[1] # (a,c,g,t)= (0.289, 0.211, 0.211, 0.289) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.234 C 0.266 G 0.266 T 0.234 # l= 1 # Values AA 0.0576 AC 0.0572 AG 0.0635 AT 0.0554 CA 0.0726 CC 0.0679 CG 0.0623 CT 0.0636 GA 0.0689 GC 0.0724 GG 0.0677 GT 0.0572 TA 0.0347 TC 0.0689 TG 0.0725 TT 0.0576 # l= 2 # Values AAA 0.0148 AAC 0.0134 AAG 0.0172 AAT 0.0122 ACA 0.0161 ACC 0.0152 ACG 0.014 ACT 0.0118 AGA 0.0169 AGC 0.0176 AGG 0.0173 AGT 0.0118 ATA 0.00941 ATC 0.016 ATG 0.0178 ATT 0.0122 CAA 0.0189 CAC 0.0165 CAG 0.0194 CAT 0.0178 CCA 0.0193 CCC 0.0168 CCG 0.0144 CCT 0.0173 CGA 0.0178 CGC 0.0161 CGG 0.0144 CGT 0.014 CTA 0.00853 CTC 0.0184 CTG 0.0194 CTT 0.0172 GAA 0.0172 GAC 0.0174 GAG 0.0184 GAT 0.016 GCA 0.019 GCC 0.0198 GCG 0.0161 GCT 0.0175 GGA 0.016 GGC 0.0197 GGG 0.0168 GGT 0.0152 GTA 0.00997 GTC 0.0174 GTG 0.0165 GTT 0.0134 TAA 0.00678 TAC 0.00998 TAG 0.00852 TAT 0.00941 TCA 0.0181 TCC 0.0161 TCG 0.0178 TCT 0.0169 TGA 0.0181 TGC 0.019 TGG 0.0193 TGT 0.0161 TTA 0.00678 TTC 0.0172 TTG 0.0189 TTT 0.0148 # l= 3 # Values AAAA 0.00401 AAAC 0.00338 AAAG 0.00431 AAAT 0.00313 AACA 0.00408 AACC 0.00351 AACG 0.0032 AACT 0.0026 AAGA 0.00485 AAGC 0.00459 AAGG 0.00456 AAGT 0.00323 AATA 0.00237 AATC 0.00332 AATG 0.00394 AATT 0.00256 ACAA 0.00422 ACAC 0.00371 ACAG 0.00425 ACAT 0.00391 ACCA 0.00459 ACCC 0.00374 ACCG 0.00291 ACCT 0.00398 ACGA 0.00442 ACGC 0.00342 ACGG 0.0033 ACGT 0.00291 ACTA 0.00178 ACTC 0.00316 ACTG 0.00366 ACTT 0.00323 AGAA 0.00447 AGAC 0.00413 AGAG 0.00449 AGAT 0.00379 AGCA 0.00489 AGCC 0.00458 AGCG 0.00358 AGCT 0.00449 AGGA 0.00422 AGGC 0.00489 AGGG 0.00418 AGGT 0.00398 AGTA 0.00222 AGTC 0.00358 AGTG 0.00344 AGTT 0.0026 ATAA 0.00197 ATAC 0.00255 ATAG 0.00217 ATAT 0.00273 ATCA 0.0047 ATCC 0.00366 ATCG 0.00383 ATCT 0.00379 ATGA 0.00475 ATGC 0.00451 ATGG 0.00466 ATGT 0.0039 ATTA 0.00166 ATTC 0.00355 ATTG 0.00385 ATTT 0.00314 CAAA 0.00452 CAAC 0.00478 CAAG 0.0057 CAAT 0.00385 CACA 0.00443 CACC 0.00471 CACG 0.0039 CACT 0.00345 CAGA 0.00472 CAGC 0.00602 CAGG 0.00497 CAGT 0.00366 CATA 0.00251 CATC 0.00573 CATG 0.00563 CATT 0.00395 CCAA 0.00489 CCAC 0.00455 CCAG 0.00523 CCAT 0.00467 CCCA 0.00449 CCCC 0.00464 CCCG 0.00347 CCCT 0.00418 CCGA 0.0039 CCGC 0.00404 CCGG 0.00313 CCGT 0.0033 CCTA 0.00219 CCTC 0.00556 CCTG 0.00497 CCTT 0.00456 CGAA 0.0041 CGAC 0.00492 CGAG 0.00501 CGAT 0.00383 CGCA 0.00391 CGCC 0.00502 CGCG 0.00355 CGCT 0.00358 CGGA 0.00327 CGGC 0.00473 CGGG 0.00347 CGGT 0.00291 CGTA 0.00208 CGTC 0.00487 CGTG 0.0039 CGTT 0.0032 CTAA 0.00156 CTAC 0.00268 CTAG 0.00213 CTAT 0.00217 CTCA 0.00431 CTCC 0.00459 CTCG 0.00501 CTCT 0.00449 CTGA 0.0043 CTGC 0.00558 CTGG 0.00522 CTGT 0.00426 CTTA 0.00185 CTTC 0.00536 CTTG 0.0057 CTTT 0.00431 GAAA 0.00454 GAAC 0.00372 GAAG 0.00536 GAAT 0.00355 GACA 0.00487 GACC 0.00405 GACG 0.00487 GACT 0.00358 GAGA 0.00507 GAGC 0.00462 GAGG 0.00556 GAGT 0.00316 GATA 0.00289 GATC 0.00404 GATG 0.00573 GATT 0.00332 GCAA 0.00489 GCAC 0.00405 GCAG 0.00558 GCAT 0.00451 GCCA 0.00566 GCCC 0.00446 GCCG 0.00473 GCCT 0.0049 GCGA 0.0045 GCGC 0.00412 GCGG 0.00404 GCGT 0.00341 GCTA 0.00232 GCTC 0.00462 GCTG 0.00601 GCTT 0.00459 GGAA 0.00416 GGAC 0.00366 GGAG 0.00459 GGAT 0.00365 GGCA 0.0053 GGCC 0.00485 GGCG 0.00502 GGCT 0.00458 GGGA 0.00397 GGGC 0.00445 GGGG 0.00463 GGGT 0.00373 GGTA 0.00296 GGTC 0.00405 GGTG 0.00471 GGTT 0.0035 GTAA 0.00196 GTAC 0.00279 GTAG 0.00267 GTAT 0.00254 GTCA 0.00467 GTCC 0.00366 GTCG 0.00491 GTCT 0.00413 GTGA 0.00419 GTGC 0.00404 GTGG 0.00454 GTGT 0.00371 GTTA 0.00152 GTTC 0.00372 GTTG 0.00478 GTTT 0.00337 TAAA 0.00175 TAAC 0.00152 TAAG 0.00185 TAAT 0.00166 TACA 0.00272 TACC 0.00296 TACG 0.00208 TACT 0.00221 TAGA 0.00223 TAGC 0.00232 TAGG 0.00219 TAGT 0.00178 TATA 0.00164 TATC 0.00289 TATG 0.00251 TATT 0.00237 TCAA 0.00486 TCAC 0.0042 TCAG 0.0043 TCAT 0.00475 TCCA 0.00459 TCCC 0.00397 TCCG 0.00327 TCCT 0.00423 TCGA 0.00504 TCGC 0.0045 TCGG 0.0039 TCGT 0.00442 TCTA 0.00223 TCTC 0.00507 TCTG 0.00471 TCTT 0.00486 TGAA 0.00442 TGAC 0.00467 TGAG 0.00431 TGAT 0.0047 TGCA 0.00492 TGCC 0.0053 TGCG 0.00391 TGCT 0.0049 TGGA 0.00458 TGGC 0.00566 TGGG 0.00449 TGGT 0.00459 TGTA 0.00271 TGTC 0.00488 TGTG 0.00442 TGTT 0.00408 TTAA 0.00129 TTAC 0.00196 TTAG 0.00155 TTAT 0.00197 TTCA 0.00442 TTCC 0.00417 TTCG 0.0041 TTCT 0.00447 TTGA 0.00486 TTGC 0.00489 TTGG 0.00488 TTGT 0.00422 TTTA 0.00175 TTTC 0.00454 TTTG 0.00453 TTTT 0.00401 # l= 4 # Values AAAAA 0.00119 AAAAC 0.000862 AAAAG 0.00117 AAAAT 0.000783 AAACA 0.00105 AAACC 0.000866 AAACG 0.000805 AAACT 0.000651 AAAGA 0.00126 AAAGC 0.0011 AAAGG 0.00108 AAAGT 0.00086 AAATA 0.000621 AAATC 0.000858 AAATG 0.00103 AAATT 0.000626 AACAA 0.00117 AACAC 0.000975 AACAG 0.00102 AACAT 0.000918 AACCA 0.00103 AACCC 0.000969 AACCG 0.000641 AACCT 0.000864 AACGA 0.000987 AACGC 0.000829 AACGG 0.00073 AACGT 0.000657 AACTA 0.000392 AACTC 0.000762 AACTG 0.000754 AACTT 0.000689 AAGAA 0.00141 AAGAC 0.00119 AAGAG 0.00122 AAGAT 0.00104 AAGCA 0.00127 AAGCC 0.00122 AAGCG 0.00086 AAGCT 0.00124 AAGGA 0.00114 AAGGC 0.00128 AAGGG 0.0011 AAGGT 0.00104 AAGTA 0.000633 AAGTC 0.00101 AAGTG 0.000896 AAGTT 0.000689 AATAA 0.00054 AATAC 0.000619 AATAG 0.000558 AATAT 0.000657 AATCA 0.00102 AATCC 0.000766 AATCG 0.000797 AATCT 0.000737 AATGA 0.00109 AATGC 0.00102 AATGG 0.001 AATGT 0.000829 AATTA 0.000389 AATTC 0.000732 AATTG 0.000815 AATTT 0.000626 ACAAA 0.00102 ACAAC 0.00108 ACAAG 0.00127 ACAAT 0.000849 ACACA 0.0011 ACACC 0.00104 ACACG 0.000854 ACACT 0.000715 ACAGA 0.00105 ACAGC 0.00136 ACAGG 0.00105 ACAGT 0.000792 ACATA 0.000599 ACATC 0.00116 ACATG 0.00132 ACATT 0.000829 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00118 ACCAG 0.0012 ACCAT 0.00105 ACCCA 0.00106 ACCCC 0.00108 ACCCG 0.000715 ACCCT 0.000875 ACCGA 0.000863 ACCGC 0.000777 ACCGG 0.000631 ACCGT 0.000639 ACCTA 0.000658 ACCTC 0.00118 ACCTG 0.0011 ACCTT 0.00104 ACGAA 0.00104 ACGAC 0.00124 ACGAG 0.00121 ACGAT 0.000933 ACGCA 0.000829 ACGCC 0.00111 ACGCG 0.000753 ACGCT 0.000724 ACGGA 0.000776 ACGGC 0.00113 ACGGG 0.000758 ACGGT 0.000639 ACGTA 0.000496 ACGTC 0.000948 ACGTG 0.000812 ACGTT 0.000657 ACTAA 0.000336 ACTAC 0.000559 ACTAG 0.000399 ACTAT 0.000489 ACTCA 0.000778 ACTCC 0.000741 ACTCG 0.000895 ACTCT 0.000747 ACTGA 0.000866 ACTGC 0.00102 ACTGG 0.000988 ACTGT 0.000792 ACTTA 0.000346 ACTTC 0.000876 ACTTG 0.00114 ACTTT 0.00086 AGAAA 0.00126 AGAAC 0.000914 AGAAG 0.00143 AGAAT 0.000859 AGACA 0.00121 AGACC 0.000933 AGACG 0.00114 AGACT 0.000851 AGAGA 0.00134 AGAGC 0.00112 AGAGG 0.00128 AGAGT 0.000747 AGATA 0.000724 AGATC 0.000989 AGATG 0.00134 AGATT 0.000737 AGCAA 0.00128 AGCAC 0.00107 AGCAG 0.00142 AGCAT 0.00113 AGCCA 0.00139 AGCCC 0.00104 AGCCG 0.001 AGCCT 0.00115 AGCGA 0.00107 AGCGC 0.000917 AGCGG 0.000869 AGCGT 0.000724 AGCTA 0.000623 AGCTC 0.00123 AGCTG 0.0014 AGCTT 0.00124 AGGAA 0.00114 AGGAC 0.00094 AGGAG 0.00124 AGGAT 0.00091 AGGCA 0.00141 AGGCC 0.00117 AGGCG 0.00117 AGGCT 0.00115 AGGGA 0.000992 AGGGC 0.0011 AGGGG 0.00122 AGGGT 0.000875 AGGTA 0.000945 AGGTC 0.00101 AGGTG 0.00116 AGGTT 0.000864 AGTAA 0.000478 AGTAC 0.000615 AGTAG 0.000585 AGTAT 0.000536 AGTCA 0.000976 AGTCC 0.00076 AGTCG 0.000995 AGTCT 0.000851 AGTGA 0.000932 AGTGC 0.000866 AGTGG 0.000932 AGTGT 0.000715 AGTTA 0.000294 AGTTC 0.000706 AGTTG 0.000947 AGTTT 0.000651 ATAAA 0.000499 ATAAC 0.000457 ATAAG 0.000514 ATAAT 0.000498 ATACA 0.000731 ATACC 0.000757 ATACG 0.00052 ATACT 0.000536 ATAGA 0.000607 ATAGC 0.000595 ATAGG 0.000476 ATAGT 0.000489 ATATA 0.000515 ATATC 0.000851 ATATG 0.000704 ATATT 0.000657 ATCAA 0.00124 ATCAC 0.00111 ATCAG 0.00107 ATCAT 0.00129 ATCCA 0.00108 ATCCC 0.000883 ATCCG 0.000782 ATCCT 0.00091 ATCGA 0.0011 ATCGC 0.00101 ATCGG 0.000784 ATCGT 0.000933 ATCTA 0.000538 ATCTC 0.00113 ATCTG 0.00108 ATCTT 0.00104 ATGAA 0.00121 ATGAC 0.00119 ATGAG 0.00106 ATGAT 0.00129 ATGCA 0.00126 ATGCC 0.00122 ATGCG 0.000897 ATGCT 0.00113 ATGGA 0.00119 ATGGC 0.00139 ATGGG 0.00104 ATGGT 0.00105 ATGTA 0.000759 ATGTC 0.00116 ATGTG 0.00107 ATGTT 0.000918 ATTAA 0.000336 ATTAC 0.000464 ATTAG 0.00036 ATTAT 0.000498 ATTCA 0.00102 ATTCC 0.000815 ATTCG 0.000855 ATTCT 0.000859 ATTGA 0.00107 ATTGC 0.00099 ATTGG 0.000946 ATTGT 0.000849 ATTTA 0.000415 ATTTC 0.001 ATTTG 0.000933 ATTTT 0.000783 CAAAA 0.00118 CAAAC 0.0011 CAAAG 0.00131 CAAAT 0.000933 CAACA 0.00144 CAACC 0.00126 CAACG 0.00112 CAACT 0.000947 CAAGA 0.00149 CAAGC 0.00157 CAAGG 0.0015 CAAGT 0.00114 CAATA 0.000693 CAATC 0.00109 CAATG 0.00125 CAATT 0.000815 CACAA 0.0011 CACAC 0.00111 CACAG 0.00114 CACAT 0.00107 CACCA 0.00152 CACCC 0.00113 CACCG 0.000896 CACCT 0.00116 CACGA 0.00122 CACGC 0.000964 CACGG 0.000896 CACGT 0.000812 CACTA 0.000538 CACTC 0.000925 CACTG 0.00108 CACTT 0.000896 CAGAA 0.00119 CAGAC 0.00121 CAGAG 0.00124 CAGAT 0.00108 CAGCA 0.00173 CAGCC 0.00162 CAGCG 0.00126 CAGCT 0.0014 CAGGA 0.00116 CAGGC 0.00149 CAGGG 0.00121 CAGGT 0.0011 CAGTA 0.000656 CAGTC 0.00117 CAGTG 0.00108 CAGTT 0.000754 CATAA 0.000497 CATAC 0.000734 CATAG 0.000571 CATAT 0.000704 CATCA 0.00173 CATCC 0.00131 CATCG 0.00134 CATCT 0.00134 CATGA 0.00141 CATGC 0.00141 CATGG 0.00149 CATGT 0.00132 CATTA 0.000493 CATTC 0.00117 CATTG 0.00125 CATTT 0.00103 CCAAA 0.00121 CCAAC 0.00123 CCAAG 0.0015 CCAAT 0.000946 CCACA 0.00114 CCACC 0.0014 CCACG 0.00107 CCACT 0.000932 CCAGA 0.00128 CCAGC 0.00162 CCAGG 0.00133 CCAGT 0.000988 CCATA 0.000615 CCATC 0.00156 CCATG 0.00149 CCATT 0.001 CCCAA 0.00118 CCCAC 0.00107 CCCAG 0.0012 CCCAT 0.00104 CCCCA 0.00111 CCCCC 0.00137 CCCCG 0.000929 CCCCT 0.00122 CCCGA 0.000907 CCCGC 0.00106 CCCGG 0.00074 CCCGT 0.000758 CCCTA 0.000451 CCCTC 0.00141 CCCTG 0.00121 CCCTT 0.0011 CCGAA 0.000933 CCGAC 0.00109 CCGAG 0.00109 CCGAT 0.000784 CCGCA 0.000952 CCGCC 0.00136 CCGCG 0.000857 CCGCT 0.000869 CCGGA 0.000722 CCGGC 0.00104 CCGGG 0.00074 CCGGT 0.000631 CCGTA 0.000455 CCGTC 0.00122 CCGTG 0.000896 CCGTT 0.00073 CCTAA 0.00041 CCTAC 0.000713 CCTAG 0.000593 CCTAT 0.000476 CCTCA 0.00128 CCTCC 0.00151 CCTCG 0.00148 CCTCT 0.00128 CCTGA 0.00111 CCTGC 0.00146 CCTGG 0.00133 CCTGT 0.00105 CCTTA 0.000553 CCTTC 0.00141 CCTTG 0.0015 CCTTT 0.00108 CGAAA 0.00109 CGAAC 0.000963 CGAAG 0.00119 CGAAT 0.000855 CGACA 0.00139 CGACC 0.00116 CGACG 0.00137 CGACT 0.000995 CGAGA 0.00133 CGAGC 0.0013 CGAGG 0.00148 CGAGT 0.000895 CGATA 0.000694 CGATC 0.000991 CGATG 0.00134 CGATT 0.000797 CGCAA 0.00108 CGCAC 0.000845 CGCAG 0.00108 CGCAT 0.000897 CGCCA 0.00139 CGCCC 0.0012 CGCCG 0.00125 CGCCT 0.00117 CGCGA 0.000971 CGCGC 0.000972 CGCGG 0.000857 CGCGT 0.000753 CGCTA 0.000489 CGCTC 0.000975 CGCTG 0.00126 CGCTT 0.00086 CGGAA 0.000832 CGGAC 0.000766 CGGAG 0.000891 CGGAT 0.000782 CGGCA 0.00127 CGGCC 0.0012 CGGCG 0.00125 CGGCT 0.001 CGGGA 0.000837 CGGGC 0.000989 CGGGG 0.000929 CGGGT 0.000715 CGGTA 0.000528 CGGTC 0.000847 CGGTG 0.000896 CGGTT 0.000641 CGTAA 0.000418 CGTAC 0.000594 CGTAG 0.000551 CGTAT 0.00052 CGTCA 0.00132 CGTCC 0.00103 CGTCG 0.00137 CGTCT 0.00114 CGTGA 0.00101 CGTGC 0.000961 CGTGG 0.00107 CGTGT 0.000854 CGTTA 0.000364 CGTTC 0.000906 CGTTG 0.00112 CGTTT 0.000805 CTAAA 0.000391 CTAAC 0.000376 CTAAG 0.000425 CTAAT 0.00036 CTACA 0.000684 CTACC 0.000854 CTACG 0.000551 CTACT 0.000585 CTAGA 0.000556 CTAGC 0.00058 CTAGG 0.000593 CTAGT 0.000399 CTATA 0.000353 CTATC 0.000686 CTATG 0.000571 CTATT 0.000558 CTCAA 0.00121 CTCAC 0.00103 CTCAG 0.00101 CTCAT 0.00106 CTCCA 0.00131 CTCCC 0.00115 CTCCG 0.000891 CTCCT 0.00124 CTCGA 0.00143 CTCGC 0.00128 CTCGG 0.00109 CTCGT 0.00121 CTCTA 0.000587 CTCTC 0.00144 CTCTG 0.00124 CTCTT 0.00122 CTGAA 0.00107 CTGAC 0.00116 CTGAG 0.00101 CTGAT 0.00107 CTGCA 0.00143 CTGCC 0.00165 CTGCG 0.00108 CTGCT 0.00142 CTGGA 0.00125 CTGGC 0.00158 CTGGG 0.0012 CTGGT 0.0012 CTGTA 0.000676 CTGTC 0.00141 CTGTG 0.00114 CTGTT 0.00102 CTTAA 0.000354 CTTAC 0.000555 CTTAG 0.000425 CTTAT 0.000514 CTTCA 0.00139 CTTCC 0.00134 CTTCG 0.00119 CTTCT 0.00143 CTTGA 0.00143 CTTGC 0.0015 CTTGG 0.0015 CTTGT 0.00127 CTTTA 0.000482 CTTTC 0.00134 CTTTG 0.00131 CTTTT 0.00117 GAAAA 0.00118 GAAAC 0.00101 GAAAG 0.00134 GAAAT 0.001 GAACA 0.00113 GAACC 0.000976 GAACG 0.000906 GAACT 0.000706 GAAGA 0.00163 GAAGC 0.00144 GAAGG 0.00141 GAAGT 0.000876 GAATA 0.000716 GAATC 0.000937 GAATG 0.00117 GAATT 0.000732 GACAA 0.00127 GACAC 0.00103 GACAG 0.00141 GACAT 0.00116 GACCA 0.00123 GACCC 0.000971 GACCG 0.000847 GACCT 0.00101 GACGA 0.00156 GACGC 0.00113 GACGG 0.00122 GACGT 0.000948 GACTA 0.000488 GACTC 0.000916 GACTG 0.00117 GACTT 0.00101 GAGAA 0.00132 GAGAC 0.00118 GAGAG 0.00144 GAGAT 0.00113 GAGCA 0.00127 GAGCC 0.00116 GAGCG 0.000975 GAGCT 0.00123 GAGGA 0.00144 GAGGC 0.00153 GAGGG 0.00141 GAGGT 0.00118 GAGTA 0.000561 GAGTC 0.000916 GAGTG 0.000925 GAGTT 0.000762 GATAA 0.000585 GATAC 0.000766 GATAG 0.000686 GATAT 0.000851 GATCA 0.00112 GATCC 0.00094 GATCG 0.000991 GATCT 0.000989 GATGA 0.00158 GATGC 0.00144 GATGG 0.00156 GATGT 0.00116 GATTA 0.000436 GATTC 0.000937 GATTG 0.00109 GATTT 0.000858 GCAAA 0.00119 GCAAC 0.00121 GCAAG 0.0015 GCAAT 0.00099 GCACA 0.00111 GCACC 0.00111 GCACG 0.000961 GCACT 0.000866 GCAGA 0.00135 GCAGC 0.00175 GCAGG 0.00146 GCAGT 0.00102 GCATA 0.000629 GCATC 0.00144 GCATG 0.00141 GCATT 0.00102 GCCAA 0.00144 GCCAC 0.00126 GCCAG 0.00158 GCCAT 0.00139 GCCCA 0.00121 GCCCC 0.00115 GCCCG 0.000989 GCCCT 0.0011 GCCGA 0.00122 GCCGC 0.00134 GCCGG 0.00104 GCCGT 0.00113 GCCTA 0.000594 GCCTC 0.00153 GCCTG 0.00149 GCCTT 0.00128 GCGAA 0.00101 GCGAC 0.00121 GCGAG 0.00128 GCGAT 0.00101 GCGCA 0.00103 GCGCC 0.0012 GCGCG 0.000972 GCGCT 0.000917 GCGGA 0.000866 GCGGC 0.00134 GCGGG 0.00106 GCGGT 0.000777 GCGTA 0.000492 GCGTC 0.00113 GCGTG 0.000964 GCGTT 0.000829 GCTAA 0.00042 GCTAC 0.000725 GCTAG 0.00058 GCTAT 0.000595 GCTCA 0.00113 GCTCC 0.00108 GCTCG 0.0013 GCTCT 0.00112 GCTGA 0.00129 GCTGC 0.00175 GCTGG 0.00162 GCTGT 0.00136 GCTTA 0.000478 GCTTC 0.00144 GCTTG 0.00157 GCTTT 0.0011 GGAAA 0.00115 GGAAC 0.000858 GGAAG 0.00134 GGAAT 0.000815 GGACA 0.000983 GGACC 0.000879 GGACG 0.00103 GGACT 0.00076 GGAGA 0.00126 GGAGC 0.00108 GGAGG 0.00151 GGAGT 0.000741 GGATA 0.000641 GGATC 0.00094 GGATG 0.00131 GGATT 0.000766 GGCAA 0.00131 GGCAC 0.00112 GGCAG 0.00165 GGCAT 0.00122 GGCCA 0.00141 GGCCC 0.00106 GGCCG 0.0012 GGCCT 0.00117 GGCGA 0.00136 GGCGC 0.0012 GGCGG 0.00136 GGCGT 0.00111 GGCTA 0.000588 GGCTC 0.00116 GGCTG 0.00162 GGCTT 0.00122 GGGAA 0.00106 GGGAC 0.000878 GGGAG 0.00115 GGGAT 0.000883 GGGCA 0.00115 GGGCC 0.00106 GGGCG 0.0012 GGGCT 0.00104 GGGGA 0.00103 GGGGC 0.00115 GGGGG 0.00137 GGGGT 0.00108 GGGTA 0.000672 GGGTC 0.000971 GGGTG 0.00113 GGGTT 0.000969 GGTAA 0.000539 GGTAC 0.000811 GGTAG 0.000854 GGTAT 0.000757 GGTCA 0.00108 GGTCC 0.000879 GGTCG 0.00116 GGTCT 0.000933 GGTGA 0.00116 GGTGC 0.00111 GGTGG 0.0014 GGTGT 0.00104 GGTTA 0.0004 GGTTC 0.000976 GGTTG 0.00126 GGTTT 0.000866 GTAAA 0.000535 GTAAC 0.000404 GTAAG 0.000555 GTAAT 0.000464 GTACA 0.000774 GTACC 0.000811 GTACG 0.000594 GTACT 0.000615 GTAGA 0.00068 GTAGC 0.000725 GTAGG 0.000713 GTAGT 0.000559 GTATA 0.000428 GTATC 0.000766 GTATG 0.000734 GTATT 0.000619 GTCAA 0.00126 GTCAC 0.00107 GTCAG 0.00116 GTCAT 0.00119 GTCCA 0.00107 GTCCC 0.000878 GTCCG 0.000766 GTCCT 0.00094 GTCGA 0.00139 GTCGC 0.00121 GTCGG 0.00109 GTCGT 0.00124 GTCTA 0.000558 GTCTC 0.00118 GTCTG 0.00121 GTCTT 0.00119 GTGAA 0.000993 GTGAC 0.00107 GTGAG 0.00103 GTGAT 0.00111 GTGCA 0.00102 GTGCC 0.00112 GTGCG 0.000845 GTGCT 0.00107 GTGGA 0.00104 GTGGC 0.00126 GTGGG 0.00107 GTGGT 0.00118 GTGTA 0.000595 GTGTC 0.00103 GTGTG 0.00111 GTGTT 0.000975 GTTAA 0.00028 GTTAC 0.000404 GTTAG 0.000376 GTTAT 0.000457 GTTCA 0.000982 GTTCC 0.000858 GTTCG 0.000963 GTTCT 0.000914 GTTGA 0.00127 GTTGC 0.00121 GTTGG 0.00123 GTTGT 0.00108 GTTTA 0.000394 GTTTC 0.00101 GTTTG 0.0011 GTTTT 0.000862 TAAAA 0.000459 TAAAC 0.000394 TAAAG 0.000482 TAAAT 0.000415 TAACA 0.000458 TAACC 0.0004 TAACG 0.000364 TAACT 0.000294 TAAGA 0.000474 TAAGC 0.000478 TAAGG 0.000553 TAAGT 0.000346 TAATA 0.000341 TAATC 0.000436 TAATG 0.000493 TAATT 0.000389 TACAA 0.000685 TACAC 0.000595 TACAG 0.000676 TACAT 0.000759 TACCA 0.00081 TACCC 0.000672 TACCG 0.000528 TACCT 0.000945 TACGA 0.000642 TACGC 0.000492 TACGG 0.000455 TACGT 0.000496 TACTA 0.000366 TACTC 0.000561 TACTG 0.000656 TACTT 0.000633 TAGAA 0.000549 TAGAC 0.000558 TAGAG 0.000587 TAGAT 0.000538 TAGCA 0.000621 TAGCC 0.000588 TAGCG 0.000489 TAGCT 0.000623 TAGGA 0.000491 TAGGC 0.000594 TAGGG 0.000451 TAGGT 0.000658 TAGTA 0.000366 TAGTC 0.000488 TAGTG 0.000538 TAGTT 0.000392 TATAA 0.000345 TATAC 0.000428 TATAG 0.000353 TATAT 0.000515 TATCA 0.000829 TATCC 0.000641 TATCG 0.000694 TATCT 0.000724 TATGA 0.000663 TATGC 0.000629 TATGG 0.000615 TATGT 0.000599 TATTA 0.000341 TATTC 0.000716 TATTG 0.000693 TATTT 0.000621 TCAAA 0.0011 TCAAC 0.00127 TCAAG 0.00143 TCAAT 0.00107 TCACA 0.00108 TCACC 0.00116 TCACG 0.00101 TCACT 0.000932 TCAGA 0.00103 TCAGC 0.00129 TCAGG 0.00111 TCAGT 0.000866 TCATA 0.000663 TCATC 0.00158 TCATG 0.00141 TCATT 0.00109 TCCAA 0.0011 TCCAC 0.00104 TCCAG 0.00125 TCCAT 0.00119 TCCCA 0.0011 TCCCC 0.00103 TCCCG 0.000837 TCCCT 0.000992 TCCGA 0.000907 TCCGC 0.000866 TCCGG 0.000722 TCCGT 0.000776 TCCTA 0.000491 TCCTC 0.00144 TCCTG 0.00116 TCCTT 0.00114 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.00139 TCGAG 0.00143 TCGAT 0.0011 TCGCA 0.0011 TCGCC 0.00136 TCGCG 0.000971 TCGCT 0.00107 TCGGA 0.000907 TCGGC 0.00122 TCGGG 0.000907 TCGGT 0.000863 TCGTA 0.000642 TCGTC 0.00156 TCGTG 0.00122 TCGTT 0.000987 TCTAA 0.00039 TCTAC 0.00068 TCTAG 0.000556 TCTAT 0.000607 TCTCA 0.00113 TCTCC 0.00126 TCTCG 0.00133 TCTCT 0.00134 TCTGA 0.00103 TCTGC 0.00135 TCTGG 0.00128 TCTGT 0.00105 TCTTA 0.000474 TCTTC 0.00163 TCTTG 0.00149 TCTTT 0.00126 TGAAA 0.00103 TGAAC 0.000982 TGAAG 0.00139 TGAAT 0.00102 TGACA 0.00129 TGACC 0.00108 TGACG 0.00132 TGACT 0.000976 TGAGA 0.00113 TGAGC 0.00113 TGAGG 0.00128 TGAGT 0.000778 TGATA 0.000829 TGATC 0.00112 TGATG 0.00173 TGATT 0.00102 TGCAA 0.00122 TGCAC 0.00102 TGCAG 0.00143 TGCAT 0.00126 TGCCA 0.00147 TGCCC 0.00115 TGCCG 0.00127 TGCCT 0.00141 TGCGA 0.0011 TGCGC 0.00103 TGCGG 0.000952 TGCGT 0.000829 TGCTA 0.000621 TGCTC 0.00127 TGCTG 0.00173 TGCTT 0.00127 TGGAA 0.00113 TGGAC 0.00107 TGGAG 0.00131 TGGAT 0.00108 TGGCA 0.00147 TGGCC 0.00141 TGGCG 0.00139 TGGCT 0.00139 TGGGA 0.0011 TGGGC 0.00121 TGGGG 0.00111 TGGGT 0.00106 TGGTA 0.00081 TGGTC 0.00123 TGGTG 0.00152 TGGTT 0.00103 TGTAA 0.000528 TGTAC 0.000774 TGTAG 0.000684 TGTAT 0.000731 TGTCA 0.00129 TGTCC 0.000983 TGTCG 0.00139 TGTCT 0.00121 TGTGA 0.00108 TGTGC 0.00111 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.0011 TGTTA 0.000458 TGTTC 0.00113 TGTTG 0.00144 TGTTT 0.00105 TTAAA 0.000322 TTAAC 0.00028 TTAAG 0.000354 TTAAT 0.000336 TTACA 0.000528 TTACC 0.000539 TTACG 0.000418 TTACT 0.000478 TTAGA 0.00039 TTAGC 0.00042 TTAGG 0.00041 TTAGT 0.000336 TTATA 0.000345 TTATC 0.000585 TTATG 0.000497 TTATT 0.00054 TTCAA 0.00115 TTCAC 0.000993 TTCAG 0.00107 TTCAT 0.00121 TTCCA 0.00113 TTCCC 0.00106 TTCCG 0.000832 TTCCT 0.00114 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.00101 TTCGG 0.000933 TTCGT 0.00104 TTCTA 0.000549 TTCTC 0.00132 TTCTG 0.00119 TTCTT 0.00141 TTGAA 0.00115 TTGAC 0.00126 TTGAG 0.00121 TTGAT 0.00124 TTGCA 0.00122 TTGCC 0.00131 TTGCG 0.00108 TTGCT 0.00128 TTGGA 0.0011 TTGGC 0.00144 TTGGG 0.00118 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.000685 TTGTC 0.00127 TTGTG 0.0011 TTGTT 0.00117 TTTAA 0.000322 TTTAC 0.000535 TTTAG 0.000391 TTTAT 0.000499 TTTCA 0.00103 TTTCC 0.00115 TTTCG 0.00109 TTTCT 0.00126 TTTGA 0.0011 TTTGC 0.00119 TTTGG 0.00121 TTTGT 0.00102 TTTTA 0.000459 TTTTC 0.00118 TTTTG 0.00118 TTTTT 0.00119 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.2977 AAAAC 0.2147 AAAAG 0.2924 AAAAT 0.1952 AAACA 0.3113 AAACC 0.2569 AAACG 0.2388 AAACT 0.1931 AAAGA 0.2934 AAAGC 0.2556 AAAGG 0.2514 AAAGT 0.1996 AAATA 0.1981 AAATC 0.2737 AAATG 0.3286 AAATT 0.1996 AACAA 0.2856 AACAC 0.2389 AACAG 0.2506 AACAT 0.2249 AACCA 0.2939 AACCC 0.2767 AACCG 0.1828 AACCT 0.2466 AACGA 0.3081 AACGC 0.2589 AACGG 0.228 AACGT 0.205 AACTA 0.1509 AACTC 0.2936 AACTG 0.2902 AACTT 0.2652 AAGAA 0.29 AAGAC 0.2453 AAGAG 0.2503 AAGAT 0.2144 AAGCA 0.2765 AAGCC 0.2659 AAGCG 0.1875 AAGCT 0.2701 AAGGA 0.2491 AAGGC 0.2814 AAGGG 0.2421 AAGGT 0.2274 AAGTA 0.1962 AAGTC 0.3126 AAGTG 0.2778 AAGTT 0.2134 AATAA 0.2275 AATAC 0.2609 AATAG 0.2349 AATAT 0.2767 AATCA 0.3072 AATCC 0.2307 AATCG 0.2401 AATCT 0.222 AATGA 0.2769 AATGC 0.2589 AATGG 0.2541 AATGT 0.2101 AATTA 0.1519 AATTC 0.2857 AATTG 0.3181 AATTT 0.2443 ACAAA 0.2421 ACAAC 0.2558 ACAAG 0.3009 ACAAT 0.2011 ACACA 0.2966 ACACC 0.2804 ACACG 0.2302 ACACT 0.1927 ACAGA 0.2468 ACAGC 0.3192 ACAGG 0.2478 ACAGT 0.1861 ACATA 0.1534 ACATC 0.297 ACATG 0.3371 ACATT 0.2125 ACCAA 0.2536 ACCAC 0.2572 ACCAG 0.2606 ACCAT 0.2286 ACCCA 0.2836 ACCCC 0.2905 ACCCG 0.1915 ACCCT 0.2344 ACCGA 0.2966 ACCGC 0.2671 ACCGG 0.2168 ACCGT 0.2195 ACCTA 0.1652 ACCTC 0.2976 ACCTG 0.2767 ACCTT 0.2605 ACGAA 0.2362 ACGAC 0.2799 ACGAG 0.2728 ACGAT 0.2111 ACGCA 0.243 ACGCC 0.3241 ACGCG 0.2206 ACGCT 0.2123 ACGGA 0.2348 ACGGC 0.3423 ACGGG 0.2295 ACGGT 0.1934 ACGTA 0.1702 ACGTC 0.3256 ACGTG 0.2787 ACGTT 0.2254 ACTAA 0.1882 ACTAC 0.3136 ACTAG 0.2239 ACTAT 0.2742 ACTCA 0.2461 ACTCC 0.2343 ACTCG 0.2832 ACTCT 0.2364 ACTGA 0.2365 ACTGC 0.2774 ACTGG 0.2698 ACTGT 0.2163 ACTTA 0.1071 ACTTC 0.2715 ACTTG 0.3548 ACTTT 0.2665 AGAAA 0.2828 AGAAC 0.2044 AGAAG 0.3207 AGAAT 0.1921 AGACA 0.2923 AGACC 0.2258 AGACG 0.2759 AGACT 0.206 AGAGA 0.2986 AGAGC 0.2492 AGAGG 0.2857 AGAGT 0.1664 AGATA 0.191 AGATC 0.2608 AGATG 0.3539 AGATT 0.1943 AGCAA 0.2614 AGCAC 0.2179 AGCAG 0.2906 AGCAT 0.2301 AGCCA 0.3037 AGCCC 0.2274 AGCCG 0.2184 AGCCT 0.2506 AGCGA 0.2992 AGCGC 0.256 AGCGG 0.2426 AGCGT 0.2022 AGCTA 0.1388 AGCTC 0.273 AGCTG 0.312 AGCTT 0.2762 AGGAA 0.2702 AGGAC 0.2223 AGGAG 0.2923 AGGAT 0.2152 AGGCA 0.2879 AGGCC 0.2385 AGGCG 0.2392 AGGCT 0.2344 AGGGA 0.237 AGGGC 0.2628 AGGGG 0.2912 AGGGT 0.2091 AGGTA 0.2376 AGGTC 0.2526 AGGTG 0.2925 AGGTT 0.2172 AGTAA 0.2158 AGTAC 0.2778 AGTAG 0.2643 AGTAT 0.2421 AGTCA 0.2724 AGTCC 0.2121 AGTCG 0.2779 AGTCT 0.2375 AGTGA 0.2705 AGTGC 0.2513 AGTGG 0.2706 AGTGT 0.2076 AGTTA 0.113 AGTTC 0.2719 AGTTG 0.3646 AGTTT 0.2505 ATAAA 0.2538 ATAAC 0.2321 ATAAG 0.2611 ATAAT 0.253 ATACA 0.2873 ATACC 0.2977 ATACG 0.2044 ATACT 0.2106 ATAGA 0.2802 ATAGC 0.2746 ATAGG 0.2197 ATAGT 0.2255 ATATA 0.1888 ATATC 0.3121 ATATG 0.2582 ATATT 0.2409 ATCAA 0.2637 ATCAC 0.2353 ATCAG 0.2266 ATCAT 0.2744 ATCCA 0.295 ATCCC 0.2417 ATCCG 0.2141 ATCCT 0.2492 ATCGA 0.288 ATCGC 0.2634 ATCGG 0.2048 ATCGT 0.2438 ATCTA 0.1418 ATCTC 0.2989 ATCTG 0.2847 ATCTT 0.2746 ATGAA 0.2538 ATGAC 0.2515 ATGAG 0.2229 ATGAT 0.2718 ATGCA 0.2793 ATGCC 0.2716 ATGCG 0.1991 ATGCT 0.25 ATGGA 0.2546 ATGGC 0.2976 ATGGG 0.2228 ATGGT 0.2251 ATGTA 0.1942 ATGTC 0.2965 ATGTG 0.2743 ATGTT 0.235 ATTAA 0.2026 ATTAC 0.28 ATTAG 0.2173 ATTAT 0.3002 ATTCA 0.2877 ATTCC 0.2294 ATTCG 0.2409 ATTCT 0.2419 ATTGA 0.2769 ATTGC 0.257 ATTGG 0.2457 ATTGT 0.2204 ATTTA 0.1324 ATTTC 0.32 ATTTG 0.2976 ATTTT 0.25 CAAAA 0.2608 CAAAC 0.2442 CAAAG 0.2889 CAAAT 0.2061 CAACA 0.3017 CAACC 0.2648 CAACG 0.2352 CAACT 0.1983 CAAGA 0.2607 CAAGC 0.2748 CAAGG 0.2638 CAAGT 0.2007 CAATA 0.1799 CAATC 0.2829 CAATG 0.3257 CAATT 0.2116 CACAA 0.2493 CACAC 0.2508 CACAG 0.2577 CACAT 0.2423 CACCA 0.3237 CACCC 0.239 CACCG 0.1902 CACCT 0.2471 CACGA 0.3144 CACGC 0.2474 CACGG 0.2298 CACGT 0.2084 CACTA 0.1562 CACTC 0.2685 CACTG 0.315 CACTT 0.2603 CAGAA 0.2521 CAGAC 0.2561 CAGAG 0.2629 CAGAT 0.2289 CAGCA 0.2883 CAGCC 0.2695 CAGCG 0.2092 CAGCT 0.233 CAGGA 0.2334 CAGGC 0.3004 CAGGG 0.2444 CAGGT 0.2218 CAGTA 0.1791 CAGTC 0.3186 CAGTG 0.2964 CAGTT 0.2059 CATAA 0.1984 CATAC 0.2928 CATAG 0.2277 CATAT 0.281 CATCA 0.3027 CATCC 0.2286 CATCG 0.2346 CATCT 0.2341 CATGA 0.2512 CATGC 0.2512 CATGG 0.264 CATGT 0.2336 CATTA 0.1251 CATTC 0.2956 CATTG 0.318 CATTT 0.2613 CCAAA 0.2486 CCAAC 0.251 CCAAG 0.3068 CCAAT 0.1937 CCACA 0.2504 CCACC 0.3089 CCACG 0.2356 CCACT 0.2052 CCAGA 0.2451 CCAGC 0.3104 CCAGG 0.2554 CCAGT 0.1891 CCATA 0.1318 CCATC 0.3342 CCATG 0.3188 CCATT 0.2152 CCCAA 0.2636 CCCAC 0.2377 CCCAG 0.2672 CCCAT 0.2316 CCCCA 0.2403 CCCCC 0.2961 CCCCG 0.2005 CCCCT 0.2631 CCCGA 0.2618 CCCGC 0.3062 CCCGG 0.2133 CCCGT 0.2187 CCCTA 0.1079 CCCTC 0.3376 CCCTG 0.2904 CCCTT 0.2642 CCGAA 0.2393 CCGAC 0.2799 CCGAG 0.2798 CCGAT 0.2011 CCGCA 0.236 CCGCC 0.3364 CCGCG 0.2124 CCGCT 0.2153 CCGGA 0.2305 CCGGC 0.332 CCGGG 0.2361 CCGGT 0.2014 CCGTA 0.1376 CCGTC 0.3699 CCGTG 0.2713 CCGTT 0.2212 CCTAA 0.1868 CCTAC 0.3254 CCTAG 0.2706 CCTAT 0.2173 CCTCA 0.2304 CCTCC 0.272 CCTCG 0.2667 CCTCT 0.2308 CCTGA 0.2243 CCTGC 0.2946 CCTGG 0.2687 CCTGT 0.2123 CCTTA 0.1214 CCTTC 0.3106 CCTTG 0.3302 CCTTT 0.2378 CGAAA 0.2651 CGAAC 0.2351 CGAAG 0.291 CGAAT 0.2088 CGACA 0.2835 CGACC 0.2356 CGACG 0.2784 CGACT 0.2026 CGAGA 0.2664 CGAGC 0.2594 CGAGG 0.2957 CGAGT 0.1786 CGATA 0.1813 CGATC 0.259 CGATG 0.3514 CGATT 0.2082 CGCAA 0.2772 CGCAC 0.2162 CGCAG 0.2771 CGCAT 0.2295 CGCCA 0.2779 CGCCC 0.2386 CGCCG 0.2501 CGCCT 0.2334 CGCGA 0.2732 CGCGC 0.2737 CGCGG 0.2412 CGCGT 0.2119 CGCTA 0.1365 CGCTC 0.2723 CGCTG 0.351 CGCTT 0.2402 CGGAA 0.2544 CGGAC 0.2342 CGGAG 0.2724 CGGAT 0.239 CGGCA 0.2679 CGGCC 0.255 CGGCG 0.2655 CGGCT 0.2116 CGGGA 0.2413 CGGGC 0.2851 CGGGG 0.2676 CGGGT 0.206 CGGTA 0.1814 CGGTC 0.2908 CGGTG 0.3077 CGGTT 0.22 CGTAA 0.2006 CGTAC 0.2851 CGTAG 0.2646 CGTAT 0.2497 CGTCA 0.2722 CGTCC 0.2125 CGTCG 0.2811 CGTCT 0.2342 CGTGA 0.2599 CGTGC 0.2465 CGTGG 0.2745 CGTGT 0.2191 CGTTA 0.1138 CGTTC 0.2833 CGTTG 0.3513 CGTTT 0.2516 CTAAA 0.2519 CTAAC 0.2422 CTAAG 0.2739 CTAAT 0.232 CTACA 0.2559 CTACC 0.3193 CTACG 0.2061 CTACT 0.2187 CTAGA 0.2611 CTAGC 0.2727 CTAGG 0.2786 CTAGT 0.1875 CTATA 0.163 CTATC 0.3164 CTATG 0.2632 CTATT 0.2574 CTCAA 0.2814 CTCAC 0.2389 CTCAG 0.2342 CTCAT 0.2455 CTCCA 0.2848 CTCCC 0.2515 CTCCG 0.1943 CTCCT 0.2694 CTCGA 0.2862 CTCGC 0.2557 CTCGG 0.2176 CTCGT 0.2405 CTCTA 0.1309 CTCTC 0.3217 CTCTG 0.2764 CTCTT 0.271 CTGAA 0.2488 CTGAC 0.2688 CTGAG 0.2347 CTGAT 0.2477 CTGCA 0.2555 CTGCC 0.2955 CTGCG 0.1941 CTGCT 0.2549 CTGGA 0.2394 CTGGC 0.302 CTGGG 0.2295 CTGGT 0.2291 CTGTA 0.159 CTGTC 0.3326 CTGTG 0.2679 CTGTT 0.2405 CTTAA 0.1913 CTTAC 0.3005 CTTAG 0.2302 CTTAT 0.278 CTTCA 0.259 CTTCC 0.2507 CTTCG 0.2226 CTTCT 0.2677 CTTGA 0.2508 CTTGC 0.2636 CTTGG 0.2628 CTTGT 0.2227 CTTTA 0.1119 CTTTC 0.3118 CTTTG 0.3037 CTTTT 0.2725 GAAAA 0.2594 GAAAC 0.2236 GAAAG 0.2959 GAAAT 0.2211 GAACA 0.3039 GAACC 0.2625 GAACG 0.2437 GAACT 0.1899 GAAGA 0.3035 GAAGC 0.2694 GAAGG 0.2638 GAAGT 0.1633 GAATA 0.2016 GAATC 0.2639 GAATG 0.3284 GAATT 0.2061 GACAA 0.2605 GACAC 0.212 GACAG 0.29 GACAT 0.2375 GACCA 0.3038 GACCC 0.2394 GACCG 0.2088 GACCT 0.248 GACGA 0.3214 GACGC 0.2328 GACGG 0.251 GACGT 0.1949 GACTA 0.1364 GACTC 0.256 GACTG 0.3258 GACTT 0.2818 GAGAA 0.2604 GAGAC 0.2317 GAGAG 0.2845 GAGAT 0.2234 GAGCA 0.2743 GAGCC 0.2499 GAGCG 0.2109 GAGCT 0.2649 GAGGA 0.2585 GAGGC 0.2746 GAGGG 0.2538 GAGGT 0.2131 GAGTA 0.1772 GAGTC 0.2896 GAGTG 0.2922 GAGTT 0.241 GATAA 0.2026 GATAC 0.2653 GATAG 0.2373 GATAT 0.2947 GATCA 0.2774 GATCC 0.2327 GATCG 0.2453 GATCT 0.2446 GATGA 0.275 GATGC 0.2513 GATGG 0.2716 GATGT 0.2021 GATTA 0.1313 GATTC 0.2822 GATTG 0.3281 GATTT 0.2585 GCAAA 0.2434 GCAAC 0.2467 GCAAG 0.3074 GCAAT 0.2024 GCACA 0.2747 GCACC 0.2736 GCACG 0.2377 GCACT 0.2141 GCAGA 0.2426 GCAGC 0.3134 GCAGG 0.262 GCAGT 0.182 GCATA 0.1395 GCATC 0.3198 GCATG 0.3139 GCATT 0.2268 GCCAA 0.2538 GCCAC 0.222 GCCAG 0.2789 GCCAT 0.2453 GCCCA 0.2725 GCCCC 0.2584 GCCCG 0.2221 GCCCT 0.2469 GCCGA 0.2583 GCCGC 0.2828 GCCGG 0.2198 GCCGT 0.2391 GCCTA 0.1213 GCCTC 0.3119 GCCTG 0.3048 GCCTT 0.2621 GCGAA 0.2238 GCGAC 0.2677 GCGAG 0.2846 GCGAT 0.2239 GCGCA 0.2508 GCGCC 0.291 GCGCG 0.2358 GCGCT 0.2224 GCGGA 0.2143 GCGGC 0.3308 GCGGG 0.2626 GCGGT 0.1922 GCGTA 0.1438 GCGTC 0.3314 GCGTG 0.2821 GCGTT 0.2426 GCTAA 0.181 GCTAC 0.3125 GCTAG 0.25 GCTAT 0.2564 GCTCA 0.2434 GCTCC 0.2332 GCTCG 0.2813 GCTCT 0.2421 GCTGA 0.2141 GCTGC 0.2908 GCTGG 0.2694 GCTGT 0.2257 GCTTA 0.1041 GCTTC 0.3147 GCTTG 0.3414 GCTTT 0.2399 GGAAA 0.2766 GGAAC 0.2058 GGAAG 0.3222 GGAAT 0.1955 GGACA 0.2688 GGACC 0.2405 GGACG 0.2829 GGACT 0.2078 GGAGA 0.2752 GGAGC 0.2346 GGAGG 0.329 GGAGT 0.1612 GGATA 0.1753 GGATC 0.2571 GGATG 0.3583 GGATT 0.2093 GGCAA 0.2472 GGCAC 0.2107 GGCAG 0.3112 GGCAT 0.2309 GGCCA 0.2914 GGCCC 0.2192 GGCCG 0.2485 GGCCT 0.2409 GGCGA 0.2706 GGCGC 0.239 GGCGG 0.2703 GGCGT 0.2201 GGCTA 0.1282 GGCTC 0.2522 GGCTG 0.3534 GGCTT 0.2662 GGGAA 0.2665 GGGAC 0.221 GGGAG 0.2903 GGGAT 0.2221 GGGCA 0.2592 GGGCC 0.2385 GGGCG 0.2686 GGGCT 0.2337 GGGGA 0.2227 GGGGC 0.248 GGGGG 0.2956 GGGGT 0.2337 GGGTA 0.1798 GGGTC 0.2597 GGGTG 0.3011 GGGTT 0.2594 GGTAA 0.1819 GGTAC 0.274 GGTAG 0.2884 GGTAT 0.2558 GGTCA 0.2671 GGTCC 0.217 GGTCG 0.2857 GGTCT 0.2302 GGTGA 0.2468 GGTGC 0.2348 GGTGG 0.2977 GGTGT 0.2207 GGTTA 0.1141 GGTTC 0.2783 GGTTG 0.3606 GGTTT 0.2469 GTAAA 0.2732 GTAAC 0.2062 GTAAG 0.2835 GTAAT 0.237 GTACA 0.2769 GTACC 0.2904 GTACG 0.2126 GTACT 0.2201 GTAGA 0.2541 GTAGC 0.2709 GTAGG 0.2663 GTAGT 0.2087 GTATA 0.1678 GTATC 0.3009 GTATG 0.2881 GTATT 0.2432 GTCAA 0.2689 GTCAC 0.228 GTCAG 0.2475 GTCAT 0.2557 GTCCA 0.2934 GTCCC 0.2402 GTCCG 0.2095 GTCCT 0.257 GTCGA 0.2818 GTCGC 0.245 GTCGG 0.2217 GTCGT 0.2515 GTCTA 0.1351 GTCTC 0.2845 GTCTG 0.2922 GTCTT 0.2882 GTGAA 0.2368 GTGAC 0.2539 GTGAG 0.2456 GTGAT 0.2638 GTGCA 0.2519 GTGCC 0.2758 GTGCG 0.2088 GTGCT 0.2636 GTGGA 0.2292 GTGGC 0.2763 GTGGG 0.2346 GTGGT 0.2599 GTGTA 0.1603 GTGTC 0.2785 GTGTG 0.2987 GTGTT 0.2625 GTTAA 0.1843 GTTAC 0.2664 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.3012 GTTCA 0.2643 GTTCC 0.2307 GTTCG 0.2592 GTTCT 0.2458 GTTGA 0.2651 GTTGC 0.2525 GTTGG 0.2565 GTTGT 0.2259 GTTTA 0.1166 GTTTC 0.3007 GTTTG 0.3274 GTTTT 0.2553 TAAAA 0.2623 TAAAC 0.225 TAAAG 0.2755 TAAAT 0.2372 TAACA 0.3021 TAACC 0.264 TAACG 0.2403 TAACT 0.1936 TAAGA 0.2561 TAAGC 0.2582 TAAGG 0.299 TAAGT 0.1868 TAATA 0.2054 TAATC 0.2627 TAATG 0.2973 TAATT 0.2346 TACAA 0.2521 TACAC 0.2193 TACAG 0.2491 TACAT 0.2795 TACCA 0.274 TACCC 0.2274 TACCG 0.1787 TACCT 0.3199 TACGA 0.3081 TACGC 0.2359 TACGG 0.2181 TACGT 0.2379 TACTA 0.1652 TACTC 0.2531 TACTG 0.296 TACTT 0.2857 TAGAA 0.246 TAGAC 0.25 TAGAG 0.2631 TAGAT 0.2409 TAGCA 0.2676 TAGCC 0.2532 TAGCG 0.2107 TAGCT 0.2685 TAGGA 0.2239 TAGGC 0.2707 TAGGG 0.2056 TAGGT 0.2998 TAGTA 0.2052 TAGTC 0.2737 TAGTG 0.3015 TAGTT 0.2197 TATAA 0.2102 TATAC 0.2605 TATAG 0.2153 TATAT 0.314 TATCA 0.2869 TATCC 0.222 TATCG 0.2402 TATCT 0.2508 TATGA 0.2648 TATGC 0.2509 TATGG 0.2453 TATGT 0.2391 TATTA 0.1438 TATTC 0.302 TATTG 0.2923 TATTT 0.262 TCAAA 0.2258 TCAAC 0.2606 TCAAG 0.2942 TCAAT 0.2194 TCACA 0.2576 TCACC 0.2778 TCACG 0.242 TCACT 0.2226 TCAGA 0.2399 TCAGC 0.2996 TCAGG 0.259 TCAGT 0.2014 TCATA 0.1397 TCATC 0.3322 TCATG 0.2979 TCATT 0.2302 TCCAA 0.2405 TCCAC 0.2274 TCCAG 0.2729 TCCAT 0.2591 TCCCA 0.2785 TCCCC 0.2604 TCCCG 0.211 TCCCT 0.25 TCCGA 0.2772 TCCGC 0.2649 TCCGG 0.2207 TCCGT 0.2372 TCCTA 0.1163 TCCTC 0.3402 TCCTG 0.2745 TCCTT 0.269 TCGAA 0.221 TCGAC 0.2753 TCGAG 0.2849 TCGAT 0.2189 TCGCA 0.2436 TCGCC 0.3022 TCGCG 0.2158 TCGCT 0.2383 TCGGA 0.2326 TCGGC 0.3133 TCGGG 0.2327 TCGGT 0.2214 TCGTA 0.1453 TCGTC 0.354 TCGTG 0.2773 TCGTT 0.2234 TCTAA 0.1746 TCTAC 0.3046 TCTAG 0.2488 TCTAT 0.272 TCTCA 0.2229 TCTCC 0.2494 TCTCG 0.2633 TCTCT 0.2644 TCTGA 0.2187 TCTGC 0.2872 TCTGG 0.2714 TCTGT 0.2227 TCTTA 0.09762 TCTTC 0.3354 TCTTG 0.3064 TCTTT 0.2605 TGAAA 0.2335 TGAAC 0.222 TGAAG 0.3136 TGAAT 0.2309 TGACA 0.2762 TGACC 0.2316 TGACG 0.2834 TGACT 0.2088 TGAGA 0.262 TGAGC 0.2609 TGAGG 0.2968 TGAGT 0.1803 TGATA 0.1761 TGATC 0.2383 TGATG 0.3688 TGATT 0.2167 TGCAA 0.2473 TGCAC 0.2072 TGCAG 0.2898 TGCAT 0.2557 TGCCA 0.2768 TGCCC 0.2181 TGCCG 0.239 TGCCT 0.2661 TGCGA 0.2801 TGCGC 0.2645 TGCGG 0.2435 TGCGT 0.2119 TGCTA 0.1269 TGCTC 0.2593 TGCTG 0.3543 TGCTT 0.2595 TGGAA 0.2465 TGGAC 0.2339 TGGAG 0.2848 TGGAT 0.2348 TGGCA 0.2588 TGGCC 0.2494 TGGCG 0.2462 TGGCT 0.2456 TGGGA 0.2461 TGGGC 0.2703 TGGGG 0.2478 TGGGT 0.2358 TGGTA 0.1762 TGGTC 0.268 TGGTG 0.3317 TGGTT 0.2241 TGTAA 0.1943 TGTAC 0.2848 TGTAG 0.2519 TGTAT 0.2691 TGTCA 0.2649 TGTCC 0.2016 TGTCG 0.2858 TGTCT 0.2477 TGTGA 0.2436 TGTGC 0.2509 TGTGG 0.2569 TGTGT 0.2486 TGTTA 0.1123 TGTTC 0.2771 TGTTG 0.3534 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2493 TTAAC 0.2165 TTAAG 0.2738 TTAAT 0.2603 TTACA 0.269 TTACC 0.2745 TTACG 0.213 TTACT 0.2435 TTAGA 0.2508 TTAGC 0.2703 TTAGG 0.2633 TTAGT 0.2157 TTATA 0.1752 TTATC 0.2975 TTATG 0.2527 TTATT 0.2745 TTCAA 0.2608 TTCAC 0.2246 TTCAG 0.242 TTCAT 0.2726 TTCCA 0.2715 TTCCC 0.2543 TTCCG 0.1999 TTCCT 0.2743 TTCGA 0.2716 TTCGC 0.2459 TTCGG 0.2277 TTCGT 0.2548 TTCTA 0.1229 TTCTC 0.2958 TTCTG 0.2661 TTCTT 0.3152 TTGAA 0.2372 TTGAC 0.2584 TTGAG 0.2495 TTGAT 0.255 TTGCA 0.2489 TTGCC 0.2679 TTGCG 0.2216 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2256 TTGGC 0.2939 TTGGG 0.2421 TTGGT 0.2384 TTGTA 0.1621 TTGTC 0.3009 TTGTG 0.261 TTGTT 0.276 TTTAA 0.1841 TTTAC 0.3063 TTTAG 0.2239 TTTAT 0.2857 TTTCA 0.2277 TTTCC 0.2541 TTTCG 0.2395 TTTCT 0.2787 TTTGA 0.2426 TTTGC 0.2631 TTTGG 0.2684 TTTGT 0.2259 TTTTA 0.1144 TTTTC 0.2935 TTTTG 0.2943 TTTTT 0.2978 [2] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.231 C 0.27 G 0.269 T 0.231 # l= 1 # Values AA 0.0563 AC 0.0572 AG 0.0633 AT 0.0538 CA 0.0725 CC 0.0696 CG 0.0639 CT 0.0634 GA 0.0689 GC 0.0738 GG 0.0695 GT 0.0571 TA 0.0328 TC 0.069 TG 0.0724 TT 0.0563 # l= 2 # Values AAA 0.0145 AAC 0.0132 AAG 0.017 AAT 0.0116 ACA 0.016 ACC 0.0154 ACG 0.0143 ACT 0.0115 AGA 0.0167 AGC 0.0176 AGG 0.0175 AGT 0.0115 ATA 0.00874 ATC 0.0157 ATG 0.0176 ATT 0.0116 CAA 0.0186 CAC 0.0167 CAG 0.0196 CAT 0.0177 CCA 0.0196 CCC 0.0175 CCG 0.0149 CCT 0.0175 CGA 0.0182 CGC 0.0167 CGG 0.0148 CGT 0.0143 CTA 0.00816 CTC 0.0187 CTG 0.0196 CTT 0.017 GAA 0.0169 GAC 0.0177 GAG 0.0187 GAT 0.0157 GCA 0.0192 GCC 0.0203 GCG 0.0166 GCT 0.0176 GGA 0.0163 GGC 0.0203 GGG 0.0175 GGT 0.0154 GTA 0.00966 GTC 0.0177 GTG 0.0167 GTT 0.0132 TAA 0.00626 TAC 0.00967 TAG 0.00815 TAT 0.00874 TCA 0.0178 TCC 0.0163 TCG 0.0182 TCT 0.0167 TGA 0.0177 TGC 0.0192 TGG 0.0196 TGT 0.016 TTA 0.00626 TTC 0.0169 TTG 0.0186 TTT 0.0145 # l= 3 # Values AAAA 0.00398 AAAC 0.00332 AAAG 0.00422 AAAT 0.00298 AACA 0.004 AACC 0.0035 AACG 0.00321 AACT 0.00246 AAGA 0.00476 AAGC 0.00456 AAGG 0.00457 AAGT 0.0031 AATA 0.00218 AATC 0.00322 AATG 0.00384 AATT 0.00242 ACAA 0.00415 ACAC 0.00375 ACAG 0.00427 ACAT 0.0038 ACCA 0.00463 ACCC 0.00383 ACCG 0.00296 ACCT 0.00397 ACGA 0.00448 ACGC 0.0035 ACGG 0.00339 ACGT 0.00291 ACTA 0.00165 ACTC 0.00314 ACTG 0.00361 ACTT 0.0031 AGAA 0.0044 AGAC 0.00415 AGAG 0.00451 AGAT 0.00366 AGCA 0.00492 AGCC 0.00463 AGCG 0.00366 AGCT 0.00442 AGGA 0.00427 AGGC 0.00497 AGGG 0.00431 AGGT 0.00398 AGTA 0.00208 AGTC 0.00355 AGTG 0.0034 AGTT 0.00245 ATAA 0.00182 ATAC 0.00242 ATAG 0.00201 ATAT 0.0025 ATCA 0.00458 ATCC 0.00364 ATCG 0.00384 ATCT 0.00366 ATGA 0.00464 ATGC 0.0045 ATGG 0.0047 ATGT 0.0038 ATTA 0.00151 ATTC 0.00343 ATTG 0.00373 ATTT 0.00298 CAAA 0.0044 CAAC 0.00478 CAAG 0.00568 CAAT 0.00373 CACA 0.00444 CACC 0.00484 CACG 0.00401 CACT 0.00341 CAGA 0.00474 CAGC 0.00613 CAGG 0.00508 CAGT 0.00361 CATA 0.00237 CATC 0.00578 CATG 0.00566 CATT 0.00384 CCAA 0.00489 CCAC 0.00467 CCAG 0.00535 CCAT 0.0047 CCCA 0.00462 CCCC 0.00493 CCCG 0.00365 CCCT 0.00432 CCGA 0.00398 CCGC 0.00423 CCGG 0.00324 CCGT 0.0034 CCTA 0.00214 CCTC 0.00573 CCTG 0.00508 CCTT 0.00457 CGAA 0.00409 CGAC 0.00509 CGAG 0.00516 CGAT 0.00384 CGCA 0.00397 CGCC 0.00527 CGCG 0.00373 CGCT 0.00366 CGGA 0.00332 CGGC 0.00492 CGGG 0.00365 CGGT 0.00296 CGTA 0.00202 CGTC 0.00505 CGTG 0.004 CGTT 0.00321 CTAA 0.00144 CTAC 0.00264 CTAG 0.00206 CTAT 0.00202 CTCA 0.00426 CTCC 0.00474 CTCG 0.00516 CTCT 0.00451 CTGA 0.00424 CTGC 0.0057 CTGG 0.00535 CTGT 0.00427 CTTA 0.00172 CTTC 0.00535 CTTG 0.00568 CTTT 0.00422 GAAA 0.0045 GAAC 0.00367 GAAG 0.00534 GAAT 0.00343 GACA 0.00491 GACC 0.00414 GACG 0.00505 GACT 0.00355 GAGA 0.00511 GAGC 0.0047 GAGG 0.00573 GAGT 0.00314 GATA 0.00273 GATC 0.00401 GATG 0.00577 GATT 0.00321 GCAA 0.00485 GCAC 0.00414 GCAG 0.00569 GCAT 0.0045 GCCA 0.00578 GCCC 0.00466 GCCG 0.00492 GCCT 0.00497 GCGA 0.00461 GCGC 0.00432 GCGG 0.00423 GCGT 0.00349 GCTA 0.00225 GCTC 0.0047 GCTG 0.00613 GCTT 0.00456 GGAA 0.00417 GGAC 0.00376 GGAG 0.00474 GGAT 0.00364 GGCA 0.00539 GGCC 0.00504 GGCG 0.00527 GGCT 0.00463 GGGA 0.00411 GGGC 0.00466 GGGG 0.00492 GGGT 0.00382 GGTA 0.00293 GGTC 0.00414 GGTG 0.00483 GGTT 0.0035 GTAA 0.00184 GTAC 0.00277 GTAG 0.00264 GTAT 0.00241 GTCA 0.00465 GTCC 0.00376 GTCG 0.00509 GTCT 0.00415 GTGA 0.00415 GTGC 0.00413 GTGG 0.00466 GTGT 0.00375 GTTA 0.00141 GTTC 0.00367 GTTG 0.00478 GTTT 0.00332 TAAA 0.00162 TAAC 0.00141 TAAG 0.00172 TAAT 0.00151 TACA 0.00262 TACC 0.00293 TACG 0.00202 TACT 0.00208 TAGA 0.00211 TAGC 0.00226 TAGG 0.00214 TAGT 0.00165 TATA 0.00147 TATC 0.00273 TATG 0.00236 TATT 0.00218 TCAA 0.00471 TCAC 0.00416 TCAG 0.00425 TCAT 0.00465 TCCA 0.00459 TCCC 0.00412 TCCG 0.00332 TCCT 0.00427 TCGA 0.00511 TCGC 0.00461 TCGG 0.00398 TCGT 0.00448 TCTA 0.00211 TCTC 0.00512 TCTG 0.00474 TCTT 0.00476 TGAA 0.00427 TGAC 0.00465 TGAG 0.00426 TGAT 0.00458 TGCA 0.00488 TGCC 0.0054 TGCG 0.00397 TGCT 0.00493 TGGA 0.00458 TGGC 0.00578 TGGG 0.00462 TGGT 0.00463 TGTA 0.00262 TGTC 0.00491 TGTG 0.00443 TGTT 0.00401 TTAA 0.00116 TTAC 0.00184 TTAG 0.00143 TTAT 0.00182 TTCA 0.00427 TTCC 0.00417 TTCG 0.00409 TTCT 0.00441 TTGA 0.00471 TTGC 0.00485 TTGG 0.00489 TTGT 0.00414 TTTA 0.00162 TTTC 0.0045 TTTG 0.0044 TTTT 0.00398 # l= 4 # Values AAAAA 0.00121 AAAAC 0.000842 AAAAG 0.00118 AAAAT 0.000748 AAACA 0.00103 AAACC 0.000871 AAACG 0.000807 AAACT 0.000615 AAAGA 0.00123 AAAGC 0.00108 AAAGG 0.00109 AAAGT 0.000816 AAATA 0.000576 AAATC 0.000827 AAATG 0.000994 AAATT 0.000581 AACAA 0.00113 AACAC 0.000975 AACAG 0.00103 AACAT 0.000877 AACCA 0.00102 AACCC 0.000981 AACCG 0.000645 AACCT 0.000849 AACGA 0.000974 AACGC 0.000844 AACGG 0.000747 AACGT 0.000644 AACTA 0.000353 AACTC 0.000739 AACTG 0.000725 AACTT 0.000637 AAGAA 0.00139 AAGAC 0.00117 AAGAG 0.00122 AAGAT 0.000989 AAGCA 0.00127 AAGCC 0.00122 AAGCG 0.00087 AAGCT 0.00121 AAGGA 0.00114 AAGGC 0.00128 AAGGG 0.00113 AAGGT 0.00102 AAGTA 0.000596 AAGTC 0.000981 AAGTG 0.000886 AAGTT 0.000637 AATAA 0.000495 AATAC 0.000578 AATAG 0.000518 AATAT 0.000589 AATCA 0.00098 AATCC 0.000745 AATCG 0.00078 AATCT 0.00071 AATGA 0.00106 AATGC 0.000996 AATGG 0.000991 AATGT 0.000789 AATTA 0.000351 AATTC 0.000705 AATTG 0.000778 AATTT 0.000581 ACAAA 0.000988 ACAAC 0.00108 ACAAG 0.00126 ACAAT 0.000818 ACACA 0.00111 ACACC 0.00105 ACACG 0.000887 ACACT 0.000705 ACAGA 0.00106 ACAGC 0.00137 ACAGG 0.00108 ACAGT 0.000769 ACATA 0.000557 ACATC 0.00112 ACATG 0.00133 ACATT 0.000789 ACCAA 0.00117 ACCAC 0.00121 ACCAG 0.00121 ACCAT 0.00105 ACCCA 0.00107 ACCCC 0.00112 ACCCG 0.000744 ACCCT 0.000889 ACCGA 0.000868 ACCGC 0.000814 ACCGG 0.000635 ACCGT 0.000645 ACCTA 0.000648 ACCTC 0.0012 ACCTG 0.00111 ACCTT 0.00102 ACGAA 0.00104 ACGAC 0.00128 ACGAG 0.00123 ACGAT 0.000932 ACGCA 0.000838 ACGCC 0.00114 ACGCG 0.000781 ACGCT 0.000735 ACGGA 0.000794 ACGGC 0.00116 ACGGG 0.000795 ACGGT 0.000645 ACGTA 0.000477 ACGTC 0.000971 ACGTG 0.000823 ACGTT 0.000644 ACTAA 0.000305 ACTAC 0.000537 ACTAG 0.00037 ACTAT 0.000435 ACTCA 0.000758 ACTCC 0.000741 ACTCG 0.000915 ACTCT 0.000723 ACTGA 0.000831 ACTGC 0.00101 ACTGG 0.000994 ACTGT 0.000769 ACTTA 0.000314 ACTTC 0.00085 ACTTG 0.00112 ACTTT 0.000816 AGAAA 0.00126 AGAAC 0.000893 AGAAG 0.00143 AGAAT 0.000833 AGACA 0.00121 AGACC 0.00094 AGACG 0.00117 AGACT 0.000832 AGAGA 0.00136 AGAGC 0.00111 AGAGG 0.00132 AGAGT 0.000723 AGATA 0.000664 AGATC 0.000952 AGATG 0.00133 AGATT 0.00071 AGCAA 0.00127 AGCAC 0.00109 AGCAG 0.00145 AGCAT 0.00111 AGCCA 0.00141 AGCCC 0.00106 AGCCG 0.00102 AGCCT 0.00115 AGCGA 0.00108 AGCGC 0.000951 AGCGG 0.000901 AGCGT 0.000735 AGCTA 0.000592 AGCTC 0.00122 AGCTG 0.0014 AGCTT 0.00121 AGGAA 0.00114 AGGAC 0.000957 AGGAG 0.00128 AGGAT 0.000893 AGGCA 0.00141 AGGCC 0.0012 AGGCG 0.00121 AGGCT 0.00115 AGGGA 0.00102 AGGGC 0.00113 AGGGG 0.00127 AGGGT 0.000889 AGGTA 0.000944 AGGTC 0.00101 AGGTG 0.00117 AGGTT 0.000849 AGTAA 0.000441 AGTAC 0.000591 AGTAG 0.000561 AGTAT 0.00049 AGTCA 0.000951 AGTCC 0.000751 AGTCG 0.00102 AGTCT 0.000832 AGTGA 0.000909 AGTGC 0.000851 AGTGG 0.000943 AGTGT 0.000705 AGTTA 0.000261 AGTTC 0.000666 AGTTG 0.000914 AGTTT 0.000615 ATAAA 0.000462 ATAAC 0.000415 ATAAG 0.000488 ATAAT 0.000451 ATACA 0.000694 ATACC 0.000732 ATACG 0.000497 ATACT 0.00049 ATAGA 0.000565 ATAGC 0.000564 ATAGG 0.000452 ATAGT 0.000435 ATATA 0.00046 ATATC 0.000789 ATATG 0.000658 ATATT 0.000589 ATCAA 0.0012 ATCAC 0.00109 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.00126 ATCCA 0.00106 ATCCC 0.000896 ATCCG 0.000791 ATCCT 0.000893 ATCGA 0.0011 ATCGC 0.00102 ATCGG 0.000784 ATCGT 0.000932 ATCTA 0.000506 ATCTC 0.0011 ATCTG 0.00106 ATCTT 0.000989 ATGAA 0.00116 ATGAC 0.00118 ATGAG 0.00105 ATGAT 0.00126 ATGCA 0.00125 ATGCC 0.00123 ATGCG 0.000913 ATGCT 0.00111 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.00141 ATGGG 0.00107 ATGGT 0.00105 ATGTA 0.000724 ATGTC 0.00115 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.000877 ATTAA 0.000302 ATTAC 0.000427 ATTAG 0.000328 ATTAT 0.000451 ATTCA 0.000965 ATTCC 0.000787 ATTCG 0.000846 ATTCT 0.000833 ATTGA 0.00102 ATTGC 0.000955 ATTGG 0.000932 ATTGT 0.000818 ATTTA 0.000372 ATTTC 0.000971 ATTTG 0.000884 ATTTT 0.000748 CAAAA 0.00115 CAAAC 0.0011 CAAAG 0.00127 CAAAT 0.000884 CAACA 0.00144 CAACC 0.00128 CAACG 0.00114 CAACT 0.000914 CAAGA 0.00147 CAAGC 0.00158 CAAGG 0.00152 CAAGT 0.00112 CAATA 0.000646 CAATC 0.00107 CAATG 0.00124 CAATT 0.000778 CACAA 0.00108 CACAC 0.00115 CACAG 0.00114 CACAT 0.00106 CACCA 0.00156 CACCC 0.00117 CACCG 0.000935 CACCT 0.00117 CACGA 0.00125 CACGC 0.00101 CACGG 0.000921 CACGT 0.000823 CACTA 0.000506 CACTC 0.000933 CACTG 0.00108 CACTT 0.000886 CAGAA 0.00119 CAGAC 0.00124 CAGAG 0.00125 CAGAT 0.00106 CAGCA 0.00177 CAGCC 0.00166 CAGCG 0.0013 CAGCT 0.0014 CAGGA 0.00118 CAGGC 0.00154 CAGGG 0.00125 CAGGT 0.00111 CAGTA 0.000629 CAGTC 0.00117 CAGTG 0.00108 CAGTT 0.000725 CATAA 0.000465 CATAC 0.000706 CATAG 0.000535 CATAT 0.000658 CATCA 0.00173 CATCC 0.00134 CATCG 0.00136 CATCT 0.00133 CATGA 0.00138 CATGC 0.00144 CATGG 0.00151 CATGT 0.00133 CATTA 0.000459 CATTC 0.00115 CATTG 0.00124 CATTT 0.000994 CCAAA 0.0012 CCAAC 0.00124 CCAAG 0.00152 CCAAT 0.000932 CCACA 0.00114 CCACC 0.00147 CCACG 0.00111 CCACT 0.000943 CCAGA 0.0013 CCAGC 0.00167 CCAGG 0.00138 CCAGT 0.000994 CCATA 0.000585 CCATC 0.00161 CCATG 0.00151 CCATT 0.000991 CCCAA 0.0012 CCCAC 0.00113 CCCAG 0.00122 CCCAT 0.00107 CCCCA 0.00116 CCCCC 0.00151 CCCCG 0.000986 CCCCT 0.00127 CCCGA 0.000939 CCCGC 0.00113 CCCGG 0.000778 CCCGT 0.000795 CCCTA 0.000449 CCCTC 0.00148 CCCTG 0.00125 CCCTT 0.00113 CCGAA 0.000938 CCGAC 0.00113 CCGAG 0.00113 CCGAT 0.000784 CCGCA 0.000954 CCGCC 0.00146 CCGCG 0.000908 CCGCT 0.000901 CCGGA 0.000731 CCGGC 0.0011 CCGGG 0.000778 CCGGT 0.000635 CCGTA 0.000446 CCGTC 0.00128 CCGTG 0.000921 CCGTT 0.000747 CCTAA 0.000383 CCTAC 0.000723 CCTAG 0.000582 CCTAT 0.000452 CCTCA 0.00128 CCTCC 0.0016 CCTCG 0.00153 CCTCT 0.00132 CCTGA 0.00111 CCTGC 0.00151 CCTGG 0.00138 CCTGT 0.00108 CCTTA 0.000523 CCTTC 0.00143 CCTTG 0.00152 CCTTT 0.00109 CGAAA 0.00108 CGAAC 0.00096 CGAAG 0.0012 CGAAT 0.000846 CGACA 0.00142 CGACC 0.00121 CGACG 0.00144 CGACT 0.00102 CGAGA 0.00137 CGAGC 0.00134 CGAGG 0.00153 CGAGT 0.000915 CGATA 0.000677 CGATC 0.00102 CGATG 0.00136 CGATT 0.00078 CGCAA 0.00109 CGCAC 0.00087 CGCAG 0.0011 CGCAT 0.000913 CGCCA 0.00145 CGCCC 0.00128 CGCCG 0.00132 CGCCT 0.00121 CGCGA 0.001 CGCGC 0.00104 CGCGG 0.000908 CGCGT 0.000781 CGCTA 0.000479 CGCTC 0.00101 CGCTG 0.0013 CGCTT 0.00087 CGGAA 0.000824 CGGAC 0.000792 CGGAG 0.000916 CGGAT 0.000791 CGGCA 0.00131 CGGCC 0.00127 CGGCG 0.00132 CGGCT 0.00102 CGGGA 0.000869 CGGGC 0.00105 CGGGG 0.000986 CGGGT 0.000744 CGGTA 0.000511 CGGTC 0.000872 CGGTG 0.000935 CGGTT 0.000645 CGTAA 0.000388 CGTAC 0.0006 CGTAG 0.00054 CGTAT 0.000497 CGTCA 0.00135 CGTCC 0.00109 CGTCG 0.00144 CGTCT 0.00117 CGTGA 0.00101 CGTGC 0.001 CGTGG 0.00111 CGTGT 0.000887 CGTTA 0.000349 CGTTC 0.000912 CGTTG 0.00114 CGTTT 0.000807 CTAAA 0.000361 CTAAC 0.000354 CTAAG 0.000391 CTAAT 0.000328 CTACA 0.000668 CTACC 0.00087 CTACG 0.00054 CTACT 0.000561 CTAGA 0.000535 CTAGC 0.000573 CTAGG 0.000582 CTAGT 0.00037 CTATA 0.000317 CTATC 0.000644 CTATG 0.000535 CTATT 0.000518 CTCAA 0.00118 CTCAC 0.00103 CTCAG 0.001 CTCAT 0.00105 CTCCA 0.00133 CTCCC 0.00122 CTCCG 0.000916 CTCCT 0.00128 CTCGA 0.00148 CTCGC 0.00133 CTCGG 0.00113 CTCGT 0.00123 CTCTA 0.000557 CTCTC 0.00149 CTCTG 0.00125 CTCTT 0.00122 CTGAA 0.00105 CTGAC 0.00116 CTGAG 0.001 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.00142 CTGCC 0.00172 CTGCG 0.0011 CTGCT 0.00145 CTGGA 0.00127 CTGGC 0.00164 CTGGG 0.00122 CTGGT 0.00121 CTGTA 0.000656 CTGTC 0.00144 CTGTG 0.00114 CTGTT 0.00103 CTTAA 0.000312 CTTAC 0.00053 CTTAG 0.000391 CTTAT 0.000488 CTTCA 0.00136 CTTCC 0.00136 CTTCG 0.0012 CTTCT 0.00143 CTTGA 0.0014 CTTGC 0.00151 CTTGG 0.00152 CTTGT 0.00126 CTTTA 0.000442 CTTTC 0.00133 CTTTG 0.00127 CTTTT 0.00118 GAAAA 0.00119 GAAAC 0.00101 GAAAG 0.00133 GAAAT 0.000971 GAACA 0.00111 GAACC 0.000976 GAACG 0.000912 GAACT 0.000666 GAAGA 0.00161 GAAGC 0.00145 GAAGG 0.00143 GAAGT 0.00085 GAATA 0.000662 GAATC 0.000915 GAATG 0.00115 GAATT 0.000705 GACAA 0.00128 GACAC 0.00104 GACAG 0.00144 GACAT 0.00115 GACCA 0.00126 GACCC 0.001 GACCG 0.000872 GACCT 0.00101 GACGA 0.00163 GACGC 0.00117 GACGG 0.00128 GACGT 0.000971 GACTA 0.000466 GACTC 0.000934 GACTG 0.00117 GACTT 0.000981 GAGAA 0.00132 GAGAC 0.0012 GAGAG 0.00149 GAGAT 0.0011 GAGCA 0.00128 GAGCC 0.00118 GAGCG 0.00101 GAGCT 0.00122 GAGGA 0.00148 GAGGC 0.00157 GAGGG 0.00148 GAGGT 0.0012 GAGTA 0.000535 GAGTC 0.000934 GAGTG 0.000933 GAGTT 0.000739 GATAA 0.000552 GATAC 0.000743 GATAG 0.000644 GATAT 0.000789 GATCA 0.0011 GATCC 0.00094 GATCG 0.00102 GATCT 0.000952 GATGA 0.00158 GATGC 0.00146 GATGG 0.00161 GATGT 0.00112 GATTA 0.000404 GATTC 0.000915 GATTG 0.00107 GATTT 0.000827 GCAAA 0.00117 GCAAC 0.00121 GCAAG 0.00151 GCAAT 0.000955 GCACA 0.00113 GCACC 0.00115 GCACG 0.001 GCACT 0.000851 GCAGA 0.00137 GCAGC 0.0018 GCAGG 0.00151 GCAGT 0.00101 GCATA 0.000605 GCATC 0.00146 GCATG 0.00144 GCATT 0.000996 GCCAA 0.00144 GCCAC 0.00128 GCCAG 0.00164 GCCAT 0.00141 GCCCA 0.00127 GCCCC 0.00121 GCCCG 0.00105 GCCCT 0.00113 GCCGA 0.00126 GCCGC 0.0014 GCCGG 0.0011 GCCGT 0.00116 GCCTA 0.000576 GCCTC 0.00157 GCCTG 0.00154 GCCTT 0.00128 GCGAA 0.00101 GCGAC 0.00125 GCGAG 0.00133 GCGAT 0.00102 GCGCA 0.00106 GCGCC 0.00126 GCGCG 0.00104 GCGCT 0.000951 GCGGA 0.000885 GCGGC 0.0014 GCGGG 0.00113 GCGGT 0.000814 GCGTA 0.000475 GCGTC 0.00117 GCGTG 0.00101 GCGTT 0.000844 GCTAA 0.000396 GCTAC 0.000723 GCTAG 0.000573 GCTAT 0.000564 GCTCA 0.00112 GCTCC 0.00112 GCTCG 0.00134 GCTCT 0.00111 GCTGA 0.00129 GCTGC 0.0018 GCTGG 0.00167 GCTGT 0.00137 GCTTA 0.000445 GCTTC 0.00145 GCTTG 0.00158 GCTTT 0.00108 GGAAA 0.00116 GGAAC 0.000863 GGAAG 0.00136 GGAAT 0.000787 GGACA 0.00101 GGACC 0.000908 GGACG 0.00109 GGACT 0.000751 GGAGA 0.00129 GGAGC 0.00112 GGAGG 0.0016 GGAGT 0.000741 GGATA 0.000614 GGATC 0.00094 GGATG 0.00134 GGATT 0.000745 GGCAA 0.00131 GGCAC 0.00114 GGCAG 0.00172 GGCAT 0.00123 GGCCA 0.00145 GGCCC 0.00112 GGCCG 0.00127 GGCCT 0.0012 GGCGA 0.00141 GGCGC 0.00126 GGCGG 0.00146 GGCGT 0.00114 GGCTA 0.000576 GGCTC 0.00118 GGCTG 0.00166 GGCTT 0.00122 GGGAA 0.00109 GGGAC 0.000919 GGGAG 0.00122 GGGAT 0.000896 GGGCA 0.0012 GGGCC 0.00112 GGGCG 0.00128 GGGCT 0.00106 GGGGA 0.00109 GGGGC 0.00121 GGGGG 0.00151 GGGGT 0.00112 GGGTA 0.000679 GGGTC 0.001 GGGTG 0.00117 GGGTT 0.000981 GGTAA 0.000516 GGTAC 0.000815 GGTAG 0.00087 GGTAT 0.000732 GGTCA 0.00108 GGTCC 0.000908 GGTCG 0.00121 GGTCT 0.00094 GGTGA 0.00118 GGTGC 0.00115 GGTGG 0.00147 GGTGT 0.00105 GGTTA 0.000377 GGTTC 0.000976 GGTTG 0.00128 GGTTT 0.000871 GTAAA 0.000497 GTAAC 0.000387 GTAAG 0.00053 GTAAT 0.000427 GTACA 0.000762 GTACC 0.000815 GTACG 0.0006 GTACT 0.000591 GTAGA 0.000659 GTAGC 0.000723 GTAGG 0.000723 GTAGT 0.000537 GTATA 0.000389 GTATC 0.000743 GTATG 0.000706 GTATT 0.000578 GTCAA 0.00125 GTCAC 0.00106 GTCAG 0.00116 GTCAT 0.00118 GTCCA 0.00109 GTCCC 0.000919 GTCCG 0.000792 GTCCT 0.000957 GTCGA 0.00143 GTCGC 0.00125 GTCGG 0.00113 GTCGT 0.00128 GTCTA 0.00054 GTCTC 0.0012 GTCTG 0.00124 GTCTT 0.00117 GTGAA 0.000981 GTGAC 0.00106 GTGAG 0.00103 GTGAT 0.00109 GTGCA 0.00103 GTGCC 0.00114 GTGCG 0.00087 GTGCT 0.00109 GTGGA 0.00105 GTGGC 0.00128 GTGGG 0.00113 GTGGT 0.00121 GTGTA 0.000585 GTGTC 0.00104 GTGTG 0.00115 GTGTT 0.000975 GTTAA 0.00025 GTTAC 0.000387 GTTAG 0.000354 GTTAT 0.000415 GTTCA 0.000951 GTTCC 0.000863 GTTCG 0.00096 GTTCT 0.000893 GTTGA 0.00124 GTTGC 0.00121 GTTGG 0.00124 GTTGT 0.00108 GTTTA 0.000371 GTTTC 0.00101 GTTTG 0.0011 GTTTT 0.000842 TAAAA 0.000432 TAAAC 0.000371 TAAAG 0.000442 TAAAT 0.000372 TAACA 0.000418 TAACC 0.000377 TAACG 0.000349 TAACT 0.000261 TAAGA 0.000442 TAAGC 0.000445 TAAGG 0.000523 TAAGT 0.000314 TAATA 0.000294 TAATC 0.000404 TAATG 0.000459 TAATT 0.000351 TACAA 0.000657 TACAC 0.000585 TACAG 0.000656 TACAT 0.000724 TACCA 0.000795 TACCC 0.000679 TACCG 0.000511 TACCT 0.000944 TACGA 0.000627 TACGC 0.000475 TACGG 0.000446 TACGT 0.000477 TACTA 0.000325 TACTC 0.000535 TACTG 0.000629 TACTT 0.000596 TAGAA 0.000507 TAGAC 0.00054 TAGAG 0.000557 TAGAT 0.000506 TAGCA 0.000608 TAGCC 0.000576 TAGCG 0.000479 TAGCT 0.000592 TAGGA 0.000468 TAGGC 0.000576 TAGGG 0.000449 TAGGT 0.000648 TAGTA 0.000325 TAGTC 0.000466 TAGTG 0.000506 TAGTT 0.000353 TATAA 0.000306 TATAC 0.000389 TATAG 0.000317 TATAT 0.00046 TATCA 0.000772 TATCC 0.000614 TATCG 0.000677 TATCT 0.000664 TATGA 0.000619 TATGC 0.000605 TATGG 0.000585 TATGT 0.000557 TATTA 0.000294 TATTC 0.000662 TATTG 0.000646 TATTT 0.000576 TCAAA 0.00105 TCAAC 0.00124 TCAAG 0.0014 TCAAT 0.00102 TCACA 0.00105 TCACC 0.00118 TCACG 0.00101 TCACT 0.000909 TCAGA 0.00102 TCAGC 0.00129 TCAGG 0.00111 TCAGT 0.000831 TCATA 0.000619 TCATC 0.00158 TCATG 0.00138 TCATT 0.00106 TCCAA 0.00108 TCCAC 0.00105 TCCAG 0.00127 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.00112 TCCCC 0.00109 TCCCG 0.000869 TCCCT 0.00102 TCCGA 0.000912 TCCGC 0.000885 TCCGG 0.000731 TCCGT 0.000794 TCCTA 0.000468 TCCTC 0.00148 TCCTG 0.00118 TCCTT 0.00114 TCGAA 0.0011 TCGAC 0.00143 TCGAG 0.00148 TCGAT 0.0011 TCGCA 0.00112 TCGCC 0.00141 TCGCG 0.001 TCGCT 0.00108 TCGGA 0.000912 TCGGC 0.00126 TCGGG 0.000939 TCGGT 0.000868 TCGTA 0.000627 TCGTC 0.00163 TCGTG 0.00125 TCGTT 0.000974 TCTAA 0.000353 TCTAC 0.000659 TCTAG 0.000535 TCTAT 0.000565 TCTCA 0.0011 TCTCC 0.00129 TCTCG 0.00137 TCTCT 0.00136 TCTGA 0.00102 TCTGC 0.00137 TCTGG 0.0013 TCTGT 0.00106 TCTTA 0.000442 TCTTC 0.00161 TCTTG 0.00147 TCTTT 0.00123 TGAAA 0.000997 TGAAC 0.000951 TGAAG 0.00136 TGAAT 0.000965 TGACA 0.00127 TGACC 0.00108 TGACG 0.00135 TGACT 0.000951 TGAGA 0.0011 TGAGC 0.00112 TGAGG 0.00128 TGAGT 0.000758 TGATA 0.000772 TGATC 0.0011 TGATG 0.00173 TGATT 0.00098 TGCAA 0.00118 TGCAC 0.00103 TGCAG 0.00142 TGCAT 0.00125 TGCCA 0.00147 TGCCC 0.0012 TGCCG 0.00131 TGCCT 0.00141 TGCGA 0.00112 TGCGC 0.00106 TGCGG 0.000954 TGCGT 0.000838 TGCTA 0.000608 TGCTC 0.00128 TGCTG 0.00177 TGCTT 0.00127 TGGAA 0.00111 TGGAC 0.00109 TGGAG 0.00133 TGGAT 0.00106 TGGCA 0.00147 TGGCC 0.00145 TGGCG 0.00145 TGGCT 0.00141 TGGGA 0.00112 TGGGC 0.00127 TGGGG 0.00116 TGGGT 0.00107 TGGTA 0.000795 TGGTC 0.00126 TGGTG 0.00156 TGGTT 0.00102 TGTAA 0.0005 TGTAC 0.000762 TGTAG 0.000668 TGTAT 0.000694 TGTCA 0.00127 TGTCC 0.00101 TGTCG 0.00142 TGTCT 0.00121 TGTGA 0.00105 TGTGC 0.00113 TGTGG 0.00114 TGTGT 0.00111 TGTTA 0.000418 TGTTC 0.00111 TGTTG 0.00144 TGTTT 0.00103 TTAAA 0.000295 TTAAC 0.00025 TTAAG 0.000312 TTAAT 0.000302 TTACA 0.0005 TTACC 0.000516 TTACG 0.000388 TTACT 0.000441 TTAGA 0.000353 TTAGC 0.000396 TTAGG 0.000383 TTAGT 0.000305 TTATA 0.000306 TTATC 0.000552 TTATG 0.000465 TTATT 0.000495 TTCAA 0.00109 TTCAC 0.000981 TTCAG 0.00105 TTCAT 0.00116 TTCCA 0.00111 TTCCC 0.00109 TTCCG 0.000824 TTCCT 0.00114 TTCGA 0.0011 TTCGC 0.00101 TTCGG 0.000938 TTCGT 0.00104 TTCTA 0.000507 TTCTC 0.00132 TTCTG 0.00119 TTCTT 0.00139 TTGAA 0.00109 TTGAC 0.00125 TTGAG 0.00118 TTGAT 0.0012 TTGCA 0.00118 TTGCC 0.00131 TTGCG 0.00109 TTGCT 0.00127 TTGGA 0.00108 TTGGC 0.00144 TTGGG 0.0012 TTGGT 0.00117 TTGTA 0.000657 TTGTC 0.00128 TTGTG 0.00108 TTGTT 0.00113 TTTAA 0.000295 TTTAC 0.000497 TTTAG 0.000361 TTTAT 0.000462 TTTCA 0.000997 TTTCC 0.00116 TTTCG 0.00108 TTTCT 0.00126 TTTGA 0.00105 TTTGC 0.00117 TTTGG 0.0012 TTTGT 0.000988 TTTTA 0.000432 TTTTC 0.00119 TTTTG 0.00115 TTTTT 0.00121 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.2977 AAAAC 0.2147 AAAAG 0.2924 AAAAT 0.1952 AAACA 0.3113 AAACC 0.2569 AAACG 0.2388 AAACT 0.1931 AAAGA 0.2934 AAAGC 0.2556 AAAGG 0.2514 AAAGT 0.1996 AAATA 0.1981 AAATC 0.2737 AAATG 0.3286 AAATT 0.1996 AACAA 0.2856 AACAC 0.2389 AACAG 0.2506 AACAT 0.2249 AACCA 0.2939 AACCC 0.2767 AACCG 0.1828 AACCT 0.2466 AACGA 0.3081 AACGC 0.2589 AACGG 0.228 AACGT 0.205 AACTA 0.1509 AACTC 0.2936 AACTG 0.2902 AACTT 0.2652 AAGAA 0.29 AAGAC 0.2453 AAGAG 0.2503 AAGAT 0.2144 AAGCA 0.2765 AAGCC 0.2659 AAGCG 0.1875 AAGCT 0.2701 AAGGA 0.2491 AAGGC 0.2814 AAGGG 0.2421 AAGGT 0.2274 AAGTA 0.1962 AAGTC 0.3126 AAGTG 0.2778 AAGTT 0.2134 AATAA 0.2275 AATAC 0.2609 AATAG 0.2349 AATAT 0.2767 AATCA 0.3072 AATCC 0.2307 AATCG 0.2401 AATCT 0.222 AATGA 0.2769 AATGC 0.2589 AATGG 0.2541 AATGT 0.2101 AATTA 0.1519 AATTC 0.2857 AATTG 0.3181 AATTT 0.2443 ACAAA 0.2421 ACAAC 0.2558 ACAAG 0.3009 ACAAT 0.2011 ACACA 0.2966 ACACC 0.2804 ACACG 0.2302 ACACT 0.1927 ACAGA 0.2468 ACAGC 0.3192 ACAGG 0.2478 ACAGT 0.1861 ACATA 0.1534 ACATC 0.297 ACATG 0.3371 ACATT 0.2125 ACCAA 0.2536 ACCAC 0.2572 ACCAG 0.2606 ACCAT 0.2286 ACCCA 0.2836 ACCCC 0.2905 ACCCG 0.1915 ACCCT 0.2344 ACCGA 0.2966 ACCGC 0.2671 ACCGG 0.2168 ACCGT 0.2195 ACCTA 0.1652 ACCTC 0.2976 ACCTG 0.2767 ACCTT 0.2605 ACGAA 0.2362 ACGAC 0.2799 ACGAG 0.2728 ACGAT 0.2111 ACGCA 0.243 ACGCC 0.3241 ACGCG 0.2206 ACGCT 0.2123 ACGGA 0.2348 ACGGC 0.3423 ACGGG 0.2295 ACGGT 0.1934 ACGTA 0.1702 ACGTC 0.3256 ACGTG 0.2787 ACGTT 0.2254 ACTAA 0.1882 ACTAC 0.3136 ACTAG 0.2239 ACTAT 0.2742 ACTCA 0.2461 ACTCC 0.2343 ACTCG 0.2832 ACTCT 0.2364 ACTGA 0.2365 ACTGC 0.2774 ACTGG 0.2698 ACTGT 0.2163 ACTTA 0.1071 ACTTC 0.2715 ACTTG 0.3548 ACTTT 0.2665 AGAAA 0.2828 AGAAC 0.2044 AGAAG 0.3207 AGAAT 0.1921 AGACA 0.2923 AGACC 0.2258 AGACG 0.2759 AGACT 0.206 AGAGA 0.2986 AGAGC 0.2492 AGAGG 0.2857 AGAGT 0.1664 AGATA 0.191 AGATC 0.2608 AGATG 0.3539 AGATT 0.1943 AGCAA 0.2614 AGCAC 0.2179 AGCAG 0.2906 AGCAT 0.2301 AGCCA 0.3037 AGCCC 0.2274 AGCCG 0.2184 AGCCT 0.2506 AGCGA 0.2992 AGCGC 0.256 AGCGG 0.2426 AGCGT 0.2022 AGCTA 0.1388 AGCTC 0.273 AGCTG 0.312 AGCTT 0.2762 AGGAA 0.2702 AGGAC 0.2223 AGGAG 0.2923 AGGAT 0.2152 AGGCA 0.2879 AGGCC 0.2385 AGGCG 0.2392 AGGCT 0.2344 AGGGA 0.237 AGGGC 0.2628 AGGGG 0.2912 AGGGT 0.2091 AGGTA 0.2376 AGGTC 0.2526 AGGTG 0.2925 AGGTT 0.2172 AGTAA 0.2158 AGTAC 0.2778 AGTAG 0.2643 AGTAT 0.2421 AGTCA 0.2724 AGTCC 0.2121 AGTCG 0.2779 AGTCT 0.2375 AGTGA 0.2705 AGTGC 0.2513 AGTGG 0.2706 AGTGT 0.2076 AGTTA 0.113 AGTTC 0.2719 AGTTG 0.3646 AGTTT 0.2505 ATAAA 0.2538 ATAAC 0.2321 ATAAG 0.2611 ATAAT 0.253 ATACA 0.2873 ATACC 0.2977 ATACG 0.2044 ATACT 0.2106 ATAGA 0.2802 ATAGC 0.2746 ATAGG 0.2197 ATAGT 0.2255 ATATA 0.1888 ATATC 0.3121 ATATG 0.2582 ATATT 0.2409 ATCAA 0.2637 ATCAC 0.2353 ATCAG 0.2266 ATCAT 0.2744 ATCCA 0.295 ATCCC 0.2417 ATCCG 0.2141 ATCCT 0.2492 ATCGA 0.288 ATCGC 0.2634 ATCGG 0.2048 ATCGT 0.2438 ATCTA 0.1418 ATCTC 0.2989 ATCTG 0.2847 ATCTT 0.2746 ATGAA 0.2538 ATGAC 0.2515 ATGAG 0.2229 ATGAT 0.2718 ATGCA 0.2793 ATGCC 0.2716 ATGCG 0.1991 ATGCT 0.25 ATGGA 0.2546 ATGGC 0.2976 ATGGG 0.2228 ATGGT 0.2251 ATGTA 0.1942 ATGTC 0.2965 ATGTG 0.2743 ATGTT 0.235 ATTAA 0.2026 ATTAC 0.28 ATTAG 0.2173 ATTAT 0.3002 ATTCA 0.2877 ATTCC 0.2294 ATTCG 0.2409 ATTCT 0.2419 ATTGA 0.2769 ATTGC 0.257 ATTGG 0.2457 ATTGT 0.2204 ATTTA 0.1324 ATTTC 0.32 ATTTG 0.2976 ATTTT 0.25 CAAAA 0.2608 CAAAC 0.2442 CAAAG 0.2889 CAAAT 0.2061 CAACA 0.3017 CAACC 0.2648 CAACG 0.2352 CAACT 0.1983 CAAGA 0.2607 CAAGC 0.2748 CAAGG 0.2638 CAAGT 0.2007 CAATA 0.1799 CAATC 0.2829 CAATG 0.3257 CAATT 0.2116 CACAA 0.2493 CACAC 0.2508 CACAG 0.2577 CACAT 0.2423 CACCA 0.3237 CACCC 0.239 CACCG 0.1902 CACCT 0.2471 CACGA 0.3144 CACGC 0.2474 CACGG 0.2298 CACGT 0.2084 CACTA 0.1562 CACTC 0.2685 CACTG 0.315 CACTT 0.2603 CAGAA 0.2521 CAGAC 0.2561 CAGAG 0.2629 CAGAT 0.2289 CAGCA 0.2883 CAGCC 0.2695 CAGCG 0.2092 CAGCT 0.233 CAGGA 0.2334 CAGGC 0.3004 CAGGG 0.2444 CAGGT 0.2218 CAGTA 0.1791 CAGTC 0.3186 CAGTG 0.2964 CAGTT 0.2059 CATAA 0.1984 CATAC 0.2928 CATAG 0.2277 CATAT 0.281 CATCA 0.3027 CATCC 0.2286 CATCG 0.2346 CATCT 0.2341 CATGA 0.2512 CATGC 0.2512 CATGG 0.264 CATGT 0.2336 CATTA 0.1251 CATTC 0.2956 CATTG 0.318 CATTT 0.2613 CCAAA 0.2486 CCAAC 0.251 CCAAG 0.3068 CCAAT 0.1937 CCACA 0.2504 CCACC 0.3089 CCACG 0.2356 CCACT 0.2052 CCAGA 0.2451 CCAGC 0.3104 CCAGG 0.2554 CCAGT 0.1891 CCATA 0.1318 CCATC 0.3342 CCATG 0.3188 CCATT 0.2152 CCCAA 0.2636 CCCAC 0.2377 CCCAG 0.2672 CCCAT 0.2316 CCCCA 0.2403 CCCCC 0.2961 CCCCG 0.2005 CCCCT 0.2631 CCCGA 0.2618 CCCGC 0.3062 CCCGG 0.2133 CCCGT 0.2187 CCCTA 0.1079 CCCTC 0.3376 CCCTG 0.2904 CCCTT 0.2642 CCGAA 0.2393 CCGAC 0.2799 CCGAG 0.2798 CCGAT 0.2011 CCGCA 0.236 CCGCC 0.3364 CCGCG 0.2124 CCGCT 0.2153 CCGGA 0.2305 CCGGC 0.332 CCGGG 0.2361 CCGGT 0.2014 CCGTA 0.1376 CCGTC 0.3699 CCGTG 0.2713 CCGTT 0.2212 CCTAA 0.1868 CCTAC 0.3254 CCTAG 0.2706 CCTAT 0.2173 CCTCA 0.2304 CCTCC 0.272 CCTCG 0.2667 CCTCT 0.2308 CCTGA 0.2243 CCTGC 0.2946 CCTGG 0.2687 CCTGT 0.2123 CCTTA 0.1214 CCTTC 0.3106 CCTTG 0.3302 CCTTT 0.2378 CGAAA 0.2651 CGAAC 0.2351 CGAAG 0.291 CGAAT 0.2088 CGACA 0.2835 CGACC 0.2356 CGACG 0.2784 CGACT 0.2026 CGAGA 0.2664 CGAGC 0.2594 CGAGG 0.2957 CGAGT 0.1786 CGATA 0.1813 CGATC 0.259 CGATG 0.3514 CGATT 0.2082 CGCAA 0.2772 CGCAC 0.2162 CGCAG 0.2771 CGCAT 0.2295 CGCCA 0.2779 CGCCC 0.2386 CGCCG 0.2501 CGCCT 0.2334 CGCGA 0.2732 CGCGC 0.2737 CGCGG 0.2412 CGCGT 0.2119 CGCTA 0.1365 CGCTC 0.2723 CGCTG 0.351 CGCTT 0.2402 CGGAA 0.2544 CGGAC 0.2342 CGGAG 0.2724 CGGAT 0.239 CGGCA 0.2679 CGGCC 0.255 CGGCG 0.2655 CGGCT 0.2116 CGGGA 0.2413 CGGGC 0.2851 CGGGG 0.2676 CGGGT 0.206 CGGTA 0.1814 CGGTC 0.2908 CGGTG 0.3077 CGGTT 0.22 CGTAA 0.2006 CGTAC 0.2851 CGTAG 0.2646 CGTAT 0.2497 CGTCA 0.2722 CGTCC 0.2125 CGTCG 0.2811 CGTCT 0.2342 CGTGA 0.2599 CGTGC 0.2465 CGTGG 0.2745 CGTGT 0.2191 CGTTA 0.1138 CGTTC 0.2833 CGTTG 0.3513 CGTTT 0.2516 CTAAA 0.2519 CTAAC 0.2422 CTAAG 0.2739 CTAAT 0.232 CTACA 0.2559 CTACC 0.3193 CTACG 0.2061 CTACT 0.2187 CTAGA 0.2611 CTAGC 0.2727 CTAGG 0.2786 CTAGT 0.1875 CTATA 0.163 CTATC 0.3164 CTATG 0.2632 CTATT 0.2574 CTCAA 0.2814 CTCAC 0.2389 CTCAG 0.2342 CTCAT 0.2455 CTCCA 0.2848 CTCCC 0.2515 CTCCG 0.1943 CTCCT 0.2694 CTCGA 0.2862 CTCGC 0.2557 CTCGG 0.2176 CTCGT 0.2405 CTCTA 0.1309 CTCTC 0.3217 CTCTG 0.2764 CTCTT 0.271 CTGAA 0.2488 CTGAC 0.2688 CTGAG 0.2347 CTGAT 0.2477 CTGCA 0.2555 CTGCC 0.2955 CTGCG 0.1941 CTGCT 0.2549 CTGGA 0.2394 CTGGC 0.302 CTGGG 0.2295 CTGGT 0.2291 CTGTA 0.159 CTGTC 0.3326 CTGTG 0.2679 CTGTT 0.2405 CTTAA 0.1913 CTTAC 0.3005 CTTAG 0.2302 CTTAT 0.278 CTTCA 0.259 CTTCC 0.2507 CTTCG 0.2226 CTTCT 0.2677 CTTGA 0.2508 CTTGC 0.2636 CTTGG 0.2628 CTTGT 0.2227 CTTTA 0.1119 CTTTC 0.3118 CTTTG 0.3037 CTTTT 0.2725 GAAAA 0.2594 GAAAC 0.2236 GAAAG 0.2959 GAAAT 0.2211 GAACA 0.3039 GAACC 0.2625 GAACG 0.2437 GAACT 0.1899 GAAGA 0.3035 GAAGC 0.2694 GAAGG 0.2638 GAAGT 0.1633 GAATA 0.2016 GAATC 0.2639 GAATG 0.3284 GAATT 0.2061 GACAA 0.2605 GACAC 0.212 GACAG 0.29 GACAT 0.2375 GACCA 0.3038 GACCC 0.2394 GACCG 0.2088 GACCT 0.248 GACGA 0.3214 GACGC 0.2328 GACGG 0.251 GACGT 0.1949 GACTA 0.1364 GACTC 0.256 GACTG 0.3258 GACTT 0.2818 GAGAA 0.2604 GAGAC 0.2317 GAGAG 0.2845 GAGAT 0.2234 GAGCA 0.2743 GAGCC 0.2499 GAGCG 0.2109 GAGCT 0.2649 GAGGA 0.2585 GAGGC 0.2746 GAGGG 0.2538 GAGGT 0.2131 GAGTA 0.1772 GAGTC 0.2896 GAGTG 0.2922 GAGTT 0.241 GATAA 0.2026 GATAC 0.2653 GATAG 0.2373 GATAT 0.2947 GATCA 0.2774 GATCC 0.2327 GATCG 0.2453 GATCT 0.2446 GATGA 0.275 GATGC 0.2513 GATGG 0.2716 GATGT 0.2021 GATTA 0.1313 GATTC 0.2822 GATTG 0.3281 GATTT 0.2585 GCAAA 0.2434 GCAAC 0.2467 GCAAG 0.3074 GCAAT 0.2024 GCACA 0.2747 GCACC 0.2736 GCACG 0.2377 GCACT 0.2141 GCAGA 0.2426 GCAGC 0.3134 GCAGG 0.262 GCAGT 0.182 GCATA 0.1395 GCATC 0.3198 GCATG 0.3139 GCATT 0.2268 GCCAA 0.2538 GCCAC 0.222 GCCAG 0.2789 GCCAT 0.2453 GCCCA 0.2725 GCCCC 0.2584 GCCCG 0.2221 GCCCT 0.2469 GCCGA 0.2583 GCCGC 0.2828 GCCGG 0.2198 GCCGT 0.2391 GCCTA 0.1213 GCCTC 0.3119 GCCTG 0.3048 GCCTT 0.2621 GCGAA 0.2238 GCGAC 0.2677 GCGAG 0.2846 GCGAT 0.2239 GCGCA 0.2508 GCGCC 0.291 GCGCG 0.2358 GCGCT 0.2224 GCGGA 0.2143 GCGGC 0.3308 GCGGG 0.2626 GCGGT 0.1922 GCGTA 0.1438 GCGTC 0.3314 GCGTG 0.2821 GCGTT 0.2426 GCTAA 0.181 GCTAC 0.3125 GCTAG 0.25 GCTAT 0.2564 GCTCA 0.2434 GCTCC 0.2332 GCTCG 0.2813 GCTCT 0.2421 GCTGA 0.2141 GCTGC 0.2908 GCTGG 0.2694 GCTGT 0.2257 GCTTA 0.1041 GCTTC 0.3147 GCTTG 0.3414 GCTTT 0.2399 GGAAA 0.2766 GGAAC 0.2058 GGAAG 0.3222 GGAAT 0.1955 GGACA 0.2688 GGACC 0.2405 GGACG 0.2829 GGACT 0.2078 GGAGA 0.2752 GGAGC 0.2346 GGAGG 0.329 GGAGT 0.1612 GGATA 0.1753 GGATC 0.2571 GGATG 0.3583 GGATT 0.2093 GGCAA 0.2472 GGCAC 0.2107 GGCAG 0.3112 GGCAT 0.2309 GGCCA 0.2914 GGCCC 0.2192 GGCCG 0.2485 GGCCT 0.2409 GGCGA 0.2706 GGCGC 0.239 GGCGG 0.2703 GGCGT 0.2201 GGCTA 0.1282 GGCTC 0.2522 GGCTG 0.3534 GGCTT 0.2662 GGGAA 0.2665 GGGAC 0.221 GGGAG 0.2903 GGGAT 0.2221 GGGCA 0.2592 GGGCC 0.2385 GGGCG 0.2686 GGGCT 0.2337 GGGGA 0.2227 GGGGC 0.248 GGGGG 0.2956 GGGGT 0.2337 GGGTA 0.1798 GGGTC 0.2597 GGGTG 0.3011 GGGTT 0.2594 GGTAA 0.1819 GGTAC 0.274 GGTAG 0.2884 GGTAT 0.2558 GGTCA 0.2671 GGTCC 0.217 GGTCG 0.2857 GGTCT 0.2302 GGTGA 0.2468 GGTGC 0.2348 GGTGG 0.2977 GGTGT 0.2207 GGTTA 0.1141 GGTTC 0.2783 GGTTG 0.3606 GGTTT 0.2469 GTAAA 0.2732 GTAAC 0.2062 GTAAG 0.2835 GTAAT 0.237 GTACA 0.2769 GTACC 0.2904 GTACG 0.2126 GTACT 0.2201 GTAGA 0.2541 GTAGC 0.2709 GTAGG 0.2663 GTAGT 0.2087 GTATA 0.1678 GTATC 0.3009 GTATG 0.2881 GTATT 0.2432 GTCAA 0.2689 GTCAC 0.228 GTCAG 0.2475 GTCAT 0.2557 GTCCA 0.2934 GTCCC 0.2402 GTCCG 0.2095 GTCCT 0.257 GTCGA 0.2818 GTCGC 0.245 GTCGG 0.2217 GTCGT 0.2515 GTCTA 0.1351 GTCTC 0.2845 GTCTG 0.2922 GTCTT 0.2882 GTGAA 0.2368 GTGAC 0.2539 GTGAG 0.2456 GTGAT 0.2638 GTGCA 0.2519 GTGCC 0.2758 GTGCG 0.2088 GTGCT 0.2636 GTGGA 0.2292 GTGGC 0.2763 GTGGG 0.2346 GTGGT 0.2599 GTGTA 0.1603 GTGTC 0.2785 GTGTG 0.2987 GTGTT 0.2625 GTTAA 0.1843 GTTAC 0.2664 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.3012 GTTCA 0.2643 GTTCC 0.2307 GTTCG 0.2592 GTTCT 0.2458 GTTGA 0.2651 GTTGC 0.2525 GTTGG 0.2565 GTTGT 0.2259 GTTTA 0.1166 GTTTC 0.3007 GTTTG 0.3274 GTTTT 0.2553 TAAAA 0.2623 TAAAC 0.225 TAAAG 0.2755 TAAAT 0.2372 TAACA 0.3021 TAACC 0.264 TAACG 0.2403 TAACT 0.1936 TAAGA 0.2561 TAAGC 0.2582 TAAGG 0.299 TAAGT 0.1868 TAATA 0.2054 TAATC 0.2627 TAATG 0.2973 TAATT 0.2346 TACAA 0.2521 TACAC 0.2193 TACAG 0.2491 TACAT 0.2795 TACCA 0.274 TACCC 0.2274 TACCG 0.1787 TACCT 0.3199 TACGA 0.3081 TACGC 0.2359 TACGG 0.2181 TACGT 0.2379 TACTA 0.1652 TACTC 0.2531 TACTG 0.296 TACTT 0.2857 TAGAA 0.246 TAGAC 0.25 TAGAG 0.2631 TAGAT 0.2409 TAGCA 0.2676 TAGCC 0.2532 TAGCG 0.2107 TAGCT 0.2685 TAGGA 0.2239 TAGGC 0.2707 TAGGG 0.2056 TAGGT 0.2998 TAGTA 0.2052 TAGTC 0.2737 TAGTG 0.3015 TAGTT 0.2197 TATAA 0.2102 TATAC 0.2605 TATAG 0.2153 TATAT 0.314 TATCA 0.2869 TATCC 0.222 TATCG 0.2402 TATCT 0.2508 TATGA 0.2648 TATGC 0.2509 TATGG 0.2453 TATGT 0.2391 TATTA 0.1438 TATTC 0.302 TATTG 0.2923 TATTT 0.262 TCAAA 0.2258 TCAAC 0.2606 TCAAG 0.2942 TCAAT 0.2194 TCACA 0.2576 TCACC 0.2778 TCACG 0.242 TCACT 0.2226 TCAGA 0.2399 TCAGC 0.2996 TCAGG 0.259 TCAGT 0.2014 TCATA 0.1397 TCATC 0.3322 TCATG 0.2979 TCATT 0.2302 TCCAA 0.2405 TCCAC 0.2274 TCCAG 0.2729 TCCAT 0.2591 TCCCA 0.2785 TCCCC 0.2604 TCCCG 0.211 TCCCT 0.25 TCCGA 0.2772 TCCGC 0.2649 TCCGG 0.2207 TCCGT 0.2372 TCCTA 0.1163 TCCTC 0.3402 TCCTG 0.2745 TCCTT 0.269 TCGAA 0.221 TCGAC 0.2753 TCGAG 0.2849 TCGAT 0.2189 TCGCA 0.2436 TCGCC 0.3022 TCGCG 0.2158 TCGCT 0.2383 TCGGA 0.2326 TCGGC 0.3133 TCGGG 0.2327 TCGGT 0.2214 TCGTA 0.1453 TCGTC 0.354 TCGTG 0.2773 TCGTT 0.2234 TCTAA 0.1746 TCTAC 0.3046 TCTAG 0.2488 TCTAT 0.272 TCTCA 0.2229 TCTCC 0.2494 TCTCG 0.2633 TCTCT 0.2644 TCTGA 0.2187 TCTGC 0.2872 TCTGG 0.2714 TCTGT 0.2227 TCTTA 0.09762 TCTTC 0.3354 TCTTG 0.3064 TCTTT 0.2605 TGAAA 0.2335 TGAAC 0.222 TGAAG 0.3136 TGAAT 0.2309 TGACA 0.2762 TGACC 0.2316 TGACG 0.2834 TGACT 0.2088 TGAGA 0.262 TGAGC 0.2609 TGAGG 0.2968 TGAGT 0.1803 TGATA 0.1761 TGATC 0.2383 TGATG 0.3688 TGATT 0.2167 TGCAA 0.2473 TGCAC 0.2072 TGCAG 0.2898 TGCAT 0.2557 TGCCA 0.2768 TGCCC 0.2181 TGCCG 0.239 TGCCT 0.2661 TGCGA 0.2801 TGCGC 0.2645 TGCGG 0.2435 TGCGT 0.2119 TGCTA 0.1269 TGCTC 0.2593 TGCTG 0.3543 TGCTT 0.2595 TGGAA 0.2465 TGGAC 0.2339 TGGAG 0.2848 TGGAT 0.2348 TGGCA 0.2588 TGGCC 0.2494 TGGCG 0.2462 TGGCT 0.2456 TGGGA 0.2461 TGGGC 0.2703 TGGGG 0.2478 TGGGT 0.2358 TGGTA 0.1762 TGGTC 0.268 TGGTG 0.3317 TGGTT 0.2241 TGTAA 0.1943 TGTAC 0.2848 TGTAG 0.2519 TGTAT 0.2691 TGTCA 0.2649 TGTCC 0.2016 TGTCG 0.2858 TGTCT 0.2477 TGTGA 0.2436 TGTGC 0.2509 TGTGG 0.2569 TGTGT 0.2486 TGTTA 0.1123 TGTTC 0.2771 TGTTG 0.3534 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2493 TTAAC 0.2165 TTAAG 0.2738 TTAAT 0.2603 TTACA 0.269 TTACC 0.2745 TTACG 0.213 TTACT 0.2435 TTAGA 0.2508 TTAGC 0.2703 TTAGG 0.2633 TTAGT 0.2157 TTATA 0.1752 TTATC 0.2975 TTATG 0.2527 TTATT 0.2745 TTCAA 0.2608 TTCAC 0.2246 TTCAG 0.242 TTCAT 0.2726 TTCCA 0.2715 TTCCC 0.2543 TTCCG 0.1999 TTCCT 0.2743 TTCGA 0.2716 TTCGC 0.2459 TTCGG 0.2277 TTCGT 0.2548 TTCTA 0.1229 TTCTC 0.2958 TTCTG 0.2661 TTCTT 0.3152 TTGAA 0.2372 TTGAC 0.2584 TTGAG 0.2495 TTGAT 0.255 TTGCA 0.2489 TTGCC 0.2679 TTGCG 0.2216 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2256 TTGGC 0.2939 TTGGG 0.2421 TTGGT 0.2384 TTGTA 0.1621 TTGTC 0.3009 TTGTG 0.261 TTGTT 0.276 TTTAA 0.1841 TTTAC 0.3063 TTTAG 0.2239 TTTAT 0.2857 TTTCA 0.2277 TTTCC 0.2541 TTTCG 0.2395 TTTCT 0.2787 TTTGA 0.2426 TTTGC 0.2631 TTTGG 0.2684 TTTGT 0.2259 TTTTA 0.1144 TTTTC 0.2935 TTTTG 0.2943 TTTTT 0.2978 [3] # (a,c,g,t)= (0.186, 0.314, 0.314, 0.186) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.226 C 0.275 G 0.274 T 0.226 # l= 1 # Values AA 0.0543 AC 0.057 AG 0.0631 AT 0.0513 CA 0.072 CC 0.0722 CG 0.067 CT 0.0632 GA 0.0689 GC 0.0763 GG 0.072 GT 0.0569 TA 0.0305 TC 0.069 TG 0.0719 TT 0.0543 # l= 2 # Values AAA 0.014 AAC 0.0128 AAG 0.0166 AAT 0.0108 ACA 0.0157 ACC 0.0155 ACG 0.0148 ACT 0.011 AGA 0.0165 AGC 0.0178 AGG 0.0179 AGT 0.011 ATA 0.00795 ATC 0.0152 ATG 0.0172 ATT 0.0109 CAA 0.0181 CAC 0.0169 CAG 0.0197 CAT 0.0172 CCA 0.0198 CCC 0.0187 CCG 0.0157 CCT 0.0179 CGA 0.0187 CGC 0.0178 CGG 0.0157 CGT 0.0148 CTA 0.00764 CTC 0.0192 CTG 0.0197 CTT 0.0166 GAA 0.0165 GAC 0.018 GAG 0.0192 GAT 0.0152 GCA 0.0193 GCC 0.0214 GCG 0.0178 GCT 0.0178 GGA 0.0166 GGC 0.0214 GGG 0.0186 GGT 0.0155 GTA 0.00925 GTC 0.018 GTG 0.0169 GTT 0.0128 TAA 0.00563 TAC 0.00926 TAG 0.00764 TAT 0.00795 TCA 0.0172 TCC 0.0166 TCG 0.0187 TCT 0.0165 TGA 0.0171 TGC 0.0193 TGG 0.0198 TGT 0.0157 TTA 0.00563 TTC 0.0165 TTG 0.0181 TTT 0.014 # l= 3 # Values AAAA 0.00395 AAAC 0.00324 AAAG 0.0041 AAAT 0.00274 AACA 0.00387 AACC 0.00346 AACG 0.00322 AACT 0.00227 AAGA 0.00464 AAGC 0.00448 AAGG 0.00458 AAGT 0.00292 AATA 0.00195 AATC 0.00303 AATG 0.00366 AATT 0.00221 ACAA 0.00403 ACAC 0.00378 ACAG 0.00423 ACAT 0.00363 ACCA 0.00461 ACCC 0.00394 ACCG 0.00302 ACCT 0.00396 ACGA 0.00459 ACGC 0.00366 ACGG 0.00357 ACGT 0.00295 ACTA 0.00149 ACTC 0.00309 ACTG 0.00347 ACTT 0.00292 AGAA 0.00431 AGAC 0.00416 AGAG 0.00457 AGAT 0.00348 AGCA 0.00496 AGCC 0.00466 AGCG 0.00381 AGCT 0.00432 AGGA 0.00434 AGGC 0.00508 AGGG 0.00455 AGGT 0.00396 AGTA 0.00192 AGTC 0.00347 AGTG 0.0033 AGTT 0.00227 ATAA 0.00164 ATAC 0.00225 ATAG 0.00183 ATAT 0.00223 ATCA 0.00434 ATCC 0.0036 ATCG 0.0038 ATCT 0.00348 ATGA 0.00446 ATGC 0.00444 ATGG 0.00469 ATGT 0.00363 ATTA 0.00134 ATTC 0.00322 ATTG 0.00354 ATTT 0.00274 CAAA 0.00423 CAAC 0.00473 CAAG 0.00563 CAAT 0.00354 CACA 0.00441 CACC 0.005 CACG 0.00418 CACT 0.00331 CAGA 0.00473 CAGC 0.0063 CAGG 0.0052 CAGT 0.00347 CATA 0.00217 CATC 0.00579 CATG 0.00561 CATT 0.00366 CCAA 0.00486 CCAC 0.00479 CCAG 0.00546 CCAT 0.0047 CCCA 0.00475 CCCC 0.00542 CCCG 0.00392 CCCT 0.00455 CCGA 0.0041 CCGC 0.00464 CCGG 0.0034 CCGT 0.00357 CCTA 0.00205 CCTC 0.0061 CCTG 0.0052 CCTT 0.00459 CGAA 0.00402 CGAC 0.00537 CGAG 0.00548 CGAT 0.0038 CGCA 0.00409 CGCC 0.00583 CGCG 0.00408 CGCT 0.00381 CGGA 0.00339 CGGC 0.00539 CGGG 0.00391 CGGT 0.00302 CGTA 0.00197 CGTC 0.0054 CGTG 0.00418 CGTT 0.00322 CTAA 0.00128 CTAC 0.00258 CTAG 0.00195 CTAT 0.00183 CTCA 0.00418 CTCC 0.00498 CTCG 0.00549 CTCT 0.00457 CTGA 0.00411 CTGC 0.00588 CTGG 0.00546 CTGT 0.00424 CTTA 0.00155 CTTC 0.00533 CTTG 0.00563 CTTT 0.0041 GAAA 0.00439 GAAC 0.00359 GAAG 0.00533 GAAT 0.00322 GACA 0.0049 GACC 0.00423 GACG 0.0054 GACT 0.00347 GAGA 0.00519 GAGC 0.00484 GAGG 0.0061 GAGT 0.00308 GATA 0.00253 GATC 0.00389 GATG 0.00578 GATT 0.00303 GCAA 0.00475 GCAC 0.00426 GCAG 0.00588 GCAT 0.00444 GCCA 0.00591 GCCC 0.00501 GCCG 0.00538 GCCT 0.00508 GCGA 0.00477 GCGC 0.00476 GCGG 0.00463 GCGT 0.00365 GCTA 0.00214 GCTC 0.00485 GCTG 0.00629 GCTT 0.00448 GGAA 0.00416 GGAC 0.00387 GGAG 0.00497 GGAT 0.00359 GGCA 0.00552 GGCC 0.00539 GGCG 0.00582 GGCT 0.00466 GGGA 0.00429 GGGC 0.00501 GGGG 0.0054 GGGT 0.00394 GGTA 0.00285 GGTC 0.00423 GGTG 0.00499 GGTT 0.00345 GTAA 0.00171 GTAC 0.00273 GTAG 0.00257 GTAT 0.00225 GTCA 0.00461 GTCC 0.00387 GTCG 0.00537 GTCT 0.00416 GTGA 0.00408 GTGC 0.00425 GTGG 0.00478 GTGT 0.00378 GTTA 0.00127 GTTC 0.00359 GTTG 0.00472 GTTT 0.00324 TAAA 0.00146 TAAC 0.00127 TAAG 0.00155 TAAT 0.00134 TACA 0.00251 TACC 0.00286 TACG 0.00197 TACT 0.00192 TAGA 0.00197 TAGC 0.00214 TAGG 0.00204 TAGT 0.00149 TATA 0.0013 TATC 0.00253 TATG 0.00217 TATT 0.00195 TCAA 0.00449 TCAC 0.00409 TCAG 0.00411 TCAT 0.00447 TCCA 0.00455 TCCC 0.00429 TCCG 0.00339 TCCT 0.00435 TCGA 0.00521 TCGC 0.00477 TCGG 0.0041 TCGT 0.00459 TCTA 0.00197 TCTC 0.0052 TCTG 0.00473 TCTT 0.00464 TGAA 0.00404 TGAC 0.00461 TGAG 0.00418 TGAT 0.00434 TGCA 0.00474 TGCC 0.00553 TGCG 0.00409 TGCT 0.00497 TGGA 0.00455 TGGC 0.00591 TGGG 0.00475 TGGT 0.00461 TGTA 0.0025 TGTC 0.0049 TGTG 0.0044 TGTT 0.00387 TTAA 0.000998 TTAC 0.0017 TTAG 0.00128 TTAT 0.00164 TTCA 0.00404 TTCC 0.00416 TTCG 0.00401 TTCT 0.00432 TTGA 0.00449 TTGC 0.00475 TTGG 0.00486 TTGT 0.00403 TTTA 0.00146 TTTC 0.00439 TTTG 0.00423 TTTT 0.00395 # l= 4 # Values AAAAA 0.00124 AAAAC 0.000813 AAAAG 0.00119 AAAAT 0.000704 AAACA 0.001 AAACC 0.000853 AAACG 0.000814 AAACT 0.000574 AAAGA 0.00119 AAAGC 0.00104 AAAGG 0.0011 AAAGT 0.000769 AAATA 0.000521 AAATC 0.00077 AAATG 0.000925 AAATT 0.000528 AACAA 0.00108 AACAC 0.000965 AACAG 0.001 AACAT 0.000823 AACCA 0.000997 AACCC 0.000993 AACCG 0.000643 AACCT 0.000821 AACGA 0.000965 AACGC 0.000859 AACGG 0.000759 AACGT 0.00064 AACTA 0.000313 AACTC 0.000711 AACTG 0.000673 AACTT 0.000577 AAGAA 0.00137 AAGAC 0.00114 AAGAG 0.00122 AAGAT 0.000914 AAGCA 0.00125 AAGCC 0.0012 AAGCG 0.000878 AAGCT 0.00115 AAGGA 0.00116 AAGGC 0.00127 AAGGG 0.00118 AAGGT 0.000986 AAGTA 0.000556 AAGTC 0.000936 AAGTG 0.000852 AAGTT 0.000577 AATAA 0.000444 AATAC 0.00053 AATAG 0.000468 AATAT 0.00051 AATCA 0.000905 AATCC 0.00071 AATCG 0.000749 AATCT 0.000665 AATGA 0.000996 AATGC 0.000956 AATGG 0.000968 AATGT 0.00074 AATTA 0.000305 AATTC 0.000655 AATTG 0.000725 AATTT 0.000528 ACAAA 0.00096 ACAAC 0.00106 ACAAG 0.00125 ACAAT 0.000762 ACACA 0.00111 ACACC 0.00106 ACACG 0.000931 ACACT 0.000674 ACAGA 0.00104 ACAGC 0.00139 ACAGG 0.00108 ACAGT 0.000726 ACATA 0.000505 ACATC 0.00106 ACATG 0.00132 ACATT 0.00074 ACCAA 0.00114 ACCAC 0.00123 ACCAG 0.00121 ACCAT 0.00103 ACCCA 0.00106 ACCCC 0.00119 ACCCG 0.000776 ACCCT 0.000915 ACCGA 0.00087 ACCGC 0.000863 ACCGG 0.000634 ACCGT 0.00065 ACCTA 0.000616 ACCTC 0.00123 ACCTG 0.00113 ACCTT 0.000986 ACGAA 0.00102 ACGAC 0.00135 ACGAG 0.00129 ACGAT 0.000928 ACGCA 0.000853 ACGCC 0.00123 ACGCG 0.000817 ACGCT 0.000748 ACGGA 0.00082 ACGGC 0.00125 ACGGG 0.000851 ACGGT 0.00065 ACGTA 0.000456 ACGTC 0.00102 ACGTG 0.000842 ACGTT 0.00064 ACTAA 0.000266 ACTAC 0.000513 ACTAG 0.000334 ACTAT 0.000379 ACTCA 0.000716 ACTCC 0.000729 ACTCG 0.000947 ACTCT 0.000692 ACTGA 0.000774 ACTGC 0.000991 ACTGG 0.000977 ACTGT 0.000726 ACTTA 0.000276 ACTTC 0.000798 ACTTG 0.00108 ACTTT 0.000769 AGAAA 0.00124 AGAAC 0.000866 AGAAG 0.00143 AGAAT 0.000782 AGACA 0.00119 AGACC 0.000944 AGACG 0.00123 AGACT 0.000793 AGAGA 0.00138 AGAGC 0.00112 AGAGG 0.00138 AGAGT 0.000692 AGATA 0.000596 AGATC 0.000901 AGATG 0.00132 AGATT 0.000665 AGCAA 0.00126 AGCAC 0.00113 AGCAG 0.0015 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.00139 AGCCC 0.0011 AGCCG 0.00104 AGCCT 0.00113 AGCGA 0.00109 AGCGC 0.00101 AGCGG 0.00097 AGCGT 0.000748 AGCTA 0.000539 AGCTC 0.00125 AGCTG 0.00138 AGCTT 0.00115 AGGAA 0.00115 AGGAC 0.00098 AGGAG 0.00135 AGGAT 0.000871 AGGCA 0.00141 AGGCC 0.00125 AGGCG 0.0013 AGGCT 0.00113 AGGGA 0.00106 AGGGC 0.0012 AGGGG 0.00138 AGGGT 0.000915 AGGTA 0.000923 AGGTC 0.00103 AGGTG 0.00118 AGGTT 0.000821 AGTAA 0.000396 AGTAC 0.000557 AGTAG 0.000533 AGTAT 0.000439 AGTCA 0.00091 AGTCC 0.000719 AGTCG 0.00105 AGTCT 0.000793 AGTGA 0.000861 AGTGC 0.000829 AGTGG 0.000944 AGTGT 0.000674 AGTTA 0.000221 AGTTC 0.000619 AGTTG 0.00086 AGTTT 0.000574 ATAAA 0.000416 ATAAC 0.000374 ATAAG 0.000445 ATAAT 0.000401 ATACA 0.000643 ATACC 0.000698 ATACG 0.000468 ATACT 0.000439 ATAGA 0.000516 ATAGC 0.000516 ATAGG 0.000421 ATAGT 0.000379 ATATA 0.000405 ATATC 0.000718 ATATG 0.000599 ATATT 0.00051 ATCAA 0.00111 ATCAC 0.00105 ATCAG 0.000984 ATCAT 0.0012 ATCCA 0.00103 ATCCC 0.000905 ATCCG 0.000787 ATCCT 0.000871 ATCGA 0.00107 ATCGC 0.00102 ATCGG 0.000773 ATCGT 0.000928 ATCTA 0.000476 ATCTC 0.00106 ATCTG 0.00103 ATCTT 0.000914 ATGAA 0.00109 ATGAC 0.00116 ATGAG 0.00102 ATGAT 0.0012 ATGCA 0.0012 ATGCC 0.00123 ATGCG 0.000932 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.00142 ATGGG 0.00109 ATGGT 0.00103 ATGTA 0.000682 ATGTC 0.00111 ATGTG 0.00102 ATGTT 0.000823 ATTAA 0.000262 ATTAC 0.000387 ATTAG 0.000289 ATTAT 0.000401 ATTCA 0.000879 ATTCC 0.00075 ATTCG 0.000811 ATTCT 0.000782 ATTGA 0.000973 ATTGC 0.000898 ATTGG 0.000911 ATTGT 0.000762 ATTTA 0.000328 ATTTC 0.000908 ATTTG 0.000802 ATTTT 0.000704 CAAAA 0.00111 CAAAC 0.00109 CAAAG 0.00122 CAAAT 0.000802 CAACA 0.00142 CAACC 0.00128 CAACG 0.00116 CAACT 0.00086 CAAGA 0.00144 CAAGC 0.00157 CAAGG 0.00154 CAAGT 0.00108 CAATA 0.000582 CAATC 0.00102 CAATG 0.00121 CAATT 0.000725 CACAA 0.00106 CACAC 0.00119 CACAG 0.00113 CACAT 0.00102 CACCA 0.0016 CACCC 0.00122 CACCG 0.000984 CACCT 0.00118 CACGA 0.00128 CACGC 0.0011 CACGG 0.000966 CACGT 0.000842 CACTA 0.000461 CACTC 0.00093 CACTG 0.00106 CACTT 0.000852 CAGAA 0.00116 CAGAC 0.00127 CAGAG 0.00126 CAGAT 0.00103 CAGCA 0.00183 CAGCC 0.0017 CAGCG 0.00138 CAGCT 0.00138 CAGGA 0.00118 CAGGC 0.0016 CAGGG 0.00129 CAGGT 0.00113 CAGTA 0.000578 CAGTC 0.00116 CAGTG 0.00106 CAGTT 0.000673 CATAA 0.000419 CATAC 0.000663 CATAG 0.000489 CATAT 0.000599 CATCA 0.0017 CATCC 0.00138 CATCG 0.00138 CATCT 0.00132 CATGA 0.00133 CATGC 0.00144 CATGG 0.00151 CATGT 0.00132 CATTA 0.000422 CATTC 0.00109 CATTG 0.00121 CATTT 0.000925 CCAAA 0.00117 CCAAC 0.00126 CCAAG 0.00152 CCAAT 0.000911 CCACA 0.00113 CCACC 0.00154 CCACG 0.00117 CCACT 0.000944 CCAGA 0.00132 CCAGC 0.00174 CCAGG 0.00142 CCAGT 0.000977 CCATA 0.000541 CCATC 0.00167 CCATG 0.00151 CCATT 0.000968 CCCAA 0.00122 CCCAC 0.00118 CCCAG 0.00126 CCCAT 0.00109 CCCCA 0.00121 CCCCC 0.00173 CCCCG 0.00109 CCCCT 0.00138 CCCGA 0.000981 CCCGC 0.00126 CCCGG 0.000823 CCCGT 0.000851 CCCTA 0.000444 CCCTC 0.00164 CCCTG 0.00129 CCCTT 0.00118 CCGAA 0.000935 CCGAC 0.0012 CCGAG 0.00119 CCGAT 0.000773 CCGCA 0.000985 CCGCC 0.00167 CCGCG 0.00101 CCGCT 0.00097 CCGGA 0.000731 CCGGC 0.00121 CCGGG 0.000823 CCGGT 0.000634 CCGTA 0.000439 CCGTC 0.0014 CCGTG 0.000966 CCGTT 0.000759 CCTAA 0.000347 CCTAC 0.000722 CCTAG 0.000555 CCTAT 0.000421 CCTCA 0.00129 CCTCC 0.00174 CCTCG 0.00169 CCTCT 0.00138 CCTGA 0.00109 CCTGC 0.00161 CCTGG 0.00142 CCTGT 0.00108 CCTTA 0.000472 CCTTC 0.00147 CCTTG 0.00154 CCTTT 0.0011 CGAAA 0.00105 CGAAC 0.000957 CGAAG 0.0012 CGAAT 0.000811 CGACA 0.00145 CGACC 0.00129 CGACG 0.00158 CGACT 0.00105 CGAGA 0.00141 CGAGC 0.00144 CGAGG 0.00169 CGAGT 0.000947 CGATA 0.000651 CGATC 0.00102 CGATG 0.00138 CGATT 0.000749 CGCAA 0.00108 CGCAC 0.000916 CGCAG 0.00116 CGCAT 0.000932 CGCCA 0.00154 CGCCC 0.00144 CGCCG 0.00154 CGCCT 0.0013 CGCGA 0.00105 CGCGC 0.00121 CGCGG 0.00101 CGCGT 0.000817 CGCTA 0.000471 CGCTC 0.00108 CGCTG 0.00138 CGCTT 0.000878 CGGAA 0.000821 CGGAC 0.00083 CGGAG 0.000957 CGGAT 0.000787 CGGCA 0.00139 CGGCC 0.00141 CGGCG 0.00154 CGGCT 0.00104 CGGGA 0.000901 CGGGC 0.00116 CGGGG 0.00109 CGGGT 0.000776 CGGTA 0.000492 CGGTC 0.000902 CGGTG 0.000984 CGGTT 0.000643 CGTAA 0.000363 CGTAC 0.000606 CGTAG 0.000532 CGTAT 0.000468 CGTCA 0.0014 CGTCC 0.00119 CGTCG 0.00158 CGTCT 0.00123 CGTGA 0.00101 CGTGC 0.00108 CGTGG 0.00117 CGTGT 0.000931 CGTTA 0.000328 CGTTC 0.000919 CGTTG 0.00116 CGTTT 0.000814 CTAAA 0.000328 CTAAC 0.000318 CTAAG 0.000347 CTAAT 0.000289 CTACA 0.000642 CTACC 0.000866 CTACG 0.000532 CTACT 0.000533 CTAGA 0.000506 CTAGC 0.000556 CTAGG 0.000555 CTAGT 0.000334 CTATA 0.000278 CTATC 0.000595 CTATG 0.000489 CTATT 0.000468 CTCAA 0.00114 CTCAC 0.00104 CTCAG 0.000978 CTCAT 0.00102 CTCCA 0.00136 CTCCC 0.00131 CTCCG 0.000957 CTCCT 0.00135 CTCGA 0.00156 CTCGC 0.00144 CTCGG 0.00119 CTCGT 0.00129 CTCTA 0.000514 CTCTC 0.00158 CTCTG 0.00126 CTCTT 0.00122 CTGAA 0.000995 CTGAC 0.00116 CTGAG 0.000978 CTGAT 0.000984 CTGCA 0.0014 CTGCC 0.00181 CTGCG 0.00116 CTGCT 0.0015 CTGGA 0.00128 CTGGC 0.00171 CTGGG 0.00126 CTGGT 0.00121 CTGTA 0.000626 CTGTC 0.00147 CTGTG 0.00113 CTGTT 0.001 CTTAA 0.000262 CTTAC 0.000493 CTTAG 0.000347 CTTAT 0.000445 CTTCA 0.00132 CTTCC 0.00139 CTTCG 0.0012 CTTCT 0.00143 CTTGA 0.00135 CTTGC 0.00151 CTTGG 0.00152 CTTGT 0.00125 CTTTA 0.000397 CTTTC 0.00129 CTTTG 0.00122 CTTTT 0.00119 GAAAA 0.00119 GAAAC 0.000997 GAAAG 0.00129 GAAAT 0.000908 GAACA 0.00107 GAACC 0.00098 GAACG 0.000919 GAACT 0.000619 GAAGA 0.0016 GAAGC 0.00147 GAAGG 0.00147 GAAGT 0.000798 GAATA 0.000596 GAATC 0.000875 GAATG 0.00109 GAATT 0.000655 GACAA 0.00128 GACAC 0.00104 GACAG 0.00147 GACAT 0.00111 GACCA 0.00126 GACCC 0.00104 GACCG 0.000902 GACCT 0.00103 GACGA 0.00174 GACGC 0.00123 GACGG 0.0014 GACGT 0.00102 GACTA 0.00043 GACTC 0.000947 GACTG 0.00116 GACTT 0.000936 GAGAA 0.00132 GAGAC 0.00123 GAGAG 0.00158 GAGAT 0.00106 GAGCA 0.00131 GAGCC 0.00121 GAGCG 0.00108 GAGCT 0.00125 GAGGA 0.00157 GAGGC 0.00167 GAGGG 0.00164 GAGGT 0.00123 GAGTA 0.000501 GAGTC 0.000947 GAGTG 0.00093 GAGTT 0.000711 GATAA 0.00051 GATAC 0.000704 GATAG 0.000595 GATAT 0.000718 GATCA 0.00104 GATCC 0.000925 GATCG 0.00102 GATCT 0.000901 GATGA 0.00157 GATGC 0.00148 GATGG 0.00167 GATGT 0.00106 GATTA 0.00036 GATTC 0.000875 GATTG 0.00102 GATTT 0.00077 GCAAA 0.00112 GCAAC 0.00122 GCAAG 0.00151 GCAAT 0.000898 GCACA 0.00114 GCACC 0.00121 GCACG 0.00108 GCACT 0.000829 GCAGA 0.0014 GCAGC 0.00189 GCAGG 0.00161 GCAGT 0.000991 GCATA 0.000564 GCATC 0.00148 GCATG 0.00144 GCATT 0.000956 GCCAA 0.00146 GCCAC 0.00132 GCCAG 0.00171 GCCAT 0.00142 GCCCA 0.00134 GCCCC 0.00131 GCCCG 0.00116 GCCCT 0.0012 GCCGA 0.00134 GCCGC 0.00159 GCCGG 0.00121 GCCGT 0.00125 GCCTA 0.000551 GCCTC 0.00167 GCCTG 0.0016 GCCTT 0.00127 GCGAA 0.00099 GCGAC 0.00132 GCGAG 0.00144 GCGAT 0.00102 GCGCA 0.00112 GCGCC 0.00142 GCGCG 0.00121 GCGCT 0.00101 GCGGA 0.000929 GCGGC 0.00159 GCGGG 0.00126 GCGGT 0.000863 GCGTA 0.000467 GCGTC 0.00123 GCGTG 0.0011 GCGTT 0.000859 GCTAA 0.000359 GCTAC 0.000707 GCTAG 0.000556 GCTAT 0.000516 GCTCA 0.0011 GCTCC 0.00118 GCTCG 0.00144 GCTCT 0.00112 GCTGA 0.00127 GCTGC 0.00189 GCTGG 0.00174 GCTGT 0.00139 GCTTA 0.000402 GCTTC 0.00147 GCTTG 0.00157 GCTTT 0.00104 GGAAA 0.00117 GGAAC 0.00086 GGAAG 0.00139 GGAAT 0.00075 GGACA 0.00103 GGACC 0.000934 GGACG 0.00119 GGACT 0.000719 GGAGA 0.00133 GGAGC 0.00118 GGAGG 0.00174 GGAGT 0.000729 GGATA 0.00058 GGATC 0.000925 GGATG 0.00138 GGATT 0.00071 GGCAA 0.00131 GGCAC 0.00118 GGCAG 0.00181 GGCAT 0.00123 GGCCA 0.00153 GGCCC 0.0012 GGCCG 0.00141 GGCCT 0.00125 GGCGA 0.00151 GGCGC 0.00142 GGCGG 0.00167 GGCGT 0.00123 GGCTA 0.000551 GGCTC 0.00121 GGCTG 0.0017 GGCTT 0.0012 GGGAA 0.00111 GGGAC 0.000967 GGGAG 0.00131 GGGAT 0.000905 GGGCA 0.00127 GGGCC 0.0012 GGGCG 0.00144 GGGCT 0.0011 GGGGA 0.00118 GGGGC 0.00131 GGGGG 0.00173 GGGGT 0.00119 GGGTA 0.000683 GGGTC 0.00104 GGGTG 0.00122 GGGTT 0.000993 GGTAA 0.000485 GGTAC 0.000809 GGTAG 0.000866 GGTAT 0.000698 GGTCA 0.00106 GGTCC 0.000934 GGTCG 0.00129 GGTCT 0.000944 GGTGA 0.00119 GGTGC 0.00121 GGTGG 0.00154 GGTGT 0.00106 GGTTA 0.000348 GGTTC 0.00098 GGTTG 0.00128 GGTTT 0.000853 GTAAA 0.000459 GTAAC 0.000366 GTAAG 0.000493 GTAAT 0.000387 GTACA 0.000756 GTACC 0.000809 GTACG 0.000606 GTACT 0.000557 GTAGA 0.000634 GTAGC 0.000707 GTAGG 0.000722 GTAGT 0.000513 GTATA 0.000354 GTATC 0.000704 GTATG 0.000663 GTATT 0.00053 GTCAA 0.00124 GTCAC 0.00105 GTCAG 0.00116 GTCAT 0.00116 GTCCA 0.00109 GTCCC 0.000967 GTCCG 0.00083 GTCCT 0.00098 GTCGA 0.0015 GTCGC 0.00132 GTCGG 0.0012 GTCGT 0.00135 GTCTA 0.000516 GTCTC 0.00123 GTCTG 0.00127 GTCTT 0.00114 GTGAA 0.000954 GTGAC 0.00105 GTGAG 0.00104 GTGAT 0.00105 GTGCA 0.00104 GTGCC 0.00118 GTGCG 0.000916 GTGCT 0.00113 GTGGA 0.00106 GTGGC 0.00132 GTGGG 0.00118 GTGGT 0.00123 GTGTA 0.000579 GTGTC 0.00104 GTGTG 0.00119 GTGTT 0.000965 GTTAA 0.000216 GTTAC 0.000366 GTTAG 0.000318 GTTAT 0.000374 GTTCA 0.000908 GTTCC 0.00086 GTTCG 0.000957 GTTCT 0.000866 GTTGA 0.00119 GTTGC 0.00122 GTTGG 0.00126 GTTGT 0.00106 GTTTA 0.000339 GTTTC 0.000997 GTTTG 0.00109 GTTTT 0.000813 TAAAA 0.0004 TAAAC 0.000339 TAAAG 0.000397 TAAAT 0.000328 TAACA 0.000377 TAACC 0.000348 TAACG 0.000328 TAACT 0.000221 TAAGA 0.0004 TAAGC 0.000402 TAAGG 0.000472 TAAGT 0.000276 TAATA 0.000253 TAATC 0.00036 TAATG 0.000422 TAATT 0.000305 TACAA 0.000616 TACAC 0.000579 TACAG 0.000626 TACAT 0.000682 TACCA 0.000754 TACCC 0.000683 TACCG 0.000492 TACCT 0.000923 TACGA 0.000607 TACGC 0.000467 TACGG 0.000439 TACGT 0.000456 TACTA 0.000288 TACTC 0.000501 TACTG 0.000578 TACTT 0.000556 TAGAA 0.000461 TAGAC 0.000516 TAGAG 0.000514 TAGAT 0.000476 TAGCA 0.000577 TAGCC 0.000551 TAGCG 0.000471 TAGCT 0.000539 TAGGA 0.000435 TAGGC 0.000551 TAGGG 0.000444 TAGGT 0.000616 TAGTA 0.000288 TAGTC 0.00043 TAGTG 0.000461 TAGTT 0.000313 TATAA 0.000267 TATAC 0.000354 TATAG 0.000278 TATAT 0.000405 TATCA 0.000699 TATCC 0.00058 TATCG 0.000651 TATCT 0.000596 TATGA 0.000561 TATGC 0.000564 TATGG 0.000541 TATGT 0.000505 TATTA 0.000253 TATTC 0.000596 TATTG 0.000582 TATTT 0.000521 TCAAA 0.000972 TCAAC 0.00119 TCAAG 0.00135 TCAAT 0.000973 TCACA 0.00103 TCACC 0.00119 TCACG 0.00101 TCACT 0.000861 TCAGA 0.000973 TCAGC 0.00127 TCAGG 0.00109 TCAGT 0.000774 TCATA 0.000561 TCATC 0.00157 TCATG 0.00133 TCATT 0.000996 TCCAA 0.00105 TCCAC 0.00106 TCCAG 0.00128 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.00114 TCCCC 0.00118 TCCCG 0.000901 TCCCT 0.00106 TCCGA 0.000914 TCCGC 0.000929 TCCGG 0.000731 TCCGT 0.00082 TCCTA 0.000435 TCCTC 0.00157 TCCTG 0.00118 TCCTT 0.00116 TCGAA 0.00107 TCGAC 0.0015 TCGAG 0.00156 TCGAT 0.00107 TCGCA 0.00113 TCGCC 0.00151 TCGCG 0.00105 TCGCT 0.00109 TCGGA 0.000914 TCGGC 0.00134 TCGGG 0.000981 TCGGT 0.00087 TCGTA 0.000607 TCGTC 0.00174 TCGTG 0.00128 TCGTT 0.000965 TCTAA 0.000313 TCTAC 0.000634 TCTAG 0.000506 TCTAT 0.000516 TCTCA 0.00107 TCTCC 0.00133 TCTCG 0.00141 TCTCT 0.00138 TCTGA 0.000973 TCTGC 0.0014 TCTGG 0.00132 TCTGT 0.00104 TCTTA 0.0004 TCTTC 0.0016 TCTTG 0.00144 TCTTT 0.00119 TGAAA 0.000932 TGAAC 0.000908 TGAAG 0.00132 TGAAT 0.000879 TGACA 0.00123 TGACC 0.00106 TGACG 0.0014 TGACT 0.00091 TGAGA 0.00107 TGAGC 0.0011 TGAGG 0.00129 TGAGT 0.000716 TGATA 0.000699 TGATC 0.00104 TGATG 0.0017 TGATT 0.000905 TGCAA 0.0011 TGCAC 0.00104 TGCAG 0.0014 TGCAT 0.0012 TGCCA 0.00145 TGCCC 0.00127 TGCCG 0.00139 TGCCT 0.00141 TGCGA 0.00113 TGCGC 0.00112 TGCGG 0.000985 TGCGT 0.000853 TGCTA 0.000577 TGCTC 0.00131 TGCTG 0.00183 TGCTT 0.00125 TGGAA 0.00108 TGGAC 0.00109 TGGAG 0.00136 TGGAT 0.00103 TGGCA 0.00145 TGGCC 0.00153 TGGCG 0.00154 TGGCT 0.00139 TGGGA 0.00114 TGGGC 0.00134 TGGGG 0.00121 TGGGT 0.00106 TGGTA 0.000754 TGGTC 0.00126 TGGTG 0.0016 TGGTT 0.000997 TGTAA 0.000464 TGTAC 0.000756 TGTAG 0.000642 TGTAT 0.000643 TGTCA 0.00123 TGTCC 0.00103 TGTCG 0.00145 TGTCT 0.00119 TGTGA 0.00103 TGTGC 0.00114 TGTGG 0.00113 TGTGT 0.00111 TGTTA 0.000377 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.00142 TGTTT 0.001 TTAAA 0.000258 TTAAC 0.000216 TTAAG 0.000262 TTAAT 0.000262 TTACA 0.000464 TTACC 0.000485 TTACG 0.000363 TTACT 0.000396 TTAGA 0.000313 TTAGC 0.000359 TTAGG 0.000347 TTAGT 0.000266 TTATA 0.000267 TTATC 0.00051 TTATG 0.000419 TTATT 0.000444 TTCAA 0.001 TTCAC 0.000954 TTCAG 0.000995 TTCAT 0.00109 TTCCA 0.00108 TTCCC 0.00111 TTCCG 0.000821 TTCCT 0.00115 TTCGA 0.00107 TTCGC 0.00099 TTCGG 0.000935 TTCGT 0.00102 TTCTA 0.000461 TTCTC 0.00132 TTCTG 0.00116 TTCTT 0.00137 TTGAA 0.001 TTGAC 0.00124 TTGAG 0.00114 TTGAT 0.00111 TTGCA 0.0011 TTGCC 0.00131 TTGCG 0.00108 TTGCT 0.00126 TTGGA 0.00105 TTGGC 0.00146 TTGGG 0.00122 TTGGT 0.00114 TTGTA 0.000616 TTGTC 0.00128 TTGTG 0.00106 TTGTT 0.00108 TTTAA 0.000258 TTTAC 0.000459 TTTAG 0.000328 TTTAT 0.000416 TTTCA 0.000932 TTTCC 0.00117 TTTCG 0.00105 TTTCT 0.00124 TTTGA 0.000972 TTTGC 0.00112 TTTGG 0.00117 TTTGT 0.00096 TTTTA 0.0004 TTTTC 0.00119 TTTTG 0.00111 TTTTT 0.00124 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.2977 AAAAC 0.2147 AAAAG 0.2924 AAAAT 0.1952 AAACA 0.3113 AAACC 0.2569 AAACG 0.2388 AAACT 0.1931 AAAGA 0.2934 AAAGC 0.2556 AAAGG 0.2514 AAAGT 0.1996 AAATA 0.1981 AAATC 0.2737 AAATG 0.3286 AAATT 0.1996 AACAA 0.2856 AACAC 0.2389 AACAG 0.2506 AACAT 0.2249 AACCA 0.2939 AACCC 0.2767 AACCG 0.1828 AACCT 0.2466 AACGA 0.3081 AACGC 0.2589 AACGG 0.228 AACGT 0.205 AACTA 0.1509 AACTC 0.2936 AACTG 0.2902 AACTT 0.2652 AAGAA 0.29 AAGAC 0.2453 AAGAG 0.2503 AAGAT 0.2144 AAGCA 0.2765 AAGCC 0.2659 AAGCG 0.1875 AAGCT 0.2701 AAGGA 0.2491 AAGGC 0.2814 AAGGG 0.2421 AAGGT 0.2274 AAGTA 0.1962 AAGTC 0.3126 AAGTG 0.2778 AAGTT 0.2134 AATAA 0.2275 AATAC 0.2609 AATAG 0.2349 AATAT 0.2767 AATCA 0.3072 AATCC 0.2307 AATCG 0.2401 AATCT 0.222 AATGA 0.2769 AATGC 0.2589 AATGG 0.2541 AATGT 0.2101 AATTA 0.1519 AATTC 0.2857 AATTG 0.3181 AATTT 0.2443 ACAAA 0.2421 ACAAC 0.2558 ACAAG 0.3009 ACAAT 0.2011 ACACA 0.2966 ACACC 0.2804 ACACG 0.2302 ACACT 0.1927 ACAGA 0.2468 ACAGC 0.3192 ACAGG 0.2478 ACAGT 0.1861 ACATA 0.1534 ACATC 0.297 ACATG 0.3371 ACATT 0.2125 ACCAA 0.2536 ACCAC 0.2572 ACCAG 0.2606 ACCAT 0.2286 ACCCA 0.2836 ACCCC 0.2905 ACCCG 0.1915 ACCCT 0.2344 ACCGA 0.2966 ACCGC 0.2671 ACCGG 0.2168 ACCGT 0.2195 ACCTA 0.1652 ACCTC 0.2976 ACCTG 0.2767 ACCTT 0.2605 ACGAA 0.2362 ACGAC 0.2799 ACGAG 0.2728 ACGAT 0.2111 ACGCA 0.243 ACGCC 0.3241 ACGCG 0.2206 ACGCT 0.2123 ACGGA 0.2348 ACGGC 0.3423 ACGGG 0.2295 ACGGT 0.1934 ACGTA 0.1702 ACGTC 0.3256 ACGTG 0.2787 ACGTT 0.2254 ACTAA 0.1882 ACTAC 0.3136 ACTAG 0.2239 ACTAT 0.2742 ACTCA 0.2461 ACTCC 0.2343 ACTCG 0.2832 ACTCT 0.2364 ACTGA 0.2365 ACTGC 0.2774 ACTGG 0.2698 ACTGT 0.2163 ACTTA 0.1071 ACTTC 0.2715 ACTTG 0.3548 ACTTT 0.2665 AGAAA 0.2828 AGAAC 0.2044 AGAAG 0.3207 AGAAT 0.1921 AGACA 0.2923 AGACC 0.2258 AGACG 0.2759 AGACT 0.206 AGAGA 0.2986 AGAGC 0.2492 AGAGG 0.2857 AGAGT 0.1664 AGATA 0.191 AGATC 0.2608 AGATG 0.3539 AGATT 0.1943 AGCAA 0.2614 AGCAC 0.2179 AGCAG 0.2906 AGCAT 0.2301 AGCCA 0.3037 AGCCC 0.2274 AGCCG 0.2184 AGCCT 0.2506 AGCGA 0.2992 AGCGC 0.256 AGCGG 0.2426 AGCGT 0.2022 AGCTA 0.1388 AGCTC 0.273 AGCTG 0.312 AGCTT 0.2762 AGGAA 0.2702 AGGAC 0.2223 AGGAG 0.2923 AGGAT 0.2152 AGGCA 0.2879 AGGCC 0.2385 AGGCG 0.2392 AGGCT 0.2344 AGGGA 0.237 AGGGC 0.2628 AGGGG 0.2912 AGGGT 0.2091 AGGTA 0.2376 AGGTC 0.2526 AGGTG 0.2925 AGGTT 0.2172 AGTAA 0.2158 AGTAC 0.2778 AGTAG 0.2643 AGTAT 0.2421 AGTCA 0.2724 AGTCC 0.2121 AGTCG 0.2779 AGTCT 0.2375 AGTGA 0.2705 AGTGC 0.2513 AGTGG 0.2706 AGTGT 0.2076 AGTTA 0.113 AGTTC 0.2719 AGTTG 0.3646 AGTTT 0.2505 ATAAA 0.2538 ATAAC 0.2321 ATAAG 0.2611 ATAAT 0.253 ATACA 0.2873 ATACC 0.2977 ATACG 0.2044 ATACT 0.2106 ATAGA 0.2802 ATAGC 0.2746 ATAGG 0.2197 ATAGT 0.2255 ATATA 0.1888 ATATC 0.3121 ATATG 0.2582 ATATT 0.2409 ATCAA 0.2637 ATCAC 0.2353 ATCAG 0.2266 ATCAT 0.2744 ATCCA 0.295 ATCCC 0.2417 ATCCG 0.2141 ATCCT 0.2492 ATCGA 0.288 ATCGC 0.2634 ATCGG 0.2048 ATCGT 0.2438 ATCTA 0.1418 ATCTC 0.2989 ATCTG 0.2847 ATCTT 0.2746 ATGAA 0.2538 ATGAC 0.2515 ATGAG 0.2229 ATGAT 0.2718 ATGCA 0.2793 ATGCC 0.2716 ATGCG 0.1991 ATGCT 0.25 ATGGA 0.2546 ATGGC 0.2976 ATGGG 0.2228 ATGGT 0.2251 ATGTA 0.1942 ATGTC 0.2965 ATGTG 0.2743 ATGTT 0.235 ATTAA 0.2026 ATTAC 0.28 ATTAG 0.2173 ATTAT 0.3002 ATTCA 0.2877 ATTCC 0.2294 ATTCG 0.2409 ATTCT 0.2419 ATTGA 0.2769 ATTGC 0.257 ATTGG 0.2457 ATTGT 0.2204 ATTTA 0.1324 ATTTC 0.32 ATTTG 0.2976 ATTTT 0.25 CAAAA 0.2608 CAAAC 0.2442 CAAAG 0.2889 CAAAT 0.2061 CAACA 0.3017 CAACC 0.2648 CAACG 0.2352 CAACT 0.1983 CAAGA 0.2607 CAAGC 0.2748 CAAGG 0.2638 CAAGT 0.2007 CAATA 0.1799 CAATC 0.2829 CAATG 0.3257 CAATT 0.2116 CACAA 0.2493 CACAC 0.2508 CACAG 0.2577 CACAT 0.2423 CACCA 0.3237 CACCC 0.239 CACCG 0.1902 CACCT 0.2471 CACGA 0.3144 CACGC 0.2474 CACGG 0.2298 CACGT 0.2084 CACTA 0.1562 CACTC 0.2685 CACTG 0.315 CACTT 0.2603 CAGAA 0.2521 CAGAC 0.2561 CAGAG 0.2629 CAGAT 0.2289 CAGCA 0.2883 CAGCC 0.2695 CAGCG 0.2092 CAGCT 0.233 CAGGA 0.2334 CAGGC 0.3004 CAGGG 0.2444 CAGGT 0.2218 CAGTA 0.1791 CAGTC 0.3186 CAGTG 0.2964 CAGTT 0.2059 CATAA 0.1984 CATAC 0.2928 CATAG 0.2277 CATAT 0.281 CATCA 0.3027 CATCC 0.2286 CATCG 0.2346 CATCT 0.2341 CATGA 0.2512 CATGC 0.2512 CATGG 0.264 CATGT 0.2336 CATTA 0.1251 CATTC 0.2956 CATTG 0.318 CATTT 0.2613 CCAAA 0.2486 CCAAC 0.251 CCAAG 0.3068 CCAAT 0.1937 CCACA 0.2504 CCACC 0.3089 CCACG 0.2356 CCACT 0.2052 CCAGA 0.2451 CCAGC 0.3104 CCAGG 0.2554 CCAGT 0.1891 CCATA 0.1318 CCATC 0.3342 CCATG 0.3188 CCATT 0.2152 CCCAA 0.2636 CCCAC 0.2377 CCCAG 0.2672 CCCAT 0.2316 CCCCA 0.2403 CCCCC 0.2961 CCCCG 0.2005 CCCCT 0.2631 CCCGA 0.2618 CCCGC 0.3062 CCCGG 0.2133 CCCGT 0.2187 CCCTA 0.1079 CCCTC 0.3376 CCCTG 0.2904 CCCTT 0.2642 CCGAA 0.2393 CCGAC 0.2799 CCGAG 0.2798 CCGAT 0.2011 CCGCA 0.236 CCGCC 0.3364 CCGCG 0.2124 CCGCT 0.2153 CCGGA 0.2305 CCGGC 0.332 CCGGG 0.2361 CCGGT 0.2014 CCGTA 0.1376 CCGTC 0.3699 CCGTG 0.2713 CCGTT 0.2212 CCTAA 0.1868 CCTAC 0.3254 CCTAG 0.2706 CCTAT 0.2173 CCTCA 0.2304 CCTCC 0.272 CCTCG 0.2667 CCTCT 0.2308 CCTGA 0.2243 CCTGC 0.2946 CCTGG 0.2687 CCTGT 0.2123 CCTTA 0.1214 CCTTC 0.3106 CCTTG 0.3302 CCTTT 0.2378 CGAAA 0.2651 CGAAC 0.2351 CGAAG 0.291 CGAAT 0.2088 CGACA 0.2835 CGACC 0.2356 CGACG 0.2784 CGACT 0.2026 CGAGA 0.2664 CGAGC 0.2594 CGAGG 0.2957 CGAGT 0.1786 CGATA 0.1813 CGATC 0.259 CGATG 0.3514 CGATT 0.2082 CGCAA 0.2772 CGCAC 0.2162 CGCAG 0.2771 CGCAT 0.2295 CGCCA 0.2779 CGCCC 0.2386 CGCCG 0.2501 CGCCT 0.2334 CGCGA 0.2732 CGCGC 0.2737 CGCGG 0.2412 CGCGT 0.2119 CGCTA 0.1365 CGCTC 0.2723 CGCTG 0.351 CGCTT 0.2402 CGGAA 0.2544 CGGAC 0.2342 CGGAG 0.2724 CGGAT 0.239 CGGCA 0.2679 CGGCC 0.255 CGGCG 0.2655 CGGCT 0.2116 CGGGA 0.2413 CGGGC 0.2851 CGGGG 0.2676 CGGGT 0.206 CGGTA 0.1814 CGGTC 0.2908 CGGTG 0.3077 CGGTT 0.22 CGTAA 0.2006 CGTAC 0.2851 CGTAG 0.2646 CGTAT 0.2497 CGTCA 0.2722 CGTCC 0.2125 CGTCG 0.2811 CGTCT 0.2342 CGTGA 0.2599 CGTGC 0.2465 CGTGG 0.2745 CGTGT 0.2191 CGTTA 0.1138 CGTTC 0.2833 CGTTG 0.3513 CGTTT 0.2516 CTAAA 0.2519 CTAAC 0.2422 CTAAG 0.2739 CTAAT 0.232 CTACA 0.2559 CTACC 0.3193 CTACG 0.2061 CTACT 0.2187 CTAGA 0.2611 CTAGC 0.2727 CTAGG 0.2786 CTAGT 0.1875 CTATA 0.163 CTATC 0.3164 CTATG 0.2632 CTATT 0.2574 CTCAA 0.2814 CTCAC 0.2389 CTCAG 0.2342 CTCAT 0.2455 CTCCA 0.2848 CTCCC 0.2515 CTCCG 0.1943 CTCCT 0.2694 CTCGA 0.2862 CTCGC 0.2557 CTCGG 0.2176 CTCGT 0.2405 CTCTA 0.1309 CTCTC 0.3217 CTCTG 0.2764 CTCTT 0.271 CTGAA 0.2488 CTGAC 0.2688 CTGAG 0.2347 CTGAT 0.2477 CTGCA 0.2555 CTGCC 0.2955 CTGCG 0.1941 CTGCT 0.2549 CTGGA 0.2394 CTGGC 0.302 CTGGG 0.2295 CTGGT 0.2291 CTGTA 0.159 CTGTC 0.3326 CTGTG 0.2679 CTGTT 0.2405 CTTAA 0.1913 CTTAC 0.3005 CTTAG 0.2302 CTTAT 0.278 CTTCA 0.259 CTTCC 0.2507 CTTCG 0.2226 CTTCT 0.2677 CTTGA 0.2508 CTTGC 0.2636 CTTGG 0.2628 CTTGT 0.2227 CTTTA 0.1119 CTTTC 0.3118 CTTTG 0.3037 CTTTT 0.2725 GAAAA 0.2594 GAAAC 0.2236 GAAAG 0.2959 GAAAT 0.2211 GAACA 0.3039 GAACC 0.2625 GAACG 0.2437 GAACT 0.1899 GAAGA 0.3035 GAAGC 0.2694 GAAGG 0.2638 GAAGT 0.1633 GAATA 0.2016 GAATC 0.2639 GAATG 0.3284 GAATT 0.2061 GACAA 0.2605 GACAC 0.212 GACAG 0.29 GACAT 0.2375 GACCA 0.3038 GACCC 0.2394 GACCG 0.2088 GACCT 0.248 GACGA 0.3214 GACGC 0.2328 GACGG 0.251 GACGT 0.1949 GACTA 0.1364 GACTC 0.256 GACTG 0.3258 GACTT 0.2818 GAGAA 0.2604 GAGAC 0.2317 GAGAG 0.2845 GAGAT 0.2234 GAGCA 0.2743 GAGCC 0.2499 GAGCG 0.2109 GAGCT 0.2649 GAGGA 0.2585 GAGGC 0.2746 GAGGG 0.2538 GAGGT 0.2131 GAGTA 0.1772 GAGTC 0.2896 GAGTG 0.2922 GAGTT 0.241 GATAA 0.2026 GATAC 0.2653 GATAG 0.2373 GATAT 0.2947 GATCA 0.2774 GATCC 0.2327 GATCG 0.2453 GATCT 0.2446 GATGA 0.275 GATGC 0.2513 GATGG 0.2716 GATGT 0.2021 GATTA 0.1313 GATTC 0.2822 GATTG 0.3281 GATTT 0.2585 GCAAA 0.2434 GCAAC 0.2467 GCAAG 0.3074 GCAAT 0.2024 GCACA 0.2747 GCACC 0.2736 GCACG 0.2377 GCACT 0.2141 GCAGA 0.2426 GCAGC 0.3134 GCAGG 0.262 GCAGT 0.182 GCATA 0.1395 GCATC 0.3198 GCATG 0.3139 GCATT 0.2268 GCCAA 0.2538 GCCAC 0.222 GCCAG 0.2789 GCCAT 0.2453 GCCCA 0.2725 GCCCC 0.2584 GCCCG 0.2221 GCCCT 0.2469 GCCGA 0.2583 GCCGC 0.2828 GCCGG 0.2198 GCCGT 0.2391 GCCTA 0.1213 GCCTC 0.3119 GCCTG 0.3048 GCCTT 0.2621 GCGAA 0.2238 GCGAC 0.2677 GCGAG 0.2846 GCGAT 0.2239 GCGCA 0.2508 GCGCC 0.291 GCGCG 0.2358 GCGCT 0.2224 GCGGA 0.2143 GCGGC 0.3308 GCGGG 0.2626 GCGGT 0.1922 GCGTA 0.1438 GCGTC 0.3314 GCGTG 0.2821 GCGTT 0.2426 GCTAA 0.181 GCTAC 0.3125 GCTAG 0.25 GCTAT 0.2564 GCTCA 0.2434 GCTCC 0.2332 GCTCG 0.2813 GCTCT 0.2421 GCTGA 0.2141 GCTGC 0.2908 GCTGG 0.2694 GCTGT 0.2257 GCTTA 0.1041 GCTTC 0.3147 GCTTG 0.3414 GCTTT 0.2399 GGAAA 0.2766 GGAAC 0.2058 GGAAG 0.3222 GGAAT 0.1955 GGACA 0.2688 GGACC 0.2405 GGACG 0.2829 GGACT 0.2078 GGAGA 0.2752 GGAGC 0.2346 GGAGG 0.329 GGAGT 0.1612 GGATA 0.1753 GGATC 0.2571 GGATG 0.3583 GGATT 0.2093 GGCAA 0.2472 GGCAC 0.2107 GGCAG 0.3112 GGCAT 0.2309 GGCCA 0.2914 GGCCC 0.2192 GGCCG 0.2485 GGCCT 0.2409 GGCGA 0.2706 GGCGC 0.239 GGCGG 0.2703 GGCGT 0.2201 GGCTA 0.1282 GGCTC 0.2522 GGCTG 0.3534 GGCTT 0.2662 GGGAA 0.2665 GGGAC 0.221 GGGAG 0.2903 GGGAT 0.2221 GGGCA 0.2592 GGGCC 0.2385 GGGCG 0.2686 GGGCT 0.2337 GGGGA 0.2227 GGGGC 0.248 GGGGG 0.2956 GGGGT 0.2337 GGGTA 0.1798 GGGTC 0.2597 GGGTG 0.3011 GGGTT 0.2594 GGTAA 0.1819 GGTAC 0.274 GGTAG 0.2884 GGTAT 0.2558 GGTCA 0.2671 GGTCC 0.217 GGTCG 0.2857 GGTCT 0.2302 GGTGA 0.2468 GGTGC 0.2348 GGTGG 0.2977 GGTGT 0.2207 GGTTA 0.1141 GGTTC 0.2783 GGTTG 0.3606 GGTTT 0.2469 GTAAA 0.2732 GTAAC 0.2062 GTAAG 0.2835 GTAAT 0.237 GTACA 0.2769 GTACC 0.2904 GTACG 0.2126 GTACT 0.2201 GTAGA 0.2541 GTAGC 0.2709 GTAGG 0.2663 GTAGT 0.2087 GTATA 0.1678 GTATC 0.3009 GTATG 0.2881 GTATT 0.2432 GTCAA 0.2689 GTCAC 0.228 GTCAG 0.2475 GTCAT 0.2557 GTCCA 0.2934 GTCCC 0.2402 GTCCG 0.2095 GTCCT 0.257 GTCGA 0.2818 GTCGC 0.245 GTCGG 0.2217 GTCGT 0.2515 GTCTA 0.1351 GTCTC 0.2845 GTCTG 0.2922 GTCTT 0.2882 GTGAA 0.2368 GTGAC 0.2539 GTGAG 0.2456 GTGAT 0.2638 GTGCA 0.2519 GTGCC 0.2758 GTGCG 0.2088 GTGCT 0.2636 GTGGA 0.2292 GTGGC 0.2763 GTGGG 0.2346 GTGGT 0.2599 GTGTA 0.1603 GTGTC 0.2785 GTGTG 0.2987 GTGTT 0.2625 GTTAA 0.1843 GTTAC 0.2664 GTTAG 0.2481 GTTAT 0.3012 GTTCA 0.2643 GTTCC 0.2307 GTTCG 0.2592 GTTCT 0.2458 GTTGA 0.2651 GTTGC 0.2525 GTTGG 0.2565 GTTGT 0.2259 GTTTA 0.1166 GTTTC 0.3007 GTTTG 0.3274 GTTTT 0.2553 TAAAA 0.2623 TAAAC 0.225 TAAAG 0.2755 TAAAT 0.2372 TAACA 0.3021 TAACC 0.264 TAACG 0.2403 TAACT 0.1936 TAAGA 0.2561 TAAGC 0.2582 TAAGG 0.299 TAAGT 0.1868 TAATA 0.2054 TAATC 0.2627 TAATG 0.2973 TAATT 0.2346 TACAA 0.2521 TACAC 0.2193 TACAG 0.2491 TACAT 0.2795 TACCA 0.274 TACCC 0.2274 TACCG 0.1787 TACCT 0.3199 TACGA 0.3081 TACGC 0.2359 TACGG 0.2181 TACGT 0.2379 TACTA 0.1652 TACTC 0.2531 TACTG 0.296 TACTT 0.2857 TAGAA 0.246 TAGAC 0.25 TAGAG 0.2631 TAGAT 0.2409 TAGCA 0.2676 TAGCC 0.2532 TAGCG 0.2107 TAGCT 0.2685 TAGGA 0.2239 TAGGC 0.2707 TAGGG 0.2056 TAGGT 0.2998 TAGTA 0.2052 TAGTC 0.2737 TAGTG 0.3015 TAGTT 0.2197 TATAA 0.2102 TATAC 0.2605 TATAG 0.2153 TATAT 0.314 TATCA 0.2869 TATCC 0.222 TATCG 0.2402 TATCT 0.2508 TATGA 0.2648 TATGC 0.2509 TATGG 0.2453 TATGT 0.2391 TATTA 0.1438 TATTC 0.302 TATTG 0.2923 TATTT 0.262 TCAAA 0.2258 TCAAC 0.2606 TCAAG 0.2942 TCAAT 0.2194 TCACA 0.2576 TCACC 0.2778 TCACG 0.242 TCACT 0.2226 TCAGA 0.2399 TCAGC 0.2996 TCAGG 0.259 TCAGT 0.2014 TCATA 0.1397 TCATC 0.3322 TCATG 0.2979 TCATT 0.2302 TCCAA 0.2405 TCCAC 0.2274 TCCAG 0.2729 TCCAT 0.2591 TCCCA 0.2785 TCCCC 0.2604 TCCCG 0.211 TCCCT 0.25 TCCGA 0.2772 TCCGC 0.2649 TCCGG 0.2207 TCCGT 0.2372 TCCTA 0.1163 TCCTC 0.3402 TCCTG 0.2745 TCCTT 0.269 TCGAA 0.221 TCGAC 0.2753 TCGAG 0.2849 TCGAT 0.2189 TCGCA 0.2436 TCGCC 0.3022 TCGCG 0.2158 TCGCT 0.2383 TCGGA 0.2326 TCGGC 0.3133 TCGGG 0.2327 TCGGT 0.2214 TCGTA 0.1453 TCGTC 0.354 TCGTG 0.2773 TCGTT 0.2234 TCTAA 0.1746 TCTAC 0.3046 TCTAG 0.2488 TCTAT 0.272 TCTCA 0.2229 TCTCC 0.2494 TCTCG 0.2633 TCTCT 0.2644 TCTGA 0.2187 TCTGC 0.2872 TCTGG 0.2714 TCTGT 0.2227 TCTTA 0.09762 TCTTC 0.3354 TCTTG 0.3064 TCTTT 0.2605 TGAAA 0.2335 TGAAC 0.222 TGAAG 0.3136 TGAAT 0.2309 TGACA 0.2762 TGACC 0.2316 TGACG 0.2834 TGACT 0.2088 TGAGA 0.262 TGAGC 0.2609 TGAGG 0.2968 TGAGT 0.1803 TGATA 0.1761 TGATC 0.2383 TGATG 0.3688 TGATT 0.2167 TGCAA 0.2473 TGCAC 0.2072 TGCAG 0.2898 TGCAT 0.2557 TGCCA 0.2768 TGCCC 0.2181 TGCCG 0.239 TGCCT 0.2661 TGCGA 0.2801 TGCGC 0.2645 TGCGG 0.2435 TGCGT 0.2119 TGCTA 0.1269 TGCTC 0.2593 TGCTG 0.3543 TGCTT 0.2595 TGGAA 0.2465 TGGAC 0.2339 TGGAG 0.2848 TGGAT 0.2348 TGGCA 0.2588 TGGCC 0.2494 TGGCG 0.2462 TGGCT 0.2456 TGGGA 0.2461 TGGGC 0.2703 TGGGG 0.2478 TGGGT 0.2358 TGGTA 0.1762 TGGTC 0.268 TGGTG 0.3317 TGGTT 0.2241 TGTAA 0.1943 TGTAC 0.2848 TGTAG 0.2519 TGTAT 0.2691 TGTCA 0.2649 TGTCC 0.2016 TGTCG 0.2858 TGTCT 0.2477 TGTGA 0.2436 TGTGC 0.2509 TGTGG 0.2569 TGTGT 0.2486 TGTTA 0.1123 TGTTC 0.2771 TGTTG 0.3534 TGTTT 0.2573 TTAAA 0.2493 TTAAC 0.2165 TTAAG 0.2738 TTAAT 0.2603 TTACA 0.269 TTACC 0.2745 TTACG 0.213 TTACT 0.2435 TTAGA 0.2508 TTAGC 0.2703 TTAGG 0.2633 TTAGT 0.2157 TTATA 0.1752 TTATC 0.2975 TTATG 0.2527 TTATT 0.2745 TTCAA 0.2608 TTCAC 0.2246 TTCAG 0.242 TTCAT 0.2726 TTCCA 0.2715 TTCCC 0.2543 TTCCG 0.1999 TTCCT 0.2743 TTCGA 0.2716 TTCGC 0.2459 TTCGG 0.2277 TTCGT 0.2548 TTCTA 0.1229 TTCTC 0.2958 TTCTG 0.2661 TTCTT 0.3152 TTGAA 0.2372 TTGAC 0.2584 TTGAG 0.2495 TTGAT 0.255 TTGCA 0.2489 TTGCC 0.2679 TTGCG 0.2216 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2256 TTGGC 0.2939 TTGGG 0.2421 TTGGT 0.2384 TTGTA 0.1621 TTGTC 0.3009 TTGTG 0.261 TTGTT 0.276 TTTAA 0.1841 TTTAC 0.3063 TTTAG 0.2239 TTTAT 0.2857 TTTCA 0.2277 TTTCC 0.2541 TTTCG 0.2395 TTTCT 0.2787 TTTGA 0.2426 TTTGC 0.2631 TTTGG 0.2684 TTTGT 0.2259 TTTTA 0.1144 TTTTC 0.2935 TTTTG 0.2943 TTTTT 0.2978