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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caAGAA---AATAGTATA--TCAAGAACTTGTATTA-AA--CA-A-------TAAC-T---TTTATA---A---CAT--------TATTGCAATT--TAC--AAA-TAAGAG-AAT----TTCTAA-TTTTAAGCAAATT---TA--TTTCAG-A-A-GC-TT---TAA---GACGA----TCAATT----CCAAATATAACTT------TCTTAAAATG-TGC---ATTCTTA------TGTT---CATTCTCATG--ATTTTTGTTAATGACAC--AAATACTTATAATTTT-TAGC-AAAATT--AT-TTTA--A--AA----GC-TTTTATTA---CAGAA----A-TCA----AT--TTAAAGTAAACAGCATACCTGTCAATTGTAATGAAAT--ATTTGTTAT---------TTATA----TATGTGT-AT---AT-----GA---TGACGAAAAACTTTATATAGTT-AAGTC-AATAAAATGCCTTATGTaaaacatacatttaacatgattataacactttcttgtttaagctattttcagtttattaaaaagtttcatgtattgcgtatatggaccttgataagaaactatatagttaaaatctatcaaaggtctcatgtc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---AAAATCATT--TC--TAA---TTGTTCTGGGGAA-AGGC----TAAA-T---TTCATA---A-----T--------T--TGCACA---GTT--TAA-CCAAAA-TGTATTCTTCTAC-ATTCAAGTAAATT---TA--TTTCTG-A-A-GC-TTTTGTAATAAGGCGAGCGATCTATT----CAAAACATTATGTAT-TAAT-TCAA--TT---C---ATT----------T------TATT-TATTGTCATTTTTGTTGCTGACAC--AAA-ATTTATAATATT-CATC-AAA--T--ATGGTTAT-----AC----CATTTCATTATTTAAGAG-----TTTA----AGCCTT-TGGTAAT-ATCATACCTGTCT--TAT--TATAA---A----CTAT---------TT-------TATATA---T---AT-----GT---TGACGAGAAGTTATA-----TTATAGTC-AATAAAAAATCTTATG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA-TAAAAG-GGAA--CTTATAA-ATGTAAGTAAAAT---TA--TTTCAG-A-A-GC-TTTTGTAATAAGGCAA----TCAATT----CCATATATTATTT-CTTAA----AA--TG-TGCTTTATT---ATGT---T------CATTCTCATG--ATTTTTGTTGATGACAC--AAATATTTACAATTTT-TATA-AAA---------TTATTA--AA----ACATCTT-TTATTACAGAGATCAATTTA----AT--TTAAAGTAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaacgtTCCA-A-A-TC-TTTTGTAATAAGGCGA----TCATTT----CTAAATATTATTT-CTTAA----AA--TG-TGC---ATT---A------TTATGTACATTCTCATG--A-TTTTGTTGATGACAC--AAATATTTATAAATTT-TATA-AAA--T--G-----ATTAT-AACATC---TTTTATTA---CAGAG----A-TCA----AT--TTAAAGTAAA-a
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a---ATT---A------TGTT---CATTCTCATG--ATTTTTGTTGATGACAC--AAATATTAATAATTTT-TATG-AAA---------TTATTAT-AACAT--CAT-TTATTA---CAGAG----A-TCA----AT--TTAGAGTAAA-Ata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctttTT---A------T------TATTCTCATG--ATTTTCGTTACTGATAC--AAA-ATTTATAATATT-CATGAAAA--TTAAT-ATGATT----ATAT--CATTTTAATATTACAGAG----ATTCT----TT--TTATAGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTTTTGTTGAAGACAC--ACATATTTATAATTTT-CATG-AAA--T--G-----ATTAT-AACAT---ATTTCATTA---CAGTG----A-TCA----AT--TTAAAGTAAATAACATACCTGTCA--TAT-----AATGAA----ATAT---------TT-------gctgtcatttataa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTTTACAATATT-CATT-AAA--T--ATGTTTAT-------ATC-C-TCTTACTACTTCAGAG----ATTCG----AT--TTATAGTAAA-GGCACACCTGTCA---GG--TAATAG--A----ATAT---------TT-------TATAT------------------------------CTATATA----TC-AGTT-AATAACATGTCTGATGCCgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acTTCA----AT--TCATAGTAAA-GGCATACCTGTTA--TGTAATAAAAT--ATTTCATAT---------TTA------TATATAT-TT---GT-----GA---CGAAGAGAAATTGTATATAGATTAAGTCTCGCACAATGTCTCGTGTC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agGATTTGTCA--CGT----AAAT--G-----TAT---------TG-------TATATAT-GTTTTAT------A---TGATGAGAAACTGTA-ATAGTTTAAATC-AATAAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcttaagaatcaaaaccggaaggtatggtagagaaagaatagaacggcacgaacgtatttgccttttttgtaataatgacattgaagacgaatgtcattttgttttaatatgtcaaacatatagtgaaatattaaacgattttatacacagagacctaacatgttgaactttttctctcttctttaatcaacaaacaataaagaaatcataaattttagtaaattcctttcaaagcattatgtaaaagaagttccataataaaacaaccaataagtgttcatcctcctttgatatcgatgaaatagaacataataaaattaccttatgtgattgagagctatgtatatattgaacatttgtaattgttaaatttgtgcatt--TAT--TAAAA--------A-GT---------TT-------CATGTATTGC---GTATATGGACCTTGATAAGAAACTAT--ATAGTTAAAATC-TATCAAAGGTCTCATGTCaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caataccaaatatgtaatgataatgacattggcactgacgataattttatcattttatcttaatatgctctgtattacaattagaggcatatttatcaagaaatattattatataagacatattaattatgcttatgctcatgtcataactacactatttgaacgtaagacaacttctaaattaaagcaaatttaatgtttaatattttatgaaaaggtaatctatcgatatcaaacagtattttttaatttgcataaaacatacatttaacatgattataacactttcttgtttaagctattttcagtt----ATAT---------TT-------TGT------------------A---TGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTCAGTC-GATAAAA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttacacaaatggatgtatTGT---GT---AT-----AA---TGACGTGAAACTATATATAGTTTGCATC-AATAAA--GTCTTATGTaaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---TGACGATAAACTGTATATAGTTTAAGTC-AATAAAATGTC--ATGT
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AAATTGGTCTGATATAGAAACAAATAGTGTTTTAAATCTTTACACATCAGTAATGGTTAATTTGGAATACGGAAACTATCTACGCGTTATAGTCACTAAATATACGAGGAGCTTAATGACTAGGTTGCATTTGTAAGCCAATAACTTAAGAATCCAAACGGGAAGGTTGGTAGAGAAAGACACAGACATATTTGCCGTTTTTGTAATGATGACATTAACGACTAATACCTTGTTTTGATATGTCAAAC
Unaligned ( gi|13 ): AAGAGTTGACGCATATTTTCTCTCGGGAAGGTATTCTCGATAAAAACATGAAAGGCATGAATTGGTTTGTCAGGCGAGTGATATTGACGAATATCAATATTTTGTATAAATAGGCCCAATGACGTATTCACCTCTTATTCTTAATCGAAATACCATAGACCAAATTTATAAAAATGGTTAATCTTTTTCAGAAAAATGATAAA
Unaligned ( gi|16 ): TGTTAATACACAATACAAACTATGTGTAAACTTATAACATTACTGCAATCTTTTCATTTCAGAGATCAATCGATAGATACTAGCATACCTGTCATGTAATGCAGTATTTGATTTATATATATATATATATAAATTACAAATAAAAAATTAATA
Unaligned ( gi|18 ): ATACGAGGAGCTTAATGACTAGGTTGCATTTGTTAGCCAATAACTTAAGAATCCAAACGGGAAGGTTGGTAGAGAAAGACACAGACGTATTTGCCGTTTTTGTAATGATGACATTAACGACTTTGTTTT
Unaligned ( gi|19 ): TGGTATGGTAAAGAATGAATATACGATCACGAACGTATTTGCTAGTTTTATAATAATGACACTGAAGACGAATTTCAATGTGTTTCAATATTGCAAACATACAGAGAATATGATAATTTTGTATA
Unaligned ( gi|23 ): GTCAGATGTGTGACAGTGCTGAAATTGAAGACGAATATCATTTTGTATTGATATGGCATATTTACTATTAGATGCAAATATATCCAAAATTGTTTTATATCCGTAGT
Unaligned ( gi|28 ): GGTATGGTAGAGAAAGAATCGAACGACACGAACGTATTTGCCATTTTTATGCAATAATAACATT
Unaligned ( gi|29 ): AAATTTAAACATATTCGGCTTTTTTGAAAAATGTTTTGTACCAGAAATTTTTGAAGTTGTATT
Unaligned ( gi|31 ): AAAAGTATTGTTTATATACGTTTTGTATGATGAGAAACTCTAACAG
Unaligned ( gi|32 ): AAATTGAAGACGAGTTTCATTTTGTATTAATAAGTCCTATTTACC
Unaligned ( gi|33 ): GCTTTTATAACAAGGCGATCAATTCCAAATATTATTTCTT
Unaligned ( gi|34 ): ATGATGAGAAACTGTAACAATTTAAATCAAAGAAATC






Alignments
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Reference ( family-804 )      :                                                          TAAGAACTCGTTAGCTGATTGTATCAAAGGATTATTAAATTGGGGTTGGGTCTAAAAAGCTAA-GTCCATCCTAAGTAATATTGGTTNTGACGTANGNATANNATGANCNAACNAATGTNANATAATANATNTTTNNCTTCGANTTTTCGNCAAAGANNGGCTNANAGTTTTATTCAAACTTGGGCGGCA-GGATATGAAGTCANNCANAGNNCTGANCCTGTTGTATAGTGGTGCGGCACTNNNGTATGGNTACGAAAGATATTTAGATTTGTTACGCAGATGTACTANACAACNANGCAGTGGTTTAN-ACTTAATTACG-ACT-TCTT--CACATTCATTAAGAATCGAAACGGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGA-ATA-GAACGA-CACG---AAAGANTTTGCCA--GATATGTAATAANGA-TGACATTGA-A--GACGA--ATTT---C---ATTTTGTTTTAATATG-TCTN-AT-T-CA--AT---TAGAA---AAAAGTATTT--CAAGAAATGTTAT-AT---ACA-AGAC----CAAN-TATGTTTATG---A---CAT--------TACTGCAATCTTC--GAA-CAAAAG-AGNA--CTT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCCGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCGATCNATT----CCAAACATTA-TTTCTTAATCT---T--AATNTGC---A-TT---A------T------CATTC-TCATGA----TTTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTTATAATNTT-CATNAA-ATAT--T--TATTATAACAT--------CATTTTATTA-TT-C-AGAG----AT--T--CAATT---TANAG-TAAA-AGCAT--ACCTGTCA--TGTAATAAAATA----AT--AT-TT-------TATGTA-----T----TATG-A----TGACGAGAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTCTTATGTC
gi|1                          :                                                          TAATAACTCGTTAGCTGATGGTGAAAAAGGTTTATCAA--TAGAATT---TC---AAAGTTAATGTACACCCTAAG--------GTTT--ATGTGCGTATAGGATAAGCCAACAAATG-AATATACTGTATATTTTCTTTCGATTTTTCGTCCAAGAATGATTGATAGTTTTATTCAAACTTGGGTGGCAAGGATGTGGAGTCAAATAGAGCATTGAGCGTGTTGTTTAGTAACGAAAAATTAAAGTTTGGTTATGAAAGATATTTAGATGTGTTATGTAGATGTACTGAACAATTACGCAGCGTTTTACTAC---ACTGCA-ACTGCCTT--CACATTCATTAAGAATTGAGACAGGACGATAT-GGTATAGAAATA-ATA-GAATGA-AATG---AAAGACTATGCCA--AACATGTAATAATAA-TGATATTGA-A--GACGA--GTTT---T---ACTTTATTTTGATATG-TTTA-AT-T-CA--AT---TAGAA---AAAAGTATTT--CAAGAAGTGTTATAAT---GCA-AGAC----CAAA-TATGTTTATG---A---CAT--------TACTGCAAACGTC--GAA-CAAAAA-AGTA--CTT-CTTAATTTAAGTAAATTTG---T---TTCCAAAGC-TTATGTAATTAG----GTAATTTATT----CCAAACATTA-TTTC-TAATCT---T--AATTTGC---A-TT---A------T------CATTC-TAATGA----CTTTTGTTGCTG----ACACAAA--ATTCATAATATT-CATTAA-ATATC-T--TATTA-AACATCG------CATCTTATTATTT-C-ATAG----AT--T--CAAGT---TATAG-TAAA-AACAG--ACCTGCCA--TGT--TAAAATA----AT--AT-TT-------TATGTA-----G----CATG-A----TGACGAGAAACTATACATAGTTCA-AGTC-AATAAAATGTCTTATGTC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AGAA--CGT-TTACATTTAAGTAAATTTA---T---TTCCGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCGATCAATT----CCAAATATTG-TTTCTTAA---------AATGTGC---A-TTTTGT------T------CATTC-TCATGA-----TTTTGTTGATG----ACACAAA-AAATTATAATTTT-TATGAA-ATG-------ATTATAACAT--------C-TTTCATTA----C-AAAG----A---T--CAATT---TAAAG-TAAATAGCAT--ACCTGTCA--TGTAATGAAATATTTGAT--ATATA-------TATATA-----TGTA-TATG-A----TGACGTGAAACTGTATATAGTTT---GTC-AATAAAATGTCTTAT
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gi|12                         : aaattggtctgatatagaaacaaatagtgttttaaatctttacacatcagtaatggttaatttggaatacggaaactatctacgcgttatagtcactaaatatacgaggagcttaatgactaggttgcatttgtaagccaataacTGACGTAAAAATAACATGATCCAACAAATGTAA-ATAATAAATATTTGCCTTCGATTTTTCGTTAAAGAATGGTTTAAAGTTTTATTCAAACTTGGACGGCA-GG-TATGAAGTCATACAGAATTTTGAACCTG-----TAGTGATACGGCACTTACGTATGGATACGAAAGATATTTAGA----TTACGCAGATaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttgcaaaactatactgaccggtaggtCGGGAAGGTAT-TCTCGATAAA-A-ACATGAAAGG-CATG---AATTGGTTTGTCA--G----------GCGAGTGATATT------GACGA--ATAT---CAATATTTTGTATAAATAGG-CCCA-AT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aagagttgacgcatattttctctAA-TAAAAG-GGAA--CTT-ATAAATGTAAGTAAAATTA---T---TTCAGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCAATCAATT----CCATATATTA-TTTCTTAA---------AATGTGCTTTA-TT---ATGT---T------CATTC-TCATGA----TTTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTTACAATTTT-TATAAA-A-----T--TATTAAAACAT--------C-TTTTATTA----C-AGAGATCAAT--T--TAATT---TAAAG-TAAgacgtattcacctcttattcttaatcgaaataccatagaccaaatttataaaaatggttaatctttttcagaaaaatgataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCAAATC-TTTTGTAATAAG----GCGATCATTT----CTAAATATTA-TTTCTTAA---------AATGTGC---A-TT---A------TTATGTACATTC-TCATGA-----TTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTTATAAATTT-TATAAA-ATG-------ATTATAACAT--------C-TTTTATTA----C-AGAG----A---T--CAATT---TAAAG-TAAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTGTTAATACACAATACAAACTATGTGTAAACTT--ATAAC-AT-------TACTGCAA--T--------CTTTTCATT---T-C-AGAG----AT-----CAATC---GATAGATACT-AGCAT--ACCTGTCA--TGTAATGCAGTA----TTTGAT-TTA------TATATA-----TA---TATta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAATATT-CATTAA-ATAT--G--T-TTATA---T--------CCTCTTACTACTT-C-AGAG----AT--T--CGATT---TATAG-TAAA-GGCAC--ACCTGTCA--GGTAATAG---A----AT--AT-TT-------TATAT-------------------------------CTATATA-----TC-AGTT-AATAACATGTCTGATGCCatataaattacaaataaaaaattaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acTTAAGAATCCAAACGGGAAGGT-T-GGTAGAGAAA-----------GA-CACA---GACGTATTTGCCG--TTTTTGTAAT---GA-TGACATTAA-C--GAC-----------------TTTGTTTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atacgaggagcttaatgactaggttgcatttgttagccaataacGGTAT-GGTAAAGAATGA-ATA-TA-CGATCACG---AACGTATTTGCTA--GTTTTATAATAA----TGACACTGA-A--GACGA--ATTT---C---AATGTGTTTCAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATGTATTACACAACTAAGCAGTGGTTT-T-ACTTAATTACA-A------T--CATATTCAC-AAATATTGAGATGG-AAGGAATTGGTGTTAATAGA-ATA-GA-----CACATTTAAAGACTTT-------ATATGTAATTAAGA-CGATACTGA-A--AACGA--ATTT---C---TTTTTGATTTAATATG-TTTT-ATGTATA--ATGAATGGAA---GGAAGTTAAT--GAAGAAATGTTATTGT---ACA-AGAC----CAAAGTAC-TTTACG---A---TAT--------AAATGAAATCATC--G---CA------------TT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTATAATGAA----GCACTCTGTT----CCAATAATTA-TTTTTTAA-CT----------TGC---A-AT---A--------------------------------TTGTTACTG----ATACAAA--AAAGATAA-ATT-AATTAATTTAA--G--TATGATGATAA--------CATTTTATTATTT-C-AGAT----AT--T--CAACCTAGTATAG-TAAT-AGCAC--AACTGTCA--TGTTATAAAGTA----GT--AT-GTA------TATGTGTTTATT----TATC-A----TGATATGAAACTGCACATAGTTTA-AATC-AATAAAAtgcaaacatacagagaatatgataattttgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TT---A------T------TATTC-TCATGA----TTTTCGTTACTG----ATACAAA--ATTTATAATATT-CATGAA-A-AT--TAATATGATTATAT--------CATTTTAATA-TTAC-AGAG----AT--T--CTTTT---TATAG-Taacaacttatatgtcttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tT--T--CAATT---CATAG-TAAA-GGCAT--ACCTGTTA--TGTAATAAAATATTTCAT--AT-TTA------TATATAT----T----TGTG-A----CGAAGAGAAATTGTATATAGATTA-AGTCTCGCACAATGTCTCGTGTCgctgtcatttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ag----TTTTTGTTGAAG----ACACACA-TATTTATAATTTT-CATGAA-ATG-------ATTATAACAT---------ATTTCATTA----C-AGTG----A---T--CAATT---TAAAG-TAAATAACAT--ACCTGTCA--TATAATGAAATA----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCA--GATGTGTGACAGTGC-TGAAATTGA-A--GACGA--ATAT---C---ATTTTGTATTGATATG-GCAT-AT-T-TACTAT---TAGAT---GCAAATATAT--CCAAAATTGTTTT-AT---Atttgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---A-TT---A------TGTT---CATTC-TCATGA----TTTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTAATAATTTT-TATGAA-A-----T--TATTATAACAT--------CA-TTTATTA----C-AGAG----A---T--CAATT---TAGAG-TAAA-Atccgtagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctttTATG---A---CAT--------AACTGCAAACTTC--GAA-CAAAAATAATA--TTT-CTTAATTTGCGTAA--TTA---TGAATTCC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -------TATATA-----T----TTTGTA----TGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTC-AGTC-GATAAAAcacaatgctttgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttacacaaatggatg----TGACGATAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTC--ATGTaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTAT-GGTAGAGAAAGA-ATC-GAACGA-CACG---AACGTATTTGCCATTTTTATGCAATA---A-TAACATTtctcgtctactactgttatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAAGAATCAAAACCGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGA-ATA-GAACGG-CACG---AACGTATTTGCCT--TTTTTGTAATA---A-TGACATTGA-A--GACGA--ATGT---C---ATTTTGTTTTAATATG-TCAA-A----CA--TA---TAGTG---AAA--TATT----AAACGATTTTAT-AC---ACAGAGAC----CTAA-CATGTTGA-----A---CTTTTTCTCTCTTCTTTAATCAAC--AAA-CAATAA-AGAA--ATC-ATAAATTTTAGTAAATTCC---T---TT-CAAAGCATTATGTAA-AAG----AAGTTCCAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcGCATTGATTTGTCA--CGTAA----ATG-----T--AT-TG-------TATATA-----TGTTTTAT--A----TGATGAGAAACTGTA-ATAGTTTA-AATC-AATAAAAaataaaacaaccaataagtgttcatcctcctttgatatcgatgaaatagaacataataaaattaccttatgtgattgagagctatgtatatattgaacatttgtaattgttaaatttgtgcattgatttgtcacgtaaatgtattgtatatatgttttatatgatgagaaactgtaatagtttaaatcaataaaaaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcttaagaatcaaaaccggaaggtatggtagagaaagaatagaacggcacgaacgtatttgccttttttgtaataatgacattgaagacgaatgtcattttgttttaatatgtcaaacatatagtgaaatattaaacgattttatacacagagacctaacatgttgaactttttctctcttctttaatcaacaaacaataaagaaatcataaattttagtaaattcctttcaaagcattatgtaaaagaagttccataataaaacaaccaataagtgttcatcctcctttgatatcgatgaaatagaacataataaaattaccttatgtgattgagagctatgtatatattgaacatttgtaattgttaaatttgt----TATA-A----TGACGTGAAACTATATATAGTTTG-CATC-AATAAA--GTCTTATGTaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtgATTGA-A--GACGA--GTTT---C---ATTTTGTATTAATAAG-TCCT-AT-T-TA--
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caataccaaatatgtaatgataatgacattggcactgacgataattttatcattttatcttaatatgctctgtattacaattagaggcatatttatcaagaaatattattatataagacatattaattatgcttatgctcatgtcataactacactatttgaacgtaagacaacttctaaattaaagcaaatttaatgtttaatattttatgaaaaggtaatctatcgatatcaaacagtatAA-CCAAAA-TGTATTCTT-CTACATTCAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTGTAATAAGGCGAGCGATCTATT----CAAAACATTA-TGTATTAAT-T---C--AATT--C---A-TT----------T------TATTTATTGTCA----TTTTTGTTGCTG----ACACAAA--ATTTATAATATT-CATCAA-ATATGGT--TAT------AC--------CATTTCATTA-TT-TAAGAG----TT--T--AAGCC---TTTGG-TAAT-ATCAT--ACCTGTCT--TATTATAA---A----CT--AT-TT-------TATATA----------TATG-T----TGACGAGAA---GT-TATA--TTATAGTC-AATAAAAAATCTTATG
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attttgcaaaactatactgaccggtaggCGGGAAGGTAT-TCTCGATAAA-AACATGAAAGG-CATG---AATTGGTTTGTCA--GGC---------G-AG-TGATATT------GACGA--ATAT---CAATATTTTGTATAAATAGGCCCA--AT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagagttgacgcatattttctctAA-TAAAAG-GGAACTT-ATAAATGTAAGTAAAATTA---T---TTCAGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCAATCAATT----CCATATATTA-TTT--CTTAA----------AATGTGCTTTA-TT---ATGTT------CATTC-TCATGA----TTTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTTACAATTTT-TATAAA------A--T--TATTAAAACAT--C-TTTTAT-T-A----C-AGAGATCA------AT--TTAA--TTTA---AA---G-TAAgacgtattcacctcttattcttaatcgaaataccatagaccaaatttataaaaatggttaatctttttcagaaaaatgataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCCAAATC-TTTTGTAATAAG----GCGATCATTT----CTAAATATTA-TTT--CTTAA----------AATGTGC---A-TT---A---TTATGTACATTC-TCATGA-----TTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTTATAAATTT-TATAAAA--T--G------ATTATAACAT--C-TTTTAT-T-A----C-AGAG----------A---TCAA--TTTA---AA---G-TAAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTGTTAATACACAATACAAACTATGTGTAAACTT--AT--AA--C--A--T--TACTGCAA--T--CTTTTCAT-T----T-C-AGAG----------AT---CAA--TCGA---TA---GATACT-A-----GCAT--ACCTGTCA--TGTAATGCAGTATTTGATTTATATA-TA--TATATA-----T-----ta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTACAATATT-CATTAAA--T--A--T--GTTTATA---T--CCTCTTAC-T-ACTT-C-AGAG----------AT--TCGA--TTTA---TA---G-TAAA-G-----GCAC--ACCTGTCA--GGTAATAGAATATTTT----ATATC-TA--TATATataaattacaaataaaaaattaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ac-TTAAGAATCCAAACGGGAAGGT-T-GGTAGAGAAA----------GA-CACA---GACGTATTTGCCG--TTTTTGTAAT----GA-TGACATTAA-C--GAC------TT---T---GTTTTcagttaataacatgtctgatgcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atacgaggagcttaatgactaggttgcatttgttagccaataacGGTAT-GGTAAAGAATGAATA-T-ACGATCACG---AACGTATTTGCTA--GTTTTATAAT-A---A-TGACACTGA-A--GACGA--ATTT---C---AATGTGTTTCAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tATGT-ATTACACAACTAAGCAGTGGTTT-T--ACTTAATTACA-A------T--CA--TATTCA-C-AAATATTGAGATGG-AAGGAATTGGTGTTAATAGAATA-GA-----CACATTTAAAGACTTT-------ATATGTAATTAA-GA-CGATACTGA-A--AACGA--ATTT---C---TTTTTGATTTAATATGTTTT--ATGTATA--ATGAATGGAAGGAAG-TTAATGAAGAAATGTTATTG-T---ACA-AGAC----CAAAGTAC-TTTACG---A---TAT--------AAATGAAATCATC--G---CA----------TT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTATAATGAA----GCACTCTGTT----CCAATAATTA-TTT--TTTAA-C-T----------TGC---A-AT---A---T--------------------------TGTTACTG----ATACAAA-AAAG-ATAA-ATT-AATTAAT--TTAA--G--TATGATGATAA--CATTTTAT-T-A-TTTC-AGAT----------AT--TCAA--CCTAGTATA---G-TAAT-A-----GCAC--AACTGTCA--TGTTATAAAGTA--------GTATG-TA--TATGTGTTTATT-----T--ATC-ATGATATGAAACTGCACATAGTTTA-AATC-AATAAAAtgcaaacatacagagaatatgataattttgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TT---A---T------TATTC-TCATGA----TTTTCGTTACTG----ATACAAA--ATTTATAATATT-CATGAAAATT--A--A--TATGATTATAT--CATTTTAA-T-A-TTAC-AGAG----------AT--TCTT--TTTA---TA---G-Taacaacttatatgtcttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tT--TCAA--TTCA---TA---G-TAAA-G-----GCAT--ACCTGTTA--TGTAATAAAATATTTC----ATATT-TA--TATATAT----T-----T--GTG-ACGAAGAGAAATTGTATATAGATTA-AGTCTCGCACAATGTCTCGTGTCgctgtcatttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ag----TTTTTGTTGAAG----ACACACA-TATTTATAATTTT-CATGAAA--T--G------ATTATAACAT---ATTTCAT-T-A----C-AGTG----------A---TCAA--TTTA---AA---G-TAAATA-----ACAT--ACCTGTCA--TATAATGAAATA--------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCA--GATGTGTGAC-AGTGC-TGAAATTGA-A--GACGA--ATAT---C---ATTTTGTATTGATATGGCAT--AT-T-TACTAT---TAGATGCAAA-TATATCCAAAATTGTTTT-A-T---Atttgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A-TT---A---TGTT---CATTC-TCATGA----TTTTTGTTGATG----ACACAAA-TATTAATAATTTT-TATGAA------A--T--TATTATAACAT--CA-TTTAT-T-A----C-AGAG----------A---TCAA--TTTA---GA---G-TAAA-A-----tccgtagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctttTATG---A---CAT--------AACTGCAAACTTC--GAA-CAAAAATAATATTT-CTTAATTTGCGTAA--TTA---TGAATTCC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TG--TATATA-----T-----T--TTGTATGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTC-AGTC-GATAAAAcacaatgctttgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gttacacaaatggaTGACGATAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTC--ATGTaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTAT-GGTAGAGAAAGAATC-GAACGA-CACG---AACGTATTTGCCATTTTTATGCAAT-A---A-TAACATTtctcgtctactactgttatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TTAAGAATCAAAACCGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGAATA-GAACGG-CACG---AACGTATTTGCCT--TTTTTGTAAT-A---A-TGACATTGA-A--GACGA--ATGT---C---ATTTTGTTTTAATATGTCAA--A----CA-------TATAGTGAAA-TAT-TAAACGATT-TTAT-A-C---ACAGAGAC----CTAA-CATGTTGA-----A---CTTTTTCTCTCTTCTTTAATCAAC--AAA-CAATAA-AGAAATC-ATAAATTTTAGTAAATTCC---T---TT-CAAAGCATTATGTAA-AAG----AAGTTCCAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcTGATATC-GATGAAA--T--A--GAACATAATAAAAT--TACCTTATGTGA-TT-G-AGAGCTATGTATATAT--TGAACATTTG---TAATTG-TTAA-ATTTGTGCATTGATTTGTCA--CGTAA----ATG---------TATTGTA--TATATG-----T-----TTTAT--ATGATGAGAAACTGTA-ATAGTTTA-AATC-AATAAAAaataaaacaaccaataagtgttcatcctcctttgatatcgatgaaatagaacataataaaattaccttatgtgattgagagctatgtatatattgaacatttgtaattgttaaatttgtgcattgatttgtcacgtaaatgtattgtatatatgttttatatgatgagaaactgtaatagtttaaatcaataaaaaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcttaagaatcaaaaccggaaggtatggtagagaaagaatagaacggcacgaacgtatttgccttttttgtaataatgacattgaagacgaatgtcattttgttttaatatgtcaaacatatagtgaaatattaaacgattttatacacagagacctaacatgttgaactttttctctcttctttaatcaacaaacaataaagaaatcataaattttagtaaattcctttcaaagcattatgtaaaagaagttccataataaaacaaccaataagtgttcatcctcctt-----T--ATA-ATGACGTGAAACTATATATAGTTTG-CATC-AATAAA--GTCTTATGTaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgATTGA-A--GACGA--GTTT---C---ATTTTGTATTAATAAGTCCT--AT-T-TA--
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaGC-TTTTATAACAAG----GCGATCAATT----CCAAATATTA-TTT--CTTcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACCA--AATATGTAATGAT-AA-TGACATTGGCACTGACGATAATTTTATC---ATTTTATCTTAATATGCTCTGTAT-TACA--AT---TAGAGGCATA-TTTATCAAGAAATATTATTA-T---ATA-AGACATATTAAT-TATGCTTATGCTCATGTCAT--------AACTACACTATTT--GAA-CGTAAG-ACAACTT-CTAAATTAAAGCAAATTTAATGT---TT---AATA-TTTTATGAAAAG----GTAATCTATCGATATCAAACAGTA-TTT--TTTAATT-TGCATAAAACATAC---ATTT---A---A------CATGA-TTATAACACTTTCTTGTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caaCTT-CTACATTCAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTGTAATAAGGCGAGCGATCTATT----CAAAACATTA-TGT--ATTAATT-C------AAT-T-C---A-TT-------T------TATTTATTGTCA----TTTTTGTTGCTG----ACACAAA--ATTTATAATATT-CATCAAA--T--A--T--GGTTAT---AC--CATTTCAT-T-A-TT-TAAGAG----------TT--TAAG--CCTT---TG---G-TAAT-A-----TCAT--ACCTGTCT--TATTATAAACT---------AT-TT-TA--TATA-------------T--ATG-TTGACGAGAA---GT-TATA--TTATAGTC-AATAAAAAATCTTATGtaagctattttcagtttattaaaaagtttcatgtattgcgtatatggaccttgataagaaactatatagttaaaatctatcaaaggtctcatgtc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaaattttatttaaattggacgtccgtctgaaaatcatttctaattgttctggggaaaggctaaatttcataatttgcacagtttaaccaaaatgtattAGAAAATAG-TATATCAAGAACT--TGT-A-TTAAACA-A-------TAAC-T---TTTATA---A---CAT--------TATTGCAATTTAC--AAA-TAA--G-AGAATTT-CTAATTTTAAGCAAATTTA---T---TTCAGAAGC-TTT------AAG----ACGATCAATT----CCAAATATAACTTT--CTTAA----------AATGTGC---A-TTCTTA---TGTT---CATTC-TCATGA----TTTTTGTTAATG----ACACAAA-TACTTATAATTTT-TAGCAAA-----A--T--TATTTTAAAAG--C-TTTTAT-T-A----C-AGAA----------A---TCAA--TTTA---AA---G-TAAACA-----GCAT--ACCTGTCAATTGTAATGAAATATTTG----TTATT-TA--TATATG-----TGTA--T--ATG-ATGACGAAAAACTTTATATAG-TTA-AGTC-AATAAAATGCCTTATGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTTATG---A---TAT--------TACTGGACTATTC--AAA-CAATAG-AGTACTA-TTAAATTTAGGTAGACATA---T---TTCCGAAG---------ATAAG----GCGATCTATT----CCAAACGTTT-TTTTCTTTTATG-C------AATA-GT---A-TG---T---T------CATTC-CCATTA----TTTTTGTTGATG----ACAC-AA-CATTTATAATATTGAAGCAAA--C--A--T--GATTTTAACAT--AA---TAT-T-A-TT-T--GAG----------ATAATCCA--TTTG---TA---G-TAAA-A-----GCAT--ACCTGTCA--TGTAATAAGATAGTTT----ATATT-TATTTATATA-----TGTATAT--ATG-ATGGCACGAAACTGTATATAGTTTA-ATTA-AATAAAAAGTATTATG
gi|8                          : aTAAGAACTCGTTAGCTGATTGTATCAAAGGATTATTAAATTGGGGTTGGGTCTAAAAAGCTAA-GTCCATCCTAAGTAATATTGGTTTTGATATATGTATATGATAAGCAAACTAATGTAAT-TAATACATTTTTTGTTTTTAGTTTTCAGCAAAGACAGACTGACAGTTTTATTCAAACTTAGGCGATA--AATATGAAGTCAATTATAGAACTGACTTTGT---TGTAT-AATAGTGTTACA-TTAA-----------------------TTA-GATT-TGTT------ATGT-TCTAAACAACAACGCAGT-GTTTAA--ACTTAATTACG-ACT-TCTT--CA--CATTCA-TTGAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTACGCATA-TCTTATCA--C---CA-ATAAGAATTGAAACAGGAAGGTAT-TTGAGAGAAAGACTT-GAAAGA-CATG---AAAGGGTTCGCCA--GACGAGTGAC-AG-GGCTGAAATTTA-A--GACGA--ATTT---C---ATTTTGTACTACTATGTCCT--AT-T-TACCAT-----GAACTTAGATATATTCACAAGCGTTGT-A-T---CCGTAGCA----CAAC-TATGTTAA-----A---GTT--------TATT--AATCTTCTTAAATCAAAAA-ATAAATTGTTAAA-TTAAGCAAATTTA---T---TTCTGAAGC-ATTTGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AAATTTAAACATATTCGGCTTTTTTGAAAAATGTTTTGTACCAGAAATTTTTGAAGTTGTATT
Unaligned ( gi|31 ): AAAAGTATTGTTTATATACGTTTTGTATGATGAGAAACTCTAACAG
Unaligned ( gi|34 ): ATGATGAGAAACTGTAACAATTTAAATCAAAGAAATC






Alignments
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attttgcaaaactatactgaccggtaggCGGGAAGGTAT-TCTCGATAAA-AACATGAAAGG-CATG---AATTGGTTTGTCA--GGCG--------AG-----TGATATT------GACGA--ATAT---CAATATTTTGTATAAATAGGCCCA--AT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagagttgacgcatattttctctAA-TAAAAG-GGAACTT-ATAAATGTAAGTAAAATTA---T---TTCAGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCAATCAAT--T----CCATATATTA-TTT-CTTAA-----AATGTGCTTTAT----T---ATGT---T------CATTC-T--CATGATTTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TTA--CAATTTTTA-TAAA------A--T-TAT-TAA--AACAT--C-TTTTATTA----C-AGAGATCAAT--TTAATT---TAAAG-TAAgacgtattcacctcttattcttaatcgaaataccatagaccaaatttataaaaatggttaatctttttcagaaaaatgataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCCAAATC-TTTTGTAATAAG----GCGATCATT--T----CTAAATATTA-TTT-CTTAA-----AATGTGC---AT----T---A------TTATGTACATTC-T--CATGA-TTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TTA--TAAATTTTA-TAAAA--T--G-----AT-TAT--AACAT--C-TTTTATTA----C-AGAG----A---TCAATT---TAAAG-TAAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTGTTAATACACAATACA-AACTAT-------GTG--TAAACTT-A-T--AA--C--A--T-TAC-TGC--AA--T--CTTTTCATT---T-C-AGAG----AT---CAATC---GATAGATACT-AGCAT--ACCTGTCA--TGTAATGC---AGTA-T-TT-G--ATTTAT--ATATA-TA----TATta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-------TTA--CAATATTCA-TTAAA--T--A--T-GTT-TAT--A---T--CCTCTTACTACTT-C-AGAG----AT--TCGATT---TATAG-TAAA-GGCAC--ACCTGTCA--GGTAATAG---AATATT-TT-A-TATCTAT--ATATatataaattacaaataaaaaattaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ac-TTAAGAATCCAAACGGGAAGGT-T-GGTAGAGAAA----------GA-CACA---GACGTATTTGCCG--TTTTTGTAAT---G--A--TGACATTAA-C--GAC------TT---T---GTTTTcagttaataacatgtctgatgcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atacgaggagcttaatgactaggttgcatttgttagccaataacGGTAT-GGTAAAGAATGAATA-TA-CGATCACG---AACGTATTTGCTA--GTTTTATAAT--A---A--TGACACTGA-A--GACGA--ATTT---C---AATGTGTTTCAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATGT-ATTACACAACTAAGCAGTGGTTT--T-ACTTAATTACA-A------T--CA--TATTCA-C-AAATATTGAGATGG-AAGGAATTGGTGTTAATAGAATA-GA-----CACATTTAAAGACTTT-------ATATGTAATTAAG--A--CGATACTGA-A--AACGA--ATTT---C---TTTTTGATTTAATATGTTTT--ATGTATA--ATGAATGGAAGGAAG-TTAATGAAGAAATGTTATT-G-T---ACA-AGAC----CAAAGTAC-TTTACG---A---TAT--------AAATGAAATCATC--G---CA----------TT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTATAATGAA----GCACTCTGT--T----CCAATAATTA-TTT-TTTAA--CT-----TGC---AA----T---A------------------------------TTGTTACTG----ATACA-AA--AA-------AGA--TAA-ATTAA-TTAAT--TTAA--G-TAT-GAT--GATAA--CATTTTATTATTT-C-AGAT----AT--TCAACCTAGTATAG-TAAT-AGCAC--AACTGTCA--TGTTATAAAGTAGTA-T-GT-A-TATGTGT--TTAT--T-----TATC-ATGATATGAAACTGCACATAGTTTA-AATC-AATAAAAtgcaaacatacagagaatatgataattttgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T----T---A------T------TATTC-T--CATGATTTTCGTTACTG----ATACA-AA--AT-------TTA--TAATATTCA-TGAAAATT--A--A-TAT-GAT--TATAT--CATTTTAATA-TTAC-AGAG----AT--TCTTTT---TATAG-Taacaacttatatgtcttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tT--TCAATT---CATAG-TAAA-GGCAT--ACCTGTTA--TGTAATAA---AATA-T-TTCA-TATTTAT--ATATATT-----TGTG-ACGAAGAGAAATTGTATATAGATTA-AGTCTCGCACAATGTCTCGTGTCgctgtcatttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agTTTTTGTTGAAG----ACACA-CA-TAT-------TTA--TAATTTTCA-TGAAA--T--G-----AT-TAT--AACAT---ATTTCATTA----C-AGTG----A---TCAATT---TAAAG-TAAATAACAT--ACCTGTCA--TATAATGA---AATA-T-TT-G-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTCA--GATGTGTGAC--AGTGC--TGAAATTGA-A--GACGA--ATAT---C---ATTTTGTATTGATATGGCAT--AT-T-TACTAT---TAGATGCAAA-TATATCCAAAATTGTTT-T-A-T---A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---AT----T---A------TGTT---CATTC-T--CATGATTTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TAA--TAATTTTTA-TGAA------A--T-TAT-TAT--AACAT--CA-TTTATTA----C-AGAG----A---TCAATT---TAGAG-TAAA-Atccgtagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctttTATG---A---CAT--------AACTGCAAACTTC--GAA-CAAAAATAATATTT-CTTAATTTGCGTAA--TTA---TGAATTCC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGT--ATATA-T-----TTTGTATGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTC-AGTC-GATAAAAcacaatgctttgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttacacaaatggaTGACGATAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTC--ATGTaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTAT-GGTAGAGAAAGAATC-GAACGA-CACG---AACGTATTTGCCATTTTTATGCAAT--A---A--TAACATTtctcgtctactactgttatat
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tc-----TATA-ATGACGTGAAACTATATATAGTTTG-CATC-AATAAA--GTCTTATGTaa
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attttgcaaaactatactgaccggtaggCGGGAAGGTAT-TCTCGATAAA-AACATGAAAGG-CATG---AATTGGTTTGTCA--GGCG--------AG-----TGATATT------GACGA--ATAT---CAATATTTTGTATAAATAGGCCCA--AT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagagttgacgcatattttctctAA-TAAAAG-GGAACTT-ATAAATGTAAGTAAAATTA---T---TTCAGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCAATCAAT--T----CCATATATTA-TTT-CTTAA-----AATGTGCTTTAT----T---ATGT---T------CATTC-T--CATGATTTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TTA--CAATTTTTA-TAAA------A--T-TAT-TAA--AACAT--C-TTTTATTA----C-AGAGATCAAT--TTAATT---TAAAG-TAAgacgtattcacctcttattcttaatcgaaataccatagaccaaatttataaaaatggttaatctttttcagaaaaatgataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCCAAATC-TTTTGTAATAAG----GCGATCATT--T----CTAAATATTA-TTT-CTTAA-----AATGTGC---AT----T---A------TTATGTACATTC-T--CATGA-TTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TTA--TAAATTTTA-TAAAA--T--G-----AT-TAT--AACAT--C-TTTTATTA----C-AGAG----A---TCAATT---TAAAG-TAAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTGTTAATACACAATACA-AACTAT-------GTG--TAAACTT-A-T--AA--C--A--T-TAC-TGC--AA--T--CTTTTCATT---T-C-AGAG----AT---CAATC---GATAGATACT-AGCAT--ACCTGTCA--TGTAATGC---AGTA-T-TT-G--ATTTAT--ATATA-TA----TATta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-------TTA--CAATATTCA-TTAAA--T--A--T-GTT-TAT--A---T--CCTCTTACTACTT-C-AGAG----AT--TCGATT---TATAG-TAAA-GGCAC--ACCTGTCA--GGTAATAG---AATATT-TT-A-TATCTAT--ATATatataaattacaaataaaaaattaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ac-TTAAGAATCCAAACGGGAAGGT-T-GGTAGAGAAA----------GA-CACA---GACGTATTTGCCG--TTTTTGTAAT---G--A--TGACATTAA-C--GAC------TT---T---GTTTTcagttaataacatgtctgatgcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atacgaggagcttaatgactaggttgcatttgttagccaataacGGTAT-GGTAAAGAATGAATA-T-ACGATCACG---AACGTATTTGCTA--GTTTTATAAT--A---A--TGACACTGA-A--GACGA--ATTT---C---AATGTGTTTCAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATGT-ATTACACAACTAAGCAGTGGTTT--T-ACTTAATTACA-A------T--CA--TATTCA-C-AAATATTGAGATGG-AAGGAATTGGTGTTAATAGAATA-GA-----CACATTTAAAGACTTT-------ATATGTAATTAAG--A--CGATACTGA-A--AACGA--ATTT---C---TTTTTGATTTAATATGTTTT--ATGTATA--ATGAATGGAAGGAAG-TTAATGAAGAAATGTTATT-G-T---ACA-AGAC----CAAAGTAC-TTTACG---A---TAT--------AAATGAAATCATC--G---CA----------TT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTATAATGAA----GCACTCTGT--T----CCAATAATTA-TTT-TTTAA--CT-----TGC---AA----T---A------------------------------TTGTTACTG----ATACA-AA--AA-------AGA--TAA-ATTAA-TTAAT--TTAA--G-TAT-GAT--GATAA--CATTTTATTATTT-C-AGAT----AT--TCAACCTAGTATAG-TAAT-AGCAC--AACTGTCA--TGTTATAAAGTAGTA-T-GT-A-TATGTGT--TTAT--T-----TATC-ATGATATGAAACTGCACATAGTTTA-AATC-AATAAAAtgcaaacatacagagaatatgataattttgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T----T---A------T------TATTC-T--CATGATTTTCGTTACTG----ATACA-AA--AT-------TTA--TAATATTCA-TGAAAATT--A--A-TAT-GAT--TATAT--CATTTTAATA-TTAC-AGAG----AT--TCTTTT---TATAG-Taacaacttatatgtcttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tT--TCAATT---CATAG-TAAA-GGCAT--ACCTGTTA--TGTAATAA---AATA-T-TTCA-TATTTAT--ATATATT-----TGTG-ACGAAGAGAAATTGTATATAGATTA-AGTCTCGCACAATGTCTCGTGTCgctgtcatttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agTTTTTGTTGAAG----ACACA-CA-TAT-------TTA--TAATTTTCA-TGAAA--T--G-----AT-TAT--AACAT---ATTTCATTA----C-AGTG----A---TCAATT---TAAAG-TAAATAACAT--ACCTGTCA--TATAATGA---AATA-T-TT-G-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTCA--GATGTGTGAC--AGTGC--TGAAATTGA-A--GACGA--ATAT---C---ATTTTGTATTGATATGGCAT--AT-T-TACTAT---TAGATGCAAA-TATATCCAAAATTGTTT-T-A-T---A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---AT----T---A------TGTT---CATTC-T--CATGATTTTTGTTGATG----ACACA-AA-TAT-------TAA--TAATTTTTA-TGAA------A--T-TAT-TAT--AACAT--CA-TTTATTA----C-AGAG----A---TCAATT---TAGAG-TAAA-Atccgtagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctttTATG---A---CAT--------AACTGCAAACTTC--GAA-CAAAAATAATATTT-CTTAATTTGCGTAA--TTA---TGAATTCC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGT--ATATA-T-----TTTGTATGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTC-AGTC-GATAAAAcacaatgctttgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttacacaaatggaTGACGATAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTC--ATGTaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTAT-GGTAGAGAAAGAATC-GAACGA-CACG---AACGTATTTGCCATTTTTATGCAAT--A---A--TAACATTtctcgtctactactgttatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TTAAGAATCAAAACCGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGAATA-GAACGG-CACG---AACGTATTTGCCT--TTTTTGTAAT--A---A--TGACATTGA-A--GACGA--ATGT---C---ATTTTGTTTTAATATGTCAA--A----CA-------TATAGTGAA---ATATTAAACGATTTTA-T-A-C---ACAGAGAC----C-TAACATGTTGA-----A---CTTTTTCTCTCTTCTTTAATCAAC--AAA-CAATAA-AGAAATC-ATAAATTTTAGTAAATTCC---T---TT-CAAAGCATTATGTAA-AAG----AAGTTCCATAAT-----AAAACA--A------CCAA--TA-AGTGTTC---AT----C---C------T------CCTT-------TGA----TATCGATG----AAATAGAA-CATAATAAAATTACCTTATGTGAT-TGAGAGCT--A--TGTATATATTGAACA------TTTGTAA-TT-----------GT--TAAATT---TGT---------GCATTGATTTGTCA--CGT----A---AATG-TATT-G-TA--TAT--ATGTT-T-----TAT--ATGATGAGAAACTGTA-ATAGTTTA-AATC-AATAAAA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tc-----TATA-ATGACGTGAAACTATATATAGTTTG-CATC-AATAAA--GTCTTATGTaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgATTGA-A--GACGA--GTTT---C---ATTTTGTATTAATAAGTCCT--AT-T-TA--
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaGC-TTTTATAACAAG----GCGATCAAT--T----CCAAATATTA-TTT-CTTcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TACCA--AATATGTAAT--GATAA--TGACATTGGCACTGACGATAATTTTATC---ATTTTATCTTAATATGCTCTGTAT-TACA--AT---TAGAGGCATA-TTTATCAAGAAATATTA-TTA-T---ATA-AGACATATT-AATTATGCTTATGCTCATGTCAT--------AACTACACTATTT--GAA-CGTAAG-ACAACTT-CTAAATTAAAGCAAATTTAATGT---TT---AATA-TTTTATGAAAAG----GTAATCTAT--CGATATCAAACAGTA-TTT-TTTAA--TT-----TGC---ATAAAAC---A------TA-----CATT--TAACATGATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaCTT-CTACATTCAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTGTAATAAGGCGAGCGATCTAT--T----CAAAACATTA-TGT-ATTAA--TTCAAT-T-C---AT----T----------T------TATTTAT--TGTCATTTTTGTTGCTG----ACACA-AA--AT-------TTA--TAATATTCA-TCAAA--T--A--T-GGT-TAT-----AC--CATTTCATTA-TT-TAAGAG----TT--TAAGCC---TTTGG-TAAT-ATCAT--ACCTGTCT--TATTATAA---ACTA-T--------TTTAT--ATA---------TATG-TTGACGAGAA---GT-TATA--TTATAGTC-AATAAAAAATCTTATGataacactttcttgtttaagctattttcagtttattaaaaagtttcatgtattgcgtatatggaccttgataagaaactatatagttaaaatctatcaaaggtctcatgtc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaaattttatttaaattggacgtccgtctgaaaatcatttctaattgttctggggaaaggctaaatttcataatttgcacagtttaaccaaaatgtattAGAAAATAG-TATATCAAGAACT--TG-T-A-TTAAACA-A-------T-AACT---TTTATA---A---CAT--------TATTGCAATTTAC--AAA-TAA--G-AGAATTT-CTAATTTTAAGCAAATTTA---T---TTCAGAAGC-TTT------AAG----ACGATCAAT--T----CCAAATATAACTTT-CTTAA-----AATGTGC---AT----TCTTA------TGTT---CATTC-T--CATGATTTTTGTTAATG----ACACA-AA-TAC-------TTA--TAATTTTTA-GCAAA-----A--T-TAT-TTT--AAAAG--C-TTTTATTA----C-AGAA----A---TCAATT---TAAAG-TAAACAGCAT--ACCTGTCAATTGTAATGA---AATA-T-TT-GTTATTTAT--ATATG-TGTA--TATG-ATGACGAAAAACTTTATATAG-TTA-AGTC-AATAAAATGCCTTATGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTTATG---A---TAT--------TACTGGACTATTC--AAA-CAATAG-AGTACTA-TTAAATTTAGGTAGACATA---T---TTCCGAAG---------ATAAG----GCGATCTAT--T----CCAAACGTTT-TTTTCTT----TT-A---TGC---AA----T---AGTATGTT------CATTC-C--CATTATTTTTGTTGATG----ACACA-A--CAT-------TTA--TAATATTGAAGCAAA--C--A--T-GAT-TTT--AACAT--AAT---ATTA-TT-T--GAG----ATAATCCATT---TGTAG-TAAA-AGCAT--ACCTGTCA--TGTAATAA---GATAGT-TT-A-TATTTATTTATATA-TGTATATATG-ATGGCACGAAACTGTATATAGTTTA-ATTA-AATAAAAAGTATTATG
gi|8                          : aTAAGAACTCGTTAGCTGATTGTATCAAAGGATTATTAAATTGGGGTTGGGTCTAAAAAGCTAA-GTCCATCCTAAGTAATATTGGTTTTGATATATGTATATGATAAGCAAACTAATGTAAT-TAATACATTTTTTGTTTTTAGTTTTCAGCAAAGACAGACTGACAGTTTTATTCAAACTTAGGCGATA--AATATGAAGTCAATTATAGAACTGACTTTGT---TGTAT-AATAGTGTTACA-TTAAT--T------------AGAT--------T-TGTT------ATGT-TCTAAACAACAACGCAGT-GTTTAA--ACTTAATTACG-ACT-TCTT--CA--CATTCA-TTGAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTACGCATA-TCTTATCA--C---CA-ATAAGAATTGAAACAGGAAGGTAT-TTGAGAGAAAGACTT-GAAAGA-CATG---AAAGGGTTCGCCA--GACGAGTGAC--AG--GGCTGAAATTTA-A--GACGA--ATTT---C---ATTTTGTACTACTATGTCCT--AT-T-TACCAT-----GAACTTAGATATATTCACAAGCGTTG-T-A-T---CCGTAGCA----C-AACTATGTTAA-----A---GTT--------TATT--AATCTTCTTAAATCAAAAA-ATAAATTGTTAAA-TTAAGCAAATTTA---T---TTCTGAAGC-ATTTGT


blockSeqs                     :     G               T   TC     A       AT       GGGTCTAA        .  C         TAATATTG    T      A     A                T  A      A                                    A                        G  A                 TT         TACACATC         CGGCAC    TTTGGAA             A    GATTACGCAG         C        AC    C  GA    AATG  TAG      CATA     AT  GC AA   C         C            A T          AACATGAAA   T    TTT    T        TTTT T      TAAGA             CACT     TA  A CAAT          T          CTGT  G ATAATGAA       GG  GA           A G   T T . TAA   G    ATATT   G        TGCTC TGT   TTTCTCTCT   GA       TT   T   AAAT  A    G                   ATG GAA         A        T   GCGA      A  AA GATA          C   T     AATGTGCTTTATTATGTT                         TAA       T           CACA     G  CT  AATAAAA   CC    T  T A G   GCTATGT      A   TG  C  CT          CTT  A    ATCA TAA      TAG  A  A    T     TG        AT   A    AGT    TTTGA          TT    ATGTATA     T                T        T    T
blockSeqs                     :                                                                                          T      T     T                T  T      C                                    C                        .  A                 TT         TTGTAT           TTACA     GTATGGA             A    CGCGTTATA          .        AC    C  TG    AA    TTA      ACT      .   .  AT   .         C            A .          GAATCGAAC   .    .      G        TT   G      AGTGC             C        .   T TATC          A          CA    . TACTAT         GC  G            T G   . . . .     T    CA      A        CG    .     A           GC       .    .   AAG   A    .                   .   .           .        T   .         A  .  .             .   .     AATGTGCATTATTATGTA                         TAT       T           .        .  A   .         .     T  T . A   TTAAGT       .   .   C  CC          TTT  .    .    T        .    A  .    T     .         .    A    .      TTTTA          .     ATGTA       .                C        .    .
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Reference ( family-804 )      :  TAANAACTCGTTAGCTGATNGTGNNAAAGGNTTATCAAATTGGGGTTGGGTCTAAAAAGCTAATGTNCACCCTAAGTAATATTGGTTTTGACGTACGTATANGATAAGCCAACAAATGTAATATAATANATATTTTCTTTCGATTTTTCGTCAAAGAATGATTGANAGTTTTATTCAAACTTGGGCGGCA-GGATATGGAGTCAAATAGAGTNTTGAACCTGT---CGT-T-AGTAATGCGACA-TTAAN--T-TGG-ATACGAAAGATATTTA-GAT-CGTTACGCAGATGT-ACTAAACAACTACGCAGCGGTTTA--AT-ACT-TAATTACG---A--TCTT--CA---CATTCA-TTAAGAATCGAAACGGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGAATA-GAACGA-CACG---AACGNATTTGCCA--NNTNTGTAAT---AA---T---G---ACATTGA-A--GACGA--ATTT---CATTTTGTNTTAATATGTCCTAT-TTACNAT---TAGAAGNAAG-TATATCAAGAANTGTTA-T-A-T---ACA-AGAC----C-AANTATGTTTATG---A---CAT--------TACTGCAATCTTC--GAA-CAAAAG-AGAACTT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCCGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCGATCNATT----CCAAACATTA-TTT-CTTAA----AATGTGCATT-N-T-ATGTTCATTCT--CATGATTTT--TGTTGATG----AC-ACA-AA-TAT---TTA--TAATNTT-CA-TNA-----AATATGATT-AT--AACAT--CATTTTAT-TA-TT-C-AGAG----A--T--TCA--ATT---TATA---G-TAAA-A-----GCAT--ACCTGTCA--TGTAATAAAATATTT--TATATTTA--TATATAT-T---TATG-ATGACGAGAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTCTTATGTC
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AGAACGT-TTACATTTAAGTAAATTTA---T---TTCCGAAGC-TTTTGTAATAAG----GCGATCAATT----CCAAATATTG-TTT-CTTAA----AATGTGCATT-T----TGTTCATTCT--CATGA-TTT--TGTTGATG----AC-ACA-AA-AAA---TTA--TAATTTT-TA-TGA-----A--ATGATT-AT--AACAT--C-TTTCAT-TA----C-AAAG----A-----TCA--ATT---TAAA---G-TAAATA-----GCAT--ACCTGTCA--TGTAATGAAATATTTGATATATATA--TATATGT-A---TATG-ATGACGTGAAACTGTATATAGTTT---GTC-AATAAAATGTCTTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                  GATATAGAAACAAATAGTGTTTTAAATCTTTACACAT-C-AGTAATG----G-TTAAT--T-TGGAATACGGAAACTATCTACG---CGTTATA-----GTCACTAAATA--TACG-AGGAGCTTA--ATGACT-AGGTTGC----A--TTTG--TAAGCCAATAACTTAAGAATCCAAACGGGAAGGT-T-GGTAGAGAAA----------GA-CACA---GACATATTTGCCG--TTTTTGTAAT---GA---T---G---ACATTAA-C--GACTA--AT------ACCTTGTTTTGATATGTCa
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attttgcaaaactatactgaccggtaggCGGGAAGGTAT-TCTCGATAAA-AACATGAAAGG-CATG---AATTGGTTTGTCA--GGCGAGTGAT---AT---T---G---AC---GA-A--TATCA--AT------ATTTTGTATAAATAGGCCCAAT-
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCCAAATC-TTTTGTAATAAG----GCGATCATTT----CTAAATATTA-TTT-CTTAA----AATGTGCATTAT-T-ATGTACATTCT--CATGA-TTT--TGTTGATG----AC-ACA-AA-TAT---TTA--TAAATTT-TA-TAA-----A--ATGATT-AT--AACAT--C-TTTTAT-TA----C-AGAG----A-----TCA--ATT---TAAA---G-TAAA-
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---TTA--CAATATT-CA-TTA-----AATATGTTT-AT--A---T--CCTCTTAC-TACTT-C-AGAG----A--T--TCG--ATT---TATA---G-TAAA-G-----GCAC--ACCTGTCA--GGTAATAGAATATTT--TATATCTA--TATATatataaattacaaataaaaaattaata
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atacgaggagcttaatgactaggttgcatttgttagccaataacGGTAT-GGTAAAGAATGAATA-TA-CGATCACG---AACGTATTTGCTA--GTTTTATAAT---AA---T---G---ACACTGA-A--GACGA--ATTT---CAATGTGTTTCAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATGT-ATTACACAACTAAGCAGTGGTTT----T-ACT-TAATTACA---A--TC-----A---TATTCA-C-AAATATTGAGATGG-AAGGAATTGGTGTTAATAGAATA-GA-----CACATTTAAAGACTTT-------ATATGTAATTAAGA---C---G---ATACTGA-A--AACGA--ATTT---CTTTTTGATTTAATATGTTTTAT-GTATAATGAATGGAAGGAAG-TTAATGAAGAAATGTTATT-G-T---ACA-AGAC----CAAAGTAC-TTTACG---A---TAT--------AAATGAAATCATC--G---CA----------TT-CTAAATTTAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTATAATGAA----GCACTCTGTT----CCAATAATTA-TTT-TTT------AACTTGCA-------AT---------------ATTGT--TACTGAT-----ACAAAA-AA-GATAAATTAATTAAT-------TTA-----AGTATGATG-AT--AA-----CATTTTAT-TATTT-C-AGAT----A--T--TCA--ACCTAGTATA---G-TAAT-A-----GCAC--AACTGTCA--TGTTATAAAGTAGTA--TGTATATG--TGTTTAT-T---TATC-ATGATATGAAACTGCACATAGTTTA-AATC-AATAAAAtgcaaacatacagagaatatgataattttgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTATTCT--CATGATTTT--CGTTACTG----AT-ACA-AA--AT---TTA--TAATATT-CA-TGAAAATTAATATGATT-AT-----AT--CATTTTAA-TA-TTAC-AGAG----A--T--TCT--TTT---TATA---G-Taacaacttatatgtcttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttta--T--TCA--ATT---CATA---G-TAAA-G-----GCAT--ACCTGTTA--TGTAATAAAATATTT--CATATTTA--TATATAT-T---TGTG-ACGAAGAGAAATTGTATATAGATTA-AGTCTCGCACAATGTCTCGTGTCgctgtcatttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agTTTT--TGTTGAAG----AC-ACA-CA-TAT---TTA--TAATTTT-CA-TGA-----A--ATGATT-AT--AACAT---ATTTCAT-TA----C-AGTG----A-----TCA--ATT---TAAA---G-TAAATA-----ACAT--ACCTGTCA--TATAATGAAATATTT--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTCA--GATGTGTGAC---AG---T---GCTGAAATTGA-A--GACGA--ATAT---CATTTTGTATTGATATGGCATAT-TTACTAT---TAGATGCAAA-TATATCCAAAATTGTTT-T-A-T---Agt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-ATGTTCATTCT--CATGATTTT--TGTTGATG----AC-ACA-AA-TAT---TAA--TAATTTT-TA-TGA-----AAT-T-ATT-AT--AACAT--CA-TTTAT-TA----C-AGAG----A-----TCA--ATT---TAGA---G-TAAA-A-----tccgtagt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctttatTATG---A---CAT--------AACTGCAAACTTC--GAA-CAAAAATAATATTT-CTTAATTTGCGTAA--TTA---TGAATTCC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG--TATATAT-T---T-TGTATGACGAGAAACTGTA-ATAGTTTC-AGTC-GATAAAAcacaatgctttgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttacacaaatggaTGACGATAAACTGTATATAGTTTA-AGTC-AATAAAATGTC--ATGTaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTAT-GGTAGAGAAAGAATC-GAACGA-CACG---AACGTATTTGCCATTTTTATGCAAT---AA---T---A---ACATTtctcgtctactactgttatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTAAGAATCAAAACCGGAAGGTAT-GGTAGAGAAAGAATA-GAACGG-CACG---AACGTATTTGCCT--TTTTTGTAAT---AA---T---G---ACATTGA-A--GACGA--ATGT---CATTTTGTTTTAATATGTCAAAC-ATATAGT-----GAA-------ATATTAAACGATTTTA-T-A-C---ACAGAGAC----C-TAACATGTTGA-----A---CTTTTTCTCTCTTCTTTAATCAAC--AAA-CAATAA-AGAAATC-ATAAATTTTAGTAAATTCC---T---TT-CAAAGCATTATGTAA-AAG----AAGTTCCAT-------AA-------------TAA----AACAACCAAT-A-A-GTGTTCATCCT--C----CTTTGATATCGATG----AA-ATAGAA-CA----TAA--TAAAATTACC-TT-------ATGTGATTGAG--AGC---------TATGTA-T------AT----A--T--TGAACATT---TGTAATTG-TTAA-ATTTGTGCATTGATTTGTCA--CGT----AAATGTAT--TGTA--TA--TATGT-T-T---TAT--ATGATGAGAAACTGTA-ATAGTTTA-AATC-AATAAAA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tc---TATA-ATGACGTGAAACTATATATAGTTTG-CATC-AATAAA--GTCTTATGTaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtgATTGA-A--GACGA--GTTT---CATTTTGTATTAATAAGTCCTAT-TTAC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaGC-TTTTATAACAAG----GCGATCAATT----CCAAATATTA-TTT-CTTc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACCA--AATATGTAATGATAA---T---G---ACATTGGCACTGACGATAATTTTATCATTTTATCTTAATATGCTCTGTATTACAAT---TAGAGGCATA-TTTATCAAGAAATATTA-TTA-T---ATA-AGACATATT-AATTATGCTTATGCTCATGTCAT--------AACTACACTATTT--GAA-CGTAAG-ACAACTT-CTAAATTAAAGCAAATTTAATGT---TT---AATA-TTTTATGAAAAG----GTAATCTATCGATATCAAACAGTA-TTT-TTT------AATTTGCATA-A-A-ACATACATT-TAACATGATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caaTA--AAACATA-CA-TTT-----AACATGATT-AT--AA-----CACTTTCT-TG-TT-T-A-AGCT--ATTT--TCA--GTT---TAT------TAAA-A-----------AGTT-TCA--TGTA----------T--TGCG--TA--TATGGAC-C---T-----TGATAAGAAAC--TATATAGTTAA-AATC-TATCAAAGGTCTCATGTCataacactttcttgtttaagctattttcagtttattaaaaagtttcatgtattgcgtatatggaccttgataagaaactatatagttaaaatctatcaaaggtctcatgtc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caataccaaatatgtaatgataatgacattggcactgacgataattttatcattttatcttaatatgctctgtattacaattagaggcatatttatcaagaaatattattatataagacatattaattatgcttatgctcatgtcataactacactatttgaacgtaagacaacttctaaattaaagcaaatttaatgtttaatattttatgaaaaggtaatctatcgatatcaaacagtattttttaatttgcaCTT-CTACATTCAAGTAAATTTA---T---TTCTGAAGC-TTTTGTAATAAGGCGAGCGATCTATT----CAAAACATTA-TGT-ATTAATTC-AAT-T-CATT-T-T-A--TTTATTGT--C---ATTTT--TGTTGCTG----AC-ACA-AA--AT---TTA--TAATATT-CA-TCA-----AATATGGTT-AT-----AC--CATTTCAT-TA-TT-TAAGAG----T--T--TAA--GCC---TTTG---G-TAAT-A-----TCAT--ACCTGTCT--TATTATAAACTATTT--TATA--TA--TATGT-------------TGACGAGAA---GT-TATA--TTATAGTC-AATAAAAAATCTTATG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gaaattttatttaaattggacgtccgtctgaaaatcatttctaattgttctggggaaaggctaaatttcataatttgcacagtttaaccaaaatgtattAGAAAATAG-TATATCAAGAACT--TG-T-A-TTAAACA-A-------T-AACT---TTTATA---A---CAT--------TATTGCAATTTAC--AAA-TAA--G-AGAATTT-CTAATTTTAAGCAAATTTA---T---TTCAGAAGC-TTT------AAG----ACGATCAATT----CCAAATATAACTTT-CTTAA----AATGTGCATT-C-TTATGTTCATTCT--CATGATTTT--TGTTAATG----AC-ACA-AA-TAC---TTA--TAATTTT-TA-GCA-----AA-ATTATT-TT--AAAAG--C-TTTTAT-TA----C-AGAA----A-----TCA--ATT---TAAA---G-TAAACA-----GCAT--ACCTGTCAATTGTAATGAAATATTT--GTTATTTA--TATATGTGTA--TATG-ATGACGAAAAACTTTATATAG-TTA-AGTC-AATAAAATGCCTTATGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTATG---A---TAT--------TACTGGACTATTC--AAA-CAATAG-AGTACTA-TTAAATTTAGGTAGACATA---T---TTCCGAAG---------ATAAG----GCGATCTATT----CCAAACGTTT-TTTTCTTT-------TATGCAAT-AGT-ATGTTCATTCC--CATTATTTT--TGTTGATG----AC-ACA-A--CAT---TTA--TAATATT-GAAGCA-----AACATGATT-TT--AACAT--AAT---AT-TA-TT-T--GAG----A--TAATCC--ATT---TGTA---G-TAAA-A-----GCAT--ACCTGTCA--TGTAATAAGATAGTT--TATATTTATTTATATATGTATATATG-ATGGCACGAAACTGTATATAGTTTA-ATTA-AATAAAAAGTATTATG
gi|8                          : aTAAGAACTCGTTAGCTGATTGTATCAAAGGATTATTAAATTGGGGTTGGGTCTAAAAAGCTAA-GTCCATCCTAAGTAATATTGGTTTTGATATATGTATATGATAAGCAAACTAATGTAAT-TAATACATTTTTTGTTTTTAGTTTTCAGCAAAGACAGACTGACAGTTTTATTCAAACTTAGGCGATA--AATATGAAGTCAATTATAGAACTGACTTTGT---TGTAT-AATAGTGTTACA-TTAAT--T------------AGAT--------T-TGTT------ATGT-TCTAAACAACAACGCAGT-GTTTA--A--ACT-TAATTACG---ACTTCTT--CA---CATTCA-TTGAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTACGCATA--TCTTATCA---C---CA-ATAAGAATTGAAACAGGAAGGTAT-TTGAGAGAAAGACTT-GAAAGA-CATG---AAAGGGTTCGCCA--GACGAGTGAC---AGGGCT---G---AAATTTA-A--GACGA--ATTT---CATTTTGTACTACTATGTCCTAT-TTACCAT-----GAACTTAGATATATTCACAAGCGTTG-T-A-T---CCGTAGCA----C-AACTATGTTAA-----A---GTT--------TATT--AATCTTCTTAAATCAAAAA-ATAAATTGTTAAA-TTAAGCAAATTTA---T---TTCTGAAGC-ATTTGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AAATTTAAACATATTCGGCTTTTTTGAAAAATGTTTTGTACCAGAAATTTTTGAAGTTGTATT
Unaligned ( gi|31 ): AAAAGTATTGTTTATATACGTTTTGTATGATGAGAAACTCTAACAG
Unaligned ( gi|34 ): ATGATGAGAAACTGTAACAATTTAAATCAAAGAAATC