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gi|8 : tccttttgacaaaccctagtacctgccgataatatagtgttacttcaaatgaagtcaatagcacacttttcattctttcccaatttaaaaaaaGTGTACTTTAAAAAT--ATATACATAT--A-GTATATAAATAGCAATATACTTAAGTATAGGGCTATATGGTTTATCAATATCAGTAAATACTACTGCATAATGGTGATATAATATGT-ATATAATCGTCAT--A--TATCATtatatacatatagtatataaatagcaatatacttaagtatagggctatatggtttatcaatatcagtaaatactactgcataatggtgatataatatgtatataatcgtcatatatcat
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-616 ) : TTAAATAAACCATCTACTTGCGTAGCTCAGTCTATTATATAACGGTACCTGCCGATATATCATAAATAAAAATATAT----GTACACTTTAAGAAGATTTTTTATTNCNTCTTGCGTGTAC----AAAATGAATATACAAATTAATGTATATAAATAACAATGTACTTATGTACGGGGTTATATGGTTCACCATTAACAGTAAACGCTACTGTATAATGGTTATAGGGNATGTCAAACGAT-GTTAT--A--TATCATGGGCATTCAATATAGAGCTACGCAAGACTATTAACTAAAATAGACTAATATACTAAACACAGTTCATTTAAA-TAAANGATACCTGTGCAGCCAAATATCAATTTAAGTCACCTTTACAATACCAACAACAATAATAATACTT-GTTGAGGGTTTTACGGCGTACTCTA-AGTTTGTTGATATTCTTATATTGACAATTACTGTTNGTATGCGGTATAAACGGTCGCTAACGATATTGTCGTACAAATAAAATTTTACCATAGCAACCGAGCACAATTAGTGTGCACA----GATA-TACAATCAACAGAANTNANTTCTGTTGAAGGTT--CATAGTTGGGTCGGA-T-CCACTTTCGATACCATC-AA-GCAAATTTATTCGCGCTNTAAGCAGAGGTGTCTGGCCTAACATATTGGTTTTACAC-A-AGCAAACAACCATAGTNGCACCTTATACACTCATAACAAGCTACTGG-TT--AACCCATCATAT----GGCTGCACAA-GT-ANAGTAAATAAATC---ATTAACAAGTCATTANTTATTAATCGTCTATTCNTAGTCGGATCANA-AAT-ATAGTCTCATAATNAG-CAAT-TGT-A-T--TAAATATAAG--TATA-AATTTA--AATA--TTCAG-AAATACTCGAACT----ANTAGT----TAAT-A-GTATATAATCGT-CATCNATCA----TCANTCATC---TATCATTCATACAAATGTTAN-AATAATCATCGATNTAT-TTT-TAATAA-TCATCTTNTCCTGCTCGCCAAAATGAC-TAGTTCAAAGCGCGAGGGTAAACAAANACTAATACATACATGCAAACTGTATAGCGTATACATGTACTTNNAAATATGGTTGA
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gi|16 : -TCAACATTTTCTGTTTGCCAAACCGAC-TTGTTTAAAGCGCGAATGTACACAAATACAAA-ACAT---TGCA--TTATATAACGTATACATGTACTTACAAATATGGTTGA
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gi|20 : taacttaaaatagtttatttaaataaatgataccaatgctgccaaatatcaatttaggtcaactttacagtaccaacaacaatattaaaattttgttgagagtttgacagcatactttatagtttgttgatattcttatgttgacaattacttatagtatgctgtataaaaggttacaaacaacattgtcatattaataaaattataccattgtaacctaacacaactagtgtgaacagatactacaatcaatagaattaaattttattgaaggttaacacagttaggtcaaattccacctatactataagcaaatttattcgcactttaagtggaggtgtttggctaatatattggttttacacatagcaaacaaccatagttgactcaatttaatacttgaagttgttaagcaccttcagtgtctcagacctgatgggcagattaggataagttgACAAAAATATACTAATAAACTAAACATAGTTCATTTAAA-TAAATGATTCATGTACAGCTAAAGATCAATTTAAGTCAC
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|20 : taacttaaaatagtttatttaaataaatgataccaatgctgccaaatatcaatttaggtcaactttacagtaccaacaacaatattaaaattttgttgagagtttgacagcatactttatagtttgttgatattcttatgttgacaattacttatagtatgctgtataaaaggttacaaacaacattgtcatattaataaaattataccattgtaacctaacacaactagtgtgaacagatactacaatcaatagaattaaattttattgaaggttaacacagttaggtcaaattccacctatactataagcaaatttattcgcactttaagtggaggtgtttggctaatatattggttttacacatagcaaacaaccatagttgactcaatttaatacttgaagttgttaagcaccttcagtgtctcagacctgatgggcagattaggataagttgACAAAAATATACTAATAAACTAAACATAGTTCATTTAAA-TAAATGATTCATGTACAGCTAAAGATCAATTTAAGTCAC
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lowQualScore : 5 5 3333 55 0 0 3333 0 3 3 7 7 0 7 7 3 77777 2 0 4 8 4 6 44 0 7777 7 000 0 7 7 7 7 3333 3 0 0 0 88 00 55555 222 2 555555 2 5 0 5 2 7777777777 8 7 44 7 9 4 11111 2 6 6666 0 444444 222222222222222222222 0 4 99 3333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 99 0 00000 0 00000 99 99 4444444444444444444444444444444444444444444 33333 1 7 9 0 7 3 6 11111111111 0 88 88 33 7 9 0 7 2 5 00 7 7 0 7 7 2 5 00 000
consensus : TTAAATAAACCATCTACTTGCGTAGCTCAGTCTATTATATAACGGTACCTGCCGATATATCATAAATAAAAATATAT----GTACACTTTAAGAAGATTTTTTATTNCNTCTTGCGTGTAC----AAAATGAATATACAAATTAATGTATATAAATAACAATGTACTTATGTACGGGGTTATATGGTTCACCATTAACAGTAAACGCTACTGTATAATGGTTATAGGGNATGTCAAACGAT-GTTAT--A--TATCATGGGCATTCAATATAGAGCTACGCAAGACTATTAACTAAAATAGACTAATATACTAAACACAGTTCATTTAAA-TAAANGATACCTGTGCAGCCAAATATCAATTTAAGTCACCTTTACAATACCAACAACAATAATAATACTT-GTTGAGGGTTTTACGGCGTACTCTA-AGTTTGTTGATATTCTTATATTGACAATTACTGTTNGTATGCGGTATAAACGGTCGCTAACGATATTGTCGTACAAATAAAATTTTACCATAGCAACCGAGCACAATTAGTGTGCACA----GATA-TACAATCAACAGAANTNANTTCTGTTGAAGGTT--CATAGTTGGGTCGGA-T-CCACTTTCGATACCATC-AA-GCAAATTTATTCGCGCTNTAAGCAGAGGTGTCTGGCCTAACATATTGGTTTTACAC-A-AGTAAACAACCATAGTTGCACCTTATACACTCATAATAAGCGATTGGCTTA--A--TATTACATGGCTGCATANGGT----T-AA------TAGAT---TATTAAC-AG-T-ATTA-ATGATTAATCNTCTAT--TT-A--GT----CGGATCANA--AT---------ATA-GTC---T-A-TAATCANC-AATC-G-T-A-TTAAAT--AT-A----TA-ATAAG-T--TA--AATAT--CCAN--AAATACTCGAACT----ANTAGT----TAAT-A-GTATATAAT--AG-TCATCAA-TCATCAATCATCTA-TCATTCATACAA-TT---CAA--TAATCATCAATTTAT--TTT-TAATAA-TCATCTTNTCCTGCTCGCCAAAATGAC-TAGTTCAAAGCGCGAGGGTAAACAAANACTAATACATACATGCAAACTGTATAGCGTATACATGTACTTNNAAATATGGTTGA
Reference ( family-616 ) : TTAAATAAACCATCTACTTGCGTAGCTCAGTCTATTATATAACGGTACCTGCCGATATATCATAAATAAAAATATAT----GTACACTTTAAGAAGATTTTTTATTNCNTCTTGCGTGTAC----AAAATGAATATACAAATTAATGTATATAAATAACAATGTACTTATGTACGGGGTTATATGGTTCACCATTAACAGTAAACGCTACTGTATAATGGTTATAGGGNATGTCAAACGAT-GTTAT--A--TATCATGGGCATTCAATATAGAGCTACGCAAGACTATTAACTAAAATAGACTAATATACTAAACACAGTTCATTTAAA-TAAANGATACCTGTGCAGCCAAATATCAATTTAAGTCACCTTTACAATACCAACAACAATAATAATACTT-GTTGAGGGTTTTACGGCGTACTCTA-AGTTTGTTGATATTCTTATATTGACAATTACTGTTNGTATGCGGTATAAACGGTCGCTAACGATATTGTCGTACAAATAAAATTTTACCATAGCAACCGAGCACAATTAGTGTGCACA----GATA-TACAATCAACAGAANTNANTTCTGTTGAAGGTT--CATAGTTGGGTCGGA-T-CCACTTTCGATACCATC-AA-GCAAATTTATTCGCGCTNTAAGCAGAGGTGTCTGGCCTAACATATTGGTTTTACAC-A-AGTAAACAACCATAGTTGCACCTTATACACTNATAATAAGCGATTGGCTTA--A--TATTACATGGCTGCATACGGT----T-AA------TAGAT---TATTAACNAG-T-ATTA-ATGATTAATCNTCTAT--TT-A--GT----CGGATCANA--AT---------ATA-GTC---T-A-TAATCANC-AATC-G-T-A-TTAAGT--AT-A----TA-ATAAG-T--TA--AATAT--CCAN--AAATACTCGAACT----ANTAGT----TAAT-A-GTATATAAT--AG-TCATCAA-TCATCAATCATCTA-TCATTCATACAA-TT---CAA--TAATCATCGATTTAT--TTT-TAATAA-TCATCTTNTCCTGCTCGCCAAAATGAC-TAGTTCAAAGCGCGAGGGTAAACAAANACTAATACATACATGCAAACTGTATAGCGTATACATGTACTTNNAAATATGGTTGA
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