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lowQualScore : .. .. . . .... .... ... . .. . . .... . . . ....... . . . .. .................................. .. . ...... .. . . . . . .. . . ... ....... . . . ..... . . ...... ..... .. . . . .. ......... . ... . .... . ..... ......................... . . . ......... . . ... .. .... ... .. . . ..... ..... . .. . .. ........... . . .. .. . . . .................. .. .. .... ..... . . . ... ... . .. ... .. . . .. ........... .. . . ...... . . .....
lowQualScore : 88 99 2 0 6666 5555 222 1 11 0 0 6666 1 4 5 2222222 0 0 7 00 6666666666666666666666666666666666 00 6 888888 00 6 6 6 3 6 11 0 4 444 0000000 6 1 1 77777 7 5 888888 11111 22 5 1 1 22 333333333 0 222 1 2222 2 77777 4444444444444444444444444 5 6 5 111111111 2 1 888 66 7777 888 66 1 3 33333 33333 2 33 2 77 88888888888 0 5 55 11 6 0 4 888888888888888888 11 00 1111 55555 2 6 0 000 000 8 66 000 22 4 2 22 00000000000 66 0 4 666666 0 0 00000
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Reference ( gi|1 ) : GTTGTACAATGCAGTAAGTAAATAGTTT--ATAATGCAATTGTAGT----TCACAACGAGCTGAATTGGACCATTGGTTAAATGTATTATCTTTTATGTAAACAACGAATGTTGTATCGGCTGATTGGAATGGTG----A-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAAGAT--TAT--C-------T------------TA---------T--TG-T--GA--TTT--T-T-TAA-CGTGA-ATCATACTGTGCATGATTG-TTTTGTGCATTGGTTCTTTCTTACTTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGTCA-TC-----CGTGT------ATCATGCGCCGTCTT--GCGCTGTATAC-A-T--GGT--T-----TTAATGTCAAGGTCACAATAGTTTAT-GTAA-TTCTTGGCTTCCGACTGGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGACTATA-TACATGTGCGAG-TTAA----ATTAAATGTTGTCATGAATT---AT--AAAA----CA---A--TAAGCAT-A-----T-----GCTTTACAAAGCA-GTTGGTTTACATAAAAAC----A-TATATATTGCTTGTGATAATGCTTTGCTTCATGATTGAATATGTTTATGG-TCGACATTTCCAT---A--T-------T--TTTTT--TT-AAGGTAATG---GCCT----GTGTGTCTGTTGTTT---CGAT---GTTCCTTGCATATGTTATGTTCTGCATAATTACTTAAATTTTGTT-----TCCGAACATAACAATGGTCAACAACATGGTA--AAGTTGCTGTTACTG-TTTAA-----GCCCTCTG
gi|4 : GTTGTACAATGCAGTAAGTAAATATTTT--ATAATGCAATTGTAGT----TCACAGCAGGCTAAATCGGACCATTGGTTAAATTTATTAACTTTTATGTAAACAACGAATGTTGTATCGGCTGATTGGAATGGTG----A-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAGGATTATAT--T-------T------------TG---------T--TG-T--GA--TTG--T-TAAAA-CAGGA-ATCATGCTGTGCATGAGTG-TTTTGTGCATTGGTTCTTTCTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGGCA-TC-----CGGGT------ATCATGCGCCGTCTT--GCGATCTACACAA-T--GGT--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAT-GTAA-TTCTTCGTTCCTGACTTGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAGTTTTT----ATTAAATGTTGTCATGAATT---AT--AAAA----CA---A--TAAGCAA-A-----T-----GCTTTCCAAAGCA-GTTGGTGTACATAAAAAA----A-TATATATTGCTTGTGATAATGCTTTGCTTCATGATTGAGGATGCTTATTG-CCGACATTTCCAT---AAGT-------T--ATTTT--T
gi|20 : GTTGTAAAATGTAGTAAGTAAATATTTT--GTAATGCA--------------------------ATTG------TAGGTAAATTTATTAACTTTTATGTAAGCAACGAATGTTGTATCGGCTGATTGGAATGGTG----A-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGCGAAAGGAT--TAT--T-------T------------TG---------T--TG-T--GA--TTT--T-T-TAA-CGGGA-ATCATACTGTGC
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gi|7 : GTACTATGCAATAAGTTAATATTTT--ATATAGCAGCTGTAGT----TCACAACTAGCTGAATAAGACCATTGGTGAAATTTATGAACTTT-ATATAAACAACGAATGTTGCATCGACTGATTGGAATTGCGCTGTA-TTT-TTCACTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAGGTT--AAT--CCTGTTGAT------------TA---------TGTTG-T--TA--TTTCTT-T-TAA-CGGGA-ATCATACTGTGCATGTGTG-TTTTGTACATTGGTGCTTTTTTGCCTTCTTT-------CCAATCTGATTTGATAGTTCGATGTCA-TC-----CATTT------ATCATGCGCCCTCAT--GCGCTGAACAC-A-T--GGG--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTG-TTATCATAA-TTCTTCGTTTGCGACTGCGCATGT-----CAGTCTG-------------------------gg
gi|23 : TACAATGCAATAAGTAAAT-GTTTTTATAATACAATTATAGTAAGCTCATGATGGGCTGAATAAAACTATCGGTGAAATTTATTtgtttgcacactatttggttatggcacatg
gi|2 : ttTTT--ATATTGCAATTGTAGT----TCACAACGAGCTGGATAAGACCATAGGTGAAATTCATTAACT---GTGTAAACA-CAAATGTTGCATCGACTGATTGGAATTTTA----T-TTT-T-CATTTTTGTAGTGTTGCGTAAAAAGAT--TAT--CCTGTTGAT------------TATG-------T--TG-T--TA--TTT--T-T-TAA-CGGGA-ATCATACTGTGCATGTGTG-TTTTGTATATTGGATCGTTCTTGCATTCTTTGAAGTTCCCTATCTGAATTCATAGCTAGATGCCA-TC-----CATGT------ATCATGCGCCCTCAT--GCGCTGTACAA-ATT--GGG--G-----TTAATGTCAATGTCACAATTATTTAA-GTAA-TTCTTGGTTTGCGACTGCGCATGT-----CAGTCTGTGTTTGCACACTAT-----------CATGAAGGAATATA-TACATATAAGAGCTTTT----ATTAAATGTTGGCATGAATTTTAAA--AAAA----AA---A--TAAACAT-A-----T-----GCTTTCCAGAGCT-ATTCGTCTACAT--AGAC----A-TTTTTAATCCTTGTGATTGTGTTTTGCTTTATGAATGAGGAT-------G-TCAACATTTTTTT---A--TAAATTCAT--TTTTT--TG-AAGATAATGT--GCAT-----CGCCTTTATTCTCT---TGAT---G-CCCTTTC-TAAAATATATTTCGCAAACTTATTCCAATCTTG
gi|8 : tT--ATATTGCAATTGTAGT----TCACAACTAGCTGAATAAGACCATTGGTGGAATTCATTAACTTTT-TATAAACAACGAATGTTGCATCGACTGATTTGAATTGTATTGTATTTT-T-CGTTTTTGTTATGTTGCATGAAAGGAT--AAT--C-------CATTTTTTGATTATA---------T--TG-T--TGTTTTT--T-T-TAA-CGGAA-ATCATGCTGTGCATGTGTG-TTTGGTACATT--TTCTTTTTTGTGTTCTTT-------CCTATCTGATTTCATAGCTCGATG-----------------------TCATGCACCCTCAT--GTGCTGTACAC-A-T--GGA--G-----TTGATGTCAATGTCACAATTGTTTAT-ATAA-TTCTTGGTTTACGACTGCGCATAT-----CAGTCTG-------------------------CGTc
gi|10 : T--ATATTGCAATTGTAGT----TCACA---------------CCATTGGTGTAATTCATTAACTTTT-TATAAACAACTAGTGTTGCATCGACTGATTTGAATTGTACTATA-TTT-TTCGTTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAGGAT--AAT--C-------C------------TATTAATTATGT--TG-T--TAT-TTT--T-T-TAA-CG-GATATGATACTGTGCAGGTGTG-TTTGGTATACT-GTTTTTTTTTGTGTTCTTT-------CCTATCTGATTTCATACCTCGATGTCA-T----------------------------------GCGCTGTACAC-A-T--GGG--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAC-ATAA-TTCGTGG-TTGCGACTGTGCATGT-----CAGTCTG-------------------------ttgcacacgctttggttagtgcacatg
gi|22 : CCGAATAAGA--ATAGGTGCAATTCATTAACT---ATATAAACACCGAATGTTGCATCGACTGATTGGAATTGT-----A-TTTGT-CATTTT------GTTG---------AT--TAT--G-------T------------TG---------T--TA-T--------T--T-T-TAA-CGGGA-ATCATACCGTGCATGTGTG-TTTTGTACATTGGATCTTTCTTGCtgtttgcacactctttggttatggcacatg
gi|6 : GCTGATTGGAATGGTG----T-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAGGAT--TAT--T-------T------------TG---------T--TG-T--GA--TTT--T-T-TAA-CGGGA-ATCATACTGTGCATGTGTG-TTTTGTGCATTGGTTCTTTC-------------------CTATTTGATTCCATAGCTTGATGTCA-TC-----CATGC------ATCATGCGCCGTCAT--GCGCTGTACAC-A-T--GGT--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTT----------------------------ATGT-----AAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAG-TTTTTTTTATTAAATGTTGCCATGAATT---AT--AAAT----CA---A--TAAACATTA-----T-----GCTTCCCAAAGCA-GTTGATCTACATAAAAA---------TATATTGCTTATGA--ATGCTTTGCTTCATGATTGATGATGTTTATGG-CCGACATTTCTTT---AAAT-------TA-TTTTT--TT-ACGGTAATG---CCCT----GTGTGTCTGTTGTTT---CGAC---GTTCCTTGCATAGGTTATGTTCTGCAAACTTACTCCATTTTTGTg
gi|12 : GCTGATTGGACTGGTG----T-TTT-TACATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAGGTT--TAT--T-------T------------TG---------T--TG-T--TA--TTT--TGT-TAA-CGGGA-ATCATACTGTGCATGAGTG-TTTTGTGCATTGGTTCTTTCTAACGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATGGCTTGATGCCA-TC-----CATGT------ATCATGCGCTGTCAT--ATGATGTACAC-A-T--GGT--G-----TAAATGTCAAGGTCACACTTGTTTAT-GTAA-TTCTTGCTTTGCTACTACGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTTCGAGTTTTT----ATTAAATGTTGCCATGAATT---AT--AAAAAG--AA---A--TAAACAT-A-----T-----ACTTTCCAAAGCA-GTTg
gi|5 : TTTGTGCTGTGTTGCGTTAAAAGAT--TATATT-------T------------TA---------A--TG-TCTG---TTT--T-T-TAA-CGGAA-AATATACTATGCATG--TGCTTTTCTGTAT---------ATTAATT-CTTT-------CCTAACTGATTTCATAGTACGATGTAAATCTAGAGCGTGTTGATCAACCATGT----TCTTATGCACTACACAC-A-TTGGGTGGTGGGGGTTAATATCAAGGTCACGTTTGTTTAC-ATAAATTCTTGGTAAGCGACTGCGTATGT-----CAGTCTGTGTTTCATACTATTTGGTTATTGTACATGAAGAA-TATA-TACATATACGAGATTAT----ATGAAATGATGGCATGAATT---AT--AAAA----TA---A--TAAACAT-AAGCAGTGATAAGCTTTCCATAGCT-GTTGACCTACATAGACACTGTGATTATA-ATTCCTTGTGAT-GTAATTTACCTTATGATTGAGGATGTTAATGGTTCTACATTT
gi|19 : TGTGCATGGGTTCTTTTTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGTCA-TC-----CGTGT------ATCATGCGCCGTCTT--GCGCTGTACAC-A-T--GAT--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAT-GTAA-TTCTTGG-TTTCGACTGGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TATATtaatgaattcactttacagtgtatggatcacccatgtattggtcatgtgctcttatgtactgcacataccgctta
gi|16 : GATGTCG-TC-----CATTT------ATCATGCGCCCTCAT--GCGC-------------GGT--T-----T-AATGTCAAGGTCACAATTGTTTAA-ATAA-TTCTTGGTTTGTGATTGCGCATGT-----CAGTCTG-------------------------
gi|15 : GATGTCG-TC-----CATTT------ATCATGCGC------------TGTACAC-A-T--GGG--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAC-ATTA-TTCTTGTTTTACGACTGTGCATGT-----CAGTCTG-------------------------tgatgcacactcttcggtaatagcacatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|14 : GATGTCG-TC-----CATTT------ATCATGTG-----TT--A------ACAA-A-T--GGG--G-----TTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAC-ATAA-TACTTGGTTTGCGACAGTGCATGT-----CAGTCTG-------------------------tgatgcacactctttggttatggcacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|13 : TG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAG-TTTT----ATTAAATGTTGTCATGAATT---AT--AAAA----CA---A--TAAGCAT-A-----T-----GCTTTCCAAAGCA-GTTGGTGTACATAAAAA-----A----ATATTGCTTGTGATAATGCTTTGCTTCATGATTGAGGATGTTAATAG-CCGACATTTCCATAA-A--A-------A--CATTT--TG-AAGGTAATG---GCAT----GTGTATCTTTTGTTT---CGAT---GTTCCTTGCATAGGTTATGATCTGCATAATTACATAAATTTTGTT-----TCCGTGCATAAAAATGGTTAACAATATGGAG--AAGCTGCTGTTACTGTTTTAA-----GCCtgacgcacactctttggttatgacacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|24 : GAAGGAATATAATACATATACGAGCTTTT----ATTA--TCTTGACATGAATT---AT--AAGT----AA---A--AAAACAT-A-----T-----
gi|9 : GGAATATA-TACATGTACAAGCTTTT----ATTA--TGTTGACATGAATG---AT--AAAA----CA---A-----ACAT-A-----T-----TC----CAAAGCT-GTTGGTCTACATAT---T----T-TTTTTTTTTTTTGTGATATTGTTTTGCTTTATGATTGAGGTTGTTTATGG-CTCACATTTCCATAA-A--T-------T--CTCTTTATT-AAGGTACTG---ACCT----tcc
gi|11 : TACA-TACATGTGCAAGCTTTT----ATTA--TGTTGACATGGATT---AT--AAAA----CA---A--TAAACAT-A-----T-----TC----CAAAGCT-GTTGGTCTACAT--AAAT----A-TTTTTATT-CTTGTGATATTGCTGTACTTTATGATTGAGGATGTTTCC---TTGA-ATT--CTT---A--T-------T--ATTT-------AGGTAATG---TCCTCAAAATGTGTcaaattttgttgataaataaaagtgttattgagctattgttatttttctgagatgttttttttatgtatatacgaaaaaaaatgtgagtttttgtttgttgcgtatccttgcataacaatggttacagcattaaaaagctgctgttactgtttaagacatgccctctgccatatagttgtatagagaaggaaag
gi|17 : aataa-TTAA------TAATTGTAG-CATGAATA---AT--AAAAAAAGCA---AATTAAACAT-G-----T-----G-TTTGCCAGGGATGTTTGTTTACATAGA--C----A-TTTTTATTCCTTGTGATTTTGTTTTGCTCTATGATCGAGGATGTTTATGG-TCAACATTTTCATCA-A--T-------TCATTTTT--TTGAATATAATG---TCCA----ATGCCTTTATTCTTT---TGATGCCGTTTTTTGTA-----TATATTTTGCATACTAATTCCCATTTTGggataaaataaataggtgttgtagagctttgttatttttctttacgtatatacaaaaaaaatgttgagttcgtgcttgttcggtttccttgcataaaaatggcattaagaagctgctgttactgtttaagacatgccctctgtcatagaattgtatagagaagaaaag
gi|21 : ctt----ATTAAATGTTGTCATGATTT---AT--AAAA----CA---A--TATTCAT-A-----T-----GCTTTCCAAAGCA-GTTGGTGTACATAAAAA--------ATATATTGCTTGTGATAATTCTTTGCTTCATGATTGAGGATGTTTATGG-ACAATATTTCCATAAAA--T-------A--TTTTT--TT-AAGGTAATG---GCCT----GTc
gi|9 : caattttttTTTGTTGCGTATCCTTGCATAACAATGGTTA-CAGCATTAAA--AAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTG
gi|11 : ggaatatatacatgtacaagcttttattatgttgacatgaatgataaaacaaacatattccaaagctgttggtctacatatttttttttttttttgtgatattgttttgctttatgattgaggttgtttatggctcacatttccataaattctctttattaaggtactgacctcaaattttgttgataaataaaagtgttattgagctattgttatttttctgagatgttttttttatgtatatacgaaaaaaaatgtgagtttttgGTT-----TCCTTGCATAAAAATGG-CATTAA------G--AAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTGccatatagttgtatagagaaggaaag
gi|18 : aataatacatacatgtgcaagcttttattatgttgacatggattataaaacaataaacatattccaaagctgttggtctacataaatatttttattcttgtgatattgctgtactttatgattgaggatgtttccttgaattcttattatttaggtaatgtcctcaaaatgtgtggataaaataaataggtgttgtagagctttgttatttttctttacgtatatacaaaaaaaatgttgagttcgtgcttgttcgCATAACAATGGTTAACAGCAT--TAAGAAGCTGCGATTACTG-TTTAA-----tcatagaattgtatagagaagaaaag
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3056 ) : GTTGTACAATGCAATAAGTAAATATTTT-ATATTGCAATTGTAGT----TCACAACGAGCTGAATAAGACCATTGGTGAAATTCATTAACTTTTATGTAAACAACGAATGTTGCATCGACTGATTGGAATNGTG----A-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAG---------------GAT--TAT--CTT---------GT--T---------G---------T-TATTT--T-TT-AA-CGGGAATCATACTGTGCATGTGTGTTT-TGTGCATTGGTTCTTTCTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTTCATAGCTCGATGTCA-TC-----CATGT--A----TCA--TGCGCCCTCATGCGCTGTACACA-T---------GGNGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTACGTAA-TTCTTGGTTTGCGACTGCGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAG---CTTTTATTAAATGTTGNCATGAATT---AT--AAAA----CA---A--TAAACA-TA-----T-----GCTTTCCAAAGCNGTTGGTCTACATAGAAAC----ATNTNT-ATTNCTTGTGATANTGCTTTGCTTTATGATTGAGGATGTTTATGG-CC--GACA--TTTCCAT--AATT--TT-TTT--TT-A-AG-GTA---ATGNCCTGTGTNTTTATTCTTT---CGAT---GTTCCTTGCATAGGTTATGTTCTGCATACTTATTCCAATTTTGTT-----TCCTTGCATAACAATGGTTAACAACATGGAGAAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTG
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gi|11 : aatGTT-----TCCTTGCATAAAAATGG-------CATTAAGAAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTGcaaaatgtgtggataaaataaataggtgttgtagagctttgttatttttctttacgtatatacaaaaaaaatgttgagttcgtgcttgttcggtttccttgcataaaaatggcattaagaagctgctgttactgtttaagacatgccctctgtcatagaattgtatagagaagaaaag
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gi|17 : ---CTTTTAATAATTGTAG-CATGAATA---AT--AAAAAAAGCA---AATTAAACA-TG-----T-----GTTTGCCAGGGATGTTTGTTTACATAGA--C----ATTTTT-ATTCCTTGTGATTTTGTTTTGCTCTATGATCGAGGATGTTTATGG-TC--AACA--TTTTCATC-AATTCATT-TTT--TTGA-AT-ATA---ATGTCCAATGCCTTTATTCTTT---TGATGCCGTTTTTTGTA-----TATATTTTGCATACTAATTCCCATTTTGtgatgcacactcttcggtaatagcacatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|18 : TTTCATA-----TCCTTGCATAACAATGGTTAACAGCATTAAGAAGCTGCGATTACTG-TTTAAGATATGCCGTCTGc
gi|19 : atgaaaaaaacagtgttgtttagctattgtaatttttctgagatgtttatttaacgtttataaaaaaaaatgtgtgtttgtgcttg-TGTGCATGGGTTCTTTTTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGTCA-TC-----CGTGT--A----TCA--TGCGCCGTCTTGCGCTGTACACA-T---------GATGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTATGTAA-TTCTTGGTTT-CGACTGGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TATATtcattgaattgtatagagaacaaaag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : ---CTTTTAATAATTGTAG-CATGAATA---AT--AAAAAAAGCA---AATTAAACA-TG-----T-----GTTTGCCAGGGATGTTTGTTTACATAGA--C----ATTTTTATTCCTTGTGATTTTGTTTTGCTCTATGATCGAGGATGTTTATGG-TC--AACA--TTTTCATC-AATTCATT-TTT--TTGA-AT-ATA---ATGTCCAATGCCTTTATTCTTT---TGATGCCGTTTTTTGTA-----TATATTTTGCATACTAATTCCCATTTTGtgatgcacactcttcggtaatagcacatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|18 : TTTCATA-----TCCTTGCATAACAATGGTTAACAGCATTAAGAAGCTGCGATTACTG-TTTAAGATATGCCGTCTGc
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : aatGTT-----TCCTTGCATAAAAATGG-------CATTAAGAAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTGcaaaatgtgtggataaaataaataggtgttgtagagctttgttatttttctttacgtatatacaaaaaaaatgttgagttcgtgcttgttcggtttccttgcataaaaatggcattaagaagctgctgttactgtttaagacatgccctctgtcatagaattgtatagagaagaaaag
gi|12 : aataatacatacatgtgcaagcttttattatgttgacatggattataaaacaataaacatattccaaagctgttggtctacataaatatttttattcttgtgatattgctgtactttatgattgaggatgtttccttgaattcttattatttaggtaatgtcctcaaaatgtgtggataaaataaataggtgttgtagagctttgttatttttctttacgtatatacaaaaaaaatgttgagttcgtgcttgttcgCTGATTGGACTGGTG----T-TTT-TACATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAG---------------GTT--TAT--TTT---------GT--T---------G---------T-TATTT--TGTT-AA-CGGGAATCATACTGTGCATGAGTGTTT-TGTGCATTGGTTCTTTCTAACGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATGGCTTGATGCCA-TC-----CATGT--ATCA--TGCGCTGTCATATGATGTACACA-T---------GGTGTAAATGTCAAGGTCACACTTGTTTATGTAA-TTCTTGCTTTGCTACTACGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTTCGAGTTTTT---ATTAAATGTTGCCATGAATT---AT--AAAAAG--AA---A--TAAACAT-A-----T-----ACTTTCCAAAGCAGTTtcatagaattgtatagagaagaaaag
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gi|14 : GATGTCG-TC-----CATTT--ATCA--TGTG---TTA--------ACAAA-T---------GGGGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTACATAA-TACTTGGTTTGCGACAGTGCATGT-----CAGTCTG-------------------------cc
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gi|16 : GATGTCG-TC-----CATTT--ATCA--TGCGCCCTCATGCGC--------------------GGTTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTAAATAA-TTCTTGGTTTGTGATTGCGCATGT-----CAGTCTG-------------------------tgatgcacactctttggttatggcacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|17 : CTTTT---AATAATTGTAG-CATGAATA---AT--AAAAAAAGCA---AATTAAACAT-G-----T-----GTTTGCCAGGGATGTTTGTTTACAT--AGAC------ATTTTTATTCCTTGTGATTTTGTTTTGCTCTATGATCGAGGATGTTTATGG-TC--AACA--TTTTCATC-AA-TTCATT-TTT--TTGA-AT-ATA---ATGTCCAATGCCTTTATTCTTT---TGATGCCGTTTTTTGTA-----TATATTTTGCATACTAATTCCCATTTTGtgatgcacactcttcggtaatagcacatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttttcaaagacctaatcgat
gi|18 : TTTCATA-----TCCTTGCATAACAATGGTTAACAGCATTAAGAAGCTGCGATTACTG-TTTAAGATATGCCGTCTGc
gi|19 : atgaaaaaaacagtgttgtttagctattgtaatttttctgagatgtttatttaacgtttataaaaaaaaatgtgtgtttgtgcttg-TGTGCATGGGTTCTTTTTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGTCA-TC-----CGTGT--ATCA--TGCGCCGTCTTGCGCTGTACACA-T---------GATGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTATGTAA-TTCTTGGTTT-CGACTGGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TATATtcattgaattgtatagagaacaaaag
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gi|26 : CATAACAATGGCTAACAATATGGAGAAGCTGCTGtcc
gi|3 : TTGTACAATGCAATAAGTAAATATTTT-GCATTGCACTTGTAGT----TCACAACGAGCTGAATAAGATTATTAGTTTAATTCGTTAACTTTA-GGTAAAATACAAATGTT----CGACT---------TGTA----G-TTT-T-CATTTTTGTTGCGTTGCGTGAAAA---------------AAAAATAT--CCT---------GT--T---------GA--------T-TATTT--T-TT-GATCGGGAATCAAACTGTGCATGTGTGTTT-TGTACATTGGTTCTTTCTTGCGTTGTTT-------CCTATCTGATTTCATAGCTTGATGCCA-TC-----CATGT--ATCA--TGCGTCCTGATGCGCTGGATACG-T---------GGGGCTAAAGTCAAGGTCACAATTGTTTACTCAA-TTCTTGGTTTGCGACTGCGCATGTTCGGACACTAT--------------------------CATAACGGAATATA-AACATATACGGGCTTTT---ATT-AATGTTGGCATGAATT---ATGGAAAA----CAAATA--TAAACAT-A-----T-----GCTTTCCGGAACCGTTCGTCTACAT--AGAC------AATTTTATTCCTTGTCATTTTGTTTCGCTTTACGATTCAGGATGTTTTTGG-TC--AACA--TTTTCAT---A-CT--TT-TTT--TG-A-AG-ATA---ATGTCCACCTTCTTTATTCTTTTGATGAT---GTTTTTTGCA-----TATATTTTGTATACTTATTCCAATTTTGT
gi|4 : GTTGTACAATGCAGTAAGTAAATATTTT-ATAATGCAATTGTAGT----TCACAGCAGGCTAAATCGGACCATTGGTTAAATTTATTAACTTTTATGTAAACAACGAATGTTGTATCGGCTGATTGGAATGGTG----A-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAG---------------GAT--TATATTTT---------GT--T---------G---------T-GATTG--T-TA-AAACAGGAATCATGCTGTGCATGAGTGTTT-TGTGCATTGGTTCTTTCTTGCGTTCTTT-------CCTATCTGATTCCATTGCTTGATGGCA-TC-----CGGGT--ATCA--TGCGCCGTCTTGCGATCTACACAAT---------GGTGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTATGTAA-TTCTTCGTTCCTGACTTGGCATGT-----CAGTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAGTTTTT---ATTAAATGTTGTCATGAATT---AT--AAAA----CA---A--TAAGCAA-A-----T-----GCTTTCCAAAGCAGTTGGTGTACATAAAAAA------ATATATATTGCTTGTGATAATGCTTTGCTTCATGATTGAGGATGCTTATTG-CC--GACA--TTTCCAT--AA-GT--TA-TTT--TT-gg
gi|5 : TTTGTGCTGTGTTGCGTTAAAA---------------GAT--TAT--ATT---------TTAAT---------G---------TCTGTTT--T-TT-AA-CGGAAAATATACTATGCATGTGCTTTTCTGTATATTAATTCTTTC-------------------CTAACTGATTTCATAGTACGATGTAAATCTAGAGCGTGTTGATCAACCATGTTCTTATGCACTACACACA-TTGGGTGGTGGGGGTTAATATCAAGGTCACGTTTGTTTACATAAATTCTTGGTAAGCGACTGCGTATGT-----CAGTCTGTGTTTCATACTATTTGGTTATTGTACATGAAG-AATATA-TACATATACGAGATTAT---ATGAAATGATGGCATGAATT---AT--AAAA----TA---A--TAAACAT-AAGCAGTGATAAGCTTTCCATAGCTGTTGACCTACAT--AGACACTGTGATTATAATTCCTTGTGAT-GTAATTTACCTTATGATTGAGGATGTTAATGGTTC--TACA--TTTTAAT--GA-AT--TC-ACT--TT-ACAGTGTATGGATCACCCATGTAT
gi|6 : CTGATTGGAATGGTG----T-TTT-T-CATTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAG---------------GAT--TAT--TTT---------GT--T---------G---------T-GATTT--T-TT-AA-CGGGAATCATACTGTGCATGTGTGTTT-TGTGCATTGGTTCTTTC-------------------CTATTTGATTCCATAGCTTGATGTCA-TC-----CATGC--ATCA--TGCGCCGTCATGCGCTGTACACA-T---------GGTGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTTATGTAA--------------------------------GTCTG-------------------------CATGAAGGAATATA-TACATGTGCGAGTTTTTTTTATTAAATGTTGCCATGAATT---AT--AAAT----CA---A--TAAACATTA-----T-----GCTTCCCAAAGCAGTTGATCTACAT--AAAA------ATAT--ATTGCTTATGA--ATGCTTTGCTTCATGATTGATGATGTTTATGG-CC--GACA--TTTCTTT--AAATTA-TT-TTT--TT-A-CG-GTA---ATGCCCTGTGTGTCTGTTGTTT---CGAC---GTTCCTTGCATAGGTTATGTTCTGCAAACTTACTCCATTTTTGTtggtcatgtgctcttatgtactgcacataccgctta
gi|7 : gGTACTATGCAATAAGTTAATATTTT-ATATAGCAGCTGTAGT----TCACAACTAGCTGAATAAGACCATTGGTGAAATTTATGAACTTTA-TATAAACAACGAATGTTGCATCGACTGATTGGAATTGCGCTGTA-TTT-TTCACTTTTGTTGTGTTGCGTGAAAG---------------GTT--AAT--CCT---------GT--T---------GATTATGTTGT-TATTTCTT-TT-AA-CGGGAATCATACTGTGCATGTGTGTTT-TGTACATTGGTGCTTTTTTGCCTTCTTT-------CCAATCTGATTTGATAGTTCGATGTCA-TC-----CATTT--ATCA--TGCGCCCTCATGCGCTGAACACA-T---------GGGGTTAATGTCAAGGTCACAATTGTTATCATAA-TTCTTCGTTTGCGACTGCGCATGT-----CAGTCTG-------------------------g
gi|8 : T-ATATTGCAATTGTAGT----TCACAACTAGCTGAATAAGACCATTGGTGGAATTCATTAACTTTT-TATAAACAACGAATGTTGCATCGACTGATTTGAATTGTATTGTATTTT-T-CGTTTTTGTTATGTTGCATGAAAGGATAATCCATTTTTTGAT--TAT--ATT---------GT--T---------G---------T-T-TTT--T-TT-AA-CGGAAATCATGCTGTGCATGTGTGTTT-GGTACATT--TTCTTTTTTGTGTTCTTT-------CCTATCTGATTTCATAGCTCGATG-------------------TCA--TGCACCCTCATGTGCTGTACACA-T---------GGAGTTGATGTCAATGTCACAATTGTTTATATAA-TTCTTGGTTTACGACTGCGCATAT-----CAGTCTG-------------------------CGTtgtttgcacactatttggttatggcacatg
gi|9 : GGAATATA-TACATGTACAAGCTTTT---ATTA--TGTTGACATGAATG---AT--AAAA----CA---A-----ACAT-A-----T---------TCCAAAGCTGTTGGTCTACAT--ATTT------TTTTTT-TTTTTTGTGATATTGTTTTGCTTTATGATTGAGGTTGTTTATGG-CT--CACA--TTTCCATA-AA-TT--CT-CTTTATT-A-AG-GTA---CTGACCTttgcacacgctttggttagtgcacatg
gi|9 : TTTGTTGCGTATCCTTGCATAACAATGGTTA-CAGCATTAAAAAGCTGCTGTTACTG-TTTAAGACATGCCCTCTGcaaattttgttgataaataaaagtgttattgagctattgttatttttctgagatgttttttttatgtatatacgaaaaaaaatgtgagtttttgtttgttgcgtatccttgcataacaatggttacagcattaaaaagctgctgttactgtttaagacatgccctctgccatatagttgtatagagaaggaaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TTTGATGCCGTTTCTTGCATATATTTTGCATACTTATTC