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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                           GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACC-CTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGTGTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCC-TGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAATA-TTTTGGATTAC------CGAAGATAGTGTGGAA----CACATTTACATCTAT--TGAA-------TGGATCA--TTT-A---CCA-CAAATGTCGGCTTATCA---ACCCTGAATGTCA--TGATCAA-------------------GAAGATATATGGAATGCATACACCTAC--AGAGGC--TCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCAT----AACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAACATGTT---TTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA------T-----TTATATATAATATAAA--TCTTT-GCTATGAGTAAAA-AATAAG-AAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATACTTC--AAAGAAAAGAA-----AATCGAATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAAT-----TAAAAAAAAATAGATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCATATTTATATTTCAGATGTATT-----AAACAATAATA-AAAT----GAATTAAC-AAATTTA-ATA----AATCTAAAAACAAACGGTAGGTTTTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGTT--AAA---AATACTTG-ATATGTTAGCAAAAAGTTAG-TAAAAACA--GGACAGAATCTCACATAG---AA---CTAGACTTACATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA---A---A--AATA--T-TA-TAC-AAGAA------G---CTAA----AAT----------ATTTT-T---ATA---AACTAAGCAACAAGGTCAAAACAAGCGACGCAAATTTC-GTTTTTT------TT-------TTAAT------ATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAAAAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
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gi|19                         : tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCACT--TTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGTGTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                              AACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTC------AACC-CCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGGTTATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGTGTCTTTGTGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATATATTTAAAACTTAAAA-AATAAG-T-TATGGGCA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                         aatcatatggtttaaaatcgttgataatctttttgaccaacagttaattatgtaaatggcgatattttgaacaggggagatTGGTTCGTTACTTGGAATTGTTTCATACAATAAAATGTGTTTTTATGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATACATTTAAACCTTTTAA-AAAAAG-T-TATGGGCAtcgctgtagtcttttttaaataagtttattaatatatcagttttataaatttttgttagcagtggaatttttgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttatagtttgtatcacaaatgagatctagtattattaatgcagatcaaaacagaatattttggattatgccttgctaaatatttgctacttccaagtttacactgtaccgtagatagtgtgtaacacgtttaaatctattgatcatttaccacaaatgtcggcttatcaaccctgaatgtcgtgatcaagaagatatatggaatacatacagctacagaggatcatcaagtgttattgtaggctcaataccgccaaatgtgaaggacatgtatggaccatgaatatatctggagcgatattatttgcagaaagtggtctctaaaatcaaatattgaagagttatatgatcagagtgataaaattgatattattttattgttcatcacagttatgataacaaaagagaaataaacgtgttttttttctcatattttaaatgttcacaataaagttctttgctatgagtaaaaaaattgaaacatttcttttacatgttcaaaatgaaaatgggtctatcaagaaggtattgggatgttcgtaaatggtacagtacgaaacgaaactataaaatatacttcaaaaaaaaaagaaaaacgaataaaagtttagaaaatgttcttaaaaaaaatagataaattagacgaagaattgtcaactgatcctagtaaccatattaatatttcagatgtattaaacaaggttcaaacaagcgacgcaaatttcgttttttccataatcttaatattaataaattaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaatggctttaaaagatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcataataattaa
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gacatgtttaatatagttagtatcacaaattagatctcgttttattaatgcagatagaaacataatatttatgattattccttgctaagtatttgttccttccatgtttacattgttaatgGAA----CACGTTTAAATCTAT--TAAA-------TGGAATA--TTTTG---CTA-CAACTGTGAGCT-ATCA---ACCACAAATGTCA--TGATCAA-------------------GAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGA--TCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGTAAAGAG-ATGTATGGACTATGAATATAT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATATTTC--AAAGAAAAGAA-----AAACGAATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA-------ATAAAAAAATAGATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCATATTAATTTTTCAGATGTATT-----AAACAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atACTATAAAATATACTTC--AAAGAAAAGAA-----AGATAAATCACAGTTTA-AAAATAGTCTTA--------AAGAAGAAATAGATAA--ACCA---GATGA---AGCATTG--TCAAACAT---TCCAAATAACAATA---ACCTTTTTGATGTTTT-----AAACAATAAAATAAAT----GAACTAAC-AAATATA-ATA----GATATAAAAACAAACGTTA----TTATATTACGAGCTAAGGCTGAATGGATTGAAGGTGCTGAAAA---AATACAAG-ATACTTTTTC--AAATTTAGAAAAAAAGA--GGGCAGAATCAAAAAAAAAATAA---CTAGACTCACATATGATAATCTTGAAATAACAAA---ATCCA--AAGA--TATATTAG-AAGAA------A---CC-A----AAC----------AATTT-T---ATAAAGAACTATACAGCAAGGTTCAAACAAGTGACGAACATTTC-AATTTTTCAATACTC-------ATAAT------ATTAATTAATTAAATGATAATCAAC--AAGAATTATGTAATGGCATTTTAACTGAATACGAGTGTGAAATAGCTTTAAagttcaaacaagcgacgcaaatttcgtttttttccgtaatcttaatattaataactaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaaagactttaacag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACGTTTT-----AAACAATAGAA-AAAT----GAATTAAC-AAATATA-ATA----GATATAACAACAAACGGTA----TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAA-GTGCTGAAAA---AATACTAG-ATACTTT-TC--AAATTTAG--AAAAAAAGTGGAAAGAATC-CAAA-AA---AATACCTAGACTTACATGTGATAATCTTGAGATAACAAA---ATCCA--AAGA----CA-TAT-AAGAA------GAAATCAA----ACC----------ATTTTAT---ACAG--AACTATACAGCAAGGTTCAAACAAGTGACGAACATTTCAGTTGTTTCAATGATC-------ATAAT------GTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAAAATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAGaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-----AAACAATAATA-AAAT----GAATAAAC-ACTTTTA-ATG----AATCTAAAAACAAACGGTAATTATTATTTTACGAGCTAGGACTGAATGGACTGAAGGTGCT--AAA---AACCATTATAGATGTT---------TTAG-TAAAAACA--GTACAGAATCTAAAAACT---AA---CTAGATTTACATATGATAATTTTGAAACA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacatgtttaatatagttagtatcacaaattagatctcgttttattaatgcagatagaaacataatatttatgattattccttgctaagtatttgttccttccatgtttacattgttaatgagatggcatgcaacaagtttaaatctattgtatagattatttacgacaactgtgagttatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctatagagacgatcatcgagtgttactatttgctcaataccgccaaatgtgaaggagatgtatggatcatgaatatatttggagcgatattatttgatgactgtgttctctaaaatcaaatattgaagagttatgcgtatagagtgaaaacattgatatggttttactattcatcacagacagtagtgataacaaaaatgaaataagtgtgttttacattttaaatgttcactatgtttatgtataacataattctttgtttagtgtaaaaaaatgaaatacgttttctgcttcactctttaaatggttctatcaagacggtatatggatattcgtaaacggtatagcacaaaacgaaactataaaatacacttcaaagaaaagaaT-----AAACAATAATA-AAAT----GAATAAAC-ACTTTTA-ATG----AATCTAAAAACAAACGGTAATTATTATTTTACGAGCTAGGACTGAATGGACTGAAGGTGCT--AAA---AACCATTATAGATGTT---------TTAG-TAAAAACA--GTACAGAATCTAAAAACT---AA---CTAGATTTACATATGATAATTTTGAAACAACAAA---ATCCA--AAGA--TATATTAC-AGGAA------A---CTTA----AAT----------A-GTT-T---ATA---TACTAA-CAGCAAGGTTCAAACAATAGACGAGACTTTC-ATTTTTT------CA-------ATAATCGTATAATCCATAAA-TAACCGATAATCAAC---AAGAATGTGTAATGGCGTTTTAACCGAATATGAGTGTAAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAGTCTTAA-ATAA-AAA---A---ATAGATAAAT-TA-GACGAAGAATTGTCAA---CTGATCCTAATTACCATATTAATTTT-TCAGATG---TATTAA---ACAAAGTTCAAACAAGCGACGCAAATTTC-GTTTTTT------TCCGTAATCTTAAT------ATTAATAA-CTAAATGATTATCAATAAGAAA--TATGTAATTGCATTTTAAAAGAATAATAGTGTAAAAAGACTTTAACAGtaccatcaaaaga
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ataaggtattgggatgttcgtaaaaggtacagtacgaaacgaaactataaaatatatttcaaagaaaagaaaaacgaataaaagtttagaaaAACAAGGTTCAAACAAGCGACGCAAATTTC-GTTTTTTCCATAATC-------TTAAT------ATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAGAAA--TATGTAATTGCATTTTAAAAGAATAATAGTGTAAAATGGCTTTAAAAGA
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATCAGAAATGAGACAATCAAATACACATCTTTTAAAAAAAAGAACACATTAAAAAAAGAAATCGAATTAAAAAATAATATAGATAATTTAGAAATAGAACTATCAGAAACTCCCAATAATGAAACTCTAATAAGTAATATAAACAATAAGAAAATTGAATTAAACAAAATTATTGAAGAACAAACTAATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGCCGAAAAAAATACTAAATATTTCAGTAATCTAGAGAGAAAAAGATCCGAGAGTAAAACTATAAATCAACTTATCAAAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTATATGAAACTAAACAATACTATAAAACTTTATATAGTAAAGTAAATACATATATAAATGATCATGAAGATGAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTTTTAAATGATCAACAAAAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAAAG
Unaligned ( gi|7 ): AATGAGTCAATCAAATACACATCTTTTAAAAAAAAGAACACATTAAAAAAAGAAATCGAATTAAAAAATAATATAGATAATTTAGAAAAAGAACTATCAGAAACTCCCAATAATGAAACTCTAATAAGTAATATAAACAATAAGAAAATTTAATTAAACAAAATTATTGAAGAACAAACTAATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGCCGAAAAAAATACTAAATATTTCAGTAATCTAGAGAGAAAAAGATCCGAGAGTAAAACTATAAATCAACTTATCAAAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTATACGAAACTAAACAATACTATAAAACTTTATATAGTAAGGTAAATACATATTTAAACGATCATGAAGATGAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTTTTAAATGATCAACAAAAGCAAGTATGTGAAGGTATTTCAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAAAG
Unaligned ( gi|13 ): GAATTAAACAAAATTATTGAAGAACAAACTAATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGCCGAAAAAAATACTAAATATTTCAGTTATCTAGAGAGAAAAAGATCCGAGAGTAAAACTATAAATCAACTTATCAAAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTATATGAAACTAAACAATACTATAAAACTTTATATAGTAAAGTAAATACATATATAAATGATCATGAAGATGAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTTTTAAATGATCAACAAAAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
Unaligned ( gi|16 ): ACTTTTAAAAATAAATGTTTGGACAACAAAATCTGGAACAAGAACGGCATGTACGCATTTGGTCTACAGTCCATTTATATCTTACAAAGATATATATTTTACTGTAAAAATACTAACTGCTGGCAGATATTACTGTCAACCATGTTTCTTAACATACAATTAAAAAAACGCAAATCAGTTAAGTCGACATTAAAAGAAATCGTTGATAATCTTTTTGACCAACAGTTTATTAAATTAATGGCGATATTTTGAACAGGGGAGGTAAG
Unaligned ( gi|18 ): TAAATTTTAAAACAGATCTAGATCTACTTAGTCCGAACAGAAATAAGACAGGTACGTATTTTGTCTACAGTACAGTTAGACTTAATACAAGGTCTGACATCCTACAAAGAAGTATATTTTTCAGCATAAAAGCACTTACAGCTGGCAGTAATTACT
Unaligned ( gi|20 ): TACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






Alignments
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Reference ( family-7167 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACTTGGAATTGTTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAGTTT--GTGAGCAATGGAATTTTTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAATA-TTTTGGATTACGTC-TTGCNNAGATAGCGTGTAA----CACGTTTAAATCTAT----TG-AA-------TGG-----ANCA--TTTA---CTA-CGANTGTGAGCTTATCAACCACGAATGTCG---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTAC--AGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCTCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGCGATATTATTTGAAGAATGTGTTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGCGTACAGAGTGATAANATTGATATTATTTTACTGTTCATC----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--GT-GTTTTTT---TCACATTTTAAATGTTCACAAT---G----TTTATATATAACATAATTCTTT-GCTACGAGTAAAAAAAA-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACACGTTCAAAATGACAATGGNTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--AAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATAACCATATTAATNTTTCAGATGT-NT-T-----AAACAATAANA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATG--AATCTAAAAACAAACGGTAATT--ATTATTTTACGAGCTAGGACTGAATGGACTGAAGGTGC----TG-AAA--A-AATANTAGTATA-TTTT-TC--A--A--ATTTAGT-AAAAAC-A--GGAC---AGAATCT-AAAA---A--ATAACTAGACTTA-CATATGATAATCTTGAAATAACAAAATCCAAAGATATATTA--C-AAGAA------ACCGA----AAT----------ATTTT-T---ATA---AA---CTAAACAGCAAGG----------TTCAA--------ACAAGCG---ACGNAAATTTC-G---TTTTTT-CAA-TAATCNTAATATTNATAAATTAAATGAT-AATCAAC---GA-AAA-TATGTAATGGCATTTTAACCGAATANGAGTGTAAAATAGCTTTAAAAGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GATAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTC------AACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGGTTATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATATATTTAAAACTTAAAA-AATAAG-TT--ATGGGCA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aatcatatggtttaaaatcgttgataatctttttgaccaacagttaattatgtaaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTAAATAAGTT------TATT-----AATATATC---AGTTTTATA-AAT--TTTT--GTTAGCAGTGGAATTTTTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG---TT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTAGTATTATTAATGCAGATCAAAACAGAATA-TTTTGGATTATGCC-TTGCTAA-ATA-TTTGCTACTTCCAAGTTTACA-CTGTACCGTA-GA-------TAGTGTGTAACACGTTTAAATCTA-T-----TGA--TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCC---------TGAATGTCGTGATCAAGAAGATATATGGAATACATACAGCTAC--AGAG--GATCATCAAGTGTTATTGTAGGCTCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATGTATGGACCATGAATATATCTGGAGCGATATTATTTGCAGAAAGTGGTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATATGATCAGAGTGATAAAATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTTATGATAACAAAAGAGAAATAAAC--GT-GTTTTTTTTCTCATATTTTAAATGTTCACA-----------------ATAA---AGTTCTTT-GCTATGAGTAAAAAAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTCAAAATGAAAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAATGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTCAAAAAAAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATGTTCTT-----AAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAGTAACCATATTAATATTTCAGATGT-AT-T-----AAACAAtcgctgtagtcttttttaaataagtttattaatatatcagttttataaatttttgttagcagtggaatttttgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttatagtttgtatcacaaatgagatctagtattattaatgcagatcaaaacagaatattttggattatgccttgctaaatatttgctacttccaagtttacactgtaccgtagatagtgtgtaacacgtttaaatctattgatcatttaccacaaatgtcggcttatcaaccctgaatgtcgtgatcaagaagatatatggaatacatacagctacagaggatcatcaagtgttattgtaggctcaataccgccaaatgtgaaggacatgtatggaccatgaatatatctggagcgatattatttgcagaaagtggtctctaaaatcaaatattgaagagttatatgatcagagtgataaaattgatattattttattgttcatcacagttatgataacaaaagagaaataaacgtgttttttttctcatattttaaatgttcacaataaagttctttgctatgagtaaaaaaattgaaacatttcttttacatgttcaaaatgaaaatgggtctatcaagaaggtattgggatgttcgtaaatggtacagtacgaaacgaaactataaaatatacttcaaaaaaaaaagaaaaacgaataaaagtttagaaaatgttcttaaaaaaaatagataaattagacgaagaattgtcaactgatcctagtaaccatattaatatttcagatgtattaaacaaggttcaaacaagcgacgcaaatttcgttttttccataatcttaatattaataaattaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaatggctttaaaagatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcataataattaa
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacAA----CACGTTTAAATCTAT----TA-AA-------TGG-----AATAT-TTTG---CTA-CAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCA---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAG--GATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGTT--ATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTTT--CTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-T-----AAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAA-GTGC----TG-AAA--A-AATACTAG-ATA-CTTT-TC--A--A--ATTTAG--AAAAAA-AGTGGAA---AGAATCCAAAAA---A--ATACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------ATCAA----ACC----------ATTTTAT---ACAG--AA---CTATACAGCAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTT-CAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGAT-AATCAAC---AA-AAATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TAATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CGAAAA--A-AATACTAA-ATA---TT-TC--A--GTTATCTAGA-GAGAAA-A--AGATCCGAGAGT----AAA---ACTATAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------ACT-A----AAC----------AATAC-T---ATA---AAACTTTATATAGTAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTT-CAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAAAA---GC-AAG-TATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTTT--GTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAATA-TTTTGGATTAC-------CGAAGATAGTGTGGAA----CACATTTACATCTAT----TG-AA-------TGG-----ATCA--TTTA---CCA-CAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCA---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTAC--AGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTT---TCACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTAAAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCATATTTATATTTCAGATGT-AT-T-----AAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGT--TTTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---AA--A-AATACTTG-ATA-TGTTAGCAAA--A--AGTTAGT-AAAAAC-A--GGAC---AGAATCT-CACA---T--AGAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAAA---AAATAT-TA-TA--C-AAGAA------GCTAA----AAT----------ATTTT-T---ATA---AA---CTAAGCAACAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT--------TTTTAATATTAATAAATTAAATGAT-TATCAATAAAAA-AAA-TATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACAAAATA-TTTATGATTATGTC-TTGCTAA-ATA-TTTGTAACTTCCATGTTTACA-CTATAC--CG-AAGATAGTGTGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA---TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAA---------TCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TAT--AGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGAC----ATGGACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-G-TTTTT---TCACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTAAAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCATATTAATTTTTCAGATGT-AT-T-----AAACAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TG--TTT-A-ATATAGTTAGTATCACAAATTAGATCTCGTTTTATTAATGCAGATAGAAACATAATA-TTTATGATTATTCC-TTGCTAAGagttcaaacaagcgacgcaaatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gacaTTACATTGTTAATGAGATGGCATGCAA----CAAGTTTAAATCTAT----TG-TA-------TAG-----ATTA--TTTA---CGA-CAACTGTGAG-TTATCAACCACAAATGTCA---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTAT--AGAGACGATCATCGAGTGTTACTATTTGCTCAATACCGCCAAATGTGAAGGAGATGTATGGATCATGAATATATTTGGAGCGATATTATTTGATGACTGTGTTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGCGTATAGAGTGAAAACATTGATATGGTTTTACTATTCATCACAGACAGTAGTGATAACAAAAATGAAATAAGT--GT-GTTTT-------ACATTTTAAATGTTCACTAT---G----TTTATGTATAACATAATTCTTT-GTTTAGTGT-AAAAAAA-TGAAA--TACGTTTTCTGCT-TCACTC-TTTA-------AATGGTTCTATCAAGACGGTATATGGATATTCGTAAACGGTATAGCACAAAACGAAACTATAAAATACAC----TTC--AAAGAAAAGAATAA-ACAATAATAAAA--TGAATAAACACTTTTAA--TGAATCTAAAAACAAACGGTAATTATTATTTTACGAGCTAGGACTGAATGGACTGAAGGTGCTAAAAACCAT-----TAT---AGATGT-TT-TAGTAAAAACAGT-ACA-GAA-TCTAAAAACT-AA-CTAGATTTACATATGATAATTTTGAAACAtatttgttccttccatgtttacattgttaatgagatggcatgcaacaagtttaaatctattgtatagattatttacgacaactgtgagttatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctatagagacgatcatcgagtgttactatttgctcaataccgccaaatgtgaaggagatgtatggatcatgaatatatttggagcgatattatttgatgactgtgttctctaaaatcaaatattgaagagttatgcgtatagagtgaaaacattgatatggttttactattcatcacagacagtagtgataacaaaaatgaaataagtgtgttttacattttaaatgttcactatgtttatgtataacataattctttgtttagtgtaaaaaaatgaaatacgttttctgcttcactctttaaatggttctatcaagacggtatatggatattcgtaaacggtatagcacaaaacgaaactataaaatacacttcaaagaaaagaataaacaataataaaatgaataaacacttttaatgaatctaaaaacaaacggtaattattattttacgagctaggactgaatggactgaaggtgctaaaaaccattatagatgttttagtaaaaacagtacagaatctaaaaactaactagatttacatatgataattttgaaaca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gacatgtttaatatagttagtatcacaaattagatctcgttttattaatgcagatagaaacataatatttatgattattccttgctaagtatttgttccttccatgtTATTTGAAGTGTTATAATTTGAAGAATGTATTGTCTAAAATCAAATATATTGAAGATCTATATGTACAGAGTGATAAAATTTATATTATTTTACTGTTCATC----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAAAAAACTTGTTGTTTTTT---TCACATTTTAAATGCTCACAATAATG----TTTTTATATAACATAATTCTTTTATTATGAGTAAAAAAAAATCAAATTCA---TTTTT--TGCTAAACGTTCAAAATGACAATGACTCTATCATGAGTGTACAGGGATGTTCGTAAAAATTGTAGTGCTAAACGAAACTATAAAA-GTAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA--CG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--AGAA---AA-AATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAACTG--TCAACTGA---TCCAAATAACGATGTTAGTATTTCAGATGT-AT-T-----AAACAATACTA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATG--AATCTAAAAACAAACGGTAGGT--ATTATTTTACGAACTAGTACTGAATGGATTGAAGGTGC----TG-AAA--ACAATAGTAG-ATA-T---------------TTTAGTAAAAAAC-A--GGAC---AAAATCT-CAAA---A--ATAACTAGACTTA-CATGTGATAATTTTGAGATAACAAAATCAAAATATATATTA--C-AAGAA------ACTAA----AAT----------ATTT-------TA---AA---CTTAGCAACAAGG----------TTCAA--------ACAAGCA---ACGCAAATCTC-T---TTTTTT-CAA-TAATCTTAATATTTATTATATAAATGAT-AGTCAAC---AATAAA-TATGCAATGGCATTTCAACCGAATATGAGTGTAAAATAGCCTTAAAAGA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAACTGGTTCGTTACTTGGAATTGTTTCATACAATAAAATGT-GTTTTTATGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATACATTTAAACCTTTTAA-AAAAAG-TT--ATGGGCA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AA----TTTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT----TTTTTATAAAACATGACATATTGT----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACAGAATATTTTTGGATTATTCC-TTGCTAA-ATAA-GTGTTACTTCCATGTTTA----CAT----TGTAA-------CGG-----AG-A----TA---CTA-TGtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACTTTTAAAAATAAATGTTTGGACAACAAAATCTGGAACAAGAACGGCATGTACGCATTTGGTCTACAGTCCATTTATATCTTACAAAGATATATATTTTACTGTAAAAATACTAACTGCTGGCAGATATTACTGTCAACCATGTTTCTTAACATACAATTAAAAAAACGCAAATCAGTTAAGTCGACATTAAAAGAAATCGTTGATAATCTTTTTGACCAACAGTTTATTAAATTAATGGCGATATTTTGAACAGGGGAGGTAAG
Unaligned ( gi|18 ): TAAATTTTAAAACAGATCTAGATCTACTTAGTCCGAACAGAAATAAGACAGGTACGTATTTTGTCTACAGTACAGTTAGACTTAATACAAGGTCTGACATCCTACAAAGAAGTATATTTTTCAGCATAAAAGCACTTACAGCTGGCAGTAATTACT
Unaligned ( gi|20 ): TACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAGATTGTATCACAGATGAGATCTGGTATTGTTAATGTAGATTGAAACA----------GAATA-TTTTGAATTATTCCTTGTTTG--TA----TTATTCCTTGTTTGTTCCTTCCATGTTAA---CATTGTTAAGGAGATCACCTCGAACACGTTTAAA-TC----------TAT----TAAA-------TGG-----AATAT-TTTG---CTAC-AACTGTGAGCT-ATCAACCACAAATGTCA---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AAA--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA-----A-TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTT-CAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC---AA----AAATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAA--A--AAATACTAAATA--T-TT---C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACT---A-TAAATCAACTTATCAAA-AATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTT-CAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATG---ATCAAC---AAAAGCAAG-TATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atAAGGTACAGTACG-AAACGA--AACTATAAAATA--TATTT--C--A--A--A-----GAAAAGA-A-AAAC----GAA--T----AAAA-----G-T--TTAGA--------A-AATAGTCTT-AAATAAAAAAAT----AGATAAATTAGACGAAGAATTGTCAAC-T-G--ATCCTAATTACCATATT-AA---TTTTT---------CAGATGTATTAAACAAAG----------TTCAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTTTCCG-TAATCTTAATATTAATAA-CTAAATGATTATCAAT---AAG---AAA-TATGTAATTGCATTTTAAAAGAATAATAGTGTAAAAAGACTTTAACAGagttcaaacaagcgacgcaaatttcgtttttttccgtaatcttaatattaataactaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaaagactttaacag
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACA----------GAATA-TT----------------TTG--GA----TTA--CC-----------------G--AA---GATAGTGT-GGA----A-------CACATTTACA-TC----------TAT----TGAA-------TGG-----ATCA--TTTA---CCAC-AAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCA---------------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTT---TCACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---AA--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT-----A-GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT--------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA----AAA-TATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACA----------AAATA-TT----------------TAT--GA----TTATGTCTT---------------GCTAA----ATA-TTT-GTA----ACTTC---CATGTTTACACTA----------TAC----CGAAGATAGTGTGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA---TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCC---------TGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACA----------GAATATTT----------------TTG--GA----TTATTCCTT---------------GCTAA----ATAA-GT-GTT----ACTTC---CATGTTTACA-TTGTAACGGAGATAC----T--A-------TGG-----AACACGTTTA---TTtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAGATTGTATCACAGATGAGATCTGGTATTGTTAATGTAGATTGAAACAGAAT----------A-TT--TTG--AA----TTATTCCTTGTTTGTATTATTCCTT-------------GTTTGTTCCTTCCATGTTA----ACATTGTTAAGGAGATCACCTCGAACACGTTTAAATC----------TAT----TAAA-------TGG-----AATAT-TTTG---CTAC-AACTGTGAGCT-ATCAACCACAAATGTCA------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA-----A-TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTT-CAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC---AA--AAATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACT---A-TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTT-CAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA----AAGCAAG-TATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atAAGGTACAGTACG-AA-ACGA--AACTATAAAATA--TATTT--C--A--A--A----GAAAAGAA-A-A-AC----GAA--T----AAAA-----G-T--TTAGA--------A-AATAGTCTT-AAATAAAAAAAT----AGATAAATTAGACGAAGAATTGTCAAC-T-G--ATCCTAATTACCATATT-AA---TTTTT---------CAGATGTATTAAACAAAG----------TTCAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTTTCCG-TAATCTTAATATTAATAA-CTAAATGATTATCAAT---AAG-AAA-TATGTAATTGCATTTTAAAAGAATAATAGTGTAAAAAGACTTTAACAGagttcaaacaagcgacgcaaatttcgtttttttccgtaatcttaatattaataactaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaaagactttaacag
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAAT----------A-TT--TTG--GA----T----------------TA--CC---------------G----------A-A----G----ATAGTGT---GGA----A-------CACATTTACATC----------TAT----TGAA-------TGG-----ATCA--TTTA---CCAC-AAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCA------------TGA---------TCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT-----A-GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT--------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA--AAA-TATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACAAAAT----------A-TT--TAT--GA----T----------------TATGTCTT-------------G----------CTA----A----ATA-TTT---GTA----ACTTC---CATGTTTACA-C----------TATAC--CGAAGATAGTGTGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA---TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT---TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT----TTTTTATAAAACATGACATATTGT----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACAGAAT----------ATTT--TTG--GA----T----------------TATTCCTT-------------G----------CTA----A----ATAA-GT---GTT----ACTTC---CATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T--A-------TGG-----AACACGTTTA---TTtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAGATTGTATCACAGATGAGATCTGGTATTGTTAATGTAGATTGAAACAGAAT----------A-TT--TTG--AA----TTATTCCTTGTTTGTATTATTCCTT-------------GTTTGTTCCTTCCATGTTA----ACATTGTTAAGGAGATCACCTCGAACACGTTTAAATC----------TAT----TAAA-------TGG-----AATAT-TTTG---CTAC-AACTGTGAGCT-ATCAACCACAAATGTC----------------ATG-----AT---CAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atAAGGTACAGTACG-AA-ACGA--AACTATAAAATA--TATTT--C--A--A--A----GAAAAGAA-A-A-AC----GAA--T----AAAA--G-----T--TTAGA--------A-AATAGTCTT-AAATAAAAAAAT----AGATAAATTAGACGAAGAATTGTCAAC-T-G--ATCCTAATTACCATATT-AA---TTTTT---------CAGATGTATTAAACAAAG----------TTCAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-GT--TTTTTTCCG-TAATCTTAATATTAAT-AACTAAATGATTATCAAT--AAG-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAATAATAGTGTAAAAAGACTTTAACAGagttcaaacaagcgacgcaaatttcgtttttttccgtaatcttaatattaataactaaatgattatcaataagaaatatgtaattgcattttaaaagaataatagtgtaaaaagactttaacag
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAAT----------A-TT--TTG--GA----TT----------------A--CC---------------G----------A-A----G----ATAGTGT---GGA----AC-------ACATTTACATC----------TAT----TGAA-------TGG-----A---------------------------TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTC---ATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACAAAAT----------A-TT--TAT--GA----TT----------------ATGTCTT-------------G----------CTA----A----ATATT-T---GTA----ACTTC---CATGTTTACA-C----------TATAC--CGAAGATAGTGTGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA---TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCC---ATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT---TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT----TTTTTATAAAACATGACATATTGT----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACAGAAT----------ATTT--TTG--GA----TT----------------ATTCCTT-------------G----------CTA----A----ATAA-GT---GTT----ACTTC---CATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T--A-------TGG-----AACACGTTTA---TTtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAGATTGTATCACAGATGAGATCTGGTATTGTTAATGTAGATTGAAACAGAATA-TTTTGAATTATTCCTTGTTTGTATTATTCCTTGTTTGTTCCTTCCATGTTAACATTGTTAAGGAGATCACCTCGAACACGTTTAAATC----------TAT----TAA-A-------TGG-----AATAT-TTTG---CTAC-AACTGTG-AG-CTATCAACCACAAATGTC----------------ATG-----A-TCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAATA-TTTTGGATT----------------A--CC--G----------A-A----GATAGTGT---GGA----AC-------ACATTTACATC----------TAT----TGA-A-------TGG-----A----------------------------TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGA-TCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACAAAATA-TTTATGATT----------------ATGTCTTG----------CTA----AATATT-T---GTA----ACTTC---CATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTGTGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA----TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCAT-AATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT---TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT----TTTTTATAAAACATGACATATTGT----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACAGAATATTTTTGGATT----------------ATTCCTTG----------CTA----AATAA-GT---GTT----ACTTC---CATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A-------TGG-----AACACGTTTA---TTtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAGATTGTATCACAGATGAGATCTGGTATTGTTAATGTAGATTGAAACAGAATA-TTTTGAATTATTCCTTGTTTGTATTATTCCTTGTTTGTTCCTTCCATGTTAACAT-----------TGT----TAA-GGAGATCACCTCG-----AACACGTTTAAATCTATTAAATG-G-AA-TATTTTGCTACAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacaaatatttcatatagattgtatcacagatgagatctggtattgttaatgtagattgaaacagaatattttgaattattccttgtttgtattattccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATATCGTATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTGTATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATGCAGATTAAAACAGAATA-TTTTGGATTA--CC--GA---AGATA----GTG--TGGAAC----ACATTTACATC----------TAT----TGA-A---------TGG-----A----------------------------TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAGTTTATATCACAAATGAGATCTCGTATTATTAATTCAGATTAAAACAAAATA-TTTATGATTATGTCTTGCT--AAATA----TT---TGTAACTTCCATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTG--TGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTA----TCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAGTTGGTATCACAGATACGATTTCGTATTATTAATGCAGCTTAAAACAGAATATTTTTGGATTATTCCTTGCT--AAATA-----AG--TGTTACTTCCATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A---------TGG-----AACACGTTTAtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAG----------ATTGTATCACA-----GATGAGATCTGG-----TATTGTTAATGTAGATTGAA--ACAGA--ATA-TTTTGAATTATT------CCTTG---TTTGTATTATTCCTTGTTTG--TTCCTTCCATGTTAACAT-----------TGT----TAA-GGAGATCACCTCG-----AACACGTTTAAATCTATTAA-ATGGAATATTTTGCTACAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATATCG-----TATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATGCAGATTAAA--ACAGA--ATA-TTTTGGATTA--------CC--G---A---AGATA----GTG--TG--GAA----CACATTTACATC----------TAT----TGA-A---------TG-------------------------------GATCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTATATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATTCAGATTAAA--ACAAA--ATA-TTTATGATTATG------TCTTG---CT--AAATA----TT---TG--TAACTTCCATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTG--TGG-----AACACGTTTAAATCTATTGA-ATGT-ATCATTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT---TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT--------------TTTTTATAAAA-----CATGACATATTG-----T----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAG----------TTGGTATCACA-----GATACGATTTCG-----TATTATTAATGCAGCTTAAA--ACAGA--ATATTTTTGGATTATT------CCTTG---CT--AAATA-----AG--TG--TTACTTCCATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A---------TGG-----AACACGTTTAtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAG----------ATTGTATCACA-----GATGAGATCTGG-----TATTGTTAATGTAGATTGAA--ACAGA--ATA-TTTTGAATTATT------CCTTG---TTTGTATTATTCCTTGTTTG--TTCCTTCCATGTTAACAT-----------TGT----TAA-GGAGATCACCTCG-----AACACGTTTAAATCTATTAA-ATGGAATATTTTGCTACAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATATCG-----TATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATGCAGATTAAA--ACAGA--ATA-TTTTGGATTA--------CC--G---A---AGATA----GTG--TG--GAA----CACATTTACATC----------TAT----TG---------------------------------------A-ATGGATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTATATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATTCAGATTAAA--ACAAA--ATA-TTTATGATTATG------TCTTG---CT--AAATA----TT---TG--TAACTTCCATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTG--TGG-----AACACGTTTAAATCTATTGA-ATGTATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT---TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT--------------TTTTTATAAAA-----CATGACATATTG-----T----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAG----------TTGGTATCACA-----GATACGATTTCG-----TATTATTAATGCAGCTTAAA--ACAGA--ATATTTTTGGATTATT------CCTTG---CT--AAATA-----AG--TG--TTACTTCCATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A---------TGG-----AACACGTTTAtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATA--TTT-C-ATATAG----------ATTGTATCACA-----GATGAGATCTGG-----TATTGTTAATGTAGATTGAA--ACAGA--ATA-TTTTGAATTATT------CCTTG---TTTGTATTATTCCTTGTTTG--TTCCTTCCATGTTAACAT-----------TGT----TAA-GGAGATCACCTCG-----AACACGTTTAAATCTATTAA-ATGGAATATTTTGCTACAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGT-TATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTT-TCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATATCG-----TATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGT-TT-TAAACAATAGAA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAACGGTA-------TTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AA-A--A--AA-TACTAGATAC-T-TTT--C--A--A--ATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTATACAGAA---CTATA---------CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----GAATT-AAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TA-ATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CG-AAAA--A--AA-TACTAAATA----TTT--C--A--GTTATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTATA---AAACTTTATA---------TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTT-TGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATGCAGATTAAA--ACAGA--ATA-TTTTGGATTA--------CC--G---A---AGATA----GTG--TG--GAA----CACATTTACATC----------TAT----TG---------------------------------------A-ATGGATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAAC--AT-GTTTTTTT---CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGT-AT-TAAACAATAATA-AAA-T----GAATT-AA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTAGGTT---TTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---A-A--A--AA-TACTTGATA--T-GTTAGCAAA--A--AGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTATA---AA---CTAAG---------CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTATATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATTCAGATTAAA--ACAAA--ATA-TTTATGATTATG------TCTTG---CT--AAATA----TT---TG--TAACTTCCATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTG--TGG-----AACACGTTTAAATCTATTGA-ATGTATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAAT--GT-GTTTTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCAACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGT-AT-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAG----------TTGGTATCACA-----GATACGATTTCG-----TATTATTAATGCAGCTTAAA--ACAGA--ATATTTTTGGATTATT------CCTTG---CT--AAATA-----AG--TG--TTACTTCCATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A---------TGG-----AACACGTTTAtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): TAAATTTTAAAACAGATCTAGATCTACTTAGTCCGAACAGAAATAAGACAGGTACGTATTTTGTCTACAGTACAGTTAGACTTAATACAAGGTCTGACATCCTACAAAGAAGTATATTTTTCAGCATAAAAGCACTTACAGCTGGCAGTAATTACT
Unaligned ( gi|20 ): TACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAATA--TTT-C-ATATAG----------ATTGTATCACA-----GATGAGATCTGG-----TATTGTTAATGTAGATTGAA--ACAGA--ATA-TTTTGAATTATT------CCTTG---TTTGTATTATTCCTTGTTTG--TTCCTTCCATGTTAACAT-----------TGT----TAA-GGAGATCACCTCG-----AACACGTTTAAATCTATTAAATGGAATATTTTGCTACAACTGTGAGC-TATCAACCACAAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACAGCTACAGAGAGGATCATCAGGTGTTTCTATTTGCTAAATACCGCCAAATGT-AAAGAGATGTATGGACTATGAATATATccttgtttgttccttccatgttaacattgttaaggagatcacctcgaacacgtttaaatctattaaatggaatattttgctacaactgtgagctatcaaccacaaatgtcatgatcaagaagatatatggaatgcatacagctacagagaggatcatcaggtgtttctatttgctaaataccgccaaatgtaaagagatgtatggactatgaatatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttttgctatggaacaaaacatttgaaaatataaaggtgaaattatttttacattgcatgacctggatttgtttacagaacatgacttcttgttcaatttgtagtgagaactcgacGGTAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCCAAACCCCGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATTACCTGAAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTCAAACTAGTTCCATCCTATTTCGTCAATATATTTAAAACTTTAAA-AAAAAAGTTATGTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaTGTAGTCTTT---TTTTAATAAGTT------TATT-----AATGTATC---AGTTTTATA-AAT--TTTTCTGAGCAATGGAATTTCTGCCGGGAAACAAAAACTTTGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTGT-TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATATCG-----TATTATTAATGCAtcgctgtagtctttttttaataagtttattaatgtatcagttttataaatttttctgagcaatggaatttctgccgggaaacaaaaactttgaaaatatatggaaatttacttttacattgcaagaactgtttttttatagtttgtatcacaaatgagatatcgtattattaatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttattaaataaatggcgatattttgaacaggggaggtaacctataatttaatcatgttggtttcggtccaaaccccgttcgttctttaggtcttttagttgatgatttgaactggttcattacctgaaattatttcatacaataaaatgtgtctttgtgttcaaactagttccatcctatttcgtcaatatatttaaaactttaaaaaaaaagttatgtgcatcgcGACGTT-T-TAAACAATAGAA-AAAT----G-AATTAA-C-AAATATA---ATA--GATATAACAACAAAC------GGTATTATATTACGAGCTAGGGCTGAATGAAATGAAG-TGC----TG-AAAA--AATACTAGA-----TACT-TTTCA-----AATTTAGAAAAAAA-GTGGAA---AGAA--TCCAAAAAA--A-----TACCTAGACTTA-CATGTGATAATCTTGAGATAACAAAATCCAAAGACATATAA--G-AAGAA------AT-C-A--AAC--CATT-TTA-TACAGA----A-----CTATA---CAG----------CAAGG----------TTCAA--------ACAAGTG---ACGAACATTTCAG---TTGTTTCAA-TGATCATAATGTTTATAAATTAAATGATAATCAAC--AAA-AATTATGTAATGGCAATTTAACTGAATATAAGTGTTAAATAAATTTAAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----G-AATTAAAC-AAAATTA---TTG--AA-----GAACAAAC--TAATGGAATTATTCTAAGAGCTAAAGCAGAATGGGTTGAAGGGGC----CGAAAAA--AATACTAAA-----TA---TTTCAGT---TATCTAGAGAGAAA-A-AGATCCGAGAG--T----AAAACTA-----TAAATCAACTTATCA-AAAATAAAACAGAAATAACAAAATCTGAAGATATTTTA--T-ATGAA------AC-T-A--AAC--AATA-CTA-TA---A----AACT--TTATA---TAG----------TAAAG----------T--AAATACATATATAAATGATCATGAAGAT----GAGTTTTTTTCAGTTAATAGGGATTCTGTT---TTAAATGATCAACAA---AAGCAAGTATGTGAAGGTATTTTAAATGAAGAAGAATGTACATTAGCTCTAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataaggtattgggatgttcgtaaGGTAACCTATAATTAAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCCGTCCGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttggtttacaatccatttatatcttacaaagatgcatattttactgtaaaatacttactgtcgaccatgtatcttaacatacaaattaaagtaccacacagcagaatagtcgacattaaatgaaatcgttgataatctttttgaccaacagttcattaagtaaatggcgatattttgaacaggggaGTAATCTACAATTTAATCATGATGGTTTCGGTCCAAACCAC-TTTGTTCTTAAGGTCGTATAGTTGATGATTTGAACTGGTTCATAACTTGGAATTGATTCATACAAT-AAATGT-GTTTTTTTGTTCAAACAAGTTCAATCCTATTTCGTAAATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCAACCTATAATTTAATCATGTTGGTTTCGGTCAAAACCCTGTTCGTTCTTTAGGTCTTTTAGATGATGATTTGATATGGTTCATTACTTGGAATTATTTCATACAATAAAATGT-GTCTTTGTGTTAAAACAAGTTCCATCCTATATCGTAAATATATTTAAAACTTAAAAGAAAAAGTTTGTGAGCAATGGAATTTCTGCCTGGAAA-AAAAAGTTAGAAAATATA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTGTATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATGCAGATTAAA--ACAGA--ATA-TTTTGGATTA--------CC--G---A---AGATA----GTG--TG--GAA----CACATTTACAT-----------------------------------------------------CTATTGAATGGATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGTCATGATCAAGAAGATATATGGAATGCATACACCTACAGAG--GCTCATCTGGTGTTACTATAGGTTCAATACCGCCAAATGTGAAGGGCATGTATGGACCATGAATATATTTGGAGTGACATCATTTGAAGAATGTGTTTTCTAAAATCAAATAT--TGAAAAGTTATGTTTTCAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATA----ACAGTAGTGATAACAAAAGAGAAATAAACATGTTT----TTTT----CACATTTTAAATGTTCACAA---------TTTATATATAATATAAATCTTT-GCTATGAGTA-AAAAATA-AGAAA--CA---TTTCT--T-TTACCCGTTCAAAATGACAATGGGTCTATCAAGAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAATACGAAACGAAACTATAAAATATAC----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-TCG--AATCAAAGTTTAGAAAATAGTTTTAATTAAAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCA---ACTGA---TCCGAATAACCA-TATTTATATTTCAGATGTA-T-TAAACAATAATA-AAAT----G-AATTAA-C-AAATTTA---ATA--AATCTAAAAACAAACGGTA--GGTTTTATTTTACGAGCTAGGACTGAATTGACTAAAGGTGT----T---AAA--AATACTTGA-----TA---TGTTAGCAAAAAGTTAGTAAAAAC-A-GGAC---AGAATCTC---ACAT--A-----GAACTAGACTTA-CATGTGATAGTTTTGAGATAA-AAA-----AAAATATTATA--C-AAGAA------GC-TAA--AAT--ATTT-TTA-TA---A----A-----CTAAG---CAA----------CAAGG----------TCAAA--------ACAAGCG---ACGCAAATTTC-G---TTTTTT-------TTTTAATATTAATAAATTAAATGATTATCAATAAAAA-AAATATGTAATTGCATTTTAAAAGAAAAATAGTGTAAAATGGCTTTAACAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCAATGGAATTTCTGCCAGGAAACAAAAACTTTGAAAATGTA----TGGAAATTTACTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-T-TTATAG----------TTTATATCACA-----AATGAGATCTCG-----TATTATTAATTCAGATTAAA--ACAAA--ATA-TTTATGATTATG------TCTTG---CT--AAATA----TT---TG--TAACTTCCATGTTTACA-C----------TATAC--CGA-AGATAGTG--TGG-----AACACGTTTAAATCTATTGAATGTATCA-TTTACCACAAATGTCGGCTTATCAACCCTGAATGCCATAATCAAGAGGATATATGTAATGCATATA--TATAGAG--GATCATCAAGTGTTACTATTTGCCCAATACCGCCAAATGTGAAGGACATG----GACCATGAATATATTTGGAGTGATATCATTTGAAGAATGAATTCTCTAAAATCAAATAT--TGAAGAGTTATGAGTACAGAGTGATAACATTGATATTATTTTATTGTTCATC----ACAGTAATGATAAGTAAAGAGAAATAAATGTG-TT----TTTT----CACATTATAAATGTTCACAAT---AATGTTTTATATATAATATAATTCTTT-GCTACGAGTA-AAACAAT-TGAAA--CA---TTTCT--T-TTACATGTTTAAAATGACAATGGGTCTAACAATAAGGTATTGGGATGTTCGTAAAAGGTACAGTACGAAACGAAACTATAAAATATAT----TTC--AAAGAAAAGAA-AA-ACG--AATAAAAGTTTAGAAAATAGTCTTAA--ATAA---AAAAATA---GATAA--ATTA---GACGA---AGAATTG--TCA---ACTGA---TCCTAATTACCA-TATTAATTTTTCAGATGTA-T-TAAACAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAACTGGTTCGTTACTTGGAATTGTTTCATACAATAAAATGT-GTTTTTATGTTCAAACAAGTTCCATCCTATTTCGTAAATACATTTAAACCTTT-TA-AAAAAAGTTATGGGCA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GTCGTTTTTTCCAAATAAGTT------TATT-----AATATACC---AGTTTTCTA-AAT--TTATGTGAACAATTGTATTTTCGTTGGGAAA--AACTCTTTGATAATCTA----TGGAAAATTTCTTTTACATTGCAAGAACTG--TTT-TACT--------------TTTTTATAAAA-----CATGACATATTG-----T----TTAATtcgctgaagtcgttttttccaaataagtttattaatataccagttttctaaatttatgtgaacaattgtattttcgttgggaaaaactctttgataatctatggaaaatttcttttacattgcaagaactgttttacttttttataaaacatgacatattgtttaattctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaactggttcgttacttggaattgtttcatacaataaaatgtgtttttatgttcaaacaagttccatcctatttcgtaaatacatttaaaccttttaaaaaaagttatgggcatcgctgaaAAATG--TTT-A-TAATAG----------TTGGTATCACA-----GATACGATTTCG-----TATTATTAATGCAGCTTAAA--ACAGA--ATATTTTTGGATTATT------CCTTG---CT--AAATA-----AG--TG--TTACTTCCATGTTTACATTGTAACGGAGATAC----T---A---------TGG-----AACACGTTTAtctgaagtaactccaaatgtttataatagttggtatcacagatacgatttcgtattattaatgcagcttaaaacagaatatttttggattattccttgctaaataagtgttacttccatgtttacattgtaacggagatactatggaacacgtttatt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACTTTTAAAAATAAATGTTTGGACAACAAAATCTGGAACAAGAACGGCATGTACGCATTTGGTCTACAGTCCATTTATATCTTACAAAGATATATATTTTACTGTAAAAATACTAACTGCTGGCAGATATTACTGTCAACCATGTTTCTTAACATACAATTAAAAAAACGCAAATCAGTTAAGTCGACATTAAAAGAAATCGTTGATAATCTTTTTGACCAACAGTTTATTAAATTAATGGCGATATTTTGAACAGGGGAGGTAAG
Unaligned ( gi|18 ): TAAATTTTAAAACAGATCTAGATCTACTTAGTCCGAACAGAAATAAGACAGGTACGTATTTTGTCTACAGTACAGTTAGACTTAATACAAGGTCTGACATCCTACAAAGAAGTATATTTTTCAGCATAAAAGCACTTACAGCTGGCAGTAATTACT
Unaligned ( gi|20 ): TACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN