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Reference ( gi|7 )            :                                                                                                                                                                                                                               AACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTATA--TTTTCAATAAAT--AATT-TA----A----GTGAATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CT----AAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAG-TCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TATAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACTGAATAACAATATGTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               AACAGTAAAACATTGCAAGATATCAAATTAAAACATTATA--TTTAAAATAATT--AAAT-TC----A----GTGAATA--AAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAATCT--T--CATT-T---CT----TAGCATAAAAGCTTCAA-AAATATATCTTCAT--GTATTACGCACTAG-C-----------AGATGAAGC-TAGATTTATAAATAAAATGATAGTGGGAAATTA--TGTA--TTGTTATATACTTAGTT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                               AACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTACA--TTTTCAATAATT--CAAT-TC----A----GTGAATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCAAGCGTGAaa
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gi|3                          :                                                                                                                    aatcagtttcagttttattgaccaaactgctagtagccattaacaatgtatatcaaaacaaataccgcatgtatatacattatatatacataggttatagacacgtaAACAGACAAACATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTACA--TTTTAAATATTT--CAAT-TC----A----GTGAATA--TAGTT----CAGAAGC
gi|13                         : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataAGCGGTTTAACATTGTAAAACTTCAAGTCTAAACTTTAAA--GTTTTAATAACTT-AATTCTA----------TGAATATCTAATTCTAAAACAAATAG---------TCTTTGTATTAAAAGTAGTAGT-TT-TTCCCT----TAGCATAAAAGCTGCAGAAAATATACTTTGCT--GTTTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                               AACAGTCAAACATCGCAAGATATCAAATCTAGA-ATTACA--TTTTAAATATTT--CAAT-TC----A----GTGAATA--TAGTT----
gi|9                          :                                                                                                                                                 gttcagttttattggcataacgacattacacagttgcctatggcatacaccatataaacataggtacatgaactcgtaAACAGTCAAACAATGT-ATGTATCGAATATA-ACATTATC--GTTTTAATGTTTT-AATT-CA---------GTTAACA--TATTT----AAGAAGCAA---------TCAACG-ATTCACGATATT--T-AT-T---TT-----AGCATAATTGTCTCAG-TA
gi|5                          :                                                                                                                               tagcatttcaatttcaatgttataacaatggccactgcatatgaaaataactattgcataaaaacacaagatttatacataatagacacattattaAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTACA--TTTTCA----AT--AATT-CA----AATCCGTGAAT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-----------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA--TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAAT
gi|15                         :                                                                                                                         tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtACAGTTAAATATTGTAAGATATCAAATCTAAATATT---------CAAT-----------TA----A----GCGAATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCAGTGTATTCAAGGTACT--A-TT-T---CT----TAGCGTAAAAGCCTTAG-TAATGTATTTTGAT--GTATTACGCACCAG-TGTTTTTTTTGTAGATtttac
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                ACATTTAAACATTGTACGATATCAAATCTAAACTTTACA--TTTT-------T--AATT-TA---------GTGAATA--CAGTT----CAGAAGCAG---------TCATTGTATTAAAGCTTGT--T-TT-T---AT----AAGCATAAAATCCTTAG-AAATAAATCTTGAT--TTGTT----TTTAGAT--TTTATTTGTATGTGAAAC-TAGATTTATACATTTACTGGCAGTCGGAAATGAACTCCCT-TTTCTA-ACATTTAGTT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                ATAGTCAAACATTGTTACGTATCAAATTTAAACATGACA--TTTTCAA-AAATTCAATT-CA---------GTGAATA--TATTA----AATAAGCAG---------TCATTATCTTCAATGAAGT--T-TT-T---AT----A
gi|24                         :                                                                                                                                          aagtttgacatttaaattctattggtatgacggacagtgaagatatgtctatggccacttacaatatatcaaatcaaatatggcattCAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTATA--TTTTCAATAAAT--AATT-TA----A----GTGAATA--TAGTT----Atttataatgtattacactaacgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                 CAGTCAAATATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTATA--TTTTCAATAATT--CATT-TA----A----ACGAATA--TAGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                 CAGTCGAACATTGCAAGAGATCAAATCTAGACATTGCA--TTT----TAAAT--ATTT-TAATTCA----GTGAATA--TAGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                   GTCAAATATTGTAAGATAACAAATCTAGACATTATA--TTTTCAATAATT--CATT-TA----A----GTGAATA--TAGT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                       AACATTGTCAGACATCATATCTAGACATTACA--TTTTTAATAATT--CAAT-TC----A----GTCAATA--TAGTT----Aga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                  ATATCAAATCTAGACATTATA--TTTTCAATAATT--CATT-TA----A----GTGAATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAAGTAGT--T-TT-T---CT----TAGCGTAAAAGCCTCTG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAG-TCGTTTATTTGTAGATGAAAA-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTTGGAAATTA--TATAG-TTTTTAGATACC---TTACAAATAATAA-------CATAA--TTTAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAATAATT--CAAT-TC----A----GTGAATC--TATTT----AAGAAGCA----------TCATTATATTCAATGCAGC--T-TT-T---aaattcgaatttctctttcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAAGTCT---------TCATTTT-TTCAA---AGT--T-TT-T---CT----TATCACAAACGACTCAG-AAATATATATTGAT--GTATTACACACAAG-TATTTTATGTGTAGATGACAT-TATGTTTATAAATTTTTTGATAGTAGGAAAT----TGTCT-TTTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gAATGTAGT--T-TTGT---C--------CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAG-TATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TATATATTTTAAAATATTTAATTtttaaattaattatttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                agcatagataatagaagtatatacagtcagacatattaaatatacatcaaatttcaataattttactccggttatatatattatgaAAAACCCCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAG-TCTTTTATTTGTAGATGAGAC-TAGATTTATAAATTTACTGACAGTGGGAAATGA--TATAT-ATTTAAAATATTTAGTTctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TCAGTTCCAGTTTTATTAACAAAACGGCAACATGCTGATTTAAACAAATATGGATTATGGACACAAACAGTCAAACAGTGATATCAAATCGATATATTACAATAATTCAATTCAACGGATATAG
Unaligned ( gi|18 ): ATTTTCAGTCTTATTGTCATAACGACGATACACAATTGACCATTAACAATGAATATTTAATTAAATATAGAATAAACATACACTATATAAACAAAGGTTATAGACTCCTAAACAG
Unaligned ( gi|30 ): CAGCACACTGCAGTACGTAATCGAAACTGAAATT






Alignments
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Reference ( family-732 )      :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTCAATAA-TTN-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAANGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTATTTTATTTGTAGATGAAAC-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTNGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAAATATTTAGTTACAAATAATAA-------CATAA--TTTAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                               ACATTTAAACATTGTACGATATCAAATCTAAACTTTA-CA--TTTT--------TA-ATT-TA----GTGA-ATA--CAGTT----CAGAAGCAG---------TCATTGTATTAAAGCTTGT--T-TT-T---ATAAGCATAAAATCCTTAG-AAATAAATCTTGAT--TTGTT----TTTAG-ATTTTATTTGTATGTGAAAC-TAGATTTATACATTTACTGGCAGTCGGAAATGAACTC-CCT-TTTCT-AACATTTAGTT-CGTATAGTAA-------TGTA
gi|10                         :                                                                                                                                   ccagtttcagttttataggcataacgacgatacataattgtctattgtatttacaatgtatggcgtacaatatatacaaaaatgttatacacATAGTCAAACATTGTTACGTATCAAATTTAAACATGA-CA--TTTTCAAAAA-TTC-AAT-TCA---GTGA-ATA--TATTA----AATAAGCAG---------TCATTATCTTCAATGAAGT--T-TT-T---tataagtgatattatgaattaacaacgtagtttat
gi|11                         :                                                                                                                                       aagtttgacatttaaattctattggtatgacggacagtgaagatatgtctatggccacttacaatatatcaaatcaaatatggcattAACAGTCAAGCAGTGCAAGATAGCAATTCTAGACATTC-CA--TTTTCAATCT-TTT-AAT-TCA---GCGG-ATA--TAGAT----AAGAAACAG---------TCATTGTATTCGAGGatatttataatgtattacactaacgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   aatcagtttcagttttattgaccaaactgctagtagccattaacaatgtatatcaaaacaaataccgcatgtatatacattatatatacataggttatagacacgtaAAAACCCCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCTTTTATTTGTAGATGAGAC-TAGATTTATAAATTTACTGACAGTGGGAAATGA--TA-TAT-ATTTAAAATATTTAGTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                          cattAGCGGTTTAACATTGTAAAACTTCAAGTCTAAACTTTA-AA--GTTTTAATAACTTA-ATTCTA-----TGA-ATATCTAATTCTAAAACAAATAG---------TCTTTGTATTAAAAGTAGTAGT-TT-TTCCCTTAGCATAAAAGCTGCAGAAAATATACTTTGCT--GTTTTcttattgttctatatgagtaatgaccatgacatgtaaaacaatttat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAAGTCT---------TCATTTT-TTCAA---AGT--T-TT-T---CTTATCACAAACGACTCAG-AAATATATATTGAT--GTATTACACACAAGTATTTTATGTGTAGATGACAT-TATGTTTATAAATTTTTTGATAGTAGGAAATTG--TCTTTT-TTTTTAAA---TTAATTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                              gACAGTTAAATATTGTAAGATATCAAATCTAAATATT----------CAAT-----------TAA---GCGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCAGTGTATTCAAGGTACT--A-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTTAG-TAATGTATTTTGAT--GTATTACGCACCAGTGTTTTTTTTGTAGATtttt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATCGCAAGATATCAAATCTAGA-ATTA-CA--TTTTAAATAT-TTC-AAT-TCA---GTGA-ATA--TAGTT----
gi|17                         :                                                                                                                                                gttcagttttattggcataacgacattacacagttgcctatggcatacaccatataaacataggtacatgaactcgtaAACAGTCAAACA--GT--GATATCAAATCGATATATTA---------CAATAA-TTC-AAT-TCA---ACGG-ATA--TAG
gi|19                         :                                                                                                                                                             tcagttccagttttattaacaaaacggcaacatgctgatttaaacaaatatggattatggacacaAACAGTCAAATATTGTATGATATCAAATATCGACATTA-TATTTTTTCAGTAA-ATT-AAT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----AAGAAG-AG---------TAATTGTATTCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                             aAACAGTAAAACATTGCAAGATATCAAATTAAAACATTA-TA--TTTAAAATAA-TTA-AAT-TCA---GTGA-ATA--AAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAATCT--T--CATT-T---CTTAGCATAAAAGCTTCAA-AAATATATCTTCAT--GTATTACGCACTA-----------GCAGATGAAGC-TAGATTTATAAATAAAATGATAGTGGGAAATTA--TG-TA--TTGTTATATACTTAGTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                      agcataggtaataaatagactcataACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTGGACATTA-CA--TTTTAAATAA-TTC-AAA-TCA---GTGA-ATA--CAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTCCATTtttttattctatatttgggacaaaataaacccctgattcaacaacaattaaggaacataatttacaaattcgattccctctttctac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-TTC-ATC-GAA---GCGA-ATA--TAGCT----A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTAAGATATCAAATCTAAACATAA-TA--TTTTCAGTAC-TTC-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-ATA-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-ATA-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----Aaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCGAACATTGCAAGAGATCAAATCTAGACATTG-CA--TTTTAAATAT-TTT-AAT-TCA---GTGA-ATA--TAGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                  GTCAAATATTGTAAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-TTC-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-TTC-ATT-TAA---ACGA-ATA--TAGTga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                      AACATTGTCAGACATCATATCTAGACATTA-CA--TTTTTAATAA-TTC-AAT-TCA---GTCA-ATA--TAGTT----A
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAATAA-TTC-AAT-TCA---GTGA-ATC--TATTT----AAGAAGCA----------TCATTATATTCAATGCAGC--T-TT-T---
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGACAAACATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTAAATAT-TTC-AAT-TCA---GTGA-ATA--TAGTT----CAGAAGC
gi|4                          : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataACAGTCAGACAT--------ATTAAATATA--CATCA-AA--TTT-CAATAA-TTTTACT-CCG---GTTATATA--TA-TT----ATGAA-------------------------ATGTAGT--T-TTGT---C----CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAGTATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TA-TATATTTTAAAATATTTAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                        agcatagataatagaagtatatAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTA-CA--TTTTCAATAA-TTC-A----AATCCGTGA-AT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA-TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAATctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
gi|6                          :                                                                                                                       tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtAACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTA-CA--TTTTCAATAA-TTC-AAT-TCA---GTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCtttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tAACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-ATA-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CTAAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACaagcgtgacttatctaataaagacttttttttagaatttcgctaatattaatgtatattcaaaataaaatacatactccagcacaactatattatcgatgtaattgatagactttttattcacaaataattgcatttgattacattttctttcttttttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                 ATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAA-TTC-ATT-TAA---GTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAAGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCTG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAA-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTTGGAAATTA--TA-TAG-TTTTTAGATACC---TTACAAATAATAA-------CATAA--TTTACtgaataacaatatgta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-732 )      :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-ANTTNAGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAANGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTNTTTTATTTGTAGATGAAAC-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTNGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAAATATTTAGTTACGAATAATAA-------CGTAAATTTTAC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAGTCT---------TCATTTT-TTCAA---AGT--T-TT-T---CTTATCACAAACGACTCAG-AAATATATATTGAT--GTATTACACACAAGTATTTTATGTGTAGATGACAT-TATGTTTATAAATTTTTTGATAGTAGGAAATTG--TCTTTT-TTTTTAAA---TTAATTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                              gACAGTTAAATATTGTAAGATATCAAATCTA-----------------AATA-TTC-AATTAAGCGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCAGTGTATTCAAGGTACT--A-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTTAG-TAATGTATTTTGAT--GTATTACGCACCAGTGTTTTTTTTGTAGATtttt
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gi|17                         :                                                                                                                                                gttcagttttattggcataacgacattacacagttgcctatggcatacaccatataaacataggtacatgaactcgtaAACAGTCAAACA--GT--GATATCAAATCGATATATTA-CA--------ATAATTC-AATTCAACGG-ATA--TAG
gi|19                         :                                                                                                                                                             tcagttccagttttattaacaaaacggcaacatgctgatttaaacaaatatggattatggacacaAACAGTCAAATATTGTATGATATCAAATATCGACATTA-TATTTTTTCAGTAAATT-AATTAAGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAG-AG---------TAATTGTATTCA
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gi|4                          : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataACAGTCAGACAT--------ATTAAATATA--CATCA-AA--TTT-CAATAATTTTACTCCGGTTATATA--TA-TT----ATGAA-------------------------ATGTAGT--T-TTGT---C----CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAGTATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TA-TATATTTTAAAATATTTAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                        agcatagataatagaagtatatAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AAATCCGTGA-AT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA-TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAATctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
gi|6                          :                                                                                                                       tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtAACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTCAGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCtttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tAACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTAAGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CTAAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACaagcgtgacttatctaataaagacttttttttagaatttcgctaatattaatgtatattcaaaataaaatacatactccagcacaactatattatcgatgtaattgatagactttttattcacaaataattgcatttgattacattttctttcttttttt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTTTCAGTCTTATTGTCATAACGACGATACACAATTGACCATTAACAATGAATATTTAATTAAATATAGAATAAACATACACTATATAAACAAAGGTTATAGACTCCTAAACAG
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Reference ( family-732 )      :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAANGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTNTTTTATTTGTAGATGAAAC-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTNGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAAATATTTAGTTACGAATAATAA-------CGTAAATTTTAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                              gACAGTTAAATATTGTAAGATATCAAATCTA-----------------AATA-TTC-AATTA--AGCGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCAGTGTATTCAAGGTACT--A-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTTAG-TAATGTATTTTGAT--GTATTACGCACCAGTGTTTTTTTTGTAGATtttt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATCGCAAGATATCAAATCTAGA-ATTA-CA--TTTTAAATATTTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----
gi|17                         :                                                                                                                                                gttcagttttattggcataacgacattacacagttgcctatggcatacaccatataaacataggtacatgaactcgtaAACAGTCAAACA--GT--GATATCAAATCGATATATTA-CA--------ATAATTC-AATTC--AACGG-ATA--TAG
gi|19                         :                                                                                                                                                             tcagttccagttttattaacaaaacggcaacatgctgatttaaacaaatatggattatggacacaAACAGTCAAATATTGTATGATATCAAATATCGACATTA-TATTTTTTCAGTAAATT-AATTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAG-AG---------TAATTGTATTCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                             aAACAGTAAAACATTGCAAGATATCAAATTAAAACATTA-TA--TTTAAAATAATTA-AATTC--AGTGA-ATA--AAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAATCT--T--CATT-T---CTTAGCATAAAAGCTTCAA-AAATATATCTTCAT--GTATTACGCACTAGC-----------AGATGAAGC-TAGATTTATAAATAAAATGATAGTGGGAAATTA--TG-TA--TTGTTATATACTTAGTT
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                  GTCAAATATTGTAAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AACGA-ATA--TAGTga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                      AACATTGTCAGACATCATATCTAGACATTA-CA--TTTTTAATAATTC-AATTC--AGTCA-ATA--TAGTT----A
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGACAAACATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTAAATATTTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----CAGAAGC
gi|4                          : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataACAGTCAGACAT--------ATTAAATATA--CATCA-AA--TTT-CAATAATTTTACTCC--GGTTATATA--TA-TT----ATGAA-------------------------ATGTAGT--T-TTGT---C----CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAGTATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TA-TATATTTTAAAATATTTAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                        agcatagataatagaagtatatAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AAATC--CGTGA-AT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA-TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAATctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
gi|6                          :                                                                                                                       tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtAACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCtttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tAACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CTAAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACaagcgtgacttatctaataaagacttttttttagaatttcgctaatattaatgtatattcaaaataaaatacatactccagcacaactatattatcgatgtaattgatagactttttattcacaaataattgcatttgattacattttctttcttttttt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACAATGTATG-TATCGAATATA-ACATTATCG--TTTT-AATGTTTT-AATTC--AGTTA-ACA--TATTT----AAGAAGCAA---------TCAACG-ATTCACGATA-T--T-TA-T---TTTAGCATAATTGTCTCAG-aaattcgaatttctctttcta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-732 )      :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAANGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTNTTTTATTTGTAGATGAAAC-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTNGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAAATATTTAGTTACGAATAATAA-------CGTAAATTTTAC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAAGTCT---------TCATTTT-TTCAA---AGT--T-TT-T---CTTATCACAAACGACTCAG-AAATATATATTGAT--GTATTACACACAAGTATTTTATGTGTAGATGACAT-TATGTTTATAAATTTTTTGATAGTAGGAAATTG--TCTTTT-TTTTTAAA---TTAATTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                              gACAGTTAAATATTGTAAGATATCAAATCTA-----------------AATA-TTC-AATTA--AGCGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCAGTGTATTCAAGGTACT--A-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTTAG-TAATGTATTTTGAT--GTATTACGCACCAGTGTTTTTTTTGTAGATtttt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATCGCAAGATATCAAATCTAGA-ATTA-CA--TTTTAAATATTTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----
gi|17                         :                                                                                                                                                gttcagttttattggcataacgacattacacagttgcctatggcatacaccatataaacataggtacatgaactcgtaAACAGTCAAACA--GT--GATATCAAATCGATATATTA-CA--------ATAATTC-AATTC--AACGG-ATA--TAG
gi|19                         :                                                                                                                                                             tcagttccagttttattaacaaaacggcaacatgctgatttaaacaaatatggattatggacacaAACAGTCAAATATTGTATGATATCAAATATCGACATTA-TATTTTTTCAGTAAATT-AATTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAG-AG---------TAATTGTATTCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                             aAACAGTAAAACATTGCAAGATATCAAATTAAAACATTA-TA--TTTAAAATAATTA-AATTC--AGTGA-ATA--AAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAATCT--T--CATT-T---CTTAGCATAAAAGCTTCAA-AAATATATCTTCAT--GTATTACGCACTAGC-----------AGATGAAGC-TAGATTTATAAATAAAATGATAGTGGGAAATTA--TG-TA--TTGTTATATACTTAGTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                      agcataggtaataaatagactcataACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTGGACATTA-CA--TTTTAAATAATTC-AAATC--AGTGA-ATA--CAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTCCATTtttttattctatatttgggacaaaataaacccctgattcaacaacaattaaggaacataatttacaaattcgattccctctttctac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-A--TCGAAGCGA-ATA--TAGCT----A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTAAGATATCAAATCTAAACATAA-TA--TTTTCAGTACTTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----Aaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCGAACATTGCAAGAGATCAAATCTAGACATTG-CA--TTTTAAATATTTT-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                  GTCAAATATTGTAAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AACGA-ATA--TAGTga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                      AACATTGTCAGACATCATATCTAGACATTA-CA--TTTTTAATAATTC-AATTC--AGTCA-ATA--TAGTT----A
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATC--TATTT----AAGAAGCA----------TCATTATATTCAATGCAGC--T-TT-T---
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGACAAACATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTAAATATTTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----CAGAAGC
gi|4                          : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataACAGTCAGACAT--------ATTAAATATA--CATCA-AA--TTT-CAATAATTTTACTCC--GGTTATATA--TA-TT----ATGAA-------------------------ATGTAGT--T-TTGT---C----CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAGTATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TA-TATATTTTAAAATATTTAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                        agcatagataatagaagtatatAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AAATC--CGTGA-AT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA-TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAATctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
gi|6                          :                                                                                                                       tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtAACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCtttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tAACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CTAAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACaagcgtgacttatctaataaagacttttttttagaatttcgctaatattaatgtatattcaaaataaaatacatactccagcacaactatattatcgatgtaattgatagactttttattcacaaataattgcatttgattacattttctttcttttttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                 ATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAAGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCTG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAA-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTTGGAAATTA--TA-TAG-TTTTTAGATACC---TTACAAATAATAA-------CATAA--TTTACtgaataacaatatgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACAATGTATG-TATCGAATATA-ACATTATCG--TTTT-AATGTTTT-AATTC--AGTTA-ACA--TATTT----AAGAAGCAA---------TCAACG-ATTCACGATA-T--T-TA-T---TTTAGCATAATTGTCTCAG-aaattcgaatttctctttcta


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    T  TT    C        T A   GA     T   TC     CTAA        GATATTGTAT             T     AG A  G TCC  T   A            A              AT               CT                  A                        G        .   T  TA                 A          TGACAAC     A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . A   .      .   .      .           G                      G     .  .  . .    T   A            .              .                AT                  .                        A        .   .  T                  A          .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     T        . A   .      .   .      .           G                      A     .  .  . .    T   G            .              .                GT                  .                        G        .   .  T                  A                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     A        . A   .      .   .      .           G                      G     .  .  . .    T   A            .              .                AT                  .                        G        .   .  T                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . A   .      .   .      .           T                      T     .  .  . .    T   A            .              .                AC                  .                        T        .   .  G                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     A        . A   .      .   .      .           G                      T     .  .  . .    A   G            .              .                CG                  .                        T        .   .  .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     A        . A   .      .   .      .           G                      T     .  .  . .    T   G            .              .                CG                  .                        T                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . A   .      .   .      .           G                      T     .  .  . .    T   A            .              .                .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . A   .      .   .      .           G                      T     .  .  . .    .   .            .              .                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . T   .      .   .      .           G                      G     .  .  . .    .                .                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . T   .      .   .      .           G                      A     .  .  . .                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     A        . T   .      .   .      .           A                      G     .  .  . .                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .     C        . A   .      .   .      .           .                      .                                                                                                                                                                           
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTTTCAGTCTTATTGTCATAACGACGATACACAATTGACCATTAACAATGAATATTTAATTAAATATAGAATAAACATACACTATATAAACAAAGGTTATAGACTCCTAAACAG
Unaligned ( gi|30 ): CAGCACACTGCAGTACGTAATCGAAACTGAAATT






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Reference ( family-732 )      :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACATTGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAANGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCAG-AAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTNTTTTATTTGTAGATGAAAC-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTNGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAAATATTTAGTTACGAATAATAA-------CGTAAATTTTAC
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----Aaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCGAACATTGCAAGAGATCAAATCTAGACATTG-CA--TTTTAAATATTTT-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                  GTCAAATATTGTAAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                CAGTCAAATATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AACGA-ATA--TAGTga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                      AACATTGTCAGACATCATATCTAGACATTA-CA--TTTTTAATAATTC-AATTC--AGTCA-ATA--TAGTT----A
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATC--TATTT----AAGAAGCA----------TCATTATATTCAATGCAGC--T-TT-T---
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGACAAACATCGTAAGATATCAAATCTAGACATTA-CA--TTTTAAATATTTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----CAGAAGC
gi|4                          : taaagcaggaaatggtaattagatattagtcagatattgacacactctgagtgacacctcggtgggaaagtaattatttatcaattaagtccagttaaaataatagaccacaggcataattgtttaaaggcaaacaaaatttaacggtcagttttattggaataacgacaataaacaattgcctatggcatacactatataaacatagataatgtactcataACAGTCAGACAT--------ATTAAATATA--CATCA-AA--TTT-CAATAATTTTACTCC--GGTTATATA--TA-TT----ATGAA-------------------------ATGTAGT--T-TTGT---C----CATAAAATCCTTAG-ACATATATTTTGATATGTATTACGTACTAGTATTTTATTTGTAAATAAAAC-TATATTAATAAATTTATTTACAGTGGGAAATGA--TA-TATATTTTAAAATATTTAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                        agcatagataatagaagtatatAATAGTCAAACAATATAGAATATCAAATATGAACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AAATC--CGTGA-AT---TTTTT----AAACAGCA---------------GTATTTAATGTAGT--T-TT-T---TT-------------CCAG-ATTTTTTTCTCGA---GTGT---GGACTA-TACTTTATCTACAGA--AAACATATTTTTGTAAACATATTGACAGCTGGAAATctcgttatagtttataaaattataggacaagaaaaactcttattcaacaatatttatgaaacataattgatgaa
gi|6                          :                                                                                                                       tttattgacattatagcaatacataattgcctatggccatttttaatgtataataaatcaattgtggcatagtcataaaatgtatataattcatagatacagtAACAGTAGAACATTGAAATATATCAAATCCAGACATTA-CA--TTTTCAATAATTC-AATTC--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAGATATTGTATTCAATGTATTCAATGTAGC--T-TT-T---CTTAGCtttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tAACAGTCAAATATTGTGAGATAACAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAAATA-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAGGTAGT--T-TT-T---CTAAGCGTAAAAGCCTCAG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAT-TAGATTTATAAATTTATTAACTGTTGGAAATGA--TA-TAT-TTTTTAGATATTTAGTTAAAAATAACGATGACAACCATAAATTTTACaagcgtgacttatctaataaagacttttttttagaatttcgctaatattaatgtatattcaaaataaaatacatactccagcacaactatattatcgatgtaattgatagactttttattcacaaataattgcatttgattacattttctttcttttttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                 ATATCAAATCTAGACATTA-TA--TTTTCAATAATTC-ATTTA--AGTGA-ATA--TAGTT----AAGAAGCAG---------TCATTGTATTCAAAGTAGT--T-TT-T---CTTAGCGTAAAAGCCTCTG-TAATATATCTTGAT--GTATTACGCACTAGTCGTTTATTTGTAGATGAAAA-TAGATTTATAAATTTATTGACAGTTGGAAATTA--TA-TAG-TTTTTAGATACC---TTACAAATAATAA-------CATAA--TTTACtgaataacaatatgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                              AACAGTCAAACAATGTATG-TATCGAATATA-ACATTATCG--TTTT-AATGTTTT-AATTC--AGTTA-ACA--TATTT----AAGAAGCAA---------TCAACG-ATTCACGATA-T--T-TA-T---TTTAGCATAATTGTCTCAG-aaattcgaatttctctttcta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTTTCAGTCTTATTGTCATAACGACGATACACAATTGACCATTAACAATGAATATTTAATTAAATATAGAATAAACATACACTATATAAACAAAGGTTATAGACTCCTAAACAG
Unaligned ( gi|30 ): CAGCACACTGCAGTACGTAATCGAAACTGAAATT