lowQualScore : 22222222222222222222222222222 1111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333 111 22222 111 1111 11 2 111 11111111 1 33333 111 44444444444 1 111 55555555555555555555555555555 22222 22222 1 1 0000000000000000000000000 7777777 222 1 1 33 1 1 1 44444444 22 11 44444 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 4444 11 11111 333 111 22 3 11 11 222 1 33 77777777777777777777 44444444 1 1 1 1111111 2222222 4444444 99999 2222 1
lowQualScore : 22 2 3 8 99999999999999 444 99 1 00000 444 4 0 8 2 7777 6 11 99 3 1 333 3 7 88888888 0 1 44 33333 1 77 111 77777777777 3 5 444 2 555 9 8 6 6 666 3 88888888888888888888888888888 55555 55555 2 0 4 44 6 0 2222222222222222222222222 0 7777 7777777 333 5 6 5 11 5 6 5 0 7 6 2 44444444 11 2 99 33333 7 6 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 6 77777 3 3 9 5 6 3333 3 8 0 11 22222 555 444 6 1 1 00 3 8 2 5 4 66 44 0 6 000 6 0 3 0 7 00 99 1 6 99999999999999999999 6 1 88 99999999 9 0 6 5 0 3 777 3 4 3 2 2 6 66 8 2222222 0000000 5 8888888 6 0 1 11111 2 0000 3 9 5
lowQualScore : .. . . . .............. ... .. . ..... ... . . . . .... . .. .. . . ... . . ........ . . .. ..... . .. ... ........... . . ... . ... . . . . ... . ............................. ..... ..... . . . .. . . ......................... . .... ....... ... . . . .. . . . . . . . ........ .. . .. ..... . . ......................................................... . . ..... . . . . . .... . . . .. ..... ... ... . . . .. . . . . . .. .. . . ... . . . . . .. .. . . .................... . . .. ........ . . . . . . ... . . . . . . .. . ....... ....... . ....... . . . ..... . .... . . .
lowQualScore : 00 0 0 0 44444444444444 000 00 4 00000 000 4 6 0 8 0000 4 00 22 0 7 888 2 0 00000000 2 8 88 00000 0 99 777 77777777777 2 0 555 2 000 0 2 0 0 000 2 22222222222222222222222222222 00000 00000 2 0 5 55 0 0 5555555555555555555555555 2 7777 0000000 333 0 0 0 77 0 0 4 0 3 7 3 77777777 77 2 00 77777 0 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 77777 7 7 7 0 6 2222 2 2 8 00 66666 666 000 0 0 0 33 0 0 0 0 8 00 88 2 0 555 0 8 0 8 0 00 22 0 0 77777777777777777777 7 0 55 77777777 3 3 4 7 4 6 222 7 0 2 2 0 8 11 3 6666666 4444444 0 2222222 0 9 9 99999 4 6666 7 1 7
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAANGAG-TTTTAAT--CAGA---TTTTTT---ATTA-ACATGA-----CA---ATTNCGTAGC-ATACA----CTGAA--CATAT--AATTTTAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTATATTATAATAA---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCNCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATGTCTTGCATACCTTCGCTTTCTT-------AGGTG-----TTGGAGA-----CCCGGG-TGTTTTCCATTGGCGGGATTNTTCTTTCG-TCTCCGGATCA-C-TA--AATAGA-TC-C--ACGTTTCATC-GTGGTTACTATGCGATCCAAGAN--GTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTA-AAAAATTTCCTGGACG-GTTACTATNCGGTCCG-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCG-ATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT--------TAC-CGTTTG--T-TTA-TGTTCGTCTGAG-GCA--CT-A-GGGACC-GTCTTGCGCTGACCTTTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTAC-NGTGACCCGCCTGTNGCTGTATA--CGACGTCC-TTAATTGTAGTC---ACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACG-ACCCCGCCCCTTCCNATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTG--TGACTCAAATGACGCCATAATAAACA---ANCGGT--TATT-----CCTTAA-TGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGA-A-TGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-GAG---CCCCACTTTAACGTCA-ATGGGTT-G-CTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCC-TT-AAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( gi|1 ) : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAG-TTT-AAT--CGGA---TTTTTT---ATTA-ACATGA-----CA---ATTACGTAGC-ATGCA----TTGAA--CATAT--AATCTTAAAAA-AAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTTATTATAATAA--ATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG--------------------TT-------AGGTG-----TTGGAGA-----CCCAGG-TGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGATAAAC-TA--AATAGA-TG-C--ACGTTTCATCGGTGGTTACTATGCGATCC---AT--GTT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT--AAACACTTCATGGATG-GTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCT-ATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATT---AAATTTACACATTTT--T-TTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT-A-GGGACCCATCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTAC-ATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCC-TTA--TGTAGTC---ACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATG-ACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTG--TGACTCAAATGATGCCATAATAAACA---ACC------ATT-----CCTTAA-TGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTG-T-TGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACAC-AAG---CCCAACTTGAACGTCA-ATGGGTT-A-TCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCC-TA-AAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAG-TTT-TAT--CAGA----TTGTT---ATTT-ACATGA-----CA---CTGAT----C-ATATA----TT-AT--CATTTCAAATTTCAAAA
gi|19 : TCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAG-TTTTAAT---------TTTTTC---ATTA-ACTTGA-----CA---ATTTCGTAGT-ATACA----CTAAA--C--AT--AATTATAAAtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|5 : CTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTT-AAT---AGATTTTTTTTT---ATTA-ACATGAAAATTCA---ATTGCGTAGC-ATATT----CTGAA--CATAT--CAT-TTAA-------AATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTATATTATGATAA--TTAATTGATT--T
gi|13 : CTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAG-TTTTAAG--CAGA---TTTTTTTTCATTA-ACTTGA-----CA---ATTTCGTAGT-ATACA----CTAAA--CATAT--GATTT--AAAG-AAGAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTATATTATAAT-----TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|2 : GAG-GTT-AACACTGGA---CTTCCT---ATTCTACAAGA-----CACGCGTTAAGTCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATAT--AAT-TTAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTATATTATAATAA--CTAATTGATT--TATTTTG---T-----------ATTTCAAATGAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTC--TCCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATGTCTTGCATACCTTTGCTTTCTT-------AGGTG-----TTGGAGA-----CCCGCG-TGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGAT---CTTATCAATAGA-TC-CCAAC-TTTCATCCGTAGTCACTATGCAGTCCAAGAA--GTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTA-AAAAATTTCCTGGA
gi|6 : attaatacatctttATAT--AAT-TTAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTATATTA-----------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATGTCTTGCATACCTTTGCTTTCTT-------AGGTG-----TTGGAGA-----CCCGGG-TGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGAT---C-T---TATAAA----------------------TTATTATGCGATCCAAGAG--GTTCAAGATGCCTTTTCGTcacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|12 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctctgcgcagaatctgaagtcaTTTATTATTATTATCATAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G--------------------TTTCGATACACGTACATATTTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGATCA---CA--AAGATACTGTC--ATGTTTTATC
gi|14 : caTAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|3 : T--CATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATGTCTTGCATACCTTCGCTTTCTT-------AGGTG-----TTGGAGA-----CCCGGG-CGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGATCAAA-TA--AATAGT-TC-T--AAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCA--ATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACG-cctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattaTTTTCGTCGATAGCACTGT--AGAAATTTCCTGGACGCATT--TACCCG-TTTG-T--G---TTTATG----TTCATCTGAAAGCAcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : ttactcagtcacaatacgtatatTTCATCGGTG-GTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCG-ATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT--------TACACGTTTTAGT-TTA-TGTT-G-CT---------CT-ATGAGACTCATTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCAT-GACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCT-TTA---ATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACG-ACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTG--GGACTAAAATAACGCCATAATAAACA---ACCGGTAGTACT-----CCTTAA-TTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGA-A-CGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CA-TAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCT-G-CTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTC-TT-AAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGtcttgcgctgacctttttcgctgaacaatatcatagctgtagcctgttagaccacaaacatcgcgtacggtgacgcgcctgtcgctgtctacgacgtccttaattgtagtctctaacgtcgcattcatagaggtcttgtggccccatcccttcccatcttctagtgacactcttcagtctcggaacctctgatgccatttaaaaacctgcgtccgtgacagtttgtttcccgtagatgcgtgctgtattatcatatacgttttcgtcggcgaatgtccaagctgacatcaaaatttgataattgcacgcgtttcttgtggctcaaatgacgccattataaacaatcgacattattccttaatgcctagttgtttacttacagaaacaggaatgacgttgagactttattatataacgtcgacgacgtcgagtagttaccgtgcttttcaatgccaaaatatcattcagaacttgatcaattatagtttacactttaaagcattaaaagacacgaaccccactttaacgccaatgggttactaaagtaacaaataaaataacaattactttatcttaaatgaaattagttctagttataaatttggcatgaacagaggtgtacttcctgaaagtttcatgtaagaaatccttaaaatgaaaaagatacaggggcagtcgggttatatctggatc
gi|2 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtTTCATCCGTA-GTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCG-ATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATTTGGAAGTTT------TTG--C-TTA-TGTTCATCTGAGTGCA-GTTGA-GGGACCAGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATAC-CGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCC-TTAATTGTAGTC---ACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACG-ACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTA--TGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTAGT------ATT-----CCTTTA-TGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAA---TGAA-TGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTAACTT---T----------AAAG--CATAAAAAGACAC-AA----CCCCACTT---TGTCA-ATGGGTT-G-CTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAAT-C-TG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCAC-CCTTG
gi|4 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactTTTTCGTCG-ATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT--------TACCCGTTTG--TGTTTATGTTCATCTGAAAGCA---------------TCTTGCGCTGACCTTTT-------------------------TCGCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTAC-GGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCC-TTAATTGTAGTC---TCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTG-GCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTG--TGGCTCAAATGACGCCATTATAAACA---ATCGACATTATT-----CCTTAA-TGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGA-A-TGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACAC-GAA---CCCCACTTTAACGCCA-ATGGGTT-ACTAA-AGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCC-TT-AAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATCg
gi|17 : ttactcagtcacaatacgtatatAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTAC-CGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTAT-TGTAGTC---ACTAACGTCGCGT-CATAGAGGT
gi|14 : tAACAGCATGTCC--TA---TCGCCTGTGGCTGTA------ATT----------GTAGTC---ACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCC-GCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAA
gi|5 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattCGTCTATAGACGTCTTACG-ACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTG--CGACTCAAATGACGCCATAATAAACA---ACCGGTTGTATT-----CCTTAA-TGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAG-G-TATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACAT-GAG---CCCCAGTTTTACGTCA-ATGGGTTGA-TAT-AATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACT
gi|11 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttGTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATG--TGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCA---AAT------GGTAGTAACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC---------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTAGG---CCCAag
gi|7 : ATTGCGCGCGTTTCTCAAATGAATCAAATGACGCCAT----AATA---A------------------------------------ACTAACGGAAACAAGA-A-TGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACAT-GTG---CCCCACTGTAACGTAA-ATGGGTT-G-CTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACC-GT-AAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCGcta
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATATAAAACATAC-----AA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCAC-AAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTT-GCTCT-AGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA----TGTTG-ATTTGTTGAAAAATTTGTGTTA-ATATTC-TATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-GAG---CCCCATTTTAACG-CATATGGGTT-G-CTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCC-GT-AAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
gi|10 : gAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACAC-GAG---CCCCACTTTAACGTCA-ATGGATT-G-CTATAGTAACG-ATTACATGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCC-GT-AAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCAC-CCTCGta
gi|18 : gACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAG-----TTGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|20 : aaGTACGAGAAATCC-GT-AAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCG
gi|16 : AATCTATA-AAATTAAAAAAG-TTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ACATACATTTGCTTCCCAACTGATTTTGATATAGGTTTCTTTTTTGGTGTAGGATGAACTTCATTGACAGGACTGTTCCTTCGTCCTTGGGTTCAAAAATATGCAGACACATGTTTCA
Unaligned ( gi|21 ): AATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCGTATAGGTAGTTTAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111 22222 11 1 1111 111 11 111 333333333333 11 111111 222222 555555555555555555555555555555 11111 111 1 555555555 22 444444444444444 111111 1 66666666666666666666666666666 333333333 11111
lowQualScore : 1 0 4444 444 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 7 44 0 3 6666 2 5 00 999 1 33 000 333333333333 4 4 1 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 1 6 6 000000000000000000000000000000 77777 0 55 1 777 3 7 2 1 0 000000000 55 555555555555555 888888 0 99999999999999999999999999999 444 0 0 0 3 1 1 3 99 1 3 1 4 0 1 777777777 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 77
lowQualScore : . . .... ... . ..... . . . . .. . .. . .. . . .... . . .. ... . .. ... ............ . . . . .. . . .. ...... ...... . . . . . .............................. ..... . .. . ... . . . . . ......... .. ............... ...... . ............................. ... . . . . . . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... ..
lowQualScore : 0 0 8888 000 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 9 66 8 8 8888 5 7 44 999 4 88 000 444444444444 9 3 0 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 0 7 7 555555555555555555555555555555 22222 2 88 0 555 3 0 5 0 7 777777777 55 000000000000000 555555 0 00000000000000000000000000000 555 2 2 2 2 0 0 3 22 0 3 0 0 3 0 111111111 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 22
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AATTT-AAAAAAAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-A-NTA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----T---ACAC-GTTT--GT--TTA-TGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-ATCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCN-TAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAANGAGTTTTAATCAGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AATTTTAAAAAAAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCNCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTNTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-A-CTA--AAT----AGAT----CC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGANGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACGGTTACTATNCGGTCCG-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----T---AC-C-GTTT--GT--TTA-TGTTCGTCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-GTCTTGCGCTGACCTTTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACNGTGACCCGCCTGTNGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCNATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCT-TAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATCTTAAAAAAAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATAATAAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCA---TGTT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTT---ACAC-ATTT--TT--TTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCATCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC----------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCT-AAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCG-TAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATG--GTAGT--AACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATTATCA-TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-A-C-A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGA---TTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GATTT--AAAGAAGAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATAAT---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : -TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-A-A-A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTA-TAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAAT-------TTTTTC---ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AATTATAAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AATTT-AAAAAAAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC---TTATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAG-T-TTTT--GC--TTA-TGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-CAGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTA--G---T--ATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAAT-CT-GAAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCG-TAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA----TTGTT---ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAATTTCAAAAtataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGA-TCATATATTATCATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAA-ATA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----T---ACAC-GTTTTAGT--TTA-TGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-ATTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCG--GTAGT--ACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCT-TAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----T---AC-CCGTTT--GTGTTTA-TGTTCATCTGAA----------A-G-----C-ATCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACAT--T--ATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCT-TAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTT---ATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CATTT-------AAAATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATGATAATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCG--GT--TGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AATTTAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA---------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC---TT----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG---------ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCG-TAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTA-ATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCG-TAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111 22222 11 111 1111 111 11 111 333333333333 11 111111 222222 444444444444444444444444444444 11111 111 1 44444444 22 22222 333333 1 111 5555555555555 1 111 333333333 11111
lowQualScore : 1 0 4444 444 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 5 5 222 0 3 6666 2 5 00 999 1 33 000 333333333333 4 4 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 6 6 666666666666666666666666666666 77777 0 44 777 3 7 1 44444444 55 55555 222222 0 222 0000000000000 6 0 111 3 0 0 0 0 3 1 5 99 1 2 1 4 0 1 777777777 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 1
lowQualScore : . . .... ... . ..... . . . . .. . .. . . ... . . .... . . .. ... . .. ... ............ . . . .. . . .. ...... ...... . . . . .............................. ..... . .. ... . . . ........ .. ..... ...... . ... ............. . . ... . . . . . . . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 8888 000 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 7 7 999 8 8 8888 5 7 44 999 4 88 000 444444444444 9 3 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 7 7 000000000000000000000000000000 22222 2 00 555 3 0 0 77777777 55 00000 222222 0 888 5555555555555 5 0 000 2 8 2 2 2 2 0 2 22 0 5 0 0 3 0 111111111 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 0
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTTT-GT--TTA-TGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT--GT--TTA-TGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCNTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGA---TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATCT-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATAATAAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCATG---TT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTTACACATTT--TT--TTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCA-TCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC----------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCTAAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATG--GTAGT--AACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATTATCA-TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-AC--A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGA---TTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GAT-T-TAAAGA-A-GAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATAAT---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : -TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-AA--A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTATAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAAT-------TTTTTC---ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AAT-TATAAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-TATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAGTTTTTGC--TTA-TGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-C-AGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTA--G---T--ATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCTG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA----TTGTT---ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAAT-T-TCAAAA-tataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGA-TCATATATTATCATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAAA-TA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTTTAGT--TTA-TGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-A-TTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCG--GTAGT--ACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----TACCCGTTT--GTGTTTA-TGTTCATCTGAA----------A-G-----C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACAT--T--ATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTT---ATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CAT-T-TAA-------AATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATGATAATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCG--GT--TGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AAT-T-TAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA---------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-T----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG---------ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCGTAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTAATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
Alignments
lowQualScore : 1 222 22222 11 111 1111 111 11 111 333333333333 11 111111 222222 444444444444444444444444444444 11111 111 1 44444444 22 22222 222 111 5555555555555 1 111 333333333 11111
lowQualScore : 1 0 0 888 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 5 5 222 0 3 6666 2 5 00 999 1 33 000 333333333333 4 4 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 6 6 666666666666666666666666666666 77777 0 44 777 3 7 1 44444444 55 55555 111 222 0000000000000 6 0 111 3 0 0 0 0 3 1 5 99 1 2 1 4 0 1 777777777 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 0
lowQualScore : . . . ... . ..... . . . . .. . .. . . ... . . .... . . .. ... . .. ... ............ . . . .. . . .. ...... ...... . . . . .............................. ..... . .. ... . . . ........ .. ..... ... ... ............. . . ... . . . . . . . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 8 000 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 7 7 999 8 8 8888 5 7 44 999 4 88 000 444444444444 9 3 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 7 7 000000000000000000000000000000 22222 2 00 555 3 0 0 77777777 55 00000 000 888 5555555555555 5 0 000 2 8 2 2 2 2 0 2 22 0 5 0 0 3 0 111111111 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 7
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGATTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGATTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGATTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATCT-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATAATAAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCATG---TT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTTACACATTT-T-TTTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCA-TCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC----------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCTAAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATG--GTAGT--AACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATTATCA-TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-AC--A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGATTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GAT-T-TAAAGA-A-GAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATAAT---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : -TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-AA--A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTATAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAAT----TTTTTC---ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AAT-TATAAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-TATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAGTTT-TTGCTTATGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-C-AGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTA--G---T--ATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCTG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA-TTGTT---ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAAT-T-TCAAAA-tataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGA-TCATATATTATCATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAAA-TA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-TAGTTTATGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-A-TTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCG--GTAGT--ACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----TACCCGTTTGT-GTTTATGTTCATCTGAA----------A-G-----C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACAT--T--ATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTTATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CAT-T-TAA-------AATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATGATAATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCG--GT--TGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AAT-T-TAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA---------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-T----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG---------ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCGTAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTAATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
Alignments
lowQualScore : 1 111 22222 11 111 1111 111 11 111 333333333333 11 111111 222222 444444444444444444444444444444 11111 111 1 44444444 22 22222 222 111 5555555555555 1 111 333333333 11111
lowQualScore : 1 0 444 0 8 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 5 5 222 0 3 6666 2 5 00 999 1 33 000 333333333333 4 4 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 6 6 666666666666666666666666666666 77777 0 44 777 3 7 1 44444444 55 55555 111 222 0000000000000 6 0 111 3 0 0 0 0 3 1 5 99 1 2 1 4 0 1 777777777 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 0
lowQualScore : . . ... . . . ..... . . . . .. . .. . . ... . . .... . . .. ... . .. ... ............ . . . .. . . .. ...... ...... . . . . .............................. ..... . .. ... . . . ........ .. ..... ... ... ............. . . ... . . . . . . . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 222 8 0 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 7 7 999 8 8 8888 5 7 44 999 4 88 000 444444444444 9 3 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 7 7 000000000000000000000000000000 22222 2 00 555 3 0 0 77777777 55 00000 000 888 5555555555555 5 0 000 2 8 2 2 2 2 0 2 22 0 5 0 0 3 0 111111111 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 7
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGA-TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATCT-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATAATAAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCATG---TT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTTACACATTT-T-TTTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCA-TCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC----------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCTAAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATG--GTAGT--AACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATTATCA-TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-AC--A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGA-TTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GAT-T-TAAAGA-A-GAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATAAT---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : -TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-AA--A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTATAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAAT-------TTTTTC-ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AAT-TATAAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-TATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAGTTT-TTGCTTATGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-C-AGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTA--G---T--ATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCTG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA----TTGTT-ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAAT-T-TCAAAA-tataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGA-TCATATATTATCATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAAA-TA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-TAGTTTATGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-A-TTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCG--GTAGT--ACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----TACCCGTTTGT-GTTTATGTTCATCTGAA----------A-G-----C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACAT--T--ATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTT-ATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CAT-T-TAA-------AATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATGATAATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCG--GT--TGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AAT-T-TAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA---------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-T----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG---------ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCGTAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTAATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
Alignments
lowQualScore : 1 111 22222 11 111 1111 111 11 111 333333333333 11 111111 222222 444444444444444444444444444444 11111 111 1 44444444 22 22222 222 111 5555555555555 1 111 333333333 11111
lowQualScore : 1 0 444 0 8 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 5 5 222 0 3 6666 2 5 00 999 1 33 000 333333333333 4 4 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 6 6 666666666666666666666666666666 77777 0 44 777 3 7 1 44444444 55 55555 111 222 0000000000000 6 0 111 3 0 0 0 0 3 1 5 99 1 2 1 4 0 1 777777777 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 0
lowQualScore : . . ... . . . ..... . . . . .. . .. . . ... . . .... . . .. ... . .. ... ............ . . . .. . . .. ...... ...... . . . . .............................. ..... . .. ... . . . ........ .. ..... ... ... ............. . . ... . . . . . . . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 222 8 0 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 7 7 999 8 8 8888 5 7 44 999 4 88 000 444444444444 9 3 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 7 7 000000000000000000000000000000 22222 2 00 555 3 0 0 77777777 55 00000 000 888 5555555555555 5 0 000 2 8 2 2 2 2 0 2 22 0 5 0 0 3 0 111111111 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 7
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGA-TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATCT-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATAATAAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCATG---TT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTTACACATTT-T-TTTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCA-TCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC----------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCTAAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATG--GTAGT--AACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATTATCA-TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTTTAAA----AGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-AC--A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGA-TTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GAT-T-TAAAGA-A-GAATAATATCTTATT--ATATAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATAAT---TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : -TAATTGATT--TATTTTG---TATTT-----------CAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-AA--A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTATAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAAT-------TTTTTC-ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AAT-TATAAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-TATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAGTTT-TTGCTTATGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-C-AGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAAGTA--G---T--ATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCTG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA----TTGTT-ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAAT-T-TCAAAA-tataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGA-TCATATATTATCATTTCA---AATTT---CAA-AATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAAA-TA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGtttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-TAGTTTATGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-A-TTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCG--GTAGT--ACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----TACCCGTTTGT-GTTTATGTTCATCTGAA----------A-G-----C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACAT--T--ATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTT-ATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CAT-T-TAA-------AATG-T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATGATAATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCG--GT--TGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AAT-T-TAAAAATCAGAATGATGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA---------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAA-AT-------GAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-T----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG---------ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCGTAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTAATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt
blockSeqs : A C TTT C T AAATT T T A A GT A CA . A TCA A GCAA G T AAC G AT CAA TCACAAGATTTT T G AA A T AT CCTTTG GAAGTG A G T T AAAAATATGCAGACACATG CCG AA CAA A A C AGAAG AA . TT CAT GTGCAGTTGA G T AG A C C G TA G G C T A GTAGT A A A A A AT G G TA A T .
blockSeqs : C C TT . T . T T A A GT . . . . AA A ATAA G . AAT G AT . CAAAATTT T C . . T C CCTTCG T C A . . TTATCAATAGATCCCAAC CGG AA . . A C ATAAG A . TA CAT GCTCTAT A . A A C C G . A A C T G GTAGT A A . T A . T . . A . .
blockSeqs : T . . . A . G T A G . . . . . A G AT G . CA G . . CAAAT T C . . C C CCTTTG . C G . . ACAAAGATACTGTCATG . AG . G A . . GT . AA . . A . G T T . G C C C C ACATT A C . A G . G . . A . .
blockSeqs : C . . . A . G C A G . . . . . . . GC . . GA T . . CAAAT . C . . C C GGTTT . C C . . AAATAAATAGTTCTAAG G C C . G C A C T GTTGT A C . G A . G . . T . .
blockSeqs : A . . . G . . . . . . . . . G . . C . C . . C . CA . . A . . TTATAAA . . . . . G C C GT . A . C A . G . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . C . . . A . . T . G A . A . . A . .
blockSeqs : . . T . A G . G . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . .
blockSeqCons : TT* A** GC** A** CAAAATTT**** C* CCTTCG GTAGT**** *****
originalCons : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAA-AAGAATGATATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATAA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAA-ATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCG--GT--T--ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
finalCons : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGATT-TTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AAT-T-TAAAAAA--GAATGATATTTTATCGC--ATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATAATA--TAATTGATT--TATTTTG---TATTTCAAAATTT----AAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTGC-ATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCGGTAGT----ATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Alignments
lowQualScore : 1111111 22222 11 222222 1111 33333 33333333333333 111 111 5555555 11 111111 222222 444444444444444444444444444444 11111 111 1 44444444 22 22222 222 111 5555555555555 1 111 1111111 11111
lowQualScore : 1 3333333 0 8 1 00000 3 1 1 1 55 5 77 5 77 555555 4444 1 22222 2 5 33333333333333 0 66 000 000 3333333 4 0 99 6 3 11 444444 555555 2 2 6 6 666666666666666666666666666666 77777 0 44 777 3 7 1 44444444 55 55555 111 222 0000000000000 6 0 111 3 0 0 0 0 3 1 5 99 1 2 1 4 0 0000000 0 5 0 1 5 0 1 1 55 3 4 55 2 4 0 00000 0
lowQualScore : . ....... . . . ..... . . . . .. . .. . .. ...... .... . ..... . . .............. . .. ... ... ....... . . .. . . .. ...... ...... . . . . .............................. ..... . .. ... . . . ........ .. ..... ... ... ............. . . ... . . . . . . . . .. . . . . . ....... . . . . . . . . .. . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 0 8888888 8 0 4 00000 3 7 7 7 77 7 99 7 99 000000 2222 7 00000 5 7 55555555555555 2 99 000 000 1111111 3 7 22 7 7 88 555555 888888 5 2 7 7 000000000000000000000000000000 22222 2 00 555 3 0 0 77777777 55 00000 000 888 5555555555555 5 0 000 2 8 2 2 2 2 0 2 22 0 5 0 0 3 7777777 7 0 3 0 0 7 4 3 55 2 0 55 0 4 7 00000 7
consensus : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AATT-T--AAAAA---A-GAATGA----TATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATA------AT-AA-TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAAA-TT-AAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCGGTAGTATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
Reference ( family-3591 ) : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAANGAGTTTTAATCAGA-TTTTTTTT-ATTAACATGA-----CAATTNCGTAGCATACACTGAA--CA-TAT--AATT-T--AAAAA---A-GAATGA----TATTTTATCGCA--TAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATA------AT-A--TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAAAATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATCCCCTGGCGATCGGCGAAGAAGACGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCGGGATTGTTCTTTCG-TCTCCGGA-TC-AN-TA--AAT----AGAT----NC--ACGTTTCAT-C-G-TGGTTACTATGCGATCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCNTGGACGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-T-GTTTATGTTCATCTGAG-GCA--CT--A-GGGAC-C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGCGTACCGTGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTCAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCCGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCGTTTCTTGTGACTCAAATGACGCCATAATAAACAANCGGTAGTATTCCTTAATGCCTTGTTGTTTACTAACGGAAACAGGAATGACGTTGAGANTTTGT-TATATGACGTCGAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAGTTGATCAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCACCCCTCG
gi|1 : TCTCTGTGCAGAACCTGAAGTCAAAAGAGTTT-AATCGGA-TTTTTT---ATTAACATGA-----CAATTACGTAGCATGCATTGAA--CA-TAT--AATC-TTAAAAAA---A-GAATGA----TATTTTATTGCAAATGAATTGCTAGTAAATTTTT-ATTATA------AT-AAATAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAAATTTCAAATGAAACTTACTTTTCCATAATAGGCAGCATTAACAGTCTGTCCTATCGGCACTGCATGTTGGAGAATCATCCTCTGGCTATCAGCAAAGAAGATGTACATTTGCTTGTC--AGATG-T---------------------TAGGTGTTGGA------GACCCAGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTGCTCTTTTG-TCTCCAGA-TA-AACTA--AAT----AGAT----GC--ACGTTTCAT-C-GGTGGTTACTATGCGATCCATG---TT---GATGCGTTTTCATCTATAGCACTGT-AAACA-CTTCATGGATGGTTACTATGCGATCCA-T--G---TTGATGCGTTTTCATCTATAGCACTGTAAACA--CTTCCAGGATGCATTAAATTTACACATTT-T-TTTAATGTTTA-CTGAGAGCAAGCT--A-GGGAC-CCA-TCTTGTGCCGACCTTTTTCATATTTAATTGTTCTGTAAGAACTCACTGAAGAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCACGTACATAGACCCGCCTGTCGCTGTATA--CGACTTCCTTA--TGTAGTCACTAACATCGCATCCAAGGAGGTCTTATGACCC-GCCCCTTCCCATTTTCTAGTGACACTCTTTTGTCTCGGAACCTCTGATATCATTCAAAAACCTGCGTCTGTGACAGTTTCTTTACAGTAGATGCCTGCTGTATCATTTCATACGTTTTGGTTGGCGAATATCCAAGCTGACAACAATATTTGATAATTGCGCTAGTTTCTTGTGACTCAAATGATGCCATAATAAACAACC------ATTCCTTAATGCCTTGCTGTTTACTAACGGAAACAGTGTTGATGTTGAGATTTTGT-TATATGACGTCAAAGACGCCGAATAATAATCCTGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAGAAATTGATCAATTGAACTTAAATTTTACACTTAAAAG--CATTAAAAGACACAA-GCCCA--ACTTGAACGTCA-ATGGGTTATCA-AGTAATGAATAAAATGACAATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGAGGACTGGTGTACTTGCTGAAATTTTCGTGTAAGAAATCCTAAAAATAAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACTCCTCG
gi|10 : GAAGACGTCGAATAATAATCATGCCTTTCAGCGCCAAAATATTGTATTTAAAAATTGATTAATTTAACTTAA-TTTTACACTTTAAAG--CATAAAAAAACACGA-GCCCC--ACTTTAACGTCA-ATGGATTGCTATAGTAACGATTACA-TGATTATTACTTTTTCTGAAATGAAAATCATTAGAGTTATATATTTGGCATGAATAGA-----GGTGTACTTGTTGAAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAAGTGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCA-CCCTCG
gi|11 : GTAGATGCCTGCTGTATCATCTTATACG-----GTTGGCGAATATCCA-GCTGACAACAAAACTTGATAATTGTGCGCGTTTCATGTGATTCAAATTATGCCATGGTAAGCAAATGGTAGTAACACTAATTGGCTTGTTGATTACTGACAAAAAC-------------AGAATTTGT-TATATGACGTTGATGACATC-AATAATATTAATGTTTTTCAGCGTAAAAATGTCACATTTAGAATTTGATCAGTTCAACTTAGATTTTGCACTTTAAAG--GGTTATAAACCACTA-GGCCC--ACT
gi|12 : ATTTATTATTATT------ATCA--TAATT-ATTATTGTTTTGCAATATTTTCACAAGATTT---TAAAAGTTACCTTTGAATCATAGTCTGCGCTTACTGTCTGTATT-TCGGCACAGCAAGTTCTATGATCATTCCCTTTCTATCCGCGAAGAACACAAACATCTGCTCCCCAAAGA-G-TTTCG--ATA----CACGTACATA--T-TTGGAGAAGTGGACGAGGTTGTATTCCATTACCGGGATTGTTCCTTCG-TCTCAGGA-TC-AC--A--A------AGATACTGTC--ATGTTTTAT-C-a
gi|13 : cCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAAAGAGTTTTAAGCAGA-TTTTTTTTCATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--CA-TAT--GATT-T--AAAGA---A-GAATAA----TATCTTATTATA--TAAATTACTAGTAGAGTTAT-ATTATA------AT----TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---C-------AAATGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCGtgagt
gi|14 : --TAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAAA-------TGAAACTTACTTTTCCATAATACGCAGCATTAACAGCATGTCCTATCG
gi|14 : CGCCTGTGGCTGTA---------------ATTGTAGTCACTAACGTCGCGTCCATAGAGGTCTTACGTCCCCGCCCCTTCCGATCTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAAcctgtggctgtaattgtagtcactaacgtcgcgtccatagaggtcttacgtccccgccccttccgatcttctagtgacactcttccgtctcggaa
gi|15 : taattgatttattttgtatttcaaatgaaacttacttttccataatacgcagcattaacagcatgtcctatACATACATTTGCTTCCC--AACTGATTTTGATATAGGTTT-CTTTTTT-GGTGTAGGAT-----GAAC---------TTCATTGACAGGACTGTTCCTTCG-TCCTTGGGTTC-AA--A--AATATGCAGAC----AC--ATGTTTCA
gi|16 : AATCTATAAAATTAAAAAAGTTCAGGGACAGTCCGGTTATGTCTCGATCATCCCTCG
gi|17 : agaatatgtctgcataaggcattacaaaatgtttaaaggcaaagaaaaacAGTACCATAGCTGTAGCTTGTACGACCACAAACATCCCGTACCGTGACCCGC------CTGTATA--CGACGTCCTTTATTGTAGTCACTAACGTCGCGT-CATAGAGGTtatg
gi|18 : tACAATTACTTTTTCTGAAATAAAAATTGTTCTAGGTATATATTTTGCATGAATAGT-----TGTGTACTTGCTAAAATTCCCATGTAAGAAATC
gi|19 : aaTCTCTACGCAGAACCTGAAATCAAACGAGTTTTAA-------TTTTTTC-ATTAACTTGA-----CAATTTCGTAGTATACACTAAA--C---AT--AATTAT--AAA
gi|2 : TCTCTACGCAGAAGTTGAAGTCATATAA--TTTAA
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagTGAAGTCA-TAT--AATT-T--AAAAA---AAGAATGA----TATTTTATCGCAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTATA------AT-AACTAATTGATT--TATTTTG---TATTT---CAAA-------TGAAACTTACTTTGCAATAATACGCAGCATTAACAGTCT--CCTATCGGCAATGCATGCTGGAGATCCATCACCTGGCGATCGGTGCTGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGCGTGTTTTCCATTGGGGGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-TATCAAT----AGAT----CCCAAC-TTTCATCC-G-TAGTCACTATGCAGTCCAAGAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGT-AAAAAATTTCCTGGACaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtagtcactatgcagtccaagaagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaatttcctggacacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|2 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagtGTCACTATGCAGTCCA-A--GAAGTTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAA-TTTCCTGGACACATT-----TGGAAGTTT-TTGCTTATGTTCATCTGAGTGCA--GTTGA-GGGAC-C-AGTCTTGCGCTGACCATTTTCATGTTTAATTGTTCTGTAAGAACTCGCTGAACAATACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCCCATACCGTGACCCACCTGCGACTGTATA--TTACATCCTTAATTGTAGTCACTAACGTCGCATCCATAGAGGTCTTACGACCCCGCCCTTTC-----TTCTTGTGACAAAAGTCCATCTCGGAACCTCTGATGCCATTAAAAAACCTACGTCCTTGACAGTTTCTTTCCCATAGATGCCTGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACAAAATTTGATTATTGCACGCATTTCTTATGACTCAAATGATGCCATAATAAACAA---GTAGTATTCCTTTATGCCTTGTTGTTTACTAACAGAAAT--GAATGACAATGAGAATTTGT-TATATGACGTCTACGACATGGAGTAATAATATTGCTTTTCAGTGCCAAAATGTCATATTTAGAAATTGATCAATTTA-------------ACTTTAAAG--CATAAAAAGACAC-A-ACCCC--ACTTT---GTCA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATAACTTTGTCTGAAATGATAATCATTGTAGTAATAGATTTGACATGAATATA-----GGTGTACTTGCTGAAATTTTCATGTAAGAAATCTG-AAAATCAAAAAGATACAGGGGCAGTCTGGTTATTTCTGGATCACCCTTacatttggaagtttttgcttatgttcatctgagtgcagttgagggaccagtcttgcgctgaccattttcatgtttaattgttctgtaagaactcgctgaacaataccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcccataccgtgacccacctgcgactgtatattacatccttaattgtagtcactaacgtcgcatccatagaggtcttacgaccccgccctttcttcttgtgacaaaagtccatctcggaacctctgatgccattaaaaaacctacgtccttgacagtttctttcccatagatgcctgctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctgacaacaaaatttgattattgcacgcatttcttatgactcaaatgatgccataataaacaagtagtattcctttatgccttgttgtttactaacagaaatgaatgacaatgagaatttgttatatgacgtctacgacatggagtaataatattgcttttcagtgccaaaatgtcatatttagaaattgatcaatttaactttaaagcataaaaagacacaaccccactttgtcaatgggttgctatagtaacgaataaaatgacaataactttgtctgaaatgataatcattgtagtaatagatttgacatgaatataggtgtacttgctgaaattttcatgtaagaaatctgaaaatcaaaaagatacaggggcagtctggttatttctggatcacccttgg
gi|20 : attaatacatctttgaggttaacactggacttcctattctacaagacacgcgttaagtctctacgcagaagttgaagtcatataatttaaaaaaagaatgatattttatcgcaaataaattgctagtaaatttatattataataactaattgatttattttgtatttcaaatgaaacttactttgcaataatacgcagcattaacagtctcctatcggcaatgcatgctggagatccatcacctggcgatcggtgctgaagatgtacatttgcttgccggatgtcttgcatacctttgctttcttaggtgttggagacccgcgtgttttccattggggggatttttctttcgtctccagatcttatcaatagatcccaactttcatccgtaAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATAGAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTTGATCACCCCTCGgg
gi|21 : gtacgAATCCGGTTATAACTGGATCATCCCTCG
gi|3 : TCTCTACGCAGAACCTGAAGTCAAACTAGTTTT-ATCAGA----TTGTT-ATTTACATGA-----CACT---G-ATCATATATT-AT--CA-TTTCAAATT-T--CAAAATTTA--AATGAAACTTACTTT-TC-CA--TAAAtataggtagtttaat
gi|3 : TTTTATC------AGATTGTTA-----TTTAC-ATGACACTGATCAT-A--TA-TTA--T--CATTTCA---AATTT---CAAAATTTAAATGAAACTTACTTTTCCATAAAACGCAGCATAAACAGACGGTCCTATCGGCACTGCATGCTGGAGAATCATGCCATGGCGATCGGTGAAGAAGATGTACATTTACTTGCC--GGATG-TCTTG-CATACCTTCGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGCGTTTTCCATTGGCCGGATTGCTCTATCGTTTTTCGGA-TCAAA-TA--AAT----AGTT----CT--AAGTTTCAT-CGG-TGGTTACTATTCGATCCAATAAGTT---GATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctaagtttcatcggtggttactattcgatccaataagttgatgccttttcgtcgatagcactgtaaaaaaatttcctggacgcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|3 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagAAGTTTCATCGGTGGTTACTATTCGATCCAATAAG---TTGATGCCTTTTCGTCGATAGCACTGTAAAAAAATTTCCTGGACGCATT-----TACACGTTT-TAGTTTATGTT---------GCT--CT--ATGAGACTC-A-TTTTACGCTGACCTTTTTCATATTTAATTATTCTGTAAAAACTCTCTGAACAGTACCATAGCTGTAGCCTGTAAGACCACAAACATCGTGTACCATGACCCGCTTGTTGGTGTATATACGACGTCTTTAATAGTTGTAACTAACGTCGCGTCCATGGAGGTCTTACGACCCCACCCCTTCCAATTTTCTAGTGACACTCTTCCGTCTCGGAACCTCTGATGACATTCAAAAACCTGCGTCCGTGGCAGTTTCCTTCCCGTAGATGCCGGCTGTATCATCTCATACGTTTTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTAACAACAAAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGGGACTAAAATAACGCCATAATAAACAACCGGTAGTACTCCTTAATTCCTTATTGTTTACTAACGGAAACAGGAACGACGTTGAGACTTTGT-TTTATAACGTCAAAGACGTCGAGTAATAATCGTGCTTTTCAACGCCAAAATATCAAATTTGGAAGTATACCAACTGAGCTTAAAGTTTACACTTTAAAG--CATAAA----------------------AACGTCA-ATGGGCTGCTGTAGTAACGAATTACACGACAATTACTTTCTCTGTAATTAAAATCGTTCCAGTTATAGAATTGGCATGAATAGA-----GGTATTCTTGCTAAATTTTTTATGTAAGAAATTCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCCGGTTATTTCTGGATCGTCCCTCGcatttacacgttttagtttatgttgctctatgagactcattttacgctgacctttttcatatttaattattctgtaaaaactctctgaacagtaccatagctgtagcctgtaagaccacaaacatcgtgtaccatgacccgcttgttggtgtatatacgacgtctttaatagttgtaactaacgtcgcgtccatggaggtcttacgaccccaccccttccaattttctagtgacactcttccgtctcggaacctctgatgacattcaaaaacctgcgtccgtggcagtttccttcccgtagatgccggctgtatcatctcatacgttttggttggcgaatgtccaagctaacaacaaaatttgataattgcgcgcatttcttgggactaaaataacgccataataaacaaccggtagtactccttaattccttattgtttactaacggaaacaggaacgacgttgagactttgttttataacgtcaaagacgtcgagtaataatcgtgcttttcaacgccaaaatatcaaatttggaagtataccaactgagcttaaagtttacactttaaagcataaaaacgtcaatgggctgctgtagtaacgaattacacgacaattactttctctgtaattaaaatcgttccagttatagaattggcatgaatagaggtattcttgctaaattttttatgtaagaaattcttaaaatgaaaaagatacaggggcagtccggttatttctggatcgtccctcg
gi|4 : tctctacgcagaacctgaagtcaaactagttttatcagattgttatttacatgacactgatcatatattatcatttcaaatttcaaaatttaaatgaaacttacttttccataaaacgcagcataaacagacggtcctatcggcactgcatgctggagaatcatgccatggcgatcggtgaagaagatgtacatttacttgccggatgtcttgcataccttcgctttcttaggtgttggagacccgggcgttttccattggccggattgctctatcgtttttcggatcaaataaatagttctTTTTCGTCGATAGCACTGTAGAAA--TTTCCTGGACGCATT-----TACCCGTTTGT-GTTTATGTTCATCTGAA----------A-G-----C-A-TCTTGCGCTGACCTTTTTC-------------------------GCTGAACAATATCATAGCTGTAGCCTGTTAGACCACAAACATCGCGTACGGTGACGCGCCTGTCGCTGTCTA--CGACGTCCTTAATTGTAGTCTCTAACGTCGCATTCATAGAGGTCTTGTGGCCCCATCCCTTCCCATCTTCTAGTGACACTCTTCAGTCTCGGAACCTCTGATGCCATTTAAAAACCTGCGTCCGTGACAGTTTGTTTCCCGTAGATGCGTGCTGTATTATCATATACGTTTTCGTCGGCGAATGTCCAAGCTGACATCAAAATTTGATAATTGCACGCGTTTCTTGTGGCTCAAATGACGCCATTATAAACAATCGACATTATTCCTTAATGCCTAGTTGTTTACTTACAGAAACAGGAATGACGTTGAGACTTTAT-TATATAACGTCGACGACGTCGAGTAGTTACCGTGCTTTTCAATGCCAAAATAT--CATTCAGAACTTGATCAA------TTATAGTTTACACTTTAAAG--CATTAAAAGACACGA-ACCCC--ACTTTAACGCCA-ATGGGTTACTAAAGTAACAAATAAAATAACAATTACTTTATCTTAAATGAAATTAGTTCTAGTTATAAATTTGGCATGAACAGA-----GGTGTACTTCCTGAAAGTTTCATGTAAGAAATCCTTAAAATGAAAAAGATACAGGGGCAGTCGGGTTATATCTGGATC
gi|5 : ttactcagtcacaatacgtatatCTCTACGCAGAACTTTAAATCAAAAGAGTTTTAAT-AGATTTTTTTTT-ATTAACATGAAAATTCAATTGCGTAGCATATTCTGAA--CA-TAT--CATT-T--AA---------AATG-----T-TTTTATCGC---------------AAATTTAT-ATTATG------AT-AATTAATTGATT--T
gi|5 : CGTCTATAGACGTCTTACGACCCCGCCCCTTCCCATCATCTAGTGACACTCTTCGTTCTCGGAACAACTGATGCCATTCTAAAAGCTGCGTCCGTGACAGTTTCTTTCCTGTAGATGCCTGCTGTATCATCTCTCGCGTTCTGGTTGGCGAATGTCCAAGCTGACAACACAATTTGATAATTGCGCGCATTTCTTGCGACTCAAATGACGCCATAATAAACAACCGGTTGTATTCCTTAATGTATTTTTATTTACTAACGGAAAGAGGTATGAAACTGAGAATTTAT-TATATTATGTCGAAGACGTGGAGTAATAATCGTGCTTTTCAGCGCCAAAACATCATATATAGAAGTTGATAAATTTAACTTAAATATTACAATTTAAAG--CATAAAAAGACATGA-GCCCC--AGTTTTACGTCA-ATGGGTTGATATAATAACAAATAAAATGACAATTCCTTTTTCTGAAAGGAAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATAAATAGA-----GGTGTACTcgtctatagacgtcttacgaccccgccccttcccatcatctagtgacactcttcgttctcggaacaactgatgccattctaaaagctgcgtccgtgacagtttctttcctgtagatgcctgctgtatcatctctcgcgttctggttggcgaatgtccaagctgacaacacaatttgataattgcgcgcatttcttgcgactcaaatgacgccataataaacaaccggttgtattccttaatgtatttttatttactaacggaaagaggtatgaaactgagaatttattatattatgtcgaagacgtggagtaataatcgtgcttttcagcgccaaaacatcatatatagaagttgataaatttaacttaaatattacaatttaaagcataaaaagacatgagccccagttttacgtcaatgggttgatataataacaaataaaatgacaattcctttttctgaaaggaaaatcgttctagttatagatttggcataaatagaggtgtactag
gi|6 : ctctacgcagaactttaaatcaaaagagttttaatagatttttttttattaacatgaaaattcaattgcgtagcatattctgaacatatcatttaaaatgtttttatcgcaaatttatattatgataattaattgatttTGCGCAGAAT---CTGAAGTCAATAT--AATT-T--AAAAATC-A-GAATGA----TGTTTTATCATAAATAAATTGCTAGTAAATTTAT-ATTA----------------ATTAATT--TATTTTG---TATTT---CAAA-------TGAAACTTACTTTCCCATAATA------ATTAATAGTTTGTCCTATTGGCACTGCATGCTGGAGAACCATCGTCTGGCGATCGGCGAAGAAGATGTACATTTGCTTGCC--GAATG-TCTTG-CATACCTTTGCTTTCTTAGGTGTTGGA------GACCCGGGTGTTTTCCATTGGCAGGATTTTTCTTTCG-TCTCCAGA-TC--T-T----AT----AAA--------------------------TTATTATGCGATCCAAGAGGTTCAAGATGCCTTTTCGTag
gi|7 : ttaatacatctaggttaacactggacatcctattctgcaacgcacgccttgggtctcATTGCGCGCGTTTCT-------CAAATGA-------AT---CAAATG-----ACGCCATAATAA----------ACTAACGGAAACAAGAATGGCGTTGGAATTTTGT-TTTATGACGTCGAAGACGTCAAGTAATGATCGTGATTTTCAGCGCCAAAATATTACATTTAGAAATTGATAAATTTAACTTAAATTTTACACTTTAAAG--CATATAAACACATGT-GCCCC--ACTGTAACGTAA-ATGGGTTGCTATAGTAACGAATAAAATGACAATTAATTTTTATGAAATGGAAATCGTTCTAGTTATAGATTTGGCATGAATAGA-----GATGTACTTGCTGAAATTTTCATCGAAGAAGACCGTAAAATGAAAAAGATACAGGTGCAGTCCGGTTACTTCTGTATCACCCCTCG
gi|8 : TTCAAATTGTGTATATATAATAT--AAAACAT---ACAA-AACCGTGCTTTTCAGCGCCAAA-TATCACACTTAGAAGTTGATCAATTTTACTTAAATGTTACACTTTAAAGATCATAAAAAGGCACAAGGCCCCTAAC----ACGTCA-ATTGGTTGCTCTAGTAACGAATGAAATGATATTTCCTGTTTCTGAAAATAATTTTGTGTTTGTTAT---TTT-GCATGAATAGA-----TGTTGATTTGTTGAAAAATTTGTGTTAATATTCTATCAAATAAAATAGATACATGG---GTC----TATTTATAAATCACt
gi|9 : tactgacataacaaactgctGTCGAAGATGTCAAGTATTAGTCATGCTTTTCAGCGCCAAAATATCACATTTAAAAGTGGATCAATTTAGCTTAAATTTTGCACTTTAAAG--CATAAAAAGACACGA-GCCCC--ATTTTAACG-CATATGGGTTGCTATAGTAACGATTAAAATGACACTTACTTTGTCTGAAATAATAATCATTCTAGTTATAAATTTGGCATGAATAGA-----GGTATACTTGCTGGAATTTTCATGTAAGAAATCCGTAAAATGAAAAAGATACAGAGGCAGTCCGATTATTTCTGGATCACCCCTCGacttt