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gi|25                         :                                                                                                                                                        aaaacttgtggaaggacagcgattcCTTT-A-TAA--G-TT----------------A-TTTAT-TT---T---AG--CCC--AAT--TGC-G--A--AG-A---A----------AT--CT--T---GAAGT--T---G----A------T-T-------T---GA--AC--CGTT-TTCG--AGTTCGC--TTCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-G--TAC------T-G--------CGTG----------TT-T-T---G-T-TG-A-----------------------------GAG-----C----T---------G---G----A-G-ATT-GAGCC-C-GCAA--CCA-CTAGCATGAGC--GGCCT--GCAC---agctatacgctctgttctctttagatgcgtgtatatttatatctatgcatcagatactggtaaccatacctaatctgtaatacacgaaatactgttgatgttattgacagtaatatactatt
gi|73                         :                                                                                                                                            ttataccaataaccataacctatactgcgttactttaCCTT-----A--G-TTAA--TA-CT-T-----G-TTTAT-TT---T---AG--CTC--ATT--TAC-A--A--AG-A---A----------AG--CA--T---AAAGA--T---C----A------T-G-------T---Gaataataatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                    T-G-TA---G-TCTA--TA-CT-A-----A-TTTAT-TA-------AG--CTT--GAC--TGC-A--A--CA-A---A----------AG--CT--T---AGAGC--T---T----ACTAGTAT-A-------T---GA--AC--CGCT-CTTG--AGTTTGA--TTCCTT--G---ATAGA---AC---CA-G--TAC------T-G--------AGTG----------TTGT-T---T-TATG-AG--A-----GG--C-A-T-TG-GGT---CGAG-----T----G---------G---G----G-G-AAC-GAACC-T-GCAA--CCT-CTGGCGCGAGC--GGCCA--ACA-----C----TAT---CCAA-TACG-CTACCACCACCAC--
gi|13                         :                                                                                                                                 gtcatagcttatcaaatcagacaaatcgtgctttgctggttttctccagtatca-TAA--A-TTCA--TA-CT-A-----A-TTTGT-TT---T---AG--CTC--GA---TGC-T--ttgaagatctctagtccttcatc
gi|46                         :                                                                                                                                      acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagat-TAT--G-TTTA--TA-CT-A-----A-TTTTT-TT---T---CA--CTT--GAA--TGT-G--A--AG-A---A----------AA--CT--C---AGAGA--T---T----A------T-AAAAAACGT---AA--AC--CGCT-CTTG--AGTCctcccgtgcccgtattgtgtgttttagaggcatattagtcgagttggggatcgaacctgcaacaactggcgtgaacggccaacactctatccactacactaccgtctcaataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                      tacttaaattttaatggtacA--G-TTGA--TA-AT-A-----A-TTTAT-TT---T---AG--CTC--GAA--TGC-G--A--TG-A---A----------AG--CT--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---GA--AC--CGCT-CTCG--AGTCCGC--TTCCTG--G---GTAAA---AC---CA-G--TAC------T-G--------CGTG----------TTGT-T---T-AATG-AG------------------CG-GG-------------------------------------G-G-ATC-GAACC-C-GAAA--CCT-CTGGCGTGAGC--GGCAA--ACAC---TC----TAC---CC-A-TTACACTACCGCC-CCGC---TTC---TT-GTTATGAGACTGTAA--ACTA-TATT--TGATTACAGCCAATATCTAACTAAAACAGCTTTCGTTC--AAA---TATATTAGCTA----TTTAGC---AATAAAGTATATATtattt
gi|3                          :                                                   agtaaaaatagtaaaagaagtattgtacattggcagacatgataaaacttttcttaactaaagataagttgccccttactgtcaacaacggataccaattgaacttttttgtctcattatttgatatcattatttA--G-TTTA--TA-TT-A-----A-TTTAT-TT---T---AG--CCT--GTT--TG--------TG-A---A----------AG--CT--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---TA--AC--TGCT-CTAG--AGTCCGT--ATCGTG--G---GTAGA---GC---CA-G--TAT------T-G--------AGTG----------TTGT-T---T-TTTG-AG--A-----GGC-C-A-T-CATGGT----GAG-----C----T---------G---G----A-G-ATC-AAGTC-C-GTAA--CCT-CGTGTGAGAGC--AGCCA--ACAC---TT----TAT---CC-A-CTGGGCTACCATC-C
gi|27                         :                                                                                                                             ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttgaatttA--G-TTTA--TA-CT-A-----A-TAT-T-TT---T---AG--CTC--T-T--TGC-A--AAGTA-A---T----------AGA-CT--C---AGTTC--T---T----A------T-A-------A---GA--AC--CACT-CTTG--TGTCTGC--TTTCTG--G---GTAGA---AC---CA-G--TAC------T-T--------AGTG----------TTGT-T---T-Ttgctcattttgaatttgtcaaggcagctattttttccatttgaatgtattggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|32                         :                                                                                                          ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggtttatactcatctcaaaatatggtttA--G-TTTA--TA-AC-A-----A-TTTCT-TT---T---AT--CTC--CAT--ATC-A--A--TA-A---A-----------G--CT--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------TTATGA--AA--AGCT-CTCG--AGTACGT--TTCCTT--A---GTTGG---TG---AG-G--TAC------T-G--------AATG----------TTGT-T---T-T-TG-AG--A-----GG--C-A-T-CG-GGttttaaaggcca
gi|7                          :                                                                                                                                                     cgcgtattttggtaacattttaaaagttgtttagtccA--G-ATTA--TA-CT-T-----A-TTTAT-TT---C---AG--CTC--GAC--TG--TGAA--CA-A---A----------AG--CT--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---
gi|11                         :                                agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaatttataattgtatcaacttaaataaatacaattaatttA--G-TTTA--TA-TT-A-----A-TTTAT-GT---T---TC--CTC--AAT--TGC-A--A--TG-T---A----------TT--CT--C---AGAAA--T--------A------T-A-------T---GA--AT--CACT-G--G--AGCCC----TTT---------GTAGA---AC---AA-G--TAC------T-T--------TGTG----------TTGT-T---T-TTTG-AG--A-----GGT-C-A-C-CG-GTC---CGAGC----C----T---------A---T------G-ATC-AATCT-G-GGGA--CAT-TTGGCtaaacgtcatcttgtgtttttttagaggtgttgggtcaactggggatcggacctgtgacctctagtttgagcagccaacactctatccactgcactacctctgcgcttagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|20                         :                                                                                                                                    agtagaacttgcatcttatatcaataaaatacaatgtgtgtaacgttaatatttA--G-TTTT--TA-TT-A-----A-TTTAT-TT---T---GG--CTC--GAT--TGCGT--A---G-A---A----------AG--CT--C---AAA-------------------------------------------GCT-CCTG--AGTCC-CTATTCCTG--T---GTAGA---AC---CA-G--CAagtctgtccactgtattgccatccactgtaatatttatgatgtttgagtagattgtgagatatggatagaattacatgtatcaaataaaatgataatatgataacagag
gi|39                         :                                                                                                                                                                                       attA--A-TCTA--CA-TT-A-----T-TCTAT-TTTAAT---AG--CTT--GAT--TGT-G--A--GA-T---A----------AG--TTGGCGAAAGAAT--T---T-----------T-A-------T---TG--AT--TGCT-CT-G--AGTCCAT--TTCTAA--G---GT------------A-T--TAC------T---------------------------T-T---T-T-TG-AG--AG----AC--C-A-T-CA-AGG---TGAG-----C----T---------T---T----G-A-ATG-GAGTC-T-GTtacagggatagaacccgcaaccgctggctttaatggccaacactctatccactaaactagcaccccactttcaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                         tt--G-TTTA--TA-CT-ACTAGTACTTTAT-TT---T---AG--CTC--GAT--TTC-G--A--TG-A---T----------AG--CT--C---AGAGT--T---T----A------T-A-------T---GA--AT--CACT-CT--------------TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-G--TAC------T-G--------AGTG----------TTGT-T---T-TATA-TG--A-----CG--C-A-
gi|57                         :                                                                                                           ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgaacgaataaccatttg--G-TTTG--GA-AT-A-----G-TTTGT-TT---C---AA--CTTTGGAT---GC-G--A--AG-A---A----------AG--TT--C----GTGT--T---T----A------T-T-------T---GA--AA---ACT-CTCA--CTTTCGT--TTCCTG--G---ATGAA---AC---ctattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           ttg-TTTA--TA-CT-A-----A-TTTAT-TT---T---AA--TTT--GAT--TGC-A--A--AG-A---A----------AG--CT--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---GA--AC--CACT-CTCA--AGTCTAC--TTATTG--G---ATAGA---AC---AA-A--TAC------T-G--------AGTG----------TTGT-T---T-ATTG-GG--A-----GG--A-A-T-TG-TGT---CAAG-----C----T---------G---G----G-G-ATC-AACTT-C-GCAA--ACT-ATGACATGAGC--GACCA----AC---TC----TAT---CC-A-CTACACTACTGCT-CCAC--TTT
gi|36                         :                                                                                                                                                              tcccttgaaaggcctcctattacaatatctat-TCTA--TA-CC-A-----A-ACCAT-TT---T---AC--CTC--AAT--TG--------TG-A---A------------------T---AAAGT--C---C----A------T-A-------------------------------GTCAAT--TTCCTG--G---GTGGA---AC---TA-G--TAC------C-A--------AGTG----------TTGTAT---T-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                    catctaactgaatataattcctatttgaTTA--TG-AT-A-----A-TTTAT-TT---T---AG--CTC--GAT---GC-C--A--TG-A---A----------GG--CT--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---GA--AC--TGCT-CTCG--AGTCCGC--TTCCAG--G---GCAGA---AC---CA-G--TAC------T-G--------AGTG----------TTGT-T---T-TATG-AG--A-----GG--C-A-T-AG-GGT---TGAG-----A----T---------G---G----A-G-ATC-GAACC-C-GCAA--CCT-CTGGCATGAGC--GGCCA--ACAC---TC----TAT---CC-A-TGGGACTACCACC-CCGC--TTTA-----AAT--TGA------AA--ttacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                  A--TA-CT-C-----T-TTTAT-TC---T---AG--GTC--AAT--T---T--G--CAGA---A----------AG--CT--C---AGAGCATT---T----AAA----T-AA------T---GA--AC--CACT-TTTG--AGTCTGA--TTCCTG--G---GTAGA---AT---CA-A--TAC------A-G--------AGTG----------TTGT-T---T-TTCA-AG--A-----GGC-C-A-T-CA-GTT---GGAG-----C----T---------A---G----G-G-ATC-AAACT-T-GCAG--CCT-CCAGCCTCAGT--GGCCA--ACAC---TC----TATTGACT-A-TAATACCAtattcaaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                   --TA-CT-A-----A-TT-GT-TT---T------------GAT--TGC-A--A--AT-G---A----------AG--AT--T---AGAGC--T---TTTCAA------T-T-------T---GT--ATTTCGCTTCT-----GTCTCA--TTCTTG--G---ATGGA---AC---AA-GAGTAC------TCG--------GGTG----------TTGT-T---A-TCTG-A---------------A-T-----GT---TGAG-----T----C---------T---T----G-G-AGC-AAGCC-T-GCA---------------AGT--GGCCATTACGT---CC----TAT---CC-caaagcttgattctcaattgttacatcagtactgcagtctacagttaaaatcaggttctgtcgtaaacctatatctgatacac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                      A-CT-A-----G-TTTAT-GT---T---AG--TTT--AAC--TGC-G--A--AG-A---A----------AG---T--C---AGAGA--TAATT----A------T-G-------T---TA--AT--CGC--CT-G--A--TCGT--TTACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-G--TAC------C-G--------AGTA----------TTTT-TAGCT-TATTTAG--T-----TG--TTA-T-AG-GGT---CGAA----------T---------A---T----G-G-----GA-------TAAACTCT-CTAGTATGAGG--GGCCA--TCA-----C----TAT---CC-A-tctaaaccaccactcagcaagatc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                          tattcagtatgaA-CT-A-----A-TTTAT-TT---T---AA--CTC--GGT--TGctgcagtacagccaacttattaaacgatatttaccaacttca
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                            -----A-CTTAG-TT---T---AG--CTT--GAT--TGC-G--A--AA-G---A----------AA--CT--C---AGAGT--T---T----aaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                                    TTAT-TT---TGTTAGGATCC--GAT---AC-T--G--GA-A---AC---------AG--GT--C---AGAGC--T---G----A------T-A-------T---GA--AC--CGCT-CTCG--AATtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                       T-CT---T---AG--CTC--AAT--TAA-T--A--AG-A---C----------AG--CT--C---ACAGT--T---T----A------T-A-------T---GG--AT--CGCT-TT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                           ---T---AA--CTT--GAT--TGC----------A---A----------AG--TT--C---AGAGT--T---G----A------T-A-------T---GA--AC--CGTT-CTCC--AGTTCAT--TCCCAG--G---AAAGA---AC---CA-G--AAC------T-G--------GGTGTGT-------TTTT-T---T-TTTT-AGTCA-----------A-T-TG-GGT---CAAA-----C----T---------G---G----G-G-ATC-GGACC-C-GCAA--CTT-TTttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                          gtcattcattatcaaatttccagggggtgcttaactttttttccaggtgtatataa--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---AA--AC--CACT-TTCA--AGTCCGC--TTTCTG--G---GTAGT---AC---CA-G--TA-------T-G--------GG-------------TGT-T---T-TAAG-AG--A---------C-G-T-CG-GGT---CGAG-----C----T-------------T----GAA-ATC-GAACC-C-AAAA--C---CTGATATGAGC--AATCA--ACAC---TT----TAT---CC-A-CTACACTACCGCC-CCAaactctgtctactgtgctactactccatttcaaagtacaatacttgtttaaggtct
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                         gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcAGT--T---T----T------T-G-------T---GA--AT--CATT-CCTATTAGTCCGT--TTTGTG--A---GTAAA---AC---CA-G--TAC------T-GTGCTTTATAATG-----------TGT-T---T-TTTG-AG--A-----tata
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTT-CTCG--AGTCCAT--TTCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-A--TAC------C-A--------AATG----------TTGC-T---G-T-TA-AG--A-----AG--g
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attG--AGTTCAT--TTCCTG--T---GTAGA---AC---CA----TGCAGCAAGT-G--------AGTG----------CTGT-T---C-T-TA-AG--A-----AT--C-A-T-CA-------CGA-----------T---------G--------G-A-ATC----CT-T-TTAA--TGT-CTGGCACAAGA--GGCCA--TCAT---TA----TGT---AC-A-Taacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGA---AC---CA-A--GGC------T-G--------TGTG----------TTGT-T---TGTGTG-TG--GTCACCAG--G-A---CA-GGT---TGAA-----CA---T---------G--------A-G-ATT-GAACC-T--TGA--CCT-CTGTAGTAAGA--TTTCA--ACAC---CC----CAC---CC-A-GGAAACCA------CCAT--ATTTGTACTAGT--TTATC----AACTAC-AGCATA--T-AT------TAATA--TCA-TGTA-----------TCTTACAGATCATACT--ACAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C---CC-G--TAT------T-G----------TG----------T-GT-T---T-TA----G--A-----GG--C-A-TATT-AGT---CGAG-----T----T---------G---G----G-G-ATC-GAACC-T-GCAA--CAA-CTGGCGTGAAC--GGCCA--ACAC---TC----TAT---CC-A-CTACACTACCGTC-TCAt
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagattaaattcatactaatttgttttagctcgatgctctcccgtgC---CA-A--AAC------T-G--------TGTA----------TTGT-T---T-CG-G-AA--A-----GA--C-C-TACG-TAT---CGAT-----A----T---------G---TTCAAG-G-ATC-GA-CC-A-ACAA--A-T-ATAGCCTGAGC--GATTA--AC-----TC----TAT---CT-G-CTGGACTACTGCataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggatagt-G--------AATG----------CTGT-T---C-T-TG-AC--A-----AG--C-AAT-AA-AGC---TGCA-----CC---T---------G---T----G---ATC-CAACC-C-ATGA--CCA-TTGGCATGAGC--AGCCA--ACACAGTTCACTGTAT---AC-A-TAAt
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G--------AGTG----------TTGT-T---T-T-CG-AG--A-----AA--C-A-------------AAAAAAACC----T---------AAGCT----C-G-ATT-GAGCC-T-ACAA--CCT-CTGAAGTGATT--GGTAA--ACGT---CA----TAT---TC-A-T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G--------AATG----------TTGT-T---T-T-TG-AG--T-----GGC-C-A-T-CA-GGT---TCAG-----CA---T---------G--------A-G-ATC-GATCC-A-GCAC--CAT-CTGGTATTATC--GGCAA--ATGT---TC----AAT---tacacca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taggtgaaacactctaaaattcgtaacctgcgtaaGTG----------TTTT-T---T-TA----G--A-----GG--T-G-T-TG-GGT---C-AA-----C----T---------G---G----G-G-ATC-GGACC-T-GTGA--CCT-CTAGTTTGAGC--AGCCA--ACAC---TC----TAT---CC-A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaatttataattgtatcaacttaaataaatacaattaatttagattatacttatttatttcagctcgactgtgaacaaaagctcagagcttatattaaacgtcatcttGTG----------TTGT-T---T-C-TG-AG--A-----AGT-C-A-T--G-TAT---TGGA-----A----T---------A---TGG--G-G-GTC-AAACG-T-GCGA--TCT-CTGACGTGTGA--GGTCA--GCAC---ctgcactacctctgcgcttagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcTG----------TTGT-T---T-T-CG-AT--A-----C---C-A-T-TG-GTT---CCAA-----C--------------A---T----GAG-ATC-AAACC-T-GCAA--ACA-CTTGCA--AGTTGGGCCA--ACA-----C----CAT---AC-A-CTGCACTACCGCgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -T-TG-GGT---C-------------T---------G--------G-G-ATCTGACCCAC-ATGA--CCT-CTTGCATGGGC--AGCCA--ACA----TC----TAt
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G-AGT---GGAA-----CCTGGT---------G---T----T-G-ATT-G-----C-ACAA--TCT-CTTGCATGAGC--AGCTA--ACAC---TC----GAT---GC-A-GTACACTATTACC-actgccacacctactattttcttatttatttaataactactattt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cctT---CGTA-----C----T---------GAATT----T-G-ATC-AAATC-C-GTGA--CCT-A----ATTAGC--TACTA--ACAC---TC----TAT---CC-A-CTGCACTACCGCA-C--C--GTTC-----AGT------------------AGGATCGTTG-T------CAATA--TA
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attttttgattttcttggttggaac---T----G-G-ATT-AAGAC-C-TTGA--CCT-CTTACATCGGT--CACCA--ACAC---TC----TAT---CC-A-ctgtctatatattgttata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccat----G-G-ATA-GAACC-C-GCAA--CCG-CTGGCTTTAAT--GGCCA--ACAC---TC----TAT---CC-A-CTAAACTAGCACC-CCAC--TTTC---cttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacag----G-G-ATG-GAACC-G-GCAA--TAT-CCAGTATGAGC--GGCCT--ACAC---TC----TAT---TC-A-CAGCACTATaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caatcttg-ATC-GAACC-C-ATAA--CCT-TTTACAAAAAC--AGCCA--AGAC---TC----TAT---CC-AGTATGA-TATTGTC-CCAC--ttagtgtgtatgttttactaatt
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GAACC-CTGTGA--TCT-CTGGTGGGAGT--GGTCA--CAAC---TC----TAT---CC-A-ttatttaagccttgttacaagacattcatagaatata
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgggaaaCC-C-G-AG--CCT-CTGGCAAGTGC--GGCCA--ACTA---TC----TAT---CC-A-CTGTACTACCTCC-CAAC--ctggcccatctacctgcttagtacttt
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a-GCAA--CTT-CTAGCATGAAT--G-CAA--ACAC---TC----TAT---GC-G-CTGCACTACCGCC-t
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggggaggaaatcaA--CCTGCTGGCATGACT--GGCCA--ACA-----C----TAT---TG-A-CTGGACTACTGCC-CC
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gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgcacTAGCATGAGT--GGTCA--ACAT---TC----TAT---CC-A-ataca
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20 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|48 ): CGAGTGCGATTTCTCGGTATATCCTGTACTGGGTGGAGTTTCTATAAGAGATCAAACCTCTGACTTCAATATCATACAATCTATCAACTACACTATCGTCC
Unaligned ( gi|51 ): GGTCAAACTGGTAATTGAGCCTGCAACCTCAAGTGTGTGCTCTAACCACTGTACTACCACTCTAATTAAAAGTCACAGATGCACCAGTGTTAACGTC
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Unaligned ( gi|65 ): TATACCCATATATTTAAGTTTGATTGCAAAGTAAGTAATCAATGTGGAGTCTGTTTCCTAGGTAAGACCAGAAGT
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Unaligned ( gi|69 ): TTGGTCATGGGTGGGACCGAATTTGCGATATTTGGCATGAACGTCTAGCATCCTATTCACTACACC
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Reference ( family-354 )      : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTAAC-----TAAA--TACCTGTTATATATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTT--TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---TAGCTC--GATT-GC--G-AN----G-A----A---A--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TC-TA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-T-CT--TA------G--T--TGA------AA--AC-AGNAT--NTGAT------CAATA--TAACTGNAACAGCTTTCGTTCTTANAGATCATACTAGNCAT--TTTTAGCATTAATAAANTATGTANGATAATATAATG
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gi|12                         :                                    agtagaacttgcatcttatatcaataaaatacaatgtgtgtaacgttaata---CATGTTTATACAT-T-TA--T----TGATATAT--CAAATATA--TA-A---AA-CCCAATCAATAACTTAATTCATA-TT----A--GTTTA--TA-C-C-A-----A-TTTATTT---CAGCTT--GATT-GC--A-AA----G-A----A---A--G-T--T--C---AG--T--T---T----A------T-G-------T---TAA--CCGC--TTCC-G--AGACTGCT--TCCTG--G---ATAGA---AC---CA-GTTC------T-G--------A--ATGGACTTTTTTATTGT----G-T-T-T-T-T-GAGAT-A-C-A-T-TA-GG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAAACAC-ACA--AAC--T-C-TGGTGTAAGT--GACCA--AC-AC-TC-AA-TCgtaatatttatgatgtttgagtagattgtgagatatggatagaattacatgtatcaaataaaatgataatatgataacagag
gi|13                         :                                                                                                                                                             gctagttaaT--TA----A--ATTCA--TA-C-T-A-----A-TTTGTTT---TAGCTC--GATttcctctaataagaaacaagaaacagtagacaaactt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagaC---CC-GTAT------T-G------------TG---T--------------G-T-T-T-T----AGAG-G-C-A-TATT-AG---T----CG-AG-T-T---------G----G----G-G-ATCGAACCT-GCA--ACA--A-C-TGGCGTGAAC--GGCCA--AC-AC-TC-TA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-TC-TCAgctctcccgtgcccgtattgtgtgttttagaggcatattagtcgagttggggatcgaacctgcaacaactggcgtgaacggccaacactctatccactacactaccgtctcaataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|14                         :                                                                                 acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagattaaattcatactaatttgttttagctcgatgctctcccgtg----A--GTCTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTA----AGCTT--GACT-GC--A-AC----A-A----A---A--G-C--T--T---AGAGC--T---T----ACTAGTAT-A-------T---GAA--CCGC--TCTT-G--AGTTTGAT--TCCTT--G---ATAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-T-G---------G----G----G-G-AACGAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCGCGAGC--GGCCA--AC-A---C-TA-TCCAATA-----CG-CT--ACCA-CCACCACT--T-ataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|15                         :                                           gtcatagcttatcaaatcagacaaatcgtgctttgctggttttctccagtatcatgtCAT-TCCA--TGAAAT--TTTCTA-TAAA---A--TA-A---A-----------------------T--TA----A--GTT-A--TA-C-T-A-------TTTATTT---TAGCTT--GATT-GT--G-AT----G-A----A---A--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------TAT-GAA--CCTC--TCCC-G--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTGGA---AT---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----G----T-G-AACAAGATC-GCA--ATG--T-C-TGGCATGAGC--GGTCA--AC-A---C-TA-ACCATTA-----CA-CC--ACCgaagatctctagtccttcatc
gi|16                         :                                                                                                                                                            ataaaacaatatcagcgagacagtttA--TA-C-T-C-----T-TTTATTC---TAGGTC--AATTTGC-----A----G-A----A---A--G-C--T--C---AGAGCATT---T----AAA----T-AA------T---GAA--CCAC--TTTT-G--AGTCTGAT--TCCTG--G---GTAGA---AT---CA-ATAC------A-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-TCAAGAG-GCC-A-T-CA-GT---T----GG-AG-C-T---------A----G----G-G-ATCAAACTT-GCA--GCC--T-C-CAGCCTCAGT--GGCCA--AC-AC-TC-TA-TTGACTA-----TA-AT--ACCA-Ctaaataagtttacagtgtgctacgtatatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                      T--TA----A--GTTTA--AAAC-A-A-----A-CTTATTT---TAAATC--AATT-CT--G-AA----G-A----ATTAA--G-C--T--T---AGAGA--T---T----A------T-A-------T---GAA--TCAA--TGTC-T--GGTCCATT--TCCAG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------G----G-T-T-T-T-T-TAGAG-G-T------------------------C-T---------A----T----A-C-ATCAA-------------------TGGTGTTAGT--GGTCA--AC-AC-TT-TA-TCCACaaagcttgattctcaattgttacatcagtactgcagtctacagttaaaatcaggttctgtcgtaaacctatatctgatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                         tataaccttagatgtttaaacatgttttgatcctgtccttcaattcaaagttgtaagaacttgcttcacaatcaatgtaaaataa----A---A--G-C--T--T---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---CAA--GTGC--TTTT-A--AGTTCGTT--TTCTG--A---GTAGA---AC---CA-GTA-----------------------G---T---------T----A-T-G-T-T-T-TAGAG-A-CCA-C-CG-AA---T----CG-AA-C-CCACGAACCCA----T----G-G-ATCGAACCC-ACG--AAC--T-C-Tggaaacatca
gi|19                         :                                                                                              atgcatttgttattaacatctattttcttatattcaggctttacatggaacaactatggccatcttaagatttaatagtaaatatttggctatggtggtataaactttagagt---TAACTT--GATT-GC------------A----A---A--G-T--T--C---AGAGT--T---G----A------T-A-------T---GAA--CCGT--TCTC-C--AGTTCATT--CCCAG--G---AAAGA---AC---CA-GAAC------T-G--------GGTGTG---T---------T----T-T-T-T-T-T-TTTAG-T-CAA-T-TG-GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCC-GCA--ACT--T-T-TA--------------------AC-TC-TG-TCTACTG-----TG-CT--ACTA-CT-CCATT--T-aaaaacatcggccaa
gi|2                          :                                                                                                             gtcattcattatcaaatttccagggggtgcttaactttttttccaggtgtatataaTT--TA-------GTTGA--TA-A-T-A-----A-TTTATTT---TAGCTC--GAAT-GC--G-AT----G-A----A---A--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T----G-T-T-T-AAT-GAG-----------CG-GG------------------------------------G-G-ATCGAACCC-GAA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCAA--AC-AC-TC-TA-CCCATTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCGC---T-T-CT--T-------G--TTATGAGACTGTAA--AC-TATAT--TTGATTACAGCCAATATCTAACTAAAACAGCTTTCGTTC----AAAT-ATATTAGCTA----TTTAGC---AATAAAGTATATAcaaagtacaatacttgtttaaggtct
gi|20                         :                                       agtaaaaatagtaaaagaagtattgtacattggcagacatgataaaacttttcttaactaaagataagttgccccttactgtcaacaacggataccaattgaacttttttgtctcattatttgatatcatta----A--GTTTT--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---TGGCTC--GATT-GC--G-TA----G-A----A---A--G-C--T--C---AAAGC--T-----------------------------------------CCT-G--AGTCC-CTATTCCTG--T---GTAGA---AC---CA-GCAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           att----G-G-ATAGAACCC-GCA--ACC--G-C-TGGCTTTAAT--GGCCA--AC-AC-TC-TA-TCCACTA-----AA-CT--AGCA-CC-CCACT--T-T-Ctacagggatagaacccgcaaccgctggctttaatggccaacactctatccactaaactagcaccccactttcaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|21                         :                                                                                                   attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacagA-C-T-A-----G-TTTATGT---TAGTTT--AACT-GC--G-AA----G-A----A---A--G----T--C---AGAGA--TAATT----A------T-G-------T---TAA--TCGC---CT--G--A--TCGTT--TACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-GTAC------C-G--------A--GTA---T---------TTTTAG-C-T-TAT-T-TAGTT-G-TTA-T-AG-GG---T----CG-AA---T---------A----T----G-G-GATAAACTC-----------T-C-TAGTATGAGG--GGCCA--TC-AC-T---A-TCCACTG-----CA-GT--ACAG-CC-aagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                               tattcagtatga---AA-C--------GAAT--AACCATT--TG-------GTTTA--TA-C-T-ACTAGTACTTTATTT---TAGCTC--GATT-TC--G-AT----G-A----T---A--G-C--T--C---AGAGT--T---T----A------T-A-------T---GAA--TCAC--T-------------CT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-aacttattaaacgatatttaccaacttca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgAGA---AC---CA-AGGC------T-G--------T--GTG---T---------T----G-T-T-T-G-T-GTGTG-GTC-A-C-CA-GG---A----CA-GG-T-T---------GAACAT----GAG-ATTGAACCT--TG--ACC--T-C-TGTAGTAAGA--TTTCA--AC-AC-CC-CA-CCCAG-G-----AA-----ACCA-CC-ATATT--TGT-AC--TA------G--T--TTATC----AACTAC-AGCAT--AT-AT------TAATA--TCA-TGTA-----------TCTTACAGATCATACTA--CAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATGatatgacgcactattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCAAACAC-GCA--ATC--T-C-TAGCACGAAT--GGCCA--AA-AC-TCGTA-TCCAGTA-----CA-CT--GCTA-CC-CC-------T-CT--TA------T--T--TCC------A----C-TTAAT--GTGAC------CAt
gi|25                         :                                                                                                                                                             ctgggttCTT--TA----C---TTTA--TA-AGT-T-----A-TTTATTT---TAGCCC--AATT-GC--G-AA----G-A----A---A--T-C--T--T---GAAGT--T---G----A------T-T-------T---GAA--CCGT--TTTC-G--AGTTCGCT--TCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T------T-T-G-T-T-GA--------------------------G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATTGAGCCC-GCA--ACC--A-C-TAGCATGAGC--GGCCT--GC-AC-gggaagaacacttgttatactctaaataccattttttaacagaacatttacatctatactgtactctgtaatgatttcaataaacacttctcttcaacttttaaatgatctatacat
gi|26                         :                                                                               ttataccaataaccataacctatactgcgtta----T--TTTTT--TAAA---AATTA-A---TA-T--------TAT---AATTCTT--T------------------------------TTT-TTT---TAGCTT--GATA-ACATG-AA----G-T----A---A--G-C--T--T---CGAGC--T---TTGA-A------TTA-------T---TAA--T-GC--TGTCCA--AGTCTG-T--TGCT----------------C---CGCGCAC------T-G--------G--G-G---C---------T----G-T-T-T-A-T-GAGAG-GCC-A-C-AA-GG---CATG-CA-AG-C-T---------T----T----C-A-ACCAAACCC-ACA--ATC--T-C-TGG---------AGCCA--AC-AC-aataataatact
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                  ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggtttatactcatctcaaaatatgg--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---AAA--CCAC--TTTC-A--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTAGT---AC---CA-GTA-------T-G--------G--GTG----------------------T-T-T-T-AAGAG-A-C-G-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T--------------T----GAA-ATCGAACCC-AAA--AC-----C-TGATATGAGC--AATCA--AC-AC-TT-TA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCAtttaaaggcca
gi|3                          :                                                                                                                                    gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---TAGCCT--GTTT-G------T----G-A----A---A--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---TAA--CTGC--TCTA-G--AGTCCGTA--TCGTG--G---GTAGA---GC---CA-GTAT------T-G--------A--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GCC-A-T-CATGG---T-----G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATCAAGTCC-GTA--ACC--T-C-GTGTGAGAGC--AGCCA--AC-AC-TT-TA-TCCACTG-----GG-CT--ACCA-TC-CTGCT--tata
gi|30                         :                                                                                                                             ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttgaa--TA-C-T-A-----A-TT-GTTT---T-------GATT-GC--A-AA----T-G----A---A--G-A--T--T---AGAGC--T---TTTCAA------T-T-------T---GTATTTCGCT-TCT------GTCTCAT--TCTTG--G---ATGGA---ACAA-GA-GTAC------TCG--------G--GTG---T---------T----G-T-TAT-C-T-GA--------A-T-----G---T----TG-AG-T-C---------T----T----G-G-AGCAAGCCT-GCA------------------AGT--GGCCATTAC-GT-CC-TA-TCCTCTA-----AA-CC--ACCA-CT-Ccattttgaatttgtcaaggcagctattttttccatttgaatgtattggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|31                         :                                                                                              TTT-TACGT-TTTAAGT----T--TTTTT--TATG---A--TA-ATTCAG-C--------TGA---TAT--TTA-TA----A--GTTTA---G-C-A-G-----A-TTTATTT---TG------------------T----A-A----A---A--G-CACT--C----GA-T--T---T----A------C------------------TCGC--ACTT-T--AATCGATT--TCCTG--A---GTA-A---AC---CA-ATAC------C-G--------G--GTG-------------------------------AAAG-C-T-A-T----AA---T----GG-AG-C-C--------------T----G-GCATTGATCCT-GAA--ACC--T-T-TGGCGTGAGagcaagatc
gi|32                         :                                                                                                                                                          aAA---AGTTGTT--TAGTCCA--GTTTA--TA-A-C-A-----A-TTTCTTT---TATCTC--CATA-TC--A-AT------A----A---A--G-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------TTATGAA--AAGC--TCTC-G--AGTACGTT--TCCTT--A---GTTGG---TG---AG-GTAC------T-G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---
gi|33                         :                                                                                                                                                                         cgcgtattttggtaacatttta-A-----A-TTTTTTT---TACCTC--CATT-GC--A-AA----G-T----A---A--A-A--T--C---AGAAC--T---A----A------A-G-------T---GAA--T--------------------------TG--G---GTATT---GT---CA-TTAT------T-G--------G--GTG---T---------T----G-T-T-C-A-T-GAGAG-----A-T-CA-AG---C----------C-T---------G---------G-A-ATTAAA-----------C--T-C-TGACATGGGC--AGCCT--TT-AC-CC-TA-TCCCCTC-----CA-CC--AGTG-CC-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---AC---CC-GTAC------T--------------TT---T---------G----G-T-T-TAT-T-GTGAG-ATC-G-T-CGTGG---T-----G-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCTGACCC-GCA--TTC--T-C-TAGCGTCAGC--TAC----AT-AC-TC----TCCA-TGAATATAA-CTCGACCG-TT-CCGCT--T-TACTGATAATACATG--T--TTA------AA--AA-AATAC--TCG-T------CAATA--agtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                          A-C-T-A-----A-TTTATTT---TAACTC--GGTT-Gc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --GTG---T---------T----G-T-T-T-C-T-GAGAA-GTC-A-T--G-TA---T----TG-GA-A-T---------A----TGG--G-G-GTCAAACGT-GCG--ATC--T-C-TGACGTGTGA--GGTCA--GC-AC-GA-AA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-aaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|36                         :                                                                                                                                 actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcTT--TG----A---TCTA--TA-C-C-A-----A-ACCATTT---TACCTC--AATT-GT--G-AA----T-A----A---A--G-T--C--C---ATAG----------------------------------------------TC-A--A-----TT--TCCTG--G---GTGGA---AC---TA-GTAC------C-A--------A--GTG---T---------T----G-TAT-T-T-T-tgtaacgtggacgattta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catctaactgaatataattccta-G-ATCAAATCC-GTG--ACC--T-A-----ATTAGC--TACTA--AC-AC-TC-TA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CA-CCG----T-T-C----A------G--T------------------AGGATCGTTG-T------CAATA--T-ACTGtacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|38                         :                                                                                                                                                           attttttgattttcttggttggaactcgtactgaattt-----A-CTTAGTT---TAGCTT--GATT-GC--G-AA----A-G----A---A--A-C--T--C---AGAGT--T---T----tctatatattgttata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----T----G-G-ATTAAGACC-TTG--ACC--T-C-TTACATCGGT--CACCA--AC-AC-TC-TA-TCCACTtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|39                         :                                                                                                        acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccatT--TA----A---TCTA--CA-T-T-A-----T-TCTATTTTAATAGCTT--GATT-GT--G-AG----A-T----A---A--G-T--TGGCGAAAGAAT--T---T-----------T-A-------T---TGA--TTGC--TCT--G--AGTCCATT--TCTAA--G---GT------------A-TTAC------T------------------------------------T-T-T-T-T-GAGAG-ACC-A-T-CA-AG---G----TG-AG-C-T---------T----T----G-A-ATGGAGTCT-Gtcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                   TTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---TAATTT--GATT-GC--A-AA----G-A----A---A--G-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--CCAC--TCTC-A--AGTCTACT--TATTG--G---ATAGA---AC---AA-ATAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-TAT-T-GGGAG-G-A-A-T-TG-TG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAACTTC-GCA--AAC--T-A-TGACATGAGC--GACCA-----AC-TC-TA-TCCACTA-----CA-CT--ACTG-CT-CCACT--T-T-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                               tcccttgaaaggcctcctattacaatatctat-------T---GAA--ACAC--TCTA-A--AATTCGTA--ACCTG--C---GTAA------------------------G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGTG-GCC-A-T-CA-GG---T----TC-AG-CAT---------G---------A-G-ATCGATCCA-GCA--CCA--T-C-TGGTATTATC--GGCAA--AT-GT-TC-AA-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                   tagg-TTTACTA---TAGCTC--GATA-GT--G-AA----G-G----A---------------------------------------------------T---GAA--TCGC--TCTC-G--ACAACGCG--TTCTG----------------------------------------------------T---------T----G-T-T-T-T-TCGAGAG-GCC-A-T-CG-GC---TCATACA-AG-C-----------A----T----A-GTATCAAACCA-ACG--ACT--T-CGTTGCGCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C---CA-AAAC------T-G--------T--GTA---T---------T----G-T-T-T-C-G-GAAAG-A-C-C-TACG-TA---T----CG-AT-A-T---------G----TTCAAG-G-ATCGA-CCA-ACA--AA---T-A-TAGCCTGAGC--GATTA--AC----TC-TA-TCTGCTG-----GA-CT--ACTG-C
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggatagt-G--AGTTCATT--TCCTG--T---GTAGA---AC---CA--TGCAGCAAGT-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-C-T-T-AAGAA-T-C-A-T-CA-----------CG-A----T---------G---------G-A-ATC---CTT-TTA--ATG--T-C-TGGCACAAGA--GGCCA--TC-AT-TA-TG-TACAt
gi|46                         :                                                                                                                                                                       --TA----T--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTTTTT---TCACTT--GAAT-GT--G-AA----G-A----A---A--A-C--T--C---AGAGA--T---T----A------T-AAAAAACGT---AAA--CCGC--TCTT-G--AGTCt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                        tacttaaattttaatggtacTCT---TAGCTC--AATT-AA--T-AA----G-A----C---A--G-C--T--C---ACAGT--T---T----A------T-A-------T---GGA--TCGC--TTTtattt
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-G--AGTGCGAT--TTCTC--G---GTATA---TC---CT-GTAC------T-G--------G--GTG---G---------A----G-T-T-T-C-T-----------A-T---------------A-AG-----------------------A-G-ATCAAACC------------T-C-TGACTTCAAT--ATCAT--AC-AA-TC-TA-TCAACTA-----CA-CT--ATCG-TC-Cttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -ATCGAACCC-ATA--ACC--T-T-TTACAAAAAC--AGCCA--AG-AC-TC-TA-TCCAGTA-----TG-AT--ATTG-TC-CCACT--T-A-TT--TA------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    TTA--TG-A-T-A-----A-TTTATTT---TAGCTC--GA-T-GC--C-AT----G-A----A---G--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--CTGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCAG--G---GCAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-AG-GG---T----TG-AG-A-T---------G----G----A-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGC--GGCCA--AC-AC-TC-TA-TCCATGG-----GA-CT--ACCA-CC-CCGCT--T-T-A----A------A--T--TGA------AA--agccttgttacaagacattcatagaatata
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T-TG-GG---T----C-------T---------G---------G-G-ATCTGACCC-ACATGACC--T-C-TTGCATGGGC--AGCCA--AC-A--TC-TA----ACTGC----CA-C---ACC--TA-CTATT--T-T-CT--TA------T--T--Ttattcaaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----T-A-ATTGAGCCT-GCA--ACC--T-C-AAGTGTGTG--------------C-TC-TA-ACCACTG-----TA-CT--ACCA-CT-CTAAT--T-atttaataactactattt
gi|52                         :                                                                                                           A--T----T--TATATAATAAA---A--TA-T---GA-A--------TAA---AGTACTTGATA----A--AGTTG--TA-C-TTA-----A-TTTATTG---TAGCAC--AATT-GC--T-AT----T-AAAACA---A--G-C--T--C---AGAAT--T---T----A------T-A-------T---aaaagtcacagatgcaccagtgttaacgtc
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--------A--ATG---C---------T----G-T-T-C-T-T-GACAA-G-C-AAT-AA-AG---C----TGCAC-C-T---------G----T----G---ATCCAACCC-ATG--ACC--A-T-TGGCATGAGC--AGCCA--AC-AC-----AGTTCACTG-----TA--T--ACa
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GAGAA-A-C-A-A-AA-AAAACC----TA-AG-C-T---------C-----------G-ATTGAGCCT-ACA--ACC--T-C-TGAAGTGATT--GGTAA--AC-GT-CA-TA-TTCATTA-----CA-CC--Aataa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GATAC---C-A-T-TG-GT---T----CC-AA-CAT---------G---------A-G-ATCAAACCT-GCA--AAC--A-C-TTGCA--AGTTGGGCCA--AC-AC-CA-TA---CACTG-----CA-CT--ACCG-C
gi|57                         :                                                                                                                                                                                --GTTTG--GA-A-T-A-----G-TTTGTTT---CAACTTTGGAT--GC--G-AA----G-A----A---A--G-T--T--C----GTGT--T---T----A------T-T-------T---GAA--A-AC--TCTC-A--CTTTCGTT--TCCTG--G---ATGAA---AC---t
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttg----G-G-ATGGAACCG-GCA--ATA--T-C-CAGTATGAGC--GGCCT--AC-AC-TC-TA-TTCACAG-----CA-CT--A
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caatcttgGT--TCTC-G--AGTCCATT--TCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-ATAC------C-A--------A--ATG---T---------T----G-C-T-G-T-T-AAGAA-G-tttagtgtgtatgttttactaatt
gi|6                          :                                                                                                                              att---A--TA-A---AATC--------TAA---CATACAT--TT----A--GCTTA--TA-C-C-A-----A-TTCATTG---TAGCTG--GATT-GC--G-AA----G-A----A---A--G-T--T--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--ATGC--CCTT-A--AGTCCGTT--ACCTG--A---GTTGA---AA---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-T------AGAGTC-C-G-C-CG-GG---T----CG-AG-A-T---------T----T----C-G-ATCGAACCC-GCA--ACG--T-T-TAGCGTGAGA--GGACA--GC-A---C-TA-TCCAGTG-----CA-CT--ACCG-CT-CAGCT--T-aacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atggataccaacacgaccataaaacaaatacctaaataaagaccgttatagttac-GCT--ACCAGT-C-TGG--TGAGT--GACCA--AC-AA-TC-AG-TCCACTG-----CA-CT--ACCA-CC-CCACT--T-T-CT--Tacatgcatattatatagttagttagaaaaaacgttcttctcttacagggatcagtgttttttactttcattttcatctacaccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --ACC--TGC-TGGCATGACT--GGCCA--AC-A---C-TA-TTGACTG-----GA-CT--ACTGCCC-CCACT--T-T-A---AA------G--T------------A--GC-AGTGT--TTGAT------ttactcctttagtctcttgtatatttgt
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       AGT--T---T----T------T-G-------T---GAA--TCAT--TCCT-ATTAGTCCGTT--TTGTG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-GTGCTTTATA--ATG---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-tttagaacagttgtg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAACCCTGTG--ATC--T-C-TGGTGGGAGT--GGTCA--CA-AC-TC-TA-TCCACTGGCC--CATCT--ACC
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgggaaa-T---------G----T----T-G-ATTG----C-ACA--ATC--T-C-TTGCATGAGC--AGCTA--AC-AC-TC-GA-TGCAGTA-----CA-CT--ATTA-CC-tgcttagtacttt
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cctgagtggaacctgg-T-T-GAAAC-G-C-A-T-GG-GG------------------------------------G-A-AACGAACAT-GCA--ACC--T-C-CGACACGAGC--GGCTA--ACTGC-CC-CA-TC
gi|7                          :                                                                                             aTTTATA-AT-TGTA--T----CAACTT------AA---A--TA-A---A-----------TAC---AATTAAT--TT----A--GATTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT---CAGCTC--GACT-GT--GAAC----A-A----A---A--G-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T-A-------T---TAA--ACGTCATCTT-G--TGT----T--TTTT--------TAGA--------------------------------G--GTG---T---------T----G----------------------------GG---T----C--AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCT-GTG--ACC--T-C-TAGTTTGAGC--AGCCA--AC-AC-TC-TA-TCCACTG-----CA-CT--ACCT-CT-GCGCT--T-atgcta
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaa-T-T-T-T-GAGAG-A-CCA-T-CG-GA---T----CA-AG---T---------A----T----G-GTATCGAACCC-GCC--ACC--A-C-TTGCGAGAAC--GGagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                     gttaTTATTT---T-GTTA--GGAT-CC--G-ATACTGG-A----A---ACAG-G--T--C---AGAGC--T---G----A------T-A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AAT
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATCA-GCA--ACT--T-C-TAGCATGAAT--G-CAA--AC-AC-TC-TA-TGCGCTG-----CA-CT--ACCG-CC-
gi|73                         :                                                                                                                                                           ggggaggaCCTT--------A--GTTAA--TA-C-T-T-----G-TTTATTT---TAGCTC--ATTT-AC--A-AA----G-A----A---A--G-C--A--T---AAAGA--T---C----A------T-G-------T---G
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -G-ATCGAACTT-GCA--TAC--T-C-TGGTGTGGGT--GACCA--AC-AT-AT-TA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-C
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCC-G-A--GCC--T-C-TGGCAAGTGC--GGCCA--AC-TA-TC-TA-TCCACTG-----TA-CT--ACCT-CC-CAACT--
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GCA--ACT--A-G-TAGCATGAGT--GGTCA--AC-AT-TC-TA-TCCACTT-----CC-CT--GCCA-CC-C
gi|78                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGCCA--AC-AT-TC-TA-TCCACTA-----CA-CT--AACA-TC-CCACT--T-T-Cagct
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GCA--CCC--T-C-TGGCATGAGA--GGCCA--AC-A---C-TA-TCCAATA-----CA-aagt
gi|8                          :                                                                                                                                                                 tTCCTT--------A--GTTTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT----AGCTC--GATT-GC--A-AT----G-A----A---A--G-C--C--C---AAAGC--T---T----A------T-A-------T---GAA--GCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--T---GTAAA---AC---CT-GTTC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TCT-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-A---------G----G----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AT-TC-TA-TCCATTA-----CA-CT--ACCG-CC-C
gi|9                          :                                                                                                     aaaacttgtggaaggacagcgattcAAA---A--TG-A---AC-T--------TAA---TTTGTTT--TT----A--GTTTA--TA-C-C-A-----A-TTTAATT---TATATC--TATT-GC--A-AG----G-A----A---A--G--------------------------------------------------------C--TCT--A--AGTTC--------TA--G---GTAGA---AC---AA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-C-T-T-T-AAG-------------------T----TA-AA-C-T---------G----G----G-T-ATTAAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGT--GGCCA--AC-ACTTT-TA-TCCAATA-----TA-CT--GCTA-CT-TCACTTGT-T-TT--TA------ATTT--TAA------GA--AC-Aagctatacgctctgttctctttagatgcgtgtatatttatatctatgcatcagatactggtaaccatacctaatctgtaatacacgaaatactgttgatgttattgacagtaatatactatt
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAAAGTATCGGTTAGGGAATTTTTAGCCTTAAACAAATATTAAAAATTGTTTGCTAAACTTGTCATGAGTAGATTAAAAACTACAAGGTGTTTTTTTAAACACATAAAAGAAAAGCATTCAAAATAGCATTTTATTTCCTGAATTATTGCCTATTATTTAGTCCTTATAACAAAAATAAAAA
Unaligned ( gi|40 ): GATAGAATATGTACTAGATGTTGGGTTGGAGTCTGGGATTAAACCCATGACTTCTTGCATAAGTGGTCAACATTCTTTCCTCTATATTACGGTCCAACTTTTGATTTAAGATTAAAAAC
Unaligned ( gi|41 ): CATACTCAAATTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAATACATGTACATGGTCTCAAGTTGAGATA
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Unaligned ( gi|64 ): ATATATTATAATAGCTTGATTGCAAAGAAAGTTCAACACCTACCGGTAAATGAACTGCTCTCAAATCTGCTTATT
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Reference ( family-354 )      : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTNACAATAATAAAGTTACCTGTTATNTATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTT--TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-T-C--T--TA------GT---TNA------A--A--AC-AG-NAT--TTGAT------CAAT-A--TAACTGTAAGTCCGTTCTTACAGATCATACT-AG-TAT--TTTTAGC---GATAAACTATATANGATGATATAATG
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gi|19                         :                                                                                                 atgcatttgttattaacatctattttcttatattcaggctttacatggaacaactatggccatcttaagatttaatagtaaatatttggctatggtggtataaactttag---T---AA--CTT--GATT-GC----------AA---AG-T--T--C---AGAGT--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGT--TCTC-C--AGTTCATT--CCCAG--G---AAAGA---AC---CA-GAAC------T-G--------GGTGTG---T---------T----T-T-T-T-T-T-TTTAG-T-CAA-T-TG-GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCC-GCA--ACT--T-T-TA--------------------AC-TCTG-TCTACTG-----TG-CT--ACTA-CT-CCA-T--T-T-C--A--AA------GT------------------AC-AA-TAC--TTGTT------TAAaaaaacatcggccaa
gi|2                          :                                                                                                             gtcattcattatcaaatttccagggggtgcttaactttttttccaggtgtatataaTT--TA-------GTTGA--TA-A-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GAAT-GC----GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T----G-T-T-TAA-T-GAG-----------CG-GG------------------------------------G-G-ATCGAACCC-GAA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCAA--AC-AC-TCTA-CCCATTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCGC---T-T-C--T--T-------GTTA-TGAGACTGTA--A--AC-TA-TAT--TTGATTACAGCCAAT-ATCTAACTAAAACAGCTTTCGTTCAAAT-ATATT-AGCTA----TTTAGC---AATAAAGTATATAggtct
gi|20                         :                                       agtaaaaatagtaaaagaagtattgtacattggcagacatgataaaacttttcttaactaaagataagttgccccttactgtcaacaacggataccaattgaacttttttgtctcattatttgatatcatta----A--GTTTT--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---T---GG--CTC--GATT-GC----GTA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T----------------------------------------------CCT-G--AGTCC-CTATTCCTG--T---GTAGA---AC---CA-GCAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             att----G-G-ATAGAACCC-GCA--ACC--G-C-TGGCTTTAAT--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----AA-CT--AGCA-CC-CCACT--T-T-CAAG--TA------AT---TAA------A--tacagggatagaacccgcaaccgctggctttaatggccaacactctatccactaaactagcaccccactttcaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|21                         :                                                                                                   attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacagA-C-T-A-----G-TTTATGT---T---AG--TTT--AACT-GC----GAA-G-AA---AG----T--C---AGAGA--TAATT----A------T------G-------T---TAA--TCGC---CT--G--A--TCGTT--TACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-GTAC------C-G--------A--GTA---T---------TTTTAG-C-T-TAT-T-TAGTT-G-TTA-T-AG-GG---T----CG-AA---T---------A----T----G-G-GATAAACTC-----------T-C-TAGTATGAGG--GGCCA--TC-AC-T--A-TCCACTG-----CA-GT--ACAG-CC-ggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                               tattcagtatga---AA-C--------GAAT--AACCATT--TG-------GTTTA--TA-C-T-ACTAGTACTTTATTT---T---AG--CTC--GATT-TC----GAT-G-AT---AG-C--T--C---AGAGT--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAC--T-------------CT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-aacttattaaacgatatttaccaacttca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgAGA---AC---CA-AGGC------T-G--------T--GTG---T---------T----G-T-T-T-G-T-GTGTG-GTC-A-C-CA-GG---A----CA-GG-T-T---------GAACAT----GAG-ATTGAACCT--TG--ACC--T-C-TGTAGTAAGA--TTTCA--AC-AC-CCCA-CCCA-GG-----AA-----ACCA-CC-ATATT--TGT-A--C--TA------GT---TTATC----A--ACTAC-AG-CAT--AT-AT------TAAT-A--TCA-TGTA-------TCTTACAGATCATACT-A--CAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATGatatgacgcactattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|25                         :                                                                                                                                                                    CTT--TA----C---TTTA--TA-AGT-T-----A-TTTATTT---T---AG--CCC--AATT-GC----GAA-G-AA---AT-C--T--T---GAAGT--T---G----A------T------T-------T---GAA--CCGT--TTTC-G--AGTTCGCT--TCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T------T-T-G-T-T-GA--------------------------G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATTGAGCCC-GCA--ACC--A-C-TAGCATGAGC--GGCCT--GC-AC-t
gi|26                         :                                                                               ttataccaataaccataacctatactgcgtta----T--TTTTT--TAAA---AATTA-A---TA-T--------TAT---AATTCTT--T------------------------------TTT-TTT---T---AG--CTT--GATA-ACAT--GAA-G-TA---AG-C--T--T---CGAGC--T---TTGA-A------TT-----A-------T---TAA--T-GC--TGTCCA--AGTCTG-T--TGCT----------------C---CGCGCAC------T-G--------G--G-G---C---------T----G-T-T-T-A-T-GAGAG-GCC-A-C-AA-GG---CATG-CA-AG-C-T---------T----T----C-A-ACCAAACCC-ACA--ATC--T-C-TGG---------AGCCA--AC-AC-aataataatact
gi|27                         :                                                                                                                                                agacagatagcatagaattgaTT--TA-------GTTTA--TA-C-T-A-----A-TAT-TTT---T---AG--CTC--T-TT-GC----AAA-GTAAT--AGAC--T--C---AGTTC--T---T----A------T------A-------A---GAA--CCAC--TCTT-G--TGTCTGCT--TTCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-T--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                               ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggtttatactcatctcaaaatatgg--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---AAA--CCAC--TTTC-A--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTAGT---AC---CA-GTA-------T-G--------G--GTG----------------------T-T-T-T-AAGAG-A-C-G-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T--------------T----GAA-ATCGAACCC-AAA--AC-----C-TGATATGAGC--AATCA--AC-AC-TTTA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCAtttaaaggcca
gi|3                          :                                                                                                                                    gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CCT--GTTT-GT----GAA--------AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--CTGC--TCTA-G--AGTCCGTA--TCGTG--G---GTAGA---GC---CA-GTAT------T-G--------A--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GCC-A-T-CATGG---T-----G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATCAAGTCC-GTA--ACC--T-C-GTGTGAGAGC--AGCCA--AC-AC-TTTA-TCCACTG-----GG-CT--ACCA-TC-CTGCTCAT-T-T--T--GA------ATTTGTCA------A--G--GC-AGCTAT--TTTTT------CCAT-T--TGAATGTAtata
gi|30                         :                                                                                                                             ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttgaa--TA-C-T-A-----A-TT-GTTT---T------------GATT-GC----AAA-T-GA---AG-A--T--T---AGAGC--T---TTTCAA------T------T-------T---GTATTTCGCT-TCT------GTCTCAT--TCTTG--G---ATGGA---ACAA-GA-GTAC------TCG--------G--GTG---T---------T----G-T-TAT-C-T-GA--------A-T-----G---T----TG-AG-T-C---------T----T----G-G-AGCAAGCCT-GCA------------------AGT--GGCCATTAC-GT-CCTA-TCCTCTA-----AA-CC--ACCA-CT-Cttggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|31                         :                                                                                              TTT-TACGT-TTTAAGT----T--TTTTT--TATG---A--TA-ATTCAG-C--------TGA---TAT--TTA-TA----A--GTTTA---G-C-A-G-----A-TTTATTT---T-----------------------GTA---AA---AG-CACT--C----GA-T--T---T----A------C-----------------------TCGC--ACTT-T--AATCGATT--TCCTG--A---GTA-A---AC---CA-ATAC------C-G--------G--GTG-------------------------------AAAG-C-T-A-T----AA---T----GG-AG-C-C--------------T----G-GCATTGATCCT-GAA--ACC--T-T-TGGCGTGAGagcaagatc
gi|32                         :                                                                                                                                                          aAA---AGTTGTT--TAGTCCA--GTTTA--TA-A-C-A-----A-TTTCTTT---T---AT--CTC--CATA-TC-----AA-T-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------TTATGAA--AAGC--TCTC-G--AGTACGTT--TCCTT--A---GTTGG---TG---AG-GTAC------T-G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---
gi|33                         :                                                                                                                                                                         cgcgtattttggtaacatttta-A-----A-TTTTTTT---T---AC--CTC--CATT-GC----AAA-G-TA---AA-A--T--C---AGAAC--T---A----A------A------G-------T---GAA--T--------------------------TG--G---GTATT---GT---CA-TTAT------T-G--------G--GTG---T---------T----G-T-T-C-A-T-GAGAG-----A-T-CA-AG---C----------C-T---------G---------G-A-ATTAAA-----------C--T-C-TGACATGGGC--AGCCT--TT-AC-CCTA-TCCCCTC-----CA-CC--AGTG-CC-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---AC---CC-GTAC------T--------------TT---T---------G----G-T-T-TAT-T-GTGAG-ATC-G-T-CGTGG---T-----G-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCTGACCC-GCA--TTC--T-C-TAGCGTCAGC--TAC----AT-AC-TC---TCCA-TGAATATAA-CTCGACCG-TT-CCGCT--T-TAC--TGATAATACATGT---TTA------A--A--AA-AA-TAC--TCG-T------CAAT-A--agtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                          A-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--CTC--GGTT-Gc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTG---T---------T----G-T-T-T-C-T-GAGAA-GTC-A-T--G-TA---T----TG-GA-A-T---------A----TGG--G-G-GTCAAACGT-GCG--ATC--T-C-TGACGTGTGA--GGTCA--GC-AC-GAAA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-aaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|36                         :                                                                                                                                 actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcTT--TG----A---TCTA--TA-C-C-A-----A-ACCATTT---T---AC--CTC--AATT-GT----GAA-T-AA---AG-T--C--C---ATAG---------------------------------------------------TC-A--A-----TT--TCCTG--G---GTGGA---AC---TA-GTAC------C-A--------A--GTG---T---------T----G-TAT-T-T-T-tgtaacgtggacgattta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catctaactgaatataattccta-G-ATCAAATCC-GTG--ACC--T-A-----ATTAGC--TACTA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CA-CCG----T-T-C------A------GT---------------------AG-GATCGTTG-T------CAAT-A--T-ACTGTtacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|38                         :                                                                                                                                                           attttttgattttcttggttggaactcgtactgaattt-----A-CTTAGTT---T---AG--CTT--GATT-GC----GAA-A-GA---AA-C--T--C---AGAGT--T---T----ctatatattgttata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----T----G-G-ATTAAGACC-TTG--ACC--T-C-TTACATCGGT--CACCA--AC-AC-TCTA-TCCACTtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|39                         :                                                                                                        acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccatT--TA----A---TCTA--CA-T-T-A-----T-TCTATTTTAAT---AG--CTT--GATT-GT----GAG-A-TA---AG-T--TGGCGAAAGAAT--T---T-----------T------A-------T---TGA--TTGC--TCT--G--AGTCCATT--TCTAA--G---GT------------A-TTAC------T------------------------------------T-T-T-T-T-GAGAG-ACC-A-T-CA-AG---G----TG-AG-C-T---------T----T----G-A-ATGGAGTCT-Gtcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                   TTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--TTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTC-A--AGTCTACT--TATTG--G---ATAGA---AC---AA-ATAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-TAT-T-GGGAG-G-A-A-T-TG-TG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAACTTC-GCA--AAC--T-A-TGACATGAGC--GACCA-----AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACTG-CT-CCACT--T-T-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 tcccttgaaaggcctcctattacaatatctat-------T---GAA--ACAC--TCTA-A--AATTCGTA--ACCTG--C---GTAA------------------------G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGTG-GCC-A-T-CA-GG---T----TC-AG-CAT---------G---------A-G-ATCGATCCA-GCA--CCA--T-C-TGGTATTATC--GGCAA--AT-GT-TCAA-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                   tagg-TTTACTA---T---AG--CTC--GATA-GT----GAA-G-GA------------------------------------------------------T---GAA--TCGC--TCTC-G--ACAACGCG--TTCTG----------------------------------------------------T---------T----G-T-T-T-T-TCGAGAG-GCC-A-T-CG-GC---TCATACA-AG-C-----------A----T----A-GTATCAAACCA-ACG--ACT--T-CGTTGCGCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C---CA-AAAC------T-G--------T--GTA---T---------T----G-T-T-T-C-G-GAAAG-A-C-C-TACG-TA---T----CG-AT-A-T---------G----TTCAAG-G-ATCGA-CCA-ACA--AA---T-A-TAGCCTGAGC--GATTA--AC----TCTA-TCTGCTG-----GA-CT--ACTG-C
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggatagt-G--AGTTCATT--TCCTG--T---GTAGA---AC---CA--TGCAGCAAGT-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-C-T-T-AAGAA-T-C-A-T-CA-----------CG-A----T---------G---------G-A-ATC---CTT-TTA--ATG--T-C-TGGCACAAGA--GGCCA--TC-AT-TATG-TACAt
gi|46                         :                                                                                                                                                                       --TA----T--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTTTTT---T---CA--CTT--GAAT-GT----GAA-G-AA---AA-C--T--C---AGAGA--T---T----A------T------AAAAAACGT---AAA--CCGC--TCTT-G--AGTCt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                        tacttaaattttaatggtacTCT---T---AG--CTC--AATT-AA----TAA-G-AC---AG-C--T--C---ACAGT--T---T----A------T------A-------T---GGA--TCGC--TTTtattt
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-G--AGTGCGAT--TTCTC--G---GTATA---TC---CT-GTAC------T-G--------G--GTG---G---------A----G-T-T-T-C-T-----------A-T---------------A-AG-----------------------A-G-ATCAAACC------------T-C-TGACTTCAAT--ATCAT--AC-AA-TCTA-TCAACTA-----CA-CT--ATCG-TC-Cttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATCGAACCC-ATA--ACC--T-T-TTACAAAAAC--AGCCA--AG-AC-TCTA-TCCAGTA-----TG-AT--ATTG-TC-CCACT--T-A-T--T--TA------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    TTA--TG-A-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GA-T-GC----CAT-G-AA---GG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CTGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCAG--G---GCAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-AG-GG---T----TG-AG-A-T---------G----G----A-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATGG-----GA-CT--ACCA-CC-CCGCT--T-T-A------A------AT---TGA------A--A--agccttgttacaagacattcatagaatata
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-TG-GG---T----C-------T---------G---------G-G-ATCTGACCC-ACATGACC--T-C-TTGCATGGGC--AGCCA--AC-A--TCTA----ACTGC----CA-C---ACC--TA-CTATT--T-T-C--T--TA------TT---Ttattcaaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----T-A-ATTGAGCCT-GCA--ACC--T-C-AAGTGTGTG--------------C-TCTA-ACCACTG-----TA-CT--ACCA-CT-CTAAT--T-atttaataactactattt
gi|52                         :                                                                                                           A--T----T--TATATAATAAA---A--TA-T---GA-A--------TAA---AGTACTTGATA----A--AGTTG--TA-C-TTA-----A-TTTATTG---T---AG--CAC--AATT-GCTATTAAA-A-CA---AG-C--T--C---AGAAT--T---T----A------T------A-------T---aaaagtcacagatgcaccagtgttaacgtc
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--ATG---C---------T----G-T-T-C-T-T-GACAA-G-C-AAT-AA-AG---C----TGCAC-C-T---------G----T----G---ATCCAACCC-ATG--ACC--A-T-TGGCATGAGC--AGCCA--AC-AC----AGTTCACTG-----TA--T--ACa
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GAGAA-A-C-A-A-AA-AAAACC----TA-AG-C-T---------C-----------G-ATTGAGCCT-ACA--ACC--T-C-TGAAGTGATT--GGTAA--AC-GT-CATA-TTCATTA-----CA-CC--Aataa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GATAC---C-A-T-TG-GT---T----CC-AA-CAT---------G---------A-G-ATCAAACCT-GCA--AAC--A-C-TTGCA--AGTTGGGCCA--AC-AC-CATA---CACTG-----CA-CT--ACCG-C
gi|57                         :                                                                                                                                                                                --GTTTG--GA-A-T-A-----G-TTTGTTT---C---AA--CTTTGGAT--GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C----GTGT--T---T----A------T------T-------T---GAA---AAC--TCTC-A--CTTTCGTT--TCCTG--G---ATGAA---AC---t
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttg----G-G-ATGGAACCG-GCA--ATA--T-C-CAGTATGAGC--GGCCT--AC-AC-TCTA-TTCACAG-----CA-CT--A
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caatcttgGT--TCTC-G--AGTCCATT--TCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-ATAC------C-A--------A--ATG---T---------T----G-C-T-G-T-T-AAGAA-G-tttagtgtgtatgttttactaatt
gi|6                          :                                                                                                                              att---A--TA-A---AATC--------TAA---CATACAT--TT----A--GCTTA--TA-C-C-A-----A-TTCATTG---T---AG--CTG--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--ATGC--CCTT-A--AGTCCGTT--ACCTG--A---GTTGA---AA---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-T------AGAGTC-C-G-C-CG-GG---T----CG-AG-A-T---------T----T----C-G-ATCGAACCC-GCA--ACG--T-T-TAGCGTGAGA--GGACA--GC-A---CTA-TCCAGTG-----CA-CT--ACCG-CT-CAGCT--T-aacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atggataccaacacgaccataaaacaaatacctaaataaagaccgttatagttac-GCT--ACCAGT-C-TGG--TGAGT--GACCA--AC-AA-TCAG-TCCACTG-----CA-CT--ACCA-CC-CCACT--T-T-C--T--Tacatgcatattatatagttagttagaaaaaacgttcttctcttacagggatcagtgttttttactttcattttcatctacaccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --ACC--TGC-TGGCATGACT--GGCCA--AC-A---CTA-TTGACTG-----GA-CT--ACTGCCC-CCACT---------------------T---TAA------AGTA--GC-AG-TGT--TTGAT------ttactcctttagtctcttgtatatttgt
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    AGT--T---T----T------T------G-------T---GAA--TCAT--TCCT-ATTAGTCCGTT--TTGTG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-GTGCTTTATA--ATG---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-tttagaacagttgtg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACCCTGTG--ATC--T-C-TGGTGGGAGT--GGTCA--CA-AC-TCTA-TCCACTGGCC--CATCT--ACC
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                  tgggaaaTTATAA---T---AG--CTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-T--T--C---AACAC--C---T----A------CCGGTAAA-------T---GAA--CTGC--TCTC-A--AATCTGCT--Ttgcttagtacttt
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atata-T---------G----T----T-G-ATTG----C-ACA--ATC--T-C-TTGCATGAGC--AGCTA--AC-AC-TCGA-TGCAGTA-----CA-CT--ATTA-CC-att
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cctgagtggaacctgg-T-T-GAAAC-G-C-A-T-GG-GG------------------------------------G-A-AACGAACAT-GCA--ACC--T-C-CGACACGAGC--GGCTA--ACTGC-CCCA-TC
gi|7                          :                                                                                             aTTTATA-AT-TGTA--T----CAACTT------AA---A--TA-A---A-----------TAC---AATTAAT--TT----A--GATTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT---C---AG--CTC--GACT-GT----GAACA-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--ACGTCATCTT-G--TGT----T--TTTT--------TAGA--------------------------------G--GTG---T---------T----G----------------------------GG---T----C--AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCT-GTG--ACC--T-C-TAGTTTGAGC--AGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCT-CT-GCGCT--T-atgcta
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gi|71                         :                                                                                                                                                                                                     gttaTTATTT---TGTTAGGATCC--GATA-CT----GGA-A-AC---AG-G--T--C---AGAGC--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AAT
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CTGGGTTTCAAACACGCAATCTCTAGCACGAATGGCCAAAACTCGTATCCAGTACACTGCTACCCCTCTTATTTCCACTTAATGTGACCAGGGAAGAACACTTGTTATACTCTAAATACCATTTTTTAACAGAACATTTACATCTATACTGTACTCTGTAATGATTTCAATAAACACTTCTCTTCAACTTTTAAATGATCTATACAT
Unaligned ( gi|28 ): AAAAGTATCGGTTAGGGAATTTTTAGCCTTAAACAAATATTAAAAATTGTTTGCTAAACTTGTCATGAGTAGATTAAAAACTACAAGGTGTTTTTTTAAACACATAAAAGAAAAGCATTCAAAATAGCATTTTATTTCCTGAATTATTGCCTATTATTTAGTCCTTATAACAAAAATAAAAA
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Unaligned ( gi|41 ): CATACTCAAATTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAATACATGTACATGGTCTCAAGTTGAGATA
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Unaligned ( gi|65 ): TATACCCATATATTTAAGTTTGATTGCAAAGTAAGTAATCAATGTGGAGTCTGTTTCCTAGGTAAGACCAGAAGT
Unaligned ( gi|67 ): AGTCTGGGATAAAACCTAAAACTTCTGACACAAGTGGTATCCCCCTTTCCACTATAGCACCATCCCAC
Unaligned ( gi|69 ): TTGGTCATGGGTGGGACCGAATTTGCGATATTTGGCATGAACGTCTAGCATCCTATTCACTACACC
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Reference ( family-354 )      : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTNACAATAATAAAGTTACCTGTTATNTATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTT--TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-T-C--T--TA------GT---TNA------A--A--AC-AG-TAT--TTGAT------CAAT-AT-NATGTAANT------GCTTTCNTACAGATCATACT-AG-TAT--TTTTAGCG---ATAAACTATATANGATGATATAATG
gi|1                          :                                              AAGCACATGTCACAATAATAAAGTTATCT--TATCTATATTGATCATTTTTA-ACAT-TCTA--T----T--TTTAT--TAAG---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTTG-TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----TAT-A-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAG--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAA-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AA-C-T---------G----T----G-G-ATCGAGCCC-GTA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATAA-----GA-CT--ATCG-CC-CCACG--T-T-C--C--TA------GT---TGA------A--A--ACGAG-CAT--CTGAT------CAAT-AT-AATATAAGT------CCGTCCTTACA---TACACTGGG-TATCGTTTTAG-G---ATAACCTATATATAATGATATAATG
gi|10                         : aattttgtcaatttcacaaatgtatagcataatgaatgaatgtatAAGCACGTGTAAC-----TAAA--TACCTGTTATATATGTT---TATTTTCATACAAAGCTA--T----T--TTAGT--TCAA---T--TGCG---AA-G--------TAA---A---CTTAGTA----ATAGTATACATA-G-T-A-----A-TTTATTT---C---AG--CTC--GATT-GT----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTT-G--CGTCTGAT--TCATG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-C--------A--ATA---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---C----TG-AG-C-T---------G----G----G-G-------------A--ACC--T-C-TGGCATGGGC--AGCCA--AC-AC-TCTT-TCCACTA-----CA-TT--A----CC-CCACT--
gi|11                         :                                                                                                                              atattgtcagtccatacagcaactgagttaaactacttcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATGT---T---TC--CTC--AATT-GC----AAT-G-TA---TT-C--T--C---AGAAA------T----A------T------A-------T---GAA--TCA----CTG-G--AGCCC-TT--T----------GTAGA---AC---AA-GTAC------T-T--------T--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GTC-A-C-CG-GT---C----CG-AGCC-T---------A----T------G-ATCAATCTG-GGG--ACA--T-T-TGGC---AG----------------TCTG-TCCACTG-----TA-TT--GCCA--T-CCACT--aaacttagagcttttctaaattgc
gi|12                         :                                    agtagaacttgcatcttatatcaataaaatacaatgtgtgtaacgttaata---CATGTTTATACAT-T-TA--T----TGATATAT--CAAATATA--TA-A---AA-CCCAATCAATAACTTAATTCATA-TT----A--GTTTA--TA-C-C-A-----A-TTTATTT---C---AG--CTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-T--T--C-----AGT--T---T----A------T------G-------T---TAA--CCGC--TTCC-G--AGACTGCT--TCCTG--G---ATAGA---AC---CA-GTTC------T-G--------A--ATGGACTTTTTTATTGT----G-T-T-T-T-T-GAGAT-A-C-A-T-TA-GG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAAACAC-ACA--AAC--T-C-TGGTGTAAGT--GACCA--AC-AC-TCAA-TCgtaatatttatgatgtttgagtagattgtgagatatggatagaattacatgtatcaaataaaatgataatatgataacagag
gi|13                         :                                                                                                                                                             gctagttaaT--TA----A--ATTCA--TA-C-T-A-----A-TTTGTTT---T---AG--CTC--GATttcctctaataagaaacaagaaacagtagacaaactt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagaC---CC-GTAT------T-G------------TG---T--------------G-T-T-T-T----AGAG-G-C-A-TATT-AG---T----CG-AG-T-T---------G----G----G-G-ATCGAACCT-GCA--ACA--A-C-TGGCGTGAAC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-TC-TCAgctctcccgtgcccgtattgtgtgttttagaggcatattagtcgagttggggatcgaacctgcaacaactggcgtgaacggccaacactctatccactacactaccgtctcaataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
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gi|15                         :                                           gtcatagcttatcaaatcagacaaatcgtgctttgctggttttctccagtatcatgtCAT-TCCA--TGAAAT--TTTCTA-TAAA---A--TA-A---A-----------------------T--TA----A--GTT-A--TA-C-T-A-------TTTATTT---T---AG--CTT--GATT-GT----GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------TAT-GAA--CCTC--TCCC-G--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTGGA---AT---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----G----T-G-AACAAGATC-GCA--ATG--T-C-TGGCATGAGC--GGTCA--AC-A---CTA-ACCATTA-----CA-CC--ACCgaagatctctagtccttcatc
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gi|17                         :                                                                                                                                                                      T--TA----A--GTTTA--AAAC-A-A-----A-CTTATTT---T---AA--ATC--AATT-CT----GAA-G-AATTAAG-C--T--T---AGAGA--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAA--TGTC-T--GGTCCATT--TCCAG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------G----G-T-T-T-T-T-TAGAG-G-T------------------------C-T---------A----T----A-C-ATCAA-------------------TGGTGTTAGT--GGTCA--AC-AC-TTTA-TCCACaaagcttgattctcaattgttacatcagtactgcagtctacagttaaaatcaggttctgtcgtaaacctatatctgatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                       tataaccttagatgtttaaacatgttttgatcctgtccttcaattcaaagttgtaagaacttgcttcacaatcaatgtaaaataaA-G-TA---AG-C--T--T---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---CAA--GTGC--TTTT-A--AGTTCGTT--TTCTG--A---GTAGA---AC---CA-GTA-----------------------G---T---------T----A-T-G-T-T-T-TAGAG-A-CCA-C-CG-AA---T----CG-AA-C-CCACGAACCCA----T----G-G-ATCGAACCC-ACG--AAC--T-C-Tggaaacatca
gi|19                         :                                                                                                 atgcatttgttattaacatctattttcttatattcaggctttacatggaacaactatggccatcttaagatttaatagtaaatatttggctatggtggtataaactttag---T---AA--CTT--GATT-GC----------AA---AG-T--T--C---AGAGT--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGT--TCTC-C--AGTTCATT--CCCAG--G---AAAGA---AC---CA-GAAC------T-G--------GGTGTG---T---------T----T-T-T-T-T-T-TTTAG-T-CAA-T-TG-GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCC-GCA--ACT--T-T-TA--------------------AC-TCTG-TCTACTG-----TG-CT--ACTA-CT-CCA-T--T-T-C--A--AA------GT------------------AC-AA-TAC--TTGTT------TAAaaaaacatcggccaa
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gi|21                         :                                                                                                   attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacagA-C-T-A-----G-TTTATGT---T---AG--TTT--AACT-GC----GAA-G-AA---AG----T--C---AGAGA--TAATT----A------T------G-------T---TAA--TCGC---CT--G--A--TCGTT--TACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-GTAC------C-G--------A--GTA---T---------TTTTAG-C-T-TAT-T-TAGTT-G-TTA-T-AG-GG---T----CG-AA---T---------A----T----G-G-GATAAACTC-----------T-C-TAGTATGAGG--GGCCA--TC-AC-T--A-TCCACTG-----CA-GT--ACAG--C-CAACT--T-----------------AT---T--------A--A--AC-GA-TAT--TT-AC------CAAggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                               tattcagtatga---AA-C--------GAAT--AACCATT--TG-------GTTTA--TA-C-T-ACTAGTACTTTATTT---T---AG--CTC--GATT-TC----GAT-G-AT---AG-C--T--C---AGAGT--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAC--T-------------CT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-cttca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgAGA---AC---CA-AGGC------T-G--------T--GTG---T---------T----G-T-T-T-G-T-GTGTG-GTC-A-C-CA-GG---A----CA-GG-T-T---------GAACAT----GAG-ATTGAACCT--TG--ACC--T-C-TGTAGTAAGA--TTTCA--AC-AC-CCCA-CCCAG-G-----AA-----ACCA-CC-ATATT--TGT-A--C--TA------GT---TTATC----A--ACTAC-AG-CAT--AT-AT------TAAT-AT-CATGTA-------------TCTTACAGATCATACT-A--CAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATGatatgacgcactattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|25                         :                                                                                                                                                                    CTT--TA----C---TTTA--TA-AGT-T-----A-TTTATTT---T---AG--CCC--AATT-GC----GAA-G-AA---AT-C--T--T---GAAGT--T---G----A------T------T-------T---GAA--CCGT--TTTC-G--AGTTCGCT--TCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T------T-T-G-T-T-GA--------------------------G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATTGAGCCC-GCA--ACC--A-C-TAGCATGAGC--GGCCT--GC-AC-t
gi|26                         :                                                                               ttataccaataaccataacctatactgcgtta----T--TTTTT--TAAA---AATTA-A---TA-T--------TAT---AATTCTT--T------------------------------TTT-TTT---T---AG--CTT--GATA-ACAT--GAA-G-TA---AG-C--T--T---CGAGC--T---TTGA-A------TT-----A-------T---TAA--T-GC--TGTCCA--AGTCTG-T--TGCT----------------C---CGCGCAC------T-G--------G--G-G---C---------T----G-T-T-T-A-T-GAGAG-GCC-A-C-AA-GG---CATG-CA-AG-C-T---------T----T----C-A-ACCAAACCC-ACA--ATC--T-C-TGG---------AGCCA--AC-AC-aataataatact
gi|27                         :                                                                                                                                                agacagatagcatagaattgaTT--TA-------GTTTA--TA-C-T-A-----A-TAT-TTT---T---AG--CTC--T-TT-GC----AAA-GTAAT--AGAC--T--C---AGTTC--T---T----A------T------A-------A---GAA--CCAC--TCTT-G--TGTCTGCT--TTCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-T--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                               ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggtttatactcatctcaaaatatgg--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---AAA--CCAC--TTTC-A--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTAGT---AC---CA-GTA-------T-G--------G--GTG----------------------T-T-T-T-AAGAG-A-C-G-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T--------------T----GAA-ATCGAACCC-AAA--AC-----C-TGATATGAGC--AATCA--AC-AC-TTTA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCAtttaaaggcca
gi|3                          :                                                                                                                                    gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CCT--GTTT-GT----GAA--------AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--CTGC--TCTA-G--AGTCCGTA--TCGTG--G---GTAGA---GC---CA-GTAT------T-G--------A--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GCC-A-T-CATGG---T-----G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATCAAGTCC-GTA--ACC--T-C-GTGTGAGAGC--AGCCA--AC-AC-TTTA-TCCACTG-----GG-CT--ACCA-TC-CTGCTCAT-T-T--T--GA------ATTTGTCA------A--G--GC-AGCTAT--TTTTT------CCAT-TTGAATGTAtata
gi|30                         :                                                                                                                             ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttgaa--TA-C-T-A-----A-TT-GTTT---T------------GATT-GC----AAA-T-GA---AG-A--T--T---AGAGC--T---TTTCAA------T------T-------T---GTATTTCGCT-TCT------GTCTCAT--TCTTG--G---ATGGA---ACAA-GA-GTAC------TCG--------G--GTG---T---------T----G-T-TAT-C-T-GA--------A-T-----G---T----TG-AG-T-C---------T----T----G-G-AGCAAGCCT-GCA------------------AGT--GGCCATTAC-GT-CCTA-TCCTCTA-----AA-CC--ACCA-CT-Cttggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|31                         :                                                                                              TTT-TACGT-TTTAAGT----T--TTTTT--TATG---A--TA-ATTCAG-C--------TGA---TAT--TTA-TA----A--GTTTA---G-C-A-G-----A-TTTATTT---T-----------------------GTA---AA---AG-CACT--C----GA-T--T---T----A------C-----------------------TCGC--ACTT-T--AATCGATT--TCCTG--A---GTA-A---AC---CA-ATAC------C-G--------G--GTG-------------------------------AAAG-C-T-A-T----AA---T----GG-AG-C-C--------------T----G-GCATTGATCCT-GAA--ACC--T-T-TGGCGTGAGagcaagatc
gi|32                         :                                                                                                                                                          aAA---AGTTGTT--TAGTCCA--GTTTA--TA-A-C-A-----A-TTTCTTT---T---AT--CTC--CATA-TC-----AA-T-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------TTATGAA--AAGC--TCTC-G--AGTACGTT--TCCTT--A---GTTGG---TG---AG-GTAC------T-G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---
gi|33                         :                                                                                                                                                                         cgcgtattttggtaacatttta-A-----A-TTTTTTT---T---AC--CTC--CATT-GC----AAA-G-TA---AA-A--T--C---AGAAC--T---A----A------A------G-------T---GAA--T--------------------------TG--G---GTATT---GT---CA-TTAT------T-G--------G--GTG---T---------T----G-T-T-C-A-T-GAGAG-----A-T-CA-AG---C----------C-T---------G---------G-A-ATTAAA-----------C--T-C-TGACATGGGC--AGCCT--TT-AC-CCTA-TCCCCTC-----CA-CC--AGTG-CC-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---AC---CC-GTAC------T--------------TT---T---------G----G-T-T-TAT-T-GTGAG-ATC-G-T-CGTGG---T-----G-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCTGACCC-GCA--TTC--T-C-TAGCGTCAGC--TAC----AT-AC-TC---TCCA-TGAATATAA-CTCGACCG-TT-CCGCT--T-TAC--TGATAATACATGT---TTA------A--A--AA-AA-TAC--TCG-T------CAAT-Aagtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                          A-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--CTC--GGTT-Gc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTG---T---------T----G-T-T-T-C-T-GAGAA-GTC-A-T--G-TA---T----TG-GA-A-T---------A----TGG--G-G-GTCAAACGT-GCG--ATC--T-C-TGACGTGTGA--GGTCA--GC-AC-GAAA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-aaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|36                         :                                                                                                                                 actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcTT--TG----A---TCTA--TA-C-C-A-----A-ACCATTT---T---AC--CTC--AATT-GT----GAA-T-AA---AG-T--C--C---ATAG---------------------------------------------------TC-A--A-----TT--TCCTG--G---GTGGA---AC---TA-GTAC------C-A--------A--GTG---T---------T----G-TAT-T-T-T-tgtaacgtggacgattta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catctaactgaatataattccta-G-ATCAAATCC-GTG--ACC--T-A-----ATTAGC--TACTA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CA-CCG----T-T-C------A------GT---------------------AG-GATCGTTG-T------CAAT-AT-ACTGTtacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|38                         :                                                                                                                                                           attttttgattttcttggttggaactcgtactgaattt-----A-CTTAGTT---T---AG--CTT--GATT-GC----GAA-A-GA---AA-C--T--C---AGAGT--T---T----ctatatattgttata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----T----G-G-ATTAAGACC-TTG--ACC--T-C-TTACATCGGT--CACCA--AC-AC-TCTA-TCCACTtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|39                         :                                                                                                        acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccatT--TA----A---TCTA--CA-T-T-A-----T-TCTATTTTAAT---AG--CTT--GATT-GT----GAG-A-TA---AG-T--TGGCGAAAGAAT--T---T-----------T------A-------T---TGA--TTGC--TCT--G--AGTCCATT--TCTAA--G---GT------------A-TTAC------T------------------------------------T-T-T-T-T-GAGAG-ACC-A-T-CA-AG---G----TG-AG-C-T---------T----T----G-A-ATGGAGTCT-Gtcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                   TTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--TTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTC-A--AGTCTACT--TATTG--G---ATAGA---AC---AA-ATAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-TAT-T-GGGAG-G-A-A-T-TG-TG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAACTTC-GCA--AAC--T-A-TGACATGAGC--GACCA-----AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACTG-CT-CCACT--T-T-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 tcccttgaaaggcctcctattacaatatctat-------T---GAA--ACAC--TCTA-A--AATTCGTA--ACCTG--C---GTAA------------------------G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGTG-GCC-A-T-CA-GG---T----TC-AG-CAT---------G---------A-G-ATCGATCCA-GCA--CCA--T-C-TGGTATTATC--GGCAA--AT-GT-TCAA-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                   tagg-TTTACTA---T---AG--CTC--GATA-GT----GAA-G-GA------------------------------------------------------T---GAA--TCGC--TCTC-G--ACAACGCG--TTCTG----------------------------------------------------T---------T----G-T-T-T-T-TCGAGAG-GCC-A-T-CG-GC---TCATACA-AG-C-----------A----T----A-GTATCAAACCA-ACG--ACT--T-CGTTGCGCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C---CA-AAAC------T-G--------T--GTA---T---------T----G-T-T-T-C-G-GAAAG-A-C-C-TACG-TA---T----CG-AT-A-T---------G----TTCAAG-G-ATCGA-CCA-ACA--AA---T-A-TAGCCTGAGC--GATTA--AC----TCTA-TCTGCTG-----GA-CT--ACTG-C
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggatagt-G--AGTTCATT--TCCTG--T---GTAGA---AC---CA--TGCAGCAAGT-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-C-T-T-AAGAA-T-C-A-T-CA-----------CG-A----T---------G---------G-A-ATC---CTT-TTA--ATG--T-C-TGGCACAAGA--GGCCA--TC-AT-TATG-TACAt
gi|46                         :                                                                                                                                                                       --TA----T--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTTTTT---T---CA--CTT--GAAT-GT----GAA-G-AA---AA-C--T--C---AGAGA--T---T----A------T------AAAAAACGT---AAA--CCGC--TCTT-G--AGTCt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                        tacttaaattttaatggtacTCT---T---AG--CTC--AATT-AA----TAA-G-AC---AG-C--T--C---ACAGT--T---T----A------T------A-------T---GGA--TCGC--TTTtattt
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-G--AGTGCGAT--TTCTC--G---GTATA---TC---CT-GTAC------T-G--------G--GTG---G---------A----G-T-T-T-C-T-----------A-T---------------A-AG-----------------------A-G-ATCAAACC------------T-C-TGACTTCAAT--ATCAT--AC-AA-TCTA-TCAACTA-----CA-CT--ATCG-TC-Cttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATCGAACCC-ATA--ACC--T-T-TTACAAAAAC--AGCCA--AG-AC-TCTA-TCCAGTA-----TG-AT--ATTG-TC-CCACT--T-A-T--T--TA------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    TTA--TG-A-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GA-T-GC----CAT-G-AA---GG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CTGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCAG--G---GCAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-AG-GG---T----TG-AG-A-T---------G----G----A-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATGG-----GA-CT--ACCA-CC-CCGCT--T-T-A------A------AT---TGA------A--A--agccttgttacaagacattcatagaatata
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-TG-GG---T----C-------T---------G---------G-G-ATCTGACCC-ACATGACC--T-C-TTGCATGGGC--AGCCA--AC-A--TCTA----ACTGC----CA-C---ACC--TA-CTATT--T-T-C--T--TATTT---AT---TTA------AT-A--ACTAC-TAT--TTtattcaaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----T-A-ATTGAGCCT-GCA--ACC--T-C-AAGTGTGTG--------------C-TCTA-ACCACTG-----TA-CT--ACCA-CT-CTAAT--T-
gi|52                         :                                                                                                           A--T----T--TATATAATAAA---A--TA-T---GA-A--------TAA---AGTACTTGATA----A--AGTTG--TA-C-TTA-----A-TTTATTG---T---AG--CAC--AATT-GCTATTAAA-A-CA---AG-C--T--C---AGAAT--T---T----A------T------A-------T---aaaagtcacagatgcaccagtgttaacgtc
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--ATG---C---------T----G-T-T-C-T-T-GACAA-G-C-AAT-AA-AG---C----TGCAC-C-T---------G----T----G---ATCCAACCC-ATG--ACC--A-T-TGGCATGAGC--AGCCA--AC-AC----AGTTCACTG-----TA--T--ACa
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GAGAA-A-C-A-A-AA-AAAACC----TA-AG-C-T---------C-----------G-ATTGAGCCT-ACA--ACC--T-C-TGAAGTGATT--GGTAA--AC-GT-CATA-TTCATTA-----CA-CC--Aataa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GATAC---C-A-T-TG-GT---T----CC-AA-CAT---------G---------A-G-ATCAAACCT-GCA--AAC--A-C-TTGCA--AGTTGGGCCA--AC-AC-CATA---CACTG-----CA-CT--ACCG-C
gi|57                         :                                                                                                                                                                                --GTTTG--GA-A-T-A-----G-TTTGTTT---C---AA--CTTTGGAT--GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C----GTGT--T---T----A------T------T-------T---GAA---AAC--TCTC-A--CTTTCGTT--TCCTG--G---ATGAA---AC---t
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttg----G-G-ATGGAACCG-GCA--ATA--T-C-CAGTATGAGC--GGCCT--AC-AC-TCTA-TTCACAG-----CA-CT--A
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caatcttgGT--TCTC-G--AGTCCATT--TCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-ATAC------C-A--------A--ATG---T---------T----G-C-T-G-T-T-AAGAA-G-tttagtgtgtatgttttactaatt
gi|6                          :                                                                                                                              att---A--TA-A---AATC--------TAA---CATACAT--TT----A--GCTTA--TA-C-C-A-----A-TTCATTG---T---AG--CTG--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--ATGC--CCTT-A--AGTCCGTT--ACCTG--A---GTTGA---AA---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-T------AGAGTC-C-G-C-CG-GG---T----CG-AG-A-T---------T----T----C-G-ATCGAACCC-GCA--ACG--T-T-TAGCGTGAGA--GGACA--GC-A---CTA-TCCAGTG-----CA-CT--ACCG-CT-CAGCT--T-aacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atggataccaacacgaccataaaacaaatacctaaataaagaccgttatagttac-GCT--ACCAGT-C-TGG--TGAGT--GACCA--AC-AA-TCAG-TCCACTG-----CA-CT--ACCA-CC-CCACT--T-T-C--T--Tacatgcatattatatagttagttagaaaaaacgttcttctcttacagggatcagtgttttttactttcattttcatctacaccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --ACC--TGC-TGGCATGACT--GGCCA--AC-A---CTA-TTGACTG-----GA-CT--ACTGCCC-CCACT---------------------T---TAA------AGTA--GC-AG-TGT--TTGAT------ttactcctttagtctcttgtatatttgt
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    AGT--T---T----T------T------G-------T---GAA--TCAT--TCCT-ATTAGTCCGTT--TTGTG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-GTGCTTTATA--ATG---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-tttagaacagttgtg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACCCTGTG--ATC--T-C-TGGTGGGAGT--GGTCA--CA-AC-TCTA-TCCACTGGCC--CATCT--ACC
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                  tgggaaaTTATAA---T---AG--CTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-T--T--C---AACAC--C---T----A------CCGGTAAA-------T---GAA--CTGC--TCTC-A--AATCTGCT--Ttgcttagtacttt
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atata-T---------G----T----T-G-ATTG----C-ACA--ATC--T-C-TTGCATGAGC--AGCTA--AC-AC-TCGA-TGCAGTA-----CA-CT--ATTA-CC-att
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cctgagtggaacctgg-T-T-GAAAC-G-C-A-T-GG-GG------------------------------------G-A-AACGAACAT-GCA--ACC--T-C-CGACACGAGC--GGCTA--ACTGC-CCCA-TC
gi|7                          :                                                                                             aTTTATA-AT-TGTA--T----CAACTT------AA---A--TA-A---A-----------TAC---AATTAAT--TT----A--GATTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT---C---AG--CTC--GACT-GT----GAACA-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--ACGTCATCTT-G--TGT----T--TTTT--------TAGA--------------------------------G--GTG---T---------T----G----------------------------GG---T----C--AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCT-GTG--ACC--T-C-TAGTTTGAGC--AGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCT-CT-GCGCT--T-atgcta
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaa-T-T-T-T-GAGAG-A-CCA-T-CG-GA---T----CA-AG---T---------A----T----G-GTATCGAACCC-GCC--ACC--A-C-TTGCGAGAAC--GGagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                     gttaTTATTT---TGTTAGGATCC--GATA-CT----GGA-A-AC---AG-G--T--C---AGAGC--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AAT
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCA-GCA--ACT--T-C-TAGCATGAAT--G-CAA--AC-AC-TCTA-TGCGCTG-----CA-CT--ACCG-CC-
gi|73                         :                                                                                                                                                           ggggaggaCCTT--------A--GTTAA--TA-C-T-T-----G-TTTATTT---T---AG--CTC--ATTT-AC----AAA-G-AA---AG-C--A--T---AAAGA--T---C----A------T------G-------T---G
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gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCC-G-A--GCC--T-C-TGGCAAGTGC--GGCCA--AC-TA-TCTA-TCCACTG-----TA-CT--ACCT-CC-CAACT--
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): AAAAGTATCGGTTAGGGAATTTTTAGCCTTAAACAAATATTAAAAATTGTTTGCTAAACTTGTCATGAGTAGATTAAAAACTACAAGGTGTTTTTTTAAACACATAAAAGAAAAGCATTCAAAATAGCATTTTATTTCCTGAATTATTGCCTATTATTTAGTCCTTATAACAAAAATAAAAA
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Reference ( family-354 )      : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTNACAATAATAAAGTTACCTGTTATNTATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTT--TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-T-C--T--TA------GT---TNA------A--A--AC-AG-TAT--TTGAT------CAAT-AT-NATGTAANT------GCTTTCNTACAGATCATACT-AG-TAT--TTTTAGCG---ATAAACTATATANGATGATATAATG
gi|1                          :                                              AAGCACATGTCACAATAATAAAGTTATCT--TATCTATATTGATCATTTTTA-ACAT-TCTA--T----T--TTTAT--TAAG---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTTG-TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----TAT-A-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAG--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAA-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AA-C-T---------G----T----G-G-ATCGAGCCC-GTA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATAA-----GA-CT--ATCG-CC-CCACG--T-T-C--C--TA------GT---TGA------A--A--ACGAG-CAT--CTGAT------CAAT-AT-AATATAAGT------CCGTCCTTACA---TACACTGGG-TATCGTTTTAG-G---ATAACCTATATATAATGATATAATG
gi|10                         : aattttgtcaatttcacaaatgtatagcataatgaatgaatgtatAAGCACGTGTAAC-----TAAA--TACCTGTTATATATGTT---TATTTTCATACAAAGCTA--T----T--TTAGT--TCAA---T--TGCG---AA-G--------TAA---A---CTTAGTA----ATAGTATACATA-G-T-A-----A-TTTATTT---C---AG--CTC--GATT-GT----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTT-G--CGTCTGAT--TCATG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-C--------A--ATA---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---C----TG-AG-C-T---------G----G----G-G-------------A--ACC--T-C-TGGCATGGGC--AGCCA--AC-AC-TCTT-TCCACTA-----CA-TT--A----CC-CCACT--
gi|11                         :                                                                                                                              atattgtcagtccatacagcaactgagttaaactacttcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATGT---T---TC--CTC--AATT-GC----AAT-G-TA---TT-C--T--C---AGAAA------T----A------T------A-------T---GAA--TCA----CTG-G--AGCCC-TT--T----------GTAGA---AC---AA-GTAC------T-T--------T--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GTC-A-C-CG-GT---C----CG-AGCC-T---------A----T------G-ATCAATCTG-GGG--ACA--T-T-TGGC---AG----------------TCTG-TCCACTG-----TA-TT--GCCA--T-CCACT--aaacttagagcttttctaaattgc
gi|12                         :                                    agtagaacttgcatcttatatcaataaaatacaatgtgtgtaacgttaata---CATGTTTATACAT-T-TA--T----TGATATAT--CAAATATA--TA-A---AA-CCCAATCAATAACTTAATTCATA-TT----A--GTTTA--TA-C-C-A-----A-TTTATTT---C---AG--CTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-T--T--C-----AGT--T---T----A------T------G-------T---TAA--CCGC--TTCC-G--AGACTGCT--TCCTG--G---ATAGA---AC---CA-GTTC------T-G--------A--ATGGACTTTTTTATTGT----G-T-T-T-T-T-GAGAT-A-C-A-T-TA-GG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAAACAC-ACA--AAC--T-C-TGGTGTAAGT--GACCA--AC-AC-TCAA-TCgtaatatttatgatgtttgagtagattgtgagatatggatagaattacatgtatcaaataaaatgataatatgataacagag
gi|13                         :                                                                                                                                                             gctagttaaT--TA----A--ATTCA--TA-C-T-A-----A-TTTGTTT---T---AG--CTC--GATttcctctaataagaaacaagaaacagtagacaaactt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagaC---CC-GTAT------T-G------------TG---T--------------G-T-T-T-T----AGAG-G-C-A-TATT-AG---T----CG-AG-T-T---------G----G----G-G-ATCGAACCT-GCA--ACA--A-C-TGGCGTGAAC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-TC-TCAgctctcccgtgcccgtattgtgtgttttagaggcatattagtcgagttggggatcgaacctgcaacaactggcgtgaacggccaacactctatccactacactaccgtctcaataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|14                         :                                                                                 acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagattaaattcatactaatttgttttagctcgatgctctcccgtg----A--GTCTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTA-------AG--CTT--GACT-GC----AAC-A-AA---AG-C--T--T---AGAGC--T---T----ACTAGTAT------A-------T---GAA--CCGC--TCTT-G--AGTTTGAT--TCCTT--G---ATAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-T-G---------G----G----G-G-AACGAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCGCGAGC--GGCCA--AC-A---CTA-TCCAATA-----CG-CT--ACCA-CCACCACT--T-ataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|15                         :                                           gtcatagcttatcaaatcagacaaatcgtgctttgctggttttctccagtatcatgtCAT-TCCA--TGAAAT--TTTCTA-TAAA---A--TA-A---A-----------------------T--TA----A--GTT-A--TA-C-T-A-------TTTATTT---T---AG--CTT--GATT-GT----GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------TAT-GAA--CCTC--TCCC-G--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTGGA---AT---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----G----T-G-AACAAGATC-GCA--ATG--T-C-TGGCATGAGC--GGTCA--AC-A---CTA-ACCATTA-----CA-CC--ACCgaagatctctagtccttcatc
gi|16                         :                                                                                                                                                            ataaaacaatatcagcgagacagtttA--TA-C-T-C-----T-TTTATTC---T---AG--GTC--AATTTGC------A-G-AA---AG-C--T--C---AGAGCATT---T----AAA----T------AA------T---GAA--CCAC--TTTT-G--AGTCTGAT--TCCTG--G---GTAGA---AT---CA-ATAC------A-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-TCAAGAG-GCC-A-T-CA-GT---T----GG-AG-C-T---------A----G----G-G-ATCAAACTT-GCA--GCC--T-C-CAGCCTCAGT--GGCCA--AC-AC-TCTA-TTGACTA-----TA-AT--ACCA-Ctaaataagtttacagtgtgctacgtatatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                      T--TA----A--GTTTA--AAAC-A-A-----A-CTTATTT---T---AA--ATC--AATT-CT----GAA-G-AATTAAG-C--T--T---AGAGA--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAA--TGTC-T--GGTCCATT--TCCAG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------G----G-T-T-T-T-T-TAGAG-G-T------------------------C-T---------A----T----A-C-ATCAA-------------------TGGTGTTAGT--GGTCA--AC-AC-TTTA-TCCACaaagcttgattctcaattgttacatcagtactgcagtctacagttaaaatcaggttctgtcgtaaacctatatctgatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                       tataaccttagatgtttaaacatgttttgatcctgtccttcaattcaaagttgtaagaacttgcttcacaatcaatgtaaaataaA-G-TA---AG-C--T--T---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---CAA--GTGC--TTTT-A--AGTTCGTT--TTCTG--A---GTAGA---AC---CA-GTA-----------------------G---T---------T----A-T-G-T-T-T-TAGAG-A-CCA-C-CG-AA---T----CG-AA-C-CCACGAACCCA----T----G-G-ATCGAACCC-ACG--AAC--T-C-Tggaaacatca
gi|19                         :                                                                                                 atgcatttgttattaacatctattttcttatattcaggctttacatggaacaactatggccatcttaagatttaatagtaaatatttggctatggtggtataaactttag---T---AA--CTT--GATT-GC----------AA---AG-T--T--C---AGAGT--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGT--TCTC-C--AGTTCATT--CCCAG--G---AAAGA---AC---CA-GAAC------T-G--------GGTGTG---T---------T----T-T-T-T-T-T-TTTAG-T-CAA-T-TG-GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCC-GCA--ACT--T-T-TA--------------------AC-TCTG-TCTACTG-----TG-CT--ACTA-CT-CCA-T--T-T-C--A--AA------GT------------------AC-AA-TAC--TTGTT------TAAaaaaacatcggccaa
gi|2                          :                                                                                                             gtcattcattatcaaatttccagggggtgcttaactttttttccaggtgtatataaTT--TA-------GTTGA--TA-A-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GAAT-GC----GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T----G-T-T-T-AAT-GAG-----------CG-GG------------------------------------G-G-ATCGAACCC-GAA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCAA--AC-AC-TCTA-CCCATTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCGC---T-T-C--T--T-------GTTA-TGAGACTGTA--A--AC-TA-TAT--TTGATTACAGCCAAT-AT-C---TAACTAAAACAGCTTTCGTTCAAAT-ATATT-AGCTA----TTTAGCA---ATAAAGTATATAggtct
gi|20                         :                                       agtaaaaatagtaaaagaagtattgtacattggcagacatgataaaacttttcttaactaaagataagttgccccttactgtcaacaacggataccaattgaacttttttgtctcattatttgatatcatta----A--GTTTT--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---T---GG--CTC--GATT-GC----GTA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T----------------------------------------------CCT-G--AGTCC-CTATTCCTG--T---GTAGA---AC---CA-GCAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             att----G-G-ATAGAACCC-GCA--ACC--G-C-TGGCTTTAAT--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----AA-CT--AGCA-CC-CCACT--T-T-CAAG--TA------AT---TAA------A--tacagggatagaacccgcaaccgctggctttaatggccaacactctatccactaaactagcaccccactttcaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|21                         :                                                                                                   attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacagA-C-T-A-----G-TTTATGT---T---AG--TTT--AACT-GC----GAA-G-AA---AG----T--C---AGAGA--TAATT----A------T------G-------T---TAA--TCGC---CT--G--A--TCGTT--TACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-GTAC------C-G--------A--GTA---T---------TTTTAG-C-T-TAT-T-TAGTT-G-TTA-T-AG-GG---T----CG-AA---T---------A----T----G-G-GATAAACTC-----------T-C-TAGTATGAGG--GGCCA--TC-AC-T--A-TCCACTG-----CA-GT--ACAG--C-CAACT--T-----------------AT---T--------A--A--AC-GA-TAT--TT-AC------CAAggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                               tattcagtatga---AA-C--------GAAT--AACCATT--TG-------GTTTA--TA-C-T-ACTAGTACTTTATTT---T---AG--CTC--GATT-TC----GAT-G-AT---AG-C--T--C---AGAGT--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAC--T-------------CT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-cttca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgAGA---AC---CA-AGGC------T-G--------T--GTG---T---------T----G-T-T-T-G-T-GTGTG-GTC-A-C-CA-GG---A----CA-GG-T-T---------GAACAT----GAG-ATTGAACCT--TG--ACC--T-C-TGTAGTAAGA--TTTCA--AC-AC-CCCA-CCCAG-G-----AA-----ACCA-CC-ATATT--TGT-A--C--TA------GT---TTATC----A--ACTAC-AG-CAT--AT-AT------TAAT-AT-CATGTA-------------TCTTACAGATCATACT-A--CAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATGatatgacgcactattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|25                         :                                                                                                                                                                    CTT--TA----C---TTTA--TA-AGT-T-----A-TTTATTT---T---AG--CCC--AATT-GC----GAA-G-AA---AT-C--T--T---GAAGT--T---G----A------T------T-------T---GAA--CCGT--TTTC-G--AGTTCGCT--TCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T------T-T-G-T-T-GA--------------------------G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATTGAGCCC-GCA--ACC--A-C-TAGCATGAGC--GGCCT--GC-AC-t
gi|26                         :                                                                               ttataccaataaccataacctatactgcgtta----T--TTTTT--TAAA---AATTA-A---TA-T--------TAT---AATTCTT--T------------------------------TTT-TTT---T---AG--CTT--GATA-ACAT--GAA-G-TA---AG-C--T--T---CGAGC--T---TTGA-A------TT-----A-------T---TAA--T-GC--TGTCCA--AGTCTG-T--TGCT----------------C---CGCGCAC------T-G--------G--G-G---C---------T----G-T-T-T-A-T-GAGAG-GCC-A-C-AA-GG---CATG-CA-AG-C-T---------T----T----C-A-ACCAAACCC-ACA--ATC--T-C-TGG---------AGCCA--AC-AC-aataataatact
gi|27                         :                                                                                                                                                agacagatagcatagaattgaTT--TA-------GTTTA--TA-C-T-A-----A-TAT-TTT---T---AG--CTC--T-TT-GC----AAA-GTAAT--AGAC--T--C---AGTTC--T---T----A------T------A-------A---GAA--CCAC--TCTT-G--TGTCTGCT--TTCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-T--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                               ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggtttatactcatctcaaaatatgg--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---AAA--CCAC--TTTC-A--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTAGT---AC---CA-GTA-------T-G--------G--GTG----------------------T-T-T-T-AAGAG-A-C-G-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T--------------T----GAA-ATCGAACCC-AAA--AC-----C-TGATATGAGC--AATCA--AC-AC-TTTA-TCCACTA-----CA-CT--ACCG-CC-CCAtttaaaggcca
gi|3                          :                                                                                                                                    gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcTT--TA-------GTTTA--TA-T-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CCT--GTTT-GT----GAA--------AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--CTGC--TCTA-G--AGTCCGTA--TCGTG--G---GTAGA---GC---CA-GTAT------T-G--------A--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GCC-A-T-CATGG---T-----G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATCAAGTCC-GTA--ACC--T-C-GTGTGAGAGC--AGCCA--AC-AC-TTTA-TCCACTG-----GG-CT--ACCA-TC-CTGCTCAT-T-T--T--GA------ATTTGTCA------A--G--GC-AGCTAT--TTTTT------CCAT-TTGAATGTAtata
gi|30                         :                                                                                                                             ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttgaa--TA-C-T-A-----A-TT-GTTT---T------------GATT-GC----AAA-T-GA---AG-A--T--T---AGAGC--T---TTTCAA------T------T-------T---GTATTTCGCT-TCT------GTCTCAT--TCTTG--G---ATGGA---ACAA-GA-GTAC------TCG--------G--GTG---T---------T----G-T-TAT-C-T-GA--------A-T-----G---T----TG-AG-T-C---------T----T----G-G-AGCAAGCCT-GCA------------------AGT--GGCCATTAC-GT-CCTA-TCCTCTA-----AA-CC--ACCA-CT-Cttggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|31                         :                                                                                              TTT-TACGT-TTTAAGT----T--TTTTT--TATG---A--TA-ATTCAG-C--------TGA---TAT--TTA-TA----A--GTTTA---G-C-A-G-----A-TTTATTT---T-----------------------GTA---AA---AG-CACT--C----GA-T--T---T----A------C-----------------------TCGC--ACTT-T--AATCGATT--TCCTG--A---GTA-A---AC---CA-ATAC------C-G--------G--GTG-------------------------------AAAG-C-T-A-T----AA---T----GG-AG-C-C--------------T----G-GCATTGATCCT-GAA--ACC--T-T-TGGCGTGAGagcaagatc
gi|32                         :                                                                                                                                                          aAA---AGTTGTT--TAGTCCA--GTTTA--TA-A-C-A-----A-TTTCTTT---T---AT--CTC--CATA-TC-----AA-T-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------TTATGAA--AAGC--TCTC-G--AGTACGTT--TCCTT--A---GTTGG---TG---AG-GTAC------T-G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---
gi|33                         :                                                                                                                                                                         cgcgtattttggtaacatttta-A-----A-TTTTTTT---T---AC--CTC--CATT-GC----AAA-G-TA---AA-A--T--C---AGAAC--T---A----A------A------G-------T---GAA--T--------------------------TG--G---GTATT---GT---CA-TTAT------T-G--------G--GTG---T---------T----G-T-T-C-A-T-GAGAG-----A-T-CA-AG---C----------C-T---------G---------G-A-ATTAAA-----------C--T-C-TGACATGGGC--AGCCT--TT-AC-CCTA-TCCCCTC-----CA-CC--AGTG-CC-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---AC---CC-GTAC------T--------------TT---T---------G----G-T-T-TAT-T-GTGAG-ATC-G-T-CGTGG---T-----G-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCTGACCC-GCA--TTC--T-C-TAGCGTCAGC--TAC----AT-AC-TC---TCCA-TGAATATAA-CTCGACCG-TT-CCGCT--T-TAC--TGATAATACATGT---TTA------A--A--AA-AA-TAC--TCG-T------CAAT-Aagtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                          A-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--CTC--GGTT-Gc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTG---T---------T----G-T-T-T-C-T-GAGAA-GTC-A-T--G-TA---T----TG-GA-A-T---------A----TGG--G-G-GTCAAACGT-GCG--ATC--T-C-TGACGTGTGA--GGTCA--GC-AC-GAAA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-aaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|36                         :                                                                                                                                 actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcTT--TG----A---TCTA--TA-C-C-A-----A-ACCATTT---T---AC--CTC--AATT-GT----GAA-T-AA---AG-T--C--C---ATAG---------------------------------------------------TC-A--A-----TT--TCCTG--G---GTGGA---AC---TA-GTAC------C-A--------A--GTG---T---------T----G-TAT-T-T-T-tgtaacgtggacgattta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catctaactgaatataattccta-G-ATCAAATCC-GTG--ACC--T-A-----ATTAGC--TACTA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CA-CCG----T-T-C------A------GT---------------------AG-GATCGTTG-T------CAAT-AT-ACTGTtacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|38                         :                                                                                                                                                           attttttgattttcttggttggaactcgtactgaattt-----A-CTTAGTT---T---AG--CTT--GATT-GC----GAA-A-GA---AA-C--T--C---AGAGT--T---T----ctatatattgttata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----T----G-G-ATTAAGACC-TTG--ACC--T-C-TTACATCGGT--CACCA--AC-AC-TCTA-TCCACTtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|39                         :                                                                                                        acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccatT--TA----A---TCTA--CA-T-T-A-----T-TCTATTTTAAT---AG--CTT--GATT-GT----GAG-A-TA---AG-T--TGGCGAAAGAAT--T---T-----------T------A-------T---TGA--TTGC--TCT--G--AGTCCATT--TCTAA--G---GT------------A-TTAC------T------------------------------------T-T-T-T-T-GAGAG-ACC-A-T-CA-AG---G----TG-AG-C-T---------T----T----G-A-ATGGAGTCT-Gtcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                   TTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AA--TTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTC-A--AGTCTACT--TATTG--G---ATAGA---AC---AA-ATAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-TAT-T-GGGAG-G-A-A-T-TG-TG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAACTTC-GCA--AAC--T-A-TGACATGAGC--GACCA-----AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACTG-CT-CCACT--T-T-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 tcccttgaaaggcctcctattacaatatctat-------T---GAA--ACAC--TCTA-A--AATTCGTA--ACCTG--C---GTAA------------------------G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGTG-GCC-A-T-CA-GG---T----TC-AG-CAT---------G---------A-G-ATCGATCCA-GCA--CCA--T-C-TGGTATTATC--GGCAA--AT-GT-TCAA-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                   tagg-TTTACTA---T---AG--CTC--GATA-GT----GAA-G-GA------------------------------------------------------T---GAA--TCGC--TCTC-G--ACAACGCG--TTCTG----------------------------------------------------T---------T----G-T-T-T-T-TCGAGAG-GCC-A-T-CG-GC---TCATACA-AG-C-----------A----T----A-GTATCAAACCA-ACG--ACT--T-CGTTGCGCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C---CA-AAAC------T-G--------T--GTA---T---------T----G-T-T-T-C-G-GAAAG-A-C-C-TACG-TA---T----CG-AT-A-T---------G----TTCAAG-G-ATCGA-CCA-ACA--AA---T-A-TAGCCTGAGC--GATTA--AC----TCTA-TCTGCTG-----GA-CT--ACTG-C
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggatagt-G--AGTTCATT--TCCTG--T---GTAGA---AC---CA--TGCAGCAAGT-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-C-T-T-AAGAA-T-C-A-T-CA-----------CG-A----T---------G---------G-A-ATC---CTT-TTA--ATG--T-C-TGGCACAAGA--GGCCA--TC-AT-TATG-TACAt
gi|46                         :                                                                                                                                                                       --TA----T--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTTTTT---T---CA--CTT--GAAT-GT----GAA-G-AA---AA-C--T--C---AGAGA--T---T----A------T------AAAAAACGT---AAA--CCGC--TCTT-G--AGTCt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                        tacttaaattttaatggtacTCT---T---AG--CTC--AATT-AA----TAA-G-AC---AG-C--T--C---ACAGT--T---T----A------T------A-------T---GGA--TCGC--TTTtattt
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-G--AGTGCGAT--TTCTC--G---GTATA---TC---CT-GTAC------T-G--------G--GTG---G---------A----G-T-T-T-C-T-----------A-T---------------A-AG-----------------------A-G-ATCAAACC------------T-C-TGACTTCAAT--ATCAT--AC-AA-TCTA-TCAACTA-----CA-CT--ATCG-TC-Cttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATCGAACCC-ATA--ACC--T-T-TTACAAAAAC--AGCCA--AG-AC-TCTA-TCCAGTA-----TG-AT--ATTG-TC-CCACT--T-A-T--T--TA------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    TTA--TG-A-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GA-T-GC----CAT-G-AA---GG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CTGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCAG--G---GCAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-AG-GG---T----TG-AG-A-T---------G----G----A-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATGG-----GA-CT--ACCA-CC-CCGCT--T-T-A------A------AT---TGA------A--A--agccttgttacaagacattcatagaatata
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-TG-GG---T----C-------T---------G---------G-G-ATCTGACCC-ACATGACC--T-C-TTGCATGGGC--AGCCA--AC-A--TCTA----ACTGC----CA-C---ACC--TA-CTATT--T-T-C--T--TATTT---AT---TTA------AT-A--ACTAC-TAT--TTtattcaaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----T-A-ATTGAGCCT-GCA--ACC--T-C-AAGTGTGTG--------------C-TCTA-ACCACTG-----TA-CT--ACCA-CT-CTAAT--T-
gi|52                         :                                                                                                           A--T----T--TATATAATAAA---A--TA-T---GA-A--------TAA---AGTACTTGATA----A--AGTTG--TA-C-TTA-----A-TTTATTG---T---AG--CAC--AATT-GCTATTAAA-A-CA---AG-C--T--C---AGAAT--T---T----A------T------A-------T---aaaagtcacagatgcaccagtgttaacgtc
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--ATG---C---------T----G-T-T-C-T-T-GACAA-G-C-AAT-AA-AG---C----TGCAC-C-T---------G----T----G---ATCCAACCC-ATG--ACC--A-T-TGGCATGAGC--AGCCA--AC-AC----AGTTCACTG-----TA--T--ACa
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GAGAA-A-C-A-A-AA-AAAACC----TA-AG-C-T---------C-----------G-ATTGAGCCT-ACA--ACC--T-C-TGAAGTGATT--GGTAA--AC-GT-CATA-TTCATTA-----CA-CC--Aataa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GATAC---C-A-T-TG-GT---T----CC-AA-CAT---------G---------A-G-ATCAAACCT-GCA--AAC--A-C-TTGCA--AGTTGGGCCA--AC-AC-CATA---CACTG-----CA-CT--ACCG-C
gi|57                         :                                                                                                                                                                                --GTTTG--GA-A-T-A-----G-TTTGTTT---C---AA--CTTTGGAT--GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C----GTGT--T---T----A------T------T-------T---GAA---AAC--TCTC-A--CTTTCGTT--TCCTG--G---ATGAA---AC---t
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttg----G-G-ATGGAACCG-GCA--ATA--T-C-CAGTATGAGC--GGCCT--AC-AC-TCTA-TTCACAG-----CA-CT--A
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caatcttgGT--TCTC-G--AGTCCATT--TCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-ATAC------C-A--------A--ATG---T---------T----G-C-T-G-T-T-AAGAA-G-tttagtgtgtatgttttactaatt
gi|6                          :                                                                                                                              att---A--TA-A---AATC--------TAA---CATACAT--TT----A--GCTTA--TA-C-C-A-----A-TTCATTG---T---AG--CTG--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-T--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--ATGC--CCTT-A--AGTCCGTT--ACCTG--A---GTTGA---AA---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-T------AGAGTC-C-G-C-CG-GG---T----CG-AG-A-T---------T----T----C-G-ATCGAACCC-GCA--ACG--T-T-TAGCGTGAGA--GGACA--GC-A---CTA-TCCAGTG-----CA-CT--ACCG-CT-CAGCT--T-aacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atggataccaacacgaccataaaacaaatacctaaataaagaccgttatagttac-GCT--ACCAGT-C-TGG--TGAGT--GACCA--AC-AA-TCAG-TCCACTG-----CA-CT--ACCA-CC-CCACT--T-T-C--T--Tacatgcatattatatagttagttagaaaaaacgttcttctcttacagggatcagtgttttttactttcattttcatctacaccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --ACC--TGC-TGGCATGACT--GGCCA--AC-A---CTA-TTGACTG-----GA-CT--ACTGCCC-CCACT---------------------T---TAA------AGTA--GC-AG-TGT--TTGAT------ttactcctttagtctcttgtatatttgt
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    AGT--T---T----T------T------G-------T---GAA--TCAT--TCCT-ATTAGTCCGTT--TTGTG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-GTGCTTTATA--ATG---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-tttagaacagttgtg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACCCTGTG--ATC--T-C-TGGTGGGAGT--GGTCA--CA-AC-TCTA-TCCACTGGCC--CATCT--ACC
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                  tgggaaaTTATAA---T---AG--CTT--GATT-GC----AAA-G-AA---AG-T--T--C---AACAC--C---T----A------CCGGTAAA-------T---GAA--CTGC--TCTC-A--AATCTGCT--Ttgcttagtacttt
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atata-T---------G----T----T-G-ATTG----C-ACA--ATC--T-C-TTGCATGAGC--AGCTA--AC-AC-TCGA-TGCAGTA-----CA-CT--ATTA-CC-att
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cctgagtggaacctgg-T-T-GAAAC-G-C-A-T-GG-GG------------------------------------G-A-AACGAACAT-GCA--ACC--T-C-CGACACGAGC--GGCTA--ACTGC-CCCA-TC
gi|7                          :                                                                                             aTTTATA-AT-TGTA--T----CAACTT------AA---A--TA-A---A-----------TAC---AATTAAT--TT----A--GATTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT---C---AG--CTC--GACT-GT----GAACA-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--ACGTCATCTT-G--TGT----T--TTTT--------TAGA--------------------------------G--GTG---T---------T----G----------------------------GG---T----C--AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCT-GTG--ACC--T-C-TAGTTTGAGC--AGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCT-CT-GCGCT--T-atgcta
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaa-T-T-T-T-GAGAG-A-CCA-T-CG-GA---T----CA-AG---T---------A----T----G-GTATCGAACCC-GCC--ACC--A-C-TTGCGAGAAC--GGagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                     gttaTTATTT---TGTTAGGATCC--GATA-CT----GGA-A-AC---AG-G--T--C---AGAGC--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AAT
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCA-GCA--ACT--T-C-TAGCATGAAT--G-CAA--AC-AC-TCTA-TGCGCTG-----CA-CT--ACCG-CC-
gi|73                         :                                                                                                                                                           ggggaggaCCTT--------A--GTTAA--TA-C-T-T-----G-TTTATTT---T---AG--CTC--ATTT-AC----AAA-G-AA---AG-C--A--T---AAAGA--T---C----A------T------G-------T---G
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -G-ATCGAACTT-GCA--TAC--T-C-TGGTGTGGGT--GACCA--AC-AT-ATTA-TTCGCTA-----CA-CT--AACG-C
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCC-G-A--GCC--T-C-TGGCAAGTGC--GGCCA--AC-TA-TCTA-TCCACTG-----TA-CT--ACCT-CC-CAACT--
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -GCA--ACT--A-G-TAGCATGAGT--GGTCA--AC-AT-TCTA-TCCACTT-----CC-CT--GCCA-CC-C
gi|78                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGCCA--AC-AT-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--AACA-TC-CCACT--T-T-C--agct
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -GCA--CCC--T-C-TGGCATGAGA--GGCCA--AC-A---CTA-TCCAATA-----CA-aagt
gi|8                          :                                                                                                                                                                 tTCCTT--------A--GTTTA--TA-C-T-T-----A-TTTATTT-------AG--CTC--GATT-GC----AAT-G-AA---AG-C--C--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--GCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--T---GTAAA---AC---CT-GTTC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TCT-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-A---------G----G----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AT-TCTA-TCCATTA-----CA-CT--ACCG-CC-C
gi|9                          :                                                                                                     aaaacttgtggaaggacagcgattcAAA---A--TG-A---AC-T--------TAA---TTTGTTT--TT----A--GTTTA--TA-C-C-A-----A-TTTAATT---T---AT--ATC--TATT-GC----AAG-G-AA---AG-------------------------------------------------------------C--TCT--A--AGTTC--------TA--G---GTAGA---AC---AA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-C-T-T-T-AAG-------------------T----TA-AA-C-T---------G----G----G-T-ATTAAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGT--GGCCA--AC-ACTTTTA-TCCAATA-----TA-CT--GCTA-CT-TCACTTGT-T-T--T--TA------AT---TTT------A--A--G--AA-CAT--TTTAA------CACTCAT-CATG-AAAT------GTTTTCATACAGATagctatacgctctgttctctttagatgcgtgtatatttatatctatgcatcagatactggtaaccatacctaatctgtaatacacgaaatactgttgatgttattgacagtaatatactatt


blockSeqs                     :                                                        A  .        .      GT   A      .         AT    AGC  AG GAAAT     G AA    TAT AT  C AACCCAATCAATAACTTAATTCATATTA                CA  A G T CTAGT C       TAA GTT  GA   TG    T  TATTA  C T  TTA  A AC GG GAA     AT AAT TTCA CTAGTA AAAAAACG       TAT   TTT   CA   CC TT      A AT     CA AAA     AGT  ATG       AGCAAG   TGCTTTATA     GAC TTTTTATTG TTTA T     A A C     ACCACCGAATCGAACCCACGAACCCAT                        A C             TG   AG        A    TTG     TT    CT            AATAT     CG    C  A     CA G ACTGATAATACATGTTTAAAAA                  C   CG  GATTACAGC    C  GAA    ACTAAAACAGCT   G    GATC     AGCTA          CATTA            A
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blockSeqs                     :                                                                                                                                 .   .   . ATACAATTAATTTA                              .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     G     .    T  .       T .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     ACAAAAAAAACCTAAGCTC                                . .             .    .         T    C       .     C             .         .     .  .     .  . ATTAAAC                                 .   .   GT                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                           ATTAA                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     C     .    C  .       C .      .  .       .    .         .        C             .   .         .    .     . . .     GCATATTAGTCGAGTTGG                                 . .             .    .         A    T       .     C             .         .     .  .     .  . CAGT                                    .   .                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     C     .    C  .       C .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     GCCATCAGTTGGAGCTAG                                 . .             .    .         G    G       .     C             .         .     .  .     .  .                                                                                                                                      
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     C     .    T  .       T .      .  .       .    .         .        G             .   .         .    .     . . .     TCCGCCGGGTCGAGATTT                                 . .             .    .         G    C       .     C             .         .     .  .     .  .                                                                                                                                      
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      T              .     A     .    C  .       T .      .  .       .    .         .        G             .   .         .    .     . . .     GCATTGGGTCGAGTGGG                                  . .             .    .         A    C       .     C             .         .     .  .     .  .                                                                                                                                      
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  A      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     A     .    T  .       T .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     CTATAATGGAGCCT                                     . .             .    .         A    C       .     C             .         .     .  .                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .   . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      G              .     T     .    C  .       T .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     ATGTTGAGTCTT                                       . .             .    .         G    C       .     T             .         .     .  .                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                           . . . .     .       .   .    .    .     .  G      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     C     .    T  .       T .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     TCATCACGATG                                        . .             .    .         A    T       .     C             .         .     .  .                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                           . . . .     .       .   .    .    .     .  A      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     A     .    C  .       T .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     ATCAAGCCTG                                         . .             .    .         G    C       .     C             .         .     .  .                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               . .     .       .   .    .    .     .  A      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      G              .     C     .    C  .       C .      .  .       .    .         .        A             .   .         .    .     . . .     GGTCAACTGG                                         . .             .    .         A    A       .     A             .         .     .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 .     .       .   .    .    .     .  A      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      A              .     G     .    .  .       C .      .  .       .    .         .        G             .   .         .    .     . . .     TTAAACTGG                                          . .             .    .         A    T       .     C             .         .     .                                                                                                                                                  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .   .    .    .     .  .      . .  .    . .  .  .       .  .   .    .      .              .     .     .    .  .       . .      .  .       .    .         .        .             .   .         .    .     . . .     GTCTAT                                             . .             .    .         G    C       .     C             .         .     .                                                                                                                                                  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .   .                          .                   .                                .                  .             .   .         .    .     . . .                                                        . .             .    .         T    C       .     A             .         .                                                                                                                                                        
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originalCons                  : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTNACAATAATAAAGTTACCTGTTATNTATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-A---AA-C--------TAA---AATCCTT--TA----A--GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-T-C--T--TA------GT---TNA------A--A--AC-AG-TAT--TTGAT------CAAT-AT-NATGTAANT------GCTTTCNTACAGATCATACT-AG-TAT--TTTTAGCG---ATAAACTATATANGATGATATAATG
finalCons                     : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCACGTGTNACAATAATAAAGTTACCTGTTATNTATGTT---CATTTTTATACAT-TCTA--T----T--TTTNT--TAAA---A--TA-AATACAATTAATTTA-------------------------GTTTA--TA-C-T-A-----A-TTTATTT---T---AG--CTC--GATT-GC----GAA-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----T----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACCG-CC-CCACT--T-TCTAAAGTAGC----------------------------AG-TAT--TTGAT------CAAT-AT-NATGTAANT------GCTTTCNTACAGATCATACT-AG-TAT--TTTTAGCG---ATAAACTATATANGATGATATAATG
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CTGGGTTTCAAACACGCAATCTCTAGCACGAATGGCCAAAACTCGTATCCAGTACACTGCTACCCCTCTTATTTCCACTTAATGTGACCAGGGAAGAACACTTGTTATACTCTAAATACCATTTTTTAACAGAACATTTACATCTATACTGTACTCTGTAATGATTTCAATAAACACTTCTCTTCAACTTTTAAATGATCTATACAT
Unaligned ( gi|28 ): AAAAGTATCGGTTAGGGAATTTTTAGCCTTAAACAAATATTAAAAATTGTTTGCTAAACTTGTCATGAGTAGATTAAAAACTACAAGGTGTTTTTTTAAACACATAAAAGAAAAGCATTCAAAATAGCATTTTATTTCCTGAATTATTGCCTATTATTTAGTCCTTATAACAAAAATAAAAA
Unaligned ( gi|40 ): GATAGAATATGTACTAGATGTTGGGTTGGAGTCTGGGATTAAACCCATGACTTCTTGCATAAGTGGTCAACATTCTTTCCTCTATATTACGGTCCAACTTTTGATTTAAGATTAAAAAC
Unaligned ( gi|41 ): CATACTCAAATTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAATACATGTACATGGTCTCAAGTTGAGATA
Unaligned ( gi|54 ): AAGCTTAAAGGGGAAGTAATTTCAAATCTTTAACGAATTCGGTTCATGACTAGAGCCAGAAGTTGGGTGTTTTTAGAGATCATCTAATCGA
Unaligned ( gi|65 ): TATACCCATATATTTAAGTTTGATTGCAAAGTAAGTAATCAATGTGGAGTCTGTTTCCTAGGTAAGACCAGAAGT
Unaligned ( gi|67 ): AGTCTGGGATAAAACCTAAAACTTCTGACACAAGTGGTATCCCCCTTTCCACTATAGCACCATCCCAC
Unaligned ( gi|69 ): TTGGTCATGGGTGGGACCGAATTTGCGATATTTGGCATGAACGTCTAGCATCCTATTCACTACACC
Unaligned ( gi|77 ): CTGGAGATTAAATCCATAACCTCCTGCATGCATGGTCAACATT
Unaligned ( gi|80 ): ATGTTACATGCAGGACTGTAAAGTTTTCTTACTAAA






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gi|13                         :                                                                                                                                                gctagttaa--AT-------------T-A---AATTCA--TA-C-TA-----A-TTTGT---TT---T---AG--C---TC--GATttcctctaataagaaacaagaaacagtagacaaactt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagC---CC-GTAT------T-G------------TG---T--------------G-T-T-T-T----AGAG-G-C-A-TATT-AG---T----CG-AG-T-T---------G----G----G-G-ATCGAACCT-GCA--ACA--A-C-TGGCGTGAAC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACC------GTC-TC-Agctctcccgtgcccgtattgtgtgttttagaggcatattagtcgagttggggatcgaacctgcaacaactggcgtgaacggccaacactctatccactacactaccgtctcaataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|14                         :                                                               acaaatatcttacaaaaatgatatttacaatatcatgccaaaatgagattaaattcatactaatttgttttagctcgatgctctcccgtg--AT-------------G-T---AGTCTA--TA-C-TA-----A-TTTAT---TA-------AG--C---TT--GACT-GC--AAC-A-AA---AG-C--T--T---AGAGC--T---T----ACTAGTAT------A-------T---GAA--CCGC--TCTT-G--AGTTTGAT--TCCTT--G---ATAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-T-G---------G----G----G-G-AACGAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCGCGAGC--GGCCA--AC-A---CTA-TCCAATA-----CG-CT--ACC------ACCACC-AC-T--T-ataacattaaacgatttattgctataaaaagtataatgttatcttacatgacggttactaaagtatggtacttactgcaatctacgccaa
gi|15                         :                                               gtcatagcttatcaaatcagacaaatcgtgctttgctggttttctccagtatcCAT-TCCA--TGAAAT--TTTCTATAAAAT---AA-A--T--------------------------------T---AAGTTA--TA-C-TA-------TTTAT---TT---T---AG--C---TT--GATT-GT--GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------TAT-GAA--CCTC--TCCC-G--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTGGA---AT---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-TG-GG---T----CG-AG-C-T---------G----G----T-G-AACAAGATC-GCA--ATG--T-C-TGGCATGAGC--GGTCA--AC-A---CTA-ACCATTA-----CA-CC--ACC------gaagatctctagtccttcatc
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gi|18                         :                                                                                                                                                                         tataaccttagatgtttaaacatgttttgatcctgtccttcaattcaaagttgtaagaacttgcttcacA-G-TA---AG-C--T--T---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---CAA--GTGC--TTTT-A--AGTTCGTT--TTCTG--A---GTAGA---AC---CA-GTA-----------------------G---T---------T----A-T-G-T-T-T-TAGAG-A-CCA-C-CG-AA---T----CG-AA-C-CCACGAACCCA----T----G-G-ATCGAACCC-ACG--AAC--T-C-Tggaaacatca
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gi|2                          :                                                                               gtcattcattatcaaatttccagggggtgcttaactttttttccaggtgtatataa-A--TA-----TCAT-TA---T-------------T-T---AGTTGA--TA-A-TA-----A-TTTAT---TT---T---AG--C---TC--GAAT-GC--GAT-G-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--G---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T----G-T-T-TAA-T-GAG-----------CG-GG------------------------------------G-G-ATCGAACCC-GAA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCAA--AC-AC-TCTA-CCCATTA-----CA-CT--ACC------GCC-CC-GC-T--T-CTTGTTATGAGACT-GTA---AAC-TA-TATTTGATTACAGCCAAT-AT-C---TAACTAAAACAGCTTTCGTTCAAAT-ATATT-AGCTA----TTTAGCA---ATAAAGTATATAggtct
gi|20                         :                                  agtaaaaatagtaaaagaagtattgtacattggcagacatgataaaacttttcttaactaaagataagttgccccttactgtcaacaacggataccaattgaacttttttgtctcattatttg-------------T-T---AGTTTT--TA-T-TA-----A-TTTAT---TT---T---GG--C---TC--GATT-GC--GTA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T----------------------------------------------CCT-G--AGTCC-CTATTCCTG--T---GTAGA---AC---CA-GCAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 a----G-G-ATAGAACCC-GCA--ACC--G-C-TGGCTTTAAT--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTA-----AA-CT--AGC------ACC-CC-AC-T--T-TC--------AA---GT----Atacagggatagaacccgcaaccgctggctttaatggccaacactctatccactaaactagcaccccactttcaagtaattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|21                         :                                                                  attagtttttattaatttattttggctcgattgcgtagaaagctcaaagctcctgagtccctattcctgtgtagaaccagcatacag--AT-------------T-C---AGTATG--AA-C-TA-----G-TTTAT---GT---T---AG--T---TT--AACT-GC--GAA-G-AA---AG----T--C---AGAGA--TAATT----A------T------G-------T---TAA--TCGC---CT--G--A--TCGTT--TACCG--GAAAGTATAT--ACATGTA-GTAC------C-G--------A--GTA---T---------TTTTAG-C-T-TAT-T-TAGTT-G-TTA-T-AG-GG---T----CG-AA---T---------A----T----G-G-GATAAACTC-----------T-C-TAGTATGAGG--GGCCA--TC-AC-T--A-TCCACTG-----CA-GT--ACA------G-C-CA-AC-T--T-ATT------AAA-----------C-GA-TATTT-AC------CAAattaaaggttatattgtatgtatactggttcctaacaagtacattaattttgttccttcattgaatctata
gi|22                         :                                                                                                                                                        t--AT-------------T-T---GGTTTA--TA-C-TACTAGTACTTTAT---TT---T---AG--C---TC--GATT-TC--GAT-G-AT---AG-C--T--C---AGAGT--T---T----A------T------A-------T---GAA--TCAC--T-------------CT--TCCTG--G---GTAGA---AC---CG-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-cttca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             ggatacacggcaagattaaaataaaattcaaatttcacacgccaaatcaatatttacatctatgaacgaataaccAGA---AC---CA-AGGC------T-G--------T--GTG---T---------T----G-T-T-T-G-T-GTGTG-GTC-A-C-CA-GG---A----CA-GG-T-T---------GAACAT----GAG-ATTGAACCT--TG--ACC--T-C-TGTAGTAAGA--TTTCA--AC-AC-CCCA-CCCAGGA-----AA-CC--ACCATATTTGTA-CT-AG-T--T-TAT------CAA---CT----A-C-AG-CATAT-AT------TAAT-AT-CATGTA-------------TCTTACAGATCATACT-A--CAT--TTTTAGCATTAATAAACTATGTAAGATAATATAATGatatgacgcactattaatatcaaaatagtataatccgaaactt
gi|25                         :                                                                                                                                                     T-TA--CT-------------T-T---ACTTTA--TA-AGTT-----A-TTTAT---TT---T---AG--C---CC--AATT-GC--GAA-G-AA---AT-C--T--T---GAAGT--T---G----A------T------T-------T---GAA--CCGT--TTTC-G--AGTTCGCT--TCCTC--G---GTAAAAGTAT---AA-GTAC------T-G--------C--GTG---T---------T------T-T-G-T-T-GA--------------------------G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATTGAGCCC-GCA--ACC--A-C-TAGCATGAGC--GGCCT--GC-AC-t
gi|26                         :                                                                              ttataccaataaccataacctatactgcgA--T----T--TTTTT-AAAAAT---TA-A--TA-----TTAT--A--AT-------------T-C-----TTT-----------------TTT-T---TT---T---AG--C---TT--GATA-ACATGAA-G-TA---AG-C--T--T---CGAGC--T---TTGA-A------TT-----A-------T---TAA--T-GC--TGTCCA--AGTCTG-T--TGCT----------------C---CGCGCAC------T-G--------G--G-G---C---------T----G-T-T-T-A-T-GAGAG-GCC-A-C-AA-GG---CATG-CA-AG-C-T---------T----T----C-A-ACCAAACCC-ACA--ATC--T-C-TGG---------AGCCA--AC-AC-aataataatact
gi|27                         :                                                                                  agacagatagcatagaattgT-TATA--C----T--CATCT-CAAAAT---A-----------------TG--GT-------------T-T---AGTTTA--TA-C-TA-----A-TAT-T---TT---T---AG--C---TC--T-TT-GC--AAA-GTAAT--AGAC--T--C---AGTTC--T---T----A------T------A-------A---GAA--CCAC--TCTT-G--TGTCTGCT--TTCTG--G---GTAGA---AC---CA-GTAC------T-T--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-T-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                       ttatacatagtatataatcatgctacaggataatttgataatatctgaacatggt--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---AAA--CCAC--TTTC-A--AGTCCGCT--TTCTG--G---GTAGT---AC---CA-GTA-------T-G--------G--GTG----------------------T-T-T-T-AAGAG-A-C-G-T-CG-GG---T----CG-AG-C-T--------------T----GAA-ATCGAACCC-AAA--AC-----C-TGATATGAGC--AATCA--AC-AC-TTTA-TCCACTA-----CA-CT--ACC------GCC-CC-Atttaaaggcca
gi|3                          :                                                                                                                       gatactttgcaattattgggctcatctgatgtcA--AT-------------T-T---AGTTTA--TA-T-TA-----A-TTTAT---TT---T---AG--C---CT--GTTT-GT--GAA--------AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--CTGC--TCTA-G--AGTCCGTA--TCGTG--G---GTAGA---GC---CA-GTAT------T-G--------A--GTG---T---------T----GTT-T-T-T-T-GAGAG-GCC-A-T-CATGG---T-----G-AG-C-T---------G----G----A-G-ATCAAGTCC-GTA--ACC--T-C-GTGTGAGAGC--AGCCA--AC-AC-TTTA-TCCACTG-----GG-CT--ACC------ATC-CT-GC-TCAT-TTT------GAATTTGTCAA-GGC-AGCTATTTTTT------CCAT-TTGAATGTAtata
gi|30                         :                                                                                                                              ctaattctgtaaaattgtagttgatatttacaatgattttgtggtgtgatgttttg--TA-C-TA-----A-TT-GT---TT---T---------------GATT-GC--AAA-T-GA---AG-A--T--T---AGAGC--T---TTTCAA------T------T-------T---GTATTTCGCT-TCT------GTCTCAT--TCTTG--G---ATGGA---ACAA-GA-GTAC------TCG--------G--GTG---T---------T----G-T-TAT-C-T-GA--------A-T-----G---T----TG-AG-T-C---------T----T----G-G-AGCAAGCCT-GCA------------------AGT--GGCCATTAC-GT-CCTA-TCCTCTA-----AA-CC--ACC------ACT-Cttggcagagtaaaaattattgtaaaatttaagttttttcataaattgaaaaaggacattgaattctataaatcaacaaatgaaacaaaatggcctgaaaatgatttgt
gi|31                         :                                                                                              TTT-TACGT-TTTAAGT----T--TTTTT-TA---T---GA----------------TA--AT-------------T-C---AGCTGA--TA------------TTTATAAGTT---T---AG--CAGATT--TATT-TT--GTA---AA---AG-CACT--C----GA-T--T---T----A------C-----------------------TCGC--ACTT-T--AATCGATT--TCCTG--A---GTA-A---AC---CA-ATAC------C-G--------G--GTG-------------------------------AAAG-C-T-A-T----AA---T----GG-AG-C-C--------------T----G-GCATTGATCCT-GAA--ACC--T-T-TGGCGTGAGagcaagatc
gi|32                         :                                                                                                                                                    aT-TA--GT-------------C-C---AGTTTA--TA-A-CA-----A-TTTCT---TT---T---AT--C---TC--CATA-TC---AA-T-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------TTATGAA--AAGC--TCTC-G--AGTACGTT--TCCTT--A---GTTGG---TG---AG-GTAC------T-G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---
gi|33                         :                                                                                                                                                                cgcgtattttggtaacattttaaaagttgtA-----A-TTTTT---TT---T---AC--C---TC--CATT-GC--AAA-G-TA---AA-A--T--C---AGAAC--T---A----A------A------G-------T---GAA--T--------------------------TG--G---GTATT---GT---CA-TTAT------T-G--------G--GTG---T---------T----G-T-T-C-A-T-GAGAG-----A-T-CA-AG---C----------C-T---------G---------G-A-ATTAAA-----------C--T-C-TGACATGGGC--AGCCT--TT-AC-CCTA-TCCCCTC-----CA-CC--AGT------GCC-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---AC---CC-GTAC------T--------------TT---T---------G----G-T-T-TAT-T-GTGAG-ATC-G-T-CGTGG---T-----G-AA-C-T---------G----G----G-G-ATCTGACCC-GCA--TTC--T-C-TAGCGTCAGC--TAC----AT-AC-TC---TCCA-TGAATATAA-CTCGACC------GTT-CC-GC-T--T-Tagtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                         A-C-TA-----A-TTTAT---TT---T---AA--C---TC--GGTT-Gactgataatacatgtttaaaaaaatactcgtcaatac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --GTG---T---------T----G-T-T-T-C-T-GAGAA-GTC-A-T--G-TA---T----TG-GA-A-T---------A----TGG--G-G-GTCAAACGT-GCG--ATC--T-C-TGACGTGTGA--GGTCA--GC-AC-GAAA-TTCGCTA-----CA-CT--AAC------Gaaaaacaatgttcgtgttgtttctgagaagtcatgtattggaatatgggggtcaaacgtgcgatctctgacgtgtgaggtcagcacgaaattcgctacactaacgtgtaacgtggacgattta
gi|36                         :                                                                                          actaatttattttaactcggttgaaaaacaatgttcAACT---GA-A--TA-----TAAT-TCCTAT-------------T-T---GATCTA--TA-C-CA-----A-ACCAT---TT---T---AC--C---TC--AATT-GT--GAA-T-AA---AG-T--C--C---ATAG---------------------------------------------------TC-A--A-----TT--TCCTG--G---GTGGA---AC---TA-GTAC------C-A--------A--GTG---T---------T----G-TAT-T-T-T-tgtaacgtggacgattta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catct-G-ATCAAATCC-GTG--ACC--T-A-----ATTAGC--TACTA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACC------GCA-CC-G-----T-TC---------A---GT----AGG-A--TCGTTG-T------CAAT-AT-ACTGTtacatttgacaagagcagcaaacatcaa
gi|38                         :                                                                                                                                                         attttttgattttcttggttggaactcgtactgaattt-----A-CTTAG---TT---T---AG--C---TT--GATT-GC--GAA-A-GA---AA-C--T--C---AGAGT--T---T----ctatatattgttata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----T----G-G-ATTAAGACC-TTG--ACC--T-C-TTACATCGGT--CACCA--AC-AC-TCTA-TCCACTtttcataaaataatgagaggccattggattaagaccttgacctcttacatcggtcaccaacactctatccacttcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|39                         :                                                                                               acttagtttagcttgattgcgaaagaaactcagagttttttcataaaataatgagaggccat-------------T-T---AATCTA--CA-T-TA-----T-TCTAT---TTTAAT---AG--C---TT--GATT-GT--GAG-A-TA---AG-T--TGGCGAAAGAAT--T---T-----------T------A-------T---TGA--TTGC--TCT--G--AGTCCATT--TCTAA--G---GT------------A-TTAC------T------------------------------------T-T-T-T-T-GAGAG-ACC-A-T-CA-AG---G----TG-AG-C-T---------T----T----G-A-ATGGAGTCT-Gtcttcgccgtgatacaagtaatttta
gi|4                          :                                                                                                                                         --TA-----CAAT-----AT-------------C-T---ATTTTA--TA-C-TA-----A-TTTAT---TT---T---AA--T---TT--GATT-GC--AAA-G-AA---AG-C--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CCAC--TCTC-A--AGTCTACT--TATTG--G---ATAGA---AC---AA-ATAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-TAT-T-GGGAG-G-A-A-T-TG-TG---T----CA-AG-C-T---------G----G----G-G-ATCAACTTC-GCA--AAC--T-A-TGACATGAGC--GACCA-----AC-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--ACT------GCT-CC-AC-T--T-Tt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               tcccttgaaaggcctcctat-------T---GAA--ACAC--TCTA-A--AATTCGTA--ACCTG--C---GTAA------------------------G--------A--ATG---T---------T----G-T-T-T-T-T-GAGTG-GCC-A-T-CA-GG---T----TC-AG-CAT---------G---------A-G-ATCGATCCA-GCA--CCA--T-C-TGGTATTATC--GGCAA--AT-GT-TCAA-Ttgatgatatatcctatttttaccagattttatcgttatgatagaaacaaataaatttgtaaatcttaaaattatcaaaactaagcacaaaaccactagtttaaaaaataatatgtcttaaaaatgatgttttgtttgtaataattggtgattattattcttatattcaaaggtgaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                 tagg-TTTAC---TA---T---AG--C---TC--GATA-GT--GAA-G-GA------------------------------------------------------T---GAA--TCGC--TCTC-G--ACAACGCG--TTCTG----------------------------------------------------T---------T----G-T-T-T-T-TCGAGAG-GCC-A-T-CG-GC---TCATACA-AG-C-----------A----T----A-GTATCAAACCA-ACG--ACT--T-CGTTGCGCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C---CA-AAAC------T-G--------T--GTA---T---------T----G-T-T-T-C-G-GAAAG-A-C-C-TACG-TA---T----CG-AT-A-T---------G----TTCAAG-G-ATCGA-CCA-ACA--AA---T-A-TAGCCTGAGC--GATTA--AC----TCTA-TCTGCTG-----GA-CT--ACT------GC
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggatagt-G--AGTTCATT--TCCTG--T---GTAGA---AC---CA--TGCAGCAAGT-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-C-T-T-AAGAA-T-C-A-T-CA-----------CG-A----T---------G---------G-A-ATC---CTT-TTA--ATG--T-C-TGGCACAAGA--GGCCA--TC-AT-TATG-TACAt
gi|46                         :                                                                                                                                                                                 GTTTA--TA-C-TA-----A-TTTTT---TT---T---CA--C---TT--GAAT-GT--GAA-G-AA---AA-C--T--C---AGAGA--T---T----A------T------AAAAAACGT---AAA--CCGC--TCTT-G--AGTCt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                   tacttaaattttaatggtactatT---CT---T---AG--C---TC--AATT-AA--TAA-G-AC---AG-C--T--C---ACAGT--T---T----A------T------A-------T---GGA--TCGC--TTTtattt
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-G--AGTGCGAT--TTCTC--G---GTATA---TC---CT-GTAC------T-G--------G--GTG---G---------A----G-T-T-T-C-T-----------A-T---------------A-AG-----------------------A-G-ATCAAACC------------T-C-TGACTTCAAT--ATCAT--AC-AA-TCTA-TCAACTA-----CA-CT--ATC------GTC-Cttctaggtataacatagattgaattgcagttactctatccaacccactttgttaa
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ATCGAACCC-ATA--ACC--T-T-TTACAAAAAC--AGCCA--AG-AC-TCTA-TCCAGTA-----TG-AT--ATT------GTC-CC-AC-T--TATTT------AA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                   TTA--TG-A-TA-----A-TTTAT---TT---T---AG--C---TC--GA-T-GC--CAT-G-AA---GG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--CTGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCAG--G---GCAGA---AC---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TAT-GAGAG-G-C-A-T-AG-GG---T----TG-AG-A-T---------G----G----A-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGC--GGCCA--AC-AC-TCTA-TCCATGG-----GA-CT--ACC------ACC-CC-GC-T--T-T---------AA---AT----TGA-AA-TATTgccttgttacaagacattcatagaatata
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T-TG-GG---T----C-------T---------G---------G-G-ATCTGACCC-ACATGACC--T-C-TTGCATGGGC--AGCCA--AC-A--TCTA----ACTGC----CA-C---ACC-------TA-CT-AT-T--T-TCT------caaattgagatagattgtgaatacagggccaggatggcatattcaagttgagatagtttgtgaatacagggactggagtgcatactgaagttgataatttgtgaataaagggcttggagtgcatattaaaggtgagaaattttgtgaatacagaaccagacggcacgctcaaattgagata
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GG---T----CA-AA-C-T---------G----G----T-A-ATTGAGCCT-GCA--ACC--T-C-AAGTGTGTG--------------C-TCTA-ACCACTG-----TA-CT--ACC------ACT-CT-AA-T--T---A------AAA---GT----CAC-AG-tatttatttaataactactattt
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -G--------A--ATG---C---------T----G-T-T-C-T-T-GACAA-G-C-AAT-AA-AG---C----TGCAC-C-T---------G----T----G---ATCCAACCC-ATG--ACC--A-T-TGGCATGAGC--AGCCA--AC-AC----AGTTCACTG-----TA--T--ACatgcaccagtgttaacgtc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GAGAA-A-C-A-A-AA-AAAACC----TA-AG-C-T---------C-----------G-ATTGAGCCT-ACA--ACC--T-C-TGAAGTGATT--GGTAA--AC-GT-CATA-TTCATTA-----CA-CC--Aataa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG---T---------T----G-T-T-T-T-C-GATAC---C-A-T-TG-GT---T----CC-AA-CAT---------G---------A-G-ATCAAACCT-GCA--AAC--A-C-TTGCA--AGTTGGGCCA--AC-AC-CATA---CACTG-----CA-CT--ACC------GC
gi|57                         :                                                                                                                                                             -------------T-T---GGTTTG--GA-A-TA-----G-TTTGT---TT---C---AA--C---TTTGGAT--GC--GAA-G-AA---AG-T--T--C----GTGT--T---T----A------T------T-------T---GAA---AAC--TCTC-A--CTTTCGTT--TCCTG--G---ATGAA---AC---t
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----G-G-ATGGAACCG-GCA--ATA--T-C-CAGTATGAGC--GGCCT--AC-AC-TCTA-TTCACAG-----CA-CT--A
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caatcttgGT--TCTC-G--AGTCCATT--TCCAGCAG---GTAGA---AC---CA-ATAC------C-A--------A--ATG---T---------T----G-C-T-G-T-T-AAGAA-G-tttagtgtgtatgttttactaatt
gi|6                          :                                                                                                                        att-TAAAATCT-AACA--TA-----CA--------T-------------T-T---AGCTTA--TA-C-CA-----A-TTCAT---TG---T---AG--C---TG--GATT-GC--GAA-G-AA---AG-T--T--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--ATGC--CCTT-A--AGTCCGTT--ACCTG--A---GTTGA---AA---CA-GTAC------T-G--------A--GTG---C---------T----G-T-T-T------AGAGTC-C-G-C-CG-GG---T----CG-AG-A-T---------T----T----C-G-ATCGAACCC-GCA--ACG--T-T-TAGCGTGAGA--GGACA--GC-A---CTA-TCCAGTG-----CA-CT--ACC------GCT-CA-GC-T--T-aacagtaaagaacggaccggaccggac
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atggataccaacacgaccataaaacaaatacctaaataaagaccgttatagttaca-GCT--ACCAGT-C-TGG--TGAGT--GACCA--AC-AA-TCAG-TCCACTG-----CA-CT--ACC------ACC-CC-AC-T--T-TCT------acatgcatattatatagttagttagaaaaaacgttcttctcttacagggatcagtgttttttactttcattttcatctacaccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --ACC--TGC-TGGCATGACT--GGCCA--AC-AC-T--A-TTGACTG-----GA-CT--ACT------GCC-CCCAC-T--T-T--------AAA---GT----AGC-AG-TGTTTGAT------tttactcctttagtctcttgtatatttgt
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      AGT--T---T----T------T------G-------T---GAA--TCAT--TCCT-ATTAGTCCGTT--TTGTG--A---GTAAA---AC---CA-GTAC------T-GTGCTTTATA--ATG---T---------G----T-T-T-T-T-T-GAGAG-tttagaacagttgtg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAACCCTGTG--ATC--T-C-TGGTGGGAGT--GGTCA--CA-AC-TCTA-TCCACTGGCC--CATCT--ACC------
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                tgggaaaTTAT---AA---T---AG--C---TT--GATT-GC--AAA-G-AA---AG-T--T--C---AACAC--C---T----A------CCGGTAAA-------T---GAA--CTGC--TCTC-A--AATCTGCT--Ttgcttagtacttt
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atata-T---------G----T----T-G-ATTG----C-ACA--ATC--T-C-TTGCATGAGC--AGCTA--AC-AC-TCGA-TGCAGTA-----CA-CT--ATT------ACC-att
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cctgagtggaacctgg-T-T-GAAAC-G-C-A-T-GG-GG------------------------------------G-A-AACGAACAT-GCA--ACC--T-C-CGACACGAGC--GGCTA--ACTGC-CCCA-TC
gi|7                          :                                                                                             aTTTATA-AT-TGTA--T----CAACTT-----AAAT---AA-A--TA-----CAAT-TA--AT-------------T-T---AGATTA--TA-C-TT-----A-TTTAT---TT---C---AG--C---TC--GACT-GT--GAACA-AA---AG-C--T--C---AGAGC--T---T----A------T------A-------T---TAA--ACGTCATCTT-G--TGT----T--TTTT--------TAGA--------------------------------G--GTG---T---------T----G----------------------------GG---T----C--AA-C-T---------G----G----G-G-ATCGGACCT-GTG--ACC--T-C-TAGTTTGAGC--AGCCA--AC-AC-TCTA-TCCACTG-----CA-CT--ACC------TCT-GC-GC-T--T-atgcta
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtcataatattataagcaatagttttaaatttgctgacagtaaaattttacgtaacaatgggtacctgtgcaacaacatgtctttatctaacaaactgtacataaagatttgaaa-T-T-T-T-GAGAG-A-CCA-T-CG-GA---T----CA-AG---T---------A----T----G-GTATCGAACCC-GCC--ACC--A-C-TTGCGAGAAC--GGagtgatttcaaatactgttttacatt
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                   gttaTTAT---TT---TGTTAGGAT---CC--GATA-CT--GGA-A-AC---AG-G--T--C---AGAGC--T---G----A------T------A-------T---GAA--CCGC--TCTC-G--AAT
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCA-GCA--ACT--T-C-TAGCATGAAT--G-CAA--AC-AC-TCTA-TGCGCTG-----CA-CT--ACC------GCC-
gi|73                         :                                                                                                                                                     ggggagga-------------T-T---AGTTAA--TA-C-TT-----G-TTTAT---TT---T---AG--C---TC--ATTT-AC--AAA-G-AA---AG-C--A--T---AAAGA--T---C----A------T------G-------T---G
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cc-G-ATCGAACTT-GCA--TAC--T-C-TGGTGTGGGT--GACCA--AC-AT-ATTA-TTCGCTA-----CA-CT--AAC------GC
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACCC-G-A--GCC--T-C-TGGCAAGTGC--GGCCA--AC-TA-TCTA-TCCACTG-----TA-CT--ACC------TCC-CA-AC-T--
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCA--ACT--A-G-TAGCATGAGT--GGTCA--AC-AT-TCTA-TCCACTT-----CC-CT--GCC------ACC-C
gi|78                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tGCCA--AC-AT-TCTA-TCCACTA-----CA-CT--AAC------ATC-CC-AC-T--T-TC--------AA---GT----agct
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCA--CCC--T-C-TGGCATGAGA--GGCCA--AC-A---CTA-TCCAATA-----CA-
gi|8                          :                                                                                                                                                            t-------------T-T---AGTTTA--TA-C-TT-----A-TTTAT---TT-------AG--C---TC--GATT-GC--AAT-G-AA---AG-C--C--C---AAAGC--T---T----A------T------A-------T---GAA--GCGC--TCTC-G--AGTCCGCT--TCCTG--T---GTAAA---AC---CT-GTTC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-T-T-TCT-GAGAG-G-C-A-T-CG-GG---T----CG-AG-C-A---------G----G----G-G-ATCGAACCC-GCA--ACC--T-C-TGGCGTGAGC--GGCCA--AC-AT-TCTA-TCCATTA-----CA-CT--ACC------GCC-C
gi|9                          :                                                                                                 aaaacttgtggaaggacagcgattctccAAAAT---GA-A--CT-----TAAT-TT--GT-------------T-TTT-AGTTTA--TA-C-CA-----A-TTTAA---TT---T---AT--A---TC--TATT-GC--AAG-G-AA---AG-------------------------------------------------------------C--TCT--A--AGTTC--------TA--G---GTAGA---AC---AA-GTAC------T-G--------A--GTG---T---------T----G-T-C-T-T-T-AAG-------------------T----TA-AA-C-T---------G----G----G-T-ATTAAACCT-GCA--ACC--T-C-TGGCATGAGT--GGCCA--AC-ACTTTTA-TCCAATA-----TA-CT--GCT------ACT-TC-AC-TTGT-TTT------TAA---TTTTA-AG--AA-CATTTTAA------CACTCAT-CATG-AAAT------GTTTTCATACAGATagctatacgctctgttctctttagatgcgtgtatatttatatctatgcatcagatactggtaaccatacctaatctgtaatacacgaaatactgttgatgttattgacagtaatatactatt
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CTGGGTTTCAAACACGCAATCTCTAGCACGAATGGCCAAAACTCGTATCCAGTACACTGCTACCCCTCTTATTTCCACTTAATGTGACCAGGGAAGAACACTTGTTATACTCTAAATACCATTTTTTAACAGAACATTTACATCTATACTGTACTCTGTAATGATTTCAATAAACACTTCTCTTCAACTTTTAAATGATCTATACAT
Unaligned ( gi|28 ): AAAAGTATCGGTTAGGGAATTTTTAGCCTTAAACAAATATTAAAAATTGTTTGCTAAACTTGTCATGAGTAGATTAAAAACTACAAGGTGTTTTTTTAAACACATAAAAGAAAAGCATTCAAAATAGCATTTTATTTCCTGAATTATTGCCTATTATTTAGTCCTTATAACAAAAATAAAAA
Unaligned ( gi|40 ): GATAGAATATGTACTAGATGTTGGGTTGGAGTCTGGGATTAAACCCATGACTTCTTGCATAAGTGGTCAACATTCTTTCCTCTATATTACGGTCCAACTTTTGATTTAAGATTAAAAAC
Unaligned ( gi|41 ): CATACTCAAATTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAGTACATGGTCTCAAGTTGAGATATTGTGTGAATACATGTACATGGTCTCAAGTTGAGATA
Unaligned ( gi|52 ): ATTTATATAATAAAATATGAATAAAGTACTTGATAAAGTTGTACTTAATTTATTGTAGCACAATTGCTATTAAAACAAGCTCAGAATTTATATA
Unaligned ( gi|54 ): AAGCTTAAAGGGGAAGTAATTTCAAATCTTTAACGAATTCGGTTCATGACTAGAGCCAGAAGTTGGGTGTTTTTAGAGATCATCTAATCGA
Unaligned ( gi|65 ): TATACCCATATATTTAAGTTTGATTGCAAAGTAAGTAATCAATGTGGAGTCTGTTTCCTAGGTAAGACCAGAAGT
Unaligned ( gi|67 ): AGTCTGGGATAAAACCTAAAACTTCTGACACAAGTGGTATCCCCCTTTCCACTATAGCACCATCCCAC
Unaligned ( gi|69 ): TTGGTCATGGGTGGGACCGAATTTGCGATATTTGGCATGAACGTCTAGCATCCTATTCACTACACC
Unaligned ( gi|77 ): CTGGAGATTAAATCCATAACCTCCTGCATGCATGGTCAACATT
Unaligned ( gi|80 ): ATGTTACATGCAGGACTGTAAAGTTTTCTTACTAAA