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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                      TATCTTTGACAAACAGACCCAAAT--TTTGCATCACACATTGTCTTGGGCTGGTTAGCATTTGTGCCAATTTATTTAAAGATCCAATCACAACTAAAGAAGATACAGTCCGGACA---------ACAGT---------GAA----CGGACA---------GAGCTGTGACCTTGACCTTTGAAGAACAGACCCAAGTCATTTACATGACACATCATCTTGTCCTTGTTAATATTTGTGCAGAGTTATTTAAAAA-TCCAATTATAACTAAAGAAGATAAGGTCCGGACAGCAGCAGACGGACCGACGGAGCTGTGACCTTGACCATAGACAAATAGACCCAAGTCAGTGACATGACACATCATCTTGTCATAGT-GAA----CATT-------TGTGCCAAGTT-----ATTTATAAA-TGCAA-T-TAA---A-ACTAAAGAAGATATGGTCCGAAC--C---GGACG-AAACACAGTTTATACATAGGATTTTCAAACACTTGAC------CT------ATGACCTTGACCTTTGACAAACAGACCT--G--TCATTTGCATGACACATCGTCTTGTCCTAG-TGAATGTTTGTGCCAAGTTACTC-AAAATTCG----ATTA-ACAACTAAATAAAATGAGGTGTGGACAG---------CAGCAGA----------------T----GGA----CAGA-GCTGTGACCT-------------TGACCT------TTAACT-------AACATGACCCA------TGACA---GAACTGACACATTGTCTTGTCCTAGTTAACACT-------TGTGCCAAA-TTATTTAAAATTGCAATTACAACT-------------------TAAG----------------AAGA------------TA-------TACATTGGATTTTCAAACACTTGAC---CTTGAGCTATGACTTTGACCTTTGAAGAACAGA-CGGAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACAT-TT-TTCC-AA-GTTAT-TCAAAATTCCAACCACAAATAAAGAAGAAATA---CAGTCCC--AACAA--GAGGAAACACAGTGTACATATTGGATTTTCAAACACTTGACCTTGATTTTATGACCCTGACCTTTTACAAACAGA-CCTAAGTCATTTGCATTACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTT---AATTGAGATTCCAATCACAACTGAATGAG--AT-----------AGCAGGGGATG-CATGGACGGACGCAGCC---GTCTATATCC-C-CC-ACTCTGCTCTAACATCGGTGGCGGTGGATAA
gi|3                          :                                                                                                                          TTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATGTGTGCCAAGTTATTTTAAATTCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACA---------GCTGA---------GGA----CG
gi|3                          : actatttttgacggacggacacatcggcttgtccttgtgaacatttattcaaaattccaatcacaactaaagaagatacggtccggacaagaagaaacatagtttataaattgaatttccaaacacttgatcttgagctatgaccttgactACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATTT----------ATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAGCTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATGTGTGCCAAGTTATTTTAAAT-TCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGcaagcacggacgcacagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          actatttttgacggacggTGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAA----CATT-------TGTGCCAAGTT-----ATTTAAAAA-TGCAA-A-CAC---A-ACTCAAGAAGATATAGTCCTGAC--A---GGACA-AAACACAGTGTATCCATTGGATTTTCAAACACTTGAC------CTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCC--AAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAG-TGAACAGTTGTTTTAAGTTATTT-AAAATTCC----AATC-ACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAG---------CAGCAGA----------------CAGACGGA----CAGA-GCTGTGTCTA-------------TGACTT------TTGACA-------AACA-GACCCA------AGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATT-------TGT-CCAAAGTTATATAAA-TTCCAATCACAACT-------------------AAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTA-------TACATTGGATTACCAAACACTTGAC---CTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACAT-TTGTGCC-AA-GTTAT-TTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATcaagcacggacgcacagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGTAATATGACACATTGTATTGTCCCAGT-GAG----CACT-------GGTGTGATGTT-----CTATATagaga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAGT-AAG----CACT-------GGTGcgaacca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGTAATATGACACATTGTCTTGCTCCAGT-GAG----CACTACCGTGATGTTCTAAATTGAAACATTAAT--A-TGTAAGT-TAA---ACACCAAAtgatgttctaaatcgaaccataaatatgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tGACACATCGGCTTGTCCTTGT-GAA----CATT-------T---------------ATTCAAAAT-TCCAA-T-CAC---A-ACTAAAGAAGATACGGTCCGGAC--A---AGAAG-AAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAGCT------ATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAG--TCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAG-TGAACATGTGTGCCAAGTTATTT-TAAATTCC----AATC-ACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAG---------Cata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actatttttgacggacgACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAG----CACT-------GGTGtgaggacgcaagcacggacgcacagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgttatactTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAG-TAAGCACTGGTGTGATGTT-CT--AAA--TCG----A--A-CCA--TAAATAtgatgttctaaatcgaaccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgATGACACATTGTCTTGTCCCAG-TGAtgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtaatATGACACAGTGTCTTGTCCCAG-TGAGCACTGGTG---AGATGTTC-TAAA-TCGAACCATTA-ATATGTAAATgcaatggtgtgattaataaatcgaaccataagtatgtaagttatagcctaaccccaaaacaagaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatATGACACATTGTATTGTCCCAG-TGAcataacctcaaaacaaacgaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtaatATGACACATTGTCTTTTCCCAG-TGAGCACCGGTGTGATGTT-CTC-AA---TCG----Agcactggtgtgatgttctatatcgaacca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgttaaATGACACATTGTCTTGCTCCAG-TGAaccataaat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgtaatGACACATCGGCTTGTCCTTG-TGAACATTTAT----------TC-AAAATTCC----AATC-ACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACA-----------AGAAGAAACATAGTTTATAAATT----GAATTTCCAAACACT-TGATCT-------------TGAGCTATGACCTTGACTTTTTACGAACA-GACCCA------AGTCATTCGCAC-GATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATG-------TGTGCCAAG-TTATTTTAAATTCCAATCACAACC-------------------GAAG----------------GAGA------------TA-------CGGATCGGAgcactaccgtgatgttctaaattgaaacattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actatttttgacggacgACACATTGTCTTGTCCCAG-TGAGCACTGGTGTGATGTT-CT--AAA--TCG----Acagctgaggacgcaagcacggacgcacagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgttatact------TGACG---GA-CGGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATT-------T-----------ATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAAG----------------AAGAAACATAGTT---TA-------TAAATTGAATTTCCAAACACTTGAT---CTTGAGCTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGA-CCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATGTG-TGCC-AA-GTTAT-TTTAAATTCCAATCACAACCGAAG--GAGATA---CGGATCG--GACAGCTGAGGAaccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actattttAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGTGAGCACC-------GGTGcgcaagcacggacgcacagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgttACT-ACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACT-------GGTGtgatgttctcaatcgaaccataaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgttatTGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAAT-------GGTGtgatgttctaaatcgaaccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtaataTGACACAGTGTCTTGTCCCAGTGAGCACT-------GGTGtgattaataaatcgaaccataagtatgtaagttatagcctaaccccaaaacaagaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aataTGACACATTGTATTGTCCCAGTGAGCACT-------GGTGagatgttctaaatcgaaccattaatatgtaaatcataacctcaaaacaaacgaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtaataTGACACATTGGCTTGTCCCAGTAAGCACT-------GGTGtgatgttctatatcgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgttataTGACGCATTGTCTTGCCCCAGTGAGCACT-------GGTGtgatgttctaaatcgaaccataaatatgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtaataTGACACATTGTCTTGCTCCAGTGAGCACTACCGTGATGTTCTAAA-TTtggtgttctaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtaataATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAA-TG-GT------GTGAT-TAATAAATCGAACCATAAGTATGTAAGTTATAGCCTAACCCCAAAACAA--GAGgaaacattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatATGACACAGTGTCTTGTCCCAGTGAGCAC-TG-GT---GA-GATGT-TCTAAA-TCGAACCATTAATAa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatATGACACATTGGCTTGTCCCAGTAAGCAC-TG-GTGT-GA---TGT-TCTAAA-TCGAACCATAAATAggtgtgatgttctatatcgaacca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgttatATGACACATTGTCTTTTCCCAGTGAGCAC-CG-GTGT-GATGTT-C-TCAA---TCGAACCATAAATtgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgttaaATGACACATTGTCTTGCTCCAGTGAGCA---C-TACC-GT-GATGT-TCTAAATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtaatGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACAT-TT------------AT-TCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGA--TA---CGGTCCG--GACAA--GAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAGCT-ATGACCTTGACTTTTTACGAACAGA-CCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATGTGTGCCAAGTT---ATTTTAAATTCCAATCACAACCGAAGGAG--ATACGGATCGGACAGCTGAGGACG-CAAGCACGGACGCAgaaacattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatttttgacggacgTTATACTACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTGATGTTCTAAATCGAcagacgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAGTAAGCACTGGTGTGATGTTCTAAATCGAaccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAATGGTGTGA--TT---AAT--AAA-TCGAACCATAAGTATGTAAGTTAT-----------AGCaccataaatatgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtaatATGACACAGTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGctaaccccaaaacaagaga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aat-CATGCATGGACGCAGCCCATTTCTTTATCCTC-TT-GCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAagatgttctaaatcgaaccattaatatgtaaatcataacctcaaaacaaacgaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTCTATTTCC-CACT-GCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGATt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attTCTATATCC-C-CCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cattCTATATCG-C-CC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TGTTATATTACACATTGCCAGAGAGCACTGGTGTGATGTCTAAATTGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCTCAAAACAAAAGAA
Unaligned ( gi|10 ): TGTTATATGACACATTGTGAACACTGGTGAGATGTTCTAAATCGAACCATAAATTTTAAGTTATAACCCCAAAACAAAAGA
Unaligned ( gi|11 ): GCCTTAGTGAGTACTGATGTGATGTTCTAAATCGAACCATTAATATGTAAGTTATAACCCCAAAGCAAAAGAA
Unaligned ( gi|15 ): TGTGATGTATTCTAAATCGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCAAAAACAAAAGAA
Unaligned ( gi|17 ): ATCAAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCCAAAACAAAACAAAAA






Alignments
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Reference ( family-665 )      :                                    NNNNTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGACACATCGNCTTGTCCTNGTGAACATNTGTGCCAAGTTATTCNAAATTCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGNCCGGACAAGAAGAAACGCNGNTTATAAATTGGATTTCCGAACACTTGATCTTGAGCTATGANCTTGACCTTTNACGAACAGACCCAANTCATTCGCACGACACATCGTCTTGNNCGGGTNNGCATNTGTGCCAANTCATTTNAAANATCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGNCCGGACAGCNGNGG--------ACGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGACCTTTGACGAACAGACCCAAGTCAGTCGCACGACACATCGTCTTGTCCCAGT-GAGCACTTGTGCCAAGTTAT-TTATAAATCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAGGACGAAACACAGTGTAT--A--TTGGATTTCCGAACACTTGANCT------ATGACCTTGACCTTTNACGAACAGACCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCTTGTCCCAGTGAGCACTNGTGCGANGTTACTCAAAATTCGAATNACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAGCAGCGGACAT-CGGATTTCCAAACGCT-TGACCTTGACCTTTGACAAACA-GACCCANGNCATTCGNACTGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGAGGCAGC----------------------TATANATCGGATT-C-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTTGACTTTTGACGAACAGA-CCCAAGTCATTCGCATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGT-CCGAGTTAT-TCNAAATTCNAACCACAANTAAAGAAGATATACGGTCCGGACAAGAGGAAACGCAGTNTATANATTGGATTNCCAAACACTTGACCTTGAGNCTATGACCTNGACCTTTNACGAACAGACCCCAAGTCATTCGCACGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTG-GTGCGA---NGTTCTAAATCG------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAAGGAGAT-----------AGCTGAGGACGCGTGCACGGACGC------------------------AGCCCATTTCTATATCCC-CC-GCTCCGCTCTACGAGCGGTGGCGGGGGATAA
gi|1                          :                                        TTTGACAAACAGACCCAAAT--TTTGCATCACACATTGTCTTGGGCTGGTTAGCATTTGTGCCAATTTATTTAAAGATCCAATCACAACTAAAGAAGATACAGTCCGGAC-------AAC-----------AGTGAA----CGGACA---------GAGCTGTGACCTTGACCTTTGAAGAACAGACCCAAGTCATTTACATGACACATCATCTTGTCCTTGTTAATATTTGTGCAGAGTTATTTAAAA-ATCCAATTATAACTAAAGAAGATAAGGTCCGGACAGCAGCAG--------ACGGACCGACGGAGCTGTGACCTTGACCATAGACAAATAGACCCAAGTCAGTGACATGACACATCATCTTGTCATAGT-GAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTATAAATGCAATTAAAACTAAAGAAGATATGGTCCGAACCGGACGAAACACAGTTTAT--ACATAGGATTTTCAAACACTTGACCT------ATGACCTTGACCTTTGACAAACAGACCT--GTCATTTGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAATGTTTGTGCCAAGTTACTCAAAATTCGATTAACAACTAAATAAAATGAGGTGTGGACAGCAGCAGAT----GGA----CAGA-GCTGTGACCTTGACCTTTAACTAACATGACCCATGACA---GAACTGACACATTGTCTTGTCCTAGTTAACACTTGTGCCAAATTATTTAAAATTGCAATTACAACTTAAGAAGA----------------------------TATACATTGGATT-TTCAAACACTTGACCTTGAGCTATGACTTTGACCTTTGAAGAACAGA-CGGAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTTT-CCAAGTTAT-TCAAAATTCCAACCACAAATAAAGAAGAAATACAGTCCCAACAAGAGGAAACACAGTGTACATATTGGATTTTCAAACACTTGACCTTGATTTTATGACCCTGACCTTTTACAAACAGA-CCTAAGTCATTTGCATTACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACATTT-GTGCCA---AGTT---AATTG------AG--ATT------CCAA-TCACAACTGAATGAGAT-----------AGCAGGGGATGCATGGACGGACGC------------------------AGCC---GTCTATATCCC-CC-ACTCTGCTCTAACATCGGTGGCGGTGGATAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatcATGACACATTGT-----------GAACACTG-GTGAGA---TGTTCTAAATCGAACCATAA--ATT------TTAAGTTATAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgttatGCCTTAGTGAGTACTG-ATGTGA---TGTTCTAAATCG------AA--ccaaaacaaaaga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCT-CTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAccattaatatgtaagttataaccccaaagcaaaagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aATGACACATTGTCTTTTCCCAGTGAGCACCG-GTGTGA---TGTTCTCAATCG------AA--t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgttaaATGACACATTGTATTGTCCCAGTGAGCACTG-GTGTGA---TGTTCTATATCG------AA--ccataaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtaatATGACGCATTGTCTTGCCCCAGTGAGCACTG-GTGTGG---TGTTCTAAATcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatATTTCTATTTCCCACT-GCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATTTCTATATCCC-CCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTGAGCTCTG-GTGTGACTCTGTTCT-AATCG------AA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                         ATGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGG--------ATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTAAAAATGCAAACACAACTCAAGAAGATATAGTCCTGACAGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGA----CAGA-GCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
gi|3                          : agtgagctctggtgtgactctgttctaatcgaaccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACAT----------TTATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAGCTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATGTGTGCCAAGTTATTTTAAAT-TCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGAacgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actatttttgacggacgGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATT----------TAT-TCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATA--CGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAG-CTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGA-CCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACA-TGTGTGCCA---AGTTAT---TTT------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGACGCACACACGGACGGACACAGCCCATTCCTATATCGC-CC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATAcgcacacacggacggacacagcccattcctatatcgcccgctctgctttacgagcgttggcgggcgatactta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actatttttgacggacgATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAATGGT-GTGA-TTAA-T--AAA-TCGAACCATAAGTATGTAAGTTATActta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtaatGTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAGT-AAGCACTGGT-----GTGATGTTCTAAATCGAACCATAAATAgcctaaccccaaaacaagaga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATGACACATTGGCTTGTCCCAGTAAGCACTG-GTGTGA---TGTTCTAAATCG------AA--tgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgttatATGACACAGTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTG-GTGAGA---TGTTCTAAATCG------AACCATTAATATGTAAA-TCATAACCccataaatatgtcagttataaccccaaaacgaaaga
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatATTACACATTG-------CCAGAGAGCACTGGT-----GTGATGTCTAAATT-GAACCATAAATATGTAAGTTATAcattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttatACACATTG-------CCAGAGAGCACTG-GTGTGA---TG-TCTAAATTG------AA--acctcaaaacaaaagaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgttatattACTACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTG-GTGTGA---TGTTCTAAATCG------AA--ccataaatatgtaagttataacctcaaaacaaaagaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): TGTGATGTATTCTAAATCGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCAAAAACAAAAGAA
Unaligned ( gi|17 ): ATCAAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCCAAAACAAAACAAAAA






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Reference ( family-665 )      : NNNNTTTGACAAACAGACCCAAATTTTGCATNACACATCGNCTTGNNCTNGTNAGCATTTGTGCCAATTTATTCAAAGNTCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAANTGAATTTCCGGACACTTGATCTTGAGCTATGACCTTGACCTTTGACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGACACATCGTCTTGTCCTNGTTAACATTTGTGCCGAGTTATTTAAAAA-TCCAATCACAACTAAAGAAGATACGGTCCGGACAGCAGCGGACGGACGNACGGAGCTGTGACCTTGACCNTNGACGAGCAGACCCAAGTCAGTTACACGACACATCGTCTTGTCNTAGT-AAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTATAAATGCAANCANAACTAAAGAAGATATGGTCCNGACNGGACGAAACACAGTNTATCCACATNGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTNACAAACAGACCCAAGTCATTNGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACGNT-------TGTNCCAAGTT--ACTCA--AAATTCNANTNACAACTAAANAAGATGAGGCGNGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGNCCNTGACCTTTGACNAACATGACCCANGNCATTCGNACTGACACATTGTCTTGTCCTAGTNAACACTTGTNCNAAGTTATNTAAAATTNCAATCACAACTNAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTACTCAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTNGACCTTTGACGAACAGACCNNAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTNGT-CCGAGTTATTCAAAATTCCAACCACAANTAAAGAAGATATACGGTCCGGACAAGAGGAAACACAGTNTACANATTGGATTTCCAAACACTTGACCTTGANTCTATGACCCTGACCTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAANGAGATACGGATCGGACAGCNGGGGACGCATGCACGGACGC------------------------AGCCCATTTCTATATCCCCCTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGCGGGGGATAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatcATGACACATTGT-----------GAACACTGGTGAG--A---TGTTCTAAATCGAACCATAA--ATT------TTAAGTTATAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgttatGCCTTAGTGAGTACTGATGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--ccaaaacaaaaga
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgttaaATGACACATTGTATTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTATATCG------AA--ccataaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtaatATGACGCATTGTCTTGCCCCAGTGAGCACTGGTGTG--G---TGTTCTAAATcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtaatATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATTTCTATATCCCCCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGTGAGCTCTGGTGTG--ACTCTGTTCT-AATCG------AA--
gi|2                          :                                                                                                                                                                    ATGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTAAAAATGCAAACACAACTCAAGAAGATATAGTCCTGACAGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGT-------TGTTTTAAGTT--ATTTA--AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtgagctctggtgtgactctgttctaatcgaaccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATT----------TATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATA--CGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAG-CTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACAT--GTGTGCCA---AGTTAT---TTT------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGACGCACACACGGACGGACACAGCCCATTCCTATATCGCCC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATAacgga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actatttttgacggacgGTAATATGACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCAATGGT-----GTGAT-TAATAAATCGAACCATAAGTATGTAAGTTATAG-CCTAACC--CCAAAACActta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAATGGTGTG--A---T-TAATAAATCG------AA--agaga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtaatATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCAATGGT-----GTGATTAATAAATCGAACCATAAGTATGTAAGTTATAccataagtatgtaagttatagcctaaccccaaaacaagaga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtaatGTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAGT-AAGCACTGGT-----GTGATGTTCTAAATCGAACCATAAATAgcctaaccccaaaacaagaga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tATGACACATTGGCTTGTCCCAGTAAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--tgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgttatATGACACAGTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGAG--A---TGTTCTAAATCG------AACCATTAATATGTAAA-TCATAACCccataaatatgtcagttataaccccaaaacgaaaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatATGACACATTGTCTTGCTCCAGTGAGCACTACCGTG--A---TGTTCTAAATTG------AA--Atcaaaacaaacgaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtaatATTACACATTG-------CCAGAGAGCACTGGTGTG--A---TG-TCTAAATTG------AA--cattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttatGTTATACTACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCACTGGTGccataaatatgtaagttataacctcaaaacaaaagaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--tgatgttctaaatcgaaccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgttatactACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTGATGTTCTAAATCGAAC-CATGAAATGTAAGTTATAACccatgaaatgtaagttataacaccaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): TGTGATGTATTCTAAATCGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCAAAAACAAAAGAA
Unaligned ( gi|17 ): ATCAAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCCAAAACAAAACAAAAA






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Reference ( family-665 )      : NNNNTTTGACAAACAGACCCAAATTTTGCATCACACATTGTCTTGGGCTGGTTAGCATTTGTGCCAATTTATTTAAAGATCCAATCACAACTAAAGAAGATACAGTCCGGACAACAGTGAACGGACAGAGCTGTGANCTTGACCTTTGANGAACAGACCCAANTCATTCGCATGACACATCGTCTTGNNCGNGTTNGCATTTGTGCCGANTCATTTAAAAAATCCAATCACAACTAAAGAAGATANGGTCCGGACAGCAGCGGACGGACCGACGGAGCTGTGACCTTGACCNTNGACGAGCAGACCCAAGTCAGTTATACGACACATCGTCTTGTCCCAGT-GAGCACTGGTGCCAAGTNAT-TTATAAATNNAACCATAANTAAAG-AAGATATAGTCCTAACCGGACGAAACACAGTNTATCCACATNGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTNACAAACAGACCCAAGTCATTNGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACGNTTGTTCTAAGTTACTCAAAATTCGANTNACAACTAAANAAGATGAGGCGNGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGNCCNTGACCTTTGACNAACATGACCCANGNCATTCGNACTGACACATTGTCTTGTCCTAGTNAACACTTGTNCNAAGTTATNTAAAATTNCAATCACAACTNAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTACTCAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTNGACCTTTGACGAACAGACCNNAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGT-CCAAGTTATTCAAAATTCCAACCACAANTAAAGAAGATATACGGTCCGGACAAGAGGAAACACAGTNTACANATTGGATTTCCAAACACTTGACCTTGANTCTATGACCCTGACCTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCATGACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAANGAGATACGGATCGGACAGCNGGGGACGCATGCACGGACGC------------------------AGCCCATTTCTATATCCCCCTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGCGGGGGATAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatcATGACACATTGT-----------GAACACTGGTGAG--A---TGTTCTAAATCGAACCATAA--ATT------TTAAGTTATAACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgttatGCCTTAGTGAGTACTGATGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--ccaaaacaaaaga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCTCTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAccattaatatgtaagttataaccccaaagcaaaagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGT-GAGCACCGGT-----GTGATGTTCTCAATCGAACCATAAATt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tATGACACATTGTCTTTTCCCAGTGAGCACCGGTGTG--A---TGTTCTCAATCG------AA--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgttaaATGACACATTGTATTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTATATCG------AA--ccataaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatATGACGCATTGTCTTGCCCCAGTGAGCACTGGTGTG--G---TGTTCTAAATcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtaatATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTTCTATATCCCCCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGTGAGCTCTGGTGTG--ACTCTGTTCT-AATCG------AA--
gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTGCCAAGTTAT-TTAAAAATGCAAACACAACTCAAG-AAGATATAGTCCTGACAGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agtgagctctggtgtgactctgttctaatcgaaccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagaGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATTT----------ATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATA--CGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAG-CTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACAT--GTGTGCCA---AGTTAT---TTT------AA--ATT------CCAA-TCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGACGCACACACGGACGGACACAGCCCATTCCTATATCGCCC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATAacgga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actatttttgacggacgGTAATATGACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCAATGGT-----GTGAT-TAATAAATCGAACCATAAGTATGT-AAGTTATAG-CCTAACC--CCAAAACActta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTTATATGACACATTGGCTTGTCCCAGT-AAGCACTGGT-----GTGATGTTCTAAATCGAACCATAAATATGT-CAGTTATAACCCCAA---AACGAAAagaga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatATGACACATTGTCTTGCTCCAGTGAGCACTACCGTG--A---TGTTCTAAATTG------AA--Atcaaaacaaacgaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgtaatGTTATATTACACATTG-------CCAGA-GAGCACTGGT-----GTGAT-GTCTAAATTGAACCATAAATATGT-AAGTTATAACCTCAAcattaatatgtaagttaaacaccaaaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tATTACACATTG-------CCAGAGAGCACTGGTGTG--A---TG-TCTAAATTG------AA--aacaaaagaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgttatGTTATACTACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCACTGGT-----GTGATGTTCTAAATCGAACCATGA--AATGTAAGTTATAccataaatatgtaagttataacctcaaaacaaaagaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tACACATTGTCTTGTCCCAGTGAGCACTGGTGTG--A---TGTTCTAAATCG------AA--acaccaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): TGTGATGTATTCTAAATCGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCAAAAACAAAAGAA
Unaligned ( gi|17 ): ATCAAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCCAAAACAAAACAAAAA






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGCCTTAGT-GAGTACTGATG-----TGA---TGT--TCT----AAATCGAACCATTAATATGTAAGTTATAACCCC-AAaacaaaaga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCTCTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAagcaaaagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGT-GAGCACCGGTG-----TGA---TGT--TCT----CAATCGAACCATAAATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTAATATGACACATTGTATTGTCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGA---TGT--TCT----ATATCGAACCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTG-----TGA---TGTATTCT----AAATCGAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCA-AA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGACGCATTGTCTTGCCCCAGTGAGCACTGGTGTG--GTGTTCTAAATaacaaaagaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtaatATCAAACCATAAATATGTAAGTTATAACCCC-AA---AACAAAACA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGATaaaa
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGT-GAGCTCTGGTG-----TGACTCTGT--TCT----AA-TCGAACCATTAATATGTAAGTTATAACCCA-AAC
gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTG-----CCA---AGT--TATTTAAAAATGCAAACACAACTCAAGAAGATATAGTCCT-GACAGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGacaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGCCTTAGT-GAGTACTGATG-----TGA---TGT--TCT----AAATCGAACCATTAAT-ATGTAAGTTATAACCCC-AAga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCTCTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAagcaaaagaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGT-GAGCACCGGTG-----TGA---TGT--TCT----CAATCGAACCATAAAT-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTAATATGACACATTGTATTGTCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGA---TGT--TCT----ATATCGAACCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTG-----TGA---TGTATTCT----AAATCGAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAACCCA-AA---AACAAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAATATGACGCATTGTCTTGCCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGG---TGT--TCT----AAATgaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATCAAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAACCCC-AA---AACAAAACA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGATaaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATTTCTATATCCCCCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
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gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTG-----CCA---AGT--TATTTAAAAATGCAAACACAACTCAAG-AAGATATAGTCCT-GACAGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGacaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGCCTTAGT-GAGTACTGATG-----TGA---TGT--TCT----AAATCGAACCATTAAT-ATGTAAGTTATAACCCCAA---A--GCAAAAga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCTCTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAgaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGT-GAGCACCGGTG-----TGA---TGT--TCT----CAATCGAACCATAAAT-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTAATATGACACATTGTATTGTCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGA---TGT--TCT----ATATCGAACCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTG-----TGA---TGTATTCT----AAATCGAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAA-CCCAAA--A--ACAAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAATATGACGCATTGTCTTGCCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGG---TGT--TCT----AAATgaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATCAAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAACCCCAA---A--ACAAAACA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGATaaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATTTCTATATCCCCCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
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gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTG-----CCA---AGT--TATTTAAAAATGCAAACACAACTCAAG-AAGATATAGTCCTGAC--AGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGcaatagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGCCTTAGT-GAGTACTGATG-----TGA---TGT--TCT----AAATCGAACCATTAAT-ATGTAAGTTATAACCCCAA---A--GCAAAAga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATGCATGGACGC------------------------AGCCCATTTCTTTATCCTCTTGCTCTGCTCTACAAGCGGTGGCGGGGGATAAgaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGTTAAATGACACATTGTCTTTTCCCAGT-GAGCACCGGTG-----TGA---TGT--TCT----CAATCGAACCATAAAT-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTAATATGACACATTGTATTGTCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGA---TGT--TCT----ATATCGAACCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTG-----TGA---TGTATTCT----AAATCGAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAA-CCCAAA--A--ACAAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAATATGACGCATTGTCTTGCCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGG---TGT--TCT----AAATgaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATCAAACCATAAAT-ATGTAAGTTATAACCCCAA---A--ACAAAACA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTCTATTTCCCACTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGTGGGGGATaaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATTTCTATATCCCCCTGCTCCACCCTACGAGCTGTGGCGGGGGAg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGT-GAGCTCTGGTG-----TGACTCTGT--TCT----AA-TCGAACCATTAAT-ATGTAAGTTATAACCCAAAC-----ACAA
gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTG-----CCA---AGT--TATTTAAAAATGCAAACACAACTCAAG-AAGATATAGTCCTGAC--AGGACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGtagatgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtgagctctggtgtgactctgttctaatcgaaccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagaGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATTT----------ATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATA--CGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAG-CTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACAT-GTGTGCCAAGTTATTTTAAATTCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGACGCACACACGGACGGACACAGCCCATTCCTATATCGCCC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATAacgga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actatttttgacggacgGTAATATGACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCAATGGTG-----TGA---T-T--AAT----AAATCGAACCATAAGT-ATGTAAGTTATAG-CCTAAC--C--CCAAAACActta
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Reference ( family-665 )      : NNNNTTTGACAAACAGACCCAAATTTTGCATCACACATTGTCTTGGGCTGGTTAGCATTTGTGCCAATTTATTTAAAGATCCAATCACAACTAAAGAAGATACAGTCCGGACAACAGTGAACGGACAGAGCTGTGANCTTGACCTTTGANGAACAGACCCAANTCATTCGCATGACACATCGTCTTGNNCGNGTTNGCATTTGTGCCGANTCATTTAAAAAATCCAATCACAACTAAAGAAGATANGGTCCGGACAGCAGCGGACGGACCGACGGAGCTGTGACCTTGACCNTNGACGAGCAGACCCAAGTCAGTNATATGACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCACTGGTG-----TGA---TGT--TCT----AAATCGAACCATAAAT-ATGTAAGTTA-----TAACCC---CAA---AACAAAACACAGTNTATCCACATNGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTNACAAACAGACCCAAGTCATTNGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACGNTTGTNCCAAGTTACTCAAAATTCNANTNACAACTAAANAAGATGAGGCGNGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGNCCNTGACCTTTGACNAACATGACCCANGNCATTCGNACTGACACATTGTCTTGTCCTAGTNAACACTTGTNCNAAGTTATNTAAAATTNCAATCACAACTNAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTACTCAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTNGACCTTTGACGAACAGACCNNAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTT-T-CCAAGTTATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATATGCGGTCCGGACAAGAGGAAACACAGTNTACANATTGGATTTCCAAACACTTGACCTTGANTCTATGACCCTGACCTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACATTGTGTGCCAAGTTANTTNAGATTCCAATCACAACCGAANGAGATACGGATCGGACAGCNGGGGACGCATGCACGGACGC------------------------AGCCCATTTCTATATCCCCCTGCTCTGCTCTACGAGCGGTGGCGGGGGATAA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGT-GAGCTCTGGTG-----TGACTCTGT--TCT----AA-TCGAACCATTAAT-ATGTAAGTTA-----TAACCC-------------AAACACAATAGAT
gi|2                          :                                                                                                                                      TGAACT--ATCTTTGATGAACAGACCCAACTCATTCGCATGACACATCGTCTTGGGTGGGTTTGCATTTGTGCCAATTCATTTAAAAAATCTAATC-CAACTAAAGAAGATATGGTCCAAACAGCAGTGGATGGACGAACAGAGCTGTGACCTTGATCTTTGAAGAGCAGACCCAAGTCATTTGCACAACACATCATCTTGTCTTAGTTAAACATTTGTG-----CCA---AGT--TATTTAAAAATGCAAACACAACTCAAG-AAGATA-----TAGTCCTGACAG---GACAAAACACAGTGTATCCA--TTGGATTTTCAAACACTTGACCTTAAGTTATGACCTTGACCTTTCACAAACAGACCCAAATTATTGGCATGACACATCGTCTTGTCCTAGTGAACAGTTGTTTTAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATAAGGCCAGGACAGCAGCAGACAGACGGACAGAGCTGTGTCTATGACTTTTGACAAACA-GACCCAAGTCATTCGCA-TGACACATTGTCTTGTCCTAGTGAACATTTGTCCAAAGTTATAT-AAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATGCAGTCCAGACAAGAGGTAACGCAGTGTATACATTGGATTAC-CAAACACTTGACCTTGAGCTATGACCTAGACCTTTGACAAACAGACCCCAAGTCATTCGCATGACACATCGTCCTGTCCTAGTGAACATTTGTGCCAAGTTATTTAAAATTCCAATCACAACTGAAGGAGATATGTTGT--GGAC----GGACGCACAGgaactatctttgatgaacagacccaactcattcgcatgacacatcgtcttgggtgggtttgcatttgtgccaattcatttaaaaaatctaatccaactaaagaagatatggtccaaacagcagtggatggacgaacagagctgtgaccttgatctttgaagagcagacccaagtcatttgcacaacacatcatcttgtcttagttaaacatttgtgccaagttatttaaaaatgcaaacacaactcaagaagatatagtcctgacaggacaaaacacagtgtatccattggattttcaaacacttgaccttaagttatgaccttgacctttcacaaacagacccaaattattggcatgacacatcgtcttgtcctagtgaacagttgttttaagttatttaaaattccaatcacaactaaagaagataaggccaggacagcagcagacagacggacagagctgtgtctatgacttttgacaaacagacccaagtcattcgcatgacacattgtcttgtcctagtgaacatttgtccaaagttatataaattccaatcacaactaaagaagatgcagtccagacaagaggtaacgcagtgtatacattggattaccaaacacttgaccttgagctatgacctagacctttgacaaacagaccccaagtcattcgcatgacacatcgtcctgtcctagtgaacatttgtgccaagttatttaaaattccaatcacaactgaaggagatatgttgtggacggacgcacagacgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtgagctctggtgtgactctgttctaatcgaaccattaatatgtaagttataacccaaacacaatagaGACACATCGGCTTGTCCTTGTGAACATTT----------ATTCAAAATTCCAATCACAACTAAAGAAGATA--CGGTCCGGACAAGAAGAAACATAGTTTATAAATTGAATTTCCAAACACTTGATCTTGAG-CTATGACCTTGACTTTTTACGAACAGACCCAAGTCATTCGCACGATACATTGTCTTGTCCTAGTGAACAT-GTGTGCCAAGTTATTTTAAATTCCAATCACAACCGAAGGAGATACGGATCGGACAGCTGAGGACGCAAGCACGGACGCACAGACGCACACACGGACGGACACAGCCCATTCCTATATCGCCC-GCTCTGCTTTACGAGCGTTGGCGGGCGATAacgga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actatttttgacggacgGTAATATGACACATTGTCTTGTCCCAGT-GAGCAATGGTG-----TGA---T-T--AAT----AAATCGAACCATAAGT-ATGTAAGTTATAGCCTAACCC---CAA---AACAAGActta
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