################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 5702 Total trinity transcripts: 29863 Percent GC: 47.43 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 4805 Contig N20: 3890 Contig N30: 3353 Contig N40: 2939 Contig N50: 2598 Median contig length: 2034 Average contig: 2258.74 Total assembled bases: 67452749 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 5235 Contig N20: 4213 Contig N30: 3619 Contig N40: 3174 Contig N50: 2805 Median contig length: 2129.5 Average contig: 2333.10 Total assembled bases: 13303359