[1] # (a,c,g,t)= (0.289, 0.211, 0.211, 0.289) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.333 C 0.167 G 0.167 T 0.333 # l= 1 # Values AA 0.118 AC 0.0575 AG 0.0501 AT 0.107 CA 0.0705 CC 0.0307 CG 0.0159 CT 0.0501 GA 0.0511 GC 0.0278 GG 0.0307 GT 0.0575 TA 0.093 TC 0.0511 TG 0.0705 TT 0.118 # l= 2 # Values AAA 0.0463 AAC 0.0196 AAG 0.0171 AAT 0.0353 ACA 0.0255 ACC 0.0101 ACG 0.00505 ACT 0.0168 AGA 0.0161 AGC 0.00825 AGG 0.00895 AGT 0.0168 ATA 0.0339 ATC 0.0153 ATG 0.0226 ATT 0.0353 CAA 0.0229 CAC 0.0122 CAG 0.0128 CAT 0.0226 CCA 0.0124 CCC 0.00621 CCG 0.00317 CCT 0.00895 CGA 0.0048 CGC 0.00285 CGG 0.00317 CGT 0.00505 CTA 0.0119 CTC 0.00832 CTG 0.0128 CTT 0.0171 GAA 0.018 GAC 0.00954 GAG 0.00832 GAT 0.0153 GCA 0.0113 GCC 0.00542 GCG 0.00285 GCT 0.00825 GGA 0.00897 GGC 0.00542 GGG 0.00621 GGT 0.0101 GTA 0.0162 GTC 0.00954 GTG 0.0122 GTT 0.0196 TAA 0.031 TAC 0.0162 TAG 0.0119 TAT 0.0339 TCA 0.0213 TCC 0.00897 TCG 0.0048 TCT 0.0161 TGA 0.0212 TGC 0.0113 TGG 0.0124 TGT 0.0255 TTA 0.031 TTC 0.018 TTG 0.0229 TTT 0.0463 # l= 3 # Values AAAA 0.0177 AAAC 0.00781 AAAG 0.00618 AAAT 0.0145 AACA 0.00886 AACC 0.00322 AACG 0.0016 AACT 0.00591 AAGA 0.00528 AAGC 0.00267 AAGG 0.00312 AAGT 0.00598 AATA 0.0116 AATC 0.00488 AATG 0.00778 AATT 0.011 ACAA 0.00827 ACAC 0.00456 ACAG 0.00446 ACAT 0.00824 ACCA 0.00423 ACCC 0.00191 ACCG 0.000973 ACCT 0.00303 ACGA 0.00151 ACGC 0.000946 ACGG 0.000979 ACGT 0.00162 ACTA 0.00391 ACTC 0.00246 ACTG 0.00447 ACTT 0.00598 AGAA 0.00566 AGAC 0.00289 AGAG 0.00276 AGAT 0.00477 AGCA 0.00344 AGCC 0.0014 AGCG 0.000862 AGCT 0.00255 AGGA 0.00259 AGGC 0.00149 AGGG 0.00183 AGGT 0.00303 AGTA 0.00474 AGTC 0.00251 AGTG 0.00365 AGTT 0.00591 ATAA 0.011 ATAC 0.00559 ATAG 0.00413 ATAT 0.0132 ATCA 0.00661 ATCC 0.00249 ATCG 0.00139 ATCT 0.00477 ATGA 0.00674 ATGC 0.00364 ATGG 0.00396 ATGT 0.00824 ATTA 0.00908 ATTC 0.00489 ATTG 0.00675 ATTT 0.0145 CAAA 0.00851 CAAC 0.00382 CAAG 0.00379 CAAT 0.00675 CACA 0.00519 CACC 0.00226 CACG 0.00112 CACT 0.00365 CAGA 0.004 CAGC 0.00208 CAGG 0.00228 CAGT 0.00447 CATA 0.00617 CATC 0.0034 CATG 0.00522 CATT 0.00778 CCAA 0.00382 CCAC 0.00219 CCAG 0.00244 CCAT 0.00396 CCCA 0.00222 CCCC 0.00155 CCCG 0.00061 CCCT 0.00183 CCGA 0.000917 CCGC 0.000605 CCGG 0.000665 CCGT 0.000979 CCTA 0.00191 CCTC 0.00163 CCTG 0.00228 CCTT 0.00312 CGAA 0.00145 CGAC 0.00102 CGAG 0.000937 CGAT 0.00139 CGCA 0.000984 CGCC 0.000635 CGCG 0.000369 CGCT 0.000861 CGGA 0.000984 CGGC 0.000599 CGGG 0.00061 CGGT 0.000973 CGTA 0.00128 CGTC 0.00105 CGTG 0.00112 CGTT 0.0016 CTAA 0.00362 CTAC 0.00232 CTAG 0.00182 CTAT 0.00413 CTCA 0.00306 CTCC 0.00157 CTCG 0.000936 CTCT 0.00276 CTGA 0.00373 CTGC 0.00221 CTGG 0.00244 CTGT 0.00446 CTTA 0.0041 CTTC 0.00298 CTTG 0.00379 CTTT 0.00618 GAAA 0.00724 GAAC 0.00288 GAAG 0.00298 GAAT 0.00489 GACA 0.00415 GACC 0.00182 GACG 0.00105 GACT 0.00251 GAGA 0.00283 GAGC 0.0014 GAGG 0.00163 GAGT 0.00246 GATA 0.0048 GATC 0.00219 GATG 0.0034 GATT 0.00488 GCAA 0.00363 GCAC 0.00185 GCAG 0.00221 GCAT 0.00364 GCCA 0.00236 GCCC 0.000965 GCCG 0.000599 GCCT 0.00149 GCGA 0.000852 GCGC 0.000447 GCGG 0.000605 GCGT 0.000946 GCTA 0.00209 GCTC 0.0014 GCTG 0.00208 GCTT 0.00267 GGAA 0.00326 GGAC 0.00166 GGAG 0.00157 GGAT 0.00249 GGCA 0.00213 GGCC 0.00125 GGCG 0.000635 GGCT 0.0014 GGGA 0.00178 GGGC 0.000965 GGGG 0.00155 GGGT 0.00191 GGTA 0.00283 GGTC 0.00182 GGTG 0.00226 GGTT 0.00322 GTAA 0.00539 GTAC 0.00287 GTAG 0.00232 GTAT 0.00559 GTCA 0.00397 GTCC 0.00166 GTCG 0.00102 GTCT 0.00289 GTGA 0.00362 GTGC 0.00185 GTGG 0.00219 GTGT 0.00456 GTTA 0.00509 GTTC 0.00288 GTTG 0.00382 GTTT 0.00781 TAAA 0.0128 TAAC 0.00509 TAAG 0.0041 TAAT 0.00908 TACA 0.00732 TACC 0.00283 TACG 0.00128 TACT 0.00474 TAGA 0.00398 TAGC 0.00209 TAGG 0.00191 TAGT 0.00391 TATA 0.0113 TATC 0.00479 TATG 0.00617 TATT 0.0116 TCAA 0.00716 TCAC 0.00362 TCAG 0.00372 TCAT 0.00674 TCCA 0.00361 TCCC 0.00178 TCCG 0.000984 TCCT 0.00259 TCGA 0.00152 TCGC 0.000852 TCGG 0.000917 TCGT 0.00151 TCTA 0.00398 TCTC 0.00283 TCTG 0.004 TCTT 0.00528 TGAA 0.00761 TGAC 0.00397 TGAG 0.00306 TGAT 0.00661 TGCA 0.00478 TGCC 0.00213 TGCG 0.000985 TGCT 0.00344 TGGA 0.00361 TGGC 0.00236 TGGG 0.00222 TGGT 0.00423 TGTA 0.00732 TGTC 0.00415 TGTG 0.00519 TGTT 0.00886 TTAA 0.011 TTAC 0.00539 TTAG 0.00362 TTAT 0.011 TTCA 0.00761 TTCC 0.00326 TTCG 0.00145 TTCT 0.00566 TTGA 0.00716 TTGC 0.00363 TTGG 0.00382 TTGT 0.00826 TTTA 0.0128 TTTC 0.00724 TTTG 0.00852 TTTT 0.0177 # l= 4 # Values AAAAA 0.00695 AAAAC 0.00287 AAAAG 0.00217 AAAAT 0.00574 AAACA 0.00369 AAACC 0.00109 AAACG 0.000669 AAACT 0.00236 AAAGA 0.00191 AAAGC 0.000955 AAAGG 0.00115 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00502 AAATC 0.002 AAATG 0.00331 AAATT 0.00421 AACAA 0.00307 AACAC 0.00153 AACAG 0.00147 AACAT 0.00279 AACCA 0.00137 AACCC 0.000607 AACCG 0.000269 AACCT 0.000979 AACGA 0.000468 AACGC 0.000297 AACGG 0.000295 AACGT 0.000542 AACTA 0.00137 AACTC 0.00084 AACTG 0.0015 AACTT 0.0022 AAGAA 0.00201 AAGAC 0.000919 AAGAG 0.000805 AAGAT 0.00155 AAGCA 0.00119 AAGCC 0.000409 AAGCG 0.000282 AAGCT 0.000795 AAGGA 0.000936 AAGGC 0.000547 AAGGG 0.000636 AAGGT 0.001 AAGTA 0.00166 AAGTC 0.000848 AAGTG 0.00127 AAGTT 0.0022 AATAA 0.00408 AATAC 0.0019 AATAG 0.00135 AATAT 0.00432 AATCA 0.00213 AATCC 0.000803 AATCG 0.000437 AATCT 0.00151 AATGA 0.0025 AATGC 0.00118 AATGG 0.00138 AATGT 0.00273 AATTA 0.00318 AATTC 0.00151 AATTG 0.00206 AATTT 0.00421 ACAAA 0.00315 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00129 ACAAT 0.0024 ACACA 0.00211 ACACC 0.000759 ACACG 0.000406 ACACT 0.00128 ACAGA 0.00145 ACAGC 0.000708 ACAGG 0.000796 ACAGT 0.00151 ACATA 0.00233 ACATC 0.00107 ACATG 0.00211 ACATT 0.00273 ACCAA 0.00131 ACCAC 0.000819 ACCAG 0.000811 ACCAT 0.00129 ACCCA 0.000747 ACCCC 0.000457 ACCCG 0.000186 ACCCT 0.000524 ACCGA 0.000275 ACCGC 0.000181 ACCGG 0.000221 ACCGT 0.000296 ACCTA 0.000683 ACCTC 0.000549 ACCTG 0.000793 ACCTT 0.001 ACGAA 0.000471 ACGAC 0.000348 ACGAG 0.000276 ACGAT 0.000417 ACGCA 0.000334 ACGCC 0.000208 ACGCG 0.000117 ACGCT 0.000288 ACGGA 0.00033 ACGGC 0.000183 ACGGG 0.000169 ACGGT 0.000296 ACGTA 0.000417 ACGTC 0.000289 ACGTG 0.000369 ACGTT 0.000542 ACTAA 0.00119 ACTAC 0.000761 ACTAG 0.000604 ACTAT 0.00136 ACTCA 0.000933 ACTCC 0.000435 ACTCG 0.000327 ACTCT 0.000764 ACTGA 0.00136 ACTGC 0.00071 ACTGG 0.000893 ACTGT 0.00151 ACTTA 0.00144 ACTTC 0.00099 ACTTG 0.00137 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.0023 AGAAC 0.000907 AGAAG 0.000944 AGAAT 0.0015 AGACA 0.00129 AGACC 0.000482 AGACG 0.000337 AGACT 0.00078 AGAGA 0.00101 AGAGC 0.000431 AGAGG 0.000557 AGAGT 0.000764 AGATA 0.00151 AGATC 0.000644 AGATG 0.0011 AGATT 0.00151 AGCAA 0.00114 AGCAC 0.00057 AGCAG 0.000662 AGCAT 0.00107 AGCCA 0.000619 AGCCC 0.000264 AGCCG 0.000146 AGCCT 0.000372 AGCGA 0.000257 AGCGC 0.000136 AGCGG 0.000181 AGCGT 0.000288 AGCTA 0.000681 AGCTC 0.000428 AGCTG 0.000642 AGCTT 0.000795 AGGAA 0.00104 AGGAC 0.000474 AGGAG 0.000416 AGGAT 0.000662 AGGCA 0.000605 AGGCC 0.000341 AGGCG 0.000171 AGGCT 0.000372 AGGGA 0.00056 AGGGC 0.000321 AGGGG 0.00043 AGGGT 0.000524 AGGTA 0.00086 AGGTC 0.000563 AGGTG 0.000625 AGGTT 0.000979 AGTAA 0.00163 AGTAC 0.000845 AGTAG 0.000712 AGTAT 0.00155 AGTCA 0.00102 AGTCC 0.000435 AGTCG 0.000274 AGTCT 0.00078 AGTGA 0.0011 AGTGC 0.000567 AGTGG 0.000702 AGTGT 0.00128 AGTTA 0.00159 AGTTC 0.000858 AGTTG 0.0011 AGTTT 0.00236 ATAAA 0.0046 ATAAC 0.00176 ATAAG 0.00129 ATAAT 0.00335 ATACA 0.00267 ATACC 0.000941 ATACG 0.000428 ATACT 0.00155 ATAGA 0.00142 ATAGC 0.000709 ATAGG 0.000646 ATAGT 0.00136 ATATA 0.00471 ATATC 0.00184 ATATG 0.00228 ATATT 0.00432 ATCAA 0.00229 ATCAC 0.00111 ATCAG 0.00112 ATCAT 0.00209 ATCCA 0.00107 ATCCC 0.000517 ATCCG 0.000244 ATCCT 0.000662 ATCGA 0.000446 ATCGC 0.000251 ATCGG 0.000279 ATCGT 0.000417 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.000859 ATCTG 0.00117 ATCTT 0.00155 ATGAA 0.00246 ATGAC 0.0013 ATGAG 0.000888 ATGAT 0.00209 ATGCA 0.0016 ATGCC 0.000676 ATGCG 0.000296 ATGCT 0.00107 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.000847 ATGGG 0.000669 ATGGT 0.00129 ATGTA 0.00255 ATGTC 0.00126 ATGTG 0.00164 ATGTT 0.00279 ATTAA 0.00322 ATTAC 0.00152 ATTAG 0.000999 ATTAT 0.00335 ATTCA 0.00215 ATTCC 0.000833 ATTCG 0.000409 ATTCT 0.0015 ATTGA 0.00215 ATTGC 0.00111 ATTGG 0.0011 ATTGT 0.0024 ATTTA 0.00389 ATTTC 0.0023 ATTTG 0.00261 ATTTT 0.00574 CAAAA 0.00308 CAAAC 0.00158 CAAAG 0.00124 CAAAT 0.00261 CAACA 0.00182 CAACC 0.000625 CAACG 0.000282 CAACT 0.0011 CAAGA 0.00113 CAAGC 0.000564 CAAGG 0.00072 CAAGT 0.00137 CAATA 0.00221 CAATC 0.00104 CAATG 0.00145 CAATT 0.00206 CACAA 0.00159 CACAC 0.00103 CACAG 0.000935 CACAT 0.00164 CACCA 0.000962 CACCC 0.000449 CACCG 0.000226 CACCT 0.000625 CACGA 0.000321 CACGC 0.000218 CACGG 0.000211 CACGT 0.000369 CACTA 0.000795 CACTC 0.000602 CACTG 0.00099 CACTT 0.00127 CAGAA 0.00132 CAGAC 0.000786 CAGAG 0.000727 CAGAT 0.00117 CAGCA 0.00085 CAGCC 0.000392 CAGCG 0.000198 CAGCT 0.000642 CAGGA 0.00066 CAGGC 0.000361 CAGGG 0.000471 CAGGT 0.000793 CAGTA 0.00126 CAGTC 0.000722 CAGTG 0.00099 CAGTT 0.0015 CATAA 0.00198 CATAC 0.00111 CATAG 0.000804 CATAT 0.00228 CATCA 0.00143 CATCC 0.000539 CATCG 0.000324 CATCT 0.0011 CATGA 0.00138 CATGC 0.000876 CATGG 0.000855 CATGT 0.00211 CATTA 0.00189 CATTC 0.00113 CATTG 0.00145 CATTT 0.00331 CCAAA 0.00141 CCAAC 0.000656 CCAAG 0.000653 CCAAT 0.0011 CCACA 0.000816 CCACC 0.000484 CCACG 0.000192 CCACT 0.000702 CCAGA 0.000681 CCAGC 0.000366 CCAGG 0.000499 CCAGT 0.000893 CCATA 0.00105 CCATC 0.000677 CCATG 0.000855 CCATT 0.00138 CCCAA 0.000646 CCCAC 0.000435 CCCAG 0.000467 CCCAT 0.000669 CCCCA 0.000501 CCCCC 0.000485 CCCCG 0.000136 CCCCT 0.00043 CCCGA 0.00017 CCCGC 0.000135 CCCGG 0.000135 CCCGT 0.000169 CCCTA 0.000375 CCCTC 0.000353 CCCTG 0.000471 CCCTT 0.000636 CCGAA 0.000255 CCGAC 0.000212 CCGAG 0.00017 CCGAT 0.000279 CCGCA 0.000196 CCGCC 0.000164 CCGCG 6.49e-05 CCGCT 0.000181 CCGGA 0.000181 CCGGC 0.000128 CCGGG 0.000135 CCGGT 0.000221 CCGTA 0.00026 CCGTC 0.000213 CCGTG 0.000211 CCGTT 0.000295 CCTAA 0.00056 CCTAC 0.000384 CCTAG 0.000316 CCTAT 0.000646 CCTCA 0.00054 CCTCC 0.000362 CCTCG 0.000176 CCTCT 0.000557 CCTGA 0.000584 CCTGC 0.000406 CCTGG 0.000499 CCTGT 0.000796 CCTTA 0.000688 CCTTC 0.000567 CCTTG 0.00072 CCTTT 0.00115 CGAAA 0.000552 CGAAC 0.000252 CGAAG 0.000241 CGAAT 0.000409 CGACA 0.000409 CGACC 0.000198 CGACG 0.000137 CGACT 0.000274 CGAGA 0.000256 CGAGC 0.000178 CGAGG 0.000176 CGAGT 0.000327 CGATA 0.000411 CGATC 0.000221 CGATG 0.000324 CGATT 0.000437 CGCAA 0.000321 CGCAC 0.000198 CGCAG 0.00017 CGCAT 0.000296 CGCCA 0.000262 CGCCC 0.000115 CGCCG 8.72e-05 CGCCT 0.000171 CGCGA 0.000121 CGCGC 6.58e-05 CGCGG 6.49e-05 CGCGT 0.000117 CGCTA 0.000214 CGCTC 0.000167 CGCTG 0.000198 CGCTT 0.000282 CGGAA 0.00034 CGGAC 0.000219 CGGAG 0.000181 CGGAT 0.000244 CGGCA 0.00023 CGGCC 0.000136 CGGCG 8.72e-05 CGGCT 0.000146 CGGGA 0.000177 CGGGC 0.000111 CGGGG 0.000136 CGGGT 0.000186 CGGTA 0.000311 CGGTC 0.000167 CGGTG 0.000226 CGGTT 0.000269 CGTAA 0.000442 CGTAC 0.000226 CGTAG 0.000184 CGTAT 0.000428 CGTCA 0.000376 CGTCC 0.000202 CGTCG 0.000137 CGTCT 0.000337 CGTGA 0.000328 CGTGC 0.000192 CGTGG 0.000192 CGTGT 0.000406 CGTTA 0.000415 CGTTC 0.000237 CGTTG 0.000282 CGTTT 0.000669 CTAAA 0.00149 CTAAC 0.000602 CTAAG 0.000521 CTAAT 0.000999 CTACA 0.000932 CTACC 0.000491 CTACG 0.000184 CTACT 0.000712 CTAGA 0.000575 CTAGC 0.000326 CTAGG 0.000316 CTAGT 0.000604 CTATA 0.00135 CTATC 0.000623 CTATG 0.000804 CTATT 0.00135 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.000581 CTCAG 0.000557 CTCAT 0.000888 CTCCA 0.000633 CTCCC 0.000337 CTCCG 0.000181 CTCCT 0.000416 CTCGA 0.000308 CTCGC 0.000183 CTCGG 0.00017 CTCGT 0.000276 CTCTA 0.000658 CTCTC 0.00057 CTCTG 0.000727 CTCTT 0.000805 CTGAA 0.00132 CTGAC 0.000723 CTGAG 0.000557 CTGAT 0.00112 CTGCA 0.000926 CTGCC 0.000454 CTGCG 0.00017 CTGCT 0.000662 CTGGA 0.000719 CTGGC 0.000442 CTGGG 0.000467 CTGGT 0.000811 CTGTA 0.00126 CTGTC 0.000794 CTGTG 0.000935 CTGTT 0.00147 CTTAA 0.00151 CTTAC 0.000783 CTTAG 0.000521 CTTAT 0.00129 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.000682 CTTCG 0.000241 CTTCT 0.000944 CTTGA 0.00119 CTTGC 0.000645 CTTGG 0.000653 CTTGT 0.00129 CTTTA 0.00174 CTTTC 0.00103 CTTTG 0.00124 CTTTT 0.00217 GAAAA 0.00268 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00103 GAAAT 0.0023 GAACA 0.00123 GAACC 0.000548 GAACG 0.000237 GAACT 0.000858 GAAGA 0.000969 GAAGC 0.000454 GAAGG 0.000567 GAAGT 0.00099 GAATA 0.00154 GAATC 0.000714 GAATG 0.00113 GAATT 0.00151 GACAA 0.00133 GACAC 0.000762 GACAG 0.000794 GACAT 0.00126 GACCA 0.000698 GACCC 0.000395 GACCG 0.000167 GACCT 0.000563 GACGA 0.000348 GACGC 0.000202 GACGG 0.000213 GACGT 0.000289 GACTA 0.000583 GACTC 0.00036 GACTG 0.000722 GACTT 0.000848 GAGAA 0.000896 GAGAC 0.000503 GAGAG 0.00057 GAGAT 0.000859 GAGCA 0.000561 GAGCC 0.000242 GAGCG 0.000167 GAGCT 0.000428 GAGGA 0.000484 GAGGC 0.000247 GAGGG 0.000353 GAGGT 0.000549 GAGTA 0.000659 GAGTC 0.00036 GAGTG 0.000602 GAGTT 0.00084 GATAA 0.00156 GATAC 0.000773 GATAG 0.000623 GATAT 0.00184 GATCA 0.00093 GATCC 0.000393 GATCG 0.000221 GATCT 0.000644 GATGA 0.0011 GATGC 0.000551 GATGG 0.000677 GATGT 0.00107 GATTA 0.00113 GATTC 0.000714 GATTG 0.00104 GATTT 0.002 GCAAA 0.00126 GCAAC 0.000617 GCAAG 0.000645 GCAAT 0.00111 GCACA 0.000781 GCACC 0.000306 GCACG 0.000192 GCACT 0.000567 GCAGA 0.000711 GCAGC 0.000386 GCAGG 0.000406 GCAGT 0.00071 GCATA 0.00103 GCATC 0.000551 GCATG 0.000876 GCATT 0.00118 GCCAA 0.000699 GCCAC 0.000375 GCCAG 0.000442 GCCAT 0.000847 GCCCA 0.000307 GCCCC 0.000225 GCCCG 0.000111 GCCCT 0.000321 GCCGA 0.000181 GCCGC 0.000107 GCCGG 0.000128 GCCGT 0.000183 GCCTA 0.000335 GCCTC 0.000247 GCCTG 0.000361 GCCTT 0.000547 GCGAA 0.000236 GCGAC 0.000182 GCGAG 0.000183 GCGAT 0.000251 GCGCA 0.000155 GCGCC 9.1e-05 GCGCG 6.58e-05 GCGCT 0.000136 GCGGA 0.000182 GCGGC 0.000107 GCGGG 0.000135 GCGGT 0.000181 GCGTA 0.000229 GCGTC 0.000202 GCGTG 0.000218 GCGTT 0.000297 GCTAA 0.000675 GCTAC 0.000383 GCTAG 0.000326 GCTAT 0.000709 GCTCA 0.00055 GCTCC 0.000241 GCTCG 0.000178 GCTCT 0.000431 GCTGA 0.000623 GCTGC 0.000386 GCTGG 0.000366 GCTGT 0.000708 GCTTA 0.000701 GCTTC 0.000454 GCTTG 0.000564 GCTTT 0.000955 GGAAA 0.00127 GGAAC 0.00047 GGAAG 0.000682 GGAAT 0.000833 GGACA 0.000726 GGACC 0.000293 GGACG 0.000202 GGACT 0.000435 GGAGA 0.00053 GGAGC 0.000241 GGAGG 0.000362 GGAGT 0.000435 GGATA 0.000753 GGATC 0.000393 GGATG 0.000539 GGATT 0.000803 GGCAA 0.000705 GGCAC 0.000294 GGCAG 0.000454 GGCAT 0.000676 GGCCA 0.000527 GGCCC 0.000249 GGCCG 0.000136 GGCCT 0.000341 GGCGA 0.000173 GGCGC 9.1e-05 GGCGG 0.000164 GGCGT 0.000208 GGCTA 0.000359 GGCTC 0.000242 GGCTG 0.000392 GGCTT 0.000409 GGGAA 0.000625 GGGAC 0.000305 GGGAG 0.000337 GGGAT 0.000517 GGGCA 0.000337 GGGCC 0.000249 GGGCG 0.000115 GGGCT 0.000264 GGGGA 0.000385 GGGGC 0.000225 GGGGG 0.000485 GGGGT 0.000457 GGGTA 0.000464 GGGTC 0.000395 GGGTG 0.000449 GGGTT 0.000607 GGTAA 0.000929 GGTAC 0.00047 GGTAG 0.000491 GGTAT 0.000941 GGTCA 0.00085 GGTCC 0.000293 GGTCG 0.000198 GGTCT 0.000482 GGTGA 0.000713 GGTGC 0.000306 GGTGG 0.000484 GGTGT 0.000759 GGTTA 0.000958 GGTTC 0.000548 GGTTG 0.000625 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00212 GTAAC 0.000974 GTAAG 0.000783 GTAAT 0.00152 GTACA 0.00133 GTACC 0.00047 GTACG 0.000226 GTACT 0.000845 GTAGA 0.00079 GTAGC 0.000383 GTAGG 0.000384 GTAGT 0.000761 GTATA 0.00181 GTATC 0.000773 GTATG 0.00111 GTATT 0.0019 GTCAA 0.00121 GTCAC 0.000726 GTCAG 0.000723 GTCAT 0.0013 GTCCA 0.000658 GTCCC 0.000305 GTCCG 0.000219 GTCCT 0.000474 GTCGA 0.000275 GTCGC 0.000182 GTCGG 0.000212 GTCGT 0.000348 GTCTA 0.000686 GTCTC 0.000503 GTCTG 0.000786 GTCTT 0.000919 GTGAA 0.00121 GTGAC 0.000726 GTGAG 0.000581 GTGAT 0.00111 GTGCA 0.000786 GTGCC 0.000294 GTGCG 0.000198 GTGCT 0.00057 GTGGA 0.000565 GTGGC 0.000375 GTGGG 0.000435 GTGGT 0.000819 GTGTA 0.00123 GTGTC 0.000762 GTGTG 0.00103 GTGTT 0.00153 GTTAA 0.00175 GTTAC 0.000974 GTTAG 0.000602 GTTAT 0.00176 GTTCA 0.00125 GTTCC 0.00047 GTTCG 0.000252 GTTCT 0.000907 GTTGA 0.00113 GTTGC 0.000617 GTTGG 0.000656 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.00212 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00158 GTTTT 0.00287 TAAAA 0.00502 TAAAC 0.00212 TAAAG 0.00174 TAAAT 0.00389 TAACA 0.00212 TAACC 0.000958 TAACG 0.000415 TAACT 0.00159 TAAGA 0.00127 TAAGC 0.000701 TAAGG 0.000688 TAAGT 0.00144 TAATA 0.00288 TAATC 0.00113 TAATG 0.00189 TAATT 0.00318 TACAA 0.00228 TACAC 0.00123 TACAG 0.00126 TACAT 0.00255 TACCA 0.0012 TACCC 0.000464 TACCG 0.000311 TACCT 0.00086 TACGA 0.000373 TACGC 0.000229 TACGG 0.00026 TACGT 0.000417 TACTA 0.00116 TACTC 0.000659 TACTG 0.00126 TACTT 0.00166 TAGAA 0.00143 TAGAC 0.000686 TAGAG 0.000658 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000839 TAGCC 0.000359 TAGCG 0.000214 TAGCT 0.000681 TAGGA 0.000514 TAGGC 0.000335 TAGGG 0.000375 TAGGT 0.000683 TAGTA 0.00116 TAGTC 0.000583 TAGTG 0.000795 TAGTT 0.00137 TATAA 0.00338 TATAC 0.00181 TATAG 0.00135 TATAT 0.00471 TATCA 0.00212 TATCC 0.000753 TATCG 0.000411 TATCT 0.00151 TATGA 0.00176 TATGC 0.00103 TATGG 0.00105 TATGT 0.00233 TATTA 0.00288 TATTC 0.00154 TATTG 0.00221 TATTT 0.00502 TCAAA 0.00269 TCAAC 0.00113 TCAAG 0.00119 TCAAT 0.00215 TCACA 0.00148 TCACC 0.000713 TCACG 0.000328 TCACT 0.0011 TCAGA 0.00116 TCAGC 0.000623 TCAGG 0.000584 TCAGT 0.00136 TCATA 0.00176 TCATC 0.0011 TCATG 0.00138 TCATT 0.0025 TCCAA 0.00117 TCCAC 0.000565 TCCAG 0.000719 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.000661 TCCCC 0.000385 TCCCG 0.000177 TCCCT 0.00056 TCCGA 0.00029 TCCGC 0.000182 TCCGG 0.000181 TCCGT 0.00033 TCCTA 0.000514 TCCTC 0.000484 TCCTG 0.00066 TCCTT 0.000936 TCGAA 0.000493 TCGAC 0.000275 TCGAG 0.000308 TCGAT 0.000446 TCGCA 0.0003 TCGCC 0.000173 TCGCG 0.000121 TCGCT 0.000257 TCGGA 0.00029 TCGGC 0.000181 TCGGG 0.00017 TCGGT 0.000275 TCGTA 0.000373 TCGTC 0.000348 TCGTG 0.000321 TCGTT 0.000468 TCTAA 0.00119 TCTAC 0.00079 TCTAG 0.000575 TCTAT 0.00142 TCTCA 0.00103 TCTCC 0.00053 TCTCG 0.000256 TCTCT 0.00101 TCTGA 0.00116 TCTGC 0.000711 TCTGG 0.000681 TCTGT 0.00145 TCTTA 0.00127 TCTTC 0.000969 TCTTG 0.00113 TCTTT 0.00191 TGAAA 0.00311 TGAAC 0.00125 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00215 TGACA 0.00172 TGACC 0.00085 TGACG 0.000376 TGACT 0.00102 TGAGA 0.00103 TGAGC 0.00055 TGAGG 0.00054 TGAGT 0.000933 TGATA 0.00212 TGATC 0.00093 TGATG 0.00143 TGATT 0.00213 TGCAA 0.00147 TGCAC 0.000786 TGCAG 0.000926 TGCAT 0.0016 TGCCA 0.000957 TGCCC 0.000337 TGCCG 0.00023 TGCCT 0.000605 TGCGA 0.0003 TGCGC 0.000155 TGCGG 0.000196 TGCGT 0.000334 TGCTA 0.000839 TGCTC 0.000561 TGCTG 0.00085 TGCTT 0.00119 TGGAA 0.00125 TGGAC 0.000658 TGGAG 0.000633 TGGAT 0.00107 TGGCA 0.000957 TGGCC 0.000527 TGGCG 0.000262 TGGCT 0.000619 TGGGA 0.000661 TGGGC 0.000307 TGGGG 0.000501 TGGGT 0.000747 TGGTA 0.0012 TGGTC 0.000698 TGGTG 0.000962 TGGTT 0.00137 TGTAA 0.00238 TGTAC 0.00133 TGTAG 0.000932 TGTAT 0.00267 TGTCA 0.00172 TGTCC 0.000726 TGTCG 0.000409 TGTCT 0.00129 TGTGA 0.00148 TGTGC 0.000781 TGTGG 0.000816 TGTGT 0.00211 TGTTA 0.00212 TGTTC 0.00123 TGTTG 0.00182 TGTTT 0.00369 TTAAA 0.00457 TTAAC 0.00175 TTAAG 0.00151 TTAAT 0.00322 TTACA 0.00238 TTACC 0.000929 TTACG 0.000442 TTACT 0.00163 TTAGA 0.00119 TTAGC 0.000675 TTAGG 0.00056 TTAGT 0.00119 TTATA 0.00338 TTATC 0.00156 TTATG 0.00198 TTATT 0.00408 TTCAA 0.00262 TTCAC 0.00121 TTCAG 0.00132 TTCAT 0.00246 TTCCA 0.00125 TTCCC 0.000625 TTCCG 0.00034 TTCCT 0.00104 TTCGA 0.000493 TTCGC 0.000236 TTCGG 0.000255 TTCGT 0.000471 TTCTA 0.00143 TTCTC 0.000896 TTCTG 0.00132 TTCTT 0.00201 TTGAA 0.00262 TTGAC 0.00121 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.00229 TTGCA 0.00147 TTGCC 0.000705 TTGCG 0.000321 TTGCT 0.00114 TTGGA 0.00117 TTGGC 0.000699 TTGGG 0.000646 TTGGT 0.00131 TTGTA 0.00228 TTGTC 0.00133 TTGTG 0.00159 TTGTT 0.00307 TTTAA 0.00457 TTTAC 0.00212 TTTAG 0.00149 TTTAT 0.0046 TTTCA 0.00311 TTTCC 0.00127 TTTCG 0.000552 TTTCT 0.0023 TTTGA 0.00269 TTTGC 0.00126 TTTGG 0.00141 TTTGT 0.00315 TTTTA 0.00502 TTTTC 0.00268 TTTTG 0.00308 TTTTT 0.00695 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3921 AAAAC 0.1616 AAAAG 0.1226 AAAAT 0.3237 AAACA 0.4719 AAACC 0.1398 AAACG 0.08559 AAACT 0.3027 AAAGA 0.3083 AAAGC 0.1544 AAAGG 0.1854 AAAGT 0.352 AAATA 0.3452 AAATC 0.1376 AAATG 0.2277 AAATT 0.2895 AACAA 0.3462 AACAC 0.1732 AACAG 0.1661 AACAT 0.3145 AACCA 0.4248 AACCC 0.1882 AACCG 0.08332 AACCT 0.3037 AACGA 0.2923 AACGC 0.185 AACGG 0.1843 AACGT 0.3384 AACTA 0.2325 AACTC 0.142 AACTG 0.2529 AACTT 0.3726 AAGAA 0.3801 AAGAC 0.174 AAGAG 0.1523 AAGAT 0.2936 AAGCA 0.4438 AAGCC 0.1531 AAGCG 0.1056 AAGCT 0.2975 AAGGA 0.3001 AAGGC 0.1752 AAGGG 0.2037 AAGGT 0.321 AAGTA 0.278 AAGTC 0.1418 AAGTG 0.2119 AAGTT 0.3683 AATAA 0.35 AATAC 0.163 AATAG 0.1161 AATAT 0.3709 AATCA 0.436 AATCC 0.1644 AATCG 0.08958 AATCT 0.31 AATGA 0.3215 AATGC 0.1514 AATGG 0.1768 AATGT 0.3503 AATTA 0.2898 AATTC 0.138 AATTG 0.1881 AATTT 0.3841 ACAAA 0.3809 ACAAC 0.172 ACAAG 0.1566 ACAAT 0.2905 ACACA 0.4634 ACACC 0.1665 ACACG 0.08905 ACACT 0.281 ACAGA 0.3246 ACAGC 0.1587 ACAGG 0.1784 ACAGT 0.3383 ACATA 0.2824 ACATC 0.1305 ACATG 0.2561 ACATT 0.331 ACCAA 0.31 ACCAC 0.1936 ACCAG 0.1918 ACCAT 0.3046 ACCCA 0.3901 ACCCC 0.2389 ACCCG 0.09722 ACCCT 0.2737 ACCGA 0.2829 ACCGC 0.1857 ACCGG 0.2271 ACCGT 0.3044 ACCTA 0.2258 ACCTC 0.1815 ACCTG 0.2619 ACCTT 0.3309 ACGAA 0.3115 ACGAC 0.2301 ACGAG 0.1824 ACGAT 0.2759 ACGCA 0.3526 ACGCC 0.2195 ACGCG 0.1237 ACGCT 0.3042 ACGGA 0.3376 ACGGC 0.1871 ACGGG 0.1728 ACGGT 0.3025 ACGTA 0.2578 ACGTC 0.1788 ACGTG 0.2281 ACGTT 0.3353 ACTAA 0.3043 ACTAC 0.1946 ACTAG 0.1544 ACTAT 0.3467 ACTCA 0.3796 ACTCC 0.1769 ACTCG 0.1329 ACTCT 0.3106 ACTGA 0.3038 ACTGC 0.1587 ACTGG 0.1998 ACTGT 0.3377 ACTTA 0.2412 ACTTC 0.1656 ACTTG 0.2292 ACTTT 0.364 AGAAA 0.4071 AGAAC 0.1602 AGAAG 0.1668 AGAAT 0.2658 AGACA 0.4473 AGACC 0.1665 AGACG 0.1166 AGACT 0.2697 AGAGA 0.3651 AGAGC 0.1561 AGAGG 0.2018 AGAGT 0.2769 AGATA 0.3169 AGATC 0.1349 AGATG 0.231 AGATT 0.3172 AGCAA 0.3314 AGCAC 0.1658 AGCAG 0.1927 AGCAT 0.3101 AGCCA 0.4415 AGCCC 0.1885 AGCCG 0.1042 AGCCT 0.2657 AGCGA 0.2988 AGCGC 0.1575 AGCGG 0.2096 AGCGT 0.3341 AGCTA 0.2673 AGCTC 0.1682 AGCTG 0.252 AGCTT 0.3124 AGGAA 0.4017 AGGAC 0.1827 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2552 AGGCA 0.4062 AGGCC 0.2287 AGGCG 0.115 AGGCT 0.25 AGGGA 0.3052 AGGGC 0.1751 AGGGG 0.2342 AGGGT 0.2855 AGGTA 0.2841 AGGTC 0.1861 AGGTG 0.2064 AGGTT 0.3235 AGTAA 0.3445 AGTAC 0.1782 AGTAG 0.1501 AGTAT 0.3271 AGTCA 0.4072 AGTCC 0.1733 AGTCG 0.1089 AGTCT 0.3106 AGTGA 0.3018 AGTGC 0.1554 AGTGG 0.1923 AGTGT 0.3506 AGTTA 0.2695 AGTTC 0.1451 AGTTG 0.1853 AGTTT 0.4001 ATAAA 0.4182 ATAAC 0.16 ATAAG 0.1174 ATAAT 0.3044 ATACA 0.4777 ATACC 0.1683 ATACG 0.07652 ATACT 0.2774 ATAGA 0.3437 ATAGC 0.1716 ATAGG 0.1565 ATAGT 0.3282 ATATA 0.3583 ATATC 0.1398 ATATG 0.1734 ATATT 0.3284 ATCAA 0.3467 ATCAC 0.1674 ATCAG 0.1698 ATCAT 0.3162 ATCCA 0.4282 ATCCC 0.2076 ATCCG 0.09812 ATCCT 0.2661 ATCGA 0.3202 ATCGC 0.1803 ATCGG 0.2003 ATCGT 0.2992 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.1799 ATCTG 0.2445 ATCTT 0.3248 ATGAA 0.365 ATGAC 0.1934 ATGAG 0.1317 ATGAT 0.3099 ATGCA 0.4396 ATGCC 0.1859 ATGCG 0.0815 ATGCT 0.2931 ATGGA 0.2924 ATGGC 0.2138 ATGGG 0.1687 ATGGT 0.325 ATGTA 0.3094 ATGTC 0.1532 ATGTG 0.199 ATGTT 0.3383 ATTAA 0.3543 ATTAC 0.167 ATTAG 0.11 ATTAT 0.3687 ATTCA 0.4388 ATTCC 0.1702 ATTCG 0.08353 ATTCT 0.3074 ATTGA 0.3184 ATTGC 0.1637 ATTGG 0.1624 ATTGT 0.3554 ATTTA 0.2678 ATTTC 0.1579 ATTTG 0.1795 ATTTT 0.3948 CAAAA 0.3621 CAAAC 0.1854 CAAAG 0.1461 CAAAT 0.3064 CAACA 0.476 CAACC 0.1636 CAACG 0.07384 CAACT 0.2865 CAAGA 0.2993 CAAGC 0.1488 CAAGG 0.1901 CAAGT 0.3618 CAATA 0.327 CAATC 0.1536 CAATG 0.2143 CAATT 0.3051 CACAA 0.3055 CACAC 0.1983 CACAG 0.1802 CACAT 0.316 CACCA 0.4253 CACCC 0.1984 CACCG 0.09999 CACCT 0.2762 CACGA 0.2866 CACGC 0.1951 CACGG 0.1883 CACGT 0.3299 CACTA 0.2177 CACTC 0.1648 CACTG 0.2708 CACTT 0.3467 CAGAA 0.3301 CAGAC 0.1965 CAGAG 0.1816 CAGAT 0.2917 CAGCA 0.4083 CAGCC 0.1882 CAGCG 0.09523 CAGCT 0.3083 CAGGA 0.2887 CAGGC 0.1581 CAGGG 0.2062 CAGGT 0.347 CAGTA 0.2825 CAGTC 0.1615 CAGTG 0.2214 CAGTT 0.3345 CATAA 0.3201 CATAC 0.1802 CATAG 0.1302 CATAT 0.3694 CATCA 0.4216 CATCC 0.1587 CATCG 0.09527 CATCT 0.3244 CATGA 0.2645 CATGC 0.1678 CATGG 0.1638 CATGT 0.4039 CATTA 0.2434 CATTC 0.1453 CATTG 0.186 CATTT 0.4253 CCAAA 0.3703 CCAAC 0.1716 CCAAG 0.1709 CCAAT 0.2872 CCACA 0.3721 CCACC 0.2204 CCACG 0.08752 CCACT 0.32 CCAGA 0.2793 CCAGC 0.1499 CCAGG 0.2047 CCAGT 0.3661 CCATA 0.2661 CCATC 0.1708 CCATG 0.2158 CCATT 0.3473 CCCAA 0.2915 CCCAC 0.1963 CCCAG 0.2107 CCCAT 0.3016 CCCCA 0.323 CCCCC 0.3126 CCCCG 0.0877 CCCCT 0.2767 CCCGA 0.2793 CCCGC 0.2218 CCCGG 0.2218 CCCGT 0.2771 CCCTA 0.2044 CCCTC 0.1924 CCCTG 0.2567 CCCTT 0.3465 CCGAA 0.2783 CCGAC 0.2315 CCGAG 0.1857 CCGAT 0.3045 CCGCA 0.3243 CCGCC 0.2703 CCGCG 0.1072 CCGCT 0.2982 CCGGA 0.2725 CCGGC 0.192 CCGGG 0.2035 CCGGT 0.3321 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.2179 CCGTG 0.215 CCGTT 0.3017 CCTAA 0.2937 CCTAC 0.2015 CCTAG 0.1657 CCTAT 0.339 CCTCA 0.3304 CCTCC 0.2214 CCTCG 0.1075 CCTCT 0.3407 CCTGA 0.2556 CCTGC 0.1776 CCTGG 0.2185 CCTGT 0.3483 CCTTA 0.2204 CCTTC 0.1816 CCTTG 0.2307 CCTTT 0.3673 CGAAA 0.38 CGAAC 0.1733 CGAAG 0.1656 CGAAT 0.2811 CGACA 0.4019 CGACC 0.1941 CGACG 0.135 CGACT 0.2689 CGAGA 0.2731 CGAGC 0.1903 CGAGG 0.1876 CGAGT 0.349 CGATA 0.295 CGATC 0.1587 CGATG 0.2324 CGATT 0.3139 CGCAA 0.3257 CGCAC 0.2008 CGCAG 0.1724 CGCAT 0.3011 CGCCA 0.4119 CGCCC 0.1811 CGCCG 0.1373 CGCCT 0.2697 CGCGA 0.3288 CGCGC 0.1783 CGCGG 0.1759 CGCGT 0.317 CGCTA 0.2479 CGCTC 0.1942 CGCTG 0.2301 CGCTT 0.3278 CGGAA 0.3455 CGGAC 0.2223 CGGAG 0.1839 CGGAT 0.2482 CGGCA 0.3833 CGGCC 0.2272 CGGCG 0.1456 CGGCT 0.2439 CGGGA 0.29 CGGGC 0.1818 CGGGG 0.2232 CGGGT 0.305 CGGTA 0.3194 CGGTC 0.1719 CGGTG 0.2325 CGGTT 0.2763 CGTAA 0.3453 CGTAC 0.1767 CGTAG 0.1436 CGTAT 0.3344 CGTCA 0.3574 CGTCC 0.1916 CGTCG 0.1305 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.2935 CGTGC 0.172 CGTGG 0.1717 CGTGT 0.3628 CGTTA 0.2589 CGTTC 0.1479 CGTTG 0.1761 CGTTT 0.4171 CTAAA 0.4131 CTAAC 0.1664 CTAAG 0.1442 CTAAT 0.2762 CTACA 0.4019 CTACC 0.2117 CTACG 0.07925 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3157 CTAGC 0.1792 CTAGG 0.1735 CTAGT 0.3316 CTATA 0.3275 CTATC 0.1508 CTATG 0.1945 CTATT 0.3272 CTCAA 0.3373 CTCAC 0.1902 CTCAG 0.1822 CTCAT 0.2903 CTCCA 0.4039 CTCCC 0.2151 CTCCG 0.1155 CTCCT 0.2655 CTCGA 0.3291 CTCGC 0.1949 CTCGG 0.1817 CTCGT 0.2942 CTCTA 0.2384 CTCTC 0.2065 CTCTG 0.2634 CTCTT 0.2917 CTGAA 0.3551 CTGAC 0.1941 CTGAG 0.1496 CTGAT 0.3012 CTGCA 0.4186 CTGCC 0.2053 CTGCG 0.07674 CTGCT 0.2993 CTGGA 0.2948 CTGGC 0.181 CTGGG 0.1915 CTGGT 0.3326 CTGTA 0.2825 CTGTC 0.1779 CTGTG 0.2096 CTGTT 0.33 CTTAA 0.3677 CTTAC 0.1907 CTTAG 0.1271 CTTAT 0.3146 CTTCA 0.3737 CTTCC 0.2289 CTTCG 0.08075 CTTCT 0.3166 CTTGA 0.3154 CTTGC 0.1703 CTTGG 0.1725 CTTGT 0.3418 CTTTA 0.2812 CTTTC 0.1659 CTTTG 0.2012 CTTTT 0.3517 GAAAA 0.3697 GAAAC 0.1714 GAAAG 0.1417 GAAAT 0.3172 GAACA 0.4289 GAACC 0.1905 GAACG 0.08239 GAACT 0.2982 GAAGA 0.3251 GAAGC 0.1523 GAAGG 0.1902 GAAGT 0.3324 GAATA 0.3138 GAATC 0.146 GAATG 0.2311 GAATT 0.3092 GACAA 0.3207 GACAC 0.1837 GACAG 0.1913 GACAT 0.3043 GACCA 0.3828 GACCC 0.2164 GACCG 0.09172 GACCT 0.3091 GACGA 0.3307 GACGC 0.1917 GACGG 0.2028 GACGT 0.2748 GACTA 0.2322 GACTC 0.1431 GACTG 0.2874 GACTT 0.3373 GAGAA 0.3169 GAGAC 0.1779 GAGAG 0.2015 GAGAT 0.3038 GAGCA 0.4011 GAGCC 0.1731 GAGCG 0.1196 GAGCT 0.3061 GAGGA 0.2964 GAGGC 0.1513 GAGGG 0.2161 GAGGT 0.3362 GAGTA 0.268 GAGTC 0.1461 GAGTG 0.2447 GAGTT 0.3412 GATAA 0.3251 GATAC 0.1612 GATAG 0.13 GATAT 0.3837 GATCA 0.4252 GATCC 0.1795 GATCG 0.1011 GATCT 0.2942 GATGA 0.3229 GATGC 0.1621 GATGG 0.199 GATGT 0.316 GATTA 0.2315 GATTC 0.1463 GATTG 0.2125 GATTT 0.4098 GCAAA 0.3482 GCAAC 0.1699 GCAAG 0.1775 GCAAT 0.3044 GCACA 0.4227 GCACC 0.1658 GCACG 0.1042 GCACT 0.3073 GCAGA 0.3214 GCAGC 0.1745 GCAGG 0.1834 GCAGT 0.3207 GCATA 0.2838 GCATC 0.1515 GCATG 0.2409 GCATT 0.3239 GCCAA 0.2958 GCCAC 0.1588 GCCAG 0.1868 GCCAT 0.3586 GCCCA 0.3185 GCCCC 0.2336 GCCCG 0.1149 GCCCT 0.333 GCCGA 0.3027 GCCGC 0.1786 GCCGG 0.2131 GCCGT 0.3056 GCCTA 0.2248 GCCTC 0.1659 GCCTG 0.2423 GCCTT 0.3669 GCGAA 0.2766 GCGAC 0.2141 GCGAG 0.2144 GCGAT 0.2949 GCGCA 0.3458 GCGCC 0.2036 GCGCG 0.1472 GCGCT 0.3034 GCGGA 0.3013 GCGGC 0.1768 GCGGG 0.2236 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.2423 GCGTC 0.2134 GCGTG 0.2308 GCGTT 0.3136 GCTAA 0.3224 GCTAC 0.1828 GCTAG 0.1559 GCTAT 0.3389 GCTCA 0.3928 GCTCC 0.1722 GCTCG 0.1273 GCTCT 0.3077 GCTGA 0.299 GCTGC 0.1855 GCTGG 0.1755 GCTGT 0.34 GCTTA 0.2624 GCTTC 0.1698 GCTTG 0.2108 GCTTT 0.357 GGAAA 0.391 GGAAC 0.1441 GGAAG 0.2094 GGAAT 0.2555 GGACA 0.4383 GGACC 0.1771 GGACG 0.1218 GGACT 0.2629 GGAGA 0.3379 GGAGC 0.1537 GGAGG 0.2308 GGAGT 0.2775 GGATA 0.3028 GGATC 0.1578 GGATG 0.2168 GGATT 0.3227 GGCAA 0.3313 GGCAC 0.1379 GGCAG 0.2133 GGCAT 0.3176 GGCCA 0.4206 GGCCC 0.1987 GGCCG 0.1087 GGCCT 0.272 GGCGA 0.2725 GGCGC 0.1432 GGCGG 0.2576 GGCGT 0.3267 GGCTA 0.256 GGCTC 0.1727 GGCTG 0.2794 GGCTT 0.2919 GGGAA 0.3503 GGGAC 0.171 GGGAG 0.189 GGGAT 0.2897 GGGCA 0.3491 GGGCC 0.2579 GGGCG 0.1192 GGGCT 0.2738 GGGGA 0.2478 GGGGC 0.1452 GGGGG 0.3126 GGGGT 0.2944 GGGTA 0.2423 GGGTC 0.2061 GGGTG 0.2344 GGGTT 0.3171 GGTAA 0.3282 GGTAC 0.1659 GGTAG 0.1733 GGTAT 0.3325 GGTCA 0.4662 GGTCC 0.161 GGTCG 0.1084 GGTCT 0.2644 GGTGA 0.3152 GGTGC 0.1354 GGTGG 0.2139 GGTGT 0.3355 GGTTA 0.2973 GGTTC 0.17 GGTTG 0.194 GGTTT 0.3387 GTAAA 0.3929 GTAAC 0.1806 GTAAG 0.1452 GTAAT 0.2813 GTACA 0.4639 GTACC 0.1634 GTACG 0.07862 GTACT 0.294 GTAGA 0.3408 GTAGC 0.165 GTAGG 0.1658 GTAGT 0.3284 GTATA 0.3234 GTATC 0.1382 GTATG 0.199 GTATT 0.3394 GTCAA 0.3061 GTCAC 0.183 GTCAG 0.1822 GTCAT 0.3286 GTCCA 0.3975 GTCCC 0.1842 GTCCG 0.132 GTCCT 0.2863 GTCGA 0.2704 GTCGC 0.1792 GTCGG 0.2086 GTCGT 0.3417 GTCTA 0.2371 GTCTC 0.1737 GTCTG 0.2717 GTCTT 0.3175 GTGAA 0.3335 GTGAC 0.2005 GTGAG 0.1606 GTGAT 0.3054 GTGCA 0.4255 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.107 GTGCT 0.3085 GTGGA 0.2576 GTGGC 0.171 GTGGG 0.1983 GTGGT 0.3731 GTGTA 0.2702 GTGTC 0.1673 GTGTG 0.2258 GTGTT 0.3368 GTTAA 0.3446 GTTAC 0.1914 GTTAG 0.1183 GTTAT 0.3457 GTTCA 0.4339 GTTCC 0.1633 GTTCG 0.08759 GTTCT 0.3152 GTTGA 0.295 GTTGC 0.1615 GTTGG 0.1715 GTTGT 0.372 GTTTA 0.2721 GTTTC 0.1588 GTTTG 0.2021 GTTTT 0.367 TAAAA 0.393 TAAAC 0.1663 TAAAG 0.1361 TAAAT 0.3047 TAACA 0.4169 TAACC 0.1884 TAACG 0.08156 TAACT 0.3131 TAAGA 0.3101 TAAGC 0.1709 TAAGG 0.1676 TAAGT 0.3514 TAATA 0.3172 TAATC 0.1245 TAATG 0.2086 TAATT 0.3497 TACAA 0.3117 TACAC 0.1681 TACAG 0.1721 TACAT 0.3481 TACCA 0.4229 TACCC 0.1638 TACCG 0.1097 TACCT 0.3036 TACGA 0.2919 TACGC 0.1791 TACGG 0.2031 TACGT 0.3259 TACTA 0.2442 TACTC 0.1391 TACTG 0.2662 TACTT 0.3505 TAGAA 0.3609 TAGAC 0.1726 TAGAG 0.1654 TAGAT 0.3011 TAGCA 0.4011 TAGCC 0.1716 TAGCG 0.1021 TAGCT 0.3253 TAGGA 0.2693 TAGGC 0.1757 TAGGG 0.1966 TAGGT 0.3584 TAGTA 0.2961 TAGTC 0.1492 TAGTG 0.2033 TAGTT 0.3514 TATAA 0.3005 TATAC 0.1606 TATAG 0.1202 TATAT 0.4186 TATCA 0.4418 TATCC 0.1571 TATCG 0.08572 TATCT 0.3154 TATGA 0.2852 TATGC 0.1672 TATGG 0.1708 TATGT 0.3768 TATTA 0.2473 TATTC 0.1319 TATTG 0.1897 TATTT 0.4311 TCAAA 0.3753 TCAAC 0.1575 TCAAG 0.1668 TCAAT 0.3004 TCACA 0.4081 TCACC 0.1969 TCACG 0.09064 TCACT 0.3044 TCAGA 0.3114 TCAGC 0.1672 TCAGG 0.1568 TCAGT 0.3646 TCATA 0.2612 TCATC 0.1628 TCATG 0.2048 TCATT 0.3712 TCCAA 0.323 TCCAC 0.1567 TCCAG 0.1992 TCCAT 0.3211 TCCCA 0.371 TCCCC 0.2158 TCCCG 0.09919 TCCCT 0.3141 TCCGA 0.2948 TCCGC 0.1853 TCCGG 0.1842 TCCGT 0.3357 TCCTA 0.198 TCCTC 0.1868 TCCTG 0.2543 TCCTT 0.3609 TCGAA 0.3237 TCGAC 0.1807 TCGAG 0.2025 TCGAT 0.2931 TCGCA 0.3522 TCGCC 0.2033 TCGCG 0.1425 TCGCT 0.302 TCGGA 0.3163 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1858 TCGGT 0.3 TCGTA 0.2473 TCGTC 0.2304 TCGTG 0.2122 TCGTT 0.3101 TCTAA 0.2996 TCTAC 0.1987 TCTAG 0.1446 TCTAT 0.3571 TCTCA 0.3659 TCTCC 0.1874 TCTCG 0.09049 TCTCT 0.3563 TCTGA 0.29 TCTGC 0.1778 TCTGG 0.1703 TCTGT 0.3619 TCTTA 0.241 TCTTC 0.1834 TCTTG 0.2147 TCTTT 0.3609 TGAAA 0.4079 TGAAC 0.1639 TGAAG 0.1463 TGAAT 0.2819 TGACA 0.4333 TGACC 0.2141 TGACG 0.09479 TGACT 0.2578 TGAGA 0.3383 TGAGC 0.1798 TGAGG 0.1766 TGAGT 0.3053 TGATA 0.3205 TGATC 0.1407 TGATG 0.2168 TGATT 0.3221 TGCAA 0.307 TGCAC 0.1645 TGCAG 0.1939 TGCAT 0.3346 TGCCA 0.4496 TGCCC 0.1582 TGCCG 0.1079 TGCCT 0.2843 TGCGA 0.3048 TGCGC 0.157 TGCGG 0.1994 TGCGT 0.3388 TGCTA 0.2442 TGCTC 0.1633 TGCTG 0.2473 TGCTT 0.3453 TGGAA 0.3469 TGGAC 0.1824 TGGAG 0.1754 TGGAT 0.2953 TGGCA 0.4048 TGGCC 0.2228 TGGCG 0.1107 TGGCT 0.2617 TGGGA 0.2984 TGGGC 0.1386 TGGGG 0.2262 TGGGT 0.3368 TGGTA 0.2833 TGGTC 0.1651 TGGTG 0.2275 TGGTT 0.3241 TGTAA 0.3257 TGTAC 0.1822 TGTAG 0.1273 TGTAT 0.3649 TGTCA 0.4145 TGTCC 0.175 TGTCG 0.09858 TGTCT 0.3119 TGTGA 0.2849 TGTGC 0.1505 TGTGG 0.1574 TGTGT 0.4072 TGTTA 0.2394 TGTTC 0.1392 TGTTG 0.2054 TGTTT 0.416 TTAAA 0.4135 TTAAC 0.1587 TTAAG 0.1366 TTAAT 0.2912 TTACA 0.4425 TTACC 0.1724 TTACG 0.08196 TTACT 0.3031 TTAGA 0.3295 TTAGC 0.1866 TTAGG 0.1549 TTAGT 0.3291 TTATA 0.3077 TTATC 0.1417 TTATG 0.1798 TTATT 0.3708 TTCAA 0.3445 TTCAC 0.1586 TTCAG 0.1737 TTCAT 0.3232 TTCCA 0.3841 TTCCC 0.1917 TTCCG 0.1043 TTCCT 0.3198 TTCGA 0.3389 TTCGC 0.162 TTCGG 0.1754 TTCGT 0.3237 TTCTA 0.2536 TTCTC 0.1583 TTCTG 0.2334 TTCTT 0.3547 TTGAA 0.3664 TTGAC 0.1696 TTGAG 0.1441 TTGAT 0.3199 TTGCA 0.4039 TTGCC 0.1942 TTGCG 0.08829 TTGCT 0.3137 TTGGA 0.305 TTGGC 0.1829 TTGGG 0.1691 TTGGT 0.343 TTGTA 0.2761 TTGTC 0.1609 TTGTG 0.1918 TTGTT 0.3712 TTTAA 0.3575 TTTAC 0.1657 TTTAG 0.1169 TTTAT 0.3599 TTTCA 0.4292 TTTCC 0.1761 TTTCG 0.07635 TTTCT 0.3183 TTTGA 0.3156 TTTGC 0.1486 TTTGG 0.1661 TTTGT 0.3697 TTTTA 0.2831 TTTTC 0.1509 TTTTG 0.1739 TTTTT 0.3922 [2] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.333 C 0.167 G 0.167 T 0.333 # l= 1 # Values AA 0.119 AC 0.0574 AG 0.05 AT 0.107 CA 0.0704 CC 0.0305 CG 0.0157 CT 0.05 GA 0.051 GC 0.0277 GG 0.0305 GT 0.0574 TA 0.0933 TC 0.051 TG 0.0704 TT 0.119 # l= 2 # Values AAA 0.0465 AAC 0.0196 AAG 0.017 AAT 0.0354 ACA 0.0255 ACC 0.0101 ACG 0.00501 ACT 0.0168 AGA 0.0161 AGC 0.00821 AGG 0.00889 AGT 0.0168 ATA 0.034 ATC 0.0152 ATG 0.0226 ATT 0.0355 CAA 0.0229 CAC 0.0122 CAG 0.0128 CAT 0.0226 CCA 0.0124 CCC 0.00617 CCG 0.00313 CCT 0.00889 CGA 0.00476 CGC 0.00282 CGG 0.00313 CGT 0.005 CTA 0.0119 CTC 0.00828 CTG 0.0128 CTT 0.017 GAA 0.018 GAC 0.00949 GAG 0.00828 GAT 0.0152 GCA 0.0113 GCC 0.00536 GCG 0.00282 GCT 0.0082 GGA 0.00893 GGC 0.00536 GGG 0.00617 GGT 0.0101 GTA 0.0162 GTC 0.00949 GTG 0.0122 GTT 0.0196 TAA 0.0312 TAC 0.0162 TAG 0.0119 TAT 0.034 TCA 0.0213 TCC 0.00894 TCG 0.00476 TCT 0.0161 TGA 0.0213 TGC 0.0113 TGG 0.0124 TGT 0.0255 TTA 0.0312 TTC 0.018 TTG 0.0229 TTT 0.0465 # l= 3 # Values AAAA 0.0178 AAAC 0.00784 AAAG 0.00619 AAAT 0.0146 AACA 0.00888 AACC 0.00322 AACG 0.00159 AACT 0.00592 AAGA 0.00528 AAGC 0.00266 AAGG 0.0031 AAGT 0.00599 AATA 0.0117 AATC 0.00489 AATG 0.0078 AATT 0.011 ACAA 0.00829 ACAC 0.00455 ACAG 0.00445 ACAT 0.00825 ACCA 0.00421 ACCC 0.0019 ACCG 0.000963 ACCT 0.003 ACGA 0.0015 ACGC 0.000936 ACGG 0.000969 ACGT 0.0016 ACTA 0.00392 ACTC 0.00246 ACTG 0.00446 ACTT 0.00599 AGAA 0.00567 AGAC 0.00288 AGAG 0.00274 AGAT 0.00477 AGCA 0.00343 AGCC 0.00139 AGCG 0.000853 AGCT 0.00254 AGGA 0.00258 AGGC 0.00147 AGGG 0.00182 AGGT 0.003 AGTA 0.00475 AGTC 0.00251 AGTG 0.00365 AGTT 0.00592 ATAA 0.0111 ATAC 0.00561 ATAG 0.00413 ATAT 0.0132 ATCA 0.00661 ATCC 0.00248 ATCG 0.00138 ATCT 0.00477 ATGA 0.00675 ATGC 0.00363 ATGG 0.00395 ATGT 0.00825 ATTA 0.00913 ATTC 0.00491 ATTG 0.00677 ATTT 0.0146 CAAA 0.00855 CAAC 0.00382 CAAG 0.00377 CAAT 0.00677 CACA 0.00518 CACC 0.00224 CACG 0.00111 CACT 0.00364 CAGA 0.00399 CAGC 0.00207 CAGG 0.00227 CAGT 0.00446 CATA 0.00619 CATC 0.00338 CATG 0.0052 CATT 0.0078 CCAA 0.00381 CCAC 0.00218 CCAG 0.00242 CCAT 0.00395 CCCA 0.0022 CCCC 0.00154 CCCG 0.000602 CCCT 0.00182 CCGA 0.000908 CCGC 0.000599 CCGG 0.000658 CCGT 0.000968 CCTA 0.0019 CCTC 0.00162 CCTG 0.00227 CCTT 0.0031 CGAA 0.00145 CGAC 0.001 CGAG 0.000931 CGAT 0.00138 CGCA 0.000979 CGCC 0.000626 CGCG 0.000365 CGCT 0.000853 CGGA 0.000976 CGGC 0.000592 CGGG 0.000602 CGGT 0.000963 CGTA 0.00127 CGTC 0.00104 CGTG 0.00111 CGTT 0.00159 CTAA 0.00362 CTAC 0.00231 CTAG 0.00181 CTAT 0.00413 CTCA 0.00305 CTCC 0.00155 CTCG 0.000931 CTCT 0.00274 CTGA 0.00372 CTGC 0.0022 CTGG 0.00242 CTGT 0.00445 CTTA 0.0041 CTTC 0.00297 CTTG 0.00377 CTTT 0.00619 GAAA 0.00726 GAAC 0.00287 GAAG 0.00297 GAAT 0.00491 GACA 0.00414 GACC 0.00181 GACG 0.00104 GACT 0.00251 GAGA 0.00281 GAGC 0.00139 GAGG 0.00162 GAGT 0.00245 GATA 0.0048 GATC 0.00217 GATG 0.00338 GATT 0.00489 GCAA 0.00363 GCAC 0.00183 GCAG 0.0022 GCAT 0.00363 GCCA 0.00234 GCCC 0.000955 GCCG 0.000592 GCCT 0.00147 GCGA 0.000845 GCGC 0.000443 GCGG 0.000599 GCGT 0.000936 GCTA 0.00208 GCTC 0.00139 GCTG 0.00207 GCTT 0.00266 GGAA 0.00326 GGAC 0.00164 GGAG 0.00155 GGAT 0.00248 GGCA 0.00211 GGCC 0.00123 GGCG 0.000626 GGCT 0.00139 GGGA 0.00177 GGGC 0.000955 GGGG 0.00154 GGGT 0.0019 GGTA 0.00282 GGTC 0.00181 GGTG 0.00224 GGTT 0.00322 GTAA 0.00539 GTAC 0.00286 GTAG 0.00231 GTAT 0.00561 GTCA 0.00396 GTCC 0.00164 GTCG 0.00101 GTCT 0.00288 GTGA 0.00361 GTGC 0.00183 GTGG 0.00218 GTGT 0.00455 GTTA 0.00508 GTTC 0.00287 GTTG 0.00382 GTTT 0.00785 TAAA 0.0129 TAAC 0.00508 TAAG 0.0041 TAAT 0.00913 TACA 0.00734 TACC 0.00282 TACG 0.00127 TACT 0.00475 TAGA 0.00398 TAGC 0.00208 TAGG 0.0019 TAGT 0.00392 TATA 0.0113 TATC 0.0048 TATG 0.00619 TATT 0.0117 TCAA 0.00718 TCAC 0.00361 TCAG 0.00372 TCAT 0.00675 TCCA 0.0036 TCCC 0.00177 TCCG 0.000976 TCCT 0.00258 TCGA 0.00151 TCGC 0.000845 TCGG 0.000908 TCGT 0.0015 TCTA 0.00398 TCTC 0.00281 TCTG 0.00399 TCTT 0.00528 TGAA 0.00763 TGAC 0.00396 TGAG 0.00305 TGAT 0.00661 TGCA 0.00477 TGCC 0.00211 TGCG 0.000979 TGCT 0.00343 TGGA 0.0036 TGGC 0.00234 TGGG 0.0022 TGGT 0.00421 TGTA 0.00734 TGTC 0.00413 TGTG 0.00518 TGTT 0.00888 TTAA 0.0111 TTAC 0.00539 TTAG 0.00362 TTAT 0.0111 TTCA 0.00763 TTCC 0.00326 TTCG 0.00145 TTCT 0.00567 TTGA 0.00717 TTGC 0.00363 TTGG 0.00381 TTGT 0.00829 TTTA 0.0129 TTTC 0.00727 TTTG 0.00855 TTTT 0.0178 # l= 4 # Values AAAAA 0.00699 AAAAC 0.00289 AAAAG 0.00218 AAAAT 0.00578 AAACA 0.00371 AAACC 0.00109 AAACG 0.000666 AAACT 0.00238 AAAGA 0.00191 AAAGC 0.000953 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00506 AAATC 0.00201 AAATG 0.00332 AAATT 0.00424 AACAA 0.00308 AACAC 0.00153 AACAG 0.00147 AACAT 0.0028 AACCA 0.00137 AACCC 0.000604 AACCG 0.000267 AACCT 0.000976 AACGA 0.000465 AACGC 0.000294 AACGG 0.000293 AACGT 0.000539 AACTA 0.00138 AACTC 0.000839 AACTG 0.00149 AACTT 0.00221 AAGAA 0.00201 AAGAC 0.000915 AAGAG 0.000805 AAGAT 0.00155 AAGCA 0.00118 AAGCC 0.000406 AAGCG 0.000279 AAGCT 0.000794 AAGGA 0.000936 AAGGC 0.000541 AAGGG 0.000633 AAGGT 0.000989 AAGTA 0.00166 AAGTC 0.000848 AAGTG 0.00127 AAGTT 0.00221 AATAA 0.0041 AATAC 0.00191 AATAG 0.00136 AATAT 0.00436 AATCA 0.00213 AATCC 0.000802 AATCG 0.000436 AATCT 0.00152 AATGA 0.00251 AATGC 0.00118 AATGG 0.00137 AATGT 0.00274 AATTA 0.0032 AATTC 0.00152 AATTG 0.00207 AATTT 0.00424 ACAAA 0.00317 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00129 ACAAT 0.00241 ACACA 0.00211 ACACC 0.000755 ACACG 0.000402 ACACT 0.00128 ACAGA 0.00145 ACAGC 0.000706 ACAGG 0.00079 ACAGT 0.00151 ACATA 0.00234 ACATC 0.00107 ACATG 0.0021 ACATT 0.00274 ACCAA 0.00131 ACCAC 0.000811 ACCAG 0.000808 ACCAT 0.00128 ACCCA 0.000741 ACCCC 0.000454 ACCCG 0.000184 ACCCT 0.000521 ACCGA 0.000273 ACCGC 0.000179 ACCGG 0.000219 ACCGT 0.000293 ACCTA 0.00068 ACCTC 0.000545 ACCTG 0.000789 ACCTT 0.000989 ACGAA 0.00047 ACGAC 0.000343 ACGAG 0.000274 ACGAT 0.000415 ACGCA 0.00033 ACGCC 0.000205 ACGCG 0.000116 ACGCT 0.000285 ACGGA 0.000328 ACGGC 0.000181 ACGGG 0.000167 ACGGT 0.000293 ACGTA 0.00041 ACGTC 0.000286 ACGTG 0.000363 ACGTT 0.000539 ACTAA 0.0012 ACTAC 0.000763 ACTAG 0.000601 ACTAT 0.00136 ACTCA 0.000931 ACTCC 0.000434 ACTCG 0.000326 ACTCT 0.000763 ACTGA 0.00136 ACTGC 0.000703 ACTGG 0.000892 ACTGT 0.00151 ACTTA 0.00145 ACTTC 0.000991 ACTTG 0.00137 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.00232 AGAAC 0.000903 AGAAG 0.00094 AGAAT 0.00151 AGACA 0.00129 AGACC 0.000479 AGACG 0.000332 AGACT 0.000778 AGAGA 0.000999 AGAGC 0.00043 AGAGG 0.00055 AGAGT 0.000763 AGATA 0.00151 AGATC 0.000639 AGATG 0.0011 AGATT 0.00152 AGCAA 0.00114 AGCAC 0.000565 AGCAG 0.000657 AGCAT 0.00106 AGCCA 0.000613 AGCCC 0.000262 AGCCG 0.000144 AGCCT 0.00037 AGCGA 0.000255 AGCGC 0.000134 AGCGG 0.000179 AGCGT 0.000285 AGCTA 0.000676 AGCTC 0.000427 AGCTG 0.00064 AGCTT 0.000794 AGGAA 0.00104 AGGAC 0.000468 AGGAG 0.000413 AGGAT 0.000661 AGGCA 0.000599 AGGCC 0.000338 AGGCG 0.000168 AGGCT 0.00037 AGGGA 0.000558 AGGGC 0.000318 AGGGG 0.000426 AGGGT 0.000521 AGGTA 0.000853 AGGTC 0.000557 AGGTG 0.000618 AGGTT 0.000976 AGTAA 0.00164 AGTAC 0.000841 AGTAG 0.000712 AGTAT 0.00156 AGTCA 0.00102 AGTCC 0.000433 AGTCG 0.000271 AGTCT 0.000778 AGTGA 0.0011 AGTGC 0.000565 AGTGG 0.000698 AGTGT 0.00128 AGTTA 0.00159 AGTTC 0.000858 AGTTG 0.00109 AGTTT 0.00238 ATAAA 0.00464 ATAAC 0.00176 ATAAG 0.00129 ATAAT 0.00337 ATACA 0.00269 ATACC 0.000936 ATACG 0.000427 ATACT 0.00156 ATAGA 0.00142 ATAGC 0.000705 ATAGG 0.000647 ATAGT 0.00136 ATATA 0.00474 ATATC 0.00185 ATATG 0.00229 ATATT 0.00436 ATCAA 0.0023 ATCAC 0.0011 ATCAG 0.00112 ATCAT 0.00209 ATCCA 0.00106 ATCCC 0.000513 ATCCG 0.000241 ATCCT 0.000661 ATCGA 0.000441 ATCGC 0.00025 ATCGG 0.000275 ATCGT 0.000415 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.000855 ATCTG 0.00116 ATCTT 0.00155 ATGAA 0.00247 ATGAC 0.0013 ATGAG 0.000888 ATGAT 0.00209 ATGCA 0.0016 ATGCC 0.000672 ATGCG 0.000295 ATGCT 0.00106 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.000836 ATGGG 0.000665 ATGGT 0.00128 ATGTA 0.00256 ATGTC 0.00126 ATGTG 0.00164 ATGTT 0.0028 ATTAA 0.00324 ATTAC 0.00152 ATTAG 0.001 ATTAT 0.00337 ATTCA 0.00216 ATTCC 0.000836 ATTCG 0.000408 ATTCT 0.00151 ATTGA 0.00216 ATTGC 0.0011 ATTGG 0.0011 ATTGT 0.00241 ATTTA 0.00393 ATTTC 0.00231 ATTTG 0.00262 ATTTT 0.00578 CAAAA 0.0031 CAAAC 0.00158 CAAAG 0.00124 CAAAT 0.00262 CAACA 0.00182 CAACC 0.000623 CAACG 0.00028 CAACT 0.00109 CAAGA 0.00113 CAAGC 0.000559 CAAGG 0.000714 CAAGT 0.00137 CAATA 0.00222 CAATC 0.00103 CAATG 0.00144 CAATT 0.00207 CACAA 0.00158 CACAC 0.00102 CACAG 0.000931 CACAT 0.00164 CACCA 0.000953 CACCC 0.000443 CACCG 0.000223 CACCT 0.000618 CACGA 0.000318 CACGC 0.000216 CACGG 0.000207 CACGT 0.000363 CACTA 0.000793 CACTC 0.000598 CACTG 0.000987 CACTT 0.00127 CAGAA 0.00132 CAGAC 0.000784 CAGAG 0.00072 CAGAT 0.00116 CAGCA 0.00085 CAGCC 0.000387 CAGCG 0.000197 CAGCT 0.00064 CAGGA 0.000655 CAGGC 0.000358 CAGGG 0.000465 CAGGT 0.000789 CAGTA 0.00126 CAGTC 0.000718 CAGTG 0.000987 CAGTT 0.00149 CATAA 0.00198 CATAC 0.00111 CATAG 0.000804 CATAT 0.00229 CATCA 0.00142 CATCC 0.000537 CATCG 0.000318 CATCT 0.0011 CATGA 0.00138 CATGC 0.000871 CATGG 0.000851 CATGT 0.0021 CATTA 0.0019 CATTC 0.00113 CATTG 0.00144 CATTT 0.00332 CCAAA 0.00141 CCAAC 0.000651 CCAAG 0.00065 CCAAT 0.0011 CCACA 0.000814 CCACC 0.000475 CCACG 0.00019 CCACT 0.000698 CCAGA 0.000675 CCAGC 0.000364 CCAGG 0.000494 CCAGT 0.000892 CCATA 0.00105 CCATC 0.000669 CCATG 0.000851 CCATT 0.00137 CCCAA 0.000644 CCCAC 0.000432 CCCAG 0.000462 CCCAT 0.000665 CCCCA 0.0005 CCCCC 0.000481 CCCCG 0.000134 CCCCT 0.000426 CCCGA 0.000168 CCCGC 0.000133 CCCGG 0.000134 CCCGT 0.000167 CCCTA 0.000374 CCCTC 0.000352 CCCTG 0.000465 CCCTT 0.000633 CCGAA 0.000254 CCGAC 0.000209 CCGAG 0.000169 CCGAT 0.000275 CCGCA 0.000195 CCGCC 0.000161 CCGCG 6.46e-05 CCGCT 0.000179 CCGGA 0.00018 CCGGC 0.000125 CCGGG 0.000134 CCGGT 0.000219 CCGTA 0.000258 CCGTC 0.00021 CCGTG 0.000207 CCGTT 0.000293 CCTAA 0.000558 CCTAC 0.000381 CCTAG 0.000313 CCTAT 0.000647 CCTCA 0.000539 CCTCC 0.000357 CCTCG 0.000174 CCTCT 0.00055 CCTGA 0.000582 CCTGC 0.000402 CCTGG 0.000494 CCTGT 0.00079 CCTTA 0.000683 CCTTC 0.000559 CCTTG 0.000714 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.00055 CGAAC 0.000249 CGAAG 0.000239 CGAAT 0.000408 CGACA 0.000406 CGACC 0.000194 CGACG 0.000134 CGACT 0.000271 CGAGA 0.000255 CGAGC 0.000176 CGAGG 0.000174 CGAGT 0.000326 CGATA 0.000409 CGATC 0.000217 CGATG 0.000318 CGATT 0.000436 CGCAA 0.000318 CGCAC 0.000196 CGCAG 0.000169 CGCAT 0.000295 CGCCA 0.000258 CGCCC 0.000114 CGCCG 8.68e-05 CGCCT 0.000168 CGCGA 0.000119 CGCGC 6.53e-05 CGCGG 6.46e-05 CGCGT 0.000116 CGCTA 0.000212 CGCTC 0.000166 CGCTG 0.000197 CGCTT 0.000279 CGGAA 0.000341 CGGAC 0.000216 CGGAG 0.000178 CGGAT 0.000241 CGGCA 0.000227 CGGCC 0.000134 CGGCG 8.68e-05 CGGCT 0.000144 CGGGA 0.000174 CGGGC 0.00011 CGGGG 0.000134 CGGGT 0.000184 CGGTA 0.000307 CGGTC 0.000166 CGGTG 0.000223 CGGTT 0.000267 CGTAA 0.00044 CGTAC 0.000222 CGTAG 0.000181 CGTAT 0.000427 CGTCA 0.000376 CGTCC 0.000198 CGTCG 0.000134 CGTCT 0.000332 CGTGA 0.000323 CGTGC 0.00019 CGTGG 0.00019 CGTGT 0.000402 CGTTA 0.00041 CGTTC 0.000234 CGTTG 0.00028 CGTTT 0.000666 CTAAA 0.0015 CTAAC 0.000599 CTAAG 0.000519 CTAAT 0.001 CTACA 0.000931 CTACC 0.000487 CTACG 0.000181 CTACT 0.000712 CTAGA 0.000573 CTAGC 0.000321 CTAGG 0.000313 CTAGT 0.000601 CTATA 0.00135 CTATC 0.000622 CTATG 0.000804 CTATT 0.00136 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.000578 CTCAG 0.000556 CTCAT 0.000888 CTCCA 0.000626 CTCCC 0.000336 CTCCG 0.000178 CTCCT 0.000413 CTCGA 0.000306 CTCGC 0.000182 CTCGG 0.000169 CTCGT 0.000274 CTCTA 0.000654 CTCTC 0.000563 CTCTG 0.00072 CTCTT 0.000805 CTGAA 0.00132 CTGAC 0.000721 CTGAG 0.000556 CTGAT 0.00112 CTGCA 0.000925 CTGCC 0.000447 CTGCG 0.000169 CTGCT 0.000657 CTGGA 0.000716 CTGGC 0.000439 CTGGG 0.000462 CTGGT 0.000808 CTGTA 0.00126 CTGTC 0.000791 CTGTG 0.000931 CTGTT 0.00147 CTTAA 0.00151 CTTAC 0.000775 CTTAG 0.000519 CTTAT 0.00129 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.00068 CTTCG 0.000239 CTTCT 0.00094 CTTGA 0.00119 CTTGC 0.000642 CTTGG 0.00065 CTTGT 0.00129 CTTTA 0.00174 CTTTC 0.00102 CTTTG 0.00124 CTTTT 0.00218 GAAAA 0.00269 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00102 GAAAT 0.00231 GAACA 0.00123 GAACC 0.000545 GAACG 0.000234 GAACT 0.000858 GAAGA 0.000966 GAAGC 0.000453 GAAGG 0.000559 GAAGT 0.000991 GAATA 0.00155 GAATC 0.00071 GAATG 0.00113 GAATT 0.00152 GACAA 0.00133 GACAC 0.000758 GACAG 0.000791 GACAT 0.00126 GACCA 0.000692 GACCC 0.000392 GACCG 0.000166 GACCT 0.000557 GACGA 0.000345 GACGC 0.000198 GACGG 0.00021 GACGT 0.000286 GACTA 0.000584 GACTC 0.000358 GACTG 0.000718 GACTT 0.000848 GAGAA 0.000894 GAGAC 0.000499 GAGAG 0.000563 GAGAT 0.000855 GAGCA 0.000558 GAGCC 0.000241 GAGCG 0.000166 GAGCT 0.000427 GAGGA 0.000478 GAGGC 0.000245 GAGGG 0.000352 GAGGT 0.000545 GAGTA 0.000661 GAGTC 0.000358 GAGTG 0.000598 GAGTT 0.000839 GATAA 0.00156 GATAC 0.000769 GATAG 0.000622 GATAT 0.00185 GATCA 0.000922 GATCC 0.000387 GATCG 0.000217 GATCT 0.000639 GATGA 0.00109 GATGC 0.000545 GATGG 0.000669 GATGT 0.00107 GATTA 0.00113 GATTC 0.00071 GATTG 0.00103 GATTT 0.00201 GCAAA 0.00127 GCAAC 0.000618 GCAAG 0.000642 GCAAT 0.0011 GCACA 0.000775 GCACC 0.000301 GCACG 0.00019 GCACT 0.000565 GCAGA 0.00071 GCAGC 0.000384 GCAGG 0.000402 GCAGT 0.000703 GCATA 0.00103 GCATC 0.000545 GCATG 0.000871 GCATT 0.00118 GCCAA 0.000695 GCCAC 0.00037 GCCAG 0.000439 GCCAT 0.000836 GCCCA 0.000303 GCCCC 0.000224 GCCCG 0.00011 GCCCT 0.000318 GCCGA 0.000178 GCCGC 0.000107 GCCGG 0.000125 GCCGT 0.000181 GCCTA 0.000331 GCCTC 0.000245 GCCTG 0.000358 GCCTT 0.000541 GCGAA 0.000234 GCGAC 0.00018 GCGAG 0.000182 GCGAT 0.00025 GCGCA 0.000153 GCGCC 9.03e-05 GCGCG 6.53e-05 GCGCT 0.000134 GCGGA 0.00018 GCGGC 0.000107 GCGGG 0.000133 GCGGT 0.000179 GCGTA 0.000227 GCGTC 0.000198 GCGTG 0.000216 GCGTT 0.000294 GCTAA 0.000671 GCTAC 0.000379 GCTAG 0.000321 GCTAT 0.000705 GCTCA 0.000548 GCTCC 0.000239 GCTCG 0.000176 GCTCT 0.00043 GCTGA 0.000621 GCTGC 0.000384 GCTGG 0.000364 GCTGT 0.000706 GCTTA 0.000697 GCTTC 0.000453 GCTTG 0.000559 GCTTT 0.000953 GGAAA 0.00128 GGAAC 0.000469 GGAAG 0.00068 GGAAT 0.000836 GGACA 0.000722 GGACC 0.00029 GGACG 0.000198 GGACT 0.000433 GGAGA 0.000523 GGAGC 0.000239 GGAGG 0.000357 GGAGT 0.000434 GGATA 0.000752 GGATC 0.000387 GGATG 0.000537 GGATT 0.000802 GGCAA 0.000704 GGCAC 0.000292 GGCAG 0.000447 GGCAT 0.000672 GGCCA 0.000516 GGCCC 0.000245 GGCCG 0.000134 GGCCT 0.000338 GGCGA 0.000171 GGCGC 9.03e-05 GGCGG 0.000161 GGCGT 0.000205 GGCTA 0.000355 GGCTC 0.000241 GGCTG 0.000387 GGCTT 0.000406 GGGAA 0.000621 GGGAC 0.000302 GGGAG 0.000336 GGGAT 0.000513 GGGCA 0.000334 GGGCC 0.000245 GGGCG 0.000114 GGGCT 0.000262 GGGGA 0.000382 GGGGC 0.000224 GGGGG 0.000481 GGGGT 0.000454 GGGTA 0.000462 GGGTC 0.000392 GGGTG 0.000443 GGGTT 0.000604 GGTAA 0.000925 GGTAC 0.000468 GGTAG 0.000487 GGTAT 0.000936 GGTCA 0.000844 GGTCC 0.00029 GGTCG 0.000194 GGTCT 0.000479 GGTGA 0.000706 GGTGC 0.000301 GGTGG 0.000475 GGTGT 0.000755 GGTTA 0.000953 GGTTC 0.000545 GGTTG 0.000623 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00212 GTAAC 0.000971 GTAAG 0.000775 GTAAT 0.00152 GTACA 0.00133 GTACC 0.000468 GTACG 0.000222 GTACT 0.000841 GTAGA 0.000787 GTAGC 0.000379 GTAGG 0.000381 GTAGT 0.000763 GTATA 0.00182 GTATC 0.000769 GTATG 0.00111 GTATT 0.00191 GTCAA 0.00121 GTCAC 0.000724 GTCAG 0.000721 GTCAT 0.0013 GTCCA 0.000656 GTCCC 0.000302 GTCCG 0.000216 GTCCT 0.000468 GTCGA 0.000273 GTCGC 0.00018 GTCGG 0.000209 GTCGT 0.000343 GTCTA 0.000683 GTCTC 0.000499 GTCTG 0.000784 GTCTT 0.000915 GTGAA 0.00121 GTGAC 0.000724 GTGAG 0.000578 GTGAT 0.0011 GTGCA 0.000779 GTGCC 0.000292 GTGCG 0.000196 GTGCT 0.000565 GTGGA 0.000563 GTGGC 0.00037 GTGGG 0.000432 GTGGT 0.000811 GTGTA 0.00123 GTGTC 0.000758 GTGTG 0.00102 GTGTT 0.00153 GTTAA 0.00175 GTTAC 0.000971 GTTAG 0.000599 GTTAT 0.00176 GTTCA 0.00125 GTTCC 0.000469 GTTCG 0.000249 GTTCT 0.000903 GTTGA 0.00113 GTTGC 0.000618 GTTGG 0.000651 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.00213 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00158 GTTTT 0.00289 TAAAA 0.00506 TAAAC 0.00213 TAAAG 0.00174 TAAAT 0.00393 TAACA 0.00213 TAACC 0.000953 TAACG 0.00041 TAACT 0.00159 TAAGA 0.00127 TAAGC 0.000697 TAAGG 0.000683 TAAGT 0.00145 TAATA 0.0029 TAATC 0.00113 TAATG 0.0019 TAATT 0.0032 TACAA 0.00229 TACAC 0.00123 TACAG 0.00126 TACAT 0.00256 TACCA 0.0012 TACCC 0.000462 TACCG 0.000307 TACCT 0.000853 TACGA 0.000373 TACGC 0.000227 TACGG 0.000258 TACGT 0.00041 TACTA 0.00116 TACTC 0.000661 TACTG 0.00126 TACTT 0.00166 TAGAA 0.00144 TAGAC 0.000683 TAGAG 0.000654 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000833 TAGCC 0.000355 TAGCG 0.000212 TAGCT 0.000676 TAGGA 0.000514 TAGGC 0.000331 TAGGG 0.000374 TAGGT 0.00068 TAGTA 0.00116 TAGTC 0.000584 TAGTG 0.000793 TAGTT 0.00138 TATAA 0.00341 TATAC 0.00182 TATAG 0.00135 TATAT 0.00474 TATCA 0.00213 TATCC 0.000752 TATCG 0.000409 TATCT 0.00151 TATGA 0.00177 TATGC 0.00103 TATGG 0.00105 TATGT 0.00234 TATTA 0.0029 TATTC 0.00155 TATTG 0.00222 TATTT 0.00506 TCAAA 0.00269 TCAAC 0.00113 TCAAG 0.00119 TCAAT 0.00216 TCACA 0.00148 TCACC 0.000706 TCACG 0.000323 TCACT 0.0011 TCAGA 0.00116 TCAGC 0.000621 TCAGG 0.000582 TCAGT 0.00136 TCATA 0.00177 TCATC 0.00109 TCATG 0.00138 TCATT 0.00251 TCCAA 0.00116 TCCAC 0.000563 TCCAG 0.000716 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.000657 TCCCC 0.000382 TCCCG 0.000174 TCCCT 0.000558 TCCGA 0.000289 TCCGC 0.00018 TCCGG 0.00018 TCCGT 0.000328 TCCTA 0.000514 TCCTC 0.000478 TCCTG 0.000655 TCCTT 0.000936 TCGAA 0.000489 TCGAC 0.000273 TCGAG 0.000306 TCGAT 0.000441 TCGCA 0.000301 TCGCC 0.000171 TCGCG 0.000119 TCGCT 0.000255 TCGGA 0.000289 TCGGC 0.000178 TCGGG 0.000168 TCGGT 0.000273 TCGTA 0.000373 TCGTC 0.000345 TCGTG 0.000318 TCGTT 0.000465 TCTAA 0.00119 TCTAC 0.000787 TCTAG 0.000573 TCTAT 0.00142 TCTCA 0.00103 TCTCC 0.000523 TCTCG 0.000255 TCTCT 0.000999 TCTGA 0.00116 TCTGC 0.00071 TCTGG 0.000675 TCTGT 0.00145 TCTTA 0.00127 TCTTC 0.000966 TCTTG 0.00113 TCTTT 0.00191 TGAAA 0.00312 TGAAC 0.00125 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00216 TGACA 0.00172 TGACC 0.000844 TGACG 0.000376 TGACT 0.00102 TGAGA 0.00103 TGAGC 0.000548 TGAGG 0.000539 TGAGT 0.000931 TGATA 0.00213 TGATC 0.000922 TGATG 0.00142 TGATT 0.00213 TGCAA 0.00147 TGCAC 0.000779 TGCAG 0.000925 TGCAT 0.0016 TGCCA 0.000954 TGCCC 0.000334 TGCCG 0.000227 TGCCT 0.000599 TGCGA 0.000301 TGCGC 0.000153 TGCGG 0.000195 TGCGT 0.00033 TGCTA 0.000833 TGCTC 0.000558 TGCTG 0.00085 TGCTT 0.00118 TGGAA 0.00126 TGGAC 0.000656 TGGAG 0.000626 TGGAT 0.00106 TGGCA 0.000954 TGGCC 0.000516 TGGCG 0.000258 TGGCT 0.000613 TGGGA 0.000657 TGGGC 0.000303 TGGGG 0.0005 TGGGT 0.000741 TGGTA 0.0012 TGGTC 0.000692 TGGTG 0.000953 TGGTT 0.00137 TGTAA 0.00239 TGTAC 0.00133 TGTAG 0.000931 TGTAT 0.00269 TGTCA 0.00172 TGTCC 0.000722 TGTCG 0.000406 TGTCT 0.00129 TGTGA 0.00148 TGTGC 0.000775 TGTGG 0.000814 TGTGT 0.00211 TGTTA 0.00213 TGTTC 0.00123 TGTTG 0.00182 TGTTT 0.00371 TTAAA 0.0046 TTAAC 0.00175 TTAAG 0.00151 TTAAT 0.00324 TTACA 0.00239 TTACC 0.000925 TTACG 0.00044 TTACT 0.00164 TTAGA 0.00119 TTAGC 0.000671 TTAGG 0.000558 TTAGT 0.0012 TTATA 0.00341 TTATC 0.00156 TTATG 0.00198 TTATT 0.0041 TTCAA 0.00263 TTCAC 0.00121 TTCAG 0.00132 TTCAT 0.00247 TTCCA 0.00126 TTCCC 0.000621 TTCCG 0.000341 TTCCT 0.00104 TTCGA 0.000489 TTCGC 0.000234 TTCGG 0.000254 TTCGT 0.00047 TTCTA 0.00144 TTCTC 0.000894 TTCTG 0.00132 TTCTT 0.00201 TTGAA 0.00263 TTGAC 0.00121 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.0023 TTGCA 0.00147 TTGCC 0.000704 TTGCG 0.000318 TTGCT 0.00114 TTGGA 0.00116 TTGGC 0.000695 TTGGG 0.000644 TTGGT 0.00131 TTGTA 0.00229 TTGTC 0.00133 TTGTG 0.00158 TTGTT 0.00308 TTTAA 0.0046 TTTAC 0.00212 TTTAG 0.0015 TTTAT 0.00464 TTTCA 0.00312 TTTCC 0.00128 TTTCG 0.00055 TTTCT 0.00232 TTTGA 0.00269 TTTGC 0.00127 TTTGG 0.00141 TTTGT 0.00317 TTTTA 0.00506 TTTTC 0.00269 TTTTG 0.0031 TTTTT 0.00699 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3921 AAAAC 0.1616 AAAAG 0.1226 AAAAT 0.3237 AAACA 0.4719 AAACC 0.1398 AAACG 0.08559 AAACT 0.3027 AAAGA 0.3083 AAAGC 0.1544 AAAGG 0.1854 AAAGT 0.352 AAATA 0.3452 AAATC 0.1376 AAATG 0.2277 AAATT 0.2895 AACAA 0.3462 AACAC 0.1732 AACAG 0.1661 AACAT 0.3145 AACCA 0.4248 AACCC 0.1882 AACCG 0.08332 AACCT 0.3037 AACGA 0.2923 AACGC 0.185 AACGG 0.1843 AACGT 0.3384 AACTA 0.2325 AACTC 0.142 AACTG 0.2529 AACTT 0.3726 AAGAA 0.3801 AAGAC 0.174 AAGAG 0.1523 AAGAT 0.2936 AAGCA 0.4438 AAGCC 0.1531 AAGCG 0.1056 AAGCT 0.2975 AAGGA 0.3001 AAGGC 0.1752 AAGGG 0.2037 AAGGT 0.321 AAGTA 0.278 AAGTC 0.1418 AAGTG 0.2119 AAGTT 0.3683 AATAA 0.35 AATAC 0.163 AATAG 0.1161 AATAT 0.3709 AATCA 0.436 AATCC 0.1644 AATCG 0.08958 AATCT 0.31 AATGA 0.3215 AATGC 0.1514 AATGG 0.1768 AATGT 0.3503 AATTA 0.2898 AATTC 0.138 AATTG 0.1881 AATTT 0.3841 ACAAA 0.3809 ACAAC 0.172 ACAAG 0.1566 ACAAT 0.2905 ACACA 0.4634 ACACC 0.1665 ACACG 0.08905 ACACT 0.281 ACAGA 0.3246 ACAGC 0.1587 ACAGG 0.1784 ACAGT 0.3383 ACATA 0.2824 ACATC 0.1305 ACATG 0.2561 ACATT 0.331 ACCAA 0.31 ACCAC 0.1936 ACCAG 0.1918 ACCAT 0.3046 ACCCA 0.3901 ACCCC 0.2389 ACCCG 0.09722 ACCCT 0.2737 ACCGA 0.2829 ACCGC 0.1857 ACCGG 0.2271 ACCGT 0.3044 ACCTA 0.2258 ACCTC 0.1815 ACCTG 0.2619 ACCTT 0.3309 ACGAA 0.3115 ACGAC 0.2301 ACGAG 0.1824 ACGAT 0.2759 ACGCA 0.3526 ACGCC 0.2195 ACGCG 0.1237 ACGCT 0.3042 ACGGA 0.3376 ACGGC 0.1871 ACGGG 0.1728 ACGGT 0.3025 ACGTA 0.2578 ACGTC 0.1788 ACGTG 0.2281 ACGTT 0.3353 ACTAA 0.3043 ACTAC 0.1946 ACTAG 0.1544 ACTAT 0.3467 ACTCA 0.3796 ACTCC 0.1769 ACTCG 0.1329 ACTCT 0.3106 ACTGA 0.3038 ACTGC 0.1587 ACTGG 0.1998 ACTGT 0.3377 ACTTA 0.2412 ACTTC 0.1656 ACTTG 0.2292 ACTTT 0.364 AGAAA 0.4071 AGAAC 0.1602 AGAAG 0.1668 AGAAT 0.2658 AGACA 0.4473 AGACC 0.1665 AGACG 0.1166 AGACT 0.2697 AGAGA 0.3651 AGAGC 0.1561 AGAGG 0.2018 AGAGT 0.2769 AGATA 0.3169 AGATC 0.1349 AGATG 0.231 AGATT 0.3172 AGCAA 0.3314 AGCAC 0.1658 AGCAG 0.1927 AGCAT 0.3101 AGCCA 0.4415 AGCCC 0.1885 AGCCG 0.1042 AGCCT 0.2657 AGCGA 0.2988 AGCGC 0.1575 AGCGG 0.2096 AGCGT 0.3341 AGCTA 0.2673 AGCTC 0.1682 AGCTG 0.252 AGCTT 0.3124 AGGAA 0.4017 AGGAC 0.1827 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2552 AGGCA 0.4062 AGGCC 0.2287 AGGCG 0.115 AGGCT 0.25 AGGGA 0.3052 AGGGC 0.1751 AGGGG 0.2342 AGGGT 0.2855 AGGTA 0.2841 AGGTC 0.1861 AGGTG 0.2064 AGGTT 0.3235 AGTAA 0.3445 AGTAC 0.1782 AGTAG 0.1501 AGTAT 0.3271 AGTCA 0.4072 AGTCC 0.1733 AGTCG 0.1089 AGTCT 0.3106 AGTGA 0.3018 AGTGC 0.1554 AGTGG 0.1923 AGTGT 0.3506 AGTTA 0.2695 AGTTC 0.1451 AGTTG 0.1853 AGTTT 0.4001 ATAAA 0.4182 ATAAC 0.16 ATAAG 0.1174 ATAAT 0.3044 ATACA 0.4777 ATACC 0.1683 ATACG 0.07652 ATACT 0.2774 ATAGA 0.3437 ATAGC 0.1716 ATAGG 0.1565 ATAGT 0.3282 ATATA 0.3583 ATATC 0.1398 ATATG 0.1734 ATATT 0.3284 ATCAA 0.3467 ATCAC 0.1674 ATCAG 0.1698 ATCAT 0.3162 ATCCA 0.4282 ATCCC 0.2076 ATCCG 0.09812 ATCCT 0.2661 ATCGA 0.3202 ATCGC 0.1803 ATCGG 0.2003 ATCGT 0.2992 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.1799 ATCTG 0.2445 ATCTT 0.3248 ATGAA 0.365 ATGAC 0.1934 ATGAG 0.1317 ATGAT 0.3099 ATGCA 0.4396 ATGCC 0.1859 ATGCG 0.0815 ATGCT 0.2931 ATGGA 0.2924 ATGGC 0.2138 ATGGG 0.1687 ATGGT 0.325 ATGTA 0.3094 ATGTC 0.1532 ATGTG 0.199 ATGTT 0.3383 ATTAA 0.3543 ATTAC 0.167 ATTAG 0.11 ATTAT 0.3687 ATTCA 0.4388 ATTCC 0.1702 ATTCG 0.08353 ATTCT 0.3074 ATTGA 0.3184 ATTGC 0.1637 ATTGG 0.1624 ATTGT 0.3554 ATTTA 0.2678 ATTTC 0.1579 ATTTG 0.1795 ATTTT 0.3948 CAAAA 0.3621 CAAAC 0.1854 CAAAG 0.1461 CAAAT 0.3064 CAACA 0.476 CAACC 0.1636 CAACG 0.07384 CAACT 0.2865 CAAGA 0.2993 CAAGC 0.1488 CAAGG 0.1901 CAAGT 0.3618 CAATA 0.327 CAATC 0.1536 CAATG 0.2143 CAATT 0.3051 CACAA 0.3055 CACAC 0.1983 CACAG 0.1802 CACAT 0.316 CACCA 0.4253 CACCC 0.1984 CACCG 0.09999 CACCT 0.2762 CACGA 0.2866 CACGC 0.1951 CACGG 0.1883 CACGT 0.3299 CACTA 0.2177 CACTC 0.1648 CACTG 0.2708 CACTT 0.3467 CAGAA 0.3301 CAGAC 0.1965 CAGAG 0.1816 CAGAT 0.2917 CAGCA 0.4083 CAGCC 0.1882 CAGCG 0.09523 CAGCT 0.3083 CAGGA 0.2887 CAGGC 0.1581 CAGGG 0.2062 CAGGT 0.347 CAGTA 0.2825 CAGTC 0.1615 CAGTG 0.2214 CAGTT 0.3345 CATAA 0.3201 CATAC 0.1802 CATAG 0.1302 CATAT 0.3694 CATCA 0.4216 CATCC 0.1587 CATCG 0.09527 CATCT 0.3244 CATGA 0.2645 CATGC 0.1678 CATGG 0.1638 CATGT 0.4039 CATTA 0.2434 CATTC 0.1453 CATTG 0.186 CATTT 0.4253 CCAAA 0.3703 CCAAC 0.1716 CCAAG 0.1709 CCAAT 0.2872 CCACA 0.3721 CCACC 0.2204 CCACG 0.08752 CCACT 0.32 CCAGA 0.2793 CCAGC 0.1499 CCAGG 0.2047 CCAGT 0.3661 CCATA 0.2661 CCATC 0.1708 CCATG 0.2158 CCATT 0.3473 CCCAA 0.2915 CCCAC 0.1963 CCCAG 0.2107 CCCAT 0.3016 CCCCA 0.323 CCCCC 0.3126 CCCCG 0.0877 CCCCT 0.2767 CCCGA 0.2793 CCCGC 0.2218 CCCGG 0.2218 CCCGT 0.2771 CCCTA 0.2044 CCCTC 0.1924 CCCTG 0.2567 CCCTT 0.3465 CCGAA 0.2783 CCGAC 0.2315 CCGAG 0.1857 CCGAT 0.3045 CCGCA 0.3243 CCGCC 0.2703 CCGCG 0.1072 CCGCT 0.2982 CCGGA 0.2725 CCGGC 0.192 CCGGG 0.2035 CCGGT 0.3321 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.2179 CCGTG 0.215 CCGTT 0.3017 CCTAA 0.2937 CCTAC 0.2015 CCTAG 0.1657 CCTAT 0.339 CCTCA 0.3304 CCTCC 0.2214 CCTCG 0.1075 CCTCT 0.3407 CCTGA 0.2556 CCTGC 0.1776 CCTGG 0.2185 CCTGT 0.3483 CCTTA 0.2204 CCTTC 0.1816 CCTTG 0.2307 CCTTT 0.3673 CGAAA 0.38 CGAAC 0.1733 CGAAG 0.1656 CGAAT 0.2811 CGACA 0.4019 CGACC 0.1941 CGACG 0.135 CGACT 0.2689 CGAGA 0.2731 CGAGC 0.1903 CGAGG 0.1876 CGAGT 0.349 CGATA 0.295 CGATC 0.1587 CGATG 0.2324 CGATT 0.3139 CGCAA 0.3257 CGCAC 0.2008 CGCAG 0.1724 CGCAT 0.3011 CGCCA 0.4119 CGCCC 0.1811 CGCCG 0.1373 CGCCT 0.2697 CGCGA 0.3288 CGCGC 0.1783 CGCGG 0.1759 CGCGT 0.317 CGCTA 0.2479 CGCTC 0.1942 CGCTG 0.2301 CGCTT 0.3278 CGGAA 0.3455 CGGAC 0.2223 CGGAG 0.1839 CGGAT 0.2482 CGGCA 0.3833 CGGCC 0.2272 CGGCG 0.1456 CGGCT 0.2439 CGGGA 0.29 CGGGC 0.1818 CGGGG 0.2232 CGGGT 0.305 CGGTA 0.3194 CGGTC 0.1719 CGGTG 0.2325 CGGTT 0.2763 CGTAA 0.3453 CGTAC 0.1767 CGTAG 0.1436 CGTAT 0.3344 CGTCA 0.3574 CGTCC 0.1916 CGTCG 0.1305 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.2935 CGTGC 0.172 CGTGG 0.1717 CGTGT 0.3628 CGTTA 0.2589 CGTTC 0.1479 CGTTG 0.1761 CGTTT 0.4171 CTAAA 0.4131 CTAAC 0.1664 CTAAG 0.1442 CTAAT 0.2762 CTACA 0.4019 CTACC 0.2117 CTACG 0.07925 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3157 CTAGC 0.1792 CTAGG 0.1735 CTAGT 0.3316 CTATA 0.3275 CTATC 0.1508 CTATG 0.1945 CTATT 0.3272 CTCAA 0.3373 CTCAC 0.1902 CTCAG 0.1822 CTCAT 0.2903 CTCCA 0.4039 CTCCC 0.2151 CTCCG 0.1155 CTCCT 0.2655 CTCGA 0.3291 CTCGC 0.1949 CTCGG 0.1817 CTCGT 0.2942 CTCTA 0.2384 CTCTC 0.2065 CTCTG 0.2634 CTCTT 0.2917 CTGAA 0.3551 CTGAC 0.1941 CTGAG 0.1496 CTGAT 0.3012 CTGCA 0.4186 CTGCC 0.2053 CTGCG 0.07674 CTGCT 0.2993 CTGGA 0.2948 CTGGC 0.181 CTGGG 0.1915 CTGGT 0.3326 CTGTA 0.2825 CTGTC 0.1779 CTGTG 0.2096 CTGTT 0.33 CTTAA 0.3677 CTTAC 0.1907 CTTAG 0.1271 CTTAT 0.3146 CTTCA 0.3737 CTTCC 0.2289 CTTCG 0.08075 CTTCT 0.3166 CTTGA 0.3154 CTTGC 0.1703 CTTGG 0.1725 CTTGT 0.3418 CTTTA 0.2812 CTTTC 0.1659 CTTTG 0.2012 CTTTT 0.3517 GAAAA 0.3697 GAAAC 0.1714 GAAAG 0.1417 GAAAT 0.3172 GAACA 0.4289 GAACC 0.1905 GAACG 0.08239 GAACT 0.2982 GAAGA 0.3251 GAAGC 0.1523 GAAGG 0.1902 GAAGT 0.3324 GAATA 0.3138 GAATC 0.146 GAATG 0.2311 GAATT 0.3092 GACAA 0.3207 GACAC 0.1837 GACAG 0.1913 GACAT 0.3043 GACCA 0.3828 GACCC 0.2164 GACCG 0.09172 GACCT 0.3091 GACGA 0.3307 GACGC 0.1917 GACGG 0.2028 GACGT 0.2748 GACTA 0.2322 GACTC 0.1431 GACTG 0.2874 GACTT 0.3373 GAGAA 0.3169 GAGAC 0.1779 GAGAG 0.2015 GAGAT 0.3038 GAGCA 0.4011 GAGCC 0.1731 GAGCG 0.1196 GAGCT 0.3061 GAGGA 0.2964 GAGGC 0.1513 GAGGG 0.2161 GAGGT 0.3362 GAGTA 0.268 GAGTC 0.1461 GAGTG 0.2447 GAGTT 0.3412 GATAA 0.3251 GATAC 0.1612 GATAG 0.13 GATAT 0.3837 GATCA 0.4252 GATCC 0.1795 GATCG 0.1011 GATCT 0.2942 GATGA 0.3229 GATGC 0.1621 GATGG 0.199 GATGT 0.316 GATTA 0.2315 GATTC 0.1463 GATTG 0.2125 GATTT 0.4098 GCAAA 0.3482 GCAAC 0.1699 GCAAG 0.1775 GCAAT 0.3044 GCACA 0.4227 GCACC 0.1658 GCACG 0.1042 GCACT 0.3073 GCAGA 0.3214 GCAGC 0.1745 GCAGG 0.1834 GCAGT 0.3207 GCATA 0.2838 GCATC 0.1515 GCATG 0.2409 GCATT 0.3239 GCCAA 0.2958 GCCAC 0.1588 GCCAG 0.1868 GCCAT 0.3586 GCCCA 0.3185 GCCCC 0.2336 GCCCG 0.1149 GCCCT 0.333 GCCGA 0.3027 GCCGC 0.1786 GCCGG 0.2131 GCCGT 0.3056 GCCTA 0.2248 GCCTC 0.1659 GCCTG 0.2423 GCCTT 0.3669 GCGAA 0.2766 GCGAC 0.2141 GCGAG 0.2144 GCGAT 0.2949 GCGCA 0.3458 GCGCC 0.2036 GCGCG 0.1472 GCGCT 0.3034 GCGGA 0.3013 GCGGC 0.1768 GCGGG 0.2236 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.2423 GCGTC 0.2134 GCGTG 0.2308 GCGTT 0.3136 GCTAA 0.3224 GCTAC 0.1828 GCTAG 0.1559 GCTAT 0.3389 GCTCA 0.3928 GCTCC 0.1722 GCTCG 0.1273 GCTCT 0.3077 GCTGA 0.299 GCTGC 0.1855 GCTGG 0.1755 GCTGT 0.34 GCTTA 0.2624 GCTTC 0.1698 GCTTG 0.2108 GCTTT 0.357 GGAAA 0.391 GGAAC 0.1441 GGAAG 0.2094 GGAAT 0.2555 GGACA 0.4383 GGACC 0.1771 GGACG 0.1218 GGACT 0.2629 GGAGA 0.3379 GGAGC 0.1537 GGAGG 0.2308 GGAGT 0.2775 GGATA 0.3028 GGATC 0.1578 GGATG 0.2168 GGATT 0.3227 GGCAA 0.3313 GGCAC 0.1379 GGCAG 0.2133 GGCAT 0.3176 GGCCA 0.4206 GGCCC 0.1987 GGCCG 0.1087 GGCCT 0.272 GGCGA 0.2725 GGCGC 0.1432 GGCGG 0.2576 GGCGT 0.3267 GGCTA 0.256 GGCTC 0.1727 GGCTG 0.2794 GGCTT 0.2919 GGGAA 0.3503 GGGAC 0.171 GGGAG 0.189 GGGAT 0.2897 GGGCA 0.3491 GGGCC 0.2579 GGGCG 0.1192 GGGCT 0.2738 GGGGA 0.2478 GGGGC 0.1452 GGGGG 0.3126 GGGGT 0.2944 GGGTA 0.2423 GGGTC 0.2061 GGGTG 0.2344 GGGTT 0.3171 GGTAA 0.3282 GGTAC 0.1659 GGTAG 0.1733 GGTAT 0.3325 GGTCA 0.4662 GGTCC 0.161 GGTCG 0.1084 GGTCT 0.2644 GGTGA 0.3152 GGTGC 0.1354 GGTGG 0.2139 GGTGT 0.3355 GGTTA 0.2973 GGTTC 0.17 GGTTG 0.194 GGTTT 0.3387 GTAAA 0.3929 GTAAC 0.1806 GTAAG 0.1452 GTAAT 0.2813 GTACA 0.4639 GTACC 0.1634 GTACG 0.07862 GTACT 0.294 GTAGA 0.3408 GTAGC 0.165 GTAGG 0.1658 GTAGT 0.3284 GTATA 0.3234 GTATC 0.1382 GTATG 0.199 GTATT 0.3394 GTCAA 0.3061 GTCAC 0.183 GTCAG 0.1822 GTCAT 0.3286 GTCCA 0.3975 GTCCC 0.1842 GTCCG 0.132 GTCCT 0.2863 GTCGA 0.2704 GTCGC 0.1792 GTCGG 0.2086 GTCGT 0.3417 GTCTA 0.2371 GTCTC 0.1737 GTCTG 0.2717 GTCTT 0.3175 GTGAA 0.3335 GTGAC 0.2005 GTGAG 0.1606 GTGAT 0.3054 GTGCA 0.4255 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.107 GTGCT 0.3085 GTGGA 0.2576 GTGGC 0.171 GTGGG 0.1983 GTGGT 0.3731 GTGTA 0.2702 GTGTC 0.1673 GTGTG 0.2258 GTGTT 0.3368 GTTAA 0.3446 GTTAC 0.1914 GTTAG 0.1183 GTTAT 0.3457 GTTCA 0.4339 GTTCC 0.1633 GTTCG 0.08759 GTTCT 0.3152 GTTGA 0.295 GTTGC 0.1615 GTTGG 0.1715 GTTGT 0.372 GTTTA 0.2721 GTTTC 0.1588 GTTTG 0.2021 GTTTT 0.367 TAAAA 0.393 TAAAC 0.1663 TAAAG 0.1361 TAAAT 0.3047 TAACA 0.4169 TAACC 0.1884 TAACG 0.08156 TAACT 0.3131 TAAGA 0.3101 TAAGC 0.1709 TAAGG 0.1676 TAAGT 0.3514 TAATA 0.3172 TAATC 0.1245 TAATG 0.2086 TAATT 0.3497 TACAA 0.3117 TACAC 0.1681 TACAG 0.1721 TACAT 0.3481 TACCA 0.4229 TACCC 0.1638 TACCG 0.1097 TACCT 0.3036 TACGA 0.2919 TACGC 0.1791 TACGG 0.2031 TACGT 0.3259 TACTA 0.2442 TACTC 0.1391 TACTG 0.2662 TACTT 0.3505 TAGAA 0.3609 TAGAC 0.1726 TAGAG 0.1654 TAGAT 0.3011 TAGCA 0.4011 TAGCC 0.1716 TAGCG 0.1021 TAGCT 0.3253 TAGGA 0.2693 TAGGC 0.1757 TAGGG 0.1966 TAGGT 0.3584 TAGTA 0.2961 TAGTC 0.1492 TAGTG 0.2033 TAGTT 0.3514 TATAA 0.3005 TATAC 0.1606 TATAG 0.1202 TATAT 0.4186 TATCA 0.4418 TATCC 0.1571 TATCG 0.08572 TATCT 0.3154 TATGA 0.2852 TATGC 0.1672 TATGG 0.1708 TATGT 0.3768 TATTA 0.2473 TATTC 0.1319 TATTG 0.1897 TATTT 0.4311 TCAAA 0.3753 TCAAC 0.1575 TCAAG 0.1668 TCAAT 0.3004 TCACA 0.4081 TCACC 0.1969 TCACG 0.09064 TCACT 0.3044 TCAGA 0.3114 TCAGC 0.1672 TCAGG 0.1568 TCAGT 0.3646 TCATA 0.2612 TCATC 0.1628 TCATG 0.2048 TCATT 0.3712 TCCAA 0.323 TCCAC 0.1567 TCCAG 0.1992 TCCAT 0.3211 TCCCA 0.371 TCCCC 0.2158 TCCCG 0.09919 TCCCT 0.3141 TCCGA 0.2948 TCCGC 0.1853 TCCGG 0.1842 TCCGT 0.3357 TCCTA 0.198 TCCTC 0.1868 TCCTG 0.2543 TCCTT 0.3609 TCGAA 0.3237 TCGAC 0.1807 TCGAG 0.2025 TCGAT 0.2931 TCGCA 0.3522 TCGCC 0.2033 TCGCG 0.1425 TCGCT 0.302 TCGGA 0.3163 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1858 TCGGT 0.3 TCGTA 0.2473 TCGTC 0.2304 TCGTG 0.2122 TCGTT 0.3101 TCTAA 0.2996 TCTAC 0.1987 TCTAG 0.1446 TCTAT 0.3571 TCTCA 0.3659 TCTCC 0.1874 TCTCG 0.09049 TCTCT 0.3563 TCTGA 0.29 TCTGC 0.1778 TCTGG 0.1703 TCTGT 0.3619 TCTTA 0.241 TCTTC 0.1834 TCTTG 0.2147 TCTTT 0.3609 TGAAA 0.4079 TGAAC 0.1639 TGAAG 0.1463 TGAAT 0.2819 TGACA 0.4333 TGACC 0.2141 TGACG 0.09479 TGACT 0.2578 TGAGA 0.3383 TGAGC 0.1798 TGAGG 0.1766 TGAGT 0.3053 TGATA 0.3205 TGATC 0.1407 TGATG 0.2168 TGATT 0.3221 TGCAA 0.307 TGCAC 0.1645 TGCAG 0.1939 TGCAT 0.3346 TGCCA 0.4496 TGCCC 0.1582 TGCCG 0.1079 TGCCT 0.2843 TGCGA 0.3048 TGCGC 0.157 TGCGG 0.1994 TGCGT 0.3388 TGCTA 0.2442 TGCTC 0.1633 TGCTG 0.2473 TGCTT 0.3453 TGGAA 0.3469 TGGAC 0.1824 TGGAG 0.1754 TGGAT 0.2953 TGGCA 0.4048 TGGCC 0.2228 TGGCG 0.1107 TGGCT 0.2617 TGGGA 0.2984 TGGGC 0.1386 TGGGG 0.2262 TGGGT 0.3368 TGGTA 0.2833 TGGTC 0.1651 TGGTG 0.2275 TGGTT 0.3241 TGTAA 0.3257 TGTAC 0.1822 TGTAG 0.1273 TGTAT 0.3649 TGTCA 0.4145 TGTCC 0.175 TGTCG 0.09858 TGTCT 0.3119 TGTGA 0.2849 TGTGC 0.1505 TGTGG 0.1574 TGTGT 0.4072 TGTTA 0.2394 TGTTC 0.1392 TGTTG 0.2054 TGTTT 0.416 TTAAA 0.4135 TTAAC 0.1587 TTAAG 0.1366 TTAAT 0.2912 TTACA 0.4425 TTACC 0.1724 TTACG 0.08196 TTACT 0.3031 TTAGA 0.3295 TTAGC 0.1866 TTAGG 0.1549 TTAGT 0.3291 TTATA 0.3077 TTATC 0.1417 TTATG 0.1798 TTATT 0.3708 TTCAA 0.3445 TTCAC 0.1586 TTCAG 0.1737 TTCAT 0.3232 TTCCA 0.3841 TTCCC 0.1917 TTCCG 0.1043 TTCCT 0.3198 TTCGA 0.3389 TTCGC 0.162 TTCGG 0.1754 TTCGT 0.3237 TTCTA 0.2536 TTCTC 0.1583 TTCTG 0.2334 TTCTT 0.3547 TTGAA 0.3664 TTGAC 0.1696 TTGAG 0.1441 TTGAT 0.3199 TTGCA 0.4039 TTGCC 0.1942 TTGCG 0.08829 TTGCT 0.3137 TTGGA 0.305 TTGGC 0.1829 TTGGG 0.1691 TTGGT 0.343 TTGTA 0.2761 TTGTC 0.1609 TTGTG 0.1918 TTGTT 0.3712 TTTAA 0.3575 TTTAC 0.1657 TTTAG 0.1169 TTTAT 0.3599 TTTCA 0.4292 TTTCC 0.1761 TTTCG 0.07635 TTTCT 0.3183 TTTGA 0.3156 TTTGC 0.1486 TTTGG 0.1661 TTTGT 0.3697 TTTTA 0.2831 TTTTC 0.1509 TTTTG 0.1739 TTTTT 0.3922 [3] # (a,c,g,t)= (0.186, 0.314, 0.314, 0.186) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.333 C 0.167 G 0.167 T 0.333 # l= 1 # Values AA 0.119 AC 0.0574 AG 0.05 AT 0.107 CA 0.0704 CC 0.0305 CG 0.0157 CT 0.05 GA 0.051 GC 0.0277 GG 0.0305 GT 0.0574 TA 0.0933 TC 0.051 TG 0.0704 TT 0.119 # l= 2 # Values AAA 0.0465 AAC 0.0196 AAG 0.017 AAT 0.0355 ACA 0.0255 ACC 0.0101 ACG 0.005 ACT 0.0168 AGA 0.0161 AGC 0.0082 AGG 0.00888 AGT 0.0168 ATA 0.0341 ATC 0.0152 ATG 0.0226 ATT 0.0355 CAA 0.0229 CAC 0.0122 CAG 0.0128 CAT 0.0226 CCA 0.0123 CCC 0.00616 CCG 0.00313 CCT 0.00888 CGA 0.00476 CGC 0.00282 CGG 0.00313 CGT 0.005 CTA 0.0119 CTC 0.00827 CTG 0.0128 CTT 0.017 GAA 0.018 GAC 0.00949 GAG 0.00827 GAT 0.0152 GCA 0.0113 GCC 0.00536 GCG 0.00282 GCT 0.0082 GGA 0.00893 GGC 0.00536 GGG 0.00616 GGT 0.0101 GTA 0.0162 GTC 0.00949 GTG 0.0122 GTT 0.0196 TAA 0.0312 TAC 0.0162 TAG 0.0119 TAT 0.0341 TCA 0.0213 TCC 0.00893 TCG 0.00476 TCT 0.0161 TGA 0.0213 TGC 0.0113 TGG 0.0123 TGT 0.0255 TTA 0.0312 TTC 0.018 TTG 0.0229 TTT 0.0465 # l= 3 # Values AAAA 0.0178 AAAC 0.00784 AAAG 0.00619 AAAT 0.0146 AACA 0.00888 AACC 0.00321 AACG 0.00159 AACT 0.00593 AAGA 0.00528 AAGC 0.00266 AAGG 0.0031 AAGT 0.00599 AATA 0.0117 AATC 0.00489 AATG 0.0078 AATT 0.011 ACAA 0.00829 ACAC 0.00454 ACAG 0.00445 ACAT 0.00826 ACCA 0.00421 ACCC 0.0019 ACCG 0.000962 ACCT 0.003 ACGA 0.0015 ACGC 0.000935 ACGG 0.000968 ACGT 0.00159 ACTA 0.00392 ACTC 0.00246 ACTG 0.00446 ACTT 0.00599 AGAA 0.00567 AGAC 0.00288 AGAG 0.00274 AGAT 0.00477 AGCA 0.00342 AGCC 0.00139 AGCG 0.000852 AGCT 0.00254 AGGA 0.00258 AGGC 0.00147 AGGG 0.00182 AGGT 0.003 AGTA 0.00475 AGTC 0.00251 AGTG 0.00364 AGTT 0.00593 ATAA 0.0111 ATAC 0.00561 ATAG 0.00413 ATAT 0.0133 ATCA 0.00661 ATCC 0.00248 ATCG 0.00138 ATCT 0.00477 ATGA 0.00675 ATGC 0.00362 ATGG 0.00395 ATGT 0.00826 ATTA 0.00913 ATTC 0.00491 ATTG 0.00677 ATTT 0.0146 CAAA 0.00855 CAAC 0.00381 CAAG 0.00377 CAAT 0.00677 CACA 0.00518 CACC 0.00224 CACG 0.0011 CACT 0.00364 CAGA 0.00399 CAGC 0.00207 CAGG 0.00227 CAGT 0.00446 CATA 0.00619 CATC 0.00338 CATG 0.0052 CATT 0.0078 CCAA 0.00381 CCAC 0.00217 CCAG 0.00242 CCAT 0.00395 CCCA 0.0022 CCCC 0.00153 CCCG 0.000602 CCCT 0.00182 CCGA 0.000908 CCGC 0.000598 CCGG 0.000656 CCGT 0.000968 CCTA 0.0019 CCTC 0.00162 CCTG 0.00226 CCTT 0.0031 CGAA 0.00145 CGAC 0.001 CGAG 0.000931 CGAT 0.00138 CGCA 0.000978 CGCC 0.000625 CGCG 0.000363 CGCT 0.000852 CGGA 0.000974 CGGC 0.000591 CGGG 0.000602 CGGT 0.000962 CGTA 0.00127 CGTC 0.00104 CGTG 0.0011 CGTT 0.00159 CTAA 0.00362 CTAC 0.00231 CTAG 0.00181 CTAT 0.00413 CTCA 0.00305 CTCC 0.00155 CTCG 0.000931 CTCT 0.00274 CTGA 0.00372 CTGC 0.0022 CTGG 0.00242 CTGT 0.00445 CTTA 0.0041 CTTC 0.00297 CTTG 0.00377 CTTT 0.00619 GAAA 0.00727 GAAC 0.00287 GAAG 0.00297 GAAT 0.00491 GACA 0.00414 GACC 0.00181 GACG 0.00104 GACT 0.00251 GAGA 0.00281 GAGC 0.00139 GAGG 0.00162 GAGT 0.00245 GATA 0.00481 GATC 0.00216 GATG 0.00338 GATT 0.00489 GCAA 0.00363 GCAC 0.00183 GCAG 0.0022 GCAT 0.00362 GCCA 0.00234 GCCC 0.000954 GCCG 0.000591 GCCT 0.00147 GCGA 0.000845 GCGC 0.000441 GCGG 0.000598 GCGT 0.000935 GCTA 0.00207 GCTC 0.00139 GCTG 0.00207 GCTT 0.00266 GGAA 0.00326 GGAC 0.00164 GGAG 0.00155 GGAT 0.00248 GGCA 0.00211 GGCC 0.00123 GGCG 0.000625 GGCT 0.00139 GGGA 0.00177 GGGC 0.000954 GGGG 0.00153 GGGT 0.0019 GGTA 0.00282 GGTC 0.00181 GGTG 0.00224 GGTT 0.00322 GTAA 0.00539 GTAC 0.00287 GTAG 0.00231 GTAT 0.00561 GTCA 0.00396 GTCC 0.00164 GTCG 0.001 GTCT 0.00288 GTGA 0.00361 GTGC 0.00183 GTGG 0.00217 GTGT 0.00454 GTTA 0.00508 GTTC 0.00287 GTTG 0.00381 GTTT 0.00784 TAAA 0.0129 TAAC 0.00509 TAAG 0.0041 TAAT 0.00913 TACA 0.00735 TACC 0.00282 TACG 0.00127 TACT 0.00475 TAGA 0.00398 TAGC 0.00207 TAGG 0.0019 TAGT 0.00392 TATA 0.0113 TATC 0.00481 TATG 0.00619 TATT 0.0117 TCAA 0.00718 TCAC 0.00361 TCAG 0.00372 TCAT 0.00675 TCCA 0.0036 TCCC 0.00177 TCCG 0.000974 TCCT 0.00258 TCGA 0.00151 TCGC 0.000845 TCGG 0.000908 TCGT 0.0015 TCTA 0.00398 TCTC 0.00281 TCTG 0.00399 TCTT 0.00529 TGAA 0.00764 TGAC 0.00396 TGAG 0.00305 TGAT 0.00661 TGCA 0.00477 TGCC 0.00211 TGCG 0.000979 TGCT 0.00342 TGGA 0.0036 TGGC 0.00234 TGGG 0.0022 TGGT 0.00421 TGTA 0.00735 TGTC 0.00413 TGTG 0.00518 TGTT 0.00888 TTAA 0.0111 TTAC 0.00539 TTAG 0.00362 TTAT 0.0111 TTCA 0.00764 TTCC 0.00326 TTCG 0.00145 TTCT 0.00567 TTGA 0.00718 TTGC 0.00363 TTGG 0.00381 TTGT 0.00829 TTTA 0.0129 TTTC 0.00727 TTTG 0.00855 TTTT 0.0178 # l= 4 # Values AAAAA 0.00699 AAAAC 0.00289 AAAAG 0.00218 AAAAT 0.00578 AAACA 0.00371 AAACC 0.00109 AAACG 0.000665 AAACT 0.00238 AAAGA 0.00191 AAAGC 0.000953 AAAGG 0.00114 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00506 AAATC 0.00201 AAATG 0.00333 AAATT 0.00424 AACAA 0.00308 AACAC 0.00153 AACAG 0.00147 AACAT 0.0028 AACCA 0.00137 AACCC 0.000603 AACCG 0.000267 AACCT 0.000976 AACGA 0.000464 AACGC 0.000294 AACGG 0.000293 AACGT 0.000538 AACTA 0.00138 AACTC 0.00084 AACTG 0.00149 AACTT 0.00221 AAGAA 0.00201 AAGAC 0.000916 AAGAG 0.000806 AAGAT 0.00155 AAGCA 0.00118 AAGCC 0.000406 AAGCG 0.000279 AAGCT 0.000794 AAGGA 0.000936 AAGGC 0.000541 AAGGG 0.000633 AAGGT 0.00099 AAGTA 0.00167 AAGTC 0.000848 AAGTG 0.00127 AAGTT 0.00221 AATAA 0.00411 AATAC 0.00191 AATAG 0.00136 AATAT 0.00437 AATCA 0.00213 AATCC 0.000802 AATCG 0.000435 AATCT 0.00152 AATGA 0.00251 AATGC 0.00118 AATGG 0.00137 AATGT 0.00274 AATTA 0.0032 AATTC 0.00152 AATTG 0.00207 AATTT 0.00424 ACAAA 0.00317 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00129 ACAAT 0.00241 ACACA 0.00211 ACACC 0.000753 ACACG 0.000401 ACACT 0.00128 ACAGA 0.00145 ACAGC 0.000706 ACAGG 0.00079 ACAGT 0.00151 ACATA 0.00234 ACATC 0.00107 ACATG 0.0021 ACATT 0.00274 ACCAA 0.00131 ACCAC 0.00081 ACCAG 0.000806 ACCAT 0.00128 ACCCA 0.000741 ACCCC 0.000453 ACCCG 0.000184 ACCCT 0.000521 ACCGA 0.000272 ACCGC 0.000179 ACCGG 0.000219 ACCGT 0.000292 ACCTA 0.00068 ACCTC 0.000545 ACCTG 0.000789 ACCTT 0.00099 ACGAA 0.00047 ACGAC 0.000343 ACGAG 0.000273 ACGAT 0.000414 ACGCA 0.00033 ACGCC 0.000204 ACGCG 0.000116 ACGCT 0.000284 ACGGA 0.000327 ACGGC 0.000181 ACGGG 0.000167 ACGGT 0.000292 ACGTA 0.000408 ACGTC 0.000286 ACGTG 0.000362 ACGTT 0.000538 ACTAA 0.0012 ACTAC 0.000764 ACTAG 0.000601 ACTAT 0.00136 ACTCA 0.00093 ACTCC 0.000434 ACTCG 0.000326 ACTCT 0.000764 ACTGA 0.00136 ACTGC 0.000702 ACTGG 0.000891 ACTGT 0.00151 ACTTA 0.00145 ACTTC 0.000992 ACTTG 0.00137 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.00232 AGAAC 0.000903 AGAAG 0.000942 AGAAT 0.00151 AGACA 0.00129 AGACC 0.000479 AGACG 0.000332 AGACT 0.000778 AGAGA 0.000996 AGAGC 0.000431 AGAGG 0.00055 AGAGT 0.000764 AGATA 0.00151 AGATC 0.000638 AGATG 0.0011 AGATT 0.00152 AGCAA 0.00114 AGCAC 0.000564 AGCAG 0.000657 AGCAT 0.00106 AGCCA 0.000612 AGCCC 0.000261 AGCCG 0.000144 AGCCT 0.00037 AGCGA 0.000255 AGCGC 0.000134 AGCGG 0.000178 AGCGT 0.000284 AGCTA 0.000674 AGCTC 0.000428 AGCTG 0.000639 AGCTT 0.000794 AGGAA 0.00104 AGGAC 0.000467 AGGAG 0.000412 AGGAT 0.000661 AGGCA 0.000598 AGGCC 0.000337 AGGCG 0.000168 AGGCT 0.00037 AGGGA 0.000559 AGGGC 0.000318 AGGGG 0.000425 AGGGT 0.000521 AGGTA 0.000853 AGGTC 0.000557 AGGTG 0.000618 AGGTT 0.000976 AGTAA 0.00164 AGTAC 0.000843 AGTAG 0.000712 AGTAT 0.00156 AGTCA 0.00102 AGTCC 0.000433 AGTCG 0.000271 AGTCT 0.000778 AGTGA 0.0011 AGTGC 0.000565 AGTGG 0.000697 AGTGT 0.00128 AGTTA 0.00159 AGTTC 0.000859 AGTTG 0.00109 AGTTT 0.00238 ATAAA 0.00464 ATAAC 0.00176 ATAAG 0.00129 ATAAT 0.00337 ATACA 0.00269 ATACC 0.000935 ATACG 0.000426 ATACT 0.00156 ATAGA 0.00142 ATAGC 0.000704 ATAGG 0.000647 ATAGT 0.00136 ATATA 0.00474 ATATC 0.00185 ATATG 0.0023 ATATT 0.00437 ATCAA 0.0023 ATCAC 0.0011 ATCAG 0.00112 ATCAT 0.00209 ATCCA 0.00106 ATCCC 0.000513 ATCCG 0.000241 ATCCT 0.000661 ATCGA 0.00044 ATCGC 0.000249 ATCGG 0.000275 ATCGT 0.000414 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.000855 ATCTG 0.00116 ATCTT 0.00155 ATGAA 0.00247 ATGAC 0.0013 ATGAG 0.000888 ATGAT 0.00209 ATGCA 0.0016 ATGCC 0.000672 ATGCG 0.000295 ATGCT 0.00106 ATGGA 0.00116 ATGGC 0.000835 ATGGG 0.000665 ATGGT 0.00128 ATGTA 0.00256 ATGTC 0.00126 ATGTG 0.00164 ATGTT 0.0028 ATTAA 0.00324 ATTAC 0.00152 ATTAG 0.001 ATTAT 0.00337 ATTCA 0.00216 ATTCC 0.000835 ATTCG 0.000408 ATTCT 0.00151 ATTGA 0.00216 ATTGC 0.0011 ATTGG 0.0011 ATTGT 0.00241 ATTTA 0.00393 ATTTC 0.00231 ATTTG 0.00262 ATTTT 0.00578 CAAAA 0.0031 CAAAC 0.00158 CAAAG 0.00124 CAAAT 0.00262 CAACA 0.00182 CAACC 0.000623 CAACG 0.000279 CAACT 0.00109 CAAGA 0.00113 CAAGC 0.000558 CAAGG 0.000714 CAAGT 0.00137 CAATA 0.00222 CAATC 0.00103 CAATG 0.00144 CAATT 0.00207 CACAA 0.00158 CACAC 0.00102 CACAG 0.00093 CACAT 0.00164 CACCA 0.000952 CACCC 0.000443 CACCG 0.000222 CACCT 0.000618 CACGA 0.000318 CACGC 0.000215 CACGG 0.000208 CACGT 0.000362 CACTA 0.000794 CACTC 0.000599 CACTG 0.000985 CACTT 0.00127 CAGAA 0.00132 CAGAC 0.000784 CAGAG 0.00072 CAGAT 0.00116 CAGCA 0.00085 CAGCC 0.000386 CAGCG 0.000197 CAGCT 0.000639 CAGGA 0.000654 CAGGC 0.000358 CAGGG 0.000464 CAGGT 0.000789 CAGTA 0.00126 CAGTC 0.000718 CAGTG 0.000985 CAGTT 0.00149 CATAA 0.00198 CATAC 0.00111 CATAG 0.000804 CATAT 0.0023 CATCA 0.00143 CATCC 0.000536 CATCG 0.000318 CATCT 0.0011 CATGA 0.00138 CATGC 0.00087 CATGG 0.00085 CATGT 0.0021 CATTA 0.0019 CATTC 0.00113 CATTG 0.00144 CATTT 0.00333 CCAAA 0.00141 CCAAC 0.000651 CCAAG 0.00065 CCAAT 0.0011 CCACA 0.000812 CCACC 0.000474 CCACG 0.000189 CCACT 0.000697 CCAGA 0.000675 CCAGC 0.000363 CCAGG 0.000493 CCAGT 0.000891 CCATA 0.00105 CCATC 0.000668 CCATG 0.00085 CCATT 0.00137 CCCAA 0.000643 CCCAC 0.000432 CCCAG 0.000461 CCCAT 0.000665 CCCCA 0.0005 CCCCC 0.000476 CCCCG 0.000134 CCCCT 0.000425 CCCGA 0.000168 CCCGC 0.000133 CCCGG 0.000133 CCCGT 0.000167 CCCTA 0.000374 CCCTC 0.000352 CCCTG 0.000464 CCCTT 0.000633 CCGAA 0.000254 CCGAC 0.000209 CCGAG 0.00017 CCGAT 0.000275 CCGCA 0.000195 CCGCC 0.000161 CCGCG 6.41e-05 CCGCT 0.000178 CCGGA 0.000179 CCGGC 0.000125 CCGGG 0.000133 CCGGT 0.000219 CCGTA 0.000258 CCGTC 0.00021 CCGTG 0.000208 CCGTT 0.000293 CCTAA 0.000559 CCTAC 0.00038 CCTAG 0.000313 CCTAT 0.000647 CCTCA 0.000539 CCTCC 0.000356 CCTCG 0.000174 CCTCT 0.00055 CCTGA 0.000582 CCTGC 0.000401 CCTGG 0.000493 CCTGT 0.00079 CCTTA 0.000683 CCTTC 0.000559 CCTTG 0.000714 CCTTT 0.00114 CGAAA 0.00055 CGAAC 0.000249 CGAAG 0.000239 CGAAT 0.000408 CGACA 0.000405 CGACC 0.000194 CGACG 0.000134 CGACT 0.000271 CGAGA 0.000255 CGAGC 0.000176 CGAGG 0.000174 CGAGT 0.000326 CGATA 0.000409 CGATC 0.000217 CGATG 0.000318 CGATT 0.000435 CGCAA 0.000318 CGCAC 0.000197 CGCAG 0.000169 CGCAT 0.000295 CGCCA 0.000258 CGCCC 0.000113 CGCCG 8.69e-05 CGCCT 0.000168 CGCGA 0.000119 CGCGC 6.44e-05 CGCGG 6.41e-05 CGCGT 0.000116 CGCTA 0.000211 CGCTC 0.000165 CGCTG 0.000197 CGCTT 0.000279 CGGAA 0.00034 CGGAC 0.000216 CGGAG 0.000177 CGGAT 0.000241 CGGCA 0.000226 CGGCC 0.000134 CGGCG 8.69e-05 CGGCT 0.000144 CGGGA 0.000174 CGGGC 0.00011 CGGGG 0.000134 CGGGT 0.000184 CGGTA 0.000306 CGGTC 0.000166 CGGTG 0.000222 CGGTT 0.000267 CGTAA 0.000438 CGTAC 0.000222 CGTAG 0.00018 CGTAT 0.000426 CGTCA 0.000375 CGTCC 0.000198 CGTCG 0.000134 CGTCT 0.000332 CGTGA 0.000323 CGTGC 0.00019 CGTGG 0.000189 CGTGT 0.000401 CGTTA 0.000411 CGTTC 0.000234 CGTTG 0.000279 CGTTT 0.000665 CTAAA 0.0015 CTAAC 0.000599 CTAAG 0.000519 CTAAT 0.001 CTACA 0.000931 CTACC 0.000486 CTACG 0.00018 CTACT 0.000712 CTAGA 0.000572 CTAGC 0.000319 CTAGG 0.000313 CTAGT 0.000601 CTATA 0.00135 CTATC 0.000621 CTATG 0.000804 CTATT 0.00136 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.000578 CTCAG 0.000556 CTCAT 0.000888 CTCCA 0.000626 CTCCC 0.000336 CTCCG 0.000177 CTCCT 0.000412 CTCGA 0.000306 CTCGC 0.000182 CTCGG 0.00017 CTCGT 0.000273 CTCTA 0.000654 CTCTC 0.00056 CTCTG 0.00072 CTCTT 0.000806 CTGAA 0.00132 CTGAC 0.00072 CTGAG 0.000556 CTGAT 0.00112 CTGCA 0.000924 CTGCC 0.000446 CTGCG 0.000169 CTGCT 0.000657 CTGGA 0.000716 CTGGC 0.000438 CTGGG 0.000461 CTGGT 0.000806 CTGTA 0.00126 CTGTC 0.00079 CTGTG 0.00093 CTGTT 0.00147 CTTAA 0.00151 CTTAC 0.000776 CTTAG 0.000519 CTTAT 0.00129 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.00068 CTTCG 0.000239 CTTCT 0.000942 CTTGA 0.00119 CTTGC 0.000642 CTTGG 0.00065 CTTGT 0.00129 CTTTA 0.00174 CTTTC 0.00102 CTTTG 0.00124 CTTTT 0.00218 GAAAA 0.00269 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00102 GAAAT 0.00231 GAACA 0.00123 GAACC 0.000545 GAACG 0.000234 GAACT 0.000859 GAAGA 0.000967 GAAGC 0.000453 GAAGG 0.000559 GAAGT 0.000992 GAATA 0.00155 GAATC 0.000709 GAATG 0.00113 GAATT 0.00152 GACAA 0.00133 GACAC 0.000757 GACAG 0.00079 GACAT 0.00126 GACCA 0.000691 GACCC 0.000391 GACCG 0.000166 GACCT 0.000557 GACGA 0.000344 GACGC 0.000198 GACGG 0.00021 GACGT 0.000286 GACTA 0.000583 GACTC 0.000357 GACTG 0.000718 GACTT 0.000848 GAGAA 0.000894 GAGAC 0.000498 GAGAG 0.00056 GAGAT 0.000855 GAGCA 0.000558 GAGCC 0.000242 GAGCG 0.000165 GAGCT 0.000428 GAGGA 0.000478 GAGGC 0.000244 GAGGG 0.000352 GAGGT 0.000545 GAGTA 0.00066 GAGTC 0.000357 GAGTG 0.000599 GAGTT 0.00084 GATAA 0.00156 GATAC 0.00077 GATAG 0.000621 GATAT 0.00185 GATCA 0.000921 GATCC 0.000387 GATCG 0.000217 GATCT 0.000638 GATGA 0.00109 GATGC 0.000545 GATGG 0.000668 GATGT 0.00107 GATTA 0.00113 GATTC 0.000709 GATTG 0.00103 GATTT 0.00201 GCAAA 0.00127 GCAAC 0.000618 GCAAG 0.000642 GCAAT 0.0011 GCACA 0.000775 GCACC 0.000301 GCACG 0.00019 GCACT 0.000565 GCAGA 0.000709 GCAGC 0.000384 GCAGG 0.000401 GCAGT 0.000702 GCATA 0.00103 GCATC 0.000545 GCATG 0.00087 GCATT 0.00118 GCCAA 0.000695 GCCAC 0.00037 GCCAG 0.000438 GCCAT 0.000835 GCCCA 0.000304 GCCCC 0.000223 GCCCG 0.00011 GCCCT 0.000318 GCCGA 0.000179 GCCGC 0.000107 GCCGG 0.000125 GCCGT 0.000181 GCCTA 0.000331 GCCTC 0.000244 GCCTG 0.000358 GCCTT 0.000541 GCGAA 0.000234 GCGAC 0.00018 GCGAG 0.000182 GCGAT 0.000249 GCGCA 0.000153 GCGCC 9.03e-05 GCGCG 6.44e-05 GCGCT 0.000134 GCGGA 0.000179 GCGGC 0.000107 GCGGG 0.000133 GCGGT 0.000179 GCGTA 0.000227 GCGTC 0.000198 GCGTG 0.000215 GCGTT 0.000294 GCTAA 0.000671 GCTAC 0.000378 GCTAG 0.000319 GCTAT 0.000704 GCTCA 0.000548 GCTCC 0.000238 GCTCG 0.000176 GCTCT 0.000431 GCTGA 0.00062 GCTGC 0.000384 GCTGG 0.000363 GCTGT 0.000706 GCTTA 0.000697 GCTTC 0.000453 GCTTG 0.000558 GCTTT 0.000953 GGAAA 0.00128 GGAAC 0.000469 GGAAG 0.00068 GGAAT 0.000835 GGACA 0.000722 GGACC 0.000289 GGACG 0.000198 GGACT 0.000433 GGAGA 0.000523 GGAGC 0.000238 GGAGG 0.000356 GGAGT 0.000434 GGATA 0.000753 GGATC 0.000387 GGATG 0.000536 GGATT 0.000802 GGCAA 0.000703 GGCAC 0.000292 GGCAG 0.000446 GGCAT 0.000672 GGCCA 0.000516 GGCCC 0.000245 GGCCG 0.000134 GGCCT 0.000337 GGCGA 0.00017 GGCGC 9.03e-05 GGCGG 0.000161 GGCGT 0.000204 GGCTA 0.000355 GGCTC 0.000242 GGCTG 0.000386 GGCTT 0.000406 GGGAA 0.00062 GGGAC 0.000302 GGGAG 0.000336 GGGAT 0.000513 GGGCA 0.000335 GGGCC 0.000245 GGGCG 0.000113 GGGCT 0.000261 GGGGA 0.000382 GGGGC 0.000223 GGGGG 0.000476 GGGGT 0.000453 GGGTA 0.000462 GGGTC 0.000391 GGGTG 0.000443 GGGTT 0.000603 GGTAA 0.000926 GGTAC 0.000469 GGTAG 0.000486 GGTAT 0.000935 GGTCA 0.000844 GGTCC 0.000289 GGTCG 0.000194 GGTCT 0.000479 GGTGA 0.000707 GGTGC 0.000301 GGTGG 0.000474 GGTGT 0.000753 GGTTA 0.000953 GGTTC 0.000545 GGTTG 0.000623 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00212 GTAAC 0.000971 GTAAG 0.000776 GTAAT 0.00152 GTACA 0.00133 GTACC 0.000469 GTACG 0.000222 GTACT 0.000843 GTAGA 0.000787 GTAGC 0.000378 GTAGG 0.00038 GTAGT 0.000764 GTATA 0.00182 GTATC 0.00077 GTATG 0.00111 GTATT 0.00191 GTCAA 0.00121 GTCAC 0.000724 GTCAG 0.00072 GTCAT 0.0013 GTCCA 0.000656 GTCCC 0.000302 GTCCG 0.000216 GTCCT 0.000467 GTCGA 0.000271 GTCGC 0.00018 GTCGG 0.000209 GTCGT 0.000343 GTCTA 0.000682 GTCTC 0.000498 GTCTG 0.000784 GTCTT 0.000916 GTGAA 0.00121 GTGAC 0.000724 GTGAG 0.000578 GTGAT 0.0011 GTGCA 0.000778 GTGCC 0.000292 GTGCG 0.000197 GTGCT 0.000564 GTGGA 0.000562 GTGGC 0.00037 GTGGG 0.000432 GTGGT 0.00081 GTGTA 0.00123 GTGTC 0.000757 GTGTG 0.00102 GTGTT 0.00153 GTTAA 0.00175 GTTAC 0.000971 GTTAG 0.000599 GTTAT 0.00176 GTTCA 0.00125 GTTCC 0.000469 GTTCG 0.000249 GTTCT 0.000903 GTTGA 0.00113 GTTGC 0.000618 GTTGG 0.000651 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.00213 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00158 GTTTT 0.00289 TAAAA 0.00506 TAAAC 0.00213 TAAAG 0.00174 TAAAT 0.00393 TAACA 0.00213 TAACC 0.000953 TAACG 0.000411 TAACT 0.00159 TAAGA 0.00128 TAAGC 0.000697 TAAGG 0.000683 TAAGT 0.00145 TAATA 0.0029 TAATC 0.00113 TAATG 0.0019 TAATT 0.0032 TACAA 0.0023 TACAC 0.00123 TACAG 0.00126 TACAT 0.00256 TACCA 0.00119 TACCC 0.000462 TACCG 0.000306 TACCT 0.000853 TACGA 0.000373 TACGC 0.000227 TACGG 0.000258 TACGT 0.000408 TACTA 0.00116 TACTC 0.00066 TACTG 0.00126 TACTT 0.00167 TAGAA 0.00144 TAGAC 0.000682 TAGAG 0.000654 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000832 TAGCC 0.000355 TAGCG 0.000211 TAGCT 0.000674 TAGGA 0.000514 TAGGC 0.000331 TAGGG 0.000374 TAGGT 0.00068 TAGTA 0.00116 TAGTC 0.000583 TAGTG 0.000794 TAGTT 0.00138 TATAA 0.00341 TATAC 0.00182 TATAG 0.00135 TATAT 0.00474 TATCA 0.00213 TATCC 0.000753 TATCG 0.000409 TATCT 0.00151 TATGA 0.00177 TATGC 0.00103 TATGG 0.00105 TATGT 0.00234 TATTA 0.0029 TATTC 0.00155 TATTG 0.00222 TATTT 0.00506 TCAAA 0.0027 TCAAC 0.00113 TCAAG 0.00119 TCAAT 0.00216 TCACA 0.00148 TCACC 0.000707 TCACG 0.000323 TCACT 0.0011 TCAGA 0.00116 TCAGC 0.00062 TCAGG 0.000582 TCAGT 0.00136 TCATA 0.00177 TCATC 0.00109 TCATG 0.00138 TCATT 0.00251 TCCAA 0.00116 TCCAC 0.000562 TCCAG 0.000716 TCCAT 0.00116 TCCCA 0.000657 TCCCC 0.000382 TCCCG 0.000174 TCCCT 0.000559 TCCGA 0.000289 TCCGC 0.000179 TCCGG 0.000179 TCCGT 0.000327 TCCTA 0.000514 TCCTC 0.000478 TCCTG 0.000654 TCCTT 0.000936 TCGAA 0.000489 TCGAC 0.000271 TCGAG 0.000306 TCGAT 0.00044 TCGCA 0.0003 TCGCC 0.00017 TCGCG 0.000119 TCGCT 0.000255 TCGGA 0.000289 TCGGC 0.000179 TCGGG 0.000168 TCGGT 0.000272 TCGTA 0.000373 TCGTC 0.000344 TCGTG 0.000318 TCGTT 0.000464 TCTAA 0.0012 TCTAC 0.000787 TCTAG 0.000572 TCTAT 0.00142 TCTCA 0.00103 TCTCC 0.000523 TCTCG 0.000255 TCTCT 0.000996 TCTGA 0.00116 TCTGC 0.000709 TCTGG 0.000675 TCTGT 0.00145 TCTTA 0.00128 TCTTC 0.000967 TCTTG 0.00113 TCTTT 0.00191 TGAAA 0.00312 TGAAC 0.00125 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00216 TGACA 0.00172 TGACC 0.000844 TGACG 0.000375 TGACT 0.00102 TGAGA 0.00103 TGAGC 0.000548 TGAGG 0.000539 TGAGT 0.00093 TGATA 0.00213 TGATC 0.000921 TGATG 0.00143 TGATT 0.00213 TGCAA 0.00147 TGCAC 0.000778 TGCAG 0.000924 TGCAT 0.0016 TGCCA 0.000953 TGCCC 0.000335 TGCCG 0.000226 TGCCT 0.000598 TGCGA 0.0003 TGCGC 0.000153 TGCGG 0.000195 TGCGT 0.00033 TGCTA 0.000832 TGCTC 0.000558 TGCTG 0.00085 TGCTT 0.00118 TGGAA 0.00126 TGGAC 0.000656 TGGAG 0.000626 TGGAT 0.00106 TGGCA 0.000953 TGGCC 0.000516 TGGCG 0.000258 TGGCT 0.000612 TGGGA 0.000657 TGGGC 0.000304 TGGGG 0.0005 TGGGT 0.000741 TGGTA 0.00119 TGGTC 0.000691 TGGTG 0.000952 TGGTT 0.00137 TGTAA 0.00239 TGTAC 0.00133 TGTAG 0.000931 TGTAT 0.00269 TGTCA 0.00172 TGTCC 0.000722 TGTCG 0.000405 TGTCT 0.00129 TGTGA 0.00148 TGTGC 0.000775 TGTGG 0.000812 TGTGT 0.00211 TGTTA 0.00213 TGTTC 0.00123 TGTTG 0.00182 TGTTT 0.00371 TTAAA 0.0046 TTAAC 0.00175 TTAAG 0.00151 TTAAT 0.00324 TTACA 0.00239 TTACC 0.000926 TTACG 0.000438 TTACT 0.00164 TTAGA 0.0012 TTAGC 0.000671 TTAGG 0.000559 TTAGT 0.0012 TTATA 0.00341 TTATC 0.00156 TTATG 0.00198 TTATT 0.00411 TTCAA 0.00263 TTCAC 0.00121 TTCAG 0.00132 TTCAT 0.00247 TTCCA 0.00126 TTCCC 0.00062 TTCCG 0.00034 TTCCT 0.00104 TTCGA 0.000489 TTCGC 0.000234 TTCGG 0.000254 TTCGT 0.00047 TTCTA 0.00144 TTCTC 0.000894 TTCTG 0.00132 TTCTT 0.00201 TTGAA 0.00263 TTGAC 0.00121 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.0023 TTGCA 0.00147 TTGCC 0.000703 TTGCG 0.000318 TTGCT 0.00114 TTGGA 0.00116 TTGGC 0.000695 TTGGG 0.000643 TTGGT 0.00131 TTGTA 0.0023 TTGTC 0.00133 TTGTG 0.00158 TTGTT 0.00308 TTTAA 0.0046 TTTAC 0.00212 TTTAG 0.0015 TTTAT 0.00464 TTTCA 0.00312 TTTCC 0.00128 TTTCG 0.00055 TTTCT 0.00232 TTTGA 0.0027 TTTGC 0.00127 TTTGG 0.00141 TTTGT 0.00317 TTTTA 0.00506 TTTTC 0.00269 TTTTG 0.0031 TTTTT 0.00699 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3921 AAAAC 0.1616 AAAAG 0.1226 AAAAT 0.3237 AAACA 0.4719 AAACC 0.1398 AAACG 0.08559 AAACT 0.3027 AAAGA 0.3083 AAAGC 0.1544 AAAGG 0.1854 AAAGT 0.352 AAATA 0.3452 AAATC 0.1376 AAATG 0.2277 AAATT 0.2895 AACAA 0.3462 AACAC 0.1732 AACAG 0.1661 AACAT 0.3145 AACCA 0.4248 AACCC 0.1882 AACCG 0.08332 AACCT 0.3037 AACGA 0.2923 AACGC 0.185 AACGG 0.1843 AACGT 0.3384 AACTA 0.2325 AACTC 0.142 AACTG 0.2529 AACTT 0.3726 AAGAA 0.3801 AAGAC 0.174 AAGAG 0.1523 AAGAT 0.2936 AAGCA 0.4438 AAGCC 0.1531 AAGCG 0.1056 AAGCT 0.2975 AAGGA 0.3001 AAGGC 0.1752 AAGGG 0.2037 AAGGT 0.321 AAGTA 0.278 AAGTC 0.1418 AAGTG 0.2119 AAGTT 0.3683 AATAA 0.35 AATAC 0.163 AATAG 0.1161 AATAT 0.3709 AATCA 0.436 AATCC 0.1644 AATCG 0.08958 AATCT 0.31 AATGA 0.3215 AATGC 0.1514 AATGG 0.1768 AATGT 0.3503 AATTA 0.2898 AATTC 0.138 AATTG 0.1881 AATTT 0.3841 ACAAA 0.3809 ACAAC 0.172 ACAAG 0.1566 ACAAT 0.2905 ACACA 0.4634 ACACC 0.1665 ACACG 0.08905 ACACT 0.281 ACAGA 0.3246 ACAGC 0.1587 ACAGG 0.1784 ACAGT 0.3383 ACATA 0.2824 ACATC 0.1305 ACATG 0.2561 ACATT 0.331 ACCAA 0.31 ACCAC 0.1936 ACCAG 0.1918 ACCAT 0.3046 ACCCA 0.3901 ACCCC 0.2389 ACCCG 0.09722 ACCCT 0.2737 ACCGA 0.2829 ACCGC 0.1857 ACCGG 0.2271 ACCGT 0.3044 ACCTA 0.2258 ACCTC 0.1815 ACCTG 0.2619 ACCTT 0.3309 ACGAA 0.3115 ACGAC 0.2301 ACGAG 0.1824 ACGAT 0.2759 ACGCA 0.3526 ACGCC 0.2195 ACGCG 0.1237 ACGCT 0.3042 ACGGA 0.3376 ACGGC 0.1871 ACGGG 0.1728 ACGGT 0.3025 ACGTA 0.2578 ACGTC 0.1788 ACGTG 0.2281 ACGTT 0.3353 ACTAA 0.3043 ACTAC 0.1946 ACTAG 0.1544 ACTAT 0.3467 ACTCA 0.3796 ACTCC 0.1769 ACTCG 0.1329 ACTCT 0.3106 ACTGA 0.3038 ACTGC 0.1587 ACTGG 0.1998 ACTGT 0.3377 ACTTA 0.2412 ACTTC 0.1656 ACTTG 0.2292 ACTTT 0.364 AGAAA 0.4071 AGAAC 0.1602 AGAAG 0.1668 AGAAT 0.2658 AGACA 0.4473 AGACC 0.1665 AGACG 0.1166 AGACT 0.2697 AGAGA 0.3651 AGAGC 0.1561 AGAGG 0.2018 AGAGT 0.2769 AGATA 0.3169 AGATC 0.1349 AGATG 0.231 AGATT 0.3172 AGCAA 0.3314 AGCAC 0.1658 AGCAG 0.1927 AGCAT 0.3101 AGCCA 0.4415 AGCCC 0.1885 AGCCG 0.1042 AGCCT 0.2657 AGCGA 0.2988 AGCGC 0.1575 AGCGG 0.2096 AGCGT 0.3341 AGCTA 0.2673 AGCTC 0.1682 AGCTG 0.252 AGCTT 0.3124 AGGAA 0.4017 AGGAC 0.1827 AGGAG 0.1604 AGGAT 0.2552 AGGCA 0.4062 AGGCC 0.2287 AGGCG 0.115 AGGCT 0.25 AGGGA 0.3052 AGGGC 0.1751 AGGGG 0.2342 AGGGT 0.2855 AGGTA 0.2841 AGGTC 0.1861 AGGTG 0.2064 AGGTT 0.3235 AGTAA 0.3445 AGTAC 0.1782 AGTAG 0.1501 AGTAT 0.3271 AGTCA 0.4072 AGTCC 0.1733 AGTCG 0.1089 AGTCT 0.3106 AGTGA 0.3018 AGTGC 0.1554 AGTGG 0.1923 AGTGT 0.3506 AGTTA 0.2695 AGTTC 0.1451 AGTTG 0.1853 AGTTT 0.4001 ATAAA 0.4182 ATAAC 0.16 ATAAG 0.1174 ATAAT 0.3044 ATACA 0.4777 ATACC 0.1683 ATACG 0.07652 ATACT 0.2774 ATAGA 0.3437 ATAGC 0.1716 ATAGG 0.1565 ATAGT 0.3282 ATATA 0.3583 ATATC 0.1398 ATATG 0.1734 ATATT 0.3284 ATCAA 0.3467 ATCAC 0.1674 ATCAG 0.1698 ATCAT 0.3162 ATCCA 0.4282 ATCCC 0.2076 ATCCG 0.09812 ATCCT 0.2661 ATCGA 0.3202 ATCGC 0.1803 ATCGG 0.2003 ATCGT 0.2992 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.1799 ATCTG 0.2445 ATCTT 0.3248 ATGAA 0.365 ATGAC 0.1934 ATGAG 0.1317 ATGAT 0.3099 ATGCA 0.4396 ATGCC 0.1859 ATGCG 0.0815 ATGCT 0.2931 ATGGA 0.2924 ATGGC 0.2138 ATGGG 0.1687 ATGGT 0.325 ATGTA 0.3094 ATGTC 0.1532 ATGTG 0.199 ATGTT 0.3383 ATTAA 0.3543 ATTAC 0.167 ATTAG 0.11 ATTAT 0.3687 ATTCA 0.4388 ATTCC 0.1702 ATTCG 0.08353 ATTCT 0.3074 ATTGA 0.3184 ATTGC 0.1637 ATTGG 0.1624 ATTGT 0.3554 ATTTA 0.2678 ATTTC 0.1579 ATTTG 0.1795 ATTTT 0.3948 CAAAA 0.3621 CAAAC 0.1854 CAAAG 0.1461 CAAAT 0.3064 CAACA 0.476 CAACC 0.1636 CAACG 0.07384 CAACT 0.2865 CAAGA 0.2993 CAAGC 0.1488 CAAGG 0.1901 CAAGT 0.3618 CAATA 0.327 CAATC 0.1536 CAATG 0.2143 CAATT 0.3051 CACAA 0.3055 CACAC 0.1983 CACAG 0.1802 CACAT 0.316 CACCA 0.4253 CACCC 0.1984 CACCG 0.09999 CACCT 0.2762 CACGA 0.2866 CACGC 0.1951 CACGG 0.1883 CACGT 0.3299 CACTA 0.2177 CACTC 0.1648 CACTG 0.2708 CACTT 0.3467 CAGAA 0.3301 CAGAC 0.1965 CAGAG 0.1816 CAGAT 0.2917 CAGCA 0.4083 CAGCC 0.1882 CAGCG 0.09523 CAGCT 0.3083 CAGGA 0.2887 CAGGC 0.1581 CAGGG 0.2062 CAGGT 0.347 CAGTA 0.2825 CAGTC 0.1615 CAGTG 0.2214 CAGTT 0.3345 CATAA 0.3201 CATAC 0.1802 CATAG 0.1302 CATAT 0.3694 CATCA 0.4216 CATCC 0.1587 CATCG 0.09527 CATCT 0.3244 CATGA 0.2645 CATGC 0.1678 CATGG 0.1638 CATGT 0.4039 CATTA 0.2434 CATTC 0.1453 CATTG 0.186 CATTT 0.4253 CCAAA 0.3703 CCAAC 0.1716 CCAAG 0.1709 CCAAT 0.2872 CCACA 0.3721 CCACC 0.2204 CCACG 0.08752 CCACT 0.32 CCAGA 0.2793 CCAGC 0.1499 CCAGG 0.2047 CCAGT 0.3661 CCATA 0.2661 CCATC 0.1708 CCATG 0.2158 CCATT 0.3473 CCCAA 0.2915 CCCAC 0.1963 CCCAG 0.2107 CCCAT 0.3016 CCCCA 0.323 CCCCC 0.3126 CCCCG 0.0877 CCCCT 0.2767 CCCGA 0.2793 CCCGC 0.2218 CCCGG 0.2218 CCCGT 0.2771 CCCTA 0.2044 CCCTC 0.1924 CCCTG 0.2567 CCCTT 0.3465 CCGAA 0.2783 CCGAC 0.2315 CCGAG 0.1857 CCGAT 0.3045 CCGCA 0.3243 CCGCC 0.2703 CCGCG 0.1072 CCGCT 0.2982 CCGGA 0.2725 CCGGC 0.192 CCGGG 0.2035 CCGGT 0.3321 CCGTA 0.2654 CCGTC 0.2179 CCGTG 0.215 CCGTT 0.3017 CCTAA 0.2937 CCTAC 0.2015 CCTAG 0.1657 CCTAT 0.339 CCTCA 0.3304 CCTCC 0.2214 CCTCG 0.1075 CCTCT 0.3407 CCTGA 0.2556 CCTGC 0.1776 CCTGG 0.2185 CCTGT 0.3483 CCTTA 0.2204 CCTTC 0.1816 CCTTG 0.2307 CCTTT 0.3673 CGAAA 0.38 CGAAC 0.1733 CGAAG 0.1656 CGAAT 0.2811 CGACA 0.4019 CGACC 0.1941 CGACG 0.135 CGACT 0.2689 CGAGA 0.2731 CGAGC 0.1903 CGAGG 0.1876 CGAGT 0.349 CGATA 0.295 CGATC 0.1587 CGATG 0.2324 CGATT 0.3139 CGCAA 0.3257 CGCAC 0.2008 CGCAG 0.1724 CGCAT 0.3011 CGCCA 0.4119 CGCCC 0.1811 CGCCG 0.1373 CGCCT 0.2697 CGCGA 0.3288 CGCGC 0.1783 CGCGG 0.1759 CGCGT 0.317 CGCTA 0.2479 CGCTC 0.1942 CGCTG 0.2301 CGCTT 0.3278 CGGAA 0.3455 CGGAC 0.2223 CGGAG 0.1839 CGGAT 0.2482 CGGCA 0.3833 CGGCC 0.2272 CGGCG 0.1456 CGGCT 0.2439 CGGGA 0.29 CGGGC 0.1818 CGGGG 0.2232 CGGGT 0.305 CGGTA 0.3194 CGGTC 0.1719 CGGTG 0.2325 CGGTT 0.2763 CGTAA 0.3453 CGTAC 0.1767 CGTAG 0.1436 CGTAT 0.3344 CGTCA 0.3574 CGTCC 0.1916 CGTCG 0.1305 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.2935 CGTGC 0.172 CGTGG 0.1717 CGTGT 0.3628 CGTTA 0.2589 CGTTC 0.1479 CGTTG 0.1761 CGTTT 0.4171 CTAAA 0.4131 CTAAC 0.1664 CTAAG 0.1442 CTAAT 0.2762 CTACA 0.4019 CTACC 0.2117 CTACG 0.07925 CTACT 0.3071 CTAGA 0.3157 CTAGC 0.1792 CTAGG 0.1735 CTAGT 0.3316 CTATA 0.3275 CTATC 0.1508 CTATG 0.1945 CTATT 0.3272 CTCAA 0.3373 CTCAC 0.1902 CTCAG 0.1822 CTCAT 0.2903 CTCCA 0.4039 CTCCC 0.2151 CTCCG 0.1155 CTCCT 0.2655 CTCGA 0.3291 CTCGC 0.1949 CTCGG 0.1817 CTCGT 0.2942 CTCTA 0.2384 CTCTC 0.2065 CTCTG 0.2634 CTCTT 0.2917 CTGAA 0.3551 CTGAC 0.1941 CTGAG 0.1496 CTGAT 0.3012 CTGCA 0.4186 CTGCC 0.2053 CTGCG 0.07674 CTGCT 0.2993 CTGGA 0.2948 CTGGC 0.181 CTGGG 0.1915 CTGGT 0.3326 CTGTA 0.2825 CTGTC 0.1779 CTGTG 0.2096 CTGTT 0.33 CTTAA 0.3677 CTTAC 0.1907 CTTAG 0.1271 CTTAT 0.3146 CTTCA 0.3737 CTTCC 0.2289 CTTCG 0.08075 CTTCT 0.3166 CTTGA 0.3154 CTTGC 0.1703 CTTGG 0.1725 CTTGT 0.3418 CTTTA 0.2812 CTTTC 0.1659 CTTTG 0.2012 CTTTT 0.3517 GAAAA 0.3697 GAAAC 0.1714 GAAAG 0.1417 GAAAT 0.3172 GAACA 0.4289 GAACC 0.1905 GAACG 0.08239 GAACT 0.2982 GAAGA 0.3251 GAAGC 0.1523 GAAGG 0.1902 GAAGT 0.3324 GAATA 0.3138 GAATC 0.146 GAATG 0.2311 GAATT 0.3092 GACAA 0.3207 GACAC 0.1837 GACAG 0.1913 GACAT 0.3043 GACCA 0.3828 GACCC 0.2164 GACCG 0.09172 GACCT 0.3091 GACGA 0.3307 GACGC 0.1917 GACGG 0.2028 GACGT 0.2748 GACTA 0.2322 GACTC 0.1431 GACTG 0.2874 GACTT 0.3373 GAGAA 0.3169 GAGAC 0.1779 GAGAG 0.2015 GAGAT 0.3038 GAGCA 0.4011 GAGCC 0.1731 GAGCG 0.1196 GAGCT 0.3061 GAGGA 0.2964 GAGGC 0.1513 GAGGG 0.2161 GAGGT 0.3362 GAGTA 0.268 GAGTC 0.1461 GAGTG 0.2447 GAGTT 0.3412 GATAA 0.3251 GATAC 0.1612 GATAG 0.13 GATAT 0.3837 GATCA 0.4252 GATCC 0.1795 GATCG 0.1011 GATCT 0.2942 GATGA 0.3229 GATGC 0.1621 GATGG 0.199 GATGT 0.316 GATTA 0.2315 GATTC 0.1463 GATTG 0.2125 GATTT 0.4098 GCAAA 0.3482 GCAAC 0.1699 GCAAG 0.1775 GCAAT 0.3044 GCACA 0.4227 GCACC 0.1658 GCACG 0.1042 GCACT 0.3073 GCAGA 0.3214 GCAGC 0.1745 GCAGG 0.1834 GCAGT 0.3207 GCATA 0.2838 GCATC 0.1515 GCATG 0.2409 GCATT 0.3239 GCCAA 0.2958 GCCAC 0.1588 GCCAG 0.1868 GCCAT 0.3586 GCCCA 0.3185 GCCCC 0.2336 GCCCG 0.1149 GCCCT 0.333 GCCGA 0.3027 GCCGC 0.1786 GCCGG 0.2131 GCCGT 0.3056 GCCTA 0.2248 GCCTC 0.1659 GCCTG 0.2423 GCCTT 0.3669 GCGAA 0.2766 GCGAC 0.2141 GCGAG 0.2144 GCGAT 0.2949 GCGCA 0.3458 GCGCC 0.2036 GCGCG 0.1472 GCGCT 0.3034 GCGGA 0.3013 GCGGC 0.1768 GCGGG 0.2236 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.2423 GCGTC 0.2134 GCGTG 0.2308 GCGTT 0.3136 GCTAA 0.3224 GCTAC 0.1828 GCTAG 0.1559 GCTAT 0.3389 GCTCA 0.3928 GCTCC 0.1722 GCTCG 0.1273 GCTCT 0.3077 GCTGA 0.299 GCTGC 0.1855 GCTGG 0.1755 GCTGT 0.34 GCTTA 0.2624 GCTTC 0.1698 GCTTG 0.2108 GCTTT 0.357 GGAAA 0.391 GGAAC 0.1441 GGAAG 0.2094 GGAAT 0.2555 GGACA 0.4383 GGACC 0.1771 GGACG 0.1218 GGACT 0.2629 GGAGA 0.3379 GGAGC 0.1537 GGAGG 0.2308 GGAGT 0.2775 GGATA 0.3028 GGATC 0.1578 GGATG 0.2168 GGATT 0.3227 GGCAA 0.3313 GGCAC 0.1379 GGCAG 0.2133 GGCAT 0.3176 GGCCA 0.4206 GGCCC 0.1987 GGCCG 0.1087 GGCCT 0.272 GGCGA 0.2725 GGCGC 0.1432 GGCGG 0.2576 GGCGT 0.3267 GGCTA 0.256 GGCTC 0.1727 GGCTG 0.2794 GGCTT 0.2919 GGGAA 0.3503 GGGAC 0.171 GGGAG 0.189 GGGAT 0.2897 GGGCA 0.3491 GGGCC 0.2579 GGGCG 0.1192 GGGCT 0.2738 GGGGA 0.2478 GGGGC 0.1452 GGGGG 0.3126 GGGGT 0.2944 GGGTA 0.2423 GGGTC 0.2061 GGGTG 0.2344 GGGTT 0.3171 GGTAA 0.3282 GGTAC 0.1659 GGTAG 0.1733 GGTAT 0.3325 GGTCA 0.4662 GGTCC 0.161 GGTCG 0.1084 GGTCT 0.2644 GGTGA 0.3152 GGTGC 0.1354 GGTGG 0.2139 GGTGT 0.3355 GGTTA 0.2973 GGTTC 0.17 GGTTG 0.194 GGTTT 0.3387 GTAAA 0.3929 GTAAC 0.1806 GTAAG 0.1452 GTAAT 0.2813 GTACA 0.4639 GTACC 0.1634 GTACG 0.07862 GTACT 0.294 GTAGA 0.3408 GTAGC 0.165 GTAGG 0.1658 GTAGT 0.3284 GTATA 0.3234 GTATC 0.1382 GTATG 0.199 GTATT 0.3394 GTCAA 0.3061 GTCAC 0.183 GTCAG 0.1822 GTCAT 0.3286 GTCCA 0.3975 GTCCC 0.1842 GTCCG 0.132 GTCCT 0.2863 GTCGA 0.2704 GTCGC 0.1792 GTCGG 0.2086 GTCGT 0.3417 GTCTA 0.2371 GTCTC 0.1737 GTCTG 0.2717 GTCTT 0.3175 GTGAA 0.3335 GTGAC 0.2005 GTGAG 0.1606 GTGAT 0.3054 GTGCA 0.4255 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.107 GTGCT 0.3085 GTGGA 0.2576 GTGGC 0.171 GTGGG 0.1983 GTGGT 0.3731 GTGTA 0.2702 GTGTC 0.1673 GTGTG 0.2258 GTGTT 0.3368 GTTAA 0.3446 GTTAC 0.1914 GTTAG 0.1183 GTTAT 0.3457 GTTCA 0.4339 GTTCC 0.1633 GTTCG 0.08759 GTTCT 0.3152 GTTGA 0.295 GTTGC 0.1615 GTTGG 0.1715 GTTGT 0.372 GTTTA 0.2721 GTTTC 0.1588 GTTTG 0.2021 GTTTT 0.367 TAAAA 0.393 TAAAC 0.1663 TAAAG 0.1361 TAAAT 0.3047 TAACA 0.4169 TAACC 0.1884 TAACG 0.08156 TAACT 0.3131 TAAGA 0.3101 TAAGC 0.1709 TAAGG 0.1676 TAAGT 0.3514 TAATA 0.3172 TAATC 0.1245 TAATG 0.2086 TAATT 0.3497 TACAA 0.3117 TACAC 0.1681 TACAG 0.1721 TACAT 0.3481 TACCA 0.4229 TACCC 0.1638 TACCG 0.1097 TACCT 0.3036 TACGA 0.2919 TACGC 0.1791 TACGG 0.2031 TACGT 0.3259 TACTA 0.2442 TACTC 0.1391 TACTG 0.2662 TACTT 0.3505 TAGAA 0.3609 TAGAC 0.1726 TAGAG 0.1654 TAGAT 0.3011 TAGCA 0.4011 TAGCC 0.1716 TAGCG 0.1021 TAGCT 0.3253 TAGGA 0.2693 TAGGC 0.1757 TAGGG 0.1966 TAGGT 0.3584 TAGTA 0.2961 TAGTC 0.1492 TAGTG 0.2033 TAGTT 0.3514 TATAA 0.3005 TATAC 0.1606 TATAG 0.1202 TATAT 0.4186 TATCA 0.4418 TATCC 0.1571 TATCG 0.08572 TATCT 0.3154 TATGA 0.2852 TATGC 0.1672 TATGG 0.1708 TATGT 0.3768 TATTA 0.2473 TATTC 0.1319 TATTG 0.1897 TATTT 0.4311 TCAAA 0.3753 TCAAC 0.1575 TCAAG 0.1668 TCAAT 0.3004 TCACA 0.4081 TCACC 0.1969 TCACG 0.09064 TCACT 0.3044 TCAGA 0.3114 TCAGC 0.1672 TCAGG 0.1568 TCAGT 0.3646 TCATA 0.2612 TCATC 0.1628 TCATG 0.2048 TCATT 0.3712 TCCAA 0.323 TCCAC 0.1567 TCCAG 0.1992 TCCAT 0.3211 TCCCA 0.371 TCCCC 0.2158 TCCCG 0.09919 TCCCT 0.3141 TCCGA 0.2948 TCCGC 0.1853 TCCGG 0.1842 TCCGT 0.3357 TCCTA 0.198 TCCTC 0.1868 TCCTG 0.2543 TCCTT 0.3609 TCGAA 0.3237 TCGAC 0.1807 TCGAG 0.2025 TCGAT 0.2931 TCGCA 0.3522 TCGCC 0.2033 TCGCG 0.1425 TCGCT 0.302 TCGGA 0.3163 TCGGC 0.1978 TCGGG 0.1858 TCGGT 0.3 TCGTA 0.2473 TCGTC 0.2304 TCGTG 0.2122 TCGTT 0.3101 TCTAA 0.2996 TCTAC 0.1987 TCTAG 0.1446 TCTAT 0.3571 TCTCA 0.3659 TCTCC 0.1874 TCTCG 0.09049 TCTCT 0.3563 TCTGA 0.29 TCTGC 0.1778 TCTGG 0.1703 TCTGT 0.3619 TCTTA 0.241 TCTTC 0.1834 TCTTG 0.2147 TCTTT 0.3609 TGAAA 0.4079 TGAAC 0.1639 TGAAG 0.1463 TGAAT 0.2819 TGACA 0.4333 TGACC 0.2141 TGACG 0.09479 TGACT 0.2578 TGAGA 0.3383 TGAGC 0.1798 TGAGG 0.1766 TGAGT 0.3053 TGATA 0.3205 TGATC 0.1407 TGATG 0.2168 TGATT 0.3221 TGCAA 0.307 TGCAC 0.1645 TGCAG 0.1939 TGCAT 0.3346 TGCCA 0.4496 TGCCC 0.1582 TGCCG 0.1079 TGCCT 0.2843 TGCGA 0.3048 TGCGC 0.157 TGCGG 0.1994 TGCGT 0.3388 TGCTA 0.2442 TGCTC 0.1633 TGCTG 0.2473 TGCTT 0.3453 TGGAA 0.3469 TGGAC 0.1824 TGGAG 0.1754 TGGAT 0.2953 TGGCA 0.4048 TGGCC 0.2228 TGGCG 0.1107 TGGCT 0.2617 TGGGA 0.2984 TGGGC 0.1386 TGGGG 0.2262 TGGGT 0.3368 TGGTA 0.2833 TGGTC 0.1651 TGGTG 0.2275 TGGTT 0.3241 TGTAA 0.3257 TGTAC 0.1822 TGTAG 0.1273 TGTAT 0.3649 TGTCA 0.4145 TGTCC 0.175 TGTCG 0.09858 TGTCT 0.3119 TGTGA 0.2849 TGTGC 0.1505 TGTGG 0.1574 TGTGT 0.4072 TGTTA 0.2394 TGTTC 0.1392 TGTTG 0.2054 TGTTT 0.416 TTAAA 0.4135 TTAAC 0.1587 TTAAG 0.1366 TTAAT 0.2912 TTACA 0.4425 TTACC 0.1724 TTACG 0.08196 TTACT 0.3031 TTAGA 0.3295 TTAGC 0.1866 TTAGG 0.1549 TTAGT 0.3291 TTATA 0.3077 TTATC 0.1417 TTATG 0.1798 TTATT 0.3708 TTCAA 0.3445 TTCAC 0.1586 TTCAG 0.1737 TTCAT 0.3232 TTCCA 0.3841 TTCCC 0.1917 TTCCG 0.1043 TTCCT 0.3198 TTCGA 0.3389 TTCGC 0.162 TTCGG 0.1754 TTCGT 0.3237 TTCTA 0.2536 TTCTC 0.1583 TTCTG 0.2334 TTCTT 0.3547 TTGAA 0.3664 TTGAC 0.1696 TTGAG 0.1441 TTGAT 0.3199 TTGCA 0.4039 TTGCC 0.1942 TTGCG 0.08829 TTGCT 0.3137 TTGGA 0.305 TTGGC 0.1829 TTGGG 0.1691 TTGGT 0.343 TTGTA 0.2761 TTGTC 0.1609 TTGTG 0.1918 TTGTT 0.3712 TTTAA 0.3575 TTTAC 0.1657 TTTAG 0.1169 TTTAT 0.3599 TTTCA 0.4292 TTTCC 0.1761 TTTCG 0.07635 TTTCT 0.3183 TTTGA 0.3156 TTTGC 0.1486 TTTGG 0.1661 TTTGT 0.3697 TTTTA 0.2831 TTTTC 0.1509 TTTTG 0.1739 TTTTT 0.3922