[1] # (a,c,g,t)= (0.272, 0.228, 0.228, 0.272) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.34 C 0.16 G 0.16 T 0.34 # l= 1 # Values AA 0.129 AC 0.0491 AG 0.0538 AT 0.109 CA 0.0614 CC 0.0293 CG 0.015 CT 0.0538 GA 0.0559 GC 0.0252 GG 0.0293 GT 0.0491 TA 0.0945 TC 0.0559 TG 0.0614 TT 0.129 # l= 2 # Values AAA 0.0517 AAC 0.0176 AAG 0.0205 AAT 0.0388 ACA 0.0195 ACC 0.0087 ACG 0.00466 ACT 0.0163 AGA 0.0192 AGC 0.00866 AGG 0.00969 AGT 0.0163 ATA 0.0345 ATC 0.0163 ATG 0.0193 ATT 0.0388 CAA 0.0235 CAC 0.0102 CAG 0.00845 CAT 0.0193 CCA 0.0112 CCC 0.00584 CCG 0.00253 CCT 0.00969 CGA 0.00553 CGC 0.00229 CGG 0.00253 CGT 0.00467 CTA 0.0141 CTC 0.0108 CTG 0.00845 CTT 0.0205 GAA 0.021 GAC 0.00777 GAG 0.0108 GAT 0.0163 GCA 0.00972 GCC 0.00453 GCG 0.00229 GCT 0.00867 GGA 0.0102 GGC 0.00453 GGG 0.00584 GGT 0.0087 GTA 0.0136 GTC 0.00777 GTG 0.0102 GTT 0.0176 TAA 0.0324 TAC 0.0136 TAG 0.0141 TAT 0.0345 TCA 0.021 TCC 0.0102 TCG 0.00553 TCT 0.0192 TGA 0.021 TGC 0.00972 TGG 0.0112 TGT 0.0195 TTA 0.0324 TTC 0.021 TTG 0.0235 TTT 0.0517 # l= 3 # Values AAAA 0.0213 AAAC 0.00649 AAAG 0.0077 AAAT 0.0162 AACA 0.00714 AACC 0.00291 AACG 0.00151 AACT 0.00606 AAGA 0.00753 AAGC 0.00304 AAGG 0.00363 AAGT 0.0063 AATA 0.0124 AATC 0.00546 AATG 0.0064 AATT 0.0146 ACAA 0.00761 ACAC 0.00323 ACAG 0.00244 ACAT 0.0062 ACCA 0.00346 ACCC 0.00173 ACCG 0.000714 ACCT 0.0028 ACGA 0.00171 ACGC 0.00065 ACGG 0.000773 ACGT 0.00153 ACTA 0.00466 ACTC 0.00295 ACTG 0.00239 ACTT 0.0063 AGAA 0.00757 AGAC 0.00246 AGAG 0.00383 AGAT 0.00532 AGCA 0.00341 AGCC 0.00148 AGCG 0.000721 AGCT 0.00306 AGGA 0.00346 AGGC 0.00149 AGGG 0.00194 AGGT 0.0028 AGTA 0.00466 AGTC 0.00241 AGTG 0.00316 AGTT 0.00606 ATAA 0.0118 ATAC 0.00468 ATAG 0.00451 ATAT 0.0134 ATCA 0.00653 ATCC 0.00285 ATCG 0.00161 ATCT 0.00532 ATGA 0.00675 ATGC 0.00295 ATGG 0.00336 ATGT 0.0062 ATTA 0.0108 ATTC 0.00556 ATTG 0.00633 ATTT 0.0162 CAAA 0.00927 CAAC 0.00391 CAAG 0.00399 CAAT 0.00633 CACA 0.00388 CACC 0.0021 CACG 0.00104 CACT 0.00316 CAGA 0.00295 CAGC 0.00169 CAGG 0.00143 CAGT 0.00239 CATA 0.00562 CATC 0.00348 CATG 0.00376 CATT 0.0064 CCAA 0.00428 CCAC 0.00211 CCAG 0.00149 CCAT 0.00336 CCCA 0.0021 CCCC 0.00134 CCCG 0.000468 CCCT 0.00194 CCGA 0.000852 CCGC 0.000455 CCGG 0.000453 CCGT 0.000774 CCTA 0.00241 CCTC 0.00223 CCTG 0.00143 CCTT 0.00363 CGAA 0.00192 CGAC 0.000857 CGAG 0.00114 CGAT 0.00161 CGCA 0.000718 CGCC 0.000524 CGCG 0.000331 CGCT 0.000721 CGGA 0.000916 CGGC 0.000436 CGGG 0.000468 CGGT 0.000714 CGTA 0.00123 CGTC 0.000888 CGTG 0.00104 CGTT 0.00151 CTAA 0.00484 CTAC 0.00239 CTAG 0.00233 CTAT 0.00451 CTCA 0.00356 CTCC 0.00228 CTCG 0.00114 CTCT 0.00383 CTGA 0.00277 CTGC 0.00175 CTGG 0.00149 CTGT 0.00244 CTTA 0.00454 CTTC 0.00426 CTTG 0.00399 CTTT 0.0077 GAAA 0.00834 GAAC 0.00284 GAAG 0.00426 GAAT 0.00556 GACA 0.00307 GACC 0.0014 GACG 0.000888 GACT 0.00241 GAGA 0.00403 GAGC 0.00161 GAGG 0.00223 GAGT 0.00295 GATA 0.00482 GATC 0.00255 GATG 0.00348 GATT 0.00546 GCAA 0.00351 GCAC 0.00151 GCAG 0.00175 GCAT 0.00295 GCCA 0.00175 GCCC 0.000863 GCCG 0.000436 GCCT 0.00149 GCGA 0.000817 GCGC 0.000371 GCGG 0.000455 GCGT 0.00065 GCTA 0.00233 GCTC 0.00161 GCTG 0.00169 GCTT 0.00304 GGAA 0.00364 GGAC 0.00146 GGAG 0.00228 GGAT 0.00286 GGCA 0.00165 GGCC 0.000877 GGCG 0.000524 GGCT 0.00148 GGGA 0.00191 GGGC 0.000863 GGGG 0.00134 GGGT 0.00173 GGTA 0.0023 GGTC 0.0014 GGTG 0.0021 GGTT 0.00291 GTAA 0.00447 GTAC 0.00204 GTAG 0.00239 GTAT 0.00468 GTCA 0.00299 GTCC 0.00146 GTCG 0.000857 GTCT 0.00246 GTGA 0.00333 GTGC 0.00151 GTGG 0.00211 GTGT 0.00323 GTTA 0.00436 GTTC 0.00284 GTTG 0.00391 GTTT 0.00649 TAAA 0.0128 TAAC 0.00436 TAAG 0.00454 TAAT 0.0108 TACA 0.00538 TACC 0.00231 TACG 0.00123 TACT 0.00466 TAGA 0.00467 TAGC 0.00233 TAGG 0.00241 TAGT 0.00466 TATA 0.0116 TATC 0.00482 TATG 0.00562 TATT 0.0124 TCAA 0.00811 TCAC 0.00333 TCAG 0.00277 TCAT 0.00675 TCCA 0.00394 TCCC 0.00191 TCCG 0.000916 TCCT 0.00346 TCGA 0.00215 TCGC 0.000817 TCGG 0.000852 TCGT 0.00171 TCTA 0.00467 TCTC 0.00403 TCTG 0.00295 TCTT 0.00753 TGAA 0.00787 TGAC 0.00299 TGAG 0.00356 TGAT 0.00653 TGCA 0.00394 TGCC 0.00165 TGCG 0.000718 TGCT 0.00341 TGGA 0.00394 TGGC 0.00175 TGGG 0.0021 TGGT 0.00346 TGTA 0.00538 TGTC 0.00307 TGTG 0.00388 TGTT 0.00714 TTAA 0.0113 TTAC 0.00447 TTAG 0.00484 TTAT 0.0118 TTCA 0.00787 TTCC 0.00364 TTCG 0.00192 TTCT 0.00757 TTGA 0.00811 TTGC 0.00351 TTGG 0.00428 TTGT 0.00761 TTTA 0.0128 TTTC 0.00833 TTTG 0.00927 TTTT 0.0213 # l= 4 # Values AAAAA 0.00886 AAAAC 0.0024 AAAAG 0.00323 AAAAT 0.00677 AAACA 0.00273 AAACC 0.00102 AAACG 0.000573 AAACT 0.00218 AAAGA 0.00295 AAAGC 0.00105 AAAGG 0.00139 AAAGT 0.00232 AAATA 0.00557 AAATC 0.0022 AAATG 0.00269 AAATT 0.00573 AACAA 0.00292 AACAC 0.00114 AACAG 0.000941 AACAT 0.00214 AACCA 0.00118 AACCC 0.000582 AACCG 0.000234 AACCT 0.000909 AACGA 0.00059 AACGC 0.000204 AACGG 0.000268 AACGT 0.000445 AACTA 0.00176 AACTC 0.0011 AACTG 0.000875 AACTT 0.00233 AAGAA 0.0032 AAGAC 0.000916 AAGAG 0.00142 AAGAT 0.002 AAGCA 0.00125 AAGCC 0.000498 AAGCG 0.000244 AAGCT 0.00105 AAGGA 0.00134 AAGGC 0.000534 AAGGG 0.000743 AAGGT 0.00101 AAGTA 0.00182 AAGTC 0.000921 AAGTG 0.00123 AAGTT 0.00233 AATAA 0.00467 AATAC 0.00157 AATAG 0.00164 AATAT 0.00453 AATCA 0.00226 AATCC 0.00092 AATCG 0.000542 AATCT 0.00174 AATGA 0.00234 AATGC 0.000934 AATGG 0.00117 AATGT 0.00196 AATTA 0.00443 AATTC 0.00202 AATTG 0.0024 AATTT 0.00573 ACAAA 0.00302 ACAAC 0.00122 ACAAG 0.00131 ACAAT 0.00205 ACACA 0.00134 ACACC 0.000595 ACACG 0.000325 ACACT 0.000972 ACAGA 0.00092 ACAGC 0.000416 ACAGG 0.000411 ACAGT 0.000692 ACATA 0.00199 ACATC 0.000957 ACATG 0.00128 ACATT 0.00196 ACCAA 0.00137 ACCAC 0.000611 ACCAG 0.000476 ACCAT 0.001 ACCCA 0.000611 ACCCC 0.00041 ACCCG 0.000151 ACCCT 0.00056 ACCGA 0.000255 ACCGC 0.000117 ACCGG 0.000131 ACCGT 0.000211 ACCTA 0.000731 ACCTC 0.00061 ACCTG 0.000447 ACCTT 0.00101 ACGAA 0.000622 ACGAC 0.000264 ACGAG 0.000356 ACGAT 0.000467 ACGCA 0.000227 ACGCC 0.00014 ACGCG 0.0001 ACGCT 0.000183 ACGGA 0.000297 ACGGC 0.000122 ACGGG 0.000143 ACGGT 0.000211 ACGTA 0.00045 ACGTC 0.000251 ACGTG 0.000388 ACGTT 0.000445 ACTAA 0.00164 ACTAC 0.000744 ACTAG 0.000779 ACTAT 0.0015 ACTCA 0.00104 ACTCC 0.000575 ACTCG 0.000325 ACTCT 0.00101 ACTGA 0.000831 ACTGC 0.000449 ACTGG 0.000415 ACTGT 0.000692 ACTTA 0.00149 ACTTC 0.00117 ACTTG 0.00133 ACTTT 0.00232 AGAAA 0.00319 AGAAC 0.000941 AGAAG 0.00157 AGAAT 0.00187 AGACA 0.001 AGACC 0.000426 AGACG 0.000284 AGACT 0.000745 AGAGA 0.00155 AGAGC 0.000499 AGAGG 0.000777 AGAGT 0.00101 AGATA 0.00164 AGATC 0.000793 AGATG 0.00115 AGATT 0.00174 AGCAA 0.00132 AGCAC 0.000512 AGCAG 0.000623 AGCAT 0.000957 AGCCA 0.000593 AGCCC 0.000286 AGCCG 0.000131 AGCCT 0.000465 AGCGA 0.000299 AGCGC 0.000106 AGCGG 0.000133 AGCGT 0.000183 AGCTA 0.000868 AGCTC 0.000563 AGCTG 0.000575 AGCTT 0.00105 AGGAA 0.00132 AGGAC 0.000467 AGGAG 0.000748 AGGAT 0.000928 AGGCA 0.000576 AGGCC 0.000278 AGGCG 0.000166 AGGCT 0.000465 AGGGA 0.000678 AGGGC 0.000266 AGGGG 0.000438 AGGGT 0.00056 AGGTA 0.000799 AGGTC 0.00045 AGGTG 0.000642 AGGTT 0.000909 AGTAA 0.00163 AGTAC 0.000704 AGTAG 0.000886 AGTAT 0.00144 AGTCA 0.000954 AGTCC 0.000441 AGTCG 0.000268 AGTCT 0.000745 AGTGA 0.00111 AGTGC 0.000451 AGTGG 0.000636 AGTGT 0.000972 AGTTA 0.00155 AGTTC 0.000977 AGTTG 0.00135 AGTTT 0.00218 ATAAA 0.00472 ATAAC 0.00152 ATAAG 0.00157 ATAAT 0.00402 ATACA 0.00213 ATACC 0.000709 ATACG 0.000401 ATACT 0.00144 ATAGA 0.00157 ATAGC 0.000721 ATAGG 0.000726 ATAGT 0.0015 ATATA 0.00512 ATATC 0.00169 ATATG 0.00211 ATATT 0.00453 ATCAA 0.00257 ATCAC 0.00103 ATCAG 0.00087 ATCAT 0.00206 ATCCA 0.00115 ATCCC 0.000523 ATCCG 0.000255 ATCCT 0.000928 ATCGA 0.000681 ATCGC 0.00022 ATCGG 0.000239 ATCGT 0.000467 ATCTA 0.00139 ATCTC 0.00108 ATCTG 0.000854 ATCTT 0.002 ATGAA 0.00258 ATGAC 0.000984 ATGAG 0.00112 ATGAT 0.00206 ATGCA 0.00128 ATGCC 0.000498 ATGCG 0.000212 ATGCT 0.000957 ATGGA 0.00126 ATGGC 0.0005 ATGGG 0.000603 ATGGT 0.001 ATGTA 0.00184 ATGTC 0.00097 ATGTG 0.00125 ATGTT 0.00214 ATTAA 0.00375 ATTAC 0.00141 ATTAG 0.00157 ATTAT 0.00402 ATTCA 0.00226 ATTCC 0.000894 ATTCG 0.000546 ATTCT 0.00187 ATTGA 0.00228 ATTGC 0.00093 ATTGG 0.00106 ATTGT 0.00205 ATTTA 0.00415 ATTTC 0.00239 ATTTG 0.00288 ATTTT 0.00677 CAAAA 0.00356 CAAAC 0.00146 CAAAG 0.00136 CAAAT 0.00288 CAACA 0.00158 CAACC 0.000671 CAACG 0.000306 CAACT 0.00135 CAAGA 0.00136 CAAGC 0.000631 CAAGG 0.000675 CAAGT 0.00133 CAATA 0.00184 CAATC 0.001 CAATG 0.00109 CAATT 0.0024 CACAA 0.00148 CACAC 0.000694 CACAG 0.000457 CACAT 0.00125 CACCA 0.000867 CACCC 0.000412 CACCG 0.000176 CACCT 0.000642 CACGA 0.000353 CACGC 0.000152 CACGG 0.000147 CACGT 0.000388 CACTA 0.000874 CACTC 0.000579 CACTG 0.000482 CACTT 0.00123 CAGAA 0.00112 CAGAC 0.000403 CAGAG 0.000565 CAGAT 0.000854 CAGCA 0.000671 CAGCC 0.000309 CAGCG 0.000136 CAGCT 0.000575 CAGGA 0.000477 CAGGC 0.000236 CAGGG 0.00027 CAGGT 0.000447 CAGTA 0.000659 CAGTC 0.000371 CAGTG 0.000482 CAGTT 0.000875 CATAA 0.0019 CATAC 0.000823 CATAG 0.000786 CATAT 0.00211 CATCA 0.00139 CATCC 0.00063 CATCG 0.000312 CATCT 0.00115 CATGA 0.00123 CATGC 0.000605 CATGG 0.000635 CATGT 0.00128 CATTA 0.0016 CATTC 0.00101 CATTG 0.00109 CATTT 0.00269 CCAAA 0.00175 CCAAC 0.000763 CCAAG 0.000702 CCAAT 0.00106 CCACA 0.00074 CCACC 0.000523 CCACG 0.00021 CCACT 0.000636 CCAGA 0.000513 CCAGC 0.000325 CCAGG 0.000242 CCAGT 0.000415 CCATA 0.000892 CCATC 0.000667 CCATG 0.000635 CCATT 0.00117 CCCAA 0.000827 CCCAC 0.000426 CCCAG 0.000242 CCCAT 0.000603 CCCCA 0.000461 CCCCC 0.00034 CCCCG 9.77e-05 CCCCT 0.000438 CCCGA 0.000166 CCCGC 8.66e-05 CCCGG 7.29e-05 CCCGT 0.000143 CCCTA 0.000468 CCCTC 0.000462 CCCTG 0.00027 CCCTT 0.000743 CCGAA 0.000294 CCGAC 0.000159 CCGAG 0.00016 CCGAT 0.000239 CCGCA 0.000135 CCGCC 0.000129 CCGCG 5.78e-05 CCGCT 0.000133 CCGGA 0.000156 CCGGC 9.4e-05 CCGGG 7.29e-05 CCGGT 0.000131 CCGTA 0.000168 CCGTC 0.00019 CCGTG 0.000147 CCGTT 0.000268 CCTAA 0.000859 CCTAC 0.000449 CCTAG 0.000377 CCTAT 0.000726 CCTCA 0.000692 CCTCC 0.000535 CCTCG 0.000221 CCTCT 0.000777 CCTGA 0.000458 CCTGC 0.00032 CCTGG 0.000242 CCTGT 0.000411 CCTTA 0.000781 CCTTC 0.000784 CCTTG 0.000675 CCTTT 0.00139 CGAAA 0.000738 CGAAC 0.000293 CGAAG 0.000346 CGAAT 0.000546 CGACA 0.000297 CGACC 0.000163 CGACG 0.000129 CGACT 0.000268 CGAGA 0.00039 CGAGC 0.000207 CGAGG 0.000221 CGAGT 0.000325 CGATA 0.000475 CGATC 0.000278 CGATG 0.000312 CGATT 0.000542 CGCAA 0.00026 CGCAC 0.00013 CGCAG 0.000115 CGCAT 0.000212 CGCCA 0.000185 CGCCC 9.41e-05 CGCCG 7.99e-05 CGCCT 0.000166 CGCGA 0.00011 CGCGC 6.24e-05 CGCGG 5.78e-05 CGCGT 0.0001 CGCTA 0.000181 CGCTC 0.00016 CGCTG 0.000136 CGCTT 0.000244 CGGAA 0.000301 CGGAC 0.000141 CGGAG 0.00022 CGGAT 0.000255 CGGCA 0.000136 CGGCC 8.83e-05 CGGCG 7.99e-05 CGGCT 0.000131 CGGGA 0.000143 CGGGC 7.65e-05 CGGGG 9.77e-05 CGGGT 0.000151 CGGTA 0.000185 CGGTC 0.000119 CGGTG 0.000176 CGGTT 0.000234 CGTAA 0.000424 CGTAC 0.000188 CGTAG 0.000218 CGTAT 0.000401 CGTCA 0.000303 CGTCC 0.000172 CGTCG 0.000129 CGTCT 0.000284 CGTGA 0.000343 CGTGC 0.000162 CGTGG 0.00021 CGTGT 0.000325 CGTTA 0.000376 CGTTC 0.000251 CGTTG 0.000306 CGTTT 0.000573 CTAAA 0.00185 CTAAC 0.000736 CTAAG 0.000686 CTAAT 0.00157 CTACA 0.000844 CTACC 0.000439 CTACG 0.000218 CTACT 0.000886 CTAGA 0.000753 CTAGC 0.000419 CTAGG 0.000377 CTAGT 0.000779 CTATA 0.00135 CTATC 0.000736 CTATG 0.000786 CTATT 0.00164 CTCAA 0.00142 CTCAC 0.000568 CTCAG 0.000455 CTCAT 0.00112 CTCCA 0.000871 CTCCC 0.000438 CTCCG 0.00022 CTCCT 0.000748 CTCGA 0.000416 CTCGC 0.000211 CTCGG 0.00016 CTCGT 0.000356 CTCTA 0.000919 CTCTC 0.000931 CTCTG 0.000565 CTCTT 0.00142 CTGAA 0.00107 CTGAC 0.000371 CTGAG 0.000455 CTGAT 0.00087 CTGCA 0.000707 CTGCC 0.000307 CTGCG 0.000115 CTGCT 0.000623 CTGGA 0.000525 CTGGC 0.000251 CTGGG 0.000242 CTGGT 0.000476 CTGTA 0.00062 CTGTC 0.000421 CTGTG 0.000457 CTGTT 0.000941 CTTAA 0.00159 CTTAC 0.000698 CTTAG 0.000686 CTTAT 0.00157 CTTCA 0.00154 CTTCC 0.000815 CTTCG 0.000346 CTTCT 0.00157 CTTGA 0.00133 CTTGC 0.000657 CTTGG 0.000702 CTTGT 0.00131 CTTTA 0.00174 CTTTC 0.00137 CTTTG 0.00136 CTTTT 0.00323 GAAAA 0.00346 GAAAC 0.00111 GAAAG 0.00137 GAAAT 0.00239 GAACA 0.00109 GAACC 0.000528 GAACG 0.000251 GAACT 0.000977 GAAGA 0.00163 GAAGC 0.000672 GAAGG 0.000784 GAAGT 0.00117 GAATA 0.00161 GAATC 0.000914 GAATG 0.00101 GAATT 0.00202 GACAA 0.00116 GACAC 0.000521 GACAG 0.000421 GACAT 0.00097 GACCA 0.00054 GACCC 0.000286 GACCG 0.000119 GACCT 0.00045 GACGA 0.000333 GACGC 0.000114 GACGG 0.00019 GACGT 0.000251 GACTA 0.000662 GACTC 0.000454 GACTG 0.000371 GACTT 0.000921 GAGAA 0.00152 GAGAC 0.000499 GAGAG 0.000931 GAGAT 0.00108 GAGCA 0.000609 GAGCC 0.000278 GAGCG 0.00016 GAGCT 0.000563 GAGGA 0.000813 GAGGC 0.000341 GAGGG 0.000462 GAGGT 0.00061 GAGTA 0.000816 GAGTC 0.000454 GAGTG 0.000579 GAGTT 0.0011 GATAA 0.00169 GATAC 0.000712 GATAG 0.000736 GATAT 0.00169 GATCA 0.000991 GATCC 0.000492 GATCG 0.000278 GATCT 0.000793 GATGA 0.00131 GATGC 0.000547 GATGG 0.000667 GATGT 0.000957 GATTA 0.00134 GATTC 0.000914 GATTG 0.001 GATTT 0.0022 GCAAA 0.00131 GCAAC 0.000617 GCAAG 0.000657 GCAAT 0.00093 GCACA 0.000583 GCACC 0.000318 GCACG 0.000162 GCACT 0.000451 GCAGA 0.000576 GCAGC 0.000407 GCAGG 0.00032 GCAGT 0.000449 GCATA 0.000861 GCATC 0.000547 GCATG 0.000605 GCATT 0.000934 GCCAA 0.000651 GCCAC 0.000346 GCCAG 0.000251 GCCAT 0.0005 GCCCA 0.000337 GCCCC 0.000183 GCCCG 7.65e-05 GCCCT 0.000266 GCCGA 0.000126 GCCGC 9.32e-05 GCCGG 9.4e-05 GCCGT 0.000122 GCCTA 0.000374 GCCTC 0.000341 GCCTG 0.000236 GCCTT 0.000534 GCGAA 0.00026 GCGAC 0.000126 GCGAG 0.000211 GCGAT 0.00022 GCGCA 0.000128 GCGCC 7.5e-05 GCGCG 6.24e-05 GCGCT 0.000106 GCGGA 0.000159 GCGGC 9.32e-05 GCGGG 8.66e-05 GCGGT 0.000117 GCGTA 0.000179 GCGTC 0.000114 GCGTG 0.000152 GCGTT 0.000204 GCTAA 0.000782 GCTAC 0.000403 GCTAG 0.000419 GCTAT 0.000721 GCTCA 0.000565 GCTCC 0.000338 GCTCG 0.000207 GCTCT 0.000499 GCTGA 0.000542 GCTGC 0.000407 GCTGG 0.000325 GCTGT 0.000416 GCTTA 0.000687 GCTTC 0.000672 GCTTG 0.000631 GCTTT 0.00105 GGAAA 0.00143 GGAAC 0.000509 GGAAG 0.000815 GGAAT 0.000894 GGACA 0.000564 GGACC 0.000282 GGACG 0.000172 GGACT 0.000441 GGAGA 0.000827 GGAGC 0.000338 GGAGG 0.000535 GGAGT 0.000575 GGATA 0.000812 GGATC 0.000492 GGATG 0.00063 GGATT 0.00092 GGCAA 0.000595 GGCAC 0.000253 GGCAG 0.000307 GGCAT 0.000498 GGCCA 0.000333 GGCCC 0.000178 GGCCG 8.83e-05 GGCCT 0.000278 GGCGA 0.00018 GGCGC 7.5e-05 GGCGG 0.000129 GGCGT 0.00014 GGCTA 0.00039 GGCTC 0.000278 GGCTG 0.000309 GGCTT 0.000498 GGGAA 0.000696 GGGAC 0.000257 GGGAG 0.000438 GGGAT 0.000523 GGGCA 0.000305 GGGCC 0.000178 GGGCG 9.41e-05 GGGCT 0.000286 GGGGA 0.000404 GGGGC 0.000183 GGGGG 0.00034 GGGGT 0.00041 GGGTA 0.000452 GGGTC 0.000286 GGGTG 0.000412 GGGTT 0.000582 GGTAA 0.000796 GGTAC 0.000361 GGTAG 0.000439 GGTAT 0.000709 GGTCA 0.000525 GGTCC 0.000282 GGTCG 0.000163 GGTCT 0.000426 GGTGA 0.00066 GGTGC 0.000318 GGTGG 0.000523 GGTGT 0.000595 GGTTA 0.000692 GGTTC 0.000528 GGTTG 0.000671 GGTTT 0.00102 GTAAA 0.00169 GTAAC 0.000664 GTAAG 0.000698 GTAAT 0.00141 GTACA 0.000785 GTACC 0.000361 GTACG 0.000188 GTACT 0.000704 GTAGA 0.000792 GTAGC 0.000403 GTAGG 0.000449 GTAGT 0.000744 GTATA 0.00158 GTATC 0.000712 GTATG 0.000823 GTATT 0.00157 GTCAA 0.00115 GTCAC 0.000486 GTCAG 0.000371 GTCAT 0.000984 GTCCA 0.000594 GTCCC 0.000257 GTCCG 0.000141 GTCCT 0.000467 GTCGA 0.000308 GTCGC 0.000126 GTCGG 0.000159 GTCGT 0.000264 GTCTA 0.000642 GTCTC 0.000499 GTCTG 0.000403 GTCTT 0.000916 GTGAA 0.00125 GTGAC 0.000486 GTGAG 0.000568 GTGAT 0.00103 GTGCA 0.000618 GTGCC 0.000253 GTGCG 0.00013 GTGCT 0.000512 GTGGA 0.000726 GTGGC 0.000346 GTGGG 0.000426 GTGGT 0.000611 GTGTA 0.000874 GTGTC 0.000521 GTGTG 0.000694 GTGTT 0.00114 GTTAA 0.00144 GTTAC 0.000664 GTTAG 0.000736 GTTAT 0.00152 GTTCA 0.0011 GTTCC 0.000509 GTTCG 0.000293 GTTCT 0.000941 GTTGA 0.00131 GTTGC 0.000617 GTTGG 0.000763 GTTGT 0.00122 GTTTA 0.00152 GTTTC 0.00111 GTTTG 0.00146 GTTTT 0.0024 TAAAA 0.00538 TAAAC 0.00152 TAAAG 0.00174 TAAAT 0.00415 TAACA 0.00174 TAACC 0.000692 TAACG 0.000376 TAACT 0.00155 TAAGA 0.00159 TAAGC 0.000687 TAAGG 0.000781 TAAGT 0.00149 TAATA 0.00338 TAATC 0.00134 TAATG 0.0016 TAATT 0.00443 TACAA 0.00205 TACAC 0.000874 TACAG 0.00062 TACAT 0.00184 TACCA 0.000869 TACCC 0.000452 TACCG 0.000185 TACCT 0.000799 TACGA 0.000434 TACGC 0.000179 TACGG 0.000168 TACGT 0.00045 TACTA 0.00136 TACTC 0.000816 TACTG 0.000659 TACTT 0.00182 TAGAA 0.00172 TAGAC 0.000642 TAGAG 0.000919 TAGAT 0.00139 TAGCA 0.000886 TAGCC 0.00039 TAGCG 0.000181 TAGCT 0.000868 TAGGA 0.000838 TAGGC 0.000374 TAGGG 0.000468 TAGGT 0.000731 TAGTA 0.00136 TAGTC 0.000662 TAGTG 0.000874 TAGTT 0.00176 TATAA 0.00357 TATAC 0.00158 TATAG 0.00135 TATAT 0.00512 TATCA 0.00189 TATCC 0.000812 TATCG 0.000475 TATCT 0.00164 TATGA 0.00187 TATGC 0.000861 TATGG 0.000892 TATGT 0.00199 TATTA 0.00338 TATTC 0.00161 TATTG 0.00184 TATTT 0.00557 TCAAA 0.00319 TCAAC 0.00131 TCAAG 0.00133 TCAAT 0.00228 TCACA 0.00122 TCACC 0.00066 TCACG 0.000343 TCACT 0.00111 TCAGA 0.000937 TCAGC 0.000542 TCAGG 0.000458 TCAGT 0.000831 TCATA 0.00187 TCATC 0.00131 TCATG 0.00123 TCATT 0.00234 TCCAA 0.00143 TCCAC 0.000726 TCCAG 0.000525 TCCAT 0.00126 TCCCA 0.000689 TCCCC 0.000404 TCCCG 0.000143 TCCCT 0.000678 TCCGA 0.000305 TCCGC 0.000159 TCCGG 0.000156 TCCGT 0.000297 TCCTA 0.000838 TCCTC 0.000813 TCCTG 0.000477 TCCTT 0.00134 TCGAA 0.000745 TCGAC 0.000308 TCGAG 0.000416 TCGAT 0.000681 TCGCA 0.000228 TCGCC 0.00018 TCGCG 0.00011 TCGCT 0.000299 TCGGA 0.000305 TCGGC 0.000126 TCGGG 0.000166 TCGGT 0.000255 TCGTA 0.000434 TCGTC 0.000333 TCGTG 0.000353 TCGTT 0.00059 TCTAA 0.00156 TCTAC 0.000792 TCTAG 0.000753 TCTAT 0.00157 TCTCA 0.00126 TCTCC 0.000827 TCTCG 0.00039 TCTCT 0.00155 TCTGA 0.000937 TCTGC 0.000576 TCTGG 0.000513 TCTGT 0.00092 TCTTA 0.00159 TCTTC 0.00163 TCTTG 0.00136 TCTTT 0.00295 TGAAA 0.00298 TGAAC 0.0011 TGAAG 0.00154 TGAAT 0.00226 TGACA 0.00121 TGACC 0.000525 TGACG 0.000303 TGACT 0.000954 TGAGA 0.00126 TGAGC 0.000565 TGAGG 0.000692 TGAGT 0.00104 TGATA 0.00189 TGATC 0.000991 TGATG 0.00139 TGATT 0.00226 TGCAA 0.00133 TGCAC 0.000618 TGCAG 0.000707 TGCAT 0.00128 TGCCA 0.000636 TGCCC 0.000305 TGCCG 0.000136 TGCCT 0.000576 TGCGA 0.000228 TGCGC 0.000128 TGCGG 0.000135 TGCGT 0.000227 TGCTA 0.000886 TGCTC 0.000609 TGCTG 0.000671 TGCTT 0.00125 TGGAA 0.00133 TGGAC 0.000594 TGGAG 0.000871 TGGAT 0.00115 TGGCA 0.000636 TGGCC 0.000333 TGGCG 0.000185 TGGCT 0.000593 TGGGA 0.000689 TGGGC 0.000337 TGGGG 0.000461 TGGGT 0.000611 TGGTA 0.000869 TGGTC 0.00054 TGGTG 0.000867 TGGTT 0.00118 TGTAA 0.00162 TGTAC 0.000785 TGTAG 0.000844 TGTAT 0.00213 TGTCA 0.00121 TGTCC 0.000564 TGTCG 0.000297 TGTCT 0.001 TGTGA 0.00122 TGTGC 0.000583 TGTGG 0.00074 TGTGT 0.00134 TGTTA 0.00174 TGTTC 0.00109 TGTTG 0.00158 TGTTT 0.00273 TTAAA 0.00453 TTAAC 0.00144 TTAAG 0.00159 TTAAT 0.00375 TTACA 0.00162 TTACC 0.000796 TTACG 0.000424 TTACT 0.00163 TTAGA 0.00156 TTAGC 0.000782 TTAGG 0.000859 TTAGT 0.00164 TTATA 0.00357 TTATC 0.00169 TTATG 0.0019 TTATT 0.00467 TTCAA 0.00298 TTCAC 0.00125 TTCAG 0.00107 TTCAT 0.00258 TTCCA 0.00133 TTCCC 0.000696 TTCCG 0.000301 TTCCT 0.00132 TTCGA 0.000745 TTCGC 0.00026 TTCGG 0.000294 TTCGT 0.000622 TTCTA 0.00172 TTCTC 0.00152 TTCTG 0.00112 TTCTT 0.0032 TTGAA 0.00298 TTGAC 0.00115 TTGAG 0.00142 TTGAT 0.00257 TTGCA 0.00133 TTGCC 0.000595 TTGCG 0.00026 TTGCT 0.00132 TTGGA 0.00143 TTGGC 0.000651 TTGGG 0.000827 TTGGT 0.00137 TTGTA 0.00205 TTGTC 0.00116 TTGTG 0.00148 TTGTT 0.00292 TTTAA 0.00453 TTTAC 0.00169 TTTAG 0.00185 TTTAT 0.00472 TTTCA 0.00298 TTTCC 0.00143 TTTCG 0.000738 TTTCT 0.00319 TTTGA 0.00319 TTTGC 0.00131 TTTGG 0.00175 TTTGT 0.00302 TTTTA 0.00538 TTTTC 0.00346 TTTTG 0.00356 TTTTT 0.00886 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4167 AAAAC 0.113 AAAAG 0.152 AAAAT 0.3184 AAACA 0.4201 AAACC 0.1563 AAACG 0.08823 AAACT 0.3353 AAAGA 0.383 AAAGC 0.1361 AAAGG 0.1801 AAAGT 0.3008 AAATA 0.3441 AAATC 0.1358 AAATG 0.1663 AAATT 0.3538 AACAA 0.4087 AACAC 0.1599 AACAG 0.1319 AACAT 0.2996 AACCA 0.4063 AACCC 0.2003 AACCG 0.08041 AACCT 0.313 AACGA 0.3915 AACGC 0.1353 AACGG 0.1779 AACGT 0.2953 AACTA 0.2901 AACTC 0.1812 AACTG 0.1444 AACTT 0.3842 AAGAA 0.4252 AAGAC 0.1216 AAGAG 0.1881 AAGAT 0.2651 AAGCA 0.4101 AAGCC 0.1639 AAGCG 0.08036 AAGCT 0.3456 AAGGA 0.3684 AAGGC 0.1472 AAGGG 0.2049 AAGGT 0.2795 AAGTA 0.289 AAGTC 0.1463 AAGTG 0.1952 AAGTT 0.3696 AATAA 0.3761 AATAC 0.1263 AATAG 0.1322 AATAT 0.3653 AATCA 0.4135 AATCC 0.1686 AATCG 0.09931 AATCT 0.3186 AATGA 0.3649 AATGC 0.1459 AATGG 0.1827 AATGT 0.3066 AATTA 0.3037 AATTC 0.1389 AATTG 0.1644 AATTT 0.393 ACAAA 0.3974 ACAAC 0.1607 ACAAG 0.1719 ACAAT 0.27 ACACA 0.414 ACACC 0.1844 ACACG 0.1006 ACACT 0.301 ACAGA 0.3773 ACAGC 0.1707 ACAGG 0.1683 ACAGT 0.2837 ACATA 0.3218 ACATC 0.1544 ACATG 0.2071 ACATT 0.3166 ACCAA 0.3949 ACCAC 0.1768 ACCAG 0.1378 ACCAT 0.2906 ACCCA 0.3528 ACCCC 0.2366 ACCCG 0.08715 ACCCT 0.3235 ACCGA 0.3573 ACCGC 0.1634 ACCGG 0.1833 ACCGT 0.2959 ACCTA 0.2609 ACCTC 0.2177 ACCTG 0.1596 ACCTT 0.3619 ACGAA 0.3642 ACGAC 0.1546 ACGAG 0.2082 ACGAT 0.273 ACGCA 0.3492 ACGCC 0.2152 ACGCG 0.154 ACGCT 0.2816 ACGGA 0.3842 ACGGC 0.1583 ACGGG 0.1844 ACGGT 0.2731 ACGTA 0.2934 ACGTC 0.1636 ACGTG 0.2529 ACGTT 0.2901 ACTAA 0.3513 ACTAC 0.1597 ACTAG 0.1672 ACTAT 0.3218 ACTCA 0.3532 ACTCC 0.1952 ACTCG 0.1101 ACTCT 0.3415 ACTGA 0.3481 ACTGC 0.1883 ACTGG 0.1738 ACTGT 0.2899 ACTTA 0.2359 ACTTC 0.186 ACTTG 0.2105 ACTTT 0.3676 AGAAA 0.422 AGAAC 0.1243 AGAAG 0.2069 AGAAT 0.2467 AGACA 0.4083 AGACC 0.1732 AGACG 0.1157 AGACT 0.3029 AGAGA 0.4043 AGAGC 0.1302 AGAGG 0.2028 AGAGT 0.2627 AGATA 0.3086 AGATC 0.1491 AGATG 0.2153 AGATT 0.3269 AGCAA 0.3868 AGCAC 0.1501 AGCAG 0.1826 AGCAT 0.2805 AGCCA 0.402 AGCCC 0.1939 AGCCG 0.08905 AGCCT 0.3151 AGCGA 0.4147 AGCGC 0.1469 AGCGG 0.1846 AGCGT 0.2538 AGCTA 0.284 AGCTC 0.1842 AGCTG 0.1881 AGCTT 0.3436 AGGAA 0.3811 AGGAC 0.1349 AGGAG 0.216 AGGAT 0.268 AGGCA 0.388 AGGCC 0.1873 AGGCG 0.1116 AGGCT 0.3131 AGGGA 0.349 AGGGC 0.1371 AGGGG 0.2254 AGGGT 0.2884 AGGTA 0.2854 AGGTC 0.1606 AGGTG 0.2293 AGGTT 0.3247 AGTAA 0.3496 AGTAC 0.151 AGTAG 0.1902 AGTAT 0.3092 AGTCA 0.396 AGTCC 0.1831 AGTCG 0.1115 AGTCT 0.3094 AGTGA 0.3495 AGTGC 0.1424 AGTGG 0.201 AGTGT 0.3071 AGTTA 0.2566 AGTTC 0.1613 AGTTG 0.2227 AGTTT 0.3595 ATAAA 0.3995 ATAAC 0.1285 ATAAG 0.1324 ATAAT 0.3396 ATACA 0.4553 ATACC 0.1515 ATACG 0.08557 ATACT 0.3077 ATAGA 0.3474 ATAGC 0.1597 ATAGG 0.1608 ATAGT 0.332 ATATA 0.3808 ATATC 0.1255 ATATG 0.1565 ATATT 0.3372 ATCAA 0.3931 ATCAC 0.1578 ATCAG 0.1332 ATCAT 0.316 ATCCA 0.4024 ATCCC 0.1832 ATCCG 0.08935 ATCCT 0.3251 ATCGA 0.4237 ATCGC 0.1371 ATCGG 0.1489 ATCGT 0.2903 ATCTA 0.2611 ATCTC 0.2031 ATCTG 0.1605 ATCTT 0.3753 ATGAA 0.382 ATGAC 0.1458 ATGAG 0.1664 ATGAT 0.3059 ATGCA 0.4343 ATGCC 0.1691 ATGCG 0.07189 ATGCT 0.3247 ATGGA 0.3734 ATGGC 0.1486 ATGGG 0.1794 ATGGT 0.2987 ATGTA 0.2965 ATGTC 0.1565 ATGTG 0.2019 ATGTT 0.345 ATTAA 0.3491 ATTAC 0.1316 ATTAG 0.1459 ATTAT 0.3734 ATTCA 0.4057 ATTCC 0.1607 ATTCG 0.09811 ATTCT 0.3355 ATTGA 0.3607 ATTGC 0.1468 ATTGG 0.1682 ATTGT 0.3243 ATTTA 0.2565 ATTTC 0.1477 ATTTG 0.1779 ATTTT 0.4179 CAAAA 0.3843 CAAAC 0.1576 CAAAG 0.1471 CAAAT 0.311 CAACA 0.4051 CAACC 0.1715 CAACG 0.07838 CAACT 0.345 CAAGA 0.3411 CAAGC 0.158 CAAGG 0.1689 CAAGT 0.3319 CAATA 0.2908 CAATC 0.1583 CAATG 0.1723 CAATT 0.3786 CACAA 0.3813 CACAC 0.1787 CACAG 0.1177 CACAT 0.3224 CACCA 0.4136 CACCC 0.1962 CACCG 0.08405 CACCT 0.3062 CACGA 0.3396 CACGC 0.1464 CACGG 0.1414 CACGT 0.3726 CACTA 0.2762 CACTC 0.1831 CACTG 0.1524 CACTT 0.3884 CAGAA 0.3817 CAGAC 0.1367 CAGAG 0.1918 CAGAT 0.2898 CAGCA 0.3968 CAGCC 0.1829 CAGCG 0.08018 CAGCT 0.3401 CAGGA 0.3334 CAGGC 0.1652 CAGGG 0.1889 CAGGT 0.3125 CAGTA 0.2761 CAGTC 0.1554 CAGTG 0.202 CAGTT 0.3665 CATAA 0.3389 CATAC 0.1464 CATAG 0.14 CATAT 0.3747 CATCA 0.4002 CATCC 0.1811 CATCG 0.08968 CATCT 0.329 CATGA 0.3285 CATGC 0.161 CATGG 0.1689 CATGT 0.3415 CATTA 0.2502 CATTC 0.1584 CATTG 0.1705 CATTT 0.4209 CCAAA 0.4082 CCAAC 0.1785 CCAAG 0.1643 CCAAT 0.249 CCACA 0.3507 CCACC 0.2482 CCACG 0.0995 CCACT 0.3016 CCAGA 0.3431 CCAGC 0.2172 CCAGG 0.1621 CCAGT 0.2776 CCATA 0.2651 CCATC 0.1983 CCATG 0.1888 CCATT 0.3477 CCCAA 0.3942 CCCAC 0.203 CCCAG 0.1153 CCCAT 0.2876 CCCCA 0.3449 CCCCC 0.2542 CCCCG 0.07311 CCCCT 0.3278 CCCGA 0.3543 CCCGC 0.1851 CCCGG 0.1558 CCCGT 0.3048 CCCTA 0.2407 CCCTC 0.2377 CCCTG 0.1391 CCCTT 0.3825 CCGAA 0.3452 CCGAC 0.1861 CCGAG 0.1878 CCGAT 0.2809 CCGCA 0.2962 CCGCC 0.2845 CCGCG 0.1269 CCGCT 0.2924 CCGGA 0.3432 CCGGC 0.2073 CCGGG 0.1608 CCGGT 0.2887 CCGTA 0.2174 CCGTC 0.2459 CCGTG 0.1902 CCGTT 0.3464 CCTAA 0.3564 CCTAC 0.1862 CCTAG 0.1562 CCTAT 0.3012 CCTCA 0.311 CCTCC 0.2405 CCTCG 0.09949 CCTCT 0.349 CCTGA 0.3201 CCTGC 0.2235 CCTGG 0.1694 CCTGT 0.287 CCTTA 0.2153 CCTTC 0.2163 CCTTG 0.186 CCTTT 0.3823 CGAAA 0.3837 CGAAC 0.1526 CGAAG 0.1798 CGAAT 0.284 CGACA 0.3461 CGACC 0.1898 CGACG 0.1507 CGACT 0.3133 CGAGA 0.3409 CGAGC 0.1813 CGAGG 0.1938 CGAGT 0.284 CGATA 0.2957 CGATC 0.1728 CGATG 0.1942 CGATT 0.3372 CGCAA 0.3625 CGCAC 0.1816 CGCAG 0.1606 CGCAT 0.2953 CGCCA 0.3522 CGCCC 0.1794 CGCCG 0.1524 CGCCT 0.3161 CGCGA 0.3341 CGCGC 0.1888 CGCGG 0.1747 CGCGT 0.3025 CGCTA 0.2513 CGCTC 0.2219 CGCTG 0.1881 CGCTT 0.3387 CGGAA 0.3282 CGGAC 0.1537 CGGAG 0.2397 CGGAT 0.2784 CGGCA 0.3128 CGGCC 0.2025 CGGCG 0.1833 CGGCT 0.3014 CGGGA 0.3053 CGGGC 0.1634 CGGGG 0.2087 CGGGT 0.3225 CGGTA 0.2585 CGGTC 0.1673 CGGTG 0.2469 CGGTT 0.3273 CGTAA 0.3447 CGTAC 0.1526 CGTAG 0.1771 CGTAT 0.3256 CGTCA 0.3413 CGTCC 0.1931 CGTCG 0.1454 CGTCT 0.3202 CGTGA 0.3296 CGTGC 0.1562 CGTGG 0.2018 CGTGT 0.3124 CGTTA 0.2496 CGTTC 0.1666 CGTTG 0.2035 CGTTT 0.3804 CTAAA 0.3816 CTAAC 0.1521 CTAAG 0.1418 CTAAT 0.3244 CTACA 0.3536 CTACC 0.184 CTACG 0.09129 CTACT 0.3711 CTAGA 0.3233 CTAGC 0.1802 CTAGG 0.1618 CTAGT 0.3347 CTATA 0.2994 CTATC 0.1629 CTATG 0.1742 CTATT 0.3634 CTCAA 0.3974 CTCAC 0.1594 CTCAG 0.1279 CTCAT 0.3153 CTCCA 0.3825 CTCCC 0.1923 CTCCG 0.09649 CTCCT 0.3287 CTCGA 0.3638 CTCGC 0.1848 CTCGG 0.1401 CTCGT 0.3113 CTCTA 0.2398 CTCTC 0.243 CTCTG 0.1475 CTCTT 0.3698 CTGAA 0.3871 CTGAC 0.1339 CTGAG 0.1646 CTGAT 0.3144 CTGCA 0.4036 CTGCC 0.1752 CTGCG 0.06577 CTGCT 0.3554 CTGGA 0.3515 CTGGC 0.1679 CTGGG 0.1618 CTGGT 0.3188 CTGTA 0.254 CTGTC 0.1728 CTGTG 0.1873 CTGTT 0.3859 CTTAA 0.3503 CTTAC 0.1538 CTTAG 0.151 CTTAT 0.3448 CTTCA 0.3604 CTTCC 0.1912 CTTCG 0.08109 CTTCT 0.3673 CTTGA 0.3322 CTTGC 0.1645 CTTGG 0.1759 CTTGT 0.3274 CTTTA 0.2254 CTTTC 0.1778 CTTTG 0.177 CTTTT 0.4198 GAAAA 0.4156 GAAAC 0.1331 GAAAG 0.1642 GAAAT 0.2871 GAACA 0.3829 GAACC 0.1856 GAACG 0.08817 GAACT 0.3434 GAAGA 0.3833 GAAGC 0.1578 GAAGG 0.1841 GAAGT 0.2748 GAATA 0.2897 GAATC 0.1642 GAATG 0.1822 GAATT 0.3639 GACAA 0.3779 GACAC 0.1695 GACAG 0.1371 GACAT 0.3155 GACCA 0.3868 GACCC 0.2052 GACCG 0.08558 GACCT 0.3224 GACGA 0.3749 GACGC 0.1287 GACGG 0.2141 GACGT 0.2823 GACTA 0.2748 GACTC 0.1886 GACTG 0.1541 GACTT 0.3825 GAGAA 0.3769 GAGAC 0.1239 GAGAG 0.231 GAGAT 0.2682 GAGCA 0.3782 GAGCC 0.1727 GAGCG 0.09939 GAGCT 0.3498 GAGGA 0.3652 GAGGC 0.1534 GAGGG 0.2075 GAGGT 0.2739 GAGTA 0.2769 GAGTC 0.1541 GAGTG 0.1966 GAGTT 0.3724 GATAA 0.3498 GATAC 0.1476 GATAG 0.1525 GATAT 0.35 GATCA 0.3881 GATCC 0.1926 GATCG 0.1087 GATCT 0.3105 GATGA 0.3763 GATGC 0.1571 GATGG 0.1916 GATGT 0.275 GATTA 0.2457 GATTC 0.1675 GATTG 0.1837 GATTT 0.4031 GCAAA 0.3719 GCAAC 0.1759 GCAAG 0.1872 GCAAT 0.265 GCACA 0.3851 GCACC 0.2099 GCACG 0.1073 GCACT 0.2976 GCAGA 0.3286 GCAGC 0.2325 GCAGG 0.1824 GCAGT 0.2564 GCATA 0.2923 GCATC 0.1855 GCATG 0.2054 GCATT 0.3168 GCCAA 0.3725 GCCAC 0.1979 GCCAG 0.1436 GCCAT 0.286 GCCCA 0.3906 GCCCC 0.2121 GCCCG 0.08862 GCCCT 0.3087 GCCGA 0.2895 GCCGC 0.2139 GCCGG 0.2156 GCCGT 0.281 GCCTA 0.2519 GCCTC 0.2298 GCCTG 0.159 GCCTT 0.3592 GCGAA 0.3183 GCGAC 0.1538 GCGAG 0.2584 GCGAT 0.2695 GCGCA 0.345 GCGCC 0.2019 GCGCG 0.168 GCGCT 0.2851 GCGGA 0.3484 GCGGC 0.2049 GCGGG 0.1903 GCGGT 0.2564 GCGTA 0.2759 GCGTC 0.1759 GCGTG 0.2343 GCGTT 0.3138 GCTAA 0.3364 GCTAC 0.1733 GCTAG 0.1803 GCTAT 0.3101 GCTCA 0.3512 GCTCC 0.2102 GCTCG 0.1287 GCTCT 0.3099 GCTGA 0.3208 GCTGC 0.2409 GCTGG 0.192 GCTGT 0.2463 GCTTA 0.2261 GCTTC 0.2213 GCTTG 0.2077 GCTTT 0.3449 GGAAA 0.3914 GGAAC 0.1396 GGAAG 0.2236 GGAAT 0.2454 GGACA 0.3866 GGACC 0.1935 GGACG 0.1176 GGACT 0.3023 GGAGA 0.3635 GGAGC 0.1487 GGAGG 0.2352 GGAGT 0.2527 GGATA 0.2846 GGATC 0.1723 GGATG 0.2208 GGATT 0.3223 GGCAA 0.3597 GGCAC 0.1532 GGCAG 0.1857 GGCAT 0.3014 GGCCA 0.3798 GGCCC 0.2024 GGCCG 0.1006 GGCCT 0.3171 GGCGA 0.3436 GGCGC 0.143 GGCGG 0.2468 GGCGT 0.2666 GGCTA 0.2646 GGCTC 0.1884 GGCTG 0.2096 GGCTT 0.3374 GGGAA 0.3636 GGGAC 0.1344 GGGAG 0.2287 GGGAT 0.2733 GGGCA 0.3536 GGGCC 0.2058 GGGCG 0.109 GGGCT 0.3316 GGGGA 0.3023 GGGGC 0.1369 GGGGG 0.2541 GGGGT 0.3066 GGGTA 0.2609 GGGTC 0.1654 GGGTG 0.2376 GGGTT 0.3361 GGTAA 0.3453 GGTAC 0.1564 GGTAG 0.1906 GGTAT 0.3076 GGTCA 0.376 GGTCC 0.2022 GGTCG 0.1166 GGTCT 0.3053 GGTGA 0.3149 GGTGC 0.1515 GGTGG 0.2496 GGTGT 0.2839 GGTTA 0.2383 GGTTC 0.1817 GGTTG 0.2308 GGTTT 0.3493 GTAAA 0.378 GTAAC 0.1488 GTAAG 0.1564 GTAAT 0.3169 GTACA 0.3853 GTACC 0.177 GTACG 0.0922 GTACT 0.3455 GTAGA 0.3319 GTAGC 0.1688 GTAGG 0.1879 GTAGT 0.3114 GTATA 0.3374 GTATC 0.1521 GTATG 0.1757 GTATT 0.3348 GTCAA 0.3846 GTCAC 0.1624 GTCAG 0.1239 GTCAT 0.329 GTCCA 0.4069 GTCCC 0.1764 GTCCG 0.09655 GTCCT 0.3202 GTCGA 0.3597 GTCGC 0.1467 GTCGG 0.1851 GTCGT 0.3084 GTCTA 0.261 GTCTC 0.2029 GTCTG 0.1637 GTCTT 0.3724 GTGAA 0.3744 GTGAC 0.1458 GTGAG 0.1704 GTGAT 0.3094 GTGCA 0.408 GTGCC 0.1674 GTGCG 0.08613 GTGCT 0.3385 GTGGA 0.3444 GTGGC 0.164 GTGGG 0.2019 GTGGT 0.2897 GTGTA 0.2705 GTGTC 0.1614 GTGTG 0.2148 GTGTT 0.3533 GTTAA 0.3299 GTTAC 0.1524 GTTAG 0.1688 GTTAT 0.3488 GTTCA 0.3873 GTTCC 0.1789 GTTCG 0.1031 GTTCT 0.3307 GTTGA 0.3342 GTTGC 0.1579 GTTGG 0.1952 GTTGT 0.3127 GTTTA 0.234 GTTTC 0.1709 GTTTG 0.225 GTTTT 0.3701 TAAAA 0.4207 TAAAC 0.1188 TAAAG 0.1357 TAAAT 0.3248 TAACA 0.3982 TAACC 0.1589 TAACG 0.08624 TAACT 0.3566 TAAGA 0.3495 TAAGC 0.1513 TAAGG 0.172 TAAGT 0.3272 TAATA 0.3146 TAATC 0.1247 TAATG 0.1489 TAATT 0.4118 TACAA 0.3806 TACAC 0.1624 TACAG 0.1152 TACAT 0.3417 TACCA 0.3771 TACCC 0.196 TACCG 0.08006 TACCT 0.3468 TACGA 0.3523 TACGC 0.1457 TACGG 0.1366 TACGT 0.3654 TACTA 0.2928 TACTC 0.1752 TACTG 0.1414 TACTT 0.3906 TAGAA 0.3686 TAGAC 0.1374 TAGAG 0.1966 TAGAT 0.2973 TAGCA 0.3811 TAGCC 0.1679 TAGCG 0.07789 TAGCT 0.3732 TAGGA 0.3475 TAGGC 0.1553 TAGGG 0.194 TAGGT 0.3032 TAGTA 0.2929 TAGTC 0.1421 TAGTG 0.1877 TAGTT 0.3774 TATAA 0.3069 TATAC 0.136 TATAG 0.1164 TATAT 0.4407 TATCA 0.3925 TATCC 0.1685 TATCG 0.09856 TATCT 0.3405 TATGA 0.333 TATGC 0.1533 TATGG 0.1587 TATGT 0.355 TATTA 0.2726 TATTC 0.1299 TATTG 0.1483 TATTT 0.4492 TCAAA 0.3937 TCAAC 0.1611 TCAAG 0.1636 TCAAT 0.2816 TCACA 0.3669 TCACC 0.1982 TCACG 0.1029 TCACT 0.332 TCAGA 0.3384 TCAGC 0.196 TCAGG 0.1654 TCAGT 0.3002 TCATA 0.2771 TCATC 0.194 TCATG 0.1829 TCATT 0.3459 TCCAA 0.3637 TCCAC 0.1844 TCCAG 0.1333 TCCAT 0.3186 TCCCA 0.36 TCCCC 0.2111 TCCCG 0.07465 TCCCT 0.3543 TCCGA 0.3329 TCCGC 0.173 TCCGG 0.1698 TCCGT 0.3243 TCCTA 0.2418 TCCTC 0.2347 TCCTG 0.1377 TCCTT 0.3857 TCGAA 0.3466 TCGAC 0.1433 TCGAG 0.1933 TCGAT 0.3167 TCGCA 0.2786 TCGCC 0.2205 TCGCG 0.1352 TCGCT 0.3657 TCGGA 0.358 TCGGC 0.1481 TCGGG 0.1946 TCGGT 0.2994 TCGTA 0.2536 TCGTC 0.1948 TCGTG 0.2066 TCGTT 0.3449 TCTAA 0.3336 TCTAC 0.1696 TCTAG 0.1611 TCTAT 0.3357 TCTCA 0.3136 TCTCC 0.2053 TCTCG 0.09669 TCTCT 0.3844 TCTGA 0.318 TCTGC 0.1955 TCTGG 0.1741 TCTGT 0.3124 TCTTA 0.2107 TCTTC 0.2169 TCTTG 0.1809 TCTTT 0.3915 TGAAA 0.3782 TGAAC 0.14 TGAAG 0.1951 TGAAT 0.2867 TGACA 0.4045 TGACC 0.1754 TGACG 0.1014 TGACT 0.3188 TGAGA 0.3547 TGAGC 0.1587 TGAGG 0.1943 TGAGT 0.2923 TGATA 0.2897 TGATC 0.1517 TGATG 0.2132 TGATT 0.3454 TGCAA 0.3386 TGCAC 0.1568 TGCAG 0.1796 TGCAT 0.325 TGCCA 0.3845 TGCCC 0.1845 TGCCG 0.08246 TGCCT 0.3485 TGCGA 0.3174 TGCGC 0.1786 TGCGG 0.1878 TGCGT 0.3162 TGCTA 0.2598 TGCTC 0.1784 TGCTG 0.1966 TGCTT 0.3652 TGGAA 0.3369 TGGAC 0.1506 TGGAG 0.2209 TGGAT 0.2915 TGGCA 0.364 TGGCC 0.1908 TGGCG 0.1057 TGGCT 0.3395 TGGGA 0.3285 TGGGC 0.1606 TGGGG 0.2197 TGGGT 0.2912 TGGTA 0.2514 TGGTC 0.1562 TGGTG 0.2509 TGGTT 0.3415 TGTAA 0.3006 TGTAC 0.146 TGTAG 0.157 TGTAT 0.3964 TGTCA 0.3935 TGTCC 0.1834 TGTCG 0.09647 TGTCT 0.3266 TGTGA 0.3149 TGTGC 0.1502 TGTGG 0.1906 TGTGT 0.3444 TGTTA 0.2432 TGTTC 0.1526 TGTTG 0.2219 TGTTT 0.3823 TTAAA 0.4005 TTAAC 0.1271 TTAAG 0.1406 TTAAT 0.3318 TTACA 0.362 TTACC 0.1783 TTACG 0.09498 TTACT 0.3648 TTAGA 0.3223 TTAGC 0.1618 TTAGG 0.1776 TTAGT 0.3384 TTATA 0.3015 TTATC 0.1427 TTATG 0.161 TTATT 0.3948 TTCAA 0.378 TTCAC 0.1584 TTCAG 0.1361 TTCAT 0.3275 TTCCA 0.3643 TTCCC 0.191 TTCCG 0.08253 TTCCT 0.3622 TTCGA 0.3878 TTCGC 0.1354 TTCGG 0.153 TTCGT 0.3238 TTCTA 0.2276 TTCTC 0.2007 TTCTG 0.1486 TTCTT 0.4231 TTGAA 0.3669 TTGAC 0.1419 TTGAG 0.1745 TTGAT 0.3167 TTGCA 0.3802 TTGCC 0.1695 TTGCG 0.07413 TTGCT 0.3762 TTGGA 0.3352 TTGGC 0.1522 TTGGG 0.1934 TTGGT 0.3193 TTGTA 0.2691 TTGTC 0.1528 TTGTG 0.1946 TTGTT 0.3835 TTTAA 0.3543 TTTAC 0.132 TTTAG 0.1443 TTTAT 0.3694 TTTCA 0.3572 TTTCC 0.1711 TTTCG 0.08849 TTTCT 0.3831 TTTGA 0.3446 TTTGC 0.1408 TTTGG 0.1884 TTTGT 0.3262 TTTTA 0.253 TTTTC 0.1629 TTTTG 0.1674 TTTTT 0.4167 [2] # (a,c,g,t)= (0.203, 0.297, 0.297, 0.203) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.347 C 0.153 G 0.153 T 0.347 # l= 1 # Values AA 0.133 AC 0.0482 AG 0.0517 AT 0.114 CA 0.0594 CC 0.0273 CG 0.0146 CT 0.0517 GA 0.0544 GC 0.0231 GG 0.0273 GT 0.0482 TA 0.0998 TC 0.0544 TG 0.0594 TT 0.133 # l= 2 # Values AAA 0.0548 AAC 0.0173 AAG 0.02 AAT 0.0414 ACA 0.0192 ACC 0.00821 ACG 0.00464 ACT 0.0161 AGA 0.0186 AGC 0.00795 AGG 0.00905 AGT 0.0161 ATA 0.0371 ATC 0.0161 ATG 0.0189 ATT 0.0414 CAA 0.0232 CAC 0.00977 CAG 0.00748 CAT 0.0189 CCA 0.0105 CCC 0.00544 CCG 0.00234 CCT 0.00905 CGA 0.00547 CGC 0.00217 CGG 0.00234 CGT 0.00464 CTA 0.014 CTC 0.0102 CTG 0.00748 CTT 0.02 GAA 0.0206 GAC 0.00744 GAG 0.0102 GAT 0.0161 GCA 0.0089 GCC 0.00412 GCG 0.00217 GCT 0.00795 GGA 0.00955 GGC 0.00412 GGG 0.00544 GGT 0.00821 GTA 0.0136 GTC 0.00744 GTG 0.00977 GTT 0.0173 TAA 0.035 TAC 0.0136 TAG 0.014 TAT 0.0371 TCA 0.0207 TCC 0.00955 TCG 0.00547 TCT 0.0186 TGA 0.0207 TGC 0.0089 TGG 0.0105 TGT 0.0192 TTA 0.035 TTC 0.0206 TTG 0.0232 TTT 0.0548 # l= 3 # Values AAAA 0.023 AAAC 0.00649 AAAG 0.00772 AAAT 0.0176 AACA 0.00706 AACC 0.00274 AACG 0.00151 AACT 0.00602 AAGA 0.00742 AAGC 0.00281 AAGG 0.00342 AAGT 0.00634 AATA 0.0136 AATC 0.00551 AATG 0.00637 AATT 0.0159 ACAA 0.00763 ACAC 0.00317 ACAG 0.00219 ACAT 0.00625 ACCA 0.00326 ACCC 0.00163 ACCG 0.000671 ACCT 0.00264 ACGA 0.0017 ACGC 0.000625 ACGG 0.000727 ACGT 0.00158 ACTA 0.00474 ACTC 0.00286 ACTG 0.00215 ACTT 0.00634 AGAA 0.0074 AGAC 0.00234 AGAG 0.00365 AGAT 0.00525 AGCA 0.0031 AGCC 0.00134 AGCG 0.000695 AGCT 0.00282 AGGA 0.00324 AGGC 0.00135 AGGG 0.00182 AGGT 0.00264 AGTA 0.00469 AGTC 0.00232 AGTG 0.00306 AGTT 0.00602 ATAA 0.013 ATAC 0.00482 ATAG 0.00458 ATAT 0.0148 ATCA 0.00654 ATCC 0.0027 ATCG 0.00164 ATCT 0.00525 ATGA 0.00677 ATGC 0.00275 ATGG 0.00317 ATGT 0.00625 ATTA 0.0119 ATTC 0.0056 ATTG 0.00637 ATTT 0.0175 CAAA 0.00937 CAAC 0.00371 CAAG 0.00371 CAAT 0.00637 CACA 0.00375 CACC 0.00195 CACG 0.00101 CACT 0.00306 CAGA 0.00265 CAGC 0.00145 CAGG 0.00123 CAGT 0.00215 CATA 0.00571 CATC 0.00326 CATG 0.00359 CATT 0.00637 CCAA 0.00408 CCAC 0.00197 CCAG 0.00128 CCAT 0.00317 CCCA 0.00195 CCCC 0.00125 CCCG 0.000423 CCCT 0.00182 CCGA 0.000799 CCGC 0.000414 CCGG 0.000398 CCGT 0.000727 CCTA 0.00236 CCTC 0.00204 CCTG 0.00123 CCTT 0.00342 CGAA 0.00193 CGAC 0.000813 CGAG 0.00108 CGAT 0.00164 CGCA 0.000675 CGCC 0.000481 CGCG 0.000317 CGCT 0.000695 CGGA 0.000851 CGGC 0.000392 CGGG 0.000423 CGGT 0.000671 CGTA 0.00127 CGTC 0.000842 CGTG 0.00101 CGTT 0.00151 CTAA 0.00494 CTAC 0.00229 CTAG 0.00222 CTAT 0.00458 CTCA 0.0034 CTCC 0.00209 CTCG 0.00108 CTCT 0.00365 CTGA 0.00251 CTGC 0.0015 CTGG 0.00128 CTGT 0.00219 CTTA 0.00461 CTTC 0.00395 CTTG 0.00371 CTTT 0.00772 GAAA 0.00836 GAAC 0.00267 GAAG 0.00395 GAAT 0.0056 GACA 0.00298 GACC 0.0013 GACG 0.000842 GACT 0.00232 GAGA 0.00387 GAGC 0.00146 GAGG 0.00204 GAGT 0.00286 GATA 0.00494 GATC 0.00243 GATG 0.00326 GATT 0.00551 GCAA 0.00327 GCAC 0.00138 GCAG 0.0015 GCAT 0.00275 GCCA 0.00159 GCCC 0.000795 GCCG 0.000392 GCCT 0.00135 GCGA 0.00079 GCGC 0.000338 GCGG 0.000414 GCGT 0.000625 GCTA 0.00223 GCTC 0.00146 GCTG 0.00145 GCTT 0.00281 GGAA 0.0034 GGAC 0.00136 GGAG 0.00209 GGAT 0.0027 GGCA 0.00149 GGCC 0.000808 GGCG 0.000481 GGCT 0.00134 GGGA 0.00176 GGGC 0.000795 GGGG 0.00125 GGGT 0.00163 GGTA 0.00222 GGTC 0.0013 GGTG 0.00195 GGTT 0.00274 GTAA 0.00455 GTAC 0.00198 GTAG 0.00229 GTAT 0.00482 GTCA 0.00293 GTCC 0.00136 GTCG 0.000813 GTCT 0.00234 GTGA 0.00325 GTGC 0.00138 GTGG 0.00197 GTGT 0.00317 GTTA 0.00445 GTTC 0.00267 GTTG 0.00371 GTTT 0.00649 TAAA 0.014 TAAC 0.00445 TAAG 0.00461 TAAT 0.0119 TACA 0.00546 TACC 0.00222 TACG 0.00127 TACT 0.00469 TAGA 0.0047 TAGC 0.00223 TAGG 0.00236 TAGT 0.00474 TATA 0.0129 TATC 0.00494 TATG 0.00571 TATT 0.0136 TCAA 0.00819 TCAC 0.00325 TCAG 0.00251 TCAT 0.00677 TCCA 0.00369 TCCC 0.00176 TCCG 0.000851 TCCT 0.00324 TCGA 0.00218 TCGC 0.000791 TCGG 0.000799 TCGT 0.0017 TCTA 0.0047 TCTC 0.00387 TCTG 0.00265 TCTT 0.00742 TGAA 0.00785 TGAC 0.00293 TGAG 0.0034 TGAT 0.00654 TGCA 0.00363 TGCC 0.00149 TGCG 0.000675 TGCT 0.0031 TGGA 0.00369 TGGC 0.00159 TGGG 0.00195 TGGT 0.00326 TGTA 0.00546 TGTC 0.00298 TGTG 0.00375 TGTT 0.00706 TTAA 0.0125 TTAC 0.00455 TTAG 0.00494 TTAT 0.013 TTCA 0.00785 TTCC 0.0034 TTCG 0.00193 TTCT 0.0074 TTGA 0.00819 TTGC 0.00327 TTGG 0.00408 TTGT 0.00763 TTTA 0.014 TTTC 0.00836 TTTG 0.00937 TTTT 0.023 # l= 4 # Values AAAAA 0.00979 AAAAC 0.00244 AAAAG 0.00332 AAAAT 0.00748 AAACA 0.00275 AAACC 0.000959 AAACG 0.000585 AAACT 0.0022 AAAGA 0.00298 AAAGC 0.000987 AAAGG 0.00135 AAAGT 0.00241 AAATA 0.00622 AAATC 0.00226 AAATG 0.00272 AAATT 0.00634 AACAA 0.00294 AACAC 0.00112 AACAG 0.000854 AACAT 0.00215 AACCA 0.00111 AACCC 0.000549 AACCG 0.00022 AACCT 0.000855 AACGA 0.000594 AACGC 0.000197 AACGG 0.000259 AACGT 0.000459 AACTA 0.0018 AACTC 0.00107 AACTG 0.000792 AACTT 0.00236 AAGAA 0.00318 AAGAC 0.000879 AAGAG 0.00136 AAGAT 0.002 AAGCA 0.00115 AAGCC 0.000455 AAGCG 0.000234 AAGCT 0.000969 AAGGA 0.00127 AAGGC 0.000485 AAGGG 0.000703 AAGGT 0.000964 AAGTA 0.00186 AAGTC 0.000907 AAGTG 0.00121 AAGTT 0.00236 AATAA 0.00523 AATAC 0.00163 AATAG 0.0017 AATAT 0.00505 AATCA 0.00232 AATCC 0.000879 AATCG 0.000564 AATCT 0.00175 AATGA 0.00238 AATGC 0.000877 AATGG 0.00112 AATGT 0.00199 AATTA 0.00501 AATTC 0.00208 AATTG 0.00248 AATTT 0.00634 ACAAA 0.0031 ACAAC 0.00118 ACAAG 0.00125 ACAAT 0.00211 ACACA 0.00132 ACACC 0.000563 ACACG 0.000326 ACACT 0.000961 ACAGA 0.000842 ACAGC 0.000359 ACAGG 0.000355 ACAGT 0.000637 ACATA 0.00208 ACATC 0.000917 ACATG 0.00126 ACATT 0.00199 ACCAA 0.00132 ACCAC 0.000571 ACCAG 0.000409 ACCAT 0.000959 ACCCA 0.00057 ACCCC 0.000391 ACCCG 0.000139 ACCCT 0.000533 ACCGA 0.000246 ACCGC 0.000106 ACCGG 0.000116 ACCGT 0.000203 ACCTA 0.000724 ACCTC 0.000564 ACCTG 0.000387 ACCTT 0.000964 ACGAA 0.00063 ACGAC 0.000252 ACGAG 0.00034 ACGAT 0.00048 ACGCA 0.00022 ACGCC 0.000129 ACGCG 9.89e-05 ACGCT 0.000177 ACGGA 0.000282 ACGGC 0.000112 ACGGG 0.000131 ACGGT 0.000203 ACGTA 0.000481 ACGTC 0.000243 ACGTG 0.000399 ACGTT 0.000459 ACTAA 0.00171 ACTAC 0.000721 ACTAG 0.000754 ACTAT 0.00156 ACTCA 0.00102 ACTCC 0.000543 ACTCG 0.000312 ACTCT 0.000979 ACTGA 0.00077 ACTGC 0.000389 ACTGG 0.000357 ACTGT 0.000637 ACTTA 0.00155 ACTTC 0.00111 ACTTG 0.00127 ACTTT 0.00241 AGAAA 0.00321 AGAAC 0.000869 AGAAG 0.00146 AGAAT 0.00186 AGACA 0.000966 AGACC 0.000388 AGACG 0.000272 AGACT 0.000711 AGAGA 0.0015 AGAGC 0.00045 AGAGG 0.000723 AGAGT 0.000979 AGATA 0.00168 AGATC 0.000752 AGATG 0.00107 AGATT 0.00175 AGCAA 0.00123 AGCAC 0.000463 AGCAG 0.000533 AGCAT 0.000879 AGCCA 0.000539 AGCCC 0.000263 AGCCG 0.000119 AGCCT 0.000418 AGCGA 0.000299 AGCGC 9.65e-05 AGCGG 0.000122 AGCGT 0.000177 AGCTA 0.000841 AGCTC 0.000509 AGCTG 0.000497 AGCTT 0.000969 AGGAA 0.00124 AGGAC 0.000435 AGGAG 0.000687 AGGAT 0.00088 AGGCA 0.00052 AGGCC 0.000253 AGGCG 0.000155 AGGCT 0.000418 AGGGA 0.000631 AGGGC 0.000242 AGGGG 0.000412 AGGGT 0.000533 AGGTA 0.00077 AGGTC 0.000416 AGGTG 0.000598 AGGTT 0.000855 AGTAA 0.00168 AGTAC 0.000686 AGTAG 0.000855 AGTAT 0.00147 AGTCA 0.000945 AGTCC 0.000406 AGTCG 0.000259 AGTCT 0.000711 AGTGA 0.00109 AGTGC 0.000411 AGTGG 0.000601 AGTGT 0.000961 AGTTA 0.00161 AGTTC 0.000916 AGTTG 0.00129 AGTTT 0.0022 ATAAA 0.00526 ATAAC 0.00157 ATAAG 0.00162 ATAAT 0.0045 ATACA 0.00223 ATACC 0.000689 ATACG 0.00042 ATACT 0.00147 ATAGA 0.0016 ATAGC 0.000695 ATAGG 0.000718 ATAGT 0.00156 ATATA 0.00581 ATATC 0.00175 ATATG 0.00219 ATATT 0.00505 ATCAA 0.00263 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.000797 ATCAT 0.0021 ATCCA 0.00109 ATCCC 0.000483 ATCCG 0.00024 ATCCT 0.00088 ATCGA 0.000711 ATCGC 0.00022 ATCGG 0.00023 ATCGT 0.00048 ATCTA 0.00142 ATCTC 0.00105 ATCTG 0.000783 ATCTT 0.002 ATGAA 0.0026 ATGAC 0.000975 ATGAG 0.00109 ATGAT 0.0021 ATGCA 0.00122 ATGCC 0.000455 ATGCG 0.000204 ATGCT 0.000879 ATGGA 0.00119 ATGGC 0.000453 ATGGG 0.000562 ATGGT 0.000959 ATGTA 0.00191 ATGTC 0.00095 ATGTG 0.00124 ATGTT 0.00215 ATTAA 0.00425 ATTAC 0.00148 ATTAG 0.00164 ATTAT 0.0045 ATTCA 0.00232 ATTCC 0.000851 ATTCG 0.000566 ATTCT 0.00186 ATTGA 0.00235 ATTGC 0.00088 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.00211 ATTTA 0.00465 ATTTC 0.00243 ATTTG 0.00298 ATTTT 0.00748 CAAAA 0.00365 CAAAC 0.00144 CAAAG 0.0013 CAAAT 0.00298 CAACA 0.0015 CAACC 0.000623 CAACG 0.000294 CAACT 0.00129 CAAGA 0.00128 CAAGC 0.000561 CAAGG 0.000599 CAAGT 0.00127 CAATA 0.0019 CAATC 0.000966 CAATG 0.00103 CAATT 0.00248 CACAA 0.00144 CACAC 0.000671 CACAG 0.000397 CACAT 0.00124 CACCA 0.000803 CACCC 0.000385 CACCG 0.000163 CACCT 0.000598 CACGA 0.000337 CACGC 0.000147 CACGG 0.000132 CACGT 0.000399 CACTA 0.000869 CACTC 0.000556 CACTG 0.000425 CACTT 0.00121 CAGAA 0.00101 CAGAC 0.000359 CAGAG 0.000499 CAGAT 0.000783 CAGCA 0.000565 CAGCC 0.000266 CAGCG 0.000126 CAGCT 0.000497 CAGGA 0.000408 CAGGC 0.000201 CAGGG 0.000231 CAGGT 0.000387 CAGTA 0.000607 CAGTC 0.000328 CAGTG 0.000425 CAGTT 0.000792 CATAA 0.00197 CATAC 0.000798 CATAG 0.000751 CATAT 0.00219 CATCA 0.00132 CATCC 0.000575 CATCG 0.000299 CATCT 0.00107 CATGA 0.00119 CATGC 0.00056 CATGG 0.000575 CATGT 0.00126 CATTA 0.00165 CATTC 0.000967 CATTG 0.00103 CATTT 0.00272 CCAAA 0.0017 CCAAC 0.000714 CCAAG 0.000626 CCAAT 0.00103 CCACA 0.000689 CCACC 0.000482 CCACG 0.000199 CCACT 0.000601 CCAGA 0.000441 CCAGC 0.000277 CCAGG 0.000202 CCAGT 0.000357 CCATA 0.00086 CCATC 0.000612 CCATG 0.000575 CCATT 0.00112 CCCAA 0.000779 CCCAC 0.000404 CCCAG 0.000205 CCCAT 0.000562 CCCCA 0.000425 CCCCC 0.000322 CCCCG 8.63e-05 CCCCT 0.000412 CCCGA 0.000151 CCCGC 7.8e-05 CCCGG 6.3e-05 CCCGT 0.000131 CCCTA 0.000457 CCCTC 0.000428 CCCTG 0.000231 CCCTT 0.000703 CCGAA 0.000279 CCGAC 0.000148 CCGAG 0.000142 CCGAT 0.00023 CCGCA 0.000122 CCGCC 0.000117 CCGCG 5.29e-05 CCGCT 0.000122 CCGGA 0.000137 CCGGC 8.21e-05 CCGGG 6.3e-05 CCGGT 0.000116 CCGTA 0.000162 CCGTC 0.000174 CCGTG 0.000132 CCGTT 0.000259 CCTAA 0.000861 CCTAC 0.000429 CCTAG 0.00035 CCTAT 0.000718 CCTCA 0.000636 CCTCC 0.000483 CCTCG 0.000199 CCTCT 0.000723 CCTGA 0.0004 CCTGC 0.00027 CCTGG 0.000202 CCTGT 0.000355 CCTTA 0.000764 CCTTC 0.000713 CCTTG 0.000599 CCTTT 0.00135 CGAAA 0.00075 CGAAC 0.000286 CGAAG 0.000327 CGAAT 0.000566 CGACA 0.000284 CGACC 0.000151 CGACG 0.000119 CGACT 0.000259 CGAGA 0.000382 CGAGC 0.000191 CGAGG 0.000199 CGAGT 0.000312 CGATA 0.000504 CGATC 0.000274 CGATG 0.000299 CGATT 0.000564 CGCAA 0.000249 CGCAC 0.000122 CGCAG 0.000101 CGCAT 0.000204 CGCCA 0.000169 CGCCC 8.67e-05 CGCCG 7.11e-05 CGCCT 0.000155 CGCGA 0.000106 CGCGC 5.95e-05 CGCGG 5.29e-05 CGCGT 9.89e-05 CGCTA 0.000181 CGCTC 0.000155 CGCTG 0.000126 CGCTT 0.000234 CGGAA 0.000278 CGGAC 0.000128 CGGAG 0.000204 CGGAT 0.00024 CGGCA 0.000121 CGGCC 8.06e-05 CGGCG 7.11e-05 CGGCT 0.000119 CGGGA 0.000128 CGGGC 7e-05 CGGGG 8.63e-05 CGGGT 0.000139 CGGTA 0.000178 CGGTC 0.000111 CGGTG 0.000163 CGGTT 0.00022 CGTAA 0.000447 CGTAC 0.000188 CGTAG 0.000216 CGTAT 0.00042 CGTCA 0.000293 CGTCC 0.000159 CGTCG 0.000119 CGTCT 0.000272 CGTGA 0.00034 CGTGC 0.00015 CGTGG 0.000199 CGTGT 0.000326 CGTTA 0.000392 CGTTC 0.000239 CGTTG 0.000294 CGTTT 0.000585 CTAAA 0.00191 CTAAC 0.000727 CTAAG 0.000661 CTAAT 0.00164 CTACA 0.000809 CTACC 0.000413 CTACG 0.000216 CTACT 0.000855 CTAGA 0.000721 CTAGC 0.000394 CTAGG 0.00035 CTAGT 0.000754 CTATA 0.00141 CTATC 0.00072 CTATG 0.000751 CTATT 0.0017 CTCAA 0.00138 CTCAC 0.000539 CTCAG 0.000399 CTCAT 0.00109 CTCCA 0.000802 CTCCC 0.000401 CTCCG 0.000204 CTCCT 0.000687 CTCGA 0.000399 CTCGC 0.000203 CTCGG 0.000142 CTCGT 0.00034 CTCTA 0.000899 CTCTC 0.000895 CTCTG 0.000499 CTCTT 0.00136 CTGAA 0.000979 CTGAC 0.000337 CTGAG 0.000399 CTGAT 0.000797 CTGCA 0.000602 CTGCC 0.000265 CTGCG 0.000101 CTGCT 0.000533 CTGGA 0.000448 CTGGC 0.000215 CTGGG 0.000205 CTGGT 0.000409 CTGTA 0.000565 CTGTC 0.000377 CTGTG 0.000397 CTGTT 0.000854 CTTAA 0.00165 CTTAC 0.000673 CTTAG 0.000661 CTTAT 0.00162 CTTCA 0.00143 CTTCC 0.000731 CTTCG 0.000327 CTTCT 0.00146 CTTGA 0.00125 CTTGC 0.000583 CTTGG 0.000626 CTTGT 0.00125 CTTTA 0.00179 CTTTC 0.00131 CTTTG 0.0013 CTTTT 0.00332 GAAAA 0.00356 GAAAC 0.00105 GAAAG 0.00131 GAAAT 0.00243 GAACA 0.00103 GAACC 0.000481 GAACG 0.000239 GAACT 0.000916 GAAGA 0.00153 GAAGC 0.000598 GAAGG 0.000713 GAAGT 0.00111 GAATA 0.00167 GAATC 0.000879 GAATG 0.000967 GAATT 0.00208 GACAA 0.00115 GACAC 0.000502 GACAG 0.000377 GACAT 0.00095 GACCA 0.000504 GACCC 0.000265 GACCG 0.000111 GACCT 0.000416 GACGA 0.000319 GACGC 0.000105 GACGG 0.000174 GACGT 0.000243 GACTA 0.000657 GACTC 0.00043 GACTG 0.000328 GACTT 0.000907 GAGAA 0.00146 GAGAC 0.00047 GAGAG 0.000895 GAGAT 0.00105 GAGCA 0.000547 GAGCC 0.000253 GAGCG 0.000155 GAGCT 0.000509 GAGGA 0.000744 GAGGC 0.000305 GAGGG 0.000428 GAGGT 0.000564 GAGTA 0.000805 GAGTC 0.00043 GAGTG 0.000556 GAGTT 0.00107 GATAA 0.00176 GATAC 0.000708 GATAG 0.00072 GATAT 0.00175 GATCA 0.000952 GATCC 0.000449 GATCG 0.000274 GATCT 0.000752 GATGA 0.00125 GATGC 0.000486 GATGG 0.000612 GATGT 0.000917 GATTA 0.0014 GATTC 0.000879 GATTG 0.000966 GATTT 0.00226 GCAAA 0.00125 GCAAC 0.000557 GCAAG 0.000583 GCAAT 0.00088 GCACA 0.000536 GCACC 0.000282 GCACG 0.00015 GCACT 0.000411 GCAGA 0.000497 GCAGC 0.000344 GCAGG 0.00027 GCAGT 0.000389 GCATA 0.000829 GCATC 0.000486 GCATG 0.00056 GCATT 0.000877 GCCAA 0.000599 GCCAC 0.00032 GCCAG 0.000215 GCCAT 0.000453 GCCCA 0.000318 GCCCC 0.000165 GCCCG 7e-05 GCCCT 0.000242 GCCGA 0.000115 GCCGC 8.32e-05 GCCGG 8.21e-05 GCCGT 0.000112 GCCTA 0.000355 GCCTC 0.000305 GCCTG 0.000201 GCCTT 0.000485 GCGAA 0.000251 GCGAC 0.000116 GCGAG 0.000203 GCGAT 0.00022 GCGCA 0.000116 GCGCC 6.68e-05 GCGCG 5.95e-05 GCGCT 9.65e-05 GCGGA 0.000146 GCGGC 8.32e-05 GCGGG 7.8e-05 GCGGT 0.000106 GCGTA 0.000176 GCGTC 0.000105 GCGTG 0.000147 GCGTT 0.000197 GCTAA 0.000762 GCTAC 0.000376 GCTAG 0.000394 GCTAT 0.000695 GCTCA 0.00052 GCTCC 0.000301 GCTCG 0.000191 GCTCT 0.00045 GCTGA 0.000473 GCTGC 0.000344 GCTGG 0.000277 GCTGT 0.000359 GCTTA 0.000662 GCTTC 0.000598 GCTTG 0.000561 GCTTT 0.000987 GGAAA 0.00136 GGAAC 0.000456 GGAAG 0.000731 GGAAT 0.000851 GGACA 0.000531 GGACC 0.000262 GGACG 0.000159 GGACT 0.000406 GGAGA 0.000767 GGAGC 0.000301 GGAGG 0.000483 GGAGT 0.000543 GGATA 0.000796 GGATC 0.000449 GGATG 0.000575 GGATT 0.000879 GGCAA 0.000547 GGCAC 0.000225 GGCAG 0.000265 GGCAT 0.000455 GGCCA 0.000305 GGCCC 0.000169 GGCCG 8.06e-05 GGCCT 0.000253 GGCGA 0.000168 GGCGC 6.68e-05 GGCGG 0.000117 GGCGT 0.000129 GGCTA 0.000366 GGCTC 0.000253 GGCTG 0.000266 GGCTT 0.000455 GGGAA 0.00064 GGGAC 0.000238 GGGAG 0.000401 GGGAT 0.000483 GGGCA 0.000277 GGGCC 0.000169 GGGCG 8.67e-05 GGGCT 0.000263 GGGGA 0.000368 GGGGC 0.000165 GGGGG 0.000322 GGGGT 0.000391 GGGTA 0.000434 GGGTC 0.000265 GGGTG 0.000385 GGGTT 0.000549 GGTAA 0.000781 GGTAC 0.000338 GGTAG 0.000413 GGTAT 0.000689 GGTCA 0.000496 GGTCC 0.000262 GGTCG 0.000151 GGTCT 0.000388 GGTGA 0.000623 GGTGC 0.000282 GGTGG 0.000482 GGTGT 0.000563 GGTTA 0.000677 GGTTC 0.000481 GGTTG 0.000623 GGTTT 0.000959 GTAAA 0.00175 GTAAC 0.000655 GTAAG 0.000673 GTAAT 0.00148 GTACA 0.000766 GTACC 0.000338 GTACG 0.000188 GTACT 0.000686 GTAGA 0.000768 GTAGC 0.000376 GTAGG 0.000429 GTAGT 0.000721 GTATA 0.00168 GTATC 0.000708 GTATG 0.000798 GTATT 0.00163 GTCAA 0.00115 GTCAC 0.000469 GTCAG 0.000337 GTCAT 0.000975 GTCCA 0.000557 GTCCC 0.000238 GTCCG 0.000128 GTCCT 0.000435 GTCGA 0.000297 GTCGC 0.000116 GTCGG 0.000148 GTCGT 0.000252 GTCTA 0.000629 GTCTC 0.00047 GTCTG 0.000359 GTCTT 0.000879 GTGAA 0.00123 GTGAC 0.000469 GTGAG 0.000539 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.00057 GTGCC 0.000225 GTGCG 0.000122 GTGCT 0.000463 GTGGA 0.000675 GTGGC 0.00032 GTGGG 0.000404 GTGGT 0.000571 GTGTA 0.000877 GTGTC 0.000502 GTGTG 0.000671 GTGTT 0.00112 GTTAA 0.0015 GTTAC 0.000655 GTTAG 0.000727 GTTAT 0.00157 GTTCA 0.00106 GTTCC 0.000456 GTTCG 0.000286 GTTCT 0.000869 GTTGA 0.00127 GTTGC 0.000557 GTTGG 0.000714 GTTGT 0.00118 GTTTA 0.00157 GTTTC 0.00105 GTTTG 0.00144 GTTTT 0.00244 TAAAA 0.00603 TAAAC 0.00157 TAAAG 0.00179 TAAAT 0.00465 TAACA 0.00177 TAACC 0.000677 TAACG 0.000392 TAACT 0.00161 TAAGA 0.00163 TAAGC 0.000662 TAAGG 0.000764 TAAGT 0.00155 TAATA 0.00381 TAATC 0.0014 TAATG 0.00165 TAATT 0.00501 TACAA 0.00211 TACAC 0.000877 TACAG 0.000565 TACAT 0.00191 TACCA 0.000839 TACCC 0.000434 TACCG 0.000178 TACCT 0.00077 TACGA 0.000452 TACGC 0.000176 TACGG 0.000162 TACGT 0.000481 TACTA 0.00142 TACTC 0.000805 TACTG 0.000607 TACTT 0.00186 TAGAA 0.00175 TAGAC 0.000629 TAGAG 0.000899 TAGAT 0.00142 TAGCA 0.000837 TAGCC 0.000366 TAGCG 0.000181 TAGCT 0.000841 TAGGA 0.000821 TAGGC 0.000355 TAGGG 0.000457 TAGGT 0.000724 TAGTA 0.00142 TAGTC 0.000657 TAGTG 0.000869 TAGTT 0.0018 TATAA 0.00399 TATAC 0.00168 TATAG 0.00141 TATAT 0.00581 TATCA 0.00196 TATCC 0.000796 TATCG 0.000504 TATCT 0.00168 TATGA 0.00194 TATGC 0.000829 TATGG 0.00086 TATGT 0.00208 TATTA 0.00381 TATTC 0.00167 TATTG 0.0019 TATTT 0.00622 TCAAA 0.00331 TCAAC 0.00127 TCAAG 0.00125 TCAAT 0.00235 TCACA 0.0012 TCACC 0.000623 TCACG 0.00034 TCACT 0.00109 TCAGA 0.000869 TCAGC 0.000473 TCAGG 0.0004 TCAGT 0.00077 TCATA 0.00194 TCATC 0.00125 TCATG 0.00119 TCATT 0.00238 TCCAA 0.00138 TCCAC 0.000675 TCCAG 0.000448 TCCAT 0.00119 TCCCA 0.000636 TCCCC 0.000368 TCCCG 0.000128 TCCCT 0.000631 TCCGA 0.000286 TCCGC 0.000146 TCCGG 0.000137 TCCGT 0.000282 TCCTA 0.000821 TCCTC 0.000744 TCCTG 0.000408 TCCTT 0.00127 TCGAA 0.000769 TCGAC 0.000297 TCGAG 0.000399 TCGAT 0.000711 TCGCA 0.000217 TCGCC 0.000168 TCGCG 0.000106 TCGCT 0.000299 TCGGA 0.000286 TCGGC 0.000115 TCGGG 0.000151 TCGGT 0.000246 TCGTA 0.000452 TCGTC 0.000319 TCGTG 0.000337 TCGTT 0.000594 TCTAA 0.00161 TCTAC 0.000768 TCTAG 0.000721 TCTAT 0.0016 TCTCA 0.00122 TCTCC 0.000767 TCTCG 0.000382 TCTCT 0.0015 TCTGA 0.000869 TCTGC 0.000497 TCTGG 0.000441 TCTGT 0.000842 TCTTA 0.00163 TCTTC 0.00153 TCTTG 0.00128 TCTTT 0.00298 TGAAA 0.00304 TGAAC 0.00106 TGAAG 0.00143 TGAAT 0.00232 TGACA 0.00119 TGACC 0.000496 TGACG 0.000293 TGACT 0.000945 TGAGA 0.00122 TGAGC 0.00052 TGAGG 0.000636 TGAGT 0.00102 TGATA 0.00196 TGATC 0.000952 TGATG 0.00132 TGATT 0.00232 TGCAA 0.00125 TGCAC 0.00057 TGCAG 0.000602 TGCAT 0.00122 TGCCA 0.000574 TGCCC 0.000277 TGCCG 0.000121 TGCCT 0.00052 TGCGA 0.000217 TGCGC 0.000116 TGCGG 0.000122 TGCGT 0.00022 TGCTA 0.000837 TGCTC 0.000547 TGCTG 0.000565 TGCTT 0.00115 TGGAA 0.00124 TGGAC 0.000557 TGGAG 0.000802 TGGAT 0.00109 TGGCA 0.000574 TGGCC 0.000305 TGGCG 0.000169 TGGCT 0.000539 TGGGA 0.000636 TGGGC 0.000318 TGGGG 0.000425 TGGGT 0.00057 TGGTA 0.000839 TGGTC 0.000504 TGGTG 0.000803 TGGTT 0.00111 TGTAA 0.00165 TGTAC 0.000766 TGTAG 0.000809 TGTAT 0.00223 TGTCA 0.00119 TGTCC 0.000531 TGTCG 0.000284 TGTCT 0.000966 TGTGA 0.0012 TGTGC 0.000536 TGTGG 0.000689 TGTGT 0.00132 TGTTA 0.00177 TGTTC 0.00103 TGTTG 0.0015 TGTTT 0.00275 TTAAA 0.00511 TTAAC 0.0015 TTAAG 0.00165 TTAAT 0.00425 TTACA 0.00165 TTACC 0.000781 TTACG 0.000447 TTACT 0.00168 TTAGA 0.00161 TTAGC 0.000762 TTAGG 0.000861 TTAGT 0.00171 TTATA 0.00399 TTATC 0.00176 TTATG 0.00197 TTATT 0.00523 TTCAA 0.00304 TTCAC 0.00123 TTCAG 0.000979 TTCAT 0.0026 TTCCA 0.00124 TTCCC 0.00064 TTCCG 0.000278 TTCCT 0.00124 TTCGA 0.000769 TTCGC 0.000251 TTCGG 0.000279 TTCGT 0.00063 TTCTA 0.00175 TTCTC 0.00146 TTCTG 0.00101 TTCTT 0.00318 TTGAA 0.00304 TTGAC 0.00115 TTGAG 0.00138 TTGAT 0.00263 TTGCA 0.00125 TTGCC 0.000547 TTGCG 0.000249 TTGCT 0.00123 TTGGA 0.00138 TTGGC 0.000599 TTGGG 0.000779 TTGGT 0.00132 TTGTA 0.00211 TTGTC 0.00115 TTGTG 0.00144 TTGTT 0.00294 TTTAA 0.00511 TTTAC 0.00175 TTTAG 0.00191 TTTAT 0.00526 TTTCA 0.00304 TTTCC 0.00136 TTTCG 0.00075 TTTCT 0.00321 TTTGA 0.00331 TTTGC 0.00125 TTTGG 0.0017 TTTGT 0.0031 TTTTA 0.00603 TTTTC 0.00356 TTTTG 0.00365 TTTTT 0.00979 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4251 AAAAC 0.1058 AAAAG 0.1442 AAAAT 0.3249 AAACA 0.4236 AAACC 0.1477 AAACG 0.09006 AAACT 0.3387 AAAGA 0.3854 AAAGC 0.1279 AAAGG 0.1743 AAAGT 0.3125 AAATA 0.3546 AAATC 0.129 AAATG 0.1552 AAATT 0.3612 AACAA 0.4161 AACAC 0.1588 AACAG 0.121 AACAT 0.3041 AACCA 0.407 AACCC 0.2003 AACCG 0.08042 AACCT 0.3122 AACGA 0.3938 AACGC 0.1308 AACGG 0.1715 AACGT 0.3039 AACTA 0.2994 AACTC 0.1771 AACTG 0.1316 AACTT 0.3919 AAGAA 0.4293 AAGAC 0.1184 AAGAG 0.183 AAGAT 0.2692 AAGCA 0.4102 AAGCC 0.1619 AAGCG 0.08314 AAGCT 0.3448 AAGGA 0.3709 AAGGC 0.1417 AAGGG 0.2056 AAGGT 0.2818 AAGTA 0.2938 AAGTC 0.1431 AAGTG 0.191 AAGTT 0.3721 AATAA 0.3841 AATAC 0.1199 AATAG 0.1246 AATAT 0.3714 AATCA 0.4204 AATCC 0.1596 AATCG 0.1024 AATCT 0.3176 AATGA 0.374 AATGC 0.1377 AATGG 0.1756 AATGT 0.3126 AATTA 0.3148 AATTC 0.1309 AATTG 0.1557 AATTT 0.3985 ACAAA 0.4065 ACAAC 0.1542 ACAAG 0.1632 ACAAT 0.2761 ACACA 0.4168 ACACC 0.1775 ACACG 0.1026 ACACT 0.303 ACAGA 0.3839 ACAGC 0.1638 ACAGG 0.1618 ACAGT 0.2905 ACATA 0.3323 ACATC 0.1467 ACATG 0.2023 ACATT 0.3187 ACCAA 0.4054 ACCAC 0.175 ACCAG 0.1255 ACCAT 0.2941 ACCCA 0.3493 ACCCC 0.2392 ACCCG 0.08495 ACCCT 0.3265 ACCGA 0.3669 ACCGC 0.1579 ACCGG 0.1729 ACCGT 0.3022 ACCTA 0.2744 ACCTC 0.2135 ACCTG 0.1467 ACCTT 0.3654 ACGAA 0.3701 ACGAC 0.1481 ACGAG 0.2 ACGAT 0.2818 ACGCA 0.3523 ACGCC 0.2062 ACGCG 0.1581 ACGCT 0.2834 ACGGA 0.3881 ACGGC 0.1533 ACGGG 0.1796 ACGGT 0.2789 ACGTA 0.3039 ACGTC 0.1537 ACGTG 0.2524 ACGTT 0.2899 ACTAA 0.3597 ACTAC 0.1519 ACTAG 0.159 ACTAT 0.3295 ACTCA 0.3578 ACTCC 0.1901 ACTCG 0.1094 ACTCT 0.3426 ACTGA 0.3575 ACTGC 0.1805 ACTGG 0.1659 ACTGT 0.296 ACTTA 0.2448 ACTTC 0.1744 ACTTG 0.2002 ACTTT 0.3806 AGAAA 0.4337 AGAAC 0.1174 AGAAG 0.1969 AGAAT 0.2519 AGACA 0.4134 AGACC 0.1659 AGACG 0.1164 AGACT 0.3044 AGAGA 0.4105 AGAGC 0.1234 AGAGG 0.198 AGAGT 0.2681 AGATA 0.3197 AGATC 0.1431 AGATG 0.204 AGATT 0.3332 AGCAA 0.3954 AGCAC 0.1492 AGCAG 0.1718 AGCAT 0.2836 AGCCA 0.4023 AGCCC 0.1966 AGCCG 0.08886 AGCCT 0.3122 AGCGA 0.431 AGCGC 0.1388 AGCGG 0.1752 AGCGT 0.255 AGCTA 0.2989 AGCTC 0.1806 AGCTG 0.1764 AGCTT 0.344 AGGAA 0.3827 AGGAC 0.1341 AGGAG 0.2118 AGGAT 0.2714 AGGCA 0.3862 AGGCC 0.1883 AGGCG 0.1148 AGGCT 0.3108 AGGGA 0.347 AGGGC 0.1331 AGGGG 0.2267 AGGGT 0.2932 AGGTA 0.2916 AGGTC 0.1578 AGGTG 0.2266 AGGTT 0.3241 AGTAA 0.3574 AGTAC 0.1462 AGTAG 0.1823 AGTAT 0.3142 AGTCA 0.4071 AGTCC 0.175 AGTCG 0.1116 AGTCT 0.3064 AGTGA 0.3553 AGTGC 0.1344 AGTGG 0.1963 AGTGT 0.314 AGTTA 0.2672 AGTTC 0.1522 AGTTG 0.2151 AGTTT 0.3655 ATAAA 0.406 ATAAC 0.1212 ATAAG 0.1252 ATAAT 0.3476 ATACA 0.4637 ATACC 0.1431 ATACG 0.08715 ATACT 0.306 ATAGA 0.3499 ATAGC 0.1518 ATAGG 0.1568 ATAGT 0.3415 ATATA 0.3926 ATATC 0.1183 ATATG 0.1477 ATATT 0.3414 ATCAA 0.4014 ATCAC 0.1555 ATCAG 0.1219 ATCAT 0.3213 ATCCA 0.4057 ATCCC 0.1791 ATCCG 0.08907 ATCCT 0.3261 ATCGA 0.4332 ATCGC 0.1343 ATCGG 0.1402 ATCGT 0.2923 ATCTA 0.271 ATCTC 0.1997 ATCTG 0.149 ATCTT 0.3802 ATGAA 0.385 ATGAC 0.1441 ATGAG 0.1604 ATGAT 0.3105 ATGCA 0.4413 ATGCC 0.1653 ATGCG 0.07407 ATGCT 0.3194 ATGGA 0.3766 ATGGC 0.1431 ATGGG 0.1774 ATGGT 0.3029 ATGTA 0.3058 ATGTC 0.1521 ATGTG 0.1984 ATGTT 0.3437 ATTAA 0.3581 ATTAC 0.1243 ATTAG 0.1383 ATTAT 0.3792 ATTCA 0.4139 ATTCC 0.152 ATTCG 0.1011 ATTCT 0.333 ATTGA 0.3693 ATTGC 0.1381 ATTGG 0.162 ATTGT 0.3306 ATTTA 0.2651 ATTTC 0.1387 ATTTG 0.17 ATTTT 0.4261 CAAAA 0.3892 CAAAC 0.1539 CAAAG 0.1384 CAAAT 0.3185 CAACA 0.4046 CAACC 0.1678 CAACG 0.07902 CAACT 0.3486 CAAGA 0.3447 CAAGC 0.1514 CAAGG 0.1617 CAAGT 0.3423 CAATA 0.2986 CAATC 0.1516 CAATG 0.1611 CAATT 0.3886 CACAA 0.3846 CACAC 0.179 CACAG 0.1058 CACAT 0.3306 CACCA 0.4121 CACCC 0.1977 CACCG 0.08347 CACCT 0.3067 CACGA 0.3319 CACGC 0.1446 CACGG 0.1298 CACGT 0.3937 CACTA 0.284 CACTC 0.1816 CACTG 0.1389 CACTT 0.3955 CAGAA 0.3805 CAGAC 0.1355 CAGAG 0.1885 CAGAT 0.2955 CAGCA 0.3887 CAGCC 0.1831 CAGCG 0.0864 CAGCT 0.3418 CAGGA 0.3324 CAGGC 0.1636 CAGGG 0.1882 CAGGT 0.3157 CAGTA 0.2819 CAGTC 0.1526 CAGTG 0.1975 CAGTT 0.368 CATAA 0.3456 CATAC 0.1397 CATAG 0.1316 CATAT 0.3831 CATCA 0.4035 CATCC 0.1762 CATCG 0.09169 CATCT 0.3285 CATGA 0.3325 CATGC 0.1558 CATGG 0.16 CATGT 0.3517 CATTA 0.2592 CATTC 0.1518 CATTG 0.1613 CATTT 0.4277 CCAAA 0.4179 CCAAC 0.1752 CCAAG 0.1536 CCAAT 0.2533 CCACA 0.3497 CCACC 0.2445 CCACG 0.1008 CCACT 0.305 CCAGA 0.3453 CCAGC 0.2165 CCAGG 0.1585 CCAGT 0.2796 CCATA 0.2717 CCATC 0.1934 CCATG 0.1816 CCATT 0.3534 CCCAA 0.3995 CCCAC 0.2072 CCCAG 0.1052 CCCAT 0.2882 CCCCA 0.3413 CCCCC 0.2586 CCCCG 0.0693 CCCCT 0.3309 CCCGA 0.3574 CCCGC 0.1845 CCCGG 0.1491 CCCGT 0.3091 CCCTA 0.2511 CCCTC 0.2351 CCCTG 0.127 CCCTT 0.3868 CCGAA 0.3496 CCGAC 0.1849 CCGAG 0.1774 CCGAT 0.2881 CCGCA 0.2945 CCGCC 0.2832 CCGCG 0.128 CCGCT 0.2943 CCGGA 0.3433 CCGGC 0.2065 CCGGG 0.1584 CCGGT 0.2919 CCGTA 0.223 CCGTC 0.2399 CCGTG 0.181 CCGTT 0.356 CCTAA 0.3653 CCTAC 0.1819 CCTAG 0.1484 CCTAT 0.3044 CCTCA 0.3115 CCTCC 0.2368 CCTCG 0.09735 CCTCT 0.3543 CCTGA 0.3258 CCTGC 0.22 CCTGG 0.1651 CCTGT 0.2892 CCTTA 0.2234 CCTTC 0.2083 CCTTG 0.1751 CCTTT 0.3932 CGAAA 0.3887 CGAAC 0.1485 CGAAG 0.1695 CGAAT 0.2934 CGACA 0.3498 CGACC 0.1855 CGACG 0.146 CGACT 0.3187 CGAGA 0.3527 CGAGC 0.176 CGAGG 0.1832 CGAGT 0.2882 CGATA 0.3072 CGATC 0.1667 CGATG 0.1822 CGATT 0.3439 CGCAA 0.3681 CGCAC 0.1806 CGCAG 0.1492 CGCAT 0.3021 CGCCA 0.3506 CGCCC 0.1803 CGCCG 0.1478 CGCCT 0.3213 CGCGA 0.3332 CGCGC 0.1876 CGCGG 0.1671 CGCGT 0.3121 CGCTA 0.2608 CGCTC 0.2226 CGCTG 0.1806 CGCTT 0.336 CGGAA 0.3269 CGGAC 0.1507 CGGAG 0.24 CGGAT 0.2824 CGGCA 0.3095 CGGCC 0.2056 CGGCG 0.1812 CGGCT 0.3036 CGGGA 0.302 CGGGC 0.1655 CGGGG 0.2043 CGGGT 0.3283 CGGTA 0.2648 CGGTC 0.1646 CGGTG 0.2424 CGGTT 0.3282 CGTAA 0.3519 CGTAC 0.148 CGTAG 0.1699 CGTAT 0.3302 CGTCA 0.3475 CGTCC 0.1885 CGTCG 0.1409 CGTCT 0.3231 CGTGA 0.3352 CGTGC 0.1483 CGTGG 0.1957 CGTGT 0.3209 CGTTA 0.2596 CGTTC 0.1585 CGTTG 0.1945 CGTTT 0.3874 CTAAA 0.387 CTAAC 0.1471 CTAAG 0.1337 CTAAT 0.3322 CTACA 0.3528 CTACC 0.1803 CTACG 0.09416 CTACT 0.3728 CTAGA 0.325 CTAGC 0.1775 CTAGG 0.1577 CTAGT 0.3398 CTATA 0.3082 CTATC 0.1572 CTATG 0.1641 CTATT 0.3704 CTCAA 0.405 CTCAC 0.1585 CTCAG 0.1173 CTCAT 0.3192 CTCCA 0.3829 CTCCC 0.1916 CTCCG 0.09759 CTCCT 0.3279 CTCGA 0.3683 CTCGC 0.1873 CTCGG 0.1306 CTCGT 0.3139 CTCTA 0.2462 CTCTC 0.2452 CTCTG 0.1368 CTCTT 0.3718 CTGAA 0.3897 CTGAC 0.1342 CTGAG 0.1587 CTGAT 0.3174 CTGCA 0.401 CTGCC 0.1766 CTGCG 0.06714 CTGCT 0.3552 CTGGA 0.3508 CTGGC 0.1682 CTGGG 0.1605 CTGGT 0.3205 CTGTA 0.2576 CTGTC 0.1718 CTGTG 0.1809 CTGTT 0.3897 CTTAA 0.359 CTTAC 0.146 CTTAG 0.1434 CTTAT 0.3517 CTTCA 0.3633 CTTCC 0.1851 CTTCG 0.0828 CTTCT 0.3688 CTTGA 0.3377 CTTGC 0.1573 CTTGG 0.169 CTTGT 0.336 CTTTA 0.2317 CTTTC 0.1703 CTTTG 0.168 CTTTT 0.4301 GAAAA 0.4263 GAAAC 0.1253 GAAAG 0.1572 GAAAT 0.2912 GAACA 0.3869 GAACC 0.1802 GAACG 0.08965 GAACT 0.3433 GAAGA 0.3883 GAAGC 0.1514 GAAGG 0.1804 GAAGT 0.2798 GAATA 0.2982 GAATC 0.157 GAATG 0.1728 GAATT 0.3721 GACAA 0.3852 GACAC 0.1689 GACAG 0.1266 GACAT 0.3194 GACCA 0.3892 GACCC 0.2043 GACCG 0.08526 GACCT 0.3213 GACGA 0.3792 GACGC 0.1246 GACGG 0.2072 GACGT 0.2889 GACTA 0.2829 GACTC 0.1851 GACTG 0.1414 GACTT 0.3906 GAGAA 0.3761 GAGAC 0.1214 GAGAG 0.2314 GAGAT 0.2711 GAGCA 0.3737 GAGCC 0.1728 GAGCG 0.1057 GAGCT 0.3477 GAGGA 0.3645 GAGGC 0.1497 GAGGG 0.2096 GAGGT 0.2762 GAGTA 0.2819 GAGTC 0.1504 GAGTG 0.1945 GAGTT 0.3731 GATAA 0.3561 GATAC 0.1434 GATAG 0.1458 GATAT 0.3547 GATCA 0.3925 GATCC 0.1849 GATCG 0.1127 GATCT 0.3098 GATGA 0.3819 GATGC 0.1492 GATGG 0.1878 GATGT 0.2811 GATTA 0.2541 GATTC 0.1595 GATTG 0.1755 GATTT 0.4109 GCAAA 0.382 GCAAC 0.1704 GCAAG 0.1784 GCAAT 0.2692 GCACA 0.3886 GCACC 0.2043 GCACG 0.1091 GCACT 0.2981 GCAGA 0.3316 GCAGC 0.2295 GCAGG 0.1799 GCAGT 0.2591 GCATA 0.3012 GCATC 0.1767 GCATG 0.2034 GCATT 0.3187 GCCAA 0.3777 GCCAC 0.2016 GCCAG 0.1353 GCCAT 0.2854 GCCCA 0.4002 GCCCC 0.2075 GCCCG 0.08795 GCCCT 0.3044 GCCGA 0.2938 GCCGC 0.2122 GCCGG 0.2095 GCCGT 0.2845 GCCTA 0.2639 GCCTC 0.2268 GCCTG 0.1491 GCCTT 0.3602 GCGAA 0.3175 GCGAC 0.1467 GCGAG 0.2569 GCGAT 0.2789 GCGCA 0.3418 GCGCC 0.1973 GCGCG 0.1758 GCGCT 0.2851 GCGGA 0.354 GCGGC 0.2011 GCGGG 0.1885 GCGGT 0.2563 GCGTA 0.282 GCGTC 0.1678 GCGTG 0.2346 GCGTT 0.3157 GCTAA 0.3422 GCTAC 0.1688 GCTAG 0.1769 GCTAT 0.3121 GCTCA 0.3557 GCTCC 0.2057 GCTCG 0.1305 GCTCT 0.308 GCTGA 0.3256 GCTGC 0.2369 GCTGG 0.1903 GCTGT 0.2471 GCTTA 0.2359 GCTTC 0.2129 GCTTG 0.1997 GCTTT 0.3515 GGAAA 0.4004 GGAAC 0.1341 GGAAG 0.2151 GGAAT 0.2503 GGACA 0.3912 GGACC 0.1928 GGACG 0.1169 GGACT 0.2992 GGAGA 0.3662 GGAGC 0.1437 GGAGG 0.2307 GGAGT 0.2594 GGATA 0.295 GGATC 0.1663 GGATG 0.213 GGATT 0.3257 GGCAA 0.3669 GGCAC 0.1505 GGCAG 0.1776 GGCAT 0.305 GGCCA 0.3778 GGCCC 0.2087 GGCCG 0.09979 GGCCT 0.3137 GGCGA 0.3494 GGCGC 0.1388 GGCGG 0.2437 GGCGT 0.2681 GGCTA 0.2735 GGCTC 0.1887 GGCTG 0.1985 GGCTT 0.3393 GGGAA 0.3632 GGGAC 0.1351 GGGAG 0.2276 GGGAT 0.2741 GGGCA 0.3478 GGGCC 0.212 GGGCG 0.109 GGGCT 0.3312 GGGGA 0.2955 GGGGC 0.1324 GGGGG 0.2585 GGGGT 0.3136 GGGTA 0.2659 GGGTC 0.1621 GGGTG 0.236 GGGTT 0.336 GGTAA 0.3515 GGTAC 0.152 GGTAG 0.1861 GGTAT 0.3103 GGTCA 0.3827 GGTCC 0.202 GGTCG 0.1163 GGTCT 0.299 GGTGA 0.3196 GGTGC 0.1446 GGTGG 0.247 GGTGT 0.2888 GGTTA 0.247 GGTTC 0.1755 GGTTG 0.2275 GGTTT 0.35 GTAAA 0.3844 GTAAC 0.1437 GTAAG 0.1478 GTAAT 0.3241 GTACA 0.3874 GTACC 0.1707 GTACG 0.09516 GTACT 0.3467 GTAGA 0.3348 GTAGC 0.1638 GTAGG 0.1871 GTAGT 0.3143 GTATA 0.3487 GTATC 0.1469 GTATG 0.1656 GTATT 0.3387 GTCAA 0.3917 GTCAC 0.16 GTCAG 0.1151 GTCAT 0.3331 GTCCA 0.41 GTCCC 0.1753 GTCCG 0.09445 GTCCT 0.3202 GTCGA 0.3653 GTCGC 0.1427 GTCGG 0.1817 GTCGT 0.3103 GTCTA 0.2694 GTCTC 0.201 GTCTG 0.1537 GTCTT 0.376 GTGAA 0.3776 GTGAC 0.144 GTGAG 0.1657 GTGAT 0.3127 GTGCA 0.4135 GTGCC 0.1628 GTGCG 0.08839 GTGCT 0.3353 GTGGA 0.3427 GTGGC 0.1625 GTGGG 0.205 GTGGT 0.2898 GTGTA 0.2764 GTGTC 0.1584 GTGTG 0.2116 GTGTT 0.3536 GTTAA 0.3367 GTTAC 0.1471 GTTAG 0.1634 GTTAT 0.3528 GTTCA 0.3963 GTTCC 0.1708 GTTCG 0.1073 GTTCT 0.3256 GTTGA 0.341 GTTGC 0.1499 GTTGG 0.1923 GTTGT 0.3168 GTTTA 0.2415 GTTTC 0.1613 GTTTG 0.2221 GTTTT 0.3752 TAAAA 0.4293 TAAAC 0.1117 TAAAG 0.1274 TAAAT 0.3315 TAACA 0.3986 TAACC 0.152 TAACG 0.08806 TAACT 0.3613 TAAGA 0.354 TAAGC 0.1437 TAAGG 0.1658 TAAGT 0.3365 TAATA 0.3212 TAATC 0.1179 TAATG 0.1391 TAATT 0.4219 TACAA 0.3858 TACAC 0.1606 TACAG 0.1035 TACAT 0.3501 TACCA 0.3777 TACCC 0.1956 TACCG 0.08007 TACCT 0.3466 TACGA 0.3553 TACGC 0.1387 TACGG 0.1276 TACGT 0.3784 TACTA 0.3019 TACTC 0.1717 TACTG 0.1294 TACTT 0.397 TAGAA 0.3724 TAGAC 0.1338 TAGAG 0.1911 TAGAT 0.3026 TAGCA 0.376 TAGCC 0.1646 TAGCG 0.08142 TAGCT 0.378 TAGGA 0.3484 TAGGC 0.1507 TAGGG 0.1937 TAGGT 0.3072 TAGTA 0.2985 TAGTC 0.1384 TAGTG 0.1832 TAGTT 0.3798 TATAA 0.3097 TATAC 0.1302 TATAG 0.1094 TATAT 0.4507 TATCA 0.3964 TATCC 0.1613 TATCG 0.1021 TATCT 0.3402 TATGA 0.3404 TATGC 0.1453 TATGG 0.1507 TATGT 0.3637 TATTA 0.2802 TATTC 0.1227 TATTG 0.1399 TATTT 0.4573 TCAAA 0.4048 TCAAC 0.1547 TCAAG 0.1529 TCAAT 0.2876 TCACA 0.3697 TCACC 0.1915 TCACG 0.1045 TCACT 0.3342 TCAGA 0.3461 TCAGC 0.1884 TCAGG 0.1591 TCAGT 0.3064 TCATA 0.2872 TCATC 0.1841 TCATG 0.1766 TCATT 0.3522 TCCAA 0.373 TCCAC 0.1828 TCCAG 0.1213 TCCAT 0.3229 TCCCA 0.3606 TCCCC 0.2089 TCCCG 0.07242 TCCCT 0.3581 TCCGA 0.3359 TCCGC 0.172 TCCGG 0.1604 TCCGT 0.3316 TCCTA 0.2534 TCCTC 0.2294 TCCTG 0.1257 TCCTT 0.3915 TCGAA 0.3535 TCGAC 0.1364 TCGAG 0.1835 TCGAT 0.3266 TCGCA 0.275 TCGCC 0.2125 TCGCG 0.1336 TCGCT 0.3789 TCGGA 0.3581 TCGGC 0.1443 TCGGG 0.1892 TCGGT 0.3085 TCGTA 0.2654 TCGTC 0.1876 TCGTG 0.1978 TCGTT 0.3493 TCTAA 0.343 TCTAC 0.1632 TCTAG 0.1534 TCTAT 0.3405 TCTCA 0.3157 TCTCC 0.1981 TCTCG 0.09885 TCTCT 0.3874 TCTGA 0.3281 TCTGC 0.1877 TCTGG 0.1665 TCTGT 0.3177 TCTTA 0.22 TCTTC 0.2068 TCTTG 0.1722 TCTTT 0.401 TGAAA 0.3873 TGAAC 0.1348 TGAAG 0.1828 TGAAT 0.2951 TGACA 0.4079 TGACC 0.1694 TGACG 0.09992 TGACT 0.3228 TGAGA 0.3593 TGAGC 0.153 TGAGG 0.187 TGAGT 0.3007 TGATA 0.2991 TGATC 0.1456 TGATG 0.2012 TGATT 0.3541 TGCAA 0.3431 TGCAC 0.157 TGCAG 0.1655 TGCAT 0.3344 TGCCA 0.3849 TGCCC 0.1854 TGCCG 0.08135 TGCCT 0.3484 TGCGA 0.322 TGCGC 0.1713 TGCGG 0.1804 TGCGT 0.3263 TGCTA 0.2699 TGCTC 0.1763 TGCTG 0.1821 TGCTT 0.3716 TGGAA 0.3356 TGGAC 0.1508 TGGAG 0.2171 TGGAT 0.2965 TGGCA 0.3618 TGGCC 0.1924 TGGCG 0.1062 TGGCT 0.3397 TGGGA 0.326 TGGGC 0.1633 TGGGG 0.2181 TGGGT 0.2926 TGGTA 0.2571 TGGTC 0.1547 TGGTG 0.2463 TGGTT 0.3419 TGTAA 0.3023 TGTAC 0.1404 TGTAG 0.1482 TGTAT 0.4092 TGTCA 0.4013 TGTCC 0.1785 TGTCG 0.09552 TGTCT 0.3246 TGTGA 0.3208 TGTGC 0.143 TGTGG 0.1837 TGTGT 0.3525 TGTTA 0.2512 TGTTC 0.1463 TGTTG 0.2129 TGTTT 0.3896 TTAAA 0.4085 TTAAC 0.1197 TTAAG 0.1322 TTAAT 0.3396 TTACA 0.3622 TTACC 0.1714 TTACG 0.09824 TTACT 0.3681 TTAGA 0.3264 TTAGC 0.1541 TTAGG 0.1742 TTAGT 0.3453 TTATA 0.3084 TTATC 0.1357 TTATG 0.1523 TTATT 0.4036 TTCAA 0.387 TTCAC 0.1565 TTCAG 0.1247 TTCAT 0.3318 TTCCA 0.3646 TTCCC 0.1884 TTCCG 0.08187 TTCCT 0.3651 TTCGA 0.3987 TTCGC 0.1301 TTCGG 0.1447 TTCGT 0.3265 TTCTA 0.2367 TTCTC 0.1967 TTCTG 0.1362 TTCTT 0.4304 TTGAA 0.371 TTGAC 0.1401 TTGAG 0.1682 TTGAT 0.3207 TTGCA 0.3815 TTGCC 0.1675 TTGCG 0.07604 TTGCT 0.375 TTGGA 0.3377 TTGGC 0.147 TTGGG 0.191 TTGGT 0.3243 TTGTA 0.2759 TTGTC 0.1502 TTGTG 0.189 TTGTT 0.3849 TTTAA 0.3643 TTTAC 0.1247 TTTAG 0.1363 TTTAT 0.3747 TTTCA 0.3636 TTTCC 0.1628 TTTCG 0.0897 TTTCT 0.3839 TTTGA 0.3537 TTTGC 0.1333 TTTGG 0.1819 TTTGT 0.3311 TTTTA 0.2617 TTTTC 0.1548 TTTTG 0.1584 TTTTT 0.4251