[1] # (a,c,g,t)= (0.359, 0.141, 0.141, 0.359) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.349 C 0.151 G 0.151 T 0.349 # l= 1 # Values AA 0.129 AC 0.052 AG 0.045 AT 0.123 CA 0.0547 CC 0.0204 CG 0.0307 CT 0.045 GA 0.0524 GC 0.026 GG 0.0204 GT 0.0521 TA 0.113 TC 0.0523 TG 0.0547 TT 0.129 # l= 2 # Values AAA 0.0509 AAC 0.0175 AAG 0.017 AAT 0.0433 ACA 0.0212 ACC 0.0063 ACG 0.0104 ACT 0.0142 AGA 0.0172 AGC 0.0071 AGG 0.00655 AGT 0.0142 ATA 0.0453 ATC 0.0162 ATG 0.0185 ATT 0.0433 CAA 0.019 CAC 0.00921 CAG 0.00801 CAT 0.0185 CCA 0.00702 CCC 0.00292 CCG 0.00387 CCT 0.00655 CGA 0.0109 CGC 0.00558 CGG 0.00388 CGT 0.0104 CTA 0.0123 CTC 0.00763 CTG 0.00801 CTT 0.017 GAA 0.0215 GAC 0.00704 GAG 0.00763 GAT 0.0162 GCA 0.00979 GCC 0.00355 GCG 0.00557 GCT 0.00709 GGA 0.0076 GGC 0.00355 GGG 0.00292 GGT 0.0063 GTA 0.0183 GTC 0.00703 GTG 0.00921 GTT 0.0175 TAA 0.0375 TAC 0.0183 TAG 0.0123 TAT 0.0453 TCA 0.0167 TCC 0.00759 TCG 0.0109 TCT 0.0172 TGA 0.0167 TGC 0.00979 TGG 0.00702 TGT 0.0212 TTA 0.0375 TTC 0.0215 TTG 0.019 TTT 0.0509 # l= 3 # Values AAAA 0.0195 AAAC 0.00668 AAAG 0.00709 AAAT 0.0176 AACA 0.00718 AACC 0.00192 AACG 0.0036 AACT 0.00484 AAGA 0.00665 AAGC 0.0025 AAGG 0.00247 AAGT 0.00541 AATA 0.0159 AATC 0.0053 AATG 0.00682 AATT 0.0153 ACAA 0.00742 ACAC 0.00331 ACAG 0.00306 ACAT 0.00739 ACCA 0.0023 ACCC 0.000733 ACCG 0.0013 ACCT 0.00197 ACGA 0.00378 ACGC 0.00176 ACGG 0.00124 ACGT 0.00361 ACTA 0.0041 ACTC 0.00201 ACTG 0.00266 ACTT 0.00541 AGAA 0.00746 AGAC 0.00197 AGAG 0.00271 AGAT 0.00502 AGCA 0.00278 AGCC 0.000915 AGCG 0.00139 AGCT 0.00201 AGGA 0.00259 AGGC 0.000972 AGGG 0.00102 AGGT 0.00197 AGTA 0.00509 AGTC 0.00177 AGTG 0.00248 AGTT 0.00484 ATAA 0.0149 ATAC 0.00664 ATAG 0.0046 ATAT 0.0192 ATCA 0.00546 ATCC 0.0021 ATCG 0.00365 ATCT 0.00502 ATGA 0.00588 ATGC 0.003 ATGG 0.00228 ATGT 0.00738 ATTA 0.0133 ATTC 0.00619 ATTG 0.00628 ATTT 0.0176 CAAA 0.00731 CAAC 0.00282 CAAG 0.00257 CAAT 0.00627 CACA 0.00337 CACC 0.00128 CACG 0.00209 CACT 0.00248 CAGA 0.00276 CAGC 0.00144 CAGG 0.00115 CAGT 0.00266 CATA 0.00625 CATC 0.00265 CATG 0.00282 CATT 0.00682 CCAA 0.00235 CCAC 0.00135 CCAG 0.00104 CCAT 0.00228 CCCA 0.00082 CCCC 0.000531 CCCG 0.000547 CCCT 0.00102 CCGA 0.00124 CCGC 0.000811 CCGG 0.000585 CCGT 0.00124 CCTA 0.00165 CCTC 0.00127 CCTG 0.00115 CCTT 0.00248 CGAA 0.00382 CGAC 0.00162 CGAG 0.00178 CGAT 0.00365 CGCA 0.00169 CGCC 0.000799 CGCG 0.0017 CGCT 0.00139 CGGA 0.00126 CGGC 0.000768 CGGG 0.000547 CGGT 0.0013 CGTA 0.00309 CGTC 0.00162 CGTG 0.00209 CGTT 0.0036 CTAA 0.00387 CTAC 0.00225 CTAG 0.00158 CTAT 0.0046 CTCA 0.00194 CTCC 0.0012 CTCG 0.00178 CTCT 0.00271 CTGA 0.00233 CTGC 0.00159 CTGG 0.00104 CTGT 0.00306 CTTA 0.00426 CTTC 0.00312 CTTG 0.00257 CTTT 0.00709 GAAA 0.00922 GAAC 0.00294 GAAG 0.00312 GAAT 0.00619 GACA 0.00271 GACC 0.000927 GACG 0.00162 GACT 0.00177 GAGA 0.00316 GAGC 0.00119 GAGG 0.00127 GAGT 0.00201 GATA 0.00575 GATC 0.00253 GATG 0.00265 GATT 0.0053 GCAA 0.00348 GCAC 0.00172 GCAG 0.00159 GCAT 0.003 GCCA 0.00132 GCCC 0.000488 GCCG 0.000767 GCCT 0.000972 GCGA 0.00185 GCGC 0.00116 GCGG 0.00081 GCGT 0.00176 GCTA 0.00196 GCTC 0.00119 GCTG 0.00144 GCTT 0.0025 GGAA 0.00332 GGAC 0.000977 GGAG 0.0012 GGAT 0.0021 GGCA 0.00128 GGCC 0.000556 GGCG 0.000799 GGCT 0.000914 GGGA 0.00116 GGGC 0.000488 GGGG 0.000531 GGGT 0.000734 GGTA 0.00217 GGTC 0.000925 GGTG 0.00128 GGTT 0.00192 GTAA 0.00611 GTAC 0.00326 GTAG 0.00225 GTAT 0.00664 GTCA 0.00247 GTCC 0.000976 GTCG 0.00162 GTCT 0.00197 GTGA 0.00283 GTGC 0.00172 GTGG 0.00135 GTGT 0.00331 GTTA 0.00509 GTTC 0.00294 GTTG 0.00282 GTTT 0.00668 TAAA 0.0148 TAAC 0.0051 TAAG 0.00426 TAAT 0.0133 TACA 0.00792 TACC 0.00217 TACG 0.00309 TACT 0.00508 TAGA 0.0046 TAGC 0.00196 TAGG 0.00165 TAGT 0.0041 TATA 0.0174 TATC 0.00575 TATG 0.00625 TATT 0.0159 TCAA 0.00571 TCAC 0.00283 TCAG 0.00233 TCAT 0.00588 TCCA 0.00258 TCCC 0.00116 TCCG 0.00126 TCCT 0.00259 TCGA 0.00399 TCGC 0.00185 TCGG 0.00124 TCGT 0.00378 TCTA 0.00459 TCTC 0.00316 TCTG 0.00276 TCTT 0.00665 TGAA 0.00687 TGAC 0.00247 TGAG 0.00194 TGAT 0.00546 TGCA 0.00404 TGCC 0.00128 TGCG 0.00169 TGCT 0.00278 TGGA 0.00258 TGGC 0.00132 TGGG 0.00082 TGGT 0.0023 TGTA 0.00792 TGTC 0.00271 TGTG 0.00337 TGTT 0.00718 TTAA 0.0126 TTAC 0.00611 TTAG 0.00387 TTAT 0.0149 TTCA 0.00687 TTCC 0.00331 TTCG 0.00382 TTCT 0.00746 TTGA 0.00572 TTGC 0.00348 TTGG 0.00235 TTGT 0.00742 TTTA 0.0148 TTTC 0.00922 TTTG 0.00731 TTTT 0.0196 # l= 4 # Values AAAAA 0.00746 AAAAC 0.00234 AAAAG 0.00286 AAAAT 0.00689 AAACA 0.00284 AAACC 0.000659 AAACG 0.00133 AAACT 0.00186 AAAGA 0.00289 AAAGC 0.000968 AAAGG 0.000996 AAAGT 0.00224 AAATA 0.00669 AAATC 0.00203 AAATG 0.00276 AAATT 0.0061 AACAA 0.0027 AACAC 0.000987 AACAG 0.00107 AACAT 0.00242 AACCA 0.000707 AACCC 0.000215 AACCG 0.000369 AACCT 0.000629 AACGA 0.0014 AACGC 0.000538 AACGG 0.000415 AACGT 0.00125 AACTA 0.00143 AACTC 0.000639 AACTG 0.000922 AACTT 0.00185 AAGAA 0.00301 AAGAC 0.000694 AAGAG 0.000973 AAGAT 0.00197 AAGCA 0.00104 AAGCC 0.000286 AAGCG 0.000457 AAGCT 0.000718 AAGGA 0.00104 AAGGC 0.000355 AAGGG 0.000384 AAGGT 0.000702 AAGTA 0.00204 AAGTC 0.000611 AAGTG 0.000912 AAGTT 0.00185 AATAA 0.00571 AATAC 0.00219 AATAG 0.00167 AATAT 0.00637 AATCA 0.00185 AATCC 0.000655 AATCG 0.00114 AATCT 0.00165 AATGA 0.00229 AATGC 0.00106 AATGG 0.000864 AATGT 0.00261 AATTA 0.00484 AATTC 0.00208 AATTG 0.00226 AATTT 0.0061 ACAAA 0.00299 ACAAC 0.000967 ACAAG 0.000983 ACAAT 0.00248 ACACA 0.0014 ACACC 0.000354 ACACG 0.000745 ACACT 0.000817 ACAGA 0.00114 ACAGC 0.000504 ACAGG 0.000426 ACAGT 0.000995 ACATA 0.00281 ACATC 0.000902 ACATG 0.00106 ACATT 0.00261 ACCAA 0.000793 ACCAC 0.000432 ACCAG 0.000341 ACCAT 0.000732 ACCCA 0.000209 ACCCC 0.000126 ACCCG 0.000137 ACCCT 0.000262 ACCGA 0.000451 ACCGC 0.00026 ACCGG 0.000184 ACCGT 0.000407 ACCTA 0.000569 ACCTC 0.000327 ACCTG 0.00037 ACCTT 0.000702 ACGAA 0.0014 ACGAC 0.000538 ACGAG 0.000597 ACGAT 0.00125 ACGCA 0.000589 ACGCC 0.000204 ACGCG 0.000526 ACGCT 0.000439 ACGGA 0.00044 ACGGC 0.000202 ACGGG 0.000192 ACGGT 0.000407 ACGTA 0.00118 ACGTC 0.000481 ACGTG 0.000703 ACGTT 0.00125 ACTAA 0.00131 ACTAC 0.000722 ACTAG 0.000532 ACTAT 0.00154 ACTCA 0.000564 ACTCC 0.000283 ACTCG 0.000503 ACTCT 0.000657 ACTGA 0.000824 ACTGC 0.000499 ACTGG 0.000338 ACTGT 0.000995 ACTTA 0.00144 ACTTC 0.000874 ACTTG 0.000863 ACTTT 0.00224 AGAAA 0.00332 AGAAC 0.000958 AGAAG 0.00107 AGAAT 0.00212 AGACA 0.000822 AGACC 0.000233 AGACG 0.000402 AGACT 0.000516 AGAGA 0.00125 AGAGC 0.000352 AGAGG 0.000447 AGAGT 0.000657 AGATA 0.00188 AGATC 0.000676 AGATG 0.000807 AGATT 0.00165 AGCAA 0.00102 AGCAC 0.000474 AGCAG 0.000471 AGCAT 0.000815 AGCCA 0.000344 AGCCC 0.000118 AGCCG 0.000183 AGCCT 0.000269 AGCGA 0.000497 AGCGC 0.000241 AGCGG 0.00021 AGCGT 0.000439 AGCTA 0.000569 AGCTC 0.000301 AGCTG 0.000426 AGCTT 0.000718 AGGAA 0.00116 AGGAC 0.000299 AGGAG 0.000409 AGGAT 0.000723 AGGCA 0.000376 AGGCC 0.000127 AGGCG 0.000199 AGGCT 0.000269 AGGGA 0.000423 AGGGC 0.000151 AGGGG 0.000182 AGGGT 0.000262 AGGTA 0.000709 AGGTC 0.000246 AGGTG 0.000384 AGGTT 0.000629 AGTAA 0.00179 AGTAC 0.000839 AGTAG 0.000684 AGTAT 0.00177 AGTCA 0.00067 AGTCC 0.000209 AGTCG 0.00038 AGTCT 0.000516 AGTGA 0.000844 AGTGC 0.000433 AGTGG 0.000385 AGTGT 0.000817 AGTTA 0.00142 AGTTC 0.000771 AGTTG 0.000785 AGTTT 0.00186 ATAAA 0.00614 ATAAC 0.00178 ATAAG 0.0016 ATAAT 0.00534 ATACA 0.00307 ATACC 0.000727 ATACG 0.00108 ATACT 0.00177 ATAGA 0.00176 ATAGC 0.000694 ATAGG 0.000608 ATAGT 0.00154 ATATA 0.00817 ATATC 0.00216 ATATG 0.00248 ATATT 0.00637 ATCAA 0.00187 ATCAC 0.000877 ATCAG 0.000776 ATCAT 0.00193 ATCCA 0.00073 ATCCC 0.000295 ATCCG 0.00035 ATCCT 0.000723 ATCGA 0.00142 ATCGC 0.000582 ATCGG 0.000392 ATCGT 0.00125 ATCTA 0.00142 ATCTC 0.000832 ATCTG 0.000799 ATCTT 0.00197 ATGAA 0.0025 ATGAC 0.000809 ATGAG 0.000634 ATGAT 0.00193 ATGCA 0.00132 ATGCC 0.000349 ATGCG 0.000514 ATGCT 0.000815 ATGGA 0.000867 ATGGC 0.00043 ATGGG 0.000256 ATGGT 0.000732 ATGTA 0.00308 ATGTC 0.00082 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.00242 ATTAA 0.00452 ATTAC 0.00211 ATTAG 0.00132 ATTAT 0.00534 ATTCA 0.00205 ATTCC 0.000862 ATTCG 0.00115 ATTCT 0.00212 ATTGA 0.00188 ATTGC 0.00115 ATTGG 0.000767 ATTGT 0.00248 ATTTA 0.00523 ATTTC 0.00299 ATTTG 0.00248 ATTTT 0.00689 CAAAA 0.00273 CAAAC 0.00106 CAAAG 0.00105 CAAAT 0.00248 CAACA 0.00108 CAACC 0.000338 CAACG 0.000614 CAACT 0.000785 CAAGA 0.000889 CAAGC 0.000423 CAAGG 0.000398 CAAGT 0.000863 CAATA 0.00214 CAATC 0.000828 CAATG 0.00104 CAATT 0.00226 CACAA 0.00107 CACAC 0.000714 CACAG 0.000524 CACAT 0.00106 CACCA 0.000443 CACCC 0.000177 CACCG 0.00028 CACCT 0.000384 CACGA 0.000691 CACGC 0.000415 CACGG 0.000278 CACGT 0.000703 CACTA 0.000641 CACTC 0.000387 CACTG 0.000536 CACTT 0.000912 CAGAA 0.00114 CAGAC 0.000361 CAGAG 0.000463 CAGAT 0.000799 CAGCA 0.000513 CAGCC 0.000226 CAGCG 0.000277 CAGCT 0.000426 CAGGA 0.00042 CAGGC 0.000194 CAGGG 0.000169 CAGGT 0.00037 CAGTA 0.00085 CAGTC 0.000348 CAGTG 0.000536 CAGTT 0.000922 CATAA 0.00201 CATAC 0.00108 CATAG 0.000682 CATAT 0.00248 CATCA 0.000848 CATCC 0.000384 CATCG 0.000614 CATCT 0.000807 CATGA 0.000845 CATGC 0.000516 CATGG 0.000394 CATGT 0.00106 CATTA 0.00192 CATTC 0.00109 CATTG 0.00104 CATTT 0.00276 CCAAA 0.000853 CCAAC 0.000406 CCAAG 0.000328 CCAAT 0.000767 CCACA 0.000359 CCACC 0.000264 CCACG 0.000339 CCACT 0.000385 CCAGA 0.000332 CCAGC 0.000206 CCAGG 0.00016 CCAGT 0.000338 CCATA 0.000611 CCATC 0.000414 CCATG 0.000394 CCATT 0.000864 CCCAA 0.000268 CCCAC 0.000176 CCCAG 0.00012 CCCAT 0.000256 CCCCA 0.00015 CCCCC 0.000106 CCCCG 9.34e-05 CCCCT 0.000182 CCCGA 0.000167 CCCGC 0.000116 CCCGG 7.28e-05 CCCGT 0.000192 CCCTA 0.000211 CCCTC 0.000254 CCCTG 0.000169 CCCTT 0.000384 CCGAA 0.000416 CCGAC 0.000211 CCGAG 0.000221 CCGAT 0.000392 CCGCA 0.00021 CCGCC 0.000141 CCGCG 0.000249 CCGCT 0.00021 CCGGA 0.000193 CCGGC 0.000135 CCGGG 7.28e-05 CCGGT 0.000184 CCGTA 0.000335 CCGTC 0.000213 CCGTG 0.000278 CCGTT 0.000415 CCTAA 0.000537 CCTAC 0.000289 CCTAG 0.000215 CCTAT 0.000608 CCTCA 0.000275 CCTCC 0.000258 CCTCG 0.000295 CCTCT 0.000447 CCTGA 0.000325 CCTGC 0.000242 CCTGG 0.00016 CCTGT 0.000426 CCTTA 0.000553 CCTTC 0.000528 CCTTG 0.000398 CCTTT 0.000996 CGAAA 0.00142 CGAAC 0.000615 CGAAG 0.000633 CGAAT 0.00115 CGACA 0.000524 CGACC 0.000246 CGACG 0.000466 CGACT 0.00038 CGAGA 0.000651 CGAGC 0.000327 CGAGG 0.000295 CGAGT 0.000503 CGATA 0.00119 CGATC 0.00071 CGATG 0.000614 CGATT 0.00114 CGCAA 0.000565 CGCAC 0.000325 CGCAG 0.000289 CGCAT 0.000514 CGCCA 0.000295 CGCCC 0.000105 CGCCG 0.0002 CGCCT 0.000199 CGCGA 0.000531 CGCGC 0.000391 CGCGG 0.000249 CGCGT 0.000526 CGCTA 0.000364 CGCTC 0.000288 CGCTG 0.000277 CGCTT 0.000457 CGGAA 0.000497 CGGAC 0.000182 CGGAG 0.000229 CGGAT 0.00035 CGGCA 0.000247 CGGCC 0.000138 CGGCG 0.0002 CGGCT 0.000183 CGGGA 0.000213 CGGGC 0.000104 CGGGG 9.34e-05 CGGGT 0.000137 CGGTA 0.000411 CGGTC 0.000241 CGGTG 0.00028 CGGTT 0.000369 CGTAA 0.000976 CGTAC 0.000606 CGTAG 0.000428 CGTAT 0.00108 CGTCA 0.000481 CGTCC 0.00027 CGTCG 0.000466 CGTCT 0.000402 CGTGA 0.000616 CGTGC 0.000385 CGTGG 0.000339 CGTGT 0.000745 CGTTA 0.000963 CGTTC 0.000701 CGTTG 0.000614 CGTTT 0.00133 CTAAA 0.00145 CTAAC 0.000635 CTAAG 0.000467 CTAAT 0.00132 CTACA 0.000814 CTACC 0.000323 CTACG 0.000428 CTACT 0.000684 CTAGA 0.000561 CTAGC 0.000276 CTAGG 0.000215 CTAGT 0.000532 CTATA 0.00155 CTATC 0.000702 CTATG 0.000682 CTATT 0.00167 CTCAA 0.000649 CTCAC 0.000377 CTCAG 0.00028 CTCAT 0.000634 CTCCA 0.000351 CTCCC 0.000215 CTCCG 0.000229 CTCCT 0.000409 CTCGA 0.000631 CTCGC 0.000327 CTCGG 0.000221 CTCGT 0.000597 CTCTA 0.000631 CTCTC 0.000642 CTCTG 0.000463 CTCTT 0.000973 CTGAA 0.000866 CTGAC 0.000404 CTGAG 0.00028 CTGAT 0.000776 CTGCA 0.000566 CTGCC 0.000259 CTGCG 0.000289 CTGCT 0.000471 CTGGA 0.000365 CTGGC 0.000211 CTGGG 0.00012 CTGGT 0.000341 CTGTA 0.000975 CTGTC 0.000498 CTGTG 0.000524 CTGTT 0.00107 CTTAA 0.00147 CTTAC 0.000725 CTTAG 0.000467 CTTAT 0.0016 CTTCA 0.000828 CTTCC 0.000592 CTTCG 0.000633 CTTCT 0.00107 CTTGA 0.000762 CTTGC 0.000499 CTTGG 0.000328 CTTGT 0.000983 CTTTA 0.00175 CTTTC 0.00142 CTTTG 0.00105 CTTTT 0.00286 GAAAA 0.00337 GAAAC 0.00144 GAAAG 0.00142 GAAAT 0.00299 GAACA 0.00113 GAACC 0.000343 GAACG 0.000701 GAACT 0.000771 GAAGA 0.00121 GAAGC 0.000505 GAAGG 0.000528 GAAGT 0.000874 GAATA 0.00211 GAATC 0.000903 GAATG 0.00109 GAATT 0.00208 GACAA 0.000953 GACAC 0.000442 GACAG 0.000498 GACAT 0.00082 GACCA 0.00033 GACCC 0.000108 GACCG 0.000241 GACCT 0.000246 GACGA 0.000618 GACGC 0.000306 GACGG 0.000213 GACGT 0.000481 GACTA 0.00053 GACTC 0.000285 GACTG 0.000348 GACTT 0.000611 GAGAA 0.00128 GAGAC 0.000403 GAGAG 0.000642 GAGAT 0.000832 GAGCA 0.00045 GAGCC 0.000154 GAGCG 0.000288 GAGCT 0.000301 GAGGA 0.000503 GAGGC 0.000189 GAGGG 0.000254 GAGGT 0.000327 GAGTA 0.000696 GAGTC 0.000285 GAGTG 0.000387 GAGTT 0.000639 GATAA 0.0019 GATAC 0.000976 GATAG 0.000702 GATAT 0.00216 GATCA 0.000798 GATCC 0.000342 GATCG 0.00071 GATCT 0.000676 GATGA 0.000894 GATGC 0.000443 GATGG 0.000414 GATGT 0.000902 GATTA 0.00154 GATTC 0.000903 GATTG 0.000828 GATTT 0.00203 GCAAA 0.00125 GCAAC 0.000588 GCAAG 0.000499 GCAAT 0.00115 GCACA 0.000653 GCACC 0.000253 GCACG 0.000385 GCACT 0.000433 GCAGA 0.000525 GCAGC 0.000321 GCAGG 0.000242 GCAGT 0.000499 GCATA 0.000983 GCATC 0.000443 GCATG 0.000516 GCATT 0.00106 GCCAA 0.000411 GCCAC 0.000271 GCCAG 0.000211 GCCAT 0.00043 GCCCA 0.000138 GCCCC 9.6e-05 GCCCG 0.000104 GCCCT 0.000151 GCCGA 0.000247 GCCGC 0.000184 GCCGG 0.000135 GCCGT 0.000202 GCCTA 0.000235 GCCTC 0.000189 GCCTG 0.000194 GCCTT 0.000355 GCGAA 0.000633 GCGAC 0.000309 GCGAG 0.000327 GCGAT 0.000582 GCGCA 0.000354 GCGCC 0.000172 GCGCG 0.000391 GCGCT 0.000241 GCGGA 0.000251 GCGGC 0.000184 GCGGG 0.000116 GCGGT 0.00026 GCGTA 0.0005 GCGTC 0.000306 GCGTG 0.000415 GCGTT 0.000538 GCTAA 0.000584 GCTAC 0.00041 GCTAG 0.000276 GCTAT 0.000694 GCTCA 0.000314 GCTCC 0.000199 GCTCG 0.000327 GCTCT 0.000352 GCTGA 0.000411 GCTGC 0.000321 GCTGG 0.000206 GCTGT 0.000504 GCTTA 0.000603 GCTTC 0.000505 GCTTG 0.000423 GCTTT 0.000968 GGAAA 0.0014 GGAAC 0.000464 GGAAG 0.000592 GGAAT 0.000862 GGACA 0.00036 GGACC 0.000137 GGACG 0.00027 GGACT 0.000209 GGAGA 0.000465 GGAGC 0.000199 GGAGG 0.000258 GGAGT 0.000283 GGATA 0.000717 GGATC 0.000342 GGATG 0.000384 GGATT 0.000655 GGCAA 0.000435 GGCAC 0.000238 GGCAG 0.000259 GGCAT 0.000349 GGCCA 0.000198 GGCCC 9.28e-05 GGCCG 0.000138 GGCCT 0.000127 GGCGA 0.000282 GGCGC 0.000172 GGCGG 0.000141 GGCGT 0.000204 GGCTA 0.000249 GGCTC 0.000154 GGCTG 0.000226 GGCTT 0.000286 GGGAA 0.000487 GGGAC 0.000168 GGGAG 0.000215 GGGAT 0.000295 GGGCA 0.000172 GGGCC 9.28e-05 GGGCG 0.000105 GGGCT 0.000118 GGGGA 0.000204 GGGGC 9.6e-05 GGGGG 0.000106 GGGGT 0.000126 GGGTA 0.000233 GGGTC 0.000108 GGGTG 0.000177 GGGTT 0.000215 GGTAA 0.000726 GGTAC 0.000394 GGTAG 0.000323 GGTAT 0.000727 GGTCA 0.000311 GGTCC 0.000137 GGTCG 0.000246 GGTCT 0.000233 GGTGA 0.000412 GGTGC 0.000253 GGTGG 0.000264 GGTGT 0.000354 GGTTA 0.000582 GGTTC 0.000343 GGTTG 0.000338 GGTTT 0.000659 GTAAA 0.00228 GTAAC 0.000992 GTAAG 0.000725 GTAAT 0.00211 GTACA 0.00142 GTACC 0.000394 GTACG 0.000606 GTACT 0.000839 GTAGA 0.000831 GTAGC 0.00041 GTAGG 0.000289 GTAGT 0.000722 GTATA 0.0024 GTATC 0.000976 GTATG 0.00108 GTATT 0.00219 GTCAA 0.000773 GTCAC 0.000484 GTCAG 0.000404 GTCAT 0.000809 GTCCA 0.000328 GTCCC 0.000168 GTCCG 0.000182 GTCCT 0.000299 GTCGA 0.000559 GTCGC 0.000309 GTCGG 0.000211 GTCGT 0.000538 GTCTA 0.000515 GTCTC 0.000403 GTCTG 0.000361 GTCTT 0.000694 GTGAA 0.00109 GTGAC 0.000484 GTGAG 0.000377 GTGAT 0.000877 GTGCA 0.000686 GTGCC 0.000238 GTGCG 0.000325 GTGCT 0.000474 GTGGA 0.000467 GTGGC 0.000271 GTGGG 0.000176 GTGGT 0.000432 GTGTA 0.00117 GTGTC 0.000442 GTGTG 0.000714 GTGTT 0.000987 GTTAA 0.00169 GTTAC 0.000992 GTTAG 0.000635 GTTAT 0.00178 GTTCA 0.000905 GTTCC 0.000464 GTTCG 0.000615 GTTCT 0.000958 GTTGA 0.000857 GTTGC 0.000588 GTTGG 0.000406 GTTGT 0.000967 GTTTA 0.00184 GTTTC 0.00144 GTTTG 0.00106 GTTTT 0.00234 TAAAA 0.006 TAAAC 0.00184 TAAAG 0.00175 TAAAT 0.00523 TAACA 0.00213 TAACC 0.000582 TAACG 0.000963 TAACT 0.00142 TAAGA 0.00166 TAAGC 0.000603 TAAGG 0.000553 TAAGT 0.00144 TAATA 0.00498 TAATC 0.00154 TAATG 0.00192 TAATT 0.00484 TACAA 0.00269 TACAC 0.00117 TACAG 0.000975 TACAT 0.00308 TACCA 0.000818 TACCC 0.000233 TACCG 0.000411 TACCT 0.000709 TACGA 0.00108 TACGC 0.0005 TACGG 0.000335 TACGT 0.00118 TACTA 0.0015 TACTC 0.000696 TACTG 0.00085 TACTT 0.00204 TAGAA 0.00203 TAGAC 0.000515 TAGAG 0.000631 TAGAT 0.00142 TAGCA 0.000782 TAGCC 0.000249 TAGCG 0.000364 TAGCT 0.000569 TAGGA 0.000634 TAGGC 0.000235 TAGGG 0.000211 TAGGT 0.000569 TAGTA 0.0015 TAGTC 0.00053 TAGTG 0.000641 TAGTT 0.00143 TATAA 0.00524 TATAC 0.0024 TATAG 0.00155 TATAT 0.00817 TATCA 0.00196 TATCC 0.000717 TATCG 0.00119 TATCT 0.00188 TATGA 0.00185 TATGC 0.000983 TATGG 0.000611 TATGT 0.00281 TATTA 0.00498 TATTC 0.00211 TATTG 0.00214 TATTT 0.00669 TCAAA 0.00222 TCAAC 0.000857 TCAAG 0.000762 TCAAT 0.00188 TCACA 0.000959 TCACC 0.000412 TCACG 0.000616 TCACT 0.000844 TCAGA 0.000768 TCAGC 0.000411 TCAGG 0.000325 TCAGT 0.000824 TCATA 0.00185 TCATC 0.000894 TCATG 0.000845 TCATT 0.00229 TCCAA 0.000882 TCCAC 0.000467 TCCAG 0.000365 TCCAT 0.000867 TCCCA 0.000323 TCCCC 0.000204 TCCCG 0.000213 TCCCT 0.000423 TCCGA 0.000374 TCCGC 0.000251 TCCGG 0.000193 TCCGT 0.00044 TCCTA 0.000634 TCCTC 0.000503 TCCTG 0.00042 TCCTT 0.00104 TCGAA 0.00137 TCGAC 0.000559 TCGAG 0.000631 TCGAT 0.00142 TCGCA 0.000541 TCGCC 0.000282 TCGCG 0.000531 TCGCT 0.000497 TCGGA 0.000374 TCGGC 0.000247 TCGGG 0.000167 TCGGT 0.000451 TCGTA 0.00108 TCGTC 0.000618 TCGTG 0.000691 TCGTT 0.0014 TCTAA 0.00145 TCTAC 0.000831 TCTAG 0.000561 TCTAT 0.00176 TCTCA 0.000789 TCTCC 0.000465 TCTCG 0.000651 TCTCT 0.00125 TCTGA 0.000768 TCTGC 0.000525 TCTGG 0.000332 TCTGT 0.00114 TCTTA 0.00166 TCTTC 0.00121 TCTTG 0.000889 TCTTT 0.00289 TGAAA 0.00309 TGAAC 0.000905 TGAAG 0.000828 TGAAT 0.00205 TGACA 0.00101 TGACC 0.000311 TGACG 0.000481 TGACT 0.00067 TGAGA 0.000789 TGAGC 0.000314 TGAGG 0.000275 TGAGT 0.000564 TGATA 0.00196 TGATC 0.000798 TGATG 0.000848 TGATT 0.00185 TGCAA 0.00146 TGCAC 0.000686 TGCAG 0.000566 TGCAT 0.00132 TGCCA 0.000485 TGCCC 0.000172 TGCCG 0.000247 TGCCT 0.000376 TGCGA 0.000541 TGCGC 0.000354 TGCGG 0.00021 TGCGT 0.000589 TGCTA 0.000782 TGCTC 0.00045 TGCTG 0.000513 TGCTT 0.00104 TGGAA 0.00117 TGGAC 0.000328 TGGAG 0.000351 TGGAT 0.00073 TGGCA 0.000485 TGGCC 0.000198 TGGCG 0.000295 TGGCT 0.000344 TGGGA 0.000323 TGGGC 0.000138 TGGGG 0.00015 TGGGT 0.000209 TGGTA 0.000818 TGGTC 0.00033 TGGTG 0.000443 TGGTT 0.000707 TGTAA 0.00262 TGTAC 0.00142 TGTAG 0.000814 TGTAT 0.00307 TGTCA 0.00101 TGTCC 0.00036 TGTCG 0.000524 TGTCT 0.000822 TGTGA 0.000959 TGTGC 0.000653 TGTGG 0.000359 TGTGT 0.0014 TGTTA 0.00213 TGTTC 0.00113 TGTTG 0.00108 TGTTT 0.00284 TTAAA 0.00496 TTAAC 0.00169 TTAAG 0.00147 TTAAT 0.00452 TTACA 0.00262 TTACC 0.000726 TTACG 0.000976 TTACT 0.00179 TTAGA 0.00145 TTAGC 0.000584 TTAGG 0.000537 TTAGT 0.00131 TTATA 0.00524 TTATC 0.0019 TTATG 0.00201 TTATT 0.00571 TTCAA 0.00242 TTCAC 0.00109 TTCAG 0.000866 TTCAT 0.0025 TTCCA 0.00117 TTCCC 0.000487 TTCCG 0.000497 TTCCT 0.00116 TTCGA 0.00137 TTCGC 0.000633 TTCGG 0.000416 TTCGT 0.0014 TTCTA 0.00203 TTCTC 0.00128 TTCTG 0.00114 TTCTT 0.00301 TTGAA 0.00242 TTGAC 0.000773 TTGAG 0.000649 TTGAT 0.00187 TTGCA 0.00146 TTGCC 0.000435 TTGCG 0.000565 TTGCT 0.00102 TTGGA 0.000882 TTGGC 0.000411 TTGGG 0.000268 TTGGT 0.000793 TTGTA 0.00269 TTGTC 0.000953 TTGTG 0.00107 TTGTT 0.0027 TTTAA 0.00496 TTTAC 0.00228 TTTAG 0.00145 TTTAT 0.00614 TTTCA 0.00309 TTTCC 0.0014 TTTCG 0.00142 TTTCT 0.00332 TTTGA 0.00222 TTTGC 0.00125 TTTGG 0.000853 TTTGT 0.00299 TTTTA 0.006 TTTTC 0.00337 TTTTG 0.00273 TTTTT 0.00746 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3815 AAAAC 0.1199 AAAAG 0.1464 AAAAT 0.3522 AAACA 0.4248 AAACC 0.09857 AAACG 0.1983 AAACT 0.2783 AAAGA 0.4072 AAAGC 0.1366 AAAGG 0.1406 AAAGT 0.3156 AAATA 0.3806 AAATC 0.1152 AAATG 0.1571 AAATT 0.3471 AACAA 0.3764 AACAC 0.1374 AACAG 0.1485 AACAT 0.3376 AACCA 0.3681 AACCC 0.1122 AACCG 0.192 AACCT 0.3277 AACGA 0.3875 AACGC 0.1494 AACGG 0.1152 AACGT 0.3479 AACTA 0.2962 AACTC 0.1319 AACTG 0.1905 AACTT 0.3814 AAGAA 0.4534 AAGAC 0.1044 AAGAG 0.1463 AAGAT 0.2959 AAGCA 0.4155 AAGCC 0.1145 AAGCG 0.1828 AAGCT 0.2872 AAGGA 0.4184 AAGGC 0.1432 AAGGG 0.1549 AAGGT 0.2835 AAGTA 0.3776 AAGTC 0.1129 AAGTG 0.1685 AAGTT 0.341 AATAA 0.3585 AATAC 0.1372 AATAG 0.1046 AATAT 0.3997 AATCA 0.3493 AATCC 0.1236 AATCG 0.2152 AATCT 0.3119 AATGA 0.3357 AATGC 0.1549 AATGG 0.1265 AATGT 0.3829 AATTA 0.3167 AATTC 0.1362 AATTG 0.1479 AATTT 0.3992 ACAAA 0.4024 ACAAC 0.1303 ACAAG 0.1325 ACAAT 0.3348 ACACA 0.422 ACACC 0.1067 ACACG 0.2248 ACACT 0.2465 ACAGA 0.3714 ACAGC 0.1645 ACAGG 0.1391 ACAGT 0.325 ACATA 0.38 ACATC 0.1221 ACATG 0.1439 ACATT 0.354 ACCAA 0.3453 ACCAC 0.1881 ACCAG 0.1482 ACCAT 0.3184 ACCCA 0.2851 ACCCC 0.1714 ACCCG 0.1863 ACCCT 0.3571 ACCGA 0.3465 ACCGC 0.2 ACCGG 0.141 ACCGT 0.3125 ACCTA 0.2891 ACCTC 0.166 ACCTG 0.188 ACCTT 0.3569 ACGAA 0.3688 ACGAC 0.1423 ACGAG 0.1577 ACGAT 0.3312 ACGCA 0.3353 ACGCC 0.1162 ACGCG 0.299 ACGCT 0.2495 ACGGA 0.355 ACGGC 0.163 ACGGG 0.1543 ACGGT 0.3278 ACGTA 0.3256 ACGTC 0.1331 ACGTG 0.1945 ACGTT 0.3468 ACTAA 0.3188 ACTAC 0.1759 ACTAG 0.1296 ACTAT 0.3756 ACTCA 0.2811 ACTCC 0.1408 ACTCG 0.2505 ACTCT 0.3276 ACTGA 0.3103 ACTGC 0.1878 ACTGG 0.1273 ACTGT 0.3746 ACTTA 0.2661 ACTTC 0.1614 ACTTG 0.1593 ACTTT 0.4132 AGAAA 0.4449 AGAAC 0.1284 AGAAG 0.1429 AGAAT 0.2838 AGACA 0.4168 AGACC 0.1179 AGACG 0.2037 AGACT 0.2615 AGAGA 0.4622 AGAGC 0.1301 AGAGG 0.165 AGAGT 0.2427 AGATA 0.3753 AGATC 0.1347 AGATG 0.1607 AGATT 0.3292 AGCAA 0.3671 AGCAC 0.1705 AGCAG 0.1695 AGCAT 0.2929 AGCCA 0.3767 AGCCC 0.1291 AGCCG 0.1999 AGCCT 0.2944 AGCGA 0.3584 AGCGC 0.1736 AGCGG 0.1516 AGCGT 0.3165 AGCTA 0.2826 AGCTC 0.1493 AGCTG 0.2115 AGCTT 0.3566 AGGAA 0.4485 AGGAC 0.1151 AGGAG 0.1577 AGGAT 0.2787 AGGCA 0.3874 AGGCC 0.1308 AGGCG 0.2051 AGGCT 0.2768 AGGGA 0.4159 AGGGC 0.1478 AGGGG 0.179 AGGGT 0.2573 AGGTA 0.3603 AGGTC 0.1248 AGGTG 0.1952 AGGTT 0.3197 AGTAA 0.3525 AGTAC 0.165 AGTAG 0.1345 AGTAT 0.3479 AGTCA 0.3774 AGTCC 0.1179 AGTCG 0.2139 AGTCT 0.2908 AGTGA 0.3405 AGTGC 0.1746 AGTGG 0.1552 AGTGT 0.3297 AGTTA 0.2942 AGTTC 0.1593 AGTTG 0.1621 AGTTT 0.3843 ATAAA 0.4133 ATAAC 0.1199 ATAAG 0.1077 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4622 ATACC 0.1094 ATACG 0.1623 ATACT 0.2662 ATAGA 0.3823 ATAGC 0.1508 ATAGG 0.132 ATAGT 0.3348 ATATA 0.4258 ATATC 0.1128 ATATG 0.1294 ATATT 0.332 ATCAA 0.3429 ATCAC 0.1606 ATCAG 0.1421 ATCAT 0.3543 ATCCA 0.3482 ATCCC 0.1405 ATCCG 0.1669 ATCCT 0.3445 ATCGA 0.3903 ATCGC 0.1593 ATCGG 0.1072 ATCGT 0.3432 ATCTA 0.2833 ATCTC 0.1657 ATCTG 0.1591 ATCTT 0.3919 ATGAA 0.4254 ATGAC 0.1377 ATGAG 0.1078 ATGAT 0.3291 ATGCA 0.4409 ATGCC 0.1163 ATGCG 0.1714 ATGCT 0.2715 ATGGA 0.3797 ATGGC 0.1881 ATGGG 0.112 ATGGT 0.3203 ATGTA 0.4175 ATGTC 0.111 ATGTG 0.1434 ATGTT 0.3281 ATTAA 0.3403 ATTAC 0.1586 ATTAG 0.09965 ATTAT 0.4015 ATTCA 0.3319 ATTCC 0.1393 ATTCG 0.1865 ATTCT 0.3423 ATTGA 0.299 ATTGC 0.1829 ATTGG 0.1222 ATTGT 0.3959 ATTTA 0.2974 ATTTC 0.1701 ATTTG 0.1408 ATTTT 0.3917 CAAAA 0.3731 CAAAC 0.1445 CAAAG 0.1435 CAAAT 0.3388 CAACA 0.3839 CAACC 0.12 CAACG 0.2178 CAACT 0.2784 CAAGA 0.3456 CAAGC 0.1645 CAAGG 0.1545 CAAGT 0.3354 CAATA 0.3414 CAATC 0.132 CAATG 0.1663 CAATT 0.3604 CACAA 0.3183 CACAC 0.2119 CACAG 0.1554 CACAT 0.3144 CACCA 0.3452 CACCC 0.1376 CACCG 0.218 CACCT 0.2992 CACGA 0.3311 CACGC 0.1987 CACGG 0.1332 CACGT 0.3369 CACTA 0.259 CACTC 0.1562 CACTG 0.2163 CACTT 0.3685 CAGAA 0.4125 CAGAC 0.1308 CAGAG 0.1677 CAGAT 0.2891 CAGCA 0.3555 CAGCC 0.1569 CAGCG 0.1923 CAGCT 0.2953 CAGGA 0.3645 CAGGC 0.1678 CAGGG 0.1467 CAGGT 0.321 CAGTA 0.3203 CAGTC 0.1309 CAGTG 0.2016 CAGTT 0.3472 CATAA 0.321 CATAC 0.1724 CATAG 0.1092 CATAT 0.3974 CATCA 0.3197 CATCC 0.1446 CATCG 0.2315 CATCT 0.3042 CATGA 0.2999 CATGC 0.183 CATGG 0.1398 CATGT 0.3773 CATTA 0.2818 CATTC 0.1602 CATTG 0.1529 CATTT 0.405 CCAAA 0.3624 CCAAC 0.1723 CCAAG 0.1394 CCAAT 0.3258 CCACA 0.2663 CCACC 0.1961 CCACG 0.2518 CCACT 0.2858 CCAGA 0.3206 CCAGC 0.1986 CCAGG 0.1542 CCAGT 0.3266 CCATA 0.2676 CCATC 0.1813 CCATG 0.1726 CCATT 0.3785 CCCAA 0.3265 CCCAC 0.2143 CCCAG 0.1468 CCCAT 0.3123 CCCCA 0.2821 CCCCC 0.1987 CCCCG 0.1757 CCCCT 0.3435 CCCGA 0.3049 CCCGC 0.2119 CCCGG 0.1329 CCCGT 0.3504 CCCTA 0.2071 CCCTC 0.2498 CCCTG 0.1662 CCCTT 0.3769 CCGAA 0.3358 CCGAC 0.1705 CCGAG 0.1779 CCGAT 0.3159 CCGCA 0.2589 CCGCC 0.1736 CCGCG 0.308 CCGCT 0.2596 CCGGA 0.3307 CCGGC 0.2307 CCGGG 0.1243 CCGGT 0.3143 CCGTA 0.2696 CCGTC 0.1718 CCGTG 0.224 CCGTT 0.3345 CCTAA 0.3257 CCTAC 0.1754 CCTAG 0.1303 CCTAT 0.3686 CCTCA 0.2155 CCTCC 0.2021 CCTCG 0.2318 CCTCT 0.3507 CCTGA 0.2817 CCTGC 0.2101 CCTGG 0.1386 CCTGT 0.3695 CCTTA 0.2234 CCTTC 0.2133 CCTTG 0.1606 CCTTT 0.4027 CGAAA 0.3709 CGAAC 0.1611 CGAAG 0.1658 CGAAT 0.3022 CGACA 0.3246 CGACC 0.1523 CGACG 0.2882 CGACT 0.2349 CGAGA 0.3665 CGAGC 0.1842 CGAGG 0.1663 CGAGT 0.283 CGATA 0.3251 CGATC 0.1944 CGATG 0.1682 CGATT 0.3123 CGCAA 0.3336 CGCAC 0.192 CGCAG 0.1706 CGCAT 0.3038 CGCCA 0.369 CGCCC 0.1314 CGCCG 0.25 CGCCT 0.2497 CGCGA 0.313 CGCGC 0.2303 CGCGG 0.1469 CGCGT 0.3097 CGCTA 0.2625 CGCTC 0.2079 CGCTG 0.2 CGCTT 0.3296 CGGAA 0.395 CGGAC 0.1447 CGGAG 0.1818 CGGAT 0.2785 CGGCA 0.3223 CGGCC 0.1794 CGGCG 0.2602 CGGCT 0.2381 CGGGA 0.3895 CGGGC 0.1898 CGGGG 0.1705 CGGGT 0.2502 CGGTA 0.3161 CGGTC 0.1853 CGGTG 0.2152 CGGTT 0.2835 CGTAA 0.316 CGTAC 0.1961 CGTAG 0.1387 CGTAT 0.3492 CGTCA 0.2972 CGTCC 0.1666 CGTCG 0.2878 CGTCT 0.2484 CGTGA 0.2953 CGTGC 0.1848 CGTGG 0.1625 CGTGT 0.3574 CGTTA 0.2673 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.1704 CGTTT 0.3678 CTAAA 0.3735 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1205 CTAAT 0.3419 CTACA 0.3619 CTACC 0.1435 CTACG 0.1905 CTACT 0.3041 CTAGA 0.354 CTAGC 0.1745 CTAGG 0.1357 CTAGT 0.3358 CTATA 0.3371 CTATC 0.1526 CTATG 0.1483 CTATT 0.362 CTCAA 0.3347 CTCAC 0.1943 CTCAG 0.1445 CTCAT 0.3266 CTCCA 0.2918 CTCCC 0.1785 CTCCG 0.1899 CTCCT 0.3398 CTCGA 0.3554 CTCGC 0.1842 CTCGG 0.1242 CTCGT 0.3362 CTCTA 0.233 CTCTC 0.237 CTCTG 0.171 CTCTT 0.359 CTGAA 0.3724 CTGAC 0.1738 CTGAG 0.1205 CTGAT 0.3334 CTGCA 0.3572 CTGCC 0.1635 CTGCG 0.1821 CTGCT 0.2973 CTGGA 0.352 CTGGC 0.2034 CTGGG 0.1161 CTGGT 0.3285 CTGTA 0.3184 CTGTC 0.1625 CTGTG 0.171 CTGTT 0.3482 CTTAA 0.3442 CTTAC 0.1702 CTTAG 0.1096 CTTAT 0.376 CTTCA 0.2653 CTTCC 0.1899 CTTCG 0.203 CTTCT 0.3419 CTTGA 0.2963 CTTGC 0.194 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3821 CTTTA 0.2476 CTTTC 0.2005 CTTTG 0.148 CTTTT 0.404 GAAAA 0.3654 GAAAC 0.156 GAAAG 0.1542 GAAAT 0.3245 GAACA 0.3836 GAACC 0.1165 GAACG 0.2381 GAACT 0.2619 GAAGA 0.3884 GAAGC 0.1621 GAAGG 0.1692 GAAGT 0.2803 GAATA 0.3406 GAATC 0.1459 GAATG 0.1768 GAATT 0.3367 GACAA 0.3515 GACAC 0.1628 GACAG 0.1834 GACAT 0.3023 GACCA 0.3572 GACCC 0.1168 GACCG 0.2605 GACCT 0.2655 GACGA 0.3821 GACGC 0.1888 GACGG 0.1318 GACGT 0.2973 GACTA 0.2988 GACTC 0.1604 GACTG 0.1961 GACTT 0.3447 GAGAA 0.4054 GAGAC 0.1276 GAGAG 0.2035 GAGAT 0.2635 GAGCA 0.3772 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2418 GAGCT 0.2521 GAGGA 0.3952 GAGGC 0.1486 GAGGG 0.1997 GAGGT 0.2565 GAGTA 0.3469 GAGTC 0.1418 GAGTG 0.1929 GAGTT 0.3184 GATAA 0.3314 GATAC 0.1699 GATAG 0.1222 GATAT 0.3765 GATCA 0.316 GATCC 0.1353 GATCG 0.281 GATCT 0.2677 GATGA 0.3371 GATGC 0.167 GATGG 0.1559 GATGT 0.34 GATTA 0.2908 GATTC 0.1704 GATTG 0.1564 GATTT 0.3824 GCAAA 0.3585 GCAAC 0.1688 GCAAG 0.1432 GCAAT 0.3294 GCACA 0.3788 GCACC 0.1465 GCACG 0.2236 GCACT 0.2511 GCAGA 0.3307 GCAGC 0.2022 GCAGG 0.1526 GCAGT 0.3145 GCATA 0.3277 GCATC 0.1477 GCATG 0.1719 GCATT 0.3527 GCCAA 0.311 GCCAC 0.2047 GCCAG 0.1593 GCCAT 0.325 GCCCA 0.282 GCCCC 0.1965 GCCCG 0.2127 GCCCT 0.3088 GCCGA 0.3213 GCCGC 0.2397 GCCGG 0.1755 GCCGT 0.2635 GCCTA 0.2414 GCCTC 0.1947 GCCTG 0.199 GCCTT 0.3649 GCGAA 0.342 GCGAC 0.1669 GCGAG 0.1767 GCGAT 0.3144 GCGCA 0.3059 GCGCC 0.1482 GCGCG 0.3379 GCGCT 0.2079 GCGGA 0.3091 GCGGC 0.2269 GCGGG 0.1428 GCGGT 0.3212 GCGTA 0.2845 GCGTC 0.1737 GCGTG 0.2358 GCGTT 0.306 GCTAA 0.2973 GCTAC 0.2085 GCTAG 0.1406 GCTAT 0.3536 GCTCA 0.263 GCTCC 0.167 GCTCG 0.2744 GCTCT 0.2955 GCTGA 0.2851 GCTGC 0.2226 GCTGG 0.1427 GCTGT 0.3496 GCTTA 0.2412 GCTTC 0.2021 GCTTG 0.1693 GCTTT 0.3874 GGAAA 0.4212 GGAAC 0.1399 GGAAG 0.1788 GGAAT 0.2601 GGACA 0.3691 GGACC 0.1401 GGACG 0.2764 GGACT 0.2144 GGAGA 0.3863 GGAGC 0.1654 GGAGG 0.2137 GGAGT 0.2346 GGATA 0.3418 GGATC 0.1629 GGATG 0.1829 GGATT 0.3123 GGCAA 0.3396 GGCAC 0.1859 GGCAG 0.2023 GGCAT 0.2723 GGCCA 0.3567 GGCCC 0.1667 GGCCG 0.2478 GGCCT 0.2288 GGCGA 0.3531 GGCGC 0.2148 GGCGG 0.176 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2719 GGCTC 0.1679 GGCTG 0.2474 GGCTT 0.3129 GGGAA 0.418 GGGAC 0.1442 GGGAG 0.1846 GGGAT 0.2532 GGGCA 0.3525 GGGCC 0.1901 GGGCG 0.2153 GGGCT 0.2421 GGGGA 0.3836 GGGGC 0.1806 GGGGG 0.1987 GGGGT 0.2371 GGGTA 0.3174 GGGTC 0.1475 GGGTG 0.2411 GGGTT 0.294 GGTAA 0.3347 GGTAC 0.1815 GGTAG 0.1487 GGTAT 0.3351 GGTCA 0.3357 GGTCC 0.1475 GGTCG 0.2656 GGTCT 0.2511 GGTGA 0.3213 GGTGC 0.1969 GGTGG 0.2058 GGTGT 0.276 GGTTA 0.3027 GGTTC 0.1785 GGTTG 0.176 GGTTT 0.3429 GTAAA 0.374 GTAAC 0.1623 GTAAG 0.1187 GTAAT 0.345 GTACA 0.4353 GTACC 0.1209 GTACG 0.1861 GTACT 0.2577 GTAGA 0.3691 GTAGC 0.1819 GTAGG 0.1284 GTAGT 0.3206 GTATA 0.3614 GTATC 0.147 GTATG 0.1622 GTATT 0.3293 GTCAA 0.3129 GTCAC 0.1958 GTCAG 0.1637 GTCAT 0.3276 GTCCA 0.3361 GTCCC 0.1719 GTCCG 0.1863 GTCCT 0.3056 GTCGA 0.3454 GTCGC 0.191 GTCGG 0.1306 GTCGT 0.3329 GTCTA 0.2612 GTCTC 0.2041 GTCTG 0.1831 GTCTT 0.3516 GTGAA 0.386 GTGAC 0.171 GTGAG 0.1332 GTGAT 0.3098 GTGCA 0.398 GTGCC 0.1382 GTGCG 0.1886 GTGCT 0.2752 GTGGA 0.3471 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1305 GTGGT 0.3212 GTGTA 0.3536 GTGTC 0.1332 GTGTG 0.2154 GTGTT 0.2978 GTTAA 0.3313 GTTAC 0.1945 GTTAG 0.1246 GTTAT 0.3496 GTTCA 0.3077 GTTCC 0.1576 GTTCG 0.2091 GTTCT 0.3257 GTTGA 0.3042 GTTGC 0.2088 GTTGG 0.1439 GTTGT 0.3431 GTTTA 0.2756 GTTTC 0.2153 GTTTG 0.1581 GTTTT 0.351 TAAAA 0.4047 TAAAC 0.1242 TAAAG 0.1184 TAAAT 0.3528 TAACA 0.4174 TAACC 0.1142 TAACG 0.1891 TAACT 0.2794 TAAGA 0.3902 TAAGC 0.1416 TAAGG 0.1298 TAAGT 0.3384 TAATA 0.3749 TAATC 0.1159 TAATG 0.1447 TAATT 0.3645 TACAA 0.3395 TACAC 0.148 TACAG 0.1231 TACAT 0.3894 TACCA 0.3769 TACCC 0.1071 TACCG 0.1893 TACCT 0.3266 TACGA 0.3487 TACGC 0.1619 TACGG 0.1083 TACGT 0.381 TACTA 0.2943 TACTC 0.1368 TACTG 0.1672 TACTT 0.4018 TAGAA 0.441 TAGAC 0.1121 TAGAG 0.1374 TAGAT 0.3095 TAGCA 0.3984 TAGCC 0.1266 TAGCG 0.1853 TAGCT 0.2897 TAGGA 0.3846 TAGGC 0.1423 TAGGG 0.1279 TAGGT 0.3451 TAGTA 0.3651 TAGTC 0.1291 TAGTG 0.1563 TAGTT 0.3495 TATAA 0.3019 TATAC 0.1382 TATAG 0.08935 TATAT 0.4705 TATCA 0.3412 TATCC 0.1247 TATCG 0.2064 TATCT 0.3277 TATGA 0.2958 TATGC 0.1573 TATGG 0.09773 TATGT 0.4492 TATTA 0.3129 TATTC 0.1323 TATTG 0.1345 TATTT 0.4203 TCAAA 0.3885 TCAAC 0.1499 TCAAG 0.1333 TCAAT 0.3282 TCACA 0.3387 TCACC 0.1455 TCACG 0.2176 TCACT 0.2981 TCAGA 0.3298 TCAGC 0.1765 TCAGG 0.1395 TCAGT 0.3542 TCATA 0.3144 TCATC 0.1521 TCATG 0.1437 TCATT 0.3898 TCCAA 0.3419 TCCAC 0.1809 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.336 TCCCA 0.278 TCCCC 0.1749 TCCCG 0.183 TCCCT 0.364 TCCGA 0.2972 TCCGC 0.1992 TCCGG 0.1535 TCCGT 0.3502 TCCTA 0.2444 TCCTC 0.194 TCCTG 0.162 TCCTT 0.3996 TCGAA 0.3442 TCGAC 0.1401 TCGAG 0.1582 TCGAT 0.3575 TCGCA 0.2923 TCGCC 0.1523 TCGCG 0.2871 TCGCT 0.2684 TCGGA 0.302 TCGGC 0.1992 TCGGG 0.1345 TCGGT 0.3643 TCGTA 0.2848 TCGTC 0.1635 TCGTG 0.1827 TCGTT 0.3691 TCTAA 0.3145 TCTAC 0.1808 TCTAG 0.1219 TCTAT 0.3828 TCTCA 0.2499 TCTCC 0.1474 TCTCG 0.2062 TCTCT 0.3965 TCTGA 0.278 TCTGC 0.1899 TCTGG 0.1203 TCTGT 0.4119 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1822 TCTTG 0.1337 TCTTT 0.4341 TGAAA 0.4492 TGAAC 0.1317 TGAAG 0.1204 TGAAT 0.2988 TGACA 0.4079 TGACC 0.126 TGACG 0.1948 TGACT 0.2713 TGAGA 0.4064 TGAGC 0.1616 TGAGG 0.1414 TGAGT 0.2906 TGATA 0.3594 TGATC 0.1462 TGATG 0.1553 TGATT 0.3391 TGCAA 0.3622 TGCAC 0.1698 TGCAG 0.1403 TGCAT 0.3277 TGCCA 0.379 TGCCC 0.1341 TGCCG 0.193 TGCCT 0.2939 TGCGA 0.3193 TGCGC 0.209 TGCGG 0.1237 TGCGT 0.348 TGCTA 0.2811 TGCTC 0.1615 TGCTG 0.1842 TGCTT 0.3731 TGGAA 0.4536 TGGAC 0.1272 TGGAG 0.1361 TGGAT 0.2831 TGGCA 0.3671 TGGCC 0.1499 TGGCG 0.2227 TGGCT 0.2603 TGGGA 0.3945 TGGGC 0.1677 TGGGG 0.1825 TGGGT 0.2552 TGGTA 0.3559 TGGTC 0.1437 TGGTG 0.1928 TGGTT 0.3075 TGTAA 0.3306 TGTAC 0.1789 TGTAG 0.1027 TGTAT 0.3878 TGTCA 0.371 TGTCC 0.1327 TGTCG 0.1933 TGTCT 0.303 TGTGA 0.2846 TGTGC 0.1938 TGTGG 0.1064 TGTGT 0.4152 TGTTA 0.2963 TGTTC 0.1574 TGTTG 0.1508 TGTTT 0.3956 TTAAA 0.3925 TTAAC 0.1336 TTAAG 0.116 TTAAT 0.3579 TTACA 0.4284 TTACC 0.1188 TTACG 0.1597 TTACT 0.2932 TTAGA 0.3731 TTAGC 0.1507 TTAGG 0.1386 TTAGT 0.3377 TTATA 0.3527 TTATC 0.1281 TTATG 0.1349 TTATT 0.3842 TTCAA 0.3516 TTCAC 0.1588 TTCAG 0.126 TTCAT 0.3636 TTCCA 0.3529 TTCCC 0.1467 TTCCG 0.1498 TTCCT 0.3507 TTCGA 0.3595 TTCGC 0.1658 TTCGG 0.109 TTCGT 0.3657 TTCTA 0.2716 TTCTC 0.1715 TTCTG 0.1528 TTCTT 0.4041 TTGAA 0.4232 TTGAC 0.1354 TTGAG 0.1137 TTGAT 0.3277 TTGCA 0.4199 TTGCC 0.1249 TTGCG 0.1621 TTGCT 0.2931 TTGGA 0.3749 TTGGC 0.1747 TTGGG 0.1135 TTGGT 0.3369 TTGTA 0.3625 TTGTC 0.1286 TTGTG 0.1446 TTGTT 0.3644 TTTAA 0.3344 TTTAC 0.1541 TTTAG 0.09755 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3349 TTTCC 0.1514 TTTCG 0.1536 TTTCT 0.3601 TTTGA 0.3039 TTTGC 0.1709 TTTGG 0.1167 TTTGT 0.4085 TTTTA 0.3068 TTTTC 0.1722 TTTTG 0.1394 TTTTT 0.3815 [2] # (a,c,g,t)= (0.343, 0.157, 0.157, 0.343) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.344 C 0.156 G 0.156 T 0.344 # l= 1 # Values AA 0.126 AC 0.0527 AG 0.0458 AT 0.119 CA 0.0547 CC 0.0216 CG 0.0338 CT 0.0457 GA 0.0541 GC 0.0274 GG 0.0216 GT 0.0527 TA 0.109 TC 0.054 TG 0.0547 TT 0.126 # l= 2 # Values AAA 0.0496 AAC 0.0177 AAG 0.0172 AAT 0.0418 ACA 0.0208 ACC 0.00661 ACG 0.0113 ACT 0.014 AGA 0.0175 AGC 0.0074 AGG 0.00686 AGT 0.014 ATA 0.043 ATC 0.0165 ATG 0.0181 ATT 0.0418 CAA 0.0188 CAC 0.00951 CAG 0.00822 CAT 0.0181 CCA 0.00729 CCC 0.00317 CCG 0.00432 CCT 0.00686 CGA 0.012 CGC 0.0062 CGG 0.00432 CGT 0.0113 CTA 0.0122 CTC 0.00817 CTG 0.00823 CTT 0.0172 GAA 0.0219 GAC 0.00744 GAG 0.00817 GAT 0.0165 GCA 0.01 GCC 0.00384 GCG 0.0062 GCT 0.0074 GGA 0.00803 GGC 0.00384 GGG 0.00317 GGT 0.00661 GTA 0.0181 GTC 0.00743 GTG 0.00951 GTT 0.0177 TAA 0.0359 TAC 0.0181 TAG 0.0122 TAT 0.043 TCA 0.0166 TCC 0.00802 TCG 0.012 TCT 0.0175 TGA 0.0166 TGC 0.01 TGG 0.00729 TGT 0.0208 TTA 0.0359 TTC 0.0219 TTG 0.0188 TTT 0.0496 # l= 3 # Values AAAA 0.019 AAAC 0.00668 AAAG 0.00711 AAAT 0.0168 AACA 0.00703 AACC 0.002 AACG 0.00391 AACT 0.00476 AAGA 0.0067 AAGC 0.00257 AAGG 0.00258 AAGT 0.00531 AATA 0.0151 AATC 0.00534 AATG 0.00664 AATT 0.0147 ACAA 0.00722 ACAC 0.00338 ACAG 0.0031 ACAT 0.00709 ACCA 0.00237 ACCC 0.00079 ACCG 0.00144 ACCT 0.00201 ACGA 0.00413 ACGC 0.00194 ACGG 0.00137 ACGT 0.00383 ACTA 0.00398 ACTC 0.00208 ACTG 0.00265 ACTT 0.00531 AGAA 0.00753 AGAC 0.00205 AGAG 0.00289 AGAT 0.00499 AGCA 0.00282 AGCC 0.000985 AGCG 0.00153 AGCT 0.00206 AGGA 0.00272 AGGC 0.00103 AGGG 0.0011 AGGT 0.00201 AGTA 0.00494 AGTC 0.00184 AGTG 0.00249 AGTT 0.00476 ATAA 0.0141 ATAC 0.00647 ATAG 0.00451 ATAT 0.018 ATCA 0.00535 ATCC 0.00219 ATCG 0.00401 ATCT 0.00499 ATGA 0.00572 ATGC 0.00299 ATGG 0.00233 ATGT 0.00709 ATTA 0.0126 ATTC 0.0062 ATTG 0.00612 ATTT 0.0168 CAAA 0.00715 CAAC 0.00291 CAAG 0.00263 CAAT 0.00612 CACA 0.00336 CACC 0.00138 CACG 0.00228 CACT 0.00249 CAGA 0.00282 CAGC 0.00153 CAGG 0.00123 CAGT 0.00265 CATA 0.00595 CATC 0.00276 CATG 0.00278 CATT 0.00665 CCAA 0.00241 CCAC 0.00144 CCAG 0.00111 CCAT 0.00234 CCCA 0.000871 CCCC 0.000585 CCCG 0.000619 CCCT 0.0011 CCGA 0.00138 CCGC 0.000909 CCGG 0.000657 CCGT 0.00137 CCTA 0.00166 CCTC 0.0014 CCTG 0.00123 CCTT 0.00258 CGAA 0.00414 CGAC 0.00183 CGAG 0.00201 CGAT 0.00401 CGCA 0.00182 CGCC 0.000895 CGCG 0.00195 CGCT 0.00153 CGGA 0.00139 CGGC 0.000868 CGGG 0.000619 CGGT 0.00144 CGTA 0.00327 CGTC 0.00182 CGTG 0.00229 CGTT 0.00391 CTAA 0.0038 CTAC 0.00229 CTAG 0.00159 CTAT 0.00451 CTCA 0.00196 CTCC 0.0013 CTCG 0.00201 CTCT 0.00289 CTGA 0.00235 CTGC 0.00167 CTGG 0.00111 CTGT 0.0031 CTTA 0.00415 CTTC 0.00327 CTTG 0.00263 CTTT 0.00711 GAAA 0.00935 GAAC 0.00309 GAAG 0.00327 GAAT 0.0062 GACA 0.00277 GACC 0.00101 GACG 0.00182 GACT 0.00184 GAGA 0.00339 GAGC 0.0013 GAGG 0.0014 GAGT 0.00208 GATA 0.00573 GATC 0.0027 GATG 0.00276 GATT 0.00534 GCAA 0.00354 GCAC 0.0018 GCAG 0.00167 GCAT 0.003 GCCA 0.0014 GCCC 0.000535 GCCG 0.000867 GCCT 0.00103 GCGA 0.00207 GCGC 0.00128 GCGG 0.000908 GCGT 0.00194 GCTA 0.002 GCTC 0.0013 GCTG 0.00153 GCTT 0.00257 GGAA 0.00347 GGAC 0.00106 GGAG 0.0013 GGAT 0.00219 GGCA 0.00134 GGCC 0.000615 GGCG 0.000895 GGCT 0.000984 GGGA 0.00126 GGGC 0.000536 GGGG 0.000585 GGGT 0.000791 GGTA 0.00222 GGTC 0.001 GGTG 0.00138 GGTT 0.002 GTAA 0.006 GTAC 0.00329 GTAG 0.00229 GTAT 0.00648 GTCA 0.0025 GTCC 0.00106 GTCG 0.00183 GTCT 0.00205 GTGA 0.00288 GTGC 0.0018 GTGG 0.00144 GTGT 0.00338 GTTA 0.00503 GTTC 0.00309 GTTG 0.00291 GTTT 0.00668 TAAA 0.0141 TAAC 0.00503 TAAG 0.00416 TAAT 0.0126 TACA 0.00764 TACC 0.00222 TACG 0.00326 TACT 0.00493 TAGA 0.00454 TAGC 0.002 TAGG 0.00166 TAGT 0.00398 TATA 0.0163 TATC 0.00573 TATG 0.00596 TATT 0.0151 TCAA 0.00563 TCAC 0.00288 TCAG 0.00235 TCAT 0.00571 TCCA 0.00265 TCCC 0.00126 TCCG 0.00139 TCCT 0.00272 TCGA 0.00441 TCGC 0.00207 TCGG 0.00138 TCGT 0.00413 TCTA 0.00454 TCTC 0.0034 TCTG 0.00282 TCTT 0.0067 TGAA 0.00676 TGAC 0.0025 TGAG 0.00196 TGAT 0.00535 TGCA 0.00402 TGCC 0.00135 TGCG 0.00182 TGCT 0.00282 TGGA 0.00266 TGGC 0.0014 TGGG 0.000871 TGGT 0.00237 TGTA 0.00763 TGTC 0.00277 TGTG 0.00336 TGTT 0.00703 TTAA 0.012 TTAC 0.006 TTAG 0.0038 TTAT 0.0141 TTCA 0.00676 TTCC 0.00347 TTCG 0.00414 TTCT 0.00754 TTGA 0.00564 TTGC 0.00354 TTGG 0.00241 TTGT 0.00723 TTTA 0.0141 TTTC 0.00935 TTTG 0.00715 TTTT 0.019 # l= 4 # Values AAAAA 0.00731 AAAAC 0.00231 AAAAG 0.00286 AAAAT 0.00655 AAACA 0.00275 AAACC 0.000686 AAACG 0.00142 AAACT 0.00182 AAAGA 0.00291 AAAGC 0.000982 AAAGG 0.00103 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00631 AAATC 0.00201 AAATG 0.00267 AAATT 0.0058 AACAA 0.00263 AACAC 0.000997 AACAG 0.00108 AACAT 0.00232 AACCA 0.000723 AACCC 0.000229 AACCG 0.000413 AACCT 0.000635 AACGA 0.00153 AACGC 0.000595 AACGG 0.000461 AACGT 0.00133 AACTA 0.00138 AACTC 0.000664 AACTG 0.000911 AACTT 0.0018 AAGAA 0.00303 AAGAC 0.000707 AAGAG 0.00103 AAGAT 0.00194 AAGCA 0.00105 AAGCC 0.0003 AAGCG 0.000496 AAGCT 0.00073 AAGGA 0.00108 AAGGC 0.000371 AAGGG 0.00041 AAGGT 0.000715 AAGTA 0.00198 AAGTC 0.000622 AAGTG 0.00091 AAGTT 0.0018 AATAA 0.0054 AATAC 0.00211 AATAG 0.00162 AATAT 0.00596 AATCA 0.00181 AATCC 0.000677 AATCG 0.00123 AATCT 0.00163 AATGA 0.00222 AATGC 0.00105 AATGG 0.000876 AATGT 0.0025 AATTA 0.00461 AATTC 0.00209 AATTG 0.0022 AATTT 0.0058 ACAAA 0.00288 ACAAC 0.000979 ACAAG 0.00098 ACAAT 0.00238 ACACA 0.00138 ACACC 0.000379 ACACG 0.000815 ACACT 0.00081 ACAGA 0.00115 ACAGC 0.000528 ACAGG 0.000443 ACAGT 0.00098 ACATA 0.00264 ACATC 0.000917 ACATG 0.00103 ACATT 0.0025 ACCAA 0.000802 ACCAC 0.000461 ACCAG 0.000361 ACCAT 0.000743 ACCCA 0.000222 ACCCC 0.000137 ACCCG 0.000155 ACCCT 0.000278 ACCGA 0.000504 ACCGC 0.000291 ACCGG 0.000205 ACCGT 0.000443 ACCTA 0.000564 ACCTC 0.000344 ACCTG 0.000385 ACCTT 0.000715 ACGAA 0.0015 ACGAC 0.000602 ACGAG 0.000675 ACGAT 0.00136 ACGCA 0.000625 ACGCC 0.000229 ACGCG 0.000604 ACGCT 0.000481 ACGGA 0.000486 ACGGC 0.000229 ACGGG 0.000216 ACGGT 0.000443 ACGTA 0.00122 ACGTC 0.000525 ACGTG 0.000759 ACGTT 0.00133 ACTAA 0.00126 ACTAC 0.000712 ACTAG 0.000525 ACTAT 0.00148 ACTCA 0.000561 ACTCC 0.000293 ACTCG 0.000554 ACTCT 0.000675 ACTGA 0.000809 ACTGC 0.000507 ACTGG 0.000355 ACTGT 0.00098 ACTTA 0.00138 ACTTC 0.000882 ACTTG 0.000867 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.00335 AGAAC 0.000987 AGAAG 0.00111 AGAAT 0.00209 AGACA 0.000834 AGACC 0.000251 AGACG 0.000449 AGACT 0.000518 AGAGA 0.00135 AGAGC 0.000376 AGAGG 0.000486 AGAGT 0.000675 AGATA 0.00184 AGATC 0.000703 AGATG 0.000819 AGATT 0.00163 AGCAA 0.00103 AGCAC 0.000489 AGCAG 0.000492 AGCAT 0.000802 AGCCA 0.000366 AGCCC 0.00013 AGCCG 0.000204 AGCCT 0.000284 AGCGA 0.000555 AGCGC 0.000263 AGCGG 0.000235 AGCGT 0.000481 AGCTA 0.000576 AGCTC 0.000321 AGCTG 0.000439 AGCTT 0.00073 AGGAA 0.00121 AGGAC 0.000316 AGGAG 0.000438 AGGAT 0.000755 AGGCA 0.000386 AGGCC 0.000138 AGGCG 0.000225 AGGCT 0.000284 AGGGA 0.000454 AGGGC 0.000164 AGGGG 0.0002 AGGGT 0.000278 AGGTA 0.000711 AGGTC 0.000261 AGGTG 0.000401 AGGTT 0.000635 AGTAA 0.00173 AGTAC 0.000827 AGTAG 0.000682 AGTAT 0.00169 AGTCA 0.000672 AGTCC 0.000222 AGTCG 0.000427 AGTCT 0.000518 AGTGA 0.000837 AGTGC 0.000439 AGTGG 0.000404 AGTGT 0.00081 AGTTA 0.00138 AGTTC 0.000777 AGTTG 0.000785 AGTTT 0.00182 ATAAA 0.00578 ATAAC 0.00173 ATAAG 0.00154 ATAAT 0.00503 ATACA 0.00293 ATACC 0.000732 ATACG 0.00112 ATACT 0.00169 ATAGA 0.00173 ATAGC 0.000696 ATAGG 0.000604 ATAGT 0.00148 ATATA 0.00756 ATATC 0.00212 ATATG 0.00233 ATATT 0.00596 ATCAA 0.00183 ATCAC 0.000881 ATCAG 0.000766 ATCAT 0.00187 ATCCA 0.000742 ATCCC 0.000309 ATCCG 0.000386 ATCCT 0.000755 ATCGA 0.00156 ATCGC 0.000645 ATCGG 0.000441 ATCGT 0.00136 ATCTA 0.00139 ATCTC 0.00086 ATCTG 0.0008 ATCTT 0.00194 ATGAA 0.00241 ATGAC 0.000803 ATGAG 0.000628 ATGAT 0.00187 ATGCA 0.0013 ATGCC 0.000353 ATGCG 0.000541 ATGCT 0.000802 ATGGA 0.000882 ATGGC 0.00044 ATGGG 0.000271 ATGGT 0.000743 ATGTA 0.00293 ATGTC 0.000813 ATGTG 0.00103 ATGTT 0.00232 ATTAA 0.00429 ATTAC 0.00203 ATTAG 0.00129 ATTAT 0.00503 ATTCA 0.002 ATTCC 0.000887 ATTCG 0.00123 ATTCT 0.00209 ATTGA 0.00183 ATTGC 0.00114 ATTGG 0.000768 ATTGT 0.00238 ATTTA 0.0049 ATTTC 0.00296 ATTTG 0.00238 ATTTT 0.00655 CAAAA 0.00264 CAAAC 0.00107 CAAAG 0.00106 CAAAT 0.00238 CAACA 0.00108 CAACC 0.000361 CAACG 0.00068 CAACT 0.000785 CAAGA 0.0009 CAAGC 0.000446 CAAGG 0.000419 CAAGT 0.000867 CAATA 0.00204 CAATC 0.000843 CAATG 0.00103 CAATT 0.0022 CACAA 0.00105 CACAC 0.000741 CACAG 0.000536 CACAT 0.00103 CACCA 0.000464 CACCC 0.000197 CACCG 0.000317 CACCT 0.000401 CACGA 0.000752 CACGC 0.00046 CACGG 0.000315 CACGT 0.000759 CACTA 0.000629 CACTC 0.000405 CACTG 0.000545 CACTT 0.00091 CAGAA 0.00114 CAGAC 0.000384 CAGAG 0.000495 CAGAT 0.0008 CAGCA 0.000526 CAGCC 0.000248 CAGCG 0.000315 CAGCT 0.000439 CAGGA 0.00044 CAGGC 0.000214 CAGGG 0.000186 CAGGT 0.000385 CAGTA 0.000827 CAGTC 0.000368 CAGTG 0.000545 CAGTT 0.000911 CATAA 0.0019 CATAC 0.00105 CATAG 0.000678 CATAT 0.00233 CATCA 0.000845 CATCC 0.000405 CATCG 0.000688 CATCT 0.000819 CATGA 0.00082 CATGC 0.000517 CATGG 0.000407 CATGT 0.00103 CATTA 0.00183 CATTC 0.00111 CATTG 0.00103 CATTT 0.00267 CCAAA 0.000852 CCAAC 0.000431 CCAAG 0.000356 CCAAT 0.000768 CCACA 0.000366 CCACC 0.000291 CCACG 0.000382 CCACT 0.000404 CCAGA 0.000351 CCAGC 0.000224 CCAGG 0.000177 CCAGT 0.000355 CCATA 0.000603 CCATC 0.000448 CCATG 0.000407 CCATT 0.000876 CCCAA 0.000278 CCCAC 0.00019 CCCAG 0.000131 CCCAT 0.000271 CCCCA 0.000161 CCCCC 0.000115 CCCCG 0.000109 CCCCT 0.0002 CCCGA 0.00019 CCCGC 0.00013 CCCGG 8.35e-05 CCCGT 0.000216 CCCTA 0.000215 CCCTC 0.000285 CCCTG 0.000186 CCCTT 0.00041 CCGAA 0.00045 CCGAC 0.000241 CCGAG 0.00025 CCGAT 0.000441 CCGCA 0.000229 CCGCC 0.000158 CCGCG 0.000286 CCGCT 0.000235 CCGGA 0.000214 CCGGC 0.000154 CCGGG 8.35e-05 CCGGT 0.000205 CCGTA 0.000356 CCGTC 0.000242 CCGTG 0.000315 CCGTT 0.000461 CCTAA 0.000534 CCTAC 0.000304 CCTAG 0.000221 CCTAT 0.000604 CCTCA 0.000281 CCTCC 0.000281 CCTCG 0.000349 CCTCT 0.000486 CCTGA 0.000339 CCTGC 0.000265 CCTGG 0.000177 CCTGT 0.000443 CCTTA 0.000555 CCTTC 0.000568 CCTTG 0.000419 CCTTT 0.00103 CGAAA 0.00152 CGAAC 0.000689 CGAAG 0.000707 CGAAT 0.00123 CGACA 0.000573 CGACC 0.00028 CGACG 0.000545 CGACT 0.000427 CGAGA 0.000733 CGAGC 0.000379 CGAGG 0.000349 CGAGT 0.000554 CGATA 0.00127 CGATC 0.000814 CGATG 0.000688 CGATT 0.00123 CGCAA 0.000605 CGCAC 0.000354 CGCAG 0.000317 CGCAT 0.000541 CGCCA 0.00032 CGCCC 0.000116 CGCCG 0.000234 CGCCT 0.000225 CGCGA 0.000612 CGCGC 0.000447 CGCGG 0.000286 CGCGT 0.000604 CGCTA 0.000394 CGCTC 0.000329 CGCTG 0.000315 CGCTT 0.000496 CGGAA 0.000541 CGGAC 0.000206 CGGAG 0.000257 CGGAT 0.000386 CGGCA 0.00027 CGGCC 0.000159 CGGCG 0.000234 CGGCT 0.000204 CGGGA 0.000237 CGGGC 0.000119 CGGGG 0.000109 CGGGT 0.000155 CGGTA 0.000443 CGGTC 0.000269 CGGTG 0.000317 CGGTT 0.000413 CGTAA 0.00102 CGTAC 0.000659 CGTAG 0.000462 CGTAT 0.00112 CGTCA 0.000517 CGTCC 0.000304 CGTCG 0.000545 CGTCT 0.000449 CGTGA 0.000661 CGTGC 0.000427 CGTGG 0.000382 CGTGT 0.000815 CGTTA 0.00102 CGTTC 0.00079 CGTTG 0.00068 CGTTT 0.00142 CTAAA 0.00141 CTAAC 0.000642 CTAAG 0.000464 CTAAT 0.00129 CTACA 0.000802 CTACC 0.000342 CTACG 0.000462 CTACT 0.000682 CTAGA 0.000559 CTAGC 0.000286 CTAGG 0.000221 CTAGT 0.000525 CTATA 0.00149 CTATC 0.000721 CTATG 0.000678 CTATT 0.00162 CTCAA 0.000655 CTCAC 0.000395 CTCAG 0.000287 CTCAT 0.000628 CTCCA 0.00037 CTCCC 0.00024 CTCCG 0.000257 CTCCT 0.000438 CTCGA 0.000711 CTCGC 0.000377 CTCGG 0.00025 CTCGT 0.000675 CTCTA 0.000645 CTCTC 0.000723 CTCTG 0.000495 CTCTT 0.00103 CTGAA 0.00087 CTGAC 0.000424 CTGAG 0.000287 CTGAT 0.000766 CTGCA 0.000581 CTGCC 0.000279 CTGCG 0.000317 CTGCT 0.000492 CTGGA 0.000384 CTGGC 0.000233 CTGGG 0.000131 CTGGT 0.000361 CTGTA 0.00096 CTGTC 0.000522 CTGTG 0.000536 CTGTT 0.00108 CTTAA 0.00142 CTTAC 0.000731 CTTAG 0.000464 CTTAT 0.00154 CTTCA 0.000822 CTTCC 0.000631 CTTCG 0.000707 CTTCT 0.00111 CTTGA 0.000777 CTTGC 0.00052 CTTGG 0.000356 CTTGT 0.00098 CTTTA 0.0017 CTTTC 0.00149 CTTTG 0.00106 CTTTT 0.00286 GAAAA 0.0034 GAAAC 0.00151 GAAAG 0.00149 GAAAT 0.00296 GAACA 0.00115 GAACC 0.000367 GAACG 0.00079 GAACT 0.000777 GAAGA 0.00128 GAAGC 0.00054 GAAGG 0.000568 GAAGT 0.000882 GAATA 0.00206 GAATC 0.000946 GAATG 0.00111 GAATT 0.00209 GACAA 0.000973 GACAC 0.000466 GACAG 0.000522 GACAT 0.000813 GACCA 0.000352 GACCC 0.000121 GACCG 0.000269 GACCT 0.000261 GACGA 0.000704 GACGC 0.000345 GACGG 0.000242 GACGT 0.000525 GACTA 0.000537 GACTC 0.00031 GACTG 0.000368 GACTT 0.000622 GAGAA 0.00137 GAGAC 0.000441 GAGAG 0.000723 GAGAT 0.00086 GAGCA 0.000473 GAGCC 0.000175 GAGCG 0.000329 GAGCT 0.000321 GAGGA 0.000557 GAGGC 0.00021 GAGGG 0.000285 GAGGT 0.000344 GAGTA 0.000702 GAGTC 0.00031 GAGTG 0.000405 GAGTT 0.000664 GATAA 0.00189 GATAC 0.000998 GATAG 0.000721 GATAT 0.00212 GATCA 0.000814 GATCC 0.000373 GATCG 0.000814 GATCT 0.000703 GATGA 0.000924 GATGC 0.000468 GATGG 0.000448 GATGT 0.000917 GATTA 0.00154 GATTC 0.000946 GATTG 0.000843 GATTT 0.00201 GCAAA 0.00126 GCAAC 0.000621 GCAAG 0.00052 GCAAT 0.00114 GCACA 0.000665 GCACC 0.000267 GCACG 0.000427 GCACT 0.000439 GCAGA 0.000551 GCAGC 0.000344 GCAGG 0.000265 GCAGT 0.000507 GCATA 0.000957 GCATC 0.000468 GCATG 0.000517 GCATT 0.00105 GCCAA 0.000433 GCCAC 0.000298 GCCAG 0.000233 GCCAT 0.00044 GCCCA 0.000148 GCCCC 0.000105 GCCCG 0.000119 GCCCT 0.000164 GCCGA 0.000277 GCCGC 0.000209 GCCGG 0.000154 GCCGT 0.000229 GCCTA 0.000239 GCCTC 0.00021 GCCTG 0.000214 GCCTT 0.000371 GCGAA 0.000698 GCGAC 0.000349 GCGAG 0.000377 GCGAT 0.000645 GCGCA 0.000382 GCGCC 0.000187 GCGCG 0.000447 GCGCT 0.000263 GCGGA 0.00028 GCGGC 0.000209 GCGGG 0.00013 GCGGT 0.000291 GCGTA 0.000541 GCGTC 0.000345 GCGTG 0.00046 GCGTT 0.000595 GCTAA 0.00059 GCTAC 0.000432 GCTAG 0.000286 GCTAT 0.000696 GCTCA 0.000323 GCTCC 0.000219 GCTCG 0.000379 GCTCT 0.000376 GCTGA 0.00043 GCTGC 0.000344 GCTGG 0.000224 GCTGT 0.000528 GCTTA 0.000605 GCTTC 0.00054 GCTTG 0.000446 GCTTT 0.000982 GGAAA 0.00146 GGAAC 0.000498 GGAAG 0.000631 GGAAT 0.000887 GGACA 0.000378 GGACC 0.000152 GGACG 0.000304 GGACT 0.000222 GGAGA 0.000512 GGAGC 0.000219 GGAGG 0.000281 GGAGT 0.000293 GGATA 0.000736 GGATC 0.000373 GGATG 0.000405 GGATT 0.000677 GGCAA 0.000459 GGCAC 0.000255 GGCAG 0.000279 GGCAT 0.000353 GGCCA 0.000217 GGCCC 0.000101 GGCCG 0.000159 GGCCT 0.000138 GGCGA 0.000322 GGCGC 0.000187 GGCGG 0.000158 GGCGT 0.000229 GGCTA 0.000262 GGCTC 0.000175 GGCTG 0.000248 GGCTT 0.0003 GGGAA 0.000522 GGGAC 0.00019 GGGAG 0.00024 GGGAT 0.000309 GGGCA 0.000189 GGGCC 0.000101 GGGCG 0.000116 GGGCT 0.00013 GGGGA 0.000228 GGGGC 0.000105 GGGGG 0.000115 GGGGT 0.000137 GGGTA 0.000243 GGGTC 0.000121 GGGTG 0.000197 GGGTT 0.000229 GGTAA 0.000739 GGTAC 0.00041 GGTAG 0.000342 GGTAT 0.000732 GGTCA 0.000322 GGTCC 0.000152 GGTCG 0.00028 GGTCT 0.000251 GGTGA 0.00044 GGTGC 0.000267 GGTGG 0.000291 GGTGT 0.000379 GGTTA 0.000588 GGTTC 0.000367 GGTTG 0.000361 GGTTT 0.000686 GTAAA 0.00224 GTAAC 0.000998 GTAAG 0.000731 GTAAT 0.00203 GTACA 0.00139 GTACC 0.00041 GTACG 0.000659 GTACT 0.000827 GTAGA 0.000843 GTAGC 0.000432 GTAGG 0.000304 GTAGT 0.000712 GTATA 0.00231 GTATC 0.000998 GTATG 0.00105 GTATT 0.00211 GTCAA 0.000778 GTCAC 0.000497 GTCAG 0.000424 GTCAT 0.000803 GTCCA 0.000344 GTCCC 0.00019 GTCCG 0.000206 GTCCT 0.000316 GTCGA 0.000634 GTCGC 0.000349 GTCGG 0.000241 GTCGT 0.000602 GTCTA 0.000521 GTCTC 0.000441 GTCTG 0.000384 GTCTT 0.000707 GTGAA 0.00111 GTGAC 0.000497 GTGAG 0.000395 GTGAT 0.000881 GTGCA 0.0007 GTGCC 0.000255 GTGCG 0.000354 GTGCT 0.000489 GTGGA 0.000494 GTGGC 0.000298 GTGGG 0.00019 GTGGT 0.000461 GTGTA 0.00118 GTGTC 0.000466 GTGTG 0.000741 GTGTT 0.000997 GTTAA 0.00166 GTTAC 0.000998 GTTAG 0.000642 GTTAT 0.00173 GTTCA 0.000912 GTTCC 0.000498 GTTCG 0.000689 GTTCT 0.000987 GTTGA 0.000876 GTTGC 0.000621 GTTGG 0.000431 GTTGT 0.000979 GTTTA 0.0018 GTTTC 0.00151 GTTTG 0.00107 GTTTT 0.00231 TAAAA 0.00568 TAAAC 0.0018 TAAAG 0.0017 TAAAT 0.0049 TAACA 0.00204 TAACC 0.000588 TAACG 0.00102 TAACT 0.00138 TAAGA 0.00161 TAAGC 0.000605 TAAGG 0.000555 TAAGT 0.00138 TAATA 0.00466 TAATC 0.00154 TAATG 0.00183 TAATT 0.00461 TACAA 0.00257 TACAC 0.00118 TACAG 0.00096 TACAT 0.00293 TACCA 0.000827 TACCC 0.000243 TACCG 0.000443 TACCT 0.000711 TACGA 0.00115 TACGC 0.000541 TACGG 0.000356 TACGT 0.00122 TACTA 0.00143 TACTC 0.000702 TACTG 0.000827 TACTT 0.00198 TAGAA 0.00199 TAGAC 0.000521 TAGAG 0.000645 TAGAT 0.00139 TAGCA 0.000772 TAGCC 0.000262 TAGCG 0.000394 TAGCT 0.000576 TAGGA 0.000644 TAGGC 0.000239 TAGGG 0.000215 TAGGT 0.000564 TAGTA 0.00143 TAGTC 0.000537 TAGTG 0.000629 TAGTT 0.00138 TATAA 0.00489 TATAC 0.00231 TATAG 0.00149 TATAT 0.00756 TATCA 0.00189 TATCC 0.000736 TATCG 0.00127 TATCT 0.00184 TATGA 0.00175 TATGC 0.000957 TATGG 0.000603 TATGT 0.00264 TATTA 0.00466 TATTC 0.00206 TATTG 0.00204 TATTT 0.00631 TCAAA 0.00216 TCAAC 0.000876 TCAAG 0.000777 TCAAT 0.00183 TCACA 0.000944 TCACC 0.00044 TCACG 0.000661 TCACT 0.000837 TCAGA 0.00077 TCAGC 0.00043 TCAGG 0.000339 TCAGT 0.000809 TCATA 0.00175 TCATC 0.000924 TCATG 0.00082 TCATT 0.00222 TCCAA 0.000895 TCCAC 0.000494 TCCAG 0.000384 TCCAT 0.000882 TCCCA 0.00034 TCCCC 0.000228 TCCCG 0.000237 TCCCT 0.000454 TCCGA 0.00041 TCCGC 0.00028 TCCGG 0.000214 TCCGT 0.000486 TCCTA 0.000644 TCCTC 0.000557 TCCTG 0.00044 TCCTT 0.00108 TCGAA 0.0015 TCGAC 0.000634 TCGAG 0.000711 TCGAT 0.00156 TCGCA 0.000581 TCGCC 0.000322 TCGCG 0.000612 TCGCT 0.000555 TCGGA 0.00041 TCGGC 0.000277 TCGGG 0.00019 TCGGT 0.000504 TCGTA 0.00115 TCGTC 0.000704 TCGTG 0.000752 TCGTT 0.00153 TCTAA 0.00141 TCTAC 0.000843 TCTAG 0.000559 TCTAT 0.00173 TCTCA 0.0008 TCTCC 0.000512 TCTCG 0.000733 TCTCT 0.00135 TCTGA 0.00077 TCTGC 0.000551 TCTGG 0.000351 TCTGT 0.00115 TCTTA 0.00161 TCTTC 0.00128 TCTTG 0.0009 TCTTT 0.00291 TGAAA 0.00302 TGAAC 0.000912 TGAAG 0.000822 TGAAT 0.002 TGACA 0.000989 TGACC 0.000322 TGACG 0.000517 TGACT 0.000672 TGAGA 0.0008 TGAGC 0.000323 TGAGG 0.000281 TGAGT 0.000561 TGATA 0.00189 TGATC 0.000814 TGATG 0.000845 TGATT 0.00181 TGCAA 0.00144 TGCAC 0.0007 TGCAG 0.000581 TGCAT 0.0013 TGCCA 0.0005 TGCCC 0.000189 TGCCG 0.00027 TGCCT 0.000386 TGCGA 0.000581 TGCGC 0.000382 TGCGG 0.000229 TGCGT 0.000625 TGCTA 0.000772 TGCTC 0.000473 TGCTG 0.000526 TGCTT 0.00105 TGGAA 0.0012 TGGAC 0.000344 TGGAG 0.00037 TGGAT 0.000742 TGGCA 0.0005 TGGCC 0.000217 TGGCG 0.00032 TGGCT 0.000366 TGGGA 0.00034 TGGGC 0.000148 TGGGG 0.000161 TGGGT 0.000222 TGGTA 0.000827 TGGTC 0.000352 TGGTG 0.000464 TGGTT 0.000723 TGTAA 0.00251 TGTAC 0.00139 TGTAG 0.000802 TGTAT 0.00293 TGTCA 0.000989 TGTCC 0.000378 TGTCG 0.000573 TGTCT 0.000834 TGTGA 0.000944 TGTGC 0.000665 TGTGG 0.000366 TGTGT 0.00138 TGTTA 0.00204 TGTTC 0.00115 TGTTG 0.00108 TGTTT 0.00275 TTAAA 0.00466 TTAAC 0.00166 TTAAG 0.00142 TTAAT 0.00429 TTACA 0.00251 TTACC 0.000739 TTACG 0.00102 TTACT 0.00173 TTAGA 0.00141 TTAGC 0.00059 TTAGG 0.000534 TTAGT 0.00126 TTATA 0.00489 TTATC 0.00189 TTATG 0.0019 TTATT 0.0054 TTCAA 0.00237 TTCAC 0.00111 TTCAG 0.00087 TTCAT 0.00241 TTCCA 0.0012 TTCCC 0.000522 TTCCG 0.000541 TTCCT 0.00121 TTCGA 0.0015 TTCGC 0.000698 TTCGG 0.00045 TTCGT 0.0015 TTCTA 0.00199 TTCTC 0.00137 TTCTG 0.00114 TTCTT 0.00303 TTGAA 0.00237 TTGAC 0.000778 TTGAG 0.000655 TTGAT 0.00183 TTGCA 0.00144 TTGCC 0.000459 TTGCG 0.000605 TTGCT 0.00103 TTGGA 0.000895 TTGGC 0.000433 TTGGG 0.000278 TTGGT 0.000802 TTGTA 0.00257 TTGTC 0.000973 TTGTG 0.00105 TTGTT 0.00263 TTTAA 0.00466 TTTAC 0.00224 TTTAG 0.00141 TTTAT 0.00578 TTTCA 0.00302 TTTCC 0.00146 TTTCG 0.00152 TTTCT 0.00335 TTTGA 0.00216 TTTGC 0.00126 TTTGG 0.000852 TTTGT 0.00288 TTTTA 0.00568 TTTTC 0.0034 TTTTG 0.00264 TTTTT 0.00731 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3815 AAAAC 0.1199 AAAAG 0.1464 AAAAT 0.3522 AAACA 0.4248 AAACC 0.09857 AAACG 0.1983 AAACT 0.2783 AAAGA 0.4072 AAAGC 0.1366 AAAGG 0.1406 AAAGT 0.3156 AAATA 0.3806 AAATC 0.1152 AAATG 0.1571 AAATT 0.3471 AACAA 0.3764 AACAC 0.1374 AACAG 0.1485 AACAT 0.3376 AACCA 0.3681 AACCC 0.1122 AACCG 0.192 AACCT 0.3277 AACGA 0.3875 AACGC 0.1494 AACGG 0.1152 AACGT 0.3479 AACTA 0.2962 AACTC 0.1319 AACTG 0.1905 AACTT 0.3814 AAGAA 0.4534 AAGAC 0.1044 AAGAG 0.1463 AAGAT 0.2959 AAGCA 0.4155 AAGCC 0.1145 AAGCG 0.1828 AAGCT 0.2872 AAGGA 0.4184 AAGGC 0.1432 AAGGG 0.1549 AAGGT 0.2835 AAGTA 0.3776 AAGTC 0.1129 AAGTG 0.1685 AAGTT 0.341 AATAA 0.3585 AATAC 0.1372 AATAG 0.1046 AATAT 0.3997 AATCA 0.3493 AATCC 0.1236 AATCG 0.2152 AATCT 0.3119 AATGA 0.3357 AATGC 0.1549 AATGG 0.1265 AATGT 0.3829 AATTA 0.3167 AATTC 0.1362 AATTG 0.1479 AATTT 0.3992 ACAAA 0.4024 ACAAC 0.1303 ACAAG 0.1325 ACAAT 0.3348 ACACA 0.422 ACACC 0.1067 ACACG 0.2248 ACACT 0.2465 ACAGA 0.3714 ACAGC 0.1645 ACAGG 0.1391 ACAGT 0.325 ACATA 0.38 ACATC 0.1221 ACATG 0.1439 ACATT 0.354 ACCAA 0.3453 ACCAC 0.1881 ACCAG 0.1482 ACCAT 0.3184 ACCCA 0.2851 ACCCC 0.1714 ACCCG 0.1863 ACCCT 0.3571 ACCGA 0.3465 ACCGC 0.2 ACCGG 0.141 ACCGT 0.3125 ACCTA 0.2891 ACCTC 0.166 ACCTG 0.188 ACCTT 0.3569 ACGAA 0.3688 ACGAC 0.1423 ACGAG 0.1577 ACGAT 0.3312 ACGCA 0.3353 ACGCC 0.1162 ACGCG 0.299 ACGCT 0.2495 ACGGA 0.355 ACGGC 0.163 ACGGG 0.1543 ACGGT 0.3278 ACGTA 0.3256 ACGTC 0.1331 ACGTG 0.1945 ACGTT 0.3468 ACTAA 0.3188 ACTAC 0.1759 ACTAG 0.1296 ACTAT 0.3756 ACTCA 0.2811 ACTCC 0.1408 ACTCG 0.2505 ACTCT 0.3276 ACTGA 0.3103 ACTGC 0.1878 ACTGG 0.1273 ACTGT 0.3746 ACTTA 0.2661 ACTTC 0.1614 ACTTG 0.1593 ACTTT 0.4132 AGAAA 0.4449 AGAAC 0.1284 AGAAG 0.1429 AGAAT 0.2838 AGACA 0.4168 AGACC 0.1179 AGACG 0.2037 AGACT 0.2615 AGAGA 0.4622 AGAGC 0.1301 AGAGG 0.165 AGAGT 0.2427 AGATA 0.3753 AGATC 0.1347 AGATG 0.1607 AGATT 0.3292 AGCAA 0.3671 AGCAC 0.1705 AGCAG 0.1695 AGCAT 0.2929 AGCCA 0.3767 AGCCC 0.1291 AGCCG 0.1999 AGCCT 0.2944 AGCGA 0.3584 AGCGC 0.1736 AGCGG 0.1516 AGCGT 0.3165 AGCTA 0.2826 AGCTC 0.1493 AGCTG 0.2115 AGCTT 0.3566 AGGAA 0.4485 AGGAC 0.1151 AGGAG 0.1577 AGGAT 0.2787 AGGCA 0.3874 AGGCC 0.1308 AGGCG 0.2051 AGGCT 0.2768 AGGGA 0.4159 AGGGC 0.1478 AGGGG 0.179 AGGGT 0.2573 AGGTA 0.3603 AGGTC 0.1248 AGGTG 0.1952 AGGTT 0.3197 AGTAA 0.3525 AGTAC 0.165 AGTAG 0.1345 AGTAT 0.3479 AGTCA 0.3774 AGTCC 0.1179 AGTCG 0.2139 AGTCT 0.2908 AGTGA 0.3405 AGTGC 0.1746 AGTGG 0.1552 AGTGT 0.3297 AGTTA 0.2942 AGTTC 0.1593 AGTTG 0.1621 AGTTT 0.3843 ATAAA 0.4133 ATAAC 0.1199 ATAAG 0.1077 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4622 ATACC 0.1094 ATACG 0.1623 ATACT 0.2662 ATAGA 0.3823 ATAGC 0.1508 ATAGG 0.132 ATAGT 0.3348 ATATA 0.4258 ATATC 0.1128 ATATG 0.1294 ATATT 0.332 ATCAA 0.3429 ATCAC 0.1606 ATCAG 0.1421 ATCAT 0.3543 ATCCA 0.3482 ATCCC 0.1405 ATCCG 0.1669 ATCCT 0.3445 ATCGA 0.3903 ATCGC 0.1593 ATCGG 0.1072 ATCGT 0.3432 ATCTA 0.2833 ATCTC 0.1657 ATCTG 0.1591 ATCTT 0.3919 ATGAA 0.4254 ATGAC 0.1377 ATGAG 0.1078 ATGAT 0.3291 ATGCA 0.4409 ATGCC 0.1163 ATGCG 0.1714 ATGCT 0.2715 ATGGA 0.3797 ATGGC 0.1881 ATGGG 0.112 ATGGT 0.3203 ATGTA 0.4175 ATGTC 0.111 ATGTG 0.1434 ATGTT 0.3281 ATTAA 0.3403 ATTAC 0.1586 ATTAG 0.09965 ATTAT 0.4015 ATTCA 0.3319 ATTCC 0.1393 ATTCG 0.1865 ATTCT 0.3423 ATTGA 0.299 ATTGC 0.1829 ATTGG 0.1222 ATTGT 0.3959 ATTTA 0.2974 ATTTC 0.1701 ATTTG 0.1408 ATTTT 0.3917 CAAAA 0.3731 CAAAC 0.1445 CAAAG 0.1435 CAAAT 0.3388 CAACA 0.3839 CAACC 0.12 CAACG 0.2178 CAACT 0.2784 CAAGA 0.3456 CAAGC 0.1645 CAAGG 0.1545 CAAGT 0.3354 CAATA 0.3414 CAATC 0.132 CAATG 0.1663 CAATT 0.3604 CACAA 0.3183 CACAC 0.2119 CACAG 0.1554 CACAT 0.3144 CACCA 0.3452 CACCC 0.1376 CACCG 0.218 CACCT 0.2992 CACGA 0.3311 CACGC 0.1987 CACGG 0.1332 CACGT 0.3369 CACTA 0.259 CACTC 0.1562 CACTG 0.2163 CACTT 0.3685 CAGAA 0.4125 CAGAC 0.1308 CAGAG 0.1677 CAGAT 0.2891 CAGCA 0.3555 CAGCC 0.1569 CAGCG 0.1923 CAGCT 0.2953 CAGGA 0.3645 CAGGC 0.1678 CAGGG 0.1467 CAGGT 0.321 CAGTA 0.3203 CAGTC 0.1309 CAGTG 0.2016 CAGTT 0.3472 CATAA 0.321 CATAC 0.1724 CATAG 0.1092 CATAT 0.3974 CATCA 0.3197 CATCC 0.1446 CATCG 0.2315 CATCT 0.3042 CATGA 0.2999 CATGC 0.183 CATGG 0.1398 CATGT 0.3773 CATTA 0.2818 CATTC 0.1602 CATTG 0.1529 CATTT 0.405 CCAAA 0.3624 CCAAC 0.1723 CCAAG 0.1394 CCAAT 0.3258 CCACA 0.2663 CCACC 0.1961 CCACG 0.2518 CCACT 0.2858 CCAGA 0.3206 CCAGC 0.1986 CCAGG 0.1542 CCAGT 0.3266 CCATA 0.2676 CCATC 0.1813 CCATG 0.1726 CCATT 0.3785 CCCAA 0.3265 CCCAC 0.2143 CCCAG 0.1468 CCCAT 0.3123 CCCCA 0.2821 CCCCC 0.1987 CCCCG 0.1757 CCCCT 0.3435 CCCGA 0.3049 CCCGC 0.2119 CCCGG 0.1329 CCCGT 0.3504 CCCTA 0.2071 CCCTC 0.2498 CCCTG 0.1662 CCCTT 0.3769 CCGAA 0.3358 CCGAC 0.1705 CCGAG 0.1779 CCGAT 0.3159 CCGCA 0.2589 CCGCC 0.1736 CCGCG 0.308 CCGCT 0.2596 CCGGA 0.3307 CCGGC 0.2307 CCGGG 0.1243 CCGGT 0.3143 CCGTA 0.2696 CCGTC 0.1718 CCGTG 0.224 CCGTT 0.3345 CCTAA 0.3257 CCTAC 0.1754 CCTAG 0.1303 CCTAT 0.3686 CCTCA 0.2155 CCTCC 0.2021 CCTCG 0.2318 CCTCT 0.3507 CCTGA 0.2817 CCTGC 0.2101 CCTGG 0.1386 CCTGT 0.3695 CCTTA 0.2234 CCTTC 0.2133 CCTTG 0.1606 CCTTT 0.4027 CGAAA 0.3709 CGAAC 0.1611 CGAAG 0.1658 CGAAT 0.3022 CGACA 0.3246 CGACC 0.1523 CGACG 0.2882 CGACT 0.2349 CGAGA 0.3665 CGAGC 0.1842 CGAGG 0.1663 CGAGT 0.283 CGATA 0.3251 CGATC 0.1944 CGATG 0.1682 CGATT 0.3123 CGCAA 0.3336 CGCAC 0.192 CGCAG 0.1706 CGCAT 0.3038 CGCCA 0.369 CGCCC 0.1314 CGCCG 0.25 CGCCT 0.2497 CGCGA 0.313 CGCGC 0.2303 CGCGG 0.1469 CGCGT 0.3097 CGCTA 0.2625 CGCTC 0.2079 CGCTG 0.2 CGCTT 0.3296 CGGAA 0.395 CGGAC 0.1447 CGGAG 0.1818 CGGAT 0.2785 CGGCA 0.3223 CGGCC 0.1794 CGGCG 0.2602 CGGCT 0.2381 CGGGA 0.3895 CGGGC 0.1898 CGGGG 0.1705 CGGGT 0.2502 CGGTA 0.3161 CGGTC 0.1853 CGGTG 0.2152 CGGTT 0.2835 CGTAA 0.316 CGTAC 0.1961 CGTAG 0.1387 CGTAT 0.3492 CGTCA 0.2972 CGTCC 0.1666 CGTCG 0.2878 CGTCT 0.2484 CGTGA 0.2953 CGTGC 0.1848 CGTGG 0.1625 CGTGT 0.3574 CGTTA 0.2673 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.1704 CGTTT 0.3678 CTAAA 0.3735 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1205 CTAAT 0.3419 CTACA 0.3619 CTACC 0.1435 CTACG 0.1905 CTACT 0.3041 CTAGA 0.354 CTAGC 0.1745 CTAGG 0.1357 CTAGT 0.3358 CTATA 0.3371 CTATC 0.1526 CTATG 0.1483 CTATT 0.362 CTCAA 0.3347 CTCAC 0.1943 CTCAG 0.1445 CTCAT 0.3266 CTCCA 0.2918 CTCCC 0.1785 CTCCG 0.1899 CTCCT 0.3398 CTCGA 0.3554 CTCGC 0.1842 CTCGG 0.1242 CTCGT 0.3362 CTCTA 0.233 CTCTC 0.237 CTCTG 0.171 CTCTT 0.359 CTGAA 0.3724 CTGAC 0.1738 CTGAG 0.1205 CTGAT 0.3334 CTGCA 0.3572 CTGCC 0.1635 CTGCG 0.1821 CTGCT 0.2973 CTGGA 0.352 CTGGC 0.2034 CTGGG 0.1161 CTGGT 0.3285 CTGTA 0.3184 CTGTC 0.1625 CTGTG 0.171 CTGTT 0.3482 CTTAA 0.3442 CTTAC 0.1702 CTTAG 0.1096 CTTAT 0.376 CTTCA 0.2653 CTTCC 0.1899 CTTCG 0.203 CTTCT 0.3419 CTTGA 0.2963 CTTGC 0.194 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3821 CTTTA 0.2476 CTTTC 0.2005 CTTTG 0.148 CTTTT 0.404 GAAAA 0.3654 GAAAC 0.156 GAAAG 0.1542 GAAAT 0.3245 GAACA 0.3836 GAACC 0.1165 GAACG 0.2381 GAACT 0.2619 GAAGA 0.3884 GAAGC 0.1621 GAAGG 0.1692 GAAGT 0.2803 GAATA 0.3406 GAATC 0.1459 GAATG 0.1768 GAATT 0.3367 GACAA 0.3515 GACAC 0.1628 GACAG 0.1834 GACAT 0.3023 GACCA 0.3572 GACCC 0.1168 GACCG 0.2605 GACCT 0.2655 GACGA 0.3821 GACGC 0.1888 GACGG 0.1318 GACGT 0.2973 GACTA 0.2988 GACTC 0.1604 GACTG 0.1961 GACTT 0.3447 GAGAA 0.4054 GAGAC 0.1276 GAGAG 0.2035 GAGAT 0.2635 GAGCA 0.3772 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2418 GAGCT 0.2521 GAGGA 0.3952 GAGGC 0.1486 GAGGG 0.1997 GAGGT 0.2565 GAGTA 0.3469 GAGTC 0.1418 GAGTG 0.1929 GAGTT 0.3184 GATAA 0.3314 GATAC 0.1699 GATAG 0.1222 GATAT 0.3765 GATCA 0.316 GATCC 0.1353 GATCG 0.281 GATCT 0.2677 GATGA 0.3371 GATGC 0.167 GATGG 0.1559 GATGT 0.34 GATTA 0.2908 GATTC 0.1704 GATTG 0.1564 GATTT 0.3824 GCAAA 0.3585 GCAAC 0.1688 GCAAG 0.1432 GCAAT 0.3294 GCACA 0.3788 GCACC 0.1465 GCACG 0.2236 GCACT 0.2511 GCAGA 0.3307 GCAGC 0.2022 GCAGG 0.1526 GCAGT 0.3145 GCATA 0.3277 GCATC 0.1477 GCATG 0.1719 GCATT 0.3527 GCCAA 0.311 GCCAC 0.2047 GCCAG 0.1593 GCCAT 0.325 GCCCA 0.282 GCCCC 0.1965 GCCCG 0.2127 GCCCT 0.3088 GCCGA 0.3213 GCCGC 0.2397 GCCGG 0.1755 GCCGT 0.2635 GCCTA 0.2414 GCCTC 0.1947 GCCTG 0.199 GCCTT 0.3649 GCGAA 0.342 GCGAC 0.1669 GCGAG 0.1767 GCGAT 0.3144 GCGCA 0.3059 GCGCC 0.1482 GCGCG 0.3379 GCGCT 0.2079 GCGGA 0.3091 GCGGC 0.2269 GCGGG 0.1428 GCGGT 0.3212 GCGTA 0.2845 GCGTC 0.1737 GCGTG 0.2358 GCGTT 0.306 GCTAA 0.2973 GCTAC 0.2085 GCTAG 0.1406 GCTAT 0.3536 GCTCA 0.263 GCTCC 0.167 GCTCG 0.2744 GCTCT 0.2955 GCTGA 0.2851 GCTGC 0.2226 GCTGG 0.1427 GCTGT 0.3496 GCTTA 0.2412 GCTTC 0.2021 GCTTG 0.1693 GCTTT 0.3874 GGAAA 0.4212 GGAAC 0.1399 GGAAG 0.1788 GGAAT 0.2601 GGACA 0.3691 GGACC 0.1401 GGACG 0.2764 GGACT 0.2144 GGAGA 0.3863 GGAGC 0.1654 GGAGG 0.2137 GGAGT 0.2346 GGATA 0.3418 GGATC 0.1629 GGATG 0.1829 GGATT 0.3123 GGCAA 0.3396 GGCAC 0.1859 GGCAG 0.2023 GGCAT 0.2723 GGCCA 0.3567 GGCCC 0.1667 GGCCG 0.2478 GGCCT 0.2288 GGCGA 0.3531 GGCGC 0.2148 GGCGG 0.176 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2719 GGCTC 0.1679 GGCTG 0.2474 GGCTT 0.3129 GGGAA 0.418 GGGAC 0.1442 GGGAG 0.1846 GGGAT 0.2532 GGGCA 0.3525 GGGCC 0.1901 GGGCG 0.2153 GGGCT 0.2421 GGGGA 0.3836 GGGGC 0.1806 GGGGG 0.1987 GGGGT 0.2371 GGGTA 0.3174 GGGTC 0.1475 GGGTG 0.2411 GGGTT 0.294 GGTAA 0.3347 GGTAC 0.1815 GGTAG 0.1487 GGTAT 0.3351 GGTCA 0.3357 GGTCC 0.1475 GGTCG 0.2656 GGTCT 0.2511 GGTGA 0.3213 GGTGC 0.1969 GGTGG 0.2058 GGTGT 0.276 GGTTA 0.3027 GGTTC 0.1785 GGTTG 0.176 GGTTT 0.3429 GTAAA 0.374 GTAAC 0.1623 GTAAG 0.1187 GTAAT 0.345 GTACA 0.4353 GTACC 0.1209 GTACG 0.1861 GTACT 0.2577 GTAGA 0.3691 GTAGC 0.1819 GTAGG 0.1284 GTAGT 0.3206 GTATA 0.3614 GTATC 0.147 GTATG 0.1622 GTATT 0.3293 GTCAA 0.3129 GTCAC 0.1958 GTCAG 0.1637 GTCAT 0.3276 GTCCA 0.3361 GTCCC 0.1719 GTCCG 0.1863 GTCCT 0.3056 GTCGA 0.3454 GTCGC 0.191 GTCGG 0.1306 GTCGT 0.3329 GTCTA 0.2612 GTCTC 0.2041 GTCTG 0.1831 GTCTT 0.3516 GTGAA 0.386 GTGAC 0.171 GTGAG 0.1332 GTGAT 0.3098 GTGCA 0.398 GTGCC 0.1382 GTGCG 0.1886 GTGCT 0.2752 GTGGA 0.3471 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1305 GTGGT 0.3212 GTGTA 0.3536 GTGTC 0.1332 GTGTG 0.2154 GTGTT 0.2978 GTTAA 0.3313 GTTAC 0.1945 GTTAG 0.1246 GTTAT 0.3496 GTTCA 0.3077 GTTCC 0.1576 GTTCG 0.2091 GTTCT 0.3257 GTTGA 0.3042 GTTGC 0.2088 GTTGG 0.1439 GTTGT 0.3431 GTTTA 0.2756 GTTTC 0.2153 GTTTG 0.1581 GTTTT 0.351 TAAAA 0.4047 TAAAC 0.1242 TAAAG 0.1184 TAAAT 0.3528 TAACA 0.4174 TAACC 0.1142 TAACG 0.1891 TAACT 0.2794 TAAGA 0.3902 TAAGC 0.1416 TAAGG 0.1298 TAAGT 0.3384 TAATA 0.3749 TAATC 0.1159 TAATG 0.1447 TAATT 0.3645 TACAA 0.3395 TACAC 0.148 TACAG 0.1231 TACAT 0.3894 TACCA 0.3769 TACCC 0.1071 TACCG 0.1893 TACCT 0.3266 TACGA 0.3487 TACGC 0.1619 TACGG 0.1083 TACGT 0.381 TACTA 0.2943 TACTC 0.1368 TACTG 0.1672 TACTT 0.4018 TAGAA 0.441 TAGAC 0.1121 TAGAG 0.1374 TAGAT 0.3095 TAGCA 0.3984 TAGCC 0.1266 TAGCG 0.1853 TAGCT 0.2897 TAGGA 0.3846 TAGGC 0.1423 TAGGG 0.1279 TAGGT 0.3451 TAGTA 0.3651 TAGTC 0.1291 TAGTG 0.1563 TAGTT 0.3495 TATAA 0.3019 TATAC 0.1382 TATAG 0.08935 TATAT 0.4705 TATCA 0.3412 TATCC 0.1247 TATCG 0.2064 TATCT 0.3277 TATGA 0.2958 TATGC 0.1573 TATGG 0.09773 TATGT 0.4492 TATTA 0.3129 TATTC 0.1323 TATTG 0.1345 TATTT 0.4203 TCAAA 0.3885 TCAAC 0.1499 TCAAG 0.1333 TCAAT 0.3282 TCACA 0.3387 TCACC 0.1455 TCACG 0.2176 TCACT 0.2981 TCAGA 0.3298 TCAGC 0.1765 TCAGG 0.1395 TCAGT 0.3542 TCATA 0.3144 TCATC 0.1521 TCATG 0.1437 TCATT 0.3898 TCCAA 0.3419 TCCAC 0.1809 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.336 TCCCA 0.278 TCCCC 0.1749 TCCCG 0.183 TCCCT 0.364 TCCGA 0.2972 TCCGC 0.1992 TCCGG 0.1535 TCCGT 0.3502 TCCTA 0.2444 TCCTC 0.194 TCCTG 0.162 TCCTT 0.3996 TCGAA 0.3442 TCGAC 0.1401 TCGAG 0.1582 TCGAT 0.3575 TCGCA 0.2923 TCGCC 0.1523 TCGCG 0.2871 TCGCT 0.2684 TCGGA 0.302 TCGGC 0.1992 TCGGG 0.1345 TCGGT 0.3643 TCGTA 0.2848 TCGTC 0.1635 TCGTG 0.1827 TCGTT 0.3691 TCTAA 0.3145 TCTAC 0.1808 TCTAG 0.1219 TCTAT 0.3828 TCTCA 0.2499 TCTCC 0.1474 TCTCG 0.2062 TCTCT 0.3965 TCTGA 0.278 TCTGC 0.1899 TCTGG 0.1203 TCTGT 0.4119 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1822 TCTTG 0.1337 TCTTT 0.4341 TGAAA 0.4492 TGAAC 0.1317 TGAAG 0.1204 TGAAT 0.2988 TGACA 0.4079 TGACC 0.126 TGACG 0.1948 TGACT 0.2713 TGAGA 0.4064 TGAGC 0.1616 TGAGG 0.1414 TGAGT 0.2906 TGATA 0.3594 TGATC 0.1462 TGATG 0.1553 TGATT 0.3391 TGCAA 0.3622 TGCAC 0.1698 TGCAG 0.1403 TGCAT 0.3277 TGCCA 0.379 TGCCC 0.1341 TGCCG 0.193 TGCCT 0.2939 TGCGA 0.3193 TGCGC 0.209 TGCGG 0.1237 TGCGT 0.348 TGCTA 0.2811 TGCTC 0.1615 TGCTG 0.1842 TGCTT 0.3731 TGGAA 0.4536 TGGAC 0.1272 TGGAG 0.1361 TGGAT 0.2831 TGGCA 0.3671 TGGCC 0.1499 TGGCG 0.2227 TGGCT 0.2603 TGGGA 0.3945 TGGGC 0.1677 TGGGG 0.1825 TGGGT 0.2552 TGGTA 0.3559 TGGTC 0.1437 TGGTG 0.1928 TGGTT 0.3075 TGTAA 0.3306 TGTAC 0.1789 TGTAG 0.1027 TGTAT 0.3878 TGTCA 0.371 TGTCC 0.1327 TGTCG 0.1933 TGTCT 0.303 TGTGA 0.2846 TGTGC 0.1938 TGTGG 0.1064 TGTGT 0.4152 TGTTA 0.2963 TGTTC 0.1574 TGTTG 0.1508 TGTTT 0.3956 TTAAA 0.3925 TTAAC 0.1336 TTAAG 0.116 TTAAT 0.3579 TTACA 0.4284 TTACC 0.1188 TTACG 0.1597 TTACT 0.2932 TTAGA 0.3731 TTAGC 0.1507 TTAGG 0.1386 TTAGT 0.3377 TTATA 0.3527 TTATC 0.1281 TTATG 0.1349 TTATT 0.3842 TTCAA 0.3516 TTCAC 0.1588 TTCAG 0.126 TTCAT 0.3636 TTCCA 0.3529 TTCCC 0.1467 TTCCG 0.1498 TTCCT 0.3507 TTCGA 0.3595 TTCGC 0.1658 TTCGG 0.109 TTCGT 0.3657 TTCTA 0.2716 TTCTC 0.1715 TTCTG 0.1528 TTCTT 0.4041 TTGAA 0.4232 TTGAC 0.1354 TTGAG 0.1137 TTGAT 0.3277 TTGCA 0.4199 TTGCC 0.1249 TTGCG 0.1621 TTGCT 0.2931 TTGGA 0.3749 TTGGC 0.1747 TTGGG 0.1135 TTGGT 0.3369 TTGTA 0.3625 TTGTC 0.1286 TTGTG 0.1446 TTGTT 0.3644 TTTAA 0.3344 TTTAC 0.1541 TTTAG 0.09755 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3349 TTTCC 0.1514 TTTCG 0.1536 TTTCT 0.3601 TTTGA 0.3039 TTTGC 0.1709 TTTGG 0.1167 TTTGT 0.4085 TTTTA 0.3068 TTTTC 0.1722 TTTTG 0.1394 TTTTT 0.3815 [3] # (a,c,g,t)= (0.327, 0.173, 0.173, 0.327) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.338 C 0.162 G 0.162 T 0.338 # l= 1 # Values AA 0.123 AC 0.0534 AG 0.0466 AT 0.115 CA 0.0546 CC 0.0231 CG 0.0373 CT 0.0466 GA 0.0559 GC 0.0291 GG 0.0231 GT 0.0534 TA 0.105 TC 0.0559 TG 0.0546 TT 0.123 # l= 2 # Values AAA 0.0482 AAC 0.0179 AAG 0.0173 AAT 0.04 ACA 0.0204 ACC 0.00695 ACG 0.0123 ACT 0.0138 AGA 0.0178 AGC 0.00776 AGG 0.00721 AGT 0.0138 ATA 0.0405 ATC 0.0169 ATG 0.0176 ATT 0.04 CAA 0.0186 CAC 0.00982 CAG 0.00848 CAT 0.0177 CCA 0.00759 CCC 0.00347 CCG 0.00485 CCT 0.00722 CGA 0.0132 CGC 0.00691 CGG 0.00486 CGT 0.0123 CTA 0.0121 CTC 0.00878 CTG 0.00848 CTT 0.0173 GAA 0.0224 GAC 0.00789 GAG 0.00879 GAT 0.0169 GCA 0.0102 GCC 0.00419 GCG 0.00691 GCT 0.00776 GGA 0.00852 GGC 0.00419 GGG 0.00347 GGT 0.00695 GTA 0.0178 GTC 0.00788 GTG 0.00982 GTT 0.0179 TAA 0.0342 TAC 0.0178 TAG 0.012 TAT 0.0405 TCA 0.0164 TCC 0.00852 TCG 0.0133 TCT 0.0178 TGA 0.0164 TGC 0.0102 TGG 0.00759 TGT 0.0204 TTA 0.0342 TTC 0.0224 TTG 0.0186 TTT 0.0482 # l= 3 # Values AAAA 0.0185 AAAC 0.00669 AAAG 0.00713 AAAT 0.0159 AACA 0.00687 AACC 0.00209 AACG 0.00426 AACT 0.00469 AAGA 0.00676 AAGC 0.00265 AAGG 0.00268 AAGT 0.0052 AATA 0.0142 AATC 0.00538 AATG 0.00644 AATT 0.014 ACAA 0.00701 ACAC 0.00345 ACAG 0.00315 ACAT 0.00675 ACCA 0.00244 ACCC 0.000856 ACCG 0.00161 ACCT 0.00205 ACGA 0.00452 ACGC 0.00214 ACGG 0.00153 ACGT 0.00407 ACTA 0.00384 ACTC 0.00216 ACTG 0.00264 ACTT 0.0052 AGAA 0.00761 AGAC 0.00214 AGAG 0.0031 AGAT 0.00494 AGCA 0.00286 AGCC 0.00107 AGCG 0.00171 AGCT 0.00212 AGGA 0.00287 AGGC 0.00111 AGGG 0.00119 AGGT 0.00205 AGTA 0.00476 AGTC 0.00191 AGTG 0.0025 AGTT 0.00468 ATAA 0.0132 ATAC 0.00627 ATAG 0.00441 ATAT 0.0166 ATCA 0.00523 ATCC 0.00229 ATCG 0.00439 ATCT 0.00494 ATGA 0.00553 ATGC 0.00299 ATGG 0.00238 ATGT 0.00675 ATTA 0.0119 ATTC 0.00621 ATTG 0.00594 ATTT 0.0159 CAAA 0.00698 CAAC 0.003 CAAG 0.00269 CAAT 0.00594 CACA 0.00333 CACC 0.00148 CACG 0.00251 CACT 0.0025 CAGA 0.00288 CAGC 0.00164 CAGG 0.00131 CAGT 0.00264 CATA 0.00562 CATC 0.00287 CATG 0.00272 CATT 0.00644 CCAA 0.00246 CCAC 0.00155 CCAG 0.00119 CCAT 0.00239 CCCA 0.000926 CCCC 0.000652 CCCG 0.000704 CCCT 0.00119 CCGA 0.00155 CCGC 0.00103 CCGG 0.000746 CCGT 0.00153 CCTA 0.00168 CCTC 0.00154 CCTG 0.00131 CCTT 0.00268 CGAA 0.0045 CGAC 0.00207 CGAG 0.00229 CGAT 0.00439 CGCA 0.00195 CGCC 0.00101 CGCG 0.00224 CGCT 0.00171 CGGA 0.00154 CGGC 0.000995 CGGG 0.000704 CGGT 0.00161 CGTA 0.00345 CGTC 0.00204 CGTG 0.00251 CGTT 0.00426 CTAA 0.00371 CTAC 0.00233 CTAG 0.0016 CTAT 0.00441 CTCA 0.00198 CTCC 0.00142 CTCG 0.00229 CTCT 0.00309 CTGA 0.00237 CTGC 0.00176 CTGG 0.00119 CTGT 0.00315 CTTA 0.00402 CTTC 0.00345 CTTG 0.00269 CTTT 0.00713 GAAA 0.00949 GAAC 0.00325 GAAG 0.00345 GAAT 0.00621 GACA 0.00284 GACC 0.0011 GACG 0.00204 GACT 0.00191 GAGA 0.00366 GAGC 0.00142 GAGG 0.00154 GAGT 0.00216 GATA 0.0057 GATC 0.0029 GATG 0.00287 GATT 0.00538 GCAA 0.0036 GCAC 0.00188 GCAG 0.00176 GCAT 0.00299 GCCA 0.0015 GCCC 0.000591 GCCG 0.000993 GCCT 0.00111 GCGA 0.00232 GCGC 0.00142 GCGG 0.00103 GCGT 0.00214 GCTA 0.00205 GCTC 0.00142 GCTG 0.00164 GCTT 0.00265 GGAA 0.00366 GGAC 0.00115 GGAG 0.00142 GGAT 0.00229 GGCA 0.00142 GGCC 0.000687 GGCG 0.00102 GGCT 0.00107 GGGA 0.00137 GGGC 0.000591 GGGG 0.000652 GGGT 0.000857 GGTA 0.00228 GGTC 0.00109 GGTG 0.00148 GGTT 0.00209 GTAA 0.00587 GTAC 0.00333 GTAG 0.00233 GTAT 0.00627 GTCA 0.00253 GTCC 0.00115 GTCG 0.00207 GTCT 0.00214 GTGA 0.00294 GTGC 0.00188 GTGG 0.00155 GTGT 0.00345 GTTA 0.00495 GTTC 0.00325 GTTG 0.00301 GTTT 0.00669 TAAA 0.0133 TAAC 0.00496 TAAG 0.00402 TAAT 0.0119 TACA 0.00732 TACC 0.00228 TACG 0.00345 TACT 0.00475 TAGA 0.00448 TAGC 0.00205 TAGG 0.00168 TAGT 0.00385 TATA 0.015 TATC 0.0057 TATG 0.00562 TATT 0.0142 TCAA 0.00553 TCAC 0.00294 TCAG 0.00237 TCAT 0.00553 TCCA 0.00273 TCCC 0.00137 TCCG 0.00154 TCCT 0.00287 TCGA 0.00486 TCGC 0.00232 TCGG 0.00156 TCGT 0.00452 TCTA 0.00448 TCTC 0.00366 TCTG 0.00288 TCTT 0.00676 TGAA 0.00663 TGAC 0.00253 TGAG 0.00198 TGAT 0.00523 TGCA 0.00401 TGCC 0.00142 TGCG 0.00195 TGCT 0.00286 TGGA 0.00274 TGGC 0.0015 TGGG 0.000925 TGGT 0.00244 TGTA 0.00732 TGTC 0.00284 TGTG 0.00333 TGTT 0.00687 TTAA 0.0114 TTAC 0.00587 TTAG 0.00371 TTAT 0.0132 TTCA 0.00663 TTCC 0.00365 TTCG 0.0045 TTCT 0.00762 TTGA 0.00554 TTGC 0.0036 TTGG 0.00246 TTGT 0.00702 TTTA 0.0133 TTTC 0.00949 TTTG 0.00697 TTTT 0.0185 # l= 4 # Values AAAAA 0.00716 AAAAC 0.00228 AAAAG 0.00285 AAAAT 0.00618 AAACA 0.00266 AAACC 0.000713 AAACG 0.00153 AAACT 0.00179 AAAGA 0.00293 AAAGC 0.000996 AAAGG 0.00107 AAAGT 0.00213 AAATA 0.00591 AAATC 0.00199 AAATG 0.00257 AAATT 0.00545 AACAA 0.00256 AACAC 0.001 AACAG 0.0011 AACAT 0.00221 AACCA 0.00074 AACCC 0.000244 AACCG 0.000463 AACCT 0.000643 AACGA 0.00167 AACGC 0.00066 AACGG 0.000519 AACGT 0.0014 AACTA 0.00133 AACTC 0.000693 AACTG 0.000897 AACTT 0.00176 AAGAA 0.00306 AAGAC 0.000723 AAGAG 0.00109 AAGAT 0.0019 AAGCA 0.00105 AAGCC 0.000316 AAGCG 0.000541 AAGCT 0.000743 AAGGA 0.00113 AAGGC 0.000389 AAGGG 0.000439 AAGGT 0.000728 AAGTA 0.0019 AAGTC 0.000633 AAGTG 0.000903 AAGTT 0.00176 AATAA 0.00507 AATAC 0.00203 AATAG 0.00157 AATAT 0.00552 AATCA 0.00175 AATCC 0.000698 AATCG 0.00133 AATCT 0.0016 AATGA 0.00214 AATGC 0.00105 AATGG 0.000887 AATGT 0.00236 AATTA 0.00433 AATTC 0.00208 AATTG 0.00213 AATTT 0.00545 ACAAA 0.00277 ACAAC 0.00099 ACAAG 0.000978 ACAAT 0.00227 ACACA 0.00136 ACACC 0.000407 ACACG 0.000887 ACACT 0.000798 ACAGA 0.00116 ACAGC 0.000565 ACAGG 0.000465 ACAGT 0.00096 ACATA 0.00246 ACATC 0.000932 ACATG 0.000994 ACATT 0.00236 ACCAA 0.000808 ACCAC 0.000488 ACCAG 0.000385 ACCAT 0.000755 ACCCA 0.000234 ACCCC 0.000151 ACCCG 0.000174 ACCCT 0.000297 ACCGA 0.000568 ACCGC 0.000325 ACCGG 0.000232 ACCGT 0.000486 ACCTA 0.000557 ACCTC 0.000364 ACCTG 0.000402 ACCTT 0.000728 ACGAA 0.00161 ACGAC 0.000676 ACGAG 0.000766 ACGAT 0.00147 ACGCA 0.000666 ACGCC 0.000259 ACGCG 0.000692 ACGCT 0.000527 ACGGA 0.000538 ACGGC 0.000259 ACGGG 0.000243 ACGGT 0.000486 ACGTA 0.00127 ACGTC 0.000575 ACGTG 0.000821 ACGTT 0.0014 ACTAA 0.00121 ACTAC 0.000702 ACTAG 0.000517 ACTAT 0.00141 ACTCA 0.000553 ACTCC 0.000305 ACTCG 0.000613 ACTCT 0.000694 ACTGA 0.00079 ACTGC 0.000517 ACTGG 0.000375 ACTGT 0.00096 ACTTA 0.00131 ACTTC 0.000893 ACTTG 0.00087 ACTTT 0.00213 AGAAA 0.00338 AGAAC 0.00102 AGAAG 0.00117 AGAAT 0.00205 AGACA 0.000848 AGACC 0.000269 AGACG 0.000504 AGACT 0.000518 AGAGA 0.00146 AGAGC 0.000404 AGAGG 0.000536 AGAGT 0.000694 AGATA 0.00178 AGATC 0.000732 AGATG 0.000831 AGATT 0.0016 AGCAA 0.00105 AGCAC 0.000509 AGCAG 0.000517 AGCAT 0.000786 AGCCA 0.000388 AGCCC 0.000143 AGCCG 0.000231 AGCCT 0.000305 AGCGA 0.00062 AGCGC 0.000291 AGCGG 0.000267 AGCGT 0.000527 AGCTA 0.000582 AGCTC 0.000344 AGCTG 0.000456 AGCTT 0.000743 AGGAA 0.00128 AGGAC 0.000335 AGGAG 0.000474 AGGAT 0.000787 AGGCA 0.000398 AGGCC 0.00015 AGGCG 0.000254 AGGCT 0.000305 AGGGA 0.000488 AGGGC 0.000177 AGGGG 0.000223 AGGGT 0.000297 AGGTA 0.000713 AGGTC 0.000279 AGGTG 0.000417 AGGTT 0.000643 AGTAA 0.00166 AGTAC 0.000814 AGTAG 0.000682 AGTAT 0.0016 AGTCA 0.000674 AGTCC 0.000237 AGTCG 0.000477 AGTCT 0.000518 AGTGA 0.000829 AGTGC 0.000446 AGTGG 0.000425 AGTGT 0.000798 AGTTA 0.00133 AGTTC 0.000782 AGTTG 0.000786 AGTTT 0.00179 ATAAA 0.0054 ATAAC 0.00167 ATAAG 0.00147 ATAAT 0.00469 ATACA 0.00277 ATACC 0.000737 ATACG 0.00117 ATACT 0.0016 ATAGA 0.00169 ATAGC 0.000697 ATAGG 0.0006 ATAGT 0.00141 ATATA 0.00688 ATATC 0.00206 ATATG 0.00216 ATATT 0.00552 ATCAA 0.00179 ATCAC 0.000886 ATCAG 0.000758 ATCAT 0.0018 ATCCA 0.000754 ATCCC 0.000324 ATCCG 0.000426 ATCCT 0.000787 ATCGA 0.00171 ATCGC 0.000714 ATCGG 0.0005 ATCGT 0.00147 ATCTA 0.00136 ATCTC 0.000891 ATCTG 0.000799 ATCTT 0.0019 ATGAA 0.00231 ATGAC 0.000794 ATGAG 0.000618 ATGAT 0.0018 ATGCA 0.00128 ATGCC 0.000357 ATGCG 0.000569 ATGCT 0.000786 ATGGA 0.000898 ATGGC 0.00045 ATGGG 0.000286 ATGGT 0.000755 ATGTA 0.00275 ATGTC 0.000804 ATGTG 0.000991 ATGTT 0.00221 ATTAA 0.00403 ATTAC 0.00194 ATTAG 0.00124 ATTAT 0.00469 ATTCA 0.00194 ATTCC 0.000913 ATTCG 0.00131 ATTCT 0.00205 ATTGA 0.00177 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.000769 ATTGT 0.00227 ATTTA 0.00455 ATTTC 0.00292 ATTTG 0.00227 ATTTT 0.00618 CAAAA 0.00255 CAAAC 0.00108 CAAAG 0.00108 CAAAT 0.00227 CAACA 0.00108 CAACC 0.000389 CAACG 0.000754 CAACT 0.000786 CAAGA 0.00091 CAAGC 0.000472 CAAGG 0.000441 CAAGT 0.00087 CAATA 0.00193 CAATC 0.000859 CAATG 0.00102 CAATT 0.00213 CACAA 0.00102 CACAC 0.000767 CACAG 0.000552 CACAT 0.000991 CACCA 0.000486 CACCC 0.00022 CACCG 0.000362 CACCT 0.000417 CACGA 0.000821 CACGC 0.000509 CACGG 0.000356 CACGT 0.000821 CACTA 0.000614 CACTC 0.000424 CACTG 0.000555 CACTT 0.000903 CAGAA 0.00115 CAGAC 0.000407 CAGAG 0.000531 CAGAT 0.000799 CAGCA 0.000546 CAGCC 0.000276 CAGCG 0.000361 CAGCT 0.000456 CAGGA 0.000466 CAGGC 0.000239 CAGGG 0.000208 CAGGT 0.000402 CAGTA 0.000796 CAGTC 0.000392 CAGTG 0.000555 CAGTT 0.000897 CATAA 0.00177 CATAC 0.00102 CATAG 0.000672 CATAT 0.00216 CATCA 0.00084 CATCC 0.000431 CATCG 0.000771 CATCT 0.000831 CATGA 0.000791 CATGC 0.000517 CATGG 0.000419 CATGT 0.000994 CATTA 0.00173 CATTC 0.00111 CATTG 0.00102 CATTT 0.00257 CCAAA 0.000848 CCAAC 0.000458 CCAAG 0.000387 CCAAT 0.000769 CCACA 0.000369 CCACC 0.000324 CCACG 0.00043 CCACT 0.000425 CCAGA 0.000373 CCAGC 0.000246 CCAGG 0.000199 CCAGT 0.000375 CCATA 0.000591 CCATC 0.000487 CCATG 0.000419 CCATT 0.000887 CCCAA 0.000289 CCCAC 0.000206 CCCAG 0.000144 CCCAT 0.000286 CCCCA 0.000174 CCCCC 0.000127 CCCCG 0.000129 CCCCT 0.000223 CCCGA 0.000218 CCCGC 0.000146 CCCGG 9.65e-05 CCCGT 0.000243 CCCTA 0.00022 CCCTC 0.000319 CCCTG 0.000208 CCCTT 0.000439 CCGAA 0.000492 CCGAC 0.000276 CCGAG 0.000287 CCGAT 0.0005 CCGCA 0.000251 CCGCC 0.00018 CCGCG 0.00033 CCGCT 0.000267 CCGGA 0.000239 CCGGC 0.000178 CCGGG 9.65e-05 CCGGT 0.000232 CCGTA 0.000378 CCGTC 0.000274 CCGTG 0.000356 CCGTT 0.000519 CCTAA 0.000531 CCTAC 0.000319 CCTAG 0.000227 CCTAT 0.0006 CCTCA 0.000287 CCTCC 0.000309 CCTCG 0.000409 CCTCT 0.000536 CCTGA 0.000356 CCTGC 0.000295 CCTGG 0.000199 CCTGT 0.000465 CCTTA 0.000556 CCTTC 0.000611 CCTTG 0.000441 CCTTT 0.00107 CGAAA 0.00164 CGAAC 0.000771 CGAAG 0.000791 CGAAT 0.00131 CGACA 0.000627 CGACC 0.000324 CGACG 0.000641 CGACT 0.000477 CGAGA 0.000829 CGAGC 0.000438 CGAGG 0.000409 CGAGT 0.000613 CGATA 0.00136 CGATC 0.000934 CGATG 0.000771 CGATT 0.00133 CGCAA 0.00065 CGCAC 0.000386 CGCAG 0.000347 CGCAT 0.000569 CGCCA 0.000354 CGCCC 0.00013 CGCCG 0.000277 CGCCT 0.000254 CGCGA 0.000704 CGCGC 0.00051 CGCGG 0.00033 CGCGT 0.000692 CGCTA 0.000428 CGCTC 0.000376 CGCTG 0.000361 CGCTT 0.000541 CGGAA 0.000594 CGGAC 0.000233 CGGAG 0.000292 CGGAT 0.000426 CGGCA 0.000299 CGGCC 0.000186 CGGCG 0.000277 CGGCT 0.000231 CGGGA 0.000265 CGGGC 0.000136 CGGGG 0.000129 CGGGT 0.000174 CGGTA 0.000482 CGGTC 0.000304 CGGTG 0.000362 CGGTT 0.000463 CGTAA 0.00107 CGTAC 0.000717 CGTAG 0.0005 CGTAT 0.00117 CGTCA 0.000554 CGTCC 0.000345 CGTCG 0.000641 CGTCT 0.000504 CGTGA 0.000712 CGTGC 0.000477 CGTGG 0.00043 CGTGT 0.000887 CGTTA 0.00108 CGTTC 0.000895 CGTTG 0.000754 CGTTT 0.00153 CTAAA 0.00136 CTAAC 0.00065 CTAAG 0.000457 CTAAT 0.00124 CTACA 0.000786 CTACC 0.000364 CTACG 0.0005 CTACT 0.000682 CTAGA 0.000556 CTAGC 0.0003 CTAGG 0.000227 CTAGT 0.000517 CTATA 0.00142 CTATC 0.00074 CTATG 0.000672 CTATT 0.00157 CTCAA 0.000658 CTCAC 0.000411 CTCAG 0.000292 CTCAT 0.000618 CTCCA 0.000388 CTCCC 0.000268 CTCCG 0.000292 CTCCT 0.000474 CTCGA 0.000803 CTCGC 0.000433 CTCGG 0.000287 CTCGT 0.000766 CTCTA 0.000661 CTCTC 0.000817 CTCTG 0.000531 CTCTT 0.00109 CTGAA 0.000875 CTGAC 0.000444 CTGAG 0.000292 CTGAT 0.000758 CTGCA 0.000598 CTGCC 0.0003 CTGCG 0.000347 CTGCT 0.000517 CTGGA 0.000405 CTGGC 0.000259 CTGGG 0.000144 CTGGT 0.000385 CTGTA 0.000949 CTGTC 0.000548 CTGTG 0.000552 CTGTT 0.0011 CTTAA 0.00136 CTTAC 0.000731 CTTAG 0.000457 CTTAT 0.00147 CTTCA 0.000814 CTTCC 0.000679 CTTCG 0.000791 CTTCT 0.00117 CTTGA 0.000784 CTTGC 0.000545 CTTGG 0.000387 CTTGT 0.000978 CTTTA 0.00164 CTTTC 0.00156 CTTTG 0.00108 CTTTT 0.00285 GAAAA 0.00342 GAAAC 0.00158 GAAAG 0.00156 GAAAT 0.00292 GAACA 0.00118 GAACC 0.000396 GAACG 0.000895 GAACT 0.000782 GAAGA 0.00136 GAAGC 0.000582 GAAGG 0.000611 GAAGT 0.000893 GAATA 0.00202 GAATC 0.000995 GAATG 0.00111 GAATT 0.00208 GACAA 0.000995 GACAC 0.000493 GACAG 0.000548 GACAT 0.000804 GACCA 0.000376 GACCC 0.000136 GACCG 0.000304 GACCT 0.000279 GACGA 0.000804 GACGC 0.00039 GACGG 0.000274 GACGT 0.000575 GACTA 0.000543 GACTC 0.000337 GACTG 0.000392 GACTT 0.000633 GAGAA 0.00147 GAGAC 0.000483 GAGAG 0.000817 GAGAT 0.000891 GAGCA 0.0005 GAGCC 0.000199 GAGCG 0.000376 GAGCT 0.000344 GAGGA 0.000621 GAGGC 0.000236 GAGGG 0.000319 GAGGT 0.000364 GAGTA 0.000708 GAGTC 0.000337 GAGTG 0.000424 GAGTT 0.000693 GATAA 0.00188 GATAC 0.00102 GATAG 0.00074 GATAT 0.00206 GATCA 0.000829 GATCC 0.000408 GATCG 0.000934 GATCT 0.000732 GATGA 0.000957 GATGC 0.000497 GATGG 0.000487 GATGT 0.000932 GATTA 0.00153 GATTC 0.000995 GATTG 0.000859 GATTT 0.00199 GCAAA 0.00127 GCAAC 0.000659 GCAAG 0.000545 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000679 GCACC 0.000281 GCACG 0.000477 GCACT 0.000446 GCAGA 0.000578 GCAGC 0.000374 GCAGG 0.000295 GCAGT 0.000517 GCATA 0.000927 GCATC 0.000497 GCATG 0.000517 GCATT 0.00105 GCCAA 0.000459 GCCAC 0.000329 GCCAG 0.000259 GCCAT 0.00045 GCCCA 0.00016 GCCCC 0.000118 GCCCG 0.000136 GCCCT 0.000177 GCCGA 0.000316 GCCGC 0.000242 GCCGG 0.000178 GCCGT 0.000259 GCCTA 0.000244 GCCTC 0.000236 GCCTG 0.000239 GCCTT 0.000389 GCGAA 0.000772 GCGAC 0.000399 GCGAG 0.000433 GCGAT 0.000714 GCGCA 0.000411 GCGCC 0.000206 GCGCG 0.00051 GCGCT 0.000291 GCGGA 0.000316 GCGGC 0.000242 GCGGG 0.000146 GCGGT 0.000325 GCGTA 0.000585 GCGTC 0.00039 GCGTG 0.000509 GCGTT 0.00066 GCTAA 0.000596 GCTAC 0.000456 GCTAG 0.0003 GCTAT 0.000697 GCTCA 0.000335 GCTCC 0.000241 GCTCG 0.000438 GCTCT 0.000404 GCTGA 0.000454 GCTGC 0.000374 GCTGG 0.000246 GCTGT 0.000565 GCTTA 0.000604 GCTTC 0.000582 GCTTG 0.000472 GCTTT 0.000996 GGAAA 0.00152 GGAAC 0.000539 GGAAG 0.000679 GGAAT 0.000913 GGACA 0.000397 GGACC 0.000168 GGACG 0.000345 GGACT 0.000237 GGAGA 0.000569 GGAGC 0.000241 GGAGG 0.000309 GGAGT 0.000305 GGATA 0.000754 GGATC 0.000408 GGATG 0.000431 GGATT 0.000698 GGCAA 0.000488 GGCAC 0.000274 GGCAG 0.0003 GGCAT 0.000357 GGCCA 0.000239 GGCCC 0.000112 GGCCG 0.000186 GGCCT 0.00015 GGCGA 0.000371 GGCGC 0.000206 GGCGG 0.00018 GGCGT 0.000259 GGCTA 0.000277 GGCTC 0.000199 GGCTG 0.000276 GGCTT 0.000316 GGGAA 0.00056 GGGAC 0.000217 GGGAG 0.000268 GGGAT 0.000324 GGGCA 0.000206 GGGCC 0.000112 GGGCG 0.00013 GGGCT 0.000143 GGGGA 0.000256 GGGGC 0.000118 GGGGG 0.000127 GGGGT 0.000151 GGGTA 0.000255 GGGTC 0.000136 GGGTG 0.00022 GGGTT 0.000244 GGTAA 0.000752 GGTAC 0.00043 GGTAG 0.000364 GGTAT 0.000737 GGTCA 0.000335 GGTCC 0.000168 GGTCG 0.000324 GGTCT 0.000269 GGTGA 0.00047 GGTGC 0.000281 GGTGG 0.000324 GGTGT 0.000407 GGTTA 0.000594 GGTTC 0.000396 GGTTG 0.000389 GGTTT 0.000713 GTAAA 0.0022 GTAAC 0.00101 GTAAG 0.000731 GTAAT 0.00194 GTACA 0.00137 GTACC 0.00043 GTACG 0.000717 GTACT 0.000814 GTAGA 0.000858 GTAGC 0.000456 GTAGG 0.000319 GTAGT 0.000702 GTATA 0.00221 GTATC 0.00102 GTATG 0.00102 GTATT 0.00203 GTCAA 0.000782 GTCAC 0.000512 GTCAG 0.000444 GTCAT 0.000794 GTCCA 0.000362 GTCCC 0.000217 GTCCG 0.000233 GTCCT 0.000335 GTCGA 0.000718 GTCGC 0.000399 GTCGG 0.000276 GTCGT 0.000676 GTCTA 0.000526 GTCTC 0.000483 GTCTG 0.000407 GTCTT 0.000723 GTGAA 0.00113 GTGAC 0.000512 GTGAG 0.000411 GTGAT 0.000886 GTGCA 0.000715 GTGCC 0.000274 GTGCG 0.000386 GTGCT 0.000509 GTGGA 0.000525 GTGGC 0.000329 GTGGG 0.000206 GTGGT 0.000488 GTGTA 0.00118 GTGTC 0.000493 GTGTG 0.000767 GTGTT 0.001 GTTAA 0.00163 GTTAC 0.00101 GTTAG 0.00065 GTTAT 0.00167 GTTCA 0.000919 GTTCC 0.000539 GTTCG 0.000771 GTTCT 0.00102 GTTGA 0.000897 GTTGC 0.000659 GTTGG 0.000458 GTTGT 0.00099 GTTTA 0.00175 GTTTC 0.00158 GTTTG 0.00108 GTTTT 0.00228 TAAAA 0.00534 TAAAC 0.00175 TAAAG 0.00164 TAAAT 0.00455 TAACA 0.00195 TAACC 0.000594 TAACG 0.00108 TAACT 0.00133 TAAGA 0.00156 TAAGC 0.000604 TAAGG 0.000556 TAAGT 0.00131 TAATA 0.00432 TAATC 0.00153 TAATG 0.00173 TAATT 0.00433 TACAA 0.00244 TACAC 0.00118 TACAG 0.000949 TACAT 0.00275 TACCA 0.000834 TACCC 0.000255 TACCG 0.000482 TACCT 0.000713 TACGA 0.00122 TACGC 0.000585 TACGG 0.000378 TACGT 0.00127 TACTA 0.00136 TACTC 0.000708 TACTG 0.000796 TACTT 0.0019 TAGAA 0.00194 TAGAC 0.000526 TAGAG 0.000661 TAGAT 0.00136 TAGCA 0.000762 TAGCC 0.000277 TAGCG 0.000428 TAGCT 0.000582 TAGGA 0.000657 TAGGC 0.000244 TAGGG 0.00022 TAGGT 0.000557 TAGTA 0.00136 TAGTC 0.000543 TAGTG 0.000614 TAGTT 0.00133 TATAA 0.00451 TATAC 0.00221 TATAG 0.00142 TATAT 0.00688 TATCA 0.00181 TATCC 0.000754 TATCG 0.00136 TATCT 0.00178 TATGA 0.00164 TATGC 0.000927 TATGG 0.000591 TATGT 0.00246 TATTA 0.00432 TATTC 0.00202 TATTG 0.00193 TATTT 0.00591 TCAAA 0.00208 TCAAC 0.000897 TCAAG 0.000784 TCAAT 0.00177 TCACA 0.000928 TCACC 0.00047 TCACG 0.000712 TCACT 0.000829 TCAGA 0.000771 TCAGC 0.000454 TCAGG 0.000356 TCAGT 0.00079 TCATA 0.00164 TCATC 0.000957 TCATG 0.000791 TCATT 0.00214 TCCAA 0.000908 TCCAC 0.000525 TCCAG 0.000405 TCCAT 0.000898 TCCCA 0.000359 TCCCC 0.000256 TCCCG 0.000265 TCCCT 0.000488 TCCGA 0.000451 TCCGC 0.000316 TCCGG 0.000239 TCCGT 0.000538 TCCTA 0.000657 TCCTC 0.000621 TCCTG 0.000466 TCCTT 0.00113 TCGAA 0.00163 TCGAC 0.000718 TCGAG 0.000803 TCGAT 0.00171 TCGCA 0.000624 TCGCC 0.000371 TCGCG 0.000704 TCGCT 0.00062 TCGGA 0.000451 TCGGC 0.000316 TCGGG 0.000218 TCGGT 0.000568 TCGTA 0.00122 TCGTC 0.000804 TCGTG 0.000821 TCGTT 0.00167 TCTAA 0.00137 TCTAC 0.000858 TCTAG 0.000556 TCTAT 0.00169 TCTCA 0.000805 TCTCC 0.000569 TCTCG 0.000829 TCTCT 0.00146 TCTGA 0.000771 TCTGC 0.000578 TCTGG 0.000373 TCTGT 0.00116 TCTTA 0.00156 TCTTC 0.00136 TCTTG 0.00091 TCTTT 0.00293 TGAAA 0.00295 TGAAC 0.000919 TGAAG 0.000814 TGAAT 0.00194 TGACA 0.000969 TGACC 0.000335 TGACG 0.000554 TGACT 0.000674 TGAGA 0.000805 TGAGC 0.000335 TGAGG 0.000287 TGAGT 0.000553 TGATA 0.00181 TGATC 0.000829 TGATG 0.00084 TGATT 0.00175 TGCAA 0.00142 TGCAC 0.000715 TGCAG 0.000598 TGCAT 0.00128 TGCCA 0.000515 TGCCC 0.000206 TGCCG 0.000299 TGCCT 0.000398 TGCGA 0.000624 TGCGC 0.000411 TGCGG 0.000251 TGCGT 0.000666 TGCTA 0.000762 TGCTC 0.0005 TGCTG 0.000546 TGCTT 0.00105 TGGAA 0.00123 TGGAC 0.000362 TGGAG 0.000388 TGGAT 0.000754 TGGCA 0.000515 TGGCC 0.000239 TGGCG 0.000354 TGGCT 0.000388 TGGGA 0.000359 TGGGC 0.00016 TGGGG 0.000174 TGGGT 0.000234 TGGTA 0.000834 TGGTC 0.000376 TGGTG 0.000486 TGGTT 0.00074 TGTAA 0.0024 TGTAC 0.00137 TGTAG 0.000786 TGTAT 0.00277 TGTCA 0.000969 TGTCC 0.000397 TGTCG 0.000627 TGTCT 0.000848 TGTGA 0.000928 TGTGC 0.000679 TGTGG 0.000369 TGTGT 0.00136 TGTTA 0.00195 TGTTC 0.00118 TGTTG 0.00108 TGTTT 0.00266 TTAAA 0.00433 TTAAC 0.00163 TTAAG 0.00136 TTAAT 0.00403 TTACA 0.0024 TTACC 0.000752 TTACG 0.00107 TTACT 0.00166 TTAGA 0.00137 TTAGC 0.000596 TTAGG 0.000531 TTAGT 0.00121 TTATA 0.00451 TTATC 0.00188 TTATG 0.00177 TTATT 0.00507 TTCAA 0.00231 TTCAC 0.00113 TTCAG 0.000875 TTCAT 0.00231 TTCCA 0.00123 TTCCC 0.00056 TTCCG 0.000594 TTCCT 0.00128 TTCGA 0.00163 TTCGC 0.000772 TTCGG 0.000492 TTCGT 0.00161 TTCTA 0.00194 TTCTC 0.00147 TTCTG 0.00115 TTCTT 0.00306 TTGAA 0.00231 TTGAC 0.000782 TTGAG 0.000658 TTGAT 0.00179 TTGCA 0.00142 TTGCC 0.000488 TTGCG 0.00065 TTGCT 0.00105 TTGGA 0.000908 TTGGC 0.000459 TTGGG 0.000289 TTGGT 0.000808 TTGTA 0.00244 TTGTC 0.000995 TTGTG 0.00102 TTGTT 0.00256 TTTAA 0.00433 TTTAC 0.0022 TTTAG 0.00136 TTTAT 0.0054 TTTCA 0.00295 TTTCC 0.00152 TTTCG 0.00164 TTTCT 0.00338 TTTGA 0.00208 TTTGC 0.00127 TTTGG 0.000848 TTTGT 0.00277 TTTTA 0.00534 TTTTC 0.00342 TTTTG 0.00255 TTTTT 0.00716 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3815 AAAAC 0.1199 AAAAG 0.1464 AAAAT 0.3522 AAACA 0.4248 AAACC 0.09857 AAACG 0.1983 AAACT 0.2783 AAAGA 0.4072 AAAGC 0.1366 AAAGG 0.1406 AAAGT 0.3156 AAATA 0.3806 AAATC 0.1152 AAATG 0.1571 AAATT 0.3471 AACAA 0.3764 AACAC 0.1374 AACAG 0.1485 AACAT 0.3376 AACCA 0.3681 AACCC 0.1122 AACCG 0.192 AACCT 0.3277 AACGA 0.3875 AACGC 0.1494 AACGG 0.1152 AACGT 0.3479 AACTA 0.2962 AACTC 0.1319 AACTG 0.1905 AACTT 0.3814 AAGAA 0.4534 AAGAC 0.1044 AAGAG 0.1463 AAGAT 0.2959 AAGCA 0.4155 AAGCC 0.1145 AAGCG 0.1828 AAGCT 0.2872 AAGGA 0.4184 AAGGC 0.1432 AAGGG 0.1549 AAGGT 0.2835 AAGTA 0.3776 AAGTC 0.1129 AAGTG 0.1685 AAGTT 0.341 AATAA 0.3585 AATAC 0.1372 AATAG 0.1046 AATAT 0.3997 AATCA 0.3493 AATCC 0.1236 AATCG 0.2152 AATCT 0.3119 AATGA 0.3357 AATGC 0.1549 AATGG 0.1265 AATGT 0.3829 AATTA 0.3167 AATTC 0.1362 AATTG 0.1479 AATTT 0.3992 ACAAA 0.4024 ACAAC 0.1303 ACAAG 0.1325 ACAAT 0.3348 ACACA 0.422 ACACC 0.1067 ACACG 0.2248 ACACT 0.2465 ACAGA 0.3714 ACAGC 0.1645 ACAGG 0.1391 ACAGT 0.325 ACATA 0.38 ACATC 0.1221 ACATG 0.1439 ACATT 0.354 ACCAA 0.3453 ACCAC 0.1881 ACCAG 0.1482 ACCAT 0.3184 ACCCA 0.2851 ACCCC 0.1714 ACCCG 0.1863 ACCCT 0.3571 ACCGA 0.3465 ACCGC 0.2 ACCGG 0.141 ACCGT 0.3125 ACCTA 0.2891 ACCTC 0.166 ACCTG 0.188 ACCTT 0.3569 ACGAA 0.3688 ACGAC 0.1423 ACGAG 0.1577 ACGAT 0.3312 ACGCA 0.3353 ACGCC 0.1162 ACGCG 0.299 ACGCT 0.2495 ACGGA 0.355 ACGGC 0.163 ACGGG 0.1543 ACGGT 0.3278 ACGTA 0.3256 ACGTC 0.1331 ACGTG 0.1945 ACGTT 0.3468 ACTAA 0.3188 ACTAC 0.1759 ACTAG 0.1296 ACTAT 0.3756 ACTCA 0.2811 ACTCC 0.1408 ACTCG 0.2505 ACTCT 0.3276 ACTGA 0.3103 ACTGC 0.1878 ACTGG 0.1273 ACTGT 0.3746 ACTTA 0.2661 ACTTC 0.1614 ACTTG 0.1593 ACTTT 0.4132 AGAAA 0.4449 AGAAC 0.1284 AGAAG 0.1429 AGAAT 0.2838 AGACA 0.4168 AGACC 0.1179 AGACG 0.2037 AGACT 0.2615 AGAGA 0.4622 AGAGC 0.1301 AGAGG 0.165 AGAGT 0.2427 AGATA 0.3753 AGATC 0.1347 AGATG 0.1607 AGATT 0.3292 AGCAA 0.3671 AGCAC 0.1705 AGCAG 0.1695 AGCAT 0.2929 AGCCA 0.3767 AGCCC 0.1291 AGCCG 0.1999 AGCCT 0.2944 AGCGA 0.3584 AGCGC 0.1736 AGCGG 0.1516 AGCGT 0.3165 AGCTA 0.2826 AGCTC 0.1493 AGCTG 0.2115 AGCTT 0.3566 AGGAA 0.4485 AGGAC 0.1151 AGGAG 0.1577 AGGAT 0.2787 AGGCA 0.3874 AGGCC 0.1308 AGGCG 0.2051 AGGCT 0.2768 AGGGA 0.4159 AGGGC 0.1478 AGGGG 0.179 AGGGT 0.2573 AGGTA 0.3603 AGGTC 0.1248 AGGTG 0.1952 AGGTT 0.3197 AGTAA 0.3525 AGTAC 0.165 AGTAG 0.1345 AGTAT 0.3479 AGTCA 0.3774 AGTCC 0.1179 AGTCG 0.2139 AGTCT 0.2908 AGTGA 0.3405 AGTGC 0.1746 AGTGG 0.1552 AGTGT 0.3297 AGTTA 0.2942 AGTTC 0.1593 AGTTG 0.1621 AGTTT 0.3843 ATAAA 0.4133 ATAAC 0.1199 ATAAG 0.1077 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4622 ATACC 0.1094 ATACG 0.1623 ATACT 0.2662 ATAGA 0.3823 ATAGC 0.1508 ATAGG 0.132 ATAGT 0.3348 ATATA 0.4258 ATATC 0.1128 ATATG 0.1294 ATATT 0.332 ATCAA 0.3429 ATCAC 0.1606 ATCAG 0.1421 ATCAT 0.3543 ATCCA 0.3482 ATCCC 0.1405 ATCCG 0.1669 ATCCT 0.3445 ATCGA 0.3903 ATCGC 0.1593 ATCGG 0.1072 ATCGT 0.3432 ATCTA 0.2833 ATCTC 0.1657 ATCTG 0.1591 ATCTT 0.3919 ATGAA 0.4254 ATGAC 0.1377 ATGAG 0.1078 ATGAT 0.3291 ATGCA 0.4409 ATGCC 0.1163 ATGCG 0.1714 ATGCT 0.2715 ATGGA 0.3797 ATGGC 0.1881 ATGGG 0.112 ATGGT 0.3203 ATGTA 0.4175 ATGTC 0.111 ATGTG 0.1434 ATGTT 0.3281 ATTAA 0.3403 ATTAC 0.1586 ATTAG 0.09965 ATTAT 0.4015 ATTCA 0.3319 ATTCC 0.1393 ATTCG 0.1865 ATTCT 0.3423 ATTGA 0.299 ATTGC 0.1829 ATTGG 0.1222 ATTGT 0.3959 ATTTA 0.2974 ATTTC 0.1701 ATTTG 0.1408 ATTTT 0.3917 CAAAA 0.3731 CAAAC 0.1445 CAAAG 0.1435 CAAAT 0.3388 CAACA 0.3839 CAACC 0.12 CAACG 0.2178 CAACT 0.2784 CAAGA 0.3456 CAAGC 0.1645 CAAGG 0.1545 CAAGT 0.3354 CAATA 0.3414 CAATC 0.132 CAATG 0.1663 CAATT 0.3604 CACAA 0.3183 CACAC 0.2119 CACAG 0.1554 CACAT 0.3144 CACCA 0.3452 CACCC 0.1376 CACCG 0.218 CACCT 0.2992 CACGA 0.3311 CACGC 0.1987 CACGG 0.1332 CACGT 0.3369 CACTA 0.259 CACTC 0.1562 CACTG 0.2163 CACTT 0.3685 CAGAA 0.4125 CAGAC 0.1308 CAGAG 0.1677 CAGAT 0.2891 CAGCA 0.3555 CAGCC 0.1569 CAGCG 0.1923 CAGCT 0.2953 CAGGA 0.3645 CAGGC 0.1678 CAGGG 0.1467 CAGGT 0.321 CAGTA 0.3203 CAGTC 0.1309 CAGTG 0.2016 CAGTT 0.3472 CATAA 0.321 CATAC 0.1724 CATAG 0.1092 CATAT 0.3974 CATCA 0.3197 CATCC 0.1446 CATCG 0.2315 CATCT 0.3042 CATGA 0.2999 CATGC 0.183 CATGG 0.1398 CATGT 0.3773 CATTA 0.2818 CATTC 0.1602 CATTG 0.1529 CATTT 0.405 CCAAA 0.3624 CCAAC 0.1723 CCAAG 0.1394 CCAAT 0.3258 CCACA 0.2663 CCACC 0.1961 CCACG 0.2518 CCACT 0.2858 CCAGA 0.3206 CCAGC 0.1986 CCAGG 0.1542 CCAGT 0.3266 CCATA 0.2676 CCATC 0.1813 CCATG 0.1726 CCATT 0.3785 CCCAA 0.3265 CCCAC 0.2143 CCCAG 0.1468 CCCAT 0.3123 CCCCA 0.2821 CCCCC 0.1987 CCCCG 0.1757 CCCCT 0.3435 CCCGA 0.3049 CCCGC 0.2119 CCCGG 0.1329 CCCGT 0.3504 CCCTA 0.2071 CCCTC 0.2498 CCCTG 0.1662 CCCTT 0.3769 CCGAA 0.3358 CCGAC 0.1705 CCGAG 0.1779 CCGAT 0.3159 CCGCA 0.2589 CCGCC 0.1736 CCGCG 0.308 CCGCT 0.2596 CCGGA 0.3307 CCGGC 0.2307 CCGGG 0.1243 CCGGT 0.3143 CCGTA 0.2696 CCGTC 0.1718 CCGTG 0.224 CCGTT 0.3345 CCTAA 0.3257 CCTAC 0.1754 CCTAG 0.1303 CCTAT 0.3686 CCTCA 0.2155 CCTCC 0.2021 CCTCG 0.2318 CCTCT 0.3507 CCTGA 0.2817 CCTGC 0.2101 CCTGG 0.1386 CCTGT 0.3695 CCTTA 0.2234 CCTTC 0.2133 CCTTG 0.1606 CCTTT 0.4027 CGAAA 0.3709 CGAAC 0.1611 CGAAG 0.1658 CGAAT 0.3022 CGACA 0.3246 CGACC 0.1523 CGACG 0.2882 CGACT 0.2349 CGAGA 0.3665 CGAGC 0.1842 CGAGG 0.1663 CGAGT 0.283 CGATA 0.3251 CGATC 0.1944 CGATG 0.1682 CGATT 0.3123 CGCAA 0.3336 CGCAC 0.192 CGCAG 0.1706 CGCAT 0.3038 CGCCA 0.369 CGCCC 0.1314 CGCCG 0.25 CGCCT 0.2497 CGCGA 0.313 CGCGC 0.2303 CGCGG 0.1469 CGCGT 0.3097 CGCTA 0.2625 CGCTC 0.2079 CGCTG 0.2 CGCTT 0.3296 CGGAA 0.395 CGGAC 0.1447 CGGAG 0.1818 CGGAT 0.2785 CGGCA 0.3223 CGGCC 0.1794 CGGCG 0.2602 CGGCT 0.2381 CGGGA 0.3895 CGGGC 0.1898 CGGGG 0.1705 CGGGT 0.2502 CGGTA 0.3161 CGGTC 0.1853 CGGTG 0.2152 CGGTT 0.2835 CGTAA 0.316 CGTAC 0.1961 CGTAG 0.1387 CGTAT 0.3492 CGTCA 0.2972 CGTCC 0.1666 CGTCG 0.2878 CGTCT 0.2484 CGTGA 0.2953 CGTGC 0.1848 CGTGG 0.1625 CGTGT 0.3574 CGTTA 0.2673 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.1704 CGTTT 0.3678 CTAAA 0.3735 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1205 CTAAT 0.3419 CTACA 0.3619 CTACC 0.1435 CTACG 0.1905 CTACT 0.3041 CTAGA 0.354 CTAGC 0.1745 CTAGG 0.1357 CTAGT 0.3358 CTATA 0.3371 CTATC 0.1526 CTATG 0.1483 CTATT 0.362 CTCAA 0.3347 CTCAC 0.1943 CTCAG 0.1445 CTCAT 0.3266 CTCCA 0.2918 CTCCC 0.1785 CTCCG 0.1899 CTCCT 0.3398 CTCGA 0.3554 CTCGC 0.1842 CTCGG 0.1242 CTCGT 0.3362 CTCTA 0.233 CTCTC 0.237 CTCTG 0.171 CTCTT 0.359 CTGAA 0.3724 CTGAC 0.1738 CTGAG 0.1205 CTGAT 0.3334 CTGCA 0.3572 CTGCC 0.1635 CTGCG 0.1821 CTGCT 0.2973 CTGGA 0.352 CTGGC 0.2034 CTGGG 0.1161 CTGGT 0.3285 CTGTA 0.3184 CTGTC 0.1625 CTGTG 0.171 CTGTT 0.3482 CTTAA 0.3442 CTTAC 0.1702 CTTAG 0.1096 CTTAT 0.376 CTTCA 0.2653 CTTCC 0.1899 CTTCG 0.203 CTTCT 0.3419 CTTGA 0.2963 CTTGC 0.194 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3821 CTTTA 0.2476 CTTTC 0.2005 CTTTG 0.148 CTTTT 0.404 GAAAA 0.3654 GAAAC 0.156 GAAAG 0.1542 GAAAT 0.3245 GAACA 0.3836 GAACC 0.1165 GAACG 0.2381 GAACT 0.2619 GAAGA 0.3884 GAAGC 0.1621 GAAGG 0.1692 GAAGT 0.2803 GAATA 0.3406 GAATC 0.1459 GAATG 0.1768 GAATT 0.3367 GACAA 0.3515 GACAC 0.1628 GACAG 0.1834 GACAT 0.3023 GACCA 0.3572 GACCC 0.1168 GACCG 0.2605 GACCT 0.2655 GACGA 0.3821 GACGC 0.1888 GACGG 0.1318 GACGT 0.2973 GACTA 0.2988 GACTC 0.1604 GACTG 0.1961 GACTT 0.3447 GAGAA 0.4054 GAGAC 0.1276 GAGAG 0.2035 GAGAT 0.2635 GAGCA 0.3772 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2418 GAGCT 0.2521 GAGGA 0.3952 GAGGC 0.1486 GAGGG 0.1997 GAGGT 0.2565 GAGTA 0.3469 GAGTC 0.1418 GAGTG 0.1929 GAGTT 0.3184 GATAA 0.3314 GATAC 0.1699 GATAG 0.1222 GATAT 0.3765 GATCA 0.316 GATCC 0.1353 GATCG 0.281 GATCT 0.2677 GATGA 0.3371 GATGC 0.167 GATGG 0.1559 GATGT 0.34 GATTA 0.2908 GATTC 0.1704 GATTG 0.1564 GATTT 0.3824 GCAAA 0.3585 GCAAC 0.1688 GCAAG 0.1432 GCAAT 0.3294 GCACA 0.3788 GCACC 0.1465 GCACG 0.2236 GCACT 0.2511 GCAGA 0.3307 GCAGC 0.2022 GCAGG 0.1526 GCAGT 0.3145 GCATA 0.3277 GCATC 0.1477 GCATG 0.1719 GCATT 0.3527 GCCAA 0.311 GCCAC 0.2047 GCCAG 0.1593 GCCAT 0.325 GCCCA 0.282 GCCCC 0.1965 GCCCG 0.2127 GCCCT 0.3088 GCCGA 0.3213 GCCGC 0.2397 GCCGG 0.1755 GCCGT 0.2635 GCCTA 0.2414 GCCTC 0.1947 GCCTG 0.199 GCCTT 0.3649 GCGAA 0.342 GCGAC 0.1669 GCGAG 0.1767 GCGAT 0.3144 GCGCA 0.3059 GCGCC 0.1482 GCGCG 0.3379 GCGCT 0.2079 GCGGA 0.3091 GCGGC 0.2269 GCGGG 0.1428 GCGGT 0.3212 GCGTA 0.2845 GCGTC 0.1737 GCGTG 0.2358 GCGTT 0.306 GCTAA 0.2973 GCTAC 0.2085 GCTAG 0.1406 GCTAT 0.3536 GCTCA 0.263 GCTCC 0.167 GCTCG 0.2744 GCTCT 0.2955 GCTGA 0.2851 GCTGC 0.2226 GCTGG 0.1427 GCTGT 0.3496 GCTTA 0.2412 GCTTC 0.2021 GCTTG 0.1693 GCTTT 0.3874 GGAAA 0.4212 GGAAC 0.1399 GGAAG 0.1788 GGAAT 0.2601 GGACA 0.3691 GGACC 0.1401 GGACG 0.2764 GGACT 0.2144 GGAGA 0.3863 GGAGC 0.1654 GGAGG 0.2137 GGAGT 0.2346 GGATA 0.3418 GGATC 0.1629 GGATG 0.1829 GGATT 0.3123 GGCAA 0.3396 GGCAC 0.1859 GGCAG 0.2023 GGCAT 0.2723 GGCCA 0.3567 GGCCC 0.1667 GGCCG 0.2478 GGCCT 0.2288 GGCGA 0.3531 GGCGC 0.2148 GGCGG 0.176 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2719 GGCTC 0.1679 GGCTG 0.2474 GGCTT 0.3129 GGGAA 0.418 GGGAC 0.1442 GGGAG 0.1846 GGGAT 0.2532 GGGCA 0.3525 GGGCC 0.1901 GGGCG 0.2153 GGGCT 0.2421 GGGGA 0.3836 GGGGC 0.1806 GGGGG 0.1987 GGGGT 0.2371 GGGTA 0.3174 GGGTC 0.1475 GGGTG 0.2411 GGGTT 0.294 GGTAA 0.3347 GGTAC 0.1815 GGTAG 0.1487 GGTAT 0.3351 GGTCA 0.3357 GGTCC 0.1475 GGTCG 0.2656 GGTCT 0.2511 GGTGA 0.3213 GGTGC 0.1969 GGTGG 0.2058 GGTGT 0.276 GGTTA 0.3027 GGTTC 0.1785 GGTTG 0.176 GGTTT 0.3429 GTAAA 0.374 GTAAC 0.1623 GTAAG 0.1187 GTAAT 0.345 GTACA 0.4353 GTACC 0.1209 GTACG 0.1861 GTACT 0.2577 GTAGA 0.3691 GTAGC 0.1819 GTAGG 0.1284 GTAGT 0.3206 GTATA 0.3614 GTATC 0.147 GTATG 0.1622 GTATT 0.3293 GTCAA 0.3129 GTCAC 0.1958 GTCAG 0.1637 GTCAT 0.3276 GTCCA 0.3361 GTCCC 0.1719 GTCCG 0.1863 GTCCT 0.3056 GTCGA 0.3454 GTCGC 0.191 GTCGG 0.1306 GTCGT 0.3329 GTCTA 0.2612 GTCTC 0.2041 GTCTG 0.1831 GTCTT 0.3516 GTGAA 0.386 GTGAC 0.171 GTGAG 0.1332 GTGAT 0.3098 GTGCA 0.398 GTGCC 0.1382 GTGCG 0.1886 GTGCT 0.2752 GTGGA 0.3471 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1305 GTGGT 0.3212 GTGTA 0.3536 GTGTC 0.1332 GTGTG 0.2154 GTGTT 0.2978 GTTAA 0.3313 GTTAC 0.1945 GTTAG 0.1246 GTTAT 0.3496 GTTCA 0.3077 GTTCC 0.1576 GTTCG 0.2091 GTTCT 0.3257 GTTGA 0.3042 GTTGC 0.2088 GTTGG 0.1439 GTTGT 0.3431 GTTTA 0.2756 GTTTC 0.2153 GTTTG 0.1581 GTTTT 0.351 TAAAA 0.4047 TAAAC 0.1242 TAAAG 0.1184 TAAAT 0.3528 TAACA 0.4174 TAACC 0.1142 TAACG 0.1891 TAACT 0.2794 TAAGA 0.3902 TAAGC 0.1416 TAAGG 0.1298 TAAGT 0.3384 TAATA 0.3749 TAATC 0.1159 TAATG 0.1447 TAATT 0.3645 TACAA 0.3395 TACAC 0.148 TACAG 0.1231 TACAT 0.3894 TACCA 0.3769 TACCC 0.1071 TACCG 0.1893 TACCT 0.3266 TACGA 0.3487 TACGC 0.1619 TACGG 0.1083 TACGT 0.381 TACTA 0.2943 TACTC 0.1368 TACTG 0.1672 TACTT 0.4018 TAGAA 0.441 TAGAC 0.1121 TAGAG 0.1374 TAGAT 0.3095 TAGCA 0.3984 TAGCC 0.1266 TAGCG 0.1853 TAGCT 0.2897 TAGGA 0.3846 TAGGC 0.1423 TAGGG 0.1279 TAGGT 0.3451 TAGTA 0.3651 TAGTC 0.1291 TAGTG 0.1563 TAGTT 0.3495 TATAA 0.3019 TATAC 0.1382 TATAG 0.08935 TATAT 0.4705 TATCA 0.3412 TATCC 0.1247 TATCG 0.2064 TATCT 0.3277 TATGA 0.2958 TATGC 0.1573 TATGG 0.09773 TATGT 0.4492 TATTA 0.3129 TATTC 0.1323 TATTG 0.1345 TATTT 0.4203 TCAAA 0.3885 TCAAC 0.1499 TCAAG 0.1333 TCAAT 0.3282 TCACA 0.3387 TCACC 0.1455 TCACG 0.2176 TCACT 0.2981 TCAGA 0.3298 TCAGC 0.1765 TCAGG 0.1395 TCAGT 0.3542 TCATA 0.3144 TCATC 0.1521 TCATG 0.1437 TCATT 0.3898 TCCAA 0.3419 TCCAC 0.1809 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.336 TCCCA 0.278 TCCCC 0.1749 TCCCG 0.183 TCCCT 0.364 TCCGA 0.2972 TCCGC 0.1992 TCCGG 0.1535 TCCGT 0.3502 TCCTA 0.2444 TCCTC 0.194 TCCTG 0.162 TCCTT 0.3996 TCGAA 0.3442 TCGAC 0.1401 TCGAG 0.1582 TCGAT 0.3575 TCGCA 0.2923 TCGCC 0.1523 TCGCG 0.2871 TCGCT 0.2684 TCGGA 0.302 TCGGC 0.1992 TCGGG 0.1345 TCGGT 0.3643 TCGTA 0.2848 TCGTC 0.1635 TCGTG 0.1827 TCGTT 0.3691 TCTAA 0.3145 TCTAC 0.1808 TCTAG 0.1219 TCTAT 0.3828 TCTCA 0.2499 TCTCC 0.1474 TCTCG 0.2062 TCTCT 0.3965 TCTGA 0.278 TCTGC 0.1899 TCTGG 0.1203 TCTGT 0.4119 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1822 TCTTG 0.1337 TCTTT 0.4341 TGAAA 0.4492 TGAAC 0.1317 TGAAG 0.1204 TGAAT 0.2988 TGACA 0.4079 TGACC 0.126 TGACG 0.1948 TGACT 0.2713 TGAGA 0.4064 TGAGC 0.1616 TGAGG 0.1414 TGAGT 0.2906 TGATA 0.3594 TGATC 0.1462 TGATG 0.1553 TGATT 0.3391 TGCAA 0.3622 TGCAC 0.1698 TGCAG 0.1403 TGCAT 0.3277 TGCCA 0.379 TGCCC 0.1341 TGCCG 0.193 TGCCT 0.2939 TGCGA 0.3193 TGCGC 0.209 TGCGG 0.1237 TGCGT 0.348 TGCTA 0.2811 TGCTC 0.1615 TGCTG 0.1842 TGCTT 0.3731 TGGAA 0.4536 TGGAC 0.1272 TGGAG 0.1361 TGGAT 0.2831 TGGCA 0.3671 TGGCC 0.1499 TGGCG 0.2227 TGGCT 0.2603 TGGGA 0.3945 TGGGC 0.1677 TGGGG 0.1825 TGGGT 0.2552 TGGTA 0.3559 TGGTC 0.1437 TGGTG 0.1928 TGGTT 0.3075 TGTAA 0.3306 TGTAC 0.1789 TGTAG 0.1027 TGTAT 0.3878 TGTCA 0.371 TGTCC 0.1327 TGTCG 0.1933 TGTCT 0.303 TGTGA 0.2846 TGTGC 0.1938 TGTGG 0.1064 TGTGT 0.4152 TGTTA 0.2963 TGTTC 0.1574 TGTTG 0.1508 TGTTT 0.3956 TTAAA 0.3925 TTAAC 0.1336 TTAAG 0.116 TTAAT 0.3579 TTACA 0.4284 TTACC 0.1188 TTACG 0.1597 TTACT 0.2932 TTAGA 0.3731 TTAGC 0.1507 TTAGG 0.1386 TTAGT 0.3377 TTATA 0.3527 TTATC 0.1281 TTATG 0.1349 TTATT 0.3842 TTCAA 0.3516 TTCAC 0.1588 TTCAG 0.126 TTCAT 0.3636 TTCCA 0.3529 TTCCC 0.1467 TTCCG 0.1498 TTCCT 0.3507 TTCGA 0.3595 TTCGC 0.1658 TTCGG 0.109 TTCGT 0.3657 TTCTA 0.2716 TTCTC 0.1715 TTCTG 0.1528 TTCTT 0.4041 TTGAA 0.4232 TTGAC 0.1354 TTGAG 0.1137 TTGAT 0.3277 TTGCA 0.4199 TTGCC 0.1249 TTGCG 0.1621 TTGCT 0.2931 TTGGA 0.3749 TTGGC 0.1747 TTGGG 0.1135 TTGGT 0.3369 TTGTA 0.3625 TTGTC 0.1286 TTGTG 0.1446 TTGTT 0.3644 TTTAA 0.3344 TTTAC 0.1541 TTTAG 0.09755 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3349 TTTCC 0.1514 TTTCG 0.1536 TTTCT 0.3601 TTTGA 0.3039 TTTGC 0.1709 TTTGG 0.1167 TTTGT 0.4085 TTTTA 0.3068 TTTTC 0.1722 TTTTG 0.1394 TTTTT 0.3815 [4] # (a,c,g,t)= (0.311, 0.189, 0.189, 0.311) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.332 C 0.168 G 0.168 T 0.332 # l= 1 # Values AA 0.12 AC 0.0541 AG 0.0475 AT 0.11 CA 0.0543 CC 0.0247 CG 0.0411 CT 0.0475 GA 0.0579 GC 0.0308 GG 0.0247 GT 0.0541 TA 0.0998 TC 0.0579 TG 0.0543 TT 0.12 # l= 2 # Values AAA 0.0467 AAC 0.0181 AAG 0.0174 AAT 0.0381 ACA 0.0199 ACC 0.0073 ACG 0.0133 ACT 0.0136 AGA 0.0181 AGC 0.00814 AGG 0.0076 AGT 0.0136 ATA 0.038 ATC 0.0172 ATG 0.0171 ATT 0.0382 CAA 0.0184 CAC 0.0101 CAG 0.00874 CAT 0.0171 CCA 0.00789 CCC 0.00378 CCG 0.00542 CCT 0.0076 CGA 0.0146 CGC 0.00769 CGG 0.00543 CGT 0.0133 CTA 0.0119 CTC 0.00945 CTG 0.00875 CTT 0.0174 GAA 0.0229 GAC 0.00837 GAG 0.00945 GAT 0.0172 GCA 0.0104 GCC 0.00456 GCG 0.00769 GCT 0.00813 GGA 0.00905 GGC 0.00456 GGG 0.00378 GGT 0.0073 GTA 0.0175 GTC 0.00837 GTG 0.0101 GTT 0.0181 TAA 0.0324 TAC 0.0175 TAG 0.0119 TAT 0.038 TCA 0.0161 TCC 0.00905 TCG 0.0146 TCT 0.0181 TGA 0.0161 TGC 0.0104 TGG 0.00788 TGT 0.0199 TTA 0.0324 TTC 0.0229 TTG 0.0184 TTT 0.0467 # l= 3 # Values AAAA 0.0179 AAAC 0.0067 AAAG 0.00713 AAAT 0.015 AACA 0.0067 AACC 0.00218 AACG 0.00464 AACT 0.00459 AAGA 0.00682 AAGC 0.00274 AAGG 0.00279 AAGT 0.00507 AATA 0.0133 AATC 0.0054 AATG 0.00619 AATT 0.0133 ACAA 0.00679 ACAC 0.00351 ACAG 0.00321 ACAT 0.00639 ACCA 0.0025 ACCC 0.000921 ACCG 0.00179 ACCT 0.00209 ACGA 0.00495 ACGC 0.00237 ACGG 0.00169 ACGT 0.00431 ACTA 0.00368 ACTC 0.00224 ACTG 0.00262 ACTT 0.00507 AGAA 0.00768 AGAC 0.00223 AGAG 0.00332 AGAT 0.00489 AGCA 0.0029 AGCC 0.00116 AGCG 0.00189 AGCT 0.00219 AGGA 0.00303 AGGC 0.00119 AGGG 0.00128 AGGT 0.00209 AGTA 0.00456 AGTC 0.00197 AGTG 0.00249 AGTT 0.00459 ATAA 0.0124 ATAC 0.00604 ATAG 0.00429 ATAT 0.0153 ATCA 0.00509 ATCC 0.0024 ATCG 0.00481 ATCT 0.00489 ATGA 0.00531 ATGC 0.00295 ATGG 0.00243 ATGT 0.00639 ATTA 0.0112 ATTC 0.00621 ATTG 0.00573 ATTT 0.015 CAAA 0.00678 CAAC 0.0031 CAAG 0.00276 CAAT 0.00573 CACA 0.00331 CACC 0.00159 CACG 0.00274 CACT 0.0025 CAGA 0.00295 CAGC 0.00176 CAGG 0.00142 CAGT 0.00262 CATA 0.00527 CATC 0.00299 CATG 0.00264 CATT 0.00619 CCAA 0.00251 CCAC 0.00166 CCAG 0.00128 CCAT 0.00243 CCCA 0.000979 CCCC 0.000728 CCCG 0.000793 CCCT 0.00128 CCGA 0.00174 CCGC 0.00116 CCGG 0.000837 CCGT 0.00169 CCTA 0.00169 CCTC 0.0017 CCTG 0.00142 CCTT 0.00279 CGAA 0.00489 CGAC 0.00233 CGAG 0.0026 CGAT 0.00481 CGCA 0.00209 CGCC 0.00114 CGCG 0.00256 CGCT 0.00189 CGGA 0.00172 CGGC 0.00113 CGGG 0.000793 CGGT 0.00179 CGTA 0.00364 CGTC 0.0023 CGTG 0.00274 CGTT 0.00464 CTAA 0.0036 CTAC 0.00237 CTAG 0.0016 CTAT 0.00429 CTCA 0.00198 CTCC 0.00155 CTCG 0.0026 CTCT 0.00332 CTGA 0.00239 CTGC 0.00186 CTGG 0.00128 CTGT 0.00321 CTTA 0.00387 CTTC 0.00365 CTTG 0.00276 CTTT 0.00713 GAAA 0.00962 GAAC 0.00342 GAAG 0.00365 GAAT 0.00621 GACA 0.00291 GACC 0.00119 GACG 0.0023 GACT 0.00197 GAGA 0.00395 GAGC 0.00155 GAGG 0.0017 GAGT 0.00224 GATA 0.00567 GATC 0.00312 GATG 0.00299 GATT 0.0054 GCAA 0.00365 GCAC 0.00198 GCAG 0.00186 GCAT 0.00295 GCCA 0.00159 GCCC 0.000646 GCCG 0.00113 GCCT 0.00119 GCGA 0.0026 GCGC 0.00156 GCGG 0.00116 GCGT 0.00237 GCTA 0.00209 GCTC 0.00155 GCTG 0.00176 GCTT 0.00274 GGAA 0.00386 GGAC 0.00125 GGAG 0.00155 GGAT 0.0024 GGCA 0.00149 GGCC 0.000761 GGCG 0.00115 GGCT 0.00116 GGGA 0.00149 GGGC 0.000647 GGGG 0.000728 GGGT 0.000922 GGTA 0.00234 GGTC 0.00119 GGTG 0.00159 GGTT 0.00218 GTAA 0.00574 GTAC 0.00338 GTAG 0.00237 GTAT 0.00605 GTCA 0.00255 GTCC 0.00125 GTCG 0.00233 GTCT 0.00223 GTGA 0.00298 GTGC 0.00197 GTGG 0.00166 GTGT 0.00351 GTTA 0.00488 GTTC 0.00342 GTTG 0.0031 GTTT 0.0067 TAAA 0.0125 TAAC 0.00488 TAAG 0.00388 TAAT 0.0112 TACA 0.00699 TACC 0.00234 TACG 0.00364 TACT 0.00456 TAGA 0.0044 TAGC 0.00209 TAGG 0.00169 TAGT 0.00368 TATA 0.0138 TATC 0.00567 TATG 0.00527 TATT 0.0133 TCAA 0.00541 TCAC 0.00298 TCAG 0.00239 TCAT 0.00531 TCCA 0.00282 TCCC 0.00149 TCCG 0.00172 TCCT 0.00303 TCGA 0.00534 TCGC 0.0026 TCGG 0.00174 TCGT 0.00495 TCTA 0.00441 TCTC 0.00395 TCTG 0.00295 TCTT 0.00682 TGAA 0.00647 TGAC 0.00256 TGAG 0.00198 TGAT 0.00509 TGCA 0.00397 TGCC 0.00149 TGCG 0.00209 TGCT 0.0029 TGGA 0.00282 TGGC 0.00159 TGGG 0.000977 TGGT 0.0025 TGTA 0.00699 TGTC 0.00291 TGTG 0.00331 TGTT 0.0067 TTAA 0.0107 TTAC 0.00574 TTAG 0.0036 TTAT 0.0124 TTCA 0.00647 TTCC 0.00385 TTCG 0.0049 TTCT 0.00769 TTGA 0.00541 TTGC 0.00365 TTGG 0.00251 TTGT 0.00679 TTTA 0.0125 TTTC 0.00961 TTTG 0.00677 TTTT 0.0179 # l= 4 # Values AAAAA 0.00701 AAAAC 0.00224 AAAAG 0.00284 AAAAT 0.00579 AAACA 0.00257 AAACC 0.00074 AAACG 0.00164 AAACT 0.00175 AAAGA 0.00295 AAAGC 0.00101 AAAGG 0.00111 AAAGT 0.00207 AAATA 0.0055 AAATC 0.00197 AAATG 0.00246 AAATT 0.0051 AACAA 0.00248 AACAC 0.00101 AACAG 0.00112 AACAT 0.00208 AACCA 0.000759 AACCC 0.000257 AACCG 0.000515 AACCT 0.000652 AACGA 0.00184 AACGC 0.000733 AACGG 0.00058 AACGT 0.00149 AACTA 0.00127 AACTC 0.000717 AACTG 0.000879 AACTT 0.00172 AAGAA 0.00307 AAGAC 0.000742 AAGAG 0.00115 AAGAT 0.00185 AAGCA 0.00106 AAGCC 0.00033 AAGCG 0.000589 AAGCT 0.000757 AAGGA 0.00118 AAGGC 0.000405 AAGGG 0.00047 AAGGT 0.000739 AAGTA 0.00181 AAGTC 0.000643 AAGTG 0.000895 AAGTT 0.00172 AATAA 0.00474 AATAC 0.00193 AATAG 0.00152 AATAT 0.00508 AATCA 0.00169 AATCC 0.000721 AATCG 0.00143 AATCT 0.00157 AATGA 0.00204 AATGC 0.00103 AATGG 0.000896 AATGT 0.00222 AATTA 0.00406 AATTC 0.00208 AATTG 0.00205 AATTT 0.0051 ACAAA 0.00266 ACAAC 0.001 ACAAG 0.000975 ACAAT 0.00216 ACACA 0.00133 ACACC 0.000435 ACACG 0.000961 ACACT 0.000785 ACAGA 0.00118 ACAGC 0.000609 ACAGG 0.00049 ACAGT 0.000933 ACATA 0.00228 ACATC 0.000946 ACATG 0.00095 ACATT 0.00222 ACCAA 0.000811 ACCAC 0.000516 ACCAG 0.000412 ACCAT 0.000761 ACCCA 0.000244 ACCCC 0.000167 ACCCG 0.000194 ACCCT 0.000318 ACCGA 0.000636 ACCGC 0.000361 ACCGG 0.00026 ACCGT 0.00053 ACCTA 0.000551 ACCTC 0.000385 ACCTG 0.00042 ACCTT 0.000739 ACGAA 0.00174 ACGAC 0.00076 ACGAG 0.000869 ACGAT 0.00158 ACGCA 0.000706 ACGCC 0.000289 ACGCG 0.000796 ACGCT 0.000575 ACGGA 0.000594 ACGGC 0.000294 ACGGG 0.000272 ACGGT 0.00053 ACGTA 0.00131 ACGTC 0.000632 ACGTG 0.000883 ACGTT 0.00149 ACTAA 0.00115 ACTAC 0.000686 ACTAG 0.000505 ACTAT 0.00134 ACTCA 0.000537 ACTCC 0.000316 ACTCG 0.000679 ACTCT 0.000711 ACTGA 0.000771 ACTGC 0.000522 ACTGG 0.000394 ACTGT 0.000933 ACTTA 0.00123 ACTTC 0.000905 ACTTG 0.000872 ACTTT 0.00207 AGAAA 0.00339 AGAAC 0.00105 AGAAG 0.00123 AGAAT 0.00201 AGACA 0.000861 AGACC 0.000289 AGACG 0.000565 AGACT 0.000519 AGAGA 0.00158 AGAGC 0.000437 AGAGG 0.000589 AGAGT 0.000711 AGATA 0.00172 AGATC 0.000762 AGATG 0.00084 AGATT 0.00157 AGCAA 0.00106 AGCAC 0.000529 AGCAG 0.000547 AGCAT 0.000765 AGCCA 0.000412 AGCCC 0.000156 AGCCG 0.000258 AGCCT 0.000332 AGCGA 0.000694 AGCGC 0.000319 AGCGG 0.000302 AGCGT 0.000575 AGCTA 0.000587 AGCTC 0.000371 AGCTG 0.000473 AGCTT 0.000757 AGGAA 0.00134 AGGAC 0.000353 AGGAG 0.000515 AGGAT 0.00082 AGGCA 0.000411 AGGCC 0.000163 AGGCG 0.000285 AGGCT 0.000332 AGGGA 0.000524 AGGGC 0.000193 AGGGG 0.000249 AGGGT 0.000318 AGGTA 0.000713 AGGTC 0.000298 AGGTG 0.000431 AGGTT 0.000652 AGTAA 0.00158 AGTAC 0.000797 AGTAG 0.000677 AGTAT 0.0015 AGTCA 0.000671 AGTCC 0.000252 AGTCG 0.000531 AGTCT 0.000519 AGTGA 0.000814 AGTGC 0.00045 AGTGG 0.000447 AGTGT 0.000785 AGTTA 0.00128 AGTTC 0.000784 AGTTG 0.00078 AGTTT 0.00175 ATAAA 0.00501 ATAAC 0.0016 ATAAG 0.0014 ATAAT 0.00436 ATACA 0.0026 ATACC 0.000736 ATACG 0.00121 ATACT 0.0015 ATAGA 0.00166 ATAGC 0.000696 ATAGG 0.000597 ATAGT 0.00134 ATATA 0.00624 ATATC 0.00201 ATATG 0.00198 ATATT 0.00508 ATCAA 0.00174 ATCAC 0.000885 ATCAG 0.000746 ATCAT 0.00172 ATCCA 0.000765 ATCCC 0.000339 ATCCG 0.000472 ATCCT 0.00082 ATCGA 0.00186 ATCGC 0.000794 ATCGG 0.000565 ATCGT 0.00158 ATCTA 0.00132 ATCTC 0.000923 ATCTG 0.000797 ATCTT 0.00185 ATGAA 0.00221 ATGAC 0.000781 ATGAG 0.000605 ATGAT 0.00172 ATGCA 0.00124 ATGCC 0.000359 ATGCG 0.000592 ATGCT 0.000765 ATGGA 0.000916 ATGGC 0.000457 ATGGG 0.000301 ATGGT 0.000761 ATGTA 0.00257 ATGTC 0.00079 ATGTG 0.000951 ATGTT 0.00208 ATTAA 0.00378 ATTAC 0.00185 ATTAG 0.00119 ATTAT 0.00436 ATTCA 0.00188 ATTCC 0.000943 ATTCG 0.00138 ATTCT 0.00201 ATTGA 0.0017 ATTGC 0.00111 ATTGG 0.000765 ATTGT 0.00216 ATTTA 0.0042 ATTTC 0.00288 ATTTG 0.00215 ATTTT 0.00579 CAAAA 0.00244 CAAAC 0.00109 CAAAG 0.00109 CAAAT 0.00215 CAACA 0.00107 CAACC 0.00042 CAACG 0.000833 CAACT 0.00078 CAAGA 0.000921 CAAGC 0.000499 CAAGG 0.000463 CAAGT 0.000872 CAATA 0.00181 CAATC 0.000871 CAATG 0.000991 CAATT 0.00205 CACAA 0.00099 CACAC 0.000793 CACAG 0.000573 CACAT 0.000951 CACCA 0.000505 CACCC 0.000245 CACCG 0.00041 CACCT 0.000431 CACGA 0.000893 CACGC 0.00056 CACGG 0.0004 CACGT 0.000883 CACTA 0.000593 CACTC 0.000445 CACTG 0.000561 CACTT 0.000895 CAGAA 0.00115 CAGAC 0.000433 CAGAG 0.000568 CAGAT 0.000797 CAGCA 0.000568 CAGCC 0.00031 CAGCG 0.000412 CAGCT 0.000473 CAGGA 0.000494 CAGGC 0.000271 CAGGG 0.000231 CAGGT 0.00042 CAGTA 0.000761 CAGTC 0.000417 CAGTG 0.000561 CAGTT 0.000879 CATAA 0.00164 CATAC 0.000989 CATAG 0.000661 CATAT 0.00198 CATCA 0.00083 CATCC 0.000456 CATCG 0.000863 CATCT 0.00084 CATGA 0.000756 CATGC 0.00051 CATGG 0.000426 CATGT 0.00095 CATTA 0.00162 CATTC 0.00112 CATTG 0.000991 CATTT 0.00246 CCAAA 0.000837 CCAAC 0.000487 CCAAG 0.000422 CCAAT 0.000765 CCACA 0.000372 CCACC 0.00036 CCACG 0.00048 CCACT 0.000447 CCAGA 0.000397 CCAGC 0.00027 CCAGG 0.000222 CCAGT 0.000394 CCATA 0.000578 CCATC 0.000531 CCATG 0.000426 CCATT 0.000896 CCCAA 0.000298 CCCAC 0.000223 CCCAG 0.000154 CCCAT 0.000301 CCCCA 0.000186 CCCCC 0.000143 CCCCG 0.00015 CCCCT 0.000249 CCCGA 0.000249 CCCGC 0.000162 CCCGG 0.000109 CCCGT 0.000272 CCCTA 0.000225 CCCTC 0.000357 CCCTG 0.000231 CCCTT 0.00047 CCGAA 0.000536 CCGAC 0.000314 CCGAG 0.000325 CCGAT 0.000565 CCGCA 0.000274 CCGCC 0.000202 CCGCG 0.000381 CCGCT 0.000302 CCGGA 0.000265 CCGGC 0.000203 CCGGG 0.000109 CCGGT 0.00026 CCGTA 0.000402 CCGTC 0.000309 CCGTG 0.0004 CCGTT 0.00058 CCTAA 0.000527 CCTAC 0.000337 CCTAG 0.000233 CCTAT 0.000597 CCTCA 0.000291 CCTCC 0.000341 CCTCG 0.000478 CCTCT 0.000589 CCTGA 0.000371 CCTGC 0.000332 CCTGG 0.000222 CCTGT 0.00049 CCTTA 0.000554 CCTTC 0.00066 CCTTG 0.000463 CCTTT 0.00111 CGAAA 0.00176 CGAAC 0.000863 CGAAG 0.000886 CGAAT 0.00138 CGACA 0.000678 CGACC 0.000372 CGACG 0.000751 CGACT 0.000531 CGAGA 0.000932 CGAGC 0.000507 CGAGG 0.000478 CGAGT 0.000679 CGATA 0.00145 CGATC 0.00107 CGATG 0.000863 CGATT 0.00143 CGCAA 0.000694 CGCAC 0.000421 CGCAG 0.000378 CGCAT 0.000592 CGCCA 0.000387 CGCCC 0.000146 CGCCG 0.000327 CGCCT 0.000285 CGCGA 0.00081 CGCGC 0.000578 CGCGG 0.000381 CGCGT 0.000796 CGCTA 0.000463 CGCTC 0.000427 CGCTG 0.000412 CGCTT 0.000589 CGGAA 0.000652 CGGAC 0.000264 CGGAG 0.000328 CGGAT 0.000472 CGGCA 0.00033 CGGCC 0.000213 CGGCG 0.000327 CGGCT 0.000258 CGGGA 0.000295 CGGGC 0.000153 CGGGG 0.00015 CGGGT 0.000194 CGGTA 0.000521 CGGTC 0.000339 CGGTG 0.00041 CGGTT 0.000515 CGTAA 0.00112 CGTAC 0.000778 CGTAG 0.00054 CGTAT 0.00121 CGTCA 0.000593 CGTCC 0.000391 CGTCG 0.000751 CGTCT 0.000565 CGTGA 0.000764 CGTGC 0.00053 CGTGG 0.00048 CGTGT 0.000961 CGTTA 0.00115 CGTTC 0.00101 CGTTG 0.000833 CGTTT 0.00164 CTAAA 0.00131 CTAAC 0.000657 CTAAG 0.000446 CTAAT 0.00119 CTACA 0.000766 CTACC 0.000387 CTACG 0.00054 CTACT 0.000677 CTAGA 0.00055 CTAGC 0.000313 CTAGG 0.000233 CTAGT 0.000505 CTATA 0.00135 CTATC 0.00076 CTATG 0.000661 CTATT 0.00152 CTCAA 0.000656 CTCAC 0.000424 CTCAG 0.000296 CTCAT 0.000605 CTCCA 0.000407 CTCCC 0.000299 CTCCG 0.000328 CTCCT 0.000515 CTCGA 0.000906 CTCGC 0.000496 CTCGG 0.000325 CTCGT 0.000869 CTCTA 0.000677 CTCTC 0.000924 CTCTG 0.000568 CTCTT 0.00115 CTGAA 0.000882 CTGAC 0.000465 CTGAG 0.000296 CTGAT 0.000746 CTGCA 0.000614 CTGCC 0.000324 CTGCG 0.000378 CTGCT 0.000547 CTGGA 0.000429 CTGGC 0.000289 CTGGG 0.000154 CTGGT 0.000412 CTGTA 0.000941 CTGTC 0.000575 CTGTG 0.000573 CTGTT 0.00112 CTTAA 0.00131 CTTAC 0.00073 CTTAG 0.000446 CTTAT 0.0014 CTTCA 0.0008 CTTCC 0.000733 CTTCG 0.000886 CTTCT 0.00123 CTTGA 0.000789 CTTGC 0.000571 CTTGG 0.000422 CTTGT 0.000975 CTTTA 0.00157 CTTTC 0.00164 CTTTG 0.00109 CTTTT 0.00284 GAAAA 0.00344 GAAAC 0.00167 GAAAG 0.00164 GAAAT 0.00288 GAACA 0.0012 GAACC 0.000426 GAACG 0.00101 GAACT 0.000784 GAAGA 0.00145 GAAGC 0.000631 GAAGG 0.00066 GAAGT 0.000905 GAATA 0.00197 GAATC 0.00104 GAATG 0.00112 GAATT 0.00208 GACAA 0.00102 GACAC 0.000524 GACAG 0.000575 GACAT 0.00079 GACCA 0.000398 GACCC 0.000153 GACCG 0.000339 GACCT 0.000298 GACGA 0.000917 GACGC 0.000442 GACGG 0.000309 GACGT 0.000632 GACTA 0.000547 GACTC 0.000366 GACTG 0.000417 GACTT 0.000643 GAGAA 0.00158 GAGAC 0.000527 GAGAG 0.000924 GAGAT 0.000923 GAGCA 0.000528 GAGCC 0.000227 GAGCG 0.000427 GAGCT 0.000371 GAGGA 0.00069 GAGGC 0.000266 GAGGG 0.000357 GAGGT 0.000385 GAGTA 0.000712 GAGTC 0.000366 GAGTG 0.000445 GAGTT 0.000717 GATAA 0.00187 GATAC 0.00103 GATAG 0.00076 GATAT 0.00201 GATCA 0.000843 GATCC 0.000445 GATCG 0.00107 GATCT 0.000762 GATGA 0.00099 GATGC 0.000523 GATGG 0.000531 GATGT 0.000946 GATTA 0.00152 GATTC 0.00104 GATTG 0.000871 GATTT 0.00197 GCAAA 0.00128 GCAAC 0.000696 GCAAG 0.000571 GCAAT 0.00111 GCACA 0.000696 GCACC 0.000299 GCACG 0.00053 GCACT 0.00045 GCAGA 0.000606 GCAGC 0.000404 GCAGG 0.000332 GCAGT 0.000522 GCATA 0.000889 GCATC 0.000523 GCATG 0.00051 GCATT 0.00103 GCCAA 0.000485 GCCAC 0.000361 GCCAG 0.000289 GCCAT 0.000457 GCCCA 0.00017 GCCCC 0.00013 GCCCG 0.000153 GCCCT 0.000193 GCCGA 0.000357 GCCGC 0.000278 GCCGG 0.000203 GCCGT 0.000294 GCCTA 0.000249 GCCTC 0.000266 GCCTG 0.000271 GCCTT 0.000405 GCGAA 0.000855 GCGAC 0.000452 GCGAG 0.000496 GCGAT 0.000794 GCGCA 0.00044 GCGCC 0.000227 GCGCG 0.000578 GCGCT 0.000319 GCGGA 0.000359 GCGGC 0.000278 GCGGG 0.000162 GCGGT 0.000361 GCGTA 0.000632 GCGTC 0.000442 GCGTG 0.00056 GCGTT 0.000733 GCTAA 0.000598 GCTAC 0.000479 GCTAG 0.000313 GCTAT 0.000696 GCTCA 0.000346 GCTCC 0.000262 GCTCG 0.000507 GCTCT 0.000437 GCTGA 0.000479 GCTGC 0.000404 GCTGG 0.00027 GCTGT 0.000609 GCTTA 0.000602 GCTTC 0.000631 GCTTG 0.000499 GCTTT 0.00101 GGAAA 0.00159 GGAAC 0.000585 GGAAG 0.000733 GGAAT 0.000943 GGACA 0.000421 GGACC 0.000184 GGACG 0.000391 GGACT 0.000252 GGAGA 0.000632 GGAGC 0.000262 GGAGG 0.000341 GGAGT 0.000316 GGATA 0.000774 GGATC 0.000445 GGATG 0.000456 GGATT 0.000721 GGCAA 0.000517 GGCAC 0.000294 GGCAG 0.000324 GGCAT 0.000359 GGCCA 0.000262 GGCCC 0.000122 GGCCG 0.000213 GGCCT 0.000163 GGCGA 0.000426 GGCGC 0.000227 GGCGG 0.000202 GGCGT 0.000289 GGCTA 0.000291 GGCTC 0.000227 GGCTG 0.00031 GGCTT 0.00033 GGGAA 0.000603 GGGAC 0.000246 GGGAG 0.000299 GGGAT 0.000339 GGGCA 0.000222 GGGCC 0.000122 GGGCG 0.000146 GGGCT 0.000156 GGGGA 0.000288 GGGGC 0.00013 GGGGG 0.000143 GGGGT 0.000167 GGGTA 0.000267 GGGTC 0.000153 GGGTG 0.000245 GGGTT 0.000257 GGTAA 0.000764 GGTAC 0.000451 GGTAG 0.000387 GGTAT 0.000736 GGTCA 0.000345 GGTCC 0.000184 GGTCG 0.000372 GGTCT 0.000289 GGTGA 0.000497 GGTGC 0.000299 GGTGG 0.00036 GGTGT 0.000435 GGTTA 0.000597 GGTTC 0.000426 GGTTG 0.00042 GGTTT 0.00074 GTAAA 0.00214 GTAAC 0.00102 GTAAG 0.00073 GTAAT 0.00185 GTACA 0.00135 GTACC 0.000451 GTACG 0.000778 GTACT 0.000797 GTAGA 0.000872 GTAGC 0.000479 GTAGG 0.000337 GTAGT 0.000686 GTATA 0.00209 GTATC 0.00103 GTATG 0.000989 GTATT 0.00193 GTCAA 0.000784 GTCAC 0.000527 GTCAG 0.000465 GTCAT 0.000781 GTCCA 0.000384 GTCCC 0.000246 GTCCG 0.000264 GTCCT 0.000353 GTCGA 0.000808 GTCGC 0.000452 GTCGG 0.000314 GTCGT 0.00076 GTCTA 0.000532 GTCTC 0.000527 GTCTG 0.000433 GTCTT 0.000742 GTGAA 0.00114 GTGAC 0.000527 GTGAG 0.000424 GTGAT 0.000885 GTGCA 0.000731 GTGCC 0.000294 GTGCG 0.000421 GTGCT 0.000529 GTGGA 0.000559 GTGGC 0.000361 GTGGG 0.000223 GTGGT 0.000516 GTGTA 0.00118 GTGTC 0.000524 GTGTG 0.000793 GTGTT 0.00101 GTTAA 0.0016 GTTAC 0.00102 GTTAG 0.000657 GTTAT 0.0016 GTTCA 0.000923 GTTCC 0.000585 GTTCG 0.000863 GTTCT 0.00105 GTTGA 0.000918 GTTGC 0.000696 GTTGG 0.000487 GTTGT 0.001 GTTTA 0.0017 GTTTC 0.00167 GTTTG 0.00109 GTTTT 0.00224 TAAAA 0.00499 TAAAC 0.0017 TAAAG 0.00157 TAAAT 0.0042 TAACA 0.00185 TAACC 0.000597 TAACG 0.00115 TAACT 0.00128 TAAGA 0.00149 TAAGC 0.000602 TAAGG 0.000554 TAAGT 0.00123 TAATA 0.00398 TAATC 0.00152 TAATG 0.00162 TAATT 0.00406 TACAA 0.0023 TACAC 0.00118 TACAG 0.000941 TACAT 0.00257 TACCA 0.000836 TACCC 0.000267 TACCG 0.000521 TACCT 0.000713 TACGA 0.0013 TACGC 0.000632 TACGG 0.000402 TACGT 0.00131 TACTA 0.00127 TACTC 0.000712 TACTG 0.000761 TACTT 0.00181 TAGAA 0.00188 TAGAC 0.000532 TAGAG 0.000677 TAGAT 0.00132 TAGCA 0.000745 TAGCC 0.000291 TAGCG 0.000463 TAGCT 0.000587 TAGGA 0.000667 TAGGC 0.000249 TAGGG 0.000225 TAGGT 0.000551 TAGTA 0.00127 TAGTC 0.000547 TAGTG 0.000593 TAGTT 0.00127 TATAA 0.00412 TATAC 0.00209 TATAG 0.00135 TATAT 0.00624 TATCA 0.00173 TATCC 0.000774 TATCG 0.00145 TATCT 0.00172 TATGA 0.00153 TATGC 0.000889 TATGG 0.000578 TATGT 0.00228 TATTA 0.00398 TATTC 0.00197 TATTG 0.00181 TATTT 0.0055 TCAAA 0.002 TCAAC 0.000918 TCAAG 0.000789 TCAAT 0.0017 TCACA 0.000906 TCACC 0.000497 TCACG 0.000764 TCACT 0.000814 TCAGA 0.000768 TCAGC 0.000479 TCAGG 0.000371 TCAGT 0.000771 TCATA 0.00153 TCATC 0.00099 TCATG 0.000756 TCATT 0.00204 TCCAA 0.00092 TCCAC 0.000559 TCCAG 0.000429 TCCAT 0.000916 TCCCA 0.000379 TCCCC 0.000288 TCCCG 0.000295 TCCCT 0.000524 TCCGA 0.000497 TCCGC 0.000359 TCCGG 0.000265 TCCGT 0.000594 TCCTA 0.000667 TCCTC 0.00069 TCCTG 0.000494 TCCTT 0.00118 TCGAA 0.00176 TCGAC 0.000808 TCGAG 0.000906 TCGAT 0.00186 TCGCA 0.000667 TCGCC 0.000426 TCGCG 0.00081 TCGCT 0.000694 TCGGA 0.000497 TCGGC 0.000357 TCGGG 0.000249 TCGGT 0.000636 TCGTA 0.0013 TCGTC 0.000917 TCGTG 0.000893 TCGTT 0.00184 TCTAA 0.00133 TCTAC 0.000872 TCTAG 0.00055 TCTAT 0.00166 TCTCA 0.000808 TCTCC 0.000632 TCTCG 0.000932 TCTCT 0.00158 TCTGA 0.000768 TCTGC 0.000606 TCTGG 0.000397 TCTGT 0.00118 TCTTA 0.00149 TCTTC 0.00145 TCTTG 0.000921 TCTTT 0.00295 TGAAA 0.00286 TGAAC 0.000923 TGAAG 0.0008 TGAAT 0.00188 TGACA 0.000945 TGACC 0.000345 TGACG 0.000593 TGACT 0.000671 TGAGA 0.000808 TGAGC 0.000346 TGAGG 0.000291 TGAGT 0.000537 TGATA 0.00173 TGATC 0.000843 TGATG 0.00083 TGATT 0.00169 TGCAA 0.00138 TGCAC 0.000731 TGCAG 0.000614 TGCAT 0.00124 TGCCA 0.00053 TGCCC 0.000222 TGCCG 0.00033 TGCCT 0.000411 TGCGA 0.000667 TGCGC 0.00044 TGCGG 0.000274 TGCGT 0.000706 TGCTA 0.000745 TGCTC 0.000528 TGCTG 0.000568 TGCTT 0.00106 TGGAA 0.00126 TGGAC 0.000384 TGGAG 0.000407 TGGAT 0.000765 TGGCA 0.00053 TGGCC 0.000262 TGGCG 0.000387 TGGCT 0.000412 TGGGA 0.000379 TGGGC 0.00017 TGGGG 0.000186 TGGGT 0.000244 TGGTA 0.000836 TGGTC 0.000398 TGGTG 0.000505 TGGTT 0.000759 TGTAA 0.00228 TGTAC 0.00135 TGTAG 0.000766 TGTAT 0.0026 TGTCA 0.000945 TGTCC 0.000421 TGTCG 0.000678 TGTCT 0.000861 TGTGA 0.000906 TGTGC 0.000696 TGTGG 0.000372 TGTGT 0.00133 TGTTA 0.00185 TGTTC 0.0012 TGTTG 0.00107 TGTTT 0.00257 TTAAA 0.00401 TTAAC 0.0016 TTAAG 0.00131 TTAAT 0.00378 TTACA 0.00228 TTACC 0.000764 TTACG 0.00112 TTACT 0.00158 TTAGA 0.00133 TTAGC 0.000598 TTAGG 0.000527 TTAGT 0.00115 TTATA 0.00412 TTATC 0.00187 TTATG 0.00164 TTATT 0.00474 TTCAA 0.00223 TTCAC 0.00114 TTCAG 0.000882 TTCAT 0.00221 TTCCA 0.00126 TTCCC 0.000603 TTCCG 0.000652 TTCCT 0.00134 TTCGA 0.00176 TTCGC 0.000855 TTCGG 0.000536 TTCGT 0.00174 TTCTA 0.00188 TTCTC 0.00158 TTCTG 0.00115 TTCTT 0.00307 TTGAA 0.00223 TTGAC 0.000784 TTGAG 0.000656 TTGAT 0.00174 TTGCA 0.00138 TTGCC 0.000517 TTGCG 0.000694 TTGCT 0.00106 TTGGA 0.00092 TTGGC 0.000485 TTGGG 0.000298 TTGGT 0.000811 TTGTA 0.0023 TTGTC 0.00102 TTGTG 0.00099 TTGTT 0.00248 TTTAA 0.00401 TTTAC 0.00214 TTTAG 0.00131 TTTAT 0.00501 TTTCA 0.00286 TTTCC 0.00159 TTTCG 0.00176 TTTCT 0.00339 TTTGA 0.002 TTTGC 0.00128 TTTGG 0.000837 TTTGT 0.00266 TTTTA 0.00499 TTTTC 0.00344 TTTTG 0.00244 TTTTT 0.00701 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3815 AAAAC 0.1199 AAAAG 0.1464 AAAAT 0.3522 AAACA 0.4248 AAACC 0.09857 AAACG 0.1983 AAACT 0.2783 AAAGA 0.4072 AAAGC 0.1366 AAAGG 0.1406 AAAGT 0.3156 AAATA 0.3806 AAATC 0.1152 AAATG 0.1571 AAATT 0.3471 AACAA 0.3764 AACAC 0.1374 AACAG 0.1485 AACAT 0.3376 AACCA 0.3681 AACCC 0.1122 AACCG 0.192 AACCT 0.3277 AACGA 0.3875 AACGC 0.1494 AACGG 0.1152 AACGT 0.3479 AACTA 0.2962 AACTC 0.1319 AACTG 0.1905 AACTT 0.3814 AAGAA 0.4534 AAGAC 0.1044 AAGAG 0.1463 AAGAT 0.2959 AAGCA 0.4155 AAGCC 0.1145 AAGCG 0.1828 AAGCT 0.2872 AAGGA 0.4184 AAGGC 0.1432 AAGGG 0.1549 AAGGT 0.2835 AAGTA 0.3776 AAGTC 0.1129 AAGTG 0.1685 AAGTT 0.341 AATAA 0.3585 AATAC 0.1372 AATAG 0.1046 AATAT 0.3997 AATCA 0.3493 AATCC 0.1236 AATCG 0.2152 AATCT 0.3119 AATGA 0.3357 AATGC 0.1549 AATGG 0.1265 AATGT 0.3829 AATTA 0.3167 AATTC 0.1362 AATTG 0.1479 AATTT 0.3992 ACAAA 0.4024 ACAAC 0.1303 ACAAG 0.1325 ACAAT 0.3348 ACACA 0.422 ACACC 0.1067 ACACG 0.2248 ACACT 0.2465 ACAGA 0.3714 ACAGC 0.1645 ACAGG 0.1391 ACAGT 0.325 ACATA 0.38 ACATC 0.1221 ACATG 0.1439 ACATT 0.354 ACCAA 0.3453 ACCAC 0.1881 ACCAG 0.1482 ACCAT 0.3184 ACCCA 0.2851 ACCCC 0.1714 ACCCG 0.1863 ACCCT 0.3571 ACCGA 0.3465 ACCGC 0.2 ACCGG 0.141 ACCGT 0.3125 ACCTA 0.2891 ACCTC 0.166 ACCTG 0.188 ACCTT 0.3569 ACGAA 0.3688 ACGAC 0.1423 ACGAG 0.1577 ACGAT 0.3312 ACGCA 0.3353 ACGCC 0.1162 ACGCG 0.299 ACGCT 0.2495 ACGGA 0.355 ACGGC 0.163 ACGGG 0.1543 ACGGT 0.3278 ACGTA 0.3256 ACGTC 0.1331 ACGTG 0.1945 ACGTT 0.3468 ACTAA 0.3188 ACTAC 0.1759 ACTAG 0.1296 ACTAT 0.3756 ACTCA 0.2811 ACTCC 0.1408 ACTCG 0.2505 ACTCT 0.3276 ACTGA 0.3103 ACTGC 0.1878 ACTGG 0.1273 ACTGT 0.3746 ACTTA 0.2661 ACTTC 0.1614 ACTTG 0.1593 ACTTT 0.4132 AGAAA 0.4449 AGAAC 0.1284 AGAAG 0.1429 AGAAT 0.2838 AGACA 0.4168 AGACC 0.1179 AGACG 0.2037 AGACT 0.2615 AGAGA 0.4622 AGAGC 0.1301 AGAGG 0.165 AGAGT 0.2427 AGATA 0.3753 AGATC 0.1347 AGATG 0.1607 AGATT 0.3292 AGCAA 0.3671 AGCAC 0.1705 AGCAG 0.1695 AGCAT 0.2929 AGCCA 0.3767 AGCCC 0.1291 AGCCG 0.1999 AGCCT 0.2944 AGCGA 0.3584 AGCGC 0.1736 AGCGG 0.1516 AGCGT 0.3165 AGCTA 0.2826 AGCTC 0.1493 AGCTG 0.2115 AGCTT 0.3566 AGGAA 0.4485 AGGAC 0.1151 AGGAG 0.1577 AGGAT 0.2787 AGGCA 0.3874 AGGCC 0.1308 AGGCG 0.2051 AGGCT 0.2768 AGGGA 0.4159 AGGGC 0.1478 AGGGG 0.179 AGGGT 0.2573 AGGTA 0.3603 AGGTC 0.1248 AGGTG 0.1952 AGGTT 0.3197 AGTAA 0.3525 AGTAC 0.165 AGTAG 0.1345 AGTAT 0.3479 AGTCA 0.3774 AGTCC 0.1179 AGTCG 0.2139 AGTCT 0.2908 AGTGA 0.3405 AGTGC 0.1746 AGTGG 0.1552 AGTGT 0.3297 AGTTA 0.2942 AGTTC 0.1593 AGTTG 0.1621 AGTTT 0.3843 ATAAA 0.4133 ATAAC 0.1199 ATAAG 0.1077 ATAAT 0.3591 ATACA 0.4622 ATACC 0.1094 ATACG 0.1623 ATACT 0.2662 ATAGA 0.3823 ATAGC 0.1508 ATAGG 0.132 ATAGT 0.3348 ATATA 0.4258 ATATC 0.1128 ATATG 0.1294 ATATT 0.332 ATCAA 0.3429 ATCAC 0.1606 ATCAG 0.1421 ATCAT 0.3543 ATCCA 0.3482 ATCCC 0.1405 ATCCG 0.1669 ATCCT 0.3445 ATCGA 0.3903 ATCGC 0.1593 ATCGG 0.1072 ATCGT 0.3432 ATCTA 0.2833 ATCTC 0.1657 ATCTG 0.1591 ATCTT 0.3919 ATGAA 0.4254 ATGAC 0.1377 ATGAG 0.1078 ATGAT 0.3291 ATGCA 0.4409 ATGCC 0.1163 ATGCG 0.1714 ATGCT 0.2715 ATGGA 0.3797 ATGGC 0.1881 ATGGG 0.112 ATGGT 0.3203 ATGTA 0.4175 ATGTC 0.111 ATGTG 0.1434 ATGTT 0.3281 ATTAA 0.3403 ATTAC 0.1586 ATTAG 0.09965 ATTAT 0.4015 ATTCA 0.3319 ATTCC 0.1393 ATTCG 0.1865 ATTCT 0.3423 ATTGA 0.299 ATTGC 0.1829 ATTGG 0.1222 ATTGT 0.3959 ATTTA 0.2974 ATTTC 0.1701 ATTTG 0.1408 ATTTT 0.3917 CAAAA 0.3731 CAAAC 0.1445 CAAAG 0.1435 CAAAT 0.3388 CAACA 0.3839 CAACC 0.12 CAACG 0.2178 CAACT 0.2784 CAAGA 0.3456 CAAGC 0.1645 CAAGG 0.1545 CAAGT 0.3354 CAATA 0.3414 CAATC 0.132 CAATG 0.1663 CAATT 0.3604 CACAA 0.3183 CACAC 0.2119 CACAG 0.1554 CACAT 0.3144 CACCA 0.3452 CACCC 0.1376 CACCG 0.218 CACCT 0.2992 CACGA 0.3311 CACGC 0.1987 CACGG 0.1332 CACGT 0.3369 CACTA 0.259 CACTC 0.1562 CACTG 0.2163 CACTT 0.3685 CAGAA 0.4125 CAGAC 0.1308 CAGAG 0.1677 CAGAT 0.2891 CAGCA 0.3555 CAGCC 0.1569 CAGCG 0.1923 CAGCT 0.2953 CAGGA 0.3645 CAGGC 0.1678 CAGGG 0.1467 CAGGT 0.321 CAGTA 0.3203 CAGTC 0.1309 CAGTG 0.2016 CAGTT 0.3472 CATAA 0.321 CATAC 0.1724 CATAG 0.1092 CATAT 0.3974 CATCA 0.3197 CATCC 0.1446 CATCG 0.2315 CATCT 0.3042 CATGA 0.2999 CATGC 0.183 CATGG 0.1398 CATGT 0.3773 CATTA 0.2818 CATTC 0.1602 CATTG 0.1529 CATTT 0.405 CCAAA 0.3624 CCAAC 0.1723 CCAAG 0.1394 CCAAT 0.3258 CCACA 0.2663 CCACC 0.1961 CCACG 0.2518 CCACT 0.2858 CCAGA 0.3206 CCAGC 0.1986 CCAGG 0.1542 CCAGT 0.3266 CCATA 0.2676 CCATC 0.1813 CCATG 0.1726 CCATT 0.3785 CCCAA 0.3265 CCCAC 0.2143 CCCAG 0.1468 CCCAT 0.3123 CCCCA 0.2821 CCCCC 0.1987 CCCCG 0.1757 CCCCT 0.3435 CCCGA 0.3049 CCCGC 0.2119 CCCGG 0.1329 CCCGT 0.3504 CCCTA 0.2071 CCCTC 0.2498 CCCTG 0.1662 CCCTT 0.3769 CCGAA 0.3358 CCGAC 0.1705 CCGAG 0.1779 CCGAT 0.3159 CCGCA 0.2589 CCGCC 0.1736 CCGCG 0.308 CCGCT 0.2596 CCGGA 0.3307 CCGGC 0.2307 CCGGG 0.1243 CCGGT 0.3143 CCGTA 0.2696 CCGTC 0.1718 CCGTG 0.224 CCGTT 0.3345 CCTAA 0.3257 CCTAC 0.1754 CCTAG 0.1303 CCTAT 0.3686 CCTCA 0.2155 CCTCC 0.2021 CCTCG 0.2318 CCTCT 0.3507 CCTGA 0.2817 CCTGC 0.2101 CCTGG 0.1386 CCTGT 0.3695 CCTTA 0.2234 CCTTC 0.2133 CCTTG 0.1606 CCTTT 0.4027 CGAAA 0.3709 CGAAC 0.1611 CGAAG 0.1658 CGAAT 0.3022 CGACA 0.3246 CGACC 0.1523 CGACG 0.2882 CGACT 0.2349 CGAGA 0.3665 CGAGC 0.1842 CGAGG 0.1663 CGAGT 0.283 CGATA 0.3251 CGATC 0.1944 CGATG 0.1682 CGATT 0.3123 CGCAA 0.3336 CGCAC 0.192 CGCAG 0.1706 CGCAT 0.3038 CGCCA 0.369 CGCCC 0.1314 CGCCG 0.25 CGCCT 0.2497 CGCGA 0.313 CGCGC 0.2303 CGCGG 0.1469 CGCGT 0.3097 CGCTA 0.2625 CGCTC 0.2079 CGCTG 0.2 CGCTT 0.3296 CGGAA 0.395 CGGAC 0.1447 CGGAG 0.1818 CGGAT 0.2785 CGGCA 0.3223 CGGCC 0.1794 CGGCG 0.2602 CGGCT 0.2381 CGGGA 0.3895 CGGGC 0.1898 CGGGG 0.1705 CGGGT 0.2502 CGGTA 0.3161 CGGTC 0.1853 CGGTG 0.2152 CGGTT 0.2835 CGTAA 0.316 CGTAC 0.1961 CGTAG 0.1387 CGTAT 0.3492 CGTCA 0.2972 CGTCC 0.1666 CGTCG 0.2878 CGTCT 0.2484 CGTGA 0.2953 CGTGC 0.1848 CGTGG 0.1625 CGTGT 0.3574 CGTTA 0.2673 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.1704 CGTTT 0.3678 CTAAA 0.3735 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1205 CTAAT 0.3419 CTACA 0.3619 CTACC 0.1435 CTACG 0.1905 CTACT 0.3041 CTAGA 0.354 CTAGC 0.1745 CTAGG 0.1357 CTAGT 0.3358 CTATA 0.3371 CTATC 0.1526 CTATG 0.1483 CTATT 0.362 CTCAA 0.3347 CTCAC 0.1943 CTCAG 0.1445 CTCAT 0.3266 CTCCA 0.2918 CTCCC 0.1785 CTCCG 0.1899 CTCCT 0.3398 CTCGA 0.3554 CTCGC 0.1842 CTCGG 0.1242 CTCGT 0.3362 CTCTA 0.233 CTCTC 0.237 CTCTG 0.171 CTCTT 0.359 CTGAA 0.3724 CTGAC 0.1738 CTGAG 0.1205 CTGAT 0.3334 CTGCA 0.3572 CTGCC 0.1635 CTGCG 0.1821 CTGCT 0.2973 CTGGA 0.352 CTGGC 0.2034 CTGGG 0.1161 CTGGT 0.3285 CTGTA 0.3184 CTGTC 0.1625 CTGTG 0.171 CTGTT 0.3482 CTTAA 0.3442 CTTAC 0.1702 CTTAG 0.1096 CTTAT 0.376 CTTCA 0.2653 CTTCC 0.1899 CTTCG 0.203 CTTCT 0.3419 CTTGA 0.2963 CTTGC 0.194 CTTGG 0.1276 CTTGT 0.3821 CTTTA 0.2476 CTTTC 0.2005 CTTTG 0.148 CTTTT 0.404 GAAAA 0.3654 GAAAC 0.156 GAAAG 0.1542 GAAAT 0.3245 GAACA 0.3836 GAACC 0.1165 GAACG 0.2381 GAACT 0.2619 GAAGA 0.3884 GAAGC 0.1621 GAAGG 0.1692 GAAGT 0.2803 GAATA 0.3406 GAATC 0.1459 GAATG 0.1768 GAATT 0.3367 GACAA 0.3515 GACAC 0.1628 GACAG 0.1834 GACAT 0.3023 GACCA 0.3572 GACCC 0.1168 GACCG 0.2605 GACCT 0.2655 GACGA 0.3821 GACGC 0.1888 GACGG 0.1318 GACGT 0.2973 GACTA 0.2988 GACTC 0.1604 GACTG 0.1961 GACTT 0.3447 GAGAA 0.4054 GAGAC 0.1276 GAGAG 0.2035 GAGAT 0.2635 GAGCA 0.3772 GAGCC 0.1288 GAGCG 0.2418 GAGCT 0.2521 GAGGA 0.3952 GAGGC 0.1486 GAGGG 0.1997 GAGGT 0.2565 GAGTA 0.3469 GAGTC 0.1418 GAGTG 0.1929 GAGTT 0.3184 GATAA 0.3314 GATAC 0.1699 GATAG 0.1222 GATAT 0.3765 GATCA 0.316 GATCC 0.1353 GATCG 0.281 GATCT 0.2677 GATGA 0.3371 GATGC 0.167 GATGG 0.1559 GATGT 0.34 GATTA 0.2908 GATTC 0.1704 GATTG 0.1564 GATTT 0.3824 GCAAA 0.3585 GCAAC 0.1688 GCAAG 0.1432 GCAAT 0.3294 GCACA 0.3788 GCACC 0.1465 GCACG 0.2236 GCACT 0.2511 GCAGA 0.3307 GCAGC 0.2022 GCAGG 0.1526 GCAGT 0.3145 GCATA 0.3277 GCATC 0.1477 GCATG 0.1719 GCATT 0.3527 GCCAA 0.311 GCCAC 0.2047 GCCAG 0.1593 GCCAT 0.325 GCCCA 0.282 GCCCC 0.1965 GCCCG 0.2127 GCCCT 0.3088 GCCGA 0.3213 GCCGC 0.2397 GCCGG 0.1755 GCCGT 0.2635 GCCTA 0.2414 GCCTC 0.1947 GCCTG 0.199 GCCTT 0.3649 GCGAA 0.342 GCGAC 0.1669 GCGAG 0.1767 GCGAT 0.3144 GCGCA 0.3059 GCGCC 0.1482 GCGCG 0.3379 GCGCT 0.2079 GCGGA 0.3091 GCGGC 0.2269 GCGGG 0.1428 GCGGT 0.3212 GCGTA 0.2845 GCGTC 0.1737 GCGTG 0.2358 GCGTT 0.306 GCTAA 0.2973 GCTAC 0.2085 GCTAG 0.1406 GCTAT 0.3536 GCTCA 0.263 GCTCC 0.167 GCTCG 0.2744 GCTCT 0.2955 GCTGA 0.2851 GCTGC 0.2226 GCTGG 0.1427 GCTGT 0.3496 GCTTA 0.2412 GCTTC 0.2021 GCTTG 0.1693 GCTTT 0.3874 GGAAA 0.4212 GGAAC 0.1399 GGAAG 0.1788 GGAAT 0.2601 GGACA 0.3691 GGACC 0.1401 GGACG 0.2764 GGACT 0.2144 GGAGA 0.3863 GGAGC 0.1654 GGAGG 0.2137 GGAGT 0.2346 GGATA 0.3418 GGATC 0.1629 GGATG 0.1829 GGATT 0.3123 GGCAA 0.3396 GGCAC 0.1859 GGCAG 0.2023 GGCAT 0.2723 GGCCA 0.3567 GGCCC 0.1667 GGCCG 0.2478 GGCCT 0.2288 GGCGA 0.3531 GGCGC 0.2148 GGCGG 0.176 GGCGT 0.2561 GGCTA 0.2719 GGCTC 0.1679 GGCTG 0.2474 GGCTT 0.3129 GGGAA 0.418 GGGAC 0.1442 GGGAG 0.1846 GGGAT 0.2532 GGGCA 0.3525 GGGCC 0.1901 GGGCG 0.2153 GGGCT 0.2421 GGGGA 0.3836 GGGGC 0.1806 GGGGG 0.1987 GGGGT 0.2371 GGGTA 0.3174 GGGTC 0.1475 GGGTG 0.2411 GGGTT 0.294 GGTAA 0.3347 GGTAC 0.1815 GGTAG 0.1487 GGTAT 0.3351 GGTCA 0.3357 GGTCC 0.1475 GGTCG 0.2656 GGTCT 0.2511 GGTGA 0.3213 GGTGC 0.1969 GGTGG 0.2058 GGTGT 0.276 GGTTA 0.3027 GGTTC 0.1785 GGTTG 0.176 GGTTT 0.3429 GTAAA 0.374 GTAAC 0.1623 GTAAG 0.1187 GTAAT 0.345 GTACA 0.4353 GTACC 0.1209 GTACG 0.1861 GTACT 0.2577 GTAGA 0.3691 GTAGC 0.1819 GTAGG 0.1284 GTAGT 0.3206 GTATA 0.3614 GTATC 0.147 GTATG 0.1622 GTATT 0.3293 GTCAA 0.3129 GTCAC 0.1958 GTCAG 0.1637 GTCAT 0.3276 GTCCA 0.3361 GTCCC 0.1719 GTCCG 0.1863 GTCCT 0.3056 GTCGA 0.3454 GTCGC 0.191 GTCGG 0.1306 GTCGT 0.3329 GTCTA 0.2612 GTCTC 0.2041 GTCTG 0.1831 GTCTT 0.3516 GTGAA 0.386 GTGAC 0.171 GTGAG 0.1332 GTGAT 0.3098 GTGCA 0.398 GTGCC 0.1382 GTGCG 0.1886 GTGCT 0.2752 GTGGA 0.3471 GTGGC 0.2012 GTGGG 0.1305 GTGGT 0.3212 GTGTA 0.3536 GTGTC 0.1332 GTGTG 0.2154 GTGTT 0.2978 GTTAA 0.3313 GTTAC 0.1945 GTTAG 0.1246 GTTAT 0.3496 GTTCA 0.3077 GTTCC 0.1576 GTTCG 0.2091 GTTCT 0.3257 GTTGA 0.3042 GTTGC 0.2088 GTTGG 0.1439 GTTGT 0.3431 GTTTA 0.2756 GTTTC 0.2153 GTTTG 0.1581 GTTTT 0.351 TAAAA 0.4047 TAAAC 0.1242 TAAAG 0.1184 TAAAT 0.3528 TAACA 0.4174 TAACC 0.1142 TAACG 0.1891 TAACT 0.2794 TAAGA 0.3902 TAAGC 0.1416 TAAGG 0.1298 TAAGT 0.3384 TAATA 0.3749 TAATC 0.1159 TAATG 0.1447 TAATT 0.3645 TACAA 0.3395 TACAC 0.148 TACAG 0.1231 TACAT 0.3894 TACCA 0.3769 TACCC 0.1071 TACCG 0.1893 TACCT 0.3266 TACGA 0.3487 TACGC 0.1619 TACGG 0.1083 TACGT 0.381 TACTA 0.2943 TACTC 0.1368 TACTG 0.1672 TACTT 0.4018 TAGAA 0.441 TAGAC 0.1121 TAGAG 0.1374 TAGAT 0.3095 TAGCA 0.3984 TAGCC 0.1266 TAGCG 0.1853 TAGCT 0.2897 TAGGA 0.3846 TAGGC 0.1423 TAGGG 0.1279 TAGGT 0.3451 TAGTA 0.3651 TAGTC 0.1291 TAGTG 0.1563 TAGTT 0.3495 TATAA 0.3019 TATAC 0.1382 TATAG 0.08935 TATAT 0.4705 TATCA 0.3412 TATCC 0.1247 TATCG 0.2064 TATCT 0.3277 TATGA 0.2958 TATGC 0.1573 TATGG 0.09773 TATGT 0.4492 TATTA 0.3129 TATTC 0.1323 TATTG 0.1345 TATTT 0.4203 TCAAA 0.3885 TCAAC 0.1499 TCAAG 0.1333 TCAAT 0.3282 TCACA 0.3387 TCACC 0.1455 TCACG 0.2176 TCACT 0.2981 TCAGA 0.3298 TCAGC 0.1765 TCAGG 0.1395 TCAGT 0.3542 TCATA 0.3144 TCATC 0.1521 TCATG 0.1437 TCATT 0.3898 TCCAA 0.3419 TCCAC 0.1809 TCCAG 0.1413 TCCAT 0.336 TCCCA 0.278 TCCCC 0.1749 TCCCG 0.183 TCCCT 0.364 TCCGA 0.2972 TCCGC 0.1992 TCCGG 0.1535 TCCGT 0.3502 TCCTA 0.2444 TCCTC 0.194 TCCTG 0.162 TCCTT 0.3996 TCGAA 0.3442 TCGAC 0.1401 TCGAG 0.1582 TCGAT 0.3575 TCGCA 0.2923 TCGCC 0.1523 TCGCG 0.2871 TCGCT 0.2684 TCGGA 0.302 TCGGC 0.1992 TCGGG 0.1345 TCGGT 0.3643 TCGTA 0.2848 TCGTC 0.1635 TCGTG 0.1827 TCGTT 0.3691 TCTAA 0.3145 TCTAC 0.1808 TCTAG 0.1219 TCTAT 0.3828 TCTCA 0.2499 TCTCC 0.1474 TCTCG 0.2062 TCTCT 0.3965 TCTGA 0.278 TCTGC 0.1899 TCTGG 0.1203 TCTGT 0.4119 TCTTA 0.25 TCTTC 0.1822 TCTTG 0.1337 TCTTT 0.4341 TGAAA 0.4492 TGAAC 0.1317 TGAAG 0.1204 TGAAT 0.2988 TGACA 0.4079 TGACC 0.126 TGACG 0.1948 TGACT 0.2713 TGAGA 0.4064 TGAGC 0.1616 TGAGG 0.1414 TGAGT 0.2906 TGATA 0.3594 TGATC 0.1462 TGATG 0.1553 TGATT 0.3391 TGCAA 0.3622 TGCAC 0.1698 TGCAG 0.1403 TGCAT 0.3277 TGCCA 0.379 TGCCC 0.1341 TGCCG 0.193 TGCCT 0.2939 TGCGA 0.3193 TGCGC 0.209 TGCGG 0.1237 TGCGT 0.348 TGCTA 0.2811 TGCTC 0.1615 TGCTG 0.1842 TGCTT 0.3731 TGGAA 0.4536 TGGAC 0.1272 TGGAG 0.1361 TGGAT 0.2831 TGGCA 0.3671 TGGCC 0.1499 TGGCG 0.2227 TGGCT 0.2603 TGGGA 0.3945 TGGGC 0.1677 TGGGG 0.1825 TGGGT 0.2552 TGGTA 0.3559 TGGTC 0.1437 TGGTG 0.1928 TGGTT 0.3075 TGTAA 0.3306 TGTAC 0.1789 TGTAG 0.1027 TGTAT 0.3878 TGTCA 0.371 TGTCC 0.1327 TGTCG 0.1933 TGTCT 0.303 TGTGA 0.2846 TGTGC 0.1938 TGTGG 0.1064 TGTGT 0.4152 TGTTA 0.2963 TGTTC 0.1574 TGTTG 0.1508 TGTTT 0.3956 TTAAA 0.3925 TTAAC 0.1336 TTAAG 0.116 TTAAT 0.3579 TTACA 0.4284 TTACC 0.1188 TTACG 0.1597 TTACT 0.2932 TTAGA 0.3731 TTAGC 0.1507 TTAGG 0.1386 TTAGT 0.3377 TTATA 0.3527 TTATC 0.1281 TTATG 0.1349 TTATT 0.3842 TTCAA 0.3516 TTCAC 0.1588 TTCAG 0.126 TTCAT 0.3636 TTCCA 0.3529 TTCCC 0.1467 TTCCG 0.1498 TTCCT 0.3507 TTCGA 0.3595 TTCGC 0.1658 TTCGG 0.109 TTCGT 0.3657 TTCTA 0.2716 TTCTC 0.1715 TTCTG 0.1528 TTCTT 0.4041 TTGAA 0.4232 TTGAC 0.1354 TTGAG 0.1137 TTGAT 0.3277 TTGCA 0.4199 TTGCC 0.1249 TTGCG 0.1621 TTGCT 0.2931 TTGGA 0.3749 TTGGC 0.1747 TTGGG 0.1135 TTGGT 0.3369 TTGTA 0.3625 TTGTC 0.1286 TTGTG 0.1446 TTGTT 0.3644 TTTAA 0.3344 TTTAC 0.1541 TTTAG 0.09755 TTTAT 0.414 TTTCA 0.3349 TTTCC 0.1514 TTTCG 0.1536 TTTCT 0.3601 TTTGA 0.3039 TTTGC 0.1709 TTTGG 0.1167 TTTGT 0.4085 TTTTA 0.3068 TTTTC 0.1722 TTTTG 0.1394 TTTTT 0.3815