################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 408543 Total trinity transcripts: 580098 Percent GC: 44.63 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 3865 Contig N20: 2697 Contig N30: 1980 Contig N40: 1442 Contig N50: 1012 Median contig length: 331 Average contig: 628.37 Total assembled bases: 364514830 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 3226 Contig N20: 2047 Contig N30: 1310 Contig N40: 840 Contig N50: 564 Median contig length: 284 Average contig: 483.10 Total assembled bases: 197366539