lowQualScore : 1111111111111111111 222222222222222 2222222222222222222222 11111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22 111 11 22 1 11 3333333333333333333333 1111111111111111111 111111 1 2222222222 11 1111 2222 111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 11111 3333333333 1111 1 11111 2222
lowQualScore : 5 6 555 5 7777777777777777777 777777777777777 3 8888888888888888888888 11 4444 11111111 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7777777777 1 1 1 55 111 66 1 1 22 22 99 22 1 1 1 444444 3333 22 1 1 3333 3 22 1 44 11 5555555555555555555555 1 1 0 1 3333 555555 7777777777777777777 333 555555 555555 1 4 44 4 1 333 22 1 9 666 22 9999999 2 55555 2 3 2 1 55 4 55 2 22 2222222222 2 2 444 44 33 1 2 1111 0000 444 1 33 0 000000000 88 666666 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777777 8 3333 22 222 22 1 1 33333 3333 1 1 8 4 2 2 55 3 6666666 4 5 22 55555 6666666 2 0000000000 7777 2 2 2 0 2 6 2 66 2 44 6 00000 555 2222 1 1
lowQualScore : . . ... . ................... ............... . ...................... .. .... ........ . ............................................................................. .......... . . . .. ... .. . . .. .. .. .. . . . ...... .... .. . . .... . .. . .. .. ...................... . . . . .... ...... ................... ... ...... ...... . . .. . . ... .. . . ... .. ....... . ..... . . . . .. . .. . .. .......... . . ... .. .. . . .... .... ... . .. . ......... .. ...... ...................................................... ...... . .... .. ... .. . . ..... .... . . . . . . .. . ....... . . .. ..... ....... . .......... .... . . . . . . . .. . .. . ..... ... .... . .
lowQualScore : 6 5 000 4 7777777777777777777 999999999999999 6 0000000000000000000000 88 5555 11111111 9 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6666666666 7 7 7 00 888 55 7 1 66 66 55 88 7 7 7 888888 5555 33 7 7 7777 4 44 7 00 22 2222222222222222222222 7 7 8 7 7777 000000 5555555555555555555 222 000000 444444 9 6 55 1 9 333 66 9 4 000 66 8888888 0 00000 0 5 0 0 00 2 88 0 88 7777777777 2 2 111 66 44 1 5 9999 5555 777 7 77 1 777777777 33 888888 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444 9 4444 22 888 22 6 6 88888 3333 5 7 5 2 1 1 44 1 8888888 5 8 99 11111 8888888 1 1111111111 8888 4 4 4 8 4 7 7 55 4 22 2 11111 444 1111 4 0
consensus : GTNACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAC---TA----N---A-------ATTAT---ATG-AT-G--NTCT-T---C------------T---TA-TTT--------ATTG--T-------AAA------GTT-CTTG-A--NTGA----CAT----------ATCGGTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCAC-ACCG--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACATTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTCAT--GCCGT-C--TN-TTN----------TA-TN--A---AT-C-ATGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-NG---AAATATA------AA-T----TAA-CAAGTA--TATCTTATT-TAA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTTAATTA-AACT--GT-TT--CAA-T--CTAAATA-NTA--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTATT-ATTAATTA-CATTATTA---CAATGATAG--AAAATAA---------C-TAA------AT-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-AAAT-CATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC--AGTTN----TCT-------TTATTTGCAT-AA--TCAG-AACTGATATTAGCACTGAC---CAA-ATATTTTTATCAAG-TAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-ATTTAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( gi|8 ) : GTTACAATAAATT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAATAC---TA----T---A-------ATTAT---ATG-AT-G--ATCT-T---C------------T---TA-TTT--------ATTG--T-------AAA------ATT-CTTG-A--ATGA----CAT----------ATCGGTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCA--ACCA-GCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACATTC--TA--TTCGCTTTGTTTG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTCTT--GCCGT-C--TA-TTG----------TA-TA--A---AT-C-ATGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-TG---AAATATA------AA-A----TAA-CAAGTA--TATATTATT-TAA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA---TA--AG------CA-TT-----ATTTC-TTTAATTA-AACT--GT-TT--CAA-T--CTAAATA-TTA--A---TTTA-TT-AAGT---TTT-GTTTAACAAACATC--TTATT-ATTAAATA-CATAATAA---CAATGATAG--AAAATAA---------C-TAA------AT-------------A------------G------------A-T------------A------AACA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-AAAA-CATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC--AGTTC----TCT-------TTATTTGCAT-AA--ACAG-ATGTGATATTAGCACTGAA---CAA-ATATTTTTATCAAG-TAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-ATTTAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T---TG------T-----------TATCTCAAT--T-----A---ATGTAACAT---GA----A---G-------ATT-T---ATG-ATAG--ATCT-T---C------------C----A-TTTTAAAGATGATTA--C-------ATT------GTT-TTT-----ATC-----CAT----------ATCGGTGCAGTTAC-T-GT-GAAGTAC-ACCG--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATATTA--TA--TTTGCTTTGTGAG--GCT-C-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATATGGT----GTCCAT--GCTGT-C--T--TTT----------TA-TA--T---ATAC-ATGAATATA-C----ACA------TAA----------------A-AG---AACTATA------AA-T----TAA-CAATTA--CGTCTTATT-TGA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CA-TG-----ATTTG-TTAAATTA-AACC--GT-TT--CAG-T--CTAAATA-ATA--C---TTTA-TT-CAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTATT-AT-AAATAACATTATTA---CAATTATAG--AAAATAA---------C-TAA------AT-------------A------------G------------A-TTACCTGAGAA--ATT----AATA----AT--CAA---A--TG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAAAATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC--TGTTA----TCT-------TTATTTGCAT-----AC----T----TATTAGCACTGGC---TAA-ATAATTTTATCAAG-TAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA--TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGTTA
gi|4 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaGTAACAATAAAGT---TATACACCGCATT-A-----G---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACAT---GA----A---G-------ATTTT----TG-GTAG--CTCT-T---CCA----------T---T--TTT--------ACGG--T-------G-------------TT--------------AT----------ATAGGTGCAGTTAC-T-GT-GATGCAC-ACCG--ACCT-ACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACATTC--TA--GTCGCTTTGTGAG--GTC-C-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTATGAT----GTTCAT--GTCGT-T--TT-TTT----------TT-TATTG---AT-C-ATAAATATG-T----ACA------TGA----------------A-AG---AAATATA------AA-T----CAA-CAAGAA--TGTCTTATT-TAA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTTAATCA-AACT--GT-TT--CAT-T--ATAAATA-ATA--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTATT-ATTAATTA-CATTATTA---CAATGATAG--AAAATAA---------C--AA------AT-------------A------------GATTACCTGAGAAA-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-TT-TATA-----TGAT----AA-TCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-ACAA-CATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTAC---CTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG-AA--TCAG-AACTGATATTAGCACTGGC---GAA-ATA-TTTTATCAAG-TAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-ATTT-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTG
gi|6 : GTAACAATAAG------GTATG------T-G-----G---TAT-TC--C--C-----ATTAATGTAACA-----A----G---A-------AGTATCCCATG-TT-GTAATTC-T---T------------A---TA-TTT--------ATTG--TT------GAA------GTT-CTTG-A---TAAG---CAT----------ATCGGTGCGGTTGCAT-AT-AAAGCGC-ATCG--ATAT-ACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACATTA--AA--TTCGCTTTGTGGG--GCC-C-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATGAAAT----GTTCAT--GTCAT-C--GT-TTT----------TA-TC--A---TT-C-ATGAATATA-TGTATACA------TGA----------------A-AG---AAATACG------AA-T----CAA-CAATTACTTCTTTT-TT-TAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA---TA--AA------CA-TT-----GTTTC-TTAAATTA-AACT--CT-TT--CAT-T--CTAAATA-ATA--T---TCTA-TA-AAAT---TCG-ATTTAACAAACATC--TTAGA-ATTAATAA-CATTATTA---TAATTGTAG--AAAATAG---------C-AAA------AA-------------A------------GATTACCTGAGAAA-T------------A------AATA----GT--CAA---A--CGTTT-TATA-----TGAT----GT-C-------TT-T-TTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA-AAAT-CACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC--AGTTA----CAT-------TTCATTGCAT-AA--TCAG-AGCTGATATAAGCACAGAC---CAATTTTTTTTTATCAAG-TAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agtgt
gi|18 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacGTAACAATAAATTATTTATAT-------T-G-----ATAGCATCCC--C--C-----A---ATGTAACAC---T-----T---A-------TTTAT---ATG-AT-G--ATCT-T---------------------A-TTT--------ATTG--TT------AAA------GTT-CTTT-A--ATAA----CAT----------ATCGGTGCTGTTAC-G-GT-TAAGCA--ACCC--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACATTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GT-------------------------------------------T-C-ATGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-AG---AAATAT-------AA-T----TAA-CAAGTA--AGTCTTATT-TAG---ATA-GAA-TCAGATTTTGTAA---------------CA-TT-----ATTTC-TTTAATTA-AACT--GT-TT--TAA-T--CTAAATA-GT-----------------GC---TTTGGTTTAACAAACATC--TTACT-ATTAATTA-CATa
gi|22 : tGTTACAATAAATT---TACATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATG--GTAC---AA----T---A-------A--------------A--GTCT-T---C------------T---TA-TT---------ATTG--TT------AAA------GTT-CTT--------------------------ATCGGTGCAGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCC--ACTT-GCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACATTC--TA--TTCGCTTTGTGAA--GCC-C-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTCAT--GCTGT-CT-TT-TTT----------TA-TG--A---AT-C-ATGAA-ATA-T----ACA------AGA----------------A-TG---AAATATA------TA-T----TCA-GAATTG--GACAGTATT---A---ATA-AA
gi|28 : GTTACGATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CCTCTC--C--TCACCGA---ATGGTACAC---TA----A---A-------AT-AT---GTG-CT-G--TTCT-T---C------------C---TT-TTT--------ATTG--TT------AAA------GTT-CTTG-A--TTAA----CAT----------ATCGGTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCG--ACCT-GCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT
gi|19 : tTTACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--C--------ATT-ATGTAACATGGATA----T---AT------ATTGT---A------G--TTCT-T---C------------C----------------------------------------ATT--TTG-ACGGTGT----TAT----------ATCGGTGCGGT-AC-TTGT-GAACCAC-ACCG--ACCT-GCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATATTC--TT--TTCGCTTTGTGAG--GCC-C-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATTCGAT----GTTCTT--GC------------------------A-TA--A---AT-TAACAAATATCTT----ATT------TAA----------------A-T----AAAT-CA------GA-ATTTGTAA-TAAACAT-TAT-TTCTT-TAA---AT---AA-TC-T-GTTTG-AATC-TA--AA------TA-AT-----ATTTT-----ATTA-AGCTTGGT-TTAACGA-T--Cg
gi|3 : tataACAATAAATT---TATATA------T-A-----G---CATTTC--C--C-----A---AGGTAGCAA---TA----T---AGTAATACATCAC---ATA-AG-T--ATCT-T---CATCAATGTAATATGAGTA-TTG--------ACTG--T-------AAGTCTTCCATT-TTAC-A--GTGT----TTT----------ATTGGTGCGGTTAC-T-AT-GTAGCTT-ATCG--ACCA-GCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAATC--TA--TTCGCTTTGTGAG--ACC-G-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATATGAT----GTTTAT--GCCGT-CTTTT-TTT----------TA-TT--G---AT-T-ATGAATATA-T----ATA------TGT----------------C-AG---ATATATA------AA-T----TAA-CAAGTA--TATCTTTTT-TAA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTAAATTA-A--T--ATATT--CAA-T--CTAAATA-GTATTT---TTTA-TC-GAAT---TTG-GTTTAACAGATATC--TTAGT-ATTATTTA-AATTATTA---CAATTGTAG--AAAATAA---------C-TAA------AT-------------A------------GATTACATTTAAAA-T------------A------AATA----AT--CAC---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-AACC-CATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG--AGTTG----TCT-------TTATTGG--T-AA--A-----------ATCAGTACTGAC---CAA-ACATTTTTATCAAG-TAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTatcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|20 : ataACAATAAATT---T-TATA------T-G-----A---TCTTTC--C--C-----A---ATGTAACAC---TA----T---A-------GTTAT---ATG-TT-A--TTCT-T---C------------T---TA-TTT--------ATTC--T-------AAA------GTT-CTTG-A--ATGA----TAA----------AATGGTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCC--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACATTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----TTTCAT--GCCGT-C--TA-TTT----------TA-AT--G---AT-C-ATAA--ATA-T----ACA------TGG----------------A-AG---AAATATA------TA-T----TAA-CAAGTA--TATCTGATT-TAA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTTAATTA-AACT--GT-TT--CAG-T--CTAAATA-TTA--T---TTTA-TT-AA
gi|21 : ACAATAAAGT---TATATA------TCGCATATA---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACAT---GA----A---A-------GTT-T---ATG-GCAG--CTCT-T---C------------C----A-TTT--------------T-------AAC------GGT-GTT--------------AT----------ATCGGTGCGGTTAC-T-GT-GATGCAC-ACCT--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACATTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCC-CTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTCAT--GTCGT-C--TGTTTT----------TA-TT--A---AT-C-ATGAATATA-T----ATATATACTTGA----------------A-TG---ACATATA------AA-T----TGA-CAAGTA--TATCT-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG---TA--a
gi|15 : taACAATAAAGT---TCTATA------T-A-----T---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAA---TG--------A-------ATGAT---ATG-AT-G--ATAT-T---------------------A-TTT--------ATTGT-T-------AAA------GTT-CTTG----ATAA----CAC----------ATCGGTGCGGTAAC-T-GT-GAAGC----CC---GCCT-GCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACATTA--TA--TT-GCTTTGTGAG--GCC-C-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-A--------------TT--GCCGT-C--TA-
gi|12 : taACAATAAAGT---T---TG------T-G-----T---CATCTC--C------------AT-TAATA-----------------------TGAC---ATG-AA-G--ATTT-T---TG-----------T---TAGCTC--------ATCG--TTTAAACAAAA------ATT---------ATGT----CGTTTTCATTCGAGTCGGTGCGATTGC-T-GT-TAAACAT-ATCG--ACCT-GTTAGTTT-GTTTTTTaaggcgctttatcaagcgtttatatataaatcatgggcgttgtcatgccttgcaaagattacctttatttgtataatcagaactgatataagcactgaccaaatgtttttatcaaataaattaagagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|29 : tataACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--CA-C-----T---ATGTAACAT---GAA---T---A-------TTTAT----TGCAT----ATCT-T---C------------C----------------------------------------ATT-TTTACA--GTGT----TAT----------ATTGGTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCC--ACCT-GCGTCTTT-GGTTTTTtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|32 : tgAATAAAGT---TATATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACAC---TA----A---A-------AT-AT---ATG-CT-G--TTCT-T---C------------T---TA-TTT--------ATTGTTT-------AAG------ATA-CTTG-A--TTAA----CAT----------Aattcgcttt
gi|14 : tgtaaaATCTG------T-G-----T---CATTTC--C--------ATT-ATGTAACAT---GA----G---A-------ATT-T---GTG-GT----ATCTCT---C------------C---CA-TTT--------G---------------A------AT-------G--GTGT----TAT----------ACCGGTGCGGTTAC-T-AT-GAAGTAC-ACAG--ACCT-GCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACATTC--TA--TTTGCTTTGTAAG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACATGAT----GTTCAT--GTCGTTC--TT-TTG----------CA---------AG-C-GCGAA-ATA-T-----CA--------A----------------G-CGTTTATATATA------AA-A----T
gi|7 : atataTATA------T-G-----A---CATTTC--C------------ATG-AATGC---T-----TCCAA-------GTTAT---ATG-AT-G--TTGT-TATTC------------G---TA-TTT--------ATTG--T-------TGA------ATTTCTTG-A--TTAT----TAC----------ATCGGTGCGGTTGC-T-GT-GAAGCAT-ATCC--ACCT-GCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-TTCATTAGTTTCGCTTTGTGAG--GCA-T-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATATGAT----GATCAC--GTCGT-C--TT-TTT----------TAATT--G---AT-T-GTGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-AG---AAACATA------AA-T----TAA-CAATTT--TATTTTATT-TTATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA---TA--TA------CT-TT-----ATTTC-TCGAATTA-AACT--GT-TT--CGA-T--CTAAATA-ATA--G---TTTA-TT-AAAT---TTG-GTT----AAACTTC--GTATGGATTG-----CATTATTA---CAATTGTAG--AAA-TAA---------C-TTG------AT-------------A------------G------------A-TTACTTG------A------GA-A----AT--GAATAGA--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA-AAAT-CATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC--AGT--------T-------TAATTAATAT-AA--TCAA-AACTGATATTAGCACTGAC---AAA-ATAGTTTTATCAAGTTAAA-----A-GACAGACCACATATGGCAG--TGT-ATtatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|9 : tgtaacgagaac---CATTTC--C--C-----A---ATGTAACAC---TA----T---A-------GTTAT---ATG-AT-G--ATCT-T---C------------T---TA-TTT--------AATG--TT------AAA------GTT-CTTG-A--TTAA----CGT----------ATTGGTGGGGTAAC-T-GT-GAAGTAC-ACCA--ACCT-GCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT-A--TA--TT------GTGAG--GCC-C-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATATGAT----GTGCAT--GTCGT-C--TA-TTG----------TA-TT--A---AT-C-ATGAATATT-A----ACA------TGA----------------A-TG---AAATATA------AA-A----TAA-CAAGTA--TATCTGATT-TAA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA---TG--AA------CA-TT-----TTTTC-CTTAATTA-AACT--TT-TT--CCA-T--CTAAATG-TTA--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GCTTAACAAACATC--TTATT-ATAAAATA-TAGTCTTA---CAATGATAG--AAAATAA---------C--AA------AC-------------A------------G------------A-TTACCTGAGAAATA------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-AAAT-CATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC--AGTTC----TCT-------TTATTTACAT-AT--TCAG-AAGTGATATTAGCACTAAC---CAA-ATATTTTTGTCAAG-TAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-ATTTAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTacagatgtaataaattcggttaattctcaatattgat
gi|30 : TGTAACAA---TAAAGCT---G-------GTTAT--------T-G--GTCT-T---T------------A---TA-TTT----------TG--T-------TAA------A-------------------CAC----------ATCAGTGCGGTTTC-T-GTTGAAAAAC-ACCG--TCCT-GTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACACTA--TA--TTTGCTTTGTg
gi|31 : GTAACAA---TA--------A-------ATTAT---ATG-AT-G--ATCG-T---C------------T-------------------------------AAA------GTT-CTTG-A--TTAA----CAT----------TAAGGTGCGGTTAC-T-GT-TAAGCAC-ATCG--ACCT-GCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACATTC--TA--TTCGCTTTGTg
gi|24 : C---TA--------A-------AGTAT---ATG-TT-G--TTGT-T---C------------T---TA-ACT--------ATTG--T----------------------TG-A--A--------GT-----------TCGGTGCGATTAC-T-GT-GAAGCT--ACCC--ACCT-GCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATATAC--TT--TTCGCTCTGTGAG--GCC-C-TAAAAAA-------------------GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGCTCAT--GCCGT-A--TA-TTT----------TA-TT--A---AT-C-ATGTATATT-T----ACA------TGG----------------A-AG---AAATAT-------AA-T----TAA-CAAATG--TA
gi|10 : T-T---C------------T---TA-TTTT-------ATTG--T-------AAA------GTT-CTTA-A--TTGA----CAT----------ATCGGTGCGGTTAC-T-GA-GAAGCAC-ACCG--ACCT-GCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCATTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--TCC-C-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTAGT--GCCGT-C--TA-TTGT---------TA-TT--T---AG-C-ATGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-AG---A----------------------------TA--TATCTGATT-TAA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CA-TT-----ATTT--TTTAATTA-AACC--TT-TT--CAA-T--CTAAATA-TTA--T---TTTA-TT-AAGT---TTA-GTTTTACAAA------------ATTAAA-A-TATTATTA---CACTGACAG--AAAATAA---------C-TAA------ATTTTATTACCTGAGA------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT----------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT--AGTTG----TC--------TTATATGCAT-AA--TCAG-AAGTGATATTAGC----AA---C----TATTCTTATCAAG-TAAATTAGGA-GAagtagtaatgggat
gi|5 : TTA--T-------AAA------ATT-ATTG-A--TTGATTAACAT----------ATCGGTGCA-TTAC-T-GT-GAAGCA----CATTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTTTC--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCC-C-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATATGAT----GTTTAT--TCCGT-C--T---TG----------T--TA--ATG-AT-C-ATGTGCGTA-T----ACA------TGA----------------A-AC---AAATATA------AA-C----TAA-CAA--------ACTAAC-TAA----TG-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------AA-TC-----ATTTC-TTTAATAA-AACT--GT-TT--CAA-C--CTAAAAA-T-A--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTATT-ATTAATTT-CATTATTA---AAAGGATAG--GAAATAA---------C-TAA------AT-------------G------------G------------A-TTACCAATGAAATA------AAAA----GT--GAA---A--CG-CT-TGTAAATTATGAT----GT-GTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA-AACT-CATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC--AAGTG----TCT-------TCATATGCAT-AA--TCAG-AACTGACATAAGCACTCTC---CAA-ATATGATTATCAAG-TAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-ATTT-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTGt
gi|2 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgatt----CGT----------ATTGGTGCGGTTAA-T-GT-GAAACACAGCCG--ATCT-GATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTTTA--TA--TTCGCTTTGTGAG--GCT-C-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATATGAT----GTTCAT--GTCGT-A--TT-TTC----------T--TA---------C--TGTCTTTA-T----AAA-------GA----------------A-AG---AAA-ATA------AG-T----TAA-CAAGTA--TATCGTATT-TGA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTAAATTA-ATCT--GC-TT--CAA-T--ATAAATA-ATA--T---TTTA-TT-AAAT---TTG-GCATAACAAACATC--TTAAT-ATTAATTA-CTTA-------CAATTATAG--AAAGTAA---------C-CTA------AT-------------A------------G------------ACT------------ACCTGAGAATGATTGGT--CAA---A--CG-CT-TATA-----TGCT----GT-TCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA-AAAT-CGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC--AGTTA----TCT-------TTATTTGCAT-AATGAC------TGATCTTAGCACTGAC---CAA-ATATTTTAATCAAG-TAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A-ATAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTGATAgt
gi|11 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatgtgacaatgatatttgtgtcatatacgttatgtaacatgaatatttatggcagctattccattttaacgatgattatatccgctaacgtcTGCGGTTAC-T-GT-GAAGCA--ACCC--ACCT-GCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACATTC--TG--TACGCTCTGTGAG--GCC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATATGAT----GTTCAT--GCCGT-C--TA-TTT----------TA-TT--A---AT-C-ATGAATATA-T----ACA------TGA----------------A-AG---AAATGTA------AA-T----TAA-CAAGTT--TATCTTATT-TAA---AT--CAA-TCAGAATTGGTCA---TC--AA------CA-TT-----ATTTCTTTTAATTA-ATCT--GT-TT--CAA-T--CT---TA-TTA--ATATTTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTATT-GTTAATTA-CATTATTA---CAATGATAGAAAAAAAAA---------C--AA------ATTGATTACCTGAG-A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-AATA-----TGGT----GT-TCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA-AAAT-CATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC--AGTTA----TCT-------TTATTTGCAT-AA--c
gi|34 : CGTCTCTACATTC--TA--TCCGCTTTGTGAA--GCC-C-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-tttgctaataattttcatcaattaa
gi|25 : atgttactcgtttaataTTTGTTTGTGGTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATATGAT----GTG-TTAAGCCGT-C--T--TTA----------TT-TA--ACTGAT-C-ATGAGTATA-T----AT-------TG-------------------TG---AAATATATATAATAA-A----TAAACACGTA--TATCTTATT-----------AAA-T-ATAAT--GT----------G------CA-TC-----AATGC-TTAAAGTA-AA-T--GT-TT--TAAAT--CTAAAAA-TTA--
gi|16 : gattttgtaaactacaccatctC-C-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCC-T-ATATGAT----GTTCAT--GCCGT-C--TA-TTG-----------G-TA--A---G--C-GTG-----A-T----ACA------TCA----------------AGCG------TTTA----------------------TA--TATATAATCATGG---ACG-ATA-TCATGACTTGTAAAGGTA--AGAGTTTTCT-TT-----ATTTG-CTTAATCAGAAGTG-GTATTAGCAC-TGACCGAATA-TT-------TTTA-TT-AAGTAAATTT-Gtat
gi|13 : aaaatcagaatttgtaataaacgttatttctttaatcaaatgtttcaatctaaatcatttaattaagtttggtctaaccaacatcttattagtgaattaattatttcaatgaaagaaataaatcgatttC-C-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACACT-T-ATATGAT----GTTCAT--GCCGT-C--TA-TTGGCCAGCGC--GA-TA--T---AT-C-AAGCGTTTA-T----ATA------TGAAATCATGGGCGTTACCA-TG---AATTGCA------AAGA----TTA-CAGTTG--TCT-TTATT-TGC---AT---GA-TCATAA---GTAA---TATTAG------CA-CTGACCAATTAC-TTTTATCA-Agagacataccacatatggcaatttatatttaaaatcgttttttcactaaagttactgttgtt
gi|12 : ctattttattgatcatgaatatttacatgaacgaaatataaataaacaagtatatctatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattaC-C-TGCGAAA-T------AAAT----A--GTCGAACGCT-T-ATATGAT----G-TCAT--GCTGT-C--TT-TTG-----------G-CA--A---G--C-GCG-ATATA-T-----CA------AGC----------------GTTG---ATATATA------AA-A----Tgtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|17 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggatta-C-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATATGAT----GTCCAT--GCCGT-C--TT-TTGGCAAGCGCGATA-TATCA---AG-C-GTTTATATA-T----ACA------cattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tgtctttttttaataaaatcaataataaacattgattcttaatttaaataatattttattaagtttggtttagcaaacatcttagtattaataacattattacaattgtagaaagtaacgtaattgattat-C--TA-TTT----------TA-TT--G---AT-C-ATGAATATT-T----ACA------TGA----------------A-CG---AAATATA------AA-T----AAA-CAAGTA--TATatcatgggcgttcttatgcctcgcagtagtctttatttggataatcaaaactgatataagtactgaccaaatgtctttatgaagtaaattaagagacataccacatatggcaatttatacgttaactcgtttttattaaacgtttatgtc
gi|19 : ATA------AA-T----TAA-CAA--A--TATCTTATT-TAA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CA-TT-----ATTTC-TTTAAATA-ATCT--GT-TT--GAA-T--CTAAATA-ATA--T---TTTA-TT-AAGC---TTG-GTTTAACGATCATCGTTTATT-ATT---TC-CATTTTTC---CAATGATAG--ctatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|17 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcTTTTT-TTA---ATA-AAA-TCA------ATAA---TA--AA------CA-TT-----GATTC-TT---------------------AA-T--TTAAATA-ATA--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAGCAAACATC--TTAGT-ATTAATAA-CATTATTA---CAATTGTAG--AAAGTAA---------CGTAATTGATTATCTGAG--------A------------A------------A-C------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-CCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA-CAAT-CATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCG---------C--AGTAG----TCT-------TTATTTGGAT-AA--TCAA-AACTGATATAAGTACTGAC---CAA-ATGTCTTTATGAAG-TAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-ACGTTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTT
gi|13 : tgtcTATT-TAC---ATG-AA---CGAAATATA-AA---TA--AA------CAAGT-----ATATC-T---AT-----CT--GT-TT--CAA-T--CTAAATACTTT--T---TTTA-TT-AAGT---TTG-GTTTAACAAACATC--TTTTT-ATTAATAA-CATCATTA---CAGTGCTAG--AAAATAA---------C--AA------AT-------------ACATTACCTGAGAA------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CA-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG-AAAT-CATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC--AGTTG----TCT-------TTATTTGCAT-GA--TCAT-AAGTAATATTAGCACTGAC---CAA-TTACTTTTATCAAG-TGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AATCAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTtatgtc
gi|16 : ctattttattgatcatgaaA-AAA-TCAGAATTTGTAA---TA--AA------CG-TT-----ATTTC-TTTAATCA-AA-T--GT-TT--CAA-T--CTAAATC------A---TTTAATT-AAGT---TTG-GTCTAACCAACATC--TTATT-AGTGAAT----TAATTATTTCAATGAAAG--AAA-TAAATCGATTTCC-TAA------G--------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CC-TATA-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA-TAAT-CATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG--AGTTT----TCT-------TTATTTGCTT-AA--TCAG-AAGTGGTATTAGCACTGAC---CGA-ATATTTTTATTAAG-TAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-ATTTAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTa
gi|12 : -T--CTAAATA-TTT--T---TTTT-TTCAAAT---TTG-AGTTAACAGACATC--TAAGT-TTTAATTA-CATTATTA---GAATTGTAG--ACAATAA---------C-TTA------AC-------------G------------G------------A-TTACCTGCGAAATA------AATA----GT--CGA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT--CATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA-AAAT-CATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT--AGTTA----TCG-------TTATTTGCAC-AATTACA--AC-TGATATAAGCACTGgtt
gi|21 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttaaatcagaatgtgaaattagctttatt---------C-TTA------AG-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGTCGTC-TGTT
gi|23 : taacaataaagttatatatcgcatatatatcttcatcaatgtaacatgaaagtttatggcagctcttccattttaacggtgttatatcggtgcggttactgtgatgcacacctacctgcttccttggtttttcgtcttaacattctattcgctttgtgaggcc-TAA------AT-------------A------------A------------A-T------------A------AAT------T--CAA---ATTCG--T-TATA-----TGGT----GT-TAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA-AACA-ATTATACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAGAGTTA----AAT-------TCATTTTCATGAA--ATAG-AACTCATATTTGCA---AATACCAA-AT-CCTTTATCATT-TCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A---AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATGtttattaatcatgaatatatatatatacttgaatgacatataaattgacaagtatatctgataaaatcagaatttttagta
gi|25 : tgaAA------AT-------------A------------A------------A-T------------A------AA------GT--CAA---T--CG-CAATATA-----TGAT----GTGTTAAGCCGTC-Tcgtatgt
gi|20 : gattttgtaaactacaccatcttttgtttgtggttacagag-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----TT-TCATGCCGTC-TATTttatttaactgatcatgagtatatattgtgaaatatatataataaataaacacgtatatcttattaaatataatgtgcatcaatgcttaaagtaaatgttttaaatctaaaaattatat
gi|18 : acaataaattttatatgatctttcccaatgtaacactatagttatatgttattcttcttatttattctaaagttcttgaatgataaaatggtgcggttactgtgaagcaacccacctgcttccttggtttttcgtctcaacattctattcgctttgtgaggccctgag-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGttaatgatcataaatatacatggaagaaatatatattaacaagtatatctgatttaaataaaatcagaatttgtaataaacattatttctttaattaaactgtttcagtctaaatattattttattaaa
gi|14 : tgtaacaataaattatttatattgatagcatcccccaatgtaacacttatttatatgatgatcttatttattgttaaagttctttaataacatatcggtgctgttacggttaagcaacccacctgcttccttggtttttcgtctttacattctattcgctttgtgaggccctgag-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TACA-----TGAT----GT-TCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA-AAAT-TATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC--AGTTA----TCT-------TTATTTAAAT-AA--TCAGTAC-TAATATTAGCACTGAC---CAA-ATATTTTTGTCAAG-TAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-ATTTAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTaatatatacatgaaagaaatataattaacaagtaagtcttatttagatagaatcagattttgtaacattatttctttaattaaactgttttaatctaaatagtgctttggtttaacaaacatcttactattaattacat
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggccctgag-------------A------------A------------A-C------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-TC-TAT--------------------TGCCGTC-TA------AAG-GCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA-AAT--CATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC------------CT-------TTATTTGTAT-AA--TCAG-AACTGATATAAGCACTGAC---CAA-ATGTTTTTATCAAA-TAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-ATTTAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGa
gi|19 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggccctgag-------------A------------A------------A-T------------A------AATA----GT--GAA---A--CG-CT-TATT-----CGAT----GT-TCTTGCatgc
gi|24 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctggg------------A------AAAA----GT--GAC---G--CT-CT-TATA-----TGATTGATGC-TCATGCCGTA-TATTataaattaacaaatatcttatttaaataaatcagaatttgtaataaacattatttctttaaataatctgtttgaatctaaataatattttattaagcttggtttaacgatcatcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|27 : ctaaagtatatgttgttgttcttaactattgttgaagttcggtgcgattactgtgaagctacccacctgcttccttcggtttttcatctctatatacttttcgctctgtgaggccctaACA----ATTGGAG---A--CG-AT-TATT-----TGAT----TT-TTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA-ACAG-AATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC--G-----------------------TGCAT-AA--ATAG-TAGTAATATTTTCACCGA----C----TACTTTTATCAAA-TAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATTttattaatcatgtatatttacatggaagaaatataattaacaaatgtaagtagtaatgggat
gi|22 : atA----GT--GAA---A--CG-CT-TATA-----TGAT----GT-TCATGCTGTC-TTTT
gi|26 : gttacaataaatttacatatgacatctctacgaatggtacaataaagtcttcttattattgttaaagttcttatcggtgcagttactgtgaagcaacccacttgctttcttgcttgttagtctctacattctattcgctttgtgaagccctgagatattgagtaaaatattg-----TGAT----GT-TCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA-------AAAT-CATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC--AGTTC----TCT-------TTATTTGCAT-AA--TCAG-AAGT-ATTTT-------------AA-ATA-TTTTATCAAG-TAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-ATTTAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCtttatgaatcatgaaatatacaagaatgaaatatatattcagaattggacagtattaataaa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111111111 222222222222 11111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111 11
lowQualScore : 1 2 444 4 333333333333333333 88 666666666666 44444444444444444444 333 5 9 4444 1 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 1 8 1 1 0 22 22 22 1 1 555555 4444 22 1 2 4444 2 22 44 9999999 1 66 3 22 1 1 1 4444 333 2 555555 1 1 333 333 1 3 1 22 333 1 1 22 1 66 11 22 1 22 1 1 22 2 2 0 2 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777 55555 333 22 2 55555 2 1 4 2 22 22 6666666 1 666 3 6666666 22 1 0 2 1 2 2 555555555 0 33 5 99999 444 22 1
lowQualScore : . . ... . .................. .. ............ .................... ... . . .... . ... .............................................................................. . . . . . . .. .. .. . . ...... .... .. . . .... . .. .. ....... . .. . .. . . . .... ... . ...... . . ... ... . . . .. ... . . .. . .. .. .. . .. . . .. . . . . . .................................................. ..... ... .. . ..... . . . . .. .. ....... . ... . ....... .. . . . . . . ......... . .. . ..... ... .. .
lowQualScore : 0 5 444 2 111111111111111111 77 555555555555 99999999999999999999 222 1 1 2222 7 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 3 7 7 2 33 44 44 9 9 555555 0000 66 9 0 2222 0 88 55 7777777 9 11 8 44 9 9 9 0000 555 0 888888 0 9 333 333 4 6 9 66 333 7 8 55 9 00 99 66 9 66 9 7 88 1 1 5 4 9 99999999999999999999999999999999999999999999999999 66666 777 99 1 00000 0 2 0 0 88 88 5555555 7 222 1 5555555 88 8 1 2 7 2 5 666666666 9 77 3 11111 777 77 6
consensus : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--AAA-------ATTA--T---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGAT--T-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC--T------NT-T-TTA-TTAAT-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTCTTT-AATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAATAA---------C---TAA------AT----T--------A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( family-4699 ) : GTNACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--ANA-------ATTA--T---ATGAT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGAN--T-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC--T------NT-T-NTA-TNAAT-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAANGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTCTTT-AATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAATAA---------C---TAA------AT-------------A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTNTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T---TG------T-----------TATCTCAAT--T-----A---ATGTAACATG--AAG-------ATT---T---ATGATAGA---TCT-T---C------------C----AT--TTTAAAGATGA--------TTA--C-ATTGTTTTT-AT--C--------CA------TATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGTACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATAT--TA--TA--TTTGCTTTGTGAGGCTC-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATA----TGGTGT-CCATGCTG--TC--T------TT-T--TA-TATATAC-ATGAATATA-C----A---C-A------TAAAAGAACT-ATAA---AT---TAACAATTA-CGTC-TTATTT-GA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TGATTTGTTA-AATTAAACC--GT-TT--CAG-TCTAAATAATA--CTTT-ATT-CAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATA-AATAACATTATTACAATTATAGAAAATAA---------C---TAA------AT-------------AGATTACCTGAGAAATTAAT-----AATCAA---A--TG-CTTATA-----TGATGTTCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAA--AATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC---TGTTATCT-------TTATTTGCAT--A-------CT--TATTAGCACTGGCTAA-ATAATTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA---------TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGT
gi|10 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaT-T---C------------T---TAT--TTT-------A--------TTG--T-AAAGTTCTTAAT--T-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGA-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGTCCC-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TAGTGCCG--TC--T------AT-TGTTA-TTTAG-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAAAGA-----------------------TA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTT-TTT-AATTAAACC--TT-TT--CAA-TCTAAATATTA--TTTT-ATT-AAGTTTAGTTTTACAAA------ATTA---AA--ATATTATTACACTGACAGAAAATAA---------C---TAA------ATTTTATTACCTGAGA------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT------------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT---AGTTGTC--------TTATATGCAT--AATCAGAAGTGATATTAGCA---AC-----TATTCTTATCAAGTAAATTAGGA-GAa
gi|11 : TGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACAT--TC--TG--TACGCTCTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC--T------AT-T-TTA-TTAAT-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAAAGAAAT-GTAA---AT---TAACAAGTT-TATC-TTATTT-AA---ATC-AA--TCAGAATTGGTCA--TCAACA-TTATTTCTTTTAATTAATCT--GT-TT--CAA-TCTTATTAATA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTGTT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAAAAAAA-------C----AA------ATTGATTACCTGAG-A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTAATA-----TGGTGTTCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA--A--AATCATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATt
gi|12 : TAACAATAAAGT---T---TG------T-G-----T---CATCTC--CATT-----A---ATATGACATG--AAG-------ATTT--T----TGTTAGC---TCA-T---C-----------------GT--TT--------AAACAAAAATTA--T-GTCGTT-TTCAT--TCG-A-------------GTCGGTGCGATTGC-TGT-TAAACATA-TCGACCTGTTAGTTT-GTTTTTTttgctaataattttcatcaattaa
gi|12 : ta-AAA-TCAGAATGTGAAA--TTAGCT-TTATTTCT----------------------------AAATATTT--TTTT-TTTCAAATTTGAGTTAACAGACATCTAAGTTTT-AATTACATTATTAGAATTGTAGACAATAA---------CT--TAACGG---ATTACCTGCG-----A------------AATAAAT-----AGTCGA---A--CG-CTTATA-----TGATG-TCATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA--A--AATCATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT---AGTTATCG-------TTATTTGCAC--AATTACAACTGATATAAGCACTGtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttC--T------AT-T-TTA-TTGAT-C-ATGAATATT-T----A---C-A------TGAACGAAAT-ATAA---AT---AAACAAGTA-TATC-T
gi|13 : TATTT-AC---ATG-AA---CGAAATATA-AA--TAAACAAGTATATCT----AT----CT--GT-TT--CAA-TCTAAATACTT--TTTTTATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTTTTATT-AATAACATCATTACAGTGCTAGAAAATAA---------C----AA------AT-------------ACATTACCTGAGAAATAAAT-----AGTGAA---A--CA-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG--A--AATCATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC---AGTTGTCT-------TTATTTGCAT--GATCATAAGTAATATTAGCACTGACCAA-TTACTTTTATCAAGTGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AA---T----CAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|14 : ctattttattgatcatgaaATCTG------T-G-----T---CATTTC--C--------ATT-ATGTAACATG--AGA-------ATT---T---GTGGT--A---TCTCT---C------------C---CAT--TTGA------A--------TGG--T----GTT------------------A------TACCGGTGCGGTTAC-TAT-GAAGTACA-CAGACCTGCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACAT--TC--TA--TTTGCTTTGTAAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACA----TGATGT-TCATGTCG--T---T------CT-T-TTG--CAAG-C-GCGAA-ATA-T----a
gi|14 : atata-------------A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTACA-----TGATGTTCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATTATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTAAAT--AATCAGTACTAATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-AT---T----TAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTcaagcgtttatatataaaattatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggccctgagTAACAATAAAGT---TCTATA------T-A-----T---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAAT---GA-------ATGA--T---ATGAT-GA---TAT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGA---T-A-A----CA------CATCGGTGCGGTAAC-TGT-GAAGC----CCG-CCTGCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACAT--TA--TA--TT-GCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-AT---------------TGCCG--TC--TAAAGGCGC-T-TTA-TCAAG-C-GTTTATATA-T----AAATC-A------TGGGCGTTGTCATGC---CT---T-GCAAAGATTACCTTTATTT------GTA-TAA-TCAGAACTGAT-A--TAAGCA---------CT-GACCAAA-T--GT-TT--TTA-TC-AAATAA---------ATT-AAGa
gi|15 : -------------A------------AACAAAT-----AGTGAA---A--CG-TCTAT---------------TGCCGTC-T-------AAAGGCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA--A--A-TCATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---------CT-------TTATTTGTAT--AATCAGAACTGATATAAGCACTGACCAA-ATGTTTTTATCAAATAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGATGagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|16 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggccctgagA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACG-TTATTTCTTT-AATCAAA-T--GT-TT--CAA-TCTAAAT--CA--TTTA-ATT-AAGTTTGGTCTAACCAACATCTTATTAGTGAATTA-ATTATTTCAATGAAAGAAA-TAAATCGATTTCC---TAA------G--------------A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CCTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA--T--AATCATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG---AGTTTTCT-------TTATTTGCTT--AATCAGAAGTGGTATTAGCACTGACCGA-ATATTTTTATTAAGTAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTc
gi|17 : -TGTC-TTTTTT-TA---ATA-AAA-TCAA------TAA--TAAACA-TTGATTCTT---------------------AA-TTTAAATAATA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAGCAAACATCTTAGTATT-AATAACATTATTACAATTGTAGAAAGTAA---------CG--TAATTGATTATCTGAG--------A------------AACAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTCCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--C--AATCATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCGCA------------GTAGTCT-------TTATTTGGAT--AATCAAAACTGATATAAGTACTGACCAA-ATGTCTTTATGAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AC---G----TTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTTgtt
gi|18 : GTAACAATAAATTATTTATAT-------T-G-----ATAGCATCCC--C--C-----A---ATGTAACACT---TA-------TTTA--T---ATGAT-GA---TCT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTTAA--T-A-A----CA------TATCGGTGCTGTTAC-GGT-TAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-----------------------------------T-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAGTA-AGTC-TTATTT-AG---ATA-GAA-TCAGATTTTGT------AACA-TTATTTCTTT-AATTAAACT--GT-TT--TAA-TCTAAATAGTG--C-----------TTTGGTTTAACAAACATCTTACTATT-AATTACATtatgtc
gi|19 : tTTACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--C--------ATT-ATGTAACA-T--GGA---------TA--T---ATATT-GT---AGT-T---C------------T---T----CC--------A--------TT------------TTGACGGT-G-T----TA------TATCGGTGCGG-TACTTGT-GAACCACA-CCGACCTGCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATAT--TC--TT--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATT----CGATGT-TCTTGC----------------------A-TAAAT-TAACAAATATCTT----A---T-T------TAAAT-AAAT-CAGA---ATTTGTAATAAACATTAT--TTCTTT-AA---AT---AA-TCTG--TTTG-AATCTAAATA-ATATTTT-----ATTAAGCTTGGT-TTAACGA-TC
gi|19 : tata-ATAA---AT---TAACAA--A-TATC-TTATTT-AA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTCTTT-AAATAATCT--GT-TT--GAA-TCTAAATAATA--TTTT-ATT-AAGCTTGGTTTAACGATCATCGT-TTATT-ATTTCCATTTTTCCAATGATAGatcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|2 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcGTGACAATGA------TATTTG------T-G-----T---CATATA--CG-T-----T---ATGTAACATG--AAT-------ATT---T---ATGGCAGC---TAT-T---C------------C----AT--TTTAACGATGA--------TTA--T-A---TCCGCTAA--C-GTC----CG------TATTGGTGCGGTTAA-TGT-GAAACACAGCCGATCTGATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTT--TA--TA--TTCGCTTTGTGAGGCTC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TA--T------TT-T-CT------T-A-CTGTCTTTA-T----A---A-A-------GAAAGAAA--ATAA---GT---TAACAAGTA-TATC-GTATTT-GA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT--TAAACA-TTATTTCTTA-AATTAATCT--GC-TT--CAA-TATAAATAATA--TTTT-ATT-AAATTTGGCATAACAAACATCTTAATATT-AATTAC----TTACAATTATAGAAAGTAA---------C---CTA------AT-------------AGACTACCTGAG-AATGATT-----GGTCAA---A--CG-CTTATA-----TGCTGTTCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA--A--AATCGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AAT---GACTGATCTTAGCACTGACCAA-ATATTTTAATCAAGTAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A----A----TAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTG
gi|20 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatACAATAAATT---T-TATA------T-G-----A---TCTTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--ATA-------GTTA--T---ATGTT-AT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTC--T-AAAGTTCTTGAA--T-G-A----TA------AAATGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATTT-TCATGCCG--TC--T------AT-T-TTA-ATGAT-C-ATAAATATA----------C-A------TGGAAGAAAT-ATAT---AT---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTCTTT-AATTAAACT--GT-TT--CAG-TCTAAATATTA--TTTT-ATT-AAatatc
gi|21 : TAACAATAAAGT---TATATA------TCGCATATA---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--AAA-------GTT---T---ATGGCAGC---TCT-T---C------------C----AT--TT----------------------T-AACGGTGTT---------------A------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GATGCACA-CCTACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCCTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TC--TG-----TT-T-TTA-TTAAT-C-ATGAATATA-T----A---T-ATATACTTGAATGACAT-ATAA---AT---TGACAAGTA-TATC-T-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG--TAa
gi|22 : GTTACAATAAATT---TACATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACAAT--AAA------------------------G---TCT-T---C------------T---TAT--T---------A--------TTG--TTAAAGTTCTT-----------------------ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACTTGCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCTG--TCT-T------TT-T-TTA-TGAAT-C-ATGAA-ATA-T----A---C-A------AGAATGAAAT-ATAT---AT---TCAGAATTG-GACA-GTATT---A---ATA-AA
gi|23 : ---TAA------AT-------------A------------AATAAAT-------TCAA---ATTCG--TTATA-----TGGTGTTAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA--AACAATTAT--ACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAG-AGTTAAAT-------TCATTTTCATGAAAT-AGAACTCATATTTGCAAATACCAA-AT-CCTTTATCATTTCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A----------AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATG
gi|24 : tgaCT--A-A-------AGTA--T---ATGTT-GT---TGT-T---C------------T---TAA--CT--------A--------TTG--TTGAAGTTC----------------------------GGTGCGATTAC-TGT-GAAGC-TA-CCCACCTGCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATAT--AC--TT--TTCGCTCTGTGAGGCCC-TAAAAA-----------------A--GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGC-TCATGCCG--TA--T------AT-T-TTA-TTAAT-C-ATGTATATT-T----A---C-A------TGGAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAATG-TAcgtatgt
gi|25 : CTACACCATC--T---TTTG-TTTGTG-GTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATA----TGATGTGTTAAGCCG--TC--T------TTAT-TTAACTGAT-C-ATGAGTATA-T----A---TTG------TGAAATATAT-ATAATAAAT---AAACACGTA-TATC-TTATT--AA---ATA---------------TAA--TGTGCA-TCAATGCTTA-AAGTAAA-T--GT-TT--TAAATCTAAAAATTA--Tagtagtaatgggat
gi|26 : gattttgtaaa-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA--------A--AATCATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAA---GTATT--------TTAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-AT---T----TAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCat
gi|27 : GAG---A--CG-ATTATT-----TGATTTTTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA--A--CAGAATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC---G-------------------TGCAT--AAATAGTAGTAATATTTTCACCGAC-----TACTTTTATCAAATAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATT
gi|28 : atacaattgGTTACGATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CCTCTC--C--TCACCGA---ATGGTACACT--AAA-------AT-A--T---GTGCT-GT---TCT-T---C------------C---TTT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGAT--T-A-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCGACCTGCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT--
gi|29 : tTGACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--CA-C-----T---ATGTAACATG--AAT-------ATT---T---AT--T-GCATATCT-T---C------------C----AT--TT-----------------TTA--C-AGTGTT------------------A------TATTGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCGTCTTT-GGTTTTTg
gi|3 : TAACAATAAATT---TATATA------T-A-----G---CATTTC--C--C-----A---AGGTAGCAAT--ATAGTAATACATCA--C---ATAAG-TA---TCT-T---CATCAATGTAATATGAGTAT--TG--------A--------CTG--T-AA-GTCTTCCAT--T-TTA----CAGTGTTTTATTGGTGCGGTTAC-TAT-GTAGCTTA-TCGACCAGCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAA--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGACCG-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TTATGCCG--TCTTT------TT-T-TTA-TTGAT-T-ATGAATATA-T----A---T-A------TGTCAGATAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTTTTT-AA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG--TAAACA-TTATTTCTTA-AATTAA--T--ATATT--CAA-TCTAAATAGTATTTTTT-ATC-GAATTTGGTTTAACAGATATCTTAGTATT-ATTTAAATTATTACAATTGTAGAAAATAA---------C---TAA------ATAGATTACATTTA-A------------AATAAAT-----AATCAC---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--ACCCATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG---AGTTGTCT-------TTATTGGTAA--AATC------------AGTACTGACCAA-ACATTTTTATCAAGTAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT-------------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTattcgcttt
gi|30 : aTGTAACAAT--AAA-------GCTGGTT---AT--T-GG---TCT-T---T------------A---TAT--TT------------------TG--T-TAA---------------A----CA------CATCAGTGCGGTTTC-TGTTGAAAAACA-CCGTCCTGTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACAC--TA--TA--TTTGCTTTGTG
gi|31 : GTAACAAT--A-A-------ATTA--T---ATGAT-GA---TCG-T---C------------T----------------------------------AAAGTTCTTGAT--T-A-A----CA------TTAAGGTGCGGTTAC-TGT-TAAGCACA-TCGACCTGCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGT
gi|32 : GTAAAAATAAAGT---TATATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACACT--AAA-------A-TA--T---ATGCT-GT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTGTTT-AAGATACTTGAT--T-A-A----CA------TA
gi|34 : tCGTCTCTACAT--TC--TA--TCCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-
gi|4 : atgttactcgtttaataGTAACAATAAAGT---TATACACCGCATT-A-----G---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--AAG-------ATT---T---TTGGTAGC---TCT-T---CCA----------T---T-T--TT--------A--------CGG--T----GTT------------------A------TATAGGTGCAGTTAC-TGT-GATGCACA-CCGACCTACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACAT--TC--TA--GTCGCTTTGTGAGGTCC-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTA----TGATGT-TCATGTCGTTTT--T------TT-T-TTA-TTGAT-C-ATAAATATG-T----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---CAACAAGAA-TGTC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA--TAAACA-TTATTTCTTT-AATCAAACT--GT-TT--CAT-TATAAATAATA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAATAA---------CAAATAG------ATTACCTGAG-----A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-TTTATA-----TGATAATCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--CAACATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTACCTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG--AATCAGAACTGATATTAGCACTGGCGAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-AT---T----T-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTGGTGT
gi|5 : --------TTA--T-AAAATTATTGAT--T-G-ATTAACA------TATCGGTGCA-TTAC-TGT-GAAGCACA-TTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATA----TGATGT-TTATTCCG--TC--T------TG-T-TAA-TGA-T-C-ATGTGCGTA-T----A---C-A------TGAAACAAAT-ATAA---AC---TAACAAAC--TAAC-T-------A---ATG-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAAAA-TCATTTCTTT-AATAAAACT--GT-TT--CAA-CCTAAA-AATA--TTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTTCATTATTAAAAGGATAGGAAATAA---------C---TAA------ATGGATTACCAATG-A------------AATAAAA-----AGTGAA---A--CG-CTTGTAAATTATGATGTGTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA--A--ACTCATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC---AAGTGTCT-------TCATATGCAT--AATCAGAACTGACATAAGCACTCTCCAA-ATATGATTATCAAGTAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-AT---T----T-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTG
gi|6 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgattGTAACAATAAGGT------ATG------T-G-----G---TAT-TC--C--C-----ATTAATGTAACA----AGA-------AGTA--TCCCATGTT-GT---AAT-T---C------------T---TATATTT--------A--------TTG--TTGAAGTTCTTGAT--A-A-G----CA------TATCGGTGCGGTTGCATAT-AAAGCGCA-TCGATATACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACAT--TA--AA--TTCGCTTTGTGGGGCCC-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATG----AAATGT-TCATGTCA--TC--G------TT-T-TTA-TCATT-C-ATGAATATA-TGTATA---C-A------TGAAAGAAAT-ACGA---AT---CAACAATTA-CTTC-TTTTTTTAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA--TAAACA-TTGTTTCTTA-AATTAAACT--CT-TT--CAT-TCTAAATAATA--TTCT-ATA-AAATTCGATTTAACAAACATCTTAGAATT-AATAACATTATTATAATTGTAGAAAATAG---------C---AAAAAAG--ATTACCTGAG-----A------------AATAAAT-----AGTCAA---A--CGTTTTATA-----TGATGT--------CT-TTTTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA--A--AATCACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC---AGTTACAT-------TTCATTGCAT--AATCAGAGCTGATATAAGCACAGACCAATTTTTTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agt
gi|7 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacTATA------T-G-----A---CATTTC--C------------ATG-AATGCTTCCAA-------GTTA--T---ATGAT-GT---TGT-TATTC------------G---TAT--TT--------A--------TTG--TTGAATTTCTTGAT--T-A-T----TA------CATCGGTGCGGTTGC-TGT-GAAGCATA-TCCACCTGCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-T--TCATTAGTTTCGCTTTGTGAGGCAT-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATA----TGATGA-TCACGTCG--TC--T------TT-T-TTAATTGAT-T-GTGAATATA-T----A---C-A------TGAAAGAAAC-ATAA---AT---TAACAATTT-TATT-TTATTT-TATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA--TATACT-TTATTTCTCG-AATTAAACT--GT-TT--CGA-TCTAAATAATA--GTTT-ATT-AAATTTGGTT----AAAC---TTCGTATG-GATTGCATTATTACAATTGTAGAAA-TAA---------C---TTG------AT-------------A------------GATTACTTGAGAAATGAATAGA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA--A--AATCATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC---AGT----T-------TAATTAATAT--AATCAAAACTGATATTAGCACTGACAAA-ATAGTTTTATCAAG----TTAAAA-GACAGACCACATATGGCAGTGTAT-ACAGATGTAATAA--ATTC-G----GT---TAAT--TCTCAATATTGa
gi|8 : tgtaacgagaacGTTACAATAAATT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAATACT--ATA-------ATTA--T---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAATTCTTGAA--T-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCAACCAGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTTTGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCTTGCCG--TC--T------AT-T-GTA-TAAAT-C-ATGAATATA-T----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATA-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA--TAAGCA-TTATTTCTTT-AATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATATTA--ATTT-ATT-AAGTTTTGTTTAACAAACATCTTATTATT-AAATACATAATAACAATGATAGAAAATAA---------C---TAA------AT-------------A------------GATAAAC-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AAACATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AAACAGATGTGATATTAGCACTGAACAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATTat
gi|9 : ---CATTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--ATA-------GTTA--T---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------ATG--TTAAAGTTCTTGAT--T-A-A----CG------TATTGGTGGGGTAAC-TGT-GAAGTACA-CCAACCTGCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT---A--TA--TT------GTGAGGCCC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATA----TGATGT-GCATGTCG--TC--T------AT-T-GTA-TTAAT-C-ATGAATATT-A----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA--TGAACA-TTTTTTCCTT-AATTAAACT--TT-TT--CCA-TCTAAATGTTA--TTTT-ATT-AAGTTTGGCTTAACAAACATCTTATTATA-AAATATAGTCTTACAATGATAGAAAATAA---------C---AAACAG---ATTACCTGAG-----A------------AATAAAT-----AGTGAA---A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC---AGTTCTCT-------TTATTTACAT--ATTCAGAAGTGATATTAGCACTAACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111111111 222222222222 1111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11
lowQualScore : 3 444 3 3333333333333333333 88 666666666666 7777 3333 2222222 333 2 9 4444 1 333 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 1 8 1 1 0 22 22 22 1 1 555555 4444 22 1 2 4444 2 22 1 1111111 1 3 1 22 444 1 333 4444 333 2 555555 1 333 333 1 3 1 22 333 1 1 22 1 1 4 11 22 1 22 1 1 55 2 0 2 0 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 2 22 2 55555 2 1 4 2 22 22 6666666 1 666 3 6666666 22 1 0 2 1 2 2 555555555 0 33 5 99999 444 22 1
lowQualScore : . ... . ................... .. ............ .... .... ....... ... . . .... . ... ............................................................................. . . . . . . .. .. .. . . ...... .... .. . . .... . .. . ....... . . . .. ... . ... .... ... . ...... . ... ... . . . .. ... . . .. . . . .. .. . .. . . .. . . . . .. ................................................ . .. . ..... . . . . .. .. ....... . ... . ....... .. . . . . . . ......... . .. . ..... ... .. .
lowQualScore : 2 111 5 5555555555555555555 77 555555555555 5555 9999 2222222 222 3 1 2222 7 000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 3 7 7 2 33 44 44 9 9 555555 0000 66 9 0 2222 0 88 9 6666666 9 8 9 66 111 9 333 0000 555 0 888888 9 333 333 4 6 9 66 333 7 8 55 9 9 1 99 66 9 66 9 7 00 1 5 4 9 44 111111111111111111111111111111111111111111111111 2 99 1 00000 0 2 0 0 88 88 5555555 7 222 2 5555555 88 8 1 2 7 2 5 666666666 9 77 3 11111 777 77 6
consensus : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-G---NTCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTC-TTGATT-A-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-T-TGATC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( family-4699 ) : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-G---NTCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTC-TTGATT-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-T-TAATC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T---TG------T-----------TATCTCAAT--T-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---ATGATAG---ATCT-T---C------------C----AT--TTTAAAGATGA--------TTA--C-ATTGTTT-TT-ATC--------CA------TATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGTACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATAT--TA--TA--TTTGCTTTGTGAGGCTC-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATA----TGGTGT-CCATGCTG--TC-T------TT-T-TAT--A-TATA--C-ATGAATA---TAC----A---C-A------TAAAAGAACT-ATAA---AT---TAACAATTA-CGTC-TTATTT-GA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TGATTTG-TTAAATTAAACC--GT-TT--CAG-TCTAAATAATACTTT--ATT-CAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATA-AATAACATTATTACAATTATAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACC--TGAG---------A-------AA-TTAATAATCAAA--TG-CTTATA-----TGATGTTCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAA--AATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC---TGTTATCT-------TTATTTGCAT--A-------CT--TATTAGCACTGGCTAA-ATAATTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA---------TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGT
gi|10 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaT-T---C------------T---TAT--TTT-------A--------TTG--T-AAAGTTC-TTAATT-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGA-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGTCCC-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TAGTGCCG--TC-T------AT-TGT-T--A-T-TTAGC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGA-----------------------TA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTT--TTTAATTAAACC--TT-TT--CAA-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAGTTTAGTTTTACAAA------ATTA---AA--ATATTATTACACTGACAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------TTTATTACCTGAGA-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT------------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT---AGTTGTC--------TTATATGCAT--AATCAGAAGTGATATTAGCA---AC-----TATTCTTATCAAGTAAATTAGGA-GAa
gi|11 : TGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACAT--TC--TG--TACGCTCTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-T-TAATC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-GTAA---AT---TAACAAGTT-TATC-TTATTT-AA---AT--CAA-TCAGAATTGGTCA--TCAACA-TTATTTCTTTTAATTAATCT--GT-TT--CAA-TCTTATTAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTGTT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAAAAAAAC---------AA----AT----------TGATTACCTGAG-A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTAATA-----TGGTGTTCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA--A--AATCATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATt
gi|12 : TAACAATAAAGT---T---TG------T-G-----T---CATCTC--CATT-----A---ATATGACATG--A----AG---ATTTT----TGTTAG---CTCA-T---C-----------------GT--TT--------AAACAAAAATTA--T-GTCGTT--TTCATTCG-A-------------GTCGGTGCGATTGC-TGT-TAAACATA-TCGACCTGTTAGTTT-GTTTTTTttgctaataattttcatcaattaa
gi|12 : ta-AAA-TCAGAATGTGAAA--TTAGCT-TTATTTC-T---------------------------AAATATTTTTTT--TTTCAAATTTGAGTTAACAGACATCTAAGTTTT-AATTACATTATTAGAATTGTAG--ACAATAAC----TT---AACGG-AT----------T------------ACCTGCGAAA-TAAATAGTCGAA--CG-CTTATA-----TGATGT-CATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA--A--AATCATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT---AGTTATCG-------TTATTTGCAC--AATTACAACTGATATAAGCACTGtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttC-T------AT-T-T-T--A-T-TGATC-ATGAATA---TTT----A---C-A------TGAACGAAAT-ATAA---AT---AAACAAGTA-TATC-T
gi|13 : TATTT-AC---ATG-AA---CGAAATATA-AA--TAAACAAGTATATC-T---AT----CT--GT-TT--CAA-TCTAAATACTTTTTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTTTTATT-AATAACATCATTACAGTGCTAG--AAAATAACAAA-T----AC----AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CA-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG--A--AATCATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC---AGTTGTCT-------TTATTTGCAT--GATCATAAGTAATATTAGCACTGACCAA-TTACTTTTATCAAGTGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AA---T----CAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|14 : ctattttattgatcatgaaATCTG------T-G-----T---CATTTC--C--------ATT-ATGTAACATG--A----GA---ATT-T---GTGGT-----ATCTCT---C------------C---CAT--TTGA------A--------TGG--T----GTT-----------------A------TACCGGTGCGGTTAC-TAT-GAAGTACA-CAGACCTGCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACAT--TC--TA--TTTGCTTTGTAAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACA----TGATGT-TCATGTCG--T--T------CT-T-T-T--G---CAAGC-GCGAA-A---TAT----a
gi|14 : atata------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTACA-----TGATGTTCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATTATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTAAAT--AATCAGTACTAATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-AT---T----TAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTcaagcgtttatatataaaattatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggccctgagTAACAATAAAGT---TCTATA------T-A-----T---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAAT--G----AA----TGAT---ATGAT-G---ATAT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTC-TTGAT--A-A----CA------CATCGGTGCGGTAAC-TGT-GAAGC----CCG-CCTGCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACAT--TA--TA--TT-GCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-AT---------------TGCCG--TC-TAAAGGCGC-T-T-T--A-T-CAAGC-GTTTATA---TAT----AAATC-A------TGGGCGTTGTCATGC---CT---T-GCAAAGATTACCTTTATTT------GTA-TAA-TCAGAACTGAT-A--TAAGCA----------CTGACCAAA-T--GT-TT--TTA-TC-AAATAA--------ATT-AAGa
gi|15 : ------------A-------AA-CAAATAGTGAAA--CG-TCTAT---------------TGCCGTC-T-------AAAGGCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA--A--A-TCATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---------CT-------TTATTTGTAT--AATCAGAACTGATATAAGCACTGACCAA-ATGTTTTTATCAAATAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGATGagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|16 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggccctgagA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACG-TTATTTC-TTTAATCAAA-T--GT-TT--CAA-TCTAAAT--CATTTA--ATT-AAGTTTGGTCTAACCAACATCTTATTAGTGAATTA-ATTATTTCAATGAAAG--AAA-TAAA----T----CG----AT----------TTCCTAAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CCTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA--T--AATCATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG---AGTTTTCT-------TTATTTGCTT--AATCAGAAGTGGTATTAGCACTGACCGA-ATATTTTTATTAAGTAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTc
gi|17 : -TGTC-TTTTTT-TA---ATA-AAA-TCAA------TAA--TAAACA-TTGATTC-TT--------------------AA-TTTAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAGCAAACATCTTAGTATT-AATAACATTATTACAATTGTAG--AAAGTAACG---T----AATTG-AT----------T------------ATCTGAGAAA-CAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTCCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--C--AATCATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCG---------C---AGTAGTCT-------TTATTTGGAT--AATCAAAACTGATATAAGTACTGACCAA-ATGTCTTTATGAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AC---G----TTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTTgtt
gi|18 : GTAACAATAAATTATTTATAT-------T-G-----ATAGCATCCC--C--C-----A---ATGTAACACT--T----AT----TTAT---ATGAT-G---ATCT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTC-TTTAAT-A-A----CA------TATCGGTGCTGTTAC-GGT-TAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT--------------------------------------TC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAGTA-AGTC-TTATTT-AG---ATA-GAA-TCAGATTTTGT------AACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--TAA-TCTAAATAGTGC------------TTTGGTTTAACAAACATCTTACTATT-AATTACATtatgtc
gi|19 : tACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--C--------ATT-ATGTAACA-T--G----GA-----TAT---ATATT-G---TAGT-T---C------------T---T----CC--------A--------TTT--T-GACGGTG-TT-------------A------TATCGGTGCGG-TACTTGT-GAACCACA-CCGACCTGCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATAT--TC--TT--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATT----CGATGT-TCTTGC------------------------A-T-AAATTAACAAATATCTTAT-----------------TTAAATAAAT-CAGA---ATTTGTAATAAACATTAT--TTCTTT-AA---AT---AA-TCTG--TTTG-AATCTAAATA-ATATTTT-----ATTAAGCTTGGT-TTAACGA-TC
gi|19 : tatatt-ATAA---AT---TAACAA--A-TATC-TTATTT-AA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAAATAATCT--GT-TT--GAA-TCTAAATAATATTTT--ATT-AAGCTTGGTTTAACGATCATCGT-TTATT-ATTTCCATTTTTCCAATGATAG--atcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|2 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcGTGACAATGA------TATTTG------T-G-----T---CATATA--CG-T-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---ATGGCAG---CTAT-T---C------------C----AT--TTTAACGATGA--------TTA--T-A---TCCGCTAACG-T-C----CG------TATTGGTGCGGTTAA-TGT-GAAACACAGCCGATCTGATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTT--TA--TA--TTCGCTTTGTGAGGCTC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TA-T------TT-TCT-T--A-C-TG-TC-TT--------TAT----A---A-A-------GAAAGAAA--ATAA---GT---TAACAAGTA-TATC-GTATTT-GA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAATCT--GC-TT--CAA-TATAAATAATATTTT--ATT-AAATTTGGCATAACAAACATCTTAATATT-AATTAC----TTACAATTATAG--AAAGTAACCTAAT----AG----AC----------T------------ACCTGAG-AA-TGATTGGTCAAA--CG-CTTATA-----TGCTGTTCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA--A--AATCGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AAT---GACTGATCTTAGCACTGACCAA-ATATTTTAATCAAGTAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A----A----TAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTG
gi|20 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatACAATAAATT---T-TATA------T-G-----A---TCTTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGTT-A---TTCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTC--T-AAAGTTC-TTGAAT-G-A----TA------AAATGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATTT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-A-TGATC-ATAA--A---TAT----A---C-A------TGGAAGAAAT-ATAT---AT---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAG-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAatatc
gi|21 : TAACAATAAAGT---TATATA------TCGCATATA---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AA---GTT-T---ATGGCAG---CTCT-T---C------------C----AT--TT----------------------T-AACGGTG-TT-------------A------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GATGCACA-CCTACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCCTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TC-TG-----TT-T-T-T--A-T-TAATC-ATGAATA---TAT----A---T-ATATACTTGAATGACAT-ATAA---AT---TGACAAGTA-TATC-T-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG--TAa
gi|22 : GTTACAATAAATT---TACATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACAAT--A----AA---------------------GTCT-T---C------------T---TAT--T---------A--------TTG--TTAAAGTTC-TT---------------------ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACTTGCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCTG--TCTT------TT-T-T-T--A-T-GAATC-ATGAA-A---TAT----A---C-A------AGAATGAAAT-ATAT---AT---TCAGAATTG-GACA-GTATT---A---ATA-AA
gi|23 : ----T----AA----AT-----------------------A-------AA-TAAAT--TCAAATTCG--TTATA-----TGGTGTTAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA--AACAATTAT--ACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAG-AGTTAAAT-------TCATTTTCATGAAAT-AGAACTCATATTTGCAAATACCAA-AT-CCTTTATCATTTCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A----------AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATG
gi|24 : tgaCT--A----AA---GT-AT---ATGTT-G---TTGT-T---C------------T---TAA--CT--------A--------TTG--TTGAAGTTC---------------------------GGTGCGATTAC-TGT-GAAGC-TA-CCCACCTGCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATAT--AC--TT--TTCGCTCTGTGAGGCCC-TAAAAA-----------------A--GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGC-TCATGCCG--TA-T------AT-T-T-T--A-T-TAATC-ATGTATA---TTT----A---C-A------TGGAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAATG-TAcgtatgt
gi|25 : CTACACCATC--T---TTTG-TTTGTG-GTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATA----TGATGTGTTAAGCCG--TC-T------TTAT-T-T--AAC-TGATC-ATGAGTA---TAT----A---TTG------TGAAATATAT-ATAATAAAT---AAACACGTA-TATC-TTATT--AA---ATA---------------TAA--TGTGCA-TCAATGC-TTAAAGTAAA-T--GT-TT--TAAATCTAAAAATTATagtagtaatgggat
gi|26 : gattttgtaaa-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA--------A--AATCATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAA---GTATT--------TTAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-AT---T----TAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCat
gi|27 : GAGA--CG-ATTATT-----TGATTTTTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA--A--CAGAATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC---G-------------------TGCAT--AAATAGTAGTAATATTTTCACCGAC-----TACTTTTATCAAATAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATT
gi|28 : atacaattgGTTACGATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CCTCTC--C--TCACCGA---ATGGTACACT--A----AA---AT-AT---GTGCT-G---TTCT-T---C------------C---TTT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTC-TTGATT-A-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCGACCTGCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT--
gi|29 : tTGACAATAAATT---TGTA--------T-G-----A---CATCTC--CA-C-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---AT--T-GCATATCT-T---C----------------CAT--TT-----------------TTA--C-AGTGTT-----------------A------TATTGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCGTCTTT-GGTTTTTg
gi|3 : TAACAATAAATT---TATATA------T-A-----G---CATTTC--C--C-----A---AGGTAGCAAT--ATAGTAATACATCAC---ATAAG-T---ATCT-T---CATCAATGTAATATGAGTAT--TG--------A--------CTG--T-AA-GTCT-TCCATT-TTA----CAGTGTTTTATTGGTGCGGTTAC-TAT-GTAGCTTA-TCGACCAGCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAA--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGACCG-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TTATGCCG--TC-T------TT-T-T-TTTA-T-TGATT-ATGAATA---TAT----A---T-A------TGTCAGATAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTTTTT-AA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAA--T--ATATT--CAA-TCTAAATAGTATTTTTTATC-GAATTTGGTTTAACAGATATCTTAGTATT-ATTTAAATTATTACAATTGTAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACATTT------------A-------AAATAAATAATCACA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--ACCCATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG---AGTTGTCT-------TTATTGGTAA--AATC------------AGTACTGACCAA-ACATTTTTATCAAGTAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT-------------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTattcgcttt
gi|30 : aTGTAACAAT--A----AA---GCTGG---TTATT-G---GTCT-T---T------------A---TAT--TT------------------TG--T-TAA--------------A----CA------CATCAGTGCGGTTTC-TGTTGAAAAACA-CCGTCCTGTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACAC--TA--TA--TTTGCTTTGTG
gi|31 : GTAACAAT--A----AA----TTAT---ATGAT-G---ATCG-T---C------------T----------------------------------AAAGTTC-TTGATT-A-A----CA------TTAAGGTGCGGTTAC-TGT-TAAGCACA-TCGACCTGCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGT
gi|32 : GTAAAAATAAAGT---TATATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACACT--A----AA---A-TAT---ATGCT-G---TTCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTGTTT-AAGATAC-TTGATT-A-A----CA------TA
gi|34 : tCGTCTCTACAT--TC--TA--TCCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-
gi|4 : atgttactcgtttaataGTAACAATAAAGT---TATACACCGCATT-A-----G---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---TTGGTAG---CTCT-T---CCA----------T---T-T--TT--------A--------CGG--T----GTT-----------------A------TATAGGTGCAGTTAC-TGT-GATGCACA-CCGACCTACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACAT--TC--TA--GTCGCTTTGTGAGGTCC-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTA----TGATGT-TCATGTCGTTTT-T------TT-T-T-T--A-T-TGATC-ATAAATA---TGT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---CAACAAGAA-TGTC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATCAAACT--GT-TT--CAT-TATAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAACAAA-T----AG----AT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-TTTATA-----TGATAATCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--CAACATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTACCTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG--AATCAGAACTGATATTAGCACTGGCGAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-AT---T----T-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTGGTGT
gi|5 : --------TTA--T-AAAATTA-TTGATT-G-ATTAACA------TATCGGTGCA-TTAC-TGT-GAAGCACA-TTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATA----TGATGT-TTATTCCG--TC-T-------T-G-T-T--A-A-TGATC-ATGTGCG---TAT----A---C-A------TGAAACAAAT-ATAA---AC---TAACAAAC--TAAC-T-------A---ATG-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAAAA-TCATTTC-TTTAATAAAACT--GT-TT--CAA-CCTAAA-AATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTTCATTATTAAAAGGATAG--GAAATAAC----T----AA----ATGGATTACCAATG-----------A-------AA-TAAAAAGTGAAA--CG-CTTGTAAATTATGATGTGTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA--A--ACTCATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC---AAGTGTCT-------TCATATGCAT--AATCAGAACTGACATAAGCACTCTCCAA-ATATGATTATCAAGTAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-AT---T----T-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTG
gi|6 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgattGTAACAATAAGGT------ATG------T-G-----G---TAT-TC--C--C-----ATTAATGTAACA----A----GA---AGTATCCCATGTT-G---TAAT-T---C------------T---TATATTT--------A--------TTG--TTGAAGTTC-TTGATA-A-G----CA------TATCGGTGCGGTTGCATAT-AAAGCGCA-TCGATATACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACAT--TA--AA--TTCGCTTTGTGGGGCCC-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATG----AAATGT-TCATGTCA--TC-G------TT-T-T-T--A-T-CATTC-ATGAATA---TATGTATA---C-A------TGAAAGAAAT-ACGA---AT---CAACAATTA-CTTC-TTTTTTTAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA--TAAACA-TTGTTTC-TTAAATTAAACT--CT-TT--CAT-TCTAAATAATATTCT--ATA-AAATTCGATTTAACAAACATCTTAGAATT-AATAACATTATTATAATTGTAG--AAAATAGC----A----AAAAAGAT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTCAAA--CGTTTTATA-----TGATGT--------CT-TTTTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA--A--AATCACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC---AGTTACAT-------TTCATTGCAT--AATCAGAGCTGATATAAGCACAGACCAATTTTTTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agt
gi|7 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacGTAACGAGAA--C---TATATG--------------A---CATTTC--C------------ATG-AATGCTTCC----AA---GTTAT---ATGAT-G---TTGT-TATTC------------G---TAT--TT--------A--------TTG--TTGAATTTC-TTGATT-A-T----TA------CATCGGTGCGGTTGC-TGT-GAAGCATA-TCCACCTGCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-T--TCATTAGTTTCGCTTTGTGAGGCAT-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATA----TGATGA-TCACGTCG--TC-T------TT-T-T-T--AAT-TGATT-GTGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAC-ATAA---AT---TAACAATTT-TATT-TTATTT-TATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA--TATACT-TTATTTC-TCGAATTAAACT--GT-TT--CGA-TCTAAATAATAGTTT--ATT-AAATTTGGTT----AAAC---TTCGTATG-GATTGCATTATTACAATTGTAG--AAA-TAAC----TTGATAG----AT----------T------------ACTTGAGAAA-TGAATAG----A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA--A--AATCATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC---AGT----T-------TAATTAATAT--AATCAAAACTGATATTAGCACTGACAAA-ATAGTTTTATCAAG----TTAAAA-GACAGACCACATATGGCAGTGTAT-ACAGATGTAATAA--ATTC-G----GT---TAAT--TCTCAATATTGa
gi|8 : tGTTACAATAAATT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAATACT--A----TA---ATTAT---ATGAT-G---ATCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAATTC-TTGAAT-G-A----CA------TATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCAACCAGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTTTGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCTTGCCG--TC-T------AT-T-G-T--A-T-AAATC-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATA-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA--TAAGCA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATATTAATTT--ATT-AAGTTTTGTTTAACAAACATCTTATTATT-AAATACATAATAACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----A-----------T------------A-------GA-TAAACAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AAACATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AAACAGATGTGATATTAGCACTGAACAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATTat
gi|9 : ---CATTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGAT-G---ATCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------ATG--TTAAAGTTC-TTGATT-A-A----CG------TATTGGTGGGGTAAC-TGT-GAAGTACA-CCAACCTGCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT---A--TA--TT------GTGAGGCCC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATA----TGATGT-GCATGTCG--TC-T------AT-T-G-T--A-T-TAATC-ATGAATA---TTA----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA--TGAACA-TTTTTTC-CTTAATTAAACT--TT-TT--CCA-TCTAAATGTTATTTT--ATT-AAGTTTGGCTTAACAAACATCTTATTATA-AAATATAGTCTTACAATGATAG--AAAATAAC----A----AACAG-AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC---AGTTCTCT-------TTATTTACAT--ATTCAGAAGTGATATTAGCACTAACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111111111 222222222222 1111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11
lowQualScore : 3 444 3 777777777777777777 88 666666666666 7777 3333 2222222 333 2 9 4444 1 333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555 3 1 8 1 1 0 22 22 22 1 1 555555 4444 22 1 2 4444 2 22 1 1111111 1 3 1 22 4 1 2 2 333 4444 333 2 555555 1 333 333 1 3 1 22 333 1 1 22 1 1 4 11 22 1 22 1 1 55 2 0 2 0 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 2 22 2 55555 2 1 4 2 22 22 6666666 1 666 3 6666666 22 1 0 2 1 2 2 555555555 0 33 5 99999 444 22 1
lowQualScore : . ... . .................. .. ............ .... .... ....... ... . . .... . ... ................................................................... ........... . . . . . . .. .. .. . . ...... .... .. . . .... . .. . ....... . . . .. . . . . ... .... ... . ...... . ... ... . . . .. ... . . .. . . . .. .. . .. . . .. . . . . .. ................................................ . .. . ..... . . . . .. .. ....... . ... . ....... .. . . . . . . ......... . .. . ..... ... .. .
lowQualScore : 2 111 5 222222222222222222 77 555555555555 5555 9999 2222222 222 3 1 2222 7 000 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444 3 7 3 7 7 2 33 44 44 9 9 555555 0000 66 9 0 2222 0 88 9 6666666 9 8 9 66 0 0 0 0 555 2222 555 0 888888 9 333 333 4 6 9 66 333 7 8 55 9 9 1 99 66 9 66 9 7 00 1 5 4 9 44 111111111111111111111111111111111111111111111111 2 99 1 00000 0 2 0 0 88 88 5555555 7 222 2 5555555 88 8 1 2 7 2 5 666666666 9 77 3 11111 777 77 6
consensus : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( family-4699 ) : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T---TG------T-----------TATCTCAAT--T-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---ATGATAGA---TCT-T---C------------C----AT--TTTAAAGATGA--------TTA--C-ATTGTTTTT-ATC-------CA------T----ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGTACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATAT--TA--TA--TTTGCTTTGTGAGGCTC-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATA----TGGTGT-CCATGCTG--TC-T------TT-T-TAT--A-T--ATAC-ATGAATA---TAC----A---C-A------TAAAAGAACT-ATAA---AT---TAACAATTA-CGTC-TTATTT-GA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TGATTTG-TTAAATTAAACC--GT-TT--CAG-TCTAAATAATACTTT--ATT-CAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATA-AATAACATTATTACAATTATAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACC--TGAG---------A-------AA-TTAATAATCAAA--TG-CTTATA-----TGATGTTCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAA--AATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC---TGTTATCT-------TTATTTGCAT--A-------CT--TATTAGCACTGGCTAA-ATAATTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA---------TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGT
gi|10 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaT-T---C------------T---TAT--TTT-------A--------TTG--T-AAAGTTCTTAATT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGA-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGTCCC-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TAGTGCCG--TC-T------AT-TGT-T--A-TTTAG-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGA-----------------------TA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTT--TTTAATTAAACC--TT-TT--CAA-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAGTTTAGTTTTACAAA------ATTA---AA--ATATTATTACACTGACAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------TTTATTACCTGAGA-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT------------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT---AGTTGTC--------TTATATGCAT--AATCAGAAGTGATATTAGCA---AC-----TATTCTTATCAAGTAAATTAGGA-GAa
gi|11 : TGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACAT--TC--TG--TACGCTCTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-GTAA---AT---TAACAAGTT-TATC-TTATTT-AA---AT--CAA-TCAGAATTGGTCA--TCAACA-TTATTTCTTTTAATTAATCT--GT-TT--CAA-TCTTATTAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTGTT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAAAAAAAC---------AA----AT----------TGATTACCTGAG-A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTAATA-----TGGTGTTCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA--A--AATCATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATt
gi|12 : TAACAATAAAGT---T---TG------T-G-----T---CATCTC--CATT-----A---ATATGACATG--A----AG---ATTTT----TGTTAGC---TCA-T---C-----------------GT--TT--------AAACAAAAATTA--T-GTCGTT-TTCATT-------CG------A----GTCGGTGCGATTGC-TGT-TAAACATA-TCGACCTGTTAGTTT-GTTTTTTttgctaataattttcatcaattaa
gi|12 : ta-AAA-TCAGAATGTGAAA--TTAGCT-TTATTTC-T---------------------------AAATATTTTTTT--TTTCAAATTTGAGTTAACAGACATCTAAGTTTT-AATTACATTATTAGAATTGTAG--ACAATAAC----TT---AACGG-AT----------T------------ACCTGCGAAA-TAAATAGTCGAA--CG-CTTATA-----TGATGT-CATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA--A--AATCATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT---AGTTATCG-------TTATTTGCAC--AATTACAACTGATATAAGCACTGtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttC-T------AT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TTT----A---C-A------TGAACGAAAT-ATAA---AT---AAACAAGTA-TATC-T
gi|13 : TATTT-AC---ATG-AA---CGAAATATA-AA--TAAACAAGTATATC-T---AT----CT--GT-TT--CAA-TCTAAATACTTTTTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTTTTATT-AATAACATCATTACAGTGCTAG--AAAATAACAAA-T----AC----AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CA-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG--A--AATCATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC---AGTTGTCT-------TTATTTGCAT--GATCATAAGTAATATTAGCACTGACCAA-TTACTTTTATCAAGTGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AA---T----CAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|14 : ctattttattgatcatgaaATCTG------T-G-----T---CATTTC--C--------ATT-ATGTAACATG--A----GA---ATT-T---GTGGT--A---TCTCT---C------------C---CAT--TTGA------A--------TGG--T----GTT---------------A------T----ACCGGTGCGGTTAC-TAT-GAAGTACA-CAGACCTGCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACAT--TC--TA--TTTGCTTTGTAAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACA----TGATGT-TCATGTCG--T--T------CT-T-T-T--a
gi|14 : atata------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTACA-----TGATGTTCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATTATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTAAAT--AATCAGTACTAATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-AT---T----TAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTgcaagcgcgaaatatcaagcgtttatatataaaattatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggccctgagTAACAATAAAGT---TCTATA------T-A-----T---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAAT--G----AA----TGAT---ATGAT-GA---TAT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGAT-----A-ACA------C----ATCGGTGCGGTAAC-TGT-GAAGC----CCG-CCTGCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACAT--TA--TA--TT-GCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-AT---------------TGCCG--TC-TAAAGGCGC-T-T-T--A-TCAAG-C-GTTTATA---TAT----AAATC-A------TGGGCGTTGTCATGC---CT---T-GCAAAGATTACCTTTATTT------GTA-TAA-TCAGAACTGAT-A--TAAGCA----------CTGACCAAA-T--GT-TT--TTA-TC-AAATAA--------ATT-AAGa
gi|15 : ------------A-------AA-CAAATAGTGAAA--CG-TCTAT---------------TGCCGTC-T-------AAAGGCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA--A--A-TCATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---------CT-------TTATTTGTAT--AATCAGAACTGATATAAGCACTGACCAA-ATGTTTTTATCAAATAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGATGagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|16 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggccctgagA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACG-TTATTTC-TTTAATCAAA-T--GT-TT--CAA-TCTAAAT--CATTTA--ATT-AAGTTTGGTCTAACCAACATCTTATTAGTGAATTA-ATTATTTCAATGAAAG--AAA-TAAA----T----CG----AT----------TTCCTAAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CCTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA--T--AATCATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG---AGTTTTCT-------TTATTTGCTT--AATCAGAAGTGGTATTAGCACTGACCGA-ATATTTTTATTAAGTAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTc
gi|17 : -TGTC-TTTTTT-TA---ATA-AAA-TCAA------TAA--TAAACA-TTGATTC-TT--------------------AA-TTTAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAGCAAACATCTTAGTATT-AATAACATTATTACAATTGTAG--AAAGTAACG---T----AATTG-AT----------T------------ATCTGAGAAA-CAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTCCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--C--AATCATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCG---------C---AGTAGTCT-------TTATTTGGAT--AATCAAAACTGATATAAGTACTGACCAA-ATGTCTTTATGAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AC---G----TTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTTgtt
gi|18 : GTAACAATAAATTATTTATAT-------T-G-----ATAGCATCCC--C--C-----A---ATGTAACACT--T----AT----TTAT---ATGAT-GA---TCT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTTAAT----A-ACA------T----ATCGGTGCTGTTAC-GGT-TAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-------------------------------------T-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAGTA-AGTC-TTATTT-AG---ATA-GAA-TCAGATTTTGT------AACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--TAA-TCTAAATAGTGC------------TTTGGTTTAACAAACATCTTACTATT-AATTACATtatgtc
gi|19 : tACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--C--------ATT-ATGTAACA-T--G----GA-----TAT---ATATT-GT---AGT-T---C------------T---T----CC--------A--------TTT--T-GACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGG-TACTTGT-GAACCACA-CCGACCTGCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATAT--TC--TT--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATT----CGATGT-TCTTGC------------------------A-TAAAT-TAACAAATATCTTAT-----------------TTAAATAAAT-CAGA---ATTTGTAATAAACATTAT--TTCTTT-AA---AT---AA-TCTG--TTTG-AATCTAAATA-ATATTTT-----ATTAAGCTTGGT-TTAACGA-TC
gi|19 : tatatt-ATAA---AT---TAACAA--A-TATC-TTATTT-AA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAAATAATCT--GT-TT--GAA-TCTAAATAATATTTT--ATT-AAGCTTGGTTTAACGATCATCGT-TTATT-ATTTCCATTTTTCCAATGATAG--atcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|2 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcGTGACAATGA------TATTTG------T-G-----T---CATATA--CG-T-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---ATGGCAGC---TAT-T---C------------C----AT--TTTAACGATGA--------TTA--T-A----TCC--GCT----A-ACG------TCCGTATTGGTGCGGTTAA-TGT-GAAACACAGCCGATCTGATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTT--TA--TA--TTCGCTTTGTGAGGCTC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TA-T------TT-TCT-T--A-CTG-T-C-TT--------TAT----A---A-A-------GAAAGAAA--ATAA---GT---TAACAAGTA-TATC-GTATTT-GA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAATCT--GC-TT--CAA-TATAAATAATATTTT--ATT-AAATTTGGCATAACAAACATCTTAATATT-AATTAC----TTACAATTATAG--AAAGTAACCTAAT----AG----AC----------T------------ACCTGAG-AA-TGATTGGTCAAA--CG-CTTATA-----TGCTGTTCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA--A--AATCGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AAT---GACTGATCTTAGCACTGACCAA-ATATTTTAATCAAGTAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A----A----TAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTG
gi|20 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatACAATAAATT---T-TATA------T-G-----A---TCTTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGTT-AT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTC--T-AAAGTTCTTGAAT----G-ATA------A----AATGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATTT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-ATGAT-C-ATAA--A---TAT----A---C-A------TGGAAGAAAT-ATAT---AT---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAG-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAatatc
gi|21 : TAACAATAAAGT---TATATA------TCGCATATA---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AA---GTT-T---ATGGCAGC---TCT-T---C------------C----AT--TT----------------------T-AACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GATGCACA-CCTACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCCTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TC-TG-----TT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---T-ATATACTTGAATGACAT-ATAA---AT---TGACAAGTA-TATC-T-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG--TAa
gi|22 : GTTACAATAAATT---TACATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACAAT--A----AA------------------G---TCT-T---C------------T---TAT--T---------A--------TTG--TTAAAGTTCTT------------------------ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACTTGCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCTG--TCTT------TT-T-T-T--A-TGAAT-C-ATGAA-A---TAT----A---C-A------AGAATGAAAT-ATAT---AT---TCAGAATTG-GACA-GTATT---A---ATA-AA
gi|23 : ----T----AA----AT-----------------------A-------AA-TAAAT--TCAAATTCG--TTATA-----TGGTGTTAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA--AACAATTAT--ACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAG-AGTTAAAT-------TCATTTTCATGAAAT-AGAACTCATATTTGCAAATACCAA-AT-CCTTTATCATTTCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A----------AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATG
gi|24 : tgaCT--A----AA---GT-AT---ATGTT-GT---TGT-T---C------------T---TAA--CT--------A--------TTG--TTGAAGTTC-----------------------------GGTGCGATTAC-TGT-GAAGC-TA-CCCACCTGCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATAT--AC--TT--TTCGCTCTGTGAGGCCC-TAAAAA-----------------A--GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGC-TCATGCCG--TA-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGTATA---TTT----A---C-A------TGGAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAATG-TAcgtatgt
gi|25 : CTACACCATC--T---TTTG-TTTGTG-GTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATA----TGATGTGTTAAGCCG--TC-T------TTAT-T-T--AACTGAT-C-ATGAGTA---TAT----A---TTG------TGAAATATAT-ATAATAAAT---AAACACGTA-TATC-TTATT--AA---ATA---------------TAA--TGTGCA-TCAATGC-TTAAAGTAAA-T--GT-TT--TAAATCTAAAAATTATagtagtaatgggat
gi|26 : gattttgtaaa-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA--------A--AATCATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAA---GTATT--------TTAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-AT---T----TAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCat
gi|27 : GAGA--CG-ATTATT-----TGATTTTTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA--A--CAGAATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC---G-------------------TGCAT--AAATAGTAGTAATATTTTCACCGAC-----TACTTTTATCAAATAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATT
gi|28 : atacaattgGTTACGATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CCTCTC--C--TCACCGA---ATGGTACACT--A----AA---AT-AT---GTGCT-GT---TCT-T---C------------C---TTT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCGACCTGCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT--
gi|29 : tTGACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--CA-C-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---AT--T-GCATATCT-T---C------------C----AT--TT-----------------TTA--C-AGTGTT---------------A------T----ATTGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCGTCTTT-GGTTTTTg
gi|3 : TAACAATAAATT---TATATA------T-A-----G---CATTTC--C--C-----A---AGGTAGCAAT--ATAGTAATACATCAC---ATAAG-TA---TCT-T---CATCAATGTAATATGAGTAT--TG--------A--------CTG--T-AA-GTCTTCCATT----TTACAGTGTTTT----ATTGGTGCGGTTAC-TAT-GTAGCTTA-TCGACCAGCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAA--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGACCG-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TTATGCCG--TC-T------TT-T-T-TTTA-TTGAT-T-ATGAATA---TAT----A---T-A------TGTCAGATAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTTTTT-AA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAA--T--ATATT--CAA-TCTAAATAGTATTTTTTATC-GAATTTGGTTTAACAGATATCTTAGTATT-ATTTAAATTATTACAATTGTAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACATTT------------A-------AAATAAATAATCACA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--ACCCATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG---AGTTGTCT-------TTATTGGTAA--AATC------------AGTACTGACCAA-ACATTTTTATCAAGTAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT-------------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTattcgcttt
gi|30 : aTGTAACAAT--A----AA---GCTGG---TTATT-GG---TCT-T---T------------A---TAT--TT------------------TG--T-TAA----------------ACA------C----ATCAGTGCGGTTTC-TGTTGAAAAACA-CCGTCCTGTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACAC--TA--TA--TTTGCTTTGTG
gi|31 : GTAACAAT--A----AA----TTAT---ATGAT-GA---TCG-T---C------------T----------------------------------AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----TAAGGTGCGGTTAC-TGT-TAAGCACA-TCGACCTGCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGT
gi|32 : GTAAAAATAAAGT---TATATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACACT--A----AA---A-TAT---ATGCT-GT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTGTTT-AAGATACTTGATT----A-ACA------T----A
gi|34 : tCGTCTCTACAT--TC--TA--TCCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-
gi|4 : atgttactcgtttaataGTAACAATAAAGT---TATACACCGCATT-A-----G---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---TTGGTAGC---TCT-T---CCA----------T---T-T--TT--------A--------CGG--T----GTT---------------A------T----ATAGGTGCAGTTAC-TGT-GATGCACA-CCGACCTACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACAT--TC--TA--GTCGCTTTGTGAGGTCC-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTA----TGATGT-TCATGTCGTTTT-T------TT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATAAATA---TGT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---CAACAAGAA-TGTC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATCAAACT--GT-TT--CAT-TATAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAACAAA-T----AG----AT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-TTTATA-----TGATAATCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--CAACATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTACCTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG--AATCAGAACTGATATTAGCACTGGCGAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-AT---T----T-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTGGTGT
gi|5 : --------TTA--T-AAAATTATTGATTGATTA-ACA------T----ATCGGTGCA-TTAC-TGT-GAAGCACA-TTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATA----TGATGT-TTATTCCG--TC-T-------T-G-T-T--A-ATGAT-C-ATGTGCG---TAT----A---C-A------TGAAACAAAT-ATAA---AC---TAACAAAC--TAAC-T-------A---ATG-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAAAA-TCATTTC-TTTAATAAAACT--GT-TT--CAA-CCTAAA-AATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTTCATTATTAAAAGGATAG--GAAATAAC----T----AA----ATGGATTACCAATG-----------A-------AA-TAAAAAGTGAAA--CG-CTTGTAAATTATGATGTGTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA--A--ACTCATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC---AAGTGTCT-------TCATATGCAT--AATCAGAACTGACATAAGCACTCTCCAA-ATATGATTATCAAGTAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-AT---T----T-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTG
gi|6 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgattGTAACAATAAGGT------ATG------T-G-----G---TAT-TC--C--C-----ATTAATGTAACA----A----GA---AGTATCCCATGTT-GT---AAT-T---C------------T---TATATTT--------A--------TTG--TTGAAGTTCTTGATA----A-GCA------T----ATCGGTGCGGTTGCATAT-AAAGCGCA-TCGATATACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACAT--TA--AA--TTCGCTTTGTGGGGCCC-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATG----AAATGT-TCATGTCA--TC-G------TT-T-T-T--A-TCATT-C-ATGAATA---TATGTATA---C-A------TGAAAGAAAT-ACGA---AT---CAACAATTA-CTTC-TTTTTTTAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA--TAAACA-TTGTTTC-TTAAATTAAACT--CT-TT--CAT-TCTAAATAATATTCT--ATA-AAATTCGATTTAACAAACATCTTAGAATT-AATAACATTATTATAATTGTAG--AAAATAGC----A----AAAAAGAT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTCAAA--CGTTTTATA-----TGATGT--------CT-TTTTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA--A--AATCACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC---AGTTACAT-------TTCATTGCAT--AATCAGAGCTGATATAAGCACAGACCAATTTTTTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agt
gi|7 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacGTAACGAGAA--C---TATATG--------------A---CATTTC--C------------ATG-AATGCTTCC----AA---GTTAT---ATGAT-GT---TGT-TATTC------------G---TAT--TT--------A--------TTG--TTGAATTTCTTGATT----A-TTA------C----ATCGGTGCGGTTGC-TGT-GAAGCATA-TCCACCTGCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-T--TCATTAGTTTCGCTTTGTGAGGCAT-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATA----TGATGA-TCACGTCG--TC-T------TT-T-T-T--AATTGAT-T-GTGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAC-ATAA---AT---TAACAATTT-TATT-TTATTT-TATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA--TATACT-TTATTTC-TCGAATTAAACT--GT-TT--CGA-TCTAAATAATAGTTT--ATT-AAATTTGGTT----AAAC---TTCGTATG-GATTGCATTATTACAATTGTAG--AAA-TAAC----TTGATAG----AT----------T------------ACTTGAGAAA-TGAATAG----A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA--A--AATCATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC---AGT----T-------TAATTAATAT--AATCAAAACTGATATTAGCACTGACAAA-ATAGTTTTATCAAG----TTAAAA-GACAGACCACATATGGCAGTGTAT-ACAGATGTAATAA--ATTC-G----GT---TAAT--TCTCAATATTGa
gi|8 : tGTTACAATAAATT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAATACT--A----TA---ATTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAATTCTTGAAT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCAACCAGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTTTGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCTTGCCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TAAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATA-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA--TAAGCA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATATTAATTT--ATT-AAGTTTTGTTTAACAAACATCTTATTATT-AAATACATAATAACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----A-----------T------------A-------GA-TAAACAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AAACATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AAACAGATGTGATATTAGCACTGAACAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATTat
gi|9 : ---CATTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------ATG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACG------T----ATTGGTGGGGTAAC-TGT-GAAGTACA-CCAACCTGCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT---A--TA--TT------GTGAGGCCC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATA----TGATGT-GCATGTCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TTA----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA--TGAACA-TTTTTTC-CTTAATTAAACT--TT-TT--CCA-TCTAAATGTTATTTT--ATT-AAGTTTGGCTTAACAAACATCTTATTATA-AAATATAGTCTTACAATGATAG--AAAATAAC----A----AACAG-AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC---AGTTCTCT-------TTATTTACAT--ATTCAGAAGTGATATTAGCACTAACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111111111 222222222222 1111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11
lowQualScore : 3 444 3 777777777777777777 88 666666666666 7777 3333 2222222 333 2 9 4444 1 333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555 3 1 8 1 1 0 22 22 22 1 1 555555 4444 22 1 2 4444 2 22 1 1111111 1 3 1 22 4 1 2 2 333 4444 333 2 555555 1 333 333 1 3 1 22 333 1 1 22 1 1 4 11 22 1 22 1 1 55 2 0 2 0 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 2 22 2 55555 2 1 4 2 22 22 6666666 1 666 3 6666666 22 1 0 2 1 2 2 555555555 0 33 5 99999 444 22 1
lowQualScore : . ... . .................. .. ............ .... .... ....... ... . . .... . ... ................................................................... ........... . . . . . . .. .. .. . . ...... .... .. . . .... . .. . ....... . . . .. . . . . ... .... ... . ...... . ... ... . . . .. ... . . .. . . . .. .. . .. . . .. . . . . .. ................................................ . .. . ..... . . . . .. .. ....... . ... . ....... .. . . . . . . ......... . .. . ..... ... .. .
lowQualScore : 2 111 5 222222222222222222 77 555555555555 5555 9999 2222222 222 3 1 2222 7 000 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44444444444 3 7 3 7 7 2 33 44 44 9 9 555555 0000 66 9 0 2222 0 88 9 6666666 9 8 9 66 0 0 0 0 555 2222 555 0 888888 9 333 333 4 6 9 66 333 7 8 55 9 9 1 99 66 9 66 9 7 00 1 5 4 9 44 111111111111111111111111111111111111111111111111 2 99 1 00000 0 2 0 0 88 88 5555555 7 222 2 5555555 88 8 1 2 7 2 5 666666666 9 77 3 11111 777 77 6
consensus : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( family-4699 ) : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T---TG------T-----------TATCTCAAT--T-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---ATGATAGA---TCT-T---C------------C----AT--TTTAAAGATGA--------TTA--C-ATTGTTTTT-ATC-------CA------T----ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGTACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATAT--TA--TA--TTTGCTTTGTGAGGCTC-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATA----TGGTGT-CCATGCTG--TC-T------TT-T-TAT--A-T--ATAC-ATGAATA---TAC----A---C-A------TAAAAGAACT-ATAA---AT---TAACAATTA-CGTC-TTATTT-GA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TGATTTG-TTAAATTAAACC--GT-TT--CAG-TCTAAATAATACTTT--ATT-CAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATA-AATAACATTATTACAATTATAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACC--TGAG---------A-------AA-TTAATAATCAAA--TG-CTTATA-----TGATGTTCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAA--AATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC---TGTTATCT-------TTATTTGCAT--A-------CT--TATTAGCACTGGCTAA-ATAATTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA---------TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGT
gi|10 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaT-T---C------------T---TAT--TTT-------A--------TTG--T-AAAGTTCTTAATT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGA-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGTCCC-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TAGTGCCG--TC-T------AT-TGT-T--A-TTTAG-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGA-----------------------TA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTT--TTTAATTAAACC--TT-TT--CAA-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAGTTTAGTTTTACAAA------ATTA---AA--ATATTATTACACTGACAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------TTTATTACCTGAGA-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT------------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT---AGTTGTC--------TTATATGCAT--AATCAGAAGTGATATTAGCA---AC-----TATTCTTATCAAGTAAATTAGGA-GAa
gi|11 : TGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACAT--TC--TG--TACGCTCTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-GTAA---AT---TAACAAGTT-TATC-TTATTT-AA---AT--CAA-TCAGAATTGGTCA--TCAACA-TTATTTCTTTTAATTAATCT--GT-TT--CAA-TCTTATTAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTGTT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAAAAAAAC---------AA----AT----------TGATTACCTGAG-A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTAATA-----TGGTGTTCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA--A--AATCATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATt
gi|12 : TAACAATAAAGT---T---TG------T-G-----T---CATCTC--CATT-----A---ATATGACATG--A----AG---ATTTT----TGTTAGC---TCA-T---C-----------------GT--TT--------AAACAAAAATTA--T-GTCGTT-TTCATT-------CG------A----GTCGGTGCGATTGC-TGT-TAAACATA-TCGACCTGTTAGTTT-GTTTTTTttgctaataattttcatcaattaa
gi|12 : ta-AAA-TCAGAATGTGAAA--TTAGCT-TTATTTC-T---------------------------AAATATTTTTTT--TTTCAAATTTGAGTTAACAGACATCTAAGTTTT-AATTACATTATTAGAATTGTAG--ACAATAAC----TT---AACGG-AT----------T------------ACCTGCGAAA-TAAATAGTCGAA--CG-CTTATA-----TGATGT-CATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA--A--AATCATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT---AGTTATCG-------TTATTTGCAC--AATTACAACTGATATAAGCACTGtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttC-T------AT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TTT----A---C-A------TGAACGAAAT-ATAA---AT---AAACAAGTA-TATC-T
gi|13 : TATTT-AC---ATG-AA---CGAAATATA-AA--TAAACAAGTATATC-T---AT----CT--GT-TT--CAA-TCTAAATACTTTTTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTTTTATT-AATAACATCATTACAGTGCTAG--AAAATAACAAA-T----AC----AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CA-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG--A--AATCATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC---AGTTGTCT-------TTATTTGCAT--GATCATAAGTAATATTAGCACTGACCAA-TTACTTTTATCAAGTGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AA---T----CAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|14 : ctattttattgatcatgaaATCTG------T-G-----T---CATTTC--C--------ATT-ATGTAACATG--A----GA---ATT-T---GTGGT--A---TCTCT---C------------C---CAT--TTGA------A--------TGG--T----GTT---------------A------T----ACCGGTGCGGTTAC-TAT-GAAGTACA-CAGACCTGCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACAT--TC--TA--TTTGCTTTGTAAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACA----TGATGT-TCATGTCG--T--T------CT-T-T-T--a
gi|14 : atata------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTACA-----TGATGTTCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATTATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTAAAT--AATCAGTACTAATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-AT---T----TAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTgcaagcgcgaaatatcaagcgtttatatataaaattatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggccctgagTAACAATAAAGT---TCTATA------T-A-----T---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACAAT--G----AA----TGAT---ATGAT-GA---TAT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGAT-----A-ACA------C----ATCGGTGCGGTAAC-TGT-GAAGC----CCG-CCTGCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACAT--TA--TA--TT-GCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-AT---------------TGCCG--TC-TAAAGGCGC-T-T-T--A-TCAAG-C-GTTTATA---TAT----AAATC-A------TGGGCGTTGTCATGC---CT---T-GCAAAGATTACCTTTATTT------GTA-TAA-TCAGAACTGAT-A--TAAGCA----------CTGACCAAA-T--GT-TT--TTA-TC-AAATAA--------ATT-AAGa
gi|15 : ------------A-------AA-CAAATAGTGAAA--CG-TCTAT---------------TGCCGTC-T-------AAAGGCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA--A--A-TCATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---------CT-------TTATTTGTAT--AATCAGAACTGATATAAGCACTGACCAA-ATGTTTTTATCAAATAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGATGagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|16 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggccctgagA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACG-TTATTTC-TTTAATCAAA-T--GT-TT--CAA-TCTAAAT--CATTTA--ATT-AAGTTTGGTCTAACCAACATCTTATTAGTGAATTA-ATTATTTCAATGAAAG--AAA-TAAA----T----CG----AT----------TTCCTAAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CCTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA--T--AATCATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG---AGTTTTCT-------TTATTTGCTT--AATCAGAAGTGGTATTAGCACTGACCGA-ATATTTTTATTAAGTAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTc
gi|17 : -TGTC-TTTTTT-TA---ATA-AAA-TCAA------TAA--TAAACA-TTGATTC-TT--------------------AA-TTTAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAGCAAACATCTTAGTATT-AATAACATTATTACAATTGTAG--AAAGTAACG---T----AATTG-AT----------T------------ATCTGAGAAA-CAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTCCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--C--AATCATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCG---------C---AGTAGTCT-------TTATTTGGAT--AATCAAAACTGATATAAGTACTGACCAA-ATGTCTTTATGAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AC---G----TTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTTgtt
gi|18 : GTAACAATAAATTATTTATAT-------T-G-----ATAGCATCCC--C--C-----A---ATGTAACACT--T----AT----TTAT---ATGAT-GA---TCT-T---------------------AT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTTAAT----A-ACA------T----ATCGGTGCTGTTAC-GGT-TAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-------------------------------------T-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAGTA-AGTC-TTATTT-AG---ATA-GAA-TCAGATTTTGT------AACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--TAA-TCTAAATAGTGC------------TTTGGTTTAACAAACATCTTACTATT-AATTACATtatgtc
gi|19 : tACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--C--------ATT-ATGTAACA-T--G----GA-----TAT---ATATT-GT---AGT-T---C------------T---T----CC--------A--------TTT--T-GACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGG-TACTTGT-GAACCACA-CCGACCTGCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATAT--TC--TT--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATT----CGATGT-TCTTGC------------------------A-TAAAT-TAACAAATATCTTAT-----------------TTAAATAAAT-CAGA---ATTTGTAATAAACATTAT--TTCTTT-AA---AT---AA-TCTG--TTTG-AATCTAAATA-ATATTTT-----ATTAAGCTTGGT-TTAACGA-TC
gi|19 : tatatt-ATAA---AT---TAACAA--A-TATC-TTATTT-AA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAAATAATCT--GT-TT--GAA-TCTAAATAATATTTT--ATT-AAGCTTGGTTTAACGATCATCGT-TTATT-ATTTCCATTTTTCCAATGATAG--atcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|2 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcGTGACAATGA------TATTTG------T-G-----T---CATATA--CG-T-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---ATGGCAGC---TAT-T---C------------C----AT--TTTAACGATGA--------TTA--T-A----TCC--GCT----A-ACG------TCCGTATTGGTGCGGTTAA-TGT-GAAACACAGCCGATCTGATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTT--TA--TA--TTCGCTTTGTGAGGCTC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TA-T------TT-TCT-T--A-CTG-T-C-TT--------TAT----A---A-A-------GAAAGAAA--ATAA---GT---TAACAAGTA-TATC-GTATTT-GA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAATCT--GC-TT--CAA-TATAAATAATATTTT--ATT-AAATTTGGCATAACAAACATCTTAATATT-AATTAC----TTACAATTATAG--AAAGTAACCTAAT----AG----AC----------T------------ACCTGAG-AA-TGATTGGTCAAA--CG-CTTATA-----TGCTGTTCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA--A--AATCGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AAT---GACTGATCTTAGCACTGACCAA-ATATTTTAATCAAGTAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A----A----TAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTG
gi|20 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatACAATAAATT---T-TATA------T-G-----A---TCTTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGTT-AT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTC--T-AAAGTTCTTGAAT----G-ATA------A----AATGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATTT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-ATGAT-C-ATAA--A---TAT----A---C-A------TGGAAGAAAT-ATAT---AT---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAG-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAatatc
gi|21 : TAACAATAAAGT---TATATA------TCGCATATA---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AA---GTT-T---ATGGCAGC---TCT-T---C------------C----AT--TT----------------------T-AACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GATGCACA-CCTACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCCTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TC-TG-----TT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---T-ATATACTTGAATGACAT-ATAA---AT---TGACAAGTA-TATC-T-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG--TAa
gi|22 : GTTACAATAAATT---TACATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACAAT--A----AA------------------G---TCT-T---C------------T---TAT--T---------A--------TTG--TTAAAGTTCTT------------------------ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACTTGCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCTG--TCTT------TT-T-T-T--A-TGAAT-C-ATGAA-A---TAT----A---C-A------AGAATGAAAT-ATAT---AT---TCAGAATTG-GACA-GTATT---A---ATA-AA
gi|23 : ----T----AA----AT-----------------------A-------AA-TAAAT--TCAAATTCG--TTATA-----TGGTGTTAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA--AACAATTAT--ACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAG-AGTTAAAT-------TCATTTTCATGAAAT-AGAACTCATATTTGCAAATACCAA-AT-CCTTTATCATTTCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A----------AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATG
gi|24 : tgaCT--A----AA---GT-AT---ATGTT-GT---TGT-T---C------------T---TAA--CT--------A--------TTG--TTGAAGTTC-----------------------------GGTGCGATTAC-TGT-GAAGC-TA-CCCACCTGCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATAT--AC--TT--TTCGCTCTGTGAGGCCC-TAAAAA-----------------A--GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGC-TCATGCCG--TA-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGTATA---TTT----A---C-A------TGGAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAATG-TAcgtatgt
gi|25 : CTACACCATC--T---TTTG-TTTGTG-GTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATA----TGATGTGTTAAGCCG--TC-T------TTAT-T-T--AACTGAT-C-ATGAGTA---TAT----A---TTG------TGAAATATAT-ATAATAAAT---AAACACGTA-TATC-TTATT--AA---ATA---------------TAA--TGTGCA-TCAATGC-TTAAAGTAAA-T--GT-TT--TAAATCTAAAAATTATagtagtaatgggat
gi|26 : gattttgtaaa-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA--------A--AATCATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAA---GTATT--------TTAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-AT---T----TAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCat
gi|27 : GAGA--CG-ATTATT-----TGATTTTTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA--A--CAGAATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC---G-------------------TGCAT--AAATAGTAGTAATATTTTCACCGAC-----TACTTTTATCAAATAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATT
gi|28 : atacaattgGTTACGATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CCTCTC--C--TCACCGA---ATGGTACACT--A----AA---AT-AT---GTGCT-GT---TCT-T---C------------C---TTT--TT--------A--------TTG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCGACCTGCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT--
gi|29 : tTGACAATAAATT---TGTATG--------------A---CATCTC--CA-C-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---AT--T-GCATATCT-T---C------------C----AT--TT-----------------TTA--C-AGTGTT---------------A------T----ATTGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCGTCTTT-GGTTTTTg
gi|3 : TAACAATAAATT---TATATA------T-A-----G---CATTTC--C--C-----A---AGGTAGCAAT--ATAGTAATACATCAC---ATAAG-TA---TCT-T---CATCAATGTAATATGAGTAT--TG--------A--------CTG--T-AA-GTCTTCCATT----TTACAGTGTTTT----ATTGGTGCGGTTAC-TAT-GTAGCTTA-TCGACCAGCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAA--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGACCG-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TTATGCCG--TC-T------TT-T-T-TTTA-TTGAT-T-ATGAATA---TAT----A---T-A------TGTCAGATAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTTTTT-AA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAA--T--ATATT--CAA-TCTAAATAGTATTTTTTATC-GAATTTGGTTTAACAGATATCTTAGTATT-ATTTAAATTATTACAATTGTAG--AAAATAAC----T----AA----ATAGATTACATTT------------A-------AAATAAATAATCACA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--ACCCATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG---AGTTGTCT-------TTATTGGTAA--AATC------------AGTACTGACCAA-ACATTTTTATCAAGTAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT-------------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTattcgcttt
gi|30 : aTGTAACAAT--A----AA---GCTGG---TTATT-GG---TCT-T---T------------A---TAT--TT------------------TG--T-TAA----------------ACA------C----ATCAGTGCGGTTTC-TGTTGAAAAACA-CCGTCCTGTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACAC--TA--TA--TTTGCTTTGTG
gi|31 : GTAACAAT--A----AA----TTAT---ATGAT-GA---TCG-T---C------------T----------------------------------AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----TAAGGTGCGGTTAC-TGT-TAAGCACA-TCGACCTGCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGT
gi|32 : GTAAAAATAAAGT---TATATA------T-G-----A---CATCTCTAC--G-----A---ATGGTACACT--A----AA---A-TAT---ATGCT-GT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTGTTT-AAGATACTTGATT----A-ACA------T----A
gi|34 : tCGTCTCTACAT--TC--TA--TCCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-
gi|4 : atgttactcgtttaataGTAACAATAAAGT---TATACACCGCATT-A-----G---TATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---TTGGTAGC---TCT-T---CCA----------T---T-T--TT--------A--------CGG--T----GTT---------------A------T----ATAGGTGCAGTTAC-TGT-GATGCACA-CCGACCTACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACAT--TC--TA--GTCGCTTTGTGAGGTCC-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTA----TGATGT-TCATGTCGTTTT-T------TT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATAAATA---TGT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---CAACAAGAA-TGTC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATCAAACT--GT-TT--CAT-TATAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAACAAA-T----AG----AT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-TTTATA-----TGATAATCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--CAACATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTACCTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG--AATCAGAACTGATATTAGCACTGGCGAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-AT---T----T-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTGGTGT
gi|5 : --------TTA--T-AAAATTATTGATTGATTA-ACA------T----ATCGGTGCA-TTAC-TGT-GAAGCACA-TTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATA----TGATGT-TTATTCCG--TC-T-------T-G-T-T--A-ATGAT-C-ATGTGCG---TAT----A---C-A------TGAAACAAAT-ATAA---AC---TAACAAAC--TAAC-T-------A---ATG-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAAAA-TCATTTC-TTTAATAAAACT--GT-TT--CAA-CCTAAA-AATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTTCATTATTAAAAGGATAG--GAAATAAC----T----AA----ATGGATTACCAATG-----------A-------AA-TAAAAAGTGAAA--CG-CTTGTAAATTATGATGTGTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA--A--ACTCATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC---AAGTGTCT-------TCATATGCAT--AATCAGAACTGACATAAGCACTCTCCAA-ATATGATTATCAAGTAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-AT---T----T-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTG
gi|6 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgattGTAACAATAAGGT------ATG------T-G-----G---TAT-TC--C--C-----ATTAATGTAACA----A----GA---AGTATCCCATGTT-GT---AAT-T---C------------T---TATATTT--------A--------TTG--TTGAAGTTCTTGATA----A-GCA------T----ATCGGTGCGGTTGCATAT-AAAGCGCA-TCGATATACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACAT--TA--AA--TTCGCTTTGTGGGGCCC-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATG----AAATGT-TCATGTCA--TC-G------TT-T-T-T--A-TCATT-C-ATGAATA---TATGTATA---C-A------TGAAAGAAAT-ACGA---AT---CAACAATTA-CTTC-TTTTTTTAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA--TAAACA-TTGTTTC-TTAAATTAAACT--CT-TT--CAT-TCTAAATAATATTCT--ATA-AAATTCGATTTAACAAACATCTTAGAATT-AATAACATTATTATAATTGTAG--AAAATAGC----A----AAAAAGAT----------TACCTGAG-----A-------AA-TAAATAGTCAAA--CGTTTTATA-----TGATGT--------CT-TTTTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA--A--AATCACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC---AGTTACAT-------TTCATTGCAT--AATCAGAGCTGATATAAGCACAGACCAATTTTTTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agt
gi|7 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacGTAACGAGAA--C---TATATG--------------A---CATTTC--C------------ATG-AATGCTTCC----AA---GTTAT---ATGAT-GT---TGT-TATTC------------G---TAT--TT--------A--------TTG--TTGAATTTCTTGATT----A-TTA------C----ATCGGTGCGGTTGC-TGT-GAAGCATA-TCCACCTGCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-T--TCATTAGTTTCGCTTTGTGAGGCAT-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATA----TGATGA-TCACGTCG--TC-T------TT-T-T-T--AATTGAT-T-GTGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAC-ATAA---AT---TAACAATTT-TATT-TTATTT-TATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA--TATACT-TTATTTC-TCGAATTAAACT--GT-TT--CGA-TCTAAATAATAGTTT--ATT-AAATTTGGTT----AAAC---TTCGTATG-GATTGCATTATTACAATTGTAG--AAA-TAAC----TTGATAG----AT----------T------------ACTTGAGAAA-TGAATAG----A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA--A--AATCATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC---AGT----T-------TAATTAATAT--AATCAAAACTGATATTAGCACTGACAAA-ATAGTTTTATCAAG----TTAAAA-GACAGACCACATATGGCAGTGTAT-ACAGATGTAATAA--ATTC-G----GT---TAAT--TCTCAATATTGa
gi|8 : tGTTACAATAAATT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAATACT--A----TA---ATTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAATTCTTGAAT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCAACCAGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTTTGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCTTGCCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TAAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATA-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA--TAAGCA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATATTAATTT--ATT-AAGTTTTGTTTAACAAACATCTTATTATT-AAATACATAATAACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----A-----------T------------A-------GA-TAAACAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AAACATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AAACAGATGTGATATTAGCACTGAACAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATTat
gi|9 : ---CATTTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------ATG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACG------T----ATTGGTGGGGTAAC-TGT-GAAGTACA-CCAACCTGCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT---A--TA--TT------GTGAGGCCC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATA----TGATGT-GCATGTCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TTA----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA--TGAACA-TTTTTTC-CTTAATTAAACT--TT-TT--CCA-TCTAAATGTTATTTT--ATT-AAGTTTGGCTTAACAAACATCTTATTATA-AAATATAGTCTTACAATGATAG--AAAATAAC----A----AACAG-AT----------T------------ACCTGAGAAA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC---AGTTCTCT-------TTATTTACAT--ATTCAGAAGTGATATTAGCACTAACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTG
blockSeqs : G ATT A TCGCATATA TA TCACCGA CTTC TAGT TACATCA CCC T A CATA C ATT ATCAATGTAATATGAGTATTGACTGTAAGTCTTCCATTTTA GTGTTTT T T C G C CA AT GT T A TGAGTA ATTG AA A C TGAT G TT T AAAGGCG A G . TT A . A TCT GTAT AAT T TATACT C TAA TTG G T T TA TTT T A TC A T T AC TG A AA A T TT C G AA TAAATTTTATTACCTGAGA A TT T AATTA C A C T . AC GCCTAAG A CTG G GCAAAGA GA G T T T . CAGATGTAA AG G ATTTT TTA AA A
blockSeqs : G . C CCGCATTAG TA CATTA TG . ATTT . G A C . . GTTTAAACAAAAATTATGTCGTTTTCATT TCCGT A . T . . . . . . . . . . . . . . . . GT . C . . A . . . . . . . . . . G T . A . . . . . . T TC . . . . A T . . . TTAACGGATTACCTGCGA . . . . . T A . . . . C AG A . . C . C . . AT . . TT . TC A
blockSeqs : T . A TGATAG . ATTA TG . GTTA . A A A . . TTATATTTATTGTTGAAGTTCTTGATAAG T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . T AC . . . . T . . . . GTAATTGATTATCTGAGA . . . . . T . . . . . C . A . . G . T . . TT . . T . C A
blockSeqs : T . G TGT . ATCA AT . GCTG . A A A . . TTATTTATTGTTTAAGATACTTGATTAA A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . T GC . . . . C . . . . TAAATGGATTACCAATGA . . . . . A . . . . . A . G . . C . T . . TT . . T . C C
blockSeqs : T . A TGT . ATCA CT . AGTA . T . A . . TTATTTTATTGTAAAGTTCTTAATTGA T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . T TC . . . . A . . . . AAAAAAGATTACCTGAGA . . . . . T . . . . . C . A . . C . T . . TT . . T . . C
blockSeqs : G . A TAT . ATT TG . GTTA . G . T . . CATTTTAACGATGATTATATCCGCTAA C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . T TC . . . . A . . . . TTGATAGATTACTTGAGA . . . . . A . . . . . C . T . . G . T . . CG . . T . . C
blockSeqs : T . A TGT . ATT CT . ATTA . T . C . . CTTTTTATTGTTAAAGTTCTTGATTAA T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . A AC . . . . G . . . . AAATTGATTACCTGAGA . . . . . T . . . . . A . G . . C . T . . TT . . A . . G
blockSeqs : G . A TGA . GTT TG . GTTA . G . T . . GTATTTATTGTTGAATTTCTTGATTAT T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . T AC . . . . A . . . . AAATACATTACCTGAGA . . . . . T . . . . . C . A . . C . C . . TT . . T . . C
blockSeqs : T . G TGA . ACT AT . ATT . T . C . . TTATTTAATGTTAAAGTTCTTGATTAA A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . A AC . . . . A . . . . CTAATAGACTACCTGAG . . . . . T . . . . . C . A . . C . C . . TT . . G . . C
blockSeqs : T . A TGA . CA CT . TGA . C . G . . TTATTTATTCTAAAGTTCTTGAATGA T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . A AC . . . . T . . . . TAAATAGATTACATTTA . . . . . A . . . . . A . C . . G . T . . TT . . T . .
blockSeqs : G . A TAG . CA CT . TTA . A . T . . TTATTTATTGTAAAATTCTTGAATGA T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . T AC . . . . T . . . . AAATAGATTACCTGAGA . . . . . T . . . . . A . G . . C . T . . TT . . G . .
blockSeqs : G . A TGA . CA TG . ATT . T . T . . ATTTATTGTTAAAGTTCTTTAATAA T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . T AC . . . . G . . . . AAACAGATTACCTGAGA . . . . . T . . . . . T . A . . C . T . . A . . T . .
blockSeqs : G . A TGG . GA AT . GTT . A . A . . ATTTATTGTTAAAGTTCTTGATAA C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . A AC . . . . A . . . . TCGATTTCCTAAGA . . . . . T . . . . . G . G . . C . G . . . . . T . .
blockSeqs : T . A TGA . CA AT . GTA . C . G . . TTATTATTGTTAAAGTTCTT T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . G C . . . . A . . . . TAAATA . . . . . T . . . . . A . A . . C . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . GA AT . ATA . G . A . . TTAACTATTGTTGAAGTTC T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . T A . . . . A . . . . TAAATA . . . . . T . . . . . A . C . . G . T . .
blockSeqs : . . . A . CA CT . ATT . T . T . . TTCCATTTTGACGGTGTT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . T A . . . . A . . . . . . . . T . . . . . C . C . . G . . .
blockSeqs : . A . CA TG . TTA . A . C . . CCATTTGAATGGTGTT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . CT . ATA . A . T . . TAAAGTTCTTGATTAA T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . A . . . . .
blockSeqs : CT . ATT . A . T . . CATTTTAACGGTGTT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . TA . . . A . . CATTTTTACAGTGTT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . CATTTTTACGGTGTT T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . ATATTTTGTTAAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : TGN*************** ** AAATAGATTACCTGAGA******************************* ** TT*******
originalCons : GTAACAATAAAGT---TATATG------T-G-----A---CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC----T----AA----AT----------T------------A-------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
finalCons : GTAACAATAAAGT---TATATGTGN---------------CATCTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------A--------TTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAACAAATAGATTACCTGAGA-------------------------------AA-TAAATAGTGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-ATT-------TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA
Alignments
lowQualScore : 222222222222 1111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 222 111111111 11
lowQualScore : 3 444 3 777777777 1 666666 88 666666666666 7777 3333 3333333 333 2 9 4444 1 333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555 3 1 8 1 1 0 22 22 22 1 1 555555 4444 22 1 2 4444 2 22 1 1111111 1 3 1 22 4 1 2 2 333 4444 333 2 555555 1 333 333 1 3 1 22 333 1 1 22 1 1 4 11 22 1 22 1 1 55 2 0 2 0 33 333 2 33 22 2 55555 2 1 4 2 22 22 6666666 1 666 3 6666666 22 1 0 2 1 2 2 555555555 0 33 5 99999 444 22 1
lowQualScore : . ... . ......... . ...... .. ............ .... .... ....... ... . . .... . ... ........................................................... ........... . . . . . . .. .. .. . . ...... .... .. . . .... . .. . ....... . . . .. . . . . ... .... ... . ...... . ... ... . . . .. ... . . .. . . . .. .. . .. . . .. . . . . .. ... . .. .. . ..... . . . . .. .. ....... . ... . ....... .. . . . . . . ......... . .. . ..... ... .. .
lowQualScore : 2 111 5 999999999 0 111111 77 555555555555 5555 9999 3333333 222 3 1 2222 7 000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444444444 3 7 3 7 7 2 33 44 44 9 9 555555 0000 66 9 0 2222 0 88 9 6666666 9 8 9 66 0 0 0 0 555 2222 555 0 888888 9 333 333 4 6 9 66 333 7 8 55 9 9 1 99 66 9 66 9 7 00 1 5 4 9 44 777 7 11 99 1 00000 0 2 0 0 88 88 5555555 7 222 2 5555555 88 8 1 2 7 2 5 666666666 9 77 3 11111 777 77 6
consensus : GTAACAATAAAGT---TATAT--G------TGNCAT------CTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------ATTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC-A-AATAG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
Reference ( family-4699 ) : GTAACAATAAAGT---TATAT--G------TGNCAT------CTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----AA---ATTAT---ATGNT-GN---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------ATTG--T-AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------NT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATANTATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC-A-AATAG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATGGGCGTTGTCAT-------GNCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAACTGATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--ACTAAATGTTGCTGTT
gi|1 : GTGACAATACAGT---T-------------TGTTAT------CTCAAT--T-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---ATGATAGA---TCT-T---C------------C----AT--TTTAAAGATGATTA--C-ATTGTTTTT-ATC-------CA------T----ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGTACA-CCGACCTGCTTCCTT-GGTTTT-CGTCTCTATAT--TA--TA--TTTGCTTTGTGAGGCTC-TGAGAAA-T------AAA-----A--GTAAAAGGCT-T-ATA----TGGTGT-CCATGCTG--TC-T------TT-T-TAT--A-T--ATAC-ATGAATA---TAC----A---C-A------TAAAAGAACT-ATAA---AT---TAACAATTA-CGTC-TTATTT-GA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TGATTTG-TTAAATTAAACC--GT-TT--CAG-TCTAAATAATACTTT--ATT-CAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATA-AATAACATTATTACAATTATAG--AAAATAACTA-AATAG-ATTACCTGAGAAATTAATAA--TCAAA--TG-CTTATA-----TGATGTTCATGTCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAACCGTTTATATATATAA--AATCATGGACGTTGTCAT-------GCCTTACAAAGATTAC---TGTTATCT-------TTATTTGCAT--A-------CT--TATTAGCACTGGCTAA-ATAATTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATACGGTAATTTATGA---------TAA--ACTTAG----GT---TTTC--GCTAAATGTTGT
gi|10 : ttttttaatgttatgtaacaatatgtttatatataggataagtcttttcgcaaattgatgtaacaataaagtttacatcgttaatgtatcttcattaaT-T---C------------T---TAT--TTT-------ATTG--T-AAAGTTCTTAATT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGA-GAAGCACA-CCGACCTGCTTCCTT-GCGATTTCGTCTTTCCAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGTCCC-TGGGATA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TAGTGCCG--TC-T------AT-TGT-T--A-TTTAG-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGA-----------------------TA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTT--TTTAATTAAACC--TT-TT--CAA-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAGTTTAGTTTTACAAA------ATTA---AA--ATATTATTACACTGACAG--AAAATAACTA-AATTTTATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGAGTG-GTACAACAAGCGTTTATAT------------ATGAGCGTTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAT---AGTTGTC--------TTATATGCAT--AATCAGAAGTGATATTAGCA---AC-----TATTCTTATCAAGTAAATTAGGA-GAa
gi|11 : TGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTGTTCTTTACAT--TC--TG--TACGCTCTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-GTAA---AT---TAACAAGTT-TATC-TTATTT-AA---AT--CAA-TCAGAATTGGTCA--TCAACA-TTATTTCTTTTAATTAATCT--GT-TT--CAA-TCTTATTAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTGTT-AATTACATTATTACAATGATAGAAAAAAAAAC-A-AATTG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTAATA-----TGGTGTTCATGACGTC-TTTCG-GCACGCGCT-ATGTATCAAGCGTTTATATACA--A--AATCATGGTCGTTGGCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AATt
gi|12 : TAACAATAAAGT---T---T--G------TGTCAT------CTC--CATT-----A---ATATGACATG--A----AG---ATT-T---TTGTTAGC---TCA-T---C-----------------GT--TTAAACAAAAATTA--T-GTCGTT-TTCATT-------CG------A----GTCGGTGCGATTGC-TGT-TAAACATA-TCGACCTGTTAGTTT-GTTTTTTttgctaataattttcatcaattaa
gi|12 : ta-AAA-TCAGAATGTGAAA--TTAGCT-TTATTTC-T---------------------------AAATATTTTTTT--TTTCAAATTTGAGTTAACAGACATCTAAGTTTT-AATTACATTATTAGAATTGTAG--ACAATAAC-TTAACGG-ATTACCTGCGAAATAAATAG--TCGAA--CG-CTTATA-----TGATGT-CATGCTGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTGATATATA--A--AATCATTGGCCTTGTAAT-------GCCTTGCAAAGAGTAT---AGTTATCG-------TTATTTGCAC--AATTACAACTGATATAAGCACTGtttaaatcagaatgtgaaattagctttatttctaaatattttttttttcaaatttgagttaacagacatctaagttttaattacattattagaattgtagacaataacttaacggattacctgcgaaataaatagtcgaacgcttatatgatgtcatgctgtcttttggcaagcgcgatatatcaagcgttgatatataaaatcattggccttgtaatgccttgcaaagagtatagttatcgttatttgcacaattacaactgatataagcactg
gi|13 : tataacaataaagtttgtgtcatctccattaatatgacatgaagatttttgttagctcatcgtttaaacaaaaattatgtcgttttcattcgagtcggtgcgattgctgttaaacatatcgacctgttagtttgtttttttttC-T------AT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATGAATA---TTT----A---C-A------TGAACGAAAT-ATAA---AT---AAACAAGTA-TATC-T
gi|13 : TATTT-AC---ATG-AA---CGAAATATA-AA--TAAACAAGTATATC-T---AT----CT--GT-TT--CAA-TCTAAATACTTTTTTT-ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTTTTATT-AATAACATCATTACAGTGCTAG--AAAATAAC-A-AATAC-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CA-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCCAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATG--A--AATCATGGGCGTTACCAT-------GAATTGCAAAGATTAC---AGTTGTCT-------TTATTTGCAT--GATCATAAGTAATATTAGCACTGACCAA-TTACTTTTATCAAGTGAAATAACG-GACATGAGATATATGGCAATTTAT-AA---T----CAA--A-TT-G----TTTTATTTT--ACTAAATGTTGATGTTatctgtttcaatctaaatactttttttattaagtttggtttaacaaacatctttttattaataacatcattacagtgctagaaaataacaaatacattacctgagaaataaatagtgaaacacttatatgatgttcatgccgtctattggccagcgcgatatatcaagcgtttatatatgaaatcatgggcgttaccatgaattgcaaagattacagttgtctttatttgcatgatcataagtaatattagcactgaccaattacttttatcaagtgaaataacggacatgagatatatggcaatttataatcaaattgttttattttactaaatgttgatgtta
gi|14 : ctattttattgatcatgaaATCT--G------TGTCAT------TTC--C--------ATT-ATGTAACATG--A----GA---ATT-T---GTGGT--A---TCTCT---C------------C---CAT--TTGA------ATGG--T----GTT---------------A------T----ACCGGTGCGGTTAC-TAT-GAAGTACA-CAGACCTGCGTCTTT-GGTTTTTCATTTATACAT--TC--TA--TTTGCTTTGTAAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ACA----TGATGT-TCATGTCG--T--T------CT-T-T-T--a
gi|14 : atataCCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTTACA-----TGATGTTCATGTCGTT-CTTTT-GCAAGCGCG-AAATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATTATGGGCTTTGTCAG-------GCCTTGCAAAGATTAC---AGTTATCT-------TTATTTAAAT--AATCAGTACTAATATTAGCACTGACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATAGCAATTACT-AT---T----TAA--CCCG-G----TG---TTTC--ACTATATGTTGATGTTgcaagcgcgaaatatcaagcgtttatatataaaattatgggctttgtcaggccttgcaaagattacagttatctttatttaaataatcagtactaatattagcactgaccaaatatttttgtcaagtaaattaagagacataccacatatagcaattactatttaacccggtgtttcactatatgttgatgtta
gi|15 : atataatctgtgtcatttccattatgtaacatgagaatttgtggtatctctcccatttgaatggtgttataccggtgcggttactatgaagtacacagacctgcgtctttggtttttcatttatacattctatttgctttgtaaggcTAACAATAAAGT---TCTAT--A------TATCAT------CTC--C--C-----A---ATGTAACAAT--G----AA----TGAT---ATGAT-GA---TAT-T---------------------AT--TT--------ATTG--TTAAAGTTCTTGAT-----A-ACA------C----ATCGGTGCGGTAAC-TGT-GAAGC----CCG-CCTGCTTCATT-GGGTTTTCGTCTCTACAT--TA--TA--TT-GCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-C------AAAT----A--GTGAAACGTC-T-AT---------------TGCCG--TC-TAAAGGCGC-T-T-T--A-TCAAG-C-GTTTATA---TAT----AAATC-A------TGGGCGTTGTCATGC---CT---T-GCAAAGATTACCTTTATTT------GTA-TAA-TCAGAACTGAT-A--TAAGCA----------CTGACCAAA-T--GT-TT--TTA-TC-AAATAA--------ATT-AAGa
gi|15 : CCTGAGAAACAAATAG--TGAAA--CG-TCTAT---------------TGCCGTC-T-------AAAGGCG-CTTTATCAAGCGTTTATATATA--A--A-TCATGGGCGTTGTCAT-------GCCTTGCAAAGATTAC---------CT-------TTATTTGTAT--AATCAGAACTGATATAAGCACTGACCAA-ATGTTTTTATCAAATAAATTAAGA-GATATATTACATATGACAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-AATTTTT---TTTT--ACTTAATATTGATGagatatattacatatgacaatttatatttaaactcaatttttttttacttaatattgatgc
gi|16 : taacaataaagttctatatatcatctcccaatgtaacaatgaatgatatgatgatattatttattgttaaagttcttgataacacatcggtgcggtaactgtgaagcccgcctgcttcattgggttttcgtctctacattatattgctttgtgaggcA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACG-TTATTTC-TTTAATCAAA-T--GT-TT--CAA-TCTAAAT--CATTTA--ATT-AAGTTTGGTCTAACCAACATCTTATTAGTGAATTA-ATTATTTCAATGAAAG--AAA----T-A-AATCG-ATTTCCTAAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CCTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GTAAGCGTG-ATACATCAAGCGTTTATATATA--T--AATCATGGACGATATCAT-------GACTTGTAAAGGTAAG---AGTTTTCT-------TTATTTGCTT--AATCAGAAGTGGTATTAGCACTGACCGA-ATATTTTTATTAAGTAAATTTGGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--AATC-G----TT---TTTTC-ACTAAA-GTTACTGTTc
gi|17 : -TGTC-TTTTTT-TA---ATA-AAA-TCAA------TAA--TAAACA-TTGATTC-TT--------------------AA-TTTAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAGCAAACATCTTAGTATT-AATAACATTATTACAATTGTAG--AAAGTAAC-GTAATTG-ATTATCTGAGAAACAAATAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTCCATGCCGTC-TTTTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--C--AATCATGGGCGTTCTTAT-------GCCTCG---------C---AGTAGTCT-------TTATTTGGAT--AATCAAAACTGATATAAGTACTGACCAA-ATGTCTTTATGAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGCAATTTAT-AC---G----TTA--ACTC-G-----T---TTTT--ATTAAACGTTgtt
gi|18 : GTAACAATAAATTATTTATATTGA------TAGCAT------CCC--C--C-----A---ATGTAACACT--T----AT----TTAT---ATGAT-GA---TCT-T---------------------AT--TT--------ATTG--TTAAAGTTCTTTAAT----A-ACA------T----ATCGGTGCTGTTAC-GGT-TAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-------------------------------------T-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAGTA-AGTC-TTATTT-AG---ATA-GAA-TCAGATTTTGT------AACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--TAA-TCTAAATAGTGC------------TTTGGTTTAACAAACATCTTACTATT-AATTACATtatgtc
gi|19 : tACAATAAATT---TGTAT--G--------ACAT------CTC--C--------ATT-ATGTAACA-T--G----GA-----TAT---ATATT-GT---AGT-T---C------------T---T----CC--------ATTT--T-GACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGG-TACTTGT-GAACCACA-CCGACCTGCGTCCTT-GGGATTTCGTCTTTATAT--TC--TT--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGGGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATT----CGATGT-TCTTGC------------------------A-TAAAT-TAACAAATATCTTAT-----------------TTAAATAAAT-CAGA---ATTTGTAATAAACATTAT--TTCTTT-AA---AT---AA-TCTG--TTTG-AATCTAAATA-ATATTTT-----ATTAAGCTTGGT-TTAACGA-TC
gi|19 : tatatt-ATAA---AT---TAACAA--A-TATC-TTATTT-AA---ATA-AA--TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAAATAATCT--GT-TT--GAA-TCTAAATAATATTTT--ATT-AAGCTTGGTTTAACGATCATCGT-TTATT-ATTTCCATTTTTCCAATGATAG--atcgtttattatttccatttttccaatgatag
gi|2 : tatattacaataaatttgtatgacatctccattatgtaacatggatatatattgtagttcttccattttgacggtgttatatcggtgcggtacttgtgaaccacaccgacctgcgtccttgggatttcgtctttatattcttttcgctttgtgaggccctgggaaataaatagtgaaacgcttattcgatgttcttgcGTGACAATGA------TATTT--G------TGTCAT------ATA--CG-T-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---ATGGCAGC---TAT-T---C------------C----AT--TTTAACGATGATTA--T-A----TCC--GCT----A-ACG------TCCGTATTGGTGCGGTTAA-TGT-GAAACACAGCCGATCTGATTCTTT-GGATTTTTGTCTCTACTT--TA--TA--TTCGCTTTGTGAGGCTC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTCAAACGTT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TA-T------TT-TCT-T--A-CTG-T-C-TT--------TAT----A---A-A-------GAAAGAAA--ATAA---GT---TAACAAGTA-TATC-GTATTT-GA---ATA-AGA-TCATTGTTTGTAT--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAATCT--GC-TT--CAA-TATAAATAATATTTT--ATT-AAATTTGGCATAACAAACATCTTAATATT-AATTAC----TTACAATTATAG--AAAGTAAC-CTAATAG-ACTACCTGAG-AATGATTGG--TCAAA--CG-CTTATA-----TGCTGTTCATGTTGTC-TTTTGCGTCGGCGTG-ATATATCAAGCATCTATATATA--A--AATCGCGGGCGTTGTCAT-------GCCTTACAATGGTTAC---AGTTATCT-------TTATTTGCAT--AAT---GACTGATCTTAGCACTGACCAA-ATATTTTAATCAAGTAAA-TAACA-GACATACCACAAATTGCAATTTAT-A----A----TAA--ACTC-G----TT---TTTTC-ACTAACTGTTG
gi|20 : tctttgtcacaatatagttatgcaatatcgttatacatcacatatatattttcatcaatACAATAAATT---T-TAT--A------TGATCT------TTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGTT-AT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------ATTC--T-AAAGTTCTTGAAT----G-ATA------A----AATGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATTT-TCATGCCG--TC-T------AT-T-T-T--A-ATGAT-C-ATAA--A---TAT----A---C-A------TGGAAGAAAT-ATAT---AT---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAG-TCTAAATATTATTTT--ATT-AAatatc
gi|21 : TAACAATAAAGT---TATAT--A------TCGCATATATATCTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AA---GTT-T---ATGGCAGC---TCT-T---C------------C----AT--TT--------------T-AACGGTGTT------------A------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GATGCACA-CCTACCTGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTTAACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCCTTAAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGTCG--TC-TG-----TT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TAT----A---T-ATATACTTGAATGACAT-ATAA---AT---TGACAAGTA-TATC-T-------G---ATA-AAA-TCAGAATTTTTAG--TAa
gi|22 : GTTACAATAAATT---TACAT--A------TGACAT------CTCTAC--G-----A---ATGGTACAAT--A----AA------------------G---TCT-T---C------------T---TAT--T---------ATTG--TTAAAGTTCTT------------------------ATCGGTGCAGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACTTGCTTTCTT-GCTTGTTAGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGATA-TTGAGTAAAATATTGA--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCATGCTG--TCTT------TT-T-T-T--A-TGAAT-C-ATGAA-A---TAT----A---C-A------AGAATGAAAT-ATAT---AT---TCAGAATTG-GACA-GTATT---A---ATA-AA
gi|23 : TGATAAATAAATAAATTCAAATTCG--TTATA-----TGGTGTTAATGTCGTC-ATTTGAGCAAGCGCG-CTATTTTCCGCGTATGAATATA--AACAATTAT--ACTTTGTCAC-------GATTTGAAAATATTACAG-AGTTAAAT-------TCATTTTCATGAAAT-AGAACTCATATTTGCAAATACCAA-AT-CCTTTATCATTTCAATTTTGA-GACAGTCGACATATGGGAATTGAT-A----------AAAGATTC-G----AT---TTAC--ACTAAATG
gi|24 : CT--A----AA---GT-AT---ATGTT-GT---TGT-T---C------------T---TAA--CT--------ATTG--TTGAAGTTC-----------------------------GGTGCGATTAC-TGT-GAAGC-TA-CCCACCTGCTTCCTTCGGTTTTTCATCTCTATAT--AC--TT--TTCGCTCTGTGAGGCCC-TAAAAA-----------------A--GTGACGCTCT-T-ATATGATTGATGC-TCATGCCG--TA-T------AT-T-T-T--A-TTAAT-C-ATGTATA---TTT----A---C-A------TGGAAGAAAT-AT-A---AT---TAACAAATG-TAcgtatgt
gi|25 : CTACACCATC--T---TTTG-TTTGTG-GTTAC-AGAGAAA-T------AAAT----AAAGTCAATCGCAAT-ATA----TGATGTGTTAAGCCG--TC-T------TTAT-T-T--AACTGAT-C-ATGAGTA---TAT----A---TTG------TGAAATATAT-ATAATAAAT---AAACACGTA-TATC-TTATT--AA---ATA---------------TAA--TGTGCA-TCAATGC-TTAAAGTAAA-T--GT-TT--TAAATCTAAAAATTATagtagtaatgggat
gi|26 : gattttgtaaa-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCCTATACATCAAGCGTTTA--------A--AATCATGGTCGGTATCAT-------GACTTGCAAAGATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AATCAGAA---GTATT--------TTAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAACTTAT-AT---T----TAA--GTTC-GT---TT---TTTT--ACTGAATGTTGCat
gi|27 : GAGA--CG-ATTATT-----TGATTTTTAAGCCGTCCTTTTG-ACATGAG-G-GTACGTACAGCATTGATATACA--A--CAGAATGGGCTTTGTC-----------------AA---TAC---G-------------------TGCAT--AAATAGTAGTAATATTTTCACCGAC-----TACTTTTATCAAATAAATAACGATAACGT-CCATACATGACAATT
gi|28 : atacaattgGTTACGATAAAGT---TATAT--G------TGACCT------CTC--C--TCACCGA---ATGGTACACT--A----AA---AT-AT---GTGCT-GT---TCT-T---C------------C---TTT--TT--------ATTG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCGACCTGCTTCTTT-GGTTTTTCGTCTCTATAT--
gi|29 : tTGACAATAAATT---TGTAT--G--------ACAT------CTC--CA-C-----T---ATGTAACATG--A----AT---ATT-T---AT--T-GCATATCT-T---C------------C----AT--TT---------TTA--C-AGTGTT---------------A------T----ATTGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCCACCTGCGTCTTT-GGTTTTTg
gi|3 : TAACAATAAATT---TATAT--A------TAGCAT------TTC--C--C-----A---AGGTAGCAAT--ATAGTAATACATCAC---ATAAG-TA---TCT-T---CATCAATGTAATATGAGTAT--TG--------ACTG--T-AA-GTCTTCCATT----TTACAGTGTTTT----ATTGGTGCGGTTAC-TAT-GTAGCTTA-TCGACCAGCTTCCTT-GGATTTTCGTCTTTACAA--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGACCG-TGAGAAA-T------AAAT----A--ATCAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TTATGCCG--TC-T------TT-T-T-TTTA-TTGAT-T-ATGAATA---TAT----A---T-A------TGTCAGATAT-ATAA---AT---TAACAAGTA-TATC-TTTTTT-AA---ATA-AGA-TCGTAATTTGTAG--TAAACA-TTATTTC-TTAAATTAA--T--ATATT--CAA-TCTAAATAGTATTTTTTATC-GAATTTGGTTTAACAGATATCTTAGTATT-ATTTAAATTATTACAATTGTAG--AAAATAACTA-AATAG-ATTACATTTAAAATAAATAA--TCACA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGACGTC-TTTTG-GCAAGCACG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--ACCCATGGGCGTTGTTAT-------GTCTCGCATAGATCAG---AGTTGTCT-------TTATTGGTAA--AATC------------AGTACTGACCAA-ACATTTTTATCAAGTAAATCAAGA-GACATGCCACATATGACAATTTAT-------------A--ATAT-G----TT---TTTTAAAATAAATGTTGCTGTTattcgcttt
gi|30 : aTGTAACAAT--A----AA---GCTGG---TTATT-GG---TCT-T---T------------A---TAT--TT----------TG--T-TAA----------------ACA------C----ATCAGTGCGGTTTC-TGTTGAAAAACA-CCGTCCTGTTTCCTT-GAATGATCGCCGCTACAC--TA--TA--TTTGCTTTGTG
gi|31 : GTAACAAT--A----AA----TTAT---ATGAT-GA---TCG-T---C------------T--------------------------AAAGTTCTTGATT----A-ACA------T----TAAGGTGCGGTTAC-TGT-TAAGCACA-TCGACCTGCTTCCTT-AGTGTTTCGTCTTTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGT
gi|32 : GTAAAAATAAAGT---TATAT--A------TGACAT------CTCTAC--G-----A---ATGGTACACT--A----AA---AT-AT---ATGCT-GT---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------ATTGTTT-AAGATACTTGATT----A-ACA------T----A
gi|34 : tCGTCTCTACAT--TC--TA--TCCGCTTTGTGAAGCCC-TGAGAAA-T------GAAT----A--GTGAAACGCT-
gi|4 : atgttactcgtttaataGTAACAATAAAGT---TATAC--ACCGCATTAGTAT------CTT--CATC-----A---ATGTAACATG--A----AG---ATT-T---TTGGTAGC---TCT-T---CCA----------T---T-T--TT--------ACGG--T----GTT---------------A------T----ATAGGTGCAGTTAC-TGT-GATGCACA-CCGACCTACTTCCAT-GGTTTTTCGTCTGTACAT--TC--TA--GTCGCTTTGTGAGGTCC-TTAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-TTA----TGATGT-TCATGTCGTTTT-T------TT-T-T-T--A-TTGAT-C-ATAAATA---TGT----A---C-A------TGAAAGAAAT-ATAA---AT---CAACAAGAA-TGTC-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCAGAATGTGTAA--TAAACA-TTATTTC-TTTAATCAAACT--GT-TT--CAT-TATAAATAATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTACATTATTACAATGATAG--AAAATAAC-A-AATAG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-TTTATA-----TGATAATCATGCCGTC-TTTCG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--CAACATGGGCGTTGTCATGCCTAAGGGCTTGCAAAGATTACCTGCATAATCTGCAAAGATCAACTGCAG--AATCAGAACTGATATTAGCACTGGCGAA-ATA-TTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATATCACATATGACAATTCCT-AT---T----T-A--ACTCGG----GT---TTCC--ACTAAATATTGGTGT
gi|5 : TTA--T-AAAATTATTGATTGATTA-ACA------T----ATCGGTGCA-TTAC-TGT-GAAGCACA-TTGTCATGCTTTATT-GCTGTTTCGTTTTTACTT--TC--TA--TTCGCTTTGTGAGGCCC-CGAGA---------------------------CGCT-T-ATA----TGATGT-TTATTCCG--TC-T-------T-G-T-T--A-ATGAT-C-ATGTGCG---TAT----A---C-A------TGAAACAAAT-ATAA---AC---TAACAAAC--TAAC-T-------A---ATG-AAA-TCAGAATTTGTAA--TAAAAA-TCATTTC-TTTAATAAAACT--GT-TT--CAA-CCTAAA-AATATTTT--ATT-AAGTTTGGTTTAACAAACATCTTATTATT-AATTTCATTATTAAAAGGATAG--GAAATAACTA-AATGG-ATTACCAATGAAATAAAAAG--TGAAA--CG-CTTGTAAATTATGATGTGTATGCCGTA-TTTTG-GAGAGCGCG-ATA---CAAGCGTTTACATATA--A--ACTCATGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAAGATAAC---AAGTGTCT-------TCATATGCAT--AATCAGAACTGACATAAGCACTCTCCAA-ATATGATTATCAAGTAAATTAAGA-CACATACCACATATGACAATTTCT-AT---T----T-A--ACTC-G----TT---TTTTTCTCTAAATGTTG
gi|6 : ttttaacaaattctctaaaaggtaagtcaatagcatgaaatcgaacgaaataacgtattcattttaatggatataatcgaatcattccattacgtgattGTAACAATAAGGT------AT--G------TGGTAT-------TC--C--C-----ATTAATGTAACA----A----GA---AGTATCCCATGTT-GT---AAT-T---C------------T---TATATTT--------ATTG--TTGAAGTTCTTGATA----A-GCA------T----ATCGGTGCGGTTGCATAT-AAAGCGCA-TCGATATACTTCCTT-GGGATTTCGTCTATACAT--TA--AA--TTCGCTTTGTGGGGCCC-TGAGAAAAT------AAAT----A--GCCAAACTTT-T-ATG----AAATGT-TCATGTCA--TC-G------TT-T-T-T--A-TCATT-C-ATGAATA---TATGTATA---C-A------TGAAAGAAAT-ACGA---AT---CAACAATTA-CTTC-TTTTTTTAA---ATA-AAA-TCCGAATGTGTAA--TAAACA-TTGTTTC-TTAAATTAAACT--CT-TT--CAT-TCTAAATAATATTCT--ATA-AAATTCGATTTAACAAACATCTTAGAATT-AATAACATTATTATAATTGTAG--AAAATAGCAA-AAAAG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TCAAA--CGTTTTATA-----TGATGT--------CT-TTTTG-GTAAGCGCG-A-------------TATGTATA--A--AATCACGGGCGTTGTCAT-------GACTTGCAAGGATTAC---AGTTACAT-------TTCATTGCAT--AATCAGAGCTGATATAAGCACAGACCAATTTTTTTTTATCAAGTAAATTAAGA-GACATACCACATATGGTAATTTAT-Agt
gi|7 : tttatcaattacgttattataaaggtatatccatcaacGTAACGAGAA--C---TATAT--G--------ACAT------TTC--C------------ATG-AATGCTTCC----AA---GTTAT---ATGAT-GT---TGT-TATTC------------G---TAT--TT--------ATTG--TTGAATTTCTTGATT----A-TTA------C----ATCGGTGCGGTTGC-TGT-GAAGCATA-TCCACCTGCTCCCTT-GGTTTATCG-CTGTAC-T--TCATTAGTTTCGCTTTGTGAGGCAT-TGATAAA-T------GATC----A--ATCAAACGCT-TCATA----TGATGA-TCACGTCG--TC-T------TT-T-T-T--AATTGAT-T-GTGAATA---TAT----A---C-A------TGAAAGAAAC-ATAA---AT---TAACAATTT-TATT-TTATTT-TATTTATATAAA-TCAGAATTTGTAA--TATACT-TTATTTC-TCGAATTAAACT--GT-TT--CGA-TCTAAATAATAGTTT--ATT-AAATTTGGTT----AAAC---TTCGTATG-GATTGCATTATTACAATTGTAG--AAA-TAAC-TTGATAG-ATTACTTGAGAAATGAATAG------A--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-GTTTG-GCAAGCACG-ATATATACAGCATTTATATACA--A--AATCATGGGCGTTTTCAT-------GCCTTGCAAAGATCGC---AGT----T-------TAATTAATAT--AATCAAAACTGATATTAGCACTGACAAA-ATAGTTTTATCAAG----TTAAAA-GACAGACCACATATGGCAGTGTAT-ACAGATGTAATAA--ATTC-G----GT---TAAT--TCTCAATATTGa
gi|8 : tGTTACAATAAATT---TATAT--G------TGACAT------CTC--C--C-----A---ATGTAATACT--A----TA---ATTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------ATTG--T-AAAATTCTTGAAT----G-ACA------T----ATCGGTGCGGTTAC-TGT-GAAGCA-A-CCAACCAGCTTCCTT-GGTTTTTCGTCTCTACAT--TC--TA--TTCGCTTTGTTTGGCCC-TGAGAAA-T------AAAT----A--GTGAAACGCT-T-ATA----TGATGT-TCTTGCCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TAAAT-C-ATGAATA---TAT----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATA-TTATTT-AA---ATA-AAA-TCATAATTTGTAA--TAAGCA-TTATTTC-TTTAATTAAACT--GT-TT--CAA-TCTAAATATTAATTT--ATT-AAGTTTTGTTTAACAAACATCTTATTATT-AAATACATAATAACAATGATAG--AAAATAACTA-AATAG-------------ATAAACAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGCCGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AAACATGGGCGTTATCAT-------GACTTGCAAACATTAC---AGTTCTCT-------TTATTTGCAT--AAACAGATGTGATATTAGCACTGAACAA-ATATTTTTATCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACATATGGCAATTTGT-AT---T----TAA--ACTC-G----TT---TTTT--AATAAATGTTGCTATTat
gi|9 : CAT------TTC--C--C-----A---ATGTAACACT--A----TA---GTTAT---ATGAT-GA---TCT-T---C------------T---TAT--TT--------AATG--TTAAAGTTCTTGATT----A-ACG------T----ATTGGTGGGGTAAC-TGT-GAAGTACA-CCAACCTGCTTCCTT-GGGATTTCGTCTTTACAT---A--TA--TT------GTGAGGCCC-TAAGAAA-T------AAAT----A--GTTAAACGCT-T-ATA----TGATGT-GCATGTCG--TC-T------AT-T-G-T--A-TTAAT-C-ATGAATA---TTA----A---C-A------TGAATGAAAT-ATAA---AA---TAACAAGTA-TATC-TGATTT-AA---ATA-AAAATCAGAACTTGTAA--TGAACA-TTTTTTC-CTTAATTAAACT--TT-TT--CCA-TCTAAATGTTATTTT--ATT-AAGTTTGGCTTAACAAACATCTTATTATA-AAATATAGTCTTACAATGATAG--AAAATAAC-A-AACAG-ATTACCTGAGAAATAAATAG--TGAAA--CG-CTTATA-----TGATGTTCATGGTGTC-TATTG-GCAAGCGCG-ATATATCAAGCGTTTATATATA--A--AATCATTTGCGTTAACAT-------GACTTGCAAAGACCAC---AGTTCTCT-------TTATTTACAT--ATTCAGAAGTGATATTAGCACTAACCAA-ATATTTTTGTCAAGTAAATTTAGA-GACATACCACAAATGGCAATTTAT-AT---T----TAA--ACTC-A----TT---TTTT--ACTGAATGTTGCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTAAGGGTAGCATATAAATAAATAATCATTAAAACACGTGTGAAACTAAACATAGCAACCAATGACGTTTGTATACGCTTGTTG
Unaligned ( gi|35 ): GCACTTTATCAATGTTCGTAACATATTTTCACAAGCAACATTTACTGAA
Unaligned ( gi|36 ): CAACACGTAGCAATTAAAACCATATCCGTGTACAGCTTATCATACAA
Unaligned ( gi|37 ): GTAGCGCTAAATGCAAGTATTAAAGCTCGTTAAAAGTGTAA