[1] # (a,c,g,t)= (0.272, 0.228, 0.228, 0.272) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.303 C 0.197 G 0.197 T 0.303 # l= 1 # Values AA 0.107 AC 0.056 AG 0.0635 AT 0.0771 CA 0.0736 CC 0.0409 CG 0.0189 CT 0.0635 GA 0.0589 GC 0.041 GG 0.0409 GT 0.056 TA 0.0641 TC 0.0589 TG 0.0736 TT 0.107 # l= 2 # Values AAA 0.043 AAC 0.0197 AAG 0.0181 AAT 0.0257 ACA 0.0236 ACC 0.0109 ACG 0.00536 ACT 0.0161 AGA 0.0203 AGC 0.0142 AGG 0.0129 AGT 0.0161 ATA 0.019 ATC 0.014 ATG 0.0183 ATT 0.0257 CAA 0.0198 CAC 0.0144 CAG 0.0211 CAT 0.0183 CCA 0.0147 CCC 0.00845 CCG 0.00489 CCT 0.0129 CGA 0.00423 CGC 0.00439 CGG 0.00489 CGT 0.00536 CTA 0.0106 CTC 0.0137 CTG 0.0211 CTT 0.0181 GAA 0.02 GAC 0.0112 GAG 0.0137 GAT 0.014 GCA 0.0143 GCC 0.00811 GCG 0.00439 GCT 0.0142 GGA 0.0134 GGC 0.00811 GGG 0.00845 GGT 0.0109 GTA 0.0108 GTC 0.0112 GTG 0.0144 GTT 0.0197 TAA 0.0237 TAC 0.0108 TAG 0.0106 TAT 0.019 TCA 0.021 TCC 0.0134 TCG 0.00423 TCT 0.0203 TGA 0.021 TGC 0.0143 TGG 0.0147 TGT 0.0236 TTA 0.0237 TTC 0.02 TTG 0.0198 TTT 0.043 # l= 3 # Values AAAA 0.0165 AAAC 0.00827 AAAG 0.00731 AAAT 0.0109 AACA 0.00834 AACC 0.00383 AACG 0.00183 AACT 0.00567 AAGA 0.00578 AAGC 0.00372 AAGG 0.00353 AAGT 0.0051 AATA 0.00777 AATC 0.00456 AATG 0.00622 AATT 0.00717 ACAA 0.00678 ACAC 0.00495 ACAG 0.00575 ACAT 0.00612 ACCA 0.0041 ACCC 0.0021 ACCG 0.00133 ACCT 0.00339 ACGA 0.00123 ACGC 0.00115 ACGG 0.00127 ACGT 0.0017 ACTA 0.00299 ACTC 0.00299 ACTG 0.00506 ACTT 0.0051 AGAA 0.00726 AGAC 0.0036 AGAG 0.00476 AGAT 0.00466 AGCA 0.00524 AGCC 0.00266 AGCG 0.00148 AGCT 0.00484 AGGA 0.00456 AGGC 0.00248 AGGG 0.00244 AGGT 0.00339 AGTA 0.00335 AGTC 0.00321 AGTG 0.00391 AGTT 0.00566 ATAA 0.00733 ATAC 0.00273 ATAG 0.00258 ATAT 0.00639 ATCA 0.00541 ATCC 0.0029 ATCG 0.00106 ATCT 0.00466 ATGA 0.00547 ATGC 0.00328 ATGG 0.00341 ATGT 0.00612 ATTA 0.00641 ATTC 0.00406 ATTG 0.00432 ATTT 0.0109 CAAA 0.00823 CAAC 0.00405 CAAG 0.00325 CAAT 0.00432 CACA 0.0064 CACC 0.00291 CACG 0.0012 CACT 0.00391 CAGA 0.0068 CAGC 0.00507 CAGG 0.00413 CAGT 0.00506 CATA 0.00367 CATC 0.00409 CATG 0.00429 CATT 0.00622 CCAA 0.00392 CCAC 0.00311 CCAG 0.00423 CCAT 0.00341 CCCA 0.00281 CCCC 0.00218 CCCG 0.00102 CCCT 0.00244 CCGA 0.00111 CCGC 0.0012 CCGG 0.00131 CCGT 0.00127 CCTA 0.00171 CCTC 0.0035 CCTG 0.00413 CCTT 0.00353 CGAA 0.00104 CGAC 0.00108 CGAG 0.00105 CGAT 0.00106 CGCA 0.0012 CGCC 0.00118 CGCG 0.000516 CGCT 0.00148 CGGA 0.00127 CGGC 0.00128 CGGG 0.00102 CGGT 0.00133 CGTA 0.000883 CGTC 0.00145 CGTG 0.0012 CGTT 0.00183 CTAA 0.00407 CTAC 0.00221 CTAG 0.00174 CTAT 0.00258 CTCA 0.00423 CTCC 0.0037 CTCG 0.00105 CTCT 0.00476 CTGA 0.00602 CTGC 0.00506 CTGG 0.00423 CTGT 0.00575 CTTA 0.00322 CTTC 0.00434 CTTG 0.00325 CTTT 0.00731 GAAA 0.00793 GAAC 0.00364 GAAG 0.00434 GAAT 0.00406 GACA 0.0042 GACC 0.00232 GACG 0.00145 GACT 0.00321 GAGA 0.00429 GAGC 0.00296 GAGG 0.0035 GAGT 0.00299 GATA 0.00277 GATC 0.00262 GATG 0.00409 GATT 0.00456 GCAA 0.00368 GCAC 0.00231 GCAG 0.00506 GCAT 0.00328 GCCA 0.00275 GCCC 0.0016 GCCG 0.00128 GCCT 0.00248 GCGA 0.00092 GCGC 0.00112 GCGG 0.0012 GCGT 0.00115 GCTA 0.00248 GCTC 0.00296 GCTG 0.00507 GCTT 0.00372 GGAA 0.00437 GGAC 0.00243 GGAG 0.0037 GGAT 0.0029 GGCA 0.00245 GGCC 0.00181 GGCG 0.00119 GGCT 0.00266 GGGA 0.00258 GGGC 0.0016 GGGG 0.00218 GGGT 0.0021 GGTA 0.00186 GGTC 0.00232 GGTG 0.00291 GGTT 0.00383 GTAA 0.00402 GTAC 0.00179 GTAG 0.00221 GTAT 0.00273 GTCA 0.00406 GTCC 0.00243 GTCG 0.00108 GTCT 0.0036 GTGA 0.00404 GTGC 0.00231 GTGG 0.00311 GTGT 0.00495 GTTA 0.00372 GTTC 0.00364 GTTG 0.00405 GTTT 0.00827 TAAA 0.0103 TAAC 0.00372 TAAG 0.00322 TAAT 0.00641 TACA 0.00466 TACC 0.00186 TACG 0.000883 TACT 0.00335 TAGA 0.00341 TAGC 0.00248 TAGG 0.00172 TAGT 0.00299 TATA 0.00481 TATC 0.00277 TATG 0.00367 TATT 0.00777 TCAA 0.00546 TCAC 0.00404 TCAG 0.00602 TCAT 0.00547 TCCA 0.005 TCCC 0.00258 TCCG 0.00127 TCCT 0.00457 TCGA 0.000959 TCGC 0.000921 TCGG 0.00111 TCGT 0.00123 TCTA 0.00341 TCTC 0.00429 TCTG 0.0068 TCTT 0.00578 TGAA 0.0073 TGAC 0.00406 TGAG 0.00423 TGAT 0.00541 TGCA 0.00544 TGCC 0.00245 TGCG 0.0012 TGCT 0.00524 TGGA 0.005 TGGC 0.00275 TGGG 0.00281 TGGT 0.0041 TGTA 0.00466 TGTC 0.0042 TGTG 0.0064 TGTT 0.00834 TTAA 0.00827 TTAC 0.00402 TTAG 0.00407 TTAT 0.00733 TTCA 0.0073 TTCC 0.00438 TTCG 0.00104 TTCT 0.00726 TTGA 0.00546 TTGC 0.00368 TTGG 0.00392 TTGT 0.00678 TTTA 0.0103 TTTC 0.00793 TTTG 0.00823 TTTT 0.0165 # l= 4 # Values AAAAA 0.00651 AAAAC 0.00321 AAAAG 0.00261 AAAAT 0.00419 AAACA 0.00362 AAACC 0.00148 AAACG 0.000771 AAACT 0.00239 AAAGA 0.0023 AAAGC 0.00147 AAAGG 0.00136 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00359 AAATC 0.00186 AAATG 0.00282 AAATT 0.00266 AACAA 0.00263 AACAC 0.00151 AACAG 0.00192 AACAT 0.00229 AACCA 0.00151 AACCC 0.000737 AACCG 0.000438 AACCT 0.00115 AACGA 0.000432 AACGC 0.000382 AACGG 0.000401 AACGT 0.000612 AACTA 0.00119 AACTC 0.00105 AACTG 0.0017 AACTT 0.00173 AAGAA 0.00223 AAGAC 0.00105 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.00129 AAGCA 0.00142 AAGCC 0.00068 AAGCG 0.000334 AAGCT 0.00129 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.000695 AAGGG 0.000625 AAGGT 0.000998 AAGTA 0.00117 AAGTC 0.000982 AAGTG 0.00122 AAGTT 0.00173 AATAA 0.00336 AATAC 0.00109 AATAG 0.000939 AATAT 0.00238 AATCA 0.00182 AATCC 0.000913 AATCG 0.000309 AATCT 0.00152 AATGA 0.0019 AATGC 0.00108 AATGG 0.00104 AATGT 0.00221 AATTA 0.00215 AATTC 0.00115 AATTG 0.00121 AATTT 0.00266 ACAAA 0.00289 ACAAC 0.0013 ACAAG 0.0011 ACAAT 0.00149 ACACA 0.00258 ACACC 0.000826 ACACG 0.000409 ACACT 0.00114 ACAGA 0.00199 ACAGC 0.00127 ACAGG 0.00111 ACAGT 0.00139 ACATA 0.00129 ACATC 0.00118 ACATG 0.00145 ACATT 0.00221 ACCAA 0.00122 ACCAC 0.000806 ACCAG 0.00123 ACCAT 0.000851 ACCCA 0.000782 ACCCC 0.000477 ACCCG 0.000286 ACCCT 0.000554 ACCGA 0.000344 ACCGC 0.000286 ACCGG 0.000366 ACCGT 0.000334 ACCTA 0.000492 ACCTC 0.000778 ACCTG 0.00112 ACCTT 0.000998 ACGAA 0.000319 ACGAC 0.000301 ACGAG 0.000314 ACGAT 0.0003 ACGCA 0.000373 ACGCC 0.000285 ACGCG 0.000123 ACGCT 0.000371 ACGGA 0.000373 ACGGC 0.000324 ACGGG 0.000243 ACGGT 0.000334 ACGTA 0.000325 ACGTC 0.0004 ACGTG 0.000362 ACGTT 0.000612 ACTAA 0.00118 ACTAC 0.00058 ACTAG 0.000491 ACTAT 0.000734 ACTCA 0.00107 ACTCC 0.000696 ACTCG 0.00026 ACTCT 0.000963 ACTGA 0.00164 ACTGC 0.00103 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00139 ACTTA 0.000944 ACTTC 0.00107 ACTTG 0.000906 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.00313 AGAAC 0.00134 AGAAG 0.00143 AGAAT 0.00137 AGACA 0.00145 AGACC 0.000665 AGACG 0.000497 AGACT 0.000995 AGAGA 0.00165 AGAGC 0.001 AGAGG 0.00114 AGAGT 0.000963 AGATA 0.00102 AGATC 0.000828 AGATG 0.00129 AGATT 0.00152 AGCAA 0.0014 AGCAC 0.000791 AGCAG 0.0019 AGCAT 0.00115 AGCCA 0.000971 AGCCC 0.000479 AGCCG 0.000416 AGCCT 0.000797 AGCGA 0.00035 AGCGC 0.00037 AGCGG 0.000393 AGCGT 0.000371 AGCTA 0.000896 AGCTC 0.000972 AGCTG 0.00168 AGCTT 0.00129 AGGAA 0.00168 AGGAC 0.000771 AGGAG 0.00126 AGGAT 0.000854 AGGCA 0.000823 AGGCC 0.000519 AGGCG 0.000341 AGGCT 0.000797 AGGGA 0.000816 AGGGC 0.000462 AGGGG 0.000606 AGGGT 0.000554 AGGTA 0.000626 AGGTC 0.000712 AGGTG 0.000902 AGGTT 0.00115 AGTAA 0.00133 AGTAC 0.000525 AGTAG 0.000673 AGTAT 0.000814 AGTCA 0.00125 AGTCC 0.000666 AGTCG 0.000305 AGTCT 0.000995 AGTGA 0.00125 AGTGC 0.000638 AGTGG 0.000872 AGTGT 0.00114 AGTTA 0.00121 AGTTC 0.000998 AGTTG 0.00107 AGTTT 0.00239 ATAAA 0.00338 ATAAC 0.00102 ATAAG 0.000902 ATAAT 0.00204 ATACA 0.00128 ATACC 0.000416 ATACG 0.000215 ATACT 0.000814 ATAGA 0.000949 ATAGC 0.000502 ATAGG 0.00039 ATAGT 0.000734 ATATA 0.00207 ATATC 0.000828 ATATG 0.00111 ATATT 0.00238 ATCAA 0.00157 ATCAC 0.000959 ATCAG 0.00152 ATCAT 0.00136 ATCCA 0.00122 ATCCC 0.000538 ATCCG 0.000286 ATCCT 0.000854 ATCGA 0.000274 ATCGC 0.000223 ATCGG 0.000266 ATCGT 0.0003 ATCTA 0.000932 ATCTC 0.000894 ATCTG 0.00154 ATCTT 0.00129 ATGAA 0.00202 ATGAC 0.00103 ATGAG 0.00106 ATGAT 0.00136 ATGCA 0.00134 ATGCC 0.000519 ATGCG 0.000264 ATGCT 0.00115 ATGGA 0.00127 ATGGC 0.000705 ATGGG 0.000585 ATGGT 0.000851 ATGTA 0.00134 ATGTC 0.00107 ATGTG 0.00142 ATGTT 0.00229 ATTAA 0.00231 ATTAC 0.00101 ATTAG 0.00105 ATTAT 0.00204 ATTCA 0.00171 ATTCC 0.000778 ATTCG 0.000203 ATTCT 0.00137 ATTGA 0.00128 ATTGC 0.000755 ATTGG 0.000793 ATTGT 0.00149 ATTTA 0.00286 ATTTC 0.00196 ATTTG 0.00192 ATTTT 0.00419 CAAAA 0.00294 CAAAC 0.00179 CAAAG 0.00158 CAAAT 0.00192 CAACA 0.00185 CAACC 0.000785 CAACG 0.000345 CAACT 0.00107 CAAGA 0.00103 CAAGC 0.000672 CAAGG 0.000646 CAAGT 0.000906 CAATA 0.00128 CAATC 0.000827 CAATG 0.000997 CAATT 0.00121 CACAA 0.00162 CACAC 0.00188 CACAG 0.00148 CACAT 0.00142 CACCA 0.00112 CACCC 0.000523 CACCG 0.000366 CACCT 0.000902 CACGA 0.000264 CACGC 0.000297 CACGG 0.000277 CACGT 0.000362 CACTA 0.000669 CACTC 0.00072 CACTG 0.0013 CACTT 0.00122 CAGAA 0.00236 CAGAC 0.00122 CAGAG 0.00168 CAGAT 0.00154 CAGCA 0.00189 CAGCC 0.000943 CAGCG 0.000556 CAGCT 0.00168 CAGGA 0.00145 CAGGC 0.000779 CAGGG 0.000782 CAGGT 0.00112 CAGTA 0.00102 CAGTC 0.00104 CAGTG 0.0013 CAGTT 0.0017 CATAA 0.0014 CATAC 0.000601 CATAG 0.000556 CATAT 0.00111 CATCA 0.00159 CATCC 0.000902 CATCG 0.000305 CATCT 0.00129 CATGA 0.00123 CATGC 0.000812 CATGG 0.000801 CATGT 0.00145 CATTA 0.0014 CATTC 0.00101 CATTG 0.000997 CATTT 0.00282 CCAAA 0.00162 CCAAC 0.000855 CCAAG 0.000652 CCAAT 0.000793 CCACA 0.00121 CCACC 0.000753 CCACG 0.000271 CCACT 0.000872 CCAGA 0.00138 CCAGC 0.000954 CCAGG 0.000889 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000654 CCATC 0.000914 CCATG 0.000801 CCATT 0.00104 CCCAA 0.000747 CCCAC 0.000668 CCCAG 0.000815 CCCAT 0.000585 CCCCA 0.00065 CCCCC 0.000665 CCCCG 0.000259 CCCCT 0.000606 CCCGA 0.000224 CCCGC 0.000252 CCCGG 0.0003 CCCGT 0.000243 CCCTA 0.000336 CCCTC 0.000695 CCCTG 0.000782 CCCTT 0.000625 CCGAA 0.00027 CCGAC 0.000296 CCGAG 0.000282 CCGAT 0.000266 CCGCA 0.000294 CCGCC 0.000366 CCGCG 0.000145 CCGCT 0.000393 CCGGA 0.000341 CCGGC 0.000302 CCGGG 0.0003 CCGGT 0.000366 CCGTA 0.000202 CCGTC 0.000393 CCGTG 0.000277 CCGTT 0.000401 CCTAA 0.000661 CCTAC 0.0004 CCTAG 0.000264 CCTAT 0.00039 CCTCA 0.000975 CCTCC 0.0011 CCTCG 0.000283 CCTCT 0.00114 CCTGA 0.00113 CCTGC 0.00101 CCTGG 0.000889 CCTGT 0.00111 CCTTA 0.000615 CCTTC 0.000905 CCTTG 0.000646 CCTTT 0.00136 CGAAA 0.000321 CGAAC 0.000253 CGAAG 0.000258 CGAAT 0.000203 CGACA 0.00035 CGACC 0.000239 CGACG 0.000188 CGACT 0.000305 CGAGA 0.000263 CGAGC 0.00024 CGAGG 0.000283 CGAGT 0.00026 CGATA 0.000221 CGATC 0.000229 CGATG 0.000305 CGATT 0.000309 CGCAA 0.000255 CGCAC 0.000248 CGCAG 0.000436 CGCAT 0.000264 CGCCA 0.000329 CGCCC 0.000254 CGCCG 0.000261 CGCCT 0.000341 CGCGA 8.99e-05 CGCGC 0.000158 CGCGG 0.000145 CGCGT 0.000123 CGCTA 0.00022 CGCTC 0.000374 CGCTG 0.000556 CGCTT 0.000334 CGGAA 0.000297 CGGAC 0.0003 CGGAG 0.000384 CGGAT 0.000286 CGGCA 0.000292 CGGCC 0.000309 CGGCG 0.000261 CGGCT 0.000416 CGGGA 0.000267 CGGGC 0.000208 CGGGG 0.000259 CGGGT 0.000286 CGGTA 0.00022 CGGTC 0.000304 CGGTG 0.000366 CGGTT 0.000438 CGTAA 0.00029 CGTAC 0.00019 CGTAG 0.000188 CGTAT 0.000215 CGTCA 0.000432 CGTCC 0.000332 CGTCG 0.000188 CGTCT 0.000497 CGTGA 0.000315 CGTGC 0.000205 CGTGG 0.000271 CGTGT 0.000409 CGTTA 0.000352 CGTTC 0.00036 CGTTG 0.000345 CGTTT 0.000771 CTAAA 0.00169 CTAAC 0.000752 CTAAG 0.000574 CTAAT 0.00105 CTACA 0.000953 CTACC 0.000395 CTACG 0.000188 CTACT 0.000673 CTAGA 0.000564 CTAGC 0.000418 CTAGG 0.000264 CTAGT 0.000491 CTATA 0.000629 CTATC 0.000452 CTATG 0.000556 CTATT 0.000939 CTCAA 0.00106 CTCAC 0.000844 CTCAG 0.00127 CTCAT 0.00106 CTCCA 0.00136 CTCCC 0.000703 CTCCG 0.000384 CTCCT 0.00126 CTCGA 0.000212 CTCGC 0.000238 CTCGG 0.000282 CTCGT 0.000314 CTCTA 0.000731 CTCTC 0.00114 CTCTG 0.00168 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00204 CTGAC 0.0012 CTGAG 0.00127 CTGAT 0.00152 CTGCA 0.00185 CTGCC 0.000871 CTGCG 0.000436 CTGCT 0.0019 CTGGA 0.00149 CTGGC 0.000703 CTGGG 0.000815 CTGGT 0.00123 CTGTA 0.00118 CTGTC 0.00118 CTGTG 0.00148 CTGTT 0.00192 CTTAA 0.00115 CTTAC 0.000595 CTTAG 0.000574 CTTAT 0.000902 CTTCA 0.00159 CTTCC 0.00107 CTTCG 0.000258 CTTCT 0.00143 CTTGA 0.000916 CTTGC 0.000586 CTTGG 0.000652 CTTGT 0.0011 CTTTA 0.00177 CTTTC 0.00135 CTTTG 0.00158 CTTTT 0.00261 GAAAA 0.00303 GAAAC 0.00159 GAAAG 0.00135 GAAAT 0.00196 GAACA 0.00138 GAACC 0.000897 GAACG 0.00036 GAACT 0.000998 GAAGA 0.00142 GAAGC 0.000952 GAAGG 0.000905 GAAGT 0.00107 GAATA 0.00111 GAATC 0.000796 GAATG 0.00101 GAATT 0.00115 GACAA 0.00116 GACAC 0.000794 GACAG 0.00118 GACAT 0.00107 GACCA 0.000777 GACCC 0.000524 GACCG 0.000304 GACCT 0.000712 GACGA 0.000347 GACGC 0.000309 GACGG 0.000393 GACGT 0.0004 GACTA 0.000517 GACTC 0.000673 GACTG 0.00104 GACTT 0.000982 GAGAA 0.00146 GAGAC 0.000803 GAGAG 0.00114 GAGAT 0.000894 GAGCA 0.000984 GAGCC 0.00063 GAGCG 0.000374 GAGCT 0.000972 GAGGA 0.00133 GAGGC 0.000693 GAGGG 0.000695 GAGGT 0.000778 GAGTA 0.000543 GAGTC 0.000673 GAGTG 0.00072 GAGTT 0.00105 GATAA 0.00106 GATAC 0.000431 GATAG 0.000452 GATAT 0.000828 GATCA 0.000981 GATCC 0.000582 GATCG 0.000229 GATCT 0.000828 GATGA 0.00125 GATGC 0.000746 GATGG 0.000914 GATGT 0.00118 GATTA 0.00107 GATTC 0.000796 GATTG 0.000827 GATTT 0.00186 GCAAA 0.00149 GCAAC 0.000849 GCAAG 0.000586 GCAAT 0.000755 GCACA 0.00098 GCACC 0.000492 GCACG 0.000205 GCACT 0.000638 GCAGA 0.0015 GCAGC 0.00152 GCAGG 0.00101 GCAGT 0.00103 GCATA 0.00064 GCATC 0.000746 GCATG 0.000812 GCATT 0.00108 GCCAA 0.000717 GCCAC 0.000628 GCCAG 0.000703 GCCAT 0.000705 GCCCA 0.0005 GCCCC 0.000426 GCCCG 0.000208 GCCCT 0.000462 GCCGA 0.000279 GCCGC 0.000374 GCCGG 0.000302 GCCGT 0.000324 GCCTA 0.000312 GCCTC 0.000693 GCCTG 0.000779 GCCTT 0.000695 GCGAA 0.000218 GCGAC 0.000242 GCGAG 0.000238 GCGAT 0.000223 GCGCA 0.000296 GCGCC 0.000292 GCGCG 0.000158 GCGCT 0.00037 GCGGA 0.000286 GCGGC 0.000374 GCGGG 0.000252 GCGGT 0.000286 GCGTA 0.000164 GCGTC 0.000309 GCGTG 0.000297 GCGTT 0.000382 GCTAA 0.00104 GCTAC 0.000519 GCTAG 0.000418 GCTAT 0.000502 GCTCA 0.000911 GCTCC 0.000804 GCTCG 0.00024 GCTCT 0.001 GCTGA 0.00133 GCTGC 0.00152 GCTGG 0.000954 GCTGT 0.00127 GCTTA 0.000629 GCTTC 0.000952 GCTTG 0.000672 GCTTT 0.00147 GGAAA 0.00177 GGAAC 0.000756 GGAAG 0.00107 GGAAT 0.000778 GGACA 0.000887 GGACC 0.000549 GGACG 0.000332 GGACT 0.000666 GGAGA 0.0011 GGAGC 0.000804 GGAGG 0.0011 GGAGT 0.000696 GGATA 0.000499 GGATC 0.000582 GGATG 0.000902 GGATT 0.000913 GGCAA 0.000654 GGCAC 0.000408 GGCAG 0.000871 GGCAT 0.000519 GGCCA 0.000561 GGCCC 0.000417 GGCCG 0.000309 GGCCT 0.000519 GGCGA 0.000241 GGCGC 0.000292 GGCGG 0.000366 GGCGT 0.000285 GGCTA 0.00041 GGCTC 0.00063 GGCTG 0.000943 GGCTT 0.00068 GGGAA 0.000885 GGGAC 0.000453 GGGAG 0.000703 GGGAT 0.000538 GGGCA 0.000445 GGGCC 0.000417 GGGCG 0.000254 GGGCT 0.000479 GGGGA 0.000612 GGGGC 0.000426 GGGGG 0.000665 GGGGT 0.000477 GGGTA 0.000315 GGGTC 0.000524 GGGTG 0.000523 GGGTT 0.000737 GGTAA 0.000718 GGTAC 0.000331 GGTAG 0.000395 GGTAT 0.000416 GGTCA 0.000864 GGTCC 0.000549 GGTCG 0.000239 GGTCT 0.000665 GGTGA 0.000842 GGTGC 0.000492 GGTGG 0.000753 GGTGT 0.000826 GGTTA 0.000666 GGTTC 0.000897 GGTTG 0.000785 GGTTT 0.00148 GTAAA 0.00172 GTAAC 0.000706 GTAAG 0.000595 GTAAT 0.00101 GTACA 0.000745 GTACC 0.000331 GTACG 0.00019 GTACT 0.000525 GTAGA 0.00071 GTAGC 0.000519 GTAGG 0.0004 GTAGT 0.00058 GTATA 0.000604 GTATC 0.000431 GTATG 0.000601 GTATT 0.00109 GTCAA 0.000992 GTCAC 0.000837 GTCAG 0.0012 GTCAT 0.00103 GTCCA 0.00091 GTCCC 0.000453 GTCCG 0.0003 GTCCT 0.000771 GTCGA 0.000243 GTCGC 0.000242 GTCGG 0.000296 GTCGT 0.000301 GTCTA 0.000529 GTCTC 0.000803 GTCTG 0.00122 GTCTT 0.00105 GTGAA 0.0014 GTGAC 0.000837 GTGAG 0.000844 GTGAT 0.000959 GTGCA 0.000868 GTGCC 0.000408 GTGCG 0.000248 GTGCT 0.000791 GTGGA 0.00101 GTGGC 0.000628 GTGGG 0.000668 GTGGT 0.000806 GTGTA 0.000773 GTGTC 0.000794 GTGTG 0.00188 GTGTT 0.00151 GTTAA 0.00124 GTTAC 0.000706 GTTAG 0.000752 GTTAT 0.00102 GTTCA 0.00129 GTTCC 0.000756 GTTCG 0.000253 GTTCT 0.00134 GTTGA 0.00104 GTTGC 0.000849 GTTGG 0.000855 GTTGT 0.0013 GTTTA 0.00169 GTTTC 0.00159 GTTTG 0.00179 GTTTT 0.00321 TAAAA 0.00404 TAAAC 0.00169 TAAAG 0.00177 TAAAT 0.00286 TAACA 0.00149 TAACC 0.000666 TAACG 0.000352 TAACT 0.00121 TAAGA 0.00104 TAAGC 0.000629 TAAGG 0.000615 TAAGT 0.000944 TAATA 0.00179 TAATC 0.00107 TAATG 0.0014 TAATT 0.00215 TACAA 0.00137 TACAC 0.000773 TACAG 0.00118 TACAT 0.00134 TACCA 0.000699 TACCC 0.000315 TACCG 0.00022 TACCT 0.000626 TACGA 0.000191 TACGC 0.000164 TACGG 0.000202 TACGT 0.000325 TACTA 0.00061 TACTC 0.000543 TACTG 0.00102 TACTT 0.00117 TAGAA 0.00122 TAGAC 0.000529 TAGAG 0.000731 TAGAT 0.000932 TAGCA 0.00095 TAGCC 0.00041 TAGCG 0.00022 TAGCT 0.000896 TAGGA 0.000575 TAGGC 0.000312 TAGGG 0.000336 TAGGT 0.000492 TAGTA 0.00061 TAGTC 0.000517 TAGTG 0.000669 TAGTT 0.00119 TATAA 0.00152 TATAC 0.000604 TATAG 0.000629 TATAT 0.00207 TATCA 0.00102 TATCC 0.000499 TATCG 0.000221 TATCT 0.00102 TATGA 0.00109 TATGC 0.00064 TATGG 0.000654 TATGT 0.00129 TATTA 0.00179 TATTC 0.00111 TATTG 0.00128 TATTT 0.00359 TCAAA 0.00223 TCAAC 0.00104 TCAAG 0.000916 TCAAT 0.00128 TCACA 0.00163 TCACC 0.000842 TCACG 0.000315 TCACT 0.00125 TCAGA 0.00193 TCAGC 0.00133 TCAGG 0.00113 TCAGT 0.00164 TCATA 0.00109 TCATC 0.00125 TCATG 0.00123 TCATT 0.0019 TCCAA 0.00123 TCCAC 0.00101 TCCAG 0.00149 TCCAT 0.00127 TCCCA 0.000882 TCCCC 0.000612 TCCCG 0.000267 TCCCT 0.000816 TCCGA 0.000267 TCCGC 0.000286 TCCGG 0.000341 TCCGT 0.000373 TCCTA 0.000575 TCCTC 0.00133 TCCTG 0.00145 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.000229 TCGAC 0.000243 TCGAG 0.000212 TCGAT 0.000274 TCGCA 0.00024 TCGCC 0.000241 TCGCG 8.99e-05 TCGCT 0.00035 TCGGA 0.000267 TCGGC 0.000279 TCGGG 0.000224 TCGGT 0.000344 TCGTA 0.000191 TCGTC 0.000347 TCGTG 0.000264 TCGTT 0.000432 TCTAA 0.00119 TCTAC 0.00071 TCTAG 0.000564 TCTAT 0.000949 TCTCA 0.00127 TCTCC 0.0011 TCTCG 0.000263 TCTCT 0.00165 TCTGA 0.00193 TCTGC 0.0015 TCTGG 0.00138 TCTGT 0.00199 TCTTA 0.00104 TCTTC 0.00142 TCTTG 0.00103 TCTTT 0.0023 TGAAA 0.00271 TGAAC 0.00129 TGAAG 0.00159 TGAAT 0.00171 TGACA 0.00152 TGACC 0.000864 TGACG 0.000432 TGACT 0.00125 TGAGA 0.00127 TGAGC 0.000911 TGAGG 0.000975 TGAGT 0.00107 TGATA 0.00102 TGATC 0.000981 TGATG 0.00159 TGATT 0.00182 TGCAA 0.00137 TGCAC 0.000868 TGCAG 0.00185 TGCAT 0.00134 TGCCA 0.000891 TGCCC 0.000445 TGCCG 0.000292 TGCCT 0.000823 TGCGA 0.00024 TGCGC 0.000296 TGCGG 0.000294 TGCGT 0.000373 TGCTA 0.00095 TGCTC 0.000984 TGCTG 0.00189 TGCTT 0.00142 TGGAA 0.00151 TGGAC 0.00091 TGGAG 0.00136 TGGAT 0.00122 TGGCA 0.000891 TGGCC 0.000561 TGGCG 0.000329 TGGCT 0.000971 TGGGA 0.000882 TGGGC 0.0005 TGGGG 0.00065 TGGGT 0.000782 TGGTA 0.000699 TGGTC 0.000777 TGGTG 0.00112 TGGTT 0.00151 TGTAA 0.00168 TGTAC 0.000745 TGTAG 0.000953 TGTAT 0.00128 TGTCA 0.00152 TGTCC 0.000887 TGTCG 0.00035 TGTCT 0.00145 TGTGA 0.00163 TGTGC 0.00098 TGTGG 0.00121 TGTGT 0.00258 TGTTA 0.00149 TGTTC 0.00138 TGTTG 0.00185 TGTTT 0.00362 TTAAA 0.00356 TTAAC 0.00124 TTAAG 0.00115 TTAAT 0.00231 TTACA 0.00168 TTACC 0.000718 TTACG 0.00029 TTACT 0.00133 TTAGA 0.00119 TTAGC 0.00104 TTAGG 0.000661 TTAGT 0.00118 TTATA 0.00152 TTATC 0.00106 TTATG 0.0014 TTATT 0.00336 TTCAA 0.00185 TTCAC 0.0014 TTCAG 0.00204 TTCAT 0.00202 TTCCA 0.00151 TTCCC 0.000885 TTCCG 0.000297 TTCCT 0.00168 TTCGA 0.000229 TTCGC 0.000218 TTCGG 0.00027 TTCGT 0.000319 TTCTA 0.00122 TTCTC 0.00146 TTCTG 0.00236 TTCTT 0.00223 TTGAA 0.00185 TTGAC 0.000992 TTGAG 0.00106 TTGAT 0.00157 TTGCA 0.00137 TTGCC 0.000654 TTGCG 0.000255 TTGCT 0.0014 TTGGA 0.00123 TTGGC 0.000717 TTGGG 0.000747 TTGGT 0.00122 TTGTA 0.00137 TTGTC 0.00116 TTGTG 0.00162 TTGTT 0.00263 TTTAA 0.00356 TTTAC 0.00172 TTTAG 0.00169 TTTAT 0.00338 TTTCA 0.00271 TTTCC 0.00177 TTTCG 0.000321 TTTCT 0.00313 TTTGA 0.00223 TTTGC 0.00149 TTTGG 0.00162 TTTGT 0.00289 TTTTA 0.00404 TTTTC 0.00303 TTTTG 0.00294 TTTTT 0.00651 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3943 AAAAC 0.1941 AAAAG 0.158 AAAAT 0.2535 AAACA 0.4376 AAACC 0.1795 AAACG 0.09333 AAACT 0.2896 AAAGA 0.3145 AAAGC 0.2013 AAAGG 0.186 AAAGT 0.2982 AAATA 0.3285 AAATC 0.1706 AAATG 0.2576 AAATT 0.2434 AACAA 0.3151 AACAC 0.1806 AACAG 0.2299 AACAT 0.2744 AACCA 0.393 AACCC 0.1922 AACCG 0.1144 AACCT 0.3004 AACGA 0.2365 AACGC 0.2089 AACGG 0.2196 AACGT 0.335 AACTA 0.2099 AACTC 0.1855 AACTG 0.2997 AACTT 0.3049 AAGAA 0.3849 AAGAC 0.1822 AAGAG 0.2094 AAGAT 0.2235 AAGCA 0.3805 AAGCC 0.1826 AAGCG 0.08964 AAGCT 0.3473 AAGGA 0.3425 AAGGC 0.1972 AAGGG 0.1772 AAGGT 0.2831 AAGTA 0.2294 AAGTC 0.1926 AAGTG 0.2391 AAGTT 0.3389 AATAA 0.4325 AATAC 0.1404 AATAG 0.1207 AATAT 0.3064 AATCA 0.3986 AATCC 0.2003 AATCG 0.06776 AATCT 0.3334 AATGA 0.3054 AATGC 0.1734 AATGG 0.1668 AATGT 0.3544 AATTA 0.2998 AATTC 0.1598 AATTG 0.1693 AATTT 0.3711 ACAAA 0.4262 ACAAC 0.1923 ACAAG 0.1615 ACAAT 0.22 ACACA 0.5204 ACACC 0.1666 ACACG 0.08251 ACACT 0.2304 ACAGA 0.3463 ACAGC 0.2203 ACAGG 0.1921 ACAGT 0.2413 ACATA 0.2103 ACATC 0.1921 ACATG 0.2371 ACATT 0.3606 ACCAA 0.2974 ACCAC 0.1966 ACCAG 0.2987 ACCAT 0.2074 ACCCA 0.3728 ACCCC 0.2271 ACCCG 0.1361 ACCCT 0.264 ACCGA 0.2588 ACCGC 0.2151 ACCGG 0.2751 ACCGT 0.2511 ACCTA 0.1451 ACCTC 0.2295 ACCTG 0.3309 ACCTT 0.2944 ACGAA 0.2583 ACGAC 0.2441 ACGAG 0.2541 ACGAT 0.2434 ACGCA 0.3232 ACGCC 0.2476 ACGCG 0.1069 ACGCT 0.3223 ACGGA 0.2929 ACGGC 0.2544 ACGGG 0.1907 ACGGT 0.262 ACGTA 0.1913 ACGTC 0.2355 ACGTG 0.2129 ACGTT 0.3602 ACTAA 0.3953 ACTAC 0.1942 ACTAG 0.1645 ACTAT 0.246 ACTCA 0.3578 ACTCC 0.2329 ACTCG 0.08704 ACTCT 0.3223 ACTGA 0.3234 ACTGC 0.203 ACTGG 0.1994 ACTGT 0.2743 ACTTA 0.1853 ACTTC 0.2092 ACTTG 0.1778 ACTTT 0.4277 AGAAA 0.4304 AGAAC 0.1843 AGAAG 0.1965 AGAAT 0.1888 AGACA 0.4017 AGACC 0.1846 AGACG 0.1378 AGACT 0.2759 AGAGA 0.3476 AGAGC 0.211 AGAGG 0.2392 AGAGT 0.2022 AGATA 0.2195 AGATC 0.1777 AGATG 0.2767 AGATT 0.326 AGCAA 0.267 AGCAC 0.151 AGCAG 0.3624 AGCAT 0.2197 AGCCA 0.3648 AGCCC 0.1799 AGCCG 0.1562 AGCCT 0.2992 AGCGA 0.2355 AGCGC 0.2494 AGCGG 0.2648 AGCGT 0.2503 AGCTA 0.185 AGCTC 0.2008 AGCTG 0.3471 AGCTT 0.2671 AGGAA 0.3679 AGGAC 0.1689 AGGAG 0.276 AGGAT 0.1872 AGGCA 0.3319 AGGCC 0.2092 AGGCG 0.1375 AGGCT 0.3214 AGGGA 0.3347 AGGGC 0.1894 AGGGG 0.2486 AGGGT 0.2273 AGGTA 0.1845 AGGTC 0.21 AGGTG 0.266 AGGTT 0.3395 AGTAA 0.3986 AGTAC 0.1569 AGTAG 0.2011 AGTAT 0.2434 AGTCA 0.3878 AGTCC 0.2074 AGTCG 0.09496 AGTCT 0.3098 AGTGA 0.3212 AGTGC 0.1633 AGTGG 0.2232 AGTGT 0.2923 AGTTA 0.2129 AGTTC 0.1761 AGTTG 0.1886 AGTTT 0.4224 ATAAA 0.4608 ATAAC 0.1386 ATAAG 0.1229 ATAAT 0.2776 ATACA 0.4702 ATACC 0.1524 ATACG 0.07883 ATACT 0.2985 ATAGA 0.3684 ATAGC 0.1951 ATAGG 0.1514 ATAGT 0.2851 ATATA 0.3233 ATATC 0.1295 ATATG 0.1744 ATATT 0.3727 ATCAA 0.2897 ATCAC 0.1773 ATCAG 0.2816 ATCAT 0.2514 ATCCA 0.4207 ATCCC 0.1856 ATCCG 0.09885 ATCCT 0.2949 ATCGA 0.2579 ATCGC 0.2094 ATCGG 0.2503 ATCGT 0.2824 ATCTA 0.2 ATCTC 0.1919 ATCTG 0.3309 ATCTT 0.2773 ATGAA 0.3694 ATGAC 0.1887 ATGAG 0.1932 ATGAT 0.2487 ATGCA 0.4101 ATGCC 0.1584 ATGCG 0.08057 ATGCT 0.351 ATGGA 0.3721 ATGGC 0.2067 ATGGG 0.1716 ATGGT 0.2496 ATGTA 0.2184 ATGTC 0.1755 ATGTG 0.2319 ATGTT 0.3742 ATTAA 0.3611 ATTAC 0.1573 ATTAG 0.1639 ATTAT 0.3178 ATTCA 0.421 ATTCC 0.1915 ATTCG 0.05001 ATTCT 0.3375 ATTGA 0.2963 ATTGC 0.1747 ATTGG 0.1836 ATTGT 0.3454 ATTTA 0.2612 ATTTC 0.1797 ATTTG 0.176 ATTTT 0.3831 CAAAA 0.3568 CAAAC 0.2175 CAAAG 0.1918 CAAAT 0.2338 CAACA 0.457 CAACC 0.1939 CAACG 0.08516 CAACT 0.2639 CAAGA 0.3155 CAAGC 0.2068 CAAGG 0.1989 CAAGT 0.2788 CAATA 0.297 CAATC 0.1913 CAATG 0.2308 CAATT 0.2809 CACAA 0.2537 CACAC 0.2938 CACAG 0.2308 CACAT 0.2216 CACCA 0.3848 CACCC 0.1796 CACCG 0.1257 CACCT 0.3098 CACGA 0.2197 CACGC 0.2479 CACGG 0.2307 CACGT 0.3017 CACTA 0.1712 CACTC 0.1844 CACTG 0.3325 CACTT 0.3119 CAGAA 0.3468 CAGAC 0.1791 CAGAG 0.2474 CAGAT 0.2267 CAGCA 0.3723 CAGCC 0.1862 CAGCG 0.1098 CAGCT 0.3318 CAGGA 0.3508 CAGGC 0.1885 CAGGG 0.1892 CAGGT 0.2715 CAGTA 0.2025 CAGTC 0.2053 CAGTG 0.2567 CAGTT 0.3355 CATAA 0.3815 CATAC 0.1637 CATAG 0.1514 CATAT 0.3034 CATCA 0.3893 CATCC 0.2206 CATCG 0.0745 CATCT 0.3155 CATGA 0.2858 CATGC 0.1893 CATGG 0.1868 CATGT 0.3381 CATTA 0.2247 CATTC 0.1627 CATTG 0.1602 CATTT 0.4524 CCAAA 0.4128 CCAAC 0.2183 CCAAG 0.1664 CCAAT 0.2025 CCACA 0.3905 CCACC 0.2421 CCACG 0.08711 CCACT 0.2803 CCAGA 0.3261 CCAGC 0.2254 CCAGG 0.2101 CCAGT 0.2385 CCATA 0.192 CCATC 0.2682 CCATG 0.2351 CCATT 0.3046 CCCAA 0.2653 CCCAC 0.2374 CCCAG 0.2895 CCCAT 0.2078 CCCCA 0.2981 CCCCC 0.305 CCCCG 0.1189 CCCCT 0.2781 CCCGA 0.2198 CCCGC 0.2477 CCCGG 0.2942 CCCGT 0.2384 CCCTA 0.1377 CCCTC 0.2852 CCCTG 0.3208 CCCTT 0.2564 CCGAA 0.242 CCGAC 0.2656 CCGAG 0.2534 CCGAT 0.239 CCGCA 0.2455 CCGCC 0.3056 CCGCG 0.1207 CCGCT 0.3282 CCGGA 0.2603 CCGGC 0.2311 CCGGG 0.2291 CCGGT 0.2794 CCGTA 0.1588 CCGTC 0.3089 CCGTG 0.2173 CCGTT 0.3151 CCTAA 0.3856 CCTAC 0.233 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.2273 CCTCA 0.2787 CCTCC 0.315 CCTCG 0.08077 CCTCT 0.3255 CCTGA 0.2722 CCTGC 0.2455 CCTGG 0.215 CCTGT 0.2673 CCTTA 0.1743 CCTTC 0.2566 CCTTG 0.1833 CCTTT 0.3858 CGAAA 0.3105 CGAAC 0.2444 CGAAG 0.2489 CGAAT 0.1962 CGACA 0.3236 CGACC 0.2208 CGACG 0.1738 CGACT 0.2819 CGAGA 0.2515 CGAGC 0.2299 CGAGG 0.2701 CGAGT 0.2485 CGATA 0.208 CGATC 0.2154 CGATG 0.2863 CGATT 0.2903 CGCAA 0.2118 CGCAC 0.2059 CGCAG 0.3627 CGCAT 0.2196 CGCCA 0.2778 CGCCC 0.2143 CGCCG 0.2205 CGCCT 0.2874 CGCGA 0.1743 CGCGC 0.3068 CGCGG 0.2802 CGCGT 0.2388 CGCTA 0.1484 CGCTC 0.252 CGCTG 0.3747 CGCTT 0.2249 CGGAA 0.2341 CGGAC 0.2365 CGGAG 0.3034 CGGAT 0.226 CGGCA 0.2281 CGGCC 0.242 CGGCG 0.2046 CGGCT 0.3253 CGGGA 0.2617 CGGGC 0.2038 CGGGG 0.2543 CGGGT 0.2803 CGGTA 0.1656 CGGTC 0.2288 CGGTG 0.2756 CGGTT 0.33 CGTAA 0.3286 CGTAC 0.2149 CGTAG 0.2128 CGTAT 0.2436 CGTCA 0.2983 CGTCC 0.2293 CGTCG 0.1297 CGTCT 0.3427 CGTGA 0.2624 CGTGC 0.171 CGTGG 0.2259 CGTGT 0.3407 CGTTA 0.1924 CGTTC 0.1968 CGTTG 0.1887 CGTTT 0.4221 CTAAA 0.4156 CTAAC 0.185 CTAAG 0.1411 CTAAT 0.2583 CTACA 0.4313 CTACC 0.179 CTACG 0.08503 CTACT 0.3047 CTAGA 0.3248 CTAGC 0.2405 CTAGG 0.1521 CTAGT 0.2827 CTATA 0.2441 CTATC 0.1754 CTATG 0.216 CTATT 0.3645 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.1997 CTCAG 0.2999 CTCAT 0.2502 CTCCA 0.3663 CTCCC 0.1897 CTCCG 0.1038 CTCCT 0.3402 CTCGA 0.203 CTCGC 0.2276 CTCGG 0.2697 CTCGT 0.2997 CTCTA 0.1535 CTCTC 0.2387 CTCTG 0.3535 CTCTT 0.2543 CTGAA 0.338 CTGAC 0.1986 CTGAG 0.2104 CTGAT 0.2531 CTGCA 0.3665 CTGCC 0.1722 CTGCG 0.08622 CTGCT 0.3751 CTGGA 0.3516 CTGGC 0.1662 CTGGG 0.1926 CTGGT 0.2896 CTGTA 0.2053 CTGTC 0.2044 CTGTG 0.2568 CTGTT 0.3335 CTTAA 0.3577 CTTAC 0.1846 CTTAG 0.178 CTTAT 0.2797 CTTCA 0.3654 CTTCC 0.2465 CTTCG 0.05935 CTTCT 0.3287 CTTGA 0.2818 CTTGC 0.1805 CTTGG 0.2007 CTTGT 0.3371 CTTTA 0.2419 CTTTC 0.1852 CTTTG 0.2159 CTTTT 0.357 GAAAA 0.3819 GAAAC 0.2 GAAAG 0.1706 GAAAT 0.2476 GAACA 0.3802 GAACC 0.2467 GAACG 0.09886 GAACT 0.2742 GAAGA 0.3269 GAAGC 0.2192 GAAGG 0.2084 GAAGT 0.2456 GAATA 0.2727 GAATC 0.1959 GAATG 0.2493 GAATT 0.2822 GACAA 0.2759 GACAC 0.1889 GACAG 0.2798 GACAT 0.2555 GACCA 0.3352 GACCC 0.2261 GACCG 0.1313 GACCT 0.3074 GACGA 0.2395 GACGC 0.2129 GACGG 0.2714 GACGT 0.2762 GACTA 0.1612 GACTC 0.2095 GACTG 0.3236 GACTT 0.3057 GAGAA 0.3394 GAGAC 0.1873 GAGAG 0.2649 GAGAT 0.2085 GAGCA 0.3324 GAGCC 0.2129 GAGCG 0.1264 GAGCT 0.3283 GAGGA 0.3806 GAGGC 0.1982 GAGGG 0.1987 GAGGT 0.2225 GAGTA 0.1817 GAGTC 0.2253 GAGTG 0.2412 GAGTT 0.3518 GATAA 0.3815 GATAC 0.1559 GATAG 0.1633 GATAT 0.2993 GATCA 0.3744 GATCC 0.2222 GATCG 0.08741 GATCT 0.316 GATGA 0.3065 GATGC 0.1824 GATGG 0.2236 GATGT 0.2874 GATTA 0.2348 GATTC 0.1746 GATTG 0.1814 GATTT 0.4092 GCAAA 0.4049 GCAAC 0.2307 GCAAG 0.1593 GCAAT 0.205 GCACA 0.4234 GCACC 0.2124 GCACG 0.08863 GCACT 0.2756 GCAGA 0.2964 GCAGC 0.2999 GCAGG 0.2007 GCAGT 0.2031 GCATA 0.1953 GCATC 0.2276 GCATG 0.2477 GCATT 0.3293 GCCAA 0.2605 GCCAC 0.2281 GCCAG 0.2555 GCCAT 0.256 GCCCA 0.3133 GCCCC 0.2671 GCCCG 0.1302 GCCCT 0.2895 GCCGA 0.2179 GCCGC 0.2922 GCCGG 0.2365 GCCGT 0.2534 GCCTA 0.1257 GCCTC 0.2796 GCCTG 0.3142 GCCTT 0.2804 GCGAA 0.2368 GCGAC 0.2626 GCGAG 0.2587 GCGAT 0.2419 GCGCA 0.265 GCGCC 0.2618 GCGCG 0.1417 GCGCT 0.3315 GCGGA 0.2385 GCGGC 0.312 GCGGG 0.2108 GCGGT 0.2387 GCGTA 0.1427 GCGTC 0.2678 GCGTG 0.2581 GCGTT 0.3314 GCTAA 0.4189 GCTAC 0.2094 GCTAG 0.1687 GCTAT 0.2029 GCTCA 0.3078 GCTCC 0.2717 GCTCG 0.08123 GCTCT 0.3392 GCTGA 0.2622 GCTGC 0.2994 GCTGG 0.1883 GCTGT 0.2501 GCTTA 0.1689 GCTTC 0.2556 GCTTG 0.1805 GCTTT 0.3951 GGAAA 0.405 GGAAC 0.1728 GGAAG 0.2445 GGAAT 0.1777 GGACA 0.3645 GGACC 0.2254 GGACG 0.1365 GGACT 0.2736 GGAGA 0.2974 GGAGC 0.2172 GGAGG 0.2976 GGAGT 0.1878 GGATA 0.1724 GGATC 0.2011 GGATG 0.3114 GGATT 0.3151 GGCAA 0.2666 GGCAC 0.1666 GGCAG 0.3552 GGCAT 0.2117 GGCCA 0.3107 GGCCC 0.2308 GGCCG 0.1713 GGCCT 0.2872 GGCGA 0.2035 GGCGC 0.2468 GGCGG 0.3089 GGCGT 0.2409 GGCTA 0.154 GGCTC 0.2366 GGCTG 0.3541 GGCTT 0.2553 GGGAA 0.3432 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.2725 GGGAT 0.2085 GGGCA 0.2793 GGGCC 0.2612 GGGCG 0.1593 GGGCT 0.3002 GGGGA 0.2809 GGGGC 0.1955 GGGGG 0.305 GGGGT 0.2187 GGGTA 0.1501 GGGTC 0.2495 GGGTG 0.2493 GGGTT 0.3511 GGTAA 0.3859 GGTAC 0.1781 GGTAG 0.2125 GGTAT 0.2235 GGTCA 0.373 GGTCC 0.2368 GGTCG 0.1031 GGTCT 0.2871 GGTGA 0.2891 GGTGC 0.1688 GGTGG 0.2586 GGTGT 0.2835 GGTTA 0.1738 GGTTC 0.2342 GGTTG 0.2049 GGTTT 0.3871 GTAAA 0.4263 GTAAC 0.1754 GTAAG 0.1479 GTAAT 0.2505 GTACA 0.4158 GTACC 0.185 GTACG 0.1059 GTACT 0.2933 GTAGA 0.3217 GTAGC 0.2348 GTAGG 0.1809 GTAGT 0.2626 GTATA 0.2214 GTATC 0.1581 GTATG 0.2205 GTATT 0.4 GTCAA 0.2446 GTCAC 0.2062 GTCAG 0.2948 GTCAT 0.2545 GTCCA 0.374 GTCCC 0.1861 GTCCG 0.1231 GTCCT 0.3168 GTCGA 0.2248 GTCGC 0.2234 GTCGG 0.2734 GTCGT 0.2784 GTCTA 0.1468 GTCTC 0.2229 GTCTG 0.338 GTCTT 0.2922 GTGAA 0.3463 GTGAC 0.2072 GTGAG 0.209 GTGAT 0.2376 GTGCA 0.375 GTGCC 0.1764 GTGCG 0.107 GTGCT 0.3415 GTGGA 0.3242 GTGGC 0.2018 GTGGG 0.2147 GTGGT 0.2592 GTGTA 0.1561 GTGTC 0.1602 GTGTG 0.3795 GTGTT 0.3042 GTTAA 0.3342 GTTAC 0.1899 GTTAG 0.2024 GTTAT 0.2734 GTTCA 0.3546 GTTCC 0.2078 GTTCG 0.06955 GTTCT 0.368 GTTGA 0.2568 GTTGC 0.2098 GTTGG 0.2112 GTTGT 0.3222 GTTTA 0.2039 GTTTC 0.1919 GTTTG 0.2165 GTTTT 0.3878 TAAAA 0.3901 TAAAC 0.1629 TAAAG 0.1709 TAAAT 0.276 TAACA 0.4016 TAACC 0.1793 TAACG 0.09462 TAACT 0.3245 TAAGA 0.3215 TAAGC 0.195 TAAGG 0.1906 TAAGT 0.2929 TAATA 0.2795 TAATC 0.1669 TAATG 0.2182 TAATT 0.3353 TACAA 0.2941 TACAC 0.1659 TACAG 0.2533 TACAT 0.2867 TACCA 0.3757 TACCC 0.1694 TACCG 0.1183 TACCT 0.3366 TACGA 0.2164 TACGC 0.1862 TACGG 0.2291 TACGT 0.3683 TACTA 0.1823 TACTC 0.1621 TACTG 0.3062 TACTT 0.3494 TAGAA 0.3576 TAGAC 0.1551 TAGAG 0.2141 TAGAT 0.2732 TAGCA 0.3836 TAGCC 0.1656 TAGCG 0.089 TAGCT 0.3617 TAGGA 0.3355 TAGGC 0.1817 TAGGG 0.1957 TAGGT 0.2871 TAGTA 0.2043 TAGTC 0.1733 TAGTG 0.224 TAGTT 0.3983 TATAA 0.3149 TATAC 0.1254 TATAG 0.1306 TATAT 0.4291 TATCA 0.3695 TATCC 0.1805 TATCG 0.07999 TATCT 0.37 TATGA 0.2975 TATGC 0.1742 TATGG 0.1781 TATGT 0.3502 TATTA 0.2305 TATTC 0.1425 TATTG 0.1651 TATTT 0.462 TCAAA 0.4078 TCAAC 0.1903 TCAAG 0.1676 TCAAT 0.2343 TCACA 0.4027 TCACC 0.2085 TCACG 0.07798 TCACT 0.3108 TCAGA 0.3209 TCAGC 0.2205 TCAGG 0.1869 TCAGT 0.2717 TCATA 0.1997 TCATC 0.229 TCATG 0.224 TCATT 0.3473 TCCAA 0.247 TCCAC 0.2017 TCCAG 0.2976 TCCAT 0.2537 TCCCA 0.3424 TCCCC 0.2376 TCCCG 0.1035 TCCCT 0.3166 TCCGA 0.2108 TCCGC 0.2255 TCCGG 0.269 TCCGT 0.2946 TCCTA 0.126 TCCTC 0.2917 TCCTG 0.3177 TCCTT 0.2646 TCGAA 0.2384 TCGAC 0.2538 TCGAG 0.2216 TCGAT 0.2862 TCGCA 0.2606 TCGCC 0.2619 TCGCG 0.09771 TCGCT 0.3798 TCGGA 0.2398 TCGGC 0.2502 TCGGG 0.2011 TCGGT 0.3089 TCGTA 0.1549 TCGTC 0.2813 TCGTG 0.2136 TCGTT 0.3503 TCTAA 0.3482 TCTAC 0.2082 TCTAG 0.1654 TCTAT 0.2781 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2568 TCTCG 0.06133 TCTCT 0.3857 TCTGA 0.284 TCTGC 0.2204 TCTGG 0.2028 TCTGT 0.2928 TCTTA 0.1793 TCTTC 0.2455 TCTTG 0.1774 TCTTT 0.3978 TGAAA 0.3718 TGAAC 0.1767 TGAAG 0.2173 TGAAT 0.2342 TGACA 0.3738 TGACC 0.2129 TGACG 0.1065 TGACT 0.3068 TGAGA 0.3006 TGAGC 0.2157 TGAGG 0.2308 TGAGT 0.2529 TGATA 0.1888 TGATC 0.1814 TGATG 0.2941 TGATT 0.3357 TGCAA 0.2527 TGCAC 0.1595 TGCAG 0.3408 TGCAT 0.247 TGCCA 0.3636 TGCCC 0.1817 TGCCG 0.119 TGCCT 0.3357 TGCGA 0.1995 TGCGC 0.2461 TGCGG 0.2445 TGCGT 0.3099 TGCTA 0.1814 TGCTC 0.1879 TGCTG 0.3601 TGCTT 0.2706 TGGAA 0.3028 TGGAC 0.1821 TGGAG 0.2714 TGGAT 0.2438 TGGCA 0.3238 TGGCC 0.2038 TGGCG 0.1196 TGGCT 0.3528 TGGGA 0.3136 TGGGC 0.1776 TGGGG 0.2309 TGGGT 0.278 TGGTA 0.1703 TGGTC 0.1893 TGGTG 0.2732 TGGTT 0.3672 TGTAA 0.3608 TGTAC 0.1597 TGTAG 0.2044 TGTAT 0.2752 TGTCA 0.361 TGTCC 0.2111 TGTCG 0.08328 TGTCT 0.3445 TGTGA 0.2541 TGTGC 0.1531 TGTGG 0.1898 TGTGT 0.4029 TGTTA 0.1789 TGTTC 0.1658 TGTTG 0.2218 TGTTT 0.4335 TTAAA 0.4304 TTAAC 0.1503 TTAAG 0.1395 TTAAT 0.2799 TTACA 0.418 TTACC 0.1784 TTACG 0.07208 TTACT 0.3315 TTAGA 0.2922 TTAGC 0.2551 TTAGG 0.1626 TTAGT 0.2902 TTATA 0.2067 TTATC 0.1439 TTATG 0.1911 TTATT 0.4584 TTCAA 0.2529 TTCAC 0.1915 TTCAG 0.2787 TTCAT 0.2768 TTCCA 0.346 TTCCC 0.2023 TTCCG 0.0678 TTCCT 0.3839 TTCGA 0.2209 TTCGC 0.2107 TTCGG 0.2605 TTCGT 0.308 TTCTA 0.1681 TTCTC 0.2005 TTCTG 0.3249 TTCTT 0.3065 TTGAA 0.338 TTGAC 0.1816 TTGAG 0.1935 TTGAT 0.2869 TTGCA 0.3735 TTGCC 0.1775 TTGCG 0.06917 TTGCT 0.3798 TTGGA 0.3151 TTGGC 0.183 TTGGG 0.1906 TTGGT 0.3114 TTGTA 0.2021 TTGTC 0.1709 TTGTG 0.2394 TTGTT 0.3876 TTTAA 0.344 TTTAC 0.1658 TTTAG 0.1634 TTTAT 0.3268 TTTCA 0.3422 TTTCC 0.2234 TTTCG 0.04052 TTTCT 0.3939 TTTGA 0.2708 TTTGC 0.1812 TTTGG 0.1966 TTTGT 0.3514 TTTTA 0.2444 TTTTC 0.1834 TTTTG 0.1778 TTTTT 0.3944 [2] # (a,c,g,t)= (0.203, 0.297, 0.297, 0.203) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.301 C 0.199 G 0.199 T 0.301 # l= 1 # Values AA 0.105 AC 0.0561 AG 0.0639 AT 0.0762 CA 0.0735 CC 0.0419 CG 0.0196 CT 0.0639 GA 0.0594 GC 0.0414 GG 0.0419 GT 0.0561 TA 0.0632 TC 0.0594 TG 0.0736 TT 0.105 # l= 2 # Values AAA 0.0421 AAC 0.0197 AAG 0.0179 AAT 0.0253 ACA 0.0234 ACC 0.0113 ACG 0.00543 ACT 0.016 AGA 0.0204 AGC 0.0144 AGG 0.0131 AGT 0.016 ATA 0.0187 ATC 0.0141 ATG 0.0181 ATT 0.0253 CAA 0.0195 CAC 0.0144 CAG 0.0216 CAT 0.0181 CCA 0.0149 CCC 0.00861 CCG 0.0053 CCT 0.0131 CGA 0.0043 CGC 0.00452 CGG 0.0053 CGT 0.00543 CTA 0.0105 CTC 0.0139 CTG 0.0216 CTT 0.0179 GAA 0.02 GAC 0.0114 GAG 0.0139 GAT 0.0141 GCA 0.0142 GCC 0.0083 GCG 0.00452 GCT 0.0144 GGA 0.0137 GGC 0.0083 GGG 0.00861 GGT 0.0113 GTA 0.0106 GTC 0.0114 GTG 0.0145 GTT 0.0197 TAA 0.0234 TAC 0.0106 TAG 0.0105 TAT 0.0187 TCA 0.021 TCC 0.0137 TCG 0.0043 TCT 0.0204 TGA 0.021 TGC 0.0142 TGG 0.0149 TGT 0.0234 TTA 0.0234 TTC 0.02 TTG 0.0195 TTT 0.0421 # l= 3 # Values AAAA 0.016 AAAC 0.00818 AAAG 0.00715 AAAT 0.0107 AACA 0.00823 AACC 0.00396 AACG 0.00184 AACT 0.00564 AAGA 0.00569 AAGC 0.00369 AAGG 0.00349 AAGT 0.00499 AATA 0.00767 AATC 0.00452 AATG 0.0061 AATT 0.00702 ACAA 0.00661 ACAC 0.00503 ACAG 0.00576 ACAT 0.00602 ACCA 0.0042 ACCC 0.00217 ACCG 0.00143 ACCT 0.00349 ACGA 0.00124 ACGC 0.00116 ACGG 0.00133 ACGT 0.0017 ACTA 0.00294 ACTC 0.003 ACTG 0.00505 ACTT 0.00499 AGAA 0.00731 AGAC 0.00364 AGAG 0.0048 AGAT 0.00465 AGCA 0.00523 AGCC 0.00273 AGCG 0.00152 AGCT 0.00491 AGGA 0.00467 AGGC 0.00251 AGGG 0.00245 AGGT 0.00349 AGTA 0.00327 AGTC 0.00322 AGTG 0.00385 AGTT 0.00564 ATAA 0.00726 ATAC 0.00266 ATAG 0.00254 ATAT 0.00628 ATCA 0.00543 ATCC 0.00291 ATCG 0.00107 ATCT 0.00465 ATGA 0.00545 ATGC 0.0032 ATGG 0.00339 ATGT 0.00602 ATTA 0.00633 ATTC 0.00401 ATTG 0.00424 ATTT 0.0107 CAAA 0.00803 CAAC 0.00401 CAAG 0.00318 CAAT 0.00424 CACA 0.00645 CACC 0.00295 CACG 0.00121 CACT 0.00385 CAGA 0.00702 CAGC 0.0052 CAGG 0.00431 CAGT 0.00505 CATA 0.00361 CATC 0.0041 CATG 0.00425 CATT 0.0061 CCAA 0.00392 CCAC 0.00312 CCAG 0.00448 CCAT 0.00339 CCCA 0.00285 CCCC 0.00221 CCCG 0.00111 CCCT 0.00245 CCGA 0.0012 CCGC 0.00129 CCGG 0.00148 CCGT 0.00133 CCTA 0.00169 CCTC 0.00361 CCTG 0.00431 CCTT 0.00349 CGAA 0.00105 CGAC 0.00112 CGAG 0.00107 CGAT 0.00107 CGCA 0.00121 CGCC 0.00127 CGCG 0.000526 CGCT 0.00152 CGGA 0.00138 CGGC 0.00138 CGGG 0.00111 CGGT 0.00143 CGTA 0.000879 CGTC 0.00151 CGTG 0.00121 CGTT 0.00184 CTAA 0.00402 CTAC 0.00218 CTAG 0.00174 CTAT 0.00254 CTCA 0.00425 CTCC 0.00384 CTCG 0.00107 CTCT 0.0048 CTGA 0.00616 CTGC 0.00518 CTGG 0.00448 CTGT 0.00576 CTTA 0.00315 CTTC 0.00437 CTTG 0.00318 CTTT 0.00716 GAAA 0.00783 GAAC 0.0038 GAAG 0.00437 GAAT 0.00401 GACA 0.00418 GACC 0.0025 GACG 0.00151 GACT 0.00322 GAGA 0.00431 GAGC 0.00302 GAGG 0.00361 GAGT 0.003 GATA 0.00272 GATC 0.00273 GATG 0.0041 GATT 0.00452 GCAA 0.00358 GCAC 0.00226 GCAG 0.00518 GCAT 0.0032 GCCA 0.00277 GCCC 0.00164 GCCG 0.00138 GCCT 0.0025 GCGA 0.000921 GCGC 0.00115 GCGG 0.00129 GCGT 0.00116 GCTA 0.00247 GCTC 0.00302 GCTG 0.0052 GCTT 0.00369 GGAA 0.0044 GGAC 0.00258 GGAG 0.00384 GGAT 0.00291 GGCA 0.00244 GGCC 0.00186 GGCG 0.00127 GGCT 0.00273 GGGA 0.00259 GGGC 0.00164 GGGG 0.00221 GGGT 0.00217 GGTA 0.00187 GGTC 0.0025 GGTG 0.00295 GGTT 0.00396 GTAA 0.00396 GTAC 0.00177 GTAG 0.00218 GTAT 0.00266 GTCA 0.00408 GTCC 0.00258 GTCG 0.00112 GTCT 0.00364 GTGA 0.00404 GTGC 0.00226 GTGG 0.00312 GTGT 0.00503 GTTA 0.00368 GTTC 0.0038 GTTG 0.00401 GTTT 0.00818 TAAA 0.0102 TAAC 0.00368 TAAG 0.00315 TAAT 0.00633 TACA 0.00455 TACC 0.00187 TACG 0.000879 TACT 0.00327 TAGA 0.00338 TAGC 0.00247 TAGG 0.00169 TAGT 0.00294 TATA 0.00473 TATC 0.00272 TATG 0.00361 TATT 0.00767 TCAA 0.00535 TCAC 0.00404 TCAG 0.00616 TCAT 0.00545 TCCA 0.0051 TCCC 0.00259 TCCG 0.00138 TCCT 0.00467 TCGA 0.000945 TCGC 0.000921 TCGG 0.0012 TCGT 0.00124 TCTA 0.00338 TCTC 0.00431 TCTG 0.00702 TCTT 0.00569 TGAA 0.00725 TGAC 0.00408 TGAG 0.00425 TGAT 0.00543 TGCA 0.00535 TGCC 0.00244 TGCG 0.00121 TGCT 0.00523 TGGA 0.0051 TGGC 0.00277 TGGG 0.00285 TGGT 0.0042 TGTA 0.00455 TGTC 0.00418 TGTG 0.00645 TGTT 0.00823 TTAA 0.00814 TTAC 0.00396 TTAG 0.00402 TTAT 0.00726 TTCA 0.00724 TTCC 0.00441 TTCG 0.00105 TTCT 0.00731 TTGA 0.00535 TTGC 0.00358 TTGG 0.00392 TTGT 0.00661 TTTA 0.0102 TTTC 0.00783 TTTG 0.00803 TTTT 0.016 # l= 4 # Values AAAAA 0.00625 AAAAC 0.00315 AAAAG 0.00253 AAAAT 0.00411 AAACA 0.00356 AAACC 0.00148 AAACG 0.000765 AAACT 0.00238 AAAGA 0.00225 AAAGC 0.00145 AAAGG 0.00134 AAAGT 0.00213 AAATA 0.00354 AAATC 0.00183 AAATG 0.00276 AAATT 0.0026 AACAA 0.00257 AACAC 0.00148 AACAG 0.00192 AACAT 0.00225 AACCA 0.00157 AACCC 0.000751 AACCG 0.000476 AACCT 0.00116 AACGA 0.000426 AACGC 0.000388 AACGG 0.000418 AACGT 0.000607 AACTA 0.00118 AACTC 0.00106 AACTG 0.00171 AACTT 0.0017 AAGAA 0.00219 AAGAC 0.00103 AAGAG 0.00119 AAGAT 0.00128 AAGCA 0.00139 AAGCC 0.000673 AAGCG 0.000332 AAGCT 0.0013 AAGGA 0.00119 AAGGC 0.000688 AAGGG 0.000608 AAGGT 0.001 AAGTA 0.00113 AAGTC 0.000966 AAGTG 0.00119 AAGTT 0.0017 AATAA 0.00333 AATAC 0.00107 AATAG 0.000926 AATAT 0.00235 AATCA 0.0018 AATCC 0.000898 AATCG 0.000305 AATCT 0.00151 AATGA 0.00188 AATGC 0.00104 AATGG 0.00101 AATGT 0.00217 AATTA 0.00212 AATTC 0.00113 AATTG 0.00117 AATTT 0.0026 ACAAA 0.00281 ACAAC 0.00128 ACAAG 0.00107 ACAAT 0.00146 ACACA 0.00267 ACACC 0.000828 ACACG 0.000408 ACACT 0.00112 ACAGA 0.00201 ACAGC 0.00127 ACAGG 0.00113 ACAGT 0.00136 ACATA 0.00125 ACATC 0.00117 ACATG 0.00142 ACATT 0.00217 ACCAA 0.00122 ACCAC 0.000808 ACCAG 0.00132 ACCAT 0.000842 ACCCA 0.000799 ACCCC 0.000484 ACCCG 0.000326 ACCCT 0.000558 ACCGA 0.000372 ACCGC 0.000295 ACCGG 0.000423 ACCGT 0.000344 ACCTA 0.000485 ACCTC 0.0008 ACCTG 0.0012 ACCTT 0.001 ACGAA 0.000318 ACGAC 0.000303 ACGAG 0.000316 ACGAT 0.000301 ACGCA 0.000363 ACGCC 0.000299 ACGCG 0.000124 ACGCT 0.000372 ACGGA 0.000392 ACGGC 0.000341 ACGGG 0.000256 ACGGT 0.000344 ACGTA 0.000323 ACGTC 0.000412 ACGTG 0.00036 ACGTT 0.000607 ACTAA 0.00116 ACTAC 0.000566 ACTAG 0.000486 ACTAT 0.000726 ACTCA 0.00107 ACTCC 0.000691 ACTCG 0.000268 ACTCT 0.000973 ACTGA 0.00163 ACTGC 0.00102 ACTGG 0.00104 ACTGT 0.00136 ACTTA 0.000919 ACTTC 0.00107 ACTTG 0.00088 ACTTT 0.00213 AGAAA 0.00308 AGAAC 0.00145 AGAAG 0.00142 AGAAT 0.00136 AGACA 0.00144 AGACC 0.000691 AGACG 0.000515 AGACT 0.00099 AGAGA 0.00165 AGAGC 0.00101 AGAGG 0.00116 AGAGT 0.000973 AGATA 0.00102 AGATC 0.000848 AGATG 0.00128 AGATT 0.00151 AGCAA 0.00137 AGCAC 0.000777 AGCAG 0.00195 AGCAT 0.00113 AGCCA 0.000976 AGCCC 0.000486 AGCCG 0.000456 AGCCT 0.000811 AGCGA 0.000351 AGCGC 0.000377 AGCGG 0.000419 AGCGT 0.000372 AGCTA 0.000904 AGCTC 0.000991 AGCTG 0.00172 AGCTT 0.0013 AGGAA 0.00171 AGGAC 0.000796 AGGAG 0.00131 AGGAT 0.000852 AGGCA 0.000808 AGGCC 0.000524 AGGCG 0.000361 AGGCT 0.000811 AGGGA 0.000816 AGGGC 0.000463 AGGGG 0.000609 AGGGT 0.000558 AGGTA 0.000631 AGGTC 0.000767 AGGTG 0.000924 AGGTT 0.00116 AGTAA 0.00131 AGTAC 0.000512 AGTAG 0.000654 AGTAT 0.000793 AGTCA 0.00124 AGTCC 0.000684 AGTCG 0.000309 AGTCT 0.00099 AGTGA 0.00124 AGTGC 0.000616 AGTGG 0.000864 AGTGT 0.00112 AGTTA 0.0012 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.00105 AGTTT 0.00238 ATAAA 0.00336 ATAAC 0.000999 ATAAG 0.000882 ATAAT 0.00202 ATACA 0.00125 ATACC 0.000408 ATACG 0.000214 ATACT 0.000793 ATAGA 0.000942 ATAGC 0.000492 ATAGG 0.000381 ATAGT 0.000726 ATATA 0.00202 ATATC 0.000814 ATATG 0.00109 ATATT 0.00235 ATCAA 0.00154 ATCAC 0.00097 ATCAG 0.00156 ATCAT 0.00136 ATCCA 0.00121 ATCCC 0.000538 ATCCG 0.000311 ATCCT 0.000852 ATCGA 0.000268 ATCGC 0.000221 ATCGG 0.00028 ATCGT 0.000301 ATCTA 0.000926 ATCTC 0.00089 ATCTG 0.00156 ATCTT 0.00128 ATGAA 0.00201 ATGAC 0.00102 ATGAG 0.00105 ATGAT 0.00136 ATGCA 0.0013 ATGCC 0.000509 ATGCG 0.00026 ATGCT 0.00113 ATGGA 0.00127 ATGGC 0.000701 ATGGG 0.000582 ATGGT 0.000842 ATGTA 0.0013 ATGTC 0.00107 ATGTG 0.00139 ATGTT 0.00225 ATTAA 0.00229 ATTAC 0.000989 ATTAG 0.00103 ATTAT 0.00202 ATTCA 0.00168 ATTCC 0.000766 ATTCG 0.000204 ATTCT 0.00136 ATTGA 0.00125 ATTGC 0.000728 ATTGG 0.000801 ATTGT 0.00146 ATTTA 0.00282 ATTTC 0.00194 ATTTG 0.00187 ATTTT 0.00411 CAAAA 0.00285 CAAAC 0.00177 CAAAG 0.00154 CAAAT 0.00187 CAACA 0.00183 CAACC 0.000794 CAACG 0.000343 CAACT 0.00105 CAAGA 0.001 CAAGC 0.00066 CAAGG 0.000636 CAAGT 0.00088 CAATA 0.00126 CAATC 0.000831 CAATG 0.000973 CAATT 0.00117 CACAA 0.00158 CACAC 0.002 CACAG 0.00148 CACAT 0.00139 CACCA 0.00112 CACCC 0.000528 CACCG 0.00038 CACCT 0.000924 CACGA 0.000261 CACGC 0.000296 CACGG 0.000288 CACGT 0.00036 CACTA 0.000651 CACTC 0.000723 CACTG 0.00128 CACTT 0.00119 CAGAA 0.00248 CAGAC 0.00125 CAGAG 0.00174 CAGAT 0.00156 CAGCA 0.00192 CAGCC 0.000984 CAGCG 0.000576 CAGCT 0.00172 CAGGA 0.00152 CAGGC 0.000796 CAGGG 0.000791 CAGGT 0.0012 CAGTA 0.00101 CAGTC 0.00105 CAGTG 0.00128 CAGTT 0.00171 CATAA 0.00139 CATAC 0.000585 CATAG 0.000548 CATAT 0.00109 CATCA 0.00161 CATCC 0.000902 CATCG 0.00031 CATCT 0.00128 CATGA 0.00121 CATGC 0.000796 CATGG 0.000813 CATGT 0.00142 CATTA 0.00137 CATTC 0.000998 CATTG 0.000973 CATTT 0.00276 CCAAA 0.0016 CCAAC 0.000861 CCAAG 0.000657 CCAAT 0.000801 CCACA 0.00121 CCACC 0.000774 CCACG 0.00028 CCACT 0.000864 CCAGA 0.00149 CCAGC 0.000996 CCAGG 0.000951 CCAGT 0.00104 CCATA 0.000648 CCATC 0.000919 CCATG 0.000813 CCATT 0.00101 CCCAA 0.000747 CCCAC 0.00067 CCCAG 0.000848 CCCAT 0.000582 CCCCA 0.000654 CCCCC 0.000673 CCCCG 0.000276 CCCCT 0.000609 CCCGA 0.000244 CCCGC 0.000277 CCCGG 0.000329 CCCGT 0.000256 CCCTA 0.000336 CCCTC 0.000711 CCCTG 0.000791 CCCTT 0.000608 CCGAA 0.000289 CCGAC 0.000325 CCGAG 0.000303 CCGAT 0.00028 CCGCA 0.000307 CCGCC 0.000411 CCGCG 0.000154 CCGCT 0.000419 CCGGA 0.000392 CCGGC 0.000334 CCGGG 0.000329 CCGGT 0.000423 CCGTA 0.000207 CCGTC 0.00042 CCGTG 0.000288 CCGTT 0.000418 CCTAA 0.000651 CCTAC 0.000396 CCTAG 0.000266 CCTAT 0.000381 CCTCA 0.00099 CCTCC 0.00117 CCTCG 0.000288 CCTCT 0.00116 CCTGA 0.00117 CCTGC 0.00105 CCTGG 0.000951 CCTGT 0.00113 CCTTA 0.000601 CCTTC 0.000914 CCTTG 0.000636 CCTTT 0.00134 CGAAA 0.000311 CGAAC 0.000271 CGAAG 0.000263 CGAAT 0.000204 CGACA 0.000344 CGACC 0.000267 CGACG 0.000198 CGACT 0.000309 CGAGA 0.000261 CGAGC 0.000248 CGAGG 0.000288 CGAGT 0.000268 CGATA 0.000212 CGATC 0.000243 CGATG 0.00031 CGATT 0.000305 CGCAA 0.000243 CGCAC 0.000247 CGCAG 0.000457 CGCAT 0.00026 CGCCA 0.00034 CGCCC 0.000278 CGCCG 0.00029 CGCCT 0.000361 CGCGA 8.68e-05 CGCGC 0.000161 CGCGG 0.000154 CGCGT 0.000124 CGCTA 0.000221 CGCTC 0.000391 CGCTG 0.000576 CGCTT 0.000332 CGGAA 0.000311 CGGAC 0.000346 CGGAG 0.000415 CGGAT 0.000311 CGGCA 0.000301 CGGCC 0.000329 CGGCG 0.00029 CGGCT 0.000456 CGGGA 0.000279 CGGGC 0.000226 CGGGG 0.000276 CGGGT 0.000326 CGGTA 0.000231 CGGTC 0.000346 CGGTG 0.00038 CGGTT 0.000476 CGTAA 0.000282 CGTAC 0.000196 CGTAG 0.000187 CGTAT 0.000214 CGTCA 0.000442 CGTCC 0.000354 CGTCG 0.000198 CGTCT 0.000515 CGTGA 0.000319 CGTGC 0.0002 CGTGG 0.00028 CGTGT 0.000408 CGTTA 0.000354 CGTTC 0.000377 CGTTG 0.000343 CGTTT 0.000765 CTAAA 0.00167 CTAAC 0.000752 CTAAG 0.000563 CTAAT 0.00103 CTACA 0.000937 CTACC 0.000403 CTACG 0.000187 CTACT 0.000654 CTAGA 0.000559 CTAGC 0.000429 CTAGG 0.000266 CTAGT 0.000486 CTATA 0.000617 CTATC 0.000448 CTATG 0.000548 CTATT 0.000926 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.000847 CTCAG 0.00131 CTCAT 0.00105 CTCCA 0.0014 CTCCC 0.000708 CTCCG 0.000415 CTCCT 0.00131 CTCGA 0.000208 CTCGC 0.000239 CTCGG 0.000303 CTCGT 0.000316 CTCTA 0.000724 CTCTC 0.00114 CTCTG 0.00174 CTCTT 0.00119 CTGAA 0.00205 CTGAC 0.00125 CTGAG 0.00131 CTGAT 0.00156 CTGCA 0.00188 CTGCC 0.000885 CTGCG 0.000457 CTGCT 0.00195 CTGGA 0.00158 CTGGC 0.000727 CTGGG 0.000848 CTGGT 0.00132 CTGTA 0.00117 CTGTC 0.00119 CTGTG 0.00148 CTGTT 0.00192 CTTAA 0.00112 CTTAC 0.00058 CTTAG 0.000563 CTTAT 0.000882 CTTCA 0.0016 CTTCC 0.00109 CTTCG 0.000263 CTTCT 0.00142 CTTGA 0.000889 CTTGC 0.000566 CTTGG 0.000657 CTTGT 0.00107 CTTTA 0.00175 CTTTC 0.00133 CTTTG 0.00154 CTTTT 0.00253 GAAAA 0.00297 GAAAC 0.00159 GAAAG 0.00133 GAAAT 0.00194 GAACA 0.00138 GAACC 0.00103 GAACG 0.000377 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00142 GAAGC 0.000972 GAAGG 0.000914 GAAGT 0.00107 GAATA 0.00109 GAATC 0.000796 GAATG 0.000998 GAATT 0.00113 GACAA 0.00113 GACAC 0.000796 GACAG 0.00119 GACAT 0.00107 GACCA 0.000812 GACCC 0.000579 GACCG 0.000346 GACCT 0.000767 GACGA 0.000362 GACGC 0.000314 GACGG 0.00042 GACGT 0.000412 GACTA 0.00051 GACTC 0.000691 GACTG 0.00105 GACTT 0.000966 GAGAA 0.00145 GAGAC 0.000831 GAGAG 0.00114 GAGAT 0.00089 GAGCA 0.000983 GAGCC 0.000657 GAGCG 0.000391 GAGCT 0.000991 GAGGA 0.00139 GAGGC 0.000714 GAGGG 0.000711 GAGGT 0.0008 GAGTA 0.000531 GAGTC 0.000691 GAGTG 0.000723 GAGTT 0.00106 GATAA 0.00104 GATAC 0.00042 GATAG 0.000448 GATAT 0.000814 GATCA 0.00101 GATCC 0.000621 GATCG 0.000243 GATCT 0.000848 GATGA 0.00127 GATGC 0.000735 GATGG 0.000919 GATGT 0.00117 GATTA 0.00106 GATTC 0.000796 GATTG 0.000831 GATTT 0.00183 GCAAA 0.00144 GCAAC 0.000848 GCAAG 0.000566 GCAAT 0.000728 GCACA 0.000954 GCACC 0.000493 GCACG 0.0002 GCACT 0.000616 GCAGA 0.00153 GCAGC 0.00158 GCAGG 0.00105 GCAGT 0.00102 GCATA 0.000624 GCATC 0.000735 GCATG 0.000796 GCATT 0.00104 GCCAA 0.000714 GCCAC 0.000632 GCCAG 0.000727 GCCAT 0.000701 GCCCA 0.000507 GCCCC 0.000447 GCCCG 0.000226 GCCCT 0.000463 GCCGA 0.000292 GCCGC 0.000409 GCCGG 0.000334 GCCGT 0.000341 GCCTA 0.000307 GCCTC 0.000714 GCCTG 0.000796 GCCTT 0.000688 GCGAA 0.000215 GCGAC 0.000247 GCGAG 0.000239 GCGAT 0.000221 GCGCA 0.000297 GCGCC 0.000314 GCGCG 0.000161 GCGCT 0.000377 GCGGA 0.000311 GCGGC 0.000409 GCGGG 0.000277 GCGGT 0.000295 GCGTA 0.000159 GCGTC 0.000314 GCGTG 0.000296 GCGTT 0.000388 GCTAA 0.00104 GCTAC 0.000513 GCTAG 0.000429 GCTAT 0.000492 GCTCA 0.000919 GCTCC 0.000842 GCTCG 0.000248 GCTCT 0.00101 GCTGA 0.00136 GCTGC 0.00158 GCTGG 0.000996 GCTGT 0.00127 GCTTA 0.000614 GCTTC 0.000972 GCTTG 0.00066 GCTTT 0.00145 GGAAA 0.00176 GGAAC 0.000791 GGAAG 0.00109 GGAAT 0.000766 GGACA 0.000907 GGACC 0.000638 GGACG 0.000354 GGACT 0.000684 GGAGA 0.00113 GGAGC 0.000842 GGAGG 0.00117 GGAGT 0.000691 GGATA 0.000491 GGATC 0.000621 GGATG 0.000902 GGATT 0.000898 GGCAA 0.000642 GGCAC 0.000402 GGCAG 0.000885 GGCAT 0.000509 GGCCA 0.000574 GGCCC 0.000435 GGCCG 0.000329 GGCCT 0.000524 GGCGA 0.000244 GGCGC 0.000314 GGCGG 0.000411 GGCGT 0.000299 GGCTA 0.000416 GGCTC 0.000657 GGCTG 0.000984 GGCTT 0.000673 GGGAA 0.000876 GGGAC 0.00047 GGGAG 0.000708 GGGAT 0.000538 GGGCA 0.000445 GGGCC 0.000435 GGGCG 0.000278 GGGCT 0.000486 GGGGA 0.000608 GGGGC 0.000447 GGGGG 0.000673 GGGGT 0.000484 GGGTA 0.000309 GGGTC 0.000579 GGGTG 0.000528 GGGTT 0.000751 GGTAA 0.000713 GGTAC 0.000342 GGTAG 0.000403 GGTAT 0.000408 GGTCA 0.000908 GGTCC 0.000638 GGTCG 0.000267 GGTCT 0.000691 GGTGA 0.000857 GGTGC 0.000493 GGTGG 0.000774 GGTGT 0.000828 GGTTA 0.000666 GGTTC 0.00103 GGTTG 0.000794 GGTTT 0.00148 GTAAA 0.00169 GTAAC 0.000699 GTAAG 0.00058 GTAAT 0.000989 GTACA 0.000719 GTACC 0.000342 GTACG 0.000196 GTACT 0.000512 GTAGA 0.000705 GTAGC 0.000513 GTAGG 0.000396 GTAGT 0.000566 GTATA 0.000589 GTATC 0.00042 GTATG 0.000585 GTATT 0.00107 GTCAA 0.000967 GTCAC 0.000839 GTCAG 0.00125 GTCAT 0.00102 GTCCA 0.000971 GTCCC 0.00047 GTCCG 0.000346 GTCCT 0.000796 GTCGA 0.000242 GTCGC 0.000247 GTCGG 0.000325 GTCGT 0.000303 GTCTA 0.000522 GTCTC 0.000831 GTCTG 0.00125 GTCTT 0.00103 GTGAA 0.00138 GTGAC 0.000839 GTGAG 0.000847 GTGAT 0.00097 GTGCA 0.000838 GTGCC 0.000402 GTGCG 0.000247 GTGCT 0.000777 GTGGA 0.00101 GTGGC 0.000632 GTGGG 0.00067 GTGGT 0.000808 GTGTA 0.000749 GTGTC 0.000796 GTGTG 0.002 GTGTT 0.00148 GTTAA 0.00123 GTTAC 0.000699 GTTAG 0.000752 GTTAT 0.000999 GTTCA 0.00129 GTTCC 0.000791 GTTCG 0.000271 GTTCT 0.00145 GTTGA 0.00103 GTTGC 0.000848 GTTGG 0.000861 GTTGT 0.00128 GTTTA 0.00167 GTTTC 0.00159 GTTTG 0.00177 GTTTT 0.00315 TAAAA 0.00397 TAAAC 0.00167 TAAAG 0.00175 TAAAT 0.00282 TAACA 0.00146 TAACC 0.000666 TAACG 0.000354 TAACT 0.0012 TAAGA 0.00102 TAAGC 0.000614 TAAGG 0.000601 TAAGT 0.000919 TAATA 0.00178 TAATC 0.00106 TAATG 0.00137 TAATT 0.00212 TACAA 0.00133 TACAC 0.000749 TACAG 0.00117 TACAT 0.0013 TACCA 0.000694 TACCC 0.000309 TACCG 0.000231 TACCT 0.000631 TACGA 0.00019 TACGC 0.000159 TACGG 0.000207 TACGT 0.000323 TACTA 0.0006 TACTC 0.000531 TACTG 0.00101 TACTT 0.00113 TAGAA 0.00121 TAGAC 0.000522 TAGAG 0.000724 TAGAT 0.000926 TAGCA 0.000929 TAGCC 0.000416 TAGCG 0.000221 TAGCT 0.000904 TAGGA 0.000566 TAGGC 0.000307 TAGGG 0.000336 TAGGT 0.000485 TAGTA 0.0006 TAGTC 0.00051 TAGTG 0.000651 TAGTT 0.00118 TATAA 0.0015 TATAC 0.000589 TATAG 0.000617 TATAT 0.00202 TATCA 0.001 TATCC 0.000491 TATCG 0.000212 TATCT 0.00102 TATGA 0.00108 TATGC 0.000624 TATGG 0.000648 TATGT 0.00125 TATTA 0.00178 TATTC 0.00109 TATTG 0.00126 TATTT 0.00354 TCAAA 0.00218 TCAAC 0.00103 TCAAG 0.000889 TCAAT 0.00125 TCACA 0.00161 TCACC 0.000857 TCACG 0.000319 TCACT 0.00124 TCAGA 0.002 TCAGC 0.00136 TCAGG 0.00117 TCAGT 0.00163 TCATA 0.00108 TCATC 0.00127 TCATG 0.00121 TCATT 0.00188 TCCAA 0.00124 TCCAC 0.00101 TCCAG 0.00158 TCCAT 0.00127 TCCCA 0.000888 TCCCC 0.000608 TCCCG 0.000279 TCCCT 0.000816 TCCGA 0.000288 TCCGC 0.000311 TCCGG 0.000392 TCCGT 0.000392 TCCTA 0.000566 TCCTC 0.00139 TCCTG 0.00152 TCCTT 0.00119 TCGAA 0.000226 TCGAC 0.000242 TCGAG 0.000208 TCGAT 0.000268 TCGCA 0.000239 TCGCC 0.000244 TCGCG 8.68e-05 TCGCT 0.000351 TCGGA 0.000288 TCGGC 0.000292 TCGGG 0.000244 TCGGT 0.000372 TCGTA 0.00019 TCGTC 0.000362 TCGTG 0.000261 TCGTT 0.000426 TCTAA 0.00117 TCTAC 0.000705 TCTAG 0.000559 TCTAT 0.000942 TCTCA 0.00127 TCTCC 0.00113 TCTCG 0.000261 TCTCT 0.00165 TCTGA 0.002 TCTGC 0.00153 TCTGG 0.00149 TCTGT 0.00201 TCTTA 0.00102 TCTTC 0.00142 TCTTG 0.001 TCTTT 0.00225 TGAAA 0.00268 TGAAC 0.00129 TGAAG 0.0016 TGAAT 0.00168 TGACA 0.00149 TGACC 0.000908 TGACG 0.000442 TGACT 0.00124 TGAGA 0.00127 TGAGC 0.000919 TGAGG 0.00099 TGAGT 0.00107 TGATA 0.001 TGATC 0.00101 TGATG 0.00161 TGATT 0.0018 TGCAA 0.00133 TGCAC 0.000838 TGCAG 0.00188 TGCAT 0.0013 TGCCA 0.000883 TGCCC 0.000445 TGCCG 0.000301 TGCCT 0.000808 TGCGA 0.000239 TGCGC 0.000297 TGCGG 0.000307 TGCGT 0.000363 TGCTA 0.000929 TGCTC 0.000983 TGCTG 0.00192 TGCTT 0.00139 TGGAA 0.00151 TGGAC 0.000971 TGGAG 0.0014 TGGAT 0.00121 TGGCA 0.000883 TGGCC 0.000574 TGGCG 0.00034 TGGCT 0.000976 TGGGA 0.000888 TGGGC 0.000507 TGGGG 0.000654 TGGGT 0.000799 TGGTA 0.000694 TGGTC 0.000812 TGGTG 0.00112 TGGTT 0.00157 TGTAA 0.00165 TGTAC 0.000719 TGTAG 0.000937 TGTAT 0.00125 TGTCA 0.00149 TGTCC 0.000907 TGTCG 0.000344 TGTCT 0.00144 TGTGA 0.00161 TGTGC 0.000954 TGTGG 0.00121 TGTGT 0.00267 TGTTA 0.00146 TGTTC 0.00138 TGTTG 0.00183 TGTTT 0.00356 TTAAA 0.0035 TTAAC 0.00123 TTAAG 0.00112 TTAAT 0.00229 TTACA 0.00165 TTACC 0.000713 TTACG 0.000282 TTACT 0.00131 TTAGA 0.00117 TTAGC 0.00104 TTAGG 0.000651 TTAGT 0.00116 TTATA 0.0015 TTATC 0.00104 TTATG 0.00139 TTATT 0.00333 TTCAA 0.00181 TTCAC 0.00138 TTCAG 0.00205 TTCAT 0.00201 TTCCA 0.00151 TTCCC 0.000876 TTCCG 0.000311 TTCCT 0.00171 TTCGA 0.000226 TTCGC 0.000215 TTCGG 0.000289 TTCGT 0.000318 TTCTA 0.00121 TTCTC 0.00145 TTCTG 0.00248 TTCTT 0.00219 TTGAA 0.00181 TTGAC 0.000967 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00154 TTGCA 0.00133 TTGCC 0.000642 TTGCG 0.000243 TTGCT 0.00137 TTGGA 0.00124 TTGGC 0.000714 TTGGG 0.000747 TTGGT 0.00122 TTGTA 0.00133 TTGTC 0.00113 TTGTG 0.00158 TTGTT 0.00257 TTTAA 0.0035 TTTAC 0.00169 TTTAG 0.00167 TTTAT 0.00336 TTTCA 0.00268 TTTCC 0.00176 TTTCG 0.000311 TTTCT 0.00308 TTTGA 0.00218 TTTGC 0.00144 TTTGG 0.0016 TTTGT 0.00281 TTTTA 0.00397 TTTTC 0.00297 TTTTG 0.00285 TTTTT 0.00625 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3943 AAAAC 0.1941 AAAAG 0.158 AAAAT 0.2535 AAACA 0.4376 AAACC 0.1795 AAACG 0.09333 AAACT 0.2896 AAAGA 0.3145 AAAGC 0.2013 AAAGG 0.186 AAAGT 0.2982 AAATA 0.3285 AAATC 0.1706 AAATG 0.2576 AAATT 0.2434 AACAA 0.3151 AACAC 0.1806 AACAG 0.2299 AACAT 0.2744 AACCA 0.393 AACCC 0.1922 AACCG 0.1144 AACCT 0.3004 AACGA 0.2365 AACGC 0.2089 AACGG 0.2196 AACGT 0.335 AACTA 0.2099 AACTC 0.1855 AACTG 0.2997 AACTT 0.3049 AAGAA 0.3849 AAGAC 0.1822 AAGAG 0.2094 AAGAT 0.2235 AAGCA 0.3805 AAGCC 0.1826 AAGCG 0.08964 AAGCT 0.3473 AAGGA 0.3425 AAGGC 0.1972 AAGGG 0.1772 AAGGT 0.2831 AAGTA 0.2294 AAGTC 0.1926 AAGTG 0.2391 AAGTT 0.3389 AATAA 0.4325 AATAC 0.1404 AATAG 0.1207 AATAT 0.3064 AATCA 0.3986 AATCC 0.2003 AATCG 0.06776 AATCT 0.3334 AATGA 0.3054 AATGC 0.1734 AATGG 0.1668 AATGT 0.3544 AATTA 0.2998 AATTC 0.1598 AATTG 0.1693 AATTT 0.3711 ACAAA 0.4262 ACAAC 0.1923 ACAAG 0.1615 ACAAT 0.22 ACACA 0.5204 ACACC 0.1666 ACACG 0.08251 ACACT 0.2304 ACAGA 0.3463 ACAGC 0.2203 ACAGG 0.1921 ACAGT 0.2413 ACATA 0.2103 ACATC 0.1921 ACATG 0.2371 ACATT 0.3606 ACCAA 0.2974 ACCAC 0.1966 ACCAG 0.2987 ACCAT 0.2074 ACCCA 0.3728 ACCCC 0.2271 ACCCG 0.1361 ACCCT 0.264 ACCGA 0.2588 ACCGC 0.2151 ACCGG 0.2751 ACCGT 0.2511 ACCTA 0.1451 ACCTC 0.2295 ACCTG 0.3309 ACCTT 0.2944 ACGAA 0.2583 ACGAC 0.2441 ACGAG 0.2541 ACGAT 0.2434 ACGCA 0.3232 ACGCC 0.2476 ACGCG 0.1069 ACGCT 0.3223 ACGGA 0.2929 ACGGC 0.2544 ACGGG 0.1907 ACGGT 0.262 ACGTA 0.1913 ACGTC 0.2355 ACGTG 0.2129 ACGTT 0.3602 ACTAA 0.3953 ACTAC 0.1942 ACTAG 0.1645 ACTAT 0.246 ACTCA 0.3578 ACTCC 0.2329 ACTCG 0.08704 ACTCT 0.3223 ACTGA 0.3234 ACTGC 0.203 ACTGG 0.1994 ACTGT 0.2743 ACTTA 0.1853 ACTTC 0.2092 ACTTG 0.1778 ACTTT 0.4277 AGAAA 0.4304 AGAAC 0.1843 AGAAG 0.1965 AGAAT 0.1888 AGACA 0.4017 AGACC 0.1846 AGACG 0.1378 AGACT 0.2759 AGAGA 0.3476 AGAGC 0.211 AGAGG 0.2392 AGAGT 0.2022 AGATA 0.2195 AGATC 0.1777 AGATG 0.2767 AGATT 0.326 AGCAA 0.267 AGCAC 0.151 AGCAG 0.3624 AGCAT 0.2197 AGCCA 0.3648 AGCCC 0.1799 AGCCG 0.1562 AGCCT 0.2992 AGCGA 0.2355 AGCGC 0.2494 AGCGG 0.2648 AGCGT 0.2503 AGCTA 0.185 AGCTC 0.2008 AGCTG 0.3471 AGCTT 0.2671 AGGAA 0.3679 AGGAC 0.1689 AGGAG 0.276 AGGAT 0.1872 AGGCA 0.3319 AGGCC 0.2092 AGGCG 0.1375 AGGCT 0.3214 AGGGA 0.3347 AGGGC 0.1894 AGGGG 0.2486 AGGGT 0.2273 AGGTA 0.1845 AGGTC 0.21 AGGTG 0.266 AGGTT 0.3395 AGTAA 0.3986 AGTAC 0.1569 AGTAG 0.2011 AGTAT 0.2434 AGTCA 0.3878 AGTCC 0.2074 AGTCG 0.09496 AGTCT 0.3098 AGTGA 0.3212 AGTGC 0.1633 AGTGG 0.2232 AGTGT 0.2923 AGTTA 0.2129 AGTTC 0.1761 AGTTG 0.1886 AGTTT 0.4224 ATAAA 0.4608 ATAAC 0.1386 ATAAG 0.1229 ATAAT 0.2776 ATACA 0.4702 ATACC 0.1524 ATACG 0.07883 ATACT 0.2985 ATAGA 0.3684 ATAGC 0.1951 ATAGG 0.1514 ATAGT 0.2851 ATATA 0.3233 ATATC 0.1295 ATATG 0.1744 ATATT 0.3727 ATCAA 0.2897 ATCAC 0.1773 ATCAG 0.2816 ATCAT 0.2514 ATCCA 0.4207 ATCCC 0.1856 ATCCG 0.09885 ATCCT 0.2949 ATCGA 0.2579 ATCGC 0.2094 ATCGG 0.2503 ATCGT 0.2824 ATCTA 0.2 ATCTC 0.1919 ATCTG 0.3309 ATCTT 0.2773 ATGAA 0.3694 ATGAC 0.1887 ATGAG 0.1932 ATGAT 0.2487 ATGCA 0.4101 ATGCC 0.1584 ATGCG 0.08057 ATGCT 0.351 ATGGA 0.3721 ATGGC 0.2067 ATGGG 0.1716 ATGGT 0.2496 ATGTA 0.2184 ATGTC 0.1755 ATGTG 0.2319 ATGTT 0.3742 ATTAA 0.3611 ATTAC 0.1573 ATTAG 0.1639 ATTAT 0.3178 ATTCA 0.421 ATTCC 0.1915 ATTCG 0.05001 ATTCT 0.3375 ATTGA 0.2963 ATTGC 0.1747 ATTGG 0.1836 ATTGT 0.3454 ATTTA 0.2612 ATTTC 0.1797 ATTTG 0.176 ATTTT 0.3831 CAAAA 0.3568 CAAAC 0.2175 CAAAG 0.1918 CAAAT 0.2338 CAACA 0.457 CAACC 0.1939 CAACG 0.08516 CAACT 0.2639 CAAGA 0.3155 CAAGC 0.2068 CAAGG 0.1989 CAAGT 0.2788 CAATA 0.297 CAATC 0.1913 CAATG 0.2308 CAATT 0.2809 CACAA 0.2537 CACAC 0.2938 CACAG 0.2308 CACAT 0.2216 CACCA 0.3848 CACCC 0.1796 CACCG 0.1257 CACCT 0.3098 CACGA 0.2197 CACGC 0.2479 CACGG 0.2307 CACGT 0.3017 CACTA 0.1712 CACTC 0.1844 CACTG 0.3325 CACTT 0.3119 CAGAA 0.3468 CAGAC 0.1791 CAGAG 0.2474 CAGAT 0.2267 CAGCA 0.3723 CAGCC 0.1862 CAGCG 0.1098 CAGCT 0.3318 CAGGA 0.3508 CAGGC 0.1885 CAGGG 0.1892 CAGGT 0.2715 CAGTA 0.2025 CAGTC 0.2053 CAGTG 0.2567 CAGTT 0.3355 CATAA 0.3815 CATAC 0.1637 CATAG 0.1514 CATAT 0.3034 CATCA 0.3893 CATCC 0.2206 CATCG 0.0745 CATCT 0.3155 CATGA 0.2858 CATGC 0.1893 CATGG 0.1868 CATGT 0.3381 CATTA 0.2247 CATTC 0.1627 CATTG 0.1602 CATTT 0.4524 CCAAA 0.4128 CCAAC 0.2183 CCAAG 0.1664 CCAAT 0.2025 CCACA 0.3905 CCACC 0.2421 CCACG 0.08711 CCACT 0.2803 CCAGA 0.3261 CCAGC 0.2254 CCAGG 0.2101 CCAGT 0.2385 CCATA 0.192 CCATC 0.2682 CCATG 0.2351 CCATT 0.3046 CCCAA 0.2653 CCCAC 0.2374 CCCAG 0.2895 CCCAT 0.2078 CCCCA 0.2981 CCCCC 0.305 CCCCG 0.1189 CCCCT 0.2781 CCCGA 0.2198 CCCGC 0.2477 CCCGG 0.2942 CCCGT 0.2384 CCCTA 0.1377 CCCTC 0.2852 CCCTG 0.3208 CCCTT 0.2564 CCGAA 0.242 CCGAC 0.2656 CCGAG 0.2534 CCGAT 0.239 CCGCA 0.2455 CCGCC 0.3056 CCGCG 0.1207 CCGCT 0.3282 CCGGA 0.2603 CCGGC 0.2311 CCGGG 0.2291 CCGGT 0.2794 CCGTA 0.1588 CCGTC 0.3089 CCGTG 0.2173 CCGTT 0.3151 CCTAA 0.3856 CCTAC 0.233 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.2273 CCTCA 0.2787 CCTCC 0.315 CCTCG 0.08077 CCTCT 0.3255 CCTGA 0.2722 CCTGC 0.2455 CCTGG 0.215 CCTGT 0.2673 CCTTA 0.1743 CCTTC 0.2566 CCTTG 0.1833 CCTTT 0.3858 CGAAA 0.3105 CGAAC 0.2444 CGAAG 0.2489 CGAAT 0.1962 CGACA 0.3236 CGACC 0.2208 CGACG 0.1738 CGACT 0.2819 CGAGA 0.2515 CGAGC 0.2299 CGAGG 0.2701 CGAGT 0.2485 CGATA 0.208 CGATC 0.2154 CGATG 0.2863 CGATT 0.2903 CGCAA 0.2118 CGCAC 0.2059 CGCAG 0.3627 CGCAT 0.2196 CGCCA 0.2778 CGCCC 0.2143 CGCCG 0.2205 CGCCT 0.2874 CGCGA 0.1743 CGCGC 0.3068 CGCGG 0.2802 CGCGT 0.2388 CGCTA 0.1484 CGCTC 0.252 CGCTG 0.3747 CGCTT 0.2249 CGGAA 0.2341 CGGAC 0.2365 CGGAG 0.3034 CGGAT 0.226 CGGCA 0.2281 CGGCC 0.242 CGGCG 0.2046 CGGCT 0.3253 CGGGA 0.2617 CGGGC 0.2038 CGGGG 0.2543 CGGGT 0.2803 CGGTA 0.1656 CGGTC 0.2288 CGGTG 0.2756 CGGTT 0.33 CGTAA 0.3286 CGTAC 0.2149 CGTAG 0.2128 CGTAT 0.2436 CGTCA 0.2983 CGTCC 0.2293 CGTCG 0.1297 CGTCT 0.3427 CGTGA 0.2624 CGTGC 0.171 CGTGG 0.2259 CGTGT 0.3407 CGTTA 0.1924 CGTTC 0.1968 CGTTG 0.1887 CGTTT 0.4221 CTAAA 0.4156 CTAAC 0.185 CTAAG 0.1411 CTAAT 0.2583 CTACA 0.4313 CTACC 0.179 CTACG 0.08503 CTACT 0.3047 CTAGA 0.3248 CTAGC 0.2405 CTAGG 0.1521 CTAGT 0.2827 CTATA 0.2441 CTATC 0.1754 CTATG 0.216 CTATT 0.3645 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.1997 CTCAG 0.2999 CTCAT 0.2502 CTCCA 0.3663 CTCCC 0.1897 CTCCG 0.1038 CTCCT 0.3402 CTCGA 0.203 CTCGC 0.2276 CTCGG 0.2697 CTCGT 0.2997 CTCTA 0.1535 CTCTC 0.2387 CTCTG 0.3535 CTCTT 0.2543 CTGAA 0.338 CTGAC 0.1986 CTGAG 0.2104 CTGAT 0.2531 CTGCA 0.3665 CTGCC 0.1722 CTGCG 0.08622 CTGCT 0.3751 CTGGA 0.3516 CTGGC 0.1662 CTGGG 0.1926 CTGGT 0.2896 CTGTA 0.2053 CTGTC 0.2044 CTGTG 0.2568 CTGTT 0.3335 CTTAA 0.3577 CTTAC 0.1846 CTTAG 0.178 CTTAT 0.2797 CTTCA 0.3654 CTTCC 0.2465 CTTCG 0.05935 CTTCT 0.3287 CTTGA 0.2818 CTTGC 0.1805 CTTGG 0.2007 CTTGT 0.3371 CTTTA 0.2419 CTTTC 0.1852 CTTTG 0.2159 CTTTT 0.357 GAAAA 0.3819 GAAAC 0.2 GAAAG 0.1706 GAAAT 0.2476 GAACA 0.3802 GAACC 0.2467 GAACG 0.09886 GAACT 0.2742 GAAGA 0.3269 GAAGC 0.2192 GAAGG 0.2084 GAAGT 0.2456 GAATA 0.2727 GAATC 0.1959 GAATG 0.2493 GAATT 0.2822 GACAA 0.2759 GACAC 0.1889 GACAG 0.2798 GACAT 0.2555 GACCA 0.3352 GACCC 0.2261 GACCG 0.1313 GACCT 0.3074 GACGA 0.2395 GACGC 0.2129 GACGG 0.2714 GACGT 0.2762 GACTA 0.1612 GACTC 0.2095 GACTG 0.3236 GACTT 0.3057 GAGAA 0.3394 GAGAC 0.1873 GAGAG 0.2649 GAGAT 0.2085 GAGCA 0.3324 GAGCC 0.2129 GAGCG 0.1264 GAGCT 0.3283 GAGGA 0.3806 GAGGC 0.1982 GAGGG 0.1987 GAGGT 0.2225 GAGTA 0.1817 GAGTC 0.2253 GAGTG 0.2412 GAGTT 0.3518 GATAA 0.3815 GATAC 0.1559 GATAG 0.1633 GATAT 0.2993 GATCA 0.3744 GATCC 0.2222 GATCG 0.08741 GATCT 0.316 GATGA 0.3065 GATGC 0.1824 GATGG 0.2236 GATGT 0.2874 GATTA 0.2348 GATTC 0.1746 GATTG 0.1814 GATTT 0.4092 GCAAA 0.4049 GCAAC 0.2307 GCAAG 0.1593 GCAAT 0.205 GCACA 0.4234 GCACC 0.2124 GCACG 0.08863 GCACT 0.2756 GCAGA 0.2964 GCAGC 0.2999 GCAGG 0.2007 GCAGT 0.2031 GCATA 0.1953 GCATC 0.2276 GCATG 0.2477 GCATT 0.3293 GCCAA 0.2605 GCCAC 0.2281 GCCAG 0.2555 GCCAT 0.256 GCCCA 0.3133 GCCCC 0.2671 GCCCG 0.1302 GCCCT 0.2895 GCCGA 0.2179 GCCGC 0.2922 GCCGG 0.2365 GCCGT 0.2534 GCCTA 0.1257 GCCTC 0.2796 GCCTG 0.3142 GCCTT 0.2804 GCGAA 0.2368 GCGAC 0.2626 GCGAG 0.2587 GCGAT 0.2419 GCGCA 0.265 GCGCC 0.2618 GCGCG 0.1417 GCGCT 0.3315 GCGGA 0.2385 GCGGC 0.312 GCGGG 0.2108 GCGGT 0.2387 GCGTA 0.1427 GCGTC 0.2678 GCGTG 0.2581 GCGTT 0.3314 GCTAA 0.4189 GCTAC 0.2094 GCTAG 0.1687 GCTAT 0.2029 GCTCA 0.3078 GCTCC 0.2717 GCTCG 0.08123 GCTCT 0.3392 GCTGA 0.2622 GCTGC 0.2994 GCTGG 0.1883 GCTGT 0.2501 GCTTA 0.1689 GCTTC 0.2556 GCTTG 0.1805 GCTTT 0.3951 GGAAA 0.405 GGAAC 0.1728 GGAAG 0.2445 GGAAT 0.1777 GGACA 0.3645 GGACC 0.2254 GGACG 0.1365 GGACT 0.2736 GGAGA 0.2974 GGAGC 0.2172 GGAGG 0.2976 GGAGT 0.1878 GGATA 0.1724 GGATC 0.2011 GGATG 0.3114 GGATT 0.3151 GGCAA 0.2666 GGCAC 0.1666 GGCAG 0.3552 GGCAT 0.2117 GGCCA 0.3107 GGCCC 0.2308 GGCCG 0.1713 GGCCT 0.2872 GGCGA 0.2035 GGCGC 0.2468 GGCGG 0.3089 GGCGT 0.2409 GGCTA 0.154 GGCTC 0.2366 GGCTG 0.3541 GGCTT 0.2553 GGGAA 0.3432 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.2725 GGGAT 0.2085 GGGCA 0.2793 GGGCC 0.2612 GGGCG 0.1593 GGGCT 0.3002 GGGGA 0.2809 GGGGC 0.1955 GGGGG 0.305 GGGGT 0.2187 GGGTA 0.1501 GGGTC 0.2495 GGGTG 0.2493 GGGTT 0.3511 GGTAA 0.3859 GGTAC 0.1781 GGTAG 0.2125 GGTAT 0.2235 GGTCA 0.373 GGTCC 0.2368 GGTCG 0.1031 GGTCT 0.2871 GGTGA 0.2891 GGTGC 0.1688 GGTGG 0.2586 GGTGT 0.2835 GGTTA 0.1738 GGTTC 0.2342 GGTTG 0.2049 GGTTT 0.3871 GTAAA 0.4263 GTAAC 0.1754 GTAAG 0.1479 GTAAT 0.2505 GTACA 0.4158 GTACC 0.185 GTACG 0.1059 GTACT 0.2933 GTAGA 0.3217 GTAGC 0.2348 GTAGG 0.1809 GTAGT 0.2626 GTATA 0.2214 GTATC 0.1581 GTATG 0.2205 GTATT 0.4 GTCAA 0.2446 GTCAC 0.2062 GTCAG 0.2948 GTCAT 0.2545 GTCCA 0.374 GTCCC 0.1861 GTCCG 0.1231 GTCCT 0.3168 GTCGA 0.2248 GTCGC 0.2234 GTCGG 0.2734 GTCGT 0.2784 GTCTA 0.1468 GTCTC 0.2229 GTCTG 0.338 GTCTT 0.2922 GTGAA 0.3463 GTGAC 0.2072 GTGAG 0.209 GTGAT 0.2376 GTGCA 0.375 GTGCC 0.1764 GTGCG 0.107 GTGCT 0.3415 GTGGA 0.3242 GTGGC 0.2018 GTGGG 0.2147 GTGGT 0.2592 GTGTA 0.1561 GTGTC 0.1602 GTGTG 0.3795 GTGTT 0.3042 GTTAA 0.3342 GTTAC 0.1899 GTTAG 0.2024 GTTAT 0.2734 GTTCA 0.3546 GTTCC 0.2078 GTTCG 0.06955 GTTCT 0.368 GTTGA 0.2568 GTTGC 0.2098 GTTGG 0.2112 GTTGT 0.3222 GTTTA 0.2039 GTTTC 0.1919 GTTTG 0.2165 GTTTT 0.3878 TAAAA 0.3901 TAAAC 0.1629 TAAAG 0.1709 TAAAT 0.276 TAACA 0.4016 TAACC 0.1793 TAACG 0.09462 TAACT 0.3245 TAAGA 0.3215 TAAGC 0.195 TAAGG 0.1906 TAAGT 0.2929 TAATA 0.2795 TAATC 0.1669 TAATG 0.2182 TAATT 0.3353 TACAA 0.2941 TACAC 0.1659 TACAG 0.2533 TACAT 0.2867 TACCA 0.3757 TACCC 0.1694 TACCG 0.1183 TACCT 0.3366 TACGA 0.2164 TACGC 0.1862 TACGG 0.2291 TACGT 0.3683 TACTA 0.1823 TACTC 0.1621 TACTG 0.3062 TACTT 0.3494 TAGAA 0.3576 TAGAC 0.1551 TAGAG 0.2141 TAGAT 0.2732 TAGCA 0.3836 TAGCC 0.1656 TAGCG 0.089 TAGCT 0.3617 TAGGA 0.3355 TAGGC 0.1817 TAGGG 0.1957 TAGGT 0.2871 TAGTA 0.2043 TAGTC 0.1733 TAGTG 0.224 TAGTT 0.3983 TATAA 0.3149 TATAC 0.1254 TATAG 0.1306 TATAT 0.4291 TATCA 0.3695 TATCC 0.1805 TATCG 0.07999 TATCT 0.37 TATGA 0.2975 TATGC 0.1742 TATGG 0.1781 TATGT 0.3502 TATTA 0.2305 TATTC 0.1425 TATTG 0.1651 TATTT 0.462 TCAAA 0.4078 TCAAC 0.1903 TCAAG 0.1676 TCAAT 0.2343 TCACA 0.4027 TCACC 0.2085 TCACG 0.07798 TCACT 0.3108 TCAGA 0.3209 TCAGC 0.2205 TCAGG 0.1869 TCAGT 0.2717 TCATA 0.1997 TCATC 0.229 TCATG 0.224 TCATT 0.3473 TCCAA 0.247 TCCAC 0.2017 TCCAG 0.2976 TCCAT 0.2537 TCCCA 0.3424 TCCCC 0.2376 TCCCG 0.1035 TCCCT 0.3166 TCCGA 0.2108 TCCGC 0.2255 TCCGG 0.269 TCCGT 0.2946 TCCTA 0.126 TCCTC 0.2917 TCCTG 0.3177 TCCTT 0.2646 TCGAA 0.2384 TCGAC 0.2538 TCGAG 0.2216 TCGAT 0.2862 TCGCA 0.2606 TCGCC 0.2619 TCGCG 0.09771 TCGCT 0.3798 TCGGA 0.2398 TCGGC 0.2502 TCGGG 0.2011 TCGGT 0.3089 TCGTA 0.1549 TCGTC 0.2813 TCGTG 0.2136 TCGTT 0.3503 TCTAA 0.3482 TCTAC 0.2082 TCTAG 0.1654 TCTAT 0.2781 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2568 TCTCG 0.06133 TCTCT 0.3857 TCTGA 0.284 TCTGC 0.2204 TCTGG 0.2028 TCTGT 0.2928 TCTTA 0.1793 TCTTC 0.2455 TCTTG 0.1774 TCTTT 0.3978 TGAAA 0.3718 TGAAC 0.1767 TGAAG 0.2173 TGAAT 0.2342 TGACA 0.3738 TGACC 0.2129 TGACG 0.1065 TGACT 0.3068 TGAGA 0.3006 TGAGC 0.2157 TGAGG 0.2308 TGAGT 0.2529 TGATA 0.1888 TGATC 0.1814 TGATG 0.2941 TGATT 0.3357 TGCAA 0.2527 TGCAC 0.1595 TGCAG 0.3408 TGCAT 0.247 TGCCA 0.3636 TGCCC 0.1817 TGCCG 0.119 TGCCT 0.3357 TGCGA 0.1995 TGCGC 0.2461 TGCGG 0.2445 TGCGT 0.3099 TGCTA 0.1814 TGCTC 0.1879 TGCTG 0.3601 TGCTT 0.2706 TGGAA 0.3028 TGGAC 0.1821 TGGAG 0.2714 TGGAT 0.2438 TGGCA 0.3238 TGGCC 0.2038 TGGCG 0.1196 TGGCT 0.3528 TGGGA 0.3136 TGGGC 0.1776 TGGGG 0.2309 TGGGT 0.278 TGGTA 0.1703 TGGTC 0.1893 TGGTG 0.2732 TGGTT 0.3672 TGTAA 0.3608 TGTAC 0.1597 TGTAG 0.2044 TGTAT 0.2752 TGTCA 0.361 TGTCC 0.2111 TGTCG 0.08328 TGTCT 0.3445 TGTGA 0.2541 TGTGC 0.1531 TGTGG 0.1898 TGTGT 0.4029 TGTTA 0.1789 TGTTC 0.1658 TGTTG 0.2218 TGTTT 0.4335 TTAAA 0.4304 TTAAC 0.1503 TTAAG 0.1395 TTAAT 0.2799 TTACA 0.418 TTACC 0.1784 TTACG 0.07208 TTACT 0.3315 TTAGA 0.2922 TTAGC 0.2551 TTAGG 0.1626 TTAGT 0.2902 TTATA 0.2067 TTATC 0.1439 TTATG 0.1911 TTATT 0.4584 TTCAA 0.2529 TTCAC 0.1915 TTCAG 0.2787 TTCAT 0.2768 TTCCA 0.346 TTCCC 0.2023 TTCCG 0.0678 TTCCT 0.3839 TTCGA 0.2209 TTCGC 0.2107 TTCGG 0.2605 TTCGT 0.308 TTCTA 0.1681 TTCTC 0.2005 TTCTG 0.3249 TTCTT 0.3065 TTGAA 0.338 TTGAC 0.1816 TTGAG 0.1935 TTGAT 0.2869 TTGCA 0.3735 TTGCC 0.1775 TTGCG 0.06917 TTGCT 0.3798 TTGGA 0.3151 TTGGC 0.183 TTGGG 0.1906 TTGGT 0.3114 TTGTA 0.2021 TTGTC 0.1709 TTGTG 0.2394 TTGTT 0.3876 TTTAA 0.344 TTTAC 0.1658 TTTAG 0.1634 TTTAT 0.3268 TTTCA 0.3422 TTTCC 0.2234 TTTCG 0.04052 TTTCT 0.3939 TTTGA 0.2708 TTTGC 0.1812 TTTGG 0.1966 TTTGT 0.3514 TTTTA 0.2444 TTTTC 0.1834 TTTTG 0.1778 TTTTT 0.3944