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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): CTTGACGTATCTTGAACCCTATGTGGGATTTTTTATCCACAGTATAACATTGTGACAGCTTCAGTTTA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|19 ): TGTATCATGGCTCGGTGTTGATTTTTCTTTTCTCCCCTATCAGACAGTGATATCCTGGTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGG
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consensus : CTCACATG-GNT--AAAA-A--G---A---C---A-T---A--A-A-AT-------CAC----A-TG-TTG-ATATCAT-T---ATTCTGACGT-A-NN-T--CTA--GCT-CT--ATTTTA----CT-G---AGT-TTTCTACGACA-------AATTC-AAGTTG--TAATATA-TTT-T-G--TAGG-CG---AGAAAA-T-AAA--TC------TAT----AACG-ACT-T---A----TG---A-GT--TGTGTATAAGGAAATCCAAC-CCTCGGGC------C--AAGAT----A-----CG--A-G------------C--AAAGAACTCGGCAGAGCCTCGTTC-TTT-GCACGT--ATC----T--T-----TA----ACCCTCGGG-TGGGA--TT-CC-T--T-AT-CCACAACGCAA--CGTCGTTACA--G-----ATTCACTTTAT
Reference ( family-4808 ) : CTCACATG-GNT--AAAA-A--G---A---C---A-T---A--A-A-AT-------CAC----A-TG-TTG-ATATCAT-T---ATTCTGACGT-A-NN-T--CTA--GCT-CT--ATTTTA----CT-G---AGT-TTTCTACGACA-------AATTC-AAGTTG--TAATATA-TTT-T-G--TAGG-CG---AGAAAA-T-AAA--TC------TAT----AACG-ACT-T---A----TG---A-GT--TGTGTATAAGGAAATCCAAC-CCTCGGGC------C--AAGAT----A-----CG--A-G------------C--AAAGAACTCGGCAGAGCCTCGTTC-TTT-GCACGT--ATC----T--T-----TA----ACCCTCGGG-TGGGA--TT-CC-T--T-AT-CCACAACGCAA--CGTCGTTACA--G-----ATTCACTTTAT
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gi|10 : tttcttttctcacctgctagatacagatatcctgctcatgtggatgtgggaagggttgggtgggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggcaggggctggagataaccttatttgtactcatttgtctggACATG-GCT--AAAA-A--G---A---T---G-T---GATA-A-AT-------CAT----A-CG-TTG-----CCT-T---ATT-----------------TA--GTT-CT--ACTTTA----CT-----ATT-ATTCCACAATA-------AA-TC-AAGTTG--TAATATATTTT-T-G--TAGA-CAGTTAAAAAATT-AAA--T
gi|11 : aaagtgttctcttggcaaccagacttggatatcctgttcatatggagggtagagtgggtggggtgttgggggtgggatggaggggaagggataatcttatctctgcctacctgtgcgG---AGAAAA-T-GAA--TC------TAT----TATG-ATA-T---G----TG---C-AT--TGTGCATAAGGTAATCAAGT-GCTAGGGC------C--AAGCT----A-----CG--A-G------------C--AAAGAAATCTGC--AGTCTAATTC-CTT-GCAT-T--ATT----G--T-----AG----ACCCTCAGG-TTGGA--TT-TC-T--TGATCCCACAATGCAA--CGCTGTTATA--A-----ATTTACTTTAT
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gi|30 : aaaacctattgtctggtctacaccaggcatgaactttctgatcatatccatgtatgaaataatcttatctggtaagattgt-TTT-C-G--TAGG-TG---TGAAAA-T-AAA--TT------TAA----AATG-AC--T---A----TG---A-GT--TATAGATAAGAAGATCCAAC-TCTC
gi|31 : cT----A-----CA--A-A------------C--AAAAAATTTGGCAGAGCCTTGATC-TTT-GCACAT--GTC----T--T-----TA----GCcgc
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gi|7 : atatatagctatatccgtagcggtctgtaCTCATATG-GGT--AAAA-A--T---A---AGTAA-T---A--A-A-AT-------C------------T--ATATCAT-T---AATCTGATG--A-AA-TGCCTA--GCC-CC--ACTTCAAAGATT-G---A---TTTCTATGTAA-------AATTC-AAGTTG--AAATGTA-TTT-TAG--TAGG-TG---AAAAAA-T-AAA--TC------TAA----AATA-ACT-T--------TT---T-GT--TGAGTATAAAGAAATCCAAC-CCGCAAGC------CTTAAAAT----ATCTTGTG--A-T------------T--AAAGAAtc
gi|8 : tCTCATGTG-GCT--CAAA-C--A---AT--C---A-T---A--A-A-AT-------CAA----A-TC-CTA-----CAT-T---ATTCTGA-------------TA---CT-TT--ATACTA----C------AGT-TTT-TAAGACA-------AAATC-AAGTTT--CCA-AGA-TTC-A-G--TAGG-CG---AGAAAA-T-TAA--TG------TAT----AATG-ACT-T---A----TG---C-GC--TGTGTTTAAGGAAATCCA---CCTTGGGT------C--AAGGTGGTGA-----TGAAA-A------------T--AAAGAACTTGACAGAGACTTCTTT-TTT-GCATGT--A---------------TA----ATCCTCATC-T-GTATTTT-CT-T--T-AT-CCAtcttgaatgaatcctttttgaacttatttgtttttatcagttatatttcagtgtt
gi|9 : tgtCTCACATT-GGT--AAAA-A--G---A---C---G-T---C--A----T-------CAA----A-TC-TT---TATTAC-TGAGACTCTGATGC---------CTA--GCT-CT--ATTTTA----CT-G-----T-TTTTTACAACA-------AATTC-AAGATG--GAATATAATTT-T-G--TAAG-TG---AGAAAA-T-AAA--TC------TATTTAAAATT-A-T-C---A----TG---A-TT--TACATATAAGCAAtgccagccacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTATCATGGCTCGGTGTTGATTTTTCTTTTCTCCCCTATCAGACAGTGATATCCTGGTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGG