lowQualScore : 333333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 111111 111111
lowQualScore : 6 4 555555 1 1 9 8 2 4 4 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 8888 4 11111 4 6 5 3 3 777777 4 111111
lowQualScore : . . ...... . . . . . . . ............................................................................................. .... . ..... . . . . . ...... . ......
lowQualScore : 0 0 000000 6 0 0 9 2 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 0 11111 4 7 7 5 6 444444 0 555555
consensus : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTAAT----ATCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCAC-GTANGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTG-TAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTC--C---ACGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
Reference ( gi|2 ) : ACCACACGAGTAGAATGTGTAACTTGATATAAATTAAT--T-ATCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATTTAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTAAAGTGCTTGGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGCTATGTGTAATGTCCTTGAGCAAGACCTTTTATCCGC-ATATGTTTAG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTG-TAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTC--T---ACGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|11 : ACCACACAAGTAGAAAGTATAACATGATATAAATTG----------------TGGTTAGCACAAAATTTAAGTATGCTTTTTGTAAATAGGTTATTAGCA-CTTTCCTGAAGTGTCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTG
gi|4 : ACCGCACAAGTAAAATGTGTAACTTGACATAAATTACG--A-ATCGAAGTTT
gi|3 : aACCACACAAGTAGAAAGTGTAACTTGGTATAAATTAAT--T-AATGGAGTTGTAGTTAGCACACATTTTAAATTTGCCTTTTGTAAATAGGTTATAAACCTTTTTTCTGAAGCGCCgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtttcaataattttctccgtgtaatgaagttccctaacgtgtaattttcacggtagggattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgtgtagcaaggttttaaacataaaggta
gi|16 : aACCACACAAATAGAATGTGTAACTTGACATAAATTA--------CGAA-------TCAA-----------AGTTTGCCTTTTGTTAATAGGTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaccaaacgtgtcaatgaaacggtattgatttagtcatgaacactggt
gi|1 : aCCACACAAGTAAAATGTGTAACTTGATATCAATTAATAATGATCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAGATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTG-TAATGAAGTTACCAA-CGTGTTTT-TTTT--C---ACGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTATTAAGGTTTTGAACACAAAt
gi|8 : CACAAGTAGAAAGTGTCACTTGATATAAATCAAT--C-ATCGAGTTTTTTATTAATACAAATTTTAACTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACATTTTTTCTGAAGCGCCctgt
gi|5 : -ATCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatgtcttatttttttaagtgtaatgaagttaccaa
gi|6 : CGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatatttttctcggtgtaatgaagttaccaacgtgtgttttttcacggtgttgattaagtaataggcactggtattggtgtgtttgtgtggtaaggttttgaacacaaaggtgta
gi|14 : CGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCATTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataagtttaaataatatttttcttggtgtaatgaatttaccaacatgttttgttttcacggtgttgattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgagtagtaaggttttgaacacacaggtgt
gi|9 : AAGTTTTGGTTAACATAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCTT-AAGCGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN---NNNAATAAGTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTG-TAATGAAGTTACC-GACGTGTGTT-TTTT--C---ATGGTGT
gi|7 : TTGGTTAACACAAACTATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTTCTGAAGCGCCTGATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAGTTTA------------------AATAAT-----ATTTTTCTTGGTA-TAATGAAGTTACC-AACGTGTGTT-TTTT--C---AAAGTGTTGATTAATTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAatttgtgtagtaaggttt
gi|15 : CCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCAC-GT-TATTTGG---CTAC----GTTGTAAATAAggtgta
gi|5 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTG-TAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTT--C---ACGGTGTTGATTAAGTAATAGGCACTG-GT------ATTGGTGTGTTTGTGTGGTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|6 : atcgaagttttgattaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTG-TAATGAATTTACC-AACATGTTTTGTTTT--C---ACGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGAGTAGTAAGGTTTTGAACACAggtgta
gi|8 : cgaagttttggttaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna---ATAA----GTT-TAAATAATGTCTTATTTTTTTAAGTG-TAATGAAGTTACCAAcaggtgt
gi|12 : cacaagtagaaagtgtcacttgatataaatcaatcatcgagttttttattaatacaaattttaactttgccttttgtaaataggttaccaacattttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTG-TAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTT--C---ACGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAAC-CAAA
gi|13 : AA----GTT-TAAATTAT-----ATTTTTCTCGGTGTTGATTAAGTCAggtg
gi|4 : ----GTT-TCAATAAT--------TTTCTCCGTG-TAATGAAGTTCCCTAACGTGTAAT-TTTC------ACGGTAGGGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGCAAGGTTTTAAACATAAAtagacactggtactggtgtgtttgtgtagtaaggttttgaacaaaaaggtgt
gi|10 : aaccgcacaagtaaaatgtgtaacttgacataaattacgaatcgaagtttgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGAAGTTAACAAACGTGTGTT-TTTC--A---ACGGTGCTGATTAAGTCATAGACACTT-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAggta
gi|13 : attttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTT--TAAAT-TATATT-TTTC--T----CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACAAAAAggtgtat
gi|3 : GTTACCAAACGTGT-------CAATGAAACGGTATTGATTTAGTCATGAACACTG-GT------ggtgt
gi|9 : aaccacacaagtagaaagtgtaacttggtataaattaattaatggagttgtagttagcacacattttaaatttgccttttgtaaataggttataaaccttttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATT-TTTC--T----CGGTGT-AATGAAGTTACCGACG-TGTGTTTTTTCA-TGGTGTATTTGTGTAGTAAGGTTT
Alignments
lowQualScore : 44444444444 333333333333333333333333333333333 11111 111111
lowQualScore : 1 22222222222 0 2 8 4 4 0 1 333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 77 888 8888 4 11111 1 8 2 3 00 999999 3 000000
lowQualScore : . ........... . . . . . . . ................................. . . . . .. ... .... . ..... . . . . .. ...... . ......
lowQualScore : 0 22222222222 1 6 0 8 8 2 8 000000000000000000000000000000000 8 8 8 6 88 888 5555 0 11111 3 8 3 3 33 666666 6 555555
consensus : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
Reference ( family-661 ) : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCACGTANGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|1 : CCACACAAGTAAAATGTGTAACTTGATATCAATTA--AT--AATGATCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAGATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTTTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTATTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|10 : TGAAGTTAACAAACGTGTGTT-TTTCAA------CGGTGCTGATTAAGTCATAGACACTT-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAActgt
gi|11 : attttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCACACAAGTAGAAAGTATAACATGATATAAATTG--------------------TGGTTAGCACAAAATTTAAGTATGCTTTTTGTAAATAGGTTATTAGCA-CTTTCCTGAAGTGTCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTGggtgtat
gi|12 : TAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAAC-CAAA
gi|13 : AAGTT--TAAAT-TATATT-TTTCT-------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACAAAAAggtg
gi|14 : CGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCATTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggtgt
gi|15 : CCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCACGT-TATTTGG---CTAC----GTTGTAAATAA
gi|16 : ACCACACAAATAGAATGTGTAACTTGACATAAATTA------------CGAA-------TCA-----------AAGTTTGCCTTTTGTTAATAGGTTA
gi|2 : aACCACACGAGTAGAATGTGTAACTTGATATAAATTA--ATT-A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATTTAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTAAAGTGCTTGGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGCTATGTGTAATGTCCTTGAGCAAGACCTTTTATCCGCATATGTTTAG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCTA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAt
gi|3 : ACCACACAAGTAGAAAGTGTAACTTGGTATAAATTA--ATTAA----T-GGAGTTGTAGTTAGCACACATTTTAAATTTGCCTTTTGTAAATAGGTTATAAACCTTTTTTCTGAAGCGCC
gi|3 : aGTTACCAAACGTGT--------CAATGAAACGGTATTGATTTAGTCATGAACACTG-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaccaaacgtgtcaatgaaacggtattgatttagtcatgaacactggt
gi|4 : aaccacacaagtagaaagtgtaacttggtataaattaattaatggagttgtagttagcacacattttaaatttgccttttgtaaataggttataaaccttttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCGCACAAGTAAAATGTGTAACTTGACATAAATTACGA---A----TCGAAGTTT
gi|4 : a----GTT-TCAATAAT--------TTTCTCCGTGTAATGAAGTTCCCTAACGTGTAAT-TTTC-A------CGGTAGGGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGCAAGGTTTTAAACATAAAgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtttcaataattttctccgtgtaatgaagttccctaacgtgtaattttcacggtagggattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgtgtagcaaggttttaaacataaaggta
gi|5 : aaccgcacaagtaaaatgtgtaacttgacataaattacgaatcgaagtttgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng--A----TCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggta
gi|5 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTAATAGGCACTG-GT------ATTGGTGTGTTTGTGTGGTAAGGTTTTGAACACAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatatttttctcggtgtaatgaagttaccaacgtgtgttttttcacggtgttgattaagtaataggcactggtattggtgtgtttgtgtggtaaggttttgaacacaaaggtgta
gi|6 : atcgaagttttgattaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCggtgta
gi|6 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAATTTACC-AACATGTTTTGTTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGAGTAGTAAGGTTTTGAACACAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataagtttaaataatatttttcttggtgtaatgaatttaccaacatgttttgttttcacggtgttgattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgagtagtaaggttttgaacacacaggtgt
gi|7 : cgaagttttggttaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGGTTAACACAAACTATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTTCTGAAGCGCC-------TGA--TTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTATAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------AAGTGTTGATTAATTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAcaggtgt
gi|8 : CACAAGTAGAAAGTGTCACTTGATATAAATCA--ATC-A----TCGAGTTTTTTATTAATACAAATTTTAACTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACATTTTTTCTGAAGCGCCggtgta
gi|8 : ---ATAA----GTT-TAAATAATGTCTTATTTTTTTAAGTGTAATGAAGTTACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatgtcttatttttttaagtgtaatgaagttaccaa
gi|9 : cacaagtagaaagtgtcacttgatataaatcaatcatcgagttttttattaatacaaattttaactttgccttttgtaaataggttaccaacattttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTTGGTTAACATAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCTT-AAGCGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNAATAAGTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACC-GACGTGTGTT-TTTTCA------TGGTGT
gi|9 : TATT-TTTCT-------CGGTGT-AATGAAGTTACCGACG-TGTGTTTTTTCA-TGGTGTATTTGTGTAGTAAGGTTTatttgtgtagtaaggttt
Alignments
lowQualScore : 44444444444 11111 111111
lowQualScore : 1 22222222222 0 2 8 4 4 0 1 1 1 1 1 6 888 8888 4 11111 1 8 2 3 00 999999 3 000000
lowQualScore : . ........... . . . . . . . . . . . . ... .... . ..... . . . . .. ...... . ......
lowQualScore : 0 22222222222 1 6 0 8 8 2 0 0 0 0 0 8 888 5555 0 11111 3 8 3 3 33 666666 6 555555
consensus : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
Reference ( family-661 ) : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|1 : CCACACAAGTAAAATGTGTAACTTGATATCAATTA--AT--AATGATCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAGATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTTTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTATTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|10 : TGAAGTTAACAAACGTGTGTT-TTTCAA------CGGTGCTGATTAAGTCATAGACACTT-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAActgt
gi|11 : attttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCACACAAGTAGAAAGTATAACATGATATAAATTG--------------------TGGTTAGCACAAAATTTAAGTATGCTTTTTGTAAATAGGTTATTAGCA-CTTTCCTGAAGTGTCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTGggtgtat
gi|12 : TAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAAC-CAAA
gi|13 : AAGTT--TAAAT-TATATT-TTTCT-------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACAAAAAggtg
gi|14 : CGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCATTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggtgt
gi|15 : CCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCACGT-TATTTGG---CTAC----GTTGTAAATAA
gi|16 : ACCACACAAATAGAATGTGTAACTTGACATAAATTA------------CGAA-------TCA-----------AAGTTTGCCTTTTGTTAATAGGTTA
gi|2 : aACCACACGAGTAGAATGTGTAACTTGATATAAATTA--ATT-A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATTTAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTAAAGTGCTTGGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGCTATGTGTAATGTCCTTGAGCAAGACCTTTTATCCGCATATGTTTAG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCTA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAt
gi|3 : ACCACACAAGTAGAAAGTGTAACTTGGTATAAATTA--ATTAA----T-GGAGTTGTAGTTAGCACACATTTTAAATTTGCCTTTTGTAAATAGGTTATAAACCTTTTTTCTGAAGCGCC
gi|3 : aGTTACCAAACGTGT--------CAATGAAACGGTATTGATTTAGTCATGAACACTG-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaccaaacgtgtcaatgaaacggtattgatttagtcatgaacactggt
gi|4 : aaccacacaagtagaaagtgtaacttggtataaattaattaatggagttgtagttagcacacattttaaatttgccttttgtaaataggttataaaccttttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCGCACAAGTAAAATGTGTAACTTGACATAAATTACGA---A----TCGAAGTTT
gi|4 : a----GTT-TCAATAAT--------TTTCTCCGTGTAATGAAGTTCCCTAACGTGTAAT-TTTC-A------CGGTAGGGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGCAAGGTTTTAAACATAAAgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtttcaataattttctccgtgtaatgaagttccctaacgtgtaattttcacggtagggattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgtgtagcaaggttttaaacataaaggta
gi|5 : aaccgcacaagtaaaatgtgtaacttgacataaattacgaatcgaagtttgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng--A----TCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggta
gi|5 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTAATAGGCACTG-GT------ATTGGTGTGTTTGTGTGGTAAGGTTTTGAACACAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatatttttctcggtgtaatgaagttaccaacgtgtgttttttcacggtgttgattaagtaataggcactggtattggtgtgtttgtgtggtaaggttttgaacacaaaggtgta
gi|6 : atcgaagttttgattaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCggtgta
gi|6 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAATTTACC-AACATGTTTTGTTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGAGTAGTAAGGTTTTGAACACAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataagtttaaataatatttttcttggtgtaatgaatttaccaacatgttttgttttcacggtgttgattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgagtagtaaggttttgaacacacaggtgt
gi|7 : cgaagttttggttaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGGTTAACACAAACTATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTTCTGAAGCGCC-------TGA--TTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTATAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------AAGTGTTGATTAATTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAcaggtgt
gi|8 : CACAAGTAGAAAGTGTCACTTGATATAAATCA--ATC-A----TCGAGTTTTTTATTAATACAAATTTTAACTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACATTTTTTCTGAAGCGCCggtgta
gi|8 : ---ATAA----GTT-TAAATAATGTCTTATTTTTTTAAGTGTAATGAAGTTACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatgtcttatttttttaagtgtaatgaagttaccaa
gi|9 : cacaagtagaaagtgtcacttgatataaatcaatcatcgagttttttattaatacaaattttaactttgccttttgtaaataggttaccaacattttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTTGGTTAACATAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCTT-AAGCGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNAATAAGTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACC-GACGTGTGTT-TTTTCA------TGGTGT
gi|9 : TATT-TTTCT-------CGGTGT-AATGAAGTTACCGACG-TGTGTTTTTTCA-TGGTGTATTTGTGTAGTAAGGTTTatttgtgtagtaaggttt
blockSeqs : A ATTAA T T T A T A T A G A . ATAA G GTCTT A A G G ATGAAA T TTTTTC
blockSeqs : T ATTA A T T A G C G C T N . . . . A A G . . . .
blockSeqs : T CGAA T . N N N N N N N N . . . . A A A . . . .
blockSeqs : A ATCA T . . . N N N N N . . . . . A A G . . . .
blockSeqs : T . A . . . . . A A A . . . .
blockSeqs : A . A . . . . . T A G . . . .
blockSeqs : A . . . . . A A T . . . .
blockSeqs : T . . . . A . G . . . .
blockSeqs : A . . . A . G . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ATA******** ***
originalCons : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
finalCons : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTAATA--------TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
Alignments
lowQualScore : 44444444444 11111 111111
lowQualScore : 1 22222222222 0 2 8 4 4 0 1 1 1 1 1 6 888 8888 4 11111 1 8 2 3 00 999999 3 000000
lowQualScore : . ........... . . . . . . . . . . . . ... .... . ..... . . . . .. ...... . ......
lowQualScore : 0 22222222222 1 6 0 8 8 2 0 0 0 0 0 8 888 5555 0 11111 3 8 3 3 33 666666 6 555555
consensus : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
Reference ( family-661 ) : ACCACACAAGTAGAANGTGTAACTTGATATAAATTA--AT--A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTGAAGTTCTTNGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGNTATGTNTAGTGTCCTTGGGCAAGACNTTNTATCCGCGTATGTTTGG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|1 : CCACACAAGTAAAATGTGTAACTTGATATCAATTA--AT--AATGATCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAGATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTTTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTATTAAGGTTTTGAACACAAA
gi|10 : TGAAGTTAACAAACGTGTGTT-TTTCAA------CGGTGCTGATTAAGTCATAGACACTT-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAActgt
gi|11 : attttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCACACAAGTAGAAAGTATAACATGATATAAATTG--------------------TGGTTAGCACAAAATTTAAGTATGCTTTTTGTAAATAGGTTATTAGCA-CTTTCCTGAAGTGTCTGATTCGTGAAGTTCTTTGTCCAGTGggtgtat
gi|12 : TAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAAC-CAAA
gi|13 : AAGTT--TAAAT-TATATT-TTTCT-------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACAAAAAggtg
gi|14 : CGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCATTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggtgt
gi|15 : CCGCCATGAATATGTTTAGTGTCCTTAGGCAAAATATTGTATCCACGT-TATTTGG---CTAC----GTTGTAAATAA
gi|16 : ACCACACAAATAGAATGTGTAACTTGACATAAATTA------------CGAA-------TCA-----------AAGTTTGCCTTTTGTTAATAGGTTA
gi|2 : aACCACACGAGTAGAATGTGTAACTTGATATAAATTA--ATT-A----TCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATTTAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCTGATTCGTAAAGTGCTTGGTCCAGTGGTAGAGCATTGGACCCATTGGGGAGACGATACCCCGCCACGGCTATGTGTAATGTCCTTGAGCAAGACCTTTTATCCGCATATGTTTAG---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAAACGTGTGTT-TTTCTA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAt
gi|3 : ACCACACAAGTAGAAAGTGTAACTTGGTATAAATTA--ATTAA----T-GGAGTTGTAGTTAGCACACATTTTAAATTTGCCTTTTGTAAATAGGTTATAAACCTTTTTTCTGAAGCGCC
gi|3 : aGTTACCAAACGTGT--------CAATGAAACGGTATTGATTTAGTCATGAACACTG-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaccaaacgtgtcaatgaaacggtattgatttagtcatgaacactggt
gi|4 : aaccacacaagtagaaagtgtaacttggtataaattaattaatggagttgtagttagcacacattttaaatttgccttttgtaaataggttataaaccttttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCGCACAAGTAAAATGTGTAACTTGACATAAATTACGA---A----TCGAAGTTT
gi|4 : a----GTT-TCAATAAT--------TTTCTCCGTGTAATGAAGTTCCCTAACGTGTAAT-TTTC-A------CGGTAGGGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGCAAGGTTTTAAACATAAAgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtttcaataattttctccgtgtaatgaagttccctaacgtgtaattttcacggtagggattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgtgtagcaaggttttaaacataaaggta
gi|5 : aaccgcacaagtaaaatgtgtaacttgacataaattacgaatcgaagtttgccttttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng--A----TCGAAGTTTTGATTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCCggta
gi|5 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTAATAGGCACTG-GT------ATTGGTGTGTTTGTGTGGTAAGGTTTTGAACACAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatatttttctcggtgtaatgaagttaccaacgtgtgttttttcacggtgttgattaagtaataggcactggtattggtgtgtttgtgtggtaaggttttgaacacaaaggtgta
gi|6 : atcgaagttttgattaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGAAGTTTTGGTTAACACAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCCTGAAGCGCggtgta
gi|6 : ---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTGTAATGAATTTACC-AACATGTTTTGTTTTCA------CGGTGTTGATTAAGTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGAGTAGTAAGGTTTTGAACACAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataagtttaaataatatttttcttggtgtaatgaatttaccaacatgttttgttttcacggtgttgattaagtcatagacactggtactggtgtgtttgagtagtaaggttttgaacacacaggtgt
gi|7 : cgaagttttggttaacacaaaatataagtttgccttttgtaaataggttaccaacattttcctgaagcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGGTTAACACAAACTATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTTCTGAAGCGCC-------TGA--TTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---ATAA----GTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTTGGTATAATGAAGTTACCAA-CGTGTGTT-TTTTCA------AAGTGTTGATTAATTCATAGACACTG-GT------ACTGGTGTGTTTGTGTAGTAAGGTTTTGAACACAAAcaggtgt
gi|8 : CACAAGTAGAAAGTGTCACTTGATATAAATCA--ATC-A----TCGAGTTTTTTATTAATACAAATTTTAACTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACATTTTTTCTGAAGCGCCggtgta
gi|8 : ---ATAA----GTT-TAAATAATGTCTTATTTTTTTAAGTGTAATGAAGTTACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataagtttaaataatgtcttatttttttaagtgtaatgaagttaccaa
gi|9 : cacaagtagaaagtgtcacttgatataaatcaatcatcgagttttttattaatacaaattttaactttgccttttgtaaataggttaccaacattttttctgaagcgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTTGGTTAACATAAAATATAAGTTTGCCTTTTGTAAATAGGTTACCAACA-TTTTCTT-AAGCGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNAATAAGTT-TAAATAAT-----ATTTTTCTCGGTGTAATGAAGTTACC-GACGTGTGTT-TTTTCA------TGGTGT
gi|9 : TATT-TTTCT-------CGGTGT-AATGAAGTTACCGACG-TGTGTTTTTTCA-TGGTGTATTTGTGTAGTAAGGTTTatttgtgtagtaaggttt