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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acTCTTT---------TGT---A----TTGTGATGAAAC------T-A----T---AC-AAAATTTATC---CTATGTATTG--GGAcaaaaaatttaatttatttattgttgtcccaatacatagggtaaatacggtaatcaagatactagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTT---------TGT---AAACATTTTACCAG--T------C-AAT--T---AC-CGTATTAACC---ATATGTTTTG--GGACA-G-T----T-AAA-A---A-T-T---T--C----T--TTTT-TTT---TT----A-AATA-G--GA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catcaatgtaaca---------TGT---A----TT------AAAC------CTA----TGTTAC-CGCATTAACC---CTATGTATTG--GGACA-G-TAAAAA-AAA-A---A-T-A---A--A----A-------ATT---AA----A-AATA-----ATA------TGT-A---Tagtattgagagagcaaaaaatttatttattttttgctatccaaatacatatggtaaatatggtataccagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                   taccctatcttttgggacagtaaaataatactattttttttaaaaatacgatactgtatatggtgcatagacataccaacattac---------TGT---A----TTAGGATGAAA---------A----T---AC-CATATTTACC---CTACATATTG--GGACA-G-T----A-AAA-A---A-A-A---A--T----T--TTTT-TTT---TA----A-AATA-----ATA----AGTAT-tgggacagcaaaaattttaattatttcttgctgtcccaatacaaagggtaaatac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                              aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctg---------TGT---A----TTAGGATGAAAT-------------T---AC-CATTCTTATC---CTATGTGTTG--GGACA-G-T----A-AAA-A---A---A---A--T----A--TTTT-TTtgggacagcacaaaattaatttgttgttgtcttattacatagggaaatacggtagtatcggtacatgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtgccggtatgcatttatcaactacatatttaacctaGT---A----TCTTGAT------------------T---AC-CGTATTTACC---CTATGTATTG--GGACA-A-C----A-ATA-A---A-T-A---AATT----AAATTTT-TTacaatattaaattctcggacagcaaaaagttgattttttttgctgtctcaataaatagagtaaatacggcactaatacattcattaatgaat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                  acctatgttttcggacgaaattaccgcatttaccctatgtattgggacagtaaaaaaataattattttttaaaataatatgtattggcacagcTAACAAAACATGAATC-AAGT-T---AC-CGTATTTACC---CTATGTATTT--GGACA-G-T----G-TAA-G---T-T-C---A--T-------TTTT-TTT---TA----A-AATA-C--GATAC-----TGT-A---TGC-------Gtagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAATAC------T-AATGGT---AC-CGTATTTATC---CTATGTACTG--GGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A--T----
gi|29                         :                                                                                                                                                                                          ttgtgtagtcaaatgctaataccaaagatgcttgatacagcctcatataattcttaataccaaattaattccatttgtttaataccgcaattaccatatccactgcatgtattaggacagtaaaaataataagtacctgggaaagcaaatcatgtaAC------T-G----T---ACATGTATTTACC---CTATGTATTG--AGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A--CTA--A--TTTT-TTT---t
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgtattgggacagca-A----T---AC-CATATTTACC---ATATGTATTT--GGATA-G-C----A-AAA-A---A-TAA---A--TAA--A--TTTT-TTa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                 catcaatgtaacattttgtaaacattttaccagtcaattaccgtattaaccatatgttttgggacagttaaaaatttcttttttttttaaataggaagtattgagagagc-A----T---AC-TGCATTAACC---CTATGTATTA--AGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A--T----accagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aataat----T---GC-CGTATTTACT---CTATTTATTG--AGACA-G-C----A-AAA-A---A---A---A--TCA--A--CTTT-TTgtatcggtacatgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                      agtgccggtatgcatttatcaactacatatttaacctatgtattaggatgaaattaccattcttatcctatgtgttgggacagtaaaaaaaatattttttacaatattaaattctcggacagc----T---AC-CGTATTCACC---CTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ACA-T---A-T-A---A--TTA--A--TTTT-TTctaatacattcattaatgaat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                            tagtggactggacctttactcctttatgataccatatataacatacaaaaattaccttactctatgaattgggacagttaaaaaattttttttttaaatgttaattatttggacagc----T---AC-CGTATTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ATA-A---A-T-A---A--TTA--A--TTTT-TTT---atttaaaaaacatagttga
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tg----T---AC-CGTATTTACC---CTGTGTATAG--GGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---G--T----ctcat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccta---AC-CGTGTTTACC---CTATATATTG--AGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-G---A--T----atacacct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctttaC-CGTTTTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A----------------TT---AA----A-AAT
gi|3                          : gattaaaaaacaaacagttattggttgtttcaatggacgaaaaaacaacagcacaacacgcatgggtttgttattttttttttttaatttaattaccggtactgtacctaccaaattgcggtacgattaatttaacattttatgttttcttttgtattgtgacaaaactataccgtatttaccctatcttttgggacagtaaaaaaataacattttttaaaaatacgatactgattacggtgcatatacataccaacattaatgtatttaacctttattttaggacaaaattactgaatttcccttttttattgggacagtaaaaaaaattattctttaaaataatatgtattgggacagcaaaGTATTTACC---CTATGTATTG--GGATA-G-C----A-ACA-T---A-T-A---A--TTAAAA--TTTT-T
gi|9                          :                 aattaaaaaacaaacagttattgtttgtttcaatggattaaaaatcaacagcacaacacgcatgggtttgttttgttttttaatttaattaccagtactgtacctatctaattgtggtatgattcatttaacatagttttcttttgtattgtgacgaaactatactgtatttaccctatttttgggacagtttaaaaatagtaatttttaaaaaatacgatactgtgcatagatataccaacattactgtatttaacttatgttttgggatgaaattacggcatttaccctatggattgggacagtaaaaaataaatatttttttaaaataatatgtgttgggacagcGTATTTACC---CTTTGTATTG--GGACA-G-C----A-AGA-A---A-T-A---A--TTAAAA--TTTT-T
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                taccctatcttttgggacagtaaaataatactattttttttaaaaatacgatactgtatatggtgcatagacataccaacattactgtattaaacctatgttaccgcattaaccctatgtattgggacagtaaaaaaaaaataaaaattaaaaataatatgtattgggacagcGCATTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-TAA--A-AAA-A---A-T-A---AT-T----A--TTTT-TTT---AA----ATAATA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaattaacGTATTTACT---GTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A--TTA--A--TTTT-TTtattgggacagcaaaaaaatttagcatttgttgctgtcccaatacatactgtaataattgtaattattcttagatacagatataagactatgaataatcattttcat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taccctatgtattgggataatcaaaaagaattttaaaaaaaataataagtattgggacagccGTATTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-T----A-ACA-A---A-T-A---g
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                aaaaatacgataccgtatacggtgcatagacataccaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTATTTACT---CTATGAATTG--GGACA-G-A----A-ATA-A---A-T-A---A--TTAC-A--TTTT-TTT---CAGTCCA-AATA-C--
gi|6                          :                                                                                                                                  aattgctgtagatatttaataatagactattgaatgtttttgttgggaattgatgtgattttttataatctcatctaccgtatttaccctgtgtaatgggacagcaaaaaaattttttttttataaaaataggatactgtatagagtgtgtatacataccaaaattactgtctttagcctatatattgggatgatttagaatagttaccctatatattgagacagtaaaaaaataaTGTTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ACA-G---A-T-A---ATTT----A--TTTT-TTaaaatttatattgtttggtgccat
gi|31                         :                                                                                                  atggattgaaaaataacaacacaacacacacaggttttttattttttttatttatttatataattactgtaccaaggtaattgtagtataattagttgtagttttttatattttgtttggttgaatattataccagagtgtacaatacttagataaacatgccaaaaataaccatattttaccctatgcattggaacaaaattactgtatttacactatgtattgtgacggcaattttttgtgcaacaatagtaagtatcaggagagcTATTTATC---CTATGTATTG--GGCCA-A-C----A-ACA-A---A-T-A---A--T----A--tg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacataaagtgctgtttatataggtTATCTACC---CTATGTTTTT--GGACA-G-C----A-ACA-G---A-T-A---A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTACC---CTATGTATTG--GGACA-G-C----A-ACA-A---A-T-A---A--TTA--A--TTTT-TTT---tg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atattttttaaataataagtattgggacagcTTACT---CTATGAATTG--GGACA-GTT----A-AAA-A---A-T--------T----T--TTTT-TTT---AA----A-ttggtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tagtggactggacctttactcctttatgataccatatataacatacaaaaattaccTACC---CTATCTTTTG--GGACA-G-T----A-AAATA---A-T-A---C--T----AT-TTTT-TTT---AA----A-AATA-C--GATAC-----TGT-A---TAT-------GGT-GCATAG--AC--AT---ACCA-AC----------ATTA-CTGTATTA-AACC-TATGT---------------------------------------TA-------C----CGCAT---T--AACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-TAA------------AA-A--A----AA-A-A-TA-AAAAT-----T--A--------A------A-------A-A--T---A--A---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AAATT----T--TA-----A-TT-A-TTTCTTG-CTGTC-CCAATACAAAGGGTAAATACtgttaattatttggacagcaaaaaattaattatatgttgctgtcccaatacatagggtgaatacggtaatttaaaaaacatagttga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A--T----A--TTTTGTTT---GGTT--G-AATA-T--TATACCAGAGTGT-ACAATAC--------TT-AGATAA--AC--AT---GCCA-AA----------AATAACCATATTTTACCC-TATGCATTGGAAC------A----------------AAA--T--TA-------C----TGTAT---T--TACA-----CT------AT-----GTATTGT-GACGG-CA----------------------------------ATTTT-----T--TGTGC----A------AC------A-A--T---A--G---T--A-AGTAT-C---A-----G---G-AGAG---C---A-A--AA-AA----T--AA-----A-TT-A-TCTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atggattgaaaaataacaacacaacacacacaggttttttattttttttatttatttatataattactgtaccaaggtaattgtagtataattagttgtagttttttTT-TTT---GA----A-A-TA-C---ATGT---A-TGT-A---GAT-------GTT-GT-------C--AT---G----------------ATTA-CCGTATTT-ACCC-TATGTATTGGGAC------A----------------GCA--A--TA-------tg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagcaaaaaaattaattatt-TTT---AA----A-A-TA-C--TATAC-------T-A---TAC-------A----CA-AG--AT--------CCA-AA----------ATTA-TCGTATTT-AACC-TATGTATTGTGAC------T----------------AAA--T--TA-------C----CATAT---T--T-----------------TTTG--GTATTGA-AACAG-TAA------------CA-A--A----Atgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaa---AA----A-GATG-CTTGATAC---AGCCTCA---TAT-------AAT-TCTTA-------AT---ACCA-A-----------ATTA---AT-TCC-A----TTTGTTT-------------------------------A--A--TA-------C----CGCAA---T--TACCATATCCACTGC--AT-----GTATTAG-GACAG-TAA------------AA----------------------------------------------------------A--T---A--A---T--A-AGTACCT---G-----G---G-AAAG---C---A-A--ATCAT----G--TA-----A-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-CCAGTACATAGGATAAATACG-GTA----C-CATt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgtgtagtcaaatgctaatacc---AA----A-AATA-C--GATAC-----CGT-A---TAC-------GGT-GCATAG--AC--AT---ACCA-AC----------ANNN-NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNN------N----------------NNN--N--NN-------N----NNNNN---N--NNNN-----NN------NN-----NNNNNNN-NNNNN-NNN------------NN-N--N----NNNN-N-NN-NNNNN-----N--N--------N------N-------N-N--N---N--N---N--N-NNNNN-N---N-----N---N-NNNN---N---N-N--NNNNN----N--NN-----N-GT-A-TTTGTTA-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACtagtattgtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A----A-AGTA-C--AATA-----ATAT-A---TAC-------GGT-GCATAG--AA--AT---ACCATAA----------ATTA-CCATATTC-AA----TTGTATTGGGACAGT---A----------------AAA--A--GAT------T----TTTTT---T--TAAA-----TA------ATAA---ATATTGG-GACAG---A------------AA-C--A----AATTAA-TT-ATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcag-C--GATAC-----TGT-A---TAT-------GGT-GCATAG--AC--AT---ACAA-AA----------TTTA-CCGTATTT-AACC-TATGTATTTGGAC------G----------------AAA--T--TA-------C----CAAAG---T--TATC-----CT------AT-----GAATTGG-GAAAG-TAA------------Aggttgtctgttccaaaacatagggttattatagtaatgat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C---AATGT-A----AC-------ATT-TTGTAA--AC--ATTTTACCA-GTCA--------ATTA-CCGTATT--AACCATATGTTTTGGGAC------AGTT-------------AAA--AATTT-------C----TTTTT---T--TTTT-----AA------ATAGGAAGTATTGA-GAGAG-C-A------------AA-A--A----ATTT-ATTT-ATTTT-----T--T--------GCTATCCA-------A-A--T---AC-A---T--A-TG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cat-A---TGC-------AGT-GCATAG--A---AT---ACCG-AA----------ATTA-CCGT--------------TTTTG--------------------------------A--TA------------TG------T--CACC-----TA------AT-----GTATTGG-GACTG-TAA------------AA-----------TG-A-TT-ATTTT-----T-----------A------A-------A-A--T---G--A---T--A-GGTAT-T---G-----G---A-ACAG---C---A-T--TCTTT----T--TA-----A-TT-A-TGCATTG-CTGTT-GTAATA-----GGTAAATACgtaaatatggtataccagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T---ATCA-AC------------TA-C-ATATTT-AACC-TATGTATTAGGAT------G----------------AAA--T--TA-------C------CAT---TCTTATC-----CT------AT-----GTGTTGG-GACAG-TAA------------AA-A--A----AA------T-ATTTT-----T--T--------A------C-------A-A--T---A--T---T--A-AATTC-T---C-----G---G-ACAG---C---A-A--AA-AG----T--TG-----A-TT---TTTTTTG-CTGTC-TCAATAAATAGAGTAAATACG-GCA----CTAATACATT---CA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtgccggtatgcatt----------ATTA-ACGCATTT-ACCC-TATGTATTGGGACAGTAAAA----------------AAA--A--TA-------A----T-TAT---T--TTTT-----TAAATAATAT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------AA-A--A----ATTT-A-GC-ATTTG-----T--T--------ttaatgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aa----------ATTA-CTGTATTT-ACCC-TATGTATTGGGAC------AGCAACAAATAATAATCAAA--A--TAGCAATTAT----TGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTGTTGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATA-A-TT-AAAATAGCAAT--T--------A------C-------C-A--T---ATTACCCT--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--gctgtcccaatacatactgtaataattgtaattattcttagatacagatataagactatgaataatcattttcat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataattatttgTA-CCATATAT-AACA-T----------AC------A----------------AAA--A--T-------------TAC-C---T--TACT-----CT------AT-----GAATTGG-GACAG-TTA------------AA-A--A----ATTT-------TTTT-----T--T--------T------A-------A-A--T---G--T---T--A-ATTAT-T---T-----G---G-ACAG---C---A-A--AAAAT----T---A-----A-TT-A-TATGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTGAATACG-GTA----tgcaattttgataccttactg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tagtggactggacctttactcctttatgaACC-TATGTTTTCGGAC------G----------------AAA--T--TA-------C----CGCAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-T-A------------AA-A--A----AATA-A-TT-ATTTT-----T--T--------A------A-------A-A--T---A--A---T--A-TGTAT-T---G-----G---C-ACAG---C---A-A--AAAAT----T--TA-----ATTT-A-TTTATTG-TTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----atttaaaaaacatagttga
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CT-TTTGTATTGTGAT------G----------------AAACTA--TA-------C----AAAAT---T--TATC-----CT------AT-----GTATTGG-GAatcaagatactagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tC------G----------------ATA--C--TA-------C----CGTAT---T--T-CC-----CT------AT-----GTAATAA-GACA---AC------------AA-C--A----AATT-A----ATTTT-----G--T--------G------C-------T-G--TCCCA--A---T--A-CTTAT-T---A-----TTTTA-AAAA---A---A-A--AATTT----T--T--------------TT-TTA-CTGTC-CCAATATGTAGGGTAAATATG-GTA----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctgtgtattaggatgaaaa----------------AAA--T--TA-------A----CGCAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-TAA------------AA-A--A----AATA-A-TT-ATTTT-----T--T--------T------A-------A-A--T---A--A---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AAAAA----T--TT-----A-GC-A-TTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACTGT-AATA-A-TTG----T-AATT-ATT---C---TTAGATACAGA--TATAAGACTATGAATAATCAT----TTTCATgtacatgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----------------AAA--T--TA-------C----CGTAT---T--CACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CATA--T----AATT-A----ATTTT-----T--T--------GCTGTCCA-------A-A--T---A--A---TTAA-CAT-T-T---A-----A---A-AAA--------A-A--AATTT----T--TT-----A------------A-CTGTC-CCAATTCATAGAGTAA---------------GGTA-ATT------TTTGTAT---GT--T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagtggactggacctttactcctttatgataccatatat----------------AAA--A--TA------------TAAAT---T--TCTA-----AA------AG-----GTATTGG-GACAG-CAA------------AA-A--A----ATTA-A-TT-ATTTA-----T--T--------aaaaaacatagttga
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaAA--A--TA-------C------CATAAAT--TACCATATTCA------ATT----GTATTGG-GACAG-T-A------------AA-A--A----GATT-------TTTT-----T--T--------T------A-------A-A--T---A--A---T--A-AATAT-T---G-----G---G-ACAGAAAC---A-A--A--------T--TA-----A-TT-A-TTGGTTGTCTGTT-CCAAAACATAGGGTTATTATA-GTA----gctgtcccaatacatagggtaaatacggtaatcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcagaaagtacaataatatatacggtgcatagAA--T--TA-------C----CGTAT---T--AACC-----AT------AT-----GTTTTGG-GACAG-TTA------------AA-A--A----T-TT-C-TT-TTTTT-----T--T--------T------A-------A-A--T---A--G---G--A-AGTAT-T---G-----A---G-AGAG---C---A-A--AAAAT----T--TA-----T-TT-A-TTTTTTG-CTATC-CAAATACATATGGTAAATATG-GTA----atgat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 catcaatgtaacattttgtaaacattttaccagtcAA--T--TA-------C----TGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAACAAATAATAATCAA-A--ATAGCAATT-A-TT-GTATT-----T----------------------------A--C---C--C---T--A-TGTGT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--taccagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgAA--A--TA-------C----TGCAT---T--AACC-----CT------AT-----GTATTAA-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATT-A-gcaattttgataccttactg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actgtatttA--G--TG-------C----CGTAT---T--TACT-----CT------AT-----TTATTGA-GACAG-CAA------------AA-A--A----AATC-A----ACTTT-----T--TGCTGTCCGA------G-------A-ATTT---A--A---T--ATTGTA------A----------------------A-A--AAT----------------A-TT---TTTTTTA-CTGTC-CCAACACATAGGATAAGAATG-GTA----
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtgccggtatgcatttatcaactacatatttaacctatgtattaggatgaaatA--G--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------aatacattcattaatgaat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgA--A--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CC------AT-----GTACTGGTGAAAG-CAA------------CG-A--A----TATT-A-cat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttatt--A--TA-------C----CATAT---T--TACC-----AT------AT-----GTATTTG-GATAG-CAA------------AA-A--ATA--AATA-A----ATTTT-----T--T--------GCTCTCTC-------A-A--T---A--C---T--T-CCTAT-TTAAA-----A---A-AAAA---A---G-A--AATTT----T--TA-----A--------------CTGTC-CCAAAACATATGGTTAATACG-GTA----accagtatt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   catcaatgtaacattttgtaaacattttaccagtcaat--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAA-CAAT-----------AA-AT-A----AATT-A--A-ATTTT-----T--T--------G------C-------T-G--TGCCA--A---T--A-CATAT-T---A-----T---T-TTAA-------A-A--AA----------TA-----A-TT-ATTTTTTTA-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATGCG-GTA----accagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acctatgttttcggacgaaat--TA-------C----CAAAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATT-A----ATTTT-----T--T--------atcaagatactagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atattttttaaataataagtattgggacagca--TA-------CA---TGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGA-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AACT-A----ATTTT-----T--T--------a
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgtattgggacagcaa--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAAT-----------AA-A--T----AATT-A----ATTTT-----T--T--------cagta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagca--TA-------C----CGTAT---T--TATC-----CT------AT-----GTACTGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATT-A-C-----------------------------------------A--T---G--A---T--T-TGCTT-TCCCA-----G---GTAC--------------------------TT-----A-TT-A-TTT-TTA-CTGTC-CTAATACATGCAGTGGATATG-GTAATTGC-GGT--ATTAAACAAATGGAAT----TAATTTGGTATTAAGAatcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgtgtagtcaaatgctaataccaaagatgcttgatacagcctcatataat--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTTG-GACAG-T---------------G-T--A----AGTTCA-TT-TTTTT-----T--T--------A------A-------A-A--T---ACGA---T--ACTGTAT-ccattagtattgtt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taacaaaacatgaatcaagt--TA-------C----CGTAT---T--TACC-----CT------GT-----GTATAGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AGTT-A-gcg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccA-------C----CGTGT---T--TACC-----CT------AT-----ATATTGA-GACAG-CAA------------CA-A--AT---GATT-A-atacacct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cttGTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GATAG-CAA------------CA-T--AT---AATT-A-AA-ATTTT-----TGCT--------G------T-------C-C--C---A--A---C--A-CATAT-T---A-----T---T-TTAA---A---A-A--AATAT----T--T-----------A-TTTTTTA-CTGTC-CCAATCCATAGGGTAAATGCC-GTA----
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aattaaaaaacaaacagttattgtttgtttcaatggattaaaaatcaacagcacaacacgcatgggtttgttttgttttttaatttaattaccagtactgtacctatctaattgtggtatgattcatttaacatagttttcttttgtattgtgacgaaactatactgtatttaccctatttttgggacagtttaaaaatagtaatttttaaaaaatacgatactgtgcatagatataccaacattactgtatttaacttatgttttgggatgaaatGTAT---T--TACC-----CT------TT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------GA-A--AT---AATT-A-AA-ATTTT-----TGCT--------GTCC---C-------A-A--T---AC-A---T--A-T-TAT-T----------------------T---T-T--AATTT----T--TA-----T-TT-T-TTTTTTA-CTGTC-CCAATACATAGGGTTAATGCG-GTA----A-CATAGGTT---TAAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taccctatcttttgggacagtaaaataatactattttttttaaaaatacgatactgtatatggtgcatagacataccaacattactgtGTAT---T--TACT-----GT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATT-A----ATTTT-----T--T--------G------G-------CTG--TCCCA--A---T--A-CTTAT-T--------------------------------ATTT----T--TTTTAAAA-TT-C-TTT-TTGATTATC-CCAATACATAGGGTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-TAA------------CA-A--A----g
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaatacgataccgtatacggtgcatagacataccaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaAT---T--TACT-----CT------AT-----GAATTGG-GACAG-AAAT-----------AA-A--T----AATT-A--C-ATTTT-----T--T----------------------------T--------------------------------------CAGT--C---C-A--AATAC----T--T------A-TT---TTT-TTA-CTGTC-TCAATATATAGGGTAACTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aattgctgtagatatttaataatagactattgaatgtttttgttgggaattgatgtgattttttataatctcatctaccgtatttaccctgtgtaatgggacagcaaaaaaattttttttttataaaaataggatactgtatagagtgtgtatacataccaaaattactgtctttagcctatatattgggatgatttagaaAT---T--TACT-----CT------AT-----GTATTGG-AACAGCTAC------------AA-A--T----AATTGA-TTGATTTaaaaatttatattgtttggtgccat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgaattaaaatgtattgggacagcT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CA-A--AT---AATTAA-AA-ATTTTGCTG-T--C--------C------C-------A-A--T---AC-A---T--A-T-TAT-T---T-----T---A-A-AG---A---A-T--AATTT----T--TT----------------TTA-CTGTC-CCAATAAAAAAGGGAAATTCA-GTA----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gattaaaaaacaaacagttattggttgtttcaatggacgaaaaaacaacagcacaacacgcatgggtttgttattttttttttttaatttaattaccggtactgtacctaccaaattgcggtacgattaatttaacattttatgttttcttttgtattgtgacaaaactataccgtatttaccctatcttttgggacagtaaaaaaataacattttttaaaaatacgatactgattacggtgcatatacataccaacattaatgtatttaacctttattttaggacaaaatT---T--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CA-G--AT---AAT----TT-ATTTT-----T--T--------G------CTCT----C-C--T---G--A---T--A-CTTAC-T---ATTGTTG---C-ACAA-------A-A--AAT----------------------------TG-CCGTC-ACAATACATAGTGTAAATACA-GTA----aacgg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atggattgaaaaataacaacacaacacacacaggttttttattttttttatttatttatataattactgtaccaaggtaattgtagtataattagttgtagttttttatattttgtttggttgaatattataccagagtgtacaatacttagataaacatgccaaaaataaccatattttaccctatgcattggaacaaaat--TACC-----CT------AT-----GTATTGG-GATAA-TCA------------AA-A--A----GA--------ATTTT-----A--A--------A------A-------A-AAAT---A--A---T--A-AGTAT-T---G-----G---G-ACAG---CCAAA-A--AATT---------A-----A-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACAGTAAATACcatg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------CA-A--A----TGCT-A-A--ATTTT-----T--T--------T------GCTGTCCCA-A--T---AC-A---T--A-T-TAT-T----------------TAA---A---A-A--AATAA----T--T------A-TT---TTTTTTA-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATGCg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaattaac------AT-----GTATTGG-GACAT-TAA------------AA-A--A----AATT-A-TT-TTTTT-----T--T--------A------A-------A-A--T---A--A---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AATTT----G--AA-----A-TT-A-TTTGTTactgtaataattgtaattattcttagatacagatataagactatgaataatcattttcat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ct------AT-----GTATTGG-GACAG-CAA------------AA-A--A----AATT-AGTT-ATTTG-----T--T--------a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -----GTATTGG-GACAG-CAA------------AA-A--A----ATTA-A-TT-ATTTG-----T--T--------gctgtctcaatacatagggtaaatacatgtacagta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atattttttaaataataa-TAA------------GA-A--T----AATT-A-CA-ATTAT-----T----------------------------A--C---A--G---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-ACAAATGC----T--AA-----A-TT---TTT-TTG-CTGTC-CCAATACATAgctgtcccaatacatagggtaaatttggtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaattaacgcatttaccctatgtattgggacagtaaaaaaaataattatttttttaaataa------------AA-A--A----AAT--A-TA-AATTT-----C--T--------A------A-------A-A--G----------------GTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AAAAA----T--TA-----A-TT-A-TTTATTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----gatacagatataagactatgaataatcattttcat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-ATTTT-----T--T--------A------A-------A----T---A--A---T--A-AGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AAAAA----T--TA-----A-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATatcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  a-----T--T--------G------A-------A-T--T---A--A---A--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--A-TCA----A--TC-----AATT-A-TTTGTAG-CTGTT-CCAATACATAGAGTAAATttggtaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ------A-------A-A--T---A--A---T--A-AGTAT-T---G-----G---G-GCAA---C---C-A--AACTT----T--TC-----AATT-A-TTTGTTA-GTGTT-CCAATACTTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-ACAAATAA----T--TA-----A-AA-A-TTT--TG-CTGTC-CCAATACATAaggcgataatattagtt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gattaaaaaacaaacagttattggttgtttcaatggacgaaaaaacaacagcacaacacgcatgggtttgttattttttttttttaatttaattaccggtactgtacctaccaaattgcggtacgattaatttaacattttatgttttcttttgtattgtgacaaaactataccgtatttaccctatcttttgggacagtaaaaaaataacattttttaaaaatacgatactgattacggtgcatatacataccaacattaatgtatttaacctttattttaggacaaaattactgaatttcccttttttattgggacagtaaaaaaaattattctttaaaataa---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-ACAAATAA----T--TA-----A-TT-T-TTTG--G-CTGTC-CCAATACTTAgggtaaaaacgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taccctatgtattgggataatcaaaaagaattttaaaaaaaataa---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-ACAAATAA----T--TA-----A-TT---TTT-TTG-CTGTC-CCAATACTTAcagtaaatacg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atattttttaaataa---T--A-TGTAT-T---G-----A---G-ACAG---C---A-ACAAATAA----C--TA-----A-TT---TTTTTTG-CTGTC-CCAATACATgggtaaatttggtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---T--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-ATAAATAA----T--TA-----A-TT---TTT-TTG-CTGTC-CCAATACgggtaaatacatgtacagta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaaatataaatttctaaaag---T--A-TGTAT-T---G-----G---A-ACAG---CT--ACA--AATAA----T--TG-----A-TTGA-TTTG----CTGTC-CCAATACATgggtaaatacggtaatcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttgaattaaa--A-TGTAT-T---G-----G---G-ACAG---C---A-A--AA---AAAAT--TA-----G-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-TCAATACATAGGGTAAATACATGTA----C-AGTA-gagtaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---A-A--AATTT----T--T-----------------TTG-CTGTC-CCATTACACAGGGTAAATACG-GTA------GATG-A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aattgctgtagatatttaataatagactattgaatgtttttgttgggaattgatgtgattttttataatcATTT----TGATT-----A-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACA-G----------TA-ATTG--CAATTTTGAT---ttttttataaaaataggatactgtatagagtgtgtatacataccaaaattactgtctttagcctatatattgggatgatttagaatagttaccctatatattgagacagtaaaaaaataagtatttggactgaaaaaaatgtaattatttatttctgtcccaattcatagagtaaataaaaatttatattgtttggtgccat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgttgctgtcccaacacatagggtaaatacaataattgctTTA----T--TT-----A-AT-A-TTCGTTG-CTTTCACCAGTACATGGGGTAAATACG-GTA----accttactg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gTT----T--TA-----A-TT-A-TTTGTTG-CTGTC-TTAATACATAGGGTTAATGCA-GTA----ttaccagtatt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actgtaT----T--TA-----A-TC-A-TTTGTTG-CTGTC-TCAATATATAGGGTAAACACG-GTttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c--TC-----A-TT---TTTTTTA-CTGTC-CCAATACGTAGGGTAAATGCT-GTA----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atggattaaaaaacaacagcataacacgcatgttttttttttggttgtttttttaatttaattaccagtactgtacctacctaattgcagtttgattaatgtaagatattttttttgttttcttttgtattgtgacgaaaatataccgtatttaccctatcttttgggacagtaaaaaattatattatttttttaaaaatatgatactgtatacggtgcatagacataccaacattactgtgtttaacctatgttttgggacgaaat--TT-----A-TT-A-TTTGTTG-TTGGC-CCAATACATAGGATAAATAttattttttaaaataatatgtattgggacagcaaactatttaattatttgttgctgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacataaagtgctgtttatatagg-----A-CT-A-TTTGTTG-CTGTC-CCTATACACAGGGTAAATACG-GTA----
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccta-TT-A-TCTGTTG-CTGTC-CAAAAACATAGGGTAGATAatacacct
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-tg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CTGTC-CAAATACATAGGGTAAA------TA----C-GGTA-ACT---TGATTC--AT---GT--TTTGtcat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taaGTC-CAAATACATAGGTTAAATACG-GTA---------A-AT-------TTTGTAT---GT--CTtgtaagttcatttttttttaaaatacgatactgtatgcg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgatactgtatatggtgcatGTC-ACAATACATAGGTTAAA------TA----C-GATA-AT-------TTTGGAT---CT--TGTGgaaattaccaaagttatcctatgaattgggaaagtaaa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): AATACAGGAGTTCAGCTATGTATGTAGAGAGAGAGGAGACATCTTATTTGAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTCAATGATATCAGATATCATGGTGACAATCTTTTAAT






Alignments
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Reference ( family-691 )      :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGG-TT-AAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTT--T-TT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCTAATTGCGGTATGATTAATTTAACA-TAGTTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAC-CAT--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTGGGACAG-C-AANA-AA--TAA-TATT---TT-TT----T---AA--AAAT-A-CGA-TAC--T---GT--ATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ANAT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTGGGAC---G----------------AAANTA-------CCG--TATTT---AC-C-C--------TATGTATTGGGACAG-CAAAAA--A-AATT-ATTATTTTTT----AA-AA----TA----A-------TATGTAT-TGGGACAG---C-AAAATNT-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-GATA-ATT---CAATTTGGAT---GT--TTTGGNACTANGAATAATCAT----TTTCAT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 acctatgttttcggacgaaattaccgcatttaccctatgtattgggacagtaaaaaaataattattttttaaaataatatgtattggcacagcaaaaaatttaatttatttattg------TA-CCATATAT-AAC--ATACA----------A----------------AAATTA-------CC------TT---AC-T-C--------TATGAATTGGGACAG-TTAAAA--A-ATTT-----TTTTTT----TA-AA----TG----T-------TAATTAT-TTGGACAG---C-AAAAAAT-T--AA-TT-ATATGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTGAATACG-GTA----tccaaatttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tagtggactggacctttactcctttatga-AACT-AT-GTTTTTT----AA-AT----TACCGTATTCACCCTATGTAT-TGGGACAG---C-AACATA---T-AA-TTAATTTTTTG-CTGTC-CAAATAatttaaaaaacatagttga
gi|16                         :                                                                                                                                                       tagtggactggacctttactcctttatgataccatatataacatacaaaaattaccttactctatgaattgggacagttaaaaaattttttttttaaatgttaatT--ACTGTA-TTTACC-CTATGTATTGGGACAG-C-AACA-AA--TAA-TAAT---C-------------A--AAAT-AGCAATTAT--T---GT--AT--------------------------------T------TA-CC----------CTATGTGTTGGGAC---AGCAACAAATAATAATTAAAATAGCAATTACCA--TA-TT---AC-C-C--------TATGTATTGGGACAG-CAACAA--ATAATT-ATga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-TT-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACA-G----------TA-ATTG--CAATTTTGAT---attgcaattttgataccttactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgttgctgtcccaacacatagggtaaatacaataattgctattttgatt----------------AAATTA-------ACG--CATTT---AC-C-C--------TATGTATTGGGACAG-TAAAAA--A-AATA-ATTATTTTTT----TA-AA----TA----A-------TATGTAT-TGGGACAG---CAAAAAAAT-TT-AG--C-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACTGTAATAATT-GTA-------ATT-ATT---C---TTAGATACAGA--TATAAGACTATGAATAATCAT----TTTCATaccttactg
gi|18                         :                                                           ATTAAAAAACAAA--GTTATTGTTTGTTTCAATGG-TTTAAAAAACAACAGCACAACATGCATGGGTTT--G-TT-ATTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTGCCTAATTGCGGTATGATTAATTAAACA-TAGCTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taAAA--A-AAT--ATAAATTTCT----AA-AA----G----------------GTAT-TGGGACAG---C-AAAAAAA-TT-AA-TT-ATTTATTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTATTGGGACAG-C-AAAA-AAATTAATTATT---TA-TTGCTGT---CC--CAAT-A-C-A-TAG--G---GTAAATACGGTA-----A----T---CAT-GACA-ACATC-----TA-C---AT----AC--ATGTATTT---C---A----------------AAAAT----------G--AATTT---ACACGC--------TATGCATatcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaaaaatataaatttctaaaag---TT-TT----T---GA--AA-T-A-CA-------T---GT--ATG---------------TAGATGTTGTCA-TGAT------TA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC---ataaaatat
gi|2                          : aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagcaaaaaaattaattatttattgctATTAAAAAACAAACAGTTATTGGTTGTTTCAATGGACG-AAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTTGTTATT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCAAATTGCGGTACGATTAATTTAACA-T-----TTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACA------AAAC-TAT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-TAAAAA-AA--TAA-CA-T---TT-TT----T---AA--AAAT-A-CGA-TAC--T---GA--TTACGGTGC----A----TATACAT-ACCA-ACAT------TA-ATGTATTT-AACCTTTATTTTAGGAC---A----------------AAATTA-------CTG--AATTT---CC-C-T--------TTTTTATTGGGACAG-TAAAAA--A-A----ATTATTCTTT----AA-AA----TA----A-------TATGTAT-TGGGACAG---C-AAAATTT-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAAAACG-Gtgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              g--ATGCAGTGC----A----TAGA-AT-ACCG-AAAT------TA-CCGTTTTT-GA--TATGT--------------------------------CA-------CC-------T---A--------------ATGTATTGGGACTG-TAAAA-------TG-ATTATTTTT-----AA-AA----TG----A-------TAGGTAT-TGGAACAG---C-ATTCTTT-TT-AA-TT-ATGCATTG-CTGTT-GTAATA-----GGTAAATAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---AC-C-C--------TATGTATTGGGATAATCAAAAA--G-AATT---------TT----AA-AAAAAATA----A-------TAAGTAT-TGGGACAG---C-CAAAAAA-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACAGTAAATACG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TT----T---AA--AA-T-A-CTA-TAC--T---AT--ACACA--------------AGAT----CCA-AAAT------TA-TCGTATTT-AACCTATGTATTGTGAC---T----------------AAATTA-------CCA--TATTT--------T--------TTGGTATTGAAACAG-TAACAA--A-A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaaaT-AA-CT-ATTTGTTG-CTGTC-CCTATACACAGGGTAAATACG-GTA----t
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgaccc-CGA-TAC--T---GT--ATATGGTGC----A----TAGACAT-ACAA-AATT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTTGGAC---G----------------AAATTA-------CCA--AAGTT---AT-C-C--------TATGAATTGGGAAAG-TAAAatacacct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -CTGTC-CAAATACATAGGGTAAATACG-G----------TA-ACT---TGATTC--AT---GT--TTTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                             taaT--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTTGGACAG-T-GTAA-GT--TCA-T-TT---TT-TT----T---TA--AAAT-A-CGA-TAC--T---GT--ATGCGtgtaagttcatttttttttaaaatacgatactgtatgcg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taacaaaacatgaatcaagtTATTTTTT----AA-A-----TA----A-------TAAGTAT-TGGGACAG---C-AAAAAAA-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATTTG-GTA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a-C--------TATGTATTGGGACAT-TAAAAA--A-AATT-ATTTTTTTTT----AA-AA----TA----A-------TATGTAT-TGGGACAG---C-AAAATTT-GA-AA-TT-ATTTGTTa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-AA----TA----A-------TAAGTAT-TGGGGCAA---C-CAAACTT-TTCAA-TT-ATTTGTTA-GTGTT-CCAATACTTAAGGa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGTAT-TGGGACAG---C-AAAAAAAATT-AG-TT-ATTTGTTG-CTGTC-TCAATACATAGGGTAAATACATGTA----C-AGTA-cgataatattagtt
gi|3                          :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATT-AAAAATCAACAGCACAACACGCATGGG-TT--T-GT-TTTG------TTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTATCTAATTGTGGTATGATTCATTTAACA-TA-----------GTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAC-TAT--ACTGTA-TTTACC-CTATTT-TTGGGACAGTT-TAAA-AA--TAG-TAAT---TT-TT----A---AA--AAAT-A-CGA-TAC--T------------GTGC----A----TAGATAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTT-AACTTATGTTTTGGGAT---G----------------AAATTA-------CGG--CATTT---AC-C-C--------TATGGATTGGGACAG-TAAAAA--ATAAAT-AT--TTTTTT----AA-AA----TA----A-------TATGTGT-TGGGACAG---C-AAAAATT-TT-AA-TT-ATATGTTG-CTATC-CCAATACATAGGGTAAATAC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTT----GA-AT----TA----A-------AATGTAT-TGGGACAG---C-AAATCAA-TC-AA-TT-ATTTGTAG-CTGTT-CCAATACATAGAGTAAAT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-TT-ATTTGTTG-TTGGC-CCAATACATAGGATAAATA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacataaagtgctgtttatataggttTAT-TT-AA-T--ATTCGTTG-CTTTCACCAGTACATGGGGTAAATACG-GTA----
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtAT-ACTG-GTAA------TA-CCGTATTT-ACCCCATGTACTGG--T---G----------------AAAGCA-------ACGAATATTttaccagtatt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttatttT-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGTC-TTAATACATAGGGTTAATGCA-GTA----t
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                       actgtatTCTTTTG----TATTGTGATG------AAAC-TAT--ACAAAA-TTTATC-CTATGTATTGGGAttt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-TT-AA-TC-ATTTGTTG-CTGTC-TCAATATATAGGGTAAACACG-GT
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gi|4                          :                                                                                          ATGGATT-AAAAAACAACAGCATAACACGCATG--TTT--T-TT-TTTTGGTTGTTTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTACCTAATTGCAGTTTGATTAATGTAAGA-TATTTTTTT---TGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAA-TAT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-T-AAAA-AA--TTA-TATTATTTT-TT----T---AA--AAAT-A-TGA-TAC--T---GT--ATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTGTTT-AACCTATGTTTTGGGAC---G----------------AAATTA-------CAG--CATTT---AC-C-C--------TACGTATTGGGACAG-TAAAAA--A-AATG-ATTATTTTTT----AA-AA----TA----A-------TATGTAT-TGGGACAG---C-AAACTAT-TT-AA-TT-ATTTGTTG-CTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    AATTGCTGTA-GAT--ATTTAATAATAGACTATTGAATGTTTTTGTTGGGAATTGATGTGATTTTTTATAATCTCATCTACCGTA-TTTACC-CTGTGTAATGGGACAG-C-AAAA-AA----A-TTTT---TT-TT----TTATAA--AAAT-A-GGA-TAC--T---GT--ATAGAGTGT----G----TATACAT-ACCA-AAAT------TA-CTGTCTTT-AGCCTATATATTGGGAT---G-----------------ATTTA-------GAA--TAGTT---AC-C-C--------TATATATTGAGACAG-TAAAAA--A-A-------------T----AA------------------------GTAT-TTGGACTG---A-AAAAAAT-GT-AA-TT-ATTTATTT-CTGTC-CCAATTCATAGAGTAAATA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-691 )      :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATTAAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTT--T-TT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCTAATTGCGGTATGATTAATTTAACA-TAGTTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAACT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTGGGACAG-T-AAAA-AATAATATT---TT-TTT---AA--AAAT-ACGATAC--T---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ANAT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTGGGAC-----------------------GA-AATTACCGTATTT---ACCC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATT-ATTATTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TANGTAT-TGGGACAGC-AAAANAT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-GATA-ATT---CAATTTGGAT---GT--TTTGAGATTAAGAATAATCATGATATTTCAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagtggactggacctttactcctttatgaAT------TA-CTGTATTT-ACCCTATGTATTGGGACAGCAACAAATAATAATCAAAATAGC-AATTATTGTATTT---ACCC--------TATGTGTTGGGACAGCAACAA--ATAATA-ATTAAAATAGCAATT----AC-CA--TATTACCCTATGTAT-TGGGACAGC-AACAAA---T--AA-TTATatttaaaaaacatagttga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACA-G----------TA-ATTG--CAATTTTGAT---tgcaattttgataccttactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgttgctgtcccaacacatagggtaaatacaataattgctattttgattA-AATTAACGCATTT---ACCC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATA-ATTATTTT-----TT----TA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGCAAAAAAAT-TT--AG--CATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACTGTAATAATT-GTA-------ATT-ATT---C---TTAGATACAGA--TATAAGACTATGAATAATCAT----TTTCATaccttactg
gi|18                         :                                                           ATTAAAAAACAAA--GTTATTGTTTGTTTCAATGGTTTAAAAAACAACAGCACAACATGCATGGGTTT--G-TT-ATTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTGCCTAATTGCGGTATGATTAATTAAACA-TAGCTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taAAA--A-AAT--ATAAATTT-----CT----AA-AA------------GGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTATTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---TT-TTT---GA--AA-T-ACA------T---GTATG---------------TAGATGTTGTCA-TGAT------TA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC-----------------------atcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|2                          : aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagcaaaaaaattaattatttattgctATTAAAAAACAAACAGTTATTGGTTGTTTCAATGGACGAAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTTGTTATT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCAAATTGCGGTACGATTAATTTAACA-T-----TTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACA------AAACT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-TAAAAA-AATAACA-T---TT-TTT---AA--AAAT-ACGATAC--T---GATTACGGTGC----A----TATACAT-ACCA-ACAT------TA-ATGTATTT-AACCTTTATTTTAGGAC-----------------------AA-AATTACTGAATTT---CCCT--------TTTTTATTGGGACAGTAAAAA--A-A----ATTATTCT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAAATTT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAAAACG-Gtgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gATGCAGTGC----A----TAGA-AT-ACCG-AAAT------TA-CCGTTTTT-GA--TATGT-------------------------------------CACC-----T---A------------ATGTATTGGGACTGTAAAA-------TG-ATTATTTT-----T-----AA-AA--TG--A---TAGGTAT-TGGAACAGC-ATTCTTT-TT--AA-TTATGCATTG-CTGTT-GTAATA-----GGTAAATAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---ACCC--------TATGTATTGGGATAATCAAAA--A-GA------ATTTT-----AA----AA-AAAATA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-CAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACAGTAAATACG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTT---AA--AA-T-ACTATAC--T---ATACACA--------------AGAT----CCA-AAAT------TA-TCGTATTT-AACCTATGTATTGTGAC-----------------------TA-AATTACCATATTT------T--------TTGGTATTGAAACAGTAACAA--A-A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaaaT--AA-CTATTTGTTG-CTGTC-CCTATACACAGGGTAAATACG-GTA----t
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccCGATAC--T---GTATATGGTGC----A----TAGACAT-ACAA-AATT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTTGGAC-----------------------GA-AATTACCAAAGTT---ATCC--------TATGAATTGGGAAAGTAAAatacacct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CTGTC-CAAATACATAGGGTAAATACG-G----------TA-ACT---TGATTC--AT---GT--TTTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            taaT--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTTGGACAG-T-GTAA-GTTCAT-TT---TT-TTT---TA--AAAT-ACGATAC--T---GTATGCGtgtaagttcatttttttttaaaatacgatactgtatgcg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taacaaaacatgaatcaagtTATTTT-----TT----AA-A---TA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATTTG-GTA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aC--------TATGTATTGGGACATTAAAAA--A-AATT-ATTTTTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAA--AT-TTGAAA-TTATTTGTTa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA--TA--A---TAAGTAT-TGGGGCAAC-CAAACTT-TTC-AA-TTATTTGTTA-GTGTT-CCAATACTTAAGGa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAAATT--AG-TTATTTGTTG-CTGTC-TCAATACATAGGGTAAATACATGTA----C-AGTA-cgataatattagtt
gi|3                          :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATTAAAAATCAACAGCACAACACGCATGGG-TT--T-GT-TTTG------TTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTATCTAATTGTGGTATGATTCATTTAACA-TA-----------GTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAACT-AT--ACTGTA-TTTACC-CTATTT-TTGGGACAGTT-TAAA-AATAGTAAT---TT-TTA---AA--AAAT-ACGATAC--T----------GTGC----A----TAGATAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTT-AACTTATGTTTTGGGAT-----------------------GA-AATTACGGCATTT---ACCC--------TATGGATTGGGACAGTAAAAA--ATAAAT-AT--TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTGT-TGGGACAGC-AAAAATT-TT--AA-TTATATGTTG-CTATC-CCAATACATAGGGTAAATAC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a-----TT----GA-AT--TA--A---AATGTAT-TGGGACAGC-AAATCAA-TC--AA-TTATTTGTAG-CTGTT-CCAATACATAGAGTAAAT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TTATTTGTTG-TTGGC-CCAATACATAGGATAAATA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacataaagtgctgtttatataggttAT-TT--AA-T-ATTCGTTG-CTTTCACCAGTACATGGGGTAAATACG-GTA----
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gttAT-ACTG-GTAA------TA-CCGTATTT-ACCCCATGTACTGG--T-----------------------GA-AAttaccagtatt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttatttaatattcgttgcT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-TTAATACATAGGGTTAATGCA-GTA----t
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                      actgtatTCTTTTG----TATTGTGATG------AAACT-AT--ACAAAA-TTTATC-CTATGTATTGGGAttt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-TT--AA-TCATTTGTTG-CTGTC-TCAATATATAGGGTAAACACG-GT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTATCTGTTG-CTGTC-CAAAAACATAGGGTAGATATG-tcat
gi|4                          :                                                                                          ATGGATTAAAAAACAACAGCATAACACGCATG--TTT--T-TT-TTTTGGTTGTTTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTACCTAATTGCAGTTTGATTAATGTAAGA-TATTTTTTT---TGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAAT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-T-AAAA-AATTATATTATTTT-TTT---AA--AAAT-ATGATAC--T---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTGTTT-AACCTATGTTTTGGGAC-----------------------GA-AATTACAGCATTT---ACCC--------TACGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATG-ATTATTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAACTAT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                   AATTGCTGTA-GAT--ATTTAATAATAGACTATTGAATGTTTTTGTTGGGAATTGATGTGATTTTTTATAATCTCATCTACCGTA-TTTACC-CTGTGTAATGGGACAG-C-AAAA-AA--ATTTT---TT-TTTTATAA--AAAT-AGGATAC--T---GTATAGAGTGT----G----TATACAT-ACCA-AAAT------TA-CTGTCTTT-AGCCTATATATTGGGAT-----------------------G--ATTTAGAATAGTT---ACCC--------TATATATTGAGACAGTAAAAA------------------------------------A--A---TAAGTAT-TTGGACTGA-AAAAAAT-GT--AA-TTATTTATTT-CTGTC-CCAATTCATAGAGTAAATA
gi|6                          :                                                                                          ATGGATTGAAAAATAACAACACAACACACACAGGTTT--T-TTATTTT------TTTTATTTATTTA--TATAATTACTGTACCAAGGTAATTGTAGTATAATTAGTT----G-TAGTTTTTT--ATATTTTGTTTGG----T----TGA--------ATATT-AT--ACCAGAGTGTACA-ATACTTA----GA----T-AAAC-A------------T-GCC---AA--AAATAACCATAT--T---TTACCCTATGC----A----TTGG----AACA-AAAT------TA-CTGTATTT-ACACTATGTATTGTGAC-----------------------GGCAATT----T-TTT---GTGCAACAATAGTAAGTATCAGGAGAGCAAAAAATA-AATT-ATaaaatttatattgtttggtgccat
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Reference ( family-691 )      :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATTAAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTT--T-TT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCTAATTGCGGTATGATTAATTTAACA-TAGTTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAACT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATNTATTGGGACAG-T-AAAA-AATAATATT---TT-TTT---AA--AAAT-ACGATAC--T---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ANAT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTGGGAC-----------------------GA-AATTACCGTATTT---ACCC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATT-ATTATTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TANGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-GATA-ATT---CAATTTGGAT---GT--TTTGAGATTAAGAATAATCATGATATTTCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgtgtagtcaaatgctaataccaaagatgcttgatacagccC-----------------------GC-AATTACCATATCC---ACTG--------CATGTATTAGGACAGTAAAAA-----------------------------------TA--A---TAAGTACCTGGGAAAGC-AAATCAT-GT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAGTACATAGGATAAATACG-GTA----C-CATccattagtattgtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                         ttgtgtagtcaaatgctaataccaaagatgcttgatacagcctcatataattcttaataccaaattaattccatttgtttaatacA--AAGT-ACAATAA--T---ATATACGGTGC----A----TAGAAAT-ACCATAAAT------TA-CCATATTC-AAT---TGTATTGGGACAGT--------------------AA-AAAGATTTTTTTTTAAATAA--------TAAATATTGGGACAG--AAAC--A-AATTAATTATTtagtattgtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcagA-AATTACCATATTC---AAT-----------TGTATTGGGACAGTAAAAA--G-ATTT-----TTTT-----TT----AA-A---TA--A---TAAATAT-TGGGACAGA-AACAAA--TT--AA-TTATTGGTTGTCTGTT-CCAAAACATAGGGTTATTATA-GTA----ggttgtctgttccaaaacatagggttattatagtaatgat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                    tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcagaaagtacaataatatatacggtgcatagaaataccat---AA--AAAT-ACGATAC--C---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAN------NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------------NN-NNNNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N-NNNN-NNNNNNNN-----NN----NN-NN--NN--N---NNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNN-NN--NN-GTATTTGTTA-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-ATCA-AC--------TA-C-ATATTT-AACCTATGTATTAGGAT-----------------------GA-AATTACCATTCTT---ATCC--------TATGTGTTGGGACAGTAAAAA--A-AA-----TATTTT-----TT----AC-AA--TA--T---TAAATTC-TCGGACAGC-AAAAAG--TT--GA-TT-TTTTTTG-CTGTC-TCAATAAATAGAGTAAATACG-GCA----CTAATACATT---CA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtgccggtatgcattACCTATGTTTTCGGAC-----------------------GA-AATTACCGCATTT---ACCC--------TATGTATTGGGACAGT-AAAA--A-AATA-ATTATTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGCACAGC-AAAAAAT-TT--AATTTATTTATTG-TTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----ttaatgaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTAC----AAAAGTAGATAC-ACTA-GTATCTTGATTA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC-----------------------AA-atcaagatactagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     acctatgttttcggacgaaattaccgcatttaccctatgtattgggacagtaaaaaaataattattttttaaaataatatgtattggcacagcaaaaaatttaatttatttattg------TA-CCATATAT-AAC--ATACA------------------------------AA-AATTACC----TT---ACTC--------TATGAATTGGGACAGTTAAAA--A-ATTT-----TTTT-----TT----TA-AA--TG--T---TAATTAT-TTGGACAGC-AAAAAAT-T---AA-TTATATGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTGAATACG-GTA----tccaaatttat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagtggactggacctttactcctttatgaAT------TA-CTGTATTT-ACCCTATGTATTGGGACAGCAACAAATAATAATCAAAATAGC-AATTATTGTATTT---ACCC--------TATGTGTTGGGACAGCAACAA--ATAATA-ATTAAAATAGCAATT----AC-CA--TATTACCCTATGTAT-TGGGACAGC-AACAAA---T--AA-TTATatttaaaaaacatagttga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACA-G----------TA-ATTG--CAATTTTGAT---tgcaattttgataccttactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgttgctgtcccaacacatagggtaaatacaataattgctattttgattA-AATTAACGCATTT---ACCC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATA-ATTATTTT-----TT----TA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGCAAAAAAAT-TT--AG--CATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACTGTAATAATT-GTA-------ATT-ATT---C---TTAGATACAGA--TATAAGACTATGAATAATCAT----TTTCATaccttactg
gi|18                         :                                                           ATTAAAAAACAAA--GTTATTGTTTGTTTCAATGGTTTAAAAAACAACAGCACAACATGCATGGGTTT--G-TT-ATTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTGCCTAATTGCGGTATGATTAATTAAACA-TAGCTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taAAA--A-AAT--ATAAATTT-----CT----AA-AA------------GGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTATTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---TT-TTT---GA--AA-T-ACA------T---GTATG---------------TAGATGTTGTCA-TGAT------TA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC-----------------------atcatgacaacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|2                          : aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagcaaaaaaattaattatttattgctATTAAAAAACAAACAGTTATTGGTTGTTTCAATGGACGAAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTTGTTATT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCAAATTGCGGTACGATTAATTTAACA-T-----TTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACA------AAACT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-TAAAAA-AATAACA-T---TT-TTT---AA--AAAT-ACGATAC--T---GATTACGGTGC----A----TATACAT-ACCA-ACAT------TA-ATGTATTT-AACCTTTATTTTAGGAC-----------------------AA-AATTACTGAATTT---CCCT--------TTTTTATTGGGACAGTAAAAA--A-A----ATTATTCT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAAATTT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAAAACG-Gtgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gATGCAGTGC----A----TAGA-AT-ACCG-AAAT------TA-CCGTTTTT-GA--TATGT-------------------------------------CACC-----T---A------------ATGTATTGGGACTGTAAAA-------TG-ATTATTTT-----T-----AA-AA--TG--A---TAGGTAT-TGGAACAGC-ATTCTTT-TT--AA-TTATGCATTG-CTGTT-GTAATA-----GGTAAATAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---ACCC--------TATGTATTGGGATAATCAAAA--A-GA------ATTTT-----AA----AA-AAAATA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-CAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATACAGTAAATACG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTT---AA--AA-T-ACTATAC--T---ATACACA--------------AGAT----CCA-AAAT------TA-TCGTATTT-AACCTATGTATTGTGAC-----------------------TA-AATTACCATATTT------T--------TTGGTATTGAAACAGTAACAA--A-A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaaaT--AA-CTATTTGTTG-CTGTC-CCTATACACAGGGTAAATACG-GTA----t
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccCGATAC--T---GTATATGGTGC----A----TAGACAT-ACAA-AATT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTTGGAC-----------------------GA-AATTACCAAAGTT---ATCC--------TATGAATTGGGAAAGTAAAatacacct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CTGTC-CAAATACATAGGGTAAATACG-G----------TA-ACT---TGATTC--AT---GT--TTTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            taaT--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTTGGACAG-T-GTAA-GTTCAT-TT---TT-TTT---TA--AAAT-ACGATAC--T---GTATGCGtgtaagttcatttttttttaaaatacgatactgtatgcg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taacaaaacatgaatcaagtTATTTT-----TT----AA-A---TA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATTTG-GTA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aC--------TATGTATTGGGACATTAAAAA--A-AATT-ATTTTTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC---AAAAT-TTGAAA-TTATTTGTTa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA--TA--A---TAAGTAT-TGGGGCAAC-CAAACTT-TTC-AA-TTATTTGTTA-GTGTT-CCAATACTTAAGGa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAAATT--AG-TTATTTGTTG-CTGTC-TCAATACATAGGGTAAATACATGTA----C-AGTA-cgataatattagtt
gi|3                          :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATTAAAAATCAACAGCACAACACGCATGGG-TT--T-GT-TTTG------TTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTATCTAATTGTGGTATGATTCATTTAACA-TA-----------GTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAACT-AT--ACTGTA-TTTACC-CTATTT-TTGGGACAGTT-TAAA-AATAGTAAT---TT-TTA---AA--AAAT-ACGATAC--T----------GTGC----A----TAGATAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTT-AACTTATGTTTTGGGAT-----------------------GA-AATTACGGCATTT---ACCC--------TATGGATTGGGACAGTAAAAA--ATAAAT-AT--TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTGT-TGGGACAGC-AAAAATT-TT--AA-TTATATGTTG-CTATC-CCAATACATAGGGTAAATAC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a-----TT----GA-AT--TA--A---AATGTAT-TGGGACAGC-AAATCAA-TC--AA-TTATTTGTAG-CTGTT-CCAATACATAGAGTAAAT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-TTATTTGTTG-TTGGC-CCAATACATAGGATAAATA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacataaagtgctgtttatataggttAT-TT--AA-T-ATTCGTTG-CTTTCACCAGTACATGGGGTAAATACG-GTA----
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gttAT-ACTG-GTAA------TA-CCGTATTT-ACCCCATGTACTGG--T-----------------------GA-AAttaccagtatt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttatttaatattcgttgcT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-TTAATACATAGGGTTAATGCA-GTA----t
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                      actgtatTCTTTTG----TATTGTGATG------AAACT-AT--ACAAAA-TTTATC-CTATGTATTGGGAttt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-TT--AA-TCATTTGTTG-CTGTC-TCAATATATAGGGTAAACACG-GT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAATACG-GTA----C-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTATCTGTTG-CTGTC-CAAAAACATAGGGTAGATATG-tcat
gi|4                          :                                                                                          ATGGATTAAAAAACAACAGCATAACACGCATG--TTT--T-TT-TTTTGGTTGTTTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTACCTAATTGCAGTTTGATTAATGTAAGA-TATTTTTTT---TGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAAT-AT--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAG-T-AAAA-AATTATATTATTTT-TTT---AA--AAAT-ATGATAC--T---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTGTTT-AACCTATGTTTTGGGAC-----------------------GA-AATTACAGCATTT---ACCC--------TACGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AATG-ATTATTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAACTAT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                   AATTGCTGTA-GAT--ATTTAATAATAGACTATTGAATGTTTTTGTTGGGAATTGATGTGATTTTTTATAATCTCATCTACCGTA-TTTACC-CTGTGTAATGGGACAG-C-AAAA-AA--ATTTT---TT-TTTTATAA--AAAT-AGGATAC--T---GTATAGAGTGT----G----TATACAT-ACCA-AAAT------TA-CTGTCTTT-AGCCTATATATTGGGAT-----------------------G--ATTTAGAATAGTT---ACCC--------TATATATTGAGACAGTAAAAA------------------------------------A--A---TAAGTAT-TTGGACTGA-AAAAAAT-GT--AA-TTATTTATTT-CTGTC-CCAATTCATAGAGTAAATA
gi|6                          :                                                                                          ATGGATTGAAAAATAACAACACAACACACACAGGTTT--T-TTATTTT------TTTTATTTATTTA--TATAATTACTGTACCAAGGTAATTGTAGTATAATTAGTT----G-TAGTTTTTT--ATATTTTGTTTGG----T----TGA--------ATATT-AT--ACCAGAGTGTACA-ATACTTA----GA----T-AAAC-A------------T-GCC---AA--AAATAACCATAT--T---TTACCCTATGC----A----TTGG----AACA-AAAT------TA-CTGTATTT-ACACTATGTATTGTGAC-----------------------GGCAATT----T-TTT---GTGCAACAATAGTAAGTATCAGGAGAGCAAAAAATA-AATT-ATaaaatttatattgtttggtgccat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT---TTGTTT---GGTTGAAT-ATTATAC--CAGAGTGTACAATACTTAGA----TAAACAT-GCCA-AAAA------TAACCATATTTTACCCTATGCATTGGAAC-----------------------AA-AATTACTGTATTT---ACAC--------TATGTATTGTGACGGCA----------------ATTTT-----TTGTGCAACAA--TA--G---TAAGTAT-CAGGAGAGC-AAAAAA--TA--AA-TTATCTGTTG-CTGTC-CCAATACATAGGGTAAACATG-ctgttgctgtcccaatacatagggtaaacatg
gi|7                          :                                                                                                                                                    atggattgaaaaataacaacacaacacacacaggttttttattttttttatttatttatataattactgtaccaaggtaattgtagtataattagttgtagttttttT--ACCGTA-TT-ACCACGCTGTATTGGGACAG-T-AAAA-AA--ATATT---TT-TTTT--AA--AAAT-ACTTTAC--C---TTAAACAGTG----------TAGACAT---CA-AAAT------TA-GCATATTT-AACCTGTGTATTAGGAT-----------------------GA-AAATACCATATTT---ACCC--------TACATATTGGGACAGTAAAAA--A-AAAT--TTTTTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-ACAAAA--TT--A----ATTTGTTG-TTGTC-TTATTACATAGGG-AAATACG-GTA----
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                     aataatTGTACCG------ATACT-A----CCGTA-TTT-CC-CTATGTAATAAGACAA-C-AACA-AATTA-ATT---TT-gtatcggtacatgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|7                          :                                                                                                                                                         aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctgtgtattaggatgaaaataccatatttaccctacatattgggacagtaaaaaaaaattttttttttaaaataataagtattgggacagcacC----A----TACATGT-ACCG-ATAC------TA-CCGTATTT--CCCTATGTAtgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                        aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctgtgtattaggatgaaaataccatatttaccctacatattgggacagtaaaaaaaaattttttttttaaaataataagtattgggacagcacaaaattaatttgttgttgtcttat-AATTACCGTATTA---ACCA--------TATGTTTTGGGACAGTTAAAA--A-T-TT-CTTTTTTT-----TT----TA-AA--TA--G---GAAGTAT-TGAGAGAGC-AAAAAAT-TT--AT-TTATTTTTTG-CTATC-CAAATACATATGGTAAATATG-GTA----tgtatttcaaaatttaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                        catcaatgtaacattttgtaaacattttaccagtcTACC-CTATCTTTTGGGACAG-T-AAAATAATACTATT---TT-TTTT--AA--AAAT-ACGATAC--T---GTATATGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTA-AACCTATGT-------------------------------------TACCGCATTA---ACCC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAA--A-AAA--ATAAAAAT-----TA----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAAAATT-TT--AA-TTATTTCTTG-CTGTC-CCAATACAAAGGGTAAATACtaccagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt


blockSeqs                     :                                                                        CA          G                                          GTTA  A    GGTTGT    A        A                                        A    A  GC     GAA            GAAT        TTTTTTAT     C  CT      G      A    C TT        T A    T  TA     ATT  G   TAT  TT    A       .  AGA           AAAAG        A  T    T A  CTTGAT  A        T         A       AGCAACAAATAATAATCAAAATA  C       G     TAA    AACAATAG                     AAATTAATTA       AGCAA  GTGC  C  AA  TT CCC  T    C         A      AA  GA  T          T     A                     T   ATTGCGG  AC   AAA A A  G   ACAGA                    C  .   
blockSeqs                     :                                                                        CA          G                                          G     .    .         .        A                                        T    .  TT     A              .           CA           .  .       .      .    G AT        . .    .  TC     .    .   T    .     .       .  .             TTAGA        C  .    . C  .       .        .         N       AGT                      .       A     .      .                            ATAATAATTA       .      .     .  .   .  .    A    .         .      C   C   .          .     .                     .   CTAA     A    G   A T  T   TAA                      .      
blockSeqs                     :                                                                        .           G                                          T     .    .         .        A                                        T    .  GA     A              .           CG           .  .       .      .    T AT        . .    .  TA     .    .   T    .     .       .  .             A            T  .    . C  .       .        .         A       .                        .       T     .      .                            NNNNNNNNN        .      .     .  .   .  .    A    .         .      T   .   .          .     .                     .   CCA      T    .   A T  A   GT                              
blockSeqs                     :                                                                                                                               T     .    .         .        A                                        T    .  GT     A              .           TG           .  .       .      .    G TT        . .    .  TT     .    .   .    .     .       .  .             A            T  .    . T  .       .        .         T       .                        .       A     .      .                            AAATAATTA        .      .     .  .   .  .    N    .         .      N   .   .          .     .                     .   CAG      A    .   G .  .                                   
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .     .       .  .             A            T  .    . A  .       .        .         A       .                        .       G     .      .                            AAAAATAA         .      .     .  .   .  .    A    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  .             .            C  .    . A  .       .        .         T       .                        .       G     .      .                            AAATTA           .      .     .  .   .  .    A    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .            .  .    . A  .       .        .         A       .                        .       A     .      .                            TGATTA           .      .     .  .   .  .    T    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .            .  .    . A  .       .        .         A       .                        .       G     .      .                            GATTT            .      .     .  .   .  .    A    .         .      A   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    . T  .       .        .         A       .                        .       A     .      .                            AAATA            .      .     .  .   .  .    T    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    . C  .       .        .         A       .                        .       G     .      .                            AATTT            .      .     .  .   .  .    T    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .       .        .         A       .                        .       G     .      .                            AGAA             .      .     .  .   .  .    T    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .             .      .                                             .      .     .  .   .  .    A    .         .      T   .   .          .     .                     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .                                                          .  .   .  .    A    .         .      .   .   .          .     .                                                                                    
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   .   .          .     .                                                                                    
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcag---------A-AATTACCATATTC---AA----T-----------TGTATTGGGACAGTAAAAAG-A----TTT-TTTT-----TT----AA-A---TA--A---TAAATAT-TGGGACAGA-AACAAA--TT--AA-TTATTGGTTGTCTGTT-CCAAAACAT--AG-------GGTTATTATA-GT-A-----ATG-ATggttgtctgttccaaaacatagggttattatagtaatgat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                        tacaactgttgtagttgtatctggaactttttgttgcatattacatcagaaagtacaataatatatacggtgcatagaaataccat---AA--AAAT-ACGATAC--C---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAN------NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------------N---------N-NNNNNNNNNNNNN---NN----NN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNN-----NN----NN-NN--NN--N---NNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNN-NN--NN-GTATTTGTTA-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-ATCA-AC--------TA-C-ATATTT-AACCTATGTATTAGGAT-----------------------G---------A-AATTACCATTCTT---AT----CC--------TATGTGTTGGGACAGTAAAAAA-AA----TA-TTTT-----TT----AC-AA--TA--T---TAAATTC-TCGGACAGC-AAAAAG--TT--GA-TT-TTTTTTG-CTGTC-TCAATAAAT--AG-------AGTAAATACG-GC-A--CTAATACATT-CA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtgccggtatgcattACCTATGTTTTCGGAC-----------------------G---------A-AATTACCGCATTT---AC----CC--------TATGTATTGGGACAGT-AAAAA-AATAATTA-TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGCACAGC-AAAAAAT-TT--AATTTATTTATTG-TTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATACG-GT-A--ttaatgaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTAC----AAAAGTAGATAC-ACTA-GTATCTTGATTA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC-----------------------AACAATAAATA-AATTAAATTTTTT---GCTGTGCCAA------TACATATT-----ATTTTAAAA-AATAATTA-TTTT-----TT----atcaagatactagtgtatctacttttgtacctccaaatttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acctatgttttcggacgaaattaccgcatttaccctatgtattgggacagta------TA-CCATATAT-AAC--ATACA------------------------------A---------A-AATTACC----TT---AC----TC--------TATGAATTGGGACAGTTAAAAA-A----TTT-TTTT-----TT----TA-AA--TG--T---TAATTAT-TTGGACAGC-AAAAAAT-T---AA-TTATATGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTGAATACG-GT-A--tccaaatttat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagtggactggacctttactcctttatgaAT------TA-CTGTATTT-ACCCTATGTATTGGGACAGCAACAAATAATAATCAAAATAG---------C-AATTATTGTATTT---AC----CC--------TATGTGTTGGGACAGCAACAAATAATAATTA-AAATAGCAATT----AC-CA--TATTACCCTATGTAT-TGGGACAGC-AACAAA---T--AA-TTATatttaaaaaacatagttga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATACA-G---------TA-ATTGCAATTTTGA--T---tgcaattttgataccttactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ataattatttgttgctgtcccaatacatagggtaatatggtaattgctattttaattattatttgttgctgtcccaacacatagggtaaatacaataattgctattttgatt---------A-AATTAACGCATTT---AC----CC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAAA-AATAATTA-TTTT-----TT----TA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGCAAAAAAAT-TT--AG--CATTTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AC-------TGTAATAATT-GT-A-----ATT-ATT-C---TTAGA--TACAGATATAAGACTATGAATAATCAT----TTTCATaccttactg
gi|18                         :                                                           ATTAAAAAACAAA--GTTATTGTTTGTTTCAATGGTTTAAAAAACAACAGCACAACATGCATGGGTTT--G-TT-ATTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTGCCTAATTGCGGTATGATTAATTAAACA-TAGCTTTTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taAAAA-AATA-TAA-ATTT-----CT----AA-AA------------GGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTATTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATACG-GT-AATC--ATG-A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---TT-TTT---GA--AA-T-ACA------T---GTATG---------------TAGATGTTGTCA-TGAT------TA-CCGTATTT-ACCCTATGTATTGGGAC-----------------------caacatctacatacatgtatttcaaaaatgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|2                          : aaaaaatataaatttctaaaaggtattgggacagcaaaaaaattaattatttattgctATTAAAAAACAAACAGTTATTGGTTGTTTCAATGGACGAAAAAACAACAGCACAACACGCATGGGTTTGTTATT-TTTT------TTTT-TTAATTTAATTACCGGTACTGTACCTACCAAATTGCGGTACGATTAATTTAACA-T-----TTT--ATGTTTTCTTTTG----TATTGTGACA------AAACT-A----T--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAGTAA-AAA-AATAACA-T---TT-TTT---AA--AAAT-ACGATAC--T---GATTACGGTGC----A----TATACAT-ACCA-ACAT------TA-ATGTATTT-AACCTTTATTTTAGGAC-----------------------A---------A-AATTACTGAATTT---CC----CT--------TTTTTATTGGGACAGTAAAAAA----AATTA-TTCT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAAATTT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAAAACG-Gtgaatttacacgctatgcatataaaatat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gATGCAGTGC----A----TAGA-AT-ACCG-AAAT------TA-CCGTTTTT-GA--TATGT----------------------------------------------CACC-----T---A----------------ATGTATTGGGACTGTAAAA-----TGATTA-TTTT-----T-----AA-AA--TG--A---TAGGTAT-TGGAACAGC-ATTCTTT-TT--AA-TTATGCATTG-CTGTT-GTAATA--------------GGTAAATAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---AC----CC--------TATGTATTGGGATAATCAAAAA-GA-----A-TTTT-----AA----AA-AAAATA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-CAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AC-------AGTAAATACG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TTT---AA--AA-T-ACTATAC--T---ATACACA--------------AGAT----CCA-AAAT------TA-TCGTATTT-AACCTATGTATTGTGAC-----------------------T---------A-AATTACCATATTT----------T--------TTGGTATTGAAACAGTAACAAA-A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaT--AA-CTATTTGTTG-CTGTC-CCTATACAC--AG-------GGTAAATACG-GT-A-----ATA-t
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgttatttaattctgtgtagaatgttgattaactacattagtcaactttgacccCGATAC--T---GTATATGGTGC----A----TAGACAT-ACAA-AATT------TA-CCGTATTT-AACCTATGTATTTGGAC-----------------------G---------A-AATTACCAAAGTT---AT----CC--------TATGAATTGGGAAAGTAAAcacct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -CTGTC-CAAATACAT--AG-------GGTAAATACG-GTAA--C--TTG-ATT-C-------A--T---GTTTTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            taa----T--ACCGTA-TTTACC-CTATGTATTTGGACAGT-G-TAA-GTTCAT-TT---TT-TTT---TA--AAAT-ACGATAC--T---GTATGCGtgtaagttcatttttttttaaaatacgatactgtatgcg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taacaaaacatgaatcaagtTA-TTTT-----TT----AA-A---TA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAA-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATTTG-GT-A--
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aC--------TATGTATTGGGACATTAAAAAA-AATTATTT-TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC---AAAAT-TTGAAA-TTATTTGTTa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-AA--TA--A---TAAGTAT-TGGGGCAAC-CAAACTT-TTC-AA-TTATTTGTTA-GTGTT-CCAATACTT--AA-------GGa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGTAT-TGGGACAGC-AAAAAAAATT--AG-TTATTTGTTG-CTGTC-TCAATACAT--AG-------GGTAAATACATGT-A--C--Acgataatattagtt
gi|3                          :                                                           ATTAAAAAACAAACAGTTATTGTTTGTTTCAATGGATTAAAAATCAACAGCACAACACGCATGGGTTT--G-TT-TTGT------TTTT-T-AATTTAATTACCAGTACTGTACCTATCTAATTGTGGTATGATTCATTTAACA-TAGTTTT-----------CTTTTG----TATTGTGACG------AAACT-A----T--ACTGTA-TTTACC-CTATTT-TTGGGACAGT-TTAAA-AATAGTAAT---TT-TTA---AA--AAAT-ACGATAC--T---GT-------GC----A----TAGATAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTT-AACTTATGTTTTGGGAT-----------------------G---------A-AATTACGGCATTT---AC----CC--------TATGGATTGGGACAGT--AAAA-AATAAATATTTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTGT-TGGGACAGC-AAAAATT-TT--AA-TTATATGTTG-CTATC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATACgta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-----TT----GA-AT--TA--A---AATGTAT-TGGGACAGC-AAATCAA-TC--AA-TTATTTGTAG-CTGTT-CCAATACAT--AG-------AGTAAAT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TTATTTGTTG-TTGGC-CCAATACAT--AG-------GATAAATA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacataaagtgctgtttatataggttAT-TT--AA-T-ATTCGTTG-CTTTCACCAGTACAT--GG-------GGTAAATACG-GT-A--
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gttAT-ACTG-GTAA------TA-CCGTATTT-ACCCCATGTACTGG--T-----------------------G---------A-AAttaccagtatt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gttatttaatattcgttgcT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGTC-TTAATACAT--AG-------GGTTAATGCA-GT-A--t
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                      actgtatTCTTTTG----TATTGTGATG------AAACT-A----T--ACAAAA-TTTATC-CTATGTATTGGGAttt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-TT--AA-TCATTTGTTG-CTGTC-TCAATATAT--AG-------GGTAAACACG-GT-
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAATACG-GT-A--C--
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTATCTGTTG-CTGTC-CAAAAACAT--AG-------GGTAGATATG-tcat
gi|4                          :                                                                                          ATGGATTAAAAAACAACAGCATAACACGCATG--TTT--T-TT-TTTTGGTTGTTTTT-TTAATTTAATTACCAGTACTGTACCTACCTAATTGCAGTTTGATTAATGTAAGA-TATTTTTTT---TGTTTTCTTTTG----TATTGTGACG------AAAAT-A----T--ACCGTA-TTTACC-CTATCTTTTGGGACAGT-A-AAA-AATTATATTATTTT-TTT---AA--AAAT-ATGATAC--T---GTATACGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTGTTT-AACCTATGTTTTGGGAC-----------------------G---------A-AATTACAGCATTT---AC----CC--------TACGTATTGGGACAGTAAAAAA-AATGATTA-TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAACTAT-TT--AA-TTATTTGTTG-CTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                   AATTGCTGTA-GAT--ATTTAATAATAGACTATTGAATGTTTTTGTTGGGAATTGATGTGATTTTTTATAATCTCA----TCTACCGTA-TTTACC-CTGTGTAATGGGACAGC-A-AAA-AA--ATTTT---TT-TTTTATAA--AAAT-AGGATAC--T---GTATAGAGTGT----G----TATACAT-ACCA-AAAT------TA-CTGTCTTT-AGCCTATATATTGGGAT-----------------------G-----------ATTTAGAATAGTT---AC----CC--------TATATATTGAGACAGTAAAAA----------------------------------A--A---TAAGTAT-TTGGACTGA-AAAAAAT-GT--AA-TTATTTATTT-CTGTC-CCAATTCAT--AG-------AGTAAATA
gi|6                          :                                                                                          ATGGATTGAAAAATAACAACACAACACACACAGGTTT--T-TTATTTT------TTTTATTTATTTA--TATAATTACTGTACCAAGGTAATTGTAGTATAATTAGTT----G-TAGTTTTTT--ATATTTTGTTTGG----T----TGA--------ATATT-A----T--ACCAGAGTGTACA-ATACTTA----GA---T-A-AAC-A------------T-GCC---AA--AAATAACCATAT--T---TTACCCTATGC----A----TTGG----AACA-AAAT------TA-CTGTATTT-ACACTATGTATTGTGAC-----------------------G---------GCAATT----T-TTT---GT----GCAACAATAGTAAGTATCAGGAGAGCAAAAAA-TA-AATTA-TCTG-----TT----aaaatttatattgtttggtgccat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATT---TTGTTT---GGTTGAAT-ATTATAC--CAGAGTGTACAATACTTAGA----TAAACAT-GCCA-AAAA------TAACCATATTTTACCCTATGCATTGGAAC-----------------------A---------A-AATTACTGTATTT---AC----AC--------TATGTATTGTGACGGCA-------------A-TTTT-----TTGTGCAACAA--TA--G---TAAGTAT-CAGGAGAGC-AAAAAA--TA--AA-TTATCTGTTG-CTGTC-CCAATACAT--AG-------GGTAAACATG-gctgtcccaatacatagggtaaacatg
gi|7                          :                                                                                                                                                    atggattgaaaaataacaacacaacacacacaggttttttattttttttatttatttatataattactgtaccaaggtaattgtagtataattagttgtagtttttt----T--ACCGTA-TT-ACCACGCTGTATTGGGACAGT-A-AAA-AA--ATATT---TT-TTTT--AA--AAAT-ACTTTAC--C---TTAAACAGTG----------TAGACAT---CA-AAAT------TA-GCATATTT-AACCTGTGTATTAGGAT-----------------------G---------A-AAATACCATATTT---AC----CC--------TACATATTGGGACAGTAAAAAA-AA-ATTTT-TTTT-----TT----AA-AA--TA--A---TAAGTAT-TGGGACAGC-ACAAAA--TT--A----ATTTGTTG-TTGTC-TTATTACAT--AG-------GG-AAATACG-GT-A--
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                     aataatTGTACCG------ATACT-A--------CCGTA-TTT-CC-CTATGTAATAAGACAAC-A-ACA-AATTA-ATT---TT-gtatcggtacatgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|7                          :                                                                                                                                                             aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctgtgtattaggatgaaaataccatatttaccctacatattgggacagtaaaaaaaaattttttttttaaaataataagtattgggacagcacC----A----TACATGT-ACCG-ATAC------TA-CCGTATTT--CCCTATGTAtgtatgtgtatttcaaaatttaatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                     aataattaccgtattaccacgctgtattgggacagtaaaaaaatattttttttaaaaatactttaccttaaacagtgtagacatcaaaattagcatatttaacctgtgtattaggatgaaaataccatatttaccctacatattgggacagtaaaaaaaaattttttttttaaaataataagtattgggacagcacaaaattaatttgttgttgtcttat-AATTACCGTATTA---AC----CA--------TATGTTTTGGGACAGTTAAAAA-TTTCTTTT-TTTT-----TT----AA-A---TA--G---GAAGTAT-TGAGAGAGC-AAAAAAT-TT--AT-TTATTTTTTG-CTATC-CAAATACAT--AT-------GGTAAATATG-GT-A--T--Atgtatttcaaaatttaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                            catcaatgtaacattttgtaaacattttaccagtcTACC-CTATCTTTTGGGACAGT-A-AAATAATACTATT---TT-TTTT--AA--AAAT-ACGATAC--T---GTATATGGTGC----A----TAGACAT-ACCA-ACAT------TA-CTGTATTA-AACCTATGT----------------------------------------------TACCGCATTA---AC----CC--------TATGTATTGGGACAGTAAAAAA-AA-AATAA-AAAT-----TA----AA-AA--TA--A---TATGTAT-TGGGACAGC-AAAAATT-TT--AA-TTATTTCTTG-CTGTC-CCAATACAA--AG-------GGTAAATACccagaccagagtaacttagtgtctgatcagtggtggtactcaccagccgttcttaagaatattcttagacttgaactctagaatgaattt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): AATACAGGAGTTCAGCTATGTATGTAGAGAGAGAGGAGACATCTTATTTGAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTCAATGATATCAGATATCATGGTGACAATCTTTTAAT