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gi|7                          :   agtgtcgccggtgttatcggatccatctgcatttaataataataaacAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGAT------A-AGTTCGTTT-AAAGAGAAATAATCTGCCTAGCGTTTTGTGAAGTTTC--CATTATAAACTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTGGTTTATTGACACAGACTTTTCAGGTGATACCGGGTCATTTCCGGTTATATCGAATCGCGCATATTTTGTGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTT-AAAAA-TCCCTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAACTTTCAGCTGATAGTTAA-TAAATTGGTGTTTTC------CTTCTTTTT---T---TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGATGATAAAATTCGGTCTTAAAAAT---T-----------AT---CGGTAA----TTTCCCATTAAATGTTTAGGTAGCAGGTTCTA
gi|14                         :                                               cagtatcgccggtgttaacgtatcacttttcatttattactaataaaattAAGAGAAATTATCTGTCGAGCATTCTATGAAGTTTC--CATTTTATATTCGATCTTACAATGTATACAATGTATGTTTATTGACACTGCCTTTTCAGGTGATA
gi|6                          :                                                                                                                                                             caatgtcgtcggtgttaacgaaccatttttaatttaatattaatgaaatcaatcttcaaattgttaattcGCGTATATTTTATGATGAGGCCGTGTCAGAGGGCTG-TTTAAAAA-GTACTGCTCAATATTTAAAAATCAGCTTTACAGTAAGTA----------------CAAAATGGTGTTTTCTCCTTCCGTCTTTTTAATTAAATAATTAAAGAAGTTAGTTAAAAGATGATAAA-TTCGGTCTTAAAA-----TTAATGTCATAAATG--CGATCACTGTTTGACCATTAAATGTTTAGGTTGTAGGTTCTATGCTT----------GTACAACCTTGCATTATATTAACTGTAAATATACTAAAAAAAAACTTTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACTTATATAAAATGGTACAACCTTACATTAAATCAACAGTAAATATACTAAAAA-GAACTTTATTC-ACCTTTCA---CCT-------------TGTCA----------CTGTACTATATGTACATTATGATTAACAT--TATACACATGCAA-----------T-----GAATTAAACGTGCA------TTTTTGGCAAATTA--TCTCTGCATCATAG-ATTTTTCTGGCATGACAGACACCACAATGTGTAATAAttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacagtcattgttatacgtgtacattatgagtaacatcatatacatgcaatgaataacaactgaattagatgtacatttcttgcaacaactctgcatcatagaattttctagcacgacaaacagcacagttaatagttaattatataattacaaaacatcaccaaacctaccgcaacttaggtgtggcgcaggcaaagatgcaaagctggagacaggatttccacttt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGTAACTATACTGAAAA-GAACTTTATCCATCCTTTCA---aaggtcccgttctgccatcactttgggaacatttgcctactagaaaaccagtaacacattgtaactttctgccatcactttgggaacatttgcctactagtaaaccagtaacaaattgtaactttaggtcccgttttgaatatgttactagttgaattttattttttaatgtgtctaatcagatgcccagattaatcatgtacataaatgtatctttgtcttgaatattgttgtattagcggtctacagtcaacagacactggtggtctcactttgaatagactatttacatagcatgagttgaggttccatcatttgtgaacaaagattttttttgtttcgcttcattaaacatctcatgtgacctaagcaacggttacacagtattattgtactgtacatactggagtagacataattcatatgtgctcagcctcatagttaacaagctgtccatcagagacataatgattctatacacatcaaacaaagacttatctttgttctcatgaatatacatgtacttcataaattatatagttaaataaaacatgaaaggactatctttagaaaacaaactattggcaggtgacaggccatggacgatagacaaattatcacaacaaaaacttcatttgacaatgtttgatagagttaaaatataatattattaagctcctttttccagataaattgatagtaagtgtaatgttttgaatatttggttatgataatatagaaagtggtatggaagcaccatatttatgagcatttgtgacaaacaaatgatatgtcatcattcattgcatctgtatcaaaaccaaatggaacataatctttatgaatccatccctggcattcatcacataggccatgcactgccaagatgaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaatGTCA----------TTGTTATACGTGTACATTATGAGTAACAT--CATATACATGCAATGAATAACAACT-----GAATTAGATGTACA----T-TTCTT-GCAA--CAA--CTCTGCATCATAG-AATTTTCTAGCACGACAAACAGCACAGT---TAATAGT-T-AATTATATAATTACAAA--A-CATCA--CCAA-ACCTACCGCAACTTAGGTGTGG--CGCAGGCAAAGATGCAAAGCTGGAGAC--------AGGATTTCCACTTTcgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaagtaatatgtgtacagtatgattaacaccatgcacaggtaatgaataactactgatcagaattaaatgtacatttctggcaacaactctgcatcatagaagtttctggcacatgtgtaataataaaaaatattcatctataaataatataattacaagacatcacaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                              gcgtatattttatgatgaggccgtgtcagagggctgtttaaaaagtactgctcaatatttaaaaatcagctttacagtaagtacaaaatggtgttttctccttccgtctttttaattaaataattaaagaagttagttaaaagatgataaattcggtcttaaaattaatgtcataaatgcgatcactgtttgaccattaaatgtttaggttgtaggttctatgcttgtacaaccttgcattatattaactgtaaatatactaaaaaaaaactttatttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacaGTAATATGTGTACAGTATGATTAACAC--CATGCACAGGTAATGAATAACTACTGATCAGAATTAAATGTACA------TTTCTGGCAA--CAA--CTCTGCATCATAG-AAGTTTCTGGCAC-------------ATGTGTAATAATAAAAAATATTCATCTATAAATAA-TATAATTACAAGAC--ATCAC------------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaaatgtaactatactgaaaagaactttatccatcctttcacgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaaTGGAGAC--------AGGATTTCCACTTTGaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cAT--------AGGATTCACACCCGACTTACAAAATAATTTACTACCAGTGTTAAGTGTTT----CTCTCA-AATCTTCTACCATCACTTTAGGAACAT--GGTCTACTAGTAAACTAGTAACACA-TTAAAACGTT-TGTTCCCGTT----AT--GGTAC-TTGG--TGGACTTTACTTTTGAATGCTTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAAACC-----------TGTATCTTTGTCTAGAATATTG------TTGTATTTGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTGAATATATGGCAGTATTTGACTACACTATTC----------TTCACATAGATTGTTTACGTAGCTTGAATTGAGGTTCCATGATTTGT--GAATAAAGATTTTTTT-----CC-TTCACTAAACATCTCATGTGTCTTATTC-----AACTGTTA-----CATGTTACATATTATTACTG-------TATTGTACTTACTAG--AGTA----CACATAA-------TTACATGT---------GCTCATAGT---------------TAACAAGATGTCCATCGGAG-AC-TA-AATGATTCTA--TTGACGTCAAACAAAGACTAATCTTTGTTCTCAT-AAATATTCATGTACTATTTA-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATAAAAGCGCTG-TCTTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGTGACATGCCATGGACGATAGACAAATTATTACGACAAATACTTTATTTGACAATGGTCAATAGTGCT-AAATATAATATTA---AGCCCCTTCTTTCAGATAAATTGAAGTGTCAATGTATTGTCTTGAA--CAGTTGGT-ATGACAATATAGCAAATGGTATGGAAAACCCATATTTATGACCATTTATGACAAGCAAATATTATGTTATCATTAATTGCATCAGTATCAAAACCAGTTGGAACATATT-TTTATGAGTCAGTCCCTGGCATCCATCACATAGTCCAGGTACTGCCTAGacatcaatgaaagatttatttttattctcattgaatatatatttgcttcatatagttacataaaacgtgaaagcactattttttagaaaacaaatattggcaagcgacaatc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATTTACACTTGACTTACATAATAATTTACTACCAGTGTCAAGTGTTT----CTCTTA-AATCTTCTACCATCACTTTAGGAACAT--GGCCTACTAGTAAACTAGTAACACA-TTGTA-CGTT-AGCTCCCGTT----AT--GTTAC-TAGG--TGAACTTTACTTC-GAATGATTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAAACC-----------TGTATCTTTGTCTAGAATAGTG------TTGTATTCGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aTTGTAACTTTCTGCCATCACTTTGGGAACATTTGC-CTACTAGTAAACCAGTAACA-AATTGTAACTTT-AGGTCCCGTTTTGAATATGTTAC-TAGT--TGAATTTTATTTTTTAATGTGTCTAA-TCAGATGCCCAGATT-AATCATGTACATAAATGTATCTTTGTCTTGAATATTG------TTGTATTAGCGGTCTACAGTCAACA-----GAC---------ACTGGTGGTCTCACTTTGAATagcaaacgaattattggcagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttacttatataaaatggtacaaccttacattaaatcaacagtaaatatactaaaaagaactttattcacctttcaccttgtcactgtactatatgtacattatgattaacattatacacatgcaatgaattaaacgtgcatttttggcaaattatctctgcatcatagatttttctggcatgacagacaccacaatgtgtaataaaaggtcccgttctgccatcactttgggaacatttgcctactagaaaaccagtaacacaTCGTCTTTCACCACTCTAGAAACGC--GGTCTTTTAGTAAACCAGCCA--------TAT--TT-TGTTCCTGTTTTATACCTGTTACCTGGTCATGCGTTCTACTTCCGAATATTTTTAAATCAGGTATTCAGATGAGACA-----------TGCACCTTTTGCTTGATAACTGAACACAGTTTATTCGCGGTGTACGGCCAACATTGTTGATGGTATTGTAACTGGTAGCCTCACTTTCAATGCTTGGTTACCCTTTATAAAACTATTagactatttacatagcatgagttgaggttccatcatttgtgaacaaagattttttttgtttcgcttcattaaacatctcatgtgacctaagcaacggttacacagtattattgtactgtacatactggagtagacataattcatatgtgctcagcctcatagttaacaagctgtccatcagagacataatgattctatacacatcaaacaaagacttatctttgttctcatgaatatacatgtacttcataaattatatagttaaataaaacatgaaaggactatctttagaaaacaaactattggcaggtgacaggccatggacgatagacaaattatcacaacaaaaacttcatttgacaatgtttgatagagttaaaatataatattattaagctcctttttccagataaattgatagtaagtgtaatgttttgaatatttggttatgataatatagaaagtggtatggaagcaccatatttatgagcatttgtgacaaacaaatgatatgtcatcattcattgcatctgtatcaaaaccaaatggaacataatctttatgaatccatccctggcattcatcacataggccatgcactgccaagatgaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cCTTTGAATAGACTATTTACATAGCATGAGTTGAGGTTCCATCATTTGT--GAACAAAGATTTTTTTTGTTTCGCTTCATTAAACATCTCATGTGACCTAAGC-----AACGGTTA-----CACAGTAT-------TATTG-------TACTGTACATACTGG--AGTAGA--CA--TAA-------T-TCATAT---------G-------TGCTCAGCCTCATAGTTAACAAGCTGTCCATCAGAG-ACATA-A-TGATTCTA--TACACATCAAACAAAGACTTATCTTTGTTCTCAT-GAATATACATGTACTTCATAAATTATATAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGGACTA-TCTTTAGAAAACAAACTATTGGCAGGTGACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATCACAACAAAAACTTCATTTGACAATGTTTGATAGAGTTAAAATATAATATTATTAAGCTCCTTTTTCCAGATAAATTGATA-GTAAGTGTAATGTTTTG-AA-TATTTGGTTATGATAATATAGAAAGTGGTATGGAAGCACCATATTTATGAGCATTTGTGACAAACAAATGATATGTCATCATTCATTGCATCTGTATCAAAACCAAATGGAACATAATCTTTATGAATCCATCCCTGGCATTCATCACATAGGCCATGCACTGCCAAGATGAttcacat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttacttatataaaatggtacaaccttacattaaatcaacagtaaatatactaaaaagaactttattcacctttcaccttgtcactgtactatatgtacattatgattaacattatacacatgcaatgaattaaacgtgcatttttggcaaattatctctgcatcatagatttttctggcatgacagacaccacaatgtgtaataaaaggtcccgttctgccatcactttgggaacatttgcctactagaaaaccagtaacacattgtaactttctgccatcactttgggaacatttgcctactagtaaaccagtaacaaattgtaactttaggtcccgttttgaatatgttactagttgaattttattttttaatgtgtctaatcagatgcccagattaatcatgtacataaatgtatctttgtcttgaatattgttgtattagcggtctacagtcaacagacactggtggtctcaGTTTACGGAGAACGACTTGAGGTTCCATCATTTTTTAGAA-AAGAATACATCC-----CCCAT--TTAA-CATTTCGTATGACTTATGCTAGATAAGTGTTACATACCATAACAG-------CACTGTACACCCTA------------G--AATAAGACT---TAA-------T-ATATATCTCCTCATCG-------T---------------TAA---------CATCAGAG-AT-TGAA-TGGTTATA--CTGACGTCAAACAAA-ACTAGTCTTTGTTCTCAT-GAATATTCATGTA-CTGATA-----CAAGTTTCATATACTAGTATGAAAGAGTTG-TCTTAAGAAAAat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcTTCCACTTTGACATCAATGAAAGATTTATTTTTATTCTCATTGAATATATATTTGCTTCATA-----TAG--TTAC-ATAA-AACGTGAAAGCACTATTTTTTAGAAAACAAA-TATTGGCAAGCGACAa
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3877 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGNTTTGTTTA-AGTTCGTTTAAAGANAAATTATCTGTCTAGCATTCTGTGAAGTTTC--CATTTTAAATTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTTGTTTATTGACACNGCCTTTTCAGGTGATA-----TCATTTC-GGTNATA-CGAATCGCGCATATTTTATGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAAGCNCTGTGCAATATTTAACNATCAGNTTTACAGTAANTATCACCTNATAGTTA-ACAAATTGGTGTTTTC------CNTCTTTTT---TA--TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGCCTTAAAA--------A------TA--TGCGATCACTGTTTGNCCATTAAATGTTTAGGTNGCAGGTTCTATACTTATATAAAATGGTACAACCTTGCATTAAATTAACAGTAAATATACTAAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCAC---CC-------------TGTCA----------CTGTAATATGTGTACATTATGATTAACATCATA--CACGTGCAATGAANAACTACT-----GAATTAAATGT---ACATT--TTTTGGCAACTCAA-TCTCTGCATCATAGA---NTTTT-CTGGCACGACAGACANCACAATGTGTAATAATATAAATTATTCAACTATAAA-N-A-TATNATTNCAAGAC--ATCGC------------G--CGCAGGCTAAGATACAAAGCTGG--------ANACAGGATTTCCACTTGACTTACAAAATANTTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTNCCATCACTTTAGGAACACG-GCCTACTAGTAAACCAGTNACA-A-TTGTAACNTTAGTTCCCGT---TTTG----CATCTG-TTAC-TAGN--TGAACTTTACTTTTGAATGTTTTNAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACNT----GTATCTTTGTCTTGAATATTG------NTGTATTCGCGGTCTACAATCAACA-----GAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTGAATGCATGGTAGCATTTGACTACACTATTCG----------TCGCATAGACTGTTTACGTAGCATGAGTTGAGGTTCCATCATTTGTGAATAAAGATTTTTTT-----CCCTTCA-TTAAACATTTCGTGTGACTTATGC-----AACTGTTACATAGTACATA------CTGTACTGTACATACT---G-AGT---A--CA--TAATNCATATGTGCT----------ATTAACAAGATGTCCATCAGAGACTAAATGATTCTA--TTGACGTCAAACAAAGACTAATCTTTGTTCTCAT-GAATATNCATGTACTTCATA-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGCGCTGTCTTT-AGNAAACGAATTATTGGCAGGTGACANGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACAAANACTTCATTTGACAATGGTCGATAGTGCTAAAATATAATATTA---AGCCCCTTCTTCCAGATAAATTGANGTGTCAATGTANTGTCTTGAATAGTTGGT-ATGACAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTGTGACAAGCAAATANTATGTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAACCAGGTGGAACATATTCTTTATGAGTCCGTCCCTGGCATCCATCACATAGTCCAGGCACTGCCNAGATGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaatGTAATATGTGTACAGTATGATTAACACCATG--CACAGGTAATGAATAACTACTGATCAGAATTAAATGT---ACA-T--TTCTGGCAA--CAA--CTCTGCATCATAGA---AGTTT-CTGGCAC-------------ATGTGTAATAATAAAAAATATTCATCTATAAATA-A-TATAATTACAAGAC--ATCAC------------gaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaagtaatatgtgtacagtatgattaacaccatgcacaggtaatgaataactactgatcagaattaaatgtacatttctggcaacaactctgcatcatagaagtttctggcacatgtgtaataataaaaaatattcatctataaataatataattacaagacatcacaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgaaatgtaactatactgaaaagaactttatccatcctttcacgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaaGTTTACGGAGAACGACTTGAGGTTCCATCATTTTTTAGAAAAGAATACATC-----CCC--CA-TTTAACATTTCGTATGACTTATGCTAGATAAGTGTTACATACCATA-A------CAGCACTGTACACCCTA--G-AATAAGA--CT--TAATATATATCTCCTC---------ATCGTTAA------CATCAGAGATTGAATGGTTATA--CTGACGTCAAACAAA-ACTAGTCTTTGTTCTCAT-GAATATTCATGTAC-TGATA-----CAAGTTTCATATACTAGTATGAAAGAGTTGTCTTA-AGAAAAaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcGATTTACACTTGACTTACATAATAATTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTACCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACTAGTAACACA-TTGT-ACGTTAGCTCCCGT---T--------A--TG-TTAC-TAGG--TGAACTTTAC-TTCGAATGATTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACCT----GTATCTTTGTCTAGAATAGTG------TTGTATTCGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aCTTT-AGCAAACGAATTATTGGCAGGagcaaacgaattattggcagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agatttacacttgacttacataataatttactaccagtgtcaagtgtttctcttaaatcttctaccatcactttaggaacatggcctactagtaaactagtaacacattgtacgttagctcccgttatgttactaggtgaactttacttcgaatgatttaaatcaggtatccagattaaacctgtatctttgtctagaatagtgttgtattcgctatctacaatcaacatacactggtggcctcaTCGTCTTTCACCACTCTAGAAACGCG-GTCTTTTAGTAAACCAGCCATA----------TTTTGTTCCTGT---TTTA----TACCTG-TTACCTGGTCATGCGTTCTACTTCCGAATATTTTTAAATCAGGTATTCAGATGAG------ACAT----GCACCTTTTGCTTGATAACTGAACACAGTTTATTCGCGGTGTACGGCCAACATTGTTGATGGTATTGTAACTGGTAGCCTCACTTTCAATGCTTGGTTACCCTTTATAAAACTATTT-----------TCACAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cCAATCTT----CAAATTGTTAATT-----------------C-----AAGAGAAATTATCTGTCGAGCATTCTATGAAGTTTC--CATTTTATATTCGATCTTACAATGTATACAATGTATGTTTATTGACACTGCCTTTTCAGGTGATA-----
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caatgtcgtcggtgttaacgaaccatttttaatttaatattaatgaaatGAGACAGGAT--TTCCACTTTGACATCAATGAAAGATTTATTTTTATTCTCATTGAATATATATTTGCTTCATA-----TA--GTTAC-ATAA-AACGTGAAAGCACTATTTTTTAGAAAACAAAT-ATTGGCAAGCGACA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgCAATCTT----CAAATTGTTCGTTATGTTTTGTTTATAGTTCATTTAAAGACAAATTATCTATCTAGCATTCTGTGAAGTTTC--CATTTTAAATTCGATCTTACAATGTCTACAGTGTTTGTTTATTGACACAGTCATTTCAGGTGATA----------------------GAATCGCGCATATTTCATGATGAGGCAGTGTCTGAGGGCTGTTTAAAAAGCACTGTGCAATATTTAACTATCAAATTTACAGTAAATATCACCTTATAGTTA-ACAAATTGATTTTTTC------CTCCTTTTT---TA--TAATTGAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-AATAAAATTCGGCCTTAAAA--------A------TA--T-TGATCCCTG----CCCATTGAATGTTTAGGTTGCCGGTTCTATACTCATA--AAATGGTACAACCTTCTATTAAATTAACAGTAAATATACTAAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCAC---CC-------------TATCA----------CTGTAATATATGCACATTATGAATAACATCATA--CACGAGCAAT-AAAAATTA-T-----GAAATAA-TGTGGAATGTTATTTTTGGCAACTTAAATCTCTGCATCATATA---TTTTTTCTGGTACAACATACACAACAATGTGTAATAATATAAATTATTCAACTATAAA-GGA-TATAATTACAAGAC--ATTAT------------G--TGCAGGCTAAGATACAAAGTTGG--------ACACAGGATTTCCACCTGGCTTACAAAATATTTTACTACCAGTGTCAAGCGTT-----CTCTTAAATATTCTTCCATCAATTTAGGAACAAA-GCCTACTAGTAAACCATTCACA-A-TTGTAACTTTAGTTCCCAT---TTTG----CATCTG-TTAC-TAGC--TGAACTTTACTTTTGAATGTTTTTAA-TCAGTTATCCAGATTAA------ACAT----GTATCTTTGTTTTGAATATTG------GTGTATTTGCGGTCTACAATCAACA-----AAC---------ACTGGTGGTCTCACTTTGAATGCATGATAGCAATTGACTACACTATTCT----------TCATACAGACTGTTTACGTAGCATGAAATGAGGTTCCATGATTTGCAAATAAATA--TTATT-----CCCTTCA-TTAAACATTGCATGTGTCTTATTC-----AGCTGTTACATAGTAT-TA------CTGTACTGTGCATGCT---A-AG----A--CA--TAATTTATATGTGCTTATA------GTTAACAAGATATCCATCAGAGAATAAATGATTCTT--TTGATGTCAAACAAAGAC-AATCTTTGTTCatc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtgtcgccggtgttaacaaatcacttttcatttattactaataaaatCAATCTT----CAAATTGGTAATAATGGCTTGTTTA-AGTCAAATTAAAGATAAATTATCTATCTCTCATTCCTTGATTTTTTTTCATTTTAAATTCGATCTTACAATATCTACATCGTTT-----TTGAAACTGCCTTTCCAGGTAGTA-------ACT----GTAATAACGGATCGTGCATAGTTTATGATGAGGCAATGTCCGAGGGTTGTTAAAAAAGTTCTATGCACTATTTAACAACTAGGTTTACAGTCATCGTCACATAAAAGTTGCACACATTGGGGTTTTC------TA-CAGTTT---TA--TA-TTAA-GAACTTAGGCAAA-GATCGACAAA-TTCGGCCTTAAAA--------AGTCATACA--TGCGATCACTGTTTGACCATTAAATGTTTAGATAGCATGTTCTGTACTTATATAAAATGGTACAACCTTGCATTTAATGGACAGTAAATGTACTCAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCACTAATCAGAATGACAAAAATGTCAAACAAGTATTTTGTAACATGTG-ACATTATGATTAACATCGTATTCATGTGCAGTGAAAAACTACT-----GAATCAGATGT---ACA-T--TGTTGACAACTCA----TCTATATCATAGAGTTCTTTT-CTGGCACGACAGACAGCACAATTGGTAGTAACATAAATTATTTAACTATGAA-T-AGTATCATTTCAAGAC--ATCGC------------ATCCCCA---TGAGAAACAAAACTAGGCACTGTCGCACATAATTTCTACATAACTTACAAAATATTTTACTATCAGTGTTAATTATTTCAATCTCCTAAACTTTGTGCCATCACTCTAGGAAC-----------------CCGATAACACA-TTGTATATTCAGTTCCCG----TTTG----CAACTG-TTAC-TATC--TGAACTTTACTTTTGCATTTGCTAAA-TTAGGTATTCATATTAA------ACAT----GTATCTTT-TATT-----TTG------GTGTATTAGTTGTCTACAATCAACA-----GGC---------ACGGGTGGTCTCATTTTGAATGCAT-------TTTG------------G----------TCGCATACACTGTTTACGGAGCATGAGTTGCGGTTCCATCATTTATG-ATAA---------T-----CCC-GCATTTACACATTTTCTGTGATTTATGC-----AAC--------------TA------CTGTACTATACATACTAGAG-AGG---A--CA--TAATT-ATATGTGCTTATA------GTTCGCAAGATGTCCGTCAGAGACTGAATGGTTCTA--CTGATGTC
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gi|7                          : gcgtatattttatgatgaggccgtgtcagagggctgtttaaaaagtactgctcaatatttaaaaatcagctttacagtaagtacaaaatggtgttttctccttccgtctttttaattaaataattaaagaagttagttaaaagatgataaattcggtcttaaaattaatgtcataaatgcgatcactgtttgaccattaaatgtttaggttgtaggttctatgcttgtacaaccttgcattatattaactgtaaatatactaaaaaaaaactttatttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacaAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGAT------A-AGTTCGTTTAAAGAGAAATAATCTGCCTAGCGTTTTGTGAAGTTTC--CATTATAAACTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTGGTTTATTGACACAGACTTTTCAGGTGATACCGGGTCATTTCCGGTTATATCGAATCGCGCATATTTTGTGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAATCCCTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAACTTTCAGCTGATAGTTA-ATAAATTGGTGTTTTC------CTTCTTTTT---T---TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGTCTTAAAA--------AT-----TA--T-CGGTAA---TTT-CCCATTAAATGTTTAGGTAGCAGGTTCTAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagtatcgccggtgttaacgtatcacttttcatttattactaataaaatt-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGCGCTGTCTTT-AGGAAACAAATTATTGACAGGTAACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATAATGACGAAAACTTCATTTGACAATGGTCAATAGTGCTAAAATACAATATAA---AGCTCCTTCTTCCAGATAA-TTGATATGTCAATGTAAT-TCCTGAACTGTTGGT-ATGGTAGTATAGCAACTGGTATGGAAGCACAATATTTATGCTCATTTGTGACAAACAAATAGTATTTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAGCCAGGTGGAACAAATTCTTTATGTTTCCATCCCTGGCATTTATCACATAATCCAGGCACTGCCAAGATGA
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Reference ( family-3877 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGNTTTGTTTA-AGTTCATTTAAAGANAAATTATCTATCTAGCATTCTGTGAAGTTTC--CATTTTAAATTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTTGTTTATTGACACAGCCTTTTCAGGTGATACCGGGTCACTTCCGGTAATAACGAATCGCGCATATTTTATGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAAGCACTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAANTATCACCTAATAGTTA-ACAAATTGGTGTTTTC------CNTCTTTTT---TA--TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGCCTTAAAA--------A------TA--TGCGATCACTGTTTGCCCATTAAATGTTTAGGTTGCAGGTTCTATACTTATATAAAATGGTACAACCTTGCATTAAATTAACAGTAAATATACTAAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCAC---CC-------------TGTCA----------CTGTAATATGTGTACATTATGATTAACATCATA--CACGTGCAATGAAAAACTACT-----GAATTAAATGT---ACATT--TTTTGGCAACTCAA-TCTCTGCATCATAGA---NTTTT-CTGGCACGACANACACCACAATGTGTAATAATATAAATTATTCAACTATAAA-G-A-TATAATTNCAAGAC--ATCGC------------G--CGCAGGCTAAGATACAAAGCTGG--------ACACAGGATTTCCACCTGACTTACAAAATATTTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTGCCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACCAGTAACACATTGTAACTTTAGTTCCCGT---TTTG----CATCTG-TTAC-TAGC--TGAACTTTACTTTCGAATGTTTTNAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACAT----GTATCTTTGTCTTGAATATTG------GTGTATTCGCGGTCTACAATCAACA-----GAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTGAATGCATGGTAGCATTTGACTACACTATTC-----------T-CGCATAGACTGTTTACGTAGCATGAATTGAGGTTCCATNATTTGTGAATAAAGATTTTTTT-----CCCTTCA-TTAAACATCTCATGTGNCTTATNC-----AACTGTTACAT-------ANTATTACTGTACTGTACATACT--AGAGTA---CA--TAATTCATATGTGCTCA------TAGTTAACAAGATGTCCATCAGAGACTGAATGATTCTA--TTGACGTCAAACAAAGACTAATCTTTGTTCTCAT-GAATATACATGTACTTCATA-----TAAAGTTAA-ATAA-AACGTGAAAGCGCTG-TCTTTAGNAAACGAATTATTGGCAGGTGACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACAAAAACTTCATTTGACAATGGTCGATAGTGCTAAAATATAATATT---AAGCTCCTTCTTCCAGATAAATTGATATGTCAATGTAATGTCTTGAATAGTTGG-TATGATAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTGTGACAAACAAATANTATGTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAACCAGGTGGAACATATTCTTTATGAGTCCGTCCCTGGCATTCATCACATAGTCCAGGCACTGCCAAGATGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaatGTAATATGTGTACAGTATGATTAACACCATG--CACAGGTAATGAATAACTACTGATCAGAATTAAATGT---ACA-T--TTCTGGCAA--CAA--CTCTGCATCATAGA---AGTTT-CTGGCAC-------------ATGTGTAATAATAAAAAATATTCATCTATAAATA-A-TATAATTACAAGAC--ATCAC------------gaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaagtaatatgtgtacagtatgattaacaccatgcacaggtaatgaataactactgatcagaattaaatgtacatttctggcaacaactctgcatcatagaagtttctggcacatgtgtaataataaaaaatattcatctataaataatataattacaagacatcacaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgaaatgtaactatactgaaaagaactttatccatcctttcacgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaaGTTTACGGAGAACGACTTGAGGTTCCATCATTTTTTAGAAAAGAATACATC-----CCC--CA-TTTAACATTTCGTATGACTTATGCTAGATAAGTGTTACAT-------ACCATAACAGCACTGTACACCCT--AGAATAAGACT--TAATATATATCTCCTCA------TCGTTAACA---------TCAGAGATTGAATGGTTATA--CTGACGTCAAACAAA-ACTAGTCTTTGTTCTCAT-GAATATTCATGTAC-TGATA-----CAAGTTTCATATACTAGTATGAAAGAGTTG-TCTTAAGAAAAaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcGATTTACACTTGACTTACATAATAATTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTACCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACTAGTAACACATTGT-ACGTTAGCTCCCGT---T--------A--TG-TTAC-TAGG--TGAACTTTAC-TTCGAATGATTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACCT----GTATCTTTGTCTAGAATAGTG------TTGTATTCGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aCTTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGagcaaacgaattattggcagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agatttacacttgacttacataataatttactaccagtgtcaagtgtttctcttaaatcttctaccatcactttaggaacatggcctactagtaaactagtaacacattgtacgttagctcccgttatgttactaggtgaactttacttcgaatgatttaaatcaggtatccagattaaacctgtatctttgtctagaatagtgttgtattcgctatctacaatcaacatacactggtggcctcaTCGTCTTTCACCACTCTAGAAACGCG-GTCTTTTAGTAAACCAGC----CAT----ATTTT-GTTCCTGT---TTTA----TACCTG-TTACCTGGTCATGCGTTCTACTTCCGAATATTTTTAAATCAGGTATTCAGATGAG------ACAT----GCACCTTTTGCTTGATAACTGAACACAGTTTATTCGCGGTGTACGGCCAACATTGTTGATGGTATTGTAACTGGTAGCCTCACTTTCAATGCTTGGTTACCCTTTATAAAACTATTT-----------T-CACAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cCAATCTT----CAAATTGTTAATT-----------------CA-----AGAGAAATTATCTGTCGAGCATTCTATGAAGTTTC--CATTTTATATTCGATCTTACAATGTATACAATGTATGTTTATTGACACTGCCTTTTCAGGTGATA
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gi|7                          : gcgtatattttatgatgaggccgtgtcagagggctgtttaaaaagtactgctcaatatttaaaaatcagctttacagtaagtacaaaatggtgttttctccttccgtctttttaattaaataattaaagaagttagttaaaagatgataaattcggtcttaaaattaatgtcataaatgcgatcactgtttgaccattaaatgtttaggttgtaggttctatgcttgtacaaccttgcattatattaactgtaaatatactaaaaaaaaactttatttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacaAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGAT------A-AGTTCGTTTAAAGAGAAATAATCTGCCTAGCGTTTTGTGAAGTTTC--CATTATAAACTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTGGTTTATTGACACAGACTTTTCAGGTGATACCGGGTCATTTCCGGTTATATCGAATCGCGCATATTTTGTGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAATCCCTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAACTTTCAGCTGATAGTTA-ATAAATTGGTGTTTTC------CTTCTTTTT---T---TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGTCTTAAAA--------AT-----TA--T-CGGTAA---TTT-CCCATTAAATGTTTAGGTAGCAGGTTCTAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagtatcgccggtgttaacgtatcacttttcatttattactaataaaatt-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGCGCTG-TCTTTAGGAAACAAATTATTGACAGGTAACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATAATGACGAAAACTTCATTTGACAATGGTCAATAGTGCTAAAATACAATATA---AAGCTCCTTCTTCCAGATAA-TTGATATGTCAATGTAAT-TCCTGAACTGTTGG-TATGGTAGTATAGCAACTGGTATGGAAGCACAATATTTATGCTCATTTGTGACAAACAAATAGTATTTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAGCCAGGTGGAACAAATTCTTTATGTTTCCATCCCTGGCATTTATCACATAATCCAGGCACTGCCAAGATGA
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Reference ( family-3877 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGNTTTGTTTA-AGTTCATTTAAAGANAAATTATCTATCTAGCATTCTGTGAAGTTTC--CATTTTAAATTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTTGTTTATTGACACAGCCTTTTCAGGTGATACCGGGTCACTTCCGGTAATAACGAATCGCGCATATTTTATGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAAGCACTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAANTATCACCTAATAGTTA-ACAAATTGGTGTTTTC------CNTCTTTTT---TA--TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGCCTTAAAA--------A------TA--TGCGATCACTGTTTGCCCATTAAATGTTTAGGTTGCAGGTTCTATACTTATATAAAATGGTACAACCTTGCATTAAATTAACAGTAAATATACTAAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCAC---CC-------------TGTCA----------CTGTAATATGTGTACATTATGATTAACATCATA--CACGTGCAATGAAAAACTACT-----GAATTAAATGT---ACATT--TTTTGGCAACTCAA-TCTCTGCATCATAGA---NTTTT-CTGGCACGACANACACCACAATGTGTAATAATATAAATTATTCAACTATAAA-G-A-TATAATTNCAAGAC--ATCGC------------G--CGCAGGCTAAGATACAAAGCTGG--------ACACAGGATTTCCACCTGACTTACAAAATATTTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTGCCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACCAGTAACACATTGTAACTTTAGTTCCCGT---TTTG----CATCTG-TTAC-TAGC--TGAACTTTACTTTCGAATGTTTTNAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACAT----GTATCTTTGTCTTGAATATTG------GTGTATTCGCGGTCTACAATCAACA-----GAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTGAATGCATGGTAGCATTTGACTACACTATTC-----------T-CGCATAGACTGTTTACGTAGCATGAATTGAGGTTCCATNATTTGTGAATAAAGATTTTTTT-----CCCTTCA-TTAAACATCTCATGTGNCTTATNC-----AACTGTTACAT-------ANTATTACTGTACTGTACATACT--AGAGTA---CA--TAATTCATATGTGCTCA------TAGTTAACAAGATGTCCATCAGAGACTGAATGATTCTA--TTGACGTCAAACAAAGACTAATCTTTGTTCTCAT-GAATATACATGTACTTCATA-----TAAAGTTAA-ATAA-AACGTGAAAGCGCTG-TCTTTAGNAAACGAATTATTGGCAGGTGACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACAAAAACTTCATTTGACAATGGTCGATAGTGCTAAAATATAATATT---AAGCTCCTTCTTCCAGATAAATTGATATGTCAATGTAATGTCTTGAATAGTTGG-TATGATAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTGTGACAAACAAATANTATGTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAACCAGGTGGAACATATTCTTTATGAGTCCGTCCCTGGCATTCATCACATAGTCCAGGCACTGCCAAGATGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaatGTAATATGTGTACAGTATGATTAACACCATG--CACAGGTAATGAATAACTACTGATCAGAATTAAATGT---ACA-T--TTCTGGCAA--CAA--CTCTGCATCATAGA---AGTTT-CTGGCAC-------------ATGTGTAATAATAAAAAATATTCATCTATAAATA-A-TATAATTACAAGAC--ATCAC------------gaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaagtaatatgtgtacagtatgattaacaccatgcacaggtaatgaataactactgatcagaattaaatgtacatttctggcaacaactctgcatcatagaagtttctggcacatgtgtaataataaaaaatattcatctataaataatataattacaagacatcacaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgaaatgtaactatactgaaaagaactttatccatcctttcacgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaaGTTTACGGAGAACGACTTGAGGTTCCATCATTTTTTAGAAAAGAATACATC-----CCC--CA-TTTAACATTTCGTATGACTTATGCTAGATAAGTGTTACAT-------ACCATAACAGCACTGTACACCCT--AGAATAAGACT--TAATATATATCTCCTCA------TCGTTAACA---------TCAGAGATTGAATGGTTATA--CTGACGTCAAACAAA-ACTAGTCTTTGTTCTCAT-GAATATTCATGTAC-TGATA-----CAAGTTTCATATACTAGTATGAAAGAGTTG-TCTTAAGAAAAaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcGATTTACACTTGACTTACATAATAATTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTACCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACTAGTAACACATTGT-ACGTTAGCTCCCGT---T--------A--TG-TTAC-TAGG--TGAACTTTAC-TTCGAATGATTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACCT----GTATCTTTGTCTAGAATAGTG------TTGTATTCGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aCTTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGagcaaacgaattattggcagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agatttacacttgacttacataataatttactaccagtgtcaagtgtttctcttaaatcttctaccatcactttaggaacatggcctactagtaaactagtaacacattgtacgttagctcccgttatgttactaggtgaactttacttcgaatgatttaaatcaggtatccagattaaacctgtatctttgtctagaatagtgttgtattcgctatctacaatcaacatacactggtggcctcaTCGTCTTTCACCACTCTAGAAACGCG-GTCTTTTAGTAAACCAGC----CAT----ATTTT-GTTCCTGT---TTTA----TACCTG-TTACCTGGTCATGCGTTCTACTTCCGAATATTTTTAAATCAGGTATTCAGATGAG------ACAT----GCACCTTTTGCTTGATAACTGAACACAGTTTATTCGCGGTGTACGGCCAACATTGTTGATGGTATTGTAACTGGTAGCCTCACTTTCAATGCTTGGTTACCCTTTATAAAACTATTT-----------T-CACAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cCAATCTT----CAAATTGTTAATT-----------------CA-----AGAGAAATTATCTGTCGAGCATTCTATGAAGTTTC--CATTTTATATTCGATCTTACAATGTATACAATGTATGTTTATTGACACTGCCTTTTCAGGTGATA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCA----------TTGTTATACGTGTACATTATGAGTAACATCATA--TACATGCAATGAATAACAACT-----GAATTAGATGT---ACATT--TCTT-GCAA--CAA--CTCTGCATCATAGA---ATTTT-CTAGCACGACAAACAGCACAGT---TAATAGT-T-AATTATATAATTACAAA---A-CATCA--CCAA-ACCTACCGCAACTTAGGTGTGG--CGCAGGCAAAGATGCAAAGCTGG--------AGACAGGATTTCCACTTaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacagtcattgttatacgtgtacattatgagtaacatcatatacatgcaatgaataacaactgaattagatgtacatttcttgcaacaactctgcatcatagaattttctagcacgacaaacagcacagttaatagttaattatataattacaaaacatcaccaaacctaccgcaacttaggtgtggcgcaggcaaagatgcaaagctggagacaggatttccacttt
gi|7                          : gcgtatattttatgatgaggccgtgtcagagggctgtttaaaaagtactgctcaatatttaaaaatcagctttacagtaagtacaaaatggtgttttctccttccgtctttttaattaaataattaaagaagttagttaaaagatgataaattcggtcttaaaattaatgtcataaatgcgatcactgtttgaccattaaatgtttaggttgtaggttctatgcttgtacaaccttgcattatattaactgtaaatatactaaaaaaaaactttatttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacaAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGAT------A-AGTTCGTTTAAAGAGAAATAATCTGCCTAGCGTTTTGTGAAGTTTC--CATTATAAACTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTGGTTTATTGACACAGACTTTTCAGGTGATACCGGGTCATTTCCGGTTATATCGAATCGCGCATATTTTGTGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAATCCCTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAACTTTCAGCTGATAGTTA-ATAAATTGGTGTTTTC------CTTCTTTTT---T---TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGTCTTAAAA--------AT-----TA--T-CGGTAA---TTT-CCCATTAAATGTTTAGGTAGCAGGTTCTAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagtatcgccggtgttaacgtatcacttttcatttattactaataaaatt-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGCGCTG-TCTTTAGGAAACAAATTATTGACAGGTAACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATAATGACGAAAACTTCATTTGACAATGGTCAATAGTGCTAAAATACAATATA---AAGCTCCTTCTTCCAGATAA-TTGATATGTCAATGTAAT-TCCTGAACTGTTGG-TATGGTAGTATAGCAACTGGTATGGAAGCACAATATTTATGCTCATTTGTGACAAACAAATAGTATTTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAGCCAGGTGGAACAAATTCTTTATGTTTCCATCCCTGGCATTTATCACATAATCCAGGCACTGCCAAGATGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGTGACATGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACACATACTTTATTTGACACTTGTCAATAGTGCTAAA-TATAATATT---AAGCCCCTTCTTCCAGATAAATTGAAGTGTCAATGTATTGTCTTGAATAGTTGG-TATGACAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTATGACAAGCAAATATTATGCTATCATTGATTGCACCTGTATCAAAACTAGGTGGAACATATT-TTTATGAGACAGTCACTGGCATCCATCACATAGTCCAGGTACTGCCTAGATGA


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Reference ( family-3877 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATCTT----CAAATTGTTAGTTATG-------T-------A-AGTTCATTTAAAGANAAATTATCTATCTAGCATTCTGTGAAGTTTC--CATTTTAAATTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTTGTTTATTGACACAGCCTTTTCAGGTGATACCGGGTCACTTCCGGTAATAACGAATCGCGCATATTTTATGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAAGCACTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAANTATCACCTAATAGTTA-ACAAATTGGTGTTTTC------CNTCTTTTT---TA--TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGCCTTAAAA-----A-TCATA--T---CGATCACTGTTTGCCCATTAAATGTTTAGGTTGCAGGTTCTATACTTATATAAAATGGTACAACCTTGCATTAAATTAACAGTAAATATACTAAAAAAGAACTTTATCCACCCTTTCAC---CC-------------TGTCA----------CTGTAATATGTGTACATTATGATTAACATCATA--CACGTGCAATGAAAAACTACT-----GAATTAAATGT---ACATT--TTTTGGCAACTCAA--CTCT--GCATCATAGA---NTTTT-CTGGCACGACANACACCACAATGTGTAATAATATAAATTATTCAACTATAAA-G-A-TATAATTNCAAGAC--ATCGC------------G--CGCAGGCTAAGATACAAAGCTGG--------ACACAGGATTTCCACCTGACTTACAAAATATTTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTGCCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACCAGTAACACATTGTAACTTTAGTTCCCGT---TTTG----CATCTG-TTAC-TAGC--TGAACTTTACTTTCGAATGTTTTNAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACAT----GTATCTTTGTCTTGAATATTG------GTGTATTCGCGGTCTACAATCAACA-----GAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTGAATGCATGGTAGCATTTGACTACACTATTC-----------T-CGCATAGACTGTTTACGTAGCATGAATTGAGGTTCCATNATTTGTGAATAAAGATTTTTTT-----CCCTTCA-TTAAACATCTCATGTGNCTTATNC-----AACTGTTACAT-------ANTATTACTGTACTGTACATACT--AGAGTA---CA--TAATTCATATGTGCTCA------TAGTTAACAAGATGTCCATCAGAGACTGAATGATTCTA--TTGACGTCAAACAAAGACTAATCTTTGTTCTCAT-GAATATACATGTACTTCATA-----TAAAGTTAA-ATAA-AACGTGAAAGCGCTG-TCTTTAGNAAACGAATTATTGGCAGGTGACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACAAAAACTTCATTTGACAATGGTCGATAGTGCTAAAATATAATATT---AAGCTCCTTCTTCCAGATAAATTGATATGTCAATGTAATGTCTTGAATAGTTGG-TATGATAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTGTGACAAACAAATANTATGTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAACCAGGTGGAACATATTCTTTATGAGTCCGTCCCTGGCATTCATCACATAGTCCAGGCACTGCCAAGATGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgaaatGTAATATGTGTACAGTATGATTAACACCATG--CACAGGTAATGAATAACTACTGATCAGAATTAAATGT---ACA-T--TTCTGGCAA--CAA--CTCT--GCATCATAGA---AGTTT-CTGGCAC-------------ATGTGTAATAATAAAAAATATTCATCTATAAATA-A-TATAATTACAAGAC--ATCAC------------gaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaagtaatatgtgtacagtatgattaacaccatgcacaggtaatgaataactactgatcagaattaaatgtacatttctggcaacaactctgcatcatagaagtttctggcacatgtgtaataataaaaaatattcatctataaataatataattacaagacatcacaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaaatgtaactatactgaaaagaactttatccatcctttcacgaatcacaatgaaaaaatgtcaaacaaccaaatgcgaaaacagtcaaGTTTACGGAGAACGACTTGAGGTTCCATCATTTTTTAGAAAAGAATACATC-----CCC--CA-TTTAACATTTCGTATGACTTATGCTAGATAAGTGTTACAT-------ACCATAACAGCACTGTACACCCT--AGAATAAGACT--TAATATATATCTCCTCA------TCGTTAACA---------TCAGAGATTGAATGGTTATA--CTGACGTCAAACAAA-ACTAGTCTTTGTTCTCAT-GAATATTCATGTAC-TGATA-----CAAGTTTCATATACTAGTATGAAAGAGTTG-TCTTAAGAAAAaaccactccgtcactttcttgtggcacaggctaggata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atcGATTTACACTTGACTTACATAATAATTTACTACCAGTGTCAAGTGTT----TCTCTTAAATCTTCTACCATCACTTTAGGAACATG-GCCTACTAGTAAACTAGTAACACATTGT-ACGTTAGCTCCCGT---T--------A--TG-TTAC-TAGG--TGAACTTTAC-TTCGAATGATTTAAA-TCAGGTATCCAGATTAA------ACCT----GTATCTTTGTCTAGAATAGTG------TTGTATTCGCTATCTACAATCAACA-----TAC---------ACTGGTGGCCTCACTTTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aCTTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGagcaaacgaattattggcagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agatttacacttgacttacataataatttactaccagtgtcaagtgtttctcttaaatcttctaccatcactttaggaacatggcctactagtaaactagtaacacattgtacgttagctcccgttatgttactaggtgaactttacttcgaatgatttaaatcaggtatccagattaaacctgtatctttgtctagaatagtgttgtattcgctatctacaatcaacatacactggtggcctcaTCGTCTTTCACCACTCTAGAAACGCG-GTCTTTTAGTAAACCAGC----CAT----ATTTT-GTTCCTGT---TTTA----TACCTG-TTACCTGGTCATGCGTTCTACTTCCGAATATTTTTAAATCAGGTATTCAGATGAG------ACAT----GCACCTTTTGCTTGATAACTGAACACAGTTTATTCGCGGTGTACGGCCAACATTGTTGATGGTATTGTAACTGGTAGCCTCACTTTCAATGCTTGGTTACCCTTTATAAAACTATTT-----------T-CACAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cCAATCTT----CAAATTGTTAATT------------------------CA-----AGAGAAATTATCTGTCGAGCATTCTATGAAGTTTC--CATTTTATATTCGATCTTACAATGTATACAATGTATGTTTATTGACACTGCCTTTTCAGGTGATA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCA----------TTGTTATACGTGTACATTATGAGTAACATCATA--TACATGCAATGAATAACAACT-----GAATTAGATGT---ACATT--TCTT-GCAA--CAA--CTCT--GCATCATAGA---ATTTT-CTAGCACGACAAACAGCACAGT---TAATAGT-T-AATTATATAATTACAAA---A-CATCA--CCAA-ACCTACCGCAACTTAGGTGTGG--CGCAGGCAAAGATGCAAAGCTGG--------AGACAGGATTTCCACTTaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacagtcattgttatacgtgtacattatgagtaacatcatatacatgcaatgaataacaactgaattagatgtacatttcttgcaacaactctgcatcatagaattttctagcacgacaaacagcacagttaatagttaattatataattacaaaacatcaccaaacctaccgcaacttaggtgtggcgcaggcaaagatgcaaagctggagacaggatttccacttt
gi|7                          : gcgtatattttatgatgaggccgtgtcagagggctgtttaaaaagtactgctcaatatttaaaaatcagctttacagtaagtacaaaatggtgttttctccttccgtctttttaattaaataattaaagaagttagttaaaagatgataaattcggtcttaaaattaatgtcataaatgcgatcactgtttgaccattaaatgtttaggttgtaggttctatgcttgtacaaccttgcattatattaactgtaaatatactaaaaaaaaactttatttacacgtccacaaatcagaatgataaaacaatgtcaaacaagtaacgcgaaaacaAATCTT----CAAATTGTTAGTTATGA------T-------A-AGTTCGTTTAAAGAGAAATAATCTGCCTAGCGTTTTGTGAAGTTTC--CATTATAAACTCGATCTTACAATGTCTACAGCGTTGGTTTATTGACACAGACTTTTCAGGTGATACCGGGTCATTTCCGGTTATATCGAATCGCGCATATTTTGTGATGAGGCAGTGTCCGAGGGCTGTTTAAAAATCCCTGTGCAATATTTAACTATCAGCTTTACAGTAACTTTCAGCTGATAGTTA-ATAAATTGGTGTTTTC------CTTCTTTTT---T---TAATTAAAGAAGTTAGTCAAAAGAT-GATAAAATTCGGTCTTAAAA-----A-T--TA--T---CGGTAA---TTT-CCCATTAAATGTTTAGGTAGCAGGTTCTAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagtatcgccggtgttaacgtatcacttttcatttattactaataaaatt-----TAAAGTTAA-ATAA-AACATGAAAGCGCTG-TCTTTAGGAAACAAATTATTGACAGGTAACAGGCCATGGACGATAGACAAATTATAATGACGAAAACTTCATTTGACAATGGTCAATAGTGCTAAAATACAATATA---AAGCTCCTTCTTCCAGATAA-TTGATATGTCAATGTAAT-TCCTGAACTGTTGG-TATGGTAGTATAGCAACTGGTATGGAAGCACAATATTTATGCTCATTTGTGACAAACAAATAGTATTTTATCATTGATTGCATCTGTATCAAAGCCAGGTGGAACAAATTCTTTATGTTTCCATCCCTGGCATTTATCACATAATCCAGGCACTGCCAAGATGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTAGCAAACGAATTATTGGCAGGTGACATGCCATGGACGATAGACAAATTATCACGACACATACTTTATTTGACACTTGTCAATAGTGCTAAA-TATAATATT---AAGCCCCTTCTTCCAGATAAATTGAAGTGTCAATGTATTGTCTTGAATAGTTGG-TATGACAATATAGCAAATGGTATGGAAGCACCATATTTATGACCATTTATGACAAGCAAATATTATGCTATCATTGATTGCACCTGTATCAAAACTAGGTGGAACATATT-TTTATGAGACAGTCACTGGCATCCATCACATAGTCCAGGTACTGCCTAGATGA
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Unaligned ( gi|16 ): TTAAATCTGTTAATCGAATTGAATTTCTTCATCTGTGATCTATTTGTCATTCATTTCATGTTTCTATGTTAATCCTAGTTACCACAATGTAACATTGCCTTCAGTTTGATA