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consensus                     : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAA-A--GTTAG-CA-AGCACATATA----CACA----CAC--AC--NC-ACA----CACG--T-G--CGTA--C-A------CATAC--GCACGCA----CGCA--------CGC---ACGCACGCA--CA----T--ATA------C--AC--------GTA---CA--C--AT--GCA---CGCAC------ACGC----ACA---CATA----C------AT----ACACAC------A--TACA----CGC--ACAC----ACA--T--ACGNATG--TA-------T------AA-T-GAAATANNAAGTAAC-AAGAACTGAATTTGTATG
Reference ( gi|7 )            : TTAATTATATTTTACAACTTTAAGATTGTTTAGGAATATTGACACTTTATTCATGGCAAGGGATAATGAG-AAACATAA-AGCATTAAATA-AGCACATATA----CACA----CAC--AC--TC-ACA----CACG--T-G--CGTA--C-A------CATAC--GCATGCA----CGCA--------CGC---ACGCACGCA--CA----T--ATA------C--AC--------ATA---CA--C--AT--GCA---TACAC------ATGC----ATA---CATA----C------AT----ACATAC------A--TACA----CGC--ACAC----ACA--T--ATGAATG--TA-------T------AA-T-GAAATAAGAAGAAAC-AGTAATT--ATTTGTATG
gi|14                         :                                                               ATAAT-----AGCATAACATCATT---CA-AGCACATATA----TAT-----------C--GC-ACA----GACA--T-G--CTTA--C-ATTTCTGCACAC--GCATTCA----CGCA--------CGC---ACGCACGCA--TG----T--A
gi|11                         :                                                               ATACTGAATGAATATAA-A---TTA--TACAGCATATGTA----TGCAAGTCCGC--AC--TC-CCG----CA----T-G--CAT------------CTTCC--ACCCGAC----CCCA--------CAC---ACG---GCG--CA----------------C--AC--------ATA---CA--C--AC--GCA---CATAC------ATAC----AGA---CAGA----C------AG----ACAGAC------A--TACA----TAC--ATAC----aa
gi|8                          :                                                                          ACACAA-AGAGTCAATTT-ATCACACACA----CACA----CAC--AC--ACAACAAACCCACG--TAA--CGCAAGCAA------CACAC--GAACGCACG--CGCA--------CGCGTAACACACGCA--TA----T--AAA------CAAAC--------ATAT--CA--C--ATGCGCA---CACAC------AAGC-----CA---CACG----C------AC----GCATAA------A--AACC----CGC--ATAC----ATA--T--ACG--CG--CA-------C------AA-T-G
gi|21                         :                                                                                      TAGACA-AGCACGCACG----CACG----CAC--AC--AC-ACG----CACG--C-G--CACA--C-A------CATAC--tg
gi|13                         :                                                                                        tgcgtcaCATATATA----CATA----CAC--ACATTC-ACA----AACGCAT-T--CATA--A-AAAGA--CATAC----ATACAT---CGTA--------CGT---ACGTACGTA--CT----T--GTG------T--GC--------GTA---CATGC--AT--GCA---TACAT------AT------ATA---CATA----C------AA----ATGTAC------G--Ta
gi|20                         :                                                                                               CACATATA----CATA----CACCGAC--TC--CA----C-CT--T-A--CCAA--C-A------CACAC--ACACACA----CACA--------CGC---ATGCACGTA--C-----T---TA------C--AC--------ATA---Ct
gi|10                         :                                                                                               CACACA-A----CAC-----CACT-ACC-TT-ACA----CTCA--C-G---GAA--C-A-------ATAA--GCATGCATAGGCACA--------CGC---GCGCATGGA--CC----C--ACA------C--AC--------GGA---TA--C--AC--GCA---CGCAC------ATAC----GAA---CATG----G------AT----ACACACTATCTGA--TACA-----------AC----ACA--T--ATAAA-GACTA-------T------GA-T-G
gi|22                         :                                                                                                ACCTATT----TACA----CAC--AC--TC-ACA----CAA-----------A--C-A------CACAC--GCACGCA----CGCA--------CGC---ACGCGCGCA--
gi|9                          :                                                                                                  ATATATTACCACC----CAC--AC--CC-ACA----CACA--T-A--CATA--T-A------CATACCAACATACT----CACACCAATACCCAC---ACCCACACA--CA----TTCATA------C--AC--------ATACCCCA--CTAAT--ACC---CACAC------ATAC------A---CATACCCCC------ACCCCAACTTAC------ACCCACA----CCC--ACAC----ACA--T--ACATACA--TA-------T------A
gi|6                          :                                                                                                  ATATA----CATG----CAC--AA--GA-ATA----TA----T-A--CATA--C-A------CATAC--AAATATA----CGCA-----------------TATGGA--CA----T--ATACTTTCCC--AC--------ATG---TA--C--AT--GCA---TGAAC------ATTT----ATA---AATA----
gi|12                         :                                                                                            catacaaactA----CTCA----CAC--AC--CC-ACA----CACA--T-ACCCGCA--C-AGC----CACAC--ACATGTA----CACA--------CTC---A------CA--CA----T--ATA------C--CC--------GTA---AA--C------GCA---CACAC---------C----A-A---CACA----C------AT----ACACAC------C--CACA----CGCGAATAC----ACA--C--ACAAATgaaaataacaagaactgaatttgtatgctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|18                         :                                                                                                                        cacccC-ACG----CACG--C-A--CGCA--C-A------CATAA--ACATGAA----TGTAT-------TGT---ACGCATGTA--CA----C--ACA------C--AC--------ATA---CA--C---T---CA---CACAA------AT
gi|16                         :                                                                                                                                   atgtatg--T-A--CGTA--C-G------CA--C--GCATGAA----CGAA--------CGA---ACGCACACAACCA----T--ACA------T--AC--------ATA---TA--C------GCA---TACAC------ACAC----ATGTTTTATA----C------AT----ACA
gi|13                         :                                                                                                                                         a--T-G--TATA--T-A------TGTAT--GCATGCA----TGTA--------CGC---ACACAAGTA--CG----T--ACG------T--AC--------GTA---CG-----AT--GTA---Tc
gi|21                         :                                                                                           catatatacatacacacattcacaaacgcattcataaaaagacatac--T-G--CGT------------CATAG--ACAAGCA----CGCA--------CGC---ACGCACACA--CA----C--GCA------C--GC--------GCA---CA--C--A----CA---TACAtacaaatgtacgtt
gi|19                         :                                                                                                                                             -G--TGTA--G-A------CACAC--GCACGCA----CGCA--------CACCAAACACACACA--C-----C--AAA------C--AC--------ACA---C---C--AA--ACA---CACAC------ACGC----ACAC--CAAA----C------AT----
gi|22                         :                                                                                                                                                   TA--C-A------CACAC--TCACACA----AACA--------CAC---ACGCACGCA--CG----C--ACG------C--AC--------GCG---CG--C--A
gi|11                         :                                                                                                                                            acctattTA--C-AG-----CATAT--GTATGCAAGTCCGCA--------CTC---CCGCATGCA--TC----T---TC------C--ACCCGACCCCACA---CA--C--G---GCG---CACAC------ATAC----ACA---CGCA----C------AT----ACATAC------A--GACA----GAC--AGAC----AGA--C--ATACATA--CA-------T------A
gi|1                          :                                                                                                                                            atactgaatgaatataaattaATGT--GTATGCG----TGTA--------C-----ATGCAGGTA--TG----T--ATA------C--AC--------A-----CA--T--GT--GCA---TACAT------TTGT----ATG---CATA----T------AT----c
gi|17                         :                                                                                                                                        tacatacatacacatccttacataaATAC--GTATGCA----CACA--------CGT---ACGCACGCA--GG----C--TTG------T--AT--------GTT---TA--C--AT--GCA---TACAaatacaaacacacatttataactgaactattaagaaacaagaactgaatttgtatgctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|23                         :                                                                                                                                                                   AC--ACATGCA----CGCA--------CGC---ACGCACGCA--CA----T--ATA------T--AT--------ATA---TA--A--AC--GCT---TAgtaattaatattaacatatacatgtgcgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                   AC--GCACGCA----AGCA--------CGC---ACACACG----TA----T--ATA------T--AT--------ATA---TA--T--AT--GTA---T-CAC------ATGT----CGA---CATG----G------AT-----C-TAC------A--TTCAATGTCG---ATAC----ATA--T--AT--ATG--TA-------T------a
gi|1                          :                                                                                                                                                                        CATACA----TACA--------CAT---CCTTACATA--AA----T--ATA------T--GC--------ATA---CA--A--AT--GTA---TGCAC------ATGTGTGTATA---CATA----CCTGCATGT----ACACGC------A--TACA----CATA-ATAC----AAA--C--ACACATT--TA-------T------AACT-GAACTATTAAGAAAC-AAGAACTGAATTTGTATG
gi|18                         :                                                                                                                                                                       taATGTA----TGCA--------CGC---ACGCACGCA--CA----C--ATA------A--AC--------ATG----A-----AT--GTATTGTACGC------ATG-------------TA----C------AC----ACACAC------A--TACA----CTC--ACAC----AAA--T--ctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                            CA----CGCA--------CGC---ACGCAAGCA--TA----T--ATA------T--AT--------ATA---TA--
gi|19                         :                                                                                                                                                                            aA----CACA--------CGC---ACGCACGCA--CAC---C--AAA------C--AC--------ACA---CA--C-------CA---AACAC------ACAC----------CAAA----C------AC----ACACAC------G--CACA----C-C--AAAC----A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                 gtgtagCATGCA--CAAGAAT--ATA------T--AC--------ATA---CA--C--AT--ACA---AATAT------ACGC----ATA---TGGA----C------AT------ATAC------T--TTCC----CAC--ATGT----ACA--TGCATGAACA--T--------T------TA-T--AAATAGAAAATAAC-AAGAACTGAATTTGTATGt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                 catacaaactatataA----C--ATA------C--AC--------ATT---CA--G--AT--GTA---TGCAC------ATGC----ATG---TATA----A------AT----ACCTGT------A--TGTA----CAC--ACAT----ACA--T--AT-AATA--CAAACACACTTTCATAAA-TAGAAATTAGAAGTAACAAGT-GTTGGATTTGCATGctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                          A------T--AC--------GTA---CG--C--AC--GCA---TGAACGAACGAACGC----ACA---CAAC----C------AT----ACATAC------A--TATA----CGCATACAC----ACA--C--ATGctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                           ------C--AC--------ATA---TA--T--ATC-GCA---CAGAC------ATGC----TTA---CATT----T------CT----GCACACGC----A--TTCA----CGC--ACGC----ACG--C--ACGCATG--TA-------ttttatacatacac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                    ataatagcataacatcattcaag------C--AC--------GCA---CG--C--AC--GCA---CACAC------ACGC----ACG---CGCA----C------AC----ACATAC------A--aa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                 tgcgtcatagacaagA---CA--C--AT--GCACG-CACGC------ACGC----ACG---CACA----T------AT----ATATAT------A--TAAA----CGC--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                     A--C--GT--ACA---TTTGT------ATGT----ATA---TATG----T------AT----GCATGC------A--TGTA----CGC--ACACAAGTACG--T--ACGTACG--TA-------C------GA-T-Gttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                   catatatacatacacacattcacaaacgcattcataaaaagacatacataA--T--AT--GTA---TGTGT------GTAC----ATA---CAGG----T------AT----TTATAC------A--TGCA----TGT--GCAT----ACA--T--CTGAATG--TG-------T------At
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                      aca--AT--GCG---TGTAC------ATGC----AGG---TATG----T------AT----ACACAC------A--T--------GT--GCAT----ACA--T--TTGTATG--CA-------T------Aaatacaaacacactttcataaatagaaattagaagtaacaagtgttggatttgcatgctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                             tacatacatacacatccttacataaataC------ACGC----ACG---CACG----C------AC----ACACAC------G--CACG----CGC--ACAC----ACA--T--Aacacataatacaaacacacatttataactgaactattaagaaacaagaactgaatttgtatgctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcgtcatagacaagATG----T------AT----GCACGC------A--CGCA----CGC--ACAC----ATAAAC--ATGAATG--TA-------T------ca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACA----C------AT----GCACGC------A--CGCA----CGC--ACGC----ACA--T--ATATATA--TA-------T------AA-tgtacgcatgtacacacacacatacactcacacaaat
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|3 ): GCATCTGAAGTTATATATAGTTTCTTTCTTTTTTAAGGAAGCCTGAATTATTAAATATTTTAAAAGTTACTAATGCCATATTCCTATTACCCTGATACGCAATCTTTGTTATTTGGCTTAATCCAAATCCTTAAAAAAATTGTTGTAATCATGGTTCACAAAACTTAGTTCTCTTTTTTATGTTATTTTTCTGCTCAAAAATACCAGCTAAGAGGTCAAAAACCAAAGTATAATACAAGTGGGGAATTGTTTTATTTACTGTTTGATTTACTCAAATTATATCCAATAGGTTTTAGAACAATAAATTGTTGTGCATCTTTTTTACAAATACAACAAATTTGAGTATCAAAATTTAAATTACAAACCAAATCAACTCTTAATTGTCTAACAGTTTCTACGCATGATATTATTGTTCGCAAATTAATAAAGATAGGGGATTTGTTATGTATCTTTTTCCAACTGTAATTTCTTGGGAATTTTTTGGACACACCTGTATTCAGTTTAATTTGAACCAATCTATTAGTATTTTTCTTTCATTTT
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Reference ( family-84 )       : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTAG-CAA-GCACATATACACA----CAC--A-CN---CACACACG--TG-CGTA--CA------CATACGCAC-GCA----CGC--ACGC---AC--GCACGCACATA--TACA--CGTA--CACA-TGCACGCACAC---------GCACA--CATACATA----C--ACAC------ATACACGC--ACACACATA---------CGNATGTAT-AA-T-GAAATANNAAGTAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                CAT-ACA----TAC--ACAT---CC--TTACATAAATA--TATG--CATA--CAAA-TGTATGCACAT---------GTGTG--TATACATA----CCTGCAT------GTACACGC--ATACACATAATACAAACACACATTTAT-AACT-GAACTATTAAGAAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|10                         :                                                                                                 taCACACA-ACAC-----CACT-A-CCTTACACTCACG------GAA--CA-------ATAAGCAT-GCATAGGCAC--ACGC---GC--GCATGGACCCA--CACA--CGGA--TACA-CGCACGCACAT---------ACGAA--CATGGATA----C--ACACTATCTGATACA-----ACACATATA---------AAGAC-TAT-GA-T-Gctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|11                         :                                                               ATACTGAATGAATATAAA--------TTAT-ACA-GCATATGTATGCAAGTCCGC--A-CT---CCCGCA----TG-CAT-----------CTTCCACCC-GAC----CCC--ACAC---AC--G-GCGCACACA--TACA--CACG--CACA-TACATACAGAC---------AGACAGACAGACATA----C--ATAC------ATAC
gi|12                         :                                                                                                          ACTCA----CAC--A-CC---CACACACA--TA-CCCG--CA------CAGCCACAC-ACA----TGT--ACAC---AC--TCA--CACATA--TACC--CGTA--AAC---GCACACAC------------CA-A--CACACATA----C--ACAC------CCACACGCGAATACACACA---------CAAAT
gi|13                         :                                                                                              cacccCATATATACATA----CAC--A-CATT-CACAAACGCATT-CATA--AAAAGA--CATACATAC-AT-----CGT--ACGT---AC--GTACGTACTTG--TGTG--CGTA--CA---TGCATGCATAC-----------ATA--TATACATA----C--AAAT------GTAC
gi|14                         :                                                                     AAT-AGCATAACA-------TCATTCAA-GCACATATATAT------------CG---CACAGACA--TG-CTTA--CATTTCTGCACACGCAT-TCA----CGC--ACGC---AC--GCACGCATGTA--gtt
gi|15                         :                                                                                                                                                           atACGCAC-GCA----AGC--ACGC---AC--ACACGTATATA--TATA----TA--TATA-TGTAT-CACAT---------GTCGA--CATGGATC----T--ACAT------TCA-ATGT--CGATACATA---------TATATGTAT-aa
gi|16                         :                                                                                                                                               A--TA------CGTACGCAC-GCA----TGA--ACGA---AC--GAACGCACACAACCATA--CATA--CATA-T--ACGCATAC---------ACACA--CATGT-TT----T--ATAC------ATACAC
gi|17                         :                                                                                                                                                           ATACGTAT-GCA----CAC--ACGT---AC--GCACGCAGGCT--TGTA--TGTT--TACA-TGCATACA
gi|18                         :                                                                                                                                                             ATGTAT-GCA----CGC--ACGC---AC--GCA--CACATA--AACA--TGAA--TGTATTGTACGCATGT---------ACACA--CACACATA----C--ACTC------ACACAgtaattaatattaacatatacatgtgcgt
gi|20                         :                                                                                                   CACATATACATA----CACCGA-CT---C-CAC-CT--TA-CCAA--CA------CACACACAC-ACA----CAC--ACGC---AT--GCACGTAC-T---TACA--CATA--Caat
gi|20                         :                                                                                  -------TTAC-CAACACACACACACACA----CAC--A-CG---CATGCACG--TA-CTTA--CA------CATAC
gi|21                         :                                                                                                              cacatatacatacaccgactccacc--TG-CGT-----------CATAGACAA-GCA----CGC--ACGC---AC--GCACACACACG--CACG--CGCA--CACA-CATAC
gi|22                         :                                                                                                    ACCTATTTACA----CAC--A-CT---CACACAA---------A--CA------CACACGCAC-GCA----CGC--ACGC---AC--GCGCGCAa
gi|23                         :                                                                                                                                                             ACACAT-GCA----CGC--ACGC---AC--GCACGCACATA--TATA--TATA--TAAA-CGC
gi|24                         :                                                                                                                                                                     CA----CGC--ACGC---AC--GCAAGCATATA--TATA--TATA--TAttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           aCATACACATT--CAGA--TGTATGCACA-TGCATGTATAA---------ATACC--TGTATGTA----C--ACAC------ATACATATA-ATACAAACA---------CACTTTCATAAA-TAGAAATTAGAAGTAACAAGTGTTGGATTTGCATG
gi|6                          :                                                                                                                                                   a------CATACAAACTATA----TAC--ATGC---ACAAGAATATATACA--TACA--CATA--CAAA-TATACGCATAT---------GGACA--TATACTTT----C--CCAC------AT----GT--ACATGCATG---------AACATTTAT-AA------ATAGAAAATAACAAGAACTGAATTTGTATGctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|7                          :                                                               ATAATGAG-AAACATAAAGCA-----TTAAATAA-GCACATATACACA----CAC--A-CT---CACACACG--TG-CGTA--CA------CATACGCAT-GCA----CGC--ACGC---AC--GCACGCACATA--TACA--CATA--CACA-TGCATACACAT---------GCATA--CATACATA----C--ATAC------ATACACGC--ACACACATA---------TGAATGTAT-AA-T-GAAATAAGAAGAAACAGTAATT--ATTTGTATGctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|8                          :            ttaattatattttacaactttaagattgtttaggaatattgacactttattcatggcaagggACACAAAGAGTCAATTTAT-CAC-ACACACACACACA----CAC--AACA---AACCCACG--TAACGCAAGCAA-----CACACGAAC-GCA----CGCGCACGCGTAAC--ACACGCATATA--AACAAACATAT-CACA-TGCGCACACACAAGCCACACGCACG--CATAAAAACCCGC--ATAC------ATATACGC--GCACA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-84 )       : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTA--T-CAA-GCACATATACACA----CAC--A-CN---CACGCACG--TG-CGTA--CA------CATACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CGTA-CACA-TGCACGCAC--AC---------GCA---CA--CAT--ACATA----C--ACA--C------GTACACGC--ACACACATA---------CANA-TTTATAA-T-GAAATAAGAAGNAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                  CATACA----TAC--ACAT---CCTTACATAAA----TATATG--CATA-CAAA-TGTATGCAC--AT---------GTG---TG--TAT--ACATA----CCTGCA--T------GTACACGC--ATACACATAATACAAACACACA-TTTATAACT-GAACTATTAAGAAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|10                         :                                                                                                   taCACACA-ACAC-----CACT-A-CCTTACACTCACG------GAA--CA-------ATAAGCATGCATAGGCAC--ACGC---GCGCATGGACC----CACACA--CGGA-TACA-CGCACGCAC--AT---------ACG---AA--CAT--GGATA----C--ACA--CTATCTGATACA-----ACACATATA---------AAGA--CTATGA-T-Gctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|11                         :                                                               ATACTGAATGAATATAAA--------TTA--T-ACA-GCATATGTATGCAAGTCCGC--A-CT---CCCGCA----TG-CAT-----------CTTCCACCCGAC----CCC--ACAC---ACG-GCGCACA----CATACA--CACG-CACA-TACATACAG--AC---------AGA---CAGACAG--ACATA----C--ATA--C------ATAC
gi|12                         :                                                                                                            ACTCA----CAC--A-CC---CACACACA--TA-CCCG--CA------CAGCCACACACA----TGT--ACAC---ACTCAC--ACA----TATACC--CGTA-AAC---GCACACAC--------------CA----A--CAC--ACATA----C--ACA--C------CCACACGCGAATACACACA---------CAAA-T
gi|13                         :                                                                                                cacccCATATATACATA----CAC--A-CATT-CACAAACGCATT-CATA--AAAAGA--CATACATACAT-----CGT--ACGT---ACGTACGTACT----TGTGTG--CGTA-CA---TGCATGCAT--AC-----------A---TA--TAT--ACATA----C--AAA--T------GTAC
gi|14                         :                                                                     AAT-AGCATAACA-------TCA--TTCAA-GCACATATATAT------------CG---CACAGACA--TG-CTTA--CATTTCTGCACACGCATTCA----CGC--ACGC---ACGCACGCATG----TAgtt
gi|15                         :                                                                                                                                                             atACGCACGCA----AGC--ACGC---ACACACGTATA----TATATA----TA-TATA-TGTAT-CAC--AT---------GTC---GA--CAT--GGATC----T--ACA--T------TCA-ATGT--CGATACATA---------TATA-TGTATaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                  A----TACGTA--CGCA-CGCA-TGAACGAACGAAC---------GCA---CA--CAA--CCATA----C--ATA--C------ATATACGC--ATACACACA---------CATGTTTTATA
gi|17                         :                                                                                                                                                             ATACGTATGCA----CAC--ACGT---ACGCACGCAGG----CTTGTA--TGTT-TACA-TGCATACA--------------GTAATTAA--TATTAACATA----T--ACA--T------GTGCcatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                               ATGTATGCA----CGC--ACGC---ACGCA--CACA----TAAACA--TGAA-TGTATTGTACGCAT--GT---------ACA---CA--CAC--ACATA----C--ACT--C------ACACAgt
gi|20                         :                                                                                                     CACATATACATA----CACCGA-CT---C-CAC-CT--TA-CCAA--CA------CACACACACACA----CAC--ACGC---ATGCACGTAC-----T-TACA--CATA-Caat
gi|20                         :                                                                                  -------TTA--C-CAACACACACACACACA----CAC--A-CG---CATGCACG--TA-CTTA--CA------CATAC
gi|21                         :                                                                                                                cacatatacatacaccgactccacc--TG-CGT-----------CATAGACAAGCA----CGC--ACGC---ACGCACACACA----CGCACG--CGCA-CACA-CATAC
gi|22                         :                                                                                                      ACCTATTTACA----CAC--A-CT---CACACAA---------A--CA------CACACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCGCGCAa
gi|23                         :                                                                                                                                                               ACACATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATATA--TATA-TAAA-CGC
gi|24                         :                                                                                                                                                                      CA----CGC--ACGC---ACGCAAGCATA----TATATA--TATA-TAttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                    aA------CATACACATTCA-----------G----ATGTATGCACA----TG--CA--TGTA-TAAA-TACCTGTAT--GT---------ACA---CA--CAT--ACATA----T--A-------------ATACAA--ACACACTTT---------CATA------AA-TAGAAATTAGAAGTAACAAGTGTTGGATTTGCATG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                           CATGCACAAGAATATATA--CATA-CACA-TACAAATAT--AC---------GCA---TA--TGG--ACATA----T--ACTTTC------CCACATGT--ACATGCATG---------AACA-TTTATAA------ATAGAAAATAACAAGAACTGAATTTGTATGctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|7                          :                                                catacaaactatataATAATGAG-AAACATAAAGCA-----TTAAAT--AA-GCACATATACACA----CAC--A-CT---CACACACG--TG-CGTA--CA------CATACGCATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CATA-CACA-TGCATACAC--AT---------GCA---TA--CAT--ACATA----C--ATA--C------ATACACGC--ACACACATA---------TGAA-TGTATAA-T-GAAATAAGAAGAAACAGTAATT--ATTTGTATGctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|8                          :            ttaattatattttacaactttaagattgtttaggaatattgacactttattcatggcaagggACACAAAGAGTCAATTTA--T-CAC-ACACACACACACA----CAC--AACA---AACCCACG--TAACGCAAGCAA-----CACACGAACGCA----CGCGCACGCGTAACACACGCATA----TAAACAAACATATCACA-TGCGCACAC--ACAAGCCACACGCA---CG--CAT--AAAAACCCGC--ATA--C------ATATACGC--GCACA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): ATAAACATTATTAAAGCAAATATGATAATAATCTATTAACAAACAGCACATGTGCAACTTTAATACAAAAGCCACTATTGCAGACAAAGTTTGTATAACGCATCATATTAAGACACTGAGGCCAGGTGTGTCACTCCTGTCATGGAATTCAGATTTGATATTTACGTGGAACTACATGCTATGCAATTGCCATCAGTGCTGTTCCAAAACAATATCATGTTTCCAAACCGGTTAAAATCAACAGTTTACTATATTCCTCTGGCAGTGAATTCCACAGTACTGGGGCAGCATACATGAAACAATTCTTATCGAACTTGGTTGTTTTAACCTGAGGGACCTAAAATCGTCTGGAGTATCTAAAACTATACGAATTTTCTCTTTTAGCAAATCTGTGATTTAGAACTGGAGGAGCAATACCGTATACCATGTTTCTATTGCCATTGTTTTCATTCTATGTTTATACGAGGACGATAACTTAACCTTATCAAGAAGTTAGTGGTCATAACTTGAATACTCATCATGAACGACTCCAAGAGCTCCTTTTCTGTATTAATTTTGGTGCAAACATGT
Unaligned ( gi|3 ): GCATCTGAAGTTATATATAGTTTCTTTCTTTTTTAAGGAAGCCTGAATTATTAAATATTTTAAAAGTTACTAATGCCATATTCCTATTACCCTGATACGCAATCTTTGTTATTTGGCTTAATCCAAATCCTTAAAAAAATTGTTGTAATCATGGTTCACAAAACTTAGTTCTCTTTTTTATGTTATTTTTCTGCTCAAAAATACCAGCTAAGAGGTCAAAAACCAAAGTATAATACAAGTGGGGAATTGTTTTATTTACTGTTTGATTTACTCAAATTATATCCAATAGGTTTTAGAACAATAAATTGTTGTGCATCTTTTTTACAAATACAACAAATTTGAGTATCAAAATTTAAATTACAAACCAAATCAACTCTTAATTGTCTAACAGTTTCTACGCATGATATTATTGTTCGCAAATTAATAAAGATAGGGGATTTGTTATGTATCTTTTTCCAACTGTAATTTCTTGGGAATTTTTTGGACACACCTGTATTCAGTTTAATTTGAACCAATCTATTAGTATTTTTCTTTCATTTT
Unaligned ( gi|5 ): GTACTCATTGTATTCAAATCCCAGTGCTCTTTCTTGTATTTTTCTATCTTTTTGGTATTATTTTCTGAACAAAATCATTTACAAAACACAAGATTAATTTTGCAAAAAAAAAGGGTGAAATTATTAAACGGTTAAATATACTTAGTTATTACTAATGTGTTTCAGAACATTCAAATGTTAAGAATTTTTTTTTATAATAACAAAAAAATATTATATCCAAATCGAGTCGTAACACTTTAACAGTTTCCTCGCATAAAATTGATGTTATGTTAA
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Unaligned ( gi|19 ): GTGTAGACACACGCACGCACGCACACCAAACACACACACCAAACACACACCAAACACACACACGCACACCAAACAT






Alignments
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consensus                     : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTA--T-CAA-GCACATATACACA----CAC--A-CN---CACGCACG--TG-CGTA--CA------CATACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CGTA-CACA-TGCACGCAC--AC---------GCA---CA--CAT--ACATA----C--ACA--C------GTACACGC--ACACACATA---------CANA-TTTATAA-T-GAAATAAGAAGNAACAAGAACTGAATTTGTATG
Reference ( family-84 )       : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTA--T-CAA-GCACATATACACA----CAC--A-CN---CACGCACG--TG-CGTA--CA------CATACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CGTA-CACA-TGCACGCAC--AC---------GCA---CA--CAT--ACATA----C--ACA--C------GTACACGC--ACACACATA---------CANA-TTTATAA-T-GAAATAAGAAGNAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                  CATACA----TAC--ACAT---CCTTACATAAA----TATATG--CATA-CAAA-TGTATGCAC--AT---------GTG---TG--TAT--ACATA----CCTGCA--T------GTACACGC--ATACACATAATACAAACACACA-TTTATAACT-GAACTATTAAGAAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|10                         :                                                                                                   taCACACA-ACAC-----CACT-A-CCTTACACTCACG------GAA--CA-------ATAAGCATGCATAGGCAC--ACGC---GCGCATGGACC----CACACA--CGGA-TACA-CGCACGCAC--AT---------ACG---AA--CAT--GGATA----C--ACA--CTATCTGATACA-----ACACATATA---------AAGA--CTATGA-T-Gctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
gi|11                         :                                                               ATACTGAATGAATATAAA--------TTA--T-ACA-GCATATGTATGCAAGTCCGC--A-CT---CCCGCA----TG-CAT-----------CTTCCACCCGAC----CCC--ACAC---ACG-GCGCACA----CATACA--CACG-CACA-TACATACAG--AC---------AGA---CAGACAG--ACATA----C--ATA--C------ATAC
gi|12                         :                                                                                                            ACTCA----CAC--A-CC---CACACACA--TA-CCCG--CA------CAGCCACACACA----TGT--ACAC---ACTCAC--ACA----TATACC--CGTA-AAC---GCACACAC--------------CA----A--CAC--ACATA----C--ACA--C------CCACACGCGAATACACACA---------CAAA-T
gi|13                         :                                                                                                cacccCATATATACATA----CAC--A-CATT-CACAAACGCATT-CATA--AAAAGA--CATACATACAT-----CGT--ACGT---ACGTACGTACT----TGTGTG--CGTA-CA---TGCATGCAT--AC-----------A---TA--TAT--ACATA----C--AAA--T------GTAC
gi|14                         :                                                                     AAT-AGCATAACA-------TCA--TTCAA-GCACATATATAT------------CG---CACAGACA--TG-CTTA--CATTTCTGCACACGCATTCA----CGC--ACGC---ACGCACGCATG----TAgtt
gi|15                         :                                                                                                                                                             atACGCACGCA----AGC--ACGC---ACACACGTATA----TATATA----TA-TATA-TGTAT-CAC--AT---------GTC---GA--CAT--GGATC----T--ACA--T------TCA-ATGT--CGATACATA---------TATA-TGTATaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                  A----TACGTA--CGCA-CGCA-TGAACGAACGAAC---------GCA---CA--CAA--CCATA----C--ATA--C------ATATACGC--ATACACACA---------CATGTTTTATA
gi|17                         :                                                                                                                                                             ATACGTATGCA----CAC--ACGT---ACGCACGCAGG----CTTGTA--TGTT-TACA-TGCATACA--------------GTAATTAA--TATTAACATA----T--ACA--T------GTGCcatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                               ATGTATGCA----CGC--ACGC---ACGCA--CACA----TAAACA--TGAA-TGTATTGTACGCAT--GT---------ACA---CA--CAC--ACATA----C--ACT--C------ACACAgt
gi|20                         :                                                                                                     CACATATACATA----CACCGA-CT---C-CAC-CT--TA-CCAA--CA------CACACACACACA----CAC--ACGC---ATGCACGTAC-----T-TACA--CATA-Caat
gi|20                         :                                                                                  -------TTA--C-CAACACACACACACACA----CAC--A-CG---CATGCACG--TA-CTTA--CA------CATAC
gi|21                         :                                                                                                                cacatatacatacaccgactccacc--TG-CGT-----------CATAGACAAGCA----CGC--ACGC---ACGCACACACA----CGCACG--CGCA-CACA-CATAC
gi|22                         :                                                                                                      ACCTATTTACA----CAC--A-CT---CACACAA---------A--CA------CACACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCGCGCAa
gi|23                         :                                                                                                                                                               ACACATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATATA--TATA-TAAA-CGC
gi|24                         :                                                                                                                                                                      CA----CGC--ACGC---ACGCAAGCATA----TATATA--TATA-TAttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                    aA------CATACACATTCA-----------G----ATGTATGCACA----TG--CA--TGTA-TAAA-TACCTGTAT--GT---------ACA---CA--CAT--ACATA----T--A-------------ATACAA--ACACACTTT---------CATA------AA-TAGAAATTAGAAGTAACAAGTGTTGGATTTGCATG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                           CATGCACAAGAATATATA--CATA-CACA-TACAAATAT--AC---------GCA---TA--TGG--ACATA----T--ACTTTC------CCACATGT--ACATGCATG---------AACA-TTTATAA------ATAGAAAATAACAAGAACTGAATTTGTATGctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|7                          :                                                catacaaactatataATAATGAG-AAACATAAAGCA-----TTAAAT--AA-GCACATATACACA----CAC--A-CT---CACACACG--TG-CGTA--CA------CATACGCATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CATA-CACA-TGCATACAC--AT---------GCA---TA--CAT--ACATA----C--ATA--C------ATACACGC--ACACACATA---------TGAA-TGTATAA-T-GAAATAAGAAGAAACAGTAATT--ATTTGTATGctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|8                          :            ttaattatattttacaactttaagattgtttaggaatattgacactttattcatggcaagggACACAAAGAGTCAATTTA--T-CAC-ACACACACACACA----CAC--AACA---AACCCACG--TAACGCAAGCAA-----CACACGAACGCA----CGCGCACGCGTAACACACGCATA----TAAACAAACATATCACA-TGCGCACAC--ACAAGCCACACGCA---CG--CAT--AAAAACCCGC--ATA--C------ATATACGC--GCACA


blockSeqs                     :                                                                  A    T         GAGTCAAT   TTC    C            AAGTC   CG A ATT    G   GCATTCATAAAAAGA                 TAGG   GC    GTA           AGAA      AA    T    T     G  CACAAGCCACACGCAC      GA   TA     CCCG .    CTATCTGA         GA         A          G TTT     TA       AG   T          GG
blockSeqs                     :                                                                       A         GCA        AAT    .            A       .  . T      A   ATGCTTACATTTCTG                 .      .     .             .         .     .    .     A  CGAACGCAC             .    .      .    .    TTCC             .          C          A TG      T        GA   T          GA
blockSeqs                     :                                                                                 A          CC     .            A       .  . C      A   GTAACGCAAGCAA                   .      .     .             .         .     .    .     A  CATACGA               .    .      .    .    CA               .          T          T TT      T        AG   A          . 
blockSeqs                     :                                                                                            TC     .            A       .  . G      A   ATACCCGCA                       .      .     .             .         .     .    .     G  GACAGAC               .    .      .    .    CC               .          C          T TG      .                          
blockSeqs                     :                                                                                                                A       .  . T      A   TTACCAACA                       .      .     .             .         .     .    .     G  CATGTCG               .    .      .    .    TG               .          C          T C                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                A       .  . G      G   GTACTTACA                       .      .     .             .         .     .    .     A  GTAATTA               .    .      .    .    TT               .          A          C .                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                A       .  . T      A   GTGCGTACA                       .      .     .             .         .     .    .     G  TGTACAC               .    .      .    .    CA               .          T          A                                    
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finalCons                     : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTA--T-CAA-GCACATATACACA----CAC--A-CN---CACGCACGTACNCACA-----------CATACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CGTA-CACA-TGCACGCAC--AC---------GCA---CA--CAT--ACATA----C--ACA--C------GTACACGC--ACACACATAC---------ANA-TTTATAAT--GAAATAAGAAGNAACAAGAACTGAATTTGTATG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-84 )       : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANTGAATGAACATAAAG-------TTA--T-CAA-GCACATATACA-CA----CAC--A-CN---CACGC--ACGT--A-CNCA--CA------CATACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CGTA-CACA-TGCACGCAC--AC---------GCA---CACAT--ACATA----C--ACA--C------GTACACGC--ACACACAT---------A-------CANA-TTT--ATAA-T-GAAATAAGAAGNAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                     CATACA----TAC--ACAT---CCTTACATAAA----TATATG--CATA-CAAA-TGTATGCAC--AT---------GTG---TGTAT--ACATA----CCTGCA--T------GTACACGC--ATACACATAATACAAACA-------CACA-TTT--ATAACT-GAACTATTAAGAAACAAGAACTGAATTTGTATG
gi|10                         :                                                                                                   taCACACA-ACA-C-----CACT-A-CCTTACACTC--ACGG--A----A--CA-------ATAAGCATGCATAGGCAC--ACGC---GCGCATGGACC----CACACA--CGGA-TACA-CGCACGCAC--AT---------ACG---AACAT--GGATA----C--ACA--CTATCTGATACA-----ACACATAT---------A-------AAGA--CT--ATGA-T-Gctacccacagtgcattgtactacagatttattttgacacaaatgcatgccatttacatgatattccattacaagaagatactaaaagctttaattggttaaaattggacgggtattttattcctctggtaagtggttccaaagttcttgggcagcatgtcgaaaactgttcttaccgtagttagttattctgatacttagtggttgagtatccaaagttatattttgttacttgctttttgtattaaggaagatggaactggtggtgcttaattattttatatttttaaaaatttctagtgccatacttctcattctcctgatatgtaaagttggtaatttggctcaatccactgaaaagctcaaaacatgttttgttgtagtcattgtacacaaatcttagtgctctttcttgtatttttttctcatttttttttggtgttattttctgaacaaaaatgccagttaagaggacaaaaattaaaatttgatagaataaaagtgtggaaaattgttaatctgtttaatttacttaaattatatccttatatatttgggtgtcaaaatttaattcaaaatccaaatcgactcctaacagtctgacagtttcttcgcatgttattgttgttttgccaaataaaaggcaggggatttttcatatgtcatttttccaactgcaatggcttggaatttatctggatttgctggtatttactgcatttccaattttagtttgttgtttatgttc
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gi|15                         :                                                                                                                                                                atACGCACGCA----AGC--ACGC---ACACACGTATA----TATATA----TA-TATA-TGTAT-CAC--AT---------GTC---GACAT--GGATC----T--ACA--T------TCA-ATGT--CGATACAT---------A-------TATA-TGT--ATaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                     A----TACGTA--CGCA-CGCA-TGAACGAACGAAC---------GCA---CACAA--CCATA----C--ATA--C------ATATACGC--ATACACAC---------A-------CATGTTTT--ATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                ATACGTATGCA----CAC--ACGT---ACGCACGCAGG----CTTGTA--TGTT-TACA-TGCATACA--------------GTAATTAATATTAACATA----T--ACA--T------GTGCcatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                                  ATGTATGCA----CGC--ACGC---ACGCA--CACA----TAAACA--TGAA-TGTATTGTACGCAT--GT---------ACA---CACAC--ACATA----C--ACT--C------ACACAgt
gi|20                         :                                                                                                     CACATATACA-TA----CACCGA-CT---C-CAC---CTT--A-CCAA--CA------CACACACACACA----CAC--ACGC---ATGCACGTAC-----T-TACA--CATA-Caat
gi|20                         :                                                                                  -------TTA--C-CAACACACACACACA-CA----CAC--A-CG---CATGC--ACGT--A-CTTA--CA------CATAC
gi|21                         :                                                                                                                                cacatatacatacaccgactccacc------CATAGACAAGCA----CGC--ACGC---ACGCACACACA----CGCACG--CGCA-CACA-CATAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                               tgcgtC--AC---------GCA---CGCAC--GCACA----C--ACA--C------GCACGCGC--ACACACAT---------A-------CAa
gi|22                         :                                                                                       tgcgtcatagacaagACCTATTTA-CA----CAC--A-CT---CAC----------A-CAAA--CA------CACACGCACGCA----CGC--ACGC---ACGCGCGCA
gi|23                         :                                                                                                                                                                  ACACATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATATA--TATA-TAAA-CGC
gi|24                         :                                                                                                                                                                         CA----CGC--ACGC---ACGCAAGCATA----TATATA--TATA-TAttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    aA----CATACA--CATT-CAGA-TGTATGCAC--AT---------GCA---TGTAT--AAATA----CCTGTA--T------GTACACAC--ATACATAT---------AATACAAACACA-CTTTCATAAATAGAAATTAGAAGTAACAAGTGTTGGATTTGCATG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                              CATGCACAAGAATATATA--CATA-CACA-TACAAATAT--AC---------GCA---TATGG--ACATA----T--ACTTTC------CCACATGT--ACATGCAT---------G-------AACA-TTT--ATAA------ATAGAAAATAACAAGAACTGAATTTGTATGctacccacagtgaattgtaggtctactacagtttatgtcgacttgcatgcatgatatttacatgatgtttaagatacttaaagcttaaattagtcataatttgacgttttttttgctgaattcctctggtaagaagttccaaagcacttgggcagaataccgaaaattgtgaccgtagtttgttgtactgatgcttcgtatttg
gi|7                          :                                                catacaaactatataATAATGAG-AAACATAAAGCA-----TTAAAT--AA-GCACATATACA-CA----CAC--A-CT---CACAC--ACGT--G-CGTA--CA------CATACGCATGCA----CGC--ACGC---ACGCACGCACA----TATACA--CATA-CACA-TGCATACAC--AT---------GCA---TACAT--ACATA----C--ATA--C------ATACACGC--ACACACAT---------A-------TGAA-TGT--ATAA-T-GAAATAAGAAGAAACAGTAATT--ATTTGTATGctacccacagtgaattgcacaacatatttattttgatttgcatgcatgacatttacatgacatttacatgacatttacatgatattccatttcaagaagatacttaaagcttaagttggttaaaatttgatgtttttggc
gi|8                          :            ttaattatattttacaactttaagattgtttaggaatattgacactttattcatggcaagggACACAAAGAGTCAATTTA--T-CAC-ACACACACACA-CA----CAC--AACA---AACCC--ACGT--AACGCAAGCAA-----CACACGAACGCA----CGCGCACGCGTAACACACGCATA----TAAACAAACATATCACA-TGCGCACAC--ACAAGCCACACGCA---CGCAT--AAAAACCCGC--ATA--C------ATATACGC--GCACA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): ATAAACATTATTAAAGCAAATATGATAATAATCTATTAACAAACAGCACATGTGCAACTTTAATACAAAAGCCACTATTGCAGACAAAGTTTGTATAACGCATCATATTAAGACACTGAGGCCAGGTGTGTCACTCCTGTCATGGAATTCAGATTTGATATTTACGTGGAACTACATGCTATGCAATTGCCATCAGTGCTGTTCCAAAACAATATCATGTTTCCAAACCGGTTAAAATCAACAGTTTACTATATTCCTCTGGCAGTGAATTCCACAGTACTGGGGCAGCATACATGAAACAATTCTTATCGAACTTGGTTGTTTTAACCTGAGGGACCTAAAATCGTCTGGAGTATCTAAAACTATACGAATTTTCTCTTTTAGCAAATCTGTGATTTAGAACTGGAGGAGCAATACCGTATACCATGTTTCTATTGCCATTGTTTTCATTCTATGTTTATACGAGGACGATAACTTAACCTTATCAAGAAGTTAGTGGTCATAACTTGAATACTCATCATGAACGACTCCAAGAGCTCCTTTTCTGTATTAATTTTGGTGCAAACATGT
Unaligned ( gi|3 ): GCATCTGAAGTTATATATAGTTTCTTTCTTTTTTAAGGAAGCCTGAATTATTAAATATTTTAAAAGTTACTAATGCCATATTCCTATTACCCTGATACGCAATCTTTGTTATTTGGCTTAATCCAAATCCTTAAAAAAATTGTTGTAATCATGGTTCACAAAACTTAGTTCTCTTTTTTATGTTATTTTTCTGCTCAAAAATACCAGCTAAGAGGTCAAAAACCAAAGTATAATACAAGTGGGGAATTGTTTTATTTACTGTTTGATTTACTCAAATTATATCCAATAGGTTTTAGAACAATAAATTGTTGTGCATCTTTTTTACAAATACAACAAATTTGAGTATCAAAATTTAAATTACAAACCAAATCAACTCTTAATTGTCTAACAGTTTCTACGCATGATATTATTGTTCGCAAATTAATAAAGATAGGGGATTTGTTATGTATCTTTTTCCAACTGTAATTTCTTGGGAATTTTTTGGACACACCTGTATTCAGTTTAATTTGAACCAATCTATTAGTATTTTTCTTTCATTTT
Unaligned ( gi|5 ): GTACTCATTGTATTCAAATCCCAGTGCTCTTTCTTGTATTTTTCTATCTTTTTGGTATTATTTTCTGAACAAAATCATTTACAAAACACAAGATTAATTTTGCAAAAAAAAAGGGTGAAATTATTAAACGGTTAAATATACTTAGTTATTACTAATGTGTTTCAGAACATTCAAATGTTAAGAATTTTTTTTTATAATAACAAAAAAATATTATATCCAAATCGAGTCGTAACACTTTAACAGTTTCCTCGCATAAAATTGATGTTATGTTAA
Unaligned ( gi|9 ): ATATATTACCACCCACACCCACACACATACATATACATACCAACATACTCACACCAATACCCACACCCACACACATTCATACACATACCCCACTAATACCCACACATACACATACCCCCACCCCAACTTACACCCACACCCACACACATACATACATATA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTAGACACACGCACGCACGCACACCAAACACACACACCAAACACACACCAAACACACACACGCACACCAAACAT