[1] # (a,c,g,t)= (0.297, 0.203, 0.203, 0.297) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.295 C 0.205 G 0.205 T 0.295 # l= 1 # Values AA 0.0975 AC 0.0529 AG 0.0577 AT 0.0868 CA 0.0645 CC 0.0469 CG 0.036 CT 0.0577 GA 0.0586 GC 0.0468 GG 0.0469 GT 0.0529 TA 0.0743 TC 0.0586 TG 0.0645 TT 0.0975 # l= 2 # Values AAA 0.0375 AAC 0.0163 AAG 0.0171 AAT 0.0266 ACA 0.018 ACC 0.0114 ACG 0.00864 ACT 0.0148 AGA 0.0178 AGC 0.0125 AGG 0.0126 AGT 0.0148 ATA 0.0248 ATC 0.0163 ATG 0.0191 ATT 0.0266 CAA 0.0201 CAC 0.0135 CAG 0.0118 CAT 0.0191 CCA 0.0149 CCC 0.0102 CCG 0.00926 CCT 0.0126 CGA 0.00937 CGC 0.00875 CGG 0.00926 CGT 0.00864 CTA 0.0146 CTC 0.0142 CTG 0.0118 CTT 0.0171 GAA 0.0179 GAC 0.0101 GAG 0.0142 GAT 0.0163 GCA 0.0139 GCC 0.0115 GCG 0.00875 GCT 0.0125 GGA 0.0138 GGC 0.0115 GGG 0.0102 GGT 0.0114 GTA 0.013 GTC 0.0101 GTG 0.0135 GTT 0.0163 TAA 0.0219 TAC 0.013 TAG 0.0146 TAT 0.0248 TCA 0.0176 TCC 0.0138 TCG 0.00937 TCT 0.0178 TGA 0.0176 TGC 0.0139 TGG 0.0149 TGT 0.018 TTA 0.0219 TTC 0.0179 TTG 0.0201 TTT 0.0375 # l= 3 # Values AAAA 0.0153 AAAC 0.006 AAAG 0.00574 AAAT 0.0105 AACA 0.0058 AACC 0.00337 AACG 0.00215 AACT 0.00496 AAGA 0.00563 AAGC 0.00337 AAGG 0.00348 AAGT 0.00464 AATA 0.00776 AATC 0.00468 AATG 0.00488 AATT 0.00928 ACAA 0.00589 ACAC 0.00358 ACAG 0.00308 ACAT 0.00546 ACCA 0.00407 ACCC 0.00222 ACCG 0.00218 ACCT 0.00294 ACGA 0.00254 ACGC 0.00173 ACGG 0.00223 ACGT 0.00214 ACTA 0.00422 ACTC 0.003 ACTG 0.00293 ACTT 0.00464 AGAA 0.00601 AGAC 0.00248 AGAG 0.00434 AGAT 0.00495 AGCA 0.0042 AGCC 0.00268 AGCG 0.0018 AGCT 0.00387 AGGA 0.00419 AGGC 0.00258 AGGG 0.00288 AGGT 0.00294 AGTA 0.00433 AGTC 0.00237 AGTG 0.00314 AGTT 0.00496 ATAA 0.0072 ATAC 0.00377 ATAG 0.00406 ATAT 0.00977 ATCA 0.00536 ATCC 0.0035 ATCG 0.00248 ATCT 0.00495 ATGA 0.00537 ATGC 0.00391 ATGG 0.00431 ATGT 0.00546 ATTA 0.00692 ATTC 0.00431 ATTG 0.00488 ATTT 0.0105 CAAA 0.00735 CAAC 0.00404 CAAG 0.00387 CAAT 0.00488 CACA 0.0045 CACC 0.00344 CACG 0.00239 CACT 0.00314 CAGA 0.00323 CAGC 0.0032 CAGG 0.00243 CAGT 0.00293 CATA 0.00469 CATC 0.00439 CATG 0.00509 CATT 0.00488 CCAA 0.00456 CCAC 0.00359 CCAG 0.00244 CCAT 0.00431 CCCA 0.00306 CCCC 0.00255 CCCG 0.00171 CCCT 0.00288 CCGA 0.00207 CCGC 0.0027 CCGG 0.00226 CCGT 0.00223 CCTA 0.00285 CCTC 0.00381 CCTG 0.00243 CCTT 0.00348 CGAA 0.00236 CGAC 0.00221 CGAG 0.00232 CGAT 0.00248 CGCA 0.0018 CGCC 0.0031 CGCG 0.00205 CGCT 0.0018 CGGA 0.00209 CGGC 0.00329 CGGG 0.00171 CGGT 0.00218 CGTA 0.00168 CGTC 0.00242 CGTG 0.00239 CGTT 0.00215 CTAA 0.00424 CTAC 0.003 CTAG 0.00327 CTAT 0.00406 CTCA 0.00336 CTCC 0.00419 CTCG 0.00232 CTCT 0.00434 CTGA 0.00318 CTGC 0.00311 CTGG 0.00244 CTGT 0.00308 CTTA 0.0035 CTTC 0.004 CTTG 0.00387 CTTT 0.00574 GAAA 0.00664 GAAC 0.00297 GAAG 0.004 GAAT 0.00431 GACA 0.00323 GACC 0.0021 GACG 0.00242 GACT 0.00237 GAGA 0.00461 GAGC 0.00279 GAGG 0.00381 GAGT 0.003 GATA 0.00378 GATC 0.00344 GATG 0.00439 GATT 0.00468 GCAA 0.00408 GCAC 0.00285 GCAG 0.00311 GCAT 0.00391 GCCA 0.00335 GCCC 0.00232 GCCG 0.00329 GCCT 0.00258 GCGA 0.00209 GCGC 0.00223 GCGG 0.0027 GCGT 0.00173 GCTA 0.00318 GCTC 0.00279 GCTG 0.0032 GCTT 0.00337 GGAA 0.00381 GGAC 0.00228 GGAG 0.00419 GGAT 0.0035 GGCA 0.00294 GGCC 0.00282 GGCG 0.0031 GGCT 0.00268 GGGA 0.00309 GGGC 0.00232 GGGG 0.00255 GGGT 0.00222 GGTA 0.00251 GGTC 0.0021 GGTG 0.00344 GGTT 0.00337 GTAA 0.00341 GTAC 0.00284 GTAG 0.003 GTAT 0.00377 GTCA 0.00315 GTCC 0.00228 GTCG 0.00221 GTCT 0.00248 GTGA 0.00346 GTGC 0.00285 GTGG 0.00359 GTGT 0.00358 GTTA 0.00326 GTTC 0.00297 GTTG 0.00404 GTTT 0.006 TAAA 0.00825 TAAC 0.00326 TAAG 0.0035 TAAT 0.00692 TACA 0.0045 TACC 0.00251 TACG 0.00168 TACT 0.00433 TAGA 0.00432 TAGC 0.00318 TAGG 0.00285 TAGT 0.00422 TATA 0.00857 TATC 0.00378 TATG 0.00469 TATT 0.00776 TCAA 0.00561 TCAC 0.00345 TCAG 0.00318 TCAT 0.00537 TCCA 0.00442 TCCC 0.00309 TCCG 0.00209 TCCT 0.00419 TCGA 0.00266 TCGC 0.00209 TCGG 0.00207 TCGT 0.00254 TCTA 0.00432 TCTC 0.0046 TCTG 0.00323 TCTT 0.00563 TGAA 0.00575 TGAC 0.00315 TGAG 0.00336 TGAT 0.00536 TGCA 0.00501 TGCC 0.00294 TGCG 0.0018 TGCT 0.00419 TGGA 0.00443 TGGC 0.00335 TGGG 0.00305 TGGT 0.00407 TGTA 0.0045 TGTC 0.00323 TGTG 0.0045 TGTT 0.0058 TTAA 0.00708 TTAC 0.00341 TTAG 0.00424 TTAT 0.0072 TTCA 0.00575 TTCC 0.00381 TTCG 0.00236 TTCT 0.00601 TTGA 0.00561 TTGC 0.00407 TTGG 0.00456 TTGT 0.0059 TTTA 0.00825 TTTC 0.00664 TTTG 0.00735 TTTT 0.0153 # l= 4 # Values AAAAA 0.00657 AAAAC 0.00222 AAAAG 0.0023 AAAAT 0.00422 AAACA 0.00222 AAACC 0.0012 AAACG 0.000759 AAACT 0.00183 AAAGA 0.00195 AAAGC 0.000971 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.00167 AAATA 0.00331 AAATC 0.00175 AAATG 0.00183 AAATT 0.00361 AACAA 0.00207 AACAC 0.00108 AACAG 0.000972 AACAT 0.00167 AACCA 0.00128 AACCC 0.000658 AACCG 0.000605 AACCT 0.000825 AACGA 0.000704 AACGC 0.000365 AACGG 0.000576 AACGT 0.000501 AACTA 0.00139 AACTC 0.000939 AACTG 0.000894 AACTT 0.00173 AAGAA 0.00217 AAGAC 0.000759 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.00149 AAGCA 0.00124 AAGCC 0.000684 AAGCG 0.000415 AAGCT 0.00103 AAGGA 0.00122 AAGGC 0.000676 AAGGG 0.000782 AAGGT 0.000808 AAGTA 0.00125 AAGTC 0.000756 AAGTG 0.000903 AAGTT 0.00173 AATAA 0.00262 AATAC 0.00117 AATAG 0.00125 AATAT 0.00272 AATCA 0.00161 AATCC 0.00101 AATCG 0.000597 AATCT 0.00147 AATGA 0.00145 AATGC 0.000943 AATGG 0.00112 AATGT 0.00136 AATTA 0.00266 AATTC 0.00146 AATTG 0.00156 AATTT 0.00361 ACAAA 0.00215 ACAAC 0.00114 ACAAG 0.00117 ACAAT 0.00143 ACACA 0.0014 ACACC 0.00078 ACACG 0.000598 ACACT 0.000801 ACAGA 0.000914 ACAGC 0.000705 ACAGG 0.000641 ACAGT 0.000822 ACATA 0.00155 ACATC 0.00106 ACATG 0.00149 ACATT 0.00136 ACCAA 0.0013 ACCAC 0.000958 ACCAG 0.000672 ACCAT 0.00114 ACCCA 0.000738 ACCCC 0.000528 ACCCG 0.00035 ACCCT 0.000608 ACCGA 0.000543 ACCGC 0.000533 ACCGG 0.000565 ACCGT 0.000539 ACCTA 0.000739 ACCTC 0.000771 ACCTG 0.000619 ACCTT 0.000808 ACGAA 0.000763 ACGAC 0.000579 ACGAG 0.000611 ACGAT 0.00059 ACGCA 0.000472 ACGCC 0.000478 ACGCG 0.0004 ACGCT 0.000377 ACGGA 0.000612 ACGGC 0.000662 ACGGG 0.000416 ACGGT 0.000539 ACGTA 0.000549 ACGTC 0.000445 ACGTG 0.000643 ACGTT 0.000501 ACTAA 0.00125 ACTAC 0.000931 ACTAG 0.000882 ACTAT 0.00116 ACTCA 0.000839 ACTCC 0.000869 ACTCG 0.00045 ACTCT 0.000846 ACTGA 0.000829 ACTGC 0.000692 ACTGG 0.000591 ACTGT 0.000822 ACTTA 0.00103 ACTTC 0.000898 ACTTG 0.00104 ACTTT 0.00167 AGAAA 0.00247 AGAAC 0.000898 AGAAG 0.0014 AGAAT 0.00124 AGACA 0.000849 AGACC 0.00051 AGACG 0.000506 AGACT 0.000612 AGAGA 0.00172 AGAGC 0.000722 AGAGG 0.00106 AGAGT 0.000846 AGATA 0.00128 AGATC 0.000945 AGATG 0.00125 AGATT 0.00147 AGCAA 0.00134 AGCAC 0.000807 AGCAG 0.000943 AGCAT 0.00111 AGCCA 0.000902 AGCCC 0.00054 AGCCG 0.000589 AGCCT 0.000647 AGCGA 0.000516 AGCGC 0.000397 AGCGG 0.000511 AGCGT 0.000377 AGCTA 0.0011 AGCTC 0.000849 AGCTG 0.000889 AGCTT 0.00103 AGGAA 0.00134 AGGAC 0.000611 AGGAG 0.00128 AGGAT 0.000958 AGGCA 0.000765 AGGCC 0.000637 AGGCG 0.000531 AGGCT 0.000647 AGGGA 0.00099 AGGGC 0.000525 AGGGG 0.000753 AGGGT 0.000608 AGGTA 0.000732 AGGTC 0.000518 AGGTG 0.000863 AGGTT 0.000825 AGTAA 0.00113 AGTAC 0.000964 AGTAG 0.00101 AGTAT 0.00122 AGTCA 0.000809 AGTCC 0.000559 AGTCG 0.000394 AGTCT 0.000612 AGTGA 0.000892 AGTGC 0.000644 AGTGG 0.000805 AGTGT 0.000801 AGTTA 0.0011 AGTTC 0.000869 AGTTG 0.00116 AGTTT 0.00183 ATAAA 0.00282 ATAAC 0.000979 ATAAG 0.00121 ATAAT 0.00219 ATACA 0.00139 ATACC 0.000697 ATACG 0.000462 ATACT 0.00122 ATAGA 0.00132 ATAGC 0.000789 ATAGG 0.000793 ATAGT 0.00116 ATATA 0.00389 ATATC 0.00126 ATATG 0.0019 ATATT 0.00272 ATCAA 0.00178 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.000922 ATCAT 0.00164 ATCCA 0.00128 ATCCC 0.000705 ATCCG 0.000554 ATCCT 0.000958 ATCGA 0.00087 ATCGC 0.000444 ATCGG 0.000576 ATCGT 0.00059 ATCTA 0.00135 ATCTC 0.00113 ATCTG 0.00098 ATCTT 0.00149 ATGAA 0.00182 ATGAC 0.000904 ATGAG 0.00101 ATGAT 0.00164 ATGCA 0.00157 ATGCC 0.000773 ATGCG 0.000467 ATGCT 0.00111 ATGGA 0.00139 ATGGC 0.000944 ATGGG 0.000835 ATGGT 0.00114 ATGTA 0.00147 ATGTC 0.000895 ATGTG 0.00142 ATGTT 0.00167 ATTAA 0.00236 ATTAC 0.00103 ATTAG 0.00134 ATTAT 0.00219 ATTCA 0.00155 ATTCC 0.000914 ATTCG 0.000599 ATTCT 0.00124 ATTGA 0.00142 ATTGC 0.000979 ATTGG 0.00105 ATTGT 0.00143 ATTTA 0.00242 ATTTC 0.00171 ATTTG 0.00215 ATTTT 0.00422 CAAAA 0.00259 CAAAC 0.0014 CAAAG 0.0012 CAAAT 0.00215 CAACA 0.00136 CAACC 0.000911 CAACG 0.000602 CAACT 0.00116 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.000884 CAAGG 0.000797 CAAGT 0.00104 CAATA 0.00128 CAATC 0.000961 CAATG 0.00108 CAATT 0.00156 CACAA 0.00133 CACAC 0.00102 CACAG 0.000724 CACAT 0.00142 CACCA 0.00117 CACCC 0.000673 CACCG 0.000734 CACCT 0.000863 CACGA 0.000568 CACGC 0.000594 CACGG 0.000587 CACGT 0.000643 CACTA 0.00083 CACTC 0.000644 CACTG 0.000764 CACTT 0.000903 CAGAA 0.000992 CAGAC 0.0005 CAGAG 0.000761 CAGAT 0.00098 CAGCA 0.00101 CAGCC 0.000748 CAGCG 0.000558 CAGCT 0.000889 CAGGA 0.000715 CAGGC 0.000572 CAGGG 0.000529 CAGGT 0.000619 CAGTA 0.000781 CAGTC 0.000493 CAGTG 0.000764 CAGTT 0.000894 CATAA 0.00122 CATAC 0.000822 CATAG 0.000749 CATAT 0.0019 CATCA 0.00143 CATCC 0.000994 CATCG 0.000717 CATCT 0.00125 CATGA 0.00125 CATGC 0.00122 CATGG 0.00112 CATGT 0.00149 CATTA 0.00109 CATTC 0.000876 CATTG 0.00108 CATTT 0.00183 CCAAA 0.00169 CCAAC 0.000985 CCAAG 0.000835 CCAAT 0.00105 CCACA 0.001 CCACC 0.00114 CCACG 0.000642 CCACT 0.000805 CCAGA 0.000625 CCAGC 0.00072 CCAGG 0.000502 CCAGT 0.000591 CCATA 0.000923 CCATC 0.00114 CCATG 0.00112 CCATT 0.00112 CCCAA 0.000947 CCCAC 0.000801 CCCAG 0.000471 CCCAT 0.000835 CCCCA 0.000658 CCCCC 0.000727 CCCCG 0.000413 CCCCT 0.000753 CCCGA 0.000373 CCCGC 0.000503 CCCGG 0.000416 CCCGT 0.000416 CCCTA 0.000601 CCCTC 0.000964 CCCTG 0.000529 CCCTT 0.000782 CCGAA 0.000494 CCGAC 0.000509 CCGAG 0.000494 CCGAT 0.000576 CCGCA 0.00045 CCGCC 0.00117 CCGCG 0.000565 CCGCT 0.000511 CCGGA 0.000464 CCGGC 0.000815 CCGGG 0.000416 CCGGT 0.000565 CCGTA 0.000367 CCGTC 0.000699 CCGTG 0.000587 CCGTT 0.000576 CCTAA 0.000862 CCTAC 0.000592 CCTAG 0.000605 CCTAT 0.000793 CCTCA 0.000747 CCTCC 0.00137 CCTCG 0.000633 CCTCT 0.00106 CCTGA 0.000621 CCTGC 0.000671 CCTGG 0.000502 CCTGT 0.000641 CCTTA 0.000661 CCTTC 0.000884 CCTTG 0.000797 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.000754 CGAAC 0.000482 CGAAG 0.000525 CGAAT 0.000599 CGACA 0.000546 CGACC 0.000463 CGACG 0.000806 CGACT 0.000394 CGAGA 0.000613 CGAGC 0.000626 CGAGG 0.000633 CGAGT 0.00045 CGATA 0.00045 CGATC 0.000716 CGATG 0.000717 CGATT 0.000597 CGCAA 0.00044 CGCAC 0.000484 CGCAG 0.000406 CGCAT 0.000467 CGCCA 0.000698 CGCCC 0.000539 CGCCG 0.00134 CGCCT 0.000531 CGCGA 0.000387 CGCGC 0.000698 CGCGG 0.000565 CGCGT 0.0004 CGCTA 0.00035 CGCTC 0.000477 CGCTG 0.000558 CGCTT 0.000415 CGGAA 0.000474 CGGAC 0.000368 CGGAG 0.000691 CGGAT 0.000554 CGGCA 0.000605 CGGCC 0.000757 CGGCG 0.00134 CGGCT 0.000589 CGGGA 0.000461 CGGGC 0.000483 CGGGG 0.000413 CGGGT 0.00035 CGGTA 0.000369 CGGTC 0.000473 CGGTG 0.000734 CGGTT 0.000605 CGTAA 0.000367 CGTAC 0.000458 CGTAG 0.000398 CGTAT 0.000462 CGTCA 0.000561 CGTCC 0.000544 CGTCG 0.000806 CGTCT 0.000506 CGTGA 0.000495 CGTGC 0.000657 CGTGG 0.000642 CGTGT 0.000598 CGTTA 0.000339 CGTTC 0.000447 CGTTG 0.000602 CGTTT 0.000759 CTAAA 0.00158 CTAAC 0.000696 CTAAG 0.000633 CTAAT 0.00134 CTACA 0.000957 CTACC 0.000636 CTACG 0.000398 CTACT 0.00101 CTAGA 0.000908 CTAGC 0.000872 CTAGG 0.000605 CTAGT 0.000882 CTATA 0.00131 CTATC 0.000753 CTATG 0.000749 CTATT 0.00125 CTCAA 0.00105 CTCAC 0.000748 CTCAG 0.000552 CTCAT 0.00101 CTCCA 0.00117 CTCCC 0.00104 CTCCG 0.000691 CTCCT 0.00128 CTCGA 0.000588 CTCGC 0.000628 CTCGG 0.000494 CTCGT 0.000611 CTCTA 0.000922 CTCTC 0.00145 CTCTG 0.000761 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00111 CTGAC 0.000598 CTGAG 0.000552 CTGAT 0.000922 CTGCA 0.00104 CTGCC 0.000721 CTGCG 0.000406 CTGCT 0.000943 CTGGA 0.000714 CTGGC 0.000581 CTGGG 0.000471 CTGGT 0.000672 CTGTA 0.000752 CTGTC 0.000634 CTGTG 0.000724 CTGTT 0.000972 CTTAA 0.00109 CTTAC 0.000561 CTTAG 0.000633 CTTAT 0.00121 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.000971 CTTCG 0.000525 CTTCT 0.0014 CTTGA 0.00097 CTTGC 0.000898 CTTGG 0.000835 CTTGT 0.00117 CTTTA 0.00112 CTTTC 0.00112 CTTTG 0.0012 CTTTT 0.0023 GAAAA 0.00272 GAAAC 0.00109 GAAAG 0.00112 GAAAT 0.00171 GAACA 0.00107 GAACC 0.000588 GAACG 0.000447 GAACT 0.000869 GAAGA 0.00143 GAAGC 0.000792 GAAGG 0.000884 GAAGT 0.000898 GAATA 0.00113 GAATC 0.000837 GAATG 0.000876 GAATT 0.00146 GACAA 0.00106 GACAC 0.000638 GACAG 0.000634 GACAT 0.000895 GACCA 0.000716 GACCC 0.000389 GACCG 0.000473 GACCT 0.000518 GACGA 0.000801 GACGC 0.00047 GACGG 0.000699 GACGT 0.000445 GACTA 0.000649 GACTC 0.000477 GACTG 0.000493 GACTT 0.000756 GAGAA 0.00141 GAGAC 0.000615 GAGAG 0.00145 GAGAT 0.00113 GAGCA 0.000884 GAGCC 0.000581 GAGCG 0.000477 GAGCT 0.000849 GAGGA 0.00132 GAGGC 0.00076 GAGGG 0.000964 GAGGT 0.000771 GAGTA 0.000945 GAGTC 0.000477 GAGTG 0.000644 GAGTT 0.000939 GATAA 0.00118 GATAC 0.000591 GATAG 0.000753 GATAT 0.00126 GATCA 0.00106 GATCC 0.00072 GATCG 0.000716 GATCT 0.000945 GATGA 0.00136 GATGC 0.000844 GATGG 0.00114 GATGT 0.00106 GATTA 0.00114 GATTC 0.000837 GATTG 0.000961 GATTT 0.00175 GCAAA 0.00135 GCAAC 0.000844 GCAAG 0.000898 GCAAT 0.000979 GCACA 0.000909 GCACC 0.000639 GCACG 0.000657 GCACT 0.000644 GCAGA 0.000746 GCAGC 0.000996 GCAGG 0.000671 GCAGT 0.000692 GCATA 0.000903 GCATC 0.000844 GCATG 0.00122 GCATT 0.000943 GCCAA 0.00092 GCCAC 0.0009 GCCAG 0.000581 GCCAT 0.000944 GCCCA 0.000804 GCCCC 0.000513 GCCCG 0.000483 GCCCT 0.000525 GCCGA 0.000637 GCCGC 0.00117 GCCGG 0.000815 GCCGT 0.000662 GCCTA 0.000572 GCCTC 0.00076 GCCTG 0.000572 GCCTT 0.000676 GCGAA 0.000461 GCGAC 0.00056 GCGAG 0.000628 GCGAT 0.000444 GCGCA 0.000443 GCGCC 0.000696 GCGCG 0.000698 GCGCT 0.000397 GCGGA 0.00049 GCGGC 0.00117 GCGGG 0.000503 GCGGT 0.000533 GCGTA 0.000297 GCGTC 0.00047 GCGTG 0.000594 GCGTT 0.000365 GCTAA 0.000863 GCTAC 0.000659 GCTAG 0.000872 GCTAT 0.000789 GCTCA 0.000706 GCTCC 0.000739 GCTCG 0.000626 GCTCT 0.000722 GCTGA 0.000782 GCTGC 0.000996 GCTGG 0.00072 GCTGT 0.000705 GCTTA 0.000719 GCTTC 0.000792 GCTTG 0.000884 GCTTT 0.000971 GGAAA 0.00132 GGAAC 0.000606 GGAAG 0.000971 GGAAT 0.000914 GGACA 0.0007 GGACC 0.00048 GGACG 0.000544 GGACT 0.000559 GGAGA 0.00121 GGAGC 0.000739 GGAGG 0.00137 GGAGT 0.000869 GGATA 0.000781 GGATC 0.00072 GGATG 0.000994 GGATT 0.00101 GGCAA 0.000846 GGCAC 0.000599 GGCAG 0.000721 GGCAT 0.000773 GGCCA 0.00074 GGCCC 0.000682 GGCCG 0.000757 GGCCT 0.000637 GGCGA 0.000757 GGCGC 0.000696 GGCGG 0.00117 GGCGT 0.000478 GGCTA 0.000665 GGCTC 0.000581 GGCTG 0.000748 GGCTT 0.000684 GGGAA 0.0008 GGGAC 0.000543 GGGAG 0.00104 GGGAT 0.000705 GGGCA 0.000564 GGGCC 0.000682 GGGCG 0.000539 GGGCT 0.00054 GGGGA 0.000785 GGGGC 0.000513 GGGGG 0.000727 GGGGT 0.000528 GGGTA 0.000505 GGGTC 0.000389 GGGTG 0.000673 GGGTT 0.000658 GGTAA 0.00067 GGTAC 0.000505 GGTAG 0.000636 GGTAT 0.000697 GGTCA 0.000643 GGTCC 0.00048 GGTCG 0.000463 GGTCT 0.00051 GGTGA 0.000883 GGTGC 0.000639 GGTGG 0.00114 GGTGT 0.00078 GGTTA 0.000672 GGTTC 0.000588 GGTTG 0.000911 GGTTT 0.0012 GTAAA 0.00124 GTAAC 0.000581 GTAAG 0.000561 GTAAT 0.00103 GTACA 0.000909 GTACC 0.000505 GTACG 0.000458 GTACT 0.000964 GTAGA 0.00082 GTAGC 0.000659 GTAGG 0.000592 GTAGT 0.000931 GTATA 0.00119 GTATC 0.000591 GTATG 0.000822 GTATT 0.00117 GTCAA 0.000996 GTCAC 0.000652 GTCAG 0.000598 GTCAT 0.000904 GTCCA 0.000762 GTCCC 0.000543 GTCCG 0.000368 GTCCT 0.000611 GTCGA 0.000561 GTCGC 0.00056 GTCGG 0.000509 GTCGT 0.000579 GTCTA 0.000602 GTCTC 0.000615 GTCTG 0.0005 GTCTT 0.000759 GTGAA 0.00104 GTGAC 0.000652 GTGAG 0.000748 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000958 GTGCC 0.000599 GTGCG 0.000484 GTGCT 0.000807 GTGGA 0.00093 GTGGC 0.0009 GTGGG 0.000801 GTGGT 0.000958 GTGTA 0.000838 GTGTC 0.000638 GTGTG 0.00102 GTGTT 0.00108 GTTAA 0.001 GTTAC 0.000581 GTTAG 0.000696 GTTAT 0.000979 GTTCA 0.000983 GTTCC 0.000606 GTTCG 0.000482 GTTCT 0.000898 GTTGA 0.00107 GTTGC 0.000844 GTTGG 0.000985 GTTGT 0.00114 GTTTA 0.00129 GTTTC 0.00109 GTTTG 0.0014 GTTTT 0.00222 TAAAA 0.00342 TAAAC 0.00129 TAAAG 0.00112 TAAAT 0.00242 TAACA 0.00115 TAACC 0.000672 TAACG 0.000339 TAACT 0.0011 TAAGA 0.00109 TAAGC 0.000719 TAAGG 0.000661 TAAGT 0.00103 TAATA 0.00204 TAATC 0.00114 TAATG 0.00109 TAATT 0.00266 TACAA 0.00143 TACAC 0.000838 TACAG 0.000752 TACAT 0.00147 TACCA 0.000902 TACCC 0.000505 TACCG 0.000369 TACCT 0.000732 TACGA 0.000472 TACGC 0.000297 TACGG 0.000367 TACGT 0.000549 TACTA 0.00135 TACTC 0.000945 TACTG 0.000781 TACTT 0.00125 TAGAA 0.00144 TAGAC 0.000602 TAGAG 0.000922 TAGAT 0.00135 TAGCA 0.00107 TAGCC 0.000665 TAGCG 0.00035 TAGCT 0.0011 TAGGA 0.000939 TAGGC 0.000572 TAGGG 0.000601 TAGGT 0.000739 TAGTA 0.00135 TAGTC 0.000649 TAGTG 0.00083 TAGTT 0.00139 TATAA 0.00218 TATAC 0.00119 TATAG 0.00131 TATAT 0.00389 TATCA 0.00127 TATCC 0.000781 TATCG 0.00045 TATCT 0.00128 TATGA 0.00132 TATGC 0.000903 TATGG 0.000923 TATGT 0.00155 TATTA 0.00204 TATTC 0.00113 TATTG 0.00128 TATTT 0.00331 TCAAA 0.00214 TCAAC 0.00107 TCAAG 0.00097 TCAAT 0.00142 TCACA 0.00119 TCACC 0.000883 TCACG 0.000495 TCACT 0.000892 TCAGA 0.000949 TCAGC 0.000782 TCAGG 0.000621 TCAGT 0.000829 TCATA 0.00132 TCATC 0.00136 TCATG 0.00125 TCATT 0.00145 TCCAA 0.00139 TCCAC 0.00093 TCCAG 0.000714 TCCAT 0.00139 TCCCA 0.000855 TCCCC 0.000785 TCCCG 0.000461 TCCCT 0.00099 TCCGA 0.000521 TCCGC 0.00049 TCCGG 0.000464 TCCGT 0.000612 TCCTA 0.000939 TCCTC 0.00132 TCCTG 0.000715 TCCTT 0.00122 TCGAA 0.000641 TCGAC 0.000561 TCGAG 0.000588 TCGAT 0.00087 TCGCA 0.000433 TCGCC 0.000757 TCGCG 0.000387 TCGCT 0.000516 TCGGA 0.000521 TCGGC 0.000637 TCGGG 0.000373 TCGGT 0.000543 TCGTA 0.000472 TCGTC 0.000801 TCGTG 0.000568 TCGTT 0.000704 TCTAA 0.00127 TCTAC 0.00082 TCTAG 0.000908 TCTAT 0.00132 TCTCA 0.00107 TCTCC 0.00121 TCTCG 0.000613 TCTCT 0.00172 TCTGA 0.000949 TCTGC 0.000746 TCTGG 0.000625 TCTGT 0.000914 TCTTA 0.00109 TCTTC 0.00143 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.00195 TGAAA 0.0021 TGAAC 0.000983 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00155 TGACA 0.00114 TGACC 0.000643 TGACG 0.000561 TGACT 0.000809 TGAGA 0.00107 TGAGC 0.000706 TGAGG 0.000747 TGAGT 0.000839 TGATA 0.00127 TGATC 0.00106 TGATG 0.00143 TGATT 0.00161 TGCAA 0.00145 TGCAC 0.000958 TGCAG 0.00104 TGCAT 0.00157 TGCCA 0.00101 TGCCC 0.000564 TGCCG 0.000605 TGCCT 0.000765 TGCGA 0.000433 TGCGC 0.000443 TGCGG 0.00045 TGCGT 0.000472 TGCTA 0.00107 TGCTC 0.000884 TGCTG 0.00101 TGCTT 0.00124 TGGAA 0.00121 TGGAC 0.000762 TGGAG 0.00117 TGGAT 0.00128 TGGCA 0.00101 TGGCC 0.00074 TGGCG 0.000698 TGGCT 0.000902 TGGGA 0.000855 TGGGC 0.000804 TGGGG 0.000658 TGGGT 0.000738 TGGTA 0.000902 TGGTC 0.000716 TGGTG 0.00117 TGGTT 0.00128 TGTAA 0.00124 TGTAC 0.000909 TGTAG 0.000957 TGTAT 0.00139 TGTCA 0.00114 TGTCC 0.0007 TGTCG 0.000546 TGTCT 0.000849 TGTGA 0.00119 TGTGC 0.000909 TGTGG 0.001 TGTGT 0.0014 TGTTA 0.00115 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.00136 TGTTT 0.00222 TTAAA 0.00262 TTAAC 0.001 TTAAG 0.00109 TTAAT 0.00236 TTACA 0.00124 TTACC 0.00067 TTACG 0.000367 TTACT 0.00113 TTAGA 0.00127 TTAGC 0.000863 TTAGG 0.000862 TTAGT 0.00125 TTATA 0.00218 TTATC 0.00118 TTATG 0.00122 TTATT 0.00262 TTCAA 0.00178 TTCAC 0.00104 TTCAG 0.00111 TTCAT 0.00182 TTCCA 0.00121 TTCCC 0.0008 TTCCG 0.000474 TTCCT 0.00134 TTCGA 0.000641 TTCGC 0.000461 TTCGG 0.000494 TTCGT 0.000763 TTCTA 0.00144 TTCTC 0.00141 TTCTG 0.000992 TTCTT 0.00217 TTGAA 0.00178 TTGAC 0.000996 TTGAG 0.00105 TTGAT 0.00178 TTGCA 0.00145 TTGCC 0.000846 TTGCG 0.00044 TTGCT 0.00134 TTGGA 0.00139 TTGGC 0.00092 TTGGG 0.000947 TTGGT 0.0013 TTGTA 0.00143 TTGTC 0.00106 TTGTG 0.00133 TTGTT 0.00207 TTTAA 0.00262 TTTAC 0.00124 TTTAG 0.00158 TTTAT 0.00282 TTTCA 0.0021 TTTCC 0.00132 TTTCG 0.000754 TTTCT 0.00247 TTTGA 0.00214 TTTGC 0.00135 TTTGG 0.00169 TTTGT 0.00215 TTTTA 0.00342 TTTTC 0.00272 TTTTG 0.00259 TTTTT 0.00657 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4293 AAAAC 0.145 AAAAG 0.1502 AAAAT 0.2756 AAACA 0.3701 AAACC 0.1992 AAACG 0.1264 AAACT 0.3043 AAAGA 0.3404 AAAGC 0.1692 AAAGG 0.1987 AAAGT 0.2917 AAATA 0.3151 AAATC 0.1667 AAATG 0.1744 AAATT 0.3437 AACAA 0.3577 AACAC 0.1868 AACAG 0.1677 AACAT 0.2879 AACCA 0.3798 AACCC 0.1954 AACCG 0.1796 AACCT 0.2452 AACGA 0.3281 AACGC 0.1701 AACGG 0.2685 AACGT 0.2333 AACTA 0.2807 AACTC 0.1895 AACTG 0.1804 AACTT 0.3493 AAGAA 0.3861 AAGAC 0.1349 AAGAG 0.2147 AAGAT 0.2643 AAGCA 0.3671 AAGCC 0.2031 AAGCG 0.1233 AAGCT 0.3065 AAGGA 0.3495 AAGGC 0.1941 AAGGG 0.2244 AAGGT 0.232 AAGTA 0.2692 AAGTC 0.163 AAGTG 0.1946 AAGTT 0.3732 AATAA 0.3377 AATAC 0.1507 AATAG 0.1617 AATAT 0.35 AATCA 0.3444 AATCC 0.2146 AATCG 0.1275 AATCT 0.3135 AATGA 0.2971 AATGC 0.1933 AATGG 0.2299 AATGT 0.2797 AATTA 0.286 AATTC 0.1575 AATTG 0.1678 AATTT 0.3887 ACAAA 0.3653 ACAAC 0.193 ACAAG 0.1985 ACAAT 0.2431 ACACA 0.3914 ACACC 0.2177 ACACG 0.1671 ACACT 0.2237 ACAGA 0.2967 ACAGC 0.2288 ACAGG 0.2079 ACAGT 0.2665 ACATA 0.283 ACATC 0.1936 ACATG 0.2736 ACATT 0.2498 ACCAA 0.3203 ACCAC 0.2354 ACCAG 0.1651 ACCAT 0.2792 ACCCA 0.3319 ACCCC 0.2373 ACCCG 0.1575 ACCCT 0.2734 ACCGA 0.2492 ACCGC 0.2443 ACCGG 0.2592 ACCGT 0.2473 ACCTA 0.2516 ACCTC 0.2626 ACCTG 0.2107 ACCTT 0.2751 ACGAA 0.3001 ACGAC 0.2278 ACGAG 0.2402 ACGAT 0.232 ACGCA 0.2735 ACGCC 0.2768 ACGCG 0.2315 ACGCT 0.2182 ACGGA 0.2744 ACGGC 0.2969 ACGGG 0.1867 ACGGT 0.2419 ACGTA 0.2566 ACGTC 0.2083 ACGTG 0.3009 ACGTT 0.2341 ACTAA 0.2965 ACTAC 0.2204 ACTAG 0.209 ACTAT 0.2741 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.2894 ACTCG 0.1498 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2825 ACTGC 0.236 ACTGG 0.2015 ACTGT 0.2801 ACTTA 0.2219 ACTTC 0.1936 ACTTG 0.2235 ACTTT 0.361 AGAAA 0.4106 AGAAC 0.1495 AGAAG 0.2328 AGAAT 0.2071 AGACA 0.3427 AGACC 0.2059 AGACG 0.2042 AGACT 0.2473 AGAGA 0.3953 AGAGC 0.1662 AGAGG 0.2438 AGAGT 0.1947 AGATA 0.2594 AGATC 0.1908 AGATG 0.2534 AGATT 0.2964 AGCAA 0.319 AGCAC 0.1924 AGCAG 0.2249 AGCAT 0.2637 AGCCA 0.337 AGCCC 0.2015 AGCCG 0.22 AGCCT 0.2415 AGCGA 0.2868 AGCGC 0.2204 AGCGG 0.2837 AGCGT 0.2091 AGCTA 0.284 AGCTC 0.2195 AGCTG 0.2298 AGCTT 0.2667 AGGAA 0.3188 AGGAC 0.1458 AGGAG 0.3065 AGGAT 0.2288 AGGCA 0.2966 AGGCC 0.247 AGGCG 0.2057 AGGCT 0.2506 AGGGA 0.3443 AGGGC 0.1825 AGGGG 0.2618 AGGGT 0.2114 AGGTA 0.2492 AGGTC 0.1763 AGGTG 0.2937 AGGTT 0.2808 AGTAA 0.2609 AGTAC 0.2228 AGTAG 0.2334 AGTAT 0.2829 AGTCA 0.3407 AGTCC 0.2355 AGTCG 0.1659 AGTCT 0.2579 AGTGA 0.2838 AGTGC 0.2051 AGTGG 0.2562 AGTGT 0.2549 AGTTA 0.222 AGTTC 0.1753 AGTTG 0.234 AGTTT 0.3687 ATAAA 0.391 ATAAC 0.136 ATAAG 0.1683 ATAAT 0.3047 ATACA 0.3677 ATACC 0.185 ATACG 0.1226 ATACT 0.3248 ATAGA 0.3257 ATAGC 0.1942 ATAGG 0.1952 ATAGT 0.2849 ATATA 0.3986 ATATC 0.129 ATATG 0.1942 ATATT 0.2781 ATCAA 0.3328 ATCAC 0.19 ATCAG 0.1719 ATCAT 0.3053 ATCCA 0.3666 ATCCC 0.2015 ATCCG 0.1581 ATCCT 0.2738 ATCGA 0.3508 ATCGC 0.1791 ATCGG 0.2321 ATCGT 0.2379 ATCTA 0.2735 ATCTC 0.2282 ATCTG 0.1979 ATCTT 0.3004 ATGAA 0.3397 ATGAC 0.1683 ATGAG 0.1872 ATGAT 0.3047 ATGCA 0.4005 ATGCC 0.1976 ATGCG 0.1194 ATGCT 0.2825 ATGGA 0.3229 ATGGC 0.2192 ATGGG 0.194 ATGGT 0.2639 ATGTA 0.2698 ATGTC 0.1639 ATGTG 0.2606 ATGTT 0.3056 ATTAA 0.3416 ATTAC 0.1483 ATTAG 0.193 ATTAT 0.3171 ATTCA 0.3603 ATTCC 0.2121 ATTCG 0.1389 ATTCT 0.2886 ATTGA 0.2913 ATTGC 0.2006 ATTGG 0.2144 ATTGT 0.2937 ATTTA 0.2305 ATTTC 0.1627 ATTTG 0.2052 ATTTT 0.4017 CAAAA 0.3523 CAAAC 0.1909 CAAAG 0.1636 CAAAT 0.2932 CAACA 0.338 CAACC 0.2256 CAACG 0.1491 CAACT 0.2872 CAAGA 0.2985 CAAGC 0.2283 CAAGG 0.2057 CAAGT 0.2676 CAATA 0.2624 CAATC 0.197 CAATG 0.2213 CAATT 0.3193 CACAA 0.2953 CACAC 0.2272 CACAG 0.1609 CACAT 0.3166 CACCA 0.341 CACCC 0.1953 CACCG 0.2132 CACCT 0.2505 CACGA 0.2373 CACGC 0.2483 CACGG 0.2453 CACGT 0.2691 CACTA 0.2643 CACTC 0.2049 CACTG 0.2433 CACTT 0.2875 CAGAA 0.3068 CAGAC 0.1547 CAGAG 0.2353 CAGAT 0.3033 CAGCA 0.3146 CAGCC 0.2335 CAGCG 0.1743 CAGCT 0.2776 CAGGA 0.2937 CAGGC 0.2349 CAGGG 0.2172 CAGGT 0.2542 CAGTA 0.2662 CAGTC 0.1683 CAGTG 0.2606 CAGTT 0.3049 CATAA 0.2607 CATAC 0.1753 CATAG 0.1596 CATAT 0.4044 CATCA 0.3246 CATCC 0.2264 CATCG 0.1632 CATCT 0.2857 CATGA 0.245 CATGC 0.2404 CATGG 0.2209 CATGT 0.2937 CATTA 0.2238 CATTC 0.1796 CATTG 0.2212 CATTT 0.3754 CCAAA 0.3716 CCAAC 0.216 CCAAG 0.1832 CCAAT 0.2293 CCACA 0.2786 CCACC 0.3183 CCACG 0.1789 CCACT 0.2243 CCAGA 0.2564 CCAGC 0.2954 CCAGG 0.2058 CCAGT 0.2424 CCATA 0.2144 CCATC 0.2638 CCATG 0.2612 CCATT 0.2606 CCCAA 0.31 CCCAC 0.2623 CCCAG 0.1541 CCCAT 0.2735 CCCCA 0.2581 CCCCC 0.2849 CCCCG 0.1619 CCCCT 0.2952 CCCGA 0.2182 CCCGC 0.2944 CCCGG 0.2435 CCCGT 0.2438 CCCTA 0.2089 CCCTC 0.3354 CCCTG 0.1839 CCCTT 0.2718 CCGAA 0.2384 CCGAC 0.2454 CCGAG 0.2384 CCGAT 0.2777 CCGCA 0.1669 CCGCC 0.4342 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.1894 CCGGA 0.2051 CCGGC 0.3608 CCGGG 0.184 CCGGT 0.2501 CCGTA 0.1647 CCGTC 0.3137 CCGTG 0.2631 CCGTT 0.2585 CCTAA 0.3024 CCTAC 0.2077 CCTAG 0.212 CCTAT 0.278 CCTCA 0.196 CCTCC 0.3601 CCTCG 0.166 CCTCT 0.2779 CCTGA 0.255 CCTGC 0.2757 CCTGG 0.2061 CCTGT 0.2632 CCTTA 0.1898 CCTTC 0.2539 CCTTG 0.2288 CCTTT 0.3274 CGAAA 0.3195 CGAAC 0.2044 CGAAG 0.2223 CGAAT 0.2539 CGACA 0.2472 CGACC 0.2098 CGACG 0.3647 CGACT 0.1782 CGAGA 0.2639 CGAGC 0.2697 CGAGG 0.2725 CGAGT 0.1939 CGATA 0.1813 CGATC 0.2887 CGATG 0.2891 CGATT 0.2409 CGCAA 0.2448 CGCAC 0.2693 CGCAG 0.2259 CGCAT 0.26 CGCCA 0.2249 CGCCC 0.1737 CGCCG 0.4304 CGCCT 0.1711 CGCGA 0.1886 CGCGC 0.3407 CGCGG 0.2757 CGCGT 0.1949 CGCTA 0.1944 CGCTC 0.265 CGCTG 0.31 CGCTT 0.2305 CGGAA 0.2271 CGGAC 0.1763 CGGAG 0.3312 CGGAT 0.2654 CGGCA 0.1841 CGGCC 0.2305 CGGCG 0.4062 CGGCT 0.1792 CGGGA 0.2699 CGGGC 0.283 CGGGG 0.2419 CGGGT 0.2052 CGGTA 0.169 CGGTC 0.2168 CGGTG 0.3368 CGGTT 0.2773 CGTAA 0.2177 CGTAC 0.2717 CGTAG 0.2363 CGTAT 0.2743 CGTCA 0.2323 CGTCC 0.2253 CGTCG 0.3333 CGTCT 0.2092 CGTGA 0.2069 CGTGC 0.2745 CGTGG 0.2684 CGTGT 0.2502 CGTTA 0.1579 CGTTC 0.2083 CGTTG 0.2805 CGTTT 0.3534 CTAAA 0.3719 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1492 CTAAT 0.3149 CTACA 0.3189 CTACC 0.212 CTACG 0.1326 CTACT 0.3365 CTAGA 0.278 CTAGC 0.2669 CTAGG 0.185 CTAGT 0.27 CTATA 0.3217 CTATC 0.1852 CTATG 0.1843 CTATT 0.3088 CTCAA 0.3128 CTCAC 0.2229 CTCAG 0.1646 CTCAT 0.2997 CTCCA 0.2802 CTCCC 0.2487 CTCCG 0.1649 CTCCT 0.3063 CTCGA 0.2533 CTCGC 0.2706 CTCGG 0.2129 CTCGT 0.2632 CTCTA 0.2122 CTCTC 0.3346 CTCTG 0.175 CTCTT 0.2782 CTGAA 0.3487 CTGAC 0.1879 CTGAG 0.1737 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3337 CTGCC 0.2321 CTGCG 0.1306 CTGCT 0.3036 CTGGA 0.293 CTGGC 0.2383 CTGGG 0.1931 CTGGT 0.2756 CTGTA 0.244 CTGTC 0.2058 CTGTG 0.2347 CTGTT 0.3154 CTTAA 0.3126 CTTAC 0.1602 CTTAG 0.1809 CTTAT 0.3464 CTTCA 0.2772 CTTCC 0.2424 CTTCG 0.131 CTTCT 0.3494 CTTGA 0.2505 CTTGC 0.2318 CTTGG 0.2156 CTTGT 0.3021 CTTTA 0.1944 CTTTC 0.1959 CTTTG 0.2094 CTTTT 0.4003 GAAAA 0.4101 GAAAC 0.1637 GAAAG 0.1692 GAAAT 0.257 GAACA 0.3588 GAACC 0.1981 GAACG 0.1506 GAACT 0.2925 GAAGA 0.3568 GAAGC 0.198 GAAGG 0.221 GAAGT 0.2243 GAATA 0.2632 GAATC 0.1943 GAATG 0.2033 GAATT 0.3392 GACAA 0.3288 GACAC 0.1976 GACAG 0.1964 GACAT 0.2772 GACCA 0.3415 GACCC 0.1858 GACCG 0.2256 GACCT 0.2471 GACGA 0.3316 GACGC 0.1945 GACGG 0.2895 GACGT 0.1844 GACTA 0.2731 GACTC 0.2008 GACTG 0.2078 GACTT 0.3184 GAGAA 0.3052 GAGAC 0.1335 GAGAG 0.3158 GAGAT 0.2455 GAGCA 0.3167 GAGCC 0.2081 GAGCG 0.171 GAGCT 0.3042 GAGGA 0.3453 GAGGC 0.1994 GAGGG 0.253 GAGGT 0.2023 GAGTA 0.3144 GAGTC 0.1587 GAGTG 0.2143 GAGTT 0.3126 GATAA 0.3116 GATAC 0.1561 GATAG 0.199 GATAT 0.3332 GATCA 0.3073 GATCC 0.2094 GATCG 0.2084 GATCT 0.275 GATGA 0.3085 GATGC 0.1922 GATGG 0.2585 GATGT 0.2408 GATTA 0.2423 GATTC 0.1788 GATTG 0.2052 GATTT 0.3737 GCAAA 0.3324 GCAAC 0.207 GCAAG 0.2204 GCAAT 0.2402 GCACA 0.3189 GCACC 0.2243 GCACG 0.2305 GCACT 0.2262 GCAGA 0.2401 GCAGC 0.3209 GCAGG 0.2161 GCAGT 0.2229 GCATA 0.2307 GCATC 0.2157 GCATG 0.3126 GCATT 0.241 GCCAA 0.275 GCCAC 0.2692 GCCAG 0.1737 GCCAT 0.2821 GCCCA 0.3458 GCCCC 0.2207 GCCCG 0.2078 GCCCT 0.2257 GCCGA 0.1937 GCCGC 0.3568 GCCGG 0.2481 GCCGT 0.2014 GCCTA 0.2218 GCCTC 0.2946 GCCTG 0.2216 GCCTT 0.2619 GCGAA 0.2202 GCGAC 0.2674 GCGAG 0.3002 GCGAT 0.2122 GCGCA 0.1983 GCGCC 0.3116 GCGCG 0.3125 GCGCT 0.1776 GCGGA 0.1815 GCGGC 0.4347 GCGGG 0.1863 GCGGT 0.1975 GCGTA 0.172 GCGTC 0.2723 GCGTG 0.344 GCGTT 0.2116 GCTAA 0.2711 GCTAC 0.207 GCTAG 0.274 GCTAT 0.2479 GCTCA 0.2527 GCTCC 0.2646 GCTCG 0.2242 GCTCT 0.2585 GCTGA 0.2441 GCTGC 0.311 GCTGG 0.2248 GCTGT 0.2201 GCTTA 0.2136 GCTTC 0.2353 GCTTG 0.2627 GCTTT 0.2885 GGAAA 0.347 GGAAC 0.1588 GGAAG 0.2544 GGAAT 0.2397 GGACA 0.3065 GGACC 0.2102 GGACG 0.2385 GGACT 0.2448 GGAGA 0.2888 GGAGC 0.1764 GGAGG 0.3274 GGAGT 0.2074 GGATA 0.2231 GGATC 0.2056 GGATG 0.2841 GGATT 0.2872 GGCAA 0.2877 GGCAC 0.2038 GGCAG 0.2453 GGCAT 0.2631 GGCCA 0.2627 GGCCC 0.242 GGCCG 0.269 GGCCT 0.2263 GGCGA 0.244 GGCGC 0.2245 GGCGG 0.3776 GGCGT 0.154 GGCTA 0.2483 GGCTC 0.217 GGCTG 0.2793 GGCTT 0.2554 GGGAA 0.259 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.3372 GGGAT 0.2282 GGGCA 0.2427 GGGCC 0.2932 GGGCG 0.2319 GGGCT 0.2321 GGGGA 0.3075 GGGGC 0.201 GGGGG 0.2847 GGGGT 0.2068 GGGTA 0.227 GGGTC 0.1751 GGGTG 0.3024 GGGTT 0.2956 GGTAA 0.267 GGTAC 0.2014 GGTAG 0.2537 GGTAT 0.278 GGTCA 0.3069 GGTCC 0.2289 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2432 GGTGA 0.2565 GGTGC 0.1855 GGTGG 0.3317 GGTGT 0.2263 GGTTA 0.1995 GGTTC 0.1747 GGTTG 0.2706 GGTTT 0.3552 GTAAA 0.364 GTAAC 0.1704 GTAAG 0.1645 GTAAT 0.3011 GTACA 0.3206 GTACC 0.1781 GTACG 0.1614 GTACT 0.3399 GTAGA 0.2732 GTAGC 0.2195 GTAGG 0.1973 GTAGT 0.31 GTATA 0.3146 GTATC 0.1567 GTATG 0.2182 GTATT 0.3104 GTCAA 0.3163 GTCAC 0.2068 GTCAG 0.1898 GTCAT 0.2871 GTCCA 0.3337 GTCCC 0.2378 GTCCG 0.161 GTCCT 0.2675 GTCGA 0.2538 GTCGC 0.2534 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2624 GTCTA 0.2431 GTCTC 0.2483 GTCTG 0.202 GTCTT 0.3066 GTGAA 0.3 GTGAC 0.1886 GTGAG 0.2165 GTGAT 0.2948 GTGCA 0.3364 GTGCC 0.2103 GTGCG 0.1699 GTGCT 0.2834 GTGGA 0.2591 GTGGC 0.2508 GTGGG 0.2232 GTGGT 0.2669 GTGTA 0.2341 GTGTC 0.1783 GTGTG 0.2852 GTGTT 0.3024 GTTAA 0.3074 GTTAC 0.1784 GTTAG 0.2136 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3311 GTTCC 0.204 GTTCG 0.1624 GTTCT 0.3025 GTTGA 0.2652 GTTGC 0.2089 GTTGG 0.244 GTTGT 0.2819 GTTTA 0.2157 GTTTC 0.1811 GTTTG 0.2336 GTTTT 0.3696 TAAAA 0.4145 TAAAC 0.1569 TAAAG 0.1353 TAAAT 0.2933 TAACA 0.352 TAACC 0.2062 TAACG 0.104 TAACT 0.3378 TAAGA 0.3115 TAAGC 0.2055 TAAGG 0.1889 TAAGT 0.2941 TAATA 0.2945 TAATC 0.164 TAATG 0.1578 TAATT 0.3837 TACAA 0.3184 TACAC 0.1865 TACAG 0.1673 TACAT 0.3278 TACCA 0.3598 TACCC 0.2013 TACCG 0.147 TACCT 0.2919 TACGA 0.2799 TACGC 0.1762 TACGG 0.2181 TACGT 0.3257 TACTA 0.3125 TACTC 0.2184 TACTG 0.1805 TACTT 0.2886 TAGAA 0.3333 TAGAC 0.1394 TAGAG 0.2136 TAGAT 0.3138 TAGCA 0.3356 TAGCC 0.209 TAGCG 0.1101 TAGCT 0.3454 TAGGA 0.3295 TAGGC 0.2007 TAGGG 0.2107 TAGGT 0.2591 TAGTA 0.3203 TAGTC 0.1536 TAGTG 0.1966 TAGTT 0.3295 TATAA 0.2544 TATAC 0.1384 TATAG 0.1526 TATAT 0.4546 TATCA 0.3349 TATCC 0.2065 TATCG 0.1189 TATCT 0.3398 TATGA 0.2813 TATGC 0.1925 TATGG 0.1967 TATGT 0.3295 TATTA 0.2626 TATTC 0.1462 TATTG 0.1649 TATTT 0.4262 TCAAA 0.3825 TCAAC 0.1909 TCAAG 0.1731 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3431 TCACC 0.2557 TCACG 0.1432 TCACT 0.258 TCAGA 0.2983 TCAGC 0.2459 TCAGG 0.1953 TCAGT 0.2606 TCATA 0.2456 TCATC 0.2523 TCATG 0.2322 TCATT 0.2699 TCCAA 0.3143 TCCAC 0.2102 TCCAG 0.1614 TCCAT 0.3142 TCCCA 0.2767 TCCCC 0.2539 TCCCG 0.1491 TCCCT 0.3204 TCCGA 0.2497 TCCGC 0.2347 TCCGG 0.2223 TCCGT 0.2933 TCCTA 0.2244 TCCTC 0.3143 TCCTG 0.1708 TCCTT 0.2906 TCGAA 0.2411 TCGAC 0.2108 TCGAG 0.2211 TCGAT 0.3271 TCGCA 0.2068 TCGCC 0.3617 TCGCG 0.1847 TCGCT 0.2467 TCGGA 0.2511 TCGGC 0.3071 TCGGG 0.1797 TCGGT 0.2621 TCGTA 0.1853 TCGTC 0.3149 TCGTG 0.223 TCGTT 0.2767 TCTAA 0.2932 TCTAC 0.1899 TCTAG 0.2104 TCTAT 0.3065 TCTCA 0.2313 TCTCC 0.2628 TCTCG 0.1331 TCTCT 0.3729 TCTGA 0.2933 TCTGC 0.2306 TCTGG 0.1933 TCTGT 0.2828 TCTTA 0.1937 TCTTC 0.2537 TCTTG 0.2055 TCTTT 0.3471 TGAAA 0.3654 TGAAC 0.1711 TGAAG 0.1931 TGAAT 0.2704 TGACA 0.3609 TGACC 0.2042 TGACG 0.1782 TGACT 0.2567 TGAGA 0.3174 TGAGC 0.2103 TGAGG 0.2225 TGAGT 0.2499 TGATA 0.2362 TGATC 0.1969 TGATG 0.2659 TGATT 0.3009 TGCAA 0.2895 TGCAC 0.1911 TGCAG 0.2068 TGCAT 0.3127 TGCCA 0.342 TGCCC 0.1919 TGCCG 0.2058 TGCCT 0.2603 TGCGA 0.2407 TGCGC 0.2464 TGCGG 0.2504 TGCGT 0.2625 TGCTA 0.2545 TGCTC 0.2108 TGCTG 0.2402 TGCTT 0.2946 TGGAA 0.2724 TGGAC 0.1722 TGGAG 0.2654 TGGAT 0.29 TGGCA 0.3006 TGGCC 0.2211 TGGCG 0.2085 TGGCT 0.2698 TGGGA 0.2799 TGGGC 0.2631 TGGGG 0.2155 TGGGT 0.2416 TGGTA 0.2216 TGGTC 0.1759 TGGTG 0.2885 TGGTT 0.314 TGTAA 0.2768 TGTAC 0.2022 TGTAG 0.2128 TGTAT 0.3082 TGTCA 0.3518 TGTCC 0.2165 TGTCG 0.169 TGTCT 0.2626 TGTGA 0.2637 TGTGC 0.2021 TGTGG 0.2224 TGTGT 0.3118 TGTTA 0.1977 TGTTC 0.1838 TGTTG 0.2353 TGTTT 0.3832 TTAAA 0.3698 TTAAC 0.1415 TTAAG 0.1546 TTAAT 0.3342 TTACA 0.365 TTACC 0.1964 TTACG 0.1075 TTACT 0.3311 TTAGA 0.2983 TTAGC 0.2034 TTAGG 0.2033 TTAGT 0.2951 TTATA 0.3026 TTATC 0.1637 TTATG 0.1698 TTATT 0.3639 TTCAA 0.3091 TTCAC 0.1804 TTCAG 0.193 TTCAT 0.3175 TTCCA 0.3159 TTCCC 0.2098 TTCCG 0.1242 TTCCT 0.35 TTCGA 0.2717 TTCGC 0.1953 TTCGG 0.2094 TTCGT 0.3235 TTCTA 0.2394 TTCTC 0.2338 TTCTG 0.165 TTCTT 0.3617 TTGAA 0.3168 TTGAC 0.1777 TTGAG 0.1872 TTGAT 0.3182 TTGCA 0.3562 TTGCC 0.2075 TTGCG 0.108 TTGCT 0.3283 TTGGA 0.3049 TTGGC 0.2017 TTGGG 0.2076 TTGGT 0.2858 TTGTA 0.2428 TTGTC 0.1802 TTGTG 0.2252 TTGTT 0.3518 TTTAA 0.3171 TTTAC 0.1504 TTTAG 0.1912 TTTAT 0.3413 TTTCA 0.316 TTTCC 0.1992 TTTCG 0.1135 TTTCT 0.3713 TTTGA 0.2919 TTTGC 0.1843 TTTGG 0.2306 TTTGT 0.2931 TTTTA 0.2235 TTTTC 0.1781 TTTTG 0.1692 TTTTT 0.4293 [2] # (a,c,g,t)= (0.284, 0.216, 0.216, 0.284) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.293 C 0.207 G 0.207 T 0.293 # l= 1 # Values AA 0.0963 AC 0.053 AG 0.0578 AT 0.0856 CA 0.0645 CC 0.0478 CG 0.0372 CT 0.0578 GA 0.0588 GC 0.0478 GG 0.0478 GT 0.0529 TA 0.073 TC 0.0588 TG 0.0645 TT 0.0963 # l= 2 # Values AAA 0.0369 AAC 0.0162 AAG 0.0171 AAT 0.0262 ACA 0.0179 ACC 0.0115 ACG 0.00881 ACT 0.0147 AGA 0.0177 AGC 0.0127 AGG 0.0127 AGT 0.0147 ATA 0.0242 ATC 0.0163 ATG 0.0189 ATT 0.0262 CAA 0.0201 CAC 0.0136 CAG 0.0119 CAT 0.0189 CCA 0.015 CCC 0.0104 CCG 0.00963 CCT 0.0127 CGA 0.00959 CGC 0.00915 CGG 0.00963 CGT 0.00881 CTA 0.0144 CTC 0.0144 CTG 0.0119 CTT 0.0171 GAA 0.0179 GAC 0.0103 GAG 0.0144 GAT 0.0163 GCA 0.0141 GCC 0.0119 GCG 0.00915 GCT 0.0127 GGA 0.0139 GGC 0.0119 GGG 0.0104 GGT 0.0115 GTA 0.0129 GTC 0.0103 GTG 0.0136 GTT 0.0162 TAA 0.0215 TAC 0.0129 TAG 0.0144 TAT 0.0242 TCA 0.0175 TCC 0.0139 TCG 0.00959 TCT 0.0177 TGA 0.0176 TGC 0.014 TGG 0.015 TGT 0.0179 TTA 0.0215 TTC 0.0179 TTG 0.0201 TTT 0.0369 # l= 3 # Values AAAA 0.015 AAAC 0.00595 AAAG 0.00568 AAAT 0.0103 AACA 0.00575 AACC 0.00337 AACG 0.00216 AACT 0.00491 AAGA 0.00559 AAGC 0.00338 AAGG 0.0035 AAGT 0.00459 AATA 0.00758 AATC 0.00465 AATG 0.00483 AATT 0.00909 ACAA 0.00585 ACAC 0.00357 ACAG 0.0031 ACAT 0.00539 ACCA 0.00408 ACCC 0.00226 ACCG 0.00224 ACCT 0.00295 ACGA 0.00259 ACGC 0.00178 ACGG 0.00228 ACGT 0.00216 ACTA 0.00417 ACTC 0.00301 ACTG 0.00295 ACTT 0.00459 AGAA 0.00596 AGAC 0.00248 AGAG 0.00437 AGAT 0.00492 AGCA 0.0042 AGCC 0.00272 AGCG 0.00186 AGCT 0.00387 AGGA 0.00422 AGGC 0.00263 AGGG 0.00292 AGGT 0.00295 AGTA 0.00428 AGTC 0.00238 AGTG 0.00315 AGTT 0.00491 ATAA 0.00704 ATAC 0.0037 ATAG 0.004 ATAT 0.00948 ATCA 0.00532 ATCC 0.00351 ATCG 0.00251 ATCT 0.00492 ATGA 0.00532 ATGC 0.00391 ATGG 0.00431 ATGT 0.00539 ATTA 0.00676 ATTC 0.00427 ATTG 0.00483 ATTT 0.0103 CAAA 0.00728 CAAC 0.00405 CAAG 0.00389 CAAT 0.00483 CACA 0.00448 CACC 0.00352 CACG 0.00246 CACT 0.00315 CAGA 0.00325 CAGC 0.00327 CAGG 0.00247 CAGT 0.00295 CATA 0.00461 CATC 0.00441 CATG 0.00507 CATT 0.00483 CCAA 0.00456 CCAC 0.00367 CCAG 0.00248 CCAT 0.00431 CCCA 0.0031 CCCC 0.00262 CCCG 0.00178 CCCT 0.00292 CCGA 0.00213 CCGC 0.00285 CCGG 0.00236 CCGT 0.00228 CCTA 0.00284 CCTC 0.00392 CCTG 0.00247 CCTT 0.00349 CGAA 0.00238 CGAC 0.0023 CGAG 0.0024 CGAT 0.00251 CGCA 0.00184 CGCC 0.00328 CGCG 0.00217 CGCT 0.00186 CGGA 0.00214 CGGC 0.00347 CGGG 0.00178 CGGT 0.00224 CGTA 0.00169 CGTC 0.0025 CGTG 0.00245 CGTT 0.00216 CTAA 0.00417 CTAC 0.003 CTAG 0.00325 CTAT 0.004 CTCA 0.00336 CTCC 0.00428 CTCG 0.0024 CTCT 0.00437 CTGA 0.0032 CTGC 0.00316 CTGG 0.00248 CTGT 0.0031 CTTA 0.00345 CTTC 0.00404 CTTG 0.00389 CTTT 0.00568 GAAA 0.00658 GAAC 0.00298 GAAG 0.00404 GAAT 0.00427 GACA 0.00325 GACC 0.00214 GACG 0.0025 GACT 0.00238 GAGA 0.00464 GAGC 0.00286 GAGG 0.00391 GAGT 0.00301 GATA 0.00374 GATC 0.00346 GATG 0.00441 GATT 0.00465 GCAA 0.00409 GCAC 0.00289 GCAG 0.00316 GCAT 0.00391 GCCA 0.00341 GCCC 0.0024 GCCG 0.00347 GCCT 0.00263 GCGA 0.00217 GCGC 0.00235 GCGG 0.00285 GCGT 0.00178 GCTA 0.00316 GCTC 0.00285 GCTG 0.00327 GCTT 0.00338 GGAA 0.00383 GGAC 0.00232 GGAG 0.00428 GGAT 0.00351 GGCA 0.00299 GGCC 0.00291 GGCG 0.00328 GGCT 0.00272 GGGA 0.00315 GGGC 0.0024 GGGG 0.00262 GGGT 0.00226 GGTA 0.0025 GGTC 0.00214 GGTG 0.00352 GGTT 0.00337 GTAA 0.00336 GTAC 0.00283 GTAG 0.003 GTAT 0.0037 GTCA 0.00316 GTCC 0.00232 GTCG 0.0023 GTCT 0.00248 GTGA 0.00347 GTGC 0.00289 GTGG 0.00367 GTGT 0.00357 GTTA 0.00321 GTTC 0.00298 GTTG 0.00405 GTTT 0.00595 TAAA 0.00807 TAAC 0.00321 TAAG 0.00345 TAAT 0.00676 TACA 0.00443 TACC 0.0025 TACG 0.00169 TACT 0.00428 TAGA 0.00424 TAGC 0.00316 TAGG 0.00284 TAGT 0.00417 TATA 0.00829 TATC 0.00374 TATG 0.00461 TATT 0.00758 TCAA 0.00556 TCAC 0.00347 TCAG 0.0032 TCAT 0.00532 TCCA 0.00443 TCCC 0.00315 TCCG 0.00214 TCCT 0.00422 TCGA 0.0027 TCGC 0.00217 TCGG 0.00213 TCGT 0.00259 TCTA 0.00424 TCTC 0.00464 TCTG 0.00325 TCTT 0.00559 TGAA 0.0057 TGAC 0.00316 TGAG 0.00336 TGAT 0.00532 TGCA 0.00501 TGCC 0.00299 TGCG 0.00184 TGCT 0.0042 TGGA 0.00443 TGGC 0.00341 TGGG 0.0031 TGGT 0.00408 TGTA 0.00443 TGTC 0.00325 TGTG 0.00448 TGTT 0.00575 TTAA 0.00691 TTAC 0.00336 TTAG 0.00417 TTAT 0.00704 TTCA 0.0057 TTCC 0.00383 TTCG 0.00238 TTCT 0.00596 TTGA 0.00556 TTGC 0.00409 TTGG 0.00456 TTGT 0.00585 TTTA 0.00807 TTTC 0.00658 TTTG 0.00728 TTTT 0.015 # l= 4 # Values AAAAA 0.00643 AAAAC 0.00219 AAAAG 0.00226 AAAAT 0.00413 AAACA 0.00219 AAACC 0.00119 AAACG 0.000759 AAACT 0.0018 AAAGA 0.00193 AAAGC 0.000969 AAAGG 0.00113 AAAGT 0.00165 AAATA 0.00322 AAATC 0.00173 AAATG 0.00181 AAATT 0.00353 AACAA 0.00205 AACAC 0.00108 AACAG 0.000973 AACAT 0.00164 AACCA 0.00127 AACCC 0.000661 AACCG 0.000614 AACCT 0.000823 AACGA 0.000709 AACGC 0.000372 AACGG 0.000584 AACGT 0.000498 AACTA 0.00137 AACTC 0.000937 AACTG 0.000894 AACTT 0.00171 AAGAA 0.00215 AAGAC 0.000758 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.00147 AAGCA 0.00123 AAGCC 0.000693 AAGCG 0.000425 AAGCT 0.00103 AAGGA 0.00122 AAGGC 0.000683 AAGGG 0.000791 AAGGT 0.000804 AAGTA 0.00123 AAGTC 0.000753 AAGTG 0.000901 AAGTT 0.00171 AATAA 0.00256 AATAC 0.00115 AATAG 0.00123 AATAT 0.00264 AATCA 0.0016 AATCC 0.00101 AATCG 0.000598 AATCT 0.00145 AATGA 0.00143 AATGC 0.000939 AATGG 0.00112 AATGT 0.00134 AATTA 0.00259 AATTC 0.00144 AATTG 0.00154 AATTT 0.00353 ACAAA 0.00213 ACAAC 0.00114 ACAAG 0.00117 ACAAT 0.00141 ACACA 0.00139 ACACC 0.000786 ACACG 0.000604 ACACT 0.000797 ACAGA 0.000913 ACAGC 0.000715 ACAGG 0.000647 ACAGT 0.00082 ACATA 0.00151 ACATC 0.00105 ACATG 0.00148 ACATT 0.00134 ACCAA 0.0013 ACCAC 0.000973 ACCAG 0.00068 ACCAT 0.00113 ACCCA 0.000744 ACCCC 0.000537 ACCCG 0.000363 ACCCT 0.000613 ACCGA 0.000554 ACCGC 0.000555 ACCGG 0.000584 ACCGT 0.000547 ACCTA 0.000733 ACCTC 0.000785 ACCTG 0.000625 ACCTT 0.000804 ACGAA 0.000765 ACGAC 0.000601 ACGAG 0.000626 ACGAT 0.000595 ACGCA 0.000479 ACGCC 0.000497 ACGCG 0.000417 ACGCT 0.000384 ACGGA 0.000617 ACGGC 0.000691 ACGGG 0.000429 ACGGT 0.000547 ACGTA 0.000549 ACGTC 0.00046 ACGTG 0.000655 ACGTT 0.000498 ACTAA 0.00123 ACTAC 0.000926 ACTAG 0.000877 ACTAT 0.00114 ACTCA 0.000833 ACTCC 0.000874 ACTCG 0.000459 ACTCT 0.000839 ACTGA 0.00083 ACTGC 0.000699 ACTGG 0.000597 ACTGT 0.00082 ACTTA 0.00101 ACTTC 0.000894 ACTTG 0.00104 ACTTT 0.00165 AGAAA 0.00243 AGAAC 0.000896 AGAAG 0.0014 AGAAT 0.00123 AGACA 0.000846 AGACC 0.000515 AGACG 0.000515 AGACT 0.000609 AGAGA 0.00172 AGAGC 0.000728 AGAGG 0.00108 AGAGT 0.000839 AGATA 0.00126 AGATC 0.000949 AGATG 0.00125 AGATT 0.00145 AGCAA 0.00134 AGCAC 0.000811 AGCAG 0.000955 AGCAT 0.0011 AGCCA 0.000908 AGCCC 0.00055 AGCCG 0.000611 AGCCT 0.000653 AGCGA 0.00053 AGCGC 0.000414 AGCGG 0.000532 AGCGT 0.000384 AGCTA 0.00108 AGCTC 0.000862 AGCTG 0.000898 AGCTT 0.00103 AGGAA 0.00133 AGGAC 0.000619 AGGAG 0.00131 AGGAT 0.000959 AGGCA 0.000773 AGGCC 0.000653 AGGCG 0.000556 AGGCT 0.000653 AGGGA 0.001 AGGGC 0.000536 AGGGG 0.000766 AGGGT 0.000613 AGGTA 0.000725 AGGTC 0.000527 AGGTG 0.000874 AGGTT 0.000823 AGTAA 0.00111 AGTAC 0.000959 AGTAG 0.00101 AGTAT 0.0012 AGTCA 0.000806 AGTCC 0.000559 AGTCG 0.000404 AGTCT 0.000609 AGTGA 0.00089 AGTGC 0.000646 AGTGG 0.000813 AGTGT 0.000797 AGTTA 0.00108 AGTTC 0.000869 AGTTG 0.00116 AGTTT 0.0018 ATAAA 0.00275 ATAAC 0.000961 ATAAG 0.00119 ATAAT 0.00214 ATACA 0.00135 ATACC 0.000691 ATACG 0.000457 ATACT 0.0012 ATAGA 0.0013 ATAGC 0.00078 ATAGG 0.000784 ATAGT 0.00114 ATATA 0.00374 ATATC 0.00124 ATATG 0.00185 ATATT 0.00264 ATCAA 0.00177 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.000923 ATCAT 0.00161 ATCCA 0.00128 ATCCC 0.000712 ATCCG 0.000561 ATCCT 0.000959 ATCGA 0.000874 ATCGC 0.000455 ATCGG 0.000583 ATCGT 0.000595 ATCTA 0.00133 ATCTC 0.00113 ATCTG 0.000982 ATCTT 0.00147 ATGAA 0.0018 ATGAC 0.000904 ATGAG 0.000999 ATGAT 0.00161 ATGCA 0.00155 ATGCC 0.000781 ATGCG 0.000474 ATGCT 0.0011 ATGGA 0.00138 ATGGC 0.000959 ATGGG 0.000843 ATGGT 0.00113 ATGTA 0.00144 ATGTC 0.000898 ATGTG 0.00141 ATGTT 0.00164 ATTAA 0.0023 ATTAC 0.00101 ATTAG 0.00131 ATTAT 0.00214 ATTCA 0.00153 ATTCC 0.000908 ATTCG 0.000598 ATTCT 0.00123 ATTGA 0.00141 ATTGC 0.000976 ATTGG 0.00104 ATTGT 0.00141 ATTTA 0.00236 ATTTC 0.00168 ATTTG 0.00213 ATTTT 0.00413 CAAAA 0.00256 CAAAC 0.0014 CAAAG 0.0012 CAAAT 0.00213 CAACA 0.00136 CAACC 0.000916 CAACG 0.000612 CAACT 0.00116 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.000892 CAAGG 0.000807 CAAGT 0.00104 CAATA 0.00126 CAATC 0.000961 CAATG 0.00108 CAATT 0.00154 CACAA 0.00132 CACAC 0.00102 CACAG 0.000729 CACAT 0.00141 CACCA 0.00119 CACCC 0.000688 CACCG 0.000766 CACCT 0.000874 CACGA 0.00058 CACGC 0.000613 CACGG 0.000607 CACGT 0.000655 CACTA 0.000821 CACTC 0.00065 CACTG 0.000772 CACTT 0.000901 CAGAA 0.000994 CAGAC 0.000505 CAGAG 0.000771 CAGAT 0.000982 CAGCA 0.00102 CAGCC 0.000768 CAGCG 0.000579 CAGCT 0.000898 CAGGA 0.000724 CAGGC 0.000584 CAGGG 0.000538 CAGGT 0.000625 CAGTA 0.000778 CAGTC 0.000501 CAGTG 0.000772 CAGTT 0.000894 CATAA 0.0012 CATAC 0.000812 CATAG 0.000742 CATAT 0.00185 CATCA 0.00142 CATCC 0.001 CATCG 0.000732 CATCT 0.00125 CATGA 0.00124 CATGC 0.00122 CATGG 0.00113 CATGT 0.00148 CATTA 0.00107 CATTC 0.000872 CATTG 0.00108 CATTT 0.00181 CCAAA 0.00168 CCAAC 0.00099 CCAAG 0.000844 CCAAT 0.00104 CCACA 0.00101 CCACC 0.00118 CCACG 0.000669 CCACT 0.000813 CCAGA 0.000632 CCAGC 0.000737 CCAGG 0.000513 CCAGT 0.000597 CCATA 0.000913 CCATC 0.00115 CCATG 0.00113 CCATT 0.00112 CCCAA 0.000951 CCCAC 0.000824 CCCAG 0.000482 CCCAT 0.000843 CCCCA 0.00067 CCCCC 0.000747 CCCCG 0.000435 CCCCT 0.000766 CCCGA 0.000387 CCCGC 0.000532 CCCGG 0.000436 CCCGT 0.000429 CCCTA 0.0006 CCCTC 0.000989 CCCTG 0.000538 CCCTT 0.000791 CCGAA 0.000501 CCGAC 0.000534 CCGAG 0.000515 CCGAT 0.000583 CCGCA 0.000467 CCGCC 0.00125 CCGCG 0.000603 CCGCT 0.000532 CCGGA 0.000482 CCGGC 0.000859 CCGGG 0.000436 CCGGT 0.000584 CCGTA 0.000369 CCGTC 0.000724 CCGTG 0.000607 CCGTT 0.000584 CCTAA 0.000854 CCTAC 0.000597 CCTAG 0.000604 CCTAT 0.000784 CCTCA 0.00076 CCTCC 0.00141 CCTCG 0.000664 CCTCT 0.00108 CCTGA 0.000626 CCTGC 0.000686 CCTGG 0.000513 CCTGT 0.000647 CCTTA 0.000654 CCTTC 0.0009 CCTTG 0.000807 CCTTT 0.00113 CGAAA 0.000754 CGAAC 0.000491 CGAAG 0.000539 CGAAT 0.000598 CGACA 0.000561 CGACC 0.000484 CGACG 0.000853 CGACT 0.000404 CGAGA 0.000626 CGAGC 0.000654 CGAGG 0.000664 CGAGT 0.000459 CGATA 0.00045 CGATC 0.000727 CGATG 0.000732 CGATT 0.000598 CGCAA 0.000449 CGCAC 0.000501 CGCAG 0.00042 CGCAT 0.000474 CGCCA 0.000727 CGCCC 0.000572 CGCCG 0.00143 CGCCT 0.000556 CGCGA 0.000405 CGCGC 0.000742 CGCGG 0.000603 CGCGT 0.000417 CGCTA 0.000355 CGCTC 0.000501 CGCTG 0.000579 CGCTT 0.000425 CGGAA 0.00048 CGGAC 0.00038 CGGAG 0.000717 CGGAT 0.000561 CGGCA 0.000631 CGGCC 0.000801 CGGCG 0.00143 CGGCT 0.000611 CGGGA 0.000478 CGGGC 0.000507 CGGGG 0.000435 CGGGT 0.000363 CGGTA 0.000372 CGGTC 0.000488 CGGTG 0.000766 CGGTT 0.000614 CGTAA 0.000365 CGTAC 0.000463 CGTAG 0.000405 CGTAT 0.000457 CGTCA 0.000574 CGTCC 0.000563 CGTCG 0.000853 CGTCT 0.000515 CGTGA 0.000503 CGTGC 0.00068 CGTGG 0.000669 CGTGT 0.000604 CGTTA 0.000336 CGTTC 0.000456 CGTTG 0.000612 CGTTT 0.000759 CTAAA 0.00155 CTAAC 0.000689 CTAAG 0.000628 CTAAT 0.00131 CTACA 0.000949 CTACC 0.000636 CTACG 0.000405 CTACT 0.00101 CTAGA 0.000897 CTAGC 0.000867 CTAGG 0.000604 CTAGT 0.000877 CTATA 0.00128 CTATC 0.000747 CTATG 0.000742 CTATT 0.00123 CTCAA 0.00105 CTCAC 0.000756 CTCAG 0.000559 CTCAT 0.000999 CTCCA 0.00119 CTCCC 0.00107 CTCCG 0.000717 CTCCT 0.00131 CTCGA 0.000605 CTCGC 0.000657 CTCGG 0.000515 CTCGT 0.000626 CTCTA 0.000911 CTCTC 0.00148 CTCTG 0.000771 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00111 CTGAC 0.000609 CTGAG 0.000559 CTGAT 0.000923 CTGCA 0.00105 CTGCC 0.000741 CTGCG 0.00042 CTGCT 0.000955 CTGGA 0.000723 CTGGC 0.000595 CTGGG 0.000482 CTGGT 0.00068 CTGTA 0.00075 CTGTC 0.000643 CTGTG 0.000729 CTGTT 0.000973 CTTAA 0.00107 CTTAC 0.000558 CTTAG 0.000628 CTTAT 0.00119 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.000983 CTTCG 0.000539 CTTCT 0.0014 CTTGA 0.000971 CTTGC 0.000907 CTTGG 0.000844 CTTGT 0.00117 CTTTA 0.0011 CTTTC 0.00112 CTTTG 0.0012 CTTTT 0.00226 GAAAA 0.00269 GAAAC 0.00108 GAAAG 0.00112 GAAAT 0.00168 GAACA 0.00106 GAACC 0.000594 GAACG 0.000456 GAACT 0.000869 GAAGA 0.00144 GAAGC 0.000805 GAAGG 0.0009 GAAGT 0.000894 GAATA 0.00112 GAATC 0.000838 GAATG 0.000872 GAATT 0.00144 GACAA 0.00106 GACAC 0.000644 GACAG 0.000643 GACAT 0.000898 GACCA 0.000721 GACCC 0.000401 GACCG 0.000488 GACCT 0.000527 GACGA 0.000828 GACGC 0.000492 GACGG 0.000724 GACGT 0.00046 GACTA 0.000645 GACTC 0.00048 GACTG 0.000501 GACTT 0.000753 GAGAA 0.00141 GAGAC 0.000623 GAGAG 0.00148 GAGAT 0.00113 GAGCA 0.000895 GAGCC 0.000597 GAGCG 0.000501 GAGCT 0.000862 GAGGA 0.00135 GAGGC 0.000792 GAGGG 0.000989 GAGGT 0.000785 GAGTA 0.000938 GAGTC 0.00048 GAGTG 0.00065 GAGTT 0.000937 GATAA 0.00116 GATAC 0.000587 GATAG 0.000747 GATAT 0.00124 GATCA 0.00106 GATCC 0.000726 GATCG 0.000727 GATCT 0.000949 GATGA 0.00136 GATGC 0.000853 GATGG 0.00115 GATGT 0.00105 GATTA 0.00112 GATTC 0.000838 GATTG 0.000961 GATTT 0.00173 GCAAA 0.00135 GCAAC 0.000851 GCAAG 0.000907 GCAAT 0.000976 GCACA 0.000912 GCACC 0.000655 GCACG 0.00068 GCACT 0.000646 GCAGA 0.000755 GCAGC 0.00102 GCAGG 0.000686 GCAGT 0.000699 GCATA 0.000893 GCATC 0.000853 GCATG 0.00122 GCATT 0.000939 GCCAA 0.000926 GCCAC 0.000927 GCCAG 0.000595 GCCAT 0.000959 GCCCA 0.000826 GCCCC 0.000532 GCCCG 0.000507 GCCCT 0.000536 GCCGA 0.000666 GCCGC 0.00125 GCCGG 0.000859 GCCGT 0.000691 GCCTA 0.000576 GCCTC 0.000792 GCCTG 0.000584 GCCTT 0.000683 GCGAA 0.000472 GCGAC 0.000587 GCGAG 0.000657 GCGAT 0.000455 GCGCA 0.000459 GCGCC 0.00074 GCGCG 0.000742 GCGCT 0.000414 GCGGA 0.000513 GCGGC 0.00125 GCGGG 0.000532 GCGGT 0.000555 GCGTA 0.0003 GCGTC 0.000492 GCGTG 0.000613 GCGTT 0.000372 GCTAA 0.000853 GCTAC 0.00066 GCTAG 0.000867 GCTAT 0.00078 GCTCA 0.000711 GCTCC 0.000762 GCTCG 0.000654 GCTCT 0.000728 GCTGA 0.000793 GCTGC 0.00102 GCTGG 0.000737 GCTGT 0.000715 GCTTA 0.000712 GCTTC 0.000805 GCTTG 0.000892 GCTTT 0.000969 GGAAA 0.00132 GGAAC 0.000613 GGAAG 0.000983 GGAAT 0.000908 GGACA 0.000706 GGACC 0.000492 GGACG 0.000563 GGACT 0.000559 GGAGA 0.00123 GGAGC 0.000762 GGAGG 0.00141 GGAGT 0.000874 GGATA 0.000774 GGATC 0.000726 GGATG 0.001 GGATT 0.00101 GGCAA 0.000855 GGCAC 0.000615 GGCAG 0.000741 GGCAT 0.000781 GGCCA 0.000758 GGCCC 0.000704 GGCCG 0.000801 GGCCT 0.000653 GGCGA 0.000795 GGCGC 0.00074 GGCGG 0.00125 GGCGT 0.000497 GGCTA 0.000665 GGCTC 0.000597 GGCTG 0.000768 GGCTT 0.000693 GGGAA 0.00081 GGGAC 0.000555 GGGAG 0.00107 GGGAT 0.000712 GGGCA 0.000575 GGGCC 0.000704 GGGCG 0.000572 GGGCT 0.00055 GGGGA 0.000804 GGGGC 0.000532 GGGGG 0.000747 GGGGT 0.000537 GGGTA 0.000507 GGGTC 0.000401 GGGTG 0.000688 GGGTT 0.000661 GGTAA 0.000664 GGTAC 0.000508 GGTAG 0.000636 GGTAT 0.000691 GGTCA 0.000647 GGTCC 0.000492 GGTCG 0.000484 GGTCT 0.000515 GGTGA 0.000898 GGTGC 0.000655 GGTGG 0.00118 GGTGT 0.000786 GGTTA 0.000668 GGTTC 0.000594 GGTTG 0.000916 GGTTT 0.00119 GTAAA 0.00122 GTAAC 0.000576 GTAAG 0.000558 GTAAT 0.00101 GTACA 0.000904 GTACC 0.000508 GTACG 0.000463 GTACT 0.000959 GTAGA 0.000813 GTAGC 0.00066 GTAGG 0.000597 GTAGT 0.000926 GTATA 0.00115 GTATC 0.000587 GTATG 0.000812 GTATT 0.00115 GTCAA 0.000993 GTCAC 0.000657 GTCAG 0.000609 GTCAT 0.000904 GTCCA 0.000766 GTCCC 0.000555 GTCCG 0.00038 GTCCT 0.000619 GTCGA 0.00058 GTCGC 0.000587 GTCGG 0.000534 GTCGT 0.000601 GTCTA 0.000598 GTCTC 0.000623 GTCTG 0.000505 GTCTT 0.000758 GTGAA 0.00104 GTGAC 0.000657 GTGAG 0.000756 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000966 GTGCC 0.000615 GTGCG 0.000501 GTGCT 0.000811 GTGGA 0.000944 GTGGC 0.000927 GTGGG 0.000824 GTGGT 0.000973 GTGTA 0.000831 GTGTC 0.000644 GTGTG 0.00102 GTGTT 0.00108 GTTAA 0.000984 GTTAC 0.000576 GTTAG 0.000689 GTTAT 0.000961 GTTCA 0.000983 GTTCC 0.000613 GTTCG 0.000491 GTTCT 0.000896 GTTGA 0.00107 GTTGC 0.000851 GTTGG 0.00099 GTTGT 0.00114 GTTTA 0.00127 GTTTC 0.00108 GTTTG 0.0014 GTTTT 0.00219 TAAAA 0.00333 TAAAC 0.00127 TAAAG 0.0011 TAAAT 0.00236 TAACA 0.00113 TAACC 0.000668 TAACG 0.000336 TAACT 0.00108 TAAGA 0.00107 TAAGC 0.000712 TAAGG 0.000654 TAAGT 0.00101 TAATA 0.00198 TAATC 0.00112 TAATG 0.00107 TAATT 0.00259 TACAA 0.00141 TACAC 0.000831 TACAG 0.00075 TACAT 0.00144 TACCA 0.000895 TACCC 0.000507 TACCG 0.000372 TACCT 0.000725 TACGA 0.000471 TACGC 0.0003 TACGG 0.000369 TACGT 0.000549 TACTA 0.00133 TACTC 0.000938 TACTG 0.000778 TACTT 0.00123 TAGAA 0.0014 TAGAC 0.000598 TAGAG 0.000911 TAGAT 0.00133 TAGCA 0.00106 TAGCC 0.000665 TAGCG 0.000355 TAGCT 0.00108 TAGGA 0.000931 TAGGC 0.000576 TAGGG 0.0006 TAGGT 0.000733 TAGTA 0.00133 TAGTC 0.000645 TAGTG 0.000821 TAGTT 0.00137 TATAA 0.00212 TATAC 0.00115 TATAG 0.00128 TATAT 0.00374 TATCA 0.00125 TATCC 0.000774 TATCG 0.00045 TATCT 0.00126 TATGA 0.00129 TATGC 0.000893 TATGG 0.000913 TATGT 0.00151 TATTA 0.00198 TATTC 0.00112 TATTG 0.00126 TATTT 0.00322 TCAAA 0.00211 TCAAC 0.00107 TCAAG 0.000971 TCAAT 0.00141 TCACA 0.00118 TCACC 0.000898 TCACG 0.000503 TCACT 0.00089 TCAGA 0.000953 TCAGC 0.000793 TCAGG 0.000626 TCAGT 0.00083 TCATA 0.00129 TCATC 0.00136 TCATG 0.00124 TCATT 0.00143 TCCAA 0.00139 TCCAC 0.000944 TCCAG 0.000723 TCCAT 0.00138 TCCCA 0.000861 TCCCC 0.000804 TCCCG 0.000478 TCCCT 0.001 TCCGA 0.000526 TCCGC 0.000513 TCCGG 0.000482 TCCGT 0.000617 TCCTA 0.000931 TCCTC 0.00135 TCCTG 0.000724 TCCTT 0.00122 TCGAA 0.000644 TCGAC 0.00058 TCGAG 0.000605 TCGAT 0.000874 TCGCA 0.00044 TCGCC 0.000795 TCGCG 0.000405 TCGCT 0.00053 TCGGA 0.000526 TCGGC 0.000666 TCGGG 0.000387 TCGGT 0.000554 TCGTA 0.000471 TCGTC 0.000828 TCGTG 0.00058 TCGTT 0.000709 TCTAA 0.00124 TCTAC 0.000813 TCTAG 0.000897 TCTAT 0.0013 TCTCA 0.00106 TCTCC 0.00123 TCTCG 0.000626 TCTCT 0.00172 TCTGA 0.000953 TCTGC 0.000755 TCTGG 0.000632 TCTGT 0.000913 TCTTA 0.00107 TCTTC 0.00144 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.00193 TGAAA 0.00207 TGAAC 0.000983 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00153 TGACA 0.00114 TGACC 0.000647 TGACG 0.000574 TGACT 0.000806 TGAGA 0.00106 TGAGC 0.000711 TGAGG 0.00076 TGAGT 0.000833 TGATA 0.00125 TGATC 0.00106 TGATG 0.00142 TGATT 0.0016 TGCAA 0.00144 TGCAC 0.000966 TGCAG 0.00105 TGCAT 0.00155 TGCCA 0.00101 TGCCC 0.000575 TGCCG 0.000631 TGCCT 0.000773 TGCGA 0.00044 TGCGC 0.000459 TGCGG 0.000467 TGCGT 0.000479 TGCTA 0.00106 TGCTC 0.000895 TGCTG 0.00102 TGCTT 0.00123 TGGAA 0.0012 TGGAC 0.000766 TGGAG 0.00119 TGGAT 0.00128 TGGCA 0.00101 TGGCC 0.000758 TGGCG 0.000727 TGGCT 0.000908 TGGGA 0.000861 TGGGC 0.000826 TGGGG 0.00067 TGGGT 0.000744 TGGTA 0.000895 TGGTC 0.000721 TGGTG 0.00119 TGGTT 0.00127 TGTAA 0.00122 TGTAC 0.000904 TGTAG 0.000949 TGTAT 0.00135 TGTCA 0.00114 TGTCC 0.000706 TGTCG 0.000561 TGTCT 0.000846 TGTGA 0.00118 TGTGC 0.000912 TGTGG 0.00101 TGTGT 0.00139 TGTTA 0.00113 TGTTC 0.00106 TGTTG 0.00136 TGTTT 0.00219 TTAAA 0.00255 TTAAC 0.000984 TTAAG 0.00107 TTAAT 0.0023 TTACA 0.00122 TTACC 0.000664 TTACG 0.000365 TTACT 0.00111 TTAGA 0.00124 TTAGC 0.000853 TTAGG 0.000854 TTAGT 0.00123 TTATA 0.00212 TTATC 0.00116 TTATG 0.0012 TTATT 0.00256 TTCAA 0.00175 TTCAC 0.00104 TTCAG 0.00111 TTCAT 0.0018 TTCCA 0.0012 TTCCC 0.00081 TTCCG 0.00048 TTCCT 0.00133 TTCGA 0.000644 TTCGC 0.000472 TTCGG 0.000501 TTCGT 0.000765 TTCTA 0.0014 TTCTC 0.00141 TTCTG 0.000994 TTCTT 0.00215 TTGAA 0.00175 TTGAC 0.000993 TTGAG 0.00105 TTGAT 0.00177 TTGCA 0.00144 TTGCC 0.000855 TTGCG 0.000449 TTGCT 0.00134 TTGGA 0.00139 TTGGC 0.000926 TTGGG 0.000951 TTGGT 0.0013 TTGTA 0.00141 TTGTC 0.00106 TTGTG 0.00132 TTGTT 0.00205 TTTAA 0.00255 TTTAC 0.00122 TTTAG 0.00155 TTTAT 0.00275 TTTCA 0.00207 TTTCC 0.00132 TTTCG 0.000754 TTTCT 0.00243 TTTGA 0.00211 TTTGC 0.00135 TTTGG 0.00168 TTTGT 0.00213 TTTTA 0.00333 TTTTC 0.00269 TTTTG 0.00256 TTTTT 0.00643 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4293 AAAAC 0.145 AAAAG 0.1502 AAAAT 0.2756 AAACA 0.3701 AAACC 0.1992 AAACG 0.1264 AAACT 0.3043 AAAGA 0.3404 AAAGC 0.1692 AAAGG 0.1987 AAAGT 0.2917 AAATA 0.3151 AAATC 0.1667 AAATG 0.1744 AAATT 0.3437 AACAA 0.3577 AACAC 0.1868 AACAG 0.1677 AACAT 0.2879 AACCA 0.3798 AACCC 0.1954 AACCG 0.1796 AACCT 0.2452 AACGA 0.3281 AACGC 0.1701 AACGG 0.2685 AACGT 0.2333 AACTA 0.2807 AACTC 0.1895 AACTG 0.1804 AACTT 0.3493 AAGAA 0.3861 AAGAC 0.1349 AAGAG 0.2147 AAGAT 0.2643 AAGCA 0.3671 AAGCC 0.2031 AAGCG 0.1233 AAGCT 0.3065 AAGGA 0.3495 AAGGC 0.1941 AAGGG 0.2244 AAGGT 0.232 AAGTA 0.2692 AAGTC 0.163 AAGTG 0.1946 AAGTT 0.3732 AATAA 0.3377 AATAC 0.1507 AATAG 0.1617 AATAT 0.35 AATCA 0.3444 AATCC 0.2146 AATCG 0.1275 AATCT 0.3135 AATGA 0.2971 AATGC 0.1933 AATGG 0.2299 AATGT 0.2797 AATTA 0.286 AATTC 0.1575 AATTG 0.1678 AATTT 0.3887 ACAAA 0.3653 ACAAC 0.193 ACAAG 0.1985 ACAAT 0.2431 ACACA 0.3914 ACACC 0.2177 ACACG 0.1671 ACACT 0.2237 ACAGA 0.2967 ACAGC 0.2288 ACAGG 0.2079 ACAGT 0.2665 ACATA 0.283 ACATC 0.1936 ACATG 0.2736 ACATT 0.2498 ACCAA 0.3203 ACCAC 0.2354 ACCAG 0.1651 ACCAT 0.2792 ACCCA 0.3319 ACCCC 0.2373 ACCCG 0.1575 ACCCT 0.2734 ACCGA 0.2492 ACCGC 0.2443 ACCGG 0.2592 ACCGT 0.2473 ACCTA 0.2516 ACCTC 0.2626 ACCTG 0.2107 ACCTT 0.2751 ACGAA 0.3001 ACGAC 0.2278 ACGAG 0.2402 ACGAT 0.232 ACGCA 0.2735 ACGCC 0.2768 ACGCG 0.2315 ACGCT 0.2182 ACGGA 0.2744 ACGGC 0.2969 ACGGG 0.1867 ACGGT 0.2419 ACGTA 0.2566 ACGTC 0.2083 ACGTG 0.3009 ACGTT 0.2341 ACTAA 0.2965 ACTAC 0.2204 ACTAG 0.209 ACTAT 0.2741 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.2894 ACTCG 0.1498 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2825 ACTGC 0.236 ACTGG 0.2015 ACTGT 0.2801 ACTTA 0.2219 ACTTC 0.1936 ACTTG 0.2235 ACTTT 0.361 AGAAA 0.4106 AGAAC 0.1495 AGAAG 0.2328 AGAAT 0.2071 AGACA 0.3427 AGACC 0.2059 AGACG 0.2042 AGACT 0.2473 AGAGA 0.3953 AGAGC 0.1662 AGAGG 0.2438 AGAGT 0.1947 AGATA 0.2594 AGATC 0.1908 AGATG 0.2534 AGATT 0.2964 AGCAA 0.319 AGCAC 0.1924 AGCAG 0.2249 AGCAT 0.2637 AGCCA 0.337 AGCCC 0.2015 AGCCG 0.22 AGCCT 0.2415 AGCGA 0.2868 AGCGC 0.2204 AGCGG 0.2837 AGCGT 0.2091 AGCTA 0.284 AGCTC 0.2195 AGCTG 0.2298 AGCTT 0.2667 AGGAA 0.3188 AGGAC 0.1458 AGGAG 0.3065 AGGAT 0.2288 AGGCA 0.2966 AGGCC 0.247 AGGCG 0.2057 AGGCT 0.2506 AGGGA 0.3443 AGGGC 0.1825 AGGGG 0.2618 AGGGT 0.2114 AGGTA 0.2492 AGGTC 0.1763 AGGTG 0.2937 AGGTT 0.2808 AGTAA 0.2609 AGTAC 0.2228 AGTAG 0.2334 AGTAT 0.2829 AGTCA 0.3407 AGTCC 0.2355 AGTCG 0.1659 AGTCT 0.2579 AGTGA 0.2838 AGTGC 0.2051 AGTGG 0.2562 AGTGT 0.2549 AGTTA 0.222 AGTTC 0.1753 AGTTG 0.234 AGTTT 0.3687 ATAAA 0.391 ATAAC 0.136 ATAAG 0.1683 ATAAT 0.3047 ATACA 0.3677 ATACC 0.185 ATACG 0.1226 ATACT 0.3248 ATAGA 0.3257 ATAGC 0.1942 ATAGG 0.1952 ATAGT 0.2849 ATATA 0.3986 ATATC 0.129 ATATG 0.1942 ATATT 0.2781 ATCAA 0.3328 ATCAC 0.19 ATCAG 0.1719 ATCAT 0.3053 ATCCA 0.3666 ATCCC 0.2015 ATCCG 0.1581 ATCCT 0.2738 ATCGA 0.3508 ATCGC 0.1791 ATCGG 0.2321 ATCGT 0.2379 ATCTA 0.2735 ATCTC 0.2282 ATCTG 0.1979 ATCTT 0.3004 ATGAA 0.3397 ATGAC 0.1683 ATGAG 0.1872 ATGAT 0.3047 ATGCA 0.4005 ATGCC 0.1976 ATGCG 0.1194 ATGCT 0.2825 ATGGA 0.3229 ATGGC 0.2192 ATGGG 0.194 ATGGT 0.2639 ATGTA 0.2698 ATGTC 0.1639 ATGTG 0.2606 ATGTT 0.3056 ATTAA 0.3416 ATTAC 0.1483 ATTAG 0.193 ATTAT 0.3171 ATTCA 0.3603 ATTCC 0.2121 ATTCG 0.1389 ATTCT 0.2886 ATTGA 0.2913 ATTGC 0.2006 ATTGG 0.2144 ATTGT 0.2937 ATTTA 0.2305 ATTTC 0.1627 ATTTG 0.2052 ATTTT 0.4017 CAAAA 0.3523 CAAAC 0.1909 CAAAG 0.1636 CAAAT 0.2932 CAACA 0.338 CAACC 0.2256 CAACG 0.1491 CAACT 0.2872 CAAGA 0.2985 CAAGC 0.2283 CAAGG 0.2057 CAAGT 0.2676 CAATA 0.2624 CAATC 0.197 CAATG 0.2213 CAATT 0.3193 CACAA 0.2953 CACAC 0.2272 CACAG 0.1609 CACAT 0.3166 CACCA 0.341 CACCC 0.1953 CACCG 0.2132 CACCT 0.2505 CACGA 0.2373 CACGC 0.2483 CACGG 0.2453 CACGT 0.2691 CACTA 0.2643 CACTC 0.2049 CACTG 0.2433 CACTT 0.2875 CAGAA 0.3068 CAGAC 0.1547 CAGAG 0.2353 CAGAT 0.3033 CAGCA 0.3146 CAGCC 0.2335 CAGCG 0.1743 CAGCT 0.2776 CAGGA 0.2937 CAGGC 0.2349 CAGGG 0.2172 CAGGT 0.2542 CAGTA 0.2662 CAGTC 0.1683 CAGTG 0.2606 CAGTT 0.3049 CATAA 0.2607 CATAC 0.1753 CATAG 0.1596 CATAT 0.4044 CATCA 0.3246 CATCC 0.2264 CATCG 0.1632 CATCT 0.2857 CATGA 0.245 CATGC 0.2404 CATGG 0.2209 CATGT 0.2937 CATTA 0.2238 CATTC 0.1796 CATTG 0.2212 CATTT 0.3754 CCAAA 0.3716 CCAAC 0.216 CCAAG 0.1832 CCAAT 0.2293 CCACA 0.2786 CCACC 0.3183 CCACG 0.1789 CCACT 0.2243 CCAGA 0.2564 CCAGC 0.2954 CCAGG 0.2058 CCAGT 0.2424 CCATA 0.2144 CCATC 0.2638 CCATG 0.2612 CCATT 0.2606 CCCAA 0.31 CCCAC 0.2623 CCCAG 0.1541 CCCAT 0.2735 CCCCA 0.2581 CCCCC 0.2849 CCCCG 0.1619 CCCCT 0.2952 CCCGA 0.2182 CCCGC 0.2944 CCCGG 0.2435 CCCGT 0.2438 CCCTA 0.2089 CCCTC 0.3354 CCCTG 0.1839 CCCTT 0.2718 CCGAA 0.2384 CCGAC 0.2454 CCGAG 0.2384 CCGAT 0.2777 CCGCA 0.1669 CCGCC 0.4342 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.1894 CCGGA 0.2051 CCGGC 0.3608 CCGGG 0.184 CCGGT 0.2501 CCGTA 0.1647 CCGTC 0.3137 CCGTG 0.2631 CCGTT 0.2585 CCTAA 0.3024 CCTAC 0.2077 CCTAG 0.212 CCTAT 0.278 CCTCA 0.196 CCTCC 0.3601 CCTCG 0.166 CCTCT 0.2779 CCTGA 0.255 CCTGC 0.2757 CCTGG 0.2061 CCTGT 0.2632 CCTTA 0.1898 CCTTC 0.2539 CCTTG 0.2288 CCTTT 0.3274 CGAAA 0.3195 CGAAC 0.2044 CGAAG 0.2223 CGAAT 0.2539 CGACA 0.2472 CGACC 0.2098 CGACG 0.3647 CGACT 0.1782 CGAGA 0.2639 CGAGC 0.2697 CGAGG 0.2725 CGAGT 0.1939 CGATA 0.1813 CGATC 0.2887 CGATG 0.2891 CGATT 0.2409 CGCAA 0.2448 CGCAC 0.2693 CGCAG 0.2259 CGCAT 0.26 CGCCA 0.2249 CGCCC 0.1737 CGCCG 0.4304 CGCCT 0.1711 CGCGA 0.1886 CGCGC 0.3407 CGCGG 0.2757 CGCGT 0.1949 CGCTA 0.1944 CGCTC 0.265 CGCTG 0.31 CGCTT 0.2305 CGGAA 0.2271 CGGAC 0.1763 CGGAG 0.3312 CGGAT 0.2654 CGGCA 0.1841 CGGCC 0.2305 CGGCG 0.4062 CGGCT 0.1792 CGGGA 0.2699 CGGGC 0.283 CGGGG 0.2419 CGGGT 0.2052 CGGTA 0.169 CGGTC 0.2168 CGGTG 0.3368 CGGTT 0.2773 CGTAA 0.2177 CGTAC 0.2717 CGTAG 0.2363 CGTAT 0.2743 CGTCA 0.2323 CGTCC 0.2253 CGTCG 0.3333 CGTCT 0.2092 CGTGA 0.2069 CGTGC 0.2745 CGTGG 0.2684 CGTGT 0.2502 CGTTA 0.1579 CGTTC 0.2083 CGTTG 0.2805 CGTTT 0.3534 CTAAA 0.3719 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1492 CTAAT 0.3149 CTACA 0.3189 CTACC 0.212 CTACG 0.1326 CTACT 0.3365 CTAGA 0.278 CTAGC 0.2669 CTAGG 0.185 CTAGT 0.27 CTATA 0.3217 CTATC 0.1852 CTATG 0.1843 CTATT 0.3088 CTCAA 0.3128 CTCAC 0.2229 CTCAG 0.1646 CTCAT 0.2997 CTCCA 0.2802 CTCCC 0.2487 CTCCG 0.1649 CTCCT 0.3063 CTCGA 0.2533 CTCGC 0.2706 CTCGG 0.2129 CTCGT 0.2632 CTCTA 0.2122 CTCTC 0.3346 CTCTG 0.175 CTCTT 0.2782 CTGAA 0.3487 CTGAC 0.1879 CTGAG 0.1737 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3337 CTGCC 0.2321 CTGCG 0.1306 CTGCT 0.3036 CTGGA 0.293 CTGGC 0.2383 CTGGG 0.1931 CTGGT 0.2756 CTGTA 0.244 CTGTC 0.2058 CTGTG 0.2347 CTGTT 0.3154 CTTAA 0.3126 CTTAC 0.1602 CTTAG 0.1809 CTTAT 0.3464 CTTCA 0.2772 CTTCC 0.2424 CTTCG 0.131 CTTCT 0.3494 CTTGA 0.2505 CTTGC 0.2318 CTTGG 0.2156 CTTGT 0.3021 CTTTA 0.1944 CTTTC 0.1959 CTTTG 0.2094 CTTTT 0.4003 GAAAA 0.4101 GAAAC 0.1637 GAAAG 0.1692 GAAAT 0.257 GAACA 0.3588 GAACC 0.1981 GAACG 0.1506 GAACT 0.2925 GAAGA 0.3568 GAAGC 0.198 GAAGG 0.221 GAAGT 0.2243 GAATA 0.2632 GAATC 0.1943 GAATG 0.2033 GAATT 0.3392 GACAA 0.3288 GACAC 0.1976 GACAG 0.1964 GACAT 0.2772 GACCA 0.3415 GACCC 0.1858 GACCG 0.2256 GACCT 0.2471 GACGA 0.3316 GACGC 0.1945 GACGG 0.2895 GACGT 0.1844 GACTA 0.2731 GACTC 0.2008 GACTG 0.2078 GACTT 0.3184 GAGAA 0.3052 GAGAC 0.1335 GAGAG 0.3158 GAGAT 0.2455 GAGCA 0.3167 GAGCC 0.2081 GAGCG 0.171 GAGCT 0.3042 GAGGA 0.3453 GAGGC 0.1994 GAGGG 0.253 GAGGT 0.2023 GAGTA 0.3144 GAGTC 0.1587 GAGTG 0.2143 GAGTT 0.3126 GATAA 0.3116 GATAC 0.1561 GATAG 0.199 GATAT 0.3332 GATCA 0.3073 GATCC 0.2094 GATCG 0.2084 GATCT 0.275 GATGA 0.3085 GATGC 0.1922 GATGG 0.2585 GATGT 0.2408 GATTA 0.2423 GATTC 0.1788 GATTG 0.2052 GATTT 0.3737 GCAAA 0.3324 GCAAC 0.207 GCAAG 0.2204 GCAAT 0.2402 GCACA 0.3189 GCACC 0.2243 GCACG 0.2305 GCACT 0.2262 GCAGA 0.2401 GCAGC 0.3209 GCAGG 0.2161 GCAGT 0.2229 GCATA 0.2307 GCATC 0.2157 GCATG 0.3126 GCATT 0.241 GCCAA 0.275 GCCAC 0.2692 GCCAG 0.1737 GCCAT 0.2821 GCCCA 0.3458 GCCCC 0.2207 GCCCG 0.2078 GCCCT 0.2257 GCCGA 0.1937 GCCGC 0.3568 GCCGG 0.2481 GCCGT 0.2014 GCCTA 0.2218 GCCTC 0.2946 GCCTG 0.2216 GCCTT 0.2619 GCGAA 0.2202 GCGAC 0.2674 GCGAG 0.3002 GCGAT 0.2122 GCGCA 0.1983 GCGCC 0.3116 GCGCG 0.3125 GCGCT 0.1776 GCGGA 0.1815 GCGGC 0.4347 GCGGG 0.1863 GCGGT 0.1975 GCGTA 0.172 GCGTC 0.2723 GCGTG 0.344 GCGTT 0.2116 GCTAA 0.2711 GCTAC 0.207 GCTAG 0.274 GCTAT 0.2479 GCTCA 0.2527 GCTCC 0.2646 GCTCG 0.2242 GCTCT 0.2585 GCTGA 0.2441 GCTGC 0.311 GCTGG 0.2248 GCTGT 0.2201 GCTTA 0.2136 GCTTC 0.2353 GCTTG 0.2627 GCTTT 0.2885 GGAAA 0.347 GGAAC 0.1588 GGAAG 0.2544 GGAAT 0.2397 GGACA 0.3065 GGACC 0.2102 GGACG 0.2385 GGACT 0.2448 GGAGA 0.2888 GGAGC 0.1764 GGAGG 0.3274 GGAGT 0.2074 GGATA 0.2231 GGATC 0.2056 GGATG 0.2841 GGATT 0.2872 GGCAA 0.2877 GGCAC 0.2038 GGCAG 0.2453 GGCAT 0.2631 GGCCA 0.2627 GGCCC 0.242 GGCCG 0.269 GGCCT 0.2263 GGCGA 0.244 GGCGC 0.2245 GGCGG 0.3776 GGCGT 0.154 GGCTA 0.2483 GGCTC 0.217 GGCTG 0.2793 GGCTT 0.2554 GGGAA 0.259 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.3372 GGGAT 0.2282 GGGCA 0.2427 GGGCC 0.2932 GGGCG 0.2319 GGGCT 0.2321 GGGGA 0.3075 GGGGC 0.201 GGGGG 0.2847 GGGGT 0.2068 GGGTA 0.227 GGGTC 0.1751 GGGTG 0.3024 GGGTT 0.2956 GGTAA 0.267 GGTAC 0.2014 GGTAG 0.2537 GGTAT 0.278 GGTCA 0.3069 GGTCC 0.2289 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2432 GGTGA 0.2565 GGTGC 0.1855 GGTGG 0.3317 GGTGT 0.2263 GGTTA 0.1995 GGTTC 0.1747 GGTTG 0.2706 GGTTT 0.3552 GTAAA 0.364 GTAAC 0.1704 GTAAG 0.1645 GTAAT 0.3011 GTACA 0.3206 GTACC 0.1781 GTACG 0.1614 GTACT 0.3399 GTAGA 0.2732 GTAGC 0.2195 GTAGG 0.1973 GTAGT 0.31 GTATA 0.3146 GTATC 0.1567 GTATG 0.2182 GTATT 0.3104 GTCAA 0.3163 GTCAC 0.2068 GTCAG 0.1898 GTCAT 0.2871 GTCCA 0.3337 GTCCC 0.2378 GTCCG 0.161 GTCCT 0.2675 GTCGA 0.2538 GTCGC 0.2534 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2624 GTCTA 0.2431 GTCTC 0.2483 GTCTG 0.202 GTCTT 0.3066 GTGAA 0.3 GTGAC 0.1886 GTGAG 0.2165 GTGAT 0.2948 GTGCA 0.3364 GTGCC 0.2103 GTGCG 0.1699 GTGCT 0.2834 GTGGA 0.2591 GTGGC 0.2508 GTGGG 0.2232 GTGGT 0.2669 GTGTA 0.2341 GTGTC 0.1783 GTGTG 0.2852 GTGTT 0.3024 GTTAA 0.3074 GTTAC 0.1784 GTTAG 0.2136 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3311 GTTCC 0.204 GTTCG 0.1624 GTTCT 0.3025 GTTGA 0.2652 GTTGC 0.2089 GTTGG 0.244 GTTGT 0.2819 GTTTA 0.2157 GTTTC 0.1811 GTTTG 0.2336 GTTTT 0.3696 TAAAA 0.4145 TAAAC 0.1569 TAAAG 0.1353 TAAAT 0.2933 TAACA 0.352 TAACC 0.2062 TAACG 0.104 TAACT 0.3378 TAAGA 0.3115 TAAGC 0.2055 TAAGG 0.1889 TAAGT 0.2941 TAATA 0.2945 TAATC 0.164 TAATG 0.1578 TAATT 0.3837 TACAA 0.3184 TACAC 0.1865 TACAG 0.1673 TACAT 0.3278 TACCA 0.3598 TACCC 0.2013 TACCG 0.147 TACCT 0.2919 TACGA 0.2799 TACGC 0.1762 TACGG 0.2181 TACGT 0.3257 TACTA 0.3125 TACTC 0.2184 TACTG 0.1805 TACTT 0.2886 TAGAA 0.3333 TAGAC 0.1394 TAGAG 0.2136 TAGAT 0.3138 TAGCA 0.3356 TAGCC 0.209 TAGCG 0.1101 TAGCT 0.3454 TAGGA 0.3295 TAGGC 0.2007 TAGGG 0.2107 TAGGT 0.2591 TAGTA 0.3203 TAGTC 0.1536 TAGTG 0.1966 TAGTT 0.3295 TATAA 0.2544 TATAC 0.1384 TATAG 0.1526 TATAT 0.4546 TATCA 0.3349 TATCC 0.2065 TATCG 0.1189 TATCT 0.3398 TATGA 0.2813 TATGC 0.1925 TATGG 0.1967 TATGT 0.3295 TATTA 0.2626 TATTC 0.1462 TATTG 0.1649 TATTT 0.4262 TCAAA 0.3825 TCAAC 0.1909 TCAAG 0.1731 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3431 TCACC 0.2557 TCACG 0.1432 TCACT 0.258 TCAGA 0.2983 TCAGC 0.2459 TCAGG 0.1953 TCAGT 0.2606 TCATA 0.2456 TCATC 0.2523 TCATG 0.2322 TCATT 0.2699 TCCAA 0.3143 TCCAC 0.2102 TCCAG 0.1614 TCCAT 0.3142 TCCCA 0.2767 TCCCC 0.2539 TCCCG 0.1491 TCCCT 0.3204 TCCGA 0.2497 TCCGC 0.2347 TCCGG 0.2223 TCCGT 0.2933 TCCTA 0.2244 TCCTC 0.3143 TCCTG 0.1708 TCCTT 0.2906 TCGAA 0.2411 TCGAC 0.2108 TCGAG 0.2211 TCGAT 0.3271 TCGCA 0.2068 TCGCC 0.3617 TCGCG 0.1847 TCGCT 0.2467 TCGGA 0.2511 TCGGC 0.3071 TCGGG 0.1797 TCGGT 0.2621 TCGTA 0.1853 TCGTC 0.3149 TCGTG 0.223 TCGTT 0.2767 TCTAA 0.2932 TCTAC 0.1899 TCTAG 0.2104 TCTAT 0.3065 TCTCA 0.2313 TCTCC 0.2628 TCTCG 0.1331 TCTCT 0.3729 TCTGA 0.2933 TCTGC 0.2306 TCTGG 0.1933 TCTGT 0.2828 TCTTA 0.1937 TCTTC 0.2537 TCTTG 0.2055 TCTTT 0.3471 TGAAA 0.3654 TGAAC 0.1711 TGAAG 0.1931 TGAAT 0.2704 TGACA 0.3609 TGACC 0.2042 TGACG 0.1782 TGACT 0.2567 TGAGA 0.3174 TGAGC 0.2103 TGAGG 0.2225 TGAGT 0.2499 TGATA 0.2362 TGATC 0.1969 TGATG 0.2659 TGATT 0.3009 TGCAA 0.2895 TGCAC 0.1911 TGCAG 0.2068 TGCAT 0.3127 TGCCA 0.342 TGCCC 0.1919 TGCCG 0.2058 TGCCT 0.2603 TGCGA 0.2407 TGCGC 0.2464 TGCGG 0.2504 TGCGT 0.2625 TGCTA 0.2545 TGCTC 0.2108 TGCTG 0.2402 TGCTT 0.2946 TGGAA 0.2724 TGGAC 0.1722 TGGAG 0.2654 TGGAT 0.29 TGGCA 0.3006 TGGCC 0.2211 TGGCG 0.2085 TGGCT 0.2698 TGGGA 0.2799 TGGGC 0.2631 TGGGG 0.2155 TGGGT 0.2416 TGGTA 0.2216 TGGTC 0.1759 TGGTG 0.2885 TGGTT 0.314 TGTAA 0.2768 TGTAC 0.2022 TGTAG 0.2128 TGTAT 0.3082 TGTCA 0.3518 TGTCC 0.2165 TGTCG 0.169 TGTCT 0.2626 TGTGA 0.2637 TGTGC 0.2021 TGTGG 0.2224 TGTGT 0.3118 TGTTA 0.1977 TGTTC 0.1838 TGTTG 0.2353 TGTTT 0.3832 TTAAA 0.3698 TTAAC 0.1415 TTAAG 0.1546 TTAAT 0.3342 TTACA 0.365 TTACC 0.1964 TTACG 0.1075 TTACT 0.3311 TTAGA 0.2983 TTAGC 0.2034 TTAGG 0.2033 TTAGT 0.2951 TTATA 0.3026 TTATC 0.1637 TTATG 0.1698 TTATT 0.3639 TTCAA 0.3091 TTCAC 0.1804 TTCAG 0.193 TTCAT 0.3175 TTCCA 0.3159 TTCCC 0.2098 TTCCG 0.1242 TTCCT 0.35 TTCGA 0.2717 TTCGC 0.1953 TTCGG 0.2094 TTCGT 0.3235 TTCTA 0.2394 TTCTC 0.2338 TTCTG 0.165 TTCTT 0.3617 TTGAA 0.3168 TTGAC 0.1777 TTGAG 0.1872 TTGAT 0.3182 TTGCA 0.3562 TTGCC 0.2075 TTGCG 0.108 TTGCT 0.3283 TTGGA 0.3049 TTGGC 0.2017 TTGGG 0.2076 TTGGT 0.2858 TTGTA 0.2428 TTGTC 0.1802 TTGTG 0.2252 TTGTT 0.3518 TTTAA 0.3171 TTTAC 0.1504 TTTAG 0.1912 TTTAT 0.3413 TTTCA 0.316 TTTCC 0.1992 TTTCG 0.1135 TTTCT 0.3713 TTTGA 0.2919 TTTGC 0.1843 TTTGG 0.2306 TTTGT 0.2931 TTTTA 0.2235 TTTTC 0.1781 TTTTG 0.1692 TTTTT 0.4293 [3] # (a,c,g,t)= (0.271, 0.229, 0.229, 0.271) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.29 C 0.21 G 0.21 T 0.29 # l= 1 # Values AA 0.095 AC 0.0531 AG 0.0579 AT 0.0842 CA 0.0646 CC 0.0488 CG 0.0386 CT 0.0579 GA 0.0591 GC 0.0489 GG 0.0488 GT 0.0531 TA 0.0715 TC 0.0591 TG 0.0645 TT 0.095 # l= 2 # Values AAA 0.0362 AAC 0.0161 AAG 0.017 AAT 0.0256 ACA 0.0178 ACC 0.0117 ACG 0.00903 ACT 0.0146 AGA 0.0177 AGC 0.0128 AGG 0.0129 AGT 0.0146 ATA 0.0236 ATC 0.0162 ATG 0.0188 ATT 0.0256 CAA 0.0199 CAC 0.0137 CAG 0.0121 CAT 0.0188 CCA 0.0152 CCC 0.0107 CCG 0.0101 CCT 0.0129 CGA 0.00986 CGC 0.00963 CGG 0.0101 CGT 0.00903 CTA 0.0142 CTC 0.0146 CTG 0.0121 CTT 0.017 GAA 0.0178 GAC 0.0105 GAG 0.0146 GAT 0.0162 GCA 0.0142 GCC 0.0123 GCG 0.00963 GCT 0.0128 GGA 0.0141 GGC 0.0123 GGG 0.0107 GGT 0.0116 GTA 0.0128 GTC 0.0105 GTG 0.0137 GTT 0.0161 TAA 0.021 TAC 0.0128 TAG 0.0142 TAT 0.0236 TCA 0.0175 TCC 0.0141 TCG 0.00986 TCT 0.0177 TGA 0.0175 TGC 0.0142 TGG 0.0152 TGT 0.0178 TTA 0.021 TTC 0.0178 TTG 0.0199 TTT 0.0362 # l= 3 # Values AAAA 0.0147 AAAC 0.00588 AAAG 0.0056 AAAT 0.0101 AACA 0.00568 AACC 0.00338 AACG 0.00218 AACT 0.00485 AAGA 0.00555 AAGC 0.00339 AAGG 0.0035 AAGT 0.00453 AATA 0.00738 AATC 0.00461 AATG 0.00477 AATT 0.00888 ACAA 0.00579 ACAC 0.00357 ACAG 0.0031 ACAT 0.00532 ACCA 0.00409 ACCC 0.00229 ACCG 0.00231 ACCT 0.00296 ACGA 0.00264 ACGC 0.00184 ACGG 0.00235 ACGT 0.00219 ACTA 0.0041 ACTC 0.00301 ACTG 0.00296 ACTT 0.00453 AGAA 0.0059 AGAC 0.0025 AGAG 0.00439 AGAT 0.00488 AGCA 0.00421 AGCC 0.00277 AGCG 0.00193 AGCT 0.00387 AGGA 0.00425 AGGC 0.0027 AGGG 0.00297 AGGT 0.00295 AGTA 0.00422 AGTC 0.00239 AGTG 0.00315 AGTT 0.00485 ATAA 0.00686 ATAC 0.00363 ATAG 0.00392 ATAT 0.00918 ATCA 0.00527 ATCC 0.00352 ATCG 0.00254 ATCT 0.00488 ATGA 0.00525 ATGC 0.00389 ATGG 0.00432 ATGT 0.00532 ATTA 0.00658 ATTC 0.00421 ATTG 0.00478 ATTT 0.0101 CAAA 0.0072 CAAC 0.00406 CAAG 0.00391 CAAT 0.00478 CACA 0.00447 CACC 0.0036 CACG 0.00254 CACT 0.00315 CAGA 0.00327 CAGC 0.00333 CAGG 0.00251 CAGT 0.00296 CATA 0.00452 CATC 0.00443 CATG 0.00506 CATT 0.00477 CCAA 0.00456 CCAC 0.00375 CCAG 0.00253 CCAT 0.00432 CCCA 0.00315 CCCC 0.0027 CCCG 0.00188 CCCT 0.00297 CCGA 0.00221 CCGC 0.00303 CCGG 0.00248 CCGT 0.00235 CCTA 0.00282 CCTC 0.00403 CCTG 0.00251 CCTT 0.0035 CGAA 0.00241 CGAC 0.00241 CGAG 0.0025 CGAT 0.00254 CGCA 0.0019 CGCC 0.00349 CGCG 0.00231 CGCT 0.00193 CGGA 0.0022 CGGC 0.00368 CGGG 0.00188 CGGT 0.00231 CGTA 0.0017 CGTC 0.00261 CGTG 0.00253 CGTT 0.00218 CTAA 0.00409 CTAC 0.00299 CTAG 0.00322 CTAT 0.00392 CTCA 0.00337 CTCC 0.00439 CTCG 0.0025 CTCT 0.00439 CTGA 0.00322 CTGC 0.00322 CTGG 0.00253 CTGT 0.0031 CTTA 0.00339 CTTC 0.00408 CTTG 0.00391 CTTT 0.0056 GAAA 0.0065 GAAC 0.003 GAAG 0.00408 GAAT 0.00422 GACA 0.00327 GACC 0.00219 GACG 0.00261 GACT 0.00239 GAGA 0.00469 GAGC 0.00292 GAGG 0.00403 GAGT 0.00301 GATA 0.00368 GATC 0.00348 GATG 0.00443 GATT 0.00461 GCAA 0.00409 GCAC 0.00294 GCAG 0.00322 GCAT 0.0039 GCCA 0.00348 GCCC 0.00249 GCCG 0.00368 GCCT 0.0027 GCGA 0.00226 GCGC 0.0025 GCGG 0.00303 GCGT 0.00184 GCTA 0.00313 GCTC 0.00292 GCTG 0.00333 GCTT 0.00339 GGAA 0.00384 GGAC 0.00236 GGAG 0.00439 GGAT 0.00352 GGCA 0.00305 GGCC 0.00303 GGCG 0.00349 GGCT 0.00277 GGGA 0.00321 GGGC 0.00249 GGGG 0.0027 GGGT 0.00229 GGTA 0.00249 GGTC 0.00219 GGTG 0.0036 GGTT 0.00338 GTAA 0.00331 GTAC 0.00283 GTAG 0.00299 GTAT 0.00363 GTCA 0.00318 GTCC 0.00236 GTCG 0.00241 GTCT 0.0025 GTGA 0.00348 GTGC 0.00294 GTGG 0.00375 GTGT 0.00357 GTTA 0.00316 GTTC 0.003 GTTG 0.00406 GTTT 0.00588 TAAA 0.00786 TAAC 0.00316 TAAG 0.00339 TAAT 0.00658 TACA 0.00436 TACC 0.00249 TACG 0.0017 TACT 0.00422 TAGA 0.00416 TAGC 0.00313 TAGG 0.00282 TAGT 0.0041 TATA 0.008 TATC 0.00368 TATG 0.00452 TATT 0.00738 TCAA 0.0055 TCAC 0.00348 TCAG 0.00322 TCAT 0.00525 TCCA 0.00444 TCCC 0.00321 TCCG 0.0022 TCCT 0.00425 TCGA 0.00275 TCGC 0.00226 TCGG 0.00221 TCGT 0.00264 TCTA 0.00416 TCTC 0.00469 TCTG 0.00327 TCTT 0.00555 TGAA 0.00564 TGAC 0.00318 TGAG 0.00337 TGAT 0.00527 TGCA 0.005 TGCC 0.00305 TGCG 0.0019 TGCT 0.00421 TGGA 0.00444 TGGC 0.00348 TGGG 0.00315 TGGT 0.00409 TGTA 0.00436 TGTC 0.00327 TGTG 0.00447 TGTT 0.00568 TTAA 0.00672 TTAC 0.00331 TTAG 0.00409 TTAT 0.00686 TTCA 0.00564 TTCC 0.00384 TTCG 0.00241 TTCT 0.0059 TTGA 0.0055 TTGC 0.00409 TTGG 0.00456 TTGT 0.00579 TTTA 0.00786 TTTC 0.0065 TTTG 0.00719 TTTT 0.0147 # l= 4 # Values AAAAA 0.00627 AAAAC 0.00217 AAAAG 0.00222 AAAAT 0.00403 AAACA 0.00216 AAACC 0.00119 AAACG 0.00076 AAACT 0.00177 AAAGA 0.0019 AAAGC 0.000965 AAAGG 0.00112 AAAGT 0.00161 AAATA 0.00313 AAATC 0.00171 AAATG 0.00178 AAATT 0.00344 AACAA 0.00203 AACAC 0.00107 AACAG 0.000971 AACAT 0.00161 AACCA 0.00127 AACCC 0.000666 AACCG 0.000625 AACCT 0.000819 AACGA 0.000715 AACGC 0.000379 AACGG 0.000594 AACGT 0.000497 AACTA 0.00134 AACTC 0.000935 AACTG 0.000892 AACTT 0.00168 AAGAA 0.00213 AAGAC 0.000757 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.00145 AAGCA 0.00123 AAGCC 0.000703 AAGCG 0.000436 AAGCT 0.00102 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.000691 AAGGG 0.000801 AAGGT 0.000797 AAGTA 0.0012 AAGTC 0.000753 AAGTG 0.000896 AAGTT 0.00168 AATAA 0.00249 AATAC 0.00112 AATAG 0.00121 AATAT 0.00256 AATCA 0.00157 AATCC 0.00101 AATCG 0.000598 AATCT 0.00143 AATGA 0.0014 AATGC 0.000934 AATGG 0.00111 AATGT 0.00132 AATTA 0.00251 AATTC 0.00142 AATTG 0.00151 AATTT 0.00344 ACAAA 0.0021 ACAAC 0.00113 ACAAG 0.00117 ACAAT 0.00138 ACACA 0.00137 ACACC 0.000794 ACACG 0.000613 ACACT 0.000791 ACAGA 0.000907 ACAGC 0.000723 ACAGG 0.000653 ACAGT 0.000819 ACATA 0.00147 ACATC 0.00105 ACATG 0.00147 ACATT 0.00132 ACCAA 0.00129 ACCAC 0.00099 ACCAG 0.00069 ACCAT 0.00112 ACCCA 0.000752 ACCCC 0.000547 ACCCG 0.000378 ACCCT 0.000616 ACCGA 0.000567 ACCGC 0.000581 ACCGG 0.000605 ACCGT 0.000558 ACCTA 0.000725 ACCTC 0.000801 ACCTG 0.000631 ACCTT 0.000797 ACGAA 0.000768 ACGAC 0.000627 ACGAG 0.000644 ACGAT 0.000601 ACGCA 0.000489 ACGCC 0.000522 ACGCG 0.000438 ACGCT 0.000393 ACGGA 0.000625 ACGGC 0.000725 ACGGG 0.000444 ACGGT 0.000558 ACGTA 0.000551 ACGTC 0.000478 ACGTG 0.00067 ACGTT 0.000497 ACTAA 0.0012 ACTAC 0.000922 ACTAG 0.000872 ACTAT 0.00111 ACTCA 0.000825 ACTCC 0.000878 ACTCG 0.000471 ACTCT 0.000833 ACTGA 0.000832 ACTGC 0.000706 ACTGG 0.000604 ACTGT 0.000819 ACTTA 0.000993 ACTTC 0.000892 ACTTG 0.00104 ACTTT 0.00161 AGAAA 0.00239 AGAAC 0.000894 AGAAG 0.00141 AGAAT 0.00121 AGACA 0.000844 AGACC 0.00052 AGACG 0.000528 AGACT 0.000607 AGAGA 0.00173 AGAGC 0.000733 AGAGG 0.00109 AGAGT 0.000833 AGATA 0.00124 AGATC 0.000952 AGATG 0.00125 AGATT 0.00143 AGCAA 0.00133 AGCAC 0.000816 AGCAG 0.000966 AGCAT 0.00109 AGCCA 0.000915 AGCCC 0.000561 AGCCG 0.000636 AGCCT 0.00066 AGCGA 0.000544 AGCGC 0.000435 AGCGG 0.000557 AGCGT 0.000393 AGCTA 0.00107 AGCTC 0.000873 AGCTG 0.000906 AGCTT 0.00102 AGGAA 0.00133 AGGAC 0.000628 AGGAG 0.00134 AGGAT 0.000958 AGGCA 0.000781 AGGCC 0.000671 AGGCG 0.000586 AGGCT 0.00066 AGGGA 0.00102 AGGGC 0.000549 AGGGG 0.00078 AGGGT 0.000616 AGGTA 0.000716 AGGTC 0.000536 AGGTG 0.000884 AGGTT 0.000819 AGTAA 0.00109 AGTAC 0.000953 AGTAG 0.001 AGTAT 0.00117 AGTCA 0.000804 AGTCC 0.000561 AGTCG 0.000417 AGTCT 0.000607 AGTGA 0.000888 AGTGC 0.000649 AGTGG 0.00082 AGTGT 0.000791 AGTTA 0.00105 AGTTC 0.000868 AGTTG 0.00115 AGTTT 0.00177 ATAAA 0.00268 ATAAC 0.000938 ATAAG 0.00116 ATAAT 0.00208 ATACA 0.00132 ATACC 0.000684 ATACG 0.000453 ATACT 0.00117 ATAGA 0.00127 ATAGC 0.000768 ATAGG 0.000774 ATAGT 0.00111 ATATA 0.00358 ATATC 0.00122 ATATG 0.00181 ATATT 0.00256 ATCAA 0.00174 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.000924 ATCAT 0.00159 ATCCA 0.00127 ATCCC 0.00072 ATCCG 0.000572 ATCCT 0.000958 ATCGA 0.00088 ATCGC 0.000468 ATCGG 0.000591 ATCGT 0.000601 ATCTA 0.0013 ATCTC 0.00114 ATCTG 0.000982 ATCTT 0.00145 ATGAA 0.00177 ATGAC 0.000902 ATGAG 0.000992 ATGAT 0.00159 ATGCA 0.00154 ATGCC 0.000787 ATGCG 0.000482 ATGCT 0.00109 ATGGA 0.00137 ATGGC 0.000976 ATGGG 0.000852 ATGGT 0.00112 ATGTA 0.00141 ATGTC 0.000898 ATGTG 0.0014 ATGTT 0.00161 ATTAA 0.00223 ATTAC 0.000991 ATTAG 0.00128 ATTAT 0.00208 ATTCA 0.00151 ATTCC 0.000902 ATTCG 0.000598 ATTCT 0.00121 ATTGA 0.00139 ATTGC 0.000973 ATTGG 0.00104 ATTGT 0.00138 ATTTA 0.0023 ATTTC 0.00165 ATTTG 0.00209 ATTTT 0.00403 CAAAA 0.00252 CAAAC 0.00139 CAAAG 0.00119 CAAAT 0.00209 CAACA 0.00136 CAACC 0.000921 CAACG 0.000624 CAACT 0.00115 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.000901 CAAGG 0.000816 CAAGT 0.00104 CAATA 0.00123 CAATC 0.00096 CAATG 0.00107 CAATT 0.00151 CACAA 0.00131 CACAC 0.00103 CACAG 0.000733 CACAT 0.0014 CACCA 0.00121 CACCC 0.000704 CACCG 0.000803 CACCT 0.000884 CACGA 0.000595 CACGC 0.000638 CACGG 0.000632 CACGT 0.00067 CACTA 0.000812 CACTC 0.000658 CACTG 0.000781 CACTT 0.000896 CAGAA 0.000994 CAGAC 0.00051 CAGAG 0.00078 CAGAT 0.000982 CAGCA 0.00103 CAGCC 0.000789 CAGCG 0.000602 CAGCT 0.000906 CAGGA 0.000734 CAGGC 0.000599 CAGGG 0.000549 CAGGT 0.000631 CAGTA 0.000775 CAGTC 0.000511 CAGTG 0.000781 CAGTT 0.000892 CATAA 0.00118 CATAC 0.0008 CATAG 0.000733 CATAT 0.00181 CATCA 0.00142 CATCC 0.00101 CATCG 0.00075 CATCT 0.00125 CATGA 0.00123 CATGC 0.00122 CATGG 0.00114 CATGT 0.00147 CATTA 0.00105 CATTC 0.000866 CATTG 0.00107 CATTT 0.00178 CCAAA 0.00167 CCAAC 0.000998 CCAAG 0.000853 CCAAT 0.00104 CCACA 0.00102 CCACC 0.00122 CCACG 0.000701 CCACT 0.00082 CCAGA 0.00064 CCAGC 0.000758 CCAGG 0.000525 CCAGT 0.000604 CCATA 0.000902 CCATC 0.00116 CCATG 0.00114 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000956 CCCAC 0.00085 CCCAG 0.000493 CCCAT 0.000852 CCCCA 0.000683 CCCCC 0.000771 CCCCG 0.000464 CCCCT 0.00078 CCCGA 0.000404 CCCGC 0.000568 CCCGG 0.00046 CCCGT 0.000444 CCCTA 0.000597 CCCTC 0.00102 CCCTG 0.000549 CCCTT 0.000801 CCGAA 0.00051 CCGAC 0.000564 CCGAG 0.00054 CCGAT 0.000591 CCGCA 0.000488 CCGCC 0.00134 CCGCG 0.000649 CCGCT 0.000557 CCGGA 0.000503 CCGGC 0.00091 CCGGG 0.00046 CCGGT 0.000605 CCGTA 0.000372 CCGTC 0.000755 CCGTG 0.000632 CCGTT 0.000594 CCTAA 0.000845 CCTAC 0.000601 CCTAG 0.000603 CCTAT 0.000774 CCTCA 0.000773 CCTCC 0.00146 CCTCG 0.0007 CCTCT 0.00109 CCTGA 0.000632 CCTGC 0.000703 CCTGG 0.000525 CCTGT 0.000653 CCTTA 0.000647 CCTTC 0.000916 CCTTG 0.000816 CCTTT 0.00112 CGAAA 0.000754 CGAAC 0.000501 CGAAG 0.000557 CGAAT 0.000598 CGACA 0.000579 CGACC 0.000508 CGACG 0.000909 CGACT 0.000417 CGAGA 0.000644 CGAGC 0.000685 CGAGG 0.0007 CGAGT 0.000471 CGATA 0.000451 CGATC 0.000741 CGATG 0.00075 CGATT 0.000598 CGCAA 0.000461 CGCAC 0.000522 CGCAG 0.000437 CGCAT 0.000482 CGCCA 0.000763 CGCCC 0.000612 CGCCG 0.00153 CGCCT 0.000586 CGCGA 0.000428 CGCGC 0.000797 CGCGG 0.000649 CGCGT 0.000438 CGCTA 0.00036 CGCTC 0.00053 CGCTG 0.000602 CGCTT 0.000436 CGGAA 0.000487 CGGAC 0.000394 CGGAG 0.000748 CGGAT 0.000572 CGGCA 0.000661 CGGCC 0.000851 CGGCG 0.00153 CGGCT 0.000636 CGGGA 0.000499 CGGGC 0.000535 CGGGG 0.000464 CGGGT 0.000378 CGGTA 0.000376 CGGTC 0.000508 CGGTG 0.000803 CGGTT 0.000625 CGTAA 0.000364 CGTAC 0.00047 CGTAG 0.000413 CGTAT 0.000453 CGTCA 0.000588 CGTCC 0.000584 CGTCG 0.000909 CGTCT 0.000528 CGTGA 0.000513 CGTGC 0.000708 CGTGG 0.000701 CGTGT 0.000613 CGTTA 0.000334 CGTTC 0.000467 CGTTG 0.000624 CGTTT 0.00076 CTAAA 0.00151 CTAAC 0.000681 CTAAG 0.000622 CTAAT 0.00128 CTACA 0.00094 CTACC 0.000637 CTACG 0.000413 CTACT 0.001 CTAGA 0.000885 CTAGC 0.000861 CTAGG 0.000603 CTAGT 0.000872 CTATA 0.00124 CTATC 0.00074 CTATG 0.000733 CTATT 0.00121 CTCAA 0.00105 CTCAC 0.000765 CTCAG 0.000565 CTCAT 0.000992 CTCCA 0.0012 CTCCC 0.0011 CTCCG 0.000748 CTCCT 0.00134 CTCGA 0.000624 CTCGC 0.000692 CTCGG 0.00054 CTCGT 0.000644 CTCTA 0.000898 CTCTC 0.0015 CTCTG 0.00078 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00111 CTGAC 0.000623 CTGAG 0.000565 CTGAT 0.000924 CTGCA 0.00106 CTGCC 0.000764 CTGCG 0.000437 CTGCT 0.000966 CTGGA 0.000732 CTGGC 0.000612 CTGGG 0.000493 CTGGT 0.00069 CTGTA 0.000746 CTGTC 0.000652 CTGTG 0.000733 CTGTT 0.000971 CTTAA 0.00105 CTTAC 0.000554 CTTAG 0.000622 CTTAT 0.00116 CTTCA 0.00112 CTTCC 0.000999 CTTCG 0.000557 CTTCT 0.00141 CTTGA 0.000968 CTTGC 0.000916 CTTGG 0.000853 CTTGT 0.00117 CTTTA 0.00107 CTTTC 0.00111 CTTTG 0.00119 CTTTT 0.00222 GAAAA 0.00265 GAAAC 0.00108 GAAAG 0.00111 GAAAT 0.00165 GAACA 0.00106 GAACC 0.000602 GAACG 0.000467 GAACT 0.000868 GAAGA 0.00145 GAAGC 0.000818 GAAGG 0.000916 GAAGT 0.000892 GAATA 0.00109 GAATC 0.000837 GAATG 0.000866 GAATT 0.00142 GACAA 0.00107 GACAC 0.000652 GACAG 0.000652 GACAT 0.000898 GACCA 0.000729 GACCC 0.000414 GACCG 0.000508 GACCT 0.000536 GACGA 0.000858 GACGC 0.000518 GACGG 0.000755 GACGT 0.000478 GACTA 0.000641 GACTC 0.000485 GACTG 0.000511 GACTT 0.000753 GAGAA 0.00141 GAGAC 0.000635 GAGAG 0.0015 GAGAT 0.00114 GAGCA 0.000905 GAGCC 0.000615 GAGCG 0.00053 GAGCT 0.000873 GAGGA 0.00139 GAGGC 0.000827 GAGGG 0.00102 GAGGT 0.000801 GAGTA 0.00093 GAGTC 0.000485 GAGTG 0.000658 GAGTT 0.000935 GATAA 0.00114 GATAC 0.000582 GATAG 0.00074 GATAT 0.00122 GATCA 0.00106 GATCC 0.000733 GATCG 0.000741 GATCT 0.000952 GATGA 0.00136 GATGC 0.000862 GATGG 0.00116 GATGT 0.00105 GATTA 0.0011 GATTC 0.000837 GATTG 0.00096 GATTT 0.00171 GCAAA 0.00134 GCAAC 0.000858 GCAAG 0.000916 GCAAT 0.000973 GCACA 0.000914 GCACC 0.000673 GCACG 0.000708 GCACT 0.000649 GCAGA 0.000764 GCAGC 0.00105 GCAGG 0.000703 GCAGT 0.000706 GCATA 0.000881 GCATC 0.000862 GCATG 0.00122 GCATT 0.000934 GCCAA 0.000933 GCCAC 0.000957 GCCAG 0.000612 GCCAT 0.000976 GCCCA 0.00085 GCCCC 0.000554 GCCCG 0.000535 GCCCT 0.000549 GCCGA 0.000701 GCCGC 0.00134 GCCGG 0.00091 GCCGT 0.000725 GCCTA 0.000581 GCCTC 0.000827 GCCTG 0.000599 GCCTT 0.000691 GCGAA 0.000485 GCGAC 0.00062 GCGAG 0.000692 GCGAT 0.000468 GCGCA 0.000476 GCGCC 0.00079 GCGCG 0.000797 GCGCT 0.000435 GCGGA 0.00054 GCGGC 0.00134 GCGGG 0.000568 GCGGT 0.000581 GCGTA 0.000305 GCGTC 0.000518 GCGTG 0.000638 GCGTT 0.000379 GCTAA 0.000842 GCTAC 0.000664 GCTAG 0.000861 GCTAT 0.000768 GCTCA 0.000717 GCTCC 0.000788 GCTCG 0.000685 GCTCT 0.000733 GCTGA 0.000803 GCTGC 0.00105 GCTGG 0.000758 GCTGT 0.000723 GCTTA 0.000704 GCTTC 0.000818 GCTTG 0.000901 GCTTT 0.000965 GGAAA 0.00132 GGAAC 0.000621 GGAAG 0.000999 GGAAT 0.000902 GGACA 0.000712 GGACC 0.000507 GGACG 0.000584 GGACT 0.000561 GGAGA 0.00126 GGAGC 0.000788 GGAGG 0.00146 GGAGT 0.000878 GGATA 0.000767 GGATC 0.000733 GGATG 0.00101 GGATT 0.00101 GGCAA 0.000866 GGCAC 0.000633 GGCAG 0.000764 GGCAT 0.000787 GGCCA 0.000779 GGCCC 0.000727 GGCCG 0.000851 GGCCT 0.000671 GGCGA 0.000843 GGCGC 0.00079 GGCGG 0.00134 GGCGT 0.000522 GGCTA 0.000664 GGCTC 0.000615 GGCTG 0.000789 GGCTT 0.000703 GGGAA 0.000821 GGGAC 0.000569 GGGAG 0.0011 GGGAT 0.00072 GGGCA 0.000586 GGGCC 0.000727 GGGCG 0.000612 GGGCT 0.000561 GGGGA 0.000827 GGGGC 0.000554 GGGGG 0.000771 GGGGT 0.000547 GGGTA 0.000509 GGGTC 0.000414 GGGTG 0.000704 GGGTT 0.000666 GGTAA 0.000655 GGTAC 0.000511 GGTAG 0.000637 GGTAT 0.000684 GGTCA 0.000652 GGTCC 0.000507 GGTCG 0.000508 GGTCT 0.00052 GGTGA 0.000913 GGTGC 0.000673 GGTGG 0.00122 GGTGT 0.000794 GGTTA 0.000664 GGTTC 0.000602 GGTTG 0.000921 GGTTT 0.00119 GTAAA 0.0012 GTAAC 0.00057 GTAAG 0.000554 GTAAT 0.000991 GTACA 0.000898 GTACC 0.000511 GTACG 0.00047 GTACT 0.000953 GTAGA 0.000806 GTAGC 0.000664 GTAGG 0.000601 GTAGT 0.000922 GTATA 0.00112 GTATC 0.000582 GTATG 0.0008 GTATT 0.00112 GTCAA 0.000988 GTCAC 0.000663 GTCAG 0.000623 GTCAT 0.000902 GTCCA 0.000773 GTCCC 0.000569 GTCCG 0.000394 GTCCT 0.000628 GTCGA 0.000603 GTCGC 0.00062 GTCGG 0.000564 GTCGT 0.000627 GTCTA 0.000596 GTCTC 0.000635 GTCTG 0.00051 GTCTT 0.000757 GTGAA 0.00104 GTGAC 0.000663 GTGAG 0.000765 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000973 GTGCC 0.000633 GTGCG 0.000522 GTGCT 0.000816 GTGGA 0.000957 GTGGC 0.000957 GTGGG 0.00085 GTGGT 0.00099 GTGTA 0.000823 GTGTC 0.000652 GTGTG 0.00103 GTGTT 0.00107 GTTAA 0.000965 GTTAC 0.00057 GTTAG 0.000681 GTTAT 0.000938 GTTCA 0.000982 GTTCC 0.000621 GTTCG 0.000501 GTTCT 0.000894 GTTGA 0.00107 GTTGC 0.000858 GTTGG 0.000998 GTTGT 0.00113 GTTTA 0.00125 GTTTC 0.00108 GTTTG 0.00139 GTTTT 0.00217 TAAAA 0.00324 TAAAC 0.00125 TAAAG 0.00107 TAAAT 0.0023 TAACA 0.0011 TAACC 0.000664 TAACG 0.000334 TAACT 0.00105 TAAGA 0.00104 TAAGC 0.000704 TAAGG 0.000647 TAAGT 0.000993 TAATA 0.00192 TAATC 0.0011 TAATG 0.00105 TAATT 0.00251 TACAA 0.00138 TACAC 0.000823 TACAG 0.000746 TACAT 0.00141 TACCA 0.000886 TACCC 0.000509 TACCG 0.000376 TACCT 0.000716 TACGA 0.000472 TACGC 0.000305 TACGG 0.000372 TACGT 0.000551 TACTA 0.00131 TACTC 0.00093 TACTG 0.000775 TACTT 0.0012 TAGAA 0.00137 TAGAC 0.000596 TAGAG 0.000898 TAGAT 0.0013 TAGCA 0.00104 TAGCC 0.000664 TAGCG 0.00036 TAGCT 0.00107 TAGGA 0.00092 TAGGC 0.000581 TAGGG 0.000597 TAGGT 0.000725 TAGTA 0.00131 TAGTC 0.000641 TAGTG 0.000812 TAGTT 0.00134 TATAA 0.00205 TATAC 0.00112 TATAG 0.00124 TATAT 0.00358 TATCA 0.00122 TATCC 0.000767 TATCG 0.000451 TATCT 0.00124 TATGA 0.00126 TATGC 0.000881 TATGG 0.000902 TATGT 0.00147 TATTA 0.00192 TATTC 0.00109 TATTG 0.00123 TATTT 0.00313 TCAAA 0.00208 TCAAC 0.00107 TCAAG 0.000968 TCAAT 0.00139 TCACA 0.00117 TCACC 0.000913 TCACG 0.000513 TCACT 0.000888 TCAGA 0.000956 TCAGC 0.000803 TCAGG 0.000632 TCAGT 0.000832 TCATA 0.00126 TCATC 0.00136 TCATG 0.00123 TCATT 0.0014 TCCAA 0.00138 TCCAC 0.000957 TCCAG 0.000732 TCCAT 0.00137 TCCCA 0.000867 TCCCC 0.000827 TCCCG 0.000499 TCCCT 0.00102 TCCGA 0.000533 TCCGC 0.00054 TCCGG 0.000503 TCCGT 0.000625 TCCTA 0.00092 TCCTC 0.00139 TCCTG 0.000734 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.000647 TCGAC 0.000603 TCGAG 0.000624 TCGAT 0.00088 TCGCA 0.000449 TCGCC 0.000843 TCGCG 0.000428 TCGCT 0.000544 TCGGA 0.000533 TCGGC 0.000701 TCGGG 0.000404 TCGGT 0.000567 TCGTA 0.000472 TCGTC 0.000858 TCGTG 0.000595 TCGTT 0.000715 TCTAA 0.00121 TCTAC 0.000806 TCTAG 0.000885 TCTAT 0.00127 TCTCA 0.00105 TCTCC 0.00126 TCTCG 0.000644 TCTCT 0.00173 TCTGA 0.000956 TCTGC 0.000764 TCTGG 0.00064 TCTGT 0.000907 TCTTA 0.00104 TCTTC 0.00145 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.0019 TGAAA 0.00204 TGAAC 0.000982 TGAAG 0.00112 TGAAT 0.00151 TGACA 0.00113 TGACC 0.000652 TGACG 0.000588 TGACT 0.000804 TGAGA 0.00105 TGAGC 0.000717 TGAGG 0.000773 TGAGT 0.000825 TGATA 0.00122 TGATC 0.00106 TGATG 0.00142 TGATT 0.00157 TGCAA 0.00143 TGCAC 0.000973 TGCAG 0.00106 TGCAT 0.00154 TGCCA 0.00102 TGCCC 0.000586 TGCCG 0.000661 TGCCT 0.000781 TGCGA 0.000449 TGCGC 0.000476 TGCGG 0.000488 TGCGT 0.000489 TGCTA 0.00104 TGCTC 0.000905 TGCTG 0.00103 TGCTT 0.00123 TGGAA 0.0012 TGGAC 0.000773 TGGAG 0.0012 TGGAT 0.00127 TGGCA 0.00102 TGGCC 0.000779 TGGCG 0.000763 TGGCT 0.000915 TGGGA 0.000867 TGGGC 0.00085 TGGGG 0.000683 TGGGT 0.000752 TGGTA 0.000886 TGGTC 0.000729 TGGTG 0.00121 TGGTT 0.00127 TGTAA 0.0012 TGTAC 0.000898 TGTAG 0.00094 TGTAT 0.00132 TGTCA 0.00113 TGTCC 0.000712 TGTCG 0.000579 TGTCT 0.000844 TGTGA 0.00117 TGTGC 0.000914 TGTGG 0.00102 TGTGT 0.00137 TGTTA 0.0011 TGTTC 0.00106 TGTTG 0.00136 TGTTT 0.00216 TTAAA 0.00247 TTAAC 0.000965 TTAAG 0.00105 TTAAT 0.00223 TTACA 0.0012 TTACC 0.000655 TTACG 0.000364 TTACT 0.00109 TTAGA 0.00121 TTAGC 0.000842 TTAGG 0.000845 TTAGT 0.0012 TTATA 0.00205 TTATC 0.00114 TTATG 0.00118 TTATT 0.00249 TTCAA 0.00172 TTCAC 0.00104 TTCAG 0.00111 TTCAT 0.00177 TTCCA 0.0012 TTCCC 0.000821 TTCCG 0.000487 TTCCT 0.00133 TTCGA 0.000647 TTCGC 0.000485 TTCGG 0.00051 TTCGT 0.000768 TTCTA 0.00137 TTCTC 0.00141 TTCTG 0.000994 TTCTT 0.00213 TTGAA 0.00172 TTGAC 0.000988 TTGAG 0.00105 TTGAT 0.00174 TTGCA 0.00143 TTGCC 0.000866 TTGCG 0.000461 TTGCT 0.00133 TTGGA 0.00138 TTGGC 0.000933 TTGGG 0.000956 TTGGT 0.00129 TTGTA 0.00138 TTGTC 0.00107 TTGTG 0.00131 TTGTT 0.00203 TTTAA 0.00247 TTTAC 0.0012 TTTAG 0.00151 TTTAT 0.00268 TTTCA 0.00204 TTTCC 0.00132 TTTCG 0.000754 TTTCT 0.00239 TTTGA 0.00208 TTTGC 0.00134 TTTGG 0.00167 TTTGT 0.0021 TTTTA 0.00324 TTTTC 0.00265 TTTTG 0.00252 TTTTT 0.00627 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4293 AAAAC 0.145 AAAAG 0.1502 AAAAT 0.2756 AAACA 0.3701 AAACC 0.1992 AAACG 0.1264 AAACT 0.3043 AAAGA 0.3404 AAAGC 0.1692 AAAGG 0.1987 AAAGT 0.2917 AAATA 0.3151 AAATC 0.1667 AAATG 0.1744 AAATT 0.3437 AACAA 0.3577 AACAC 0.1868 AACAG 0.1677 AACAT 0.2879 AACCA 0.3798 AACCC 0.1954 AACCG 0.1796 AACCT 0.2452 AACGA 0.3281 AACGC 0.1701 AACGG 0.2685 AACGT 0.2333 AACTA 0.2807 AACTC 0.1895 AACTG 0.1804 AACTT 0.3493 AAGAA 0.3861 AAGAC 0.1349 AAGAG 0.2147 AAGAT 0.2643 AAGCA 0.3671 AAGCC 0.2031 AAGCG 0.1233 AAGCT 0.3065 AAGGA 0.3495 AAGGC 0.1941 AAGGG 0.2244 AAGGT 0.232 AAGTA 0.2692 AAGTC 0.163 AAGTG 0.1946 AAGTT 0.3732 AATAA 0.3377 AATAC 0.1507 AATAG 0.1617 AATAT 0.35 AATCA 0.3444 AATCC 0.2146 AATCG 0.1275 AATCT 0.3135 AATGA 0.2971 AATGC 0.1933 AATGG 0.2299 AATGT 0.2797 AATTA 0.286 AATTC 0.1575 AATTG 0.1678 AATTT 0.3887 ACAAA 0.3653 ACAAC 0.193 ACAAG 0.1985 ACAAT 0.2431 ACACA 0.3914 ACACC 0.2177 ACACG 0.1671 ACACT 0.2237 ACAGA 0.2967 ACAGC 0.2288 ACAGG 0.2079 ACAGT 0.2665 ACATA 0.283 ACATC 0.1936 ACATG 0.2736 ACATT 0.2498 ACCAA 0.3203 ACCAC 0.2354 ACCAG 0.1651 ACCAT 0.2792 ACCCA 0.3319 ACCCC 0.2373 ACCCG 0.1575 ACCCT 0.2734 ACCGA 0.2492 ACCGC 0.2443 ACCGG 0.2592 ACCGT 0.2473 ACCTA 0.2516 ACCTC 0.2626 ACCTG 0.2107 ACCTT 0.2751 ACGAA 0.3001 ACGAC 0.2278 ACGAG 0.2402 ACGAT 0.232 ACGCA 0.2735 ACGCC 0.2768 ACGCG 0.2315 ACGCT 0.2182 ACGGA 0.2744 ACGGC 0.2969 ACGGG 0.1867 ACGGT 0.2419 ACGTA 0.2566 ACGTC 0.2083 ACGTG 0.3009 ACGTT 0.2341 ACTAA 0.2965 ACTAC 0.2204 ACTAG 0.209 ACTAT 0.2741 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.2894 ACTCG 0.1498 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2825 ACTGC 0.236 ACTGG 0.2015 ACTGT 0.2801 ACTTA 0.2219 ACTTC 0.1936 ACTTG 0.2235 ACTTT 0.361 AGAAA 0.4106 AGAAC 0.1495 AGAAG 0.2328 AGAAT 0.2071 AGACA 0.3427 AGACC 0.2059 AGACG 0.2042 AGACT 0.2473 AGAGA 0.3953 AGAGC 0.1662 AGAGG 0.2438 AGAGT 0.1947 AGATA 0.2594 AGATC 0.1908 AGATG 0.2534 AGATT 0.2964 AGCAA 0.319 AGCAC 0.1924 AGCAG 0.2249 AGCAT 0.2637 AGCCA 0.337 AGCCC 0.2015 AGCCG 0.22 AGCCT 0.2415 AGCGA 0.2868 AGCGC 0.2204 AGCGG 0.2837 AGCGT 0.2091 AGCTA 0.284 AGCTC 0.2195 AGCTG 0.2298 AGCTT 0.2667 AGGAA 0.3188 AGGAC 0.1458 AGGAG 0.3065 AGGAT 0.2288 AGGCA 0.2966 AGGCC 0.247 AGGCG 0.2057 AGGCT 0.2506 AGGGA 0.3443 AGGGC 0.1825 AGGGG 0.2618 AGGGT 0.2114 AGGTA 0.2492 AGGTC 0.1763 AGGTG 0.2937 AGGTT 0.2808 AGTAA 0.2609 AGTAC 0.2228 AGTAG 0.2334 AGTAT 0.2829 AGTCA 0.3407 AGTCC 0.2355 AGTCG 0.1659 AGTCT 0.2579 AGTGA 0.2838 AGTGC 0.2051 AGTGG 0.2562 AGTGT 0.2549 AGTTA 0.222 AGTTC 0.1753 AGTTG 0.234 AGTTT 0.3687 ATAAA 0.391 ATAAC 0.136 ATAAG 0.1683 ATAAT 0.3047 ATACA 0.3677 ATACC 0.185 ATACG 0.1226 ATACT 0.3248 ATAGA 0.3257 ATAGC 0.1942 ATAGG 0.1952 ATAGT 0.2849 ATATA 0.3986 ATATC 0.129 ATATG 0.1942 ATATT 0.2781 ATCAA 0.3328 ATCAC 0.19 ATCAG 0.1719 ATCAT 0.3053 ATCCA 0.3666 ATCCC 0.2015 ATCCG 0.1581 ATCCT 0.2738 ATCGA 0.3508 ATCGC 0.1791 ATCGG 0.2321 ATCGT 0.2379 ATCTA 0.2735 ATCTC 0.2282 ATCTG 0.1979 ATCTT 0.3004 ATGAA 0.3397 ATGAC 0.1683 ATGAG 0.1872 ATGAT 0.3047 ATGCA 0.4005 ATGCC 0.1976 ATGCG 0.1194 ATGCT 0.2825 ATGGA 0.3229 ATGGC 0.2192 ATGGG 0.194 ATGGT 0.2639 ATGTA 0.2698 ATGTC 0.1639 ATGTG 0.2606 ATGTT 0.3056 ATTAA 0.3416 ATTAC 0.1483 ATTAG 0.193 ATTAT 0.3171 ATTCA 0.3603 ATTCC 0.2121 ATTCG 0.1389 ATTCT 0.2886 ATTGA 0.2913 ATTGC 0.2006 ATTGG 0.2144 ATTGT 0.2937 ATTTA 0.2305 ATTTC 0.1627 ATTTG 0.2052 ATTTT 0.4017 CAAAA 0.3523 CAAAC 0.1909 CAAAG 0.1636 CAAAT 0.2932 CAACA 0.338 CAACC 0.2256 CAACG 0.1491 CAACT 0.2872 CAAGA 0.2985 CAAGC 0.2283 CAAGG 0.2057 CAAGT 0.2676 CAATA 0.2624 CAATC 0.197 CAATG 0.2213 CAATT 0.3193 CACAA 0.2953 CACAC 0.2272 CACAG 0.1609 CACAT 0.3166 CACCA 0.341 CACCC 0.1953 CACCG 0.2132 CACCT 0.2505 CACGA 0.2373 CACGC 0.2483 CACGG 0.2453 CACGT 0.2691 CACTA 0.2643 CACTC 0.2049 CACTG 0.2433 CACTT 0.2875 CAGAA 0.3068 CAGAC 0.1547 CAGAG 0.2353 CAGAT 0.3033 CAGCA 0.3146 CAGCC 0.2335 CAGCG 0.1743 CAGCT 0.2776 CAGGA 0.2937 CAGGC 0.2349 CAGGG 0.2172 CAGGT 0.2542 CAGTA 0.2662 CAGTC 0.1683 CAGTG 0.2606 CAGTT 0.3049 CATAA 0.2607 CATAC 0.1753 CATAG 0.1596 CATAT 0.4044 CATCA 0.3246 CATCC 0.2264 CATCG 0.1632 CATCT 0.2857 CATGA 0.245 CATGC 0.2404 CATGG 0.2209 CATGT 0.2937 CATTA 0.2238 CATTC 0.1796 CATTG 0.2212 CATTT 0.3754 CCAAA 0.3716 CCAAC 0.216 CCAAG 0.1832 CCAAT 0.2293 CCACA 0.2786 CCACC 0.3183 CCACG 0.1789 CCACT 0.2243 CCAGA 0.2564 CCAGC 0.2954 CCAGG 0.2058 CCAGT 0.2424 CCATA 0.2144 CCATC 0.2638 CCATG 0.2612 CCATT 0.2606 CCCAA 0.31 CCCAC 0.2623 CCCAG 0.1541 CCCAT 0.2735 CCCCA 0.2581 CCCCC 0.2849 CCCCG 0.1619 CCCCT 0.2952 CCCGA 0.2182 CCCGC 0.2944 CCCGG 0.2435 CCCGT 0.2438 CCCTA 0.2089 CCCTC 0.3354 CCCTG 0.1839 CCCTT 0.2718 CCGAA 0.2384 CCGAC 0.2454 CCGAG 0.2384 CCGAT 0.2777 CCGCA 0.1669 CCGCC 0.4342 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.1894 CCGGA 0.2051 CCGGC 0.3608 CCGGG 0.184 CCGGT 0.2501 CCGTA 0.1647 CCGTC 0.3137 CCGTG 0.2631 CCGTT 0.2585 CCTAA 0.3024 CCTAC 0.2077 CCTAG 0.212 CCTAT 0.278 CCTCA 0.196 CCTCC 0.3601 CCTCG 0.166 CCTCT 0.2779 CCTGA 0.255 CCTGC 0.2757 CCTGG 0.2061 CCTGT 0.2632 CCTTA 0.1898 CCTTC 0.2539 CCTTG 0.2288 CCTTT 0.3274 CGAAA 0.3195 CGAAC 0.2044 CGAAG 0.2223 CGAAT 0.2539 CGACA 0.2472 CGACC 0.2098 CGACG 0.3647 CGACT 0.1782 CGAGA 0.2639 CGAGC 0.2697 CGAGG 0.2725 CGAGT 0.1939 CGATA 0.1813 CGATC 0.2887 CGATG 0.2891 CGATT 0.2409 CGCAA 0.2448 CGCAC 0.2693 CGCAG 0.2259 CGCAT 0.26 CGCCA 0.2249 CGCCC 0.1737 CGCCG 0.4304 CGCCT 0.1711 CGCGA 0.1886 CGCGC 0.3407 CGCGG 0.2757 CGCGT 0.1949 CGCTA 0.1944 CGCTC 0.265 CGCTG 0.31 CGCTT 0.2305 CGGAA 0.2271 CGGAC 0.1763 CGGAG 0.3312 CGGAT 0.2654 CGGCA 0.1841 CGGCC 0.2305 CGGCG 0.4062 CGGCT 0.1792 CGGGA 0.2699 CGGGC 0.283 CGGGG 0.2419 CGGGT 0.2052 CGGTA 0.169 CGGTC 0.2168 CGGTG 0.3368 CGGTT 0.2773 CGTAA 0.2177 CGTAC 0.2717 CGTAG 0.2363 CGTAT 0.2743 CGTCA 0.2323 CGTCC 0.2253 CGTCG 0.3333 CGTCT 0.2092 CGTGA 0.2069 CGTGC 0.2745 CGTGG 0.2684 CGTGT 0.2502 CGTTA 0.1579 CGTTC 0.2083 CGTTG 0.2805 CGTTT 0.3534 CTAAA 0.3719 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1492 CTAAT 0.3149 CTACA 0.3189 CTACC 0.212 CTACG 0.1326 CTACT 0.3365 CTAGA 0.278 CTAGC 0.2669 CTAGG 0.185 CTAGT 0.27 CTATA 0.3217 CTATC 0.1852 CTATG 0.1843 CTATT 0.3088 CTCAA 0.3128 CTCAC 0.2229 CTCAG 0.1646 CTCAT 0.2997 CTCCA 0.2802 CTCCC 0.2487 CTCCG 0.1649 CTCCT 0.3063 CTCGA 0.2533 CTCGC 0.2706 CTCGG 0.2129 CTCGT 0.2632 CTCTA 0.2122 CTCTC 0.3346 CTCTG 0.175 CTCTT 0.2782 CTGAA 0.3487 CTGAC 0.1879 CTGAG 0.1737 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3337 CTGCC 0.2321 CTGCG 0.1306 CTGCT 0.3036 CTGGA 0.293 CTGGC 0.2383 CTGGG 0.1931 CTGGT 0.2756 CTGTA 0.244 CTGTC 0.2058 CTGTG 0.2347 CTGTT 0.3154 CTTAA 0.3126 CTTAC 0.1602 CTTAG 0.1809 CTTAT 0.3464 CTTCA 0.2772 CTTCC 0.2424 CTTCG 0.131 CTTCT 0.3494 CTTGA 0.2505 CTTGC 0.2318 CTTGG 0.2156 CTTGT 0.3021 CTTTA 0.1944 CTTTC 0.1959 CTTTG 0.2094 CTTTT 0.4003 GAAAA 0.4101 GAAAC 0.1637 GAAAG 0.1692 GAAAT 0.257 GAACA 0.3588 GAACC 0.1981 GAACG 0.1506 GAACT 0.2925 GAAGA 0.3568 GAAGC 0.198 GAAGG 0.221 GAAGT 0.2243 GAATA 0.2632 GAATC 0.1943 GAATG 0.2033 GAATT 0.3392 GACAA 0.3288 GACAC 0.1976 GACAG 0.1964 GACAT 0.2772 GACCA 0.3415 GACCC 0.1858 GACCG 0.2256 GACCT 0.2471 GACGA 0.3316 GACGC 0.1945 GACGG 0.2895 GACGT 0.1844 GACTA 0.2731 GACTC 0.2008 GACTG 0.2078 GACTT 0.3184 GAGAA 0.3052 GAGAC 0.1335 GAGAG 0.3158 GAGAT 0.2455 GAGCA 0.3167 GAGCC 0.2081 GAGCG 0.171 GAGCT 0.3042 GAGGA 0.3453 GAGGC 0.1994 GAGGG 0.253 GAGGT 0.2023 GAGTA 0.3144 GAGTC 0.1587 GAGTG 0.2143 GAGTT 0.3126 GATAA 0.3116 GATAC 0.1561 GATAG 0.199 GATAT 0.3332 GATCA 0.3073 GATCC 0.2094 GATCG 0.2084 GATCT 0.275 GATGA 0.3085 GATGC 0.1922 GATGG 0.2585 GATGT 0.2408 GATTA 0.2423 GATTC 0.1788 GATTG 0.2052 GATTT 0.3737 GCAAA 0.3324 GCAAC 0.207 GCAAG 0.2204 GCAAT 0.2402 GCACA 0.3189 GCACC 0.2243 GCACG 0.2305 GCACT 0.2262 GCAGA 0.2401 GCAGC 0.3209 GCAGG 0.2161 GCAGT 0.2229 GCATA 0.2307 GCATC 0.2157 GCATG 0.3126 GCATT 0.241 GCCAA 0.275 GCCAC 0.2692 GCCAG 0.1737 GCCAT 0.2821 GCCCA 0.3458 GCCCC 0.2207 GCCCG 0.2078 GCCCT 0.2257 GCCGA 0.1937 GCCGC 0.3568 GCCGG 0.2481 GCCGT 0.2014 GCCTA 0.2218 GCCTC 0.2946 GCCTG 0.2216 GCCTT 0.2619 GCGAA 0.2202 GCGAC 0.2674 GCGAG 0.3002 GCGAT 0.2122 GCGCA 0.1983 GCGCC 0.3116 GCGCG 0.3125 GCGCT 0.1776 GCGGA 0.1815 GCGGC 0.4347 GCGGG 0.1863 GCGGT 0.1975 GCGTA 0.172 GCGTC 0.2723 GCGTG 0.344 GCGTT 0.2116 GCTAA 0.2711 GCTAC 0.207 GCTAG 0.274 GCTAT 0.2479 GCTCA 0.2527 GCTCC 0.2646 GCTCG 0.2242 GCTCT 0.2585 GCTGA 0.2441 GCTGC 0.311 GCTGG 0.2248 GCTGT 0.2201 GCTTA 0.2136 GCTTC 0.2353 GCTTG 0.2627 GCTTT 0.2885 GGAAA 0.347 GGAAC 0.1588 GGAAG 0.2544 GGAAT 0.2397 GGACA 0.3065 GGACC 0.2102 GGACG 0.2385 GGACT 0.2448 GGAGA 0.2888 GGAGC 0.1764 GGAGG 0.3274 GGAGT 0.2074 GGATA 0.2231 GGATC 0.2056 GGATG 0.2841 GGATT 0.2872 GGCAA 0.2877 GGCAC 0.2038 GGCAG 0.2453 GGCAT 0.2631 GGCCA 0.2627 GGCCC 0.242 GGCCG 0.269 GGCCT 0.2263 GGCGA 0.244 GGCGC 0.2245 GGCGG 0.3776 GGCGT 0.154 GGCTA 0.2483 GGCTC 0.217 GGCTG 0.2793 GGCTT 0.2554 GGGAA 0.259 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.3372 GGGAT 0.2282 GGGCA 0.2427 GGGCC 0.2932 GGGCG 0.2319 GGGCT 0.2321 GGGGA 0.3075 GGGGC 0.201 GGGGG 0.2847 GGGGT 0.2068 GGGTA 0.227 GGGTC 0.1751 GGGTG 0.3024 GGGTT 0.2956 GGTAA 0.267 GGTAC 0.2014 GGTAG 0.2537 GGTAT 0.278 GGTCA 0.3069 GGTCC 0.2289 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2432 GGTGA 0.2565 GGTGC 0.1855 GGTGG 0.3317 GGTGT 0.2263 GGTTA 0.1995 GGTTC 0.1747 GGTTG 0.2706 GGTTT 0.3552 GTAAA 0.364 GTAAC 0.1704 GTAAG 0.1645 GTAAT 0.3011 GTACA 0.3206 GTACC 0.1781 GTACG 0.1614 GTACT 0.3399 GTAGA 0.2732 GTAGC 0.2195 GTAGG 0.1973 GTAGT 0.31 GTATA 0.3146 GTATC 0.1567 GTATG 0.2182 GTATT 0.3104 GTCAA 0.3163 GTCAC 0.2068 GTCAG 0.1898 GTCAT 0.2871 GTCCA 0.3337 GTCCC 0.2378 GTCCG 0.161 GTCCT 0.2675 GTCGA 0.2538 GTCGC 0.2534 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2624 GTCTA 0.2431 GTCTC 0.2483 GTCTG 0.202 GTCTT 0.3066 GTGAA 0.3 GTGAC 0.1886 GTGAG 0.2165 GTGAT 0.2948 GTGCA 0.3364 GTGCC 0.2103 GTGCG 0.1699 GTGCT 0.2834 GTGGA 0.2591 GTGGC 0.2508 GTGGG 0.2232 GTGGT 0.2669 GTGTA 0.2341 GTGTC 0.1783 GTGTG 0.2852 GTGTT 0.3024 GTTAA 0.3074 GTTAC 0.1784 GTTAG 0.2136 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3311 GTTCC 0.204 GTTCG 0.1624 GTTCT 0.3025 GTTGA 0.2652 GTTGC 0.2089 GTTGG 0.244 GTTGT 0.2819 GTTTA 0.2157 GTTTC 0.1811 GTTTG 0.2336 GTTTT 0.3696 TAAAA 0.4145 TAAAC 0.1569 TAAAG 0.1353 TAAAT 0.2933 TAACA 0.352 TAACC 0.2062 TAACG 0.104 TAACT 0.3378 TAAGA 0.3115 TAAGC 0.2055 TAAGG 0.1889 TAAGT 0.2941 TAATA 0.2945 TAATC 0.164 TAATG 0.1578 TAATT 0.3837 TACAA 0.3184 TACAC 0.1865 TACAG 0.1673 TACAT 0.3278 TACCA 0.3598 TACCC 0.2013 TACCG 0.147 TACCT 0.2919 TACGA 0.2799 TACGC 0.1762 TACGG 0.2181 TACGT 0.3257 TACTA 0.3125 TACTC 0.2184 TACTG 0.1805 TACTT 0.2886 TAGAA 0.3333 TAGAC 0.1394 TAGAG 0.2136 TAGAT 0.3138 TAGCA 0.3356 TAGCC 0.209 TAGCG 0.1101 TAGCT 0.3454 TAGGA 0.3295 TAGGC 0.2007 TAGGG 0.2107 TAGGT 0.2591 TAGTA 0.3203 TAGTC 0.1536 TAGTG 0.1966 TAGTT 0.3295 TATAA 0.2544 TATAC 0.1384 TATAG 0.1526 TATAT 0.4546 TATCA 0.3349 TATCC 0.2065 TATCG 0.1189 TATCT 0.3398 TATGA 0.2813 TATGC 0.1925 TATGG 0.1967 TATGT 0.3295 TATTA 0.2626 TATTC 0.1462 TATTG 0.1649 TATTT 0.4262 TCAAA 0.3825 TCAAC 0.1909 TCAAG 0.1731 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3431 TCACC 0.2557 TCACG 0.1432 TCACT 0.258 TCAGA 0.2983 TCAGC 0.2459 TCAGG 0.1953 TCAGT 0.2606 TCATA 0.2456 TCATC 0.2523 TCATG 0.2322 TCATT 0.2699 TCCAA 0.3143 TCCAC 0.2102 TCCAG 0.1614 TCCAT 0.3142 TCCCA 0.2767 TCCCC 0.2539 TCCCG 0.1491 TCCCT 0.3204 TCCGA 0.2497 TCCGC 0.2347 TCCGG 0.2223 TCCGT 0.2933 TCCTA 0.2244 TCCTC 0.3143 TCCTG 0.1708 TCCTT 0.2906 TCGAA 0.2411 TCGAC 0.2108 TCGAG 0.2211 TCGAT 0.3271 TCGCA 0.2068 TCGCC 0.3617 TCGCG 0.1847 TCGCT 0.2467 TCGGA 0.2511 TCGGC 0.3071 TCGGG 0.1797 TCGGT 0.2621 TCGTA 0.1853 TCGTC 0.3149 TCGTG 0.223 TCGTT 0.2767 TCTAA 0.2932 TCTAC 0.1899 TCTAG 0.2104 TCTAT 0.3065 TCTCA 0.2313 TCTCC 0.2628 TCTCG 0.1331 TCTCT 0.3729 TCTGA 0.2933 TCTGC 0.2306 TCTGG 0.1933 TCTGT 0.2828 TCTTA 0.1937 TCTTC 0.2537 TCTTG 0.2055 TCTTT 0.3471 TGAAA 0.3654 TGAAC 0.1711 TGAAG 0.1931 TGAAT 0.2704 TGACA 0.3609 TGACC 0.2042 TGACG 0.1782 TGACT 0.2567 TGAGA 0.3174 TGAGC 0.2103 TGAGG 0.2225 TGAGT 0.2499 TGATA 0.2362 TGATC 0.1969 TGATG 0.2659 TGATT 0.3009 TGCAA 0.2895 TGCAC 0.1911 TGCAG 0.2068 TGCAT 0.3127 TGCCA 0.342 TGCCC 0.1919 TGCCG 0.2058 TGCCT 0.2603 TGCGA 0.2407 TGCGC 0.2464 TGCGG 0.2504 TGCGT 0.2625 TGCTA 0.2545 TGCTC 0.2108 TGCTG 0.2402 TGCTT 0.2946 TGGAA 0.2724 TGGAC 0.1722 TGGAG 0.2654 TGGAT 0.29 TGGCA 0.3006 TGGCC 0.2211 TGGCG 0.2085 TGGCT 0.2698 TGGGA 0.2799 TGGGC 0.2631 TGGGG 0.2155 TGGGT 0.2416 TGGTA 0.2216 TGGTC 0.1759 TGGTG 0.2885 TGGTT 0.314 TGTAA 0.2768 TGTAC 0.2022 TGTAG 0.2128 TGTAT 0.3082 TGTCA 0.3518 TGTCC 0.2165 TGTCG 0.169 TGTCT 0.2626 TGTGA 0.2637 TGTGC 0.2021 TGTGG 0.2224 TGTGT 0.3118 TGTTA 0.1977 TGTTC 0.1838 TGTTG 0.2353 TGTTT 0.3832 TTAAA 0.3698 TTAAC 0.1415 TTAAG 0.1546 TTAAT 0.3342 TTACA 0.365 TTACC 0.1964 TTACG 0.1075 TTACT 0.3311 TTAGA 0.2983 TTAGC 0.2034 TTAGG 0.2033 TTAGT 0.2951 TTATA 0.3026 TTATC 0.1637 TTATG 0.1698 TTATT 0.3639 TTCAA 0.3091 TTCAC 0.1804 TTCAG 0.193 TTCAT 0.3175 TTCCA 0.3159 TTCCC 0.2098 TTCCG 0.1242 TTCCT 0.35 TTCGA 0.2717 TTCGC 0.1953 TTCGG 0.2094 TTCGT 0.3235 TTCTA 0.2394 TTCTC 0.2338 TTCTG 0.165 TTCTT 0.3617 TTGAA 0.3168 TTGAC 0.1777 TTGAG 0.1872 TTGAT 0.3182 TTGCA 0.3562 TTGCC 0.2075 TTGCG 0.108 TTGCT 0.3283 TTGGA 0.3049 TTGGC 0.2017 TTGGG 0.2076 TTGGT 0.2858 TTGTA 0.2428 TTGTC 0.1802 TTGTG 0.2252 TTGTT 0.3518 TTTAA 0.3171 TTTAC 0.1504 TTTAG 0.1912 TTTAT 0.3413 TTTCA 0.316 TTTCC 0.1992 TTTCG 0.1135 TTTCT 0.3713 TTTGA 0.2919 TTTGC 0.1843 TTTGG 0.2306 TTTGT 0.2931 TTTTA 0.2235 TTTTC 0.1781 TTTTG 0.1692 TTTTT 0.4293 [4] # (a,c,g,t)= (0.258, 0.242, 0.242, 0.258) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.287 C 0.213 G 0.213 T 0.287 # l= 1 # Values AA 0.0934 AC 0.0532 AG 0.058 AT 0.0827 CA 0.0645 CC 0.0499 CG 0.0402 CT 0.058 GA 0.0594 GC 0.0502 GG 0.0499 GT 0.0532 TA 0.0699 TC 0.0594 TG 0.0645 TT 0.0934 # l= 2 # Values AAA 0.0355 AAC 0.016 AAG 0.0169 AAT 0.0251 ACA 0.0176 ACC 0.0118 ACG 0.00928 ACT 0.0145 AGA 0.0176 AGC 0.0129 AGG 0.013 AGT 0.0145 ATA 0.0229 ATC 0.0161 ATG 0.0186 ATT 0.0251 CAA 0.0198 CAC 0.0139 CAG 0.0122 CAT 0.0186 CCA 0.0153 CCC 0.011 CCG 0.0106 CCT 0.0131 CGA 0.0102 CGC 0.0102 CGG 0.0106 CGT 0.00928 CTA 0.014 CTC 0.0149 CTG 0.0122 CTT 0.0169 GAA 0.0177 GAC 0.0107 GAG 0.0149 GAT 0.0161 GCA 0.0143 GCC 0.0128 GCG 0.0102 GCT 0.0129 GGA 0.0143 GGC 0.0128 GGG 0.011 GGT 0.0118 GTA 0.0126 GTC 0.0107 GTG 0.0139 GTT 0.016 TAA 0.0204 TAC 0.0126 TAG 0.014 TAT 0.0229 TCA 0.0173 TCC 0.0143 TCG 0.0102 TCT 0.0176 TGA 0.0174 TGC 0.0143 TGG 0.0153 TGT 0.0176 TTA 0.0204 TTC 0.0177 TTG 0.0198 TTT 0.0355 # l= 3 # Values AAAA 0.0143 AAAC 0.00581 AAAG 0.00552 AAAT 0.00981 AACA 0.00561 AACC 0.00339 AACG 0.00221 AACT 0.00478 AAGA 0.0055 AAGC 0.0034 AAGG 0.00352 AAGT 0.00447 AATA 0.00716 AATC 0.00456 AATG 0.0047 AATT 0.00865 ACAA 0.00572 ACAC 0.00356 ACAG 0.00311 ACAT 0.00523 ACCA 0.0041 ACCC 0.00233 ACCG 0.00239 ACCT 0.00297 ACGA 0.0027 ACGC 0.00191 ACGG 0.00243 ACGT 0.00223 ACTA 0.00403 ACTC 0.00301 ACTG 0.00297 ACTT 0.00447 AGAA 0.00584 AGAC 0.00251 AGAG 0.00442 AGAT 0.00483 AGCA 0.0042 AGCC 0.00283 AGCG 0.00201 AGCT 0.00387 AGGA 0.0043 AGGC 0.00277 AGGG 0.00302 AGGT 0.00296 AGTA 0.00415 AGTC 0.0024 AGTG 0.00315 AGTT 0.00478 ATAA 0.00666 ATAC 0.00354 ATAG 0.00383 ATAT 0.00884 ATCA 0.00521 ATCC 0.00353 ATCG 0.00257 ATCT 0.00483 ATGA 0.00518 ATGC 0.00388 ATGG 0.00432 ATGT 0.00523 ATTA 0.00638 ATTC 0.00416 ATTG 0.00472 ATTT 0.00981 CAAA 0.0071 CAAC 0.00406 CAAG 0.00393 CAAT 0.00471 CACA 0.00445 CACC 0.00368 CACG 0.00263 CACT 0.00315 CAGA 0.00328 CAGC 0.00341 CAGG 0.00256 CAGT 0.00297 CATA 0.00442 CATC 0.00445 CATG 0.00503 CATT 0.0047 CCAA 0.00455 CCAC 0.00385 CCAG 0.00258 CCAT 0.00432 CCCA 0.00321 CCCC 0.00279 CCCG 0.00198 CCCT 0.00302 CCGA 0.00229 CCGC 0.00323 CCGG 0.00261 CCGT 0.00243 CCTA 0.0028 CCTC 0.00417 CCTG 0.00256 CCTT 0.00352 CGAA 0.00244 CGAC 0.00254 CGAG 0.00261 CGAT 0.00257 CGCA 0.00197 CGCC 0.00373 CGCG 0.00248 CGCT 0.00201 CGGA 0.00228 CGGC 0.00391 CGGG 0.00198 CGGT 0.00239 CGTA 0.00171 CGTC 0.00273 CGTG 0.00263 CGTT 0.00221 CTAA 0.004 CTAC 0.00299 CTAG 0.00319 CTAT 0.00383 CTCA 0.00338 CTCC 0.00451 CTCG 0.00261 CTCT 0.00442 CTGA 0.00324 CTGC 0.00328 CTGG 0.00258 CTGT 0.00311 CTTA 0.00333 CTTC 0.00412 CTTG 0.00393 CTTT 0.00552 GAAA 0.00642 GAAC 0.00301 GAAG 0.00412 GAAT 0.00416 GACA 0.00329 GACC 0.00224 GACG 0.00273 GACT 0.0024 GAGA 0.00474 GAGC 0.003 GAGG 0.00417 GAGT 0.00301 GATA 0.00362 GATC 0.00351 GATG 0.00445 GATT 0.00456 GCAA 0.0041 GCAC 0.003 GCAG 0.00328 GCAT 0.00388 GCCA 0.00356 GCCC 0.00259 GCCG 0.00391 GCCT 0.00277 GCGA 0.00237 GCGC 0.00267 GCGG 0.00323 GCGT 0.00191 GCTA 0.0031 GCTC 0.003 GCTG 0.0034 GCTT 0.0034 GGAA 0.00385 GGAC 0.00242 GGAG 0.00451 GGAT 0.00353 GGCA 0.00311 GGCC 0.00316 GGCG 0.00373 GGCT 0.00283 GGGA 0.00329 GGGC 0.00259 GGGG 0.00279 GGGT 0.00233 GGTA 0.00247 GGTC 0.00224 GGTG 0.00368 GGTT 0.00339 GTAA 0.00325 GTAC 0.00283 GTAG 0.00298 GTAT 0.00355 GTCA 0.00319 GTCC 0.00242 GTCG 0.00254 GTCT 0.00251 GTGA 0.0035 GTGC 0.003 GTGG 0.00385 GTGT 0.00356 GTTA 0.0031 GTTC 0.00301 GTTG 0.00406 GTTT 0.00581 TAAA 0.00763 TAAC 0.0031 TAAG 0.00333 TAAT 0.00638 TACA 0.00428 TACC 0.00247 TACG 0.00171 TACT 0.00415 TAGA 0.00407 TAGC 0.0031 TAGG 0.0028 TAGT 0.00403 TATA 0.00767 TATC 0.00362 TATG 0.00442 TATT 0.00716 TCAA 0.00543 TCAC 0.0035 TCAG 0.00324 TCAT 0.00518 TCCA 0.00445 TCCC 0.00329 TCCG 0.00228 TCCT 0.0043 TCGA 0.00281 TCGC 0.00237 TCGG 0.00229 TCGT 0.0027 TCTA 0.00407 TCTC 0.00474 TCTG 0.00328 TCTT 0.0055 TGAA 0.00557 TGAC 0.00319 TGAG 0.00338 TGAT 0.00521 TGCA 0.00498 TGCC 0.00311 TGCG 0.00196 TGCT 0.0042 TGGA 0.00445 TGGC 0.00356 TGGG 0.00321 TGGT 0.0041 TGTA 0.00428 TGTC 0.00328 TGTG 0.00445 TGTT 0.00561 TTAA 0.00653 TTAC 0.00325 TTAG 0.004 TTAT 0.00666 TTCA 0.00557 TTCC 0.00385 TTCG 0.00244 TTCT 0.00584 TTGA 0.00543 TTGC 0.00409 TTGG 0.00455 TTGT 0.00572 TTTA 0.00763 TTTC 0.00642 TTTG 0.00709 TTTT 0.0143 # l= 4 # Values AAAAA 0.00611 AAAAC 0.00214 AAAAG 0.00218 AAAAT 0.00392 AAACA 0.00212 AAACC 0.00119 AAACG 0.00076 AAACT 0.00174 AAAGA 0.00187 AAAGC 0.00096 AAAGG 0.00112 AAAGT 0.00158 AAATA 0.00302 AAATC 0.00169 AAATG 0.00175 AAATT 0.00334 AACAA 0.002 AACAC 0.00105 AACAG 0.000969 AACAT 0.00158 AACCA 0.00126 AACCC 0.000671 AACCG 0.000639 AACCT 0.000816 AACGA 0.000721 AACGC 0.000388 AACGG 0.000605 AACGT 0.000495 AACTA 0.00131 AACTC 0.000933 AACTG 0.000889 AACTT 0.00165 AAGAA 0.00211 AAGAC 0.000756 AAGAG 0.00121 AAGAT 0.00143 AAGCA 0.00122 AAGCC 0.000712 AAGCG 0.000449 AAGCT 0.00102 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.0007 AAGGG 0.000815 AAGGT 0.000793 AAGTA 0.00118 AAGTC 0.000752 AAGTG 0.000892 AAGTT 0.00165 AATAA 0.00242 AATAC 0.00109 AATAG 0.00118 AATAT 0.00247 AATCA 0.00154 AATCC 0.00101 AATCG 0.000598 AATCT 0.00141 AATGA 0.00137 AATGC 0.000926 AATGG 0.00111 AATGT 0.00129 AATTA 0.00243 AATTC 0.00139 AATTG 0.00148 AATTT 0.00334 ACAAA 0.00207 ACAAC 0.00113 ACAAG 0.00117 ACAAT 0.00135 ACACA 0.00135 ACACC 0.000801 ACACG 0.000623 ACACT 0.000783 ACAGA 0.000904 ACAGC 0.000732 ACAGG 0.000661 ACAGT 0.000815 ACATA 0.00143 ACATC 0.00104 ACATG 0.00146 ACATT 0.00129 ACCAA 0.00128 ACCAC 0.00101 ACCAG 0.000701 ACCAT 0.00111 ACCCA 0.000759 ACCCC 0.000559 ACCCG 0.000395 ACCCT 0.000621 ACCGA 0.000582 ACCGC 0.000611 ACCGG 0.00063 ACCGT 0.00057 ACCTA 0.000716 ACCTC 0.000818 ACCTG 0.000637 ACCTT 0.000793 ACGAA 0.000771 ACGAC 0.000658 ACGAG 0.000666 ACGAT 0.000606 ACGCA 0.000499 ACGCC 0.000548 ACGCG 0.000462 ACGCT 0.000403 ACGGA 0.000634 ACGGC 0.000763 ACGGG 0.000461 ACGGT 0.00057 ACGTA 0.000553 ACGTC 0.000498 ACGTG 0.000688 ACGTT 0.000495 ACTAA 0.00117 ACTAC 0.000917 ACTAG 0.000866 ACTAT 0.00108 ACTCA 0.000818 ACTCC 0.000885 ACTCG 0.000485 ACTCT 0.000826 ACTGA 0.000832 ACTGC 0.000712 ACTGG 0.000612 ACTGT 0.000815 ACTTA 0.000973 ACTTC 0.000888 ACTTG 0.00103 ACTTT 0.00158 AGAAA 0.00235 AGAAC 0.00089 AGAAG 0.00141 AGAAT 0.00119 AGACA 0.00084 AGACC 0.000528 AGACG 0.00054 AGACT 0.000605 AGAGA 0.00174 AGAGC 0.00074 AGAGG 0.00111 AGAGT 0.000826 AGATA 0.00121 AGATC 0.000957 AGATG 0.00125 AGATT 0.00141 AGCAA 0.00133 AGCAC 0.000821 AGCAG 0.000977 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.000921 AGCCC 0.000575 AGCCG 0.000662 AGCCT 0.000668 AGCGA 0.00056 AGCGC 0.00046 AGCGG 0.000585 AGCGT 0.000403 AGCTA 0.00105 AGCTC 0.000886 AGCTG 0.000915 AGCTT 0.00102 AGGAA 0.00133 AGGAC 0.000638 AGGAG 0.00137 AGGAT 0.000959 AGGCA 0.000789 AGGCC 0.00069 AGGCG 0.00062 AGGCT 0.000668 AGGGA 0.00104 AGGGC 0.000564 AGGGG 0.000797 AGGGT 0.000621 AGGTA 0.000706 AGGTC 0.000547 AGGTG 0.000897 AGGTT 0.000816 AGTAA 0.00106 AGTAC 0.000947 AGTAG 0.000997 AGTAT 0.00114 AGTCA 0.0008 AGTCC 0.000564 AGTCG 0.000431 AGTCT 0.000605 AGTGA 0.000887 AGTGC 0.000652 AGTGG 0.000829 AGTGT 0.000783 AGTTA 0.00103 AGTTC 0.000865 AGTTG 0.00115 AGTTT 0.00174 ATAAA 0.0026 ATAAC 0.000915 ATAAG 0.00113 ATAAT 0.00201 ATACA 0.00128 ATACC 0.000675 ATACG 0.000448 ATACT 0.00114 ATAGA 0.00123 ATAGC 0.000755 ATAGG 0.000762 ATAGT 0.00108 ATATA 0.00341 ATATC 0.0012 ATATG 0.00176 ATATT 0.00247 ATCAA 0.00172 ATCAC 0.00101 ATCAG 0.000925 ATCAT 0.00156 ATCCA 0.00126 ATCCC 0.000729 ATCCG 0.000583 ATCCT 0.000959 ATCGA 0.000885 ATCGC 0.000482 ATCGG 0.000599 ATCGT 0.000606 ATCTA 0.00127 ATCTC 0.00115 ATCTG 0.000983 ATCTT 0.00143 ATGAA 0.00173 ATGAC 0.000901 ATGAG 0.000984 ATGAT 0.00156 ATGCA 0.00152 ATGCC 0.000792 ATGCG 0.000489 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00136 ATGGC 0.000995 ATGGG 0.00086 ATGGT 0.00111 ATGTA 0.00137 ATGTC 0.000899 ATGTG 0.00138 ATGTT 0.00158 ATTAA 0.00216 ATTAC 0.000969 ATTAG 0.00125 ATTAT 0.00201 ATTCA 0.00148 ATTCC 0.000896 ATTCG 0.000599 ATTCT 0.00119 ATTGA 0.00136 ATTGC 0.000968 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.00135 ATTTA 0.00223 ATTTC 0.00162 ATTTG 0.00205 ATTTT 0.00392 CAAAA 0.00248 CAAAC 0.00138 CAAAG 0.00119 CAAAT 0.00205 CAACA 0.00135 CAACC 0.000927 CAACG 0.000636 CAACT 0.00115 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.000909 CAAGG 0.000828 CAAGT 0.00103 CAATA 0.00121 CAATC 0.00096 CAATG 0.00107 CAATT 0.00148 CACAA 0.0013 CACAC 0.00103 CACAG 0.000739 CACAT 0.00138 CACCA 0.00122 CACCC 0.000721 CACCG 0.000843 CACCT 0.000897 CACGA 0.000611 CACGC 0.000668 CACGG 0.00066 CACGT 0.000688 CACTA 0.000801 CACTC 0.000668 CACTG 0.00079 CACTT 0.000892 CAGAA 0.000993 CAGAC 0.000515 CAGAG 0.00079 CAGAT 0.000983 CAGCA 0.00105 CAGCC 0.000814 CAGCG 0.000629 CAGCT 0.000915 CAGGA 0.000745 CAGGC 0.000616 CAGGG 0.00056 CAGGT 0.000637 CAGTA 0.000768 CAGTC 0.000522 CAGTG 0.00079 CAGTT 0.000889 CATAA 0.00115 CATAC 0.000786 CATAG 0.000724 CATAT 0.00176 CATCA 0.00141 CATCC 0.00102 CATCG 0.000768 CATCT 0.00125 CATGA 0.00121 CATGC 0.00121 CATGG 0.00115 CATGT 0.00146 CATTA 0.00102 CATTC 0.000857 CATTG 0.00107 CATTT 0.00175 CCAAA 0.00166 CCAAC 0.00101 CCAAG 0.000863 CCAAT 0.00103 CCACA 0.00102 CCACC 0.00126 CCACG 0.000738 CCACT 0.000829 CCAGA 0.000649 CCAGC 0.00078 CCAGG 0.00054 CCAGT 0.000612 CCATA 0.00089 CCATC 0.00118 CCATG 0.00115 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000961 CCCAC 0.000878 CCCAG 0.000507 CCCAT 0.00086 CCCCA 0.000697 CCCCC 0.000798 CCCCG 0.000496 CCCCT 0.000797 CCCGA 0.000425 CCCGC 0.000608 CCCGG 0.000489 CCCGT 0.000461 CCCTA 0.000596 CCCTC 0.00105 CCCTG 0.00056 CCCTT 0.000815 CCGAA 0.000521 CCGAC 0.000598 CCGAG 0.00057 CCGAT 0.000599 CCGCA 0.000511 CCGCC 0.00143 CCGCG 0.000703 CCGCT 0.000585 CCGGA 0.000528 CCGGC 0.000967 CCGGG 0.000489 CCGGT 0.00063 CCGTA 0.000375 CCGTC 0.000788 CCGTG 0.00066 CCGTT 0.000605 CCTAA 0.000835 CCTAC 0.000605 CCTAG 0.000602 CCTAT 0.000762 CCTCA 0.000788 CCTCC 0.00152 CCTCG 0.000742 CCTCT 0.00111 CCTGA 0.000638 CCTGC 0.000719 CCTGG 0.00054 CCTGT 0.000661 CCTTA 0.000641 CCTTC 0.000935 CCTTG 0.000828 CCTTT 0.00112 CGAAA 0.000755 CGAAC 0.000513 CGAAG 0.000577 CGAAT 0.000599 CGACA 0.000598 CGACC 0.000535 CGACG 0.000974 CGACT 0.000431 CGAGA 0.000664 CGAGC 0.000722 CGAGG 0.000742 CGAGT 0.000485 CGATA 0.000452 CGATC 0.000754 CGATG 0.000768 CGATT 0.000598 CGCAA 0.000474 CGCAC 0.000548 CGCAG 0.000454 CGCAT 0.000489 CGCCA 0.000804 CGCCC 0.000657 CGCCG 0.00164 CGCCT 0.00062 CGCGA 0.000452 CGCGC 0.000861 CGCGG 0.000703 CGCGT 0.000462 CGCTA 0.000367 CGCTC 0.000563 CGCTG 0.000629 CGCTT 0.000449 CGGAA 0.000498 CGGAC 0.000412 CGGAG 0.000784 CGGAT 0.000583 CGGCA 0.000694 CGGCC 0.000908 CGGCG 0.00164 CGGCT 0.000662 CGGGA 0.000525 CGGGC 0.000567 CGGGG 0.000496 CGGGT 0.000395 CGGTA 0.00038 CGGTC 0.000531 CGGTG 0.000843 CGGTT 0.000639 CGTAA 0.000363 CGTAC 0.000479 CGTAG 0.000423 CGTAT 0.000448 CGTCA 0.000604 CGTCC 0.000611 CGTCG 0.000974 CGTCT 0.00054 CGTGA 0.000526 CGTGC 0.00074 CGTGG 0.000738 CGTGT 0.000623 CGTTA 0.000332 CGTTC 0.000481 CGTTG 0.000636 CGTTT 0.00076 CTAAA 0.00147 CTAAC 0.000672 CTAAG 0.000616 CTAAT 0.00125 CTACA 0.00093 CTACC 0.000636 CTACG 0.000423 CTACT 0.000997 CTAGA 0.000869 CTAGC 0.000855 CTAGG 0.000602 CTAGT 0.000866 CTATA 0.0012 CTATC 0.000731 CTATG 0.000724 CTATT 0.00118 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.000776 CTCAG 0.000573 CTCAT 0.000984 CTCCA 0.00122 CTCCC 0.00114 CTCCG 0.000784 CTCCT 0.00137 CTCGA 0.000646 CTCGC 0.00073 CTCGG 0.00057 CTCGT 0.000666 CTCTA 0.000885 CTCTC 0.00154 CTCTG 0.00079 CTCTT 0.00121 CTGAA 0.00111 CTGAC 0.000637 CTGAG 0.000573 CTGAT 0.000925 CTGCA 0.00106 CTGCC 0.000789 CTGCG 0.000454 CTGCT 0.000977 CTGGA 0.000742 CTGGC 0.000631 CTGGG 0.000507 CTGGT 0.000701 CTGTA 0.000743 CTGTC 0.000661 CTGTG 0.000739 CTGTT 0.000969 CTTAA 0.00103 CTTAC 0.000551 CTTAG 0.000616 CTTAT 0.00113 CTTCA 0.00112 CTTCC 0.00101 CTTCG 0.000577 CTTCT 0.00141 CTTGA 0.000965 CTTGC 0.000925 CTTGG 0.000863 CTTGT 0.00117 CTTTA 0.00105 CTTTC 0.0011 CTTTG 0.00119 CTTTT 0.00218 GAAAA 0.00261 GAAAC 0.00108 GAAAG 0.0011 GAAAT 0.00162 GAACA 0.00106 GAACC 0.000611 GAACG 0.000481 GAACT 0.000865 GAAGA 0.00146 GAAGC 0.000832 GAAGG 0.000935 GAAGT 0.000888 GAATA 0.00107 GAATC 0.000835 GAATG 0.000857 GAATT 0.00139 GACAA 0.00107 GACAC 0.000659 GACAG 0.000661 GACAT 0.000899 GACCA 0.000736 GACCC 0.000431 GACCG 0.000531 GACCT 0.000547 GACGA 0.000896 GACGC 0.000547 GACGG 0.000788 GACGT 0.000498 GACTA 0.000637 GACTC 0.000491 GACTG 0.000522 GACTT 0.000752 GAGAA 0.00141 GAGAC 0.000649 GAGAG 0.00154 GAGAT 0.00115 GAGCA 0.000916 GAGCC 0.000635 GAGCG 0.000563 GAGCT 0.000886 GAGGA 0.00143 GAGGC 0.000868 GAGGG 0.00105 GAGGT 0.000818 GAGTA 0.000923 GAGTC 0.000491 GAGTG 0.000668 GAGTT 0.000933 GATAA 0.00111 GATAC 0.000577 GATAG 0.000731 GATAT 0.0012 GATCA 0.00106 GATCC 0.000741 GATCG 0.000754 GATCT 0.000957 GATGA 0.00136 GATGC 0.00087 GATGG 0.00118 GATGT 0.00104 GATTA 0.00108 GATTC 0.000835 GATTG 0.00096 GATTT 0.00169 GCAAA 0.00134 GCAAC 0.000865 GCAAG 0.000925 GCAAT 0.000968 GCACA 0.000918 GCACC 0.000694 GCACG 0.00074 GCACT 0.000652 GCAGA 0.000772 GCAGC 0.00108 GCAGG 0.000719 GCAGT 0.000712 GCATA 0.000868 GCATC 0.00087 GCATG 0.00121 GCATT 0.000926 GCCAA 0.00094 GCCAC 0.000992 GCCAG 0.000631 GCCAT 0.000995 GCCCA 0.000877 GCCCC 0.000578 GCCCG 0.000567 GCCCT 0.000564 GCCGA 0.000739 GCCGC 0.00144 GCCGG 0.000967 GCCGT 0.000763 GCCTA 0.000584 GCCTC 0.000868 GCCTG 0.000616 GCCTT 0.0007 GCGAA 0.0005 GCGAC 0.000654 GCGAG 0.00073 GCGAT 0.000482 GCGCA 0.000497 GCGCC 0.00085 GCGCG 0.000861 GCGCT 0.00046 GCGGA 0.000572 GCGGC 0.00144 GCGGG 0.000608 GCGGT 0.000611 GCGTA 0.000311 GCGTC 0.000547 GCGTG 0.000668 GCGTT 0.000388 GCTAA 0.000829 GCTAC 0.000666 GCTAG 0.000855 GCTAT 0.000755 GCTCA 0.000723 GCTCC 0.000816 GCTCG 0.000722 GCTCT 0.00074 GCTGA 0.000816 GCTGC 0.00108 GCTGG 0.00078 GCTGT 0.000732 GCTTA 0.000695 GCTTC 0.000832 GCTTG 0.000909 GCTTT 0.00096 GGAAA 0.00131 GGAAC 0.000631 GGAAG 0.00101 GGAAT 0.000896 GGACA 0.000718 GGACC 0.000525 GGACG 0.000611 GGACT 0.000564 GGAGA 0.00129 GGAGC 0.000816 GGAGG 0.00152 GGAGT 0.000885 GGATA 0.00076 GGATC 0.000741 GGATG 0.00102 GGATT 0.00101 GGCAA 0.000877 GGCAC 0.000654 GGCAG 0.000789 GGCAT 0.000792 GGCCA 0.000802 GGCCC 0.000755 GGCCG 0.000908 GGCCT 0.00069 GGCGA 0.000895 GGCGC 0.00085 GGCGG 0.00143 GGCGT 0.000548 GGCTA 0.000665 GGCTC 0.000635 GGCTG 0.000814 GGCTT 0.000712 GGGAA 0.000833 GGGAC 0.000588 GGGAG 0.00114 GGGAT 0.000729 GGGCA 0.000598 GGGCC 0.000755 GGGCG 0.000657 GGGCT 0.000575 GGGGA 0.000853 GGGGC 0.000578 GGGGG 0.000798 GGGGT 0.000559 GGGTA 0.000511 GGGTC 0.000431 GGGTG 0.000721 GGGTT 0.000671 GGTAA 0.000646 GGTAC 0.000514 GGTAG 0.000636 GGTAT 0.000675 GGTCA 0.000656 GGTCC 0.000525 GGTCG 0.000535 GGTCT 0.000528 GGTGA 0.00093 GGTGC 0.000694 GGTGG 0.00126 GGTGT 0.000801 GGTTA 0.000661 GGTTC 0.000611 GGTTG 0.000927 GGTTT 0.00119 GTAAA 0.00117 GTAAC 0.000563 GTAAG 0.000551 GTAAT 0.000969 GTACA 0.000892 GTACC 0.000514 GTACG 0.000479 GTACT 0.000947 GTAGA 0.000798 GTAGC 0.000666 GTAGG 0.000605 GTAGT 0.000917 GTATA 0.00109 GTATC 0.000577 GTATG 0.000786 GTATT 0.00109 GTCAA 0.000981 GTCAC 0.00067 GTCAG 0.000637 GTCAT 0.000901 GTCCA 0.000781 GTCCC 0.000588 GTCCG 0.000412 GTCCT 0.000638 GTCGA 0.000629 GTCGC 0.000654 GTCGG 0.000598 GTCGT 0.000658 GTCTA 0.000593 GTCTC 0.000649 GTCTG 0.000515 GTCTT 0.000756 GTGAA 0.00104 GTGAC 0.00067 GTGAG 0.000776 GTGAT 0.00101 GTGCA 0.000982 GTGCC 0.000654 GTGCG 0.000548 GTGCT 0.000821 GTGGA 0.000975 GTGGC 0.000992 GTGGG 0.000878 GTGGT 0.00101 GTGTA 0.000814 GTGTC 0.000659 GTGTG 0.00103 GTGTT 0.00105 GTTAA 0.000946 GTTAC 0.000563 GTTAG 0.000672 GTTAT 0.000915 GTTCA 0.00098 GTTCC 0.000631 GTTCG 0.000513 GTTCT 0.00089 GTTGA 0.00107 GTTGC 0.000865 GTTGG 0.00101 GTTGT 0.00113 GTTTA 0.00122 GTTTC 0.00108 GTTTG 0.00138 GTTTT 0.00214 TAAAA 0.00314 TAAAC 0.00122 TAAAG 0.00105 TAAAT 0.00223 TAACA 0.00108 TAACC 0.000661 TAACG 0.000332 TAACT 0.00103 TAAGA 0.00102 TAAGC 0.000695 TAAGG 0.000641 TAAGT 0.000973 TAATA 0.00186 TAATC 0.00108 TAATG 0.00102 TAATT 0.00243 TACAA 0.00136 TACAC 0.000814 TACAG 0.000743 TACAT 0.00137 TACCA 0.000874 TACCC 0.000511 TACCG 0.00038 TACCT 0.000706 TACGA 0.000474 TACGC 0.000311 TACGG 0.000375 TACGT 0.000553 TACTA 0.00128 TACTC 0.000923 TACTG 0.000768 TACTT 0.00118 TAGAA 0.00133 TAGAC 0.000593 TAGAG 0.000885 TAGAT 0.00127 TAGCA 0.00102 TAGCC 0.000665 TAGCG 0.000367 TAGCT 0.00105 TAGGA 0.000908 TAGGC 0.000584 TAGGG 0.000596 TAGGT 0.000716 TAGTA 0.00128 TAGTC 0.000637 TAGTG 0.000801 TAGTT 0.00131 TATAA 0.00198 TATAC 0.00109 TATAG 0.0012 TATAT 0.00341 TATCA 0.0012 TATCC 0.00076 TATCG 0.000452 TATCT 0.00121 TATGA 0.00123 TATGC 0.000868 TATGG 0.00089 TATGT 0.00143 TATTA 0.00186 TATTC 0.00107 TATTG 0.00121 TATTT 0.00302 TCAAA 0.00204 TCAAC 0.00107 TCAAG 0.000965 TCAAT 0.00136 TCACA 0.00115 TCACC 0.00093 TCACG 0.000526 TCACT 0.000887 TCAGA 0.000958 TCAGC 0.000816 TCAGG 0.000638 TCAGT 0.000832 TCATA 0.00123 TCATC 0.00136 TCATG 0.00121 TCATT 0.00137 TCCAA 0.00137 TCCAC 0.000975 TCCAG 0.000742 TCCAT 0.00136 TCCCA 0.000874 TCCCC 0.000853 TCCCG 0.000525 TCCCT 0.00104 TCCGA 0.000542 TCCGC 0.000572 TCCGG 0.000528 TCCGT 0.000634 TCCTA 0.000908 TCCTC 0.00143 TCCTG 0.000745 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.000652 TCGAC 0.000629 TCGAG 0.000646 TCGAT 0.000885 TCGCA 0.000459 TCGCC 0.000895 TCGCG 0.000452 TCGCT 0.00056 TCGGA 0.000542 TCGGC 0.000739 TCGGG 0.000425 TCGGT 0.000582 TCGTA 0.000474 TCGTC 0.000896 TCGTG 0.000611 TCGTT 0.000721 TCTAA 0.00117 TCTAC 0.000798 TCTAG 0.000869 TCTAT 0.00123 TCTCA 0.00105 TCTCC 0.00129 TCTCG 0.000664 TCTCT 0.00174 TCTGA 0.000958 TCTGC 0.000772 TCTGG 0.000649 TCTGT 0.000904 TCTTA 0.00102 TCTTC 0.00146 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.00187 TGAAA 0.002 TGAAC 0.00098 TGAAG 0.00112 TGAAT 0.00148 TGACA 0.00113 TGACC 0.000656 TGACG 0.000604 TGACT 0.0008 TGAGA 0.00105 TGAGC 0.000723 TGAGG 0.000788 TGAGT 0.000818 TGATA 0.0012 TGATC 0.00106 TGATG 0.00141 TGATT 0.00154 TGCAA 0.00142 TGCAC 0.000982 TGCAG 0.00106 TGCAT 0.00152 TGCCA 0.00103 TGCCC 0.000598 TGCCG 0.000694 TGCCT 0.000789 TGCGA 0.000459 TGCGC 0.000497 TGCGG 0.000511 TGCGT 0.000499 TGCTA 0.00102 TGCTC 0.000916 TGCTG 0.00105 TGCTT 0.00122 TGGAA 0.00119 TGGAC 0.000781 TGGAG 0.00122 TGGAT 0.00126 TGGCA 0.00103 TGGCC 0.000802 TGGCG 0.000804 TGGCT 0.000921 TGGGA 0.000874 TGGGC 0.000877 TGGGG 0.000697 TGGGT 0.000759 TGGTA 0.000874 TGGTC 0.000736 TGGTG 0.00122 TGGTT 0.00126 TGTAA 0.00118 TGTAC 0.000892 TGTAG 0.00093 TGTAT 0.00128 TGTCA 0.00113 TGTCC 0.000718 TGTCG 0.000598 TGTCT 0.00084 TGTGA 0.00115 TGTGC 0.000918 TGTGG 0.00102 TGTGT 0.00135 TGTTA 0.00108 TGTTC 0.00106 TGTTG 0.00135 TGTTT 0.00212 TTAAA 0.00239 TTAAC 0.000946 TTAAG 0.00103 TTAAT 0.00216 TTACA 0.00118 TTACC 0.000646 TTACG 0.000363 TTACT 0.00106 TTAGA 0.00117 TTAGC 0.000829 TTAGG 0.000835 TTAGT 0.00117 TTATA 0.00198 TTATC 0.00111 TTATG 0.00115 TTATT 0.00242 TTCAA 0.00169 TTCAC 0.00104 TTCAG 0.00111 TTCAT 0.00173 TTCCA 0.00119 TTCCC 0.000833 TTCCG 0.000498 TTCCT 0.00133 TTCGA 0.000652 TTCGC 0.0005 TTCGG 0.000521 TTCGT 0.000771 TTCTA 0.00133 TTCTC 0.00141 TTCTG 0.000993 TTCTT 0.00211 TTGAA 0.00169 TTGAC 0.000981 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00172 TTGCA 0.00142 TTGCC 0.000877 TTGCG 0.000474 TTGCT 0.00133 TTGGA 0.00137 TTGGC 0.00094 TTGGG 0.000961 TTGGT 0.00128 TTGTA 0.00136 TTGTC 0.00107 TTGTG 0.0013 TTGTT 0.002 TTTAA 0.00239 TTTAC 0.00117 TTTAG 0.00147 TTTAT 0.0026 TTTCA 0.002 TTTCC 0.00131 TTTCG 0.000755 TTTCT 0.00235 TTTGA 0.00204 TTTGC 0.00134 TTTGG 0.00166 TTTGT 0.00207 TTTTA 0.00314 TTTTC 0.00261 TTTTG 0.00248 TTTTT 0.00611 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4293 AAAAC 0.145 AAAAG 0.1502 AAAAT 0.2756 AAACA 0.3701 AAACC 0.1992 AAACG 0.1264 AAACT 0.3043 AAAGA 0.3404 AAAGC 0.1692 AAAGG 0.1987 AAAGT 0.2917 AAATA 0.3151 AAATC 0.1667 AAATG 0.1744 AAATT 0.3437 AACAA 0.3577 AACAC 0.1868 AACAG 0.1677 AACAT 0.2879 AACCA 0.3798 AACCC 0.1954 AACCG 0.1796 AACCT 0.2452 AACGA 0.3281 AACGC 0.1701 AACGG 0.2685 AACGT 0.2333 AACTA 0.2807 AACTC 0.1895 AACTG 0.1804 AACTT 0.3493 AAGAA 0.3861 AAGAC 0.1349 AAGAG 0.2147 AAGAT 0.2643 AAGCA 0.3671 AAGCC 0.2031 AAGCG 0.1233 AAGCT 0.3065 AAGGA 0.3495 AAGGC 0.1941 AAGGG 0.2244 AAGGT 0.232 AAGTA 0.2692 AAGTC 0.163 AAGTG 0.1946 AAGTT 0.3732 AATAA 0.3377 AATAC 0.1507 AATAG 0.1617 AATAT 0.35 AATCA 0.3444 AATCC 0.2146 AATCG 0.1275 AATCT 0.3135 AATGA 0.2971 AATGC 0.1933 AATGG 0.2299 AATGT 0.2797 AATTA 0.286 AATTC 0.1575 AATTG 0.1678 AATTT 0.3887 ACAAA 0.3653 ACAAC 0.193 ACAAG 0.1985 ACAAT 0.2431 ACACA 0.3914 ACACC 0.2177 ACACG 0.1671 ACACT 0.2237 ACAGA 0.2967 ACAGC 0.2288 ACAGG 0.2079 ACAGT 0.2665 ACATA 0.283 ACATC 0.1936 ACATG 0.2736 ACATT 0.2498 ACCAA 0.3203 ACCAC 0.2354 ACCAG 0.1651 ACCAT 0.2792 ACCCA 0.3319 ACCCC 0.2373 ACCCG 0.1575 ACCCT 0.2734 ACCGA 0.2492 ACCGC 0.2443 ACCGG 0.2592 ACCGT 0.2473 ACCTA 0.2516 ACCTC 0.2626 ACCTG 0.2107 ACCTT 0.2751 ACGAA 0.3001 ACGAC 0.2278 ACGAG 0.2402 ACGAT 0.232 ACGCA 0.2735 ACGCC 0.2768 ACGCG 0.2315 ACGCT 0.2182 ACGGA 0.2744 ACGGC 0.2969 ACGGG 0.1867 ACGGT 0.2419 ACGTA 0.2566 ACGTC 0.2083 ACGTG 0.3009 ACGTT 0.2341 ACTAA 0.2965 ACTAC 0.2204 ACTAG 0.209 ACTAT 0.2741 ACTCA 0.2792 ACTCC 0.2894 ACTCG 0.1498 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2825 ACTGC 0.236 ACTGG 0.2015 ACTGT 0.2801 ACTTA 0.2219 ACTTC 0.1936 ACTTG 0.2235 ACTTT 0.361 AGAAA 0.4106 AGAAC 0.1495 AGAAG 0.2328 AGAAT 0.2071 AGACA 0.3427 AGACC 0.2059 AGACG 0.2042 AGACT 0.2473 AGAGA 0.3953 AGAGC 0.1662 AGAGG 0.2438 AGAGT 0.1947 AGATA 0.2594 AGATC 0.1908 AGATG 0.2534 AGATT 0.2964 AGCAA 0.319 AGCAC 0.1924 AGCAG 0.2249 AGCAT 0.2637 AGCCA 0.337 AGCCC 0.2015 AGCCG 0.22 AGCCT 0.2415 AGCGA 0.2868 AGCGC 0.2204 AGCGG 0.2837 AGCGT 0.2091 AGCTA 0.284 AGCTC 0.2195 AGCTG 0.2298 AGCTT 0.2667 AGGAA 0.3188 AGGAC 0.1458 AGGAG 0.3065 AGGAT 0.2288 AGGCA 0.2966 AGGCC 0.247 AGGCG 0.2057 AGGCT 0.2506 AGGGA 0.3443 AGGGC 0.1825 AGGGG 0.2618 AGGGT 0.2114 AGGTA 0.2492 AGGTC 0.1763 AGGTG 0.2937 AGGTT 0.2808 AGTAA 0.2609 AGTAC 0.2228 AGTAG 0.2334 AGTAT 0.2829 AGTCA 0.3407 AGTCC 0.2355 AGTCG 0.1659 AGTCT 0.2579 AGTGA 0.2838 AGTGC 0.2051 AGTGG 0.2562 AGTGT 0.2549 AGTTA 0.222 AGTTC 0.1753 AGTTG 0.234 AGTTT 0.3687 ATAAA 0.391 ATAAC 0.136 ATAAG 0.1683 ATAAT 0.3047 ATACA 0.3677 ATACC 0.185 ATACG 0.1226 ATACT 0.3248 ATAGA 0.3257 ATAGC 0.1942 ATAGG 0.1952 ATAGT 0.2849 ATATA 0.3986 ATATC 0.129 ATATG 0.1942 ATATT 0.2781 ATCAA 0.3328 ATCAC 0.19 ATCAG 0.1719 ATCAT 0.3053 ATCCA 0.3666 ATCCC 0.2015 ATCCG 0.1581 ATCCT 0.2738 ATCGA 0.3508 ATCGC 0.1791 ATCGG 0.2321 ATCGT 0.2379 ATCTA 0.2735 ATCTC 0.2282 ATCTG 0.1979 ATCTT 0.3004 ATGAA 0.3397 ATGAC 0.1683 ATGAG 0.1872 ATGAT 0.3047 ATGCA 0.4005 ATGCC 0.1976 ATGCG 0.1194 ATGCT 0.2825 ATGGA 0.3229 ATGGC 0.2192 ATGGG 0.194 ATGGT 0.2639 ATGTA 0.2698 ATGTC 0.1639 ATGTG 0.2606 ATGTT 0.3056 ATTAA 0.3416 ATTAC 0.1483 ATTAG 0.193 ATTAT 0.3171 ATTCA 0.3603 ATTCC 0.2121 ATTCG 0.1389 ATTCT 0.2886 ATTGA 0.2913 ATTGC 0.2006 ATTGG 0.2144 ATTGT 0.2937 ATTTA 0.2305 ATTTC 0.1627 ATTTG 0.2052 ATTTT 0.4017 CAAAA 0.3523 CAAAC 0.1909 CAAAG 0.1636 CAAAT 0.2932 CAACA 0.338 CAACC 0.2256 CAACG 0.1491 CAACT 0.2872 CAAGA 0.2985 CAAGC 0.2283 CAAGG 0.2057 CAAGT 0.2676 CAATA 0.2624 CAATC 0.197 CAATG 0.2213 CAATT 0.3193 CACAA 0.2953 CACAC 0.2272 CACAG 0.1609 CACAT 0.3166 CACCA 0.341 CACCC 0.1953 CACCG 0.2132 CACCT 0.2505 CACGA 0.2373 CACGC 0.2483 CACGG 0.2453 CACGT 0.2691 CACTA 0.2643 CACTC 0.2049 CACTG 0.2433 CACTT 0.2875 CAGAA 0.3068 CAGAC 0.1547 CAGAG 0.2353 CAGAT 0.3033 CAGCA 0.3146 CAGCC 0.2335 CAGCG 0.1743 CAGCT 0.2776 CAGGA 0.2937 CAGGC 0.2349 CAGGG 0.2172 CAGGT 0.2542 CAGTA 0.2662 CAGTC 0.1683 CAGTG 0.2606 CAGTT 0.3049 CATAA 0.2607 CATAC 0.1753 CATAG 0.1596 CATAT 0.4044 CATCA 0.3246 CATCC 0.2264 CATCG 0.1632 CATCT 0.2857 CATGA 0.245 CATGC 0.2404 CATGG 0.2209 CATGT 0.2937 CATTA 0.2238 CATTC 0.1796 CATTG 0.2212 CATTT 0.3754 CCAAA 0.3716 CCAAC 0.216 CCAAG 0.1832 CCAAT 0.2293 CCACA 0.2786 CCACC 0.3183 CCACG 0.1789 CCACT 0.2243 CCAGA 0.2564 CCAGC 0.2954 CCAGG 0.2058 CCAGT 0.2424 CCATA 0.2144 CCATC 0.2638 CCATG 0.2612 CCATT 0.2606 CCCAA 0.31 CCCAC 0.2623 CCCAG 0.1541 CCCAT 0.2735 CCCCA 0.2581 CCCCC 0.2849 CCCCG 0.1619 CCCCT 0.2952 CCCGA 0.2182 CCCGC 0.2944 CCCGG 0.2435 CCCGT 0.2438 CCCTA 0.2089 CCCTC 0.3354 CCCTG 0.1839 CCCTT 0.2718 CCGAA 0.2384 CCGAC 0.2454 CCGAG 0.2384 CCGAT 0.2777 CCGCA 0.1669 CCGCC 0.4342 CCGCG 0.2094 CCGCT 0.1894 CCGGA 0.2051 CCGGC 0.3608 CCGGG 0.184 CCGGT 0.2501 CCGTA 0.1647 CCGTC 0.3137 CCGTG 0.2631 CCGTT 0.2585 CCTAA 0.3024 CCTAC 0.2077 CCTAG 0.212 CCTAT 0.278 CCTCA 0.196 CCTCC 0.3601 CCTCG 0.166 CCTCT 0.2779 CCTGA 0.255 CCTGC 0.2757 CCTGG 0.2061 CCTGT 0.2632 CCTTA 0.1898 CCTTC 0.2539 CCTTG 0.2288 CCTTT 0.3274 CGAAA 0.3195 CGAAC 0.2044 CGAAG 0.2223 CGAAT 0.2539 CGACA 0.2472 CGACC 0.2098 CGACG 0.3647 CGACT 0.1782 CGAGA 0.2639 CGAGC 0.2697 CGAGG 0.2725 CGAGT 0.1939 CGATA 0.1813 CGATC 0.2887 CGATG 0.2891 CGATT 0.2409 CGCAA 0.2448 CGCAC 0.2693 CGCAG 0.2259 CGCAT 0.26 CGCCA 0.2249 CGCCC 0.1737 CGCCG 0.4304 CGCCT 0.1711 CGCGA 0.1886 CGCGC 0.3407 CGCGG 0.2757 CGCGT 0.1949 CGCTA 0.1944 CGCTC 0.265 CGCTG 0.31 CGCTT 0.2305 CGGAA 0.2271 CGGAC 0.1763 CGGAG 0.3312 CGGAT 0.2654 CGGCA 0.1841 CGGCC 0.2305 CGGCG 0.4062 CGGCT 0.1792 CGGGA 0.2699 CGGGC 0.283 CGGGG 0.2419 CGGGT 0.2052 CGGTA 0.169 CGGTC 0.2168 CGGTG 0.3368 CGGTT 0.2773 CGTAA 0.2177 CGTAC 0.2717 CGTAG 0.2363 CGTAT 0.2743 CGTCA 0.2323 CGTCC 0.2253 CGTCG 0.3333 CGTCT 0.2092 CGTGA 0.2069 CGTGC 0.2745 CGTGG 0.2684 CGTGT 0.2502 CGTTA 0.1579 CGTTC 0.2083 CGTTG 0.2805 CGTTT 0.3534 CTAAA 0.3719 CTAAC 0.164 CTAAG 0.1492 CTAAT 0.3149 CTACA 0.3189 CTACC 0.212 CTACG 0.1326 CTACT 0.3365 CTAGA 0.278 CTAGC 0.2669 CTAGG 0.185 CTAGT 0.27 CTATA 0.3217 CTATC 0.1852 CTATG 0.1843 CTATT 0.3088 CTCAA 0.3128 CTCAC 0.2229 CTCAG 0.1646 CTCAT 0.2997 CTCCA 0.2802 CTCCC 0.2487 CTCCG 0.1649 CTCCT 0.3063 CTCGA 0.2533 CTCGC 0.2706 CTCGG 0.2129 CTCGT 0.2632 CTCTA 0.2122 CTCTC 0.3346 CTCTG 0.175 CTCTT 0.2782 CTGAA 0.3487 CTGAC 0.1879 CTGAG 0.1737 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3337 CTGCC 0.2321 CTGCG 0.1306 CTGCT 0.3036 CTGGA 0.293 CTGGC 0.2383 CTGGG 0.1931 CTGGT 0.2756 CTGTA 0.244 CTGTC 0.2058 CTGTG 0.2347 CTGTT 0.3154 CTTAA 0.3126 CTTAC 0.1602 CTTAG 0.1809 CTTAT 0.3464 CTTCA 0.2772 CTTCC 0.2424 CTTCG 0.131 CTTCT 0.3494 CTTGA 0.2505 CTTGC 0.2318 CTTGG 0.2156 CTTGT 0.3021 CTTTA 0.1944 CTTTC 0.1959 CTTTG 0.2094 CTTTT 0.4003 GAAAA 0.4101 GAAAC 0.1637 GAAAG 0.1692 GAAAT 0.257 GAACA 0.3588 GAACC 0.1981 GAACG 0.1506 GAACT 0.2925 GAAGA 0.3568 GAAGC 0.198 GAAGG 0.221 GAAGT 0.2243 GAATA 0.2632 GAATC 0.1943 GAATG 0.2033 GAATT 0.3392 GACAA 0.3288 GACAC 0.1976 GACAG 0.1964 GACAT 0.2772 GACCA 0.3415 GACCC 0.1858 GACCG 0.2256 GACCT 0.2471 GACGA 0.3316 GACGC 0.1945 GACGG 0.2895 GACGT 0.1844 GACTA 0.2731 GACTC 0.2008 GACTG 0.2078 GACTT 0.3184 GAGAA 0.3052 GAGAC 0.1335 GAGAG 0.3158 GAGAT 0.2455 GAGCA 0.3167 GAGCC 0.2081 GAGCG 0.171 GAGCT 0.3042 GAGGA 0.3453 GAGGC 0.1994 GAGGG 0.253 GAGGT 0.2023 GAGTA 0.3144 GAGTC 0.1587 GAGTG 0.2143 GAGTT 0.3126 GATAA 0.3116 GATAC 0.1561 GATAG 0.199 GATAT 0.3332 GATCA 0.3073 GATCC 0.2094 GATCG 0.2084 GATCT 0.275 GATGA 0.3085 GATGC 0.1922 GATGG 0.2585 GATGT 0.2408 GATTA 0.2423 GATTC 0.1788 GATTG 0.2052 GATTT 0.3737 GCAAA 0.3324 GCAAC 0.207 GCAAG 0.2204 GCAAT 0.2402 GCACA 0.3189 GCACC 0.2243 GCACG 0.2305 GCACT 0.2262 GCAGA 0.2401 GCAGC 0.3209 GCAGG 0.2161 GCAGT 0.2229 GCATA 0.2307 GCATC 0.2157 GCATG 0.3126 GCATT 0.241 GCCAA 0.275 GCCAC 0.2692 GCCAG 0.1737 GCCAT 0.2821 GCCCA 0.3458 GCCCC 0.2207 GCCCG 0.2078 GCCCT 0.2257 GCCGA 0.1937 GCCGC 0.3568 GCCGG 0.2481 GCCGT 0.2014 GCCTA 0.2218 GCCTC 0.2946 GCCTG 0.2216 GCCTT 0.2619 GCGAA 0.2202 GCGAC 0.2674 GCGAG 0.3002 GCGAT 0.2122 GCGCA 0.1983 GCGCC 0.3116 GCGCG 0.3125 GCGCT 0.1776 GCGGA 0.1815 GCGGC 0.4347 GCGGG 0.1863 GCGGT 0.1975 GCGTA 0.172 GCGTC 0.2723 GCGTG 0.344 GCGTT 0.2116 GCTAA 0.2711 GCTAC 0.207 GCTAG 0.274 GCTAT 0.2479 GCTCA 0.2527 GCTCC 0.2646 GCTCG 0.2242 GCTCT 0.2585 GCTGA 0.2441 GCTGC 0.311 GCTGG 0.2248 GCTGT 0.2201 GCTTA 0.2136 GCTTC 0.2353 GCTTG 0.2627 GCTTT 0.2885 GGAAA 0.347 GGAAC 0.1588 GGAAG 0.2544 GGAAT 0.2397 GGACA 0.3065 GGACC 0.2102 GGACG 0.2385 GGACT 0.2448 GGAGA 0.2888 GGAGC 0.1764 GGAGG 0.3274 GGAGT 0.2074 GGATA 0.2231 GGATC 0.2056 GGATG 0.2841 GGATT 0.2872 GGCAA 0.2877 GGCAC 0.2038 GGCAG 0.2453 GGCAT 0.2631 GGCCA 0.2627 GGCCC 0.242 GGCCG 0.269 GGCCT 0.2263 GGCGA 0.244 GGCGC 0.2245 GGCGG 0.3776 GGCGT 0.154 GGCTA 0.2483 GGCTC 0.217 GGCTG 0.2793 GGCTT 0.2554 GGGAA 0.259 GGGAC 0.1757 GGGAG 0.3372 GGGAT 0.2282 GGGCA 0.2427 GGGCC 0.2932 GGGCG 0.2319 GGGCT 0.2321 GGGGA 0.3075 GGGGC 0.201 GGGGG 0.2847 GGGGT 0.2068 GGGTA 0.227 GGGTC 0.1751 GGGTG 0.3024 GGGTT 0.2956 GGTAA 0.267 GGTAC 0.2014 GGTAG 0.2537 GGTAT 0.278 GGTCA 0.3069 GGTCC 0.2289 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2432 GGTGA 0.2565 GGTGC 0.1855 GGTGG 0.3317 GGTGT 0.2263 GGTTA 0.1995 GGTTC 0.1747 GGTTG 0.2706 GGTTT 0.3552 GTAAA 0.364 GTAAC 0.1704 GTAAG 0.1645 GTAAT 0.3011 GTACA 0.3206 GTACC 0.1781 GTACG 0.1614 GTACT 0.3399 GTAGA 0.2732 GTAGC 0.2195 GTAGG 0.1973 GTAGT 0.31 GTATA 0.3146 GTATC 0.1567 GTATG 0.2182 GTATT 0.3104 GTCAA 0.3163 GTCAC 0.2068 GTCAG 0.1898 GTCAT 0.2871 GTCCA 0.3337 GTCCC 0.2378 GTCCG 0.161 GTCCT 0.2675 GTCGA 0.2538 GTCGC 0.2534 GTCGG 0.2304 GTCGT 0.2624 GTCTA 0.2431 GTCTC 0.2483 GTCTG 0.202 GTCTT 0.3066 GTGAA 0.3 GTGAC 0.1886 GTGAG 0.2165 GTGAT 0.2948 GTGCA 0.3364 GTGCC 0.2103 GTGCG 0.1699 GTGCT 0.2834 GTGGA 0.2591 GTGGC 0.2508 GTGGG 0.2232 GTGGT 0.2669 GTGTA 0.2341 GTGTC 0.1783 GTGTG 0.2852 GTGTT 0.3024 GTTAA 0.3074 GTTAC 0.1784 GTTAG 0.2136 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3311 GTTCC 0.204 GTTCG 0.1624 GTTCT 0.3025 GTTGA 0.2652 GTTGC 0.2089 GTTGG 0.244 GTTGT 0.2819 GTTTA 0.2157 GTTTC 0.1811 GTTTG 0.2336 GTTTT 0.3696 TAAAA 0.4145 TAAAC 0.1569 TAAAG 0.1353 TAAAT 0.2933 TAACA 0.352 TAACC 0.2062 TAACG 0.104 TAACT 0.3378 TAAGA 0.3115 TAAGC 0.2055 TAAGG 0.1889 TAAGT 0.2941 TAATA 0.2945 TAATC 0.164 TAATG 0.1578 TAATT 0.3837 TACAA 0.3184 TACAC 0.1865 TACAG 0.1673 TACAT 0.3278 TACCA 0.3598 TACCC 0.2013 TACCG 0.147 TACCT 0.2919 TACGA 0.2799 TACGC 0.1762 TACGG 0.2181 TACGT 0.3257 TACTA 0.3125 TACTC 0.2184 TACTG 0.1805 TACTT 0.2886 TAGAA 0.3333 TAGAC 0.1394 TAGAG 0.2136 TAGAT 0.3138 TAGCA 0.3356 TAGCC 0.209 TAGCG 0.1101 TAGCT 0.3454 TAGGA 0.3295 TAGGC 0.2007 TAGGG 0.2107 TAGGT 0.2591 TAGTA 0.3203 TAGTC 0.1536 TAGTG 0.1966 TAGTT 0.3295 TATAA 0.2544 TATAC 0.1384 TATAG 0.1526 TATAT 0.4546 TATCA 0.3349 TATCC 0.2065 TATCG 0.1189 TATCT 0.3398 TATGA 0.2813 TATGC 0.1925 TATGG 0.1967 TATGT 0.3295 TATTA 0.2626 TATTC 0.1462 TATTG 0.1649 TATTT 0.4262 TCAAA 0.3825 TCAAC 0.1909 TCAAG 0.1731 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3431 TCACC 0.2557 TCACG 0.1432 TCACT 0.258 TCAGA 0.2983 TCAGC 0.2459 TCAGG 0.1953 TCAGT 0.2606 TCATA 0.2456 TCATC 0.2523 TCATG 0.2322 TCATT 0.2699 TCCAA 0.3143 TCCAC 0.2102 TCCAG 0.1614 TCCAT 0.3142 TCCCA 0.2767 TCCCC 0.2539 TCCCG 0.1491 TCCCT 0.3204 TCCGA 0.2497 TCCGC 0.2347 TCCGG 0.2223 TCCGT 0.2933 TCCTA 0.2244 TCCTC 0.3143 TCCTG 0.1708 TCCTT 0.2906 TCGAA 0.2411 TCGAC 0.2108 TCGAG 0.2211 TCGAT 0.3271 TCGCA 0.2068 TCGCC 0.3617 TCGCG 0.1847 TCGCT 0.2467 TCGGA 0.2511 TCGGC 0.3071 TCGGG 0.1797 TCGGT 0.2621 TCGTA 0.1853 TCGTC 0.3149 TCGTG 0.223 TCGTT 0.2767 TCTAA 0.2932 TCTAC 0.1899 TCTAG 0.2104 TCTAT 0.3065 TCTCA 0.2313 TCTCC 0.2628 TCTCG 0.1331 TCTCT 0.3729 TCTGA 0.2933 TCTGC 0.2306 TCTGG 0.1933 TCTGT 0.2828 TCTTA 0.1937 TCTTC 0.2537 TCTTG 0.2055 TCTTT 0.3471 TGAAA 0.3654 TGAAC 0.1711 TGAAG 0.1931 TGAAT 0.2704 TGACA 0.3609 TGACC 0.2042 TGACG 0.1782 TGACT 0.2567 TGAGA 0.3174 TGAGC 0.2103 TGAGG 0.2225 TGAGT 0.2499 TGATA 0.2362 TGATC 0.1969 TGATG 0.2659 TGATT 0.3009 TGCAA 0.2895 TGCAC 0.1911 TGCAG 0.2068 TGCAT 0.3127 TGCCA 0.342 TGCCC 0.1919 TGCCG 0.2058 TGCCT 0.2603 TGCGA 0.2407 TGCGC 0.2464 TGCGG 0.2504 TGCGT 0.2625 TGCTA 0.2545 TGCTC 0.2108 TGCTG 0.2402 TGCTT 0.2946 TGGAA 0.2724 TGGAC 0.1722 TGGAG 0.2654 TGGAT 0.29 TGGCA 0.3006 TGGCC 0.2211 TGGCG 0.2085 TGGCT 0.2698 TGGGA 0.2799 TGGGC 0.2631 TGGGG 0.2155 TGGGT 0.2416 TGGTA 0.2216 TGGTC 0.1759 TGGTG 0.2885 TGGTT 0.314 TGTAA 0.2768 TGTAC 0.2022 TGTAG 0.2128 TGTAT 0.3082 TGTCA 0.3518 TGTCC 0.2165 TGTCG 0.169 TGTCT 0.2626 TGTGA 0.2637 TGTGC 0.2021 TGTGG 0.2224 TGTGT 0.3118 TGTTA 0.1977 TGTTC 0.1838 TGTTG 0.2353 TGTTT 0.3832 TTAAA 0.3698 TTAAC 0.1415 TTAAG 0.1546 TTAAT 0.3342 TTACA 0.365 TTACC 0.1964 TTACG 0.1075 TTACT 0.3311 TTAGA 0.2983 TTAGC 0.2034 TTAGG 0.2033 TTAGT 0.2951 TTATA 0.3026 TTATC 0.1637 TTATG 0.1698 TTATT 0.3639 TTCAA 0.3091 TTCAC 0.1804 TTCAG 0.193 TTCAT 0.3175 TTCCA 0.3159 TTCCC 0.2098 TTCCG 0.1242 TTCCT 0.35 TTCGA 0.2717 TTCGC 0.1953 TTCGG 0.2094 TTCGT 0.3235 TTCTA 0.2394 TTCTC 0.2338 TTCTG 0.165 TTCTT 0.3617 TTGAA 0.3168 TTGAC 0.1777 TTGAG 0.1872 TTGAT 0.3182 TTGCA 0.3562 TTGCC 0.2075 TTGCG 0.108 TTGCT 0.3283 TTGGA 0.3049 TTGGC 0.2017 TTGGG 0.2076 TTGGT 0.2858 TTGTA 0.2428 TTGTC 0.1802 TTGTG 0.2252 TTGTT 0.3518 TTTAA 0.3171 TTTAC 0.1504 TTTAG 0.1912 TTTAT 0.3413 TTTCA 0.316 TTTCC 0.1992 TTTCG 0.1135 TTTCT 0.3713 TTTGA 0.2919 TTTGC 0.1843 TTTGG 0.2306 TTTGT 0.2931 TTTTA 0.2235 TTTTC 0.1781 TTTTG 0.1692 TTTTT 0.4293