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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAATA-AAA-ATAT-TTGT--TTG-T-TTGTTTGTAACTATGTATTTTTT---GTGAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT--CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAAATATATTAATGTATACAAATGTAACAT-GAC---TAT----------TGTGCATGCAGCATTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGAA----------TT---T-------------ACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTTG-CAG--------------AATTA-------TT-------GT---------------------TTCTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTT-ACAATGCAATGCAAATATG-TTTGCATTAATGAAATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAATGCTGTTTTAT--GTCTAATC-AAA--TAT-TTGT--TTG-T-TT--------CTATGTTTTTTTT---GTGAAAACTATCCATTATCCATATAT-TTGTTT--A-GATACTTTAA-TGTGAATTTATTAATTAAGTAAACTGTGATAATTTTTT--CATAGTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAAATATATTAATGTATACAAATGTAACAT-GAC---TAT----------TATGCATGCTGCAATTATT---CATA-AAATTGGA-CTGGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGGA----------TG---T-------------ACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTTGTTCAAAT-GGCTTTTG-CAG--------------AATTA-------TT-------GT---------------------TTCTCAACAAATTATGTTTTTTTTTCAGCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-AAGTGTGCAGTGCTTAAATGTATCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATCTTTAAGATGGTAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTT-ACAATGCAATGCAACTATGTTTTGAATTAATGAAATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTTATTTGGGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAATA-AAA-TTAT-TTGT--TTG-T-Tca
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAATA--AA-ATAT-TTGT--TTG-T-T
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACGCAAGTATTGTTTTAT--GCCTAAT--AAA-ATATGTTGT--TTG-T-TTa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAAC--AAA-ATAT-TTAT--TTG-T-TTGT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCTGAATA-AAA-TTAT-TTGTA-TTG-TATTG
gi|24                         : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAATA-AAA-TTAT-TTGTTGTTA-T-TTGTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctgataatcttattttcatgttttcattgttgtaatattcgtgtggactataaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--TCCGAAT--AAA-ATAT-TTG---TTG-T-T
gi|28                         :                                                                                                                                                      ttatggcttcccaatgcacaaagacaataaacaattaatccaaatttatatattttgccatccaacttagaacaattaatccaaatttatatattttgccatccaacttagaacaattaatccaaatttatatattttgccatccgacttagaatgaatagttagcatcagacttatatttgcataactatgataattgttacattgtatttaaacaatatttattaactttatttacttctctgataatcttattttcacgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAATA-AAA-TTAT-TTGgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ataatatttatgtgggctataaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAATA-AAA-TTAT-TTGTTGTTG---TTGTTatgtt
gi|12                         :                                                                                      cgatttatatgtagatagtgaaggcgttgccgtaattggatttatcggttgtgtatttgtttcatctgtcttcgtcataaatattttaaacgttattattgtcattggcctaatttgagtaaatttgaaagtactatggcctcccaaggcacaaatacaataaacaattaatccgaatttatatagtatgccttccaccttagaatgaatacttagcatcagacttatatttgcgtaaattaataacataactaagaaaattgttaaattgtatttaaccaatatttattaaatttatttacttttctgataatcttattttcatgttttcactgttgtaatattggtatgggctataaACACACAAGTGCTGTTTTAT--GACTAAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                    ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAAT--GAA-ATAT-TTTT--TGG-T-TT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGAT--CAG-ATAT-GTGT--TTG-T-TT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAATT-AAA--TAT-CCGT--TTG-T-TTGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                            acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaCACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCGTAATA-AAA--TAT-TTGT--TTG-T-T--------ATTATGC-TTATTT---CTGAAACGCATCC-TTTATCAAA-ATATTTTTT--ATGACACTTCCAACGTGAATTGATTATTTAAGTAAACT--GATTATTTTTT--CAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTTCACAGTAATACAACTGGTAAATCATGGTGTACGAACAC-----------------------TTTCATTTTAA-TATATTGATATATATCAATGTTACAT-TAA---TGTA---------TATAGATGTAACATTAATG---TATATAAATGTAA-CATGTAC-----ATGCTGAAGTT--T--GAGTGGAA----------TC---TGGCTTTTTTTGGTACCGATTTCGCAACCACTTTTTGGCTGTATTTAGTTCCCATTGACTTTTGGCAGTGTTATTGTATTTTAATTACATGTAATTATAA---GT---------------------TTCCCAGCAAATTACGTTATTGT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGTTTAGATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCATAACCCATCCTTATAGTACAATGACGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACCAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GATTCTT-ACTAAGCAATGCTAATATG-TT-------ATG-ACT-----TATTACAAATGTTTTGATCAGTA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgagCACGCAAGTTCTGTTTTAT--GCCTAATA-AA----GT-GTGT--GTG-T-TTGTTTGTtgtcgggg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACGCAAGTTCTGTTTTAT--GTCTAATA-AAA-------TAT--TTG-T-TTGTTTGCA---------------------------TCCATTATCTATA-AC-TTTTTT--AAGATACTTTAA-TGTAAATTTATTATTTAAATAAACTTTGATTATTTTTTT-CAGATTATGA----CTTCATACATCAACACTAAATTACACAGTAATATAACTGGTAAATCATTATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AATAGTTTCATTTTAAATATATCAATGTATACAAATGTAACAT-GAC---TAT----------TGTGTATGCTGCAATTATT---CATA-AAATGGGA-TTTGAGTTATTTATACCCAAATCAAATGGAGTGGAAACTTGCTTTTTTATGT-------------ACTCGTTTTACAATAACTTTTTGGTCGTGCTTAGTTCAAAT-GACTTTTT-CAG--------------ATCTA-------TT-------GT---------------------TTCTCAACAAATTATG-TTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGATTTTGTTTATAAT-TCGTGTGCAGTGCTTAAATTTAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAACGAAGTACATCCATCTTTAAGATGGAAGATGGTGGTTCAATTCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGGG-GTTTCTT-ACTATCCAATGCAAATATGTTTTGAATAAACG-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagtATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAAT--AAA-ATAT-TTGT--TTATT-TTGTTTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAATA-AAATATGT-TTGT--TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                           atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacAAGTGCTGTTATAT--GCGT--TACAAA-ATAT-TTGT--TTG-T-T--------ACTATGTTTTTTTTTTTGTGAAACGCATCCTTTATCCAAA-AT-TTTTTTTAATGACACTTCCAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTG----AATATTTTTTCAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTGATACAACTGGTAAATCATGATGTACAACCACTTTAAAATAGCAGTATTAAAGAGTATCATTTTAA-TATATTGATGTATATAAATGTAGCATTGATGTATATAAATGTAACATGTGCATGCTGCAGTT--T---CA-----GTGGAAACTGGCTTT-TTTATG------------------------------------T-------------ACTGGTTTGGCAACCACTTTCGGGTTGCGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAG--------------TGTTA-------TT-------GTCCTTTAATTAAATATATAATTTTCTCAACAAATTATGTTAATAT---AGCAGCCAGTGAAA-CGGGATTAAATTTATGAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCTAAACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTT-ACTAAGCA----AAATCTG--TTACA--AAT----------TAGTACAAATGTTTTGATCGGTAAGTTGGGG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTATTAGGCATA-AAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgTTTTGCAACAACTTTCGGGTTGTGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGTTCTTTAATTA-------TTTTCAAATGTCAGG-----------------TTCTCAACAAATGATGTTATTAT---AGCAGCCAGTGAAAATAGGATTATATTTAGACT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATTTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTT-ACTAAGCAATGCAAATCTG-TTTGTACGAATGatatttgtttattttgttt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATTTG-AATACAATGTACAATGAT--AATATGGT------AT-CATCCTTACAGTAAAATG---TCCATC---TTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTGAACAACACATTACATATttttgatcagtaag
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTATATACTTTCATCGCATGATCTTACCATTGATTTTGGAAAATATACAATTGTAAATGTAGCAATCGCTCAACGAACCTGCTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCATAAATATGTTAAACATTATAATTGTCAATGGCCTTATTTGAATACATTTAAAAATATTATGACCTCCCATTCTACAAGGACAATAAACAATCTATCCAAATTTATATATTTTGCCTTCCAACTTAGAATGGATACTTAGCATCAGACTTATACTTGCAGTAAATTAATAACATAACTATGATAGTTGTTAAATTGTATTAAACCAATATTTATTAACTTTATTTACTTCTCTGATAATCTTTATTTCATGTTTTCACTGTTATAATATTTGTGTTGGTAATAAACATGCAAGTGCTGTT
Unaligned ( gi|10 ): ATGCTCTCAGACTATTGGAACTGGAAGATATACTGAAAATGTAGCACGTGTGCAACGCAGTTACTTACAATTTAACATGTATATGGTAGAAACGCGGGTATATCAATTTCTATCGGTTGTCGTAAGTATAGAGAACTCTGTCAAATATATTTTAAACGTTAATATTGCCATTAGCCTAATTCGATTACATTTGAAGGTGTCCTTCAGATGCACAAAAACACGATAGACCATTTATCCAAAATTTATATATTTTGTCCTCCCTCTCAGAGTAAATACATGATTTCTGGCGTCATGATCAGTCTTATAATTGTAGCTAAATATTAA
Unaligned ( gi|16 ): ACTTTACCTCAAACTCGGAGTAGATACTAAGCTTTCAGTCATCATTATAGTAAATTATTAAAACAATAACATTACTATGGTTGTTAAATTCTTGGAATGAAATATATCAAATCACTATTTATTAACTAAATTCACTTCTCTGATATCATTATTGTCATGTTTATCTTTATTGTTGTATTATTTGTGTAATCTATCAACACGCACTAGCTGCTTCATGCCTTAGCTAAAAAGTGTTTGTTGTTG
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTCTATTGGTATGTCCAAAGTTAGAGAACTTGCTCATAAATAATTAAAACATTATTATTGCCATTGGCCTAATTTGAATAAATTTGAAATAAAATGGCCTCCCAATGCTAATAAACAATTGATCGAAACTGACATATTTTGCCTTCAAACTAACTGTAAATACTTATCTTTCAGACATCATGACTTATAGTTGCAGAAAATTGATAAATTAATAACACAACTATGATAGTTAA
Unaligned ( gi|20 ): AATTTTATGTATTTTGCCTTCAAACTTAGAGTAAATACCTAACTTTCAGACAACATGACTTATAATTGCAGAAAAATTGATACATTTATAATATAACTATGATTGTTAAATAGTATTAAACAAATTACTTCTTAACTTAATTTACCTCTGTGATA
Unaligned ( gi|25 ): TTTATCAATTAAGCTATAAACGAAAATACATTATTATTTGTTAAGTTATACACAAAGGACTTTTTGTCTCTTTTTAATTAAAAAT
Unaligned ( gi|29 ): ACATTGATGTAACATAAATGCAGCATGGATGTAACACGGATGTAATATGTG






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Reference ( family-768 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--TA-AAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTG--ACTATGTTTTTTTT---GTGAAACGCATCCATTATCCANA-AT-TTTTTT--ATGACACTTCNAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTGTGATNATTTTTTTCAGATTGTGGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTAATACAACTGGTAAATCATGATGTANNAACACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTGATGTATACAAATGTAACATGACTATATGTGCATGCTGCANTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATC-AAT-GGAGTGGA-------------ATNT-------------ACTGGTTTTGCAACCACTTTCGGGTCGTGTTTAGTTCCAAT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--T--TTAATTA----T------TT----A---GTC---TTCTCAACAAATTATGTTATTNT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGATTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCAAGACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTANGCAATGCAAATATGTTTTGNA-T-AATG-AATGAAGGTAGTANAANTGTTTTGATCNGTAATTTGGGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAATGCTGTTTTAT--GTCTAA--TC-AAA---TAT-TTGT--TTG-T--TT--------CTATGTTTTTTTT---GTGAAAACTATCCATTATCCATATAT-TTGTTT--A-GATACTT-TAATGTGAATTTATTAATTAAGTAAACTGTGATAATTTTTT-CATAGTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TATGCATGCTGCAATTATT---CATA-AAATTGGA-CTGGCATTATTTATACCCAAATC-AATAGGAGTGGG-------------ATGT-------------ACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTTGTTCAAAT-GGCTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T---------GT----TTCTCAACAAATTATGTTTTTTTTTCAGCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-AAGTGTGCAGTGCTTAAATGTATCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGTAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAACTATGTTTTGAATT-AATGAAATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTTATTTGGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaTTTTGCAACAACTTTCGGGTTGTGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--TCTTTAATTA----T------TTTCAAAT--GTCAGGTTCTCAACAAATGATGTTATTAT---AGCAGCCAGTGAAAATAGGATTATATTTAGACT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATTTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCAATGCAAATCTGTTT----------------------GTACGAATGTTTTGATCAGTAAca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACACAAGTGCTGTTTTAT--GACTAA--Tg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAA--TA-AAATA-TGT-TTGT--TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                     atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAA--C--AAA-A-TAT-TTAT--TTG-T--TTGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAA--TT-AAA---TAT-CCGT--TTG-T--TTGTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                           acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaACACGCACTAGCTGCTTCAT--GCCTTAGCTA-AAA-AGTGT-TTG---TTG-T--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actttacctcaaactcggagtagatactaagctttcagtcatcattatagtaaattattaaaacaataacattactatggttgttaaattcttggaatgaaatatatcaaatcactatttattaactaaattcacttctctgatatcattattgtcatgtttatctttattgttgtattatttgtgtaatctatcaATATTTG-AATACAATGTACAATG--ATAATATGGTATCA-------TCCTTACAGTAAAATG-------TCCATCTTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttatagtttgtttcaaaacattgatgctcactattatcattgttacgatactaTTATTAGGCATA-AAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAAgaacaacacattacatatcaaataaagat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--T--AAA-A-TAT-TTGT--TTATT--TTGTTTaatatttgtttattttgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAA--TA-AAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTGTAACTATGTATTTTTT---GTGAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT-CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCAGCATTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATC-AATAGGAGTGGA-------------ATTT-------------ACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T---------GT----TTCTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAAATATG-TTTGCATT-AATGAAATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGA--T--CAG-A-TAT-GTGT--TTG-T--TT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAA--TA-AAA-T-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAA--T--GAA-A-TAT-TTTT--TGG-T--TT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAA--TA-AAA-T-TAT-TTGTTGTTA-T--TTGTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgataatcttattttcatgttttcattgttgtaatattcgtgtggactataaCACGCAAGTTCTGTTTTAT--GCCTAA--TA-AAGTG-TGT-GTGT--TTG-T--TTGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAA--TA--AA-A-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAA--TA-AAA-T-TAT-TTGa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataatatttatgtgggctataaCACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCGTAA--TA-AAA---TAT-TTGT--TTG-T--T--------ATTATGCTTATTTC----TGAAACGCATCCTTTATC-AAA-ATATTTTTT--ATGACACTTCCAACGTGAATTGATTATTTAAGTAAACTG--ATTATTTTTT-CAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTTCACAGTAATACAACTGGTAAATCATGGTGTACGAACAC-----------------------TTTCATTTTAA------------TATA---------TTGATATATATCAATGTTACATTAATGTATATAGATGTAACATTAATG---TATATAAATGTAA-CATGTAC-----ATGCTGAAGT----T-TGAGTGGA-------------ATCTGGCTTTTTTTGGTACCGATTTCGCAACCACTTTTTGGCTGTATTTAGTTCCCATTGACTTTTGGCAGTGTTATTGTATT--TTAATTA----CATGTAATT----ATAAGT----TTCCCAGCAAATTACGTTATTGT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGTTTAGATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCATAACCCATCCTTATAGTACAATGACGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACCAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GATTCTTACTAAGCAATGCTAATATGTT---------ATG-ACT-----TATTACAAATGTTTTGATCAGTATGTCGGGGatgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgagACACGCAAGTATTGTTTTAT--GCCTAA--T--AAA-A-TATGTTGT--TTG-T--TT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACGCAAGTTCTGTTTTAT--GTCTAA--TA-AAA---TAT-TTGT--TTG-T--TTG-------------------------------CATCCATTATCTATA-AC-TTTTTT--AAGATACTT-TAATGTAAATTTATTATTTAAATAAACTTTGATTATTTTTTTCAGATTATGA----CTTCATACATCAACACTAAATTACACAGTAATATAACTGGTAAATCATTATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AATAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TCAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGTATGCTGCAATTATT---CATA-AAATGGGA-TTTGAGTTATTTATACCCAAATCAAAT-GGAGTGGAAACTTGCTTTTTTATGT-------------ACTCGTTTTACAATAACTTTTTGGTCGTGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-TCAGATCTATTGT---------------------------------------TTCTCAACAAATTATGTT-TTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGATTTTGTTTATAAT-TCGTGTGCAGTGCTTAAATTTAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAACGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGAAGATGGTGGTTCAATTCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGGG-GTTTCTTACTATCCAATGCAAATATGTTTTGAA-TAAACG-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagtACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCTGAA--TA-AAA-T-TAT-TTGTA-TTG-TA-TTG
gi|8                          : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAA--TA-AAA-T-TAT-TTG---TTG-TTGTTGTT
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): ATGCTCTCAGACTATTGGAACTGGAAGATATACTGAAAATGTAGCACGTGTGCAACGCAGTTACTTACAATTTAACATGTATATGGTAGAAACGCGGGTATATCAATTTCTATCGGTTGTCGTAAGTATAGAGAACTCTGTCAAATATATTTTAAACGTTAATATTGCCATTAGCCTAATTCGATTACATTTGAAGGTGTCCTTCAGATGCACAAAAACACGATAGACCATTTATCCAAAATTTATATATTTTGTCCTCCCTCTCAGAGTAAATACATGATTTCTGGCGTCATGATCAGTCTTATAATTGTAGCTAAATATTAA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTCTATTGGTATGTCCAAAGTTAGAGAACTTGCTCATAAATAATTAAAACATTATTATTGCCATTGGCCTAATTTGAATAAATTTGAAATAAAATGGCCTCCCAATGCTAATAAACAATTGATCGAAACTGACATATTTTGCCTTCAAACTAACTGTAAATACTTATCTTTCAGACATCATGACTTATAGTTGCAGAAAATTGATAAATTAATAACACAACTATGATAGTTAA
Unaligned ( gi|20 ): AATTTTATGTATTTTGCCTTCAAACTTAGAGTAAATACCTAACTTTCAGACAACATGACTTATAATTGCAGAAAAATTGATACATTTATAATATAACTATGATTGTTAAATAGTATTAAACAAATTACTTCTTAACTTAATTTACCTCTGTGATA
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Reference ( family-768 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTT----ACTATGTTTTTTTT---GTGAAANNCATCCATTATCCATA-AT-TTTTTT--ATGATACTTCTAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTGTGATAATTTTTTTCAGATTATGGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTAATACAACTGGTAAATCATGATATANTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCTGCANTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------GTACTGGTTTTGCAACCACTTTCGGGTCGTGCTTAGTTCNAAT-GACTTTTGGCAGTGTTATTG--T--T--TTAATTA----T------TT---------AGTTT-CTCAACAAATTATGTTATTNT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGATTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTNNAATATAGCTTCAAGACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTANGCAATGCAAATATGTTTTG-A--T-AACG-AATGAAGGTAGTANAANTGTTTTGATCNGTAATTTGGGG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAA--TAAAATA-TGT-TTGT--TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                     atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAA--C-AAA-A-TAT-TTAT--TTG-T--TTGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAA--TTAAA---TAT-CCGT--TTG-T--TTGTT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                           acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaACACGCACTAGCTGCTTCAT--GCCTTAGCTAAAA-AGTGT-TTG---TTG-T--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actttacctcaaactcggagtagatactaagctttcagtcatcattatagtaaattattaaaacaataacattactatggttgttaaattcttggaatgaaatatatcaaatcactatttattaactaaattcacttctctgatatcattattgtcatgtttatctttattgttgtattatttgtgtaatctatcaATATTTG-AATACAATGTACAATG--ATAATATGGTATCA-------TCCTTACAGTAAAATG-------TCCATCTTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttatagtttgtttcaaaacattgatgctcactattatcattgttacgatactaTTATTAGGCATA-AAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAAgaacaacacattacatatcaaataaagat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TAT-TTGT--TTATT--TTGTT----aatatttgtttattttgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTGTAACTATGTATTTTTT---GTGAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT-CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCAGCATTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------TTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-GCAG------------------AATTA----T------T-----------GTTT-CTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAAATATGTTTGC-AT-T-AATGAAATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGGt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGA--T-CAG-A-TAT-GTGT--TTG-T--TT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAA--T-GAA-A-TAT-TTTT--TGG-T--TT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGTTGTTA-T--TTGTT----
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAA--TA-AA-A-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGa
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaAAGTGCTGTTATAT--GCGTTA--CAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ACTATGTTTTTTTTTTTGTGAAACGCATCCTTTATCCAAA-AT-TTTTTTTAATGACACTTCCAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTG-AATA--TTTTTTCAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTGATACAACTGGTAAATCATGATGTACAACCACTTTAAAATAGCAGTATTAAAGAGTATCATTTTAATATATTGATGTATATAAATGTAGCATTGATGTATATAAATGTAACATG--------TGCATGCTGCAGTT--T---CA-----GTGGAAACTGGCTTT-TTTAT-------------------------------------------------GTACTGGTTTGGCAACCACTTTCGGGTTGCGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTG--TCCT--TTAATTAAATAT------AT---------AATTTTCTCAACAAATTATGTTAATAT---AGCAGCCAGTGAAA-CGGGATTAAATTTATGAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCTAAACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCA----AAATCTGTT----------ACA-AAT-----TAGTACAAATGTTTTGATCGGTAAGTTGGGG
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gi|8                          : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTG---TTG-TTGTTGTT----
gi|9                          :                                                                                      cgatttatatgtagatagtgaaggcgttgccgtaattggatttatcggttgtgtatttgtttcatctgtcttcgtcataaatattttaaacgttattattgtcattggcctaatttgagtaaatttgaaagtactatggcctcccaaggcacaaatacaataaacaattaatccgaatttatatagtatgccttccaccttagaatgaatacttagcatcagacttatatttgcgtaaattaataacataactaagaaaattgttaaattgtatttaaccaatatttattaaatttatttacttttctgataatcttattttcatgttttcactgttgtaatattggtatgggctataaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--TCCGAA--T-AAA-A-TAT-TTG---TTG-T--T
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): ATGCTCTCAGACTATTGGAACTGGAAGATATACTGAAAATGTAGCACGTGTGCAACGCAGTTACTTACAATTTAACATGTATATGGTAGAAACGCGGGTATATCAATTTCTATCGGTTGTCGTAAGTATAGAGAACTCTGTCAAATATATTTTAAACGTTAATATTGCCATTAGCCTAATTCGATTACATTTGAAGGTGTCCTTCAGATGCACAAAAACACGATAGACCATTTATCCAAAATTTATATATTTTGTCCTCCCTCTCAGAGTAAATACATGATTTCTGGCGTCATGATCAGTCTTATAATTGTAGCTAAATATTAA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTCTATTGGTATGTCCAAAGTTAGAGAACTTGCTCATAAATAATTAAAACATTATTATTGCCATTGGCCTAATTTGAATAAATTTGAAATAAAATGGCCTCCCAATGCTAATAAACAATTGATCGAAACTGACATATTTTGCCTTCAAACTAACTGTAAATACTTATCTTTCAGACATCATGACTTATAGTTGCAGAAAATTGATAAATTAATAACACAACTATGATAGTTAA
Unaligned ( gi|20 ): AATTTTATGTATTTTGCCTTCAAACTTAGAGTAAATACCTAACTTTCAGACAACATGACTTATAATTGCAGAAAAATTGATACATTTATAATATAACTATGATTGTTAAATAGTATTAAACAAATTACTTCTTAACTTAATTTACCTCTGTGATA
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Reference ( family-768 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTT----ACTATGTTTTTTTT---GTGAAANNCATCCATTATCCATA-AT-TTTTTT--ATGATACTTCTAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTGTGATAATTTTTTTCAGATTATGGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTAATACAACTGGTAAATCATGATATANTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCTGCANTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------GTACTGGTTTTGCAACCACTTTCGGGTCGTGCTTAGTTCNAAT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--T--TTAATTA----T------TT---------A---GTTT-CTCAACAAATTATGTTATTNT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGATTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTNNAATATAGCTTCAAGACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTANGCAATGCAAATATGTTT---A---T-AACG-AATGAAGGTAGTANAANTGTTTTGATCNGTAATTTGGGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAATGCTGTTTTAT--GTCTAA--TCAAA---TAT-TTGT--TTG-T--TT--------CTATGTTTTTTTT---GTGAAAACTATCCATTATCCATATAT-TTGTTT--A-GATACTT-TAATGTGAATTTATTAATTAAGTAAACTGTGATAATTTTTT-CATAGTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TATGCATGCTGCAATTATT---CATA-AAATTGGA-CTGGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGG-------------AT-------------GTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTTGTTCAAAT-GGCTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGTTTTTTTTTCAGCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-AAGTGTGCAGTGCTTAAATGTATCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGTAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAACTATGTTTTG-AAT-T-AATGAAATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTTATTTGGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaaTTTTGCAACAACTTTCGGGTTGTGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--TCTTTAATTA----T------TTTCAAATGTCA---GGTT-CTCAACAAATGATGTTATTAT---AGCAGCCAGTGAAAATAGGATTATATTTAGACT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATTTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCAATGCAAATCTGTTT---G---T--ACG-AA---------------TGTTTTGATCAGTAAca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACACAAGTGCTGTTTTAT--GACTAA--Tg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAA--TAAAATA-TGT-TTGT--TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                     atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAA--C-AAA-A-TAT-TTAT--TTG-T--TTGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAA--TTAAA---TAT-CCGT--TTG-T--TTGTT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                           acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaACACGCACTAGCTGCTTCAT--GCCTTAGCTAAAA-AGTGT-TTG---TTG-T--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actttacctcaaactcggagtagatactaagctttcagtcatcattatagtaaattattaaaacaataacattactatggttgttaaattcttggaatgaaatatatcaaatcactatttattaactaaattcacttctctgatatcattattgtcatgtttatctttattgttgtattatttgtgtaatctatcaATATTTG-AATACAATGTACAATG--ATAATATGGTATCA-------TCCTTACAGTAAAATG-------TCCATCTTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttatagtttgtttcaaaacattgatgctcactattatcattgttacgatactaTTATTAGGCATA-AAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAAgaacaacacattacatatcaaataaagat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TAT-TTGT--TTATT--TTGTT----aatatttgtttattttgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTGTAACTATGTATTTTTT---GTGAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT-CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCAGCATTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------TTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAAATATGTTT---GCATT-AATGAAATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGGt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGA--T-CAG-A-TAT-GTGT--TTG-T--TT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAA--T-GAA-A-TAT-TTTT--TGG-T--TT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGTTGTTA-T--TTGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgataatcttattttcatgttttcattgttgtaatattcgtgtggactataaCACGCAAGTTCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAGTG-TGT-GTGT--TTG-T--TTGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAA--TA-AA-A-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataatatttatgtgggctataaCACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCGTAA--TAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ATTATGCTTATTTC----TGAAACGCATCCTTTATCAA-A-ATATTTTTT--ATGACACTTCCAACGTGAATTGATTATTTAAGTAAACTG--ATTATTTTTT-CAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTTCACAGTAATACAACTGGTAAATCATGGTGTACGAACAC-----------------------TTTCATTTTAA------------TATA---------TTGATATATATCAATGTTACATTAATGTATATAGATGTAACATTAATG---TATATAAATGTAA-CATGTAC-----ATGCTGAAGTT--T--GAGTGGA-------------ATCTGGCTTTTTTTGGTACCGATTTCGCAACCACTTTTTGGCTGTATTTAGTTCCCATTGACTTTTGGCAGTGTTATTGTATT--TTAATTA----CATGTAATT---------ATAAGTTT-CCCAGCAAATTACGTTATTGT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGTTTAGATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCATAACCCATCCTTATAGTACAATGACGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACCAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GATTCTTACTAAGCAATGCTAATATG-TT---A---T-GAC----T-----TATTACAAATGTTTTGATCAGTATGTCGGGGatgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgagACACGCAAGTATTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TATGTTGT--TTG-T--TT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACGCAAGTTCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA---TAT-TTGT--TTG-T--TTG-------------------------------CATCCATTATCTATA-AC-TTTTTT--AAGATACTT-TAATGTAAATTTATTATTTAAATAAACTTTGATTATTTTTTTCAGATTATGA----CTTCATACATCAACACTAAATTACACAGTAATATAACTGGTAAATCATTATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AATAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TCAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGTATGCTGCAATTATT---CATA-AAATGGGA-TTTGAGTTATTTATACCCAAATCAAATGGAGTGGAAACTTGCTTTTTTAT-------------GTACTCGTTTTACAATAACTTTTTGGTCGTGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-TCAG----AT------------CTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGTT-TTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGATTTTGTTTATAAT-TCGTGTGCAGTGCTTAAATTTAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAACGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGAAGATGGTGGTTCAATTCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGGG-GTTTCTTACTATCCAATGCAAATATGTTTTGAA---TAAACG-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGG
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gi|8                          : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTG---TTG-TTGTTGTT----
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): ATGCTCTCAGACTATTGGAACTGGAAGATATACTGAAAATGTAGCACGTGTGCAACGCAGTTACTTACAATTTAACATGTATATGGTAGAAACGCGGGTATATCAATTTCTATCGGTTGTCGTAAGTATAGAGAACTCTGTCAAATATATTTTAAACGTTAATATTGCCATTAGCCTAATTCGATTACATTTGAAGGTGTCCTTCAGATGCACAAAAACACGATAGACCATTTATCCAAAATTTATATATTTTGTCCTCCCTCTCAGAGTAAATACATGATTTCTGGCGTCATGATCAGTCTTATAATTGTAGCTAAATATTAA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTCTATTGGTATGTCCAAAGTTAGAGAACTTGCTCATAAATAATTAAAACATTATTATTGCCATTGGCCTAATTTGAATAAATTTGAAATAAAATGGCCTCCCAATGCTAATAAACAATTGATCGAAACTGACATATTTTGCCTTCAAACTAACTGTAAATACTTATCTTTCAGACATCATGACTTATAGTTGCAGAAAATTGATAAATTAATAACACAACTATGATAGTTAA
Unaligned ( gi|20 ): AATTTTATGTATTTTGCCTTCAAACTTAGAGTAAATACCTAACTTTCAGACAACATGACTTATAATTGCAGAAAAATTGATACATTTATAATATAACTATGATTGTTAAATAGTATTAAACAAATTACTTCTTAACTTAATTTACCTCTGTGATA
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Reference ( family-768 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTT----ACTATGTTTTTTTT---GTGAAANNCATCCATTATCCATA-AT-TTTTTT--ATGATACTTCTAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTGTGATAATTTTTTTCAGATTATGGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTAATACAACTGGTAAATCATGATATANTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCTGCANTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------GTACTGGTTTTGCAACCACTTTCGGGTCGTGCTTAGTTCNAAT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--T--TTAATTA----T------TT---------A---GTTT-CTCAACAAATTATGTTATTNT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGATTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTNNAATATAGCTTCAAGACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTANGCAATGCAAATATGTTT---A---T-AACG-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCNGTAATTTGGGG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAA--TAAAATA-TGT-TTGT--TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                     atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAA--C-AAA-A-TAT-TTAT--TTG-T--TTGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAA--TTAAA---TAT-CCGT--TTG-T--TTGTT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                           acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaACACGCACTAGCTGCTTCAT--GCCTTAGCTAAAA-AGTGT-TTG---TTG-T--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actttacctcaaactcggagtagatactaagctttcagtcatcattatagtaaattattaaaacaataacattactatggttgttaaattcttggaatgaaatatatcaaatcactatttattaactaaattcacttctctgatatcattattgtcatgtttatctttattgttgtattatttgtgtaatctatcaATATTTG-AATACAATGTACAATG--ATAATATGGTATCA-------TCCTTACAGTAAAATG-------TCCATCTTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttatagtttgtttcaaaacattgatgctcactattatcattgttacgatactaTTATTAGGCATA-AAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAAgaacaacacattacatatcaaataaagat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TAT-TTGT--TTATT--TTGTT----aatatttgtttattttgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTGTAACTATGTATTTTTT---GTGAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT-CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAAAATAGTAGTC---AAGAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGCATGCAGCATTTATT---CATA-AAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGA-------------AT-------------TTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAAATATGTTT---GCATT-AATGAAATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGGt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGA--T-CAG-A-TAT-GTGT--TTG-T--TT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAA--T-GAA-A-TAT-TTTT--TGG-T--TT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGTTGTTA-T--TTGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgataatcttattttcatgttttcattgttgtaatattcgtgtggactataaCACGCAAGTTCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAGTG-TGT-GTGT--TTG-T--TTGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAA--TA-AA-A-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataatatttatgtgggctataaCACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCGTAA--TAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ATTATGCTTATTTC----TGAAACGCATCCTTTATCAA-A-ATATTTTTT--ATGACACTTCCAACGTGAATTGATTATTTAAGTAAACTG--ATTATTTTTT-CAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTTCACAGTAATACAACTGGTAAATCATGGTGTACGAACAC-----------------------TTTCATTTTAA------------TATA---------TTGATATATATCAATGTTACATTAATGTATATAGATGTAACATTAATG---TATATAAATGTAA-CATGTAC-----ATGCTGAAGTT--T--GAGTGGA-------------ATCTGGCTTTTTTTGGTACCGATTTCGCAACCACTTTTTGGCTGTATTTAGTTCCCATTGACTTTTGGCAGTGTTATTGTATT--TTAATTA----CATGTAATT---------ATAAGTTT-CCCAGCAAATTACGTTATTGT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGTTTAGATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCATAACCCATCCTTATAGTACAATGACGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACCAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GATTCTTACTAAGCAATGCTAATATG-TT---A---T-GAC----T-----TATTACAAATGTTTTGATCAGTATGTCGGGGatgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgagACACGCAAGTATTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TATGTTGT--TTG-T--TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaAAGTGCTGTTATAT--GCGTTA--CAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ACTATGTTTTTTTTTTTGTGAAACGCATCCTTTATCCAAA-AT-TTTTTTTAATGACACTTCCAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTG-AATA--TTTTTTCAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTGATACAACTGGTAAATCATGATGTACAACCACTTTAAAATAGCAGTATTAAAGAGTATCATTTTAATATATTGATGTATATAAATGTAGCATTGATGTATATAAATGTAACATG--------TGCATGCTGCAGTT--T---CA-----GTGGAAACTGGCTTT-TTTAT-------------------------------------------------GTACTGGTTTGGCAACCACTTTCGGGTTGCGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGTCCT--TTAATTAAATAT------AT---------A---ATTTTCTCAACAAATTATGTTAATAT---AGCAGCCAGTGAAA-CGGGATTAAATTTATGAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCTAAACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCA----AAATCTGTT-----------ACA-AAT-----TAGTACAAATGTTTTGATCGGTAAGTTGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACGCAAGTTCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA---TAT-TTGT--TTG-T--TTG-------------------------------CATCCATTATCTATA-AC-TTTTTT--AAGATACTT-TAATGTAAATTTATTATTTAAATAAACTTTGATTATTTTTTTCAGATTATGA----CTTCATACATCAACACTAAATTACACAGTAATATAACTGGTAAATCATTATATAATAATACCTTAAAATAGTAGTC---AATAGTTTCATTTTAA-----------ATATA---------TCAATGTATACAAATGTAACATGACTAT-TGTGTATGCTGCAATTATT---CATA-AAATGGGA-TTTGAGTTATTTATACCCAAATCAAATGGAGTGGAAACTTGCTTTTTTAT-------------GTACTCGTTTTACAATAACTTTTTGGTCGTGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-TCAG----AT------------CTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGTT-TTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGATTTTGTTTATAAT-TCGTGTGCAGTGCTTAAATTTAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAACGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGAAGATGGTGGTTCAATTCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGGG-GTTTCTTACTATCCAATGCAAATATGTTTTGAA---TAAACG-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagtACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCTGAA--TAAAA-T-TAT-TTGTA-TTG-TA-TTG
gi|8                          : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTG---TTG-TTGTTGTT----
gi|9                          :                                                                                      cgatttatatgtagatagtgaaggcgttgccgtaattggatttatcggttgtgtatttgtttcatctgtcttcgtcataaatattttaaacgttattattgtcattggcctaatttgagtaaatttgaaagtactatggcctcccaaggcacaaatacaataaacaattaatccgaatttatatagtatgccttccaccttagaatgaatacttagcatcagacttatatttgcgtaaattaataacataactaagaaaattgttaaattgtatttaaccaatatttattaaatttatttacttttctgataatcttattttcatgttttcactgttgtaatattggtatgggctataaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--TCCGAA--T-AAA-A-TAT-TTG---TTG-T--T


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Reference ( family-768 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTT----ACTATGT-TTTTTTT-T----GAAANNCATCCATTATCCATA-AT-TTTTTT--A-GATACTTCTAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTGTGATAATTTTTTTCAGATTATGGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTAATACAACTGGTAAATCATGATATANTAATACCTTAA----AATA-------GTA-GTC---AAGAGTTTCATT------T-TAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTATTGTGCATGCTGCANTTATT---CATAAAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGAA--------------GTACTGGTTTTGCAACCACTTTCGGGTCGTGCTTAGTTCNAAT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--T--TTAATTA----T------TT---------A---GTTT-CTCAACAAATTATGTTATTNT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGATTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTNNAATATAGCTTCAAGACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTANGCAATGCAAATATGTT--T-------AC-------G-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCNGTAATTTGGGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAATGCTGTTTTAT--GTCTAA--TCAAA---TAT-TTGT--TTG-T--TT--------CTATGT-TTTTTTTGT----GAAAACTATCCATTATCCATATAT-TTGTTT--A-GATACTT-TAATGTGAATTTATTAATTAAGTAAACTGTGATAATTTTTT-CATAGTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAATAATACCTTAA----AATA-------GTA-GTC---AAGAGTTTCATT------T-TAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTATTATGCATGCTGCAATTATT---CATAAAATTGGA-CTGGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGGAT-------------GTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTTGTTCAAAT-GGCTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGTTTTTTTTTCAGCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-AAGTGTGCAGTGCTTAAATGTATCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGTAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAACTATGTT--TTGAATTAAT-------GAAATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTTATTTGGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaTTTTGCAACAACTTTCGGGTTGTGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGT--TCTTTAATTA----T------TTTCAAATGTCA---GGTT-CTCAACAAATGATGTTATTAT---AGCAGCCAGTGAAAATAGGATTATATTTAGACT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCCATTTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCAATGCAAATCTGTTTGT-------AC-------G-AA---------------TGTTTTGATCAGTAAca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACACAAGTGCTGTTTTAT--GACTAA--Tg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         ataataaacaatatatcgaaatttatatagtttgccttcagacttaaaggcattaagcattatagtaaatacttagttttcagacaccatgatcaaactaccgatttcagtaaattacatgtaataaattaacaacacagctttgatggttaatttgtattaaaacagtatttattaactttatttactcctctgataatcttattttcatgttttgactatactgttacaatatttcattgactttaaCAAGTGCTGATTTAT--GCCTAA--TAAAATA-TGT-TTGT--TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                     atggcctcccaaatgcacaaaaacaataaaacaatttatcgaaatttatacattatgctttcagactaaatatttcactttcaaataacataacttataacttcagaaaattaaaaacttattaacacaactatgattgttaaattgtattaaactaaaagttattaacttgttttacttctctggtaaacttctttacatgttttccctatactgttgtaacattaacaacACACGCAAGTGCTGTTTAAT--GCCGAA--C-AAA-A-TAT-TTAT--TTG-T--TTGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                 atggcctcccaatgcacaaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaattttgaacgaatactattgaaaaaaagcattagactaatatttgcagtaaatcaatagcataactatgatatttaaccaatatttattaacattatttacttctctgatgatcttattttcatgttttcactgttgtaatatttgtgtgggctataaATACGCAACTACTGGGTTATTTGCCTAA--TTAAA---TAT-CCGT--TTG-T--TTGTT----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                           acaataaacactatattaaatttgttaactatactttcaatctaagagaaaaaatactttcagacaccatgacacataattgcagaaaatgtatcaataatataactatcattgttaaattgtattatacttactaagaatatacattactttacaataaacttatggttatgttttaactataaggttgcaaatttatgttgactatcaACACGCACTAGCTGCTTCAT--GCCTTAGCTAAAA-AGTGT-TTG---TTG-T--T
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actttacctcaaactcggagtagatactaagctttcagtcatcattatagtaaattattaaaacaataacattactatggttgttaaattcttggaatgaaatatatcaaatcactatttattaactaaattcacttctctgatatcattattgtcatgtttatctttattgttgtattatttgtgtaatctatcaATATTTG-AATACAATGTACAATG--ATAATATGGTATCA-------TCCTTACAGTAAAATG-------TCCATCTTTTAAGATGGAAGTTGTTGGCTCAATTCCAATTTAGAATAAT---TTGAAGAGTTTCTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttatagtttgtttcaaaacattgatgctcactattatcattgttacgatactaTTATTAGGCATAAAACAGCA-CTTGCATT-TTTATAGCCAAgaacaacacattacatatcaaataaagat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgATGCAAGTGCTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TAT-TTGT--TTATT--TTGTT----aatatttgtttattttgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataccttttagcatcacccgtacacnnnnnnnnnngtaataacatagtataacttttagcatcacccatacactaccaatgttcattaacatgatagtcttagtttcatgaattcccttttgtaatatttgtgttggctataaaaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA-A-TAT-TTGT--TTG-T--TTGTTTGTAACTATGTATTTTTTG-T----GAAAACTATCCATTTTCCATA-AC-TTTTTT--A-GATACTTTTA-TGCGGATTTATTAATTAAGTAAACTATGATAATATTTT-CATATTATGG----CTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAG-AATACAACTGGTAAGTCATGATATAGTAATACCTTAA----AATA-------GTA-GTC---AAGAGTTTCATT------T-TAA-----------ATATA---------TTAATGTATACAAATGTAACATGACTATTGTGCATGCAGCATTTATT---CATAAAATGGGA-CTTGCATTATTTATACCCAAATCAATAGGAGTGGAAT-------------TTACTGGTTTTGCAATCACTTTTGGGTCATGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-GCAG----------------AATTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGCTTTTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGGTTATATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTTAAATGTAGCTTCAAGATGCATCCTCATAGTACATTGAAGTACATCAATCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATTCCAACTACGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACAATGCAATGCAAATATGTT--T-------GCATTAATGA-AATGAAAGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGTGGt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACGCAAGTGCTG--CTAT--GCCCGA--T-CAG-A-TAT-GTGT--TTG-T--TT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgaatatttcacaaatcgaaattgttaaaacattatactttaagtaatacccttattgatatatctgtgtattgtaatgttggctataaACACGCAAGTGATGTTTTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcaaatctaagcagtacataatactaataatactattctgttttcatgttttcactattgtaatatttgtgtgggctataaACACACAAGTGATGTTTTAG--GCCTAA--T-GAA-A-TAT-TTTT--TGG-T--TT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtaacttctctgataaccttattttcatgttttcactatactgttgtaatatttgtgtcggctataaaACATGCAGGTGCTGTTTTAT--GGCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGTTGTTA-T--TTGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgataatcttattttcatgttttcattgttgtaatattcgtgtggactataaCACGCAAGTTCTGTTTTAT--GCCTAA--TAAAGTG-TGT-GTGT--TTG-T--TTGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcactgttgtaatatttgtgttgcctataagACACGCAACTGCTGTTCTAT--GACTAA--TA-AA-A-TAT-TTGT--TTG-T--T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attgtaatatttgtgttagctatcaACACTCAGGTGCTGTTTTAT--GCCAAA--TAAAA-T-TAT-TTGa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataatatttatgtgggctataaCACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCGTAA--TAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ATTATGC-TTATTTC-T----GAAACGCATCCTTTATCAA-A-ATATTTTTT--ATGACACTTCCAACGTGAATTGATTATTTAAGTAAACTG--ATTATTTTTT-CAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTTCACAGTAATACAACTGGTAAATCATGGTGTACGAACACTTTCATTTTAATATATTGATATATATC---AAT-GTTACATTAATGTATATAG-----------ATGTAACA------TTAATGTATATAAATGTAACATG-------TACATGCTGAAGT--TT-------GAGTGGAA-TCTGGCTTTTTT-------------------TGG-----------------TACCGATTTCGCAACCACTTTTTGGCTGTATTTAGTTCCCATTGACTTTTGGCAGTGTTATTGTATT--TTAATTA----CATGTAATT---------ATAAGTTT-CCCAGCAAATTACGTTATTGT---AGCAGCCAGTGAAAACGGGTTTAGATTTATAAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCATAACCCATCCTTATAGTACAATGACGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACCAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GATTCTTACTAAGCAATGCTAATATG-T--T-------AT-------G-ACT-----TATTACAAATGTTTTGATCAGTATGTCGGGGatgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgagACACGCAAGTATTGTTTTAT--GCCTAA--T-AAA-A-TATGTTGT--TTG-T--TT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaAAGTGCTGTTATAT--GCGTTA--CAAAA--------TAT--TTG-T--TTGTT----ACTATGT-TTTTTTT-TTTGTGAAACGCATCCTTTATCCAAA-AT-TTTTTTTAATGACACTTCCAACGTGAATTTATTATTTAAGTAAACTG-AATA--TTTTTTCAGATTGTAGAGCTCTTCATGCAACAAAACTAAATTACACAGTGATACAACTGGTAAATCATGATGTACAACCACTTTAA----AATA-------GCA-GTATTAAAGAGTATCATT------T-TAATATATTGATGTATATAAATGTAGCATTGATGTATATAAATGTAACATG-------TGCATGCTGCAGTT--T---CA----GTGGAAACTGGCTTT-TTTAT------------------------------------GTACTGGTTTGGCAACCACTTTCGGGTTGCGTTTAGTTCCATT-GACTTTTGGCAGTGTTATTGTCCT--TTAATTAAATAT------AT---------A---ATTTTCTCAACAAATTATGTTAATAT---AGCAGCCAGTGAAA-CGGGATTAAATTTATGAT-TAGTGTGCAGTGCTGTAATATAGCTTCTAAACGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTT-AAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGAG-GCTTCTTACTAAGCA----AAATCTG-T--T-------AC-------A-AAT-----TAGTACAAATGTTTTGATCGGTAAGTTGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACGCAAGTTCTGTTTTAT--GTCTAA--TAAAA---TAT-TTGT--TTG-T--TTG---------------------------------CATCCATTATCTATA-AC-TTTTTT--AAGATACTT-TAATGTAAATTTATTATTTAAATAAACTTTGATTATTTTTTTCAGATTATGA----CTTCATACATCAACACTAAATTACACAGTAATATAACTGGTAAATCATTATATAATAATACCTTAA----AATA-------GTA-GTC---AATAGTTTCATT------T-TAA-----------ATATA---------TCAATGTATACAAATGTAACATGACTATTGTGTATGCTGCAATTATT---CATAAAATGGGA-TTTGAGTTATTTATACCCAAATCAAATGGAGTGGAAACTTGCTTTTTTATGTACTCGTTTTACAATAACTTTTTGGTCGTGCTTAGTTCAAAT-GACTTTT-TCAG----AT------------CTA----T------T--------------GTTT-CTCAACAAATTATGTT-TTTT---ATCAGCCAGTGAAAACAGGATTTTGTTTATAAT-TCGTGTGCAGTGCTTAAATTTAGCTTCAAGATGCATCCTTATAGTACAACGAAGTACATCCATCTTT-AAGATGGAAGATGGTGGTTCAATTCCAACTAAGGAT-ATCTGTTGGGG-GTTTCTTACTATCCAATGCAAATATGTT--TTGAATAAAC-------G-AATGAAGGTAGTAAAATTGTTTTGATCTGTAATTTGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagtACACGCAAGTGCTGTTTTAT--GCTGAA--TAAAA-T-TAT-TTGTA-TTG-TA-TTG
gi|8                          : ttttaactttcatcacattatcttgccattgaaactggaagatatacaaatgtatcacacgcttaacgaatctgcttacaacgtaacatgaacagggtagaaaacgattatccttttctattgacacgtccttagaacagagaacttcgccataactattttaaacgttgttattatcattggctttatttgaataaatttaaaaagttttatggcctcccaatgcataaagacaataaacaatttatccaaatttatatattttgccttccaacttcgaatgaatagttagcatcagacttatatttgcagtaaattaatgaattaataacacaactatgataattgttacaatgcatttaaccaatatgtattaattttatttacttctctgataatcttattttcataatttcactgttgtaatatttgtgtgggctattaACACGCAAGTACTGCTGTAT--GCCGAA--TAAAA-T-TAT-TTG---TTG-TTGTTGTT----
gi|9                          :                                                                                      cgatttatatgtagatagtgaaggcgttgccgtaattggatttatcggttgtgtatttgtttcatctgtcttcgtcataaatattttaaacgttattattgtcattggcctaatttgagtaaatttgaaagtactatggcctcccaaggcacaaatacaataaacaattaatccgaatttatatagtatgccttccaccttagaatgaatacttagcatcagacttatatttgcgtaaattaataacataactaagaaaattgttaaattgtatttaaccaatatttattaaatttatttacttttctgataatcttattttcatgttttcactgttgtaatattggtatgggctataaACACGCAAGTGCTGTTTTAT--TCCGAA--T-AAA-A-TAT-TTG---TTG-T--T
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTATATACTTTCATCGCATGATCTTACCATTGATTTTGGAAAATATACAATTGTAAATGTAGCAATCGCTCAACGAACCTGCTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCATAAATATGTTAAACATTATAATTGTCAATGGCCTTATTTGAATACATTTAAAAATATTATGACCTCCCATTCTACAAGGACAATAAACAATCTATCCAAATTTATATATTTTGCCTTCCAACTTAGAATGGATACTTAGCATCAGACTTATACTTGCAGTAAATTAATAACATAACTATGATAGTTGTTAAATTGTATTAAACCAATATTTATTAACTTTATTTACTTCTCTGATAATCTTTATTTCATGTTTTCACTGTTATAATATTTGTGTTGGTAATAAACATGCAAGTGCTGTT
Unaligned ( gi|10 ): ATGCTCTCAGACTATTGGAACTGGAAGATATACTGAAAATGTAGCACGTGTGCAACGCAGTTACTTACAATTTAACATGTATATGGTAGAAACGCGGGTATATCAATTTCTATCGGTTGTCGTAAGTATAGAGAACTCTGTCAAATATATTTTAAACGTTAATATTGCCATTAGCCTAATTCGATTACATTTGAAGGTGTCCTTCAGATGCACAAAAACACGATAGACCATTTATCCAAAATTTATATATTTTGTCCTCCCTCTCAGAGTAAATACATGATTTCTGGCGTCATGATCAGTCTTATAATTGTAGCTAAATATTAA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTCTATTGGTATGTCCAAAGTTAGAGAACTTGCTCATAAATAATTAAAACATTATTATTGCCATTGGCCTAATTTGAATAAATTTGAAATAAAATGGCCTCCCAATGCTAATAAACAATTGATCGAAACTGACATATTTTGCCTTCAAACTAACTGTAAATACTTATCTTTCAGACATCATGACTTATAGTTGCAGAAAATTGATAAATTAATAACACAACTATGATAGTTAA
Unaligned ( gi|20 ): AATTTTATGTATTTTGCCTTCAAACTTAGAGTAAATACCTAACTTTCAGACAACATGACTTATAATTGCAGAAAAATTGATACATTTATAATATAACTATGATTGTTAAATAGTATTAAACAAATTACTTCTTAACTTAATTTACCTCTGTGATA
Unaligned ( gi|25 ): TTTATCAATTAAGCTATAAACGAAAATACATTATTATTTGTTAAGTTATACACAAAGGACTTTTTGTCTCTTTTTAATTAAAAAT
Unaligned ( gi|29 ): ACATTGATGTAACATAAATGCAGCATGGATGTAACACGGATGTAATATGTG