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Reference ( gi|3 )            :                                                                 AGCGATGGGCAATCAGAA-ATATTTGGAAATCGATTATTGG----ATAAAATCGGATGTATGAAT--TCGATTA--TA---ATCAGAAATATAAGTTTACAATGAAGAAGT---TTA-TAAAA----GA-A-GTTAA------------AATGCTTGCA-TT-CATCACAA-----ATTC-ATCAGTTTG--A-----CT------------AG--T-------G-------TTAAA----------CTTTGATCTAACATTGTATAATTGGTTTGGAAGTCATTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTGAAGTCTTATCTATGCACATAGTTCATGTTGTTTATTATA--T---TA-TTC-TAATAC------AGTT-----TT--TA----TGCTTAACATTCATGTCCTTTATTCTATTTCTTCT---A--AT--A---GTCTG---TT-AGTA--A-------------TA---------------TCACATTAC-----AAGCCAAAC-AAACTAAA-AAA-ATTACATTTTCTG-TTATAATCGATTA-T--TCAATTTCACAATC---AAT-----A--ATC-----TA-----AT-----GAGT-ATTTCCACTAAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCATTATATT
gi|2                          :                                                                 AGTGATAGGCAATTTGAATATATTTGGAAATGGATTATTAG----ATATAATTGGATGTATGAAA--TTGATTACTTATCGATCTGAAATA-AAATTTACAATGAAGAACT---TTT-TAAAA----GA-AAGTTAA------------AATGCTTGCA-TT-CATCATAA-----GTTC-ATCAGTTTG--ATACTTCT------------AGTTT-------GAACAGTTTTAAA----------CTTTGATCTAAGATGGTATAAGTGGTTGAGAAAATGTGAGT---TTTTTAAGCTCAC-TTTCATTTTA--TT-G----------------------------GTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTATTTATT-TAAGT---TG-TTC-TAATAC------AGTC-----TT--TATTTTTGCTTAAAATTCATGTCCTTTATTATAGTTATTCT---A--ATACA---GTCTG---TT-AGTATTACCAGGTTTTCTATTA---------------TCACATTTC-----AAGTCAATT-GAACT-AA-AAA-ATAACATTTTCAA-TATTAATCAATTA-T--TCAATTTCACAATC---GAT-----A--ATC-----GAATCAGAT-----GAGT-ATTTTTGATCAGTTACAGATTTTAATCGAGTAATTGTTACAT
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gi|13                         : ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactAGTGATGGGTAATCAAAA-ATAATTGGAAATCGCTTATCAGATTTATGAAATT-GAT-TACTAA---TCGATTA--TA---ATCGAAAA------TTTAAAATGAAGAACT---TCA-TAAAattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
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gi|5                          :                                                                                                                                                                     gccagtattaaataatcaattaacctaactatttTAA------------AATGCTTGCA-TTTCATCACAA-----ATTG-ATCGGTTTGATA-----CTGCCAGTTTGAACAG--T-------T-------TTAAA----------CTTTGATCTTAGATTGTATAATTGGTTGAGAAGTCATTGGT---CATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TTGG-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTC-TATCTATACACATGATTCAGGTTGTTTAT--------------------TAC------AGTT-----CT--TA----TACTAGAGAT---TG-----TA--CTACGT-TTCC---A--AT-------------------------------------TA---------------TCACATTAC-----ATGCCAAAT-GAACTAAA-AAC-A--ACATTTTCAA-TTGTAATTGATTA-T--TCAATTTCACAACC---GAT-----A--ATC-----AAATTGGAT-----GAGT-ATTT-----------TCGATTTTAATCAATTAATCGTTACATgtttcaacagtttttaaactt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cTCTTCT---A--AT--ACA-GTCTG---TT-AGTT--A-------------TACTAGGTTTCCTATTATCACATTAC-----AAGCCAAAT-GAACTGAA-AAACA--ACATTTTTGA-TTATAGTAGATTA-T--TCAATTTCACAACTGAAAATCG---A--ATC-----AG-----AT-----GAGT-ACTTTCGATTAGTTATCTATTTTAATTGATTAATCTTTACAT
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                    AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATNGNTTATCGGA--TAT--AATCGGATGTATNAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA-TAAAA-AA-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCACAA-----ATTC-ATCAGTTTGATA-------T--CT------------AG--TG-------TTAAA----------CTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTTTATTANANTTCTTCT---AAT-CA-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAATGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGAT-----A--ATC-----G-----GAT-----GAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCGTTACAT
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGAT-A--------T--CTG-----------A---GTTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAA--T--GATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                        ttacaattttgTAAAATGCTTGC-ATTTCATCACAAATTGATCGGTTTGAT-ACTGCCAG-T--TTG-----------AACAGTTTTAAACTTTGATCTTAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCATTGGT---CATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TTGG-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTC-TATCTATACACATGATTCAGGTTGTTTAT------------------TAC------AGTT-----CT--TA----TACTAGAGAT---TG------TACTACGTTTC-----------C--A-----A---TTA-TC--------------A-------------C-A---------------TTACAT----------GCCAAATGAA-CTAAA---AAC--A--ACATTTTCAATTGTAATTGATTAT---TCAATTTCACAACCGATAATCAAA--TTGGATGAGTATTT-----------TCGATTTTAATCAATTAATCGTTACAT
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gi|8                          :                                                               ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactA---ATCGGAAATATT--ATTACAATGAAGAACTTGAA--GAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTGGC-ATT-CATCACAAATTAATCAATTTGAT----------T--CTGCTAGTTTTAACA---GTTTTAAACTTTGATCTATGA-TATATA-ATTGATTGAGAAGattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGAT--A--G--CTAGTCT---G-A---G----TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-T-GCTAGTTT-GA--A--G-TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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gi|15                         :                                                    GTGATGGGCAATCGAAA-ATATTTGGAAATCGCTTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGAT
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gi|3                          :                                                   AGCGATGGGCAATCAGAA-ATATTTGGAAATCGATTATTGGA--TAA--AATCGGATGTA-TGAATTCGATTA--TA---ATCAGAAATATAAGTTTACAATGAAGAAGTTTA---TAAAA-G----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA--------CTAGT----------G-TT--AAACTTTGATCTAACATTGTATA-ATTGGTTTGGAAGTCATTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTGAAGTCTTATCTATGCACATAGTTCATGTTGTTTATTAT--A-T-TATTC-TAATAC------AGTT-----TT--TA----TGCTTAACATTCATGTCCTT-TATTCTATTTCTTCT---AAT----A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACAAA-CTAAA---AAA--ATTACATTTTCTGTTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCAATAATCTA-----ATGAGTATTTCCACTAAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCATTATATca
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gi|8                          :                                                               ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactA---ATCGGAAATATT--ATTACAATGAAGAACTTGAA--GAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTGGC-ATT-CATCACAAATTAATCAATTTGATT-C-T-GCTAGTTT-TAACA--G-TTTTAAACTTTGATCTATGA-TATATA-ATTGATTGAGAAGattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactagtgatgggcTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTT--------------A-------------T-ACTAGGTTTCCTATTATCACATTAC-----AAGCCAAATGAA-CTGAA---AAAC-A--ACATTTTTGATTATAGTAGATTAT---TCAATTTCACAACTGAAAATCGAATCAGATGAGTACTTTCGATTAGTTATCTATTTTAATTGATTAATCTTTACAT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TGACGAAAAGCTGTATATAGTAAAGTCAATTAAATGTCTAATGTCTATGTCTTATGTCTATAATAATTTAATGACAGTGTATACTATTGTATTTTCAGTGA
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Unaligned ( gi|17 ): TGTTGAAATCTTGAAACAAATACAAGATATTTTATATAGATATGTCTGTAT






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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-T-GCTAGTTT-GAA-A-G-TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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gi|8                          :                                                               ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactA---ATCGGAAATATT--ATTACAATGAAGAACTTGAA--GAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTGGC-ATT-CATCACAAATTAATCAATTTGATT-C-T-GCTAGTTT-TAACA-G-TTTTAAACTTTGATCTATGA-TATATA-ATTGATTGAGAAGattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-T-GCTAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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gi|12                         :                                                                                                                                         AACATA--TT-ACAATGGAGAAGTTAATTGTAAAA-ATATGCATTTAAATTGTA-AATTGCAATGCTTACA-AT-CATCATAAATTCAACTTTTTGA-TAA-T-GCTAGTTTCAACAGTTTTTAAACTTca
gi|13                         :                 gccagtattaaataatcaattaacctaactatttAGTGATGGGTAATCAAAA-ATAATTGGAAATCGCTTATCAGATTTATGAAATT-GAT-TACT--AATCGATTA--TA---ATCGAAA----A--TTTAAAATGAAGAACTTCA---TAAA
gi|15                         :                                                    GTGATGGGCAATCGAAA-ATATTTGGAAATCGCTTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGAT
gi|2                          :                                                   AGTGATAGGCAATTTGAATATATTTGGAAATGGATTATTAGA--TAT--AATTGGATGTA-TGAAATTGATTACTTATCGATCTGAAATAAAA-TTTACAATGAAGAACTTTT---TAAAAGA----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCATAAGTTCATCAGTTTGA-T-ACT-TCTAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTAAGATGGTATA-AGTGGTTGAGAAAATGTGAGT---TTTTTAAGCTCAC-TTTCATTTTA--TT-G----------------------------GTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTATTTATT-TA-AGT-TGTTC-TAATAC------AGTC-----TT--TATTTTTGCTTAAAATTCATGTCCTT-TATTATAGTTATTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTATT------------ACCAGGTTTTCTATT-A---------------TCACATTTC-----AAGTCAATTGAA-CTAAA---AAAT-A--ACATTTTCAATATTAATCAATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCAGATGAGTATTTTTGATCAGTTACAGATTTTAATCGAGTAATTGTTACATaa
gi|3                          :                                                   AGCGATGGGCAATCAGAA-ATATTTGGAAATCGATTATTGGA--TAA--AATCGGATGTA-TGAATTCGATTA--TA---ATCAGAAATATAAGTTTACAATGAAGAAGTTTA---TAAAA-G----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA--------CTAG--TG--------TTAAACTTTGATCTAACATTGTATA-ATTGGTTTGGAAGTCATTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTGAAGTCTTATCTATGCACATAGTTCATGTTGTTTATTAT--A-T-TATTC-TAATAC------AGTT-----TT--TA----TGCTTAACATTCATGTCCTT-TATTCTATTTCTTCT---AAT----A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACAAA-CTAAA---AAA--ATTACATTTTCTGTTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCAATAATCTA-----ATGAGTATTTCCACTAAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCATTATATca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                        ACAAATTCATCATAATAA-T-AAT-GCTATTTTTGATAG-TTTTAAACTTTGATGTAGCAGTGTTTA-ATCAGTTAATAAGTTGTTAGT---TATCTAGGCTCACTTTTTAAGTTGGCTA-G-TCTATTTATGCATGAATAGACTTAAAAAACTTATATATGCCCACAATTCAGGTTGTTTATTATATA-CATATTTATAATACATCTATAGTC-----TTGATATT--TGCTCAAG-TTCATGTCCTT-AATTAAAGTTCTTCT---AACAC--A-GCCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------CTAGGTTACCTATTA--CCAAACAAA-CTAAA---AAAACA--ACATTTTCGATTTTAATGGATTAT---TCAATTTCAt
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gi|8                          :                                                               ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactA---ATCGGAAATATT--ATTACAATGAAGAACTTGAA--GAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTGGCA-TT-CATCACAAATTAATCAATTTGATT-C-T-GCTAGTTTTAACAG-TTTTAAACTTTGATCTATGA-TATATA-ATTGATTGAGAAGattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACTTNA---TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-T-GCTAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTGTTTATTATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--TA----TGCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A--A--AAATTTCCGATAATAATCGATTATTAATCAATTTCATA---GATA
gi|1                          : tgtatgaaatcgataaatgtgaattatttgatatttatataattaaggtgtatatgatgctgagaaaaactgtatatagtttaagtcaataaattgtcttatggctatgtcttaAATCGATTA--TT---ATCGGAAAT-T---TTTACAATGAAGAACT--------GAA-A----------------A-AGTTAAAAAGTTTGCA-TT-CCTCACAAATTCATAATTTTGA-T-A-TTACTAGTTTAAAAAG-TTTTTAACTTTGATCT-----TATATATATT-----ATAATTTATTA------ACTT--------TTTTTATTTTGA-TG-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAATGTTT-------------AAGTTATGTAGTTTCTTATA-G-T-AATTC-AAATAC-------GTTATTTATT--TA----TGCTTAAAAGTCATGTCCTT-TATTACAGTTCTTCT---AATAC--A-GTATG---TTAGTATTACTGGGTTCCCTA-------------TTA---------------TCACATTAC-----AAGCAAAATGAA-CTGAA---AAAC-A--ACATTTTTGATTATAATCAATTAT---TTAATTTCATAATCGATAATCGAATCGGAAGAGTATTTTCGATTA---------TTTAATC----AATCGCTACATacaatgaagaactgaaaaagttaaaaagtttgcattcctcacaaattcataattttgatattactagtttaaaaagtttttaactttgatcttatatatattataatttattaactttttttattttgatggtctatttatagactttaatgtttaagttatgtagtttcttatagtaattcaaatacgttatttatttatgcttaaaagtcatgtcctttattacagttcttctaatacagtatgttagtattactgggttccctattatcacattacaagcaaaatgaactgaaaaacaacatttttgattataatcaattatttaatttcataatcgataatcgaatcggaagagtattttcgattatttaatcaatcgctacatc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtatgaaatcgataaatgtgaattatttgatatttatataattaaggtgtatatgatgctgagaaaaactgtatatagtttaagtcaataaattgtcttatggctatgtcttatatctatgaaattgattaatTTATTATA-G-T-TATTC-TAATA---------------------------GACTAATAT--A-GT-------TTCAATTTTTGCTCAAAATAC--ATGTCT----TT--------------------------------T-A---------------TCACATAAG-----AAGCCAAATGAA-CTTGA---AAC--A--ACATTTTCGATTGTG-------------CAATTTCATCATTGATAGTAGAATCAGATGAGTGTTTTCGATCATTTATCGATTATAAc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cTTCT---AATGC--A-GTCTAGATTTATTT--------------T-------------T-A---------------TCACATTAT-----AAACCAAATGAAATTAAAGAAAAA--A--ATATTTT-GATTATATTTAGTTAT---CCAATTTCATCATCGATA---GAATTGGACAAGCAATTTCGTTCAGTTATCGATTATAATTGATT-ATTGGCACAT
gi|12                         :                                                                                                                                         AACATA--TT-ACAATGGAGAAGTTAATTGTAAAA-ATATGCATTTAAATTGTA-AATTGCAATGCTTACA-AT-CATCATAAATTCAACTTTTTGA-TAA-T-GCTAGTTTCAACAGTTTTTAAACTTca
gi|13                         :                 gccagtattaaataatcaattaacctaactatttAGTGATGGGTAATCAAAA-ATAATTGGAAATCGCTTATCAGATTTATGAAATT-GAT-TACT--AATCGATTA--TA---ATCGAAA----A--TTTAAAATGAAGAACTTCA---TAAA
gi|15                         :                                                    GTGATGGGCAATCGAAA-ATATTTGGAAATCGCTTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGAT
gi|2                          :                                                   AGTGATAGGCAATTTGAATATATTTGGAAATGGATTATTAGA--TAT--AATTGGATGTA-TGAAATTGATTACTTATCGATCTGAAATAAAA-TTTACAATGAAGAACTTTT---TAAAAGA----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCATAAGTTCATCAGTTTGA-T-ACT-TCTAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTAAGATGGTATA-AGTGGTTGAGAAAATGTGAGT---TTTTTAAGCTCAC-TTTCATTTTA--TT-G----------------------------GTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTATTTATT-TA-AGT-TGTTC-TAATAC------AGTC-----TT--TATTTTTGCTTAAAATTCATGTCCTT-TATTATAGTTATTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTATT------------ACCAGGTTTTCTATT-A---------------TCACATTTC-----AAGTCAATTGAA-CTAAA---AAAT-A--ACATTTTCAATATTAATCAATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCAGATGAGTATTTTTGATCAGTTACAGATTTTAATCGAGTAATTGTTACATaa
gi|3                          :                                                   AGCGATGGGCAATCAGAA-ATATTTGGAAATCGATTATTGGA--TAA--AATCGGATGTA-TGAATTCGATTA--TA---ATCAGAAATATAAGTTTACAATGAAGAAGTTTA---TAAAA-G----------------A-AGTTAAAATGCTTGCA-TT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA--------CTAG--TG--------TTAAACTTTGATCTAACATTGTATA-ATTGGTTTGGAAGTCATTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTGAAGTCTTATCTATGCACATAGTTCATGTTGTTTATTAT--A-T-TATTC-TAATAC------AGTT-----TT--TA----TGCTTAACATTCATGTCCTT-TATTCTATTTCTTCT---AAT----A-GTCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACAAA-CTAAA---AAA--ATTACATTTTCTGTTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCAATAATCTA-----ATGAGTATTTCCACTAAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCATTATATca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                        ACAAATTCATCATAATAA-T-AAT-GCTATTTTTGATAG-TTTTAAACTTTGATGTAGCAGTGTTTA-ATCAGTTAATAAGTTGTTAGT---TATCTAGGCTCACTTTTTAAGTTGGCTA-G-TCTATTTATGCATGAATAGACTTAAAAAACTTATATATGCCCACAATTCAGGTTGTTTATTATATA-CATATTTATAATACATCTATAGTC-----TTGATATT--TGCTCAAG-TTCATGTCCTT-AATTAAAGTTCTTCT---AACAC--A-GCCTG---TTAGTA--------------A-------------T-A---------------CTAGGTTACCTATTA--CCAAACAAA-CTAAA---AAAACA--ACATTTTCGATTTTAATGGATTAT---TCAATTTCAt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                        ttacaattttgTAAAATGCTTGCA-TTTCATCACAAATTGATCGGTTTGA-T-ACT-GCCAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTTAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCATTGGT---CATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TTGG-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTC-TATCTATACACATGATTCAGGTTGTTTAT------------------TAC------AGTT-----CT--TA----TACTAGAGAT---TG------TACTACGTTTC-----------C--A-----A---TTA-TC--------------A-------------C-A---------------TTACAT----------GCCAAATGAA-CTAAA---AAC--A--ACATTTTCAATTGTAATTGATTAT---TCAATTTCACAACCGATAATCAAATTGGATGAGTATTT-----------TCGATTTTAATCAATTAATCGTTACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAGGATCACTTTTTATTT-G--TT-GGTCTATTT--------ATAGACTTTAA-GTCTTATCTATGCACATTATTCATGTTGTTTATTACA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTC-----TT--T-------C------TTTATGTTATTGTGTTAG--------T---AATACTAG-GT------TTCGTA--------------G-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAT--A--ACATT-------------GATTAT---TTAATTTCACAATCGATAATCGAATTTGATGAGTATTTTCAATAAGCTATTCA-TCTATTTGATAAATCGTTca
gi|7                          :                                                  tAGTGATGGGCAATCGGAA-TTATTTGGAAATAGATTATCGTA--TAT--AATCGTATGTA-T--------------------CAGAGATATA--TTTTCAGTGAAAAACTTAA---AAAAA-A----------------ACAGTTAAAACGCTTGTAATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-AAGCTAGTTTGAA--G-TTTTAAACTTTGATCTAAGGTTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCATTAGTTTATATTTAGGGTCACTgaa
gi|8                          :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATT
gi|8                          :                                                               ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactA---ATCGGAAATATT--ATTACAATGAAGAACTTGAA--GAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTGGCA-TT-CATCACAAATTAATCAATTTGATT-C-T-GCTAGTTTTAACAG-TTTTAAACTTTGATCTATGA-TATATA-ATTGATTGAGAAGattacaatgaagaacttgaagaaaaaaagttaaaatgctggcattcatcacaaattaatcaatttgattctgctagttttaacagttttaaactttgatctatgatatataattgattgagaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttataaatgaatatgtcacagctcaaatggttgaagaataaataaaaaataactggtatttactagtgatgggcTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---TTAGTT--------------A-------------T-ACTAGGTTTCCTATTATCACATTAC-----AAGCCAAATGAA-CTGAA---AAAC-A--ACATTTTTGATTATAGTAGATTAT---TCAATTTCACAACTGAAAATCGAATCAGATGAGTACTTTCGATTAGTTATCTATTTTAATTGATTAATCTTTACAT


blockSeqs                     :                                                                     T                       .    .            . GA         CTTATCG         A AAG                 AATTGT    ATATGCATTTAAATTGT  C                A  T                T     TAAT           C  C  T                AAG T      .                     TTA                        GC  G G       ATGCATGA           A                                  A ATACA      A      ATCTATAGTCTTGATATT              TA T     CC  G     AAT       CAA     TA T  C AGAT   T ATTACCAGGTTTTCTATTA                                     CTATT            A     GAA   AC TT            A  A C      .                            A                C T
blockSeqs                     :                                                                     .                       .    .            . GA         TA              A AA                  GAAG      GA                 .                .  .                G     TACT           G  C  .                AAC T      .                     .                          .   . .       .                  A                                  A AAGT       .      AGTCTTTATTTT                    AA T     CC  .     TAG       .       .  .  C G      G TATACTAGGTTTCCTATTA                                     .                .     .     C  .             G  T T      .                            G                C G
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4252 )     :                                                   AGTGATGGGCAATCGGAA-ATATTTGGAAATCGATTATCGGA--TAT--AATCGGATGTA-TGAAATCGATTA--TA---ATCGGAAATATA--TTTACAATGAAGAACT---TTA-TAAAA-A----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA-T-A-T-GCTAGTTTGAACAG-TTTTAAACTTTGATCTAAGATTGTATA-ATTGGTTGAGAAGTCGTTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAAAGTCTTATCTATGCACATAATTCATGTTG-TTTATT-ATA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTCTT--TA--TTT--GCTTAANATTCATGTCCTT-TATTANANTTCTTCT---AATAC--A-GTCTG---T--TA-GT----A--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAA--A--ACATTTTCGATTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCGATAATCGAATCGGATGAGTATTTTCGATCAGTTATCGATTTTAATCGATTAATCGTTACAT
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gi|1                          : tgtatgaaatcgataaatgtgaattatttgatatttatataattaaggtgtatatgatgctgagaaaaactgtatatagtttaagtcaataaattgtcttatggctatgtcttaAATCGATTA--TT---ATCGGAAAT-T---TTTACAATGAAGAACT---------GAA-A----------------A-AGTTAAAAAGTTTGC-ATT-CCTCACAAATTCATAATTTTGA-T-A-TTACTAGTTTAAAAAG-TTTTTAACTTTGATCT-----TATATATATT-----ATAATTTATTA------ACTT--------TTTTTATTTTGA-TG-G-TCTATTT--------ATAGACTTTAATGTTT-------------AAGTTATGTAG-TTTCTT-ATA-G-T-AATTC-AAATAC------GTTATT--TA--TTTATGCTTAAAAGTCATGTCCTT-TATTACAGTTCTTCT---AATAC--A-GTATG---T--TA-GT----ATTACTGGGTTCCCTA-------------TTA---------------TCACATTAC-----AAGCAAAATGAA-CTGAA---AAAC-A--ACATTTTTGATTATAATCAATTAT---TTAATTTCATAATCGATAATCGAATCGGAAGAGTATTTTCGATTA---------TTTAATC----AATCGCTACATacaatgaagaactgaaaaagttaaaaagtttgcattcctcacaaattcataattttgatattactagtttaaaaagtttttaactttgatcttatatatattataatttattaactttttttattttgatggtctatttatagactttaatgtttaagttatgtagtttcttatagtaattcaaatacgttatttatttatgcttaaaagtcatgtcctttattacagttcttctaatacagtatgttagtattactgggttccctattatcacattacaagcaaaatgaactgaaaaacaacatttttgattataatcaattatttaatttcataatcgataatcgaatcggaagagtattttcgattatttaatcaatcgctacatc
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gi|13                         :                 gccagtattaaataatcaattaacctaactatttAGTGATGGGTAATCAAAA-ATAATTGGAAATCGCTTATCAGATTTATGAAATT-GAT-TACT--AATCGATTA--TA---ATCGAAA----A--TTTAAAATGAAGAACT---TCA-TAAA
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gi|3                          :                                                   AGCGATGGGCAATCAGAA-ATATTTGGAAATCGATTATTGGA--TAA--AATCGGATGTA-TGAATTCGATTA--TA---ATCAGAAATATAAGTTTACAATGAAGAAGT---TTA-TAAAA-G----------------A-AGTTAAAATGCTTGC-ATT-CATCACAAATTCATCAGTTTGA--------CTAG--TG--------TTAAACTTTGATCTAACATTGTATA-ATTGGTTTGGAAGTCATTAGT---TATTTAGGCTCACTTTTTATTTTG--TT-G-TCTATTT--------ATAGACTTTGAAGTCTTATCTATGCACATAGTTCATGTTG-TTTATT-AT--A-T-TATTC-TAATAC------AGTTTT--TA----T--GCTTAACATTCATGTCCTT-TATTCTATTTCTTCT---AAT----A-GTCTG---T--TA-GT----A--------------A-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACAAA-CTAAA---AAA--ATTACATTTTCTGTTATAATCGATTAT---TCAATTTCACAATCAATAATCTA-----ATGAGTATTTCCACTAAGTTATCGATTTTAATTGATTAATCATTATATca
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                         taaaatgcttgcatttcatcacaaattgatcggtttgatactgccagtttgaacagttttaaactttgatcttagattgtataattggttgagaagtcattggtcatttaggctcactttttatttTTTAGGATCACTTTTTATTT-G--TT-GGTCTATTT--------ATAGACTTTAA-GTCTTATCTATGCACATTATTCATGTTG-TTTATT-ACA-A-T-TATTC-TAATAC------AGTCTT--TC--TTT-------------ATGTTATTGTGTTAG--------T---AATACTAG-GT------T--TC-GT----A--------------G-------------T-A---------------TCACATTAC-----AAGCCAAACGAA-CTAAA---AAT--A--ACATT-------------GATTAT---TTAATTTCACAATCGATAATCGAATTTGATGAGTATTTTCAATAAGCTATTCA-TCTATTTGATAAATCGTTca
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