################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 27399 Total trinity transcripts: 78649 Percent GC: 48.83 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 5638 Contig N20: 4370 Contig N30: 3580 Contig N40: 3016 Contig N50: 2580 Median contig length: 1522 Average contig: 1825.11 Total assembled bases: 143543003 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 5753 Contig N20: 4423 Contig N30: 3622 Contig N40: 3052 Contig N50: 2597 Median contig length: 979 Average contig: 1505.44 Total assembled bases: 41247546