lowQualScore : 1111 1 1 22222 1 8888888888 111 111 1 333333 11 3333333333 1 222222222222222222222 1111 1111111 22222222222
lowQualScore : 7777 5 7 22222 6 7 3 66 5 6 0 5 1 7777777777 5 1 0 8 666 666 5 6 5 1 111111 6 6 55 0 2 1111111111 7777 4 2 55 333333333333333333333 55 3 55 3 0000 1 4 33 7 2222222 66 1 66 88888888888
lowQualScore : .... . . ..... . . . .. . . . . . .......... . . . . ... ... . . . . ...... . . .. . . .......... .... . . .. ..................... .. . .. . .... . . .. . ....... .. . .. ...........
lowQualScore : 0000 0 0 66666 0 8 0 99 7 6 1 0 4 4444444444 4 7 5 2 111 111 0 0 1 0 222222 2 7 11 8 9 7777777777 7777 1 5 00 999999999999999999999 00 6 00 6 6666 4 9 99 0 0000000 11 0 11 44444444444
consensus : NTTTTTTTTCATGGAAT-TACGGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTC--CGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCATG----TATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTCAGCTGGT--ATAATAATATGT-AAAACAA-TATTTTTCATGAA-CAC---------TATTATA----CATGTACTT--AC-------A-T--G----T---GT--TGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCTTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATG--TACGTGAA--TAAA--------NTTTACTTACT
Reference ( gi|2 ) : ATTTTTTTTCATGGAATGTAAAGTGTATGAAAATTTAACAATGGATGTTTT--GGATGAAAATTATTTTGATTTAAGAGATACAAATACTTT-TCATATGTTAATGTCCAATGCTGATAAAACTGTCATACCGGTATACAAAATTGCAAGGTTCCTGTATGGGGCTTTCAACAAACAACATAGTTTCATATAGTTGTGAGGCTATAGTTTAGCCATT--ATAATGATATGT-AAAACAT-TATTTTTCATGAA-CAA---------TATTATA----CATATCCTT--AC-------A-T--A----T---GT--TGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTTTATTGTATATTTGTATGATGGGCTGGAGGCC-----TGTATG--TATGTGAA--TAGA--------ATTTACTTACT
gi|1 : TTTTTTTTCATGAAAATTGCGGTGTATGAAAATTTAAGAAAAGATATTTTTTGG-TGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACTAACATTTT-TTGTATGTTTATGTCTAGTTATAATAGAACTGTTATAT--GTATGCAAATGTGCTAGGTTTCTGTATAGGGATTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATAGAATTGTGAGATCAAAATATAGCTTAT--ATAATGACATGT-AAATCAC-TATTTTTCATGAA-CAC---------TGTTATT----CATGTACTT--AC-------C-T--G----T---GT--TGATCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTTCAGAGTAGGTGTGTA
gi|3 : attgggtgacatagaaattttggattatgtccagtttgttttcagagaaatttttttgtaattaaatatcttTTTTTTCATGGAATGTACAGTGAATGAAAATCTAAGAAAGGATGTTTC--CGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTAGGTTAATGTCCAATGATGATAAAACTGTCA------TATGCAAAATTGCAAGGTT-CTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATTTAATTGTGAAGCTATACTTCAGCTGGT--ATAATAATATGT-AAAACAA-TATTTTTCATGAA-C
gi|5 : aaaggtcgtcatattgggttagatagaaattttagattttgtccaatatgttctcaaagaaatattttggtaattgaatctgaatttcaAAT-TACAGTGTTTGAAAATTAAAGAAAGGATGTTTC--TGATGAAAATTGTTTTAATTTAAGAGACATAAACAC-TT-TCGTATGTAAATGTCCAATAATGAT-AAACTGTCA------TATGCACAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGTTTTCGAAAAACGAATTAGTTTAATATGATTGTGAG---ATA-------------ATAATGATATGT-AAAACAA-TATTTT-------------------------------CATGTACTT--AC-------A-T--A----T---AT--TGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCTTAGTGTA
gi|6 : AAAGGATGTTTT--TGGTGAAATTTATTTTAATTTAAGG----------------CATAGGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCATGC--------AAAATTGCGAAATTTCTG-----------------------TAGAT--ATATAATTGTGAGGCTATAGTTAAGCTGGT--ATAATAATATGT-AAAACAA-TATTTTTCATGAA-CAT---------TATTGTA----CATGTACTT--AC-------ATT--AATTTT---GT--TGGTCATTTTTT--G-TGT---ATGTTCTTATTGCATATTTGTATGATTGGTCGGAGGCC-----TATATG--TACGTGAA--TAcgtgaataaacatatttacttactt
gi|8 : gTTCT--GG-TGAACATTATTTTAATTTAAAGGACACAAACAAATT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCATGC--------AAAACTGCGATGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTTAAGTTATAGTTTAGCTGGT--ATAATAATATGTAAAAACAA-TATTTTTCATAAA-CAC---------TATTATG----CATATa
gi|4 : ggaaatAAATGTTTC-TCAAATG---AGGTTTGA-GATAATAAAACT----------CATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGCATTCGAAAAACGAAATAGTTAAATA-AATTGTCAGGCAATACTTCAGCTGGT--ATAATAATATGT-AAAACAA-TATTTTTCATGAA-CAC---------TATTATA----CATGTACTT--AC-------A-TTAA----TTTTGT--TGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCTTCTTGTATAGTTGTATGATGGGTCGGAGGCC-----TATTTG--TACGTGAA--TAAA--------CTTTTCTTACTa
gi|7 : tgcttttgaaaagtatcagtttttcaAAATACTTTGTC-TATGTTAATGTCCAACGATATTAAAATTGCCATA------TGCAAAATTGCGATGTTCCTTTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATTATTGTGAGGTTTTAGTTTAGCTGGT--ATAAAAAATTGTAAAAACAA-TA-ATTTAATGAA-CTC---------TAGTATA-----------TT--AC-------A-T--G----T---GT--TG-----TTATT--G-TG------------------TATTTGTGTCATGGGCCGGAGGCC-----TATATG--TACGTAAAATTACA--------ATTTATTtact
gi|14 : ATCGGACTTCCGAAGAACGAAATAGTTTAATGTAATTGTGAGGCTATAGTTTAACTGGTA-ATAAAAATATGT-AAAACAA-TATTTTCCATGAA-CAgt
gi|9 : cTTTAATATAATTGTGAGGCTATACTTCAGCTGTT--ATAATAATATGT-AAAACAA-TATTTTTCATGAA-CAC---------TATTATACATGCATGTACTT--AC-------ATT--AATTTT---GT--TGGTCA-TTCTT--G-----------------TGTATAGTTGTATGATGGGCGGGAGGCC-----AATATG--TTCGTGAA--TAAA--------CTTTACTTAtt
gi|16 : acTTTAATATAATTGTTAGGCTATATTTCAGCTGGT--ATAATAATATGT-AAATCAA-TGTTTTTAATGAA-CAC---------TA
gi|11 : TGCGATACTATAGTTTAGC--TTGCATAAT-ATACGT-AAAACAGACAGT----ATGAA-CAC---------TGTTATA----CATGTACTT--AC-------A-T--G----T---GT--ATGTCA-CTATT--GCTG----ATGGTCCC---GTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCT-----TATATGACCGTGTG-----------------TTTACTTAC
gi|10 : aT-AAAAAGT-TATTTT--------CAAAGT------TATCATA-----ATACCGTTGAACCGTATCAA-T--A----TT--GTGATGGTCA-TTCTT--G-TGT---GT-TCTTTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGTAGGCCTATTGTATATG--TATGTGAA--TAAA--------ATTTACTTACT
gi|12 : AAATAT-TCTCTTTCACAAA-TAAG--------TATAATG----CATGTACTT--GC-------A-T--G----T---GT--TGGTAA-TTCCTCAG-TTTCTCATGTTCTTATTGTATATTTTTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATG--TACGTGAA--taactgtgatatatac
gi|13 : agATTATTCATGAAACAAATTGAAAGCTGTTATA----CGTGTACTT--AC-------A-T--G----C---AT--TAGTCG-TTCTT-------------TTCTTATTGTATATGTGTATGATGGGTCAGAGGCC-----TCTATG--TACGTGAA--TAAAATAGACATATTTACTTACacaaatgttctaactttcttact
gi|15 : T--AC-------A-T--A----T---GT--TGGTCA-TTATT--G-TGT---ATGTTCTTATTGTATATTTGTAGGCTGGGCCGGAGGCC-----TATATG--TATGATAA--TAAA--------CTTTACTTc
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GAATGTTTTCGTAGTGCAAATTTGGATGTTTGACCGGAGACCTATATAAACGTGAATAATCT
Unaligned ( gi|18 ): AAAGGTCGTCATATTTGGTTAGATAGACATTTTTGATTTT
Alignments
lowQualScore : 222 11 3333333 22222 111111111
lowQualScore : 111 2 11 5 5 1 7777777 0 2 3 2 3 6 2 444 2 7777 55555 33 3 88888888888 44 3 99999 3 55 777777777
lowQualScore : ... . .. . . . ....... . . . . . . . ... . .... ..... .. . ........... .. . ..... . .. .........
lowQualScore : 000 0 55 1 7 7 5555555 2 2 8 2 3 2 9 777 9 1111 00000 66 3 44444444444 22 1 11111 6 00 111111111
consensus : NTTTTTTTTCATGGAA-TGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
Reference ( family-618 ) : NTTTTTTTTCATGGAA-T-TACGGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCC-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
gi|1 : TTTTTTTTCATGAAAAT-TGCGGTGTATGAAAATTTAAGAAAAGATATTTTTTGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACTAACATTTT-TTGTATGTTTATGTCTAGTTATAATAGAACTGTTATAT--GTATGCAAATGTGCTAGGTTTCTGTATAGGGATTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATAGAATTGTGAGATCAAAATATAGCTTAT-ATAATGACATGT-AAATCA-CTATT---TTTCATGAACAC-TGTTATT----CATGTACTTACC-----T-GTGTTGATCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--C-AGAGTAGGTGTGTA
gi|10 : attgggtgacatagaaattttggattatgtccagtttgttttcagagaaatttttttgtaattaaatatcttT---TATCAT-AATAC-CGTTGAA----C-CGTATCAATA-----TTGTGATGGTCA-TTCTT--G-TGT-----GTTCT--TTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGTAGGCCTATTGTATATGTATGTG-AA--TAAA--------ATTTACTTACT
gi|11 : taaaaagttattttcaaagTGCGATACTATAGTTTAGCTTGC-ATAATA-TACGT-AAAACAGACAGT-------ATGAACAC-TGTTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTATGTCA-CTATT--GCTG----ATGGTC------CCGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCT-----TATATGACCGTG-----T-----------GTTTACTTACtaactgtgatatatac
gi|12 : aA-ATATTCTCTTTCACAAATAAGTATAATG----CATGTACTTGCA-----T-GTGTTGGTAA-TTCCTCAG-TTTCTCATGTTCT--T-ATTGTATATTTTTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTGAAA--CAAA--------TGTT-CTAACT
gi|13 : agaT-GAAACA-A-ATT---------GAAAGC-TGTTATA----CGTGTACTTACA-----T-GCATTAGTCG-TTCTT-------------TTCT--T-ATTGTATATGTGTATGATGGGTCAGAGGCC-----TCTATGTACGTG-AA--TAAAATAGACATATTTACTTACttcttact
gi|14 : attattcaATCGGACTTCCGAAGAACGAAATAGTTTAATGTAATTGTGAGGCTATAGTTTAACTGGTAATAAAAATATGT-AAAACA-ATATT---TTCCATGAACAT-Tc
gi|15 : cTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTATT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTAGGCTGGGCCGGAGGCC-----TATATGTATGAT-AA--TAAA--------CTTTACTT
gi|16 : TTTAATATAATTGTTAGGCTATATTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAATCA-ATGTT---TTTAATGAACAC-TA
gi|17 : ---ATGTTTTCGT-AGTGCAAATTTGGATGTTTGACCGGAGACC-----TATATAAACGTG-AA--TAA
gi|2 : gaTTTTTTTTCATGGAA-TGTAAAGTGTATGAAAATTTAACAATGGATGTTTTG-GATGAAAATTATTTTGATTTAAGAGATACAAATACTTT-TCATATGTTAATGTCCAATGCTGATAAAACTGTCATACCGGTATACAAAATTGCAAGGTTCCTGTATGGGGCTTTCAACAAACAACATAGTTTCATATAGTTGTGAGGCTATAGTTTAGCCATT-ATAATGATATGT-AAAACA-TTATT---TTTCATGAACAA-TATTATA----CATATCCTTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCTGGAGGCC-----TGTATGTATGTG-AA--TAGA--------ATTTACTTACTtct
gi|3 : aTTTTTTCATGGAA-TGTACAGTGAATGAAAATCTAAGAAAGGATGTTTCC-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTAGGTTAATGTCCAATGATGATAAAACTGTCA------TATGCAAAATTGCAAGGTT-CTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATTTAATTGTGAAGCTATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAAC
gi|4 : aaaggtcgtcatattgggttagatagaaattttagattttgtccaatatgttctcaaagaaatattttggtaattgaatctgaatttcaGATAATAAAACT----------CATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGCATTCGAAAAACGAAATAGTTAAATA-AATTGTCAGGCAATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-CTTGTATAGTTGTATGATGGGTCGGAGGCC-----TATTTGTACGTG-AA--TAAA--------CTTTTCTTACT
gi|5 : tgcttttgaaaagtatcagtttttcaaaatgtttctcaaatgaggtttgaAA-T-TACAGTGTTTGAAAATTAAAGAAAGGATGTTTCT-GATGAAAATTGTTTTAATTTAAGAGACATAAACAC-TT-TCGTATGTAAATGTCCAATAATGAT-AAACTGTCA------TATGCACAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGTTTTCGAAAAACGAATTAGTTTAATATGATTGTGAG---ATA------------ATAATGATATGT-AAAACA-ATATT---TT----------------------CATGTACTTACA-----T-ATATTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-AGTGTAtact
gi|6 : GAAAGGATGTTTTT-GGTGAAATTTATTTTAATTTAAGG----------------CATAGGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAATTGCGAAATTTCTGT-------------------AGATA------TATAATTGTGAGGCTATAGTTAAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAT-TATTGTA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCATTTTTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGCATATTTGTATGATTGGTCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAcgtgaataaacatatttacttactt
gi|7 : AAATACTTTGTC-TATGTTAATGTCCAACGATATTAAAATTGCCAT------ATGCAAAATTGCGATGTTCCTTTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATTATTGTGAGGTTTTAGTTTAGCTGGT-ATAAAAAATTGTAAAAACA-ATA-A---TTTAATGAACTC-TAGTATA-----------TTACA-----T-GTGTTG--------------------------T--T-ATTGTGTATTTGTGTCATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTA-AAATTACA--------ATTTATT
gi|8 : GGAAATTTCT-GGTGAACATTATTTTAATTTAAAGGACACAAACAAATT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAACTGCGATGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTTAAGTTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGTAAAAACA-ATATT---TTTCATAAACAC-TATTATG----CATATAgt
gi|9 : TTTAATATAATTGTGAGGCTATACTTCAGCTGTT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATACATGCATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G--------------------TGTATAGTTGTATGATGGGCGGGAGGCC-----AATATGTTCGTG-AA--TAAA--------CTTTACTTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAAGGTCGTCATATTTGGTTAGATAGACATTTTTGATTTT
Alignments
lowQualScore : 3333333 22222 111111111
lowQualScore : 8 6 5 5 1 7777777 0 2 3 0 3 6 2 444 2 7777 55555 33 3 88888888888 44 3 99999 3 55 777777777
lowQualScore : . . . . . ....... . . . . . . . ... . .... ..... .. . ........... .. . ..... . .. .........
lowQualScore : 8 7 1 7 7 5555555 2 2 8 2 3 2 9 777 9 1111 00000 66 3 44444444444 22 1 11111 6 00 111111111
consensus : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
Reference ( family-618 ) : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
gi|1 : TTTTTTTTCATGAAAATTGCGGTGTATGAAAATTTAAGAAAAGATATTTTTTGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACTAACATTTT-TTGTATGTTTATGTCTAGTTATAATAGAACTGTTATAT--GTATGCAAATGTGCTAGGTTTCTGTATAGGGATTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATAGAATTGTGAGATCAAAATATAGCTTAT-ATAATGACATGT-AAATCA-CTATT---TTTCATGAACAC-TGTTATT----CATGTACTTACC-----T-GTGTTGATCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--C-AGAGTAGGTGTGTA
gi|10 : attgggtgacatagaaattttggattatgtccagtttgttttcagagaaatttttttgtaattaaatatcttT---TATCAT-AATAC-CGTTGAA----C-CGTATCAATA-----TTGTGATGGTCA-TTCTT--G-TGT-----GTTCT--TTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGTAGGCCTATTGTATATGTATGTG-AA--TAAA--------ATTTACTTACT
gi|11 : taaaaagttattttcaaagTGCGATACTATAGTTTAGCTTGC-ATAATA-TACGT-AAAACAGACAGT-------ATGAACAC-TGTTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTATGTCA-CTATT--GCTG----ATGGTC------CCGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCT-----TATATGACCGTG-----T-----------GTTTACTTACtaactgtgatatatac
gi|12 : aA-ATATTCTCTTTCACAAATAAGTATAATG----CATGTACTTGCA-----T-GTGTTGGTAA-TTCCTCAG-TTTCTCATGTTCT--T-ATTGTATATTTTTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTGAAA--CAAA--------TGTT-CTAACT
gi|13 : agaT-GAAACA-A-ATT---------GAAAGC-TGTTATA----CGTGTACTTACA-----T-GCATTAGTCG-TTCTT-------------TTCT--T-ATTGTATATGTGTATGATGGGTCAGAGGCC-----TCTATGTACGTG-AA--TAAAATAGACATATTTACTTACttcttact
gi|14 : attattcaATCGGACTTCCGAAGAACGAAATAGTTTAATGTAATTGTGAGGCTATAGTTTAACTGGTAATAAAAATATGT-AAAACA-ATATT---TTCCATGAACAT-Tc
gi|15 : cTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTATT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTAGGCTGGGCCGGAGGCC-----TATATGTATGAT-AA--TAAA--------CTTTACTT
gi|16 : TTTAATATAATTGTTAGGCTATATTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAATCA-ATGTT---TTTAATGAACAC-TA
gi|17 : ---ATGTTTTCGT-AGTGCAAATTTGGATGTTTGACCGGAGACC-----TATATAAACGTG-AA--TAA
gi|2 : gaTTTTTTTTCATGGAATGTAAAGTGTATGAAAATTTAACAATGGATGTTTTG-GATGAAAATTATTTTGATTTAAGAGATACAAATACTTT-TCATATGTTAATGTCCAATGCTGATAAAACTGTCATACCGGTATACAAAATTGCAAGGTTCCTGTATGGGGCTTTCAACAAACAACATAGTTTCATATAGTTGTGAGGCTATAGTTTAGCCATT-ATAATGATATGT-AAAACA-TTATT---TTTCATGAACAA-TATTATA----CATATCCTTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCTGGAGGCC-----TGTATGTATGTG-AA--TAGA--------ATTTACTTACTtct
gi|3 : aTTTTTTCATGGAATGTACAGTGAATGAAAATCTAAGAAAGGATGTTTCC-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTAGGTTAATGTCCAATGATGATAAAACTGTCA------TATGCAAAATTGCAAGGTT-CTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATTTAATTGTGAAGCTATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAAC
gi|4 : aaaggtcgtcatattgggttagatagaaattttagattttgtccaatatgttctcaaagaaatattttggtaattgaatctgaatttcaGATAATAAAACT----------CATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGCATTCGAAAAACGAAATAGTTAAATA-AATTGTCAGGCAATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-CTTGTATAGTTGTATGATGGGTCGGAGGCC-----TATTTGTACGTG-AA--TAAA--------CTTTTCTTACT
gi|5 : tgcttttgaaaagtatcagtttttcaaaatgtttctcaaatgaggtttgaAAT-TACAGTGTTTGAAAATTAAAGAAAGGATGTTTCT-GATGAAAATTGTTTTAATTTAAGAGACATAAACAC-TT-TCGTATGTAAATGTCCAATAATGAT-AAACTGTCA------TATGCACAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGTTTTCGAAAAACGAATTAGTTTAATATGATTGTGAG---ATA------------ATAATGATATGT-AAAACA-ATATT---TT----------------------CATGTACTTACA-----T-ATATTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-AGTGTAtact
gi|6 : GAAAGGATGTTTTT-GGTGAAATTTATTTTAATTTAAGG----------------CATAGGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAATTGCGAAATTTCTGT-------------------AGATA------TATAATTGTGAGGCTATAGTTAAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAT-TATTGTA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCATTTTTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGCATATTTGTATGATTGGTCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAcgtgaataaacatatttacttactt
gi|7 : AAATACTTTGTC-TATGTTAATGTCCAACGATATTAAAATTGCCAT------ATGCAAAATTGCGATGTTCCTTTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATTATTGTGAGGTTTTAGTTTAGCTGGT-ATAAAAAATTGTAAAAACA-ATA-A---TTTAATGAACTC-TAGTATA-----------TTACA-----T-GTGTTG--------------------------T--T-ATTGTGTATTTGTGTCATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTA-AAATTACA--------ATTTATT
gi|8 : GGAAATTTCT-GGTGAACATTATTTTAATTTAAAGGACACAAACAAATT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAACTGCGATGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTTAAGTTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGTAAAAACA-ATATT---TTTCATAAACAC-TATTATG----CATATAgt
gi|9 : TTTAATATAATTGTGAGGCTATACTTCAGCTGTT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATACATGCATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G--------------------TGTATAGTTGTATGATGGGCGGGAGGCC-----AATATGTTCGTG-AA--TAAA--------CTTTACTTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAAGGTCGTCATATTTGGTTAGATAGACATTTTTGATTTT
Alignments
lowQualScore : 3333333 22222 111111111
lowQualScore : 8 6 5 5 1 7777777 0 2 3 0 3 6 2 444 2 7777 55555 33 3 88888888888 44 3 99999 3 55 777777777
lowQualScore : . . . . . ....... . . . . . . . ... . .... ..... .. . ........... .. . ..... . .. .........
lowQualScore : 8 7 1 7 7 5555555 2 2 8 2 3 2 9 777 9 1111 00000 66 3 44444444444 22 1 11111 6 00 111111111
consensus : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
Reference ( family-618 ) : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
gi|1 : TTTTTTTTCATGAAAATTGCGGTGTATGAAAATTTAAGAAAAGATATTTTTTGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACTAACATTTT-TTGTATGTTTATGTCTAGTTATAATAGAACTGTTATAT--GTATGCAAATGTGCTAGGTTTCTGTATAGGGATTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATAGAATTGTGAGATCAAAATATAGCTTAT-ATAATGACATGT-AAATCA-CTATT---TTTCATGAACAC-TGTTATT----CATGTACTTACC-----T-GTGTTGATCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--C-AGAGTAGGTGTGTA
gi|10 : attgggtgacatagaaattttggattatgtccagtttgttttcagagaaatttttttgtaattaaatatcttT---TATCAT-AATAC-CGTTGAA----C-CGTATCAATA-----TTGTGATGGTCA-TTCTT--G-TGT-----GTTCT--TTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGTAGGCCTATTGTATATGTATGTG-AA--TAAA--------ATTTACTTACT
gi|11 : taaaaagttattttcaaagTGCGATACTATAGTTTAGCTTGC-ATAATA-TACGT-AAAACAGACAGT-------ATGAACAC-TGTTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTATGTCA-CTATT--GCTG----ATGGTC------CCGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCT-----TATATGACCGTG-----T-----------GTTTACTTACtaactgtgatatatac
gi|12 : aA-ATATTCTCTTTCACAAATAAGTATAATG----CATGTACTTGCA-----T-GTGTTGGTAA-TTCCTCAG-TTTCTCATGTTCT--T-ATTGTATATTTTTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTGAAA--CAAA--------TGTT-CTAACT
gi|13 : agaT-GAAACA-A-ATT---------GAAAGC-TGTTATA----CGTGTACTTACA-----T-GCATTAGTCG-TTCTT-------------TTCT--T-ATTGTATATGTGTATGATGGGTCAGAGGCC-----TCTATGTACGTG-AA--TAAAATAGACATATTTACTTACttcttact
gi|14 : attattcaATCGGACTTCCGAAGAACGAAATAGTTTAATGTAATTGTGAGGCTATAGTTTAACTGGTAATAAAAATATGT-AAAACA-ATATT---TTCCATGAACAT-Tc
gi|15 : cTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTATT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTAGGCTGGGCCGGAGGCC-----TATATGTATGAT-AA--TAAA--------CTTTACTT
gi|16 : TTTAATATAATTGTTAGGCTATATTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAATCA-ATGTT---TTTAATGAACAC-TA
gi|17 : ---ATGTTTTCGT-AGTGCAAATTTGGATGTTTGACCGGAGACC-----TATATAAACGTG-AA--TAA
gi|2 : gaTTTTTTTTCATGGAATGTAAAGTGTATGAAAATTTAACAATGGATGTTTTG-GATGAAAATTATTTTGATTTAAGAGATACAAATACTTT-TCATATGTTAATGTCCAATGCTGATAAAACTGTCATACCGGTATACAAAATTGCAAGGTTCCTGTATGGGGCTTTCAACAAACAACATAGTTTCATATAGTTGTGAGGCTATAGTTTAGCCATT-ATAATGATATGT-AAAACA-TTATT---TTTCATGAACAA-TATTATA----CATATCCTTACA-----T-ATGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCTGGAGGCC-----TGTATGTATGTG-AA--TAGA--------ATTTACTTACTtct
gi|3 : aTTTTTTCATGGAATGTACAGTGAATGAAAATCTAAGAAAGGATGTTTCC-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTAGGTTAATGTCCAATGATGATAAAACTGTCA------TATGCAAAATTGCAAGGTT-CTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATTTAATTGTGAAGCTATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAAC
gi|4 : aaaggtcgtcatattgggttagatagaaattttagattttgtccaatatgttctcaaagaaatattttggtaattgaatctgaatttcaGATAATAAAACT----------CATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGCATTCGAAAAACGAAATAGTTAAATA-AATTGTCAGGCAATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-CTTGTATAGTTGTATGATGGGTCGGAGGCC-----TATTTGTACGTG-AA--TAAA--------CTTTTCTTACT
gi|5 : tgcttttgaaaagtatcagtttttcaaaatgtttctcaaatgaggtttgaAAT-TACAGTGTTTGAAAATTAAAGAAAGGATGTTTCT-GATGAAAATTGTTTTAATTTAAGAGACATAAACAC-TT-TCGTATGTAAATGTCCAATAATGAT-AAACTGTCA------TATGCACAATTGCGAGGTTCCTGTTTAGGGTTTTCGAAAAACGAATTAGTTTAATATGATTGTGAG---ATA------------ATAATGATATGT-AAAACA-ATATT---TT----------------------CATGTACTTACA-----T-ATATTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-AGTGTAtact
gi|6 : GAAAGGATGTTTTT-GGTGAAATTTATTTTAATTTAAGG----------------CATAGGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAATTGCGAAATTTCTGT-------------------AGATA------TATAATTGTGAGGCTATAGTTAAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAT-TATTGTA----CATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCATTTTTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGCATATTTGTATGATTGGTCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAcgtgaataaacatatttacttactt
gi|7 : AAATACTTTGTC-TATGTTAATGTCCAACGATATTAAAATTGCCAT------ATGCAAAATTGCGATGTTCCTTTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATTATTGTGAGGTTTTAGTTTAGCTGGT-ATAAAAAATTGTAAAAACA-ATA-A---TTTAATGAACTC-TAGTATA-----------TTACA-----T-GTGTTG--------------------------T--T-ATTGTGTATTTGTGTCATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTA-AAATTACA--------ATTTATT
gi|8 : GGAAATTTCT-GGTGAACATTATTTTAATTTAAAGGACACAAACAAATT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----G----CAAAACTGCGATGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTTAAGTTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGTAAAAACA-ATATT---TTTCATAAACAC-TATTATG----CATATAgt
gi|9 : TTTAATATAATTGTGAGGCTATACTTCAGCTGTT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATACATGCATGTACTTACATTAATT-TTGTTGGTCA-TTCTT--G--------------------TGTATAGTTGTATGATGGGCGGGAGGCC-----AATATGTTCGTG-AA--TAAA--------CTTTACTTA
blockSeqs : G . T G A TACCGGT A G A A G CTC G CATG TTAAT TG T CAGTTTCTCA CG T . A AT ATAGACATA
blockSeqs : G . T . G TG A G . A . . . . TTAAT G . GCTGA . . . . . G
blockSeqs : . . T . G TG A T . . . . . . TTAAT G . GTGTA . . . . . T
blockSeqs : . A . A T T G . . . . . . . G . GTGTA . . . . . C
blockSeqs : . . . G C T C . . . . . . . A . GTGTA . . . . . A
blockSeqs : . . . T A C . . . . . . . A . GTGTA . . . . . C
blockSeqs : T A G . . . . . . . T . GTGTA . . . . . A
blockSeqs : . G . . . . . . . A . GTGT . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . T . G . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : T****** *****
originalCons : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT----GTATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
finalCons : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT------ATGCAAAATTGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-GTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAAGGTCGTCATATTTGGTTAGATAGACATTTTTGATTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 111111111
lowQualScore : 8 6 77 1 7777777 888 5 0 2 3 0 3 6 2 444 2 7777 9999999999999 3 88888888888 44 3 99999 3 55 777777777
lowQualScore : . . .. . ....... ... . . . . . . . . ... . .... ............. . ........... .. . ..... . .. .........
lowQualScore : 8 7 11 7 6666666 888 0 2 2 8 2 3 2 9 777 9 1111 6666666666666 3 44444444444 22 1 11111 6 00 111111111
consensus : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCATA------TGCA---AAAT-TGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-G-----TGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
Reference ( family-618 ) : NTTTTTTTTCATGGAATGTACAGTGTATGAAAATTTAAGAAAGGATGTTTCT-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCATA------TGCA---AAAT-TGCGAGGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTGAGGCTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-G-----TGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAA--------NTTTACTTACT
gi|1 : TTTTTTTTCATGAAAATTGCGGTGTATGAAAATTTAAGAAAAGATATTTTTTGGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACTAACATTTT-TTGTATGTTTATGTCTAGTTATAATAGAACTGTTATA------TGTATGCAAATGTGCTAGGTTTCTGTATAGGGATTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATAGAATTGTGAGATCAAAATATAGCTTAT-ATAATGACATGT-AAATCA-CTATT---TTTCATGAACAC-TGTTATT----CATGTACTTACC-----T-G-----TGTTGATCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--C-AGAGTAGGTGTGTA
gi|10 : attgggtgacatagaaattttggattatgtccagtttgttttcagagaaatttttttgtaattaaatatcttT---TATCAT-AATAC-CGTTGAA----C-CGTATCAATA-----TTG-----TGATGGTCA-TTCTT--G-TGT-----GTTCT--TTATTGTATATTTGTATGATGGGCCGTAGGCCTATTGTATATGTATGTG-AA--TAAA--------ATTTACTTACT
gi|11 : taaaaagttattttcaaagTGCGATACTATAGTTTAGCTTGC-ATAATA-TACGT-AAAACAGACAGT-------ATGAACAC-TGTTATA----CATGTACTTACA-----T-G-----TGTATGTCA-CTATT--GCTG----ATGGTC------CCGTATATTTGTATGATGGGCCGGAGGCT-----TATATGACCGTG-----T-----------GTTTACTTACtaactgtgatatatac
gi|12 : aA-ATATTCTCTTTCACAAATAAGTATAATG----CATGTACTTGCA-----T-G-----TGTTGGTAA-TTCCTCAG-TTTCTCATGTTCT--T-ATTGTATATTTTTATGATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTGAAA--CAAA--------TGTT-CTAACT
gi|13 : agaT-GAAACA-A-ATT---------GAAAGC-TGTTATA----CGTGTACTTACA-----T-G-----CATTAGTCG-TTCTT-------------TTCT--T-ATTGTATATGTGTATGATGGGTCAGAGGCC-----TCTATGTACGTG-AA--TAAAATAGACATATTTACTTACttcttact
gi|14 : attattcaATCGGACTTCCGAAGAACGAAATAGTTTAATGTAATTGTGAGGCTATAGTTTAACTGGTAATAAAAATATGT-AAAACA-ATATT---TTCCATGAACAT-Tc
gi|15 : cTACA-----T-A-----TGTTGGTCA-TTATT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGTATATTTGTAGGCTGGGCCGGAGGCC-----TATATGTATGAT-AA--TAAA--------CTTTACTT
gi|16 : TTTAATATAATTGTTAGGCTATATTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAATCA-ATGTT---TTTAATGAACAC-TA
gi|17 : ---ATGTTTTCGT-AGTGCAAATTTGGATGTTTGACCGGAGACC-----TATATAAACGTG-AA--TAA
gi|2 : gaTTTTTTTTCATGGAATGTAAAGTGTATGAAAATTTAACAATGGATGTTTTG-GATGAAAATTATTTTGATTTAAGAGATACAAATACTTT-TCATATGTTAATGTCCAATGCTGATAAAACTGTCATACCGGTATACA---AAAT-TGCAAGGTTCCTGTATGGGGCTTTCAACAAACAACATAGTTTCATATAGTTGTGAGGCTATAGTTTAGCCATT-ATAATGATATGT-AAAACA-TTATT---TTTCATGAACAA-TATTATA----CATATCCTTACA-----T-A-----TGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTTT--T-ATTGTATATTTGTATGATGGGCTGGAGGCC-----TGTATGTATGTG-AA--TAGA--------ATTTACTTACTtct
gi|3 : aTTTTTTCATGGAATGTACAGTGAATGAAAATCTAAGAAAGGATGTTTCC-GGTGAAAATTATTTTAATTTAAGAGACACAAACACTTT-TCGTAGGTTAATGTCCAATGATGATAAAACTGTCATA------TGCA---AAAT-TGCAAGGTT-CTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATTTAATTGTGAAGCTATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAAC
gi|4 : aaaggtcgtcatattgggttagatagaaattttagattttgtccaatatgttctcaaagaaatattttggtaattgaatctgaatttcaGATAATAAAACT----CA------TGCA---AAAT-TGCGAGGTTCCTGTTTAGGGCATTCGAAAAACGAAATAGTTAAATA-AATTGTCAGGCAATACTTCAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATA----CATGTACTTACA-----T-TAATTTTGTTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-CTTGTATAGTTGTATGATGGGTCGGAGGCC-----TATTTGTACGTG-AA--TAAA--------CTTTTCTTACT
gi|5 : tgcttttgaaaagtatcagtttttcaaaatgtttctcaaatgaggtttgaAAT-TACAGTGTTTGAAAATTAAAGAAAGGATGTTTCT-GATGAAAATTGTTTTAATTTAAGAGACATAAACACTTT--CGTATGTAAATGTCCAATAATGATAAA-CTGTCATA------TGCA---CAAT-TGCGAGGTTCCTGTTTAGGGTTTTCGAAAAACGAATTAGTTTAATATGATTGTGAG---ATA------------ATAATGATATGT-AAAACA-ATATT---TT----------------------CATGTACTTACA-----T-A-----TATTGGTCA-TTCTT--G-TGT---ATGTTCT--T-AGTGTAtact
gi|6 : GAAAGGATGTTTTT-GGTGAAATTTATTTTAATTTAAGG----------------CATAGGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT--------GCA---AAAT-TGCGAAATTTCTGT-------------------AGATA------TATAATTGTGAGGCTATAGTTAAGCTGGT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAT-TATTGTA----CATGTACTTACATTAATT-T-----TGTTGGTCATTTTTT--G-TGT---ATGTTCT--T-ATTGCATATTTGTATGATTGGTCGGAGGCC-----TATATGTACGTG-AA--TAAcgtgaataaacatatttacttactt
gi|7 : AAATACTTTGTC-TATGTTAATGTCCAACGATATTAAAATTGCCATA------TGCA---AAAT-TGCGATGTTCCTTTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATTATTGTGAGGTTTTAGTTTAGCTGGT-ATAAAAAATTGTAAAAACA-ATA-A---TTTAATGAACTC-TAGTATA-----------TTACA-----T-G-----TGTTG--------------------------T--T-ATTGTGTATTTGTGTCATGGGCCGGAGGCC-----TATATGTACGTA-AAATTACA--------ATTTATT
gi|8 : GGAAATTTCT-GGTGAACATTATTTTAATTTAAAGGACACAAACAAATT-TCGTATGTTAATGTCCAATGATAATAAAACTGTCAT--------GCA---AAAC-TGCGATGTTCCTGTATAGGGCTTTCGAAAAACGAAATAGTTTAATATAATTGTTAAGTTATAGTTTAGCTGGT-ATAATAATATGTAAAAACA-ATATT---TTTCATAAACAC-TATTATG----CATATAgt
gi|9 : TTTAATATAATTGTGAGGCTATACTTCAGCTGTT-ATAATAATATGT-AAAACA-ATATT---TTTCATGAACAC-TATTATACATGCATGTACTTACATTAATT-T-----TGTTGGTCA-TTCTT--G--------------------TGTATAGTTGTATGATGGGCGGGAGGCC-----AATATGTTCGTG-AA--TAAA--------CTTTACTTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAAGGTCGTCATATTTGGTTAGATAGACATTTTTGATTTT