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Reference ( gi|2 ) : TTACCTGTCAATGTTTTCTCCTACCGGGGAAGTTGTGGGACCGGGGTAGCGATGGGA-----ATA--CCC------GGGGGATAAGAC-------------AGA--------CT-ACGTC-G-C----CACCAGGCAG--G---G-AATT--A---G--ATA--------T-TTGAATAGACG------CTCAC-CCT--GGA--GAAT----TT--------GAC----T--AC---GATG----GC--A----TTC-C--TAGTGATGGGAAT-TAGA-CAACCAATTTCG---A----G--T---T-TGT-TT---------AATTCCCCTGGGCGTGTTT-CCA--CCA-CTCCCGCC-C--ACTCTCTGATGTGGGCG---AACATTAA
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Reference ( family-958 ) : NNACNTACCAACGTT-TCC-CCTACCGGGGA----G-TGG-ANCGG---AACGATGGAA-----ATACC----CG-GGGAATAAGA---CA--GA-CNA--CG-------------GN----CA-----------CCAG---GTGGG---GAATT--A---G--ATA---T-TTGAATAGACT------CCCACCCT-GG-GGA-------------------AT----TT---G--ACTA-AGGTG-TC--ATTCC--TAGGGATGGGAAT-TAGA-CAAC-CAATT-T-G--A-A---G--T-TTGT-C----T-AATTC-CCCCGG-GTGTGT------CTC-CGCCG-C-T-CCC-GCCC--ACTCCCTGATG-GGGCG---AACATT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AGGCACAGCCAGGGAATTAGACAAGGAAATTCTTGGGCAGGCACACCCAGGGAATTAGACAACAATGTAAGGCACATATGTCTGACTTAGACAAACAATAACCAA
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gi|25 : -TTGTC----T-AATTC-CCT-GG-GTGTG---C------C-----Ct
gi|3 : gc----CA-GGAAATA-GA-A--------AGA-C-A----------G----TGAC-------------CAG---ATGAG---AAATT--A---T--ATA---T-TTGAATAGACT------CCAACAAT-GG-GGA-------------------AT----TT---G--ACTA-AGGTGTA--TTTC-G--TAGAGATGGG-ATTA-TA-TAAT-TAATTT-G-GA-T--AT-GTATC----T-AATTG-CCCAAA-CTGTG---C-----------------T-----A--CCCTCCCC--ATCCTCGCTG-CGGGA---AACAcgaaatcctggggcaggcacagccagggaattag
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