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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                       CAGTGTATTGAATATATGCAGTAT-TTACCAAAACAAACTCGTAGTGACGTAGCGCTGGCTTTTATTAGCCTCACACAAATTGAGCATGAAATTGGAAAGCGCAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGTACCATTAATAAACGATTCTGGATAAACACACCTTTTGTTACTAGGCTTATACAA--TTCATGCCTTATCCACGT-AAAACGGAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATTCTAGGCAAATACAAATTGACCGATGTTCT-------------TCCACTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACGATGGAAAAAA-GACTTGAATTAGGTATACATAAATCAGCCGAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAACAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGT---ATTTCTCCCA----AATATATCGCGA-ATCACTACCGTACTGTAGAACTGTCACCTTTATAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-TCAAA-----CTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGTTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACCAAGTATATGGATTAGATATCTACGATAAG-TTTGTAACATGAACGCTTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACATACGGTTGCTATTTCAAAAAATACATTTAGGCATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGTTAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGTTCGTCGTTATATCGTTTTGACAACGAAAATAACAATACAAAAT--AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATACGTTCCTTTCATTTAACATTT-AAGGTACGAGTATATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAACTAATACCACTTTTAGTACCCATATAGTGTATGC-TATT---GTGTTTCGT-TTTGGCAAGTCATATCATTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAATGCGTCAATATGTTTTGCAATTTG-A-TGGGCAT------ATCATTAATTTATTCCGTGTGTATAT-ATGTAAGTTGTTTGAACT----ATCGAAGTTATATGTGTGTTTGTATTG------TAT-ATATATGATTGCCATTTAATTGTCTATATGTGTATTATGTTTTTGTATATTTATTGTACTTCCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAATAATTAATCAATCA
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gi|3                          :                                                                                                                               ctttatacggcttctaactatggtactccattacggacacttaactcaaatcgccagaGAGCATGAAATTGACAGGCGGAAGTTCTTGATGTTTGGACAATTATGTAGTATTGATAAACGCTTCAGGATAAACACACTTTTTGTTAATATGCTTATACAA--TTCATGTCCCATCCTTGT-AAAACACAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATTCTAGGCAAATACAAGTTGACCGATGTTCTAACGGAATACATTTCTACTACAATCTTCCCTACGTTA---AGACAATGGAAAAAAAGACTTAAATTAAGTATACATAAATCAGCCGCATTTGACTTTAGAACAAGACTTATTCAAGACGACAGTCTCAATAATTT-CTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGT---ATTTTTCCCACCCAAACATATCGCAA-TTCTCTACCGTATTGTAAAACTGTCACTTTTATAATTGGTAAATCATTCGACCGCAAATA-TCAAA-----CTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGGACATTTAATTTTGTTCTGCTGGTCAAATAACTCCCTCCGACATAGTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATGTGTACGATAAGTTTTGTAACATGAACGCCTTTAATC-ATATTATATAATTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGACAAACAAACGGTTGCTATTTC----ATTACATTTAGACATTAACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCGTTTGTGTTTTGTCACTTTGATGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAGGGAAAAT-ATAATACAACATTCAACGTATTAA----AAATATAATATaatca
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagtatttggaactaataccactttcagtacccatatagttatTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATAGTTGGAACTAATACCACTTTCAGTACCACTAAAGTGTATGC-TCTT---GTTTTTCGT-TTCGGCTAGTCGTATCAGTCATTGGGCTACATGTGACAATACTCTTCTAAAAGTGTCGATGTGTTTTGCAATTTG-AATGGACAC------ATCATTTATCTATTTCCTTTGTATAT-ATGTAAGTTGTTTGAACT----ATCGAAGTTATATGTTTGTTTGTATTG------TAA-ATATTTGATTGTCATTTCATTGTTTATATGTGTATTAATTGTTTGTATATGTATTGTACTCTCATGTTGCTGTTTAAATGTTTGAACTCTCCTGTAAATTTGTACTATGGAGGCAATAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaataataaaatctgattattcatatttagattataatgttttgaaagtgaacatgaaaccagaTAGTATTTGGAACTAATACCACTTTCAGTACCCATATAGT-TATgc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-TCTT---ATGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGAGCTACATGTGGCAATATTCTTCTTAAAGTGTCAATATGTTTTACAGTTTG-AATGGACAT------ATCATTTATTAAAT-----TATATAT-ATGTAAATTGTT-GAACTTAGTATCATAGTTCTATGTTTGTTTGTATTG------TATTATATTTGATTGACATTTAATTGTCTATATGTGAATTATGATTTTGTATATGTATTGTATTCCCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATATTCTCCTGTATATTTGTATTATGGAGGAAAtacactatatgggtactgaaagtggtattagttccaaatattatctttcaaaaacaaaaagtaccttgaaagttaaatgaaagaatcgcattattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATGTAAATTGTTTGAACT----ATCGAAGTTATATGTGT--TTGTGTTG------TAT-ATATTTGACTGACATTTAATTGTCTACATGTGTATTATATTTTTGTACAT-----GTATTCCCTTGTTGCTGTTTATATGTTTATTCTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATACAGAATCAATCAGTCA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTGTTG------TAT-ATATATGATTGTCATTTAATTGTTTATATGTGTATTATGTTTTTGTATATGTATTGTGTTCCCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATTAAGAATCa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AACATCAAAGCGTATATATGAATCGGTTGTTCTTCCCAAAGCACTATATGGGAGTGAACTATGGAATGATCTCACAGACAATCAGTTATGTCCCCTAGAGCGGGCTCATCGACAGTGCGTTAAGCGTATTCAAAATATACCGACAAGATCAAGAACAGATATTGCCTTAAGCTGTCTGGGTATTTGCCCTATTAAACATATTATTGACAAGAGAAAATTACTGTTACTTGGGCAATTGTGTCGGCTAAACCCAAAATTCAAAATTAAACAAATATTTTCCCGTAGACCTACATCATACTTTTCCACACCCCTAAAAATGAAAGGATTCATGCCTGATATATATAGATTATTAGGTCGGTACGGCTTAACCAAGTATCTAACAGACTATTCAAAAACCGGAGAATTCCCTTCTCAAAATATATGGAAAAAATCGATAAAAATCGCAATCCATAAAACGGTAGAGTTTGACTGGAGAAACAGACTCTTTTGTGACG
Unaligned ( gi|14 ): TATATGTGTTGTCATCTTGCACATCGTTCCGATGTTTATATAGAAGTATAATATAATTTGTTCCTTTCAATTTGTATTCATGTTAATATGTGTTTATACGTATATGTACATTATTCAACCTTATCTGTATGTTTATACCCTCTTGTATGTTTATAAGGAGAAATAAGACAATCGCTCA
Unaligned ( gi|18 ): ACCCCCAAGAAAAAAAAATACTTCATACCTGATTTATATAGATTGTCGGGCCGGTATAGCTTA
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Reference ( family-953 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAATGTATTAAACATATNCNGNNTATTACCGA----ANCAANCTCG--TAGTGACNTAGCGCCGGCTT--TAATTGGCCTCACACCAATCGAGCATGAAATTGACAGGCGNAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGTAGTATTAATAAACGC----TTCAGGAT-ANACACACTTTTTGTTAATANGCTTATACAA--TTCATGTCTCATCCACGT-----AAAACGCAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAATTGACCGATGT-TTTAACGGAATANATTTCTA---CTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACA-ATGGAAAAAA-AGACTTAAATTAAGT----ATACATAAATCAGCCNAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAATAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTCT----CCCAAATATATCGCGATTCTCTACCGTACTGTAGAACTGTCACTTTTACAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-TCAAA-----CTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATATGTACGATAAGCTTTGTAACATGGACGCCTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACAAACGGTTGCTATTTCAAAAATTACATTTAGACATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAACGAAAATAACAATAC-ACAAT-AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATGCGTTCCTTTCATTTAACTTTTAAGGTACGAGTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTATGC---TCTT-GTGTTTCGT-TTCGGCAAGTCATATCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGTCAATATGTTTTGCAATTTGAAATGGACAT------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAT-ATATNTGATTGNCATTTAATTGTCTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTACTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAAGAATCAATCAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacatcaaagcgtatatatgaatcggttgttcttcccaaagcactatatgggagtgaactatggaatgatctcacagacaatcagttatgtcccctagagcgggctcatcgaATTTTAAATATTATATTATAT-----ATTAATTGTTTGTATTCAACGTGTT--AATCAAAT--AA-A-AGTA---T---CTTCAAATAATGAGATCCTTTCTTTTACATTTTAAGGTAT------ATTT-TGTTTTTTGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACAACTTTCTGTACCAATATAATGTATGC---TCTT-TTGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGCCAATATGTTTTGCAGTTTG-AATGGAC--------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATCTAAATTGT----TTGAACT----ATCGGA-TT-T-ATGTTTGTTT----GAAGAG------TAT-ATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGCATTATGTTTTT----GTTTATGTATTG----------------------------TATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAA-AAAGAATCAATCAATCActtttgtgacg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATAGTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCACTAAAGTGTATGC---TCTT-GTTTTTCGT-TTCGGCTAGTCGTATCAGTCATTGGGCTACATGTGACAATACTCTTCTAAAAGTGTCGATGTGTTTTGCAATTTGAA-TGGACAC------ATCATTTATCTATTTCCTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAA-ATATTTGATTGTCATTTCATTGTTTAT--ATGTGTATTAATTGTTT----GTATATGTATTGTACTC--TCATGTTGCTGTTTAAATGTTTGAACTCTCCTGTAAATTTGTACTATGGAGGCAATAAAGatca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaataataaaatctgattattcatatttagattataatgttttgaaagtgaacatgaaaccagaC---TCTT-ATGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGAGCTACATGTGGCAATATTCTTCTTAAAGTGTCAATATGTTTTACAGTTTGAA-TGGACAT------ATCATTTATTAAATT-----ATATAT-ATGTAAATTGT----T-GAACTTAGTATCATAGTTCT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TATTATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGAATTATGATTTT----GTATATGTATTGTATTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATATTCTCCTGTATATTTGTATTATGGAGGAAAc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAT-ATGT--GTTGTCATCTTGCAC-----ATCG---TTCCGATGTTTATATAGAAGTATAA------TAT-A-ATTTG-TT-CCTTTCAATT-TGTATTCATGT-TAATATGTGTTTATACGTATATGTACATTATTCAACCTTAT--CTGT----ATGTTTATACCCTCTTGTATGTTTATA--A-GGA-GAAAT-AAGA--CAATCGCTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATGTAAATTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGT--GTTT----GTGTTG------TAT-ATATTTGACTGACATTTAATTGTCTAC--ATGTGTATTATATTTTT----GTACATGTATT-----C--CCTTGTTGCTGTTTATATGTTTATTCTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATACAGAATCAATCAGTCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGT-TATa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAATAATGCGATTCTTTCATTTAACTTTCAAGGTAC---T---TTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTAtacactatatgggtactgaaagtggtattagttccaaatattatctttcaaaaacaaaaagtaccttgaaagttaaatgaaagaatcgcattattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagtatttggaactaataccactttcagtacccatatagttatT----GTGTTG------TAT-ATATATGATTGTCATTTAATTGTTTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTGTTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATTAAGAATCA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCCCTAAGTTA---AGACA-ATGGGAAAA---TACTTTAATTAAGT----ATTCATAAATCAGCCCAATTTGGC--------AAGACTGATTCAAGACGACAGTCTCAATAATTTTCTCAAAATACAAACAGAA-TTGTACCAAACAGTATTTGATATTTCT----CCCAAATATATTGCGATTCTCTACCGTACTGTTAAACTGTCACTTTTACAATTGGTAAATTGTTTGCCTGCAAATA-TCAAACCAAACTGTTTGTTCGCAGTGCAGTCTC-ATTAAAGAAACTGAAGCTGAACAATTAATTTTTTTCTATTCGTCAAATAACTCTCTCCGACATACTTTATTATGAAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATAAGTACGATAGGCTTTGTAACATGAAAGCCTTTAATC-AAATTATATAATTAttccctaagttaagacaatgggaaaatactttaattaagtattcataaatcagcccaatttggcaagactgattcaagacgacagtctcaataattttctcaaaatacaaacagaattgtaccaaacagtatttgatatttctcccaaatatattgcgattctctaccgtactgttaaactgtcacttttacaattggtaaattgtttgcctgcaaatatcaaaccaaactgtttgttcgcagtgcagtctcattaaagaaactgaagctgaacaattaatttttttctattcgtcaaataactctctccgacatactttattatgaaatatacacaaagtatgtggatcagataagtacgataggctttgtaacatgaaagcctttaatcaaattatataatta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-953 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGTATTAAACGTATNCAGNATATTACCGA----ANCAA--ACTCGTAGTGACNTAGCGCTGGCTT--TAATTGGCCTCACAC-AA-TCGAGCATGAAATTGACAAGCGNAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGT-AGCATTAATAAACGC----TTCAGGA-TAAACACACNTTTTGTTAATAGGCTTATACAA--TTCATGTCTCATCCACGT-----AAAACGCAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAATTGACCGATGT-TCTAACGGAATA-A-TTTC---CACTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACA-ATGGAAAAAAAGACTTNAATTAA----GT-ATACATAAATCAGCCGAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAATAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTCTCCCA----AATATATCGCGATTCTCTACCGTACTGTAGAACTGTCACTTTTATAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-T-----CAAACTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATATGTACGATAAGCTTTGTAACATGAACGCCTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACAAACGGTTGCTATTTCAAAAATTACATTTAGGCATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAACGAAAATAACAATAC-ACAAT-AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATGCGTTCCTTTCATTTAACTTTTAAGGTACGAGTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTATGC---TCTT-GTGTTTCGT-TTCGGCAAGTCATATCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGTCAATATGTTTTGCAATTTGAAATGGACAT------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAT-ATATNTGATTGNCATTTAATTGTCTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTACTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAAGAATCAATCAATCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATAGTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCACTAAAGTGTATGC---TCTT-GTTTTTCGT-TTCGGCTAGTCGTATCAGTCATTGGGCTACATGTGACAATACTCTTCTAAAAGTGTCGATGTGTTTTGCAATTTGAA-TGGACAC------ATCATTTATCTATTTCCTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAA-ATATTTGATTGTCATTTCATTGTTTAT--ATGTGTATTAATTGTTT----GTATATGTATTGTACTC--TCATGTTGCTGTTTAAATGTTTGAACTCTCCTGTAAATTTGTACTATGGAGGCAATAAAGatca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaataataaaatctgattattcatatttagattataatgttttgaaagtgaacatgaaaccagaC---TCTT-ATGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGAGCTACATGTGGCAATATTCTTCTTAAAGTGTCAATATGTTTTACAGTTTGAA-TGGACAT------ATCATTTATTAAATT-----ATATAT-ATGTAAATTGT----T-GAACTTAGTATCATAGTTCT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TATTATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGAATTATGATTTT----GTATATGTATTGTATTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATATTCTCCTGTATATTTGTATTATGGAGGAAAc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAT-ATGT--GTTGTCATCTTGCAC-----ATCG---TTCCGATGTTTATATAGAAGTATAA------TAT-A-ATTTG-TT-CCTTTCAATT-TGTATTCATGT-TAATATGTGTTTATACGTATATGTACATTATTCAACCTTAT--CTGT----ATGTTTATACCCTCTTGTATGTTTATA--A-GGA-GAAAT-AAGA--CAATCGCTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATGTAAATTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGT--GTTT----GTGTTG------TAT-ATATTTGACTGACATTTAATTGTCTAC--ATGTGTATTATATTTTT----GTACATGTATT-----C--CCTTGTTGCTGTTTATATGTTTATTCTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATACAGAATCAATCAGTCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGT-TATa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAATAATGCGATTCTTTCATTTAACTTTCAAGGTAC---T---TTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTAtacactatatgggtactgaaagtggtattagttccaaatattatctttcaaaaacaaaaagtaccttgaaagttaaatgaaagaatcgcattattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagtatttggaactaataccactttcagtacccatatagttatT----GTGTTG------TAT-ATATATGATTGTCATTTAATTGTTTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTGTTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATTAAGAATCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGTATTGAATATATGCAGTAT-TTACCAA----AACAA--ACTCGTAGTGACGTAGCGCTGGCTT--TTATTAGCCTCACAC-AAATTGAGCATGAAATTGGAAAGCGCAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGT-ACCATTAATAAACGA----TTCTGGA-TAAACACACCTTTTGTTACTAGGCTTATACAA--TTCATGCCTTATCCACGT-----AAAACGGAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAATTGACCGATGT-TCT--------------TC---CACTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACG-ATGGAAAAAA-GACTTGAATTAG----GT-ATACATAAATCAGCCGAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAACAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTCTCCCA----AATATATCGCGAATCACTACCGTACTGTAGAACTGTCACCTTTATAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-T-----CAAACTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGTTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACCAAGTATATGGATTAGATATCTACGATAAG-TTTGTAACATGAACGCTTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACATACGGTTGCTATTTCAAAAAATACATTTAGGCATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGTTAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGTTCGTCGTTATATCGTTTTGACAACGAAAATAACAATAC-AAAAT-AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATACGTTCCTTTCATTTAACATTTAAGGTACGAGTATATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTTAGTACCCATATAGTGTATGC---TATT-GTGTTTCGT-TTTGGCAAGTCATATCATTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAATGCGTCAATATGTTTTGCAATTTG--ATGGGCAT------ATCATTAATTTATTCCGTGTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTGTGTTT----GTATTG------TAT-ATATATGATTGCCATTTAATTGTCTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATTTATTGTACTT--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAATAATTAATCAATCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAGCATGAAATTGACAGGCGGAAGTTCTTGATGTTTGGACAATTATGT-AGTATTGATAAACGC----TTCAGGA-TAAACACACTTTTTGTTAATATGCTTATACAA--TTCATGTCCCATCCTTGT-----AAAACACAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAGTTGACCGATGT-TCTAACGGAATACA-TTTC---TACTACAATCTTCCCTACGTTA---AGACA-ATGGAAAAAAAGACTTAAATTAA----GT-ATACATAAATCAGCCGCATTTGACTTTAGAACAAGACTTATTCAAGACGACAGTCTCAATAATTT-CTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTTTCCCACCCAAACATATCGCAATTCTCTACCGTATTGTAAAACTGTCACTTTTATAATTGGTAAATCATTCGACCGCAAATA-T-----CAAACTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGGACATTTAATTTTGTTCTGCTGGTCAAATAACTCCCTCCGACATAGTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATGTGTACGATAAGTTTTGTAACATGAACGCCTTTAATC-ATATTATATAATTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGACAAACAAACGGTTGCTATTTC----ATTACATTTAGACATTAACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCGTTTGTGTTTTGTCACTTTGATGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAGGGAAAAT-ATAATACAACATTCAACGTATTAA----AAATATAATAT
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Unaligned ( gi|19 ): AATGACGTAGCACTAGCCTGTAAAGTGTTAATGCCATCATA






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Reference ( family-953 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGTATTAAACGTATNCAGNATATTACCGA----ANCAA--ACTCGTAGTGACNTAGCGCTGGCTT--TAATTGGCCTCACAC-AA-TCGAGCATGAAATTGACAAGCGNAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGT-AGCATTAATAAACGC----TTCAGGA-TAAACACACNTTTTGTTAATAGGCTTATACAA--TTCATGTCTCATCCACGT-----AAAACGCAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAATTGACCGATGT-TCTAACGGAATA-A-TTTC---CACTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACA-ATGGAAAAAAAGACTTNAATTAA----GT-ATACATAAATCAGCCGAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAATAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTCTCCCA----AATATATCGCGATTCTCTACCGTACTGTAGAACTGTCACTTTTATAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-T-----CAAACTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATATGTACGATAAGCTTTGTAACATGAACGCCTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACAAACGGTTGCTATTTCAAAAATTACATTTAGGCATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAACGAAAATAACAATAC-ACAAT-AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATGCGTTCCTTTCATTTAACTTTTAAGGTACGAGTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTATGC---TCTT-GTGTTTCGT-TTCGGCAAGTCATATCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGTCAATATGTTTTGCAATTTGAAATGGACAT------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAT-ATATNTGATTGNCATTTAATTGTCTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTACTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAAGAATCAATCAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacatcaaagcgtatatatgaatcggttgttcttcccaaagcactatatgggagtgaactatggaatgatctcacagacaatcagttatgtcccctagagcgggctcatcgaATTTTAAATATTATATTATAT-----ATTAATTGTTTGTATTCAACGTGTT--AATCAAAT--AA-A-AGTA---T---CTTCAAATAATGAGATCCTTTCTTTTACATTTTAAGGTAT------ATTT-TGTTTTTTGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACAACTTTCTGTACCAATATAATGTATGC---TCTT-TTGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGCCAATATGTTTTGCAGTTTG-AATGGAC--------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATCTAAATTGT----TTGAACT----ATCGGA-TT-T-ATGTTTGTTT----GAAGAG------TAT-ATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGCATTATGTTTTT----GTTTATGTATTG----------------------------TATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAA-AAAGAATCAATCAATCActtttgtgacg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATAGTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCACTAAAGTGTATGC---TCTT-GTTTTTCGT-TTCGGCTAGTCGTATCAGTCATTGGGCTACATGTGACAATACTCTTCTAAAAGTGTCGATGTGTTTTGCAATTTGAA-TGGACAC------ATCATTTATCTATTTCCTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAA-ATATTTGATTGTCATTTCATTGTTTAT--ATGTGTATTAATTGTTT----GTATATGTATTGTACTC--TCATGTTGCTGTTTAAATGTTTGAACTCTCCTGTAAATTTGTACTATGGAGGCAATAAAGatca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaataataaaatctgattattcatatttagattataatgttttgaaagtgaacatgaaaccagaC---TCTT-ATGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGAGCTACATGTGGCAATATTCTTCTTAAAGTGTCAATATGTTTTACAGTTTGAA-TGGACAT------ATCATTTATTAAATT-----ATATAT-ATGTAAATTGT----T-GAACTTAGTATCATAGTTCT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TATTATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGAATTATGATTTT----GTATATGTATTGTATTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATATTCTCCTGTATATTTGTATTATGGAGGAAAc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAT-ATGT--GTTGTCATCTTGCAC-----ATCG---TTCCGATGTTTATATAGAAGTATAA------TAT-A-ATTTG-TT-CCTTTCAATT-TGTATTCATGT-TAATATGTGTTTATACGTATATGTACATTATTCAACCTTAT--CTGT----ATGTTTATACCCTCTTGTATGTTTATA--A-GGA-GAAAT-AAGA--CAATCGCTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATGTAAATTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGT--GTTT----GTGTTG------TAT-ATATTTGACTGACATTTAATTGTCTAC--ATGTGTATTATATTTTT----GTACATGTATT-----C--CCTTGTTGCTGTTTATATGTTTATTCTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATACAGAATCAATCAGTCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGT-TATa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAATAATGCGATTCTTTCATTTAACTTTCAAGGTAC---T---TTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTAtacactatatgggtactgaaagtggtattagttccaaatattatctttcaaaaacaaaaagtaccttgaaagttaaatgaaagaatcgcattattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagtatttggaactaataccactttcagtacccatatagttatT----GTGTTG------TAT-ATATATGATTGTCATTTAATTGTTTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTGTTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATTAAGAATCA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctttatacggcttctaactatggtactccattacggacacttaactcaaatcgccagaCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACA----AACGAACGGTTGCTATTTCAAAAAGTACATTTACACATTTACCTCATATGATTAA-GCATTAAGATATACGTGTATGTAGACAACACACA---TGCTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCT-----CGTCATTATCTCGTATTGACAGGGGAAATATTAATAC-ACAAT-AATATTTAAATTTTGGATATTATATTATAT-----ATTAATTGTTTGTATACAACGTTTT--AA----A---AATA-AAT---------TTAAAAAAATAAGATCCTTTCATTTAACTTTTAAG---C---TACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACTATTTTCAGTACACATATAGTGTATGC---TTTT-GAGTTTCGT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTTAGCTACATGTGACAATATT-TTCTAAAAGTGTCAATATGTTTTGCAATTTG-AATAGACATTGATTGATCATTTATTTTGTTCATTTGTATATAATGTAAATTGT----ACGAATT----ATCGAAGTTAT-ATACTTGTTG----ATATTG------TAT-ATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGTAATATGTGTGT----GTATATGTAT-----TC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTTTCCTGGATATTTATACTATGGGGAAAATAAAGAATCAATCAaatca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-953 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGTATTAAACGTATNCAGNATATTACCGA----ANCAA--ACTCGTAGTGACNTAGCGCTGGCTT--TAATTGGCCTCACAC-AA-TCGAGCATGAAATTGACAAGCGNAAGCTCTTGATGTTTGGACAATTATGT-AGCATTAATAAACGC----TTCAGGA-TAAACACACNTTTTGTTAATAGGCTTATACAA--TTCATGTCTCATCCACGT-----AAAACGCAGGGTTTTATGCCAGATA------TCTACCGTATT-CTAGGCAAATACAAATTGACCGATGT-TCTAACGGAATA-A-TTTC---CACTGCATTCTTCCCTACGTTA---AGACA-ATGGAAAAAAA-ACTTNAATTAA----GT-ATACATAAATCAGCCGAATTTGACTTTAGAACAAGACTGGTTCAAGACGACAGTCTCAATAGTTTTCTCAATATACAAAGAGAAATCGTACCAAACAGTATTTGGTATTTCTCCCA----AATATATCGCGATTCTCTACCGTACTGTAGAACTGTCACTTTTATAATTGGTAAATTATTTGCCCGCAAATA-T-----CAAACTGTTTGTCCGCAGTGCAGTCTC-ATTACAGAAACTGTAGCTGAACATTTAATTTTGTTCTGCTCGTCAAATAACTCCCTCCGACATACTTTATTATGTAATATACACAAAGTATGTGGATCAGATATGTACGATAAGCTTTGTAACATGAACGCCTTTAATC-AAATTATAGAACTAGTTTCCGGTTATCCTTCTTTAAACATGACAGATAAACAAACGGTTGCTATTTCAAAAATTACATTTAGGCATTTACATCATATGACTAAAGCATTAAGATATACGTTTATGTAGATAACACACACAATACTTCATCTTTTGTGTTTTGTCACTTTGTTGCTGAGCTCGTCGTTATCTCGTATTGACAACGAAAATAACAATAC-ACAAT-AATATTTTAATTTTAAATATTATATTATATTATATATTTATTGTTTGTATTCAAAGTGTT--AA----A---AA-A-AATA---T---CTTCAAATAATGCGTTCCTTTCATTTAACTTTTAAGGTACGAGTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTATGC---TCTT-GTGTTTCGT-TTCGGCAAGTCATATCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGTCAATATGTTTTGCAATTTGAAATGGACAT------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAT-ATATNTGATTGNCATTTAATTGTCTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTACTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATAAAGAATCAATCAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacatcaaagcgtatatatgaatcggttgttcttcccaaagcactatatgggagtgaactatggaatgatctcacagacaatcagttatgtcccctagagcgggctcatcgaATTTTAAATATTATATTATAT-----ATTAATTGTTTGTATTCAACGTGTT--AATCAAAT--AA-A-AGTA---T---CTTCAAATAATGAGATCCTTTCTTTTACATTTTAAGGTAT------ATTT-TGTTTTTTGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACAACTTTCTGTACCAATATAATGTATGC---TCTT-TTGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGGGCTACATGTGGCAATATTCTTCTAAAAGTGCCAATATGTTTTGCAGTTTG-AATGGAC--------ATCATTTATTTATTTCGTTTGTATAT-ATCTAAATTGT----TTGAACT----ATCGGA-TT-T-ATGTTTGTTT----GAAGAG------TAT-ATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGCATTATGTTTTT----GTTTATGTATTG----------------------------TATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAA-AAAGAATCAATCAATCActtttgtgacg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTACATTT-TGTTTT-TGAAAGATAATAGTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCACTAAAGTGTATGC---TCTT-GTTTTTCGT-TTCGGCTAGTCGTATCAGTCATTGGGCTACATGTGACAATACTCTTCTAAAAGTGTCGATGTGTTTTGCAATTTGAA-TGGACAC------ATCATTTATCTATTTCCTTTGTATAT-ATGTAAGTTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TAA-ATATTTGATTGTCATTTCATTGTTTAT--ATGTGTATTAATTGTTT----GTATATGTATTGTACTC--TCATGTTGCTGTTTAAATGTTTGAACTCTCCTGTAAATTTGTACTATGGAGGCAATAAAGatca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaataataaaatctgattattcatatttagattataatgttttgaaagtgaacatgaaaccagaC---TCTT-ATGTTTCAT-TTTGGCAAGTCATGTCAGTCATTGAGCTACATGTGGCAATATTCTTCTTAAAGTGTCAATATGTTTTACAGTTTGAA-TGGACAT------ATCATTTATTAAATT-----ATATAT-ATGTAAATTGT----T-GAACTTAGTATCATAGTTCT-ATGTTTGTTT----GTATTG------TATTATATTTGATTGACATTTAATTGTCTAT--ATGTGAATTATGATTTT----GTATATGTATTGTATTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATATTCTCCTGTATATTTGTATTATGGAGGAAAc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAT-ATGT--GTTGTCATCTTGCAC-----ATCG---TTCCGATGTTTATATAGAAGTATAA------TAT-A-ATTTG-TT-CCTTTCAATT-TGTATTCATGT-TAATATGTGTTTATACGTATATGTACATTATTCAACCTTAT--CTGT----ATGTTTATACCCTCTTGTATGTTTATA--A-GGA-GAAAT-AAGA--CAATCGCTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATGTAAATTGT----TTGAACT----ATCGAAGTTAT-ATGT--GTTT----GTGTTG------TAT-ATATTTGACTGACATTTAATTGTCTAC--ATGTGTATTATATTTTT----GTACATGTATT-----C--CCTTGTTGCTGTTTATATGTTTATTCTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATACAGAATCAATCAGTCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGT-TATa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAATAATGCGATTCTTTCATTTAACTTTCAAGGTAC---T---TTT-TGTTTT-TGAAAGATAATATTTGGAAC-TAATACCACTTTCAGTACCCATATAGTGTAtacactatatgggtactgaaagtggtattagttccaaatattatctttcaaaaacaaaaagtaccttgaaagttaaatgaaagaatcgcattattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagtatttggaactaataccactttcagtacccatatagttatT----GTGTTG------TAT-ATATATGATTGTCATTTAATTGTTTAT--ATGTGTATTATGTTTTT----GTATATGTATTGTGTTC--CCATGTTGCTGTTTAAATGTTTATACTCTCCTGTATATTTGTACTATGGAGGAAATTAAGAATCA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ACCCCCAAGAAAAAAAAATACTTCATACCTGATTTATATAGATTGTCGGGCCGGTATAGCTTA
Unaligned ( gi|19 ): AATGACGTAGCACTAGCCTGTAAAGTGTTAATGCCATCATA