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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                GGATGAAAAACAACGGTATATCACAATCAATAACAAGAGCTGTCAGAGGGACAGCAAGCTCGACTATTAAAATATTTGTCACAAAAGTACAAATTTGATTGAGACTAATGACAAATCCAAGCAAATAAGAGTTATCTAACTT--TCA------AAG--CTGAC--AATTGGGAA----TATATGGACTT----GATGGTACTTGTATGCAAAACTTTAACAAGAATTT-CTATGTCAAACAAGGG-CA-AATATTT--------GCATTATATTCAGACAAGAGTTATGTAACTTAATTATTGTAGTAGGGTTGGTGA----------ATG--GGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAAGTTAATAC--ATGCAATGG-TTACT-GAGATATGGACTTGATGGTACTTGCAC----GCAGAACTTTAAC-CAG-AT---TTT-----CT-AAGTCAA-ACAAGGG---CAATAAT---TTGCATTATATTT--ATGCAAG-GTTATCTAACATAGTTATTGTAATAGGGTAGATGACTG------------GGAAGACTTGTGTAAAGTTTCGATCAAATAC-ATTGAGTGGTTGGTGAGATATGAACTTTATGGTACTTACAC----GTAAAACTTTAACCAGA---ATTT-----T-T---AAGTCAAACAAGGGCAATAATNNNNNNNNNNAAATA-CATTG-AGTGGTTGG------TGAGATTTAGACTAGATG-GTACTTGCACG----CAAAACTTTAACCAG---AA-TATCTAAGT----CAAAACAAGGCCAATAATTTGCACTGTATATTCATGCAAGAGTTATGCAACTCAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTG------------GGAAGACTTGTGTAAAGTTTCAATAAAATAC-ATTGAGTGGTTGGTGAGATATGGAGTTGATGGTACTTGCACA----CAAAACTTTAACCAGA---ATTT-----T-TAAGGCAAACAAGGGCAATAATTTGTATTATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAAAACTGTCAGAAGGACAGTGGGCTCAACCATTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtacatgtaagaaatgttgttacacttGAGCTGCCGAAGATTCAGCACCCTTGACTATTCAAATATATGTCACAAAAGTACAAATGTGATTGAGACTGATGACAAATCCAAGCAAAtat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAAATTTGATTAAGACTGATGACAAGACCAAGCAAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATAAGAGTTATCTAATTT--ACA------AAA--TCAACT-AATTg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAAGAGCTATCTAACTT--ACA------AAA--TTGACCAAATTGGGtgagtagg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGAT--GACTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTAC----ATGCAAG---TTACTGAGAATTT-CTAAGTCAAACAAGG--CA-A-TAATT--------TCATTATATTCA------AGCTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGA----------CTG--GGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAAGTCAATAC--ATGCAATGG-TTACT-GAGATAAGG----------ACTTGCAT----GCAAACTTTTAAC-CAtagatctt
gi|4                          : taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagttccaatcaaagaagggcaataatttgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcATTGGTAA----GATATAAACTT----AATGGTACTTGCACACAAAACTTTAACCAGAATTTTCTAAGTCAAACAACGG-CA-ATAATTT--------GCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                     taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagagcattatagtcatccaagagttatgtaacttagttattgtagtacgttcgatgactggaaaatcttgtgtgaagtttcaatcaaatacatggagtgATATGGAATT----GATGGTACTTGCTTGCAAATCTTTAACAAGCTTTT-CTAAATTGGACAAGgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagAAGTT-CCA-ATCAAAGAAGGG-CA-ATAATTT--------GCATTATTTTCATGCAAGCGTCATATAACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGA----------CTA--GGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATG-AGTAA-TTGGT-GAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAAT-TTA-ATACATTTAGCGATT-GAGTCAA-ACAAGGG---CAATACT---TTGCATCATATTC--TTGCAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGATGACTA------------GGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTAC-ATacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaCAAAC--GGGTCATAATGTTTTAACAAGAGCATTATAGTCATCCAAGAGTTATGTAACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGA----------CTG--GAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC--ATGGAGTGA-TTGGT-AAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAAACTTTAAC-CAGAAT---TTT-----CT-AAGTCAA-ACAACGG---CAATAAT---TTGCATTATATTC--AAGCAAGAGTTATCTAgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTGGTTAATGTAGTAGGTTTAATGACTAAGAAATAATGTAGGAAGTATTGTGTGAAGTTTCGATCAAATAC--AT-TAAGGGATTTTT-TAGATA----------AGTACT----C----ACAAAACTTTAAC-CAG--T---TTT-----ATAAAGTAAA-ACAgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGA----------CTG--TGAATAATTGTGCA--GTTT-----TAATAC--AT----TGA-GTACTTGAGATATGGAATTGATGGTACTTGCTT----GCAAATCTTTAAC-AAG-CT---TTT-----CT-AAATTGG-ACAAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----------ATG--GAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAA--ACGCAATGG-TTACT-GAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGAAG-GTA--CTT-----C----GCCGACACAAGGGAGAAAATAATACATTCAATCATTTTTCCATATAAG-Gacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagGCATTATAGTC--ATCCAAGAGTTATGTAACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTG------------GAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAAACTTTAACCAGA---ATTT-----TCT---AAGTCAAACAACGGCAATAATctttgcatcatattcttgcaagagttatctaacttagttattgtagaagggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttccaaggcagtacatgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT-----T-T---AAGTCAAACAAAGGCCCTAATTTGCAAAACAAAAAAACATGGTAATAGTTGTCCCACTTGA---TTAATTTAGTTG-GT--TT-CATGACTACAAAGCCATATGTAA---AG-T-TCCAA-T----CAAAG-AAGGGCAATAATTTGCATT--ATTTTCATGCAAGCGTCATATAACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTA------------GGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATGAGTAATTGGTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAATTTAATACATTTAGCGAT-TGAGTCAAACAAGGGCAATACTTTGCATCATATTCTTGCAAGAGTTATCTAACTTAacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataaAATAATTGTGCAGTTTTAATA-CATTG-AGTACTTG---------AGATATGGAATTGATG-GTACTTGCTTG----CAAATCTTTAACAAG---CT-TTTCTAAATTGGACAAGACAgttattgtagaagggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttccaaggcagtacatgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagctgttttagtaagcttgatgactgtgAAATA-CATGG-AGTGATTGG------TAAGATATAAACTTAATG-GTACTTGCACA----CAAAACTTTAACCAG---AATTTTCTAAGT----C-AAACAACGGCAATAATTTGCAT--TATATTCAAGCAAGAGTTATctggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagagcattatagtcatccaagagttatgtaacttagttattgtagtacgttcgatgactggaaaatcttgtgtgaagtttcaatcAAATA-CATTA-AGGGATT-------------TTT----TAGATAAGTACT----CA----CAAAACTTTAACCAGTTTTA-TA---AAGT-----AAAACActagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atattcatgcaagagttatctaacttggttaatgtagtaggtttaatgactaagaaataatgtaggaagtattgtgtgaagtttcgatcAACAAGGGTCGTAATTTGTTTTGT----TCATGCAAAAGTT-----------TTAT----GGAAAGT---------------------------CTCGTGTGAAATTACAATCCAATAA-ACGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCACG----CTAAACTATAAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattTATAGTCATCCAAGAGTTATGTAACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTG------------GAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCACA----CAAAACTTTAACCAGA---ATTT-----TCTAAGTCAAACAACGGCAATAATTTGCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagagcatATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTGGTTAATGTAGTAGGTTTAATGACTAAGAAATAATGTAGGAAGTATTGTGTGAAGTTTCGATCAAATAC-ATTAAGGGATTTTTTAGATA----------AGTACT----CA----CAAAACTTTAACCAG-----TTT-----TATAAAGTAAAgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGACTG------------TGAATAATTGTGCA--GTTTTAATA-----C-ATTGAGTACTTG---AGATATGGAATTGATGGTACTTGCTTG----CAAATCTTTAACAAGC---TTTT-----C-TAAATTGGACAAGaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tCACAT---CGAAAGTTAAATCAGT---AT----------GAGATTAACAAGGGTCGTAATTTGT-TT-TGTTCATGCAAAAGTTacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaacATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TAAGTACAAAAAGGGCCATAATTTAGAAAAAAATAGCTAGAGTTACCCCTGTTCATTAATGTAGTTGGATTTAGACTGCAAAACCTTATTTAAAGTTACATCAA
Unaligned ( gi|8 ): AATACATGCAGTGACTGCTGAGTTATAAAATTACAATGGCCCTAATTTGCAAAAAAAATCTGGCAAGAGTTATCCGACTTGATTAATTTAG
Unaligned ( gi|9 ): ATTGAAAACAAGAAACTGGTGTATTGCAATCAAACCATTACCGGTTTACAAATTGTGTTACCATAGCAACCACATTTTTTATAAAGTTAAA
Unaligned ( gi|11 ): TAAGACACTCGAGTATGTCAAGCAATAAATAACTTCCATTCCAGTTAACCAATTTTGTTGCCATAGCAA
Unaligned ( gi|12 ): AGAATTATCGGACTTGATTAATTTAGTTGATTTCATGACTTCAAAGTCATA
Unaligned ( gi|13 ): GGTGAGTAGAATAGCTCTTTTTATTTTCCAAATAGTCGAGCTAAAAA
Unaligned ( gi|17 ): AATTGAGTAGGTCTTACAACTGCAATACCTGGTAT






Alignments
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Reference ( family-4215 )     :                                                                                GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAGAGCTGCCGGAGGNNCAGCGNNCTCGACCATTNAAATATATGTCACAAAAGTACAAATNTGATTGAGACTGATGACAAGNCCAAGCAAATAAGAGTTATCTAACTTA-------CAAAA---TCGAC-C-GA-TTGGGAAGG-CTCGTATAAANTT----GACGGTA-CTTGCACG------CAA------A-CTTTAA--------CGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGGGCAATNATTTGCATTAT----ATTCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGNTTGATGACTGGGAAGNCTTGTGTGAAGTTTCAATCNAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATATGGA-TTGATGGTACTTGCAC----GCAAANCTTTAAC-C--AGATATTT-----CTAAGTCGA-ACAAGGGCAATAATTTGCATTATAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGNTTGATGAC------------TAGGAAGNCTTGTGTAAAGTTTCAATCAAATACATTGAGTGATTGGTNAGATATGGACTTGATGGTACTCGCACGCAAAACTTTAACCAGAATTTTT---AAGTCAA-ACAAGGG---CAATAATTNNNNAGNCNAAATA-CATNG-AGTGATTG-TG--A---GATNTAAANTNGATGGT-ACTTGCACG----CAAAAC----TTTAACCA--GNATTTCTAAGTCAAAACAAGGG---CAATAATTTGCATT-TA--TATT----CATGCAAGAGTTATNT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGNTTGATGACTGGGAAGNCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATTGAGTGATTGNTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCAC----GCAAA-----ACTTTAACCAGNATTT-----T-TAAGTCGAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                           AATAAGAGTTATCTAATTTA-------CAAAA---TCAAC-T-AATTTGAGTAGG-atctt
gi|16                         :                                                                                                                                                                         CAAATTTGATTAAGACTGATGACAAGACCAAGCAAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                             TAAGAGTTATCTAACTTA-------CAAAA---TTGACAA-AA-TTGAGTAGGACT--TATAA--CT----G-CAATACCTTGTATATAGTTTCAATCCAATA-CATGAAGTGTCTGCTGATAATTT-TAAGTCAAACAAAGGCCCTAATTTGCAAAACAAAAAAACATGGTAATAGTTGTCCCACTTGATTAATTTAGTTGGTTTCATGACTACAAAGCCATATGTAAAGTTCCAATCAAAGAAG--GGCAATAATTg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTT---AAGTCAA-ACAAAGG---CCCTAATTTGCAAAACAAAAAAACATGGTAATAGTTG-TCCCACTTGAT-TAATTTAGTTGGT---TT-CATGACTACAAAGCCATATGTAA--A--G---TTCCAA-TCAAAG-AAGGG---CAATAATTTGCATT--A--TTTT----CATGCAAGCGTCATAT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATGAGTAATTGGTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAATTTAAT--ACATTTAGCGAT-TGAGTCAAACAAGGGCAATACTTTGCATCATATTCTTGCAAGAGTTATCTAACTTAtgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcaagagttatctaacttagttattgtagaagggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttccaaggcagtacatgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                 taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataaAAGTTCCAA-TCAAAGAAGGGCAATAATTTGCATTAT----TTTCAT-GCAAGCGTCATATAACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATG-AGTAATTGGTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAAT-TTAATACATTTAGCGATTGAGTCAA-ACAAGGGCAATACTTTGCATCATAT-TCTT-GCAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGATGAC------------TAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTACATgttattgtagaagggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttccaaggcagtacatgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|2                          : taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGAT---GA-CTAGGAAGG-CTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTA-CATGCAAG-------------------TTAC--------TGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGG-CAATAATTT-CATTAT----ATTCA-------AGCTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAAGTCAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATAAGG----------ACTTGCAT----GCAAACTTTTAAC-C--A-ATGTGT-----C-ATGCCGA-Agcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagttccaatcaaagaagggcaataatttgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcTAGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGACTGTGAATAATTGTGC--AGTTTTAAT-----AC-ATTGAGT-ACT--TGAGATATGGAATTGATGGTACTTGCTT----GCAAA-----TCTTTAACAAGCTTTT-----C-TAAATTGGACAAGgcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGAA-----AGTTAAATCAGTAT----------GAGATTAACAAGGGTCGTAATTTG--TTTTGTTCATGCAAAAGTTacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                       tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatA-ACAAGGGTCGTAATTTG--TTTTGT-TCAT-GCAA--------------------------AAGTTTTATG----------------GAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAACGCAATGGTTACTGAGAT--------GATG--ACGTGCACGCTAAACTATAACGAAGGTACTT---C-GCCGACACAAGGGAGAAAATAATttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                         tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattTGGAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAA--CGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGA--AGGTACTT-----C---GCCGACACAAGGGAGAAAAT----AATACAT-TCAacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttaGATGATGACGTGCACG----CTAAAC----TATAACGAAGGTACTTC---GCCGACACAAGGGAGAAAATAA--TACATT-CAATCATTTTTCCATATAAGGATT-TGTGAATTTAatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgaGCATT--A--TAGT----CATCCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTGGAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAA-----ACTTTAACCAGAATTT-----TCTAAGTCAAACAACGGCAATAATTTGCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagaATAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTGGTTAATGTAGTAGGTTTAATGACTAAGAAATAATGTAGGAAGTATTGTGTGAAGTTTCGATCAAATACATTAAGGGATTTTTTAGATA----------AGTACT----CACAAAACTTTAACCAG---TTTTATAAAGTAAA-ACAgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAGTACA-AAAAGGGCCATAATTTAGAAAAAA----ATAGCTAGAGTTACCCCTGTTCATTAATGTAGTTGGATTTA-GAC------------TGCAAAACCTTATTTAAAGTTAC-ATCAA
gi|7                          :                                                                                GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAAAACTGTCAGAAGGACAGTGGGCTCAACCATT---ATAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtacatgtaagaaatgttgttacacttAATACA--TGCAGTGACTGCTGAGTTAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ACAATGGCCCTAATTTGCAAAAAAAATCTG-GCAAGAGTTATCCGACTTGATTAATTTAGaaaattacaatggccctaatttgcaaaaaaaatctggcaagagttatccgacttgattaatttag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): ATTGAAAACAAGAAACTGGTGTATTGCAATCAAACCATTACCGGTTTACAAATTGTGTTACCATAGCAACCACATTTTTTATAAAGTTAAA
Unaligned ( gi|11 ): TAAGACACTCGAGTATGTCAAGCAATAAATAACTTCCATTCCAGTTAACCAATTTTGTTGCCATAGCAA
Unaligned ( gi|12 ): AGAATTATCGGACTTGATTAATTTAGTTGATTTCATGACTTCAAAGTCATA
Unaligned ( gi|13 ): GGTGAGTAGAATAGCTCTTTTTATTTTCCAAATAGTCGAGCTAAAAA
Unaligned ( gi|17 ): AATTGAGTAGGTCTTACAACTGCAATACCTGGTAT






Alignments
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Reference ( family-4215 )     :                                                                               GGANGAAAAANAACGGTATNNCACAATCAATAACAAGAGCTGTCGGAGGGACAGCGNGCTCGACTATT-AAA-TATNTGTCACAAAAGTACAAATTTGATTGAGACTGATGACAAATCCAAGCAAATAAGAGTTATCTAACTTA-------CAAAA---TTGAC--AA-TTGGGTAGGCTTGTATAAA-TT----GGCGGTACTTGTATGCAAA--CTTAACGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCATGCAAGAGTTATNTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAATCNAATAC--ATGCAATGGTTACTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCAC----GCAAAACTTTAAC-C--AGATATTT-----CTAAGTCGA-ACAAGGGCNATAATTTGCANNATAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTG----GTT-----AATGTAGTAGGNTTNATGAC------------TGGGAAGNCTTGTGTAAAGTTNCGATCAAATACATTNAGTGGTTNNTGAGATA--------ATGGTACTTGCACGCAAAACTTTAACCAGGGTTTTT---AAGTCAA-ACAAGGG---CAATAATTTGCAAAACAAAANAACATNGTAGTGGTTGGTNCCACTTGATTTAGNCTAGATGGT-ACTTGCACG----CAAAACTNTA-AC--AG--ACT-TCCAAGTCGAAACAAGGG---CAATAATTTGCATT-CA--TATT----CATGCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGNTTGATGACTGGGAAGACTTGTGTAAAGTTTCAATCAAATAC-ATTGAGTGATTGGTGAGATATGGANTTGATGGTACTTGCAC----GCAAA-----ACTTTAACCAGNATTT-----T-TAAGTCGAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTA
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gi|3                          :           tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaaTGGAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAA--ACGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGA--AGGTACTT-----C---GCCGACACAAGGGAGAAAAT----AATACAT-TCAacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): ATTGAAAACAAGAAACTGGTGTATTGCAATCAAACCATTACCGGTTTACAAATTGTGTTACCATAGCAACCACATTTTTTATAAAGTTAAA
Unaligned ( gi|11 ): TAAGACACTCGAGTATGTCAAGCAATAAATAACTTCCATTCCAGTTAACCAATTTTGTTGCCATAGCAA
Unaligned ( gi|12 ): AGAATTATCGGACTTGATTAATTTAGTTGATTTCATGACTTCAAAGTCATA
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Reference ( family-4215 )     :                                                                               GGANGAAAAANAACGGTATNNCACAATCAATAACAAGAGCTGTCGGAGGGACAGCGNGCTCGACTATT-AAA-TATNTGTCACAAAAGTACAAATTTGATTGAGACTGATGACAAATCCAAGCAAATAAGAGTTATCTAACTTA-------CAAAA---TCGACC-AA-TTGGGNAGGCTTGTGTGGANTTCCAAGGCGGTACTTGTATGCAAGACTTTANCGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCA-G-CAAGAGTTATNTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAANCCAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCAC----GCAAAACTTTAAC-C--AGATATTT-----CTAAGTCGA-ACAAGGGCNATAATTTGCAANANAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTG----GTT-----AATGTAGTAGGNTTNATGAC------------TGGGAAGNCTTGTGTAAAGTTNCGATCNAATACATGNAGTGGTTGCTGAG--ATA--------ATGGTACTTGCACGCAAAACTTTAACCAGGGTTTTT---AAGTCAA-ACAAGGG---CAATAATTTGCAAAACAAAANAACATNGTAGTGGTTGGTNCCACTTGATTTAGNCTAGATGGT-ACTTGCACG----CAAAACTATA-AC--AG--ANT-TCCAAGTCGAAACAAGGG---CAATAATTTGCATT-CA--TATT----CATGCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGNTTGATGACTGGGAAGACTTGTGTAAAGTTTCAATCAAATAC-ATTGAGTGATTGGTGAGATATGGANTTGATGGTACTTGCAC----GCAAA-----ACTTTAACCAGNATTT-----T-TAAGTCGAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagttccaatcaaagaagggcaataatttgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcTAGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGACTGTGAATAATTGTGCA--GTTTTAAT-----AC-ATTGAGT-ACT--TGAGATATGGAATTGATGGTACTTGCTT----GCAAA-----TCTTTAACAAGCTTTT-----C-TAAATTGGACAAGgcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAA-----AGTTAAATCAGTAT----------GAGATTAACAAGGGTCGTAATTTG--TTTTGTTCATGCAAAAGTTacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                              tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatCAAGGGTCGT--AATTTGTTTTGTT-----CATGCAA-AAGTTTTATG----------------GAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAACGCAATGGTTACTGAG--ATG--------ATG--ACGTGCACGCTAAACTATAACGAAGGTACTT----CGCCGACACAAGGGAGAAAATAATttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaaTGGAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAA--CGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGA--AGGTACTT-----C---GCCGACACAAGGGAGAAAAT----AATACAT-TCAacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttaAGATGATGACGTGCACG----CTAAACTATA-ACGAAGGTACT-TC---GCCGACACAAGGGAGAAAATAA--TACATT-CAATCATTTTTCCATATAAGGATT-TGTGAATTTAatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgGCATT--A--TAGT----CATCCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTGGAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAA-----ACTTTAACCAGAATTT-----TCTAAGTCAAACAACGGCAATAATTTGCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAta
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAGTACA-AAAAGGGCCATAATTTAGAAAAAA----ATAGCTAGAGTTACC---CCTGTTC-ATT-----AATGTAGTTGGATTTA-GAC------------TGCAAAACCTTATTTAAAGTTAC-ATCAA
gi|7                          :                                                                               GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAAAACTGTCAGAAGGACAGTGGGCTCAACCATT-ATA-T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtacatgtaagaaatgttgttacacttAATACATGCAGTGACTGCTGAGTTATA--------A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -ACAATGGCCCTAATTTGCAAAAAAAATCTG-GCAAGAGTTATCCGACTTG----ATT-----AATTTAGaattacaatggccctaatttgcaaaaaaaatctggcaagagttatccgacttgattaatttag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|11 ): TAAGACACTCGAGTATGTCAAGCAATAAATAACTTCCATTCCAGTTAACCAATTTTGTTGCCATAGCAA
Unaligned ( gi|12 ): AGAATTATCGGACTTGATTAATTTAGTTGATTTCATGACTTCAAAGTCATA
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Unaligned ( gi|17 ): AATTGAGTAGGTCTTACAACTGCAATACCTGGTAT






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Reference ( family-4215 )     :                                                                               GGANGAAAAANAACGGTATNNCACAATCAATAACAAGAGCTGTCGGAGGGACAGCGNGCTCGACTATT-AAA-TATNTGTCACAAAAGTACAAATTTGATTGAGACTGATGACAAATCCAAGCAAATAAGAGTTATCTAACTTA-------CAAAA---TCGACC-AA-TTGGGNAGGCTTGTGTGGANTTCCAAGGCGGTACTTGTATGCAAGACTTTANCGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCA-G-CAAGAGTTATNTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAANCCAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCAC----GCAAAACTTTAAC-C--AGATATTT-----CTAAGTCGA-ACAAGGGCNATAATTTGCAANANAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTG----GTT-----AATGTAGTAGGNTTNATGAC------------TGGGAAGNCTTGTGTAAAGTTNCGATCNAATACATGNAGTGGTTGCTGAG--ATA--------ATGGTACTTGCACGCAAAACTTTAACCAGGGTTTTT---AAGTCAA-ACAAGGG---CAATAATTTGCAAAACAAAANAACATNGTAGTGGTTGGTNCCACTTGATTTAGNCTAGATGGT-ACTTGCACG----CAAAACTATA-AC--AG--ANT-TCCAAGTCGAAACAAGGG---CAATAATTTGCATT-CA--TATT----CATGCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGNTTGATGACTGGGAAGACTTGTGTAAAGTTTCAATCAAATAC-ATTGAGTGATTGGTGAGATATGGANTTGATGGTACTTGCAC----GCAAA-----ACTTTAACCAGNATTT-----T-TAAGTCGAACAAGGGCAATAATTTGCATTATATTCATGCAAGAGTTATCTAACTTA
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gi|2                          : taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGAT--GA-CTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTAC----ATGCAAG---TTACTGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGG-CAATAATTT-CATTATATTCA-------AGCTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAAGTCAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATAAGG----------ACTTGCAT----GCAAACTTTTAAC-C--A-ATGTGT-----C-ATGCCGA-Aatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagttccaatcaaagaagggcaataatttgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcTAGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGACTGTGAATAATTGTGCA--GTTTTAAT-----AC-ATTGAGT-ACT--TGAGATATGGAATTGATGGTACTTGCTT----GCAAA-----TCTTTAACAAGCTTTT-----C-TAAATTGGACAAGgcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAA-----AGTTAAATCAGTAT----------GAGATTAACAAGGGTCGTAATTTG--TTTTGTTCATGCAAAAGTTacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                              tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatCAAGGGTCGT--AATTTGTTTTGTT-----CATGCAA-AAGTTTTATG----------------GAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAACGCAATGGTTACTGAG--ATG--------ATG--ACGTGCACGCTAAACTATAACGAAGGTACTT----CGCCGACACAAGGGAGAAAATAATttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaaTGGAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAA--CGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGA--AGGTACTT-----C---GCCGACACAAGGGAGAAAAT----AATACAT-TCAacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttaAGATGATGACGTGCACG----CTAAACTATA-ACGAAGGTACT-TC---GCCGACACAAGGGAGAAAATAA--TACATT-CAATCATTTTTCCATATAAGGATT-TGTGAATTTAatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgGCATT--A--TAGT----CATCCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTGGAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAA-----ACTTTAACCAGAATTT-----TCTAAGTCAAACAACGGCAATAATTTGCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagaATAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTG----GTT-----AATGTAGTAGGTTTAATGACTAAGAAATAATGTAGGAAGTATTGTGTGAAGTTTCGATCAAATACATTAAGGGATTTTTTAG--ATA--------A--GTACT----CACAAAACTTTAACCAG---TTTTATAAAGTAAA-ACAgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAGTACA-AAAAGGGCCATAATTTAGAAAAAA----ATAGCTAGAGTTACC---CCTGTTC-ATT-----AATGTAGTTGGATTTA-GAC------------TGCAAAACCTTATTTAAAGTTAC-ATCAA
gi|7                          :                                                                               GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAAAACTGTCAGAAGGACAGTGGGCTCAACCATT-ATA-T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtacatgtaagaaatgttgttacacttAATACATGCAGTGACTGCTGAGTTATA--------A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -ACAATGGCCCTAATTTGCAAAAAAAATCTG-GCAAGAGTTATCCGACTTG----ATT-----AATTTAGaattacaatggccctaatttgcaaaaaaaatctggcaagagttatccgacttgattaatttag


blockSeqs                     :                                                                                  A      A        TG    .                             AC           C   .   A                                                                   GTTATTG     GGG T   CA  T     T GGCT        G  CCAA        .          .     C             G          G         G           TG           A                                                       T        AA  C              TAT  ACT     GT        ATAT     GA      TTAATACATTTAGCGATT  A   A C        A          TC T AA    A            T      CAAA   GACAA       T   A  T     TAAGAAATAATG       C             T A   C        A G        G  TT   ATGACGTGCACGCTAAACTATAACGAAGGTACTTC                   C       AGA                    A A   G T       .  CCCACTT  .    T         GA   G    ACTA          ACGAAGGT  G .  CAA   G         AGA      T       CAATCATTTTTC             A   G                    G              GG        A         C      A       A   G            C                ATAT     GATTC        A  C    AGCGAT     T A                  C
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                           AATAAGAGTTATCTAATTTA-------CAAAA---TCAACT-AATTTGAGTAGGatctt
gi|16                         :                                                                                                                                                                         CAAATTTGATTAAGACTGATGACAAGACCAAGCAAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGAGTTATCTAACTTACAAAATTGACAAAATTGAGTAGGACTTATAAC------------TGCAATACCTTGTATATAGTTTCAATCCAATACATGAAGTGTCTGCT--G--ATA--------AT------------------TTTAA----------------GTCAA-ACAAAGG---CCCTAATTTGCAAAACAAAAAAACATGGTAATAGTT-GTCCCACTTGA-TTAATTTAGTTGGT---TT-CATGACTACAAAGCCATATGT--AA--AGT-TCCAA-TC-AAAGAAGGG---CAATAATTTGCATT--A--TTTT----CATGCAAGCGTCATAT-AACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATGAGTAATTGGTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAATTTAAT--ACATTTAGCGAT-TGAGTCAAACAAGGGCAATACTTTGCATCATATTCTTGCAAGAGTTATCTAACTTAg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tAAGTTCCAA-TCAAAGAAGGGCAATAATTTGCATTATTTTCATG-CAAGCGTCATATAACTTAGTTATTGTAGTAAGGTTGATGACTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTTAATCAAATACAAATG-AGTAATTGGTGAGATATGGACTTGATGGTACTTGCACATATGTAAAGATTCAAT-TTAATACATTTAGCGATTGAGTCAA-ACAAGGGCAATACTTTGCATCATAT-TCTT-GCAAGAGTTATCTAACTTA----GTT-----ATTGTAGAAGGGTTGATGAC------------TAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTACATGCA--AGTTACTGAG--Agttattgtagaagggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttccaaggcagtacatgcaagttactgagaatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|2                          : taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaAAGAGTTATCTAACTTAGTTATTGTAGAAGGGTTGAT--GA-CTAGGAAGGCTTGTGTAAAGTTCCAAGGCAGTAC----ATGCAAG---TTACTGAGAATTTCTAAGTCAAACAAGG-CAATAATTT-CATTATATTCA-------AGCTATCTAACTTAGTTATTGTAGTAGGGTTGGTGACTGGGAAGGCTTGTGTAAAGTTTCAAGTCAATACA--TGCAATGGTTACTGAGATAAGG----------ACTTGCAT----GCAAACTTTTAAC-C--A-ATGTGT-----C-ATGCCGA-Aatttctaagtcaaacaaggcaataatttcattatattcaagctatctaacttagttattgtagtagggttggtgactgggaaggcttgtgtaaagtttcaagtcaatacatgcaatggttactgagataaggacttgcatgcaaacttttaaccaatgtgtcatgccgaagcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagagttatctaacttacaaaattgacaaaattgagtaggacttataactgcaataccttgtatatagtttcaatccaatacatgaagtgtctgctgataattttaagtcaaacaaaggccctaatttgcaaaacaaaaaaacatggtaatagttgtcccacttgattaatttagttggtttcatgactacaaagccatatgtaaagttccaatcaaagaagggcaataatttgcattattttcatgcaagcgtcatataacttagttattgtagtaaggttgatgactaggaaggcttgtgtaaagttttaatcaaatacaaatgagtaattggtgagatatggacttgatggtacttgcacatatgtaaagattcaatttaatacatttagcgattgagtcaaacaagggcaatactttgcatcatattcttgcTAGCTGTTTTAGTAAGCTTGATGACTGTGAATAATTGTGCA--GTTTTAAT-----AC-ATTGAGT-ACT--TGAGATATGGAATTGATGGTACTTGCTT----GCAAA-----TCTTTAACAAGCTTTT-----C-TAAATTGGACAAGgcacgagtcagtagaatagctctctttattcttcgaatagtcgagctaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAA-----AGTTAAATCAGTAT----------GAGATTAACAAGGGTCGTAATTTG--TTTTGTTCATGCAAAAGTTacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                              tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatCAAGGGTCGT--AATTTGTTTTGTT-----CATGCAA-AAGTTTTATG----------------GAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAACGCAATGGTTACTGAG--ATG--------ATG--ACGTGCACGCTAAACTATAACGAAGGTACTT----CGCCGACACAAGGGAGAAAATAATttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgagatgatgacgtgcacgctaaactataacgaaggtacttcgccgacacaagggagaaaataatacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaaTGGAAAGTCTCGTGTGAAATTACAATCCAATAAA--CGCAATGGTTACTGAGA--------TGATG--ACGTGCAC----GCTAAACTATAACGA--AGGTACTT-----C---GCCGACACAAGGGAGAAAAT----AATACAT-TCAacattcaatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttaAGATGATGACGTGCACG----CTAAACTATA-ACGAAGGTACT-TC---GCCGACACAAGGGAGAAAATAA--TACATT-CAATCATTTTTCCATATAAGGATT-TGTGAATTTAatcatttttccatataaggatttgtgaatttata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagctgttttagtaagcttgatgactgtgaataattgtgcagttttaatacattgagtacttgagatatggaattgatggtacttgcttgcaaatctttaacaagcttttctaaattggacaagacactggagtattgcaagcaatatatgtctcctaccggtttactaattttgttgtcatagcaactacaatttttgtcaaattgaaatggttaaatgatctgcataatatccttattgctttctatctacatactttaccaaacagtgttgccataacaaccacagttgttatacctaatgaaaaaataaaatgaccttagttttatcattattgtcctctaaccacatcgaaagttaaatcagtatgagattaacaagggtcgtaatttgttttgttcatgcaaaagttttatggaaagtctcgtgtgaaattacaatccaataaacgcaatggttactgGCATT--A--TAGT----CATCCAAGAGTTATGT-AACTTAGTTATTGTAGTACGTTCGATGACTGGAAAATCTTGTGTGAAGTTTCAATCAAATAC-ATGGAGTGATTGGTAAGATATAAACTTAATGGTACTTGCAC----ACAAA-----ACTTTAACCAGAATTT-----TCTAAGTCAAACAACGGCAATAATTTGCATTATATTCAAGCAAGAGTTATCTAta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taataaagaaattaaagtggatttggacaatttttatggatatagtgctctgaagtatgtgcagttgcaaacgggtcataatgttttaacaagaATAT-TCAT-GCAAGAGTTATCTAACTTG----GTT-----AATGTAGTAGGTTTAATGACTAAGAAATAATGTAGGAAGTATTGTGTGAAGTTTCGATCAAATACATTAAGGGATTTTTTAG--ATA--------A--GTACT----CACAAAACTTTAACCAG---TTTTATAAAGTAAA-ACAgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAGTACA-AAAAGGGCCATAATTTAGAAAAAA----ATAGCTAGAGTTACC---CCTGTTC-ATT-----AATGTAGTTGGATTTA-GAC------------TGCAAAACCTTATTTAAAGTTAC-ATCAA
gi|7                          :                                                                               GGAAGAAAAAAAATAATATTGCACA-----TAACAAAAACTGTCAGAAGGACAGTGGGCTCAACCATT-ATA-T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtacatgtaagaaatgttgttacacttAATACATGCAGTGACTGCTGAGTTATA--------A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -ACAATGGCCCTAATTTGCAAAAAAAATCTG-GCAAGAGTTATCCGACTTG----ATT-----AATTTAGaattacaatggccctaatttgcaaaaaaaatctggcaagagttatccgacttgattaatttag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): ATTGAAAACAAGAAACTGGTGTATTGCAATCAAACCATTACCGGTTTACAAATTGTGTTACCATAGCAACCACATTTTTTATAAAGTTAAA
Unaligned ( gi|11 ): TAAGACACTCGAGTATGTCAAGCAATAAATAACTTCCATTCCAGTTAACCAATTTTGTTGCCATAGCAA
Unaligned ( gi|12 ): AGAATTATCGGACTTGATTAATTTAGTTGATTTCATGACTTCAAAGTCATA
Unaligned ( gi|13 ): GGTGAGTAGAATAGCTCTTTTTATTTTCCAAATAGTCGAGCTAAAAA
Unaligned ( gi|17 ): AATTGAGTAGGTCTTACAACTGCAATACCTGGTAT