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Reference ( gi|1 ) : ATACGGCTCAGCCAAGATAAAGTGGACATTTATGTTGCACGGAGGGTGAAAATTAAACATATTCAAATGGTT-AAATCAGGTTTATATATGTGTT-GGG--CAACCCTTATGCATATTTTCCTGAAATGATTTCCATGTTCCAGATGTCATTTAAAAGTTACAGTCAGACAAATACACCCAACTATGAGGGCCTACAGACTATACATGCCTAAGCATAACGCATATACTTTAAAGTGTTAAAGGGCCTTTATAAGCATGTTTTTGTCATAGAAACTTTGAACAATATCACGTTAATACAATTTTATG-AAAA-AGAAGTAAATGTT---TAAGAATAAGTATGACTTTTCACATTATACATTACATGTACC--TGAAATTA----ATTTTA--AGGACATATTTTCCATTTAGCATTCTGGTGGAATAA-GAAGCTTTTATAAAT--AATTTTTCCCATGTAGTAAATTATAAAGGTGCTATAAATTAAACCCAAAAGTATTG-TTTTGAA-TTTTTGAACACTGTAATAACAACATGAACAGGAAATTGTT------TACTAATTCAGGCCTACGGACTATACAGATATATAT-T---------TGTTTT-AAAAAACTAATCTCAAGTGTCCATTTAAAGATAAATATGTTAAAACATA-TTTTTTACGATCAATTTAGATTACTTTATCAAAATACAACAAGAAAAGTTTACATTCTGTATCATTTTTTTTTCAATATTTTATTAAATATTGAAGAAAAAAGTAGAAATGAGCTATATTTTGACAAATTCTTTAACAAAATGCTGTTAACACTTCCATATTGTTGTAAGTATCTGGAAATTTCATTGCAGAAAGTAAATGAAACAATATGATTTTCATAAGAGAGACA----TACACTAATGTTGTGAC--ATGTTATTTAT-----ATAAAGTAGACCAGGCCTTTGGACTATACATATACCTAGTAAACATTTCTT-A-AACTACCATATCTTTCAGCAGCAA-TATGCTCCCATGTATATGCCAGTTATTTTAATATTTTCTGTGTGGCGTTCCTGTTGTAGAGGTTTTTGATAGTCTTTCAGTAATTTTGTGT--CACAGGTGGAACATTCTATTCTAAGGCAATTTGTTTGTCATGAACACTTACTGGACAGAGTGTCAGGTCAGACAG---CA---TCTTGTCAGTATTTATTACTGTGTAAA-TTTGCCAAAATGTTTTTTTACTTTAATAGGATGTCAATGATTTGTTTTCAAGGCTATGTTGCAACAAATTTGACAATGACATGACTTCTTGATTGTTTCAGACACTAGTCTTACTTGTTTAAGCTTCAAGATTTAAAACAATGGAAACCCATTCTATCCATTCATCTCTATTCTGAGTTTTATAAATTTATGTGAAATATATCTGTCCATGACATTATATACCATGTTTCTGTACGTATATATTTCTTTGCTTCACCTATTACAGATGTATTTTCACTTCCAATATTTGTTTATGTTTTTGGAGATTCTATCATTTTTT-CCCCAACAATAGCTGCTCTTTCTTTAGGTGTTTCTGGCAATAATGCTTTTACTCCTTTCCCTCCAAAGTATATACTCCATTTAATATGGGGTAATTTTGATGACCCAGGAGTCTTTTGTTCTCTGGCATTGTTCTTGTGTTCATTTTCTGGAGAAGTGCATTCAGTTTCCTGTGTTTGCTATCTCAGTTTTACTCTATT---A---GTT-TTT-AGCTTCAACCATGGTGTTCTAAGAACAACAATACTTTTTT-GCTTTTCAATGCAATGTAAGATGGTGAAAGAGTTTTCATTGTTTTTGGATTACTCTTTCTTTTTCTGACAGGTTTTCACATTGACATATATATTGTATGTGCTTGCTTTTAATTTGTTCTGATAATTTT-CTTTT-TTACTATTTTGGACTGTTTTCTTTATTCTAGAT-C-------ATTTGCACACATATTTTTTTTATTTGTCAGAATCATTTATGACA-TTTTGCTTATATCTCCTCATTTTCTAGCATAACCTACCTAGTTCCCCCTCTGGTCATTTATTCTCGTCCTTTTTGCAAAATAGGTTAATGTTTCATAATACTTATTGGAAATGATTGGCATATTTACTGAAATTAGAGCTATAACTTCTT----TAGAAATAACCGTTATGTTCTTTGTATAGTACGTAGCCCCATTTACTTCATTTATG--ATACT---------TAACA--TTGGT-TACAGTA-GATATTT-------A-------CTCTTCTTTTTCTATCAGCAGCATATATACATGTT-GTTTTATA-AATAAAGGTGGAATTAACACTCTTTAAACATCTAGACCATAGGCAAGATATGGTGTTTATTGTAATATTTACACTACACATGGTAGTTTTGTCAAAAAGTAAATAATTTTTACCGACAACTAGTCTTATCACTTGTATAGGTCCATAATCTACTCAAATCTAAGGTTTCTTAGCCAAAACTTTTTGCTTTTTTTTTATAAATAAGTCTGAAAACATTATATTTTT-GGGAGGGCTACGGACAATAGAGGGCTACTGACAACATTGTTTTGTCCATAACATTGCCATGCTGTATGGTAGCAGAAAGTGACTTTCTATGACATTAGCAAGCCATGACCTGACAATAAAAAAAGATGTCTCATTACATAAAAGTGTTACCTTATGAAAATATGGCGTGATGAAATAT-GGGACTACCGACTATAC-AAAAAAAGAGCC--TTTTC--ATGGGTGACTGAAAAAATTTGGAATCTTTAA--AGTATAAATGCTTG-TAGTTTTTAAACAAATTAAGCAGCTAAACTGTTTGGTTTCCTTCTTATAATAGTAATGGGTAAAAAAACCTTAAATGCATAACGAAGGTGTACATTTACATTTTTTAA---TGTAACTTCAACAATTCTTTGAGAAT---TGTTGGTCCGT-AAAAAATTCCACGCACATAAATGTGTTCTTTATTTAGTAAAAGTCATTTAAACTTAAAAAAATTTGGAAACTGGATTTAGGTAGTGTCTTAAAAAATACAATTTTTTATGTGCAACAGCATAACACCTCAAAAATAGCAA-TTTC-AGGTCTTTAAGGTCTCATAATTCATTAACCATTCAATATAAATAACTATAACTATATATCATTGGAAAGCTTGCTTCGAAA--CCTATTTGGAAATGTAGGTTATTTTGAGATTTGGCATATCAGAAGCTTACAGCATGCATTTAACATAGGCAAAAATGAAATGCTCACTTTATCTTGGCTGAGCCGT
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gi|15 : CGGCTCAGCCAAGATAAAGTGAGCATTT
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gi|9 : AAATGTCCACTTTATCTTGGTTGAGACGTacgttgcatggagggtgaaaattaaacatattcaaatggtttaaataaggtttatatatgtgttgggggcaatctttatgcatattttcctgaaatgattttcatgttccagatgtcattaaaaagttacagtcagacatatacacccaccaatgagagcctacagactatacatgcctaagcataatgcatatactttaaaatgttaaagggcttttatagtcatgtttttatcatagaaactttgaacaatatcacgttaatacaattttatgaaaaaagaagtaaatgtttaaggataagtatgatttttctcattttccatttagtattctggtggaaatagaagattttattaaaaatttctcccatgtattaaataataaaggtgctataaatcaaacccaaaagtattgttttgaatttttgaacgctgtaataacaacataaataggaatttgtttactaattcaggcctatggactatacagatatataaatgttttaaaaaactaatcttaagtgtcaatttaaagataaatatgttaatacatattttttacgatcaatttagattactttataaaaatacaacaagaaaagtttacattttgtataatttgttcaatatcttattaaaaattgaagaaaaaagtagaaatgtgctatattttgacaaattctttaacaaaatgctgttaacacttccatattgttgtaagtatctggaaatttcattgcagagagtaaataaaacaataccattttcataggagagacatacactaatgttttgacatgttatttatagaaagtagaccaggccaacggactttacatatacctagttaacctttcttaaaattaccatatctttttacagtaatatgctcctgtgtatatgccagttattgtaatattttctgtgtggctttcctgttctagaggtttttgatagtctttcagtaattttgtgttacaggtgttattttcttctaaggcaatttgtttgtcatgaacatttactgg
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Alignments
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Reference ( family-433 ) : NNACGGCTCAGCCAAGATAAAGTGGACATTTACGTTGCACGGAGGGTGAAAATTAAACATATTCAAATGGTT-AAATCAGGTTTATATATGTGTTGGGG-CAACCCTTATGCATATTTTCCTGAAATGATTTCCATGTTCCAGATGTCATTAAAAAGTTACAGTCAGACAAATACACCCACCTATGAGGGCCTACGGACTATACATGCCTAAGCATAACGCATATACTTTAAAGTGTTAAAGGGCCTTTATAAGCATGTTTTTGTCATAGAAACTTTGAACAATATCACGTTAATACAATTTTATGAAAAAAGAAGTAAATGTT---TAAGGATCAGTATGATTTTTCACATTATACATTACATGTACCTGAAATTAATTTTAAGGACATATTTTCCATTTAGCATTCTGGTGGAATGAGAAGCTTTTATAAATAATTTCTCCCATGTAGTAAATTATAAAGGTGCTATAAATCAAACCCAAAAGTATTG-TTTTGAATTTTT-GAACGCTGTAATAACAACATGAACAGGAAATTGTT------TACTAATTCAGGCCTACGGACTATACAGAT----------ATATATAT--GTTTT-AAAAAACTAATCTCAAGTGTCCATTTAAAGATAAATATGTTAATACATATTTT-TTACGATCAATTTAGATTACTTTATCAAAATACAACAAGAAAAGTTTACATTTTGTATCATTTTTTT--CAATATTTTATTAAATATTGAAGAAAAAAGTAGAAATGTGCTATATTTTGACAAATTCTTTAACAAAATGCTGTTAACACTTCCATATTGTTGTAAGTATCTGGAAATTTCATTGCAGAAAGTAAATAAAACAATATGATTTTCATAAGAGAGACA----TACACTAATGTTGTGACATGTTATTTATATAAAGTAGACCAGGCCTATGGACTATACATATACCTAGTAAACATTTCTTAGAACTACCATATCTTTCAACAGCAAT-ATGCTCCCATGTATATGCCAGTTATTGTAATATTTTCTGTGTGGCTTTCCTGTTGTAGAGGTTTTTGATAGTCTTTCAGTAATTTTGTGTCACA--GGTGGAACATTCTATTCTAAGGCAATTTGTTTGTCATGAACACTTACTGGACAGAGTGTCAGGTCAGACAGCGTCTTCTTGTCAGTATTTATTACTGTGTAAATTTTGCCAAAATGTTTTCTTATTT----AGGATGTCAATGATTTGTTTTCAAGGCTATGTTGCAACAAATTTGACAATGACATGACTTCTTGATTGTTTCAGACACTAGTCTTACTTGTTTAAGCTTCAAGATTTAAAACAATGGAAACCC----TATCCATTCATCTCTATTCTGAGTTTTGTAAATTTATGTGAAATATATCTGTCCATGACATTATATACCATGTTTCTGTACGTATATATTTCTTTGCTTCACCTATTACAGATGTATTTTCACTTCCAATATTTGTTTATGTTTTTGGAGATTCTATCATTTTTTCCCCCAACAATAGCTGCTCTTTCTTTAGGTGTTTCTGGCAATAACGCTTTTACTCCCTTCCCTCCAAAGTATATACTCCATTTAATATGGGGTAATTTTGATGACCCAGGAGTCTTTTGTTCTCTGGCATTGTTCTTGTGTTCATTTTCTGGAGAAGTGCATTCAGTTTCCTGTGTTTGGTATCTCAGTTTTACTCTATTATAAGTT-TTT-AGCTTCAACCGTGGTGTTCAAAGAACAACAATACTTTTTT-GCTTTTCAATGCAATGTAAGATGGTGAAAGAGTTTTCATTGTTTTTGGATTACTCTTTCTTTTTCTGACAGGTTTTCACATTGACATATATATTGTATGTGCTTGCTTTTAATTTGTTCTGCTAATTTT-TTTTT-TTACTATTTTGGACTGTTTTCTTAATTCTAG--------ACCATTTGCACACATATTTTTTTTATTTGTCAGAATCATTTTTGACA-TTTTGCTTATATCTCCTCATTTTCTAGCATAACCTACCTAGTCCCCCCTCTGGTCATTTATTCTGGTCCTTTTTGCAAAATAGATTAGTGTTTCATAATACTTATTTGAAATGATTGGCATATTTACTGAAATTAGAGCTAGAACTTCTT----TAGAAATAACCGTTATGTTCTTTGTATAGTCCGTAGCCCCTTTTACTTCATTTATGATACTTAACATTGGTTACAGCAGATATTTATTTATAACTATTCTTTTTCTATCAGCAGCATGTATACATTTTG-TCTTATACATAAAAGTGAAATTAACACTCTTTAAACATCTAGACCATAGGCAAGATACGGTGTTAATTGTAATATTTACACTACACATGATAGTTTTGTCAAAAAGTTAATAATTTTTACCGACAACTAGTCTTATCACTTGTATAGGTCCATAATCTACTCAAATCTAATGTTTCTTAGCCAAAACTTGTTGC--TTTCTTTATAAATAAGTCTGAAAACATTATATTTTTGGGGAGGGCTACGGACAATACAGGGCTACGGACAACATTGTTTTGTCCATAACATTGTCATGCTGTATGGTAGCAGAAAGTGACTTTCTATGACATTAGCAAGCCATGACCTGACAATAAAAAAAGATGTCTTATTACANCAAAGTGTTACCTTATGAAAATATGGCATGATGAAATAT-GGGGCTACGGACTATAC-AAAAAAAGAGCCTTTTCTTATGGGTGACTGAAAAAATTTGGAATCTTTAA-AAGTATTAATGCTTG-TAGTTTT-----TA------AACATGT---------------TTAGCAG--------------CTAAAC-TGTTTGG----------------TTTCCTACTTAGAATAGTAATGGGT-AAAAAACCTTAAAAGCATAACGAAGGTGTACATTTACATTTTTTAA---TGTAACTTCAACAATTCTTTGAGAAT---TGTTGGTCCGT-AAAAAATTCCACGCACATAAATGTGTTCTCTATTTAGTAAAAGTCATTTAAACTT-AAAAAATTTGGAAACTGGATTTAGGTAGTGTCTTAAAAAATACAATTTTTTACGTGCAACAGCATAACGCCTCAAAAATGGCAATTTTCAGGCCTTTAAGGTCTCATAATTCATTAACCATTCAATATAAATAACTATAACTATATATCATTGGAAAGCTTGCCTC-AAAACCTATTT-GGAAATGTATGTTATTTTGAGATTTGGTATATCAGAAGCTTACAGCATGCATATAACATAGGCAAAAATGAAATGCTCACTTTATCTTGGCTGAGCCGT
gi|1 : ACGGCTCAGCCAAGATAAAGTGGACATTTATGTTGCACGGAGGGTGAAAATTAAACATATTCAAATGGTT-AAATCAGGTTTATATATGTGTTGGG--CAACCCTTATGCATATTTTCCTGAAATGATTTCCATGTTCCAGATGTCATTTAAAAGTTACAGTCAGACAAATACACCCAACTATGAGGGCCTACAGACTATACATGCCTAAGCATAACGCATATACTTTAAAGTGTTAAAGGGCCTTTATAAGCATGTTTTTGTCATAGAAACTTTGAACAATATCACGTTAATACAATTTTATGAAAAA-GAAGTAAATGTT---TAAGAATAAGTATGACTTTTCACATTATACATTACATGTACCTGAAATTAATTTTAAGGACATATTTTCCATTTAGCATTCTGGTGGAATAAGAAGCTTTTATAAATAATTTTTCCCATGTAGTAAATTATAAAGGTGCTATAAATTAAACCCAAAAGTATTG-TTTTGAATTTTT-GAACACTGTAATAACAACATGAACAGGAAATTGTT------TACTAATTCAGGCCTACGGACTATACAGAT----------ATATATTT--GTTTT-AAAAAACTAATCTCAAGTGTCCATTTAAAGATAAATATGTTAAAACATATTTT-TTACGATCAATTTAGATTACTTTATCAAAATACAACAAGAAAAGTTTACATTCTGTATCATTTTTTTTTCAATATTTTATTAAATATTGAAGAAAAAAGTAGAAATGAGCTATATTTTGACAAATTCTTTAACAAAATGCTGTTAACACTTCCATATTGTTGTAAGTATCTGGAAATTTCATTGCAGAAAGTAAATGAAACAATATGATTTTCATAAGAGAGACA----TACACTAATGTTGTGACATGTTATTTATATAAAGTAGACCAGGCCTTTGGACTATACATATACCTAGTAAACATTTCTTA-AACTACCATATCTTTCAGCAGCAAT-ATGCTCCCATGTATATGCCAGTTATTTTAATATTTTCTGTGTGGCGTTCCTGTTGTAGAGGTTTTTGATAGTCTTTCAGTAATTTTGTGTCACA--GGTGGAACATTCTATTCTAAGGCAATTTGTTTGTCATGAACACTTACTGGACAGAGTGTCAGGTCAGACAGCATCTT---GTCAGTATTTATTACTGTGTAAATTT-GCCAAAATGTTTTTTTACTTTAATAGGATGTCAATGATTTGTTTTCAAGGCTATGTTGCAACAAATTTGACAATGACATGACTTCTTGATTGTTTCAGACACTAGTCTTACTTGTTTAAGCTTCAAGATTTAAAACAATGGAAACCCATTCTATCCATTCATCTCTATTCTGAGTTTTATAAATTTATGTGAAATATATCTGTCCATGACATTATATACCATGTTTCTGTACGTATATATTTCTTTGCTTCACCTATTACAGATGTATTTTCACTTCCAATATTTGTTTATGTTTTTGGAGATTCTATCATTTTTTCCCC-AACAATAGCTGCTCTTTCTTTAGGTGTTTCTGGCAATAATGCTTTTACTCCTTTCCCTCCAAAGTATATACTCCATTTAATATGGGGTAATTTTGATGACCCAGGAGTCTTTTGTTCTCTGGCATTGTTCTTGTGTTCATTTTCTGGAGAAGTGCATTCAGTTTCCTGTGTTTGCTATCTCAGTTTTACTCTATTA---GTT-TTT-AGCTTCAACCATGGTGTTCTAAGAACAACAATACTTTTTT-GCTTTTCAATGCAATGTAAGATGGTGAAAGAGTTTTCATTGTTTTTGGATTACTCTTTCTTTTTCTGACAGGTTTTCACATTGACATATATATTGTATGTGCTTGCTTTTAATTTGTTCTGATAATTTT-CTTTT-TTACTATTTTGGACTGTTTTCTTTATTCTAG--------ATCATTTGCACACATATTTTTTTTATTTGTCAGAATCATTTATGACA-TTTTGCTTATATCTCCTCATTTTCTAGCATAACCTACCTAGTTCCCCCTCTGGTCATTTATTCTCGTCCTTTTTGCAAAATAGGTTAATGTTTCATAATACTTATTGGAAATGATTGGCATATTTACTGAAATTAGAGCTATAACTTCTT----TAGAAATAACCGTTATGTTCTTTGTATAGTACGTAGCCCCATTTACTTCATTTATGATACTTAACATTGGTTACAGTAGATATTT-------ACTCTTCTTTTTCTATCAGCAGCATATATACATGTTG-TTTTATAAATAAAGGTGGAATTAACACTCTTTAAACATCTAGACCATAGGCAAGATATGGTGTTTATTGTAATATTTACACTACACATGGTAGTTTTGTCAAAAAGTAAATAATTTTTACCGACAACTAGTCTTATCACTTGTATAGGTCCATAATCTACTCAAATCTAAGGTTTCTTAGCCAAAACTTTTTGCTTTTTTTTTATAAATAAGTCTGAAAACATTATATTTTT-GGGAGGGCTACGGACAATAGAGGGCTACTGACAACATTGTTTTGTCCATAACATTGCCATGCTGTATGGTAGCAGAAAGTGACTTTCTATGACATTAGCAAGCCATGACCTGACAATAAAAAAAGATGTCTCATTACATAAAAGTGTTACCTTATGAAAATATGGCGTGATGAAATAT-GGGACTACCGACTATAC-AAAAAAAGAGCCTTTTC--ATGGGTGACTGAAAAAATTTGGAATCTTT-A-AAGTATAAATGCTTG-TAGTTTT-----TA------AACAAAT---------------TAAGCAG--------------CTAAAC-TGTTTGG----------------TTTCCTTCTTATAATAGTAATGGGTAAAAAAACCTTAAATGCATAACGAAGGTGTACATTTACATTTTTTAA---TGTAACTTCAACAATTCTTTGAGAAT---TGTTGGTCCGT-AAAAAATTCCACGCACATAAATGTGTTCTTTATTTAGTAAAAGTCATTTAAACTTAAAAAAATTTGGAAACTGGATTTAGGTAGTGTCTTAAAAAATACAATTTTTTATGTGCAACAGCATAACACCTCAAAAATAGCAA-TTTCAGGTCTTTAAGGTCTCATAATTCATTAACCATTCAATATAAATAACTATAACTATATATCATTGGAAAGCTTGCTTC-GAAACCTATTT-GGAAATGTAGGTTATTTTGAGATTTGGCATATCAGAAGCTTACAGCATGCATTTAACATAGGCAAAAATGAAATGCTCACTTTATCTTGGCTGAGCCGT
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