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gi|30                         :                                              gtcaaaacgattttgtatatggggaatttggcagaactgacttttgagaacaataatttgaatgctataacattttggcttaaaataatctcaggaagtagaaaatagaaataacatataagtctatgttatcagatattgatacttatccaaataaagcaaattgggtttctcttgtcagacaaactttataacttaccatttaactatgtatgtcaaagagttggaaacactgattgtttttattaaaccttaaaatgagattgagagataaGCATGATTAAATTAC-CAAA-ACAACAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAA-TG-TAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAGGACTTt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atataatgtttatccaatgatgCACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTATATCTA-TTTAAATTACAACCATATTGATCAAA-TG-TA-A-GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTC-GA-----AAA-GA-GTA---TTTAGAAACAACCTAG-----CACAC---TTA-------GA--------T----T--AT--GTGATGCATGCGGAGTT------------GGCATGCA--------------TT-A-ATGCCATTT----------------A----GGGC---------ACA------TATCCTG-----TAAA-A--GTT-TT-TTTCCA--A---ATTAAT---ATAAAGTTGTCGA--ACT--GT--CA-A----A-------A----A----A---TAACAACAAAC--GTATT--ATA-A-AAAACG---AATCTGTT-TGTATACACAAAGCG--TTTC-AAA-TGAAATA--TG----TA-TGGTCGTGGGTAGAAGT------TAAATTAAATgacgcagataaagtgttgtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agataacttaattcaatatttgagaacgcaCACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTATATCTA-TTTAAATTACAACCATATTGATCAAA-TG-TA-A-GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCT
gi|6                          : tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagataacttaattcaatatttgagaacgcaTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTAT-TAA-AGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGAT------TTTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGAAA-ATTGTA---GATGGAAACAAACGAG-----CACACAGTGCCTG-----GA--------TAGCTC--AT--GTAATA-GAGCGAA---TT--------CG-------------------------A-ATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTTTA------TAT--TG-----TAAA-A--GTTATC-ATAATATCA---ACC----CAAGTATGTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC---TGACAGCAAAC--AAATT--ATA-T-GAAATG---TCT--GTT-TATATATACAAAGCG--TTTA-AAC-TGAAAAT--CAAGTATA-TGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acagataattgtatccaatgttggaattaacggTTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTAT-TAACTG-TAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATAAATGA-GAA---GATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA--------T----TAAAT--GTATTACGTACGTATTTCTAGAG-GA-CGAGTAT-TG-TTAAATA---T-TTA-G-ATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACC
gi|13                         :                                                                              aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgtcttggaaagtagtaAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTAT-TAA-AGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G----------ACTA-----AGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAAAA-AA-ATAATAGATGGAAGCAAGCGAG-----CACAAATTGCCTA-----GA--------TAGCTC--AT--GTAATACA-GCGAA----------------------------------T-TTG-A-ATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTTTA------TAT--TT-----TAAA-A--GTTATT-ATAATATCA---ACCGA----AGTATGTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A----AA---C---TGACAGCAAAC--AAA----ATATATGAAACC---TGTTTGTT-TATATACACAAAGCG--TTTA--ATCTGAAAAT--CAAGTATA-TGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATaatacgcaatatata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCTTCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAA-GG-TAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGACga
gi|4                          :                                                                                                                                                     aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagctttatctaaacttggaatgcacggttaaatgacaatagTTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGAAA-AGTGGA---AATGGAAGCAACTGAG-----CACACCTTTTA-------AAAATATATTT----T--GTTTGTAAAATATTCCGAGATCTA-GATGA-CGTGT----------------T-TTT-A-TT-TCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATAT--CT-----GAAA-A--GTTATT------AT-----ACCAACCCAGGTATGTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA----AA---C---TGACATCAAAC--AAATT--ATA-A-GAAACC---TGTCTGTT-TATATACACAAAAAG--TTTA-AAC-TGAAAAA--CGAGCCTA-TGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAATAAT-----A-TTGTCTATAGTCCATA-C--TG-TTAAAA--TGCAG-TATAAACTCT-------CCAT-A-TCATTGT---AATAGTAATTAATG-A-G-------TT---------AA--T-CT-TC-------TTTA----------------------------------TTAA-AATAAATATATTAGCACACAGGTACCTAAGTGGTGCAGC-GTTT--------------A-T--AAT---ATTTT------TA-AATAT---T-TATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGGGCTTTTTCGCATAGTCTT-GAGGTAGAAA-ATTGTA---GATGGAAGCAACCGAG-----CACACCTTTTCAA-----GA--------TATACT--AT--GTAATACGTGCGGAGTTCTG-GA-GAACGAGTAT-CA-TT---TT---TATTT-GGATATCGTGT----------ATACA-A----GGATTG------TATA------TGT--TT-----TAAG-A--TTTATT-ATTGTATCA---ACT----CAAGTATGTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------ATGTAAC---AAAGTAACAGCAAAC--ATATT--ATA-A-GAAACG---TGTCTGTT-TCCATTTACAGAGCT--TTCAGTAC-TGAAAAA--CGAGTGTA-TGGTCTTTGGTAGAAATTAATTGTAAATGAAATGAAATAAA-----A-TTATAAA-AGT--ATA-CACTG-TTAATA--TGCAA-TATATACT-C-------CCCAGA-TCATTGT---AGTAGTAATTGATG-taacatgtt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caaatatttagagttcctttTA---GATTGGTATAATCAAG-----TACTCTTTTTCAAAACA-GA--------T----T--TT--GTAATGCATGAGTAGTGTTA-----------TAT----TC---TA---T-TTG-C-ATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTATA------TA-----------AAA-ACAGTTATC-TTTATATTA---ATC----CAAGTTTGTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A----AA---A---TGACACCAAACGTAAG----ATA-A-GAAATA---TGTCTGTT-Tagtaaatc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaggttgaacttgtGTGCGTAGTTCTATAG-GG-CGAGTAT-CT-TT---TTACAT-TTG-A-ATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTCTA------TAT--TT-----AACG-A--GTTATT-ATCTTATCA-----C--CCCAGGTATGTT-TGAAT-ATT---T--TG-A----A-----------------T---TGGTA-----C--A---------------------TAT-TGTC-CACAT---CA-AGCG--TTTA-AAC-AGAAAAA--TGAGTATAATATT-ATG-------ATCAATAGTAAATCAAATGAAATAAA-----A-TCATAAA-AGT--ATA-CACTG-TTAAAA--TATAA-TATATCCT-C-------CCTTGA-CCATTGT---TATAGTAATTGATG------------------AATAAA--T-----------------C----------------C----TT----------TTAAGA-----TATGTTAGCACACTGATACCAAAGTGGTGCTGTGTTTGTAAT-------A--C-T--ATC---AATAT------GA-CATATAAGTATGTTACAGCCCA--ATATTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -AG-GA-AGAGTAT-CAGTT---TT---TATTTGA-ATGTCATTT----------ATACA-A----GA--------CTTATA------TAC--TG-----CAAA----GT-------------------CAACCCAAGTATATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA----GA---C---TGACAGCAAAC--AAATT--ATA-A-GAAACC---TATCTATT-TACATATACAAAGCG--TTTA-AAC-AGAAAAA--CGAGTCTA-acgtct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATAT-CA-TT---AT---T-TTA-A-AAGTTGTTTTTCATAAGTAATACA-AAAACGAACTTAAGACTTATA------TGT--TT-------AT-A--GTTATT-GTTATATGA---TCC----CAATTATGTT-TAAA--ACT--GT--TG-A----ATTGTTACA----AA---C---TGACAGCAAAC--ATATT--ATA-A-GAAACA---TGTCTGTT-GACACAT--ATAACACTTTTA-AAC-TGAAAAA--CGAGTATA-TAGCCTTTGATAGAAATCAAATGTAAAACAAATGAAACAAA-----A-TTGTTTG-AGC--AAA-CACTT-TTCAAA--TCAAA-TATATACT-T-------CCATGA-CTATTGA---AGAAGTTATTGAT----------------A-AAA-AAA--T----------------------------------CAG--TT----------TTAAGA-TAAATATGTTAGCACACATATACCACAGTGGTGCAATGTTTGTAAT-------A--C-T--ATT---AAAAT------GA-CATAT---
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA----AA---C---GGACAGCAAAC--ATATT--ATA-C-TAAAGA---TA-ATATTATAGAT-TGTAAA-------TA-GAC-TGTAAAT--CGAATCTA-TAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAAT-GAATAAA-----AGT-GTATA-AAT--ATA--AACAGTTAAAAAATGTAAATATATACA-C-------CTA-GA-TCATTAT---AG---TAATTAATG-ATG--------------AGTAAA--T-------------CCT-----------------------TT----------TTGA-AATAGATATATTGTCACACAGATACCAAAGTGGTGCACTCTTTTTAAT-------A--C-T--ATT---AACAC------GA-CATAC---G-TGTAACATTCCA--ATCTT--TATTTCTGAAATCaggaaatccttttttta
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaAC-TGAAAA---CGTTTCTA-TGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a--CGAGACTT-TGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAAcgaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TA-TGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAAT-GAATAAA-----A-TTATTTG-TGT--AAA-CACTG-TTAAAA--TTCAA-TATATACT-C-------CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-------------------A-AAATAAA--T-ATGTA-----AGCACACATATACCGAAGTGGTGCGGTGTTTGTAATACTATTAAATATAAATATGAACGCACACATATATCAAAGTGGTGCGGTGTTTGTAAT-------ACTA-TTAAATATAAATAT------GG-CATCT---T-TGTTACAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAATAAT-----A-CTGTTTA-AGT--CTA-CACTG-ATGAAA--TACCA-TATATACT-C-------CCAT-A-TCATT------GCAATAGTT---------------TCTAATGAGTAAA--T----------------------------------CCT-GTT----------T--AAAATAAATATGTAAGCACACAGGTACCAAAGTGGTGTAGTGTTTGTAATACCTTTAA--A-T--AGT---AGTATAACATATGACATAT---A-TGTTACAACCTA--ATCTGTATGTTTG--AAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGAAATAAA-----A-TTGTTGA-AGT--CTA-CACCG-TTTAAA--TGTAA-TATA-ATT-TACACTCCCCA-GA-TCATTGT---AGTAGTAATTCATG------------------AATAA--------TT-----ATTTT----------------------GT--------------AAAACAGATATGTTAGCACACAGGTACCGAAGTGGTGTAGT-GTTT--------------G-T--AAT---ACTGT------TA-AATAT---T-TATA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A--TACAA-TATATACTCT-------CCAAGA-TCATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATCCTTCTTAA--AATAGA--TAATGTT-----AGtgacatatatgttgatgtttgaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA-TATATACA-C-------CCGTGA-TCATTAT---AATAGCAATTGAT------------------GAGTAAATTT-ATGTTTTAAAAATGTACA-----------AGCACcacaaagaaaccaagtggtgcagcttttgtaatacttttaaatactaacagaaaatgtatgttacaaccaaatctttatgtttacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATG------------------AATAAA--T----------------------------------CA---TT----------TTTAGAATATATATGTAA----ACAAATACCAAAGTGGTGAAGTGTTTGTAAT-------A--T-T--ATT---AACAT------GG-CTTAT---A-TGTAATAATTCA--ATCTTTATATTTG--AAATgcacgca
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCAAGTAAATTTAAGGTATATAAAGTTAGTCAAAACGATTTTGTTTATGGGGAAATAAGCAGCAAAAAGTTTAATGCAGTGACATTTTAGCTTAAAATTATATCAGCGGAAATAGAAAATATATAAAATAAGATATATGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATCGAAATAAAACTATTGAACTTCTCTTATCAGAGAGTCTTAGTAACTTAGGCTTTAACTTAATATATGGCTTGGT
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATA-AT-TTTATTCAATCCTNCNAATCTTGGAATGCAC--GNTTAAATAACTCAAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTNAANGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGAAAAN-TG-T-AGATGGAAGCAACCGAG-----CACACCTTTTC-NAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TN-AATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAATAA------AA-TTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGA-TCATTGT---AGTAGTAATTGATG---------AATAAAT-------TTT-----TAC---T-T--T-TAAGAATAAAT-ATGTTAGCACACAGATACCAAAGTGGTGCAGTGTTTGTAAT-------ANT----ANT-------A-------ATATGA-CA--TAT---T-TGTAACAACCCA--ATCTTTATATTTGAAATCA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtcttgtgtcaagacatacgtATA-AC-TTAATTCAAT-------ATTTGAGAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTC-------GAAAAG-AG-T-ATTTAGAAACAACCTAG-----CACACTT------AGAT------T---A---T-------GTGATGCATGCGGAGTT--------------GGCATGCA---TT-----------------AATGCCATTT----------------A----GGGC-----AC--A------TATCCTGTAAAA--GTT-T-----TTTT--------------CCAAATTAA-TATAAAGTTGTCGA--ACT--GT--CA-A----A-------A-------AA-----TAACAACAAACGTATTATA--AAAAACG---AATCTGTT-TGTA--TACACAAAGCGTTTCA-AATGAAATA--TG----TATGGTCGTGGGTAGAAGT------TAAATTAAAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agACCTA------TATATTT--AAA--ATTAAACAAATATTATTTAAAAAAGTTATCAAACCAAGTAG---ATT-TAAA--ACTGAAT--TGTA----AC------A-------AAC----AGACAGCCAACATATTGTA--CGAAACAAATTGTTTGTT-AACA--TTTAAAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAAAATGAGCCCATGGCCGTGGATAGAAATCAGTTGTAAATCAAATGAA-TGA------AA-TTGTATA-AGTTTA-CGCTGTTATA---TACAG-TATA-----TACATC-CTA-GA-TCATTAG---AGTGGTAAATGATG---------AGTAAAT-----------------C---T-T--T-TA--------T-ATCTTAGAAAACAGATACCAAAGTGGTGCAGTGTTTGTAAT-------ACC----ATT-------A-------ATATGATTAATTATG--T-TACAGCAACCCATTATATTTATCTTTAACGTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttattGTGCGTAGTTCT--ATAG--GGCGAGTAT-CT---TT---T-TACATT---TG-AATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTC------TATATTTAACGA--GTTAT-----TATCTTATCA---------C--CCCAGGTAT---GTT-TGAA----T--AT--T-------------------------T----TGA----------ATT------GGTACA---TAT-TGTC-CACA--T---CAA-GCGTTTAA-ACAGAAAAA--TGAGT--ATAAT-ATT-ATG---ATCAATAGTAAATCAAATGAAATAA------AA-TCATAAA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TATAA-TATA-----TCC-TC-CCTTGA-CCATTGT---TATAGTAATTGATG---------AATAAAT-------C---------C---T-T--T-TAAG-----AT-ATGTTAGCACACTGATACCAAAGTGGTGCTGTGTTTGTAAT-------ACT----ATC-------A-------ATATGA-CA--TATAAGTATGTTACAGCCCA--ATATTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAAAAAAATAAT-AGATGGAAGCAAGCGAG-----CACAAATTGCC-TAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TG-AATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAcgtct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagctttatTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-TAA------AA-GTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GA-TCATTAT---AGTAATTAATGATG---------AGTAAAT-------CCT-----T-------T--T-TGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATACCAAAGTGGTGCACTCTTTTTAAT-------ACT----ATT-------A-------ACACGA-CA--TAC---G-TGTAACATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA-AA------AA-TTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGA-TAACTGT---AGTATTAATTGATG---------AGGAAAT-------CCT-----T-T---T-T--T-TA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-TAA------AA-TTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT--------------------------------------------------AAAATAAAT-ATGTAAGCACACATATACCGAAGTGGTGCGGTGTTTGTAAT-------ACT----ATTA------A-------ATATAA--A--TAT---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -----TAC---T-A--T-TAAATATAAAT-ATGAACGCACACATATATCAAAGTGGTGCGGTGTTTGTAAT-------ACT----ATTAAATATAA-------ATATGG-CA--TCT---T-TGTTACAAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    tatggtcattgataaaaatcaattgtaaataaaatgaataaaattatttgtgtaaacactgttaaaattcaatatatactccctgattcattgtaatagtaattaaaataaatatgtaagcacacatataccgaagtggtgcggtgtttgtaaTCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATAAATG-AG-A-AGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TA-GATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAATAA------TA-CTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-A-TCATTGC---AATAGTTTCTAATG---------AGTAAAT-------C---------C---TGT--T-TAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTACCAAAGTGGTGTAGTGTTTGTAATACCTTTAAAT----AGT-------AGTATAACATATGA-CA--TAT---A-TGTTACAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -GAGGTTGAAC-T-TG-TTAGATTGGTATAATCAAG-----TACTCTTTTTC-AAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TG-CATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAATAA------TA-TTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAATAA------AA-TTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGA-TCATTGT---AGTAGTAATTCATG---------AATAA-----------T-----TAT---T-T--TGTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTACCGAAGTGGTGTAGTGTTTGTAAT-------ACT----GTT-------AAATATTTATATGA-CA--TAT---A-TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TG-AATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGA-TCATTGTTGAAGTAGTAATTGATG---------AGTAAAT-------CCT-----T-C---T-T------AAAATAGATAATGTTAGCACAAAGAAACC-AAGTGGTGCAGCTTTTGTAATACTTTTAAAT----ACT-------A-------ACAGAA-AA--TGT---A-TGTTACAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATA-AT-TTTATTCAATCCT---------GGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATT------AAATGT--ACAT-------TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGAAAAG-TG-A-AGTTTGAAGCAACCGAG-----CACACCTATCC-AAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T-------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATTAAAGCAGTAA-TT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATG---------AATAAAT-------C--------AT---T-T--T-TA-GAATATAT-ATGT----AAACAAATACCAAAGTGGTGAAGTGTTTGTAAT-------ATT----ATT-------A-------ACATGG-CT--TAT---A-TGTAATAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaATATA-ATGTTTATCCAAT-------------GATGGCAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAGGACTTt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-TATA-----TAC-AC-CCGTGA-TCATTAT---AATAGCAATTGATG---------AGTAAAT-------TTA-----TG----T-T--T-TAA----AAAT-GTACAAGCACGCAgacgcagataaagtgttgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-A-GCATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGAAAAG-TG-G-AAATGGAAGCAACTGAG-----CACACCTTTTA-AAAAT--A---T---A---TTTTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT--A--GATGACGTGT-------------T-T----T---T---ATTTCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCTGAAAA--GTTAT-----TAT-------A-------CCAACCCAGGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAATAA------TA-TTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-A-TCATTGT---AATAGTAATTAATG---------AGTTAAT-------CTT-------C---T-TTAT-TAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTACCTAAGTGGTGCAGCGTTTATAAT-------ATTTTTAAAT-------ATTT----ATATAA-CA--TGT---T-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATA-AC-TTAATTCAAT-------ATTTGAGAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCT
gi|6                          :                                                                                           tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagATA-AT-TGTAT---------CCAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGAAAAT-TG-T-AGATGGAAACAAACGAG-----CACACAGTGCC-TGGAT--AGCTC---A---T-------GTAATA------GAG--------------CGAAT--------------------T---CG-AATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTGTAAAA--GTTAT-----CATAATATCAA-------CC----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATA-AT-TTNATTCAATC-TCTAATCTCGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATCTTAC-TT--T-TAAGAATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TNT--GTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAA-AAAAATAATAGATGGAAGCAAGCGAGCA---CA---AATTGCCTAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TCTAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagctttaTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATCCT---TT--T-TGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CGT--GTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATCCTTT-TT--T-TA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATTAA-------------------------AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----T
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TAGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATCCTG---T--T-TAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TAT--GTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TGCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaggttgaacttgtAAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAA---TTAT-TT--TGTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TAT--GT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TGAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATCCT---TC--T-TAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TAT--GTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATA-AT-TTTATTCAATC-------CT-GGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--AT-TT--T-TA-GAATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TAT--GTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaATATA-ATGTTTATCCAAT------------GATGGCAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAAT-TTATGTT--T-TAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-AG-CATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGA-AAAG-TG-GAAATGGAAGCAACTGAGCA---CA---CCTTTTAAAAAT--A---T---A---TTTTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT--A--GATGACGTGT-------------T-T----T---T--ATTTCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCTGAAAA--GTTAT-----TAT-------A-------CCAACCCAGGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAAT-AA------TATTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-AT-CATTGT---AATAGTAATTAATGAGTTAATCTT-C-TTTAT-TAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTAC------------CTAA---GT---------GGTGC---AGCGTTT--ATAATATTTTT-A--------------A------AT-----AT---T----TAT--ATAA---CA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATA-AC-TTAATTCAATA-TTTGA-----GAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTtgtt
gi|6                          :                                                                                                             tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcag-TCCAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAACAAACGAGCA---CA---CAGTGCCTGGAT--AGCTC---A---T-------GTAATA------GAG--------------CGAAT--------------------T---CGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTGTAAAA--GTTAT-----CATAATATCAA-------CC----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCAAGTAAATTTAAGGTATATAAAGTTAGTCAAAACGATTTTGTTTATGGGGAAATAAGCAGCAAAAAGTTTAATGCAGTGACATTTTAGCTTAAAATTATATCAGCGGAAATAGAAAATATATAAAATAAGATATATGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATCGAAATAAAACTATTGAACTTCTCTTATCAGAGAGTCTTAGTAACTTAGGCTTTAACTTAATATATGGCTTGGT
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATA-AT-TTNATTCAATN-TCTAATCTTGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTAA-AATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttattGTGCGTAGTTCT--ATAG--GGCGAGTAT-CT---TT---T-TACATT---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTC------TATATTTAACGA--GTTAT-----TATCTTATCA---------C--CCCAGGTAT---GTT-TGAA----T--AT--T-------------------------T----TGA----------ATT------GGTACA---TAT-TGTC-CACA--T---CAA-GCGTTTAA-ACAGAAAAA--TGAGT--ATAAT-ATT-ATG---ATCAATAGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATCATAAA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TATAA-TATA-----TCC-TC-CCTTGAC-CATTGT---TATAGTAATTGATGAATAAATC--C---TT-TTA-----AGAT-ATGTTAGCACACTGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---TGTGTTT--GTAATACTATC-A--------------AT-A-TGAC-----AT---ATAAGTA--TGTTA---CAGCCCA--ATATTTACGTCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAA-AAAAATAATAGATGGAAGCAAGCGAGCA---CA---AATTGCCTAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TA-TCTAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagcttTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CG--TGTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATC--C-T-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-----------------------AA-AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----Ttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TAGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATC--C-T-GT-TTAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TGCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaggttgaacttgtAAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAATTA--T-T-TT-GTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TGAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TC-TTAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TA--TGTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATA-AT-TTTATTCAAT--------CCTGGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--A-T-TT-TTAG-AATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TA--TGTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaATATA-ATGTTTATCCAATG-----AT----G---GCAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAATT--TATGTT-TTAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATA-AC-TTAATTCAATA-TTTGA-----GAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTtgtt
gi|6                          :                                                                                                           tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagTA-TCCAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAACAAACGAGCA---CA---CAGTGCCTGGAT--AGCTC---A---T-------GTAATA------GAG--------------CGAAT--------------------T---CGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTGTAAAA--GTTAT-----CATAATATCAA-------CC----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCAAGTAAATTTAAGGTATATAAAGTTAGTCAAAACGATTTTGTTTATGGGGAAATAAGCAGCAAAAAGTTTAATGCAGTGACATTTTAGCTTAAAATTATATCAGCGGAAATAGAAAATATATAAAATAAGATATATGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATCGAAATAAAACTATTGAACTTCTCTTATCAGAGAGTCTTAGTAACTTAGGCTTTAACTTAATATATGGCTTGGT
Unaligned ( gi|20 ): CAATTTAAACATCAAAATATGTCAAAAACGAGTCTGTGTATATATATATGAAAGGACTTGGACAGAACTGACTCTGGCAACAAGAATTGCTTATGCTATAAAATAATCACTGCAGGAAACATACAAAATAAAAAGTTACAAATCTGGCTTTTCTTGTCGGAGTCCCAAAGACAATCTTAATAACTTAACAGTCAACTATGTATGGTTTGGTCAAAGAGTTGAGGACAC
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Unaligned ( gi|25 ): AATTTTAAGTAAATTTAAGGCATTAAAAATAAGTAAAGTAACCGATTTTGATGGGGAATTAAGTGGAAATACCTTAACAACAAGAATTTTAAATCCTATAAAATGTTGGCTTATCATATTCTCAGTGGGAAATAAAAAATATATAACAATAATATATAAGTCAATGTTATCACAAAAAAAGTATCTTAATAAA
Unaligned ( gi|28 ): AGTGATTTTAAAACATAGAGACATATAAAGAAATAGATGTCGATGTTTTAAGAAATTGAAAATAATAAAAAAATGGGCTTCTCTTGTCAGAGACAATCTTAATAATTGAGATTTAACTATGTATAAGTTGGTCAAGGTGTAGGAAACACTAAAAAGTTTTAATGAAAC
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATA-ATTTNATTCAATATC---TAATCTTGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTAA-AATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agACCTA------TATATTT--AAA--ATTAAACAAATATTATTTAAAAAAGTTATCAAACCAAGTAG---ATT-TAAA--ACTGAAT--TGTA----AC------A-------AAC----AGACAGCCAACATATTGTA--CGAAACAAATTGTTTGTT-AACA--TTTAAAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAAAATGAGCCCATGGCCGTGGATAGAAATCAGTTGTAAATCAAATGAA-T-GA------AATTGTATA-AGTTTA-CGCTGTTATA---TACAG-TATA-----TACATC-CTA-GAT-CATTAG---AGTGGTAAATGATGAGTAAATC--T-T-TT-----------AT-ATCTTAGAAAACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACCATT-A--------------AT-A-TGAT------T---AAT--TA--TGTTACAGCAACCCATTATATTTATCTTTAACGTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttattGTGCGTAGTTCT--ATAG--GGCGAGTAT-CT---TT---T-TACATT---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTC------TATATTTAACGA--GTTAT-----TATCTTATCA---------C--CCCAGGTAT---GTT-TGAA----T--AT--T-------------------------T----TGA----------ATT------GGTACA---TAT-TGTC-CACA--T---CAA-GCGTTTAA-ACAGAAAAA--TGAGT--ATAAT-ATT-ATG---ATCAATAGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATCATAAA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TATAA-TATA-----TCC-TC-CCTTGAC-CATTGT---TATAGTAATTGATGAATAAATC--C---TT-TTA-----AGAT-ATGTTAGCACACTGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---TGTGTTT--GTAATACTATC-A--------------AT-A-TGAC-----AT---ATAAGTA--TGTTA---CAGCCCA--ATATTTACGTCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAA-AAAAATAATAGATGGAAGCAAGCGAGCA---CA---AATTGCCTAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATC---TAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagcttTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CG--TGTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATC--C-T-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-----------------------AA-AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----Ttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TAGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATC--C-T-GT-TTAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TGCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaggttgaacttgtAAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAATTA--T-T-TT-GTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TGAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TC-TTAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TA--TGTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACATA-ATTTTATTCAAT----------CCTGGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--A-T-TT-TTAG-AATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TA--TGTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaTATC---CAATGATGG----CAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atataatgttAA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAATT--TATGTT-TTAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-AG-CATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGA-AAAG-TG-GAAATGGAAGCAACTGAGCA---CA---CCTTTTAAAAAT--A---T---A---TTTTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT--A--GATGACGTGT-------------T-T----T---T--ATTTCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCTGAAAA--GTTAT-----TAT-------A-------CCAACCCAGGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAAT-AA------TATTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-AT-CATTGT---AATAGTAATTAATGAGTTAATCTTC-T-TTATTAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTAC------------CTAA---GT---------GGTGC---AGCGTTT--ATAATATTTTT-A--------------A------AT-----AT---T----TA--TATAA---CA
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gi|6                          :                                                                                         tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagTATC---CAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAACAAACGAGCA---CA---CAGTGCCTGGAT--AGCTC---A---T-------GTAATA------GAG--------------CGAAT--------------------T---CGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTGTAAAA--GTTAT-----CATAATATCAA-------CC----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCAAGTAAATTTAAGGTATATAAAGTTAGTCAAAACGATTTTGTTTATGGGGAAATAAGCAGCAAAAAGTTTAATGCAGTGACATTTTAGCTTAAAATTATATCAGCGGAAATAGAAAATATATAAAATAAGATATATGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATCGAAATAAAACTATTGAACTTCTCTTATCAGAGAGTCTTAGTAACTTAGGCTTTAACTTAATATATGGCTTGGT
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Unaligned ( gi|25 ): AATTTTAAGTAAATTTAAGGCATTAAAAATAAGTAAAGTAACCGATTTTGATGGGGAATTAAGTGGAAATACCTTAACAACAAGAATTTTAAATCCTATAAAATGTTGGCTTATCATATTCTCAGTGGGAAATAAAAAATATATAACAATAATATATAAGTCAATGTTATCACAAAAAAAGTATCTTAATAAA
Unaligned ( gi|28 ): AGTGATTTTAAAACATAGAGACATATAAAGAAATAGATGTCGATGTTTTAAGAAATTGAAAATAATAAAAAAATGGGCTTCTCTTGTCAGAGACAATCTTAATAATTGAGATTTAACTATGTATAAGTTGGTCAAGGTGTAGGAAACACTAAAAAGTTTTAATGAAAC
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATATATATAAGTCAAATGTTGTCAGATATTGAAGAATATCAGAATAAAACAAATTGGGTTAAAAATTCTCTTGTCAGAGATCTTAATAACGTAGGATTTAACTATCTATGACTTAGTCAAGGAGTTGGTAACACTAAATTGTTTTT
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATAACTTAATTCAATATCTAATCTTGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTAA-AATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agACCTA------TATATTT--AAA--ATTAAACAAATATTATTTAAAAAAGTTATCAAACCAAGTAG---ATT-TAAA--ACTGAAT--TGTA----AC------A-------AAC----AGACAGCCAACATATTGTA--CGAAACAAATTGTTTGTT-AACA--TTTAAAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAAAATGAGCCCATGGCCGTGGATAGAAATCAGTTGTAAATCAAATGAA-T-GA------AATTGTATA-AGTTTA-CGCTGTTATA---TACAG-TATA-----TACATC-CTA-GAT-CATTAG---AGTGGTAAATGATGAGTAAATC--T-T-TT-----------AT-ATCTTAGAAAACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACCATT-A--------------AT-A-TGAT------T---AAT--TA--TGTTACAGCAACCCATTATATTTATCTTTAACGTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattGTGCGTAGTTCT--ATAG--GGCGAGTAT-CT---TT---T-TACATT---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTC------TATATTTAACGA--GTTAT-----TATCTTATCA---------C--CCCAGGTAT---GTT-TGAA----T--AT--T-------------------------T----TGA----------ATT------GGTACA---TAT-TGTC-CACA--T---CAA-GCGTTTAA-ACAGAAAAA--TGAGT--ATAAT-ATT-ATG---ATCAATAGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATCATAAA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TATAA-TATA-----TCC-TC-CCTTGAC-CATTGT---TATAGTAATTGATGAATAAATC--C---TT-TTA-----AGAT-ATGTTAGCACACTGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---TGTGTTT--GTAATACTATC-A--------------AT-A-TGAC-----AT---ATAAGTA--TGTTA---CAGCCCA--ATATTTACGTCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAA-AAAAATAATAGATGGAAGCAAGCGAGCA---CA---AATTGCCTAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATCTAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagcttTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CG--TGTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATC--C-T-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-----------------------AA-AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----Ttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TAGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATC--C-T-GT-TTAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TGCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gaggttgaacttgtAAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAATTA--T-T-TT-GTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TGAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TC-TTAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TA--TGTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATTTTATTCAAT-------CCTGGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--A-T-TT-TTAG-AATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TA--TGTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaTATCCAATGATGG----CAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atataatgttAA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAATT--TATGTT-TTAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-AG-CATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGA-AAAG-TG-GAAATGGAAGCAACTGAGCA---CA---CCTTTTAAAAAT--A---T---A---TTTTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT--A--GATGACGTGT-------------T-T----T---T--ATTTCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCTGAAAA--GTTAT-----TAT-------A-------CCAACCCAGGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAAT-AA------TATTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-AT-CATTGT---AATAGTAATTAATGAGTTAATCTTC-T-TTATTAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTAC------------CTAA---GT---------GGTGC---AGCGTTT--ATAATATTTTT-A--------------A------AT-----AT---T----TA--TATAA---CA
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATAACTTAATTCAATATCTAATCTTGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGAT--A---T---A---T-------GTAATACGTGCGGAGTTCT--A--G--GACGAGTAT-CA---TT---T-T----T---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATCAA-------CCAACCCAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------A-------AAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTAA-AATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agACCTA------TATATTT--AAA--ATTAAACAAATATTATTTAAAAAAGTTATCAAACCAAGTAG---ATT-TAAA--ACTGAAT--TGTA----AC------A-------AAC----AGACAGCCAACATATTGTA--CGAAACAAATTGTTTGTT-AACA--TTTAAAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAAAATGAGCCCATGGCCGTGGATAGAAATCAGTTGTAAATCAAATGAA-T-GA------AATTGTATA-AGTTTA-CGCTGTTATA---TACAG-TATA-----TACATC-CTA-GAT-CATTAG---AGTGGTAAATGATGAGTAAATC--T-T-TT-----------AT-ATCTTAGAAAACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACCATT-A--------------AT-A-TGAT------T---AAT--TA--TGTTACAGCAACCCATTATATTTATCTTTAACGTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattGTGCGTAGTTCT--ATAG--GGCGAGTAT-CT---TT---T-TACATT---TGAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGGTCTC------TATATTTAACGA--GTTAT-----TATCTTATCA---------C--CCCAGGTAT---GTT-TGAA----T--AT--T-------------------------T----TGA----------ATT------GGTACA---TAT-TGTC-CACA--T---CAA-GCGTTTAA-ACAGAAAAA--TGAGT--ATAAT-ATT-ATG---ATCAATAGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATCATAAA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TATAA-TATA-----TCC-TC-CCTTGAC-CATTGT---TATAGTAATTGATGAATAAATC--C---TT-TTA-----AGAT-ATGTTAGCACACTGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---TGTGTTT--GTAATACTATC-A--------------AT-A-TGAC-----AT---ATAAGTA--TGTTA---CAGCCCA--ATATTTACGTCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTGCAACCATATTTATTAAAGATAAATAT--ACAC-A-A--ATTTCGA-G---------------ACTAAGGGTTTCTTCACATGGACTT-GAAGTAAA-AAAAATAATAGATGGAAGCAAGCGAGCA---CA---AATTGCCTAGAT--AGCTC---A---T-------GTAATACA-GCGAA-----------------------------------T----T---TGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACCTT------TATATTTTAAAA--GTTAT-----TATAATATCAA-------CCGA----AGTAT---GTT--AAA--ATT------TC-A----C-------A-------AAC----TGACAGCAAACAAAATATA--TGAAACC---TGTTTGTT-TATA--TACACAAAGCGTTTAA-TCTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATCTAAACTTGGAATGCAC--GGTTAAATGAC-----------AATAGTCT---------------TCCTTTAAAGTCCAACCATGTTTATTAAAGGTAAATGT--ATAC-AGT--TTTA-GA-GT-TGCA-ATGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagcttTT-CAAA--TCT--AT--TG-A----ATTATTACA-------AAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CG--TGTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTA------TATGTTTTAAAA--GTTAT-----TATTATATTAA-------CCCAC----ATAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATC--C-T-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-----------------------AA-AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----Ttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGA---TTAAA---T-------GTATTACGTACGTATTTCTAGA--G--GACGAGTAT-TG---TTAAATAT----T---TAGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATC--C-T-GT-TTAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAAC--A---G---A---TTTT----GTAATGCATGAGTAGTGTT--A-----------TAT------TC---TAT----T---TGCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA----AAAACAGTTAT-----CTTTATATTAA-------TC----CAAGTTT---GTA-TGAACTACTTAAT--TG-ATAAAA-------A-------AAA----TGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gaggttgaacttgtAAA--AGT--ATCTTA-A----T-------A-------AAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAATTA--T-T-TT-GTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A--G--GAAGAGTAT-CAGTTTT---TAT----T---TGAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTGCAAA---GT---------------------------CAACCCAAGTAT---ATT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ACTGTTACA-------GAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TC-TTAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TA--TGTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATTTTATTCAAT-------CCTGGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTT--AGGTT---A---T-------GTAATACGTGC------------------TGAGTAT--A---T------------------ATAT-ATTT--------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTTTAAAA--CGTAT-----TATTATTT-----------CAACCCAAGTAT---CTT-TAAA--ATT--AT--TG-A----A-------A-------TGT----TAAAAGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--A-T-TT-TTAG-AATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TA--TGTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaTATCCAATGATGG----CAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atataatgttAA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAATT--TATGTT-TTAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-AG-CATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGA-AAAG-TG-GAAATGGAAGCAACTGAGCA---CA---CCTTTTAAAAAT--A---T---A---TTTTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT--A--GATGACGTGT-------------T-T----T---T--ATTTCGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCTGAAAA--GTTAT-----TAT-------A-------CCAACCCAGGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----ATTGTTACA-------AAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAAT-AA------TATTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-AT-CATTGT---AATAGTAATTAATGAGTTAATCTTC-T-TTATTAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTAC------------CTAA---GT---------GGTGC---AGCGTTT--ATAATATTTTT-A--------------A------AT-----AT---T----TA--TATAA---CA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAACTTAATTCAATATTTGA-----GAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTtgtt
gi|6                          :                                                                                 tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagTAATT--GTATCCAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAACAAACGAGCA---CA---CAGTGCCTGGAT--AGCTC---A---T-------GTAATA------GAG--------------CGAAT--------------------T---CGAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTGTAAAA--GTTAT-----CATAATATCAA-------CC----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TA-A----A-------ATTTCACAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acagaAGGGCTTTTTCGCATAGTCTT-GAGGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTTCAAGAT--A---T---ACTAT-------GTAATACGTGCGGAGTTCTGGA--G--AACGAGTAT-CA---TT---T-T----TATTTGGATATCGTGT----------ATACA-A----GGATT---G---TA------TATGTTTTAAGA--TTTAT-----TATTGTATCAA-------CT----CAAGTAT---GTT-TAAA--ACT--AT--TG-A----A-------ATGT----AACAAAGTAACAGCAAACATATTATA--AGAAACG---TGTCTGTT-TCCA--TTTACAGAGCTTTCAGTACTGAAAAA--CGAGTGTATGGTCTTTGGTAGAAATTAATTGTAAATGAAATGAAAT-AA------AATTATAAA-AGTATA-CACTGTTAATA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caaatatttagagttcctttTAACTC--TTTCTAATCTTGGAATGCAC--TGTTAAATGACTCGAGCAAAGCAATATTCTATAGA--ATTTTTCTTCCTTTAAACAACAGCCGTATTTATTAAAGGTAAATGT--TCAC---T---TTACGGTGT-TGCACATAACCA
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Reference ( family-652 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATAACTTAATTCAATATCTAATCTTGGAACGCAC--GNTTAAATGACTCGAGCAGAGCAATANTCTATAGA-CANTTTTNTTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAAATGTAAATGT--ACAC-A-T--ATTACGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCACATAGGCTT-GAGGTAGA-AAAG-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTCCAAGATAGNTT--ATGT----AATACGTGCGGAGTTCT----A----ACGAGTAT-C-----T----T-----ATTT-GAATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCTA------TATATTT-----TAAA-A--GTTATTATT------A--TAT----CAACCCAAGTATGTTTAAAACTATTGAA--T--T--TA-CAAAC----TGACAGCAAACANATTATA--AGAAACN---TGTCTGTT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATCAAATGAAAT-AA------AATTGTNTA-AGTATA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCATGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTAA-AATAAAT-ATGTTAGCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---AGTGTTT--GTAATACTATT-A--------------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTNA---CAACCCA--ATCTTTATGTTTGAAATCA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaatatgtataaataatatagtagtatactagtaagtctatgttatcagaaattgaaaactatccaaataaaacaaattggacttatctagtcagagacaaccttaataaccagtgacgtaataagtggataggtcactgtaataacttaggatatcgctatgtgtggcttagtcaattagtgggaaacactaaattgtttttattaaaccttaaaatgagattaagagagagcttTTCAAATCTATTGAA--T--TATTA-CAAAC----GGACAGCAAACATATTATA--CTAAAGA---TA-ATATTATAGA--T-TGTAAA-----TAG-ACTGTAAAT--CGAATCTATAACAATGGATAGTCATGATTTGTAAATCAAATGAA-T-AA------AAGTGTATA-AATATA-AACAGTTAAAAAATGTAAATATA-----TAC-AC-CTA-GAT-CATTAT---AGTAATTAATGATGAGTAAATC--C-T-TT-TTGA-AATAGAT-ATATTGTCACACAGATAC------------CAAA---GT---------GGTGC---ACTCTTT--TTAATACTATT-A--------------AC-A-CGAC-----AT---A----CG--TGTAA---CATTCCA--ATCTTTATTTCTGAAATC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTA------TATGTTT-----TAAA-A--GTTATTATT------A--TAT----TAACCCACATATGTTTAAAACTATTGAA--T--TGTTA-CAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACT---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTAA-ATTGAAAAA--CGAGTCTTTGGTCATTGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATAAAA--AA------AATTGTTTA-AATTTA-CACTATTAAAA--TGGAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-AACTGT---AGTATTAATTGATGAGGAAATC--C-T-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATGGTCATTGATAAAAATCAATTGTAAATAAAATGAA-T-AA------AATTATTTG-TGTAAA-CACTGTTAAAA--TTCAA-TATA-----TAC-TC-CC-TGATTCATTGT---AATAGTAATT-----------------------AA-AATAAAT-ATGTAAGCACACATATAC------------CGAA---GT---------GGTGC---GGTGTTT--GTAATACTATTAA--------------AT-A-TAA------AT---A----Ttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCTTGGAAAGTAG--TATTGAATAACTCAAGCAGAGCAATAATTTAACGA-CAATCTTATTCCTTTAAACTACAACCATATTTATTAACTGTAAATGTACACAC-A-T--ATTTAGA-GT-TGCA-ATGACTAGACTAAGGGTTTCTTCAAATAAGCTTAGAGGTATA-AATG-AG-AAGATGGAAGCAATCGAGAATTTCAAACCCCTTCTAAGATAGATTAAATGT----ATTACGTACGTATTTCT----AGAGGACGAGTAT-TG----TTAAAT-----ATTT-AGATGTCGTTT----------ATACA-A----GGACTTAAGACCAA------TAgaacgcacacatatatcaaagtggtgcggtgtttgtaatactattaaatataaatatggcatctttgttacaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagcaagtttttaatgttagaaaagtaaagtttggcttaaaataatctcaaaaggaaacagaaaatataatatatataagtcattgttttcagaaaatgaagagtatccaaataaatcaaactggtcatgtccaatcagaaacaatctaagaacttaggatttaactaggtatgaatttggcatattggaaacaacacattgattaataaaacaatgtgttgtttccaatatgcccttaaaacgggactcagatgtagcagcgATAGAAATCAATTGTAAATAAAATGAAAT-AA------TACTGTTTA-AGTCTA-CACTGATGAAA--TACCA-TATA-----TAC-TC-CCAT-AT-CATTGC---AATAGTTTCTAATGAGTAAATC--C-T-GT-TTAA-AATAAAT-ATGTAAGCACACAGGTAC------------CAAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACCTTT-AAATAGTAGTATAACAT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGTTA---CAACCTA--ATCTGTATGTTTGAAAcgcaatatata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TAGATTGGTATAATCAAGTA---CT---CTTTTTCAAAACAGATT--TTGT----AATGCATGAGTAGTGTT----A---------TAT-T-----C----T-----ATTT-GCATGTCATTT----------TTACAGA----GGA-TTAAGAATTA------TATA---------AAA-ACAGTTATCTTT------A--TAT----TAATCCAAGTTTGTATGAA-CTACTTAA--T--T--GA-TAAAAAAAATGACACCAAACGTAAGATA--AGAAATA---TGTCTGTT-T
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gaggttgaacttgtAAAAGTATC-----T--T--AA-TAAAC----TGACAGAAAACAAAGTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGTGTTTGA-ACAGAAAAA--CGAGACTATGACAATTGGCAGAAATCAATATTAAATCAAATGAAAT-AA------TATTGTTTA-ACTATA-TATTG---------ACAA-TATA-----T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaatatataacaataatatataagtcaatgttatcacaaaATGAAAT-AA------AATTGTTGA-AGTCTA-CACCGTTTAAA--TGTAA-TATAATTTACAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTCATGAATAATTA--T-T-TT-GTAA-AACAGAT-ATGTTAGCACACAGGTAC------------CGAA---GT---------GGTGT---AGTGTTT--GTAATACTGTT-AAATATTT-------AT-A-TGAC-----AT---A----TA--TGT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAGTAT-CAGTTTT----T-----ATTT-GAATGTCATTT----------ATACA-A----G--------ACTTA------TATACTG-----CAAA-G----------------------T----CAACCCAAGTATATTTAAAACTATTGAA--C--TGTTA-CAGAC----TGACAGCAAACAAATTATA--AGAAACC---TATCTATT-TACA--TATACAAAGCGTTTAA-ACAGAAAAA--CGAGTCTAtgatgtttgaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aggaaA--TACAA-TATA-----TAC-TCTCCAAGAT-CATTGTTGAAGTAGTAATTGATGAGTAAATC--C-T-TC-TTAA-AATAGATAATGTTAGCACAAAGAAAC------------C-AA---GT---------GGTGC---AGCTTTT--GTAATACTTTTAA--------------AT-ACTAACAGAAAAT---G----TA--TGTTA---CAACCAA--ATCTTTATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATTTTATTCAAT-------CCTGGAATGCAC--GATAAAATAAATCGAGCAGAGCAATATTCTATAGA-CATTTTTTTTCTTTTGAACTACAACCATATTTATTAAATGTA----------C-A-T---TTA-GT-GT-TGCA-ATGACTAAAC-AA------------ATAGGCTT-AAGGTAGA-AAAG-TG-AAGTTTGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTATCCAAGTTAGGTT--ATGT----AATACGTGCTGAGT----------------ATAT-A-----TA---T-----ATTT--------------------------A-A----GGTATTAAAACCTA------AACATTT-----TAAA-A--CGTATTATT------A--TTT----CAACCCAAGTATCTTTAAAATTATTGAA--A--T--GT-TAAA---------AGCAAACAAATTACATCATAAGTA---TTCCTGTT-CACATGTATACAAAGC--------CT--------------------CATGGATAGAAATCATTTGTAAATCAAATGAATT-AAAGCAGTAATT-CATG-AATAAATCATTTTTAGAA--T---A-TATA-----Tacaac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgactgtgATGA---ATTAA---AGCAGTAATTCATGAATAAATC--A-T-TT-TTAG-AATATAT-ATGT----AAACAAATAC------------CAAA---GT---------GGTGA---AGTGTTT--GTAATATTATT-A--------------AC-A-TGGC-----TT---A----TA--TGTAA---TAATTCA--ATCTTTATATTTGAAATgtaaacaaataccaaagtggtgaagtgtttgtaatattattaacatggcttatatgtaataattcaatctttatatttgaaatt
gi|30                         : tgactgtgacataattttattcaatcctggaatgcacgataaaataaatcgagcagagcaatattctatagacattttttttcttttgaactacaaccatatttattaaatgtacatttagtgttgcaatgactaaacaaataggcttaaggtagaaaagtgaagtttgaagcaaccgagcacacctatccaagttaggttatgtaatacgtgctgagtatatatatatttaaggtattaaaacctaaacattttaaaacgtattattatttcaacccaagtatctttaaaattattgaaatgttaaaagcaaacaaattacatcataagtattcctgttcacatgtatacaaagcctcatggatagaaatcatttgtaaatcaaTATCCAATGATGG----CAT--GATTAAATTACCAAAACAA--CAATAACTTATAGA-CACTT------------ACTACAACCATATTTATTAAATGTAAAAAT--ACACAA-A--ATTA--A-ATATATA-ATGGCTAGACTAAG--------------GACTT-GACGCAGATAAAG-TG-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atataatgttAA-TATA-----TAC-AC-CCGTGAT-CATTAT---AATAGCAATTGATGAGTAAATT--TATGTT-TTAA----AAAT-GTACAAGCACGCAtgtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taA-ACTGAAAA---CGTTTCTATGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATAAAACGAAcgca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-AGTCTA-CACTGTTAAAA--TGCAA-TATA-----TAC-TCTCTAT-AG-CATTG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gag--CGAGACTTTGGTCATTGATAGAAATCAATTGTAAATTAAATGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTA-GA-AT-TGCA-ATG----------GAATTTCTTAAAATAGGCTT-GATAAAGA-AAAG-TG-GAAATGGAAGCAACTGAGCA---CA---CCTTTTAAAAATATATT--TTGTTTGTAAAATATTCCGAGATCT----AGATGACGTGT-T-T-----T----T-----ATTT-------CGTTT----------AAACA-A----GGAATTAAGACCTACAAGTATATATCT-----GAAA-A--GTTATTAT-----------AC----CAACCCAGGTATGTTTAAAACTATTGAA--T--TGTTA-CAAAC----TGACATCAAACAAATTATA--AGAAACC---TGTCTGTT-TATA--TACACAAAAAGTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGCCTATGGTTATTGACAGAAAGCCATTGTAAATTAAATTAAAT-AA------TATTGTCTATAGTCCA-TACTGTTAAAA--TGCAG-TATA-----AAC-TCTCCAT-AT-CATTGT---AATAGTAATTAATGAGTTAATCTTC-T-TTATTAA-AATAAAT-ATATTAGCACACAGGTAC------------CTAA---GT---------GGTGC---AGCGTTT--ATAATATTTTT-A--------------A------AT-----AT---T----TA--TATAA---CA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAACTTAATTCAATATTTGA-----GAACGCACACGCATAAA--AC--AAGCGGAGCCAGACTGTATAGAACAGTAT-ATCTATTTAAATTACAACCATATTGATCAAATGTAA--GC--ACAC-A-TAGATT-C-A-G--TGCC-ATGACTAGACTAAGTGTTCTGTCACATAGGCTtgtt
gi|6                          :                                                                                 tcaaaacatttttagatctggtgatttgagcataatcgatttttaacatgaacttttaatgttataacattggatcaaatagtcttggctgaaaatataaagaaagcaaaaattatattaaaaaactaatacaatacgatattttcagcaattgaatagagtatgcataaaactaaatggcttacgtttgtttgagataaaattgatagcttatggctttacttcatgtatgtaaaacttggtcatgaagatgtaaatactacagtgttttgtcaaacgttaaagatagattttcagTAATT--GTATCCAATGTTGGAATTAAC--GGTTAAATAACTCAAGCAGAGCAAT-TTCTATAGA-CATTTCTGTTCCTTTACACTACAACTTTATTTATTAAAGATAAATAA--ACAC-A-A--ATTTCGA-GT-TGCA-ATGACCAGATT------TTTTTCGCATAGGCTT-GAAGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAACAAACGAGCA---CA---CAGTGCCTGGATAGCTC--ATGT----AATA------GAG--------------CGA----------------------ATTC-GAATTTCGTTT----------ATATA-A----GGACTTAAGACTTT------TATATTG-----TAAA-A--GTTATCATA------A--TAT----CAACCCAAGTATGTTTAAAACTATTAAAATT--T--CA-CAAAC----TGACAGCAAACAAATTATA--TGAAA-----TGTCTGTT-TATA--TATACAAAGCGTTTAA-ACTGAAAAT--CAAGTATATGGTCATTGATAGAAATCAATAGTAAATCAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acagaAGGGCTTTTTCGCATAGTCTT-GAGGTAGA-AAAT-TG-TAGATGGAAGCAACCGAGCA---CA---CCTTTTCAAGATATACT--ATGT----AATACGTGCGGAGTTCTGGAGA----ACGAGTAT-CATTT-T----T-----ATTT-GGATATCGTGT----------ATACA-A----GGATT---G---TA------TATGTTT-----TAAG-A--TTTATTATT------G--TAT----CAACTCAAGTATGTTTAAAACTATTGAAA-T--G--TAACAAAG----TAACAGCAAACATATTATA--AGAAACG---TGTCTGTT-TCCA--TTTACAGAGCTTTCAGTACTGAAAAA--CGAGTGTATGGTCTTTGGTAGAAATTAATTGTAAATGAAATGAAAT-AA------AATTATAAA-AGTATA-CACTGTTAATA--TGCAA-TATA-----TAC-TC-CCCAGAT-CATTGT---AGTAGTAATTGATGAGTAAATC--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caaatatttagagttcctttTAACTC--TTTCTAATCTTGGAATGCAC--TGTTAAATGACTCGAGCAAAGCAATATTCTATAGA--ATTTTTCTTCCTTTAAACAACAGCCGTATTTATTAAAGGTAAATGT--TCAC---T---TTACGGTGT-TGCACATAACCA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtcaaaacgattttgtatatggggaatttggcagaactgacttttgagaacaataatttgaatgctataacattttggcttaaaataatctcaggaagtagaaaatagaaataacatataagtctatgttatcagatattgatacttatccaaataaagcaaattgggtttctcttgtcagacaaactttataacttaccatttaactatgtatgtcaaagagttggaaacactgattgtttttattaaaccttaaaatgagattgagagaTAT-CA----T----T-----ATTTTAAAAGTTGTTTTTCATAAGTAATACA-AAAACGAACTTAAGACTTA------TATGTTT-------AT-A--GTTATTGTT------A--TAT----GATCCCAATTATGTTTAAAACTGTTGAA--T--TGTTA-CAAAC----TGACAGCAAACATATTATA--AGAAACA---TGTCTGTT-GACA--CATATAACACTTTTAA-ACTGAAAAA--CGAGTATATAGCCTTTGATAGAAATCAAATGTAAAACAAATGAAAC-AA------AATTGTTTG-AGCAAA-CACTTTTCAAA--TCAAA-TATA-----TAC-TT-CCATGAC-TATTGA---AGAAGTTATTGATAAAAAAATC--A-G-TT-TTAA-GATAAAT-ATGTTAGCACACATATAC------------CACA---GT---------GGTGC---AATGTTT--GTAATACTATT-A--------------AA-A-TGAC-----AT---A----TA--TCTGA------------------ATGTTTGAAATt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTGCAAATCAATTTTAGGCATGAAAATAGGCTGTCAAAACGATTTTGTGGAATAGGCGGAAACTGACTTTTTGACAACAAGAATTGTTAATGCTATAAACCTTTGGCTTAAACTAATCTCGGCAGGAAATAGAATAATATAAAAGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATTTAAATAAAACAAATTGGGCTTCTCTAATAATTTAGCGTTTTACTTTTTTGGCTTGGTCAAGATGTTGGACGCATTAACTTGTTTTATAAAACCCTACAATGAGACTAAGATATGACTGTGTCCAATCTTGGAATTCGCGATAGAA
Unaligned ( gi|19 ): TTTTCCAAGTAAATTTAAGGTATATAAAGTTAGTCAAAACGATTTTGTTTATGGGGAAATAAGCAGCAAAAAGTTTAATGCAGTGACATTTTAGCTTAAAATTATATCAGCGGAAATAGAAAATATATAAAATAAGATATATGTCGATGTTATCAGAAATTAAAGAGTATCGAAATAAAACTATTGAACTTCTCTTATCAGAGAGTCTTAGTAACTTAGGCTTTAACTTAATATATGGCTTGGT
Unaligned ( gi|20 ): CAATTTAAACATCAAAATATGTCAAAAACGAGTCTGTGTATATATATATGAAAGGACTTGGACAGAACTGACTCTGGCAACAAGAATTGCTTATGCTATAAAATAATCACTGCAGGAAACATACAAAATAAAAAGTTACAAATCTGGCTTTTCTTGTCGGAGTCCCAAAGACAATCTTAATAACTTAACAGTCAACTATGTATGGTTTGGTCAAAGAGTTGAGGACAC
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