lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
lowQualScore                  :                            1                                                  22          22222          1                                       1          333                        222222222                              22222               3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333               1111                                           1                     111111111   11         111                       111               44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                11111111            111111111                2222222222           11111                               3                            6666666666666              1    444444              111                666       3333      111           55        1  
lowQualScore                  :                      6  2  3    55555        2 2 22  333 5 22     666    22 2 11    3     00000          6      5555  2  2 33 5555   777777  2   5 444    2 444          4    2        555555555  3         444   0  3  3   3 11111   777     66  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  8  999  0    5555     4  777 4     4         0   7777  3    6     666 0    3    3 444444444   77       2 777  4  999999   1 666  0 888   5     8     55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555  9  55  55     33333333 1  55   4  666666666  2   2 5  4    0000000000           11111  4   2 4 66  6666      0   6  0     6             6    3   0000000000000  0  5    33  4    888888      1  8    999              2 222       5555   6  666  77 3 6   55 6  6   7  
lowQualScore                  :                      .  .  .    .....        . . ..  ... . ..     ...    .. . ..    .     .....          .      ....  .  . .. ....   ......  .   . ...    . ...          .    .        .........  .         ...   .  .  .   . .....   ...     ..  ..........................................................  .  ...  .    ....     .  ... .     .         .   ....  .    .     ... .    .    . .........   ..       . ...  .  ......   . ...  . ...   .     .     .................................................................  .  ..  ..     ........ .  ..   .  .........  .   . .  .    ..........           .....  .   . . ..  ....      .   .  .     .             .    .   .............  .  .    ..  .    ......      .  .    ...              . ...       ....   .  ...  .. . .   .. .  .   .  
lowQualScore                  :                      3  2  4    33333        0 0 88  555 7 66     000    88 3 66    4     11111          4      0000  4  4 22 0000   222222  5   5 444    7 666          8    2        555555555  6         333   5  6  6   6 55555   000     11  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  0  777  7    6666     0  000 0     8         2   7777  6    5     444 3    6    6 555555555   77       2 111  0  222222   9 333  4 888   6     9     88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  8  55  55     77777777 6  55   0  000000000  7   9 2  4    4444444444           11111  4   2 4 44  3333      4   6  1     0             6    0   8888888888888  8  0    22  6    999999      0  0    666              5 555       3333   0  555  00 0 0   00 0  0   0  
consensus                     :               AAAAGAAGAC-AAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTA----TACAGCCTTCATCAGGTT----CA-AA-A--T----ACA------TA-ATAAT---AAAC-AACGTCATAAATTGATGACGTCATAAAC---AG-TTAAA-CGACGTTACGT-TTTGGC-GT-AAA-AA-NANATG---AAATA--TG---------CAGA---ATAT--T---GGC--A--A---------G-------------CA-TA-CCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAANGTAAACAGGATAT----AC-ATAAATATAA---GTACAG-GATC-A---------AAANGATACATAATTACCA-GT--GA--AAAGAAANTGCGT--GTTAAGCAG-AAAAACAN-A--AA--ANNC-AGT-A-A--ATA---AATG---T---ACTA----CA-----T-A-GT--ATAAC--CT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA---------TGGCAGGTNAG-AAAA---------CTATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGCCCAAAAAGAGAGACTAATAAACAGGGTACANAATT-TTTGATAA---TAAGGCCTTGCGGAAAAACTGTACCCAGTTTATG-AATCCAGTAGGTCTCCTTCAANAGTCCTTTCAT---GTTGTTANNNACNNCNATGTCAATGAGGATGAAA
Reference ( gi|1 )            :               AAAAGAAAAC-AATCTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAAC--AGTTTATTTTGGCTA----AACAGCCTTCAGCAGGTT----CA-AA-A--T----ACA------TA-ATACT---AAAC-ACTTTCATAAATTGGTGACATCATAAAC---TG-TT-AA-CGACGTTACGT-TTTGGC-GT-AAA-AG-AAGATG---AAATA--TG---------AAGA---ATAT--T---GGC---------------G-------------CA-TA-CCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAGGGTAT----AC-ATAACTATAA---GTACAG-GATC-A---------AAATGATACATAATAATCA-GT--GA--AAAGAAATTGTGG--GTTAAGCAG-AAAAACGC-A--AA--ACCC-AGT-A-A--ATA---AATA---T---ACCA----CA-----A-A-GT--ATGAC--CT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA---------TGGCAGGTTAG-AAAA---------TTATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGCCCCAATAGAGAAACTAATAAACAGGGTACAGAATTGTTTGATAA---TAAGGCCTTGCAGAGAAACGGTTCCCAGTTTATG-AATCAATTAGGTCTCCTTCAACA---TTTTCATA--ATTGCTAGAAACATCAACGTC--TAAGAATGTAA
gi|14                         :               AAAACAAGAC-AAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCA---GAAC--AATACATTTCGTCTA----TGCAGCTTTCATTAGGCT----CA-AA-A--T----ACA------TA-ATAAT---AAAC-AACATCAAAAGTTGAT
gi|5                          :           taaattAAGAAGAC-AAACTCC-----ATGTTACA-G-T--AT---T-T--ATGCT---GAAC--AGTGTATTATGGCTA----TACAGCCTTCATAGGGCT----CA-AT-A--T----GCA------TA-ATAAT---AAAC-AACGTTA-AAATTGATGACGTCATAAAC---AG-TTAAA-CGACGTTACGT-TTTGGT-GT-AAA-AATAAAATG---AAATA--TGCATACAATTAAGGTTTATCTAAT---AACCAAATAA--------G-------------CA-TA-CGTT-ATAAAT--AAACG-TA---C-CAAAAAATAAGTAGGATAT----AC-ATACATATTA---GGATTT-GATC-A---------AAACGATACATACTTGCCT-GT--G-----AGAAAATGTAT--GCCTAGTAG-AAAA-----A--AA--ACT---GT---G--ATA---ACTG---T---ATGA----TA-----T-A-TTTAATAAC--CT--AATAATT-----TACAG--GAA-CA---------TGGCAG----G-AAAA---------CTATTAAAACAT-----TA-AATAC-AA-AAC-A-Aactctacctttaatatggtacatgtatgaccatacaggttttattaatgagattagtgatgcaaaataaccaagtcaaaactaataaaaagt
gi|6                          :       tgttaaaaccAAGAAGAG-AAACTCC-----ATGTGAAA-G-G--TG---T-T--ATGCT---GAAC--AATGTATTTCGGCTA----TACAGCCTTCGTCAGCTT----CA-AA-A--A----ACA------TA-ATAAT---AAAC-AACGACATAAATTGATGACGCCATAAAC---AG-TTAAA-CAATGTTATGTGTTT--T-GT-AAA-AA-TCAATG---AAACA--TG---------CAGA---ATAT--T---GGCATAATAACCAAATAAG-------------CA-TA-CCTCAATAA----AAATG-TA---C-AAAAATGTAGACAGTGAAT----AC-ATAAATATAA---GAACAG-TATA-A---------AAAATATACATAATccgcacacaaaaaataattagata
gi|7                          :        attaaaaacAAGAATACTAAT-TCC-----ATATAAAA-G-A--TTACGT-T--ATG-----------AGT--ATTTCTGCTA----TAGAGCCTTCA------T----CA-AA-A--T----ACA------TA-TTAGT---CAAC-AACGTCATCAATTGATGACGTCATAAAC---AG-TTAAA-CGACGTTTTGT-TTTGGC-AT-AAA-TA-TACATC---AAATA--TA---------TTGA---ATAT--T---GGTTAATAACCAAAAGA-G-------------CAGTA--CTCAAT-A----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAGGGTAT----AC-ATAAATATAA---GTACAG-GATC-A---------AAAGTATACATAATTAACA-GT--TC--AAATAAATTGtacaatgctgtataatacagtataaactaataatttataagaataaaacatgttagaaaactattgaatcatttaaattcaataaataaataccctaaagagagactaataagcaggggacataattttagaaataagacttgcagaaaaag
gi|16                         :  aaataaattaaaaacAAGAAGAC-AAAATCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTT----TACAGCCTTCATCAGGTT----CA-AA-A--T----ACA------GA-ACAGT---AAAC-AACGTCATAGATTGATAGCATCATAAAC---AG-TTAAA-CGACGTTACTT-TTTGGC-GT-AAA-AA-ATGAT-----AATAACCA---------AAAA---A---------G-----------------G-------------CA-TA-CGTCAATAcataattaatgacgaacttattagtttgaagtgctatggactgccaagcgtcttattgacaaaattgatataataatataaatattttaa
gi|10                         :    ataaattaaaatcAAGAAGAC-AAACTCT-----ATATAATA-A-T--GT---T-T--ATGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTT----TACATCCTTTATCAGGTT----CA-AA-A--T----ACA------TA-ATAAT---AAA----TGTCATAAATTGGTGACGTCATCAAC-------------------A-----------GT-AAA-AA-TAGATG---TAATA--TG---------CAGA---GTAA--T---TGC---------------G-------------TAATAACC-----AA----AAATG-CATACC-CAGGAGGTAAACAGGATAT----TT-ATA--TATAATACGTACAGAGATC-A---------AAATGATACATAATTACCA-
gi|13                         :      tcaatttaaacAAGAAAA---AT-TCC-----ATATAAAT-G-A--TT---TAT--TTGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTA----TAAAGCCTTCTTTAGGTT----CT-AA-A--T----GCA------T--ATAGT---AAACGA----CATAAATTGATGACGTCATCAAC---AGATA-AA-TGACGTTGCAT-TTTGAC-GT-AAACAT-GATATATATAAATA--T----------AAGA---ACA-------GG-----------------------------------------ATAA----AAATGCTA---CACAAaaatatataatactgtttaatgcccggacctggttttagt
gi|21                         :    ataaattaaaaacAAGGAGAC-AAACTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAAC--AATGTATTTAATCAA----TACAGCCTTCATCCGGTT----CA-AA-ACGT----ATA------TA-Attacctgcgaaaagaaattgcgtgttaagcagaaaaaacataaaaa
gi|9                          :        attaaaaacAATAAGAC-AAACTCG-----ATGTAAAA-G-TAATT---T-T---TGCC---GAAC--AGTGCAATTCGGCTA----TACAGCCTTCTTCAGCTT----CA-AA-A--A----GTA------TA-ATAAT---AAAC-Aaataactgaccgtttaaccctatttaaagataatatgtgta
gi|23                         :      agattaaaaacAAGAAGAC-AAGCTCCTAGACATGTAAAC-G-T--T---------ATGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTA----TACAGTATTCATCAGGTT----CA-CA-A--T----TTA------AA-ATATT---ACAT-AACGTCATAAATTGATGACGTacccaataacgaaaaaatgtcgggtaagaaaactattgaaacatttaatatataaccaaaaatacctaaaagagagacaaataaacaatgtacagaattttgaaattccaaatggctttaagttaaaatcacataacacagtacgtgagagtgcagtacacatattttgacacttttagataataaaactcaatg
gi|28                         :      aaattaaagacAAGAAGAC-CAACTCC-----ATGTATAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAAC--AATACATTTTGGCTA----GACAGCCTTCA
gi|22                         :      agatttaaaacAAGAAGAC-AAACTCC-----ATGTAAAATG-T--TT---T-TTTGTGCT---GAAC--AACGCATTTCTGTTA----TACAACCTTCATCAGGTT----CA-AACA--T----ACA------AT-GTAAT---CAAT-ACTGTCATGA
gi|19                         :        attaaagacAATAACAC-AAACTCC-----ATATAAAT-G-T--TT---T-T--ATGCTAA-GAAC----TGCATTTCGTCTA----TACAGCCCTCATCAGGTT----TA-AA-A--C----Atacgtattgtcaaaagatga
gi|27                         : acaattattataaaacAAGAAGAC-AAACTCT-----ATGTATAA-G-C--TT---A----ATGCT---GAAC--AATGCATTTCGGCTA----CACAGCCTTCATCAGttaagtgtaaaatgaaggcaactaaaaaaaattgaaatatccaatactaatatatatgtatt
gi|24                         :      aaattagaaacAAGAAGAC-AAACGCA-----ATTTTAAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAAA--AATGCATTTCCCCTATATGGACAGTCTTCATCAGGCT----CA-AA-A--A----ACA------AA-AAATT---At
gi|30                         :     taaattgaagacAAGAAGTC-AACCTCC-----ATGTTACA-GAT--TT---T-T--ATGCT---GAAC--A
gi|20                         :      taaattaaaaacAAAAGAC-AAACTCC-----ATATCAAA-G-T--GT---T-T--ATGCT---CAAC--AATGCATTTCGGCTA----TATAGCCGTTATTAGGTT----CA-AT-A--TACGAACA------TA-ATCATAAAAAAC-AACATCATGAATTAATGGCGTCATAAAC---AG-TT-
gi|32                         :  atattataaatacattAGAAGAC-AAACTCC-----ATGCAAAA-G-T--CG---T-T--ATGCT---GAAg
gi|3                          :                        aaaagcgCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAAC--AATGCATTTCAGCTA----TACAAACTTCATCAGGTT----CG-AA-A--T----ACATACATTTA-ATAAT---AAAC-A---TCGTAAATTGATGACACCATAAACAGTTG-TT----CGGTATTACGA-TTTTTC-GT-AAA-AA-TGAATG---AAATA--TG---------CATT---ATAT--T---GGCATAATAAACAAATAAG-------------CA-TA-TATCAATAA----AAAAG-TA---T-TAAAATATAAACAAGATAT----AC-ATAAATATAA---GTACAG-AATC-A---------AAA-GTTA----------A-GT--GA--AAAAAA--TGTGT--TTTAAGCAGAAAAAACAT-A--AA--AAAA-AAC-A-GGTATA---AATG---T---ACTATC--TA-----T-A-AT--TTAAC--CT--AATAACTTTAAATACAA--GAA-AA---------TGGCAGGTAAG-AAAA---------TTATTGAAACAT-----TT-AAT-------AC-A-AAAAATGCCGAAA-AGAGAGACCATTAAACAAGTTACTGACT--TTTAGCAT---TAAGGCCTTGTGGA-AAAC-------------TG-AATCCAGTAGGTCTCCTTCAAAAGT-CTTTCA
gi|17                         :                                        ACAAAA-G-T--TT---T----ATGCC---GAACGAAGC--ATTTTGACTA----CACAGCCTTCATCAACCTACTACACAA-A--T----ATA------TACATG-T---AA-----TTGCATTATATGATG-CAT-ACAAA----GG-GT-AA-T-ATGTT--GT-TTTAGTAGTCGGA-AT-AAAATG---AAAatc
gi|29                         :                                   aattaaaaactagacgacaaacg-T--ATGCTTCTGAAC--AGTGTATTTTGGATA----TACAGCCTTCAggaacatgca
gi|8                          :                                                                                                     CTTCATCAGATT----TA-AA-A--T----ACA------TA-ACAAT---AAAC-AACATTATAAATTGATGAGGTCATAAAC---TG-TT-AAACGACGTTACGT-TTTGAC-GT-AAA-AC-A-GATG---AAAGT--TG---------CGTA---ATAC--CCAAAAA---------------A-------------CA-TA-CATCAATAA----AAATG-AA---C-CGAACTGTTAACATGATAT----AC-ATAAA-ATAA---GTACAG-GATCTA---------AAAT-ATACATCTTTACCA--T--GG--G--GAAAATGCAT--GTTGAACAA-AAAAACAA-A--AA--AACT-A---------TA---ACTG---T---ACTA----TA-----T-A-GT--ATAACACCT--AATAACT-----TA-AA--GAA-A----------TGACAGGTAAG-AAAA---------CTATTGAAACAT-----TT-AATACAAA-AAC-A-Attttattcctcaaacataataat
gi|26                         :                                                                                                                                                  ga---AAAC-AACGTCATAAATTGATGACGTCATAAAC---AG-TTAAA-CGCCGTTAC------GGC-GT-AAA-AA-AA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                  A-CGACATGACGA-GTTGGA-GT-AAA-AA-TATATG---AAATA--TG---------CAAA---ATAT--A---GGT---------------GTATTAATATAAAGCA-TA-ACTCAATAATCGTAAATG-TA---C-TAAAAAATAAACAGGATAT----AC-ATAAGTAGAA---AAATAG-GATT-A---------AAAATAGACATAATTACCA-GTGCGA--AAATATATT-TGGTTGTTAATCAG-AAAAACA--A--CA--ACAT-AAA-C-A--ATA---AATA---T---ttttttgtttgtttttttct
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                ---------------G-------------CA-TA-TCCCAATAA----AAAAG-AA---C-GAAAAAATAAGCAAGATAT----ACAATAA-TATAA---ATACAG-GA-C-A---------AAA-AATACATGATTACAA-AT--GA--AAAATTAATGCTT--GTT-AGTAG-AAAAACAA-A--AA--ACTT-ATTGA-A--ACATTTAATA---CAAAACCAAAACCA-----A-A-AG--ATAGA--CT--AATAA--------ACAG--GAA-GA---------Tt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaccaaaag-TA---C-TAAAATGTAAACAACGTATGTTGAC-ATACTTACAG---GTGAAG-GATC-GCAATGATCGAAATGATAAATGACTACCA-GT--AG--AAAGAAATTGCGC--GTTAAGGAG-AAAAACATAA--AA--AAAC-AGT---A--ATA---ATTG---T---ACTG----TG-----T-A-GT--ATAAA--CT--AATAACT--------AA--AAATAA---------TGACA-GTTAGTAAAG---------CTATTGAAACAT-----TT-AATAC-A------A-AAAAATGCCACAAAAGAGAGACTAATAAACAGGTTAGATAATT-CTAGA-AT---TGAGGCTTTGTGGAATAAC--TACTCAGTTTATG-AGTTCAGAAGGTCTCATTAAAAAGTCTTTCCATACTGTTGTTAACCATATCAATGaattttaaacttaaggccttgcagaaaaactgtactcagtttatgaatccagtaggtctc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTAAACAGGGTAT----AC-ATAAAGTTAA---ATACTG-GATC-A---------AAA------ATA-TAGTCACAT--GATTAAATA---TACGT--GTTTAGCAG-AAAAA-GC-ATTAA--ATCCGACC-ACA--ATT---ACTG---T---ACTA----CA-----T-GTAT--ATAAC--CTGAAATAACT-----CACAA--GAA-AA---------TGAGAGGTTAG-AAAA---------CTATTGAAATAT-----TT-AATTC-AA-AAA-ATAAAAATGCTCAAA-AGAGTGACTGATAAACAAGATACACAATT------TAA---TA-------------AAACTATAACCGGTTTATG-CACTATGTAGGTATCCTTCAACAGTCTTTTCAT---ATTGTTATAAACCACCATGTCAATGAGGATGAAAggcatgaaactaaagtcatttaaattgtgattgtcttggctaaaatgttcaacaacattagttggaaaaaaacccaggaccaatgaaactatttatatcgaagcggtgagtattcaaacttattttaaaagtgatttaatatataatcttaggataagtagatctacaatttgtttcaacattaaatttgaattcagggt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAAACATGATAT----AT-ATAAATATAA---GAACAG-GATA-A---------AAATGCTACACAATTACCT-GC--GA--AAAGAAATTGCGT--GTTAAGCAGAAAAAACAT-A--AA--Accaaagtcttttaaattgtgattgtcttggttaaaatgagcagcagcatgaataggaagagtagattcaatgaaacaattgttattgaaggggtgactataaatacgctttgtaacagtggt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ataaattaaaaacaagaaaaattccatataaatgatttatttgctgaacaatgcatttcggctataaagccttctttaggttctaaatgcatatagtaaacgacataaattgatgacgtcatcaacagataaatgacgttgcattttgacTGAGCAA-TAAGATAC-A--TACCATCT-AGTGA-A--ATA---AATACCGT---ACTA----CATGTATATA-GC--ATAAC--CA--CATAACT-----TACAA--GAC-AA---------TGGCAGATAAG-AAAA---------CTATTGAAACATGGGTCTT-GATAC-AAGAACAA-AAAAATACACAAAAAGGGAGACTAATAAACAAGGTACAGAAa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-AAT-A-AT-ATA---AATA---C---AGGA----CA-----A-A-AA--AT-AC-------ATGA-T-----TACAAATGAA-AAATTAATGCTTGTTAG--TAG-AAAAACAAAAAACTTATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-C-AAAA-----CCAAAAGATAGACTAATAAACAGG----AAGATAATTT--TAAACTTAAGGCCTTGCAGAAAAACTGTACTCAGTTTATG-AATCCAGTAGGTCTC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaccaaaaggcatatcccaataaaaaagaacgaaaaaataagcaagatata-A-GT--ATAAA--CT--AATAATT-----TATAA--GAA-TA---------AAACATGTTAG-AAAA---------CTATTGAATCAT-----TTAAATTC-AA-TA--A-ATAAATACCCTAA-AGAGAGACTAATAAGCAGGGGACATAATT-TTAGA-AA---TAAGA-CTTGCAGAAAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                  attaaaaacaagaagagaaactccatgtgaaaggtgttatgctgaacaatgtatttcggctatacagccttcgtcagcttcaaaaaacataataataaacaacgacataaattgatgacgccataaacagttaaacaatgttatgtgttttgtaaaaatcaatgaaacatgcagaatattggcataataaccaaataagcatacctcaataaaaatgtacaaaaatgtagacagtgaatacataaatataagaacagtataaaaaatatacataattacaatgctgtataatacAC--CC--AATAAC---------GA--AAA-AA---------TGTCGGGTAAG-AAAA---------CTATTGAAACAT-----TT-AATAT-AT-AAC-C-AAAAATACCTAAA-AGAGAGACAAATAAACAATGTACAGAAT--TTTGA-AA---Tg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agattaaaaacaataagacaaactcgatgtaaaagtaatttttgccgaacagtgcaattcggctatacagccttcttcagcttcaaaaagtataataataaacaCCCAGTTTTTTTAACCGAGTAGGTCTCCTTCAGCAGT-CTTTCAGT--GTTGTTAtccaaatggctttaagttaaaatcacataacacagtacgtgagagtgcagtacacatattttgacacttttagataataaaactcaatg

Unaligned ( gi|25 ): ATAAATTAAGAACAAGAATACGAACTTCATGTAAAACAATCTATGTTGAACAACATGTTCAGCTATACAGCCATCATCAGGTC
Unaligned ( gi|31 ): ACAAATTAAAATCAAGAAGGCAAACTCCATGTCAAAGTTTTTAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           22222222222222222222222222222222222222222222                1111                                                              111111111                         11111111                                   22222222222222222               22222222222222222                  111111                           22222222222                 11111                            1                                333333333333                   11                                        1        11          111                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      44444        1 1 22  333 5 22     555           1         4444                333     2 4444444   666666       333                  888888           3         3       0   3     7777    44    88 2    3        5    22222222222222222222222222222222222222222222    4  66       5555     4  777 4     1        3     7777         3    0    3     333333333   55   7777    1   1  0 55555555 3  4   333     0   7  3   3  77   44444444444444444    77777      55555555555555555   55    666      222222 2  55   4  55  55      2  33333333333      4          00000  4   1 4 44   4 4          7                      00   1    000000000000 1   2     2 3     88             6  1 1 6               1   5      8 22      333 888 1     7     3      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      .....        . . ..  ... . ..     ...           .         ....                ...     . .......   ......       ...                  ......           .         .       .   .     ....    ..    .. .    .        .    ............................................    .  ..       ....     .  ... .     .        .     ....         .    .    .     .........   ..   ....    .   .  . ........ .  .   ...     .   .  .   .  ..   .................    .....      .................   ..    ...      ...... .  ..   .  ..  ..      .  ...........      .          .....  .   . . ..   . .          .                      ..   .    ............ .   .     . .     ..             .  . . .               .   .      . ..      ... ... .     .     .      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      33333        7 7 44  000 0 33     444           9         0000                555     1 5555555   444444       777                  222222           3         3       5   3     1111    66    88 3    6        7    77777777777777777777777777777777777777777777    0  66       6666     0  000 0     0        6     7777         6    3    6     333333333   66   1111    2   8  5 22222222 6  5   888     5   3  6   6  22   11111111111111111    66666      11111111111111111   55    222      222222 5  55   0  55  55      4  00000000000      0          00000  0   1 0 99   0 0          2                      44   0    888888888888 7   5     2 2     66             7  7 0 7               0   0      0 00      000 000 0     3     7      
consensus                     :                                                                                                                                                     AAAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAA-TANATGA-AATATGCAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------A----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAANGTAAACAG-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAANGATA----CATAATTACCAGT--GAAAAGA-AANTGCGT-GTTAAGCAG-AA-AAA-CA-NAAA---ANNC-AGT-A-A--ATAANT---GTACTA--CAT------A-GT--ATA--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTNAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGCCC-AAAAGAGAGACTAATAAACAGGGTACANAATT-TT-GATAA---TAAGGCCTTGCGGAAAAACTGTACCCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAACAGTCTTTTCA-T-ATTGTTATAAAC--CCACGTCAATGAGNATGAAA
Reference ( family-3553 )     :                                                                                                                                                     AAAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAA-NANATGA-AATATGCAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------A----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAANGTAAACAG-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAANGATA----CATAATTACCAGT--GAAAAGA-AANTGCGT-GTTAAGCAG-AA-AAA-CA-NAAA---ANNC-AGT-A-A--ATAAAT---GTACTA--CAT------A-GT--ATA--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTNAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGCCCAAAAAGAGAGACTAATAAACAGGGTACANAATT-TTTGATAA---TAAGGCCTTGCGGAAAAACTGTACCCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAANAGTCCTTTCA-T-GTTGTTANNNACNNCNATGTCAATGAGGATGAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                     AAAAGAAAACAATCTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAGTTTAT-TTTGGCTAA----ACAGCCTTCAGCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATACT---AAACACTTTCATAAATTG------GTGACATCATA-AACTGTTAA-CGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAG-AAGATGA-AATATGAAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------------GCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAG-GGTAT----ACATAACTA-TAAGTACAG-GATCA---------AAATGATA----CATAATAATCAGT--GAAAAGA-AATTGTGG-GTTAAGCAG-AA-AAA-CG-CAAA---ACCC-AGT-A-A--ATAAAT---ATACCA--CAA------A-GT--ATG--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTTAG-----------AAAATT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGCCCCAATAGAGAAACTAATAAACAGGGTACAGAATTGTTTGATAA---TAAGGCCTTGCAGAGAAACGGTTCCCAGTTTATG-AATCAA-TTAGGTCTCCTTCAACA---TTTTCA-TAATTGCTAGAAACATCAACGTC--TAAGAATGTAA
gi|10                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCT-----ATATAATA-A-T--GT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTTT----ACATCCTTTATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAAT---GTCATAAATTG------GTGACGTCATC-AACAGT----------------------------A--AAAA-TAGATGT-AATATGCAGAGTAATT--GCG-----------------T-------------A----A-TA--ACC-----AA----AAATG-CATACC-CAGGAGGTAAACAG-GATAT----TTATATATAATACGTACAGAGATCA---------AAATGATA----CATAATTACCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcaatttaaacTACCCAGTTTTTTTAACCGA-GTAGGTCTCCTTCAGCAGT-CTTTCAGT-GTTGTTAaaatatataatactgtttaatgcccggacctggttttagt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACCA---------AAAGG-------CATA--TCCCAAT--AAAAAAG-AA---CG-----AA--AA-AATAAG-CA-AGAT---ATAC-AAT-A-AT-ATAAAT---ACAGGA--CAA------A-AA--ATA----C----ATGA-T-----TACAAATGAA-AAATTAATGCTTGTTAGTAGAAAAACAAAAAACTTATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-C-AAAA----CCAAAA-GATAGACTAATAAACAGGA-AGATAATT-TT----AAACTTAAGGCCTTGCAGAAAAACTGTACTCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCttttatttataatttaaatcggcatgaaactaaatgcatttagactgtgatcatgagcagcaacatgagtagaaaaagctggatcaatgaaacaatattatcggaggggtgactatacataaactttaaaacttcttcaatatgtggcattatatagtagtagtactagtacaattagtttcaaaattaattttaaattaagagt
gi|13                         :                                                                                                                                                    aAAAACAAGAAAAATTCC-----ATATAAAT-G-A--TT---TAT--TTGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----AAAGCCTTCTTTAGGT---TCTAA-A--T----GCA------TA-TAGT---AAACGAC---ATAAATTG------ATGACGTCATC-AACAGATAAATGACGTTGCAT-TTTGA----CGTA--A-----ACATGA-TATATATA-AATA-T-------------------------------------A----AGAA-CA---GGATAA----AAATGCTA---CACAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaattaACGTAAACAT-GATAT----ATATAAATA-TAAGAACAG-GATAA---------AAATGCTA----CACAATTACCTGC--GAAAAGA-AATTGCGT-GTTAAGCAGAAA-AAA-CA-TAAA---Attacctgcgaaaagaaattgcgtgttaagcagaaaaaacataaaaa
gi|14                         : ataaattaaaaacaagaaaaattccatataaatgatttatttgctgaacaatgcatttcggctataaagccttctttaggttctaaatgcatatagtaaacgacataaattgatgacgtcatcaacagataaatgacgttgcattttgAAAACAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCA---GAACAATACAT-TTCGTCTAT----GCAGCTTTCATTAGGC---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACATCAAAAGTTG------ATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taaattACGACATGACGA-GTTGG----AGTA--AAAA-TATATGA-AATATGCAAAATA-TA--G-G-----------------TGTATTAATATA--A----AGCA-TAACTCAATAATCGTAAATG-TA---C-TAAAAAATAAACAG-GATAT----ACATAAGTA-GAAAAATAG-GATTA---------AAAATAGA----CATAATTACCAGTGCGAAAATATATTTGGTT-GTTAATCAG-AA-AAA-CA-ACAACATAAAC-AAT-A-A--ATAactctacctttaatatggtacatgtatgaccatacaggttttattaatgagattagtgatgcaaaataaccaagtcaaaactaataaaaagt
gi|16                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAAATCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTTT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------GAACAGT---AAACAACGTCATAGATTG------ATAGCATCATA-AACAGTTAAACGACGTTACTT-TTTGG----CGTA--AAAA----ATGATAATAACCAAAA-A---------------------------------------A----GGCA-TACGTCAATAtt
gi|17                         :                                                                                                                                           ataaattaaaatcAGACGACAAACGAC-----A----AAA-G-T--TT---T----ATGCC---GAACGAAGCAT-TTTGACTAC----ACAGCCTTCATCAACC---T---A-C--T----ACA------CAAATAT---ATAC-ATGT----AATTGCATTATATGATG-CATACAAAGGGTAA--TATGTT--GT-TTTAGTAGTCGGAATAAAA-TGAAAGG-AACATGCA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aattaaaaactTGAGCAA-TA-AGA-TA-CATACC-ATCT-AGTGA-A--ATAAATACCGTACTA--CATGTATATA-GC--ATA--ACCA--CATAACT-----TACAA--GAC-AA--TG--GCAGATAAG-----------AAAACT-ATTGAAACATGGGTCTT-GATAC-AAGAACAA-AAAAATACACAAAAAGGGAGACTAATAAACAAGGTACAGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                       AATAACACAAACTCC-----ATATAAAT-G-T--TT---T-T--ATGCTAA-GAAC--TGCAT-TTCGTCTAT----ACAGCCCTCATCAGGT---TTAAA-A--C----A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaattattataaaac-TA---C-TAAAATGTAAACAA-CGTATGTTGACATACTTA-CAGGTGAAG-GATCGCAATGATCGAAATGATA----AATGACTACCAGT--AGAAAGA-AATTGCGC-GTTAAGGAG-AA-AAA-CATAAAA---AAAC-AGT---A--ATAATT---GTACTG--TGT------A-GT--ATA--AACT--AATAACT--------AA--AAATAA--TG--ACA-GTTAGT----------AAAGCT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-A------A-AAAAATGCCACAAAAGAGAGACTAATAAACAGGTTAGATAATT-CTAGA-AT---TGAGGCTTTGTGGAATAAC--TACTCAGTTTATG-AGTTCA-GAAGGTCTCATTAAAAAGTCTTTCCA-T-ACTGTTGTTAA---CCATATCAATGGGCATGAAAttaagtgtaaaatgaaggcaactaaaaaaaattgaaatatccaatactaatatatatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                        AAAAGACAAACTCC-----ATATCAAA-G-T--GT---T-T--ATGCT---CAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ATAGCCGTTATTAGGT---TCAAT-A--TACGAACA------TAATCATAAAAAACAACATCATGAATTA------ATGGCGTCATA-AACAGTTctaaagtcatttaaattgtgattgtcttggctaaaatgttcaacaacattagttggaaaaaaacccaggaccaatgaaactatttatatcgaagcggtgagtattcaaacttattttaaaagtgatttaatatataatcttaggataagtagatctacaatttgtttcaacattaaatttgaattcagggt
gi|21                         :                                                                                                                                       atattataaatacattAAGGAGACAAACTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGTAT-TTAATCAAT----ACAGCCTTCATCCGGT---TCAAA-ACGT----ATA------TAA-AAT---AAg
gi|22                         :                                                                                                                                              attaaaaacAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAATG-T--TT---T-TTTGTGCT---GAACAACGCAT-TTCTGTTAT----ACAACCTTCATCAGGT---TCAAACA--T----ACA------ATGTAAT---CAATACTGTCATGActgaccgtttaaccctatttaaagataatatgtgta
gi|23                         :                                                                                                                                              attaaagacAAGAAGACAAGCTCCTAGACATGTAAAC-G-T--T---------ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGTATTCATCAGGT---TCACA-A--T----TTA------AAATATT---ACATAACGTCATAAATTG------ATGACGTtacgtattgtcaaaagatga
gi|24                         :                                                                                                                                            aaattaaagacAAGAAGACAAACGCA-----ATTTTAAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAAAAATGCAT-TTCCCCTATATGGACAGTCTTCATCAGGC---TCAAA-A--A----ACA-------AAAAAT---
gi|25                         :                                                                                                                                           taaattgaagacAAGAATACGAACTTC-----ATGTAAAA-C-A--AT---C-T--ATGTT---GAACAA--CATGTTCAGCTAT----ACAGCCATCATCAGGT---ta
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaattaagaac---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGCCGTTAC------GG----CGTA--AAAA-AAc
gi|27                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCT-----ATGTATAA-G-C--TT---A----ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAC----ACAGCCTTCATCAGttttttgtttgtttttttct
gi|28                         :                                                                                                                                            aaattagaaacAAGAAGACCAACTCC-----ATGTATAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAACAATACAT-TTTGGCTAG----ACAGCCTTCAt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                    agatttaaaac-T--ATGCTTCTGAACAGTGTAT-TTTGGATAT----ACAGCCTTCATTTTATTCCTCAA----------ACA------TAATAAT---
gi|3                          :                                                                                                                                                                    CC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCAGCTAT----ACAAACTTCATCAGGT---TCGAA-A--T----ACATACATTTAATAAT---AAACA---TCGTAAATTG------ATGACACCATA-AACAGTTGTTCGGTATTACGA-TTTTT----CGTA--AAAA-TGAATGA-AATATGCATTATA-TT--G-G-----------------CATAATAAACAAATA----AGCA-TATATCAATAA----AAAAG-TA---T-TAAAATATAAACAA-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-AATCA---------AAAG-------------TTA--AGT--GAAA--A-AAATGTGT-TTTAAGCAGAAA-AAA-CA-TAAA---AAAA-AAC-A-GGTATAAAT---GTACTATCTAT------A-AT--TTA--ACCT--AATAACTTTAAATACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTAAG-----------AAAATT-ATTGAAACAT-----TT-AAT-------AC-A-AAAAATG-CCGAAAAGAGAGACCATTAAACAAGTTAC-TGACT-TTTAGCAT---TAAGGCCTTGTGG-AAAAC-------------TG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAAAAGT-CTTTCA-
gi|30                         :                                                                                                                                                       AAGAAGTCAACCTCC-----ATGTTACA-GAT--TT---T-T--ATGCT---GAACAatc
gi|31                         :                                                                                                                                           taaattaaaaacAAGAAGGCAAACTCC-----ATGTCAAA-G-T--TT---T-T--AT
gi|32                         :                                                                                                                                           acaaattaaaatcAGAAGACAAACTCC-----ATGCAAAA-G-T--CG---T-T--ATGCT---GAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaagcgAAGTTAAACAG-GGTAT----ACATAAAGT-TAAATACTG-GATCA---------AAAATATAGTCACATGATTA-------------A-ATATACGT-GTTTAGCAG-AA-AAAGCA-TTAA---ATCCGACC-ACA--ATTACT---GTACTA--CAT------GTAT--ATA--ACCTGAAATAACT-----CACAA--GAA-AA--TG--AGAGGTTAG-----------AAAACT-ATTGAAATAT-----TT-AATTC-AA-AAA-ATAAAAATGCTC-AAAAGAGTGACTGATAAACAAGATACACAATT------TAA---T-------------AAAACTATAACCGGTTTATG-CA-CTATGTAGGTATCCTTCAACAGTCTTTTCA-T-ATTGTTATAAACCACCATGTCAATGAGGATGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCC-----ATGTTACA-G-T--AT---T-T--ATGCT---GAACAGTGTAT-TATGGCTAT----ACAGCCTTCATAGGGC---TCAAT-A--T----GCA------TAATAAT---AAACAACGTTA-AAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----TGTA--AAAATAAAATGA-AATATGCATACAA-TTAAG-GTTTATCTAATAACCAAAT-------------A----AGCA-TACGTT-ATAAAT--AAACG-TA---C-CAAAAAATAAGTAG-GATAT----ACATACATA-TTAGGATTT-GATCA---------AAACGATA----CATACTTGCCTGT--G---AGA-AAATGTAT-GCCTAGTAG-AA-AA------AAA---ACT---GT---G--ATAACT---GTATGA--TAT------A-TTTAATA--ACCT--AATAATT-----TACAG--GAA-CA--TG--GCAG----G-----------AAAACT-ATTAAAACAT-----TA-AATAC-AA-AAC-A-Accaaagtcttttaaattgtgattgtcttggttaaaatgagcagcagcatgaataggaagagtagattcaatgaaacaattgttattgaaggggtgactataaatacgctttgtaacagtggt
gi|6                          :                                                                                                                                             tgttaaaaccAAGAAGAGAAACTCC-----ATGTGAAA-G-G--TG---T-T--ATGCT---GAACAATGTAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCGTCAGCT---TCAAA-A--A----ACA------TAATAAT---AAACAACGACATAAATTG------ATGACGCCATA-AACAGTTAAACAATGTTATGTGTTT------TGTA--AAAA-TCAATGA-AACATGCAGAATA-TT--G-G-----------------CATAATAACCAAATA----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-AAAAATGTAGACAGTGA-AT----ACATAAATA-TAAGAACAG-TATAA---------AAAATATA----CATAATTAC---------------AATGC-T-GT-------------------ATA---ATAC-AGT------ATAA-------ACTA-----------------ATA--ATTT---ATA---------AGAA--TAA-AA-------CATGTTAG-----------AAAACT-ATTGAATCAT-----TTAAATTC-AA-TA--A-ATAAATACCC-TAAAGAGAGACTAATAAGCAGGGGACATAATT-TTAGA-AA---TAAGA-CTTGCAGAAAAAccgcacacaaaaaataattagata
gi|7                          :                                                                                                                                              attaaaaacAAGAATACTAATTCC-----ATATAAAA-G-A--TTACGT-T--ATG----------A-GTAT-TTCTGCTAT----AGAGCCTTCATCA---------AA-A--T----ACA------TATTAGT---CAACAACGTCATCAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTTTGT-TTTGG----CATA--AATA-TACATCA-AATATATTGAATA-TT--G-GTTAATAAC---------C-------------AAAAGAGCAGTA-CTCAAT-A----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAG-GGTAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAAGTATA----CATAATTAACAGT--TCAAATA-AATTGCATAATTAAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                          aaataaattaaaaacCTTCATCAGAT---TTAAA-A--T----ACA------TAACAAT---AAACAACATTATAAATTG------ATGAGGTCATA-AACTGTTAAACGACGTTACGT-TTTGA----CGT---AAAA-CAGATGA-AAGTTGCGTAATACCC--A-A-----------------A-------------A----AACA-TACATCAATAA----AAATG-AA---C-CGAACTGTTAACAT-GATAT----ACATAAA-A-TAAGTACAG-GATCT---------AAAATATA----CATCTTTACCA-T--G--GGGA-AAATGCAT-GTTGAACAA-AA-AAA-CA-AAAA---AACT----------ATAACT---GTACTA--TAT------A-GT--ATAACACCT--AATAACT-----TA-AA--G-A-AA--TG--ACAGGTAAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATACAAA-AAC-A-Atgacgaacttattagtttgaagtgctatggactgccaagcgtcttattgacaaaattgatataataatataaatattttaa
gi|9                          :                                                                                                                                                     gaAATAAGACAAACTCG-----ATGTAAAA-G-TAATT---T-T---TGCC---GAACAGTGCAA-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCTTCAGCT---TCAAA-A--A----GTA------TAATAAT---AAACAAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agattaaaaac-A-A--A-AAGT---ATAATA---AT------A-A---ACA--ACCC--AATAAC---------GA--AAA-AA--TG--TCGGGTAAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAT-AT-AAC-C-AAAAATACCT-AAAAGAGAGACAAATAAACAATGTACAGAATT-TTccaataacgaaaaaatgtcgggtaagaaaactattgaaacatttaatatataaccaaaaatacctaaaagagagacaaataaacaatgtacagaattttgaaattccaaatggctttaagttaaaatcacataacacagtacgtgagagtgcagtacacatattttgacacttttagataataaaactcaatg

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           22222222222222222222222222222222222222222222                1111                                                              111111111                         11111111                                   22222222222222222               22222222222222222                  111111                           22222222222                 11111                                                                   111                     11                                                1           444                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      44444        1 1 22  333 5 22     555           1         4444                333     2 4444444   666666       333                  888888           3         3       0   3     7777    44    5555    3        5    22222222222222222222222222222222222222222222    4  66       5555     4  777 4     1        3     7777         3    0    3     333333333   55   7777    1   1  0 55555555 3  4   333     0   7  3   3  77   44444444444444444    4 777      55555555555555555   55    666      222222 2  55   4  55  55      2  33333333333      4          00000  4   1 4 44   4 4        5 5    5                   00   1   77 0 444 2 1   2     2 3     88             6  1 1 6                           0           333   0   7     1      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      .....        . . ..  ... . ..     ...           .         ....                ...     . .......   ......       ...                  ......           .         .       .   .     ....    ..    ....    .        .    ............................................    .  ..       ....     .  ... .     .        .     ....         .    .    .     .........   ..   ....    .   .  . ........ .  .   ...     .   .  .   .  ..   .................    . ...      .................   ..    ...      ...... .  ..   .  ..  ..      .  ...........      .          .....  .   . . ..   . .        . .    .                   ..   .   .. . ... . .   .     . .     ..             .  . . .                           .           ...   .   .     .      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                      33333        7 7 44  000 0 33     444           9         0000                555     1 5555555   444444       777                  222222           3         3       5   3     1111    66    4444    6        7    77777777777777777777777777777777777777777777    0  66       6666     0  000 0     0        6     7777         6    3    6     333333333   66   1111    2   8  5 22222222 6  5   888     5   3  6   6  22   11111111111111111    9 000      11111111111111111   55    222      222222 5  55   0  55  55      4  00000000000      0          00000  0   1 0 99   0 0        0 0    0                   44   0   99 1 999 1 7   5     2 2     66             7  7 0 7                           0           333   7   3     0      
consensus                     :                                                                                                                                                     AAAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAAT-ANATGA-AATATGCAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------A----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAANGTAAACAG-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAANGATA----CATAATTACCAGT--GAAAAGA-AANTGCGT-GTTAAGCAG-AA-AAA-CA-NAAA---ANNC-AGT-A-A--ATAANT---GTACTA--CAT------A-GT--ATA--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTNAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGC-C-CAAA-AGAGAGACTAATAAACAGGGTACANAAT--TTTAGNANTAAGGCCTTGCGGAAAAACTGTACCCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAACAGTCTTTCCAT-ATTGTTATAAAC--CCACGTCAATGAGNATGAAA
Reference ( family-3553 )     :                                                                                                                                                     AAAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAAT-ANATGA-AATATGCAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------A----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAANGTAAACAG-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAANGATA----CATAATTACCAGT--GAAAAGA-AANTGCGT-GTTAAGCAG-AA-AAA-CA-NAAA---ANNC-AGT-A-A--ATAANT---GTACTA--CAT------A-GT--ATA--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTNAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGC-C-CAAA-AGAGAGACTAATAAACAGGGTACANAAT--TTTGATAATAAGGCCTTGCGGAAAAACTGTACCCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAACAGTCTTTTCAT-ATTGTTATAAAC--CCACGTCAATGAGNATGAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                     AAAAGAAAACAATCTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAGTTTAT-TTTGGCTAA----ACAGCCTTCAGCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATACT---AAACACTTTCATAAATTG------GTGACATCATA-AACTGTTAA-CGACGTTACGT-TTTGG----CGTA--AAAGA-AGATGA-AATATGAAGAATA-TT--G-G-----------------C-------------------GCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAG-GGTAT----ACATAACTA-TAAGTACAG-GATCA---------AAATGATA----CATAATAATCAGT--GAAAAGA-AATTGTGG-GTTAAGCAG-AA-AAA-CG-CAAA---ACCC-AGT-A-A--ATAAAT---ATACCA--CAA------A-GT--ATG--ACCT--AATAACT-----TACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTTAG-----------AAAATT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-A-AAAAATGC-C-CCAATAGAGAAACTAATAAACAGGGTACAGAATTGTTTGATAATAAGGCCTTGCAGAGAAACGGTTCCCAGTTTATG-AATCAA-TTAGGTCTCCTTCAACA---TTTTCATAATTGCTAGAAACATCAACGTC--TAAGAATGTAA
gi|10                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCT-----ATATAATA-A-T--GT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTTT----ACATCCTTTATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAAT---GTCATAAATTG------GTGACGTCATC-AACAGT----------------------------A--AAAAT-AGATGT-AATATGCAGAGTAATT--GCG-----------------T-------------A----A-TA--ACC-----AA----AAATG-CATACC-CAGGAGGTAAACAG-GATAT----TTATATATAATACGTACAGAGATCA---------AAATGATA----CATAATTACCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcaatttaaacTACCCAGTTTTTTTAACCGA-GTAGGTCTCCTTCAGCAGTCTTTCAGT-GTTGTTATaaatatataatactgtttaatgcccggacctggttttagt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACCA---------AAAGG-------CATA--TCCCAAT--AAAAAAG-AA---CG-----AA--AA-AATAAG-CA-AGAT---ATAC-AAT-A-AT-ATAAAT---ACAGGA--CAA------A-AA--ATA----C----ATGA-T-----TACAAATGAA-AAATTAATGCTTGTTAGTAGAAAAACAAAAAACTTATTGAAACAT-----TT-AATAC-AA-AAC-C-AAAA-----C-CAAA-AGATAGACTAATAAACAGGA-AGATAAT--TTTAAACTTAAGGCCTTGCAGAAAAACTGTACTCAGTTTATG-AATCCA-GTAGGTCTCtttatttataatttaaatcggcatgaaactaaatgcatttagactgtgatcatgagcagcaacatgagtagaaaaagctggatcaatgaaacaatattatcggaggggtgactatacataaactttaaaacttcttcaatatgtggcattatatagtagtagtactagtacaattagtttcaaaattaattttaaattaagagt
gi|13                         :                                                                                                                                                    aAAAACAAGAAAAATTCC-----ATATAAAT-G-A--TT---TAT--TTGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----AAAGCCTTCTTTAGGT---TCTAA-A--T----GCA------TA-TAGT---AAACGAC---ATAAATTG------ATGACGTCATC-AACAGATAAATGACGTTGCAT-TTTGA----CGTA--A-----ACATGA-TATATATA-AATA-T-------------------------------------A----AGAA-CA---GGATAA----AAATGCTA---CACAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaattaACGTAAACAT-GATAT----ATATAAATA-TAAGAACAG-GATAA---------AAATGCTA----CACAATTACCTGC--GAAAAGA-AATTGCGT-GTTAAGCAGAAA-AAA-CA-TAAA---Attacctgcgaaaagaaattgcgtgttaagcagaaaaaacataaaaa
gi|14                         : ataaattaaaaacaagaaaaattccatataaatgatttatttgctgaacaatgcatttcggctataaagccttctttaggttctaaatgcatatagtaaacgacataaattgatgacgtcatcaacagataaatgacgttgcattttgAAAACAAGACAAACTCC-----ATGTAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCA---GAACAATACAT-TTCGTCTAT----GCAGCTTTCATTAGGC---TCAAA-A--T----ACA------TAATAAT---AAACAACATCAAAAGTTG------ATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taaattACGACATGACGA-GTTGG----AGTA--AAAAT-ATATGA-AATATGCAAAATA-TA--G-G-----------------TGTATTAATATA--A----AGCA-TAACTCAATAATCGTAAATG-TA---C-TAAAAAATAAACAG-GATAT----ACATAAGTA-GAAAAATAG-GATTA---------AAAATAGA----CATAATTACCAGTGCGAAAATATATTTGGTT-GTTAATCAG-AA-AAA-CA-ACAACATAAAC-AAT-A-A--ATAactctacctttaatatggtacatgtatgaccatacaggttttattaatgagattagtgatgcaaaataaccaagtcaaaactaataaaaagt
gi|16                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAAATCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTTT----ACAGCCTTCATCAGGT---TCAAA-A--T----ACA------GAACAGT---AAACAACGTCATAGATTG------ATAGCATCATA-AACAGTTAAACGACGTTACTT-TTTGG----CGTA--AAAA----ATGATAATAACCAAAA-A---------------------------------------A----GGCA-TACGTCAATAtt
gi|17                         :                                                                                                                                           ataaattaaaatcAGACGACAAACGAC-----A----AAA-G-T--TT---T----ATGCC---GAACGAAGCAT-TTTGACTAC----ACAGCCTTCATCAACC---T---A-C--T----ACA------CAAATAT---ATAC-ATGT----AATTGCATTATATGATG-CATACAAAGGGTAA--TATGTT--GT-TTTAGTAGTCGGAATAAAAT-GAAAGG-AACATGCA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aattaaaaactTGAGCAA-TA-AGA-TA-CATACC-ATCT-AGTGA-A--ATAAATACCGTACTA--CATGTATATA-GC--ATA--ACCA--CATAACT-----TACAA--GAC-AA--TG--GCAGATAAG-----------AAAACT-ATTGAAACATGGGTCTT-GATAC-AAGAACAA-AAAAATACAC-AAAA-AGGGAGACTAATAAACAAGGTACAGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                       AATAACACAAACTCC-----ATATAAAT-G-T--TT---T-T--ATGCTAA-GAAC--TGCAT-TTCGTCTAT----ACAGCCCTCATCAGGT---TTAAA-A--C----A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaattattataaaac-TA---C-TAAAATGTAAACAA-CGTATGTTGACATACTTA-CAGGTGAAG-GATCGCAATGATCGAAATGATA----AATGACTACCAGT--AGAAAGA-AATTGCGC-GTTAAGGAG-AA-AAA-CATAAAA---AAAC-AGT---A--ATAATT---GTACTG--TGT------A-GT--ATA--AACT--AATAACT--------AA--AAATAA--TG--ACA-GTTAGT----------AAAGCT-ATTGAAACAT-----TT-AATAC-A------A-AAAAATGC-CACAAA-AGAGAGACTAATAAACAGGTTAGATAAT--TCTAGAATTGAGGCTTTGTGGAATAAC--TACTCAGTTTATG-AGTTCA-GAAGGTCTCATTAAAAAGTCTTTCCAT-ACTGTTGTTAA---CCATATCAATGGGCATGAAAttaagtgtaaaatgaaggcaactaaaaaaaattgaaatatccaatactaatatatatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                        AAAAGACAAACTCC-----ATATCAAA-G-T--GT---T-T--ATGCT---CAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ATAGCCGTTATTAGGT---TCAAT-A--TACGAACA------TAATCATAAAAAACAACATCATGAATTA------ATGGCGTCATA-AACAGTTctaaagtcatttaaattgtgattgtcttggctaaaatgttcaacaacattagttggaaaaaaacccaggaccaatgaaactatttatatcgaagcggtgagtattcaaacttattttaaaagtgatttaatatataatcttaggataagtagatctacaatttgtttcaacattaaatttgaattcagggt
gi|21                         :                                                                                                                                       atattataaatacattAAGGAGACAAACTCC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGTAT-TTAATCAAT----ACAGCCTTCATCCGGT---TCAAA-ACGT----ATA------TAA-AAT---AAg
gi|22                         :                                                                                                                                              attaaaaacAAGAAGACAAACTCC-----ATGTAAAATG-T--TT---T-TTTGTGCT---GAACAACGCAT-TTCTGTTAT----ACAACCTTCATCAGGT---TCAAACA--T----ACA------ATGTAAT---CAATACTGTCATGActgaccgtttaaccctatttaaagataatatgtgta
gi|23                         :                                                                                                                                              attaaagacAAGAAGACAAGCTCCTAGACATGTAAAC-G-T--T---------ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAT----ACAGTATTCATCAGGT---TCACA-A--T----TTA------AAATATT---ACATAACGTCATAAATTG------ATGACGTtacgtattgtcaaaagatga
gi|24                         :                                                                                                                                            aaattaaagacAAGAAGACAAACGCA-----ATTTTAAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAAAAATGCAT-TTCCCCTATATGGACAGTCTTCATCAGGC---TCAAA-A--A----ACA-------AAAAAT---
gi|25                         :                                                                                                                                           taaattgaagacAAGAATACGAACTTC-----ATGTAAAA-C-A--AT---C-T--ATGTT---GAACAA--CATGTTCAGCTAT----ACAGCCATCATCAGGT---ta
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaattaagaac---AAACAACGTCATAAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGCCGTTAC------GG----CGTA--AAAAc
gi|27                         :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCT-----ATGTATAA-G-C--TT---A----ATGCT---GAACAATGCAT-TTCGGCTAC----ACAGCCTTCATCAGaattttttgtttgtttttttct
gi|28                         :                                                                                                                                            aaattagaaacAAGAAGACCAACTCC-----ATGTATAA-G-T--TT---TTT--ATGCT---GAACAATACAT-TTTGGCTAG----ACAGCCTTCAt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                    agatttaaaac-T--ATGCTTCTGAACAGTGTAT-TTTGGATAT----ACAGCCTTCATTTTATTCCTCAA----------ACA------TAATAAT---
gi|3                          :                                                                                                                                                                    CC-----ATATAAAA-G-T--TT---T-T--ATGCT---GAACAATGCAT-TTCAGCTAT----ACAAACTTCATCAGGT---TCGAA-A--T----ACATACATTTAATAAT---AAACA---TCGTAAATTG------ATGACACCATA-AACAGTTGTTCGGTATTACGA-TTTTT----CGTA--AAAAT-GAATGA-AATATGCATTATA-TT--G-G-----------------CATAATAAACAAATA----AGCA-TATATCAATAA----AAAAG-TA---T-TAAAATATAAACAA-GATAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-AATCA---------AAAG-------------TTA--AGT--GAAA--A-AAATGTGT-TTTAAGCAGAAA-AAA-CA-TAAA---AAAA-AAC-A-GGTATAAAT---GTACTATCTAT------A-AT--TTA--ACCT--AATAACTTTAAATACAA--GAA-AA--TG--GCAGGTAAG-----------AAAATT-ATTGAAACAT-----TT-AAT-------AC-A-AAAAATGC-C-GAAA-AGAGAGACCATTAAACAAGTTACTGACT--TTTAGCATTAAGGCCTTGTGG-AAAAC-------------TG-AATCCA-GTAGGTCTCCTTCAAAAGTCTTT
gi|30                         :                                                                                                                                                       AAGAAGTCAACCTCC-----ATGTTACA-GAT--TT---T-T--ATGCT---GAACAcaatc
gi|31                         :                                                                                                                                           taaattaaaaacAAGAAGGCAAACTCC-----ATGTCAAA-G-T--TT---T-T--AT
gi|32                         :                                                                                                                                           acaaattaaaatcAGAAGACAAACTCC-----ATGCAAAA-G-T--CG---T-T--ATGCT---GAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaagcgAAGTTAAACAG-GGTAT----ACATAAAGT-TAAATACTG-GATCA---------AAAATATAGTCACATGATTA-------------A-ATATACGT-GTTTAGCAG-AA-AAAGCA-TTAA---ATCCGACC-ACA--ATTACT---GTACTA--CAT------GTAT--ATA--ACCTGAAATAACT-----CACAA--GAA-AA--TG--AGAGGTTAG-----------AAAACT-ATTGAAATAT-----TT-AATTC-AA-AAA-ATAAAAATGC-T-CAAA-AGAGTGACTGATAAACAAGATACACAAT--T----TAAT-------------AAAACTATAACCGGTTTATG-CA-CTATGTAGGTATCCTTCAACAGTCTTTTCAT-ATTGTTATAAACCACCATGTCAATGAGGATGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                       AAGAAGACAAACTCC-----ATGTTACA-G-T--AT---T-T--ATGCT---GAACAGTGTAT-TATGGCTAT----ACAGCCTTCATAGGGC---TCAAT-A--T----GCA------TAATAAT---AAACAACGTTA-AAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTACGT-TTTGG----TGTA--AAAATAAAATGA-AATATGCATACAA-TTAAG-GTTTATCTAATAACCAAAT-------------A----AGCA-TACGTT-ATAAAT--AAACG-TA---C-CAAAAAATAAGTAG-GATAT----ACATACATA-TTAGGATTT-GATCA---------AAACGATA----CATACTTGCCTGT--G---AGA-AAATGTAT-GCCTAGTAG-AA-AA------AAA---ACT---GT---G--ATAACT---GTATGA--TAT------A-TTTAATA--ACCT--AATAATT-----TACAG--GAA-CA--TG--GCAG----G-----------AAAACT-ATTAAAACAT-----TA-AATAC-AA-AAC-A-Accaaagtcttttaaattgtgattgtcttggttaaaatgagcagcagcatgaataggaagagtagattcaatgaaacaattgttattgaaggggtgactataaatacgctttgtaacagtggt
gi|6                          :                                                                                                                                             tgttaaaaccAAGAAGAGAAACTCC-----ATGTGAAA-G-G--TG---T-T--ATGCT---GAACAATGTAT-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCGTCAGCT---TCAAA-A--A----ACA------TAATAAT---AAACAACGACATAAATTG------ATGACGCCATA-AACAGTTAAACAATGTTATGTGTTT------TGTA--AAAAT-CAATGA-AACATGCAGAATA-TT--G-G-----------------CATAATAACCAAATA----AGCA-TACCTCAATAA----AAATG-TA---C-AAAAATGTAGACAGTGA-AT----ACATAAATA-TAAGAACAG-TATAA---------AAAATATA----CATAATTAC---------------AATGC-T-GT-------------------ATA---ATAC-AGT------ATAA-------ACTA-----------------ATA--ATTT---ATA---------AGAA--TAA-AA-------CATGTTAG-----------AAAACT-ATTGAATCAT-----TTAAATTC-AA-TA--A-ATAAATAC-C-CTAA-AGAGAGACTAATAAGCAGGGGACATAAT--TTTAGAAATAAGA-CTTGCAGAAAAAccgcacacaaaaaataattagata
gi|7                          :                                                                                                                                              attaaaaacAAGAATACTAATTCC-----ATATAAAA-G-A--TTACGT-T--ATG----------A-GTAT-TTCTGCTAT----AGAGCCTTCATCA---------AA-A--T----ACA------TATTAGT---CAACAACGTCATCAATTG------ATGACGTCATA-AACAGTTAAACGACGTTTTGT-TTTGG----CATA--AATAT-ACATCA-AATATATTGAATA-TT--G-GTTAATAAC---------C-------------AAAAGAGCAGTA-CTCAAT-A----AAATG-TA---C-CAAAAGGTAAACAG-GGTAT----ACATAAATA-TAAGTACAG-GATCA---------AAAGTATA----CATAATTAACAGT--TCAAATA-AATTGCATAATTAAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                          aaataaattaaaaacCTTCATCAGAT---TTAAA-A--T----ACA------TAACAAT---AAACAACATTATAAATTG------ATGAGGTCATA-AACTGTTAAACGACGTTACGT-TTTGA----CGT---AAAAC-AGATGA-AAGTTGCGTAATACCC--A-A-----------------A-------------A----AACA-TACATCAATAA----AAATG-AA---C-CGAACTGTTAACAT-GATAT----ACATAAA-A-TAAGTACAG-GATCT---------AAAATATA----CATCTTTACCA-T--G--GGGA-AAATGCAT-GTTGAACAA-AA-AAA-CA-AAAA---AACT----------ATAACT---GTACTA--TAT------A-GT--ATAACACCT--AATAACT-----TA-AA--G-A-AA--TG--ACAGGTAAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATACAAA-AAC-A-Atgacgaacttattagtttgaagtgctatggactgccaagcgtcttattgacaaaattgatataataatataaatattttaa
gi|9                          :                                                                                                                                                     gaAATAAGACAAACTCG-----ATGTAAAA-G-TAATT---T-T---TGCC---GAACAGTGCAA-TTCGGCTAT----ACAGCCTTCTTCAGCT---TCAAA-A--A----GTA------TAATAAT---AAACAAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agattaaaaac-A-A--A-AAGT---ATAATA---AT------A-A---ACA--ACCC--AATAAC---------GA--AAA-AA--TG--TCGGGTAAG-----------AAAACT-ATTGAAACAT-----TT-AATAT-AT-AAC-C-AAAAATAC-C-TAAA-AGAGAGACAAATAAACAATGTACAGAAT--TTTGA-AATccaataacgaaaaaatgtcgggtaagaaaactattgaaacatttaatatataaccaaaaatacctaaaagagagacaaataaacaatgtacagaattttgaaattccaaatggctttaagttaaaatcacataacacagtacgtgagagtgcagtacacatattttgacacttttagataataaaactcaatg