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gi|39 : atgtacatGTATGTACTCAATGGCGGGGCATT-ACTANNNNNNNNNNAT-----CGTGGTGTCA---------TATTTAA-------TGT----ATGTACTCAATG
gi|37 : atGTTTGACGAATATTCAAATTATCCGTCCACAAAAGATAATACCCGTCATAGGAGAAATTCTGGAAGCGTTGGCACTGACATTAAAT
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3113 ) : 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gi|1 : 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gi|10 : tcacaGAAAAGACTCTTGGAGTGAAATAGTTTTTGCTAGAATCCAGTGTGAATACAAGATATGCACGCAGCAGATGCCATATATCATCAAATCTATAGTGTTAACTTCAGAACAAATATGGGTAT--TCCAAA-GCAATCCACATTTGACGAAGTTGAACCTGTGCGCTCTGAAAGGCCATCCGTAGATGAAACTTACGCCGCATTTCTACGTGTTGTGCAATTTCTTGAA---------GAAAATGATGATGAACAAATTTCGATAAATGATCTTATTATGAAAATGAAACAGTATCTAGAAGGAACAACATATGAGCCATACAGCTTTAAACACATGAAACAAAAATTACTTATCCATTTTGGAAACAAAATTA-TTATAACAAATAGTTACGGAAAG---ACTATAGTGATATAAACGGCTACTGCTTCTTCAGTTTTGGACCAGTTATATAACATGC-----------CAAAAGCATGACAATTCCGAAGCAGAAAA-AAT-GC-GAATCATAGAGACAGCTGCTAAATTATTAAATAATGACATgactcttggagtgaaatagtttttgctagaatccagtgtgaatacaagatatgcacgcagcagatgccatatatcatcaaatctatagtgttaacttcagaacaaatatgggtattccaaagcaatccacatttgacgaagttgaacctgtgcgctctgaaaggccatccgtagatgaaacttacgccgcatttctacgtgttgtgcaatttcttgaagaaaatgatgatgaacaaatttcgataaatgatcttattatgaaaatgaaacagtatctagaaggaacaacatatgagccatacagctttaaacacatgaaacaaaaattacttatccattttggaaacaaaattattataacaaatagttacggaaagactatagtgatataaacggctactgcttcttcagttttggaccagttatataacatgccaaaagcatgacaattccgaagcagaaaaaatgcgaatcatagagacagctgctaaattattaaataatgacat
gi|11 : tcacacagcattgttctattactgtttaatacgcggtatcaattaatgatatgatattttataaagttattcaatagtacgatagtatctttctgttgttaagttgtttatagtcagcaaaagaagaatggacgcatgcccgttggatacaaaaagtcttgaaaatggtcatgatattaaaaaactgagagtcaaaggttgtaagggtatcaacagagctagcaaagaccaggttaaaatgtgcactaaacctgtcaactgtcatataccaatgcataatctactaatagtcagaaaagaaaacttgaaacagaaagtcaatcaacaagcagtgttaagcgagttcttcgttcggaaagtatgttttttttttaaagatgattgtttctttgtggtaaatccaataacattaatgacaaacctatATTAAACTGCGGACTAATTGCAACAG---GAAA--TGTTGTAATAGTTTCTGAAA--GTTA---AA---TCCTTTTTCAGATACGTACCAAAAATA-G-ACAAAAATAGGA---CATCTTTATCATTTT---GG-ATTTT
gi|12 : tagtaaatgtcggggagttctatagcagtggatagtgtcaccgatgaaaaggagtaaattgtttcctaatttatttatataaatacagagcgatcgcagacatatgattgtatgatatattgtacaacgcaaaaaacatatatgaatgaatatataactgactgattgactgaataacattttactgcacgccgacacacatattaacaaatgaaatggttaagaagagaaatcaaaattatttttaataaaatatttaattaaagataaaaatgatatgaaaagtatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactttttccaattgttatgtaatagtaaatctagtaacaattatgaagaaagaaaaaaaaacagctcaagggaagattttgttaaaattttaaaaacatgaaaaagtgggtgggtattttgcgtgtattatttttttatcctaaataaaattgaactttgtttaagaatgtagttaatagaaaacaccatgctaatagtgtgttgagacacgcccagtttattaattaaaagttaactggtggccaatttattgattaaacgactttcgtttcgaaatcctatttaaagannnnnnnnnnccaatttattgattaaacgactttcgtttcgaaatcctatttaaagaataggcacctttttgtatggtTTTCTTCAAATCAGAAACCCATTTAATGAATACTCAACCCTTATCAACATATATATTT-A-GTGGAGTTATTGCAGAAGAACA------------TGTTTTCAGAGCTAAATAATTAGATCAAAATATAATTACT-----------T----CTAAATTTGAATACTCAT------TTAAACG--AAAATA-TCAAGCAGTAACAATGGACATTC--AATTAAATGTCAAATTCGACGACGAACACGTAAAGGTTGACGCTCAGA--TGTTGTTTCAAAGATTAATAATATCCGCAGCACA------------ACAAGATGAGATCGGCTCTCTTTATACATACGCACTGTGTTCATATCCAGCGTAATTGTTTGACGCTGATGGTCTTATA--GTGCG--AGTTCCGGA---------------AGATGCAATGTCCAGTTTAAC-TTTCTTAGATAAATATACCGTAGATGAAAATGCAAAGTATGTACTCGATGACGAGGCA-TAACTC-AAAATATTTCTACGGAGTCGTGGTGTGA---------CATTTAACAC-CATCGCTGATATGTATTCAGTGTATA---CATTTAAATATTATGGCCCA--AATA-------------ATGTT-------------GATATTCAAATTCTCTGTCTATAAAACATA--ACCCATTAAAGGAAACATTCTGGAAGAGTTAGCACTGCCGTTAAATTTGATGGCAAAGCCATATTAAATAT-AAAAAAGGAGATATTTCTTGCAAATATTAACCACAAATCAAGAGTCATTGAC------ATGCTAA---GAACCCACCTTCAACCTAAGTACATCGAGACTATTCAAT-CTGAAGGTGATGCAGATTT
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gi|14 : tacatggacatactgctaaccaattcatacgtcaatgtgtcacaaataatgtggaccacgacatactaaccagagatggtcacaaaacgttccatgcaatggaaattataacagcaggctcaccaggtggtaaaaccaataacgtatttccagactgaaaataccttcagtatataaattgtaagagattggtaaggtcaatgttcatttctacagtccacagacgattctgaacattagtcatgaaccgttaagttttgaagtcgatgatgttacagcaacatatagacatcctattgaaaacaccatgactgtcgagagctgatcgccatgcaaatgatgaatagccgcagcagtgaataccccggtcagtcctcatcagATTGCT-ATGTTATGGTAAATCCAATAACAaaacatgattgtaagtgcagatcc
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gi|15 : ATGATGTTAACTTCAGAACAAATAGAAATATTCTCCAAA-GCAATTtaaaagccgcgtatcatgatgttaacttcagaacaaatagaaatattctccaaagcaattgggcgtactgaaacttatgttgcatttctatgtttttgcacaaaaaatgaaaatgaaacagcatctagaaacatatgagccatacagcttctaacacataaaacaaaaaattcttagccattttgtagagaaaaaacttataacaaatatcacagaaggacaactatagtgacattaacggctattgcttcttcaattttagaacagttctttaaattgctaaaaaaacaacaaaagaagaccaaaccgaagcagaataatcatagagtcatagagatagctgcttaatttttgaagaatggcattaaatcaattgatatagataaaatcatttatccctattgc
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gi|17 : ttttgtgataaatccaacatcgatgacaaacctatgaaaaatatatatcaaggccgcacttttgactttcaagagaaaaggtagctggctgctgtatgcgctcaaagacaagacttaaaagccgcgtatcatgatgttaacttcagaacaaatagaaatattctccaaagcaattgggcgtactgaaacttatgttgcatttctatgtttttgcacaaaaaCTGAACCGTATTGTATACTTTTGGACGGATTGAAATGCCCCGCGAATCGGAATTTAATCAATTTATACACGAAAATAAAAAAATCGCAGTATTTT--------TATT-GTATAAAGAATGATGCAGCTTATAAATGTGAGTGTTTAATTTAGAAGCATTCTTATCACTGGCGAT----------AGTTGTATTCGTTTCTCTCTGTATAGCCAGGTTAATAACTGTTAGCGTGTCATTATCCGGTATTATT---CAA-GCAGCATTGTACTGATTACTGTTTAATACGCAATATCAAATAATGTTATTTTACTTTATATATGCATTAAATTGTACAATCGTATCGTTCAGT----AAGTTACT--TA--------TTGTTGACAAAAGAAGAATAGACACATG----------AC-------CTTGGGAATGGTCAAGATATTGTAAAAATGAGAGTTAAAGGTTGTGAAGGTATCAACAGAGCTAGTA
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gi|7 : TCTAATGAGTGGTTCTGGTATGCGCGAGTTATTGGAAGTGATATATGCTAAGATAACAGTTAGTCATATGTTAAGCAATAAAGCCATTTCCAGAGCTGCTAGTGG-ACATTTGCTGGTAAAGTCTGTTCTTGCAACACTACTTCTGGAAAACTTGTATGAGACTCTGTTACTGGGCATTGTGGACCGAGATGAAACAG---------------------CTACATGC--AT---------GGTGGCACA-----AGAA---------------TCTTATCTTTAAGATTTTTGTCAACTAAC------------------------AGAGGATAATTCAAGGACGGAGATAGCAGAGGATCTACAGG------------------------TTGTAAAAC----A-------TGCTTGGAGATGTGATAGATG------TTACGGT----AGTATTTGTAATGATGAAACATGTATTTTT-AACAGATCAATCTCAAAATCGAACAATACAAAACTTGCTGTGCAGTGTTTAAAACACACAAAGTCTGGTTCCAATACCTCGAA-------------TATGATCATTTATAAATT---------------ACTTG--------TTTGGATACAT---A-TG-T-TACGTGTGTTACCCTATTTCGCTGCAACGGGGCAGTATCTGTGTGCAAAATTG----GTGTGTATTTACATGCAAAATATGCATG-ATAGTCCCAATACCAATCCTGAAGTTTACAGAAAATGTAAAGAAGGGTACCATGCATGTTGTCAGATGAAGTGATACATGTATATTCTGGGCCGGTTTATTAACTTATCGCATAATAGAACAGATGCTAATGACAAGTATGAAAACAAGTGACTGTGT---GACCAAGGGAAGGGGT-TGACAGCAC---AGATGGTAACATGGCTCCTTTCAGCACTGTCCGGTGTAACCATGAATCAGGCGATGCAACAATTTTCTTACATTACATACACAGCAAATGAACAACACAGTGACACA------GCTAGACAGACGA-GAGACAACAGTGACATGTTGAAAC------TATCTATATTTCTTAAAACCAGATGCCCATTCAATGAATATTCAACCCTTAT-------------------GGAGTTACTGCAGAAGAACAGGTACATGTAAGTGTTGACAGAGCTAAAGAATAAGATCAAAATATAATTACTGCAAAG------------ATAGTTGAAAACACAT------TTA------AAAAAA-GCCAGCAGTAACAATGGA--TTCCAAATTAAATGTTAAATTCTTTGATGAACATGTTAATGTTGACCCTCAGTAATGTTGTTCCAAGGATTAATA---TCTCCGGCA---CAAGTTATCACACAAGATGAGAATGGCTCTC----TACATACAAGTTGTGCTT-TATCCACCGTCATTGTTTGACGCTAATGATCTTA-G--G--TG--AGTTCCGAACGAACTAAAACTTAAAGATGCAATGTCTAAAATGAG-TGACTTTGACAAATGTACCATACATG-AAATGCAAAGTATGTACTAAATGGCGAGGCATT-ACTA-AA
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gi|9 : aACTTTACCTTGGATTAATTGCAAGAAAAAC-----TGTTTTTGAAGTTTCTGAAACTATTATTTAAT--TTGATCATAGAGAT---GAAAATAGG-AC-AAAATC--------------TCATTTA---AGTACTTTTATTCTTGGTTATCATTTGGAGAGTTGTATTATCCGAATTCTATGACATATTGTG-------TT---CTTTCAGTTTT-AATTAA-CATTTAATTTTGCATAATTTTATG-TTA-T-TTAATCGAATTGTATACTTTTGTATGGATTGAATAGCTCCGCGAATAGAAATTCAATCAATTTATTGACGAAAATTTATCAATCTGAGTATTTCAGGTTTTTTGTTTGTATATAAAATG---CAGCTT-AAAATGTCAGCGTTCAATTCAGAAACAAGCTTATCACTGGCGACTGCTGGCGCAAGTGGTACACGTTTCTC--TGAA-AGTT--------------------GTCATTATCC---AGTATTGTTC-ATGCAGCATTGTTCC-AATAATGTTTAATACGCGGTAGCAATTAATGATATAATATTTTATAAAGGTATTCAATTGTATGATAGTATCTTTCTGT----AAGTTGTTAATAGTTGTTAGTAGTCAATAAAAGAAGAATGGATGCATGCCCGTTGCGTACAGAAAGTCTTGAAAATGGTCATGATATTGTAAAACT--GAGTCGAAGGTTGTAAGGGTATCAACAGAGCTAGCAAAGAGCGCAATGATAATGTCACTTTGCAACCAGGTTAAAATGTGCACAAGACTTGCCGACT--GTCATATACTAATG--CAAAATCTGTTGGTAGTCAGAAAAGAAAACTT-GAAACAGAAAGTCAGTCAACAAGCAGTGTTAAGCGAGTTCTTCGTTCAGAAAGTA------TA-TTTTAAAGATGA---CTTATTTTGTGGTAAATCCAATAACATTGATGACAAACTTATG-AAAATGTATTTCCTGTCCGCATCTTTGACTTTCA--AGAAAAGGTAGCAGA----TGTATGCGCTAAAAGACAAGACTCTTGGAGTGAAATAGTATTTGCTAGAATCCAGTGTA--TTCAAGATTTGCACGCAGCAGATGCCA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAAAAGCTTAAATAACTGACCTTATAAGAATATACTAAGATCCTAGCATTCTTTTAAACACAATGATACCTTTCAAAAATAGTATCTCATTTTAAAACGTAAGTATTGGTGGGTGGGGTAATCTAACACTGGTTTAAAGGCTTTATAATGATTTTAAAGCATTGTTTATGTCATGTAAGTTTAAACATTATATGCTTGATAGTTCTTCAAAGTAGTTTATATTGATATTACACCAAATAAACAATACGAATATGACAAGAACAACTAAATGTTGTTTTCAGAAAATATCAGAAATATAAAAAAAGGAACAATGTTTGACTAATTTTTTTTTTCAAACAAATTGAACTTTGATTTTTCTCTACTGTAGTAATTATGTCATTCCGAATGTTTTACTCTTTCCAAAAACATAAATATCATTTATGTACTAATTTGTCTAAGGTTTGGCTTATATTTTCATAAATTGACTAGACTAG
Unaligned ( gi|26 ): TTACGTAATGGTTAATCTAATAAAAACTGTAAAGAAAAAAGCAGTTGAAAGGAATATCTTATTAAAATTATGAAAATATGAAGTGGTGGGTTAATTGGACATGGTATTTTGCTTGTATTATTATTTTTTCTCAAATAAAATTTAGGCGGTAAAAAGGAAACGCCATACTTATAGTGTGTTTGAATATGCCCAGTTTATAAATTAAACGTTAACTGGTGGCCACTTTATTGATTAAACGACTTTTATTTCAAAATCCTGTTTAAGGAATAGGTAACTTTTTGTATGG
Unaligned ( gi|29 ): AAATGAATGAATGGTGTTTTACGGCACGTCGACACATAAATAGGTAATTTTGTGCGCAAAAAGATTAATATAAGCGAGGACAAAAATAATTATATTAAATAAATATAGTTAAAATGTATTAAAACTATTTATAAAAAATCATTAAAAAATATTTACAAATAAATAAATGAAAAATCAATTAAATACAGGGAAATCAACAATATACTAAATCATTTAACCCGTAAACGGGTTTTAAACTAAGTATGTTCAAAGAGTTTAACCTCTTATA
Unaligned ( gi|30 ): ACACTGTAGCAATGAAAGTGTCATCTACAAAAATTAGTAAATTGTTTTCTGATTTATTTATATAAATACAGAGTGGTCGCATACATATGATTGTATGGTATATTGTACAACGCCAAATACATATATGAATGAATTAATAACTGACTAACTGAATGAATGACGTTCTAAAGCGAGTTTAATAAATGAAATGAATTAGAAGAGAAATGAAAATTCTTTTTAATAAATTATTTATTTAAAGATAAAATGATAAA
Unaligned ( gi|31 ): AATAAACATTACAAATATGACAAGAACAACTAAATGTTATTGTTTTCGAAAAATATCAGAAATAAAAAAAAATAAAAAAGGAACAATATTTGACCAATTTATTTTCAAACATTGTTGACCTTCGATTTTCCTCTACTTTAAGTATGTCATTCCAAATGGTTTTCTCTTTCCAAAAATGTAAACATTACTTATGTACTA
Unaligned ( gi|33 ): ATCGATATTTTTATATTGTTTGTCAGGCGATGGGTGTTAAAGATAAAAGATAAGAAACAAAAATACACTGCTCTAGCGGATCTGTAATCCATTAGCTACGGTACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): ATATATAGACAATTTCTATGGAAAACGACATGACTGTCGAGAACTGATTGCCATGTAAATGATTAATACCCATGGTGAATACCCCGTATGTGATTCCT