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gi|14                         : atTGATGGATTCTTT-ATTTCTTCAAAAGATACATACATTAATTTATAAA-ATAAAG-CAAGATTTATCAATGCTCATGTACACATAAACACATATTTATATAATTACATATTAGAAG-----ACAAA----ATAGACTGATATTAAGAAGAAAAAA---ATAGGTGCGCATGTTTATACAAAA
gi|8                          :         tTTTTTTTATTTCTCCATTAA-TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGCCAGGGTTAAACAATGTACATGCACATACAAACACATATTTTAAAAATTAAAAA--AAAAAAAAAAAAAAAAGTTATACACATATATT------AAAACATCCCTAAGCGTACATGTATATGT-AAATTTAATACAGTTTTCTTACAGACAGTGTTTACGACC---AGTCCATCTTCGCTTTTAATTTCAAAGAAATTCGAAGAAATTCGAAGAAAAGTATGTATCTTGGCGAAACTAAATGCAAGATGACAAAACAT-------GCGTGACAT----GCTGT-TTGTGAAG-CA--ATAT--A-AACGTATTAAGTCTCAAGCATactattcagaac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                 gattttttgggtATACAGTGTTC--ACA---------TCCAATC---AAT-CG---CCGCTTGTAAATCCAA---------AAAATATTCAAAAA----TATGTGTCTTGTAGAGACGAAA-GCAAGATGACACAATAT-------GGATGACA-----------TCGAGAAGTTA--AAAT--A-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   tacgtacatttGAAAAT-ATGTGTTTTGTCGAAACGAAATACAATGTCACAAAGTAT-------Gcaaatataaatttatcgttttaagttacaagagcacatactt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                              aaacaatatgtaaatatatccagtctgaagcctcGAAT-ATGTGCATTGTCGAAACGAAATGCAAAATGACACAA--T-------GAATGA-AT----GATGT-T-GTG-----------T--A---TGTATTCACTTTTAAGCAT-------ATGTGCCTTGTTGAACGTGAGG--AAAGA-TA-A---CACAATAATAAT--GAAGTTTTCTTTTATAAA-TGCAGCTGCATTCAGTTTAA--AGAATATGTGTCTTGTTGAATCGACGAGCT-GCAA-----AATGT-----GA-T--A----CT---GGGGAAGATGTTTAGATATT---ATACAAA----TGAATTCAGTT-------TTAAGAATATGTGCGTTGTCGGA----A-A-GAATTACA-GGGTTATA-TAATAT--AAATAACTTTTAG-agaagcttcaatagaaacgcacccattaattaaatcaatgacagatacacatatgatatattacataaaaagatatgtgactataaaggaaaaaactgtctataaagcaagaacgagtaaatgaaactgatgtgtcgaacattataagttgctgtaagttgttgttgttgacaata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTACGTGTCTTGCCGAAACGAAATGCTAGACGACAAAACAT-------ACAC-GTAT----GC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGAACGATGTGCAAGATGACAACACATATATTTTGTG-ATTATTTCGGTGGT-TAGTGAAA-CA--AAAA--ACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCCnnnnnnnnnncaattaattgaatcgatgacacataaacatatcatacagtacacaataaacgtgactataaagaacaaaaatgattataaagcttgaatgaatataaaaaaactgttgtaaaagaacataatatattgctatcagtttttgttgttgacaaaattaaattttgttgatgaaaagc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAAAT-------ACACA-TAT----GGTGTATTGTGGTA-TATTATAT--A-AATGTATTCTGTCTGAAGCGTCAAGAATATGTGCCTTGTCAAA----ACG--AAAAAACA-ATGTTACA-TAATATGA-GTAGCT--CCTAGAAAAAATACA--TTCATTAA--TTGATTAGAACA--------ATT-AAT-GTGAAA-T-ACAC-----A-TAT-----GA-CACA----TT---GTCG--------TA--TATT---ACATAAA----TGTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaacatattcattaattaattagaatatttaatgtAAA-CA--ATATGTA-AATATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAA----ACG--AAATA-CA-ATGTCACA-AAGTA-TGAGAAGCT--TCAATAGAAA-CGCA--CCCATTAA--TTA--------A--------ATC-AAT-GACAGA-T-ACAC-----A-TAT-----GA--------------------------TA--TATT---ACATAAA----gccattatatattggaaaatatgaatataaagcatgaatgaataaataaaattgatgtgaaaaacacaatactttgctaacagttttgtgctgttgacaatattaattttgtttaagaaacaacatttatataacattcagaattataaaaatgttacgacctttctaaatatatgtacgtaggattattgtcatatgttgcaaatatctaaatgtgatctttgaaagagcagcatatcaacaatttgatcataaggacgtagttcacaaagaccgttaaatgttttcgcaccacacaatttgtgaagattacaccgtatattatggcgcatagtgttatttgatgcgcaaaacagaattagatgttaagctgccgattctgtagtcattttacattttggacaactagatatgt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA----ACG--AAATA-CA-ATGTCACA-TAATATGA-GTAGCT--CCTAGAGAAA-TTCA--ATTATTAA--TTAATTAGAACA--------ATT-TAT-ATCAAG-G-ACAT-----A-TAT-----GA-TACA----TT---ATGG--------TG--TATT---ACATAAA----TGTATTCAATaagatatgtgactataaaggaaaaaactgtctataaagcaagaacgagtaaatgaaactgatgtgtcgaacattataagttgctgtaagttgttgttgttgacaata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A--TTCATTAA--TTAATTAGAATA--------TTT-AAT-GTAAAA-T-ACAC-----A-TAT-----GG-TGTA----TT---GTGG--------TA--TATT---ATATAAA----TGTATTCTGTCTGAAGCGTCAAGAATATGTGCCTTGTCAAA----A-CGAAAAAACA-ATGTTACA-TAATAT--GAGTAGCTCCTAGAAAAAATACA--TTCATTAA--TTGATTAGAACA-AT-TAATGTGAAAT--AC--------ACATAT-----GACA----------CA----TT---GTCGTATATT---ACATAAA----TGTAaatatattggctatataggaaaatatgaatttacagcatgaatgaataaatgaatttgatgtgaaaaatacaatatttgcaaacagtttgatgctgttgacaatatcaattttgtttatgaaacaacatttaaataacattcaaaattattaaaattttacgacctttctaaatatatgtacgtaggattattttcatatgatgcaaatatctaaatgtcaactttgaaagtgcaattcttcgtctatatgtaatattaaaggaggcatatcctaagatcatttcaacaatttgatcatcaggacgtagttcgcaaaggtcgttaaatgttttcgttccacacaatttgtggggattacaccgtagattatcacgaagggttatttgatgggcaaaacagaattaaatgttcagctgccgattctgtagttattttacatttcggacaactaaatatgtatttacgtgcaaataatttactcactataaacattaccgttctgcagtacggtaaatagtcacgattcaattgacagaagcgccatatactgcttggagcgatttcgctttttatgtatagaaaggcactaagactgtcgtctaaaatatattatgtttattatttttatgtatagcttgttgtgatcgtttttttttcatgtgtcttaaaccgtgaaaagatgcacttaaaagatattcgttcaaaacttcggtcagattatatattcctaaaatacggtaaatatctgggaccggtcataatgttttactatgattagacatgtattgtacaagcatattaacgaatagcgtttttatcctaaagcgaccactaatactgcataattgaccaaatattaatactgttctaccggtgtcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcaacat-AAT-GCAAAA-TGACAC-----A--AT-----GAATGAA----TG---ATGT--------TG--TGT----------A----TGTATTCACTTTTAAGCAT-------ATGTGCCTTGTTGAACGTGA-G-GAAAGATA-A---CACAATAATAATGAAGT-TTTCTTTT-ATAAATGCAGCTGCATTCAGTTTAA--AGAATATGTGTCTTGTTGAATCGACGAGCTGCAAAATGT-----GATACTGGGGAAGATG----TT----TAG-ATATT---ATACAAA----TGAATTCAGTTT-------TAAGAATATGTGCGTTGTCGGAA-AG--AATTA-CA-GGGTTATA---TA----A----gccattatatattggaaaatatgaatataaagcatgaatgaataaataaaattgatgtgaaaaacacaatactttgctaacagttttgtgctgttgacaatattaattttgtttaagaaacaacatttatataacattcagaattataaaaatgttacgacctttctaaatatatgtacgtaggattattgtcatatgttgcaaatatctaaatgtgatctttgaaagagcagcatatcaacaatttgatcataaggacgtagttcacaaagaccgttaaatgttttcgcaccacacaatttgtgaagattacaccgtatattatggcgcatagtgttatttgatgcgcaaaacagaattagatgttaagctgccgattctgtagtcattttacattttggacaactagatatgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaatatgtgcattgtcgaaacgaAT-GACAAA---ACATGCGTGA-CAT-----GC-TGT-----TT---GTGA--------AG--CA-----ATATAGA----TATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTACCTTGTCGAA----A-A-GAAATACA-ATGCCACA-TAATAT--GAGTAGCTCCTTG-AGAAACACA--TTCATTAA--TTAATTAGAATA-TT-AAATGTCAAAT--AC--------ACATAT-----GATG----------TA----TT---GTGGTATATT---ACATAAA----TGTATTCAGTCTAAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAACCA--AAATA-CA-ATGTTACA---TA----ATATGAG--TAGCTCCTAGAAAAA-TACATTCATTCATT-T---ATTAGAAC--AAGTATTGTTAAATACACATATGAtataaataacttttag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                     ttgattaattcttttatataagagtataagcatacagacaaggttaaataatgtacatgcacatacaaacacatatttacataattacaaatgggaacaaatacacatatattaataaatccctaggcgtacgtgtaaatgtaaatttaataaagtattattacagatattgtaactgttagtccaccttcacttgtaatttcaaagaaagaagaaattcgtagagaagtatgtatcttgtcgaaacgaaatgcaagAT-GACAAA---ACAT-----G-CGT-----AA-CATACTGTTT---GTGA--------AG--CA-----ATATAAA----TATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTCGTCGAAT---G-T-CAAATACACATATGACA-TATTAcac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                       attgattgcttcttgtattcctccgtagatatatacaggaaagtaaaaacatacaggcaaggttaaataatgtacatgcacatacaaacacacatttacattattacatatggtaagaaaaataaaagttatacacatatataagaacttcttaggcgtacatgttaatgtaaatttaacacagtatgcttacagatagtgtttacggccagtccgtcttcgattgtaatttcaaagaaagaagaaattcgaggagaattatgtatcttgtcaaaacgaaatgcaacAT-GACAA--C-ACAT-----A-TATTTTGTGA-T-TA----TTTCGGTGG--------T---TAGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cggaacgatgtgcaagCAAA-T-ACAC-----A-TAT-----GA-CATA----TT---ATGG--------TA--TATT---ACATAAA----TGTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtT---ATGTAAA----TATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAA----A-C-GAAATACA-ATGTCACA-AAGTAT--GAGAAGCTTCAAT-AGAAACGCA--CCCATTAA--TTA--------A-AT-CAATGACAGAT--AC--------ACATAT-----GATA----------TA----TT---
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacaaAA----A-C-GAAATACA-ATGTCACA-TAATAT--GAGTAGCTCCTAG-AGAAATTCA--ATTATTAA--TTAATTAGAACA-AT-TTATATCAAGG--AC--------ATATAT-----GATA----------CA----TT---ATGGTGTATT---ACATAAA----TGTATTCAATacataaaaagatatgtgactataaaggaaaaaactgtctataaagcaagaacgagtaaatgaaactgatgtgtcgaacattataagttgctgtaagttgttgttgttgacaata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACATA--TTCATTAA--TTAATTAGAATA-TT-TAATGTAAAAT--AC--------ACATAT-----GGTG----------TA----TT---GTGGTATATT---ATATAAA----TGTATTCTGTCTGAAGCGTCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAA-CG--AAAAAACA-ATGTTACA---TA----ATATGAG--TAGCTCCTAGAAAAAATACATTCATTAATTG----ATTAGAAC--AATTAATGTGAAATACACATATGACACATTGTCGTATATTACATAAATGTAGCCATTA-TATAT-TGG---------A-AAATA-TGAATATAAAGCATGAATGAATA-AATAAAATTGATGTGAAA-AACACAATACTTTGCTAACAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTAAGAAACAACATTTATATAACATTCAGAATTATAAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATA----TGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TC-ATATG-----------T-------------------TGCAAAT-----ATCTAAATGTGATCTTTGAAA-GAGCAGCATATC--------------AACAATTTGATCATAAGGACGTAGTTCACAAAGACCGTTAAATGTTTTCGCACCACACAATTTGTGAAGATTACACCGTATATTATGGCGCATAGTGTTATTTGATGCGCAAAACAGAATTAGATGTTAAGCTGCCGATTCTGTAGTCAT--TTTACATTTTGGACAACTAGATATGTaatatattggctatataggaaaatatgaatttacagcatgaatgaataaatgaatttgatgtgaaaaatacaatatttgcaaacagtttgatgctgttgacaatatcaattttgtttatgaaacaacatttaaataacattcaaaattattaaaattttacgacctttctaaatatatgtacgtaggattattttcatatgatgcaaatatctaaatgtcaactttgaaagtgcaattcttcgtctatatgtaatattaaaggaggcatatcctaagatcatttcaacaatttgatcatcaggacgtagttcgcaaaggtcgttaaatgttttcgttccacacaatttgtggggattacaccgtagattatcacgaagggttatttgatgggcaaaacagaattaaatgttcagctgccgattctgtagttattttacatttcggacaactaaatatgtatttacgtgcaaataatttactcactataaacattaccgttctgcagtacggtaaatagtcacgattcaattgacagaagcgccatatactgcttggagcgatttcgctttttatgtatagaaaggcactaagactgtcgtctaaaatatattatgtttattatttttatgtatagcttgttgtgatcgtttttttttcatgtgtcttaaaccgtgaaaagatgcacttaaaagatattcgttcaaaacttcggtcagattatatattcctaaaatacggtaaatatctgggaccggtcataatgttttactatgattagacatgtattgtacaagcatattaacgaatagcgtttttatcctaaagcgaccactaatactgcataattgaccaaatattaatactgttctaccggtgtcat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcATGACAAA---AC--------ATGCGT-----AACA----------TACTGTTT---GTGAAGCA-----ATATAAA----TATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTCGTC-GAA-TGTCAAATA-CACATATGACA---TA----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attgattgcttcttgtattcctccgtagatatatacaggaaagtaaaaacatacaggcaaggttaaataatgtacatgcacatacaaacacacatttacattattacatatggtaagaaaaataaaagttatacacatatataagaacttcttaggcgtacatgttaatgtaaatttaacacagtatgcttacagatagtgtttacggccagtccgtcttcgattgtaatttcaaagaaagaagaaattcgaggagaattatgtatcttgtcaaaacgaaatgcaacGTCAAAT--AC--------ACATAT-----GACA----------TA----TT---ATGGTATATT---ACATAAA----TGTAtta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAC--AC--------ATATATTTTGTGAT-----------TA----TTTCGGTGGT-TAGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cggaacgatgtgcaagatgacT---ATGTAAA----TATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAAA-CG--AAATA-CA-ATGTCACAAAGTATGAGA----AGCTT-----CAATAGAAA-CGCACCCATTAATTA--------------AATCAATGACAGATACACATATGATATATT----------ACATAAA----------AAGATATGTGACTATAAAGGA-AAAAACTGTCTATAAAGCAAGAACGAGTA-AATGAAACTGATGTGTCG-AACATTATAAGTTGCTGTAAGTTGT-TGTTGTTGACAATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaacaaTACGTGTCTTGCCGAAA-CG--AAATG-CT-AGACGACA----A----A----A---------C---ATACA-CGTATGCNNNNNNNNNNCAATTA--ATTGAATCGATGACACATAAACATATCATACA-----GTACA-CA-ATAAACGT----------------GACTATAAAGAACAAAAA-TGATTATAAAGCTTGAATGAATATAAAAAAACTGTTGTAAAAGAACATAATATATTGCTATCAGTTTT-TGTTGTTGACAAAATTAAATTTTGTTGATGAAA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAATGTCAAATACACATATGACATATTctgttctaccggtgtcat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attgattgcttcttgtattcctccgtagatatatacaggaaagtaaaaacatacaggcaaggttaaataatgtacatgcacatacaaacacacatttacattattacatatggtaagaaaaataaaagttatacacatatataagaacttcttaggcgtacatgttaatgtaaatttaacacagtatgcttacagatagtgtttacggccagtccgtcttcgattgtaatttcaaagaaagaagaaattcgaggagaattatgtatcttgtcaaaacgaaatgcaacatgacaaaacatgcgtaacatactgtttgtgaagcaatataaatatattcagtctgaagcatcaagaatatgtgcctcgtcgGTCAAATACACATATGACATATTATGGTATATTACATAAATGTAa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTAGCATTCAAAAGTATTAAAATGTTACGACCTTATTAGATATAGGATCGGA----GGATTATT----------------GTCATATGATGCAAATATCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-GGTGCAATTCT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTGAATATA----TGTACATAGGATTAT-----------------G----------------T--AAATGAAGCAAATATATGACTCGAATCTTTTAAGAATGCA-TTATTTGCT-TAGCTGTAAGTTC--AAATGA--AGGTTATTCTGAAGTTAATT-CAATAATTAGATtcc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCTCAGCTATAGTGTCCGTG--TATGATTTACATTTCGGGCAAATGGTTATGTACTTGCGTGAGAAGAGTTTACTTACAATAAACATCACTGACCTACAGTATGGTAAATAAT-------CACTGTATAACTGGCTGAAACGCCATATACCACTTTGAGCAATACTGTT-TTT--ATCCGCTTA-AAATGTATGGAGGCT-TCGATGT----GACATAAGCC-AGTCTGCAGCCGTGCGTATTAA---C--CGT-TTCTTCTAT-TA--TTGCCTC-ACGGTTGG---AAA----TATTT-----TT-------------T---GGA---A---A----TAAA--TTCATGTAAAA---TCTCAGTGA------------G-CTGTATTTTCCCAGTATATGGTATATGTC---G--ATATaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gACGATA-------------TAACTGGCT-------GAAACGCAATATAACACTTGGAACAATAATATTTTGT--AT--GCTTAAAAATGAATGGAGGCTTCCG-TCAGACAAAAATCTG-----TTTTTATA-------ATCGAAGTC--TGCAACTGTGTGTACTGCAAGTTTTAATCGTTTCTTCCAT----TGCCTCAGAGTTGGGAAAGA-----T---GCT-TTGGAAA----C--AAGTTCTTGTAAAA---CCTCAGTGA------------GATTGTATTTTCCCAGAATACGATATATGTCGGGC--TTAAAA-CCggtatatgtcgatatggtatatgtcgggggcataaaaccaaatgttgttcttggttaaacaaatattgcacgagtcgattaccgaaaaatagtgtttatcccgtagtagttatctatgtgagacacttggccaaacataagatgctttcgtttatctatttca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacagtatggtaaaaaaatcGGAGCGATTTT-CT-TTTGCAT--GCATCAAAAGGCAATAAGACTTTCA-TCG----AAAATAAGCCTAGTCTTTAAAG------A--AAATGCAACGT-TTTTTACGCAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTT--AT--GCATAGAAAGGCACT------GTCG-TCT----AAAATAAGCCGATTTT--AAA-------TTTAAATTC--TGTGTTTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCGTTTTTT-CAT----TGTCT-----TAAACCAGGAAAAGAT---GCACTTG---AAAAAT--G--TTCGTTCAAAA---CTTTGGTCA------------GATTATATTTTCCTAAAATACGGTAAATATTTGGG--ATAT-------AATGTTTTACTAGGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATAAATG---AATATTATTT-T----TATCCTAAAGCGACAACTAATACTGCATA--------ATTG-ACCAAATAGTA-ATAGCTGACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCCtgtctt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATATGGTATATGTCGGGGGCATAAAA-CCA-AATGTTGTTCTTGG-TTAAACAAATATTGCACGAGTCGATTACCGAAAAATAGTGTTTATCCCGTA----G----------TAGT--TATCTATGTGAGACACTTGGCCAAACATAAGAT-GCTTTCGTTTATCTATTTCAaatacttgttaacgcgacatcggttcttgtaagttttggtagtgattgcctgtattttacacattctacgttaactctttcaagagatcggatttgggtgtctgttattgagttccatagttcgcatccgtagagagctctggagagaacaacattttcatataaatgttttgcaataggatgcaaaccatctttatgaacgccacagtcggcttatccaaatatgttttgcttaattttgtacacgcctctttaatattaacgtttaaacacatatctttgctacaagttacaccaagatgtacatatttataagcttccttaacgattactgccatgaccttaaattgttttgaaagtcggaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgctcagctatagtgtccgtgtatgatttacatttcgggcaaatggttatgtacttgcgtgagaagagtttacttacaataaacatcactgacctacagtatggtaaataatcactgtataactggctgaaacgccatataccactttgagcaatactgtttttatccgcttaaaatgtatggaggcttcgatgtgacataagccagtctgcagccgtgcgtattaaccgtttcttctattattgcctcacggttggaaatattttttggaaataaattcatgtaaaatctcagtgagctgtattttcccagtatatggtatatgtcgatatggtatatgtcgAGATATCTGGG--AC-CAGTCCT-AATGTTTTACTATGTTTAGACATGTATTGTACAAGCCTATTAACG---AATAGTGTTT-T----TA----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAGCTTACACTTGTCTATTT-ATATTATATTGGCATCAGGCCtcttaaagcgaccactaata
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): ACTTGTTAACGCGAAATCGGCCTTTGAGTATATATATATTACACATTTAAGAGATCGCATTTTGGTGTCATTTATAGAGTCCCATAGTTCGAAGCCATATAGAGTAATTTAGAAAAGACACCAATTAATTATTCTCGTGTTGCATGCATAGTACATACATTATCTTTAGTAACGCCTCATATAATCCAAAATATATTTTACGAAATATGTACACGCTTTTTCATTAATAGCATTTGGATCATAT
Unaligned ( gi|21 ): ACAAGTTACACCAAGATGTACATATTTATAAGCTTCATTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGGCCTAGAATTGTTTTGAAATTCGGAAT
Unaligned ( gi|22 ): ACGCATATCTTTACGACAAGTGACACAAAGATAACATATTTGTAAGCTCTGAGCTTTAAAACCTCAGATTTGTTCTGAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|23 ): GTACATGCTTTATTAATGGCATGGTATGAACACATAGCTTTGTTATACGTGACACCAAGCTGTACATA
Unaligned ( gi|24 ): ATAACTTCCCTTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGACCTTGAATTG






Alignments
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Reference ( family-3060 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGATTGATTCTTTTATTTCTCCGTAA-A-TATATACAGGAGAGTATAAACATACAGNCAAGGTTAAACAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACANATGGGAAGAAAAAACAAAAGTTATACACATATATT-------AAAANATCCCTAGGCGTACATGTNNATGTAAAATTTAATACAGTATTCTTACAGATAGTGTTTACGACCAGTCCGTCTTCGCTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAAGAGAATTATGTGTCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATGC-----GCGAC-AT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAA----ACG--AAATACA-ATGTCAC-ATAATATTGAGTAG----CTCCTAGAGA---AAC-GCATTCATTAATTAATTAGAATA-----NTT----AAT-GNCAAA-TAC-ACATATGACGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAAA-CGAAATACAATGTCACATAATATGAGTAGCTCCTAGAGAAACGCATTCATTAATTAATTAGAACAATTAATGTCAAATACACATATGATATATTGTGGTATATTACATAAATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTNACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-CGCATTCATTAAT--TAATTAGAACAATTAATGTCAAATACACATATGACACATTATGGTATATTACATAAATGTA--CCA-TAATATAT-TGGCTATAAAGGA-AAANA-TGANTATAAAGCATGAATGAATA-AATGAAACTGATGTGAAA-AACACAATANNTTGCTANCAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTANATAACATTCAAAATTATTAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TCTAAATG-----------TG------ATCTTTGAA-AGTGCAATTCT-T-N-TCTANATGTAATNTT--AAA-GA--AG-CATATCCTGAGGTC-ATT-CAACAATTTGATCATNAGGACGTAGTTCGCAAAGGCCGTTAAATGTTTTCGCNCCACACAATTTGTGGGGATTACACCGTANATTATCGCGNATGGNGTTATTTGATGNGCAAAACAGAATTAGATGTTCAGCTGCCGATTCCGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAGATATGTACTTGCGTGCGAANAGTTTACTCACNATAAACATCACCGNCCTGCAGTACGGTAAATAG-------TC-------A-------ATTGACAGAAACGCCATATACCGCTTGGAGCGATNTTGCTTTT-TAT--GCATAGAAAGGCACTGAGGCTNTCG-TCTAAAATAAGCCTANT---TTTTAAA-ATTAAATTC--CGT-T-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCT-----T------T-----G-G--AG--G-ATGCG-TTGGAA-A-T--A--TTCGTNTAAAACCTCGGTNAGATTGTATTTTCCCAGAATACGGTANATGTCTGGG--ATANAG-CCA-AATGTTTTACTANGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATTAACG---AATAGTGTTTTTATCC--TAA-AGCGA-CA-CTAATACTGC---ATAATTGACCAAATATTAATA-GCTTACGCTTGTCTATTTCATATTNTATTGGCATNAGGCC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGTAAATATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACAAAGTATG-A-GAAGCTTCAATAGAAA-CGCACCCATTAAT--TA--------AATCAATGACAGATACACATATGA----------TATATTACATAAA-----------AAGATATGTGACTATAAAGGA-AAAAACTGTCTATAAAGCAAGAACGAGTA-AATGAAACTGATGTGTCG-AACATTATAAGTTGCTGTAAGTTGT-TGTTGTTGACAATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaacaaTACGTGTCTTGCCGAAACGAAATG-CTAGACGACAAAACATACACGTA--TGCNNNNNNNN-NNCA-------AT--TAATTG----AATCGATGACACATAAACATATCATACA-----GTACAC-A-ATAAACGT-----------------GACTATAAAGAACAAAAA-TGATTATAAAGCTTGAATGAATATAAAAAAACTGTTGTAAAAGAACATAATATATTGCTATCAGTTTT-TGTTGTTGACAAAATTAAATTTTGTTGATGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tACAGTGTTCACATCCAATCAATCGCCGCTTGTAAATCCAA---------AAAATATTCAAAAA----TATGTGTCTTGTAGAGACGAAA-GCAAGATGACACAATATGG-----ATGAC-AT----actattcagaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacgtacatttatTGAATATATGTACATAGGATTA-T----------------G------------------TAAATGAAGCAAATATATGACTCGAATCTTTTAAGAATGCATTATT-T-G-CTTAGCTGTAAGTTC--AAATGA--AG-GTTATTCTGAAGTTAATT-CAATAATTAGATcgagaagttaaaataacaaatataaatttatcgttttaagttacaagagcacatactt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCATTCAAAAGTATTAAAATGTTACGACCTTATTAGATATAGGATCGGAGGATTATT----------------GTCATATGATGCAAATATCTAAATG-----------TG------ATCTTTGAA-GGTGCAATTCT-T-aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttCGGAACGATGTGCAAGATGACAACACATATATTTTGTGATTATTTCGGTGGTT-AGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCCcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGAGCGATTTT-CTTTTGCAT--GCATCAAAAGGCAATAAGACTTTCA-TCGAAAATAAGCCTAGT---CTTTAAAGA--AAATGCAACGT-T-TTTTACGCAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-TTCAATTATTAAT--TAATTAGAACAATTTATATCAAGGACATATATGATACATTATGGTGTATTACATAAATGTATTCAA-TAATATAT-TGGCTATATAGGA-AAATA-TGAATTTACAGCATGAATGAATA-AATGAATTTGATGTGAAA-AATACAATAT-TTGCAAACAGTTTGATGCTGTTGACAATATC-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTAAATAACATTCAAAATTATTAAAATTTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATTTTCATATGATGCAAATA----------------TCTAAATG-----------TC------AACTTTGAA-AGTGCAATTCT-T-CGTCTATATGTAATATT--AAA-GG--AGGCATATCCTAAGATC-ATTTCAACAATTTGATCATCAGGACGTAGTTCGCAAAGGTCGTTAAATGTTTTCGTTCCACACAATTTGTGGGGATTACACCGTAGATTATCACGAA--GGGTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAAATATGTATTTACGTGCAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAGTCACGATTC-------A-------ATTGACAGAAGCGCCATATACTGCTTGGAGCGATTTCGCTTTT-TAT--GTATAGAAAGGCACTAAGACTGTCG-TCTAAAATA----TATTATGTTT-----ATTA-----------T-TTTTATGTATAGCTTGTTGTGATCGTTTTTTTTTC----ATGTGTCT-----TAAACCGT-----GAA--AA--G-ATGCACTTAAAAGA-T--A--TTCGTTCAAAACTTCGGTCAGATTATATATTCCTAAAATACGGTAAATATCTGGG--AC-CGG-TCATAATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCATATTAACG---AATAGCGTTTTTATCC--TAA-AGCGACCA-CTAATACTGC---ATAATTGACCAAATATTAATA-tgtctt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TA-GCTTACACTTGTCTATTT-ATATTATATTGGCATCAGGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT-TAT--GCATAGAAAGGCACTG------TCG-TCTAAAATAAGCCGA-----TTTTAAA-TTTAAATTC--TGTGT-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCT-----T------AAACCAG-G--AAAAG-ATGCACTTGAAA-AAT--G--TTCGTTCAAAACTTTGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTAAATATTTGGG--ATATA-------ATGTTTTACTAGGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATAAATG---AATATTATTTTTATCC--TAA-AGCGA-CAACTAATACTGC---ATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTGACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCCa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcTGATTAATTCTTTTAT----------------ATA----AGAGTATAAGCATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAA-------CAAA-----TACACATATATT-------AATAAATCCCTAGGCGTACGTGTAAATGTAAA-TTTAATAAAGTATTATTACAGATATTGTA-ACTGTTAGTCCACCTTCACTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGTAGAGAAGTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATGC-----GTGAC-AT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-GATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTACCTTGTCGAA----AAG--AAATACA-ATGCCAC-ATAATA-TGAGTAG----CTCCTTGAGA---AAC-ACATTCATTAATTAATTAGAATA-----TTA----AAT-GTCAAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTCTAAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAACCAAAATACAATGTTACATAATATGAGTAGCTCCTAGAAAAATACATTCATTCATTTATTAGAACAAGTATTGTTAAATACACATATGACA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTGCTCAGCTATAGTGTCCGTG--TATGATTTACATTTCGGGCAAATGGTTATGTACTTGCGTGAGAAGAGTTTACTTACAATAAACATCACTGACCTACAGTATGGTAAATAA-------TCACTGTATA-------ACTGGCTGAAACGCCATATACCACTTTGAGCAATACTG-TTTT-TATCCGCTTA-AAATGTATGGAGGCT-TCGATGTGACATAAGCC-AGT---CTGCAG----------C--CGT--------------GC--GTATTAACCG---TTTCTTCTATTAT-TGCCTCACGGT------T-----G-G--AA--ATATTTT-TTGGAA-A-TAAA--TTCATGTAAAATCTCAGTGAG-CTGTATTTTCCCAGTATATGGTATATGTC---G--ATATGG-c
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gi|7                          : gtgctcagctatagtgtccgtgtatgatttacatttcgggcaaatggttatgtacttgcgtgagaagagtttacttacaataaacatcactgacctacagtatggtaaataatcactgtataactggctgaaacgccatataccactttgagcaatactgtttttatccgcttaaaatgtatggaggcttcgatgtgacataagccagtctgcagccgtgcgtattaaccgtttcttctattattgcctcacggttggaaatattttttggaaataaattcatgtaaaatctcagtgagctgtattttcccagtatatggtatatgtcgatatggtatatgtcgTGATTGCTTCTTGTATTCCTCCGTAG-A-TATATACAGGAAAGTAAAAACATACAGGCAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACACATTTACATTATTACATATGGTAAGAAAAA-TAAAAGTTATACACATATAT--------AAGAACTTCTTAGGCGTACATGTTAATGTAAA-TTTAACACAGTATGCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGATTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAGGAGAATTATGTATCTTGTCAAAACGAAATGCAACATGACAAAACATGC-----GTAAC-AT----ACTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTCGTCG-A----ATGTCAAATACACATATGAC-ATATTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atTTTTTTTATTTCTCCATTA-A-TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGCCAGGGTTAAACAATGTACATGCACATACAAACACATATTTTAAAAATTAAAAA--AAAAAAAAAAAAAAAAGTTATACACATATATT-------AAAACATCCCTAAGCGTACATGTATATGTAAA-TTTAATACAGTTTTCTTACAGACAGTGTTTACGACCAGTCCATCTTCGCTTTTAATTTCAAAGAAATTCGAAGAAATTCGAAGAAAAGTATGTATCTTGGCGAAACTAAATGCAAGATGACAAAACATGC-----GTGAC-AT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AACGTATTAAGTCTCAAGCAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gattttttgggtGAAT-ATGTGCATTGTCGAAACGAAATGCAAAATGACACA--ATGA-----ATGA--AT----GATGTTGTGT-------------ATGTATTCACTTTTAAGC-------ATATGTGCCTTGTTGAACGTGAGG--AAAGATA-A---CACAATAATAATGA--AGTTTTCTTTTATAAATGCAGCTGCATTCAGT--TTAA--AGAATATGTGTCTTGTTGAATCGACGAGCTGCAAAATGTGA--TACTGGGGAAGATGTTTAGATATTATACAAATGAATTCAGTT-------TTAAGAATATGTGCGTTGTCGGAA-AGAATTACAGGGTTATATAATATAAATAACTTTTAG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): ACTTGTTAACGCGAAATCGGCCTTTGAGTATATATATATTACACATTTAAGAGATCGCATTTTGGTGTCATTTATAGAGTCCCATAGTTCGAAGCCATATAGAGTAATTTAGAAAAGACACCAATTAATTATTCTCGTGTTGCATGCATAGTACATACATTATCTTTAGTAACGCCTCATATAATCCAAAATATATTTTACGAAATATGTACACGCTTTTTCATTAATAGCATTTGGATCATAT
Unaligned ( gi|21 ): ACAAGTTACACCAAGATGTACATATTTATAAGCTTCATTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGGCCTAGAATTGTTTTGAAATTCGGAAT
Unaligned ( gi|22 ): ACGCATATCTTTACGACAAGTGACACAAAGATAACATATTTGTAAGCTCTGAGCTTTAAAACCTCAGATTTGTTCTGAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|23 ): GTACATGCTTTATTAATGGCATGGTATGAACACATAGCTTTGTTATACGTGACACCAAGCTGTACATA
Unaligned ( gi|24 ): ATAACTTCCCTTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGACCTTGAATTG






Alignments
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Reference ( family-3060 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGATTGATTCTTTTATTCCTCCANAA-A-TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAAGAAAAAACAAAAGTTATACACATATATT-------AAAAAATCCCTAGGCGTACATGTAAATGTAAAATTTAATACAGTATTCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGCTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAAGAGAATTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAA----ANG--AAATACA-ATNTCAC-ATAAT-A-TGAGTAG----CTCCTAGAGA---AAC-GCATTCATTAATTAATTAGAATA-----NTT----AAT-GACGAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTTCGAAGCATCAAGAATACGTGCCTTGTCGAAA-CGAAATACAATGTTACATAATATAAGTAGCTCCTAGAGAAACGCATTCATTNATTAATTAGAACAATTAATGTNAAATACACATATGATATATTGTGGTATATTATATAAATGTATTCAGTCTGAAGCGTCGAGAATATGTGCCTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-CGCATTCATTAAT--TAATTAGAACAATTAATGTCAAATACACATATGATACATTGTGGTATATTACATAAATGTA--CCA-TAATATAT-TGGCTATANAGGA-AAATA-TGAATATAAAGCATGAATGAATA-AATGAAATTGATGTGAAA-AACACAATANNTTGCTAACAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTANATAACATTCAGAATTATTAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-AGTGCAATTCT-T-GTCTANNTGTAATCTT--AAATGA--AGCATATCCTGAAATC-ATT-CAACAATTTGATCATAAGGACGTAGTTCGCAAAGATCGTTAAATGTTTTCGCTCCACACAATTTGTGAAGATTACACCGTAGATTATGACGCA-GGTGTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAGATATGTATTTACGTGNAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAA-------TC-------A-------ACTGGCNGAAGCGCCATATACCGCTTGGAGCGATTTTGCTTTT-TAT--GCATAGAAAGGCACTGAGAC-T-TC-G-TCTAAAATA-AGCCTA-GTTTTTAAA-ATTAAATTC--CGT-T-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTCA----G--TT--GG--AA--G-ATGCACTTGGAA-A-T--A--TTCGTTTAAAACTTCGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTANATGTCTGGG--ATANAG-CCA-AATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATTAACG---AATAGTGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTTACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATGTAAATATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACAAAGTATG-A-GAAGCTTCAATAGAAA-CGCACCCATTAAT--TA--------AATCAATGACAGATACACATATGA----------TATATTACATAAA-----------AAGATATGTGACTATAAAGGA-AAAAACTGTCTATAAAGCAAGAACGAGTA-AATGAAACTGATGTGTCG-AACATTATAAGTTGCTGTAAGTTGT-TGTTGTTGACAATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaTACGTGTCTTGCCGAAACGAAATG-CTAGACGACAAAACATACACGTA--TGCNNNNNNNN-NNCA-------AT--TAATTG----AATCGATGACACATAAACATATCATACA-----GTACAC-A-ATAAACGT-----------------GACTATAAAGAACAAAAA-TGATTATAAAGCTTGAATGAATATAAAAAAACTGTTGTAAAAGAACATAATATATTGCTATCAGTTTT-TGTTGTTGACAAAATTAAATTTTGTTGATGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tACAGTGTTCACATCCAATCAATCGCCGCTTGTAAATCCAA---------AAAATATTCAAAAA----TATGTGTCTTGTAGAGACGAAA-GCAAGATGACACAATATG-----GATGA-CAT----actattcagaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacgtacatttatTGAATATATGTACATAGGATTAT-----------------G----------------T--AAATGAAGCAAATATATGACTCGAATCTTTTAAGAATGCATTATT-T-GCTTAGCTGTAAGTTC--AAATGA--AGGTTATTCTGAAGTTAATT-CAATAATTAGATcgagaagttaaaataacaaatataaatttatcgttttaagttacaagagcacatactt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAGCATTCAAAAGTATTAAAATGTTACGACCTTATTAGATATAGGATCGGAGGATTATT----------------GTCATATGATGCAAATATCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-GGTGCAATTCT-T-aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttCGGAACGATGTGCAAGATGACAACACATATATTTTGTGATTATTTCGGTGGTT-AGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCCcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGAGCGATTTT-CTTTTGCAT--GCATCAAAAGGCAATAAGACTT-TC-A-TCGAAAATA-AGCCTA-GTCTTTAAAGA--AAATGCAACGT-T-TTTTACGCAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-TTCAATTATTAAT--TAATTAGAACAATTTATATCAAGGACATATATGATACATTATGGTGTATTACATAAATGTATTCAA-TAATATAT-TGGCTATATAGGA-AAATA-TGAATTTACAGCATGAATGAATA-AATGAATTTGATGTGAAA-AATACAATAT-TTGCAAACAGTTTGATGCTGTTGACAATATC-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTAAATAACATTCAAAATTATTAAAATTTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATTTTCATATGATGCAAATA----------------TCTAAATG-----------TCA------ACTTTGAA-AGTGCAATTCT-TCGTCTATATGTAATATT--AAAGGA--GGCATATCCTAAGATC-ATTTCAACAATTTGATCATCAGGACGTAGTTCGCAAAGGTCGTTAAATGTTTTCGTTCCACACAATTTGTGGGGATTACACCGTAGATTATCACGAA-GG-GTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAAATATGTATTTACGTGCAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAGTCACGATTC-------A-------ATTGACAGAAGCGCCATATACTGCTTGGAGCGATTTCGCTTTT-TAT--GTATAGAAAGGCACTAAGAC-TGTC-G-TCTAAAATATA--TTATGTTT------ATTA-----------T-TTTTATGTATAGCTTGTTGTGATCGTTTTTTTTTC----ATGTGTCTTAAACCG--TG--AA--AA--G-ATGCACTTAAAAGA-T--A--TTCGTTCAAAACTTCGGTCAGATTATATATTCCTAAAATACGGTAAATATCTGGG--AC-CGG-TCATAATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCATATTAACG---AATAGCGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATATTAATA-tgtctt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TA-GCTTACACTTGTCTATTT-ATATTATATTGGCATCAGGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TT-TAT--GCATAGAAAGGCACTG-------TC-G-TCTAAAATA-AGCCGA---TTTTAAA-TTTAAATTC--TGTGT-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTTA----A--ACCAGG--AAAAG-ATGCACTTGAAA-AAT--G--TTCGTTCAAAACTTTGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTAAATATTTGGG--ATATA-------ATGTTTTACTAGGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATAAATG---AATATTATTTTTATCCTAAAGCGACAACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTGACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCCa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcTGATTAATTCTTTTAT----------------ATA----AGAGTATAAGCATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAA-------CAAA-----TACACATATATT-------AATAAATCCCTAGGCGTACGTGTAAATGTAAA-TTTAATAAAGTATTATTACAGATATTGTA-ACTGTTAGTCCACCTTCACTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGTAGAGAAGTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-GATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTACCTTGTCGAA----AAG--AAATACA-ATGCCAC-ATAAT-A-TGAGTAG----CTCCTTGAGA---AAC-ACATTCATTAATTAATTAGAATA-----TTA----AAT-GTCAAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTCTAAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAACCAAAATACAATGTTACATAATATGAGTAGCTCCTAGAAAAATACATTCATTCATTTATTAGAACAAGTATTGTTAAATACACATATGACA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTGCTCAGCTATAGTGTCCGTG--TATGATTTACATTTCGGGCAAATGGTTATGTACTTGCGTGAGAAGAGTTTACTTACAATAAACATCACTGACCTACAGTATGGTAAATAA-------TCACTGTATA-------ACTGGCTGAAACGCCATATACCACTTTGAGCAATACTG-TTTT-TATCCGCTTA-AAATGTATGGAGGC-T-TC-GATGTGACATA-AGCC-A-GTCTGCAG----------C--CGT--------------GC--GTATTAACCG---TTTCTTCTATTAT-TGCCTCACG--G--TT--GG--AA--ATATTT-TTTGGAA-A-TAAA--TTCATGTAAAATCTCAGTGAG-CTGTATTTTCCCAGTATATGGTATATGTC---G--ATATGG-c
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATATGGTATATGTCGGGGGCATAAAA-CCA-AATGTTGTTCT-TGGTTAAACAAATATTGCACGAGTCGATTACCGAAAAATAGTG--TTTATCCCGTAGTAGTTATCTATGTGAGACACTTGGCCAAACA-TAAGATGCTTTCGTTTATCTATTTCtatatgtcgatatggtatatgtcgggggcataaaaccaaatgttgttcttggttaaacaaatattgcacgagtcgattaccgaaaaatagtgtttatcccgtagtagttatctatgtgagacacttggccaaacataagatgctttcgtttatctatttca
gi|7                          : gtgctcagctatagtgtccgtgtatgatttacatttcgggcaaatggttatgtacttgcgtgagaagagtttacttacaataaacatcactgacctacagtatggtaaataatcactgtataactggctgaaacgccatataccactttgagcaatactgtttttatccgcttaaaatgtatggaggcttcgatgtgacataagccagtctgcagccgtgcgtattaaccgtttcttctattattgcctcacggttggaaatattttttggaaataaattcatgtaaaatctcagtgagctgtattttcccagtatatggtatatgtcgatatggtatatgtcgTGATTGCTTCTTGTATTCCTCCGTAG-A-TATATACAGGAAAGTAAAAACATACAGGCAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACACATTTACATTATTACATATGGTAAGAAAAA-TAAAAGTTATACACATATAT--------AAGAACTTCTTAGGCGTACATGTTAATGTAAA-TTTAACACAGTATGCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGATTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAGGAGAATTATGTATCTTGTCAAAACGAAATGCAACATGACAAAACATG-----CGTAA-CAT----ACTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTCGTCG-A----ATGTCAAATACACATATGAC-ATATT-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atTTTTTTTATTTCTCCATTA-A-TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGCCAGGGTTAAACAATGTACATGCACATACAAACACATATTTTAAAAATTAAAAA--AAAAAAAAAAAAAAAAGTTATACACATATATT-------AAAACATCCCTAAGCGTACATGTATATGTAAA-TTTAATACAGTTTTCTTACAGACAGTGTTTACGACCAGTCCATCTTCGCTTTTAATTTCAAAGAAATTCGAAGAAATTCGAAGAAAAGTATGTATCTTGGCGAAACTAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AACGTATTAAGTCTCAAGCAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gattttttgggtGAAT-ATGTGCATTGTCGAAACGAAATGCAAAATGACACA--ATG-----AATGA--AT----GATGTTGTGT-------------ATGTATTCACTTTTAAGC-------ATATGTGCCTTGTTGAACGTGAGG--AAAGATA-A---CACAATAATAA-TGA--AGTTTTCTTTTATAAATGCAGCTGCATTCAGT--TTAA--AGAATATGTGTCTTGTTGAATCGACGAGCTGCAAAATGTGA--TACTGGGGAAGATGTTTAGATATTATACAAATGAATTCAGTT-------TTAAGAATATGTGCGTTGTCGGAA-AGAATTACAGGGTTATATAATATAAATAACTTTTAG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): ACAAGTTACACCAAGATGTACATATTTATAAGCTTCATTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGGCCTAGAATTGTTTTGAAATTCGGAAT
Unaligned ( gi|22 ): ACGCATATCTTTACGACAAGTGACACAAAGATAACATATTTGTAAGCTCTGAGCTTTAAAACCTCAGATTTGTTCTGAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|23 ): GTACATGCTTTATTAATGGCATGGTATGAACACATAGCTTTGTTATACGTGACACCAAGCTGTACATA
Unaligned ( gi|24 ): ATAACTTCCCTTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGACCTTGAATTG






Alignments
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Reference ( family-3060 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGATTGATTCTTTTATTCCTCCANAA-A-TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAAGAAAAAACAAAAGTTATACACATATATT-------AAAAAATCCCTAGGCGTACATGTAAATGTAAAATTTAATACAGTATTCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGCTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAAGAGAATTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAA----ANG--AAATACA-ATNTCAC-ATAAT-A-TGAGTAG----CTCCTAGAGA---AAC-GCATTCATTAATTAATTAGAATA-----NTT----AAT-GACGAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTTCGAAGCATCAAGAATACGTGCCTTGTCGAAA-CGAAATACAATGTTACATAATATAAGTAGCTCCTAGAGAAACGCATTCATTNATTAATTAGAACAATTAATGTNAAATACACATATGATATATTGTGGTATATTATATAAATGTATTCAGTCTGAAGCGTCGAGAATATGTGCCTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-CGCATTCATTAAT--TAATTAGAACAATTAATGTCAAATACACATATGATACATTGTGGTATATTACATAAATGTA--CCA-TAATATAT-TGGCTATANAGGA-AAATA-TGAATATAAAGCATGAATGAATA-AATGAAATTGATGTGAAA-AACACAATANNTTGCTAACAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTANATAACATTCAGAATTATTAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-AGTGCAATTCT-T-GTCTANNTGTAATCTT--AAATGA--AGCATATCCTGAAATC-ATT-CAACAATTTGATCATAAGGACGTAGTTCGCAAAGATCGTTAAATGTTTTCGCTCCACACAATTTGTGAAGATTACACCGTAGATTATGACGCA-GGTGTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAGATATGTATTTACGTGNAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAA-------TC-------A-------ACTGGCNGAAGCGCCATATACCGCTTGGAGCGATTTTGCTTTT-TAT--GCATAGAAAGGCACTGAGAC-T-TC-G-TCTAAAATA-AGCCTA-GTTTTTAAA-ATTAAATTC--CGT-T-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTCA----G--TT--GG--AA--G-ATGCACTTGGAA-A-T--A--TTCGTTTAAAACTTCGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTANATGTCTGGG--ATANAG-CCA-AATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATTAACG---AATAGTGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTTACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATGTAAATATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACAAAGTATG-A-GAAGCTTCAATAGAAA-CGCACCCATTAAT--TA--------AATCAATGACAGATACACATATGA----------TATATTACATAAA-----------AAGATATGTGACTATAAAGGA-AAAAACTGTCTATAAAGCAAGAACGAGTA-AATGAAACTGATGTGTCG-AACATTATAAGTTGCTGTAAGTTGT-TGTTGTTGACAATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaTACGTGTCTTGCCGAAACGAAATG-CTAGACGACAAAACATACACGTA--TGCNNNNNNNN-NNCA-------AT--TAATTG----AATCGATGACACATAAACATATCATACA-----GTACAC-A-ATAAACGT-----------------GACTATAAAGAACAAAAA-TGATTATAAAGCTTGAATGAATATAAAAAAACTGTTGTAAAAGAACATAATATATTGCTATCAGTTTT-TGTTGTTGACAAAATTAAATTTTGTTGATGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tACAGTGTTCACATCCAATCAATCGCCGCTTGTAAATCCAA---------AAAATATTCAAAAA----TATGTGTCTTGTAGAGACGAAA-GCAAGATGACACAATATG-----GATGA-CAT----actattcagaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacgtacatttatTGAATATATGTACATAGGATTAT-----------------G----------------T--AAATGAAGCAAATATATGACTCGAATCTTTTAAGAATGCATTATT-T-GCTTAGCTGTAAGTTC--AAATGA--AGGTTATTCTGAAGTTAATT-CAATAATTAGATcgagaagttaaaataacaaatataaatttatcgttttaagttacaagagcacatactt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAGCATTCAAAAGTATTAAAATGTTACGACCTTATTAGATATAGGATCGGAGGATTATT----------------GTCATATGATGCAAATATCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-GGTGCAATTCT-T-aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttCGGAACGATGTGCAAGATGACAACACATATATTTTGTGATTATTTCGGTGGTT-AGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCCcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGAGCGATTTT-CTTTTGCAT--GCATCAAAAGGCAATAAGACTT-TC-A-TCGAAAATA-AGCCTA-GTCTTTAAAGA--AAATGCAACGT-T-TTTTACGCAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-TTCAATTATTAAT--TAATTAGAACAATTTATATCAAGGACATATATGATACATTATGGTGTATTACATAAATGTATTCAA-TAATATAT-TGGCTATATAGGA-AAATA-TGAATTTACAGCATGAATGAATA-AATGAATTTGATGTGAAA-AATACAATAT-TTGCAAACAGTTTGATGCTGTTGACAATATC-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTAAATAACATTCAAAATTATTAAAATTTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATTTTCATATGATGCAAATA----------------TCTAAATG-----------TCA------ACTTTGAA-AGTGCAATTCT-TCGTCTATATGTAATATT--AAAGGA--GGCATATCCTAAGATC-ATTTCAACAATTTGATCATCAGGACGTAGTTCGCAAAGGTCGTTAAATGTTTTCGTTCCACACAATTTGTGGGGATTACACCGTAGATTATCACGAA-GG-GTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAAATATGTATTTACGTGCAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAGTCACGATTC-------A-------ATTGACAGAAGCGCCATATACTGCTTGGAGCGATTTCGCTTTT-TAT--GTATAGAAAGGCACTAAGAC-TGTC-G-TCTAAAATATA--TTATGTTT------ATTA-----------T-TTTTATGTATAGCTTGTTGTGATCGTTTTTTTTTC----ATGTGTCTTAAACCG--TG--AA--AA--G-ATGCACTTAAAAGA-T--A--TTCGTTCAAAACTTCGGTCAGATTATATATTCCTAAAATACGGTAAATATCTGGG--AC-CGG-TCATAATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCATATTAACG---AATAGCGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATATTAATA-tgtctt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TA-GCTTACACTTGTCTATTT-ATATTATATTGGCATCAGGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TT-TAT--GCATAGAAAGGCACTG-------TC-G-TCTAAAATA-AGCCGA---TTTTAAA-TTTAAATTC--TGTGT-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTTA----A--ACCAGG--AAAAG-ATGCACTTGAAA-AAT--G--TTCGTTCAAAACTTTGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTAAATATTTGGG--ATATA-------ATGTTTTACTAGGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATAAATG---AATATTATTTTTATCCTAAAGCGACAACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTGACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCCa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAACATATTCATTAATTAATTAGAATATTTAATGTAAAATACACATATGGTGTATTGTGGTATATTATATAAATGTATTCTGTCTGAAGCGTCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAACGAAAAAACAATGTTACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAAAAAATACATTCATTAAT--TGATTAGAACAATTAATGTGAAATACACATATGACACATTGTCGTATATTACATAAATGTAG-CCA-TTATATAT-TGG---------A-AAATA-TGAATATAAAGCATGAATGAATA-AATAAAATTGATGTGAAA-AACACAATACTTTGCTAACAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTAAGAAACAACATTTATATAACATTCAGAATTATAAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TC-ATATG-----------T-------------------TGCAA---A-T-ATCTAAATGTGATCTTTGAAA-GAGCAGCATA-------------T-CAACAATTTGATCATAAGGACGTAGTTCACAAAGACCGTTAAATGTTTTCGCACCACACAATTTGTGAAGATTACACCGTATATTATGGCGCATAGTGTTATTTGATGCGCAAAACAGAATTAGATGTTAAGCTGCCGATTCTGTAGTCAT--TTTACATTTTGGACAACTAGATATGTaatacttgttaacgcgacatcggttcttgtaagttttggtagtgattgcctgtattttacacattctacgttaactctttcaagagatcggatttgggtgtctgttattgagttccatagttcgcatccgtagagagctctggagagaacaacattttcatataaatgttttgcaataggatgcaaaccatctttatgaacgccacagtcggcttatccaaatatgttttgcttaattttgtacacgcctctttaatattaacgtttaaacacatatctttgctacaagttacaccaagatgtacatatttataagcttccttaacgattactgccatgaccttaaattgttttgaaagtcggaat
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Reference ( family-3060 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGATTGATTCTTTTATTCCTCC--A---GA---TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAAGA-----CAAAA---GTTATACACATATATT-------AAAAAATCCCTAGGCGTACATGTAAATGTAAAATTTAATACAGTATTCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGCTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAAGAGAATTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATGTATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCGAA----ANG--AAATACA-ATNTCAC-ATAAT-ATGAGTAG----CTCCTAGAGA---AAC-GCATTCATTAATTAATTAGAATA-----NTT----AAT-GACGAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTTCGAAGCATCAAGAATACGTGCCTTGTCGAAA-CGAAATACAATGTTACATAATATAAGTAGCTCCTAGAGAAACGCATTCATTNATTAATTAGAACAATTAATGTNAAATACACATATGATATATTGTGGTATATTATATAAATGTATTCAGTCTGAAGCGTCGAGAATATGTGCCTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-CGCATTCATTAAT--TAATTAGAACAATTAATGTCAAATACACATATGATACATTGTGGTATATTACATAAATG-------TA-------ATATAT-TGGCTATANAGGA-AAATA-TGAATATAAAGCATGAATGAATA-AATGAAATTGATGTGAAA-AACACAATANNTTGCTAACAGTTTTGTGCTGTTGACAATATT-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTANATAACATTCAGAATTATTAAAATGTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATT----------------G----------------TCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-AGTGCAATTCT-T-GTCTANNTGTAATCTT--AAATGA--AGCATATCCTGAAATC-ATT-CAACAATTTGATCATAAGGACGTAGTTCGCAAAGATCGTTAAATGTTTTCGCTCCACACAATTTGTGAAGATTACACCGTAGATTATGACGCA-GGTGTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAGATATGTATTTACGTGNAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAA-------TC-------A-------ACTGGCNGAAGCGCCATATACCGCTTGGAGCGATTTTGCTTTT-TAT--GCATAGAAAGGCACTGAGAC-T-TC-G-TCTAAAATA-AGCC-NG-TTTTTAAA-ATTAAATTC--CGT-T-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTTAAACCGG--GAAAAGATGC-TTTGGAAAC-A-GTTCGTTTAAAACTTCGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTANATGTCTGGG--ATANAG-CCA-AATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATTAACG---AATAGTGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTTACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATGTAAATATATCCAGTCTGAAGCCTCGAAAATATGTGTTTTGTCGAAACGAAATA-CAATGTCACAAAGTATG-A-GAAGCTTCAATAGAAA-CGCACCCATTAAT--TA--------AATCAATGACAGATACACATATGA----------TATATTACATAAA----------A-------AGATATGTGACTATAAAGGA-AAAAACTGTCTATAAAGCAAGAACGAGTA-AATGAAACTGATGTGTCG-AACATTATAAGTTGCTGTAAGTTGT-TGTTGTTGACAATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaacaaTACGTGTCTTGCCGAAACGAAATG-CTAGACGACAAAACATACACGTA--TGCNNNNNNNN-NNCA-------AT--TAATTG----AATCGATGACACATAAACATATCATACA-----GTACAC-A-ATAAACG-------T----------------GACTATAAAGAACAAAAA-TGATTATAAAGCTTGAATGAATATAAAAAAACTGTTGTAAAAGAACATAATATATTGCTATCAGTTTT-TGTTGTTGACAAAATTAAATTTTGTTGATGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tACAGTGTTCACATCCAATCAATCGCCGCTTGTAAATCCAA---------AAAATATTCAAAAA----TATGTGTCTTGTAGAGACGAAA-GCAAGATGACACAATATG-----GATGA-CAT----actattcagaac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacgtacatttatTGAATATATGTACATAGGATTAT-----------------G----------------T--AAATGAAGCAAATATATGACTCGAATCTTTTAAGAATGCATTATT-T-GCTTAGCTGTAAGTTC--AAATGA--AGGTTATTCTGAAGTTAATT-CAATAATTAGATcgagaagttaaaataacaaatataaatttatcgttttaagttacaagagcacatactt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAGCATTCAAAAGTATTAAAATGTTACGACCTTATTAGATATAGGATCGGAGGATTATT----------------GTCATATGATGCAAATATCTAAATG-----------TGA------TCTTTGAA-GGTGCAATTCT-T-aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttCGGAACGATGTGCAAGATGACAACACATATATTTTGTGATTATTTCGGTGGTT-AGTGAAACAAAAAACAATATATTCAGTCTGAAACATCAAGAGTATGTGTCTTGCCcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGAGCGATTTT-CTTTTGCAT--GCATCAAAAGGCAATAAGACTT-TC-A-TCGAAAATA-AGCCTAG-TCTTTAAAGA--AAATGCAACGT-T-TTTTACGCAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACGAAATA-CAATGTCACATAATATG-A-GTAGCTCCTAGAGAAA-TTCAATTATTAAT--TAATTAGAACAATTTATATCAAGGACATATATGATACATTATGGTGTATTACATAAATG-------TATTCAATAATATAT-TGGCTATATAGGA-AAATA-TGAATTTACAGCATGAATGAATA-AATGAATTTGATGTGAAA-AATACAATAT-TTGCAAACAGTTTGATGCTGTTGACAATATC-AATTTTGTTTATGAAACAACATTTAAATAACATTCAAAATTATTAAAATTTTACGACCTTTCTAAATATATGTACGTAGGATTATTTTCATATGATGCAAATA----------------TCTAAATG-----------TCA------ACTTTGAA-AGTGCAATTCT-TCGTCTATATGTAATATT--AAAGGA--GGCATATCCTAAGATC-ATTTCAACAATTTGATCATCAGGACGTAGTTCGCAAAGGTCGTTAAATGTTTTCGTTCCACACAATTTGTGGGGATTACACCGTAGATTATCACGAA-GG-GTTATTTGATGGGCAAAACAGAATTAAATGTTCAGCTGCCGATTCTGTAGTTAT--TTTACATTTCGGACAACTAAATATGTATTTACGTGCAAATAATTTACTCACTATAAACATTACCGTTCTGCAGTACGGTAAATAGTCACGATTC-------A-------ATTGACAGAAGCGCCATATACTGCTTGGAGCGATTTCGCTTTT-TAT--GTATAGAAAGGCACTAAGAC-TGTC-G-TCTAAAATATATTA-TG-TTT------ATTA-----------T-TTTTATGTATAGCTTGTTGTGATCGTTTTTTTTTC----ATGTGTCTTAAACCGT--GAAAAGATGC-ACTTAAAAG-ATATTCGTTCAAAACTTCGGTCAGATTATATATTCCTAAAATACGGTAAATATCTGGG--AC-CGG-TCATAATGTTTTACTATGATTAGACATGTATTGTACAAGCATATTAACG---AATAGCGTTTTTATCCTAAAGCGACCACTAATACTGCATAATTGACCAAATATTAATA-tgtctt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TA-GCTTACACTTGTCTATTT-ATATTATATTGGCATCAGGCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT-TAT--GCATAGAAAGGCACTG-------TC-G-TCTAAAATA-AGCC-GA-TTTT-AAA-TTTAAATTC--TGTGT-TTTTATGTATAGCTTGTTTTAATCG---TTTTTTC----AT-TGTCTTAAACCAG--GAAAAGATGCACTTGAAAAA-T-GTTCGTTCAAAACTTTGGTCAGATTATATTTTCCTAAAATACGGTAAATATTTGGG--ATATA-------ATGTTTTACTAGGATTAGACATGTATTGTACAAGCCTATAAATG---AATATTATTTTTATCCTAAAGCGACAACTAATACTGCATAATTGACCAAATAGTAATA-GCTGACGCTTGTCTATTTCATATTCTATTGGCATAAGGCCa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcTGATTAATTCTTTTAT--------------------ATA----AGAGTATAAGCATACAGACAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACATATTTACATAATTACAAATGGGAA-------CAAA--------TACACATATATT-------AATAAATCCCTAGGCGTACGTGTAAATGTAAA-TTTAATAAAGTATTATTACAGATATTGTA-ACTGTTAGTCCACCTTCACTTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGTAGAGAAGTATGTATCTTGTCGAAACGAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-GATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTACCTTGTCGAA----AAG--AAATACA-ATGCCAC-ATAAT-ATGAGTAG----CTCCTTGAGA---AAC-ACATTCATTAATTAATTAGAATA-----TTA----AAT-GTCAAA-TAC-ACATATGATGTATTGTGG----T------ATATTACATAAATGTATTCAGTCTAAAGCATCAAGAATATGTGCCTTGTCAAAACCAAAATACAATGTTACATAATATGAGTAGCTCCTAGAAAAATACATTCATTCATTTATTAGAACAAGTATTGTTAAATACACATATGACA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tTGCTCAGCTATAGTGTCCGTG--TATGATTTACATTTCGGGCAAATGGTTATGTACTTGCGTGAGAAGAGTTTACTTACAATAAACATCACTGACCTACAGTATGGTAAATAA-------TCACTGTATA-------ACTGGCTGAAACGCCATATACCACTTTGAGCAATACTG-TTTT-TATCCGCTTA-AAATGTATGGAGGC-T-TC-GATGTGACATA-AGCC-AG-TCTGCAG----------C--CGT--------------GC--GTATTAACCG---TTTCTTCTATTAT-TGCCTCA---CGGTTGGAAATATTT-TTTGGAAATAA-ATTCATGTAAAATCTCAGTGAG-CTGTATTTTCCCAGTATATGGTATATGTC---G--ATATGG-c
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gi|7                          : gtgctcagctatagtgtccgtgtatgatttacatttcgggcaaatggttatgtacttgcgtgagaagagtttacttacaataaacatcactgacctacagtatggtaaataatcactgtataactggctgaaacgccatataccactttgagcaatactgtttttatccgcttaaaatgtatggaggcttcgatgtgacataagccagtctgcagccgtgcgtattaaccgtttcttctattattgcctcacggttggaaatattttttggaaataaattcatgtaaaatctcagtgagctgtattttcccagtatatggtatatgtcgatatggtatatgtcgTGATTGCTTCTTGTATTCCTCCGTA---GA---TATATACAGGAAAGTAAAAACATACAGGCAAGGTTAAATAATGTACATGCACATACAAACACACATTTACATTATTACATATGGTAAGAAAAA-TAAAA---GTTATACACATATAT--------AAGAACTTCTTAGGCGTACATGTTAATGTAAA-TTTAACACAGTATGCTTACAGATAGTGTTTACGGCCAGTCCGTCTTCGATTGTAATTTCAAAGAAA---GAAGAAATTCGAGGAGAATTATGTATCTTGTCAAAACGAAATGCAACATGACAAAACATG-----CGTAA-CAT----ACTGTT-TGTGAAGCAATATA-AATATATTCAGTCTGAAGCATCAAGAATATGTGCCTCGTCG-A----ATGTCAAATACACATATGAC-ATATT-A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atTTTTTTTATTTCTCC--ATT-AA---TGTATACAGGAGAGTATAAACATACAGCCAGGGTTAAACAATGTACATGCACATACAAACACATATTTTAAAAATTAAAAAAAAAAAAA-----AAAAAAAAGTTATACACATATATT-------AAAACATCCCTAAGCGTACATGTATATGTAAA-TTTAATACAGTTTTCTTACAGACAGTGTTTACGACCAGTCCATCTTCGCTTTTAATTTCAAAGAAATTCGAAGAAATTCGAAGAAAAGTATGTATCTTGGCGAAACTAAATGCAAGATGACAAAACATG-----CGTGA-CAT----GCTGTT-TGTGAAGCAATATA-AACGTATTAAGTCTCAAGCAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gattttttgggtGAAT-ATGTGCATTGTCGAAACGAAATGCAAAATGACACA--ATG-----AATGA--AT----GATGTTGTGT-------------ATGTATTCACTTTTAAGC-------ATATGTGCCTTGTTGAACGTGAGG--AAAGATA-A---CACAATAATAATGA--AGTTTTCTTTTATAAATGCAGCTGCATTCAGT--TTAA--AGAATATGTGTCTTGTTGAATCGACGAGCTGCAAAATGTGA--TACTGGGGAAGATGTTTAGATATTATACAAATGAATTCAGTT-------TTAAGAATATGTGCGTTGTCGGAA-AGAATTACAGGGTTATATAATATAAATAACTTTTAG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): ACAAGTTACACCAAGATGTACATATTTATAAGCTTCATTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGGCCTAGAATTGTTTTGAAATTCGGAAT
Unaligned ( gi|22 ): ACGCATATCTTTACGACAAGTGACACAAAGATAACATATTTGTAAGCTCTGAGCTTTAAAACCTCAGATTTGTTCTGAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|23 ): GTACATGCTTTATTAATGGCATGGTATGAACACATAGCTTTGTTATACGTGACACCAAGCTGTACATA
Unaligned ( gi|24 ): ATAACTTCCCTTAACGTTTTCTGGGCCTATTTGCCATGACCTTGAATTG