[1] # (a,c,g,t)= (0.333, 0.167, 0.167, 0.333) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.344 C 0.156 G 0.156 T 0.344 # l= 1 # Values AA 0.147 AC 0.0532 AG 0.0444 AT 0.0987 CA 0.0578 CC 0.0265 CG 0.0277 CT 0.0444 GA 0.0479 GC 0.0288 GG 0.0264 GT 0.0532 TA 0.0906 TC 0.0479 TG 0.0577 TT 0.147 # l= 2 # Values AAA 0.0668 AAC 0.0203 AAG 0.0165 AAT 0.0438 ACA 0.0206 ACC 0.0085 ACG 0.00857 ACT 0.0155 AGA 0.0139 AGC 0.00794 AGG 0.00718 AGT 0.0155 ATA 0.0276 ATC 0.0128 ATG 0.0145 ATT 0.0438 CAA 0.0236 CAC 0.0107 CAG 0.0089 CAT 0.0145 CCA 0.0097 CCC 0.0048 CCG 0.00478 CCT 0.00718 CGA 0.00887 CGC 0.00545 CGG 0.00478 CGT 0.00857 CTA 0.0116 CTC 0.00748 CTG 0.0089 CTT 0.0165 GAA 0.0195 GAC 0.00815 GAG 0.00748 GAT 0.0128 GCA 0.0102 GCC 0.00525 GCG 0.00544 GCT 0.00794 GGA 0.00791 GGC 0.00525 GGG 0.00479 GGT 0.0085 GTA 0.014 GTC 0.00816 GTG 0.0107 GTT 0.0203 TAA 0.0375 TAC 0.014 TAG 0.0116 TAT 0.0276 TCA 0.0172 TCC 0.00792 TCG 0.00887 TCT 0.0139 TGA 0.0172 TGC 0.0102 TGG 0.00969 TGT 0.0206 TTA 0.0375 TTC 0.0195 TTG 0.0236 TTT 0.0668 # l= 3 # Values AAAA 0.0305 AAAC 0.00913 AAAG 0.0069 AAAT 0.0203 AACA 0.00808 AACC 0.00302 AACG 0.00319 AACT 0.00604 AAGA 0.00495 AAGC 0.00288 AAGG 0.00254 AAGT 0.00611 AATA 0.0135 AATC 0.00532 AATG 0.00649 AATT 0.0184 ACAA 0.00859 ACAC 0.00368 ACAG 0.00319 ACAT 0.00517 ACCA 0.00312 ACCC 0.00142 ACCG 0.00152 ACCT 0.00244 ACGA 0.00272 ACGC 0.00156 ACGG 0.00129 ACGT 0.003 ACTA 0.00393 ACTC 0.00229 ACTG 0.00312 ACTT 0.00611 AGAA 0.00586 AGAC 0.00216 AGAG 0.00219 AGAT 0.00366 AGCA 0.00279 AGCC 0.00133 AGCG 0.00155 AGCT 0.00227 AGGA 0.00218 AGGC 0.00126 AGGG 0.0013 AGGT 0.00244 AGTA 0.00389 AGTC 0.00229 AGTG 0.00324 AGTT 0.00604 ATAA 0.0132 ATAC 0.0038 ATAG 0.00318 ATAT 0.00746 ATCA 0.00487 ATCC 0.00186 ATCG 0.00242 ATCT 0.00367 ATGA 0.00454 ATGC 0.00245 ATGG 0.00233 ATGT 0.00517 ATTA 0.012 ATTC 0.0051 ATTG 0.00635 ATTT 0.0203 CAAA 0.0106 CAAC 0.00364 CAAG 0.00304 CAAT 0.00635 CACA 0.00394 CACC 0.00193 CACG 0.00161 CACT 0.00324 CAGA 0.00273 CAGC 0.00165 CAGG 0.00139 CAGT 0.00312 CATA 0.00369 CATC 0.00216 CATG 0.00214 CATT 0.00649 CCAA 0.00399 CCAC 0.00195 CCAG 0.00143 CCAT 0.00233 CCCA 0.00165 CCCC 0.00104 CCCG 0.000808 CCCT 0.0013 CCGA 0.00155 CCGC 0.000954 CCGG 0.000983 CCGT 0.00129 CCTA 0.00193 CCTC 0.00132 CCTG 0.00139 CCTT 0.00254 CGAA 0.00339 CGAC 0.00158 CGAG 0.00147 CGAT 0.00242 CGCA 0.00178 CGCC 0.00119 CGCG 0.000926 CGCT 0.00155 CGGA 0.00141 CGGC 0.00103 CGGG 0.000808 CGGT 0.00153 CGTA 0.00223 CGTC 0.00154 CGTG 0.00161 CGTT 0.00319 CTAA 0.00458 CTAC 0.00213 CTAG 0.00171 CTAT 0.00318 CTCA 0.00251 CTCC 0.00131 CTCG 0.00147 CTCT 0.00219 CTGA 0.0027 CTGC 0.00157 CTGG 0.00143 CTGT 0.00319 CTTA 0.00398 CTTC 0.00256 CTTG 0.00304 CTTT 0.0069 GAAA 0.00923 GAAC 0.00257 GAAG 0.00256 GAAT 0.0051 GACA 0.003 GACC 0.00133 GACG 0.00154 GACT 0.00229 GAGA 0.00245 GAGC 0.00142 GAGG 0.00132 GAGT 0.00229 GATA 0.00373 GATC 0.0016 GATG 0.00216 GATT 0.00532 GCAA 0.00427 GCAC 0.00189 GCAG 0.00157 GCAT 0.00245 GCCA 0.00202 GCCC 0.000943 GCCG 0.00103 GCCT 0.00126 GCGA 0.00173 GCGC 0.0012 GCGG 0.000954 GCGT 0.00156 GCTA 0.00198 GCTC 0.00142 GCTG 0.00165 GCTT 0.00288 GGAA 0.00343 GGAC 0.00131 GGAG 0.00131 GGAT 0.00186 GGCA 0.00174 GGCC 0.000996 GGCG 0.00119 GGCT 0.00133 GGGA 0.0014 GGGC 0.000944 GGGG 0.00103 GGGT 0.00142 GGTA 0.00223 GGTC 0.00133 GGTG 0.00193 GGTT 0.00302 GTAA 0.00579 GTAC 0.00225 GTAG 0.00213 GTAT 0.0038 GTCA 0.0031 GTCC 0.00131 GTCG 0.00158 GTCT 0.00216 GTGA 0.0032 GTGC 0.00189 GTGG 0.00195 GTGT 0.00368 GTTA 0.00498 GTTC 0.00257 GTTG 0.00364 GTTT 0.00913 TAAA 0.0166 TAAC 0.00498 TAAG 0.00398 TAAT 0.012 TACA 0.00561 TACC 0.00223 TACG 0.00223 TACT 0.00389 TAGA 0.00374 TAGC 0.00198 TAGG 0.00193 TAGT 0.00393 TATA 0.00666 TATC 0.00373 TATG 0.00369 TATT 0.0135 TCAA 0.0068 TCAC 0.0032 TCAG 0.00271 TCAT 0.00454 TCCA 0.00292 TCCC 0.0014 TCCG 0.00141 TCCT 0.00218 TCGA 0.00285 TCGC 0.00173 TCGG 0.00155 TCGT 0.00272 TCTA 0.00374 TCTC 0.00245 TCTG 0.00273 TCTT 0.00495 TGAA 0.00678 TGAC 0.0031 TGAG 0.00251 TGAT 0.00486 TGCA 0.00387 TGCC 0.00174 TGCG 0.00178 TGCT 0.00278 TGGA 0.00292 TGGC 0.00201 TGGG 0.00165 TGGT 0.00312 TGTA 0.00561 TGTC 0.003 TGTG 0.00394 TGTT 0.00808 TTAA 0.014 TTAC 0.00578 TTAG 0.00457 TTAT 0.0132 TTCA 0.00677 TTCC 0.00343 TTCG 0.00339 TTCT 0.00585 TTGA 0.0068 TTGC 0.00426 TTGG 0.00399 TTGT 0.00859 TTTA 0.0165 TTTC 0.00923 TTTG 0.0106 TTTT 0.0304 # l= 4 # Values AAAAA 0.0137 AAAAC 0.00421 AAAAG 0.00294 AAAAT 0.00965 AAACA 0.0036 AAACC 0.00136 AAACG 0.00148 AAACT 0.00269 AAAGA 0.00199 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000962 AAAGT 0.00272 AAATA 0.00659 AAATC 0.00256 AAATG 0.00318 AAATT 0.00799 AACAA 0.00345 AACAC 0.00149 AACAG 0.00118 AACAT 0.00195 AACCA 0.00111 AACCC 0.000513 AACCG 0.000621 AACCT 0.000778 AACGA 0.00101 AACGC 0.00063 AACGG 0.000504 AACGT 0.00105 AACTA 0.00169 AACTC 0.000886 AACTG 0.00125 AACTT 0.00221 AAGAA 0.00211 AAGAC 0.00083 AAGAG 0.000775 AAGAT 0.00124 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000487 AAGCG 0.000579 AAGCT 0.000802 AAGGA 0.000782 AAGGC 0.000498 AAGGG 0.000454 AAGGT 0.000807 AAGTA 0.00164 AAGTC 0.000922 AAGTG 0.00134 AAGTT 0.00221 AATAA 0.0068 AATAC 0.00178 AATAG 0.00145 AATAT 0.00348 AATCA 0.00205 AATCC 0.000782 AATCG 0.00109 AATCT 0.00139 AATGA 0.00205 AATGC 0.00112 AATGG 0.00103 AATGT 0.00229 AATTA 0.00549 AATTC 0.00225 AATTG 0.00272 AATTT 0.00799 ACAAA 0.0038 ACAAC 0.00129 ACAAG 0.00102 ACAAT 0.00248 ACACA 0.00138 ACACC 0.000642 ACACG 0.000593 ACACT 0.00106 ACAGA 0.00102 ACAGC 0.000573 ACAGG 0.000508 ACAGT 0.0011 ACATA 0.00139 ACATC 0.000722 ACATG 0.000762 ACATT 0.00229 ACCAA 0.00133 ACCAC 0.00061 ACCAG 0.000442 ACCAT 0.000731 ACCCA 0.000493 ACCCC 0.000296 ACCCG 0.000228 ACCCT 0.000401 ACCGA 0.000501 ACCGC 0.000297 ACCGG 0.000307 ACCGT 0.000421 ACCTA 0.000743 ACCTC 0.000427 ACCTG 0.000462 ACCTT 0.000807 ACGAA 0.00107 ACGAC 0.000475 ACGAG 0.000471 ACGAT 0.000714 ACGCA 0.000557 ACGCC 0.000308 ACGCG 0.000252 ACGCT 0.000439 ACGGA 0.000385 ACGGC 0.000276 ACGGG 0.000208 ACGGT 0.000421 ACGTA 0.000808 ACGTC 0.000531 ACGTG 0.000617 ACGTT 0.00105 ACTAA 0.00155 ACTAC 0.000675 ACTAG 0.000576 ACTAT 0.00113 ACTCA 0.00083 ACTCC 0.000353 ACTCG 0.000488 ACTCT 0.000619 ACTGA 0.001 ACTGC 0.000523 ACTGG 0.000499 ACTGT 0.0011 ACTTA 0.00148 ACTTC 0.000812 ACTTG 0.0011 ACTTT 0.00272 AGAAA 0.00288 AGAAC 0.000753 AGAAG 0.000744 AGAAT 0.00148 AGACA 0.000839 AGACC 0.000313 AGACG 0.000422 AGACT 0.000586 AGAGA 0.000779 AGAGC 0.000417 AGAGG 0.000379 AGAGT 0.000619 AGATA 0.00122 AGATC 0.000431 AGATG 0.00062 AGATT 0.00139 AGCAA 0.00119 AGCAC 0.000521 AGCAG 0.000461 AGCAT 0.000609 AGCCA 0.000492 AGCCC 0.000237 AGCCG 0.000282 AGCCT 0.000321 AGCGA 0.00052 AGCGC 0.000321 AGCGG 0.000271 AGCGT 0.000439 AGCTA 0.000594 AGCTC 0.000392 AGCTG 0.000481 AGCTT 0.000802 AGGAA 0.000965 AGGAC 0.000335 AGGAG 0.000352 AGGAT 0.00053 AGGCA 0.000447 AGGCC 0.000231 AGGCG 0.000262 AGGCT 0.000321 AGGGA 0.000383 AGGGC 0.00026 AGGGG 0.000255 AGGGT 0.000401 AGGTA 0.000759 AGGTC 0.000374 AGGTG 0.000528 AGGTT 0.000778 AGTAA 0.00163 AGTAC 0.00064 AGTAG 0.000617 AGTAT 0.00101 AGTCA 0.000835 AGTCC 0.000363 AGTCG 0.000509 AGTCT 0.000586 AGTGA 0.000999 AGTGC 0.000586 AGTGG 0.00059 AGTGT 0.00106 AGTTA 0.00152 AGTTC 0.000765 AGTTG 0.00105 AGTTT 0.00269 ATAAA 0.00601 ATAAC 0.00173 ATAAG 0.00132 ATAAT 0.00411 ATACA 0.00161 ATACC 0.000576 ATACG 0.000605 ATACT 0.00101 ATAGA 0.001 ATAGC 0.000543 ATAGG 0.000502 ATAGT 0.00113 ATATA 0.00196 ATATC 0.00103 ATATG 0.000991 ATATT 0.00348 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.000983 ATCAG 0.000799 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.000668 ATCCC 0.000318 ATCCG 0.000341 ATCCT 0.00053 ATCGA 0.000801 ATCGC 0.000495 ATCGG 0.000412 ATCGT 0.000714 ATCTA 0.00102 ATCTC 0.000672 ATCTG 0.000738 ATCTT 0.00124 ATGAA 0.00182 ATGAC 0.000825 ATGAG 0.000669 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000375 ATGCG 0.000451 ATGCT 0.000609 ATGGA 0.000719 ATGGC 0.000503 ATGGG 0.000377 ATGGT 0.000731 ATGTA 0.00149 ATGTC 0.000746 ATGTG 0.00098 ATGTT 0.00195 ATTAA 0.00462 ATTAC 0.00183 ATTAG 0.00144 ATTAT 0.00411 ATTCA 0.00183 ATTCC 0.000902 ATTCG 0.000889 ATTCT 0.00148 ATTGA 0.00175 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.000996 ATTGT 0.00248 ATTTA 0.00508 ATTTC 0.00268 ATTTG 0.00291 ATTTT 0.00965 CAAAA 0.00504 CAAAC 0.00149 CAAAG 0.00115 CAAAT 0.00291 CAACA 0.00149 CAACC 0.000553 CAACG 0.000543 CAACT 0.00105 CAAGA 0.000905 CAAGC 0.000504 CAAGG 0.000537 CAAGT 0.0011 CAATA 0.00191 CAATC 0.000786 CAATG 0.000942 CAATT 0.00272 CACAA 0.00168 CACAC 0.000702 CACAG 0.000579 CACAT 0.00098 CACCA 0.000713 CACCC 0.000371 CACCG 0.000314 CACCT 0.000528 CACGA 0.0005 CACGC 0.00028 CACGG 0.000212 CACGT 0.000617 CACTA 0.000722 CACTC 0.000523 CACTG 0.000649 CACTT 0.00134 CAGAA 0.00117 CAGAC 0.000427 CAGAG 0.000396 CAGAT 0.000738 CAGCA 0.000537 CAGCC 0.000301 CAGCG 0.000333 CAGCT 0.000481 CAGGA 0.000447 CAGGC 0.000222 CAGGG 0.000261 CAGGT 0.000462 CAGTA 0.000724 CAGTC 0.000499 CAGTG 0.000649 CAGTT 0.00125 CATAA 0.00171 CATAC 0.000523 CATAG 0.000462 CATAT 0.000991 CATCA 0.000811 CATCC 0.00035 CATCG 0.000381 CATCT 0.00062 CATGA 0.000658 CATGC 0.000379 CATGG 0.000341 CATGT 0.000762 CATTA 0.00157 CATTC 0.000802 CATTG 0.000942 CATTT 0.00318 CCAAA 0.00178 CCAAC 0.0007 CCAAG 0.000513 CCAAT 0.000996 CCACA 0.000686 CCACC 0.000403 CCACG 0.000268 CCACT 0.00059 CCAGA 0.000443 CCAGC 0.000265 CCAGG 0.000223 CCAGT 0.000499 CCATA 0.000585 CCATC 0.000372 CCATG 0.000341 CCATT 0.00103 CCCAA 0.000682 CCCAC 0.000353 CCCAG 0.00024 CCCAT 0.000377 CCCCA 0.000373 CCCCC 0.000231 CCCCG 0.000177 CCCCT 0.000255 CCCGA 0.000279 CCCGC 0.000152 CCCGG 0.000169 CCCGT 0.000208 CCCTA 0.000333 CCCTC 0.000249 CCCTG 0.000261 CCCTT 0.000454 CCGAA 0.0006 CCGAC 0.000299 CCGAG 0.000241 CCGAT 0.000412 CCGCA 0.000293 CCGCC 0.00024 CCGCG 0.00015 CCGCT 0.000271 CCGGA 0.000312 CCGGC 0.000195 CCGGG 0.000169 CCGGT 0.000307 CCGTA 0.000333 CCGTC 0.00024 CCGTG 0.000212 CCGTT 0.000504 CCTAA 0.000778 CCTAC 0.000402 CCTAG 0.000246 CCTAT 0.000502 CCTCA 0.000423 CCTCC 0.000265 CCTCG 0.000252 CCTCT 0.000379 CCTGA 0.000411 CCTGC 0.000251 CCTGG 0.000223 CCTGT 0.000508 CCTTA 0.000598 CCTTC 0.000443 CCTTG 0.000537 CCTTT 0.000962 CGAAA 0.0016 CGAAC 0.000464 CGAAG 0.000439 CGAAT 0.000889 CGACA 0.000494 CGACC 0.000295 CGACG 0.000287 CGACT 0.000509 CGAGA 0.000455 CGAGC 0.000273 CGAGG 0.000252 CGAGT 0.000488 CGATA 0.000648 CGATC 0.000305 CGATG 0.000381 CGATT 0.00109 CGCAA 0.000709 CGCAC 0.000343 CGCAG 0.00028 CGCAT 0.000451 CGCCA 0.000465 CGCCC 0.000218 CGCCG 0.000241 CGCCT 0.000262 CGCGA 0.000307 CGCGC 0.000217 CGCGG 0.00015 CGCGT 0.000252 CGCTA 0.000349 CGCTC 0.000289 CGCTG 0.000333 CGCTT 0.000579 CGGAA 0.000597 CGGAC 0.000247 CGGAG 0.000227 CGGAT 0.000341 CGGCA 0.0003 CGGCC 0.000209 CGGCG 0.000241 CGGCT 0.000282 CGGGA 0.000259 CGGGC 0.000145 CGGGG 0.000177 CGGGT 0.000228 CGGTA 0.000345 CGGTC 0.000243 CGGTG 0.000314 CGGTT 0.000621 CGTAA 0.000978 CGTAC 0.000323 CGTAG 0.000326 CGTAT 0.000605 CGTCA 0.000557 CGTCC 0.000272 CGTCG 0.000287 CGTCT 0.000422 CGTGA 0.000469 CGTGC 0.000279 CGTGG 0.000268 CGTGT 0.000593 CGTTA 0.000719 CGTTC 0.00045 CGTTG 0.000543 CGTTT 0.00148 CTAAA 0.00198 CTAAC 0.000663 CTAAG 0.000489 CTAAT 0.00144 CTACA 0.000832 CTACC 0.000351 CTACG 0.000326 CTACT 0.000617 CTAGA 0.000611 CTAGC 0.000275 CTAGG 0.000246 CTAGT 0.000576 CTATA 0.000809 CTATC 0.000456 CTATG 0.000462 CTATT 0.00145 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.000432 CTCAG 0.000373 CTCAT 0.000669 CTCCA 0.000495 CTCCC 0.000236 CTCCG 0.000227 CTCCT 0.000352 CTCGA 0.000486 CTCGC 0.00027 CTCGG 0.000241 CTCGT 0.000471 CTCTA 0.000607 CTCTC 0.000416 CTCTG 0.000396 CTCTT 0.000775 CTGAA 0.00107 CTGAC 0.000467 CTGAG 0.000373 CTGAT 0.000799 CTGCA 0.000575 CTGCC 0.000259 CTGCG 0.00028 CTGCT 0.000461 CTGGA 0.000481 CTGGC 0.000266 CTGGG 0.00024 CTGGT 0.000442 CTGTA 0.000924 CTGTC 0.000505 CTGTG 0.000579 CTGTT 0.00118 CTTAA 0.00155 CTTAC 0.000627 CTTAG 0.000489 CTTAT 0.00132 CTTCA 0.000898 CTTCC 0.000478 CTTCG 0.000439 CTTCT 0.000744 CTTGA 0.000967 CTTGC 0.000545 CTTGG 0.000513 CTTGT 0.00102 CTTTA 0.00178 CTTTC 0.00103 CTTTG 0.00115 CTTTT 0.00294 GAAAA 0.00421 GAAAC 0.00131 GAAAG 0.00103 GAAAT 0.00268 GAACA 0.000976 GAACC 0.000376 GAACG 0.00045 GAACT 0.000765 GAAGA 0.00082 GAAGC 0.000484 GAAGG 0.000443 GAAGT 0.000812 GAATA 0.0014 GAATC 0.000649 GAATG 0.000802 GAATT 0.00225 GACAA 0.00117 GACAC 0.000574 GACAG 0.000505 GACAT 0.000746 GACCA 0.000494 GACCC 0.000215 GACCG 0.000243 GACCT 0.000374 GACGA 0.000462 GACGC 0.000306 GACGG 0.00024 GACGT 0.000531 GACTA 0.00055 GACTC 0.000321 GACTG 0.000499 GACTT 0.000922 GAGAA 0.000987 GAGAC 0.000373 GAGAG 0.000416 GAGAT 0.000672 GAGCA 0.000509 GAGCC 0.000235 GAGCG 0.000289 GAGCT 0.000392 GAGGA 0.000408 GAGGC 0.000235 GAGGG 0.000249 GAGGT 0.000427 GAGTA 0.00056 GAGTC 0.000321 GAGTG 0.000523 GAGTT 0.000886 GATAA 0.00177 GATAC 0.000474 GATAG 0.000456 GATAT 0.00103 GATCA 0.000615 GATCC 0.000249 GATCG 0.000305 GATCT 0.000431 GATGA 0.000704 GATGC 0.000363 GATGG 0.000372 GATGT 0.000722 GATTA 0.00132 GATTC 0.000649 GATTG 0.000786 GATTT 0.00256 GCAAA 0.00188 GCAAC 0.000708 GCAAG 0.000545 GCAAT 0.00113 GCACA 0.000676 GCACC 0.000344 GCACG 0.000279 GCACT 0.000586 GCAGA 0.000479 GCAGC 0.000321 GCAGG 0.000251 GCAGT 0.000523 GCATA 0.000587 GCATC 0.000363 GCATG 0.000379 GCATT 0.00112 GCCAA 0.000824 GCCAC 0.000419 GCCAG 0.000266 GCCAT 0.000503 GCCCA 0.000298 GCCCC 0.000241 GCCCG 0.000145 GCCCT 0.00026 GCCGA 0.000318 GCCGC 0.000245 GCCGG 0.000195 GCCGT 0.000276 GCCTA 0.000306 GCCTC 0.000235 GCCTG 0.000222 GCCTT 0.000498 GCGAA 0.000627 GCGAC 0.000342 GCGAG 0.00027 GCGAT 0.000495 GCGCA 0.000364 GCGCC 0.0003 GCGCG 0.000217 GCGCT 0.000321 GCGGA 0.000261 GCGGC 0.000245 GCGGG 0.000152 GCGGT 0.000297 GCGTA 0.00034 GCGTC 0.000306 GCGTG 0.00028 GCGTT 0.00063 GCTAA 0.000791 GCTAC 0.000374 GCTAG 0.000275 GCTAT 0.000543 GCTCA 0.000465 GCTCC 0.00027 GCTCG 0.000273 GCTCT 0.000417 GCTGA 0.000492 GCTGC 0.000321 GCTGG 0.000265 GCTGT 0.000573 GCTTA 0.000663 GCTTC 0.000484 GCTTG 0.000504 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00156 GGAAC 0.000492 GGAAG 0.000478 GGAAT 0.000902 GGACA 0.000468 GGACC 0.000208 GGACG 0.000272 GGACT 0.000363 GGAGA 0.000423 GGAGC 0.00027 GGAGG 0.000265 GGAGT 0.000353 GGATA 0.000477 GGATC 0.000249 GGATG 0.00035 GGATT 0.000782 GGCAA 0.000746 GGCAC 0.000358 GGCAG 0.000259 GGCAT 0.000375 GGCCA 0.000356 GGCCC 0.0002 GGCCG 0.000209 GGCCT 0.000231 GGCGA 0.000339 GGCGC 0.0003 GGCGG 0.00024 GGCGT 0.000308 GGCTA 0.000309 GGCTC 0.000235 GGCTG 0.000301 GGCTT 0.000487 GGGAA 0.000593 GGGAC 0.000254 GGGAG 0.000236 GGGAT 0.000318 GGGCA 0.000289 GGGCC 0.0002 GGGCG 0.000218 GGGCT 0.000237 GGGGA 0.000268 GGGGC 0.000241 GGGGG 0.000231 GGGGT 0.000296 GGGTA 0.00032 GGGTC 0.000215 GGGTG 0.000371 GGGTT 0.000513 GGTAA 0.000911 GGTAC 0.000389 GGTAG 0.000351 GGTAT 0.000576 GGTCA 0.000512 GGTCC 0.000208 GGTCG 0.000295 GGTCT 0.000313 GGTGA 0.000536 GGTGC 0.000344 GGTGG 0.000403 GGTGT 0.000642 GGTTA 0.00073 GGTTC 0.000376 GGTTG 0.000553 GGTTT 0.00136 GTAAA 0.0025 GTAAC 0.000828 GTAAG 0.000627 GTAAT 0.00183 GTACA 0.000898 GTACC 0.000389 GTACG 0.000323 GTACT 0.00064 GTAGA 0.000676 GTAGC 0.000374 GTAGG 0.000402 GTAGT 0.000675 GTATA 0.00103 GTATC 0.000474 GTATG 0.000523 GTATT 0.00178 GTCAA 0.00117 GTCAC 0.000635 GTCAG 0.000467 GTCAT 0.000825 GTCCA 0.000474 GTCCC 0.000254 GTCCG 0.000247 GTCCT 0.000335 GTCGA 0.000469 GTCGC 0.000342 GTCGG 0.000299 GTCGT 0.000475 GTCTA 0.000529 GTCTC 0.000373 GTCTG 0.000427 GTCTT 0.00083 GTGAA 0.00115 GTGAC 0.000635 GTGAG 0.000432 GTGAT 0.000983 GTGCA 0.000664 GTGCC 0.000358 GTGCG 0.000343 GTGCT 0.000521 GTGGA 0.000565 GTGGC 0.000419 GTGGG 0.000353 GTGGT 0.00061 GTGTA 0.00091 GTGTC 0.000574 GTGTG 0.000702 GTGTT 0.00149 GTTAA 0.00176 GTTAC 0.000828 GTTAG 0.000663 GTTAT 0.00173 GTTCA 0.000857 GTTCC 0.000492 GTTCG 0.000464 GTTCT 0.000753 GTTGA 0.000949 GTTGC 0.000708 GTTGG 0.0007 GTTGT 0.00129 GTTTA 0.00213 GTTTC 0.00131 GTTTG 0.00149 GTTTT 0.00421 TAAAA 0.00756 TAAAC 0.00213 TAAAG 0.00178 TAAAT 0.00508 TAACA 0.00201 TAACC 0.00073 TAACG 0.000719 TAACT 0.00152 TAAGA 0.00124 TAAGC 0.000663 TAAGG 0.000598 TAAGT 0.00148 TAATA 0.00362 TAATC 0.00132 TAATG 0.00157 TAATT 0.00549 TACAA 0.00229 TACAC 0.00091 TACAG 0.000924 TACAT 0.00149 TACCA 0.000803 TACCC 0.00032 TACCG 0.000345 TACCT 0.000759 TACGA 0.00075 TACGC 0.00034 TACGG 0.000333 TACGT 0.000808 TACTA 0.000966 TACTC 0.00056 TACTG 0.000724 TACTT 0.00164 TAGAA 0.00159 TAGAC 0.000529 TAGAG 0.000607 TAGAT 0.00102 TAGCA 0.000732 TAGCC 0.000309 TAGCG 0.000349 TAGCT 0.000594 TAGGA 0.000546 TAGGC 0.000306 TAGGG 0.000333 TAGGT 0.000743 TAGTA 0.000966 TAGTC 0.00055 TAGTG 0.000722 TAGTT 0.00169 TATAA 0.00287 TATAC 0.00103 TATAG 0.000809 TATAT 0.00196 TATCA 0.00139 TATCC 0.000477 TATCG 0.000648 TATCT 0.00122 TATGA 0.00112 TATGC 0.000587 TATGG 0.000585 TATGT 0.00139 TATTA 0.00362 TATTC 0.0014 TATTG 0.00191 TATTT 0.00659 TCAAA 0.00313 TCAAC 0.000949 TCAAG 0.000967 TCAAT 0.00175 TCACA 0.0012 TCACC 0.000536 TCACG 0.000469 TCACT 0.000999 TCAGA 0.000796 TCAGC 0.000492 TCAGG 0.000411 TCAGT 0.001 TCATA 0.00112 TCATC 0.000704 TCATG 0.000658 TCATT 0.00205 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000565 TCCAG 0.000481 TCCAT 0.000719 TCCCA 0.00049 TCCCC 0.000268 TCCCG 0.000259 TCCCT 0.000383 TCCGA 0.000454 TCCGC 0.000261 TCCGG 0.000312 TCCGT 0.000385 TCCTA 0.000546 TCCTC 0.000408 TCCTG 0.000447 TCCTT 0.000782 TCGAA 0.0011 TCGAC 0.000469 TCGAG 0.000486 TCGAT 0.000801 TCGCA 0.000568 TCGCC 0.000339 TCGCG 0.000307 TCGCT 0.00052 TCGGA 0.000454 TCGGC 0.000318 TCGGG 0.000279 TCGGT 0.000501 TCGTA 0.00075 TCGTC 0.000462 TCGTG 0.0005 TCGTT 0.00101 TCTAA 0.00146 TCTAC 0.000676 TCTAG 0.000611 TCTAT 0.001 TCTCA 0.000789 TCTCC 0.000423 TCTCG 0.000455 TCTCT 0.000779 TCTGA 0.000796 TCTGC 0.000479 TCTGG 0.000443 TCTGT 0.00102 TCTTA 0.00124 TCTTC 0.00082 TCTTG 0.000905 TCTTT 0.00199 TGAAA 0.00319 TGAAC 0.000857 TGAAG 0.000898 TGAAT 0.00183 TGACA 0.0012 TGACC 0.000512 TGACG 0.000557 TGACT 0.000835 TGAGA 0.000789 TGAGC 0.000465 TGAGG 0.000423 TGAGT 0.00083 TGATA 0.00139 TGATC 0.000615 TGATG 0.000811 TGATT 0.00205 TGCAA 0.00162 TGCAC 0.000664 TGCAG 0.000575 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.000704 TGCCC 0.000289 TGCCG 0.0003 TGCCT 0.000447 TGCGA 0.000568 TGCGC 0.000364 TGCGG 0.000293 TGCGT 0.000557 TGCTA 0.000732 TGCTC 0.000509 TGCTG 0.000537 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000474 TGGAG 0.000495 TGGAT 0.000668 TGGCA 0.000704 TGGCC 0.000356 TGGCG 0.000465 TGGCT 0.000492 TGGGA 0.00049 TGGGC 0.000298 TGGGG 0.000373 TGGGT 0.000493 TGGTA 0.000803 TGGTC 0.000494 TGGTG 0.000713 TGGTT 0.00111 TGTAA 0.00227 TGTAC 0.000898 TGTAG 0.000832 TGTAT 0.00161 TGTCA 0.0012 TGTCC 0.000468 TGTCG 0.000494 TGTCT 0.000839 TGTGA 0.0012 TGTGC 0.000676 TGTGG 0.000686 TGTGT 0.00138 TGTTA 0.00201 TGTTC 0.000976 TGTTG 0.00149 TGTTT 0.0036 TTAAA 0.00607 TTAAC 0.00176 TTAAG 0.00155 TTAAT 0.00462 TTACA 0.00227 TTACC 0.000911 TTACG 0.000978 TTACT 0.00163 TTAGA 0.00146 TTAGC 0.000791 TTAGG 0.000778 TTAGT 0.00155 TTATA 0.00287 TTATC 0.00177 TTATG 0.00171 TTATT 0.0068 TTCAA 0.00273 TTCAC 0.00115 TTCAG 0.00107 TTCAT 0.00182 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.000593 TTCCG 0.000597 TTCCT 0.000965 TTCGA 0.0011 TTCGC 0.000627 TTCGG 0.0006 TTCGT 0.00107 TTCTA 0.00159 TTCTC 0.000987 TTCTG 0.00117 TTCTT 0.00211 TTGAA 0.00273 TTGAC 0.00117 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00162 TTGCC 0.000746 TTGCG 0.000709 TTGCT 0.00119 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.000824 TTGGG 0.000682 TTGGT 0.00133 TTGTA 0.00229 TTGTC 0.00117 TTGTG 0.00168 TTGTT 0.00345 TTTAA 0.00607 TTTAC 0.0025 TTTAG 0.00198 TTTAT 0.00601 TTTCA 0.00319 TTTCC 0.00156 TTTCG 0.0016 TTTCT 0.00288 TTTGA 0.00313 TTTGC 0.00188 TTTGG 0.00178 TTTGT 0.0038 TTTTA 0.00756 TTTTC 0.00421 TTTTG 0.00504 TTTTT 0.0137 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4485 AAAAC 0.1382 AAAAG 0.09649 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3938 AAACC 0.1492 AAACG 0.1621 AAACT 0.2948 AAAGA 0.2881 AAAGC 0.178 AAAGG 0.1394 AAAGT 0.3945 AAATA 0.3243 AAATC 0.1262 AAATG 0.1565 AAATT 0.3929 AACAA 0.4268 AACAC 0.1845 AACAG 0.1466 AACAT 0.242 AACCA 0.3665 AACCC 0.1698 AACCG 0.2059 AACCT 0.2578 AACGA 0.3168 AACGC 0.1973 AACGG 0.1578 AACGT 0.3282 AACTA 0.2804 AACTC 0.1467 AACTG 0.2067 AACTT 0.3662 AAGAA 0.4259 AAGAC 0.1678 AAGAG 0.1565 AAGAT 0.2498 AAGCA 0.3507 AAGCC 0.1693 AAGCG 0.2013 AAGCT 0.2787 AAGGA 0.3077 AAGGC 0.1959 AAGGG 0.1787 AAGGT 0.3177 AAGTA 0.2679 AAGTC 0.1508 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3617 AATAA 0.5034 AATAC 0.1314 AATAG 0.1074 AATAT 0.2578 AATCA 0.386 AATCC 0.1471 AATCG 0.2047 AATCT 0.2621 AATGA 0.3163 AATGC 0.1722 AATGG 0.1586 AATGT 0.3529 AATTA 0.2977 AATTC 0.122 AATTG 0.1473 AATTT 0.4331 ACAAA 0.4428 ACAAC 0.1499 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2889 ACACA 0.3756 ACACC 0.1744 ACACG 0.1611 ACACT 0.2889 ACAGA 0.3179 ACAGC 0.1794 ACAGG 0.1591 ACAGT 0.3436 ACATA 0.2695 ACATC 0.1397 ACATG 0.1475 ACATT 0.4433 ACCAA 0.4276 ACCAC 0.1959 ACCAG 0.1419 ACCAT 0.2345 ACCCA 0.3476 ACCCC 0.2088 ACCCG 0.1605 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3282 ACCGC 0.1944 ACCGG 0.2013 ACCGT 0.2762 ACCTA 0.3046 ACCTC 0.175 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.331 ACGAA 0.391 ACGAC 0.1743 ACGAG 0.1727 ACGAT 0.262 ACGCA 0.3582 ACGCC 0.1976 ACGCG 0.1622 ACGCT 0.2819 ACGGA 0.2983 ACGGC 0.214 ACGGG 0.1611 ACGGT 0.3266 ACGTA 0.2688 ACGTC 0.1768 ACGTG 0.2055 ACGTT 0.3489 ACTAA 0.3936 ACTAC 0.1716 ACTAG 0.1466 ACTAT 0.2882 ACTCA 0.3623 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.2132 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3216 ACTGC 0.1675 ACTGG 0.1597 ACTGT 0.3513 ACTTA 0.2425 ACTTC 0.1328 ACTTG 0.1793 ACTTT 0.4454 AGAAA 0.4915 AGAAC 0.1287 AGAAG 0.127 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3884 AGACC 0.1447 AGACG 0.1953 AGACT 0.2716 AGAGA 0.3551 AGAGC 0.19 AGAGG 0.1727 AGAGT 0.2822 AGATA 0.3335 AGATC 0.1175 AGATG 0.169 AGATT 0.38 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.1656 AGCAT 0.2189 AGCCA 0.3693 AGCCC 0.1781 AGCCG 0.2117 AGCCT 0.2409 AGCGA 0.3354 AGCGC 0.2072 AGCGG 0.1745 AGCGT 0.2829 AGCTA 0.2617 AGCTC 0.1728 AGCTG 0.2121 AGCTT 0.3535 AGGAA 0.4425 AGGAC 0.1534 AGGAG 0.1611 AGGAT 0.2429 AGGCA 0.3547 AGGCC 0.1833 AGGCG 0.2075 AGGCT 0.2544 AGGGA 0.2947 AGGGC 0.2002 AGGGG 0.196 AGGGT 0.309 AGGTA 0.3111 AGGTC 0.1534 AGGTG 0.2164 AGGTT 0.3192 AGTAA 0.4183 AGTAC 0.1645 AGTAG 0.1586 AGTAT 0.2586 AGTCA 0.3641 AGTCC 0.1583 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.2558 AGTGA 0.3086 AGTGC 0.1809 AGTGG 0.1821 AGTGT 0.3284 AGTTA 0.2526 AGTTC 0.1267 AGTTG 0.1745 AGTTT 0.4462 ATAAA 0.4564 ATAAC 0.1314 ATAAG 0.1002 ATAAT 0.312 ATACA 0.4242 ATACC 0.1517 ATACG 0.1593 ATACT 0.2648 ATAGA 0.3146 ATAGC 0.1709 ATAGG 0.1579 ATAGT 0.3565 ATATA 0.2623 ATATC 0.1381 ATATG 0.1328 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3824 ATCAC 0.2021 ATCAG 0.1644 ATCAT 0.2511 ATCCA 0.3594 ATCCC 0.1715 ATCCG 0.1837 ATCCT 0.2854 ATCGA 0.3305 ATCGC 0.2045 ATCGG 0.1702 ATCGT 0.2948 ATCTA 0.2781 ATCTC 0.1833 ATCTG 0.2013 ATCTT 0.3374 ATGAA 0.4019 ATGAC 0.1818 ATGAG 0.1474 ATGAT 0.2689 ATGCA 0.4137 ATGCC 0.1533 ATGCG 0.184 ATGCT 0.2489 ATGGA 0.3086 ATGGC 0.2158 ATGGG 0.1619 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.2883 ATGTC 0.1442 ATGTG 0.1895 ATGTT 0.378 ATTAA 0.385 ATTAC 0.1522 ATTAG 0.1204 ATTAT 0.3424 ATTCA 0.3581 ATTCC 0.177 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2904 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1568 ATTGT 0.3904 ATTTA 0.2498 ATTTC 0.1319 ATTTG 0.1434 ATTTT 0.4749 CAAAA 0.4757 CAAAC 0.1408 CAAAG 0.1083 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4101 CAACC 0.1518 CAACG 0.1491 CAACT 0.2891 CAAGA 0.2975 CAAGC 0.1656 CAAGG 0.1765 CAAGT 0.3604 CAATA 0.3003 CAATC 0.1237 CAATG 0.1484 CAATT 0.4276 CACAA 0.4263 CACAC 0.1781 CACAG 0.1469 CACAT 0.2486 CACCA 0.3702 CACCC 0.1927 CACCG 0.1632 CACCT 0.2739 CACGA 0.3108 CACGC 0.1739 CACGG 0.1319 CACGT 0.3834 CACTA 0.2231 CACTC 0.1616 CACTG 0.2005 CACTT 0.4147 CAGAA 0.4287 CAGAC 0.1564 CAGAG 0.145 CAGAT 0.2699 CAGCA 0.3247 CAGCC 0.1824 CAGCG 0.2016 CAGCT 0.2913 CAGGA 0.3212 CAGGC 0.1595 CAGGG 0.1877 CAGGT 0.3316 CAGTA 0.2319 CAGTC 0.16 CAGTG 0.208 CAGTT 0.4 CATAA 0.4643 CATAC 0.1419 CATAG 0.1252 CATAT 0.2686 CATCA 0.3753 CATCC 0.1619 CATCG 0.1761 CATCT 0.2867 CATGA 0.3072 CATGC 0.1772 CATGG 0.1594 CATGT 0.3562 CATTA 0.2414 CATTC 0.1235 CATTG 0.1451 CATTT 0.49 CCAAA 0.4463 CCAAC 0.1754 CCAAG 0.1285 CCAAT 0.2497 CCACA 0.3522 CCACC 0.2073 CCACG 0.1375 CCACT 0.303 CCAGA 0.3099 CCAGC 0.1856 CCAGG 0.1558 CCAGT 0.3487 CCATA 0.2513 CCATC 0.1599 CCATG 0.1465 CCATT 0.4422 CCCAA 0.4128 CCCAC 0.2135 CCCAG 0.1452 CCCAT 0.2285 CCCCA 0.3604 CCCCC 0.2228 CCCCG 0.1707 CCCCT 0.246 CCCGA 0.3455 CCCGC 0.1879 CCCGG 0.2094 CCCGT 0.2572 CCCTA 0.2569 CCCTC 0.1918 CCCTG 0.2014 CCCTT 0.3499 CCGAA 0.3868 CCGAC 0.1927 CCGAG 0.155 CCGAT 0.2655 CCGCA 0.3075 CCGCC 0.2518 CCGCG 0.1571 CCGCT 0.2836 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.1981 CCGGG 0.1721 CCGGT 0.3125 CCGTA 0.2586 CCGTC 0.1858 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3909 CCTAA 0.4036 CCTAC 0.2086 CCTAG 0.1275 CCTAT 0.2602 CCTCA 0.3206 CCTCC 0.2009 CCTCG 0.1909 CCTCT 0.2876 CCTGA 0.295 CCTGC 0.1801 CCTGG 0.16 CCTGT 0.3649 CCTTA 0.2355 CCTTC 0.1743 CCTTG 0.2113 CCTTT 0.3788 CGAAA 0.4714 CGAAC 0.1369 CGAAG 0.1294 CGAAT 0.2622 CGACA 0.3117 CGACC 0.1862 CGACG 0.1811 CGACT 0.3209 CGAGA 0.3102 CGAGC 0.1859 CGAGG 0.1714 CGAGT 0.3325 CGATA 0.2675 CGATC 0.1258 CGATG 0.1572 CGATT 0.4495 CGCAA 0.3978 CGCAC 0.1925 CGCAG 0.1569 CGCAT 0.2528 CGCCA 0.3924 CGCCC 0.1835 CGCCG 0.2035 CGCCT 0.2206 CGCGA 0.3313 CGCGC 0.234 CGCGG 0.162 CGCGT 0.2727 CGCTA 0.2252 CGCTC 0.1865 CGCTG 0.2148 CGCTT 0.3735 CGGAA 0.4227 CGGAC 0.1748 CGGAG 0.1608 CGGAT 0.2416 CGGCA 0.2904 CGGCC 0.2027 CGGCG 0.2338 CGGCT 0.2731 CGGGA 0.3207 CGGGC 0.1791 CGGGG 0.2186 CGGGT 0.2816 CGGTA 0.2266 CGGTC 0.1596 CGGTG 0.2062 CGGTT 0.4076 CGTAA 0.4381 CGTAC 0.1446 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2711 CGTCA 0.3623 CGTCC 0.177 CGTCG 0.1866 CGTCT 0.2741 CGTGA 0.2916 CGTGC 0.1735 CGTGG 0.1663 CGTGT 0.3685 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.1408 CGTTG 0.1701 CGTTT 0.4638 CTAAA 0.4321 CTAAC 0.145 CTAAG 0.107 CTAAT 0.3159 CTACA 0.3915 CTACC 0.1649 CTACG 0.1535 CTACT 0.2901 CTAGA 0.3575 CTAGC 0.1611 CTAGG 0.144 CTAGT 0.3374 CTATA 0.2547 CTATC 0.1434 CTATG 0.1453 CTATT 0.4566 CTCAA 0.4117 CTCAC 0.1723 CTCAG 0.149 CTCAT 0.267 CTCCA 0.3782 CTCCC 0.1801 CTCCG 0.1734 CTCCT 0.2684 CTCGA 0.3313 CTCGC 0.184 CTCGG 0.1639 CTCGT 0.3208 CTCTA 0.2768 CTCTC 0.1895 CTCTG 0.1805 CTCTT 0.3532 CTGAA 0.394 CTGAC 0.1726 CTGAG 0.138 CTGAT 0.2954 CTGCA 0.3653 CTGCC 0.1643 CTGCG 0.1776 CTGCT 0.2927 CTGGA 0.3366 CTGGC 0.1861 CTGGG 0.1678 CTGGT 0.3095 CTGTA 0.2894 CTGTC 0.1583 CTGTG 0.1814 CTGTT 0.3709 CTTAA 0.3882 CTTAC 0.1576 CTTAG 0.1228 CTTAT 0.3314 CTTCA 0.351 CTTCC 0.1869 CTTCG 0.1715 CTTCT 0.2906 CTTGA 0.3179 CTTGC 0.1791 CTTGG 0.1686 CTTGT 0.3344 CTTTA 0.2585 CTTTC 0.1496 CTTTG 0.1663 CTTTT 0.4256 GAAAA 0.4558 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1119 GAAAT 0.2904 GAACA 0.3804 GAACC 0.1464 GAACG 0.1752 GAACT 0.2979 GAAGA 0.3204 GAAGC 0.1891 GAAGG 0.1731 GAAGT 0.3174 GAATA 0.2741 GAATC 0.1273 GAATG 0.1573 GAATT 0.4412 GACAA 0.3915 GACAC 0.1915 GACAG 0.1685 GACAT 0.2486 GACCA 0.3724 GACCC 0.162 GACCG 0.1835 GACCT 0.2822 GACGA 0.3002 GACGC 0.1989 GACGG 0.1557 GACGT 0.3452 GACTA 0.2401 GACTC 0.14 GACTG 0.2178 GACTT 0.4021 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1523 GAGAG 0.1699 GAGAT 0.2744 GAGCA 0.357 GAGCC 0.1648 GAGCG 0.203 GAGCT 0.2752 GAGGA 0.3094 GAGGC 0.1784 GAGGG 0.1887 GAGGT 0.3236 GAGTA 0.2447 GAGTC 0.1401 GAGTG 0.2284 GAGTT 0.3867 GATAA 0.4748 GATAC 0.127 GATAG 0.1221 GATAT 0.2762 GATCA 0.3845 GATCC 0.1559 GATCG 0.1904 GATCT 0.2692 GATGA 0.3258 GATGC 0.1678 GATGG 0.1723 GATGT 0.3341 GATTA 0.2478 GATTC 0.122 GATTG 0.1478 GATTT 0.4824 GCAAA 0.4415 GCAAC 0.1661 GCAAG 0.1278 GCAAT 0.2647 GCACA 0.3587 GCACC 0.1825 GCACG 0.1481 GCACT 0.3107 GCAGA 0.3043 GCAGC 0.2042 GCAGG 0.1593 GCAGT 0.3322 GCATA 0.24 GCATC 0.1482 GCATG 0.155 GCATT 0.4568 GCCAA 0.4096 GCCAC 0.2083 GCCAG 0.1321 GCCAT 0.2499 GCCCA 0.3159 GCCCC 0.2556 GCCCG 0.1532 GCCCT 0.2753 GCCGA 0.3075 GCCGC 0.2372 GCCGG 0.1883 GCCGT 0.267 GCCTA 0.2428 GCCTC 0.1866 GCCTG 0.176 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3614 GCGAC 0.1971 GCGAG 0.1557 GCGAT 0.2857 GCGCA 0.303 GCGCC 0.2493 GCGCG 0.1803 GCGCT 0.2674 GCGGA 0.2735 GCGGC 0.2569 GCGGG 0.159 GCGGT 0.3106 GCGTA 0.2182 GCGTC 0.1967 GCGTG 0.18 GCGTT 0.405 GCTAA 0.3989 GCTAC 0.1885 GCTAG 0.1387 GCTAT 0.2739 GCTCA 0.3263 GCTCC 0.1895 GCTCG 0.1915 GCTCT 0.2927 GCTGA 0.298 GCTGC 0.1946 GCTGG 0.1606 GCTGT 0.3468 GCTTA 0.2303 GCTTC 0.168 GCTTG 0.175 GCTTT 0.4268 GGAAA 0.455 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1392 GGAAT 0.2626 GGACA 0.357 GGACC 0.1584 GGACG 0.2077 GGACT 0.2769 GGAGA 0.3229 GGAGC 0.206 GGAGG 0.202 GGAGT 0.2692 GGATA 0.2568 GGATC 0.1342 GGATG 0.1883 GGATT 0.4208 GGCAA 0.4291 GGCAC 0.2061 GGCAG 0.1489 GGCAT 0.2159 GGCCA 0.3573 GGCCC 0.2007 GGCCG 0.21 GGCCT 0.232 GGCGA 0.286 GGCGC 0.2524 GGCGG 0.2025 GGCGT 0.2591 GGCTA 0.232 GGCTC 0.1761 GGCTG 0.2261 GGCTT 0.3657 GGGAA 0.4231 GGGAC 0.1814 GGGAG 0.1683 GGGAT 0.2273 GGGCA 0.306 GGGCC 0.212 GGGCG 0.2307 GGGCT 0.2513 GGGGA 0.2587 GGGGC 0.233 GGGGG 0.2225 GGGGT 0.2857 GGGTA 0.2255 GGGTC 0.1514 GGGTG 0.2616 GGGTT 0.3615 GGTAA 0.409 GGTAC 0.1749 GGTAG 0.1575 GGTAT 0.2587 GGTCA 0.3858 GGTCC 0.1564 GGTCG 0.2223 GGTCT 0.2355 GGTGA 0.2786 GGTGC 0.1787 GGTGG 0.2095 GGTGT 0.3332 GGTTA 0.2416 GGTTC 0.1243 GGTTG 0.183 GGTTT 0.451 GTAAA 0.4328 GTAAC 0.1432 GTAAG 0.1085 GTAAT 0.3156 GTACA 0.3991 GTACC 0.1731 GTACG 0.1434 GTACT 0.2844 GTAGA 0.3178 GTAGC 0.1758 GTAGG 0.1892 GTAGT 0.3173 GTATA 0.2699 GTATC 0.1248 GTATG 0.1378 GTATT 0.4676 GTCAA 0.3786 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1506 GTCAT 0.2661 GTCCA 0.3619 GTCCC 0.194 GTCCG 0.1885 GTCCT 0.2556 GTCGA 0.2958 GTCGC 0.2157 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.2997 GTCTA 0.245 GTCTC 0.1726 GTCTG 0.1979 GTCTT 0.3845 GTGAA 0.36 GTGAC 0.1982 GTGAG 0.1349 GTGAT 0.3069 GTGCA 0.3521 GTGCC 0.19 GTGCG 0.1819 GTGCT 0.2761 GTGGA 0.2901 GTGGC 0.2152 GTGGG 0.1811 GTGGT 0.3135 GTGTA 0.2476 GTGTC 0.1562 GTGTG 0.191 GTGTT 0.4052 GTTAA 0.354 GTTAC 0.1662 GTTAG 0.133 GTTAT 0.3469 GTTCA 0.334 GTTCC 0.1916 GTTCG 0.1809 GTTCT 0.2935 GTTGA 0.2604 GTTGC 0.1943 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2327 GTTTC 0.1435 GTTTG 0.1633 GTTTT 0.4605 TAAAA 0.457 TAAAC 0.1285 TAAAG 0.1079 TAAAT 0.3067 TAACA 0.403 TAACC 0.1466 TAACG 0.1444 TAACT 0.306 TAAGA 0.311 TAAGC 0.1665 TAAGG 0.1502 TAAGT 0.3723 TAATA 0.3018 TAATC 0.1099 TAATG 0.1307 TAATT 0.4577 TACAA 0.4076 TACAC 0.1622 TACAG 0.1646 TACAT 0.2656 TACCA 0.3605 TACCC 0.1437 TACCG 0.1552 TACCT 0.3407 TACGA 0.3364 TACGC 0.1522 TACGG 0.1495 TACGT 0.362 TACTA 0.2485 TACTC 0.1442 TACTG 0.1862 TACTT 0.4212 TAGAA 0.4245 TAGAC 0.1413 TAGAG 0.1622 TAGAT 0.2721 TAGCA 0.3689 TAGCC 0.1558 TAGCG 0.176 TAGCT 0.2993 TAGGA 0.2831 TAGGC 0.1588 TAGGG 0.1729 TAGGT 0.3852 TAGTA 0.2457 TAGTC 0.14 TAGTG 0.1837 TAGTT 0.4306 TATAA 0.4306 TATAC 0.1539 TATAG 0.1215 TATAT 0.2939 TATCA 0.3714 TATCC 0.1278 TATCG 0.1734 TATCT 0.3273 TATGA 0.3044 TATGC 0.1592 TATGG 0.1586 TATGT 0.3777 TATTA 0.2678 TATTC 0.1034 TATTG 0.1411 TATTT 0.4877 TCAAA 0.461 TCAAC 0.1396 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2572 TCACA 0.3739 TCACC 0.1675 TCACG 0.1466 TCACT 0.312 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.182 TCAGG 0.1519 TCAGT 0.3714 TCATA 0.2474 TCATC 0.1552 TCATG 0.1449 TCATT 0.4525 TCCAA 0.3949 TCCAC 0.1937 TCCAG 0.1649 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.3499 TCCCC 0.1915 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.2734 TCCGA 0.3216 TCCGC 0.1849 TCCGG 0.2209 TCCGT 0.2726 TCCTA 0.2501 TCCTC 0.187 TCCTG 0.2049 TCCTT 0.3581 TCGAA 0.3852 TCGAC 0.1641 TCGAG 0.1702 TCGAT 0.2804 TCGCA 0.3276 TCGCC 0.1957 TCGCG 0.1768 TCGCT 0.2999 TCGGA 0.2926 TCGGC 0.2049 TCGGG 0.1799 TCGGT 0.3226 TCGTA 0.2754 TCGTC 0.1695 TCGTG 0.1837 TCGTT 0.3714 TCTAA 0.3892 TCTAC 0.1805 TCTAG 0.1631 TCTAT 0.2671 TCTCA 0.3224 TCTCC 0.173 TCTCG 0.1861 TCTCT 0.3185 TCTGA 0.2913 TCTGC 0.1752 TCTGG 0.1621 TCTGT 0.3714 TCTTA 0.2501 TCTTC 0.1655 TCTTG 0.1827 TCTTT 0.4016 TGAAA 0.4713 TGAAC 0.1265 TGAAG 0.1326 TGAAT 0.2695 TGACA 0.3863 TGACC 0.165 TGACG 0.1796 TGACT 0.2691 TGAGA 0.3148 TGAGC 0.1855 TGAGG 0.1686 TGAGT 0.3311 TGATA 0.2851 TGATC 0.1264 TGATG 0.1667 TGATT 0.4218 TGCAA 0.418 TGCAC 0.1716 TGCAG 0.1486 TGCAT 0.2618 TGCCA 0.4045 TGCCC 0.166 TGCCG 0.1724 TGCCT 0.2571 TGCGA 0.3186 TGCGC 0.2042 TGCGG 0.1646 TGCGT 0.3126 TGCTA 0.2627 TGCTC 0.1825 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3622 TGGAA 0.4387 TGGAC 0.1626 TGGAG 0.1699 TGGAT 0.2289 TGGCA 0.3489 TGGCC 0.1765 TGGCG 0.2308 TGGCT 0.2438 TGGGA 0.2962 TGGGC 0.1804 TGGGG 0.2255 TGGGT 0.2979 TGGTA 0.2576 TGGTC 0.1585 TGGTG 0.2288 TGGTT 0.3551 TGTAA 0.4045 TGTAC 0.16 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2872 TGTCA 0.3996 TGTCC 0.156 TGTCG 0.1647 TGTCT 0.2797 TGTGA 0.3038 TGTGC 0.1716 TGTGG 0.1739 TGTGT 0.3507 TGTTA 0.2486 TGTTC 0.1209 TGTTG 0.185 TGTTT 0.4455 TTAAA 0.4335 TTAAC 0.1261 TTAAG 0.1105 TTAAT 0.33 TTACA 0.3924 TTACC 0.1574 TTACG 0.169 TTACT 0.2812 TTAGA 0.3185 TTAGC 0.173 TTAGG 0.1702 TTAGT 0.3383 TTATA 0.218 TTATC 0.1347 TTATG 0.1302 TTATT 0.5171 TTCAA 0.4034 TTCAC 0.1701 TTCAG 0.1573 TTCAT 0.2693 TTCCA 0.3725 TTCCC 0.1726 TTCCG 0.1738 TTCCT 0.2811 TTCGA 0.3242 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.177 TTCGT 0.314 TTCTA 0.2714 TTCTC 0.1685 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.36 TTGAA 0.4021 TTGAC 0.1727 TTGAG 0.1518 TTGAT 0.2735 TTGCA 0.3792 TTGCC 0.1749 TTGCG 0.1662 TTGCT 0.2797 TTGGA 0.2887 TTGGC 0.2065 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3339 TTGTA 0.2663 TTGTC 0.1367 TTGTG 0.1957 TTGTT 0.4013 TTTAA 0.3665 TTTAC 0.1513 TTTAG 0.1194 TTTAT 0.3629 TTTCA 0.3458 TTTCC 0.1693 TTTCG 0.1732 TTTCT 0.3117 TTTGA 0.2956 TTTGC 0.1776 TTTGG 0.168 TTTGT 0.3588 TTTTA 0.2482 TTTTC 0.1381 TTTTG 0.1654 TTTTT 0.4482 [2] # (a,c,g,t)= (0.315, 0.185, 0.185, 0.315) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.342 C 0.158 G 0.158 T 0.342 # l= 1 # Values AA 0.146 AC 0.0535 AG 0.0445 AT 0.0978 CA 0.0581 CC 0.0272 CG 0.0286 CT 0.0445 GA 0.0482 GC 0.0295 GG 0.0272 GT 0.0535 TA 0.0895 TC 0.0482 TG 0.0581 TT 0.146 # l= 2 # Values AAA 0.0658 AAC 0.0203 AAG 0.0164 AAT 0.0433 ACA 0.0206 ACC 0.00863 ACG 0.0088 ACT 0.0154 AGA 0.0137 AGC 0.00805 AGG 0.00729 AGT 0.0154 ATA 0.0272 ATC 0.0129 ATG 0.0145 ATT 0.0433 CAA 0.0237 CAC 0.0109 CAG 0.00897 CAT 0.0145 CCA 0.00987 CCC 0.00502 CCG 0.005 CCT 0.00729 CGA 0.0091 CGC 0.00569 CGG 0.005 CGT 0.0088 CTA 0.0115 CTC 0.0076 CTG 0.00897 CTT 0.0164 GAA 0.0194 GAC 0.00831 GAG 0.0076 GAT 0.0129 GCA 0.0103 GCC 0.00548 GCG 0.00569 GCT 0.00804 GGA 0.00805 GGC 0.00547 GGG 0.00501 GGT 0.00863 GTA 0.0139 GTC 0.00831 GTG 0.0109 GTT 0.0203 TAA 0.037 TAC 0.0139 TAG 0.0115 TAT 0.0272 TCA 0.0173 TCC 0.00806 TCG 0.0091 TCT 0.0137 TGA 0.0173 TGC 0.0103 TGG 0.00986 TGT 0.0206 TTA 0.037 TTC 0.0194 TTG 0.0237 TTT 0.0658 # l= 3 # Values AAAA 0.0298 AAAC 0.00911 AAAG 0.00685 AAAT 0.02 AACA 0.00804 AACC 0.00306 AACG 0.00325 AACT 0.00598 AAGA 0.00488 AAGC 0.0029 AAGG 0.00258 AAGT 0.00607 AATA 0.0133 AATC 0.00533 AATG 0.00647 AATT 0.0182 ACAA 0.00857 ACAC 0.00373 ACAG 0.0032 ACAT 0.00514 ACCA 0.00314 ACCC 0.00146 ACCG 0.00158 ACCT 0.00245 ACGA 0.00279 ACGC 0.00161 ACGG 0.00134 ACGT 0.00306 ACTA 0.00388 ACTC 0.00232 ACTG 0.00314 ACTT 0.00607 AGAA 0.00576 AGAC 0.00217 AGAG 0.00219 AGAT 0.00362 AGCA 0.00279 AGCC 0.00138 AGCG 0.0016 AGCT 0.00228 AGGA 0.00221 AGGC 0.00129 AGGG 0.00133 AGGT 0.00245 AGTA 0.00383 AGTC 0.00232 AGTG 0.00328 AGTT 0.00598 ATAA 0.013 ATAC 0.00375 ATAG 0.00314 ATAT 0.00731 ATCA 0.00488 ATCC 0.00188 ATCG 0.00248 ATCT 0.00362 ATGA 0.00454 ATGC 0.00247 ATGG 0.00235 ATGT 0.00513 ATTA 0.0118 ATTC 0.00509 ATTG 0.00639 ATTT 0.02 CAAA 0.0106 CAAC 0.00368 CAAG 0.00308 CAAT 0.00639 CACA 0.00399 CACC 0.00198 CACG 0.00168 CACT 0.00328 CAGA 0.00271 CAGC 0.00169 CAGG 0.00142 CAGT 0.00315 CATA 0.00365 CATC 0.00218 CATG 0.00218 CATT 0.00648 CCAA 0.00404 CCAC 0.002 CCAG 0.00147 CCAT 0.00235 CCCA 0.00171 CCCC 0.00111 CCCG 0.000859 CCCT 0.00134 CCGA 0.00161 CCGC 0.00101 CCGG 0.00103 CCGT 0.00134 CCTA 0.00193 CCTC 0.00136 CCTG 0.00142 CCTT 0.00258 CGAA 0.00346 CGAC 0.00165 CGAG 0.00152 CGAT 0.00248 CGCA 0.00185 CGCC 0.00126 CGCG 0.000989 CGCT 0.0016 CGGA 0.00146 CGGC 0.0011 CGGG 0.000859 CGGT 0.00158 CGTA 0.00226 CGTC 0.0016 CGTG 0.00168 CGTT 0.00325 CTAA 0.00451 CTAC 0.00212 CTAG 0.00171 CTAT 0.00314 CTCA 0.00253 CTCC 0.00135 CTCG 0.00152 CTCT 0.00219 CTGA 0.00271 CTGC 0.0016 CTGG 0.00147 CTGT 0.0032 CTTA 0.00395 CTTC 0.00256 CTTG 0.00308 CTTT 0.00685 GAAA 0.00919 GAAC 0.00258 GAAG 0.00256 GAAT 0.00509 GACA 0.00303 GACC 0.00136 GACG 0.0016 GACT 0.00232 GAGA 0.00246 GAGC 0.00146 GAGG 0.00136 GAGT 0.00232 GATA 0.00373 GATC 0.00162 GATG 0.00218 GATT 0.00533 GCAA 0.00432 GCAC 0.00193 GCAG 0.0016 GCAT 0.00247 GCCA 0.00208 GCCC 0.00101 GCCG 0.0011 GCCT 0.00129 GCGA 0.0018 GCGC 0.00127 GCGG 0.00101 GCGT 0.00161 GCTA 0.00199 GCTC 0.00146 GCTG 0.00169 GCTT 0.0029 GGAA 0.00348 GGAC 0.00134 GGAG 0.00135 GGAT 0.00188 GGCA 0.00179 GGCC 0.00106 GGCG 0.00126 GGCT 0.00138 GGGA 0.00145 GGGC 0.00101 GGGG 0.0011 GGGT 0.00146 GGTA 0.00223 GGTC 0.00136 GGTG 0.00198 GGTT 0.00306 GTAA 0.00577 GTAC 0.00226 GTAG 0.00212 GTAT 0.00375 GTCA 0.00315 GTCC 0.00135 GTCG 0.00165 GTCT 0.00217 GTGA 0.00325 GTGC 0.00193 GTGG 0.002 GTGT 0.00374 GTTA 0.00496 GTTC 0.00258 GTTG 0.00369 GTTT 0.00911 TAAA 0.0163 TAAC 0.00496 TAAG 0.00395 TAAT 0.0118 TACA 0.00557 TACC 0.00223 TACG 0.00227 TACT 0.00383 TAGA 0.00369 TAGC 0.00199 TAGG 0.00193 TAGT 0.00388 TATA 0.00651 TATC 0.00373 TATG 0.00365 TATT 0.0133 TCAA 0.00678 TCAC 0.00325 TCAG 0.00271 TCAT 0.00454 TCCA 0.00294 TCCC 0.00145 TCCG 0.00146 TCCT 0.00221 TCGA 0.00291 TCGC 0.0018 TCGG 0.00161 TCGT 0.00279 TCTA 0.00369 TCTC 0.00246 TCTG 0.00271 TCTT 0.00488 TGAA 0.00672 TGAC 0.00315 TGAG 0.00253 TGAT 0.00488 TGCA 0.0039 TGCC 0.00179 TGCG 0.00184 TGCT 0.00279 TGGA 0.00294 TGGC 0.00208 TGGG 0.00171 TGGT 0.00314 TGTA 0.00557 TGTC 0.00303 TGTG 0.00399 TGTT 0.00804 TTAA 0.0137 TTAC 0.00577 TTAG 0.00451 TTAT 0.013 TTCA 0.00672 TTCC 0.00348 TTCG 0.00346 TTCT 0.00576 TTGA 0.00678 TTGC 0.00431 TTGG 0.00404 TTGT 0.00857 TTTA 0.0163 TTTC 0.00919 TTTG 0.0105 TTTT 0.0298 # l= 4 # Values AAAAA 0.0133 AAAAC 0.00417 AAAAG 0.0029 AAAAT 0.00943 AAACA 0.00358 AAACC 0.00137 AAACG 0.0015 AAACT 0.00266 AAAGA 0.00195 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000975 AAAGT 0.00269 AAATA 0.00646 AAATC 0.00256 AAATG 0.00315 AAATT 0.00784 AACAA 0.00343 AACAC 0.0015 AACAG 0.00118 AACAT 0.00193 AACCA 0.00111 AACCC 0.000529 AACCG 0.000639 AACCT 0.00078 AACGA 0.00103 AACGC 0.000645 AACGG 0.00052 AACGT 0.00106 AACTA 0.00166 AACTC 0.000887 AACTG 0.00125 AACTT 0.00218 AAGAA 0.00206 AAGAC 0.000831 AAGAG 0.000772 AAGAT 0.00121 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000499 AAGCG 0.000596 AAGCT 0.000799 AAGGA 0.000788 AAGGC 0.000509 AAGGG 0.000473 AAGGT 0.00081 AAGTA 0.00161 AAGTC 0.000926 AAGTG 0.00136 AAGTT 0.00218 AATAA 0.00668 AATAC 0.00176 AATAG 0.00144 AATAT 0.0034 AATCA 0.00206 AATCC 0.000791 AATCG 0.00111 AATCT 0.00138 AATGA 0.00205 AATGC 0.00112 AATGG 0.00103 AATGT 0.00227 AATTA 0.00541 AATTC 0.00224 AATTG 0.00273 AATTT 0.00784 ACAAA 0.00377 ACAAC 0.0013 ACAAG 0.00103 ACAAT 0.00247 ACACA 0.0014 ACACC 0.000656 ACACG 0.000611 ACACT 0.00107 ACAGA 0.001 ACAGC 0.000582 ACAGG 0.00051 ACAGT 0.0011 ACATA 0.00138 ACATC 0.00072 ACATG 0.000772 ACATT 0.00227 ACCAA 0.00134 ACCAC 0.000622 ACCAG 0.000451 ACCAT 0.000726 ACCCA 0.000504 ACCCC 0.000311 ACCCG 0.000239 ACCCT 0.000402 ACCGA 0.000513 ACCGC 0.000312 ACCGG 0.00032 ACCGT 0.000436 ACCTA 0.000735 ACCTC 0.000436 ACCTG 0.000472 ACCTT 0.00081 ACGAA 0.00109 ACGAC 0.000489 ACGAG 0.000485 ACGAT 0.000726 ACGCA 0.000575 ACGCC 0.000322 ACGCG 0.000268 ACGCT 0.00045 ACGGA 0.000396 ACGGC 0.00029 ACGGG 0.000219 ACGGT 0.000436 ACGTA 0.000815 ACGTC 0.000547 ACGTG 0.00064 ACGTT 0.00106 ACTAA 0.00152 ACTAC 0.00067 ACTAG 0.000575 ACTAT 0.00112 ACTCA 0.000834 ACTCC 0.000361 ACTCG 0.000507 ACTCT 0.000614 ACTGA 0.001 ACTGC 0.000529 ACTGG 0.000511 ACTGT 0.0011 ACTTA 0.00147 ACTTC 0.000806 ACTTG 0.00111 ACTTT 0.00269 AGAAA 0.00283 AGAAC 0.000746 AGAAG 0.000736 AGAAT 0.00145 AGACA 0.000837 AGACC 0.000315 AGACG 0.000435 AGACT 0.000585 AGAGA 0.000772 AGAGC 0.000421 AGAGG 0.000388 AGAGT 0.000614 AGATA 0.0012 AGATC 0.000428 AGATG 0.000618 AGATT 0.00138 AGCAA 0.0012 AGCAC 0.000527 AGCAG 0.000462 AGCAT 0.000606 AGCCA 0.000506 AGCCC 0.000251 AGCCG 0.000294 AGCCT 0.000324 AGCGA 0.000531 AGCGC 0.000338 AGCGG 0.000282 AGCGT 0.00045 AGCTA 0.000587 AGCTC 0.000398 AGCTG 0.000491 AGCTT 0.000799 AGGAA 0.000975 AGGAC 0.000341 AGGAG 0.000359 AGGAT 0.000533 AGGCA 0.000453 AGGCC 0.000242 AGGCG 0.000274 AGGCT 0.000324 AGGGA 0.000391 AGGGC 0.000272 AGGGG 0.00027 AGGGT 0.000402 AGGTA 0.000752 AGGTC 0.000384 AGGTG 0.000537 AGGTT 0.00078 AGTAA 0.0016 AGTAC 0.000638 AGTAG 0.000606 AGTAT 0.000987 AGTCA 0.000841 AGTCC 0.000373 AGTCG 0.000522 AGTCT 0.000585 AGTGA 0.00101 AGTGC 0.000597 AGTGG 0.000606 AGTGT 0.00107 AGTTA 0.0015 AGTTC 0.000763 AGTTG 0.00106 AGTTT 0.00266 ATAAA 0.00593 ATAAC 0.00171 ATAAG 0.0013 ATAAT 0.00401 ATACA 0.00159 ATACC 0.000567 ATACG 0.000607 ATACT 0.000987 ATAGA 0.000985 ATAGC 0.000542 ATAGG 0.0005 ATAGT 0.00112 ATATA 0.00192 ATATC 0.00102 ATATG 0.000977 ATATT 0.0034 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.000997 ATCAG 0.000802 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.00067 ATCCC 0.000329 ATCCG 0.000349 ATCCT 0.000533 ATCGA 0.000814 ATCGC 0.000512 ATCGG 0.000425 ATCGT 0.000726 ATCTA 0.000996 ATCTC 0.000677 ATCTG 0.000733 ATCTT 0.00121 ATGAA 0.00181 ATGAC 0.000833 ATGAG 0.000676 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000384 ATGCG 0.000464 ATGCT 0.000606 ATGGA 0.000723 ATGGC 0.000514 ATGGG 0.000387 ATGGT 0.000726 ATGTA 0.00147 ATGTC 0.000747 ATGTG 0.000986 ATGTT 0.00193 ATTAA 0.00454 ATTAC 0.00183 ATTAG 0.00143 ATTAT 0.00401 ATTCA 0.00181 ATTCC 0.000913 ATTCG 0.00091 ATTCT 0.00145 ATTGA 0.00175 ATTGC 0.00115 ATTGG 0.00101 ATTGT 0.00247 ATTTA 0.005 ATTTC 0.00268 ATTTG 0.00291 ATTTT 0.00943 CAAAA 0.00497 CAAAC 0.00151 CAAAG 0.00115 CAAAT 0.00291 CAACA 0.0015 CAACC 0.000568 CAACG 0.000556 CAACT 0.00106 CAAGA 0.000904 CAAGC 0.000516 CAAGG 0.000551 CAAGT 0.00111 CAATA 0.0019 CAATC 0.000801 CAATG 0.000954 CAATT 0.00273 CACAA 0.00169 CACAC 0.000723 CACAG 0.000586 CACAT 0.000986 CACCA 0.000728 CACCC 0.000382 CACCG 0.000333 CACCT 0.000537 CACGA 0.000521 CACGC 0.000297 CACGG 0.000225 CACGT 0.00064 CACTA 0.000722 CACTC 0.000538 CACTG 0.000659 CACTT 0.00136 CAGAA 0.00115 CAGAC 0.000431 CAGAG 0.000397 CAGAT 0.000733 CAGCA 0.000544 CAGCC 0.000314 CAGCG 0.000343 CAGCT 0.000491 CAGGA 0.00046 CAGGC 0.000227 CAGGG 0.000264 CAGGT 0.000472 CAGTA 0.00072 CAGTC 0.000511 CAGTG 0.000659 CAGTT 0.00125 CATAA 0.0017 CATAC 0.000519 CATAG 0.000456 CATAT 0.000977 CATCA 0.000818 CATCC 0.000356 CATCG 0.00039 CATCT 0.000618 CATGA 0.000665 CATGC 0.000389 CATGG 0.00035 CATGT 0.000772 CATTA 0.00156 CATTC 0.000807 CATTG 0.000954 CATTT 0.00315 CCAAA 0.00179 CCAAC 0.000717 CCAAG 0.000524 CCAAT 0.00101 CCACA 0.000694 CCACC 0.000419 CCACG 0.000286 CCACT 0.000606 CCAGA 0.00045 CCAGC 0.000275 CCAGG 0.000232 CCAGT 0.000511 CCATA 0.000583 CCATC 0.00038 CCATG 0.00035 CCATT 0.00103 CCCAA 0.000705 CCCAC 0.000368 CCCAG 0.000251 CCCAT 0.000387 CCCCA 0.000395 CCCCC 0.000248 CCCCG 0.000191 CCCCT 0.00027 CCCGA 0.000296 CCCGC 0.000164 CCCGG 0.00018 CCCGT 0.000219 CCCTA 0.000338 CCCTC 0.00026 CCCTG 0.000264 CCCTT 0.000473 CCGAA 0.000618 CCGAC 0.000315 CCGAG 0.000255 CCGAT 0.000425 CCGCA 0.000308 CCGCC 0.00026 CCGCG 0.000162 CCGCT 0.000282 CCGGA 0.000322 CCGGC 0.00021 CCGGG 0.00018 CCGGT 0.00032 CCGTA 0.000342 CCGTC 0.000252 CCGTG 0.000225 CCGTT 0.00052 CCTAA 0.000778 CCTAC 0.000402 CCTAG 0.000246 CCTAT 0.0005 CCTCA 0.000431 CCTCC 0.000276 CCTCG 0.000265 CCTCT 0.000388 CCTGA 0.000421 CCTGC 0.00026 CCTGG 0.000232 CCTGT 0.00051 CCTTA 0.000603 CCTTC 0.00045 CCTTG 0.000551 CCTTT 0.000975 CGAAA 0.00162 CGAAC 0.000479 CGAAG 0.000445 CGAAT 0.00091 CGACA 0.000508 CGACC 0.00031 CGACG 0.000306 CGACT 0.000522 CGAGA 0.00047 CGAGC 0.000283 CGAGG 0.000265 CGAGT 0.000507 CGATA 0.00066 CGATC 0.000318 CGATG 0.00039 CGATT 0.00111 CGCAA 0.000731 CGCAC 0.00036 CGCAG 0.00029 CGCAT 0.000464 CGCCA 0.000487 CGCCC 0.000234 CGCCG 0.000264 CGCCT 0.000274 CGCGA 0.000326 CGCGC 0.000233 CGCGG 0.000162 CGCGT 0.000268 CGCTA 0.000358 CGCTC 0.000303 CGCTG 0.000343 CGCTT 0.000596 CGGAA 0.000616 CGGAC 0.000257 CGGAG 0.000239 CGGAT 0.000349 CGGCA 0.000315 CGGCC 0.000223 CGGCG 0.000264 CGGCT 0.000294 CGGGA 0.000272 CGGGC 0.000157 CGGGG 0.000191 CGGGT 0.000239 CGGTA 0.000353 CGGTC 0.000255 CGGTG 0.000333 CGGTT 0.000639 CGTAA 0.000999 CGTAC 0.000327 CGTAG 0.000332 CGTAT 0.000607 CGTCA 0.000576 CGTCC 0.000287 CGTCG 0.000306 CGTCT 0.000435 CGTGA 0.000489 CGTGC 0.000295 CGTGG 0.000286 CGTGT 0.000611 CGTTA 0.00073 CGTTC 0.000461 CGTTG 0.000556 CGTTT 0.0015 CTAAA 0.00193 CTAAC 0.000666 CTAAG 0.000482 CTAAT 0.00143 CTACA 0.000824 CTACC 0.000353 CTACG 0.000332 CTACT 0.000606 CTAGA 0.000608 CTAGC 0.000279 CTAGG 0.000246 CTAGT 0.000575 CTATA 0.000795 CTATC 0.000455 CTATG 0.000456 CTATT 0.00144 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.000445 CTCAG 0.000372 CTCAT 0.000676 CTCCA 0.000505 CTCCC 0.000246 CTCCG 0.000239 CTCCT 0.000359 CTCGA 0.000501 CTCGC 0.000283 CTCGG 0.000255 CTCGT 0.000485 CTCTA 0.000605 CTCTC 0.000419 CTCTG 0.000397 CTCTT 0.000772 CTGAA 0.00106 CTGAC 0.000479 CTGAG 0.000372 CTGAT 0.000802 CTGCA 0.000582 CTGCC 0.000267 CTGCG 0.00029 CTGCT 0.000462 CTGGA 0.000488 CTGGC 0.000277 CTGGG 0.000251 CTGGT 0.000451 CTGTA 0.000909 CTGTC 0.000517 CTGTG 0.000586 CTGTT 0.00118 CTTAA 0.00153 CTTAC 0.000629 CTTAG 0.000482 CTTAT 0.0013 CTTCA 0.000897 CTTCC 0.000483 CTTCG 0.000445 CTTCT 0.000736 CTTGA 0.000973 CTTGC 0.000557 CTTGG 0.000524 CTTGT 0.00103 CTTTA 0.00176 CTTTC 0.00103 CTTTG 0.00115 CTTTT 0.0029 GAAAA 0.00416 GAAAC 0.00132 GAAAG 0.00103 GAAAT 0.00268 GAACA 0.000974 GAACC 0.000383 GAACG 0.000461 GAACT 0.000763 GAAGA 0.000814 GAAGC 0.000491 GAAGG 0.00045 GAAGT 0.000806 GAATA 0.00139 GAATC 0.000655 GAATG 0.000807 GAATT 0.00224 GACAA 0.00118 GACAC 0.000586 GACAG 0.000517 GACAT 0.000747 GACCA 0.0005 GACCC 0.000223 GACCG 0.000255 GACCT 0.000384 GACGA 0.000479 GACGC 0.000325 GACGG 0.000252 GACGT 0.000547 GACTA 0.000551 GACTC 0.000332 GACTG 0.000511 GACTT 0.000926 GAGAA 0.000987 GAGAC 0.000381 GAGAG 0.000419 GAGAT 0.000677 GAGCA 0.000515 GAGCC 0.000245 GAGCG 0.000303 GAGCT 0.000398 GAGGA 0.000418 GAGGC 0.000246 GAGGG 0.00026 GAGGT 0.000436 GAGTA 0.000559 GAGTC 0.000332 GAGTG 0.000538 GAGTT 0.000887 GATAA 0.00178 GATAC 0.00047 GATAG 0.000455 GATAT 0.00102 GATCA 0.000615 GATCC 0.000255 GATCG 0.000318 GATCT 0.000428 GATGA 0.000713 GATGC 0.000369 GATGG 0.00038 GATGT 0.00072 GATTA 0.00131 GATTC 0.000655 GATTG 0.000801 GATTT 0.00256 GCAAA 0.00189 GCAAC 0.000717 GCAAG 0.000557 GCAAT 0.00115 GCACA 0.000685 GCACC 0.000357 GCACG 0.000295 GCACT 0.000597 GCAGA 0.000478 GCAGC 0.000334 GCAGG 0.00026 GCAGT 0.000529 GCATA 0.000585 GCATC 0.000369 GCATG 0.000389 GCATT 0.00112 GCCAA 0.000845 GCCAC 0.000441 GCCAG 0.000277 GCCAT 0.000514 GCCCA 0.000314 GCCCC 0.000263 GCCCG 0.000157 GCCCT 0.000272 GCCGA 0.000334 GCCGC 0.000263 GCCGG 0.00021 GCCGT 0.00029 GCCTA 0.00031 GCCTC 0.000246 GCCTG 0.000227 GCCTT 0.000509 GCGAA 0.000644 GCGAC 0.000356 GCGAG 0.000283 GCGAT 0.000512 GCGCA 0.00038 GCGCC 0.00032 GCGCG 0.000233 GCGCT 0.000338 GCGGA 0.000273 GCGGC 0.000263 GCGGG 0.000164 GCGGT 0.000312 GCGTA 0.000347 GCGTC 0.000325 GCGTG 0.000297 GCGTT 0.000645 GCTAA 0.00079 GCTAC 0.000378 GCTAG 0.000279 GCTAT 0.000542 GCTCA 0.000476 GCTCC 0.000282 GCTCG 0.000283 GCTCT 0.000421 GCTGA 0.000501 GCTGC 0.000334 GCTGG 0.000275 GCTGT 0.000582 GCTTA 0.000665 GCTTC 0.000491 GCTTG 0.000516 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00158 GGAAC 0.000502 GGAAG 0.000483 GGAAT 0.000913 GGACA 0.000472 GGACC 0.000214 GGACG 0.000287 GGACT 0.000373 GGAGA 0.000431 GGAGC 0.000282 GGAGG 0.000276 GGAGT 0.000361 GGATA 0.00048 GGATC 0.000255 GGATG 0.000356 GGATT 0.000791 GGCAA 0.000764 GGCAC 0.000372 GGCAG 0.000267 GGCAT 0.000384 GGCCA 0.000373 GGCCC 0.000217 GGCCG 0.000223 GGCCT 0.000242 GGCGA 0.000357 GGCGC 0.00032 GGCGG 0.00026 GGCGT 0.000322 GGCTA 0.000318 GGCTC 0.000245 GGCTG 0.000314 GGCTT 0.000499 GGGAA 0.00061 GGGAC 0.000264 GGGAG 0.000246 GGGAT 0.000329 GGGCA 0.000303 GGGCC 0.000217 GGGCG 0.000234 GGGCT 0.000251 GGGGA 0.000285 GGGGC 0.000263 GGGGG 0.000248 GGGGT 0.000311 GGGTA 0.000323 GGGTC 0.000223 GGGTG 0.000382 GGGTT 0.000529 GGTAA 0.000913 GGTAC 0.000394 GGTAG 0.000353 GGTAT 0.000567 GGTCA 0.000525 GGTCC 0.000214 GGTCG 0.00031 GGTCT 0.000315 GGTGA 0.000548 GGTGC 0.000357 GGTGG 0.000419 GGTGT 0.000656 GGTTA 0.00074 GGTTC 0.000383 GGTTG 0.000568 GGTTT 0.00137 GTAAA 0.00248 GTAAC 0.000831 GTAAG 0.000629 GTAAT 0.00183 GTACA 0.000902 GTACC 0.000394 GTACG 0.000327 GTACT 0.000638 GTAGA 0.000669 GTAGC 0.000378 GTAGG 0.000402 GTAGT 0.00067 GTATA 0.001 GTATC 0.00047 GTATG 0.000519 GTATT 0.00176 GTCAA 0.00119 GTCAC 0.000653 GTCAG 0.000479 GTCAT 0.000833 GTCCA 0.000483 GTCCC 0.000264 GTCCG 0.000257 GTCCT 0.000341 GTCGA 0.000485 GTCGC 0.000356 GTCGG 0.000315 GTCGT 0.000489 GTCTA 0.000527 GTCTC 0.000381 GTCTG 0.000431 GTCTT 0.000831 GTGAA 0.00116 GTGAC 0.000653 GTGAG 0.000445 GTGAT 0.000997 GTGCA 0.000676 GTGCC 0.000372 GTGCG 0.00036 GTGCT 0.000527 GTGGA 0.000573 GTGGC 0.000441 GTGGG 0.000368 GTGGT 0.000622 GTGTA 0.000921 GTGTC 0.000586 GTGTG 0.000723 GTGTT 0.0015 GTTAA 0.00175 GTTAC 0.000831 GTTAG 0.000666 GTTAT 0.00171 GTTCA 0.000855 GTTCC 0.000502 GTTCG 0.000479 GTTCT 0.000746 GTTGA 0.000954 GTTGC 0.000717 GTTGG 0.000717 GTTGT 0.0013 GTTTA 0.0021 GTTTC 0.00132 GTTTG 0.00151 GTTTT 0.00417 TAAAA 0.00739 TAAAC 0.0021 TAAAG 0.00176 TAAAT 0.005 TAACA 0.00199 TAACC 0.00074 TAACG 0.00073 TAACT 0.0015 TAAGA 0.00121 TAAGC 0.000665 TAAGG 0.000603 TAAGT 0.00147 TAATA 0.00352 TAATC 0.00131 TAATG 0.00156 TAATT 0.00541 TACAA 0.00227 TACAC 0.000921 TACAG 0.000909 TACAT 0.00147 TACCA 0.000799 TACCC 0.000323 TACCG 0.000353 TACCT 0.000752 TACGA 0.00076 TACGC 0.000347 TACGG 0.000342 TACGT 0.000815 TACTA 0.000944 TACTC 0.000559 TACTG 0.00072 TACTT 0.00161 TAGAA 0.00156 TAGAC 0.000527 TAGAG 0.000605 TAGAT 0.000996 TAGCA 0.000726 TAGCC 0.000318 TAGCG 0.000358 TAGCT 0.000587 TAGGA 0.000543 TAGGC 0.00031 TAGGG 0.000338 TAGGT 0.000735 TAGTA 0.000944 TAGTC 0.000551 TAGTG 0.000722 TAGTT 0.00166 TATAA 0.00279 TATAC 0.001 TATAG 0.000795 TATAT 0.00192 TATCA 0.00139 TATCC 0.00048 TATCG 0.00066 TATCT 0.0012 TATGA 0.00111 TATGC 0.000585 TATGG 0.000583 TATGT 0.00138 TATTA 0.00352 TATTC 0.00139 TATTG 0.0019 TATTT 0.00646 TCAAA 0.0031 TCAAC 0.000954 TCAAG 0.000973 TCAAT 0.00175 TCACA 0.00121 TCACC 0.000548 TCACG 0.000489 TCACT 0.00101 TCAGA 0.000784 TCAGC 0.000501 TCAGG 0.000421 TCAGT 0.001 TCATA 0.00111 TCATC 0.000713 TCATG 0.000665 TCATT 0.00205 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000573 TCCAG 0.000488 TCCAT 0.000723 TCCCA 0.0005 TCCCC 0.000285 TCCCG 0.000272 TCCCT 0.000391 TCCGA 0.000468 TCCGC 0.000273 TCCGG 0.000322 TCCGT 0.000396 TCCTA 0.000543 TCCTC 0.000418 TCCTG 0.00046 TCCTT 0.000788 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.000485 TCGAG 0.000501 TCGAT 0.000814 TCGCA 0.000583 TCGCC 0.000357 TCGCG 0.000326 TCGCT 0.000531 TCGGA 0.000468 TCGGC 0.000334 TCGGG 0.000296 TCGGT 0.000513 TCGTA 0.00076 TCGTC 0.000479 TCGTG 0.000521 TCGTT 0.00103 TCTAA 0.00142 TCTAC 0.000669 TCTAG 0.000608 TCTAT 0.000985 TCTCA 0.000791 TCTCC 0.000431 TCTCG 0.00047 TCTCT 0.000772 TCTGA 0.000784 TCTGC 0.000478 TCTGG 0.00045 TCTGT 0.001 TCTTA 0.00121 TCTTC 0.000814 TCTTG 0.000904 TCTTT 0.00195 TGAAA 0.00316 TGAAC 0.000855 TGAAG 0.000897 TGAAT 0.00181 TGACA 0.00121 TGACC 0.000525 TGACG 0.000576 TGACT 0.000841 TGAGA 0.000791 TGAGC 0.000476 TGAGG 0.000431 TGAGT 0.000834 TGATA 0.00139 TGATC 0.000615 TGATG 0.000818 TGATT 0.00206 TGCAA 0.00163 TGCAC 0.000676 TGCAG 0.000582 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.000717 TGCCC 0.000303 TGCCG 0.000315 TGCCT 0.000453 TGCGA 0.000583 TGCGC 0.00038 TGCGG 0.000308 TGCGT 0.000575 TGCTA 0.000726 TGCTC 0.000515 TGCTG 0.000544 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000483 TGGAG 0.000505 TGGAT 0.00067 TGGCA 0.000717 TGGCC 0.000373 TGGCG 0.000487 TGGCT 0.000506 TGGGA 0.0005 TGGGC 0.000314 TGGGG 0.000395 TGGGT 0.000504 TGGTA 0.000799 TGGTC 0.0005 TGGTG 0.000728 TGGTT 0.00111 TGTAA 0.00225 TGTAC 0.000902 TGTAG 0.000824 TGTAT 0.00159 TGTCA 0.00121 TGTCC 0.000472 TGTCG 0.000508 TGTCT 0.000837 TGTGA 0.00121 TGTGC 0.000685 TGTGG 0.000694 TGTGT 0.0014 TGTTA 0.00199 TGTTC 0.000974 TGTTG 0.0015 TGTTT 0.00358 TTAAA 0.00592 TTAAC 0.00175 TTAAG 0.00153 TTAAT 0.00454 TTACA 0.00225 TTACC 0.000913 TTACG 0.000999 TTACT 0.0016 TTAGA 0.00142 TTAGC 0.00079 TTAGG 0.000778 TTAGT 0.00152 TTATA 0.00279 TTATC 0.00178 TTATG 0.0017 TTATT 0.00668 TTCAA 0.0027 TTCAC 0.00116 TTCAG 0.00106 TTCAT 0.00181 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.00061 TTCCG 0.000616 TTCCT 0.000975 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000644 TTCGG 0.000618 TTCGT 0.00109 TTCTA 0.00156 TTCTC 0.000987 TTCTG 0.00115 TTCTT 0.00206 TTGAA 0.0027 TTGAC 0.00119 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00163 TTGCC 0.000764 TTGCG 0.000731 TTGCT 0.0012 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.000845 TTGGG 0.000705 TTGGT 0.00134 TTGTA 0.00227 TTGTC 0.00118 TTGTG 0.00169 TTGTT 0.00343 TTTAA 0.00592 TTTAC 0.00248 TTTAG 0.00193 TTTAT 0.00593 TTTCA 0.00316 TTTCC 0.00158 TTTCG 0.00162 TTTCT 0.00283 TTTGA 0.0031 TTTGC 0.00189 TTTGG 0.00179 TTTGT 0.00377 TTTTA 0.00739 TTTTC 0.00416 TTTTG 0.00497 TTTTT 0.0133 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4485 AAAAC 0.1382 AAAAG 0.09649 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3938 AAACC 0.1492 AAACG 0.1621 AAACT 0.2948 AAAGA 0.2881 AAAGC 0.178 AAAGG 0.1394 AAAGT 0.3945 AAATA 0.3243 AAATC 0.1262 AAATG 0.1565 AAATT 0.3929 AACAA 0.4268 AACAC 0.1845 AACAG 0.1466 AACAT 0.242 AACCA 0.3665 AACCC 0.1698 AACCG 0.2059 AACCT 0.2578 AACGA 0.3168 AACGC 0.1973 AACGG 0.1578 AACGT 0.3282 AACTA 0.2804 AACTC 0.1467 AACTG 0.2067 AACTT 0.3662 AAGAA 0.4259 AAGAC 0.1678 AAGAG 0.1565 AAGAT 0.2498 AAGCA 0.3507 AAGCC 0.1693 AAGCG 0.2013 AAGCT 0.2787 AAGGA 0.3077 AAGGC 0.1959 AAGGG 0.1787 AAGGT 0.3177 AAGTA 0.2679 AAGTC 0.1508 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3617 AATAA 0.5034 AATAC 0.1314 AATAG 0.1074 AATAT 0.2578 AATCA 0.386 AATCC 0.1471 AATCG 0.2047 AATCT 0.2621 AATGA 0.3163 AATGC 0.1722 AATGG 0.1586 AATGT 0.3529 AATTA 0.2977 AATTC 0.122 AATTG 0.1473 AATTT 0.4331 ACAAA 0.4428 ACAAC 0.1499 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2889 ACACA 0.3756 ACACC 0.1744 ACACG 0.1611 ACACT 0.2889 ACAGA 0.3179 ACAGC 0.1794 ACAGG 0.1591 ACAGT 0.3436 ACATA 0.2695 ACATC 0.1397 ACATG 0.1475 ACATT 0.4433 ACCAA 0.4276 ACCAC 0.1959 ACCAG 0.1419 ACCAT 0.2345 ACCCA 0.3476 ACCCC 0.2088 ACCCG 0.1605 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3282 ACCGC 0.1944 ACCGG 0.2013 ACCGT 0.2762 ACCTA 0.3046 ACCTC 0.175 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.331 ACGAA 0.391 ACGAC 0.1743 ACGAG 0.1727 ACGAT 0.262 ACGCA 0.3582 ACGCC 0.1976 ACGCG 0.1622 ACGCT 0.2819 ACGGA 0.2983 ACGGC 0.214 ACGGG 0.1611 ACGGT 0.3266 ACGTA 0.2688 ACGTC 0.1768 ACGTG 0.2055 ACGTT 0.3489 ACTAA 0.3936 ACTAC 0.1716 ACTAG 0.1466 ACTAT 0.2882 ACTCA 0.3623 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.2132 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3216 ACTGC 0.1675 ACTGG 0.1597 ACTGT 0.3513 ACTTA 0.2425 ACTTC 0.1328 ACTTG 0.1793 ACTTT 0.4454 AGAAA 0.4915 AGAAC 0.1287 AGAAG 0.127 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3884 AGACC 0.1447 AGACG 0.1953 AGACT 0.2716 AGAGA 0.3551 AGAGC 0.19 AGAGG 0.1727 AGAGT 0.2822 AGATA 0.3335 AGATC 0.1175 AGATG 0.169 AGATT 0.38 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.1656 AGCAT 0.2189 AGCCA 0.3693 AGCCC 0.1781 AGCCG 0.2117 AGCCT 0.2409 AGCGA 0.3354 AGCGC 0.2072 AGCGG 0.1745 AGCGT 0.2829 AGCTA 0.2617 AGCTC 0.1728 AGCTG 0.2121 AGCTT 0.3535 AGGAA 0.4425 AGGAC 0.1534 AGGAG 0.1611 AGGAT 0.2429 AGGCA 0.3547 AGGCC 0.1833 AGGCG 0.2075 AGGCT 0.2544 AGGGA 0.2947 AGGGC 0.2002 AGGGG 0.196 AGGGT 0.309 AGGTA 0.3111 AGGTC 0.1534 AGGTG 0.2164 AGGTT 0.3192 AGTAA 0.4183 AGTAC 0.1645 AGTAG 0.1586 AGTAT 0.2586 AGTCA 0.3641 AGTCC 0.1583 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.2558 AGTGA 0.3086 AGTGC 0.1809 AGTGG 0.1821 AGTGT 0.3284 AGTTA 0.2526 AGTTC 0.1267 AGTTG 0.1745 AGTTT 0.4462 ATAAA 0.4564 ATAAC 0.1314 ATAAG 0.1002 ATAAT 0.312 ATACA 0.4242 ATACC 0.1517 ATACG 0.1593 ATACT 0.2648 ATAGA 0.3146 ATAGC 0.1709 ATAGG 0.1579 ATAGT 0.3565 ATATA 0.2623 ATATC 0.1381 ATATG 0.1328 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3824 ATCAC 0.2021 ATCAG 0.1644 ATCAT 0.2511 ATCCA 0.3594 ATCCC 0.1715 ATCCG 0.1837 ATCCT 0.2854 ATCGA 0.3305 ATCGC 0.2045 ATCGG 0.1702 ATCGT 0.2948 ATCTA 0.2781 ATCTC 0.1833 ATCTG 0.2013 ATCTT 0.3374 ATGAA 0.4019 ATGAC 0.1818 ATGAG 0.1474 ATGAT 0.2689 ATGCA 0.4137 ATGCC 0.1533 ATGCG 0.184 ATGCT 0.2489 ATGGA 0.3086 ATGGC 0.2158 ATGGG 0.1619 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.2883 ATGTC 0.1442 ATGTG 0.1895 ATGTT 0.378 ATTAA 0.385 ATTAC 0.1522 ATTAG 0.1204 ATTAT 0.3424 ATTCA 0.3581 ATTCC 0.177 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2904 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1568 ATTGT 0.3904 ATTTA 0.2498 ATTTC 0.1319 ATTTG 0.1434 ATTTT 0.4749 CAAAA 0.4757 CAAAC 0.1408 CAAAG 0.1083 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4101 CAACC 0.1518 CAACG 0.1491 CAACT 0.2891 CAAGA 0.2975 CAAGC 0.1656 CAAGG 0.1765 CAAGT 0.3604 CAATA 0.3003 CAATC 0.1237 CAATG 0.1484 CAATT 0.4276 CACAA 0.4263 CACAC 0.1781 CACAG 0.1469 CACAT 0.2486 CACCA 0.3702 CACCC 0.1927 CACCG 0.1632 CACCT 0.2739 CACGA 0.3108 CACGC 0.1739 CACGG 0.1319 CACGT 0.3834 CACTA 0.2231 CACTC 0.1616 CACTG 0.2005 CACTT 0.4147 CAGAA 0.4287 CAGAC 0.1564 CAGAG 0.145 CAGAT 0.2699 CAGCA 0.3247 CAGCC 0.1824 CAGCG 0.2016 CAGCT 0.2913 CAGGA 0.3212 CAGGC 0.1595 CAGGG 0.1877 CAGGT 0.3316 CAGTA 0.2319 CAGTC 0.16 CAGTG 0.208 CAGTT 0.4 CATAA 0.4643 CATAC 0.1419 CATAG 0.1252 CATAT 0.2686 CATCA 0.3753 CATCC 0.1619 CATCG 0.1761 CATCT 0.2867 CATGA 0.3072 CATGC 0.1772 CATGG 0.1594 CATGT 0.3562 CATTA 0.2414 CATTC 0.1235 CATTG 0.1451 CATTT 0.49 CCAAA 0.4463 CCAAC 0.1754 CCAAG 0.1285 CCAAT 0.2497 CCACA 0.3522 CCACC 0.2073 CCACG 0.1375 CCACT 0.303 CCAGA 0.3099 CCAGC 0.1856 CCAGG 0.1558 CCAGT 0.3487 CCATA 0.2513 CCATC 0.1599 CCATG 0.1465 CCATT 0.4422 CCCAA 0.4128 CCCAC 0.2135 CCCAG 0.1452 CCCAT 0.2285 CCCCA 0.3604 CCCCC 0.2228 CCCCG 0.1707 CCCCT 0.246 CCCGA 0.3455 CCCGC 0.1879 CCCGG 0.2094 CCCGT 0.2572 CCCTA 0.2569 CCCTC 0.1918 CCCTG 0.2014 CCCTT 0.3499 CCGAA 0.3868 CCGAC 0.1927 CCGAG 0.155 CCGAT 0.2655 CCGCA 0.3075 CCGCC 0.2518 CCGCG 0.1571 CCGCT 0.2836 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.1981 CCGGG 0.1721 CCGGT 0.3125 CCGTA 0.2586 CCGTC 0.1858 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3909 CCTAA 0.4036 CCTAC 0.2086 CCTAG 0.1275 CCTAT 0.2602 CCTCA 0.3206 CCTCC 0.2009 CCTCG 0.1909 CCTCT 0.2876 CCTGA 0.295 CCTGC 0.1801 CCTGG 0.16 CCTGT 0.3649 CCTTA 0.2355 CCTTC 0.1743 CCTTG 0.2113 CCTTT 0.3788 CGAAA 0.4714 CGAAC 0.1369 CGAAG 0.1294 CGAAT 0.2622 CGACA 0.3117 CGACC 0.1862 CGACG 0.1811 CGACT 0.3209 CGAGA 0.3102 CGAGC 0.1859 CGAGG 0.1714 CGAGT 0.3325 CGATA 0.2675 CGATC 0.1258 CGATG 0.1572 CGATT 0.4495 CGCAA 0.3978 CGCAC 0.1925 CGCAG 0.1569 CGCAT 0.2528 CGCCA 0.3924 CGCCC 0.1835 CGCCG 0.2035 CGCCT 0.2206 CGCGA 0.3313 CGCGC 0.234 CGCGG 0.162 CGCGT 0.2727 CGCTA 0.2252 CGCTC 0.1865 CGCTG 0.2148 CGCTT 0.3735 CGGAA 0.4227 CGGAC 0.1748 CGGAG 0.1608 CGGAT 0.2416 CGGCA 0.2904 CGGCC 0.2027 CGGCG 0.2338 CGGCT 0.2731 CGGGA 0.3207 CGGGC 0.1791 CGGGG 0.2186 CGGGT 0.2816 CGGTA 0.2266 CGGTC 0.1596 CGGTG 0.2062 CGGTT 0.4076 CGTAA 0.4381 CGTAC 0.1446 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2711 CGTCA 0.3623 CGTCC 0.177 CGTCG 0.1866 CGTCT 0.2741 CGTGA 0.2916 CGTGC 0.1735 CGTGG 0.1663 CGTGT 0.3685 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.1408 CGTTG 0.1701 CGTTT 0.4638 CTAAA 0.4321 CTAAC 0.145 CTAAG 0.107 CTAAT 0.3159 CTACA 0.3915 CTACC 0.1649 CTACG 0.1535 CTACT 0.2901 CTAGA 0.3575 CTAGC 0.1611 CTAGG 0.144 CTAGT 0.3374 CTATA 0.2547 CTATC 0.1434 CTATG 0.1453 CTATT 0.4566 CTCAA 0.4117 CTCAC 0.1723 CTCAG 0.149 CTCAT 0.267 CTCCA 0.3782 CTCCC 0.1801 CTCCG 0.1734 CTCCT 0.2684 CTCGA 0.3313 CTCGC 0.184 CTCGG 0.1639 CTCGT 0.3208 CTCTA 0.2768 CTCTC 0.1895 CTCTG 0.1805 CTCTT 0.3532 CTGAA 0.394 CTGAC 0.1726 CTGAG 0.138 CTGAT 0.2954 CTGCA 0.3653 CTGCC 0.1643 CTGCG 0.1776 CTGCT 0.2927 CTGGA 0.3366 CTGGC 0.1861 CTGGG 0.1678 CTGGT 0.3095 CTGTA 0.2894 CTGTC 0.1583 CTGTG 0.1814 CTGTT 0.3709 CTTAA 0.3882 CTTAC 0.1576 CTTAG 0.1228 CTTAT 0.3314 CTTCA 0.351 CTTCC 0.1869 CTTCG 0.1715 CTTCT 0.2906 CTTGA 0.3179 CTTGC 0.1791 CTTGG 0.1686 CTTGT 0.3344 CTTTA 0.2585 CTTTC 0.1496 CTTTG 0.1663 CTTTT 0.4256 GAAAA 0.4558 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1119 GAAAT 0.2904 GAACA 0.3804 GAACC 0.1464 GAACG 0.1752 GAACT 0.2979 GAAGA 0.3204 GAAGC 0.1891 GAAGG 0.1731 GAAGT 0.3174 GAATA 0.2741 GAATC 0.1273 GAATG 0.1573 GAATT 0.4412 GACAA 0.3915 GACAC 0.1915 GACAG 0.1685 GACAT 0.2486 GACCA 0.3724 GACCC 0.162 GACCG 0.1835 GACCT 0.2822 GACGA 0.3002 GACGC 0.1989 GACGG 0.1557 GACGT 0.3452 GACTA 0.2401 GACTC 0.14 GACTG 0.2178 GACTT 0.4021 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1523 GAGAG 0.1699 GAGAT 0.2744 GAGCA 0.357 GAGCC 0.1648 GAGCG 0.203 GAGCT 0.2752 GAGGA 0.3094 GAGGC 0.1784 GAGGG 0.1887 GAGGT 0.3236 GAGTA 0.2447 GAGTC 0.1401 GAGTG 0.2284 GAGTT 0.3867 GATAA 0.4748 GATAC 0.127 GATAG 0.1221 GATAT 0.2762 GATCA 0.3845 GATCC 0.1559 GATCG 0.1904 GATCT 0.2692 GATGA 0.3258 GATGC 0.1678 GATGG 0.1723 GATGT 0.3341 GATTA 0.2478 GATTC 0.122 GATTG 0.1478 GATTT 0.4824 GCAAA 0.4415 GCAAC 0.1661 GCAAG 0.1278 GCAAT 0.2647 GCACA 0.3587 GCACC 0.1825 GCACG 0.1481 GCACT 0.3107 GCAGA 0.3043 GCAGC 0.2042 GCAGG 0.1593 GCAGT 0.3322 GCATA 0.24 GCATC 0.1482 GCATG 0.155 GCATT 0.4568 GCCAA 0.4096 GCCAC 0.2083 GCCAG 0.1321 GCCAT 0.2499 GCCCA 0.3159 GCCCC 0.2556 GCCCG 0.1532 GCCCT 0.2753 GCCGA 0.3075 GCCGC 0.2372 GCCGG 0.1883 GCCGT 0.267 GCCTA 0.2428 GCCTC 0.1866 GCCTG 0.176 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3614 GCGAC 0.1971 GCGAG 0.1557 GCGAT 0.2857 GCGCA 0.303 GCGCC 0.2493 GCGCG 0.1803 GCGCT 0.2674 GCGGA 0.2735 GCGGC 0.2569 GCGGG 0.159 GCGGT 0.3106 GCGTA 0.2182 GCGTC 0.1967 GCGTG 0.18 GCGTT 0.405 GCTAA 0.3989 GCTAC 0.1885 GCTAG 0.1387 GCTAT 0.2739 GCTCA 0.3263 GCTCC 0.1895 GCTCG 0.1915 GCTCT 0.2927 GCTGA 0.298 GCTGC 0.1946 GCTGG 0.1606 GCTGT 0.3468 GCTTA 0.2303 GCTTC 0.168 GCTTG 0.175 GCTTT 0.4268 GGAAA 0.455 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1392 GGAAT 0.2626 GGACA 0.357 GGACC 0.1584 GGACG 0.2077 GGACT 0.2769 GGAGA 0.3229 GGAGC 0.206 GGAGG 0.202 GGAGT 0.2692 GGATA 0.2568 GGATC 0.1342 GGATG 0.1883 GGATT 0.4208 GGCAA 0.4291 GGCAC 0.2061 GGCAG 0.1489 GGCAT 0.2159 GGCCA 0.3573 GGCCC 0.2007 GGCCG 0.21 GGCCT 0.232 GGCGA 0.286 GGCGC 0.2524 GGCGG 0.2025 GGCGT 0.2591 GGCTA 0.232 GGCTC 0.1761 GGCTG 0.2261 GGCTT 0.3657 GGGAA 0.4231 GGGAC 0.1814 GGGAG 0.1683 GGGAT 0.2273 GGGCA 0.306 GGGCC 0.212 GGGCG 0.2307 GGGCT 0.2513 GGGGA 0.2587 GGGGC 0.233 GGGGG 0.2225 GGGGT 0.2857 GGGTA 0.2255 GGGTC 0.1514 GGGTG 0.2616 GGGTT 0.3615 GGTAA 0.409 GGTAC 0.1749 GGTAG 0.1575 GGTAT 0.2587 GGTCA 0.3858 GGTCC 0.1564 GGTCG 0.2223 GGTCT 0.2355 GGTGA 0.2786 GGTGC 0.1787 GGTGG 0.2095 GGTGT 0.3332 GGTTA 0.2416 GGTTC 0.1243 GGTTG 0.183 GGTTT 0.451 GTAAA 0.4328 GTAAC 0.1432 GTAAG 0.1085 GTAAT 0.3156 GTACA 0.3991 GTACC 0.1731 GTACG 0.1434 GTACT 0.2844 GTAGA 0.3178 GTAGC 0.1758 GTAGG 0.1892 GTAGT 0.3173 GTATA 0.2699 GTATC 0.1248 GTATG 0.1378 GTATT 0.4676 GTCAA 0.3786 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1506 GTCAT 0.2661 GTCCA 0.3619 GTCCC 0.194 GTCCG 0.1885 GTCCT 0.2556 GTCGA 0.2958 GTCGC 0.2157 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.2997 GTCTA 0.245 GTCTC 0.1726 GTCTG 0.1979 GTCTT 0.3845 GTGAA 0.36 GTGAC 0.1982 GTGAG 0.1349 GTGAT 0.3069 GTGCA 0.3521 GTGCC 0.19 GTGCG 0.1819 GTGCT 0.2761 GTGGA 0.2901 GTGGC 0.2152 GTGGG 0.1811 GTGGT 0.3135 GTGTA 0.2476 GTGTC 0.1562 GTGTG 0.191 GTGTT 0.4052 GTTAA 0.354 GTTAC 0.1662 GTTAG 0.133 GTTAT 0.3469 GTTCA 0.334 GTTCC 0.1916 GTTCG 0.1809 GTTCT 0.2935 GTTGA 0.2604 GTTGC 0.1943 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2327 GTTTC 0.1435 GTTTG 0.1633 GTTTT 0.4605 TAAAA 0.457 TAAAC 0.1285 TAAAG 0.1079 TAAAT 0.3067 TAACA 0.403 TAACC 0.1466 TAACG 0.1444 TAACT 0.306 TAAGA 0.311 TAAGC 0.1665 TAAGG 0.1502 TAAGT 0.3723 TAATA 0.3018 TAATC 0.1099 TAATG 0.1307 TAATT 0.4577 TACAA 0.4076 TACAC 0.1622 TACAG 0.1646 TACAT 0.2656 TACCA 0.3605 TACCC 0.1437 TACCG 0.1552 TACCT 0.3407 TACGA 0.3364 TACGC 0.1522 TACGG 0.1495 TACGT 0.362 TACTA 0.2485 TACTC 0.1442 TACTG 0.1862 TACTT 0.4212 TAGAA 0.4245 TAGAC 0.1413 TAGAG 0.1622 TAGAT 0.2721 TAGCA 0.3689 TAGCC 0.1558 TAGCG 0.176 TAGCT 0.2993 TAGGA 0.2831 TAGGC 0.1588 TAGGG 0.1729 TAGGT 0.3852 TAGTA 0.2457 TAGTC 0.14 TAGTG 0.1837 TAGTT 0.4306 TATAA 0.4306 TATAC 0.1539 TATAG 0.1215 TATAT 0.2939 TATCA 0.3714 TATCC 0.1278 TATCG 0.1734 TATCT 0.3273 TATGA 0.3044 TATGC 0.1592 TATGG 0.1586 TATGT 0.3777 TATTA 0.2678 TATTC 0.1034 TATTG 0.1411 TATTT 0.4877 TCAAA 0.461 TCAAC 0.1396 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2572 TCACA 0.3739 TCACC 0.1675 TCACG 0.1466 TCACT 0.312 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.182 TCAGG 0.1519 TCAGT 0.3714 TCATA 0.2474 TCATC 0.1552 TCATG 0.1449 TCATT 0.4525 TCCAA 0.3949 TCCAC 0.1937 TCCAG 0.1649 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.3499 TCCCC 0.1915 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.2734 TCCGA 0.3216 TCCGC 0.1849 TCCGG 0.2209 TCCGT 0.2726 TCCTA 0.2501 TCCTC 0.187 TCCTG 0.2049 TCCTT 0.3581 TCGAA 0.3852 TCGAC 0.1641 TCGAG 0.1702 TCGAT 0.2804 TCGCA 0.3276 TCGCC 0.1957 TCGCG 0.1768 TCGCT 0.2999 TCGGA 0.2926 TCGGC 0.2049 TCGGG 0.1799 TCGGT 0.3226 TCGTA 0.2754 TCGTC 0.1695 TCGTG 0.1837 TCGTT 0.3714 TCTAA 0.3892 TCTAC 0.1805 TCTAG 0.1631 TCTAT 0.2671 TCTCA 0.3224 TCTCC 0.173 TCTCG 0.1861 TCTCT 0.3185 TCTGA 0.2913 TCTGC 0.1752 TCTGG 0.1621 TCTGT 0.3714 TCTTA 0.2501 TCTTC 0.1655 TCTTG 0.1827 TCTTT 0.4016 TGAAA 0.4713 TGAAC 0.1265 TGAAG 0.1326 TGAAT 0.2695 TGACA 0.3863 TGACC 0.165 TGACG 0.1796 TGACT 0.2691 TGAGA 0.3148 TGAGC 0.1855 TGAGG 0.1686 TGAGT 0.3311 TGATA 0.2851 TGATC 0.1264 TGATG 0.1667 TGATT 0.4218 TGCAA 0.418 TGCAC 0.1716 TGCAG 0.1486 TGCAT 0.2618 TGCCA 0.4045 TGCCC 0.166 TGCCG 0.1724 TGCCT 0.2571 TGCGA 0.3186 TGCGC 0.2042 TGCGG 0.1646 TGCGT 0.3126 TGCTA 0.2627 TGCTC 0.1825 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3622 TGGAA 0.4387 TGGAC 0.1626 TGGAG 0.1699 TGGAT 0.2289 TGGCA 0.3489 TGGCC 0.1765 TGGCG 0.2308 TGGCT 0.2438 TGGGA 0.2962 TGGGC 0.1804 TGGGG 0.2255 TGGGT 0.2979 TGGTA 0.2576 TGGTC 0.1585 TGGTG 0.2288 TGGTT 0.3551 TGTAA 0.4045 TGTAC 0.16 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2872 TGTCA 0.3996 TGTCC 0.156 TGTCG 0.1647 TGTCT 0.2797 TGTGA 0.3038 TGTGC 0.1716 TGTGG 0.1739 TGTGT 0.3507 TGTTA 0.2486 TGTTC 0.1209 TGTTG 0.185 TGTTT 0.4455 TTAAA 0.4335 TTAAC 0.1261 TTAAG 0.1105 TTAAT 0.33 TTACA 0.3924 TTACC 0.1574 TTACG 0.169 TTACT 0.2812 TTAGA 0.3185 TTAGC 0.173 TTAGG 0.1702 TTAGT 0.3383 TTATA 0.218 TTATC 0.1347 TTATG 0.1302 TTATT 0.5171 TTCAA 0.4034 TTCAC 0.1701 TTCAG 0.1573 TTCAT 0.2693 TTCCA 0.3725 TTCCC 0.1726 TTCCG 0.1738 TTCCT 0.2811 TTCGA 0.3242 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.177 TTCGT 0.314 TTCTA 0.2714 TTCTC 0.1685 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.36 TTGAA 0.4021 TTGAC 0.1727 TTGAG 0.1518 TTGAT 0.2735 TTGCA 0.3792 TTGCC 0.1749 TTGCG 0.1662 TTGCT 0.2797 TTGGA 0.2887 TTGGC 0.2065 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3339 TTGTA 0.2663 TTGTC 0.1367 TTGTG 0.1957 TTGTT 0.4013 TTTAA 0.3665 TTTAC 0.1513 TTTAG 0.1194 TTTAT 0.3629 TTTCA 0.3458 TTTCC 0.1693 TTTCG 0.1732 TTTCT 0.3117 TTTGA 0.2956 TTTGC 0.1776 TTTGG 0.168 TTTGT 0.3588 TTTTA 0.2482 TTTTC 0.1381 TTTTG 0.1654 TTTTT 0.4482 [3] # (a,c,g,t)= (0.297, 0.203, 0.203, 0.297) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.34 C 0.161 G 0.161 T 0.339 # l= 1 # Values AA 0.144 AC 0.0538 AG 0.0445 AT 0.0969 CA 0.0585 CC 0.028 CG 0.0296 CT 0.0445 GA 0.0485 GC 0.0303 GG 0.028 GT 0.0538 TA 0.0883 TC 0.0485 TG 0.0584 TT 0.144 # l= 2 # Values AAA 0.0647 AAC 0.0203 AAG 0.0164 AAT 0.0428 ACA 0.0206 ACC 0.00878 ACG 0.00903 ACT 0.0154 AGA 0.0136 AGC 0.00816 AGG 0.00741 AGT 0.0154 ATA 0.0267 ATC 0.0129 ATG 0.0145 ATT 0.0428 CAA 0.0238 CAC 0.0112 CAG 0.00905 CAT 0.0145 CCA 0.0101 CCC 0.00528 CCG 0.00523 CCT 0.00741 CGA 0.00934 CGC 0.00597 CGG 0.00523 CGT 0.00904 CTA 0.0114 CTC 0.00773 CTG 0.00905 CTT 0.0164 GAA 0.0194 GAC 0.00848 GAG 0.00773 GAT 0.0129 GCA 0.0105 GCC 0.00572 GCG 0.00597 GCT 0.00815 GGA 0.00821 GGC 0.00572 GGG 0.00527 GGT 0.00877 GTA 0.0138 GTC 0.00848 GTG 0.0112 GTT 0.0203 TAA 0.0364 TAC 0.0138 TAG 0.0114 TAT 0.0267 TCA 0.0173 TCC 0.00822 TCG 0.00934 TCT 0.0136 TGA 0.0173 TGC 0.0105 TGG 0.0101 TGT 0.0206 TTA 0.0364 TTC 0.0194 TTG 0.0238 TTT 0.0647 # l= 3 # Values AAAA 0.0291 AAAC 0.00908 AAAG 0.0068 AAAT 0.0197 AACA 0.00801 AACC 0.00311 AACG 0.00331 AACT 0.00591 AAGA 0.00481 AAGC 0.00293 AAGG 0.00262 AAGT 0.00604 AATA 0.013 AATC 0.00535 AATG 0.00644 AATT 0.018 ACAA 0.00855 ACAC 0.0038 ACAG 0.0032 ACAT 0.00509 ACCA 0.00316 ACCC 0.00151 ACCG 0.00164 ACCT 0.00247 ACGA 0.00284 ACGC 0.00168 ACGG 0.0014 ACGT 0.00312 ACTA 0.00382 ACTC 0.00234 ACTG 0.00317 ACTT 0.00604 AGAA 0.00566 AGAC 0.00218 AGAG 0.00219 AGAT 0.00357 AGCA 0.0028 AGCC 0.00142 AGCG 0.00165 AGCT 0.00228 AGGA 0.00224 AGGC 0.00133 AGGG 0.00138 AGGT 0.00247 AGTA 0.00378 AGTC 0.00235 AGTG 0.00333 AGTT 0.00591 ATAA 0.0127 ATAC 0.00371 ATAG 0.0031 ATAT 0.00715 ATCA 0.0049 ATCC 0.00191 ATCG 0.00253 ATCT 0.00357 ATGA 0.00452 ATGC 0.00248 ATGG 0.00237 ATGT 0.00509 ATTA 0.0116 ATTC 0.00507 ATTG 0.00642 ATTT 0.0197 CAAA 0.0105 CAAC 0.00373 CAAG 0.00312 CAAT 0.00642 CACA 0.00404 CACC 0.00204 CACG 0.00176 CACT 0.00333 CAGA 0.00269 CAGC 0.00174 CAGG 0.00145 CAGT 0.00317 CATA 0.00361 CATC 0.00221 CATG 0.00221 CATT 0.00644 CCAA 0.0041 CCAC 0.00207 CCAG 0.00151 CCAT 0.00237 CCCA 0.00178 CCCC 0.00119 CCCG 0.00092 CCCT 0.00138 CCGA 0.00167 CCGC 0.00108 CCGG 0.00108 CCGT 0.0014 CCTA 0.00193 CCTC 0.00141 CCTG 0.00145 CCTT 0.00262 CGAA 0.00352 CGAC 0.00171 CGAG 0.00158 CGAT 0.00253 CGCA 0.00191 CGCC 0.00134 CGCG 0.00107 CGCT 0.00165 CGGA 0.00151 CGGC 0.00116 CGGG 0.000919 CGGT 0.00164 CGTA 0.00229 CGTC 0.00167 CGTG 0.00176 CGTT 0.00331 CTAA 0.00445 CTAC 0.00211 CTAG 0.00171 CTAT 0.0031 CTCA 0.00256 CTCC 0.0014 CTCG 0.00159 CTCT 0.00219 CTGA 0.00271 CTGC 0.00163 CTGG 0.00151 CTGT 0.0032 CTTA 0.00393 CTTC 0.00255 CTTG 0.00312 CTTT 0.0068 GAAA 0.00913 GAAC 0.0026 GAAG 0.00256 GAAT 0.00507 GACA 0.00306 GACC 0.00141 GACG 0.00167 GACT 0.00235 GAGA 0.00248 GAGC 0.0015 GAGG 0.00141 GAGT 0.00234 GATA 0.00372 GATC 0.00163 GATG 0.00221 GATT 0.00535 GCAA 0.00437 GCAC 0.00199 GCAG 0.00163 GCAT 0.00248 GCCA 0.00216 GCCC 0.00107 GCCG 0.00116 GCCT 0.00133 GCGA 0.00186 GCGC 0.00136 GCGG 0.00108 GCGT 0.00168 GCTA 0.002 GCTC 0.0015 GCTG 0.00174 GCTT 0.00293 GGAA 0.00353 GGAC 0.00138 GGAG 0.0014 GGAT 0.00191 GGCA 0.00184 GGCC 0.00112 GGCG 0.00134 GGCT 0.00142 GGGA 0.0015 GGGC 0.00107 GGGG 0.00119 GGGT 0.0015 GGTA 0.00222 GGTC 0.0014 GGTG 0.00204 GGTT 0.00311 GTAA 0.00574 GTAC 0.00227 GTAG 0.00211 GTAT 0.00371 GTCA 0.00321 GTCC 0.00138 GTCG 0.00171 GTCT 0.00218 GTGA 0.00331 GTGC 0.00199 GTGG 0.00207 GTGT 0.0038 GTTA 0.00494 GTTC 0.0026 GTTG 0.00373 GTTT 0.00907 TAAA 0.0159 TAAC 0.00494 TAAG 0.00393 TAAT 0.0116 TACA 0.00553 TACC 0.00222 TACG 0.00229 TACT 0.00378 TAGA 0.00362 TAGC 0.00199 TAGG 0.00193 TAGT 0.00382 TATA 0.00635 TATC 0.00372 TATG 0.00361 TATT 0.013 TCAA 0.00676 TCAC 0.00331 TCAG 0.00272 TCAT 0.00453 TCCA 0.00296 TCCC 0.0015 TCCG 0.00151 TCCT 0.00224 TCGA 0.00296 TCGC 0.00186 TCGG 0.00167 TCGT 0.00285 TCTA 0.00362 TCTC 0.00248 TCTG 0.00269 TCTT 0.00481 TGAA 0.00666 TGAC 0.00321 TGAG 0.00256 TGAT 0.00489 TGCA 0.00392 TGCC 0.00184 TGCG 0.00191 TGCT 0.0028 TGGA 0.00296 TGGC 0.00215 TGGG 0.00178 TGGT 0.00316 TGTA 0.00553 TGTC 0.00306 TGTG 0.00404 TGTT 0.00801 TTAA 0.0135 TTAC 0.00574 TTAG 0.00445 TTAT 0.0127 TTCA 0.00666 TTCC 0.00353 TTCG 0.00352 TTCT 0.00565 TTGA 0.00676 TTGC 0.00436 TTGG 0.0041 TTGT 0.00855 TTTA 0.0159 TTTC 0.00913 TTTG 0.0105 TTTT 0.0291 # l= 4 # Values AAAAA 0.0129 AAAAC 0.00413 AAAAG 0.00287 AAAAT 0.00919 AAACA 0.00355 AAACC 0.00138 AAACG 0.00152 AAACT 0.00262 AAAGA 0.00192 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.000989 AAAGT 0.00266 AAATA 0.00633 AAATC 0.00256 AAATG 0.00311 AAATT 0.00767 AACAA 0.00341 AACAC 0.00152 AACAG 0.00118 AACAT 0.0019 AACCA 0.00112 AACCC 0.000549 AACCG 0.000656 AACCT 0.000783 AACGA 0.00104 AACGC 0.000661 AACGG 0.000538 AACGT 0.00107 AACTA 0.00163 AACTC 0.000889 AACTG 0.00126 AACTT 0.00214 AAGAA 0.00202 AAGAC 0.000831 AAGAG 0.000771 AAGAT 0.00119 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000512 AAGCG 0.000613 AAGCT 0.000794 AAGGA 0.000793 AAGGC 0.000522 AAGGG 0.000493 AAGGT 0.000812 AAGTA 0.00159 AAGTC 0.00093 AAGTG 0.00138 AAGTT 0.00214 AATAA 0.00656 AATAC 0.00174 AATAG 0.00142 AATAT 0.00331 AATCA 0.00206 AATCC 0.000802 AATCG 0.00113 AATCT 0.00136 AATGA 0.00204 AATGC 0.00113 AATGG 0.00104 AATGT 0.00223 AATTA 0.00531 AATTC 0.00222 AATTG 0.00274 AATTT 0.00767 ACAAA 0.00374 ACAAC 0.00131 ACAAG 0.00103 ACAAT 0.00247 ACACA 0.00142 ACACC 0.000672 ACACG 0.000632 ACACT 0.00108 ACAGA 0.000987 ACAGC 0.000593 ACAGG 0.000512 ACAGT 0.00111 ACATA 0.00136 ACATC 0.00072 ACATG 0.00078 ACATT 0.00223 ACCAA 0.00135 ACCAC 0.000636 ACCAG 0.000459 ACCAT 0.000719 ACCCA 0.000519 ACCCC 0.00033 ACCCG 0.000252 ACCCT 0.000404 ACCGA 0.000527 ACCGC 0.00033 ACCGG 0.000333 ACCGT 0.000449 ACCTA 0.000728 ACCTC 0.000449 ACCTG 0.00048 ACCTT 0.000812 ACGAA 0.00111 ACGAC 0.000502 ACGAG 0.0005 ACGAT 0.000739 ACGCA 0.000592 ACGCC 0.000337 ACGCG 0.000287 ACGCT 0.000459 ACGGA 0.00041 ACGGC 0.000307 ACGGG 0.00023 ACGGT 0.000449 ACGTA 0.00082 ACGTC 0.000563 ACGTG 0.000665 ACGTT 0.00107 ACTAA 0.00149 ACTAC 0.000663 ACTAG 0.000573 ACTAT 0.00109 ACTCA 0.000839 ACTCC 0.000371 ACTCG 0.000525 ACTCT 0.000609 ACTGA 0.00101 ACTGC 0.000532 ACTGG 0.000523 ACTGT 0.00111 ACTTA 0.00146 ACTTC 0.000796 ACTTG 0.00112 ACTTT 0.00266 AGAAA 0.00277 AGAAC 0.00074 AGAAG 0.000726 AGAAT 0.00142 AGACA 0.000835 AGACC 0.000319 AGACG 0.000446 AGACT 0.000582 AGAGA 0.000765 AGAGC 0.000421 AGAGG 0.000397 AGAGT 0.000609 AGATA 0.00118 AGATC 0.000425 AGATG 0.000618 AGATT 0.00136 AGCAA 0.0012 AGCAC 0.000534 AGCAG 0.000462 AGCAT 0.000602 AGCCA 0.000522 AGCCC 0.000266 AGCCG 0.000307 AGCCT 0.000329 AGCGA 0.000542 AGCGC 0.000357 AGCGG 0.000295 AGCGT 0.000459 AGCTA 0.000582 AGCTC 0.000405 AGCTG 0.000502 AGCTT 0.000794 AGGAA 0.000984 AGGAC 0.000346 AGGAG 0.00037 AGGAT 0.000536 AGGCA 0.000459 AGGCC 0.000252 AGGCG 0.000287 AGGCT 0.000329 AGGGA 0.000399 AGGGC 0.000285 AGGGG 0.000289 AGGGT 0.000404 AGGTA 0.000741 AGGTC 0.000396 AGGTG 0.000548 AGGTT 0.000783 AGTAA 0.00158 AGTAC 0.000635 AGTAG 0.000598 AGTAT 0.00097 AGTCA 0.000848 AGTCC 0.000383 AGTCG 0.000536 AGTCT 0.000582 AGTGA 0.00102 AGTGC 0.000608 AGTGG 0.000624 AGTGT 0.00108 AGTTA 0.00147 AGTTC 0.000761 AGTTG 0.00106 AGTTT 0.00262 ATAAA 0.00584 ATAAC 0.0017 ATAAG 0.00129 ATAAT 0.00391 ATACA 0.00157 ATACC 0.000558 ATACG 0.000608 ATACT 0.00097 ATAGA 0.000969 ATAGC 0.000539 ATAGG 0.000499 ATAGT 0.00109 ATATA 0.00187 ATATC 0.00101 ATATG 0.00096 ATATT 0.00331 ATCAA 0.00186 ATCAC 0.00101 ATCAG 0.000805 ATCAT 0.00121 ATCCA 0.000674 ATCCC 0.000341 ATCCG 0.000357 ATCCT 0.000536 ATCGA 0.000826 ATCGC 0.000531 ATCGG 0.000437 ATCGT 0.000739 ATCTA 0.000973 ATCTC 0.000683 ATCTG 0.000728 ATCTT 0.00119 ATGAA 0.00179 ATGAC 0.00084 ATGAG 0.000682 ATGAT 0.00121 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.000393 ATGCG 0.000478 ATGCT 0.000602 ATGGA 0.000729 ATGGC 0.000527 ATGGG 0.000398 ATGGT 0.000719 ATGTA 0.00145 ATGTC 0.000747 ATGTG 0.000992 ATGTT 0.0019 ATTAA 0.00445 ATTAC 0.00182 ATTAG 0.00142 ATTAT 0.00391 ATTCA 0.0018 ATTCC 0.00092 ATTCG 0.00093 ATTCT 0.00142 ATTGA 0.00176 ATTGC 0.00117 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.00247 ATTTA 0.00492 ATTTC 0.00267 ATTTG 0.00289 ATTTT 0.00919 CAAAA 0.0049 CAAAC 0.00154 CAAAG 0.00116 CAAAT 0.00289 CAACA 0.00152 CAACC 0.000583 CAACG 0.00057 CAACT 0.00106 CAAGA 0.000903 CAAGC 0.000529 CAAGG 0.000566 CAAGT 0.00112 CAATA 0.0019 CAATC 0.000817 CAATG 0.000966 CAATT 0.00274 CACAA 0.00171 CACAC 0.00075 CACAG 0.000594 CACAT 0.000992 CACCA 0.000742 CACCC 0.000397 CACCG 0.000352 CACCT 0.000548 CACGA 0.000542 CACGC 0.000314 CACGG 0.000241 CACGT 0.000665 CACTA 0.000722 CACTC 0.000556 CACTG 0.000668 CACTT 0.00138 CAGAA 0.00113 CAGAC 0.000435 CAGAG 0.000398 CAGAT 0.000728 CAGCA 0.000554 CAGCC 0.000328 CAGCG 0.000353 CAGCT 0.000502 CAGGA 0.000473 CAGGC 0.000234 CAGGG 0.000268 CAGGT 0.00048 CAGTA 0.000715 CAGTC 0.000524 CAGTG 0.000668 CAGTT 0.00126 CATAA 0.00168 CATAC 0.000517 CATAG 0.00045 CATAT 0.00096 CATCA 0.000825 CATCC 0.000364 CATCG 0.0004 CATCT 0.000618 CATGA 0.000669 CATGC 0.000399 CATGG 0.000359 CATGT 0.00078 CATTA 0.00155 CATTC 0.00081 CATTG 0.000966 CATTT 0.00311 CCAAA 0.0018 CCAAC 0.000737 CCAAG 0.000539 CCAAT 0.00103 CCACA 0.000704 CCACC 0.000435 CCACG 0.000305 CCACT 0.000624 CCAGA 0.000457 CCAGC 0.000286 CCAGG 0.000242 CCAGT 0.000523 CCATA 0.000582 CCATC 0.000391 CCATG 0.000359 CCATT 0.00104 CCCAA 0.000731 CCCAC 0.000386 CCCAG 0.000264 CCCAT 0.000398 CCCCA 0.000421 CCCCC 0.000271 CCCCG 0.000209 CCCCT 0.000289 CCCGA 0.000316 CCCGC 0.00018 CCCGG 0.000193 CCCGT 0.00023 CCCTA 0.000343 CCCTC 0.000273 CCCTG 0.000268 CCCTT 0.000493 CCGAA 0.000636 CCGAC 0.000331 CCGAG 0.000269 CCGAT 0.000437 CCGCA 0.000324 CCGCC 0.000283 CCGCG 0.000177 CCGCT 0.000295 CCGGA 0.000332 CCGGC 0.000226 CCGGG 0.000193 CCGGT 0.000333 CCGTA 0.000351 CCGTC 0.000265 CCGTG 0.000241 CCGTT 0.000538 CCTAA 0.000777 CCTAC 0.000402 CCTAG 0.000248 CCTAT 0.000499 CCTCA 0.000441 CCTCC 0.000291 CCTCG 0.00028 CCTCT 0.000397 CCTGA 0.00043 CCTGC 0.00027 CCTGG 0.000242 CCTGT 0.000512 CCTTA 0.000609 CCTTC 0.000454 CCTTG 0.000566 CCTTT 0.000989 CGAAA 0.00165 CGAAC 0.000493 CGAAG 0.000451 CGAAT 0.00093 CGACA 0.000521 CGACC 0.000325 CGACG 0.000325 CGACT 0.000536 CGAGA 0.000485 CGAGC 0.000296 CGAGG 0.00028 CGAGT 0.000525 CGATA 0.000668 CGATC 0.000333 CGATG 0.0004 CGATT 0.00113 CGCAA 0.000756 CGCAC 0.000378 CGCAG 0.000299 CGCAT 0.000478 CGCCA 0.000513 CGCCC 0.000251 CGCCG 0.000288 CGCCT 0.000287 CGCGA 0.000347 CGCGC 0.000255 CGCGG 0.000177 CGCGT 0.000287 CGCTA 0.000369 CGCTC 0.000318 CGCTG 0.000353 CGCTT 0.000613 CGGAA 0.000636 CGGAC 0.000266 CGGAG 0.000252 CGGAT 0.000357 CGGCA 0.00033 CGGCC 0.000238 CGGCG 0.000288 CGGCT 0.000307 CGGGA 0.000287 CGGGC 0.000171 CGGGG 0.000209 CGGGT 0.000252 CGGTA 0.000362 CGGTC 0.000268 CGGTG 0.000352 CGGTT 0.000656 CGTAA 0.00102 CGTAC 0.000332 CGTAG 0.000336 CGTAT 0.000608 CGTCA 0.000595 CGTCC 0.000301 CGTCG 0.000325 CGTCT 0.000446 CGTGA 0.000511 CGTGC 0.000312 CGTGG 0.000305 CGTGT 0.000632 CGTTA 0.000741 CGTTC 0.000475 CGTTG 0.00057 CGTTT 0.00152 CTAAA 0.00188 CTAAC 0.000668 CTAAG 0.000477 CTAAT 0.00142 CTACA 0.000816 CTACC 0.000355 CTACG 0.000336 CTACT 0.000598 CTAGA 0.000604 CTAGC 0.000283 CTAGG 0.000248 CTAGT 0.000573 CTATA 0.000778 CTATC 0.000454 CTATG 0.00045 CTATT 0.00142 CTCAA 0.00104 CTCAC 0.00046 CTCAG 0.000373 CTCAT 0.000682 CTCCA 0.000517 CTCCC 0.000257 CTCCG 0.000252 CTCCT 0.00037 CTCGA 0.000518 CTCGC 0.000298 CTCGG 0.000269 CTCGT 0.0005 CTCTA 0.0006 CTCTC 0.000423 CTCTG 0.000398 CTCTT 0.000771 CTGAA 0.00105 CTGAC 0.00049 CTGAG 0.000373 CTGAT 0.000805 CTGCA 0.000588 CTGCC 0.000276 CTGCG 0.000299 CTGCT 0.000462 CTGGA 0.000496 CTGGC 0.000289 CTGGG 0.000264 CTGGT 0.000459 CTGTA 0.000898 CTGTC 0.000529 CTGTG 0.000594 CTGTT 0.00118 CTTAA 0.00152 CTTAC 0.000631 CTTAG 0.000477 CTTAT 0.00129 CTTCA 0.000892 CTTCC 0.000487 CTTCG 0.000451 CTTCT 0.000726 CTTGA 0.00098 CTTGC 0.000568 CTTGG 0.000539 CTTGT 0.00103 CTTTA 0.00173 CTTTC 0.00104 CTTTG 0.00116 CTTTT 0.00287 GAAAA 0.0041 GAAAC 0.00133 GAAAG 0.00104 GAAAT 0.00267 GAACA 0.000974 GAACC 0.000393 GAACG 0.000475 GAACT 0.000761 GAAGA 0.000806 GAAGC 0.000497 GAAGG 0.000454 GAAGT 0.000796 GAATA 0.00137 GAATC 0.000662 GAATG 0.00081 GAATT 0.00222 GACAA 0.00118 GACAC 0.000598 GACAG 0.000529 GACAT 0.000747 GACCA 0.000508 GACCC 0.000233 GACCG 0.000268 GACCT 0.000396 GACGA 0.000495 GACGC 0.000344 GACGG 0.000265 GACGT 0.000563 GACTA 0.000552 GACTC 0.000343 GACTG 0.000524 GACTT 0.00093 GAGAA 0.000984 GAGAC 0.000391 GAGAG 0.000423 GAGAT 0.000683 GAGCA 0.00052 GAGCC 0.000256 GAGCG 0.000318 GAGCT 0.000405 GAGGA 0.00043 GAGGC 0.000258 GAGGG 0.000273 GAGGT 0.000449 GAGTA 0.000557 GAGTC 0.000343 GAGTG 0.000556 GAGTT 0.000889 GATAA 0.00179 GATAC 0.000465 GATAG 0.000454 GATAT 0.00101 GATCA 0.000614 GATCC 0.000262 GATCG 0.000333 GATCT 0.000425 GATGA 0.000721 GATGC 0.000374 GATGG 0.000391 GATGT 0.00072 GATTA 0.00131 GATTC 0.000662 GATTG 0.000817 GATTT 0.00256 GCAAA 0.0019 GCAAC 0.000725 GCAAG 0.000568 GCAAT 0.00117 GCACA 0.000694 GCACC 0.000371 GCACG 0.000312 GCACT 0.000608 GCAGA 0.000476 GCAGC 0.000347 GCAGG 0.00027 GCAGT 0.000532 GCATA 0.000579 GCATC 0.000374 GCATG 0.000399 GCATT 0.00113 GCCAA 0.00087 GCCAC 0.000466 GCCAG 0.000289 GCCAT 0.000527 GCCCA 0.00033 GCCCC 0.000289 GCCCG 0.000171 GCCCT 0.000285 GCCGA 0.000349 GCCGC 0.000283 GCCGG 0.000226 GCCGT 0.000307 GCCTA 0.000313 GCCTC 0.000258 GCCTG 0.000234 GCCTT 0.000522 GCGAA 0.000662 GCGAC 0.000372 GCGAG 0.000298 GCGAT 0.000531 GCGCA 0.000399 GCGCC 0.000344 GCGCG 0.000255 GCGCT 0.000357 GCGGA 0.000287 GCGGC 0.000283 GCGGG 0.00018 GCGGT 0.00033 GCGTA 0.000356 GCGTC 0.000344 GCGTG 0.000314 GCGTT 0.000661 GCTAA 0.00079 GCTAC 0.000382 GCTAG 0.000283 GCTAT 0.000539 GCTCA 0.000487 GCTCC 0.000295 GCTCG 0.000296 GCTCT 0.000421 GCTGA 0.00051 GCTGC 0.000347 GCTGG 0.000286 GCTGT 0.000593 GCTTA 0.000669 GCTTC 0.000497 GCTTG 0.000529 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00161 GGAAC 0.000514 GGAAG 0.000487 GGAAT 0.00092 GGACA 0.000476 GGACC 0.000222 GGACG 0.000301 GGACT 0.000383 GGAGA 0.00044 GGAGC 0.000295 GGAGG 0.000291 GGAGT 0.000371 GGATA 0.000482 GGATC 0.000262 GGATG 0.000364 GGATT 0.000802 GGCAA 0.000781 GGCAC 0.000387 GGCAG 0.000276 GGCAT 0.000393 GGCCA 0.000393 GGCCC 0.000236 GGCCG 0.000238 GGCCT 0.000252 GGCGA 0.000376 GGCGC 0.000344 GGCGG 0.000283 GGCGT 0.000337 GGCTA 0.000328 GGCTC 0.000256 GGCTG 0.000328 GGCTT 0.000512 GGGAA 0.000629 GGGAC 0.000277 GGGAG 0.000257 GGGAT 0.000341 GGGCA 0.00032 GGGCC 0.000236 GGGCG 0.000251 GGGCT 0.000266 GGGGA 0.000304 GGGGC 0.000289 GGGGG 0.000271 GGGGT 0.00033 GGGTA 0.000327 GGGTC 0.000233 GGGTG 0.000397 GGGTT 0.000549 GGTAA 0.000912 GGTAC 0.000398 GGTAG 0.000355 GGTAT 0.000558 GGTCA 0.00054 GGTCC 0.000222 GGTCG 0.000325 GGTCT 0.000319 GGTGA 0.00056 GGTGC 0.000371 GGTGG 0.000435 GGTGT 0.000672 GGTTA 0.000753 GGTTC 0.000393 GGTTG 0.000583 GGTTT 0.00138 GTAAA 0.00245 GTAAC 0.000835 GTAAG 0.000631 GTAAT 0.00182 GTACA 0.000904 GTACC 0.000398 GTACG 0.000332 GTACT 0.000635 GTAGA 0.000661 GTAGC 0.000382 GTAGG 0.000402 GTAGT 0.000663 GTATA 0.000982 GTATC 0.000465 GTATG 0.000517 GTATT 0.00174 GTCAA 0.0012 GTCAC 0.000675 GTCAG 0.00049 GTCAT 0.00084 GTCCA 0.000493 GTCCC 0.000277 GTCCG 0.000266 GTCCT 0.000346 GTCGA 0.000502 GTCGC 0.000372 GTCGG 0.000331 GTCGT 0.000502 GTCTA 0.000526 GTCTC 0.000391 GTCTG 0.000435 GTCTT 0.000831 GTGAA 0.00117 GTGAC 0.000675 GTGAG 0.00046 GTGAT 0.00101 GTGCA 0.000687 GTGCC 0.000387 GTGCG 0.000378 GTGCT 0.000534 GTGGA 0.000583 GTGGC 0.000466 GTGGG 0.000386 GTGGT 0.000636 GTGTA 0.000933 GTGTC 0.000598 GTGTG 0.00075 GTGTT 0.00152 GTTAA 0.00173 GTTAC 0.000835 GTTAG 0.000668 GTTAT 0.0017 GTTCA 0.000856 GTTCC 0.000514 GTTCG 0.000493 GTTCT 0.00074 GTTGA 0.00096 GTTGC 0.000725 GTTGG 0.000737 GTTGT 0.00131 GTTTA 0.00208 GTTTC 0.00133 GTTTG 0.00154 GTTTT 0.00413 TAAAA 0.0072 TAAAC 0.00208 TAAAG 0.00173 TAAAT 0.00492 TAACA 0.00197 TAACC 0.000753 TAACG 0.000741 TAACT 0.00147 TAAGA 0.00119 TAAGC 0.000669 TAAGG 0.000609 TAAGT 0.00146 TAATA 0.00343 TAATC 0.00131 TAATG 0.00155 TAATT 0.00531 TACAA 0.00225 TACAC 0.000933 TACAG 0.000898 TACAT 0.00145 TACCA 0.000794 TACCC 0.000327 TACCG 0.000362 TACCT 0.000741 TACGA 0.000767 TACGC 0.000356 TACGG 0.000351 TACGT 0.00082 TACTA 0.000919 TACTC 0.000557 TACTG 0.000715 TACTT 0.00159 TAGAA 0.00152 TAGAC 0.000526 TAGAG 0.0006 TAGAT 0.000973 TAGCA 0.000717 TAGCC 0.000328 TAGCG 0.000369 TAGCT 0.000582 TAGGA 0.000542 TAGGC 0.000313 TAGGG 0.000343 TAGGT 0.000728 TAGTA 0.000919 TAGTC 0.000552 TAGTG 0.000722 TAGTT 0.00163 TATAA 0.00272 TATAC 0.000982 TATAG 0.000778 TATAT 0.00187 TATCA 0.0014 TATCC 0.000482 TATCG 0.000668 TATCT 0.00118 TATGA 0.00109 TATGC 0.000579 TATGG 0.000582 TATGT 0.00136 TATTA 0.00343 TATTC 0.00137 TATTG 0.0019 TATTT 0.00633 TCAAA 0.00306 TCAAC 0.00096 TCAAG 0.00098 TCAAT 0.00176 TCACA 0.00123 TCACC 0.00056 TCACG 0.000511 TCACT 0.00102 TCAGA 0.000769 TCAGC 0.00051 TCAGG 0.00043 TCAGT 0.00101 TCATA 0.00109 TCATC 0.000721 TCATG 0.000669 TCATT 0.00204 TCCAA 0.00116 TCCAC 0.000583 TCCAG 0.000496 TCCAT 0.000729 TCCCA 0.000512 TCCCC 0.000304 TCCCG 0.000287 TCCCT 0.000399 TCCGA 0.000481 TCCGC 0.000287 TCCGG 0.000332 TCCGT 0.00041 TCCTA 0.000542 TCCTC 0.00043 TCCTG 0.000473 TCCTT 0.000793 TCGAA 0.00112 TCGAC 0.000502 TCGAG 0.000518 TCGAT 0.000826 TCGCA 0.000598 TCGCC 0.000376 TCGCG 0.000347 TCGCT 0.000542 TCGGA 0.000481 TCGGC 0.000349 TCGGG 0.000316 TCGGT 0.000527 TCGTA 0.000767 TCGTC 0.000495 TCGTG 0.000542 TCGTT 0.00104 TCTAA 0.00139 TCTAC 0.000661 TCTAG 0.000604 TCTAT 0.000969 TCTCA 0.00079 TCTCC 0.00044 TCTCG 0.000485 TCTCT 0.000765 TCTGA 0.000769 TCTGC 0.000476 TCTGG 0.000457 TCTGT 0.000987 TCTTA 0.00119 TCTTC 0.000806 TCTTG 0.000903 TCTTT 0.00192 TGAAA 0.00311 TGAAC 0.000856 TGAAG 0.000892 TGAAT 0.0018 TGACA 0.00123 TGACC 0.00054 TGACG 0.000595 TGACT 0.000848 TGAGA 0.00079 TGAGC 0.000487 TGAGG 0.000441 TGAGT 0.000839 TGATA 0.0014 TGATC 0.000614 TGATG 0.000825 TGATT 0.00206 TGCAA 0.00163 TGCAC 0.000687 TGCAG 0.000588 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.00073 TGCCC 0.00032 TGCCG 0.00033 TGCCT 0.000459 TGCGA 0.000598 TGCGC 0.000399 TGCGG 0.000324 TGCGT 0.000592 TGCTA 0.000717 TGCTC 0.00052 TGCTG 0.000554 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00128 TGGAC 0.000493 TGGAG 0.000517 TGGAT 0.000674 TGGCA 0.00073 TGGCC 0.000393 TGGCG 0.000513 TGGCT 0.000522 TGGGA 0.000512 TGGGC 0.00033 TGGGG 0.000421 TGGGT 0.000519 TGGTA 0.000794 TGGTC 0.000508 TGGTG 0.000742 TGGTT 0.00112 TGTAA 0.00224 TGTAC 0.000904 TGTAG 0.000816 TGTAT 0.00157 TGTCA 0.00123 TGTCC 0.000476 TGTCG 0.000521 TGTCT 0.000835 TGTGA 0.00123 TGTGC 0.000694 TGTGG 0.000704 TGTGT 0.00142 TGTTA 0.00197 TGTTC 0.000974 TGTTG 0.00152 TGTTT 0.00355 TTAAA 0.00576 TTAAC 0.00173 TTAAG 0.00152 TTAAT 0.00445 TTACA 0.00224 TTACC 0.000912 TTACG 0.00102 TTACT 0.00158 TTAGA 0.00139 TTAGC 0.00079 TTAGG 0.000777 TTAGT 0.00149 TTATA 0.00272 TTATC 0.00179 TTATG 0.00168 TTATT 0.00656 TTCAA 0.00266 TTCAC 0.00117 TTCAG 0.00105 TTCAT 0.00179 TTCCA 0.00128 TTCCC 0.000629 TTCCG 0.000636 TTCCT 0.000984 TTCGA 0.00112 TTCGC 0.000662 TTCGG 0.000636 TTCGT 0.00111 TTCTA 0.00152 TTCTC 0.000984 TTCTG 0.00113 TTCTT 0.00202 TTGAA 0.00266 TTGAC 0.0012 TTGAG 0.00104 TTGAT 0.00186 TTGCA 0.00163 TTGCC 0.000781 TTGCG 0.000756 TTGCT 0.0012 TTGGA 0.00116 TTGGC 0.00087 TTGGG 0.000731 TTGGT 0.00135 TTGTA 0.00225 TTGTC 0.00118 TTGTG 0.00171 TTGTT 0.00341 TTTAA 0.00576 TTTAC 0.00245 TTTAG 0.00188 TTTAT 0.00584 TTTCA 0.00311 TTTCC 0.00161 TTTCG 0.00165 TTTCT 0.00277 TTTGA 0.00306 TTTGC 0.0019 TTTGG 0.0018 TTTGT 0.00374 TTTTA 0.0072 TTTTC 0.0041 TTTTG 0.0049 TTTTT 0.0129 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4485 AAAAC 0.1382 AAAAG 0.09649 AAAAT 0.3169 AAACA 0.3938 AAACC 0.1492 AAACG 0.1621 AAACT 0.2948 AAAGA 0.2881 AAAGC 0.178 AAAGG 0.1394 AAAGT 0.3945 AAATA 0.3243 AAATC 0.1262 AAATG 0.1565 AAATT 0.3929 AACAA 0.4268 AACAC 0.1845 AACAG 0.1466 AACAT 0.242 AACCA 0.3665 AACCC 0.1698 AACCG 0.2059 AACCT 0.2578 AACGA 0.3168 AACGC 0.1973 AACGG 0.1578 AACGT 0.3282 AACTA 0.2804 AACTC 0.1467 AACTG 0.2067 AACTT 0.3662 AAGAA 0.4259 AAGAC 0.1678 AAGAG 0.1565 AAGAT 0.2498 AAGCA 0.3507 AAGCC 0.1693 AAGCG 0.2013 AAGCT 0.2787 AAGGA 0.3077 AAGGC 0.1959 AAGGG 0.1787 AAGGT 0.3177 AAGTA 0.2679 AAGTC 0.1508 AAGTG 0.2197 AAGTT 0.3617 AATAA 0.5034 AATAC 0.1314 AATAG 0.1074 AATAT 0.2578 AATCA 0.386 AATCC 0.1471 AATCG 0.2047 AATCT 0.2621 AATGA 0.3163 AATGC 0.1722 AATGG 0.1586 AATGT 0.3529 AATTA 0.2977 AATTC 0.122 AATTG 0.1473 AATTT 0.4331 ACAAA 0.4428 ACAAC 0.1499 ACAAG 0.1185 ACAAT 0.2889 ACACA 0.3756 ACACC 0.1744 ACACG 0.1611 ACACT 0.2889 ACAGA 0.3179 ACAGC 0.1794 ACAGG 0.1591 ACAGT 0.3436 ACATA 0.2695 ACATC 0.1397 ACATG 0.1475 ACATT 0.4433 ACCAA 0.4276 ACCAC 0.1959 ACCAG 0.1419 ACCAT 0.2345 ACCCA 0.3476 ACCCC 0.2088 ACCCG 0.1605 ACCCT 0.283 ACCGA 0.3282 ACCGC 0.1944 ACCGG 0.2013 ACCGT 0.2762 ACCTA 0.3046 ACCTC 0.175 ACCTG 0.1893 ACCTT 0.331 ACGAA 0.391 ACGAC 0.1743 ACGAG 0.1727 ACGAT 0.262 ACGCA 0.3582 ACGCC 0.1976 ACGCG 0.1622 ACGCT 0.2819 ACGGA 0.2983 ACGGC 0.214 ACGGG 0.1611 ACGGT 0.3266 ACGTA 0.2688 ACGTC 0.1768 ACGTG 0.2055 ACGTT 0.3489 ACTAA 0.3936 ACTAC 0.1716 ACTAG 0.1466 ACTAT 0.2882 ACTCA 0.3623 ACTCC 0.1541 ACTCG 0.2132 ACTCT 0.2704 ACTGA 0.3216 ACTGC 0.1675 ACTGG 0.1597 ACTGT 0.3513 ACTTA 0.2425 ACTTC 0.1328 ACTTG 0.1793 ACTTT 0.4454 AGAAA 0.4915 AGAAC 0.1287 AGAAG 0.127 AGAAT 0.2528 AGACA 0.3884 AGACC 0.1447 AGACG 0.1953 AGACT 0.2716 AGAGA 0.3551 AGAGC 0.19 AGAGG 0.1727 AGAGT 0.2822 AGATA 0.3335 AGATC 0.1175 AGATG 0.169 AGATT 0.38 AGCAA 0.4285 AGCAC 0.187 AGCAG 0.1656 AGCAT 0.2189 AGCCA 0.3693 AGCCC 0.1781 AGCCG 0.2117 AGCCT 0.2409 AGCGA 0.3354 AGCGC 0.2072 AGCGG 0.1745 AGCGT 0.2829 AGCTA 0.2617 AGCTC 0.1728 AGCTG 0.2121 AGCTT 0.3535 AGGAA 0.4425 AGGAC 0.1534 AGGAG 0.1611 AGGAT 0.2429 AGGCA 0.3547 AGGCC 0.1833 AGGCG 0.2075 AGGCT 0.2544 AGGGA 0.2947 AGGGC 0.2002 AGGGG 0.196 AGGGT 0.309 AGGTA 0.3111 AGGTC 0.1534 AGGTG 0.2164 AGGTT 0.3192 AGTAA 0.4183 AGTAC 0.1645 AGTAG 0.1586 AGTAT 0.2586 AGTCA 0.3641 AGTCC 0.1583 AGTCG 0.2218 AGTCT 0.2558 AGTGA 0.3086 AGTGC 0.1809 AGTGG 0.1821 AGTGT 0.3284 AGTTA 0.2526 AGTTC 0.1267 AGTTG 0.1745 AGTTT 0.4462 ATAAA 0.4564 ATAAC 0.1314 ATAAG 0.1002 ATAAT 0.312 ATACA 0.4242 ATACC 0.1517 ATACG 0.1593 ATACT 0.2648 ATAGA 0.3146 ATAGC 0.1709 ATAGG 0.1579 ATAGT 0.3565 ATATA 0.2623 ATATC 0.1381 ATATG 0.1328 ATATT 0.4667 ATCAA 0.3824 ATCAC 0.2021 ATCAG 0.1644 ATCAT 0.2511 ATCCA 0.3594 ATCCC 0.1715 ATCCG 0.1837 ATCCT 0.2854 ATCGA 0.3305 ATCGC 0.2045 ATCGG 0.1702 ATCGT 0.2948 ATCTA 0.2781 ATCTC 0.1833 ATCTG 0.2013 ATCTT 0.3374 ATGAA 0.4019 ATGAC 0.1818 ATGAG 0.1474 ATGAT 0.2689 ATGCA 0.4137 ATGCC 0.1533 ATGCG 0.184 ATGCT 0.2489 ATGGA 0.3086 ATGGC 0.2158 ATGGG 0.1619 ATGGT 0.3137 ATGTA 0.2883 ATGTC 0.1442 ATGTG 0.1895 ATGTT 0.378 ATTAA 0.385 ATTAC 0.1522 ATTAG 0.1204 ATTAT 0.3424 ATTCA 0.3581 ATTCC 0.177 ATTCG 0.1745 ATTCT 0.2904 ATTGA 0.2752 ATTGC 0.1776 ATTGG 0.1568 ATTGT 0.3904 ATTTA 0.2498 ATTTC 0.1319 ATTTG 0.1434 ATTTT 0.4749 CAAAA 0.4757 CAAAC 0.1408 CAAAG 0.1083 CAAAT 0.2751 CAACA 0.4101 CAACC 0.1518 CAACG 0.1491 CAACT 0.2891 CAAGA 0.2975 CAAGC 0.1656 CAAGG 0.1765 CAAGT 0.3604 CAATA 0.3003 CAATC 0.1237 CAATG 0.1484 CAATT 0.4276 CACAA 0.4263 CACAC 0.1781 CACAG 0.1469 CACAT 0.2486 CACCA 0.3702 CACCC 0.1927 CACCG 0.1632 CACCT 0.2739 CACGA 0.3108 CACGC 0.1739 CACGG 0.1319 CACGT 0.3834 CACTA 0.2231 CACTC 0.1616 CACTG 0.2005 CACTT 0.4147 CAGAA 0.4287 CAGAC 0.1564 CAGAG 0.145 CAGAT 0.2699 CAGCA 0.3247 CAGCC 0.1824 CAGCG 0.2016 CAGCT 0.2913 CAGGA 0.3212 CAGGC 0.1595 CAGGG 0.1877 CAGGT 0.3316 CAGTA 0.2319 CAGTC 0.16 CAGTG 0.208 CAGTT 0.4 CATAA 0.4643 CATAC 0.1419 CATAG 0.1252 CATAT 0.2686 CATCA 0.3753 CATCC 0.1619 CATCG 0.1761 CATCT 0.2867 CATGA 0.3072 CATGC 0.1772 CATGG 0.1594 CATGT 0.3562 CATTA 0.2414 CATTC 0.1235 CATTG 0.1451 CATTT 0.49 CCAAA 0.4463 CCAAC 0.1754 CCAAG 0.1285 CCAAT 0.2497 CCACA 0.3522 CCACC 0.2073 CCACG 0.1375 CCACT 0.303 CCAGA 0.3099 CCAGC 0.1856 CCAGG 0.1558 CCAGT 0.3487 CCATA 0.2513 CCATC 0.1599 CCATG 0.1465 CCATT 0.4422 CCCAA 0.4128 CCCAC 0.2135 CCCAG 0.1452 CCCAT 0.2285 CCCCA 0.3604 CCCCC 0.2228 CCCCG 0.1707 CCCCT 0.246 CCCGA 0.3455 CCCGC 0.1879 CCCGG 0.2094 CCCGT 0.2572 CCCTA 0.2569 CCCTC 0.1918 CCCTG 0.2014 CCCTT 0.3499 CCGAA 0.3868 CCGAC 0.1927 CCGAG 0.155 CCGAT 0.2655 CCGCA 0.3075 CCGCC 0.2518 CCGCG 0.1571 CCGCT 0.2836 CCGGA 0.3173 CCGGC 0.1981 CCGGG 0.1721 CCGGT 0.3125 CCGTA 0.2586 CCGTC 0.1858 CCGTG 0.1647 CCGTT 0.3909 CCTAA 0.4036 CCTAC 0.2086 CCTAG 0.1275 CCTAT 0.2602 CCTCA 0.3206 CCTCC 0.2009 CCTCG 0.1909 CCTCT 0.2876 CCTGA 0.295 CCTGC 0.1801 CCTGG 0.16 CCTGT 0.3649 CCTTA 0.2355 CCTTC 0.1743 CCTTG 0.2113 CCTTT 0.3788 CGAAA 0.4714 CGAAC 0.1369 CGAAG 0.1294 CGAAT 0.2622 CGACA 0.3117 CGACC 0.1862 CGACG 0.1811 CGACT 0.3209 CGAGA 0.3102 CGAGC 0.1859 CGAGG 0.1714 CGAGT 0.3325 CGATA 0.2675 CGATC 0.1258 CGATG 0.1572 CGATT 0.4495 CGCAA 0.3978 CGCAC 0.1925 CGCAG 0.1569 CGCAT 0.2528 CGCCA 0.3924 CGCCC 0.1835 CGCCG 0.2035 CGCCT 0.2206 CGCGA 0.3313 CGCGC 0.234 CGCGG 0.162 CGCGT 0.2727 CGCTA 0.2252 CGCTC 0.1865 CGCTG 0.2148 CGCTT 0.3735 CGGAA 0.4227 CGGAC 0.1748 CGGAG 0.1608 CGGAT 0.2416 CGGCA 0.2904 CGGCC 0.2027 CGGCG 0.2338 CGGCT 0.2731 CGGGA 0.3207 CGGGC 0.1791 CGGGG 0.2186 CGGGT 0.2816 CGGTA 0.2266 CGGTC 0.1596 CGGTG 0.2062 CGGTT 0.4076 CGTAA 0.4381 CGTAC 0.1446 CGTAG 0.1462 CGTAT 0.2711 CGTCA 0.3623 CGTCC 0.177 CGTCG 0.1866 CGTCT 0.2741 CGTGA 0.2916 CGTGC 0.1735 CGTGG 0.1663 CGTGT 0.3685 CGTTA 0.2253 CGTTC 0.1408 CGTTG 0.1701 CGTTT 0.4638 CTAAA 0.4321 CTAAC 0.145 CTAAG 0.107 CTAAT 0.3159 CTACA 0.3915 CTACC 0.1649 CTACG 0.1535 CTACT 0.2901 CTAGA 0.3575 CTAGC 0.1611 CTAGG 0.144 CTAGT 0.3374 CTATA 0.2547 CTATC 0.1434 CTATG 0.1453 CTATT 0.4566 CTCAA 0.4117 CTCAC 0.1723 CTCAG 0.149 CTCAT 0.267 CTCCA 0.3782 CTCCC 0.1801 CTCCG 0.1734 CTCCT 0.2684 CTCGA 0.3313 CTCGC 0.184 CTCGG 0.1639 CTCGT 0.3208 CTCTA 0.2768 CTCTC 0.1895 CTCTG 0.1805 CTCTT 0.3532 CTGAA 0.394 CTGAC 0.1726 CTGAG 0.138 CTGAT 0.2954 CTGCA 0.3653 CTGCC 0.1643 CTGCG 0.1776 CTGCT 0.2927 CTGGA 0.3366 CTGGC 0.1861 CTGGG 0.1678 CTGGT 0.3095 CTGTA 0.2894 CTGTC 0.1583 CTGTG 0.1814 CTGTT 0.3709 CTTAA 0.3882 CTTAC 0.1576 CTTAG 0.1228 CTTAT 0.3314 CTTCA 0.351 CTTCC 0.1869 CTTCG 0.1715 CTTCT 0.2906 CTTGA 0.3179 CTTGC 0.1791 CTTGG 0.1686 CTTGT 0.3344 CTTTA 0.2585 CTTTC 0.1496 CTTTG 0.1663 CTTTT 0.4256 GAAAA 0.4558 GAAAC 0.142 GAAAG 0.1119 GAAAT 0.2904 GAACA 0.3804 GAACC 0.1464 GAACG 0.1752 GAACT 0.2979 GAAGA 0.3204 GAAGC 0.1891 GAAGG 0.1731 GAAGT 0.3174 GAATA 0.2741 GAATC 0.1273 GAATG 0.1573 GAATT 0.4412 GACAA 0.3915 GACAC 0.1915 GACAG 0.1685 GACAT 0.2486 GACCA 0.3724 GACCC 0.162 GACCG 0.1835 GACCT 0.2822 GACGA 0.3002 GACGC 0.1989 GACGG 0.1557 GACGT 0.3452 GACTA 0.2401 GACTC 0.14 GACTG 0.2178 GACTT 0.4021 GAGAA 0.4033 GAGAC 0.1523 GAGAG 0.1699 GAGAT 0.2744 GAGCA 0.357 GAGCC 0.1648 GAGCG 0.203 GAGCT 0.2752 GAGGA 0.3094 GAGGC 0.1784 GAGGG 0.1887 GAGGT 0.3236 GAGTA 0.2447 GAGTC 0.1401 GAGTG 0.2284 GAGTT 0.3867 GATAA 0.4748 GATAC 0.127 GATAG 0.1221 GATAT 0.2762 GATCA 0.3845 GATCC 0.1559 GATCG 0.1904 GATCT 0.2692 GATGA 0.3258 GATGC 0.1678 GATGG 0.1723 GATGT 0.3341 GATTA 0.2478 GATTC 0.122 GATTG 0.1478 GATTT 0.4824 GCAAA 0.4415 GCAAC 0.1661 GCAAG 0.1278 GCAAT 0.2647 GCACA 0.3587 GCACC 0.1825 GCACG 0.1481 GCACT 0.3107 GCAGA 0.3043 GCAGC 0.2042 GCAGG 0.1593 GCAGT 0.3322 GCATA 0.24 GCATC 0.1482 GCATG 0.155 GCATT 0.4568 GCCAA 0.4096 GCCAC 0.2083 GCCAG 0.1321 GCCAT 0.2499 GCCCA 0.3159 GCCCC 0.2556 GCCCG 0.1532 GCCCT 0.2753 GCCGA 0.3075 GCCGC 0.2372 GCCGG 0.1883 GCCGT 0.267 GCCTA 0.2428 GCCTC 0.1866 GCCTG 0.176 GCCTT 0.3946 GCGAA 0.3614 GCGAC 0.1971 GCGAG 0.1557 GCGAT 0.2857 GCGCA 0.303 GCGCC 0.2493 GCGCG 0.1803 GCGCT 0.2674 GCGGA 0.2735 GCGGC 0.2569 GCGGG 0.159 GCGGT 0.3106 GCGTA 0.2182 GCGTC 0.1967 GCGTG 0.18 GCGTT 0.405 GCTAA 0.3989 GCTAC 0.1885 GCTAG 0.1387 GCTAT 0.2739 GCTCA 0.3263 GCTCC 0.1895 GCTCG 0.1915 GCTCT 0.2927 GCTGA 0.298 GCTGC 0.1946 GCTGG 0.1606 GCTGT 0.3468 GCTTA 0.2303 GCTTC 0.168 GCTTG 0.175 GCTTT 0.4268 GGAAA 0.455 GGAAC 0.1432 GGAAG 0.1392 GGAAT 0.2626 GGACA 0.357 GGACC 0.1584 GGACG 0.2077 GGACT 0.2769 GGAGA 0.3229 GGAGC 0.206 GGAGG 0.202 GGAGT 0.2692 GGATA 0.2568 GGATC 0.1342 GGATG 0.1883 GGATT 0.4208 GGCAA 0.4291 GGCAC 0.2061 GGCAG 0.1489 GGCAT 0.2159 GGCCA 0.3573 GGCCC 0.2007 GGCCG 0.21 GGCCT 0.232 GGCGA 0.286 GGCGC 0.2524 GGCGG 0.2025 GGCGT 0.2591 GGCTA 0.232 GGCTC 0.1761 GGCTG 0.2261 GGCTT 0.3657 GGGAA 0.4231 GGGAC 0.1814 GGGAG 0.1683 GGGAT 0.2273 GGGCA 0.306 GGGCC 0.212 GGGCG 0.2307 GGGCT 0.2513 GGGGA 0.2587 GGGGC 0.233 GGGGG 0.2225 GGGGT 0.2857 GGGTA 0.2255 GGGTC 0.1514 GGGTG 0.2616 GGGTT 0.3615 GGTAA 0.409 GGTAC 0.1749 GGTAG 0.1575 GGTAT 0.2587 GGTCA 0.3858 GGTCC 0.1564 GGTCG 0.2223 GGTCT 0.2355 GGTGA 0.2786 GGTGC 0.1787 GGTGG 0.2095 GGTGT 0.3332 GGTTA 0.2416 GGTTC 0.1243 GGTTG 0.183 GGTTT 0.451 GTAAA 0.4328 GTAAC 0.1432 GTAAG 0.1085 GTAAT 0.3156 GTACA 0.3991 GTACC 0.1731 GTACG 0.1434 GTACT 0.2844 GTAGA 0.3178 GTAGC 0.1758 GTAGG 0.1892 GTAGT 0.3173 GTATA 0.2699 GTATC 0.1248 GTATG 0.1378 GTATT 0.4676 GTCAA 0.3786 GTCAC 0.2047 GTCAG 0.1506 GTCAT 0.2661 GTCCA 0.3619 GTCCC 0.194 GTCCG 0.1885 GTCCT 0.2556 GTCGA 0.2958 GTCGC 0.2157 GTCGG 0.1888 GTCGT 0.2997 GTCTA 0.245 GTCTC 0.1726 GTCTG 0.1979 GTCTT 0.3845 GTGAA 0.36 GTGAC 0.1982 GTGAG 0.1349 GTGAT 0.3069 GTGCA 0.3521 GTGCC 0.19 GTGCG 0.1819 GTGCT 0.2761 GTGGA 0.2901 GTGGC 0.2152 GTGGG 0.1811 GTGGT 0.3135 GTGTA 0.2476 GTGTC 0.1562 GTGTG 0.191 GTGTT 0.4052 GTTAA 0.354 GTTAC 0.1662 GTTAG 0.133 GTTAT 0.3469 GTTCA 0.334 GTTCC 0.1916 GTTCG 0.1809 GTTCT 0.2935 GTTGA 0.2604 GTTGC 0.1943 GTTGG 0.1921 GTTGT 0.3532 GTTTA 0.2327 GTTTC 0.1435 GTTTG 0.1633 GTTTT 0.4605 TAAAA 0.457 TAAAC 0.1285 TAAAG 0.1079 TAAAT 0.3067 TAACA 0.403 TAACC 0.1466 TAACG 0.1444 TAACT 0.306 TAAGA 0.311 TAAGC 0.1665 TAAGG 0.1502 TAAGT 0.3723 TAATA 0.3018 TAATC 0.1099 TAATG 0.1307 TAATT 0.4577 TACAA 0.4076 TACAC 0.1622 TACAG 0.1646 TACAT 0.2656 TACCA 0.3605 TACCC 0.1437 TACCG 0.1552 TACCT 0.3407 TACGA 0.3364 TACGC 0.1522 TACGG 0.1495 TACGT 0.362 TACTA 0.2485 TACTC 0.1442 TACTG 0.1862 TACTT 0.4212 TAGAA 0.4245 TAGAC 0.1413 TAGAG 0.1622 TAGAT 0.2721 TAGCA 0.3689 TAGCC 0.1558 TAGCG 0.176 TAGCT 0.2993 TAGGA 0.2831 TAGGC 0.1588 TAGGG 0.1729 TAGGT 0.3852 TAGTA 0.2457 TAGTC 0.14 TAGTG 0.1837 TAGTT 0.4306 TATAA 0.4306 TATAC 0.1539 TATAG 0.1215 TATAT 0.2939 TATCA 0.3714 TATCC 0.1278 TATCG 0.1734 TATCT 0.3273 TATGA 0.3044 TATGC 0.1592 TATGG 0.1586 TATGT 0.3777 TATTA 0.2678 TATTC 0.1034 TATTG 0.1411 TATTT 0.4877 TCAAA 0.461 TCAAC 0.1396 TCAAG 0.1422 TCAAT 0.2572 TCACA 0.3739 TCACC 0.1675 TCACG 0.1466 TCACT 0.312 TCAGA 0.2946 TCAGC 0.182 TCAGG 0.1519 TCAGT 0.3714 TCATA 0.2474 TCATC 0.1552 TCATG 0.1449 TCATT 0.4525 TCCAA 0.3949 TCCAC 0.1937 TCCAG 0.1649 TCCAT 0.2465 TCCCA 0.3499 TCCCC 0.1915 TCCCG 0.1851 TCCCT 0.2734 TCCGA 0.3216 TCCGC 0.1849 TCCGG 0.2209 TCCGT 0.2726 TCCTA 0.2501 TCCTC 0.187 TCCTG 0.2049 TCCTT 0.3581 TCGAA 0.3852 TCGAC 0.1641 TCGAG 0.1702 TCGAT 0.2804 TCGCA 0.3276 TCGCC 0.1957 TCGCG 0.1768 TCGCT 0.2999 TCGGA 0.2926 TCGGC 0.2049 TCGGG 0.1799 TCGGT 0.3226 TCGTA 0.2754 TCGTC 0.1695 TCGTG 0.1837 TCGTT 0.3714 TCTAA 0.3892 TCTAC 0.1805 TCTAG 0.1631 TCTAT 0.2671 TCTCA 0.3224 TCTCC 0.173 TCTCG 0.1861 TCTCT 0.3185 TCTGA 0.2913 TCTGC 0.1752 TCTGG 0.1621 TCTGT 0.3714 TCTTA 0.2501 TCTTC 0.1655 TCTTG 0.1827 TCTTT 0.4016 TGAAA 0.4713 TGAAC 0.1265 TGAAG 0.1326 TGAAT 0.2695 TGACA 0.3863 TGACC 0.165 TGACG 0.1796 TGACT 0.2691 TGAGA 0.3148 TGAGC 0.1855 TGAGG 0.1686 TGAGT 0.3311 TGATA 0.2851 TGATC 0.1264 TGATG 0.1667 TGATT 0.4218 TGCAA 0.418 TGCAC 0.1716 TGCAG 0.1486 TGCAT 0.2618 TGCCA 0.4045 TGCCC 0.166 TGCCG 0.1724 TGCCT 0.2571 TGCGA 0.3186 TGCGC 0.2042 TGCGG 0.1646 TGCGT 0.3126 TGCTA 0.2627 TGCTC 0.1825 TGCTG 0.1926 TGCTT 0.3622 TGGAA 0.4387 TGGAC 0.1626 TGGAG 0.1699 TGGAT 0.2289 TGGCA 0.3489 TGGCC 0.1765 TGGCG 0.2308 TGGCT 0.2438 TGGGA 0.2962 TGGGC 0.1804 TGGGG 0.2255 TGGGT 0.2979 TGGTA 0.2576 TGGTC 0.1585 TGGTG 0.2288 TGGTT 0.3551 TGTAA 0.4045 TGTAC 0.16 TGTAG 0.1483 TGTAT 0.2872 TGTCA 0.3996 TGTCC 0.156 TGTCG 0.1647 TGTCT 0.2797 TGTGA 0.3038 TGTGC 0.1716 TGTGG 0.1739 TGTGT 0.3507 TGTTA 0.2486 TGTTC 0.1209 TGTTG 0.185 TGTTT 0.4455 TTAAA 0.4335 TTAAC 0.1261 TTAAG 0.1105 TTAAT 0.33 TTACA 0.3924 TTACC 0.1574 TTACG 0.169 TTACT 0.2812 TTAGA 0.3185 TTAGC 0.173 TTAGG 0.1702 TTAGT 0.3383 TTATA 0.218 TTATC 0.1347 TTATG 0.1302 TTATT 0.5171 TTCAA 0.4034 TTCAC 0.1701 TTCAG 0.1573 TTCAT 0.2693 TTCCA 0.3725 TTCCC 0.1726 TTCCG 0.1738 TTCCT 0.2811 TTCGA 0.3242 TTCGC 0.1847 TTCGG 0.177 TTCGT 0.314 TTCTA 0.2714 TTCTC 0.1685 TTCTG 0.2001 TTCTT 0.36 TTGAA 0.4021 TTGAC 0.1727 TTGAG 0.1518 TTGAT 0.2735 TTGCA 0.3792 TTGCC 0.1749 TTGCG 0.1662 TTGCT 0.2797 TTGGA 0.2887 TTGGC 0.2065 TTGGG 0.1709 TTGGT 0.3339 TTGTA 0.2663 TTGTC 0.1367 TTGTG 0.1957 TTGTT 0.4013 TTTAA 0.3665 TTTAC 0.1513 TTTAG 0.1194 TTTAT 0.3629 TTTCA 0.3458 TTTCC 0.1693 TTTCG 0.1732 TTTCT 0.3117 TTTGA 0.2956 TTTGC 0.1776 TTTGG 0.168 TTTGT 0.3588 TTTTA 0.2482 TTTTC 0.1381 TTTTG 0.1654 TTTTT 0.4482