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gi|16                         :                                                                                                                                                  ATATGCAATTT-CATATGA----TATTAAGCAAATTG----G-----AAAA--T--G-AAT-AGA--A-T---AAT--TTAGGTAAATTCTCAAAAGC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                 AA--TA----G-----AAGA-----G-CAT-A-A----------T--GTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGATA-TGGTGATTA--A----GT-AGTAG--TGTAAA--TAT-AGT--TT-TC--C------T--TT---------TTAGAT-ATACCTTTGTCAA-AACATTtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                 tgataG----G-----AACACTT--A-TTT-A-AGAA-T---AAT--GTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGATA-TGGTGATTG--A----AT-TGTAG--TGTAAA--CAG-AGTAGTTTCC--C------T--TTTTTA-----AGATAC-ATACCTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                            -----AACA--T--T-AAT-AGA--A-T---ACT--TAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGTTG-TGGTGATTA--A----AT-AGTAG--TGTAAA--TAA-TGG--TCCTT--CAAAGTTT--TT---------AG-----ATGCCTatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                  ACA--T--A-AAT-AGA--A-T---AAT--GTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGATA-TGGTGATTA--A----AT-AGCAG--TGTTTA--TAA-AGA--TTCTC--CT-----T--TT---------TTAGAT-ATGTCTTTGTCAA-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                   GATAAACTTTCAAAAGCACAAA-T-CAGATA-TGGTGTCTA--A----CT-AGTAG--TGAACA--TAG-CGT--TTCTC--C------C--TT---------TTAGAT-ATACCATTGTCAATAAC-TTTGCAACCATTCTTTGA-CAATTAT--TCCGTA-------GATATTTCATTTTCATGTACAATATCTAACAGTATAT------GGTATCTGGT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATCGTAT------TGTCTCTAGTTGCAATGA---C-T-TCCTGTA-GAATTGCGTTTCTTAAGTCTACATAAAAAG----TACAGTCTAATAAGAAGTGTAATTCGTCTTCCACTATT-CCTATGTCACAGAACTGG-C-ATGGTCGCTGATAA-G---AACTTTCGTCTGCATAT--CGGCCTGTTTCAGTTT-----TCGGTGAAAGAATACCA-GTGTGATAACTAAATTGTGCCAAAATTGA------TCG----TTCACTT-TTAATAA---GCG--GCATGTT---------CACAT---ATaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCTCAAGTCAACATGAACTG----TTCAGGCTAATA-TGAATTTGATTTGTCTTCTA-TACCACTTGTGCAACATAACCGT-T-AAATTCTTTGAGTAGG---AGATTTC-CCTAC-T-TGACGGCTTGTTTC-ATTC-----ggttcacatatggttcactcatgaaagtgtctttaaataaaacgtatgtccctaatttcagcttatcccgaatctaagttattcaaatgattaaattatg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTGTCATAA-ACCCG-ACAAAGTATCTGATTA-G---GACGTTCGCCTACAT-T--T----CGTTTCAATTCAATCCTCAGTAGAATAAAACAACATCAC-------AATTGTAATATAATTGATATTAGCCGCATATTCACGTATGAATCTCTCATG--AAAT--TAAACCAAAACGTAC---GTTC-----TCAG------TTT--------TGACATATC---ATTTATCGTACGACACCAAACAATTAAGTTATGGA----CTC--TAA--C--TGTTATATTAAAGAAGCCACAATTAAATGTGTTTTACTGTTAAAATGATCGAGTGAATTAAATTTTTTCATTAAA------TATCAAACGTTACACGTACTAGACCAGTTATTTT-ACCAACCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctcgtagaattgcaattcttaggtctacaagctagaaagaacaacataT-TTAA------ACA--AACTGTT-------------T---GTTT-----TTAG------TTT--------TGGCAAGTCCCGA---ATCATACCACAGTATGTATATAAGTAATAGTATCTTACAATAAAACAATAGTATGA-AAAGAAGCCATGTTTACGTATGATTTATTGTTAAAATGATAAGATAAATC---T---TGCAA--AATATATTT----AATAT------TAGTGAACAAGTCATGTTCACAAACCTGATAGTCATTATTAcaattaaaggcatatctaattaat
gi|6                          :                                                                                                                 cgtaagtaaatatgtaaatagtttattgtggcatgtacatggcaatacaataacgtatatattacaaactgattaataaagactcaatactctaggtctataaatcactgccaataatagcaatatgcaatttcacatgattagaaataattgactaaagcattaattgaattatgttagtaaactttcttaaatataaatatacatatggtaattagtcagatagttgtatatggagatttccttatctttaatgatgcttttgtcatacatgttgttactatttttcaacaaatgttcattagatatttcattttctgtacataatctagcatgacatagtgtctggtttcattgacatcccgtaagattgtaatcataataactatatgattataagaaatttgattcgtcttctaatgcattgtgacacagaactatcaaactctctgtttaggacgacgttcgcctacatatcggcatgatgcaatcttaagtggaaaataccacacccaaactgtgccaaaattgtttattcacctttaataagctgtatatgattcattcacgaacctgtcT-TTAA------ATA--AAA-------------CGTAT---GTCC-----CTAA------TTT--------CAGCTTATCCCGA---ATC-TAAGcgggccccttttgttaattatatttctttaaaactaattgtagtccaaaaacgtcaaatgaaatccaatgtctgtaactgctttgtaactatg
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTGAACAAGTAAGTAAGTAAATAGTTTATAACAGTGACATGTGCATGATAGCACAATAATATATGTTTTACAAAATGATAAATAGAAGAGTAGAATAGAAGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATAAAGTTAATATTTTTATAGTGACACGTGCATGACAATACAAAAACGTATATATATATATTGCAGGTTAAATAGTAGAGAACC
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Reference ( family-700 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAATAATAGAGCACCCGGCCCANTGGGCCTATAAGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CACATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATANAT---AGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAG---AG--TT-TCT-C--C-----T--TT----------A-A-GAT--ATGCCTTTGTCAAA-AACTTCGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCATTTT-ATGTACAGAATCTAACATT--AT--AT--AGTC--TCTGGTTTCAATGA---CT-TCCTGTAGANTTGCGTTTCTTAAGTCNACATNAAAAGTATAGTCTAATAAGAAATNTGATTCGTCTTCTACTGTC-CTTGTGTCACAGAACCGG-NAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCGCCTACGTATCGGCCTGTTTCAATTCTCAGTGGAANAATACC------ACACCCGAACTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----A--CG----AAATG-----TT---------CGCA----T---GTTC----------TTA--------GTT-----------T----------CGGCATATCCCGAATCGTACGACACCATATATTTAAGTAATAGTTTCT--------AACAATATTATGT-AAAGAAGCCATANTTACGTGTGTTTTATTGTTAAAATGATNAANTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCAGTTA-T-TTCACAAACCTGANAGCCATNATTAAA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                             atgtcagtaggtaagtcaatagtatactacagtgatatgctcatgacagtacaaacatatatgcattacaaaatgaCACTGCCAATGAAGTAGT--T---GGTAATGAACATTTT-GACACGGAAAC----AAGTGA--TG----GGGGTTG-----GCATCGAC---AGAA-----TATTGTAAGT---------AAAGCATAAC-TATACA---TA-T-----TTAT----GTATCGG--T-TAAT--TAA------------T-C--C-----T--TTATTTTAAAAAA-A-AAG--AGGATTTTGTCAAA-A-----GCTACATGTCTTTGA-TAATTGT--TCATCA--------ACACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATAAACTTTCAAAAGCACAAA-T-CAGA---TA-TGGTGTCTAA----CTAGTAG--TGAACA--TAG---CG--TT-TCTCC--C-----T--TT----------T-A-GAT--ATACCATTGTCAAT-AACTTTGCAACCATTCTTTGA-CAATTAT--TCCGTA-------GATATTTCATTTTCATGTACAATATCTAACAGT--AT--AT--GGTA--TCTGGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G----G-----A-----ACACTTATTTAAGAA-----TAATGTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGA---TA-TGGTGATTGA----ATTGTAG--TGTAAA--CAGAGTAG--TT-TCC-CTTT-----T--TT----------A-A-GATACATACCTTaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTCTCAAGTCAACATGAACTGTTCAGGCTAATATGAA-TTTGATTTGTCTTCTA-TACCACTTGTGCAACATAACCGT-TAAATTCTTTGAGTAG---GAGATTTC-CCTACTTGACGGCTTGTTTC-ATTCatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAAAT---AGAAGAGCATAATGTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGA---TA-TGGTGATTAA----GTAGTAG--TGTAAA--TAT---AG--TT-TTC-C--T-----T--TT----------T-A-GAT--ATACCTTTGTCAAA-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgATATGCAATTT-CATATGATATT----AAGCAAATTG----G-----A-----AAATGAAT---AGAA-----TAATTTAGGTAAATTCTCAAAAGCcatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----ACATAAAT---AGAA-----TAATGTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGCAG--TGTTTA--TAA---AG--AT-TCT-C--CTT---T--TT----------T-A-GAT--ATGTCTTTGTCAAtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -----A-----ACATTAAT---AGAA-----TACTTAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGT---TG-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAA---TG--GT-CCT-T--CAAAGTT--TT----------T-A-G----ATGCCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTAGGCCTATTTGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---ATTAATATGCAATTTTCCCATGTTAGT----AATCAA--TG----G-----A-----ACATAAAT---AGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAGTGCACAAA-TGAAGA---CA-CGGTGATTGA----ATAATAG--TGTAAA--CAA---AT--TT-TCA-C--C-----TG-TT----------A-A-GAT--ATGCCTTTGTAAAA-AAAT--GCCACCTTTCTTTGA-CAATTGTAATAATAACAATTGTGATAATTTAGTTT-ATATATAAAATTTAACATT--GT--AT--AGTC--TCTGGTTGCAGTGATATCTATCTTGTAGAGTTGCATTTATTAAGTCTATATCAAAAG--TAGTCTAATTAAAAATGTAATTCGTCTTCAACTGTC-CTGGTGTCACAGAACCGGCAAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCACCTATGTATTGGCCTGTTTCAATTATCAGTGGAAAAATACC------ACA-CCAAACTGTGTAAAATTTGAT------CG----TTCACTT-TTAATAT-----A--TG----ACATG-----TT---------CACA----TATGGTTCACTCGTGAAATT---------GTC-----------TTTAAATAAAACGGCATATCTCGAATCTTACGAGACCATATATTTGAAAAATAGTTTCT--------AACAATATAATGT-AAAAAAACCATAGTTACAGGTGTTTTATTGTTAAAATGGTTAACTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCA--TA---TTCACAAATCTGAAAGCTATAATTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                             atacgtaagtaagtaaatagtttattatagacatgcctccacaatgatatatgttttacaaaatgacaaatTAAATAGTAGAGCACTCGGCCCATTGGGGCTATAAGTCACTGCCAAT-GAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CATATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATACAT---A-AA-----TACTGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGA---TA-TGGTGTTTAA----ATAGTAG--TATAAA--TAG---AG--TT-TCT-C--C-----T--TT----------AGA-GAT--ATGCCTTTGTCAAA-ACTTTTGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCAGTTT-ATGTATAAATTCTAACATT--GC--AT--AGTC--ACTGGTTGCAATGA---CT-TTTTTTAGATTGGCATTTCTTCAGTCGATATCAACAGCACAGTCCTATAGCAAATTTGATTCGCCTTTCACTGTC-CCTGTGTCACAGCACCGG-AAAAGTCTTTGACTAG---AA-CTTTCGCCTACGT-TCGACCTGTTTCAATTCTCAGAGGAAGAATACC------ACATGTGAATTGTGCCAAAATTGAC------CG----TTTACTT-TTA--AT-----G--TA----AAATG-----TT---------CGTA----T---GTTC----------TTA--------ATT-----------T----------CGGCCTATCCGGAATCGTAAGAAACCATATATTTGAAAAATAGTTACT--------AGCAATGTTATGT-AAAGTAGCCATGTTTACAGATGTTTTATGATTGAAATGATTAAGTAAATCGAATTCATGCAT--AA----------TA-ATGTTACCAGACCAGTTATT-TTCACAAATCTGATAGTAATAATTAAAggcttattttgttagtcgtttcaaaattgatcagtctattccaaaaaacgcaacattgaaatccaatgtcggtaactacatggcaaccatg
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAA-----TAATGTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGA---TA-TGGTGATTGA----ATTGTAG--TGTAAA--CAGAGTAGTT-TCC-CTTT-----T-T----T----------A-AGATACATACCTTaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaacacttatttaTTTCTCAAGTCAACATGAACTGTTCAGGCTAATATGAA-TTTGATTTGTCTTCTA--TACCACTTGTGCAACATAACCGTT-AAATTCTTTGAGTAG---GAGATTTC-CCTACTTGACGGCTTGTTTC-ATTCatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATAAATAGAAGAGCATAATGTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGA---TA-TGGTGATTAA----GTAGTAG--TGTAAA--TAT---AGTT-TTC-C--T-----T-T----T----------T-AGAT--ATACCTTTGTCAAA-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgATATGCAATTT-CATATGATATT----AAGCAAATTG----G-----A-----AAATGAATAGAA-----TAATTTAGGTAAATTCTCAAAAGCcatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGCAG--TGTTTA--TAA---AGAT-TCT-C--CTT---T-T----T----------T-AGAT--ATGTCTTTGTCAAtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -----A-----ACATTAATAGAA-----TACTTAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGT---TG-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAA---TGGT-CCT-T--CAAAGTT-T----T----------T-AG----ATGCCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-GTAGGCCTATTTGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---ATTAATATGCAATTTTCCCATGTTAGT----AATCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAGTGCACAAA-TGAAGA---CA-CGGTGATTGA----ATAATAG--TGTAAA--CAA---ATTT-TCA-C--C-----TGT----T----------A-AGAT--ATGCCTTTGTAAAA-AAAT--GCCACCTTTCTTTGA-CAATTGTAATAATAACAATTGTGATAATTTAGTTT-ATATATAAAATTTAACATTGTAT------AGTC--TCTGGTTGCAGTGATATCTATCTTGTAGAGTTGCATTTATTAAGTCTATATCAAAAGT--AGTCTAATTAAAAATGTAATTCGTCTTCAAC-TGTC-CTGGTGTCACAGAACCGGCAAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCACCTATGTATTGGCCTGTTTCAATTATCAGTGGAAAAATACC------ACA-CCAAACTGTGTAAAATTTGAT------CG----TTCACTT-TTAATAT-----A---TG-ACATG-----TT---------CACA-------------------TATGGTT----CACTCGTGAAATT-GTCTTTAAATAAAACGGCATATCTCGAATCTTACGAGACCATATATTTGAAAAATAGTTTCT--------AACAATATAATGT-AAAAAAACCATAGTTACAGGTGTTTTATTGTTAAAATGGTTAACTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCA--TA---TTCACAAATCTGAAAGCTATAATTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              atacgtaagtaagtaaatagtttattatagacatgcctccacaatgatatatgttttacaaaatgacaaatTAAATAGTAGAGCACTCGGCCCA-TTGGGGCTATAAGTCACTGCCAAT-GAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CATATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATACATA-AA-----TACTGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGA---TA-TGGTGTTTAA----ATAGTAG--TATAAA--TAG---AGTT-TCT-C--C-----T-T----T----------AGAGAT--ATGCCTTTGTCAAA-ACTTTTGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCAGTTT-ATGTATAAATTCTAACATTGCAT------AGTC--ACTGGTTGCAATGA---CT-TTTTTTAGATTGGCATTTCTTCAGTCGATATCAACAGCACAGTCCTATAGCAAATTTGATTCGCCTTTCAC-TGTC-CCTGTGTCACAGCACCGGA-AAAGTCTTTGACTAG---AA-CTTTCGCCTACGT-TCGACCTGTTTCAATTCTCAGAGGAAGAATACC------ACATGTGAATTGTGCCAAAATTGAC------CG----TTTACTT-TTA--AT-----G---TA-AAATG-----TT---------CGTA-------------------T---GTT----C----------TTAATTT----------CGGCCTATCCGGAATCGTAAGAAACCATATATTTGAAAAATAGTTACT--------AGCAATGTTATGT-AAAGTAGCCATGTTTACAGATGTTTTATGATTGAAATGATTAAGTAAATCGAATTCATGCAT--AA----------TA-ATGTTACCAGACCAGTTATT-TTCACAAATCTGATAGTAATAATTAAAggcttattttgttagtcgtttcaaaattgatcagtctattccaaaaaacgcaacattgaaatccaatgtcggtaactacatggcaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATAGTAGAGCACCTGGAAGA-ATAT-CCTATAAGTCACTGACAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAACTC-CGCATGGTAAT----AAGCAA--TG----T-----C-----ACATAAATAAAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCATAAA-TGCAGA---TA-TGATAATTAA----AAAGCAG--TATAAA--CAG---AGTTCTTT-C--T-----T-T----T----------T-AGAT--ATGTCTTAATAAAA-AACGTCACCTCCTTTCTTTTG-TTGCTGT--TCACTA-------GACATTTCATTTT-ATGTACAGAATCTAACCTTTGATCGATTAAGTCGTTCT--TTTCCATGG---TA-TCCTGCAGGATTGCATGTCTTAAACCGACATAAAAAGT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCGTAT------TGTC--TCTAGTTGCAATGA---CT-TCCTGTAGAATTGCGTTTCTTAAGTCTACATAAAAAGTACAGTCTAATAAGAAGTGTAATTCGTCTTCCAC-TATT-CCTATGTCACAGAACTGGC-ATGGTCGCTGATAAG---AA-CTTTCGTCTGCATATCGGCCTGTTTCAGTTTTCGGTGAAAGAATACCAGTGTGATAACTAAATTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----AAG-CG-GCATG-----TT---------CACA-------------------T---ATcaattaaaggcatatctaattaat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAA-----TAATGTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGA---TA-TGGTGATTGA----ATTGTAG--TGTAAA--CAG-AGTAGT-TTCCC-----TT----T-TTTA---AGATACATACCTTaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaacacttatttaTTTCTCAAGTCAACATGAACTGTTCA-GGCTAATATGAA-TTTGATTTGTCTTCTA--TACCACTTGTGCAACATAACCGTT-AAATTCTTTGAGTAG---GAGATTTC-CCTACTTGACGGCTTGTTTC-ATTCatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATAAATAGAAGAGCATAATGTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGA---TA-TGGTGATTAA----GTAGTAG--TGTAAA--TAT-AGT--T-TTCCT-----TT----T-T------AGAT--ATACCTTTGTCAAA-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgATATGCAATTT-CATATGATATT----AAGCAAATTG----G-----A-----AAATGAATAGAA-----TAATTTAGGTAAATTCTCAAAAGCcatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGCAG--TGTTTA--TAA-AGA--T-TCTCCTT---TT----T-T------AGAT--ATGTCTTTGTCAAtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -----A-----ACATTAATAGAA-----TACTTAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGT---TG-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAA-TGG--T-CCTTCAAAGTTT----T-T------AG----ATGCCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-GTAGGCCTATTTGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---ATTAATATGCAATTTTCCCATGTTAGT----AATCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAGTGCACAAA-TGAAGA---CA-CGGTGATTGA----ATAATAG--TGTAAA--CAA-ATT--T-TCACC-----TG----T-TA-----AGAT--ATGCCTTTGTAAAA-AAAT--GCCACCTTTCTTTGA-CAATTGTAATAATAACAATTGTGATAATTTAGTTT-ATATATAAAATTTAACATTGTAT------AGTC--TCTGGTTGCAGTGATATCTATCTTGTAGAGTTGCATTTATTAAGTCTATATCAAAAGT--A-GTCTAATTAAAAATGTAATTCGTCTTCAAC-TGTC-CTGGTGTCACAGAACCGGCAAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCACCTATGTATTGGCCTGTTTCAATTATCAGTGGAAAAATACC------ACA-CCAAACTGTGTAAAATTTGAT------CG----TTCACTT-TTAATAT-----A---TG-ACATG-----TT---------CACA-------------------TATGGTT----CACTCGTGAAATT-GTCTTTAAATAAAACGGCATATCTCGAATCTTACGAGACCATATATTTGAAAAATAGTTTCT--------AACAATATAATGT-AAAAAAACCATAGTTACAGGTGTTTTATTGTTAAAATGGTTAACTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCA--TA---TTCACAAATCTGAAAGCTATAATTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              atacgtaagtaagtaaatagtttattatagacatgcctccacaatgatatatgttttacaaaatgacaaatTAAATAGTAGAGCACTCGGCCCA-TTGGGGCTATAAGTCACTGCCAAT-GAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CATATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATACATA-AA-----TACTGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGA---TA-TGGTGTTTAA----ATAGTAG--TATAAA--TAG-AGT--T-TCTCC-----TT----TAG------AGAT--ATGCCTTTGTCAAA-ACTTTTGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCAGTTT-ATGTATAAATTCTAACATTGCAT------AGTC--ACTGGTTGCAATGA---CT-TTTTTTAGATTGGCATTTCTTCAGTCGATATCAACAGCACA-GTCCTATAGCAAATTTGATTCGCCTTTCAC-TGTC-CCTGTGTCACAGCACCGGA-AAAGTCTTTGACTAG---AA-CTTTCGCCTACGT-TCGACCTGTTTCAATTCTCAGAGGAAGAATACC------ACATGTGAATTGTGCCAAAATTGAC------CG----TTTACTT-TTA--AT-----G---TA-AAATG-----TT---------CGTA-------------------T---GTT----C----------TTAATTT----------CGGCCTATCCGGAATCGTAAGAAACCATATATTTGAAAAATAGTTACT--------AGCAATGTTATGT-AAAGTAGCCATGTTTACAGATGTTTTATGATTGAAATGATTAAGTAAATCGAATTCATGCAT--AA----------TA-ATGTTACCAGACCAGTTATT-TTCACAAATCTGATAGTAATAATTAAAggcttattttgttagtcgtttcaaaattgatcagtctattccaaaaaacgcaacattgaaatccaatgtcggtaactacatggcaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATAGTAGAGCACCTGGAAGA-ATAT-CCTATAAGTCACTGACAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAACTC-CGCATGGTAAT----AAGCAA--TG----T-----C-----ACATAAATAAAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCATAAA-TGCAGA---TA-TGATAATTAA----AAAGCAG--TATAAA--CAG-AGT--TCTTTCT-----TT----T-T------AGAT--ATGTCTTAATAAAA-AACGTCACCTCCTTTCTTTTG-TTGCTGT--TCACTA-------GACATTTCATTTT-ATGTACAGAATCTAACCTTTGATCGATTAAGTCGTTCT--TTTCCATGG---TA-TCCTGCAGGATTGCATGTCTTAAACCGACATAAAAAGT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGTAT------TGTC--TCTAGTTGCAATGA---CT-TCCTGTAGAATTGCGTTTCTTAAGTCTACATAAAAAGTACA-GTCTAATAAGAAGTGTAATTCGTCTTCCAC-TATT-CCTATGTCACAGAACTGGC-ATGGTCGCTGATAAG---AA-CTTTCGTCTGCATATCGGCCTGTTTCAGTTTTCGGTGAAAGAATACCAGTGTGATAACTAAATTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----AAG-CG-GCATG-----TT---------CACA-------------------T---ATcaattaaaggcatatctaattaat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAA-----TAATGTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGA---TA-TGGTGATTGA----ATTGTAG--TGTAAA--CAG-AGTAGT-TTCCC-----TT----T-TTTA---AGATACATACCTTaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaacacttatttaTTTCTCAAGTCAACATGAACTGTTCA-GGCTAATATGAA-TTTGATTTGTCTTCTA--TACCACTTGTGCAACATAACCGTT-AAATTCTTTGAGTAG---GAGATTTC-CCTACTTGACGGCTTGTTTC-ATTCatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATAAATAGAAGAGCATAATGTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGA---TA-TGGTGATTAA----GTAGTAG--TGTAAA--TAT-AGT--T-TTCCT-----TT----T-T------AGAT--ATACCTTTGTCAAA-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgATATGCAATTT-CATATGATATT----AAGCAAATTG----G-----A-----AAATGAATAGAA-----TAATTTAGGTAAATTCTCAAAAGCcatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGCAG--TGTTTA--TAA-AGA--T-TCTCCTT---TT----T-T------AGAT--ATGTCTTTGTCAAtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -----A-----ACATTAATAGAA-----TACTTAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGT---TG-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAA-TGG--T-CCTTCAAAGTTT----T-T------AG----ATGCCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-GTAGGCCTATTTGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---ATTAATATGCAATTTTCCCATGTTAGT----AATCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAGTGCACAAA-TGAAGA---CA-CGGTGATTGA----ATAATAG--TGTAAA--CAA-ATT--T-TCACC-----TG----T-TA-----AGAT--ATGCCTTTGTAAAA-AAAT--GCCACCTTTCTTTGA-CAATTGTAATAATAACAATTGTGATAATTTAGTTT-ATATATAAAATTTAACATTGTAT------AGTC--TCTGGTTGCAGTGATATCTATCTTGTAGAGTTGCATTTATTAAGTCTATATCAAAAGT--A-GTCTAATTAAAAATGTAATTCGTCTTCAAC-TGTC-CTGGTGTCACAGAACCGGCAAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCACCTATGTATTGGCCTGTTTCAATTATCAGTGGAAAAATACC------ACA-CCAAACTGTGTAAAATTTGAT------CG----TTCACTT-TTAATAT-----A---TG-ACATG-----TT---------CACA-------------------TATGGTT----CACTCGTGAAATT-GTCTTTAAATAAAACGGCATATCTCGAATCTTACGAGACCATATATTTGAAAAATAGTTTCT--------AACAATATAATGT-AAAAAAACCATAGTTACAGGTGTTTTATTGTTAAAATGGTTAACTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCA--TA---TTCACAAATCTGAAAGCTATAATTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              atacgtaagtaagtaaatagtttattatagacatgcctccacaatgatatatgttttacaaaatgacaaatTAAATAGTAGAGCACTCGGCCCA-TTGGGGCTATAAGTCACTGCCAAT-GAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CATATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATACATA-AA-----TACTGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGA---TA-TGGTGTTTAA----ATAGTAG--TATAAA--TAG-AGT--T-TCTCC-----TT----TAG------AGAT--ATGCCTTTGTCAAA-ACTTTTGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCAGTTT-ATGTATAAATTCTAACATTGCAT------AGTC--ACTGGTTGCAATGA---CT-TTTTTTAGATTGGCATTTCTTCAGTCGATATCAACAGCACA-GTCCTATAGCAAATTTGATTCGCCTTTCAC-TGTC-CCTGTGTCACAGCACCGGA-AAAGTCTTTGACTAG---AA-CTTTCGCCTACGT-TCGACCTGTTTCAATTCTCAGAGGAAGAATACC------ACATGTGAATTGTGCCAAAATTGAC------CG----TTTACTT-TTA--AT-----G---TA-AAATG-----TT---------CGTA-------------------T---GTT----C----------TTAATTT----------CGGCCTATCCGGAATCGTAAGAAACCATATATTTGAAAAATAGTTACT--------AGCAATGTTATGT-AAAGTAGCCATGTTTACAGATGTTTTATGATTGAAATGATTAAGTAAATCGAATTCATGCAT--AA----------TA-ATGTTACCAGACCAGTTATT-TTCACAAATCTGATAGTAATAATTAAAggcttattttgttagtcgtttcaaaattgatcagtctattccaaaaaacgcaacattgaaatccaatgtcggtaactacatggcaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATAGTAGAGCACCTGGAAGA-ATAT-CCTATAAGTCACTGACAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAACTC-CGCATGGTAAT----AAGCAA--TG----T-----C-----ACATAAATAAAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCATAAA-TGCAGA---TA-TGATAATTAA----AAAGCAG--TATAAA--CAG-AGT--TCTTTCT-----TT----T-T------AGAT--ATGTCTTAATAAAA-AACGTCACCTCCTTTCTTTTG-TTGCTGT--TCACTA-------GACATTTCATTTT-ATGTACAGAATCTAACCTTTGATCGATTAAGTCGTTCT--TTTCCATGG---TA-TCCTGCAGGATTGCATGTCTTAAACCGACATAAAAAGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgaataagtgagtaaatagtgtagtatagtgacatgtgaatgcatgacaatacaataatttatatattacaacatga-TCTCGTAGAATTGCAATTCTTAGGTC-----------TACA-AGCTAGAAAGAA--------------CAACATAT-----GTGTCATAAACCCGAC-AAAGTATCTGATTAG---GA-CGTTCGCCTACATTTCGTTTCAATTCAATCCTCAGTAGAATAAAACA------ACATCACAATTGTAATATAATTGATATTAGCCGCATATTCACGTATGA--ATCTCTCA---TG-AAAT-------TAAACCAAAACGTA-------------------C---GTT----C----------TCAGTTT----------TGACATATCATTTATCGTACGACACCAAACAATTAAGTTATGGACTCT--------AAC--TGTTATATTAAAGAAGCCACAATTAAATGTGTTTTACTGTTAAAATGATCGAGTGAATTAAATTTTTTCATTAAATATCAAACGTTACACG-TACTAGACCAGTTA-T-TTTACCAACCTgaacataatcatatcataactcgtaact
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGTAT------TGTC--TCTAGTTGCAATGA---CT-TCCTGTAGAATTGCGTTTCTTAAGTCTACATAAAAAGTACA-GTCTAATAAGAAGTGTAATTCGTCTTCCAC-TATT-CCTATGTCACAGAACTGGC-ATGGTCGCTGATAAG---AA-CTTTCGTCTGCATATCGGCCTGTTTCAGTTTTCGGTGAAAGAATACCAGTGTGATAACTAAATTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----AAG-CG-GCATG-----TT---------CACA-------------------T---ATcaattaaaggcatatctaattaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-TTA--A------A---TA-AAA------------------CGTA-------------------T---GTC----C----------CTAATTT----------CAGCTTATCCCGAATCggttcacatatggttcactcatgaaagtgtctttaaataaaacgtatgtccctaatttcagcttatcccgaatctaagttattcaaatgattaaattatg
gi|7                          : atcgtattgtctctagttgcaatgacttcctgtagaattgcgtttcttaagtctacataaaaagtacagtctaataagaagtgtaattcgtcttccactattcctatgtcacagaactggcatggtcgctgataagaactttcgtctgcatatcggcctgtttcagttttcggtgaaagaataccagtgtgataactaaattgtgccaaaattgatcgttcacttttaataagcggcatgttcacatatggttcacatatggttcactcatgaaagtgtcTATTAGAGCAACCGGCCGAAGTGG-CCTATAAGTCACTGCCTTT-AAATAA---A---TGTAATATGTAATTT-CACATGATAAT----GAGCAA--TG----G-----A-----ACATATATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCGGTAGCACACC-TGTAGT---CA------ATTAA----GTAATAG--TATTGA--TAG-AGT--G-TCTTCA----TT----T-A------AAAT--ATTATTTTGTCATA-ACCTTGGCCACCTTT-TCTGA--AATAGT--CCATTA-------GTAATTTTTTTTT-ACGCACAGAATCTAACAATATAT------AGTC--TCTGGTTTCAATAA---taagttattcaaatgattaaattatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         cacgacaacacaattacgtacacgttatgaactgataaatacttgAAAAAATAGAGCGCCCGGTCCA-GTGGGCCTATAAGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---AGTAATATACAATTT-CGCATGGTAATTAATAAGCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAAAA-----TAATCTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGAAGA---CA-GAGTGATTCA----ATTGTAG--TATAAA--TAGTAAT--A-TC-CA-----TT----T-T------AG----ATGCCTTTGTCAAA-AACTTAGCCACCTGTCTTTAATCAA-TGT--TT-----------GATGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                            ttattatatattgacagtacactaatacatgtattacaaaatgaaaAATAGAACACTCGACCTA-ATGACCGTAT-------TGTCAAT-AAATAGTACATGTAGTAATATACATTTT-CACATGAAAAT----AAGCAA--TACATTA-----A-----GCATAGAT-GGA-----TAAAGTA--TAGAT-----AAAGCACACA-TGTACATTTTA-T--TTATTAG----TCAGGAGGTTACAAAAGTCG-AAT--T-TCTAC-----TTG---T-T------AAAA--CTGCCTTTG--AAATAATTT


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Reference ( family-700 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATAGTAGAGCACCCGGCCCA-GTGGGCCTATAAGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CACATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAG-AGT--T-TCTCC-----TT----T-T------AGAT--ATGCCTTTGTCAAA-AACTTCGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCATTTT-ATGTACAAAATCTAACATTGTAT------AGTC--TCTGGTTNCAATGA---CT-TCCCGTAGAATTGCATTTCTTAAGTCGACATAAAAAGTACA-GNCTAATAAGAAATTTGATTCGTCTTCNAC-TGTC-CTTGTGTCACAGAACCGGC-AAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCGCCTACGTATCGGCCTGTTTCAATTCTCAGTGGAAGAATACC------ACATCCGAATTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----A---TG-ANATG-----TT---------CGCA-------------------T---GTT----C----------TTAGTTT----------CGGCATATCCCGAATCGTACGANACCATATATTTGAGNAATAGTTTCT--------AACAATGTTATGT-AAAGAAGCCATGNTTACANGTGTTTTATTGTTAAAATGATTAAGTAAATCGAATTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCAGTTA-T-TTCACAAACCTGATAGTNATAATTAAA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                               atgtcagtaggtaagtcaatagtatactacagtgatatgctcatgacagtacaaacatatatgcattacaaaatgaCACTGCCAATGAAGTAGT--T---GGTAATGAACATTTT-GACACGGAAAC----AAGTGA--TG----GGGGTTG-----GCATCGACAGAA-----TATTGTAAGT---------AAAGCATAAC-TATACA---TA-T-----TTAT----GTATCGG--T-TAAT--TAA------T-CCTTTA----TT----T-TAAAAAAAAAG--AGGATTTTGTCAAA-A-----GCTACATGTCTTTGA-TAATTGT--TCATCA--------ACACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATAAACTTTCAAAAGCACAAA-T-CAGA---TA-TGGTGTCTAA----CTAGTAG--TGAACA--TAG-CGT--T-TCTCCC----TT----T-T------AGAT--ATACCATTGTCAAT-AACTTTGCAACCATTCTTTGA-CAATTAT--TCCGTA-------GATATTTCATTTTCATGTACAATATCTAACAGTATAT------GGTA--TCTGGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAA-----TAATGTAGGTAACCATT-AAAAGCATATA-TGCAGA---TA-TGGTGATTGA----ATTGTAG--TGTAAA--CAG-AGTAGT-TTCCC-----TT----T-TTTA---AGATACATACCTTaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaacacttatttaTTTCTCAAGTCAACATGAACTGTTCA-GGCTAATATGAA-TTTGATTTGTCTTCTA--TACCACTTGTGCAACATAACCGTT-AAATTCTTTGAGTAG---GAGATTTC-CCTACTTGACGGCTTGTTTC-ATTCatctacgtttgcaaattcgggataaaaatgaccttgaactttgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATAAATAGAAGAGCATAATGTGGGTAAACTTTTAAAAGCACAAAATGTAGA---TA-TGGTGATTAA----GTAGTAG--TGTAAA--TAT-AGT--T-TTCCT-----TT----T-T------AGAT--ATACCTTTGTCAAA-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgATATGCAATTT-CATATGATATT----AAGCAAATTG----G-----A-----AAATGAATAGAA-----TAATTTAGGTAAATTCTCAAAAGCcatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGGAAACTTT-GAAGGCTCAAA-TGCAGA---TA-TGGTGATTAA----ATAGCAG--TGTTTA--TAA-AGA--T-TCTCCTT---TT----T-T------AGAT--ATGTCTTTGTCAAtatatgatgcctacagcaaaaacaatctcagatttctt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -----A-----ACATTAATAGAA-----TACTTAAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGT---TG-TGGTGATTAA----ATAGTAG--TGTAAA--TAA-TGG--T-CCTTCAAAGTTT----T-T------AG----ATGCCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-GTAGGCCTATTTGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---ATTAATATGCAATTTTCCCATGTTAGT----AATCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAGTGCACAAA-TGAAGA---CA-CGGTGATTGA----ATAATAG--TGTAAA--CAA-ATT--T-TCACC-----TG----T-TA-----AGAT--ATGCCTTTGTAAAA-AAAT--GCCACCTTTCTTTGA-CAATTGTAATAATAACAATTGTGATAATTTAGTTT-ATATATAAAATTTAACATTGTAT------AGTC--TCTGGTTGCAGTGATATCTATCTTGTAGAGTTGCATTTATTAAGTCTATATCAAAAGT--A-GTCTAATTAAAAATGTAATTCGTCTTCAAC-TGTC-CTGGTGTCACAGAACCGGCAAAAGTCTCTGATTAG---GA-CTTTCACCTATGTATTGGCCTGTTTCAATTATCAGTGGAAAAATACC------ACA-CCAAACTGTGTAAAATTTGAT------CG----TTCACTT-TTAATAT-----A---TG-ACATG-----TT---------CACA-------------------TATGGTT----CACTCGTGAAATT-GTCTTTAAATAAAACGGCATATCTCGAATCTTACGAGACCATATATTTGAAAAATAGTTTCT--------AACAATATAATGT-AAAAAAACCATAGTTACAGGTGTTTTATTGTTAAAATGGTTAACTAAATCGAGTTCTTGCAT--AATAT---AC-TTA-ACGTTACTAGACCA--TA---TTCACAAATCTGAAAGCTATAATTAAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              atacgtaagtaagtaaatagtttattatagacatgcctccacaatgatatatgttttacaaaatgacaaatTAAATAGTAGAGCACTCGGCCCA-TTGGGGCTATAAGTCACTGCCAAT-GAATAG---A---AGTAATATGCAATTT-CATATGATAAT----AAGCAA--TG----G-----A-----ACATACATA-AA-----TACTGTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGTAGA---TA-TGGTGTTTAA----ATAGTAG--TATAAA--TAG-AGT--T-TCTCC-----TT----TAG------AGAT--ATGCCTTTGTCAAA-ACTTTTGCCACCTTTCTTTGA-CAATTGT--TCATTA-------GATATTTCAGTTT-ATGTATAAATTCTAACATTGCAT------AGTC--ACTGGTTGCAATGA---CT-TTTTTTAGATTGGCATTTCTTCAGTCGATATCAACAGCACA-GTCCTATAGCAAATTTGATTCGCCTTTCAC-TGTC-CCTGTGTCACAGCACCGGA-AAAGTCTTTGACTAG---AA-CTTTCGCCTACGT-TCGACCTGTTTCAATTCTCAGAGGAAGAATACC------ACATGTGAATTGTGCCAAAATTGAC------CG----TTTACTT-TTA--AT-----G---TA-AAATG-----TT---------CGTA-------------------T---GTT----C----------TTAATTT----------CGGCCTATCCGGAATCGTAAGAAACCATATATTTGAAAAATAGTTACT--------AGCAATGTTATGT-AAAGTAGCCATGTTTACAGATGTTTTATGATTGAAATGATTAAGTAAATCGAATTCATGCAT--AA----------TA-ATGTTACCAGACCAGTTATT-TTCACAAATCTGATAGTAATAATTAAAggcttattttgttagtcgtttcaaaattgatcagtctattccaaaaaacgcaacattgaaatccaatgtcggtaactacatggcaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATAGTAGAGCACCTGGAAGA-ATAT-CCTATAAGTCACTGACAAT-AAATAG---A---AGTAATATGCAACTC-CGCATGGTAAT----AAGCAA--TG----T-----C-----ACATAAATAAAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCAAAAGCATAAA-TGCAGA---TA-TGATAATTAA----AAAGCAG--TATAAA--CAG-AGT--TCTTTCT-----TT----T-T------AGAT--ATGTCTTAATAAAA-AACGTCACCTCCTTTCTTTTG-TTGCTGT--TCACTA-------GACATTTCATTTT-ATGTACAGAATCTAACCTTTGATCGATTAAGTCGTTCT--TTTCCATGG---TA-TCCTGCAGGATTGCATGTCTTAAACCGACATAAAAAGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgaataagtgagtaaatagtgtagtatagtgacatgtgaatgcatgacaatacaataatttatatattacaacatga-TCTCGTAGAATTGCAATTCTTAGGTC-----------TACA-AGCTAGAAAGAA--------------CAACATAT-----GTGTCATAAACCCGAC-AAAGTATCTGATTAG---GA-CGTTCGCCTACATTTCGTTTCAATTCAATCCTCAGTAGAATAAAACA------ACATCACAATTGTAATATAATTGATATTAGCCGCATATTCACGTATGA--ATCTCTCA---TG-AAAT-------TAAACCAAAACGTA-------------------C---GTT----C----------TCAGTTT----------TGACATATCATTTATCGTACGACACCAAACAATTAAGTTATGGACTCT--------AAC--TGTTATATTAAAGAAGCCACAATTAAATGTGTTTTACTGTTAAAATGATCGAGTGAATTAAATTTTTTCATTAAATATCAAACGTTACACG-TACTAGACCAGTTA-T-TTTACCAACCTgaacataatcatatcataactcgtaact
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGTAT------TGTC--TCTAGTTGCAATGA---CT-TCCTGTAGAATTGCGTTTCTTAAGTCTACATAAAAAGTACA-GTCTAATAAGAAGTGTAATTCGTCTTCCAC-TATT-CCTATGTCACAGAACTGGC-ATGGTCGCTGATAAG---AA-CTTTCGTCTGCATATCGGCCTGTTTCAGTTTTCGGTGAAAGAATACCAGTGTGATAACTAAATTGTGCCAAAATTGAT------CG----TTCACTT-TTA--AT-----AAG-CG-GCATG-----TT---------CACA-------------------T---ATcaattaaaggcatatctaattaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-TTA--A------A---TA-AAA------------------CGTA-------------------T---GTC----C----------CTAATTT----------CAGCTTATCCCGAATCggttcacatatggttcactcatgaaagtgtctttaaataaaacgtatgtccctaatttcagcttatcccgaatctaagttattcaaatgattaaattatg
gi|7                          : atcgtattgtctctagttgcaatgacttcctgtagaattgcgtttcttaagtctacataaaaagtacagtctaataagaagtgtaattcgtcttccactattcctatgtcacagaactggcatggtcgctgataagaactttcgtctgcatatcggcctgtttcagttttcggtgaaagaataccagtgtgataactaaattgtgccaaaattgatcgttcacttttaataagcggcatgttcacatatggttcacatatggttcactcatgaaagtgtcTATTAGAGCAACCGGCCGAAGTGG-CCTATAAGTCACTGCCTTT-AAATAA---A---TGTAATATGTAATTT-CACATGATAAT----GAGCAA--TG----G-----A-----ACATATATAGAA-----TAATGTAGGTAAACTTTCGGTAGCACACC-TGTAGT---CA------ATTAA----GTAATAG--TATTGA--TAG-AGT--G-TCTTCA----TT----T-A------AAAT--ATTATTTTGTCATA-ACCTTGGCCACCTTT-TCTGA--AATAGT--CCATTA-------GTAATTTTTTTTT-ACGCACAGAATCTAACAATATAT------AGTC--TCTGGTTTCAATAA---taagttattcaaatgattaaattatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         cacgacaacacaattacgtacacgttatgaactgataaatacttgAAAAAATAGAGCGCCCGGTCCA-GTGGGCCTATAAGTCACTGCCAAT-AAATAG---A---AGTAATATACAATTT-CGCATGGTAATTAATAAGCAA--TG----G-----A-----ACATAAATAAAA-----TAATCTAGGTAAACTTTCAAAAGCACAAA-TGAAGA---CA-GAGTGATTCA----ATTGTAG--TATAAA--TAGTAAT--A-TC-CA-----TT----T-T------AG----ATGCCTTTGTCAAA-AACTTAGCCACCTGTCTTTAATCAA-TGT--TT-----------GATGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                            ttattatatattgacagtacactaatacatgtattacaaaatgaaaAATAGAACACTCGACCTA-ATGACCGTAT-------TGTCAAT-AAATAGTACATGTAGTAATATACATTTT-CACATGAAAAT----AAGCAA--TACATTA-----A-----GCATAGAT-GGA-----TAAAGTA--TAGAT-----AAAGCACACA-TGTACATTTTA-T--TTATTAG----TCAGGAGGTTACAAAAGTCG-AAT--T-TCTAC-----TTG---T-T------AAAA--CTGCCTTTG--AAATAATTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTGAACAAGTAAGTAAGTAAATAGTTTATAACAGTGACATGTGCATGATAGCACAATAATATATGTTTTACAAAATGATAAATAGAAGAGTAGAATAGAAGAAT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATAAAGTTAATATTTTTATAGTGACACGTGCATGACAATACAAAAACGTATATATATATATTGCAGGTTAAATAGTAGAGAACC
Unaligned ( gi|21 ): AGTAAATAAAGTAAATATTTTTATAGTGACACGTGCATGACAATACAAAAAAGTATATATATTACAAAATGTTAAATAGTAAAGA
Unaligned ( gi|22 ): TGATCACCTGGCATGTTGACATATGGTTCGCCCACGAAATGGTCTTTAAATAAAA