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lowQualScore : . ..... ......... ............ . . .... ............................................................... .... . ...................................................................................... . . ................................. . . ......... ... .. . ... . ....... . .... . . .. ................... .. ...... . ..... . . .... ........ . .. .... . .
lowQualScore : 3 66666 444444444 444444444444 7 9 5555 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6666 9 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 5 000000000000000000000000000000000 3 9 666666666 777 22 1 222 8 0000000 8 9999 7 8 00 6666666666666666666 77 555555 0 77777 5 0 4444 11111111 7 22 1111 0 5
consensus : CTGTACCACAGGT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TCAG--G----TTA--GG-TGG---GCCAGCATATACTTT----------CT------------------CATA------CA----------C----------TCTCTCC---T-CAGGTTG------------------C--C-------C--------C------------C--C---------------CC---------A----T-AATTGAAACGCTCCTACACC--CAT-GAATAT-T------------GATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA-ACAATGAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAGCAC-TGTT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTG--GT------AACGTT-AAAT-----GTCG-C-ACCGACGC---T-------AA-ATGTCGCAAC--GC----TGACACCAACGCTA
Reference ( gi|7 ) : CTGTACCACATGT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TCAG--G----GTT--GG-TGG---ACCAGCATATACTTT----------CT------------------CACA------CA----------C----------TCTCTCA---T-CAGGTTG------------------C--C-------T--------T------------C--C---------------CC---------A----T-AATTGAAACGCTCATTCACA--CAG-GAA-----------------GATCA-CAAT-------GGATAC--AAAAA-ACAATAAGTGTTG---TA-TTAAA---GAACCAC-TGTT----GGTA-GGGTAGAT--CT---------CG--C-TG-G--GT------AACGTT-AAAT-----GTCG-C-ACCGACGC---T-------TA-ATGTCGCAAC--GC----TGACTCTAACGCTA
gi|6 : CTGTACCACAGGTCCACAGACCAATATAGTGACCCGTTTAATAT---------TCAG--G----TTA--GG-TTG---GCCAGCATATACTTT----------CTCCTTCTCCCCCCCCCCCCCCCC------CC----------C----------CCCCCCACCCT-CACGCC-------------------C--C-------T--------T------------C--C---------------AA---------AA---T-AATTAAAA-GTTTCTACACC--TAA-GAATATAT------------GATCA-CAATTAGTAATGAATA-----AAA-ACAATGAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAGCAC-TGTT-----GCA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTG--GTA-----AACGTT-AAAT-----GCCG-CAACCGA
gi|9 : CTGTACCACAGGT-----GGATAATATAGTGACCCGTTT
gi|17 : CTGTATCACAGCT-----GACCAACATAGTGACTCTTTTAATGT---------Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatctcatcaataatagctcttatatccatgaatatatgatcacaatgaatacaaaagcaatgagtgttgtattaaacaagcactgttcctagggtagatcactctgtgttaacgttaaatgccgcaccgaca
gi|43 : CTGTTCCACAGGT-----GACCAATATAGTGATCCGTTaaatttaaactgtatctttgcaaacatttaaagaatgcatgaatgtcgacatgtatcgtaaatcaatatttacattagaacaaacaattacaaaaaagaaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaataattatgatttacgg
gi|2 : cTGTAACACAGCT-----GACCAATATAGTGACTGTTTTAATGT---------
gi|11 : GTACCACATGT-----GACCAATAGAGTGACCCGTTTAGTATCCCCTACTTTCATTTA----GTT--G--TG-----CCAGCATATACGTT----------CT------------------CATA------CA----------C----------TCTGTCC---T-CAGGTTCTC----------------C--C-------C--------A------------C--C---------------CC---------ACCGAT-AATTGAAACGCTCCTACACC--CAT-GAATATAT------------GATCA-CAAT-------GAATCC--AAAAA--CAATGAGTGTTG---TA-CTAAA---CAAGCAC-TGTT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTT--GT------AACcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataatgaatatatgaccacaatgaatacaaaaacaataagtgatgtacttaacaaacaatgttactaggtaagggtagatcactctgtggtaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaaattgtattgttgcaaccgacgttatatgtcgcaacgctgacacc
gi|8 : GTACCACAGGT-----GGCCAAAATTGTGACCCATTTAATGT---------TCAG--GTAAGGTT--GG-T-------CAGCATAAACGTT----------CT------------------CAAA------CA----------TCATCATATATTCTCTCC---T-CAGGTTA------------------C--C-------A--------CCACCCCAA----C--C---------------CC---------A----T-AAATGAAAAGCTTTTTCATC--CAT-GAATATAT------------GATCC-CAAT-------GAATACAAAAAAA-ACCATGAGTGTTG---TA-TGAAA---CAAACAC-TCTT----GCTG-GGGTAGA----T---------CA--C-TGTA--GT------AACATT-AAAT-----GTCG-C-GCCGA
gi|12 : GTACCACAGGT-----GACCAATATAGCGACCCGTTTAATGT---------TCAG--G----TAA--GG-TTG---GCCAGCATATACTTT----------CT------------------CATA------CATCATCATACAC----------TCTCTCC---T-CAGGTTG------------------C--C-------C--------C------------CCTC---------------CC---------A----T-AATTGAAAAGATCCTACACC--CAT-GAATGTATTCAATGATCCATGATTATCAAT-------GAATAC---AAAA-ACAATGCGTGTTaaccga
gi|5 : GTACCACAAGT-----GATCAATATAGTGACCCATTTNNNNN---------NNNN--N----NNN--NN-NNN---NNNNNNNNNNNNNNN----------NN------------------NNNN------NN----------N----------NNNNNNN---N-NNNNNNN------------------N--N-------N--------NNNNNNNNNNNNAC--CA--------------CC---------AA---T-AATTAAAACGCTCCTACATC--CAT-GAATATGT------------GATCA-CAAT-------GAATAC---AAAA-ACAATGAGTGTTG---TA-TTGTA---AAA-------------GCTA-GGGTAGATAACTCTGTGGTAACG--T-TG-GTTGTCGCATCAACGCT-AAAT-----GTCG-CAACCGACG----T-------TATATGTCGCAAC--GC----TGACACCAACGCTcttcgaaaccgacattatatgatgtgctag
gi|27 : GTATCACAGGT-----GACCAATATAGTGACTCGTTTAATGT---------TCAG--G----TAA--GG-TTG---GCCAGCATATTTGTT----------CT------------------CATA------CATCATCATATAC----------TCTCCCT---T-CAAATTG------------------C--C-------C--------CTAAC--------C--C---------------CC---------A----T-AA
gi|38 : GTTCCAAAGGT-----GACCAATATCGTGATCCTTTTAATGG---------TCAG--G----a
gi|15 : CACAGGT-----GACCAATATAGTGAGTCGTTTAATGT---------TCAG--C----TTG--GG-TGGGCCACCATCATATACTTTCTCATATATCCT------------------CATA------CA----------C----------TCTTTCC---T-CAGGTTGCATCCCACCCAGCCCCCAC--C-------C--------TGA----------C--C---------------CCCA-------A----T-AATTAAAACGCTCCTACAC---CAGTGAA-----------------TAT-A-TTAT---------ATAC---AAAA-ACAATtaaggtggg
gi|4 : CACATG-------ACCAATACACTGACCCGTTTAATGT---------TCA--------GTTAAGG-CGG---ACCAGCATATATTTT----------Ccttttttcagcgcttgtatt
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gi|33 : tACAGGG-----GACCAAAACAGTGACCCGTTTAAAGT---------TCAG--G----TAA--GG-TAG----CCAGCATATCATTG----------CT------------------CATA------CA----------T----------CCTCgaact
gi|1 : T-----GATCAATATAGTGACCCTTTTAATTT---------Tatacactctcctta
gi|28 : cT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TAAG--G----TAA--AG-TGG---GCCAGCATATACTTT----------CT------------------CATA------CA----------T----------CCTCaaatttaaactgtctttgcaaacatttaaagaactaatgaatgtcaacacattccgtaaaacaccatttacattaaaagcatttataaagaaagaaaaagctttattcaacatacaaataatcataattaacgggctattcgcaagggattattagtattgtttaaataaacactacagacttcaatgaagaattacgatactgtttatacacgcaagctgatgtatatgatcacaatgaatataaaaccaatgagcgtagtatttaacaagcactgatgctagggtagatcactctggtaacgtaaatgtctcaccgacgctaaatgtcgcaaccgacgttatatgccgtcgcaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcgtcgcaacactgacaccaacgcta
gi|16 : -----GACCAATATAGTGACCCGTTTNNNNN---------NNNN--N----NNN--NN-NNN---NNNNNNNNNNNNNNN----------NN------------------NNNN------NN----------N----------NNNNNNN---N-NNNNNNN------------------N--NNNNNNAAT--------C------------C--C---------------CC---------A----T-AATTGTAAAGCTCCT--ACA--T-----------------------------CAAT-------GAATAC---AAAA-CCAATGATTGTTG---TA-TAAAA---CAAGCAC-TGTT----GCTA-GGGTATAT--CA---------CT--C-TGTG--GT------AAatacactctcttctcagcccccccccccccccccccccccccc
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gi|35 : ttctc------------------CATA------CA----------C----------TCTCTCA---T-CAGGTTG------------------c
gi|22 : ---T-CAGGTTG------------------A--C-------C--------C------------C--C---------------CCTCACCCCCAA----T-AATTAAAACGCTCCTGCATC--CA------------------------------------------TAC--AAAA--ACAATAAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAGCACGTGTT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGCG--GT------AACGTT-AATT-----ATCG-C-ATCGACGA---T-------AA-ATGTggctcaccgccccccccccccctccccaccacaccccaataattgaaacgcacctac
gi|18 : ccAGGTTG------------------C--C-------CCC------T------------C--C---------------CCCAATA----A----T-AATTAAAAAGCTCCTACACC--CAT-GAATATAT------------AATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA--CAATGAGTTTTG---TA-TTAAA---CAAGCAC-TGTT----GCTA-AGGTATAT--CA---------C---T-TT-G--GT------AACGTT-AATT-----GTCG-C-ACCGACAA---T-------AA-ATGTCGCAAC--
gi|21 : ------------------C--C-------C--------C------------C--C---------------CC---------A----TTAATTGAAAAGCTTATTCATC--CAT-AAATATAT------------GATCA-CATT-------GAATAC--AAAAA--CAATGAGTGTTGTATTA-TTAAA---CAAGCAC-TCTT----GTTA-GGATAGAT--CA---------CACTC-TGTG--GT------AACGTT-AAAT-----GTCG-C-GTCGAcgatgttatatg
gi|24 : cccccc------------------C--C-------T--------C------------C--C---------------CC---------AA---T-TACTAAAACGTTTCT--------------------------------ATAA-CCAT-------GAATAT--ATGATTATAATGAGTGTTG---TA-TTAAG---CAAGCTC-TGTT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--CTTT-G--GT------AACATT-AATT-----GTCG-C-ACC
gi|19 : ccccccccccccctcc---------------CC---------A----T-AATAGAAAAGCTCATACATC--TAT-GAATATAT------------GATCA-CAAT-------AAATAC--AAAAA--CAACGAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAACAC-TCGT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTG--GT------AATGTT-AAAT-----GTCG-C-GTCGA
gi|23 : tgccctcaatccccccaccctccacccccacaacaGAAACGCTCCTACACC--CAT-GAATATGT------------GATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA--CAGTGAGTGTTG---TA-TTAAA-------CA----------------GATAGAT--CG---------CT--C-TGTG--GTTT----AACGTA-AAAT-----GTCG-C-ACCGACGC---T-------AA-ATGTCGCAAC--GC----TGACACTTACGCTA
gi|4 : GCTCA--CACATCCAT-GAA-----------------TAT-----AT-------GATCAC--AAAAA--CAATGAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAACAC-TGTT----GCGA-GGGTACAT--CA---------CT--C-TGTG--GT------AACGTT-AAATCCCGAGTCGAA-ACCGAa
gi|9 : cacatgaccaatacactgacccgtttaatgttcagttaaggcggaccagcatatattttcacctcaggttatttctctccctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------------GATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAG--CAATGAGTGTTG---TA-TTAAA---CAAGCAC-TGTT----CCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTG--TT------AACGTT-AAAT-----GCCG-C-ACCGAC
gi|2 : ctgtaccacaggtggataatatagtgacccgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatctcatcaataatagctcttatatccatgaatatat-----------------GACCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA--CAATAAGTGATG---TA-CTTAA---CAAACAA-TGTTACTAGGTAAGGGTAGAT--CA---------CT--C-TGTG--GT------AACGTT-AAAT-----GTCG-C-ACCGACGC---TAAAATTGTA-TTGTTGCAAC--a
gi|1 : tgtaacacagctgaccaatatagtgactgttttaatgtcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataatgaatatat-----------------GATCA-CAAT-------GAATAT--AAAAC--CAATGAGCGTAG---TA-TTTAA---CAAGCAC-TGAT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CT--C-T--G--GT------AACG-T-AAAT-----GTCT-C-ACCGACGC---T-------AA-ATGTCGCAAC--cgacgttatatgtcgcaacgctgacacc
gi|25 : ctgatcaatatagtgacccttttaattttaaatttaaactgtctttgcaaacatttaaagaactaatgaatgtcaacacattccgtaaaacaccatttacattaaaagcatttataaagaaagaaaaagctttattcaacatacaaataatcataattaacgggctattcgcaagggattattagtattgtttaaataaacactacagacttcaatgaagaattacgatactgtttatacacgcaagctgatgtatat-----------------GGTCA-CAAT-------GAATAT--GAAAA--CAATGAGTGTCG---TA-TTAAA---CAAGCAC-TGTT----GCTA-GGGTAGAT--CA---------CG--C-TGTG--GA------AACTTT-AAAT-----GTCG-------------------------------CAAC--GC----TGACACCAACGCTAcgacgttatatgccgtcgcaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcgtcgcaacactgacaccaacgcta
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gi|37 : G--C-TA-A--GA------ATCGTT-AAAT-----GTCT-C-ACAGACGC---T-------AA-ACGCCGCAAC--gaca
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gi|32 : gattact--C-TGTG--GT------TACGTT-AAAT-----GTCG-C-GTCGAaac
gi|26 : taaatgaaaaggtattgcatctatcaatatatgatcacaatgaatacaaaaagaagcacc-G--GC------AACGTT-GAAC-----GTCG-C-ACCGAAGCTATT-------TA-ACGTCaaccgac
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gi|26 : gtatgcc------AACGTA-AAAG-----GTCG-C-ACCAATGC---T-------AA-ATGTCGC--C--AC----TAACtaacgttttatgtctcaagaatggcgttaaatgttgcaaccgacgctaagtttcgcaaaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|20 : ttaatcaacttcttaaaaatgtgtgacT-ACAT-----GCCG-C-ACTGAAGC---T-------AA-ATGTCGCAgttatataccgcaagactgacgttaaatagcttcggtgcgacgttcaacgttgccacaatca
gi|1 : ggGTCGCAAC--AC----TGACACCAACGCTActggtttatcagcgcaaaaatatatatagttaagtaatacaaactttttcaaattcgttagtaatcaccatcactgacacggaaaatggtgtgcggatggctggtgggtgaatggttggtaggtggggtt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): CTGCACCCCTTCCCCTCACCATCCCCAATAACTGAAACGCTCCCACGCCCATGCCAAAACAACATGAGTTTTTTTTTAAAAAA
Unaligned ( gi|41 ): TGACAAATATTTTAATAGTTCGTTTTAAGTTATCATAC
Alignments
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lowQualScore : ..... ......... . . ... ..................... ... .......... .. ..................... ...... . ......... .. ................................................................................ . . ... . .............. . ....... ... . . ... . . ..... .. .. .. .. . ... . ..... . . ... ... ... ................... .. ....
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consensus : CTGTACCACAGGT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TCAGGTNAGGTGGG---CCAGCATATACTTT----------C----------TCA---TAC----------ACTC--TCTCC---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AATTGAAACGCTCCTACACCCA---TGA-ATATA------------TGATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAAACAATGAGTGTTGTA-TTA---AACAAG-CAC-TGTTGCTAGG-----GTAGATCAC--T--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AATGTCGC-------------------AAC--GC----TGACACCAACGCTA
Reference ( family-3783 ) : CTGTACCACAGGT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TCAGGTTAGGTGGG---CCAGCATATACTTT----------C----------TCA---TAC----------ACTC--TCTCC---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AATTGAAACGCTCCTACACCCA---TGA-ATAT-------------TGATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAAACAATGAGTGTTGTA-TTA---AACAAG-CAC-TGTTGCTAGG-----GTAGATCAC--T--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AATGTCGC-------------------AAC--GC----TGACACCAACGCTA
gi|1 : T-----GATCAATATAGTGACCCTTTTAATTT---------T
gi|1 : cTACACGCAAGCTGATGTATA------------TGATCA-CAAT-------GAATAT--AAAAC-CAATGAGCGTAGTA-TTT---AACAAG-CAC-TGATGCTAGG-----GTAGATCAC--T--C--TG--G--T-A---ACG-T-AAAT-----GTCT-C-A---C---CGACGCTA---AATGTCGC-------------------AAC--aaatttaaactgtctttgcaaacatttaaagaactaatgaatgtcaacacattccgtaaaacaccatttacattaaaagcatttataaagaaagaaaaagctttattcaacatacaaataatcataattaacgggctattcgcaagggattattagtattgtttaaataaacactacagacttcaatgaagaattacgatactgtttatacacgcaagctgatgtatatgatcacaatgaatataaaaccaatgagcgtagtatttaacaagcactgatgctagggtagatcactctggtaacgtaaatgtctcaccgacgctaaatgtcgcaaccgacgttatatgccgtcgcaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcgtcgcaacactgacaccaacgcta
gi|1 : ctgatcaatatagtgacccttttaattttaaatttaaactgtctttgcaaacatttaaagaactaatgaatgtcaacacattccgtaaaacaccatttacattaaaagcatttataaagaaagaaaaagctttattcaacatacaaataatcataattaacgggctattcgcaagggattattagtattgtttaaataaacactacagacttcaatgaagaattacgatactgtttaGTCGC-------------------AAC--AC----TGACACCAACGCTAcgacgttatatgccgtcgcaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcgtcgcaacactgacaccaacgcta
gi|10 : ctgatcaatatagtgacccttttaattttaaatttaaactgtctttgcaaacatttaaagaactaatgaatgtcaacacattccgtaaaacaccatttacattaaaagcatttataaagaaagaaaaagctttattcaacatacaaataatcataattaacgggctattcgcaagggattattagtattgtttaaataaacactacagacttcaatgaagaattacgatactgtttatacacgcaagctgatgtatatgatcacaatgaatataaaaccaatgagcgtagtatttaacaagcactgatgctagggtagatcactctggtaacgtaaatgtctcaccgacgctaaatgtcgcaaccgacgttatatgccgtcgcaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcACATAT-----GGCCAATATAGTGAACCGTTTAATGT---------TCATGTTAGGTGGG---CCAGCAT----TTT----------C----------TC----TG-------------TC--TCTCC---------------------TTTTTTGCAACCT---------CCA-C--------------C-------C-------C--CTACCACACTC---------C---------------------A----T-TATTGAAACGCTCCTACACCCA---TAA-AT----------------GATCG-CAAT-------CAATAC--AAATA-CAACCAGTGTTGTA-TTA---AACAAT-CAC-TGCTGCTGGG-----ATAAATCAC--C--TTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---A---CG
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gi|14 : gtatgccaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaatgtcgtaacCGTT-AAAT-----GTTG-C-AA--C---CGACGCTA---AGTTTCGC-------------------AAgtttcgcaaaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|14 : gtatgccaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaatgtcgtaactaacgttttatgtctcaagaatggT-ATAT-----GTCG-C-AAACC---CAACGCTA---AATGTAGC-------------------ACT--GT----TCTTATCAACGaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
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gi|2 : tgccctcaatccccccaccctccacccccacaacaTGTAACACAGCT-----GACCAATATAGTGACTGTTTTAATGT---------
gi|2 : A---TGA-ATATA------------TGACCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA-CAATAAGTGATGTA-CTT---AACAAA-CAA-TGTTACTAGGTAAGGGTAGATCAC--T--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AA-ATTGT-------------------ATT--GT----TGCAACCGACGTTAcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataatgaatatatgaccacaatgaatacaaaaacaataagtgatgtacttaacaaacaatgttactaggtaagggtagatcactctgtggtaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaaattgtattgttgcaaccgacgttatatgtcgcaacgctgacacc
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gi|19 : ---------C---------C---------------------A----T-AATAGAAAAGCTCATACATCTA---TGA-ATAT------------ATGATCA-CAAT-------AAATAC--AAAAA-CAACGAGTGTTG---TA-TTAAACAAA-CAC-TCGTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGTG--G--T-A---ATGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAcgatgttatatg
gi|2 : tgccctcaatccccccaccctccacccccacaacaTGTAACACAGCT-----GACCAATATAGTGACTGTTTTAATGT---------
gi|2 : A---TGA-ATAT------------ATGACCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA-CAATAAGTGATG---TA-CTTAACAAA-CAA-TGTTACTAGGTAAGGGTAGAT--CACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AA-ATTGT-------------------ATT--GT----TGCAACCGACGTTAcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataatgaatatatgaccacaatgaatacaaaaacaataagtgatgtacttaacaaacaatgttactaggtaagggtagatcactctgtggtaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaaattgtattgttgcaaccgacgttatatgtcgcaacgctgacacc
gi|20 : tgtaacacagctgaccaatatagtgactgttttaatgtcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataT-ACAT-----GCCG-C-A---C---TGAAGCTA---AATGTCGC-------------------Atatgtcgcaacgctgacacc
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gi|26 : ttaatcaacttcttaaaaatgTGTG--G--C-A---ACGTT-GAAC-----GTCG-C-A---C---CGAAGCTATTTAACGTCtataccgcaagactgacgttaaatagcttcggtgcgacgttcaacgttgccacaatca
gi|27 : ttaatcaacttcttaaaaatgtgtgacaacgtaaaaggtcgcaccaatgctaaatgtcgccactaacgttatataccgcaagactGTATCACAGGT-----GACCAATATAGTGACTCGTTTAATGT---------TCAGGTAAGGTTGG---CCAGCATATTTGTT----------C----------TCA---TACATCATCATATACTC--TCCCT---------------------T------CAAATT---------GC--C--------------CCTAA---C-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AAatca
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gi|31 : ------------ATGATCA-CAAT-------GAATAT--AAAAA-CAATGTGTGTTG---TA-TTAAACAAA-CAC-TGCTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGTGGTG--T-A---CCATT-AAAT-----GTCA-C-A---C---TGAAGCaa
gi|32 : c----T-AAATGAAAAGGTATTGCATCTA---TCA-ATAT------------ATGATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAAa
gi|32 : --CACC--CTGTG--G--T-T---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAgaagcaccctgtggttacgttaaatgtcgcgtcgaaaccgac
gi|33 : taaatgaaaaggtattgcatctatcaatatatgatcacaatgaatacaaaaagaagACAGGG-----GACCAAAACAGTGACCCGTTTAAAGT---------TCAGGTAAGGT-AG---CCAGCATATCATTG----------C----------TCA---TAC----------ATCC--TCaaccgac
gi|34 : ---TGC----------ACCCCTTCCCC---------------------T------CA--------------C--C--------------A-------T-------C--C---------C---------C---------------------AA---T-AACTGAAACGCTCCCACGCCCA---TGatacactctcctta
gi|35 : cCA---TAC----------ACTC--TCTCA---------------------T------CAGGTTGGGCTCACCGC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------CCCCCCTCCCCACCACACCCCAA----T-AATTGAAACGCACCTACccaaaacaacatgagtttttttttaaaaaa
gi|36 : AACAATGAGTGTTG---TA-GTATACAAA-CAC-TGTTCCTAGG-----G----------T--CCGTG--G--T-A---ACGTTAAAAC-----GTTG-C-A---------ACGCTG---A
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gi|40 : cacatgaccaatacactgacccgtttaatgttcagttaaggcggaccagcatatattttcacctcaggttatttctctccctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATACATC----------C----------TCA---TAC----------TTTC--TCTCC---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------C-------C-------T--C---------C---------C---------------------
gi|42 : ttctcGAT--TACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAcc
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): TGACAAATATTTTAATAGTTCGTTTTAAGTTATCATAC
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gi|14 : g--T-A---ACGTT-TTAT-----GTCT-C-A---AGAATGGCGTTA---AATGTTGC-------------------AA----C----CGACGCTAAtaacgttttatgtctcaagaatggcgttaaatgttgcaaccgacgctaagtttcgcaaaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|14 : gtatgccaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaatgtcgtaacCGTT-AAAT-----GTTG-C-AA--C---CGACGCTA---AGTTTCGC-------------------AAgtttcgcaaaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|14 : gtatgccaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaatgtcgtaactaacgttttatgtctcaagaatggT-ATAT-----GTCG-C-AAACC---CAACGCTA---AATGTAGC-------------------ACT--GT----TCTTATCAACGaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaatatatgtcgcaaacccaacgctaaatgtagcactgttcttatcaacgtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|15 : gtatgccaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaatgtcgtaactaacgttttatgtctcaagaatggcgttaaatgttgcaaccgacgctaagtttcgcaaaatcatctgccgtttagggttgcaacattttaacgaccaaCACAGGT-----GACCAATATAGTGAGTCGTTTAATGT---------TCAGCTTGGGTGGGCCACCATCATATACTTTCTCATATATCC----------TCA---TAC----------ACTC--TTTCC---------------------T------CAGGTT---------GCATC--------------C-------CACCCAG-C--C---------C---------CCACCCTGACCCCCA-------A----T-AATTAAAACGCTCCTACACCAG---TGA-ATAT------------ATTAT----------------ATAC---AAAAACAATtaaaaccatatatagttaagtaa
gi|16 : -----GACCAATATAGTGACCCGTTTNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN----------N----------NNN---NNN----------NNNN--NNNNN---------------------N------NNNNNN---------NN--N--------------NNNNNAATC-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AATTGTAAAGCTCCTACATC----------------------------------AAT-------GAATAC--AAAAC-CAATGATTGTTG---TA-TAAAACAAG-CAC-TGTTGCTAGG-----GTATAT--CACT--CTGTG--G--T-A---Acttttttcagcgcttgtatt
gi|17 : CTGTATCACAGCT-----GACCAACATAGTGACTCTTTTAATGT---------T
gi|18 : AGGTT---------GC--C--------------C-------C-------C--T---------C---------CCCCAATA--------------A----T-AATTAAAAAGCTCCTACACCCA---TGA-ATAT------------ATAATCA-CAAT-------GAATAC---AAAAACAATGAGTTTTG---TA-TTAAACAAG-CAC-TGTTGCTAAG-----GTATAT--CACT--T--TG--G--T-A---ACGTT-AATT-----GTCG-C-A---C---CGACAATA---AATGTCGC-------------------AAC--aaatttaaactgtatctttgcaaacatttaaagaatgcatgaatgtcgacatgtatcgtaaatcaatatttacattagaacaaacaattacaaaaaagaaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaataattatgatttacgg
gi|19 : ---------C---------C---------------------A----T-AATAGAAAAGCTCATACATCTA---TGA-ATAT------------ATGATCA-CAAT-------AAATAC--AAAAA-CAACGAGTGTTG---TA-TTAAACAAA-CAC-TCGTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGTG--G--T-A---ATGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAcgatgttatatg
gi|2 : tgccctcaatccccccaccctccacccccacaacaTGTAACACAGCT-----GACCAATATAGTGACTGTTTTAATGT---------
gi|2 : A---TGA-ATAT------------ATGACCA-CAAT-------GAATAC--AAAAA-CAATAAGTGATG---TA-CTTAACAAA-CAA-TGTTACTAGGTAAGGGTAGAT--CACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AA-ATTGT-------------------ATT--GT----TGCAACCGACGTTAcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataatgaatatatgaccacaatgaatacaaaaacaataagtgatgtacttaacaaacaatgttactaggtaagggtagatcactctgtggtaacgttaaatgtcgcaccgacgctaaaattgtattgttgcaaccgacgttatatgtcgcaacgctgacacc
gi|20 : tgtaacacagctgaccaatatagtgactgttttaatgtcaaatttaaactgtatctttgcaaacattaaagaatgaatgaatgtcgacatataccgtaaaacaccatttacatcaaaacaaacattaacaaagatagaaaaagctgcattcaacatacaaatgaaatattaattataatttacgggctcgtcgcacgggacattattagcattgtttaaataaatactacaaatttcaatgactaatgacgacacaagctcatgagcgcaataT-ACAT-----GCCG-C-A---C---TGAAGCTA---AATGTCGC-------------------Atatgtcgcaacgctgacacc
gi|21 : ggC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------C---------------------A----TTAATTGAAAAGCTTATTCATCCA---TAA-ATAT------------ATGATCA-CATT-------GAATAC--AAAAA-CAATGAGTGTTGTATTA-TTAAACAAG-CAC-TCTTGTTAGG-----ATAGATCACACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGActggtttatcagcgcaaaaatatatatagttaagtaatacaaactttttcaaattcgttagtaatcaccatcactgacacggaaaatggtgtgcggatggctggtgggtgaatggttggtaggtggggtt
gi|22 : ccccccCC---------------------T------CAGGTT---------GA--C--------------C-------C-------C--C---------C---------CTCACCCCCA------------A----T-AATTAAAACGCTCCTGCATCCA---T------------------------------------------AC--AAAAA-CAATAAGTGTTG---TA-TTAAACAAG-CACGTGTTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGCG--G--T-A---ACGTT-AATT-----ATCG-C-A---T---CGACGATA---AATGT
gi|23 : GAAACGCTCCTACACCCA---TGA-ATAT------------GTGATCA-CAAT-------GAATAC---AAAAACAGTGAGTGTTG---TA-TTAAACA----------------G-----ATAGAT--CGCT--CTGTG--GTTT-A---ACGTA-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTA---AATGTCGC-------------------AAC--GC----TGACACTTACGCTA
gi|24 : C--T--------------C-------C-------C--C---------C---------A---------------------A----T-TACTAAAACGTTTCTATAACCA---TGA-ATAT------------ATGATTA-TAAT-------G------------------AGTGTTG---TA-TTAAGCAAG-CTC-TGTTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTTTG--G--T-A---ACATT-AATT-----GTCG-C-A---C---Ca
gi|25 : ccccccccccccctcccA-ATAT------------ATGGTCA-CAAT-------GAATAT--GAAAA-CAATGAGTGTCG---TA-TTAAACAAG-CAC-TGTTGCTAGG-----GTAGAT--CACG--CTGTG--G--A-A---AC-TT-------------------------------TA---AATGTCGC-------------------AAC--GC----TGACACCAACGCTA
gi|26 : tgatgagcgcaataacaTGTG--A--C-A---ACGTA-AAAG-----GTCG-C-A---C---CAATGCTA---AATGTCGC---------------------------------CACTAACGTTAa
gi|26 : ttaatcaacttcttaaaaatgTGTG--G--C-A---ACGTT-GAAC-----GTCG-C-A---C---CGAAGCTATTTAACGTCtataccgcaagactgacgttaaatagcttcggtgcgacgttcaacgttgccacaatca
gi|27 : ttaatcaacttcttaaaaatgtgtgacaacgtaaaaggtcgcaccaatgctaaatgtcgccactaacgttatataccgcaagactGTATCACAGGT-----GACCAATATAGTGACTCGTTTAATGT---------TCAGGTAAGGTTGG---CCAGCATATTTGTT----------C----------TCA---TACATCATCATATACTC--TCCCT---------------------T------CAAATT---------GC--C--------------CCTAA---C-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AAatca
gi|28 : T-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TAAGGTAAAGTGGG---CCAGCATATACTTTCTCATACATCC----------TCA---TAC----------ACTC--TCTTC---------------------T------CA-------------GC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------C---------------------a
gi|29 : AATAC--AAAA-ACAATGAGTGTTG---TA-TTAAACAAG-CAC-TGTTGCTAGG-----G----------T--CTGCG--G--T-A---ACGTTAAAAT-----GTCA-C-A---C---AGACGCTA---AATGCCGC-------------------AAC--GC----CGACACCAACGCcccccccccccccccccc
gi|3 : TAC--AAAAA-CGGTGAGTGTTG---TAGTTAAA----------GTTGTGAGG-----GTATAG--CGCTAAATGTC--A--C-ACCGGCGTT--AAT-----GTCG-CAA---C---CAACGTTA---TACGTCGC-------------------AGT--GC----TGGCACCAg
gi|30 : g---------TCATGTTGGATGGG---CCAGTATATACTTTGGCCTT----C----------CCAA--TATTTT-------ACTC--TTTCC---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------C-------C-------C--C---------CACCCTCCCCC---------------------AAA--T-AATTGAAACACTCCTACGCCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcactatatgtcgcaagatttgcaccaacggtatatatatcgcaaccaaaactcttaatatcgaacggttttatcagagcaaaacatgtattatagctaagtatcataatcatcatcaaattcagtagtaatcaccattcttgacaatgaagtgcgtggagggatggggagggtggggt
gi|31 : ------------ATGATCA-CAAT-------GAATAT--AAAAA-CAATGTGTGTTG---TA-TTAAACAAA-CAC-TGCTGCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGTGGTG--T-A---CCATT-AAAT-----GTCA-C-A---C---TGAAGCaa
gi|32 : c----T-AAATGAAAAGGTATTGCATCTA---TCA-ATAT------------ATGATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAAa
gi|32 : --CACC--CTGTG--G--T-T---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAgaagcaccctgtggttacgttaaatgtcgcgtcgaaaccgac
gi|33 : taaatgaaaaggtattgcatctatcaatatatgatcacaatgaatacaaaaagaagACAGGG-----GACCAAAACAGTGACCCGTTTAAAGT---------TCAGGTAAGGT-AG---CCAGCATATCATTG----------C----------TCA---TAC----------ATCC--TCaaccgac
gi|34 : ---TGC----------ACCCCTTCCCC---------------------T------CA--------------C--C--------------A-------T-------C--C---------C---------C---------------------AA---T-AACTGAAACGCTCCCACGCCCA---TGatacactctcctta
gi|35 : cCA---TAC----------ACTC--TCTCA---------------------T------CAGGTTGGGCTCACCGC--C--------------C-------C-------C--C---------C---------CCCCCCTCCCCACCACACCCCAA----T-AATTGAAACGCACCTACccaaaacaacatgagtttttttttaaaaaa
gi|36 : AACAATGAGTGTTG---TA-GTATACAAA-CAC-TGTTCCTAGG-----G----------T--CCGTG--G--T-A---ACGTTAAAAC-----GTTG-C-A---------ACGCTG---A
gi|37 : CGTT-AAAT-----GTCT-C-A---C---AGACGCTA---AACGCCGC-------------------AAC--ca
gi|38 : gtaggctaagaatGTTCCAAAGGT-----GACCAATATCGTGATCCTTTTAATGG---------TCAGGTAAGGTGGG---aaacgttatacactc
gi|39 : GTGGA---C-AGCATATACTTT----------T----------TCA---TAC----------ATCC--TC
gi|4 : aaggaCACA--T-----GACCAATACACTGACCCGTTTAATGT---------TCAGTTAAGGCGGA---CCAGCATATATTTTCAC-------C----------TCAGGTTAT-----------TTC--TCTCC---------------------atatactctct
gi|4 : GCTCACACATCCA---TGA-ATAT------------ATGATCA-CAA-------------------AAACAATGAGTGTTG---TA-TTAAACAAA-CAC-TGTTGCGAGG-----GTACAT--CACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAATCCCGAGTCGAA-A---C---CGActcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcacacatccatgaatatatgatcacaaaaacaatgagtgttgtattaaacaaacactgttgcgagggtacatcactctgtggtaacgttaaatcccgagtcgaaaccga
gi|40 : cacatgaccaatacactgacccgtttaatgttcagttaaggcggaccagcatatattttcacctcaggttatttctctccctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATACATC----------C----------TCA---TAC----------TTTC--TCTCC---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------C-------C-------T--C---------C---------C---------------------
gi|42 : ttctcGAT--TACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-G---T---CGAcc
gi|43 : CTGTTCCACAGGT-----GACCAATATAGTGATCCGTTaac
gi|5 : cGTACCACAAGT-----GATCAATATAGTGACCCATTTNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN----------N----------NNN---NNN----------NNNN--NNNNN---------------------N------NNNNNN---------NN--NNNNNNNNNNNNNNAC-------C-------A--C---------C---------A---------------------A----T-AATTAAAACGCTCCTACATCCA---TGA-ATAT------------GTGATCA-CAAT-------GAATAC---AAAAACAATGAGTGTTG---TA-TTGTAAAA----------GCTAGG-----GTAGAT--AACT--CTGTG--G--T-A---ACGTT-GGTT-----GTCG-C-A---T---CAACGCTA---AATGTCGCAACCGACGTTATATGTCGCAAC--GC----TGACACCAACGCT
gi|6 : CTGTACCACAGGTCCACAGACCAATATAGTGACCCGTTTAATAT---------TCAGGTTAGGTTGG---CCAGCATATACTTT----------C----------TCC---TTC----------TCCC--CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCT------CA---C---------GC--C--------------C-------C-------T--T---------C---------C---------------------AAAA-T-AATTAAAA-GTTTCTACACCTA---AGA-ATAT------------ATGATCA-CAATTAGTAATGAATA-----AAAACAATGAGTGTTG---TA-TTAAACAAG-CAC-TGTTGC-AGG-----GTAGAT--CACT--CTGTG--G--TAA---ACGTT-AAAT-----GCCG-CAA---C---CGA
gi|7 : CTGTACCACATGT-----GACCAATATAGTGACCCGTTTAATGT---------TCAGGGTTGGTGGA---CCAGCATATACTTT----------C----------TCA---CAC----------ACTC--TCTCA---------------------T------CAGGTT---------GC--C--------------T-------T-------C--C---------C---------C---------------------A----T-AATTGAAACGCTCATTCACACA---GGA-A-----------------GATCA-CAAT-------GGATAC--AAAAAACAATAAGTGTTG---TA-TTAAAGAAC-CAC-TGTTGGTAGG-----GTAGAT--CTCG--CTG-G--G--T-A---ACGTT-AAAT-----GTCG-C-A---C---CGACGCTT---AATGTCGC-------------------AAC--GC----TGACTCTAACGCTA
gi|8 : GTACCACAGGT-----GGCCAAAATTGTGACCCATTTAATGT---------TCAGGTAAGGTTGG---TCAGCATAAACGTT----------CTCAAACATCATCA---TAT----------ATTC--TCTCC---------------------T------CAGGTT---------AC--CA-------------C-------CACCCCAAC--C---------C---------C---------------------A----T-AAATGAAAAGCTTTTTCATCCA---TGA-ATAT------------ATGATCC-CAAT-------GAATACAAAAAAAACCATGAGTGTTG---TA-TGAAACAAA-CAC-TCTTGCTGGG-----GTAGAT--CA----CTGTA--G--T-A---ACATT-AAAT-----GTCG-C-G---C---CGA
gi|9 : CTGTACCACAGGT-----GGATAATATAGTGACCCGTTTaaccga
gi|9 : GCTCTTATATCCA---TGA-ATAT------------ATGATCA-CAAT-------GAATAC--AAAAG-CAATGAGTGTTG---TA-TTAAACAAG-CAC-TGTTCCTAGG-----GTAGAT--CACT--CTGTG--T--T-A---ACGTT-AAAT-----GCCG-C-A---C---CGACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatctcatcaataatagctcttatatccatgaatatatgatcacaatgaatacaaaagcaatgagtgttgtattaaacaagcactgttcctagggtagatcactctgtgttaacgttaaatgccgcaccgaca
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Unaligned ( gi|41 ): TGACAAATATTTTAATAGTTCGTTTTAAGTTATCATAC