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Reference ( gi|1 )            :                                                                 TACA-ATA-AA--C-ATATACATTA-TGTAAACAAACA-CTGGAGTGAAAATTAAACAGAATGGAACA-ACCAA--TG----AGAAGCATAT---ATCAACTTTAAATAAGTAATTT-ATTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAAT-TC-ATGTTTTCTTCTA-TA-AAA------AGCATTTAAC-AAGTACTT-TGAAACAGAGATTATATCACATTTATCTGGTGTGAGCACA-----ATC-----AAATAGAT-TTAAAAAAAAACTAGATCTTAGCCAAGCGT--CATTAAGGCATAGTAA---TCCAA---------G-ATGTTAATAAACTGGGCA-TTCGGAATAGAAATGAAACTCATTTTCAGTTACACGTACATTTGCTTTATGACAAAATAAACAAAGTCGTAGAATT
gi|15                         :                                                                 TATA-ATA-AA--A-ATATACATTGGTGTAAGCAAACA-TTGGAGCTAAAATCAG-CAGAATGGAACA-AACAA--TT----AAAAACAT----------------ATAAGTAATTT-GTTAAGTTA
gi|6                          :                                                       tcacacaaaaTACA-ATA-AA--C-ATAT------------ACAAACATTTGAAGTGAAAATCAAATAGAA-GTAACA----AA--T-------------------TTAGCTT--AATA-------T-ATTA-----------T--GGAT---TTAT-ATTTCCTAAT-TCTATA-TTTCTTTTACCA-AAAAACATTAACATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATAAGATC
gi|3                          :                cataaacatagactattcagtactataggccggtctaacagtggtcaaaaACA-ACATAA--T--TATACACTA-TGTAAACTAACA-CTGGAGTGACCATCAAAAAGAATGGAACA-AACAA--TT----AAAAATATAT---GTTAACTT-AAATTAGTAATTT-GTTAAGTTACATTTAT---------TTAT-ATTTTCTAAT-TT-TAGTTTTCTTTTA-TC-AAA------AGCATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATTATATCACGTTTGTCTGATGTGGACATCCTTGTATA-----AAATAGATGTT---AAAGATCTAGAACTTAGCCAGACAT--CTTTAAAGTAGAGTAG---GCCAA---------G-GTGTTCATAAA-------------AAT-GAAATGAAATTCATCTTCAACTTCATGTACATTTGttgatttgaattcatatctcaaccaaacat
gi|2                          :                                                       gttatacatagACAGATA-AA--TTATATGAATTA-TGCAAACAAACA-CTAGAGTGGCCATCAAATAAAATGAAACA-AACA--------------CAGAC---AT-----TTAAATAAGCGTTTTTATCAAG--ACATCTCG--AAAG---T-AT-AGTTCCTTAT-TCTAT-TTTTATTTTA-TC-AAA------AGCATTTAAC-CAGTATTT-TGAG--AAAGATCATGTC----TTATCTGATATGGACATAATTGTATC-----AAACATAT------AAATAACTTGATATTAACCA--CGTAGCATTAAAATATTGAAT---TTCAA---------ATATATC--TAAACT---CATTTCGTGATAat
gi|13                         : agcaaagtcattgacatatacaaagtttattcagtaatataggtcactgacacaacatatcataaACA-ATA-AA--C-GTAT---------TAAACAAACA-CTGGAGTGACAATCAAATAGAATCGAATA-
gi|18                         :              ataaacatcgttagttcagtaatgtatgccactggcaaaaaaaccccacaacaaa-ATA-AAATT-ATGTACATTA-TTTAAACAAACA-TTGGAGTGACAATCAAATAGAATcacacttaaaaa
gi|12                         :                                                                        A-AA--C-ATATATATTT-TGTAAACAAACA-TTGGAGTGACAATCAAATAGAATGTAACA-AACAAA-TT----CGTAACATAT---ATTAACTTTAAAAAAGTG-TTT-GTTAGTTTACATTTAT--AGAC---TTAT-ATTTTCTAAT-TC-ttaagttcaaaaaaat
gi|10                         :                                                                                               AACAAACA-TTGGAATGACAACCAAATAGATTGGAACA-AAC----TGTTTCAGAAAAAAAG---ATTCACTTTTGATAAG--------TTAAATTA-----AT--AGGT---TTGT-AGTTCATAATATC-A-GTGTTCTGAT--TACAAG------GGCATTTAGT-AAGTACTC-TGAca
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gi|14                         :                                                                                                                          AGAATAAAACA-AACAAATTG----AAAA-CATATTAAATTAACTTTAAATAAATA-TTT-GCAAGGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTC
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Reference ( family-980 )      :                                                                 TACA-ATA-AA--C-ATATACATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACATAT---ATTAACTTTAAATAAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCNAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATNATATCACGTTTATCTGATGTGGACATA--TGTATTAAATANA---T-TT--AAAAGATCTAGATCTTAGCCAGACATCTTTA-AAGTATAGAAG---TTC---------GAGGTGTTCGTANATTGGGCATTC-G-AATAGAAACGAAACTCATCTTCAACTTCATGTACATTTG
gi|1                          :                                                                 TACA-ATA-AA--C-ATATACATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGAAAATTAAACAGAATGGAACAACC-AA-TG--AGAAGCATAT---ATCAACTTTAAATAAGTA-ATTTATTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCATGTTT------TCTT-CT--ATAAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAAACAGAGATTATATCACATTTATCTGGTGTGAGCACA-----ATCAAATAGA---T-TTAAAAAAAAACTAGATCTTAGCCAAGCGTCATTA-AGGCATAGTAA---TCC---------AAGATGTTAATAAACTGGGCATTCGG-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAGTTACACGTACATTTG
gi|10                         :                                                                                               AACAAACATT-GGAATGACAACCAAATAGATTGGAACAAAC-TG-TTTCAGAAAAAAAG---ATTCACT-------------TTTGATAAGTTAAATTAAT--AGGT---TTGT-AGTTCATAATATCAGTGT------TCTGATT--A-CAAGGG-------CATTTAGT-AAGTACTC-TGAGctttatgacaaaataaacaaagtcgtagaatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                             TA-ATTTGTTAAGTTGCATTTAT--GGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAA-------CATCTAAC-AAGTATTTCTGAGATAAACACAATATCATGTATACCTGATGTGGACATAATTGTATAAAATACA---T-TT--TAAAc
gi|12                         :                                                                        A-AA--C-ATATATATTT-TGTAAACAAACATT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGTAACAAACAAA-TT--CGTAACATAT---ATTAACTTTAAAAAAGT--GTTTGTTAGTTTACATTTAT--AGAC---TTAT-ATTTTCTAATTCCA
gi|13                         :                                                                  ACA-ATA-AA--C-GTAT---------TAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATCGAATACAC-AC-TT--AAAAA
gi|14                         :                                         ataaacatcgttagttcagtaatgtatgccactggcaaaaaaaccccacaacaaaACAAACATT-ATTGCGAC--T--AGTAGAATAAAACAAAC-AAATT--GAAAACATATTAAATTAACTTTAAATAAATA--TTTGCAAGGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTC
gi|15                         :                                                      ttattaatattTATA-ATA-AA--A-ATATACATTGGTGTAAGCAAACATT-GGAGCTAAAATCAG-CAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACAT----------------ATAAGTA-ATTTGTTAAGTTA
gi|16                         :                                                                                        tcacacaaaaAAACACT-GGAGTGACAATCAAGTAAAA-----CAAAC-AG-TT--AAAAACATTT---GTTAACTTTAAATAAACA-ATTTGTTAAATTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTC
gi|17                         :                                                                                                                                GAACACAC-AAAGT--GAAAACATAA---ATTAACTTTAAATAAGT--ATGTGTT-AGATACATTTAT--AGAG---GTAT-AT
gi|18                         :                                                                     -ATA-AAATT-ATGTACATTA-TTTAAACAAACATT-GGAGTGACAATCAAATAGAATc
gi|2                          :                                                                  ACAGATA-AA--TTATATGAATTA-TGCAAACAAACACT-AGAGTGGCCATCAAATAAAATGAAACAAAC--------ACAGACA------------TTTAAATAAGCGTTTTTATCAAG--ACATCTCG--AAAG----TAT-AGTTCCTTATTCTATTTT------TATT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-CAGTATTT-TGAG--AAAGATCATGTC----TTATCTGATATGGACATAATTGTATCAAACATA---T------AAATAACTTGATATTAACCACGTAGCATTA-AAATATTGAAT---TTC---------AAttaagttcaaaaaaat
gi|3                          : agcaaagtcattgacatatacaaagtttattcagtaatataggtcactgacacaacatatcataaACA-ACATAA--T--TATACACTA-TGTAAACTAACACT-GGAGTGACCATCAAAAAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAATATAT---GTTAACTT-AAATTAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT---------TTAT-ATTTTCTAATTTTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATTATATCACGTTTGTCTGATGTGGACATCCTTGTATAAAATAGA---T-GT--TAAAGATCTAGAACTTAGCCAGACATCTTTA-AAGTAGAGTAG---GCC---------AAGGTGTTCATAAA-------------AAT-GAAATGAAATTCATCTTCAACTTCATGTACATTTGatatatctaaactcatttcgtgata
gi|4                          :                                                                                                                                   gttatacatag--AAGATCATAT---A--AA-TTTGTATAAGTC-ATTTGTTAAGGTACGTTGAT--CGAG---A-ATCATTTTTGAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATAAAAAA-------CATTTAAT-AAGCACTT-TGAGATAGAGATGATATCATTTTTATCTGATGT----ATA--------AAACAGA---T-TT---AAAGATTTAGATCTTAGC---------TTATGAGCATAGGAGCATTTCAAATACCTGGGGGTGTTCATATATTGGGCATTC-GAAAAAGAAACGAAACTAACTTTCAAat
gi|5                          :                                                                                                                                                                          AAGTA-TTTTGTGAAGTTGCATTGAT--AGTT---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TATT-TT--TTCACAAG-------CAGTTAAC-AAGTATTT-TTAAATAAAGATTATACCATGCTTGCCTGGTGTGGACAAACCTGTATTAAATAAA---T-TT--TAAAGA---AA---TTAGCCAAGCATCTTTA-AAATATAAAAatgtttgtatgcgtatagtgtgc
gi|6                          :                                                            atgtaTACA-ATA-AA--C-ATATACA------------AACATTTGAAGTGAAAATCAA-----ATAGAAGTAAC-AA-------------AT----TTAGCTT--AATA----------------TA---TTAT--GGAT---TTAT-ATTTCCTAATTCTATATT------TCTT-TT--ACCAAAAAACATTAACATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATAAGATC---TTGATTTGAtatacatgcatcattataatgaagatccaaatcagcatgaacatcataaacttaatgtcat
gi|7                          :                                                                                                                                                               cataaacatagactattcagtactataggccggtctaacagtggtcaaaa-ATTTTCTAAATTTAATTTGAAAACTCCT-TTCAATCAAAC--------CGTTTTA-----TAC-----ATATATAAATC----CACGTTCATCTGGTGTGGAAACA-----ATTAAACAAAATATATT--GGAAGATCTAAATTTTAACCAGAAATCTTT--AAGTATAGACA---TAT---------GAGATGTTCGTATGTCGGGCATT------TAAAAATGAAACTCATattcatatctcaaccaaacat
gi|8                          :                                                                                                                                                                               -ATTTGCTTAGCTACATTTGTTGAAAGCATTTAT-ATT--CTAATTCTAAATT------T-TT-TA--ATGAATGG-------CATTTCACTAAAT-CTT-TGAGATAAAAATCAT-----GTTCATCTGATGTGAACATA-----ATTCAATGGA---T-TT--AGATATTTTATATCTTGACCAGACATCTATA-
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Reference ( family-980 )      :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACATAT---ATTAACTTTAAATAAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATNATATCACGTTTATCTGATGTGGA--C-AT-A-TTGTATTAAATAGATTT--NAAAGATCTAGATCTTAGCCAGGCATCTTTA-AAGTATAGNAGT----------CC--GAGGTGTTCATANATCGGGCATTC-G-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAACTNCACGTACATTTG
gi|1                          :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGAAAATTAAACAGAATGGAACAACC-AA-TG--AGAAGCATAT---ATCAACTTTAAATAAGTA-ATTTATTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCATGTTT------TCTT-CT--ATAAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAAACAGAGATTATATCACATTTATCTGGTGTGAG--C-AC-A-----ATCAAATAGATTTAAAAAAAAACTAGATCTTAGCCAAGCGTCATTA-AGGCATAGTAAT----------CC--AAGATGTTAATAAACTGGGCATTCGG-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAGTTACACGTACATTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                TA-ATTTGTTAAGTTGCATTTAT--GGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAA-------CATCTAAC-AAGTATTTCTGAGATAAACACAATATCATGTATACCTGATGTGGA--C-ATAA-TTGTATAAAATACATTT--TAAAc
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gi|13                         :                                                              ACAATA-AA--CG-------TAT-----------TAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATCGAATACAC-AC-TT--AAAAA
gi|14                         :                                            ataaacatcgttagttcagtaatgtatgccactggcaaaaaaaccccacaacaaaACAAACATT-ATTGCGAC--T--AGTAGAATAAAACAAAC-AAATT--GAAAACATATTAAATTAACTTTAAATAAATA--TTTGCAAGGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTC
gi|15                         :                                                  ttattaatattTATAATA-AA--AA-------TATAC--ATTGGTGTAAGCAAACATT-GGAGCTAAAATCAG-CAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACAT----------------ATAAGTA-ATTTGTTAAGTTA
gi|16                         :                                                                                           tcacacaaaaAAACACT-GGAGTGACAATCAAGTAAAA-----CAAAC-AG-TT--AAAAACATTT---GTTAACTTTAAATAAACA-ATTTGTTAAATTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTC
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gi|18                         :                                                                 ATA-AAATTA-------TGTAC--ATTA-TTTAAACAAACATT-GGAGTGACAATCAAATAGAATc
gi|2                          :                                                                 ATA-AA--CAGATAAATTATATGAATTA-TGCAAACAAACACT-AGAGTGGCCATCAAATAAAATGAAACAAAC--------ACAGACA------------TTTAAATAAGCGTTTTTATCAAG--ACATCTCG--AAAG----TAT-AGTTCCTTATTCTATTTT------TATT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-CAGTATTT-TGAG--AAAGATCATGTC----TTATCTGATATGGA--C-ATAA-TTGTATCAAACATAT-----AAATAACTTGATATTAACCACGTAGCATTA-AAATATTGAATT----------TC--AAttaagttcaaaaaaat
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Reference ( family-980 )      :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACATAT---ATTAACTTTAAATAAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATNATATCACGTTTATCTGATGTGGA--C-AT-A-TTGTATNAAATAGATTT--NAAAGATCTAGATCTTAGCCAGGCATCTTTA-AAGTATAGNAGT----------CC--GAGGTGTTCATANATCGGGCATTC-G-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAACTNCACGTACATTTG
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gi|15                         :                                                  ttattaatattTATAATA-AA--AA-------TATAC--ATTGGTGTAAGCAAACATT-GGAGCTAAAATCAG-CAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACAT----------------ATAAGTA-ATTTGTTAAGTTA
gi|16                         :                                                                                           tcacacaaaaAAACACT-GGAGTGACAATCAAGTAAAA-----CAAAC-AG-TT--AAAAACATTT---GTTAACTTTAAATAAACA-ATTTGTTAAATTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTC
gi|17                         :                                                                                                                                   GAACACAC-AAAGT--GAAAACATAA---ATTAACTTTAAATAAGT--ATGTGTT-AGATACATTTAT--AGAG---GTAT-AT
gi|18                         :                                                                 ATA-AAATTA-------TGTAC--ATTA-TTTAAACAAACATT-GGAGTGACAATCAAATAGAATc
gi|2                          :                                                                 ATA-AA--CAGATAAATTATATGAATTA-TGCAAACAAACACT-AGAGTGGCCATCAAATAAAATGAAACAAAC--------ACAGACA------------TTTAAATAAGCGTTTTTATCAAG--ACATCTCG--AAAG----TAT-AGTTCCTTATTCTATTTT------TATT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-CAGTATTT-TGAG--AAAGATCATGTC----TTATCTGATATGGA--C-ATAA-TTGTATCAAACATAT-----AAATAACTTGATATTAACCACGTAGCATTA-AAATATTGAATT----------TC--AAttaagttcaaaaaaat
gi|3                          : agcaaagtcattgacatatacaaagtttattcagtaatataggtcactgacacaacatatcACAACATAA--T--------TATAC--ACTA-TGTAAACTAACACT-GGAGTGACCATCAAAAAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAATATAT---GTTAACTT-AAATTAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT---------TTAT-ATTTTCTAATTTTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATTATATCACGTTTGTCTGATGTGGA--C-ATCC-TTGTATAAAATAGATGT--TAAAGATCTAGAACTTAGCCAGACATCTTTA-AAGTAGAGTAGG----------CC--AAGGTGTTCATAAA-------------AAT-GAAATGAAATTCATCTTCAACTTCATGTACATTTGatatatctaaactcatttcgtgata
gi|4                          :                                                                                                                                      gttatacatag--AAGATCATAT---A--AA-TTTGTATAAGTC-ATTTGTTAAGGTACGTTGAT--CGAG---A-ATCATTTTTGAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATAAAAAA-------CATTTAAT-AAGCACTT-TGAGATAGAGATGATATCATTTTTATCTGATGT----------------ATAAAACAGATTT---AAAGATTTAGATCTTAGC---------TTATGAGCATAGGAGCATTTCAAATACCTGGGGGTGTTCATATATTGGGCATTC-GAAAAAGAAACGAAACTAACTTTCAAat
gi|5                          :                                                                                                                                                                             AAGTA-TTTTGTGAAGTTGCATTGAT--AGTT---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TATT-TT--TTCACAAG-------CAGTTAAC-AAGTATTT-TTAAATAAAGATTATACCATGCTTGCCTGGTGTGGA--C-AA-ACCTGTATTAAATAAATTT--TAAAGA---AA---TTAGCCAAGCATCTTTA-AAATATAAAAatgtttgtatgcgtatagtgtgc
gi|6                          :                                                        atgtaTACAATA-AA--CA-------TATAC--A------------AACATTTGAAGTGAAAATCAA-----ATAGAAGTAAC-AA-------------AT----TTAGCTT--AATA----------------TA---TTAT--GGAT---TTAT-ATTTCCTAATTCTATATT------TCTT-TT--ACCAAAAAACATTAACATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATAAGATC---TTGATTTGAtatacatgcatcattataatgaagatccaaatcagcatgaacatcataaacttaatgtcat
gi|7                          :                                                                                                                                                                  cataaacatagactattcagtactataggccggtctaacagtggtcaaaa-ATTTTCTAAATTTAATTTGAAAACTCCT-TTCAATCAAAC--------CGTTTTA-----TAC-----ATATATAAATC----CACGTTCATCTGGTGTGGAAAC-A--A-TTAAACAAAATATATT---GGAAGATCTAAATTTTAACCAGAAATCTTT--AAGTATAGACAT----------AT--GAGATGTTCGTATGTCGGGCATT------TAAAAATGAAACTCATattcatatctcaaccaaacat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                  -ATTTGCTTAGCTACATTTGTTGAAAGCATTTAT-ATT--CTAATTCTAAATT------T-TT-TA--ATGAATGG-------CATTTCACTAAAT-CTT-TGAGATAAAAATCAT-----GTTCATCTGATGTGAA--C-AT-A-----ATTCAATGGATTT--AGATATTTTATATCTTGACCAGACATCTATA-
gi|9                          :                                                                                                                                         AT-AA-TT--ATATATATAT---AT--ACTTTAC----GTA-ATTTGCTAAGTTACATTGAT--GGAA---ATAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--AACAAAAG-------CATTTGAC-AAGTACTT-TGAGACAGGGGTAATATCAAGTGTATCTGTTGTGGA--CAAA-A-TTGTATTAgcgt


blockSeqs                     :                                                                    T  CAGATAAAT       GA T GG              T              A               A  TTTC           TAAATT     T        GTT                   TG   GCAT    C                  GAAAAC    A  CA        ACATTAA        T        C            A     AT                AA A TAATTGT   A     C  TTT       A              CG    A   T        A GCATTTCAAATACCTG            A TT       CGA    A                      T
blockSeqs                     :                                                                    .  ATTA            .  T T               .              A               .  ATT            ATT        T        AA                    .    T       .                  .         .  .         .              .        .            C     AC                .  . TAATTGT   C     T  GTT       T              GA    T   .        T TTTC                        T TC       .      A                       
blockSeqs                     :                                                                    .  CA              .  T A               .              A               .  AGT            ATT        T        AA                    .    G       .                  .         .  .         .              .        .            T     AT                .  . TCCTTGT   A     G  TTT       T              AG    T   .        G GGCC                        T .        .      .                       
blockSeqs                     :                                                                    .  CG              .  T A               .              G               .  TT             GTT        T        AA                    .    C       .                  .         .  .         .              .        .            G     AT                .  . AACCTGT   A     G  TTA       T              GA    T   .        A ATAT                                                                  
blockSeqs                     :                                                                    .  AA              .  C A               .              G               .  TT             ATT        T        AA                    .    G       .                  .         .  .         .              .        .            T     AC                .  . AATTGT    T     A  TT        T              GA    T   .        A                                                                       
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blockSeqs                     :                                                                                                            .              A               .  TT             AT         .        AA                    .    G       .                  .         .  .         .              .        .            C     .                 .  . .         T                                                                                                                            
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finalCons                     :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACATAT---ATTAACTTTAAATAAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAAAG-------CATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATNATATCACGTTTATCTGATGTGGA--C-ATAATTGT-ATNAAATAGATTTT--AAAGATCTAGATCTTAGCCAGGCATCTTTA-AAGTATAGNAGT----------CC--GAGGTGTTCATANATCGGGCATTC-G-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAACTNCACGTACATTTG





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Reference ( family-980 )      :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACATAT---ATTAACTTTAAATAAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAA-------AGCATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATNATATCACGTTTATCTGATGTGGACATAATTGTATNAAATAGATTT--TAAAGA---TCTAGATCTTAGCCAGGCATCTTTA-AAGTATAGNAGT----------CC--GAGGTGTTCATANATCGGGCATTC-G-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAACTNCACGTACATTTG
gi|1                          :                                                             TACAATA-AA--CA-------TATAC--ATTA-TGTAAACAAACACT-GGAGTGAAAATTAAACAGAATGGAACAACC-AA-TG--AGAAGCATAT---ATCAACTTTAAATAAGTA-ATTTATTAAGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTCATGTTT------TCTT-CT--ATAAAA-------AGCATTTAAC-AAGTACTT-TGAAACAGAGATTATATCACATTTATCTGGTGTGAGCACA-----ATCAAATAGATTTAAAAAAAA---ACTAGATCTTAGCCAAGCGTCATTA-AGGCATAGTAAT----------CC--AAGATGTTAATAAACTGGGCATTCGG-AATAGAAATGAAACTCATTTTCAGTTACACGTACATTTG
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gi|12                         :                                                                   A-AA--CA-------TATAT--ATTT-TGTAAACAAACATT-GGAGTGACAATCAAATAGAATGTAACAAACAAA-TT--CGTAACATAT---ATTAACTTTAAAAAAGT--GTTTGTTAGTTTACATTTAT--AGAC---TTAT-ATTTTCTAATTCCA
gi|13                         :                                                              ACAATA-AA--CG-------TAT-----------TAAACAAACACT-GGAGTGACAATCAAATAGAATCGAATACAC-AC-TT--AAAAA
gi|14                         :                                            ataaacatcgttagttcagtaatgtatgccactggcaaaaaaaccccacaacaaaACAAACATT-ATTGCGAC--T--AGTAGAATAAAACAAAC-AAATT--GAAAACATATTAAATTAACTTTAAATAAATA--TTTGCAAGGTTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTC
gi|15                         :                                                  ttattaatattTATAATA-AA--AA-------TATAC--ATTGGTGTAAGCAAACATT-GGAGCTAAAATCAG-CAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAACAT----------------ATAAGTA-ATTTGTTAAGTTA
gi|16                         :                                                                                           tcacacaaaaAAACACT-GGAGTGACAATCAAGTAAAA-----CAAAC-AG-TT--AAAAACATTT---GTTAACTTTAAATAAACA-ATTTGTTAAATTACATTTAT--AGAG---TTAT-ATTTTCTAATTC
gi|17                         :                                                                                                                                   GAACACAC-AAAGT--GAAAACATAA---ATTAACTTTAAATAAGT--ATGTGTT-AGATACATTTAT--AGAG---GTAT-AT
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gi|2                          :                                                                 ATA-AA--CAGATAAATTATATGAATTA-TGCAAACAAACACT-AGAGTGGCCATCAAATAAAATGAAACAAAC--------ACAGACA------------TTTAAATAAGCGTTTTTATCAAG--ACATCTCG--AAAG----TAT-AGTTCCTTATTCTATTTT------TATT-TT--ATCAAA-------AGCATTTAAC-CAGTATTT-TGAG--AAAGATCATGTC----TTATCTGATATGGACATAATTGTATCAAACATA-----TAAATA---ACTTGATATTAACCACGTAGCATTA-AAATATTGAATT----------TC--AAttaagttcaaaaaaat
gi|3                          : agcaaagtcattgacatatacaaagtttattcagtaatataggtcactgacacaacatatcACAACATAA--T--------TATAC--ACTA-TGTAAACTAACACT-GGAGTGACCATCAAAAAGAATGGAACAAAC-AA-TT--AAAAATATAT---GTTAACTT-AAATTAGTA-ATTTGTTAAGTTACATTTAT---------TTAT-ATTTTCTAATTTTAGTTT------TCTT-TT--ATCAAA-------AGCATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATTATATCACGTTTGTCTGATGTGGACATCCTTGTATAAAATAGATGT--TAAAGA---TCTAGAACTTAGCCAGACATCTTTA-AAGTAGAGTAGG----------CC--AAGGTGTTCATAAA-------------AAT-GAAATGAAATTCATCTTCAACTTCATGTACATTTGatatatctaaactcatttcgtgata
gi|4                          :                                                                                                                                      gttatacatag--AAGATCATAT---A--AA-TTTGTATAAGTC-ATTTGTTAAGGTACGTTGAT--CGAG---A-ATCATTTTTGAATTCTAGTTT------TCTT-TT--ATAAAA-------AACATTTAAT-AAGCACTT-TGAGATAGAGATGATATCATTTTTATCTGA------------TGTATAAAACAGA-TT--TAAAGA---TTTAGATCTTAGC---------TTATGAGCATAGGAGCATTTCAAATACCTGGGGGTGTTCATATATTGGGCATTC-GAAAAAGAAACGAAACTAACTTTCAAat
gi|5                          :                                                                                                                                                                             AAGTA-TTTTGTGAAGTTGCATTGAT--AGTT---TTAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TATT-TT--TTCACA-------AGCAGTTAAC-AAGTATTT-TTAAATAAAGATTATACCATGCTTGCCTGGTGTGGACAAACCTGTATTAAATAAATTT--TAAAGA------AA---TTAGCCAAGCATCTTTA-AAATATAAAAatgtttgtatgcgtatagtgtgc
gi|6                          :                                                        atgtaTACAATA-AA--CA-------TATAC--A------------AACATTTGAAGTGAAAATCAA-----ATAGAAGTAAC-AA-------------AT----TTAGCTT--AATA----------------TA---TTAT--GGAT---TTAT-ATTTCCTAATTCTATATT------TCTT-TT--ACCAAAAAACATTAACATTTAAC-AAGTACTT-TGAGATAGAGATAAGATC---TTGATTTGAtatacatgcatcattataatgaagatccaaatcagcatgaacatcataaacttaatgtcat
gi|7                          :                                                                                                                                                                  cataaacatagactattcagtactataggccggtctaacagtggtcaaaa-ATTTTCTAAATTTAATTTGAAAACTCCT-TTCAATCAAA-------C-CGTTTTA-----TAC-----ATATATAAATC----CACGTTCATCTGGTGTGGAAACAATTAAACAAAATATATTG---GAAGA---TCTAAATTTTAACCAGAAATCTTTA-A-GTATAGACAT----------AT--GAGATGTTCGTATGTCGGGCATT------TAAAAATGAAACTCATattcatatctcaaccaaacat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                  -ATTTGCTTAGCTACATTTGTTGAAAGCATTTAT-ATT--CTAATTCTAAATT------T-TT-TA--ATGAAT-------GGCATTTCACTAAAT-CTT-TGAGATAAAAATCAT-----GTTCATCTGATGTGAACATAATT-----CAATGGATTT-----AGATATTTTATATCTTGACCAGACATCTATA-
gi|9                          :                                                                                                                                         AT-AA-TT--ATATATATAT---AT--ACTTTAC----GTA-ATTTGCTAAGTTACATTGAT--GGAA---ATAT-ATTTTCTAATTCTAGTTT------TCTT-TT--AACAAA-------AGCATTTGAC-AAGTACTT-TGAGACAGGGGTAATATCAAGTGTATCTGTTGTGGACAAAATTGTATTAgcgt