[1] # (a,c,g,t)= (0.306, 0.194, 0.194, 0.306) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.231 C 0.27 G 0.269 T 0.231 # l= 1 # Values AA 0.0562 AC 0.0578 AG 0.0631 AT 0.0535 CA 0.0725 CC 0.0708 CG 0.0629 CT 0.0632 GA 0.0684 GC 0.0725 GG 0.0706 GT 0.0578 TA 0.0335 TC 0.0685 TG 0.0724 TT 0.0563 # l= 2 # Values AAA 0.0148 AAC 0.013 AAG 0.0167 AAT 0.0118 ACA 0.0162 ACC 0.0158 ACG 0.0142 ACT 0.0116 AGA 0.0167 AGC 0.0174 AGG 0.0175 AGT 0.0116 ATA 0.00868 ATC 0.0154 ATG 0.0176 ATT 0.0118 CAA 0.0184 CAC 0.0174 CAG 0.0191 CAT 0.0176 CCA 0.0197 CCC 0.019 CCG 0.0146 CCT 0.0175 CGA 0.0179 CGC 0.0162 CGG 0.0146 CGT 0.0142 CTA 0.00835 CTC 0.019 CTG 0.0191 CTT 0.0167 GAA 0.0167 GAC 0.0173 GAG 0.019 GAT 0.0154 GCA 0.019 GCC 0.0199 GCG 0.0162 GCT 0.0174 GGA 0.0161 GGC 0.0199 GGG 0.0189 GGT 0.0158 GTA 0.0101 GTC 0.0173 GTG 0.0173 GTT 0.013 TAA 0.00638 TAC 0.0102 TAG 0.00833 TAT 0.00867 TCA 0.0177 TCC 0.0161 TCG 0.0179 TCT 0.0167 TGA 0.0177 TGC 0.019 TGG 0.0197 TGT 0.0162 TTA 0.00638 TTC 0.0167 TTG 0.0184 TTT 0.0148 # l= 3 # Values AAAA 0.00425 AAAC 0.00331 AAAG 0.00433 AAAT 0.00289 AACA 0.004 AACC 0.00343 AACG 0.00313 AACT 0.00243 AAGA 0.00466 AAGC 0.00454 AAGG 0.00447 AAGT 0.00305 AATA 0.00223 AATC 0.00311 AATG 0.00374 AATT 0.00269 ACAA 0.00411 ACAC 0.00399 ACAG 0.00423 ACAT 0.00385 ACCA 0.00464 ACCC 0.00398 ACCG 0.00307 ACCT 0.00409 ACGA 0.00441 ACGC 0.00356 ACGG 0.00338 ACGT 0.00286 ACTA 0.00177 ACTC 0.00319 ACTG 0.00358 ACTT 0.00304 AGAA 0.00428 AGAC 0.0042 AGAG 0.00465 AGAT 0.00361 AGCA 0.00489 AGCC 0.00459 AGCG 0.00354 AGCT 0.00434 AGGA 0.00402 AGGC 0.0048 AGGG 0.0046 AGGT 0.00409 AGTA 0.00216 AGTC 0.00349 AGTG 0.00351 AGTT 0.00243 ATAA 0.00183 ATAC 0.00248 ATAG 0.00193 ATAT 0.00245 ATCA 0.00454 ATCC 0.00352 ATCG 0.00375 ATCT 0.00361 ATGA 0.00457 ATGC 0.00456 ATGG 0.00463 ATGT 0.00385 ATTA 0.00155 ATTC 0.0034 ATTG 0.00393 ATTT 0.00289 CAAA 0.00437 CAAC 0.00461 CAAG 0.00553 CAAT 0.00393 CACA 0.00458 CACC 0.0051 CACG 0.00414 CACT 0.00351 CAGA 0.00455 CAGC 0.00583 CAGG 0.00515 CAGT 0.00358 CATA 0.00239 CATC 0.00577 CATG 0.0057 CATT 0.00374 CCAA 0.0049 CCAC 0.00488 CCAG 0.00526 CCAT 0.00463 CCCA 0.00495 CCCC 0.00569 CCCG 0.00371 CCCT 0.00461 CCGA 0.00399 CCGC 0.00408 CCGG 0.00311 CCGT 0.0034 CCTA 0.00219 CCTC 0.00569 CCTG 0.00515 CCTT 0.00447 CGAA 0.00404 CGAC 0.00493 CGAG 0.00518 CGAT 0.00375 CGCA 0.00393 CGCC 0.005 CGCG 0.0037 CGCT 0.00354 CGGA 0.00329 CGGC 0.00452 CGGG 0.00371 CGGT 0.00307 CGTA 0.00214 CGTC 0.00481 CGTG 0.00414 CGTT 0.00313 CTAA 0.00149 CTAC 0.00283 CTAG 0.00209 CTAT 0.00193 CTCA 0.00442 CTCC 0.00478 CTCG 0.00518 CTCT 0.00465 CTGA 0.00421 CTGC 0.0054 CTGG 0.00526 CTGT 0.00424 CTTA 0.00163 CTTC 0.00521 CTTG 0.00553 CTTT 0.00434 GAAA 0.0045 GAAC 0.00355 GAAG 0.00521 GAAT 0.00341 GACA 0.0048 GACC 0.00423 GACG 0.00481 GACT 0.00348 GAGA 0.00541 GAGC 0.00475 GAGG 0.00568 GAGT 0.00319 GATA 0.0026 GATC 0.00394 GATG 0.00576 GATT 0.00311 GCAA 0.00478 GCAC 0.00422 GCAG 0.0054 GCAT 0.00456 GCCA 0.00569 GCCC 0.00492 GCCG 0.00452 GCCT 0.0048 GCGA 0.00445 GCGC 0.0041 GCGG 0.00407 GCGT 0.00355 GCTA 0.00227 GCTC 0.00474 GCTG 0.00582 GCTT 0.00453 GGAA 0.00418 GGAC 0.00362 GGAG 0.00477 GGAT 0.00352 GGCA 0.00537 GGCC 0.00499 GGCG 0.00499 GGCT 0.00458 GGGA 0.00438 GGGC 0.00492 GGGG 0.00569 GGGT 0.00397 GGTA 0.00302 GGTC 0.00422 GGTG 0.0051 GGTT 0.00344 GTAA 0.00192 GTAC 0.00292 GTAG 0.00282 GTAT 0.00247 GTCA 0.00456 GTCC 0.00363 GTCG 0.00493 GTCT 0.0042 GTGA 0.00426 GTGC 0.00421 GTGG 0.00487 GTGT 0.00398 GTTA 0.00153 GTTC 0.00355 GTTG 0.00461 GTTT 0.0033 TAAA 0.00166 TAAC 0.00153 TAAG 0.00163 TAAT 0.00155 TACA 0.00282 TACC 0.00302 TACG 0.00214 TACT 0.00216 TAGA 0.00212 TAGC 0.00227 TAGG 0.00219 TAGT 0.00176 TATA 0.00146 TATC 0.0026 TATG 0.00239 TATT 0.00223 TCAA 0.00464 TCAC 0.00426 TCAG 0.0042 TCAT 0.00457 TCCA 0.00439 TCCC 0.00439 TCCG 0.00329 TCCT 0.00402 TCGA 0.00504 TCGC 0.00446 TCGG 0.00399 TCGT 0.00441 TCTA 0.00212 TCTC 0.00541 TCTG 0.00455 TCTT 0.00467 TGAA 0.00416 TGAC 0.00456 TGAG 0.00442 TGAT 0.00454 TGCA 0.00477 TGCC 0.00537 TGCG 0.00392 TGCT 0.00489 TGGA 0.00439 TGGC 0.00569 TGGG 0.00495 TGGT 0.00463 TGTA 0.00281 TGTC 0.0048 TGTG 0.00457 TGTT 0.004 TTAA 0.00115 TTAC 0.00192 TTAG 0.00148 TTAT 0.00183 TTCA 0.00416 TTCC 0.00418 TTCG 0.00404 TTCT 0.00429 TTGA 0.00464 TTGC 0.00478 TTGG 0.0049 TTGT 0.00412 TTTA 0.00166 TTTC 0.00451 TTTG 0.00437 TTTT 0.00425 # l= 4 # Values AAAAA 0.00139 AAAAC 0.000885 AAAAG 0.00124 AAAAT 0.00074 AAACA 0.00103 AAACC 0.000852 AAACG 0.00081 AAACT 0.000612 AAAGA 0.00127 AAAGC 0.00114 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.000786 AAATA 0.000625 AAATC 0.00076 AAATG 0.000865 AAATT 0.000642 AACAA 0.00114 AACAC 0.000941 AACAG 0.00101 AACAT 0.000911 AACCA 0.00102 AACCC 0.000996 AACCG 0.000622 AACCT 0.000802 AACGA 0.001 AACGC 0.000802 AACGG 0.000697 AACGT 0.000631 AACTA 0.000374 AACTC 0.00072 AACTG 0.000713 AACTT 0.000622 AAGAA 0.0014 AAGAC 0.00115 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.000906 AAGCA 0.00127 AAGCC 0.00119 AAGCG 0.000859 AAGCT 0.00121 AAGGA 0.00105 AAGGC 0.00119 AAGGG 0.00123 AAGGT 0.00101 AAGTA 0.0006 AAGTC 0.000942 AAGTG 0.00088 AAGTT 0.000622 AATAA 0.000509 AATAC 0.000604 AATAG 0.000506 AATAT 0.000616 AATCA 0.000981 AATCC 0.00071 AATCG 0.000745 AATCT 0.000675 AATGA 0.000969 AATGC 0.00101 AATGG 0.00103 AATGT 0.000726 AATTA 0.000419 AATTC 0.000719 AATTG 0.000905 AATTT 0.000642 ACAAA 0.00101 ACAAC 0.00106 ACAAG 0.0012 ACAAT 0.000846 ACACA 0.00119 ACACC 0.0011 ACACG 0.000916 ACACT 0.000777 ACAGA 0.00101 ACAGC 0.00128 ACAGG 0.00118 ACAGT 0.000765 ACATA 0.000588 ACATC 0.0011 ACATG 0.00144 ACATT 0.000726 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00124 ACCAG 0.00123 ACCAT 0.001 ACCCA 0.00112 ACCCC 0.00116 ACCCG 0.000772 ACCCT 0.000923 ACCGA 0.000972 ACCGC 0.000814 ACCGG 0.00061 ACCGT 0.000671 ACCTA 0.000687 ACCTC 0.00122 ACCTG 0.00118 ACCTT 0.00101 ACGAA 0.001 ACGAC 0.00125 ACGAG 0.00126 ACGAT 0.000899 ACGCA 0.000871 ACGCC 0.00108 ACGCG 0.000812 ACGCT 0.000792 ACGGA 0.000835 ACGGC 0.00107 ACGGG 0.000823 ACGGT 0.000671 ACGTA 0.000537 ACGTC 0.00088 ACGTG 0.000815 ACGTT 0.000631 ACTAA 0.000294 ACTAC 0.000643 ACTAG 0.000415 ACTAT 0.000412 ACTCA 0.00073 ACTCC 0.000719 ACTCG 0.000942 ACTCT 0.000802 ACTGA 0.000838 ACTGC 0.000986 ACTGG 0.00099 ACTGT 0.000765 ACTTA 0.000302 ACTTC 0.000882 ACTTG 0.00108 ACTTT 0.000786 AGAAA 0.00129 AGAAC 0.000834 AGAAG 0.00135 AGAAT 0.000811 AGACA 0.0012 AGACC 0.000983 AGACG 0.0012 AGACT 0.000823 AGAGA 0.00145 AGAGC 0.00108 AGAGG 0.00131 AGAGT 0.000802 AGATA 0.000676 AGATC 0.000901 AGATG 0.00135 AGATT 0.000675 AGCAA 0.00129 AGCAC 0.00113 AGCAG 0.00136 AGCAT 0.00111 AGCCA 0.00134 AGCCC 0.00114 AGCCG 0.000988 AGCCT 0.00111 AGCGA 0.00105 AGCGC 0.000848 AGCGG 0.000855 AGCGT 0.000792 AGCTA 0.000612 AGCTC 0.00124 AGCTG 0.00128 AGCTT 0.00121 AGGAA 0.00108 AGGAC 0.000876 AGGAG 0.00121 AGGAT 0.000857 AGGCA 0.00139 AGGCC 0.00114 AGGCG 0.00116 AGGCT 0.00111 AGGGA 0.00111 AGGGC 0.00113 AGGGG 0.00144 AGGGT 0.000923 AGGTA 0.00104 AGGTC 0.00104 AGGTG 0.00121 AGGTT 0.000802 AGTAA 0.000422 AGTAC 0.000563 AGTAG 0.00064 AGTAT 0.000534 AGTCA 0.000975 AGTCC 0.000724 AGTCG 0.000962 AGTCT 0.000823 AGTGA 0.000919 AGTGC 0.000821 AGTGG 0.000993 AGTGT 0.000777 AGTTA 0.000309 AGTTC 0.000629 AGTTG 0.000883 AGTTT 0.000612 ATAAA 0.000479 ATAAC 0.000444 ATAAG 0.000455 ATAAT 0.000448 ATACA 0.000721 ATACC 0.000692 ATACG 0.000525 ATACT 0.000534 ATAGA 0.000552 ATAGC 0.000554 ATAGG 0.000412 ATAGT 0.000412 ATATA 0.000426 ATATC 0.00073 ATATG 0.000675 ATATT 0.000616 ATCAA 0.00118 ATCAC 0.00116 ATCAG 0.000997 ATCAT 0.00121 ATCCA 0.000934 ATCCC 0.000959 ATCCG 0.000773 ATCCT 0.000857 ATCGA 0.0011 ATCGC 0.000985 ATCGG 0.000761 ATCGT 0.000899 ATCTA 0.00051 ATCTC 0.00115 ATCTG 0.00104 ATCTT 0.000906 ATGAA 0.00105 ATGAC 0.0011 ATGAG 0.0012 ATGAT 0.00121 ATGCA 0.00127 ATGCC 0.00122 ATGCG 0.000959 ATGCT 0.00111 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.00135 ATGGG 0.00111 ATGGT 0.001 ATGTA 0.00074 ATGTC 0.00117 ATGTG 0.00103 ATGTT 0.000911 ATTAA 0.000292 ATTAC 0.000482 ATTAG 0.000332 ATTAT 0.000448 ATTCA 0.000934 ATTCC 0.000799 ATTCG 0.000863 ATTCT 0.000811 ATTGA 0.00106 ATTGC 0.000981 ATTGG 0.00105 ATTGT 0.000846 ATTTA 0.000399 ATTTC 0.000889 ATTTG 0.000865 ATTTT 0.00074 CAAAA 0.00118 CAAAC 0.00108 CAAAG 0.00124 CAAAT 0.000865 CAACA 0.00143 CAACC 0.00122 CAACG 0.00107 CAACT 0.000883 CAAGA 0.00144 CAAGC 0.00155 CAAGG 0.00146 CAAGT 0.00108 CAATA 0.000689 CAATC 0.00112 CAATG 0.00121 CAATT 0.000905 CACAA 0.00105 CACAC 0.00131 CACAG 0.00118 CACAT 0.00103 CACCA 0.00162 CACCC 0.00127 CACCG 0.000996 CACCT 0.00121 CACGA 0.00123 CACGC 0.0011 CACGG 0.001 CACGT 0.000815 CACTA 0.000507 CACTC 0.000998 CACTG 0.00113 CACTT 0.00088 CAGAA 0.00108 CAGAC 0.00121 CAGAG 0.00122 CAGAT 0.00104 CAGCA 0.00164 CAGCC 0.00167 CAGCG 0.00122 CAGCT 0.00128 CAGGA 0.00109 CAGGC 0.00156 CAGGG 0.00132 CAGGT 0.00118 CAGTA 0.000657 CAGTC 0.00109 CAGTG 0.00113 CAGTT 0.000713 CATAA 0.000466 CATAC 0.000716 CATAG 0.000532 CATAT 0.000675 CATCA 0.00175 CATCC 0.00134 CATCG 0.00132 CATCT 0.00135 CATGA 0.00145 CATGC 0.00142 CATGG 0.00141 CATGT 0.00144 CATTA 0.000476 CATTC 0.00119 CATTG 0.00121 CATTT 0.000865 CCAAA 0.00116 CCAAC 0.00122 CCAAG 0.00147 CCAAT 0.00105 CCACA 0.00113 CCACC 0.00161 CCACG 0.00115 CCACT 0.000993 CCAGA 0.00126 CCAGC 0.00164 CCAGG 0.00137 CCAGT 0.00099 CCATA 0.000576 CCATC 0.00161 CCATG 0.00141 CCATT 0.00103 CCCAA 0.00127 CCCAC 0.00127 CCCAG 0.0013 CCCAT 0.00111 CCCCA 0.00125 CCCCC 0.00199 CCCCG 0.00101 CCCCT 0.00144 CCCGA 0.000959 CCCGC 0.00116 CCCGG 0.000772 CCCGT 0.000823 CCCTA 0.000489 CCCTC 0.00156 CCCTG 0.00132 CCCTT 0.00123 CCGAA 0.000987 CCGAC 0.00114 CCGAG 0.00111 CCGAT 0.000761 CCGCA 0.000941 CCGCC 0.00142 CCGCG 0.000853 CCGCT 0.000855 CCGGA 0.000692 CCGGC 0.00104 CCGGG 0.000772 CCGGT 0.00061 CCGTA 0.000487 CCGTC 0.0012 CCGTG 0.001 CCGTT 0.000697 CCTAA 0.000401 CCTAC 0.000767 CCTAG 0.000605 CCTAT 0.000412 CCTCA 0.00128 CCTCC 0.00159 CCTCG 0.0015 CCTCT 0.00131 CCTGA 0.00112 CCTGC 0.00148 CCTGG 0.00137 CCTGT 0.00118 CCTTA 0.000461 CCTTC 0.00141 CCTTG 0.00146 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.00111 CGAAC 0.000873 CGAAG 0.0012 CGAAT 0.000863 CGACA 0.00139 CGACC 0.00125 CGACG 0.00133 CGACT 0.000962 CGAGA 0.0014 CGAGC 0.00134 CGAGG 0.0015 CGAGT 0.000942 CGATA 0.000674 CGATC 0.00101 CGATG 0.00132 CGATT 0.000745 CGCAA 0.00107 CGCAC 0.000901 CGCAG 0.000998 CGCAT 0.000959 CGCCA 0.00139 CGCCC 0.00127 CGCCG 0.00118 CGCCT 0.00116 CGCGA 0.00101 CGCGC 0.00103 CGCGG 0.000853 CGCGT 0.000812 CGCTA 0.000449 CGCTC 0.00102 CGCTG 0.00122 CGCTT 0.000859 CGGAA 0.00081 CGGAC 0.000806 CGGAG 0.000902 CGGAT 0.000773 CGGCA 0.00118 CGGCC 0.00118 CGGCG 0.00118 CGGCT 0.000988 CGGGA 0.000895 CGGGC 0.00104 CGGGG 0.00101 CGGGT 0.000772 CGGTA 0.00054 CGGTC 0.000907 CGGTG 0.000996 CGGTT 0.000622 CGTAA 0.000404 CGTAC 0.000612 CGTAG 0.000598 CGTAT 0.000525 CGTCA 0.00125 CGTCC 0.00102 CGTCG 0.00133 CGTCT 0.0012 CGTGA 0.00103 CGTGC 0.00104 CGTGG 0.00115 CGTGT 0.000916 CGTTA 0.000361 CGTTC 0.00089 CGTTG 0.00107 CGTTT 0.00081 CTAAA 0.000376 CTAAC 0.000381 CTAAG 0.000396 CTAAT 0.000332 CTACA 0.00071 CTACC 0.000873 CTACG 0.000598 CTACT 0.00064 CTAGA 0.000498 CTAGC 0.000573 CTAGG 0.000605 CTAGT 0.000415 CTATA 0.0003 CTATC 0.000594 CTATG 0.000532 CTATT 0.000506 CTCAA 0.0011 CTCAC 0.00107 CTCAG 0.00104 CTCAT 0.0012 CTCCA 0.0013 CTCCC 0.00136 CTCCG 0.000902 CTCCT 0.00121 CTCGA 0.00149 CTCGC 0.00132 CTCGG 0.00111 CTCGT 0.00126 CTCTA 0.000547 CTCTC 0.00167 CTCTG 0.00122 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00104 CTGAC 0.00112 CTGAG 0.00104 CTGAT 0.000997 CTGCA 0.00137 CTGCC 0.00167 CTGCG 0.000998 CTGCT 0.00136 CTGGA 0.00116 CTGGC 0.00157 CTGGG 0.0013 CTGGT 0.00123 CTGTA 0.000682 CTGTC 0.00136 CTGTG 0.00118 CTGTT 0.00101 CTTAA 0.000275 CTTAC 0.000503 CTTAG 0.000396 CTTAT 0.000455 CTTCA 0.00127 CTTCC 0.00139 CTTCG 0.0012 CTTCT 0.00135 CTTGA 0.00142 CTTGC 0.00144 CTTGG 0.00147 CTTGT 0.0012 CTTTA 0.000421 CTTTC 0.00143 CTTTG 0.00124 CTTTT 0.00124 GAAAA 0.00123 GAAAC 0.000955 GAAAG 0.00143 GAAAT 0.000889 GAACA 0.00108 GAACC 0.000949 GAACG 0.00089 GAACT 0.000629 GAAGA 0.00153 GAAGC 0.00139 GAAGG 0.00141 GAAGT 0.000882 GAATA 0.000649 GAATC 0.000844 GAATG 0.00119 GAATT 0.000719 GACAA 0.00119 GACAC 0.00107 GACAG 0.00136 GACAT 0.00117 GACCA 0.00123 GACCC 0.00104 GACCG 0.000907 GACCT 0.00104 GACGA 0.00157 GACGC 0.00117 GACGG 0.0012 GACGT 0.00088 GACTA 0.000542 GACTC 0.000917 GACTG 0.00109 GACTT 0.000942 GAGAA 0.00133 GAGAC 0.00125 GAGAG 0.00167 GAGAT 0.00115 GAGCA 0.00132 GAGCC 0.00117 GAGCG 0.00102 GAGCT 0.00124 GAGGA 0.00143 GAGGC 0.00149 GAGGG 0.00156 GAGGT 0.00122 GAGTA 0.000558 GAGTC 0.000917 GAGTG 0.000998 GAGTT 0.00072 GATAA 0.000531 GATAC 0.000745 GATAG 0.000594 GATAT 0.00073 GATCA 0.00111 GATCC 0.00092 GATCG 0.00101 GATCT 0.000901 GATGA 0.00154 GATGC 0.00152 GATGG 0.00161 GATGT 0.0011 GATTA 0.000387 GATTC 0.000844 GATTG 0.00112 GATTT 0.00076 GCAAA 0.00119 GCAAC 0.00118 GCAAG 0.00144 GCAAT 0.000981 GCACA 0.00117 GCACC 0.00118 GCACG 0.00104 GCACT 0.000821 GCAGA 0.00129 GCAGC 0.00166 GCAGG 0.00148 GCAGT 0.000986 GCATA 0.000606 GCATC 0.00152 GCATG 0.00142 GCATT 0.00101 GCCAA 0.00148 GCCAC 0.00129 GCCAG 0.00157 GCCAT 0.00135 GCCCA 0.00139 GCCCC 0.00136 GCCCG 0.00104 GCCCT 0.00113 GCCGA 0.0012 GCCGC 0.00122 GCCGG 0.00104 GCCGT 0.00107 GCCTA 0.000566 GCCTC 0.00149 GCCTG 0.00156 GCCTT 0.00119 GCGAA 0.000979 GCGAC 0.00118 GCGAG 0.00132 GCGAT 0.000985 GCGCA 0.00105 GCGCC 0.00117 GCGCG 0.00103 GCGCT 0.000848 GCGGA 0.000892 GCGGC 0.00122 GCGGG 0.00116 GCGGT 0.000814 GCGTA 0.000496 GCGTC 0.00117 GCGTG 0.0011 GCGTT 0.000802 GCTAA 0.000422 GCTAC 0.000719 GCTAG 0.000573 GCTAT 0.000554 GCTCA 0.00119 GCTCC 0.00113 GCTCG 0.00134 GCTCT 0.00108 GCTGA 0.00125 GCTGC 0.00166 GCTGG 0.00164 GCTGT 0.00128 GCTTA 0.00045 GCTTC 0.00139 GCTTG 0.00155 GCTTT 0.00114 GGAAA 0.00113 GGAAC 0.000859 GGAAG 0.00139 GGAAT 0.000799 GGACA 0.00103 GGACC 0.000852 GGACG 0.00102 GGACT 0.000724 GGAGA 0.00133 GGAGC 0.00113 GGAGG 0.00159 GGAGT 0.000719 GGATA 0.000552 GGATC 0.00092 GGATG 0.00134 GGATT 0.00071 GGCAA 0.0013 GGCAC 0.00117 GGCAG 0.00167 GGCAT 0.00122 GGCCA 0.00148 GGCCC 0.00119 GGCCG 0.00118 GGCCT 0.00114 GGCGA 0.00132 GGCGC 0.00117 GGCGG 0.00142 GGCGT 0.00108 GGCTA 0.00056 GGCTC 0.00117 GGCTG 0.00167 GGCTT 0.00119 GGGAA 0.00118 GGGAC 0.000885 GGGAG 0.00136 GGGAT 0.000959 GGGCA 0.00132 GGGCC 0.00119 GGGCG 0.00127 GGGCT 0.00114 GGGGA 0.00118 GGGGC 0.00136 GGGGG 0.00199 GGGGT 0.00116 GGGTA 0.000666 GGGTC 0.00104 GGGTG 0.00127 GGGTT 0.000996 GGTAA 0.000569 GGTAC 0.000888 GGTAG 0.000873 GGTAT 0.000692 GGTCA 0.00114 GGTCC 0.000852 GGTCG 0.00125 GGTCT 0.000983 GGTGA 0.00121 GGTGC 0.00118 GGTGG 0.00161 GGTGT 0.0011 GGTTA 0.000409 GGTTC 0.000949 GGTTG 0.00122 GGTTT 0.000852 GTAAA 0.000485 GTAAC 0.000452 GTAAG 0.000503 GTAAT 0.000482 GTACA 0.00086 GTACC 0.000888 GTACG 0.000612 GTACT 0.000563 GTAGA 0.000698 GTAGC 0.000719 GTAGG 0.000767 GTAGT 0.000643 GTATA 0.000415 GTATC 0.000745 GTATG 0.000716 GTATT 0.000604 GTCAA 0.00128 GTCAC 0.00106 GTCAG 0.00112 GTCAT 0.0011 GTCCA 0.00106 GTCCC 0.000885 GTCCG 0.000806 GTCCT 0.000876 GTCGA 0.00137 GTCGC 0.00118 GTCGG 0.00114 GTCGT 0.00125 GTCTA 0.000581 GTCTC 0.00125 GTCTG 0.00121 GTCTT 0.00115 GTGAA 0.00098 GTGAC 0.00106 GTGAG 0.00107 GTGAT 0.00116 GTGCA 0.00101 GTGCC 0.00117 GTGCG 0.000901 GTGCT 0.00113 GTGGA 0.00108 GTGGC 0.00129 GTGGG 0.00127 GTGGT 0.00124 GTGTA 0.000663 GTGTC 0.00107 GTGTG 0.00131 GTGTT 0.000941 GTTAA 0.000258 GTTAC 0.000452 GTTAG 0.000381 GTTAT 0.000444 GTTCA 0.000983 GTTCC 0.000859 GTTCG 0.000873 GTTCT 0.000834 GTTGA 0.00116 GTTGC 0.00118 GTTGG 0.00122 GTTGT 0.00106 GTTTA 0.000389 GTTTC 0.000955 GTTTG 0.00108 GTTTT 0.000885 TAAAA 0.000451 TAAAC 0.000389 TAAAG 0.000421 TAAAT 0.000399 TAACA 0.000454 TAACC 0.000409 TAACG 0.000361 TAACT 0.000309 TAAGA 0.000419 TAAGC 0.00045 TAAGG 0.000461 TAAGT 0.000302 TAATA 0.000271 TAATC 0.000387 TAATG 0.000476 TAATT 0.000419 TACAA 0.000728 TACAC 0.000663 TACAG 0.000682 TACAT 0.00074 TACCA 0.000769 TACCC 0.000666 TACCG 0.00054 TACCT 0.00104 TACGA 0.000616 TACGC 0.000496 TACGG 0.000487 TACGT 0.000537 TACTA 0.000347 TACTC 0.000558 TACTG 0.000657 TACTT 0.0006 TAGAA 0.000481 TAGAC 0.000581 TAGAG 0.000547 TAGAT 0.00051 TAGCA 0.000647 TAGCC 0.00056 TAGCG 0.000449 TAGCT 0.000612 TAGGA 0.000448 TAGGC 0.000566 TAGGG 0.000489 TAGGT 0.000687 TAGTA 0.000347 TAGTC 0.000542 TAGTG 0.000507 TAGTT 0.000374 TATAA 0.000322 TATAC 0.000415 TATAG 0.0003 TATAT 0.000426 TATCA 0.0007 TATCC 0.000552 TATCG 0.000674 TATCT 0.000676 TATGA 0.000617 TATGC 0.000606 TATGG 0.000576 TATGT 0.000588 TATTA 0.000271 TATTC 0.000649 TATTG 0.000689 TATTT 0.000625 TCAAA 0.00101 TCAAC 0.00116 TCAAG 0.00142 TCAAT 0.00106 TCACA 0.00109 TCACC 0.00121 TCACG 0.00103 TCACT 0.000919 TCAGA 0.000991 TCAGC 0.00125 TCAGG 0.00112 TCAGT 0.000838 TCATA 0.000617 TCATC 0.00154 TCATG 0.00145 TCATT 0.000969 TCCAA 0.000989 TCCAC 0.00108 TCCAG 0.00116 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.00119 TCCCC 0.00118 TCCCG 0.000895 TCCCT 0.00111 TCCGA 0.000866 TCCGC 0.000892 TCCGG 0.000692 TCCGT 0.000835 TCCTA 0.000448 TCCTC 0.00143 TCCTG 0.00109 TCCTT 0.00105 TCGAA 0.00107 TCGAC 0.00137 TCGAG 0.00149 TCGAT 0.0011 TCGCA 0.00107 TCGCC 0.00132 TCGCG 0.00101 TCGCT 0.00105 TCGGA 0.000866 TCGGC 0.0012 TCGGG 0.000959 TCGGT 0.000972 TCGTA 0.000616 TCGTC 0.00157 TCGTG 0.00123 TCGTT 0.001 TCTAA 0.000371 TCTAC 0.000698 TCTAG 0.000498 TCTAT 0.000552 TCTCA 0.00122 TCTCC 0.00133 TCTCG 0.0014 TCTCT 0.00145 TCTGA 0.000991 TCTGC 0.00129 TCTGG 0.00126 TCTGT 0.00101 TCTTA 0.000419 TCTTC 0.00153 TCTTG 0.00144 TCTTT 0.00127 TGAAA 0.000973 TGAAC 0.000983 TGAAG 0.00127 TGAAT 0.000934 TGACA 0.00119 TGACC 0.00114 TGACG 0.00125 TGACT 0.000975 TGAGA 0.00122 TGAGC 0.00119 TGAGG 0.00128 TGAGT 0.00073 TGATA 0.0007 TGATC 0.00111 TGATG 0.00175 TGATT 0.000981 TGCAA 0.00112 TGCAC 0.00101 TGCAG 0.00137 TGCAT 0.00127 TGCCA 0.00149 TGCCC 0.00132 TGCCG 0.00118 TGCCT 0.00139 TGCGA 0.00107 TGCGC 0.00105 TGCGG 0.000941 TGCGT 0.000871 TGCTA 0.000647 TGCTC 0.00132 TGCTG 0.00164 TGCTT 0.00127 TGGAA 0.0011 TGGAC 0.00106 TGGAG 0.0013 TGGAT 0.000934 TGGCA 0.00149 TGGCC 0.00148 TGGCG 0.00139 TGGCT 0.00134 TGGGA 0.00119 TGGGC 0.00139 TGGGG 0.00125 TGGGT 0.00112 TGGTA 0.000769 TGGTC 0.00123 TGGTG 0.00162 TGGTT 0.00102 TGTAA 0.000525 TGTAC 0.00086 TGTAG 0.00071 TGTAT 0.000721 TGTCA 0.00119 TGTCC 0.00103 TGTCG 0.00139 TGTCT 0.0012 TGTGA 0.00109 TGTGC 0.00117 TGTGG 0.00113 TGTGT 0.00119 TGTTA 0.000454 TGTTC 0.00108 TGTTG 0.00143 TGTTT 0.00103 TTAAA 0.000321 TTAAC 0.000258 TTAAG 0.000275 TTAAT 0.000292 TTACA 0.000525 TTACC 0.000569 TTACG 0.000404 TTACT 0.000422 TTAGA 0.000371 TTAGC 0.000422 TTAGG 0.000401 TTAGT 0.000294 TTATA 0.000322 TTATC 0.000531 TTATG 0.000466 TTATT 0.000509 TTCAA 0.00109 TTCAC 0.00098 TTCAG 0.00104 TTCAT 0.00105 TTCCA 0.0011 TTCCC 0.00118 TTCCG 0.00081 TTCCT 0.00108 TTCGA 0.00107 TTCGC 0.000979 TTCGG 0.000987 TTCGT 0.001 TTCTA 0.000481 TTCTC 0.00133 TTCTG 0.00108 TTCTT 0.0014 TTGAA 0.00109 TTGAC 0.00128 TTGAG 0.0011 TTGAT 0.00118 TTGCA 0.00112 TTGCC 0.0013 TTGCG 0.00107 TTGCT 0.00129 TTGGA 0.000989 TTGGC 0.00148 TTGGG 0.00127 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.000728 TTGTC 0.00119 TTGTG 0.00105 TTGTT 0.00114 TTTAA 0.000321 TTTAC 0.000485 TTTAG 0.000376 TTTAT 0.000479 TTTCA 0.000973 TTTCC 0.00113 TTTCG 0.00111 TTTCT 0.00129 TTTGA 0.00101 TTTGC 0.00119 TTTGG 0.00116 TTTGT 0.00101 TTTTA 0.000451 TTTTC 0.00123 TTTTG 0.00118 TTTTT 0.00139 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3272 AAAAC 0.2081 AAAAG 0.2909 AAAAT 0.1738 AAACA 0.3117 AAACC 0.258 AAACG 0.2453 AAACT 0.185 AAAGA 0.2928 AAAGC 0.2632 AAAGG 0.2628 AAAGT 0.1812 AAATA 0.216 AAATC 0.2627 AAATG 0.2994 AAATT 0.2219 AACAA 0.2845 AACAC 0.2351 AACAG 0.2527 AACAT 0.2276 AACCA 0.2959 AACCC 0.29 AACCG 0.1808 AACCT 0.2332 AACGA 0.3201 AACGC 0.2561 AACGG 0.2225 AACGT 0.2014 AACTA 0.1535 AACTC 0.2968 AACTG 0.2936 AACTT 0.2561 AAGAA 0.3004 AAGAC 0.2469 AAGAG 0.2588 AAGAT 0.194 AAGCA 0.281 AAGCC 0.2624 AAGCG 0.1894 AAGCT 0.2673 AAGGA 0.2346 AAGGC 0.2653 AAGGG 0.2752 AAGGT 0.2249 AAGTA 0.197 AAGTC 0.3096 AAGTG 0.2892 AAGTT 0.2042 AATAA 0.2275 AATAC 0.2704 AATAG 0.2262 AATAT 0.276 AATCA 0.3156 AATCC 0.2281 AATCG 0.2395 AATCT 0.2168 AATGA 0.2593 AATGC 0.2706 AATGG 0.276 AATGT 0.1941 AATTA 0.1556 AATTC 0.268 AATTG 0.3372 AATTT 0.2391 ACAAA 0.2452 ACAAC 0.257 ACAAG 0.2923 ACAAT 0.2054 ACACA 0.2989 ACACC 0.2756 ACACG 0.2303 ACACT 0.1952 ACAGA 0.239 ACAGC 0.3016 ACAGG 0.279 ACAGT 0.1805 ACATA 0.1525 ACATC 0.2854 ACATG 0.3735 ACATT 0.1886 ACCAA 0.2517 ACCAC 0.2675 ACCAG 0.2647 ACCAT 0.2161 ACCCA 0.2821 ACCCC 0.2912 ACCCG 0.1943 ACCCT 0.2324 ACCGA 0.3173 ACCGC 0.2655 ACCGG 0.1986 ACCGT 0.2186 ACCTA 0.1677 ACCTC 0.2981 ACCTG 0.2883 ACCTT 0.246 ACGAA 0.2275 ACGAC 0.2832 ACGAG 0.2858 ACGAT 0.2036 ACGCA 0.2451 ACGCC 0.3038 ACGCG 0.2284 ACGCT 0.2227 ACGGA 0.2458 ACGGC 0.3146 ACGGG 0.2422 ACGGT 0.1974 ACGTA 0.1874 ACGTC 0.3076 ACGTG 0.2848 ACGTT 0.2202 ACTAA 0.1661 ACTAC 0.3652 ACTAG 0.2352 ACTAT 0.2335 ACTCA 0.2286 ACTCC 0.2253 ACTCG 0.2951 ACTCT 0.251 ACTGA 0.2341 ACTGC 0.2755 ACTGG 0.2766 ACTGT 0.2138 ACTTA 0.09824 ACTTC 0.289 ACTTG 0.3552 ACTTT 0.2576 AGAAA 0.3022 AGAAC 0.1944 AGAAG 0.3144 AGAAT 0.189 AGACA 0.2846 AGACC 0.2338 AGACG 0.2857 AGACT 0.1958 AGAGA 0.3127 AGAGC 0.2331 AGAGG 0.2821 AGAGT 0.1721 AGATA 0.1872 AGATC 0.2499 AGATG 0.376 AGATT 0.1869 AGCAA 0.2641 AGCAC 0.2312 AGCAG 0.2774 AGCAT 0.2273 AGCCA 0.293 AGCCC 0.2492 AGCCG 0.2155 AGCCT 0.2423 AGCGA 0.296 AGCGC 0.2393 AGCGG 0.2412 AGCGT 0.2234 AGCTA 0.1406 AGCTC 0.2851 AGCTG 0.2954 AGCTT 0.2789 AGGAA 0.2689 AGGAC 0.2176 AGGAG 0.3008 AGGAT 0.2128 AGGCA 0.2905 AGGCC 0.2365 AGGCG 0.2419 AGGCT 0.2311 AGGGA 0.2415 AGGGC 0.2457 AGGGG 0.3126 AGGGT 0.2002 AGGTA 0.255 AGGTC 0.2546 AGGTG 0.2948 AGGTT 0.1957 AGTAA 0.195 AGTAC 0.2608 AGTAG 0.2967 AGTAT 0.2474 AGTCA 0.2799 AGTCC 0.2077 AGTCG 0.2761 AGTCT 0.2363 AGTGA 0.2619 AGTGC 0.2338 AGTGG 0.2831 AGTGT 0.2212 AGTTA 0.1266 AGTTC 0.2586 AGTTG 0.3634 AGTTT 0.2515 ATAAA 0.2625 ATAAC 0.243 ATAAG 0.2493 ATAAT 0.2451 ATACA 0.292 ATACC 0.2799 ATACG 0.2121 ATACT 0.216 ATAGA 0.2859 ATAGC 0.2874 ATAGG 0.2133 ATAGT 0.2133 ATATA 0.1736 ATATC 0.2986 ATATG 0.2759 ATATT 0.252 ATCAA 0.259 ATCAC 0.255 ATCAG 0.2196 ATCAT 0.2664 ATCCA 0.2652 ATCCC 0.2723 ATCCG 0.2193 ATCCT 0.2432 ATCGA 0.2947 ATCGC 0.2628 ATCGG 0.2028 ATCGT 0.2398 ATCTA 0.141 ATCTC 0.3196 ATCTG 0.2883 ATCTT 0.2511 ATGAA 0.2302 ATGAC 0.2419 ATGAG 0.2631 ATGAT 0.2648 ATGCA 0.2779 ATGCC 0.2682 ATGCG 0.2102 ATGCT 0.2437 ATGGA 0.251 ATGGC 0.2924 ATGGG 0.2401 ATGGT 0.2165 ATGTA 0.192 ATGTC 0.3038 ATGTG 0.2675 ATGTT 0.2367 ATTAA 0.1875 ATTAC 0.3106 ATTAG 0.2135 ATTAT 0.2884 ATTCA 0.2743 ATTCC 0.2344 ATTCG 0.2532 ATTCT 0.2381 ATTGA 0.2685 ATTGC 0.2495 ATTGG 0.2668 ATTGT 0.2152 ATTTA 0.1375 ATTTC 0.3077 ATTTG 0.2991 ATTTT 0.2557 CAAAA 0.2698 CAAAC 0.2474 CAAAG 0.2849 CAAAT 0.1979 CAACA 0.3114 CAACC 0.2655 CAACG 0.2317 CAACT 0.1914 CAAGA 0.2597 CAAGC 0.2811 CAAGG 0.2635 CAAGT 0.1957 CAATA 0.1752 CAATC 0.2859 CAATG 0.3085 CAATT 0.2303 CACAA 0.2295 CACAC 0.2874 CACAG 0.2579 CACAT 0.2251 CACCA 0.3187 CACCC 0.2495 CACCG 0.1953 CACCT 0.2365 CACGA 0.296 CACGC 0.2658 CACGG 0.2415 CACGT 0.1967 CACTA 0.144 CACTC 0.2845 CACTG 0.3208 CACTT 0.2507 CAGAA 0.2369 CAGAC 0.2668 CAGAG 0.2678 CAGAT 0.2285 CAGCA 0.2827 CAGCC 0.2875 CAGCG 0.2094 CAGCT 0.2204 CAGGA 0.2121 CAGGC 0.3021 CAGGG 0.257 CAGGT 0.2288 CAGTA 0.183 CAGTC 0.304 CAGTG 0.3142 CAGTT 0.1988 CATAA 0.1947 CATAC 0.2999 CATAG 0.2228 CATAT 0.2826 CATCA 0.3043 CATCC 0.2325 CATCG 0.2283 CATCT 0.2349 CATGA 0.2536 CATGC 0.2484 CATGG 0.2464 CATGT 0.2516 CATTA 0.127 CATTC 0.3173 CATTG 0.3242 CATTT 0.2315 CCAAA 0.2364 CCAAC 0.2487 CCAAG 0.3007 CCAAT 0.2141 CCACA 0.2314 CCACC 0.3299 CCACG 0.2349 CCACT 0.2037 CCAGA 0.239 CCAGC 0.3122 CCAGG 0.2608 CCAGT 0.188 CCATA 0.1243 CCATC 0.3487 CCATG 0.304 CCATT 0.223 CCCAA 0.2561 CCCAC 0.2561 CCCAG 0.2633 CCCAT 0.2244 CCCCA 0.2189 CCCCC 0.3503 CCCCG 0.1777 CCCCT 0.2531 CCCGA 0.2586 CCCGC 0.3117 CCCGG 0.208 CCCGT 0.2217 CCCTA 0.1059 CCCTC 0.3384 CCCTG 0.2881 CCCTT 0.2677 CCGAA 0.2471 CCGAC 0.2848 CCGAG 0.2778 CCGAT 0.1903 CCGCA 0.231 CCGCC 0.3497 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.2099 CCGGA 0.2222 CCGGC 0.3339 CCGGG 0.2481 CCGGT 0.1958 CCGTA 0.1434 CCGTC 0.3553 CCGTG 0.2956 CCGTT 0.2057 CCTAA 0.1831 CCTAC 0.3516 CCTAG 0.277 CCTAT 0.1883 CCTCA 0.2253 CCTCC 0.2797 CCTCG 0.2642 CCTCT 0.2309 CCTGA 0.2179 CCTGC 0.2869 CCTGG 0.2661 CCTGT 0.2292 CCTTA 0.1028 CCTTC 0.3158 CCTTG 0.3263 CCTTT 0.255 CGAAA 0.2738 CGAAC 0.2159 CGAAG 0.297 CGAAT 0.2133 CGACA 0.2815 CGACC 0.2528 CGACG 0.2707 CGACT 0.195 CGAGA 0.2696 CGAGC 0.2587 CGAGG 0.2899 CGAGT 0.1817 CGATA 0.1796 CGATC 0.2702 CGATG 0.3515 CGATT 0.1987 CGCAA 0.2717 CGCAC 0.2295 CGCAG 0.2544 CGCAT 0.2444 CGCCA 0.2777 CGCCC 0.2539 CGCCG 0.2357 CGCCT 0.2327 CGCGA 0.2722 CGCGC 0.2779 CGCGG 0.2305 CGCGT 0.2194 CGCTA 0.1264 CGCTC 0.2873 CGCTG 0.344 CGCTT 0.2422 CGGAA 0.2461 CGGAC 0.245 CGGAG 0.2741 CGGAT 0.2348 CGGCA 0.26 CGGCC 0.2617 CGGCG 0.26 CGGCT 0.2182 CGGGA 0.2409 CGGGC 0.279 CGGGG 0.2723 CGGGT 0.2077 CGGTA 0.1759 CGGTC 0.2962 CGGTG 0.3252 CGGTT 0.2028 CGTAA 0.1884 CGTAC 0.2862 CGTAG 0.2799 CGTAT 0.2454 CGTCA 0.2607 CGTCC 0.2122 CGTCG 0.2774 CGTCT 0.2496 CGTGA 0.25 CGTGC 0.2518 CGTGG 0.2768 CGTGT 0.2213 CGTTA 0.1148 CGTTC 0.2847 CGTTG 0.3416 CGTTT 0.259 CTAAA 0.2532 CTAAC 0.2565 CTAAG 0.2668 CTAAT 0.2235 CTACA 0.2516 CTACC 0.3097 CTACG 0.2119 CTACT 0.2268 CTAGA 0.2382 CTAGC 0.274 CTAGG 0.2896 CTAGT 0.1983 CTATA 0.1546 CTATC 0.3076 CTATG 0.2758 CTATT 0.2619 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.2417 CTCAG 0.2361 CTCAT 0.272 CTCCA 0.272 CTCCC 0.2854 CTCCG 0.1889 CTCCT 0.2537 CTCGA 0.2879 CTCGC 0.2547 CTCGG 0.214 CTCGT 0.2434 CTCTA 0.1174 CTCTC 0.3607 CTCTG 0.2621 CTCTT 0.2598 CTGAA 0.2472 CTGAC 0.2675 CTGAG 0.2481 CTGAT 0.2372 CTGCA 0.2541 CTGCC 0.3102 CTGCG 0.1847 CTGCT 0.2511 CTGGA 0.22 CTGGC 0.2994 CTGGG 0.2476 CTGGT 0.2331 CTGTA 0.1609 CTGTC 0.3216 CTGTG 0.2786 CTGTT 0.2389 CTTAA 0.1682 CTTAC 0.3091 CTTAG 0.2431 CTTAT 0.2796 CTTCA 0.2431 CTTCC 0.2675 CTTCG 0.2306 CTTCT 0.2589 CTTGA 0.2567 CTTGC 0.2596 CTTGG 0.2662 CTTGT 0.2176 CTTTA 0.09675 CTTTC 0.3308 CTTTG 0.2871 CTTTT 0.2853 GAAAA 0.273 GAAAC 0.2118 GAAAG 0.318 GAAAT 0.1972 GAACA 0.3047 GAACC 0.2675 GAACG 0.2508 GAACT 0.1769 GAAGA 0.294 GAAGC 0.2665 GAAGG 0.2705 GAAGT 0.1689 GAATA 0.1908 GAATC 0.2485 GAATG 0.3491 GAATT 0.2116 GACAA 0.249 GACAC 0.2237 GACAG 0.2837 GACAT 0.2436 GACCA 0.2917 GACCC 0.2469 GACCG 0.2147 GACCT 0.2467 GACGA 0.3258 GACGC 0.2422 GACGG 0.2495 GACGT 0.1826 GACTA 0.155 GACTC 0.2628 GACTG 0.3122 GACTT 0.27 GAGAA 0.2451 GAGAC 0.232 GAGAG 0.3099 GAGAT 0.2129 GAGCA 0.2788 GAGCC 0.2458 GAGCG 0.2145 GAGCT 0.2609 GAGGA 0.2506 GAGGC 0.2617 GAGGG 0.2734 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.1745 GAGTC 0.2873 GAGTG 0.3127 GAGTT 0.2255 GATAA 0.2042 GATAC 0.2868 GATAG 0.2282 GATAT 0.2809 GATCA 0.2814 GATCC 0.2333 GATCG 0.2569 GATCT 0.2285 GATGA 0.2663 GATGC 0.2643 GATGG 0.2794 GATGT 0.1901 GATTA 0.124 GATTC 0.2713 GATTG 0.3608 GATTT 0.2439 GCAAA 0.2486 GCAAC 0.2464 GCAAG 0.3001 GCAAT 0.205 GCACA 0.2767 GCACC 0.2812 GCACG 0.2474 GCACT 0.1947 GCAGA 0.2378 GCAGC 0.3064 GCAGG 0.2735 GCAGT 0.1822 GCATA 0.1326 GCATC 0.3347 GCATG 0.3109 GCATT 0.2218 GCCAA 0.2593 GCCAC 0.2266 GCCAG 0.2766 GCCAT 0.2375 GCCCA 0.2832 GCCCC 0.2762 GCCCG 0.2105 GCCCT 0.23 GCCGA 0.2646 GCCGC 0.2695 GCCGG 0.2297 GCCGT 0.2362 GCCTA 0.1176 GCCTC 0.3104 GCCTG 0.3246 GCCTT 0.2474 GCGAA 0.2194 GCGAC 0.2642 GCGAG 0.2957 GCGAT 0.2207 GCGCA 0.2565 GCGCC 0.2861 GCGCG 0.2506 GCGCT 0.2068 GCGGA 0.2186 GCGGC 0.2986 GCGGG 0.2834 GCGGT 0.1994 GCGTA 0.1389 GCGTC 0.3274 GCGTG 0.3089 GCGTT 0.2248 GCTAA 0.1857 GCTAC 0.3172 GCTAG 0.2525 GCTAT 0.2445 GCTCA 0.2505 GCTCC 0.2386 GCTCG 0.2823 GCTCT 0.2285 GCTGA 0.2151 GCTGC 0.2842 GCTGG 0.2817 GCTGT 0.219 GCTTA 0.09894 GCTTC 0.3065 GCTTG 0.343 GCTTT 0.2516 GGAAA 0.27 GGAAC 0.2055 GGAAG 0.3335 GGAAT 0.191 GGACA 0.2838 GGACC 0.235 GGACG 0.2817 GGACT 0.1996 GGAGA 0.2796 GGAGC 0.2371 GGAGG 0.3329 GGAGT 0.1504 GGATA 0.1563 GGATC 0.2613 GGATG 0.3809 GGATT 0.2015 GGCAA 0.2422 GGCAC 0.2185 GGCAG 0.3117 GGCAT 0.2276 GGCCA 0.2961 GGCCC 0.2392 GGCCG 0.2373 GGCCT 0.2275 GGCGA 0.2647 GGCGC 0.2346 GGCGG 0.2848 GGCGT 0.2159 GGCTA 0.1218 GGCTC 0.2542 GGCTG 0.3647 GGCTT 0.2592 GGGAA 0.2696 GGGAC 0.2015 GGGAG 0.3104 GGGAT 0.2185 GGGCA 0.2676 GGGCC 0.2427 GGGCG 0.2577 GGGCT 0.232 GGGGA 0.2077 GGGGC 0.2389 GGGGG 0.3503 GGGGT 0.2031 GGGTA 0.1672 GGGTC 0.2623 GGGTG 0.32 GGGTT 0.2505 GGTAA 0.188 GGTAC 0.2941 GGTAG 0.2891 GGTAT 0.2288 GGTCA 0.2708 GGTCC 0.2015 GGTCG 0.2951 GGTCT 0.2326 GGTGA 0.238 GGTGC 0.2321 GGTGG 0.3152 GGTGT 0.2147 GGTTA 0.1188 GGTTC 0.2766 GGTTG 0.3566 GGTTT 0.2481 GTAAA 0.2522 GTAAC 0.2353 GTAAG 0.2617 GTAAT 0.2507 GTACA 0.2943 GTACC 0.3042 GTACG 0.2091 GTACT 0.1924 GTAGA 0.247 GTAGC 0.2542 GTAGG 0.2714 GTAGT 0.2274 GTATA 0.167 GTATC 0.3007 GTATG 0.2887 GTATT 0.2435 GTCAA 0.2801 GTCAC 0.2314 GTCAG 0.2463 GTCAT 0.2421 GTCCA 0.2919 GTCCC 0.2441 GTCCG 0.2224 GTCCT 0.2417 GTCGA 0.2775 GTCGC 0.2389 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2532 GTCTA 0.1381 GTCTC 0.2989 GTCTG 0.2888 GTCTT 0.2743 GTGAA 0.2299 GTGAC 0.2479 GTGAG 0.2506 GTGAT 0.2717 GTGCA 0.2396 GTGCC 0.2786 GTGCG 0.2135 GTGCT 0.2682 GTGGA 0.222 GTGGC 0.2644 GTGGG 0.2597 GTGGT 0.254 GTGTA 0.1659 GTGTC 0.269 GTGTG 0.3294 GTGTT 0.2357 GTTAA 0.1673 GTTAC 0.2951 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.2895 GTTCA 0.277 GTTCC 0.242 GTTCG 0.246 GTTCT 0.235 GTTGA 0.2508 GTTGC 0.2556 GTTGG 0.2641 GTTGT 0.2295 GTTTA 0.1172 GTTTC 0.2888 GTTTG 0.3267 GTTTT 0.2674 TAAAA 0.272 TAAAC 0.2344 TAAAG 0.2535 TAAAT 0.2402 TAACA 0.2965 TAACC 0.2671 TAACG 0.2351 TAACT 0.2013 TAAGA 0.2568 TAAGC 0.2762 TAAGG 0.2827 TAAGT 0.1844 TAATA 0.1739 TAATC 0.2494 TAATG 0.3069 TAATT 0.2698 TACAA 0.2589 TACAC 0.2357 TACAG 0.2425 TACAT 0.2629 TACCA 0.2548 TACCC 0.2205 TACCG 0.1786 TACCT 0.3461 TACGA 0.2887 TACGC 0.2322 TACGG 0.2277 TACGT 0.2515 TACTA 0.1602 TACTC 0.2582 TACTG 0.3039 TACTT 0.2777 TAGAA 0.2269 TAGAC 0.2745 TAGAG 0.2582 TAGAT 0.2405 TAGCA 0.2854 TAGCC 0.2469 TAGCG 0.1979 TAGCT 0.2698 TAGGA 0.2042 TAGGC 0.2585 TAGGG 0.2231 TAGGT 0.3142 TAGTA 0.1959 TAGTC 0.3066 TAGTG 0.2865 TAGTT 0.2111 TATAA 0.2197 TATAC 0.2842 TATAG 0.2046 TATAT 0.2914 TATCA 0.2693 TATCC 0.2119 TATCG 0.259 TATCT 0.2598 TATGA 0.2586 TATGC 0.2538 TATGG 0.2414 TATGT 0.2462 TATTA 0.1207 TATTC 0.2907 TATTG 0.3087 TATTT 0.2799 TCAAA 0.2175 TCAAC 0.2492 TCAAG 0.3059 TCAAT 0.2274 TCACA 0.2568 TCACC 0.2849 TCACG 0.2427 TCACT 0.2155 TCAGA 0.2357 TCAGC 0.2982 TCAGG 0.2671 TCAGT 0.1991 TCATA 0.1348 TCATC 0.3364 TCATG 0.3167 TCATT 0.2121 TCCAA 0.2251 TCCAC 0.2468 TCCAG 0.2636 TCCAT 0.2645 TCCCA 0.272 TCCCC 0.2698 TCCCG 0.2042 TCCCT 0.254 TCCGA 0.2638 TCCGC 0.2716 TCCGG 0.2104 TCCGT 0.2542 TCCTA 0.111 TCCTC 0.3552 TCCTG 0.2723 TCCTT 0.2614 TCGAA 0.2132 TCGAC 0.2717 TCGAG 0.296 TCGAT 0.2191 TCGCA 0.2403 TCGCC 0.2975 TCGCG 0.2263 TCGCT 0.2358 TCGGA 0.2169 TCGGC 0.2995 TCGGG 0.2401 TCGGT 0.2435 TCGTA 0.1395 TCGTC 0.3557 TCGTG 0.2779 TCGTT 0.2269 TCTAA 0.1748 TCTAC 0.33 TCTAG 0.235 TCTAT 0.2603 TCTCA 0.2257 TCTCC 0.2469 TCTCG 0.2583 TCTCT 0.2691 TCTGA 0.218 TCTGC 0.2828 TCTGG 0.2765 TCTGT 0.2226 TCTTA 0.08958 TCTTC 0.3293 TCTTG 0.3085 TCTTT 0.2726 TGAAA 0.2342 TGAAC 0.2365 TGAAG 0.3046 TGAAT 0.2247 TGACA 0.2606 TGACC 0.2508 TGACG 0.2749 TGACT 0.2137 TGAGA 0.2762 TGAGC 0.269 TGAGG 0.2898 TGAGT 0.1649 TGATA 0.1539 TGATC 0.2441 TGATG 0.3862 TGATT 0.2158 TGCAA 0.2347 TGCAC 0.2118 TGCAG 0.2878 TGCAT 0.2657 TGCCA 0.2766 TGCCC 0.2449 TGCCG 0.2189 TGCCT 0.2595 TGCGA 0.2718 TGCGC 0.2675 TGCGG 0.2392 TGCGT 0.2215 TGCTA 0.1321 TGCTC 0.2707 TGCTG 0.3367 TGCTT 0.2605 TGGAA 0.2509 TGGAC 0.2408 TGGAG 0.2955 TGGAT 0.2127 TGGCA 0.2611 TGGCC 0.2596 TGGCG 0.2435 TGGCT 0.2358 TGGGA 0.2406 TGGGC 0.2816 TGGGG 0.2516 TGGGT 0.2261 TGGTA 0.1655 TGGTC 0.2655 TGGTG 0.3502 TGGTT 0.2189 TGTAA 0.1861 TGTAC 0.3055 TGTAG 0.2521 TGTAT 0.2562 TGTCA 0.2477 TGTCC 0.2142 TGTCG 0.2891 TGTCT 0.2491 TGTGA 0.2392 TGTGC 0.2547 TGTGG 0.2465 TGTGT 0.2597 TGTTA 0.1132 TGTTC 0.2705 TGTTG 0.359 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2803 TTAAC 0.2248 TTAAG 0.2399 TTAAT 0.255 TTACA 0.2736 TTACC 0.2966 TTACG 0.2101 TTACT 0.2196 TTAGA 0.2495 TTAGC 0.2838 TTAGG 0.2695 TTAGT 0.1972 TTATA 0.1755 TTATC 0.2911 TTATG 0.2549 TTATT 0.2785 TTCAA 0.2613 TTCAC 0.2357 TTCAG 0.25 TTCAT 0.253 TTCCA 0.2637 TTCCC 0.2832 TTCCG 0.1939 TTCCT 0.2592 TTCGA 0.2657 TTCGC 0.2421 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2482 TTCTA 0.1119 TTCTC 0.3095 TTCTG 0.2515 TTCTT 0.3271 TTGAA 0.2338 TTGAC 0.2752 TTGAG 0.2379 TTGAT 0.2531 TTGCA 0.2342 TTGCC 0.2725 TTGCG 0.223 TTGCT 0.2703 TTGGA 0.2017 TTGGC 0.3015 TTGGG 0.2587 TTGGT 0.238 TTGTA 0.1769 TTGTC 0.2907 TTGTG 0.2554 TTGTT 0.277 TTTAA 0.1927 TTTAC 0.2922 TTTAG 0.2263 TTTAT 0.2888 TTTCA 0.2161 TTTCC 0.2505 TTTCG 0.2458 TTTCT 0.2877 TTTGA 0.2312 TTTGC 0.2724 TTTGG 0.2652 TTTGT 0.2312 TTTTA 0.1059 TTTTC 0.2896 TTTTG 0.2772 TTTTT 0.3272 [2] # (a,c,g,t)= (0.272, 0.228, 0.228, 0.272) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.231 C 0.269 G 0.268 T 0.231 # l= 1 # Values AA 0.0565 AC 0.058 AG 0.0631 AT 0.0538 CA 0.0728 CC 0.0701 CG 0.0626 CT 0.0632 GA 0.0684 GC 0.0723 GG 0.0699 GT 0.0579 TA 0.0337 TC 0.0685 TG 0.0727 TT 0.0565 # l= 2 # Values AAA 0.0148 AAC 0.0131 AAG 0.0168 AAT 0.0118 ACA 0.0163 ACC 0.0157 ACG 0.0142 ACT 0.0117 AGA 0.0167 AGC 0.0174 AGG 0.0173 AGT 0.0117 ATA 0.00877 ATC 0.0155 ATG 0.0177 ATT 0.0118 CAA 0.0186 CAC 0.0173 CAG 0.0191 CAT 0.0177 CCA 0.0196 CCC 0.0186 CCG 0.0145 CCT 0.0174 CGA 0.0179 CGC 0.0161 CGG 0.0144 CGT 0.0142 CTA 0.00838 CTC 0.0188 CTG 0.0191 CTT 0.0168 GAA 0.0167 GAC 0.0174 GAG 0.0188 GAT 0.0155 GCA 0.019 GCC 0.0198 GCG 0.016 GCT 0.0174 GGA 0.016 GGC 0.0198 GGG 0.0185 GGT 0.0157 GTA 0.0101 GTC 0.0174 GTG 0.0173 GTT 0.0131 TAA 0.00644 TAC 0.0102 TAG 0.00836 TAT 0.00875 TCA 0.0178 TCC 0.016 TCG 0.0179 TCT 0.0167 TGA 0.0178 TGC 0.019 TGG 0.0196 TGT 0.0163 TTA 0.00645 TTC 0.0168 TTG 0.0185 TTT 0.0148 # l= 3 # Values AAAA 0.00421 AAAC 0.00334 AAAG 0.00434 AAAT 0.00291 AACA 0.00406 AACC 0.00347 AACG 0.00313 AACT 0.00245 AAGA 0.00468 AAGC 0.00456 AAGG 0.00446 AAGT 0.0031 AATA 0.00225 AATC 0.00311 AATG 0.00376 AATT 0.00272 ACAA 0.00413 ACAC 0.00396 ACAG 0.00428 ACAT 0.00393 ACCA 0.00462 ACCC 0.00392 ACCG 0.00309 ACCT 0.00409 ACGA 0.00441 ACGC 0.00356 ACGG 0.00337 ACGT 0.00285 ACTA 0.00179 ACTC 0.0032 ACTG 0.00363 ACTT 0.00309 AGAA 0.00429 AGAC 0.00421 AGAG 0.00456 AGAT 0.00365 AGCA 0.00488 AGCC 0.00461 AGCG 0.00354 AGCT 0.00435 AGGA 0.004 AGGC 0.00477 AGGG 0.0045 AGGT 0.00409 AGTA 0.00217 AGTC 0.00354 AGTG 0.00355 AGTT 0.00245 ATAA 0.00184 ATAC 0.00249 ATAG 0.00196 ATAT 0.00248 ATCA 0.00458 ATCC 0.00352 ATCG 0.00377 ATCT 0.00365 ATGA 0.00458 ATGC 0.00456 ATGG 0.00465 ATGT 0.00393 ATTA 0.00155 ATTC 0.00342 ATTG 0.00395 ATTT 0.00291 CAAA 0.00439 CAAC 0.00464 CAAG 0.00558 CAAT 0.00395 CACA 0.00459 CACC 0.00501 CACG 0.00415 CACT 0.00355 CAGA 0.00456 CAGC 0.00583 CAGG 0.00514 CAGT 0.00362 CATA 0.00241 CATC 0.0058 CATG 0.00575 CATT 0.00376 CCAA 0.00489 CCAC 0.00485 CCAG 0.00521 CCAT 0.00465 CCCA 0.0049 CCCC 0.0055 CCCG 0.00365 CCCT 0.0045 CCGA 0.00399 CCGC 0.00401 CCGG 0.00309 CCGT 0.00338 CCTA 0.00218 CCTC 0.00557 CCTG 0.00514 CCTT 0.00447 CGAA 0.00405 CGAC 0.00492 CGAG 0.00517 CGAT 0.00377 CGCA 0.00397 CGCC 0.00488 CGCG 0.00368 CGCT 0.00354 CGGA 0.00326 CGGC 0.00448 CGGG 0.00364 CGGT 0.00309 CGTA 0.00213 CGTC 0.00477 CGTG 0.00415 CGTT 0.00313 CTAA 0.0015 CTAC 0.00282 CTAG 0.0021 CTAT 0.00195 CTCA 0.00442 CTCC 0.00466 CTCG 0.00517 CTCT 0.00457 CTGA 0.00426 CTGC 0.0054 CTGG 0.00521 CTGT 0.00428 CTTA 0.00167 CTTC 0.00521 CTTG 0.00558 CTTT 0.00434 GAAA 0.00452 GAAC 0.00359 GAAG 0.00521 GAAT 0.00343 GACA 0.00484 GACC 0.00422 GACG 0.00477 GACT 0.00354 GAGA 0.00533 GAGC 0.00473 GAGG 0.00556 GAGT 0.0032 GATA 0.00264 GATC 0.00398 GATG 0.00579 GATT 0.00311 GCAA 0.00482 GCAC 0.00422 GCAG 0.0054 GCAT 0.00456 GCCA 0.00567 GCCC 0.00485 GCCG 0.00449 GCCT 0.00477 GCGA 0.00445 GCGC 0.00405 GCGG 0.004 GCGT 0.00356 GCTA 0.00228 GCTC 0.00473 GCTG 0.00582 GCTT 0.00455 GGAA 0.00416 GGAC 0.00364 GGAG 0.00466 GGAT 0.00353 GGCA 0.00538 GGCC 0.00492 GGCG 0.00487 GGCT 0.00461 GGGA 0.00429 GGGC 0.00485 GGGG 0.0055 GGGT 0.00391 GGTA 0.00301 GGTC 0.00422 GGTG 0.00501 GGTT 0.00347 GTAA 0.00196 GTAC 0.00288 GTAG 0.00281 GTAT 0.00249 GTCA 0.00461 GTCC 0.00364 GTCG 0.00492 GTCT 0.00421 GTGA 0.0043 GTGC 0.00421 GTGG 0.00485 GTGT 0.00395 GTTA 0.00155 GTTC 0.00359 GTTG 0.00464 GTTT 0.00333 TAAA 0.00168 TAAC 0.00155 TAAG 0.00167 TAAT 0.00155 TACA 0.00282 TACC 0.00301 TACG 0.00214 TACT 0.00217 TAGA 0.00213 TAGC 0.00228 TAGG 0.00218 TAGT 0.00179 TATA 0.00147 TATC 0.00264 TATG 0.00241 TATT 0.00225 TCAA 0.00471 TCAC 0.0043 TCAG 0.00425 TCAT 0.00458 TCCA 0.00441 TCCC 0.00429 TCCG 0.00327 TCCT 0.00401 TCGA 0.00504 TCGC 0.00447 TCGG 0.00399 TCGT 0.00442 TCTA 0.00212 TCTC 0.00533 TCTG 0.00456 TCTT 0.00469 TGAA 0.00424 TGAC 0.00461 TGAG 0.00442 TGAT 0.00457 TGCA 0.00478 TGCC 0.00538 TGCG 0.00396 TGCT 0.00489 TGGA 0.00441 TGGC 0.00567 TGGG 0.0049 TGGT 0.00461 TGTA 0.00282 TGTC 0.00484 TGTG 0.00459 TGTT 0.00406 TTAA 0.00115 TTAC 0.00196 TTAG 0.00149 TTAT 0.00184 TTCA 0.00423 TTCC 0.00416 TTCG 0.00405 TTCT 0.0043 TTGA 0.00471 TTGC 0.00482 TTGG 0.00489 TTGT 0.00414 TTTA 0.00168 TTTC 0.00452 TTTG 0.00438 TTTT 0.00421 # l= 4 # Values AAAAA 0.00136 AAAAC 0.000877 AAAAG 0.00123 AAAAT 0.000743 AAACA 0.00104 AAACC 0.000868 AAACG 0.000804 AAACT 0.00062 AAAGA 0.00126 AAAGC 0.00115 AAAGG 0.00113 AAAGT 0.000798 AAATA 0.000636 AAATC 0.000767 AAATG 0.000874 AAATT 0.000636 AACAA 0.00115 AACAC 0.00095 AACAG 0.00103 AACAT 0.00093 AACCA 0.00104 AACCC 0.000994 AACCG 0.000634 AACCT 0.000808 AACGA 0.00101 AACGC 0.000793 AACGG 0.000695 AACGT 0.000627 AACTA 0.000371 AACTC 0.000716 AACTG 0.000733 AACTT 0.00063 AAGAA 0.0014 AAGAC 0.00117 AAGAG 0.0012 AAGAT 0.000923 AAGCA 0.00126 AAGCC 0.0012 AAGCG 0.000866 AAGCT 0.00122 AAGGA 0.00105 AAGGC 0.00119 AAGGG 0.00122 AAGGT 0.00101 AAGTA 0.0006 AAGTC 0.000959 AAGTG 0.000902 AAGTT 0.00063 AATAA 0.000499 AATAC 0.000605 AATAG 0.000513 AATAT 0.000632 AATCA 0.000972 AATCC 0.00071 AATCG 0.00075 AATCT 0.00068 AATGA 0.000974 AATGC 0.00102 AATGG 0.00102 AATGT 0.000742 AATTA 0.000421 AATTC 0.000734 AATTG 0.000926 AATTT 0.000636 ACAAA 0.00102 ACAAC 0.00106 ACAAG 0.00121 ACAAT 0.000853 ACACA 0.00116 ACACC 0.00107 ACACG 0.000917 ACACT 0.000795 ACAGA 0.00103 ACAGC 0.00129 ACAGG 0.00118 ACAGT 0.000784 ACATA 0.000594 ACATC 0.00112 ACATG 0.00147 ACATT 0.000742 ACCAA 0.00116 ACCAC 0.00123 ACCAG 0.00122 ACCAT 0.001 ACCCA 0.0011 ACCCC 0.00114 ACCCG 0.00075 ACCCT 0.000917 ACCGA 0.000982 ACCGC 0.000812 ACCGG 0.000618 ACCGT 0.000675 ACCTA 0.000685 ACCTC 0.00121 ACCTG 0.00118 ACCTT 0.00101 ACGAA 0.000995 ACGAC 0.00124 ACGAG 0.00126 ACGAT 0.000924 ACGCA 0.000886 ACGCC 0.00105 ACGCG 0.000828 ACGCT 0.000791 ACGGA 0.000821 ACGGC 0.00107 ACGGG 0.000815 ACGGT 0.000675 ACGTA 0.000529 ACGTC 0.000875 ACGTG 0.000815 ACGTT 0.000627 ACTAA 0.000295 ACTAC 0.000651 ACTAG 0.000421 ACTAT 0.00042 ACTCA 0.000732 ACTCC 0.000718 ACTCG 0.000953 ACTCT 0.000796 ACTGA 0.000839 ACTGC 0.00101 ACTGG 0.00099 ACTGT 0.000784 ACTTA 0.000314 ACTTC 0.000894 ACTTG 0.00109 ACTTT 0.000798 AGAAA 0.0013 AGAAC 0.000843 AGAAG 0.00133 AGAAT 0.00082 AGACA 0.0012 AGACC 0.000986 AGACG 0.00119 AGACT 0.00083 AGAGA 0.0014 AGAGC 0.00108 AGAGG 0.00129 AGAGT 0.000796 AGATA 0.000683 AGATC 0.000917 AGATG 0.00137 AGATT 0.00068 AGCAA 0.00129 AGCAC 0.00111 AGCAG 0.00135 AGCAT 0.00113 AGCCA 0.00134 AGCCC 0.00114 AGCCG 0.000995 AGCCT 0.00112 AGCGA 0.00105 AGCGC 0.000849 AGCGG 0.000849 AGCGT 0.000791 AGCTA 0.000612 AGCTC 0.00124 AGCTG 0.00127 AGCTT 0.00122 AGGAA 0.00109 AGGAC 0.000883 AGGAG 0.00117 AGGAT 0.000864 AGGCA 0.00138 AGGCC 0.00112 AGGCG 0.00114 AGGCT 0.00112 AGGGA 0.00109 AGGGC 0.00111 AGGGG 0.00138 AGGGT 0.000917 AGGTA 0.00103 AGGTC 0.00105 AGGTG 0.0012 AGGTT 0.000808 AGTAA 0.000424 AGTAC 0.000553 AGTAG 0.000641 AGTAT 0.000548 AGTCA 0.00101 AGTCC 0.000738 AGTCG 0.000962 AGTCT 0.00083 AGTGA 0.000919 AGTGC 0.000838 AGTGG 0.000998 AGTGT 0.000795 AGTTA 0.000308 AGTTC 0.000633 AGTTG 0.000891 AGTTT 0.00062 ATAAA 0.000476 ATAAC 0.000447 ATAAG 0.000462 ATAAT 0.000451 ATACA 0.000727 ATACC 0.000693 ATACG 0.000518 ATACT 0.000548 ATAGA 0.000566 ATAGC 0.000552 ATAGG 0.000416 ATAGT 0.00042 ATATA 0.000418 ATATC 0.000743 ATATG 0.000684 ATATT 0.000632 ATCAA 0.00118 ATCAC 0.00117 ATCAG 0.001 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.000938 ATCCC 0.000949 ATCCG 0.000775 ATCCT 0.000864 ATCGA 0.0011 ATCGC 0.000982 ATCGG 0.000763 ATCGT 0.000924 ATCTA 0.000517 ATCTC 0.00115 ATCTG 0.00106 ATCTT 0.000923 ATGAA 0.00106 ATGAC 0.00111 ATGAG 0.00119 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00125 ATGCC 0.00122 ATGCG 0.000958 ATGCT 0.00113 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.00138 ATGGG 0.0011 ATGGT 0.001 ATGTA 0.000747 ATGTC 0.0012 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.00093 ATTAA 0.000283 ATTAC 0.000486 ATTAG 0.00033 ATTAT 0.000451 ATTCA 0.000961 ATTCC 0.000793 ATTCG 0.000858 ATTCT 0.00082 ATTGA 0.00107 ATTGC 0.000975 ATTGG 0.00106 ATTGT 0.000853 ATTTA 0.000393 ATTTC 0.000901 ATTTG 0.000876 ATTTT 0.000743 CAAAA 0.00117 CAAAC 0.00108 CAAAG 0.00126 CAAAT 0.000876 CAACA 0.00146 CAACC 0.00123 CAACG 0.00106 CAACT 0.000891 CAAGA 0.00145 CAAGC 0.00156 CAAGG 0.00148 CAAGT 0.00109 CAATA 0.000706 CAATC 0.0011 CAATG 0.00121 CAATT 0.000926 CACAA 0.00105 CACAC 0.0013 CACAG 0.00119 CACAT 0.00106 CACCA 0.00157 CACCC 0.00125 CACCG 0.000994 CACCT 0.0012 CACGA 0.00123 CACGC 0.0011 CACGG 0.00101 CACGT 0.000815 CACTA 0.000518 CACTC 0.00099 CACTG 0.00114 CACTT 0.000902 CAGAA 0.00111 CAGAC 0.0012 CAGAG 0.0012 CAGAT 0.00106 CAGCA 0.00164 CAGCC 0.00169 CAGCG 0.00122 CAGCT 0.00127 CAGGA 0.00111 CAGGC 0.00154 CAGGG 0.00131 CAGGT 0.00118 CAGTA 0.000671 CAGTC 0.00108 CAGTG 0.00114 CAGTT 0.000733 CATAA 0.000469 CATAC 0.00072 CATAG 0.000536 CATAT 0.000684 CATCA 0.00177 CATCC 0.00133 CATCG 0.00132 CATCT 0.00137 CATGA 0.00144 CATGC 0.00142 CATGG 0.00143 CATGT 0.00147 CATTA 0.000481 CATTC 0.00119 CATTG 0.00121 CATTT 0.000874 CCAAA 0.00114 CCAAC 0.00123 CCAAG 0.00146 CCAAT 0.00106 CCACA 0.00114 CCACC 0.00157 CCACG 0.00114 CCACT 0.000998 CCAGA 0.00125 CCAGC 0.00162 CCAGG 0.00135 CCAGT 0.00099 CCATA 0.000582 CCATC 0.00162 CCATG 0.00143 CCATT 0.00102 CCCAA 0.00126 CCCAC 0.00125 CCCAG 0.00129 CCCAT 0.0011 CCCCA 0.00122 CCCCC 0.00191 CCCCG 0.000983 CCCCT 0.00138 CCCGA 0.000953 CCCGC 0.00112 CCCGG 0.000753 CCCGT 0.000815 CCCTA 0.000481 CCCTC 0.00148 CCCTG 0.00131 CCCTT 0.00122 CCGAA 0.000993 CCGAC 0.00113 CCGAG 0.00111 CCGAT 0.000763 CCGCA 0.000948 CCGCC 0.00136 CCGCG 0.000844 CCGCT 0.000849 CCGGA 0.000684 CCGGC 0.00103 CCGGG 0.000753 CCGGT 0.000618 CCGTA 0.00049 CCGTC 0.00117 CCGTG 0.00101 CCGTT 0.000695 CCTAA 0.000404 CCTAC 0.000753 CCTAG 0.000605 CCTAT 0.000416 CCTCA 0.00127 CCTCC 0.00153 CCTCG 0.00147 CCTCT 0.00129 CCTGA 0.00115 CCTGC 0.00146 CCTGG 0.00135 CCTGT 0.00118 CCTTA 0.000471 CCTTC 0.00138 CCTTG 0.00148 CCTTT 0.00113 CGAAA 0.00111 CGAAC 0.000887 CGAAG 0.0012 CGAAT 0.000858 CGACA 0.00139 CGACC 0.00125 CGACG 0.00132 CGACT 0.000962 CGAGA 0.00141 CGAGC 0.00133 CGAGG 0.00147 CGAGT 0.000953 CGATA 0.000683 CGATC 0.00102 CGATG 0.00132 CGATT 0.00075 CGCAA 0.00108 CGCAC 0.000911 CGCAG 0.00101 CGCAT 0.000958 CGCCA 0.00136 CGCCC 0.00123 CGCCG 0.00114 CGCCT 0.00114 CGCGA 0.00101 CGCGC 0.000996 CGCGG 0.000844 CGCGT 0.000828 CGCTA 0.000452 CGCTC 0.001 CGCTG 0.00122 CGCTT 0.000866 CGGAA 0.000794 CGGAC 0.000808 CGGAG 0.000889 CGGAT 0.000775 CGGCA 0.00119 CGGCC 0.00117 CGGCG 0.00114 CGGCT 0.000995 CGGGA 0.000876 CGGGC 0.00104 CGGGG 0.000983 CGGGT 0.00075 CGGTA 0.000543 CGGTC 0.000916 CGGTG 0.000994 CGGTT 0.000634 CGTAA 0.00042 CGTAC 0.000605 CGTAG 0.000594 CGTAT 0.000518 CGTCA 0.00125 CGTCC 0.00101 CGTCG 0.00132 CGTCT 0.00119 CGTGA 0.00105 CGTGC 0.00104 CGTGG 0.00114 CGTGT 0.000917 CGTTA 0.000363 CGTTC 0.000904 CGTTG 0.00106 CGTTT 0.000804 CTAAA 0.000381 CTAAC 0.000383 CTAAG 0.0004 CTAAT 0.00033 CTACA 0.000713 CTACC 0.000866 CTACG 0.000594 CTACT 0.000641 CTAGA 0.000487 CTAGC 0.000585 CTAGG 0.000605 CTAGT 0.000421 CTATA 0.000305 CTATC 0.000602 CTATG 0.000536 CTATT 0.000513 CTCAA 0.00113 CTCAC 0.00105 CTCAG 0.00105 CTCAT 0.00119 CTCCA 0.00129 CTCCC 0.0013 CTCCG 0.000889 CTCCT 0.00117 CTCGA 0.00149 CTCGC 0.0013 CTCGG 0.00111 CTCGT 0.00126 CTCTA 0.000551 CTCTC 0.00162 CTCTG 0.0012 CTCTT 0.0012 CTGAA 0.00107 CTGAC 0.00113 CTGAG 0.00105 CTGAT 0.001 CTGCA 0.00138 CTGCC 0.00166 CTGCG 0.00101 CTGCT 0.00135 CTGGA 0.00116 CTGGC 0.00154 CTGGG 0.00129 CTGGT 0.00122 CTGTA 0.000689 CTGTC 0.00137 CTGTG 0.00119 CTGTT 0.00103 CTTAA 0.000282 CTTAC 0.000521 CTTAG 0.0004 CTTAT 0.000462 CTTCA 0.0013 CTTCC 0.00138 CTTCG 0.0012 CTTCT 0.00133 CTTGA 0.00145 CTTGC 0.00145 CTTGG 0.00146 CTTGT 0.00121 CTTTA 0.000424 CTTTC 0.00142 CTTTG 0.00126 CTTTT 0.00123 GAAAA 0.00123 GAAAC 0.000969 GAAAG 0.00142 GAAAT 0.000901 GAACA 0.0011 GAACC 0.000958 GAACG 0.000904 GAACT 0.000633 GAAGA 0.00155 GAAGC 0.00139 GAAGG 0.00138 GAAGT 0.000894 GAATA 0.000638 GAATC 0.000863 GAATG 0.00119 GAATT 0.000734 GACAA 0.00121 GACAC 0.00106 GACAG 0.00137 GACAT 0.0012 GACCA 0.00124 GACCC 0.00101 GACCG 0.000916 GACCT 0.00105 GACGA 0.00155 GACGC 0.00118 GACGG 0.00117 GACGT 0.000875 GACTA 0.000561 GACTC 0.000938 GACTG 0.00108 GACTT 0.000959 GAGAA 0.0013 GAGAC 0.00126 GAGAG 0.00162 GAGAT 0.00115 GAGCA 0.00133 GAGCC 0.00116 GAGCG 0.001 GAGCT 0.00124 GAGGA 0.00141 GAGGC 0.00146 GAGGG 0.00148 GAGGT 0.00121 GAGTA 0.000556 GAGTC 0.000938 GAGTG 0.00099 GAGTT 0.000716 GATAA 0.000537 GATAC 0.000755 GATAG 0.000602 GATAT 0.000743 GATCA 0.00111 GATCC 0.00093 GATCG 0.00102 GATCT 0.000917 GATGA 0.00155 GATGC 0.00151 GATGG 0.00162 GATGT 0.00112 GATTA 0.00038 GATTC 0.000863 GATTG 0.0011 GATTT 0.000767 GCAAA 0.0012 GCAAC 0.0012 GCAAG 0.00145 GCAAT 0.000975 GCACA 0.00117 GCACC 0.00117 GCACG 0.00104 GCACT 0.000838 GCAGA 0.00129 GCAGC 0.00165 GCAGG 0.00146 GCAGT 0.00101 GCATA 0.00061 GCATC 0.00151 GCATG 0.00142 GCATT 0.00102 GCCAA 0.00147 GCCAC 0.00128 GCCAG 0.00154 GCCAT 0.00138 GCCCA 0.00139 GCCCC 0.00131 GCCCG 0.00104 GCCCT 0.00111 GCCGA 0.00119 GCCGC 0.00119 GCCGG 0.00103 GCCGT 0.00107 GCCTA 0.000573 GCCTC 0.00146 GCCTG 0.00154 GCCTT 0.00119 GCGAA 0.000986 GCGAC 0.00119 GCGAG 0.0013 GCGAT 0.000982 GCGCA 0.00105 GCGCC 0.00115 GCGCG 0.000996 GCGCT 0.000849 GCGGA 0.000887 GCGGC 0.00119 GCGGG 0.00112 GCGGT 0.000812 GCGTA 0.000494 GCGTC 0.00118 GCGTG 0.0011 GCGTT 0.000793 GCTAA 0.000423 GCTAC 0.000721 GCTAG 0.000585 GCTAT 0.000552 GCTCA 0.00119 GCTCC 0.00112 GCTCG 0.00133 GCTCT 0.00108 GCTGA 0.00127 GCTGC 0.00165 GCTGG 0.00162 GCTGT 0.00129 GCTTA 0.000455 GCTTC 0.00139 GCTTG 0.00156 GCTTT 0.00115 GGAAA 0.00113 GGAAC 0.000864 GGAAG 0.00138 GGAAT 0.000793 GGACA 0.00104 GGACC 0.000852 GGACG 0.00101 GGACT 0.000738 GGAGA 0.00129 GGAGC 0.00112 GGAGG 0.00153 GGAGT 0.000718 GGATA 0.000553 GGATC 0.00093 GGATG 0.00133 GGATT 0.00071 GGCAA 0.00132 GGCAC 0.00118 GGCAG 0.00166 GGCAT 0.00122 GGCCA 0.00147 GGCCC 0.00116 GGCCG 0.00117 GGCCT 0.00112 GGCGA 0.00131 GGCGC 0.00115 GGCGG 0.00136 GGCGT 0.00105 GGCTA 0.000563 GGCTC 0.00116 GGCTG 0.00169 GGCTT 0.0012 GGGAA 0.00117 GGGAC 0.000867 GGGAG 0.0013 GGGAT 0.000949 GGGCA 0.00131 GGGCC 0.00116 GGGCG 0.00123 GGGCT 0.00114 GGGGA 0.00113 GGGGC 0.00131 GGGGG 0.00191 GGGGT 0.00114 GGGTA 0.000662 GGGTC 0.00101 GGGTG 0.00125 GGGTT 0.000994 GGTAA 0.000578 GGTAC 0.000873 GGTAG 0.000866 GGTAT 0.000693 GGTCA 0.00114 GGTCC 0.000852 GGTCG 0.00125 GGTCT 0.000986 GGTGA 0.0012 GGTGC 0.00117 GGTGG 0.00157 GGTGT 0.00107 GGTTA 0.000412 GGTTC 0.000958 GGTTG 0.00123 GGTTT 0.000868 GTAAA 0.000489 GTAAC 0.000462 GTAAG 0.000521 GTAAT 0.000486 GTACA 0.000847 GTACC 0.000873 GTACG 0.000605 GTACT 0.000553 GTAGA 0.000697 GTAGC 0.000721 GTAGG 0.000753 GTAGT 0.000651 GTATA 0.000415 GTATC 0.000755 GTATG 0.00072 GTATT 0.000605 GTCAA 0.0013 GTCAC 0.00107 GTCAG 0.00113 GTCAT 0.00111 GTCCA 0.00108 GTCCC 0.000867 GTCCG 0.000808 GTCCT 0.000883 GTCGA 0.00136 GTCGC 0.00119 GTCGG 0.00113 GTCGT 0.00124 GTCTA 0.000577 GTCTC 0.00126 GTCTG 0.0012 GTCTT 0.00117 GTGAA 0.00102 GTGAC 0.00107 GTGAG 0.00105 GTGAT 0.00117 GTGCA 0.00101 GTGCC 0.00118 GTGCG 0.000911 GTGCT 0.00111 GTGGA 0.00109 GTGGC 0.00128 GTGGG 0.00125 GTGGT 0.00123 GTGTA 0.000652 GTGTC 0.00106 GTGTG 0.0013 GTGTT 0.00095 GTTAA 0.000259 GTTAC 0.000462 GTTAG 0.000383 GTTAT 0.000447 GTTCA 0.001 GTTCC 0.000864 GTTCG 0.000887 GTTCT 0.000843 GTTGA 0.00116 GTTGC 0.0012 GTTGG 0.00123 GTTGT 0.00106 GTTTA 0.000409 GTTTC 0.000969 GTTTG 0.00108 GTTTT 0.000877 TAAAA 0.000451 TAAAC 0.000409 TAAAG 0.000424 TAAAT 0.000393 TAACA 0.000466 TAACC 0.000412 TAACG 0.000363 TAACT 0.000308 TAAGA 0.00043 TAAGC 0.000455 TAAGG 0.000471 TAAGT 0.000314 TAATA 0.000269 TAATC 0.00038 TAATG 0.000481 TAATT 0.000421 TACAA 0.000729 TACAC 0.000652 TACAG 0.000689 TACAT 0.000747 TACCA 0.000778 TACCC 0.000662 TACCG 0.000543 TACCT 0.00103 TACGA 0.000622 TACGC 0.000494 TACGG 0.00049 TACGT 0.000529 TACTA 0.000343 TACTC 0.000556 TACTG 0.000671 TACTT 0.0006 TAGAA 0.000479 TAGAC 0.000577 TAGAG 0.000551 TAGAT 0.000517 TAGCA 0.000654 TAGCC 0.000563 TAGCG 0.000452 TAGCT 0.000612 TAGGA 0.000441 TAGGC 0.000573 TAGGG 0.000481 TAGGT 0.000685 TAGTA 0.000343 TAGTC 0.000561 TAGTG 0.000518 TAGTT 0.000371 TATAA 0.000331 TATAC 0.000415 TATAG 0.000305 TATAT 0.000418 TATCA 0.00072 TATCC 0.000553 TATCG 0.000683 TATCT 0.000683 TATGA 0.000622 TATGC 0.00061 TATGG 0.000582 TATGT 0.000594 TATTA 0.000269 TATTC 0.000638 TATTG 0.000706 TATTT 0.000636 TCAAA 0.00102 TCAAC 0.00116 TCAAG 0.00145 TCAAT 0.00107 TCACA 0.00112 TCACC 0.0012 TCACG 0.00105 TCACT 0.000919 TCAGA 0.000993 TCAGC 0.00127 TCAGG 0.00115 TCAGT 0.000839 TCATA 0.000622 TCATC 0.00155 TCATG 0.00144 TCATT 0.000974 TCCAA 0.001 TCCAC 0.00109 TCCAG 0.00116 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.00119 TCCCC 0.00113 TCCCG 0.000876 TCCCT 0.00109 TCCGA 0.000869 TCCGC 0.000887 TCCGG 0.000684 TCCGT 0.000821 TCCTA 0.000441 TCCTC 0.00141 TCCTG 0.00111 TCCTT 0.00105 TCGAA 0.00108 TCGAC 0.00136 TCGAG 0.00149 TCGAT 0.0011 TCGCA 0.00108 TCGCC 0.00131 TCGCG 0.00101 TCGCT 0.00105 TCGGA 0.000869 TCGGC 0.00119 TCGGG 0.000953 TCGGT 0.000982 TCGTA 0.000622 TCGTC 0.00155 TCGTG 0.00123 TCGTT 0.00101 TCTAA 0.000375 TCTAC 0.000697 TCTAG 0.000487 TCTAT 0.000566 TCTCA 0.00123 TCTCC 0.00129 TCTCG 0.00141 TCTCT 0.0014 TCTGA 0.000993 TCTGC 0.00129 TCTGG 0.00125 TCTGT 0.00103 TCTTA 0.00043 TCTTC 0.00155 TCTTG 0.00145 TCTTT 0.00126 TGAAA 0.000974 TGAAC 0.001 TGAAG 0.0013 TGAAT 0.000961 TGACA 0.00121 TGACC 0.00114 TGACG 0.00125 TGACT 0.00101 TGAGA 0.00123 TGAGC 0.00119 TGAGG 0.00127 TGAGT 0.000732 TGATA 0.00072 TGATC 0.00111 TGATG 0.00177 TGATT 0.000972 TGCAA 0.00113 TGCAC 0.00101 TGCAG 0.00138 TGCAT 0.00125 TGCCA 0.0015 TGCCC 0.00131 TGCCG 0.00119 TGCCT 0.00138 TGCGA 0.00108 TGCGC 0.00105 TGCGG 0.000948 TGCGT 0.000886 TGCTA 0.000654 TGCTC 0.00133 TGCTG 0.00164 TGCTT 0.00126 TGGAA 0.0011 TGGAC 0.00108 TGGAG 0.00129 TGGAT 0.000938 TGGCA 0.0015 TGGCC 0.00147 TGGCG 0.00136 TGGCT 0.00134 TGGGA 0.00119 TGGGC 0.00139 TGGGG 0.00122 TGGGT 0.0011 TGGTA 0.000778 TGGTC 0.00124 TGGTG 0.00157 TGGTT 0.00104 TGTAA 0.000532 TGTAC 0.000847 TGTAG 0.000713 TGTAT 0.000727 TGTCA 0.00121 TGTCC 0.00104 TGTCG 0.00139 TGTCT 0.0012 TGTGA 0.00112 TGTGC 0.00117 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.00116 TGTTA 0.000466 TGTTC 0.0011 TGTTG 0.00146 TGTTT 0.00104 TTAAA 0.00033 TTAAC 0.000259 TTAAG 0.000282 TTAAT 0.000283 TTACA 0.000532 TTACC 0.000578 TTACG 0.00042 TTACT 0.000424 TTAGA 0.000375 TTAGC 0.000423 TTAGG 0.000404 TTAGT 0.000295 TTATA 0.000331 TTATC 0.000537 TTATG 0.000469 TTATT 0.000499 TTCAA 0.0011 TTCAC 0.00102 TTCAG 0.00107 TTCAT 0.00106 TTCCA 0.0011 TTCCC 0.00117 TTCCG 0.000794 TTCCT 0.00109 TTCGA 0.00108 TTCGC 0.000986 TTCGG 0.000993 TTCGT 0.000995 TTCTA 0.000479 TTCTC 0.0013 TTCTG 0.00111 TTCTT 0.0014 TTGAA 0.0011 TTGAC 0.0013 TTGAG 0.00113 TTGAT 0.00118 TTGCA 0.00113 TTGCC 0.00132 TTGCG 0.00108 TTGCT 0.00129 TTGGA 0.001 TTGGC 0.00147 TTGGG 0.00126 TTGGT 0.00116 TTGTA 0.000729 TTGTC 0.00121 TTGTG 0.00105 TTGTT 0.00115 TTTAA 0.00033 TTTAC 0.000489 TTTAG 0.000381 TTTAT 0.000476 TTTCA 0.000974 TTTCC 0.00113 TTTCG 0.00111 TTTCT 0.0013 TTTGA 0.00102 TTTGC 0.0012 TTTGG 0.00114 TTTGT 0.00102 TTTTA 0.000451 TTTTC 0.00123 TTTTG 0.00117 TTTTT 0.00136 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3272 AAAAC 0.2081 AAAAG 0.2909 AAAAT 0.1738 AAACA 0.3117 AAACC 0.258 AAACG 0.2453 AAACT 0.185 AAAGA 0.2928 AAAGC 0.2632 AAAGG 0.2628 AAAGT 0.1812 AAATA 0.216 AAATC 0.2627 AAATG 0.2994 AAATT 0.2219 AACAA 0.2845 AACAC 0.2351 AACAG 0.2527 AACAT 0.2276 AACCA 0.2959 AACCC 0.29 AACCG 0.1808 AACCT 0.2332 AACGA 0.3201 AACGC 0.2561 AACGG 0.2225 AACGT 0.2014 AACTA 0.1535 AACTC 0.2968 AACTG 0.2936 AACTT 0.2561 AAGAA 0.3004 AAGAC 0.2469 AAGAG 0.2588 AAGAT 0.194 AAGCA 0.281 AAGCC 0.2624 AAGCG 0.1894 AAGCT 0.2673 AAGGA 0.2346 AAGGC 0.2653 AAGGG 0.2752 AAGGT 0.2249 AAGTA 0.197 AAGTC 0.3096 AAGTG 0.2892 AAGTT 0.2042 AATAA 0.2275 AATAC 0.2704 AATAG 0.2262 AATAT 0.276 AATCA 0.3156 AATCC 0.2281 AATCG 0.2395 AATCT 0.2168 AATGA 0.2593 AATGC 0.2706 AATGG 0.276 AATGT 0.1941 AATTA 0.1556 AATTC 0.268 AATTG 0.3372 AATTT 0.2391 ACAAA 0.2452 ACAAC 0.257 ACAAG 0.2923 ACAAT 0.2054 ACACA 0.2989 ACACC 0.2756 ACACG 0.2303 ACACT 0.1952 ACAGA 0.239 ACAGC 0.3016 ACAGG 0.279 ACAGT 0.1805 ACATA 0.1525 ACATC 0.2854 ACATG 0.3735 ACATT 0.1886 ACCAA 0.2517 ACCAC 0.2675 ACCAG 0.2647 ACCAT 0.2161 ACCCA 0.2821 ACCCC 0.2912 ACCCG 0.1943 ACCCT 0.2324 ACCGA 0.3173 ACCGC 0.2655 ACCGG 0.1986 ACCGT 0.2186 ACCTA 0.1677 ACCTC 0.2981 ACCTG 0.2883 ACCTT 0.246 ACGAA 0.2275 ACGAC 0.2832 ACGAG 0.2858 ACGAT 0.2036 ACGCA 0.2451 ACGCC 0.3038 ACGCG 0.2284 ACGCT 0.2227 ACGGA 0.2458 ACGGC 0.3146 ACGGG 0.2422 ACGGT 0.1974 ACGTA 0.1874 ACGTC 0.3076 ACGTG 0.2848 ACGTT 0.2202 ACTAA 0.1661 ACTAC 0.3652 ACTAG 0.2352 ACTAT 0.2335 ACTCA 0.2286 ACTCC 0.2253 ACTCG 0.2951 ACTCT 0.251 ACTGA 0.2341 ACTGC 0.2755 ACTGG 0.2766 ACTGT 0.2138 ACTTA 0.09824 ACTTC 0.289 ACTTG 0.3552 ACTTT 0.2576 AGAAA 0.3022 AGAAC 0.1944 AGAAG 0.3144 AGAAT 0.189 AGACA 0.2846 AGACC 0.2338 AGACG 0.2857 AGACT 0.1958 AGAGA 0.3127 AGAGC 0.2331 AGAGG 0.2821 AGAGT 0.1721 AGATA 0.1872 AGATC 0.2499 AGATG 0.376 AGATT 0.1869 AGCAA 0.2641 AGCAC 0.2312 AGCAG 0.2774 AGCAT 0.2273 AGCCA 0.293 AGCCC 0.2492 AGCCG 0.2155 AGCCT 0.2423 AGCGA 0.296 AGCGC 0.2393 AGCGG 0.2412 AGCGT 0.2234 AGCTA 0.1406 AGCTC 0.2851 AGCTG 0.2954 AGCTT 0.2789 AGGAA 0.2689 AGGAC 0.2176 AGGAG 0.3008 AGGAT 0.2128 AGGCA 0.2905 AGGCC 0.2365 AGGCG 0.2419 AGGCT 0.2311 AGGGA 0.2415 AGGGC 0.2457 AGGGG 0.3126 AGGGT 0.2002 AGGTA 0.255 AGGTC 0.2546 AGGTG 0.2948 AGGTT 0.1957 AGTAA 0.195 AGTAC 0.2608 AGTAG 0.2967 AGTAT 0.2474 AGTCA 0.2799 AGTCC 0.2077 AGTCG 0.2761 AGTCT 0.2363 AGTGA 0.2619 AGTGC 0.2338 AGTGG 0.2831 AGTGT 0.2212 AGTTA 0.1266 AGTTC 0.2586 AGTTG 0.3634 AGTTT 0.2515 ATAAA 0.2625 ATAAC 0.243 ATAAG 0.2493 ATAAT 0.2451 ATACA 0.292 ATACC 0.2799 ATACG 0.2121 ATACT 0.216 ATAGA 0.2859 ATAGC 0.2874 ATAGG 0.2133 ATAGT 0.2133 ATATA 0.1736 ATATC 0.2986 ATATG 0.2759 ATATT 0.252 ATCAA 0.259 ATCAC 0.255 ATCAG 0.2196 ATCAT 0.2664 ATCCA 0.2652 ATCCC 0.2723 ATCCG 0.2193 ATCCT 0.2432 ATCGA 0.2947 ATCGC 0.2628 ATCGG 0.2028 ATCGT 0.2398 ATCTA 0.141 ATCTC 0.3196 ATCTG 0.2883 ATCTT 0.2511 ATGAA 0.2302 ATGAC 0.2419 ATGAG 0.2631 ATGAT 0.2648 ATGCA 0.2779 ATGCC 0.2682 ATGCG 0.2102 ATGCT 0.2437 ATGGA 0.251 ATGGC 0.2924 ATGGG 0.2401 ATGGT 0.2165 ATGTA 0.192 ATGTC 0.3038 ATGTG 0.2675 ATGTT 0.2367 ATTAA 0.1875 ATTAC 0.3106 ATTAG 0.2135 ATTAT 0.2884 ATTCA 0.2743 ATTCC 0.2344 ATTCG 0.2532 ATTCT 0.2381 ATTGA 0.2685 ATTGC 0.2495 ATTGG 0.2668 ATTGT 0.2152 ATTTA 0.1375 ATTTC 0.3077 ATTTG 0.2991 ATTTT 0.2557 CAAAA 0.2698 CAAAC 0.2474 CAAAG 0.2849 CAAAT 0.1979 CAACA 0.3114 CAACC 0.2655 CAACG 0.2317 CAACT 0.1914 CAAGA 0.2597 CAAGC 0.2811 CAAGG 0.2635 CAAGT 0.1957 CAATA 0.1752 CAATC 0.2859 CAATG 0.3085 CAATT 0.2303 CACAA 0.2295 CACAC 0.2874 CACAG 0.2579 CACAT 0.2251 CACCA 0.3187 CACCC 0.2495 CACCG 0.1953 CACCT 0.2365 CACGA 0.296 CACGC 0.2658 CACGG 0.2415 CACGT 0.1967 CACTA 0.144 CACTC 0.2845 CACTG 0.3208 CACTT 0.2507 CAGAA 0.2369 CAGAC 0.2668 CAGAG 0.2678 CAGAT 0.2285 CAGCA 0.2827 CAGCC 0.2875 CAGCG 0.2094 CAGCT 0.2204 CAGGA 0.2121 CAGGC 0.3021 CAGGG 0.257 CAGGT 0.2288 CAGTA 0.183 CAGTC 0.304 CAGTG 0.3142 CAGTT 0.1988 CATAA 0.1947 CATAC 0.2999 CATAG 0.2228 CATAT 0.2826 CATCA 0.3043 CATCC 0.2325 CATCG 0.2283 CATCT 0.2349 CATGA 0.2536 CATGC 0.2484 CATGG 0.2464 CATGT 0.2516 CATTA 0.127 CATTC 0.3173 CATTG 0.3242 CATTT 0.2315 CCAAA 0.2364 CCAAC 0.2487 CCAAG 0.3007 CCAAT 0.2141 CCACA 0.2314 CCACC 0.3299 CCACG 0.2349 CCACT 0.2037 CCAGA 0.239 CCAGC 0.3122 CCAGG 0.2608 CCAGT 0.188 CCATA 0.1243 CCATC 0.3487 CCATG 0.304 CCATT 0.223 CCCAA 0.2561 CCCAC 0.2561 CCCAG 0.2633 CCCAT 0.2244 CCCCA 0.2189 CCCCC 0.3503 CCCCG 0.1777 CCCCT 0.2531 CCCGA 0.2586 CCCGC 0.3117 CCCGG 0.208 CCCGT 0.2217 CCCTA 0.1059 CCCTC 0.3384 CCCTG 0.2881 CCCTT 0.2677 CCGAA 0.2471 CCGAC 0.2848 CCGAG 0.2778 CCGAT 0.1903 CCGCA 0.231 CCGCC 0.3497 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.2099 CCGGA 0.2222 CCGGC 0.3339 CCGGG 0.2481 CCGGT 0.1958 CCGTA 0.1434 CCGTC 0.3553 CCGTG 0.2956 CCGTT 0.2057 CCTAA 0.1831 CCTAC 0.3516 CCTAG 0.277 CCTAT 0.1883 CCTCA 0.2253 CCTCC 0.2797 CCTCG 0.2642 CCTCT 0.2309 CCTGA 0.2179 CCTGC 0.2869 CCTGG 0.2661 CCTGT 0.2292 CCTTA 0.1028 CCTTC 0.3158 CCTTG 0.3263 CCTTT 0.255 CGAAA 0.2738 CGAAC 0.2159 CGAAG 0.297 CGAAT 0.2133 CGACA 0.2815 CGACC 0.2528 CGACG 0.2707 CGACT 0.195 CGAGA 0.2696 CGAGC 0.2587 CGAGG 0.2899 CGAGT 0.1817 CGATA 0.1796 CGATC 0.2702 CGATG 0.3515 CGATT 0.1987 CGCAA 0.2717 CGCAC 0.2295 CGCAG 0.2544 CGCAT 0.2444 CGCCA 0.2777 CGCCC 0.2539 CGCCG 0.2357 CGCCT 0.2327 CGCGA 0.2722 CGCGC 0.2779 CGCGG 0.2305 CGCGT 0.2194 CGCTA 0.1264 CGCTC 0.2873 CGCTG 0.344 CGCTT 0.2422 CGGAA 0.2461 CGGAC 0.245 CGGAG 0.2741 CGGAT 0.2348 CGGCA 0.26 CGGCC 0.2617 CGGCG 0.26 CGGCT 0.2182 CGGGA 0.2409 CGGGC 0.279 CGGGG 0.2723 CGGGT 0.2077 CGGTA 0.1759 CGGTC 0.2962 CGGTG 0.3252 CGGTT 0.2028 CGTAA 0.1884 CGTAC 0.2862 CGTAG 0.2799 CGTAT 0.2454 CGTCA 0.2607 CGTCC 0.2122 CGTCG 0.2774 CGTCT 0.2496 CGTGA 0.25 CGTGC 0.2518 CGTGG 0.2768 CGTGT 0.2213 CGTTA 0.1148 CGTTC 0.2847 CGTTG 0.3416 CGTTT 0.259 CTAAA 0.2532 CTAAC 0.2565 CTAAG 0.2668 CTAAT 0.2235 CTACA 0.2516 CTACC 0.3097 CTACG 0.2119 CTACT 0.2268 CTAGA 0.2382 CTAGC 0.274 CTAGG 0.2896 CTAGT 0.1983 CTATA 0.1546 CTATC 0.3076 CTATG 0.2758 CTATT 0.2619 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.2417 CTCAG 0.2361 CTCAT 0.272 CTCCA 0.272 CTCCC 0.2854 CTCCG 0.1889 CTCCT 0.2537 CTCGA 0.2879 CTCGC 0.2547 CTCGG 0.214 CTCGT 0.2434 CTCTA 0.1174 CTCTC 0.3607 CTCTG 0.2621 CTCTT 0.2598 CTGAA 0.2472 CTGAC 0.2675 CTGAG 0.2481 CTGAT 0.2372 CTGCA 0.2541 CTGCC 0.3102 CTGCG 0.1847 CTGCT 0.2511 CTGGA 0.22 CTGGC 0.2994 CTGGG 0.2476 CTGGT 0.2331 CTGTA 0.1609 CTGTC 0.3216 CTGTG 0.2786 CTGTT 0.2389 CTTAA 0.1682 CTTAC 0.3091 CTTAG 0.2431 CTTAT 0.2796 CTTCA 0.2431 CTTCC 0.2675 CTTCG 0.2306 CTTCT 0.2589 CTTGA 0.2567 CTTGC 0.2596 CTTGG 0.2662 CTTGT 0.2176 CTTTA 0.09675 CTTTC 0.3308 CTTTG 0.2871 CTTTT 0.2853 GAAAA 0.273 GAAAC 0.2118 GAAAG 0.318 GAAAT 0.1972 GAACA 0.3047 GAACC 0.2675 GAACG 0.2508 GAACT 0.1769 GAAGA 0.294 GAAGC 0.2665 GAAGG 0.2705 GAAGT 0.1689 GAATA 0.1908 GAATC 0.2485 GAATG 0.3491 GAATT 0.2116 GACAA 0.249 GACAC 0.2237 GACAG 0.2837 GACAT 0.2436 GACCA 0.2917 GACCC 0.2469 GACCG 0.2147 GACCT 0.2467 GACGA 0.3258 GACGC 0.2422 GACGG 0.2495 GACGT 0.1826 GACTA 0.155 GACTC 0.2628 GACTG 0.3122 GACTT 0.27 GAGAA 0.2451 GAGAC 0.232 GAGAG 0.3099 GAGAT 0.2129 GAGCA 0.2788 GAGCC 0.2458 GAGCG 0.2145 GAGCT 0.2609 GAGGA 0.2506 GAGGC 0.2617 GAGGG 0.2734 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.1745 GAGTC 0.2873 GAGTG 0.3127 GAGTT 0.2255 GATAA 0.2042 GATAC 0.2868 GATAG 0.2282 GATAT 0.2809 GATCA 0.2814 GATCC 0.2333 GATCG 0.2569 GATCT 0.2285 GATGA 0.2663 GATGC 0.2643 GATGG 0.2794 GATGT 0.1901 GATTA 0.124 GATTC 0.2713 GATTG 0.3608 GATTT 0.2439 GCAAA 0.2486 GCAAC 0.2464 GCAAG 0.3001 GCAAT 0.205 GCACA 0.2767 GCACC 0.2812 GCACG 0.2474 GCACT 0.1947 GCAGA 0.2378 GCAGC 0.3064 GCAGG 0.2735 GCAGT 0.1822 GCATA 0.1326 GCATC 0.3347 GCATG 0.3109 GCATT 0.2218 GCCAA 0.2593 GCCAC 0.2266 GCCAG 0.2766 GCCAT 0.2375 GCCCA 0.2832 GCCCC 0.2762 GCCCG 0.2105 GCCCT 0.23 GCCGA 0.2646 GCCGC 0.2695 GCCGG 0.2297 GCCGT 0.2362 GCCTA 0.1176 GCCTC 0.3104 GCCTG 0.3246 GCCTT 0.2474 GCGAA 0.2194 GCGAC 0.2642 GCGAG 0.2957 GCGAT 0.2207 GCGCA 0.2565 GCGCC 0.2861 GCGCG 0.2506 GCGCT 0.2068 GCGGA 0.2186 GCGGC 0.2986 GCGGG 0.2834 GCGGT 0.1994 GCGTA 0.1389 GCGTC 0.3274 GCGTG 0.3089 GCGTT 0.2248 GCTAA 0.1857 GCTAC 0.3172 GCTAG 0.2525 GCTAT 0.2445 GCTCA 0.2505 GCTCC 0.2386 GCTCG 0.2823 GCTCT 0.2285 GCTGA 0.2151 GCTGC 0.2842 GCTGG 0.2817 GCTGT 0.219 GCTTA 0.09894 GCTTC 0.3065 GCTTG 0.343 GCTTT 0.2516 GGAAA 0.27 GGAAC 0.2055 GGAAG 0.3335 GGAAT 0.191 GGACA 0.2838 GGACC 0.235 GGACG 0.2817 GGACT 0.1996 GGAGA 0.2796 GGAGC 0.2371 GGAGG 0.3329 GGAGT 0.1504 GGATA 0.1563 GGATC 0.2613 GGATG 0.3809 GGATT 0.2015 GGCAA 0.2422 GGCAC 0.2185 GGCAG 0.3117 GGCAT 0.2276 GGCCA 0.2961 GGCCC 0.2392 GGCCG 0.2373 GGCCT 0.2275 GGCGA 0.2647 GGCGC 0.2346 GGCGG 0.2848 GGCGT 0.2159 GGCTA 0.1218 GGCTC 0.2542 GGCTG 0.3647 GGCTT 0.2592 GGGAA 0.2696 GGGAC 0.2015 GGGAG 0.3104 GGGAT 0.2185 GGGCA 0.2676 GGGCC 0.2427 GGGCG 0.2577 GGGCT 0.232 GGGGA 0.2077 GGGGC 0.2389 GGGGG 0.3503 GGGGT 0.2031 GGGTA 0.1672 GGGTC 0.2623 GGGTG 0.32 GGGTT 0.2505 GGTAA 0.188 GGTAC 0.2941 GGTAG 0.2891 GGTAT 0.2288 GGTCA 0.2708 GGTCC 0.2015 GGTCG 0.2951 GGTCT 0.2326 GGTGA 0.238 GGTGC 0.2321 GGTGG 0.3152 GGTGT 0.2147 GGTTA 0.1188 GGTTC 0.2766 GGTTG 0.3566 GGTTT 0.2481 GTAAA 0.2522 GTAAC 0.2353 GTAAG 0.2617 GTAAT 0.2507 GTACA 0.2943 GTACC 0.3042 GTACG 0.2091 GTACT 0.1924 GTAGA 0.247 GTAGC 0.2542 GTAGG 0.2714 GTAGT 0.2274 GTATA 0.167 GTATC 0.3007 GTATG 0.2887 GTATT 0.2435 GTCAA 0.2801 GTCAC 0.2314 GTCAG 0.2463 GTCAT 0.2421 GTCCA 0.2919 GTCCC 0.2441 GTCCG 0.2224 GTCCT 0.2417 GTCGA 0.2775 GTCGC 0.2389 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2532 GTCTA 0.1381 GTCTC 0.2989 GTCTG 0.2888 GTCTT 0.2743 GTGAA 0.2299 GTGAC 0.2479 GTGAG 0.2506 GTGAT 0.2717 GTGCA 0.2396 GTGCC 0.2786 GTGCG 0.2135 GTGCT 0.2682 GTGGA 0.222 GTGGC 0.2644 GTGGG 0.2597 GTGGT 0.254 GTGTA 0.1659 GTGTC 0.269 GTGTG 0.3294 GTGTT 0.2357 GTTAA 0.1673 GTTAC 0.2951 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.2895 GTTCA 0.277 GTTCC 0.242 GTTCG 0.246 GTTCT 0.235 GTTGA 0.2508 GTTGC 0.2556 GTTGG 0.2641 GTTGT 0.2295 GTTTA 0.1172 GTTTC 0.2888 GTTTG 0.3267 GTTTT 0.2674 TAAAA 0.272 TAAAC 0.2344 TAAAG 0.2535 TAAAT 0.2402 TAACA 0.2965 TAACC 0.2671 TAACG 0.2351 TAACT 0.2013 TAAGA 0.2568 TAAGC 0.2762 TAAGG 0.2827 TAAGT 0.1844 TAATA 0.1739 TAATC 0.2494 TAATG 0.3069 TAATT 0.2698 TACAA 0.2589 TACAC 0.2357 TACAG 0.2425 TACAT 0.2629 TACCA 0.2548 TACCC 0.2205 TACCG 0.1786 TACCT 0.3461 TACGA 0.2887 TACGC 0.2322 TACGG 0.2277 TACGT 0.2515 TACTA 0.1602 TACTC 0.2582 TACTG 0.3039 TACTT 0.2777 TAGAA 0.2269 TAGAC 0.2745 TAGAG 0.2582 TAGAT 0.2405 TAGCA 0.2854 TAGCC 0.2469 TAGCG 0.1979 TAGCT 0.2698 TAGGA 0.2042 TAGGC 0.2585 TAGGG 0.2231 TAGGT 0.3142 TAGTA 0.1959 TAGTC 0.3066 TAGTG 0.2865 TAGTT 0.2111 TATAA 0.2197 TATAC 0.2842 TATAG 0.2046 TATAT 0.2914 TATCA 0.2693 TATCC 0.2119 TATCG 0.259 TATCT 0.2598 TATGA 0.2586 TATGC 0.2538 TATGG 0.2414 TATGT 0.2462 TATTA 0.1207 TATTC 0.2907 TATTG 0.3087 TATTT 0.2799 TCAAA 0.2175 TCAAC 0.2492 TCAAG 0.3059 TCAAT 0.2274 TCACA 0.2568 TCACC 0.2849 TCACG 0.2427 TCACT 0.2155 TCAGA 0.2357 TCAGC 0.2982 TCAGG 0.2671 TCAGT 0.1991 TCATA 0.1348 TCATC 0.3364 TCATG 0.3167 TCATT 0.2121 TCCAA 0.2251 TCCAC 0.2468 TCCAG 0.2636 TCCAT 0.2645 TCCCA 0.272 TCCCC 0.2698 TCCCG 0.2042 TCCCT 0.254 TCCGA 0.2638 TCCGC 0.2716 TCCGG 0.2104 TCCGT 0.2542 TCCTA 0.111 TCCTC 0.3552 TCCTG 0.2723 TCCTT 0.2614 TCGAA 0.2132 TCGAC 0.2717 TCGAG 0.296 TCGAT 0.2191 TCGCA 0.2403 TCGCC 0.2975 TCGCG 0.2263 TCGCT 0.2358 TCGGA 0.2169 TCGGC 0.2995 TCGGG 0.2401 TCGGT 0.2435 TCGTA 0.1395 TCGTC 0.3557 TCGTG 0.2779 TCGTT 0.2269 TCTAA 0.1748 TCTAC 0.33 TCTAG 0.235 TCTAT 0.2603 TCTCA 0.2257 TCTCC 0.2469 TCTCG 0.2583 TCTCT 0.2691 TCTGA 0.218 TCTGC 0.2828 TCTGG 0.2765 TCTGT 0.2226 TCTTA 0.08958 TCTTC 0.3293 TCTTG 0.3085 TCTTT 0.2726 TGAAA 0.2342 TGAAC 0.2365 TGAAG 0.3046 TGAAT 0.2247 TGACA 0.2606 TGACC 0.2508 TGACG 0.2749 TGACT 0.2137 TGAGA 0.2762 TGAGC 0.269 TGAGG 0.2898 TGAGT 0.1649 TGATA 0.1539 TGATC 0.2441 TGATG 0.3862 TGATT 0.2158 TGCAA 0.2347 TGCAC 0.2118 TGCAG 0.2878 TGCAT 0.2657 TGCCA 0.2766 TGCCC 0.2449 TGCCG 0.2189 TGCCT 0.2595 TGCGA 0.2718 TGCGC 0.2675 TGCGG 0.2392 TGCGT 0.2215 TGCTA 0.1321 TGCTC 0.2707 TGCTG 0.3367 TGCTT 0.2605 TGGAA 0.2509 TGGAC 0.2408 TGGAG 0.2955 TGGAT 0.2127 TGGCA 0.2611 TGGCC 0.2596 TGGCG 0.2435 TGGCT 0.2358 TGGGA 0.2406 TGGGC 0.2816 TGGGG 0.2516 TGGGT 0.2261 TGGTA 0.1655 TGGTC 0.2655 TGGTG 0.3502 TGGTT 0.2189 TGTAA 0.1861 TGTAC 0.3055 TGTAG 0.2521 TGTAT 0.2562 TGTCA 0.2477 TGTCC 0.2142 TGTCG 0.2891 TGTCT 0.2491 TGTGA 0.2392 TGTGC 0.2547 TGTGG 0.2465 TGTGT 0.2597 TGTTA 0.1132 TGTTC 0.2705 TGTTG 0.359 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2803 TTAAC 0.2248 TTAAG 0.2399 TTAAT 0.255 TTACA 0.2736 TTACC 0.2966 TTACG 0.2101 TTACT 0.2196 TTAGA 0.2495 TTAGC 0.2838 TTAGG 0.2695 TTAGT 0.1972 TTATA 0.1755 TTATC 0.2911 TTATG 0.2549 TTATT 0.2785 TTCAA 0.2613 TTCAC 0.2357 TTCAG 0.25 TTCAT 0.253 TTCCA 0.2637 TTCCC 0.2832 TTCCG 0.1939 TTCCT 0.2592 TTCGA 0.2657 TTCGC 0.2421 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2482 TTCTA 0.1119 TTCTC 0.3095 TTCTG 0.2515 TTCTT 0.3271 TTGAA 0.2338 TTGAC 0.2752 TTGAG 0.2379 TTGAT 0.2531 TTGCA 0.2342 TTGCC 0.2725 TTGCG 0.223 TTGCT 0.2703 TTGGA 0.2017 TTGGC 0.3015 TTGGG 0.2587 TTGGT 0.238 TTGTA 0.1769 TTGTC 0.2907 TTGTG 0.2554 TTGTT 0.277 TTTAA 0.1927 TTTAC 0.2922 TTTAG 0.2263 TTTAT 0.2888 TTTCA 0.2161 TTTCC 0.2505 TTTCG 0.2458 TTTCT 0.2877 TTTGA 0.2312 TTTGC 0.2724 TTTGG 0.2652 TTTGT 0.2312 TTTTA 0.1059 TTTTC 0.2896 TTTTG 0.2772 TTTTT 0.3272 [3] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.229 C 0.271 G 0.27 T 0.23 # l= 1 # Values AA 0.0557 AC 0.0578 AG 0.0632 AT 0.0527 CA 0.0726 CC 0.0713 CG 0.0633 CT 0.0633 GA 0.0685 GC 0.073 GG 0.0712 GT 0.0578 TA 0.0327 TC 0.0685 TG 0.0726 TT 0.0557 # l= 2 # Values AAA 0.0146 AAC 0.013 AAG 0.0166 AAT 0.0115 ACA 0.0161 ACC 0.0158 ACG 0.0143 ACT 0.0115 AGA 0.0167 AGC 0.0175 AGG 0.0176 AGT 0.0115 ATA 0.00842 ATC 0.0153 ATG 0.0175 ATT 0.0115 CAA 0.0183 CAC 0.0174 CAG 0.0193 CAT 0.0175 CCA 0.0198 CCC 0.0191 CCG 0.0147 CCT 0.0176 CGA 0.018 CGC 0.0164 CGG 0.0147 CGT 0.0143 CTA 0.00826 CTC 0.0191 CTG 0.0193 CTT 0.0166 GAA 0.0166 GAC 0.0175 GAG 0.0191 GAT 0.0153 GCA 0.0191 GCC 0.0202 GCG 0.0163 GCT 0.0174 GGA 0.0162 GGC 0.0202 GGG 0.0191 GGT 0.0158 GTA 0.00993 GTC 0.0175 GTG 0.0174 GTT 0.013 TAA 0.0061 TAC 0.00995 TAG 0.00824 TAT 0.00841 TCA 0.0176 TCC 0.0162 TCG 0.018 TCT 0.0167 TGA 0.0176 TGC 0.0191 TGG 0.0198 TGT 0.0161 TTA 0.0061 TTC 0.0166 TTG 0.0183 TTT 0.0146 # l= 3 # Values AAAA 0.0042 AAAC 0.0033 AAAG 0.00429 AAAT 0.00282 AACA 0.004 AACC 0.00344 AACG 0.00315 AACT 0.00237 AAGA 0.00464 AAGC 0.00452 AAGG 0.00448 AAGT 0.003 AATA 0.00214 AATC 0.00306 AATG 0.00367 AATT 0.00261 ACAA 0.00408 ACAC 0.00394 ACAG 0.00429 ACAT 0.00382 ACCA 0.00464 ACCC 0.004 ACCG 0.0031 ACCT 0.00407 ACGA 0.00445 ACGC 0.00358 ACGG 0.00343 ACGT 0.00284 ACTA 0.00173 ACTC 0.00318 ACTG 0.00362 ACTT 0.003 AGAA 0.00427 AGAC 0.00421 AGAG 0.00466 AGAT 0.00359 AGCA 0.00489 AGCC 0.00464 AGCG 0.00357 AGCT 0.00434 AGGA 0.00406 AGGC 0.00485 AGGG 0.00464 AGGT 0.00407 AGTA 0.00211 AGTC 0.00352 AGTG 0.00354 AGTT 0.00237 ATAA 0.00175 ATAC 0.00241 ATAG 0.0019 ATAT 0.00236 ATCA 0.00448 ATCC 0.00352 ATCG 0.00375 ATCT 0.00358 ATGA 0.00449 ATGC 0.00451 ATGG 0.00468 ATGT 0.00382 ATTA 0.00145 ATTC 0.00336 ATTG 0.00384 ATTT 0.00282 CAAA 0.00433 CAAC 0.00464 CAAG 0.00554 CAAT 0.00384 CACA 0.00458 CACC 0.0051 CACG 0.00419 CACT 0.00354 CAGA 0.00459 CAGC 0.0059 CAGG 0.00521 CAGT 0.00361 CATA 0.00234 CATC 0.00579 CATG 0.0057 CATT 0.00367 CCAA 0.00487 CCAC 0.00494 CCAG 0.0053 CCAT 0.00468 CCCA 0.00498 CCCC 0.00576 CCCG 0.00376 CCCT 0.00464 CCGA 0.00401 CCGC 0.00412 CCGG 0.00314 CCGT 0.00345 CCTA 0.0022 CCTC 0.00571 CCTG 0.00521 CCTT 0.00449 CGAA 0.00403 CGAC 0.00499 CGAG 0.00524 CGAT 0.00375 CGCA 0.00396 CGCC 0.00503 CGCG 0.00377 CGCT 0.00357 CGGA 0.00327 CGGC 0.00459 CGGG 0.00375 CGGT 0.0031 CGTA 0.0021 CGTC 0.00487 CGTG 0.0042 CGTT 0.00315 CTAA 0.00143 CTAC 0.00281 CTAG 0.00211 CTAT 0.0019 CTCA 0.00438 CTCC 0.00479 CTCG 0.00524 CTCT 0.00467 CTGA 0.00424 CTGC 0.00549 CTGG 0.0053 CTGT 0.00429 CTTA 0.0016 CTTC 0.0052 CTTG 0.00555 CTTT 0.00429 GAAA 0.00449 GAAC 0.00357 GAAG 0.00519 GAAT 0.00337 GACA 0.00483 GACC 0.00427 GACG 0.00486 GACT 0.00352 GAGA 0.0054 GAGC 0.00479 GAGG 0.00571 GAGT 0.00318 GATA 0.00256 GATC 0.00393 GATG 0.00578 GATT 0.00305 GCAA 0.0048 GCAC 0.00428 GCAG 0.00549 GCAT 0.00452 GCCA 0.00574 GCCC 0.00497 GCCG 0.0046 GCCT 0.00485 GCGA 0.00451 GCGC 0.00412 GCGG 0.00411 GCGT 0.00358 GCTA 0.00225 GCTC 0.00479 GCTG 0.00589 GCTT 0.00452 GGAA 0.00422 GGAC 0.00366 GGAG 0.00479 GGAT 0.00352 GGCA 0.00547 GGCC 0.00503 GGCG 0.00502 GGCT 0.00464 GGGA 0.00441 GGGC 0.00497 GGGG 0.00576 GGGT 0.004 GGTA 0.003 GGTC 0.00427 GGTG 0.0051 GGTT 0.00344 GTAA 0.00186 GTAC 0.00286 GTAG 0.0028 GTAT 0.00241 GTCA 0.00462 GTCC 0.00366 GTCG 0.00499 GTCT 0.00421 GTGA 0.00427 GTGC 0.00427 GTGG 0.00493 GTGT 0.00393 GTTA 0.00146 GTTC 0.00357 GTTG 0.00464 GTTT 0.0033 TAAA 0.00159 TAAC 0.00146 TAAG 0.0016 TAAT 0.00145 TACA 0.00273 TACC 0.003 TACG 0.0021 TACT 0.0021 TAGA 0.00208 TAGC 0.00224 TAGG 0.00219 TAGT 0.00173 TATA 0.00138 TATC 0.00256 TATG 0.00234 TATT 0.00214 TCAA 0.00459 TCAC 0.00427 TCAG 0.00424 TCAT 0.00449 TCCA 0.00442 TCCC 0.00441 TCCG 0.00328 TCCT 0.00407 TCGA 0.00502 TCGC 0.00452 TCGG 0.00401 TCGT 0.00445 TCTA 0.00208 TCTC 0.0054 TCTG 0.00459 TCTT 0.00465 TGAA 0.00411 TGAC 0.00462 TGAG 0.00438 TGAT 0.00448 TGCA 0.00476 TGCC 0.00547 TGCG 0.00395 TGCT 0.00489 TGGA 0.00442 TGGC 0.00574 TGGG 0.00499 TGGT 0.00463 TGTA 0.00273 TGTC 0.00483 TGTG 0.00457 TGTT 0.00401 TTAA 0.00106 TTAC 0.00187 TTAG 0.00143 TTAT 0.00174 TTCA 0.00411 TTCC 0.00422 TTCG 0.00402 TTCT 0.00427 TTGA 0.00459 TTGC 0.0048 TTGG 0.00487 TTGT 0.00409 TTTA 0.00159 TTTC 0.0045 TTTG 0.00433 TTTT 0.0042 # l= 4 # Values AAAAA 0.00138 AAAAC 0.000878 AAAAG 0.00121 AAAAT 0.000725 AAACA 0.00102 AAACC 0.000865 AAACG 0.000811 AAACT 0.000599 AAAGA 0.00125 AAAGC 0.00112 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.000782 AAATA 0.000603 AAATC 0.000752 AAATG 0.000849 AAATT 0.000615 AACAA 0.00114 AACAC 0.000939 AACAG 0.00103 AACAT 0.000898 AACCA 0.00102 AACCC 0.00101 AACCG 0.000622 AACCT 0.00079 AACGA 0.00102 AACGC 0.000798 AACGG 0.000702 AACGT 0.000631 AACTA 0.000351 AACTC 0.000694 AACTG 0.00072 AACTT 0.000601 AAGAA 0.00139 AAGAC 0.00115 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.000902 AAGCA 0.00126 AAGCC 0.0012 AAGCG 0.00086 AAGCT 0.0012 AAGGA 0.00105 AAGGC 0.00121 AAGGG 0.00124 AAGGT 0.000986 AAGTA 0.000575 AAGTC 0.000939 AAGTG 0.000883 AAGTT 0.000601 AATAA 0.000478 AATAC 0.000583 AATAG 0.00049 AATAT 0.000588 AATCA 0.00095 AATCC 0.000704 AATCG 0.000742 AATCT 0.000657 AATGA 0.000951 AATGC 0.001 AATGG 0.00101 AATGT 0.000708 AATTA 0.000388 AATTC 0.000718 AATTG 0.000888 AATTT 0.000615 ACAAA 0.00101 ACAAC 0.00105 ACAAG 0.00121 ACAAT 0.000822 ACACA 0.00116 ACACC 0.00108 ACACG 0.000908 ACACT 0.000784 ACAGA 0.00102 ACAGC 0.0013 ACAGG 0.00119 ACAGT 0.000771 ACATA 0.000572 ACATC 0.00111 ACATG 0.00143 ACATT 0.000708 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00125 ACCAG 0.00122 ACCAT 0.000994 ACCCA 0.00112 ACCCC 0.00118 ACCCG 0.00077 ACCCT 0.000934 ACCGA 0.000981 ACCGC 0.000822 ACCGG 0.000615 ACCGT 0.000682 ACCTA 0.000685 ACCTC 0.00121 ACCTG 0.00118 ACCTT 0.000986 ACGAA 0.000994 ACGAC 0.00126 ACGAG 0.00129 ACGAT 0.000916 ACGCA 0.00088 ACGCC 0.00108 ACGCG 0.000832 ACGCT 0.000784 ACGGA 0.000826 ACGGC 0.0011 ACGGG 0.000842 ACGGT 0.000682 ACGTA 0.000516 ACGTC 0.000876 ACGTG 0.000815 ACGTT 0.000631 ACTAA 0.000284 ACTAC 0.000628 ACTAG 0.000413 ACTAT 0.0004 ACTCA 0.000716 ACTCC 0.00071 ACTCG 0.000956 ACTCT 0.000797 ACTGA 0.000841 ACTGC 0.00101 ACTGG 0.000991 ACTGT 0.000771 ACTTA 0.000295 ACTTC 0.000866 ACTTG 0.00106 ACTTT 0.000782 AGAAA 0.0013 AGAAC 0.000831 AGAAG 0.00134 AGAAT 0.000794 AGACA 0.0012 AGACC 0.000993 AGACG 0.00121 AGACT 0.00081 AGAGA 0.00143 AGAGC 0.0011 AGAGG 0.00133 AGAGT 0.000797 AGATA 0.000659 AGATC 0.000903 AGATG 0.00137 AGATT 0.000657 AGCAA 0.00128 AGCAC 0.00113 AGCAG 0.00138 AGCAT 0.00111 AGCCA 0.00135 AGCCC 0.00115 AGCCG 0.00101 AGCCT 0.00112 AGCGA 0.00106 AGCGC 0.000856 AGCGG 0.000866 AGCGT 0.000784 AGCTA 0.000608 AGCTC 0.00125 AGCTG 0.00128 AGCTT 0.0012 AGGAA 0.00111 AGGAC 0.000882 AGGAG 0.00122 AGGAT 0.000853 AGGCA 0.00143 AGGCC 0.00113 AGGCG 0.00117 AGGCT 0.00112 AGGGA 0.00112 AGGGC 0.00113 AGGGG 0.00145 AGGGT 0.000934 AGGTA 0.00103 AGGTC 0.00105 AGGTG 0.0012 AGGTT 0.00079 AGTAA 0.000405 AGTAC 0.000547 AGTAG 0.000627 AGTAT 0.000524 AGTCA 0.001 AGTCC 0.000727 AGTCG 0.000973 AGTCT 0.00081 AGTGA 0.000903 AGTGC 0.000837 AGTGG 0.00101 AGTGT 0.000784 AGTTA 0.000287 AGTTC 0.000608 AGTTG 0.000875 AGTTT 0.000599 ATAAA 0.000456 ATAAC 0.000427 ATAAG 0.000439 ATAAT 0.000422 ATACA 0.000698 ATACC 0.000688 ATACG 0.000497 ATACT 0.000524 ATAGA 0.000548 ATAGC 0.000544 ATAGG 0.000404 ATAGT 0.0004 ATATA 0.000394 ATATC 0.000708 ATATG 0.000671 ATATT 0.000588 ATCAA 0.00113 ATCAC 0.00115 ATCAG 0.00101 ATCAT 0.00119 ATCCA 0.000939 ATCCC 0.000963 ATCCG 0.000761 ATCCT 0.000853 ATCGA 0.00108 ATCGC 0.000987 ATCGG 0.000758 ATCGT 0.000916 ATCTA 0.000501 ATCTC 0.00114 ATCTG 0.00104 ATCTT 0.000902 ATGAA 0.00103 ATGAC 0.00111 ATGAG 0.00116 ATGAT 0.00119 ATGCA 0.00124 ATGCC 0.00122 ATGCG 0.000954 ATGCT 0.00111 ATGGA 0.00117 ATGGC 0.00139 ATGGG 0.00112 ATGGT 0.000994 ATGTA 0.000712 ATGTC 0.00117 ATGTG 0.00104 ATGTT 0.000898 ATTAA 0.000255 ATTAC 0.000459 ATTAG 0.000314 ATTAT 0.000422 ATTCA 0.000932 ATTCC 0.000803 ATTCG 0.000843 ATTCT 0.000794 ATTGA 0.00103 ATTGC 0.00095 ATTGG 0.00104 ATTGT 0.000822 ATTTA 0.000365 ATTTC 0.000874 ATTTG 0.000854 ATTTT 0.000725 CAAAA 0.00116 CAAAC 0.00107 CAAAG 0.00124 CAAAT 0.000854 CAACA 0.00145 CAACC 0.00123 CAACG 0.00108 CAACT 0.000875 CAAGA 0.00143 CAAGC 0.00157 CAAGG 0.00149 CAAGT 0.00106 CAATA 0.000667 CAATC 0.00109 CAATG 0.0012 CAATT 0.000888 CACAA 0.00104 CACAC 0.0013 CACAG 0.00119 CACAT 0.00104 CACCA 0.00161 CACCC 0.00129 CACCG 0.001 CACCT 0.0012 CACGA 0.00124 CACGC 0.00111 CACGG 0.00103 CACGT 0.000815 CACTA 0.000509 CACTC 0.000997 CACTG 0.00115 CACTT 0.000883 CAGAA 0.00111 CAGAC 0.00122 CAGAG 0.00123 CAGAT 0.00104 CAGCA 0.00167 CAGCC 0.00171 CAGCG 0.00123 CAGCT 0.00128 CAGGA 0.00112 CAGGC 0.00158 CAGGG 0.00133 CAGGT 0.00118 CAGTA 0.000653 CAGTC 0.0011 CAGTG 0.00115 CAGTT 0.00072 CATAA 0.000445 CATAC 0.000699 CATAG 0.000528 CATAT 0.000671 CATCA 0.00176 CATCC 0.00135 CATCG 0.00131 CATCT 0.00137 CATGA 0.00141 CATGC 0.0014 CATGG 0.00146 CATGT 0.00143 CATTA 0.000449 CATTC 0.00117 CATTG 0.0012 CATTT 0.000849 CCAAA 0.00113 CCAAC 0.00124 CCAAG 0.00146 CCAAT 0.00104 CCACA 0.00114 CCACC 0.00161 CCACG 0.00116 CCACT 0.00101 CCAGA 0.00127 CCAGC 0.00165 CCAGG 0.00138 CCAGT 0.000991 CCATA 0.00058 CCATC 0.00163 CCATG 0.00146 CCATT 0.00101 CCCAA 0.00126 CCCAC 0.00128 CCCAG 0.00133 CCCAT 0.00112 CCCCA 0.00125 CCCCC 0.00204 CCCCG 0.00102 CCCCT 0.00145 CCCGA 0.000968 CCCGC 0.00116 CCCGG 0.000779 CCCGT 0.000842 CCCTA 0.000493 CCCTC 0.00157 CCCTG 0.00133 CCCTT 0.00124 CCGAA 0.000984 CCGAC 0.00115 CCGAG 0.00112 CCGAT 0.000758 CCGCA 0.00095 CCGCC 0.00143 CCGCG 0.000873 CCGCT 0.000866 CCGGA 0.000682 CCGGC 0.00106 CCGGG 0.000779 CCGGT 0.000615 CCGTA 0.000488 CCGTC 0.00122 CCGTG 0.00103 CCGTT 0.000702 CCTAA 0.000394 CCTAC 0.000775 CCTAG 0.00062 CCTAT 0.000404 CCTCA 0.00127 CCTCC 0.0016 CCTCG 0.00151 CCTCT 0.00133 CCTGA 0.00114 CCTGC 0.00149 CCTGG 0.00138 CCTGT 0.00119 CCTTA 0.000457 CCTTC 0.0014 CCTTG 0.00149 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.0011 CGAAC 0.000894 CGAAG 0.00118 CGAAT 0.000843 CGACA 0.0014 CGACC 0.00126 CGACG 0.00135 CGACT 0.000973 CGAGA 0.00142 CGAGC 0.00135 CGAGG 0.00151 CGAGT 0.000956 CGATA 0.000672 CGATC 0.00102 CGATG 0.00131 CGATT 0.000742 CGCAA 0.00107 CGCAC 0.00092 CGCAG 0.00101 CGCAT 0.000954 CGCCA 0.00139 CGCCC 0.00128 CGCCG 0.00118 CGCCT 0.00117 CGCGA 0.00103 CGCGC 0.00103 CGCGG 0.000873 CGCGT 0.000832 CGCTA 0.000452 CGCTC 0.00103 CGCTG 0.00123 CGCTT 0.00086 CGGAA 0.000803 CGGAC 0.000811 CGGAG 0.000902 CGGAT 0.000761 CGGCA 0.00121 CGGCC 0.0012 CGGCG 0.00118 CGGCT 0.00101 CGGGA 0.000898 CGGGC 0.00107 CGGGG 0.00102 CGGGT 0.00077 CGGTA 0.00054 CGGTC 0.000936 CGGTG 0.001 CGGTT 0.000622 CGTAA 0.0004 CGTAC 0.000605 CGTAG 0.000598 CGTAT 0.000497 CGTCA 0.00127 CGTCC 0.00103 CGTCG 0.00135 CGTCT 0.00121 CGTGA 0.00106 CGTGC 0.00106 CGTGG 0.00116 CGTGT 0.000908 CGTTA 0.000351 CGTTC 0.00091 CGTTG 0.00108 CGTTT 0.000811 CTAAA 0.00037 CTAAC 0.00036 CTAAG 0.000388 CTAAT 0.000314 CTACA 0.000694 CTACC 0.000883 CTACG 0.000598 CTACT 0.000627 CTAGA 0.00049 CTAGC 0.000584 CTAGG 0.00062 CTAGT 0.000413 CTATA 0.000284 CTATC 0.000598 CTATG 0.000528 CTATT 0.00049 CTCAA 0.00111 CTCAC 0.00106 CTCAG 0.00105 CTCAT 0.00116 CTCCA 0.0013 CTCCC 0.00137 CTCCG 0.000902 CTCCT 0.00122 CTCGA 0.0015 CTCGC 0.00134 CTCGG 0.00112 CTCGT 0.00129 CTCTA 0.000543 CTCTC 0.00168 CTCTG 0.00123 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00103 CTGAC 0.00115 CTGAG 0.00105 CTGAT 0.00101 CTGCA 0.00139 CTGCC 0.00172 CTGCG 0.00101 CTGCT 0.00138 CTGGA 0.00117 CTGGC 0.00159 CTGGG 0.00133 CTGGT 0.00122 CTGTA 0.000676 CTGTC 0.00139 CTGTG 0.00119 CTGTT 0.00103 CTTAA 0.000266 CTTAC 0.000504 CTTAG 0.000388 CTTAT 0.000439 CTTCA 0.00126 CTTCC 0.00141 CTTCG 0.00118 CTTCT 0.00134 CTTGA 0.00141 CTTGC 0.00147 CTTGG 0.00146 CTTGT 0.00121 CTTTA 0.000403 CTTTC 0.00143 CTTTG 0.00124 CTTTT 0.00121 GAAAA 0.00122 GAAAC 0.000971 GAAAG 0.00143 GAAAT 0.000874 GAACA 0.00109 GAACC 0.000961 GAACG 0.00091 GAACT 0.000608 GAAGA 0.00154 GAAGC 0.0014 GAAGG 0.0014 GAAGT 0.000866 GAATA 0.000615 GAATC 0.000859 GAATG 0.00117 GAATT 0.000718 GACAA 0.00121 GACAC 0.00106 GACAG 0.00139 GACAT 0.00117 GACCA 0.00125 GACCC 0.00104 GACCG 0.000936 GACCT 0.00105 GACGA 0.00159 GACGC 0.00118 GACGG 0.00122 GACGT 0.000876 GACTA 0.000541 GACTC 0.000944 GACTG 0.0011 GACTT 0.000939 GAGAA 0.00131 GAGAC 0.00127 GAGAG 0.00168 GAGAT 0.00114 GAGCA 0.00133 GAGCC 0.00118 GAGCG 0.00103 GAGCT 0.00125 GAGGA 0.00144 GAGGC 0.00149 GAGGG 0.00157 GAGGT 0.00121 GAGTA 0.000546 GAGTC 0.000944 GAGTG 0.000997 GAGTT 0.000694 GATAA 0.000515 GATAC 0.00074 GATAG 0.000598 GATAT 0.000708 GATCA 0.00109 GATCC 0.000923 GATCG 0.00102 GATCT 0.000903 GATGA 0.00154 GATGC 0.00151 GATGG 0.00163 GATGT 0.00111 GATTA 0.000359 GATTC 0.000859 GATTG 0.00109 GATTT 0.000752 GCAAA 0.00118 GCAAC 0.00121 GCAAG 0.00147 GCAAT 0.00095 GCACA 0.00117 GCACC 0.0012 GCACG 0.00106 GCACT 0.000837 GCAGA 0.00131 GCAGC 0.00167 GCAGG 0.00149 GCAGT 0.00101 GCATA 0.000599 GCATC 0.00151 GCATG 0.0014 GCATT 0.001 GCCAA 0.00146 GCCAC 0.00131 GCCAG 0.00159 GCCAT 0.00139 GCCCA 0.00141 GCCCC 0.00136 GCCCG 0.00107 GCCCT 0.00113 GCCGA 0.00119 GCCGC 0.00124 GCCGG 0.00106 GCCGT 0.0011 GCCTA 0.000573 GCCTC 0.00149 GCCTG 0.00158 GCCTT 0.00121 GCGAA 0.000987 GCGAC 0.00121 GCGAG 0.00134 GCGAT 0.000987 GCGCA 0.00105 GCGCC 0.00118 GCGCG 0.00103 GCGCT 0.000856 GCGGA 0.000896 GCGGC 0.00124 GCGGG 0.00116 GCGGT 0.000822 GCGTA 0.000492 GCGTC 0.00118 GCGTG 0.00111 GCGTT 0.000798 GCTAA 0.000407 GCTAC 0.00071 GCTAG 0.000584 GCTAT 0.000544 GCTCA 0.00118 GCTCC 0.00115 GCTCG 0.00135 GCTCT 0.0011 GCTGA 0.00127 GCTGC 0.00167 GCTGG 0.00165 GCTGT 0.0013 GCTTA 0.000433 GCTTC 0.0014 GCTTG 0.00157 GCTTT 0.00112 GGAAA 0.00115 GGAAC 0.000861 GGAAG 0.00141 GGAAT 0.000803 GGACA 0.00103 GGACC 0.000871 GGACG 0.00103 GGACT 0.000727 GGAGA 0.00133 GGAGC 0.00115 GGAGG 0.0016 GGAGT 0.00071 GGATA 0.000541 GGATC 0.000923 GGATG 0.00135 GGATT 0.000704 GGCAA 0.00134 GGCAC 0.0012 GGCAG 0.00172 GGCAT 0.00122 GGCCA 0.0015 GGCCC 0.0012 GGCCG 0.0012 GGCCT 0.00113 GGCGA 0.00134 GGCGC 0.00118 GGCGG 0.00143 GGCGT 0.00108 GGCTA 0.000555 GGCTC 0.00118 GGCTG 0.00171 GGCTT 0.0012 GGGAA 0.00119 GGGAC 0.000894 GGGAG 0.00137 GGGAT 0.000963 GGGCA 0.00134 GGGCC 0.0012 GGGCG 0.00128 GGGCT 0.00115 GGGGA 0.00119 GGGGC 0.00136 GGGGG 0.00204 GGGGT 0.00118 GGGTA 0.000667 GGGTC 0.00104 GGGTG 0.00129 GGGTT 0.00101 GGTAA 0.000552 GGTAC 0.000879 GGTAG 0.000883 GGTAT 0.000688 GGTCA 0.00114 GGTCC 0.000871 GGTCG 0.00126 GGTCT 0.000993 GGTGA 0.0012 GGTGC 0.0012 GGTGG 0.00161 GGTGT 0.00108 GGTTA 0.000383 GGTTC 0.000961 GGTTG 0.00123 GGTTT 0.000865 GTAAA 0.00046 GTAAC 0.000442 GTAAG 0.000504 GTAAT 0.000459 GTACA 0.000833 GTACC 0.000879 GTACG 0.000605 GTACT 0.000547 GTAGA 0.000694 GTAGC 0.00071 GTAGG 0.000775 GTAGT 0.000628 GTATA 0.000392 GTATC 0.00074 GTATG 0.000699 GTATT 0.000583 GTCAA 0.00129 GTCAC 0.00108 GTCAG 0.00115 GTCAT 0.00111 GTCCA 0.00107 GTCCC 0.000894 GTCCG 0.000811 GTCCT 0.000882 GTCGA 0.00138 GTCGC 0.00121 GTCGG 0.00115 GTCGT 0.00126 GTCTA 0.000574 GTCTC 0.00127 GTCTG 0.00122 GTCTT 0.00115 GTGAA 0.000984 GTGAC 0.00108 GTGAG 0.00106 GTGAT 0.00115 GTGCA 0.00103 GTGCC 0.0012 GTGCG 0.00092 GTGCT 0.00113 GTGGA 0.0011 GTGGC 0.00131 GTGGG 0.00128 GTGGT 0.00125 GTGTA 0.000642 GTGTC 0.00106 GTGTG 0.0013 GTGTT 0.000939 GTTAA 0.000234 GTTAC 0.000442 GTTAG 0.00036 GTTAT 0.000427 GTTCA 0.00098 GTTCC 0.000861 GTTCG 0.000894 GTTCT 0.000831 GTTGA 0.00115 GTTGC 0.00121 GTTGG 0.00124 GTTGT 0.00105 GTTTA 0.000388 GTTTC 0.000971 GTTTG 0.00107 GTTTT 0.000878 TAAAA 0.000432 TAAAC 0.000388 TAAAG 0.000403 TAAAT 0.000365 TAACA 0.00044 TAACC 0.000383 TAACG 0.000351 TAACT 0.000287 TAAGA 0.000416 TAAGC 0.000433 TAAGG 0.000457 TAAGT 0.000295 TAATA 0.000254 TAATC 0.000359 TAATG 0.000449 TAATT 0.000388 TACAA 0.000697 TACAC 0.000642 TACAG 0.000676 TACAT 0.000712 TACCA 0.000764 TACCC 0.000667 TACCG 0.00054 TACCT 0.00103 TACGA 0.000601 TACGC 0.000492 TACGG 0.000488 TACGT 0.000516 TACTA 0.000331 TACTC 0.000546 TACTG 0.000653 TACTT 0.000575 TAGAA 0.000463 TAGAC 0.000574 TAGAG 0.000543 TAGAT 0.000501 TAGCA 0.000631 TAGCC 0.000555 TAGCG 0.000452 TAGCT 0.000608 TAGGA 0.000446 TAGGC 0.000573 TAGGG 0.000493 TAGGT 0.000685 TAGTA 0.000331 TAGTC 0.000541 TAGTG 0.000509 TAGTT 0.000351 TATAA 0.000307 TATAC 0.000392 TATAG 0.000284 TATAT 0.000394 TATCA 0.000688 TATCC 0.000541 TATCG 0.000672 TATCT 0.000659 TATGA 0.00059 TATGC 0.000599 TATGG 0.00058 TATGT 0.000572 TATTA 0.000254 TATTC 0.000615 TATTG 0.000667 TATTT 0.000603 TCAAA 0.000998 TCAAC 0.00115 TCAAG 0.00141 TCAAT 0.00103 TCACA 0.0011 TCACC 0.0012 TCACG 0.00106 TCACT 0.000903 TCAGA 0.000986 TCAGC 0.00127 TCAGG 0.00114 TCAGT 0.000841 TCATA 0.00059 TCATC 0.00154 TCATG 0.00141 TCATT 0.000951 TCCAA 0.000984 TCCAC 0.0011 TCCAG 0.00117 TCCAT 0.00117 TCCCA 0.00121 TCCCC 0.00119 TCCCG 0.000898 TCCCT 0.00112 TCCGA 0.000868 TCCGC 0.000896 TCCGG 0.000682 TCCGT 0.000826 TCCTA 0.000446 TCCTC 0.00144 TCCTG 0.00112 TCCTT 0.00105 TCGAA 0.00106 TCGAC 0.00138 TCGAG 0.0015 TCGAT 0.00108 TCGCA 0.00108 TCGCC 0.00134 TCGCG 0.00103 TCGCT 0.00106 TCGGA 0.000868 TCGGC 0.00119 TCGGG 0.000968 TCGGT 0.000981 TCGTA 0.000601 TCGTC 0.00159 TCGTG 0.00124 TCGTT 0.00102 TCTAA 0.000349 TCTAC 0.000694 TCTAG 0.00049 TCTAT 0.000548 TCTCA 0.00121 TCTCC 0.00133 TCTCG 0.00142 TCTCT 0.00143 TCTGA 0.000986 TCTGC 0.00131 TCTGG 0.00127 TCTGT 0.00102 TCTTA 0.000416 TCTTC 0.00154 TCTTG 0.00143 TCTTT 0.00125 TGAAA 0.00094 TGAAC 0.00098 TGAAG 0.00126 TGAAT 0.000932 TGACA 0.0012 TGACC 0.00114 TGACG 0.00127 TGACT 0.001 TGAGA 0.00121 TGAGC 0.00118 TGAGG 0.00127 TGAGT 0.000716 TGATA 0.000688 TGATC 0.00109 TGATG 0.00176 TGATT 0.00095 TGCAA 0.00111 TGCAC 0.00103 TGCAG 0.00139 TGCAT 0.00124 TGCCA 0.0015 TGCCC 0.00134 TGCCG 0.00121 TGCCT 0.00143 TGCGA 0.00108 TGCGC 0.00105 TGCGG 0.00095 TGCGT 0.00088 TGCTA 0.000631 TGCTC 0.00133 TGCTG 0.00167 TGCTT 0.00126 TGGAA 0.00111 TGGAC 0.00107 TGGAG 0.0013 TGGAT 0.000939 TGGCA 0.0015 TGGCC 0.0015 TGGCG 0.00139 TGGCT 0.00135 TGGGA 0.00121 TGGGC 0.00141 TGGGG 0.00125 TGGGT 0.00112 TGGTA 0.000764 TGGTC 0.00125 TGGTG 0.00161 TGGTT 0.00102 TGTAA 0.000506 TGTAC 0.000833 TGTAG 0.000694 TGTAT 0.000698 TGTCA 0.0012 TGTCC 0.00103 TGTCG 0.0014 TGTCT 0.0012 TGTGA 0.0011 TGTGC 0.00117 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.00116 TGTTA 0.00044 TGTTC 0.00109 TGTTG 0.00145 TGTTT 0.00102 TTAAA 0.000302 TTAAC 0.000234 TTAAG 0.000266 TTAAT 0.000255 TTACA 0.000506 TTACC 0.000552 TTACG 0.0004 TTACT 0.000405 TTAGA 0.000349 TTAGC 0.000407 TTAGG 0.000394 TTAGT 0.000284 TTATA 0.000307 TTATC 0.000515 TTATG 0.000445 TTATT 0.000478 TTCAA 0.00106 TTCAC 0.000984 TTCAG 0.00103 TTCAT 0.00103 TTCCA 0.00111 TTCCC 0.00119 TTCCG 0.000803 TTCCT 0.00111 TTCGA 0.00106 TTCGC 0.000987 TTCGG 0.000984 TTCGT 0.000994 TTCTA 0.000463 TTCTC 0.00131 TTCTG 0.00111 TTCTT 0.00139 TTGAA 0.00106 TTGAC 0.00129 TTGAG 0.00111 TTGAT 0.00113 TTGCA 0.00111 TTGCC 0.00134 TTGCG 0.00107 TTGCT 0.00128 TTGGA 0.000984 TTGGC 0.00146 TTGGG 0.00126 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.000697 TTGTC 0.00121 TTGTG 0.00104 TTGTT 0.00114 TTTAA 0.000302 TTTAC 0.00046 TTTAG 0.00037 TTTAT 0.000456 TTTCA 0.00094 TTTCC 0.00115 TTTCG 0.0011 TTTCT 0.0013 TTTGA 0.000998 TTTGC 0.00118 TTTGG 0.00113 TTTGT 0.00101 TTTTA 0.000432 TTTTC 0.00122 TTTTG 0.00116 TTTTT 0.00138 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3272 AAAAC 0.2081 AAAAG 0.2909 AAAAT 0.1738 AAACA 0.3117 AAACC 0.258 AAACG 0.2453 AAACT 0.185 AAAGA 0.2928 AAAGC 0.2632 AAAGG 0.2628 AAAGT 0.1812 AAATA 0.216 AAATC 0.2627 AAATG 0.2994 AAATT 0.2219 AACAA 0.2845 AACAC 0.2351 AACAG 0.2527 AACAT 0.2276 AACCA 0.2959 AACCC 0.29 AACCG 0.1808 AACCT 0.2332 AACGA 0.3201 AACGC 0.2561 AACGG 0.2225 AACGT 0.2014 AACTA 0.1535 AACTC 0.2968 AACTG 0.2936 AACTT 0.2561 AAGAA 0.3004 AAGAC 0.2469 AAGAG 0.2588 AAGAT 0.194 AAGCA 0.281 AAGCC 0.2624 AAGCG 0.1894 AAGCT 0.2673 AAGGA 0.2346 AAGGC 0.2653 AAGGG 0.2752 AAGGT 0.2249 AAGTA 0.197 AAGTC 0.3096 AAGTG 0.2892 AAGTT 0.2042 AATAA 0.2275 AATAC 0.2704 AATAG 0.2262 AATAT 0.276 AATCA 0.3156 AATCC 0.2281 AATCG 0.2395 AATCT 0.2168 AATGA 0.2593 AATGC 0.2706 AATGG 0.276 AATGT 0.1941 AATTA 0.1556 AATTC 0.268 AATTG 0.3372 AATTT 0.2391 ACAAA 0.2452 ACAAC 0.257 ACAAG 0.2923 ACAAT 0.2054 ACACA 0.2989 ACACC 0.2756 ACACG 0.2303 ACACT 0.1952 ACAGA 0.239 ACAGC 0.3016 ACAGG 0.279 ACAGT 0.1805 ACATA 0.1525 ACATC 0.2854 ACATG 0.3735 ACATT 0.1886 ACCAA 0.2517 ACCAC 0.2675 ACCAG 0.2647 ACCAT 0.2161 ACCCA 0.2821 ACCCC 0.2912 ACCCG 0.1943 ACCCT 0.2324 ACCGA 0.3173 ACCGC 0.2655 ACCGG 0.1986 ACCGT 0.2186 ACCTA 0.1677 ACCTC 0.2981 ACCTG 0.2883 ACCTT 0.246 ACGAA 0.2275 ACGAC 0.2832 ACGAG 0.2858 ACGAT 0.2036 ACGCA 0.2451 ACGCC 0.3038 ACGCG 0.2284 ACGCT 0.2227 ACGGA 0.2458 ACGGC 0.3146 ACGGG 0.2422 ACGGT 0.1974 ACGTA 0.1874 ACGTC 0.3076 ACGTG 0.2848 ACGTT 0.2202 ACTAA 0.1661 ACTAC 0.3652 ACTAG 0.2352 ACTAT 0.2335 ACTCA 0.2286 ACTCC 0.2253 ACTCG 0.2951 ACTCT 0.251 ACTGA 0.2341 ACTGC 0.2755 ACTGG 0.2766 ACTGT 0.2138 ACTTA 0.09824 ACTTC 0.289 ACTTG 0.3552 ACTTT 0.2576 AGAAA 0.3022 AGAAC 0.1944 AGAAG 0.3144 AGAAT 0.189 AGACA 0.2846 AGACC 0.2338 AGACG 0.2857 AGACT 0.1958 AGAGA 0.3127 AGAGC 0.2331 AGAGG 0.2821 AGAGT 0.1721 AGATA 0.1872 AGATC 0.2499 AGATG 0.376 AGATT 0.1869 AGCAA 0.2641 AGCAC 0.2312 AGCAG 0.2774 AGCAT 0.2273 AGCCA 0.293 AGCCC 0.2492 AGCCG 0.2155 AGCCT 0.2423 AGCGA 0.296 AGCGC 0.2393 AGCGG 0.2412 AGCGT 0.2234 AGCTA 0.1406 AGCTC 0.2851 AGCTG 0.2954 AGCTT 0.2789 AGGAA 0.2689 AGGAC 0.2176 AGGAG 0.3008 AGGAT 0.2128 AGGCA 0.2905 AGGCC 0.2365 AGGCG 0.2419 AGGCT 0.2311 AGGGA 0.2415 AGGGC 0.2457 AGGGG 0.3126 AGGGT 0.2002 AGGTA 0.255 AGGTC 0.2546 AGGTG 0.2948 AGGTT 0.1957 AGTAA 0.195 AGTAC 0.2608 AGTAG 0.2967 AGTAT 0.2474 AGTCA 0.2799 AGTCC 0.2077 AGTCG 0.2761 AGTCT 0.2363 AGTGA 0.2619 AGTGC 0.2338 AGTGG 0.2831 AGTGT 0.2212 AGTTA 0.1266 AGTTC 0.2586 AGTTG 0.3634 AGTTT 0.2515 ATAAA 0.2625 ATAAC 0.243 ATAAG 0.2493 ATAAT 0.2451 ATACA 0.292 ATACC 0.2799 ATACG 0.2121 ATACT 0.216 ATAGA 0.2859 ATAGC 0.2874 ATAGG 0.2133 ATAGT 0.2133 ATATA 0.1736 ATATC 0.2986 ATATG 0.2759 ATATT 0.252 ATCAA 0.259 ATCAC 0.255 ATCAG 0.2196 ATCAT 0.2664 ATCCA 0.2652 ATCCC 0.2723 ATCCG 0.2193 ATCCT 0.2432 ATCGA 0.2947 ATCGC 0.2628 ATCGG 0.2028 ATCGT 0.2398 ATCTA 0.141 ATCTC 0.3196 ATCTG 0.2883 ATCTT 0.2511 ATGAA 0.2302 ATGAC 0.2419 ATGAG 0.2631 ATGAT 0.2648 ATGCA 0.2779 ATGCC 0.2682 ATGCG 0.2102 ATGCT 0.2437 ATGGA 0.251 ATGGC 0.2924 ATGGG 0.2401 ATGGT 0.2165 ATGTA 0.192 ATGTC 0.3038 ATGTG 0.2675 ATGTT 0.2367 ATTAA 0.1875 ATTAC 0.3106 ATTAG 0.2135 ATTAT 0.2884 ATTCA 0.2743 ATTCC 0.2344 ATTCG 0.2532 ATTCT 0.2381 ATTGA 0.2685 ATTGC 0.2495 ATTGG 0.2668 ATTGT 0.2152 ATTTA 0.1375 ATTTC 0.3077 ATTTG 0.2991 ATTTT 0.2557 CAAAA 0.2698 CAAAC 0.2474 CAAAG 0.2849 CAAAT 0.1979 CAACA 0.3114 CAACC 0.2655 CAACG 0.2317 CAACT 0.1914 CAAGA 0.2597 CAAGC 0.2811 CAAGG 0.2635 CAAGT 0.1957 CAATA 0.1752 CAATC 0.2859 CAATG 0.3085 CAATT 0.2303 CACAA 0.2295 CACAC 0.2874 CACAG 0.2579 CACAT 0.2251 CACCA 0.3187 CACCC 0.2495 CACCG 0.1953 CACCT 0.2365 CACGA 0.296 CACGC 0.2658 CACGG 0.2415 CACGT 0.1967 CACTA 0.144 CACTC 0.2845 CACTG 0.3208 CACTT 0.2507 CAGAA 0.2369 CAGAC 0.2668 CAGAG 0.2678 CAGAT 0.2285 CAGCA 0.2827 CAGCC 0.2875 CAGCG 0.2094 CAGCT 0.2204 CAGGA 0.2121 CAGGC 0.3021 CAGGG 0.257 CAGGT 0.2288 CAGTA 0.183 CAGTC 0.304 CAGTG 0.3142 CAGTT 0.1988 CATAA 0.1947 CATAC 0.2999 CATAG 0.2228 CATAT 0.2826 CATCA 0.3043 CATCC 0.2325 CATCG 0.2283 CATCT 0.2349 CATGA 0.2536 CATGC 0.2484 CATGG 0.2464 CATGT 0.2516 CATTA 0.127 CATTC 0.3173 CATTG 0.3242 CATTT 0.2315 CCAAA 0.2364 CCAAC 0.2487 CCAAG 0.3007 CCAAT 0.2141 CCACA 0.2314 CCACC 0.3299 CCACG 0.2349 CCACT 0.2037 CCAGA 0.239 CCAGC 0.3122 CCAGG 0.2608 CCAGT 0.188 CCATA 0.1243 CCATC 0.3487 CCATG 0.304 CCATT 0.223 CCCAA 0.2561 CCCAC 0.2561 CCCAG 0.2633 CCCAT 0.2244 CCCCA 0.2189 CCCCC 0.3503 CCCCG 0.1777 CCCCT 0.2531 CCCGA 0.2586 CCCGC 0.3117 CCCGG 0.208 CCCGT 0.2217 CCCTA 0.1059 CCCTC 0.3384 CCCTG 0.2881 CCCTT 0.2677 CCGAA 0.2471 CCGAC 0.2848 CCGAG 0.2778 CCGAT 0.1903 CCGCA 0.231 CCGCC 0.3497 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.2099 CCGGA 0.2222 CCGGC 0.3339 CCGGG 0.2481 CCGGT 0.1958 CCGTA 0.1434 CCGTC 0.3553 CCGTG 0.2956 CCGTT 0.2057 CCTAA 0.1831 CCTAC 0.3516 CCTAG 0.277 CCTAT 0.1883 CCTCA 0.2253 CCTCC 0.2797 CCTCG 0.2642 CCTCT 0.2309 CCTGA 0.2179 CCTGC 0.2869 CCTGG 0.2661 CCTGT 0.2292 CCTTA 0.1028 CCTTC 0.3158 CCTTG 0.3263 CCTTT 0.255 CGAAA 0.2738 CGAAC 0.2159 CGAAG 0.297 CGAAT 0.2133 CGACA 0.2815 CGACC 0.2528 CGACG 0.2707 CGACT 0.195 CGAGA 0.2696 CGAGC 0.2587 CGAGG 0.2899 CGAGT 0.1817 CGATA 0.1796 CGATC 0.2702 CGATG 0.3515 CGATT 0.1987 CGCAA 0.2717 CGCAC 0.2295 CGCAG 0.2544 CGCAT 0.2444 CGCCA 0.2777 CGCCC 0.2539 CGCCG 0.2357 CGCCT 0.2327 CGCGA 0.2722 CGCGC 0.2779 CGCGG 0.2305 CGCGT 0.2194 CGCTA 0.1264 CGCTC 0.2873 CGCTG 0.344 CGCTT 0.2422 CGGAA 0.2461 CGGAC 0.245 CGGAG 0.2741 CGGAT 0.2348 CGGCA 0.26 CGGCC 0.2617 CGGCG 0.26 CGGCT 0.2182 CGGGA 0.2409 CGGGC 0.279 CGGGG 0.2723 CGGGT 0.2077 CGGTA 0.1759 CGGTC 0.2962 CGGTG 0.3252 CGGTT 0.2028 CGTAA 0.1884 CGTAC 0.2862 CGTAG 0.2799 CGTAT 0.2454 CGTCA 0.2607 CGTCC 0.2122 CGTCG 0.2774 CGTCT 0.2496 CGTGA 0.25 CGTGC 0.2518 CGTGG 0.2768 CGTGT 0.2213 CGTTA 0.1148 CGTTC 0.2847 CGTTG 0.3416 CGTTT 0.259 CTAAA 0.2532 CTAAC 0.2565 CTAAG 0.2668 CTAAT 0.2235 CTACA 0.2516 CTACC 0.3097 CTACG 0.2119 CTACT 0.2268 CTAGA 0.2382 CTAGC 0.274 CTAGG 0.2896 CTAGT 0.1983 CTATA 0.1546 CTATC 0.3076 CTATG 0.2758 CTATT 0.2619 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.2417 CTCAG 0.2361 CTCAT 0.272 CTCCA 0.272 CTCCC 0.2854 CTCCG 0.1889 CTCCT 0.2537 CTCGA 0.2879 CTCGC 0.2547 CTCGG 0.214 CTCGT 0.2434 CTCTA 0.1174 CTCTC 0.3607 CTCTG 0.2621 CTCTT 0.2598 CTGAA 0.2472 CTGAC 0.2675 CTGAG 0.2481 CTGAT 0.2372 CTGCA 0.2541 CTGCC 0.3102 CTGCG 0.1847 CTGCT 0.2511 CTGGA 0.22 CTGGC 0.2994 CTGGG 0.2476 CTGGT 0.2331 CTGTA 0.1609 CTGTC 0.3216 CTGTG 0.2786 CTGTT 0.2389 CTTAA 0.1682 CTTAC 0.3091 CTTAG 0.2431 CTTAT 0.2796 CTTCA 0.2431 CTTCC 0.2675 CTTCG 0.2306 CTTCT 0.2589 CTTGA 0.2567 CTTGC 0.2596 CTTGG 0.2662 CTTGT 0.2176 CTTTA 0.09675 CTTTC 0.3308 CTTTG 0.2871 CTTTT 0.2853 GAAAA 0.273 GAAAC 0.2118 GAAAG 0.318 GAAAT 0.1972 GAACA 0.3047 GAACC 0.2675 GAACG 0.2508 GAACT 0.1769 GAAGA 0.294 GAAGC 0.2665 GAAGG 0.2705 GAAGT 0.1689 GAATA 0.1908 GAATC 0.2485 GAATG 0.3491 GAATT 0.2116 GACAA 0.249 GACAC 0.2237 GACAG 0.2837 GACAT 0.2436 GACCA 0.2917 GACCC 0.2469 GACCG 0.2147 GACCT 0.2467 GACGA 0.3258 GACGC 0.2422 GACGG 0.2495 GACGT 0.1826 GACTA 0.155 GACTC 0.2628 GACTG 0.3122 GACTT 0.27 GAGAA 0.2451 GAGAC 0.232 GAGAG 0.3099 GAGAT 0.2129 GAGCA 0.2788 GAGCC 0.2458 GAGCG 0.2145 GAGCT 0.2609 GAGGA 0.2506 GAGGC 0.2617 GAGGG 0.2734 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.1745 GAGTC 0.2873 GAGTG 0.3127 GAGTT 0.2255 GATAA 0.2042 GATAC 0.2868 GATAG 0.2282 GATAT 0.2809 GATCA 0.2814 GATCC 0.2333 GATCG 0.2569 GATCT 0.2285 GATGA 0.2663 GATGC 0.2643 GATGG 0.2794 GATGT 0.1901 GATTA 0.124 GATTC 0.2713 GATTG 0.3608 GATTT 0.2439 GCAAA 0.2486 GCAAC 0.2464 GCAAG 0.3001 GCAAT 0.205 GCACA 0.2767 GCACC 0.2812 GCACG 0.2474 GCACT 0.1947 GCAGA 0.2378 GCAGC 0.3064 GCAGG 0.2735 GCAGT 0.1822 GCATA 0.1326 GCATC 0.3347 GCATG 0.3109 GCATT 0.2218 GCCAA 0.2593 GCCAC 0.2266 GCCAG 0.2766 GCCAT 0.2375 GCCCA 0.2832 GCCCC 0.2762 GCCCG 0.2105 GCCCT 0.23 GCCGA 0.2646 GCCGC 0.2695 GCCGG 0.2297 GCCGT 0.2362 GCCTA 0.1176 GCCTC 0.3104 GCCTG 0.3246 GCCTT 0.2474 GCGAA 0.2194 GCGAC 0.2642 GCGAG 0.2957 GCGAT 0.2207 GCGCA 0.2565 GCGCC 0.2861 GCGCG 0.2506 GCGCT 0.2068 GCGGA 0.2186 GCGGC 0.2986 GCGGG 0.2834 GCGGT 0.1994 GCGTA 0.1389 GCGTC 0.3274 GCGTG 0.3089 GCGTT 0.2248 GCTAA 0.1857 GCTAC 0.3172 GCTAG 0.2525 GCTAT 0.2445 GCTCA 0.2505 GCTCC 0.2386 GCTCG 0.2823 GCTCT 0.2285 GCTGA 0.2151 GCTGC 0.2842 GCTGG 0.2817 GCTGT 0.219 GCTTA 0.09894 GCTTC 0.3065 GCTTG 0.343 GCTTT 0.2516 GGAAA 0.27 GGAAC 0.2055 GGAAG 0.3335 GGAAT 0.191 GGACA 0.2838 GGACC 0.235 GGACG 0.2817 GGACT 0.1996 GGAGA 0.2796 GGAGC 0.2371 GGAGG 0.3329 GGAGT 0.1504 GGATA 0.1563 GGATC 0.2613 GGATG 0.3809 GGATT 0.2015 GGCAA 0.2422 GGCAC 0.2185 GGCAG 0.3117 GGCAT 0.2276 GGCCA 0.2961 GGCCC 0.2392 GGCCG 0.2373 GGCCT 0.2275 GGCGA 0.2647 GGCGC 0.2346 GGCGG 0.2848 GGCGT 0.2159 GGCTA 0.1218 GGCTC 0.2542 GGCTG 0.3647 GGCTT 0.2592 GGGAA 0.2696 GGGAC 0.2015 GGGAG 0.3104 GGGAT 0.2185 GGGCA 0.2676 GGGCC 0.2427 GGGCG 0.2577 GGGCT 0.232 GGGGA 0.2077 GGGGC 0.2389 GGGGG 0.3503 GGGGT 0.2031 GGGTA 0.1672 GGGTC 0.2623 GGGTG 0.32 GGGTT 0.2505 GGTAA 0.188 GGTAC 0.2941 GGTAG 0.2891 GGTAT 0.2288 GGTCA 0.2708 GGTCC 0.2015 GGTCG 0.2951 GGTCT 0.2326 GGTGA 0.238 GGTGC 0.2321 GGTGG 0.3152 GGTGT 0.2147 GGTTA 0.1188 GGTTC 0.2766 GGTTG 0.3566 GGTTT 0.2481 GTAAA 0.2522 GTAAC 0.2353 GTAAG 0.2617 GTAAT 0.2507 GTACA 0.2943 GTACC 0.3042 GTACG 0.2091 GTACT 0.1924 GTAGA 0.247 GTAGC 0.2542 GTAGG 0.2714 GTAGT 0.2274 GTATA 0.167 GTATC 0.3007 GTATG 0.2887 GTATT 0.2435 GTCAA 0.2801 GTCAC 0.2314 GTCAG 0.2463 GTCAT 0.2421 GTCCA 0.2919 GTCCC 0.2441 GTCCG 0.2224 GTCCT 0.2417 GTCGA 0.2775 GTCGC 0.2389 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2532 GTCTA 0.1381 GTCTC 0.2989 GTCTG 0.2888 GTCTT 0.2743 GTGAA 0.2299 GTGAC 0.2479 GTGAG 0.2506 GTGAT 0.2717 GTGCA 0.2396 GTGCC 0.2786 GTGCG 0.2135 GTGCT 0.2682 GTGGA 0.222 GTGGC 0.2644 GTGGG 0.2597 GTGGT 0.254 GTGTA 0.1659 GTGTC 0.269 GTGTG 0.3294 GTGTT 0.2357 GTTAA 0.1673 GTTAC 0.2951 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.2895 GTTCA 0.277 GTTCC 0.242 GTTCG 0.246 GTTCT 0.235 GTTGA 0.2508 GTTGC 0.2556 GTTGG 0.2641 GTTGT 0.2295 GTTTA 0.1172 GTTTC 0.2888 GTTTG 0.3267 GTTTT 0.2674 TAAAA 0.272 TAAAC 0.2344 TAAAG 0.2535 TAAAT 0.2402 TAACA 0.2965 TAACC 0.2671 TAACG 0.2351 TAACT 0.2013 TAAGA 0.2568 TAAGC 0.2762 TAAGG 0.2827 TAAGT 0.1844 TAATA 0.1739 TAATC 0.2494 TAATG 0.3069 TAATT 0.2698 TACAA 0.2589 TACAC 0.2357 TACAG 0.2425 TACAT 0.2629 TACCA 0.2548 TACCC 0.2205 TACCG 0.1786 TACCT 0.3461 TACGA 0.2887 TACGC 0.2322 TACGG 0.2277 TACGT 0.2515 TACTA 0.1602 TACTC 0.2582 TACTG 0.3039 TACTT 0.2777 TAGAA 0.2269 TAGAC 0.2745 TAGAG 0.2582 TAGAT 0.2405 TAGCA 0.2854 TAGCC 0.2469 TAGCG 0.1979 TAGCT 0.2698 TAGGA 0.2042 TAGGC 0.2585 TAGGG 0.2231 TAGGT 0.3142 TAGTA 0.1959 TAGTC 0.3066 TAGTG 0.2865 TAGTT 0.2111 TATAA 0.2197 TATAC 0.2842 TATAG 0.2046 TATAT 0.2914 TATCA 0.2693 TATCC 0.2119 TATCG 0.259 TATCT 0.2598 TATGA 0.2586 TATGC 0.2538 TATGG 0.2414 TATGT 0.2462 TATTA 0.1207 TATTC 0.2907 TATTG 0.3087 TATTT 0.2799 TCAAA 0.2175 TCAAC 0.2492 TCAAG 0.3059 TCAAT 0.2274 TCACA 0.2568 TCACC 0.2849 TCACG 0.2427 TCACT 0.2155 TCAGA 0.2357 TCAGC 0.2982 TCAGG 0.2671 TCAGT 0.1991 TCATA 0.1348 TCATC 0.3364 TCATG 0.3167 TCATT 0.2121 TCCAA 0.2251 TCCAC 0.2468 TCCAG 0.2636 TCCAT 0.2645 TCCCA 0.272 TCCCC 0.2698 TCCCG 0.2042 TCCCT 0.254 TCCGA 0.2638 TCCGC 0.2716 TCCGG 0.2104 TCCGT 0.2542 TCCTA 0.111 TCCTC 0.3552 TCCTG 0.2723 TCCTT 0.2614 TCGAA 0.2132 TCGAC 0.2717 TCGAG 0.296 TCGAT 0.2191 TCGCA 0.2403 TCGCC 0.2975 TCGCG 0.2263 TCGCT 0.2358 TCGGA 0.2169 TCGGC 0.2995 TCGGG 0.2401 TCGGT 0.2435 TCGTA 0.1395 TCGTC 0.3557 TCGTG 0.2779 TCGTT 0.2269 TCTAA 0.1748 TCTAC 0.33 TCTAG 0.235 TCTAT 0.2603 TCTCA 0.2257 TCTCC 0.2469 TCTCG 0.2583 TCTCT 0.2691 TCTGA 0.218 TCTGC 0.2828 TCTGG 0.2765 TCTGT 0.2226 TCTTA 0.08958 TCTTC 0.3293 TCTTG 0.3085 TCTTT 0.2726 TGAAA 0.2342 TGAAC 0.2365 TGAAG 0.3046 TGAAT 0.2247 TGACA 0.2606 TGACC 0.2508 TGACG 0.2749 TGACT 0.2137 TGAGA 0.2762 TGAGC 0.269 TGAGG 0.2898 TGAGT 0.1649 TGATA 0.1539 TGATC 0.2441 TGATG 0.3862 TGATT 0.2158 TGCAA 0.2347 TGCAC 0.2118 TGCAG 0.2878 TGCAT 0.2657 TGCCA 0.2766 TGCCC 0.2449 TGCCG 0.2189 TGCCT 0.2595 TGCGA 0.2718 TGCGC 0.2675 TGCGG 0.2392 TGCGT 0.2215 TGCTA 0.1321 TGCTC 0.2707 TGCTG 0.3367 TGCTT 0.2605 TGGAA 0.2509 TGGAC 0.2408 TGGAG 0.2955 TGGAT 0.2127 TGGCA 0.2611 TGGCC 0.2596 TGGCG 0.2435 TGGCT 0.2358 TGGGA 0.2406 TGGGC 0.2816 TGGGG 0.2516 TGGGT 0.2261 TGGTA 0.1655 TGGTC 0.2655 TGGTG 0.3502 TGGTT 0.2189 TGTAA 0.1861 TGTAC 0.3055 TGTAG 0.2521 TGTAT 0.2562 TGTCA 0.2477 TGTCC 0.2142 TGTCG 0.2891 TGTCT 0.2491 TGTGA 0.2392 TGTGC 0.2547 TGTGG 0.2465 TGTGT 0.2597 TGTTA 0.1132 TGTTC 0.2705 TGTTG 0.359 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2803 TTAAC 0.2248 TTAAG 0.2399 TTAAT 0.255 TTACA 0.2736 TTACC 0.2966 TTACG 0.2101 TTACT 0.2196 TTAGA 0.2495 TTAGC 0.2838 TTAGG 0.2695 TTAGT 0.1972 TTATA 0.1755 TTATC 0.2911 TTATG 0.2549 TTATT 0.2785 TTCAA 0.2613 TTCAC 0.2357 TTCAG 0.25 TTCAT 0.253 TTCCA 0.2637 TTCCC 0.2832 TTCCG 0.1939 TTCCT 0.2592 TTCGA 0.2657 TTCGC 0.2421 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2482 TTCTA 0.1119 TTCTC 0.3095 TTCTG 0.2515 TTCTT 0.3271 TTGAA 0.2338 TTGAC 0.2752 TTGAG 0.2379 TTGAT 0.2531 TTGCA 0.2342 TTGCC 0.2725 TTGCG 0.223 TTGCT 0.2703 TTGGA 0.2017 TTGGC 0.3015 TTGGG 0.2587 TTGGT 0.238 TTGTA 0.1769 TTGTC 0.2907 TTGTG 0.2554 TTGTT 0.277 TTTAA 0.1927 TTTAC 0.2922 TTTAG 0.2263 TTTAT 0.2888 TTTCA 0.2161 TTTCC 0.2505 TTTCG 0.2458 TTTCT 0.2877 TTTGA 0.2312 TTTGC 0.2724 TTTGG 0.2652 TTTGT 0.2312 TTTTA 0.1059 TTTTC 0.2896 TTTTG 0.2772 TTTTT 0.3272 [4] # (a,c,g,t)= (0.203, 0.297, 0.297, 0.203) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.227 C 0.273 G 0.272 T 0.228 # l= 1 # Values AA 0.0548 AC 0.0576 AG 0.0634 AT 0.0517 CA 0.0724 CC 0.0726 CG 0.0641 CT 0.0634 GA 0.0685 GC 0.0739 GG 0.0725 GT 0.0576 TA 0.0317 TC 0.0686 TG 0.0723 TT 0.0549 # l= 2 # Values AAA 0.0145 AAC 0.0128 AAG 0.0165 AAT 0.0111 ACA 0.016 ACC 0.0159 ACG 0.0144 ACT 0.0113 AGA 0.0167 AGC 0.0175 AGG 0.0178 AGT 0.0113 ATA 0.00809 ATC 0.0152 ATG 0.0173 ATT 0.0111 CAA 0.0181 CAC 0.0175 CAG 0.0194 CAT 0.0173 CCA 0.02 CCC 0.0197 CCG 0.015 CCT 0.0179 CGA 0.0181 CGC 0.0167 CGG 0.015 CGT 0.0144 CTA 0.00811 CTC 0.0194 CTG 0.0194 CTT 0.0165 GAA 0.0165 GAC 0.0176 GAG 0.0193 GAT 0.0152 GCA 0.0191 GCC 0.0206 GCG 0.0166 GCT 0.0175 GGA 0.0163 GGC 0.0206 GGG 0.0197 GGT 0.0159 GTA 0.00973 GTC 0.0176 GTG 0.0175 GTT 0.0128 TAA 0.00578 TAC 0.00975 TAG 0.0081 TAT 0.00808 TCA 0.0173 TCC 0.0164 TCG 0.0181 TCT 0.0168 TGA 0.0173 TGC 0.0191 TGG 0.0199 TGT 0.0159 TTA 0.00578 TTC 0.0165 TTG 0.0181 TTT 0.0145 # l= 3 # Values AAAA 0.00421 AAAC 0.00328 AAAG 0.00425 AAAT 0.00272 AACA 0.00394 AACC 0.00341 AACG 0.00316 AACT 0.0023 AAGA 0.00459 AAGC 0.00447 AAGG 0.0045 AAGT 0.00292 AATA 0.00204 AATC 0.003 AATG 0.00359 AATT 0.00248 ACAA 0.00402 ACAC 0.00394 ACAG 0.00428 ACAT 0.00371 ACCA 0.00465 ACCC 0.00407 ACCG 0.00311 ACCT 0.00404 ACGA 0.00449 ACGC 0.00361 ACGG 0.0035 ACGT 0.00283 ACTA 0.00167 ACTC 0.00317 ACTG 0.00359 ACTT 0.00291 AGAA 0.00425 AGAC 0.00422 AGAG 0.00476 AGAT 0.00351 AGCA 0.00489 AGCC 0.00468 AGCG 0.0036 AGCT 0.00431 AGGA 0.0041 AGGC 0.00492 AGGG 0.00478 AGGT 0.00404 AGTA 0.00205 AGTC 0.00348 AGTG 0.00352 AGTT 0.0023 ATAA 0.00166 ATAC 0.00233 ATAG 0.00184 ATAT 0.00225 ATCA 0.00439 ATCC 0.00351 ATCG 0.00374 ATCT 0.00351 ATGA 0.00442 ATGC 0.00449 ATGG 0.0047 ATGT 0.0037 ATTA 0.00136 ATTC 0.00329 ATTG 0.00373 ATTT 0.00273 CAAA 0.00426 CAAC 0.00462 CAAG 0.0055 CAAT 0.00373 CACA 0.00455 CACC 0.00517 CACG 0.00422 CACT 0.00352 CAGA 0.00463 CAGC 0.00596 CAGG 0.00527 CAGT 0.00359 CATA 0.00226 CATC 0.0058 CATG 0.00567 CATT 0.00359 CCAA 0.00487 CCAC 0.005 CCAG 0.00538 CCAT 0.00471 CCCA 0.00505 CCCC 0.00603 CCCG 0.00387 CCCT 0.00479 CCGA 0.00403 CCGC 0.00424 CCGG 0.0032 CCGT 0.00351 CCTA 0.0022 CCTC 0.00588 CCTG 0.00527 CCTT 0.00451 CGAA 0.00401 CGAC 0.00506 CGAG 0.00532 CGAT 0.00374 CGCA 0.00395 CGCC 0.00521 CGCG 0.00386 CGCT 0.0036 CGGA 0.00329 CGGC 0.00472 CGGG 0.00386 CGGT 0.00311 CGTA 0.00207 CGTC 0.00496 CGTG 0.00423 CGTT 0.00317 CTAA 0.00137 CTAC 0.00278 CTAG 0.00211 CTAT 0.00184 CTCA 0.00435 CTCC 0.00493 CTCG 0.00532 CTCT 0.00477 CTGA 0.00422 CTGC 0.00557 CTGG 0.00538 CTGT 0.00428 CTTA 0.00153 CTTC 0.0052 CTTG 0.0055 CTTT 0.00425 GAAA 0.00448 GAAC 0.00354 GAAG 0.0052 GAAT 0.00329 GACA 0.00482 GACC 0.00431 GACG 0.00496 GACT 0.00348 GAGA 0.00547 GAGC 0.00484 GAGG 0.00587 GAGT 0.00317 GATA 0.00249 GATC 0.00388 GATG 0.00579 GATT 0.00299 GCAA 0.00475 GCAC 0.00431 GCAG 0.00557 GCAT 0.00449 GCCA 0.00583 GCCC 0.00512 GCCG 0.00472 GCCT 0.00493 GCGA 0.00457 GCGC 0.00422 GCGG 0.00423 GCGT 0.0036 GCTA 0.00221 GCTC 0.00485 GCTG 0.00595 GCTT 0.00447 GGAA 0.00426 GGAC 0.00367 GGAG 0.00492 GGAT 0.00351 GGCA 0.00554 GGCC 0.00518 GGCG 0.00521 GGCT 0.00468 GGGA 0.00452 GGGC 0.00512 GGGG 0.00603 GGGT 0.00406 GGTA 0.00298 GGTC 0.00431 GGTG 0.00517 GGTT 0.00341 GTAA 0.00177 GTAC 0.00286 GTAG 0.00278 GTAT 0.00232 GTCA 0.00462 GTCC 0.00367 GTCG 0.00506 GTCT 0.00422 GTGA 0.00424 GTGC 0.00431 GTGG 0.00499 GTGT 0.00393 GTTA 0.00138 GTTC 0.00354 GTTG 0.00462 GTTT 0.00327 TAAA 0.00151 TAAC 0.00138 TAAG 0.00153 TAAT 0.00136 TACA 0.00264 TACC 0.00298 TACG 0.00207 TACT 0.00205 TAGA 0.00204 TAGC 0.00221 TAGG 0.00219 TAGT 0.00166 TATA 0.0013 TATC 0.00249 TATG 0.00226 TATT 0.00204 TCAA 0.00447 TCAC 0.00424 TCAG 0.00421 TCAT 0.00442 TCCA 0.00443 TCCC 0.00453 TCCG 0.0033 TCCT 0.00411 TCGA 0.00503 TCGC 0.00458 TCGG 0.00403 TCGT 0.00449 TCTA 0.00204 TCTC 0.00547 TCTG 0.00463 TCTT 0.0046 TGAA 0.00399 TGAC 0.00462 TGAG 0.00435 TGAT 0.00439 TGCA 0.00475 TGCC 0.00554 TGCG 0.00394 TGCT 0.00489 TGGA 0.00443 TGGC 0.00583 TGGG 0.00505 TGGT 0.00464 TGTA 0.00264 TGTC 0.00481 TGTG 0.00455 TGTT 0.00395 TTAA 0.000976 TTAC 0.00177 TTAG 0.00137 TTAT 0.00166 TTCA 0.00399 TTCC 0.00426 TTCG 0.00401 TTCT 0.00425 TTGA 0.00446 TTGC 0.00476 TTGG 0.00486 TTGT 0.00403 TTTA 0.00151 TTTC 0.00448 TTTG 0.00426 TTTT 0.00421 # l= 4 # Values AAAAA 0.00142 AAAAC 0.000877 AAAAG 0.0012 AAAAT 0.00071 AAACA 0.00101 AAACC 0.00086 AAACG 0.000814 AAACT 0.000585 AAAGA 0.00124 AAAGC 0.00109 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.000774 AAATA 0.000577 AAATC 0.000734 AAATG 0.000829 AAATT 0.000585 AACAA 0.00112 AACAC 0.000922 AACAG 0.00103 AACAT 0.000867 AACCA 0.00101 AACCC 0.00101 AACCG 0.000617 AACCT 0.000773 AACGA 0.00102 AACGC 0.000804 AACGG 0.000714 AACGT 0.000629 AACTA 0.000335 AACTC 0.000676 AACTG 0.000706 AACTT 0.000579 AAGAA 0.00137 AAGAC 0.00112 AAGAG 0.00122 AAGAT 0.000876 AAGCA 0.00125 AAGCC 0.00119 AAGCG 0.00085 AAGCT 0.00118 AAGGA 0.00106 AAGGC 0.00122 AAGGG 0.00127 AAGGT 0.000969 AAGTA 0.000558 AAGTC 0.000916 AAGTG 0.000862 AAGTT 0.000579 AATAA 0.00046 AATAC 0.000562 AATAG 0.000466 AATAT 0.000552 AATCA 0.000929 AATCC 0.000693 AATCG 0.000738 AATCT 0.000633 AATGA 0.000928 AATGC 0.000988 AATGG 0.000999 AATGT 0.000674 AATTA 0.000362 AATTC 0.000694 AATTG 0.000839 AATTT 0.000585 ACAAA 0.001 ACAAC 0.00103 ACAAG 0.0012 ACAAT 0.000794 ACACA 0.00117 ACACC 0.00108 ACACG 0.000902 ACACT 0.000775 ACAGA 0.00102 ACAGC 0.00131 ACAGG 0.0012 ACAGT 0.000755 ACATA 0.000548 ACATC 0.00109 ACATG 0.00139 ACATT 0.000674 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00126 ACCAG 0.00122 ACCAT 0.000984 ACCCA 0.00113 ACCCC 0.0012 ACCCG 0.000787 ACCCT 0.000946 ACCGA 0.000974 ACCGC 0.000832 ACCGG 0.000617 ACCGT 0.000685 ACCTA 0.000677 ACCTC 0.00122 ACCTG 0.00118 ACCTT 0.000969 ACGAA 0.000993 ACGAC 0.00129 ACGAG 0.00131 ACGAT 0.000902 ACGCA 0.000869 ACGCC 0.00111 ACGCG 0.000842 ACGCT 0.000777 ACGGA 0.000827 ACGGC 0.00113 ACGGG 0.000865 ACGGT 0.000685 ACGTA 0.000506 ACGTC 0.000877 ACGTG 0.000818 ACGTT 0.000629 ACTAA 0.000269 ACTAC 0.000608 ACTAG 0.000402 ACTAT 0.000384 ACTCA 0.000703 ACTCC 0.000712 ACTCG 0.000962 ACTCT 0.000796 ACTGA 0.000838 ACTGC 0.00101 ACTGG 0.000986 ACTGT 0.000755 ACTTA 0.000277 ACTTC 0.00084 ACTTG 0.00103 ACTTT 0.000774 AGAAA 0.00131 AGAAC 0.000817 AGAAG 0.00136 AGAAT 0.000769 AGACA 0.00121 AGACC 0.000998 AGACG 0.00122 AGACT 0.000792 AGAGA 0.00148 AGAGC 0.00112 AGAGG 0.00137 AGAGT 0.000796 AGATA 0.00064 AGATC 0.000884 AGATG 0.00136 AGATT 0.000633 AGCAA 0.00127 AGCAC 0.00114 AGCAG 0.0014 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.00137 AGCCC 0.00117 AGCCG 0.00103 AGCCT 0.00111 AGCGA 0.00108 AGCGC 0.000867 AGCGG 0.000882 AGCGT 0.000777 AGCTA 0.000597 AGCTC 0.00125 AGCTG 0.00128 AGCTT 0.00118 AGGAA 0.00112 AGGAC 0.000875 AGGAG 0.00127 AGGAT 0.000843 AGGCA 0.00146 AGGCC 0.00115 AGGCG 0.0012 AGGCT 0.00111 AGGGA 0.00115 AGGGC 0.00117 AGGGG 0.00153 AGGGT 0.000946 AGGTA 0.00103 AGGTC 0.00104 AGGTG 0.0012 AGGTT 0.000773 AGTAA 0.000389 AGTAC 0.000546 AGTAG 0.000613 AGTAT 0.0005 AGTCA 0.000992 AGTCC 0.000713 AGTCG 0.000982 AGTCT 0.000792 AGTGA 0.000895 AGTGC 0.000833 AGTGG 0.00102 AGTGT 0.000775 AGTTA 0.000267 AGTTC 0.00059 AGTTG 0.000856 AGTTT 0.000585 ATAAA 0.000438 ATAAC 0.000408 ATAAG 0.000419 ATAAT 0.000395 ATACA 0.000671 ATACC 0.000676 ATACG 0.000478 ATACT 0.0005 ATAGA 0.000528 ATAGC 0.000538 ATAGG 0.00039 ATAGT 0.000384 ATATA 0.000372 ATATC 0.000676 ATATG 0.000655 ATATT 0.000552 ATCAA 0.00108 ATCAC 0.00113 ATCAG 0.00101 ATCAT 0.00116 ATCCA 0.000936 ATCCC 0.000978 ATCCG 0.000756 ATCCT 0.000843 ATCGA 0.00108 ATCGC 0.001 ATCGG 0.000761 ATCGT 0.000902 ATCTA 0.000484 ATCTC 0.00113 ATCTG 0.00102 ATCTT 0.000876 ATGAA 0.00102 ATGAC 0.00111 ATGAG 0.00113 ATGAT 0.00116 ATGCA 0.00124 ATGCC 0.00122 ATGCG 0.000954 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.00141 ATGGG 0.00113 ATGGT 0.000984 ATGTA 0.000676 ATGTC 0.00114 ATGTG 0.00102 ATGTT 0.000867 ATTAA 0.000235 ATTAC 0.000435 ATTAG 0.000299 ATTAT 0.000395 ATTCA 0.000895 ATTCC 0.000802 ATTCG 0.000826 ATTCT 0.000769 ATTGA 0.000982 ATTGC 0.000925 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.000794 ATTTA 0.000342 ATTTC 0.000847 ATTTG 0.000825 ATTTT 0.00071 CAAAA 0.00115 CAAAC 0.00106 CAAAG 0.00122 CAAAT 0.000825 CAACA 0.00144 CAACC 0.00123 CAACG 0.00109 CAACT 0.000856 CAAGA 0.00141 CAAGC 0.00158 CAAGG 0.00149 CAAGT 0.00103 CAATA 0.000628 CAATC 0.00108 CAATG 0.00118 CAATT 0.000839 CACAA 0.00102 CACAC 0.00132 CACAG 0.00119 CACAT 0.00102 CACCA 0.00163 CACCC 0.00133 CACCG 0.00101 CACCT 0.0012 CACGA 0.00125 CACGC 0.00113 CACGG 0.00103 CACGT 0.000818 CACTA 0.000495 CACTC 0.00101 CACTG 0.00115 CACTT 0.000862 CAGAA 0.0011 CAGAC 0.00124 CAGAG 0.00126 CAGAT 0.00102 CAGCA 0.0017 CAGCC 0.00173 CAGCG 0.00124 CAGCT 0.00128 CAGGA 0.00113 CAGGC 0.00161 CAGGG 0.00135 CAGGT 0.00118 CAGTA 0.000634 CAGTC 0.0011 CAGTG 0.00115 CAGTT 0.000706 CATAA 0.000419 CATAC 0.000672 CATAG 0.000516 CATAT 0.000655 CATCA 0.00174 CATCC 0.00137 CATCG 0.00132 CATCT 0.00136 CATGA 0.00139 CATGC 0.0014 CATGG 0.00148 CATGT 0.00139 CATTA 0.000421 CATTC 0.00116 CATTG 0.00118 CATTT 0.000829 CCAAA 0.00113 CCAAC 0.00125 CCAAG 0.00145 CCAAT 0.00103 CCACA 0.00114 CCACC 0.00166 CCACG 0.00117 CCACT 0.00102 CCAGA 0.00129 CCAGC 0.00168 CCAGG 0.00141 CCAGT 0.000986 CCATA 0.000571 CCATC 0.00165 CCATG 0.00148 CCATT 0.000999 CCCAA 0.00127 CCCAC 0.0013 CCCAG 0.00136 CCCAT 0.00113 CCCCA 0.00127 CCCCC 0.00216 CCCCG 0.00106 CCCCT 0.00153 CCCGA 0.000974 CCCGC 0.00121 CCCGG 0.00081 CCCGT 0.000865 CCCTA 0.000502 CCCTC 0.00166 CCCTG 0.00135 CCCTT 0.00127 CCGAA 0.000978 CCGAC 0.00117 CCGAG 0.00112 CCGAT 0.000761 CCGCA 0.000947 CCGCC 0.0015 CCGCG 0.000906 CCGCT 0.000882 CCGGA 0.000686 CCGGC 0.00109 CCGGG 0.00081 CCGGT 0.000617 CCGTA 0.000485 CCGTC 0.00127 CCGTG 0.00103 CCGTT 0.000714 CCTAA 0.000386 CCTAC 0.000786 CCTAG 0.00063 CCTAT 0.00039 CCTCA 0.00127 CCTCC 0.00167 CCTCG 0.00156 CCTCT 0.00137 CCTGA 0.00113 CCTGC 0.00153 CCTGG 0.00141 CCTGT 0.0012 CCTTA 0.000442 CCTTC 0.00143 CCTTG 0.00149 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.0011 CGAAC 0.000904 CGAAG 0.00117 CGAAT 0.000826 CGACA 0.00141 CGACC 0.00128 CGACG 0.00138 CGACT 0.000982 CGAGA 0.00143 CGAGC 0.00136 CGAGG 0.00156 CGAGT 0.000962 CGATA 0.000659 CGATC 0.00102 CGATG 0.00132 CGATT 0.000738 CGCAA 0.00105 CGCAC 0.000922 CGCAG 0.00101 CGCAT 0.000954 CGCCA 0.00143 CGCCC 0.00134 CGCCG 0.00123 CGCCT 0.0012 CGCGA 0.00104 CGCGC 0.00107 CGCGG 0.000906 CGCGT 0.000842 CGCTA 0.000451 CGCTC 0.00106 CGCTG 0.00124 CGCTT 0.00085 CGGAA 0.000811 CGGAC 0.000817 CGGAG 0.000913 CGGAT 0.000756 CGGCA 0.00123 CGGCC 0.00124 CGGCG 0.00123 CGGCT 0.00103 CGGGA 0.000922 CGGGC 0.0011 CGGGG 0.00106 CGGGT 0.000787 CGGTA 0.000532 CGGTC 0.000952 CGGTG 0.00101 CGGTT 0.000617 CGTAA 0.000379 CGTAC 0.000607 CGTAG 0.000605 CGTAT 0.000478 CGTCA 0.0013 CGTCC 0.00106 CGTCG 0.00138 CGTCT 0.00122 CGTGA 0.00107 CGTGC 0.00108 CGTGG 0.00117 CGTGT 0.000902 CGTTA 0.000345 CGTTC 0.000914 CGTTG 0.00109 CGTTT 0.000814 CTAAA 0.000357 CTAAC 0.000342 CTAAG 0.000372 CTAAT 0.000299 CTACA 0.000674 CTACC 0.000888 CTACG 0.000605 CTACT 0.000613 CTAGA 0.000496 CTAGC 0.00058 CTAGG 0.00063 CTAGT 0.000402 CTATA 0.000266 CTATC 0.000593 CTATG 0.000516 CTATT 0.000466 CTCAA 0.00108 CTCAC 0.00109 CTCAG 0.00105 CTCAT 0.00113 CTCCA 0.00132 CTCCC 0.00143 CTCCG 0.000913 CTCCT 0.00127 CTCGA 0.00151 CTCGC 0.00137 CTCGG 0.00112 CTCGT 0.00131 CTCTA 0.000531 CTCTC 0.00174 CTCTG 0.00126 CTCTT 0.00122 CTGAA 0.000994 CTGAC 0.00116 CTGAG 0.00105 CTGAT 0.00101 CTGCA 0.00139 CTGCC 0.00177 CTGCG 0.00101 CTGCT 0.0014 CTGGA 0.00117 CTGGC 0.00163 CTGGG 0.00136 CTGGT 0.00122 CTGTA 0.000661 CTGTC 0.0014 CTGTG 0.00119 CTGTT 0.00103 CTTAA 0.000251 CTTAC 0.000484 CTTAG 0.000372 CTTAT 0.000419 CTTCA 0.00122 CTTCC 0.00144 CTTCG 0.00117 CTTCT 0.00136 CTTGA 0.00137 CTTGC 0.00148 CTTGG 0.00145 CTTGT 0.0012 CTTTA 0.000381 CTTTC 0.00144 CTTTG 0.00122 CTTTT 0.0012 GAAAA 0.00122 GAAAC 0.000974 GAAAG 0.00144 GAAAT 0.000847 GAACA 0.00107 GAACC 0.000961 GAACG 0.000914 GAACT 0.00059 GAAGA 0.00154 GAAGC 0.0014 GAAGG 0.00143 GAAGT 0.00084 GAATA 0.000594 GAATC 0.000841 GAATG 0.00116 GAATT 0.000694 GACAA 0.00121 GACAC 0.00107 GACAG 0.0014 GACAT 0.00114 GACCA 0.00125 GACCC 0.00106 GACCG 0.000952 GACCT 0.00104 GACGA 0.00164 GACGC 0.00118 GACGG 0.00127 GACGT 0.000877 GACTA 0.000521 GACTC 0.000946 GACTG 0.0011 GACTT 0.000916 GAGAA 0.00131 GAGAC 0.00129 GAGAG 0.00174 GAGAT 0.00113 GAGCA 0.00133 GAGCC 0.0012 GAGCG 0.00106 GAGCT 0.00125 GAGGA 0.00147 GAGGC 0.00153 GAGGG 0.00166 GAGGT 0.00122 GAGTA 0.00054 GAGTC 0.000946 GAGTG 0.00101 GAGTT 0.000676 GATAA 0.000496 GATAC 0.000725 GATAG 0.000593 GATAT 0.000676 GATCA 0.00106 GATCC 0.000918 GATCG 0.00102 GATCT 0.000884 GATGA 0.00154 GATGC 0.00151 GATGG 0.00165 GATGT 0.00109 GATTA 0.000339 GATTC 0.000841 GATTG 0.00108 GATTT 0.000734 GCAAA 0.00116 GCAAC 0.00119 GCAAG 0.00148 GCAAT 0.000925 GCACA 0.00116 GCACC 0.00123 GCACG 0.00108 GCACT 0.000833 GCAGA 0.00133 GCAGC 0.0017 GCAGG 0.00153 GCAGT 0.00101 GCATA 0.000584 GCATC 0.00151 GCATG 0.0014 GCATT 0.000988 GCCAA 0.00145 GCCAC 0.00133 GCCAG 0.00163 GCCAT 0.00141 GCCCA 0.00144 GCCCC 0.00142 GCCCG 0.0011 GCCCT 0.00117 GCCGA 0.0012 GCCGC 0.0013 GCCGG 0.00109 GCCGT 0.00113 GCCTA 0.000568 GCCTC 0.00153 GCCTG 0.00161 GCCTT 0.00122 GCGAA 0.00099 GCGAC 0.00122 GCGAG 0.00137 GCGAT 0.001 GCGCA 0.00105 GCGCC 0.00123 GCGCG 0.00107 GCGCT 0.000867 GCGGA 0.000901 GCGGC 0.0013 GCGGG 0.00121 GCGGT 0.000832 GCGTA 0.00049 GCGTC 0.00118 GCGTG 0.00113 GCGTT 0.000804 GCTAA 0.00039 GCTAC 0.000699 GCTAG 0.00058 GCTAT 0.000538 GCTCA 0.00118 GCTCC 0.00118 GCTCG 0.00136 GCTCT 0.00112 GCTGA 0.00127 GCTGC 0.0017 GCTGG 0.00168 GCTGT 0.00131 GCTTA 0.000409 GCTTC 0.0014 GCTTG 0.00158 GCTTT 0.00109 GGAAA 0.00116 GGAAC 0.000858 GGAAG 0.00144 GGAAT 0.000802 GGACA 0.00102 GGACC 0.000884 GGACG 0.00106 GGACT 0.000713 GGAGA 0.00136 GGAGC 0.00118 GGAGG 0.00167 GGAGT 0.000712 GGATA 0.000532 GGATC 0.000918 GGATG 0.00137 GGATT 0.000693 GGCAA 0.00135 GGCAC 0.00121 GGCAG 0.00177 GGCAT 0.00122 GGCCA 0.00154 GGCCC 0.00125 GGCCG 0.00124 GGCCT 0.00115 GGCGA 0.00137 GGCGC 0.00123 GGCGG 0.0015 GGCGT 0.00111 GGCTA 0.00055 GGCTC 0.0012 GGCTG 0.00173 GGCTT 0.00119 GGGAA 0.0012 GGGAC 0.000921 GGGAG 0.00143 GGGAT 0.000978 GGGCA 0.00136 GGGCC 0.00125 GGGCG 0.00134 GGGCT 0.00117 GGGGA 0.00124 GGGGC 0.00142 GGGGG 0.00216 GGGGT 0.0012 GGGTA 0.000667 GGGTC 0.00106 GGGTG 0.00133 GGGTT 0.00101 GGTAA 0.000527 GGTAC 0.000888 GGTAG 0.000888 GGTAT 0.000676 GGTCA 0.00115 GGTCC 0.000884 GGTCG 0.00128 GGTCT 0.000998 GGTGA 0.0012 GGTGC 0.00123 GGTGG 0.00166 GGTGT 0.00108 GGTTA 0.000357 GGTTC 0.000961 GGTTG 0.00123 GGTTT 0.00086 GTAAA 0.000436 GTAAC 0.00042 GTAAG 0.000484 GTAAT 0.000435 GTACA 0.00082 GTACC 0.000888 GTACG 0.000607 GTACT 0.000546 GTAGA 0.000691 GTAGC 0.000699 GTAGG 0.000786 GTAGT 0.000608 GTATA 0.000373 GTATC 0.000725 GTATG 0.000672 GTATT 0.000562 GTCAA 0.00128 GTCAC 0.00107 GTCAG 0.00116 GTCAT 0.00111 GTCCA 0.00105 GTCCC 0.000921 GTCCG 0.000817 GTCCT 0.000875 GTCGA 0.00139 GTCGC 0.00122 GTCGG 0.00117 GTCGT 0.00129 GTCTA 0.000572 GTCTC 0.00129 GTCTG 0.00124 GTCTT 0.00112 GTGAA 0.000953 GTGAC 0.00107 GTGAG 0.00109 GTGAT 0.00113 GTGCA 0.00104 GTGCC 0.00121 GTGCG 0.000922 GTGCT 0.00114 GTGGA 0.00111 GTGGC 0.00133 GTGGG 0.0013 GTGGT 0.00126 GTGTA 0.000634 GTGTC 0.00107 GTGTG 0.00132 GTGTT 0.000922 GTTAA 0.000215 GTTAC 0.00042 GTTAG 0.000342 GTTAT 0.000408 GTTCA 0.00096 GTTCC 0.000858 GTTCG 0.000904 GTTCT 0.000817 GTTGA 0.00114 GTTGC 0.00119 GTTGG 0.00125 GTTGT 0.00103 GTTTA 0.00037 GTTTC 0.000974 GTTTG 0.00106 GTTTT 0.000877 TAAAA 0.000413 TAAAC 0.00037 TAAAG 0.000381 TAAAT 0.000342 TAACA 0.000415 TAACC 0.000357 TAACG 0.000345 TAACT 0.000267 TAAGA 0.000401 TAAGC 0.000409 TAAGG 0.000442 TAAGT 0.000277 TAATA 0.000241 TAATC 0.000339 TAATG 0.000421 TAATT 0.000362 TACAA 0.000667 TACAC 0.000634 TACAG 0.000661 TACAT 0.000676 TACCA 0.00075 TACCC 0.000667 TACCG 0.000532 TACCT 0.00103 TACGA 0.000587 TACGC 0.00049 TACGG 0.000485 TACGT 0.000506 TACTA 0.000318 TACTC 0.00054 TACTG 0.000634 TACTT 0.000558 TAGAA 0.000454 TAGAC 0.000572 TAGAG 0.000531 TAGAT 0.000484 TAGCA 0.000609 TAGCC 0.00055 TAGCG 0.000451 TAGCT 0.000597 TAGGA 0.000449 TAGGC 0.000568 TAGGG 0.000502 TAGGT 0.000677 TAGTA 0.000318 TAGTC 0.000521 TAGTG 0.000495 TAGTT 0.000335 TATAA 0.000286 TATAC 0.000373 TATAG 0.000266 TATAT 0.000372 TATCA 0.000658 TATCC 0.000532 TATCG 0.000659 TATCT 0.00064 TATGA 0.000559 TATGC 0.000584 TATGG 0.000571 TATGT 0.000548 TATTA 0.000241 TATTC 0.000594 TATTG 0.000628 TATTT 0.000577 TCAAA 0.00097 TCAAC 0.00114 TCAAG 0.00137 TCAAT 0.000982 TCACA 0.00108 TCACC 0.0012 TCACG 0.00107 TCACT 0.000895 TCAGA 0.000978 TCAGC 0.00127 TCAGG 0.00113 TCAGT 0.000838 TCATA 0.000559 TCATC 0.00154 TCATG 0.00139 TCATT 0.000928 TCCAA 0.000972 TCCAC 0.00111 TCCAG 0.00117 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.00121 TCCCC 0.00124 TCCCG 0.000922 TCCCT 0.00115 TCCGA 0.000879 TCCGC 0.000901 TCCGG 0.000686 TCCGT 0.000827 TCCTA 0.000449 TCCTC 0.00147 TCCTG 0.00113 TCCTT 0.00106 TCGAA 0.00105 TCGAC 0.00139 TCGAG 0.00151 TCGAT 0.00108 TCGCA 0.00108 TCGCC 0.00137 TCGCG 0.00104 TCGCT 0.00108 TCGGA 0.000879 TCGGC 0.0012 TCGGG 0.000974 TCGGT 0.000974 TCGTA 0.000587 TCGTC 0.00164 TCGTG 0.00125 TCGTT 0.00102 TCTAA 0.000328 TCTAC 0.000691 TCTAG 0.000496 TCTAT 0.000528 TCTCA 0.0012 TCTCC 0.00136 TCTCG 0.00143 TCTCT 0.00148 TCTGA 0.000978 TCTGC 0.00133 TCTGG 0.00129 TCTGT 0.00102 TCTTA 0.000401 TCTTC 0.00154 TCTTG 0.00141 TCTTT 0.00124 TGAAA 0.000909 TGAAC 0.00096 TGAAG 0.00122 TGAAT 0.000895 TGACA 0.00118 TGACC 0.00115 TGACG 0.0013 TGACT 0.000992 TGAGA 0.0012 TGAGC 0.00118 TGAGG 0.00127 TGAGT 0.000703 TGATA 0.000658 TGATC 0.00106 TGATG 0.00174 TGATT 0.000929 TGCAA 0.00108 TGCAC 0.00104 TGCAG 0.00139 TGCAT 0.00124 TGCCA 0.00149 TGCCC 0.00136 TGCCG 0.00123 TGCCT 0.00146 TGCGA 0.00108 TGCGC 0.00105 TGCGG 0.000947 TGCGT 0.000869 TGCTA 0.000609 TGCTC 0.00133 TGCTG 0.0017 TGCTT 0.00125 TGGAA 0.00112 TGGAC 0.00105 TGGAG 0.00132 TGGAT 0.000936 TGGCA 0.00149 TGGCC 0.00154 TGGCG 0.00143 TGGCT 0.00137 TGGGA 0.00121 TGGGC 0.00144 TGGGG 0.00127 TGGGT 0.00113 TGGTA 0.00075 TGGTC 0.00125 TGGTG 0.00163 TGGTT 0.00101 TGTAA 0.000477 TGTAC 0.00082 TGTAG 0.000674 TGTAT 0.000671 TGTCA 0.00118 TGTCC 0.00102 TGTCG 0.00141 TGTCT 0.00121 TGTGA 0.00108 TGTGC 0.00116 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.00117 TGTTA 0.000415 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.00144 TGTTT 0.00101 TTAAA 0.000275 TTAAC 0.000215 TTAAG 0.000251 TTAAT 0.000235 TTACA 0.000477 TTACC 0.000527 TTACG 0.000379 TTACT 0.000389 TTAGA 0.000328 TTAGC 0.00039 TTAGG 0.000386 TTAGT 0.000269 TTATA 0.000286 TTATC 0.000496 TTATG 0.000419 TTATT 0.00046 TTCAA 0.00103 TTCAC 0.000953 TTCAG 0.000994 TTCAT 0.00102 TTCCA 0.00112 TTCCC 0.0012 TTCCG 0.000811 TTCCT 0.00112 TTCGA 0.00105 TTCGC 0.00099 TTCGG 0.000978 TTCGT 0.000993 TTCTA 0.000454 TTCTC 0.00131 TTCTG 0.0011 TTCTT 0.00137 TTGAA 0.00103 TTGAC 0.00128 TTGAG 0.00108 TTGAT 0.00108 TTGCA 0.00108 TTGCC 0.00135 TTGCG 0.00105 TTGCT 0.00127 TTGGA 0.000972 TTGGC 0.00145 TTGGG 0.00127 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.000667 TTGTC 0.00121 TTGTG 0.00102 TTGTT 0.00112 TTTAA 0.000275 TTTAC 0.000436 TTTAG 0.000357 TTTAT 0.000438 TTTCA 0.000909 TTTCC 0.00116 TTTCG 0.0011 TTTCT 0.00131 TTTGA 0.00097 TTTGC 0.00116 TTTGG 0.00113 TTTGT 0.001 TTTTA 0.000413 TTTTC 0.00122 TTTTG 0.00115 TTTTT 0.00142 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3272 AAAAC 0.2081 AAAAG 0.2909 AAAAT 0.1738 AAACA 0.3117 AAACC 0.258 AAACG 0.2453 AAACT 0.185 AAAGA 0.2928 AAAGC 0.2632 AAAGG 0.2628 AAAGT 0.1812 AAATA 0.216 AAATC 0.2627 AAATG 0.2994 AAATT 0.2219 AACAA 0.2845 AACAC 0.2351 AACAG 0.2527 AACAT 0.2276 AACCA 0.2959 AACCC 0.29 AACCG 0.1808 AACCT 0.2332 AACGA 0.3201 AACGC 0.2561 AACGG 0.2225 AACGT 0.2014 AACTA 0.1535 AACTC 0.2968 AACTG 0.2936 AACTT 0.2561 AAGAA 0.3004 AAGAC 0.2469 AAGAG 0.2588 AAGAT 0.194 AAGCA 0.281 AAGCC 0.2624 AAGCG 0.1894 AAGCT 0.2673 AAGGA 0.2346 AAGGC 0.2653 AAGGG 0.2752 AAGGT 0.2249 AAGTA 0.197 AAGTC 0.3096 AAGTG 0.2892 AAGTT 0.2042 AATAA 0.2275 AATAC 0.2704 AATAG 0.2262 AATAT 0.276 AATCA 0.3156 AATCC 0.2281 AATCG 0.2395 AATCT 0.2168 AATGA 0.2593 AATGC 0.2706 AATGG 0.276 AATGT 0.1941 AATTA 0.1556 AATTC 0.268 AATTG 0.3372 AATTT 0.2391 ACAAA 0.2452 ACAAC 0.257 ACAAG 0.2923 ACAAT 0.2054 ACACA 0.2989 ACACC 0.2756 ACACG 0.2303 ACACT 0.1952 ACAGA 0.239 ACAGC 0.3016 ACAGG 0.279 ACAGT 0.1805 ACATA 0.1525 ACATC 0.2854 ACATG 0.3735 ACATT 0.1886 ACCAA 0.2517 ACCAC 0.2675 ACCAG 0.2647 ACCAT 0.2161 ACCCA 0.2821 ACCCC 0.2912 ACCCG 0.1943 ACCCT 0.2324 ACCGA 0.3173 ACCGC 0.2655 ACCGG 0.1986 ACCGT 0.2186 ACCTA 0.1677 ACCTC 0.2981 ACCTG 0.2883 ACCTT 0.246 ACGAA 0.2275 ACGAC 0.2832 ACGAG 0.2858 ACGAT 0.2036 ACGCA 0.2451 ACGCC 0.3038 ACGCG 0.2284 ACGCT 0.2227 ACGGA 0.2458 ACGGC 0.3146 ACGGG 0.2422 ACGGT 0.1974 ACGTA 0.1874 ACGTC 0.3076 ACGTG 0.2848 ACGTT 0.2202 ACTAA 0.1661 ACTAC 0.3652 ACTAG 0.2352 ACTAT 0.2335 ACTCA 0.2286 ACTCC 0.2253 ACTCG 0.2951 ACTCT 0.251 ACTGA 0.2341 ACTGC 0.2755 ACTGG 0.2766 ACTGT 0.2138 ACTTA 0.09824 ACTTC 0.289 ACTTG 0.3552 ACTTT 0.2576 AGAAA 0.3022 AGAAC 0.1944 AGAAG 0.3144 AGAAT 0.189 AGACA 0.2846 AGACC 0.2338 AGACG 0.2857 AGACT 0.1958 AGAGA 0.3127 AGAGC 0.2331 AGAGG 0.2821 AGAGT 0.1721 AGATA 0.1872 AGATC 0.2499 AGATG 0.376 AGATT 0.1869 AGCAA 0.2641 AGCAC 0.2312 AGCAG 0.2774 AGCAT 0.2273 AGCCA 0.293 AGCCC 0.2492 AGCCG 0.2155 AGCCT 0.2423 AGCGA 0.296 AGCGC 0.2393 AGCGG 0.2412 AGCGT 0.2234 AGCTA 0.1406 AGCTC 0.2851 AGCTG 0.2954 AGCTT 0.2789 AGGAA 0.2689 AGGAC 0.2176 AGGAG 0.3008 AGGAT 0.2128 AGGCA 0.2905 AGGCC 0.2365 AGGCG 0.2419 AGGCT 0.2311 AGGGA 0.2415 AGGGC 0.2457 AGGGG 0.3126 AGGGT 0.2002 AGGTA 0.255 AGGTC 0.2546 AGGTG 0.2948 AGGTT 0.1957 AGTAA 0.195 AGTAC 0.2608 AGTAG 0.2967 AGTAT 0.2474 AGTCA 0.2799 AGTCC 0.2077 AGTCG 0.2761 AGTCT 0.2363 AGTGA 0.2619 AGTGC 0.2338 AGTGG 0.2831 AGTGT 0.2212 AGTTA 0.1266 AGTTC 0.2586 AGTTG 0.3634 AGTTT 0.2515 ATAAA 0.2625 ATAAC 0.243 ATAAG 0.2493 ATAAT 0.2451 ATACA 0.292 ATACC 0.2799 ATACG 0.2121 ATACT 0.216 ATAGA 0.2859 ATAGC 0.2874 ATAGG 0.2133 ATAGT 0.2133 ATATA 0.1736 ATATC 0.2986 ATATG 0.2759 ATATT 0.252 ATCAA 0.259 ATCAC 0.255 ATCAG 0.2196 ATCAT 0.2664 ATCCA 0.2652 ATCCC 0.2723 ATCCG 0.2193 ATCCT 0.2432 ATCGA 0.2947 ATCGC 0.2628 ATCGG 0.2028 ATCGT 0.2398 ATCTA 0.141 ATCTC 0.3196 ATCTG 0.2883 ATCTT 0.2511 ATGAA 0.2302 ATGAC 0.2419 ATGAG 0.2631 ATGAT 0.2648 ATGCA 0.2779 ATGCC 0.2682 ATGCG 0.2102 ATGCT 0.2437 ATGGA 0.251 ATGGC 0.2924 ATGGG 0.2401 ATGGT 0.2165 ATGTA 0.192 ATGTC 0.3038 ATGTG 0.2675 ATGTT 0.2367 ATTAA 0.1875 ATTAC 0.3106 ATTAG 0.2135 ATTAT 0.2884 ATTCA 0.2743 ATTCC 0.2344 ATTCG 0.2532 ATTCT 0.2381 ATTGA 0.2685 ATTGC 0.2495 ATTGG 0.2668 ATTGT 0.2152 ATTTA 0.1375 ATTTC 0.3077 ATTTG 0.2991 ATTTT 0.2557 CAAAA 0.2698 CAAAC 0.2474 CAAAG 0.2849 CAAAT 0.1979 CAACA 0.3114 CAACC 0.2655 CAACG 0.2317 CAACT 0.1914 CAAGA 0.2597 CAAGC 0.2811 CAAGG 0.2635 CAAGT 0.1957 CAATA 0.1752 CAATC 0.2859 CAATG 0.3085 CAATT 0.2303 CACAA 0.2295 CACAC 0.2874 CACAG 0.2579 CACAT 0.2251 CACCA 0.3187 CACCC 0.2495 CACCG 0.1953 CACCT 0.2365 CACGA 0.296 CACGC 0.2658 CACGG 0.2415 CACGT 0.1967 CACTA 0.144 CACTC 0.2845 CACTG 0.3208 CACTT 0.2507 CAGAA 0.2369 CAGAC 0.2668 CAGAG 0.2678 CAGAT 0.2285 CAGCA 0.2827 CAGCC 0.2875 CAGCG 0.2094 CAGCT 0.2204 CAGGA 0.2121 CAGGC 0.3021 CAGGG 0.257 CAGGT 0.2288 CAGTA 0.183 CAGTC 0.304 CAGTG 0.3142 CAGTT 0.1988 CATAA 0.1947 CATAC 0.2999 CATAG 0.2228 CATAT 0.2826 CATCA 0.3043 CATCC 0.2325 CATCG 0.2283 CATCT 0.2349 CATGA 0.2536 CATGC 0.2484 CATGG 0.2464 CATGT 0.2516 CATTA 0.127 CATTC 0.3173 CATTG 0.3242 CATTT 0.2315 CCAAA 0.2364 CCAAC 0.2487 CCAAG 0.3007 CCAAT 0.2141 CCACA 0.2314 CCACC 0.3299 CCACG 0.2349 CCACT 0.2037 CCAGA 0.239 CCAGC 0.3122 CCAGG 0.2608 CCAGT 0.188 CCATA 0.1243 CCATC 0.3487 CCATG 0.304 CCATT 0.223 CCCAA 0.2561 CCCAC 0.2561 CCCAG 0.2633 CCCAT 0.2244 CCCCA 0.2189 CCCCC 0.3503 CCCCG 0.1777 CCCCT 0.2531 CCCGA 0.2586 CCCGC 0.3117 CCCGG 0.208 CCCGT 0.2217 CCCTA 0.1059 CCCTC 0.3384 CCCTG 0.2881 CCCTT 0.2677 CCGAA 0.2471 CCGAC 0.2848 CCGAG 0.2778 CCGAT 0.1903 CCGCA 0.231 CCGCC 0.3497 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.2099 CCGGA 0.2222 CCGGC 0.3339 CCGGG 0.2481 CCGGT 0.1958 CCGTA 0.1434 CCGTC 0.3553 CCGTG 0.2956 CCGTT 0.2057 CCTAA 0.1831 CCTAC 0.3516 CCTAG 0.277 CCTAT 0.1883 CCTCA 0.2253 CCTCC 0.2797 CCTCG 0.2642 CCTCT 0.2309 CCTGA 0.2179 CCTGC 0.2869 CCTGG 0.2661 CCTGT 0.2292 CCTTA 0.1028 CCTTC 0.3158 CCTTG 0.3263 CCTTT 0.255 CGAAA 0.2738 CGAAC 0.2159 CGAAG 0.297 CGAAT 0.2133 CGACA 0.2815 CGACC 0.2528 CGACG 0.2707 CGACT 0.195 CGAGA 0.2696 CGAGC 0.2587 CGAGG 0.2899 CGAGT 0.1817 CGATA 0.1796 CGATC 0.2702 CGATG 0.3515 CGATT 0.1987 CGCAA 0.2717 CGCAC 0.2295 CGCAG 0.2544 CGCAT 0.2444 CGCCA 0.2777 CGCCC 0.2539 CGCCG 0.2357 CGCCT 0.2327 CGCGA 0.2722 CGCGC 0.2779 CGCGG 0.2305 CGCGT 0.2194 CGCTA 0.1264 CGCTC 0.2873 CGCTG 0.344 CGCTT 0.2422 CGGAA 0.2461 CGGAC 0.245 CGGAG 0.2741 CGGAT 0.2348 CGGCA 0.26 CGGCC 0.2617 CGGCG 0.26 CGGCT 0.2182 CGGGA 0.2409 CGGGC 0.279 CGGGG 0.2723 CGGGT 0.2077 CGGTA 0.1759 CGGTC 0.2962 CGGTG 0.3252 CGGTT 0.2028 CGTAA 0.1884 CGTAC 0.2862 CGTAG 0.2799 CGTAT 0.2454 CGTCA 0.2607 CGTCC 0.2122 CGTCG 0.2774 CGTCT 0.2496 CGTGA 0.25 CGTGC 0.2518 CGTGG 0.2768 CGTGT 0.2213 CGTTA 0.1148 CGTTC 0.2847 CGTTG 0.3416 CGTTT 0.259 CTAAA 0.2532 CTAAC 0.2565 CTAAG 0.2668 CTAAT 0.2235 CTACA 0.2516 CTACC 0.3097 CTACG 0.2119 CTACT 0.2268 CTAGA 0.2382 CTAGC 0.274 CTAGG 0.2896 CTAGT 0.1983 CTATA 0.1546 CTATC 0.3076 CTATG 0.2758 CTATT 0.2619 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.2417 CTCAG 0.2361 CTCAT 0.272 CTCCA 0.272 CTCCC 0.2854 CTCCG 0.1889 CTCCT 0.2537 CTCGA 0.2879 CTCGC 0.2547 CTCGG 0.214 CTCGT 0.2434 CTCTA 0.1174 CTCTC 0.3607 CTCTG 0.2621 CTCTT 0.2598 CTGAA 0.2472 CTGAC 0.2675 CTGAG 0.2481 CTGAT 0.2372 CTGCA 0.2541 CTGCC 0.3102 CTGCG 0.1847 CTGCT 0.2511 CTGGA 0.22 CTGGC 0.2994 CTGGG 0.2476 CTGGT 0.2331 CTGTA 0.1609 CTGTC 0.3216 CTGTG 0.2786 CTGTT 0.2389 CTTAA 0.1682 CTTAC 0.3091 CTTAG 0.2431 CTTAT 0.2796 CTTCA 0.2431 CTTCC 0.2675 CTTCG 0.2306 CTTCT 0.2589 CTTGA 0.2567 CTTGC 0.2596 CTTGG 0.2662 CTTGT 0.2176 CTTTA 0.09675 CTTTC 0.3308 CTTTG 0.2871 CTTTT 0.2853 GAAAA 0.273 GAAAC 0.2118 GAAAG 0.318 GAAAT 0.1972 GAACA 0.3047 GAACC 0.2675 GAACG 0.2508 GAACT 0.1769 GAAGA 0.294 GAAGC 0.2665 GAAGG 0.2705 GAAGT 0.1689 GAATA 0.1908 GAATC 0.2485 GAATG 0.3491 GAATT 0.2116 GACAA 0.249 GACAC 0.2237 GACAG 0.2837 GACAT 0.2436 GACCA 0.2917 GACCC 0.2469 GACCG 0.2147 GACCT 0.2467 GACGA 0.3258 GACGC 0.2422 GACGG 0.2495 GACGT 0.1826 GACTA 0.155 GACTC 0.2628 GACTG 0.3122 GACTT 0.27 GAGAA 0.2451 GAGAC 0.232 GAGAG 0.3099 GAGAT 0.2129 GAGCA 0.2788 GAGCC 0.2458 GAGCG 0.2145 GAGCT 0.2609 GAGGA 0.2506 GAGGC 0.2617 GAGGG 0.2734 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.1745 GAGTC 0.2873 GAGTG 0.3127 GAGTT 0.2255 GATAA 0.2042 GATAC 0.2868 GATAG 0.2282 GATAT 0.2809 GATCA 0.2814 GATCC 0.2333 GATCG 0.2569 GATCT 0.2285 GATGA 0.2663 GATGC 0.2643 GATGG 0.2794 GATGT 0.1901 GATTA 0.124 GATTC 0.2713 GATTG 0.3608 GATTT 0.2439 GCAAA 0.2486 GCAAC 0.2464 GCAAG 0.3001 GCAAT 0.205 GCACA 0.2767 GCACC 0.2812 GCACG 0.2474 GCACT 0.1947 GCAGA 0.2378 GCAGC 0.3064 GCAGG 0.2735 GCAGT 0.1822 GCATA 0.1326 GCATC 0.3347 GCATG 0.3109 GCATT 0.2218 GCCAA 0.2593 GCCAC 0.2266 GCCAG 0.2766 GCCAT 0.2375 GCCCA 0.2832 GCCCC 0.2762 GCCCG 0.2105 GCCCT 0.23 GCCGA 0.2646 GCCGC 0.2695 GCCGG 0.2297 GCCGT 0.2362 GCCTA 0.1176 GCCTC 0.3104 GCCTG 0.3246 GCCTT 0.2474 GCGAA 0.2194 GCGAC 0.2642 GCGAG 0.2957 GCGAT 0.2207 GCGCA 0.2565 GCGCC 0.2861 GCGCG 0.2506 GCGCT 0.2068 GCGGA 0.2186 GCGGC 0.2986 GCGGG 0.2834 GCGGT 0.1994 GCGTA 0.1389 GCGTC 0.3274 GCGTG 0.3089 GCGTT 0.2248 GCTAA 0.1857 GCTAC 0.3172 GCTAG 0.2525 GCTAT 0.2445 GCTCA 0.2505 GCTCC 0.2386 GCTCG 0.2823 GCTCT 0.2285 GCTGA 0.2151 GCTGC 0.2842 GCTGG 0.2817 GCTGT 0.219 GCTTA 0.09894 GCTTC 0.3065 GCTTG 0.343 GCTTT 0.2516 GGAAA 0.27 GGAAC 0.2055 GGAAG 0.3335 GGAAT 0.191 GGACA 0.2838 GGACC 0.235 GGACG 0.2817 GGACT 0.1996 GGAGA 0.2796 GGAGC 0.2371 GGAGG 0.3329 GGAGT 0.1504 GGATA 0.1563 GGATC 0.2613 GGATG 0.3809 GGATT 0.2015 GGCAA 0.2422 GGCAC 0.2185 GGCAG 0.3117 GGCAT 0.2276 GGCCA 0.2961 GGCCC 0.2392 GGCCG 0.2373 GGCCT 0.2275 GGCGA 0.2647 GGCGC 0.2346 GGCGG 0.2848 GGCGT 0.2159 GGCTA 0.1218 GGCTC 0.2542 GGCTG 0.3647 GGCTT 0.2592 GGGAA 0.2696 GGGAC 0.2015 GGGAG 0.3104 GGGAT 0.2185 GGGCA 0.2676 GGGCC 0.2427 GGGCG 0.2577 GGGCT 0.232 GGGGA 0.2077 GGGGC 0.2389 GGGGG 0.3503 GGGGT 0.2031 GGGTA 0.1672 GGGTC 0.2623 GGGTG 0.32 GGGTT 0.2505 GGTAA 0.188 GGTAC 0.2941 GGTAG 0.2891 GGTAT 0.2288 GGTCA 0.2708 GGTCC 0.2015 GGTCG 0.2951 GGTCT 0.2326 GGTGA 0.238 GGTGC 0.2321 GGTGG 0.3152 GGTGT 0.2147 GGTTA 0.1188 GGTTC 0.2766 GGTTG 0.3566 GGTTT 0.2481 GTAAA 0.2522 GTAAC 0.2353 GTAAG 0.2617 GTAAT 0.2507 GTACA 0.2943 GTACC 0.3042 GTACG 0.2091 GTACT 0.1924 GTAGA 0.247 GTAGC 0.2542 GTAGG 0.2714 GTAGT 0.2274 GTATA 0.167 GTATC 0.3007 GTATG 0.2887 GTATT 0.2435 GTCAA 0.2801 GTCAC 0.2314 GTCAG 0.2463 GTCAT 0.2421 GTCCA 0.2919 GTCCC 0.2441 GTCCG 0.2224 GTCCT 0.2417 GTCGA 0.2775 GTCGC 0.2389 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2532 GTCTA 0.1381 GTCTC 0.2989 GTCTG 0.2888 GTCTT 0.2743 GTGAA 0.2299 GTGAC 0.2479 GTGAG 0.2506 GTGAT 0.2717 GTGCA 0.2396 GTGCC 0.2786 GTGCG 0.2135 GTGCT 0.2682 GTGGA 0.222 GTGGC 0.2644 GTGGG 0.2597 GTGGT 0.254 GTGTA 0.1659 GTGTC 0.269 GTGTG 0.3294 GTGTT 0.2357 GTTAA 0.1673 GTTAC 0.2951 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.2895 GTTCA 0.277 GTTCC 0.242 GTTCG 0.246 GTTCT 0.235 GTTGA 0.2508 GTTGC 0.2556 GTTGG 0.2641 GTTGT 0.2295 GTTTA 0.1172 GTTTC 0.2888 GTTTG 0.3267 GTTTT 0.2674 TAAAA 0.272 TAAAC 0.2344 TAAAG 0.2535 TAAAT 0.2402 TAACA 0.2965 TAACC 0.2671 TAACG 0.2351 TAACT 0.2013 TAAGA 0.2568 TAAGC 0.2762 TAAGG 0.2827 TAAGT 0.1844 TAATA 0.1739 TAATC 0.2494 TAATG 0.3069 TAATT 0.2698 TACAA 0.2589 TACAC 0.2357 TACAG 0.2425 TACAT 0.2629 TACCA 0.2548 TACCC 0.2205 TACCG 0.1786 TACCT 0.3461 TACGA 0.2887 TACGC 0.2322 TACGG 0.2277 TACGT 0.2515 TACTA 0.1602 TACTC 0.2582 TACTG 0.3039 TACTT 0.2777 TAGAA 0.2269 TAGAC 0.2745 TAGAG 0.2582 TAGAT 0.2405 TAGCA 0.2854 TAGCC 0.2469 TAGCG 0.1979 TAGCT 0.2698 TAGGA 0.2042 TAGGC 0.2585 TAGGG 0.2231 TAGGT 0.3142 TAGTA 0.1959 TAGTC 0.3066 TAGTG 0.2865 TAGTT 0.2111 TATAA 0.2197 TATAC 0.2842 TATAG 0.2046 TATAT 0.2914 TATCA 0.2693 TATCC 0.2119 TATCG 0.259 TATCT 0.2598 TATGA 0.2586 TATGC 0.2538 TATGG 0.2414 TATGT 0.2462 TATTA 0.1207 TATTC 0.2907 TATTG 0.3087 TATTT 0.2799 TCAAA 0.2175 TCAAC 0.2492 TCAAG 0.3059 TCAAT 0.2274 TCACA 0.2568 TCACC 0.2849 TCACG 0.2427 TCACT 0.2155 TCAGA 0.2357 TCAGC 0.2982 TCAGG 0.2671 TCAGT 0.1991 TCATA 0.1348 TCATC 0.3364 TCATG 0.3167 TCATT 0.2121 TCCAA 0.2251 TCCAC 0.2468 TCCAG 0.2636 TCCAT 0.2645 TCCCA 0.272 TCCCC 0.2698 TCCCG 0.2042 TCCCT 0.254 TCCGA 0.2638 TCCGC 0.2716 TCCGG 0.2104 TCCGT 0.2542 TCCTA 0.111 TCCTC 0.3552 TCCTG 0.2723 TCCTT 0.2614 TCGAA 0.2132 TCGAC 0.2717 TCGAG 0.296 TCGAT 0.2191 TCGCA 0.2403 TCGCC 0.2975 TCGCG 0.2263 TCGCT 0.2358 TCGGA 0.2169 TCGGC 0.2995 TCGGG 0.2401 TCGGT 0.2435 TCGTA 0.1395 TCGTC 0.3557 TCGTG 0.2779 TCGTT 0.2269 TCTAA 0.1748 TCTAC 0.33 TCTAG 0.235 TCTAT 0.2603 TCTCA 0.2257 TCTCC 0.2469 TCTCG 0.2583 TCTCT 0.2691 TCTGA 0.218 TCTGC 0.2828 TCTGG 0.2765 TCTGT 0.2226 TCTTA 0.08958 TCTTC 0.3293 TCTTG 0.3085 TCTTT 0.2726 TGAAA 0.2342 TGAAC 0.2365 TGAAG 0.3046 TGAAT 0.2247 TGACA 0.2606 TGACC 0.2508 TGACG 0.2749 TGACT 0.2137 TGAGA 0.2762 TGAGC 0.269 TGAGG 0.2898 TGAGT 0.1649 TGATA 0.1539 TGATC 0.2441 TGATG 0.3862 TGATT 0.2158 TGCAA 0.2347 TGCAC 0.2118 TGCAG 0.2878 TGCAT 0.2657 TGCCA 0.2766 TGCCC 0.2449 TGCCG 0.2189 TGCCT 0.2595 TGCGA 0.2718 TGCGC 0.2675 TGCGG 0.2392 TGCGT 0.2215 TGCTA 0.1321 TGCTC 0.2707 TGCTG 0.3367 TGCTT 0.2605 TGGAA 0.2509 TGGAC 0.2408 TGGAG 0.2955 TGGAT 0.2127 TGGCA 0.2611 TGGCC 0.2596 TGGCG 0.2435 TGGCT 0.2358 TGGGA 0.2406 TGGGC 0.2816 TGGGG 0.2516 TGGGT 0.2261 TGGTA 0.1655 TGGTC 0.2655 TGGTG 0.3502 TGGTT 0.2189 TGTAA 0.1861 TGTAC 0.3055 TGTAG 0.2521 TGTAT 0.2562 TGTCA 0.2477 TGTCC 0.2142 TGTCG 0.2891 TGTCT 0.2491 TGTGA 0.2392 TGTGC 0.2547 TGTGG 0.2465 TGTGT 0.2597 TGTTA 0.1132 TGTTC 0.2705 TGTTG 0.359 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2803 TTAAC 0.2248 TTAAG 0.2399 TTAAT 0.255 TTACA 0.2736 TTACC 0.2966 TTACG 0.2101 TTACT 0.2196 TTAGA 0.2495 TTAGC 0.2838 TTAGG 0.2695 TTAGT 0.1972 TTATA 0.1755 TTATC 0.2911 TTATG 0.2549 TTATT 0.2785 TTCAA 0.2613 TTCAC 0.2357 TTCAG 0.25 TTCAT 0.253 TTCCA 0.2637 TTCCC 0.2832 TTCCG 0.1939 TTCCT 0.2592 TTCGA 0.2657 TTCGC 0.2421 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2482 TTCTA 0.1119 TTCTC 0.3095 TTCTG 0.2515 TTCTT 0.3271 TTGAA 0.2338 TTGAC 0.2752 TTGAG 0.2379 TTGAT 0.2531 TTGCA 0.2342 TTGCC 0.2725 TTGCG 0.223 TTGCT 0.2703 TTGGA 0.2017 TTGGC 0.3015 TTGGG 0.2587 TTGGT 0.238 TTGTA 0.1769 TTGTC 0.2907 TTGTG 0.2554 TTGTT 0.277 TTTAA 0.1927 TTTAC 0.2922 TTTAG 0.2263 TTTAT 0.2888 TTTCA 0.2161 TTTCC 0.2505 TTTCG 0.2458 TTTCT 0.2877 TTTGA 0.2312 TTTGC 0.2724 TTTGG 0.2652 TTTGT 0.2312 TTTTA 0.1059 TTTTC 0.2896 TTTTG 0.2772 TTTTT 0.3272 [5] # (a,c,g,t)= (0.169, 0.331, 0.331, 0.169) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.226 C 0.275 G 0.274 T 0.226 # l= 1 # Values AA 0.0541 AC 0.0574 AG 0.0635 AT 0.0507 CA 0.0721 CC 0.0737 CG 0.065 CT 0.0636 GA 0.0686 GC 0.0747 GG 0.0736 GT 0.0574 TA 0.0309 TC 0.0687 TG 0.072 TT 0.0541 # l= 2 # Values AAA 0.0143 AAC 0.0127 AAG 0.0163 AAT 0.0108 ACA 0.0158 ACC 0.0159 ACG 0.0146 ACT 0.0112 AGA 0.0167 AGC 0.0175 AGG 0.0181 AGT 0.0112 ATA 0.00779 ATC 0.015 ATG 0.0171 ATT 0.0108 CAA 0.0179 CAC 0.0175 CAG 0.0195 CAT 0.0172 CCA 0.0201 CCC 0.0202 CCG 0.0153 CCT 0.0181 CGA 0.0183 CGC 0.017 CGG 0.0152 CGT 0.0146 CTA 0.00798 CTC 0.0197 CTG 0.0195 CTT 0.0164 GAA 0.0164 GAC 0.0177 GAG 0.0196 GAT 0.015 GCA 0.0191 GCC 0.021 GCG 0.017 GCT 0.0175 GGA 0.0165 GGC 0.021 GGG 0.0202 GGT 0.0159 GTA 0.00957 GTC 0.0177 GTG 0.0175 GTT 0.0127 TAA 0.00554 TAC 0.00959 TAG 0.00797 TAT 0.00778 TCA 0.0171 TCC 0.0165 TCG 0.0183 TCT 0.0168 TGA 0.0171 TGC 0.0191 TGG 0.0201 TGT 0.0158 TTA 0.00554 TTC 0.0164 TTG 0.0179 TTT 0.0143 # l= 3 # Values AAAA 0.00422 AAAC 0.00324 AAAG 0.00421 AAAT 0.00264 AACA 0.00389 AACC 0.00336 AACG 0.00319 AACT 0.00224 AAGA 0.00456 AAGC 0.00445 AAGG 0.00451 AAGT 0.00284 AATA 0.00194 AATC 0.00295 AATG 0.00351 AATT 0.00236 ACAA 0.00397 ACAC 0.00395 ACAG 0.00425 ACAT 0.0036 ACCA 0.00465 ACCC 0.00412 ACCG 0.0031 ACCT 0.00402 ACGA 0.00453 ACGC 0.00365 ACGG 0.00355 ACGT 0.00283 ACTA 0.00162 ACTC 0.00317 ACTG 0.00356 ACTT 0.00283 AGAA 0.00421 AGAC 0.00423 AGAG 0.00486 AGAT 0.00345 AGCA 0.00487 AGCC 0.0047 AGCG 0.00366 AGCT 0.00429 AGGA 0.00416 AGGC 0.005 AGGG 0.00492 AGGT 0.00402 AGTA 0.002 AGTC 0.00345 AGTG 0.00349 AGTT 0.00224 ATAA 0.00159 ATAC 0.00226 ATAG 0.00178 ATAT 0.00216 ATCA 0.00431 ATCC 0.0035 ATCG 0.00372 ATCT 0.00345 ATGA 0.00437 ATGC 0.00447 ATGG 0.00471 ATGT 0.0036 ATTA 0.0013 ATTC 0.00321 ATTG 0.00363 ATTT 0.00264 CAAA 0.00419 CAAC 0.0046 CAAG 0.00546 CAAT 0.00363 CACA 0.00452 CACC 0.00522 CACG 0.00424 CACT 0.00349 CAGA 0.00465 CAGC 0.00601 CAGG 0.00533 CAGT 0.00355 CATA 0.0022 CATC 0.00578 CATG 0.00566 CATT 0.00352 CCAA 0.00485 CCAC 0.00504 CCAG 0.00546 CCAT 0.00472 CCCA 0.00509 CCCC 0.00625 CCCG 0.00396 CCCT 0.00492 CCGA 0.00405 CCGC 0.00436 CCGG 0.00325 CCGT 0.00356 CCTA 0.00218 CCTC 0.00607 CCTG 0.00532 CCTT 0.00451 CGAA 0.004 CGAC 0.00516 CGAG 0.0054 CGAT 0.00372 CGCA 0.00395 CGCC 0.00541 CGCG 0.00395 CGCT 0.00366 CGGA 0.00333 CGGC 0.00485 CGGG 0.00396 CGGT 0.0031 CGTA 0.00205 CGTC 0.00507 CGTG 0.00424 CGTT 0.00319 CTAA 0.00132 CTAC 0.00277 CTAG 0.0021 CTAT 0.00178 CTCA 0.00432 CTCC 0.00506 CTCG 0.0054 CTCT 0.00487 CTGA 0.00417 CTGC 0.00565 CTGG 0.00545 CTGT 0.00426 CTTA 0.00147 CTTC 0.00521 CTTG 0.00547 CTTT 0.00421 GAAA 0.00445 GAAC 0.00351 GAAG 0.0052 GAAT 0.00321 GACA 0.0048 GACC 0.00435 GACG 0.00507 GACT 0.00345 GAGA 0.00553 GAGC 0.0049 GAGG 0.00606 GAGT 0.00316 GATA 0.00243 GATC 0.00382 GATG 0.00578 GATT 0.00295 GCAA 0.0047 GCAC 0.00432 GCAG 0.00565 GCAT 0.00447 GCCA 0.00592 GCCC 0.00525 GCCG 0.00485 GCCT 0.005 GCGA 0.00463 GCGC 0.00434 GCGG 0.00435 GCGT 0.00365 GCTA 0.00217 GCTC 0.0049 GCTG 0.006 GCTT 0.00444 GGAA 0.00428 GGAC 0.00369 GGAG 0.00505 GGAT 0.0035 GGCA 0.00561 GGCC 0.00532 GGCG 0.0054 GGCT 0.00469 GGGA 0.00461 GGGC 0.00525 GGGG 0.00626 GGGT 0.00411 GGTA 0.00295 GGTC 0.00435 GGTG 0.00522 GGTT 0.00336 GTAA 0.0017 GTAC 0.00286 GTAG 0.00277 GTAT 0.00225 GTCA 0.00459 GTCC 0.00369 GTCG 0.00515 GTCT 0.00422 GTGA 0.00419 GTGC 0.00431 GTGG 0.00504 GTGT 0.00394 GTTA 0.00133 GTTC 0.00351 GTTG 0.0046 GTTT 0.00324 TAAA 0.00144 TAAC 0.00132 TAAG 0.00147 TAAT 0.0013 TACA 0.00257 TACC 0.00295 TACG 0.00206 TACT 0.00199 TAGA 0.002 TAGC 0.00217 TAGG 0.00218 TAGT 0.00162 TATA 0.00122 TATC 0.00243 TATG 0.0022 TATT 0.00194 TCAA 0.00436 TCAC 0.00419 TCAG 0.00417 TCAT 0.00437 TCCA 0.00441 TCCC 0.00462 TCCG 0.00333 TCCT 0.00416 TCGA 0.00506 TCGC 0.00465 TCGG 0.00405 TCGT 0.00453 TCTA 0.002 TCTC 0.00553 TCTG 0.00465 TCTT 0.00457 TGAA 0.00387 TGAC 0.00459 TGAG 0.00432 TGAT 0.00431 TGCA 0.00471 TGCC 0.00561 TGCG 0.00394 TGCT 0.00487 TGGA 0.00442 TGGC 0.00592 TGGG 0.00509 TGGT 0.00464 TGTA 0.00257 TGTC 0.0048 TGTG 0.00452 TGTT 0.00389 TTAA 0.000918 TTAC 0.0017 TTAG 0.00132 TTAT 0.00159 TTCA 0.00388 TTCC 0.00428 TTCG 0.004 TTCT 0.00422 TTGA 0.00436 TTGC 0.00471 TTGG 0.00485 TTGT 0.00397 TTTA 0.00144 TTTC 0.00446 TTTG 0.00419 TTTT 0.00421 # l= 4 # Values AAAAA 0.00146 AAAAC 0.000879 AAAAG 0.00119 AAAAT 0.000691 AAACA 0.000997 AAACC 0.000844 AAACG 0.000824 AAACT 0.000571 AAAGA 0.00124 AAAGC 0.00107 AAAGG 0.00115 AAAGT 0.000761 AAATA 0.000551 AAATC 0.000718 AAATG 0.000808 AAATT 0.000566 AACAA 0.00111 AACAC 0.000906 AACAG 0.00103 AACAT 0.00084 AACCA 0.000987 AACCC 0.00101 AACCG 0.000609 AACCT 0.000756 AACGA 0.00102 AACGC 0.000814 AACGG 0.000726 AACGT 0.000629 AACTA 0.000328 AACTC 0.000667 AACTG 0.000692 AACTT 0.000554 AAGAA 0.00136 AAGAC 0.00111 AAGAG 0.00124 AAGAT 0.000855 AAGCA 0.00125 AAGCC 0.00118 AAGCG 0.000851 AAGCT 0.00116 AAGGA 0.00106 AAGGC 0.00123 AAGGG 0.00128 AAGGT 0.000948 AAGTA 0.00054 AAGTC 0.000901 AAGTG 0.000839 AAGTT 0.000554 AATAA 0.00044 AATAC 0.000545 AATAG 0.000439 AATAT 0.00052 AATCA 0.00092 AATCC 0.000687 AATCG 0.000728 AATCT 0.000614 AATGA 0.000905 AATGC 0.00097 AATGG 0.000995 AATGT 0.000646 AATTA 0.00034 AATTC 0.000666 AATTG 0.00079 AATTT 0.000566 ACAAA 0.000987 ACAAC 0.00102 ACAAG 0.0012 ACAAT 0.000767 ACACA 0.00119 ACACC 0.00109 ACACG 0.000905 ACACT 0.000761 ACAGA 0.00101 ACAGC 0.00131 ACAGG 0.0012 ACAGT 0.000732 ACATA 0.000531 ACATC 0.00106 ACATG 0.00136 ACATT 0.000646 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00127 ACCAG 0.00123 ACCAT 0.000973 ACCCA 0.00113 ACCCC 0.00122 ACCCG 0.000803 ACCCT 0.000955 ACCGA 0.00096 ACCGC 0.000845 ACCGG 0.000612 ACCGT 0.000686 ACCTA 0.000664 ACCTC 0.00123 ACCTG 0.00118 ACCTT 0.000948 ACGAA 0.000991 ACGAC 0.00132 ACGAG 0.00133 ACGAT 0.000885 ACGCA 0.000865 ACGCC 0.00114 ACGCG 0.000857 ACGCT 0.00078 ACGGA 0.000832 ACGGC 0.00116 ACGGG 0.00089 ACGGT 0.000686 ACGTA 0.000502 ACGTC 0.000879 ACGTG 0.000823 ACGTT 0.000629 ACTAA 0.000257 ACTAC 0.000594 ACTAG 0.000399 ACTAT 0.000367 ACTCA 0.000681 ACTCC 0.000716 ACTCG 0.00097 ACTCT 0.000797 ACTGA 0.000826 ACTGC 0.00101 ACTGG 0.000987 ACTGT 0.000732 ACTTA 0.000261 ACTTC 0.000815 ACTTG 0.001 ACTTT 0.000761 AGAAA 0.0013 AGAAC 0.000806 AGAAG 0.00137 AGAAT 0.000738 AGACA 0.00121 AGACC 0.001 AGACG 0.00124 AGACT 0.000773 AGAGA 0.00151 AGAGC 0.00114 AGAGG 0.00142 AGAGT 0.000797 AGATA 0.000625 AGATC 0.000866 AGATG 0.00134 AGATT 0.000614 AGCAA 0.00126 AGCAC 0.00115 AGCAG 0.00142 AGCAT 0.00105 AGCCA 0.00138 AGCCC 0.00118 AGCCG 0.00103 AGCCT 0.00111 AGCGA 0.00109 AGCGC 0.000884 AGCGG 0.000899 AGCGT 0.00078 AGCTA 0.000585 AGCTC 0.00126 AGCTG 0.00129 AGCTT 0.00116 AGGAA 0.00113 AGGAC 0.000877 AGGAG 0.00131 AGGAT 0.000841 AGGCA 0.00148 AGGCC 0.00117 AGGCG 0.00124 AGGCT 0.00111 AGGGA 0.00117 AGGGC 0.0012 AGGGG 0.0016 AGGGT 0.000955 AGGTA 0.00102 AGGTC 0.00104 AGGTG 0.0012 AGGTT 0.000756 AGTAA 0.000378 AGTAC 0.000543 AGTAG 0.000597 AGTAT 0.000475 AGTCA 0.000976 AGTCC 0.00071 AGTCG 0.000987 AGTCT 0.000773 AGTGA 0.000883 AGTGC 0.000821 AGTGG 0.00103 AGTGT 0.000761 AGTTA 0.000254 AGTTC 0.000575 AGTTG 0.000843 AGTTT 0.000571 ATAAA 0.000424 ATAAC 0.00039 ATAAG 0.000407 ATAAT 0.000373 ATACA 0.000647 ATACC 0.000664 ATACG 0.000465 ATACT 0.000475 ATAGA 0.000507 ATAGC 0.00053 ATAGG 0.000377 ATAGT 0.000367 ATATA 0.000354 ATATC 0.000647 ATATG 0.000637 ATATT 0.00052 ATCAA 0.00105 ATCAC 0.0011 ATCAG 0.00101 ATCAT 0.00114 ATCCA 0.000929 ATCCC 0.000981 ATCCG 0.00075 ATCCT 0.000841 ATCGA 0.00106 ATCGC 0.00101 ATCGG 0.000763 ATCGT 0.000885 ATCTA 0.000467 ATCTC 0.00112 ATCTG 0.00101 ATCTT 0.000855 ATGAA 0.000999 ATGAC 0.00111 ATGAG 0.00112 ATGAT 0.00114 ATGCA 0.00123 ATGCC 0.00123 ATGCG 0.000958 ATGCT 0.00105 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.00142 ATGGG 0.00114 ATGGT 0.000973 ATGTA 0.000646 ATGTC 0.00112 ATGTG 0.001 ATGTT 0.00084 ATTAA 0.000222 ATTAC 0.000415 ATTAG 0.00029 ATTAT 0.000373 ATTCA 0.000859 ATTCC 0.000795 ATTCG 0.000818 ATTCT 0.000738 ATTGA 0.000946 ATTGC 0.000905 ATTGG 0.00101 ATTGT 0.000767 ATTTA 0.00033 ATTTC 0.000823 ATTTG 0.000798 ATTTT 0.000691 CAAAA 0.00115 CAAAC 0.00104 CAAAG 0.00121 CAAAT 0.000798 CAACA 0.00143 CAACC 0.00122 CAACG 0.00111 CAACT 0.000843 CAAGA 0.0014 CAAGC 0.00158 CAAGG 0.00148 CAAGT 0.001 CAATA 0.000593 CAATC 0.00108 CAATG 0.00116 CAATT 0.00079 CACAA 0.00101 CACAC 0.00133 CACAG 0.00118 CACAT 0.001 CACCA 0.00166 CACCC 0.00135 CACCG 0.00101 CACCT 0.0012 CACGA 0.00125 CACGC 0.00115 CACGG 0.00102 CACGT 0.000823 CACTA 0.000481 CACTC 0.00102 CACTG 0.00115 CACTT 0.000839 CAGAA 0.00109 CAGAC 0.00125 CAGAG 0.0013 CAGAT 0.00101 CAGCA 0.00171 CAGCC 0.00175 CAGCG 0.00125 CAGCT 0.00129 CAGGA 0.00114 CAGGC 0.00163 CAGGG 0.00138 CAGGT 0.00118 CAGTA 0.000617 CAGTC 0.0011 CAGTG 0.00115 CAGTT 0.000692 CATAA 0.000403 CATAC 0.000648 CATAG 0.00051 CATAT 0.000637 CATCA 0.00172 CATCC 0.00139 CATCG 0.00133 CATCT 0.00134 CATGA 0.00139 CATGC 0.0014 CATGG 0.0015 CATGT 0.00136 CATTA 0.000402 CATTC 0.00115 CATTG 0.00116 CATTT 0.000808 CCAAA 0.00112 CCAAC 0.00126 CCAAG 0.00146 CCAAT 0.00101 CCACA 0.00114 CCACC 0.0017 CCACG 0.00118 CCACT 0.00103 CCAGA 0.00131 CCAGC 0.0017 CCAGG 0.00145 CCAGT 0.000987 CCATA 0.000562 CCATC 0.00166 CCATG 0.0015 CCATT 0.000995 CCCAA 0.00126 CCCAC 0.00131 CCCAG 0.00138 CCCAT 0.00114 CCCCA 0.00129 CCCCC 0.00226 CCCCG 0.00111 CCCCT 0.0016 CCCGA 0.000983 CCCGC 0.00125 CCCGG 0.000832 CCCGT 0.00089 CCCTA 0.000508 CCCTC 0.00175 CCCTG 0.00138 CCCTT 0.00128 CCGAA 0.00097 CCGAC 0.00119 CCGAG 0.00113 CCGAT 0.000763 CCGCA 0.000948 CCGCC 0.00158 CCGCG 0.000931 CCGCT 0.000899 CCGGA 0.00069 CCGGC 0.00112 CCGGG 0.000832 CCGGT 0.000612 CCGTA 0.000487 CCGTC 0.00132 CCGTG 0.00102 CCGTT 0.000726 CCTAA 0.000378 CCTAC 0.000791 CCTAG 0.000634 CCTAT 0.000377 CCTCA 0.00127 CCTCC 0.00175 CCTCG 0.00161 CCTCT 0.00142 CCTGA 0.00112 CCTGC 0.00155 CCTGG 0.00145 CCTGT 0.0012 CCTTA 0.000426 CCTTC 0.00145 CCTTG 0.00148 CCTTT 0.00115 CGAAA 0.0011 CGAAC 0.000912 CGAAG 0.00117 CGAAT 0.000818 CGACA 0.00143 CGACC 0.0013 CGACG 0.00144 CGACT 0.000987 CGAGA 0.00144 CGAGC 0.00138 CGAGG 0.00161 CGAGT 0.00097 CGATA 0.000647 CGATC 0.00101 CGATG 0.00133 CGATT 0.000728 CGCAA 0.00104 CGCAC 0.000924 CGCAG 0.00102 CGCAT 0.000958 CGCCA 0.00148 CGCCC 0.0014 CGCCG 0.00128 CGCCT 0.00124 CGCGA 0.00105 CGCGC 0.00111 CGCGG 0.000931 CGCGT 0.000857 CGCTA 0.00045 CGCTC 0.0011 CGCTG 0.00125 CGCTT 0.000851 CGGAA 0.000824 CGGAC 0.00083 CGGAG 0.000929 CGGAT 0.00075 CGGCA 0.00125 CGGCC 0.00129 CGGCG 0.00128 CGGCT 0.00103 CGGGA 0.000937 CGGGC 0.00112 CGGGG 0.00111 CGGGT 0.000803 CGGTA 0.000525 CGGTC 0.000955 CGGTG 0.00101 CGGTT 0.000609 CGTAA 0.00036 CGTAC 0.000611 CGTAG 0.00062 CGTAT 0.000465 CGTCA 0.00132 CGTCC 0.00108 CGTCG 0.00144 CGTCT 0.00124 CGTGA 0.00106 CGTGC 0.0011 CGTGG 0.00118 CGTGT 0.000905 CGTTA 0.000339 CGTTC 0.000917 CGTTG 0.00111 CGTTT 0.000824 CTAAA 0.000346 CTAAC 0.000328 CTAAG 0.000357 CTAAT 0.00029 CTACA 0.000658 CTACC 0.00089 CTACG 0.00062 CTACT 0.000597 CTAGA 0.000496 CTAGC 0.000571 CTAGG 0.000634 CTAGT 0.000399 CTATA 0.00025 CTATC 0.000581 CTATG 0.00051 CTATT 0.000439 CTCAA 0.00105 CTCAC 0.0011 CTCAG 0.00104 CTCAT 0.00112 CTCCA 0.00133 CTCCC 0.00148 CTCCG 0.000929 CTCCT 0.00131 CTCGA 0.00153 CTCGC 0.00141 CTCGG 0.00113 CTCGT 0.00133 CTCTA 0.000526 CTCTC 0.00179 CTCTG 0.0013 CTCTT 0.00124 CTGAA 0.000956 CTGAC 0.00116 CTGAG 0.00104 CTGAT 0.00101 CTGCA 0.00139 CTGCC 0.00182 CTGCG 0.00102 CTGCT 0.00142 CTGGA 0.00117 CTGGC 0.00167 CTGGG 0.00138 CTGGT 0.00123 CTGTA 0.000643 CTGTC 0.0014 CTGTG 0.00118 CTGTT 0.00103 CTTAA 0.000236 CTTAC 0.000467 CTTAG 0.000357 CTTAT 0.000407 CTTCA 0.00119 CTTCC 0.00147 CTTCG 0.00117 CTTCT 0.00137 CTTGA 0.00133 CTTGC 0.00148 CTTGG 0.00146 CTTGT 0.0012 CTTTA 0.000362 CTTTC 0.00145 CTTTG 0.00121 CTTTT 0.00119 GAAAA 0.00121 GAAAC 0.000968 GAAAG 0.00145 GAAAT 0.000823 GAACA 0.00106 GAACC 0.000959 GAACG 0.000917 GAACT 0.000575 GAAGA 0.00153 GAAGC 0.0014 GAAGG 0.00145 GAAGT 0.000815 GAATA 0.000572 GAATC 0.000823 GAATG 0.00115 GAATT 0.000666 GACAA 0.0012 GACAC 0.00108 GACAG 0.0014 GACAT 0.00112 GACCA 0.00126 GACCC 0.00109 GACCG 0.000955 GACCT 0.00104 GACGA 0.00168 GACGC 0.00119 GACGG 0.00132 GACGT 0.000879 GACTA 0.000506 GACTC 0.000946 GACTG 0.0011 GACTT 0.000901 GAGAA 0.00132 GAGAC 0.00129 GAGAG 0.00179 GAGAT 0.00112 GAGCA 0.00133 GAGCC 0.00121 GAGCG 0.0011 GAGCT 0.00126 GAGGA 0.0015 GAGGC 0.00158 GAGGG 0.00175 GAGGT 0.00123 GAGTA 0.000532 GAGTC 0.000946 GAGTG 0.00102 GAGTT 0.000667 GATAA 0.000487 GATAC 0.000712 GATAG 0.000581 GATAT 0.000647 GATCA 0.00104 GATCC 0.000904 GATCG 0.00101 GATCT 0.000866 GATGA 0.00155 GATGC 0.00152 GATGG 0.00166 GATGT 0.00106 GATTA 0.000326 GATTC 0.000823 GATTG 0.00108 GATTT 0.000718 GCAAA 0.00113 GCAAC 0.00119 GCAAG 0.00148 GCAAT 0.000905 GCACA 0.00115 GCACC 0.00124 GCACG 0.0011 GCACT 0.000821 GCAGA 0.00135 GCAGC 0.00174 GCAGG 0.00155 GCAGT 0.00101 GCATA 0.000572 GCATC 0.00152 GCATG 0.0014 GCATT 0.00097 GCCAA 0.00147 GCCAC 0.00136 GCCAG 0.00167 GCCAT 0.00142 GCCCA 0.00146 GCCCC 0.00148 GCCCG 0.00112 GCCCT 0.0012 GCCGA 0.00122 GCCGC 0.00135 GCCGG 0.00112 GCCGT 0.00116 GCCTA 0.000556 GCCTC 0.00158 GCCTG 0.00163 GCCTT 0.00123 GCGAA 0.000998 GCGAC 0.00123 GCGAG 0.00141 GCGAT 0.00101 GCGCA 0.00105 GCGCC 0.00129 GCGCG 0.00111 GCGCT 0.000884 GCGGA 0.000916 GCGGC 0.00135 GCGGG 0.00125 GCGGT 0.000845 GCGTA 0.000489 GCGTC 0.00119 GCGTG 0.00115 GCGTT 0.000814 GCTAA 0.000377 GCTAC 0.000694 GCTAG 0.000571 GCTAT 0.00053 GCTCA 0.00118 GCTCC 0.0012 GCTCG 0.00138 GCTCT 0.00114 GCTGA 0.00126 GCTGC 0.00174 GCTGG 0.0017 GCTGT 0.00131 GCTTA 0.000395 GCTTC 0.0014 GCTTG 0.00158 GCTTT 0.00107 GGAAA 0.00117 GGAAC 0.000852 GGAAG 0.00147 GGAAT 0.000795 GGACA 0.00101 GGACC 0.000897 GGACG 0.00108 GGACT 0.00071 GGAGA 0.00139 GGAGC 0.0012 GGAGG 0.00175 GGAGT 0.000716 GGATA 0.00052 GGATC 0.000904 GGATG 0.00139 GGATT 0.000687 GGCAA 0.00136 GGCAC 0.00121 GGCAG 0.00182 GGCAT 0.00123 GGCCA 0.00157 GGCCC 0.00129 GGCCG 0.00129 GGCCT 0.00117 GGCGA 0.0014 GGCGC 0.00129 GGCGG 0.00158 GGCGT 0.00114 GGCTA 0.000553 GGCTC 0.00121 GGCTG 0.00175 GGCTT 0.00118 GGGAA 0.00121 GGGAC 0.000947 GGGAG 0.00148 GGGAT 0.000981 GGGCA 0.00138 GGGCC 0.00129 GGGCG 0.0014 GGGCT 0.00118 GGGGA 0.0013 GGGGC 0.00148 GGGGG 0.00226 GGGGT 0.00122 GGGTA 0.000666 GGGTC 0.00109 GGGTG 0.00135 GGGTT 0.00101 GGTAA 0.000505 GGTAC 0.000893 GGTAG 0.00089 GGTAT 0.000664 GGTCA 0.00115 GGTCC 0.000897 GGTCG 0.0013 GGTCT 0.001 GGTGA 0.0012 GGTGC 0.00124 GGTGG 0.0017 GGTGT 0.00109 GGTTA 0.000338 GGTTC 0.000959 GGTTG 0.00122 GGTTT 0.000844 GTAAA 0.000418 GTAAC 0.000403 GTAAG 0.000467 GTAAT 0.000415 GTACA 0.00081 GTACC 0.000893 GTACG 0.000611 GTACT 0.000543 GTAGA 0.000689 GTAGC 0.000694 GTAGG 0.000791 GTAGT 0.000594 GTATA 0.000355 GTATC 0.000712 GTATG 0.000648 GTATT 0.000545 GTCAA 0.00126 GTCAC 0.00106 GTCAG 0.00116 GTCAT 0.00111 GTCCA 0.00104 GTCCC 0.000947 GTCCG 0.00083 GTCCT 0.000877 GTCGA 0.00141 GTCGC 0.00123 GTCGG 0.00119 GTCGT 0.00132 GTCTA 0.000572 GTCTC 0.00129 GTCTG 0.00125 GTCTT 0.00111 GTGAA 0.00092 GTGAC 0.00106 GTGAG 0.0011 GTGAT 0.0011 GTGCA 0.00104 GTGCC 0.00121 GTGCG 0.000924 GTGCT 0.00115 GTGGA 0.00111 GTGGC 0.00136 GTGGG 0.00131 GTGGT 0.00127 GTGTA 0.000631 GTGTC 0.00108 GTGTG 0.00133 GTGTT 0.000906 GTTAA 0.000203 GTTAC 0.000403 GTTAG 0.000328 GTTAT 0.00039 GTTCA 0.000943 GTTCC 0.000852 GTTCG 0.000912 GTTCT 0.000806 GTTGA 0.00114 GTTGC 0.00119 GTTGG 0.00126 GTTGT 0.00102 GTTTA 0.000352 GTTTC 0.000968 GTTTG 0.00104 GTTTT 0.000879 TAAAA 0.0004 TAAAC 0.000352 TAAAG 0.000362 TAAAT 0.00033 TAACA 0.000393 TAACC 0.000338 TAACG 0.000339 TAACT 0.000254 TAAGA 0.000387 TAAGC 0.000395 TAAGG 0.000426 TAAGT 0.000261 TAATA 0.000228 TAATC 0.000326 TAATG 0.000402 TAATT 0.00034 TACAA 0.00065 TACAC 0.000631 TACAG 0.000643 TACAT 0.000646 TACCA 0.00074 TACCC 0.000666 TACCG 0.000525 TACCT 0.00102 TACGA 0.000575 TACGC 0.000489 TACGG 0.000487 TACGT 0.000502 TACTA 0.000307 TACTC 0.000532 TACTG 0.000617 TACTT 0.00054 TAGAA 0.000437 TAGAC 0.000572 TAGAG 0.000526 TAGAT 0.000467 TAGCA 0.000586 TAGCC 0.000553 TAGCG 0.00045 TAGCT 0.000585 TAGGA 0.000456 TAGGC 0.000556 TAGGG 0.000508 TAGGT 0.000664 TAGTA 0.000307 TAGTC 0.000506 TAGTG 0.000481 TAGTT 0.000328 TATAA 0.000264 TATAC 0.000355 TATAG 0.00025 TATAT 0.000354 TATCA 0.000633 TATCC 0.00052 TATCG 0.000647 TATCT 0.000625 TATGA 0.000533 TATGC 0.000572 TATGG 0.000562 TATGT 0.000531 TATTA 0.000228 TATTC 0.000572 TATTG 0.000593 TATTT 0.000551 TCAAA 0.000948 TCAAC 0.00114 TCAAG 0.00133 TCAAT 0.000946 TCACA 0.00105 TCACC 0.0012 TCACG 0.00106 TCACT 0.000883 TCAGA 0.000963 TCAGC 0.00126 TCAGG 0.00112 TCAGT 0.000826 TCATA 0.000533 TCATC 0.00155 TCATG 0.00139 TCATT 0.000905 TCCAA 0.00095 TCCAC 0.00111 TCCAG 0.00117 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.00121 TCCCC 0.0013 TCCCG 0.000937 TCCCT 0.00117 TCCGA 0.000889 TCCGC 0.000916 TCCGG 0.00069 TCCGT 0.000832 TCCTA 0.000456 TCCTC 0.0015 TCCTG 0.00114 TCCTT 0.00106 TCGAA 0.00104 TCGAC 0.00141 TCGAG 0.00153 TCGAT 0.00106 TCGCA 0.00108 TCGCC 0.0014 TCGCG 0.00105 TCGCT 0.00109 TCGGA 0.000889 TCGGC 0.00122 TCGGG 0.000983 TCGGT 0.00096 TCGTA 0.000575 TCGTC 0.00168 TCGTG 0.00125 TCGTT 0.00102 TCTAA 0.000311 TCTAC 0.000689 TCTAG 0.000496 TCTAT 0.000507 TCTCA 0.00118 TCTCC 0.00139 TCTCG 0.00144 TCTCT 0.00151 TCTGA 0.000963 TCTGC 0.00135 TCTGG 0.00131 TCTGT 0.00101 TCTTA 0.000387 TCTTC 0.00153 TCTTG 0.0014 TCTTT 0.00124 TGAAA 0.000881 TGAAC 0.000943 TGAAG 0.00119 TGAAT 0.000859 TGACA 0.00115 TGACC 0.00115 TGACG 0.00132 TGACT 0.000976 TGAGA 0.00118 TGAGC 0.00118 TGAGG 0.00127 TGAGT 0.000681 TGATA 0.000633 TGATC 0.00104 TGATG 0.00172 TGATT 0.00092 TGCAA 0.00105 TGCAC 0.00104 TGCAG 0.00139 TGCAT 0.00123 TGCCA 0.0015 TGCCC 0.00138 TGCCG 0.00125 TGCCT 0.00148 TGCGA 0.00108 TGCGC 0.00105 TGCGG 0.000948 TGCGT 0.000865 TGCTA 0.000586 TGCTC 0.00133 TGCTG 0.00171 TGCTT 0.00125 TGGAA 0.00112 TGGAC 0.00104 TGGAG 0.00133 TGGAT 0.000929 TGGCA 0.0015 TGGCC 0.00157 TGGCG 0.00148 TGGCT 0.00138 TGGGA 0.00121 TGGGC 0.00146 TGGGG 0.00129 TGGGT 0.00113 TGGTA 0.00074 TGGTC 0.00126 TGGTG 0.00166 TGGTT 0.000987 TGTAA 0.000458 TGTAC 0.00081 TGTAG 0.000658 TGTAT 0.000647 TGTCA 0.00115 TGTCC 0.00101 TGTCG 0.00143 TGTCT 0.00121 TGTGA 0.00105 TGTGC 0.00115 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.00119 TGTTA 0.000393 TGTTC 0.00106 TGTTG 0.00143 TGTTT 0.000997 TTAAA 0.000256 TTAAC 0.000203 TTAAG 0.000236 TTAAT 0.000222 TTACA 0.000458 TTACC 0.000505 TTACG 0.00036 TTACT 0.000378 TTAGA 0.000311 TTAGC 0.000377 TTAGG 0.000378 TTAGT 0.000257 TTATA 0.000264 TTATC 0.000487 TTATG 0.000403 TTATT 0.00044 TTCAA 0.001 TTCAC 0.00092 TTCAG 0.000956 TTCAT 0.000999 TTCCA 0.00112 TTCCC 0.00121 TTCCG 0.000824 TTCCT 0.00113 TTCGA 0.00104 TTCGC 0.000998 TTCGG 0.00097 TTCGT 0.000991 TTCTA 0.000437 TTCTC 0.00132 TTCTG 0.00109 TTCTT 0.00136 TTGAA 0.001 TTGAC 0.00126 TTGAG 0.00105 TTGAT 0.00105 TTGCA 0.00105 TTGCC 0.00136 TTGCG 0.00104 TTGCT 0.00126 TTGGA 0.00095 TTGGC 0.00147 TTGGG 0.00126 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.00065 TTGTC 0.0012 TTGTG 0.00101 TTGTT 0.00111 TTTAA 0.000256 TTTAC 0.000418 TTTAG 0.000346 TTTAT 0.000424 TTTCA 0.000881 TTTCC 0.00117 TTTCG 0.0011 TTTCT 0.0013 TTTGA 0.000948 TTTGC 0.00113 TTTGG 0.00112 TTTGT 0.000987 TTTTA 0.0004 TTTTC 0.00121 TTTTG 0.00115 TTTTT 0.00146 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3272 AAAAC 0.2081 AAAAG 0.2909 AAAAT 0.1738 AAACA 0.3117 AAACC 0.258 AAACG 0.2453 AAACT 0.185 AAAGA 0.2928 AAAGC 0.2632 AAAGG 0.2628 AAAGT 0.1812 AAATA 0.216 AAATC 0.2627 AAATG 0.2994 AAATT 0.2219 AACAA 0.2845 AACAC 0.2351 AACAG 0.2527 AACAT 0.2276 AACCA 0.2959 AACCC 0.29 AACCG 0.1808 AACCT 0.2332 AACGA 0.3201 AACGC 0.2561 AACGG 0.2225 AACGT 0.2014 AACTA 0.1535 AACTC 0.2968 AACTG 0.2936 AACTT 0.2561 AAGAA 0.3004 AAGAC 0.2469 AAGAG 0.2588 AAGAT 0.194 AAGCA 0.281 AAGCC 0.2624 AAGCG 0.1894 AAGCT 0.2673 AAGGA 0.2346 AAGGC 0.2653 AAGGG 0.2752 AAGGT 0.2249 AAGTA 0.197 AAGTC 0.3096 AAGTG 0.2892 AAGTT 0.2042 AATAA 0.2275 AATAC 0.2704 AATAG 0.2262 AATAT 0.276 AATCA 0.3156 AATCC 0.2281 AATCG 0.2395 AATCT 0.2168 AATGA 0.2593 AATGC 0.2706 AATGG 0.276 AATGT 0.1941 AATTA 0.1556 AATTC 0.268 AATTG 0.3372 AATTT 0.2391 ACAAA 0.2452 ACAAC 0.257 ACAAG 0.2923 ACAAT 0.2054 ACACA 0.2989 ACACC 0.2756 ACACG 0.2303 ACACT 0.1952 ACAGA 0.239 ACAGC 0.3016 ACAGG 0.279 ACAGT 0.1805 ACATA 0.1525 ACATC 0.2854 ACATG 0.3735 ACATT 0.1886 ACCAA 0.2517 ACCAC 0.2675 ACCAG 0.2647 ACCAT 0.2161 ACCCA 0.2821 ACCCC 0.2912 ACCCG 0.1943 ACCCT 0.2324 ACCGA 0.3173 ACCGC 0.2655 ACCGG 0.1986 ACCGT 0.2186 ACCTA 0.1677 ACCTC 0.2981 ACCTG 0.2883 ACCTT 0.246 ACGAA 0.2275 ACGAC 0.2832 ACGAG 0.2858 ACGAT 0.2036 ACGCA 0.2451 ACGCC 0.3038 ACGCG 0.2284 ACGCT 0.2227 ACGGA 0.2458 ACGGC 0.3146 ACGGG 0.2422 ACGGT 0.1974 ACGTA 0.1874 ACGTC 0.3076 ACGTG 0.2848 ACGTT 0.2202 ACTAA 0.1661 ACTAC 0.3652 ACTAG 0.2352 ACTAT 0.2335 ACTCA 0.2286 ACTCC 0.2253 ACTCG 0.2951 ACTCT 0.251 ACTGA 0.2341 ACTGC 0.2755 ACTGG 0.2766 ACTGT 0.2138 ACTTA 0.09824 ACTTC 0.289 ACTTG 0.3552 ACTTT 0.2576 AGAAA 0.3022 AGAAC 0.1944 AGAAG 0.3144 AGAAT 0.189 AGACA 0.2846 AGACC 0.2338 AGACG 0.2857 AGACT 0.1958 AGAGA 0.3127 AGAGC 0.2331 AGAGG 0.2821 AGAGT 0.1721 AGATA 0.1872 AGATC 0.2499 AGATG 0.376 AGATT 0.1869 AGCAA 0.2641 AGCAC 0.2312 AGCAG 0.2774 AGCAT 0.2273 AGCCA 0.293 AGCCC 0.2492 AGCCG 0.2155 AGCCT 0.2423 AGCGA 0.296 AGCGC 0.2393 AGCGG 0.2412 AGCGT 0.2234 AGCTA 0.1406 AGCTC 0.2851 AGCTG 0.2954 AGCTT 0.2789 AGGAA 0.2689 AGGAC 0.2176 AGGAG 0.3008 AGGAT 0.2128 AGGCA 0.2905 AGGCC 0.2365 AGGCG 0.2419 AGGCT 0.2311 AGGGA 0.2415 AGGGC 0.2457 AGGGG 0.3126 AGGGT 0.2002 AGGTA 0.255 AGGTC 0.2546 AGGTG 0.2948 AGGTT 0.1957 AGTAA 0.195 AGTAC 0.2608 AGTAG 0.2967 AGTAT 0.2474 AGTCA 0.2799 AGTCC 0.2077 AGTCG 0.2761 AGTCT 0.2363 AGTGA 0.2619 AGTGC 0.2338 AGTGG 0.2831 AGTGT 0.2212 AGTTA 0.1266 AGTTC 0.2586 AGTTG 0.3634 AGTTT 0.2515 ATAAA 0.2625 ATAAC 0.243 ATAAG 0.2493 ATAAT 0.2451 ATACA 0.292 ATACC 0.2799 ATACG 0.2121 ATACT 0.216 ATAGA 0.2859 ATAGC 0.2874 ATAGG 0.2133 ATAGT 0.2133 ATATA 0.1736 ATATC 0.2986 ATATG 0.2759 ATATT 0.252 ATCAA 0.259 ATCAC 0.255 ATCAG 0.2196 ATCAT 0.2664 ATCCA 0.2652 ATCCC 0.2723 ATCCG 0.2193 ATCCT 0.2432 ATCGA 0.2947 ATCGC 0.2628 ATCGG 0.2028 ATCGT 0.2398 ATCTA 0.141 ATCTC 0.3196 ATCTG 0.2883 ATCTT 0.2511 ATGAA 0.2302 ATGAC 0.2419 ATGAG 0.2631 ATGAT 0.2648 ATGCA 0.2779 ATGCC 0.2682 ATGCG 0.2102 ATGCT 0.2437 ATGGA 0.251 ATGGC 0.2924 ATGGG 0.2401 ATGGT 0.2165 ATGTA 0.192 ATGTC 0.3038 ATGTG 0.2675 ATGTT 0.2367 ATTAA 0.1875 ATTAC 0.3106 ATTAG 0.2135 ATTAT 0.2884 ATTCA 0.2743 ATTCC 0.2344 ATTCG 0.2532 ATTCT 0.2381 ATTGA 0.2685 ATTGC 0.2495 ATTGG 0.2668 ATTGT 0.2152 ATTTA 0.1375 ATTTC 0.3077 ATTTG 0.2991 ATTTT 0.2557 CAAAA 0.2698 CAAAC 0.2474 CAAAG 0.2849 CAAAT 0.1979 CAACA 0.3114 CAACC 0.2655 CAACG 0.2317 CAACT 0.1914 CAAGA 0.2597 CAAGC 0.2811 CAAGG 0.2635 CAAGT 0.1957 CAATA 0.1752 CAATC 0.2859 CAATG 0.3085 CAATT 0.2303 CACAA 0.2295 CACAC 0.2874 CACAG 0.2579 CACAT 0.2251 CACCA 0.3187 CACCC 0.2495 CACCG 0.1953 CACCT 0.2365 CACGA 0.296 CACGC 0.2658 CACGG 0.2415 CACGT 0.1967 CACTA 0.144 CACTC 0.2845 CACTG 0.3208 CACTT 0.2507 CAGAA 0.2369 CAGAC 0.2668 CAGAG 0.2678 CAGAT 0.2285 CAGCA 0.2827 CAGCC 0.2875 CAGCG 0.2094 CAGCT 0.2204 CAGGA 0.2121 CAGGC 0.3021 CAGGG 0.257 CAGGT 0.2288 CAGTA 0.183 CAGTC 0.304 CAGTG 0.3142 CAGTT 0.1988 CATAA 0.1947 CATAC 0.2999 CATAG 0.2228 CATAT 0.2826 CATCA 0.3043 CATCC 0.2325 CATCG 0.2283 CATCT 0.2349 CATGA 0.2536 CATGC 0.2484 CATGG 0.2464 CATGT 0.2516 CATTA 0.127 CATTC 0.3173 CATTG 0.3242 CATTT 0.2315 CCAAA 0.2364 CCAAC 0.2487 CCAAG 0.3007 CCAAT 0.2141 CCACA 0.2314 CCACC 0.3299 CCACG 0.2349 CCACT 0.2037 CCAGA 0.239 CCAGC 0.3122 CCAGG 0.2608 CCAGT 0.188 CCATA 0.1243 CCATC 0.3487 CCATG 0.304 CCATT 0.223 CCCAA 0.2561 CCCAC 0.2561 CCCAG 0.2633 CCCAT 0.2244 CCCCA 0.2189 CCCCC 0.3503 CCCCG 0.1777 CCCCT 0.2531 CCCGA 0.2586 CCCGC 0.3117 CCCGG 0.208 CCCGT 0.2217 CCCTA 0.1059 CCCTC 0.3384 CCCTG 0.2881 CCCTT 0.2677 CCGAA 0.2471 CCGAC 0.2848 CCGAG 0.2778 CCGAT 0.1903 CCGCA 0.231 CCGCC 0.3497 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.2099 CCGGA 0.2222 CCGGC 0.3339 CCGGG 0.2481 CCGGT 0.1958 CCGTA 0.1434 CCGTC 0.3553 CCGTG 0.2956 CCGTT 0.2057 CCTAA 0.1831 CCTAC 0.3516 CCTAG 0.277 CCTAT 0.1883 CCTCA 0.2253 CCTCC 0.2797 CCTCG 0.2642 CCTCT 0.2309 CCTGA 0.2179 CCTGC 0.2869 CCTGG 0.2661 CCTGT 0.2292 CCTTA 0.1028 CCTTC 0.3158 CCTTG 0.3263 CCTTT 0.255 CGAAA 0.2738 CGAAC 0.2159 CGAAG 0.297 CGAAT 0.2133 CGACA 0.2815 CGACC 0.2528 CGACG 0.2707 CGACT 0.195 CGAGA 0.2696 CGAGC 0.2587 CGAGG 0.2899 CGAGT 0.1817 CGATA 0.1796 CGATC 0.2702 CGATG 0.3515 CGATT 0.1987 CGCAA 0.2717 CGCAC 0.2295 CGCAG 0.2544 CGCAT 0.2444 CGCCA 0.2777 CGCCC 0.2539 CGCCG 0.2357 CGCCT 0.2327 CGCGA 0.2722 CGCGC 0.2779 CGCGG 0.2305 CGCGT 0.2194 CGCTA 0.1264 CGCTC 0.2873 CGCTG 0.344 CGCTT 0.2422 CGGAA 0.2461 CGGAC 0.245 CGGAG 0.2741 CGGAT 0.2348 CGGCA 0.26 CGGCC 0.2617 CGGCG 0.26 CGGCT 0.2182 CGGGA 0.2409 CGGGC 0.279 CGGGG 0.2723 CGGGT 0.2077 CGGTA 0.1759 CGGTC 0.2962 CGGTG 0.3252 CGGTT 0.2028 CGTAA 0.1884 CGTAC 0.2862 CGTAG 0.2799 CGTAT 0.2454 CGTCA 0.2607 CGTCC 0.2122 CGTCG 0.2774 CGTCT 0.2496 CGTGA 0.25 CGTGC 0.2518 CGTGG 0.2768 CGTGT 0.2213 CGTTA 0.1148 CGTTC 0.2847 CGTTG 0.3416 CGTTT 0.259 CTAAA 0.2532 CTAAC 0.2565 CTAAG 0.2668 CTAAT 0.2235 CTACA 0.2516 CTACC 0.3097 CTACG 0.2119 CTACT 0.2268 CTAGA 0.2382 CTAGC 0.274 CTAGG 0.2896 CTAGT 0.1983 CTATA 0.1546 CTATC 0.3076 CTATG 0.2758 CTATT 0.2619 CTCAA 0.2502 CTCAC 0.2417 CTCAG 0.2361 CTCAT 0.272 CTCCA 0.272 CTCCC 0.2854 CTCCG 0.1889 CTCCT 0.2537 CTCGA 0.2879 CTCGC 0.2547 CTCGG 0.214 CTCGT 0.2434 CTCTA 0.1174 CTCTC 0.3607 CTCTG 0.2621 CTCTT 0.2598 CTGAA 0.2472 CTGAC 0.2675 CTGAG 0.2481 CTGAT 0.2372 CTGCA 0.2541 CTGCC 0.3102 CTGCG 0.1847 CTGCT 0.2511 CTGGA 0.22 CTGGC 0.2994 CTGGG 0.2476 CTGGT 0.2331 CTGTA 0.1609 CTGTC 0.3216 CTGTG 0.2786 CTGTT 0.2389 CTTAA 0.1682 CTTAC 0.3091 CTTAG 0.2431 CTTAT 0.2796 CTTCA 0.2431 CTTCC 0.2675 CTTCG 0.2306 CTTCT 0.2589 CTTGA 0.2567 CTTGC 0.2596 CTTGG 0.2662 CTTGT 0.2176 CTTTA 0.09675 CTTTC 0.3308 CTTTG 0.2871 CTTTT 0.2853 GAAAA 0.273 GAAAC 0.2118 GAAAG 0.318 GAAAT 0.1972 GAACA 0.3047 GAACC 0.2675 GAACG 0.2508 GAACT 0.1769 GAAGA 0.294 GAAGC 0.2665 GAAGG 0.2705 GAAGT 0.1689 GAATA 0.1908 GAATC 0.2485 GAATG 0.3491 GAATT 0.2116 GACAA 0.249 GACAC 0.2237 GACAG 0.2837 GACAT 0.2436 GACCA 0.2917 GACCC 0.2469 GACCG 0.2147 GACCT 0.2467 GACGA 0.3258 GACGC 0.2422 GACGG 0.2495 GACGT 0.1826 GACTA 0.155 GACTC 0.2628 GACTG 0.3122 GACTT 0.27 GAGAA 0.2451 GAGAC 0.232 GAGAG 0.3099 GAGAT 0.2129 GAGCA 0.2788 GAGCC 0.2458 GAGCG 0.2145 GAGCT 0.2609 GAGGA 0.2506 GAGGC 0.2617 GAGGG 0.2734 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.1745 GAGTC 0.2873 GAGTG 0.3127 GAGTT 0.2255 GATAA 0.2042 GATAC 0.2868 GATAG 0.2282 GATAT 0.2809 GATCA 0.2814 GATCC 0.2333 GATCG 0.2569 GATCT 0.2285 GATGA 0.2663 GATGC 0.2643 GATGG 0.2794 GATGT 0.1901 GATTA 0.124 GATTC 0.2713 GATTG 0.3608 GATTT 0.2439 GCAAA 0.2486 GCAAC 0.2464 GCAAG 0.3001 GCAAT 0.205 GCACA 0.2767 GCACC 0.2812 GCACG 0.2474 GCACT 0.1947 GCAGA 0.2378 GCAGC 0.3064 GCAGG 0.2735 GCAGT 0.1822 GCATA 0.1326 GCATC 0.3347 GCATG 0.3109 GCATT 0.2218 GCCAA 0.2593 GCCAC 0.2266 GCCAG 0.2766 GCCAT 0.2375 GCCCA 0.2832 GCCCC 0.2762 GCCCG 0.2105 GCCCT 0.23 GCCGA 0.2646 GCCGC 0.2695 GCCGG 0.2297 GCCGT 0.2362 GCCTA 0.1176 GCCTC 0.3104 GCCTG 0.3246 GCCTT 0.2474 GCGAA 0.2194 GCGAC 0.2642 GCGAG 0.2957 GCGAT 0.2207 GCGCA 0.2565 GCGCC 0.2861 GCGCG 0.2506 GCGCT 0.2068 GCGGA 0.2186 GCGGC 0.2986 GCGGG 0.2834 GCGGT 0.1994 GCGTA 0.1389 GCGTC 0.3274 GCGTG 0.3089 GCGTT 0.2248 GCTAA 0.1857 GCTAC 0.3172 GCTAG 0.2525 GCTAT 0.2445 GCTCA 0.2505 GCTCC 0.2386 GCTCG 0.2823 GCTCT 0.2285 GCTGA 0.2151 GCTGC 0.2842 GCTGG 0.2817 GCTGT 0.219 GCTTA 0.09894 GCTTC 0.3065 GCTTG 0.343 GCTTT 0.2516 GGAAA 0.27 GGAAC 0.2055 GGAAG 0.3335 GGAAT 0.191 GGACA 0.2838 GGACC 0.235 GGACG 0.2817 GGACT 0.1996 GGAGA 0.2796 GGAGC 0.2371 GGAGG 0.3329 GGAGT 0.1504 GGATA 0.1563 GGATC 0.2613 GGATG 0.3809 GGATT 0.2015 GGCAA 0.2422 GGCAC 0.2185 GGCAG 0.3117 GGCAT 0.2276 GGCCA 0.2961 GGCCC 0.2392 GGCCG 0.2373 GGCCT 0.2275 GGCGA 0.2647 GGCGC 0.2346 GGCGG 0.2848 GGCGT 0.2159 GGCTA 0.1218 GGCTC 0.2542 GGCTG 0.3647 GGCTT 0.2592 GGGAA 0.2696 GGGAC 0.2015 GGGAG 0.3104 GGGAT 0.2185 GGGCA 0.2676 GGGCC 0.2427 GGGCG 0.2577 GGGCT 0.232 GGGGA 0.2077 GGGGC 0.2389 GGGGG 0.3503 GGGGT 0.2031 GGGTA 0.1672 GGGTC 0.2623 GGGTG 0.32 GGGTT 0.2505 GGTAA 0.188 GGTAC 0.2941 GGTAG 0.2891 GGTAT 0.2288 GGTCA 0.2708 GGTCC 0.2015 GGTCG 0.2951 GGTCT 0.2326 GGTGA 0.238 GGTGC 0.2321 GGTGG 0.3152 GGTGT 0.2147 GGTTA 0.1188 GGTTC 0.2766 GGTTG 0.3566 GGTTT 0.2481 GTAAA 0.2522 GTAAC 0.2353 GTAAG 0.2617 GTAAT 0.2507 GTACA 0.2943 GTACC 0.3042 GTACG 0.2091 GTACT 0.1924 GTAGA 0.247 GTAGC 0.2542 GTAGG 0.2714 GTAGT 0.2274 GTATA 0.167 GTATC 0.3007 GTATG 0.2887 GTATT 0.2435 GTCAA 0.2801 GTCAC 0.2314 GTCAG 0.2463 GTCAT 0.2421 GTCCA 0.2919 GTCCC 0.2441 GTCCG 0.2224 GTCCT 0.2417 GTCGA 0.2775 GTCGC 0.2389 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2532 GTCTA 0.1381 GTCTC 0.2989 GTCTG 0.2888 GTCTT 0.2743 GTGAA 0.2299 GTGAC 0.2479 GTGAG 0.2506 GTGAT 0.2717 GTGCA 0.2396 GTGCC 0.2786 GTGCG 0.2135 GTGCT 0.2682 GTGGA 0.222 GTGGC 0.2644 GTGGG 0.2597 GTGGT 0.254 GTGTA 0.1659 GTGTC 0.269 GTGTG 0.3294 GTGTT 0.2357 GTTAA 0.1673 GTTAC 0.2951 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.2895 GTTCA 0.277 GTTCC 0.242 GTTCG 0.246 GTTCT 0.235 GTTGA 0.2508 GTTGC 0.2556 GTTGG 0.2641 GTTGT 0.2295 GTTTA 0.1172 GTTTC 0.2888 GTTTG 0.3267 GTTTT 0.2674 TAAAA 0.272 TAAAC 0.2344 TAAAG 0.2535 TAAAT 0.2402 TAACA 0.2965 TAACC 0.2671 TAACG 0.2351 TAACT 0.2013 TAAGA 0.2568 TAAGC 0.2762 TAAGG 0.2827 TAAGT 0.1844 TAATA 0.1739 TAATC 0.2494 TAATG 0.3069 TAATT 0.2698 TACAA 0.2589 TACAC 0.2357 TACAG 0.2425 TACAT 0.2629 TACCA 0.2548 TACCC 0.2205 TACCG 0.1786 TACCT 0.3461 TACGA 0.2887 TACGC 0.2322 TACGG 0.2277 TACGT 0.2515 TACTA 0.1602 TACTC 0.2582 TACTG 0.3039 TACTT 0.2777 TAGAA 0.2269 TAGAC 0.2745 TAGAG 0.2582 TAGAT 0.2405 TAGCA 0.2854 TAGCC 0.2469 TAGCG 0.1979 TAGCT 0.2698 TAGGA 0.2042 TAGGC 0.2585 TAGGG 0.2231 TAGGT 0.3142 TAGTA 0.1959 TAGTC 0.3066 TAGTG 0.2865 TAGTT 0.2111 TATAA 0.2197 TATAC 0.2842 TATAG 0.2046 TATAT 0.2914 TATCA 0.2693 TATCC 0.2119 TATCG 0.259 TATCT 0.2598 TATGA 0.2586 TATGC 0.2538 TATGG 0.2414 TATGT 0.2462 TATTA 0.1207 TATTC 0.2907 TATTG 0.3087 TATTT 0.2799 TCAAA 0.2175 TCAAC 0.2492 TCAAG 0.3059 TCAAT 0.2274 TCACA 0.2568 TCACC 0.2849 TCACG 0.2427 TCACT 0.2155 TCAGA 0.2357 TCAGC 0.2982 TCAGG 0.2671 TCAGT 0.1991 TCATA 0.1348 TCATC 0.3364 TCATG 0.3167 TCATT 0.2121 TCCAA 0.2251 TCCAC 0.2468 TCCAG 0.2636 TCCAT 0.2645 TCCCA 0.272 TCCCC 0.2698 TCCCG 0.2042 TCCCT 0.254 TCCGA 0.2638 TCCGC 0.2716 TCCGG 0.2104 TCCGT 0.2542 TCCTA 0.111 TCCTC 0.3552 TCCTG 0.2723 TCCTT 0.2614 TCGAA 0.2132 TCGAC 0.2717 TCGAG 0.296 TCGAT 0.2191 TCGCA 0.2403 TCGCC 0.2975 TCGCG 0.2263 TCGCT 0.2358 TCGGA 0.2169 TCGGC 0.2995 TCGGG 0.2401 TCGGT 0.2435 TCGTA 0.1395 TCGTC 0.3557 TCGTG 0.2779 TCGTT 0.2269 TCTAA 0.1748 TCTAC 0.33 TCTAG 0.235 TCTAT 0.2603 TCTCA 0.2257 TCTCC 0.2469 TCTCG 0.2583 TCTCT 0.2691 TCTGA 0.218 TCTGC 0.2828 TCTGG 0.2765 TCTGT 0.2226 TCTTA 0.08958 TCTTC 0.3293 TCTTG 0.3085 TCTTT 0.2726 TGAAA 0.2342 TGAAC 0.2365 TGAAG 0.3046 TGAAT 0.2247 TGACA 0.2606 TGACC 0.2508 TGACG 0.2749 TGACT 0.2137 TGAGA 0.2762 TGAGC 0.269 TGAGG 0.2898 TGAGT 0.1649 TGATA 0.1539 TGATC 0.2441 TGATG 0.3862 TGATT 0.2158 TGCAA 0.2347 TGCAC 0.2118 TGCAG 0.2878 TGCAT 0.2657 TGCCA 0.2766 TGCCC 0.2449 TGCCG 0.2189 TGCCT 0.2595 TGCGA 0.2718 TGCGC 0.2675 TGCGG 0.2392 TGCGT 0.2215 TGCTA 0.1321 TGCTC 0.2707 TGCTG 0.3367 TGCTT 0.2605 TGGAA 0.2509 TGGAC 0.2408 TGGAG 0.2955 TGGAT 0.2127 TGGCA 0.2611 TGGCC 0.2596 TGGCG 0.2435 TGGCT 0.2358 TGGGA 0.2406 TGGGC 0.2816 TGGGG 0.2516 TGGGT 0.2261 TGGTA 0.1655 TGGTC 0.2655 TGGTG 0.3502 TGGTT 0.2189 TGTAA 0.1861 TGTAC 0.3055 TGTAG 0.2521 TGTAT 0.2562 TGTCA 0.2477 TGTCC 0.2142 TGTCG 0.2891 TGTCT 0.2491 TGTGA 0.2392 TGTGC 0.2547 TGTGG 0.2465 TGTGT 0.2597 TGTTA 0.1132 TGTTC 0.2705 TGTTG 0.359 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2803 TTAAC 0.2248 TTAAG 0.2399 TTAAT 0.255 TTACA 0.2736 TTACC 0.2966 TTACG 0.2101 TTACT 0.2196 TTAGA 0.2495 TTAGC 0.2838 TTAGG 0.2695 TTAGT 0.1972 TTATA 0.1755 TTATC 0.2911 TTATG 0.2549 TTATT 0.2785 TTCAA 0.2613 TTCAC 0.2357 TTCAG 0.25 TTCAT 0.253 TTCCA 0.2637 TTCCC 0.2832 TTCCG 0.1939 TTCCT 0.2592 TTCGA 0.2657 TTCGC 0.2421 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2482 TTCTA 0.1119 TTCTC 0.3095 TTCTG 0.2515 TTCTT 0.3271 TTGAA 0.2338 TTGAC 0.2752 TTGAG 0.2379 TTGAT 0.2531 TTGCA 0.2342 TTGCC 0.2725 TTGCG 0.223 TTGCT 0.2703 TTGGA 0.2017 TTGGC 0.3015 TTGGG 0.2587 TTGGT 0.238 TTGTA 0.1769 TTGTC 0.2907 TTGTG 0.2554 TTGTT 0.277 TTTAA 0.1927 TTTAC 0.2922 TTTAG 0.2263 TTTAT 0.2888 TTTCA 0.2161 TTTCC 0.2505 TTTCG 0.2458 TTTCT 0.2877 TTTGA 0.2312 TTTGC 0.2724 TTTGG 0.2652 TTTGT 0.2312 TTTTA 0.1059 TTTTC 0.2896 TTTTG 0.2772 TTTTT 0.3272