lowQualScore : 11111111111 99999999999999999999999999999 11 11111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222 222222222222222222 1 1111 111111111111111 3333333333333333333333333333 1 11111111111 1111 111111111111111 11111111 1 44444444444444444444444 11111111 1 111
lowQualScore : 44 44444444444 22 11111111111111111111111111111 1 1 9999999999999 1 2 99 6 4444444444 0 111 00 1 5 2 2 1 5 1 1 1 0 1 1 1 7 111 88888888888888888888888888888 333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777 33 0 333333333 0 222222222222222222 2 11 1 11 0 2 0 111 77 111 1 2 00 111 55 1 0000 1 33 2 55 0 0 2 3 0 111111111111111 444 0 55 33333333 1 8 4444444444444444444444444444 111 0 44444444444444 22 0 22222222 222222222 22 3333 0 0 33333333333 6 111 77 4 22222222222 0 3333333333 111 0 1 4444 4444 222 333 0 777777777777777777 777777777777777 0 0 4 44 88888888 33333 11 2 0 1 0 1 1 1 9 111 4444444444 2 77 00000000000000000000000 111 00000000 11 777777777777777777 0 1 2 3 3 3 2 33 777 9 2 555 222 99 1 888 33 4 4 3
lowQualScore : .. ........... .. ............................. . . ............. . . .. . .......... . ... .. . . . . . . . . . . . . . . ... ............................. ......... ............................................... .. . ......... . .................. . .. . .. . . . ... .. ... . . .. ... .. . .... . .. . .. . . . . . ............... ... . .. ........ . . ............................ ... . .............. .. . ........ ......... .. .... . . ........... . ... .. . ........... . .......... ... . . .... .... ... ... . .................. ............... . . . .. ........ ..... .. . . . . . . . . ... .......... . .. ....................... ... ........ .. .................. . . . . . . . .. ... . . ... ... .. . ... .. . . .
lowQualScore : 11 00000000000 44 77777777777777777777777777777 3 3 5555555555555 3 0 33 0 6666666666 1 888 22 1 3 1 9 0 9 0 0 0 9 0 0 0 2 777 66666666666666666666666666666 333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222 99 8 000000000 7 000000000000000000 1 00 4 00 2 1 7 222 11 222 9 3 99 222 66 4 8888 5 88 1 99 7 7 3 6 7 222222222222222 666 7 33 44444444 6 8 9999999999999999999999999999 222 7 00000000000000 33 0 55555555 666666666 88 4444 7 7 33333333333 6 333 22 4 66666666666 7 2222222222 333 8 6 1111 9999 444 555 8 555555555555555555 000000000000000 4 8 2 55 55555555 22222 33 9 9 8 9 8 0 7 3 666 3333333333 0 99 33333333333333333333333 888 77777777 77 666666666666666666 5 0 0 3 4 2 2 66 444 9 7 000 777 66 8 666 66 0 0 9
consensus : TTGAACTCCTTAG-AG----------GCTCCTT--AGTG----GT----T-AG-TG----------C-CC-C-TTTG----------AA-CTC-CTNAGTGG----------CCCC---TTA-GT-G-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CC-TNA---G-NG---GC-T---C-------C-------TT---------AGTG-N-----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-N-C-TT--T-GA--ACT-C-C---TN-A---GTGGCT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-G-AGAC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CNTTT-T-----AA---C-----N---------CC---TTA-G--------------T--GNC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--T-CCTN----------A-G----------TG---CC-C-CN---TTT-T--A---AC--C-C------------------CT----N----------AGTG-G-TCC-TTAGTG--G-C-N-C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGTGGCTC---CTTA----------GT-G-CCCC---T--GT--AA------C--CCC---TTAGAGG---CCCCTT-AG------------------TGG-TCCTTAGT-G-C-C-C-C--TTTG--AACCCCTTAGTGGCTCCTT---AGT---G--C-CC-CTTT-GAA-C-TCCTTAT
Reference ( gi|11 ) : TTGAACTCCTTAG-AG----------GCTCCTT--AGTG----GT--TAT-AA-TG----------C-CC-C-TTAG----------AA-CTC-ATAAGTGG----------CCCC---TTT-GT-G-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CC-TAA---G-AG---GC-T---T-------T-------TT---------AGTG-G-----------C--AC-----T--TTA-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACT-C-C---TA-A---GTAGCT--CC---TTAA-T-G----C-C--C-C--T-TT-GAACTCCCTA-G-AGAC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CATTT-T-----AA---C-----A---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GCA---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CA---TTT-T--A---AT--C-C------------------CT----A----------AGTG-G-TCT-TTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CATT-AGTGGCTC---CTTA----------GT-G-TCCC---T--GT--AA------C--TCC---TTAGAAG---CTCCTT-AG------------------TGG-TCCTTAGT-G-C-C-C-C--TTTA--AACTCATTAGTGGCTCCTT---AGT---G--C-CA-ATTT-GAA-C-TCTTTAT
gi|12 : TTGAACTCCTTAG-AG----------GCTCCTT--AGTG---------------------------C-CC-CATTTT----------AA-CTC-CTTAGTGT----------CCCC---TTT-GA-A-C-C-C-C-T-T-A-G-TA-GA-CC-TAA---G-TG---CC-CCA-T-------T-------TT---------AAT------------------C-----C--CTA-------A----------GTGGTC-TT---------TAG-TG--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACT-C-A---TT-A---GTGGCT--CC---TTAG-T-G----T-C--C-C--A-TT-TAACTCCTTA-G-AGGCTCCTTAGTGGTCCTT---AGT-G-CC--------C-C--TT-T-----AAACTC-----ATTAGTGGTTCC---TTA-GTGCCNNNNNNNNNNT--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--T-CTTA----------A-G----------TG---CC-C-CG---TTT-T--A---AC--C-C------------------CT----T----------TTTG-G-TCC-TTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CATT-AGTGGCTC---CTAA----------AT-G-TCCC---T--TTG-AA------C--ACC---TTAGA
gi|7 : tgaactcctaagtagctccttaatgcccttTTAAACTCCT-AC-AG----------GCTC-TT--AGTG----G------------------------CA-C-TTTG----------AA-CCC-CTAAGTGG----------CTCC---TTA-AT-G-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CT-TTA---G-AG---GC-T---C-------C-------TT---------AATGTC-----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--CC-CT---------TAG-TA--G-----------------------------T-C-C---TA-A---GT-GCC--CCATTTTAG-T-G----G-C--A-C--T-TT-GAACTCATTA-A-TGGC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CA-TT-G-----AC---C-----T---------CC---TAA-G--------------A--GGC--------TCCT---------T--T---------------------------GTG---G--T-CCTT----------A-G----------TG---GC-A-C----TTT-G--A---AT--T-T------------------AT----A----------AGTG-G-Tg
gi|19 : cctgagtgcccctTTGAACTCCTAAG-AG----------GCTCCGT--AGTG----G------------------------CA-C-TTTG----------AA-CTC-TTAAGTGG----------CTCC---TTA-AT-G---C-C-A-G-T-T-G-AA-CT-CC-TTA---G-AG---GC-T---C-------C-------TT---------AGTG-C-----------C--CC-----T--TT--------------------T--TCACT---------TAA-TG--G-----------------------------T-C-C---TG-A---GT-GT--------------------C-C--C-C--T-TT-GAAACCTTTA-GTAG------------TCCTA---AGT-G-CC--------C-CATTT-T-----AA---tcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|15 : tagtgcccccccctTTGACCTCCTAAG-AG----------GCTCCTT--TGTG----GT--CCTTAG-TGGCACTTTGAAC-TC-C-TTAGTGGCACTTTGAA-CTA-ATAAGTGG----------CTCC---TTA-GT-G-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CA-TTA---G-AG---GC-T---C-------C-------TT---------TGTG-G-------------------------------------------------TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-A-G-TT--T-GA--ATT-C-C---TA-A---GAGGCT--CC---TAAG-T-G----G-C--A-C--T-TT-GAAC
gi|3 : gcactttgaactcattagtggctccttagtgcccccaTTGAACTCCTTAG-TG----------TCCCCTT----TG------------AA-------------C-CC-C-TAAG----------TA-GTC-TTAAGT-G----------CCCCATTTTT-TT-A-C-C-C-C-T-T-T-G-A----------------------C-T---T-------C-------TT---------AGTG-G-----------T--AC---------TA-------AGG--------GG--TC-CT---------TAG-TG--GC----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TA-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-AT---C-C--T-C--A-TT-TAACATCTTA-A-GGGC----------CCCTTTGCAGT-A-CC--------ct
gi|1 : ctTTGAATTCCTTAG-TGCCCACTTTCAACTCCTT--AGTG----C----------------------C-CC-C-TTTT----------AA-CCC-CTTAGAGA----------CTCC---TTA-GT-G-C-CCC-C-T-T-T-A-AA-C--CC-TTA---G-AG---AC-T---C-------C-------TT---------AGTA-G-------------------------------------------------TC-CT---------TAG-TG--GC----------C-A-C-TT--T------CT-T-T---GA-A-------CC--CC---TTAG-T-GT---C-C--C-C--T-TT-TAATCCCTTA-G-TGAC----------CCCTTTGCAGT-A-CC--------tagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|4 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttTTAAACTCCTTAGTAG------------TCCTT--AGTG----------------C----------C-CC-C-TTTT----------AA-CCC-ATTAGAGA----------CTCC---TTA-GT-GAC-T-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TTA---G-TA---GC-----C-------C-------TT---------AGTGTC-----------C--CC-----T--TTT-------A----------AT--CC-CT---------TAG-TG--AC----------C-C-C-TT--T-GG--AGTAC-C---TA-tagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : tagtgcccactttttaccactTTTAACTCCTTAG-TG----------GCTCCTT--AGTG----GTACT-T-AG-TG----------G-TC-C-TTAG----------gtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|20 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgcttagtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtccttagtgccccctTTGAACGCCTAAG-TG----------ACTCTTT--AGTA----GTC-TTT-AG-TGG---------T-CC-C-TTTG----------AA-C-----------------------CC---TTTAGT-G-T-C-CTC-T-T-T-T-AA-CC-CC-TAA---G-AG---GC-T---C-------C-------TT---------AGTG-----------------------------------------------AC--CC-CT---------TTG-CA--G-----------T-A-C-CT--A-GA--GCT-T-T---TT-A---GTTG-T--CT---CTAA-T-tggcatttagtagg
gi|34 : accccttagtagtccttaatgaccctTTGAACTCATTAG-TG----------GCTCCT-----------------T-AA-TG----------T-CC-C-TTTT----------AA-CTC-CTTAGAGG----------CTCC---Ttggaac
gi|32 : tcctTTGAACTCACTAG-AG----------GCTCCT
gi|30 : gtagtcataagtaccccattttaacccttagttgcactTTGAACTCCTTAG-TG----------G-TCCTT--AGTGCCCCCT--T-T-GA--A----------C-CT-C-TTAG----------TA-GTC-CTGAGTGG----------C
gi|36 : cctTTGAACTCCTTAG-AG----------GCTCCTT--AGTG----tattagttggacc
gi|5 : ggtccttagtgcccctAACCCCTTTG-AG----------ACTTCTT--AGTG----GT-------------------------------------------A-C----TAAGGGG----------TC-C---TTA-GT-GGC-C-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TAA---GTAG------T---C-------C-------TT---------AGT--A-----------C--CC-----TCATTT-------A----------AC--CT-CT---------TAG-TG--AC----------C-C-C-TT--T-GC--AGTAC-C---T--A---GTGCCT--TT---TTGT-T-G----T-C--C-T--T-
gi|9 : ttAACCCATTGGTAG------------TCCTT--AGTG----CT-----------------------CC-C-TTTG----------AA-CCC-CTTAGTGG-----------TCC---TAA-GT-G-C-C-C-C-C-T-TAG-AA-Caataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|16 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTCCTTAG-TG----------ACCCCTTTGAATC----CC--T-T-AG-TG----------C-CCAT-TTTG----------AA-ATC-ATAAGTAGTCCTTCGTGCCCCC---TTT-GT-G-G-C-C-C-T-T-A-G-TA-GT-TC-TAA---G-TG---GC-T---A-------T-------Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagTCTTTTG-TG----------ACTCTTT--TGTG----GT------------------------C-T-TTAG----------TA-ATC-ATAAGTAC----------CACT---TTT-GT-G-G-T-C-C-T-T-G-G-AA-GT-CC-TTA---G-TGACAGC-T---TTGTTGTAT-------TT---------AGTG-agcagggcccg
gi|30 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaatagaagtccttagtggcagctttgttgtactgagtggCCTTTG-AA-----------CTCCTT--AGTG----GT------------------------C-C-TTAG----------------------TGC----------CCCC---TTT-GA-A-C-C-T-C-T-T-A-G-TA-GT-CC-TGA---G-TG---GC-----T-------A-------TT---------AGT
gi|9 : CCTTTG-AA-----------CCCCTT--AGTG----GT--CCT-AAGTGC---------C-CC-C-TTAG----------AA-Ctggacc
gi|21 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctcG-AG----------ACTTCTT--AGTG----GT-------------------------------------------A-C----TAAG-GG----------GTCC---TTA-GTGG-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-TC-CT-TAA---GTAG------T---C-------C-------TT---------AGT--A-----------C--CC-----TCATTA-------A----------AC--CT-CT---------TAGTTA--C-----------C-C-C-TT--T-GC--AGTAC-C---T--A---GTGCCT--TT---TTGT-T-G----T-C--C-C--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|24 : tatgtgccccattttaaccacctG-AA----------ACCCCTT--AGTA----GTACT-T-AG-TGC---------C-CC-C-TTAG----------CATCCC-AT-AGTGG----------Caatag
gi|23 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatG-AA----------ACCCCTT--AGTG----------------A----------C-CC-C-TTTG----------AA-CCC-CTACGTGA----------CTCC---TTttttagtaggacccgaatct
gi|2 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatCTCCTT--AGTG---------------T-----------C-CC-C-TTTG----------AA-CCCCATA-GTAG----------TCC----TTA-GT-G-C-C-C-CAT-T-T-T-AA-CC-CA-TTT---G-AG---AC-T---T-------C-------TT---------AGTG-G-----------T--AC-----T----A-------AGG--------AG--TC-CT---------TAG-TG--GC----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TT-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-A----C-CTTC-A--T-TT--AACCTCTTA-G-TGAC----------CCCTT---ataggcatttagt
gi|10 : tgcaCTT--AGTA----GT--CCTTAG-TG----------CTCC-C-TTTG----------AA-CCC-CTTAGTGG----------TCC----TTA-GT-G-C-C-C-CCT-T-T-T-AA-CT-CC-TTA---G-TG---GC-T---C-------C-------TT---------AGTG-G-----------T--AC-----T--TAG-------T----------GG--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-A-T-TT--tgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|13 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgT--TAT-GA-T--------------C-T-TTAG----------TA-GTC-CTAAGTGC----------TTCT---TTT-GT-A-G-T-C-C-A-T-G-A-AA-GT-CC-TTA---G-TG---ACAT---C-------T-------TTGTTGTATTAAGTG-G-----------T--CC-----T--TTA-------T----------GCA-TA-TT---------TTG-TG--G-----------T-----TT--T-GAGTACT-C-C---TA-A---GTACCT--TC---TTTG-T-G----G-T--C-C--T-TG-GAAGTCACTA-G-TGAC----------AGCTT---TGT---------------CATAT---------------------------------TTA-G--------------T--G-G--------TCCT---------T--T----G-T-GGTCTTTA-----------GTA---G--T-TCTA----------A-G----------TG---CC-T-C----TTT-TGGG---GT--C-T------------------TTGG--A----------AGTACG-TCT-T--GTG--G-T-A-C-----T--TG-G-A-AG-T-CTTT-AGTGACAG---CTT------------T-G-T------T--GT--A----------------TTA--------------AG------------------TGG-TCCTTTGT-G-agtagg
gi|2 : tagtggtcctttggtcctctt--TAT-GA-AA----------C-CC-C-TTAG------------------TAA----------------TC---TTTAGT-G-CTC-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TTA---G-TG---G--T---C-------T-------TT---------AGTGCC-----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--G-----------T-A-C-TT--A-GT--AGT-C-C---TT-A---GTGGC---AT---TTAG-T-AGGACC-C--C-C--T-TA-GGAGTCCTTA-G-TGG-----------TACTT---AGT-G-GT--------C-CTTAG-T-----GG---C-----A----------T---TTA-G--------------TAGGAC--------CCAT---------T--TG---G-A-ACACCTCA-----------TCAATTA--T-CCTA----------A-G----------T
gi|9 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaa--TAT-GA-AA----------C-CC-A-TTGG----------TA-GTC-CTTAGTGC----------TCCC---TTT-GA-A-C-C-C-C-T-T-A-G-TG-GT-CC-TAA---G-TG---CC-C---C-------C-------TT---------AG
gi|36 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaaT-AG-TG----------C-CC-C-TTTG----------AA-CTC-CTTAGAGG----------CTCC---TTA-GT-G-aacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|4 : ggtcct-TA----------C-CA-C-TTTA----------AA-CTC-CTTAGTAG----------TCC----TTA-GT-G-C-C-C-CCT-T-T-T-AA-CC-CA-TTA---G-AG---AC-T---C-------C-------TT---------AGTG-A-----------CT-CC-----T--TTG-------A----------AC--CC-CT---------TAG-TA--G-----------C-C-C-TTAGT-GT--CCC-C-T---T------TTAATC--CC---TTAG-T-GA---C-C--C-C--T-TT-GGAGTACCTA-G-TGCC----------TTTTT---TGT-
gi|34 : tagtgcccacttttC-C-TTTG----------AA-CTC-ATTAGTGG----------CTCC---TTA-AT-G-T-C-C-C-T-T-T-T-AA-CT-CC-TTA---G-AG---GC-T---ctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|30 : tC-C-TTTG----------AA-CTC-CTTAGTGG----------TCC----TTA-GT-G-C-C-C-CCT-T-T-G-AACCT-CT-TAG---T-AG------T---C-------C-------TG---------AGTG-G-----------C--cct
gi|15 : -C-TTTG----------AA-CTC-ATTAGTGG----------CTCC---TTA-GT-G-C-C-C-C-CAT-T-G-AC-CT-CC-TAA---G-AG---GC-TCCTT-------TGTGGTCCTT---------AGTG-G-----------C--AC-----T--TTG-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACT-A-A---TA-A---GTGGCT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-C--T-TT-GAACTCATTA-G-AGGC----------TCCTT---TGT-G--------------GT------------------------------CC---TTA-G--------------T--G-G--------CAGT---------T--T----G-A-ATTCCTAA-----------G-A---GGCT-CCTA----------A-G----------TG------G-CA---CTT-T--G---AA--C-C------------------tattagttggacc
gi|23 : gca----------AA-CCC-CTTAGTGA----------CCCC---TTT-GA-A-C-C-C-C-T-A-C-GTGA-CT-CC-TTA---T-AG---GC-----A-------T-------TT---------AGTt
gi|37 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga----------AA-CTC-ATAAGTAG-----------TCC---TTA-GT-G-C-CTT-C-T-T-T-G-
gi|19 : AGTG-----------CCCC------------C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CC-TAA---G-AG---GC-T--------------------------------------------------------------------------------------C-CG---------TAG-TG--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACT-C-T---TA-A---GTGGCT--CC---TTAA-T-G----C-C--A-G--T-T--GAACTCCTTA-G-AGGC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CTTTT-T-----CA---CTTA--ATGGT-----CC---TGA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-AACCTTTA-----------GTA---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CA---TTT-T--A---Atggtcc
gi|10 : tAGTAG----------TCC----TTA-GT-G-CTC-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TTA---G-TG---G--T---C-------C-------TT---------AGTG-C-----------C--CCC----T--TTT-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-T-C-CT--TAGT--GGT-A-C---TT-A---GTGG-T--CC---TTAG-T-G----
gi|20 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgcttAGTAG----------TCC----TTA-AT-G-A-C-C-C-T-T-T-G-AA-CG-CC-TAA---G-TG---AC-T---C-------T-------TT---------AGTA-GTCTTTAGTGGTC--CC-----T--TTG-------A----------AC--CC-TT---------TAG-TG--T-----------C-CTC-TT--T-TA--ACC-C-C---TA-A---GAGGCT--CC---TTAG-T-GA---C-C--C-C--T-TT-GCAGTACCTA-G-AG-C----------TTTTT---AGT-gcatttagtagg
gi|17 : accccttGTGA----------CTCT---TTT-GT-G-G-T-C-T-T-T-A-G-TA-AT-CA-TAA---G-TA---CC-A---C-------T-------TT---------TGTG-G-----------T--CC-----T--TGG-------A----------AG--TC-CT---------TAG-TG--A-----------C-AGC-TT--T-Gtgtctctaattggaac
gi|17 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaatagaagtccttagtggcagctttgttgtactgagtggtcttttGTGC----------CTCT---TTT-GT-G-G-C-C-T-T-TAT-T-AG--T-CC-TAA---G--T---AC-T---T-------C-------TT----------GTG-AT----------C--AA-----T----AG------A----------AG--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-AGC-TT--T-GT--TGT-A-C---TG-A---GTGG-T--CT---TTTG-T-GA---C-T--C-T--T-TT-GTGGTCTTTA-G-TAA-----------TCATA---AGT-A-CC--------A-C-TTT-T-----G--------------------------TG-G--------------T--------------CCT---------T--G----G-A-AGTCCTTA-----------Gttgtatttagtg
gi|2 : gcctccttt----------CTCC---TTA-GT-GTC-C-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CCATAG---T-AG------T---C-------C-------TT---------AGTG-C-----------CCCAT-----T--TTA-------ACCCATTTGAGAC--TT-CT---------TAG-TG--G-----------T-A-------------------C---TA-A---GGAG-T--CC---TTAG-TGG----C-C--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-GTAG------------TCCTT---AGT-A-CCT-------T-CA-TT-T-----AA---C-----C---------TC---TTA-G--------------T--GAC--------CCCT---------T--T----G-tgacagctttgttgtatttagtg
gi|3 : tgca----------CTCC---TTA-GT-GTC-C-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TAA---GTAG------T---C-------T-------TA---------AGTG-C-----------C--CCATTTTT--TTACCCCTTTG----------AC--TT-CT---------TAG-TG--G-----------T-A-------------------C---TA-A---G-GGGT--CC---TTAG-TGG----C-C--C-C--T-TT-GAAC-CCCTA-A-GTAG----------TCCTT---AGT-ATCC--------T-CA-TT-T-----AA---C-----A---------TC---TTA-A--------------G--GGC--------CCCT---------T--T---------------------------GCA---G--TACCT-----------A-G----------TG---CC--------TTT-T--cagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|23 : ctttgaa----------CCCC---TTA-GT-GAC-C-C-C-T-T-T-G-AA-CC-CC-TAC---G-TG---AC-T---C-------C-------TT---------ATAG-G-----------C--AT-----T--Ttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|8 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaCC---TTA-GT-G-C-CCC-C-C-T-T-T-AA-CC-CC-TTA---G-CA---CC-T---C-------C-------TT---------AGAG-A-----------C--TC-----A--TTA-------GT---------AG--TC-CT---------TAG-TG--G-----------C-CTC-CT--T-GA--ACC-C-C---TT-A---GTAG-T--CC---TAAG-T-G----C-C--C-CCTT-TT-AAACCCCTTA-G-AGAC----------TCCTT---AGT-G-TC--------C-C--CT-T-----AG---T-----AGT-------CC---TTA-G--------------T--GCC--------CCTT---------T--T----T-A-AC-----N-----------NNN---N--N-NNNN----------A-G----------TG---TC-C-CC---TT---------------------------------------------------AGTA-G-TCC-TTAGTG--G-C-T-C-----C--TTTG-A-AC-C-CCTT-AGTAG-TC---TTTA----------GT-G-CCCC----------------------CC---TT-TAAA---CCCCTT-TG------------------CAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTTagt
gi|36 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtCC---TTA-GT-G-C-C-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CC-TTA---G-AG---GC-T---C-------C-------TT---------AGTG-gttgtctg
gi|35 : ggtC---TTA-GT-G-C-C-C-CCT-T-T-T-AA-CC-CC-TAA---G-AG---
gi|21 : ttattttgatttaggcagctgatT-GT-G-C-C-C-CAT-T-T-T-AA-CCACC-T-----G-AG---AC-T---T-------C-------TT---------AGTG-G-----------T--AC-----T----A-------A----------GGGGTC-CT---------TAG-TG--GC----------C-C-C-TT--T-GA--ATC-C-T---TA-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-A----C-C--CTC--A-TT-AAACCTCTTA-G-TTAC----------CCCTTTGCAGT-A-CC--------aa
gi|6 : ta-C-C-T-T-T-T-G-AA-TT-CC-T------------------------------------T---------AGTG-C-----------CC-AT-----T--TTC-------A----------AC--TC-AT---------TAG-TG--C-----------C-C-CCTT--T-TA--ACC-C-C---TT-A---GAGACT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-C--T-TT-TAAC-CCTTA-G-AGAC----------TTCTT---AGT----------------AGT-----------------------------CC---TTA-G--------------T--GGC--------CTCT---------T--TCTTTG-A-ACCCCTTA-----------GCA---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-T--A---AC--C-C------------------CT----T----------ACAG-A-TTTCTTAGTG--C-C-C-C-----C--TTAG-AGAC-T-CCTT-AGTAG-TC---CTTA----------GTGG-CCCC---T--TTG-AA------C--CCC---TTAGTGG-----CCTT-TG------------------CAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTTtagtgcctttttgttgtccctaatag
gi|1 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C-C-T-T-T-T-G-AA-TT-CC-T------------------------------------T---------AGTG-C-----------CC-AC-----T--TTC-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TG--C-----------C-C-CCTT--T-TA--ACC-C-C---TT-A---GAGACT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-CC-T-TT-AAAC-CCTTA-G-AGAC----------TCCTT---AGTAG-TCCTTAGTGGC-CACTT-TCTTTGAA---C-----C---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----T-A-ATCCCTTAGTGACCCCTTTGCA---G--TACCT-----------A-G----------TG---CC-T-TT---TTT-T--gttgtctgtaata
gi|34 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CA-TTA---G-TG---GC-T---C-------C-------TT---------AATG-T-----------C--CC-----T--TTT-------A----------AC--TC-CT---------TAG-AG--G-----------C-gtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|30 : t-C-C-T-T-T-G-AA-CT-CC-TTA---G-TG---G--T---C-------C-------TT---------AGTGCC-----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--CT-CT---------TAG-TA--G-----------------------------T-C-C---TG-A---GTGGCT--tcct
gi|12 : -T-G-AA-CT-CC-TAA---G-TA---GC-T---C-------C-------TT---------AATG-C-----------C--CT-----T--TTG-------A----------AC--TC-CT---------TAG-AG--G-----------C-T-C-CT--TAGT--GCC-C-CATTT-------TAACT--CC---TTAG-T-GT---C-C--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-GTAGA------------CCTA---AGT-G-CC--------C-CATTT-T-----AA---T-----C---------CC---TAA-G--------------TG-GTCTTTAGTGGCACT---------T--T----G-A-ACTCATTA-----------GTG---GC-T-CCTT----------A-G----------TG---TC-C-CA---TTT-A--A---CT--C-C------------------TT----AGAGGCTCCTTAGTG-G-TCC-TTAGTG--C-C-C-C-----T--TT-A-A-AC-T-CATT-AGTGGTTC---CTTA----------GT-G-CCNN---N--NN--NNNNNTGTC--CCC---TTTGAA----CCCCTT-AG------------------TAG-TCTTAAGT-G-C-C-C-CG-TTTT--AACCCCTTTTTGG-TCCTT---AGT---G--G-CA-CTTT-GAA-C-TCATTAattagttggacc
gi|5 : -AA-CC-CC-TTT---G-AG---AC-T---T-------C-------TT---------AGTG-G-----------T--AC-----T----A-------A----------GGGGTC-CT---------TAG-TG--GC----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TA-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-A----C-C--CTC--A-TT-TAACCTCTTA-G-TGAC----------CCCTTTGCAGT-A-CC--------gtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|22 : ttT-CT-TAACATG-AA---AC-C---C-------C-------TT---------AATG-A-----------CC-AC-----T--TTG-------T----------AG--TC-TT---------CAG-TGTTG-----------C---C-TT--T-GA--ACT-C-C---TT-A---GTGGtagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|4 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaaC-T---T-------T-------TT---------AC---------------C--AC-----T--TTA-------A----------AC--TC-CT---------TAG-TA--GTCCTTAGTGCCC-C-C-TT--T-TA--ACC-C-A---TT-A---GAGACT--CC---TTAG-T-GA---C-T--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-GTAG------------CCCTT---AGT-G-TC--------C-CCTTT-T-----AA---T-----C---------CC---TTA-G--------------T--GAC--------CCCT---------T--T----G-G-At
gi|21 : tagtgccca---T-------T-------TT---------AAC--------------C--AC-----C--TGA-------G----------AC--TT-CT---------TAG-TG--G-----------T-A-C-T--------------------A-A---GGGG-T--CC---TTAG-T-GG---C-C--C-C--T-TT-GAA-TCCTTA-A-GTAG----------TCCTT---AGT-A-CC--------CTCA-TT-A-----AA---C-----C---------TC---TTA-G--------------T---T----------------------------------ACCCCTTT-----------GCA---G--TACCT-----------A-G----------TG---CC-T-TT---TTG-T--T---GT--C-C------------------CT----A----------Agtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|10 : tatgtgcccca-------TT---------AGTG-CT----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--CC-CT---------TAG-TG--GTCCTTAGTGCCC-C-C-TT--T-TA--ACT-C-C---TT-A---GTGGCT--CC---TTAG-T-G-------------------GTACT---TA-G-TGG-----------TCCTT---AGT-G-----------G-CATTT-tag
gi|32 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgcttagtagtcc-------TT---------AGTT-G-----------C--AC-----T--TTG-------A----------AC--TC-AC---------TAG-AG--G-----------C-agtagg
gi|9 : gtagtcataagtaccccattttaaccc-------TT---------AGTG-CT----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--CC-CT---------TAG-TG--G-----------------------------T-C-C---TA-A---GTGCCC--CC---TTAtcct
gi|36 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtcc-------TT---------AGTG-C-----------C--CC-----T--TTG-------A----------AC--TC-CT---------TAG-AG--G-----------C-T-C-CT--T-gaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|16 : ggtcc-------TT---------AGTG-A-----------C--CCC----T--TTG-------A----------AT--CC-CT---------TAG-TG--C-----------CCA-T-TT--T-GA--AAT-C-A---TA-A---GTAG-T--CC---TTCG-T-G----C-C--C-CC-T-TT-GTGGCCCTTA-GTAG------------TTCTA---AGT-G-agtg
gi|14 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagtcc-------TT---------AATG-A-----------CC-AC-----T--TTG-------T----------AG--TC-TT---------CAG-TGTTG-----------C---C-TT--T-GA--ACT-C-C---TT-A---GTGGgctattagcagggcccg
gi|7 : ttaacatgaaacccc---------AGTG-C-----------C--CC-----T--TTA-------A----------AC--TC-CTACAGGCTCTTAG-TG--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TA-A---GTGGCT--CC---TTAA-T-G----C-C--C-C--T-TT-GAACTCTTTA-G-AGGC----------TCCTT---AAT-G-TC--------C-CCTTT-G-----AA---C-----C---------CC---TTA-G--------------T-----------------------------------------------------------A---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CA---TT--------------------------------------------------------------TTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CATT-AATGGCTC---CTTA----------GT-G-CCCCAT-T--G---AC------C--TCC---TAAGAGG---CTCCTT-TG------------------TGG-TCCTTAGT-G-G-C-A-C--TTTG--AATTTATAAGTGGTTCtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|32 : cctg-----------C--AT-----T--TTA-------A--------------CC-CT---------TAG-TT--G-----------C-A-C-TT--T-GA--ACT-CAC---TAGA---G--GCT--CC---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|5 : gtagtcataagtacccC-----T--TTG-------AG---------AC--TT-CT---------TAG-TG--G-----------T-A-C-T--------------------A-A---GGGG-T--CC---TTAG-T-GG---C-C--C-C--T-TT-GAAC-CCCTA-A-GTAG----------TCCTT---AGT-A-CC--------CTCA-TT-T-----AA---C-----C---------TC---TTA-G--------------T--G-----------------------------------ACCCCTTT-----------GCA---G--TACCT-----------A-G----------TG---CC-T-TT---TTG-T--T---GT--C-C------------------TT----A----------A
gi|18 : ttaaccc-----T--TTG-------A----------AT--TC-CT---------TAG-TGT-C-----------C-A-C-TT--T-CA--ACT-C-C---Ttaggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|23 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctA-------A----------AC--CC-CT---------TAG-TG--A-----------C-C-CCTT--T-GA--ACC-C-C---TA-C---GTGACT--CC---TTAta
gi|22 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgA-------A----------AC--CC-CT---------TAA-TG--A-----------CCA-C-TT--T-G---------------------TAG-T--CT---TCAG-T-G----T-TG-C-C--T-TT-GAACTCCTTA-G-taggcatttagt
gi|14 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgA-------A----------AC--CC-CT---------TAA-TG--A-----------CCA-C-TT--T-G---------------------TAG-T--CT---TCAG-T-G----T-TG-C-C--T-TT-GAACTCCTTA-G-tggt
gi|2 : ttaacatg----------AC--TC-CT---------TAG-TGT-C-----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---AT-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-G----C-C--C-CA-T-TT-TAACCCATTT-G-AGAC----------TTCTT---AGT-G--------------GTAC-T-----AA---G-----GAGT------CC---TTA-G--------------T--GGC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TA---CCTT-CA----TT-T--A---AC--C-T------------------CT----T----------AGTG-tggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|10 : tgc--TC-CT---------TAG-TG--CT----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TT-A---GTGG-T--CC---TTAG-T-G----C-C--C-CC-T-TT-TAACTCCTTA-G-TGGC----------TCCTT---AGT-G-acccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgcttagtag--TC-CT---------TAA-TG--A-----------C-C-C-TT--T-GA--ACG-C-C---TA-A---GTGACT--CT---TTAG-T-A----G-T--C-T--T-TA-GTGGTCCCTT-T-GAAC----------CCTTT---AGT-G-TC--------C-TCTTT-T-----AA---C-----C---------CC---TAA-G--------------A--GGC--------TCCT---------TAGT----G---ACCCCTTT-----------GCA---G--TACCT-----------A-G----------AG---CT--------TTT-T--AGTTGT--C-T------------------CT----A----------ATTG-G-gtacttagtggtccttagtggcatttagtagg
gi|9 : accccttagtag--TC-CT---------TAG-TGC-T-----------C-C-C-TT--T-GA--ACC-C-C---TT-A---GTGG-T--CC---TAAG-T-G----C-C--C-C--C-TTAGAACaac
gi|36 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtag--TC-CT---------TAG-TG--C-----------C-C-C-TT--T-GA--ACT-C-C---TT-A---GAGGCT--CC---TTAG-T-G----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|16 : gg--TC-CT---------TAG-TG--AC----------C-C-C-TT--T-GA--A-T-C--------------------CC---TTAG-T-G----C-C--CAT--T-TT-GAAAT-CATA-A-GTAG----------TCCTT---CGT-G-CC--------C-CCTTTGT-----GG---C---------------CC---TTA-G--------------T--
gi|23 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag-TG--A-----------C-A-A-TC--T-TA--A-T-C-T---TA-ATATGAAACC--CC---TTAG-T-GA---C-C--C-C--T-TT-GAAC-CCCTACG-TGAC----------TCCTT---Aagttctaagtggctattagcagggcccg
gi|4 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaac-----------C-A-C-TT--T-AA--ACT-C-C---TT-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-G----C-C--C-CC-T-TT-TAACCCATTA-G-AGAC----------TCCTT---AGT-G-AC--------T-CCTTT-G-----AA---CCCCTTAGTAGC----CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----T-A-ATCCCTTA-----------Gtaggcatttagt
gi|35 : tagtgcccactttttac-A-T-TT--T-GA------T-T---TA-G---GCAGCTGATC---TTAG-T-G----C-C--C-CC-T-TT-TAACCCCTAA-G-AGAtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|34 : tt-C-TT--T-GA--ACT-C-A---TT-A---GTGGCT--CC---TTAA-T-G----T-C--C-C--T-TT-TAACTCCTTA-G-AGGC----------TCCTa
gi|30 : tc-C-TT--T-GA--ACT-C-C---TT-A---GTGG-T--CC---TTAG-T-GC---C-C--C-C--T-TT-GAACCTCTTA-GTAG------------TCCTG---AGT-G-
gi|12 : c--T-GA--ACT-C-C---TA-A---GTAGCT--CC---TTAA-T-G----C-C--C-T--T-TT-GAACTCCTTA-G-AGGC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CATTT-T-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--A-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CA---TTT-T--A---AT--C-C------------------CT----A----------AGTG-G-TCT-TTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CATT-AGTGGCTC---CTTA----------GT-G-TCCCA--T--TT--AA------C--TCC---TTAGAGG---CTCCTT-AG------------------TGG-TCCTTAGT-G-C-C-C-C--TTTA--AACTCATTAGTGGTTCCTT---AGT---G--C-Cgctattagttggacc
gi|10 : A--ACC-G-C---TT-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-G----CTC--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-G-TGG-----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CCTTT-T-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------T--GGC--------TCCT---------T--A----G-T-GGTACTTA-----------GTG---G--T-CCTT----------A-G----------TG------G-CA---TTT-nnnnnnnnnntgtcccctttgaaccccttagtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|9 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaA--ACC-C-A---TT-G---GTAG-T--CC---TTAG-T-G----CTC--C-C--T-TT-GAACCCCTTA-G-TGG-----------TCCTA---AGT-G-CC--------C-CCTTagtagg
gi|37 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaA--ACT-C-A---TA-A---GTAG-T--CC---TTAG-T-G----C-CT-T-C--T-TT-Gagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|38 : ---GTAGT----C---TTAAGT-G----C-CG-C-C--T-TT-GAACTCCTTA-G-tggtcc
gi|16 : ttTAG-T--CC---TTAG-T-GA---C-C--C-C--T-TT-GAA-TC----------------------CCTT---AGT-G--C--------C-CATTT-T-----GAAATC-----ATAAGTAGT-CC---TTC-G--------------T--GCC--------CCCT---------T--T----G-T-GGCCCTTA-----------GTA---G--T-TCTA----------A-G----------TG---t
gi|3 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgtAACT--CC---TTAG-T-GT---C-C--C-C--T-TT-GAAC-CCCTA-A-GTAG----------TCTTA---AGT-G-CC--------C-CATTT-T---------------------------T---TTA---------------------C--------CCCT---------T--T----G---ACTTCTTA-----------GTG---G--T-ACTAAGGGGTCCTTA-G----------TG---GC-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------CT----A----------AGTA-G-TCC-TTAGTA--T-C---C-----TCATT-T-A-ACAT-C-TT-AAGGGCCC---CTTgctattagcagggcccg
gi|8 : ctttgT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-C--CCTT-TAACCCCTTA-G-CACC----------TCCTT---AGA-G-AC--------T-CATT--------AG---T-----AGT-------CC---TTA-G--------------T--GGC--------CTCC---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-TA-A---AC--C-C------------------CT----T----------AGAG-ACTCC-TTAGTG--T-C--------------------C-C-C-TT-AGTAG-TC---CTTA----------GT-G-CCCCTT-T--TT--AA------CNNNNN---NNNNNAGTGTCCCCTT-AG------------------TAG-TCCTTAGTGG-C-T-C-C--TTTG--AACCCCTTAGTAG-TCTTT---AGT---GCCC-CC-CTTT-AAA-C-CCCTTtgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|36 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagT--CC---TTAG-T-G----C-C--C-C--T-TT-GAACTCCTTA-G-AGGC----------TCCTT---AGT-G-tgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|32 : gg--CC---TTAG-T-T----G-C--A-C--T-TT-GAACTCACTA-G-AGGC----------TCCT
gi|21 : gtagtcataagtaccccattttaac-T-G----C-C--C-CA-T-TT-TAACCACCT--G-AGAC----------TTCTT---AGT-G--------------GTAC-T-----AA---G-----GGGT------CC---TTA-G--------------T--GGC--------CCCT---------T--T----G-A-ATCCTTAA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TA---CC-CTCA---TTA----A---AC--C-T------------------CT----T----------AGT------------TA--C-C-C-C-----T--TT-G-C-AG-T-ACCT-AGTGCCTT---TTTG----------TT-G-TCCC---T--
gi|19 : tatg----C-C--C-C--T-TT-GAACTCCTAA-G-AGGC----------TCCGT---AGT-G-GC--------A-C-TTT-G-----AA---C-----T---------CT---TAA-G--------------T--GGC--------TCCTTAATGCCAGT--T----G-A-ACTCCTTA-----------G-A---GGCT-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-C----TTT-T-------T--C-A------------------CT----T----------AATG-G-TCC-TGAGTGT-C-C-C-C-----T--TT-G-A-AA-C-CTTT-AGTAG-TC---CTAA----------GT-G-CCCC---aatag
gi|34 : tagtgcccc--C-C--T-TT-GAACTCATTA-G-TGGC----------TCCTT---AAT-G-TC--------C-C-TTT-T-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------A--GGC--------TCCT---------attttaa
gi|30 : t--C-C--T-TT-GAACTCCTTA-G-TGG-----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CCTTT-G-----AA---C-----C---------TC---TTA-G--------------TA-GTC--------C
gi|15 : -C--T-TT-GAACTCATTA-G-TGGC----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-CCATT-G-----AC---C-----T---------CC---TAA-G--------------A--GGC--------TCCT---------T--T----G-----------------------TG---G--T-CCTT----------A-G----------TG---GC----A---CTT-T--G---AA--C--------------------------------------------TCC-TTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-AATA-AGTGGCTC---CTTA----------GT-G-CCCC---T--TTG-AA------C--TCA---TTAGAGG---CTCCTT-TG------------------TGG-TCCTTAGT-G-G-C-A-G--TTTG--AATTCCTAAGAGGCTCCTA---AGT---G--G-CA-CTTT-GAA-C-tgagtggctattagttggacc
gi|10 : gcaAACCGCTTA-GTAG------------TCCTT---AGT-G-CT--------C-CCTTT-G-----AA---CCCCTTAGTGGT----CC---TTA-G--------------T--GCC--------CCCT---------T--T----T-A-ACTCCTTA-----------GTG---GC-T-CCTT----------A-G----------TG---------------G-T--A----------------------------CT----T----------AGTG-G-TCC-TTAGTG--G-C-A-T-----T--Tct
gi|5 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCCCTTT-G-AGAC----------TTCTT---AGT-G--------------GTAC-T-----AA---G-----GGGT------CC---TTA-G--------------T--GGC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTAA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TA---CC-CTCA----TT-T--A---AC--C-T------------------CT----T----------AGTG-A-CCC---------------C-----T--TT-G-C-AG-T-ACCT-AGTGCCTT---TTTG----------TT-G-TCCT---T--agtagg
gi|20 : ttACCCCTTA-GTAG------------TCCTT---AAT-G-AC--------C-C-TTT-G-----AA---C-----G---------CC---TAA-G--------------T--G-----------------------------------ACTCTTTA-----------GTA---G--T-CTTT----------A-G----------TG---GT-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------TT----T----------AGTG---TCC-T-------------C-----T--TT-T-A-AC-C-CCTA-AGAGGCTC---CTTA----------GT-G-ACCCCTTT--GC--AG---------TAC---CTAG-AG---CTTTTT-AG------------------TTG-TCTCTAAT-aataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|31 : TCCTTA-G-TGCC----------TCCTT---TGT-G-TC--------C-CTTTT-TC----AG---T-----A---------C----TTA-G--------------T--G-C--------CCTT---------T--T----G-tggaac
gi|2 : gtaagttg-G-AAAC----------CCCTT---AGT-A--------------AT------------------------------CT---TTA-G--------------T--GCT--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTG---G--T-CTTT----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-G--A---AC--T-C------------------CT----T----------AGTG-G-TAC-TTAGTA--G------------------------T-CCTT-AGTGGC-A---TTTA----------GT-A-----------GG--AC------C--CCC---TTAGGAG----TCCTT-AG------------------TGG-TACTTAGT-G-G-T-C-C--------------TTAGTGGC-ATTT---AGTAGGA--C-CC-ATTTGGAA-C-ACCTCATctgcctccaata
gi|23 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatat-G-AAAC----------CCCTT---AGT-G-AC--------C-CCTTT-G-----AA---C-----C---------CC---TAC-G--------------T--GAC--------TCCT---------T--caattatcctaagt
gi|22 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatat-G-AAAC----------CCCTT---AAT-G-AC--------C-ACTTTGT-----AG---T---------------CT---TCA-G--------------T--GTT--------GCCT---------T--T----G-A-ACTCCTTA-----------GTG---G--T-ataggcatttagt
gi|14 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacat-G-AAAC----------CCCTT---AAT-G-AC--------C-ACTTTGT-----AG---T---------------CT---TCA-G--------------T--GTT--------GCCT---------T--T----G-A-ACTCCTTA-----------GTG---G--T-CGTA----------
gi|1 : ttaacatAT----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-ACTTT-C-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------T--GCC--------CCCT---------T--T----T-A-ACCCCTTA-----------G-A---GACT-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-A--A---AC--C-C------------------TT----AGAGACTCCTTAGTA-G-TCC-TTAGTG--GCC-A-C-----T--TT------C-T---TT-G--AACCC---CTTA----------GT-G-TCCCCT-T--TT--AA------T--CCC---TTAGTGA---CCCCTT-TG------------------CAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|30 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaAC----------TCCTT---AGT-G--------------GT------------------------------CC---TTA-G--------------T--GCC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCTCTTA-----------GTA---G--T-CCTG----------A-G----------TG---ttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|36 : cctttga----------TCCTT---AGT-G-CC--------C-C-TTT-G-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------A--GGC--------TCCT---------T--gctattagttggacc
gi|16 : gg----------TCCTT---AGT-G-AC--------C-CCTTT-G-----AA---T-----C---------CC---TTA-G--------------T--GCC--------CATT---------T--T----G-A-AATCATAA-----------GTA---G--T-CCTT----------C-G----------TG---CC-C-CC---TTT-G--T---GG--C-C------------------CT----T----------AGTA-G-TTC-TAAGTG--G-C-agtg
gi|35 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagCTT---AGT-G-CC--------C-CCTTT-T-----AA---C-----C---------CC---TAA-G--------------tattagcagggcccg
gi|4 : ttattttgatttaggcagctgatT---AGT-G-CC--------C--ACTT-T-------------------------------TTA---------------------C--------CACT---------T--T----A-A-ACTCCTTA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-T--A---AC--C-C------------------AT----T----------AGAG-ACTCC-TTAGTG--A-CTC-C-----T--TT-G-A-AC-C-CCTT-AGTAGC-C---CTTA----------GT-G-TCCCCT-T--TT--AA------T--CCC---TTAGTGA---CCCCTT-TG------------------GAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTTagaa
gi|32 : ---AGT-A-CC--------C-CATTT-T-----AA---C---------------CC---TTA-G--------------T---TG--------CACT---------T--T----G-A-ACTCACTA-----------G-A---GGCT-CCTtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|9 : gtagtcata-CC--------T-CATTT-------AA---C-----C---------TC---TTA-G--------------T--G---------------------------------A-CCCCCATA-----------GCA---G--TACCT-----------A-G----------TG---CC-T-TT---TTG-T--T---GT--C-C------------------CT----A----------A
gi|18 : c--------C-CTTTT-G-----AA---T-----T---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CACT---------T--T----C-A-ACTCCTTA-----------taggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|3 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT-G-----AA---C-----T---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTAA-----------GTA---G--T-CTTA----------A-G----------TG---CC-C-CATTTTTT-T--A---CC--C-CTTTGACTTCTTAGTGGTACT----A----------AGGG-G-TCC-TTAGTG--GCC-C-C-----T--TT-G-A-AC-C-CCTA-AGTAG-TC---CTTA----------GT-A-TCCTCA-T--TT--AA------C--ATC---TTAAGGG---CCCCTT-TG------------------CAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTT
gi|16 : c-----AA---C-----A---------CCATGTTA-G--------------T--------------CCT---------TAGT----G-A--CCCCTTT-----------GAA---T--C-CCTT----------A-G----------TG----C-C-CA---TTT-TGAA---AT----C------------------AT----A----------AGTA-G-TCC-TTCGTGC-C-C-C-C-----T--TT-GTG-GC-C-C-TT-AGTAG-TT---CTAA----------GT-G-gttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|23 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatga-----AA---C-----C---------CC---TTA-G--------------T--GAC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTgctattagcagggcccg
gi|2 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaA---C-----T---------CC---TTA-G--------------T--GTC--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCATA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-CA---TTT-T--A---AC--C-CAT----------------TT----G----------AG-A-C-TTC-TTAGTG--G-T-A-C-----T--AA-G-G-AG-T-CCTT-AGTGGCCC---CTT------------T-G---------------AA------C--CCC---TTAGTAG----TCCTT-AG------------------TA---CCTT----------C-A--TTTA--ACCTC-TTAGTGACCCCTT---acgtgactccttataggcatttagt
gi|35 : tgc-----A---------TC---TTA-G--------------T--GCC--------CCCT---------T--T----T-A-ACCCCTAA-----------Gtgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|13 : ttattttgatttaggcagctg---------CC---TTT-G-----------------GTC--------CTCT---------T--TTAT-G-A---TCTTTA-----------GTA---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CT-T-CT---TTTGT--A---GT--C-C------------------AT----G----------AA-A-G-TCC-TTAGTG--A-C-ATC-----T--TT-G----T-TGTATTAAGTGGTCC---TTTATGCATATTTTGT-G-GTTT---TGAGT---A------C--TCC---TAAGTAC---CTTCTT-TG------------------TGG-TCCTTGG-------------------AAGTCACTAGTGACAGCTT-----T---G--T-CATATTT-agaa
gi|9 : tagtggt---------CC---TTA-G--------------T--GCT--------CCCT---------T--T----G-A-ACCCCTTA-----------GTG---G--T-CCTA----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTagtggtcctttgtggtctttagtagttctaagtgcctcttttggggtctttggaagtacgtcttgtggtacttggaagtctttagtgacagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|36 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagt---------CC---TTA-G--------------T--G-C--------CCCT---------T--T----G-A-ACTCCTTA-----------G-A---GGCT-CCTT----------A-G----------TG---agaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|17 : ggt---------CC---TTT-G--------------T--GCC--------TCTT---------T--T----G-T-GGCCTTTA-----------TTA---G--T-CCTA----------A-G----------TA---CT-T-C----TTG-T--G---AT--C-A------------------AT---------------AGAA-G-TCC-TTAGTG--G-C-AGC-----T--TT-G----T-TGTACTGAGTGG-TC---TTT-----------------------T--GT--GA------C--TCT---TTTGTGG----TCTTT-AG------------------TAA-TCATAAGT-A-C-CAC-T--TTTG--TGGTCCTTGGAAG-TCCTT---AGT---G--A-CA-GCTT-
gi|31 : gcct---------CC---TTA-G--------------T--GCC--------TCCT---------T--T----GTG-TCCCTTTT-----------TCA---G--T-ACTT----------A-G----------TG---CC-C------TTT-T--G---CT--G-C------------------CT----tgttgtatttagtg
gi|38 : gtaagttgtC---TTAAG--------------T--GCC--------GCCT---------T--T----G-A-ACTCCTTA-----------Gccaata
gi|5 : ttgtagtC--------CCCT---------T--T----G-AGACTTCTTA-----------GTG---G--T-ACTA----------A-GGGGTCCTTAGTG---GC-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------CT----A----------AGTA-G-TCC-TTAGT-------A-CCCTCAT--TT-A-A-CC-T-C-TT-AGTGACCC---CTT------------T-G----C---A--GT--A------------C---CTAGTGC---CTTTTT--G------------------TTG-TCCTTAAT-t
gi|14 : ttaaC--------CCCT---------TAAT----G-A--CCACTTT-----------GTA---G--T-CTTC----------A-G----------TG---TT-G-CC---TTT-G--A---AC--T-C------------------CT----T----------AGTG-G-TCaggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|34 : ttaacatgaaaCCT---------T--T----G-A-ACTCATTA-----------GTG---GC-T-CCTT----------A-A----------TG---TC-C-C----TTT-T--A---AC--T-C------------------CT----T----------AGAG-G-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|30 : tCCT---------T--T----G-A-ACTCCTTA-----------GTG---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-G--A---AC--C-T------------------CT----T----------AGTA-G-TCC-TGAGTG--G-C-ctcct
gi|3 : CT---------T--T----G-A-ACTCCTT-------------------------------------A-G----------TG---TC-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------CT----A----------AGTA-G-TCT-TAAGT---G-C--------------------C-C-CATT-------TT---TTTA---------------CCCC---T--TT--GA------C--TTC---TTAGTGG----TACTA-AG------------------GGG-TCCTTAGTGG-C-C-C-C--TTTG--AACCCCTAAGTAG-TCCTT---AGT---ATCC-TC-ATTT--AA-CATCTtattagttggacc
gi|10 : -A-ACCGCTTA-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CT-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------CT----T----------AGTG-G-TCC-TTAGTGC-C-C-C-C-----T--TT-T-A-AC-T-CCTT-AGTGGCTC---CTTA----------GT-G-----------GT--A------------C---TTAGTGG----TCCTT-AG------------------TGG-CATTTAGT-aagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|9 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-ACCCATTG-----------GTA---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CT-C-CC---TTT-G--A---AC--C-C------------------CT----T----------AGTG-G-TCC-TAAGTG--C-C-C-C-----C--TTAG-A-AC-agg
gi|24 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-ACCCCTTA-----------GTA---G--T-ACTT----------A-G----------TG---CC-C-C-----CT-T--AGC-AT--C-C------------------CA----T----------AGTG-G-CTT-TTAGTA--G-G-A-C-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|32 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatga-----------GTA---G--T-CATA----------A-G----------TA---CC-C-CA---TTT-T--A---AC--C-C----------------------------------------------TTAGTT--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CACT-AGAGGCTC---CTccgaatct
gi|22 : CA---A--T-CTTA----------ACA----------TGAAACC-C-C------T-T--A---ATGAC-CA-----------------CT----T----------TGTA-G-TCT-TCAGTGTTG-C---C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGTGG
gi|36 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtct---G--T-CCTT----------A-G----------TG---CC-C-C----TTT-G--A---AC--T-C------------------CT----T----------AGAG-GCTCC-TTAGTG--t
gi|35 : gCTT----------A-G----------TG---CC-C-CC---TTT-T--A---AC--C-C------------------CT----A----------AG
gi|21 : ttattttgatttaggcagctgatTA----------T-G----------TG---CC-C-CA---TTT-T--A---AC--CAC------------------CT----G----------AG-A-C-TTC-TTAGTG--G-T-A-C-----------------------T-AAGGGGTC---CTTA----------GT-G-GCC-----------------------CC---TTTGAA-----TCCTTAAG------------------TAG-TCCTTAGT-A-C-C-CTC--ATTA--AACCTCTTAGTTACCCCTTTGCAGT---A--C-Cagaa
gi|19 : ----------A-G----------TG---CC-C-CCCCCTTT-G--A---AC--T-C------------------CT----A----------AGAG-GCTCC-GTAGTG--G-C-A-C-----T--TT-G-A-AC-T-CTTA-AGTGGCTC---CTTA----------AT-G---CC---A--GTTGAA------C--TCC---TTAGAGG---CTCCTT-AGTGCCCCTTTTTCACTTAATGG-TCCTGAGT-GTC-C-C-C--TTTG--AAACCTTTAGTAG-TCCTA---AGT---G--C-Ctagtgcctttttgttgtccctaatag
gi|22 : tA---TTT-A--A---AT--C-A------------------CTTAAAA----------AGTG-T-TCT-TTA-TA--G-C-------------T---A-AC-T-GAC--AGT--CTCAATCTTA----------A------CA---T--GA--AA------C--CCC---TTAATGA---CCACTT-TG------------------TAG-TCTTCAGT-G-T-TGC-C--TTTG--AACTCCTTAGTGGccattttaa
gi|34 : tgattaatgatatgtcata---TTT-G--A---AC--T-C------------------AT----T----------AGTG-GCTCC-TTAATG--T-C-C-C-----T--TT-T-A-AC-T-CCTT-AGAGGCTC---CTt
gi|30 : tcc---TTT-G--A---AC--T-C------------------CT----T----------AGTG-G-TCC-TTAGTGC-C-C-C-C-----T--TT-G-A-AC-C-TCTT-AGTAG-TC---CTGA----------GT-G-
gi|9 : cc--A---AC--C-C------------------AT----T----------GGTA-G-TCC-TTAGTG--CTC-C-C-----T--TT-G-A-AC-C-CCTT-AGTGG-TC---CTAA----------GT-G-CCC-----------------------CC---TTAGAAgctattagttggacc
gi|20 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga---AC--C-C------------------CT----T----------AGTA-G-TCC-TTAATG--A-C-C-C-----T--TT-G-A-AC-G-CCTA-AGTGACTC---TTTA----------GTAG-TCTT---TA-GT--GG------T--CCC---TTTGAA----CCCTTT-AG------------------T-G-TCCT-------------C--TTTT--AACCCCTAAGAGGCTCCTT---AGT---GA-C-CC-CTTT-Gcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ------------------CT----A----------AGGG-G-TCC-TTAGTG--G-C-C-CC----T--TT-G-A-AC-C-CCTA-AGTAG-TC---CTTA----------GT-A-CCCTCA-T--TT--AA------C--CTC---TTAGTGA---CCCCTT-TG------------------CAG-TACCTAGT-G-C-C-T-T--TTTcagtacctagagctttttagttgtctctaattggaac
gi|14 : ttaacccctttgagacttcttagtggtaGTA-G-TCT-TCAGTGTTG-C---C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGTGGgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|38 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttGTA-G-TCT-TAAGTGCCG-C---C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|36 : ttG-G-TCC-TTAGTG--C-C-C-C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGAGGCTC---CTTA----------GT-G-
gi|5 : -C-----T--TT-G-AGAC-T-TCTT-AGTGG-TA---CTAA----------GG-GGTCCT---TA-GT--GG------C--CCC---TTTGAA----CCCCTA-AG------------------TAG-TCCTTAGT-A-C-C-C-TCATTTA--ACCTC-TTAGTGACCCCTTTGCAGT---A--C-C
gi|34 : ttaaccc-C-----T--TT-G-A-AC-T-CATT-AGTGGCTC---CTTA----------AT-G-TCCCT--T--TT--AA------C--TCC---TTAGAGG---CTCCTtagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|30 : tc-C-----T--TT-G-A-AC-T-CCTT-AGTGG-TC---CTTA----------GT-G-CCCCCTTT--G---AA------C--CTC---TTAGTAG----TCCTG-AG------------------TGG-CTATTAGT-
gi|9 : c-A-AC-C-CATT-GGTAG-TC---CTTA----------GT-G-CTCC-----------------------C---TTTGAA----CCCCTT-AG------------------TGG-TCCTAAGT-G-C-C-C-C--CTTA--GAtggacc
gi|24 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-AC-C-CCTT-AGTAG-TA---CTTA----------GT-G-CCC-----------------------CC---TTAGCAT---C-CCAT-AG------------------TGG-CTTTTAGT-acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|23 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatga-A-AC-C-CCTT-AGTGACCC---CTTT----------GA-A-CCCC---TACGT--GA------C--TCC---TTATAGG---Caggacccgaatct
gi|16 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-T-CCTT-AGTGACCC---CTTT----------GA-A-TCCC---T---T--AG------T--GCCCATTTTGAAA----TCATA-AG------------------TAG-TCCTTCGT-G-C-C-C-C--CTT------T-----GTGGC-CCTT---AGT---atttagt
gi|10 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagTT-AGTAG-TC---CTTA----------GT-G-CTCC-----------------------C---TTTGAA----CCCCTT-AG------------------TGG-TCCTTAGT-G-C-C-C-CC-TTTT--AACTCCTTAGTGGCTCCTT---AGT---G--agttctaagtggctattagcagggcccg
gi|36 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccgcTC---CTTA----------GT-G-CCCC---T--TTG-AA------C--TCC---TTAGAGG---CTCCTT-AG------------------TGgtacttagtggtccttagtggcatttagtagg
gi|16 : ggCCA---T--GT--TA------G--TCC---TTAGTGA---CCCCTT-TG------------------AAT-CCCTTAGT-G-C-C-CAT--TTTG--AAATCATAAGTAG-TCCTT---CGT---G--C-C
gi|14 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaaca---T--GA--AA------C--CCC---TTAATGA---CCACTT-TG------------------TAG-TCTTCAGT-G-T-TGC-C--TTTG--AACTCCTTAGTGGccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagcagggcccg
gi|34 : ttaaca--TCC---TTTGAA----CTCATT-AG------------------TGGCTCCTTAAT-G-T-C-C-C--TTTT--AACTCCTTAGAGGCTCCTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|30 : CC---TTTGAA----CTCCTT-AG------------------TGG-TCCTTAGT-GCC-C-C-C--TTTG--AACCTCTTAGTAG-TCCTG---AGT---G--G-CT-ATT
gi|10 : GAAA---CCGCTT-AG------------------TAG-TCCTTAGT-G-CTC-C-C--TTTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTT---AGT---GC-C-CC-CTTT-TAA-C-TCCTTAagttggacc
gi|5 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatGAAA---CCCCTT-AG------------------TAG-TCCTTAGT-G-CTC-C-C--TTTG--AATCCCTTAGTGG-TCCTT---AGT---G--C-Cgtggctccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtagg
gi|9 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatGAAA---CCCATT-GG------------------TAG-TCCTTAGT-G-CTC-C-C--TTTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTA---AGT---G--C-Cccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|24 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatGAAA---CCCCTT-AG------------------TAG-TACTTAGT-G-C-C-C-C--CTTAGCATCCCA-TAGTGGCT-TTT---AGT---cccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|36 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatGG-TCCTTAGT-G-C-C-C-C--TTTG--AACTCCTTAGAGGCTCCTT---AGT---G--aggacccgaatct
gi|32 : CCTTAGT-T-G-C-A-C--TTTG--AACTCACTAGAGGCTCCT
gi|23 : gtagtcataagtaccccattttaacCCTTAGT-GAC-C-C-C--TTTG--AACCCCTACGTGACTCCTT---A
gi|34 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacc-C-C--TTTG--AACTCATTAGTGGCTCCTT---AAT---G--T-CC-CTTT-TAA-C-TCCTTAtaggcatttagt
gi|30 : t-C-C--TTTG--AACTCCTTAGTGG-TCCTT---AGT---GC-C-CC-CTTT-GAACC-TCTgaggctcct
gi|9 : A--AACCCATTGGTAG-TCCTT---AGT---G--CTCC-CTTT-GAA-C-CCCTTAagtagtcctgagtggctattagttggacc
gi|37 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatg--AACTCATAAGTAG-TCCTT---AGT---G--C-Cgtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|36 : TCCTT---AGT---G--C-CC-CTTT-GAA-C-TCCTTAttctttgtggtcc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|26 ): AAACCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGAACTCCTTAGTGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|33 ): TTTTAAGCCCTAAGGGACACCTTTGTAGTACCTAGTGCCCTTTTTTGTATGTAATAA
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 4444444444 555555555555 1 1111111111 11111111111 44444444444444444444444444 11111 2222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 11111111111111 11111111111 111111111 222222222222222
lowQualScore : 2 1 3333333333 444444444444 3 4 777 7777777777 1 1 0 5 555 77 7777 3 55555555555 4 1 3 00000000000000000000000000 11 1 4 4 44444 0 44 1 1 0 6 3 3 2 1 4444444444444444444444 3 1 44 1 1 6666 5555 555555555555555555555555555555555 777 9999999 44 7 2 55555555555555 3 5555555 66 333 1 5555555 2 2 1 5 33333333333 1 4444 888888888 33 555 999999999999999 6 0
lowQualScore : . . .......... ............ . . ... .......... . . . . ... .. .... . ........... . . . .......................... .. . . . ..... . .. . . . . . . . . ...................... . . .. . . .... .... ................................. ... ....... .. . . .............. . ....... .. ... . ....... . . . . ........... . .... ......... .. ... ............... . .
lowQualScore : 5 2 8888888888 222222222222 3 4 888 5555555555 6 0 4 1 888 99 1111 3 88888888888 2 0 3 11111111111111111111111111 00 9 0 0 44444 1 66 0 4 1 2 1 1 9 6 2222222222222222222222 6 7 44 5 5 5555 9999 555555555555555555555555555555555 888 8888888 33 0 1 88888888888888 6 9999999 55 333 5 8888888 3 8 4 9 00000000000 5 5555 222222222 99 000 666666666666666 7 3
consensus : TTNAACTCCTTAGAG----------GCTCCTTAGTGG---TCCT-TA--GTG-CCCC-TTT---GAAC----------TCCTTAGTGGCCCCTT---AGTG--CCCC----T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC-TCCTT----------AGT-----------GGCCCTTTGAAC-TCCTTAGTG-GCA-C--TTTGA--ACTCCTAAGTGGCTCCTTAGTG-CC-CC-TTTGAACT-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAACT-------CCTTAGTGNCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTNAGT-GCCCC---CTTTT---AACCC-----------CT---TAGTG----------G-TCCTTAGTG-G-C-C-----C--TTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G--CC--CC--T--NT-AAC-----C-CCTTAG-NGA--CCCCT-T------AGTAGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-GAACTCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACTCCTTAGAG----------GCTCCTTAGTGG---T----TA--GTG-CCCC-TTT---GAAC----------TCCTNAGTGGCCCCTT---AGTG--CCCC----T-TT-----------GAACTCCTNAGNGGC-TCCTT----------AGT-----------GNCCCTTTGAAC-TCCTTAGTG-GCN-C--TTTGA--ACTCCTNAGTGGCTCCTTAGTG-CC-CC-TTTGAACC-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAACN-------CCTTAGTGNCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTNAGT-GCCCC---NTTTT---AACCC-----------CT---NAGTG----------G-TCCTTAGTG-G-C-N-----C--TTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G--CC--CC--T--GT-AAC-----C-CCTTAG-AGG--CCCCT-T------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-GAACTCCTTAT
gi|1 : C-CTTTTGA-ATTCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAACT-------CCTTAGTGCCCCCTTTTA-ACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GCCCC---CTTTA---AACCCTTAGAGACTC-CT---TAGTA----------G-TCCTTAGTG-G-C-CACTTTC--TTTGAACCCCTTAGTG--TCC----------C--CT--T--TT-AAT-----C-CCTTAG-TGA--CCCCT-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-AAA--CCCCT-T------AGTAGTCATTAGT-G-CTC-----------CCTTA-GAACCCCTT----AGTGG---------TCCTTA--GT---GC--------------CCCCTCT-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatA-ACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCTCC---CTTTG---AACCC-----------CT---TAGTG----------G-TCCTTAGTGCC-C-C-----C--TTTTAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G-------------GT-A----------CTTAG-TGG---TCCT-T------AGTGGCATTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAG----------GCTCCTTAGTGG---T----TATAATG-CCCC-TTA---GAAC----------TCATAAGTGGCCCCTT---TGTG--CCCC----T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC-TTTTT----------AGT-----------GGCACTTTAAAC-TCCTTAGTG-GCA-C--TTTGA--ACTCCTAAGTAGCTCCTTAATG-CC-CC-TTTGAACT-CCCTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAACA-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GCCCC---ATTTT---AATCC-----------CT---AAGTG----------G-TCTTTAGTG-G-C-A-----C--TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGT-G--TC--CC--T--GT-AAC-----T-CCTTAG-AAG--CTCCT-T------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-AAACTCATT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAAGTAGCTCCTTAATG-CC-CT-TTTGAACT-CCTTAGAGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAACT-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GCCCC---ATTTT---AATCC-----------CT---AAGTG----------G-TCTTTAGTG-G-C-A-----C--TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGT-G--TC--CCA-T--TT-AAC-----T-CCTTAG-AGG--CTCCT-T------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-AAACTCATT----AGTGGT--------TCCTTA--GT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : TTTAACTCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAGACCT----AA--GTG-CCCCATTT---TAAT----------CCCTAAGTGGTCT-TT---AGTG--GCAC----T-TT-----------GAACTCATTAGTGGC-TCCTT----------AGT-----------GTCCCATTTAAC-TCCTTAGAG-GC--------------TCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CC-TTTAAACT-CATTAGTGGTTCCTTAGTGCCN-NNNN-NNNNN--------------TGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCTTAAGT-GCCCC---GTTTT---AACCC-----------CT---TTTTG----------G-TCCTTAGTG-G-C-A-----C--TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTAAAT-G--TC--CC--T--TTGAAC-----A-CCTTAG-AGgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaactcctaagtagctccttaatgcccttttgaactccttagaggctccttagtgccccatTAGTGG---TCCTTTG--GT--CCTC-TTTTATGA------------TCTTTAGTAGTCC-TA---AGTG--CTTC----T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACATCTTTGTTGTATTA-AGT-----------GGTCCTTTATGCATATTTTGTG-GT-----TTTGAGTACTCCTAAGTACCTTCTTTGTG-GT-CC-TTGGAAGT-CACTAGTGACAGCTTTGT-----CATA-T--------------TTAGTGG-TCCTTTGT-GGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GCCTC---TTTTG---GGGTC-----------TTTGGAAGTAC---------G-TCTT--GTG-G-T-A-----C--TTGGAAGTCTTTAGTGACAGCTTTGT------------T--GT-A-----------TTA--------------------AGTGGTCCTTTGT-G-
gi|14 : --T--GA-AAC-----C-CCTTAA-TGA--CCACT-T------TGTAGTCTTCAGT-G-T-TG----------CCTTT-GAACTCCTT----AGTGG
gi|14 : ttaacaT-AAC-----C-CCTAAG-GGA--CCCCT-T------TGCAGTACTAAGT-A-C-C-----------TTTTT-tcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-TTT---GAAC----------TCATTAGTGGCTCCTT---AGTG--CCCC----CATT-----------GACCTCCTAAGAGGC-TCCTTTGTGGTCCTTAGT-----------GGCACTTTGAAC-TCCTTAGTG-GCA-C--TTTGA--ACTAATAAGTGGCTCCTTAGTG-CC-CC-TTTGAACT-CATTAGAGGCTCCTTTGTG-----GT---------------CCTTAGTGG-CAGTTTGA-ATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-GGCAC----TTTG---AACCtttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAATC-------CCTTAGTGCCCATTTTGA-AATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GCCCC---CTTTG---TGGCC-----------CT---TAGTA----------G-TTCTAAGTG-G-C-T-----A--TTt
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagCT-------CCTTTGTGCCTCTTTTGT-GGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-ACTTC----TTGT---GATCA-----------AT----AGAA----------G-TCCTTAGTG-G-C-AG----C--TTTGTTGTACTGAGTGG-TCTTT---------------T--GT-GAC-----T-CTTTTG-TGG--TCT-T-T------AGTAATCATAAGT-A-C-CACTTTTGTGGTCCTTG-GAAGTCCTT----AGTGAC--------agcagggcccg
gi|18 : gcCCTTTTGAAT-TCCTTAGTGTCCA-C--TTTCA--ACTCCTTAagctttgttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT---AGTG--CCCCCCCCT-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC-TCC----------------------------------G--------TAGTG-GCA-C--TTTGA--ACTCTTAAGTGGCTCCTTAATG-CC-AG-TT-GAACT-CCTTAGAGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGA-AACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---ATTTT---AA
gi|2 : ACT-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---ATTTT---AACCCATTTGAGACTTCT---TAGTGGTACTAAGGAG-TCCTTAGTG-GCC-C-----C--TTTGAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGT-A--CCTTCA--T--TT-AAC-----C-TCTTAG-TGA--CCCCT-T------TGCAGTATCTAGT-G-C-C-----------CTT
gi|2 : tgcA-ACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GCTCC---CTTTG---AACCC-----------CT---TAGTG----------G-TCTTTAGTG-C-C-C-----CC-TTTGAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTAG--TC--CT--TA-GT-GGC-----A-T-TTAGTAGGACCCCCT-T------AGGAGTCCTTAGT-G-G-T-----------ACTTA-GTGGTCCTT----AGTGGC---------ATTTA--GTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaAC----------CCCTTAGTAGTCC-TT---AATG--ACCC----T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC-TCTTT----------AGTAGTCTTTAGTGGTCCCTTTGAAC-CCTTTAGTG-TCCTC--TTTTA--ACCCCTAAGAGGCTCCTTAGTGACC-CC-TTTGCAGT-ACCTAGAG-CTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GTG-CC-CCATTTTAACCACCT--GAGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGGT----CCTTAGTGGCCCCTTTGA-ATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-ACCCT---CATTA---AACCT-----------CT---TAGT--------------------TA-C-C-C-----C--TTTGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTT-G--TC--CC--T--tgtctctaattggaac
gi|22 : tat--T--GA-AAC-----C-CCTTAA-TGA--CCACT-T------TGTAGTCTTCAGT-G-T-TG----------CCTTT-GAACTCCTT----AGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacaA-ACCCCTT------------AGT-GACCC---CTTTG---AACCC-----------CT---ACGTG----------ACTCCTTATAG-G-C-A-----T--TTt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTT---AGTGA-CCCC----T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC-TCCTT----------Aagt
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaG-AAA--CCCCT-T------AGTAGTACTTAGT-G-C-C-----------CCCTTAGCATCCCAT----AGTGGC--------T-TTTA--GT---taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatat-TTT---GAAC----------TCCTTAGTGGCCCaggacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAACT-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTTTTTT---ACCCCTTTGACTT---CT---TAGTGGTACTAAGGGG-TCCTTAGTG-GCC-C-----C--TTTGAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGT-A--TC--CTCAT--TT-AAC-----A-TCTTAA-GGG--CCCCT-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-G
gi|3 : cAACC-------CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---CTTTG---AACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGA-ACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GCCCC---CTTTG---AACCT-----------CT---TAGTA----------G-TCCTGAGTG-G-C-T-----A--TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : ------AGTTGTCCTTAGT-G-C-CT----------CCTTT-GTGTCCCTTTTTCAGTA------------CTTA--GT---G---------------CCCTTTT-agttggacc
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-ACCCC---ATTTT---AACCC------------------------------------TTAGTT-G-C-A-----C--TTTGAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : T-AAG-----C-CCTAAG-GGA--CACCT-T------TGTAGTACCTAGT-G-C-C-----------CTTTT-
gi|34 : tttCC-TTT---GAAC----------TCATTAGTGGCTCCTT---AATG--TCCC----T-TT-----------TAACTCCTTAGAGGC-TCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tCTTAGT-GCCCC---CTTTT---AACCC-----------CT---AAG
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-GAACTCCTT----AGAGGC--------TCCTTA--GT---G---------------agaa
gi|37 : A--ACTCATAAGTAG-TCCTTAGTG-CCTTC-TTTG
gi|38 : GTAGTCTTAAGT-G-C-CG----------CCTTT-GAACTCCTT----AGTtggtcc
gi|4 : ttTAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAA-ACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---CTTTT---AACCC-----------AT---TAGAG----------ACTCCTTAGTG-A-CTC-----C--TTTGAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGT-GTCCC--CT--T--TT-AAT-----C-CCTTAG-TGA--CCCCT-T------TGGAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-
gi|4 : G-AAA--CCCCT-T------AGTAATCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGG---------TCATTATTGT---C---------------CCCCTTT-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatAACC-CCTTTGAGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGGT----CCTTAGTGGCCCCTTTGA-ACCCCTAAGTAG--TCCTTAGT-ACCCT---CATTT---AACCT-----------CT---TAGTG----------A-CCC-----------------C--TTTGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTT-G--TC--CT--T--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttG-AAA--CCCCT-T------AGTAGTCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAATCCCTT----AGTGG---------TCCTTA--GT---GC--------------CCCCTTT-AAACaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatCCTTAGT-GCCCC---CTTTT---AACCC-----------CT---TAGAG----------ACTCCTTAGTA-GCC-C-----C--TTTGAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGT-G--CC--CCCTT--GA-AAC-----C-CCTTAG-TAA--CCCCT-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : CCTTTTGAAT-TCCTTAGT--GCC-CATTTTCA--ACTCATTAGT-GC----------CC-CC-TTTTAACC-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG-----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGCCTC---TTTCTTTGAACCC-----------CT---TAGCA----------G-TCCTAAGTGCC-C-C-----C--TTTTAACCCCTTACAGATTTCTTAGT-G--C---------------C-----C-CCTTAG-AGA--CTCCT-T------AGTAGTCCTTAGTGG-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGCCTTTGCAGTACCTA--GT---G---------------CCTTTTT-ttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTG---AGTG--CCCC----T-TT-----------AAACTCCT-ACAGGC-T-------------------------------------------CTTAGTG-GCA-C--TTTGA--ACCCCTAAGTGGCTCCTTAATG-CC-CC-TTTGAACT-CTTTAGAGGCT------------------------------CCTTAATGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---ATT----------------------------------------------TTAGTG-G-C-A-----C--TTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGT-G--CC--CC--A--TT-GAC-----CTCCTAAG-AGG--CTCCT-T------TGTGGTCCTTAGT-G-G-C-----------ACTTT-GAATTTATA----AGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGT-G--TC--CC--T--TTGAAC-----A-CCTTAG-AGG--CTCCT-A------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTA-GAACTCATA----ATTTGC--------TTCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAG----------GCTCCTAAGTGG---TCCT-TA--GTG-CCCC-TTA---GAAC----------TCATAATTTGCTTCTT---AGTG--CCCC----T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC-TCCTT----------AGT-----------AGTCTTTaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTTTAACCCCTAAGAG----------AATCCTTAATAG---TCCT-TT--GTGGCCTC-TTT---AAACCCCTTGGTAGTCCTAAGTACTCTCTTTAANNNN--NNNN----N-NN-----------NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN----------NNN-----------NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNN-N--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNAGTCCTTAGTGCCC-CCCT-TTAACC-------CCTTAGCACCTCCTTAGAGACTCATTAGTAG--TCCTTAGT-GGCCT---CCTTG---AACCC-----------CT---TAGTA----------G-TCCTAAGTG-C-C-C-----CCTTTTAAACCCCTTAGAGACTCCTTAGT-GT-CC--CC--TTAGT-AGT-----C-C-TTAG--TG--CCCCT-TTTTAACNNNNNNNNNNAGT-GTC-C-----------CCTTA-GTAGTCCTT----AGTGGC--------TCCTTT--GA---A---------------CCCCTTA-GTAGTCTTTAaggggc
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaTCCTTAGTGCCC-CC-CTTTAACC-CCTTAGCACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG-T-------CCTTAGTGGCCTCCTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---CTTTTA--AACCC-----------CT---TAGAG----------ACTCCTTAGTG-T-C-C----------------CCTTAGTAG-TCCTTAGT-G--CC--CCTTT--TT-AACNNNNNN-NNNNAG-TGT--CCCCT-T------AGTAGTCCTTAGTGG-C-T-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTAG---------TCTTTA--GT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCCCCTTAGTAG---TCCT-TA--GTGGCTCC-TTT---GAAC----------CCCTTAGTAG-TCTTT---AGTGCCCCCC----T-TT-----------AAACCCCTTTGCAG--TACCT----------AGT-----------GCCTTTTTGtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtCCC-TCAT-TTAACC-------TCTTAGTGAC----------CCCCATAGCAG--TACCTAGT-GCCTT---TTTGT---TGTCC-----------CT---AAttgtctg
gi|9 : T-AAC-----C-TCTTAG-TGA--CCCCCAT------AGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-Gtaggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|9 : ccctcattG-AAA--CCCAT-T------GGTAGTCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGG---------TCCTAA--GT---G---------------CCCCCTTAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 33333333333 111111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 111111 22222222222222 1111111111111111111111111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 2222222222222222 1111111 11111111111 111111111 222222222222222
lowQualScore : 1 1 0 5 1 22222222222 777 4 0 6 555 3 77 3 777777777777 2 2 3 1111111111111111111111111111111111111111111 111111 00000000000000 5 33 3 2 33 33 7 2 4 2 2 2 3333333333333333333333333 3 1 44 1 222 77777 1 6666666666666666666666 333 22222222222222222222222 0 1111111111111111 1 77777 55 9 666 33 0000000 22 22 1 44444 333 1 1 7777777 3 1 6 11111111111 1 4444 888888888 33 555 999999999999999 6 2
lowQualScore : . . . . . ........... ... . . . ... . .. . ............ . . . ........................................... ...... .............. . .. . . .. .. . . . . . . ......................... . . .. . ... ..... . ...................... ... ....................... . ................ . ..... .. . ... .. ....... .. .. . ..... ... . . ....... . . . ........... . .... ......... .. ... ............... . .
lowQualScore : 0 2 4 7 4 99999999999 888 4 7 7 888 3 99 3 000000000000 2 2 2 5555555555555555555555555555555555555555555 111111 22222222222222 7 99 1 9 99 44 1 4 7 4 4 8 3333333333333333333333333 6 7 66 0 777 11111 5 1111111111111111111111 000 55555555555555555555555 5 7777777777777777 9 44444 00 5 222 11 3333333 66 66 9 88888 777 5 5 6666666 0 5 2 99999999999 6 7777 222222222 99 000 666666666666666 2 7
consensus : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-----------CCCCTTT---G-AACTCCTTAGTGGCCCCTT---AGTG-CCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------TCCTT---------AGTG---G-----------CCCTTTGAAC-TCCTTAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGTG-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC---T-------CCTTAGTGNCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTNAGTGCCCC---CTTTN----AA-CC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-TCCTTAGTG-------------G--C-C-----C--TTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TTT--A--AC--C-CCTT-----AGN--GACCCC-T-T------NGTAGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-GAACNCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTNAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-----------CCCCTTT---G-AACTCCTTAGTGGCCCCTT---AGTG-CCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------TCCTT---------AGTG---G-----------CCCTTTGAAC-TCCTTAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGTG-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC---T-------CCTTAGTGNCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTNAGTGCCCC---CTTTT----AA-CC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-TCCTTAGTG-------------G--C-C-----C--TTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TNT--A--AC--C-CCTT-----AGN--GACCCC-T-T------AGTAGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-GAACTCCTTAT
gi|1 : ATTCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC---T-------CCTTAGTGCCCCCTTTTA-ACCCCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCCC---CTTTA----AA-CCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-TCCTTAGTG-------------G--C-CACTTTC--TTTGAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TTT--A--AT--C-CCTT-----AGT--GACCCC-T-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaGA--AACCCC-T-T------AGTAGTCATTAGT-G-CTC-----------CCTTA-GAACCCCTT----AGTGG---------TCCTTA--GT---GC--------------CCCCTCT-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatA-ACCGCTTAGTAG--TCCTTAGTGCTCC---CTTTG----AA-CC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-TCCTTAGTGC------------C--C-C-----C--TTTTAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------GT--A---------CTT-----AGT--GG-TCC-T-T------AGTGGCATTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG-----------CCCCTTA---G-AACTCATAAGTGGCCCCTT---TGTG-CCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------TTTTT---------AGTG---G-----------CACTTTAAAC-TCCTTAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAATG-CC-CC-T-TTGAACT-CCCTAGAGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC---A-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGCAG--TCCTAAGTGCCCC---ATTTT----AA-TC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-TCTTTAGTG-------------G--C-A-----C--TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TGT--A--AC--T-CCTT-----AGA--AGCTCC-T-T------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-AAACTCATT----AGTGGC--------TCCTTA--GT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAATG-CC-CT-T-TTGAACT-CCTTAGAGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC---T-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--ACCTAAGTGCCCC---ATTTT----AA-TC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-TCTTTAGTG-------------G--C-A-----C--TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TTT--A--AC--T-CCTT-----AGA--GGCTCC-T-T------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTT-AAACTCATT----AGTGGT--------TCCTTA--GT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG-----------CCCTTTT---G-AACTCCTTAGAGGCTCCTT---AGTG-CCCCA-T-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------TC-------------------------------CCCTTTGAAC-CCCTTAGTA-GACCTAAGTGCCCCA-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGTG-GC-AC-T-TTGAACT-CATTAGTGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC---T-------CCTTAGAGG-----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGTG-CCC---CTTTA----AA-CT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTTCCTTAGTGCCNNNNNNNNNNTGTCC-C-----C--TTTGAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTTT--A--AC--C-CCTT-----------------T-T--------TGGTCCTTAGT-G-G-C-----------ACTTT-GAACTCATT----AGTGGC--------TCCTAA--AT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT-----------CCTCTTTTATG-A--TCTTTAGTAGTCC-TA---AGTG-CTTC--T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------TCTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCTTTATGCATATTTTGTG-G------------T---TTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGTG-GT-CC-T-TGGAAGT-CACTAGTGACAGCTTTGT-----CATA-TT-----------------TAGTGGTCC-TTTGT-GGTCTTTAGTAG--TTCTAAGTGCCTC---TTTTG----GG-GT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-TCTT--GTG-------------G--T-A-----C--TTGGAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : --A--AC--C-CCTT-----AAT--GACCAC-T-T------TGTAGTCTTCAGT-G-T-TG----------CCTTT-GAACTCCTT----AGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatgaT--A--AC--C-CCTA-----AGG--GACCCC-T-T------TGCAGTACTAAGT-A-C-C-----------TTTTT-tcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTT---G-AACTCATTAGTGGCTCCTT---AGTG-CCCC--CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGTCCTT---------AGTG---G-----------CACTTTGAAC-TCCTTAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGTG-CC-CC-T-TTGAACT-CATTAGAGGCTCCTTTGTG-------------G---T-------CCTTAGTGG-CAGTTTGA-ATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGTG-GCA---CTTTG----AA-CC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT---C-------CCTTAGTGCCCATTTTGA-AATCATAAGTAG--TCCTTCGTGCCCC---CTTTG----TG-GC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-TTCTAAGTG-------------G--C-t
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC---T-------CCTTTGTGCCTCTTTTGT-GGCCTTTATTAG--TCCTAAGTACTTC----TTGT----GA-TC----------A-----------AT----AGA----------A----------G-TCCTTAGTG-------------G--C-AG----C--TTTGTTGTACTGAGTGG-TCTTTTGTG------------------AC--T-CTTT-----TGT--GGTCT--T-T------AGTAATCATAAGT-A-C-CACTTTTGTGGTCCTTG-GAAGTCCTT----AGTGAC--------tattagcagggcccg
gi|17 : gcAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG-----------GTCTTTT---GTGACTCTTTTGTGGTCT-TT---AGT------------------------AA-TCATAAGTACC----------ACTTT---------TGTG---G-----------TCCTTGGAAG-TCCTTAGTG-A------------CAGCTTTGagctttgttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaatagC-CTTT-TGAAT---T-------CCTTAGTGTCCACTTTCA-ACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCC----------CCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------TCC------------------------------------G--------TAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAATG-CC-AG-T-T-GAACT-CCTTAGAGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCAC---TTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGA-AACCTTTAGTAG--TCCTAAGTGCCCC---ATTTT----AA-
gi|2 : AC---T-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCATAGTAG--TCCTTAGTGCCCC---ATTTT----AA-CC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-TCCTTAGTG-------------GC-C-C-----C--TTTGAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TTT--A--AC--C-TCTT-----AGT--GACCCC-T-T------TGCAGTATCTAGT-G-C-C-----------CTT
gi|2 : tgcA-ACCCCTTAGTAA--TCTTTAGTGCTCC---CTTTG----AA-CC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-TCTTTAGTG-------------C--C-C-----CC-TTTGAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--T-T--A--GTGGC-ATTT-----AGTAGGACCCCCT-T------AGGAGTCCTTAGT-G-G-T-----------ACTTA-GTGGTCCTT----AGTGGC---------ATTTA--GTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTTAGTAGTCC-TT---AATG-ACCC--T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------TCTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCTTTGAAC-CCTTTAGTG-T------------CCTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGTGACC-CC-T-TTGCAGT-ACCTAGAG-CTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GTG-CC-CCAT-TTTAACCACCT--GAGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGGT-------CCTTAGTGGCCCCTTTGA-ATCCTTAAGTAG--TCCTTAGTACCCT---CATTA----AA-CC----------T-----------CTT---AGT------------------------------TA-------------C--C-C-----C--TTTGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat--A--AC--C-CCTT-----AAT--GACCAC-T-T------TGTAGTCTTCAGT-G-T-TG----------CCTTT-GAACTCCTT----AGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTTTTGTAG---CTAACTG-A------------CA-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGTGACC-CC-T-TTGAACC-CCTACGTGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaCCCCTT---AGTGACCCC--T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------TCCTT---------Ataggcatttagt
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaGA--AACCCC-T-T------AGTAGTACTTAGT-G-C-C-----------CCCTTAGCATCCCAT----AGTGGC--------T-TTTA--GT---taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatTTT---G-AACTCCTTAGTGGCCCaggacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC---T-------CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCCTAAGTAG--TCTTAAGTGCCCCATTTTTTT----AC-CC----------CTTTGACTT---CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-TCCTTAGTG-------------GC-C-C-----C--TTTGAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATTT--A--AC--A-TCTT-----AAG--GGCCCC-T-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-G
gi|3 : cAAC---C-------CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCTGTTAGTAG--TCCTTAGTGCCCC---CTTTG----AA-Cttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGA-ACTCCTTAGTGG--TCCTTAGTGCCCC---CTTTG----AA-CC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-TCCTGAGTG-------------G--C-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : ------AGTTGTCCTTAGT-G-C-CT----------CCTTT-GTGTCCCTTTTTCAGTA------------CTTA--GT---G---------------CCCTTTT-Gtattagttggacc
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGTACCCC---ATTTT----AA-CC----------C----------------------------------------------TTAGTT-------------G--C-A-----C--TTTGAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TTT--A--AG--C-CCTA-----AGG--GACACC-T-T------TGTAGTACCTAGT-G-C-C-----------CTTTT-
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAATG-TC-CC-T-TTTAACT-CCTTAGAGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tcA-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGTG-CC-CCCT-TTTAACC-CCTAAGAGA
gi|35 : ttCTTAGTGCCCC---CTTTT----AA-CC----------C-----------CTA---AGa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGTG-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAGAGGCTCCTTAGTGagaa
gi|37 : ggA--ACTCATAA-GTAG---T--CCTTAGTG-CCTTC-T-TTG
gi|38 : GTAG--TCTTAAGTGCCGC---CTTTG----AA-CT----------C-----------CTT---AGT----------tggtcc
gi|4 : ttTAGTGCCCACTTT-TTA----------------------CCACTTTAA-ACTCCTTAGTAG--TCCTTAGTGCCCC---CTTTT----AA-CC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACTCCTTAGTG-------------A--CTC-----C--TTTGAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TTT--A--AT--C-CCTT-----AGT--GACCCC-T-T------TGGAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-
gi|4 : GA--AACCCC-T-T------AGTAATCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGG---------TCATTATTGT---C---------------CCCCTTT-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatAACC-CCTTTGAGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGGT-------CCTTAGTGGCCCCTTTGA-ACCCCTAAGTAG--TCCTTAGTACCCT---CATTT----AA-CC----------T-----------CTT---AGT----------G----------A-C------------------------C-C-----C--TTTGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CT--Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttGA--AACCCC-T-T------AGTAGTCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAATCCCTT----AGTGG---------TCCTTA--GT---GC--------------CCCCTTT-AAACaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatCCTTAGTGCCCC---CTTTT----AA-CC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACTCCTTAGTA-------------GC-C-C-----C--TTTGAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CTTGAA--AC--C-CCTT-----AGT--AACCCC-T-T------TGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTTTTGAAT-TCCTTAGTGCC------------CA-TTTTCA--ACTC--A--------------TTAGTGCCC-CC-T-TTTAACC-CCTTAGAGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC-----------CCTTAGAG-----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGCCT---CTTTCTTTGAA-CC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-TCCTAAGTGC------------C--C-C-----C--TTTTAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C----------------C--C-CCTT-----AGA--GACTCC-T-T------AGTAGTCCTTAGTGG-C-C-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGGCCTTTGCAGTACCTA--GT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTG---AGTG-CCCC--T-TT-----------AAACTCCT-ACAGGC----------T---------------------------------------------CTTAGTG-G------------CA-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAATG-CC-CC-T-TTGAACT-CTTTAGAG-----------------------GC---T-------CCTTAATGTCCCCTTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTAAGTGCCCC---ATT--------------------------------------------------------------------TTAGTG-------------G--C-A-----C--TTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--ATT--G--AC--CTCCTA-----AGA--GGCTCC-T-T------TGTGGTCCTTAGT-G-G-C-----------ACTTT-GAATTTATA----AGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TTTG-A--AC--A-CCTT-----AGA--GGCTCC-T-A------AGTGGTCCTTAGT-G-C-C-----------CCTTA-GAACTCATA----ATTTGC--------TTCTTA--GT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG-----------CCCCTTA---G-AACTCATAATTTGCTTCTT---AGTG-CCCC--T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------TCCTT---------AGTA---G-----------TCTTTaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGGCCTCTTTAAACCCCTTG---G-TAGTCCTAAGTACTCTCTTTAANNNN-NNNN--N-NN-----------NNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNN---------NNNN---N-----------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-N------------NN-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNNN-NN-NN-N-NNNNNNN-NNNNNNNNAGTCCTTAGTGCCC-CCCT-TTAAC---C-------CCTTAGCACCTCCTTAGAGACTCATTAGTAG--TCCTTAGTGGCCT---CCTTG----AA-CC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-TCCTAAGTG-------------C--C-C-----CCTTTTAAACCCCTTAGAGACTCCTTAGTG--TC--CC--CTT--AGTAG--T-CCTT-----AGT--G-CCCC-T-TTTTAACNNNNNNNNNNAGT-GTC-C-----------CCTTA-GTAGTCCTT----AGTGGC--------TCCTTT--GA---A---------------CCCCTTA-GTAGTCTTTAaggggc
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGTG-CC-CC-CCTTTAACC-CCTTAGCACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG----T-------CCTTAGTGGCCTCCTTGA-ACCCCTTAGTAG--TCCTAAGTGCCCC---CTTTT----AAACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACTCCTTAGTG-------------T--C-C-----C-----------CTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CC--TTTTTA--AC--N-NNNNNNNNNAGT--GTCCCC-T-T------AGTAGTCCTTAGTGG-C-T-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTAG---------TCTTTA--GT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCCCCTTAGTAG-TCCTTAGTGG----------CTCCTTT---G-AACCCCTTAGTAGTCT-TT---AGTG-CCCCCCT-TT-----------AAAC------------------------------------------------------CCCTTTGCAG-TACCTAGTG-C------------CT-TTTTGtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgt--TTT--A--AC--C-TCTT-----AGT--GACCCC-CAT------AGCAGTACCTAGT-G-C-C-----------TTTTT-Gttgtctg
gi|9 : ccctcaGA--AACCCA-T-T------GGTAGTCCTTAGT-G-CTC-----------CCTTT-GAACCCCTT----AGTGG---------TCCTAA--GT---G---------------CCCCCTTAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 111111111111111111 1111111111111111111111 11111111111 1111111111111111111111111111111111 2222222222222222 1 11 1111111111111 222222222 3333333333333333333
lowQualScore : 2 1 2 4 8 4 666 3 7777 0 1 8 3 7777 77 3 888888888888 1 2 3 555555555555555555555555555555555555555555555 2 33 222222222 999999999999999999 33 0 2 2 666 33 2 4 2 6 2 2 2 4 4444444444444444444444 3 44 1 1 444 1 2 2 6666666666 22222222222 222 6666666666666666666666666666666666 22 0000000000000000 1 88888 3 4 444 33 33 22 777 44444 1 22 1 77777777777 1 1 0 3 1 1 5 0000000000000 6666 0 444444444 7777777777777777777 8 1
lowQualScore : . . . . . . ... . .... . . . . .... .. . ............ . . . ............................................. . .. ......... .................. .. . . . ... .. . . . . . . . . ...................... . .. . . ... . . . .......... ........... ... .................................. .. ................ . ..... . . ... .. .. .. ... ..... . .. . ........... . . . . . . . ............. .... . ......... ................... . .
lowQualScore : 2 4 7 4 9 4 444 6 1111 1 6 2 3 1111 99 3 999999999999 2 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000 9 99 333333333 666666666666666666 77 1 3 7 111 22 2 4 2 7 2 4 4 2 6666666666666666666666 8 11 5 4 777 3 3 7 3333333333 44444444444 666 6666666666666666666666666666666666 22 8888888888888888 7 22222 6 5 444 11 00 88 555 55555 8 55 6 99999999999 7 0 4 3 7 7 2 0000000000000 1111 3 333333333 1111111111111111111 0 0
consensus : TTGAACCCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C-C-----C-TTTGAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTT-------------GAA----CTCCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTNAGT-GCCCC---C-TTTNA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C-C-----C-TTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTT-------------GAA----CCCCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACNCCTTAT
gi|1 : ATTCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC-------TCCTTAGTGCCCCCTTTTAACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GCCCC---C-TTTAA-ACCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C-CACTTTC-TTTGAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaAACCCCTTAGTAG--TCATTAGT-GCTCC---C-TTAGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C-C-----C-TCTGAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCTCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C-C-----C-TTTTAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------G--T---A----------CT--TAGTGG------------TCCT-TAGTGGCATTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG-CC-CCTT---AG-AACTCATA----AGTGGCCCCTTTGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--TTTT---------AGTG---G-----------CACT-TTAAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CCCTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------ACCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GCCCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C-A-----C-TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TG--T---AAC-----T-CCT--TAGAAG-----------CTCCT-TAGTGGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTT-------------AAA----CTCATTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CC-CT-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GCCCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C-A-----C-TTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TT--T---AAC-----T-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-TAGTGGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTT-------------AAA----CTCATTAGTGGT--------TCCTTAGT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG-CC-CTTT---TG-AACTCCTT----AGAGGCTCCTTAGTG-C----CCCA-T-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------T--C-------------------------------CCCT-TTGAAC-CCCT---------TAGTAGACCTAAGTGCCCC-A-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGT-G-GC-AC-T-TTGAACT-CATTAG-TGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC-------TCCTTAGAGG----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-G-CCC---C-TTTAA-ACT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTT----------CCTTA--GTGCCNNNNNNNNNNTGTCC-C-----C-TTTGAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTT--T---AAC-----C-CCT--T--------------------T-TTG--GTCCTTAGT-G-G-C-ACTTT-------------GAA----CTCATTAGTGGC--------TCCTAAAT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT-CC-TCTTTTATG-A--TCTTT----AGTAG-TCCTAAGTG-C----TTC--T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------T--CTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCT-TTATGCATATT---------TTGTGG----------------TTTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGT-G-GT-CC-T-TGGAAGT-CACTAG-TGACAGCTTTGT-----CATA-T--------------TTAGTGG-TCCTTTGTGGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GCCTC---T-TTTGG-GGT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-T----------CTT----GTG-------------G--T-A-----C-TTGGAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : ---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGTCTTCAGT-G-T-TGCCTTT-------------GAA----CTCCTTAGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatga--T---AAC-----C-CCT--AAGGGA-----------CCCCT-TTGCAGTACTAAGT-A-C-C-TTTTT-------------tcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTT---TG-AACTCATT----AGTGGCTCCTTAGTG-C----CCC--CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGT--CCTT---------AGTG---G-----------CACT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CATTAG-AGGCTCCTTTGTG-------------G-------TCCTTAGTGG-CAGTTTGAATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-G-GCA---C-TTTGA-ACC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaGAAA-----------CACCA-TGTTAGTCCTTAGT-GAC-C-CCTTT-------------GAA----TCCCTTAGTGt
gi|16 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT-------CCCTTAGTGCCCATTTTGAAATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GCCCC---C-TTTGT-GGC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------TCTAA--GTG-------------G--C-cccattttgaaatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagcagggcccg
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC-------TCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-ACTTC---T-TGTGA---T----------C-----------AAT---AGA----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C-AG----C-TTTGTTGTACTGAGTGG-TCTTTTGTG-------------------AC-----T-CTT--TTGTGG-----------TCT-T-TAGTAATCATAAGT-A-C-CACTTTT-------------GTG----GTCCTTGGAAG---------TCCTTAGT---GA--------------CAGCTTT-Gtattagcagggcccg
gi|17 : gcGAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG-GT-CTTT---TGTGACTCTTT----TGTGGTCT-TTAGT----------------------------AA-TCATAAGTACC----------A--CTTT---------TGTG---G-----------TCCT-TGGAAG-TCCT---------TAGTGA------------C-AGCTTTGttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaataC-CTTT-TGAAT-------TCCTTAGTGTCCACTTTCAACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCCCCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--CC------------G------------------------------------------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G--C-CA-G-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGAAACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---A-TTTTA-A
gi|2 : AC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---A-TTTTA-ACC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C-C-----C-TTTGAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGTATCTAGT-G-C-C-CTT
gi|2 : tgcAACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GCTCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------C--C-C-----CCTTTGAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--TTAGT---GGC-----A-TTTAGTAGGAC-----------CCCCT-TAGGAGTCCTTAGT-G-G-T-ACTTA-------------GTG----GTCCTTAGTGGC---------ATTTAGTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTT----AGTAGTCC-TTAATG-A----CCC--T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------T--CTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCT-TTGAAC-CCTT---------TAGTGT------------C-CTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGT-GACC-CC-T-TTGCAGT-ACCTAG-AG-CTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GT-G-CC-CCAT-TTTAACCACCT--G-AGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGG----TCCTTAGTGGCCCCTTTGAATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-ACCCT---C-ATTAA-ACC----------T-----------CTT---AGT------------------------------------------TA-------------C--C-C-----C-TTTGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGTCTTCAGT-G-T-TGCCTTT-------------GAA----CTCCTTAGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTT-TTGTAG---CT---------AACTGA------------C-A-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGT-GACC-CC-T-TTGAACC-CCTACG-TGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaCCCCTTAGTGAC----CCC--T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------T--CCTT---------Ataggcatttagt
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaAACCCCTTAGTAG--TACTTAGT-GCCCC---C-TTAGC-ATC----------C-----------CAT---AGT----------G----------G-C----------TTTTA--GTA-------------G--taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatgaTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCgacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTT-TTTTA-CCC----------CTTTGACTT---CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C-C-----C-TTTGAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATT--T---AAC-----A-TCT--TAAGGG-----------CCCCT-TTGCAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------G
gi|3 : cAAC-------CCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---C-TTTGA-ACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGAACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GCCCC---C-TTTGA-ACC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTGA--GTG-------------G--C-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : AGTTG-TCCTTAGTG-CCTCCTT---TG-TGTCCCTTTTTCAGTA----CTTAGTG-C----CCT--T-TT-----------Gtattagttggacc
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-ACCCC---A-TTTTA-ACC----------C--------------------------------------------------------TTA--GTT-------------G--C-A-----C-TTTGAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TT--T---AAG-----C-CCT--AAGGGA-----------CACCT-TTGTAGTACCTAGT-G-C-C-CTTTT-------------
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-TC-CC-T-TTTAACT-CCTTAG-AGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tc-A-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGT-G-CC-CCCT-TTTAACC-CCTAAG-AGA
gi|35 : ttCTTAGT-GCCCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTA---AGa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGagaa
gi|37 : ggA--ACTCATAA-GTAG---T--CCTTAGT-G-CCTTC-T-TTG
gi|38 : GTAG--TCTTAAGT-GCCGC---C-TTTGA-ACT----------C-----------CTT---AGT----------tggtcc
gi|4 : ttTAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAAACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCCCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------A--CTC-----C-TTTGAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGGAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------
gi|4 : AACCCCTTAGTAA--TCCTTAGT-GCTCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CATTATTGTC-------------C--C-C-----C-TTTGAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaCCC---C-TTTGAGACT----------T-----------CTT---AGT----------G----------G-TACTAAGGGGTCCTTA--GTG-------------G--C-C-----CCTTTGAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--CC--CTCATT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttaaTTTAACCTCTTAGTGACCCCTTTGCAG-TACCTAGTG-CC-TTTT---TG-TTGTCCTT----AATAGttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|5 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcaAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GCTCC---C-TTTGA-ATC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C-C-----C-TTTAAACgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTAGT-GCCCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTA-------------GC-C-C-----C-TTTGAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CT--TGA-AAC-----C-CCT--TAGTAA-----------CCCCT-TTGCAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTT-TTGAAT-TCCT---------TAGTGC------------CCA-TTTTCA--ACTC---A-------------TTAGT-G-CC-CCCT-TTTAACC-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGCCTCTTTC-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-T----------CCTAA--GTGC------------C--C-C-----C-TTTTAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C-----------------C-----C-CCT--TAGAGA-----------CTCCT-TAGTAGTCCTTAGTGG-C-C-CCTTT-------------GAA----CCCCTTAGTGGCCTTTGCAGTACCTAGT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CCTG---------AGTG---C-----------CCCT-TTAAAC-TCCTACAGGCTCTTAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-CC-CC-T-TTGAACT-CTTTAG-AGGCTCCTTAATG------------------------------TCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---A-TTT--------------------------------------------------------------------------TA--GTG-------------G--C-A-----C-TTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--AT--T---GAC-----CTCCT--AAGAGG-----------CTCCT-TTGTGGTCCTTAGT-G-G-C-ACTTT-------------GAA----TTTATAAGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TT--TG--AAC-----A-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-AAGTGGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTA-------------GAA----CTCATAATTTGC--------TTCTTAGT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTT---AG-AACTCATA----ATTTGCTTCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------T--CCTT---------AGTA---G-----------TCTT-Taagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTAGGCAGC----------TGATCTT---------AGTG---C-----------CCCCATTTAAC-CCCT---------AAG-----------------A-----GA--A-TCCTTA-ATAG---T--CCTTTGTGG-CC-TC-T-TTAAACC-CCTTGGTAG--TCCTAAGTACTC-TCTT-Taggggc
gi|8 : tattttgattTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGGCC-TCTT---TA-AACCCCTT----GGTAGTCC-TAAGTA-C----TCT--C-TT------------------TAANNNNN----------N--NNNN---------NNNN---N-----------NNNN-NNNNNN-NNNN---------NNNNNN------------N-N-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNN-N-NN-NN-N-NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNAG-------TCCTTAGTGCCCCCCTTTAACCCCTTAGCA-------------CCTC---C-TTAGAGACT----------C-----------ATT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C-CT----C-CTTGAACCCCTTAGTAG-TCCTAAGTG--CC--CC--CT--TTTAAAC-----C-CCT--TAGAGACTCCTTAGTGTCCCCT-TAGTAGTCCTTAGT-G-C-C-CCTTTTTAACNNNNNNNNNNAGTGTCCCCTTAGTAG---------TCCTTAGTG--G---------------CTCCTTT-GAACCCCTTAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtggctcctttgaaccccttagtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGT-G-CC-CC-CCTTTAACC-CCTTAG-CACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG--------TCCTTAGTGGCCTCCTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GCCCC---CTTTTAA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------T--C-C---------------CCTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CCTTTT--T---AACNNNNNN-NNN--NAGTGT-----------CCCCT-TAGTAGTCCTTAGTGG-C-T-CCTTT-------------GAA----CCCCTTAGTAG---------TCTTTAGT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCCCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCT-CCTT---TG-AACCCCTT----AGTAGTCT-TTAGTG-C----CCCCCT-TT-----------AAAC--------------------------------------------------------CCCT-TTGCAG-TACC---------TAGTGC------------C-T-TTTTGtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgt--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCCATAGCAGTACCTAGT-G-C-C-TTTTT-------------Gttgtctg
gi|9 : ccctcaGAAA-----------CCCAT-TGGTAGTCCTTAGT-G-CTC-CCTTT-------------GAA----CCCCTTAGTGG---------TCCTAAGT---G---------------CCCCCTTAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 1 1 111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 111111111111111111 111111111 1111111111111111111111111111111111 2222222222222222 1 11 1111111111111111 111111111 4444444444444444444
lowQualScore : 4 2 5 0 0 5 777 4 7777 2 3 7777 77 3 888888888888 1 2 3 555555555555555555555555555555555555555555555 2 33 222222222 999999999999999999 33 0 1 2 33 33 2 4 7 2 2 2 0 888888 2 0 333333333 3 33 0 1 666666666666 222 1 2 6666666666 77777777777 222 5555555555555555555555555555555555 22 1111111111111111 66666666 3 222 22 1 3 444 22 44 22 666 66666 1 22 1 77777777777 1 1 333 3 5 1 8888888888888888 777777777 3333333333333333333 5 1
lowQualScore : . . . . . . ... . .... . . .... .. . ............ . . . ............................................. . .. ......... .................. .. . . . .. .. . . . . . . . ...... . . ......... . .. . . ............ ... . . .......... ........... ... .................................. .. ................ ........ . ... .. . . ... .. .. .. ... ..... . .. . ........... . . ... . . . ................ ......... ................... . .
lowQualScore : 2 2 0 1 0 0 000 0 7777 7 3 1111 99 3 999999999999 2 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000 9 99 333333333 444444444444444444 99 9 4 9 99 44 4 7 1 4 4 4 4 888888 4 1 111111111 8 99 8 4 888888888888 333 3 8 5555555555 33333333333 777 1111111111111111111111111111111111 11 6666666666666666 66666666 3 999 33 7 4 222 88 33 55 999 55555 7 33 6 99999999999 7 0 888 3 5 8 9999999999999999 777777777 9999999999999999999 0 7
consensus : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTTT---G-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACCCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTTT---G-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
gi|1 : TCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC-------TCCTTAGTGCCCCCTTTTAACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTAA-ACCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CACTTTC-T---T--T-GAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatAACCCCTTAGTAG--TCATTAGT-GC------------TCC---C-TTAGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---C--T-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------G--T---A----------CT--TAGTGG------------TCCT-TAGTGGC-A-TTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG-CC-CCTTA---G-AACTCATA----AGTGGCCCCTTTGTG-C----CCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--TTTT---------AGTG---G-----------CACT-TTAAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCCTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------ACCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TG--T---AAC-----T-CCT--TAGAAG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCT-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TT--T---AAC-----T-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGT--------TCCTTAGT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG-CC-CTTTT---G-AACTCCTT----AGAGGCTCCTTAGTG-C----CCCA-T-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------T--C-------------------------------CCCT-TTGAAC-CCCT---------TAGTAGACCTAAGTGCCCC-A-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGT-G-GCAC-T-TTGAACT-CATTAG-TGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC-------TCCTTAGAGG----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-G-------------CCC---C-TTTAA-ACT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTT----------CCTTA--GTGCCNNNNNNNNNNTGTCC--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTT--T---AAC-----C-CCT--T--------------------T-TTG--GT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTAAAT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT-CC-TCTTTTATG-A--TCTTT----AGTAGTCC-TAAGTG-C----TTC--T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------T--CTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCT-TTATGCATATT---------TTGTGG------------T----TTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGT-G-GTCC-T-TGGAAGT-CACTAG-TGACAGCTTTGT-----CATA-TT--------------TAGTGGTCC-TTTGTGGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GC------------CTC---T-TTTGG-GGT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-T----------CTT----GTG-------------G--T--A-----C-T---T--G-GAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : ---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatga--T---AAC-----C-CCT--AAGGGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CTAAGT-ACC-TT-TTTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTT---G-AACTCATT----AGTGGCTCCTTAGTG-C----CCC--CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGT--CCTT---------AGTG---G-----------CACT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CATTAG-AGGCTCCTTTGTG-------------G-------TCCTTAGTGG-CAGTTTGAATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-G-------------GCA---C-TTTGA-ACC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT-------CCCTTAGTGCCCATTTTGAAATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GC------------CCC---C-TTTGT-GGC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------TCTAA--GTG-------------G--C--t
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC-------TCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-AC------------TTC---T-TGTGA---T----------C-----------AAT---AGA----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--CAGC-----T-T---TGTT-GTAC---TGAGTGG-TCTTTTGTG--AC--TC--TT--T---TGTGG---T-CTT--TAGTAA-----------TCA-T-AAGTACCAC-TTTTGT-GGT-CC-TTGGAAGT----------------CCTTAGTGAC--------tattagcagggcccg
gi|17 : gcGAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG-GT-CTTTT---GTGACTCTTT----TGTGGTCT-TTAGT----------------------------AA-TCATAAGTACC----------A--CTTT---------TGTG---G-----------TCCT-TGGAAG-TCCT---------TAGTGA------------C-AGCTTTGagctttgttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaataC-CTTT-TGAAT-------TCCTTAGTGTCCACTTTCAACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCCCCCC--T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--CC------------G------------------------------------------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G--CCA-G-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGAAACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-A
gi|2 : AC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-TCTAGT-GCC-CT-T
gi|2 : tgcAACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--TTAGT---GGC-----A-TTTAGTAGGAC-----------CCCCT-TAGGAGT-C-CTTAGT-GGT-AC-TTAGTGGT----------------CCTTAGTGGC---------ATTTAGTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTT----AGTAGTCC-TTAATG-A----CCC--T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------T--CTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCT-TTGAAC-CCTT---------TAGTGT------------C-CTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGCAGT-ACCTAG-A-GCTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GT-G-CCCCAT-TTTAACCACCT--G-AGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGG----TCCTTAGTGGCCCCTTTGAATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-AC------------CCT---C-ATTAA-ACC----------T-----------CTT---AGT------------------------------------------TA-------------C--C--C-----C-T---T--T-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTT-TTGTAG---CT---------AACTGA------------C-A-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGAACC-CCTACG-TGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaAACCCCTTAGTGACCCCTT--TG------------------AAC-----C-CCT--ACGTGA-----------CTCCT-TA-TAGG-CATTTAGT-taggcatttagt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTTAGTGAC----CCC--T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------T--CCTT---------A
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaAACCCCTTAGTAG--TACTTAGT-GC------------CCC---C-TTAGC-ATC----------C-----------CAT---AGT----------G----------G-C----------TTTTA--GTA-------------G--taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatgaTTT---G-AACTCCTT----AGTGGCCCgacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTTTTTTACCC---C-TTTG--ACT----------T-----------CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATT--T---AAC-----A-TCT--TAAGGG-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTG
gi|3 : cAAC-------CCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGAACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTGA--GTG-------------G--C--T-----A-TTAGT--T-GGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : AGTTG-TCCTTAGTG-CCTCCTTT---G-TGTCCCTTTTTCAGTA----CTTAGTG-C----CCT--T-TT-----------G
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-AC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------C--------------------------------------------------------TTA--GTT-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TT--T---AAG-----C-CCT--AAGGGA-----------CACCT-TTGTAGT-A-CCTAGT-GCC-CT-TTT
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-TCCC-T-TTTAACT-CCTTAG-AGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tc-A-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTAAG-AG
gi|35 : ttCTTAGTG--CC--CCCTTT--T---AAC-----C-CCT--AAGAGA-----------aa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGa
gi|37 : ggAACTCATAAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CTT---C-TTTG
gi|38 : -TTGTAGT-C-TTAAGT-GCCGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTtggtcc
gi|4 : TAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAAACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------A--CT-C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGGAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|4 : AACCCCTTAGTAA--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CATTATTGTC-------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatga------------CCC---C-TTTGAGACT----------T-----------CTT---AGT----------G----------G-TACTAAGGGGTCCTTA--GTG-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--CC--CTCATT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGTTGT----------------CCTTAATAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttaaAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ATC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-AAACgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTA-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CT--TGA-AAC-----C-CCT--TAGTAA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTT-TTGAAT-TCCT---------TAGTGC------------CCA-TTTTCA--ACTC---A-------------TTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGC------------CTCTTTC-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-T----------CCTAA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C-----------------C-----C-CCT--TAGAGA-----------CTCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCC-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTGGCCTTTGCAGTACCTAGT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CCTG---------AGTG---C-----------CCCT-TTAAAC-TCCTACAGGCTCTTAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CTTTAG-AGGCTCCTTAATG------------------------------TCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTT--------------------------------------------------------------------------TA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--AT--T---GAC-----CTCCT--AAGAGG-----------CTCCT-TTGTGGT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAATT----------------TATAAGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TT--TG--AAC-----A-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-AAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTAGAACT----------------CATAATTTGC--------TTCTTAGT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG-CC-CCTTA---G-AACTCATA----ATTTGCTTCTTAGTG-C----CCC--T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------T--CCTT---------AGTA---G-----------TCTT-Taagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTAGGCAGC----------TGATCTT---------AGTG---C-----------CCCCATTTAAC-CCCT---------AAG-----------------A-----GA--A-TCCTTA-ATAG---T--CCTTTGTGG-CCTC-T-TTAAACC-CCTTGGTAG--TCCTAAGTACTC-TCTT-Taggggc
gi|8 : tattttgattTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGGCC-TCTTT---A-AACCCCTT----GGTAGTCC-TAAGTA-C----TCT--C-TT------------------TAANNNNN----------N--NNNN---------NNNN---N-----------NNNN-NNNNNN-NNNN---------NNNNNN------------N-N-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNN-N-NNNN-N-NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNAG-------TCCTTAGTGCCCCCCTTTAACCCCTTAGCA-------------C------------CTC---C-TTAGAGACT----------C-----------ATT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CT----C-C---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTAAGTG--CC--CC--CT--TTTAAAC-----C-CCT--TAGAGACTCCTTAGTGTCCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CCTTTTTAACNNNNNNNNNNAGTGTCCCCTTAGTAG---------TCCTTAGTG--G---------------CTCCTTT-GAACCCCTTAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtggctcctttgaaccccttagtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGT-G-CCCC-CCTTTAACC-CCTTAG-CACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG--------TCCTTAGTGGCCTCCTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---CTTTTAA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG---------------------------T-----------CCCCTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CCTTTT--T---AACNNNNNN-NNN--NAGTGT-----------CCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCT-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTAG---------TCTTTAGT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCCCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCT-CCTTT---G-AACCCCTT----AGTAGTCT-TTAGTG-C----CCCCCT-TT-----------AAAC--------------------------------------------------------CCCT-TTGCAG-TACC---------TAGTGC------------C-T-TTTTGtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgt--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCCATAGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGttgtctg
gi|9 : ccctcaAACCCATTGGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTAA--GTG-------------C--C--C-----C-C---T--TAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 11 111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11111111111111111 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 2222222222222222 1 11 1111111111111111 111111111 4444444444444444444
lowQualScore : 3 2 5 0 11 5 777 4 7777 1 3 3 7777 3 3 777777777777 1 2 555555555555555555555555555555555555555555555 3 55 333333333 99999999999999999 33 0 1 2 33 33 2 4 7 2 2 2 0 4444444444444444444444 3 33 0 1 666666666666 222 1 2 6666666666 77777777777 222 5555555555555555555555555555555555 22 1111111111111111 66666666 3 222 22 1 3 444 22 44 22 666 66666 1 22 1 77777777777 1 1 333 3 5 1 8888888888888888 777777777 3333333333333333333 5 1
lowQualScore : . . . . .. . ... . .... . . . .... . . ............ . . ............................................. . .. ......... ................. .. . . . .. .. . . . . . . . ...................... . .. . . ............ ... . . .......... ........... ... .................................. .. ................ ........ . ... .. . . ... .. .. .. ... ..... . .. . ........... . . ... . . . ................ ......... ................... . .
lowQualScore : 2 2 0 1 99 0 000 0 7777 6 6 3 1111 3 3 666666666666 0 2 777777777777777777777777777777777777777777777 1 00 333333333 22222222222222222 99 9 4 9 99 44 4 7 1 4 4 4 4 6666666666666666666666 8 99 8 4 888888888888 333 3 8 5555555555 33333333333 777 1111111111111111111111111111111111 11 6666666666666666 66666666 3 999 33 7 4 222 88 33 55 999 55555 7 33 6 99999999999 7 0 888 3 5 8 9999999999999999 777777777 9999999999999999999 0 7
consensus : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
gi|1 : TCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC-------TCCTTAGTGCCCCCTTTTAACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTAA-ACCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CACTTTC-T---T--T-GAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatAACCCCTTAGTAG--TCATTAGT-GC------------TCC---C-TTAGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---C--T-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------G--T---A----------CT--TAGTGG------------TCCT-TAGTGGC-A-TTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----AGTGGCCCCTTTGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--TTTT---------AGTG---G-----------CACT-TTAAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCCTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------ACCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TG--T---AAC-----T-CCT--TAGAAG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCT-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TT--T---AAC-----T-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGT--------TCCTTAGT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG--CC-CTTT---TG-AACTCCTT----AGAGGCTCCTTAGTG-C----CCCAT-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------T--C-------------------------------CCCT-TTGAAC-CCCT---------TAGTAGACCTAAGTGCCCC-A-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGT-G-GCAC-T-TTGAACT-CATTAG-TGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC-------TCCTTAGAGG----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-G-------------CCC---C-TTTAA-ACT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTT----------CCTTA--GTGCCNNNNNNNNNNTGTCC--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTT--T---AAC-----C-CCT--T--------------------T-TTG--GT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTAAAT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT--CC-TCTTTTATG-A--TCTTT----AGTAG-TCCTAAGTG-C----TTC-T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------T--CTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCT-TTATGCATATT---------TTGTGG----------------TTTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGT-G-GTCC-T-TGGAAGT-CACTAG-TGACAGCTTTGT-----CATA-T--------------TTAGTGG-TCCTTTGTGGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GC------------CTC---T-TTTGG-GGT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-T----------CTT----GTG-------------G--T--A-----C-T---T--G-GAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : ---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatga--T---AAC-----C-CCT--AAGGGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CTAAGT-ACC-TT-TTTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTT---TG-AACTCATT----AGTGGCTCCTTAGTG-C----CCC-CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGT--CCTT---------AGTG---G-----------CACT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CATTAG-AGGCTCCTTTGTG-------------G-------TCCTTAGTGG-CAGTTTGAATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-G-------------GCA---C-TTTGA-ACC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT-------CCCTTAGTGCCCATTTTGAAATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GC------------CCC---C-TTTGT-GGC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------TCTAA--GTG-------------G--C--t
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC-------TCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-AC------------TTC---T-TGTGA---T----------C-----------AAT---AGA----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--CAGC-----T-T---TGTT-GTAC---TGAGTGG-TCTTTTGTG--AC--TC--TT--T---TGTGG---T-CTT--TAGTAA-----------TCA-T-AAGTACCAC-TTTTGT-GGT-CC-TTGGAAGT----------------CCTTAGTGAC--------tattagcagggcccg
gi|17 : gcGAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG--GT-CTTT---TGTGACTCTTT----TGTGGTCT-TTAGT---------------------------AA-TCATAAGTACC----------A--CTTT---------TGTG---G-----------TCCT-TGGAAG-TCCT---------TAGTGA------------C-AGCTTTGagctttgttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaataC-CTTT-TGAAT-------TCCTTAGTGTCCACTTTCAACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCCCCCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--CC------------G------------------------------------------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G--CCA-G-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGAAACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-A
gi|2 : AC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-TCTAGT-GCC-CT-T
gi|2 : tgcAACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--TTAGT---GGC-----A-TTTAGTAGGAC-----------CCCCT-TAGGAGT-C-CTTAGT-GGT-AC-TTAGTGGT----------------CCTTAGTGGC---------ATTTAGTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTT----AGTAGTCC-TTAATG-A----CCC-T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------T--CTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCT-TTGAAC-CCTT---------TAGTGT------------C-CTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGCAGT-ACCTAG-A-GCTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GT-G-CCCCAT-TTTAACCACCT--G-AGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGG----TCCTTAGTGGCCCCTTTGAATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-AC------------CCT---C-ATTAA-ACC----------T-----------CTT---AGT------------------------------------------TA-------------C--C--C-----C-T---T--T-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTT-TTGTAG---CT---------AACTGA------------C-A-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGAACC-CCTACG-TGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaAACCCCTTAGTGACCCCTT--TG------------------AAC-----C-CCT--ACGTGA-----------CTCCT-TA-TAGG-CATTTAGT-taggcatttagt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTTAGTGAC----CCC-T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------T--CCTT---------A
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaAACCCCTTAGTAG--TACTTAGT-GC------------CCC---C-TTAGC-ATC----------C-----------CAT---AGT----------G----------G-C----------TTTTA--GTA-------------G--taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatgaTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCgacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTTTTTTACCC---C-TTTG--ACT----------T-----------CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATT--T---AAC-----A-TCT--TAAGGG-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTG
gi|3 : cAAC-------CCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGAACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTGA--GTG-------------G--C--T-----A-TTAGT--T-GGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : AGTTG-TCCTTAGTG--CCTCCTT---TG-TGTCCCTTTTTCAGTA----CTTAGTG-C----CCT-T-TT-----------G
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-AC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------C--------------------------------------------------------TTA--GTT-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TT--T---AAG-----C-CCT--AAGGGA-----------CACCT-TTGTAGT-A-CCTAGT-GCC-CT-TTT
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-TCCC-T-TTTAACT-CCTTAG-AGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tc-A-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTAAG-AG
gi|35 : ttCTTAGTG--CC--CCCTTT--T---AAC-----C-CCT--AAGAGA-----------aa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGa
gi|37 : ggAACTCATAAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CTT---C-TTTG
gi|38 : -TTGTAGT-C-TTAAGT-GCCGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTtggtcc
gi|4 : TAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAAACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------A--CT-C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGGAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|4 : AACCCCTTAGTAA--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CATTATTGTC-------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatga------------CCC---C-TTTGAGACT----------T-----------CTT---AGT----------G----------G-TACTAAGGGGTCCTTA--GTG-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--CC--CTCATT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGTTGT----------------CCTTAATAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttaaAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ATC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-AAACgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTA-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CT--TGA-AAC-----C-CCT--TAGTAA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTT-TTGAAT-TCCT---------TAGTGC------------CCA-TTTTCA--ACTC---A-------------TTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGC------------CTCTTTC-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-T----------CCTAA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C-----------------C-----C-CCT--TAGAGA-----------CTCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCC-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTGGCCTTTGCAGTACCTAGT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CCTG---------AGTG---C-----------CCCT-TTAAAC-TCCTACAGGCTCTTAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CTTTAG-AGGCTCCTTAATG------------------------------TCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTT--------------------------------------------------------------------------TA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--AT--T---GAC-----CTCCT--AAGAGG-----------CTCCT-TTGTGGT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAATT----------------TATAAGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TT--TG--AAC-----A-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-AAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTAGAACT----------------CATAATTTGC--------TTCTTAGT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----ATTTGCTTCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------T--CCTT---------AGTA---G-----------TCTT-Taagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTAGGCAGC----------TGATCTT---------AGTG---C-----------CCCCATTTAAC-CCCT---------AAG-----------------A-----GA--A-TCCTTA-ATAG---T--CCTTTGTGG-CCTC-T-TTAAACC-CCTTGGTAG--TCCTAAGTACTC-TCTT-Taggggc
gi|8 : tattttgattTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGG-CC-TCTT---TA-AACCCCTT----GGTAGTCC-TAAGTA-C----TCT-C-TT------------------TAANNNNN----------N--NNNN---------NNNN---N-----------NNNN-NNNNNN-NNNN---------NNNNNN------------N-N-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNN-N-NNNN-N-NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNAG-------TCCTTAGTGCCCCCCTTTAACCCCTTAGCA-------------C------------CTC---C-TTAGAGACT----------C-----------ATT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CT----C-C---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTAAGTG--CC--CC--CT--TTTAAAC-----C-CCT--TAGAGACTCCTTAGTGTCCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CCTTTTTAACNNNNNNNNNNAGTGTCCCCTTAGTAG---------TCCTTAGTG--G---------------CTCCTTT-GAACCCCTTAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtggctcctttgaaccccttagtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGT-G-CCCC-CCTTTAACC-CCTTAG-CACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG--------TCCTTAGTGGCCTCCTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---CTTTTAA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG---------------------------T-----------CCCCTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CCTTTT--T---AACNNNNNN-NNN--NAGTGT-----------CCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCT-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTAG---------TCTTTAGT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCTCCTTTGAA-CCCCTTAGTAG-TCTTTAGTGCCCC-CCTT---TA-AACCCCTT----TGCAGTACC-TAGTG-C----CTT-T-TT-----------Gtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtgg--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCCATAGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGttgtctg
gi|9 : ccctcaAACCCATTGGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTAA--GTG-------------C--C--C-----C-C---T--TAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 11 111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11111111111111111 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 2222222222222222 1 11 1111111111111111 111111111 4444444444444444444
lowQualScore : 3 2 5 0 11 5 777 4 7777 1 3 3 7777 3 3 777777777777 1 2 555555555555555555555555555555555555555555555 3 55 333333333 99999999999999999 33 0 1 2 33 33 2 4 7 2 2 2 0 4444444444444444444444 3 33 0 1 666666666666 222 1 2 6666666666 77777777777 222 5555555555555555555555555555555555 22 1111111111111111 66666666 3 222 22 1 3 444 22 44 22 666 66666 1 22 1 77777777777 1 1 333 3 5 1 8888888888888888 777777777 3333333333333333333 5 1
lowQualScore : . . . . .. . ... . .... . . . .... . . ............ . . ............................................. . .. ......... ................. .. . . . .. .. . . . . . . . ...................... . .. . . ............ ... . . .......... ........... ... .................................. .. ................ ........ . ... .. . . ... .. .. .. ... ..... . .. . ........... . . ... . . . ................ ......... ................... . .
lowQualScore : 2 2 0 1 99 0 000 0 7777 6 6 3 1111 3 3 666666666666 0 2 777777777777777777777777777777777777777777777 1 00 333333333 22222222222222222 99 9 4 9 99 44 4 7 1 4 4 4 4 6666666666666666666666 8 99 8 4 888888888888 333 3 8 5555555555 33333333333 777 1111111111111111111111111111111111 11 6666666666666666 66666666 3 999 33 7 4 222 88 33 55 999 55555 7 33 6 99999999999 7 0 888 3 5 8 9999999999999999 777777777 9999999999999999999 0 7
consensus : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
gi|1 : TCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC-------TCCTTAGTGCCCCCTTTTAACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTAA-ACCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CACTTTC-T---T--T-GAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatAACCCCTTAGTAG--TCATTAGT-GC------------TCC---C-TTAGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---C--T-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------G--T---A----------CT--TAGTGG------------TCCT-TAGTGGC-A-TTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----AGTGGCCCCTTTGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--TTTT---------AGTG---G-----------CACT-TTAAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCCTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------ACCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TG--T---AAC-----T-CCT--TAGAAG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCT-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TT--T---AAC-----T-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGT--------TCCTTAGT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG--CC-CTTT---TG-AACTCCTT----AGAGGCTCCTTAGTG-C----CCCAT-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------T--C-------------------------------CCCT-TTGAAC-CCCT---------TAGTAGACCTAAGTGCCCC-A-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGT-G-GCAC-T-TTGAACT-CATTAG-TGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC-------TCCTTAGAGG----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-G-------------CCC---C-TTTAA-ACT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTT----------CCTTA--GTGCCNNNNNNNNNNTGTCC--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTT--T---AAC-----C-CCT--T--------------------T-TTG--GT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTAAAT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT--CC-TCTTTTATG-A--TCTTT----AGTAG-TCCTAAGTG-C----TTC-T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------T--CTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCT-TTATGCATATT---------TTGTGG----------------TTTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGT-G-GTCC-T-TGGAAGT-CACTAG-TGACAGCTTTGT-----CATA-T--------------TTAGTGG-TCCTTTGTGGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GC------------CTC---T-TTTGG-GGT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-T----------CTT----GTG-------------G--T--A-----C-T---T--G-GAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : ---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatga--T---AAC-----C-CCT--AAGGGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CTAAGT-ACC-TT-TTTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTT---TG-AACTCATT----AGTGGCTCCTTAGTG-C----CCC-CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGT--CCTT---------AGTG---G-----------CACT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CATTAG-AGGCTCCTTTGTG-------------G-------TCCTTAGTGG-CAGTTTGAATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-G-------------GCA---C-TTTGA-ACC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT-------CCCTTAGTGCCCATTTTGAAATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GC------------CCC---C-TTTGT-GGC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------TCTAA--GTG-------------G--C--t
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC-------TCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-AC------------TTC---T-TGTGA---T----------C-----------AAT---AGA----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--CAGC-----T-T---TGTT-GTAC---TGAGTGG-TCTTTTGTG--AC--TC--TT--T---TGTGG---T-CTT--TAGTAA-----------TCA-T-AAGTACCAC-TTTTGT-GGT-CC-TTGGAAGT----------------CCTTAGTGAC--------tattagcagggcccg
gi|17 : gcGAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG--GT-CTTT---TGTGACTCTTT----TGTGGTCT-TTAGT---------------------------AA-TCATAAGTACC----------A--CTTT---------TGTG---G-----------TCCT-TGGAAG-TCCT---------TAGTGA------------C-AGCTTTGagctttgttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaataC-CTTT-TGAAT-------TCCTTAGTGTCCACTTTCAACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCCCCCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--CC------------G------------------------------------------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G--CCA-G-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGAAACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-A
gi|2 : AC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-TCTAGT-GCC-CT-T
gi|2 : tgcAACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--TTAGT---GGC-----A-TTTAGTAGGAC-----------CCCCT-TAGGAGT-C-CTTAGT-GGT-AC-TTAGTGGT----------------CCTTAGTGGC---------ATTTAGTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTT----AGTAGTCC-TTAATG-A----CCC-T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------T--CTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCT-TTGAAC-CCTT---------TAGTGT------------C-CTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGCAGT-ACCTAG-A-GCTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GT-G-CCCCAT-TTTAACCACCT--G-AGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGG----TCCTTAGTGGCCCCTTTGAATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-AC------------CCT---C-ATTAA-ACC----------T-----------CTT---AGT------------------------------------------TA-------------C--C--C-----C-T---T--T-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTT-TTGTAG---CT---------AACTGA------------C-A-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGAACC-CCTACG-TGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaAACCCCTTAGTGACCCCTT--TG------------------AAC-----C-CCT--ACGTGA-----------CTCCT-TA-TAGG-CATTTAGT-taggcatttagt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTTAGTGAC----CCC-T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------T--CCTT---------A
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaAACCCCTTAGTAG--TACTTAGT-GC------------CCC---C-TTAGC-ATC----------C-----------CAT---AGT----------G----------G-C----------TTTTA--GTA-------------G--taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatgaTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCgacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTTTTTTACCC---C-TTTG--ACT----------T-----------CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATT--T---AAC-----A-TCT--TAAGGG-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTG
gi|3 : cAAC-------CCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGAACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTGA--GTG-------------G--C--T-----A-TTAGT--T-GGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : AGTTG-TCCTTAGTG--CCTCCTT---TG-TGTCCCTTTTTCAGTA----CTTAGTG-C----CCT-T-TT-----------G
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-AC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------C--------------------------------------------------------TTA--GTT-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TT--T---AAG-----C-CCT--AAGGGA-----------CACCT-TTGTAGT-A-CCTAGT-GCC-CT-TTT
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-TCCC-T-TTTAACT-CCTTAG-AGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tc-A-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTAAG-AG
gi|35 : ttCTTAGTG--CC--CCCTTT--T---AAC-----C-CCT--AAGAGA-----------aa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGa
gi|37 : ggAACTCATAAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CTT---C-TTTG
gi|38 : -TTGTAGT-C-TTAAGT-GCCGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTtggtcc
gi|4 : TAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAAACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------A--CT-C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGGAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|4 : AACCCCTTAGTAA--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CATTATTGTC-------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatga------------CCC---C-TTTGAGACT----------T-----------CTT---AGT----------G----------G-TACTAAGGGGTCCTTA--GTG-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--CC--CTCATT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGTTGT----------------CCTTAATAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttaaAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ATC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-AAACgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTA-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CT--TGA-AAC-----C-CCT--TAGTAA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTT-TTGAAT-TCCT---------TAGTGC------------CCA-TTTTCA--ACTC---A-------------TTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGC------------CTCTTTC-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-T----------CCTAA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C-----------------C-----C-CCT--TAGAGA-----------CTCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCC-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTGGCCTTTGCAGTACCTAGT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CCTG---------AGTG---C-----------CCCT-TTAAAC-TCCTACAGGCTCTTAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CTTTAG-AGGCTCCTTAATG------------------------------TCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTT--------------------------------------------------------------------------TA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--AT--T---GAC-----CTCCT--AAGAGG-----------CTCCT-TTGTGGT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAATT----------------TATAAGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TT--TG--AAC-----A-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-AAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTAGAACT----------------CATAATTTGC--------TTCTTAGT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----ATTTGCTTCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------T--CCTT---------AGTA---G-----------TCTT-Taagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTAGGCAGC----------TGATCTT---------AGTG---C-----------CCCCATTTAAC-CCCT---------AAG-----------------A-----GA--A-TCCTTA-ATAG---T--CCTTTGTGG-CCTC-T-TTAAACC-CCTTGGTAG--TCCTAAGTACTC-TCTT-Taggggc
gi|8 : tattttgattTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGG-CC-TCTT---TA-AACCCCTT----GGTAGTCC-TAAGTA-C----TCT-C-TT------------------TAANNNNN----------N--NNNN---------NNNN---N-----------NNNN-NNNNNN-NNNN---------NNNNNN------------N-N-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNN-N-NNNN-N-NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNAG-------TCCTTAGTGCCCCCCTTTAACCCCTTAGCA-------------C------------CTC---C-TTAGAGACT----------C-----------ATT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CT----C-C---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTAAGTG--CC--CC--CT--TTTAAAC-----C-CCT--TAGAGACTCCTTAGTGTCCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CCTTTTTAACNNNNNNNNNNAGTGTCCCCTTAGTAG---------TCCTTAGTG--G---------------CTCCTTT-GAACCCCTTAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtggctcctttgaaccccttagtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGT-G-CCCC-CCTTTAACC-CCTTAG-CACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG--------TCCTTAGTGGCCTCCTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---CTTTTAA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG---------------------------T-----------CCCCTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CCTTTT--T---AACNNNNNN-NNN--NAGTGT-----------CCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCT-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTAG---------TCTTTAGT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCTCCTTTGAA-CCCCTTAGTAG-TCTTTAGTGCCCC-CCTT---TA-AACCCCTT----TGCAGTACC-TAGTG-C----CTT-T-TT-----------Gtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtgg--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCCATAGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGttgtctg
gi|9 : ccctcaAACCCATTGGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTAA--GTG-------------C--C--C-----C-C---T--TAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
blockSeqs : G A C CC T TTA T TTTC C C A CCCC A A TGTAGTCCATGA T A TCTTTAGTAGTCTTTAGTGGT A AT ACAGGCTCT ACCTAAGTGCCCCAT GT C T AA GA G A A C A T CCCCTTTTTCACTTAATGGT T GC G CCCATTTTTTTA TTT T G . ATTTGAGACTT GGA GGTACTAAGGAGT TT CCNNNNNNNNNNTGTC AGC C TAG GT A C TCC TT GT AG TTA NNNNN T AG T CTCCTTAGTGT A A AC G G T NNNNNNNNNAGTGTCC CCTTTGCAG GCCNNNNNNNNNNTGT G C
blockSeqs : G G . G . . . . C C . . . . T T G ATCTTTGTTGTATTAAGTGG . C . CAGC . C . . . . A C . . . CCCCATTTTAACA T . . . . . G . . . GGTACTAAGGGGT . CC TC C . . . C T . CA . GA GG . . A . . A CA G G . . T AGGA . A
blockSeqs : A T . . . . . . T C . . . . G A C TCCTTTGTGGTCCTTAGTGG . T . CCTC . C . . . . . C . . . CCCCATTTTAACT G . . . . . . . . . GGTACTAAGGGGT . CC CT . . . . C T . CT . G . . . A . . A A . G . . C GCC . A
blockSeqs : . T . . . . . . T C . . . . G T G TGATCTTAGTGC . T . CCAT . A . . . . . . . . . ACCCCTTTGAATC G . . . . . . . . . GGTT . GC C . . . . C C . CA . . . . . T . . T C . . . . C GG . T
blockSeqs : G . . . . . . C C . . . . G A A ACTTTTGTGG . C . CAC . T . . . . . . . . . NNNNNNNNNNAGT G . . . . . . . . . ACGT . CC C . . . . C A . TT . . . . . G . . T C . . . . C G . C
blockSeqs : A . . . . . . C C . . . . G T A TCCTTAGTAG . T . CAC . C . . . . . . . . . ACTCATTAGTAGT C . . . . . . . . . GACT . GC A . . . . C C . A . . . . . T . . T C . . . . T G . C
blockSeqs : A . . . . . . C C . . . . G T G NNNNNNNNNN . T . CAA . T . . . . . . . . . TCCCATTTAACT C . . . . . . . . . GACT . CC A . . . . C G . . . . . . . T . . A C . . . . C G .
blockSeqs : . . . T . . . . . C A G TCCG . C . CAC . A . . . . . . . . . GTACTAAGGGGT T . . . . . . . . . GACT . CC C . . . . C T . . . . . . . G . . T A . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . G C N TC . N . NNN . T . . . . . . . . . CCCACTTTTTA T . . . . . . . . . GGT . G A . . . . T T . . . . . . . T . . A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . N . . . . T . C . . . . . . . . . CCCCTTTTAAC T . . . . . . . . . GGT . G C . . . . C C . . . . . . . T . . T C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . CATAT G . . . . . . . . . GGT . G C . . . . C C . . . . . . . G . . A C . . . .
blockSeqs : . . N . . . . . . . . . GT T . . . . . . . . . GGT . G C . . . . . C . . . . . . . G . . T A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . AGT . G C . . . . . C . . . . . . . A . . T A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . AGT . C T . . . . . C . . . . . . . T . . T C . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . GGT . G A . . . . . T . . . . . . . T . . T A . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . . GGC . G C . . . . . C . . . . . . . T . . T A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AGT . G C . . . . . C . . . . . . . A . . T A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GGT . A C . . . . . . . . . . . . . A . . A C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GGT . C C . . . . . . . . . . . . . A . . T C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AGT . G C . . . . . . . . . . . A . . A C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AGT . G A . . . . . . . . . . T . . A C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GGT . G C . . . . . . . . T . . A C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ** ********** C*******
originalCons : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
finalCons : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--CC-------C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA
Alignments
lowQualScore : 11 111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11111111111111111 1111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 2222222222222222 1 11 1111111111111111 111111111 4444444444444444444
lowQualScore : 3 2 5 0 11 5 777 4 7777 1 3 3 7777 3 3 777777777777 1 2 555555555555555555555555555555555555555555555 3 55 333333333 99999999999999999 33 0 1 2 33 33 2 4 7 2 2 2 0 4444444444444444444444 3 33 0 1 666666666666 222 1 2 6666666666 77777777777 222 5555555555555555555555555555555555 22 1111111111111111 66666666 3 222 22 1 3 444 22 44 22 666 66666 1 22 1 77777777777 1 1 333 3 5 1 8888888888888888 777777777 3333333333333333333 5 1
lowQualScore : . . . . .. . ... . .... . . . .... . . ............ . . ............................................. . .. ......... ................. .. . . . .. .. . . . . . . . ...................... . .. . . ............ ... . . .......... ........... ... .................................. .. ................ ........ . ... .. . . ... .. .. .. ... ..... . .. . ........... . . ... . . . ................ ......... ................... . .
lowQualScore : 2 2 0 1 99 0 000 0 7777 6 6 3 1111 3 3 666666666666 0 2 777777777777777777777777777777777777777777777 1 00 333333333 22222222222222222 99 9 4 9 99 44 4 7 1 4 4 4 4 6666666666666666666666 8 99 8 4 888888888888 333 3 8 5555555555 33333333333 777 1111111111111111111111111111111111 11 6666666666666666 66666666 3 999 33 7 4 222 88 33 55 999 55555 7 33 6 99999999999 7 0 888 3 5 8 9999999999999999 777777777 9999999999999999999 0 7
consensus : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
Reference ( family-366 ) : TTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGNGGC----------T--CCTT---------AGTG---G-----------CCCT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CNTT-TTAAC-------TCCTTAGTGNCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGTG--CC--CC--TT--T---AAC-----C-CCT--TAGNGA-----------CCCCT-TNGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCCCTTT-GAACCCCTTAT
gi|1 : TCCTTAGTGCCC-ACTT-TCAAC-------TCCTTAGTGCCCCCTTTTAACCCCTTAG-AGACTCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTAA-ACCCTTAGAGACTC-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CACTTTC-T---T--T-GAACCCCTTAGTG--TC---------CC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|1 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatAACCCCTTAGTAG--TCATTAGT-GC------------TCC---C-TTAGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---C--T-GAACttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtcattagtgctcccttagaaccccttagtggtccttagtgccccctctgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|10 : gaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccactttcaactccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccctttaaacccttagagactccttagtagtccttagtggccactttctttgaaccccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaAACCGCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-----------G--T---A----------CT--TAGTGG------------TCCT-TAGTGGC-A-TTTAGT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttag
gi|11 : cccctttgcagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgattaatgcagagtcatcatttaaatcacttaatatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGG-TTAT-AATG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----AGTGGCCCCTTTGTG-C----CCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--TTTT---------AGTG---G-----------CACT-TTAAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCCTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------ACCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGCAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CC--TG--T---AAC-----T-CCT--TAGAAG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTTAGT---G---------------CCAATTT-GAACTCTTTATagg
gi|12 : TGA--ACTCCTAA-GTAG--CT--CCTTAAT-G-CCCT-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CATT-TTAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--ACCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ATC----------C-----------CTA---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTG--TC--CCA-TT--T---AAC-----T-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-TAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTTAAACT----------------CATTAGTGGT--------TCCTTAGT---GCCNNNNNNNNNNTGTCCCCTTT-GAACCCCTTA
gi|12 : CTCCTAAGTAGCTCCTTAATG--CC-CTTT---TG-AACTCCTT----AGAGGCTCCTTAGTG-C----CCCAT-TT-----------TAACTCCTTAGTG------------T--C-------------------------------CCCT-TTGAAC-CCCT---------TAGTAGACCTAAGTGCCCC-A-TTTT-A--ATCCCTAA-GTGG---T--CTTTAGT-G-GCAC-T-TTGAACT-CATTAG-TGGCTCCTTAGTGTCC-CA-T-TTAAC-------TCCTTAGAGG----------CTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-G-------------CCC---C-TTTAA-ACT----------C-----------ATT---AGT----------G----------GTT----------CCTTA--GTGCCNNNNNNNNNNTGTCC--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCTTAAGTG--CC--CCGTTT--T---AAC-----C-CCT--T--------------------T-TTG--GT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAACT----------------CATTAGTGGC--------TCCTAAAT---G---------------TCCCTTT-GAACACCTTAgtagtcttaagtgccccgttttaacccctttttggtccttagtggcactttgaactcattagtggctcctaaatgtccctttgaacaccttagag
gi|13 : tgaaTAGTGG-TCCTTTGGT--CC-TCTTTTATG-A--TCTTT----AGTAG-TCCTAAGTG-C----TTC-T-TTTGTAGTCCATGAAAGTCCTTAGTGACA---------T--CTTTGTTGTATTAAGTG---G-----------TCCT-TTATGCATATT---------TTGTGG----------------TTTTGAGTACTCCTAA-GTAC--CT--TCTTTGT-G-GTCC-T-TGGAAGT-CACTAG-TGACAGCTTTGT-----CATA-T--------------TTAGTGG-TCCTTTGTGGTCTTTAGTAG--TTCTAAGT-GC------------CTC---T-TTTGG-GGT----------C-----------TTTGGAAGT----------AC---------G-T----------CTT----GTG-------------G--T--A-----C-T---T--G-GAAGTCTTTAGTGACgag
gi|14 : ---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGagctttgttgtattaagtggtcctttgtg
gi|14 : ttaacatga--T---AAC-----C-CCT--AAGGGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CTAAGT-ACC-TT-TTTtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacccctaagggacccctttgcagtactaagtaccttttttttgtatgtaaaagg
gi|15 : ttaacatgaaaccccttaatgaccactttgtagtcttcagtgttgcctttgaactccttagtggtcgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTT---TG-AACTCATT----AGTGGCTCCTTAGTG-C----CCC-CATT-----------GACCTCCTAAGAGGCTCCTTTGTGGT--CCTT---------AGTG---G-----------CACT-TTGAAC-TCCT---------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTAATAA-GTGG--CT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CATTAG-AGGCTCCTTTGTG-------------G-------TCCTTAGTGG-CAGTTTGAATTCCTAAG-AGGCTCCTAAGT-G-------------GCA---C-TTTGA-ACC----------tttgtatgtaaaagg
gi|16 : gcaTCCTTAGTGACC-CCTT-TGAAT-------CCCTTAGTGCCCATTTTGAAATCATAAGTAG--TCCTTCGT-GC------------CCC---C-TTTGT-GGC----------C-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------TCTAA--GTG-------------G--C--t
gi|17 : aggtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagC-------TCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGCCTTTATTAG--TCCTAAGT-AC------------TTC---T-TGTGA---T----------C-----------AAT---AGA----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--CAGC-----T-T---TGTT-GTAC---TGAGTGG-TCTTTTGTG--AC--TC--TT--T---TGTGG---T-CTT--TAGTAA-----------TCA-T-AAGTACCAC-TTTTGT-GGT-CC-TTGGAAGT----------------CCTTAGTGAC--------tattagcagggcccg
gi|17 : gcGAAGTCCTTAGTGGCAGCTTTGTTG-TACTGAGTG--GT-CTTT---TGTGACTCTTT----TGTGGTCT-TTAGT---------------------------AA-TCATAAGTACC----------A--CTTT---------TGTG---G-----------TCCT-TGGAAG-TCCT---------TAGTGA------------C-AGCTTTGagctttgttgtatttagtg
gi|18 : gcctcctttgtgcctcttttgtggcctttattagtcctaagtacttcttgtgatcaataC-CTTT-TGAAT-------TCCTTAGTGTCCACTTTCAACTCCTTAttgtatttagtg
gi|19 : ggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTG-CCCCCCCC-T-TT-----------GAACTCCTAAGAGGC----------T--CC------------G------------------------------------------TAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACTCTTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G--CCA-G-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGCCC-CTTT-TTCACTTAATGGTCCTGAGTGTCCCCTTTGAAACCTTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-A
gi|2 : AC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCATAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------CATTTGAGACTTCTT---AGT----------GGTACTAAGGAG-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTTAGTA--CCTTCA--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-TCTAGT-GCC-CT-T
gi|2 : tgcAACCCCTTAGTAA--TCTTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CTTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACTCCTTAGTGG-TACTTAGTA--GT--CC--TTAGT---GGC-----A-TTTAGTAGGAC-----------CCCCT-TAGGAGT-C-CTTAGT-GGT-AC-TTAGTGGT----------------CCTTAGTGGC---------ATTTAGTAGGA---------------CCCATTTGGAACACCTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatctttagtgctccctttgaaccccttagtggtctttagtgccccctttgaactccttagtggtacttagtagtccttagtggcatttagtaggacccccttaggagtccttagtggtacttagtggtccttagtggcatttagtaggacccatttggaacacctcatcaattatcctaagt
gi|20 : tgcactccttagtgtcccctttgaaccccatagtagtccttagtgccccattttaacccatttgagacttcttagtggtactaaggagtccttagtggcccctttgaaccccttagtagtccttagtaccttcatttaacctcttagtgacccctttgcagtatctagtgcccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtgattaatgccaagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtctattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaACCCCTT----AGTAGTCC-TTAATG-A----CCC-T-TT-----------GAACGCCTAAGTGAC----------T--CTTT---------AGTA---GTCTTTAGTGGTCCCT-TTGAAC-CCTT---------TAGTGT------------C-CTCTTTTA--ACCCCTAA-GAGG--CT--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGCAGT-ACCTAG-A-GCTTTTTAGTcaattatcctaagt
gi|21 : GT-G-CCCCAT-TTTAACCACCT--G-AGACTTCTTAGTG-----GTA-CTAAGGGG----TCCTTAGTGGCCCCTTTGAATCCTTAAGTAG--TCCTTAGT-AC------------CCT---C-ATTAA-ACC----------T-----------CTT---AGT------------------------------------------TA-------------C--C--C-----C-T---T--T-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTG--TC--CC--Ttgtctctaattggaac
gi|22 : tat---AAC-----C-CCT--TAATGA-----------CCACT-TTGTAGT-C-TTCAGT-GTTGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTGGaatag
gi|23 : tgattaatgatatgtcataatttaaatcacttaaaaagtgttctttatagctaactgacagtctcaatcttaacatgaCTT---------AGCGTGTG-----------TCTT-TTGTAG---CT---------AACTGA------------C-A-ATCTTA--A-TCTTAATATGAAACC--CCTTAGT-GACCCC-T-TTGAACC-CCTACG-TGACTCCTTAt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcaAACCCCTTAGTGACCCCTT--TG------------------AAC-----C-CCT--ACGTGA-----------CTCCT-TA-TAGG-CATTTAGT-taggcatttagt
gi|23 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTTAGTGAC----CCC-T-TT-----------GAACCCCTACGTGAC----------T--CCTT---------A
gi|24 : gttattaatgccatgttataatttaaatcacttagcgtgtgtcttttgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaAACCCCTTAGTAG--TACTTAGT-GC------------CCC---C-TTAGC-ATC----------C-----------CAT---AGT----------G----------G-C----------TTTTA--GTA-------------G--taggcatttagt
gi|26 : gccaccatctatcacttaaatatgtcctttatagccaactgacaatcttaatatgaTT---TG-AACTCCTT----AGTGGCCCgacccgaatct
gi|3 : aaaccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-TGAAC-------TCCTTAGTGTCCCCTTTGAACCCCTAAGTAG--TCTTAAGT-GCCCCATTTTTTTACCC---C-TTTG--ACT----------T-----------CTT---AGTGGTACTAAGGG----------G-T----------CCTTA--GTG-------------GC-C--C-----C-T---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--TC--CTCATT--T---AAC-----A-TCT--TAAGGG-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTG
gi|3 : cAAC-------CCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCTGTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtgccccctttgaacctgttagtagtccttagtgccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|30 : ctttgaactccttagtgtcccctttgaacccctaagtagtcttaagtgccccatttttttacccctttgacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtatcctcatttaacatcttaagggcccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgattaatgacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtctttatagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTTGAACTCCTTAGTGG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTGA-ACC----------T-----------CTT---AGT----------A----------G-T----------CCTGA--GTG-------------G--C--T-----A-TTAGT--T-GGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattaagtaggaccc
gi|31 : AGTTG-TCCTTAGTG--CCTCCTT---TG-TGTCCCTTTTTCAGTA----CTTAGTG-C----CCT-T-TT-----------G
gi|32 : gtaGTAG--TCATAAGT-AC------------CCC---A-TTTTA-ACC----------C--------------------------------------------------------TTA--GTT-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCACTAGAGGCTCCTctgcctccaata
gi|33 : --TT--T---AAG-----C-CCT--AAGGGA-----------CACCT-TTGTAGT-A-CCTAGT-GCC-CT-TTT
gi|34 : t-CTTTGA--ACTCATTA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-TCCC-T-TTTAACT-CCTTAG-AGGCTCCTttgtatgtaataa
gi|35 : tc-A-TTTTGA-----TTTAG-GCAG--CTGATCTTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTAAG-AG
gi|35 : ttCTTAGTG--CC--CCCTTT--T---AAC-----C-CCT--AAGAGA-----------aa
gi|36 : ttattttgatttaggcagctgatT--CCTTAGT-G-CCCC-T-TTGAACT-CCTTAG-AGGCTCCTTAGTGa
gi|37 : ggAACTCATAAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CTT---C-TTTG
gi|38 : -TTGTAGT-C-TTAAGT-GCCGCC-TTTGAACT----------------CCTTAGTtggtcc
gi|4 : TAGTGCCCACTTT-TTA-------------------CCACTTTAAACTCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------ATT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG-------------A--CT-C-----C-T---T--T-GAACCCCTTAGTAGC-CCTTAGTGTCCC--CT--TT--T---AAT-----C-CCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGGAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTT
gi|4 : AACCCCTTAGTAA--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CATTATTGTC-------------C--C--C-----C-T---T--T-GAACtgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtaatccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcattattgtccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : tagtgcccactttttaccactttaaactccttagtagtccttagtgcccccttttaacccattagagactccttagtgactcctttgaaccccttagtagcccttagtgtccccttttaatcccttagtgacccctttggagtacctagtgccttttttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactaacaatcttaatcttaatatga------------CCC---C-TTTGAGACT----------T-----------CTT---AGT----------G----------G-TACTAAGGGGTCCTTA--GTG-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACCCCTAAGTAG-TCCTTAGTA--CC--CTCATT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGTTGT----------------CCTTAATAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
gi|5 : ttaaAACCCCTTAGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ATC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTTA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-AAACgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttgaatcccttagtggtccttagtgccccctttaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccttaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcacttaaatcacttaaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCTTAGT-GC------------CCC---C-TTTTA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTA-------------G--C--C-----CCT---T--T-GAACTCCTTAGTAG-TCCTCAGTG--CC--CC--CT--TGA-AAC-----C-CCT--TAGTAA-----------CCCCT-TTGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : -----------CCTT-TTGAAT-TCCT---------TAGTGC------------CCA-TTTTCA--ACTC---A-------------TTAGT-G-CCCCCT-TTTAACC-CCTTAG-AGACTCCTTAGTGCCC-C-TT-TTAAC--------CCTTAGAG----------ACTTCTTAGTAG--TCCTTAGTGGC------------CTCTTTC-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGC----------A----------G-T----------CCTAA--GTGC------------C--C--C-----C-T---T--T-TAACCCCTTACAGATTTCTTAGTG--C-----------------C-----C-CCT--TAGAGA-----------CTCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCC-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTGGCCTTTGCAGTACCTAGT---G---------------CCTTTTT-Gttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaattccttagtgcccattttcaactcattagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtgccccttttaacccttagagacttcttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagcagtcctaagtgcccccttttaaccccttacagatttcttagtgcccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtggcctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaata
gi|7 : ccttagtgcccccttttaaccccttagagactccttagtagcccctttgaactccttagtagtcctcagtgcccccttgaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CCTG---------AGTG---C-----------CCCT-TTAAAC-TCCTACAGGCTCTTAGTGG------------C-A-CTTTGA--ACCCCTAA-GTGG--CT--CCTTAAT-G-CCCC-T-TTGAACT-CTTTAG-AGGCTCCTTAATG------------------------------TCCCCTTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---A-TTT--------------------------------------------------------------------------TA--GTG-------------G--C--A-----C-T---T--T-GAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG--CC--CC--AT--T---GAC-----CTCCT--AAGAGG-----------CTCCT-TTGTGGT-C-CTTAGT-GGC-AC-TTTGAATT----------------TATAAGTGGT--------TCttgtctgtaata
gi|7 : TTTGTGTCTCCTAAGTG--TC--CC--TT--TG--AAC-----A-CCT--TAGAGG-----------CTCCT-AAGTGGT-C-CTTAGT-GCC-CC-TTAGAACT----------------CATAATTTGC--------TTCTTAGT---G---------------CCCCTTT-CAACTCCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctttgaacaccttagaggctcctaagtggtccttagtgccccttagaactcataatttgcttcttagtgcccctttcaactcctaagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|7 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTGAACACCTTAGAGGCTCCTAAGTGG-TCCTTAGTG--CC-CCTT---AG-AACTCATA----ATTTGCTTCTTAGTG-C----CCC-T-TT-----------CAACTCCTAAGATGC----------T--CCTT---------AGTA---G-----------TCTT-Taagatgctccttagtagtctttaggggc
gi|8 : cctgagtgcccctttaaactcctacaggctcttagtggcactttgaacccctaagtggctccttaatgcccctttgaactctttagaggctccttaatgtcccctttgaaccccttagtagtcctaagtgccccattttagtggcactttgaactcattaatggctccttagtgccccattgacctcctaagaggctcctttgtggtccttagtggcactttgaatttataagtggttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgtgtctcctaagtgtccctTAGGCAGC----------TGATCTT---------AGTG---C-----------CCCCATTTAAC-CCCT---------AAG-----------------A-----GA--A-TCCTTA-ATAG---T--CCTTTGTGG-CCTC-T-TTAAACC-CCTTGGTAG--TCCTAAGTACTC-TCTT-Taggggc
gi|8 : tattttgattTTTAACCCCTAAGAGAATCCTTAATAG-TCCTTTGTGG-CC-TCTT---TA-AACCCCTT----GGTAGTCC-TAAGTA-C----TCT-C-TT------------------TAANNNNN----------N--NNNN---------NNNN---N-----------NNNN-NNNNNN-NNNN---------NNNNNN------------N-N-NNNNNN--NNNNNNNN-NNNN--NN--NNNNNNN-N-NNNN-N-NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNAG-------TCCTTAGTGCCCCCCTTTAACCCCTTAGCA-------------C------------CTC---C-TTAGAGACT----------C-----------ATT---AGT----------A----------G-T----------CCTTA--GTG-------------G--C--CT----C-C---T--T-GAACCCCTTAGTAG-TCCTAAGTG--CC--CC--CT--TTTAAAC-----C-CCT--TAGAGACTCCTTAGTGTCCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGT-GCC-CCTTTTTAACNNNNNNNNNNAGTGTCCCCTTAGTAG---------TCCTTAGTG--G---------------CTCCTTT-GAACCCCTTAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtggctcctttgaaccccttagtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccaT--CCTTAGT-G-CCCC-CCTTTAACC-CCTTAG-CACCTCCTTAGAGACT-CATTAGTAG--------TCCTTAGTGGCCTCCTTGAACCCCTTAGTAG--TCCTAAGT-GC------------CCC---CTTTTAA-ACC----------C-----------CTT---AGA----------G----------ACT----------CCTTA--GTG---------------------------T-----------CCCCTTAGTAG-TCCTTAGTG--CC--CCTTTT--T---AACNNNNNN-NNN--NAGTGT-----------CCCCT-TAGTAGT-C-CTTAGTGGCT-CC-TTTGAACC----------------CCTTAGTAG---------TCTTTAGT---GCC-------------CCCCTTT-AAACCCCTTgtagtctttagtgcccccctttaaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|8 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagCTCCTTTGAA-CCCCTTAGTAG-TCTTTAGTGCCCC-CCTT---TA-AACCCCTT----TGCAGTACC-TAGTG-C----CTT-T-TT-----------Gtgcagtacctagtgcctttttgttgtctg
gi|9 : tattttgatttaggcagctgatcttagtgcccccatttaacccctaagagaatccttaatagtcctttgtggcctctttaaaccccttggtagtcctaagtactctctttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccttagtgcccccctttaaccccttagcacctccttagagactcattagtagtccttagtggcctccttgaaccccttagtagtcctaagtgcccccttttaaaccccttagagactccttagtgtccccttagtagtccttagtgcccctttttaacnnnnnnnnnnagtgtccccttagtagtccttagtgg--TT--T---AAC-----C-TCT--TAGTGA-----------CCCCCATAGCAGT-A-CCTAGT-GCC-TT-TTTGttgtctg
gi|9 : ccctcaAACCCATTGGTAG--TCCTTAGT-GC------------TCC---C-TTTGA-ACC----------C-----------CTT---AGT----------G----------G-T----------CCTAA--GTG-------------C--C--C-----C-C---T--TAGAACttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtag
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGATTAATGCCGAGTCGTCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAACTAACTGACAATCTTAATCTTAATATGAAACCCCT
Unaligned ( gi|27 ): TTAATGACGTGTCATCATTCAAATTACTTAAAATGTGTCCTATATAGCTAACTGACAATCTCAATCTTAATACGAAACC
Unaligned ( gi|28 ): CCTTTTTTTGTGGTCTTAGTTGCCATAAACATTTCTTTTGTGATCATAAGTAGTAGTCCTTAGTGACAGCTTTGTCGT
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAATGATTAAATCACATAAAATGTGTCCTTTGTAACTGATAATCTTAATAATAATAAAATCCTTTAGTGGCC
Unaligned ( gi|39 ): GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATA