lowQualScore : 1 5555555 3333333 22 55555555555 222222 33333333333333333333333333 11111111111 111 1 1 1 33 1 1 55555555555555 111111111 1 5555555 333333 1 11 1 1 11 11111 1 111111 222222222 111111 22222 111 11 22222 11 66666666666 22222 3333333 11 1 333 111 11 1 777 22
lowQualScore : 5 7 0 6 6 4 0000000 3 8 2222222 1 2 3 0 6 5 8 1 66 9 9 22 5 0 00000000000 333333 66666666666666666666666666 66666666666 6 5 000 6 5 2 6 5 3 1 6 3 77 2 66 2 0 3 3 2 3 3 3 6 33333333333333 0 7 5 0 777777777 0 444 4 3 2 6 4 2 2222222 222222 6 8 5 3 1 8 11 4 5 5 44 5 1 5 3 11111 2 1 6 5 5 66 5 0 7 4 3 7 7 3 6 1 1 888888 1 555555555 666666 55555 4 1 0 2 6 4 5 88 6 444 88 6 1 33333 6 11 0 55555555555 55 33 8 00000 4 7777777 11 3 8 6 5 0 111 1 7 777 3 99 5 000 11 3 3 3 2 0 0
lowQualScore : . . . . . . ....... . . ....... . . . . . . . . .. . . .. . . ........... ...... .......................... ........... . . ... . . . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . .............. . . . . ......... . ... . . . . . . ....... ...... . . . . . . .. . . . .. . . . . ..... . . . . . .. . . . . . . . . . . . ...... . ......... ...... ..... . . . . . . . .. . ... .. . . ..... . .. . ........... .. .. . ..... . ....... .. . . . . . ... . . ... . .. . ... .. . . . . . .
lowQualScore : 2 0 1 0 7 4 6666666 4 4 8888888 1 3 2 8 6 2 8 1 55 2 6 22 1 8 44444444444 888888 55555555555555555555555555 55555555555 5 0 999 0 0 0 0 0 7 0 7 0 33 3 77 0 7 0 0 3 0 0 3 7 88888888888888 7 6 9 7 555555555 0 888 0 0 5 0 0 5 7777777 333333 7 3 3 3 0 6 11 7 6 0 44 0 8 0 0 11111 3 8 2 0 0 99 0 4 0 3 3 0 0 5 0 7 0 111111 6 444444444 444444 77777 8 4 6 8 6 1 5 55 0 000 66 0 4 66666 6 00 6 22222222222 44 22 0 00000 4 0000000 00 0 0 0 0 8 000 4 8 444 8 88 0 000 55 2 2 0 8 8 2
consensus : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG--N--AATTTTATTGAANTGA---NN--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTANTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTGATAAATATG----T-----CGAGTT--TC--CTCTCGGCTGCT-GT-GG-G-CNTTT--GGAAATGTAAC------GATCACAT-TTN--CCACTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAACTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCNCTCAAANTTATCTCANCCATGNAATTATTTCTANTGTTCCNTCCGCAAATTCANGGTNAATNT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATC-CATATAATAA------CT------ATAAACATGCCGTACATCTTTGNGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTT-AGTTACANCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTNTTTCCATTCNTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTNGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGGAGTTGGGAAATC-GCATCGCCATTTGTANGTTA-ATCCGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAATTTGCATGTTGCAATTTCAATATAACCTT-GCAGT-TT--AT-TACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTAC-----GATTGAATTGTATTTACTTTGCAGAAAAGA---T-G--AAAG------CTNNGAAAGGTAAGACTTGTTTTGTATTAACATGGGTTTCACATATAATAAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCANCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAT---GGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAA----TTTAATG--ATAGCAACTGATCATGTA-A-TTTTG---TTTTTNATTGTGCAA-TA-----ANGATCAGTT-----TTTTTT--CCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAT-GTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Reference ( gi|1 ) : TGGTGAAATAAAACAGACAGAAACCATTTTAAGGGCG-GTATTG--G--AGTTCTATTGAACTGA---CA--ATGCATATCCTTCATACGAGACACCATCCCAGTTGTAGCTCGCTCAATAAAACTCATCTTTTAACAAATAT-----T-----CGAGTT--TA--CTCTCGACTGCT-GT-GG-G-CGTTT--GGAAATGTAAC------GATCACAT-TTA--CCACTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAACTTTTCCTTTGACTAAAAAGACAGTATCTTGTAATAAAATCGCTATATGTTTTCCTCGAAAAATTATCTCAATCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATC-CATATAACAA------CT------ACAAACATGCTATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTT-AGTTACATCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATATTAATTCGTTTTTACTTGAATGCAAAGAA-ATCATAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTCGGAAATT-GAATAGCAATTTGTAAATTA-ATCTGCATTT-TCATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAATTTGCATATTACAATTTCAATATAACATT-GCAGT-TT--AT-TACCACAAAATAACAACATTTTATGCTCATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATATTGCATATTTAATTCGTCAAAATCAACATGCAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTAC-----AATTGAATTGTATTTACTTTGCAGAAAAAA---T-T--AAAG------CTGCGATAGGTAAGACTTGTTTTGTATCAACATGGGTTTCACATGTAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTATGTCTTTGAGTGCTTCCACTATGTACTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAT---GGCGTTTCAAAAATAATCGACATTACATTTAA----ATAAATG--ATAGCAACTGATCATGTA-A---------TTTTTTATTATGCAA-TA-----AAGATCAG-------TTTTTT--CCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTCGAATAGATGTGCAGTTTAAAACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAA-GTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTCATACTTAACTTAATATGCAGTTAAAATGTTATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|8 : GTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTT-AAGGGCG-GTATTG--A--AATTCTGTTGAACTGA---CC--ATGCATATCCTTCATACAAGACTCCGTCCCAGTTGTAGCTC-CTCAATAAAA-TCAACTTTTGACAAATAT-----T-----CGAGTT--GA--CTCTCAGTTGCT-GT-GG-GGCGTTT--GAAAATGTAAC------GATCACAT-TTA--CCGCTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAACTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCACTGTATGTTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNA------CT------ACAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTT-AGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAAATCGTT
gi|10 : GTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCGTGT-TTA--A--AATTTTATTGAACTGAATTTA--TTG-ATATCCTTCAAACGAGACCCCGTGTCATTTGTAGTTCGCTAAATTAAACTCATTTTCTGATAAATAT-----T-----CGAGTT--TA--CTCTCGGCTGCT-GTCGG-G-CTGTT--GGAAATGTAAC------GATCACAT-TTA--CCACTGTAACAAATATAGAGACGCCAGGTAAATGTTTTCAACTTTCCATATGACTAAGAAAACAGTATCTTATATTACAATATATGTATGTTTTCCAC-CAAACTTATCTCACCCATGAAA-TATTTCTATTGTTCCTTCCATAAATTCACGGTAAATAT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATC-CATAAAACAA------CT------ATAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGTGTAAGTATTTCCATTCT-ATTCGCAT
gi|2 : GAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG--TTTA-TTTTATTGAA--AA---CAGTATTCAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--ATTTAATATATATG----TTATTATGAGTTTCTC--CTCTTTAC--CT-GT-TG-G-ACTT------AACTTAAT------GGATATAT-TTT--CTACTGTATCACATATactcaatttagt
gi|3 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcaaattgtagttgggaaatcgcttcgccatttgtatgttaatctgcgctttccaatgaccttgtcctcactttaacatcttttggtatgttaaaatttcaatttaacattgcagtttaagaccacaaaataacatcattttatgcacatcaccatggtccgtagcttaaaaatcaaagtcacacaattaccaaaataaatttattgcatatgtaattcatcaaaatcaacaagtaatcaatatttgaaatttttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgagtgaattgtattcactttgcagacaaatatatagcttcgagaggtaagacttgttttgtatcaacatgggtttcacatataattaatggtgtagtaaacatgccgtacgcctttggatgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcatggcggttcaagaataatcgacattacatttaaataaatgatagcaactgatcatgtatttttttattgtgcaataatgatcagttttttccggtgttaaaatttgtgttgcttgaatatatgtgaactttaagacaccgcctcaaaatatttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgatatttattcaagttgatatacgctcatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataagtcaatagcaattttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctaGAAATAAAA-------AAAC-ATTTAAAGTGCG-GTATTGTTT--A-TTTTGTTGAAATCA---GT--ATACAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG----TTGTTATGAGTTTCTC--CTCTTTAC--CT-GT-TG-G-ACTT------AATG----------GAT-ATAT-TTT--CTACTGTTACGCATATgca
gi|13 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcccatataataaatggtgttgtaaacatcacgtacgtctttgagtgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctaGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG--TTTA-TTTTATTGAAATCA---GT--ATAAAAATCTCGCTTACGAGTCACGGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCAT--TTTAATATATATGTTATTA----TGAGTT--TCTCCTCTTTACT-----T-G-------TT--GGACAT--AACTTATTGGAT-ATAT-TTT--CTACTGTAACACATATg
gi|15 : gattaagtaaaccgtagtcaaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaaaaaaatagttgtattactaactgatgaattttcatttgtctaGAAATAAAACAGTCGAAAACCA----AAGTCCG-GTATTG--------TTTATTTTATTGA----A--ATAAATAGTCTTTAgtag
gi|9 : tatttactggtttctactctacaaaataaattagttgtactactaattcatgatatttgtttttcatttgcctaAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCG-GCATTT--A--AATTCAAT-GAACTGA---CC--ATGCATGGCCTTCATACGAGACTCCGTCGCAGTTGCAGTTCGCTCAATAAAACTCATCTTCTGATAAATGT-----T-----CGAATC--T---CTCTCGGCTGCT-ATCGG-G-CATTT--GGAAATGTAAC------GATCACAT-TTA--CCACTGTAACAAATAAAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAACTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTCTCTTATAACACAATCGCTATATGTTTTCCTCT-AAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATATTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTTAAAAAAAATTGTCAATATCACATATC-CATATAACAA------CA------ACAAACATGCAATATATATT--TGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCTATTC-AGTTAAAACGAAAGGTACGTTTTATTTCGAAAACATTCTTTCCATTCTTTTattctctattaataatgcattttgatatacatattgttcaattagtt
gi|12 : AAACAGTCGAAAACTATTTAAAGTG-A-TTATTG----------TATTGAAATGA---AT--ATACAGATCTCACATACGAGACACCATGCCAACTATATTTCGTTCAATCATATTCA-GTTTTAATAAATAT-----T-----TGAGTT--TC--TTCTCTTTTCCT-TT-TG-G-ACTTC----AAAT-TAAT------GAATATAT-TTT--CTACTGTAACAAATATcgcatactcaattttgtttaattcagtg
gi|14 : attgaagtagtaaacatgctgtacatattttaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagAACAGACGGAAACAATTTTAAGTGTT-GCATTA--A--AATGTTATTAAAATGA---------GCATAgt
gi|17 : ttttttgatgCATGCGAGAC----TAGCAGTTGTAGTTCTCTCCATCAAAT--ATTTTTTTAAAAATAGGA---T-----TGAGTC--TA--TTCT-G--TGCTCGT-GTTG-CAATAAAGAAAACATA--------GATCGCTTCTTATTCCACTGTACTAAATATAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgtgtagagatgcaggtcaaatttttaaacctttccatatgacgaagaaaacgg
gi|6 : ctacTATCACATATAATAA------ATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTG---------CTATTTTGAG---CATTGGAA
gi|5 : ttggttttaacttcggaagaatatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgctttcataagaccttgtcctgtctttagcagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaccacaaaataacaacattttatgcacatcaacattgtccgtagtttaattttcaaagtcacacaacttccaaaagaaatatattgcatatgtaattcgtcaaaatcaacatataatcaatctttgaaattgtttaataactgtgtttttttggacacgatacctttttatgattgaattggattgtctttacttttcagaaaaagtggaagctcagaaaggtaagacttgttttgtataaacatgggC-CATATAATAA------ATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGC---TA---TTATtgtatagacaccatggcatggcgggtcaggaataatcgacaatacatttaattttataaatgtaatagcgactgatcaggttagttttgggtttttaataatggagcaaagttcagttcagttttttttctggtgttagaatttgcgttgcttgaatatttgtgaacttttagacaccgcctaaaatgttttcgatgttgaaaagtagggatttattgatactgagatcatcgtaac
gi|3 : ttacttgaatgcaaagacatctcagaacatattggtctatcaaatcggagttgggaaatagaatcgccatttgtaagttaatctgcgttttcatatgaccttgtcatgtctttaacagcaatttgcatattacaatttcaatattacattgcagtttattaccacaaaataacaaaattttatgcacatcaccattgtccgtagattcaaaatcaaagtcacacaactaccaaaataaatattttgcatatttaatttgtcaaaatcaactagtaatcaatctttgaaattgtttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgattgaattgtgtttactttgcagtaaagatgaaagctgcgcaaggtaagacttgtgtattactatgggattcC-CATATAATAAATGGTGTT------GTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGC---TA---TTATgagcattgaaatgtaaagacaccatgtcatggcggctaaagaataatcgacattatatttaatttaatgatagcaactgaatatgtaaattttgtttgtgcaataatgatctttttttttcggtgttagaatttgtatttgcttgaatatattaagacaccgccacaaaatgtttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagtacatcgtaatacttaacttatgcagataaaatgcgataatctgagttaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgacattaattcaagttgatatacgtttatattgggttaaagaaatgtacatatttacacttttataatgcaagagcaattttga
gi|4 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|6 : aagataaataaaactatgatcaaacttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcgaattgtagttggaaaatcgcattgccatttgtacgttaatccgcacattcctatgatcttgttctgtctttaacagcaatttgcatgttacaatttcaatattacctttgtagtttattaccacaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatagcttaaagtttcaagtcacacagctaccaatagaaatatattgcatatgtatttcgtcaaaatcaacatgtaatcaatccttggaattgtttaataactgtgtttcattggacacgataccgttttacgagtgaattgtatttactttgcaaaatgtgaaaagttcggaaaggtaagatttgttttgtattaacatgggtataacgtgtaattaattgtgtagtTTGGTTTTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAAATC-GAATCGCCATTTGTATGTTA-ATCTGCGCTT-TCATAAGACCTTG-----TCCTGTCTTTAGCAGCTATTTGCATGTTACAATTTCAATATAACCTT-GCAGT-TT--AT-TACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCAACATTGTCCGTAGTTTAATTTTCAAAGTCACACAACTTCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATATAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCTTTTTATGATTGAATTGGATTGTCTTTACTTTTCAGAAAAAG---T-G--GAAG------CTCAGAAAGGTAAGACTTGTTTTGTATAAACATGGGTATCACATATAATAAATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTTTGAGCATTGGAATGTATAGACACCATGGCAT---GGCGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTTTATAAATGTAATAGCGACTGATCAGGTT-AGTTTTGGG-TTTTTAATAATGGAG-CA-----AAGTTCAGTTCAGTTTTTTTT--CTGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATTTGTGAACTTTTAGACACCGCC-T-AAAATGTTTTCGAT-GTTGAAAAGTAGGGATTTATTGATACTGAGATCATCGTcgaatatgagtattgaaatgtataaacaccatgtcttttgggtcaggaataatcgacaatacatttaatttaataatagcaactgataaggtaaattttgttttttttcatgatgtagctaatttcaggatcagtttttttcccggtgttagaatttgcgttgcttgaatatatgtgaactttaagacactgccttaaaatgtttttgatgttgagaagtaggtatctatcaatactgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcaataatctgagtgaattatgataccgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttata
gi|11 : GTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCAAATTGGTCTATCGAATTGAAGTT-AAAAATTCGCATCGCCATTAGTATGTTC-AACAGCAATT-ACCTATGAAGTTG-----TCCAGTCTTTAACAACAATTTGCATGTTGCAAATTTAATGTAACCTT-GCAGT-TT--AT-TACCACAAATAAACAACATTTAATGCACATaac
gi|5 : taTTACTTGAATGCAAAGAC-ATCTCAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTGGGAAATA-GAATCGCCATTTGTAAGTTA-ATCTGCGTTT-TCATATGACCTTG-----TCATGTCTTTAACAGCAATTTGCATATTACAATTTCAATATTACATT-GCAGT-TT--AT-TACCACAAAATAACAAAATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGATTCAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATTTTGCATATTTAATTTGTCAAAATCAACTAGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTAC-----GATTGAATTGTGTTTACTTTGCAGTAAAGA---T-G--AAAG------CTGCGCAAGGTAAGACTTG---TGTATTACTATGGGATTCCCATATAATAAATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTAAAGACACCATGTCAT---GGCGGCTAAAGAATAATCGACATTATATTTAA----TTTAATG--ATAGCAACTGAATATGTA-A---------ATTTTGTTTGTGCAA-TA-----ATGATCTT-------TTTTTT--TCGGTGTTAGAATTTGTATTTGCTTGAATATA--------TTAAGACACCGCC-ACAAAATGTTTTTGAT-GTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGTACATCGTAATACTTAACT---TATGCAGATAAAATGCGATAATCTGAGTTAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTAATTCAAGTTGATATACGTTTATATTGGGTTAAAGAAATGTACATATTTACACTTTTATAATGCAAGAGCAATTgatgacatttgcaatctgtttatttataggttttaaaaaggaatgttattgttgatgtttaatgtaaaatgtatatgtgtctcagtatttcagaatcttacatgtataatgacacaagcatagtctgaaaaataatttgcattt
gi|2 : CACATTGGTCTATCAAATTGTAGTTGGGAAATC-GCTTCGCCATTTGTATGTTA-ATCTGCGCTT-TCCAATGACCTTG-----TCCTCACTTTAACATCTTTTGGTATGTTAAAATTTCAATTTAACATT-GCAGT-TT--AA-GACCACAAAATAACATCATTTTATGCACATCACCATGGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAATTACCAAAATAAATTTATTGCATATGTAATTCATCAAAATCAACAAGTAATCAATATTTGAAATT-TTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTAC-----GAGTGAATTGTATTCACTTTGCAGACAAAT---A-T--ATAG------CTTCGAGAGGTAAGACTTGTTTTGTATCAACATGGGTTTCACATATAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGCCTTTGGATGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAT---GGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAA----ATAAATG--ATAGCAACTGATCATGTA-T---------TTTTTTATTGTGCAA-TA-----ATGATCAG-------TTTTTT--CCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATATTTTTGAT-GTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTCATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAAGTCAATAGCAATTttga
gi|3 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAAATC-GAATCGCCATTTGTATGTTA-ATCTGCGTTT-TGATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCTATTTGCATGTTACAATTTCAATATAACCTT-GCAGT-TT--AT-TAACTCAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATGGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTCCCAAAAGAAATATGTTGCATATTGAATTCGTCAAAAAAAACATATAGTCAATCTTTGAACTTA-TTA--AACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCGTTTAAC-----GATTGAATTGTGTTTACTTTGCAGAAAAAA---T-G--AAAG------CTGCGGAAGGTAAGACTTGTTTCGTATTAACATTGGTTTCCCATATAATAAATGGTGTTGTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAA---TGCAGTTAAAGAATAATCGATATTACATTTAA----TTTAATG--ATAGCAACTGATCATGTACA---------TTTTGTTTTTTTCAA-TC-----AAGATCAGTT-----TTTTTT--CCGGTGTTAGAATTTGTC-TTGTTTGAATATATGTGATCTTTTACACACCGCCGT--AAATGTTTT--AATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGCAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAA-TATGACAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATTttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctagaaataaaacaatcgaaaaccattaaaaatgcggcattgtttattttattgaaaacagtattcaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcaatttaatatatatgttattatgagtttctcctctttacctgttggacttaacttaatggatatattttctactgtatcacatatgca
gi|4 : taattggaagactatttcacatCACATTGGTCTATCGAATTGTAGTTGGAAAATC-GCATTGCCATTTGTACGTTA-ATCCGCACAT-TCCTATGATCTTG-----TTCTGTCTTTAACAGCAATTTGCATGTTACAATTTCAATATTACCTTTGTAGT-TT--AT-TACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATAGCTTAAAGTTTCAAGTCACACAGCTACCAATAGAAATATATTGCATATGTATTTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCCTTGGAATTGTTTAATAACTGTGTTTCATTGGACACGATACCGTTTTAC-----GAGTGAATTGTATTTACTTTGC----AAAA---TGTGAAAAG------TTCGGAAAGGTAAGATTTGTTTTGTATTAACATGGGTATAACGTGTAATTAATTGTGTAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGCGAATATGAGTATTGAAATGTATAAACACCATGTCTTTTGGG----TCAGGAATAATCGACAATACATTTAA----TTTAATA--ATAGCAACTGATAAGGTA-AATTTTGTTTTTTTTCATGATGTAGCTAATTTCAGGATCAG-------TTTTTTTCCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACTGCC-TTAAAATGTTTTTGAT-GTTGAGAAGTAGGTATCTATCAATACTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCAATAATCTGAGTGAATTATGATACCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|7 : aagataaataaaactatgatcaaacttagttctaacttcggaggaatatttcacatGTTGGAAAATC-GCATTGCCATTTGTAAGTTA-ATCCGTACTT-TCCTTTGACTGTG-----TCGTGTCTTTTACAGCAGTT-GCATATTGCAATTTCAATATAACTTC-ACAGT-TT--GT-TACAACAAAATATCAACATGTTATGCACAATAACATTATCCGTAGCTTAAAGTTCAATGTCACACAACTCCAAAAAGAAATATATTGTAAAAGCGTTTTGCCAAAG-CAACATATATTTAGTA-TTGAAATTGTTTTATATATAT-TTTTATATGACACGGCACTGTTTTAC-----GATTAAATTGTATTTACTTTTCAGATAAGAGGGT-G--AAAAAGTTTTCT------GGTAAGACTTGTTTTGTATTTACA
gi|19 : ttgTTGTCATTTGCATGTGCATTTATGATATTACATTGGTACATCCTATCTTTAACGGTAACATGCATATTGCAAaaaacattatataatgaattgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagattggtgtactaaacacatattttagtgcatcaagcatgtgtcagttatatatacagtacgctattgtggatctggaataaacgacaatacattgaataaaataataacaac
gi|16 : ttggttggacaatcacaTG-----TCCTATCTTCATTAG------GCATATTGCAAGT---GTACACTATT--CACTATTGAATGTAGCATAATGTA-TAACATTTTATGCACAATGTCAAGGTCTGTTGTTTAAAAGTCACGGTCgt
gi|21 : tggtggtggaaatgtcacattatcattttttttttcatatatacgtccagcttattgCGTTTTAC-----GATTTAATTGTATTTACTTTGCACAAGAGC---T-C--AAAG------CTTAGAATGGTAAGATTTGTTTTggacttctaact
gi|10 : atcgcatatgtatttTAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGT
gi|9 : gtgaaataaaacagacggaaaccatttgaagggcgtgtttaaaattttattgaactgaatttattgatatccttcaaacgagaccccgtgtcatttgtagttcgctaaattaaactcattttctgataaatattcgagtttactctcggctgctgtcgggctgttggaaatgtaacgatcacatttaccactgtaacaaatatagagacgccaggtaaatgttttcaactttccatatgactaagaaaacagtatcttatattacaatatatgtatgttttccaccaaacttatctcacccatgaaatatttctattgttccttccataaattcacggtaaatataaagaaattgtcaatatcacatatccataaaacaactaAAACATGCAATATATATTTG--TGCTTCCAGCATGTGTTAgtaagtatttccattctattcgcatactcaatttagt
gi|8 : aaataaaacagacggaaaccatttgaagggcggcatttaaattcaatgaactgaccatgcatggccttcatacgagactccgtcgcagttgcagttcgctcaataaaactcatcttctgataaatgttcgaatctctctcggctgctatcgggcatttggaaatgtaacgatcacatttaccactgtaacaaataaagagacgcaaggtaaatgttttcaactttccatttgactaaaaatacagtctcttataacacaatcgctatatgttttcctctaaaattatctcaaccatgcaattatttctaatattccatccgcaaattcaaggttaatttaaaaaaaattgtcaatatcacatatccatataacaacaacAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGTTACCATcctattcagttaaaacgaaaggtacgttttatttcgaaaacattctttccattcttttcgcatactcaattttgtttaattcagtg
gi|20 : gtgaaataaaacagacggaaaccatttaagggcggtattgaaattctgttgaactgaccatgcatatccttcatacaagactccgtcccagttgtagctcctcaataaaatcaacttttgacaaatattcgagttgactctcagttgctgtggggcgtttgaaaatgtaacgatcacatttaccgctgtaacaaatatagagacgcaaggtaaatgttttcaactttccatttgactaaaaatacagtatcttataatacaatcactgtatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactacTTTCAACATGCTTTAACATTTACCAGAGTTGTTTAACGTCTGTCTTGGATTAAAGAAATGTATCGAT------TTTTATAATACAATAGCAATtttagttacaacgaaaggcacgttttatttcgaaaacattatttccattcgtttaattcagtgctttacgttgatactaaatcgtt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAACTGGTGTATTAAGTCTAGCCCTATATTATGAGTGGTAGTGGCAATATCACATTGACATTTTGTACATCCATCTATACTGTCCCATTGCTGTGTCCTCCAACATGCATATTGCAATTTGAATATGACT
Alignments
lowQualScore : 22222 11 44444444 11 11111111111111 111111 22 1 11 111 111 222 11111 111111 11111 2222222222 2222 111111 111 111
lowQualScore : 2 3 4 0 22222 1 7777 2 1 4 4 0 1 2 1 88 1 22222222 11 22 99999 0 77777777777777 2 111111 4 8888 1 0 55 8 1 6 0 2 1 33 1 1 1 5 1 1 1 1 1 0 4 2 66 33 777 777 1 1 1 1 1 4 000 5 0 1 4 4 1 4 4 1 99999 2 3 3 0 4 55 2 4 1 1 0 0 1 22222 5 2 888 999 5 22 666666 0 1 1 4 1 1 0 3 2 44444 77 6 6 2222222222 1111 999999 6 99 1 111111 0 6 111 444 0 1
lowQualScore : . . . . ..... . .... . . . . . . . . .. . ........ .. .. ..... . .............. . ...... . .... . . .. . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . .. .. ... ... . . . . . . ... . . . . . . . . . ..... . . . . . .. . . . . . . . ..... . . ... ... . .. ...... . . . . . . . . . ..... .. . . .......... .... ...... . .. . ...... . . ... ... . .
lowQualScore : 4 1 0 5 99999 0 5555 7 0 1 5 2 0 7 0 55 6 11111111 00 00 00000 2 00000000000000 7 555555 3 5555 0 6 55 0 4 2 2 5 0 22 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 8 2 22 22 555 555 0 0 0 0 0 0 000 7 1 4 0 0 0 6 0 0 11111 5 6 6 2 0 55 9 4 0 0 7 7 7 55555 0 2 888 444 0 00 444444 7 9 3 3 0 7 7 7 1 33333 99 7 7 8888888888 5555 888888 7 22 0 888888 7 7 333 000 8 0
consensus : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTTT--GGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCNNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTNACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TG--AAA-GCTNCGAAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAATTN----AATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Reference ( family-3248 ) : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NA-ATTTTATTGAANTGANN--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTANTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTGATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCGGCTGCTGT-GGG-CNTTT--GGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCNCTCAAANTTATCTCANCCATGNAATTATTTCTANTGTTCCNTCCGCAAATTCANGGTNAATNT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAATAACTATAAACATGCCGTACATCTTTGNGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACANCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTNTTTCCATTCNTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTNGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTANGTTAATCCGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TGCAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TG--AAA-GCTNNGAAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATAAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCANCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAATTT----AATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTN---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|1 : GTGAAATAAAACAGACAGAAACCATTTTAAGGGCG-GTATTG-GA-GTTCTATTGAACTGACA--ATGCATATCCTTCATACGAGACACCATCCCAGTTGTAGCTCGCTCAATAAAACTCATCTTTTAACAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGACTGCTGT-GGG-CGTTT--GGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTTCCTTTGACTAAAAAGACAGTATCTTGTAATAAAATCGCTATATGTTTTCCTCGAAAAATTATCTCAATCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCTATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACATCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATATTAATTCGTTTTTACTTGAATGCAAAGAA-ATCATAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTCGGAA-ATTGAATAGCAATTT-GTAAATTAATCTGCATTT-TCATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--AACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCTCATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATATTGCATATTTAATTCGTCAAAATCAACATGCAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACAATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAAA---TT--AAA-GCTGCGATAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATGTAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTATGTCTTTGAGTGCTTCCACTATGTACTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGTTTCAAAAATAATCGACATTACATTTAAATA----AATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A--------TTTTTT---AT--TAT-GC-AAT--AAAG---A--TCAG--TTTTTTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTCGAATAGATGTGCAGTTTAAAACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAAGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTCATACTTAACTTAATATGCAGTTAAAATGTTATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|10 : tgGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCGTGT-TTA-AA-ATTTTATTGAACTGAATTTATTGATATCCTTCAAACGAGACCCCGTGTCATTTGTAGTTCGCTAAATTAAACTCATTTTCTGATAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGGCTGCTGTCGGG-CTGTT--GGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCCAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATATGACTAAGAAAACAGTATCTTATATTACAATATATGTATGTTTTCCAC-CAAACTTATCTCACCCATGAAA-TATTTCTATTGTTCCTTCCATAAATTCACGGTAAATAT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATAAAACAACTATAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGTGTAAGTATTTCCATTCTATTCGCA
gi|11 : TAGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCAAATTGGTCTATCGAATTGAAGTTAAAAA-TTCGCATCGCCATTA-GTATGTTCAACAGCAATT-ACCTATGAAGTTG-----TCCAGTCTTTAACAACAAT-TTGCATGT-TGCAAA-TTTAATGT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAATAAACAACATTTAATGCACATtactcaatttagt
gi|12 : GTAGTAAACATGCTGTACATATTTgatgacatttgcaatctgtttatttataggttttaaaaaggaatgttattgttgatgtttaatgtaaaatgtatatgtgtctcagtatttcagaatcttacatgtataatgacacaagcatagtctgaaaaataatttgcattt
gi|12 : attgaaAAACAGTCGAAAACTATTTAAAGTG-----ATT-----ATTGTATTGAAATGAAT--ATACAGATCTCACATACGAGACACCATGCCAACTATATTTCGTTCAATCATATTCA-GTTTTAATAAATAT--T-----TGAGTT--TCTTCTCTTTTCCTTT-TGG-ACTTC----AAAT-TAAT------GAATATATT----TTCTACTGTAACAAA--TATtaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagaaacagtcgaaaactatttaaagtgattattgtattgaaatgaatatacagatctcacatacgagacaccatgccaactatatttcgttcaatcatattcagttttaataaatatttgagtttcttctcttttccttttggacttcaaattaatgaatatattttctactgtaacaaatatgt
gi|13 : attgaagtagtaaacatgctgtacatattttaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAATCAGT--ATAAAAATCTCGCTTACGAGTCACGGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTATTATGAGTT--TCTCCTC-TTTACT-T-G------TT--GGACA--TAACTTATTGGAT-ATATT----TTCTACTGTAACACA--TATgt
gi|14 : gattaagtaaaccgtagtcaaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaaaaaaatagttgtattactaactgatgaattttcatttgtctaAACAGACGGAAACAATTTTAAGTGTT-GCATTA-AA-ATGTTATTAAAATGAGC--ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-----NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNNNN--NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNN----NNNNNNNNNAATACATGTGTAGAGATGCAGGTCAAAT-TTTTAAACCTTTCCATATGACGAAGAAAACGGgtag
gi|15 : ttttttgatgGAAATAAAACAGTCGAAAACC----AAAGTCCG-GTATTGTTT-ATTTTATTGAAATAAAT--A
gi|16 : tatttactggtttctactctacaaaataaattagttgtactactaattcatgatatttgtttttcatttgcctaTG-----TCCTATCTTCATTAGGCATATTGCAAGTGTACACTATTCACTATTGAA---T-GTAG--------CATAATGTA-TAACATTTTATGCACAATGTCAAGGTCTGTTGTTTAAAAGTCACGGTCG---GACTTCTAAgtctttaattctctattaataatgcattttgatatacatattgttcaattagtt
gi|17 : tggtggtggaaatgtcacattatcattttttttttcatatatacgtccagcttattgCATGCGAGAC----TAGCAGTTGTAGTTCTCTCCATCAAAT--ATTTTTTTAAAAATAGGAT-----TGAGTC--TATTCTGTGCTCGTGT-TG--CAATAAAGAAAACATA--------GATCGC-TTCTTATTCCACTGTACTAAA--TATAGAct
gi|18 : ctacTGGCAATATCACATTGACATTTTGTACATCCATCTATACTG-TCCCATTGCTGTG-----TCCT----CCAACA-------TGCATAT-TGCAAT-TTGAATAT--GAC
gi|19 : aaactggtgtattaagtctagccctatattatgagtggtagGTTGGACA-ATCACATTGTCATTT-GCATGT------GCATTTATGATATTACATTGGTACATCCTATCTTTAACGGTAAC-ATGCATAT-TGCAAt
gi|2 : ttgTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGTAGTTGGGAA-ATCGCTTCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCCAATGACCTTG-----TCCTCACTTTAACATCTTT-TGGTATGT-TAAAAT-TTCAATTT--AACATT-GCAGTTTAAGACCACAAAATAACATCATTTTATGCACATCACCATGGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAATTACCAAAATAAATTTATTGCATATGTAATTCATCAAAATCAACAAGTAATCAATATTTGAAATT-TTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTCACTTTGCAGACAAATA---T---ATA-GCTTCGAGAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATATAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGCCTTTGGATGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAAATA----AATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A------T---TTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AATG---A--TCAGTTTT--TTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATATTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTCATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAAGTCAATAGCAATTgt
gi|2 : tGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAAACAGT--ATTCAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--ATTTAATATATATG-TTATTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AACTTAAT------GGATATATT----TTCTACTGTATCACA--TATttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctagaaataaaacaatcgaaaaccattaaaaatgcggcattgtttattttattgaaaacagtattcaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcaatttaatatatatgttattatgagtttctcctctttacctgttggacttaacttaatggatatattttctactgtatcacatatgca
gi|20 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcaaattgtagttgggaaatcgcttcgccatttgtatgttaatctgcgctttccaatgaccttgtcctcactttaacatcttttggtatgttaaaatttcaatttaacattgcagtttaagaccacaaaataacatcattttatgcacatcaccatggtccgtagcttaaaaatcaaagtcacacaattaccaaaataaatttattgcatatgtaattcatcaaaatcaacaagtaatcaatatttgaaatttttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgagtgaattgtattcactttgcagacaaatatatagcttcgagaggtaagacttgttttgtatcaacatgggtttcacatataattaatggtgtagtaaacatgccgtacgcctttggatgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcatggcggttcaagaataatcgacattacatttaaataaatgatagcaactgatcatgtatttttttattgtgcaataatgatcagttttttccggtgttaaaatttgtgttgcttgaatatatgtgaactttaagacaccgcctcaaaatatttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgatatttattcaagttgatatacgctcatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataagtcaatagcaattttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctaTTTCAACATGCTTTAACATTTACCAGAGTTGTTTAACGTCTGTCTTGGATTAAAGAAATGTATCGAT------TTTTATAATACAATAGCAATgca
gi|21 : CGTTTTACGATTTA-----ATTGTATTTACTTTGCACA-AGAGC---TC--AAA-GCTTAGAATGGTAAGATTTGTTTT
gi|3 : atcgcatatgtatttT---TG-GAAGACTATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGTTT-TGATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTAACTCAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATGGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTCCCAAAAGAAATATGTTGCATATTGAATTCGTCAAAAAAAACATATAGTCAATCTTTGAACTTA-TTA--AACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCGTTTAACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGA-AAAAA---TG--AAA-GCTGCGGAAGGTAAGACTTGTTTCGTATT------AACATTGGTTTCCCATATAATAAATGGTGTTGTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAATGCAGTTAAAGAATAATCGATATTACATTTAATTT----AATG--ATAGCAACTGATCATG-T-ACA-TTTT--GTTTTT-----T--T----C-AAT--CAAG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGTC-TTGTTTGAATATATGTGATCTTTTACACACCGCCGT--AAATG-TTTTAATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGCAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAA-TATGACAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|3 : taaGAAATAAAA-------AAAC-ATTTAAAGTGCG-GTATTG-TTTATTTTGTTGAAATCAGT--ATACAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTGTTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AATG----------GAT-ATATT----TTCTACTGTTACGCA--TATttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|4 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcccatataataaatggtgttgtaaacatcacgtacgtctttgagtgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctaTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGTAGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTACGTTAATCCGCACAT-TCCTATGATCTTG-----TTCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--TACCTTTGTAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATAGCTTAAAGTTTCAAGTCACACAGCTACCAATAGAAATATATTGCATATGTATTTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCCTTGGAATTGTTTAATAACTGTGTTTCATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTTACTTTGCA---AAATG---TG--AAAAGTTCGGAAAGGTAAGATTTGTTTTGTATT------AACATGGGTATAACGTGTAATTAATTGTGTAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGCGAATATGAGTATTGAAATGTATAAACACCATGTC-TTTTGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTT----AATA--ATAGCAACTGATAAGG-T-A-AATTTT--GTTTTTTTTCATGATGTAGCTAATTTCAGG---A--TCAGTTTTTTTCCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACTGCC-TTAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGGTATCTATCAATACTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCAATAATCTGAGTGAATTATGATACCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAg
gi|5 : aagataaataaaactatgatcaaactTTACTTGAATG-CAAAGACATCTCAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTGGGAA-ATAGAATCGCCATTT-GTAAGTTAATCTGCGTTT-TCATATGACCTTG-----TCATGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--TACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAAAATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGATTCAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATTTTGCATATTTAATTTGTCAAAATCAACTAGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGT-AAAGA---TG--AAA-GCTGCGCAAGGTAAGACTTG---TGTATT------ACTATGGGATTCCCATATAATAAATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTAAAGACACCATGTCATGGCGGCTAAAGAATAATCGACATTATATTTAATTT----AATG--ATAGCAACTGAATATG-TAA-A-TTTT--GT---------T--TGT-GC-AAT--AATG---A--TC--TTTTTTTTTCGGTGTTAGAATTTGTATTTGCTTGAATATA--------TTAAGACACCGCC-ACAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGTACATCGTAATACTTAACT---TATGCAGATAAAATGCGATAATCTGAGTTAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTAATTCAAGTTGATATACGTTTATATTGGGTTAAAGAAATGTACATATTTACACTTTTATAATGCAAGAGCAATT
gi|6 : TGGTTTTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCATAAGACCTTG-----TCCTGTCTTTAGCAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCAACATTGTCCGTAGTTTAATTTTCAAAGTCACACAACTTCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATATAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCTTTTTATGATTGAATTGGATTGTCTTTACTTTTCAGA-AAAAG---TG--GAA-GCTCAGAAAGGTAAGACTTGTTTTGTATA------AACATGGGTATCACATATAATAAATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTTTGAGCATTGGAATGTATAGACACCATGGCATGGCGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTTTATAAATGTAATAGCGACTGATCAGGTT-A-G-TTTTGGGTTTTTA---AT--AAT-GG-AGC--AAAGTTCAGTTCAGTTTTTTTTCTGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATTTGTGAACTTTTAGACACCGCC-T-AAAATGTTTTCGATGTTGAAAAGTAGGGATTTATTGATACTGAGATCATCGTAAttga
gi|7 : tGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTAAGTTAATCCGTACTT-TCCTTTGACTGTG-----TCGTGTCTTTTACAGCAGT-T-GCATAT-TGCAAT-TTCAATAT--AACTTC-ACAGTTTGTTACAACAAAATATCAACATGTTATGCACAATAACATTATCCGTAGCTTAAAGTTCAATGTCACACAACTCCAAAAAGAAATATATTGTAAAAGCGTTTTGCCAAAG-CAACATATATTTAGTATT-GAAATTGTTTTATATATAT-TTTTATATGACACGGCACTGTTTTACGATTAA-----ATTGTATTTACTTTTCAGA-TAAGAGGGTGAAAAA-GTTTT--CTGGTAAGACTTGTTTTGTATTTACAAAAACAT--------TATATAATGAATc
gi|7 : ttgTGGTGTACTAAACA---CATA----TTTTAGTGCATCAAGCATGTGTCAGT-------------TATATATACAGTACGCTATTGTGGATCTGGAATAAACGACAATACATTGAATAA----AATA--ATAACAACtgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagattggtgtactaaacacatattttagtgcatcaagcatgtgtcagttatatatacagtacgctattgtggatctggaataaacgacaatacattgaataaaataataacaac
gi|8 : ttggttggaaaatcgcattgccatttgtaagttaatccgtactttcctttgactgtgtcgtgtcttttacagcagttgcatattgcaatttcaatataacttcacagtttgttacaacaaaatatcaacatgttatgcacaataacattatccgtagcttaaagttcaatgtcacacaactccaaaaagaaatatattgtaaaagcgttttgccaaagcaacatatatttagtattgaaattgttttatatatatttttatatgacacggcactgttttacgattaaattgtatttacttttcagataagagggtgaaaaagttttctggtaagacttgttttgtatttacaaaaacattatataatgaattgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagatGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTAAGG-GCG-GTATTG-AA-ATTCTGTTGAACTGACC--ATGCATATCCTTCATACAAGACTCCGTCCCAGTTGTAGCTC-CTCAAT-AAAATCAACTTTTGACAAATAT--T-----CGAGTT--GACTCTCAGTTGCTGT-GGGGCGTTT--GAAAATGTAAC------GATCACATT----TACCGCTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCACTGTATGTTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTACAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAAATCGTT
gi|9 : AAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCG-GCATTT-AA-ATTCAAT-GAACTGACC--ATGCATGGCCTTCATACGAGACTCCGTCGCAGTTGCAGTTCGCTCAATAAAACTCATCTTCTGATAAATGT--T-----CGAATC--TC-TCTCGGCTGCTATCGGG-CATTT--GGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TAAAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTCTCTTATAACACAATCGCTATATGTTTTCCTCT-AAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATATTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTTAAAAAAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACAACAAACATGCAATATATATTT--GTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCTATTCAGTTAAAACGAAAGGTACGTTTTATTTCGAAAACATTCTTTCCATTCTTTT
Alignments
lowQualScore : 22222 11 44444444 11 11111111111111 111111 22 1 111 111 111 11111 111111 1111 2222222222 11111111111 111111 111 111
lowQualScore : 2 3 4 0 11111 0 5555 2 1 4 4 0 1 2 1 88 22222222 11 22 44444 0 77777777777777 2 111111 4 8888 1 0 55 8 1 1 0 2 11 5 0 0 55 777 777 1 1 1 111 6 0 1 1 4 4 5 4 1 99999 2 3 3 4 55 2 4 1 1 0 0 1 22222 5 2 888 2 888 1 77 666666 0 1 1 1 1 0 1 1 2222 1 77 6 6 2222222222 99999999999 6 99 1 111111 0 6 111 444 0 1
lowQualScore : . . . . ..... . .... . . . . . . . . .. ........ .. .. ..... . .............. . ...... . .... . . .. . . . . . .. . . . .. ... ... . . . ... . . . . . . . . . ..... . . . . .. . . . . . . . ..... . . ... . ... . .. ...... . . . . . . . . .... . .. . . .......... ........... . .. . ...... . . ... ... . .
lowQualScore : 4 1 0 5 55555 6 9999 7 0 1 5 2 1 7 0 55 11111111 00 00 88888 2 00000000000000 7 555555 3 5555 0 6 55 0 4 0 2 5 55 8 0 2 88 555 555 0 5 0 777 7 1 4 4 0 0 5 0 0 11111 5 6 6 0 55 9 4 0 0 7 7 7 55555 0 2 888 5 888 0 00 444444 7 9 3 0 7 7 0 0 1111 0 99 7 7 8888888888 77777777777 7 22 0 888888 7 7 333 000 8 0
consensus : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Reference ( family-3248 ) : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCNNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTNACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|1 : GTGAAATAAAACAGACAGAAACCATTTTAAGGGCG-GTATTG-GA-GTTCTATTGAACTGACA--ATGCATATCCTTCATACGAGACACCATCCCAGTTGTAGCTCGCTCAATAAAACTCATCTTTTAACAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGACTGCTGT-GGG-CGTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTTCCTTTGACTAAAAAGACAGTATCTTGTAATAAAATCGCTATATGTTTTCCTCGAAAAATTATCTCAATCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCTATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACATCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATATTAATTCGTTTTTACTTGAATGCAAAGAA-ATCATAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTCGGAA-ATTGAATAGCAATTT-GTAAATTAATCTGCATTT-TCATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--AACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCTCATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATATTGCATATTTAATTCGTCAAAATCAACATGCAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACAATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAAA---TTAAAG---CTGCG-ATAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATGTAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTATGTCTTTGAGTGCTTCCACTATGTACTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGTTTCAAAAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A--------TTTTTT---AT--TAT-GC-AAT--AAAG---A--TCAG--TTTTTTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTCGAATAGATGTGCAGTTTAAAACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAAGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTCATACTTAACTTAATATGCAGTTAAAATGTTATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|10 : tgGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCGTGT-TTA-AA-ATTTTATTGAACTGAATTTATTGATATCCTTCAAACGAGACCCCGTGTCATTTGTAGTTCGCTAAATTAAACTCATTTTCTGATAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGGCTGCTGTCGGG-CTGT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCCAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATATGACTAAGAAAACAGTATCTTATATTACAATATATGTATGTTTTCCAC-CAAACTTATCTCACCCATGAAA-TATTTCTATTGTTCCTTCCATAAATTCACGGTAAATAT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATAAAACAACTATAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGTGTAAGTATTTCCATTCTATTCGCA
gi|11 : TAGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCAAATTGGTCTATCGAATTGAAGTTAAAAA-TTCGCATCGCCATTA-GTATGTTCAACAGCAATT-ACCTATGAAGTTG-----TCCAGTCTTTAACAACAAT-TTGCATGT-TGCAAA-TTTAATGT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAATAAACAACATTTAATGCACATtactcaatttagt
gi|12 : GTAGTAAACATGCTGTACATATTTgatgacatttgcaatctgtttatttataggttttaaaaaggaatgttattgttgatgtttaatgtaaaatgtatatgtgtctcagtatttcagaatcttacatgtataatgacacaagcatagtctgaaaaataatttgcattt
gi|12 : attgaaAAACAGTCGAAAACTATTTAAAGTG-----ATT-----ATTGTATTGAAATGAAT--ATACAGATCTCACATACGAGACACCATGCCAACTATATTTCGTTCAATCATATTCA-GTTTTAATAAATAT--T-----TGAGTT--TCTTCTCTTTTCCTTT-TGG-ACTT--C--AAAT-TAAT------GAATATATT----TTCTACTGTAACAAA--TATtaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagaaacagtcgaaaactatttaaagtgattattgtattgaaatgaatatacagatctcacatacgagacaccatgccaactatatttcgttcaatcatattcagttttaataaatatttgagtttcttctcttttccttttggacttcaaattaatgaatatattttctactgtaacaaatatgt
gi|13 : attgaagtagtaaacatgctgtacatattttaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAATCAGT--ATAAAAATCTCGCTTACGAGTCACGGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTATTATGAGTT--TCTCCTCT-TTACT-T-G------T--TGGACA--TAACTTATTGGAT-ATATT----TTCTACTGTAACACA--TATgt
gi|14 : gattaagtaaaccgtagtcaaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaaaaaaatagttgtattactaactgatgaattttcatttgtctaAACAGACGGAAACAATTTTAAGTGTT-GCATTA-AA-ATGTTATTAAAATGAGC--ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-----NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNNN--NNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNN----NNNNNNNNNAATACATGTGTAGAGATGCAGGTCAAAT-TTTTAAACCTTTCCATATGACGAAGAAAACGGgtag
gi|15 : ttttttgatgGAAATAAAACAGTCGAAAACC----AAAGTCCG-GTATTGTTT-ATTTTATTGAAATAAAT--A
gi|16 : tatttactggtttctactctacaaaataaattagttgtactactaattcatgatatttgtttttcatttgcctaTG-----TCCTATCTTCATTAGGCATATTGCAAGTGTACACTATTCACTATTGAA---T-GTAG--------CATAATGTA-TAACATTTTATGCACAATGTCAAGGTCTGTTGTTTAAAAGTCACGGTCG---GACTTCTAAgtctttaattctctattaataatgcattttgatatacatattgttcaattagtt
gi|17 : tggtggtggaaatgtcacattatcattttttttttcatatatacgtccagcttattgCATGCGAGAC----TAGCAGTTGTAGTTCTCTCCATCAAAT--ATTTTTTTAAAAATAGGAT-----TGAGTC--TATTCTGTGCTCGTGT--TG-CAATAAAGAAAACATA--------GATCGC-TTCTTATTCCACTGTACTAAA--TATAGAct
gi|18 : ctacTGGCAATATCACATTGACATTTTGTACATCCATCTATACTG-TCCCATTGCTGTG-----TC----CTCCAACA-------TGCATAT-TGCAAT-TTGAATAT--GAC
gi|19 : aaactggtgtattaagtctagccctatattatgagtggtagGTTGGACA-ATCACATTGTCATTT-GCATGT------GCATTTATGATATTACATTGGTACATCCTATCTTTAACGGTAAC-ATGCATAT-TGCAAt
gi|2 : ttgTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGTAGTTGGGAA-ATCGCTTCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCCAATGACCTTG-----TCCTCACTTTAACATCTTT-TGGTATGT-TAAAAT-TTCAATTT--AACATT-GCAGTTTAAGACCACAAAATAACATCATTTTATGCACATCACCATGGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAATTACCAAAATAAATTTATTGCATATGTAATTCATCAAAATCAACAAGTAATCAATATTTGAAATT-TTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTCACTTTGCAGACAAATA---T-ATAG---CTTCG-AGAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATATAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGCCTTTGGATGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A------T---TTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AATG---A--TCAGTTTT--TTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATATTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTCATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAAGTCAATAGCAATTgt
gi|2 : tGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAAACAGT--ATTCAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--ATTTAATATATATG-TTATTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AACTTAAT------GGATATATT----TTCTACTGTATCACA--TATttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctagaaataaaacaatcgaaaaccattaaaaatgcggcattgtttattttattgaaaacagtattcaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcaatttaatatatatgttattatgagtttctcctctttacctgttggacttaacttaatggatatattttctactgtatcacatatgca
gi|20 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcaaattgtagttgggaaatcgcttcgccatttgtatgttaatctgcgctttccaatgaccttgtcctcactttaacatcttttggtatgttaaaatttcaatttaacattgcagtttaagaccacaaaataacatcattttatgcacatcaccatggtccgtagcttaaaaatcaaagtcacacaattaccaaaataaatttattgcatatgtaattcatcaaaatcaacaagtaatcaatatttgaaatttttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgagtgaattgtattcactttgcagacaaatatatagcttcgagaggtaagacttgttttgtatcaacatgggtttcacatataattaatggtgtagtaaacatgccgtacgcctttggatgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcatggcggttcaagaataatcgacattacatttaaataaatgatagcaactgatcatgtatttttttattgtgcaataatgatcagttttttccggtgttaaaatttgtgttgcttgaatatatgtgaactttaagacaccgcctcaaaatatttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgatatttattcaagttgatatacgctcatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataagtcaatagcaattttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctaTTTCAACATGCTTTAACATTTACCAGAGTTGTTTAACGTCTGTCTTGGATTAAAGAAATGTATCGAT------TTTTATAATACAATAGCAATgca
gi|21 : CGTTTTACGATTTA-----ATTGTATTTACTTTGCACA-AGAGC---TCAAAG---CTTAG-AATGGTAAGATTTGTTTT
gi|3 : atcgcatatgtatttT---TG-GAAGACTATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGTTT-TGATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTAACTCAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATGGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTCCCAAAAGAAATATGTTGCATATTGAATTCGTCAAAAAAAACATATAGTCAATCTTTGAACTTA-TTA--AACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCGTTTAACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGA-AAAAA---TGAAAG---CTGCG-GAAGGTAAGACTTGTTTCGTATT------AACATTGGTTTCCCATATAATAAATGGTGTTGTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAATGCAGTTAAAGAATAATCGATATTACATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-ACA-TTTT--GTTTTTT----T-------C-AAT--CAAG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGTC-TTGTTTGAATATATGTGATCTTTTACACACCGCCGT--AAATG-TTTTAATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGCAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAA-TATGACAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|3 : taaGAAATAAAA-------AAAC-ATTTAAAGTGCG-GTATTG-TTTATTTTGTTGAAATCAGT--ATACAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTGTTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AATG----------GAT-ATATT----TTCTACTGTTACGCA--TATttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|4 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcccatataataaatggtgttgtaaacatcacgtacgtctttgagtgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctaTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGTAGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTACGTTAATCCGCACAT-TCCTATGATCTTG-----TTCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--TACCTTTGTAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATAGCTTAAAGTTTCAAGTCACACAGCTACCAATAGAAATATATTGCATATGTATTTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCCTTGGAATTGTTTAATAACTGTGTTTCATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTTACTTTGCA---AAATG---TGAAAA---GTTCGGAAAGGTAAGATTTGTTTTGTATT------AACATGGGTATAACGTGTAATTAATTGTGTAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGCGAATATGAGTATTGAAATGTATAAACACCATGTC-TTTTGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAAT----TTAATA--ATAGCAACTGATAAGG-T-A-AATTTT--GTTTTTTTTCATGATGTAGCTAATTTCAGG---A--TCAGTTTTTTTCCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACTGCC-TTAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGGTATCTATCAATACTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCAATAATCTGAGTGAATTATGATACCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAg
gi|5 : aagataaataaaactatgatcaaactAAAGACATCTCAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTGGGAA-ATAGAATCGCCATTT-GTAAGTTAATCTGCGTTT-TCATATGACCTTG-----TCATGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--TACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAAAATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGATTCAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATTTTGCATATTTAATTTGTCAAAATCAACTAGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGT-AAAGA---TGAAAG---CTGCG-CAAGGTAAGACTTG---TGTATT------ACTATGGGATTCCCATATAATAAATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTAAAGACACCATGTCATGGCGGCTAAAGAATAATCGACATTATATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGAATATG-TAA-A-TTTT--GT---------T--TGT-GC-AAT--AATG---A--TC--TTTTTTTTTCGGTGTTAGAATTTGTATTTGCTTGAATATA--------TTAAGACACCGCC-ACAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGTACATCGTAATACTTAACT---TATGCAGATAAAATGCGATAATCTGAGTTAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTAATTCAAGTTGATATACGTTTATATTGGGTTAAAGAAATGTACATATTTACACTTTTATAATGCAAGAGCAATT
gi|6 : ttacttgaatgcTGGTTTTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCATAAGACCTTG-----TCCTGTCTTTAGCAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCAACATTGTCCGTAGTTTAATTTTCAAAGTCACACAACTTCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATATAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCTTTTTATGATTGAATTGGATTGTCTTTACTTTTCAGA-AAAAG---TGGAAG---CTCAG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATA------AACATGGGTATCACATATAATAAATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTTTGAGCATTGGAATGTATAGACACCATGGCATGGCGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTTTATAAATGTAATAGCGACTGATCAGGTT-A-G-TTTTGGGTTTTTA---AT--AAT-GG-AGC--AAAGTTCAGTTCAGTTTTTTTTCTGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATTTGTGAACTTTTAGACACCGCC-T-AAAATGTTTTCGATGTTGAAAAGTAGGGATTTATTGATACTGAGATCATCGTAAttga
gi|7 : tGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTAAGTTAATCCGTACTT-TCCTTTGACTGTG-----TCGTGTCTTTTACAGCAGT-T-GCATAT-TGCAAT-TTCAATAT--AACTTC-ACAGTTTGTTACAACAAAATATCAACATGTTATGCACAATAACATTATCCGTAGCTTAAAGTTCAATGTCACACAACTCCAAAAAGAAATATATTGTAAAAGCGTTTTGCCAAAG-CAACATATATTTAGTATT-GAAATTGTTTTATATATAT-TTTTATATGACACGGCACTGTTTTACGATTAA-----ATTGTATTTACTTTTCAGA-TAAGAGGGTGAAAAAGTTTTCT----GGTAAGACTTGTTTTGTATTTACAAAAACAT--------TATATAATGAATc
gi|7 : ttgTGGTGTACTAAACA---CATA----TTTTAGTGCATCAAGCATGTGTCAGT-------------TATATATACAGTACGCTATTGTGGATCTGGAATAAACGACAATACATTGAAT----AAAATA--ATAACAACtgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagattggtgtactaaacacatattttagtgcatcaagcatgtgtcagttatatatacagtacgctattgtggatctggaataaacgacaatacattgaataaaataataacaac
gi|8 : ttggttggaaaatcgcattgccatttgtaagttaatccgtactttcctttgactgtgtcgtgtcttttacagcagttgcatattgcaatttcaatataacttcacagtttgttacaacaaaatatcaacatgttatgcacaataacattatccgtagcttaaagttcaatgtcacacaactccaaaaagaaatatattgtaaaagcgttttgccaaagcaacatatatttagtattgaaattgttttatatatatttttatatgacacggcactgttttacgattaaattgtatttacttttcagataagagggtgaaaaagttttctggtaagacttgttttgtatttacaaaaacattatataatgaattgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagatGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTAAGG-GCG-GTATTG-AA-ATTCTGTTGAACTGACC--ATGCATATCCTTCATACAAGACTCCGTCCCAGTTGTAGCTC-CTCAAT-AAAATCAACTTTTGACAAATAT--T-----CGAGTT--GACTCTCAGTTGCTGT-GGGGCGTT--TGAAAATGTAAC------GATCACATT----TACCGCTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCACTGTATGTTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTACAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAAATCGTT
gi|9 : AAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCG-GCATTT-AA-ATTCAAT-GAACTGACC--ATGCATGGCCTTCATACGAGACTCCGTCGCAGTTGCAGTTCGCTCAATAAAACTCATCTTCTGATAAATGT--T-----CGAATC--TC-TCTCGGCTGCTATCGGG-CATT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TAAAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTCTCTTATAACACAATCGCTATATGTTTTCCTC-TAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATATTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTTAAAAAAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACAACAAACATGCAATATATATT--TGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCTATTCAGTTAAAACGAAAGGTACGTTTTATTTCGAAAACATTCTTTCCATTCTTTT
Alignments
lowQualScore : 22222 11 44444444 11 11111111111111 111111 11 1 111 111 111 11111 111111 1111 2222222222 11111111111 111111 111 111
lowQualScore : 2 3 4 0 11111 0 5555 2 1 4 4 0 1 2 1 88 22222222 11 22 44444 0 77777777777777 2 111111 4 8888 1 0 55 8 1 1 0 2 88 5 0 0 55 777 777 1 1 1 111 6 0 1 1 4 4 5 4 1 99999 2 3 3 4 55 2 4 1 1 0 0 1 22222 5 2 888 2 888 1 77 666666 0 1 1 1 1 0 1 1 2222 1 77 6 6 2222222222 99999999999 6 99 1 111111 0 6 111 444 0 1
lowQualScore : . . . . ..... . .... . . . . . . . . .. ........ .. .. ..... . .............. . ...... . .... . . .. . . . . . .. . . . .. ... ... . . . ... . . . . . . . . . ..... . . . . .. . . . . . . . ..... . . ... . ... . .. ...... . . . . . . . . .... . .. . . .......... ........... . .. . ...... . . ... ... . .
lowQualScore : 4 1 0 5 55555 6 9999 7 0 1 5 2 1 7 0 55 11111111 00 00 88888 2 00000000000000 7 555555 3 5555 0 6 55 0 4 0 2 5 88 8 0 2 88 555 555 0 5 4 777 7 1 4 4 0 0 5 0 0 11111 5 6 6 0 55 9 4 0 0 7 7 7 55555 0 2 888 5 888 0 00 444444 7 9 3 0 7 7 0 0 1111 0 99 7 7 8888888888 77777777777 7 22 0 888888 7 7 333 000 8 0
consensus : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Reference ( family-3248 ) : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|1 : GTGAAATAAAACAGACAGAAACCATTTTAAGGGCG-GTATTG-GA-GTTCTATTGAACTGACA--ATGCATATCCTTCATACGAGACACCATCCCAGTTGTAGCTCGCTCAATAAAACTCATCTTTTAACAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGACTGCTGT-GGG-CGTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTTCCTTTGACTAAAAAGACAGTATCTTGTAATAAAATCGCTATATGTTTTCCTCGAAAAATTATCTCAATCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCTATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACATCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATATTAATTCGTTTTTACTTGAATGCAAAGAA-ATCATAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTCGGAA-ATTGAATAGCAATTT-GTAAATTAATCTGCATTT-TCATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--AACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCTCATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATATTGCATATTTAATTCGTCAAAATCAACATGCAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACAATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAAA---TTAAAG---CTGCG-ATAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATGTAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTATGTCTTTGAGTGCTTCCACTATGTACTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGTTTCAAAAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A--------TTTTTT---AT--TAT-GC-AAT--AAAG---A--TCAG--TTTTTTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTCGAATAGATGTGCAGTTTAAAACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAAGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTCATACTTAACTTAATATGCAGTTAAAATGTTATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|10 : tgGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCGTGT-TTA-AA-ATTTTATTGAACTGAATTTATTGATATCCTTCAAACGAGACCCCGTGTCATTTGTAGTTCGCTAAATTAAACTCATTTTCTGATAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGGCTGCTGTCGGG-CTGT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCCAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATATGACTAAGAAAACAGTATCTTATATTACAATATATGTATGTTTTCCAC-CAAACTTATCTCACCCATGAAA-TATTTCTATTGTTCCTTCCATAAATTCACGGTAAATAT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATAAAACAACTATAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGTGTAAGTATTTCCATTCTATTCGCA
gi|11 : TAGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCAAATTGGTCTATCGAATTGAAGTTAAAAA-TTCGCATCGCCATTA-GTATGTTCAACAGCAATT-ACCTATGAAGTTG-----TCCAGTCTTTAACAACAAT-TTGCATGT-TGCAAA-TTTAATGT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAATAAACAACATTTAATGCACATtactcaatttagt
gi|12 : GTAGTAAACATGCTGTACATATTTgatgacatttgcaatctgtttatttataggttttaaaaaggaatgttattgttgatgtttaatgtaaaatgtatatgtgtctcagtatttcagaatcttacatgtataatgacacaagcatagtctgaaaaataatttgcattt
gi|12 : attgaaAAACAGTCGAAAACTATTTAAAGTG-----ATT-----ATTGTATTGAAATGAAT--ATACAGATCTCACATACGAGACACCATGCCAACTATATTTCGTTCAATCATATTCA-GTTTTAATAAATAT--T-----TGAGTT--TCTTCTCTTTTCCTTT-TGG-ACTT--C--AAAT-TAAT------GAATATATT----TTCTACTGTAACAAA--TATtaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagaaacagtcgaaaactatttaaagtgattattgtattgaaatgaatatacagatctcacatacgagacaccatgccaactatatttcgttcaatcatattcagttttaataaatatttgagtttcttctcttttccttttggacttcaaattaatgaatatattttctactgtaacaaatatgt
gi|13 : attgaagtagtaaacatgctgtacatattttaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAATCAGT--ATAAAAATCTCGCTTACGAGTCACGGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTATTATGAGTT--TCTCCTCT-TTACT-T-G------T--TGGACA--TAACTTATTGGAT-ATATT----TTCTACTGTAACACA--TATgt
gi|14 : gattaagtaaaccgtagtcaaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaaaaaaatagttgtattactaactgatgaattttcatttgtctaAACAGACGGAAACAATTTTAAGTGTT-GCATTA-AA-ATGTTATTAAAATGAGC--ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-----NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNNN--NNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNN----NNNNNNNNNAATACATGTGTAGAGATGCAGGTCAAAT-TTTTAAACCTTTCCATATGACGAAGAAAACGGgtag
gi|15 : ttttttgatgGAAATAAAACAGTCGAAAACC----AAAGTCCG-GTATTGTTT-ATTTTATTGAAATAAAT--A
gi|16 : tatttactggtttctactctacaaaataaattagttgtactactaattcatgatatttgtttttcatttgcctaTG-----TCCTATCTTCATTAGGCATATTGCAAGTGTACACTATTCACTATTGAA---T-GTAG--------CATAATGTA-TAACATTTTATGCACAATGTCAAGGTCTGTTGTTTAAAAGTCACGGTCG---GACTTCTAAgtctttaattctctattaataatgcattttgatatacatattgttcaattagtt
gi|17 : tggtggtggaaatgtcacattatcattttttttttcatatatacgtccagcttattgCATGCGAGAC----TAGCAGTTGTAGTTCTCTCCATCAAAT--ATTTTTTTAAAAATAGGAT-----TGAGTC--TATTCTGTGCTCGTGT--TG-CAATAAAGAAAACATA--------GATCGC-TTCTTATTCCACTGTACTAAA--TATAGAct
gi|18 : ctacTGGCAATATCACATTGACATTTTGTACATCCATCTATACTG-TCCCATTGCTGTG-----TC----CTCCAACA-------TGCATAT-TGCAAT-TTGAATAT--GAC
gi|19 : aaactggtgtattaagtctagccctatattatgagtggtagGTTGGACA-ATCACATTGTCATTT-GCATGT------GCATTTATGATATTACATTGGTACATCCTATCTTTAACGGTAAC-ATGCATAT-TGCAAt
gi|2 : ttgTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGTAGTTGGGAA-ATCGCTTCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCCAATGACCTTG-----TCCTCACTTTAACATCTTT-TGGTATGT-TAAAAT-TTCAATTT--AACATT-GCAGTTTAAGACCACAAAATAACATCATTTTATGCACATCACCATGGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAATTACCAAAATAAATTTATTGCATATGTAATTCATCAAAATCAACAAGTAATCAATATTTGAAATT-TTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTCACTTTGCAGACAAATA---T-ATAG---CTTCG-AGAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATATAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGCCTTTGGATGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A------T---TTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AATG---A--TCAGTTTT--TTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATATTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTCATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAAGTCAATAGCAATTgt
gi|2 : tGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAAACAGT--ATTCAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--ATTTAATATATATG-TTATTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AACTTAAT------GGATATATT----TTCTACTGTATCACA--TATttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctagaaataaaacaatcgaaaaccattaaaaatgcggcattgtttattttattgaaaacagtattcaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcaatttaatatatatgttattatgagtttctcctctttacctgttggacttaacttaatggatatattttctactgtatcacatatgca
gi|20 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcaaattgtagttgggaaatcgcttcgccatttgtatgttaatctgcgctttccaatgaccttgtcctcactttaacatcttttggtatgttaaaatttcaatttaacattgcagtttaagaccacaaaataacatcattttatgcacatcaccatggtccgtagcttaaaaatcaaagtcacacaattaccaaaataaatttattgcatatgtaattcatcaaaatcaacaagtaatcaatatttgaaatttttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgagtgaattgtattcactttgcagacaaatatatagcttcgagaggtaagacttgttttgtatcaacatgggtttcacatataattaatggtgtagtaaacatgccgtacgcctttggatgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcatggcggttcaagaataatcgacattacatttaaataaatgatagcaactgatcatgtatttttttattgtgcaataatgatcagttttttccggtgttaaaatttgtgttgcttgaatatatgtgaactttaagacaccgcctcaaaatatttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgatatttattcaagttgatatacgctcatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataagtcaatagcaattttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctaTTTCAACATGCTTTAACATTTACCAGAGTTGTTTAACGTCTGTCTTGGATTAAAGAAATGTATCGAT------TTTTATAATACAATAGCAATgca
gi|21 : CGTTTTACGATTTA-----ATTGTATTTACTTTGCACA-AGAGC---TCAAAG---CTTAG-AATGGTAAGATTTGTTTT
gi|3 : atcgcatatgtatttT---TG-GAAGACTATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGTTT-TGATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTAACTCAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATGGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTCCCAAAAGAAATATGTTGCATATTGAATTCGTCAAAAAAAACATATAGTCAATCTTTGAACTTA-TTA--AACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCGTTTAACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGA-AAAAA---TGAAAG---CTGCG-GAAGGTAAGACTTGTTTCGTATT------AACATTGGTTTCCCATATAATAAATGGTGTTGTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAATGCAGTTAAAGAATAATCGATATTACATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-ACA-TTTT--GTTTTTT----T-------C-AAT--CAAG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGTC-TTGTTTGAATATATGTGATCTTTTACACACCGCCGT--AAATG-TTTTAATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGCAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAA-TATGACAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|3 : taaGAAATAAAA-------AAAC-ATTTAAAGTGCG-GTATTG-TTTATTTTGTTGAAATCAGT--ATACAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTGTTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGT-TGG-ACTT------AATG----------GAT-ATATT----TTCTACTGTTACGCA--TATttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|4 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcccatataataaatggtgttgtaaacatcacgtacgtctttgagtgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctaTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGTAGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTACGTTAATCCGCACAT-TCCTATGATCTTG-----TTCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--TACCTTTGTAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATAGCTTAAAGTTTCAAGTCACACAGCTACCAATAGAAATATATTGCATATGTATTTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCCTTGGAATTGTTTAATAACTGTGTTTCATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTTACTTTGCA---AAATG---TGAAAA---GTTCGGAAAGGTAAGATTTGTTTTGTATT------AACATGGGTATAACGTGTAATTAATTGTGTAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGCGAATATGAGTATTGAAATGTATAAACACCATGTC-TTTTGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAAT----TTAATA--ATAGCAACTGATAAGG-T-A-AATTTT--GTTTTTTTTCATGATGTAGCTAATTTCAGG---A--TCAGTTTTTTTCCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACTGCC-TTAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGGTATCTATCAATACTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCAATAATCTGAGTGAATTATGATACCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAg
gi|5 : aagataaataaaactatgatcaaactAAAGACATCTCAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTGGGAA-ATAGAATCGCCATTT-GTAAGTTAATCTGCGTTT-TCATATGACCTTG-----TCATGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--TACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAAAATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGATTCAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATTTTGCATATTTAATTTGTCAAAATCAACTAGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGT-AAAGA---TGAAAG---CTGCG-CAAGGTAAGACTTG---TGTATT------ACTATGGGATTCCCATATAATAAATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTAAAGACACCATGTCATGGCGGCTAAAGAATAATCGACATTATATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGAATATG-TAA-A-TTTT--GT---------T--TGT-GC-AAT--AATG---A--TC--TTTTTTTTTCGGTGTTAGAATTTGTATTTGCTTGAATATA--------TTAAGACACCGCC-ACAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGTACATCGTAATACTTAACT---TATGCAGATAAAATGCGATAATCTGAGTTAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTAATTCAAGTTGATATACGTTTATATTGGGTTAAAGAAATGTACATATTTACACTTTTATAATGCAAGAGCAATT
gi|6 : ttacttgaatgcTGGTTTTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCATAAGACCTTG-----TCCTGTCTTTAGCAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCAACATTGTCCGTAGTTTAATTTTCAAAGTCACACAACTTCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATATAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCTTTTTATGATTGAATTGGATTGTCTTTACTTTTCAGA-AAAAG---TGGAAG---CTCAG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATA------AACATGGGTATCACATATAATAAATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTTTGAGCATTGGAATGTATAGACACCATGGCATGGCGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTTTATAAATGTAATAGCGACTGATCAGGTT-A-G-TTTTGGGTTTTTA---AT--AAT-GG-AGC--AAAGTTCAGTTCAGTTTTTTTTCTGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATTTGTGAACTTTTAGACACCGCC-T-AAAATGTTTTCGATGTTGAAAAGTAGGGATTTATTGATACTGAGATCATCGTAAttga
gi|7 : tGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTAAGTTAATCCGTACTT-TCCTTTGACTGTG-----TCGTGTCTTTTACAGCAGT-T-GCATAT-TGCAAT-TTCAATAT--AACTTC-ACAGTTTGTTACAACAAAATATCAACATGTTATGCACAATAACATTATCCGTAGCTTAAAGTTCAATGTCACACAACTCCAAAAAGAAATATATTGTAAAAGCGTTTTGCCAAAG-CAACATATATTTAGTATT-GAAATTGTTTTATATATAT-TTTTATATGACACGGCACTGTTTTACGATTAA-----ATTGTATTTACTTTTCAGA-TAAGAGGGTGAAAAAGTTTTCT----GGTAAGACTTGTTTTGTATTTACAAAAACAT--------TATATAATGAATc
gi|7 : ttgTGGTGTACTAAACA---CATA----TTTTAGTGCATCAAGCATGTGTCAGT-------------TATATATACAGTACGCTATTGTGGATCTGGAATAAACGACAATACATTGAAT----AAAATA--ATAACAACtgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagattggtgtactaaacacatattttagtgcatcaagcatgtgtcagttatatatacagtacgctattgtggatctggaataaacgacaatacattgaataaaataataacaac
gi|8 : ttggttggaaaatcgcattgccatttgtaagttaatccgtactttcctttgactgtgtcgtgtcttttacagcagttgcatattgcaatttcaatataacttcacagtttgttacaacaaaatatcaacatgttatgcacaataacattatccgtagcttaaagttcaatgtcacacaactccaaaaagaaatatattgtaaaagcgttttgccaaagcaacatatatttagtattgaaattgttttatatatatttttatatgacacggcactgttttacgattaaattgtatttacttttcagataagagggtgaaaaagttttctggtaagacttgttttgtatttacaaaaacattatataatgaattgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagatGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTAAGG-GCG-GTATTG-AA-ATTCTGTTGAACTGACC--ATGCATATCCTTCATACAAGACTCCGTCCCAGTTGTAGCTC-CTCAAT-AAAATCAACTTTTGACAAATAT--T-----CGAGTT--GACTCTCAGTTGCTGT-GGGGCGTT--TGAAAATGTAAC------GATCACATT----TACCGCTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCACTGTATGTTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTACAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAAATCGTT
gi|9 : AAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCG-GCATTT-AA-ATTCAAT-GAACTGACC--ATGCATGGCCTTCATACGAGACTCCGTCGCAGTTGCAGTTCGCTCAATAAAACTCATCTTCTGATAAATGT--T-----CGAATC--TC-TCTCGGCTGCTATCGGG-CATT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TACCACTGTAACAAA--TAAAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAATACAGTCTCTTATAACACAATCGCTATATGTTTTCCTC-TAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATATTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTTAAAAAAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACAACAAACATGCAATATATATT--TGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCTATTCAGTTAAAACGAAAGGTACGTTTTATTTCGAAAACATTCTTTCCATTCTTTT
blockSeqs : A G T GTTT ATTT T T T C G T C TT GTTATTA TC AC GGCTG CGGGCTGTTGG G TTATTG C CTTA A TG C A A C NN N A TT AAG TTT A A T . . G T T T T A C GTACA A A G A TG C T G T T ATTGG C T GGG C AGT T GA TACAAA T A T A T T TTTA A TA T A GTTTTGGG TTCATGATGTA T TT T TTCAGT T TC . G
blockSeqs : T T . GTTT AT A G A A T C T NN GTTATTA TC CT TTTTC TGCAATAAAGA N . T . T . . A A C C T . TG . . A A . . A T . . C . C . C . . . . A . A A A . . G . G . T A . T C A A T T . T . . . CATTTTG ATTGT . . A A . GT . A
blockSeqs : T T . GTTT GT A A G A T C A TT GTTGTTA . CT NNNNN GGGGCGTTTGA A . N . T . . T T . T . . . . . A A . . A T . . T . A . A . . . . C . A C T . . A . G . G A . A A T A G A . T . . . AATTTTG ATAAT . . G A . TT . T
blockSeqs : A T . GTTT GC A N N N N N N AC GAT . NN TGCTC CGGGCATTTGG T . C . N . . T T G A . . G T . . T . C . T . . . . C . T A T . . T . G . T G . T C A A C T . T . . . ATTTTG TTGT . . T A . AC . T
blockSeqs : T T . AAA AT T A G A G C T TC NN . AT AGTTG NNNNNNNNNN G . T . T . C . . A C . . T . A . T . . . . A . A A T . . G . G . G C . A A A T G A . A . . . T T . . A A . T G
blockSeqs : T T . AAA GT A A G A T C A G T . CC GGCTG TGGACTTC G . C . T . A T . . C . C . A . . . . C . T T . . . A . G . C A . . . G . A A . A .
blockSeqs : A T . GAA GT G T T T T C A . T . CC TTTA TGGACTT G . C . T . . . A . A . A . . . . T . T C . . G . . . T .
blockSeqs : A G . TAA CC G T T T G A A . T . AC TAC TGGACTT . . . . A . . . T . A . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . CC . G . C . T . C TAC GTTGG . . . . A . . . A . C . A . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : TGGGCANTTGG*** *** ATTTTG**** ***
originalCons : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGT-GGG-CNTT--TGGAAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
finalCons : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGTTGGGCANTTGG---AAATGTAAC------GATCACATT----TNCCACTGTAACAAA--TATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAA-CTTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-AATTTTG----TTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Alignments
lowQualScore : 22222 22 44444444 11 2222222222 11 1 111 111 111 11111 111111 1111 2222222222 11111111111 111111 111 111
lowQualScore : 2 3 4 0 11111 0 5555 2 1 4 4 0 1 2 1 00 66666666 88 1 1 88 2 1111111111 2 22 0 9999 1 0 8 1 1 0 2 88 5 0 0 55 777 777 1 1 1 111 6 0 1 1 4 4 5 4 1 99999 2 3 3 4 55 2 4 1 1 0 0 1 0 22222 5 2 888 2 888 1 77 666666 0 1 1 1 1 0 1 1 2222 1 77 6 6 2222222222 99999999999 6 99 1 111111 0 6 111 444 0 1
lowQualScore : . . . . ..... . .... . . . . . . . . .. ........ .. . . .. . .......... . .. . .... . . . . . . . .. . . . .. ... ... . . . ... . . . . . . . . . ..... . . . . .. . . . . . . . . ..... . . ... . ... . .. ...... . . . . . . . . .... . .. . . .......... ........... . .. . ...... . . ... ... . .
lowQualScore : 4 1 0 5 55555 6 9999 2 0 5 9 1 1 9 0 33 66666666 33 1 0 66 4 0000000000 9 99 9 4444 0 8 0 4 0 2 5 88 8 0 2 88 555 555 0 5 4 777 7 1 4 4 0 0 5 0 0 11111 5 6 6 0 55 9 4 0 0 7 7 7 1 55555 0 2 888 5 888 0 00 444444 7 9 3 0 7 7 0 0 1111 0 99 7 7 8888888888 77777777777 7 22 0 888888 7 7 333 000 8 0
consensus : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCTGCTGCTGTCGGGCACTT--GGAAACGTAACGATCACATT----TNCCACTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
Reference ( family-3248 ) : NNGTGAAATAAAACAGNCGGAAACCATTTAAAGTGCG-GCATTG-NN-ATTTTATTGAAATGAGT--ATGCANATCCCGCATACGAGACACCGTGCCAGCTGTAGTTCGCTCAATCAAANTCATCTTTTAATAAATATG-T-----CGAGTT--TCCTCTCNGCTGCTGTTGGGCANTT--GGAAATGTAACGATCACATT----TNCCACTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTCCATTTGACTAAAAANACAGTATCTTATAATACAATCGCTGTATGTTTTCCTCGNAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCCATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAANTAGTTCTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATCGGAGTTGGGAA-ATCGCATCGCCATTT-GTACGTTAATCTGCGCTT-TCNTATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAANTCAAAGTCACACAACTNCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAGA---TGAAAG---CTNCG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATT------AACATGGGTTTCACATATAATNAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGNTCAGGAATAATCGACANTACATTTAAT----TNAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A-TTTT--GTTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AANG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|1 : GTGAAATAAAACAGACAGAAACCATTTTAAGGGCG-GTATTG-GA-GTTCTATTGAACTGACA--ATGCATATCCTTCATACGAGACACCATCCCAGTTGTAGCTCGCTCAATAAAACTCATCTTTTAACAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGACTGCTGT-GGGCGTTT--GGAAATGTAACGATCACATT----TACCACTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTTCCTTTGACTAAAAAGACAGTATCTTGTAATAAAATCGCTATATGTTTTCCTCGAAAAATTATCTCAATCATGCAATTATTTCTAATGTTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACTACAAACATGCTATACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACATCGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATATTAATTCGTTTTTACTTGAATGCAAAGAA-ATCATAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTCGGAA-ATTGAATAGCAATTT-GTAAATTAATCTGCATTT-TCATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--AACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCTCATCACCATTGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATATTGCATATTTAATTCGTCAAAATCAACATGCAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACAATTGA-----ATTGTATTTACTTTGCAGA-AAAAA---TTAAAG---CTGCG-ATAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATGTAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTATGTCTTTGAGTGCTTCCACTATGTACTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGTTTCAAAAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A-A--------TTTTTT---AT--TAT-GC-AAT--AAAG---A--TCAG--TTTTTTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTCGAATAGATGTGCAGTTTAAAACACCGCC-TCAAAATGTTTTTGAAGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTCATACTTAACTTAATATGCAGTTAAAATGTTATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|10 : tgGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCGTGT-TTA-AA-ATTTTATTGAACTGAATTTATTGATATCCTTCAAACGAGACCCCGTGTCATTTGTAGTTCGCTAAATTAAACTCATTTTCTGATAAATAT--T-----CGAGTT--TACTCTCGGCTGCTGTCGGGCTGTT--GGAAATGTAACGATCACATT----TACCACTGTAACAAATATAGAGACGCCAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTCCATATGACTAAGAAAACAGTATCTTATATTACAATATATGTATGTTTTCCAC-CAAACTTATCTCACCCATGAAA-TATTTCTATTGTTCCTTCCATAAATTCACGGTAAATAT-AAAGAAATTGTCAATATCACATATCCATAAAACAACTATAAACATGCCATACATCCTTTTGTGCTTCCAGCATGTGTAAGTATTTCCATTCTATTCGCA
gi|11 : TAGTTCTTACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCAAATTGGTCTATCGAATTGAAGTTAAAAA-TTCGCATCGCCATTA-GTATGTTCAACAGCAATT-ACCTATGAAGTTG-----TCCAGTCTTTAACAACAAT-TTGCATGT-TGCAAA-TTTAATGT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAATAAACAACATTTAATGCACATtactcaatttagt
gi|12 : GTAGTAAACATGCTGTACATATTTgatgacatttgcaatctgtttatttataggttttaaaaaggaatgttattgttgatgtttaatgtaaaatgtatatgtgtctcagtatttcagaatcttacatgtataatgacacaagcatagtctgaaaaataatttgcattt
gi|12 : attgaaAAACAGTCGAAAACTATTTAAAGTG-----ATT-----ATTGTATTGAAATGAAT--ATACAGATCTCACATACGAGACACCATGCCAACTATATTTCGTTCAATCATATTCA-GTTTTAATAAATAT--T-----TGAGTT--TCTTCTCTTTTCCTTTTGG--ACTT---CAAAT-TAATGAATATATT----TTCTACTGTAACAAATATtaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagaaacagtcgaaaactatttaaagtgattattgtattgaaatgaatatacagatctcacatacgagacaccatgccaactatatttcgttcaatcatattcagttttaataaatatttgagtttcttctcttttccttttggacttcaaattaatgaatatattttctactgtaacaaatatgt
gi|13 : attgaagtagtaaacatgctgtacatattttaagacaatctcaataaagaaacgaaatttgaaaaatatgttacgattttttaacaaattcttatcgtaatttgtaatactaaatcatgatatttaattttcttttgtctagGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAATCAGT--ATAAAAATCTCGCTTACGAGTCACGGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTATTATGAGTTTCTCCTCTTTACT--TGTTGGACAT-------AACTTATTGGATATATT----TTCTACTGTAACACATATgt
gi|14 : gattaagtaaaccgtagtcaaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaaaaaaatagttgtattactaactgatgaattttcatttgtctaAACAGACGGAAACAATTTTAAGTGTT-GCATTA-AA-ATGTTATTAAAATGAGC--ATgtag
gi|14 : ttttttgatgACATGTGTAGAGATGCAGGTCAAAT-TTTTAAACCTTTCCATATGACGAAGAAAACGGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgtgtagagatgcaggtcaaatttttaaacctttccatatgacgaagaaaacgg
gi|15 : ttttttgatgaacagacggaaacaattttaagtgttgcattaaaatgttattaaaatgagcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatGAAATAAAACAGTCGAAAACC----AAAGTCCG-GTATTGTTT-ATTTTATTGAAATAAAT--A
gi|16 : tatttactggtttctactctacaaaataaattagttgtactactaattcatgatatttgtttttcatttgcctaTG-----TCCTATCTTCATTAGGCATATTGCAAGTGTACACTATTCACTATTGAA---T-GTAG--------CATAATGTA-TAACATTTTATGCACAATGTCAAGGTCTGTTGTTTAAAAGTCACGGTCG---GACTTCTAAgtctttaattctctattaataatgcattttgatatacatattgttcaattagtt
gi|17 : tggtggtggaaatgtcacattatcattttttttttcatatatacgtccagcttattgCATGCGAGAC----TAGCAGTTGTAGTTCTCTCCATCAAAT--ATTTTTTTAAAAATAGGAT-----TGAGTC--TATTCTGTGCTCGTGTTG--CAATAAAGAAAACATA--GATCGC-TTCTTATTCCACTGTACTAAATATAGAct
gi|18 : ctacTGGCAATATCACATTGACATTTTGTACATCCATCTATACTG-TCCCATTGCTGTG-----TC----CTCCAACA-------TGCATAT-TGCAAT-TTGAATAT--GAC
gi|19 : aaactggtgtattaagtctagccctatattatgagtggtagGTTGGACA-ATCACATTGTCATTT-GCATGT------GCATTTATGATATTACATTGGTACATCCTATCTTTAACGGTAAC-ATGCATAT-TGCAAt
gi|2 : ttgTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGTAGTTGGGAA-ATCGCTTCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCCAATGACCTTG-----TCCTCACTTTAACATCTTT-TGGTATGT-TAAAAT-TTCAATTT--AACATT-GCAGTTTAAGACCACAAAATAACATCATTTTATGCACATCACCATGGTCCGTAGCTTAAAAATCAAAGTCACACAATTACCAAAATAAATTTATTGCATATGTAATTCATCAAAATCAACAAGTAATCAATATTTGAAATT-TTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTCACTTTGCAGACAAATA---T-ATAG---CTTCG-AGAGGTAAGACTTGTTTTGTATC------AACATGGGTTTCACATATAATTAATGGTGTAGTAAACATGCCGTACGCCTTTGGATGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCATGGCGGTTCAAGAATAATCGACATTACATTTAAA----TAAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-A------T---TTTTTT---AT--TGT-GC-AAT--AATG---A--TCAGTTTT--TTCCGGTGTTAAAATTTGTG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACCGCC-TCAAAATATTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGATATTTATTCAAGTTGATATACGCTCATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAAGTCAATAGCAATTgt
gi|2 : tGAAATAAAACAATCGAAAACCATTAAAAATGCG-GCATTG-TTTATTTTATTGAAAACAGT--ATTCAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--ATTTAATATATATG-TTATTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGTTGG--ACTT-----AACTTAATGGATATATT----TTCTACTGTATCACATATttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctagaaataaaacaatcgaaaaccattaaaaatgcggcattgtttattttattgaaaacagtattcaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcaatttaatatatatgttattatgagtttctcctctttacctgttggacttaacttaatggatatattttctactgtatcacatatgca
gi|20 : ttagttctaacttcggaggaatatttcacatcacattggtctatcaaattgtagttgggaaatcgcttcgccatttgtatgttaatctgcgctttccaatgaccttgtcctcactttaacatcttttggtatgttaaaatttcaatttaacattgcagtttaagaccacaaaataacatcattttatgcacatcaccatggtccgtagcttaaaaatcaaagtcacacaattaccaaaataaatttattgcatatgtaattcatcaaaatcaacaagtaatcaatatttgaaatttttaataactgtgttttattggacacgataccgttttacgagtgaattgtattcactttgcagacaaatatatagcttcgagaggtaagacttgttttgtatcaacatgggtttcacatataattaatggtgtagtaaacatgccgtacgcctttggatgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcatggcggttcaagaataatcgacattacatttaaataaatgatagcaactgatcatgtatttttttattgtgcaataatgatcagttttttccggtgttaaaatttgtgttgcttgaatatatgtgaactttaagacaccgcctcaaaatatttttgatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgtaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaattatgatagcgatgttgtttatttagttttattttccaacgccctttgatatttattcaagttgatatacgctcatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataagtcaatagcaattttgattaagtcaaccgtagtcgaaaatatttcgctggtttctaatctacaaaataattagttgtattacttactgatgaattttcatttgtctaTTTCAACATGCTTTAACATTTACCAGAGTTGTTTAACGTCTGTCTTGGATTAAAGAAATGTATCGAT------TTTTATAATACAATAGCAATgca
gi|21 : CGTTTTACGATTTA-----ATTGTATTTACTTTGCACA-AGAGC---TCAAAG---CTTAG-AATGGTAAGATTTGTTTT
gi|3 : atcgcatatgtatttT---TG-GAAGACTATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGTTT-TGATATGACCTTG-----TCCTGTCTTTAACAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTAACTCAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATGGCTTAAAAATCAAAGTCACACAACTCCCAAAAGAAATATGTTGCATATTGAATTCGTCAAAAAAAACATATAGTCAATCTTTGAACTTA-TTA--AACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCGTTTAACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGA-AAAAA---TGAAAG---CTGCG-GAAGGTAAGACTTGTTTCGTATT------AACATTGGTTTCCCATATAATAAATGGTGTTGTAAACATCACGTACGTCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTATAGACACCATGTCAATGCAGTTAAAGAATAATCGATATTACATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGATCATG-T-ACA-TTTT--GTTTTTT----T-------C-AAT--CAAG---A--TCAGTTTTTTTTCCGGTGTTAGAATTTGTC-TTGTTTGAATATATGTGATCTTTTACACACCGCCGT--AAATG-TTTTAATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGATCATCGCAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCGATAATCTGAGTGAA-TATGACAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAATGCAATAGCAATT
gi|3 : taaGAAATAAAA-------AAAC-ATTTAAAGTGCG-GTATTG-TTTATTTTGTTGAAATCAGT--ATACAAATCTCGCTTACGAGTCACCGTGCCAACTGTATTTCGTTCAATCAAAATCA--TTTTAATATATATG-TTGTTATGAGTTTCTCCTCTTTAC--CTGTTGG--ACTT-----AATG----GAT-ATATT----TTCTACTGTTACGCATATttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctagaaataaaaaaacatttaaagtgcggtattgtttattttgttgaaatcagtatacaaatctcgcttacgagtcaccgtgccaactgtatttcgttcaatcaaaatcattttaatatatatgttgttatgagtttctcctctttacctgttggacttaatggatatattttctactgttacgcatatg
gi|4 : taattggaagactatttcacatcacattggtctatcaaattggagttgggaaatcgaatcgccatttgtatgttaatctgcgttttgatatgaccttgtcctgtctttaacagctatttgcatgttacaatttcaatataaccttgcagtttattaactcaaaataacaacattttatgcacatcaccattgtccatggcttaaaaatcaaagtcacacaactcccaaaagaaatatgttgcatattgaattcgtcaaaaaaaacatatagtcaatctttgaacttattaaactgtgtttttttggacacgataccgtttaacgattgaattgtgtttactttgcagaaaaaatgaaagctgcggaaggtaagacttgtttcgtattaacattggtttcccatataataaatggtgttgtaaacatcacgtacgtctttgagtgcttccaccatgtgctattatgagcattgaaatgtatagacaccatgtcaatgcagttaaagaataatcgatattacatttaatttaatgatagcaactgatcatgtacattttgtttttttcaatcaagatcagttttttttccggtgttagaatttgtcttgtttgaatatatgtgatcttttacacaccgccgtaaatgttttaatgttgagaagtagaaatctatcgatattgagatcatcgcaatacttaacttatgcagttaaaatgcgataatctgagtgaatatgacagcgatgttgtttatttagttttattttccaacttcctttaacatttattcaagttgatatacgtttatcttggattaaagaaatgtacagatttacacttttataatgcaatagcaattttgattaagtaaaccgtagtcgaaaatatttctttggtttctaatctacaattaacttaattgtaatactaattcatgatattgtttttttcattagcctaTAGTTCTAACTT---CG-GAGGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCGAATTGTAGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTACGTTAATCCGCACAT-TCCTATGATCTTG-----TTCTGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--TACCTTTGTAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCACCATTGTCCATAGCTTAAAGTTTCAAGTCACACAGCTACCAATAGAAATATATTGCATATGTATTTCGTCAAAATCAACATGTAATCAATCCTTGGAATTGTTTAATAACTGTGTTTCATTGGACACGATACCGTTTTACGAGTGA-----ATTGTATTTACTTTGCA---AAATG---TGAAAA---GTTCGGAAAGGTAAGATTTGTTTTGTATT------AACATGGGTATAACGTGTAATTAATTGTGTAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCTACCAAGTGCGAATATGAGTATTGAAATGTATAAACACCATGTC-TTTTGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAAT----TTAATA--ATAGCAACTGATAAGG-T-A-AATTTT--GTTTTTTTTCATGATGTAGCTAATTTCAGG---A--TCAGTTTTTTTCCCGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATATGTGAACTTTAAGACACTGCC-TTAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGGTATCTATCAATACTGAGATCATCGTAATACTTAACT---TATGCAGTTAAAATGCAATAATCTGAGTGAATTATGATACCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACTTCCTTTAACATTTATTCAAGTTGATATACGTTTATCTTGGATTAAAGAAATGTACAGATTTACACTTTTATAg
gi|5 : aagataaataaaactatgatcaaactAAAGACATCTCAGAACATATTGGTCTATCAAATCGGAGTTGGGAA-ATAGAATCGCCATTT-GTAAGTTAATCTGCGTTT-TCATATGACCTTG-----TCATGTCTTTAACAGCAAT-TTGCATAT-TACAAT-TTCAATAT--TACATT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAAAATTTTATGCACATCACCATTGTCCGTAGATTCAAAATCAAAGTCACACAACTACCAAAATAAATATTTTGCATATTTAATTTGTCAAAATCAACTAGTAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTATTGGACACGATACCGTTTTACGATTGA-----ATTGTGTTTACTTTGCAGT-AAAGA---TGAAAG---CTGCG-CAAGGTAAGACTTG---TGTATT------ACTATGGGATTCCCATATAATAAATGGTGTAATAAACATGCCGTACGACTTTGAGTGCTTCCAGCATGTGCTATTATGAGCATTGAAATGTAAAGACACCATGTCATGGCGGCTAAAGAATAATCGACATTATATTTAAT----TTAATG--ATAGCAACTGAATATG-TAA-A-TTTT--GT---------T--TGT-GC-AAT--AATG---A--TC--TTTTTTTTTCGGTGTTAGAATTTGTATTTGCTTGAATATA--------TTAAGACACCGCC-ACAAAATGTTTTTGATGTTGAGAAGTAGAAATCTATCGATATTGAGTACATCGTAATACTTAACT---TATGCAGATAAAATGCGATAATCTGAGTTAATTATGATAGCGATGTTGTTTATTTAGTTTTATTTTCCAACGCCCTTTGACATTAATTCAAGTTGATATACGTTTATATTGGGTTAAAGAAATGTACATATTTACACTTTTATAATGCAAGAGCAATT
gi|6 : ttacttgaatgcTGGTTTTAACTT---CG-GAAGAATATTTCACATCACATTGGTCTATCAAATTGGAGTTGGGAA-ATCGAATCGCCATTT-GTATGTTAATCTGCGCTT-TCATAAGACCTTG-----TCCTGTCTTTAGCAGCTAT-TTGCATGT-TACAAT-TTCAATAT--AACCTT-GCAGTTTATTACCACAAAATAACAACATTTTATGCACATCAACATTGTCCGTAGTTTAATTTTCAAAGTCACACAACTTCCAAAAGAAATATATTGCATATGTAATTCGTCAAAATCAACATATAATCAATCTTTGAAATTGTTTAATAACTGTGTTTTTTTGGACACGATACCTTTTTATGATTGAATTGGATTGTCTTTACTTTTCAGA-AAAAG---TGGAAG---CTCAG-AAAGGTAAGACTTGTTTTGTATA------AACATGGGTATCACATATAATAAATGGTGCAGTAAACATGCCGTACATCTTTGAGTGCTTCCACCATGTGCTATTTTGAGCATTGGAATGTATAGACACCATGGCATGGCGGGTCAGGAATAATCGACAATACATTTAATTTTATAAATGTAATAGCGACTGATCAGGTT-A-G-TTTTGGGTTTTTA---AT--AAT-GG-AGC--AAAGTTCAGTTCAGTTTTTTTTCTGGTGTTAGAATTTGCG-TTGCTTGAATATTTGTGAACTTTTAGACACCGCC-T-AAAATGTTTTCGATGTTGAAAAGTAGGGATTTATTGATACTGAGATCATCGTAAttga
gi|7 : tGTTGGAAA-ATCGCATTGCCATTT-GTAAGTTAATCCGTACTT-TCCTTTGACTGTG-----TCGTGTCTTTTACAGCAGT-T-GCATAT-TGCAAT-TTCAATAT--AACTTC-ACAGTTTGTTACAACAAAATATCAACATGTTATGCACAATAACATTATCCGTAGCTTAAAGTTCAATGTCACACAACTCCAAAAAGAAATATATTGTAAAAGCGTTTTGCCAAAG-CAACATATATTTAGTA-TTGAAATTGTTTTATATATAT-TTTTATATGACACGGCACTGTTTTACGATTAA-----ATTGTATTTACTTTTCAGA-TAAGAGGGTGAAAAAGTTTTCT----GGTAAGACTTGTTTTGTATTTACAAAAACAT--------TATATAATGAATc
gi|7 : ttgTGGTGTACTAAACA---CATA----TTTTAGTGCATCAAGCATGTGTCAGT-------------TATATATACAGTACGCTATTGTGGATCTGGAATAAACGACAATACATTGAAT----AAAATA--ATAACAACtgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagattggtgtactaaacacatattttagtgcatcaagcatgtgtcagttatatatacagtacgctattgtggatctggaataaacgacaatacattgaataaaataataacaac
gi|8 : ttggttggaaaatcgcattgccatttgtaagttaatccgtactttcctttgactgtgtcgtgtcttttacagcagttgcatattgcaatttcaatataacttcacagtttgttacaacaaaatatcaacatgttatgcacaataacattatccgtagcttaaagttcaatgtcacacaactccaaaaagaaatatattgtaaaagcgttttgccaaagcaacatatatttagtattgaaattgttttatatatatttttatatgacacggcactgttttacgattaaattgtatttacttttcagataagagggtgaaaaagttttctggtaagacttgttttgtatttacaaaaacattatataatgaattgagttcgaaattggagaagttacgttgaactgaaattgtatcatgaaagatggagatGTGAAATAAAACAGACGGAAACCATTTAAGG-GCG-GTATTG-AA-ATTCTGTTGAACTGACC--ATGCATATCCTTCATACAAGACTCCGTCCCAGTTGTAGCTC-CTCAAT-AAAATCAACTTTTGACAAATAT--T-----CGAGTT--GACTCTCAGTTGCTGTGGGGCGTTT--GAAAATGTAACGATCACATT----TACCGCTGTAACAAATATAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTCCATTTGACTAAAAATACAGTATCTTATAATACAATCACTGTATGTTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTACAAATATGCCAGACATCTTTGTGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCATTTTAGTTACAACGAAAGGCACGTTTTATTTCGAAAACATTATTTCCATTCGTTTAATTCAGTGCTTTACGTTGATACTAAATCGTT
gi|9 : AAATAAAACAGACGGAAACCATTTGAAGGGCG-GCATTT-AA-ATTCAAT-GAACTGACC--ATGCATGGCCTTCATACGAGACTCCGTCGCAGTTGCAGTTCGCTCAATAAAACTCATCTTCTGATAAATGT--T-----CGAATC--TC-TCTCGGCTGCTATCGGGCATTT--GGAAATGTAACGATCACATT----TACCACTGTAACAAATAAAGAGACGCAAGGTAAATGTTTTCAAC-TTTCCATTTGACTAAAAATACAGTCTCTTATAACACAATCGCTATATGTTTTCCTC-TAAAATTATCTCAACCATGCAATTATTTCTAATATTCCATCCGCAAATTCAAGGTTAATTTAAAAAAAATTGTCAATATCACATATCCATATAACAACAACAAACATGCAATATATATT--TGTGCTTCCAGCATGTGT---TA---CCTATTCAGTTAAAACGAAAGGTACGTTTTATTTCGAAAACATTCTTTCCATTCTTTT