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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                caagttgttttaatatgttctttgtcatgccaaacTTTTGTCAGTTAGTG------CAT--TG-----TTGTCTTG---T---CAC-T-------AAA--------T--GTGGTAGCT--A-------G----TGTATGAC--CTGCTAT-C-AGCTT-T-GT-CAATTATTGTCTTGTTTTTTTCAC--------------------T---------T-------A------------------TTTT--GTCA---gccaatgttgtcaacatgcagcga
gi|17                         : cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgaaaaatgattatctggctaagaatttgagttagtgcattgtcctgccgtcaaattgtcagtaagcgTTTTGTAAGTAATTG------TCC--TG-----TC---CTG---T---CT--T---------C--------T--AT------TCTA-------TCT--TGT----C--CTGCCAT-C-TA-TT-T-GGTCAGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                    cttgtcctgtcacccgTTTGTCAGTTAGTG------CC--------------------------------------AC------------------------------------GT----C--CTGCCAC-C-AA-TTAT-GT-CAGTTAGTGCCTTG-TCTTGTCAT---------CAA-------GTG--------T-------A---------T--T----GTCCT--GCCA---CC--G-----T----TT--GT------G--TCAG-TGAGTGC-----CT--TGT----C---CTGTCGA-CAATTC-T-GCCAGTaag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                      tgtgttaatatgtgctttgtcatgccaccgaaTGTTAGTTCGTG------CCG--TG-----TC---CTG---CTACCA--GTTGTGTTAATATG-----T--GT------T----------T----TGC----C--ATGCCAT-C-AA-TT-TTGT-CAGGTAGTGCCTTG-TCCTGTCA-----------------------------------------------------------------TCA---CG--------T----TT--GTC---T-------G-TTAGTGC-----CT--TGT----C---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                   ccttgccataccaccatttttgtcggttagtccattaccctgcaaccaatgTGTCAGTTAGTG------CCT--TA-----TC---CTA---T---C-------------------------------------------------------------GCCA----AT-TT-T-GT-CAGTTAGTACCTTG-TCCTGCCAC---------TAAATGT---GT---------T-------A---------C----------CT--GTCA---AC--A---GTT----TT--GTC---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                     ttgtcctgccatcaaatgGTCAGTAAGTGTCATGTCCTGCTGCAAATTT---TTG---T---CA--GT------AAG--------T--GC---------A-------T----TGT----C--CTGCTAC-C-GA-TT-TTGT-CAGTAACGGCCTTG-TTCTACCGC---------CA---------------------------------------------GTTTT--GTCA---ag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                               tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaa------CCT--TG-----TC---ATG---T---CA--CC------AAT--------T---------------------T----TGT----AAACTCTTAT-C-AA-TT-TTGT-CAGGTAAGGCCTTG-CCCTGTCAC---------CAA---TTTTGT---------C-------AATTCGTGCGT--T----GTCCT--GCCA---CC--A-----T----TT--GTG---TTAGATCA------TGC-----CT--TTT----C---CTGCCAC-CAGTTT-T-ATCAGTTTGTGCCTTGTCTTG---CTA--C-C---------AGTTG---T-------G--TT-------------AATATGTTTTT--------T---------GTAGTGCCTC-TAA---TTT-T-GTCAG-Tggcagcgatttgtc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                           --TG-----TT---GTGACAT---CA--GT------AAA--------T--G----------A-------T----TAC----C--TGGCTGA-T-AA-TT-T----CATTTAGTGCCTTG-TCCTGCCGT---------AAA--------------------------A---------T--T----GT-CA--GT------A--A---GC---------GTT---TTG--TCAG-TTAGTGC-----AT--TGT----CGTCCTTCAACTCAATGT-G-GT-AGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCA--A-CTTTGTCAGTA---A---G-------G--TC-------------A---------A--------T---------GTCCTGCCAC-CAG---TTT-T-GTCAG-AAAGTGCCTTTT---TCTGCCTACAA---TTG---TGTTAATAA----GTACCTTG-TCTTGCCACCAGTTT-T-GT
gi|6                          :                                                                                                                                                                         acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacgg--A-------T----TAC----C--CTGCAAC-C-AA-TG-T-GT-TAGTTCGTGCCGTG-TCCTGCTAC---------CAG---TTGTGT---------T-------A---------A--TATGTGTTTT--GCCATGCCATCA---ATT----TT--GTC---AGG--T------AGTGC-----CT--TGT----C---CTGTCAT-CACGTT-T-GTCTGTTAGTGCCTTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccttgccataccaccatttttgtcggttagtcc--A-------T----TAT----C--TGGCTAA-G-AA-TT-T-GA---GTTAGTGCATTG-TCCTGCCGT---------CAAAT-T---GT---------C-------A---------G--TAAGCGTTTT--GTCAGT-TA--GTGCATTG---TT--GTC---TTG--TCAC-TAAATGTGGTAGCTAGTGTATGAC---CTGCTAT-CAGCTT-T-GTCAATTATTGTCTTGTTTTc
gi|7                          :                                                                                                                                                  cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgaaaaatg-------T----TGT----C--CTGC-AC-C-AG-TTGT-GT-CAGTTAGTGCCTTG-TC------------------------------------------------------------------CT--GT-A---CC--A---ATT----TT--GTC---ATT--T------AGTGC-----CT--TGT----C---CTGTCGC-CAATTTGT-GTCAGTAGGTTCCTTGTCCTG---TCA--T-C---------A---G---G-------T--TT-------------G---------T--------T---------GTCTTGCCGT-CAA---TTT-T-GTCAG-TAAGTGCCTTGT---CCTtttcacttattttgtca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtgcc-------T----TGC----C--ATACCAC-C-AT-TT-TTGT-CGGTTAGTCCATTA-CCCTGCAAC---------CAA---T---GTGTTAGTTCGT-------G---------CCGT----GTCCT--GCTA---CC--A---GTT--------GT------G--TTAA-TATGTGT-----TT--TGC----C---ATGCCAT-CAATTT-T-GTCAGGTAGTGCCTTGTCCTG---TCA-----------------------------------------------------------------------------------TCAC-------GTT-T-GTCTG-TTAGTGCCTTGT---Cccca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cc-------T----TAT----C--TTGCCAC-A-AA-TTGT-GT-CAATTAGTGCATTG-TCCTTCCAC----------AA---T---GT---------T--------------------T----GCCAT--GTTA---TA--C---ATTGTCTTTCCATCAAATTG--TCAG-CCAATGC-----CT--TAT----C---CTGCCAC-CAATGT-T-GT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acactttcgtcaatttgtcaggcagggcc-------T----TGT----C--CTGCCAT-CAAA-TG-T-GT-CAGTTAGTGCCTTA-TCCTATCGC---------CAA---T---TT---------T-------G-------------------TCA--GTTA----G--T---ACC----TT--GTC---CTG--CCAC-TAAATGT-----GT--TA-----C---CTGTCAA-CAGTTT-T-GTCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -------T----TGT----C--ATGCCAAAC-AT-TT-T-GT-CAGTTAGTACCTTG-TCCTGTCGC---------CAA---T---GT---------T-------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caagttgttttaatatgttct-------T----TGT----C--CTGTCAC-C-CG-TT-TTGT-AAGTAATTGTCCTG-TCCTGTCTT---------CTA---T---TC---------T-------ATC-------T--T----GTCCT--GCCA-------------T----CT--ATT---TGG--TCAG-TAAGgtcaacatgcagcga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c----TAT----C--CTGTCGC-C-AA-TT-T-TATCAGTTATTGATTTG-TCCTGTCAC---------TGACTTT---GT---------C-------AATAAAGC--T--T----GTCCT--GTCG---CT--A---ATT----TT--AT-----------GG-TTATTCC-----CC--TGT----C---CTG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agttatagcgacattatttaaatgattatctggctgaaaaagtcacttagtgaca-C-AA-TT-T-GT-CAGGCAGGGCCTTA-TCTTGCCACAAATTGTGTCAA---TTA-GTG--------C-------A---------T--T----GTCCT--TCCA---CA--A---TGT----TT--GCC---ATG--TTA------TAC-----AT--TGT----C---TTTCCAT-CAAATT---GTCAGCCAATGCCTTATCCTG---CCA--C-C---------A---A---T-------G--TT-------------G---------T--------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acactttcgtCCTTG-TCATGTCAC---------CAA---T---TT---------TGTAA---A---------C--T----CTT----ATCA-----------ATT----TT--GTC----------AGGTAAG-GC-----CT--TGC----C---CTGTCAC-CAATTT-T-GTCAATTCGTGC---------------------------------------------------------------G---------T--------T---------GTCCTGCCAC-CAT---TTG-T-GTTAGATCA-TGCCTTTT---CCTGCCACCAGT-TTTATC-----AGTTT----GTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTG-T-GTTAATATGTTTTTTGTAGTGCCTC-TAATTTTGTCA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTG-TCCTGTCAC---------CCG---T---TT---------TGTAAGTAA---------T--T----GTCCT--GTC-------------------CT--GTC---TTC--T-AT-TC--TAT-----CT--TGT----C---CTGCCAT-CTATTT-G-GTCAGTAAGgt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCAG---------TAAG--T---GT---------C-------A------------T----GTCCT--GCTG---CA--A---ATT----TT---------TG--TCAG-TAAGTGC-----AT--TGT----C---CTGCTAC-CGATTT-T-GTCAGTAACGGCCTTGTT-----------------------------------------------------------------------------------------CTACCGC-CAG---TTT-T-GTCAG-GCAGCGATTTGT---C
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaaGTCAC---------TTA-------GT---------G-------A---------CA-T----ATCCT--GTCG---CC--A---ATT----TT--ATC----------AG-TTATTGA-----TT--TGT----C---CTGTCAC-TGACTT-T-GTCAA-TAAAGC-TTGTCCTG---TCG--C-T---------A---A---TTTTATG-G--TT-------------A---------T--------T---------CCCCTGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agttatagcgacattatttaaatgattatctggctgaaaaa--T----GTCCT--GCCAT--CA--A---AT---------GT------G--TCAG-TTAGTGC-----CT--TAT----C---CTATCGC-CAATTT-T-GTCAGTTAGTACCTTGTCCTG---CCA--C-T---------A---AATGT-------G--TT-------------A------------------------------CCTGTCAA-CAG---TTT-T-GTCAG-ctg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t--T----GTTCTTTGTCATGCCA--A---ACA----TT--------TTG--TCAG-TTAGTAC-----CT--TGT----C---CTGTCGC-CAATGT-T-GTCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caagttgttttaataTT----TC--GTCAATTTG--TCAG-GCAGGGC-----CT--TAT----C---TTGCCAC-AAATTG-T-GTCAATTAGTGCATTGTCCT----TCC--A-C---------A---A---T-------G--TTTGCCATGTTATACA---------T--------T---------GTCTTTCCAT-CAA----AT-T-GTCAG-CCAATGCCTTAT---CCTGCCACCAAT-GTTGTacatgcagcga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acac----TT--GTT---TT-----AA-TATGTTC-----TT--TGT----C---ATGCCAA-ACATTT-T-GTCAGTTAGTACCTTGTCCTG---TCG--C-C---------A---A---T-------G--TT-------------G---------T--------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caag---TTG--TCAG-TTAGTGC-----CA--CGT----C---CTGCCAC-CAATTA-T-GTCAGTTAGTGCCTTGTCTTG---TCA--T-C---------A---AG--T-------G---T-------------A---------T--------T---------GTCCTGCCAC-CGT---TTG-T-GTCAG-TGAGTGCCTTGT---CCTGTCGACAAT-TCTGCCcaacatgcagcga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtgttaatatgtgctttgtcatgccaccgaatTG--TTAA-TATGTGC-----TT--TGT----C---ATGCCAC-CGAATT-T-GTCAGTTAGTGCCACGTCCTG---CCA--------------------------------------------------------------------------------------C-CAA---TTA-T-GTCAG-TTAGTGCCTTGT---CTTGTCATCAA----------------------GTGTATTG-TCCTGCCACCGTTTG-T-GTCAGTG----------AGTGCCTT-G--TCCTGTCGA-C-A---AT--agt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgTG--TTAA-TAAGTAC-----CT--TGT----C---TTGCTAC-CAGTTT-T-GTCAGtctgccagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtgccttttcctgcaaataattgG--TCAG-TAAGTGT-----CA--TGT----C---CTGCTGC-AAATTT-TTGTCAGTAAGTGC---------------------------------------------------------------A---------T--------T---------GTCCTGCTAC-CGA---TTT-T-GTCAG-TAACGGCCTTGT---TCTACCGCCAGT-TTTGTC-----AGGCA----GCGATTTG-TCa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaaG--TCAC-TTAGTGA-----CA--TAT----C---CTGTCGC-CAATTT-T-ATCAGTTA-----TTG-----------------------------A---T-----------------------------------T--------T---------GTCCTGTCAC-TGA---CTT-T-GTCAA-TAA--AGCTTGT---CCTGTCGCTAAT-TTTAT------GGTTA----TTCCCCTG-TCCTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agttatagcgacattatttaaatgattatctggctgaaaaaG--TCAA-TCAGTGT-----CA--TGC----C---CTGTCGC-CAATTG-T-GTCAGTTAGTGCTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaag--TCAT-TTAGTGC-----CT--TGT----C---CTGCCGT-AAAATT---GTCAGTAAGCGTTTTGT-CAG---TTA--G-------------------T-------GCATT-------------G---------T--------C---------GTCCTTCAACTCAA---TGT-G-GT-AG-CTAGTGCATTGT---CCTGCTTTCAAC-TTTGTC-----AGTAA----GGTCAATG-TCCTGCCACCAGTTT-T-GTCAGAA----------AGTGCCTT-T--TTCTGCCTA-C-AATTGT--GT--TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTTTGg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacggtgttgtgacatcagtaaatgattacctggctgataattAG-TTAGTGC-----AT--TGT----C---CTGCCGT-CAA-AT-T-GTCAGTAAGCGTTTTG-TCAG---TTAGTG-C---------A------------------TT-------------G---------T--------T---------GTCTTGTCAC-TAA---ATG-T-GGTAG-CTAGTGTA-TGA---CCTGCTATCAGC-TTTGTC-----AATTA----TTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTT-T-GTCAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgaaaaatgattatctggctaagaatttgAGTGC-----CT--TTT----C---CTGCAAA-TAATTG-T-GTTAATAAGTACCTTG-----------------------------------------------------------------------------------------TCTTGCTAC-CAG---TTT-T-GTCAG-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGC-----CT--TGT----C---CTGC-AC-CAGTTG-T-GTCAGTTAGTGCCTTGTCCTG---T-A--C-C---------A---A---TTTT----G--TC-------------A---------T--------TTAGTGCCTTGTCCTGTCGC-CAA---TTTGT-GTCAG-TAGGTTCCTTGT---CCTGTCATCAGG-TTTGT---------------------TG-TCTTGCCGTCAATTT-T-GTCAGTA----------AGTGCCTT-G--TCCTa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-----CT--TGC----C---ATACCAC-CATTTT-T-GTCGGTTAGTCCATTACCCTG----CA--ACC---------A---ATG-T-------G--TT-------------AG--------TTCGTGCCGT---------GTCCTGCTAC-CAG---TTG-T-GTTAA-TATGTGTTTTGC---CATGCCATCAAT-TTTGTC-----AGGTA----GTGCCTTG-TCCTGTCATCACGTT-T-GTCTGTT----------AGTGCCTT-ccca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -----CT--TGT----C---CTGTCAC-CCGTTT-T-GTAAGTAATTGTCCTGTCCTG---TCT--T-C---------T---A---T-------T--CT-------------ATC-------T--------T---------GTCCTGCCAT-CTA---TTT-G-GTCAG-TAAGgtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TGT----C---CTGCCAT-CAAATG-T-GTCAGTTAGTGCCTTATCCTA---TCG--C-C---------A---A---TTTTGTCAG--TT-------------AGTACC----T--------T---------GTCCTGCCAC-TAA---ATG-T-GTTA-----------------CCTGTCAACAGT-TTTGTC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT-T-G--AGTTAGTGCATTGTCCTG---CCG--T-C---------A---A-----------------------------A---------T--------T---------GTC-----AG-TAAGCGTTT-T-GTCAG-TTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAA-TGTG----GT-AGCTA----GTGTAT-G-ACCTGCTATCAGCTT-T-GTCAATT----------ATTGTCTTGT--TTTTTTCAC-T------T--AT--T----------TTGTCag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgaaaaatgattatctggctaagaaTTGTTTT------A--A-T---------A-------T-------G--TT-------------C---------T--------TT--------GTCATGCCAA-ACA---TTT-T-GTCAG-TTAGTACCTTGT---CCTGTCGCCAAT-GTTGTCa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caagG---TCA--G-T---------A---AG--T-------G--TC-------------A---------T------------------GTCCTGCTGC-AAA---TTT-TTGTCAG-TAAGTGCATTGT---CCTGCTACCGAT-TTTGTC-----AGTAA----CGGCCTTG-TTCTACCGCCAGTTT-T-GTCAGaacatgcagcga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaaG---TCA--ATC---------A---G---T-------G--TC-------------A---------T------------------GCCCTGTCGC-CAA---TTG-T-GTCAG-TTAGTGCTTgcagcgatttgtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaag---------T--------T---------GTCCTGC-AC-CAG---TTG-T-GTCAG-TTAGTGCCTTGT---CCTGT-ACCAAT-TTTGTC-----ATTTA----GTGCCTTG-TCCTGTCGCCAATTTGT-GTCAGTA----------GGTTCCTT-G--TCCTGTCAT-C-A---GG--TT--TG---------TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGT-GCCTTGTCCg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtgcc---------T--------T---------GCCATACCAC-CAT---TTT-T-GTCGG-TTAGTCCATTAC---CCTGCAACCAA----TG---TGTTAGTTC----GTGCCGTG-TCCTGCTACCAGTTG-T-GTTAATA----------TGTG--------TTTTGCCA---------------------------------TGCCATCAATTTTGTCAGGTAGT-GCCTTGTCCTGTtccca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cc---------T--------T---------ATCTTGCCAC-AAA---TTG-T-GTCAA-TTAGTGCATTGT---CCTTCCAC-AATGTTTGCCATGTTA---------TACATTG-TCTTTCCATCAAATT---GTCAGCC----------AATGCCTT-A--TCCTGCCAC-C-A---AT--GT--TG---------Tcatcacgtttgtctgttagtgccttgtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acactttcgtcaatttgtcaggcagggcc---------T--------T---------GTCCTGCCAT-CAA---ATG-T-GTCAG-TTAGTGCCTTAT---CCTATCGCCAAT-TTTGTC-----AGTTA----GTACCTTG-TCCTGCCACTAAATG-T-GTTA--------------------------CCTGTCAA-C-A---GT--TT--TG---------T
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---------T--------T---------GTCCTGTCAC-CCG---TTT-T-GTAAG-TAA-----TTGT---CCTGTC--------CTGTCTT-CTATTC------TATCTTG-TCCTGCCATCTATTT-G-GTCAGTA----------AGcag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            c---------T--------T---------TTCCTGCAAA-TAA---TTG-T-GTTAA-TAAGTACCTTGT---CTTGCTACCAGT-TTTGTC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtgcc-T-GTTAA-TATGTGCTTTGT---CATGCCACCGAA-TTTGTC-----AGTTA----GTGCCACG-TCCTGCCACCAATTA-T-GTCAGTT----------AGTGCCTT-G--TCTTGTCAT-CAA---GT--G---TA---------TTGTCCTGCCACCGTTTGTGTCAGTGAGT-GCCTTGTCCTGTaga
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tg-GTCAG-TAAGTGTCATGT---CCTGCTGCAAAT-TTT----TGTCAGTAA----GTGCATTG-TCCTGCTACCGATTT-T-GTCAGTA----------ACGGCCTT-G--TTCTACCGC-C-A---GT--TT--TG---------Tcgacaattctgccagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaa-GTCAC-TTAGTGACATAT---CCTGTCGCCAAT-TTTATC-----AGTTA----TTGATTTG-TCCTGTCACTGACTT-T-GTCAATA----------AA-G-CTT-G--TCCTGTCGC-T-A---AT--TT--TA---------TGGTcaggcagcgatttgtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agttatagcgacattatttaaatgattatctggctgaaaaa-GTCAA-TCAGTGTCATGC---CCTGTCGCCAAT-TGTGTC-----AGTTA----GTGCTTtattcccctgtcctg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagAGTGCCTTTT---CCTGCAAATAAT-T--GT---GTTAATAA----GTACCTTG-TCTTGCTACCAGTTT-T-GTCAGg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTCTTTGT---CATGCCAAACAT-TTTGTC-----AGTTA----GTACCTTG-TCCTGTCGCCAATGT-T-GTCAa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caagttgttttaatatTTGTT--TTAATATGTTCTTTG-TCATGCCAAACATTT-T-GTCAGTT----------AGTACCTT-G--TCCTGTCGC-C-A---AT--GT--TG---------Tacatgcagcga
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caagGTCAGTAA----GTGTCATG-TCCTGCTGCAAATTT-TTGTCAGTA----------AGTGC--------------------------------A---------TTGTCCTGCTACCGATTTTGTCAG-TAACGGCCTTGTTCcaacatgcagcga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaaGTCACTTA----GTGACATA-TCCTGTCGCCAATTT-T-ATCAGTT----------ATTG----------------------------AT--T-----------TGTCCTGTCACTGACTTTG-TCAATAAA-G-CTTGTCCTGTtaccgccagttttgtcaggcagcgatttgtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agttatagcgacattatttaaatgattatctggctgaaaaaGTCAATCA----GTGTCATG-CCCTGTCGCCAATTG-T-GTCAGTT----------AGTGCTTcgctaattttatggttattcccctgtcctg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagAGTTA----GTGCATTG-TCCTGCCGTCAA-AT-T-GTCAGTA----------AGCG--------TTTTGTCAGTT-A---GTGCAT--TG---------TTGTCTTGTCACTAAATGTGGTAGCTAGT-Gg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgaaaaatgattatctggctaagaatttgA----GTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTG-T-GTTAATA----------AGTACCTT-G--TCTTGCTAC-C-A---GT--TT--TG---------Ttatgacctgctatcagctttgtcaattattgtcttgtttttttcacttattttgtca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTG-TCCTGTCACCCGTTT-T-GTAAGTA----------ATTGTCCT-G--TCCTGTCTT-C------T--ATTCTATC-------TTGTCCTGCCATCTATTTcaga
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                          AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCANAANTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGTCAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATGTTATTGTC--CTGTCA-CN-AATTTTGTC---TTGTCAG-TNAGTGCCTT---GT---CCTGCCAC-CAATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTCC------------TGTCANCA---A---TGT----T-------------A---------T--------T-GTCCTGC------CACCAATTTTGTCAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCGCCAATTTT-GTC--G-TAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCGCCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAGTNTTGTTGTCCTGCCACCGATTTTGTCAGNTAGTGCCTTGTCCTGT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                   GTCAA-TCAGTGTCAT---GC---CCTGTCGC-CAATTGTGTCAGTTAGTGCTT
gi|5                          : agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAAT--T-TTGTAAACTCTTA-TC-AATTTTGTC--------AGGTAAG-GCCTT---GC---CCTGTCAC-CAATTTTGTCAATTCGTGCGTTGTCC------------TGCCACCATTTG---TGT----T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTGC------CACCAGTTTTATCAGTTTGTGCCTTGTCTTGCTACCAGTTGT-GT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                               CCTT---GC---CATACCAC-CATTTTTGTCGGTTAGTCCATTACCC------------TGCAACCA---ATG-TGT----T-------------AG--------TTCGTGCCGT-GTCCTGC------TACCAGTTGTGTTAATATGTGTTTTGCCATGCCATCAATTTT-GTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                     AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCTG---TCAG-AANTGTTATTGTCCGGCC-ANNAATTTG-CAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCGCCAA--T--TA------------TTGTC--CTGTCA-CN-AATTTCGTC---TTGTCAGTTAGTGC---CTT---GTCCTGCCAC-CAATTTTGTCAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CANCA---A---TG----T-T-------------A---------T--------T-GTCCTG------CCAC-CAGTTT-TG---TCAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCGCCAATTTT-GTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAGTTTTG--TTGTCCTGCCGNCGATTTTGTCAGNNAGTGCCTTGTCCCGT
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caagttgttttaatCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGaacatgcagcga
gi|2                          :                                                                                                                                     AA-AAATG--ATTATCTGGCT-AAGAATTTG--AGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA------A------------T-------TGTCA-GT-AA--GCGTT---TTGTCAGTTAGTGCATTGTT---GTCTTGTCAC-TAAATGTGGTAGCTAGTGTA-TGACCTGC------------TATCA---GCTTTGTCAAT-T-------------A---------T--------T-GTCTTGTTTTTTTCAC-TTATTT-TG---TCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                    cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggtattatgacatgAGTGCCTTTTCCTGCAAATAATTGT-GT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAG
gi|3                          :                                                                                                     AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCTG---TCAG-AACTGTTATTGTCCTGCC-ACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTTA------------CTGTT--CTGTCA-CA-AATTTTGTC---TTGTCAGTAAGTGC---CTT---GTCCTGCCAC-CAATTTTGTCAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TG----T-T-------------A---------T--------T-GTCCTG------CCAC-CAATTT-TG---TCAGTCAGTACCTTGTCCTGTCACCAATTTT-GTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTTA-TGACATCAGTAAGTGA-TTATCTGACTGAAAAG----GTC-----AATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCAATTG-TGTCAGTTAGTGCTT
gi|4                          :                                                                                                         agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataGTCAATCAGTGT---CAT---GCCCTGTCGC-CAATTGTGTCAGTTAGTGCTTg
gi|5                          : agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T-------------TTGTAAACTCTTA-TC-AATTT--------TGTCAGGTAAGGC---CTT---GCCCTGTCAC-CAATTTTGTCAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TG----T-T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTG------CCAC-CAGTTT-TA---TCAGTTTGTGCCTTGTCTTGCTACCAGTTGT-GT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                            C---CTT---GCCATACCAC-CATTTTTGTCGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TG----T-T-------------AG--------TTCGTGCCGT-GTCCTG------CTAC-CAGTTG-TG---TTAATATGTGTTTTGCCATGCCATCAATTTT-GTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---------T--------T-GTCCTG------C-AC-CAGTTG-TG---TCAGTTAGTGCCTTGTCCTGT-ACCAATTTT-GTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                                                                                                                                    AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGG-C-T-AAAAAGTT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--TA------------TTGTC--CTGTCA-CN-AATTTCGT----TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCGCCAATTTT-GTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGTCAGTTTTG--TTGTCCTGCCATCGATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                    AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTNT---G---ACATCAG--AAATG--ATTATCTGG-C-T-AANAATTTG-CANTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--TA------------TTGTC--CTGTCA-CN-AATTTCGTC---TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCGCCAATTTT-GTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAGTTTTA--TTGTCCTGCCATCGATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
gi|1                          :                                                                                                                                                        TGTTGT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTACCTGG-C-T-GATAATTT--CATTTAGTGCCTTGTCCTGCCGTAAA------A------------T-------TGTCA-GT-AA--GCGTT---TTGTCAGTTAGTGC---ATTGTCGT-CCTTCAACTCAATGTGGTAGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCAACTTTGTCAGTA---A---GGT-C-------------A---------A--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGAAAGTGCCTTT-TTCTGCCTACAATTGT-GT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTT-TGT
gi|10                         : acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacgg---G---ATATAAGC-AAATG--ATTATCTGG-CAG-AAAAAGT---CAGTAAGTGTCATGTCCTG---------------------------------CTG----CA-AATTT-------TTGTCAGTAAGTGC---ATTGTCCTGCTACCGATTT--TGT--CAGTAA----------CGGC------------C---------------------------------------T--------T-GTTCTACCGC-CAGTTT-TGTCAGGCAGCGATTTG-TC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgacGTCAGTAAGTGTCATG-TCCTGCTGCAAATTTTTGTC-----AGTAAGTGCATTGTCCTGCTACCGATTT-TGTCAGTAACGGCCTTGTTCTACCGCCAGTTTTG--T----CAGGCAGCGA-TTTGTC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                          tgacgatataagcaaatgattatctggcagaaaaaTTTCGTCAATTTGTCAGGCAGGGC---CTTATCTTGCCACAAATTG--TGT--CAATTAGTGCATTGTCCTTC------------CA-CA---A---TGT-TTGCCATGTTATACA---------T--------T-GTCTTTCCAT-CAA-AT-TGTCAGCCAATGCCTTA-TCCTGCCACCAATGTT-GT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                          acac------------TTGTC--CTGCCATCA-AAT---GT------GTCAGTTAGTGC---CTTATCCTATCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTACCTTGTCCTGC------------CACTA---AATGTGT-T-------------A----------------------CCTGTCAA-CAGTTT-TGTCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---A---TGT-T-------------C---------T--------TTGTCATGCCAAACA-TTT-TGTCAGTTAGTACCTTG-TCCTGTCGCCAATGTT-GTC----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caagttgttttaatCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGaacatgcagcga
gi|18                         :                                                                                                                                                         GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGAC-G-AAAAAGT---CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
gi|2                          :                                                                                                                                           gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGG-C-T-AAGAATTTG--AGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA------A------------T-------TGTCA-GT-AA--GCGTT---TTGTCAGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------T-GACCTGCTAT-CAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTT-GTC----at
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGT-GT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                    AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTG-C-C-ACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTTA------------CTGTT--CTGTCA-CA-AATTTTGTC---TTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTT-GTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                         GTTAT---G---ACATCAGT-AAGTG--ATTATCTGA-C-T-GAAAAGGT--CAATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCAA--T--TG-------------TGTC--
gi|4                          :                                                                                                                                                agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                         agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T-------------TTGTAAACTCTTA-TC-AATTT--------TGTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTGCCAC-CAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGT-GT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C---CTTGCCATACCACCATTTT--TGT--CGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TGT-T-------------AG--------TTCGTGCCGT-GTCCTGCTAC-CAGTTG-TGTTAATATGTGTTTTG-CCATGCCATCAATTTT-GTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---------T--------T-GTCCTGC-AC-CAGTTG-TGTCAGTTAGTGCCTTG-TCCTGT-ACCAATTTT-GTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         gtgcc------------TTGTC--ATGCCA-CCGAATTT---------GTCAGTTAGTGC---CACGTCCTGCCACCAATTA--TGT--CAGTTAGTGCCTTGTCTTGT------------CATCA---A----GTGT-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-C-GTTTGTGTCAGTGAGTGCCTTG-TCCTGTCGACAATTCT-G-C----CAGTtccca
gi|9                          :                                                                                                                                         tgtgttaatatgtgctGTTATAGCG---ACATTATTTAAATG--ATTATCTGG-C-TGAAAAAGT---CACTTAGTGACATATCCTGTCGCCAATTT--TATCAGTTATTGATTTGTC--CTGTCA-CT-GACT--------TTGTCAA-TAAAG----CTTGTCCTGTCGCTAATTT--TAT---GGTTATTCCCCTGTCCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): AACGTATAGTGTATAATAAATTTGATTGTATATGGTGAAATAGTTGTGCCTACCTAAATCTACATATTCATTAATTAAATCGACAACAGAAACGAATTTGTTCGACATTAAATTCTTTACGT
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGG-CTAAAAAGTT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--TA------------TTGTC--CTGTCACNAATTTCG-T----TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCGCCAATTTT-GTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGTCAGTTTTG--TTGTCCTGCCATCGATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
gi|1                          :                                                                                                                                                          TGTTGT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTACCTGG-CTGATAATTT--CATTTAGTGCCTTGTCCTGCCGTAAA------A------------T-------TGTCAGTAA--GCGTT----TTGTCAGTTAGTGC---ATTGTCGT-CCTTCAACTCAATGTGGTAGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCAACTTTGTCAGTA---A---GGT-C-------------A---------A--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGAAAGTGCCTTT-TTCTGCCTACAATTGT-GT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTT-TGT
gi|10                         : acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacggAC---G---ATATAAGC-AAATG--ATTATCTGG-CAGAAAAAGT--CAGTAAGTGTCATGTCCTG---------------------------------CTG---CAAATTT--------TTGTCAGTAAGTGC---ATTGTCCTGCTACCGATTT--TGT--CAGTAA----------CGGC------------C---------------------------------------T--------T-GTTCTACCGC-CAGTTT-TGTCAGGCAGCGATTTG-TC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgGTCAGTAAGTGTCATG-TCCTGCTGCAAATTTTTGTC-----AGTAAGTGCATTGTCCTGCTACCGATTT-TGTCAGTAACGGCCTTGTTCTACCGCCAGTTTTG--T----CAGGCAGCGA-TTTGTC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                          acac------------TTGTC--CTGCCATCAA----A-T----GTGTCAGTTAGTGC---CTTATCCTATCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTACCTTGTCCTGC------------CACTA---AATGTGT-T-------------A----------------------CCTGTCAA-CAGTTT-TGTCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---A---TGT-T-------------C---------T--------TTGTCATGCCAAACA-TTT-TGTCAGTTAGTACCTTG-TCCTGTCGCCAATGTT-GTC----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caagttgttttaatCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGaacatgcagcga
gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAG-T--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGG-CTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA------A------------T-------TGTCAGTAA--GCGTT----TTGTCAGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------T-GACCTGCTAT-CAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTT-GTC----at
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGT-GT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTG-CCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTTA------------CTGTT--CTGTCACAAATTTTG-TC---TTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTT-GTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                           GTTAT---G---ACATCAGT-AAGTG--ATTATCTGA-CTGAAAAGGT--CAATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCAA--T--TG-------------TGTC--
gi|4                          :                                                                                                                                               agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                         agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T-------------TTGTAAACTCTTATCAATTT---------TGTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTGCCAC-CAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGT-GT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---------T--------T-GTCCTGC-AC-CAGTTG-TGTCAGTTAGTGCCTTG-TCCTGT-ACCAATTTT-GTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGCCGAAAANNT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--T---------------A------------TTGTC--CTGTCACCAATTTCG-T----TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCGCCAATTTTGTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCGTCAGTTTTG--TTGTCCTGCCATCGATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
gi|1                          :                                                                                                                                                          TGTTGT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTACCTGGCTGATAATTT--CATTTAGTGCCTTGTCCTGCCGTAAA---------------------A------------T-------TGTCAGTAA--GCGTT----TTGTCAGTTAGTGC---ATTGTCGT-CCTTCAACTCAATGTGGTAGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCAACTTTGTCAGTA---A---GGT-C-------------A---------A--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGAAAGTGCCTTT-TTCTGCCTACAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTT-TGT
gi|10                         : acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacggAC---G---ATATAAGC-AAATG--ATTATCTGGCAGAAAAAGT--CAGTAAGTGTCATGTCCTGCTGCAAA--T--TTTTGTCAGTAAGTGCA------------TTGTC--CTGCTACCGATTT---------TGTCAGTAACGGC---CTTGTTCTACCGCCAGTTT--TGT--CAGGCAGCGATTTGTC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgCACTTTCG-TCAATTTGTCAGGCAGGGC---CTTATCTTGCCACAAATTG--TGT--CAATTAGTGCATTGTCCTTC------------CA-CA---A---TGT-TTGCCATGTTATACA---------T--------T-GTCTTTCCAT-CAA-AT-TGTCAGCCAATGCCTTA-TCCTGCCACCAATGTTGT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---A---TGT-T-------------C---------T--------TTGTCATGCCAAACA-TTT-TGTCAGTTAGTACCTTG-TCCTGTCGCCAATGTTGTC----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caagttgttttaatCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGaacatgcagcga
gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAGT--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGGCTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA---------------------A------------T-------TGTCAGTAA--GCGTT----TTGTCAGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------T-GACCTGCTAT-CAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTTGTC----at
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gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTT---------------A------------CTGTT--CTGTCACAAATTTTG-TC---TTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
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gi|4                          :                                                                                                                                                             agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                        agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T----------------------------TTGTAAACTCTTATCAATTT---------TGTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTGCCAC-CAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGCCGAAAANGT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--T---------------A------------TTGTC--CTGTCACCGATTTCGT----TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCACCAATTTTGTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCATCAGTTTTA--TTGTCCTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
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gi|10                         : acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacggAC---G---ATATAAGC-AAATG--ATTATCTGGCAGAAAAAGT--CAGTAAGTGTCATGTCCTGCTGCAAA--T--TTTTGTCAGTAAGTGCA------------TTGTC--CTGCTACCGATTT--------TGTCAGTAACGGC---CTTGTTCTACCGCCAGTTT--TGT--CAGGCAGCGATTTGTC
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gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAGT--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTT---------------A------------CTGTT--CTGTCACAAATTTTGTC---TTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------T-GTCCTGCCAC-CAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
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gi|4                          :                                                                                                                                                            agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                        agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T----------------------------TTGTAAACTCTTATCAATTT--------TGTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------T-TTCCTGCCAC-CAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C---CTTGCCATACCACCATTTT--TGT--CGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TGT-T-------------AG--------TTCGTGCCGT-GTCCTGCTAC-CAGTTG-TGTTAATATGTGTTTTG-CCATGCCATCAATTTTGTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): AACGTATAGTGTATAATAAATTTGATTGTATATGGTGAAATAGTTGTGCCTACCTAAATCTACATATTCATTAATTAAATCGACAACAGAAACGAATTTGTTCGACATTAAATTCTTTACGT
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGCCGAAAANGT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--TA------------TTGTC--CTGTCACCGATTTT---TTGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCACCAATTTTGTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCATCAGTTTTA--TTGTCCTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
gi|1                          :                                                                                                                                                          TGTTGT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTACCTGGCTGATAATTT--CATTTAGTGCCTTGTCCTGCCGTAAA------A------------TTGTC--A-GTAAGCG---TT---TTGTCAGTTAGTGC---ATTGTCGT-CCTTCAACTCAATGTGGTAGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCAACTTTGTCAGTA---A---GGT-C-------------A---------A--------TGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGAAAGTGCCTTT-TTCTGCCTACAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTT-TGT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                           ca------------TTGTC--ATGCCA--AACATT---TTGTCAGTTAGTAC---CTTGTCCTGTCGCCAATGT--TGT--CAacatgcagcga
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gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGGCTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA------A------------TTGTC--A-GTAAGCG---TT---TTGTCAGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------TGACCTGCTATCAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTTGTC----at
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gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTTA------------CTGTT--CTGTCACAAATTTTGTCTTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
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gi|4                          :                                                                                                                                          agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                        agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T-------------TTGTAAACTCTTATCAATTTT-----GTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------TTTCCTGCCACCAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGCCGAAAANGT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--TA------------TTGT-----CNTGTCACCGAT-TTT----TGTCAGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCACCAATTTTGTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCATCAGTTTTA--TTGTCCTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                           ca------------TTGT-----CATGCCA--AACATTT----TGTCAGTTAGTAC---CTTGTCCTGTCGCCAATGT--TGT--CAacatgcagcga
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gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAGT--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGGCTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA------A------------TTGT-----CA-GTAAGCG---TTT----TGTCAGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------TGACCTGCTATCAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTTGTC----at
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTTA------------CTGT-----TCTGTCACAAAT-TTTGTCTTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                           GTTAT---G---ACATCAGT-AAGTG--ATTATCTGACTGAAAAGGT--CAATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCAA--T--TG-------------TGT-----C
gi|4                          :                                                                                                                                              agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaGTCAATCAGTGT---CATGCCCTGTCGCCAATTG--TGT--CAGTTAGTGCTTagttagtgcttg
gi|5                          :                                        agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataagttatgacatcagtaagtgattatctgactgaaaagCCTTGTCATGTCACCAA--T--T-------------TTGTAAACTCTTATCA---AT-TTT-----GTCAGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------TTTCCTGCCACCAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C---CTTGCCATACCACCATTTT--TGT--CGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TGT-T-------------AG--------TTCGTGCCGTGTCCTGCTACCAGTTG-TGTTAATATGTGTTTTG-CCATGCCATCAATTTTGTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---------T--------TGTCCTGC-ACCAGTTG-TGTCAGTTAGTGCCTTG-TCCTGT-ACCAATTTTGTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
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gi|9                          :                                                                                                                                           tgtgttaatatgtgctGTTATAGCG---ACATTATTTAAATG--ATTATCTGGCTGAAAAAGT--CACTTAGTGACATATCCTGTCGCCAATTT--TATCAGTTATTGATTTGT-----CCTGTCACTGA--CTT----TGTCAA-TAAAG----CTTGTCCTGTCGCTAATTT--TAT---GGTTATTCCCCTGTCCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-403 )      :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTAT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGCCGAAAANGT--CAGTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAA--T--T---------------A------------TTGT-----CNTGTCACCGATTTTGTC-----AGTTAGTGC---CTTGTCCTGCCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCNTTGTCCTGC------------CACCA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTNAGTGCCTTG-TCCTGCCACCAATTTTGTC----TAGTNAGTGCCTTGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGTAAGTGCCTTGTCCTGTCATCAGTTTTA--TTGTCCTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCCCGT
gi|1                          :                                                                                                                                                          TGTTGT---G---ACATCAGT-AAATG--ATTACCTGGCTGATAATTT--CATTTAGTGCCTTGTCCTGCCGTAAA---------------------A------------TTGT-----CA-GTAAGCG-TTTTGTC-----AGTTAGTGC---ATTGTCGT-CCTTCAACTCAATGTGGTAGCTAGTGCATTGTCCTGCTTTCAACTTTGTCAGTA---A---GGT-C-------------A---------A--------TGTCCTGCCACCAGTTT-TGTCAGAAAGTGCCTTT-TTCTGCCTACAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCCACCAGTTT-TGT
gi|10                         : acgtatagtgcattcttaattcaaaatataaacatatatagcgacattatgcaaggctaaatccgcatatcgatttattaagtcgacaacaggaacaatcattatgttgacctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaacggAC---G---ATATAAGC-AAATG--ATTATCTGGCAGAAAAAGT--CAGTAAGTGTCATGTCCTGCTGCAAA--T--TTTTGTCAGTAAGTGCA------------TTGT-----CCTGCTACCGATTTTGTC-----AGTAACGGC---CTTGTTCTACCGCCAGTTT--TGT--CAGGCAGCGATTTGTC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgTTTGTC-----AGGCAGGGC---CTTATCTTGCCACAAATTG--TGT--CAATTAGTGCATTGTCCTTC------------CA-CA---A---TGT-TTGCCATGTTATACA---------T--------TGTCTTTCCATCAA-AT-TGTCAGCCAATGCCTTA-TCCTGCCACCAATGTTGT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                               acactttcgtcaa------------TTGT-----CCTGCCATCAAATGTGTC-----AGTTAGTGC---CTTATCCTATCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTACCTTGTCCTGC------------CACTA---AATGTGT-T-------------A---------------------CCTGTCAACAGTTT-TGTCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTTG-TTTTAATATGTTCTTTG-TCATGCCAAACATTTTGTC-----AGTTAGTACCTTGTCCTGTCGCCAATGT-TGTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                          ca------------TTGT-----CATGCCAAACATTTTGTC-----AGTTAGTAC---CTTGTCCTGTCGCCAATGT--TGT--CAacatgcagcga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caagttgttttaatatgttctCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGacatgcagcga
gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAGT--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA--
gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGGCTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA---------------------A------------TTGT-----CA-GTAAGCG-TTTTGTC-----AGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------TGACCTGCTATCAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTTGTC----at
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA--TGTT---------------A------------CTGT-----TCTGTCACAAATTTTGTCTTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                           GTTAT---G---ACATCAGT-AAGTG--ATTATCTGACTGAAAAGGT--CAATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCAA--T--T---------------G-----------------------------------TGTC-----AGTTAGTGC---TT
gi|5                          :                                                                            agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaCCTTGTCATGTCACCAA--T--T----------------------------TTGTAAACTCTTATCA---ATTTTGTC-----AGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------TTTCCTGCCACCAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C---CTTGCCATACCACCATTTT--TGT--CGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TGT-T-------------AG--------TTCGTGCCGTGTCCTGCTACCAGTTG-TGTTAATATGTGTTTTG-CCATGCCATCAATTTTGTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---------T--------TGTCCTGC-ACCAGTTG-TGTCAGTTAGTGCCTTG-TCCTGT-ACCAATTTTGTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                       gtgcc------------TTGT-----CATGCCACCGAATTTGTC-----AGTTAGTGC---CACGTCCTGCCACCAATTA--TGT--CAGTTAGTGCCTTGTCTTGT------------CATCA---A----GTGT-------------A---------T--------TGTCCTGCCACC-GTTTGTGTCAGTGAGTGCCTTG-TCCTGTCGACAATTCTG-C----CAGTtccca
gi|9                          :                                                                                                                                           tgtgttaatatgtgctGTTATAGCG---ACATTATTTAAATG--ATTATCTGGCTGAAAAAGT--CACTTAGTGACATATCCTGTCGCCAATTT--T---------------ATCAGTTATTGATTTGT-----CCTGTCACTGACTTTGTC-----AA-TAAAG----CTTGTCCTGTCGCTAATTT--TAT---GGTTATTCCCCTGTCCTG


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                AGC GAG       TT     TT          A     AG GA  G                       TTTTTGTCAGTAAGTGCA                    AAACT CT    CCGAT      TTGTC         ATT           G       .    .           T         CACAATGTTTGCCATGTTATACAT                                                      G       C         T        C         CTTGTT   T                    A   G                                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   .         C      .           C     AG .   A                       TTTTATCAGTTATTGAT                     .     CT    TCAAA      .             .             A       .    .           A         CACCATTTGTGTTAGATCATGCCT                                                      .       A         .        A         CC       A                    G   .                                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   .         T      .           T     TT .   G                       TGTTA                                 .     AT    AACAT      .             .             G       .    .           C         AACCAATGTGTTAGTTCGTGCCG                                                       .       T         .        C         C        T                    G   .                                    
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                               acactttcgtc------------TTGTC--CTGCCATCAAATGTGTC-----AGTTAGTGC---CTTATCCTATCGCCAATTT--TGT--CAGTTAGTACCTTGTCCTGC------------CACTA---AATGTGT-T-------------A---------------------CCTGTCAACAGTTT-TGTCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTTG-TTTTAATATGTTCTTTG-TCATGCCAAACATTTTGTC-----AGTTAGTACCTTGTCCTGTCGCCAATGT-TGTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ca------------TTGTC--ATGCCAAACATTTTGTC-----AGTTAGTAC---CTTGTCCTGTCGCCAATGT--TGT--CAacatgcagcga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caagttgttttaatatgttctCTTGTCCTGTCACCCGTTT-TGTAAGTAATTGTCCTGTCCTGTCTTCTATTCTATCTTGTCCTGCCATCTATTTGGTCAGTAAGacatgcagcga
gi|18                         :                                                                                                                                                           GTTAT---GGAGACATCAGT-AAATG--ATTATCTGGACGAAAAAGT--CAATTAGAAACTTATCCTGTCGTCAA-
gi|2                          :                                                                                                                                             gttatatattgaaTATTAT---G---ACATGAA--AAATG--ATTATCTGGCTAAGAATTT--GAGTTAGTGCATTGTCCTGCCGTCAA-------------------A------------TTGTC--A-GTAAGCG-TTTTGTC-----AGTTAGTGCATTGTTGTCTTGTCACTAAATG--TGG--TAGCTAGTG---------------------------------------T-------------A------------------TGACCTGCTATCAGCTT-TGTCAATTATTGTCTTGTTTTTTTCACTTATTTTGTC----at
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                cgtatagtgcatacttaattctaaatatgaacatataaagtgacattttgcaaggctaaatccacatatcgatttagtaagtcgacaacagaaacatatgtggccgacatttcattcattatgttgatataatcttctttaaaaaacttgtatttggaaaacggAGTGCCTTT-TCCTGCAAATAATTGTGT-----TAATAAGTACCTTGTCTTGCTACCAGTTT-TGTCAGa
gi|3                          :                                                                                                                                      AATTTTGTCAGTTAGTGCCTTGTTCT---G------TCAG--AACTGTTATTGTCCTGCCACCAATTTGACAGTTATTGCCTTGTCCTGTCACCAA-TGTT--------------A------------CTGTT--CTGTCACAAATTTTGTCTTGTCAGTAAGTGC---CTTGTCCTGCCACCAATTT--TGT--CAGTTAGTGCTTTGTTCTGT------------CAACA---A---TGT-T-------------A---------T--------TGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTCAGTACCTTG-TCCTGTCACCAATTTTGTCTTGTTAGTTAGTGCCTTGTCCTGCCACCAATTT-TGTCAGTAAGTGCCTTTTTCTGTCAACAGTATTA--TTGTCCTACCACCAATTTTGATAGACAATGCCTTGTCCCGTa
gi|4                          :                                                                                                                                                           GTTAT---G---ACATCAGT-AAGTG--ATTATCTGACTGAAAAGGT--CAATCAGTGTCATGCCCTGTCGCCA--------------------A------------TTG-----------------TGTC-----AGTTAGTGC---TT
gi|5                          :                                                                            agcgtatagtgtataataaattaaaaatatatacctttattagtatgtttaactaatcttaatctacatatctattaaaatgacaaaaaagaacgtagttggtcaacatttatcgttatgttgacatacttgaataaCCTTGTCATGTCACCAA-T-TT----------------------------TGTAAACTCTTATCAATTTTGTC-----AGGTAAGGC---CTTGCCCTGTCACCAATTT--TGT--CAATTCGTGCGTTGTCCTGC------------CACCATTTG---TGT-T-------------AGATCATGCCT--------TTTCCTGCCACCAGTTT-TATCAGTTTGTGCCTTG-TCTTGCTACCAGTTGTGT-----TAATATGTTTTTTGTAGTGCCTCTAATTT-TGTCAGTg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C---CTTGCCATACCACCATTTT--TGT--CGGTTAGTCCATTACCCTGC------------AACCA---ATG-TGT-T-------------AG--------TTCGTGCCGTGTCCTGCTACCAGTTG-TGTTAATATGTGTTTTG-CCATGCCATCAATTTTGTC-----AGGTAGTGCCTTGTCCTGTCATCACGTT-TGTCTGTTAGTGCCTTGTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---------T--------TGTCCTGC-ACCAGTTG-TGTCAGTTAGTGCCTTG-TCCTGT-ACCAATTTTGTC-----ATTTAGTGCCTTGTCCTGTCGCCAATTTGTGTCAGTAGGTTCCTTGTCCTGTCATCAGGTTTG--TTGTCTTGCCGTCAATTTTGTCAGTAAGTGCCTTGTCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                     gtgcc------------TTGTC--ATGCCACCGAATTTGTC-----AGTTAGTGC---CACGTCCTGCCACCAATTA--TGT--CAGTTAGTGCCTTGTCTTGT------------CATCA---A----GTGT-------------A---------T--------TGTCCTGCCACC-GTTTGTGTCAGTGAGTGCCTTG-TCCTGTCGACAATTCTG-C----CAGTtccca
gi|9                          :                                                                                                                                           tgtgttaatatgtgctGTTATAGCG---ACATTATTTAAATG--ATTATCTGGCTGAAAAAGT--CACTTAGTGACATATCCTGTCGCCAATT-TT--------------ATCAGTTATTGATTTGTC--CTGTCACTGACTTTGTC-----AA-TAAAG----CTTGTCCTGTCGCTAATTT--TAT---GGTTATTCCCCTGTCCTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): ATAACGTAAAGTGTATACTAAATTATATATAAATGTATATGGTGAAATAGCTCTGCCAGCCTAAATCCACATATCCATTAATTATGTCGACAACAGCAACATATTTGGTTGCCATAACTTTCATT
Unaligned ( gi|13 ): AACGTATAGTGTATAATAAATTTGATTGTATATGGTGAAATAGTTGTGCCTACCTAAATCTACATATTCATTAATTAAATCGACAACAGAAACGAATTTGTTCGACATTAAATTCTTTACGT
Unaligned ( gi|16 ): TGGTGAAATAGTTCCGCCAGTCTTAATCCACATATCCATTCATTAAATCGGCATCAATGGAGATTTGGTCGACATTTCATTCATT
Unaligned ( gi|19 ): ATATGGTGAAATAGTTCTGGTAGTATAAATCCACATATCCATAAATTGAATCGACAACAGGACCATATTGG