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lowQualScore                  :       5     222   6      77777    1111111  777 4      777777777 666         2  2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2   22222222222222 33   1  66666    8888888 0   44444444444444444444444      22   1111111   3   22        0 111111111111111111111111111111 1      1  6 5555    1   3     55  22  1   00   3333              55555 1111 5           88        0   5555             000000   22     44444444444444   0  8888     33     77     
lowQualScore                  :       .     ...   .      .....    .......  ... .      ......... ...         .  . ..................................................................... .   .............. ..   .  .....    ....... .   .......................      ..   .......   .   ..        . .............................. .      .  . ....    .   .     ..  ..  .   ..   ....              ..... .... .           ..        .   ....             ......   ..     ..............   .  ....     ..     ..     
lowQualScore                  :       0     000   0      11111    0000000  000 5      333333333 444         7  7 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5   22222222222222 44   3  22222    1111111 4   00000000000000000000000      99   1111111   8   99        7 444444444444444444444444444444 8      8  5 5555    8   5     33  00  8   77   9999              66666 9999 0           88        6   7777             111111   44     99999999999999   0  8888     88     55     
consensus                     :    NCACGAGAGTGNTTTAGAATAAAT---AACA---A---TG---GCGGTCGA--C--T---GT--CAATACAAG-AT-A-------A--A------A------A----A--T--G---TGA-----A----------------GT---T-TCT--ATN---------T--TCACCA-----TGTA-------ACACTN-------TAAAGGTAANN----TGGTGA--GAAAAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCACA-TT-AT--ATTAG---G-GCTTTC-CCAA-C--GTAA-AAT-TAACT-GACCAAT-CAGCGTGT----TCCTACTATTGCTA-----GAT--G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGTGACGG-NCCCNAGC-GGGGAG--AG--NGA--GG-CCG-TTCTG-CAGTC--TAACCTGGTAAG
Reference ( gi|3 )            :    GCAGGAGAGGAATTT-GAATAAGT---AACA---A---TG---GTGGTCGA--C--T---GT--CAATACAAG-AT-A-------A--A------A------A----G--T--G---TGA-----A----------------GT---T-TCT--GTT---------T--TCAGCA-----TGTA-------ACACTT-------TACAGGCAACT----TGGTGA--GAAGGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCATG-TTGAT--ATTAA---G-GCTTTC-CCGA-A--GTAA-AAT-TAACT-CACTGAT-CAGTTTGT----TCCTACTATTGCTA-----GGC--G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGTGATGGAACCAAAGC-AGGGAG--AG--GGA--GG-CCA-TTCCG-TAGTC--TAATC--ATAAGGT
gi|13                         :     CACGAGAGTGTTTA-GAATAAAT---AACATAAA---TG---GCGGTTGA--C--TTT-GT--CATTACAAG-AT-A-------A--A------AC-----AT---A--T--G---CGA-----A----------------GTCGTT-TCT--ATT---------T--TCACCA-----TGTA-------AGACTA-------TAAAGAT-ACTA---TGGTAA--AAA--AA---TATCGAC--ATGTGAACTT-------T-TCAAA-TT--T--ATTTG---T-ACTTTT-TCAA-AATGTGA-AAT-TAACT-GACCAAT-CAATGTGT----
gi|7                          :     CATGAGAG--AGTT-AATTAAAT---AACA---AAATTA---GCGGTTGATTC--T---GT--CACTACACG-AT-A-------A--A------AC-----AC---A--T--G---TGAAAT--A----------------GT---TATCT--G
gi|2                          :                TTT-AAATAA-C---AACA---ACACTG---GCAATCAATTC--T---GT--CGATTCAAACAT-A-------ATTG------A------A----A--T--A---TAACTAACA----------------AT---T-ACT--GTTAGATATTTAT--TAACCA-----TATG-------ACACTT-------T----------------------GAAT-AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCACA-TCGAC----TAG---T-GCTTTT-CAAA-C--GGTA-AAT-TAACT-GACCAAT-CAGCATTC----TCCTACTTTTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGTGATGG-ATCTTAGC-GGGGAG--Agtgataacaaaataatgaaatttgaacagaatcattttacatgcgtaaaactaacagactaatcagcatattcctaatagtgttagatgtcgagggctaaaaacaatactacgtgacggattcaagtgtgacgggaagagcttagcccattttaca
gi|10                         :            gtgtTTTAGAATACATTACAACA---A---TG---GCGGTCGA--C--TCT-GC--CAATACATG-AA-A-------A--A------A------ACATCA--T--G---TGA-----A-----------------------TTT--GTT---------T---CAATA-----TACACAACCCAGCACTG-------TAT-GGAAGTT----GGGTGA--CAAAAAT----ATCGAA--ATTTAATCCT-------C-TCAT--TTAAT--TTTAATAGA-GTTTTC-TCAACA--TTAA-AGTATA--T-GACTTAT-CAGCGTGC----TTCTACTATTGCTA-----Gtagatctgcaaacgtttctacagtcaagatagtatttacat
gi|25                         :          agagcgTTTAGAATAAAT---AACA---A---CAACAGCGGCCGA--C--T---CTTTCAATACAAG-AA-A-------G--A------ATATGCTA----GTAT--G---TGAAAT--A----------------GT---T-TCT--ATA---------T--GTACCA-----TGatg
gi|4                          :                 gagcgATAA-C---AACA---A---TG---GCGGTTGA--CATT---GG--CGATGCAAG-AT-A-------A--A------A------C----A--T--G---AGA-----AATA-------------GT---T-TCTTTATT---------T--TTACCA-----AATA-------ATACTTAATGTAATACTAGTA--T----TAG-GA--GACAAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCATA-TT--T--ACTAG---G-ACTTTC-CCAA-C--GTAA-AAT-TAACG-AACCAAT-CAGCCTTT----TTCTACTATTGATG-----GAT--G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG---CGGA--CAGAGC-TGGGgacatatggtgagaacatttttttttaaattta
gi|9                          :          gagcgtttagactatAGC---AACA-------TG---GCGGTCGAACC--T---GT--CAATACAAG-AA-A-------A--ACAT---A------ATT--A--T--A---TGA-----A----------------AT---A-GCT--GATATA------T--TCACCA-----TATA-------ACATCA-------TAAAAGTAAAA----TCGTGA--GAAAT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCACA-TT--C--ATCAG---G-GTTTAC-CCAA-C--GTAA-AAC-TAACT-GACCGAT-CAGCATGT----TCCTACTGTTGCtctgtttctgc
gi|8                          : acgagagcgtttataaaaaaaaatgtT---AACA---T---TA---GCACTCGA--C--TCGAG---CAATGCAAG-ATTA-------A--ACATATGA------A----A--T--A---TGA-----ATGGCATAGT-------GT---T-TCC--TTA---------T--TCACCA-----TGTA-------AC--TT-------TATAA--AAATGAAGTGGTGA--GAAAAA---------AA--AGTTAAATCT-C-A-C-A-TC-TG-TT---------A---G-GGTTTC-TCGA-C--GTGA-AAT-AAACT-TAC-AAG-CGG---GT----TCCTACTATTGCTA-----AAT--G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|1                          :                       aatac---AATA---G---TG---GTGATCGA-----T---G---CAAAATAA--AT-A-------A--A------A------A----A--TATG---TGA-----AATATAACTGGCAGATAGT---T-TCT--TCA---------T--TCATCA-----TGTA-------ACACTG-------CAAAGGTAATA----TGGTGA--GAAAAAT---TATAAAACAAACTCAACTGGA-A-C-C-TCACAATTAAT--A-------G-GCTTTC-CCAA-C--ACAA-AAT-TTACT-GACCAAT-CTGTGTGT----TCCTACTATTGTTA-----GAT--C-TAGCCAATCATTGTGCTCCTACCAG----TGCTATGTAATGG-TCTCTAGC-AGGGAG--AA--CCA--GGATCA-TTCTA-TGATCTTTAACCTGATAAG
gi|30                         :        agagtgttaagattaattac---AACA---A---TG---GCGGTC----T--T---GT--CAATACAAG-TT-A-------A--A------AC-----AT---A--T--G---TGAGAT--A----------------GT---T-TTT--aaatac
gi|23                         :                                       agtgcgagagcgtcac--C--T---GG--CAATACAAG-AT-A--------------------------------T--A---TA----------------------------T-TCT--ATA---------T--TCACCA-----TGCA-------ACAATA-------TGAATGGATAT----TGGTAA--CAAAAAT---TATCGGA--TTTGGAACTTAA-A-C-C-TCACA-TTTAT--ACTAAT--A-TTTTTT-CCAA-AACGTAA-AAT-Ta
gi|16                         :                                                      t--C--T---GT--CGATCCAAG-AT-ATAACGCGA--A------A------T----G--T--GGTTTGAAGAT-A----------------GT---T-TCT--ACT---------TCACCACCA-----TGCA-------ACACT---------------AAAT------------GAAAGTT---TG-CGAA--A---GAAAT----A-T-C-TCACA-T--A---ATTAG---G-ACTTTC-CAAA-A--GTCA-AAT-TAAAT-GTCCAAT-CAGCATGC----TCC
gi|19                         :                     aaagcgttcggagtaaaaacatcattgttcatctatt--T---GT--CATTAAAAT-AT-G-------A--A------AT-----AT---A--T--G---TGA-----A----------------ATAG-T-TTT--ATA---------T--TCAGCA-----TGTA-------A-ATTTA------TAGAGATAAAA----TGGTGA--TACGAA----TATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAAA-TTAAT---TAAA---GTGTTTTT-CC-A-C--ATAA-TAT-TAACT-GACCAAT-CAGCATGC----TCC
gi|22                         :                                               aacgtttggcaatt---GT--AAATACAAG-AT-A-------A--A------A------C----C--TC-A---T-------A----------------CC---T-TCT--ATA---------T--TCACAA-----TGTA-------ACATTG-------TAAGGGGAATA----TGGCTA--GAAAAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CACA-TT--T--ATTAC---A-TATTTC-CCAA-A--GTAA-AAT-TAACT-GACCAAT-CAGTGTAT----TCCTATTATTGTTA-----G
gi|20                         :                                                                         CAAG-AT-A-------A--A------A------C----G--T--G---TGA-----AATA-------------GT---T-TCT--TTA---------T--TCAGCACAACATCTA-------ACACTA-------TAAAGGTAATA----TGGTGA--GAAAAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCACA-TT--T--ATTGG---C-GCTTTCTCCAC-A--GTAACGAT-TTGCTACAGTAAG-CGG---GT----TCTTACCACTGGCA-----GAT--G-Taaata
gi|12                         :                                                                                                                            -----A----------------GT---T-TCT--ATA---------T--TCATCA-----TGTT-------GAATTT-------TA-AGGTAAAA----CGGTGG--GAAA-AT---TTT--AA--CTTTGAACTT-A-AAC-C-TCACA-TT--T--ATTAC---A-GTTTTC-CCAA-T--GCAA-AAT-CAACT-GACCAAT-CAGGGTGT----TCCTAATATTGCTA-----GAC--A-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTAACAA----TGCCATGTAGAGGAACTCAAGC-AGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                       taaataaaat---------T--TCACCA-----TGTT-------ACACTA-------TAAAGG-AACTA---TGGTGGTGGAAAAAA---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-------ATT-TT--T--AATAG---G-GCTTTG-TCAA-C--GTAA-AAT-TAACT-AACCAAT-CCGAGTGT----CCCTACTATTG-TA-----AAT--G-TAGCGAATGAGCGTATTCCTAACTT----TGCAATGTGACGG-ACCCAAGC-ACGAAGCTCG--AGATCGA-TCAGTTCTA-CAGTC--TAAtccgtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                a---------T--TCGTCA-----TGTG-------A-ACTA-------TAAAGGTAACT----TTGTGA--CAA--AA---TATTG-----TTTGGCCTT-A-AAC-C-TCATA-TC--T--A--AA---G-GCTTTC-CCAA-T--GTCA-TAT-TAACT-AACCAAT-CAGCGTGC----TCCTATTATTACTA-----GAC--GATAGCCAATCAACAAGCTCCTGTCAA----TGCTATGCG-TCGGTCTATAAC-GGGAAA--AGCTGGA---A-CCG-TCTCGACAGTT--TAA
gi|14                         :                                                                                                                                                    agataaaacgtaaaatatgtcttgaaaataattccttaaA-------ACACTT-------TAAAGGTAATA----TGATGA--GAAAAAT---TACACAA--ATTTTAACGT-A-A-AAT-TCACA-TT--C--ATTAG---G-GCTTTC-CCAA-C--ATAA-GAT-TAAC------AATCCAATTTATGCAATCCTACCATAGCTA-----GAT--G-TAGCCAGTCAGTTGGCTCCTACCAG----TGgaaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                           ----TAGTAA--GAAAAAT---TATTGAA--ATTTGAACTT-ACA-C-C-TCAAA-TT--T--TTTAG---G-GCTTTC-CCAA-C--GTAA-AAT-TAACT-GACCAAT-CTATGTGT----TCCTACTATTTCTG-----GAT--G-TAGCCAATCAGTGTGCACCTAACGG----TGCTATGGGATGG-ATCGAAGCTTTGAAG--AC--TGG--GT-CCG-TT--G-TAGTC--TAATC--GTAtaagtaaacatctctagcagaatgagctgggactgattcta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                          c----TGGTGA--GAAAAAG---TA---AA--ATTTGAACTT-ATT-C-C-TCAAA-T--AT--ATAAG---G-GTTTTC-CCAA-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                taata--GAAAAAC---TATTGAA--ATTCAAAC---------C-TCACA-TTTAG--A--AG---G-GGTTTC-CCAA-T--GTTA-AATATAACT-GACCAAC-CGGCGTGT----TCCTATTATTATTA-----CAT--G-TAGCCACTCAGCGCGCTCCTACCAA----TGCCACGTAACGGACCCt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tTTCGACCTT-A-AAC-T-TCCCA-TTGACCGAGTAG---A-GCTTTT-C------------AGT-TAACT-GACCAAT-CAGACTAC----TGCCACTATTGCCA-----AGC--G--------------TGTTCCTACCAA----TGTCACTTGACAG-TCCCAAGC----GAG--GG--GAA--AG-Cttgcgcgaagagctgtgcaattcctacttctgatcagttggttttacat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                           agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat-A-A-C-C-TCACA-TTAGT----TAT---G-GCTTTC-CCGA-C--GTAG-ATC-TAAAT-GACCAAT-CAGtttgaatgtt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                     tatgactggccagatagattccttattgacagtgtaacataacacaggtaatatgataagttaTGA---ATTTG---G-GCTTTC-CTAA-C--GTCA-ATT-TACCT-AACAGAT-CAACATGT----TCCTAATATTGCTA-----GGTA-A-TAGCCAATCAAAGGGATCTTACCAA----TGCAATATGAcgtattggtatcaat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acAT-TAACT-GACCAAT-CAACATAC----TCCTACTATTGCTT-----GAT--GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGTGAgtgctgtgataaactcagataagtagaatgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                            tggaataacaacagcaatggcagttgactctgtcgattgaaaataaaactatgtgaaatattagtggcagatagattcttaactcaccatgggacactatgaaagtaattttgtcacattaaatattattaggg----TCTTACTATTACTA-----GAT--G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGAGATGccgtccatggagatcttgggccatttctg
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): ATAACAACAAACATGGCGGTTAACTTTGTCGATGCAAGATGAAACTTATGCAGATAGTAACAGATAGAT
Unaligned ( gi|32 ): TTTCCCAACGTTAAATTCACTCACCAATCAGCATTTTCCTATATTGATAAATAATAGC






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consensus                     :          NCACGAGAGCG-TT-TAGA--ATA-A--A---C---AACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATT--CA----C--CATGTAACACTATAAAGGTAATA-TGG-T-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCNAG-----C-GGGGAGAG-CGA--GG-C---C-----G-T-TCTACAGTC--TAATCTGATAAG
Reference ( family-4768 )     :          NCACGAGAGTGNTT-TAGA--ATA-A--A---T---AACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATNTT--CA----C--CATGTAACACTNTAAAGGTAANN-TGG-T-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-NCCCNAG-----C-GGGGAGAG-NGA--GG-C---C-----G-T-TCTGCAGTC--TAACCTGGTAAG
gi|1                          :               AGAGTG-TT-AAGA--TTA-ATTA---C---AATA---G---TGGTGATCGA-----T---G-CAAAATAA--AT-A-A--A------A-A---------ATATGT---GA---------AATATAACTGGCAGATAG----T----------------TTCT-----TCATT--CA----T--CATGTAACACTGCAAAGGTAATA-TGG-T-----GA--GAA--AAAT---TATAAAACAAACTCAACTGGA-A-C-C-TCAC---A-AT-------T--AATA--GG-CTTTCCC---AAC-ACAA-AAT-TTACTGACCAATCTGTGTGTTCCTACTA--TTGTTAGAT-------C-TAGCCAATCATTGTGCTCCTACCAG----TGCTATGT-AATGG-TCTCTAG-----C-AGGGAGAA-CCA--GGAT---C-----A-T-TCTATGATCTTTAACCTGATAAG
gi|10                         :               AGAGCG-TT-TAGA--ATA-C--A---TTACAACA---A---TGGCGGTCGA--C--TCT-GCCAATACATG-AA-A-A--A------A-ACATC-----AT--GT---GA---------ATTT-------------G----T----------------TTCA-----ATATA--CA----C--AACCCAGCACTGTATGG--AAGT-TGGGT-----GA--CAA--AAAT----ATCGAA--ATTTAATCCT-------C-TCATTTAA-TT-T-----T--AATA--GAGTTTTCTC---AAC-ATTA-AAG-TATATGACTTATCAGCGTGCTTCTACTA--TTGCTAGAT-------G-aaatac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                          TT--CA----C--CATGTTACACTATAAAGGAACTA-TGG-T-----GGTGGAA--AAAA---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-A-T-T--------TT-------T--AATA--GGGCTTTGTC---AAC-GTAA-AAT-TAACTAACCAATCCGAGTGTCCCTACTA--TTG-TAAAT-------G-TAGCGAATGAGCGTATTCCTAACTT----TGCAATGT-GACGG-ACCCAAG-----C-ACGAAGCT-CGA--GA-T---CGATCAG-T-TCTACAGTC--TAA
gi|12                         :                                                                                             a--A------A-A---------AT------------------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATT--CA----T--CATGTTGAATTTTAA-GGTAAAA-CGG-T-----GG--GAA--AATT---T-T--AA--CTTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTA--CAGTTTTCCC---AAT-GCAA-AAT-CAACTGACCAATCAGGGTGTTCCTAATA--TTGCTAGAC-------A-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTAACAA----TGCCATGTAGAGGA-ACTCAAG-----C-AGGG
gi|13                         :      taaatCACGAGAGTG-TT-TAGA--ATA-A--A---T---AACATAAA---TGGCGGTTGA--C--TTT-GTCATTACAAG-AT-A-A--A------ACAT--------AT--GC---GA---------A----------------G----TCGT-------------TTCT-----ATTTT--CA----C--CATGTAAGACTATAAAGATACTA-TGG-T-----AA--AAA--AA-----TATCGAC--ATGTGAACTT-------T-TCAA---A-TT-------T--ATTT--GTACTTTTTCAA-AAT-GTGA-AAT-TAACTGACCAATCAATGTGTtccgtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                            AACACTTTAAAGGTAATA-TGA-T-----GA--GAA--AAAT---TACACAA--ATTTTAACGT-A-A-AAT-TCAC---A-TT-------C--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-ATAA-GAT-TAACAATCCAATTTATGCAATCCTACCA--TAGCTAGAT-------G-TAGCCAGTCAGTTGGCTCCTACCAG----TG-TAAGT-AAACA-TCTCTAG-----C-AGAATGAGCTGG--GA-C---T-----GAT-TCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                           --GAA--AAAC---TATTGAA--ATTCAAAC---------C-TCAC---A-TT-------T--AGAA--GGGGTTTCCC---AAT-GTTA-AATATAACTGACCAACCGGCGTGTTCCTATTA--TTATTACAT-------G-TAGCCACTCAGCGCGCTCCTACCAA----TGCCACGT-AACGG-ACCCTTG-----C-GCGAAGAG-a
gi|16                         :                                                                  t--C--T---GTCGATCCAAG-AT-ATA--ACGCG--A-A---------AT--GT---GGTTTGAAGATA----------------G----T----------------TTCT-----ACTTCACCA----C--CATGCAACACT--AAATGAAAGT-T---T-----GC--GAA--A----------GAA--AT-----------A-T-C-TCAC---A-T--A--------ATTA--GGACTTTCCA---AAA-GTCA-AAT-TAAATGTCCAATCAGCATGCTCCctgtgcaattcctacttctgatcagttggttttacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                         aaagcgttcggagtaaaaacatcattgttcatctatt-TAG-T-----AA--GAA--AAAT---TATTGAA--ATTTGAACTT-ACA-C-C-TCAA---A-TT-------T--TTTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCTATGTGTTCCTACTA--TTTCTGGAT-------G-TAGCCAATCAGTGTGCACCTAACGG----TGCTATGG-GATGG-ATCGAAG-----CTTTGAAGAC-TGG--GT-C---C-----G-T---TGTAGTC--TAATC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  cTTCGACCTT-A-AAC-T-TCCC---A-TTGA-----CCGAGTA--GAGCTTTTC-------------AGT-TAACTGACCAATCAGACTACTGCCACTA--TTGCCA---------------------AGCGTGTTCCTACCAA----TGTCACTT-GACAG-TCCCAAG-----C-GAGGGGAA-AGgta
gi|19                         :                             agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat--T---GTCATTAAAAT-AT-G-A--A------ATAT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TAG--------------TTTT-----ATATT--CA----G--CATGTAAATTTATAGAGATAAAA-TGG-T-----GA--TAC--GAAT----ATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAA---A-TT-A--------ATTAAAGTGTTTTTCC---A-C-ATAA-TAT-TAACTGACCAATCAGCATGCTCCctttgaatgtt
gi|2                          :    aacgtttggcaattGTGTTT-TA-A--ATA-ACAA---C---AACA---C---TGGCAATCAATTC--T---GTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATT--TATTAAC--CATATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTTAG-----C-GGGGAGAT-AGATCTG-CAAAC-----GTT-TCTACAGTC--
gi|20                         :                                                                                   CAAG-AT-A-A--A------A-C---------GT--GT---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATT--CAGCA-CAACATCTAACACTATAAAGGTAATA-TGG-T-----GA--GAA--AAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTG--GCGCTTTCTC---CACAGTAACGAT-TTGCTA--CAGTAAGCGGGTTCTTACCA--CTGGCAGAT-------G-Taagatagtatttacat
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gi|22                         :     agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatga---GTAAATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATT--CA----C--AATGTAACATTGTAAGGGGAATA-TGG-C-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
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gi|25                         : tatgactggccagatGAGCG-TT-TAGA--ATA-A--A---TAACAACA---A---CAGCGGCCGACTC--T---TTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATG--TA----C--CATG-GAC------------ATA-TGG-T-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
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gi|29                         :              acgcaaaatattcaaacata-A--A---C---AACA---AACATGGCGGTTAA--CTTT---GTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATT-T-GA--ATA-A--G---T---AACA---A---TGGTGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTT--CA----G--CATGTAACACTTTACAGGCAACT-TGG-T-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAAAG-----C-AGGGAGAG-GGA--GG-C---C-----A-T-TCCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
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gi|4                          :                GAGCG-TT-TAGACTATATA--A---C---AACA---A---TGGCGGTTGA--CATT---GGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCTTT---ATTTT--TA----C--CAAATAATACTT--AATGTAATACTAG-TATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-A-CAGAG-----C-TGGG
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gi|6                          :                      ag-TGGA--ATA-ACAA---C---AGCA---A---TGGCAGTTGA--C--TCT-GTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACT--CA----C--CATGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACCG-TCCgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAG--T-TA-A--TTA-A--A---T---AACA---AAATTAGCGGTTGATTC--T---GTCACTACACG-AT-A-A--A------A--------------------------------------------------------------------------------------CA----C---ATGTGA------AATAGTTATC-TGG-T-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCAAGTGTGAC-GGGAAGAGCTTA--GC-C---C-----A-T-TTTACAatggagatcttgggccatttctg
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Reference ( family-4768 )     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCNAG-----C--GGGGAGA-------GC-GAGG-CC-----G-T-T-CTACAGTC--TAATCTGATAAG
gi|1                          :               AGAGTGTTAAGA--TT-A---ATTA--------CAATA---G---TGGTGATCGA-----T---G-CAAAATAA--AT-A-A--A------A-A---------ATATGT---GA---------AATATAACTGGCAGATAG----T----------------TTCT-----TCATTC--A----T--CA---TGTAACACTGCAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATAAAACAAACTCAACTGGA-A-C-C-TCAC---A-AT-------T--AATA--GG-CTTTCCC---AAC-ACAA-AAT-TTACTGACCAATCTGTGTGTTCCTACTA--TTGTTAGAT-------C-TAGCCAATCATTGTGCTCCTACCAG----TGCTATGT-AATGG-TCTCTAG-----C--AGGGAGA-------AC-CAGGATC-----A-T-T-CTATGATCTTTAACCTGATAAG
gi|10                         :               AGAGCGTTTAGA--AT-AC--ATTA--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--TCT-GCCAATACATG-AA-A-A--A------A-ACATC-----AT--GT---GA---------ATTT-------------G----T----------------TTCA-----ATATAC--A----C--AA---CCCAGCACTGTAT--GGAAGTT-GGGT-----GA--CAA--AAAT----ATCGAA--ATTTAATCCT-------C-TCATTTAA-TT-T-----T--AATA--GAGTTTTCTC---AAC-ATTA-AAG-TATATGACTTATCAGCGTGCTTCTACTA--TTGCTAGAT-------G-aaatac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                            ATTC--A----C--CA---TGTTACACTATAAA-GGAACTA-TGGT-----GGTGGAA--AAAA---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-A-T-T--------TT-------T--AATA--GGGCTTTGTC---AAC-GTAA-AAT-TAACTAACCAATCCGAGTGTCCCTACTA--TTG-TAAAT-------G-TAGCGAATGAGCGTATTCCTAACTT----TGCAATGT-GACGG-ACCCAAG-----C--ACGAAGC-------TC-GAGA-TCGATCAG-T-T-CTACAGTC--TAA
gi|12                         :                                                                                                 --A------A-A---------AT------------------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----T--CA---TGTTGAATTTTAA--GGTAAAA-CGGT-----GG--GAA--AATT---T-T--AA--CTTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTA--CAGTTTTCCC---AAT-GCAA-AAT-CAACTGACCAATCAGGGTGTTCCTAATA--TTGCTAGAC-------A-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTAACAA----TGCCATGTAGAGGA-ACTCAAG-----C--AGGG
gi|13                         :      taaatCACGAGAGTGTTTAGA--AT-A---A--A--------TAACATAAA---TGGCGGTTGA--C--TTT-GTCATTACAAG-AT-A-A--A------ACAT--------AT--GC---GA---------A----------------G----TCGT-------------TTCT-----ATTTTC--A----C--CA---TGTAAGACTATAAA-GATACTA-TGGT-----AA--AAA--AA-----TATCGAC--ATGTGAACTT-------T-TCAA---A-TT-------T--ATTT--GTACTTTTTCAA-AAT-GTGA-AAT-TAACTGACCAATCAATGTGTtccgtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                  AACACTTTAAA-GGTAATA-TGAT-----GA--GAA--AAAT---TACACAA--ATTTTAACGTAA-A-A-T-TCAC---A-TT-------C--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-ATAA-GAT-TAACAATCCAATTTATGCAATCCTACCA--TAGCTAGAT-------G-TAGCCAGTCAGTTGGCTCCTACCAG----TG-TAAGT-AAACA-TCTCTAG-----C--AGAATGA-------GCTGGGA-CT-----GAT-T-CTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                 --GAA--AAAC---TATTGAA--ATTCAAAC---------C-TCAC---A-TT-------T--AGAA--GGGGTTTCCC---AAT-GTTA-AATATAACTGACCAACCGGCGTGTTCCTATTA--TTATTACAT-------G-TAGCCACTCAGCGCGCTCCTACCAA----TGCCACGT-AACGG-ACCCTTG-----C--GCGAAGA-------GC-TGTG-CA-----A-T-TCCTAC-TTC--TGATC
gi|16                         :              tAAAGCGTTCGGA--GT-A---A--AAA------CATCA---T---TGTTCATCTATTC--T---GTCGATCCAAG-AT-ATA--ACGCG--A-A---------AT--GT---GGTTTGAAGATA----------------G----T----------------TTCT-----AC-TTC--A----C--CACCATGCAACACTA--------AAT---------------GAA--AGTT---TG-CGAA--A---GAAAT----A-T-C-TCAC---A-T--A--------ATTA--GGACTTTCCA---AAA-GTCA-AAT-TAAATGTCCAATCAGCATGCTCCagttggttttacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                     -TAGT-----AA--GAA--AAAT---TATTGAA--ATTTGAACTT-ACA-C-C-TCAA---A-TT-------T--TTTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCTATGTGTTCCTACTA--TTTCTGGAT-------G-TAGCCAATCAGTGTGCACCTAACGG----TGCTATGG-GATGG-ATCGAAG-----CT-TTGAAGA-------CT-GGGT-CC-----G-T-T-GT--AGTC--TAATC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        cTTCGACCTT-A-AAC-T-TCCC---A-TTGA-----CCGAGTA--GAGCTTTTC-------------AGT-TAACTGACCAATCAGACTACTGCCACTA--TTGCCA---------------------AGCGTGTTCCTACCAA----TGTCACTT-GACAG-TCCCAAG-----CGAGGGGAAA-------GC-gta
gi|19                         :                                agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat--T---GTCATTAAAAT-AT-G-A--A------ATAT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TAG--------------TTTT-----ATATTC--A----G--CA---TGTAAATTTATAGA-GATAAAA-TGGT-----GA--TAC--GAAT----ATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAA---A-TT-A--------ATTAAAGTGTTTTTCC---A-C-ATAA-TAT-TAACTGACCAATCAGCATGCTCCtttgaatgtt
gi|2                          :    aacgtttggcaattGTGTTTTAA--AT-A---ACAA--------CAACA---C---TGGCAATCAATTC--T---GTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATTT--ATTAAC--CA---TATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTTAG-----C--GGGGAGATAGATCTGC-AAA---C-----GTT-T-CTACAGTC--
gi|20                         :                                                                                      CAAG-AT-A-A--A------A-C---------GT--GT---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTC--AGCA-CAACA---TCTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTG--GCGCTTTCTC---CACAGTAACGAT-TTGCTA--CAGTAAGCGGGTTCTTACCA--CTGGCAGAT-------G-Taagatagtatttacat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --ATTT--GGGCTTTCCT---AAC-GTCA-ATT-TACCTAACAGATCAACATGTTCCTAATA--TTGCTAGGTA------A-TAGCCAATCAAAGGGATCTTACCAA----TGCAATAT-GAC
gi|22                         :               agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatgaATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATTC--A----C--AA---TGTAACATTGTAAG-GGGAATA-TGGC-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
gi|23                         :                                                                  gtaa--C--T---GGCAATACAAG-AT-A------------------------T--AT---A-------------------------------------------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGCAACAATATGAATGG--ATATTGGT-----AA--CAA--AAAT---TATCGGA--TTTGGAACTTAA-A-C-C-TCAC---ATTT-A-----T--ACTA--ATATTTTTTCCAAAAC-GTAA-AAT-Taata
gi|24                         :                                                                                                                                t---------A----------------G----A----------------TTCC-----TTATTG--A----C--AG---TGTAACATAACACA-GGTAATA-TGAT-----AA--G-------T---TA------------------A-A-C-C-TCAC---A-TT-A--------GTTA--TGGCTTTCCC---GAC-GTAG-ATC-TAAATGACCAATCAGCGTATT
gi|25                         : tatgactggccagatGAGCGTTTAGA--AT-AAATA--A--------CAACA---A---CAGCGGCCGACTC--T---TTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATGT--A----C--CA---TG-GAC-------------ATA-TGGT-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-AGT-AAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTATCG--TTGCCAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTTCTATTAA----TGCTTTAT-GATGG-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acCCAATCAGCGTCCTATTACTATGTTGAAAGAT-------GATAGTGAATAAGAGTGCTCGTAACAA------CTA-------------CAAA-----T--AGGATGA-------GCTGGGT-CC-----G-T-T-TTACgtgctgtgataaactcagataagtagaatgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaagtctgtaacatTCTTACTA--TTACTAGAT-------G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGA-GATG
gi|29                         :             acgcaaaatattcaaacata---A--A--------CAACA---AACATGGCGGTTAA--C--TTT-GTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATTTGA--AT-A---A--G--------TAACA---A---TGGTGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTTC--A----G--CA---TGTAACACTTTACA-GGCAACT-TGGT-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAAAG-----C--AGGGAGA-------GG-GAGG-CC-----A-T-T-CCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
gi|30                         :            gCGAGAGCGTC----------------A--------CAACA---A---TGGCGGTC----T--T---GTCAATACAAG-TT-A-A--A------ACAT--------AT--GT---GAGAT------A----------------G----T----------------TTTT-----Agt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                            agtgTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAG---TA---AA--ATTTGAACTT-ATT-C-C-TCAA---A--T-A-----T--ATAA--GGGTTTTCCC---AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCC---AAC-GTTA-AAT-TCACTCACCAATCAGCATTTTCCTA-TA--TTGATAAATA------A-TAGCt
gi|4                          :                GAGCGTTTAGACTAT-AT--A--A--------CAACA---A---TGGCGGTTGA--CATT---GGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTTTTA----C--CA---AATAATACT-TAA--TGTAATACTAGTATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-A-CAGAG-----C--TGGG
gi|5                          :                                                                                  GATAAAAC-GT-A-A--A------A-T---------AT--GTCTTGA---------A----------------AATAAT----------------TCCT-----TAATTC--G----T--CA---TGTGA-ACTATAAA-GGTAACT-TTGT-----GA--CAA--AA-----TATTG-----TTTGGCCTT-A-AAC-C-TCAT---A-TC-------T--A--A--AGGCTTTCCC---AAT-GTCA-TAT-TAACTAACCAATCAGCGTGCTCCTATTA--TTACTAGAC-------GATAGCCAATCAACAAGCTCCTGTCAA----TGCTATGC-GTCGG-TCTATAA-----C--GGGAAAA-------GCTGGAA-CC-----G-TCT-CGACAGTT--TAAtctgtttctgc
gi|6                          :                      aTGGA--AT-A---ACAA--------CAGCA---A---TGGCAGTTGA--C--TCT-GTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACTC--A----C--CA---TGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAGTT---A--ATTA---A--A--------TAACA---AAATTAGCGGTTGATTC--T---GTCACTACACG-AT-A-A--A------A------------------------------------------------------------------------------------C--A----C---A---TGTGA-A--ATA----GTTATC-TGGT-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCAAGTGTGAC--GGGAAGA-------GCTTAGC-CC-----A-T-T-TTACAcgtccatggagatcttgggccatttctg
gi|8                          :                                                 AACA---T---TAGCACTCGA--C--TCGAG-CAATGCAAG-ATTA-A--ACATATGA-A---------AT--AT---GA---------ATGGCATAGT-------G----T----------------TTCC-----TTATTC--A----C--CA---TGTAACTTTATAAA-AATGAAG-TGGT-----GA--GAA--AAA---------AA--AGTTAAAT---------C-TCAC---A-TC-------T--GTTA--GGG-TTTCTC---GAC-GTGA-AAT-AAACTTAC--A--AGCGGGTTCCTACTA--TTGCTAAAT-------G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|9                          :      aatactACGAGAGCGTTTATA--AA-A---A--AAAATGTAGCAACA-------TGGCGGTCGAACC--T---GTCAATACAAG-AA-A-A--ACAT---A-ATT-------AT--AT---GA---------AATA-------------G----C----------------TGAT-----ATATTC--A----C--CA---TATAACATCATAAA-AGTAAAA-TCGT-----GA--GAA--AT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCAC---A-TT-------C--ATCA--GGGTTTACCC---AAC-GTAA-AAC-TAACTGACCGATCAGCATGTTCCTACTG--TTGC





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consensus                     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCAAG-----C--GGGAAGAG-CTGGGNCC-----G-------T-T-CTACAGTC--TAATCTGATAAG
Reference ( family-4768 )     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCNAG-----C--GGGGAGAG-C-GGGNCC-----G-------T-T-CTACAGTC--TAATCTGATAAG
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gi|12                         :                                                                                                 --A------A-A---------AT------------------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----T--CA---TGTTGAATTTTAA--GGTAAAA-CGGT-----GG--GAA--AATT---T-T--AA--CTTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTA--CAGTTTTCCC---AAT-GCAA-AAT-CAACTGACCAATCAGGGTGTTCCTAATA--TTGCTAGAC-------A-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTAACAA----TGCCATGTAGAGGA-ACTCAAG-----C--AGGG
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gi|19                         :                                agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat--T---GTCATTAAAAT-AT-G-A--A------ATAT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TAG--------------TTTT-----ATATTC--A----G--CA---TGTAAATTTATAGA-GATAAAA-TGGT-----GA--TAC--GAAT----ATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAA---A-TT-A--------ATTAAAGTGTTTTTCC---A-C-ATAA-TAT-TAACTGACCAATCAGCATGCTCCtttgaatgtt
gi|2                          :    aacgtttggcaattGTGTTTTAA--AT-A---ACAA--------CAACA---C---TGGCAATCAATTC--T---GTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATTT--ATTAAC--CA---TATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTTAG-----C--GGGGAGA--T-AGATCT-----GCAAACGTT-T-CTACAGTC--
gi|20                         :                                                                                      CAAG-AT-A-A--A------A-C---------GT--GT---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTC--AGCA-CAACA---TCTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTG--GCGCTTTCTC---CACAGTAACGAT-TTGCTA--CAGTAAGCGGGTTCTTACCA--CTGGCAGAT-------G-Taagatagtatttacat
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gi|22                         :               agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatgaATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATTC--A----C--AA---TGTAACATTGTAAG-GGGAATA-TGGC-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
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gi|25                         : tatgactggccagatGAGCGTTTAGA--AT-AAATA--A--------CAACA---A---CAGCGGCCGACTC--T---TTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATGT--A----C--CA---TG-GAC-------------ATA-TGGT-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acCCAATCAGCGTCCTATTACTATGTTGAAAGAT-------GATAGTGAATAAGAGTGCTCGTAACAA------CTA-------------CAAA-----T--AGGATGAG-CTGGGTCC-----G-------T-T-TTACgtgctgtgataaactcagataagtagaatgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaagtctgtaacatTCTTACTA--TTACTAGAT-------G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGA-GATG
gi|29                         :             acgcaaaatattcaaacata---A--A--------CAACA---AACATGGCGGTTAA--C--TTT-GTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATTTGA--AT-A---A--G--------TAACA---A---TGGTGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTTC--A----G--CA---TGTAACACTTTACA-GGCAACT-TGGT-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAAAG-----C--AGGGAGAG-G-GAGGCC-----A-------T-T-CCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
gi|30                         :            gCGAGAGCGTC----------------A--------CAACA---A---TGGCGGTC----T--T---GTCAATACAAG-TT-A-A--A------ACAT--------AT--GT---GAGAT------A----------------G----T----------------TTTT-----Agt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                            agtgTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAG---TA---AA--ATTTGAACTT-ATT-C-C-TCAA---A--T-A-----T--ATAA--GGGTTTTCCC---AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCC---AAC-GTTA-AAT-TCACTCACCAATCAGCATTTTCCTA-TA--TTGATAAATA------A-TAGCt
gi|4                          :                GAGCGTTTAGACTAT-AT--A--A--------CAACA---A---TGGCGGTTGA--CATT---GGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTTTTA----C--CA---AATAATACT-TAA--TGTAATACTAGTATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-AC-----------------AGAG-CTGGGTCT-----G-------T-T-
gi|5                          :                                                                                  GATAAAAC-GT-A-A--A------A-T---------AT--GTCTTGA---------A----------------AATAAT----------------TCCT-----TAATTC--G----T--CA---TGTGA-ACTATAAA-GGTAACT-TTGT-----GA--CAA--AA-----TATTG-----TTTGGCCTT-A-AAC-C-TCAT---A-TC-------T--A--A--AGGCTTTCCC---AAT-GTCA-TAT-TAACTAACCAATCAGCGTGCTCCTATTA--TTACTAGAC-------GATAGCCAATCAACAAGCTCCTGTCAA----TGCTATGC-GTCGG-TCTATAA-----C--GGGAAAAG-CTGGAACC-----G-------TCT-CGACAGTT--TAAtctgc
gi|6                          :                      aTGGA--AT-A---ACAA--------CAGCA---A---TGGCAGTTGA--C--TCT-GTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACTC--A----C--CA---TGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAGTT---A--ATTA---A--A--------TAACA---AAATTAGCGGTTGATTC--T---GTCACTACACG-AT-A-A--A------A------------------------------------------------------------------------------------C--A----C---A---TGTGA-A--ATA----GTTATC-TGGT-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCAAGTGTGAC--GGGAAGAG-CTTAGCCC-----A-------T-T-TTACAcgtccatggagatcttgggccatttctg
gi|8                          :                                                 AACA---T---TAGCACTCGA--C--TCGAG-CAATGCAAG-ATTA-A--ACATATGA-A---------AT--AT---GA---------ATGGCATAGT-------G----T----------------TTCC-----TTATTC--A----C--CA---TGTAACTTTATAAA-AATGAAG-TGGT-----GA--GAA--AAA---------AA--AGTTAAAT---------C-TCAC---A-TC-------T--GTTA--GGG-TTTCTC---GAC-GTGA-AAT-AAACTTAC--A--AGCGGGTTCCTACTA--TTGCTAAAT-------G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|9                          :      aatactACGAGAGCGTTTATA--AA-A---A--AAAATGTAGCAACA-------TGGCGGTCGAACC--T---GTCAATACAAG-AA-A-A--ACAT---A-ATT-------AT--AT---GA---------AATA-------------G----C----------------TGAT-----ATATTC--A----C--CA---TATAACATCATAAA-AGTAAAA-TCGT-----GA--GAA--AT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCAC---A-TT-------C--ATCA--GGGTTTACCC---AAC-GTAA-AAC-TAACTGACCGATCAGCATGTTCCTACTG--TTGC





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Reference ( family-4768 )     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCA-AG-----C--GGGAA----G--AG--CTGG-GNCCG-T-TCTACAGTC--TAATCTGATAAG
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gi|12                         :                                                                                                 --A------A-A---------AT------------------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----T--CA---TGTTGAATTTTAA--GGTAAAA-CGGT-----GG--GAA--AATT---T-T--AA--CTTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTA--CAGTTTTCCC---AAT-GCAA-AAT-CAACTGACCAATCAGGGTGTTCCTAATA--TTGCTAGAC-------A-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTAACAA----TGCCATGTAGAGGA-ACTCA-AG-----C--AGG
gi|13                         :      taaatCACGAGAGTGTTTAGA--AT-A---A--A--------TAACATAAA---TGGCGGTTGA--C--TTT-GTCATTACAAG-AT-A-A--A------ACAT--------AT--GC---GA---------A----------------G----TCGT-------------TTCT-----ATTTTC--A----C--CA---TGTAAGACTATAAA-GATACTA-TGGT-----AA--AAA--AA-----TATCGAC--ATGTGAACTT-------T-TCAA---A-TT-------T--ATTT--GTACTTTTTCAA-AAT-GTGA-AAT-TAACTGACCAATCAATGTGTgtccgtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                  AACACTTTAAA-GGTAATA-TGAT-----GA--GAA--AAAT---TACACAA--ATTTTAACGTAA-A-A-T-TCAC---A-TT-------C--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-ATAA-GAT-TAACAATCCAATTTATGCAATCCTACCA--TAGCTAGAT-------G-TAGCCAGTCAGTTGGCTCCTACCAG----TG-TAAGT-AAACA-TCTCT-AG-----C--AGAAT----G--AG--CTGG-GACTGAT-TCTA
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gi|19                         :                                agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat--T---GTCATTAAAAT-AT-G-A--A------ATAT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TAG--------------TTTT-----ATATTC--A----G--CA---TGTAAATTTATAGA-GATAAAA-TGGT-----GA--TAC--GAAT----ATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAA---A-TT-A--------ATTAAAGTGTTTTTCC---A-C-ATAA-TAT-TAACTGACCAATCAGCATGCTCCttgaatgtt
gi|2                          :    aacgtttggcaattGTGTTTTAA--AT-A---ACAA--------CAACA---C---TGGCAATCAATTC--T---GTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATTT--ATTAAC--CA---TATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTT-AG-----C--GGGGA----GATAGATCTGC-AAACGTT-TCTACAGTC--
gi|20                         :                                                                                      CAAG-AT-A-A--A------A-C---------GT--GT---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTC--AGCA-CAACA---TCTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTG--GCGCTTTCTC---CACAGTAACGAT-TTGCTA--CAGTAAGCGGGTTCTTACCA--CTGGCAGAT-------G-Taagatagtatttacat
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gi|22                         :               agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatgaATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATTC--A----C--AA---TGTAACATTGTAAG-GGGAATA-TGGC-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
gi|23                         :                                                                  gtaa--C--T---GGCAATACAAG-AT-A------------------------T--AT---A-------------------------------------------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGCAACAATATGAATGG--ATATTGGT-----AA--CAA--AAAT---TATCGGA--TTTGGAACTTAA-A-C-C-TCAC---ATTT-A-----T--ACTA--ATATTTTTTCCAAAAC-GTAA-AAT-Taata
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gi|25                         : tatgactggccagatGAGCGTTTAGA--AT-AAATA--A--------CAACA---A---CAGCGGCCGACTC--T---TTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATGT--A----C--CA---TG-GAC-------------ATA-TGGT-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-AGT-AAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTATCG--TTGCCAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTTCTATTAA----TGCTTTAT-GATGG-
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaagtctgtaacatTCTTACTA--TTACTAGAT-------G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGA-GATG
gi|29                         :             acgcaaaatattcaaacata---A--A--------CAACA---AACATGGCGGTTAA--C--TTT-GTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATTTGA--AT-A---A--G--------TAACA---A---TGGTGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTTC--A----G--CA---TGTAACACTTTACA-GGCAACT-TGGT-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAA-AG-----C--AGGGA----G--AG----GGAGGCCA-T-TCCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
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gi|4                          :                GAGCGTTTAGACTAT-AT--A--A--------CAACA---A---TGGCGGTTGA--CATT---GGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTTTTA----C--CA---AATAATACT-TAA--TGTAATACTAGTATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-AC------------------A----G--AG--CTGG-GTCTG-T-T
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gi|6                          :                      aTGGA--AT-A---ACAA--------CAGCA---A---TGGCAGTTGA--C--TCT-GTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACTC--A----C--CA---TGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACCG--TCCA--------T--GG--A----G--AT--CTTG-GGCCA-T-Tgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAGTT---A--ATTA---A--A--------TAACA---AAATTAGCGGTTGATTC--T---GTCACTACACG-AT-A-A--A------A------------------------------------------------------------------------------------C--A----C---A---TGTGA-A--ATA----GTTATC-TGGT-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCA-AGTGTGAC--GGGAA----G--AG--CTTA-GCCCA-T-TTTACAtctg
gi|8                          :                                                 AACA---T---TAGCACTCGA--C--TCGAG-CAATGCAAG-ATTA-A--ACATATGA-A---------AT--AT---GA---------ATGGCATAGT-------G----T----------------TTCC-----TTATTC--A----C--CA---TGTAACTTTATAAA-AATGAAG-TGGT-----GA--GAA--AAA---------AA--AGTTAAAT---------C-TCAC---A-TC-------T--GTTA--GGG-TTTCTC---GAC-GTGA-AAT-AAACTTAC--A--AGCGGGTTCCTACTA--TTGCTAAAT-------G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|9                          :      aatactACGAGAGCGTTTATA--AA-A---A--AAAATGTAGCAACA-------TGGCGGTCGAACC--T---GTCAATACAAG-AA-A-A--ACAT---A-ATT-------AT--AT---GA---------AATA-------------G----C----------------TGAT-----ATATTC--A----C--CA---TATAACATCATAAA-AGTAAAA-TCGT-----GA--GAA--AT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCAC---A-TT-------C--ATCA--GGGTTTACCC---AAC-GTAA-AAC-TAACTGACCGATCAGCATGTTCCTACTG--TTGC





Alignments
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lowQualScore                  :                       ..  ..  . ...............     .......          ......... . .       .  . . .. .............................................................................    ......     .. .... ..  ...         .  ...  .   ..    .....  ..   ..  . .......   ..        ......... .    ... .  ..........    ..   .      ...   .  . .   .                            ..         .........           .         .   ....        .  .  ..   ..  .........    .... ..  ..    . .   . .         ..     ..     
lowQualScore                  :                       44  66  3 888888888888888     0000000          333333333 1 4       1  1 1 88 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000    111111     88 8888 88  555         6  222  7   22    33333  33   33  0 7777777   33        222222222 7    999 7  6666666666    22   8      888   6  8 5   5                            44         444444444           4         0   7777        4  1  00   00  444444444    5555 22  22    6 0   3 6         22     00     
consensus                     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCA-AG-----C--GGGAA----G--AG--CTGG-GNCCG-T-TCTACAGTC--TAATCTGATAAG
Reference ( family-4768 )     :          NCACGAGAGCGTTTAGA--AT-A---A--A--------CAACA---A---TGGCGGTCGA--C--T---GTCGATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------AT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAC---A-TT-A-----T--ATTA--GGGCTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTACTA--TTGCTAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTACCAA----TGCTATGT-GACGG-ACCCA-AG-----C--GGGAA----G--AG--CTGG-GNCCG-T-TCTACAGTC--TAATCTGATAAG
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gi|19                         :                                agttaccagtttgtattcatactgtggcgttataaaggtat--T---GTCATTAAAAT-AT-G-A--A------ATAT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TAG--------------TTTT-----ATATTC--A----G--CA---TGTAAATTTATAGA-GATAAAA-TGGT-----GA--TAC--GAAT----ATTGAA--ATTTTAACCA-ACA-C-T-TCAA---A-TT-A--------ATTAAAGTGTTTTTCC---A-C-ATAA-TAT-TAACTGACCAATCAGCATGCTCCttgaatgtt
gi|2                          :    aacgtttggcaattGTGTTTTAA--AT-A---ACAA--------CAACA---C---TGGCAATCAATTC--T---GTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATTT--ATTAAC--CA---TATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTT-AG-----C--GGGGA----GATAGATCTGC-AAACGTT-TCTACAGTC--
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gi|22                         :               agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatgaATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATTC--A----C--AA---TGTAACATTGTAAG-GGGAATA-TGGC-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
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gi|24                         :                                                                                                                                t---------A----------------G----A----------------TTCC-----TTATTG--A----C--AG---TGTAACATAACACA-GGTAATA-TGAT-----AA--G-------T---TA------------------A-A-C-C-TCAC---A-TT-A--------GTTA--TGGCTTTCCC---GAC-GTAG-ATC-TAAATGACCAATCAGCGTATT
gi|25                         : tatgactggccagatGAGCGTTTAGA--AT-AAATA--A--------CAACA---A---CAGCGGCCGACTC--T---TTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATGT--A----C--CA---TG-GAC-------------ATA-TGGT-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-AGT-AAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTATCG--TTGCCAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTTCTATTAA----TGCTTTAT-GATGG-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acCCAATCAGCGTCCTATTACTATGTTGAAAGAT-------GATAGTGAATAAGAGTGCTCGTAACAA------CTA-------------CA-AA-----T--AGGAT----G--AG--CTGG-GTCCG-T-TTTACgtgctgtgataaactcagataagtagaatgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaagtctgtaacatTCTTACTA--TTACTAGAT-------G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGA-GATG
gi|29                         :             acgcaaaatattcaaacata---A--A--------CAACA---AACATGGCGGTTAA--C--TTT-GTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATTTGA--AT-A---A--G--------TAACA---A---TGGTGGTCGA--C--T---GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTTC--A----G--CA---TGTAACACTTTACA-GGCAACT-TGGT-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAA-AG-----C--AGGGA----G--AG----GGAGGCCA-T-TCCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
gi|30                         :            gCGAGAGCGTC----------------A--------CAACA---A---TGGCGGTC----T--T---GTCAATACAAG-TT-A-A--A------ACAT--------AT--GT---GAGAT------A----------------G----T----------------TTTT-----Agt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                            agtgTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAG---TA---AA--ATTTGAACTT-ATT-C-C-TCAA---A--T-A-----T--ATAA--GGGTTTTCCC---AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCC---AAC-GTTA-AAT-TCACTCACCAATCAGCATTTTCCTA-TA--TTGATAAATA------A-TAGCt
gi|4                          :                GAGCGTTTAGACTAT-AT--A--A--------CAACA---A---TGGCGGTTGA--CATT---GGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTTTTA----C--CA---AATAATACT-TAA--TGTAATACTAGTATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-AC------------------A----G--AG--CTGG-GTCTG-T-T
gi|5                          :                                                                                  GATAAAAC-GT-A-A--A------A-T---------AT--GTCTTGA---------A----------------AATAAT----------------TCCT-----TAATTC--G----T--CA---TGTGA-ACTATAAA-GGTAACT-TTGT-----GA--CAA--AA-----TATTG-----TTTGGCCTT-A-AAC-C-TCAT---A-TC-------T--A--A--AGGCTTTCCC---AAT-GTCA-TAT-TAACTAACCAATCAGCGTGCTCCTATTA--TTACTAGAC-------GATAGCCAATCAACAAGCTCCTGTCAA----TGCTATGC-GTCGG--TCTATAA-----C--GGGAA----A--AG--CTGG-AACCG-TCTCGACAGTT--TAAtctgc
gi|6                          :                      aTGGA--AT-A---ACAA--------CAGCA---A---TGGCAGTTGA--C--TCT-GTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACTC--A----C--CA---TGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACCG--TCCA--------T--GG--A----G--AT--CTTG-GGCCA-T-Tgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAGTT---A--ATTA---A--A--------TAACA---AAATTAGCGGTTGATTC--T---GTCACTACACG-AT-A-A--A------A------------------------------------------------------------------------------------C--A----C---A---TGTGA-A--ATA----GTTATC-TGGT-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCA-AGTGTGAC--GGGAA----G--AG--CTTA-GCCCA-T-TTTACAtctg
gi|8                          :                                                 AACA---T---TAGCACTCGA--C--TCGAG-CAATGCAAG-ATTA-A--ACATATGA-A---------AT--AT---GA---------ATGGCATAGT-------G----T----------------TTCC-----TTATTC--A----C--CA---TGTAACTTTATAAA-AATGAAG-TGGT-----GA--GAA--AAA---------AA--AGTTAAAT---------C-TCAC---A-TC-------T--GTTA--GGG-TTTCTC---GAC-GTGA-AAT-AAACTTAC--A--AGCGGGTTCCTACTA--TTGCTAAAT-------G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|9                          :      aatactACGAGAGCGTTTATA--AA-A---A--AAAATGTAGCAACA-------TGGCGGTCGAACC--T---GTCAATACAAG-AA-A-A--ACAT---A-ATT-------AT--AT---GA---------AATA-------------G----C----------------TGAT-----ATATTC--A----C--CA---TATAACATCATAAA-AGTAAAA-TCGT-----GA--GAA--AT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCAC---A-TT-------C--ATCA--GGGTTTACCC---AAC-GTAA-AAC-TAACTGACCGATCAGCATGTTCCTACTG--TTGC


blockSeqs                     :                       TA  CT  T AAAAATGTAG          TAAA             CTCGA     C         C  T T TT ACTATGTGAAATATTAGTGGCAGATAGA                                                     GTTAGA     TT TTAA AA  CCA         G  AAT  A   AT    ATTAG  TG   CA  A AACTATC   .         TTAAAC    A    TTA T  AAATATT       AA          CAA   A    C   A                            TG         ATGGTTGG            C         A   TTAT        A     AA   AT  TGTGACG      GCTC AT  AT    A T   A C         .      . 
blockSeqs                     :                       TA  .   . CATTA               AACA             CTCT      T         .  . . .  CATATGAAATATGAATGGCATAGTGT                                                       A          .  GCA  .   .           A  AA   A   AC    .      .    .   A TATC      .         GTAAAA    .    .   .  GACCG         .           AA    .    .   .                            .          AA                  T         A   .           .     A    A   CGAG         .    .   .     . A   T .         .        
blockSeqs                     :                       CG  .   . AATAA               AAAT             CTTT      T         .  . . .  CGCGAAATGTGGTTTGAAGATAGT                                                         A          .  .    .   .           T  AA   T   T     .      .    .   T TATC      .         TTACAC    .    .   .  GAT           .           .     .    .   .                            .          GA                  T         C   .           .     A    A   CTT          .    .   .     . T   . .         .        
blockSeqs                     :                       TT  .   . AAAA                A                TTCT      T         .  . . .  AATATGCTAGTATGTGAAATAGT                                                          A          .  .    .   .           A  AA   T   A     .      .    .   A TACA      .         TTAAAC    .    .   .  TT            .           .     .    .   .                            .          AA                  C         C   .           .     T    T   CA           .    .   .     . A   . .         .        
blockSeqs                     :                       TA  .   . ACAA                T                TTCT      T         .  . . .  CATAATTATATGAAATAGC                                                              A          .  .    .   .           T  GA   T   A     .      .    .   A TATT      .         CAACAC    .    .   .  AT            .           .     .    .   .                            .          GA                  T         A   .           .     A    T   CA           .    .   .     . T   . .         .        
blockSeqs                     :                       TT  .   . ACAA                C                CTCT      G         .  . . .  AACATCATGTGAATTTGT                                                               A          .  .    .   .           A  AA   T   A     .      .    .   T TATT      .         TTAAAC    .    .   .  AT            .           .     .    .   .                            .          GA                  C         C   .           .     A    A   CA           .    .   .     . G   . .                  
blockSeqs                     :                       TA  .   . TAA                 A                CTTT      T         .  . . .  ATATGTCTTGAAAATAAT                                                               T          .  .    .   .           A  AA   T   A     .      .    .   A TGTT      .         TTAAAC    .    .   .  AC            .           .     .    .   .                            .          G                   T         C   .           .     T    A   CG           .    .   .     . T   . .                  
blockSeqs                     :                       TG  .   . AA                  A                CATT      T         .  . . .  ACATATGCGAAGTCGT                                                                 A          .  .    .   .           T  AG   G   A     .      .    .   A TATC      .         TTATTC    .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                   A         C   .           .     A    T   CG           .    .   .     . A   . .                  
blockSeqs                     :                       TA  .   . AA                  A                CTCT      T         .  . . .  AAATATAACTAACAAT                                                                 A          .  .    .   .           A  CA   T   A     .      .    .   A TTTT      .         AAAGAC    .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          A                   C         T   .           .     A    A   TA           .    .   .     . G   . .                  
blockSeqs                     :                       .   .   . AG                  A                TTCT      T         .  . . .  ACATATGTGAGATAGT                                                                 T          .  .    .   .           G  CA   C   A     .      .    .   G TATC      .         TTAAAC    .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                   A         A   .           .     A    A   CA           .    .   .     . C   . .                  
blockSeqs                     :                       .   .   . AA                  A                ACCT      G         .  . . .  ATATATGTGAAATAG                                                                  A          .  .    .   .           A  AA   T   A     .      .    .   A TATT      .         ATAAAA    .    .   .  C             .           .     .    .   .                            .          G                   C         C   .           .     .    A   CG           .    .   .                                
blockSeqs                     :                                 A                   T                CT        T         .  . . .  ACGTGTGAAATAGT                                                                   G          .  .    .   .           A  AA   T   A     .      .    .   A TACT      .         TTAAA     .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                   A         A   .           .     .    A   TG           .    .   .                                
blockSeqs                     :                                                     .                CT        T         .  . . .  ACATGAGAAATAGT                                                                   A          .  .    .   .           T  AA   T   T     .      .    .   T ATC       .         GTAAG     .    .   .  A             .           .     .    .   .                            .          G                   C         C   .           .     .    .   .                                                      
blockSeqs                     :                                                                      TT        T         .  . . .  AAGTGTGAAGT                                                                      T          .  .    .   .           A  T    T   A     .      .    .   A TGC       .         TTAAC     .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                   C         T   .           .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                .         .  . . .  ACCTCATACC                                                                       T          .  .    .   .           A  A    T   T     .      .    .   A ATT       .         AGAA      .    .   .  A             .           .     .    .   .                            .          G                   A         T   .           .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                          .  . . .  AAATAGT                                                                          T          .  .    .   .           A  A    T   C     .      .    .   A TTC       .         TAT       .    .   .  G             .           .     .    .   .                            .          G                   C         A   .           .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                          .  . . .  TATA                                                                             T          .  .    .   .           A  .    .   G     .      .    .   A ATT       .         AAC       .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                   .         C   .                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                          .  . . .  A                                                                                A          .  .    .   .           A  .    .   A     .      .    .   A AAT       .         CT        .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          G                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                 .                                                                                   .          .  .    .   .           .  .    .   .     .      .    .   A TT        .         TT        .    .   .  A             .           .     .    .   .                            .          G                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                        .  .    .   .     .      .    .   . TA        .         TT        .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .          .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                .   .     .      .    .   . TA        .         .         .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                          .      .    .   . T         .         .         .    .   .  T             .           .     .    .   .                            .                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                 .    .   . .         .         .         .    .   .  C             .           .     .    .   .                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           .     .    .   .                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .          .   .                                                                                                                                                           


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gi|2                          :      aacgtttggcaaGTGTTTTAA--AT-A-ACAA--------CAACA---C---TGGCAATCAATTCTGTCGATTCAAACAT-A-ATTG------A-A---------AT--AT---AACTAAC----A----------------A----T----------------TACTGTTAGATATTT--ATTAAC--CA---TATGACACTTTGAA------------T----------------AT---T-TCGAA--ATTTAACCGT-A-A-G-CATCAC---A-TC-G--------ACTA--GTGCTTTTCA---AAC-GGTA-AAT-TAACTGACCAATCAGCATTCTCCTACTT--TTGCTACATATGGTTGG-TAGCCAATCAGTGTGCTCCTTCCAG----TGATATGT-GATGG-ATCTT-AG-----C--GGGGA----GATAGATCTGC-AAACGTT-TCTACAGTC--
gi|20                         :                                                                               CAAG-AT-A-A--A------A-C---------GT--GT---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTC--AGCA-CAACA---TCTAACACTATAAA-GGTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAGT---TGTTGAA--ATTTGAACTTAA-A-C-C-TCAC---A-TT-------T--ATTG--GCGCTTTCTC---CACAGTAACGAT-TTGCTA--CAGTAAGCGGGTTCTTACCA--CTGGCAGAT-------G-Taagatagtatttacat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --ATTT--GGGCTTTCCT---AAC-GTCA-ATT-TACCTAACAGATCAACATGTTCCTAATA--TTGCTAGGTA------A-TAGCCAATCAAAGGGATCTTACCAA----TGCAATAT-GAC
gi|22                         :        agacaaaacgtatgtgaaataagactcgcatatagtatttctttacacaccaggtgacactttcatgaATACAAG-AT-A-A--A------A-CCTC------AT------------------A----------------C----C----------------TTCT-----ATATTC--A----C--AA---TGTAACATTGTAAG-GGGAATA-TGGC-----TA--GAA--AAAT----ATTGAA--ATTTGAACTT----------CAC---A-TT-------T--ATTA--CATATTTCCC---AAA-GTAA-AAT-TAACTGACCAATCAGTGTATTCCTATTA--TTGTTAGA
gi|23                         :                                                                 gtaaTCTGGCAATACAAG-AT-A------------------------T--AT---A-------------------------------------------------TTCT-----ATATTC--A----C--CA---TGCAACAATATGAATGG--ATATTGGT-----AA--CAA--AAAT---TATCGGA--TTTGGAACTTAA-A-C-C-TCAC---ATTT-A-----T--ACTA--ATATTTTTTCCAAAAC-GTAA-AAT-Taata
gi|24                         :                                                                                                                          ---------A----------------G----A----------------TTCC-----TTATTG--A----C--AG---TGTAACATAACACA-GGTAATA-TGAT-----AA--G-------T---TA------------------A-A-C-C-TCAC---A-TT-A--------GTTA--TGGCTTTCCC---GAC-GTAG-ATC-TAAATGACCAATCAGCGTATT
gi|25                         : tatgactggccagatGAGCGTTTAGA--AT-A-A--ATAA-----CAACA---A---CAGCGGCCGACTCTTTCAATACAAG-A--A-A--G------A-ATATGCTAGTAT--GT---GAAAT------A----------------G----T----------------TTCT-----ATATGT--A----C--CA---TG-GAC-------------ATA-TGGT-----GA--GAA--CATT---TTTT------TTTAAATTT-A-ggtatcaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AGT-AAACTGACCAATCAGCGTGTTCCTATCG--TTGCCAGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTTCTATTAA----TGCTTTAT-GATGG-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acCCAATCAGCGTCCTATTACTATGTTGAAAGAT-------GATAGTGAATAAGAGTGCTCGTAACAA------CTA-------------CA-AA-----T--AGGAT----G--AG--CTGG-GTCCG-T-TTTACgtgctgtgataaactcagataagtagaatgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaagtctgtaacatTCTTACTA--TTACTAGAT-------G-TAGCCAATCAACGTGCTCCTACTAATTATTGCTGTGA-GATG
gi|29                         :             acgcaaaatattcaaacata-A--A--------CAACA---AACATGGCGGTTAACTTTGTCGATGCAAG-AT-G-A--A------A-
gi|3                          :         atCAGGAGAGGAATTTGA--AT-A-A--G--------TAACA---A---TGGTGGTCGACT--GTCAATACAAG-AT-A-A--A------A-A---------GT--GT---GA---------A----------------G----T----------------TTCT-----GTTTTC--A----G--CA---TGTAACACTTTACA-GGCAACT-TGGT-----GA--GAA--GGAT---TATCGAA--ATTTGAACTT-A-A-C-C-TCAT---G-TTGA-----T--ATTA--AGGCTTTCCC---GAA-GTAA-AAT-TAACTCACTGATCAGTTTGTTCCTACTA--TTGCTAGGC-------G-TAGCCAATCAGAATGCTCCTAACAA----TGCTATGT-GATGGAACCAA-AG-----C--AGGGA----G--AG----GGAGGCCA-T-TCCGTAGTC--TAATC--ATAAGcttatgcagatagtaacagatagat
gi|30                         :            gCGAGAGCGTC--------------A--------CAACA---A---TGGCGGTC----TTGTCAATACAAG-TT-A-A--A------ACAT--------AT--GT---GAGAT------A----------------G----T----------------TTTT-----Agt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                     agtgTAATA-TGGT-----GA--GAA--AAAG---TA---AA--ATTTGAACTT-ATT-C-C-TCAA---A--T-A-----T--ATAA--GGGTTTTCCC---AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCCC---AAC-GTTA-AAT-TCACTCACCAATCAGCATTTTCCTA-TA--TTGATAAATA------A-TAGCt
gi|4                          :                GAGCGTTTAGACTAT-ATA--A--------CAACA---A---TGGCGGTTGACATTGGCGATGCAAG-AT-A-A--A------A-C---------AT--GA---GA---------AATA-------------G----T----------------TTCT-----TTATTTTTA----C--CA---AATAATACT-TAA--TGTAATACTAGTATTAGGA--GAC--AAATAACTATCGAA--ATTTGAACAA-AGA-C-C-TCAT---A-TT-------T--ACTA--GGACTTTCCC---AAC-GTAA-AAT-TAACGAACCAATCAGCCTTTTTCTACTA--TTGATGGAT-------G-TAGCCAATCAGCGTGCTCCTGCAAA----TGATATG----CGG-AC------------------A----G--AG--CTGG-GTCTG-T-T
gi|5                          :                                                                           GATAAAAC-GT-A-A--A------A-T---------AT--GTCTTGA---------A----------------AATAAT----------------TCCT-----TAATTC--G----T--CA---TGTGA-ACTATAAA-GGTAACT-TTGT-----GA--CAA--AA-----TATTG-----TTTGGCCTT-A-AAC-C-TCAT---A-TC-------T--A--A--AGGCTTTCCC---AAT-GTCA-TAT-TAACTAACCAATCAGCGTGCTCCTATTA--TTACTAGAC-------GATAGCCAATCAACAAGCTCCTGTCAA----TGCTATGC-GTCGG--TCTATAA-----C--GGGAA----A--AG--CTGG-AACCG-TCTCGACAGTT--TAAtctgc
gi|6                          :                      aTGGA--AT-A-ACAA--------CAGCA---A---TGGCAGTTGACTCTGTCGATTGAAA-AT-A-A--A------A-CT--------AT--GT---GA---------A----------------A----TATTAGTGGCAGATAGATTCT-----TAACTC--A----C--CA---TGGGACACTA----------------T-----GA--AAG--TAAT---T----------TTG--------------TCAC---A-TT-AAATATT--ATTA--GGG--------------------AT-TAACTGACCAATCAACATACTCCTACTA--TTGCTTGAT-------GATAGCCAATCAGAGTGCT-TTGTCAA----TACCATGT-GACCG--TCCA--------T--GG--A----G--AT--CTTG-GGCCA-T-Tgaaatt
gi|7                          :           CATGAGAGAGTT---A--ATTA-A--A--------TAACA---AAATTAGCGGTTGATTCTGTCACTACACG-AT-A-A--A------A------------------------------------------------------------------------------------C--A----C---A---TGTGA-A--ATA----GTTATC-TGGT-----GA--TAACAAAAT---AAT-GAA--ATTTGAACAG-A-A-----TCAT---T-TT-A-----C--AT------------------GC-GTAA-AAC-TAACAGACTAATCAGCATATTCCTAATA--GTGTTAGAT-------G-T---CGA-----GGGCTAAAAACAA----TACTACGT-GACGG-ATTCA-AGTGTGAC--GGGAA----G--AG--CTTA-GCCCA-T-TTTACAtctg
gi|8                          :                                               AACA---T---TAGCACTCGACTCGAGCAATGCAAG-ATTA-A--ACATATGA-A---------AT--AT---GA---------ATGGCATAGT-------G----T----------------TTCC-----TTATTC--A----C--CA---TGTAACTTTATAAA-AATGAAG-TGGT-----GA--GAA--AAA---------AA--AGTTAAAT---------C-TCAC---A-TC-------T--GTTA--GGG-TTTCTC---GAC-GTGA-AAT-AAACTTAC--A--AGCGGGTTCCTACTA--TTGCTAAAT-------G-TAGCCAATCAGCGAGCGTCTACCAA----TGATA
gi|9                          :      aatactACGAGAGCGTTTATA--AA-A-A--AAAATGTAGCAACA-------TGGCGGTCGAACCTGTCAATACAAG-AA-A-A--ACAT---A-ATT-------AT--AT---GA---------AATA-------------G----C----------------TGAT-----ATATTC--A----C--CA---TATAACATCATAAA-AGTAAAA-TCGT-----GA--GAA--AT-T---TACTGAG--ACTTGAACAT-A-A-AAC-GCAC---A-TT-------C--ATCA--GGGTTTACCC---AAC-GTAA-AAC-TAACTGACCGATCAGCATGTTCCTACTG--TTGC