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Reference ( gi|1 ) : TAGTTGATAGTAAAACATCAACAGCAAAACGACGTGAAGTGT---GTTGTAGATAATATTCA-T--GCATTAACAGTCCTGCCTAAAATACAGCGGAATTTCGGG--AATCTTGTAT-AT-----TC-TAC---ACTCAATGACCAGCATTTAATTTTGTTATATACTGCAT-GTGAAAGTCTTTATTTATCTAATAGAATGTGTG---AATGAGTT----GTATGCTCTATATTGCGTCATATGGCCCAGCGTAGCTAGTGCGTTTTGCTCGGCCAGTGGGACAATAC---ATGTTTAAATTATCAAGTGTAACAA-AAAC--ATAAAATCTCTATGTGTAT----AT--GTTT-----GTAT-TACA--TACGTAACGTTTATTATA--CA-TCTA-TATATATGTTAATGTTTTCTTCTT-TTAATTATTTTG--ACA----------T---TAG---AC---CAAGTTATACGTAA-TATAGTAAAGTCTATAT-TTCC------CACT-------CA----------T----------TTACA-------TG---TTC--CC-TGCCTGAGTGTAAGTGTGA--ATCTGATTGAT---AATGTGTATGTATTGTCAGAGT-T----TA-ATAGTTACTGTATTTTTTGTTAATGCCTTATTG-TTCAAGGTAA-TGAACATTTAATAATGTTTTTG-CCTAATAAAGA-----AATTGGAAATGATGCTTTAAGGAACAAT
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gi|5 : tcactgaccaacattacaaaaaattaagtcattattcttaacaaaaatttcaaatattaattaagcttgctacatatgcttacctggcgatgttgaagcgtgaaagtctgacctagcgattttaatttaatcagtctgcctcgtcatatgtgtaaataatcaattttaacagtaatataatttattcacatactgctttaactccaaatcgaatttcactataatatatccagtttcaatctaccttgatgttttatacattcagcataatttaacacgttttgtacataaatagttttcactggccttacctattggcgactacaacaggtgactaaatgtcgtgaataataaaagcacgtgcagtatagtattaTTGATAGTGAAAATTCAACAGCAAAATCACGTGCATTG------TGT------TACTC--------TT--CAGTC-----------------GAATCTCGGA--AGTCT-GT-T-AT-----AC-TAC---ATTGAATGATCAGTATTGAATAAAGTTATA--CT-CA--------GT----ATTTCAGTAATTGAATGTGTG---ATTGA-TTCCTGGTTTGCTATACATTATGCCATATGACTCGGCCAAGCT
gi|6 : aagtgtgattgagtgatcaaaatatttaatttatcattacaccataattatgtttatgaaaaataccttaacaattactgaatatcgtactcacatactgcctttaatccaaatcgaatttcactttagtatatccaaattaaatccacttgcaattgttatgcattgagaatacacatgttttgaacagaaaaagttctaaattcccctggccttacacgccgagcaccacaacatagtaaataatcatagcacatgtcgcataggtgtattgatttaTTTATAGCAAAAAAACAACAGCAAAGTCACGTGAATTGT---GTTATAGTGGA---TCA-T--G--------GTC-----------ATAGTCGAATCTCGGG--AGTCTTTT-T-AT-----AC-TAC---ATTAAGTGACCAGCATtg
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gi|13 : tcacaggtcgacattacataaatacaagataacacaaaattcaaaattgttaataaaaattactaaatatgttcacctggcgatgttgaaacgtgaaagtctgacctagtgattcttaaccctaatcctattcgccatatgtttgataattaattttaacagtaataaaatttactcacatactgccataaatccaaatcgaatttcactgtaatatatccagtttaaatccactgttgtatgcatatagcataatttaacacgtttttgtagagaactaagtccatgtttccttggcgaccacaaaatgcggctagataacgtaaatattaaaagcacgtgccgtatagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaAATTCAGCC--ATCTCGGG--AGTTTTTTTA-AT-----AC-TAC---ATTAACTGACCAGCATTGAATAGTGTTATA
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gi|16 : AA-AAAC--ATAAAACCTCTATGAGTAT----AT--GGTT-----ATAC-TGAA--TAATTTACGTATATTATA--AA-TCTA-TATATATATTAATGATTTCTTCAT-TAAGATATTTTG--AC
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gi|17 : tctgttagtatttATCTTGTGTTAACGCCTTAGTG-TTCAAGGCGATTGAACATTTAATtaaattgaattgttactttctcaactttgactg
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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