lowQualScore : 111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 2 111 1 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 111111 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222 555555555555555555 2 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 4444444444 1111111111111111111111111111111111111111111111111 111111 222222 11111 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 5 6 7 3 0 888 0 7 6 4 4 55 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 3 6 888888 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 0 7 0 333 6 2 4 555555555555555555 6 0 0 3 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88 77 7 66 0000000000 9 2222222222222222222222222222222222222222222222222 666666 111111 33333 4 11 99999999 66 777 88888888 1111111 3 1 22 5 2 555 2 2 1 5555 4 666666 333 0 0 2 33 44 111 9 6
lowQualScore : . . . . . ... . . . . . .. ................................................................................. . . . ...... . .............................................................................................. . . . . . ... . . . .................. . . . . . ........................................................................................................................ .. .. . .. .......... . ................................................. ...... ...... ..... . .. ........ .. ... ........ ....... . . .. . . ... . . . .... . ...... ... . . . .. .. ... . .
lowQualScore : 5 0 3 7 7 777 7 0 0 0 0 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 0 333333 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 5 2 3 7 333 0 5 0 555555555555555555 0 0 0 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 55 0 99 1111111111 6 2222222222222222222222222222222222222222222222222 444444 999999 00000 4 00 66666666 11 888 44444444 8888888 1 5 00 4 9 000 9 9 4 3333 6 444444 999 6 6 2 77 66 444 6 0
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTGAAAGCGTATCGTTTAAACGATTAAACCAAAGACGTAACAATGAAAATCAATTTGTGTTTGATNACAANTATNNAAACGCCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTNATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATC---AATTTTATATACATGATTTGATGTNATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATNTTGTTAACTTGGTTAAAGTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCGTGCAGATGGTCAGAGGTGGCAACACCNGTCTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGCTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATTTTTTTCCTGTATATATCTTTG----------ATT---TTAA--AT----T--T----------G-----AGA------GA--GA--GAG----GGAGAGAGACGTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( gi|1 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAAGAAGCGTATCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGAAACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAAATATTTAAACGCCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATC---AATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTGATAACT---------TTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATT---TTAA-----------T----------G-----AGA------GA--GA--GAG----AGAGAGAGACGTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGAGCCGGATTTGCGT
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTAGAAGCGTATCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGTAACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAAATATCTAAACGCCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAA--------------ACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATC---AATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACT---------TTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATT---TTAA-----------T----------
gi|3 : caattaagttAACGGTTTTT-AAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTGAAAGCGTATCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGTAATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAATTATAAAAACGCCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATC---AATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTGGTTAAAG---------TTAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|5 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAACAA-TTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAAAGACGTAACAATGAAAATCAAT
gi|32 : tAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCAgttttcatacatcccagttattagaataatcaaatcaatttgcgtttaatttaaaactaaactttattatttacgccgggcaatatgcaaacaaataaatagacacaatgttgacacaatgtaaaccaattttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaactgtaaattaaaaacataccgcttttcgttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttctaaaagagtaccatctgcattataaa
gi|31 : attcagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|14 : aattgagttGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTG
gi|5 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAA
gi|3 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgagtcgtacattgtgcaaacaattacaacaataatttgaacaaggagaacaatttgcatttcattgaaagcatatggtttaaatgattaaaccaaagacgtaacaatgaaaatcaatgttttcatacatcccagttattagaataatcaaatcaatttgcgtttaatttCATGTATATAAAATT---GATATTGAATATCTGTACTTTTATACACATG
gi|14 : aacggtttttaaaaattaaaggtaaacttgattacttgggtcgtacattgtgcaaacaattacaacaattatttgaacaaggaaaacaatttgcatttgattgaaagcgtatcgtttaaacgcttaaaccaaagacgtaataatgaaaatcagtttgtgtttgataacaattataaaaacgccaatacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaactaatcttgattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaatagacacaatgatgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaactgtaaattaaaaatgtaccgcttttcgttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagtactaatagagtaccatccgCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatttgatgtcatacttaaacagactgctatttgttgttatactagattttagtgtttcattttgttaacttggttaaagttaa
gi|33 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAGTTTTTGT--GTTTT--------TTTTgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATT---TTAA-----------aattat
gi|16 : actgtgctgcatATAGGTTTCGT--GTTTTTTT--ATCTTTTTCTTTTATATATCTTTG----------ATTTTATTAA-----------TATTGTTTTAAG-----AGATAAAATGA--GA--GAG----AGAGAGCGATGTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATTATTATATG------TGTC---CTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|6 : ttgaatATAGTTTTTGT--GTT-------GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT-----------------TTAAAAATATCGTCTT----------G-----AGA------GATAGAATGAG----GGAGAGAGATGTATATAATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A---GCT-TCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTTATTGTATGCACTAATGCA---CTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAa
gi|12 : atatttattaatttatatATAGTTTTTGT--GTTGT------TTTTTTACCTGTATATATCTTT------------TC---ATAAGTATCGTCT--T----------G-----AGA------GATAGAACGAG----GGAAAGAGATGTATATAATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATACGTG------------TTTAAT-TCCCAAAACTA---C-C-TACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTTATTGTA--------TGCA---CTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATACTTTTTGT--GTTGT--------TTTTTCCTGTATATATATTT-----------------TTAAAAATATCGTCTT----------G-----AGA------AA--TA--GAA----CAAGGGAGA-ATATATAATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAAT-TCCCAAAAA-AAATG-C-TACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTTATTGTA--------TGCA---CTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|24 : tatatttcttaattttaatTTTTGT--GTTGT-----TTTTTTTACCTGTATATATCTTTATAAAAGTATCGTC---TTAA-----------C----------GTCTTAAGA------GA--TA--GAACAATGGAGATAGATGCATATAATTATATTCAT--Tatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|28 : -----------T----------G-----AGG------GA--AA--GAG----AGAGACATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|7 : cctgcctgtatttttaatagtaatgttttgagagatagatA------GA--GA--GAG----AGCAAGCAACGTATATAGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAATATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAgttg
gi|2 : GACGTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|4 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncACGTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|8 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaATATA-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCA----------------------TGTATA------TGTA---TTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|18 : ataaaCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATTATTATA--------TGCA---CTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|23 : -----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A---G-T-TACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATTATTATGTG------T------TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|10 : taTTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A---G-C-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTTATTATATG------TGTA---CTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|9 : AATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A---G-T-TAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|19 : ttTGTGTTTCTCCTAATTTAAT-TCCCAAAAT-T---A-TGTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT------TG------TACA---TTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAA-TCCGCAATAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
gi|23 : ----TTATTAATCATAATTTG------TTTATTCCTATTTAATTTCCAA--ATC-AGTT-A--CTTTT-CAATTACAAATCCTCATTAATTAataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|20 : tactaactaaattgat----TCACTT-TCATTATATT------TGTA---CAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAA-TCCGCAGCAATttatgtgtttttttaattaccggtatgtttttaat
gi|17 : aattaatatccaaaattatTTATTATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|15 : ATATG------TGTA---CTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|4 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|7 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTggggccggattgtcc
gi|11 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTggggccagattgtcca
gi|9 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTggggccggattgtccat
gi|17 : ttaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcctgttaccagtcattttttcaataaaaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTggggccggattgtccataa
gi|15 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTggggccgga
11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 222222 111 1111111 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777777777 22 11 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 1111 8888888888888888888888888888888 4444444444 1111 1111 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 9 0 8 0 1 1 7777777 888888 3 111 2 9999999 2 00 8 2 1 1 0 3 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 1 1 0 1 000000000 44 0 33 0 1 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 6 0000 777 4 9999 1 7777777777777777777777777777777 2222222222 0000 0000 55 1 7777 00 33333333 55 777 55555555 0000000 2 22 2 33 2 0 5555 444 666666 0 2 33 33 000
lowQualScore : . . . . . . ....... ...... . ... . ....... . .. . . . . . . . .. ............................................................................................. . . . . . ......... .. . .. . . . ........................................................................................................................ . . . .... ... . .... . ............................... .......... .... .... .. . .... .. ........ .. ... ........ ....... . .. . .. . . .... ... ...... . . .. .. ...
lowQualScore : 0 0 0 8 0 0 0000000 888888 2 555 5 8888888 0 00 0 0 8 0 0 2 5 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 0 7 0 777777777 33 7 33 7 0 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7 6666 888 4 7777 6 1111111111111111111111111111111 9999999999 6666 6666 55 4 7777 00 99999999 55 000 88888888 8888888 9 33 7 77 7 7 3333 111 444444 6 2 77 77 666
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTGGAAGCGTATCGTTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAAATATNT-----AAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTT--------TTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTG----------ATTNTA--A-A--TATCGTCTTGAGAGATA----GA--GAG----GGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( family-3170 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTGAAAGCGTATCGTTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGTGTTTGATNACAANTATNN-----AAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTNATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTNATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATNTTGTTAACTTGGTTAAAGTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCGTGCAGATGGTCAGAGGTGGCAACACCNGTCTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGCTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATTTTTTTCCTGTATATATCTTTG----------ATTTTA--A-A--T------TTGAGAGA------GA--GAG----GGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
gi|1 : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAAGAAGCGTATCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGA-AACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAAATATTT-----AAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGT-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTT---------TGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATTTTA--A------------TGAGAGA------GA--GAG----AGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTA
gi|10 : TTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A--G-CTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTT---ATTATATG------TGTACTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggagccggatttgcgt
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|11 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|12 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG----TTTTTG---TGTTGT----TTTTTTACCTGTATATATCTTT------------TCATA--A-G--TATCGTCTTGAGAGATA----GAACGAG----GGA----AAGAG--ATGTATAT----AATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATA--CGTGTTT-----AATT------CCCAAAACTA--C-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTT---ATTGTA--------TGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAggggccggattgtccat
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATAC----TTTTTG---TGTTGT------TTTTTCCTGTATATATATTT------------TTAAA--A-A--TATCGTCTTGAGAAA------TA--GAA----CAA----GGGAG--A-ATATAT----AATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAATTCCCAAAAAA-AATG-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTA--------TGCACTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|14 : tatatttcttaattttaatCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|14 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTGgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|15 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|15 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|16 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG----GTTTCG---TGTTTTTTTATCTTTTTCTTTTATATATCTTTG----------ATTTTATTA-A--TATTGTTTTAAGAGATAAAATGA--GAG----AGA----GAGAGCGATGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTCCTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAggggccggattgtcca
gi|17 : ttgaatTT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAa
gi|17 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|18 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATT---ATTATA--------TGCACTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAggggccgga
gi|19 : TGTGTTTCTCCTAATTTAATTCCCAAAATT-A--T-GTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT---------TG------TACATTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAAT-CCGCAATAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTAGAAGCGTATCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGT-AACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAAATATCT-----AAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATAT--------------TTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACT---------TTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAAT-GTCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATTTTA--A-ataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|2 : caattaagttG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|20 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAA----TTATTCACTTTCATTATATT------TGTACAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAAT-CCGCAGCAAT
gi|23 : aattaatatccaa-----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A--G-TTACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATT---ATTATGTG------T---TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|24 : taTTTTG---TGTTGT---TTTTTTTACCTGTATATATCTTTATAAAAGTATCGTCTTA--ACG--TC-----TTAAGAGA------TA--GAACAATGGA----GATAG--ATGCATAT----AATTATATTCAT--T
gi|28 : CCTGCCTGTATTTTTA----------ATAGTA--A-TGTT------TTGAGAGATA----GATTGAG----GGAAAGAGAGAG--ACATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|3 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTGAAAGCGTATCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGT-AATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAATTATAA-----AAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTGGTTAAAGTTAAgttg
gi|31 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|32 : aattgagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|33 : attcagttTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAG----TTTTTG---TGTTTT----TTTT
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT---ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTG----------ATTTTA--A-A--aattat
gi|4 : actgtgctgcat--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|4 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|5 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAACAATTT-GCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATggggccggattgtcc
gi|5 : tATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAA-CAATTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAA---AGACGTA--ACAATG-----A-AAATCAA--TGTT-TTCATACATCCCAGTTATTAGAATAATCAAATCAATTTGCGTTTAATTTAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAAgttttcatacatcccagttattagaataatcaaatcaatttgcgtttaatttaaaactaaactttattatttacgccgggcaatatgcaaacaaataaatagacacaatgttgacacaatgtaaaccaattttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaactgtaaattaaaaacataccgcttttcgttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttctaaaagagtaccatctgcattataaa
gi|6 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgagtcgtacATAG----TTTTTG---TGTT-----GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT------------TTAAA--A-A--TATCGTCTTGAGAGATA----GAATGAG----GGA----GAGAG--ATGTATAT----AATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A--GCTTCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTATGCACTAATGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|7 : atatttattaatttatatAGA------GA--GAG----AGC----AAGCA--ACGTATAT----AGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAAT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|7 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|8 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAT----A-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A--G-TTAC-TTTCA-------------------------TGTATA------TGTATTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAggggccagattgtcca
gi|9 : ataaaAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|9 : ttGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1111 11 1 11 1111 222222 111 1111111 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 11 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 222222 11 222222222222 1111 33 1111 11 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 5 3 9999 33 0 3 2 33 8888 888888 3 000 1 9999999 1 00 8 1 1 1 0 3 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 7 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 6 0000 777 4 111111 44 1 66 111111111111 0000 44 0000 1 11 7777 00 33333333 55 777 55555555 0000000 2 22 2 33 2 0 5555 444 666666 0 2 33 33 000
lowQualScore : . . .... .. . . . .. .... ...... . ... . ....... . .. . . . . . . . .. ............................................................................................. . . . . .. . ........................................................................................................................ . . .... ... . ...... .. . .. ............ .... .. .... . .. .... .. ........ .. ... ........ ....... . .. . .. . . .... ... ...... . . .. .. ...
lowQualScore : 5 3 5555 88 0 2 0 88 5555 888888 2 888 0 8888888 0 00 0 0 0 2 0 2 5 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 3 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 6666 888 4 333333 77 0 11 333333333333 6666 44 6666 4 00 7777 00 99999999 55 000 88888888 8888888 9 33 7 77 7 7 3333 111 444444 6 2 77 77 666
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNTA--AATAT--------CGTCTTGAGAGATA----GAACGAGGGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( family-3170 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTG---GAAGCGTA--TCGTTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNTA--AATAT--------CGTCTTGAGAGATA----GA--GAGGGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
gi|1 : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGA-AACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATT---TAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGT-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTT-GATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTA--A-----------------TGAGAG--A----GA--GAGAGA----GAGAG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTA
gi|10 : TTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A--G-CTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTT---ATTATATG------TGTACTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggagccggatttgcgt
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|11 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|12 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG----TTTTTG---TGTTGT----TTTTTTACCTGTATATATCTTT--TCATA--AGTAT--------CGTCTTGAGAGATA----GAACGAGGGA----AAGAG--ATGTATAT----AATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATA--CGTGTTT-----AATT------CCCAAAACTA--C-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTT---ATTGTA--------TGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAggggccggattgtccat
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATAC----TTTTTG---TGTTGT------TTTTTCCTGTATATATATTT--TTAAA--AATAT--------CGTCTTGAGAAATA----GAACAAGGGA----GA-------ATATAT----AATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAATTCCCAAAAAA-AATG-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTA--------TGCACTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|14 : tatatttcttaattttaatCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|14 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTGgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|15 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|15 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|16 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG----GTTTCG---TGTTTTTTTATCTTTTTCTTTTATATATCTTTGATTTTATTAATAT--------TGTTTTAAGAGATAAAATGA--GAGAGA----GAGAGCGATGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTCCTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAggggccggattgtcca
gi|17 : ttgaatTT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAa
gi|17 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|18 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATT---ATTATA--------TGCACTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAggggccgga
gi|19 : TGTGTTTCTCCTAATTTAATTCCCAAAATT-A--T-GTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT---------TG------TACATTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAAT-CCGCAATAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGT-AACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATC---TAAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATAT--------------TTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAAC-TTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAAT-GTCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAG----TTTTTG---TGTTTT---ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTA--Aataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|2 : caattaagttG--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|20 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAA----TTATTCACTTTCATTATATT------TGTACAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAAT-CCGCAGCAAT
gi|23 : aattaatatccaa-----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A--G-TTACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATT---ATTATGTG------T---TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|24 : taTTTTG---TGTTGT---TTTTTTTACCTGTATATATCTTTA--TAAA--AGTATCGTCTTAACGTCTTAAGAGATA----GAACAATGGA----GATAG--ATGCATAT----AATTATATTCAT--T
gi|28 : CCTGCCTGTATTTTTAATAGTA--A------------TGTTTTGAGAGATA----GATTGAGGGAAAGAGAGAG--ACATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|3 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTG---AAAGCGTA--TCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGT-AATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAA--TTATA---AAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTgttg
gi|31 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCAggttaaagttaa
gi|32 : aattgagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|33 : attcagttTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAG----TTTTTG---TGTTTT------TTTT
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT---ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTA--AAaattat
gi|4 : actgtgctgcat--ACGTATAT----AATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|4 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|5 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAA-CAATTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAA---AGACGTA--ACAATG-----A-AAATCAA--TGTT-TTCATACATCCCAGTTATTAGAATAATCAAATCAATTTGCGTTTAATTTAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAAggggccggattgtcc
gi|6 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacATAG----TTTTTG---TGTT-----GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT--TTAAA--AATAT--------CGTCTTGAGAGATA----GAATGAGGGA----GAGAG--ATGTATAT----AATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A--GCTTCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTATGCACTAATGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|7 : atatttattaatttatatA----GA--GAGAGA----GCAAGCAACGTATAT----AGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAAT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|7 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|8 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAT----A-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A--G-TTAC-TTTCA-------------------------TGTATA------TGTATTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAggggccagattgtcca
gi|9 : ataaaAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|9 : ttGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 111 11 1 11 1111 222222 111 1111111 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 11 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333333 11 11111111 33333333333333333333333333333333333333 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 5 3 777 33 0 3 2 33 8888 888888 3 000 1 9999999 1 00 8 1 1 1 0 3 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 7 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 6 66 4 22222222 44 555 66 7 88888888 22 9999 66666666666666666666666666666666666666 00 33333333 55 777 55555555 0000000 2 22 2 33 2 0 5555 444 666666 0 2 33 33 000
lowQualScore : . . ... .. . . . .. .... ...... . ... . ....... . .. . . . . . . . .. ............................................................................................. . . . . .. . ........................................................................................................................ . . .. . ........ .. ... .. . ........ .. .... ...................................... .. ........ .. ... ........ ....... . .. . .. . . .... ... ...... . . .. .. ...
lowQualScore : 5 3 555 88 0 2 0 88 5555 888888 2 888 0 8888888 0 00 0 0 0 2 0 2 5 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 3 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 11 4 44444444 77 111 11 0 11111111 11 4444 88888888888888888888888888888888888888 00 99999999 55 000 88888888 8888888 9 33 7 77 7 7 3333 111 444444 6 2 77 77 666
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( family-3170 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
gi|1 : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGA-AACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATT---TAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGT-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTT-GATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--A---------TGA--------GAG--AGA--GAGA----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTA
gi|10 : TTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A--G-CTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTT---ATTATATG------TGTACTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggagccggatttgcgt
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|11 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|12 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGTTTTTGT--GTTGT------TTTTTTACCTGTATATATCTTT--TCAT-A--AGTATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAA--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATA--CGTGTTT-----AATT------CCCAAAACTA--C-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTT---ATTGTA--------TGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAggggccggattgtccat
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATACTTTTTGT--GTTGT--------TTTTTCCTGTATATATATTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAAATAGAACAAGG----GAG--------------------A-----------------ATATATAATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAATTCCCAAAAAA-AATG-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTA--------TGCACTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|14 : tatatttcttaattttaatCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|14 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTGgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|15 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|15 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|16 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGGTTTCGT--GTTTTTTT--ATCTTTTTCTTTTATATATCTTTGATTTT-ATTAATATTGTTTTAA--------GAGATAAAATGAGA----GAG--------------------AG--AG--AGCGAT----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTCCTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAggggccggattgtcca
gi|17 : ttgaatTT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAa
gi|17 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|18 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATT---ATTATA--------TGCACTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAggggccgga
gi|19 : TGTGTTTCTCCTAATTTAATTCCCAAAATT-A--T-GTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT---------TG------TACATTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAAT-CCGCAATAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGT-AACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATC---TAAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATAT--------------TTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAAC-TTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAAT-GTCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--Aataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|2 : caattaagttG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|20 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAA----TTATTCACTTTCATTATATT------TGTACAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAAT-CCGCAGCAAT
gi|23 : aattaatatccaa-----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A--G-TTACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATT---ATTATGTG------T---TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|24 : taTTTTGT--GTTGT-----TTTTTTTACCTGTATATATCTTTA--TAA-A--AGTATCGTCTTAACGTCTTAAGAGATAGAACAATG----GAG--------------------AT--AG--A----T----GCATATAATTATATTCAT--T
gi|28 : CCTGCCTGTATTTTTAATAGT-A--A----TGTTTTGA--------GAGATAGATTGAGGGAAAGAG--------------------AG--AG--A----CATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|3 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTG---AAAGCGTA--TCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGT-AATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAA--TTATA---AAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTgttg
gi|31 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCAggttaaagttaa
gi|32 : aattgagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|33 : attcagttTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAGTTTTTGT--GTTTT--------TTTT
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTAA--AANNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAG--CA--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAaattat
gi|4 : actgtgctgcatGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|5 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAA-CAATTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAA---AGACGTA--ACAATG-----A-AAATCAA--TGTT-TTCATACATCCCAGTTATTAGAATAATCAAATCAATTTGCGTTTAATTTAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAAggggccggattgtcc
gi|6 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacATAGTTTTTGT--GTT-------GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAATGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A--GCTTCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTATGCACTAATGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|7 : atatttattaatttatatGAGA----GAG--------------------AGCAAGCAA----C----GTATATAGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAAT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|7 : aGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|8 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATA-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A--G-TTAC-TTTCA-------------------------TGTATA------TGTATTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAggggccagattgtcca
gi|9 : ataaaAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|9 : ttGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 111 11 1 11 1111 222222 111 1111111 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 11 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333333 11 11111111 33333333333333333333333333333333333333 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 5 3 777 33 0 3 2 33 8888 888888 3 000 1 9999999 1 00 8 1 1 1 0 3 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 7 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 6 66 4 22222222 44 555 66 7 88888888 22 9999 66666666666666666666666666666666666666 00 33333333 55 777 55555555 0000000 2 22 2 33 2 0 5555 444 666666 0 2 33 33 000
lowQualScore : . . ... .. . . . .. .... ...... . ... . ....... . .. . . . . . . . .. ............................................................................................. . . . . .. . ........................................................................................................................ . . .. . ........ .. ... .. . ........ .. .... ...................................... .. ........ .. ... ........ ....... . .. . .. . . .... ... ...... . . .. .. ...
lowQualScore : 5 3 555 88 0 2 0 88 5555 888888 2 888 0 8888888 0 00 0 0 0 2 0 2 5 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 3 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 11 4 44444444 77 111 11 0 11111111 11 4444 88888888888888888888888888888888888888 00 99999999 55 000 88888888 8888888 9 33 7 77 7 7 3333 111 444444 6 2 77 77 666
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( family-3170 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
gi|1 : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGA-AACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATT---TAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGT-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTT-GATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--A---------TGA--------GAG--AGA--GAGA----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTA
gi|10 : TTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A--G-CTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTT---ATTATATG------TGTACTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggagccggatttgcgt
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|11 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|12 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGTTTTTGT--GTTGT------TTTTTTACCTGTATATATCTTT--TCAT-A--AGTATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAA--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATA--CGTGTTT-----AATT------CCCAAAACTA--C-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTT---ATTGTA--------TGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAggggccggattgtccat
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATACTTTTTGT--GTTGT--------TTTTTCCTGTATATATATTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAAATAGAACAAGG----GAG--------------------A-----------------ATATATAATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAATTCCCAAAAAA-AATG-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTA--------TGCACTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|14 : tatatttcttaattttaatCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|14 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTGgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|15 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|15 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|16 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGGTTTCGT--GTTTTTTT--ATCTTTTTCTTTTATATATCTTTGATTTT-ATTAATATTGTTTTAA--------GAGATAAAATGAGA----GAG--------------------AG--AG--AGCGAT----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTCCTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAggggccggattgtcca
gi|17 : ttgaatTT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAa
gi|17 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|18 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATT---ATTATA--------TGCACTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAggggccgga
gi|19 : TGTGTTTCTCCTAATTTAATTCCCAAAATT-A--T-GTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT---------TG------TACATTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAAT-CCGCAATAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGT-AACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATC---TAAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATAT--------------TTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAAC-TTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAAT-GTCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--Aataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|2 : caattaagttG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|20 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAA----TTATTCACTTTCATTATATT------TGTACAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAAT-CCGCAGCAAT
gi|23 : aattaatatccaa-----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A--G-TTACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATT---ATTATGTG------T---TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|24 : taTTTTGT--GTTGT-----TTTTTTTACCTGTATATATCTTTA--TAA-A--AGTATCGTCTTAACGTCTTAAGAGATAGAACAATG----GAG--------------------AT--AG--A----T----GCATATAATTATATTCAT--T
gi|28 : CCTGCCTGTATTTTTAATAGT-A--A----TGTTTTGA--------GAGATAGATTGAGGGAAAGAG--------------------AG--AG--A----CATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|3 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTG---AAAGCGTA--TCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGT-AATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAA--TTATA---AAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTgttg
gi|31 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCAggttaaagttaa
gi|32 : aattgagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|33 : attcagttTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAGTTTTTGT--GTTTT--------TTTT
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTAA--AANNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAG--CA--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAaattat
gi|4 : actgtgctgcatGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|5 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAA-CAATTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAA---AGACGTA--ACAATG-----A-AAATCAA--TGTT-TTCATACATCCCAGTTATTAGAATAATCAAATCAATTTGCGTTTAATTTAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAAggggccggattgtcc
gi|6 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacATAGTTTTTGT--GTT-------GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAATGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A--GCTTCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTATGCACTAATGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|7 : atatttattaatttatatGAGA----GAG--------------------AGCAAGCAA----C----GTATATAGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAAT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|7 : aGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|8 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATA-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A--G-TTAC-TTTCA-------------------------TGTATA------TGTATTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAggggccagattgtcca
gi|9 : ataaaAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|9 : ttGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
blockSeqs : T . CTC CA G T T GC GGTT ATTAAA T CGC T TGCAAAC A CA G A G A T T A TT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G T T T GG T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A C TT G TTTTTATC GA TTA TT G CGTCTTAA AC GAAA NNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAGCAAC TG TTATGAT TG TTT AATTAA TTCTTGA G TG T AT C T ATCC TTC CACTAA A TG CT TTT
blockSeqs : T . . . . T T . C . T NNN N NNNNNNN N NN N N N G . T A TT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G . . G . . . . G TTTATC GA AT . A . AC . AGAGAGCGAT TG GATTA . . TAA . . TG . . . T . . . . C C T
blockSeqs : . . . . . C . A . . A A A C . . C C T . . . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . T ATA AA AA . A . AT . AGAGACATAT . TTTC . . TA . . TT . . . T . . . . G C T
blockSeqs : . . T TTT GA TT . G . AC . AGCAAGCAAC . TGTT . . C . . CA . . . T . . . . G A T
blockSeqs : . . G GCT A TT . A . TT . AGAGAT . TTTC . . T . . CT . . . . . . . . G A T
blockSeqs : . T TT . AA . A . NN . ATAGAT . TTTC . . C . . TG . . . . . . . . C C T
blockSeqs : . T . . GT . . . AT . AGAGAT . TTC . . C . . AT . . . . . . . . G C A
blockSeqs : . . . . AA . . A . GGT . . C . . TG . . . . . . . . C C T
blockSeqs : . A . . C . . TG . . . . . . . . G A T
blockSeqs : . T . . TG . . . . . . . . C C A
blockSeqs : . . TG . . . . . . . . T T T
blockSeqs : . . . . . . . . . . C C T
blockSeqs : . . . . . . . . . . C T .
blockSeqs : . . . . . . . . . G C .
blockSeqs : . . . . C C .
blockSeqs : . . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqCons : AC
originalCons : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
finalCons : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 111 11 1 11 1111 222222 111 1111111 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 11 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333333 11 11111111 33333333333333333333333333333333333333 11 11111111 11111111 1111111 1 111
lowQualScore : 5 3 777 33 0 3 2 33 8888 888888 3 000 1 9999999 1 00 8 1 1 1 0 3 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 7 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 6 66 4 22222222 44 555 66 7 88888888 22 9999 66666666666666666666666666666666666666 00 33333333 55 777 55555555 0000000 2 22 2 33 2 0 5555 444 666666 0 2 33 33 000
lowQualScore : . . ... .. . . . .. .... ...... . ... . ....... . .. . . . . . . . .. ............................................................................................. . . . . .. . ........................................................................................................................ . . .. . ........ .. ... .. . ........ .. .... ...................................... .. ........ .. ... ........ ....... . .. . .. . . .... ... ...... . . .. .. ...
lowQualScore : 5 3 555 88 0 2 0 88 5555 888888 2 888 0 8888888 0 00 0 0 0 2 0 2 5 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 3 5 3 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 11 4 44444444 77 111 11 0 11111111 11 4444 88888888888888888888888888888888888888 00 99999999 55 000 88888888 8888888 9 33 7 77 7 7 3333 111 444444 6 2 77 77 666
consensus : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
Reference ( family-3170 ) : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGT-AACAATGAAAATCAATTTGCGTTTGATTACAA--ATATN---TAAACG------CCAATACAGACGTNGCACANTGTGCAAACAAATNAACATGTTGTTCATANATCCCAGTTATTAGAATAATNAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATGGTCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCCTGTATATATCTTTGATTNT-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGT
gi|1 : AACGGTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAATAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTTTGCGTTTGATAA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGACGA-AACAGTGAAAATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATT---TAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATGTTTAAAAACTGTTAATTAAAAACGTACCGCTTTTCGT-AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATATGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAACTTT-GATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGCTTCGTGCG-ACAAATG-TCAAAGGTGGCAACACCTG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGTAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--A---------TGA--------GAG--AGA--GAGA----GAG--------------------AG--AG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAACCCCGCAGTAATTA
gi|10 : TTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATTAGTGTGTTTTGTCTAATTTAATCCCCCA---C-A--G-CTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGGTT---ATTATATG------TGTACTATGTAGTT--------CC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCACAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggagccggatttgcgt
gi|11 : TGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACG-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggcgggatttgcatggggccggattgtccataa
gi|11 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTttatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtccat
gi|12 : tgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaattcccgttacgagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattattatatgcattccaaattatgtaataactattcagtgtattacttttgacattagaaataccaaaaaataaataattcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGTTTTTGT--GTTGT------TTTTTTACCTGTATATATCTTT--TCAT-A--AGTATCGTCTTGA--------GAGATAGAACGAGG----GAA--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCAT--T--ATT-TATGATTAT--ATTTGTTAAT-----TAATTATTAA-------ATTGAATT-ATATATCATA--CGTGTTT-----AATT------CCCAAAACTA--C-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTTCTT---ATTGTA--------TGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-AGTA-A---TATATCAATAACAATCCAGCGGGAATTAggggccggattgtccat
gi|13 : tatatatttgttatgttaatATACTTTTTGT--GTTGT--------TTTTTCCTGTATATATATTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAAATAGAACAAGG----GAG--------------------A-----------------ATATATAATTATATTCATTGTTTATGAT-T--ATATTGA---ATAATT-----TA-TTATTAA-------ATTGAATTGAAAAATCATACGTG------------TTTAATTCCCAAAAAA-AATG-CTACTTTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTA--------TGCACTTTAT-ATTCCCGTT-ATG-AGTA-A---TATTTCAATCACAACCCCGAAGTTATTAatatgtgcgtttcaaatgatctattaactttccaatatttcatcagaaatac
gi|14 : tatatttcttaattttaatCGTGTGTGCAGATGGTCAGAAATGGCAACATCTGTCTTTGatatgtgcgtttcaaattacctaaaaactttccaatatttcattagaaatac
gi|14 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaaGTTATTTAAAA-TTAAAAGTACACTTGGTTATTTGAGTCACACATTGTGgtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacgttatttaaaattaaaagtacacttggttatttgagtcacacattgtg
gi|15 : atactcacttgatagcttaccagatagctcaagaacttccacgttatgatcaacgtgtgtgcagatggtcagaaatggcaacatctgtctttggtttcagtttctttgcctcaactactgcagtgcaaccatcccaatcaaaaagcatcaatgcatatatgaaattgaaactacccataactgaaatataaaaataacatgagactgcagctgtcggagtgtatatatttttatgtttaaaacaattaacgtgtactgtaccacATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-ATTTTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTA
gi|15 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcca
gi|16 : attaacatgtctatacaatggatatgtagcgagtactaatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAGGTTTCGT--GTTTTTTT--ATCTTTTTCTTTTATATATCTTTGATTTT-ATTAATATTGTTTTAA--------GAGATAAAATGAGA----GAG--------------------AG--AG--AGCGAT----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTTAGTT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTTTCCAATTAAATCTCCCAAAAC-G--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTCCTATGTTATTCCCGTT-ATG-AGTC-A--TTTTTTCAATGACAATCCCGTAGTAATCAggggccggattgtcca
gi|17 : ttgaatTT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCGCGCAGTAATTAa
gi|17 : GGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccgga
gi|18 : ttattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtcattttttcaataacaatcgcgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATT-G-T--TTAT--G---ATTATT-----T--TAATTAATTCTTGAATTGAATT-ATAAATCATA--TGTGTTTCAT---------TCCCCCAAAA--A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTTATT---ATTATA--------TGCACTATAT-ATTCCCGTT-AAG-AGTA-A---GTTTTCAATAACAATCGCACAGTAATTAggggccgga
gi|19 : TGTGTTTCTCCTAATTTAATTCCCAAAATT-A--T-GTACTTTTCATTAGCAC----TCATTGATT---------TG------TACATTATAT--TTCCTG-T-ACTGAGT--A---TTTTTCAGGAACAAT-CCGCAATAATatttgtgcatttcaaatcatctaataactctccaatatttcattagaaatacc
gi|2 : AACGTTTTTTTAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTCGTGCATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAAAAAGGAAAACAATTT-GCGTTTGATTA---GAAGCGTA--TCGCTTAAACGATTAAACCAAAGCCGT-AACAATGAATATCAATTTGTGTTTGATTACAA--ATATC---TAAACG------CCAATACAGACGTCGCACATTGTGCAAACAAATAAACATGTTGTTCATAAATCCCAGTTATTAGAATAATGAAATCAATTTGCGTTTGATTTAAAACTAATCTTAATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAAACACAATGTTGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATAT--------------TTAAAAACGTACCGCTTTTCG-TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTACTAATAGAGTACCATCCGCGTGTGTATAAAAGTACAGATGTTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTGATACTTAAACGGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTTATATTGTTAAC-TTTGATAACTTTAAAATGGATGATTGGTGTATAACCTGTCGGAACACTGTGCGGCCGAGGCAACATGCTGTTTCGTGCG-ACAAAT-GTCAAAGGTGGCAACACCGG-CTTTGCGGAACTGGTAAATTATTGTGTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTGAGGATTTAAACACCTACCTGTTGTGTTTATCACCCTCTATTTTAATCGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTGT--GTTTT-----ATATTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTT-A--Aataggctttccaaattactgaacagcttttcaacatttaatatgtccgaaatac
gi|2 : caattaagttG--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCACTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCGTT-ACC-AGTC-C--TTTTTTCAATAACAATCCCAGAGTAATTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgacgtatataattatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctcccaaaacagttactttcattaacaatcactgattattatatgtgtactatgtaattcccgttaccagtccttttttcaataacaatcccagagtaatt
gi|20 : caattaagttaacgtttttttaaaaattaaaggtaaacttgattactcgggtcgtgcattgtgcaaacaattacaacaattatttgaaaaaggaaaacaatttgcgtttgattagaagcgtatcgcttaaacgattaaaccaaagccgtaacaatgaatatcaatttgtgtttgattacaaatatctaaacgccaatacagacgtcgcacattgtgcaaacaaataaacatgttgttcataaatcccagttattagaataatgaaatcaatttgcgtttgatttaaaactaatcttaattatttacgtcgggcaatatgcaaacaaataaataaacacaatgttgacacaatgtaaatcaatttgcatttagtaaaacatctcttttgatatttaaaaacgtaccgcttttcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtactaatagagtaccatccgcgtgtgtataaaagtacagatgttcaatatcaattttatatacatgatttgatgtgatacttaaacggactgctatttgttgttatactagattttagtgttttatattgttaactttgataactttaaaatggatgattggtgtataacctgtcggaacactgtgcggccgaggcaacatgctgtttcgtgcgacaaatgtcaaaggtggcaacaccggctttgcggaactggtaaattattgtgttttctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaggatttaaacacctacctgttgtgtttatcaccctctattttaatcgaagaagtagacgatagtttttgtgttttatatttttcttgtaaatatctttgattttaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAA----TTATTCACTTTCATTATATT------TGTACAATATATCTCCCG-T-ACT-AAGT-A--ATTTTTCAGGAACAAT-CCGCAGCAAT
gi|23 : aattaatatccaa-----C--TAACTAA-------ATTGATTT-ATTAATCATAA-TTTGTTTATTCCTATTTAAT-TTCCAAATC-A--G-TTACTTTTCAATTACAAATCCTCATTAATT---ATTATGTG------T---TTTTTTAA------TT-ACC-GGT--A--TGTTTTTAATataggcgtttcaaattatcaaacagcttttcaacattaaatatgtcagaaatacca
gi|24 : taTTTTGT--GTTGT-----TTTTTTTACCTGTATATATCTTTA--TAA-A--AGTATCGTCTTAACGTCTTAAGAGATAGAACAATG----GAG--------------------AT--AG--A----T----GCATATAATTATATTCAT--T
gi|28 : CCTGCCTGTATTTTTAATAGT-A--A----TGTTTTGA--------GAGATAGATTGAGGGAAAGAG--------------------AG--AG--A----CATATATATATAACTGTATTTGT--Tgtttatgattat
gi|3 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTTGGGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATTATTTGAACAAGGAAAACAATTT-GCATTTGATTG---AAAGCGTA--TCGTTTAAACGCTTAAACCAAAGACGT-AATAATGAAAATCAGTTTGTGTTTGATAACAA--TTATA---AAAACG------CCAATACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTAATCTTGATTATTTACGTCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGATGACACAATGTAAATCAA-TTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAATGTACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTACTAATAGAGTACCATCCGCATGTGTATAAAAGTACAGATATTCAATATCAATTTTATATACATGATTTGATGTCATACTTAAACAGACTGCTATTTGTTGTTATACTAGATTTTAGTGTTTCATTTTGTTAACTTgttg
gi|31 : AACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATAACTCGGGTTGTGCATTGTGCAggttaaagttaa
gi|32 : aattgagttAACGGTTTT-TAAAAATTAAAGGTAAACTTGATTACTCGGGTTGTGCATTGTGCA
gi|33 : attcagttTGTGCTT--CAT--TCTATTTTAATCGAAGAAGTAGATGATAGTTTTTGT--GTTTT--------TTTT
gi|4 : TCTATTTTAATTGAAGAAGTAGACGATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATCTTTTTCTTGTAAATATCTTTGATTTTAA--AANNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAG--CA--A----C----GTATATAATTATATTCAT--TTCATT-T----CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCAAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATCCCCTTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAaattat
gi|4 : actgtgctgcatGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccggattgtcc
gi|5 : actgtgctgcattctattttaattgaagaagtagacgatagtttttttttgtttttttttatctttttcttgtaaatatctttgattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagcaacgtatataattatattcatttcatttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatctccaaaaacagttactttcattaacaatcattgattattatatgtgtactatgtaatcccctttaccagtcattttttcaataacaatcccgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGATTACTCGAGTCGTACATTGTGCAAACAATTACAACAATAATTTGAACAAGGAGAA-CAATTTGCATTTCATTGAAAGCATATGGTTTAAATGATTAAACCAA---AGACGTA--ACAATG-----A-AAATCAA--TGTT-TTCATACATCCCAGTTATTAGAATAATCAAATCAATTTGCGTTTAATTTAAAACTAAACTTTATTATTTACGCCGGGCAATATGCAAACAAATAAATAGACACAATGTTGACACAATGTAAACCAATTTTGCATTTAGTAAAACATCTCTTTTGATATTTAAAAACTGTAAATTAAAAACATACCGCTTTTCGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTCTAAAAGAGTACCATCTGCAT---TATAAAggggccggattgtcc
gi|6 : taacggtttttaaaaattaaaggtaaacATAGTTTTTGT--GTT-------GCTTTTTTCCTGTATATATCTTT--TTAA-A--AATATCGTCTTGA--------GAGATAGAATGAGG----GAG--------------------AG--AG--A----T----GTATATAATTATATTCACTGTTTATG-G-T---TAT--A---TTAATTAATTAA--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAATG------------TTTAATTCCCAAAAAT-A--GCTTCT-TTTCATTAACAG----TCATTGGTT---ATTGTATGCACTAATGCACTATATAATTCCTGTT-ATG-A-TT-A--ATATTTCAATAACAATCCCACAGTAATTA
gi|7 : atatttattaatttatatGAGA----GAG--------------------AGCAAGCAA----C----GTATATAGTTATATTCAT--TTCATT-T-T--CTAT--A---GCCATT-----C--TTATTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGAAT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCCATTAACC-GGCCTT--TTTTTTTAATAACAATCCTGCAGTAATTAatatgtgcgtttcaaattatctaataactttacaatatttcattagaaataccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaacggggtcggatttacatggggccggatattccata
gi|7 : aGGTAGCGGGGCCGGATTTGCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgcgtggggccagattgtcca
gi|8 : agagagagagcaagcaacgtatatagttatattcatttcattttctatagccattcttattaaattgaattataaatcataagtgtgttttgtccaatttaatcccccaaaacagttactttcattaacaatcattgaatattatatgtgtactatgtaattcccattaaccggcctttttttttaataacaatcctgcagtaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATA-TTA-ATTCAT--GTCAT-------ATAT--A---GCCATT-----T--TAACTAA-------ATTGAATT-ATAAATCATAAGTTTGTTTTGTCCAATTTAATCCCCGAAAAC-A--G-TTAC-TTTCA-------------------------TGTATA------TGTATTATGTAATTCCCGGT-ACG-CGTC-A---TTTTTCAATAACAATCCCGCAGTAATTAggggccagattgtcca
gi|9 : ataaaAATT-ATAAATCATAAGTGTGTTTTGTCCAATTTAATCTCCCAAAAC-A--G-TTAC-TTTCATTAACAA----TCATTGATT---ATTATATG------TGTACTATGTAATTCCTGTT-ACC-AGTC-A--TTTTTTCAATAAAAATCCCGCAGTAATTAatatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagaggggccggatttgcatggggccggataatccataa
gi|9 : ttGGTAGCGGGGCCGGATTTGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtagcggggccggatttgagtggggccggattgtccataa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATGGGGCCGGATATTCCATACC
Unaligned ( gi|22 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGACGGGGCCCGATTTCCATGGGGCCTGATACTCCATAA
Unaligned ( gi|25 ): CAATATAAAAATCTTTTTAGAACTATGTCAGCTGGTTATCACAAAGATATTTCATCCAGGGGCCGGATAAGTAATGAGGCCAGATTTACATGTGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATATCATTCTTAGAATTAATGTCGGTTGGATATTCCAAAGATATTACATCCAGGGTCCGGATTAGTAATGAGGCCAGATTTACATGGGGCTGGATAGTCAAT
Unaligned ( gi|27 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACGGGGCTGGATTTACATGGGGCCGGATATTCCATAG
Unaligned ( gi|29 ): CGAAGGACGTTTCATCCAGGGGCCGGATTAGTGACGGGCTGGATATACATGGGGCCGGATTCTCCACAAC
Unaligned ( gi|30 ): TCCAATGACGTTTCATTCAGGTGCCGATTAGAAAAGCGGTCGGGTTTACATGGGGCCGGATATTCCA
Unaligned ( gi|34 ): GTAAGTGATATTATTTTTAAAATTAATGTGGGGCCGGGTGTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): GTGACGGGGTCGGATTTCCATGAGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|36 ): GTGACGGGGCCGGATTTCCATGGGGCCGGATACTCCATAAC
Unaligned ( gi|37 ): ATGATGGGGCCGGATTTACATGGTGCCGATATGCCATAAT