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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAATGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACCAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACatgccaatataatccttttaa
gi|4                          :                                                                          gatttgtttgttagttcaaatatttaacactaggtcttcctgggacctggaagagtaaccagtacgcaagcacacctatctctgcaaataactgataacttgctcacttgaagcaactgtgacagacaaatgacaatgagaagcaatgtcgtatatcaatcatcacatagtttgtggccacagtggcgtagctgacccTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACCCGCTGTTAATCCAGACTTTTCATGTATGCAGTGTGCATAAAATAATGCTTATGTATTGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTT--ATCAAATTGACAGTAATTGCATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCACAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCATGATGTTATCCGATGATTGATCGGAA-ATCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGTAAATG-----------TAAACAAAAAC-AAAATCATGGCTTCAGACACCAGATGTTTA------TAATAA--AGGTTATGCATTTAAGCACTT-------TAAACGCGTACAT-CTCTCAGTTATAAGTCTATCTTCATCCTGGGTGTGTGTATTTAGGACCAGGAAT-TGAT---G-------GTAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTATTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGCATGCACAAATTAATGTTAAGGTATTGACGCATAACCTTTATTT-AC-----------GTCAAATTATCAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAAATCGGGAACAAGTCTTCACGATGTTGTCCGATGATTGATCGGAA-ACCCAAAAGCGGTTCGTTGAAAGTGGTGAATGT----------AAT-CAAAAAC-AAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTG------TAACAAAAAGGTTATGAAATAAGACACTT-------TAGACGCGTATAT-CTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACTGGGAAT-TGAC---Gatgccaatataatcccttaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAAGGGATTATATTGGCAgtaatatgccagtataatcccttt
gi|6                          : ttacgtattacctttatttacttgaaagttatcaaattaacagtaattgaataatggccaaaactttagtacgtcagcaataaagtattgtgcaatgtttacattgaactccgtaaatttcccaaacaaagccttgaaaacgagatcaggaacgagtcttcacgatgttatccgatgattgatcggaaacccaaaagcgattcgttaaaaatggcaaatgtaaacaaaaaacgcggcttcaaaaaacctgtctgtaataaagaggttatgcaataagacactttagatgcgtatatctctaagttataagtgtatcttcatgctgggcatgtgtatcttggacagggaattgacggtaataACGTATTACCTTTATTT-ACTTGAAAGTT--ATCAAATTAACAGTAATTGAATAATGGCCAAAACTTTAGTACGTCA-GCAATAAAGTATTGTGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAATTTCCCAAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAA-ACCCAAAAGCGATTCGTTAAAAATGGCAAATGT-----------------AAACAAAAAACGCGGCTTCAAAAAACC--TGTCTG------TAATAAAGAGGTTATGCAATAAGACACTT-------TAGATGCGTATAT-CTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCATGTGTATCTTGGACAGGGAAT-TGAC---G-------GT-AATAT---GCCAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttTAATCGAAAGAGCTGAAGGCGGTTTGTTAAAAATG---------------------ACGAAGGT-AAA--CGTTGC-------AC---ATATTTGCCTATAAAACAAAGA--TTATAACATTAGATAGTTTGAAAAATGGATGTGTACATGCTCT-AGTTGTAAGTATAataatcccttta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcacaaaaatagcttaaatcgaggtttcaagaacgtgtatgttgttaGACATCGCAT-TT------CA-AT-CGTACATACTCGGGCAATCTCGTCATTC-T--TCGAATCTA-TA-GACTTCTCTT---AGGAAGTc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACATGGAACCTGACCTGACA-AG-TATACATAATGGGTCAA--CC-T---TC-T--TTAG---TA--A-G-C--CTCGT---AGGTAATT-CAAGGATACATC-ATATTGGAAAT-ATAATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atctaggaatattattgtaAC---GTATAT-CGTACATACTCGGCCAATTCCGTCA-TCCT--TCGG---TATTA-GAC--CTCGC---AGCTAGTC-CAAGGATCCACC-AAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aC---GCA-GT-CGCGCATACTCGGTCAATTCCGTAA-AC-TTCTCGG---TAAT--GGC--TTTGCCG-AGGTAGTT-CAAtgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttggccaatccCA-AT-CGTACACACTCGGCCAATTCCGTCA-TCTT--TCGG---TATTA-AA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atA-AC-CATACATGTTCAACCAATTCAATCA-TC-T--TATG---TATTA-GAC--TTCGTTACAGGTAGCC-CAAGGATACAAC-TAATTGGAAAT-ATAATTTGGTTATT--CAGACGATTTACGCAAAATGAACTAGTTTG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AT-CTTACATACTCGGCCAATTTCGTAA-TA-T--TC-------TTATAAC--CGCGA---GAGAAGTC-CAGCGATACACCTAAAT-GGAAAT-GGAATTCTATT-TT-TCCGGCAGATTACGCTTAAGGAATTATTTTGTG----TCTT----ATTATCAT---TG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-CGTAAATACTCGGTCAATTTCGTCA-CCTT--TCGG---CAT------------C---AAGTCATC-GAAAGATACACC-AAAACCGGAAT-GTAATTCGCCT-TTCC------AACTACGCAAAAATATCTAGTTTATGT--CTCTTTCTAGTTGTTttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -CGTAACTACTTGGCGATCTCCGGCA-TG-C--TCGGA--TAATA--AC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-TC-T--TCGG---TATTA-GAC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACC-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACC-AAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGGGGTTTCATTCGGATTGTTGT---TGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATACCAAATCATGTTAAAATATATGTTTTGATTTAAGTGCTAATCATATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACATACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTCAATGGAAGACTCGGTTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACC-AAATTGAAAAC-ACGATGAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGAACTTTTT--------------GGATTGTTGT---TGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAATAACTATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAGCTATTCGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATGCCAAATCTTTTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTGCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTGTATAACGTACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGGGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTTCAGCTTTTACTTTGCTATTTCTTTGTATTTCTCCTC---TTATTACGTTAAGGGAAGACCCGGTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACC-AAATTGGAAAT-GAAATTAGGTT-TTCTCCGGCGAATAACACAATAGGAACTTTTTTGTGT--TTCATTCGGATTGCTGC---GTGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGAATATGAATATGGCCTATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTTTGATTAAAGTGCAAATCAAATAGGTACATTGAAAATTCTGTACAACGTACATAATACAGTAACGGTTTTGCGTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCAAGCTT-----------CTTCTTTGTACTTCTCCTCTTATTGATGCGTTAATGGAAGACCAGGTTA
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TACACCTCGTGTATAGCTCTAGAATACACCAA






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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTCGTAAATACTCGGTCAATTTCGTCA-CCTT--TCGG-CAT---------------C---AAGTCATC-GAAAGATACACCAAAACCGGAAT-GTAATTCGCCT-TTCC------AACTACGCAAAAATATCTAGTTTATG--TCTCTTTCTAGTTGTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-ACCATACATGTTCAACCAATTCAATCA-TC-T--TATG-TAT---TA-GAC--TTCGTTACAGGTAGCC-CAAGGATACAACTAATTGGAAAT-ATAATTTGGTTATT--CAGACGATTTACGCAAAATGAACTAGTTTGta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACATGGAACCTGACCTGACA-AGTATACATAATGGGTCAA--CC-T---TC-T--TTAG-TA-----A-G-C--CTCGT---AGGTAATT-CAAGGATACATCATATTGGAAAT-ATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atctaggaatattattgtaC---GCA-GTCGCGCATACTCGGTCAATTCCGTAA-AC-TTCTCGG-TAA---T--GGC--TTTGCCG-AGGTAGTT-CAA
gi|2                          :                                    ttggccaatccTTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACGAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGTACAAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACCTCTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATATAGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGTCTCGAAAACAAAATTGGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCAGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGAGAATG-----------TAAACAAAAACAAAAACGTGGCTTCAAAAACCCAATGTTTGTAATAAAGATGTTATGCAGTTAGACACTTTAGATGTGTATATCTCTATGTTATAAGTGTATCTCCATGCT-GCCGTGTGTATTTAGGACAGGAAAT-TGAT---G
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgCA-ATCGTACATACTCGGGCAATCTCGTCATTC-T--TCGA--ATCTATA-GACTTCTCTT---AGGAAGTgtaatatgcaaatataatccctttaag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gacatcgcatttCGTAACTACTTGGCGATCTCCGGCA-TG-C--TCGGATAA---TA--AC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CA-ATCGTACACACTCGGCCAATTCCGTCA-TCTT--TCGG-TAT---TA-AA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCGTCTTATATCTGTAGACAGATATGGCGCCA-ATGTTGACA
gi|3                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACATGCTGTTAATCC----------CGTATTCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATGTATAGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTAAATCAAATTAACAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCC-ACAATAAAGTATTGCTCAATGTTTACATCGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCTGGAATGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCAGTGTGTTGAAAATGGCGAATGTAAACAAAATGTTAACAAAAACAAAAATGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTATAATAAAGAGATTATGCAATTAGACACTTTTAATGCGTATTTCTCTAAGTAATAAGTGTATCATCATGCTTGGTGTGTGTATTAAGGACAGGGAAT-TGACA--GTA-AT
gi|4                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACCCGCTGTTAATCCAGACTTTTCATGTATGCAGTGTGCATAAAATAATGCTTATGTATTGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTGACAGTAATTGCATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCACAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCATGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAATCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGTAAATG-----------TAAACAAAAACAAAATCATGGCTTCAGACACCAGATGTTTATAATAA--AGGTTATGCATTTAAGCACTTTAAACGCGTACATCTCTCAGTTATAAGTCTATCTTCATCCTGGGTGTGTGTATTTAGGACCAGGAAT-TGAT---Gatgccaatataatccttttaa
gi|5                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTATTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGCATGCACAAATTAATGTTAAGGTATTGACGCATAACCTTTATTT-AC---------G--TCAAATTATCAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAAATCGGGAACAAGTCTTCACGATGTTGTCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGGTTCGTTGAAAGTGGTGAATG-----------TAATCAAAAACAAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGTAACAAAAAGGTTATGAAATAAGACACTTTAGACGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACTGGGAAT-TGAC---Ggtaaaatgccaatataatcccttaaa
gi|6                          :                                                                                                                                          ACGTATTACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATAATGGCCAAAACTTTAGTACGTCA-GCAATAAAGTATTGTGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAATTTCCCAAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGATTCGTTAAAAATGGCAAATG-----------TAAACA-----AAAAACGCGGCTTCAAAAAACC--TGTCTGTAATAAAGAGGTTATGCAATAAGACACTTTAGATGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCATGTGTATCTTGGACAGGGAAT-TGAC---G------GTA-ATAT---GCCAATgtaatatgccagtataatcccttt
gi|6                          :                                              ttTAAAGGGATTATATTGGCAataatcccttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                             ttacgtattacctttatttacttgaaagttatcaaattaacagtaattgaataatggccaaaactttagtacgtcagcaataaagtattgtgcaatgtttacattgaactccgtaaatttcccaaacaaagccttgaaaacgagatcaggaacgagtcttcacgatgttatccgatgattgatcggaaacccaaaagcgattcgttaaaaatggcaaatgtaaacaaaaaacgcggcttcaaaaaacctgtctgtaataaagaggttatgcaataagacactttagatgcgtatatctctaagttataagtgtatcttcatgctgggcatgtgtatcttggacagggaattgacggtaataCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGGGGTTTCATTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATACCAAATCATGTTAAAATATATGTTTTGATTTAAGTGCTAATCATATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACATACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTCAATGGAAGACTCGGTTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATATAGTGACGTATAACCTTTTTTTTACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTTATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAACCCTCGGAAACGAGATTGGGAACGAGTCTTCACGATGATATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGTAAATGTT-----------TTACAAAAACAAAATCGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGAAATAAAGAGGTTATGCAATTAGACACTTTAGACGCGCATATCTCTAAGTTATAAGTATATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACATGGAAT-TGAC---GCA-ATCGTAAATACTCGGCCAATTCCGTCA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AGGTAGTC-CAAGGATCCACCAAATCGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGG--GTTCTTTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTTATGTTTGTAAACAAATATGGCGCCGTATGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATTGCAAATGCCAAATCATGTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTTCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTATACAATGTACATGATACAGTACCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTAACTTTGTTATTTCTTTGTATTTTTCCTCTTATTATTACGTTATGGGAAGACCGGGTTA
gi|10                         : atggtgcagcatttagtggttaatataatatttataaatactttaaTTAATGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACCAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAAC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gatttgtttgttagttcaaatatttaacactaggtcttcctgggacctggaagagtaaccagtacgcaagcacacctatctctgcaaataactgataacttgctcacttgaagcaactgtgacagacaaatgacaatgagaagcaatgtcgtatatcaatcatcacatagtttgtggccacagtggcgtagctgacccCCAAATCGGAAAAAGTGATAAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGCACTTTTTTGTG--TTTCATTCGTATTGTTGTGTGTGTCTTCTCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGCCAGGGACGCTGAACTGTTTGAA-GGCGATTTGAAATATGGCCAATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTATGAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGGAAAT-GTAATTAGGTT-TTCCCCGGCAAATTACCTAACTGGGGCTCTTTTGTG--TTGCAC----AT--------GTGTCTTCGCCTAAAGGTTGTAAACAAATATGACGTCGCCTGTTGACAGGGAAGTTGAACCGTTTGAATGGCGATTTTGAATATG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ATCTTACATACTCGGCCAATTTCGTAA-TA-T--TC-----T---TATAAC--CGCGA---GAGAAGTC-CAGCGATACACCTAAATGGAAAT-GGAATTCTATT-TT-TCCGGCAGATTACGCTTAAGGAATTATTTTGTG--TCTTATT---ATCATTGTTctat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AC---GTATATCGTACATACTCGGCCAATTCCGTCA-TCCT--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGC---AGCTAGTC-CAAGGATCCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGTG--Tt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTCGTAAATACTCGGTCAATTTCGTCA-CCTT--TCGG-CAT---------------C---AAGTCATC-GAAAGATACACCAAAACCGGAAT-GTAATTCGCCT-TTCC------AACTACGCAAAAATATCTAGTTTATG--TCTCTTTCTAGTTGTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ACCATACATGTTCAACCAATTCAATCA-TC-T--TATG-TAT---TA-GAC--TTCGTTACAGGTAGCC-CAAGGATACAACTAATTGGAAAT-ATAATTTGGTTATT--CAGACGATTTACGCAAAATGAACTAGTTTGta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATGGAACCTGACCTGACA-AGTATACATAATGGGTCAA--CC-T---TC-T--TTAG-TA-----A-G-C--CTCGT---AGGTAATT-CAAGGATACATCATATTGGAAAT-ATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctaggaatattattgtaC---GCA-GTCGCGCATACTCGGTCAATTCCGTAA-AC-TTCTCGG-TAA---T--GGC--TTTGCCG-AGGTAGTT-CAA
gi|2                          :                                    ttggccaatccTTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACGAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGTACAAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACCTCTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATATAGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGTCTCGAAAACAAAATTGGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCAGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGAGAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAAACGTGGCTTCAAAAACCCAATGTTTGTAATAAAGATGTTATGCAGTTAGACACTTTAGATGTGTATATCTCTATGTTATAAGTGTATCTCCATGCT-GCCGTGTGTATTTAGGACAGGAAAT-TGAT---G
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgCA-ATCGTACATACTCGGGCAATCTCGTCATTC-T--TCGA--ATCTATA-GACTTCTCTT---AGGAAGTgtaatatgcaaatataatccctttaag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gacatcgcatttCGTAACTACTTGGCGATCTCCGGCA-TG-C--TCGGATAA---TA--AC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA-ATCGTACACACTCGGCCAATTCCGTCA-TCTT--TCGG-TAT---TA-AA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCGTCTTATATCTGTAGACAGATATGGCGCCA-ATGTTGACA
gi|3                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACATGCTGTTAATCC----------CGTATTCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATGTATAGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTAAATCAAATTAACAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCC-ACAATAAAGTATTGCTCAATGTTTACATCGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCTGGAATGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCAGTGTGTTGAAAATGGCGAATGTAAACAAAATGTTA-ACAAAAACAAAAATGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTATAATAAAGAGATTATGCAATTAGACACTTTTAATGCGTATTTCTCTAAGTAATAAGTGTATCATCATGCTTGGTGTGTGTATTAAGGACAGGGAAT-TGACA--GTA-AT
gi|4                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACCCGCTGTTAATCCAGACTTTTCATGTATGCAGTGTGCATAAAATAATGCTTATGTATTGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTGACAGTAATTGCATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCACAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCATGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAATCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGTAAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAATCATGGCTTCAGACACCAGATGTTTATAATAA--AGGTTATGCATTTAAGCACTTTAAACGCGTACATCTCTCAGTTATAAGTCTATCTTCATCCTGGGTGTGTGTATTTAGGACCAGGAAT-TGAT---Gatgccaatataatccttttaa
gi|5                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTATTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGCATGCACAAATTAATGTTAAGGTATTGACGCATAACCTTTATTT-AC---------G--TCAAATTATCAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAAATCGGGAACAAGTCTTCACGATGTTGTCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGGTTCGTTGAAAGTGGTGAATGTA-----------A-TCAAAAACAAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGTAACAAAAAGGTTATGAAATAAGACACTTTAGACGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACTGGGAAT-TGAC---Ggtaaaatgccaatataatcccttaaa
gi|6                          :                                                                                                                                          ACGTATTACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATAATGGCCAAAACTTTAGTACGTCA-GCAATAAAGTATTGTGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAATTTCCCAAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGATTCGTTAAAAATGGCAAATGTA-----------A-ACA-----AAAAACGCGGCTTCAAAAAACC--TGTCTGTAATAAAGAGGTTATGCAATAAGACACTTTAGATGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCATGTGTATCTTGGACAGGGAAT-TGAC---G------GTA-ATAT---GCCAATgtaatatgccagtataatcccttt
gi|6                          :                                              ttTAAAGGGATTATATTGGCAataatcccttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                              ttacgtattacctttatttacttgaaagttatcaaattaacagtaattgaataatggccaaaactttagtacgtcagcaataaagtattgtgcaatgtttacattgaactccgtaaatttcccaaacaaagccttgaaaacgagatcaggaacgagtcttcacgatgttatccgatgattgatcggaaacccaaaagcgattcgttaaaaatggcaaatgtaaacaaaaaacgcggcttcaaaaaacctgtctgtaataaagaggttatgcaataagacactttagatgcgtatatctctaagttataagtgtatcttcatgctgggcatgtgtatcttggacagggaattgacggtaataCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGGGGTTTCATTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATACCAAATCATGTTAAAATATATGTTTTGATTTAAGTGCTAATCATATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACATACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTCAATGGAAGACTCGGTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGGAAAT-GAAATTAGGTT-TTCTCCGGCGAATAACACAATAGGAACTTTTTTGTG--TTTCATTCGGATTGCTGCGTGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGAATATGAATATGGCCTATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTTTGATTAAAGTGCAAATCAAATAGGTACATTGAAAATTCTGTACAACGTACATAATACAGTAACGGTTTTGCGTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCAAGCTT-----------CTTCTTTGTACTTCTCCTCTTATTGATGCGTTAATGGAAGACCAGGTTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGAAAAC-ACGATGAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGAACTTTTT--------------GGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAATAACTATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAGCTATTCGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATGCCAAATCTTTTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTGCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTGTATAACGTACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGGGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTTCAGCTTTTACTTTGCTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTAT---TACGTTAAGGGAAGACCCGGTTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TCACAAAAATAGCTTAAATCGAGGTTTCAAGAACGTGTATGTTGTTATAATCGAAAGAGCTGAAGGCGGTTTGTTAAAAATGACGAAGGTAAACGTTGCACATATTTGCCTATAAAACAAAGATTATAACATTAGATAGTTTGAAAAATGGATGTGTACATGCTCTAGTTGTAAGTATAC
Unaligned ( gi|25 ): TACACCTCGTGTATAGCTCTAGAATACACCAA






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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ATCTTACATACTCGGCCAATTTCGTAA-TA-T--TC-----T---TATAAC--CGCGA---GAGAAGTC-CAGCGATACACCTAAATGGAAAT-GGAATTCTATT-TT-TCCGGCAGATTACGCTTAAGGAATTATTTTGTG--TCTTATT---ATCATTGTTctat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AC---GTATATCGTACATACTCGGCCAATTCCGTCA-TCCT--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGC---AGCTAGTC-CAAGGATCCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGTG--Tt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTCGTAAATACTCGGTCAATTTCGTCA-CCTT--TCGG-CAT---------------C---AAGTCATC-GAAAGATACACCAAAACCGGAAT-GTAATTCGCCT-TTCC------AACTACGCAAAAATATCTAGTTTATG--TCTCTTTCTAGTTGTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ACCATACATGTTCAACCAATTCAATCA-TC-T--TATG-TAT---TA-GAC--TTCGTTACAGGTAGCC-CAAGGATACAACTAATTGGAAAT-ATAATTTGGTTATT--CAGACGATTTACGCAAAATGAACTAGTTTGta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATGGAACCTGACCTGACA-AGTATACATAATGGGTCAA--CC-T---TC-T--TTAG-TA-----A-G-C--CTCGT---AGGTAATT-CAAGGATACATCATATTGGAAAT-ATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctaggaatattattgtaC---GCA-GTCGCGCATACTCGGTCAATTCCGTAA-AC-TTCTCGG-TAA---T--GGC--TTTGCCG-AGGTAGTT-CAA
gi|2                          :                                    ttggccaatccTTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACGAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGTACAAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACCTCTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATATAGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGTCTCGAAAACAAAATTGGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCAGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGAGAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAAACGTGGCTTCAAAAACCCAATGTTTGTAATAAAGATGTTATGCAGTTAGACACTTTAGATGTGTATATCTCTATGTTATAAGTGTATCTCCATGCT-GCCGTGTGTATTTAGGACAGGAAAT-TGAT---G
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgCA-ATCGTACATACTCGGGCAATCTCGTCATTC-T--TCGA--ATCTATA-GACTTCTCTT---AGGAAGTgtaatatgcaaatataatccctttaag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gacatcgcatttCGTAACTACTTGGCGATCTCCGGCA-TG-C--TCGGATAA---TA--AC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA-ATCGTACACACTCGGCCAATTCCGTCA-TCTT--TCGG-TAT---TA-AA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCGTCTTATATCTGTAGACAGATATGGCGCCA-ATGTTGACA
gi|3                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACATGCTGTTAATCC----------CGTATTCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATGTATAGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTAAATCAAATTAACAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCC-ACAATAAAGTATTGCTCAATGTTTACATCGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCTGGAATGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCAGTGTGTTGAAAATGGCGAATGTAAACAAAATGTTA-ACAAAAACAAAAATGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTATAATAAAGAGATTATGCAATTAGACACTTTTAATGCGTATTTCTCTAAGTAATAAGTGTATCATCATGCTTGGTGTGTGTATTAAGGACAGGGAAT-TGACA--GTA-AT
gi|4                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACCCGCTGTTAATCCAGACTTTTCATGTATGCAGTGTGCATAAAATAATGCTTATGTATTGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTGACAGTAATTGCATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCACAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCATGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAATCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGTAAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAATCATGGCTTCAGACACCAGATGTTTATAATAA--AGGTTATGCATTTAAGCACTTTAAACGCGTACATCTCTCAGTTATAAGTCTATCTTCATCCTGGGTGTGTGTATTTAGGACCAGGAAT-TGAT---Gatgccaatataatccttttaa
gi|5                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTATTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGCATGCACAAATTAATGTTAAGGTATTGACGCATAACCTTTATTT-AC---------G--TCAAATTATCAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAAATCGGGAACAAGTCTTCACGATGTTGTCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGGTTCGTTGAAAGTGGTGAATGTA-----------A-TCAAAAACAAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGTAACAAAAAGGTTATGAAATAAGACACTTTAGACGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACTGGGAAT-TGAC---Ggtaaaatgccaatataatcccttaaa
gi|6                          :                                                                                                                                          ACGTATTACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATAATGGCCAAAACTTTAGTACGTCA-GCAATAAAGTATTGTGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAATTTCCCAAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGATTCGTTAAAAATGGCAAATGTA-----------A-ACA-----AAAAACGCGGCTTCAAAAAACC--TGTCTGTAATAAAGAGGTTATGCAATAAGACACTTTAGATGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCATGTGTATCTTGGACAGGGAAT-TGAC---G------GTA-ATAT---GCCAATgtaatatgccagtataatcccttt
gi|6                          :                                              ttTAAAGGGATTATATTGGCAataatcccttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                              ttacgtattacctttatttacttgaaagttatcaaattaacagtaattgaataatggccaaaactttagtacgtcagcaataaagtattgtgcaatgtttacattgaactccgtaaatttcccaaacaaagccttgaaaacgagatcaggaacgagtcttcacgatgttatccgatgattgatcggaaacccaaaagcgattcgttaaaaatggcaaatgtaaacaaaaaacgcggcttcaaaaaacctgtctgtaataaagaggttatgcaataagacactttagatgcgtatatctctaagttataagtgtatcttcatgctgggcatgtgtatcttggacagggaattgacggtaataCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGGGGTTTCATTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATACCAAATCATGTTAAAATATATGTTTTGATTTAAGTGCTAATCATATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACATACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTCAATGGAAGACTCGGTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGGAAAT-GAAATTAGGTT-TTCTCCGGCGAATAACACAATAGGAACTTTTTTGTG--TTTCATTCGGATTGCTGCGTGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGAATATGAATATGGCCTATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTTTGATTAAAGTGCAAATCAAATAGGTACATTGAAAATTCTGTACAACGTACATAATACAGTAACGGTTTTGCGTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCAAGCTT-----------CTTCTTTGTACTTCTCCTCTTATTGATGCGTTAATGGAAGACCAGGTTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGAAAAC-ACGATGAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGAACTTTTT--------------GGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAATAACTATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAGCTATTCGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATGCCAAATCTTTTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTGCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTGTATAACGTACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGGGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTTCAGCTTTTACTTTGCTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTAT---TACGTTAAGGGAAGACCCGGTTA


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .            .                                              C                                                                                                                                          C       A                                          G                                                                             G                         .    A     .      C                    .  T .     .  T     .   .      CG         G                       .           .             T  C                   .       TCTA        TG                                                                    .                                                                         .    .                                                                             TT                                TGA        T        A
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TCACAAAAATAGCTTAAATCGAGGTTTCAAGAACGTGTATGTTGTTATAATCGAAAGAGCTGAAGGCGGTTTGTTAAAAATGACGAAGGTAAACGTTGCACATATTTGCCTATAAAACAAAGATTATAACATTAGATAGTTTGAAAAATGGATGTGTACATGCTCTAGTTGTAAGTATAC
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Reference ( family-3185 )     : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCGGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGCGAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGTAATAAAGAGGTTATGCAATTAGACACTTTAGACGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACAGGGAAT-TGAC---GCA-ATCGTACATACTCGGCCAATTCCGTCA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AGGTAGTC-CAAGGATACACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACGCAACAGGAACTTTTTTGTG--TTTCATTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCGTTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTTTGATTGAAGTGCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACGTACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTTAANGGAAGACCNGGTTA
gi|1                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATATAGTGACGTATAACCTTTTTTTTACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTTATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAACCCTCGGAAACGAGATTGGGAACGAGTCTTCACGATGATATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGTAAATGTT-----------TTACAAAAACAAAATCGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGAAATAAAGAGGTTATGCAATTAGACACTTTAGACGCGCATATCTCTAAGTTATAAGTATATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACATGGAAT-TGAC---GCA-ATCGTAAATACTCGGCCAATTCCGTCA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AGGTAGTC-CAAGGATCCACCAAATCGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGG--GTTCTTTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTTATGTTTGTAAACAAATATGGCGCCGTATGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATTGCAAATGCCAAATCATGTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTTCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTATACAATGTACATGATACAGTACCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTAACTTTGTTATTTCTTTGTATTTTTCCTCTTATTATTACGTTATGGGAAGACCGGGTTA
gi|10                         : atggtgcagcatttagtggttaatataatatttataaatactttaaTTAATGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGCACCAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAAC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gatttgtttgttagttcaaatatttaacactaggtcttcctgggacctggaagagtaaccagtacgcaagcacacctatctctgcaaataactgataacttgctcacttgaagcaactgtgacagacaaatgacaatgagaagcaatgtcgtatatcaatcatcacatagtttgtggccacagtggcgtagctgacccCCAAATCGGAAAAAGTGATAAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGCACTTTTTTGTG--TTTCATTCGTATTGTTGTGTGTGTCTTCTCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGCCAGGGACGCTGAACTGTTTGAA-GGCGATTTGAAATATGGCCAATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTATGAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGGAAAT-GTAATTAGGTT-TTCCCCGGCAAATTACCTAACTGGGGCTCTTTTGTG--TTGCAC----AT--------GTGTCTTCGCCTAAAGGTTGTAAACAAATATGACGTCGCCTGTTGACAGGGAAGTTGAACCGTTTGAATGGCGATTTTGAATATG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ATCTTACATACTCGGCCAATTTCGTAA-TA-T--TC-----T---TATAAC--CGCGA---GAGAAGTC-CAGCGATACACCTAAATGGAAAT-GGAATTCTATT-TT-TCCGGCAGATTACGCTTAAGGAATTATTTTGTG--TCTTATT---ATCATTGTTctat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AC---GTATATCGTACATACTCGGCCAATTCCGTCA-TCCT--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGC---AGCTAGTC-CAAGGATCCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGTG--Tt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTCGTAAATACTCGGTCAATTTCGTCA-CCTT--TCGG-CAT---------------C---AAGTCATC-GAAAGATACACCAAAACCGGAAT-GTAATTCGCCT-TTCC------AACTACGCAAAAATATCTAGTTTATG--TCTCTTTCTAGTTGTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ACCATACATGTTCAACCAATTCAATCA-TC-T--TATG-TAT---TA-GAC--TTCGTTACAGGTAGCC-CAAGGATACAACTAATTGGAAAT-ATAATTTGGTTATT--CAGACGATTTACGCAAAATGAACTAGTTTGta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATGGAACCTGACCTGACA-AGTATACATAATGGGTCAA--CC-T---TC-T--TTAG-TA-----A-G-C--CTCGT---AGGTAATT-CAAGGATACATCATATTGGAAAT-ATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctaggaatattattgtaC---GCA-GTCGCGCATACTCGGTCAATTCCGTAA-AC-TTCTCGG-TAA---T--GGC--TTTGCCG-AGGTAGTT-CAA
gi|2                          :                                    ttggccaatccTTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACGAACACGCTGTTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGTGTGTACAAAATAATGCTTATGTATTGACGTATAACCTCTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATATAGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGTCTCGAAAACAAAATTGGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCAGAAACCCGAAAGCGGTTTGTTGAAAATGGAGAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAAACGTGGCTTCAAAAACCCAATGTTTGTAATAAAGATGTTATGCAGTTAGACACTTTAGATGTGTATATCTCTATGTTATAAGTGTATCTCCATGCT-GCCGTGTGTATTTAGGACAGGAAAT-TGAT---G
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgCA-ATCGTACATACTCGGGCAATCTCGTCATTC-T--TCGA--ATCTATA-GACTTCTCTT---AGGAAGTgtaatatgcaaatataatccctttaag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gacatcgcatttCGTAACTACTTGGCGATCTCCGGCA-TG-C--TCGGATAA---TA--AC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA-ATCGTACACACTCGGCCAATTCCGTCA-TCTT--TCGG-TAT---TA-AA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atA-TC-T--TCGG-TAT---TA-GAC--CTCGT---AAATAATTGTAGGAATACACCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCGTCTTATATCTGTAGACAGATATGGCGCCA-ATGTTGACA
gi|3                          :                                               TTAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACATGCTGTTAATCC----------CGTATTCAGTGTGCACAAAATAATGCTTATGTATAGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTAAATCAAATTAACAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCC-ACAATAAAGTATTGCTCAATGTTTACATCGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCTGGAATGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCGAAAGCAGTGTGTTGAAAATGGCGAATGTAAACAAAATGTTA-ACAAAAACAAAAATGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTATAATAAAGAGATTATGCAATTAGACACTTTTAATGCGTATTTCTCTAAGTAATAAGTGTATCATCATGCTTGGTGTGTGTATTAAGGACAGGGAAT-TGACA--GTA-AT
gi|4                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACCCGCTGTTAATCCAGACTTTTCATGTATGCAGTGTGCATAAAATAATGCTTATGTATTGATGTATAACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTGACAGTAATTGCATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCACAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCATGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAATCCGAAAGCGGTTCGTTGAAAATGGTAAATGTA-----------A-ACAAAAACAAAATCATGGCTTCAGACACCAGATGTTTATAATAA--AGGTTATGCATTTAAGCACTTTAAACGCGTACATCTCTCAGTTATAAGTCTATCTTCATCCTGGGTGTGTGTATTTAGGACCAGGAAT-TGAT---Gatgccaatataatccttttaa
gi|5                          :                                                TAAAGGGATTATATTGGCAAGTAACACAAACACGCTATTAATCCAGACTTTTCCTGTATGCAGCATGCACAAATTAATGTTAAGGTATTGACGCATAACCTTTATTT-AC---------G--TCAAATTATCAGTAATTGAATATTGGCCAAAACTTTAATACGTCCCGCAATAAAGTATTGCGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAACTTCCCGAACAAAGCCTCGAAAACGAAATCGGGAACAAGTCTTCACGATGTTGTCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGGTTCGTTGAAAGTGGTGAATGTA-----------A-TCAAAAACAAAAACGTGGCTTCAGAAACCCGATGTTTGTAACAAAAAGGTTATGAAATAAGACACTTTAGACGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCGTGTGTATTTAGGACTGGGAAT-TGAC---Ggtaaaatgccaatataatcccttaaa
gi|6                          :                                                                                                                                          ACGTATTACCTTTATTT-ACTTGAAAGTTA--TCAAATTAACAGTAATTGAATAATGGCCAAAACTTTAGTACGTCA-GCAATAAAGTATTGTGCAATGTTTACATTGAACTCCGTAAATTTCCCAAACAAAGCCTTGAAAACGAGATCAGGAACGAGTCTTCACGATGTTATCCGATGATTGATCGGAAACCCAAAAGCGATTCGTTAAAAATGGCAAATGTA-----------A-ACA-----AAAAACGCGGCTTCAAAAAACC--TGTCTGTAATAAAGAGGTTATGCAATAAGACACTTTAGATGCGTATATCTCTAAGTTATAAGTGTATCTTCATGCTGGGCATGTGTATCTTGGACAGGGAAT-TGAC---G------GTA-ATAT---GCCAATgtaatatgccagtataatcccttt
gi|6                          :                                              ttTAAAGGGATTATATTGGCAataatcccttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                              ttacgtattacctttatttacttgaaagttatcaaattaacagtaattgaataatggccaaaactttagtacgtcagcaataaagtattgtgcaatgtttacattgaactccgtaaatttcccaaacaaagccttgaaaacgagatcaggaacgagtcttcacgatgttatccgatgattgatcggaaacccaaaagcgattcgttaaaaatggcaaatgtaaacaaaaaacgcggcttcaaaaaacctgtctgtaataaagaggttatgcaataagacactttagatgcgtatatctctaagttataagtgtatcttcatgctgggcatgtgtatcttggacagggaattgacggtaataCACCAAATTGGAAAT-GTGATTAGGTT-TTCCCCGGCGAATAACACAACAGGAACTTTTTTGGGGGTTTCATTCGGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATACCAAATCATGTTAAAATATATGTTTTGATTTAAGTGCTAATCATATAAGT--GTC--AAATTCTGTACAACATACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCCAGCTTTTACTTTGTTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTATTAATACGTCAATGGAAGACTCGGTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGGAAAT-GAAATTAGGTT-TTCTCCGGCGAATAACACAATAGGAACTTTTTTGTG--TTTCATTCGGATTGCTGCGTGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAACAAATATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAACCATTTGAA-GGCGAATATGAATATGGCCTATGCCAAATCATGTTTAAATATATGTTTTGATTAAAGTGCAAATCAAATAGGTACATTGAAAATTCTGTACAACGTACATAATACAGTAACGGTTTTGCGTACGAGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTCAAGCTT-----------CTTCTTTGTACTTCTCCTCTTATTGATGCGTTAATGGAAGACCAGGTTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACCAAATTGAAAAC-ACGATGAGGTT-TTCCCCAGCGAATAACACAACAGGAACTTTTT--------------GGATTGTTGTTGGTGTCTTCGCCTAATGTTTGTAAATAACTATGGCGTCGTCTGTTGACAGGGACGCTGAGCTATTCGAA-GGCGATTTGGAATATGGCCAATGCCAAATCTTTTTTAAATACATGTTTTGATTGAAGTGCAAATCAAATAAGT--GTC--AAATTCTGTATAACGTACATGATACAGTAGCGGTTTTGCCTACGGGCTCGGGAGGAAAAGTTTGATTTTTCAGCTTTTACTTTGCTATTTCTTTGTATTTCTCCTCTTAT---TACGTTAAGGGAAGACCCGGTTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TCACAAAAATAGCTTAAATCGAGGTTTCAAGAACGTGTATGTTGTTATAATCGAAAGAGCTGAAGGCGGTTTGTTAAAAATGACGAAGGTAAACGTTGCACATATTTGCCTATAAAACAAAGATTATAACATTAGATAGTTTGAAAAATGGATGTGTACATGCTCTAGTTGTAAGTATAC
Unaligned ( gi|25 ): TACACCTCGTGTATAGCTCTAGAATACACCAA