTGG 0.000469 GTTGT 0.000936 GTTTA 0.00173 GTTTC 0.00166 GTTTG 0.00109 GTTTT 0.0022 TAAAA 0.0051 TAAAC 0.00173 TAAAG 0.00159 TAAAT 0.00453 TAACA 0.00188 TAACC 0.000624 TAACG 0.00117 TAACT 0.0013 TAAGA 0.00151 TAAGC 0.000617 TAAGG 0.000549 TAAGT 0.00125 TAATA 0.00412 TAATC 0.00159 TAATG 0.00164 TAATT 0.00433 TACAA 0.00228 TACAC 0.00108 TACAG 0.000949 TACAT 0.00259 TACCA 0.00077 TACCC 0.000254 TACCG 0.000524 TACCT 0.000682 TACGA 0.00136 TACGC 0.000644 TACGG 0.000406 TACGT 0.00136 TACTA 0.00127 TACTC 0.00071 TACTG 0.000748 TACTT 0.00182 TAGAA 0.00193 TAGAC 0.000557 TAGAG 0.000628 TAGAT 0.00136 TAGCA 0.000728 TAGCC 0.000308 TAGCG 0.000486 TAGCT 0.000584 TAGGA 0.000645 TAGGC 0.000242 TAGGG 0.000234 TAGGT 0.000535 TAGTA 0.00127 TAGTC 0.000538 TAGTG 0.000543 TAGTT 0.0013 TATAA 0.00416 TATAC 0.00207 TATAG 0.00138 TATAT 0.00591 TATCA 0.00181 TATCC 0.000769 TATCG 0.00154 TATCT 0.00183 TATGA 0.00161 TATGC 0.000912 TATGG 0.000635 TATGT 0.00227 TATTA 0.00412 TATTC 0.00208 TATTG 0.00182 TATTT 0.00579 TCAAA 0.00201 TCAAC 0.000914 TCAAG 0.0008 TCAAT 0.00178 TCACA 0.000908 TCACC 0.00046 TCACG 0.00081 TCACT 0.000793 TCAGA 0.000803 TCAGC 0.000457 TCAGG 0.000341 TCAGT 0.000789 TCATA 0.00161 TCATC 0.000991 TCATG 0.000775 TCATT 0.00214 TCCAA 0.000909 TCCAC 0.000564 TCCAG 0.000437 TCCAT 0.000915 TCCCA 0.000371 TCCCC 0.000265 TCCCG 0.00029 TCCCT 0.000492 TCCGA 0.000538 TCCGC 0.000357 TCCGG 0.000235 TCCGT 0.000564 TCCTA 0.000645 TCCTC 0.000688 TCCTG 0.000474 TCCTT 0.00115 TCGAA 0.00177 TCGAC 0.000825 TCGAG 0.000879 TCGAT 0.00186 TCGCA 0.000725 TCGCC 0.000411 TCGCG 0.000846 TCGCT 0.000725 TCGGA 0.000538 TCGGC 0.000363 TCGGG 0.000236 TCGGT 0.000614 TCGTA 0.00136 TCGTC 0.000889 TCGTG 0.000923 TCGTT 0.00186 TCTAA 0.00137 TCTAC 0.000869 TCTAG 0.000544 TCTAT 0.0017 TCTCA 0.000835 TCTCC 0.000598 TCTCG 0.000866 TCTCT 0.00144 TCTGA 0.000803 TCTGC 0.000574 TCTGG 0.000381 TCTGT 0.00111 TCTTA 0.00151 TCTTC 0.00149 TCTTG 0.000936 TCTTT 0.0028 TGAAA 0.00291 TGAAC 0.000928 TGAAG 0.00087 TGAAT 0.00192 TGACA 0.000937 TGACC 0.000351 TGACG 0.000596 TGACT 0.000672 TGAGA 0.000835 TGAGC 0.000316 TGAGG 0.000287 TGAGT 0.00052 TGATA 0.00181 TGATC 0.00088 TGATG 0.000786 TGATT 0.00176 TGCAA 0.00139 TGCAC 0.000692 TGCAG 0.000539 TGCAT 0.00121 TGCCA 0.000519 TGCCC 0.000191 TGCCG 0.000333 TGCCT 0.000422 TGCGA 0.000725 TGCGC 0.000415 TGCGG 0.000263 TGCGT 0.000688 TGCTA 0.000728 TGCTC 0.000517 TGCTG 0.000504 TGCTT 0.001 TGGAA 0.00127 TGGAC 0.000387 TGGAG 0.000418 TGGAT 0.000748 TGGCA 0.000519 TGGCC 0.00025 TGGCG 0.000379 TGGCT 0.000419 TGGGA 0.000371 TGGGC 0.000152 TGGGG 0.000156 TGGGT 0.000253 TGGTA 0.00077 TGGTC 0.000382 TGGTG 0.000427 TGGTT 0.000769 TGTAA 0.00228 TGTAC 0.00129 TGTAG 0.00075 TGTAT 0.00257 TGTCA 0.000937 TGTCC 0.000444 TGTCG 0.000663 TGTCT 0.000832 TGTGA 0.000908 TGTGC 0.000596 TGTGG 0.000361 TGTGT 0.00121 TGTTA 0.00188 TGTTC 0.00118 TGTTG 0.000988 TGTTT 0.00253 TTAAA 0.00424 TTAAC 0.0016 TTAAG 0.00132 TTAAT 0.00397 TTACA 0.00228 TTACC 0.000748 TTACG 0.00124 TTACT 0.00161 TTAGA 0.00137 TTAGC 0.000626 TTAGG 0.000506 TTAGT 0.00117 TTATA 0.00416 TTATC 0.00203 TTATG 0.00174 TTATT 0.00495 TTCAA 0.00226 TTCAC 0.00114 TTCAG 0.000905 TTCAT 0.00233 TTCCA 0.00127 TTCCC 0.000598 TTCCG 0.000634 TTCCT 0.00136 TTCGA 0.00177 TTCGC 0.000921 TTCGG 0.00054 TTCGT 0.00182 TTCTA 0.00193 TTCTC 0.0015 TTCTG 0.0011 TTCTT 0.00302 TTGAA 0.00226 TTGAC 0.00082 TTGAG 0.000652 TTGAT 0.00178 TTGCA 0.00139 TTGCC 0.000529 TTGCG 0.00071 TTGCT 0.00103 TTGGA 0.000909 TTGGC 0.000471 TTGGG 0.000274 TTGGT 0.000776 TTGTA 0.00228 TTGTC 0.00102 TTGTG 0.00094 TTGTT 0.00243 TTTAA 0.00424 TTTAC 0.00216 TTTAG 0.00133 TTTAT 0.00524 TTTCA 0.00291 TTTCC 0.0016 TTTCG 0.00182 TTTCT 0.00335 TTTGA 0.00201 TTTGC 0.0013 TTTGG 0.000809 TTTGT 0.00263 TTTTA 0.0051 TTTTC 0.00345 TTTTG 0.00233 TTTTT 0.0062 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [5] # (a,c,g,t)= (0.3, 0.2, 0.2, 0.3) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.326 C 0.174 G 0.174 T 0.326 # l= 1 # Values AA 0.117 AC 0.0542 AG 0.0478 AT 0.107 CA 0.0532 CC 0.0264 CG 0.0471 CT 0.0478 GA 0.0606 GC 0.0331 GG 0.0264 GT 0.0543 TA 0.095 TC 0.0606 TG 0.0532 TT 0.117 # l= 2 # Values AAA 0.0442 AAC 0.0183 AAG 0.0173 AAT 0.0371 ACA 0.0186 ACC 0.00754 ACG 0.0149 ACT 0.0132 AGA 0.0182 AGC 0.00859 AGG 0.00783 AGT 0.0132 ATA 0.0353 ATC 0.0179 ATG 0.0165 ATT 0.0371 CAA 0.0179 CAC 0.0101 CAG 0.00876 CAT 0.0165 CCA 0.00812 CCC 0.00407 CCG 0.00635 CCT 0.00783 CGA 0.0168 CGC 0.00901 CGG 0.00635 CGT 0.0149 CTA 0.0116 CTC 0.0101 CTG 0.00876 CTT 0.0173 GAA 0.0237 GAC 0.00893 GAG 0.0101 GAT 0.0179 GCA 0.0105 GCC 0.00507 GCG 0.00901 GCT 0.00859 GGA 0.00968 GGC 0.00507 GGG 0.00407 GGT 0.00754 GTA 0.017 GTC 0.00893 GTG 0.0101 GTT 0.0183 TAA 0.0311 TAC 0.017 TAG 0.0116 TAT 0.0353 TCA 0.016 TCC 0.00968 TCG 0.0168 TCT 0.0182 TGA 0.016 TGC 0.0105 TGG 0.00812 TGT 0.0186 TTA 0.0311 TTC 0.0237 TTG 0.0179 TTT 0.0442 # l= 3 # Values AAAA 0.016 AAAC 0.0067 AAAG 0.00693 AAAT 0.0146 AACA 0.0063 AACC 0.00232 AACG 0.00517 AACT 0.00449 AAGA 0.00674 AAGC 0.00289 AAGG 0.00284 AAGT 0.00486 AATA 0.0125 AATC 0.00559 AATG 0.00595 AATT 0.013 ACAA 0.0063 ACAC 0.00336 ACAG 0.00309 ACAT 0.00586 ACCA 0.00243 ACCC 0.000996 ACCG 0.00208 ACCT 0.00204 ACGA 0.0056 ACGC 0.00274 ACGG 0.00191 ACGT 0.00465 ACTA 0.00342 ACTC 0.00233 ACTG 0.00259 ACTT 0.00486 AGAA 0.00759 AGAC 0.00229 AGAG 0.00337 AGAT 0.0049 AGCA 0.00279 AGCC 0.00131 AGCG 0.00222 AGCT 0.00228 AGGA 0.00315 AGGC 0.00128 AGGG 0.00135 AGGT 0.00205 AGTA 0.00428 AGTC 0.00208 AGTG 0.00237 AGTT 0.00449 ATAA 0.0117 ATAC 0.00574 ATAG 0.00417 ATAT 0.0137 ATCA 0.00501 ATCC 0.00249 ATCG 0.00549 ATCT 0.0049 ATGA 0.00521 ATGC 0.00296 ATGG 0.00245 ATGT 0.00586 ATTA 0.0107 ATTC 0.00638 ATTG 0.00547 ATTT 0.0146 CAAA 0.00649 CAAC 0.00314 CAAG 0.00276 CAAT 0.00547 CACA 0.00298 CACC 0.00161 CACG 0.0031 CACT 0.00237 CAGA 0.00294 CAGC 0.00182 CAGG 0.00141 CAGT 0.0026 CATA 0.00496 CATC 0.00306 CATG 0.0025 CATT 0.00595 CCAA 0.00251 CCAC 0.00174 CCAG 0.00142 CCAT 0.00245 CCCA 0.001 CCCC 0.000797 CCCG 0.000924 CCCT 0.00135 CCGA 0.00204 CCGC 0.00137 CCGG 0.00102 CCGT 0.00191 CCTA 0.00168 CCTC 0.00189 CCTG 0.00141 CCTT 0.00284 CGAA 0.00561 CGAC 0.00267 CGAG 0.00306 CGAT 0.00548 CGCA 0.0023 CGCC 0.00133 CGCG 0.00316 CGCT 0.00222 CGGA 0.00196 CGGC 0.00139 CGGG 0.000924 CGGT 0.00208 CGTA 0.00403 CGTC 0.00259 CGTG 0.00311 CGTT 0.00517 CTAA 0.00352 CTAC 0.00239 CTAG 0.00154 CTAT 0.00417 CTCA 0.00195 CTCC 0.00168 CTCG 0.00306 CTCT 0.00337 CTGA 0.00241 CTGC 0.00184 CTGG 0.00142 CTGT 0.00309 CTTA 0.00374 CTTC 0.00391 CTTG 0.00276 CTTT 0.00693 GAAA 0.00984 GAAC 0.00359 GAAG 0.00391 GAAT 0.00638 GACA 0.00297 GACC 0.0013 GACG 0.00259 GACT 0.00208 GAGA 0.00412 GAGC 0.00172 GAGG 0.00189 GAGT 0.00233 GATA 0.00588 GATC 0.00336 GATG 0.00306 GATT 0.00559 GCAA 0.00375 GCAC 0.00193 GCAG 0.00184 GCAT 0.00296 GCCA 0.00173 GCCC 0.000671 GCCG 0.00139 GCCT 0.00128 GCGA 0.00317 GCGC 0.00173 GCGG 0.00137 GCGT 0.00274 GCTA 0.00217 GCTC 0.00172 GCTG 0.00182 GCTT 0.00289 GGAA 0.00414 GGAC 0.00137 GGAG 0.00168 GGAT 0.00249 GGCA 0.0016 GGCC 0.000839 GGCG 0.00133 GGCT 0.00131 GGGA 0.00161 GGGC 0.00067 GGGG 0.000797 GGGT 0.000996 GGTA 0.00232 GGTC 0.0013 GGTG 0.00161 GGTT 0.00232 GTAA 0.00568 GTAC 0.00318 GTAG 0.00239 GTAT 0.00574 GTCA 0.00261 GTCC 0.00137 GTCG 0.00267 GTCT 0.00229 GTGA 0.00303 GTGC 0.00193 GTGG 0.00174 GTGT 0.00336 GTTA 0.00483 GTTC 0.00359 GTTG 0.00314 GTTT 0.0067 TAAA 0.0119 TAAC 0.00483 TAAG 0.00374 TAAT 0.0107 TACA 0.00637 TACC 0.00232 TACG 0.00403 TACT 0.00428 TAGA 0.00435 TAGC 0.00217 TAGG 0.00168 TAGT 0.00342 TATA 0.0119 TATC 0.00589 TATG 0.00496 TATT 0.0125 TCAA 0.0053 TCAC 0.00303 TCAG 0.00241 TCAT 0.00521 TCCA 0.00296 TCCC 0.00161 TCCG 0.00196 TCCT 0.00315 TCGA 0.00601 TCGC 0.00317 TCGG 0.00204 TCGT 0.0056 TCTA 0.00435 TCTC 0.00412 TCTG 0.00294 TCTT 0.00675 TGAA 0.00638 TGAC 0.00261 TGAG 0.00195 TGAT 0.00501 TGCA 0.00379 TGCC 0.0016 TGCG 0.0023 TGCT 0.00279 TGGA 0.00296 TGGC 0.00173 TGGG 0.001 TGGT 0.00242 TGTA 0.00637 TGTC 0.00296 TGTG 0.00298 TGTT 0.0063 TTAA 0.0102 TTAC 0.00568 TTAG 0.00352 TTAT 0.0117 TTCA 0.00638 TTCC 0.00414 TTCG 0.00561 TTCT 0.00759 TTGA 0.0053 TTGC 0.00375 TTGG 0.00251 TTGT 0.0063 TTTA 0.0119 TTTC 0.00984 TTTG 0.00649 TTTT 0.016 # l= 4 # Values AAAAA 0.00577 AAAAC 0.00214 AAAAG 0.00259 AAAAT 0.00552 AAACA 0.00241 AAACC 0.000767 AAACG 0.00183 AAACT 0.00169 AAAGA 0.00279 AAAGC 0.00105 AAAGG 0.00112 AAAGT 0.00198 AAATA 0.00522 AAATC 0.00202 AAATG 0.00236 AAATT 0.00496 AACAA 0.00231 AACAC 0.00103 AACAG 0.00106 AACAT 0.0019 AACCA 0.000784 AACCC 0.000295 AACCG 0.000624 AACCT 0.000616 AACGA 0.00208 AACGC 0.000872 AACGG 0.000654 AACGT 0.00156 AACTA 0.00122 AACTC 0.000737 AACTG 0.000891 AACTT 0.00164 AAGAA 0.003 AAGAC 0.000748 AAGAG 0.00118 AAGAT 0.00182 AAGCA 0.001 AAGCC 0.00037 AAGCG 0.00072 AAGCT 0.000794 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.000424 AAGGG 0.000489 AAGGT 0.00072 AAGTA 0.0017 AAGTC 0.00066 AAGTG 0.000859 AAGTT 0.00164 AATAA 0.00447 AATAC 0.00186 AATAG 0.00145 AATAT 0.00473 AATCA 0.00168 AATCC 0.00075 AATCG 0.00161 AATCT 0.00154 AATGA 0.002 AATGC 0.000983 AATGG 0.000882 AATGT 0.00209 AATTA 0.00396 AATTC 0.00213 AATTG 0.00198 AATTT 0.00496 ACAAA 0.00245 ACAAC 0.000938 ACAAG 0.000955 ACAAT 0.00195 ACACA 0.00115 ACACC 0.000443 ACACG 0.00104 ACACT 0.000729 ACAGA 0.00112 ACAGC 0.000559 ACAGG 0.000502 ACAGT 0.000911 ACATA 0.00201 ACATC 0.0009 ACATG 0.000857 ACATT 0.00209 ACCAA 0.000787 ACCAC 0.000486 ACCAG 0.000441 ACCAT 0.000711 ACCCA 0.000263 ACCCC 0.000181 ACCCG 0.00022 ACCCT 0.000332 ACCGA 0.000707 ACCGC 0.000401 ACCGG 0.000339 ACCGT 0.000629 ACCTA 0.000529 ACCTC 0.000407 ACCTG 0.000389 ACCTT 0.00072 ACGAA 0.00198 ACGAC 0.000794 ACGAG 0.00102 ACGAT 0.0018 ACGCA 0.000742 ACGCC 0.000328 ACGCG 0.000994 ACGCT 0.000671 ACGGA 0.000638 ACGGC 0.000353 ACGGG 0.000295 ACGGT 0.000629 ACGTA 0.00142 ACGTC 0.000702 ACGTG 0.000963 ACGTT 0.00156 ACTAA 0.00108 ACTAC 0.000658 ACTAG 0.000465 ACTAT 0.00122 ACTCA 0.000496 ACTCC 0.000326 ACTCG 0.000799 ACTCT 0.000713 ACTGA 0.000764 ACTGC 0.000496 ACTGG 0.000424 ACTGT 0.000911 ACTTA 0.00115 ACTTC 0.000914 ACTTG 0.000819 ACTTT 0.00198 AGAAA 0.00335 AGAAC 0.000988 AGAAG 0.00128 AGAAT 0.00197 AGACA 0.000836 AGACC 0.000281 AGACG 0.000625 AGACT 0.000547 AGAGA 0.00159 AGAGC 0.000452 AGAGG 0.000621 AGAGT 0.000713 AGATA 0.00175 AGATC 0.000801 AGATG 0.00081 AGATT 0.00154 AGCAA 0.00104 AGCAC 0.000451 AGCAG 0.000537 AGCAT 0.000765 AGCCA 0.000461 AGCCC 0.000162 AGCCG 0.00036 AGCCT 0.000324 AGCGA 0.000836 AGCGC 0.000355 AGCGG 0.000357 AGCGT 0.000671 AGCTA 0.000594 AGCTC 0.000395 AGCTG 0.000494 AGCTT 0.000794 AGGAA 0.00143 AGGAC 0.00039 AGGAG 0.000534 AGGAT 0.000799 AGGCA 0.000447 AGGCC 0.000172 AGGCG 0.000339 AGGCT 0.000324 AGGGA 0.000555 AGGGC 0.000188 AGGGG 0.000272 AGGGT 0.000332 AGGTA 0.000692 AGGTC 0.000317 AGGTG 0.000421 AGGTT 0.000616 AGTAA 0.0015 AGTAC 0.000722 AGTAG 0.000654 AGTAT 0.0014 AGTCA 0.000664 AGTCC 0.00026 AGTCG 0.000609 AGTCT 0.000547 AGTGA 0.000777 AGTGC 0.00041 AGTGG 0.000455 AGTGT 0.000729 AGTTA 0.00122 AGTTC 0.000778 AGTTG 0.000793 AGTTT 0.00169 ATAAA 0.00472 ATAAC 0.00161 ATAAG 0.00132 ATAAT 0.00402 ATACA 0.00232 ATACC 0.000717 ATACG 0.0013 ATACT 0.0014 ATAGA 0.00162 ATAGC 0.000747 ATAGG 0.00059 ATAGT 0.00122 ATATA 0.00513 ATATC 0.00199 ATATG 0.00184 ATATT 0.00473 ATCAA 0.00169 ATCAC 0.0009 ATCAG 0.000782 ATCAT 0.00164 ATCCA 0.000769 ATCCC 0.000385 ATCCG 0.000538 ATCCT 0.000799 ATCGA 0.00206 ATCGC 0.000945 ATCGG 0.000679 ATCGT 0.0018 ATCTA 0.00129 ATCTC 0.000972 ATCTG 0.000824 ATCTT 0.00182 ATGAA 0.00218 ATGAC 0.000774 ATGAG 0.000613 ATGAT 0.00164 ATGCA 0.00116 ATGCC 0.000386 ATGCG 0.00065 ATGCT 0.000765 ATGGA 0.000938 ATGGC 0.00048 ATGGG 0.000317 ATGGT 0.000711 ATGTA 0.00232 ATGTC 0.000771 ATGTG 0.000868 ATGTT 0.0019 ATTAA 0.00361 ATTAC 0.00182 ATTAG 0.00121 ATTAT 0.00402 ATTCA 0.00181 ATTCC 0.00102 ATTCG 0.00159 ATTCT 0.00197 ATTGA 0.00165 ATTGC 0.00109 ATTGG 0.000768 ATTGT 0.00195 ATTTA 0.00407 ATTTC 0.0029 ATTTG 0.00207 ATTTT 0.00552 CAAAA 0.00218 CAAAC 0.00111 CAAAG 0.00112 CAAAT 0.00207 CAACA 0.000967 CAACC 0.000458 CAACG 0.000923 CAACT 0.000793 CAAGA 0.000942 CAAGC 0.000518 CAAGG 0.000482 CAAGT 0.000819 CAATA 0.00164 CAATC 0.000884 CAATG 0.000972 CAATT 0.00198 CACAA 0.000885 CACAC 0.000673 CACAG 0.00055 CACAT 0.000868 CACCA 0.000453 CACCC 0.000262 CACCG 0.000477 CACCT 0.000421 CACGA 0.00103 CACGC 0.000647 CACGG 0.000464 CACGT 0.000963 CACTA 0.000508 CACTC 0.000469 CACTG 0.000535 CACTT 0.000859 CAGAA 0.0011 CAGAC 0.000437 CAGAG 0.00058 CAGAT 0.000824 CAGCA 0.00052 CAGCC 0.000335 CAGCG 0.000468 CAGCT 0.000494 CAGGA 0.000505 CAGGC 0.000281 CAGGG 0.000239 CAGGT 0.000389 CAGTA 0.0007 CAGTC 0.000469 CAGTG 0.000535 CAGTT 0.000891 CATAA 0.00158 CATAC 0.000899 CATAG 0.000642 CATAT 0.00184 CATCA 0.000759 CATCC 0.000475 CATCG 0.00101 CATCT 0.00081 CATGA 0.00073 CATGC 0.000505 CATGG 0.000413 CATGT 0.000857 CATTA 0.00151 CATTC 0.00111 CATTG 0.000972 CATTT 0.00236 CCAAA 0.000808 CCAAC 0.000517 CCAAG 0.000419 CCAAT 0.000768 CCACA 0.000367 CCACC 0.000378 CCACG 0.000539 CCACT 0.000455 CCAGA 0.000412 CCAGC 0.000336 CCAGG 0.000248 CCAGT 0.000424 CCATA 0.000622 CCATC 0.000529 CCATG 0.000413 CCATT 0.000882 CCCAA 0.000286 CCCAC 0.000232 CCCAG 0.000168 CCCAT 0.000317 CCCCA 0.000171 CCCCC 0.000167 CCCCG 0.000188 CCCCT 0.000272 CCCGA 0.000281 CCCGC 0.000195 CCCGG 0.000153 CCCGT 0.000295 CCCTA 0.000243 CCCTC 0.000376 CCCTG 0.000239 CCCTT 0.000489 CCGAA 0.000605 CCGAC 0.000362 CCGAG 0.000393 CCGAT 0.000679 CCGCA 0.000298 CCGCC 0.000244 CCGCG 0.000471 CCGCT 0.000357 CCGGA 0.000277 CCGGC 0.000254 CCGGG 0.000153 CCGGT 0.000339 CCGTA 0.000448 CCGTC 0.000348 CCGTG 0.000464 CCGTT 0.000654 CCTAA 0.000503 CCTAC 0.000361 CCTAG 0.000223 CCTAT 0.00059 CCTCA 0.000293 CCTCC 0.000389 CCTCG 0.00059 CCTCT 0.000621 CCTGA 0.000359 CCTGC 0.000304 CCTGG 0.000248 CCTGT 0.000502 CCTTA 0.000539 CCTTC 0.000702 CCTTG 0.000482 CCTTT 0.00112 CGAAA 0.00198 CGAAC 0.00103 CGAAG 0.00101 CGAAT 0.00159 CGACA 0.000734 CGACC 0.000449 CGACG 0.000874 CGACT 0.000609 CGAGA 0.00102 CGAGC 0.000654 CGAGG 0.00059 CGAGT 0.000799 CGATA 0.00167 CGATC 0.00119 CGATG 0.00101 CGATT 0.00161 CGCAA 0.000775 CGCAC 0.000447 CGCAG 0.000428 CGCAT 0.00065 CGCCA 0.000438 CGCCC 0.000179 CGCCG 0.00037 CGCCT 0.000339 CGCGA 0.00105 CGCGC 0.000648 CGCGG 0.000471 CGCGT 0.000994 CGCTA 0.000534 CGCTC 0.000497 CGCTG 0.000468 CGCTT 0.00072 CGGAA 0.000723 CGGAC 0.00032 CGGAG 0.000379 CGGAT 0.000538 CGGCA 0.000394 CGGCC 0.000264 CGGCG 0.00037 CGGCT 0.00036 CGGGA 0.000342 CGGGC 0.000175 CGGGG 0.000188 CGGGT 0.00022 CGGTA 0.000588 CGGTC 0.000388 CGGTG 0.000477 CGGTT 0.000624 CGTAA 0.00131 CGTAC 0.0008 CGTAG 0.000617 CGTAT 0.0013 CGTCA 0.000653 CGTCC 0.000437 CGTCG 0.000874 CGTCT 0.000625 CGTGA 0.000891 CGTGC 0.000632 CGTGG 0.000539 CGTGT 0.00104 CGTTA 0.00126 CGTTC 0.00115 CGTTG 0.000923 CGTTT 0.00183 CTAAA 0.00125 CTAAC 0.000624 CTAAG 0.000434 CTAAT 0.00121 CTACA 0.000718 CTACC 0.000398 CTACG 0.000617 CTACT 0.000654 CTAGA 0.000548 CTAGC 0.000303 CTAGG 0.000223 CTAGT 0.000465 CTATA 0.00127 CTATC 0.00081 CTATG 0.000642 CTATT 0.00145 CTCAA 0.000635 CTCAC 0.000408 CTCAG 0.000295 CTCAT 0.000613 CTCCA 0.000452 CTCCC 0.000317 CTCCG 0.000379 CTCCT 0.000534 CTCGA 0.00103 CTCGC 0.000611 CTCGG 0.000393 CTCGT 0.00102 CTCTA 0.000636 CTCTC 0.000976 CTCTG 0.00058 CTCTT 0.00118 CTGAA 0.000903 CTGAC 0.000433 CTGAG 0.000295 CTGAT 0.000782 CTGCA 0.000549 CTGCC 0.000327 CTGCG 0.000428 CTGCT 0.000537 CTGGA 0.000475 CTGGC 0.000337 CTGGG 0.000168 CTGGT 0.000441 CTGTA 0.000918 CTGTC 0.000564 CTGTG 0.00055 CTGTT 0.00106 CTTAA 0.00125 CTTAC 0.000729 CTTAG 0.000434 CTTAT 0.00132 CTTCA 0.000847 CTTCC 0.000761 CTTCG 0.00101 CTTCT 0.00128 CTTGA 0.000802 CTTGC 0.000586 CTTGG 0.000419 CTTGT 0.000955 CTTTA 0.00151 CTTTC 0.00171 CTTTG 0.00112 CTTTT 0.00259 GAAAA 0.00345 GAAAC 0.00178 GAAAG 0.00171 GAAAT 0.0029 GAACA 0.0012 GAACC 0.000465 GAACG 0.00115 GAACT 0.000778 GAAGA 0.00159 GAAGC 0.000698 GAAGG 0.000702 GAAGT 0.000914 GAATA 0.00201 GAATC 0.00113 GAATG 0.00111 GAATT 0.00213 GACAA 0.00104 GACAC 0.000593 GACAG 0.000564 GACAT 0.000771 GACCA 0.000423 GACCC 0.000168 GACCG 0.000388 GACCT 0.000317 GACGA 0.00104 GACGC 0.000498 GACGG 0.000348 GACGT 0.000702 GACTA 0.000546 GACTC 0.000405 GACTG 0.000469 GACTT 0.00066 GAGAA 0.00163 GAGAC 0.000547 GAGAG 0.000976 GAGAT 0.000972 GAGCA 0.000563 GAGCC 0.000264 GAGCG 0.000497 GAGCT 0.000395 GAGGA 0.000785 GAGGC 0.000324 GAGGG 0.000376 GAGGT 0.000407 GAGTA 0.000724 GAGTC 0.000405 GAGTG 0.000469 GAGTT 0.000737 GATAA 0.002 GATAC 0.00109 GATAG 0.00081 GATAT 0.00199 GATCA 0.000895 GATCC 0.000476 GATCG 0.00119 GATCT 0.000801 GATGA 0.00103 GATGC 0.000598 GATGG 0.000529 GATGT 0.0009 GATTA 0.00156 GATTC 0.00113 GATTG 0.000884 GATTT 0.00202 GCAAA 0.00132 GCAAC 0.000751 GCAAG 0.000586 GCAAT 0.00109 GCACA 0.000597 GCACC 0.000288 GCACG 0.000632 GCACT 0.00041 GCAGA 0.000611 GCAGC 0.00043 GCAGG 0.000304 GCAGT 0.000496 GCATA 0.000875 GCATC 0.000598 GCATG 0.000505 GCATT 0.000983 GCCAA 0.000508 GCCAC 0.000406 GCCAG 0.000337 GCCAT 0.00048 GCCCA 0.000166 GCCCC 0.000141 GCCCG 0.000175 GCCCT 0.000188 GCCGA 0.000435 GCCGC 0.000346 GCCGG 0.000254 GCCGT 0.000353 GCCTA 0.000253 GCCTC 0.000324 GCCTG 0.000281 GCCTT 0.000424 GCGAA 0.00106 GCGAC 0.000558 GCGAG 0.000611 GCGAT 0.000945 GCGCA 0.000464 GCGCC 0.000262 GCGCG 0.000648 GCGCT 0.000355 GCGGA 0.000428 GCGGC 0.000346 GCGGG 0.000195 GCGGT 0.000401 GCGTA 0.000719 GCGTC 0.000498 GCGTG 0.000647 GCGTT 0.000872 GCTAA 0.000637 GCTAC 0.000484 GCTAG 0.000303 GCTAT 0.000747 GCTCA 0.000326 GCTCC 0.000288 GCTCG 0.000654 GCTCT 0.000452 GCTGA 0.000491 GCTGC 0.00043 GCTGG 0.000336 GCTGT 0.000559 GCTTA 0.000618 GCTTC 0.000698 GCTTG 0.000518 GCTTT 0.00105 GGAAA 0.00171 GGAAC 0.000651 GGAAG 0.000761 GGAAT 0.00102 GGACA 0.000479 GGACC 0.000192 GGACG 0.000437 GGACT 0.00026 GGAGA 0.00068 GGAGC 0.000288 GGAGG 0.000389 GGAGT 0.000326 GGATA 0.00079 GGATC 0.000476 GGATG 0.000475 GGATT 0.00075 GGCAA 0.000575 GGCAC 0.00031 GGCAG 0.000327 GGCAT 0.000386 GGCCA 0.000288 GGCCC 0.000115 GGCCG 0.000264 GGCCT 0.000172 GGCGA 0.000492 GGCGC 0.000262 GGCGG 0.000244 GGCGT 0.000328 GGCTA 0.000338 GGCTC 0.000264 GGCTG 0.000335 GGCTT 0.00037 GGGAA 0.000667 GGGAC 0.00024 GGGAG 0.000317 GGGAT 0.000385 GGGCA 0.000215 GGGCC 0.000115 GGGCG 0.000179 GGGCT 0.000162 GGGGA 0.000308 GGGGC 0.000141 GGGGG 0.000167 GGGGT 0.000181 GGGTA 0.000271 GGGTC 0.000168 GGGTG 0.000262 GGGTT 0.000295 GGTAA 0.000774 GGTAC 0.000427 GGTAG 0.000398 GGTAT 0.000717 GGTCA 0.000373 GGTCC 0.000192 GGTCG 0.000449 GGTCT 0.000281 GGTGA 0.000501 GGTGC 0.000288 GGTGG 0.000378 GGTGT 0.000443 GGTTA 0.000629 GGTTC 0.000465 GGTTG 0.000458 GGTTT 0.000767 GTAAA 0.00208 GTAAC 0.00105 GTAAG 0.000729 GTAAT 0.00182 GTACA 0.00123 GTACC 0.000427 GTACG 0.0008 GTACT 0.000722 GTAGA 0.000885 GTAGC 0.000484 GTAGG 0.000361 GTAGT 0.000658 GTATA 0.0019 GTATC 0.00109 GTATG 0.000899 GTATT 0.00186 GTCAA 0.000826 GTCAC 0.000573 GTCAG 0.000433 GTCAT 0.000774 GTCCA 0.000417 GTCCC 0.00024 GTCCG 0.00032 GTCCT 0.00039 GTCGA 0.000953 GTCGC 0.000558 GTCGG 0.000362 GTCGT 0.000794 GTCTA 0.000558 GTCTC 0.000547 GTCTG 0.000437 GTCTT 0.000748 GTGAA 0.00115 GTGAC 0.000573 GTGAG 0.000408 GTGAT 0.0009 GTGCA 0.00072 GTGCC 0.00031 GTGCG 0.000447 GTGCT 0.000451 GTGGA 0.000616 GTGGC 0.000406 GTGGG 0.000232 GTGGT 0.000486 GTGTA 0.00106 GTGTC 0.000593 GTGTG 0.000673 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.00155 GTTAC 0.00105 GTTAG 0.000624 GTTAT 0.00161 GTTCA 0.000926 GTTCC 0.000651 GTTCG 0.00103 GTTCT 0.000988 GTTGA 0.000935 GTTGC 0.000751 GTTGG 0.000517 GTTGT 0.000938 GTTTA 0.00167 GTTTC 0.00178 GTTTG 0.00111 GTTTT 0.00214 TAAAA 0.00461 TAAAC 0.00167 TAAAG 0.00151 TAAAT 0.00407 TAACA 0.00173 TAACC 0.000629 TAACG 0.00126 TAACT 0.00122 TAAGA 0.00142 TAAGC 0.000618 TAAGG 0.000539 TAAGT 0.00115 TAATA 0.00364 TAATC 0.00156 TAATG 0.00151 TAATT 0.00396 TACAA 0.00207 TACAC 0.00106 TACAG 0.000918 TACAT 0.00232 TACCA 0.000766 TACCC 0.000271 TACCG 0.000588 TACCT 0.000692 TACGA 0.00145 TACGC 0.000719 TACGG 0.000448 TACGT 0.00142 TACTA 0.00115 TACTC 0.000724 TACTG 0.0007 TACTT 0.0017 TAGAA 0.00187 TAGAC 0.000558 TAGAG 0.000636 TAGAT 0.00129 TAGCA 0.000704 TAGCC 0.000338 TAGCG 0.000534 TAGCT 0.000594 TAGGA 0.000653 TAGGC 0.000253 TAGGG 0.000243 TAGGT 0.000529 TAGTA 0.00115 TAGTC 0.000546 TAGTG 0.000508 TAGTT 0.00122 TATAA 0.00361 TATAC 0.0019 TATAG 0.00127 TATAT 0.00513 TATCA 0.00168 TATCC 0.00079 TATCG 0.00167 TATCT 0.00175 TATGA 0.00145 TATGC 0.000875 TATGG 0.000622 TATGT 0.00201 TATTA 0.00364 TATTC 0.00201 TATTG 0.00164 TATTT 0.00522 TCAAA 0.00191 TCAAC 0.000935 TCAAG 0.000802 TCAAT 0.00165 TCACA 0.000865 TCACC 0.000501 TCACG 0.000891 TCACT 0.000777 TCAGA 0.000799 TCAGC 0.000491 TCAGG 0.000359 TCAGT 0.000764 TCATA 0.00145 TCATC 0.00103 TCATG 0.00073 TCATT 0.002 TCCAA 0.00093 TCCAC 0.000616 TCCAG 0.000475 TCCAT 0.000938 TCCCA 0.000402 TCCCC 0.000308 TCCCG 0.000342 TCCCT 0.000555 TCCGA 0.000617 TCCGC 0.000428 TCCGG 0.000277 TCCGT 0.000638 TCCTA 0.000653 TCCTC 0.000785 TCCTG 0.000505 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.00196 TCGAC 0.000953 TCGAG 0.00103 TCGAT 0.00206 TCGCA 0.000796 TCGCC 0.000492 TCGCG 0.00105 TCGCT 0.000836 TCGGA 0.000617 TCGGC 0.000435 TCGGG 0.000281 TCGGT 0.000707 TCGTA 0.00145 TCGTC 0.00104 TCGTG 0.00103 TCGTT 0.00208 TCTAA 0.0013 TCTAC 0.000885 TCTAG 0.000548 TCTAT 0.00162 TCTCA 0.000836 TCTCC 0.00068 TCTCG 0.00102 TCTCT 0.00159 TCTGA 0.000799 TCTGC 0.000611 TCTGG 0.000412 TCTGT 0.00112 TCTTA 0.00142 TCTTC 0.00159 TCTTG 0.000942 TCTTT 0.00279 TGAAA 0.0028 TGAAC 0.000926 TGAAG 0.000847 TGAAT 0.00181 TGACA 0.000917 TGACC 0.000373 TGACG 0.000653 TGACT 0.000664 TGAGA 0.000836 TGAGC 0.000326 TGAGG 0.000293 TGAGT 0.000496 TGATA 0.00168 TGATC 0.000895 TGATG 0.000759 TGATT 0.00168 TGCAA 0.00136 TGCAC 0.00072 TGCAG 0.000549 TGCAT 0.00116 TGCCA 0.000543 TGCCC 0.000215 TGCCG 0.000394 TGCCT 0.000447 TGCGA 0.000796 TGCGC 0.000464 TGCGG 0.000298 TGCGT 0.000742 TGCTA 0.000704 TGCTC 0.000563 TGCTG 0.00052 TGCTT 0.001 TGGAA 0.00132 TGGAC 0.000417 TGGAG 0.000452 TGGAT 0.000769 TGGCA 0.000543 TGGCC 0.000288 TGGCG 0.000438 TGGCT 0.000461 TGGGA 0.000402 TGGGC 0.000166 TGGGG 0.000171 TGGGT 0.000263 TGGTA 0.000766 TGGTC 0.000423 TGGTG 0.000453 TGGTT 0.000784 TGTAA 0.00209 TGTAC 0.00123 TGTAG 0.000718 TGTAT 0.00232 TGTCA 0.000917 TGTCC 0.000479 TGTCG 0.000734 TGTCT 0.000836 TGTGA 0.000865 TGTGC 0.000597 TGTGG 0.000367 TGTGT 0.00115 TGTTA 0.00173 TGTTC 0.0012 TGTTG 0.000967 TGTTT 0.00241 TTAAA 0.00382 TTAAC 0.00155 TTAAG 0.00125 TTAAT 0.00361 TTACA 0.00209 TTACC 0.000774 TTACG 0.00131 TTACT 0.0015 TTAGA 0.0013 TTAGC 0.000637 TTAGG 0.000503 TTAGT 0.00108 TTATA 0.00361 TTATC 0.002 TTATG 0.00158 TTATT 0.00447 TTCAA 0.00215 TTCAC 0.00115 TTCAG 0.000903 TTCAT 0.00218 TTCCA 0.00132 TTCCC 0.000667 TTCCG 0.000723 TTCCT 0.00143 TTCGA 0.00196 TTCGC 0.00106 TTCGG 0.000605 TTCGT 0.00198 TTCTA 0.00187 TTCTC 0.00163 TTCTG 0.0011 TTCTT 0.003 TTGAA 0.00215 TTGAC 0.000826 TTGAG 0.000635 TTGAT 0.00169 TTGCA 0.00136 TTGCC 0.000575 TTGCG 0.000775 TTGCT 0.00104 TTGGA 0.00093 TTGGC 0.000508 TTGGG 0.000286 TTGGT 0.000787 TTGTA 0.00207 TTGTC 0.00104 TTGTG 0.000885 TTGTT 0.00231 TTTAA 0.00382 TTTAC 0.00208 TTTAG 0.00125 TTTAT 0.00472 TTTCA 0.0028 TTTCC 0.00171 TTTCG 0.00198 TTTCT 0.00335 TTTGA 0.00191 TTTGC 0.00132 TTTGG 0.000808 TTTGT 0.00245 TTTTA 0.00461 TTTTC 0.00345 TTTTG 0.00218 TTTTT 0.00577 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [6] # (a,c,g,t)= (0.275, 0.225, 0.225, 0.275) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.318 C 0.182 G 0.182 T 0.318 # l= 1 # Values AA 0.113 AC 0.0549 AG 0.0486 AT 0.101 CA 0.0524 CC 0.0286 CG 0.0526 CT 0.0486 GA 0.0627 GC 0.0359 GG 0.0286 GT 0.0549 TA 0.0897 TC 0.0627 TG 0.0524 TT 0.113 # l= 2 # Values AAA 0.0423 AAC 0.0184 AAG 0.0173 AAT 0.0349 ACA 0.0178 ACC 0.00799 ACG 0.0162 ACT 0.0129 AGA 0.0184 AGC 0.0091 AGG 0.00828 AGT 0.0129 ATA 0.0326 ATC 0.0181 ATG 0.0157 ATT 0.0349 CAA 0.0174 CAC 0.0103 CAG 0.00895 CAT 0.0157 CCA 0.00845 CCC 0.00456 CCG 0.00734 CCT 0.00828 CGA 0.0186 CGC 0.0104 CGG 0.00734 CGT 0.0162 CTA 0.0113 CTC 0.011 CTG 0.00895 CTT 0.0173 GAA 0.0241 GAC 0.00953 GAG 0.011 GAT 0.0181 GCA 0.0107 GCC 0.00572 GCG 0.0104 GCT 0.0091 GGA 0.0104 GGC 0.00572 GGG 0.00456 GGT 0.00799 GTA 0.0166 GTC 0.00953 GTG 0.0103 GTT 0.0184 TAA 0.0292 TAC 0.0166 TAG 0.0113 TAT 0.0326 TCA 0.0154 TCC 0.0104 TCG 0.0186 TCT 0.0184 TGA 0.0154 TGC 0.0107 TGG 0.00845 TGT 0.0178 TTA 0.0292 TTC 0.0241 TTG 0.0174 TTT 0.0423 # l= 3 # Values AAAA 0.0151 AAAC 0.00669 AAAG 0.0069 AAAT 0.0136 AACA 0.00604 AACC 0.00242 AACG 0.00562 AACT 0.00436 AAGA 0.00669 AAGC 0.003 AAGG 0.00297 AAGT 0.00467 AATA 0.0115 AATC 0.00558 AATG 0.00562 AATT 0.0122 ACAA 0.00596 ACAC 0.00338 ACAG 0.00307 ACAT 0.00542 ACCA 0.00247 ACCC 0.00109 ACCG 0.00235 ACCT 0.00209 ACGA 0.00606 ACGC 0.0031 ACGG 0.00216 ACGT 0.00486 ACTA 0.00322 ACTC 0.00244 ACTG 0.00253 ACTT 0.00467 AGAA 0.00757 AGAC 0.00236 AGAG 0.00365 AGAT 0.00478 AGCA 0.0028 AGCC 0.00145 AGCG 0.0025 AGCT 0.00235 AGGA 0.00331 AGGC 0.0014 AGGG 0.00149 AGGT 0.00209 AGTA 0.00404 AGTC 0.00213 AGTG 0.00233 AGTT 0.00436 ATAA 0.0108 ATAC 0.00546 ATAG 0.00399 ATAT 0.0124 ATCA 0.00477 ATCC 0.00261 ATCG 0.00594 ATCT 0.00478 ATGA 0.00491 ATGC 0.00292 ATGG 0.00246 ATGT 0.00542 ATTA 0.00986 ATTC 0.00631 ATTG 0.00515 ATTT 0.0136 CAAA 0.00623 CAAC 0.00324 CAAG 0.00277 CAAT 0.00515 CACA 0.00285 CACC 0.00177 CACG 0.00339 CACT 0.00233 CAGA 0.00295 CAGC 0.00196 CAGG 0.0015 CAGT 0.00253 CATA 0.00457 CATC 0.00314 CATG 0.00238 CATT 0.00562 CCAA 0.00256 CCAC 0.00189 CCAG 0.00154 CCAT 0.00246 CCCA 0.00105 CCCC 0.000928 CCCG 0.00109 CCCT 0.00149 CCGA 0.00232 CCGC 0.00164 CCGG 0.00122 CCGT 0.00216 CCTA 0.00168 CCTC 0.00214 CCTG 0.0015 CCTT 0.00297 CGAA 0.00608 CGAC 0.00304 CGAG 0.00356 CGAT 0.00594 CGCA 0.00247 CGCC 0.00156 CGCG 0.0039 CGCT 0.0025 CGGA 0.00222 CGGC 0.00168 CGGG 0.00109 CGGT 0.00235 CGTA 0.00421 CGTC 0.00296 CGTG 0.00339 CGTT 0.00562 CTAA 0.00336 CTAC 0.00242 CTAG 0.00155 CTAT 0.00399 CTCA 0.00192 CTCC 0.00188 CTCG 0.00356 CTCT 0.00365 CTGA 0.00239 CTGC 0.00195 CTGG 0.00154 CTGT 0.00307 CTTA 0.00356 CTTC 0.0041 CTTG 0.00277 CTTT 0.0069 GAAA 0.00991 GAAC 0.0038 GAAG 0.0041 GAAT 0.00631 GACA 0.003 GACC 0.00143 GACG 0.00296 GACT 0.00213 GAGA 0.00451 GAGC 0.00192 GAGG 0.00214 GAGT 0.00244 GATA 0.00578 GATC 0.00361 GATG 0.00314 GATT 0.00558 GCAA 0.0038 GCAC 0.00203 GCAG 0.00195 GCAT 0.00292 GCCA 0.00187 GCCC 0.000767 GCCG 0.00168 GCCT 0.0014 GCGA 0.00366 GCGC 0.00203 GCGG 0.00164 GCGT 0.0031 GCTA 0.00222 GCTC 0.00192 GCTG 0.00196 GCTT 0.003 GGAA 0.00436 GGAC 0.00152 GGAG 0.00188 GGAT 0.00261 GGCA 0.00173 GGCC 0.000977 GGCG 0.00156 GGCT 0.00145 GGGA 0.00178 GGGC 0.000767 GGGG 0.000928 GGGT 0.00109 GGTA 0.00238 GGTC 0.00143 GGTG 0.00177 GGTT 0.00242 GTAA 0.0055 GTAC 0.00318 GTAG 0.00242 GTAT 0.00546 GTCA 0.00261 GTCC 0.00152 GTCG 0.00304 GTCT 0.00236 GTGA 0.00304 GTGC 0.00203 GTGG 0.00189 GTGT 0.00338 GTTA 0.0047 GTTC 0.0038 GTTG 0.00324 GTTT 0.00669 TAAA 0.011 TAAC 0.0047 TAAG 0.00356 TAAT 0.00986 TACA 0.00594 TACC 0.00238 TACG 0.00421 TACT 0.00404 TAGA 0.0042 TAGC 0.00222 TAGG 0.00168 TAGT 0.00322 TATA 0.0107 TATC 0.00578 TATG 0.00457 TATT 0.0115 TCAA 0.00507 TCAC 0.00304 TCAG 0.00239 TCAT 0.00491 TCCA 0.00305 TCCC 0.00178 TCCG 0.00222 TCCT 0.00331 TCGA 0.00659 TCGC 0.00366 TCGG 0.00232 TCGT 0.00606 TCTA 0.0042 TCTC 0.00451 TCTG 0.00295 TCTT 0.0067 TGAA 0.00611 TGAC 0.00261 TGAG 0.00191 TGAT 0.00477 TGCA 0.0037 TGCC 0.00173 TGCG 0.00247 TGCT 0.0028 TGGA 0.00305 TGGC 0.00187 TGGG 0.00105 TGGT 0.00247 TGTA 0.00594 TGTC 0.003 TGTG 0.00285 TGTT 0.00604 TTAA 0.00953 TTAC 0.0055 TTAG 0.00336 TTAT 0.0108 TTCA 0.00611 TTCC 0.00436 TTCG 0.00608 TTCT 0.00757 TTGA 0.00507 TTGC 0.0038 TTGG 0.00256 TTGT 0.00596 TTTA 0.011 TTTC 0.00991 TTTG 0.00623 TTTT 0.0151 # l= 4 # Values AAAAA 0.0054 AAAAC 0.00208 AAAAG 0.00254 AAAAT 0.0051 AAACA 0.00229 AAACC 0.000786 AAACG 0.00197 AAACT 0.00165 AAAGA 0.00275 AAAGC 0.00109 AAAGG 0.00117 AAAGT 0.0019 AAATA 0.00478 AAATC 0.00199 AAATG 0.00221 AAATT 0.00461 AACAA 0.0022 AACAC 0.00103 AACAG 0.00104 AACAT 0.00176 AACCA 0.00079 AACCC 0.000313 AACCG 0.000698 AACCT 0.000617 AACGA 0.00225 AACGC 0.000986 AACGG 0.000735 AACGT 0.00165 AACTA 0.00115 AACTC 0.000758 AACTG 0.00087 AACTT 0.00158 AAGAA 0.00296 AAGAC 0.000746 AAGAG 0.00125 AAGAT 0.00175 AAGCA 0.000991 AAGCC 0.000398 AAGCG 0.000797 AAGCT 0.000813 AAGGA 0.00125 AAGGC 0.000447 AAGGG 0.00054 AAGGT 0.00073 AAGTA 0.0016 AAGTC 0.000656 AAGTG 0.00083 AAGTT 0.00158 AATAA 0.0041 AATAC 0.00175 AATAG 0.00138 AATAT 0.00427 AATCA 0.0016 AATCC 0.000777 AATCG 0.00171 AATCT 0.00149 AATGA 0.00186 AATGC 0.000951 AATGG 0.000878 AATGT 0.00193 AATTA 0.00366 AATTC 0.00208 AATTG 0.00186 AATTT 0.00461 ACAAA 0.0023 ACAAC 0.000929 ACAAG 0.000927 ACAAT 0.0018 ACACA 0.00108 ACACC 0.000473 ACACG 0.00112 ACACT 0.000704 ACAGA 0.0011 ACAGC 0.000581 ACAGG 0.000515 ACAGT 0.000871 ACATA 0.00181 ACATC 0.000893 ACATG 0.000788 ACATT 0.00193 ACCAA 0.000788 ACCAC 0.000511 ACCAG 0.00047 ACCAT 0.000705 ACCCA 0.00027 ACCCC 0.000208 ACCCG 0.000248 ACCCT 0.00036 ACCGA 0.000791 ACCGC 0.000468 ACCGG 0.000396 ACCGT 0.000695 ACCTA 0.00052 ACCTC 0.000438 ACCTG 0.0004 ACCTT 0.00073 ACGAA 0.00211 ACGAC 0.000887 ACGAG 0.00117 ACGAT 0.00189 ACGCA 0.000778 ACGCC 0.000378 ACGCG 0.00122 ACGCT 0.000729 ACGGA 0.000707 ACGGC 0.000421 ACGGG 0.000342 ACGGT 0.000695 ACGTA 0.00144 ACGTC 0.000772 ACGTG 0.001 ACGTT 0.00165 ACTAA 0.00101 ACTAC 0.000638 ACTAG 0.000452 ACTAT 0.00113 ACTCA 0.000471 ACTCC 0.000345 ACTCG 0.000897 ACTCT 0.000723 ACTGA 0.00073 ACTGC 0.000497 ACTGG 0.000437 ACTGT 0.000871 ACTTA 0.00107 ACTTC 0.000898 ACTTG 0.000801 ACTTT 0.0019 AGAAA 0.00332 AGAAC 0.00102 AGAAG 0.00134 AGAAT 0.00189 AGACA 0.000825 AGACC 0.000304 AGACG 0.000691 AGACT 0.000541 AGAGA 0.00175 AGAGC 0.000489 AGAGG 0.000689 AGAGT 0.000723 AGATA 0.00167 AGATC 0.000821 AGATG 0.000801 AGATT 0.00149 AGCAA 0.00104 AGCAC 0.000459 AGCAG 0.000565 AGCAT 0.000743 AGCCA 0.000494 AGCCC 0.00018 AGCCG 0.000427 AGCCT 0.000347 AGCGA 0.000943 AGCGC 0.000406 AGCGG 0.000417 AGCGT 0.000729 AGCTA 0.000601 AGCTC 0.000423 AGCTG 0.000517 AGCTT 0.000813 AGGAA 0.00147 AGGAC 0.000423 AGGAG 0.000593 AGGAT 0.000818 AGGCA 0.00047 AGGCC 0.000191 AGGCG 0.000393 AGGCT 0.000347 AGGGA 0.000613 AGGGC 0.000206 AGGGG 0.000311 AGGGT 0.00036 AGGTA 0.000696 AGGTC 0.00033 AGGTG 0.000444 AGGTT 0.000617 AGTAA 0.00141 AGTAC 0.000691 AGTAG 0.00064 AGTAT 0.0013 AGTCA 0.000645 AGTCC 0.000274 AGTCG 0.000672 AGTCT 0.000541 AGTGA 0.000746 AGTGC 0.000407 AGTGG 0.000476 AGTGT 0.000704 AGTTA 0.00115 AGTTC 0.000774 AGTTG 0.000788 AGTTT 0.00165 ATAAA 0.00435 ATAAC 0.00152 ATAAG 0.00123 ATAAT 0.00366 ATACA 0.00213 ATACC 0.000714 ATACG 0.00132 ATACT 0.0013 ATAGA 0.00154 ATAGC 0.000745 ATAGG 0.000577 ATAGT 0.00113 ATATA 0.00457 ATATC 0.0019 ATATG 0.00165 ATATT 0.00427 ATCAA 0.0016 ATCAC 0.000886 ATCAG 0.000759 ATCAT 0.00153 ATCCA 0.000783 ATCCC 0.000414 ATCCG 0.000598 ATCCT 0.000818 ATCGA 0.00222 ATCGC 0.00106 ATCGG 0.000768 ATCGT 0.00189 ATCTA 0.00121 ATCTC 0.00101 ATCTG 0.000812 ATCTT 0.00175 ATGAA 0.00204 ATGAC 0.000753 ATGAG 0.000588 ATGAT 0.00153 ATGCA 0.0011 ATGCC 0.000397 ATGCG 0.000681 ATGCT 0.000743 ATGGA 0.000946 ATGGC 0.000491 ATGGG 0.000321 ATGGT 0.000705 ATGTA 0.00211 ATGTC 0.00075 ATGTG 0.000804 ATGTT 0.00176 ATTAA 0.00333 ATTAC 0.00172 ATTAG 0.00115 ATTAT 0.00366 ATTCA 0.0017 ATTCC 0.00104 ATTCG 0.00167 ATTCT 0.00189 ATTGA 0.00154 ATTGC 0.00106 ATTGG 0.000754 ATTGT 0.0018 ATTTA 0.00372 ATTTC 0.00282 ATTTG 0.00194 ATTTT 0.0051 CAAAA 0.00205 CAAAC 0.00112 CAAAG 0.00113 CAAAT 0.00194 CAACA 0.000938 CAACC 0.000488 CAACG 0.00102 CAACT 0.000788 CAAGA 0.000934 CAAGC 0.000536 CAAGG 0.0005 CAAGT 0.000801 CAATA 0.0015 CAATC 0.000874 CAATG 0.000917 CAATT 0.00186 CACAA 0.000822 CACAC 0.000675 CACAG 0.000552 CACAT 0.000804 CACCA 0.00047 CACCC 0.000299 CACCG 0.000553 CACCT 0.000444 CACGA 0.00112 CACGC 0.000738 CACGG 0.000539 CACGT 0.001 CACTA 0.000476 CACTC 0.0005 CACTG 0.000528 CACTT 0.00083 CAGAA 0.00107 CAGAC 0.000456 CAGAG 0.000614 CAGAT 0.000812 CAGCA 0.000528 CAGCC 0.000381 CAGCG 0.000534 CAGCT 0.000517 CAGGA 0.000523 CAGGC 0.000314 CAGGG 0.000261 CAGGT 0.0004 CAGTA 0.000653 CAGTC 0.000484 CAGTG 0.000528 CAGTT 0.00087 CATAA 0.00147 CATAC 0.000839 CATAG 0.000612 CATAT 0.00165 CATCA 0.000726 CATCC 0.000504 CATCG 0.00111 CATCT 0.000801 CATGA 0.000679 CATGC 0.000497 CATGG 0.000418 CATGT 0.000788 CATTA 0.0014 CATTC 0.00109 CATTG 0.000917 CATTT 0.00221 CCAAA 0.0008 CCAAC 0.000565 CCAAG 0.000444 CCAAT 0.000754 CCACA 0.000365 CCACC 0.000438 CCACG 0.000612 CCACT 0.000476 CCAGA 0.000438 CCAGC 0.000382 CCAGG 0.000278 CCAGT 0.000437 CCATA 0.000604 CCATC 0.000563 CCATG 0.000418 CCATT 0.000878 CCCAA 0.000292 CCCAC 0.000257 CCCAG 0.000183 CCCAT 0.000321 CCCCA 0.000181 CCCCC 0.000201 CCCCG 0.000235 CCCCT 0.000311 CCCGA 0.000325 CCCGC 0.000238 CCCGG 0.000187 CCCGT 0.000342 CCCTA 0.000246 CCCTC 0.000442 CCCTG 0.000261 CCCTT 0.00054 CCGAA 0.000666 CCGAC 0.000424 CCGAG 0.000461 CCGAT 0.000768 CCGCA 0.00033 CCGCC 0.000299 CCGCG 0.000595 CCGCT 0.000417 CCGGA 0.000322 CCGGC 0.000314 CCGGG 0.000187 CCGGT 0.000396 CCGTA 0.000481 CCGTC 0.000409 CCGTG 0.000539 CCGTT 0.000735 CCTAA 0.000491 CCTAC 0.000381 CCTAG 0.000232 CCTAT 0.000577 CCTCA 0.000293 CCTCC 0.000455 CCTCG 0.000701 CCTCT 0.000689 CCTGA 0.000372 CCTGC 0.000333 CCTGG 0.000278 CCTGT 0.000515 CCTTA 0.000526 CCTTC 0.000775 CCTTG 0.0005 CCTTT 0.00117 CGAAA 0.00212 CGAAC 0.00117 CGAAG 0.00113 CGAAT 0.00167 CGACA 0.000789 CGACC 0.000525 CGACG 0.00105 CGACT 0.000672 CGAGA 0.00118 CGAGC 0.000781 CGAGG 0.000701 CGAGT 0.000897 CGATA 0.00175 CGATC 0.00137 CGATG 0.00111 CGATT 0.00171 CGCAA 0.000826 CGCAC 0.000492 CGCAG 0.000468 CGCAT 0.000681 CGCCA 0.000495 CGCCC 0.000213 CGCCG 0.000463 CGCCT 0.000393 CGCGA 0.00128 CGCGC 0.000805 CGCGG 0.000595 CGCGT 0.00122 CGCTA 0.000578 CGCTC 0.000587 CGCTG 0.000534 CGCTT 0.000797 CGGAA 0.000806 CGGAC 0.000377 CGGAG 0.000442 CGGAT 0.000598 CGGCA 0.000462 CGGCC 0.000327 CGGCG 0.000463 CGGCT 0.000427 CGGGA 0.000396 CGGGC 0.000214 CGGGG 0.000235 CGGGT 0.000248 CGGTA 0.000644 CGGTC 0.000454 CGGTG 0.000553 CGGTT 0.000698 CGTAA 0.00136 CGTAC 0.000857 CGTAG 0.000672 CGTAT 0.00132 CGTCA 0.000695 CGTCC 0.000521 CGTCG 0.00105 CGTCT 0.000691 CGTGA 0.000951 CGTGC 0.00071 CGTGG 0.000612 CGTGT 0.00112 CGTTA 0.00132 CGTTC 0.00131 CGTTG 0.00102 CGTTT 0.00197 CTAAA 0.00118 CTAAC 0.000623 CTAAG 0.000416 CTAAT 0.00115 CTACA 0.000682 CTACC 0.000431 CTACG 0.000672 CTACT 0.00064 CTAGA 0.000547 CTAGC 0.000319 CTAGG 0.000232 CTAGT 0.000452 CTATA 0.00118 CTATC 0.000825 CTATG 0.000612 CTATT 0.00138 CTCAA 0.000611 CTCAC 0.000416 CTCAG 0.000299 CTCAT 0.000588 CTCCA 0.000475 CTCCC 0.00037 CTCCG 0.000442 CTCCT 0.000593 CTCGA 0.00119 CTCGC 0.000741 CTCGG 0.000461 CTCGT 0.00117 CTCTA 0.000638 CTCTC 0.00115 CTCTG 0.000614 CTCTT 0.00125 CTGAA 0.000887 CTGAC 0.000444 CTGAG 0.000299 CTGAT 0.000759 CTGCA 0.000547 CTGCC 0.00037 CTGCG 0.000468 CTGCT 0.000565 CTGGA 0.000502 CTGGC 0.000382 CTGGG 0.000183 CTGGT 0.00047 CTGTA 0.00088 CTGTC 0.000595 CTGTG 0.000552 CTGTT 0.00104 CTTAA 0.00119 CTTAC 0.000716 CTTAG 0.000416 CTTAT 0.00123 CTTCA 0.000816 CTTCC 0.000822 CTTCG 0.00113 CTTCT 0.00134 CTTGA 0.000791 CTTGC 0.000609 CTTGG 0.000444 CTTGT 0.000927 CTTTA 0.00144 CTTTC 0.00178 CTTTG 0.00113 CTTTT 0.00254 GAAAA 0.00343 GAAAC 0.00187 GAAAG 0.00178 GAAAT 0.00282 GAACA 0.00121 GAACC 0.000513 GAACG 0.00131 GAACT 0.000774 GAAGA 0.00167 GAAGC 0.000762 GAAGG 0.000775 GAAGT 0.000898 GAATA 0.00194 GAATC 0.0012 GAATG 0.00109 GAATT 0.00208 GACAA 0.00104 GACAC 0.000622 GACAG 0.000595 GACAT 0.00075 GACCA 0.000459 GACCC 0.000189 GACCG 0.000454 GACCT 0.00033 GACGA 0.00119 GACGC 0.000587 GACGG 0.000409 GACGT 0.000772 GACTA 0.000545 GACTC 0.000447 GACTG 0.000484 GACTT 0.000656 GAGAA 0.00175 GAGAC 0.000605 GAGAG 0.00115 GAGAT 0.00101 GAGCA 0.000604 GAGCC 0.000306 GAGCG 0.000587 GAGCT 0.000423 GAGGA 0.000882 GAGGC 0.000375 GAGGG 0.000442 GAGGT 0.000438 GAGTA 0.000733 GAGTC 0.000447 GAGTG 0.0005 GAGTT 0.000758 GATAA 0.00196 GATAC 0.0011 GATAG 0.000825 GATAT 0.0019 GATCA 0.000889 GATCC 0.000529 GATCG 0.00137 GATCT 0.000821 GATGA 0.00105 GATGC 0.000639 GATGG 0.000563 GATGT 0.000893 GATTA 0.00152 GATTC 0.0012 GATTG 0.000874 GATTT 0.00199 GCAAA 0.00133 GCAAC 0.000804 GCAAG 0.000609 GCAAT 0.00106 GCACA 0.000591 GCACC 0.000323 GCACG 0.00071 GCACT 0.000407 GCAGA 0.000633 GCAGC 0.000487 GCAGG 0.000333 GCAGT 0.000497 GCATA 0.000835 GCATC 0.000639 GCATG 0.000497 GCATT 0.000951 GCCAA 0.000539 GCCAC 0.00046 GCCAG 0.000382 GCCAT 0.000491 GCCCA 0.000178 GCCCC 0.00017 GCCCG 0.000214 GCCCT 0.000206 GCCGA 0.000511 GCCGC 0.000434 GCCGG 0.000314 GCCGT 0.000421 GCCTA 0.000264 GCCTC 0.000375 GCCTG 0.000314 GCCTT 0.000447 GCGAA 0.00119 GCGAC 0.000662 GCGAG 0.000741 GCGAT 0.00106 GCGCA 0.000508 GCGCC 0.000306 GCGCG 0.000805 GCGCT 0.000406 GCGGA 0.000502 GCGGC 0.000434 GCGGG 0.000238 GCGGT 0.000468 GCGTA 0.00079 GCGTC 0.000587 GCGTG 0.000738 GCGTT 0.000986 GCTAA 0.00064 GCTAC 0.000518 GCTAG 0.000319 GCTAT 0.000745 GCTCA 0.000328 GCTCC 0.000321 GCTCG 0.000781 GCTCT 0.000489 GCTGA 0.00051 GCTGC 0.000487 GCTGG 0.000382 GCTGT 0.000581 GCTTA 0.000617 GCTTC 0.000762 GCTTG 0.000536 GCTTT 0.00109 GGAAA 0.00179 GGAAC 0.000707 GGAAG 0.000822 GGAAT 0.00104 GGACA 0.000503 GGACC 0.000218 GGACG 0.000521 GGACT 0.000274 GGAGA 0.00076 GGAGC 0.000321 GGAGG 0.000455 GGAGT 0.000345 GGATA 0.000803 GGATC 0.000529 GGATG 0.000504 GGATT 0.000777 GGCAA 0.000621 GGCAC 0.000341 GGCAG 0.00037 GGCAT 0.000397 GGCCA 0.000324 GGCCC 0.000135 GGCCG 0.000327 GGCCT 0.000191 GGCGA 0.000582 GGCGC 0.000306 GGCGG 0.000299 GGCGT 0.000378 GGCTA 0.000363 GGCTC 0.000306 GGCTG 0.000381 GGCTT 0.000398 GGGAA 0.000727 GGGAC 0.000272 GGGAG 0.00037 GGGAT 0.000414 GGGCA 0.000239 GGGCC 0.000135 GGGCG 0.000213 GGGCT 0.00018 GGGGA 0.00035 GGGGC 0.00017 GGGGG 0.000201 GGGGT 0.000208 GGGTA 0.000284 GGGTC 0.000189 GGGTG 0.000299 GGGTT 0.000313 GGTAA 0.000791 GGTAC 0.000445 GGTAG 0.000431 GGTAT 0.000714 GGTCA 0.000385 GGTCC 0.000218 GGTCG 0.000525 GGTCT 0.000304 GGTGA 0.000532 GGTGC 0.000323 GGTGG 0.000438 GGTGT 0.000473 GGTTA 0.00063 GGTTC 0.000513 GGTTG 0.000488 GGTTT 0.000786 GTAAA 0.002 GTAAC 0.00106 GTAAG 0.000716 GTAAT 0.00172 GTACA 0.00119 GTACC 0.000445 GTACG 0.000857 GTACT 0.000691 GTAGA 0.000886 GTAGC 0.000518 GTAGG 0.000381 GTAGT 0.000638 GTATA 0.00177 GTATC 0.0011 GTATG 0.000839 GTATT 0.00175 GTCAA 0.000823 GTCAC 0.000593 GTCAG 0.000444 GTCAT 0.000753 GTCCA 0.000444 GTCCC 0.000272 GTCCG 0.000377 GTCCT 0.000423 GTCGA 0.00107 GTCGC 0.000662 GTCGG 0.000424 GTCGT 0.000887 GTCTA 0.000552 GTCTC 0.000605 GTCTG 0.000456 GTCTT 0.000746 GTGAA 0.00115 GTGAC 0.000593 GTGAG 0.000416 GTGAT 0.000886 GTGCA 0.000738 GTGCC 0.000341 GTGCG 0.000492 GTGCT 0.000459 GTGGA 0.000663 GTGGC 0.00046 GTGGG 0.000257 GTGGT 0.000511 GTGTA 0.00105 GTGTC 0.000622 GTGTG 0.000675 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.00149 GTTAC 0.00106 GTTAG 0.000623 GTTAT 0.00152 GTTCA 0.000907 GTTCC 0.000707 GTTCG 0.00117 GTTCT 0.00102 GTTGA 0.00094 GTTGC 0.000804 GTTGG 0.000565 GTTGT 0.000929 GTTTA 0.00162 GTTTC 0.00187 GTTTG 0.00112 GTTTT 0.00208 TAAAA 0.00425 TAAAC 0.00162 TAAAG 0.00144 TAAAT 0.00372 TAACA 0.0016 TAACC 0.00063 TAACG 0.00132 TAACT 0.00115 TAAGA 0.00134 TAAGC 0.000617 TAAGG 0.000526 TAAGT 0.00107 TAATA 0.00328 TAATC 0.00152 TAATG 0.0014 TAATT 0.00366 TACAA 0.00191 TACAC 0.00105 TACAG 0.00088 TACAT 0.00211 TACCA 0.000755 TACCC 0.000284 TACCG 0.000644 TACCT 0.000696 TACGA 0.0015 TACGC 0.00079 TACGG 0.000481 TACGT 0.00144 TACTA 0.00105 TACTC 0.000733 TACTG 0.000653 TACTT 0.0016 TAGAA 0.0018 TAGAC 0.000552 TAGAG 0.000638 TAGAT 0.00121 TAGCA 0.00068 TAGCC 0.000363 TAGCG 0.000578 TAGCT 0.000601 TAGGA 0.000653 TAGGC 0.000264 TAGGG 0.000246 TAGGT 0.00052 TAGTA 0.00105 TAGTC 0.000545 TAGTG 0.000476 TAGTT 0.00115 TATAA 0.00323 TATAC 0.00177 TATAG 0.00118 TATAT 0.00457 TATCA 0.00156 TATCC 0.000803 TATCG 0.00175 TATCT 0.00167 TATGA 0.00132 TATGC 0.000835 TATGG 0.000604 TATGT 0.00181 TATTA 0.00328 TATTC 0.00194 TATTG 0.0015 TATTT 0.00478 TCAAA 0.0018 TCAAC 0.00094 TCAAG 0.000791 TCAAT 0.00154 TCACA 0.000814 TCACC 0.000532 TCACG 0.000951 TCACT 0.000746 TCAGA 0.000777 TCAGC 0.00051 TCAGG 0.000372 TCAGT 0.00073 TCATA 0.00132 TCATC 0.00105 TCATG 0.000679 TCATT 0.00186 TCCAA 0.000943 TCCAC 0.000663 TCCAG 0.000502 TCCAT 0.000946 TCCCA 0.000424 TCCCC 0.00035 TCCCG 0.000396 TCCCT 0.000613 TCCGA 0.000692 TCCGC 0.000502 TCCGG 0.000322 TCCGT 0.000707 TCCTA 0.000653 TCCTC 0.000882 TCCTG 0.000523 TCCTT 0.00125 TCGAA 0.00211 TCGAC 0.00107 TCGAG 0.00119 TCGAT 0.00222 TCGCA 0.000851 TCGCC 0.000582 TCGCG 0.00128 TCGCT 0.000943 TCGGA 0.000692 TCGGC 0.000511 TCGGG 0.000325 TCGGT 0.000791 TCGTA 0.0015 TCGTC 0.00119 TCGTG 0.00112 TCGTT 0.00225 TCTAA 0.00123 TCTAC 0.000886 TCTAG 0.000547 TCTAT 0.00154 TCTCA 0.000823 TCTCC 0.00076 TCTCG 0.00118 TCTCT 0.00175 TCTGA 0.000777 TCTGC 0.000633 TCTGG 0.000438 TCTGT 0.0011 TCTTA 0.00134 TCTTC 0.00167 TCTTG 0.000934 TCTTT 0.00275 TGAAA 0.00269 TGAAC 0.000907 TGAAG 0.000816 TGAAT 0.0017 TGACA 0.000887 TGACC 0.000385 TGACG 0.000695 TGACT 0.000645 TGAGA 0.000823 TGAGC 0.000328 TGAGG 0.000293 TGAGT 0.000471 TGATA 0.00156 TGATC 0.000889 TGATG 0.000726 TGATT 0.0016 TGCAA 0.00132 TGCAC 0.000738 TGCAG 0.000547 TGCAT 0.0011 TGCCA 0.000558 TGCCC 0.000239 TGCCG 0.000462 TGCCT 0.00047 TGCGA 0.000851 TGCGC 0.000508 TGCGG 0.00033 TGCGT 0.000778 TGCTA 0.00068 TGCTC 0.000604 TGCTG 0.000528 TGCTT 0.000991 TGGAA 0.00135 TGGAC 0.000444 TGGAG 0.000475 TGGAT 0.000783 TGGCA 0.000558 TGGCC 0.000324 TGGCG 0.000495 TGGCT 0.000494 TGGGA 0.000424 TGGGC 0.000178 TGGGG 0.000181 TGGGT 0.00027 TGGTA 0.000755 TGGTC 0.000459 TGGTG 0.00047 TGGTT 0.00079 TGTAA 0.00194 TGTAC 0.00119 TGTAG 0.000682 TGTAT 0.00213 TGTCA 0.000887 TGTCC 0.000503 TGTCG 0.000789 TGTCT 0.000825 TGTGA 0.000814 TGTGC 0.000591 TGTGG 0.000365 TGTGT 0.00108 TGTTA 0.0016 TGTTC 0.00121 TGTTG 0.000938 TGTTT 0.00229 TTAAA 0.00351 TTAAC 0.00149 TTAAG 0.00119 TTAAT 0.00333 TTACA 0.00194 TTACC 0.000791 TTACG 0.00136 TTACT 0.00141 TTAGA 0.00123 TTAGC 0.00064 TTAGG 0.000491 TTAGT 0.00101 TTATA 0.00323 TTATC 0.00196 TTATG 0.00147 TTATT 0.0041 TTCAA 0.00203 TTCAC 0.00115 TTCAG 0.000887 TTCAT 0.00204 TTCCA 0.00135 TTCCC 0.000727 TTCCG 0.000806 TTCCT 0.00147 TTCGA 0.00211 TTCGC 0.00119 TTCGG 0.000666 TTCGT 0.00211 TTCTA 0.0018 TTCTC 0.00175 TTCTG 0.00107 TTCTT 0.00296 TTGAA 0.00203 TTGAC 0.000823 TTGAG 0.000611 TTGAT 0.0016 TTGCA 0.00132 TTGCC 0.000621 TTGCG 0.000826 TTGCT 0.00104 TTGGA 0.000943 TTGGC 0.000539 TTGGG 0.000292 TTGGT 0.000788 TTGTA 0.00191 TTGTC 0.00104 TTGTG 0.000822 TTGTT 0.0022 TTTAA 0.00351 TTTAC 0.002 TTTAG 0.00118 TTTAT 0.00435 TTTCA 0.00269 TTTCC 0.00179 TTTCG 0.00212 TTTCT 0.00332 TTTGA 0.0018 TTTGC 0.00133 TTTGG 0.0008 TTTGT 0.0023 TTTTA 0.00425 TTTTC 0.00343 TTTTG 0.00205 TTTTT 0.0054 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682 [7] # (a,c,g,t)= (0.25, 0.25, 0.25, 0.25) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.317 C 0.183 G 0.183 T 0.317 # l= 1 # Values AA 0.113 AC 0.0547 AG 0.0484 AT 0.101 CA 0.0518 CC 0.029 CG 0.0537 CT 0.0484 GA 0.0626 GC 0.0367 GG 0.029 GT 0.0547 TA 0.09 TC 0.0626 TG 0.0518 TT 0.113 # l= 2 # Values AAA 0.0423 AAC 0.0183 AAG 0.0172 AAT 0.0349 ACA 0.0177 ACC 0.00801 ACG 0.0162 ACT 0.0128 AGA 0.0182 AGC 0.00913 AGG 0.00831 AGT 0.0128 ATA 0.0329 ATC 0.0179 ATG 0.0156 ATT 0.0349 CAA 0.0172 CAC 0.0102 CAG 0.00881 CAT 0.0156 CCA 0.00836 CCC 0.00468 CCG 0.00767 CCT 0.00831 CGA 0.0188 CGC 0.011 CGG 0.00767 CGT 0.0162 CTA 0.0112 CTC 0.0112 CTG 0.00881 CTT 0.0172 GAA 0.0239 GAC 0.00958 GAG 0.0112 GAT 0.0179 GCA 0.0107 GCC 0.00591 GCG 0.011 GCT 0.00913 GGA 0.0104 GGC 0.00591 GGG 0.00468 GGT 0.008 GTA 0.0165 GTC 0.00958 GTG 0.0102 GTT 0.0183 TAA 0.0293 TAC 0.0165 TAG 0.0112 TAT 0.0329 TCA 0.0151 TCC 0.0104 TCG 0.0188 TCT 0.0182 TGA 0.0151 TGC 0.0107 TGG 0.00836 TGT 0.0177 TTA 0.0293 TTC 0.0239 TTG 0.0172 TTT 0.0423 # l= 3 # Values AAAA 0.0151 AAAC 0.00665 AAAG 0.00683 AAAT 0.0137 AACA 0.00598 AACC 0.00242 AACG 0.00562 AACT 0.00433 AAGA 0.0066 AAGC 0.00298 AAGG 0.00296 AAGT 0.00463 AATA 0.0116 AATC 0.00549 AATG 0.00556 AATT 0.0122 ACAA 0.00592 ACAC 0.00332 ACAG 0.00301 ACAT 0.00544 ACCA 0.00243 ACCC 0.00109 ACCG 0.00241 ACCT 0.00208 ACGA 0.00603 ACGC 0.00319 ACGG 0.00223 ACGT 0.00477 ACTA 0.00322 ACTC 0.00243 ACTG 0.00247 ACTT 0.00463 AGAA 0.00746 AGAC 0.00234 AGAG 0.00369 AGAT 0.0047 AGCA 0.00278 AGCC 0.00146 AGCG 0.00256 AGCT 0.00232 AGGA 0.00329 AGGC 0.00142 AGGG 0.00152 AGGT 0.00208 AGTA 0.00405 AGTC 0.0021 AGTG 0.00228 AGTT 0.00433 ATAA 0.0109 ATAC 0.00545 ATAG 0.00396 ATAT 0.0126 ATCA 0.00468 ATCC 0.0026 ATCG 0.00592 ATCT 0.0047 ATGA 0.00482 ATGC 0.0029 ATGG 0.00241 ATGT 0.00544 ATTA 0.00993 ATTC 0.00623 ATTG 0.0051 ATTT 0.0137 CAAA 0.00619 CAAC 0.00321 CAAG 0.00272 CAAT 0.0051 CACA 0.0028 CACC 0.00177 CACG 0.00337 CACT 0.00228 CAGA 0.00289 CAGC 0.00197 CAGG 0.00148 CAGT 0.00247 CATA 0.0046 CATC 0.0031 CATG 0.00232 CATT 0.00556 CCAA 0.00253 CCAC 0.00189 CCAG 0.00153 CCAT 0.00241 CCCA 0.00104 CCCC 0.000974 CCCG 0.00115 CCCT 0.00152 CCGA 0.00239 CCGC 0.00177 CCGG 0.00128 CCGT 0.00223 CCTA 0.00167 CCTC 0.0022 CCTG 0.00148 CCTT 0.00296 CGAA 0.0061 CGAC 0.00313 CGAG 0.0037 CGAT 0.00592 CGCA 0.00247 CGCC 0.00166 CGCG 0.00427 CGCT 0.00256 CGGA 0.00229 CGGC 0.00182 CGGG 0.00115 CGGT 0.00241 CGTA 0.00416 CGTC 0.00307 CGTG 0.00337 CGTT 0.00562 CTAA 0.00331 CTAC 0.00241 CTAG 0.00155 CTAT 0.00396 CTCA 0.00186 CTCC 0.00193 CTCG 0.0037 CTCT 0.0037 CTGA 0.00231 CTGC 0.00196 CTGG 0.00153 CTGT 0.00301 CTTA 0.00353 CTTC 0.00408 CTTG 0.00272 CTTT 0.00683 GAAA 0.00979 GAAC 0.00381 GAAG 0.00408 GAAT 0.00623 GACA 0.00296 GACC 0.00145 GACG 0.00307 GACT 0.0021 GAGA 0.00459 GAGC 0.00196 GAGG 0.0022 GAGT 0.00243 GATA 0.00569 GATC 0.00362 GATG 0.0031 GATT 0.00549 GCAA 0.00376 GCAC 0.00203 GCAG 0.00196 GCAT 0.0029 GCCA 0.00187 GCCC 0.000804 GCCG 0.00182 GCCT 0.00142 GCGA 0.00383 GCGC 0.00217 GCGG 0.00177 GCGT 0.00319 GCTA 0.00222 GCTC 0.00195 GCTG 0.00197 GCTT 0.00298 GGAA 0.00435 GGAC 0.00155 GGAG 0.00193 GGAT 0.0026 GGCA 0.00176 GGCC 0.00103 GGCG 0.00166 GGCT 0.00146 GGGA 0.00182 GGGC 0.000804 GGGG 0.000974 GGGT 0.00109 GGTA 0.00236 GGTC 0.00145 GGTG 0.00177 GGTT 0.00242 GTAA 0.00549 GTAC 0.00317 GTAG 0.00241 GTAT 0.00545 GTCA 0.00256 GTCC 0.00155 GTCG 0.00313 GTCT 0.00234 GTGA 0.00297 GTGC 0.00203 GTGG 0.00189 GTGT 0.00332 GTTA 0.00467 GTTC 0.00381 GTTG 0.00321 GTTT 0.00665 TAAA 0.0112 TAAC 0.00467 TAAG 0.00353 TAAT 0.00992 TACA 0.00596 TACC 0.00236 TACG 0.00416 TACT 0.00404 TAGA 0.00412 TAGC 0.00222 TAGG 0.00167 TAGT 0.00322 TATA 0.011 TATC 0.00569 TATG 0.0046 TATT 0.0116 TCAA 0.00499 TCAC 0.00297 TCAG 0.00232 TCAT 0.00482 TCCA 0.00302 TCCC 0.00182 TCCG 0.00229 TCCT 0.00329 TCGA 0.00661 TCGC 0.00383 TCGG 0.00239 TCGT 0.00603 TCTA 0.00412 TCTC 0.00459 TCTG 0.00289 TCTT 0.0066 TGAA 0.006 TGAC 0.00256 TGAG 0.00186 TGAT 0.00468 TGCA 0.00365 TGCC 0.00176 TGCG 0.00247 TGCT 0.00278 TGGA 0.00302 TGGC 0.00187 TGGG 0.00105 TGGT 0.00243 TGTA 0.00596 TGTC 0.00296 TGTG 0.0028 TGTT 0.00598 TTAA 0.00959 TTAC 0.0055 TTAG 0.00331 TTAT 0.0109 TTCA 0.006 TTCC 0.00435 TTCG 0.0061 TTCT 0.00746 TTGA 0.00498 TTGC 0.00376 TTGG 0.00253 TTGT 0.00592 TTTA 0.0112 TTTC 0.00979 TTTG 0.00619 TTTT 0.0151 # l= 4 # Values AAAAA 0.0054 AAAAC 0.00207 AAAAG 0.00252 AAAAT 0.00515 AAACA 0.00227 AAACC 0.000777 AAACG 0.00196 AAACT 0.00165 AAAGA 0.00271 AAAGC 0.00108 AAAGG 0.00116 AAAGT 0.00188 AAATA 0.00485 AAATC 0.00197 AAATG 0.00219 AAATT 0.00465 AACAA 0.00218 AACAC 0.00101 AACAG 0.00102 AACAT 0.00177 AACCA 0.000778 AACCC 0.000307 AACCG 0.000716 AACCT 0.000615 AACGA 0.00224 AACGC 0.00101 AACGG 0.000757 AACGT 0.00162 AACTA 0.00115 AACTC 0.000744 AACTG 0.000854 AACTT 0.00158 AAGAA 0.00291 AAGAC 0.000734 AAGAG 0.00124 AAGAT 0.00171 AAGCA 0.000976 AAGCC 0.000395 AAGCG 0.000809 AAGCT 0.000799 AAGGA 0.00124 AAGGC 0.000447 AAGGG 0.000547 AAGGT 0.000723 AAGTA 0.0016 AAGTC 0.000636 AAGTG 0.000809 AAGTT 0.00158 AATAA 0.00416 AATAC 0.00174 AATAG 0.00137 AATAT 0.00437 AATCA 0.00158 AATCC 0.000762 AATCG 0.00169 AATCT 0.00146 AATGA 0.00182 AATGC 0.000943 AATGG 0.000856 AATGT 0.00194 AATTA 0.00369 AATTC 0.00205 AATTG 0.00184 AATTT 0.00465 ACAAA 0.0023 ACAAC 0.000912 ACAAG 0.000902 ACAAT 0.00181 ACACA 0.00106 ACACC 0.000471 ACACG 0.0011 ACACT 0.00069 ACAGA 0.00109 ACAGC 0.000579 ACAGG 0.000502 ACAGT 0.000846 ACATA 0.00185 ACATC 0.000876 ACATG 0.000779 ACATT 0.00194 ACCAA 0.000775 ACCAC 0.000502 ACCAG 0.000465 ACCAT 0.000686 ACCCA 0.000267 ACCCC 0.000208 ACCCG 0.000249 ACCCT 0.000362 ACCGA 0.000803 ACCGC 0.000496 ACCGG 0.000413 ACCGT 0.000701 ACCTA 0.000516 ACCTC 0.000447 ACCTG 0.00039 ACCTT 0.000723 ACGAA 0.00208 ACGAC 0.000899 ACGAG 0.0012 ACGAT 0.00185 ACGCA 0.00077 ACGCC 0.000385 ACGCG 0.00132 ACGCT 0.000721 ACGGA 0.000725 ACGGC 0.000449 ACGGG 0.000353 ACGGT 0.000701 ACGTA 0.00142 ACGTC 0.000783 ACGTG 0.000956 ACGTT 0.00162 ACTAA 0.00101 ACTAC 0.000637 ACTAG 0.000451 ACTAT 0.00113 ACTCA 0.000463 ACTCC 0.000349 ACTCG 0.000908 ACTCT 0.000713 ACTGA 0.000707 ACTGC 0.000488 ACTGG 0.000428 ACTGT 0.000846 ACTTA 0.00108 ACTTC 0.000876 ACTTG 0.000793 ACTTT 0.00188 AGAAA 0.00325 AGAAC 0.00101 AGAAG 0.00134 AGAAT 0.00186 AGACA 0.000807 AGACC 0.000306 AGACG 0.000704 AGACT 0.000527 AGAGA 0.00179 AGAGC 0.000495 AGAGG 0.000702 AGAGT 0.000713 AGATA 0.00165 AGATC 0.000809 AGATG 0.000783 AGATT 0.00146 AGCAA 0.00103 AGCAC 0.00045 AGCAG 0.000565 AGCAT 0.000737 AGCCA 0.000484 AGCCC 0.00018 AGCCG 0.000451 AGCCT 0.000346 AGCGA 0.000968 AGCGC 0.000431 AGCGG 0.000442 AGCGT 0.000721 AGCTA 0.000598 AGCTC 0.000419 AGCTG 0.000509 AGCTT 0.000799 AGGAA 0.00146 AGGAC 0.000428 AGGAG 0.000606 AGGAT 0.000801 AGGCA 0.000474 AGGCC 0.000191 AGGCG 0.000408 AGGCT 0.000346 AGGGA 0.000623 AGGGC 0.000209 AGGGG 0.000321 AGGGT 0.000362 AGGTA 0.000694 AGGTC 0.000329 AGGTG 0.000439 AGGTT 0.000615 AGTAA 0.00142 AGTAC 0.000689 AGTAG 0.000639 AGTAT 0.0013 AGTCA 0.000624 AGTCC 0.000272 AGTCG 0.000676 AGTCT 0.000527 AGTGA 0.000719 AGTGC 0.000403 AGTGG 0.000469 AGTGT 0.00069 AGTTA 0.00114 AGTTC 0.000762 AGTTG 0.000774 AGTTT 0.00165 ATAAA 0.00442 ATAAC 0.00152 ATAAG 0.00124 ATAAT 0.00372 ATACA 0.00216 ATACC 0.0007 ATACG 0.0013 ATACT 0.0013 ATAGA 0.00152 ATAGC 0.000748 ATAGG 0.000573 ATAGT 0.00113 ATATA 0.00471 ATATC 0.00186 ATATG 0.00168 ATATT 0.00437 ATCAA 0.00158 ATCAC 0.00086 ATCAG 0.000733 ATCAT 0.00151 ATCCA 0.000775 ATCCC 0.000413 ATCCG 0.000608 ATCCT 0.000801 ATCGA 0.0022 ATCGC 0.00109 ATCGG 0.000784 ATCGT 0.00185 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.000999 ATCTG 0.00079 ATCTT 0.00171 ATGAA 0.00201 ATGAC 0.000738 ATGAG 0.000568 ATGAT 0.00151 ATGCA 0.00109 ATGCC 0.000392 ATGCG 0.000682 ATGCT 0.000737 ATGGA 0.000929 ATGGC 0.00048 ATGGG 0.000312 ATGGT 0.000686 ATGTA 0.00214 ATGTC 0.000742 ATGTG 0.000793 ATGTT 0.00177 ATTAA 0.00336 ATTAC 0.00172 ATTAG 0.00113 ATTAT 0.00372 ATTCA 0.00168 ATTCC 0.00104 ATTCG 0.00166 ATTCT 0.00186 ATTGA 0.00152 ATTGC 0.00103 ATTGG 0.000731 ATTGT 0.00181 ATTTA 0.0038 ATTTC 0.00278 ATTTG 0.00194 ATTTT 0.00515 CAAAA 0.00204 CAAAC 0.0011 CAAAG 0.00111 CAAAT 0.00194 CAACA 0.000915 CAACC 0.000487 CAACG 0.00103 CAACT 0.000774 CAAGA 0.000914 CAAGC 0.000515 CAAGG 0.000493 CAAGT 0.000793 CAATA 0.00151 CAATC 0.000846 CAATG 0.000895 CAATT 0.00184 CACAA 0.000803 CACAC 0.000661 CACAG 0.000542 CACAT 0.000793 CACCA 0.000458 CACCC 0.000304 CACCG 0.000571 CACCT 0.000439 CACGA 0.0011 CACGC 0.000756 CACGG 0.000557 CACGT 0.000956 CACTA 0.000472 CACTC 0.0005 CACTG 0.0005 CACTT 0.000809 CAGAA 0.00104 CAGAC 0.00045 CAGAG 0.000612 CAGAT 0.00079 CAGCA 0.000519 CAGCC 0.000394 CAGCG 0.000547 CAGCT 0.000509 CAGGA 0.00051 CAGGC 0.00032 CAGGG 0.000261 CAGGT 0.00039 CAGTA 0.000646 CAGTC 0.000469 CAGTG 0.0005 CAGTT 0.000854 CATAA 0.00148 CATAC 0.000832 CATAG 0.000604 CATAT 0.00168 CATCA 0.000709 CATCC 0.000502 CATCG 0.0011 CATCT 0.000783 CATGA 0.000655 CATGC 0.000489 CATGG 0.0004 CATGT 0.000779 CATTA 0.0014 CATTC 0.00107 CATTG 0.000895 CATTT 0.00219 CCAAA 0.000785 CCAAC 0.000575 CCAAG 0.000442 CCAAT 0.000731 CCACA 0.000353 CCACC 0.000451 CCACG 0.00062 CCACT 0.000469 CCAGA 0.000436 CCAGC 0.000385 CCAGG 0.000278 CCAGT 0.000428 CCATA 0.000592 CCATC 0.00056 CCATG 0.0004 CCATT 0.000856 CCCAA 0.000287 CCCAC 0.000262 CCCAG 0.000183 CCCAT 0.000312 CCCCA 0.000179 CCCCC 0.00022 CCCCG 0.000254 CCCCT 0.000321 CCCGA 0.000337 CCCGC 0.000261 CCCGG 0.000198 CCCGT 0.000353 CCCTA 0.000241 CCCTC 0.000465 CCCTG 0.000261 CCCTT 0.000547 CCGAA 0.000678 CCGAC 0.000449 CCGAG 0.000476 CCGAT 0.000784 CCGCA 0.000334 CCGCC 0.000333 CCGCG 0.000662 CCGCT 0.000442 CCGGA 0.000333 CCGGC 0.00034 CCGGG 0.000198 CCGGT 0.000413 CCGTA 0.000481 CCGTC 0.000434 CCGTG 0.000557 CCGTT 0.000757 CCTAA 0.000477 CCTAC 0.000383 CCTAG 0.000233 CCTAT 0.000573 CCTCA 0.000281 CCTCC 0.000479 CCTCG 0.000738 CCTCT 0.000702 CCTGA 0.000367 CCTGC 0.000336 CCTGG 0.000278 CCTGT 0.000502 CCTTA 0.000516 CCTTC 0.000785 CCTTG 0.000493 CCTTT 0.00116 CGAAA 0.00212 CGAAC 0.0012 CGAAG 0.00113 CGAAT 0.00166 CGACA 0.000787 CGACC 0.000545 CGACG 0.00112 CGACT 0.000676 CGAGA 0.00123 CGAGC 0.000825 CGAGG 0.000738 CGAGT 0.000908 CGATA 0.00171 CGATC 0.00142 CGATG 0.0011 CGATT 0.00169 CGCAA 0.000817 CGCAC 0.0005 CGCAG 0.000468 CGCAT 0.000682 CGCCA 0.000507 CGCCC 0.000231 CGCCG 0.000512 CGCCT 0.000408 CGCGA 0.00139 CGCGC 0.000903 CGCGG 0.000662 CGCGT 0.00132 CGCTA 0.00059 CGCTC 0.000617 CGCTG 0.000547 CGCTT 0.000809 CGGAA 0.000822 CGGAC 0.000397 CGGAG 0.000465 CGGAT 0.000608 CGGCA 0.000495 CGGCC 0.000358 CGGCG 0.000512 CGGCT 0.000451 CGGGA 0.000413 CGGGC 0.000232 CGGGG 0.000254 CGGGT 0.000249 CGGTA 0.00065 CGGTC 0.000476 CGGTG 0.000571 CGGTT 0.000716 CGTAA 0.00134 CGTAC 0.000853 CGTAG 0.000669 CGTAT 0.0013 CGTCA 0.000685 CGTCC 0.00056 CGTCG 0.00112 CGTCT 0.000704 CGTGA 0.000933 CGTGC 0.000715 CGTGG 0.00062 CGTGT 0.0011 CGTTA 0.0013 CGTTC 0.00133 CGTTG 0.00103 CGTTT 0.00196 CTAAA 0.00117 CTAAC 0.000609 CTAAG 0.000404 CTAAT 0.00113 CTACA 0.000671 CTACC 0.000434 CTACG 0.000669 CTACT 0.000639 CTAGA 0.000541 CTAGC 0.000323 CTAGG 0.000233 CTAGT 0.000451 CTATA 0.00118 CTATC 0.000814 CTATG 0.000604 CTATT 0.00137 CTCAA 0.000592 CTCAC 0.000404 CTCAG 0.000293 CTCAT 0.000568 CTCCA 0.000464 CTCCC 0.000391 CTCCG 0.000465 CTCCT 0.000606 CTCGA 0.00123 CTCGC 0.000798 CTCGG 0.000476 CTCGT 0.0012 CTCTA 0.000628 CTCTC 0.00121 CTCTG 0.000612 CTCTT 0.00124 CTGAA 0.000862 CTGAC 0.000428 CTGAG 0.000293 CTGAT 0.000733 CTGCA 0.000533 CTGCC 0.000389 CTGCG 0.000468 CTGCT 0.000565 CTGGA 0.000493 CTGGC 0.000386 CTGGG 0.000183 CTGGT 0.000465 CTGTA 0.000862 CTGTC 0.000589 CTGTG 0.000542 CTGTT 0.00102 CTTAA 0.00118 CTTAC 0.000707 CTTAG 0.000404 CTTAT 0.00124 CTTCA 0.00079 CTTCC 0.000826 CTTCG 0.00113 CTTCT 0.00134 CTTGA 0.00077 CTTGC 0.0006 CTTGG 0.000442 CTTGT 0.000902 CTTTA 0.00144 CTTTC 0.00177 CTTTG 0.00111 CTTTT 0.00252 GAAAA 0.00338 GAAAC 0.00185 GAAAG 0.00177 GAAAT 0.00278 GAACA 0.00119 GAACC 0.000528 GAACG 0.00133 GAACT 0.000762 GAAGA 0.00165 GAAGC 0.000767 GAAGG 0.000785 GAAGT 0.000876 GAATA 0.00193 GAATC 0.00119 GAATG 0.00107 GAATT 0.00205 GACAA 0.00102 GACAC 0.000608 GACAG 0.000589 GACAT 0.000742 GACCA 0.000455 GACCC 0.000192 GACCG 0.000476 GACCT 0.000329 GACGA 0.00123 GACGC 0.000622 GACGG 0.000434 GACGT 0.000783 GACTA 0.000536 GACTC 0.000458 GACTG 0.000469 GACTT 0.000636 GAGAA 0.00176 GAGAC 0.000617 GAGAG 0.00121 GAGAT 0.000999 GAGCA 0.00061 GAGCC 0.000309 GAGCG 0.000617 GAGCT 0.000419 GAGGA 0.0009 GAGGC 0.000386 GAGGG 0.000465 GAGGT 0.000447 GAGTA 0.000731 GAGTC 0.000458 GAGTG 0.0005 GAGTT 0.000744 GATAA 0.00192 GATAC 0.00109 GATAG 0.000814 GATAT 0.00186 GATCA 0.00086 GATCC 0.000539 GATCG 0.00142 GATCT 0.000809 GATGA 0.00102 GATGC 0.000641 GATGG 0.00056 GATGT 0.000876 GATTA 0.00149 GATTC 0.00119 GATTG 0.000846 GATTT 0.00197 GCAAA 0.00132 GCAAC 0.000808 GCAAG 0.0006 GCAAT 0.00103 GCACA 0.000585 GCACC 0.000329 GCACG 0.000715 GCACT 0.000403 GCAGA 0.000623 GCAGC 0.000508 GCAGG 0.000336 GCAGT 0.000488 GCATA 0.000829 GCATC 0.000641 GCATG 0.000489 GCATT 0.000943 GCCAA 0.00054 GCCAC 0.000466 GCCAG 0.000386 GCCAT 0.00048 GCCCA 0.000179 GCCCC 0.000184 GCCCG 0.000232 GCCCT 0.000209 GCCGA 0.000539 GCCGC 0.000488 GCCGG 0.00034 GCCGT 0.000449 GCCTA 0.000267 GCCTC 0.000386 GCCTG 0.00032 GCCTT 0.000447 GCGAA 0.00123 GCGAC 0.000704 GCGAG 0.000798 GCGAT 0.00109 GCGCA 0.000514 GCGCC 0.000322 GCGCG 0.000903 GCGCT 0.000431 GCGGA 0.000525 GCGGC 0.000488 GCGGG 0.000261 GCGGT 0.000496 GCGTA 0.000805 GCGTC 0.000622 GCGTG 0.000756 GCGTT 0.00101 GCTAA 0.000626 GCTAC 0.000527 GCTAG 0.000323 GCTAT 0.000748 GCTCA 0.000315 GCTCC 0.000321 GCTCG 0.000825 GCTCT 0.000495 GCTGA 0.000495 GCTGC 0.000508 GCTGG 0.000385 GCTGT 0.000579 GCTTA 0.000613 GCTTC 0.000767 GCTTG 0.000515 GCTTT 0.00108 GGAAA 0.00177 GGAAC 0.000714 GGAAG 0.000826 GGAAT 0.00104 GGACA 0.000494 GGACC 0.000225 GGACG 0.00056 GGACT 0.000272 GGAGA 0.000777 GGAGC 0.000321 GGAGG 0.000479 GGAGT 0.000349 GGATA 0.000794 GGATC 0.000539 GGATG 0.000502 GGATT 0.000762 GGCAA 0.000631 GGCAC 0.00035 GGCAG 0.000389 GGCAT 0.000392 GGCCA 0.000333 GGCCC 0.000147 GGCCG 0.000358 GGCCT 0.000191 GGCGA 0.000618 GGCGC 0.000322 GGCGG 0.000333 GGCGT 0.000385 GGCTA 0.000365 GGCTC 0.000309 GGCTG 0.000394 GGCTT 0.000395 GGGAA 0.000733 GGGAC 0.000282 GGGAG 0.000391 GGGAT 0.000413 GGGCA 0.000246 GGGCC 0.000147 GGGCG 0.000231 GGGCT 0.00018 GGGGA 0.000361 GGGGC 0.000184 GGGGG 0.00022 GGGGT 0.000208 GGGTA 0.000283 GGGTC 0.000192 GGGTG 0.000304 GGGTT 0.000307 GGTAA 0.000786 GGTAC 0.000444 GGTAG 0.000434 GGTAT 0.0007 GGTCA 0.000377 GGTCC 0.000225 GGTCG 0.000545 GGTCT 0.000306 GGTGA 0.000521 GGTGC 0.000329 GGTGG 0.000451 GGTGT 0.000471 GGTTA 0.000625 GGTTC 0.000528 GGTTG 0.000487 GGTTT 0.000777 GTAAA 0.00201 GTAAC 0.00106 GTAAG 0.000707 GTAAT 0.00172 GTACA 0.00119 GTACC 0.000444 GTACG 0.000853 GTACT 0.000689 GTAGA 0.000866 GTAGC 0.000527 GTAGG 0.000383 GTAGT 0.000637 GTATA 0.00179 GTATC 0.00109 GTATG 0.000832 GTATT 0.00174 GTCAA 0.000808 GTCAC 0.000582 GTCAG 0.000428 GTCAT 0.000738 GTCCA 0.000445 GTCCC 0.000282 GTCCG 0.000397 GTCCT 0.000428 GTCGA 0.00108 GTCGC 0.000704 GTCGG 0.000449 GTCGT 0.000899 GTCTA 0.000543 GTCTC 0.000617 GTCTG 0.00045 GTCTT 0.000734 GTGAA 0.00112 GTGAC 0.000582 GTGAG 0.000404 GTGAT 0.00086 GTGCA 0.000733 GTGCC 0.00035 GTGCG 0.0005 GTGCT 0.00045 GTGGA 0.000663 GTGGC 0.000466 GTGGG 0.000262 GTGGT 0.000502 GTGTA 0.00104 GTGTC 0.000608 GTGTG 0.000661 GTGTT 0.00101 GTTAA 0.00147 GTTAC 0.00106 GTTAG 0.000609 GTTAT 0.00152 GTTCA 0.000882 GTTCC 0.000714 GTTCG 0.0012 GTTCT 0.00101 GTTGA 0.000911 GTTGC 0.000808 GTTGG 0.000575 GTTGT 0.000912 GTTTA 0.00163 GTTTC 0.00185 GTTTG 0.0011 GTTTT 0.00207 TAAAA 0.00431 TAAAC 0.00163 TAAAG 0.00144 TAAAT 0.0038 TAACA 0.0016 TAACC 0.000625 TAACG 0.0013 TAACT 0.00114 TAAGA 0.00132 TAAGC 0.000613 TAAGG 0.000516 TAAGT 0.00108 TAATA 0.00334 TAATC 0.00149 TAATG 0.0014 TAATT 0.00369 TACAA 0.00192 TACAC 0.00104 TACAG 0.000862 TACAT 0.00214 TACCA 0.000738 TACCC 0.000283 TACCG 0.00065 TACCT 0.000694 TACGA 0.00146 TACGC 0.000805 TACGG 0.000481 TACGT 0.00142 TACTA 0.00107 TACTC 0.000731 TACTG 0.000646 TACTT 0.0016 TAGAA 0.00176 TAGAC 0.000543 TAGAG 0.000628 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000672 TAGCC 0.000365 TAGCG 0.00059 TAGCT 0.000598 TAGGA 0.000643 TAGGC 0.000267 TAGGG 0.000241 TAGGT 0.000516 TAGTA 0.00107 TAGTC 0.000536 TAGTG 0.000472 TAGTT 0.00115 TATAA 0.00335 TATAC 0.00179 TATAG 0.00118 TATAT 0.00471 TATCA 0.00154 TATCC 0.000794 TATCG 0.00171 TATCT 0.00165 TATGA 0.00133 TATGC 0.000829 TATGG 0.000592 TATGT 0.00185 TATTA 0.00334 TATTC 0.00193 TATTG 0.00151 TATTT 0.00485 TCAAA 0.00178 TCAAC 0.000911 TCAAG 0.00077 TCAAT 0.00152 TCACA 0.000795 TCACC 0.000521 TCACG 0.000933 TCACT 0.000719 TCAGA 0.000747 TCAGC 0.000495 TCAGG 0.000367 TCAGT 0.000707 TCATA 0.00133 TCATC 0.00102 TCATG 0.000655 TCATT 0.00182 TCCAA 0.000931 TCCAC 0.000663 TCCAG 0.000493 TCCAT 0.000929 TCCCA 0.000421 TCCCC 0.000361 TCCCG 0.000413 TCCCT 0.000623 TCCGA 0.000708 TCCGC 0.000525 TCCGG 0.000333 TCCGT 0.000725 TCCTA 0.000643 TCCTC 0.0009 TCCTG 0.00051 TCCTT 0.00124 TCGAA 0.00211 TCGAC 0.00108 TCGAG 0.00123 TCGAT 0.0022 TCGCA 0.000849 TCGCC 0.000618 TCGCG 0.00139 TCGCT 0.000968 TCGGA 0.000708 TCGGC 0.000539 TCGGG 0.000337 TCGGT 0.000803 TCGTA 0.00146 TCGTC 0.00123 TCGTG 0.0011 TCGTT 0.00224 TCTAA 0.0012 TCTAC 0.000866 TCTAG 0.000541 TCTAT 0.00152 TCTCA 0.000798 TCTCC 0.000777 TCTCG 0.00123 TCTCT 0.00179 TCTGA 0.000747 TCTGC 0.000623 TCTGG 0.000436 TCTGT 0.00109 TCTTA 0.00132 TCTTC 0.00165 TCTTG 0.000914 TCTTT 0.00271 TGAAA 0.00265 TGAAC 0.000882 TGAAG 0.00079 TGAAT 0.00168 TGACA 0.000869 TGACC 0.000377 TGACG 0.000685 TGACT 0.000624 TGAGA 0.000798 TGAGC 0.000315 TGAGG 0.000281 TGAGT 0.000463 TGATA 0.00154 TGATC 0.00086 TGATG 0.000709 TGATT 0.00158 TGCAA 0.00129 TGCAC 0.000733 TGCAG 0.000533 TGCAT 0.00109 TGCCA 0.000547 TGCCC 0.000246 TGCCG 0.000495 TGCCT 0.000474 TGCGA 0.000849 TGCGC 0.000514 TGCGG 0.000334 TGCGT 0.00077 TGCTA 0.000672 TGCTC 0.00061 TGCTG 0.000519 TGCTT 0.000976 TGGAA 0.00133 TGGAC 0.000445 TGGAG 0.000464 TGGAT 0.000775 TGGCA 0.000547 TGGCC 0.000333 TGGCG 0.000507 TGGCT 0.000484 TGGGA 0.000421 TGGGC 0.000179 TGGGG 0.000179 TGGGT 0.000267 TGGTA 0.000738 TGGTC 0.000455 TGGTG 0.000458 TGGTT 0.000778 TGTAA 0.00195 TGTAC 0.00119 TGTAG 0.000671 TGTAT 0.00216 TGTCA 0.000869 TGTCC 0.000494 TGTCG 0.000787 TGTCT 0.000807 TGTGA 0.000795 TGTGC 0.000585 TGTGG 0.000353 TGTGT 0.00106 TGTTA 0.0016 TGTTC 0.00119 TGTTG 0.000915 TGTTT 0.00227 TTAAA 0.00358 TTAAC 0.00147 TTAAG 0.00118 TTAAT 0.00336 TTACA 0.00195 TTACC 0.000786 TTACG 0.00134 TTACT 0.00142 TTAGA 0.0012 TTAGC 0.000626 TTAGG 0.000477 TTAGT 0.00101 TTATA 0.00335 TTATC 0.00192 TTATG 0.00148 TTATT 0.00416 TTCAA 0.002 TTCAC 0.00112 TTCAG 0.000862 TTCAT 0.00201 TTCCA 0.00133 TTCCC 0.000733 TTCCG 0.000822 TTCCT 0.00146 TTCGA 0.00211 TTCGC 0.00123 TTCGG 0.000678 TTCGT 0.00208 TTCTA 0.00176 TTCTC 0.00176 TTCTG 0.00104 TTCTT 0.00291 TTGAA 0.002 TTGAC 0.000808 TTGAG 0.000592 TTGAT 0.00158 TTGCA 0.00129 TTGCC 0.000631 TTGCG 0.000817 TTGCT 0.00103 TTGGA 0.000931 TTGGC 0.00054 TTGGG 0.000287 TTGGT 0.000775 TTGTA 0.00192 TTGTC 0.00102 TTGTG 0.000803 TTGTT 0.00218 TTTAA 0.00358 TTTAC 0.00201 TTTAG 0.00117 TTTAT 0.00442 TTTCA 0.00265 TTTCC 0.00177 TTTCG 0.00212 TTTCT 0.00325 TTTGA 0.00178 TTTGC 0.00132 TTTGG 0.000785 TTTGT 0.0023 TTTTA 0.00431 TTTTC 0.00338 TTTTG 0.00204 TTTTT 0.0054 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3718 AAAAC 0.1225 AAAAG 0.1422 AAAAT 0.3726 AAACA 0.4176 AAACC 0.1019 AAACG 0.2025 AAACT 0.2818 AAAGA 0.4094 AAAGC 0.1367 AAAGG 0.1377 AAAGT 0.3235 AAATA 0.3869 AAATC 0.1124 AAATG 0.1556 AAATT 0.3481 AACAA 0.3788 AACAC 0.1388 AACAG 0.145 AACAT 0.3395 AACCA 0.3688 AACCC 0.1136 AACCG 0.2095 AACCT 0.3072 AACGA 0.4007 AACGC 0.1533 AACGG 0.1176 AACGT 0.3259 AACTA 0.3025 AACTC 0.1319 AACTG 0.1895 AACTT 0.3809 AAGAA 0.4578 AAGAC 0.1076 AAGAG 0.1457 AAGAT 0.2974 AAGCA 0.4043 AAGCC 0.1126 AAGCG 0.1982 AAGCT 0.2868 AAGGA 0.4266 AAGGC 0.143 AAGGG 0.1446 AAGGT 0.2823 AAGTA 0.3841 AAGTC 0.1149 AAGTG 0.164 AAGTT 0.3405 AATAA 0.3652 AATAC 0.1346 AATAG 0.102 AATAT 0.4044 AATCA 0.3537 AATCC 0.1177 AATCG 0.2245 AATCT 0.3066 AATGA 0.3419 AATGC 0.1521 AATGG 0.1211 AATGT 0.3845 AATTA 0.3274 AATTC 0.1376 AATTG 0.1447 AATTT 0.3982 ACAAA 0.4009 ACAAC 0.1249 ACAAG 0.1333 ACAAT 0.3413 ACACA 0.4124 ACACC 0.1078 ACACG 0.2375 ACACT 0.2464 ACAGA 0.3659 ACAGC 0.1615 ACAGG 0.1409 ACAGT 0.3308 ACATA 0.381 ACATC 0.1196 ACATG 0.142 ACATT 0.3609 ACCAA 0.3415 ACCAC 0.1783 ACCAG 0.1589 ACCAT 0.3225 ACCCA 0.3179 ACCCC 0.1523 ACCCG 0.1847 ACCCT 0.3451 ACCGA 0.3463 ACCGC 0.183 ACCGG 0.1488 ACCGT 0.3225 ACCTA 0.2918 ACCTC 0.1705 ACCTG 0.176 ACCTT 0.3636 ACGAA 0.3752 ACGAC 0.1295 ACGAG 0.1566 ACGAT 0.3388 ACGCA 0.3248 ACGCC 0.1111 ACGCG 0.3049 ACGCT 0.2593 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.165 ACGGG 0.1376 ACGGT 0.3445 ACGTA 0.3382 ACGTC 0.134 ACGTG 0.1985 ACGTT 0.3278 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.1733 ACTAG 0.1232 ACTAT 0.3816 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.133 ACTCG 0.2587 ACTCT 0.33 ACTGA 0.3095 ACTGC 0.1816 ACTGG 0.136 ACTGT 0.3758 ACTTA 0.2682 ACTTC 0.1688 ACTTG 0.1553 ACTTT 0.4055 AGAAA 0.4491 AGAAC 0.1181 AGAAG 0.1485 AGAAT 0.2875 AGACA 0.4099 AGACC 0.1091 AGACG 0.216 AGACT 0.2686 AGAGA 0.4602 AGAGC 0.1292 AGAGG 0.1663 AGAGT 0.2445 AGATA 0.3858 AGATC 0.1352 AGATG 0.1565 AGATT 0.3271 AGCAA 0.378 AGCAC 0.1507 AGCAG 0.1685 AGCAT 0.3032 AGCCA 0.3766 AGCCC 0.1215 AGCCG 0.2256 AGCCT 0.2767 AGCGA 0.371 AGCGC 0.1671 AGCGG 0.1478 AGCGT 0.3142 AGCTA 0.2896 AGCTC 0.1476 AGCTG 0.2031 AGCTT 0.3618 AGGAA 0.4694 AGGAC 0.114 AGGAG 0.1467 AGGAT 0.2695 AGGCA 0.4007 AGGCC 0.1232 AGGCG 0.2154 AGGCT 0.2603 AGGGA 0.4136 AGGGC 0.1393 AGGGG 0.1832 AGGGT 0.2644 AGGTA 0.3567 AGGTC 0.1363 AGGTG 0.1797 AGGTT 0.3265 AGTAA 0.3599 AGTAC 0.1587 AGTAG 0.1348 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3699 AGTCC 0.1158 AGTCG 0.2226 AGTCT 0.2936 AGTGA 0.3435 AGTGC 0.165 AGTGG 0.1603 AGTGT 0.3339 AGTTA 0.2985 AGTTC 0.154 AGTTG 0.1595 AGTTT 0.3872 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1229 ATAAG 0.1067 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4627 ATACC 0.105 ATACG 0.1716 ATACT 0.2641 ATAGA 0.3901 ATAGC 0.1564 ATAGG 0.1268 ATAGT 0.328 ATATA 0.3979 ATATC 0.1171 ATATG 0.1322 ATATT 0.3517 ATCAA 0.3482 ATCAC 0.1596 ATCAG 0.141 ATCAT 0.3522 ATCCA 0.3429 ATCCC 0.1388 ATCCG 0.1803 ATCCT 0.3403 ATCGA 0.3773 ATCGC 0.1622 ATCGG 0.1096 ATCGT 0.35 ATCTA 0.2913 ATCTC 0.1651 ATCTG 0.1575 ATCTT 0.3874 ATGAA 0.431 ATGAC 0.1329 ATGAG 0.1086 ATGAT 0.332 ATGCA 0.4379 ATGCC 0.114 ATGCG 0.1741 ATGCT 0.2762 ATGGA 0.3856 ATGGC 0.181 ATGGG 0.1206 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.4289 ATGTC 0.1088 ATGTG 0.1396 ATGTT 0.3264 ATTAA 0.3504 ATTAC 0.1567 ATTAG 0.09992 ATTAT 0.3963 ATTCA 0.3332 ATTCC 0.1425 ATTCG 0.1924 ATTCT 0.3344 ATTGA 0.3146 ATTGC 0.1788 ATTGG 0.1167 ATTGT 0.3922 ATTTA 0.3045 ATTTC 0.167 ATTTG 0.1387 ATTTT 0.3899 CAAAA 0.3641 CAAAC 0.1449 CAAAG 0.1445 CAAAT 0.3498 CAACA 0.3688 CAACC 0.1287 CAACG 0.2194 CAACT 0.2852 CAAGA 0.3578 CAAGC 0.1632 CAAGG 0.1539 CAAGT 0.3288 CAATA 0.3431 CAATC 0.1322 CAATG 0.1668 CAATT 0.3637 CACAA 0.3214 CACAC 0.1997 CACAG 0.1552 CACAT 0.3263 CACCA 0.3242 CACCC 0.1441 CACCG 0.2406 CACCT 0.2924 CACGA 0.3359 CACGC 0.1922 CACGG 0.1278 CACGT 0.3455 CACTA 0.2589 CACTC 0.1574 CACTG 0.2058 CACTT 0.3788 CAGAA 0.4045 CAGAC 0.1296 CAGAG 0.1675 CAGAT 0.2985 CAGCA 0.3444 CAGCC 0.1561 CAGCG 0.2112 CAGCT 0.2884 CAGGA 0.3715 CAGGC 0.1743 CAGGG 0.1517 CAGGT 0.3018 CAGTA 0.3185 CAGTC 0.1482 CAGTG 0.1839 CAGTT 0.352 CATAA 0.3242 CATAC 0.1682 CATAG 0.1111 CATAT 0.3973 CATCA 0.3079 CATCC 0.1411 CATCG 0.2491 CATCT 0.304 CATGA 0.304 CATGC 0.1787 CATGG 0.1313 CATGT 0.3859 CATTA 0.2734 CATTC 0.1577 CATTG 0.1559 CATTT 0.4089 CCAAA 0.3559 CCAAC 0.171 CCAAG 0.1453 CCAAT 0.3309 CCACA 0.2685 CCACC 0.1787 CCACG 0.2605 CCACT 0.2932 CCAGA 0.3121 CCAGC 0.2007 CCAGG 0.1469 CCAGT 0.3415 CCATA 0.2906 CCATC 0.1762 CCATG 0.1604 CCATT 0.3743 CCCAA 0.3121 CCCAC 0.2014 CCCAG 0.1463 CCCAT 0.3412 CCCCA 0.2614 CCCCC 0.2001 CCCCG 0.1795 CCCCT 0.359 CCCGA 0.3142 CCCGC 0.2073 CCCGG 0.1478 CCCGT 0.3291 CCCTA 0.2257 CCCTC 0.233 CCCTG 0.1742 CCCTT 0.3671 CCGAA 0.3333 CCGAC 0.1656 CCGAG 0.1704 CCGAT 0.3312 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.1689 CCGCG 0.3006 CCGCT 0.2769 CCGGA 0.2957 CCGGC 0.2201 CCGGG 0.1351 CCGGT 0.3485 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.1672 CCGTG 0.2188 CCGTT 0.348 CCTAA 0.3157 CCTAC 0.1853 CCTAG 0.1244 CCTAT 0.3784 CCTCA 0.2128 CCTCC 0.1865 CCTCG 0.2513 CCTCT 0.3495 CCTGA 0.2794 CCTGC 0.1998 CCTGG 0.1391 CCTGT 0.3827 CCTTA 0.2335 CCTTC 0.2041 CCTTG 0.1646 CCTTT 0.399 CGAAA 0.3731 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1623 CGAAT 0.3044 CGACA 0.3198 CGACC 0.1531 CGACG 0.2808 CGACT 0.2456 CGAGA 0.3471 CGAGC 0.1918 CGAGG 0.1764 CGAGT 0.285 CGATA 0.329 CGATC 0.1847 CGATG 0.17 CGATT 0.3172 CGCAA 0.3445 CGCAC 0.1802 CGCAG 0.17 CGCAT 0.3045 CGCCA 0.3633 CGCCC 0.133 CGCCG 0.2386 CGCCT 0.2655 CGCGA 0.3289 CGCGC 0.2105 CGCGG 0.1394 CGCGT 0.3213 CGCTA 0.2743 CGCTC 0.1936 CGCTG 0.1971 CGCTT 0.3366 CGGAA 0.3826 CGGAC 0.1467 CGGAG 0.1761 CGGAT 0.2933 CGGCA 0.3204 CGGCC 0.1757 CGGCG 0.24 CGGCT 0.2633 CGGGA 0.3954 CGGGC 0.1784 CGGGG 0.1674 CGGGT 0.2577 CGGTA 0.3125 CGGTC 0.1663 CGGTG 0.208 CGGTT 0.3115 CGTAA 0.3337 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1324 CGTAT 0.3515 CGTCA 0.2987 CGTCC 0.1546 CGTCG 0.2824 CGTCT 0.2628 CGTGA 0.3035 CGTGC 0.1864 CGTGG 0.1554 CGTGT 0.3531 CGTTA 0.273 CGTTC 0.1943 CGTTG 0.164 CGTTT 0.3693 CTAAA 0.3766 CTAAC 0.1546 CTAAG 0.1152 CTAAT 0.3569 CTACA 0.3627 CTACC 0.1376 CTACG 0.1938 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3574 CTAGC 0.1717 CTAGG 0.1331 CTAGT 0.3384 CTATA 0.3413 CTATC 0.1546 CTATG 0.1501 CTATT 0.3558 CTCAA 0.3464 CTCAC 0.1759 CTCAG 0.1347 CTCAT 0.3418 CTCCA 0.308 CTCCC 0.1672 CTCCG 0.1947 CTCCT 0.3337 CTCGA 0.3447 CTCGC 0.1857 CTCGG 0.1207 CTCGT 0.3475 CTCTA 0.231 CTCTC 0.2347 CTCTG 0.1705 CTCTT 0.366 CTGAA 0.3942 CTGAC 0.1528 CTGAG 0.1126 CTGAT 0.3417 CTGCA 0.3425 CTGCC 0.1601 CTGCG 0.1934 CTGCT 0.3038 CTGGA 0.3487 CTGGC 0.2057 CTGGG 0.1122 CTGGT 0.3358 CTGTA 0.3399 CTGTC 0.147 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3489 CTTAA 0.3387 CTTAC 0.1743 CTTAG 0.1052 CTTAT 0.3827 CTTCA 0.28 CTTCC 0.1775 CTTCG 0.2049 CTTCT 0.3397 CTTGA 0.3032 CTTGC 0.1878 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3805 CTTTA 0.2545 CTTTC 0.2017 CTTTG 0.1501 CTTTT 0.3921 GAAAA 0.3675 GAAAC 0.1538 GAAAG 0.1507 GAAAT 0.3293 GAACA 0.3823 GAACC 0.1144 GAACG 0.2452 GAACT 0.2572 GAAGA 0.4061 GAAGC 0.1584 GAAGG 0.1516 GAAGT 0.2867 GAATA 0.3448 GAATC 0.1407 GAATG 0.1715 GAATT 0.3479 GACAA 0.3623 GACAC 0.1725 GACAG 0.1626 GACAT 0.3038 GACCA 0.349 GACCC 0.1193 GACCG 0.2468 GACCT 0.286 GACGA 0.3892 GACGC 0.1781 GACGG 0.128 GACGT 0.3048 GACTA 0.2821 GACTC 0.1612 GACTG 0.2136 GACTT 0.3432 GAGAA 0.408 GAGAC 0.1227 GAGAG 0.1993 GAGAT 0.2708 GAGCA 0.3758 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2457 GAGCT 0.2496 GAGGA 0.4164 GAGGC 0.1543 GAGGG 0.1757 GAGGT 0.2532 GAGTA 0.3438 GAGTC 0.1472 GAGTG 0.1863 GAGTT 0.3235 GATAA 0.3423 GATAC 0.1673 GATAG 0.1224 GATAT 0.3718 GATCA 0.321 GATCC 0.1283 GATCG 0.2802 GATCT 0.27 GATGA 0.343 GATGC 0.1737 GATGG 0.1505 GATGT 0.3387 GATTA 0.3011 GATTC 0.1655 GATTG 0.1555 GATTT 0.3811 GCAAA 0.3627 GCAAC 0.17 GCAAG 0.1383 GCAAT 0.3301 GCACA 0.3733 GCACC 0.1261 GCACG 0.2537 GCACT 0.2468 GCAGA 0.3353 GCAGC 0.1988 GCAGG 0.1462 GCAGT 0.3185 GCATA 0.327 GCATC 0.1534 GCATG 0.1657 GCATT 0.3505 GCCAA 0.3154 GCCAC 0.1999 GCCAG 0.1671 GCCAT 0.3194 GCCCA 0.2926 GCCCC 0.1824 GCCCG 0.2164 GCCCT 0.3086 GCCGA 0.3312 GCCGC 0.2374 GCCGG 0.1633 GCCGT 0.2683 GCCTA 0.2332 GCCTC 0.2055 GCCTG 0.2012 GCCTT 0.3611 GCGAA 0.351 GCGAC 0.1611 GCGAG 0.1699 GCGAT 0.3192 GCGCA 0.3022 GCGCC 0.1464 GCGCG 0.3265 GCGCT 0.2253 GCGGA 0.3172 GCGGC 0.2327 GCGGG 0.1374 GCGGT 0.3118 GCGTA 0.2891 GCGTC 0.1632 GCGTG 0.2291 GCGTT 0.3177 GCTAA 0.3002 GCTAC 0.1994 GCTAG 0.1289 GCTAT 0.3718 GCTCA 0.2476 GCTCC 0.1569 GCTCG 0.2985 GCTCT 0.2982 GCTGA 0.2816 GCTGC 0.2168 GCTGG 0.153 GCTGT 0.3502 GCTTA 0.2485 GCTTC 0.2065 GCTTG 0.168 GCTTT 0.3791 GGAAA 0.4132 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1686 GGAAT 0.2741 GGACA 0.389 GGACC 0.1279 GGACG 0.2632 GGACT 0.2194 GGAGA 0.4068 GGAGC 0.1583 GGAGG 0.206 GGAGT 0.2284 GGATA 0.3517 GGATC 0.1589 GGATG 0.1806 GGATT 0.3099 GGCAA 0.3632 GGCAC 0.1748 GGCAG 0.1917 GGCAT 0.2702 GGCCA 0.3693 GGCCC 0.135 GGCCG 0.2654 GGCCT 0.2305 GGCGA 0.3669 GGCGC 0.2065 GGCGG 0.1713 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2843 GGCTC 0.1659 GGCTG 0.238 GGCTT 0.3111 GGGAA 0.4347 GGGAC 0.135 GGGAG 0.172 GGGAT 0.2582 GGGCA 0.348 GGGCC 0.1598 GGGCG 0.2393 GGGCT 0.2525 GGGGA 0.4111 GGGGC 0.1613 GGGGG 0.2002 GGGGT 0.2287 GGGTA 0.3127 GGGTC 0.1472 GGGTG 0.2293 GGGTT 0.3114 GGTAA 0.3381 GGTAC 0.1763 GGTAG 0.1481 GGTAT 0.3359 GGTCA 0.3391 GGTCC 0.1367 GGTCG 0.2819 GGTCT 0.2433 GGTGA 0.3341 GGTGC 0.1718 GGTGG 0.1988 GGTGT 0.2996 GGTTA 0.3104 GGTTC 0.1671 GGTTG 0.1774 GGTTT 0.3464 GTAAA 0.3737 GTAAC 0.1635 GTAAG 0.1179 GTAAT 0.3467 GTACA 0.4402 GTACC 0.1168 GTACG 0.1865 GTACT 0.2555 GTAGA 0.372 GTAGC 0.1773 GTAGG 0.1336 GTAGT 0.3182 GTATA 0.3611 GTATC 0.148 GTATG 0.1585 GTATT 0.3331 GTCAA 0.3297 GTCAC 0.1957 GTCAG 0.1453 GTCAT 0.3326 GTCCA 0.3416 GTCCC 0.1563 GTCCG 0.1932 GTCCT 0.3087 GTCGA 0.3624 GTCGC 0.1929 GTCGG 0.1287 GTCGT 0.315 GTCTA 0.2731 GTCTC 0.1934 GTCTG 0.1756 GTCTT 0.3586 GTGAA 0.3918 GTGAC 0.1688 GTGAG 0.1212 GTGAT 0.3216 GTGCA 0.407 GTGCC 0.1386 GTGCG 0.1947 GTGCT 0.2595 GTGGA 0.3668 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1257 GTGGT 0.3073 GTGTA 0.3468 GTGTC 0.1448 GTGTG 0.2015 GTGTT 0.3075 GTTAA 0.3244 GTTAC 0.197 GTTAG 0.1146 GTTAT 0.3634 GTTCA 0.3132 GTTCC 0.1653 GTTCG 0.2225 GTTCT 0.3 GTTGA 0.311 GTTGC 0.2145 GTTGG 0.1408 GTTGT 0.3349 GTTTA 0.2801 GTTTC 0.2161 GTTTG 0.1569 GTTTT 0.3481 TAAAA 0.406 TAAAC 0.1217 TAAAG 0.1148 TAAAT 0.3637 TAACA 0.4145 TAACC 0.1174 TAACG 0.1908 TAACT 0.279 TAAGA 0.3905 TAAGC 0.143 TAAGG 0.1309 TAAGT 0.3379 TAATA 0.3768 TAATC 0.1175 TAATG 0.1375 TAATT 0.3757 TACAA 0.3398 TACAC 0.1383 TACAG 0.124 TACAT 0.3993 TACCA 0.3719 TACCC 0.108 TACCG 0.1997 TACCT 0.3225 TACGA 0.3597 TACGC 0.1567 TACGG 0.1012 TACGT 0.3817 TACTA 0.2997 TACTC 0.1324 TACTG 0.1626 TACTT 0.4052 TAGAA 0.4352 TAGAC 0.1165 TAGAG 0.1307 TAGAT 0.3211 TAGCA 0.3874 TAGCC 0.1279 TAGCG 0.2019 TAGCT 0.2828 TAGGA 0.3926 TAGGC 0.1372 TAGGG 0.1329 TAGGT 0.3413 TAGTA 0.3714 TAGTC 0.1248 TAGTG 0.1473 TAGTT 0.3558 TATAA 0.3137 TATAC 0.1424 TATAG 0.09354 TATAT 0.4465 TATCA 0.3434 TATCC 0.1198 TATCG 0.2124 TATCT 0.3261 TATGA 0.3032 TATGC 0.1528 TATGG 0.1023 TATGT 0.4435 TATTA 0.3133 TATTC 0.1331 TATTG 0.1304 TATTT 0.4247 TCAAA 0.3832 TCAAC 0.1451 TCAAG 0.1331 TCAAT 0.345 TCACA 0.3478 TCACC 0.1365 TCACG 0.2319 TCACT 0.2851 TCAGA 0.3455 TCAGC 0.1686 TCAGG 0.134 TCAGT 0.3559 TCATA 0.3216 TCATC 0.1486 TCATG 0.139 TCATT 0.3887 TCCAA 0.3395 TCCAC 0.1831 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.3394 TCCCA 0.2824 TCCCC 0.1785 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.3537 TCCGA 0.3212 TCCGC 0.197 TCCGG 0.133 TCCGT 0.3489 TCCTA 0.2435 TCCTC 0.2024 TCCTG 0.1571 TCCTT 0.3995 TCGAA 0.3465 TCGAC 0.1452 TCGAG 0.1512 TCGAT 0.3561 TCGCA 0.2985 TCGCC 0.1434 TCGCG 0.2817 TCGCT 0.2764 TCGGA 0.3152 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1274 TCGGT 0.357 TCGTA 0.2941 TCGTC 0.1584 TCGTG 0.1785 TCGTT 0.3689 TCTAA 0.3149 TCTAC 0.1784 TCTAG 0.1139 TCTAT 0.392 TCTCA 0.2581 TCTCC 0.1499 TCTCG 0.1998 TCTCT 0.3912 TCTGA 0.2929 TCTGC 0.1854 TCTGG 0.12 TCTGT 0.4028 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1947 TCTTG 0.1356 TCTTT 0.4208 TGAAA 0.4419 TGAAC 0.1299 TGAAG 0.1267 TGAAT 0.3044 TGACA 0.3981 TGACC 0.1252 TGACG 0.2013 TGACT 0.2767 TGAGA 0.4237 TGAGC 0.1488 TGAGG 0.1387 TGAGT 0.291 TGATA 0.3709 TGATC 0.1466 TGATG 0.146 TGATT 0.3419 TGCAA 0.3684 TGCAC 0.1654 TGCAG 0.1314 TGCAT 0.3333 TGCCA 0.3797 TGCCC 0.1196 TGCCG 0.1973 TGCCT 0.306 TGCGA 0.3484 TGCGC 0.1942 TGCGG 0.1166 TGCGT 0.34 TGCTA 0.288 TGCTC 0.1628 TGCTG 0.1767 TGCTT 0.3757 TGGAA 0.4584 TGGAC 0.1288 TGGAG 0.1375 TGGAT 0.2765 TGGCA 0.3694 TGGCC 0.1473 TGGCG 0.2198 TGGCT 0.2647 TGGGA 0.3933 TGGGC 0.1577 TGGGG 0.1594 TGGGT 0.2897 TGGTA 0.3549 TGGTC 0.1419 TGGTG 0.1708 TGGTT 0.3364 TGTAA 0.3378 TGTAC 0.1749 TGTAG 0.1012 TGTAT 0.3901 TGTCA 0.3607 TGTCC 0.1398 TGTCG 0.1975 TGTCT 0.3038 TGTGA 0.3035 TGTGC 0.1834 TGTGG 0.1062 TGTGT 0.4079 TGTTA 0.3078 TGTTC 0.1592 TGTTG 0.143 TGTTT 0.3918 TTAAA 0.3999 TTAAC 0.1313 TTAAG 0.1111 TTAAT 0.366 TTACA 0.425 TTACC 0.1121 TTACG 0.1719 TTACT 0.2898 TTAGA 0.3772 TTAGC 0.1532 TTAGG 0.1304 TTAGT 0.3401 TTATA 0.3464 TTATC 0.1327 TTATG 0.1332 TTATT 0.3823 TTCAA 0.3497 TTCAC 0.1562 TTCAG 0.1284 TTCAT 0.3687 TTCCA 0.3494 TTCCC 0.1433 TTCCG 0.1442 TTCCT 0.3632 TTCGA 0.3519 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.1053 TTCGT 0.3725 TTCTA 0.2736 TTCTC 0.1708 TTCTG 0.1471 TTCTT 0.4046 TTGAA 0.4166 TTGAC 0.1365 TTGAG 0.1146 TTGAT 0.334 TTGCA 0.409 TTGCC 0.1312 TTGCG 0.1679 TTGCT 0.2919 TTGGA 0.3811 TTGGC 0.178 TTGGG 0.1098 TTGGT 0.3358 TTGTA 0.3702 TTGTC 0.1314 TTGTG 0.139 TTGTT 0.3591 TTTAA 0.3367 TTTAC 0.1532 TTTAG 0.09586 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3323 TTTCC 0.1481 TTTCG 0.1619 TTTCT 0.3528 TTTGA 0.3051 TTTGC 0.1748 TTTGG 0.1119 TTTGT 0.4127 TTTTA 0.3199 TTTTC 0.1732 TTTTG 0.1381 TTTTT 0.3682