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Reference ( gi|1 ) : TTGTCA-TAAATACCTTAGAATTATAATTGACATTCAC--ATTTTTC---CTGTGAGTCAG--ATGTTTTA--GTATCATCCCATCAATGTCTGT--GAAAAAGATGAAAATCT-TTTTTCC--TG--T-----TG--------ACACGAGCCTTCTTAGAAGG--AGGACTAAATACAGGAGTCTTCCTC-A---TTTTAATTGCTACCTGGTTT-CTGAGTTGT-ATAAAA-TAACCACAATT--AAT------CCGTAGTGA------TAATTTGATGT-GGAAACATGTCGCCTTCTTTACTATACCGCTCGAAAA---ATTTCCTGGAGG-ATTTA--ACATGGTTGAC--T-------ATT-GTCATTTGGTAA-TATTCGCGGTATCCACTGAGCAC-------------TGACTGTGT---------------TTTTTAAA--------AC---T----------TTACAT------------TTACGTC----------ACAAATGTCTCTAATAGTCACACGGTGGTTCACATAGATAACGTCATTTATCGAATTTATTGAATCAATCAACT-TCACGTCAGTTGTTGTC-TT---CTTCCTCATCCTGGTCCATCTTCTAACCCTAGCCATCCGTCCTT---CAGGC--G-A--AATGCCAT-TTA------AA----------T----------AT----CAG-------ATGATTTAATAGATGTCCTCTTCATCATTTCATACATTTGTGCAGGTCTGTTGCCCGGCTCAGTTAAAAAT---TTA-----T--GC---GCGACTTTCTTTCGAATCTTTTGACAT--TTT--T--TTT--TTGTT-ATTGCTTAGTT---CAGT-AATGGTTGCTTGCTTGTTGATTGTTTACTAATGGTAA-TGGAT-ATG--ATGA-CAACATTTC-TAAAATATATG-TT-AA-GA---TGTCAAACAAGATGCAGATGAA----------ATT------CA----AGT-------GTAT--TGATTTTTAATTGTTTGGTTCTGTTCACAT--AAGATTTGGTCTA--TAA---TTTCTCAT-T--CCTGTTCTTTCATTCATGGGTTATTATAGGAATGTATCAAATTGAGCTTACACATTTTTAGGCTTATTATTACTATTAACGTATTGTGTAGATAATGACTTCAGCTCTATCTACACGCAGTACAGTGATGTAAA--CATGACAGATAAATAATTTAGAG-C-A-A-AATCTCATT-AATTTAAATTACCCCT
gi|7 : GTCAATACACATATGAGAA--ACAATTGGTATTTACGGATTTTCCAATTTGT---------ACGGTATAATGTATTATCACTTTAATGCCTGCTAAAAAAAGATGAACATCT-GTTTTCC--CG--C-----TGACTTGGAAACACGCGCTTTCTTAGAAGG--AAGAT---ATGCATGAAACTTCCACTT---TTTTAATTGTTCCTTAATTTGTTGA-TTGTAACAAAA-CATCCACCTCT--CAT------TCGTAGTGATACATGTAATTCGCTGC--AAAACATGCCGTCTACTTTACTATAC
gi|4 : cgatactgacgcacgacgtcgagcgacgtcaatttcatgaatctactttcagcacgtgaacgtttctcgaaatactttttatcacaggagatacatttctgttgtctttcaataaattgcttgcttttacatgtctttacaccaccgtaaattttgaccaaaaacaaccttttgtgctgcatatgaagttcaataaatcaTTTTTC---CTGTTGGTATGGCATGCTTTA-----TTATTCCATCAATTCCTAC--GAAAATGATGATTATCT-GCTTTCC--TG--TAGACTTGGCA-----ACACAAACCTTTTTAGGTGG--AGGA---GATGCCGGAGTCGTCCACTG---TTTTTATTGTTCCTCTGTTT-CTGGGTCGT-ATAAAAGCAACCAAATTT--CAT------CCGTAGTGA------TGATTCTCTGC-AGAAAAATGTCACAGTCTTTATGATACCACTC--AAA---ATATCCTGGAGGCATTTA--CAAT-GTTGACTTT-------CTT-GTCATTTGATAA-TATTTGTGGTATCCACCGAGCAC-------------atttatcttagacgcacggcacgattggttttatt
gi|6 : gatatacaaggtgtgatctaaaatgaatgagattgattctagtatggaaagggtatgtggaatatcaaactgaaacaaagacaaaatgaagtccaatctttattcagcaacttcaccaaatattaactcttttgtattgaagtgataaacccttgcaattctacaccaggtacataacgtcgaagcggggcagtcagatactaacacccgacgttaaagacgtcaacgtcatgaatctaccataagcacgtcaacgtttctcaaaaatctctccatcacaggaaacacatttctccagttgtctgtcgatccattgtctgtataattatgtctttataccaccgtgaatctagtcaggatacaacattttgttctgcatatgaaagttcttttaatgggtcaaatcagttacctttcaatgATCTGTTTTTCCGCTGACT-----TGGAG-----ACACGGACCTTGTTAGGTGG--AGGA---GATGCAGAAGTCT--CTT-ACTTTTTTGATTATTCCTTCGTTT-CTGGGTCAT-ATAAAA------ACAATT--AATTTTCAGCCGCATTGA------AGGTTTGCTGC-AGAACCATGCCACCTTCTTCATGATAACGCTCCAAAA---GTATTCTGGAGGCATTT---ACACGATTGACTTT-------ATT-GTCATTTTAT-A-TATTCCCGGTATCCACCGAGCAC-------------TTACTTTGTACATATCGAAATATGTTTCAAAA--------AC---TTTGTAAACAGTTGCATAACTGTATCCAGTTACATC----------ACAAATGTCTGTAATAGTGGCACGGCGGTCTGCATAGAT-ACGTCTTTTATC-AAT--------TCAATCAACTAT--TGTCCATTATTGTCTTT---CTTCCTTGTCTCGGTTCATCTTCTAAACCTAGTGGTCCATCCTT---AAAGC--ATC--AATGCCATCTTAAAACC-AA----------TGCCCACGAAAAA----CAG-------ATGTTTTCATAAATGTCCTCTGCATCATTTCATACA---------------------GTTCAGTTAAAAAT---TTAATTACT--GT---GCGATTTTCAATCAAATCTATAGACGT--CAT--TAATTTAATTGTTGATT-TTTAATT---ctccttg
gi|2 : T-TTTTTCC--TGAAT-----TGGCG-----ACAGGAACCGTTT---AAGGTAAAGA--AAATGCCAGA---TTCTTC-A---TTT------------------CTGAGTTTA-ATAAAT-TCAACAAAATTT-CGT------TCATAGCGA------TGATTCGCCAC-ATAAACATGTCGCTTTCTTTACGATAACGGTT--AAA---AT-----------ATTCA--AT----TTGAC--T-------ATTTGTCATTTGATAA-TACTTACGGTATCCATCGAGCACCTATATACTTATTTAAATGTGT---------------CTCTAAAAGATTGTAAACAGTT----------CTATAA------------TTGTGTCCAGATAAATCACAAATGCCTCAAATGGTCACACGGCGGTCCGCTTAGATGACGTCCTTTATC---------GAATCGATCAACA-TCACGTCAGTTATTGCCTTT---CTTCCTTTTCCCGGTTC-TCGCCT----TTAGCCATCTGTCTTT---TAAGCTTG----GATGCCAT-CCC------AA----------T----------GC----CCGTGAACGTGTGATTTCATATATACCCTCTGCATCCTTTCATACATTTAAGTAGG--TGTTTCCCAGCTAA---AAAAATATATTAC----T--GC---GCGATTTTCTATCGAATCTTTAGGCA---TCG--T--TTC--TTGTT-AATTTTTAGTTTAACGGTAAACCGTTGCTTGTTTGTCGAGTGTGTACTTAC-GTAAGCGGAT-ATGTCATCA-CAA---TTA-TAAATCATATGCTT-AC-GA---CGTCATGCAAGATGCCGACAAAATTGCGCTACATT------CG----AGT-------GTGG--TGAATATTAATTGTgta
gi|20 : CCTGGTGT-GTC--TTG--ATAAAA-CAACCA-AGTTGTAA-------CCGTAGTGA------TAATGTGCTGT-AGAAACATGTCGTATTCTTTACGCTAAAGCTCCAAAA---ATGTCCCGGAGG-aacgtactcttcgtgcccaactctttggtttataggttactgtggcaacgtatcaaatgagcgtatgcttattattatttacctatcgtgtacattatgacttcagcttttggtatagacattatcttggtataaaaacgacagatatatagtttagagcaaacatttagatcacccc
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gi|3 : AT------------TCACATC----------ACAAATGTCTTTTATAGTCACACACCGGTCCGCATAGATGCCGTCCTTTACCGAAT---------CAATCAACG-TCGCGTCATTTATTGCC-TTAAAC--CCTCGCCCCGGTTCATCTTCTTACCCTCGT-ATCCGTACTTAAACAT-C--G-A----TGCCAT-CTATAAACCAA----------TGCAAGTGA--AA----CAG-------ATGATTTCATACATGTTCTCTGCATCATTGCATACGTTTGTGTGGTTGTGTTGCCAAA-TCAGTTAAAAAT---TCA-----TTTACTCTGCCATTTTCTATCAAATCTTT-GA--T--GTA--A--TGA--TTGTT-ATTATTTAGTT---CAGC-AA-GATTGCTTGTTTGTCGATTGATTACTAACGGTAA-C-----ATA--ACGGTCAACATTTA-TAAATCATATG-CT-AAAGA---TGTAATACAAGATTCAGACGAA----------ATTG-----CA----AGTAATTCGAGTATGTTAATTTTTA-TTGTTACGTTCTCTTCCCAG--AAGATATGGTTTA--CTA---TTTCTCGT-G--CCCGTTCTTCCGTTCATGGGTTACTCTAG---------------------CACATATTTATGCATGTTTACACTTTTTACGTTTCTTGTAGATAATGACTTCAGCTTTgcatatctaaatgtgtctcgaaaacgttgtaaacagttccataatttgtatgtgtccagtgtcaattcacatcacaaatgtcttttatagtcacacaccggtccgcatagatgccgtcctttaccgaatcaatcaacgtcgcgtcatttattgccttaaaccctcgccccggttcatcttcttaccctcgtatccgtacttaaacatcgatgccatctataaaccaatgcaagtgaaacagatgatttcatacatgttctctgcatcattgcatacgtttgtgtggttgtgttgccaaatcagttaaaaattcatttactctgccattttctatcaaatctttgatgtaatgattgttattatttagttcagcaagattgcttgtttgtcgattgattactaacggtaacataacggtcaacatttataaatcatatgctaaagatgtaatacaagattcagacgaaattgcaagtaattcgagtatgttaatttttattgttacgttctcttcccagaagatatggtttactatttctcgtgcccgttcttccgttcatgggttactctagcacatatttatgcatgtttacactttttacgtttcttgtagataatgacttcagcttttttaaaatttcattaaatttagatcacccc
gi|5 : tataaaacatcaaagtttcatttgtagtgatgatttgctgtagaaaaaatgtcgtattatttacgaaacagctccaaaacatatttggaggtaccacacggttgccttaattagatttttatcaattaactattcattctatacacaaaacacctactatgtgcatatctaaatgtgtctcgaaaacgttgtaaacagttccataatttgtatgtgtccagtgtcaTACATC----------ACAAATATCCCTAATAGTCACACGGTGGTTCGCATATATGACATCCTTTATCAAAT---------CAATCGATG-TAATGTCAATTATTGTC-TTT--CTTCCTCGTCAATGTTAATCTTCTACCTCTAGCCATCCACCCTT----AAAC--C-ATTGATGCTAT-CTA------AAAACCAATGCCT----------GTGGCACAG-------ATGGTTTCATAGATGTCCTCTACATCATTTCATACATTTATGTAGGTGTGTTTCCCAGTGTAGTTAAAA-T---TTAACTACT--GA---GCGATTTTCTATCAAATCTTTCGACGT--CAT--T--TCT--T-GTT-ATTATTTAGTT---CAGT-AATAGTTACTTGTTTGTCGATTGTGTACTAACATTAA-CGGAT-ATG--ATAT-CAAAATTTT-AAAAGCATACGCCT-AT-GA---CATCATACAAGGTGCAGACGAA----------ATTGAGCTACATTAGAGT-------ATAT--TGAATTTTAATTGTAACATTTTCTTCATATAGAAGATATTGTCTAAGTGAGTGTTTCTCGTGC--CCTGCTCTTCAGTTCAAGGGTTACTATAGCAACGTACCAAA-TGAGCTTTTGCGATTTTAAACTTTTTATTAT--TTA---TA----GTAGATAATGACTTCAGCTTTATGTACATACAGTATCTTGGTATAAA--AACAACAGATAAATGTTTTAGAG-CAA-A-AATCTCATTAAATTTAGATTAGCCtttaaaatttcattaaatttagatcacccc
gi|15 : TACGTTTGTATAGCTGTGTT-CCCAACTCAGTTACAATT---TTAATTACT--GC---GCGATTTTCTATCGAATGTTCAAACG---TCA--T--CTC--TGGTT-ATTACTTATTT---TAGC-AACGGTTGTTTGTTT
gi|8 : taatcaattgaaagCGAGCCTTTAGACGTCATTTCAT--TTC--TTGTT-ATGGTTTTGTT---CAGC-AACGGTTGCTTGTTTGTCGATTGTTTGCTAACGGTAA-CGGATTATG--TCGT-CA-CATTTTATAAAACATATG-CTGAA-GAAATTCTC--------TACA-----------------TT------CG----ATT-------GTGT--TGGTTTTTACTTGTAACGTTCTCTTCACAA--AAG-TATGATCTT--CTA---TTTCCC-T-TGCCCTGT-CTTCCGTTCATGGATTACTATAGTAACGTATTAAAT-AAGCTTTTGTATCTTTAAACGTATCGTTG---TTTACGTATCATGTAGATAATAACTTCAGCTTCATGTACAGACAGTATCTTGGTATAAA--AACGACAGATATATCTTTAAGAG-C-A-ATTATCTCATTAAATTTAGAactat
gi|11 : gatcaaaatatctattcggtaccctgcattttaacgaatcttaaGTTATACAAGATGCAGACGAA----------ATTGCGCTACATTAGAGT-------GTGT--TCATTTTTAATTGTAACATTCTTTTCACA---AGGATCTGGTCTA--TTA---TTTTTTGTGC--CCCGCTCTTCCATTCATAGATAACTATAG--------CAA------CTTATTCATTTTTAAACTTATTATTA---TTTACGTATCATGTAGATAATAACTTCAGCTTTATGTATAGACAGAACCTGGGTATAAA--AACAACAGATAAATGTTTAAGAA-CAA-A-AATCTCATTAAATTTAGATCACCCgcacac
gi|12 : cTGT--TGATTTTTAATTGTAACATCCTTTTCAAAG--AATATCTTGTCTA--CTA---TTTCTCATGC--CCCGCTCTTTCGTTCATAGGTTACCATACTAATGTATCAAAT-GAATTTATGCATTTTTAAACTTATTATT--TAT----GTATCGTGTAGATAGGTACTTCAGCTTTATGTACAGACAGTACCTTGGTATAAA--AACAACAGATAAATGTTTTAGAA-CAA-A-AATCTCATTAAATTTAGAT
gi|2 : tTCTTTGGTTTATAGGTTACTGTGGCAACGTATCAAA-TGAGCGTAT----------GCTTATTAT---TATTTACCTATCGTGTACATTATGACTTCAGCTTTTGGTATAGACATTATCTTGGTATAAA--AACGACAGATATATAGTTTAGAG-C-A-A-A--C-------ATTTAGATCACCCCc
gi|14 : ttttttcctgaattggcgacaggaaccgtttaaggtaaagaaaatgccagattcttcatttctgagtttaataaattcaacaaaatttcgttcatagcgatgattcgccacataaacatgtcgctttctttacgataacggttaaaatattcaatttgactatttgtcatttgataatacttacggtatccatcgagcacctatatacttatttaaatgtgtctctaaaagattgtaaacagttctataattgtgtccagataaatcacaaatgcctcaaatggtcacacggcggtccgcttagatgacgtcctttatcgaatcgatcaacatcacgtcagttattgcctttcttccttttcccggttctcgcctttagccatctgtcttttaagcttggatgccatcccaatgcccgtgaacgtgtgatttcatatataccctctgcatcctttcatacatttaagtaggtgtttcccagctaaaaaaatatattactgcgcgattttctatcgaatctttaggcatcgtttcttgttaatttttagtttaacggtaaaccgttgcttgtttgtcgagtgtgtacttacgtaagcggatatgtcatcacaattataaatcatatgcttacgacgtcatgcaagatgccgacaaaattgcgctacattcgagtgtggtgaatattaattgtaacgtactcttcgtgcccaacTCTTCCGTTCATGGGCAACTATAGCAACATATCCAAT-GAGTTTATGCATTTTTAAACTTATTATTATT--T--CGTATTGTGTA----ATGACTTCAGCTTTATGTATAAACAGTACCTTGATACAAA--AGTAATAGATAAATCTTTTAGAG-CAA-A-AATCTAATT-AA
gi|16 : CATTTTTAAACTTATTATCA---TTTACATATACTGTAGATAATTACTTCAGCTTTATGTACACACAGTAACTTGATACAAA--AACGACACATAAATATTTTAGAGCC-A-A-ACTATCATTAAATTTAGATCACaa
gi|23 : atgTACACACAGTACCTTGATATAAAAACAT--CAAATGCACATTTTAGAG-C-ACA-AATTTCATTAAATTTCAATCACACCTa
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): TTAGTACATACGAGGGGTGATCTAAAATTACAGAGGCTGATTCTAGTACAGAAAAGGTATATCGAATAGCAAACTGAAACAAAAGACAAAATGAAGGTCATCTTTATTCAGCAACTGTACCAAAAATCAACAAATTGGCATTGGAATTGGTAAATTCAAGCAATTTTACAACAGATACATAACGTCGGAGTGAGACAGCGCGATACTGTTACACGCTGTCGGGAAACTTCAATTTCATGAATCTACCTTCAGCACGTCAACGTTTTTCGAAACCCTCTCCGTCACGGGACAGGATACACAATTCTGCTGTCGGTTGTTCCAATGTCTATA
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Unaligned ( gi|19 ): TAAATCTAATGAGAATGATTCGATTTTGAAAAGGGTTCTTGGAATATCAAACTAAAAAAATCAAAACTAAAAAAGTCAAAATGAAGTCCGATCTTCATACATCA
Unaligned ( gi|21 ): GTATATAGGAGGGGTGATTTAAATTTAATGAGACGTATTCTAGTATGGGAAGGGTATTTTGAATATTAAACTGAAACAAAGATCAA
Unaligned ( gi|22 ): ATATTTGGATTATCAAACTAAAACAAAGACAAATAAAGTCCAATATATATTAATCAACTTCACCAAATATCAACTCATTTGTAA
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