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originalCons : TTTTGTCGA--GCCCGCTT-GCGGTGAGCTCGA-CA-TAGTCGTCA---CA-ATGGCGGTTCGGT--GT-ATGTG---TG-T-CATCCGTCCATGCGTCTGTC------CGTC-CGT--GATCTCGTCCGGGCTNTAACTTTCTCATA----CATAGAGGGATTTTGAAATA-ACNTGTCAGTACTGGTGGGNCTGACANTGAANCCCTGGGGNACAT
finalCons : TTTTGTCGA--GCCCGCTT-GCGGTGAGCTCGA-CA-TAGTCGTCA---CA-ATGGCGGTTCGGT--GT-ATGTGTGTC--------CGTCCATGCGTCTGTCCGTCCG-----------ATCTCGTCCGGGCTNTAACTTTCTCATA----CATAGAGGGATTTTGAAATA-ACNTGTCAGTACTGGTGGGNCTGACANTGAANCCCTGGGGNACAT
Alignments
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