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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAATATAT----AGTTATAGTGGCCGCA-GT-AAAGC------CAGGT----GCACACG--G---AAG-------CTG------C-TAA----AACA---CAT-------GTCCGT-GATAT-----AGCACAAATGCTCACGG-----AGGC-T------G--C--A--A---ACGTT-----T--A----TAG--TGC---CCGTG--AT---AAAG-CAT--AT-TA---TTC--ACGGAA---------GCT---GGGAA-AAAA-ACA---A----AA-------------------CAAA--AGAAA--AACA----CATATAA--TG---CTAG-T-GTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCTTTGT-TTAAA--G--ATATAGATACA----G----TGCCCGTGGTGAAAG--T-AGA--TGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-TA-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AAATTTACGTAAAGCAATATCATG--AAATCAGAACGCTAGAC-ACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATA-TACAC--AAGTGTCAT-G-CAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATAT------TGAAA--A-ATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG--------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGA--CGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTGAGATA-------------GACCAGGTAACT-----GACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGC--GATAAGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCT---T--GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATA---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTATTATTTATATTAATAAGTACAATATTTATATTTTAATGTGTGGTTTTCCTATGTTGAAGAAACAGAGACTGAGAGATAATATATATGAAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAATATAT----GGATATAGTGCCCGTG-AT-GAAAC------CAGAT----GCCCACA--G---AAG-------CTG------CTTAC----AACA---TAT-------GCCCGT-GGTAA-----AGTTTAAATACTCACGG-----TAGC-T------G--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgtttAAATATAT----AA--ACAGTACCTGCG-GT-AAAAC------CAGAT----GCTCACG--G---AAG-------CTG---------AC----AACA---TAT-------GCCCGT-GGTAA-----AGCA-AGATGCTCACGG-----AAGC-TTTATTAA--A--A--A---ATATA-----T--A----TAA--TGC---CCGTG--CT---AAAG-GAA--GA-TG---CTC--ACGGAC---------GCT---G------------------------------------------CTAA--TG--------G----CAT---A--TG---CCCG-T-GGTAAATCAA--AA-------ATGATCACG--GAAGCTTTAT-TTAAA--A--ATTT--ATATA----G----TGCCCGTGGT-AAAG--CAAAA--TGCTCACGGAAGCT----------GCT-AA-TG-Attaaattgacgtaatgcaatataatgaaatcagaacgctagacactcctttttgtttttgaaatggtggagtgtataaaaatgttaatatactaaggatatggtatagaatatagaagctgacaggacacggtcctgcagtatcgaagtatatacgaatatcggattcgagaccattgagagttatatatacacgcaagtgtcataacaatataccagtccgtaccgaccgtattacataattaaaatgacaaagtcgatatataaatatagaaaaattatactgtactccccatgaatttatgatcacccaatgcgcctcactgctgtcatgatggcatgtcgtatggaccggtagaaccgctgctgtccaaactgattcaggtggacgccatcgtcacggaagatgggtgttcggaccccgaagatccgtctttgacaccagaagcgaatgttatcatggacaccaagcaatgtgttgtgttagtgtatacctgcttgtcctcgtgcatttcggcagaaatacaccgtggtttaatcctcgagaatatttcacacatcacaacctgtccaacattatagtcattatgtagcataacagccaagtcctcaatatcactcgctagtgtcaatggatgaatatgctcacataagtcattacctccaatttttataacaacaaccgccggtgcaacttcgagtaaaaaagtatgaacatggcgcagaaacgcattcttgtacgtgacttgcaatccaccaaatcgtttatgaacagcactgcattttaccaattcataatctgctaacatacccccctacacacagatgaagaaacagcatggccaagacgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcgcaccgaagtatccgccatgtttgtttaactacacaacaccatgcgttgaaattaaaagtctgtgacgtgtaaacaatctaggtgtaaaacacaagaaattgacagtagtcagtagaaacaatatacctggatatcactgttcaaacaaggaatgataaaatatagacactaatcaaaacgaaaaacaaatgtgttaacaaataactacgtgtgttccaagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgagagcttatccgtcatacttccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagagatgtgcggttcgagagtgttttgattagtaactaagataaaggatctccactggcccggtaactgaccaaacattgacgagctaaacggtgatgcttccaacagagcttgtgtatgtgcggtgaggcttccgataaaaaactgattatacaatacacgcttcccttagctcgagttatgaaacgcgctatgattttc
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATA-TGCCCGTG-GT-AAAGC------CAGTT----GGTCATG--G---AGG-------CTG--------TAGT---AACG---TAT-------GCCCGT-GTTATGCTAAAGCATAAATGCTCACGG-----AAGC-T------G--T--A--A---Agtacaaatatgttctgaaatataaggaaagcagaacgctagactatccgttttgtgttttaaatgactgtatccacatgttaattttctaaggatatggtatagcatataaaagctgacaggacacgatcctgcagtatttatttatatacgaatatcggatccgagaccattgagagttatatattatcaagtgtcttagaaatataaaagatcgtattacttaattaaaatcacaaagatataatatagtactcgccgagaatttacgatcccacaatgcgtctcattgctgtcatgtcgtatagaccggttgaactgcagctgttcaaactgatttaggtggacaccatcgtcaatgaagacgggtgttcgggccgtcaatgacgccagaagcgaatgttatcatggacatcaagcaatgtgtttagtattgtgttggtttgtacacacttgtcctcgtacatctcggcagaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatttcacacatcacggcctgttccactttagcataacagcaaagtccttcaaatcaatcgctagtttctatagataaatatgctcacataagtcggaagttttttgccaatttcattactccaatttgtagaataatgaccgccggtgcaacttgatcgaagttaaaaagtatgaaaatggcgcatgaacgcattcttg
gi|8                          : tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggctataatgctggatgtgaaagcatgcaacaggtttatgcgctcgaagaagctaataacaaaaacagaTGTCCGTT-GT-TAAGCA-----TAAAT----GCTCACG--T---AAG-------CTT------T-TAA----AAGA---TATATACAGAGCCCGT-GGTAA-----AGTATAAATGCT------------GT-T------A--A--A--A---ATATA-----TAAA----CAG--TAC---CTGCG--GT---AAAACCAG--A--TG---CTC--ACGGAA---------GCT---G----------ACA---------------------------------------------A----CAT---A--TG---CCCG-T-GGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCTTTAT-TAAAA--A--ATAT--ATATA----A----TGCCCGTGCTAAAGG--A-AGA--TGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-TG-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAAATTTATATAGTGC----CCGTGGTAAAGCAAAATGCTaacacataaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaCCGTG-GG-AAAGC------CAGGT----GCTCACG--G---AAG-------CTG------T-TAT----AACG---TAT-------Gcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agcacaaatgctcacagaagctgcgaataacatacaaaagtagatgcttgtggtagcataagggaaatatagcgtgctcgtgcaaaagcatagaccctaacggaagcaaaacaaaaatatataatgtactcgtgtcaaatcagaaatgttcacggaatatcAGCA-----CAAAT----GCTCACA--G---AAG-------CTG------C-GAAT---AACA---TAC-------A---------AA-----AGTA--GATGCTTGTGG-----TAGCATAAG---G--G--A--A---A---------T--A----TAGCGTGC---TCGTG--CA---AAAG-CAT--AG--A---CCCTAACGGAA---------GC-----------AAA-ACA---A----AAATATATAATGTACTCGTGTCAAATCAGAAA--TGTT----CACGGAA--TAT--CCCG-T-GGGAAAGCC---AG-------GTGCTCACG--GAAGCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGT----GCACGTG--G---AAC-------CAA------C-TCA----TGC----CAT-------GTCCGTTGTTA------AGCATAAATGCTCACGT-----AAGC-T------gttataacgtatg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtttaaatatatggatatagT-------GCCTGT-GCTAA-----AGCATAAATGCTCACGGTTAAAGGGT-T------GTTC--T--G---ACCTTCCTAAT--A----AAG--TGC---CTGTG--CT---AAAG-CAT--A---AAGGCTC--ACGGAA---------GAT---GT-------------------------------------------------AAA--AACA----CATAAAG--TG---CCCG-T-GCTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCTTAATAATAAT--ACTATATATATATA----G----TGACCCTGGTAAAGC--T-TAA--TGCTCATGGAAGCT----------G---TA-CA-A-ATA-TGTTCttaaattgacgtaatgcaatataatgaaatcagaacgctagacactcctttttgtttttgaaatggtggagtgtataaaaatgttaatatactaaggatatggtatagaatatagaagctgacaggacacggtcctgcagtatcgaagtatatacgaatatcggattcgagaccattgagagttatatatacacgcaagtgtcataacaatataccagtccgtaccgaccgtattacataattaaaatgacaaagtcgatatataaatatagaaaaattatactgtactccccatgaatttatgatcacccaatgcgcctcactgctgtcatgatggcatgtcgtatggaccggtagaaccgctgctgtccaaactgattcaggtggacgccatcgtcacggaagatgggtgttcggaccccgaagatccgtctttgacaccagaagcgaatgttatcatggacaccaagcaatgtgttgtgttagtgtatacctgcttgtcctcgtgcatttcggcagaaatacaccgtggtttaatcctcgagaatatttcacacatcacaacctgtccaacattatagtcattatgtagcataacagccaagtcctcaatatcactcgctagtgtcaatggatgaatatgctcacataagtcattacctccaatttttataacaacaaccgccggtgcaacttcgagtaaaaaagtatgaacatggcgcagaaacgcattcttgtacgtgacttgcaatccaccaaatcgtttatgaacagcactgcattttaccaattcataatctgctaacatacccccctacacacagatgaagaaacagcatggccaagacgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcgcaccgaagtatccgccatgtttgtttaactacacaacaccatgcgttgaaattaaaagtctgtgacgtgtaaacaatctaggtgtaaaacacaagaaattgacagtagtcagtagaaacaatatacctggatatcactgttcaaacaaggaatgataaaatatagacactaatcaaaacgaaaaacaaatgtgttaacaaataactacgtgtgttccaagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgagagcttatccgtcatacttccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagagatgtgcggttcgagagtgttttgattagtaactaagataaaggatctccactggcccggtaactgaccaaacattgacgagctaaacggtgatgcttccaacagagcttgtgtatgtgcggtgaggcttccgataaaaaactgattatacaatacacgcttcccttagctcgagttatgaaacgcgctatgattttc
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -----T--A----TAG--TGC---CCGTG--ATG--AAAC-CAG--A--TG---CCC--ACAGAA---------GCT---G-----------C----T----TA-------------------CAA------------------CATA-----TG---CCCG-T-GGTAAAGTTT--AA-------ATACTCACG--GTAGC--TG--TTAAATTG--ACGTA-ATGCA----A----T----ATAATGAAAT--C-AGA--
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaatatgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcGCAGTATAAGG--TAAGCAGAACGCTAGAC-ATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCATagatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgttatAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTCtaatatagtactctcggtgaatttacgatcccacactgcgtctaattgctagatggcatgtcgtatagaccggtagaaccgctgatgtccaaaccgatttaggtggacgccgccgtcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagtaCATGATGGCATGTCGTATAGACCAGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTAGACGCCGTCGTCACTGAAGTCGGGTGTTCGGACCCCGAAGATCCGTCGATGACACCAGAAGATAATGTAATCATGGACATCAAGTAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTTTGTACACACTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGAAGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGCCATTCTTTAGCATAACAGCAAAGTCTCCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGAAGTGTATTTACCAATTTCATTACCTCCAGTTTGTAGAACAACGACCGCTGGTGCAACT---TTG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACGCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTATTGTGTAAGTGTGTACACACTTGTCCTCGTATATATCGGCA-AAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATGTCACACATCACAACATGTCCGACATTAAAATCATTCTTTAGCATAACAG-CAAGTCCTTCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGAATAAATATGCTCTCATAAGTCGTTTGCCAATT-------TCATTACCTCCAATTTGTAGAAGAACGATAGCCGATGCATCT---TCG-AGT-AAAAAGTATGAAAATGGCGCTTAAACGCATTCTGTTCCATGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGT--CAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgctatgaacC--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGT--CGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAG---TAGTCACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACT-----GACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCGTGATA-------------CCGAAT---TCAGGATT-G------CCACAGAGTT---TA-GCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaTCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAgtaaaact
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTT---TA-------------GACAAAGGAACTCCACTGACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGC--GATAAGAACT--------------------GATTCAGGTTTGCCACAGAG-T---TAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGAT-ACAA-CT--TGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAaagtgttaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgtgatgaatcggggtggtggtgggtaagaattaGAGCTTATCCG--TC-ATACTTCCAGCAGAGCTAATT--GCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtttaaatatatggatatagtgcccgtgatgaaaccagatgcccacagaagctgcttacaacatatgcccgtggtaaagtttaaatactcacggtagctgttaaattgacgtaatgcaatataatgaaatcagaacgctagacactcctttttgtttttgaaatggtggagtgtataaaaatgttaatatactaaggatatggtatagaatatagaagctgacaggacacggtcctgcagtatcgaagtatatacgaatatcggattcgagaccattgagagttatatatacacgcaagtgtcataacaatataccagtccgtaccgaccgtattacataattaaaatgacaaagtcgatatataaatatagaaaaattatactgtactccccatgaatttatgatcacccaatgcgcctcactgctgtcatgatggcatgtcgtatggaccggtagaaccgctgctgtccaaactgattcaggtggacgccatcgtcacggaagatgggtgttcggaccccgaagatccgtctttgacaccagaagcgaatgttatcatggacaccaagcaatgtgttgtgttagtgtatacctgcttgtcctcgtgcatttcggcagaaatacaccgtggtttaatcctcgagaatatttcacacatcacaacctgtccaacattatagtcattatgtagcataacagccaagtcctcaatatcactcgctagtgtcaatggatgaatatgctcacataagtcattacctccaatttttataacaacaaccgccggtgcaacttcgagtaaaaaagtatgaacatggcgcagaaacgcattcttgtacgtgacttgcaatccaccaaatcgtttatgaacagcactgcattttaccaattcataatctgctaacatacccccctacacacagatgaagaaacagcatggccaagacgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcgcaccgaagtatccgccatgtttgtttaactacacaacaccatgcgttgaaattaaaagtctgtgacgtgtaaacaatctaggtgtaaaacacaagaaattgacagtagtcagtagaaacaatatacctggatatcactgttcaaacaaggaatgataaaatatagacactaatcaaaacgaaaaacaaatgtgttaacaaataactacgtgtgttccaagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcga-ATGCTTCCAACAGAGCT---T--GTGTATGTGCGGTGAGGCTTCCGATAAAAAACTGATTATA---CAATACACGCTTCCCTTAGCTCGAGTTATGAAACGCGCTATGATTTTCgatgtgcggttcgagagtgttttgattagtaactaagataaaggatctccactggcccggtaactgaccaaacattgacgagctaaacggtgatgcttccaacagagcttgtgtatgtgcggtgaggcttccgataaaaaactgattatacaatacacgcttcccttagctcgagttatgaaacgcgctatgattttc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






Alignments
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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAATATATGGT-ATAGTGC---CCGTGGTAAAGCACAGAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-AAC------AT---A-T-------GCCCGTGNTAAAGCATAAATGCTCACGG---AAG-------C-T----GNAAACAT-----ATA--TAGTGC---CCGTGNTAAAGCAT--A-A-TGCTCACGGAAGCT---G------AAACAAAA-----CGNAG--AA--AACNCATATAATG--CCCG-TGNTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTAT-TTAAAA--ATATA-ATATAGTGCCCGTGGTGAAANCA--GATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AAATTNACGTAATGCAATATAANGAAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTATCCACATGTTAATATTCTAAGGATATGGTATAGCATATANAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATTACACGCAAGTGTCNTAGANAATATACCAGTCCGTANNGACCGTATTACNTAATTAAAATNACAAAGTCGATATACAAATAT-------GAGA--A-ATAATATAGTACTCNCCGTGAATTTACGATCCCACAATGCGTCTCATTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACTGAAGACGGGTGTTCGGACCCCGAAGATCCGTCGATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACATCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTNTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGNANGNTATTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTTTACCAATTCATAATCTGCTA-----ACANACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACNGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACANCATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACANAAAACAAATCGTGTTAACAATANAACTACGTGCGATCCGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTN-AGACAAA--ATCTCCACTGACCAGGNAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTAATTGC---T---GTGTGGAGAGGCTTGC--GATAAGA--------GTCCGAG-NTGTCCGGATTATGCTTCCNACAGAGCTTAGCGTNTGTGTGAAAAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTATACGATACACGCTTCCCTTAGCTCGAATTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :                       tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAAT---------GCTCACA----GAAGCTGC---GAATAAC------AT---A-C-------A--------AAAG--TAGATGCTTGTGG---TAG-------CATAA--GGGAA-AT-----ATA--GCGTGC---TCGTGCAAAAGCAT--AGA-CCCTAACGGAAGC----A------AAACAAAA-------------------ATATATAATGTACTCG-TGTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT-----------------------CCCGTGGGAAAGCCA--GGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-----A-ACGT-----A-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGTTATGCAGTATAAGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGCTATGAACACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TA--TAATGCTGACTGCGTTAAAGCATGCA-T-TATTTGC--AAGCTCCCG------AATCGAAAGTGCACGTGG--AACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----T-TTAAAAG-ATAT
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaatatgaaagggAAATATATAGTTATAGTGG---CCGCAGTAAAGC-CAGGT---------GCACACG----GAAGCTGC---TAA-AAC------AC---A-T-------GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGG---AGG-------C-T----GCAAACGT-----TTA--TAGTGC---CCGTGATAAAGCAT--A-T-TATTCACGGAAGCT---GGGAAAAAAACAAAA-----CAAAAGAAA--AACACATATAATG--CTAG-TGTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGT-TTAAAG--ATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAGTA--GATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AAATTTACGTAAAGCAATATCATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATAT---ACACAAGTGTCATG--CAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATT------GAAA--A-ATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG--------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTA-----ACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTAT---GTGTGAAAAGGCTAGC--GATAAGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA---------------TGGAGAGGCTTGCGTGATA-------------CCGAA-T--TCAGGATTG------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tATAAAGTG--CCTG-TGCTAAAGCAT--AA-------AGGCTCACG--GAAG------AT-GTAAAA--ACACA--TAAAGTGCCCGTGCT-AAAGCATAAATGCTCACGGAAGCTTAATAATAATACTATA-T-----ATATAT-----AGTGACCCTG----G-TAAAGCTTAA-TGCTCATGGAAGC--TGTAC---AAAT--ATGTTCTGAAATATAAGGAAAGCAGAACGCTAGACTATCCGTTTTGTGTTTTAAATG----ACTGTATCCACATGTTAATTTTCTAAGGATATGGTATAGCATATAAAAGCTGACAGGACACGATCCTGCAGTATTTATTTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATTAT---CAAGTGTCTTAGA-AATATA---------AAAGATCGTATTACTTAATTAAAATCACAAAG-------------AT---------------ATAATATAGTACTCGCCGAGAATTTACGATCCCACAATGCGTCTCATTGCTGTCATG--------TCGTATAGACCGGTTGAACTGCAGCTGTTCAAACTGATTTAGGTGGACACCATCGTCAATGAAGACGGGTGTTCGGG----------CCGTCAATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACATCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTGGTTTGTACACACTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACGGCCTGTTC--CA-----------CTTTAGCATAACAGCAAAGTCCTTCAAATCAATCGCTAGTTTCTATAGATAAATATGCTCACATAAGTCGGAAGTTTTTTGCCAATTTCATTA-CTCCAATTTGTAGAATAATGACCGCCGGTGCAACTTGATCGAAGTTAAAAAGTATGAAAATGGCGCATGAACGCATTCTTGttctgaaatataaggaaagcagaacgctagactatccgttttgtgttttaaatgactgtatccacatgttaattttctaaggatatggtatagcatataaaagctgacaggacacgatcctgcagtatttatttatatacgaatatcggatccgagaccattgagagttatatattatcaagtgtcttagaaatataaaagatcgtattacttaattaaaatcacaaagatataatatagtactcgccgagaatttacgatcccacaatgcgtctcattgctgtcatgtcgtatagaccggttgaactgcagctgttcaaactgatttaggtggacaccatcgtcaatgaagacgggtgttcgggccgtcaatgacgccagaagcgaatgttatcatggacatcaagcaatgtgtttagtattgtgttggtttgtacacacttgtcctcgtacatctcggcagaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatttcacacatcacggcctgttccactttagcataacagcaaagtccttcaaatcaatcgctagtttctatagataaatatgctcacataagtcggaagttttttgccaatttcattactccaatttgtagaataatgaccgccggtgcaacttgatcgaagttaaaaagtatgaaaatggcgcatgaacgcattcttg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatagtgcctgtgctaaagcataaatgctcacggttaaagggttgttctgaccttcctaAGTATTGTGTAAGTGTGTACACACTTGTCCTCGTATATATCGGCA-AAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATGTCACACATCACAACATGTCCGACATTAAAATCATTCTTTAGCATAACAGC-AAGTCCTTCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGAATAAATATGCTCTCATAAGTCG-------TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAAGAACGATAGCCGATGCATCT---TCG-AGT-AAAAAGTATGAAAATGGCGCTTAAACGCATTCTGTTCCATGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACAC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaGGT-ATAATGCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGCAAGCTCCCGAATCGAAAGTGCACGTGG-AACCAACTCATGCCA-T-------GTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGT---AAG-------C-TTTTAAAAGATAT-----ATA--CAGAGC---CCGTGGTAAAGTAT--A-AATGCT-------GTT---A------AAA----A-----TATAT--AA--A-------CAGTA--CCTG-CGGTAAAAC-C--AG-------ATGCTCACG--GAAGC---------TGACA--ACATA-------TGCCCGTGGTAAAGCAA--GATGCTCACGGAAGCT------------T-TA-TTAAAAA-ATATATATAA-TGCCCGTG----C-TAAAGGA-AGATGCTCACGGACGC--TGC-T---AA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaagTGT---CCGTTGTTAAGCATAAAT---------GCTCACG----TAAGCTTT---TAA-AAG------AT---A-TATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT----------G-------T-T----AAAAATAT-----ATAAACAGTAC---CTGCGGTAAAACCA--G-A-TGCTCACGGAAGCT---G------A--CAA----------------------CATAT---G--CCCG-TGGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTAT-TAAAAA--ATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGGAA--GATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-----G-GCAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAAATTTATATAGTGC-CCGTGGT-AAAGCAAAATGCTtggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTAT----ATAGTGC---CCGTGGTAAAGCA-AAAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGC---TTCAGTGTCGAGGGCCTTGC--GATAAGA--------A-CTGA-----TTCAGGTT-TG----CCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATGGT-ATAGTGC---CCGCGGTAAAGCACAAAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-AAC------AT---AT-------GCCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGGAAGC-T----GAAAACATATANA--G-TGCCCGCGNTAAAGCAT--A-ATGCTCACGG---AAG-------CT---G------AAACAAAA-----C----GTAAAAACA---CATATAGTGCCCG-TGNTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAA-ATATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGC----------TGCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AAATTTACGTAATGCAATATAATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATTACACGCAAGTGTCATAACAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :               tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAAT---------GCTCACA----GAAGCTGC---GAATAAC------AT---AC-------A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAA--GGGAA-ATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCAT--AGACCCTAACGG---AAG-------C---------------AAAA-----C------AAAAATA---TATAATGTACTCG-TGTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT---------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGC----------TG-T-TA-T-----A-ACGT-----A-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGTTATGCAGTATAAGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgctatgaac-T----GAAAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCA-TTATTTGC-----AAG-------CTCCCG------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATGTCCG-TTGTTAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGG---CCGCAGTAAAGC-CAGGT---------GCACACG----GAAGCTGC---TAA-AAC------AC---AT-------GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-T----GCAAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCAT--A-TTATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAACAAAA-----CAAAAG-AAAAACA---CATATAATGCTAG-TGTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAG-ATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGC----------TGCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AAATTTACGTAAAGCAATATCATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATAT---ACACAAGTGTCATG-CAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaGGT-ATAATGCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGCAAGCTCCCGAATCGAAAGTGCACGTGG-AACCAACTCATGCCAT-------GTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGC-TTTTAAAAGATATATACA--G-AGCCCGTGGTAAAGTATA-A-ATGCT----------G-------TT---A----------AAAA-----T----ATATAAAC---------AGTACCTG-CGGTAAAAC-C--AG-------ATGCTCACG--GAAGC--------TGACA-ACATA-------TGCCCGTGGTAAAGC-AAGATGCTCACGGAAGC----------T--T-TA-TTAAAAA-ATATATATAA-TGCCCGTG----C-TAAAGGA-AGATGCTCACGGACGC--TGC-T---AA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagTGT---CCGTTGTTAAGCATAAAT---------GCTCACG----TAAGCTTT---TAA-AAG------AT---ATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-T----AAAAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAACCA--G-ATGCTCACGG---AAG-------CT---G------A--CAA------------------------CATAT---GCCCG-TGGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAA-ATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGC----------TGCT-AA-T-----G-GCAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAAATTTATATAGTGC-CCGTGGT-AAAGCAAAATGCTtggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTAT----ATAGTGC---CCGTGGTAAAGCA-AAAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






Alignments
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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATGGT-ATAGTGC---CCGCGGTAAAGCACAAAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-AA----C------ATAC---GTCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGGAAGC-T----GAAAATATATANA--G-TGCCCGCGNTAAAGCATAAAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAAAA-----C----GTAAAAACA---CATANAGTGCCCG-TGNTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAAACATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AAATTTACGTAATGCAATATAATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACACGCAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :               tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAAT---------GCTCACA----GAAGCTGC---GAATAA----C------ATAC---A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAA--GGGAA-ATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGG---AAG------------------------CAAAA-----C------AAAAATA---TATAATGTACTCG-TGTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT--------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-----A-ACGT-----A-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGTTATGCAGTATAAGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgctatgaac-T----GAAAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATGTCCG-TTGTTAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAA
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGG---CCGCAGTAAAGC-CAGGT---------GCACACG----GAAGCTGC---TAA-AA----C------ACAT---GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-T----GCAAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAA--CAAAA-----CAAAAG-AAAAACA---CATATAATGCTAG-TGTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAGATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-----A-ACAT-----A-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AAATTTACGTAAAGCAATATCATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTATgatat
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaGGT-ATAATGCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGCAAGCTCCCGAATCGAAAGTGCACGTGG-AA----CCAACTCATGCCATGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGC-TTTTAAAAGATATATACA--G-AGCCCGTGGTAAAGTATAAAT-GCT----------G-------TT---A------------AAAA-----T----ATATAAAC---------AGTACCTG-CGGTAAAAC-C--AG-------ATGCTCACG--GAAGC--------TGACAACATA-------TGCCCGTGGTAAAGC-AAGATGCTCACGGAAGCT------------T-TA-TTAAAAA-ATATATATAA-TGCCCGTG----C-TAAAGGA-AGATGCTCACGGACGC--TGC-T---AA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagTGT---CCGTTGTTAAGCATAAAT---------GCTCACG----TAAGCTTT---TAA-AAGATAT------ATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-T----AAAAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAA------------------------CATA---TGCCCG-TGGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAAATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-----G-GCAT-----A-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAAATTTATATAGTGC-CCGTGGT-AAAGCAAAATGCTtggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTAT----ATAGTGC---CCGTGGTAAAGCA-AAAT---------GCTCACG----GAAGCTGC---TAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATGGT-ATAGTGCCCGCGGTAAAGCACAAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-AA----CATACGG--TCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGGAAGC-T--GAAAATATATANA--G-TGCCCGCGNTAAAGCATANAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAAAA-----C----GT--AA--AACACATANAGTGCCCG-TGNTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAAACATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-TA-ACATA-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AAATTTACGTAATGCAATATAATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACAC-CAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :            tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAATGCTCACAGAAGCTGCGAATAA----CATACA-----------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAAGGGAA-ATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGG---AAG------------------------CAAAA-----C----A---AA--AATATATAATGTACTCG-TGTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT--------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-TA-ACGTA-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTATGCAGTATAAGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgctatgaac-T--GAAAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATGTCCG-TTGTTAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAA
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGGCCGCAGTAAAGC-CAGGTGCACACGGAAGCTGCTAA-AA----CACATG---TCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-T--GCAAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAA--CAAAA-----CAAAAGA--AA--AACACATATAATGCTAG-TGTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAGATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-TA-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AAATTTACGTAAAGCAATATCATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTATgatat
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaTGCACGTGGAACCA----------ACT-CA-TG-CCAT---GTCCGTT----G-TTAAGCATAAATGCTCACGTAAGC--TTT-T---AAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagTGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGCTTTTAA-AAGATATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-T--AAAAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAA------------------------CATA---TGCCCG-TGGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAAATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-TG-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAAATTTATATAGTGC-CCGTGGT-AAAGCAAAATGCTagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTAT----ATAGTGCCCGTGGTAAAGCA-AAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATAGTTATAGTGNCCGCGGTAAAGCACAAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-AA----CATAC---GCCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGG-GGC-T---GAAAACGTATANA--G-TGCCCGCGNTAAAGCATANAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAAAA-----C----GT--AA--AACNCATANAATG--CCCG-T-GTTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAA-ATATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAATGCAATATA---ATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACAC-CAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :            tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAATGCTCACAGAAGCTGCGAATAA----CATAC---A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAAGGGAAA--TATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGG---AAG-------C-----------------AAAA-----C--------AA--AA-ATATATAATGTACTCG-T-GTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT---------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-A-ACGTA-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-----GTTATGCAGTATA---AGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgctatgaac-T---GAAAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGGCCGCAGTAAAGC-CAGGTGCACACGGAAGCTGCTAA-AA----CACAT---GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-T---GCAAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAA--CAAAA-----CAAAAGA--AA--AACACATATAATG--CTAG-T-GTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAG-ATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAAAGCAATATC---ATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaa-T---GAAAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT--ATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-GTTAAAAAT----------A---TA-TAA-ACA-G-TACCTGCG----G-TAAAACC-AGATGCTCACGGAAGC--TGA-C---AACATATGCCCGTGGTAAAGCAAGATGCTCACGGAAGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGCTTTTAA-AAGATATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-T---AAAAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAA------------------------CATA---TG--CCCG-T-GGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAA-ATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-G-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAA-ATTTAT-----ATAGTGC-CCGTG---GT-AAAGCAAAATGCTtttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTATA----TAGTGCCCGTGGTAAAGCA-AAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATAGTTATAGTGNCCGCGGTAAAGCACAAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-AA----CATAC---GCCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGG-GGC-TGA-AAANGTATANN--G-TGCCCGCGNTAAAGCATANAT-ACTCGCGG---AAG-------CT---G--------A--CGAAA-----C----GT--AA--AACTCATATAATG--CCCG-T-GTTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAA-ATATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAATGCAATATA---ATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACAC-CAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :            tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAATGCTCACAGAAGCTGCGAATAA----CATAC---A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAAGGGAAATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGG---AAG------------------------CAAAA-----C--------AA--AAAT-ATATAATGTACTCG-T-GTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT---------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-A-ACGTA-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AT-----GTTATGCAGTATA---AGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgctatgaac-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGGCCGCAGTAAAGC-CAGGTGCACACGGAAGCTGCTAA-AA----CACAT---GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-TGC-AAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAA--CAAAA-----CAAAAGA--AA--AACACATATAATG--CTAG-T-GTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAG-ATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAAAGCAATATC---ATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    catgatggcatgtcgtatagaccagtagaaccgctgctgtccaaactgatttaggtagacgccgtcgtcactgaagtcgggtgttcggaccccgaagatccgtcgatgacaccagaagataatgtaatcatggacatcaagtaatgtgtttagtattgtgttagtttgtacacacttgtcctcgtacatctcggcagaaatgcaccgaagtttgatcctcgtgaatatttcacacatcacaacctgtccgacattatagccattctttagcataacagcaaagtctcccaaatcactcgctagtgtcaatggatgaatatgctcacataagtcgaagtgtatttaccaatttcattacctccagtttgtagaacaacgaccgctggtgcaactttgagtaaaaaagtatgaaaatggcgcataaacgcattcttgtccgtgacgcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaTATA--G-TGCCTGTGCTAAAGCATAAAT-GCTCACGGTTAAAGGGTTGTTCT---G--------A--C---------C----TT--C-----CTAATAAAGTG--CCTG-T-GCTAAAGCAT--AA-------AGGCTCACG--GAAG------ATGTAAAA-ACACA--TAAAGTGCCCGTGCTAAAGCATAAATGCTCACGGAAGCTTAATAATAATACTATA-T-ATATATAGTGACCCTG----G-TAAAGCTTAA-TGCTCATGGAAGC--TGTAC---AA-AT--AT-----GTTCTGAAATATA---AGGAAAGCAGAACGCTAGACTATCCGTTTTGTGTTTTAAATG----ACTGTATCCACATGTTAATTTTCTAAGGATATGGTATAGCATATAAAAGCTGACAGGACACGATCCTGCAGTATTTATTTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATAT-TAT-CAAGTGTCTTAGAAATATA---------AAAGATCGTATTACTTAATTAAAATCACAAA---GAT-------------------------ATAATATAGTACTCGCCGAGAATTTACGATCCCACAATGCGTCTCATTGCTGT--------CATGTCGTATAGACCGGTTGAACTGCAGCTGTTCAAACTGATTTAGGTGGACACCATCGTCAATGAAGACGGGTGTTCGGG----------CCGTCAATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACATCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTGGTTTGTACACACTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACGGCCTGTTC--CA-----------CTTTAGCATAACAGCAAAGTCCTTCAAATCAATCGCTAGTTTCTATAGATAAATATGCTCACATAAGTCGGAAGTTT---TTTGCCAATTTCATTA-CTCCAATTTGTAGAATAATGACCGCCGGTGCAACTTGATCGAAGTTAAAAAGTATGAAAATGGCGCATGAACGCATTCTTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaa-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT--ATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-GTTAAAAAT----------A---TA-TAA-ACA-G-TACCTGCG----G-TAAAACC-AGATGCTCACGGAAGC--TGA-C---AACATATGCCCGTGGTAAAGCAAGATGCTCACGGAAGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGCTTTTAA-AAGATATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-TAA-AAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAA------------------------CATAT---G--CCCG-T-GGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAA-ATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-G-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAA-ATTTAT-----ATAGTGC-CCGTG---GT-AAAGCAAAATGCTtttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTATA----TAGTGCCCGTGGTAAAGCA-AAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATAGTTATAGTGNCCGCGGTAAAGCACAAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-AA----CATAC---GCCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGG-GGC-TGA-AAANGTATANN--G-TGCCCGCGNTAAAGCATANAT-ACTCGCGG---AAG-------CT---G--------A--CGAAA-----C----GT--AA--AACTCATATAATG--CCCG-T-GTTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTTAAAA-ATATA-ATATAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAATGCAATATA---ATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACAC-CAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCGA-----T---TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :            tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAATGCTCACAGAAGCTGCGAATAA----CATAC---A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAAGGGAAATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGG---AAG------------------------CAAAA-----C--------AA--AAAT-ATATAATGTACTCG-T-GTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA------TAT---------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-A-ACGTA-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AT-----GTTATGCAGTATA---AGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgctatgaac-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGGCCGCAGTAAAGC-CAGGTGCACACGGAAGCTGCTAA-AA----CACAT---GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-TGC-AAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGG---AAG-------CT---GGGAAAAAAA--CAAAA-----CAAAAGA--AA--AACACATATAATG--CTAG-T-GTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTGTTTAAAG-ATATAGATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAAAGCAATATC---ATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG-----------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    catgatggcatgtcgtatagaccagtagaaccgctgctgtccaaactgatttaggtagacgccgtcgtcactgaagtcgggtgttcggaccccgaagatccgtcgatgacaccagaagataatgtaatcatggacatcaagtaatgtgtttagtattgtgttagtttgtacacacttgtcctcgtacatctcggcagaaatgcaccgaagtttgatcctcgtgaatatttcacacatcacaacctgtccgacattatagccattctttagcataacagcaaagtctcccaaatcactcgctagtgtcaatggatgaatatgctcacataagtcgaagtgtatttaccaatttcattacctccagtttgtagaacaacgaccgctggtgcaactttgagtaaaaaagtatgaaaatggcgcataaacgcattcttgtccgtgacgcgcaatccaccgaatcctttatgaacaaTATA--G-TGCCTGTGCTAAAGCATAAAT-GCTCACGGTTAAAGGGTTGTTCT---G--------A--C---------C----TT--C-----CTAATAAAGTG--CCTG-T-GCTAAAGCAT--AA-------AGGCTCACG--GAAG------ATGTAAAA-ACACA--TAAAGTGCCCGTGCTAAAGCATAAATGCTCACGGAAGCTTAATAATAATACTATA-T-ATATATAGTGACCCTG----G-TAAAGCTTAA-TGCTCATGGAAGC--TGTAC---AA-AT--AT-----GTTCTGAAATATA---AGGAAAGCAGAACGCTAGACTATCCGTTTTGTGTTTTAAATG----ACTGTATCCACATGTTAATTTTCTAAGGATATGGTATAGCATATAAAAGCTGACAGGACACGATCCTGCAGTATTTATTTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATAT-TAT-CAAGTGTCTTAGAAATATA---------AAAGATCGTATTACTTAATTAAAATCACAAA---GAT-------------------------ATAATATAGTACTCGCCGAGAATTTACGATCCCACAATGCGTCTCATTGCTGT--------CATGTCGTATAGACCGGTTGAACTGCAGCTGTTCAAACTGATTTAGGTGGACACCATCGTCAATGAAGACGGGTGTTCGGG----------CCGTCAATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACATCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTGGTTTGTACACACTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACGGCCTGTTC--CA-----------CTTTAGCATAACAGCAAAGTCCTTCAAATCAATCGCTAGTTTCTATAGATAAATATGCTCACATAAGTCGGAAGTTT---TTTGCCAATTTCATTA-CTCCAATTTGTAGAATAATGACCGCCGGTGCAACTTGATCGAAGTTAAAAAGTATGAAAATGGCGCATGAACGCATTCTTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaa-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC-----AAG-------CTCCCG--------AATCGAAAGTGCAC----GTGGAACCAACTCATGCCATG--TCCG-TTGTTAA-GCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGCT-----TTTAAAAGATAT--ATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-GTTAAAAAT----------A---TA-TAA-ACA-G-TACCTGCG----G-TAAAACC-AGATGCTCACGGAAGC--TGA-C---AACATATGCCCGTGGTAAAGCAAGATGCTCACGGAAGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGCTTTTAA-AAGATATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-TAA-AAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGG---AAG-------CT---G--------A--CAA------------------------CATAT---G--CCCG-T-GGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCT--TTATTAAAAA-ATATA--TATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-G-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAA-ATTTAT-----ATAGTGC-CCGTG---GT-AAAGCAAAATGCTtttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTATA----TAGTGCCCGTGGTAAAGCA-AAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT






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Reference ( family-6987 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATNTATAGTTATAGTGNCCGCGGTAAAGCACAAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-AA----CATAC---GCCCGTGGTAAAGCATAAATGCTCGCGG-GGC-TGA-AAANGTATANN--G-TGCCCGCGNTAAAGCATANAT-ACTCGCGGAAGCT---G------AATCGAAAGT-CA-GTG----GAACCAACTCATATAATG--CCCG-TGTTAAAGCAT--AA-------ATGCTCACG--GAAGC-TT-ATT-TAAAA-ATAT-G-ATACAGTGCCCGTGGTAAAGC-CAGATGCTCACGGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGCCCGTG----G-TAAAGCNTAAATGCTCACGGAAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAATGCAATATA---ATGAAAGCAGAACGCTAGACACTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGANTGTATNCACATGTTAATATNCTAAGGATATGGTATAGNATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATACGAATATCGGATCCGAGACCATTGAGAGTTATATATACAC-CAAGTGTCATAGCAATATACCAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACAAAGTCGATATATAAATATCGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCGTGAATTTACGATCNCNCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCAAACTGATTTAGGTGGACGCCGTCGTCACNGAAGACGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCNATGACGCCAGAAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAGTATTGTGTTAGTGTGTACACGCTTGTCCTCGTACATCTCGGCAGAAATGCACCGTGGTTTGATCCTCGTGAATATTTCACACATCACAACCTGTCCGACATTATAGTCATTCTTTAGCATAACAGCNAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAGTCG-------TTTGCCAATTTCATTACCTCCAATTTGTAGAACAACGACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCATAAACGCATTCTTGTCCGTGACTCGCAATCCACCGAATCCTTTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGCCAAGNCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAGTATCCGCCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTAAACAATCCAGNTATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACGTAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTACGTGCGNTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTG-AGACAAAGGATCTCCACTGACCNGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCGGTCATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCGTATGTGTGGAGAGGCTTGCGATA--AGA--TGTGCGGTCCGAG-NTGTCCGGATT-ACGCTTCCCACAGAGCTTAGCGTNNGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAAAA-CTGATTANNCAATACACGCTNCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|10                         :            tgttatacctaggaaagtcatgatctgagaagaaaaaaaagtcgtcttagttgagtggtacgccgatagccaggcagaggtcctgaaagttgtgcagatcctgaaaagctagtgtgtacgaaggagccaaaaataggaaatcgtcaaaaattttaacaatattttttttgcgataaatttgtgggtggctatccacaataaagcagaattaaaagataaaaaaaattgacaactggaagaagttcacatcggtaaacacttatcgaagaaaaaaataaaaaaacatttgaaacctcaaagttcgtaatcgtcttggtggatagtgattatacggaatgccgcttcaatgtctgttttggccataaaagcgtgtttgccaatttgttttaagcccagcggcgaaaccctaaaattaggaaatggttcatgtttgaaaggtcccgccactctgcaagattctaattctttcgaaatcttctgggaaacaatagaagcatgtgaatgagcagaaagtaaattgggacaattttgacatcggcgtacgccctcaaaatttaatcggaaaccttctttaaagccattgaccaaatagtctgataacgttttatcgtatccttttaaaaacgattccaaaacccaccattttaccggaattggtagggaaatgttacgatttcctagtattttacctgtttggcaaagattgtaagggattgaaacttttaggttgttgtttggtaggttaagagtttagctgctctggataccgtttccagcatttgaattgtcgatgatgtcctgagcaggttttgcatcgatgtaaaaacgtacatcctgtgcagtgttcccacttgttgtatttgtgacatgcttgtttggcttgagacataggtctctggaagatggaacgaaaaggctgcttataactcagagctttcatgtaaagctaattgtgaagtgaattcctcggaaaaggggccgtttgtctaagcagaaggaactgtctgtcatagaaatgccaatttcctctagaactcgaaattgagcgaacagtggtgccatattgggcgaggtgtcagccatgtctggatattttaacttgtagacagaagagaaagtggcgaaagcatctgtccattgttccatagaaaggaacttcttggatgaggttagggtgacagcagaaattccagactcagagagtgtgagttgaaatgactggtggattggcagaaaaaataatagaaaaatcaacaaattcattgttccatatcttctcttttactttcagaggaacggagacatgtaaaggtatagaaactgatgtttgattactgagaagagaagtggccggattagttggaaaagcagagtttaggggaacggtatgtacatgattgaaataatcagtagagacatttatacctggcatgttcaaatgccctggttgaatggcttggcttgtggtagtatgacttgaatcatgacgcagtggttcggctgttgtaagtcccagcacctcgttgacttttgtctgtaccaagctctgtatttcggatgtaatggcagcagtgatggatgctgttgaaaaacagtgtccggttgatcgtggctgattgaagatgcaggctcttatacataactgctatcagatatcgaaacatcattcgatggccgacttgttgttgccgtatgtgacggttctgaacgttcattgcaaattggtggccgactgtttccagttgtggaacggcgcttttgattgttaacggctggacgcttccttttctgcctggaactcattgtcctaaaagagatgaagcaaattagtaacatataaaaaaaggggtatataccaagtgatgggaccccttctgtattactattccaatgatatggaaatatatcataggcAGCACAAATGCTCACAGAAGCTGCGAATAA----CATAC---A--------AAAG--TAGATGCTTGTGGTAGCATAAGGGAAATATAGC--G-TGCTCGTGCAAAAGCATAGAC-CCTAACGGAAGC----A------AAACAAAAAT---------------------ATATAATGTACTCG-TGTCAAATCAG--AA-------ATGTTCACG--GAA----T-AT-----------------------CCCGTGGGAAAGC-CAGGTGCTCACGGAAGCT----------G-T-TA-T-A-ACGTA-TGacacataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT-----GTTATGCAGTATA---AGGTAAGCAGAACGCTAGACATTCCTTTTTGTGTTTGAAATGGTGGACTGTAGCCACATGTTAATATTTTAAGGATATGGTATAGCATATATAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATTTAAGTATATACGAATATCGGATCTGAGACCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCT-TGGCGTGTAAACAGTCCAGTTATAAAACACAATAAAATGACAATAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATAAAAAATATAACTAATGTTCACTGTTCAACTAATGAATAATAAAATTTAAACACTAATTAAAACATAAAACAAAAAGTGTTAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGT--ATATACGAATATCGGATCTGAGACCATATAATATAGTACTCTCGGTGAATTTACGATCCCACACTGCGTCTAATTGCTA----GATGGCATGTCGTATAGACCGGTAGAACCGCTGATGTCCAAACCGATTTAGGTGGACGCCGCCGTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAAACCCCC--ACACACAGAGTAAGACACAGCATGGCCAAGTCAACTAA------TATGACCTATAACTGCGACGCACACTGGTGTATCAACCATGTGAGTTTACATACATAACTACATGCGTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgctatgaac-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC--AAGCTCCCG------AATCGAAAGTGCACGTG----GAACCAACTCATGCCATG--TCCGTTGTT-AAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGC-T---TT-TAAAAGATAT-
gi|3                          : gtgttatacataagaaagttatgatccgagaaggacagaaagtcgtacgccgattgtcaaatagaggtcctggaagttgtgcagatcctgaaaagccagtgtgtacgaatgtgccaaaaataggaaatcttgtagaattttagcaatatattttgattataacttgggggtggcaatccacaataaagcagaagtaaatgagtaaaaaagttgacaactggaagaagctcccattggtaagcacttatcgtagtaaaacaaaccatcccattcgacacctaaaattgcggaatagtctgggttgatagggatgatacggaatggcgctgcaataacagttttggccataaaagtgtgtttgccaatttgttttaaacatgaaattttgtcatcagtcgtagaaaaggtcacatatgaaactcatcaggggtatgttttcgaaccacgcccagcggcgaaacctgcatgaaaggccattccactatgccagattctagttatttcaatatcttctggagcagaagcatgtgcatgcgcagaaagtaatttacgactatctcgacacagtgtatgtccttaacacttaatcgtaaaccttctctaaaactattaaccaaacaatctgattttatcatatccttagtaaaaacaattccaaaacctaccatttaactggagttggtggggaaatattacgattctccagtataccgcctgtttggcaaggatcgtaagggattgaaactatttggtgtttgtttgtggttgaattggaaggttgagagtgctgttgctctgagtttcgttcccagcatttgtattgcggattttgtccagagcaggttctgcagcgatgtaaaaacgtacatcctttacagagtccctcctttgtaagtgttacatacttgcttggcgagccacaatggtgtctagaatttgaatcgaaagggctgcttttgactcagagtttttatgtaaagctcagtgtgcagtattttccacggaaatggtgtagtttatctagaaatgccatttttttagaacgtgaaattgagcggatagtggtgccatatcagcaatgtctggatactttaaccgacagacacaagagtaagaagcgaaagcatatgtcctctggaacttcttggaggaggttgggttggcagcagaaattcaagacacagagaatgtgagttggaataactgtggtggattgacaaaaaatgtagacaaatcaacagattcattgttcatatcttctctttttcttccactagtttcagaggaacagtgacatgtagaggtagattaactgatgtttgacaactgagaagagacgtggcctgattagatggaagagcagagtttaagggaactgtactatcattattgacataaataagaagagacatttatacctggcatattcaaatgctttgcccgaatggcttggctagttgtatttagacttcaaacatgacgcactggtctaattgttgtccctcctagcactttgttgattttttctaacacaagccctgtacttcggatggaattgcagctgtgacggatgctgtcagttgtagaacagcagtatccgtttgatagtggctgtttgaagtttatggttcatgtacataatagttatcagatacagtgacatcactgacttgtcgctgtatgtgatgttcctgagtgtgcactgcgaatgggcggccggcggtcttcagttgtggaacggcgattatggttgttaacggctggtggcgcttgacgctttctttaagcctggagttcattgtgctgaaagagatgaagtttaatgactaacatggcaaaggggatataaagtgatgaaaccccttatgtattactattccaagcatatggaaaaataAAATATATAGTTATAGTGGCCGCAGTAAAGC-CAGGTGCACACGGAAGCTGCTAA-AA----CACAT---GTCCGTGATATAGCACAAATGCTCACGGAGGC-TGC-AAACGTTTATA--G-TGCCCGTGATAAAGCATAT-T-ATTCACGGAAGCT---GGGAAAAAAACAAAA---CA-AAA----GAAA-AACACATATAATG--CTAG-TGTGAAAGCCT--AA-------ATGCTCACG--GAAGC-TTTGTT-TAAAG-ATATAG-ATACAGTGCCCGTGGTGAAAG-TAGATGCCCACAGAAGCT----------GCT-TA-T-A-ACATA-TGTCCGTG----G-TAAAGTTTAAATACTCACGGTAGC--TGT-T---AA-ATTTAC-----GTAAAGCAATATC---ATGAAATCAGAACGCTAGACACTC-TTTTTGTGTTTGAAATGGTGGAGTGTATACACATGTTAATATACTAAGGATATGGTATAGAATATAGAAGCTGACAGGACACGGTCCTGCAGTATCGAAGTATATATGAATATCGGATTCGAGACCATAGACAGTTATATATACAC--AAGTGTCAT-GCAATATACTAGTCCGTACCGATCGTATTACATAATTAAAATGACTAAGTCGTTATATAAATATTGAA---------AAATAATACAGTACTCCCCATGAATTTATGATCACCCAATGCGCCTCACTGCTGTCATGATGGCATGTCGTATGAACCGGTAGAACCGCTGCTGTCCACACTGATTCAGGTGGACGCCATCGTCACGAAAGATGGGTGTTCGGGCCCCGAAGATCCGTCTATGACGCCAGGAGCGAATGTTATCATGGACACCAAGCAATGTGTTTAATATTGTGTTAGTGTGCACCCGCTTGTCCTCGTACATTTCGGCAGAAATACACCGTGGTTTAATCCTCGTGAAAATTTCACACATCACAACCTGACCGACATTATAGTTATTCTGTAGCATAACAGCCAAGTCCTCCAAATCACTCGCTAGTGTCAATGGATGAATATGCTCACATAAG--------------------TCATTACCTCCAATTTGTATAACAACAACCGCCGGTGCAACT---TCG-AGTAAAAAAGTATGAAAATGGCGCAGAAACGCATTCTTATCCGTGACTCGCAATCCACCAAATCCTCTATGAACAACACTGCATTCTACCAGTCCATAATCCGCTAACATACCCCC--ACACACAGATGAAGAAACAGCATGGCCAAGACGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCGCACAGAAATATCCGCCATGTTATTTTAACCACACAACAACATGCGTTGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGGAAACAATCCAGATGTAAAACACAAGAAATTGACAATAGTCAATTAAAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAAAGAATAATAAAATTTAGACACTAATCAAAACGTAAAACAAATT-TGTTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGAAATTACTG-AGATA-------------GACCAGGTAACTGACCAATCAGCGACGAGCTAATCCTGCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATA--AGACCTGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATT-ACGCTTCCCGCAGAGCTT-GTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAAAA-CTCATTATACAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAACGCGCTATGATTTTCATAGCTAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--ACACACAGAGGAAGAAACGGCATGGACAAGTCGACGAATAAAACTATGATCTAAAATTGCGACGCGCACAGTAGT---CACCATGTTGGTTTACATACACAACAACATGTGTTGAAATTTAAAGTCTGTGGCGTGTAAACACTCCAGTTATAAAACACAAGAAAATGACAAAAGTC-ATTATAAACAATATACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAGCAATGAATAATAAAATTTAGACACTAATTAAAACAGAAAACAAATCGTGTTAACAATAAAACTATGTGCGATCGGAAAGTGTCTAGAGTAATGACTA-AGACAAAGGATCTCCACTGACCCGGAAACTGACCACTCAGCGACAAGCTAATCGGTCAGGCTTCCAACAGAGCTA------------TGGAGAGGCTTGCG-T----GA--TA------CCGAA-T--TCAGGATT-G------CCACAGAGTTTAGCGTCGGTGTGAAAATAC-TGCAAT-GAGA-CCGATTAATCAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAATTATAAAACACGCTATGATTTTCATAGCTATacacagaggaagaaacggcatggacaagtcgacgaataaaactatgatctaaaattgcgacgcgcacagtagtcaccatgttggtttacatacacaacaacatgtgttgaaatttaaagtctgtggcgtgtaaacactccagttataaaacacaagaaaatgacaaaagtcattataaacaatatacctggatatcactgttcaagcaatgaataataaaatttagacactaattaaaacagaaaacaaatcgtgttaacaataaaactatgtgcgatcggaaagtgtctagagtaatgactaagacaaaggatctccactgacccggaaactgaccactcagcgacaagctaatcggtcaggcttccaacagagctatggagaggcttgcgtgataccgaattcaggattgccacagagtttagcgtcggtgtgaaaatactgcaatgagaccgattaatcaatacacgctgcccttagctcgaattataaaacacgctatgattttcatagctat
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--ACACACAGAGGAAGAAACAGCATGGAAAATCCGACGAACGAAACTATGACCTATAACTGCGACGCACACAGAAGTATCAGCCATGTTGGTTTACATACACAACATCATGTGATGAAATTAAAAGTCTGTGGCGTGTTAACAATCCTG-TATAAAACACAAGAAAATGACAATAGTC-ATTATAGACAATGTACCTGGATA-----------------TCACTGTTCAAACAATGAGTAATAAAATTTAGACTCTAATTAAAACATAAAACAAATCGTGTTAATAGTAAAACTacacagaggaagaaacagcatggaaaatccgacgaacgaaactatgacctataactgcgacgcacacagaagtatcagccatgttggtttacatacacaacatcatgtgatgaaattaaaagtctgtggcgtgttaacaatcctgtataaaacacaagaaaatgacaatagtcattatagacaatgtacctggatatcactgttcaaacaatgagtaataaaatttagactctaattaaaacataaaacaaatcgtgttaatagtaaaact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtattgtgtaagtgtgtacacacttgtcctcgtatatatcggcaaaatgcaccgtggtttgatcctcgtgaatatgtcacacatcacaacatgtccgacattaaaatcattctttagcataacagcaagtccttcaaatcactcgctagtgtcaatgaataaatatgctctcataagtcgtttgccaatttcattacctccaatttgtagaagaacgatagccgatgcatcttcgagtaaaaagtatgaaaatggcgcttaaacgcattctgttccatgactcgcaatccaccgaatcctttatgaacaa-TGA-AAGGGTATAAT--GCTGACTGCGTTAAAGCATGCATTATTTGC--AAGCTCCCG------AATCGAAAGTGCACGTG----GAACCAACTCATGCCATG--TCCGTTGTT-AAGCAT--AA-------ATGCTCACG--TAAGC-T---TT-TAAAAGATAT---ATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-GTTAAAAAT----------A---TA-TAA-ACA-G-TACCTGCG----G-TAAAACC-AGATGCTCACGGAAGC--TGA-C---AACATATGCCCGTGGTAAAGCAAGATGCTCACGGAAGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTGTCCGTTGTTAAGCATAAATGCTCACGTAAGCTTTTAA-AAGATATATACAGAGCCCGTGGTAAAGTATAAATGCT-------GT-TAA-AAATATATAAACAG-TACCTGCGGTAAAAC-CAGAT-GCTCACGGAAGCT---G------A------------------------CAAC----ATA-TG--CCCG-TGGTAAAGCA---AG-------ATGCTCACG--GAAGCTTT-ATT-AAAAA-ATAT---ATATAATGCCCGTGCTAAAGG-AAGATGCTCACGGACGCT----------GCT-AA-T-G-GCATA-TGCCCGTG----G-TAAATCAAAAATGATCACGGAAGCTTTAT-TTAAAA-ATTTAT-----ATAGTGC-CCGTG---GT-AAAGCAAAATGCTtttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaaaatttatatagtgcccgtggtaaagcaaaatgctcacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccaAAATTTATA----TAGTGCCCGTGGTAAAGCA-AAATGCTCACGGAAGCTGCTAA-cacggaagctgctaatgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atgaaagggtataatgctgactgcgttaaagcatgcattatttgcaagctcccgaatcgaaagtgcacgtggaaccaactcatgccatgtccgttgttaagcataaatgctcacgtaagcttttaaaagatatatacagagcccgtggtaaagtataaatgctgttaaaaatatataaacagtacctgcggtaaaaccagatgctcacggaagctgacaacatatgcccgtggtaaagcaagatgctcacggaagctttattaaaaaatatatataatgcccgtgctaaaggaagatgctcacggacgctgctaatggcatatgcccgtggtaaatcaaaaatgatcacggaagctttatttaaTAAGAATTAAACTATGTGCGATCCGAAAGTTTATAGAGTAATGACTTTAGACAAAGGAACTCCACTG------------ACCAATCAGCGATGAGCTAATCGGTCAGGCTTACAACAGAGCTAATTGCTTCAGTGTCGAGGGCCTTGCGATA--AGA-------------A-------CTGATTCAGGTTTGCCACAGAGTTAAGCGTCTGTGTGAAAAGAC-TGCGATACAAC-TTGATAAATCGATACACGCGTCCATTAGCATGCATTATAAAACACGCTGTGATTTTCATAGCTAtgaattaaattagtaatatgtaaaggggggatataaacttagtgatgggacccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ATGAATTAAATTAGTAATATGTAAAGGGGGGATATAAACTTAGTGATGGGACCCGTTGTGTATTACTATTTCAATGATATTGAATGTTATTATAGGCTATTATGCTGGCTGTGAAAGCATGCATCAAATTTATGCGCACGAAACGGAA
Unaligned ( gi|16 ): ATATATGTACAAAAACATGACAATACTTCCACGAAGATGACATATATTTGACTTAATAGTGTTCATGGTATCTATGTTACAAACAGATAATG
Unaligned ( gi|17 ): TGATAGGGTATAATGCTGGCTGTGTTAAAGCATGCATCATGTT